Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: Scaffold1646
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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1 ACTTCAAAGT
*
11 TGCCACGGAGCTGTGGACTTAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
38 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * ** **
65 TGCCATGG-GGTGTTAAACTTAAAAGTT
1 TGCCACGGAGTTG-TGGACTTAAAAGGG
** * * * * *
92 TGCCGTGAAGCTGTGGAATTAAAAAGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * * **
119 TGCCACGGAGCTGTCGTCTTAAAAATG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
146 TGCCACGGAGTTAG-GGACATAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTT-GTGGACTTAAAAGGG
* *
173 CGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
200 TGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAAGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TTAAAAGGG
* *** * *
228 CGCCACATTGTTGTGGACTTAAATGTG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
** *
255 TGCCAAAGAGTTATGGACTT-AAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
281 TTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAA-GG
1 -TGCCACGGAGTTGTGGAC-TT-AAAAGGG
* *
310 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAATGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
337 TGCCACGGAGTTG-GGAACTTTGAAAGAG
1 TGCCACGGAGTTGTGG-AC-TTAAAAGGG
*
365 TGCCACGGAGTTGTGGACTTTAAAAAGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TTAAAAGGG
* * ** * *
393 TGCCACGAAGCTAAGGACTTAAATGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * * * *
420 TGCTATGGAGCTGCT-GACTTCAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTG-TGGACTTAAAAGGG
** *
447 TGCCACGGAGTTGTGGACTCCAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
474 TGCCACGAAGCTGTGGACTTAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* **
501 TGCCACGGAGTTCTGGACTTAAAAGTT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
528 TGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TTAAAAGGG
* * * * **
556 TGCCGCGGAGCTATAGACTTAAAAATG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
583 TCCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGTG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * * **
610 TGCCATGGGGTTGTAGACTTAAAAGTT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
** * * *
637 TGCCACAAAGCTGTGGAATTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* **
664 TGCCACGGAGCTGTGGACTTAAAAATG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
691 TGCCACGGAGTTAG-GGACTTAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTT-GTGGACTTAAAAGGG
* *
718 TGCCACGGTGTTGTGGACTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * * **
745 TGCCATGG-GGTGTTAGACTTAAAAGTT
1 TGCCACGGAGTTG-TGGACTTAAAAGGG
* * * * *
772 TGCCGCGAAGCTGTGGTA-TTAAAAAGT
1 TGCCACGGAGTTGTGG-ACTTAAAAGGG
* **
799 TGCCACGGAGCTGTGGACTTAAAAATG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
826 TGCCACAGAGTTAG-GGACTTAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTT-GTGGACTTAAAAGGG
*
853 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
880 TGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAAGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TTAAAAGGG
* *** *
908 CGCCACATTGTTGTGGACTTAAAAGTG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
** * * *
935 TGCCAAAGAGTTTTGGACATAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
962 TGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAA-GG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TT-AAAAGGG
* *
990 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAATGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
1017 TGCCACGGAGTTG-GGAACTTTGAAAGAG
1 TGCCACGGAGTTGTGG-AC-TTAAAAGGG
*
1045 TGCCACGGAGTTGTGGACTTTAAAAAGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TTAAAAGGG
* * ** *
1073 TGCCACGAAGCTAAGGACTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * * * *
1100 TGCTACTGAGCTGCT-GACTTCAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTG-TGGACTTAAAAGGG
** *
1127 TGCCACGGAGTTGTGGACTCCAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * **
1154 TGCCACGAAGCTGTGGACTTAAAAATG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
1181 TGCCAC-GATGTTGTAGACTTAAAAGGG
1 TGCCACGGA-GTTGTGGACTTAAAAGGG
* * * * *
1208 TGGCACGGGGTTATGGGCTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * * *
1235 TGCCACGAAGCTGTGGACTTCAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* **
1262 TGCCACGGAGCTGTGGACTTAAAAATG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
1289 CGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
1316 TGCCACGGAGTTCTGGACTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* **
1343 TGCCACGGAGTTGCGGACTTAAAAGTT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
1370 TGCCACGGAGTTGTGGACTATAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACT-TAAAAGGG
* * * *
1398 GGCCACGGAGTTGTCGACTAAAAAGTG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * *
1425 TGCCAAGGAGTTATGGACTTAAAAGGT
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* *
1452 TGTCGCGGAGTTGTGGACTATAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACT-TAAAAGGG
* * *
1480 -GGCACGGAGTTGTCGAC-T----GTG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* * *
1501 TGCCGA-GGAGTTATGGGCTTAAAAGGT
1 TGCC-ACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
* ** *
1528 TGCCGCGGAGTTGTCAAATATAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACT-TAAAAGGG
* * *
1556 TGCCACAGAGTTATGGAGTTAAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTT-AAAAGGG
*
1584 TGCTACGGAGTTGTGGACTTTAAAAGGG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TTAAAAGGG
* * *
1612 TGCCACAGG-GATGTGAACTTAAAAGGT
1 TGCCAC-GGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
*
1639 TGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAA-GG
1 TGCCACGGAGTTGTGGAC-TT-AAAAGGG
1667 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAA
1 TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAA
1691 TGTTGCTGAA
Statistics
Matches: 1303, Mismatches: 298, Indels: 105
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
21 2 0.00
22 11 0.01
23 2 0.00
25 1 0.00
26 35 0.03
27 931 0.71
28 300 0.23
29 18 0.01
30 3 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.16, G:0.31, T:0.25
Consensus pattern (27 bp):
TGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGG
Found at i:1396 original size:680 final size:679
Alignment explanation
Indices: 1--1696 Score: 2344
Period size: 680 Copynumber: 2.5 Consensus size: 679
* *
1 ACTTCAAAG-TTGCCACGGAGCTGTGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGT
1 ACTTAAAAGTTTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGT
* *
65 TGCCATGGGGTGTTAAACTTAAAAGTTTGCCGTGAAGCTGTGGAATTAAAAAGTTGCCACGGAGC
66 TGCCATGGGGTGTTAGACTTAAAAGTTTGCCGCGAAGCTGTGG-ATTAAAAAGTTGCCACGGAGC
* * *
130 TGTCGTCTTAAAAATGTGCCACGGAGTTAGGGACATAAAAGGGCGCCACGGAGTTGTGGACTTAA
130 TGTCGACTTAAAAATGTGCCACGGAGTTAGGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTAA
*
195 AAGGTTGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAAGGCGCCACATTGTTGTGGACTTAAATGTGTGCCA
195 AAGGTTGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAAGGCGCCACATTGTTGTGGACTTAAAAGTGTGCCA
*
260 AAGAGTTATGGACTTAAAGGGTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAAGGTGCCACGGAGTTGTG
260 AAGAGTTATGGACTTAAAAGGTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAAGGTGCCACGGAGTTGTG
325 GACTTAAAATGTTGCCACGGAGTTGGGAACTTTGAAAGAGTGCCACGGAGTTGTGGACTTTAAAA
325 GACTTAAAATGTTGCCACGGAGTTGGGAACTTTGAAAGAGTGCCACGGAGTTGTGGACTTTAAAA
*
390 AGGTGCCACGAAGCTAAGGACTTAAATGGTTGCTATGGAGCTGCTGACTTCAAAGGTTGCCACGG
390 AGGTGCCACGAAGCTAAGGACTTAAAAGGTTGCTATGGAGCTGCTGACTTCAAAGGTTGCCACGG
* *
455 AGTTGTGGACTCCAAAGGTTGCCACGAAGCTGTGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTCTGGACT
455 AGTTGTGGACTCCAAAGGTTGCCACGAAGCTGTGGACTTAAAAAGGTGCCACGGAGTTCTAGACT
** * * * *
520 TAAAAGTTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAGGGTGCCGCGGAGCTATAGACTTAAAAATGTC
520 TAAAAGGGTGCCACGGAGTTATGAACTTTAAAAGGGTGCCACGAAGCTATAGACTTAAAAATGTC
* * * * * ** *
585 CCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGTGTGCCATGGGGTTGTAGACTTAAAAGTTTGCCACAAAGCTG
585 CCACGGAGCTGTGGACTTAAAAATGCGCCACGGAGTTGTAGACTTAAAAGGGTGCCACAAAGCTC
*
650 TGGAATTAAAAGGTTGCCACGGAGCTGTGG
650 TGGAATTAAAAGGTTGCCACGGAGCTGCGG
* * *
680 ACTTAAAAATGTGCCACGGAGTTAG-GGACTTAAAAGGGTGCCACGGTGTTGTGGACTTAAAAGG
1 ACTTAAAAGTTTGCCACGGAGTT-GTGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGG
744 TTGCCATGGGGTGTTAGACTTAAAAGTTTGCCGCGAAGCTGTGGTATTAAAAAGTTGCCACGGAG
65 TTGCCATGGGGTGTTAGACTTAAAAGTTTGCCGCGAAGCTGTGG-ATTAAAAAGTTGCCACGGAG
* *
809 CTGTGGACTTAAAAATGTGCCACAGAGTTAGGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTA
129 CTGTCGACTTAAAAATGTGCCACGGAGTTAGGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTA
874 AAAGGTTGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAAGGCGCCACATTGTTGTGGACTTAAAAGTGTGCC
194 AAAGGTTGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAAGGCGCCACATTGTTGTGGACTTAAAAGTGTGCC
* *
939 AAAGAGTTTTGGACATAAAAGGTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAAGGTGCCACGGAGTTGT
259 AAAGAGTTATGGACTTAAAAGGTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAAGGTGCCACGGAGTTGT
1004 GGACTTAAAATGTTGCCACGGAGTTGGGAACTTTGAAAGAGTGCCACGGAGTTGTGGACTTTAAA
324 GGACTTAAAATGTTGCCACGGAGTTGGGAACTTTGAAAGAGTGCCACGGAGTTGTGGACTTTAAA
1069 AAGGTGCCACGAAGCTAAGGACTTAAAAGGTTGCTACT-GAGCTGCTGACTTCAAAGGTTGCCAC
389 AAGGTGCCACGAAGCTAAGGACTTAAAAGGTTGCTA-TGGAGCTGCTGACTTCAAAGGTTGCCAC
* *
1133 GGAGTTGTGGACTCCAAAGGTTGCCACGAAGCTGTGGACTTAAAAATGTGCCAC-GATGTTGTAG
453 GGAGTTGTGGACTCCAAAGGTTGCCACGAAGCTGTGGACTTAAAAAGGTGCCACGGA-GTTCTAG
* * ** * * * * *
1197 ACTTAAAAGGGTGGCACGGGGTTATGGGC-TTAAAAGGTTGCCACGAAGCTGTGGACTT-CAAAG
517 ACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTATGAACTTTAAAAGGGTGCCACGAAGCTATAGACTTAAAAAT
* * **
1260 GTTGCCACGGAGCTGTGGACTTAAAAATGCGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGGTGCCACGGA
582 G-TCCCACGGAGCTGTGGACTTAAAAATGCGCCACGGAGTTGTAGACTTAAAAGGGTGCCACAAA
* * *
1325 GTTCTGGACTTAAAAGGTTGCCACGGAGTTGCGG
646 GCTCTGGAATTAAAAGGTTGCCACGGAGCTGCGG
* * *
1359 ACTTAAAAGTTTGCCACGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCCACGGAGTTGTCGAC-TAAAAAG
1 ACTTAAAAGTTTGCCACGGAGTTGTGGACT-TAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGG
* * * * * * * * ** *
