Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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65 CACCCTTGAT-GGCCCACTGTCTCACGGGTTTTTATTTTACTCGGGTTAATCTTGGACCTGATTC
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129 GGTTTTTTGCACGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATGTTT--TAAAA-TATGTGGACTCGTCAA-CC
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250 GTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGT
* *
319 GCAATAGAGCTGGT
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* * * *
333 ATGATCGCA-CCAT-CCATTTTGCCATAACAAACTATAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
396 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTTAGCTGATTCGATTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * ** * *
461 -AGTTACTAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCACGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCTAGCGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
525 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAATGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAAGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * * *
590 TAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGCTGGGATCCGGTGGAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
655 GGT
326 GGT
* * *
658 ATGATCGCACCCA-GCTCTTTTAGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTT-GCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
*
722 CCTTGTAGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
65 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
* * *
787 TTAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CTA-G
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
* * *
850 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAATGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAAGAGGTCAACCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
* * * *
915 CTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACTGCGGGGTTCTGATGGGATCCGGGGCGTTAGTGC
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*
980 TGCT
325 TGGT
*
984 ATGATCGCAACCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1049 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * **
1114 TAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCTAGTGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
1179 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAATGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
1244 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGAATCCGGGGCGTTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
1309 GGT
326 GGT
* *
1312 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTTCAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1377 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG-TTTTT
* *
1442 TCAGTTAATAAGGCTTTTC-AAAATTTTTTCATAAAA-TATGTGACTCGTTAACCCAAATCCAAC
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAA-TTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
* *
1505 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACAAGGACTTCCTAGGAGGTCACCAAT
194 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
* *
1570 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGAGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
1635 CTGGT
324 CTGGT
* * *
1640 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTATAAATACCATCCTTTCTCGCTTTGTCTCC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * *
1705 CTTGAGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGGTTAAACGTGACCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
1770 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGC
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
1835 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCGC-AGGAGGTCACCCATC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTC-CTAGGAGGTCACCCATC
*
1899 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGC
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1964 TGGT
325 TGGT
* * *
1968 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCACGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
2033 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
2098 TAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCAAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
2163 GGTTAAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAAGTCACCCATC
196 GGTT-AAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
* * *
2228 CTAGTACTACTCTCGCCTAAGCACGCTTAACTACGAAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
*
2293 TGTT
325 TGGT
* *
2297 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAAAAATACCATCCTTTCTCGTTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * * *
2362 CTTGAGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGGTTAATCGTGACCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
2427 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
2492 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
** * * * * * *
2557 TTTTACTACTCTCGCCCAATCACGCTTACCTGCGGAGTTCTTATGAGATCCGGTGCAATAGAGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
2622 GGT
326 GGT
* * * *
2625 ATGATCGCA-CCATCCCATTTTGCCATAACAAACTATAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
2689 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTTAGCTGATTCGATTTTTT
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* ** * *
2754 TAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCACGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCTAGCGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
2818 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAATGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTTAACCATCC
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* * *
2883 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGAATCCGGGGCGTTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
2948 GGT
326 GGT
2951 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
3016 CATT-TGGGCTCATGTCTCACGGGTTTCTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
66 C-TTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
* * *
3080 TCAATTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCAAACG
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
*
3145 AGGTTAAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCC-AAGAGGTCACCCAT
195 AGGTT-AAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
* *
3209 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTACGAAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
3274 CTGGT
324 CTGGT
* *
