Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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*
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* * *
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* * *
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* *
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* * * *
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325 GGATG
* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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*
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326 GATG
* ** * *
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1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
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66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGT-GACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
1438 TTTTATTCTTTAACGTCG-TGGATTTGGG-TGACGAGTCTCATAATTTTGGGAAAAAATTTCGAA
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* * * * * *
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* * * * * *
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1630 TGGATG
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** * * *
1636 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCATATCCCATCAGAACACCGCTGTTAAGCGTGCGTGGG
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* * *
1701 CGAAAGTAGTACTAGGATGGGTGAACTCGTGGGAAGCCCATCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* *
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*
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* * * *
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*
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* * * *
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* * * * * * * * *
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3277 AAGGATG
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* * * *
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*
3349 CGAGTGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
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* * *
3414 TTTATTTTTTAACCTCGCTGGATTTGGGTTAACGAGTCTCATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
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196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
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3608 GATG
326 GATG
* * *
3612 GGTGCGATCGTACCAGCACTAGTGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * * *
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* *
3742 TCTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGT-ACATAATTTTAGGAAAAAATTTCAAAA
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3806 AGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACTCGTGAG
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* * *
3870 ACATGGGCCCACATGTGTGACAGGGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
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3935 GATG
326 GATG
* ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
4396 TTTTATTTTTTAACCTCGCTGGATTTGGGTTAACGAGTCTCATAATTTTAGGAAAAAATTTTGAA
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*
4724 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGT-ACATAATTTTAGGAAAAAATTTCAAAA
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4788 AACCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACTCGTGAG
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* *
4852 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGGGCGAGGAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
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* *
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** * *
5180 GACAAAGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAA-GATGGTATTTGTAGTTTGTGATGGCAAAAAG
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325 GGATG
** *
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* * *
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* * * *
5379 TTTGTTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTCAGGAAAAAATTTCAAAA
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* *
5444 AGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGATGTTTAATCGACTAAAATATAAACCCGTGAG
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* *
5508 ACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGTTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
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* *
5577 GGTGCGATCATACCAGCACTAAAGCACCGGATCCCATTAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
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* * *
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5771 AAGCTTTATTAACTGAAAAAAACTAAAGCAACTGATGTTTGATCGAGTAAAATATAATCCCATGA
195 AAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
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5836 GACTTGGGCCCACAAGGGTGACGGGGTAAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAG
260 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
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5901 AGATG
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5906 GGTGTGATCATACTAGTACTAATGCACAGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTGAAGCGTGCTTGGG
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* *
5971 CGAGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCCTTTTAATT
