Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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2065167 GCATCTTAAG
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2065291 TCATTCCAAG
2065301 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
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1 AT
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2065814 TTCATACTAC
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1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
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2066252 GAAAGAAAAA
* * *
2066262 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT GT GT GT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
* *
2066304 GT AT GT AT AT AT AT AT AT AT AT A
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT A
2066327 ATTCACTGCT
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*
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1 TATATATATATATATATGTATG
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TATATATATATATATATGTATG
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2076104 AAGGCTTATT
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1 TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC
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1 TC
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TC
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* **
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* * *
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* *
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* *
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*
2081991 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AG AT AT AT -T AT
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1 A
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*
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* * *
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* ** *
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*
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* * * *
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**
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* * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * *
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* * * ** * *
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* * ** *
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*
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*
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*
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*
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*
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1 TTTAAGGTTT
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* *
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*
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*
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* * *
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*
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1 GTTT
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* *
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* *
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* *
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*
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1 AGTTTAGAG
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* * *
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*
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Found at i:2084082 original size:32 final size:32
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*
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** * * *
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* * *
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*** * *
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*
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1 GGGTTTCGGGTTTCGGGTTTC
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* *
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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*
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* *
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*
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* *
2097359 GGGGTTCGGGTTTTCGGGGGTTC
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*
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* * *
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* *
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*
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*
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*
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1 -GGG-TTTCGG-GTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTCG--G-GT-TTC
* *
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1 GGGTTTCGGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTT-CGGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCG-GGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTCGGG--TTTC
* *
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1 GGGTTTCGGGTTTCGGGTTTC
*
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*
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1 GGGTTTCGGGTTTCG-GGTTTC
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*
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* *
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1 GGGTTTCGGGTTTCGGGT-TTC
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1 GGGTTTCG-GGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGT-TTCGG-GTTTCGGGTTTC
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*
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1 G-GGTTTCGGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTCGGGTTT--C
*
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1 G-GGTTT-CGGGTTTCGGGTTTC