1423 TGTGCCAAGGAGT-TATGGACTTAAAAGGTTGTCGCGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCACGG
65 T-TGCCATGGGGTGT-TAGACTTAAAAGTTTGCCGCGAAGCTGTGGATTA-AAAAGTTGCCACGG
* * * * **
1487 AGTTGTCGAC-T----GTGTGCCGA-GGAGTTATGGG-CTTAAAAGGTTGCCGCGGAGTTGTCAA
127 AGCTGTCGACTTAAAAATGTGCC-ACGGAGTTA-GGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGA
* * * * * * * * ***
1545 ATATAAAAGGGTGCCACAGAGTTATGGA-GTTAAAAAGGGTGCTACGGAGTTGTGGACTTTAAAA
190 CT-TAAAAGGTTGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAA-GGCGCCACATTGTTGTGGAC-TTAAAA
* * * * * *
1609 GGGTGCCACAGGGATGTGAACTTAAAAGGTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAAGGTGCCACG
252 GTGTGCCAAAGAGTTATGGACTTAAAAGGTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAAGGTGCCACG
1674 GAGTTGTGGACTTAAAATGTTGC
317 GAGTTGTGGACTTAAAATGTTGC
1697 TGAAAGCTTA
Statistics
Matches: 906, Mismatches: 96, Indels: 32
0.88 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
675 43 0.05
676 40 0.04
677 87 0.10
678 5 0.01
679 151 0.17
680 578 0.64
681 2 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.16, G:0.31, T:0.25
Consensus pattern (679 bp):
ACTTAAAAGTTTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGGT
TGCCATGGGGTGTTAGACTTAAAAGTTTGCCGCGAAGCTGTGGATTAAAAAGTTGCCACGGAGCT
GTCGACTTAAAAATGTGCCACGGAGTTAGGGACTTAAAAGGGTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAA
AGGTTGCCACGGAGTTGTAGACTTTAAAAAGGCGCCACATTGTTGTGGACTTAAAAGTGTGCCAA
AGAGTTATGGACTTAAAAGGTTGCCACGGAGTTGTGAACTTTGAAAAGGTGCCACGGAGTTGTGG
ACTTAAAATGTTGCCACGGAGTTGGGAACTTTGAAAGAGTGCCACGGAGTTGTGGACTTTAAAAA
GGTGCCACGAAGCTAAGGACTTAAAAGGTTGCTATGGAGCTGCTGACTTCAAAGGTTGCCACGGA
GTTGTGGACTCCAAAGGTTGCCACGAAGCTGTGGACTTAAAAAGGTGCCACGGAGTTCTAGACTT
AAAAGGGTGCCACGGAGTTATGAACTTTAAAAGGGTGCCACGAAGCTATAGACTTAAAAATGTCC
CACGGAGCTGTGGACTTAAAAATGCGCCACGGAGTTGTAGACTTAAAAGGGTGCCACAAAGCTCT
GGAATTAAAAGGTTGCCACGGAGCTGCGG
Found at i:1535 original size:76 final size:78
Alignment explanation
Indices: 1294--1567 Score: 295
Period size: 82 Copynumber: 3.4 Consensus size: 78
1284 AAATGCGCCA
* * * * **
1294 CGGAGTTGTGGACT-TAAAAGGGTGCCACGGAGTTCTGGACTTAAAAG-GTTGCCACGGAGTTGC
1 CGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCCACGGAGTTGTCGAC-T---AGTG-TGCCAAGGAGTTAT
* *
1357 GGACTTAAAAGTTTGCCA
61 GGACTTAAAAGGTTGCCG
1375 CGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCCACGGAGTTGTCGACTAAAAAGTGTGCCAAGGAGTTATG
1 CGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCCACGGAGTTGTCGACT----AGTGTGCCAAGGAGTTATG
*
1440 GACTTAAAAGGTTGTCG
62 GACTTAAAAGGTTGCCG
* *
1457 CGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGG-CACGGAGTTGTCGACT-GTGTGCCGAGGAGTTATGGGCT
1 CGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCCACGGAGTTGTCGACTAGTGTGCCAAGGAGTTATGGACT
1520 TAAAAGGTTGCCG
66 TAAAAGGTTGCCG
** * * *
1533 CGGAGTTGTCAAATATAAAAGGGTGCCACAGAGTT
1 CGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCCACGGAGTT
1568 ATGGAGTTAA
Statistics
Matches: 172, Mismatches: 17, Indels: 12
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
76 53 0.31
77 8 0.05
81 31 0.18
82 79 0.46
83 1 0.01
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.34, T:0.24
Consensus pattern (78 bp):
CGGAGTTGTGGACTATAAAAGGGGGCCACGGAGTTGTCGACTAGTGTGCCAAGGAGTTATGGACT
TAAAAGGTTGCCG
Found at i:2465 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 2447--2472 Score: 52
Period size: 13 Copynumber: 2.0 Consensus size: 13
2437 CAATTTTTTG
2447 TGTATCGATACAT
1 TGTATCGATACAT
2460 TGTATCGATACAT
1 TGTATCGATACAT
2473 ACTTGCTGTA
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 13 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.15, T:0.38
Consensus pattern (13 bp):
TGTATCGATACAT
Found at i:3211 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 3170--3213 Score: 54
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
3160 CTCTCCTTTA
* *
3170 TCTCCCCCGTTTATTAATAAT
1 TCTCCCCCGTTAATCAATAAT
3191 TCTCCCCC-TTAATCAAGTAAT
1 TCTCCCCCGTTAATCAA-TAAT
3212 TC
1 TC
3214 ATATCAAAAA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
20 6 0.30
21 14 0.70
ACGTcount: A:0.25, C:0.32, G:0.05, T:0.39
Consensus pattern (21 bp):
TCTCCCCCGTTAATCAATAAT
Found at i:5055 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 5019--5057 Score: 69
Period size: 13 Copynumber: 3.0 Consensus size: 13
5009 ATAATCACCC
*
5019 TGTATCGATAAAA
1 TGTATCGATACAA
5032 TGTATCGATACAA
1 TGTATCGATACAA
5045 TGTATCGATACAA
1 TGTATCGATACAA
5058 AGAAAAATGT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 25 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.13, G:0.15, T:0.31
Consensus pattern (13 bp):
TGTATCGATACAA
Found at i:5068 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 5043--5121 Score: 77
Period size: 20 Copynumber: 3.7 Consensus size: 20
5033 GTATCGATAC
5043 AATGTATCGATACAAAGAAA
1 AATGTATCGATACAAAGAAA
**
5063 AATGTATCGATACATTGAATTTCCA
1 AATGTATCGATACAAAGAA-----A
*
5088 AATGTATCGATACACAGAAA
1 AATGTATCGATACAAAGAAA
*
5108 CATGTATCGATACA
1 AATGTATCGATACA
5122 TTTTGGACAT
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 5, Indels: 10
0.77 0.08 0.16
Matches are distributed among these distances:
20 31 0.63
25 18 0.37
ACGTcount: A:0.44, C:0.15, G:0.14, T:0.27
Consensus pattern (20 bp):
AATGTATCGATACAAAGAAA
Found at i:8217 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 8106--29889 Score: 15352
Period size: 27 Copynumber: 800.6 Consensus size: 27
8096 CCTACAGCAG
* ** *
8106 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
8133 CTCCGTGGC-ACCTTTTGAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
8161 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
*
8189 CTCCGTGGCAACATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
8216 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
* *
8244 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTTCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
8271 C-CCTGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCC-GTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
8299 CTCCGTAGCACCCTTTTTAACTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * **
8327 CTCTGTGGCACCCTTTTATATTTGACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTA-AGTCCACAA
* * *
8355 CTCCGCGGCAACCTTTTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
8382 CTCC-T--CGACAC----ACAGTCGACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTA-AGTCCACAA
* **
8404 CTCCAT-GCCCCCTTTTATAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTA-AGTCCACAA
* * *
8431 CTCCGCGACAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
8458 CTCCTTGGC-ACACTTTTTAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* **
8485 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCTGCAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
8512 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
8539 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
8566 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
**
8593 CTCCGTGGCAA-CTTTTGAAGTCCACGG
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
8620 CTTCGTGGCAACCTTCTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
8647 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
8674 CAT-CGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 C-TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* **
8701 CTTCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
8728 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* ** *
8755 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
8782 CTTCGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
8810 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
*
8838 CTCCGTGGCAACATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
8865 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
8893 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
8920 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * *
8947 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
8975 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
9002 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * *
9029 CTCTGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
9056 CTCCGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
9083 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTA-ACA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACA-A
* *
9110 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
9137 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
9164 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
9191 CTCCGTGGCAACCTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
9218 CTTTGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
9245 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
9272 CTCCGTGG--ACATTTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
9298 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
9326 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
9353 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
9380 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
9407 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* ** *
9434 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
9461 CTCCGTGGC-ACCTTTTGAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
9489 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
*
9517 CTCCGTGGCAACATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
9544 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
* *
9572 CTCCGTGGCAACCCTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
9599 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * *
9626 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
9654 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
9681 CTCCGTGCCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
9708 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
9735 CTCCGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
9762 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTA-ACA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACA-A
* *
9789 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
9816 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
9843 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
9870 CTCAGTGGCAACATTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
9897 CTTTGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
9924 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
9951 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