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6101 AGCGTTATGAACTG-AAAAAACCGAATAAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
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1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * * *
6625 TGAGAGTAGTGCTAGTATGGGTGACCTCATGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAA-T
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
6689 TTTATTCTTTAACATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCTCATAATTTTGGGAAAAAATTTCGAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * * *
6754 AGCCTTCTTAACT-TAAAAAACCGAATCAACTGACATTTAATCGAGCAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * * *
6818 ACAAGGGCCCACAAGGGTTG-CAGAGCTAGAAAGGATGGTTTTTGTAGTTTGTGATGGCAAAAAG
261 ACATGGGCCCACAAGGG-TGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
6882 GGATG
325 GGATG
* * * * * *
6887 GGTGCAATCATACCAGCACTAATGCAACAGATCTCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTAGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
6952 CGAGTGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCAATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * *
7017 TTTATTTTTTAACCTCGCTGGATATGGGTTAACGAGTCTCATAATTTTAGGAAAAAATTTTGAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * *
7082 AGCCTTATGAACT-AAAAAAACCGAATAAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * **
7146 ACATGAGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGGTACTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
7211 GATG
326 GATG
* * * *
7215 GGTGCGATCGTACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAATTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
7280 CGAGAGTAGTACTAGTATGGGTGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCGCCTCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
7345 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGT-ACATAATTTTAGGAAAAATTTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * **
7409 AACATTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAAATCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
7473 ACACGGGCCCACAAGGGTGACAGGGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
7538 GATG
326 GATG
* ** * * *
7542 GGTGCGATCATACCAGCACTAATACATTGGATCCAATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGCG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * * *
7607 TGAGAGTAGTACTAGTATGGTTGACCTTGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAA-T
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
7671 TTTATTCTTTAACATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCCCATAATTTTGGGAAAAAATTTCGAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * * * *
7736 AACCTTCTTAACCG-AAAAAACCGAATCAACTGACATTTAATCGAGTAAATTATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * *
7800 ACAAGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATGGTATTTGTAGTTTGTGATGGCAAAAAGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
7865 GATG
326 GATG
* * *
7869 GGTGCGATCATACTAGCACTAATGCACCAGATCCCATCAGAACTTCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
** * * *
7934 AAAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCATGGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
** ** * *
7999 TTCGTTTTTTAAAATCGTTCGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* *
8064 AGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGATGTTTTATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * * * *
8128 ACATAGGCCCATAAGGGTGACAGAGTGAGAAAGGATGGTACTTGTAGCTTGTTATGGCAAAAAGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
*
8193 GACG
326 GATG
* ** *
8197 GGTGCGATCATACCAGCACTAACGCACCAAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
8262 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGAACTCGTGGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTCTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
** *
8327 TTCGTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGG-AAAAATTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * *
8391 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACTGAATCAACTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGCGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * *
8456 ACATGGACCCACAAGGGTGACAGATCGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGTTATGGCAAAAAGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
8521 GATG
326 GATG
* * ** * * *
8525 GGTGTGATCATACTAGCACTAATGCATAGGATGCCATCAGAATTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
8590 C-AGGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTTC-TGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAA
66 CGA-GAGTAGTACTAGGATGGGTGACC-TCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * *
8653 TTTTTATTTTTTAACCTCATTGTATTTGGGTTGAC-ATGTCACATAATTTTA-GAAAAAATTTTG
129 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGA-GTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCG
* * * * * * *
8716 GAAAGCCTTATTATCTGAAAAAAACTGAAGCAACTGACATTTAATCGAGTAAAACATAAACCCAT
193 AAAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
* * * * * *
8781 GAGACTTGGGCCGACAAGGGTGACGGGGAGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
258 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
*
8846 AGGGATG
323 GGGGATG
* ** * * *
8853 GGTGTGATCATACTGGCACTAATGCACAGGATCCCATTAGAACTTCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
8918 CGAGAGTAGTACTTA-GATGGGTGACCTCGTGGGAAGTACTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
66 CGAGAGTAGTAC-TAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