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1 GGG-TTT-C-GGGTTTCGGG-TTTC
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1 GGGTTT--CGGGTTTCGGG-TTTC
*
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GGGTTTCGGGTTTCGGGTTTC
Found at i:2091914 original size:16 final size:17
Alignment explanation
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*
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**
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TTTCGGGTTTCGGGGGT
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*
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1 -TTCGGGTTTCG-GGTG
* *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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1 TTCGGGTT-T-CGGGTG
*
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* *
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*
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*
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*
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*
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* *
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1 -TTCGGGTTTC-GG-GTG
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTCGGGTTTCGGGTG
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Alignment explanation
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*
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*
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Statistics
Matches: 34, Mismatches: 3, Indels: 8
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Matches are distributed among these distances:
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TTCGGTTTTCGGG
Found at i:2092293 original size:37 final size:33
Alignment explanation
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*
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*
2092296 GGGTTTGGG--T--GGTTTGGGGTTTGGGTTTG
1 GGGTTCGGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGTTTG
*
2092325 GAGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGG-TT-GGTATTG
1 G-GG-TTCGGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGT-TTG
*
2092359 GGGTTTGGGGTTTTGAGGGTTTGGGGGTTTTGCGGGGTTTG
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* * * *
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1 GGGTTCGGGTTTG-GGGTTTGGGGTTT--GGGTTTG
* **
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1 GGG-TTCGGGTTTGGGGTTTGGGG--TTT-GGG-TTT-G
*
2092475 GGGTTTGGGTTTGGGG-TTGGGGTTTGGGGTTTG
1 GGGTTCGGGTTTGGGGTTTGGGGTTT-GGGTTTG
* *
2092508 GGGTTTTGGGGTTT-GGGTTTGGGGGTTTGGGGTAGTG
1 GGG--TTCGGGTTTGGGGTTT-GGGGTTT-GGGT-TTG
*
2092545 GGGTTTGGAGGGTTTGGGGTTT-GGG-TTGGGTTTG
1 GGG-TT--CGGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGTTTG
*
2092579 TGGGTTTTGGAGTTTGGGAGTTTTGGGGTTTAGGGTTT-
1 -GGG-TTCGG-GTTTGGG-G-TTTGGGGTTT-GGGTTTG
* *
2092617 GGGTTGTGGAGTTTGCGGATGTTGGGGTTTGGGTTTGG
1 GGGTT-CGG-GTTTG-GGGT-TTGGGGTTTGGGTTT-G
* *
2092655 GGGTTATGAGGGTTCTTGGGTTATGGGGTTTGGGGTTTG
1 GGG-T-T-CGGGTT-TGGGGTT-TGGGGTTT-GGGTTTG
*
2092694 GGAGTTTGGGGGTGTTGGGGATGTCTGGGGCTTTTGTTGGGGTTTTG
1 GG-G-TT-CGGGT-TTGGGG-T-T-TGGGG----T-TT-GGG-TTTG
*
2092741 GGG-GCGGGTTTGGGGTTTTGGGGTTTGGGGCTTTAG
1 GGGTTCGGGTTTGGGG-TTTGGGGTTT-GGG-TTT-G
* * *
2092777 GGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGGTTG
1 GGGTTCGGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGTTTG
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1 GGG
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.04, C:0.03, G:0.53, T:0.40
Consensus pattern (33 bp):
GGGTTCGGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGGGTTTG
Found at i:2092713 original size:9 final size:8
Alignment explanation
Indices: 2092267--2092806 Score: 227
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*
2092267 GGGTTTCG
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1 GGGTTTGG
*
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 G-GGTTTGG
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1 GGGTTTGG
2092318 GGGTTTGG
1 GGGTTTGG
*
2092326 AGGTTT-G
1 GGGTTTGG
2092333 GGGTTT-G
1 GGGTTTGG
2092340 GGGTTTGGG
1 GGGTTT-GG
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1 G--GGT-TTGG
2092359 GGGTTTGG
1 GGGTTTGG
* *
2092367 GGTTTTGA
1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGG-TTTG-G
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
*
2092407 GGG-TTGA
1 GGGTTTGG
*
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1 GGGTTTGG
*
2092421 GGGTTTCG
1 GGGTTTGG
*
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1 GGGTTTGG
*
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1 GGGTTTGG
*
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
*
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* *
2092467 GGATTTAG
1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
*
2092508 GGGTTTTG
1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
*
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1 GGGTTTG-G
2092545 GGGTTTGG
1 GGGTTTGG
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1 -GGGTTTGG
2092561 GGGTTTGGG
1 GGGTTT-GG
*
2092570 TTGGGTTTGT
1 --GGGTTTGG
*
2092580 GGGTTTTG
1 GGGTTTGG
*
2092588 GAGTTTGG
1 GGGTTTGG
* *
2092596 GAGTTTTG
1 GGGTTTGG
*
2092604 GGGTTT-A
1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
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* *
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*
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1 GGGTTTGG
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1 GGGTTTGG
*
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*
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1 GGGTT-TGG
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1 GGGTTTGG
*
2092695 GAGTTTGG
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1 GGGT-TTGG
*
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*