3279 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAAAAATACCATCCTTTCTCGTTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * *
3344 CTTGAGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCTG-TTAAACGTGACCTGATTCGGTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTC-GATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
* *
3408 TCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAAAATTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
*
3473 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
*
3538 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
*
3603 TGAT
325 TGGT
* *
3607 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTCGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTATCTCGCTCTGTCAC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTT-GCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
* * *
3671 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGGTTAAACGTGACCTGATTCGGTTTTT
65 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
* *
3736 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCTAGCG
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
* * * *
3801 AGGTTAAAAAATTAAAATTAAAATGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
* * * *
3866 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACAGCGGAGTTCTGATGGGATCTGGGGCGTTAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
*
3931 TGTT
325 TGGT
3935 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
3999 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
4064 CAGTTAATAAGGCTTTTCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
4129 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCT
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* *
4194 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAATTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
4259 AGGT
326 -GGT
*
4263 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
4327 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG-TTTTT
*
4392 TCAGTTAATAAGGCTTT-C-AAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTTAACCCAAATCCAACG
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
*
4455 AGGTTAAAAAAT-AAAATTAAAAAAATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
*
4519 CTAGTACTACTCTCGCCCAATCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
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4584 TGGT
325 TGGT
4588 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
4652 CTTGAGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTTAGCTGATTCGGTTTTTT
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*
4782 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
4847 TAGTACTACTCTCG-CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
4911 GGT
326 GGT
* *
4914 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCATTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
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66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
5043 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
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5108 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCC-AGGAGGTCACCCATCC
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5172 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
5237 GGT
326 GGT
5240 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
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5304 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
5369 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
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5434 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
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5499 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
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5564 GGT
326 GGT
5567 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
5631 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGGTTTTT
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*
5696 CAGTTAATAAGGCTTTTCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
5761 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCCCCCATCT
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
5826 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCATGCTTAACTGCGGAATTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
*
5891 AGT
326 GGT
* *
5894 ATGATCGCACCCATCCCGTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
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5959 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG-TTTTT
* *
6024 TCAGTTAATAAGGCTTTTC-AAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTTAACCCAAATCCAAC
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAA-TTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
*
6088 GAGCTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
194 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
6153 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
6218 CTGGT
324 CTGGT
6223 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
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*
6418 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATC
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*
6483 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
6548 TGGT
325 TGGT
* *
6552 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
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* *
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* *
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* *
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* *
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* * * *
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131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
7075 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
7140 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
7205 GGT
326 GGT
*
7208 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
7272 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
7337 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
7401 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
7466 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
7531 GGT
326 GGT
7534 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
7599 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
7664 CAGTTAATAAGGCTTTTCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
