Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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1 AAG
* * *
4 CCTCGTGTTGCACTCATC-TTTT-ATTTTGA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGATAGAGT
1 CCTCGTGTTGCACCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGA-CGAGT
* *
66 CA-ACTAA-TTT-TG-AAAAA-TCGGAAAGCC-TATTAA-TG-AAAAATCGAATCAGCTAACGTT
65 CACA-TAATTTTATGAAAAAATTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTT
*
123 TAATCGAGTAGTAAAATACAAACCCATGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGA
129 TAATC--G-AGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGA
* * *
188 TGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGA
191 TGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGA
* *
253 TCCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-AGAGTAGAACTAGGATCGGTGACCTCCT
256 T-CCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT
317 GGGAAGT
320 GGGAAGT
* *
324 CCTCGTGTTGCATTCCCATCTTTTTAATTTTTATTATTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAG
1 CCTCGTGTTGCA--CCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAG
* * * *
389 CCACATAATTTTATGAAAAAATTCGGAAATCTTTATCAACTGAAAAAACCCGAATCAGCTGACGT
64 TCACATAATTTTATGAAAAAATTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAA-CCGAATCAGCTGACGT
* * *
454 TTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATA
128 TTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATG
* * *
519 GTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCAGATC
193 GTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC
* * * * * *
584 CCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCCAGAGTGGTTCTAGGATGGGTGATCTCCTGGG
258 CCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG
649 AAGT
323 AAGT
* * *
653 CCTCGTGTTTGCACCCAATCTTTTTAATTTTTCTTTTTTAACCTCGTTGGA-TTGAGTTGTCGAG
1 CCTCGTG-TTGCACCC-ATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAG
* * * * * *
717 TCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAGCTTTATTAACTGAAAAAAACCGACTCAGCTGATG
64 TCACATAATTTTATGAAAAAA-TTCGGAAAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACG
* *
782 TTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT
127 TTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT
*
847 GGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGA
192 GGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGA
*
911 TCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTA
256 TCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTG
976 GGAAGT
321 GGAAGT
*
982 CCTCGTGTTGCACACCCATCTTTTTAACTTTTA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAG
1 CCTCGTGTTG--CACCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAG
* * * *
1046 TCACATAATTTTATGAAAAATTTTC-GCAAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGT
64 TCACATAATTTTATGAAAAA-ATTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGT
* * *
1110 TTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACAAGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATG
128 TTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATG
* * * *
1175 GTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGCTGGGTGCGATCATACTAGCACTAATGTACCGGA-C
193 GTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC
* *
1239 CGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG
258 C-CATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG
*
1304 GAAGC
322 GAAGT
* *
1309 CCTCGTGTTGCACTCATCTTTTTAATTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTC
1 CCTCGTGTTGCACCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTC
* * *
1374 ACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTT
66 ACATAATTTTATGAAAAAA-TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT
* *
1439 AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGT
130 AATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGT
* * * *
1504 ATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGGGTGCGATCATACCCGCACCAATGTACCGGATCC
195 ATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC
* * *
1568 CATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTTGGA
259 CATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGA
1633 AGT
324 AGT
*
1636 CCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTT--TTTTTATTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACTAG
1 CCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTTTA-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAG
* * * *
1698 TCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAGCTAACG
64 TCACATAATTTTATGAAAAA-ATTCGGAAAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACG
* *
1763 TTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCAGAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGAT
127 TTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT
* * * *
1828 AGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGTCCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGAT
192 GGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT
* * *
1893 CCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAG
257 CCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG
*
1958 AAAGT
322 GAAGT
*
1963 CCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGT
1 CCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGT
** *
2028 CACATAATTTTATGAAAATTTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTT
65 CACATAATTTTATGAAAAAATTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT
* * *
2093 AATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGAT
130 AATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGT
* *
2158 ATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCC
195 ATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCC
2223 AT
260 AT
2225 GCCCAAAAGG
Statistics
Matches: 1709, Mismatches: 153, Indels: 71
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
320 12 0.01
322 5 0.00
323 4 0.00
324 14 0.01
325 52 0.03
326 132 0.08
327 798 0.47
328 141 0.08
329 497 0.29
330 29 0.02
331 5 0.00
332 20 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (326 bp):
CCTCGTGTTGCACCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTC
ACATAATTTTATGAAAAAATTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA
ATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA
TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
TCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAG
T
Found at i:2301 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 2125--2324 Score: 339
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
2115 TGAGACATGG
* *
2125 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
2190 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
2225 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* *
2289 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
2325 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 94, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 93 0.99
ACGTcount: A:0.31, C:0.18, G:0.29, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:2687 original size:428 final size:427
Alignment explanation
Indices: 1798--3079 Score: 2118
Period size: 428 Copynumber: 3.0 Consensus size: 427
1788 TGAGACATGG
* * * * *
1798 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
1863 TCCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAACGTGCTTG-GCG
* *
1928 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
1993 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
2057 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
2122 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
2187 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
390 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAA
2225 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAA-TGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGT-ATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
*
2289 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAACGTGCTTAGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAACGTGCTT-GGC
* * *
2354 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * *
2419 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
* *
2484 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
* * *
2549 ATGGGCTCACAAGGGTGACAGAGCGAAAAAGGATGATATTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
2614 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAA
389 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAA
* *
2653 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
2718 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAACCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAACGTGCTT-GGCG
*
2783 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
2848 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
2913 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* * *
2978 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * *
3043 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCA
390 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
3080 TCAAAACTCC
Statistics
Matches: 795, Mismatches: 56, Indels: 7
0.93 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 223 0.28
428 571 0.72
429 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (427 bp):
GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAACGTGCTTGGCGA
GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
GGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAA
Found at i:2729 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 2556--2751 Score: 313
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
2546 GACATGGGCT
* * *
2556 CACAAGGGTGACAGAGCGAAAAAGGATGATATTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAAAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
*
2621 GATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAAGCC
66 GATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAAGCC
* *
2656 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTG
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAAAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTG
*
2720 CGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
65 CGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
2752 TCAGAACTCC
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 87 0.99
ACGTcount: A:0.33, C:0.19, G:0.28, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
CACAAGGGTGACAGAGCGAAAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
GATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAAGCC
Found at i:3268 original size:328 final size:328
Alignment explanation
Indices: 2653--4059 Score: 2249
Period size: 328 Copynumber: 4.3 Consensus size: 328
2643 CGCATCCCAA
* * * *
2653 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
2718 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAACCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
2783 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
2848 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
2913 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
*
2978 CGG
326 TGG
*
2981 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
3046 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
3110 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
3175 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
3240 CCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
3305 ATGG
325 ATGG
*
3309 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
3373 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
3438 GAAAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC--TTT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
3499 TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTTTCGCAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGGAA
*
3562 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
3627 CATGG
324 CATGG
* *
3632 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* *
3695 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
3760 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
3825 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * *
3890 AGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
3955 CATGG
324 CATGG
* *
3960 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* **
4025 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
4060 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 993, Mismatches: 71, Indels: 30
0.91 0.06 0.03
Matches are distributed among these distances:
322 3 0.00
323 220 0.22
324 69 0.07
325 8 0.01
327 145 0.15
328 492 0.50
329 56 0.06
ACGTcount: A:0.29, C:0.19, G:0.24, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
TGG
Found at i:3919 original size:651 final size:654
Alignment explanation
Indices: 2653--4059 Score: 2263
Period size: 651 Copynumber: 2.2 Consensus size: 654
2643 CGCATCCCAA
* * * *
2653 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
2718 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAACCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAACCGTGCTTGGGCG
* * * * *
2783 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AAAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTT-ATTTT
* * * *
2848 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATAAAAAATTTTCGCAAAG
* *
2913 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
*
2978 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
324 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * *
3043 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGA
* * * *
3108 GCAGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATT
454 GCAGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCCTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
3173 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
519 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * *
3238 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAG
3303 ACATGG
649 ACATGG
*
3309 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * * *
3373 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAACCGTGCTTGGGC
3438 GAAAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTT-TTTTT
130 GAAAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTATTTTT
3501 -TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATAAAAAATTTTCGCAAAGC
195 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATAAAAAATTTTCGCAAAGC
* *
3565 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
260 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACAC
* *
3630 GGGCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGA
325 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGA
*
3693 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
3758 AGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
453 AGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCCTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * *
3823 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
517 TTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* * *
3888 AAAGCCTTATTAACTG-AAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTG
582 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTG
3952 AGACATGG
647 AGACATGG
* *
3960 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
4025 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACC-ACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGA-ATCCCAT
4060 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 693, Mismatches: 52, Indels: 17
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
650 4 0.01
651 375 0.54
652 143 0.21
654 3 0.00
656 164 0.24
657 4 0.01
ACGTcount: A:0.29, C:0.19, G:0.24, T:0.27
Consensus pattern (654 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAACCGTGCTTGGGCG
AAAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTATTTTTA
TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATAAAAAATTTTCGCAAAGCC
TTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACACG
GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGAGC
AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCCTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGAC
ATGG
Found at i:4136 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 3960--4159 Score: 330
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
3950 TGAGACATGG
* *
3960 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
4025 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
4060 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* **
4124 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
4160 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 6, Indels: 2
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 92 0.99
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.29, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:4564 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 4388--4587 Score: 312
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
4378 TGAGACATGG
* *
4388 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
* *
4453 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACTGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
* * *
4488 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-CAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
4552 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
4588 CAGAACTCCG
Statistics
Matches: 91, Mismatches: 8, Indels: 2
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 90 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.20, G:0.28, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
Found at i:4915 original size:428 final size:427
Alignment explanation
Indices: 3632--4915 Score: 2120
Period size: 428 Copynumber: 3.0 Consensus size: 427
3622 TGAGACATGG
* * * *
3632 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGGATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATGG
* * *
3696 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG-GG
* *
3761 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
3826 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
* * * *
3891 GCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
*
3956 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
*
4021 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
389 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
4060 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
4125 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG-G
* * * *
4190 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
4255 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
4320 CCTTATTAAGTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* *
4385 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
4450 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACTGCATCCCAT
390 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
* *
4488 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
4553 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGGG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GGGG
* *
4618 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
4683 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGGCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
*
4748 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* * *
4813 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * *
4878 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCAT
390 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
4916 CAAAACTCCG
Statistics
Matches: 795, Mismatches: 58, Indels: 6
0.93 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 4 0.01
428 788 0.99
429 3 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (427 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGGA
GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
GGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:5173 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 4488--5895 Score: 2270
Period size: 328 Copynumber: 4.3 Consensus size: 328
4478 TGCATCCCAT
* * * *
4488 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
4553 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGG-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GGGC
* * *
4617 GAGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
4682 TTATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGGCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
* *
4747 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
*
4812 ATGA
325 ATGG
*
4816 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
4881 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
4946 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGCCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
5010 GATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
5075 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
5140 TGG
326 TGG
* *
5143 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
5207 GTGCGATCATACCAGCACCAATGTACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
5272 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
5334 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACTAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
*
5399 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
5464 ATGG
325 ATGG
* * *
5468 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
5533 TCCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
5598 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
5663 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
5728 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
5793 TGG
326 TGG
* *
5796 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
5861 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
5896 GCCCAAAAGG
Statistics
Matches: 994, Mismatches: 79, Indels: 14
0.91 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
324 3 0.00
325 293 0.29
326 4 0.00
327 304 0.31
328 390 0.39
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.24, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
TGG
Found at i:5972 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 5796--5995 Score: 330
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
5786 TGAGACATGG
* *
5796 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
5861 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
* *
5896 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* *
5960 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
5996 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 6, Indels: 2
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 92 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.18, G:0.29, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
GCCCAAAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:6271 original size:428 final size:426
Alignment explanation
Indices: 5468--6751 Score: 2138
Period size: 428 Copynumber: 3.0 Consensus size: 426
5458 TGAGACATGG
* * *
5468 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAA-GATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
5533 TCCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG-GCG
* *
5598 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
129 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
5663 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
5728 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
*
5793 TGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
324 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
5858 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
389 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
5896 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAA-GATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
5961 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAACGTGCTTAGGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GGCG
* * *
6026 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
129 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
6091 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGACAAAA-TTTCGTAAA
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGA-AAAATTTTCGGAAA
* *
6155 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
258 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
*
6220 ATGGGCTCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
323 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
*
6285 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAA
388 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
* *
6324 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAG-ATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
6389 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GGCG
* *
6454 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
129 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
6519 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
6584 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* * *
6649 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
324 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * *
6714 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCAT
389 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
6752 CAAAACTCCG
Statistics
Matches: 800, Mismatches: 52, Indels: 8
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 5 0.01
428 790 0.99
429 5 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (426 bp):
GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGCGAG
AGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTA
TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGCC
TTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATG
GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:6400 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 6227--6422 Score: 331
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
6217 GACATGGGCT
* *
6227 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
*
6292 GATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAAGCC
66 GATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAAGCC
*
6327 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTG
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTG
*
6391 CGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
65 CGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
6423 TCAGAACTCC
Statistics
Matches: 90, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 89 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.19, G:0.29, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
GATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAAGCC
Found at i:6922 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 6324--7731 Score: 2247
Period size: 328 Copynumber: 4.3 Consensus size: 328
6314 CGCATCCCAA
* * * *
6324 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
6389 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
6454 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
6519 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
6584 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
*
6649 CGG
326 TGG
*
6652 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
6717 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
6781 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
6846 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
6911 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
6976 TGG
326 TGG
*
6979 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * * *
7043 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCATCGGATCCCATCAAAACTTCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
7108 GAAAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
7171 TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTTTCGCAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGGAA
*
7234 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
7299 CATGG
324 CATGG
* *
7304 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* *
7367 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
7432 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
7497 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGATGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * *
7562 AGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
7627 CATGG
324 CATGG
* *
7632 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* **
7697 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
7732 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 992, Mismatches: 76, Indels: 24
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
324 9 0.01
325 281 0.28
326 10 0.01
327 307 0.31
328 380 0.38
329 5 0.01
ACGTcount: A:0.29, C:0.19, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
TGG
Found at i:7808 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 7632--7831 Score: 330
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
7622 TGAGACATGG
* *
7632 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
7697 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
7732 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* **
7796 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
7832 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 6, Indels: 2
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 92 0.99
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.29, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:8134 original size:427 final size:427
Alignment explanation
Indices: 7304--8574 Score: 2114
Period size: 427 Copynumber: 3.0 Consensus size: 427
7294 TGAGACATGG
* * * *
7304 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGGATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATGG
* * *
7368 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
7433 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
*
7498 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGATGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
* * *
7563 GCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
*
7628 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
7693 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
389 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
7732 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
7797 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
7862 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTG-GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
7927 TA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
7991 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* *
8056 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
8121 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
390 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
* *
8159 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
8224 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
8289 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
8354 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGGCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
8419 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* * *
8484 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* *
8549 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGC
390 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGC
8575 GCCGGATCCC
Statistics
Matches: 786, Mismatches: 53, Indels: 8
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 405 0.52
428 381 0.48
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (427 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
GGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:8235 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 8059--8258 Score: 321
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
8049 TGAGACATGG
* *
8059 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
*
8124 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
* * *
8159 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-CAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
8223 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
8259 CAGAACTCCG
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 91 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.20, G:0.28, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
Found at i:8844 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 8159--9566 Score: 2277
Period size: 328 Copynumber: 4.3 Consensus size: 328
8149 CGCATCCCAT
* * * *
8159 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
8224 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
8289 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
8354 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGGCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
8419 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
*
8484 TGA
326 TGG
*
8487 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
8552 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
8617 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGCCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
8681 GATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
8746 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
8811 TGG
326 TGG
* *
8814 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
8878 GTGCGATCATACCAGCACCAATGTACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
8943 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
9005 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACTAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
*
9070 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
9135 ATGG
325 ATGG
* * *
9139 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
9204 TCCGATCATACCAGCACAAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
9269 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
9334 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
9399 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
9464 TGG
326 TGG
*
9467 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
9532 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
9567 GCCCAAAAGG
Statistics
Matches: 994, Mismatches: 80, Indels: 12
0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
324 3 0.00
325 293 0.29
326 4 0.00
327 301 0.30
328 393 0.40
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.24, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
TGG
Found at i:9643 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 9467--9666 Score: 339
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
9457 TGAGACATGG
* *
9467 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
9532 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
9567 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* *
9631 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
9667 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 94, Mismatches: 5, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 93 0.99
ACGTcount: A:0.31, C:0.18, G:0.29, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:9942 original size:428 final size:425
Alignment explanation
Indices: 9139--10422 Score: 2118
Period size: 428 Copynumber: 3.0 Consensus size: 425
9129 TGAGACATGG
* * *
9139 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAA-GATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
9204 TCCGATCATACCAGCACAAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG-GCG
* *
9269 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
129 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
9334 TATTTTTTAACCTCGTCGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
9399 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAG-TAAATACAAACCCGTGAGACA
9464 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
323 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
9529 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
388 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
9567 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAA-GATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
9632 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAACGTGCTTAGGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GGCG
* * *
9697 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
129 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
9762 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
9827 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAGATATAAACCCGTGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAA-ATACAAACCCGTGAGACA
*
9892 TGGGCTCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
323 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
9957 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAA
388 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
* * *
9995 GCCCACAAGGGTGATAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAG-ATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
10060 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAATTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT-GGCG
*
10125 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
129 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
10190 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
10255 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGT-AAATACAAACCCGTGAGACA
* * *
10320 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
323 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * *
10385 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCAT
388 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
10423 CAAAACTCCG
Statistics
Matches: 798, Mismatches: 54, Indels: 8
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 4 0.01
428 791 0.99
429 3 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (425 bp):
GCCCAAAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGCGAG
AGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTA
TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGCC
TTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAATACAAACCCGTGAGACATGG
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:10071 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 9898--10093 Score: 322
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
9888 GACATGGGCT
* *
9898 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
*
9963 GATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAAGCC
66 GATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAAGCC
* *
9998 CACAAGGGTGATAGAGCGAGAAAGTAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTG
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTG
*
10062 CGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
65 CGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
10094 TCAGAATTCC
Statistics
Matches: 89, Mismatches: 6, Indels: 2
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 88 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.18, G:0.29, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
GATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAAGCC
Found at i:10590 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 9995--11399 Score: 2220
Period size: 328 Copynumber: 4.3 Consensus size: 328
9985 CGCATCCCAA
* * * * *
9995 GCCCACAAGGGTGATAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
10060 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAATTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
10125 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
10190 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
10255 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
*
10320 CGG
326 TGG
*
10323 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
10388 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * * *
10452 AGAGTAGTACTAGGATCGGCGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
10517 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
10582 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
10647 TGG
326 TGG
*
10650 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
10714 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
10779 GAAAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC---TT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
10839 TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTTTCGCAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGGAA
*
10902 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
10967 CATGG
324 CATGG
* **
10972 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATAGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* *
11035 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
11100 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
11165 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * *
11230 AGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
11295 CATGG
324 CATGG
* *
11300 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* **
11365 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
11400 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 986, Mismatches: 76, Indels: 30
0.90 0.07 0.03
Matches are distributed among these distances:
321 8 0.01
322 278 0.28
323 10 0.01
325 4 0.00
327 309 0.31
328 372 0.38
329 5 0.01
ACGTcount: A:0.29, C:0.19, G:0.24, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
TGG
Found at i:11476 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 11300--11499 Score: 330
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
11290 TGAGACATGG
* *
11300 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
11365 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
11400 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* **
11464 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
11500 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 6, Indels: 2
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 92 0.99
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.29, T:0.21
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:11775 original size:428 final size:428
Alignment explanation
Indices: 10972--12683 Score: 2861
Period size: 428 Copynumber: 4.0 Consensus size: 428
10962 TGAGACATGG
* * * ** *
10972 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGGATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATAGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATGC
* ** *
11036 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
11101 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAG-AAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
130 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCT-GTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
* *
11165 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGGAA
* * *
11230 AGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
*
11295 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
324 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
*
11360 ATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
389 ATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
* *
11400 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
11465 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
11530 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
11595 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
11660 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* *
11725 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
11790 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
391 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
11828 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
* * *
11893 TGCGATCATACCAGCACTAATGCCCCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAACGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
11958 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
12023 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
12088 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGTTGACGTTTAATCGAGTAAGATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
*
12153 TGGGCTCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
12218 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAA
391 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
12256 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
* * *
12321 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGCTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
** * * *
12386 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* *
12451 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
12516 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* * *
12581 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * *
12646 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCAT
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TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
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11718 TGAGACATGG
* *
11728 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
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* * *
11828 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-CAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
* * *
11892 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCCCCGGATCCCAT
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GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
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12149 GACATGGGCT
* *
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1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
*
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*
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*
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Statistics
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CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
GATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAAGCC
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12246 CGCATCCCAA
* * * *
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* *
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*
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131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
12451 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
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* * *
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*
12581 CGG
325 TGG
*
12584 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
12649 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
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* * *
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* *
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* *
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325 TGG
* *
12911 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
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* * *
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* * *
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* * *
13102 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACTAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
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*
13167 GCCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
13232 ATGA
324 ATGG
* * * * *
13236 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTTTTTTTAGTTTGTTATGGAAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
13301 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
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* * * * *
13366 AGAGTAGTACTAGGATTGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
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*
13431 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAAAG
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* * * *
13496 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
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13560 ATGG
324 ATGG
* * *
13564 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
13629 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGACG
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* * * *
13694 AGAGTTGTTCTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
13759 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
13824 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
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325 TGG
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1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
13956 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCTTCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
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* * *
14021 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACTTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
14086 TTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAA
* * * * *
14151 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
14216 ATGG
324 ATGG
* * *
14220 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
14285 TGCGATCTTACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
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* * *
14349 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
14414 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAA-AATTTCGGAAAG
* *
14479 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
14544 TGG
325 TGG
* * * *
14547 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
14612 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
14677 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
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*
14742 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* * *
14807 CCTTATTAACTAAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
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14872 TGG
325 TGG
* * * *
14875 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * * *
14940 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
15005 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
15070 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
15135 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
15200 TGG
325 TGG
* * * *
15203 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
15268 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
15333 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
15398 TATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAAAG
* * * * *
15463 CCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
15528 TGA
325 TGG
* * * * * *
15531 GCCCACAAGGGTGACAGATCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
** * * *
15596 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTTGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
15661 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
15726 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTCATGAAAAATTTTCGCAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* * *
15791 CCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
15856 GGG
325 TGG
* * * * * *
15859 GCCCATAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
15924 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
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* * * * *
15988 GAGAGCAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * *
16052 TGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAA
*
16117 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGGGAC
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**
16182 ATAA
324 ATGG
*
16186 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAAGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
16250 GTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
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* *
16315 GAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * * * * *
16379 TTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGACTCATATAATGTCATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAA
* * *
16444 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
16509 ATGG
324 ATGG
* *
16513 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
16578 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
16643 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
16708 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
*
16773 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
16838 TGA
325 TGG
* *
16841 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTACGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
16906 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
16971 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
17036 TA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* *
17100 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
17165 TGG
325 TGG
*
17168 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * *
17233 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
17297 AGAGTAGTACTATGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
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*
17361 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAA
*
17426 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTACAT-GAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
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323 CATGG
*
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* * * * *
17559 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGTGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
17623 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
17688 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * * *
17753 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
17818 CATGA
323 CATGG
* * * * *
17823 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
17888 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
17953 ACAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
18018 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAACTTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAAAG
* * * * *
18083 CCTTATTAACTAAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
18148 TGG
325 TGG
*
18151 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
18216 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
18280 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
18345 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
18410 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
18475 TGG
325 TGG
*
18478 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * * *
18542 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
18606 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTATTTT-AT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCT-TTTTAAT
* * * * * *
18670 TTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGA
193 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGA
* * * *
18735 AAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
257 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
18800 ACATGA
322 ACATGG
*
18806 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
18871 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGCCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
18936 AGAGTAGTACTAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
19001 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGT-TGAAAAATTTTCGGAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATGAAAAA-TTTCGGAAA
* *
19065 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
19130 ATGG
324 ATGG
*
19134 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
19199 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGGTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
19263 AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
131 AGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
*
19327 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAA
* *
19392 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
19457 ATGA
324 ATGG
*
19461 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * *
19525 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
19589 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
19654 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * * *
19719 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
19784 CATGA
323 CATGG
* * * * * *
19789 GCCCACAAGGGTGACTAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAG
1 GCCCACAAGGGTGAC-AGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* *
19854 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
19919 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
19984 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGT-TGAAAAATTTTCGGAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATGAAAAA-TTTCGGAA
* * *
20048 AGCCTTATTAACTGAAAAAAATCGAATCAGCTGACG-TTAATTGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
258 AGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
20112 ACATGG
322 ACATGG
*
20118 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * *
20183 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
20247 AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
131 AGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
20311 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGTAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAA
*
20376 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT-AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
20441 CATGA
323 CATGG
20446 GCCCACAA-GGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * *
20509 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
20574 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
*
20639 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAA-TTTCGGAA
* * * *
20703 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCATGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
20768 CATGG
323 CATGG
*
20773 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
20838 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
20902 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
20967 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
21032 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
21097 TGG
325 TGG
* *
21100 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGCAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * *
21164 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
21228 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
21293 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * *
21358 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
21423 CATGA
323 CATGG
*
21428 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
21493 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGCCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
21558 AGAGTAGTACTAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
21623 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGT-TGAAAAATTTTCGGAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATGAAAAA-TTTCGGAAA
* *
21687 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
21752 ATGG
324 ATGG
*
21756 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * *
21821 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
21885 AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
131 AGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
21949 TTATTTTTGAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCAGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAA
* *
22014 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
22079 ATGG
324 ATGG
*
22083 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * *
22147 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
22211 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
22276 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * * *
22341 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
22406 CATGA
323 CATGG
* * * * * *
22411 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
22476 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
22541 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
22606 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* * * * *
22671 CCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
22736 TGG
325 TGG
* *
22739 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
22804 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
22869 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
22934 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
*
22999 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
23064 TGA
325 TGG
*
23067 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
23132 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
23197 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * * *
23262 TATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAAAG
* * * *
23327 CCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
23392 TGA
325 TGG
*
23395 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
23460 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
23494 AGCCCACGAG
Statistics
Matches: 9976, Mismatches: 835, Indels: 198
0.91 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
324 9 0.00
325 283 0.03
326 97 0.01
327 3169 0.32
328 6104 0.61
329 295 0.03
330 19 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (327 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
GG
Found at i:14618 original size:655 final size:654
Alignment explanation
Indices: 12256--23493 Score: 17187
Period size: 655 Copynumber: 17.2 Consensus size: 654
12246 CGCATCCCAA
* * * *
12256 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
12321 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGCTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
12386 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
12451 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* * *
12516 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
12581 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* * *
12646 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
12711 GCGAGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGCCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
12775 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCGGA
* *
12840 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
12905 ACATGG
649 ACATGG
* *
12911 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
12975 GTGCGATCATACCAGCACCAATGTACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
13040 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * *
13102 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACTAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAA
*
13167 GCCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * * *
13232 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTTTTTTTAGTTTGTTATGG-AAAAAGGGG
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAA-GGG
* *
13296 ATGCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
388 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
* * * * *
13361 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATTGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTA
453 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
13426 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAA-TTTC
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAA-AATTTTC
* * * *
13490 GGAAAGCCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
581 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
13554 TGAGACATGG
645 TGAGACATGG
* * *
13564 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
13629 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGACG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
13694 AGAGTTGTTCTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
13759 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
13824 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
13889 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* * *
13954 GGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCTTCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
14019 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACTTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
14084 TTTTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAAT-TTATGAAAAATTTTCGGA
* * * * *
14149 AAGCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
14214 ACATGG
649 ACATGG
* * *
14220 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
14285 TGCGATCTTACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
14349 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
14414 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAA-AATTTCGGAAAG
* *
14479 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
14544 TGGGCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* ** * * *
14609 GGGTGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
14674 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
14739 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCGGA
* * *
14804 AAGCCTTATTAACTAAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
14869 ACATGG
649 ACATGG
* * * *
14875 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * * *
14940 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
15005 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
15070 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
15135 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
15200 TGGGCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* ** * * *
15265 GGGTGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
15330 GCGAGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
15395 TTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATG-AAAATATTTCGG
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAAT-TTTCGG
* * * * *
15459 AAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
15524 GACATGA
648 GACATGG
* * * * * *
15531 GCCCACAAGGGTGACAGATCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
** * * *
15596 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTTGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
15661 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
15726 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTCATGAAAAATTTTCGCAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* * *
15791 CCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * * * *
15856 GGGGCCCATAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* *
15921 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * * * *
15985 GGCGAGAGCAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * *
16049 TTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGG
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCGG
*
16114 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGG
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
**
16179 GACATAA
648 GACATGG
*
16186 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAAGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
16250 GTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
16315 GAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * * * * *
16379 TTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGACTCATATAATGTCATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAA
* * *
16444 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
16509 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGA
* *
16574 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * *
16639 AGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAT
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * *
16704 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGT
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCGG
*
16769 AAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
16834 GACATGA
648 GACATGG
* *
16841 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTACGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
16906 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
16971 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
17036 TA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* *
17100 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
17165 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* ** * *
17230 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
17295 GC-AGAGTAGTACTATGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAA
455 GCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* *
17358 TTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCGG
*
17423 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTACAT-GAGTAAAATATAAACCCGTG
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA-ATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
17487 AGACATGG
647 AGACATGG
*
17495 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * * *
17559 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGTGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
17623 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
17688 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * * *
17753 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* * * * * *
17818 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGG
323 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGG
* *
17883 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTT
388 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
* *
17948 AGGCGACAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
453 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
* *
18013 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAACTTTTCG
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCG
* * * * *
18078 GAAAGCCTTATTAACTAAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCATG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
18143 AGACATGG
647 AGACATGG
*
18151 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
18216 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
18280 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
18345 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
18410 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
18475 TGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* * * * *
18540 GGGCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTA
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
*
18604 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTATTTT-
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCT-TTTTA
* * * *
18668 ATTTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTAT-TAAAATATTTC