8982 TTTTAATTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGCTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAATTTTC-AG
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA-
* * * * * *
9046 AAAGCTTTAATACCTGAAAAAAACCGAATCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACTCGTA
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * * * * * * * *
9111 AGATATCGGCCAACAACGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTCGTTGTTGCAAAAA
259 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
*
9176 AGGATG
324 GGGATG
* *
9182 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATTAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
9247 CAAGAGTAGTACTA-GATTGGGTGACCTCGTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
66 CGAGAGTAGTACTAGGA-TGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
** * * * *
9311 TTTTATTTTTTAACCTCACTGGATTTGGGTTGGCGAGCCTCATAATTTTGGGAAAAAATTTCGAA
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAA
*
9376 AAGCCTTATTAACT-AAAAAAACCGAATCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATAT-AACCCGTGA
195 AAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * * *
9439 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGAGAGAAAGGATAGTAATTGTAGTTTGTTGTGGCAAAAGG
260 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
9504 GGATG
325 GGATG
* * * * *
9509 GGTGTGATCGTATCC-GCACTAATACACTGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
1 GGTGCGATCATA-CCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
9573 GCGAGAGTAGTACTAGTATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGAGTTGCACCCCATCTTTTTAA-
65 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
9637 TTTTATTCTTTAACATCGTTGGATTTGGATTGACGAGTCTCATAATTTT-GGCAAAAAATTTCG-
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGG-AAAAAATTTCGA
*
9700 AAAGCCTTCTTAA-TCGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
194 AAAGCCTTATTAACT-GAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
** *
9764 GAGACAAAGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTGATGGCAAAA
258 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
*
9829 AGGGATG
323 GGGGATG
* * *
9836 GGTGCGATCATACCAGCACTAATACACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTTGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
9901 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTTGTGGGAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
9966 TTCATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* *
10031 AGCCTTACTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
10095 ACATGGGCCCACAAGGG-GAACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATTGAAAAAGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTG-ACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
10159 GGATG
325 GGATG
*
10164 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
10228 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGACCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTT-ATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * * * * *
10292 TGTTATTTTTTAATCTCGTTGTATCTGGATTGACGTGTCATAT-ATTGTTTGAAAAAAATTTTGA
131 T-TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATT-TTAGGAAAAAATTTCGA
10356 AAAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGA-TGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCA-ACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
* ** * * *
10419 GAGATAAAGGCCCACAAGGGTGATAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGCAGTTTGTGATGGCAAAA
258 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
* *
10484 AGGGATT
323 GGGGATG
* * *
10491 GGTGCGATCATACCAGCACTAATACATCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
**
10556 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAACCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
10621 TTCATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAATTTTAGGAAAAAGTTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * *
10686 AGCCTTACTAACTG-AAAAAACCGAATCAACAGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * *
10750 ACATGGGCCCATAAGAGG-AACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATTGCAAAAGG
261 ACATGGGCCCACAAG-GGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
10814 GGATG
325 GGATG
* * *
10819 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATTAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTT-GG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
10883 CGAGAGTAGTACTAAGGATGGGTGACCTCTTGGGATGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTATT
66 CGAGAGTAGTACT-AGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * * * *
10948 TTTTATTTTTTAATCTCGTTGTATTCGGATTGACGTGTCATATAATGTTT-GAAAAAAATTTCGA
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAAT-TTTAGGAAAAAATTTCGA
** * *
11012 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACTAAAGCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * * * *
11077 AGACATGGGCCCAC-AGGGATGACAGAGCGAGAAATGATGGTATTGGCAGTTTGTAATGGTAAAA
259 AGACATGGGCCCACAAGGG-TGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
*
11141 AGGGATG
323 GGGGATG
* * * * * *
11148 AGTGTGATCATACCTA-CACTAATGCACAGCATCCCATTAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
1 GGTGCGATCATACC-AGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * * *
11212 GCGAGTGTAATACTAGAATGGGTGACCTTGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTATTAA-
65 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * *