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*
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*
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*
2092753 GGGTTTTG
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* *
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1 GG
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Statistics
Matches: 423, Mismatches: 56, Indels: 106
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Matches are distributed among these distances:
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12 2 0.00
ACGTcount: A:0.04, C:0.02, G:0.54, T:0.41
Consensus pattern (8 bp):
GGGTTTGG
Found at i:2092900 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 2092836--2098576 Score: 4007
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*
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*
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*
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*
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*
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2093004 GGGTTTCGGGTTT-
1 GGGTTTCGGGTTTC
* *
2093017 AGGTTAC-GG--TC
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*
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1 GGGTTTCGGGTTT-C
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1 GGGTTTCGGGTTT-C
* *
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*
2093192 GGGTGGGTACGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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*
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*
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*
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*
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1 GGG-TTTCGGG-TT-TC
*
2093377 GGGTTTCGGGTTGC
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*
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*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
2093547 GGGTTTCGGGGTTTC
1 GGGTTTC-GGGTTTC
*
2093562 TGGGTTTCGGGGGTTC
1 -GGGTTTC-GGGTTTC
2093578 GGGGTTTCGGGTTTC
1 -GGGTTTCGGGTTTC
*
2093593 GGTGCGGTTCGGGTTTC
1 -G-G-GTTTCGGGTTTC
2093610 GGGTTTCGGGTTTTTTCCC
1 GGGTTTCGGG---TTT--C
****** *
2093629 CCCCCCCGGGGTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGG-TTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTT-CGGG-TTTC
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1 GG-GTTT-CGGGTTTC
* *
2093702 GGATTTAGGGTTATTC
1 GGGTTTCGGG-T-TTC
* *
2093718 GGGTTTTAGGGTGT-
1 GGG-TTTCGGGTTTC
2093732 -GGTTTC-GG-TTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2093743 GGTTTTCGGGTTTTC
1 GGGTTTCGGG-TTTC
*
2093758 GGGGTT-GGGTTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGG-TTTC
*
2093786 GGGTTTTTGGG--TC
1 GGG-TTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTC-GG-GTTTC
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1 GGGTTT-CGGGTT--TC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 G-GGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTT-CGGGTT-TC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
2093961 GGGTTTCGGG-TTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
* *
2093974 GGGGTT-GTG-TTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGG--TTTCGGGTTTC
**
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1 GGGTTTC-GGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGT-TTC
*
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1 GGGTTTCGGGTT-TC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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*
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*
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1 GGGTTTCGGG-TTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGT-TTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGG--T-TTCGGGTTTC
**
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1 GGGTTTCGGGTTTC
* *
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1 GGGTTTCGGGTTTC
* *
2094366 GGGTTT-AGG-TAC
1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2094378 GGTTGTTCGGGTTTTC
1 GGGT-TTCGGG-TTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTT-TCGGG-TTTC
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1 GGGTTTCGGG-TTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2094492 GGG-TTC-GGTTAC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGG-TTTCGGGTTTC
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*
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1 GGGTTTCGGGTT-TC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGG--T-TTCGGG-TTTC
*
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1 GGG-TTTCGGGTT-TC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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*
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1 GGGT-TTC-GGGTT--TC
*
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1 GGG-TTTCGG----GTTTC
**
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1 G--GGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGG-TT--TCGGGTTTC
*
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1 -GGGTT-TCG-GG-TTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTT-C
*
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1 GGGTTT-CGGGTTT-C
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1 GGG-TTTCGGGT-TTC
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1 GGGTT-TCGGGTTTC
*
2094852 -GGATTCGGGTTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GG-GTTTCG-GGTT-TC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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*
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1 GGGTT-TCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTT-TC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 -GG--GTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGT-TTCGGGTTTC