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAAT-TTTC
* * * * *
18732 AGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
581 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
*
18797 GAGACATGA
646 GAGACATGG
*
18806 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
18871 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGCCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
18936 AGAGTAGTACTAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
19001 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGT-TGAAAAATTTTCGGAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATGAAAAA-TTTCGGAAA
* *
19065 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
19130 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGA
* ** * * *
19195 TGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGGTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
*
19260 GGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
* *
19323 ATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCG
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCG
* *
19388 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
*
19453 AGACATGA
647 AGACATGG
*
19461 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * *
19525 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
19589 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
19654 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * * *
19719 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* * * * * *
19784 CATGAGCCCACAAGGGTGACTAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGG
323 CATGGGCCCACAAGGGTGAC-AGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGG
* * *
19849 GATAGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACT
387 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* *
19914 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTT
452 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
*
19979 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGTTGAAAAATTTTC
517 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-ATGAAAAATTTTC
* * *
20044 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAAATCGAATCAGCTGACG-TTAATTGAGTAAAATACAAACCCG
581 GGAAAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
20108 TGAGACATGG
645 TGAGACATGG
*
20118 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * *
20183 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
20247 AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
131 AGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
20311 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGTAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAA
*
20376 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT-AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* *
20441 CATGAGCCCACAA-GGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGG
323 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGG
* * *
20505 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTT
388 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
*
20570 AGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
453 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
* *
20635 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTTTGGAAAAATTTTCG
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTAT-GAAAAATTTTCG
* * * *
20700 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCATG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
20765 AGACATGG
647 AGACATGG
*
20773 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
20838 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
20902 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
20967 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
21032 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
21097 TGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGCAGTTTGTTATGGCAGAAAGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* * * *
21162 GGGCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
21226 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * * *
21291 TTTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTAT-TAAAATATTTCA
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAAT-TTTCG
* * * *
21355 GAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
*
21420 AGACATGA
647 AGACATGG
*
21428 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
21493 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGCCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
21558 AGAGTAGTACTAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
21623 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGT-TGAAAAATTTTCGGAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATGAAAAA-TTTCGGAAA
* *
21687 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
21752 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGA
* ** * *
21817 TGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
*
21882 GGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
* * *
21945 ATTTTTATTTTTGAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCA
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCG
* *
22010 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
22075 AGACATGG
647 AGACATGG
*
22083 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * *
22147 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
22211 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * *
22276 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * * *
22341 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* * * * * *
22406 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGG
323 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGG
* * *
22471 ATAGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTT
388 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
* *
22536 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTA
453 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
22601 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCG
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAATTTTCG
* * * * *
22666 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGTG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
22731 AGACATGG
647 AGACATGG
* *
22739 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
22804 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
22869 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
22934 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
*
22999 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
23064 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* * * *
23129 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
23194 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * *
23259 TTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTAT-TAAAATATTTCAG
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTATGAAAAAT-TTTCGG
* * * *
23323 AAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
23388 GACATGA
648 GACATGG
*
23395 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
23460 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
23494 AGCCCACGAG
Statistics
Matches: 9671, Mismatches: 826, Indels: 171
0.91 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
651 3 0.00
652 288 0.03
653 302 0.03
654 751 0.08
655 4449 0.46
656 3523 0.36
657 334 0.03
658 21 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (654 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATG
GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTATGAAAAATTTTCGGAAA
GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
ATGG
Found at i:14681 original size:983 final size:981
Alignment explanation
Indices: 12256--23493 Score: 17173
Period size: 983 Copynumber: 11.4 Consensus size: 981
12246 CGCATCCCAA
* * * *
12256 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGTATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
12321 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGCTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
12386 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTT
* *
12451 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* * *
12516 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * *
12581 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
324 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* * * *
12646 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
12711 GCGAGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGCCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
12775 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGGA
* *
12840 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
12905 ACATGGGCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGG
649 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GG
* * *
12970 GGTGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGTACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
713 GGTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* * *
13035 TGGGCGAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTT
778 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
* *
13099 --TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACTAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTC
843 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTC
* * *
13162 GCAAAGCCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
908 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
*
13227 GAGACATGA
973 GAGACATGG
* * * * *
13236 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTTTTTTTAGTTTGTTATGGAAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
13301 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
13366 AGAGTAGTACTAGGATTGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CATCTTTTTAATTTT
13431 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAA-AATTTCGGAAAG
* * * *
13496 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * * *
13560 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAATGGGA
323 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGA
*
13625 TGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
* * * * *
13690 GACGAGAGTTGTTCTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * *
13755 TTTTTCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGA
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGG
* *
13820 AAAGCTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
13885 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATG
648 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-G
* * *
13950 GGGTGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCTTCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
712 GGGTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* * *
14015 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACTTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTT
777 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* * *
14080 TAATTTTTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTT
842 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTT
* * * * * * *
14145 CGCAAAGCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCG
907 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
14210 TGAGACATGG
972 TGAGACATGG
* * *
14220 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
14285 TGCGATCTTACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
14349 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACC-CATCTTTTTAATTTT
*
14414 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAA-AATTTCGGAAAG
* *
14479 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * *
14544 TGGGCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
324 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* ** * *
14609 GGGTGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
*
14674 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
14739 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGGA
* * *
14804 AAGCCTTATTAACTAAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * *
14869 ACATGGGCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGG
649 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGG
* * ** * * *
14934 GATGGGTGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCT
713 GGTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* *
14999 TGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
778 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
* *
15064 AATTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
843 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTC
*
15129 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGT
908 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
15194 GAGACATGG
973 GAGACATGG
* * * *
15203 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * * *
15268 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
15333 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTT
* *
15398 TATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAA-ATTTCGGAAAG
* * * * *
15463 CCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * * * *
15528 TGAGCCCACAAGGGTGACAGATCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGAT
324 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
** * * * *
15593 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTTG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
*
15658 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
15723 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTCATG-AAAAATTTTCG
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTT-ATGAAAAAATTTT-G
* * * *
15786 CAAAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * * *
15851 AGACAGGGGCCCATAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAA
647 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAA
* * * *
15916 GAGCTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGT
711 GGGGTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGT
* * * * *
15980 GCTTGGGCGAGAGCAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTT
775 GCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTT
* * * *
16044 TTTAATTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGT
840 TTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATT
*
16109 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
905 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
* **
16174 CGTGGGACATAA
970 CGTGAGACATGG
*
16186 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAAGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * * *
16250 GTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
16315 GAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCATCTTTTTAATTTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCATCTTTTTAATTTT
* * * * * * *
16380 TATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGACTCATATAA-TGTCATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACT-TTATGAAAAA-TTTCGGAAA
* * *
16444 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
258 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * *
16509 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGA
323 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGA
*
16574 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
* * *
16639 AGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAT
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * *
16704 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGT
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGG
*
16769 AAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * *
16834 GACATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTACGGCAAAAGG
648 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* *
16899 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGC
713 GG-TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
*
16964 TTAGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
777 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
*
17029 TAATTTTTA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTT
842 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTT
*
17093 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCG
907 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
17158 TGAGACATGG
972 TGAGACATGG
*
17168 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
17233 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAA-CCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGC-ACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
17297 -AGAGTAGTACTATGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATT
130 GAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATT
* *
17360 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
193 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATG-AAAAATTTCGGAA
*
17425 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTACAT-GAGTAAAATATAAACCCGTGAG
257 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA-ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * *
17489 ACATGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGG
321 ACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGG
* * * *
17554 GATGGGCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGTGTGC
386 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGC
*
17618 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
450 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* * * * * *
17683 TTATTTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTT
515 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTT
** * * * * *
17748 CAGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCG
580 TGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
* * * * *
17813 TGAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAA
645 TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAA
* * *
17878 ATGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCG
710 A-GGGGTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCG
* *
17943 TGCTTAGGCGACAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCT
774 TGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCT
* *
18008 TTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAACT
839 TTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT
* * *
18073 TTTCGGAAAGCCTTATTAACTAAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAC
904 TTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAAC
*
18138 CCATGAGACATGG
969 CCGTGAGACATGG
*
18151 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
18216 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
18280 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTT
* * *
18345 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
18410 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
18475 TGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGGAT
324 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* * * *
18540 GGGCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTA
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
*
18604 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTATTTT-
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCT-TTTTA
* * * * * **
18668 ATTTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCA
517 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTG
* * * *
18733 GAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* *
18798 AGACATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
647 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
* *
18863 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTG
712 GGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* * *
18928 CTTAGCCGAGAGTAGTACTAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
776 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
18993 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGT-TGAAAAATT
841 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATGAAAAATT
*
19057 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACC
905 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
19122 CGTGAGACATGG
970 CGTGAGACATGG
*
19134 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
19199 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAA-CCCATCAAAACTCCGCAGGTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGC-ACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
19263 -AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATT
130 GAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATT
* *
19326 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
193 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATG-AAAAATTTCGGAA
* *
19391 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
257 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* *
19456 CATGAGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGG
322 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGG
* * *
19521 ATGGGCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCT
387 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCT
*
19585 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
451 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
* * * * * * *
19650 TATTTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTC
516 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTT
* * * * * *
19715 AGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGT
581 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
* * * * *
19780 GAGACATGAGCCCACAAGGGTGACTAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAA
646 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGAC-AGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAA
* * *
19845 ATGGGATAGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCA
710 A-GGGGTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCG
* * *
19910 TACTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCT
774 TGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCT
19975 TTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGT-TGAAAAA
839 TTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT-TATGAAAAA
* *
20039 TTTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAAATCGAATCAGCTGACG-TTAATTGAGTAAAATACAA
903 TTTTCGGAAAGCCTTATTAACTG-AAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAA
20103 ACCCGTGAGACATGG
967 ACCCGTGAGACATGG
*
20118 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
20183 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAA-CCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGC-ACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
20247 -AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATT
130 GAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATT
* * *
20310 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGTAA
193 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATG-AAAAATTTCGGAA
*
20375 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
257 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT-AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
20440 ACATGAGCCCACAA-GGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGG
321 ACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGG
* * * *
20504 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCT
386 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCT
*
20569 TAGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
451 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
* * *
20634 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAA-TTTTTGGAAAAATTTT
516 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTT
* * * *
20698 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCA
581 -GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
*
20763 TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAA
645 TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAA
* * *
20828 AGGGGATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCG
710 AGGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCG
* *
20893 TGCTTGGGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCT
774 TGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCT
* *
20957 TTTTAATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA
839 TTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT
*
21022 TTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAAC
904 TTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAAC
21087 CCGTGAGACATGG
969 CCGTGAGACATGG
* *
21100 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGCAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * * *
21164 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
21228 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATT
* * * * *
21293 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
193 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * *
21358 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
257 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* *
21423 CATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
322 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGG
** *
21488 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTT
387 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTT
* * *
21553 AGCCGAGAGTAGTACTAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
452 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
*
21618 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTGTTG-AAAAATTTT
517 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTT-ATGAAAAAATTTT
* *
21681 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCG
581 -GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
*
21746 TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAA
645 TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAA
* ** * *
21811 AGGGGATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCG
710 AGGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCG
*
21876 TGCTTGGGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATC
774 TGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC
*
21939 TTTTTAATTTTTATTTTTGAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA
838 TTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA
* * *
22004 ATTTCAGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAA
903 TTTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAA
22069 CCCGTGAGACATGG
968 CCCGTGAGACATGG
*
22083 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * * *
22147 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
22211 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATT
* * * * *
22276 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
193 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAA-ATTTCGGAA
* * * * *
22341 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
257 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* * * * *
22406 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGG
322 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGG
* * * *
22471 ATAGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTT
387 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTT
* *
22536 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTA
452 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
*
22601 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTTC
517 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTT-
* * * * *
22665 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGT
581 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
* *
22730 GAGACATGGGCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
646 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
* *
22795 GGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGT
711 GGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGT
* * *
22860 GCTTCGGCGAGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTT
775 GCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTT
* * *
22925 TTTAATGTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAAT
840 TTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATT
* * *
22990 TTCGTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
905 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
*
23055 CGTGAGACATGA
970 CGTGAGACATGG
*
23067 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
23132 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACC-AGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGA-ATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
23196 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
23261 TTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAA-ATTTCGGAAA
* * * *
23326 GCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
258 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
23391 ATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
323 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGA
* *
23456 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCA
23494 AGCCCACGAG
Statistics
Matches: 9587, Mismatches: 605, Indels: 128
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
979 3 0.00
980 460 0.05
981 395 0.04
982 1756 0.18
983 4591 0.48
984 2317 0.24
985 65 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (981 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAATTTCGGAAAGCC
TTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATG
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGG
GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGC
GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGGAAA
GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGT
GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
ACATGG
Found at i:23571 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 23394--23593 Score: 337
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
23384 GTGAGACATG
* * * *
23394 AGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
23459 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
66 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
*
23494 AGCCCACGAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
23559 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
66 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
23594 TCAGAACTCC
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 7, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
100 93 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.20, G:0.29, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
Found at i:23863 original size:428 final size:428
Alignment explanation
Indices: 23066--23921 Score: 1367
Period size: 428 Copynumber: 2.0 Consensus size: 428
23056 GTGAGACATG
* * * *
23066 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
23131 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGC
66 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGC
* * *
23196 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATTT
131 GAGAGTAGTACAAAGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
23261 TTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAA
196 TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAA
* * * *
23326 GCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 GCCTAATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGAC
* *
23391 ATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
326 ACGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
23456 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
391 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
*
23494 AGCCCACGAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
* *
23559 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACC-GAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
66 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAG-ATCACATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGG
* *
23623 CGAGAGTATTACAAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
130 CGAGAGTAGTACAAAGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
23688 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTTTTGAAAA-ATTTTCGG
195 TTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATT-AAAATA-TTTCAG
* * *
23751 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGA
258 AAAGCCTAATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGA
* *
23816 GACACGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGG
323 GACACGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* * * *
23881 GGATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCA
388 GGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
23922 TCAAAACTCC
Statistics
Matches: 392, Mismatches: 33, Indels: 6
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 7 0.02
428 385 0.98
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (428 bp):
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGC
GAGAGTAGTACAAAGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAA
GCCTAATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGAC
ACGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
Found at i:24825 original size:328 final size:328
Alignment explanation
Indices: 23495--24900 Score: 2238
Period size: 328 Copynumber: 4.3 Consensus size: 328
23485 CGCATCCCAA
* * *
23495 GCCCACGAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
23560 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
23625 AGAGTATTACAAAGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
23690 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
23755 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
*
23820 CGG
326 TGG
* *
23823 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
23888 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * * *
23952 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
24017 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
24082 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
24147 TGG
326 TGG
* *
24150 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
24214 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
24279 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC--TTT--TTT
130 GAGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * *
24340 TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATAAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
*
24404 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
24469 ATGG
325 ATGG
* *
24473 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAAG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* *
24536 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
24601 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
24666 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
* * *
24731 AGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
24796 CATGG
324 CATGG
* *
24801 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAG-TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* **
24865 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
24901 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 991, Mismatches: 74, Indels: 26
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
322 3 0.00
323 283 0.29
324 9 0.01
325 3 0.00
326 4 0.00
327 307 0.31
328 382 0.39
ACGTcount: A:0.29, C:0.19, G:0.24, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACAAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
TGG
