Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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*
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*
1825 AAAAATACCCATTCCTTTCTCGCTTCGT--CCCTTGTGGGCCCATGGTC-CTACGGTGTTTATAT
64 AAAAATA-CCA-TCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCAT-GTCTC-ACGG-GTTTATAT
* *
1887 TTTACCTCAATTAATTTTAAACGTCAAACTGATTCGGTTTTTTTTTCTATGTTAATAAGGGCTTT
124 TTTA-CTC----GA--TTAAACGTC-AACTGATTCGG---TTTTTTC-A-GTTAATAA-GGCTGT
* * *
1952 CCGAAATTTTTTAAT-AATTTATG-GACTCGGTCAACCCAAATTCAAC-ATTTGGTTAAAAAATA
175 CCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGTGACTC-GTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATA
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1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCC-TTTTGCCATAACAAACTA
2172 AAAATACCGATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTAA
65 AAAATACC-ATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTT-A
2237 CTCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAA
128 CTCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAA
*
2302 GTTATGTGACTCGTCAACCAAAATCCAACGATTTGGTT-AAAAATAAAAATTAAAAAGAT-GGGT
193 GTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGT
2365 GCAAACACGAGGAC-TCCCAGGAGGTCACCACCAT-CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTC
258 GC-AACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCA-C-CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTT-
*
2428 ATACTGCGAAGTTC
319 A-ACTGCGGAGTTC
2442 TGAT-GGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACT-A
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
*
2505 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCTTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
66 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
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131 GA-TTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGT
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195 TAT-GTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
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2765 CGGAGTTC
324 CGGAGTTC
*
2773 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAGCTAA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
2838 AAATACCAGTCCTTTCTCGCTCCCGTCACCCTTGGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTTATATTTT
66 AAATACCA-TCCTTTCTCGCT-CCGTCACCCTT-GTGGGCCCATGTCTCACGGG-TTTATATTTT
2903 ACTCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAA
127 ACTCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAA
*
2968 AGTTATGTGACTCGTCAACCAAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGG
192 AGTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGG
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257 TGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCC-ATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAA
3098 CTGCGGAGTTC
321 CTGCGGAGTTC
3109 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAAGCTA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAA-CTA
* * *
3174 CAAATACCGTCATTTCTCGCTCCGTCACCCTTGT-GGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
65 AAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
*
3238 CGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAA-TTTTTCATAAAGT
130 CGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGT
3302 TATGGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTT-AAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
195 TAT-GTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
3366 CAACACGAGGACTTCCCA-GAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCCTCGCCCAAGCACGCTTAACT
259 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACT-CTCGCCCAAGCACGCTTAACT
3430 GCGGAGTTC
323 GCGGAGTTC
* *
3439 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATC-CACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAGCTAC
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
*
3503 AAATACCAGTCATTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTAAC
66 AAATACCA-TCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTT-AC
*
3568 TCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAG
129 TCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAG
3633 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
194 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
3698 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCTCGCCCAAGCACGCTT-AC
259 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTA--CTCTCGCCCAAGCACGCTTAAC
3762 TGCGGAGTTC
322 TGCGGAGTTC
3772 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
*
3837 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCTTTGT-GGCCCATGTCCTCACGGGTTTATATTTTACT
66 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGT-CTCACGGGTTTATATTTTACT
* *
3901 CGATTAAACGTCAACCTGATTCGGTTTTTTTCAGTTATTAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAA
130 CGATTAAACGTCAA-CTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAA
3966 GTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTT-AAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGT
193 GTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGT
*
4030 GCAAACACGAGGAACTTCCCA-GAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCCCGCTTAA
258 GC-AACACGAGG-ACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAA
*
4094 CTGTAGGAGTTC
321 CTG-CGGAGTTC
*
4106 TGATGGGAT-CGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCACC-TTTGCCATAACAACCTA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCC-CCTTTTGCCATAACAAACTA
* *
4169 AAAATACCGTCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGT-GGCCAATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
65 AAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
*
4233 CGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGGCTTTCCG-AATTTTTTCATAAAG
130 CGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAA-GGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAG
4297 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
194 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
*
4362 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTCACTG
259 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTG
4427 CGGAGTTC
324 CGGAGTTC
4435 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTAA
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4499 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCA-CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
66 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
*
4563 GATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTTATTAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGT
131 GATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAG-TTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGT
*
4628 TATGTGACTCGTCAAACCAAATCCAACGATTT-GTTAAAAAAATAAAAATT-AAAAGATGGGGTG
195 TATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTT-AAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
4691 CAACACGAGGACTTCCTCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACT
259 CAACACGAGGACTTCC-CAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACT
4756 GCGGAGTTC
323 GCGGAGTTC
*
4765 TGATGGGAT-CGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAC-AACTAC
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
* *
4828 AAATACCAGTCATTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTATCACGGGTTTATATTTTAC
66 AAATACCA-TC-CTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTAC
4893 TCGATTAAACGTCAACTGATTCGG-TTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAG
129 TCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAG
4957 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA-TTGGTTAAAAAATAAAAATT-AAAAGATGGGGTG
194 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
*
5020 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCAATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTT-ACTG
259 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTG
5084 CGGAGTTC
324 CGGAGTTC
*
5092 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCTCACCCATCCCCTTTTGCCATAAC-AACTAA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
*
5156 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCA-CCTTTTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
66 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
5220 GATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGTT
131 GATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGTT
5285 ATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGATTTGGTTAAAAAAT-AAAATTAAAAAGATGGGGTGCA
196 ATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCA
5348 ACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC-AGCACGCTTAACTGCG
261 ACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCG
5412 GAGTTC
326 GAGTTC
* *
5418 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAGCTAC
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
5482 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
66 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
5547 GATTAAACGTCAACTGATTCGG-TTTTTCAGTTAATAAGGC-GTTCCGAAATTTTTTCATAAAGT
131 GATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTG-TCCGAAATTTTTTCATAAAGT
5610 TATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATT-AAAAGATGGGGTGC
195 TATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGC
*
5674 AACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCTATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGC
260 AACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGC
5739 GGAGTTC
325 GGAGTTC
5746 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
5811 AAATACCATCC-TTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTA-ATTTTACTC
66 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
*
5874 GATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTATTAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGTT
131 GATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGTT
5939 ATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGG-GCA
196 ATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCA
*
6002 ACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCAAAGCACGCTTAACTGCG
261 ACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCG
6067 GAGTTC
326 GAGTTC
6073 TGATGGGAATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATTGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAA-AAAGC
1 TGATGGG-ATCCGGTGCATTAGTGCTGGTA-TGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAA-C
* *
6137 TACAAATACC-T-ATTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGG-CCATGTCTTCACGGGTTTATATTTT
63 TAAAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTC-TCACGGGTTTATATTTT
*
6199 ACTCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTTCCGAAATTTTTTCATA
127 ACTCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGC-TGTCCGAAATTTTTTCAT-
6264 AAGTTAGTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGA
190 AA---AGTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGA
6329 TGGGGTGCAACACGAGGACTT-CCAGGAGGTCACCCAT-CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGC
252 TGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGC
6392 TT-ACTGCGGAGTTC
317 TTAACTGCGGAGTTC
6406 -GAT-GGATCCGGTGCATTAGTGCT-GTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAA
*
6468 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCTTTGTGGGCCCATGTTCTCACGGGTTTTATATTTTAC
66 AAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATG-TCTCACGGG-TTTATATTTTAC
6533 TCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAG-TAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAG
129 TCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAG
6597 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
194 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
6662 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTG
259 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTG
*
6727 AGGAGTTC
324 CGGAGTTC
6735 TAGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTA
1 T-GATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTA
*
6800 AAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCTTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
65 AAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
*
6865 CGATCAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTT-ATAAGGCTGTCCGAAA-TTTTTCATAAAGT
130 CGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGT
6928 TATGTGACTCGTCAACCCAAAATCCAACGATTT-GTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
195 TATGTGACTCGTCAACCC-AAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTG
6992 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCA-CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTG
259 CAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTG
7056 CGGAGTTC
324 CGGAGTTC
*
7064 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAGCTA
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG-CACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTA
* * *
7129 CAAATACCGTCATTTCTCGCTCCGTCACCCTTGT-GGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
65 AAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
*
7193 CGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGG-TGTTCGAAATTTTTTCATAAAGT
130 CGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGT
7257 TATGTGACTCGTCAA-CCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATT-AAAAGAT-GGGTGC
195 TATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGC
*
7319 AACACGAGGACTTCCCAGGAGG-CACCAATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGC
260 AACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGC
*
7383 GAAGTTC
325 GGAGTTC
7390 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTTGCCATAACAAAGCT
1 TGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCC-TTTTGCCATAACAAA-CT
* * *
7455 ACAAATACCGTCATTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTAC
64 AAAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTAC
*
7520 TCGATTAAACGTCAACTGATTC-GTTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAA-TTTTTCATAAAG
129 TCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAG
7583 TTATGTGACTCGTCAA-CCAAATCCAACGATTTGG-TAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGCGCCC
194 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATTTGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATG-G---
* *
7646 CCGGTGCAAACAAGACGGCACCTTCACCAGGCCACGCCGATCACCCATTCTAAGTACTACTC-CG
255 --GGTGC-AACACGA-GG-A-CTTC-CCAGG--A-G--G-TCACCCATCCT-AGTACTACTCTCG
*
7710 CAAACACCCAGTACACGCTCTCAACTGTCGCGAGTTAC
306 ----C-CCAAG--CACGCT-T-AACTG-CG-GAGTT-C
* * *
7748 TGATGGGATAGCCGCTGCCACCCTTAGTGCTGCCGTATGCACCTAGCCACCCATTCCCCTTTGGC
1 TGATGGGAT--CCGGTG-CA---TTAGTGCTG--GTATG-A--TCG-CACCCA-TCCCCTTTTGC
*
7813 CACTAACAAACACTAAAAACTACC-TCCTTTCTCTGCT-CGTCACCCTCTGTTGTGCCCATGTCT
53 CA-TAAC-AA-ACTAAAAA-TACCATCCTTTCTC-GCTCCGTCACCCT-TG-TGGGCCCATGTCT
*
7876 CCACGGGTTTACTA-TTTATTCGATTACAAC-TCAACTGA-TCGG-TTTTTCACCGTTATATAAG