9978 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
10006 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
10033 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
10060 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
10087 CTCCATGGCCACCTTTAAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
10114 CTTCGTGGCAAGCTTTTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
10141 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
10168 CAT-CATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 C-TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
**
10195 CTCCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
10222 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* * ** *
10249 CTCCGTAGCAAACTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
10276 CTCCGTGGC-ACCTTTTGAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
10304 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* * *
10332 CTCCATGGCAACATTTTAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
10359 CTTCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
* *
10387 CTCCGTGGCAACCCTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
10414 CTCTTTGGC-ACACATTCAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * *
10441 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
10469 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
10496 CTCCGTGCCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
10523 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
10550 CTCCGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
10577 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTA-ACA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACA-A
* *
10604 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
10631 CTCCGTGGCATCCTTTTAAG-CCCCTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
10658 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
10685 CTCCGTGGCAACATTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
10712 CTTTGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
10739 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
10766 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
10793 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
** * * *
10821 CTTAGTGCCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
10848 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
10875 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
10902 CTCCATGGCCACCTTTAAAATCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
10929 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
10956 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
10983 CAT-CATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 C-TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
**
11010 CTCCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
11037 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-TAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* ** *
11064 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
11091 CTCCGTGGC-ACCTTTTTCAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* *
11119 CTCAGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* * *
11147 CTTCGTGGCAACATTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
11174 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
* *
11202 CTCCGTGGTAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
11229 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * *
11256 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
11284 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
11311 CTCCGTGCCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
11338 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * *
11365 CAATGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCTACAT
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
11393 CTCTGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
11420 CTCCGTGG-AACCCTTTCAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
11447 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
11474 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
11501 CTTCGGGGAAAACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
11528 CCCCATGGC-ACACTTTTAGGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
11555 CTCCATGG-TACATTTTTAAGTCTACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
11582 CTCCGTGGCAACCATTTGAA-TCCACAG
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * * * *
11609 CTCTGTGGAAACCTTTTAACTCAATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
11636 CTCCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
11663 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-TAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* ** *
11690 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
11717 CTCCGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* *
11745 CTCAGTGGC-ACTCTTTCAGAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTA-AG-TCCACAA
* *
11773 CTCCGTGGCAACATTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
11800 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
11828 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
11855 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * *
11882 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTAAAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
11910 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCTCAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
11937 CTCCGTGCCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * * *
11964 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
11991 CTCTGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
12018 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTAACAC
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTC-CACAA
*
12046 CT-CATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
12072 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * *
12099 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
12126 CTCCGTGGCAACATTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
12153 CTTTGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
12180 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
12207 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
12234 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
12262 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
12289 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
12316 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
12343 CTCCAG-GGCCACCTTTAAAGTCCACAG
1 CTCC-GTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
12370 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
12397 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
12424 CAT-CATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 C-TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
**
12451 CTCCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
12478 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* * ** *
12505 CTCCGTAGCAACCTTTTATGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
12532 CTCCGTGGC-ACCTTTTTAGAGTGCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTA-AGTCCACAA
*
12560 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* * *
12588 CTCCGTGGCAACATTTTATGTCCAAAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
12615 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
* *
12643 CTCCGTGGCAACCTTTTAACTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
12670 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * **
12697 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTTTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* *
12725 CTCCGTGACAACCTTTTAACTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
12752 CTCCGTGCCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * *
12779 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
12806 CTCCGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
12833 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTA-ACA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACA-A
* * * *
12860 CCCCATGGCCACCTTTTAAATCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
12887 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
12914 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
12941 CTCCATGGCAACATTTTAATTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
12968 CTTTGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
12995 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACGA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
13022 CTCCGTGGC-ACATCTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
13049 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
13077 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
13104 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
13131 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
13158 CTCCATGGCCACCTTTGATGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
13185 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
13212 CACCGTGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
13239 CAT-CATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 C-TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
**
13266 CTCCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
13293 CTCCGTGGCAACCTCTGAAGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** *
13320 CTCCGTAGCAACTTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
13347 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
13375 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* *
13403 CTCCGTGGCAACATTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
13430 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAATTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
13458 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
13485 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** *
13512 CAATGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
13540 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
13567 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
** * *
13594 CTCAATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
13621 CTCCGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
13648 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTA-ACA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACA-A