Found at i:24978 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 24805--25000 Score: 313
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
24795 ACATGGGCCT
* * *
24805 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
1 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
24870 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
66 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
*
24905 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
* **
24969 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
25001 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 87 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.18, G:0.29, T:0.22
Consensus pattern (100 bp):
ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:25328 original size:428 final size:428
Alignment explanation
Indices: 24473--25316 Score: 1379
Period size: 428 Copynumber: 2.0 Consensus size: 428
24463 TGAGACATGG
* * * *
24473 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAAGATTTGTAGTTTGTTATTGGAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATAAGAGTTGTAGTTTGTTATTGGAAAAGGGGATGGG
**
24538 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
* * *
24603 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
24668 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
24733 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
* * *
24798 TGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
24863 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
391 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
24901 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATAAG-AGTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAAGGGGATG
* *
24964 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAG
*
25029 CGAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCT-GTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
129 CGAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTAG-AAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
* * *
25093 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTA
193 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* * *
25158 AAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
258 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAG
* *
25223 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGG
323 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* *
25288 GATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGC
388 GATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGC
25317 GCCGGATCCC
Statistics
Matches: 384, Mismatches: 29, Indels: 6
0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 6 0.02
428 378 0.98
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (428 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATAAGAGTTGTAGTTTGTTATTGGAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
TGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:25496 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 24901--25655 Score: 1188
Period size: 327 Copynumber: 2.3 Consensus size: 328
24891 CACATCCCAT
* * * *
24901 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
24966 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
25031 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* * * * *
25096 TATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
25161 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
25226 TGG
326 TGG
* *
25229 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
25294 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
25358 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
25423 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
25488 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
25553 TGG
326 TGG
* * *
25556 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* **
25621 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
25656 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 388, Mismatches: 39, Indels: 1
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
327 269 0.69
328 119 0.31
ACGTcount: A:0.29, C:0.19, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
TGG
Found at i:25596 original size:755 final size:754
Alignment explanation
Indices: 24150--27167 Score: 3464
Period size: 755 Copynumber: 4.0 Consensus size: 754
24140 TGAGACATGG
* * *
24150 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * * *
24214 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
24279 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAG-GAAGTCCTCTTGTTGCACCCC-A-TCTTT--TT
130 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCT-GTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
* *
24339 TTT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTTTCGCA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGTA
* *
24402 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
258 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * *
24467 ACATGGGCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAAG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAAT
323 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAG
*
24530 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTG
386 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* * * * *
24595 CTTGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
451 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCATCTTT
*
24660 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTT
515 TTAATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTT
24725 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACC
580 T-GGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACC
*
24790 GTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAA
644 GTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAA
24855 AAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
709 AAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
* *
24901 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
24966 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
25031 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* *
25096 TATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGTAAAG
*
25161 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
25226 TGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* *
25291 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
391 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
25356 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
456 GCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
*
25420 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
520 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTT-GGA
*
25485 AAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAG
*
25550 ACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGG
649 ACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
25615 GATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
714 GATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
25656 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
25721 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
25786 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
25851 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGTAAAG
*
25916 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* **
25981 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * **** * *
26046 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCATGCCCACAAGGGTGACAG---AGCGAGA
391 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT---CAAAACTCCG-CAGTTAAGCGTGC
** ** * ** * * * * * **
26108 AAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGG-G-GATGCGTGCGATCA-TACCAGCACTAAT
452 TTGG-GCG-AG-AGTAG--TACTA-GG---ATGGTGAGCT-CCTGGGA--AGT-CC-TC-CTGTT
** *** * ** ****** * * * * * *
26170 GCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTT-AA--GCG-T-G-CTTAGG-CGA-GAGT-A-TTACT
502 GCACCCCATCTTTTTA-ATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAAT
*** ** ** * * * ** * * * *
26225 AGGATGGGTGACCTCTTGGGAAG--TT-CT--CGTGTTG-CACC---CCATCT---TTTTAAT--
566 TTTAT--GAAAAATTTTGGAAAGCCTTATTAAC-TGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCG
** ** * * ** * * ** * ***
26276 TTTTATTTTTC-AACCTCGTTG-GATTTGGG-TTGAC--GAGCCACATAATTTTATGAAA--A--
628 AGTTA-AATACAAAAC-CG-TGAGACATGGGCCT-ACAAGGGTGACA-GA-GCGA-GAAAGGATG
* * * * ** ** * * * * * * **
26332 A-ATTTCGGAAAGCCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAAT-CGAGTAAAATAT
686 ATATTT--G-TAG-TTTGT-TA-TGGCAAAAGGGGAT-GGGTG-CG-ATAATACCAGCACTA-AT
** * **
26395 AAACC-CGTGAGACAT
741 GCACCACAT--CCCAT
26410 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
1 --GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * *
26475 CGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * * * * *
26540 CGAGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
* * *
26605 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGTAA
* * * *
26670 AGCCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
26734 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGG
323 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* * *
26799 GATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCT
388 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* * * *
26864 TGGGCGAGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
453 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATG-GTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCATCTTTTT
* * * *
26929 AATTTTTCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTT
517 AATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTT
* * * * * * * *
26994 GAAAAGCTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCGGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGT
581 GGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGT
* *
27059 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
646 GAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
* * **
27124 TGGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCAT
711 -GGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
27168 CAAAACTCCG
Statistics
Matches: 1882, Mismatches: 284, Indels: 195
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
743 4 0.00
744 18 0.01
745 2 0.00
746 13 0.01
747 13 0.01
748 23 0.01
749 19 0.01
750 20 0.01
751 170 0.09
752 28 0.01
753 24 0.01
754 6 0.00
755 727 0.39
756 640 0.34
757 11 0.01
758 10 0.01
759 18 0.01
760 21 0.01
761 11 0.01
762 12 0.01
763 21 0.01
764 22 0.01
765 14 0.01
766 12 0.01
767 1 0.00
768 18 0.01
769 4 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (754 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGTAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
GCGAGAGTAGTACTAGGATGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTGGAAA
GCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGAC
ATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:25733 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 25560--25746 Score: 322
Period size: 100 Copynumber: 1.9 Consensus size: 100
25550 ACATGGGCCT
* *
25560 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
25625 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
66 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
*
25660 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
*
25724 GATCATACCAGCACTAATGCACC
65 GATAATACCAGCACTAATGCACC
25747 GGATCCTATC
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 4, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 81 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.29, T:0.22
Consensus pattern (100 bp):
ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:26030 original size:428 final size:428
Alignment explanation
Indices: 25229--26511 Score: 2113
Period size: 428 Copynumber: 3.0 Consensus size: 428
25219 TGAGACATGG
* * * *
25229 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
25294 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
25358 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
25423 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
25488 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
25553 TGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
25618 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
391 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
25656 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
25721 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
25786 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
25851 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
25916 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
25981 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
26046 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
391 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
* *
26084 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
26149 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
26214 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
26279 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
26344 CCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
26409 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
* *
26473 TGCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGA-ATCCCAT
390 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACC-ACATCCCAT
26512 CAGAACTCCG
Statistics
Matches: 793, Mismatches: 60, Indels: 5
0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 120 0.15
428 673 0.85
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (428 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:26160 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 25984--26183 Score: 321
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
25974 TGAGACATGG
* *
25984 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
*
26049 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
* * *
26084 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-CAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
26148 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
26184 CAGAACTCCG
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 91 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.20, G:0.28, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
Found at i:26681 original size:328 final size:328
Alignment explanation
Indices: 26084--29453 Score: 5237
Period size: 328 Copynumber: 10.3 Consensus size: 328
26074 CGCATCCCAT
* * * *
26084 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
26149 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
26214 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
26279 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
26344 CCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
26409 TGA
326 TGG
* * *
26412 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
26477 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
26542 AGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
26607 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
26672 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
26736 ATGG
325 ATGG
* *
26740 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
26805 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
26870 AGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
26935 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
27000 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCGGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
27065 TGG
326 TGG
27068 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
27132 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
27197 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
27262 TTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
27327 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
27392 ATGG
325 ATGG
* * *
27396 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
27461 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
27525 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
27590 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
27655 CCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
27719 ATGG
325 ATGG
* *
27723 GCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
27788 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
27853 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
27918 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
27983 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
28048 TGG
326 TGG
* * * *
28051 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
28116 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
28181 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
28245 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
28310 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
28375 CGG
326 TGG
* *
28378 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTATAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
28443 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
28507 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
28572 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
28637 CCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
28702 ATGG
325 ATGG
*
28706 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
28770 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
28835 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC---TT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
28895 TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTTTCGCAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGGAA
* *
28958 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
29023 CATGG
324 CATGG
* *
29028 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* * *
29091 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT-CCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
29155 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
29219 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * *
29284 AGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
29349 CATGG
324 CATGG
* * *
29354 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* **
29419 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
29454 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 2787, Mismatches: 231, Indels: 49
0.91 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
321 85 0.03
322 137 0.05
323 71 0.03
324 5 0.00
325 9 0.00
326 251 0.09
327 639 0.23
328 1533 0.55
329 57 0.02
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGG
Found at i:27812 original size:655 final size:655
Alignment explanation
Indices: 26087--29453 Score: 5215
Period size: 655 Copynumber: 5.1 Consensus size: 655
26077 ATCCCATGCC
* * * * *
26087 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
* *
26152 GATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCGAGA
66 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
* * *
26217 GTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTAT
131 GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTAT
* * * *
26282 TTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCT
196 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAGCCT
* *
26347 TATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGA
261 TATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGG
* * *
26412 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
326 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
26477 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
391 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
26542 AGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
456 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTG-GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
26607 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAAAG
520 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
26672 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
585 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
26736 ATGGGCC
649 ATGGGCA
*
26743 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
* *
26808 GATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
66 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
* * * * *
26873 GTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTCT
131 GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTAT
* * *
26938 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAGCTT
196 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAGCCT
* *
27003 TATTAACTGAAAAAACCGAATCGGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGG
261 TATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGG
27068 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
326 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
*
27132 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
390 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
27197 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATT
455 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
27262 TTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
519 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
27327 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
584 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
27392 ATGGGCA
649 ATGGGCA
* *
27399 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
* *
27464 GATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
66 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
* * *
27528 GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTTTAT
131 GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTAT
* *
27593 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAGCCA
196 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAGCCT
* * * *
27658 TATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATG
261 TATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATG
* *
27722 GGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
325 GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* * * *
27787 GTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGC
390 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
27852 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
455 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG-AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
*
27917 TGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
519 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
27982 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
584 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
28047 ATGGGCA
649 ATGGGCA
* *
28054 CACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
* ** * * *
28119 GATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
66 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
*
28184 GTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTTAATTTTTAT
131 GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTAT
* * * *
28248 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGCCT
196 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAGCCT
* * * *
28313 TATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACACGG
261 TATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGG
* *
28378 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTATAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
326 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
28443 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
391 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
28507 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
456 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
28572 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
520 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
28637 CCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
585 CCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
28702 ATGGGCC
649 ATGGGCA
* * *
28709 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGGTGGGTGC
1 CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
* * *
28774 GATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
66 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
* * * *
28839 GTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC---TT--TTTTT-T
131 GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTAT
*
28898 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TGTTAT-AAAAAATTTTCGCAAAGC
196 TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACT-TTATGAAAAAA-TTTCGAAAAGC
* *
28961 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
259 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
29026 GGGCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGA
324 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGA
*
29089 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT-CCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
387 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
29153 AGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTTAA
452 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
*
29217 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
516 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* * * *
29282 AAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGA
581 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
29347 GACATGGGC-
646 GACATGGGCA
* * *
29356 CTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTG
1 C-ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTG
* **
29421 CGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
65 CGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
29454 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 2478, Mismatches: 217, Indels: 40
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
647 1 0.00
648 138 0.06
649 120 0.05
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651 10 0.00
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654 139 0.06
655 1058 0.43
656 758 0.31
657 6 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (655 bp):
CACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGTGC
GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA
GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTAT
TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAGCCT
TATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGG
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
GGGCA
Found at i:27991 original size:983 final size:980
Alignment explanation
Indices: 26084--29453 Score: 5384
Period size: 983 Copynumber: 3.4 Consensus size: 980
26074 CGCATCCCAT
* * * * *
26084 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
* * *
26149 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
26214 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTTAATTTT
* * *
26279 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
26344 CCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* *
26409 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
26474 GCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
26539 GCGAGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAAT
*
26604 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGA
*
26669 AAGCCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAGTCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
585 AAGCCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAGTCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
26734 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGG
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* * * *
26864 TGGGCGAGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
780 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
* * *
26929 AATTTTTCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTT
844 AA-TTTT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
* * *
26994 GAAAAGCTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCGGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGT
907 GAAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
27059 GAGACATGG
972 GAGACATGG
*
27068 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
*
27133 TGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
27198 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATC-TTTTAATTTT
* * * *
27263 TATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * * *
27328 CCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
* *
27393 TGGGCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
27458 GGGTGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
27522 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAAT
* *
27587 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGA
* * **
27652 AAGCCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAGTCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
585 AAGCCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAGTCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
27717 ACATGGGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGG
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715 GATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCT
*
27847 TGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
780 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG-AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
27912 AATTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
844 AATTTT--TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
* * *
27977 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGT
907 GAAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
28042 GAGACATGG
972 GAGACATGG
* * * *
28051 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
* ** * * * *
28116 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
28181 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTTTT
*
28246 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * *
28311 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACAC
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
* * *
28376 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTATAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * * * *
28441 GGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * * *
28506 C-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCC-CATCTTTTTAAT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCA-CCTCATCTTTTTAAT
* * *
28569 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGA
* * *
28634 AAGCCTTATTAACTGAAAAAAACCAAATCAG-CTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
585 AAGCCATATCAACTG-AAAAAACCGAATCAGTC-GATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* *
28698 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAAT
648 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAA-
* ** * *
28763 GGGG-TGGGTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGT
712 GGGGATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGT
* * *
28827 GCTTGGGCGAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC--
777 GCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTT
*
28890 TTT--TTTTTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTT
841 TTTAATTTTTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TT
* * *
28952 TCGCAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCC
905 TCGAAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
29017 GTGAGACATGG
970 GTGAGACATGG
*
29028 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAATGGGATG
* *
29091 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT-CCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
29155 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTT
29220 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
* * *
29285 GCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
* *
29350 ATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAG-TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
*
29414 ATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACC-ACATCCCAT
388 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGA-ATCCCAT
29454 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 2206, Mismatches: 167, Indels: 34
0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
975 1 0.00
976 312 0.14
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979 4 0.00
981 3 0.00
982 350 0.16
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984 394 0.18
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (980 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATT
TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAA
AGCCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAGTCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGG
ATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTT
GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
TTTTTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGAAA
AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
CATGG
Found at i:29827 original size:426 final size:426
Alignment explanation
Indices: 29028--29871 Score: 1390
Period size: 426 Copynumber: 2.0 Consensus size: 426
29018 TGAGACATGG
* *
29028 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGGATTTGTAGTTTGTTATTGGAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGGAGTTGTAGTTTGTTATTGGAAAATGGGATGGG
**
29093 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
* * *
29158 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTAATTTTTA
131 GAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTAATTTTTA
*
29223 TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGCC
196 TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCC
* *
29288 TTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACATG
261 TTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACATG
* * *
29353 GGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
326 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
29418 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
391 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
* *
29454 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGGAGTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATGG
* *
29517 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCA-CGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT-CCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAGC
*
29581 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCT-GTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
129 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTAG-AAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAAC-TTTTAATT
* *
29645 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
192 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * *
29710 AGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
257 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGA
* *
29775 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGG
322 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
*
29840 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCA
387 ATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCA
29872 GATCACATCA
Statistics
Matches: 388, Mismatches: 26, Indels: 8
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
424 6 0.02
425 113 0.29