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1 GGGTT-TCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTC-GGGTTTC
*
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1 G-GGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTT-TCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTC--GGGTTT-C
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2095332 GGGTTTCGGGGTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTT-C
* *
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTT-TCGGGTTTC
*
2095489 GGGTTTCGGGTATC
1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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*
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1 -G-GGTTTCGGGTTTC
*
2095561 GGGTTTC-GG-ATC
1 GGGTTTCGGGTTTC
* *
2095573 GGTTTTC-GG-TAC
1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2095585 GGGTGTCGGGTTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGT-TTCGGGTTTC
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* *
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*
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1 GGGTT-TCGGG-TTTC
* * *
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 ---GGGTTTCGGGTTTC
*
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*
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1 GGGTTTCGGG-TTTC
* *
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 -GGGTTTCGGGTTTC
*
2096072 -GG-TTCGGGTTTA
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 G-GG-TTTCGGG--TTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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*
2096224 GGGGTTCCGGGTTTC
1 -GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTT-TCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGG-GTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2096280 GGGGTT---GTTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 G-GGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGGTTTC-GGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTT-C
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1 GGGT-TTCGGG-TTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCG-GGTTTC
*
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1 GGGTTTCGGGTT-TC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2096486 GGCTTTCGGG-TTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGT-TTC
*
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1 GGG-TTT-CGGGTTTC
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1 G-GGTTTCGGGTTTC
*
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1 GGG-TT--TCGGG-TTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
* *
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1 -GGG-TTTCG-GGTT---TC
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1 GGGTTTCGGGTTT---C
*
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1 -GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTT-CGGG-TTTC
*
2096769 -GG--TCGGGGTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2096780 GGGTTTCGGGGTGTC
1 GGGTTTC-GGGTTTC
*
2096795 CGGTTT-GGGTTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
2096808 GGGATTTCCGAGGTATGTTGC
1 GGG-TTT-CG-GG--T-TT-C
*
2096829 GGTTTTCGGG-TTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTT-TC
*
2096856 GGGTTTCGGGGTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2096884 GGG-TTCGGGGTT-
1 GGGTTTCGGGTTTC
2096896 --GTTTCGGGTTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTT-CGGGTT-TC
*
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1 G-GGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTT-C
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1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGG-TTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
2097018 -TG-TTCGGGTTTC
1 GGGTTTCGGGTTTC
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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*
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1 -GG-GTTTCGGGTTTC
*
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1 GGG-TTTCGGG-TTT-C
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1 GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 ---GGGTTTCGGGTTT--C
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*
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*
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*
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*
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*
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1 -GGGTTTCGG-G-TTT-C
* *
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1 -GGGTTTCGGGTTTC
*
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1 TTCGGGT
*
2090639 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
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1 TT-CGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TT-CGGGT
*
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1 T-TCG-GGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TT-CGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
2091101 TTGGGGT
1 TTCGGGT
**
2091108 TGAGGG-
1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGG-T
*
2091122 TTGGGGGT
1 TT-CGGGT
*
2091130 TTGGGGTTTT
1 TTCGGG---T
*
2091140 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
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1 -TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
2091177 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCG-GGT
*
2091198 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091205 GTTTGGGT
1 -TTCGGGT
2091213 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2091219 TTGGGGATT
1 TTCGGG--T
*
2091228 TTGGGGGAT
1 TT-CGGG-T
*
2091237 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091244 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091251 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091258 TTAGGGGT
1 TT-CGGGT
* *
2091266 TTGGGGGG
1 TT-CGGGT
*