* *
13675 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
13702 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
13729 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
13756 CTCCGTGGCAACATTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * * * *
13783 CTTTGTGGCAAACTTTCCCCATGGCACACTTTTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT---TAAGTC-CAC----AA
*
13818 GTCCACAACTCCGTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 -C-------TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
13853 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
13880 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
13907 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
13935 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
13962 CTCCATGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
13989 CTCCGTGGC-ACATTTTTATGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
14016 CTCCATGGCCACCTTTGAAG-CCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
14042 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
14069 CCCCGTGGCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
14096 CATCAC--GGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 C-TC-CGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* **
14123 CTCTGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
14150 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-TAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* ** *
14177 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
14204 CTCCGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* *
14232 CTCAGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* *
14260 CTCCGTGGCAACATTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
14287 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
14315 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
14342 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * *
14369 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTAAAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
14397 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * ***
14424 CTCCGTGCCACCCGTTTAAGTCGTTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
14451 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
14478 CTCCGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
14505 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTAACAC
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTC-CACAA
*
14533 CT-CATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
14559 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * *
14586 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
14613 CTCCGTGGCAACATTTTAA-TCCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGT-CCACAA
** * *
14640 CTTTGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
14667 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
14694 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
14721 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
14749 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
14776 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
14803 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
14830 CTCCATGGCCACCATTGAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* **
14857 CTTCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
14884 CCCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* * ** *
14911 CTCCGTAGCAACCATTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
14938 CTCCGTGGCAACCTTTTTAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
14965 CTTCGTGACAACCTTTTAAGCCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
14992 CCCCATGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
15019 CAT-CATGGC-ACATTTTTAAGTCCCCAG
1 C-TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
15046 CTCCGCGGCAACCTTTGT-TGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
15073 CCCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* *** *
15100 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCTTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
15127 CTCCGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
15155 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* * *
15183 CTTCGTGGCAACATTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
15210 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
* * *
15238 CTCCATGGTAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
15265 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * *
15292 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
15320 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
15347 CTCCGTGCCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
*
15374 CTCCGGGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** *
15401 CAATGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
**
15429 CTCTATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
15456 CTCCGTGG-AACCCTTTCAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
15483 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
** * *
15510 CTTTGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
15537 CTTCGGGGAAAACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
15564 CCCCATGGC-ACACTTTTAGGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
15591 CTCCATGG-TACATTTTTAAGTCTACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
15618 CTCCGTGGCAACCATTTCAA-TCCACAG
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * * * * *
15645 CTCTGTGGAAACGTTTTAACTCAATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
15672 CTCCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
15699 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGT-TAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* ** *
15726 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
15753 CTCCGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
** *
15781 CTTAGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* *
15809 CTCCGTGGCAACATTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
15836 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
15864 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
15891 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * *
15918 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTAAAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
15946 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCTCAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
15973 CTCCGTGCCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * *
16000 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
16027 CTCCGTGGCAACTTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
16054 CTTCGCGGCAAACTTTTAAGTCTAACAC
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTC-CACAA
*
16082 CT-CATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
16108 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* *
16135 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
16162 CTCCGTGGCAACATTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
16189 CTTTGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
16216 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
16243 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTATAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
16270 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
16298 CTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
16325 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
16352 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
16379 CTCCATGGCCACCATTGAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* **
16406 CTTCGTGGCAACCTTTGGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
16433 CCCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* ** *
16460 CTCCGTAGCAACC-TTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
16486 CTCCGTGGCAACCTTTTTAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
16513 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGCCCATAAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* * *
16541 C-CCGTGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
16567 CAT-CATGGC-ACATTTTTAAGTCCCCAG
1 C-TCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
16594 CTCCGCGGCAACCTTTGT-AGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
16621 CCCCGTGGCAACCTTTGAAGT-CAGCAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCA-CAA
* * *** *
16648 CTCCGTAGTAACCTTTTAAGTCTTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
16675 CTCCGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
16703 CTCCGTGGC-ACTCTTTCAAAGTTCC-CAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTT-TAAG-TCCACAA
* *
16731 CTCCGTGGCAACATTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
16758 CTCCGTGGC-ACCTTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT--AAGTCCACAA
*
16786 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
16813 CTCTTTGGC-ACACATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * *
16840 CAATGTGGC-GCCTTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
16868 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
16895 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
16922 CTCCGTAGCACCCTTTTAAAGTACACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * *
16950 CTCTGAGGC-ACCTTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * *
16977 TTCCGTGGC-ACATTTTAAATCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
17003 CCCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
17030 CTTCGGGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
17057 CTTCGGGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
17084 CTTCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
17111 TTCTGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
17138 CTTTGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
17165 C-CCTGTGTCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCC-GTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * * *
17192 CACTGT-GCCACATTTTTAAGTCCAGAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
17219 CTCCGTGGCAACCGTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
17246 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
17273 CTCTGTGGC-ACCTTTTTAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* * *
17301 C-CCTTGGC-ACACTTTTAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* **