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ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (426 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGGAGTTGTAGTTTGTTATTGGAAAATGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
GAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTAATTTTTA
TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCC
TTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACATG
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:30049 original size:328 final size:326
Alignment explanation
Indices: 29454--30859 Score: 2134
Period size: 327 Copynumber: 4.3 Consensus size: 326
29444 CACATCCCAT
* * * *
29454 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGATGGGT
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAGGGGATGGGT
* *
29519 GCGATCATACCAGCACTAATGCA-CGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
29583 GAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAA-TTTT
29648 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
195 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
*
29713 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
260 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
29778 GA
325 GA
29780 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAGGGGATGGG
* * *
29845 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
29910 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT-TT
29975 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
194 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
*
30040 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
259 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
30105 TGA
324 TGA
*
30108 GCCC-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAATGGGGGTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAA-GGGGATGGG
* *
30172 TGCGATCATACCAGCAC-CATGCACCGGATCCCATCA-ACACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
30235 GAGAGTAGTACTAGGATTGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAAT
129 GAGAGTAGTACTAGGA-TGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTT-AAT
* * * * * * *
30300 TTTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAA
192 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
* * *
30365 AGCCTTATT-AGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
257 AGCCTTATTAAG-TGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
*
30429 ACATGG
321 ACATGA
* * *
30435 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA-TTTGTAGTTTGTTATGGC--AAAGGGGATG
*
30500 GGTGCGATCATACTAGCACT-ATGCACC-GAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
63 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAG-ATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
30562 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAAT
127 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
* *
30627 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGTGTTGACGAGTCCACATAACTTT-TG-AAAAATTTCGG
192 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGG-GTTGACGAGT-CACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGT
* * * *
30690 AAAGCCTTATTAACTGAAGAAACC-AATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGA
255 AAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGA
*
30754 GACATGG
320 GACATGA
* * *
30761 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAG-AAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAGGGGATGGG
* *
30825 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCCCAT
30860 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 994, Mismatches: 65, Indels: 43
0.90 0.06 0.04
Matches are distributed among these distances:
323 28 0.03
324 26 0.03
325 13 0.01
326 173 0.17
327 329 0.33
328 314 0.32
329 75 0.08
330 33 0.03
331 3 0.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.18, G:0.25, T:0.28
Consensus pattern (326 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAGGGGATGGGT
GCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTTA
TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGCC
TTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACATG
A
Found at i:30937 original size:100 final size:98
Alignment explanation
Indices: 30765--30959 Score: 302
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 98
30755 ACATGGGCCT
* *
30765 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGA
1 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAA-GATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGA
30830 TAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
65 TAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
30864 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAA-ATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAGATGATA-T--TTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
* **
30928 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
63 GATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
30960 CAGAACTCAC
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 5, Indels: 5
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
97 6 0.07
98 1 0.01
99 20 0.23
100 61 0.69
ACGTcount: A:0.31, C:0.18, G:0.29, T:0.22
Consensus pattern (98 bp):
ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGAT
AATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:31563 original size:327 final size:326
Alignment explanation
Indices: 30860--31612 Score: 1150
Period size: 326 Copynumber: 2.3 Consensus size: 326
30850 CACATCCCAT
* * *
30860 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
*
30924 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
30989 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* * * * *
31054 TATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
195 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * *
31119 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
260 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACAT
*
31184 GG
325 AG
* * *
31186 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
31251 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACT-CACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
31315 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
31380 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAA-TTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
31445 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
259 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
31510 TAG
324 TAG
* *
31513 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* **
31578 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
31613 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 384, Mismatches: 40, Indels: 5
0.90 0.09 0.01
Matches are distributed among these distances:
326 194 0.51
327 190 0.49
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (326 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
GAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTTT
ATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCC
TTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACATA
G
Found at i:31628 original size:753 final size:754
Alignment explanation
Indices: 30108--33121 Score: 3330
Period size: 753 Copynumber: 4.0 Consensus size: 754
30098 TGAGACATGA
* * * *
30108 GCCC-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAATGGGGGTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
30172 TGCGATCATACCAGCAC-CATGCACCGGATCCCATCA-ACACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * * *
30235 GAGAGTAGTACTAGGATTGGGTGACCTCCTAG-GAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAA
130 GAGAGTAGAACTAGGA-TAGGTGACCTCCT-GTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
* * * * *
30299 TTTTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAA-TGTTATGAAAAATTTTTGC
193 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACT-TTATGAAAAAATTTCGT
* * * *
30363 AAAGCCTTATT-AGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTG
257 AAAGCCTTATTAAG-TGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* *
30427 AGACATGGGCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
321 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTA-TTTGTAGTTTGTTATGGC-AAA
* * *
30492 ATGGGATGGGTGCGATCATACTAGCACT-ATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCG
384 AGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCG
* * * *
30555 TGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCA-CCTCATC
449 TGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCC-CATC
*
30619 TTTTTAA-TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGTGTTGACGAGTCCACATAACTTT-TGAAA
512 TTTTTAATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGTGTTGACGAG-CCACATAACTTTATGAAA
*
30682 AATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAA
576 AATTTTGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAA
*
30747 ACCGTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAG-AAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGG
641 ACCGTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGG
30811 CAAAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
706 CAAAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
* *
30860 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
30925 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACT-CACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
30989 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* *
31054 TATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGTAAAG
31118 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
31183 TGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * *
31248 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
391 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
31313 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
456 GCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
*
31377 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGG-GTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
520 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGTGTTGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAATTTT-GG
*
31441 AAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGA
584 AAAGCCTTATTAACTGAAGAAACC-AATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGA
* *
31506 GACATAGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGG
648 GACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
31571 GGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
713 GGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
31613 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
31678 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
31743 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* *
31808 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTG-AAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGTAAAG
31872 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATAT-AACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* **
31936 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * **** *
32001 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCATGCCCACAAGGGTGACAG---AGCGAG-
391 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT---CAGAACTCCG-CAGTTAAGCGTGC
*** ** * * *** * *** * * * * * *
32062 AAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGG-CAA--AAGGGGATG-CGTGC-GAT-CATACCAGC--
452 TTGGGCGAG-AGTAGTA--CTAGGATGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTT
** **** *** * * * * * * *
32119 ACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTC--CGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCGAG--AGTATTACT
514 TTTAAT---TTTTAT-TTTTCA-ACCTCGTTGGA-TT-TG-GTG-TT-GACGAGCCA-CATAACT
** ** ** * * * ** * * * * *
32180 AGGATGGGTGACCTCTTGGGAAG--TT-CT--CGTGTTG-CACC--CCATCT---TTTTAAT--T
568 -TTAT--GAAAAATTTTGGAAAGCCTTATTAAC-TGAAGAAACCAATCAGCTGACGTTTAATCGA
* ** * * ** * * **
32232 TTTATTTTTC-AACCTCGTTG-GATTTGGG--T-------TGAC-GAGCCACATAATTTTATGAA
629 GTTA-AATACAAAAC-CG-TGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGA-AA--GGATG--
* * * * * ** ** * * * * * * **
32285 AAATTTCGGAAAGCCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAAT-CGAGTAAAATAT
686 ATATTT--G-TAG-TTTGT-TA-TGGCAAAAGGGGAT-GGGTG-CG-ATAATACCAGCACTA-AT
** * **
32349 AAACC-CGTGAGACAT
741 GCACCACAT--CCCAT
32364 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
1 --GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * *
32429 CGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * * * * *
32494 CGAGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
* *
32559 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGTAA
* * * * *
32624 AGCCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
259 AGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
32688 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGG
323 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* *
32753 GATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCT
388 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* * * * *
32818 TGGGCGAGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
453 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATG-GTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTT
* * * *
32883 AATTTTTCTTTTTTAACCTCGTTGGATTT-GAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTT
517 AATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGTGTTGACGAGCCACATAACTTTATG-AAAAATTT
* * * * * * *
32947 TGAAAAGCTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCG
581 TGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACC-AATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCG
* *
33012 TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAA
645 TGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAA
* * **
33077 ATGGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCAT
710 A-GGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
33122 CAAAACTCCG
Statistics
Matches: 1867, Mismatches: 284, Indels: 216
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
736 6 0.00
737 6 0.00
739 3 0.00
741 5 0.00
743 1 0.00
744 2 0.00
745 9 0.00
746 10 0.01
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749 47 0.03
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756 28 0.01
757 19 0.01
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765 2 0.00
766 1 0.00
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772 6 0.00
773 6 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (754 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGTAAAG
CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
GCGAGAGTAGTACTAGGATGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATT
TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGTGTTGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAATTTTGGAA
AGCCTTATTAACTGAAGAAACCAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGAC
ATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:31690 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 31517--31703 Score: 322
Period size: 100 Copynumber: 1.9 Consensus size: 100
31507 ACATAGGCCT
* *
31517 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
31582 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
66 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
*
31617 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
*
31681 GATCATACCAGCACTAATGCACC
65 GATAATACCAGCACTAATGCACC
31704 GGATCCTATC
Statistics
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0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
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100 81 0.99
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ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:32072 original size:426 final size:426
Alignment explanation
Indices: 31186--32465 Score: 2087
Period size: 426 Copynumber: 3.0 Consensus size: 426
31176 TGAGACATGG
* * * *
31186 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
31251 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
31315 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
31380 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* * * * *
31445 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATA-TAACCCGTGAGACA
* * *
31510 TAGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
324 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
31575 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
389 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
31613 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
31678 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
31743 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
31808 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAATTTCGTAAAGC
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
*
31873 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAACCCGTGAGACATG
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAACCCGTGAGACATG
* *
31938 GGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
326 GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
32003 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
391 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
* *
32039 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
32104 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
32169 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
32234 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
*
32299 CTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATAT-AACCCGTGAGACAT
* *
32364 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * *
32428 GCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
389 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
32466 CAGAACTCCG
Statistics
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0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (426 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAACCCGTGAGACATG
GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:32115 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 31939--32138 Score: 321
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
31929 TGAGACATGG
* *
31939 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
*
32004 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
* * *
32039 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-CAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
32103 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
32139 CAGAACTCCG
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 91 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.20, G:0.28, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
Found at i:32817 original size:328 final size:327
Alignment explanation
Indices: 32039--35412 Score: 5130
Period size: 328 Copynumber: 10.3 Consensus size: 327
32029 CGCATCCCAT
* * * *
32039 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
32104 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
32169 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
32234 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
*
32299 CTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
32364 GA
326 GG
* * *
32366 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
32431 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
32496 AGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
32561 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAA-AATTTCGGAAAG
* * * *
32626 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
32690 ATGG
324 ATGG
* *
32694 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
32759 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
32824 AGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
32889 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
32954 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
33019 TGG
325 TGG
33022 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
33086 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
33151 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
33216 TTA-TTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAA
* * * * *
33280 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
33345 ATGG
324 ATGG
* * *
33349 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
33414 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
33478 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
33543 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
33608 CCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
33672 ATGG
324 ATGG
* *
33676 GCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
33741 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
33806 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
33871 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
33936 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
34001 TGG
325 TGG
* * * *
34004 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
34069 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
34134 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
34199 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAAG
* * *
34264 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
34329 CGG
325 TGG
* *
34332 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTATAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
34397 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
34461 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
34526 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAAG
* *
34591 CCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
34656 TGG
325 TGG
*
34659 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
34723 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
34788 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC---TT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
34848 TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGGAAA
* *
34911 GCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
259 GCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
34976 CATGG
323 CATGG
* *
34981 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* * *
35044 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
35109 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGGGTTGCA-CCCATCTTGTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
35173 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGA-TTGGGTTGACGAGTCACAGTAATTTTATGAAAAATTTTCGTA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACA-TAATTTTATGAAAAA-TTTCGGA
* * * *
35237 AAGCCTTATTAACTGAAGAAACCCGAATCAGACTGACGTTT-ATCGAGTTAAATACAAAACCGTG
257 AAGCCTTATTAACTGAA-AAAACCGAATCAG-CTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
35301 AGACAATGG
320 AGAC-ATGG
* * *
35310 GCCTACAAGGGTGACAAGAAGCGAGAAAGGATGATATTTGGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
1 GCCCACAAGGGTGAC-AG-AGCGAGAAAGGATGGTATTT-GTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* **
35375 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
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35413 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 2789, Mismatches: 221, Indels: 69
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
320 5 0.00
321 30 0.01
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323 10 0.00
324 2 0.00
325 2 0.00
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Consensus pattern (327 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
GG
Found at i:33299 original size:655 final size:654
Alignment explanation
Indices: 32039--35412 Score: 5130
Period size: 655 Copynumber: 5.2 Consensus size: 654
32029 CGCATCCCAT
* * * * *
32039 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
* *
32104 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
32169 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
32234 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTCGGAAAGC
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAATTTTGAAAAGC
*
32299 CTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * *
32364 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * *
32429 CGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
32494 CGAGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTG-GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
32559 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * *
32624 AGCCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
32688 ACATGG
649 ACATGG
*
32694 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
* *
32759 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
32824 AGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
32889 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATG-AAAAATTTTGAAAAG
* *
32954 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
33019 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGA
*
33083 TGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
*
33148 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * * * *
33213 ATTTTA-TTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGC
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* * * * *
33277 AAAGCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
33342 GACATGG
648 GACATGG
* * *
33349 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
* *
33414 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
33478 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
33543 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATG-AAAAATTTTGAAAAG
* * * * *
33608 CCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
33672 ATGGGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
* * *
33737 TGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
*
33802 AGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG-AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
*
33867 TTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* *
33932 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
33997 GACATGG
648 GACATGG
* * *
34004 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
* ** * * *
34069 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
34134 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
34199 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAATTTT-GAAAAG
* * *
34264 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
34329 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTATAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* *
34394 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
34459 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
34523 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* *
34588 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
34653 ACATGG
649 ACATGG
* * *
34659 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGGTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
* * *
34724 TGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
34789 AGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC---TT--TTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
34849 T-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TGTTAT-AAAAATTTTCGCAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACT-TTATGAAAAATTTT-GAAAA
* *
34911 GCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
259 GCCTTATTAACTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* *
34976 CATGGGCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATG
323 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGG
*
35039 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGC
386 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* * * *
35104 TTGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGGGTTGCA-CCCATCTTGT
451 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
*
35168 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGA-TTGGGTTGACGAGTCACAGTAATTTTATGAAAAATTT
515 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACA-TAATTTTATGAAAAAATT
* * * * *
35232 TCGTAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCCGAATCAGACTGACGTTT-ATCGAGTTAAATACAAAA
579 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAA-AAAACCGAATCAG-CTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAAC
35296 CCGTGAGACAATGG
642 CCGTGAGAC-ATGG
* * * *
35310 GCCTACAAGGGTGACAAGAAGCGAGAAAGGATGATATTTGGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
1 GCCCACAAGGGTGAC-AG-AGCGAGAAAGGATGGTATTT-GTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGAT
* **
35375 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
63 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
35413 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 2480, Mismatches: 215, Indels: 49
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
648 45 0.02
649 282 0.11
650 86 0.03
651 26 0.01
652 4 0.00
653 26 0.01
654 445 0.18
655 983 0.40
656 577 0.23
657 6 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (654 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAATTTTGAAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
ATGG
Found at i:36157 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 35413--36488 Score: 1786
Period size: 327 Copynumber: 3.3 Consensus size: 328
35403 CACATCCCAT
* * * *
35413 GCCCACAA-GGTGACAAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAAGTTTTGTTAT-GCAAAAAGGGGA
1 GCCCACAAGGGTGAC-AGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGT-AG-TTTGTTATGGC-GAAAGGGGA
* * * * * *
35476 TGGGTGCGATCATACCA-CACTAATGCAACGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTG
62 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTA
* * *
35540 GGCGGAGAGTAGAACTAGGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTT
127 GGC-GAGAGTAGTACTA-GGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTT
35605 AATTTTTA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTC
190 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTC
35669 GTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
255 GTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
35734 GAGACATGA
320 GAGACATGA
35743 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
35808 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
*
35873 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
35938 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
36003 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
36068 TGA
326 TGA
36071 GCCC-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
36135 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
* * *
36200 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* * * * * * *
36265 TATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAG-AAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTC-GTAAA
* * *
36329 GCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
36394 ATGA
325 ATGA
*
36398 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
*
36463 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACC
36489 GCATCCCAAG
Statistics
Matches: 710, Mismatches: 30, Indels: 14
0.94 0.04 0.02
Matches are distributed among these distances:
327 363 0.51
328 264 0.37
329 48 0.07
330 29 0.04
331 6 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGA
Found at i:36574 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 36397--36596 Score: 328
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
36387 GTGAGACATG
* * * * *
36397 AGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
36462 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
66 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
*
36497 AGCCCACGAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
36562 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
66 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
36597 TCAGAACTCC
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 8, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
100 92 1.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.20, G:0.30, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCA
Found at i:36874 original size:428 final size:428
Alignment explanation
Indices: 36070--37352 Score: 2061
Period size: 428 Copynumber: 3.0 Consensus size: 428
36060 GTGAGACATG
* * *
36070 AGCCC-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* * *
36134 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACC-AGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGG
66 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGA-ATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
36198 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTTATT
130 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * *
36263 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATT--AAAATATTTCAG
195 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTTTTGAAAAAT-TTTCGG
* * *
36326 AAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
258 AAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* *
36391 GACATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGG
323 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGG
36456 GGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
388 GGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
* *
36497 AGCCCACGAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
36562 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
36627 GAGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
131 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
36692 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAA
196 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAA
* * * * * *
36757 GCCTTATTAACTGAAGAAACCAAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGAC
261 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * * * *
36822 ATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
326 ATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
*
36887 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCA
391 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
* * *
36925 TGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* *
36990 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
37055 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
131 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
37120 TTATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAA
196 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAA
37185 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
37250 ATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
326 ATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
* * * *
37315 TGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCA
391 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
37353 TCAAAACTCC
Statistics
Matches: 788, Mismatches: 64, Indels: 7
0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
427 10 0.01
428 772 0.98
429 6 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (428 bp):
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAA
GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
ATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCA
Found at i:37003 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 36830--37025 Score: 313
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
36820 ACATGGGCCT
* * *
36830 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
1 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