2091274 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091281 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091288 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091295 TT-GGGG
1 TTCGGGT
*
2091301 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091308 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091315 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2091323 TTGGGGTAATT
1 TTCGGG----T
*
2091334 TTAGGGGT
1 TT-CGGGT
*
2091342 TTGAGGGT
1 TT-CGGGT
*
2091350 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091357 TTGGGTGTTTT
1 TTCGG-G---T
*
2091368 TTGGGGGT
1 TT-CGGGT
*
2091376 GTT-GGGG
1 -TTCGGGT
*
2091383 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091390 TTGGGGT
1 TTCGGGT
* *
2091397 TTTGGGG
1 TTCGGGT
*
2091404 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091411 TTGGGGGT
1 TT-CGGGT
*
2091419 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091426 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2091434 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2091442 TTGGGAGT
1 TTCGG-GT
*
2091450 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091457 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091464 TTGGGGTGAAT
1 TT-CGG-G--T
*
2091475 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091482 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091489 GT-GAGGT
1 TTCG-GGT
*
2091496 TTGGGTGT
1 TTCGG-GT
*
2091504 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2091512 TTGGGGT
1 TTCGGGT
2091519 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2091525 TT-GGGG
1 TTCGGGT
*
2091531 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091538 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091545 GTTGGGGT
1 -TTCGGGT
*
2091553 TTGAGGGGT
1 TT--CGGGT
*
2091562 TTGGGGT
1 TTCGGGT
2091569 TT-GGAGT
1 TTCGG-GT
*
2091576 TATGGGGTT
1 T-TCGGG-T
*
2091585 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2091593 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2091600 GTTGGGGT
1 -TTCGGGT
2091608 TT-GGGT
1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
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1 TTCG---GGT
*
2091632 GGTC-GGT
1 -TTCGGGT
*
2091639 ATCGGG-
1 TTCGGGT
2091645 TTC-GG-
1 TTCGGGT
2091650 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2091657 TT--GG-
1 TTCGGGT
2091661 TTCAGGAGTT
1 TTC-GG-G-T
*
2091671 CTTAGGGT
1 -TTCGGGT
2091679 TTCGGGGT
1 TTC-GGGT
*
2091687 TT-GTG-
1 TTCGGGT
*
2091692 TTCAGGT
1 TTCGGGT
2091699 TTCGGG-
1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
2091713 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TT-C-GGGT
*
2091729 TGCGGGT
1 TTCGGGT
2091736 TTC-GGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
2091747 TTCGGGT
1 TTCGGGT
**
2091754 TT-AAGT
1 TTCGGGT
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1 -TT-CGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCG-GGT
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1 T-TC-GGGT
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1 TTCGGG--T
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1 TTCG-GGT
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1 TT-CGG-GT
*
2091817 CTTCAGGAT
1 -TTC-GGGT
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1 TTCG-GGT
2091834 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
2091855 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTC---GGGT
2091872 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2091879 TTCGAGGT
1 TTCG-GGT
*
2091887 TCCCGGGT
1 T-TCGGGT
2091895 TTCGGGGGTT
1 TTC--GGG-T
2091905 TTCGGG-
1 TTCGGGT
*
2091911 TTCGCGT
1 TTCGGGT
2091918 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2091925 TTACCGGT
1 TT-CGGGT
2091933 TT--GG-
1 TTCGGGT
2091937 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCG-GGT
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1 TTCGGGT
*
2091958 -T-GGTT
1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
*
2091971 TATCGGGA
1 T-TCGGGT
2091979 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2091986 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
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1 --TT-CGGGT
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1 TTC-G-GGT
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1 -TTCGGGT
*
2092021 TTC-CG-
1 TTCGGGT
2092026 -TCGGGT
1 TTCGGGT
2092032 TGTCCGGGTT
1 T-T-CGGG-T
2092042 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092049 TTCGGGAGTT
1 TTC-GG-G-T
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1 TTCG-GG-T
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1 TTCGGGT
2092075 TT--GGT
1 TTCGGGT
*
2092080 TACCGGGT
1 T-TCGGGT
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1 -TTCG-GGT
2092097 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
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1 -TTCGGGT
*
2092113 GTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 --TTCGGGT
*
2092128 TTAGGGTT
1 TTCGGG-T
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1 --TTCGGGT
2092145 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092152 TTACGGGT
1 TT-CGGGT
2092160 TGTCGGGT
1 T-TCGGGT
2092168 GTTCGGGT
1 -TTCGGGT
*
2092176 TTCCCGGT
1 TT-CGGGT
*
2092184 TTCGGTT
1 TTCGGGT
2092191 TTCGGG-
1 TTCGGGT
2092197 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2092203 TTCGGG-
1 TTCGGGT
*
2092209 TCCTGGCGTT
1 TTC-GG-G-T
2092219 TTCGGG-
1 TTCGGGT
2092225 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092232 TTCGGGGT
1 TTC-GGGT
2092240 TTCTGGCGT
1 TTC-GG-GT
2092249 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092256 TTCGGGGT
1 TTC-GGGT
*
2092264 CTCGGGT
1 TTCGGGT
2092271 TTCGGGGT
1 TTC-GGGT
*
2092279 TTGGGGT
1 TTCGGGT
2092286 TGT-GGGT
1 T-TCGGGT
*
2092293 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092300 TTGGGTGGT
1 TT-CG-GGT
*
2092309 TTGGGGT
1 TTCGGGT
2092316 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2092322 TTGGAGGT