111 -CACGGGTTTA-TATTTTACTCGATTA-AACGTCAACTGATTCGGTTTTTTCA--GTTA-ATAAG
* * * *
7937 GCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAGTTATGTG-CATCCGTCAATACCAAATCAAACGACTCTTTGG
170 GCTGTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGTGAC-T-CGTCAA-CCCAAATCCAACGA---TTTGG
* *
8001 TTCAAAAAAATAAAAATTTCTTTTAAAAAGATGGGGTGTGTGAACACGCAGGACTTCACAGCGA-
229 TT--AAAAAATAAAAA------TTAAAAAGAT-GGG-GTG-CAACACG-AGGACTTCCCAG-GAG
*
8065 GTCA-CCATCCTCAGTTAC-ACTCTC-CGCCAACGCCACGCCCTTAACTGCAGAGTTC
281 GTCACCCATCCT-AG-TACTACTCTCGC-CCAA-G-CACG--CTTAACTGCGGAGTTC
*
8120 TGATGGAATCCGG
1 TGATGGGATCCGG
8133 ATTGCATGGC
Statistics
Matches: 5706, Mismatches: 115, Indels: 383
0.92 0.02 0.06
Matches are distributed among these distances:
325 108 0.02
326 514 0.09
327 454 0.08
328 615 0.11
329 600 0.11
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350 1 0.00
351 4 0.00
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354 1 0.00
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357 4 0.00
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361 2 0.00
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367 1 0.00
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370 16 0.00
371 9 0.00
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375 43 0.01
376 11 0.00
377 19 0.00
378 20 0.00
379 18 0.00
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GAGTTC
Found at i:8986 original size:331 final size:331
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*
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326 TCCTCG
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*
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*
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*
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*
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* *
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* *
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*
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*
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* *
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*
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326 TCCTCG
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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21584 TCCTCG
326 TCCTCG
21590 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
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*
21655 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGACAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
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326 TCCTCG
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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326 TCCTCG
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*
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*
33237 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGACAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
33302 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
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326 TCCTCG
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326 TCCTCG
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326 TCCTCG
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*
34360 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
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*
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* *
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* *
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* *
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*
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36146 TCCTCG
326 TCCTCG
36152 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
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*
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* * *
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* *
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326 TCCTCG
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*
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196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
37074 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
37139 TCCTCG
326 TCCTCG
37145 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
37210 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
37275 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
37340 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
37405 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
37470 TCCTCG
326 TCCTCG
37476 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
37541 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
37606 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAA-GGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
37670 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
37734 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
37799 TCCTCG
326 TCCTCG
37805 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
37870 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
37935 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAA-GGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
37999 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
38064 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
38129 TCCTCG
326 TCCTCG
38135 TGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC-AATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
*
38198 CATAA-TTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGTTGACGTTT
* * *
38262 AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGT
130 AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGT
* * *
38327 AGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGCGATCAAACCAGCACTAATGCACCGGATCCC
195 ATTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCC
38391 ATCAGAACTCCG-AGCTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGA
260 ATCAGAACTCCGCAG-TTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGA
38455 AGTCCTCG
324 AGTCCTCG
38463 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC-AATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
*
38527 CATAA-TTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
*
38591 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
38656 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
38720 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
38785 TCCTCG
326 TCCTCG
38791 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC-AATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* *
38855 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTAAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* *
38920 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
38985 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
*
39049 TCAGAACTCCGCAGTAAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
39114 TCCTCG
326 TCCTCG
*
39120 TGTTGCACCCTATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC-AATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
*
39184 CATAACTTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTACTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTT
66 CATAAC-TTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTT
39249 AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGGAGCGAGAAAGGATGG
130 AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGAC-GGAGCGAGAAAGGATGG
*