36895 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
66 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
*
36930 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
* **
36994 GATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
37026 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 87 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.18, G:0.29, T:0.22
Consensus pattern (100 bp):
ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:37489 original size:755 final size:756
Alignment explanation
Indices: 34659--38108 Score: 4288
Period size: 755 Copynumber: 4.6 Consensus size: 756
34649 TGAGACATGG
* * * *
34659 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * * *
34723 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
34788 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAG-GAAGTCCTCTTGTTGCACCCC-A--TCTT--TT
130 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCT-GTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
* * * *
34847 TTT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAATTTTCGCAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
* * *
34910 AGCCTTATTAACTGAAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
259 AGCCTTATTAAGTG-AAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
34975 ACATGGGCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAAT
323 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAG
* *
35038 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTG
386 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* * * * *
35103 CTTGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGGGTTGCA-CCCATCTTG
451 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
35167 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGA-TTGGGTTGACGAGTCACAGTAATTTTATGAAAAATT
516 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACA-TAATTTTATGAAAAATT
*
35231 TTCGTAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCCGAATCAGACTGACGTTT-ATCGAGTTAAATACAAA
580 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAA-CCGAATCAG-CTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAA
*
35295 ACCGTGAGACAATGGGCCTACAAGGGTGACAAGAAGCGAGAAAGGATGATATTTGGTTGTTTGTT
643 ACCGTGAGAC-ATGGGCCTACAAGGGTGAC-AG-AGCGAGAAAGGATGATATTT-GTAGTTTGTT
35360 ATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
704 ATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
35413 GCCCACAA-GGTGACAAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAAGTTTTGTTAT-GCAAAAAGGGGA
1 GCCCACAAGGGTGAC-AGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGT-AG-TTTGTTATGGC-AAAAGGGGA
*
35476 TGGGTGCGATCATACCA-CACTAATGCAACGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTG
62 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTG
35540 GGCGGAGAGTAGAACTAGGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTT
127 GGC-GAGAGTAGAACTA-GGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTT
35605 AATTTTTA-TTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTC
190 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTC
35669 GTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
255 GTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
* *
35734 GAGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAA
320 GAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA
* * *
35799 GGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGT
385 GGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGT
* *
35864 GCTTAGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTT
450 GCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTT
* * *
35929 TTTAATGTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAAT
515 TTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATT
* * * * * *
35994 TTCGTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
580 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAAC
* * * *
36059 CGTGAGACATGAGCC-CCAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCG
645 CGTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCA
* * *
36123 AAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACAT
710 AAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
* **** *** ** * ** * * **
36170 ---CAGAACTCCG-CAG-TTTAG-CGTGCT--TAGGCG-AG--AG-TA--GTACTA--GGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * ** * ** ** ** *** ** ** *** *
36219 TGAC-CTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAT-CTTTTTTATTTTTATTTTTTAACGTCATT
66 TG-CGATCATA-CCAG--CAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCA-CAGTTAA-G-C-GT
* ** * ** ** ** **
36282 GGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAA
122 -G-CTTGGG-CGA-GAGT---AGAAC-----TAGGATAGGT--G--A-CCT-CCT--GTG-AAGT
* * * ** * ** * ** * * ** * ***
36347 AC-CGT-AT-CA-GCTGAC-CTTTAATCGAGTAAAATATAAACC-CG-TGAGACATGAGCCCACA
166 CCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT--TTTTATTTTTTAACCTCGTTG-GATTTGGGTTGAC-
* * ** * * * * *** ** *
36405 AGGGTGACAT-A--GCGAGAAAGGATGGTATTT-GT--AG-TTTGTT-A-TGGCGAAAGGGGAT-
227 -GAGTCACATAATTTTGTGAAA--A---AATTTCGTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATC
* * * * * ** ** * ** * *
36460 GGGTG-CG-ATAATACCAGCACTA-ATGCA-CCG-CATCCCA--AGCCCACGAGGGTGACAGAGC
286 AGCTGACGTTTAAT-CGAGTAAAATATAAACCCGTGA-GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGC
* * *
36518 GAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGTGCGATCATACCAGCACTAA
349 GAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAA
* *
36583 TGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTATTACTAGGATGGGT
414 TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGT
36648 GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGA
479 GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGA
*
36713 TTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACC
544 TTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAGAAACC
*
36778 AAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAG
609 GAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACATGGGCCTACAAGGGTGACAG
*
36843 AGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCAC
674 AGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATAATACCAGCAC
36908 TAATGCACCACATCCCAT
739 TAATGCACCACATCCCAT
*
36926 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
36991 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
37056 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
37121 TATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
37186 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
37251 TGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * *
37316 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
391 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
37381 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
456 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
37445 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
521 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
*
37510 AAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAG
586 AAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAG
* *
37575 ACATAGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGG
651 ACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
37640 GATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
716 GATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
37681 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
37746 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
37811 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
37876 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
37941 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* **
38006 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* *
38071 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
391 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
38109 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 2280, Mismatches: 308, Indels: 215
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
739 13 0.01
740 2 0.00
741 2 0.00
742 1 0.00
743 9 0.00
744 20 0.01
745 9 0.00
746 9 0.00
747 18 0.01
748 19 0.01
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752 9 0.00
753 25 0.01
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759 15 0.01
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763 122 0.05
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767 6 0.00
768 15 0.01
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770 3 0.00
771 3 0.00
772 13 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (756 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
AAGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAG
ACATGGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
GATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:37521 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 36926--37680 Score: 1179
Period size: 327 Copynumber: 2.3 Consensus size: 328
36916 CACATCCCAT
* * * *
36926 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
36991 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
37056 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
* * * * *
37121 TATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
37186 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
*
37251 TGG
326 TAG
* *
37254 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
37319 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
37383 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
*
37448 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
37513 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
37578 TAG
326 TAG
* * *
37581 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* **
37646 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
37681 GCCCACAAGG
Statistics
Matches: 387, Mismatches: 40, Indels: 1
0.90 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
327 268 0.69
328 119 0.31
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
TAG
Found at i:37758 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 37585--37771 Score: 322
Period size: 100 Copynumber: 1.9 Consensus size: 100
37575 ACATAGGCCT
* *
37585 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
37650 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
66 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
*
37685 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
*
37749 GATCATACCAGCACTAATGCACC
65 GATAATACCAGCACTAATGCACC
37772 GGATCCTATC
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 4, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 81 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.29, T:0.22
Consensus pattern (100 bp):
ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:38055 original size:428 final size:428
Alignment explanation
Indices: 37254--38536 Score: 2104
Period size: 428 Copynumber: 3.0 Consensus size: 428
37244 TGAGACATGG
* * * *
37254 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
37319 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
37383 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
37448 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
37513 CCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
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326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
37643 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
391 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
*
37681 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
37746 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
37811 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
37876 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
37941 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
38006 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
*
38071 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
391 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
* *
38109 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
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66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
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131 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
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196 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
38369 CCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
38434 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
326 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
* *
38498 TGCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGA-ATCCCAT
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38537 CAGAACTCCG
Statistics
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GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
Found at i:38185 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 38009--38208 Score: 321
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37999 TGAGACATGG
* *
38009 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
*
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66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
* * *
38109 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGC
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGA-CAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
38173 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
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38209 CAGAACTCCG
Statistics
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GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
Found at i:40016 original size:983 final size:982
Alignment explanation
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38099 CGCATCCCAT
* * * *
38109 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
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* *
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65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
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* * *
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*
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* *
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*
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* * * *
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*
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* *
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* *
38758 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAG
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTGGG
* *
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* *
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130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
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* * * * *
39353 CCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
39418 TGGGCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * *
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* *
39547 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAAT
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* *
39612 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGA
* * *
39677 AAGCCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
585 AAGCCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* *
39741 GACATGGGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* *
39806 GGATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
*
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* * *
40001 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCG
908 CGAAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
40066 TGAGACATGG
973 TGAGACATGG
* * * *
40076 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGTGGG
* * ** * * *
40141 TGCGATCACAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
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* *
40206 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
40271 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
40336 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * *
40401 CGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTATAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * *
40466 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
40531 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCC-CATCTTTTTAA
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCTCATCTTTTTAA
* * *
40594 TTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGG
* * * * *
40659 AAAGCCTTATTAACTGAAGAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
584 AAAGCCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
40724 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-G
* * *
40789 GGG-TGGGTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTG
713 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* * * * *
40853 CTTGGGCGAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC-TT
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*
40917 TT--TTTT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTT
843 TTAATTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TT
* * *
40978 TCGCAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCC
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41043 GTGAGACATGG
972 GTGAGACATGG
* *
41054 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAA-GGGGTG
* *
41117 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCA-AACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
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* * *
41372 AGACATGGGCCCATAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATTGTATTTGTAGTTTTGTTATGGCAAAA
320 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAG-TTTGTTATGGCAAAA
* * * * *
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* ** * * * *
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* *
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* * * *
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*
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* * * *
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* *
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* *
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*
42019 TAAACCCGTGAGACATGA
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*
42037 GCCC-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TGGG
* * * *
42101 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACAATCAGAA-TCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGC
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*
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* * * * * *
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* * * *
42291 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC-TGAGA
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* * * *
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* *
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Statistics
Matches: 3093, Mismatches: 234, Indels: 81
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (982 bp):
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GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
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GAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
ATTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGA
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GACATGG
Found at i:42536 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 42359--42558 Score: 321
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
42349 CTGAGACATG
* * * *
42359 AGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
*
42424 GTGCGATAATACCAGC-ATAATGCACCGCATCCCA
66 GTGCGATAATACCAGCAATAATGCACCGAATCCCA
*
42458 AGCCCACGAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTA-TTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
*
42523 CGTGCGATCATACCAGCAATAATGCACCGAATCCCA
65 CGTGCGATAATACCAGCAATAATGCACCGAATCCCA
42559 TCAGAACTCC
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 32 0.35
100 43 0.47
101 17 0.18
ACGTcount: A:0.31, C:0.18, G:0.30, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGC
GTGCGATAATACCAGCAATAATGCACCGAATCCCA
Found at i:42942 original size:424 final size:425
Alignment explanation
Indices: 42036--43300 Score: 1881
Period size: 426 Copynumber: 3.0 Consensus size: 425
42026 GTGAGACATG
* * *
42036 AGCCC-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* * *
42100 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACC-AGATCACAATCAGAA-TCCGCAGTTTAGCGTGCTTAG
66 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGA-ATC-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
42163 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGT-C-CGTGTTGCACCCCATCTTTTTTA-
129 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
42225 TTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATT--AAAATATTTCA
194 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTT-TTGAAAAAT-TTTCG
* * * * *
42288 GAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCTGA
256 GAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATAAAAACCGTGA
*
42353 GACATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGG
321 GACATGGGCCCACAAGGGTGACA-AGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGG
*
42418 GGATGGGTGCGATAATACCAGCA-TAATGCACCGCATCCCA
385 GGATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCA
*
42458 AGCCCACGAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAG-TTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* *
42523 CGTGCGATCATACCAGCAATAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
42588 CGAGAATATTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
130 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
42653 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTGAAAAATTTTCGGAAA
195 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTGAAAAATTTTCGGAAA
* * * *
42718 GCCTTATTAACTGAAGAAACC-AAACAGCTGACGTTTAAATCGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
260 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT-AATCGAGTAAAATA-AAAACCGTGAGA
* * * * *
42782 CATGGGCCTACAAGGGTGACAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTTTTATGGC-AAAAGGGA
323 CATGGGCCCACAAGGGTGACAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
42846 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCA
388 TGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCA
* * *
42884 TGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTT-TTATGGCAAAAGGGGATGG
1 AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* *
42948 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCAACACGGAT-CCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGG
66 GTGCGATCATACCAGCACTAATGC-AC-CGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
43012 GCGAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
129 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
43077 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTA
194 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTT-TGAAAAATTTTCGGA
*
43142 AAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
258 AAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATA-AAAACCGTGAG
43207 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGG
322 ACATGGGCCCACAAGGGTGAC-AAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGG
* *
43272 GATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGC
386 GATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGC
43301 GCCGGATCCC
Statistics
Matches: 762, Mismatches: 63, Indels: 30
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
422 5 0.01
423 35 0.05
424 151 0.20
425 191 0.25
426 225 0.30
427 123 0.16
428 32 0.04
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (425 bp):
AGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATAAAAACCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGG
GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCA
Found at i:42961 original size:99 final size:98
Alignment explanation
Indices: 42791--42972 Score: 278
Period size: 99 Copynumber: 1.8 Consensus size: 98
42781 ACATGGGCCT
* * *
42791 ACAAGGGTGACAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTTTTATGGCAAAAGGGATGGGTGCGAT
1 ACAAGGGTGACAAGCAAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGATGGGTGCGAT
42856 AATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
66 AATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
*
42889 ACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGAT-AGTAGTTGTAG-TTTTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACA-AGCAAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAA-GGGATGGGTGC
*
42952 GATCATACCAGCACTAATGCA
63 GATAATACCAGCACTAATGCA
42973 ACACGGATCC
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 5, Indels: 5
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
98 27 0.36
99 49 0.64
ACGTcount: A:0.33, C:0.16, G:0.27, T:0.23
Consensus pattern (98 bp):
ACAAGGGTGACAAGCAAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGATGGGTGCGAT
AATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:43480 original size:327 final size:329
Alignment explanation
Indices: 42885--43628 Score: 1145
Period size: 327 Copynumber: 2.3 Consensus size: 329
42875 CACATCCCAT
* * * *
42885 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTT-TTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
42949 TGCGATCATACCAGCACTAATGCAACACGGATCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCAACACGGATCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
43014 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
131 GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
* * * * *
43079 TTATTTTTTAACCTCGTTGGGTTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAA
196 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
43144 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGAC
*
43209 ATGG
326 ATAG
* *
43213 GCCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
43278 TGCGATCATCCCAGCACTAATGC-GC-CGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCAACACGGAT-CCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
43341 C-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATT
130 CGAGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
*
43405 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
195 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * *
43470 AGCCTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGA
260 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGA
43535 CATAG
325 CATAG
* * *
43540 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
43605 TGCGATAATACCAGCACTAATGCA
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCA
43629 CCACATCCCA
Statistics
Matches: 376, Mismatches: 37, Indels: 6
0.90 0.09 0.01
Matches are distributed among these distances:
327 264 0.70
328 71 0.19
329 41 0.11
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (329 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCAACACGGATCCATCAAAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGC
GAGAGTAGAACTAGGATAGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACCGTGAGAC
ATAG
Found at i:43717 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 43544--43730 Score: 322
Period size: 100 Copynumber: 1.9 Consensus size: 100
43534 ACATAGGCCT
* *
43544 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
43609 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
66 ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
*
43644 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
1 ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGC
*
43708 GATCATACCAGCACTAATGCACC
65 GATAATACCAGCACTAATGCACC
43731 GGATCCTATC
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 4, Indels: 2
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 81 0.99
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.29, T:0.22
Consensus pattern (100 bp):
ACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCG
ATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCC
Found at i:44119 original size:425 final size:426
Alignment explanation
Indices: 43214--44488 Score: 1987
Period size: 425 Copynumber: 3.0 Consensus size: 426
43204 GAGACATGGG
* * * *
43214 CCCACAAGGGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
* * *
43279 GCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-A
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * * *
43343 GAGTAGTACTAGGATCGGTGAACTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
43408 ATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * *
43473 CTTATTAACTGAAGAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATGGAGTTAAATACAAAACCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
* *
43538 AGGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
326 -GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
*
43603 GGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCACATCCCAT
390 GGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
43640 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 -CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
43705 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
65 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* ** *
43770 AGAGTAGAACTAGGATAGGTGACCTCCTCCTGAA-TCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
130 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCT-GGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
43834 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTGTGAAAAAATTTCGTAAA
194 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
*
43898 GCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATA-AAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
* *
43962 ATGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
324 ATGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
44027 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
389 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
44065 CCCACAAGGGTGACCAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTT-TTATTGGCAAAAGGGGATGC
1 CCCACAAGGGTGA-CAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATGG
* *
44129 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGC
64 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * * *
44194 GAGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATT
129 GAGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
44259 TTATTTTTCAACCTCG-TGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAA
194 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
44322 GCCTTATCAACTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCG-GTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
*
44385 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTTG-TATGGCAAAAGGGG
324 ATG-GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
* * *
44448 ATGCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
387 ATGGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
44488 C
1 C
44489 AGAACTCCGC
Statistics
Matches: 779, Mismatches: 60, Indels: 22
0.90 0.07 0.03
Matches are distributed among these distances:
422 8 0.01
423 97 0.12
424 108 0.14
425 273 0.35
426 14 0.02
427 183 0.23
428 93 0.12
429 3 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.19, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (426 bp):
CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
GAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:44141 original size:100 final size:99
Alignment explanation
Indices: 43966--44165 Score: 305
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 99
43956 TGAGACATGG
* *
43966 CCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGT
*
44031 GCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 GCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
* *
44065 CCCACAAGGGTGACCAGAGCGAGAAAGGAT-AGTAGTTGTAGTTT-TTATTGGCAAAAGGGGATG
1 CCCACAAGGGTGA-CAGAGCAAGAAAGGATGA-CAGTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
*
44128 CGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
63 CGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
44165 C
1 C
44166 AGAACTCCGC
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 6, Indels: 5
0.89 0.06 0.05
Matches are distributed among these distances:
99 17 0.18
100 75 0.82
ACGTcount: A:0.32, C:0.21, G:0.27, T:0.20
Consensus pattern (99 bp):
CCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGT
GCGATAATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCAT
Found at i:45686 original size:655 final size:655
Alignment explanation
Indices: 44065--72277 Score: 40627
Period size: 655 Copynumber: 42.9 Consensus size: 655
44055 CGCATCCCAT
* * * *
44065 CCCACAAGGGTGACCAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTT-TTATTGGCAAAAGGGGATGC
1 CCCACAAGGGTGA-CAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAATGGGATGG
* *
44129 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGC
64 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
44194 GAGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
44259 TTATTTTTCAACCTCG-TGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
*
44322 GCCTTATCAACTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCG-GTAAAATATAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * *
44385 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTG-TATGGCAAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-
* *
44449 TGCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * * * *
44514 GGCGAGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
*
44579 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAA-TTTCG
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAA-AATTTTCG
* * * *
44643 GAAAGCCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
44707 GAGACATGGG
646 GAGACATGGG
* *
44717 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
44782 GCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * * *
44847 GAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
44912 CTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTC-AAAAG
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGGAAAG
* *
44976 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
45041 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGT
* *
45106 GGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
45171 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAA
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
45236 TTTTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * * * *
45301 AAGCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
45366 ACATGGG
649 ACATGGG
* *
45373 CACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
45438 GCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
45502 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
45567 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * * *
45632 CATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
45696 TGGGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-T
* * *
45761 GGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGA
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
45826 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCAATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
45891 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* *