1 TTCG-GGT
*
2092330 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092337 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092344 TT-GGGG
1 TTCGGGT
2092350 TT--GGT
1 TTCGGGT
*
2092355 ATTGGGGT
1 -TTCGGGT
*
2092363 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2092371 TTGAGGGT
1 TT-CGGGT
*
2092379 TTGGGGGTT
1 TT-CGGG-T
2092388 TTGCGGGGT
1 TT-C-GGGT
*
2092397 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092404 TTGGGGT
1 TTCGGGT
** *
2092411 TGAGGGA
1 TTCGGGT
*
2092418 TTGGGGT
1 TTCGGGT
2092425 TTCGGGGT
1 TTC-GGGT
* *
2092433 ATGGGGT
1 TTCGGGT
* *
2092440 TTTGGGG
1 TTCGGGT
* *
2092447 ATGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092454 TTGGGGATT
1 TTCGGG--T
*
2092463 TTGGGGAT
1 TTCGGG-T
*
2092471 TTAGGGGT
1 TT-CGGGT
2092479 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2092485 TT-GGGG
1 TTCGGGT
*
2092491 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092498 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092505 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2092513 TTGGGGT
1 TTCGGGT
2092520 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2092526 TTGGGGGT
1 TT-CGGGT
*
2092534 TTGGGGT
1 TTCGGGT
* *
2092541 AGTGGGGT
1 -TTCGGGT
*
2092549 TTGGAGGGT
1 TT--CGGGT
*
2092558 TTGGGGT
1 TTCGGGT
2092565 TT-GGG-
1 TTCGGGT
2092570 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2092576 TTGTGGGT
1 TT-CGGGT
*
2092584 TTTGGAGT
1 TTCGG-GT
*
2092592 TTGGGAGTT
1 TTCGG-G-T
*
2092601 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092608 TTAGGGT
1 TTCGGGT
2092615 TT-GGGT
1 TTCGGGT
2092621 TGT-GGAGT
1 T-TCGG-GT
*
2092629 TTGCGGAT
1 TT-CGGGT
*
2092637 GTTGGGGT
1 -TTCGGGT
2092645 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2092651 TTGGGGGT
1 TT-CGGGT
*
2092659 TATGAGGGT
1 T-T-CGGGT
*
2092668 TCTTGGGT
1 T-TCGGGT
*
2092676 TATGGGGT
1 T-TCGGGT
*
2092684 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092691 TTGGGAGT
1 TTCGG-GT
*
2092699 TTGGGGGT
1 TT-CGGGT
*
2092707 GTTGGGGAT
1 -TTCGGG-T
*
2092716 GTCTGGGGCT
1 -T-TCGGG-T
*
2092726 TT--TG-
1 TTCGGGT
*
2092730 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092737 TTTGGG-
1 TTCGGGT
**
2092743 GGCGGGT
1 TTCGGGT
*
2092750 TTGGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2092758 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092765 TTGGGGCT
1 TTCGGG-T
*
2092773 TTAGGGT
1 TTCGGGT
*
2092780 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092787 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092794 TTGGGGT
1 TTCGGGT
*
2092801 TTGGGGT
1 TTCGGGT
**
2092808 TGGGGGCTTT
1 TTCGGG---T
2092818 TGTCGGG-
1 T-TCGGGT
2092825 TT--GGT
1 TTCGGGT
2092830 ATTCCAGGGT
1 -TT-C-GGGT
2092840 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092847 TTCGAGGT
1 TTCG-GGT
2092855 TTCCGGGT
1 TT-CGGGT
2092863 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
2092871 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092878 TTCCGGGT
1 TT-CGGGT
2092886 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092893 TTCGGG-
1 TTCGGGT
2092899 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092906 TTCGGGAT
1 TTCGGG-T
2092914 TT-GGGT
1 TTCGGGT
*
2092920 TGCGGG-
1 TTCGGGT
*
2092926 -TCCGGT
1 TTCGGGT
2092932 TTCTGGCG-
1 TTC-GG-GT
2092940 TTCAGGGGGT
1 TTC---GGGT
2092950 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092957 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2092964 TTCGGG-
1 TTCGGGT
*
2092970 TTC--GC
1 TTCGGGT
2092975 TTC-GG-
1 TTCGGGT
*
2092980 TT-GGGG
1 TTCGGGT
2092986 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2092993 GTTCGGGG
1 -TTCGGGT
2093001 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093008 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2093015 TT-AGGT
1 TTCGGGT
*
2093021 TAC-GG-
1 TTCGGGT
*
2093026 -TCGGTT
1 TTCGGGT
2093032 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093039 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093046 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2093052 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
2093060 TCGTCAGGGT
1 T--TC-GGGT
2093070 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093077 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
2093085 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
2093093 TGGTCGGGT
1 T--TCGGGT
2093102 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093109 TGTCGGG-
1 T-TCGGGT
2093116 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093123 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2093129 TTGCGGGT
1 TT-CGGGT
2093137 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093144 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093151 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093158 TTCCGGGT
1 TT-CGGGT
*
2093166 TTAGGGT
1 TTCGGGT
*
2093173 GTGCGGGT
1 -TTCGGGT
2093181 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093188 ATTCGGGT
1 -TTCGGGT
*
2093196 GGGTACGGGT
1 ---TTCGGGT
2093206 TTCGGATGGT
1 TTC-G--GGT
2093216 GTTCGGGT
1 -TTCGGGT
2093224 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093231 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2093237 TT--GGT
1 TTCGGGT
2093242 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2093248 TTCGGG-
1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
* *
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTC-GGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -TTCG-GGT
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1 TTCGGG-T
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1 TTCGGG-T
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTC-G-GGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
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1 TT-CGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
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1 TTC-GGGT
*
2093567 TTCGGGGG
1 TTC-GGGT