7729 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTA-GAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
7793 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
7858 GGT
326 GGT
7861 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
7926 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
7991 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
8056 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
8121 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
8186 GGT
326 GGT
*
8189 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
8253 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* *
8318 TAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
8383 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCC-AAGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
8447 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGACGAAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTG-CGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
8512 TGGT
325 TGGT
8516 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTTCTGTCAC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC-TCTGTCAC
8580 CCTTGATGGG-CCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCCTGATTCGGTTT
65 CCTTG-TGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAG-CTGATTCGGTTT
8644 TTTCAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAA
128 TTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAA
8708 CGAGGTTAAAAAATAAAAATT-AAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCA
193 CGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCA
8772 TCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGT
258 TCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGT
8837 GCTGGT
323 GCTGGT
8843 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
8908 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
8973 AAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
9038 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
9103 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
9168 GGT
326 GGT
9171 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
9235 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
9300 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
9364 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCA-CCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
9428 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
9493 GGT
326 GGT
9496 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATA-CATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
9559 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
9624 CAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
9688 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
9753 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
9818 GGT
326 GGT
*
9821 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
9885 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
9950 TAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
10014 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
10079 TAGTACTACTCTCGCCCAATCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
10144 GGT
326 GGT
10147 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
10212 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
10277 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
10342 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
10407 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
10472 GGT
326 GGT
*
10475 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
10539 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
10604 AAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
10668 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
10733 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
10798 GGT
326 GGT
10801 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
10866 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
10931 CAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
10995 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAACGATGGGGCGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
11060 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
11125 GGT
326 GGT
11128 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
11193 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
11258 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
11323 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCC-AGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
11387 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
11452 GGT
326 GGT
11455 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
11519 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
11584 CAGTTAATAAGGCTTTCC-AAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAA-TTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
* *
11648 AGATTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTCGGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
11713 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
11778 TGGT
325 TGGT
11782 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
11846 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
11911 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
11976 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
12041 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
12106 GGT
326 GGT
* *
12109 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
12174 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
12239 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
12304 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAACATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTGACCGATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
12369 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
12434 GGT
326 GGT
12437 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * * *
12502 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCAATTAAACGTCAACTGATTCAGTTTGTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
**
12567 CAGTTTGTAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * * *
12631 GGTTAAAAAATAAAAACTAAAACGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAAGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* *
12696 TAGTACTACTCTCGTCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
12761 GGT
326 GGT
*
12764 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATAGCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * * *
12829 CTTGCGGGCTCATGTCTCATGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTAATTTGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
12894 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
12959 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCC-AGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
13023 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
*
13088 GGA
326 GGT
*
13091 ATGATCGCACCCATCTCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * * *
13156 CTTGTGGGCTCGTGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTTGATTAAACGTCAGCTAATTTGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
13221 CAGTTAAAAAGGC-TTCC-AAGATTTTTTCATAAAAATATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAA-AATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
* * * *
13284 GGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAACATGGGGCGCAACACGAGGACTT-CTCAGGAGGTTACCCAT
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCT-AGGAGGTCACCCAT
* * * *
13348 CCTAGCACTACTCTCACCCACGCACGCTTTACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
13413 CTGGT
324 CTGGT
* *
13418 ATGATCGCACCCATCACCTTTTGCAATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
13483 CATGTGGTCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
13548 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCAGAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
13612 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCC-AAGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
13676 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGC-GAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
13740 GGT
326 GGT
13743 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
13807 CTTGTGGG-CCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
13871 CAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
13935 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGTGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
14000 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
14065 GGT
326 GGT
* *
14068 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
14133 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
14198 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
14262 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
14327 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
14392 GGT
326 GGT
* * * *
14395 TTGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * * **
14460 CTTGTGGGCTCATGTCTCACAGGTTTATATTTTACTCGAGTAAACGTCAGCTGATTCGAATTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
14525 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
14590 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* *
14655 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATTAGTGC
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGC-ATTAGTGC
14720 TGGT
325 TGGT
*
14724 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
14788 CTTATGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * * * *
14853 CGGCTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCAACCCAAATTCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
14918 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTAAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
14983 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
*
15048 AGT
326 GGT
* * *
15051 TTGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAAAAATACCATCCTTTCTCGTTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * *
15116 CTTGAGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGGTTAAACGTGAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
15181 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
15246 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
15311 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
15376 GGT
326 GGT
* *
15379 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTATCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
15443 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
15508 -AGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
15571 GGTT-AAAAATAAAAATT-AAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
15634 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCA-TAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
15698 GGT
326 GGT
*
15701 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
15765 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * * *
15830 CAGCTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCAACCCAAATTCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
15895 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
15960 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
16025 GGT
326 GGT
* * * *
16028 TTGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
16093 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
16158 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
16223 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
16288 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAGCT-CGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
16352 GGT
326 GGT
* *
16355 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
16420 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
16485 CAGCTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
131 CAG-TTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
16550 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
*
16615 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
16680 TGGT
325 TGGT
16684 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
16749 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
16814 CAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
16878 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
16943 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAAGCT-CGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAA-CTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
17007 TGGT
325 TGGT
*
17011 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
17076 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
17141 CAGCTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
131 CAG-TTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
17206 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
* * *
17271 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
17336 TGGT
325 TGGT
* * * *
17340 TTGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * **
17405 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGAATTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