45956 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
46021 ACATGGG
649 ACATGGG
* * * *
46028 CACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* ** * * *
46093 GCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
46158 GAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
46223 ATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * * *
46288 CTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * * * *
46353 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
** * * *
46418 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTTGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
46483 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
46548 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
* * *
46613 AGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGA
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
46678 CAAGGG
650 CATGGG
* * * * * *
46684 CCCATAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
46749 GCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
46813 AGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
46877 GATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAAGTTTATGAAAAAGTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
46942 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGGGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
** *
47007 TAAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAAGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGT
* * *
47072 GGGTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
47137 GCGAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * * *
47201 TTTTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTCATGAAAAATTTTTGCA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * *
47266 AAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
47331 ACATGGG
649 ACATGGG
*
47338 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
47403 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
47468 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
47533 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
*
47598 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
47663 GAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* * * *
47728 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTTCACAGTTTAGCGTGCTTAGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
47793 CGAGAGTAGTACTGGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
47858 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGAAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
* *
47923 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
47988 CATGGG
650 CATGGG
* *
47994 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* ** * *
48059 GCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-A
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
48123 GAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 GAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
48187 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
48252 CCTTATTAACTGAAAATATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
48317 TGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGT
* * * * *
48382 GGGCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * *
48446 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTTTTGCA-CCCATCTTTTTTA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * * * *
48510 TTTTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTAT-TAAAATATTTCA
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT-TTTCG
* * * * *
48574 GAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTG
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
*
48639 AGACATGAG
647 AGACATGGG
* * * * *
48648 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
48713 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
48778 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
48843 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * * *
48908 CTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
48973 GGGCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* * *
49038 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
49103 CGAGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATG
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
49168 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
*
49233 AGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
49298 CATGAG
650 CATGGG
* *
49304 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
** * * *
49369 GCGATCATACCAGCACTAATGCACAAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
49434 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
49499 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGAAAG
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
49563 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
49628 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-T
* * *
49693 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
49758 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
49822 TTTTATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * *
49887 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAATTATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
49952 ACATGGG
649 ACATGGG
* *
49959 CCCATAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGGG
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAATGGGATGGG
** * * * * *
50023 TGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGGC
65 TGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
50087 GAGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
50152 TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * * *
50217 GCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * * * * *
50282 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAATTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGG
* * * * *
50347 TGGGTGCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCTGCAGTTAAGCATGCTTG
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
50412 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* *
50477 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTTGC
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
* * * *
50542 AAAGCCTTATTAATTG-AAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
50606 GACAAGGG
648 GACATGGG
* * * *
50614 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
*
50679 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * * *
50744 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
50809 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * *
50874 CATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * *
50938 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATTGCAAAAAGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGT
* * *
51003 CGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
51068 GCGAGAGTTGTTCTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
51133 TTTTCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTT-GA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTTCGG
* * *
51197 AAAGCTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGATGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
51262 GACATGGG
648 GACATGGG
*
51270 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
51335 GCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
51400 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * * *
51465 ATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAATGTTATGAAAAATTTTCGAAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * * *
51530 CTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * *
51595 GGGCACACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* *
51660 GGTGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
51724 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCGCCTCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
51789 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAA-TTTCGAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAA-AATTTTCGGA
* * *
51853 AAGCCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAG-TCAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
51917 GACATGAG
648 GACATGGG
* * *
51925 CCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
51990 GCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
52055 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTG
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
52120 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCAGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
52185 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * *
52250 GGGCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGTG
* ** * * *
52315 GGTGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
52380 CGAGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
52445 TTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATG-AAAATATTTCGGA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT-TTTCGGA
* * * * *
52509 AAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
52574 ACATGAG
649 ACATGGG
* * * *
52581 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
** *
52646 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGT-CGCAGTTAAGCATGCTTGGGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
52710 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
52775 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
52840 CCTTATTAATTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGGGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * * * *
52905 AGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAACGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGT
* *
52970 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * * *
53034 GGCGAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * *
53098 TTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGG
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
*
53163 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGG
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
***
53228 GACACAAG
648 GACATGGG
*
53236 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
53301 GCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
53366 GATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * * *
53430 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * *
53495 CTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
53560 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* * *
53625 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
53690 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
53755 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
*
53820 AGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
53885 CATGAG
650 CATGGG
* *
53891 CCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
53956 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
54021 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
54086 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
54151 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
54216 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* ** * *
54281 GGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
54346 C-AGAGTAGTACTAGGATCTGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
455 CGAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
54409 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
*
54474 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTGAA-CGAGTAAAATATAAACCCGTGA
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT-AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
54538 GACATGGG
648 GACATGGG
*
54546 CCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGGG
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAATGGGATGGG
* * * * *
54610 CGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTAAAGCGTGCTTGGGC
65 TGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
54674 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * * * *
54739 TTATTTTTTAACGTCTTTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
54804 GCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * * * * *
54869 ATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGG
* * *
54934 TAGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTG
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
54999 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
55064 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
* * * * *
55129 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
55194 GACATGGG
648 GACATGGG
* * *
55202 CCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
55267 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
55332 GAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
55397 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
*
55462 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
55527 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* * * * *
55592 GGTGCGATCGTACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
55657 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGCGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
55722 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAATTTTCGGA
* * * *
55786 AAGCCTTATCAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
55851 ACATGGG
649 ACATGGG
* *
55858 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
55923 GCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-A
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
55987 GAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
56052 ATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
56117 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * *
56182 GGGCCCATAAGGGTGACTGGGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGTG
** * * * * *
56247 GGTGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
56311 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCATGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
56376 TTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATG-AAAATATTTCGG
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT-TTTCGG
* * * *
56440 AAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
56505 GACATGAG
648 GACATGGG
* * * *
56513 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
56578 GCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
56643 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
56708 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGTAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * *
56773 CTTATTAATTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACAA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * * *
56837 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGTGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGTG
*
56902 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
56966 GCGAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * * *
57030 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGAATTTGGGTAGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* *
57095 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCATGGG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
57160 ACATGAG
649 ACATGGG
* *
57167 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
57232 GCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
57297 GATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGTA-CCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * * *
57361 ATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
57426 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * *
57491 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGGTAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* * * *
57556 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
57621 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCACCTTGAAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
57686 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATATGGGTT---GAGTCACATAATTTTGTGAAAAAAATTTCGTA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTTCGGA
* *
57748 AAGCTTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
57813 ACATGAG
649 ACATGGG
* *
57820 CCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
57885 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
57950 GAGTAGTACTAGGATGGGTGTCCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
58015 ATTTTTTAACATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTAACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
58080 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
58145 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* *
58210 GGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
58274 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
58338 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGCA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * *
58403 AAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
58468 ACATGGG
649 ACATGGG
*
58475 CCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGGG
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAATGGGATGGG
* * * *
58539 TGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 TGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
58603 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
58668 TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAATATTTCAGAAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
58733 GCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGTTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGAC
259 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* * * * * * *
58798 ATGAGCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGG
* * *
58863 TAGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTG
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * *
58928 GGCGAGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCCCCTGGGAAGTCCTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* *
58993 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACGTAATTTTATGAAAAATTTTCGC
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
* * * * *
59058 AAAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGCGTAAAATACAATCCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* *
59123 GACAAGAG
648 GACATGGG
* * *
59131 CCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGCTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
59196 GCGATCATACCAGCACTAATGTACAGGA-CCGCATCAGAACTCTGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
59260 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
59324 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACGTAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
59389 CCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGCGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * *
59454 AGAGCCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGCT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGT
* * * *
59519 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACAGGA-CCGCATCAGAACTCTGTAGTTAAGCGTGCTTG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
59583 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * *
59647 TTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGG
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
* * * *
59712 AAAGTCTTATTAAATGAATAAACCGAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
59777 GACATGGG
648 GACATGGG
* * *
59785 CCCACAAGGGCGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
59850 GCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * * *
59915 GAGTAGTACTAGAATGGGTGATCTCCTAGGAAGTCCTCGGGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * * *
59980 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTCGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
60045 CTTATTATCTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAG-AAAA-ATACAACCCGTGAGACA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATA-AACCCGTGAGACA
* *
60108 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGT
* * * * *
60173 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATACACCGGATCCCATCAAAACTCAGTAGTTAAGCGTGCTTGA
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
60238 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
*
60303 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTGGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
60368 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
60433 ACATGAG
649 ACATGGG
*
60440 CCCACAAGGGTAACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
60505 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
60569 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
60634 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTGGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
60699 CCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACTGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
60764 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGT
* *
60829 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
60894 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
*
60959 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * *
61024 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCAAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
61089 ACATGGG
649 ACATGGG
* * *
61096 CCCACAACGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
61161 GCGATCATACCAGCACTAATGCGCCGGATCCTATCA-ATACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG-T
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
61224 AGTGTAGTACTAGGATCGGAGACCTCCTCGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
61289 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACA-CATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
61353 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGTTGACGTTTAGAT-GAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA-ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
61417 ATGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-
* * * * **
61482 TGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATTG-ACTGGATCCCATTAGAACTTCATAGTTAAGCGTGCTT
388 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
61546 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
452 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
* * *
61611 ATCTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCG
517 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCG
* * * * * *
61676 CAAAGCCTTATTAAATGAAAAAACCGAATCAACTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTC
582 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
*
61741 AAACATGGG
647 AGACATGGG
*
61750 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
61815 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
61879 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
61944 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTGGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
62009 CCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACTGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
62074 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-T
* * * **** *
62139 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCATGCCCACAAGGGTGACAG---AGCGAGA
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT---CAGAACTCCG-CAGTTAAGCGTG-
** *** * * * ** * * * **
62201 AATGATAGTAGCCGTAGTTTATTATGGCAAAAGGG-GA--TGGGTGCGATCA-TACCAGCACTAA
449 CTTGGGCG-AG-AGTAG--TACTA-GG---ATGGGTGACCT-CCTGGGA--AGT-CC-TC-GTGT
** *** * ** ** *** * * ** * * *
62262 TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCA-CCGTTAAGCGT-GCTTGGGTGAGAGTAGTACTAGGAT-A
500 TGCACCCCATCTTTTTA-ATTTTTATTTTTTAA-CCTCG-TTGGATTTGGGTTG-ACGA-G-TCA
** * ** ** ** * * *** * * *** ******
62324 GGTGACCTCCTGGGAAGTCCACGTGTT-GCACCCCAACTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTC-G
559 CAT-A-ATTTTATGAA----AAATTTTCGGAAAGC--CTTATTAACTGAAAAAACCGAA--TCAG
* * * * * * **** * * **
62387 TTGGATTTGGGTTGA-CGAGT--CACATAATTTTGTGAAAAAAT-TT
614 CT-GA---CGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG-AGACATGGG
** ** * * * * * ** ** * * **
62430 CGTA-AAGCCTTATTA-A-CTGA-AAA-AATCGAATCAGCTGACGTTT-AAACGAGTAAAATATA
1 CCCACAAGGGTGA-CAGAGC-GAGAAAGGATGGTATTTG-T-A-GTTTGTTATG-GCAAAAT-GG
* *** * * * * **** * * ** *
62489 AACCCGTGAGA-CATGCGC-CCAC-AAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTA-TTTGTAGTTT
59 GATGGGTGCGATCATAC-CAGCACTAA---TG-C--ACCG-GATCCCATCAGAACTCCGCA----
* * ** * * * * *** **
62549 GTTATGGCAGAAAGGGATGGGTGCGA-TCA-TACCAGCACTAATTGACCGTATCCCATTTGAA--
112 GTTA-AGC-G---TGCTTGGGCGAGAGT-AGTACTAGGA-TGGGTGACC---T-CC-TGGGAAGT
* ** * *** ** * *** *
62610 CTTCGTAGTT--A-AGCGTGCTTGGGCAAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTC-TTGGGAAGTC
165 CCTCGT-GTTGCACCCCAT-CTT--TTTA-A-T--TTTTA--TTTTTTAACCTCGTT-GG-A-T-
* * * *** * ** * *
62671 CTCGTGTTGCAACCCA-TCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGT
216 -TTGGGTTG--A-CGAGTC-ACATAA-TTTTA----TGAA----A--AAATTT-CG--GA-AAG-
* * *
62735 CACATAACTTTA-TGAAAAAATTTCCGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTAACGT
260 C-C-TTA-TTAACTG-AAAAA--------A-CC---------G-----A----ATCAGCTGACGT
* * * *
62799 TTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACAAGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATA
294 TTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATG
* * * ** * * *
62864 GCAGTTGTAATTTGTCGTGGCAAAATGGGATAGGTGCGATCATACCGGCACTAATGCACCGGATC
359 GTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC
* * * *
62929 CCATCAAAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTTGGATGGGTGAGCTCCTGGG
423 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG
* * *
62994 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTCTAA--TTT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTCGGGTTGAC
488 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGAC
* ** *
63056 GTGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTT-GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATAGAACCAGCTG
553 GAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTG
* * * *
63120 ACGTTTAATCTAGTAAAATACAAGCCCGTGAAACATGGG
617 ACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGG
* * *
63159 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGCATTTGTAGTTTGTTTTGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
63224 GCGATCATATCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTGCGTAGTTAAGAGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
63289 GAGTAGTAATAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
63354 ATTTTTTAACCCCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * **
63419 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTAACGTTTAATAAAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
63484 GGGCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* *
63549 GGTGCGATCATACCAGCACAAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
63614 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
63679 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
* * *
63744 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGA
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
63809 CATGGG
650 CATGGG
* *
63815 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATAGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
63880 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
63945 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
64010 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * *
64075 CTTATTAACTGAAAAAACAGAATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGAGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
64140 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* *
64205 GGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
64270 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
64335 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
* * *
64400 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGG
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
64465 CATGGG
650 CATGGG
*
64471 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
64536 GCGATCATACCAGCACCAAAGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
64601 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
64666 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
64731 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
64796 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* *
64861 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGA
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGG
* * *
64925 GCGACAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
64990 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTCTCGCA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * * * *
65055 AAGCCTTATTAATTGAAAAAGCTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
65120 ACAAGGG
649 ACATGGG
* * *
65127 GCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGTTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
65192 GCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGACCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * * * *
65257 GAGTAGTACCAGAATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTTG
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
65321 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
65386 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
65451 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* *
65516 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-ATACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
65580 G-TAGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTCGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
65644 TTTTGTTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACACAATTTTATGAAAAATTTTCGCA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * * * *
65709 AAGCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
65774 ACATGGG
649 ACATGGG
* *
65781 CACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
65846 GCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
65910 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
65975 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * *
66040 CATATCAACTGAAAAAACCGAATCAG-TCAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
66104 TGGGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-T
* * *
66169 GGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGA
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
66234 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
66299 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCAGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * * *
66364 AAGCCTTATTAACTGAAGAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACTCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
66429 ACATGGG
649 ACATGGG
* * * *
66436 CACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* ** * * *
66501 GCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * * *
66566 GAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTTATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
66631 ATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * *
66696 CTAATTAACTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * * * *
66761 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* ** * *
66826 GGTGCGATCATACCAGCAGTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGT-CACAGTTAAGCATGCTTGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
66890 GCGAGAGTAGTACTCGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
*
66955 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * *
67020 AAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
67085 ACAAGGG
649 ACATGGG
* * * * *
67092 CCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
67157 ACGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
67221 AGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
67285 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
67350 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGGGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
**
67415 TAAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGT
* * * * *
67480 GGGTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGCTAAGCATGCTTGG
389 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
67545 GCCAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
67609 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* * *
67674 AAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
67739 ACATGGG
649 ACATGGG
* *
67746 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGAT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
67811 GCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
67876 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
67941 ATTTTTTAACCTCGTTAGATTTGGGTTGACGAGTCAGATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
*
68006 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
68071 GAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGGTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* * *
68136 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT-CCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
68200 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
68265 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
* *
68330 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACG-TTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
68395 ACATGGG
649 ACATGGG
* * *
68402 CCCACAAGGGCGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
68467 GCGATCATACTAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
68532 GAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
68597 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
68662 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
68727 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* * * *
68792 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
68857 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
*
68922 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAATTTTCGGA
* * *
68986 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
69051 ACATGGG
649 ACATGGG
* *
69058 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
69123 GCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-A
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
69187 GAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
69252 ATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
69317 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * *
69382 GGGCCCATAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGTG
** * * * * *
69447 GGTGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
69511 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
69576 TTTTAATTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATG-AAAATATTTCGG
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT-TTTCGG
* * * *
69640 AAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
69705 GACATGAG
648 GACATGGG
* * * *
69713 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
69778 GCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
69843 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