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1 TTC-GGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTC-G-G-GT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG---T
****
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1 TT--CGGGT
** *
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG-T
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1 TTCGGGT
2093661 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TT-CGGG-T
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1 TTCGG-GT
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1 TT-CGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGG-T
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1 -TTCGGG-T
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
2093740 TTCGGTT
1 TTCGGGT
2093747 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
*
2093755 TTCGGGG
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
2093768 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2093775 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
2093783 TTCGGGTT
1 TTCGGG-T
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC-GG-GT
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1 TTCGGGT
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1 TT-CGGGT
*
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1 T--TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCG-GGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC-G--GGT
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1 TTCGGGT
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1 T-T-CGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TT-CGGGT
*
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
2093958 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
2093971 TTCGGGG
1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG--T
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
**
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1 TTC-GGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 ---TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -T-TCG-GGT
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1 TTC-GGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTC-GGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCG-GGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG-T
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG--T
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG--T
*
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1 -TTCGGGT
**
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1 TTCGGGT
2094344 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
*
2094370 TT-AGG-
1 TTCGGGT
* *
2094375 TACGGTT
1 TTCGGGT
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1 -TTCGGG-T
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 T-TCGGG-T
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG-T
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1 TTCGGG-T
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1 -TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG-T
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -TTCG-GG-T
*
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1 TTCGGGT
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1 TTC-GG--G-T
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG--T
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1 -TTCGGG-T
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1 TTCG-GGT
*
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1 TTCG---GGT
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1 TTCGGG-T
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1 TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCG---GGT
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1 TTCGGGT
*
2094697 CTTCAGGTT
1 -TTC-GGGT
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1 T--TCGGG-T
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1 TTCGG----GT
* **
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1 TTCG--GGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGG-T
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1 T--TCGGGT
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1 TTC-GGGT
*
2094780 TGCCGAGGTT
1 T-TCG-GG-T
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TT-CGGGT
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1 TT-CGGGT
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1 TT-CGGG-T
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1 TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGG-GT
*
2094882 TGCGAGGT
1 TTCG-GGT
*
2094890 TGTCGGTT
1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TT-CGGGT
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1 TTC-GGGT
*
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1 --TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TT--CGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 T-TC-GGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTC-GG--GT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
2095151 TTC--GT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TTCGGG-T
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1 T-TC--G-GG-T
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1 -TTCGGGT
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1 TTCG-GGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
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1 TT-CGGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TT-CGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC--GGGT
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1 TT-CGGGT
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1 TTCGGGT
2095329 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2095336 TTCGGGG
1 TTCGGGT
2095343 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095350 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095357 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TT---C-GGGT