17327 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCGTAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
*
17355 CTCCGTGG----C-TTTAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** *
17377 CTCCATGGCACCCATTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
17405 CTCCGTGGCAACCTTTTATGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
17432 CTCTTTGGC-CCACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
17459 CACCGTGGCACCCTTTCTAACTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
17487 CTCCGTGGCACCCTTTTATATTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTA-AGTCCACAA
* *
17515 CTCCGCGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
17542 CTCCTTGGC-ACACTTTTTAGTCGACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
** ** ** *
17569 CTCCGTGGCCGCCTACTCCGTGGCA-AA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGT-CCACAA
** * * * **** * * *
17596 CT-TTTAAGTCTACATCTCCCTGGCAACATT
1 CTCCGT--GGCAACCT-TTTAAGTCCACA-A
* ** * * ** *
17626 TTAAGT-CCACAAC---TCCGTGGCACAA
1 CTCCGTGGCA-ACCTTTTAAGT-CCACAA
* * ** * **
17651 -T--TTTG-AATCC-ACTGA-TCCATTA
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
* *** *** * *
17673 CAACC-TTTTAAGCC-CACAACTCCGTGGCAA
1 C-TCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCC---ACAA
*** * ****
17703 --CC-TTTTAAGTCC--AT-AGCTCCGTGG
1 CTCCGTGGCAA--CCTTTTAAG-TCCACAA
* * *** ** ** * *
17727 CACCCTTTTAAAGTCTACAACTCCGTGGCAA
1 CTCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCC---ACAA
* * * * * *
17758 CCTTTTCAGT-CCATAACTCTTTGGCACACTTTTAAGTCCCCAA
1 -C---TCCGTGGC--AAC-CTTT--TA-A---GT---C-CACAA
* * *
17801 CTCTGTAGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
*** *
17829 CTCTAAGGC-ACCTTTTTCAA-TCCATAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* * * * *
17856 TTCCATGGC-ACATTTTTAAGACCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
17883 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
17910 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
17937 CTCCGTGGCAGCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
17964 CTCTATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
17991 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
18018 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGCCCA-AA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
18044 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
18071 CAT-CGTGGCACATTTTTTAAGCCCACAG
1 C-TCCGTGGCA-ACCTTTTAAGTCCACAA
* *
18099 CTTCGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
18126 CTCCGTGGCACCCTTCAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
18153 CTCTGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
18180 CTCTGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * ** *
18207 CTTTGTCGCAACCTTTTAAGTTTATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
18234 C-CCTGTGGC-ACGCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCC-GTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
18261 CACCATGG-GACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
18288 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
18315 CTCCGTGGCAACCTTTGAAGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
18342 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
18369 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
** *
18397 C-CTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
18423 CTCCATGGC-ACC-----CGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
18444 CTCCGTGGCACCCTTTTAAAATTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
18472 ATCTGTGGCAACCTTTTAAGTCTACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
18499 CTTCGTGGCACCCTTTTTAGGTACACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * *
18527 CTCCATGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
18555 CTCCGTGGCAACCTTCTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
18582 CTCTATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *** * *
18609 CACCGTGGTGCCCTTTTAAAGTCTAAAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
*
18637 CACCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
18664 CTCCGAGGCAACCATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
18691 GC-CCGTGGCACCCTTTGAAGTCCACAA
1 -CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
18718 CTCTGTGGC-ACAATTTTAAGTGCACAC
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
18745 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
18772 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
18799 CTCTGTGGCAACCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
*
18827 CTCCATGGC-ACCATTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC--TTTTAAGTCCACAA
* * *
18855 CCCCGTGGCACCCATTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
** * * *
18883 CTCCACGGTAACCTTTTATGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
18910 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* ** * * *
18937 CACCGTGGCGCCCTTTCAAAGTCTAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
18965 CTCCGAGGCAACCTTTTAAGTCCAAAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
18992 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
19019 CTCCGTGGCACCCTTTAAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
19046 CTCCGTGGCACCCTTTAAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
19073 CTTCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
19100 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
19127 CTCTGCGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
19154 CTTTGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
19181 C-CCTGTGGC-ACGCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCC-GTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
19208 CACCATGGC--CCATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACC--TTTTAAGTCCACAA
**
19235 CTCTATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * * *
19262 CCCCGTGTCAACCTTTGATGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
19289 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
19316 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* *
19344 C-CCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
19370 CTCCATGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * *
19398 CTCCGTGGCACCCTTTCAGAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTA-AGTCCACAA
19426 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
19453 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* *
19481 CTCCGTGGCAACCTTCTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
19508 CTCTATGGC-ACACTTTTAGGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* ** *
19535 CACCGTGGCGCCCTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
**
19563 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACCT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
19590 CTCTGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * *
19618 CTCCATCGC-ACCATTTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC--TTTTAAGTCCACAA
* * *
19646 CTCCGTGGCACCCATTTAAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * *
19674 CTCCGT-GCGAACGTTTTCAGTCCACAG
1 CTCCGTGGC-AACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
19701 CTCCGTGGCAACGTTTTAACTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
19728 CTCCGTAGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
19755 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
* * *
19783 CTCCTTGGCAAACTTTTTAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
19810 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGACCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
19838 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGGCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * *
19866 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* ** *
19894 ATCTATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
19921 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
19948 CACCGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
*
19976 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
20003 CTCTGAGGAAACCATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
20030 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
20057 CTCCGTGAC-ACATTTTTAAG-CGCACAC
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTC-CACAA
20084 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
20111 CTCCGTGGTAACCTTTTAAGTCCATAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
20138 CTCTGTGGCACCCTTTTAAAATCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* *
20166 CTCCGTGGCACCCTTTTTAACTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
20194 CCCCGTGGCACCCTTTTATAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTA-AGTCCACAA
** * * *
20222 CTCCACGACAACTTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
20249 CTCCTTGGC-ACACTTTTAGGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
** *
20276 CTCCGTGGCCCCCTTTTAAAGTCCAGAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
*
20304 CTCCGTGGC-CCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * *
20331 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCGCCA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
20358 CTCCATGGCACCCTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
20385 CTCTGTGGC-ACATTTTTAAGTCCAGAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
20412 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
20439 CTTCGTGGCAGCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** * *
20466 CTCCATGACCCCCTTTCAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
20494 CTCCTTGGCGACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
20521 CTCTGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
20548 CTCTGTGG-AACCCTTCAAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
* * *
20575 GTCCGTGGC-ACTTTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
20602 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
20629 CTTCGTGCCAGCCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
20656 CTCTGCGGCACCCTTTTCAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * *
20684 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCAGAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
20711 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** *
20738 CTTTGTGGCAGCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
20765 CTCCATGACACCCTTTCAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
20793 CTCCTTGGCGACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
20820 CTCCGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
20847 CTCTGTGG-AACCCTTCAAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
* *
20874 CTCCGTGGC-ACTTTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
20901 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
20928 CTTCGTGGCAGCCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
20955 CTCTGCGGCACCCTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
** *
20983 CTTTGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
21010 CTCTTTGGC-ACACTTGTAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
21037 CTCCGTAG-AACCCTTTTAAAGGCAACAA
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTT-AAGTCCACAA
***
21065 CTCTAAGGC-ACCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * *
21092 CTCCATTGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
21119 CTCCGTGGGAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
21146 CTTCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
21173 CTCCATGCCACCCTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
21200 CTCTATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
21227 CTCCATGGCAACCTTTTAATTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
21254 CTTCGTGGCAAACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
21281 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
21308 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
21335 CTCCGTGGCAACCTTTTCAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
21362 CTCCGTGGCAACCTTTTAACTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
21389 CTCTGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
21416 CTCCGTGGC-ACCTTTTTAAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
21444 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
21471 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
** * **
21499 CTCCGTGGCTCCCTTTCAAAGTTTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
*
21527 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
21554 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
21581 CACCGTGGC-ACACTTTTAAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* **
21609 CTCCGTGGCAAACTTTTCTGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
21636 CTCCGAGGCAACCATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
21663 CTATGTGGCACCCTTTTAGGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
21690 CTCCGTGGC-ACACTTTTAATTCCACAC
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
**
21717 CTCCAAGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
21744 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
21771 CTCTGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * *
21799 CTCCGTGGC-ACTTATTTTAACTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC--CTTTTAAGTCCACAA
* *
21827 CTCCGTGGCACCCTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * *
21855 CTCCGCGGCAACCTTTTATGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
21882 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * ** * *
21909 CTCCATGACGCCCTTTCAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
21937 CTCCTTGGCGACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
21964 CTCCGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** * *
21991 CTCTGTGG-AACCCTTCAAAGTCGACAG
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
* *
22018 CTCCGTGGC-ACTTTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
22045 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCC---A---C--AA
* *
22080 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
22107 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
22135 CTCTGTGGCAGCCTTTCAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** * *
22162 CACTTTGGC-GCACTTTTACA-TCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTA-AGTCCACAA
* * * *
22189 CTCCGTAGTACCCTTTTAAAGTCAACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
**
22217 CTCTATGGC-ACCGTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
22244 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
22271 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
22298 CTCCGTGGTAACCTTTTATGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
22325 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * *
22352 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
22379 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** *
22406 CTTCGTAGCAAATTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
22433 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
22460 CAT-CGTAGC-ACATATTTAAGTCCATAG
1 C-TCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
22487 CTCCATAGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
22514 CTCCGTGGAAACCTTTGAAGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * ** *
22541 CTCCATAGCTAGCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
22568 CTCCAAGGC-ACCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
** *
22595 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACGA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
22622 CTTCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * **
22650 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
** * *
22678 CTCCGTGGCAACCGATTAGGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
22705 CTCTTTGGC-ACACTTTTCAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * * *
22732 CAAAGTGGCACCCTCTTAAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
22760 CACCGTGGCAACCTTTTAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
22787 CTCCACGGC-ACACTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCAC-AA
*
22814 CTCCGTGGC-ACAATTTTAAGTCCAC-A
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
22840 GTCCGTGGTAACCTTTTAATTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
22867 CTTCGTGGCAAACTTTTAA-ACCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCC-ACAA
* *
22894 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
22921 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* ** * *
22948 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTTAAGAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
22975 CTCCGTGGCAACCTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
23002 CTTCGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
23029 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
23056 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAG-CCTACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCC-ACAA
* * *
23083 CTCCGAGGCAACCTTTTCAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
23110 CTCCGTGGCAACCTTTTAACTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
23137 CTCCATAGCAACCTTTTAAGTTCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
23164 CTCCGTGAC-ACCTTTTTAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
23192 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
23219 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * * *
23247 CTTCATGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
*
23275 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
23302 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
23329 CACCATGGC-ACACTTTTAAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* *
23357 CTCCGTGGCAAACTTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
23384 CTCCGAGGCAACCATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
23411 CTCTGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
23438 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAC
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
23465 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
23492 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
23519 CTCTGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* *
23547 CTCCGTGGC-ACTCATTTTAACTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-C-TTTTAAGTCCACAA
* * *
23575 CTTCGTGGCACCCTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
23603 CTCCGCGGCAACCTTTTATGTTCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
23630 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * ** * *
23657 CTCCATGACGCCCTTTCAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
23685 CTCC-TCAGCGACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGT-GGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
23712 CTCCGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** * *
23739 CTCTGTGG-AACCCTTCAAAGTCGACAG
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
*
23766 CTCCGTGGC-A-CTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
23791 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
23818 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
23845 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* * *
23873 CTCTGTGGCAGCCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
23900 CACTTTGGC-ACACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
23927 CTCCGTAGCACCCTTTTAAAGTCAACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
**
23955 CTCTATGGC-ACCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
23982 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
24009 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
24036 CTCCGTGGTAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
24063 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * *
24090 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
24117 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** *
24144 CTTCGTAGCAAATTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
24171 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
24198 CAT-CGTAGC-ACATATTTAAGTCCATAG
1 C-TCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
24225 CTCCATAGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
24252 CTCCGTGGAAACCTTTGAAGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * ** *
24279 CTCCATAGCTAGCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
24306 CTCCAAGGC-ACCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
** *
24333 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACGA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
24360 CTTCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * **
24388 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
** * *
24416 CTCCGTGGCAACCGATTAGGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