17470 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
17535 GGATAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAGCACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
17600 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
17665 GGT
326 GGT
* *
17668 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
17732 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* *
17797 -ACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
17861 AGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
17926 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
17991 GGT
326 GGT
17994 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
18059 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
18124 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCAT-AAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
18188 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
18253 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
18318 GGT
326 GGT
* *
18321 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
18386 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
18451 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
18516 GGATAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAGCACAAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* *
18581 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGAAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
18646 GGT
326 GGT
18649 ATGATCGCACCCCA-CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATA-CATTCCTTTCTCGCTCTGTCA
1 ATGATCGCA-CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCA-TCCTTTCTCGCTCTGTCA
* *
18712 CCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAACTGATTCGGTTTT
64 CCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTT
** * *
18777 TTCAGTTTGTAAGGCTTTCCGTAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
129 TTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
* * *
18842 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAACGATGGGGCGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCAT
194 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
* * *
18907 CCTAGTACAACTCTCACCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
18972 CTGGT
324 CTGGT
*
18977 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
19042 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
19107 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-CAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
19171 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
19236 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
19301 GGT
326 GGT
* * *
19304 TTGATCGCACCCAT-CCCTTTCTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTT-TGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
* * * **
19368 CCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAGTAAACGTCAGCTGATTCGAATTTT
65 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
* * *
19433 TAACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
*
19498 AGGATAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
19563 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCA-TAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
19627 TGGT
325 TGGT
19631 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
19695 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
19760 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
19825 GGTT-AAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
19889 TAGTACTATTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGTATTAGTGCC
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
19954 GGT
326 GGT
* *
19957 TTGATCGCACCCAT-CCCTTTCTGCCATAACAAACTACAAATACAATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTT-TGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
* *
20021 CCTTGTGGGCTCATGTCTCACAGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGAGTTTT
65 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCG-GTTTT
*
20086 TTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
129 TTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
20151 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
194 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
*
20216 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
20281 CTGGT
324 CTGGT
*
20286 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * *
20351 CTTGTGAGCTCATGTCTCATGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
20416 -AGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
20480 GGTTAAAAAAT-AAAATTAAAACGATGGGGCGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
20544 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
20609 GGT
326 GGT
*
20612 ATGATCGCACCCAT-CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
20676 CTTATGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGATTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * * * *
20741 CGGCTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCAACCCAAATTCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
20806 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
20871 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
20936 GGT
326 GGT
* * *
20939 TTGATCGCACCCAT-CCCTTTCTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTT-TGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
* *
21003 CCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
65 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
* *
21068 TAAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
21133 AGGTT-AAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
21197 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
21262 TGGT
325 TGGT
* *
21266 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
21331 CTTATGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
*
21396 CAGTTAATAAGGCTTTCCG-AAATTTTTCATAAAGTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
21460 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
*
21525 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
21590 GGT
326 GGT
* *
21593 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
21658 CTTATGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * * * *
21723 CGGCTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCAACCCAAATTCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
21788 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * * * *
21853 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGTTGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
21918 GGT
326 GGT
* *
21921 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
21986 CTTATGGGCCCATGTCTCATGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * * * *
22051 CGGCTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCAACCCAAATTCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
22116 GGTTAAAAAA-AAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
22180 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
22245 GGT
326 GGT
* * * * *
22248 TTGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTATCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * * **
22313 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCAAGTAAACGTCAGCTGATTCGACTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * *
22378 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATTTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
22443 GGATAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAGCACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * * *
22508 TAGTACTACTGTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
22573 GGT
326 GGT
* * * * *
22576 TTGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTATCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * **
22641 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAGTAAACGTCAGCTGATTCGAATTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
22706 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
22771 GGATAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGGGCAGCACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* *
22836 TTGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
22901 GGT
326 GGT
* *
22904 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
22969 CTTATGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAAGCTGATTCGATTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTC-AGCTGATTCG-GTTTT
* * * *
23034 TTCAGGTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCAACCCAAAT-CAAC
129 TTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
* *
23098 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCAT
194 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
* * *
23163 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
23228 CTGGT
324 CTGGT
* * * *
23233 TTGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
23298 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
23363 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
23428 GGATTAAAAAATAAAAATTAAAAAGAT-GGGTGCAACACGAAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
196 GG-TTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACG-AGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
23492 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
23557 CTGGT
324 CTGGT
23562 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
23627 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGG-TTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
23691 ---TCTAAT-A-GCTTTAC-TAATTTTTTCAT-AAATTATGTGACTCGTCAACCC-AATCCAACG
131 CAGT-TAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
* * *
23748 AGGTTAAAAAAT-AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAGCACAAGGACTTCC-AAGAGGTCACCCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
23811 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGC-GAGTTCTGATGGGATCCGG-GCA-TAGTGC
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGC
23873 TGGT
325 TGGT
*
23877 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTTCCATAACAAACTACAAATA-CATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * *
23941 CTTATGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTAATTCAGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * * * * *
24006 CGGCTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCATCCCAAATTCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* *
24071 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAGCACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * * *
24136 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
24201 GGT
326 GGT
* *
24204 ATGATCGCACCCA-CCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCATTTCTCGCTCTGTCAC
1 ATGATCGCACCCATCCCC-TTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
*
24268 CCTTATGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
65 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTT
* * * * * *
24333 TCGGCTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTCGTCAACCCAAATTCAACG
130 TCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACG
* *
24398 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCAACCATC
195 AGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
24463 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAAGCT-CGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
260 CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAA-CTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
24527 CTGGT
324 CTGGT
* * *
24532 ATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* * * **
24597 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAGTAAACGTCAGCTGATTCGAATTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
24662 AACTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
* * *
24727 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAAGAGGTGACCGATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* *
24792 TAGTGCTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGGGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
24857 GGT
326 GGT
24860 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
24925 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGAG-TTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCG-GTTTTT
* *
24989 TAACGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
130 TCA-GTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC
* * *
25054 GAGGATAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGGGCAGCACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
194 GAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCAT
* *
25119 CCTTGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAATAGTG
259 CCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTG
25184 CTGGT
324 CTGGT
* * * * *
25189 ATGATCGCACCTATCCCTTTTTGCCATAAGAAACTACAAATACTATGCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
* *
25254 CTTATGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGATTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * * * * * *
25319 CGGCTAATAAGGCTTT-CGAAATTTTTTCATAAAGTTATGCGACTAGTCAACCCAAATTCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
*