11276 --TT-TTTTGTAACGTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCAAATAATTTTAGGAAAGAATTTC-AG
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA-
*
11337 AAAGCCTTATTAACT-AAAAAAA-CGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAGCCCGTG
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
*
11400 AGACATGGGCCCACAAGGG-GAACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATTGCAAAA
259 AGACATGGGCCCACAAGGGTG-ACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
11464 GGGGATG
323 GGGGATG
* *
11471 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC-TCGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
11535 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGACCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTATTT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA---
* * * * * * *
11600 TTTATGTTTTATTTTTTAATCTCGTTGTATTTGGATTGACGTGTCATAT-ATTGTTTGAAAAAAA
128 ---AT-TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATT-TTAGGAAAAAA
*
11664 TTTCGAAAAGCCTTATTAACT-AAAACAACCGAATCAGA-TGACGTTTAATCGAGTAAAATATAA
188 TTTCGAAAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCA-ACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAA
* ** * * *
11727 ACCCGGGAGACAAAGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATGGTATTTGCAGTTTGTGATG
252 ACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATG
* *
11792 GCAAAAAGGGATT
317 GCAAAAGGGGATG
* * *
11805 GGTGCGATCATACCAGCACTAATACACCGGATCCCATCAGAACTTCACAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
11870 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
11935 TTCA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * * *
11999 ACCCTTACTAACT-AAAAAAACCGAATCAACAGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
12063 ACATGGGCCCATAAGGG-GAACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTACT-GCAAAAG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTG-ACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAG
12126 GGGATG
324 GGGATG
** *
12132 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCAGTGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
12197 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGT-GACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * * * *
12262 TTTTATTTTTTAATCTCGTTGTATTTAGATTGACGTGTCATATAATGTTT-GAAAAAAATTTCGA
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAAT-TTTAGGAAAAAATTTCGA
* *
12326 AAAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACTCGTG
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* *
12390 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAAAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAG
259 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
12455 GGGATG
324 GGGATG
** * *
12461 GGTGTAATCATACCAGCACTAATACTCCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTTGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC-TTGG
* * * *
12526 G-GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCATGGGAAGTCTTCGTGCTACACCCCATCTTTTTAAT
65 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
12590 TTTCATTTTTTAACCTCGTTGGATTTAGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAAATTCAAA
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAA
* * *
12655 AAGCCTTATTAACTGTAAAAAATCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAACATAAACCCGTGA
195 AAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* *
12720 GACATGGGCCCA-TAGGGGGAACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
260 GACATGGGCCCACAAGGGTG-ACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
*
12784 AGGATG
324 GGGATG
* * *
12790 GGTGCGATCATAACAGCACTAATGTACTGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
12855 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCATGTTGCACCCTATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
12920 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTT-TAGA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA-A
* * *
12984 AAGCCTTATTACCTGAAGAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGACTAAAATATAAACCCGTGA
195 AAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * * *
13049 GACACGGGCCCACAAGGGAGACAGAGCGACAAAGGATGGTATTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGG
260 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
13114 GGATG
325 GGATG
* *
13119 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACAGGATCTCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
13184 CAAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCTCATC-TTTTAA--
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
13246 TTT-TTTTTTAATCTCGTTGTATTTGGGTTGACGTGTCACATAATTTTTGAAAAAAATTTTGAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
** * *
13310 AGCCTTATTAACTGAAAAAAAACTAAAGCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
196 AGCCTTATTAACTG-AAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * * * * * * * *
13375 GATATGGGCCCAC-AGGGATGACGGAGCGAGAAATGTTGGTATTGGCAGTTTGTAATGGTAAAAA
260 GACATGGGCCCACAAGGG-TGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
13439 GGGATG
324 GGGATG
* * * * * *
13445 AGTGTGATCATACCTA-CACTAATGCACAGCATCCCATTAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
1 GGTGCGATCATACC-AGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * * *
13509 GCGAGTGTAATACTAGAATGGGTGACCTTGTGGGAAGTCCTCGCGTTGCACCCCATCTTTTTAA-
65 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
