Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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* * * *
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** *
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* *
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*
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*
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*
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* *
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*
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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** *
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*
2013 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAAT-AGATACGCGACATTGACGCTTTGATGTCGCAAGAA
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* *
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* * * * *
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*
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*
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*
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*
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*
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* * * * * *
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*
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* *
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* * * * *
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* *
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* * *
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** * **
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* * * *
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** *
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*
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* * ** *
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* * * *
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* *
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323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGT-AAAGTCTATG
* *
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*
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*
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* *
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*
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* * * * * *
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* *
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*
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*
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* *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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** *
4796 TCAAA-TTCA-TCCATTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCGCAACAGTCTCCACTCTTTTCGAGA
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* *
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* *
4924 AAGCTTTTCTTCCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
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* * * *
4989 AGTCACACAAATCCTTATTCCTT-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAGGCATA
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* *
5053 CACGATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
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* * *
5118 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCAC
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*
5183 TATAAACTTATTCTCCTCCATAG
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*
5206 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
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* *
5270 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
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*
5399 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
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* * * * * *
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*
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* *
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*
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*
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* * * * * *
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* *
6954 CACGATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * *
7019 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCAC
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAG
*
7084 TATAAACTTATTCTCCTCCATAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
7107 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
7171 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
7235 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
7300 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGA-AAGACATGAA
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAA-ACATGAA
* * * *
7364 TAGACACAAAAATCCTCATAC-TCTTTTGGATTAGGCACCATCAACTTAGTCTTCTCAAAAGCAA
258 TAGACACAAAAATCCTCATTCTTC-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCAT
* * *
7428 ACACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTCTTCCCACCAATTTCGGAAAAGTCTATG
322 ACACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATG
* * * *
7493 TTCATGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTCTAGTAATGATCTTTTTCATGTTGTGATTAGGCAG
387 TTCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATCACGTTGTGATTAGGCAG
*
7558 TATAAACTTATTCTCCTCCATAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
7581 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
7645 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
7709 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
*
7774 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
7839 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
259 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
*
7904 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAACGCTTTTTTCCCACCAATTTTGATAAAGTCTATGT
324 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * * * * *
7969 ACATGCCTCAAATGTGACAAACATGGATTGTAGTAATGATCCTCATTCACGTTGTGATTCGGCAG
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTA-TCACGTTGTGATTAGGCAG
8034 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
* *
8057 GATAAATGAGATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATTTTTTCTTTGCCCTA-TTTCCTTAAAAT
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
8121 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
66 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
*
8186 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCAGCAAGAAA
131 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTC-GCAAGAAA
* *
8251 AGCATTTCTTTCAACCATTTTTGATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATA
195 AGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATA
* * * * *
8316 GACACAGAAATCCTCATTCTTTTTTAGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTTATAAGCGTACA
260 GACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATACA
* *
8381 CGATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTC
325 CGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTC
* * *
8446 GTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCACTA
390 GTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAGTA
** * **
8511 TAAACAAACTT-TCTTTATTAG
454 TAAACTTA-TTCTCCTCCTTAG
* * * *
8532 GATAAGTGATATTGATGATTTTCTTTTGCA-GAGAAAACTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAACA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATG-GAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAA
** *
8596 TCAAA-TTCA-TCCATTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCGCAACAGTCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCATTCC-TTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
*
8659 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAAT-AGATACGCGACATTGACGCTTTGATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
* *
8723 AAGCTTTTCTTCCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
* * * *
8788 AGTCACACAAATCCTTATTCCTT-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAGGCATA
259 AGACACAAAAATCCTCATT-CTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATA
* *
8852 CACGATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* *
8917 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCAC
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAG
*
8982 TATAAACTTATTCTCCTCCATAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
9005 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
9069 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
9133 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
*
9198 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
9263 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
259 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
9328 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAACGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
324 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * * * * *
9393 ACCTGCCTCAAATGTGACAAACATGGATTGTAGTAATGATCCTCATTCACGTTGTGATTCGGCAG
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTA-TCACGTTGTGATTAGGCAG
9458 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
* * *
9481 GATAAATGAGATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATTTTTTCTTTGCCTTATTTTCCTTAAAAT
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
*
9546 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATC
66 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
*
9611 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
131 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
* *
9676 GCATTTCTTTCAACCATTTTTGATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
196 GCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
* * * * *
9741 ACACACAAATCCTCATTCTTTTTTAGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTTATAAGCGTACAC
261 ACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATACAC
* *
9806 GATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
326 GATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
** * * *
9871 TAACTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCACTAT
391 TGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAGTAT
** * **
9936 AAACAAACTT-TCTTTATTAG
455 AAACTTA-TTCTCCTCCTTAG
* * * *
9956 GATAAGTGATATTGATGATTTTCTTTTGCA-GAGAAAACTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAACA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATG-GAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAA
** *
10020 TCAAA-TTCA-TCCATTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCGCAACAGTCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCATTCC-TTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
* *
10083 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTGATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
* * *
10148 AAGCTTTTCTTCCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTATTAAATAAGACAAACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
* * * *
10213 AGTCACACAAATCCTTATTCCTT-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAGGCATA
259 AGACACAAAAATCCTCATT-CTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATA
* *
10277 CACGATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * *
10342 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCAC
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAG
*
10407 TATAAACTTATTCTCCTCCATAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
10430 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
10494 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
10558 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
*
10623 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
10688 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
259 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
10753 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAACGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
324 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * * * * *
10818 ACCTGCCTCAAATGTGACAAACATGGATTGTAGTAATGATCCTCATTCACGTTGTGATTCGGCAG
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTA-TCACGTTGTGATTAGGCAG
10883 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
* * * *
10906 GATAAATGAGATGGATGGTTTTCTTTTGCATGGAAATTTTTTCTTTGCCTTATTTTCCTTAAAAT
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
*
10971 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATC
66 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
*
11036 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
131 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
* * *
11101 GCATTTTTTTCAACCATTTTTGATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
196 GCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
* * * * *
11166 ACACACAAATCCTCATTCTTTTTTAGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTTATAAGCGTACAC
261 ACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATACAC
* *
11231 GATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
326 GATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
** * * *
11296 TAACTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCACTAT
391 TGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAGTAT
** * **
11361 AAACAAACTT-TCTTTATTAG
455 AAACTTA-TTCTCCTCCTTAG
* * * *
11381 GATAAGTGATATTGATGATTTTCTTTTGCA-GAGAAAACTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAACA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATG-GAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAA
* ** *
11445 TCAAA-TTCA-TCCATTAAATAAGGCAAGCATTGAATCTCGCAACAGTCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCATTCC-TTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
11508 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
* *
11573 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTGATAGAATCAAAGTTTATCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
* * * * *
11638 AGTCA-AATAAATCCTCATAC-TCTTTTGGATTAGGCACCATCAACTTAGTCTTCTCAAAAGCAA
259 AGACACAA-AAATCCTCATTCTTC-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCAT
* * * *
11701 ACACGATATTGATAGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTCTTCCCACCAATTTCGGAAAAGTCTATG
322 ACACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATG
* * *
11766 TTCATGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTCTAGTAATGATCTTCAATCACGTTGTGATTAGGCA
387 TTCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTT-TATCACGTTGTGATTAGGCA
*
11831 GTATAAACTTATTCTCCTCCATAG
451 GTATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
* *
11855 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTCCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
11919 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
11983 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
*
12048 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
12113 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
259 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
*
12178 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAACGCTTTTTTCCCACCAATTTTGATAAAGTCTATGT
324 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * * * * *
12243 ACATGCCTCAAATGTGACAAACATGGATTGTAGTAATGATCCTCATTCACGTTGTGATTCGGCAG
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTA-TCACGTTGTGATTAGGCAG
12308 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
* *
12331 GATAAATGAGATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATTTTTTCTTTGCCCTA-TTTCCTTAAAAT
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
12395 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
66 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
* **
12460 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCATAAGAAAA
131 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
* *
12525 GCATTTCTTTCAACCATTTTTGATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
196 GCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
* * * * *
12590 ACACAGAAATCCTCATTCTTTTTTAGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTTATAAGCGTACAC
261 ACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATACAC
* **
12655 GATGTTGATGGTTTGGTTTTAATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTC
326 GATATTGATGGTTTGG-TTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTC
* * * *
12720 GTGCCTCAAATGTGCCAAACAAGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCACTA
390 GTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAGTA
** * **
12785 TAAACAAACTT-TCTTTATTAG
454 TAAACTTA-TTCTCCTCCTTAG
* * * *
12806 GATAAGTGATATTGATGATTTTCTTTTGCA-GAGAAAACTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAACA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATG-GAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAA
** *
12870 TCAAA-TTCA-TCCATTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCGCAACAGTCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCATTCC-TTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
* *
12933 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTGATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
* *
12998 AAGCTTTTCTTCCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
* * * *
13063 AGTCACACAAATCCTTATTCCTT-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAGGCATA
259 AGACACAAAAATCCTCATT-CTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATA
13127 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
*
13192 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTCTAGTAATGATCTTTATCACGTTGTGATTAGGCAGT
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATCACGTTGTGATTAGGCAGT
*
13257 ATAAACTTATTCTCCTCCATAG
453 ATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
13279 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
13343 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
13407 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
* *
13472 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGTAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
*
13537 AGACACAAAAATCCTCATTCCTT-TTCGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATA
259 AGACACAAAAATCCTCATT-CTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATA
*
13601 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAACGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATG
323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATG
*
13666 TTCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTGGTAATGATCTTTATCTAC-TTGTGATTAGGCA
387 TTCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCA
* *
13730 CTATAAACTTATTCTCCTCATTAG
451 GTATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
13754 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAA-CTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAACAT
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
*
13818 CAAAGTTCA-TCCATTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAGTCTCCACTCTTTTCGAGAT
66 CAAAGTTCATTCC-TTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGAT
13882 TGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAA
130 TGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAA
13947 AGC-TTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGAC-AACATGAATA
195 AGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATA
*
14010 GTCACAAAAATCCTCATTCCTT-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCA-AAGGCATA
260 GACACAAAAATCCTCATT-CTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAA-GCATA
*
14073 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTCTTCCCACCAATTTTGGTAAAAGTCTATG
323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGT-AAAGTCTATG
*
14138 TTCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTCTAGTAATGATCTTTATCACTGTTGTGATTAGGCA
387 TTCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATCAC-GTTGTGATTAGGCA
*
14203 GTATAAACTTATTCTCCTCCATAG
451 GTATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
14227 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
14291 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
14355 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
*
14420 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
14485 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
259 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
*
14550 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAACGCTTTTTTCCCACCAATTTTGATAAAGTCTATGT
324 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * * * * *
14615 ACATGCCTCAAATGTGACAAACATGGATTGTAGTAATGATCCTCATTCACGTTGTGATTCGGCAG
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTA-TCACGTTGTGATTAGGCAG
14680 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
452 TATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
* *
14703 GATAAATGAGATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATTTTTTCTTTGCCCTA-TTTCCTTAAAAT
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
14767 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
66 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
14832 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
131 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
* * *
14897 GCATTTCTTTCAACCATTTTTGATAGAATCAAAGTTTATCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
196 GCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
* * * *
14962 ACACAAAAATCCTCATTCTTTTTTAGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTTATAAGCGTACAC
261 ACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATACAC
* *
15027 GATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
326 GATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
* * *
15092 TGCCTCAAATGTGCCAAACA-GGATTGTGGTAATGATCTTTATCTACTTTGTGATTAGGCACTAT
391 TGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATC-ACGTTGTGATTAGGCAGTAT
** * **
15156 AAACAAACTT-TCTTTATTAG
455 AAACTTA-TTCTCCTCCTTAG
* * * *
15176 GATAAGTGATATTGATGATTTTCTTTTGCA-GAGAAAACTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAACA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATG-GAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAA
** *
15240 TCAAA-TTCA-TCCATTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCGCAACAGTCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCATTCC-TTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
* *
15303 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTGATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
* *
15368 AAGCTTTTCTTCCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
* * *
15433 AGTCACAAAAATCCTTATTCCTT-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAGGCATA
259 AGACACAAAAATCCTCATT-CTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATA
* *
15497 CACGATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
323 CACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
15562 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGGTAATGATCTTTATCTACTGTTGTGATTAGGC
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTA-GTAATGATCTTTATC-AC-GTTGTGATTAGGC
* *
15627 ACTATAAACTTATTCTCCTCCATAG
450 AGTATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
15652 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
15716 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
15780 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
*
15845 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
15910 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
259 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
15975 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAACGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
324 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * * * * *
16040 ACATGCCTCAAATGTGACAAAACATGGATTGTAGTAATGATCCTCATTCACGTTGTGATTCGGCA
388 TCGTGCCTCAAATGTG-CCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTA-TCACGTTGTGATTAGGCA
16105 GTATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
451 GTATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
* *
16129 GATAAATGAGATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATTTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
*
16194 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATC
66 CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
*
16259 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
131 GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
* *
16324 GCATTTCTTTCAACCATTTTTGATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
196 GCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
* * * *
16389 ACACACAAATCCTCA---------AGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTTATAAGCGTACAC
261 ACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATACAC
* *
16445 GATGTTGATGGTTTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
326 GATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
* * * * *
16510 TGAACTC-AATGTG-C-AACAATGGATTGTGGTACTTGGCTCCTTTATCTACTTTGTGAATTAAG
391 TG-CCTCAAATGTGCCAAAC-ATGGATTGTAGTA-AT-GAT-CTTTATC-ACGTTGTG-ATT-AG
* ** **
16572 GCACTAT-AACAAACTT-T-CTATTTAG
448 GCAGTATAAACTTA-TTCTCCTCCTTAG
*
16597 GATACAGGATGATATTGATTTG-TATTTCTTTTGCATAGGAAA-CTTTTC-TTGCCCTATTTTCC
1 GATA-A--ATGATATGGA--TGAT-TTTCTTTTGCAT-GGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCC
* * ** *
16659 TTAACATCAAA-TTCA-TCCATTAAATAAGGCAGGCATTGATTCTCGCAACAGGTCTCCCACTCT
59 TTAAAATCAAAGTTCATTCC-TTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACA-ATCT-CCACTCT
* *
16722 TTTCGAGATTAGGGAACC-AAAACACATTCCTTTCAATAGGATACGCGACATTTGACGC-TTGAT
121 TTTCGAGATT-GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACA-TTGACGCTTTAAT
* * *
16785 -TCGCAAG-AAAGC-TTT-TTCTCCAA-CG-TATTTATAAATATCAAAGTTTGTCTATTAAATAA
184 GTCGCAAGAAAAGCATTTCTT-T-CAACCGTTTTTTATAGA-ATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAA
* * * *
16844 GACAAACATGAATAGTCAC-ACAATCCTTA-TC--CGTTTGG-TTAGTCACCATAAACTTAGTC-
246 GACAAACATGAATAGACACAAAAATCCTCATTCTTC-TTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCT
* * *
16903 TCTCATAGGGCATACACGATGTTGATGG-TTGGTTTCATAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTT
310 TCTCATA-AGCATACACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTT
* * * *
16967 GGTAAGGTCTATGTTCGTGCCTCAAA-GGGCCAAACATGGGATTGTGGTAATGATCTGTATCTAC
374 GGTAAAGTCTATGTTCGTGCCTCAAATGTGCCAAACAT-GGATTGTAGTAATGATCTTTATC-AC
* * *
17031 TTTGTGATTAGGCACTATAAACTTATTC-CCTCCATAG
437 GTTGTGATTAGGCAGTATAAACTTATTCTCCTCCTTAG
*
17068 GATAAATGATATGGATGATATTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTT-CCTCTATTTTCCTTAAAA
1 GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCC-CTATTTTCCTTAAAA
* *
17132 TCAAAGTAC-TCTCCTTAAACAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
65 TCAAAGTTCAT-TCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGA
17196 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
129 TTGGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAA
*
17261 AAGCATTTCTTTCAACCG-TTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAGACATGAAT
194 AAGCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAAT
17325 AGA-ACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
259 AGACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATAC
*
17389 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAACGC-TTTTTCCTACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
324 ACGATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAA-GCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGT
* * * * *
17453 ACCTGCCTC-AATGTG-GACAACA-GGATTGTAGTAA-GATC-CTATTCACGTTGTGATTTCGGC
388 TCGTGCCTCAAATGTGCCA-AACATGGATTGTAGTAATGATCTTTA-TCACGTTGTGA-TTAGGC
17513 AAGTATAAACTTATTCTCCTCC
450 -AGTATAAACTTATTCTCCTCC
Statistics
Matches: 15705, Mismatches: 1075, Indels: 565
0.91 0.06 0.03
Matches are distributed among these distances:
464 8 0.00
465 109 0.01
466 256 0.02
467 251 0.02
468 197 0.01
469 156 0.01
470 218 0.01
471 324 0.02
472 541 0.03
473 1307 0.08
474 3112 0.20
475 5383 0.34
476 3155 0.20
477 604 0.04
478 67 0.00
479 17 0.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.19, G:0.15, T:0.35
Consensus pattern (474 bp):
GATAAATGATATGGATGATTTTCTTTTGCATGGAAATCTTTTCTTTGCCCTATTTTCCTTAAAAT
CAAAGTTCATTCCTTAAATAAGGCAAGCATTGATTCTCATAACAATCTCCACTCTTTTCGAGATT
GGGAACCAAAAACACATTCCTTTCAATAAGATACGCGACATTGACGCTTTAATGTCGCAAGAAAA
GCATTTCTTTCAACCGTTTTTTATAGAATCAAAGTTTGTCTCTTAAATAAGACAAACATGAATAG
ACACAAAAATCCTCATTCTTCTTTGGATTAGGCACCATAAACTTAGTCTTCTCATAAGCATACAC
GATATTGATGGTTTGGTTTCGTAAGAAAGCTTTTTTCCCACCAATTTTGGTAAAGTCTATGTTCG
TGCCTCAAATGTGCCAAACATGGATTGTAGTAATGATCTTTATCACGTTGTGATTAGGCAGTATA
AACTTATTCTCCTCCTTAG
Done.