24443 CTCTTTGGC-ACACTTTTCAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * * *
24470 CAAAGTGGCACCCTCTTAAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
24498 CACCGTGGCAACCTTTTAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
24525 CTCCACGGC-ACACTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCAC-AA
*
24552 CTCCGTGGC-ACAATTTTAAGTCCAC-A
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
24578 GTCCGTGGTAACCTTTTAATTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
24605 CTTCGTGGCAAACTTTTAA-ACCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCC-ACAA
* *
24632 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
24659 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* ** * *
24686 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTTAAGAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
24713 CTCCGTGGCAACCTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
24740 CTTCGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
24767 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
24794 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAG-CCTACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCC-ACAA
* * *
24821 CTCCGAGGCAACCTTTTCAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
24848 CTCCGTGGCAACCTTTTAACTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
24875 CTCCATAGCAACCTTTTAAGTTCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
24902 CTCCGTGAC-ACCTTTTTAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
24930 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
24957 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * * *
24985 CTTCATGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
*
25013 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
25040 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
25067 CACCATGGC-ACACTTTTAAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* *
25095 CTCCGTGGCAAACTTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
25122 CTCCGAGGCAACCATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
25149 CTCTGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
25176 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAC
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
25203 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
25230 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
25257 CTCTGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* *
25285 CTCCGTGGC-ACTCATTTTAACTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-C-TTTTAAGTCCACAA
* *
25313 CTCCGTGGCACCCTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
25341 CTCCGCGGCAACCTTTTATGTTCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
25368 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * ** * *
25395 CTCCATGACGCCCTTTCAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
25423 CTCC-TCAGCGACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGT-GGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
25450 CTCCGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** * *
25477 CTCTGTGG-AACCCTTCAAAGTCGACAG
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
*
25504 CTCCGTGGC-A-CTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
25529 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
25556 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
25583 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* * *
25611 CTCTGTGGCAGCCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
25638 CACTTTGGC-ACACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
25665 CTCCGTAGCACCCTTTTAAAGTCAACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
**
25693 CTCTATGGC-ACCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
25720 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
25747 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
25774 CTCCGTGGTAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
25801 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * *
25828 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
25855 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** *
25882 CTTCGTAGCAAATTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
25909 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
25936 CAT-CGTAGC-ACATATTTAAGTCCATAG
1 C-TCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
25963 CTCCATAGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
25990 CTCCGTGGAAACCTTTGAAGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * ** *
26017 CTCCATAGCTAGCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
26044 CTCCAAGGC-ACCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
** *
26071 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACGA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
26098 CTTCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * **
26126 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
** * *
26154 CTCCGTGGCAACCGATTAGGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
26181 CTCTTTGGC-ACACTTTTCAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * * *
26208 CAAAGTGGCACCCTCTTAAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
26236 CACCGTGGCAACCTTTTAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
26263 CTCCACGGC-ACACTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCAC-AA
*
26290 CTCCGTGGC-ACAATTTTAAGTCCAC-A
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
26316 GTCCGTGGTAACCTTTTAATTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
26343 CTTCGTGGCAAACTTTTAA-ACCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCC-ACAA
* *
26370 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
26397 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * * *
26424 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTTCAGAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
26451 CTCCGTGGCAACCTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
26478 CTTCGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
26505 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
26532 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
26559 CTCCGAGGCAACCTTTTCAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
26586 CTCCGTGGCAACCTTTTAACTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
26613 CTCCATAGCAACCTTTTAAGTTCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
26640 CTCCGTGAC-ACCTTTTTAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
26668 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
26695 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * * *
26723 CTTCATGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
*
26751 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
26778 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
26805 CACCATGGC-ACACTTTTAAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* *
26833 CTCCGTGGCAAACTTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
26860 CTCCGAGGCAACCATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
26887 CTCTGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
26914 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAC
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
26941 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
26968 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
26995 CTCTGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* *
27023 CTCCGTGGC-ACTCATTTTAACTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-C-TTTTAAGTCCACAA
* * *
27051 CTTCGTGGCACCCTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
27079 CTCCGCGGCAACCTTTTATGTTCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
27106 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * ** * *
27133 CTCCATGACGCCCTTTCAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
27161 CTCC-TCAGCGACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGT-GGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
27188 CTCCGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** * *
27215 CTCTGTGG-AACCCTTCAAAGTCGACAG
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
*
27242 CTCCGTGGC-A-CTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
27267 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
27294 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
27321 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* * *
27349 CTCTGTGGCAGCCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
27376 CACTTTGGC-ACACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
27403 CTCCGTAGCACCCTTTTAAAGTCAACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
**
27431 CTCTATGGC-ACCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
27458 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
27485 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
27512 CTCCGTGGTAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
27539 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
27566 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
27593 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** *
27620 CTTCGTAGCAAATTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
27647 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
27674 CAT-CGTAGC-ACATATTTAAGTCCATAG
1 C-TCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
27701 CTCCATAGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
27728 CTCCGTGGAAACCTTTGAAGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * ** *
27755 CTCCATAGCTAGCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
27782 CTCCAAGGC-ACCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
** *
27809 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACGA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
27836 CTTCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * **
27864 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
** * *
27892 CTCCGTGGCAACCGATTAGGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
27919 CTCTTTGGC-ACACTTTTCAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * * *
27946 CAAAGTGGCACCCTCTTAAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
27974 CACCGTGGCAACCTTTTAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
28001 CTCCACGGC-ACACTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCAC-AA
*
28028 CTCCGTGGC-ACAATTTTAAGTCCAC-A