39314 TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC
194 TATTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC
39378 CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGA
259 CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGA
39442 AGTCCTCG
324 AGTCCTCG
*
39450 TGTTGCACCCTATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC-AATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
*
39514 CATAACTTTATG-AAAAATTTCGG-AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
*
39577 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
39642 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
39707 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
39772 TCCTCG
326 TCCTCG
39778 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC---TCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* *
39840 CATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* *
39905 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
39970 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
*
40034 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
40099 TCCTCG
326 TCCTCG
40105 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC--ATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* *
40168 CATAA-TTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTATCTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* *
40232 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
40297 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
40362 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
40427 TCCTCG
326 TCCTCG
*
40433 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC--TTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* * * *
40496 CATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACT-AAAAAACCGAATTAGCTAACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* * * * *
40560 GTCGAGTAAAATATAAACTCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
* * * * *
40625 GTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGCGATCAAACCAGAACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
* * * *
40690 TCAGAACTACGGAGCTAAACGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
40755 TCCTCG
326 TCCTCG
*
40761 TGTTGCACCCTATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC---TCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* * *
40823 CATAATTTTATGAAAAAATTACGGAAAGCCTTACTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* *
40888 ATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
* * *
40953 TTTGTAGTTTATTATGGCAAAAAGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
* *
41018 TCTGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
41083 TCCTCG
326 TCCTCG
* * *
41089 TGTTGCGCCCTATCGTTTTAATTTTTATTTTTTAACC---TCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* ** * *
41151 CATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTATGTTAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* * * **
41216 ATCGAGTAAAATACAAACTCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
*
41281 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
*
41346 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
*
41411 TCCTTG
326 TCCTCG
*
41417 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTGTATTTTTTAACC---TCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* * * *
41479 CATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAATACCGAATTAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* * * *
41544 ATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
* *
41609 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCCCCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
* *
41674 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATTGGTGACCTCCTAGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
*
41739 TACTCG
326 TCCTCG
* * *
41745 TGTTGCGCCACATCATTTTAATTTTTATTTTTTAACC---TCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* *
41807 CATAATTTTATG----AA------AAA----TATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* * * * * **
41858 ATCGAGAAAAATACAAACTCGAGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
* * * * *
41923 TTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAGGTGATGGGTGCGATCATACAAGCACTAATGCCCCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
*
41988 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTCGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
42053 TCCTCG
326 TCCTCG
* * * *
42059 TGTTGCGCCACATCGTTTTAATTTTTATTTTTTAACC---TCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* * * *
42121 CATAATTTTATG----AA------AAA----TATTAACTAAAAAAACCGAACCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
* * * * * **
42172 ATGGAGTAAAATACAAACTCGAGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
* **
42237 TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGCAGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
* ** * *
42302 TCAGAACTGCTTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
*
42367 TCCTTG
326 TCCTCG
*
42373 TGTTGCACCCCATCTATTTT-ATTTTTA-TTTTTAACC---TCGCTGGATTTGGGTTGACGAGTC
1 TGTTGCACCCCATCT-TTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTC
* * *
42433 ACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGACGTTT
65 ACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTT
* * * * * *
42498 AATTGAGCAAAATACAAACCCGCGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGT
130 AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGT
*
42563 ATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCC
195 ATTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCC
*
42627 ATCAGAACTCCGCAGTAAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAA
260 ATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAA
42692 GTCCTCG
325 GTCCTCG
*
42699 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACC---TCGTTGGATTCGGGTTGACGAGTCA
1 TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
* * *
42761 CATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTAAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
66 CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
** * * * *
42826 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATTAGCCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAATGATAGTA
131 ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
* * * * * *
42891 GTTGTACTTTGTTATGGGAAAAAGGGATGGGTGCGATCAAACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
196 TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
* * * * *
42956 TCACAACTCCGGAGCTAA-AGTGCTTGGGCGAGAGTAGTCCTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
261 TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
43020 TCCTCG
326 TCCTCG
43026 TGTTGC
1 TGTTGC
43032 GCCACATCG
Statistics
Matches: 34017, Mismatches: 275, Indels: 107
0.99 0.01 0.00
Matches are distributed among these distances:
313 44 0.00
314 536 0.02
315 4 0.00
317 2 0.00
318 3 0.00
323 3 0.00
324 2 0.00
325 4 0.00
326 202 0.01
327 928 0.03
328 2100 0.06
329 875 0.03
330 3993 0.12
331 24311 0.71
332 1010 0.03
ACGTcount: A:0.29, C:0.19, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (331 bp):
TGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCAAATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCA
CATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTA
ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACGGAGCGAGAAAGGATGGTA
TTTTTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
TCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
TCCTCG
Done.