25383 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGTGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
196 GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
* * *
25448 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGTTTAGCTCCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
261 TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
25513 GGT
326 GGT
* * * *
25516 TTGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAGTACAATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
1 ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
*
25581 CTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
66 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
* * *
25646 AACTTAATAA-GCTTTCCGAAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
131 CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
25710 GGTATAAAAAAT-AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
196 GGT-TAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATC
* *
25774 TTAGTACTACTCTCGCACCCAAGCACGCTTACCTGCGGAGTTCTGAT-GGATCCTGG-GCATTAG
260 CTAGTACTACTCTCG--CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCC-GGTGCATTAG
*
25837 GGCTGG-
322 TGCTGGT
25843 ATTGATCGCACCCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAACTATACCATGCCTTTC-CGCTCTG
1 A-TGATCGCA-CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAA--ATACCAT-CCTTTCTCGCTCTG
* *
25907 -CTCCCTTGT-GGCCTCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAACTGATTCGG
61 TCACCCTTGTGGGCC-CATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG
* * * * *
25970 TTTTTTCAGTTAGTAAGGCTTTTCGTAATTTTTTCAT-AAATTATGTTACTCGTCAACCCAAATC
125 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
*
26034 CAACGAGGTTAAAAAATAAAAA-TATAAAAGATGGGGTGCAACACGA-GACTTCCCAGGAGGTCA
190 CAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTA-AAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCA
* * * *
26097 CCC-TCCTAGTA--AATCTCACCCAAAGC-CGATTAATTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGG
254 CCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC-AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGG
26154 CCAGAGCGAA
Statistics
Matches: 24666, Mismatches: 996, Indels: 326
0.95 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
314 43 0.00
315 90 0.00
316 3 0.00
317 23 0.00
318 49 0.00
319 29 0.00
320 30 0.00
321 54 0.00
322 217 0.01
323 345 0.01
324 453 0.02
325 940 0.04
326 3206 0.13
327 8268 0.34
328 8041 0.33
329 2555 0.10
330 261 0.01
331 40 0.00
332 19 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.24, G:0.19, T:0.30
Consensus pattern (328 bp):
ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACC
CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTT
CAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAATTTTTCATAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA
GGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCTAGGAGGTCACCCATCC
TAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT
GGT
Found at i:27903 original size:331 final size:312
Alignment explanation
Indices: 26558--28372 Score: 842
Period size: 332 Copynumber: 5.6 Consensus size: 312
26548 GCTCTCCTTT
* * *
26558 CCAGCACTAA-GCC-CCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGTGCTTTGACGATGAGTA
1 CCAGCACTAATGCCACCGGATTCCATCAG-ACTCCGCAG-TAAGCGTG-G--TGGGCGA-GAGTA
* * * *
26621 GT-CTTAAGGATGTG-TGACCTCCT-GGGAAGTCCTCGTGTTGAGCCAACATCGTTTTAATTTTT
60 GTAC-T-AGGATGGGTTGACCTCCTGGGGAAGTTCT-GTGTTGCGCC-CCATCG-TTTAA--TTT
* *
26683 TTTTTTTTTAACCTCGTTGGATTT--G--GGTTGACGAGTCACATTATTTTATGAAAAACTATTA
118 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TATT-
* * * *
26744 AAACTGAAAAAAACGAATCAGCTGACGTTTAATCGAAGTAAAATTACAAACTCGAGAGAAATGGA
181 -AACTG-AAAAAACG-ATCAGCTGACGGTTAATC--AGT-AAA-TACAAACCCGTGAGACAT-GA
* ** * * * *
26809 GCC--CAAAGGGTGACAAAGCGAGAAAG-GATG-GATTTGTCGTTGTTATGGCAAAAGAGGATGG
238 GCCGACCAAGGGTGACAAAGCGAGGGAGAAATGTGACTTGTAGTTCTTATGGCAAAA-AGGATGG
* * *
26870 GTGGCGATCCTA
302 GT-ACAATCATA
* ** * * * *
26882 CCAGCA-T-ATG-CACCGGATCCCATCCTAATCCACAAGT-AGCTGTGCTTGGCGAGGAGTTAGT
1 CCAGCACTAATGCCACCGGATTCCATCAGACTCCGC-AGTAAGC-GTGGTGGGCGA-GAG-TAGT
* * * * *
26943 ACTA-GA-GGG-T-ACCTCGTGGGAAAGTCCTTTGTTGC-CACCCATCTTTTTAATTTTTATTTT
62 ACTAGGATGGGTTGACCTCCTGGGGAAGTTCTGTGTTGCGC-CCCATC-GTTTAATTTTTATTTT
* **
27003 TATAACCT-GTTGGATTCT--G-CGGTTGACGACCGTCTTATAATTTT-TGAAAATTTCGAAAGC
125 T-TAACCTCGTTGGATT-TGGGTTGGTTGACGA--GTCACATAATTTTATG--AA-----AAA--
* * * * * *
27063 CTTATTAA-GGTAAACAACCGAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTTAAAATATAAACCCGTGACAC
177 --TATTAACTG-AAA-AAACG-ATCAGCTGACGGTTAATC-AG-T-AAATACAAACCCGTGAGAC
* ** * * * * * * *
27127 ATGAGCCCA-CAAGGGTG--TGACCGAGCGAGAAAGGATGTAGTTGTACTTTGTTATGGAAAAAA
234 ATGAGCCGACCAAGGGTGACAAAGCGAGGGAGAAATG-TG-ACTTGTA-GTTCTTATGG--CAAA
* * * *
27189 AAGGATCGAGTGCGGATCAAA
294 AAGGAT-GGGTAC-AATCATA
* * * * * * * *
27210 CCAGCCACTTAATG-CTCCGTA-TCCTATCAGAACTCCGGAGCTAAACTTGCTTGGGGGAGTGTA
1 CCAG-CAC-TAATGCCACCGGATTCC-ATCAG-ACTCCGCAG-TAAGCGTG-GTGGGCGAGAGTA
* *** * *
27273 GTACTAGGATGGG-TGA-CTCCTGGGGAAGTCCTCGTGTTGCAGCATTATCTTTTTAA-TTTTCT
60 GTACTAGGATGGGTTGACCTCCTGGGGAAGTTCT-GTGTTGC-GCCCCATC-GTTTAATTTTTAT
*
27335 TCTTTAACCTCGTTGGATTT-GG-T-GTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAAATTATGGAA
122 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG---AAAA--AT----
* *
27397 ACGCCTACTAACCTTGAAAAACCGATCAG-TGACGTTTAATCGAGGTGTTAAAATACAAA-CCGT
178 A----T--TAA-C-TGAAAAAACGATCAGCTGACGGTTAATC-A---G-T-AAATACAAACCCGT
* * * * *
27460 GAGACATGAGCCCA-CAAGGGGTGACAAAGCTGA-GAAGAAAGGATGGTATTTGTAGCTTTATTA
229 GAGACATGAGCCGACCAA-GGGTGACAAAGC-GAGGGAGAAATG-T-G-ACTTGTAG--TTCTTA
* * **
27523 TGGAACAAAAGGATGGCGTGCGCTCATA
287 TGGCA-AAAAGGATGG-GTACAATCATA
*
27551 CTAGCACTAATGCCACCGGATTCCATCAGACTCCGCAGTAGTTTAGCGTGGTGGGCGAGAGTAGT
1 CCAGCACTAATGCCACCGGATTCCATCAGACTCCGCAGTA----AGCGTGGTGGGCGAGAGTAGT
27616 ACTAGGATGGGTTGACCTCCTGGGGGAAGTTCTGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTT
62 ACTAGGATGGGTTGACCTCCT-GGGGAAGTTCTGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTT
* * *
27681 TAACCTCGTTGGATTTGGGTTGGTTGACGAGTAACATAATTTTATGAAAAATATTAA-TGATACA
126 TAACCTCGTTGGATTTGGGTTGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATATTAACTGAAAAA
* *
27745 ACGAATTCAGCTGACGGTTAATTCGGAAGTAAA-ATAAA-CCGTGAGACATGAGCCGA-CAAGTG
191 ACG-A-TCAGCTGACGGTTAA-TC---AGTAAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCGACCAAGGG
*
27807 TGACAAAGCGAGAAAGGATGAGAAAGGATGTAGACTTGTAGTTTCTTATTGCAAAAAGGATGGGT
250 TGACAAAGC--G--AGG--GAG-AA--ATGT-GACTTGTAG-TTCTTATGGCAAAAAGGATGGGT