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1 --TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
2095387 TTGCGGGG
1 TT-CGGGT
*
2095395 TTC--TT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
2095420 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095427 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGG-GT
2095442 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGG-T
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1 TT-CGGGT
*
2095464 TGCGGGT
1 TTCGGGT
2095471 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
2095493 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2095500 ATCGGG-
1 TTCGGGT
2095506 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2095513 TGCGGGTT
1 TTCGGG-T
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1 -TTCGGGT
2095529 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095536 TTCGGAGT
1 TTCGG-GT
*
2095544 TTCGGAGGA
1 TTC-G-GGT
2095553 TT--GGT
1 TTCGGGT
2095558 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095565 TTC-GG-
1 TTCGGGT
* *
2095570 ATCGGTT
1 TTCGGGT
2095577 TTC-GG-
1 TTCGGGT
*
2095582 TACGGGT
1 TTCGGGT
*
2095589 GTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC-GGGT
2095626 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 TTCGG-G-T
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 -TT-CGGGT
* *
2095663 TGCGGTT
1 TTCGGGT
2095670 GTTCGGCGT
1 -TTCGG-GT
2095679 TTCCAGGGTT
1 TT-C-GGG-T
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1 TTC-GGGT
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1 T-TCGGGT
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1 TTCGGGT
2095712 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2095719 GTTACGGTT
1 -TT-CGGGT
2095728 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095735 TCGGTCGGGT
1 T---TCGGGT
2095745 TCTCGGGTT
1 T-TCGGG-T
*
2095754 TTCCGG-
1 TTCGGGT
* *
2095760 TT-AGAT
1 TTCGGGT
2095766 TTCGGGGT
1 TTC-GGGT
*
2095774 TTAGGGTT
1 TTCGGG-T
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1 TTCGGGT
2095789 ATTCGGGT
1 -TTCGGGT
2095797 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2095803 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095810 TTCGGAGT
1 TTCGG-GT
2095818 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095825 TTGCGGGT
1 TT-CGGGT
2095833 TTCGGGT
1 TTCGGGT
*
2095840 TATTGGGT
1 T-TCGGGT
2095848 ATTCGGGGT
1 -TTC-GGGT
2095857 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095864 TTAC-GGT
1 TT-CGGGT
2095871 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2095877 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095884 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095891 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095898 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095905 TTC-GGT
1 TTCGGGT
2095911 TTCGGAG-
1 TTCGG-GT
2095918 TTCGGGT
1 TTCGGGT
2095925 TTCGGGT
1 TTCGGGT
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1 -TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTC---GGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
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1 TTCGGGT
*
2095981 GTAGTTGCGG-
1 -T--TCG-GGT
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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TTCGGGT
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* * * * * * * * *
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** * ** * * * * *
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2098751 TCCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (1 bp):
C
Found at i:2098648 original size:8 final size:8
Alignment explanation
Indices: 2098635--2098753 Score: 123
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2098625 CTTCACCCCT
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1 CCCCCTCC
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1 CCCCCTCC
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1 CCCCCTCC
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1 CCCCCTC-C
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1 CCCCCTCC
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1 CCCCCTCC
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1 CCCCCTCC
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*
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1 CCCCCTCC
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*
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1 CCCCCTCC
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1 CCCCCTCC
*
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CCCCCTCC
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Alignment explanation
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*
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*
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*
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Statistics
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Consensus pattern (7 bp):
CCCCTCC
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Alignment explanation
Indices: 2098630--2098749 Score: 145
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*
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*
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*
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1 CCCC
2098750 CTCCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CCCCTCCCCCCTCC
Found at i:2098680 original size:36 final size:36
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*
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* *
2098701 CCCCTCCCCCCATCCCCCCTCCCCCC-CCGCCCCCTCC
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2098738 ACCCCTCCCC
1 -CCCCTCCCC
2098748 CCCTCCA
Statistics
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Consensus pattern (36 bp):
CCCCTCCCCTCCCCCCCTCCCCCCTCCCCCCCCTCC
Done.