13573 --TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCAAATAATTTTAGGAAAGAATTTC-AG
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA-
*
13634 AAAGCCTTATTAACT-AAAAAAA-CGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAGCCCGTG
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * *
13697 AGACATTGGCCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAAGGGTGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
259 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
13762 GGGATG
324 GGGATG
* * * * * *
13768 GGTGCTATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCAATCAGAACTCCGCAGCTAAGCATGCTTTGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
13833 CGAGAGTAGTACTTGGATGGGTGACCTCGTTGGAAGTACTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
13898 TTCATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAAATTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * * *
13963 AGCCCTATTAACTGTAAAAAATCGAATCAACTGACTTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * *
14028 ACATGTGCCCACAAGGG-GAACAAACCGAGATAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTG-ACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
14092 GGATG
325 GGATG
* *
14097 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-AG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
14161 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGA-CTCTTGGGAAGTCCTTGTGTTGCACCTCATCTTTTTATTT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA---
* * * * *
14225 TTTATTTTTTATTTTTTAATCTCGTTGTATTTGGATTGACGTGTCATATAATGTTT--GAAAAAT
128 ---A-TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAAT-TTTAGGAAAAA-
14288 ATTTCGAAAAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAA
187 ATTTCGAAAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAA
* * * * *
14352 ACTCGTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAAAAATGATGGTATTTGTATTTTGTTATG
252 ACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATG
14417 GCAAAAGGGGATG
317 GCAAAAGGGGATG
* *
14430 GGTGCAATCATACCAGCACTAATACACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
14495 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
** ** * *
14560 TTCGTTTTTTAAAATCGTTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* *
14625 AGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAACTGATGTTTTATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * *
14689 ACATAGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTACTTGTAGTTTGTGATGGCAAAAAGG
261 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
**
14754 GACA
326 GATG
* ** * *
14758 GGTGCGATCATACCAGCACTAACGCACCAAATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTAGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
14823 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTCTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
** *
14888 TTCGTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* * *
14953 AGCCTTATTAACTGAAAAAAAACTGAATCAACTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGCGA
196 AGCCTTATTAACTG-AAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * * *
15018 GACATGGACCCACAAGGGTGACAGATCGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGTTATGGCAAAATG
260 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
15083 GGATG
325 GGATG
* * ** * * *
15088 GGTGTGATCATACTAGCACTAATGCATAGGATGCCATCAGAATTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
15153 C-AGGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTTC-TGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTCTTAA
66 CGA-GAGTAGTACTAGGATGGGTGACC-TCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* ** * * *
15216 TTTTTATTTTTTAACCTCATTCTATTTGGGTTGACGTGTCACATAATTTTA-GAAAAAATTTTGG
129 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA
* * * * * *
15280 AAAGCCTTATTATCTGAAAAAAAACTGAAGCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAACATAAATCCAT
194 AAAGCCTTATTAACTG-AAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
* * * * *
15345 GAGACTTGGGCCCACAAGGGTGACGGGGAGAGAAATGAT-GTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
258 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
15409 -GGGATG
323 GGGGATG
* * * **
15415 GGTGTGATCATACTAGCACTAATGCACAGGATCCCATCAGAACTTTGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
15480 CGAGAGTAGTACTTGGATGGGTGACCACGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
15545 TTTAATTTTTAACCCTCGTTGGATTTGGGCTGTCGAGTCACATAATTTTAGGAAAAATTTTC-AG
131 TTTATTTTTTAA-CCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA-
* * * * * * *
15609 AAAGCTTTAATACCTGAAAAAAATCGAATCAACTAACGTTTAAATCGAGT-AAATATAAAACTCA
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTT-AATCGAGTAAAATAT-AAACCCG
* * * * * * * * * * *
15673 TAAGATATCGGCCAACAACGGTGACGGAGCGAGAGAGGATGATATTTGGTAGTTCGTTGTTGCAA
257 TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTT-GTAGTTTGTTATGGCAA
*
15738 AA-AGGATG
321 AAGGGGATG
* *
15746 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATTAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
15811 CGAGAGTAGTACTA-GATTGGGTGACCTCGTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
66 CGAGAGTAGTACTAGGA-TGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
** * * * *
15875 TTTT-TATTTTTAACCTCACTGGATTTGGGTTGGCGAGCCTCATAATTTTGGGAAAAAATTTCGA
130 TTTTAT-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA
* * *
15939 AAAGCCTTATTAACTAAAAAAAACCGAAGCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * * *
16004 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGAGAGAAAGGATAGTAATTGTAGTTTGTTGTGGCAAAAG
259 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
16069 GGGATG
324 GGGATG
* * * *
16075 GGT-CTGATCATATCAGCACTAATACACTGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
1 GGTGC-GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
16139 GCGAGAGTAGTACTAGTATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGAGTTGCACCCCATCTTTTTAA-
65 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * * *
16203 TTTTATTCTTTAACATTGTTGGATTTGGATTGACGAGTCTCATAATTTTGGGAAAAAATTTCG-A
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAA
* * *
16267 AAGCCTTCTCAACCGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
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** * * *
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260 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
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325 GGATG
* * *
16402 GGTGCGATCATACCAGCACTAATACACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTTGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
16467 AGAGAGTAGTACTAGGAT-GGTGACCTTGTGGGAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
16531 TTCATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAA-TTCAAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
* *
16595 AGCCTTACTAACTG-TAAAAACCGAATCAACTGACTGTTTAATCGAGT-AAATATAAACCCGTGA
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*
16658 GACATGGGCCCACAAGGG-GAACAGAGCGAAAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
260 GACATGGGCCCACAAGGGTG-ACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
16722 GGGATG
324 GGGATG
* * *
16728 GGTGCGATCATACCAGCACTAACGCACTGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
16793 CGAGAGTAGTACTA-GATGGGTGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTATTT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
16857 TTTATTTTTTAATCTCGTTGTATTTGGATTGACGTGTCATATAATGTTT--GAAAAAAATTCGAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAAT-TTTAGGAAAAAATTTCGAA
* *
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* * *
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260 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
17046 GGATTG
325 GGA-TG
* * * *
17052 GGTGCAATCATACCAGCACTAATACACCGGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGGGCTTTG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACC-GGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
17117 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGA-CTCGTGGGAAGTCTTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAAT
65 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
17181 TTTCATTTTTTAACCTCGTTGGATTTAGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTAGGAAAAAAATTC-A
130 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTT-GGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA
* * *
17244 AAAGCCTTATTAACTGTAAAAAATCGAATCAACTGACG-TTAATCGAGTAAAACATAAACCCGTG
194 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * *
17308 AGACATGGGCCCA-TAGGGGGAACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
259 AGACATGGGCCCACAAGGGTG-ACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
17372 GAGGGAT-
323 G-GGGATG
* * *
17379 GGTGCGATCATAACAGCACTAATGTACTGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
17444 AGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCG-GTTGCACCCTATCTTTTTAATT
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
17508 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAA-TTTAGGAAAAAATTT-TAGA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGA-A
* * * *
17571 AA-CACTTATTACCTGAAGAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGACTAAAATATAAACCCGTG
195 AAGC-CTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * *
17635 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGACAAAGGATGGTATTTGTAGTTTTTTATGGCACAAG
259 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAA
17700 GGGGATG
323 GGGGATG
* * *
17707 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACAGGATCTCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
1 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
17772 CAAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCTCATC-TTTTAA--
66 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
17834 TTT-TTTTTTAATCTCGTTGTATTTGGGTTGACGTGTCACATAATTTTTGAAAAAAATTTTGAAA
131 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
17898 AGCCTTATTAACTGAAAAAAA
196 AGCCTTATTAACTGAAAAAAA
17919 ACTAAAGCAA
Statistics
Matches: 15494, Mismatches: 1866, Indels: 463
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
322 60 0.00
323 357 0.02
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CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAGGAAAAAATTTCGAAA
AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAACTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
GATG
Found at i:14232 original size:6 final size:7
Alignment explanation
Indices: 14216--14242 Score: 54
Period size: 7 Copynumber: 3.9 Consensus size: 7
14206 GCACCTCATC
14216 TTTTTAT
1 TTTTTAT
14223 TTTTTAT
1 TTTTTAT
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1 TTTTTAT
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1 TTTTTA
14243 ATCTCGTTGT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
7 20 1.00
ACGTcount: A:0.15, C:0.00, G:0.00, T:0.85
Consensus pattern (7 bp):
TTTTTAT
Done.