*
27872 GCAATCATTA
304 ACAATCA-TA
* *
27882 CCCGCACTAATGCCACCGGATT-CATCAGACTCCGCAGCTAAGCCGTGGTTTGGGCGGGGGGAGT
1 CCAGCACTAATGCCACCGGATTCCATCAGACTCCGCAG-TAAG-CGTGG--TGGGC---GAGAGT
* *
27946 CGTACTAGGATGGGTGGACCTCCT-GGGAACGTTCTCGTTGGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTT
59 AGTACTAGGATGGGTTGACCTCCTGGGGAA-GTTCT-G-T-GTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTT
*
28010 A-TTTTTAACCTCTGTTGGATTTGGG-T--TTGACGAGTCA-ATAATTTCTGTGAAAAAATATTA
120 ATTTTTTAACCTC-GTTGGATTTGGGTTGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATG-AAAAATATTA
* *
28070 ACTGAAAAAACGATCAGCTGACGTTTAATCAGTAAATACAAACCCGTGAGACATGAGCGGACCAA
182 ACTGAAAAAACGATCAGCTGACGGTTAATCAGTAAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCGACCAA
* * ** * * ** *
28135 GGGTGACAAATCGAGGGAGAACTGTGGTTTGTTGTTGTTATGGCAAAGGGGATGGGTACGATCAT
247 GGGTGACAAAGCGAGGGAGAAATGTGACTTGTAGTTCTTATGGCAAAAAGGATGGGTACAATCAT
28200 A
312 A
* * * *
28201 CCAGCACTAA-G-CACCGGATCCCATCCAGAACTCCTCA-TAAGCATGCTTGGGCGAGAGTAAGT
1 CCAGCACTAATGCCACCGGATTCCAT-CAG-ACTCCGCAGTAAGCGTG-GTGGGCGAGAGT-AGT
* * * *
28263 ACTAGGATGGG-TGACCTCGT-GGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTTTTATTTTT
62 ACTAGGATGGGTTGACCTCCTGGGGAAGTTC-TGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTT
*
28326 TAACCTCGTT-GA-TT---TAGGTTGACGACGTCACATAATTTTATGAAAAA
126 TAACCTCGTTGGATTTGGGTTGGTTGACGA-GTCACATAATTTTATGAAAAA
28373 ATTTCGGCAA
Statistics
Matches: 1192, Mismatches: 157, Indels: 300
0.72 0.10 0.18
Matches are distributed among these distances:
308 14 0.01
309 9 0.01
310 33 0.03
311 12 0.01
312 4 0.00
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314 21 0.02
315 19 0.02
316 19 0.02
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318 12 0.01
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320 36 0.03
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322 21 0.02
323 45 0.04
324 38 0.03
325 8 0.01
326 24 0.02
327 45 0.04
328 31 0.03
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332 76 0.06
333 63 0.05
334 67 0.06
335 64 0.05
336 24 0.02
337 9 0.01
338 27 0.02
339 33 0.03
340 16 0.01
341 53 0.04
342 62 0.05
343 22 0.02
344 11 0.01
345 23 0.02
ACGTcount: A:0.29, C:0.18, G:0.24, T:0.29
Consensus pattern (312 bp):
CCAGCACTAATGCCACCGGATTCCATCAGACTCCGCAGTAAGCGTGGTGGGCGAGAGTAGTACTA
GGATGGGTTGACCTCCTGGGGAAGTTCTGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTTTAACC
TCGTTGGATTTGGGTTGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATATTAACTGAAAAAACGAT
CAGCTGACGGTTAATCAGTAAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCGACCAAGGGTGACAAAGCGA
GGGAGAAATGTGACTTGTAGTTCTTATGGCAAAAAGGATGGGTACAATCATA
Found at i:28015 original size:335 final size:323
Alignment explanation
Indices: 27447--28374 Score: 817
Period size: 331 Copynumber: 2.9 Consensus size: 323
27437 CGAGGTGTTA
* *
27447 AAATACAAA-CCGTGAGACATGAGCCCA-CAAGGGGTGACAAAGC-TG--A-GA--AGAAAGGAT
1 AAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCGACCAA-GGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGAGAAAGGAT
* * * * ** **
27504 G--GTATTTGTAGCTTTATTATGGAACAAAAGGATGGCGTGCGCTCA-TACTAGCACTAATGCCA
65 GTAG-ACTTGTAG-TTTCTTATTGCA-AAAAGGATGG-GTGCAATCATTACCCGCACTAATGCCA
*
27566 CCGGATTCCATCAGACTCCGCAGTAGTTTAGCGTGGTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTTGA
126 CCGGATTCCATCAGACTCCGCAGTA---TAGCGTGGTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGGA
27631 CCTCCTGGGGGAAGTTCTGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTTTAACCTC-GTTGGAT
188 CCTCCT-GGGGAAGTTCTGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTA-TTTTTAACCTCTGTTGGAT
* *
27695 TTGGGTTGGTTGACGAGTAACATAATTT-TATG-AAAAATATTAA-TGATACAACGAATTCAGCT
251 TTGGG-T--TTGACGAGTAA-ATAATTTCTATGAAAAAATATTAACTGAAAAAACG-A-TCAGCT
27757 GACGGTTAATTCGGAAGT
310 GACGGTTAA-TC---AGT
* *
27775 AAA-ATAAA-CCGTGAGACATGAGCCGA-CAAGTGTGACAAAGCGAGAAAGGATGAGAAAGGATG
1 AAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCGACCAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGAGAAAGGATG
27837 TAGACTTGTAGTTTCTTATTGCAAAAAGGATGGGTGCAATCATTACCCGCACTAATGCCACCGGA
66 TAGACTTGTAGTTTCTTATTGCAAAAAGGATGGGTGCAATCATTACCCGCACTAATGCCACCGGA
* *
27902 TT-CATCAGACTCCGCAGCTA-AGCCGTGGTTTGGGCGGGGGGAGTCGTACTAGGATGGGTGGAC
131 TTCCATCAGACTCCGCAG-TATAG-CGTGG--TGGGC---GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGGAC
27965 CTCCT-GGGAACGTTCTCGTTGGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTTAACCTCTGTTGGA
189 CTCCTGGGGAA-GTTCT-G-T-GTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTTAACCTCTGTTGGA
* * *
28029 TTTGGGTTTGACGAGTCAATAATTTCTGTGAAAAAATATTAACTGAAAAAACGATCAGCTGACGT
250 TTTGGGTTTGACGAGTAAATAATTTCTATGAAAAAATATTAACTGAAAAAACGATCAGCTGACGG
28094 TTAATCAGT
315 TTAATCAGT
* * *
28103 AAATACAAACCCGTGAGACATGAGCGGACCAAGGGTGACAAATC--G--AGG--GAG-AA--CTG
1 AAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCGACCAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGAGAAAGGATG
** * * * ** * * *
28159 T-GGTTTGTTG-TTGTTATGGCAAAGGGGATGGGTACGATCA-TACCAGCACTAA-G-CACCGGA
66 TAGACTTGTAGTTTCTTATTGCAAAAAGGATGGGTGCAATCATTACCCGCACTAATGCCACCGGA
* * * *
28219 TCCCATCCAGAACTCCTCA-TA-AGCATGCTTGGGCGAGAGTAAGTACTAGGATGGGT-GACCTC
131 TTCCAT-CAG-ACTCCGCAGTATAGCGTG-GTGGGCGAGAGT-AGTACTAGGATGGGTGGACCTC
* * * * *
28281 GT-GGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTC-GTT-GATTTAG
192 CTGGGGAAGTTC-TGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTA-TTTTTAACCTCTGTTGGATTTGG
*
28343 G-TTGACGACGTCACATAATTT-TATGAAAAAAT
255 GTTTGACGA-GT-AAATAATTTCTATGAAAAAAT
28375 TTCGGCAAGC
Statistics
Matches: 515, Mismatches: 49, Indels: 91
0.79 0.07 0.14
Matches are distributed among these distances:
308 7 0.01
309 19 0.04
310 33 0.06
311 12 0.02
312 4 0.01
313 18 0.03
314 14 0.03
316 5 0.01
317 11 0.02
318 8 0.02
319 14 0.03
320 31 0.06
321 6 0.01
322 3 0.01
324 2 0.00
325 3 0.01
326 11 0.02
327 30 0.06
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329 6 0.01
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333 47 0.09
334 22 0.04
335 37 0.07
ACGTcount: A:0.29, C:0.18, G:0.26, T:0.28
Consensus pattern (323 bp):
AAATACAAACCCGTGAGACATGAGCCGACCAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGAGAAAGGATG
TAGACTTGTAGTTTCTTATTGCAAAAAGGATGGGTGCAATCATTACCCGCACTAATGCCACCGGA
TTCCATCAGACTCCGCAGTATAGCGTGGTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGGACCTCCTGG
GGAAGTTCTGTGTTGCGCCCCATCGTTTAATTTTTATTTTTAACCTCTGTTGGATTTGGGTTTGA
CGAGTAAATAATTTCTATGAAAAAATATTAACTGAAAAAACGATCAGCTGACGGTTAATCAGT
Done.