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
28054 GTCCGTGGTAACCTTTTAATTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
28081 CTTCGTGGCAAACTTTTAA-ACCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCC-ACAA
* *
28108 CCCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
28135 CTCCGTGGCACCCTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCAC-AA
* * * *
28162 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTTCAGAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
28189 CTCCGTGGCAACCTTTTAATTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
28216 CTTCGTGGCAAACTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
28243 CCCCATGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
28270 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCTACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
28297 CTCCGAGGCAACCTTTTCAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
28324 CTCCGTGGCAACCTTTTAACTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * *
28351 CTCCATAGCAACCTTTTAAGTTCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
28378 CTCCGTGAC-ACCTTTTTAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTT-AAGTCCACAA
*
28406 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
28433 CTCCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * * * *
28461 CTTCATGGCACCCTTTCAAAGTTCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
*
28489 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
28516 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * *
28543 CACCATGGC-ACACTTTTAAAGTCCCCAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* *
28571 CTCCGTGGCAAACTTTTATGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
28598 CTCCGAGGCAACCATTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
28625 CTCTGTGGCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
28652 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAC
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
28679 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
28706 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAT
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
28733 CTCTGTGGCACCCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* *
28761 CTCCGTGGC-ACTCATTTTAACTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-C-TTTTAAGTCCACAA
* * *
28789 CTTCGTGGCACCCTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
* * * *
28817 CTCCGCGGCAACCTTTTATGTTCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
28844 CTCCTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * ** * *
28871 CTCCATGACGCCCTTTCAAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
* * *
28899 CTCC-TCAGCGACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGT-GGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
28926 CTCCGTGGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** * *
28953 CTCTGTGG-AACCCTTCAAAGTCGACAG
1 CTCCGTGGCAA-CCTTTTAAGTCCACAA
*
28980 CTCCGTGGC-A-CTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
29005 TTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* *
29032 CTCCATGGCAACCTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
29059 CTCCGTGGC-ACACTTTTAAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTT-AAGTCCACAA
* * *
29087 CTCTGTGGCAGCCTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* ** *
29114 CACTTTGGCATA-CTTTTAAGTCTACAA
1 CTCCGTGGCA-ACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
29141 CTCCGTAGCACCCTTTTAAAGTCAACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
**
29169 CTCTATGGC-ACCGTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* *
29196 CTCCGTGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*
29223 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
*
29250 CTCCGTGGTAACCTTTTAA-TCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGT-CCACAA
* * *
29277 CTCCGTGGTAACCTTTTATGCCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
29304 CTCCGTGGC-ACCATTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * *
29331 CTCCATGGC-ACATTTTTAAGTCCACAG
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
29358 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCATAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * ** *
29385 CTTCGTAGCAAATTTTTAAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
29412 CCCCGTGCCACCCTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
29439 CAT-CGTAGC-ACATATTTAAGTCCATAG
1 C-TCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
29466 CTCCATAGCAACCTTTTGAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * *
29493 CTCCGTGGAAACCTTTGAAGTCAACAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * * * ** *
29520 CTCCATAGCCAGCTTTTAAGTCCTTAG
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
29547 CTCCAAGGC-ACCTTTTAAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTT-AAGTCCACAA
** *
29574 CTCTTTGGC-ACACTTTTAAGTCCACGA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* *
29601 CTTCGTGGCACCCTTTTTAAGTCCACAA
1 CTCCGTGGCAACC-TTTTAAGTCCACAA
* * **
29629 CTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTT-TAAGTCCACAA
** * *
29657 CTCCGTGGCAACCGATTAGGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
** * *
29684 CTCTTTGGC-ACACTTTTCAGTCCATAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
*** * * * *
29711 CAAAGTGGCACCCTCTTAAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCT-TTTAAGTCCACAA
* * *
29739 CACCGTGGCAACCTTTTAAGTCTATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
**
29766 CTCCACGGC-ACACTTTTAAGTCC-CTAA
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCAC-AA
*
29793 CTCCGTGGC-ACAATTTTAAGTCCAC-A
1 CTCCGTGGCAAC-CTTTTAAGTCCACAA
* * * *
29819 GTCCGTGGTAACCTTTTAATTCCATAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
* * *
29846 CTTCGTGGCAAACTTTTAA-ACCTACAA
1 CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCC-ACAA
* *
29873 CCCCATGGCAACCTTTT
1 CTCCGTGGCAACCTTTT
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CTCCGTGGCAACCTTTTAAGTCCACAA
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Alignment explanation
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13724 CCTAACTCCG
* * * * **
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66 CCCCA
*
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65 T
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Statistics
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TGGCACACTTTTAAGTCCACAACTCCGTGGCAACATTTTAAGTCCACAACTCCGTGGCAAACTTT
CCCCA
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Indices: 17342--17385 Score: 61
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17332 TGGCACCCTT
** *
17342 TTTAAGTCCGTAACTCCGTGGC
1 TTTAAGTCCCCAACTCCATGGC
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1 TTTAAGTCCCCAACTCCATGGC
17386 ACCCATTCAA
Statistics
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TTTAAGTCCCCAACTCCATGGC
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Indices: 17514--17646 Score: 178
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17504 ATATTCCACA
* * * * *
17514 ACTCCGCGGCAACCTTTTAAGTCCATAACTCCTTGGC-ACACTTTTTAGTCGACAACTCCGTGGC
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* * *
17583 ACTCCGTGGCAAACTTTTAAGTCTACATCTCCCTGGCAACATTTTAAGTCCACAACTCCGTGGC
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17647 ACAATTTTGA
Statistics
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ACTCCGCGGCAAACTTTTAAGTCCACAACTCCCTGGCAACATTTTAAGTCCACAACTCCGTGGCC
GCCT
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Alignment explanation
Indices: 18415--18456 Score: 66
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18405 ACACTTTTAA
*
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*
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18457 TTTTAAAATT
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Consensus pattern (21 bp):
GTCCACAACTCCATGGCACCC
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Alignment explanation
Indices: 29615--29803 Score: 195
Period size: 82 Copynumber: 2.3 Consensus size: 82
29605 GTGGCACCCT
* *
29615 TTTTAAGTCCAC-AACTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAACTCCGTGGCAACCGATTAGGTC
1 TTTTAAGTCC-CTAACTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAACACCGTGGCAACCGATTAAGTC
***
29679 CATAACTCTTTGGCACAC
65 CATAACTCCACGGCACAC
* * *** * * **
29697 TTTTCAGTCCATAACAAAGTGGCACCCTCTT-AAAG-TCTATAACACCGTGGCAACCTTTTAAGT
1 TTTTAAGTCCCTAACTCCGTGGCACCCT-TTCAAAGAAC-ACAACACCGTGGCAACCGATTAAGT
*
29760 CTATAACTCCACGGCACAC
64 CCATAACTCCACGGCACAC
29779 TTTTAAGTCCCTAACTCCGTGGCAC
1 TTTTAAGTCCCTAACTCCGTGGCAC
29804 AATTTTAAGT
Statistics
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Consensus pattern (82 bp):
TTTTAAGTCCCTAACTCCGTGGCACCCTTTCAAAGAACACAACACCGTGGCAACCGATTAAGTCC
ATAACTCCACGGCACAC
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Alignment explanation
Indices: 29891--30067 Score: 138
Period size: 26 Copynumber: 6.8 Consensus size: 27
29881 CAACCTTTTG
*
29891 GTGCCACGGAG-TGTGGGACTGAAAAG-
1 GTGCCACGGAGTTGT-GGACTTAAAAGT
* * *
29917 GTTGCCTCGGAGCTGTAGG-CTTAAAAAT
1 G-TGCCACGGAGTTGT-GGACTTAAAAGT
29945 GTGCCACGGAGTTGTGGAC-TAAAAGT
1 GTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGT
* * *
29971 GTGCCATGGGGTTGTAGACTTAAAAGT
1 GTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGT
* * ** *
29998 -TGCCACGGAGCTCTTAACTTAAAAAT
1 GTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGT
* *
30024 GTG-CACGGAGTT-AGGACTT-AAAGG
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Statistics
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GTGCCACGGAGTTGTGGACTTAAAAGT
Found at i:30008 original size:79 final size:77
Alignment explanation
Indices: 29890--30067 Score: 207
Period size: 79 Copynumber: 2.3 Consensus size: 77
29880 GCAACCTTTT
* * * *
29890 GGTGCCACGGAGTGTGGGACTGAAAAGGTTGCCTCGGAGCT-GTAGGCTTAAAAATGTGCCACGG
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*
29954 AGTTGTGGACTAAAAG
63 AGTT-AGGACTAAAAG
* * * *
29970 TGTGCCATGGGGTTGTAGACTTAAAA-GTTGCCACGGAGCTCTTAACTTAAAAATGTGCACGGAG
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*
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1 GGTGCCACGGAGTTGTGACTT
Statistics
Matches: 83, Mismatches: 13, Indels: 8
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GGTGCCACGGAGTTGTGACTTAAAAGGTTGCCACGGAGCTCGTAACTTAAAAATGTGCACGGAGT
TAGGACTAAAAG
Done.