69908 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* * * *
69973 CTTATTAATTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACAA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * *
70037 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGTG
*
70102 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
70166 GCGAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAAT
454 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * * *
70230 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGAATTTGGGTAGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGA
519 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
* *
70295 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCATGGG
584 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
70360 ACATGAG
649 ACATGGG
* *
70367 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
70432 GCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
70497 GATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGTA-CCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * * *
70561 ATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
70626 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
70691 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGTG
* * * * *
70756 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCAACAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
70821 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTTGAAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAATT
455 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
70886 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTT---GAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
520 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAA
*
70948 AGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
585 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
71013 CATGAG
650 CATGGG
*
71019 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
71084 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
71149 GAGTAGTACTAGGATGGGTGTCCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
71214 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGC
* *
71279 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
71344 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG-TG
* *
71409 GGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCTAGTTAAGCGTGCTTG
390 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGC-AGTTAAGCGTGCTTG
* * **
71473 GGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-TTCATCTTTTTAA
453 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* *
71536 TTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-TTTCGT
518 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGG
* * *
71600 AAAGCC-TATTAATTGAAAAAACCAAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
583 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
71664 GACATGGG
648 GACATGGG
*
71672 CCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGGG
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAATGGGATGGG
* * * * *
71736 TGCGATCATACCAGCACTAATTGCACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGGC
65 TGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
71801 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
71866 TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAATATTTC-GAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-ATTTCGGAA
* *
71930 AGCC-TATTAAGTGAAAAAAAACGTAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAAT-TAAACCCAGTG
258 AGCCTTATTAACTG-AAAAAACCG-AATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC-GTG
* * *
71993 AGACATGAGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCATTTGTAAGTTTGTTTATGGCGA
320 AGACATG-GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGT-AGTTTG-TTATGGCAA
* *
72058 AAGGGGATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCAGTTAAG
382 AAGGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGCAGTTAAG
* * ***
72122 CGTGCTTGGGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCATTTCAT
445 CGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAT
* * *
72186 C-TTTTAATTTTTAATTTTTCAACCACGTAGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTATGAA
510 CTTTTTAATTTTT-ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTTATGAA
* * *
72250 AAAATTTCGCAAAGCCTTATTAATTGAA
573 AAATTTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAA
Statistics
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TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
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ATGGG
Found at i:45984 original size:983 final size:983
Alignment explanation
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44055 CGCATCCCAT
* * * *
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* *
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* * * *
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* *
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*
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* * *
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* *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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584 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* *
44708 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAA
648 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
* *
44773 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTG
713 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* * * *
44838 CTTGGGCGAGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
778 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
* * *
44903 TTAATTTTTCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATT
842 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-T
* * *
44968 TTC-AAAAGCTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACC
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45032 CGTGAGACATGGG
971 CGTGAGACATGGG
*
45045 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
45110 GCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
45175 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
45240 ATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * * * *
45305 CTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * *
45370 GGGCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* *
45435 GGTGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
45499 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * *
45564 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAA
521 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * * *
45629 AGCCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
586 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
45693 ACATGGGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* *
45758 GATGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCT
715 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* *
45823 TGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCAATCTTTTT
780 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG-AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
*
45888 AATTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
844 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
* *
45953 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGT
909 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
46018 GAGACATGGG
974 GAGACATGGG
* * * *
46028 CACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* ** * * *
46093 GCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
46158 GAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
46223 ATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATG-AAAATATTTCGGAAAG
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT-TTTCGGAAAG
* * * * *
46287 CCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * * * *
46352 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
** * * *
46417 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTTG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
46482 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
46547 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* * *
46612 AAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * * * *
46677 ACAAGGGCCCATAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGA
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* * *
46742 GCTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGC
715 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* * *
46806 TTGGGCGAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCC-TGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* * * * *
46870 TAATTTTGATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAAGTTTATGAAAAAGTTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
46935 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
* **
47000 TGGGACATAAG
973 TGAGACATGGG
* *
47011 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAAGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
47076 GCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
47141 GATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * * * *
47205 ATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTCATGAAAAATTTTTGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * *
47270 CTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
47335 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * *
47400 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
47465 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
47530 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
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*
47595 AGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
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* *
47660 CATGAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
651 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
* * *
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* *
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* *
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* * *
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975 AGACATGGG
* *
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1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* ** * *
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*
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* *
48187 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
48252 CCTTATTAACTGAAAATATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
48317 TGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGA
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* * * * *
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389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
* * *
48445 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTTTTGCA-CCCATCTTTTTT
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* * * * * * *
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* * * * *
48574 GAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTG
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* * * * * *
48639 AGACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAAT
648 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
* * *
48704 GGGATAGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATA
713 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* *
48769 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTT
778 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
*
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842 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATT
* * * * *
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972 GTGAGACATGGG
* * *
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* * *
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* * *
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* * *
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*
49236 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
49301 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
** * * *
49366 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACAAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
49431 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
49496 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGA
521 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAAATTTCGGA
* * * *
49560 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCATGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
49625 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* * *
49690 GATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
715 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* *
49755 TGGGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTT
780 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
* * * *
49819 AATTTTTATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTC
844 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
* * *
49884 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAATTATAAACCCGT
909 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
49949 GAGACATGGG
974 GAGACATGGG
* *
49959 CCCATAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGGG
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAATGGGATGGG
** * * * * *
50023 TGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGGC
65 TGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
50087 GAGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * *
50152 TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATG-AAAATATTTCGGAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT-TTTCGGAA
* * * * * *
50216 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
258 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* * * * * *
50281 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAATTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGG
323 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
* * * * *
50346 ATGGGTGCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCTGCAGTTAAGCATGCTT
388 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
* *
50411 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
453 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
* *
50476 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTTG
518 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCG
* * * * *
50541 CAAAGCCTTATTAATTG-AAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTG
583 GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTG
* * *
50605 AGACAAGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
648 AGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAG
* *
50670 GGGATGCGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
713 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* * *
50735 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTT
778 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTG-GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
* *
50800 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATT
842 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATT
* * * * *
50865 TCGAAAAGCCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
907 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
50929 CGTGAGACATGGG
971 CGTGAGACATGGG
* * * *
50942 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATTGCAAAAAGGGATCGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
51007 GCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
51072 GAGTTGTTCTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
51137 CTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTT-GAAAAG
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTTCGGAAAG
* * *
51201 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGATGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
51266 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGA
* *
51330 TGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
51395 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * * *
51460 TTTTTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAATGTTATGAAAAATTTTCGA
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* * * * *
51525 AAAGCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGA
584 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * * *
51590 GACATGGGCACACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* *
51655 GGATGGGTGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* * * *
51719 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCGCCTCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* *
51784 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * *
51849 CGAAAAGCCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAG-TCAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
*
51913 GTGAGACATGAG
972 GTGAGACATGGG
* * *
51925 CCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
51990 GCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
52055 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTG
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
52120 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCAGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* *
52185 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * *
52250 GGGCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* ** * * *
52315 GGTGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
52380 CGAGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
52445 TTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAA
521 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * * *
52510 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
586 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* * * * * *
52575 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGG
651 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
** *
52640 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGT-CGCAGTTAAGCATGCT
716 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAGCGTGCT
52704 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
780 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
*
52769 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTC
844 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
* * * * *
52834 GCAAAGCCTTATTAATTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGT
909 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
* *
52899 GGGACAAGGG
974 GAGACATGGG
* * * * * *
52909 CCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAACGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
52974 GCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
53038 AGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
53102 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
*
53167 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGGGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
***
53232 CAAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGA
* * * *
53296 TGGGTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCATGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
53361 GGCGAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * * *
53425 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGC
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* * *
53490 AAAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGA
584 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* *
53555 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* *
53620 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
*
53685 TTGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG-AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* *
53750 TATTTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* *
53815 CGTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
*
53880 TGAGACATGAG
973 TGAGACATGGG
* *
53891 CCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
53956 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
54021 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
54086 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* *
54151 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
54216 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* ** * *
54281 GGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
54346 C-AGAGTAGTACTAGGATCTGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
456 CGAGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
*
54409 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
*
54474 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTGAA-CGAGTAAAATATAAACCCGTGA
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT-AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
*
54538 GACATGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAG
* * * * *
54602 GGGATGGGCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTAAAGCGT
713 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGT
54666 GCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTT
777 GCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTT
* * * * * *
54731 TTTAATTTTTATTTTTTAACGTCTTTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATAT
841 TTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAAT
* * * * * *
54796 TTCAGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACC
906 TTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC
*
54861 CGTGAGACATGAG
971 CGTGAGACATGGG
* * * * *
54874 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
54939 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
55004 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
55069 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * * * *
55134 CTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
55199 GGGCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * *
55264 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
55329 CGAGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATG
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
55394 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAA
521 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
*
55459 AGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
586 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
* *
55524 CATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGG
651 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
* * * *
55589 ATGGGTGCGATCGTACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTT
716 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
* *
55654 AGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGCGTTGCACCCCATCTTTTTA
781 GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTA
* *
55719 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTC
845 ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAAATTTC
* * * *
55783 GGAAAGCCTTATCAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCAT
909 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
55848 GAGACATGGG
974 GAGACATGGG
* *
55858 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
55923 GCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-A
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
55987 GAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
56052 ATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* *
56117 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * *
56182 GGGCCCATAAGGGTGACTGGGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGAT
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGAT
** * * * * *
56246 GGGTGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTA
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * *
56310 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCATGTTGCACCCCAACTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * *
56375 TTTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGG
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* * * *
56440 AAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGA
584 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * * * * *
56505 GACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* * * *
56570 GGATGGGTGCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
*
56635 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
*
56700 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * *
56765 CGTAAAGCCTTATTAATTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
*
56829 TGAGACAAGGG
973 TGAGACATGGG
* * * * * *
56840 CCCACAAGGGTGACAGAGTGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
*
56905 GCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
56969 AGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * * *
57033 GATTTTTTAACCTCGTTGAATTTGGGTAGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* *
57098 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCATGGGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
57163 TGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGG-
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGA
* *
57227 TGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * *
57292 GGCGAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGTA-CCCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * * *
57356 TTTTTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGC
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* *
57421 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGA
584 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * *
57486 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGGTAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* * *
57551 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* * * *
57616 TTGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCACCTTGAAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCC-TGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* *
57681 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATATGGGTT---GAGTCACATAATTTTGTGAAAAAAATT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAAATT
* * *
57743 TCGTAAAGCTTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
907 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
*
57808 GTGAGACATGAG
972 GTGAGACATGGG
* *
57820 CCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
57885 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
57950 GAGTAGTACTAGGATGGGTGTCCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
58015 ATTTTTTAACATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTAACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* *
58080 CTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
58145 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* *
58210 GGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * *
58274 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
58338 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGCA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* * *
58403 AAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
58468 ACATGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-G
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGG
* * * *
58532 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTG
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* *
58596 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
778 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
* * *
58661 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAATATT
842 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATT
* * * * * *
58726 TCAGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGTTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCC
907 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
*
58791 GTGAGACATGAG
972 GTGAGACATGGG
* * * * * *
58803 CCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
58868 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
58933 GAGTAGTACTAGGATAGGTGACCCCCTGGGAAGTCCTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
58998 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACGTAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * * * * *
59063 CTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGCGTAAAATACAATCCCGTGAGACAA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * *
59128 GAGCCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGCTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * * *
59193 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACAGGA-CCGCATCAGAACTCTGTAGTTAAGCGTGCTTGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
59257 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
59321 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACGTAATTTTATGAAAAATTTTCGCA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* * * * *
59386 AAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGCGTAAAATACAATCCCGTGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * * *
59451 ACAAGAGCCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* * * * *
59516 GCTGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACAGGA-CCGCATCAGAACTCTGTAGTTAAGCGTGC
715 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* *
59580 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* *
59644 TAATTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * *
59709 CGGAAAGTCTTATTAAATGAATAAACCGAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
59774 TGAGACATGGG
973 TGAGACATGGG
* * *
59785 CCCACAAGGGCGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGGTGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
59850 GCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * * *
59915 GAGTAGTACTAGAATGGGTGATCTCCTAGGAAGTCCTCGGGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * *
59980 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTCGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* *
60045 CTTATTATCTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAG-AAAA-ATACAACCCGTGAGACA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATA-AACCCGTGAGACA
* *
60108 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * * *
60173 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATACACCGGATCCCATCAAAACTCAGTAGTTAAGCGTGCTTGA
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
60238 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
60303 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTGGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
60368 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* * *
60433 ACATGAGCCCACAAGGGTAACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
*
60498 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGC
715 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGC
*
60562 TTGAGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG-AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* *
60627 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTGGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * *
60692 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACTG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
60757 TGAGACATGGG
973 TGAGACATGGG
*
60768 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
60833 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
60898 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
60963 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * *
61028 CTTATTAACTGAAAAAATCAAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* *
61093 GGGCCCACAACGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* *
61158 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCGCCGGATCCTATCA-ATACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * * * *
61222 G-TAGTGTAGTACTAGGATCGGAGACCTCCTCGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
61286 TTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACA-CATTTTATGAAAAAATTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* *
61350 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGTTGACGTTTAGAT-GAGTAAAATATAAACCCGTGA
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA-ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* *
61414 GACATGGGCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* * * * **
61479 GGATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATTG-ACTGGATCCCATTAGAACTTCATAGTTAAGCGTG
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
61543 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
778 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
* * * *
61608 TTAATCTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTT
842 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATT
* * * * *
61673 TCGCAAAGCCTTATTAAATGAAAAAACCGAATCAACTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCC
907 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
* *
61738 GTCAAACATGGG
972 GTGAGACATGGG
*
61750 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
61815 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
61879 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
61944 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTGGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * * *
62009 CCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACTGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
62074 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * * **** *
62139 GGGTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCATGCCCACAAGGGTGACAG---AGCGAGA
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT---CAGAACTCCG-CAGTTAAGCGTG-
** *** * * * ** * * * **
62201 AATGATAGTAGCCGTAGTTTATTATGGCAAAAGGG-GA--TGGGTGCGATCA-TACCAGCACTAA
450 CTTGGGCG-AG-AGTAG--TACTA-GG---ATGGGTGACCT-CCTGGGA--AGT-CC-TC-GTGT
** *** * ** ** *** * * * *
62262 TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCA-CCGTTAA--GCG-T-G-CTTGGG-TGA-GAGT-A-GTAC
501 TGCACCCCATCTTTTTA-ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA
*** *** ** * * **** * * *
62317 TAGGAT-AGGTGACCTCCTGGGAAGTCC------ACGTG-TTGCACC---CCAACT---TTTTAA
565 TTTTATGA-AAAAATTTC-GGAAAG-CCTTATTAAC-TGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAA
** * ** * * ** *** * * * ** *
62368 T--TTTTATTTTTTAACCTCGTTG-GATTTGGGTTGAC--GAGTCACATAATTTTGTGAAA--A-
626 TCGAGTAAAATATAAACC-CG-TGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACA-GA--GCGAGAAAGGAT
* * * ** ** * * * * * * * * *
62425 --AATTTCGTAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTA-AAAT-
686 GGTATTT-GT--AG-TTTGTT-A-TGGCAAAAGGGGAT-GGGTG-CGATCATACCAGCACTAATG
** * * * * **** * * * * * * *
62486 -A--TAAACCCGTGAG-ACATGCGCCCACAAGGGTGAC-AGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAG
743 CACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAGCGTG-CTTGGGCGAG--A-G-TAGTACTAGGA-
** * * * * *** * ** * *** *
62546 TTTGTTA--TGGCAGAAAGGGAT-G-GGTGCGATCATACCAGCA-CTAATTGA-CCGTATCCCAT
801 TGGGTGACCT-CCTGGAAGTCCTCGTGTTGC-A-C---CC--CATCTTTTTAATTTTTAT---TT
* * ** * * * **
62605 TTGAACTTCGTAGTTAAGCG-TGCTTGGGCAAGA-GTAGTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAA
855 TTTAAC--C-TCGTT--G-GAT--TTGGG-TTGACG-AGT-C-A-CA----T-A-ATTTTATGAA
**** * * ** * * * *** ** ** * *** * *
62668 GTCCTCGTGTTGCAACCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGA-CG
901 AAAAT--T-TCGGAAAGC--CTTATTAA--CTGA---AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCG
* * *** * * **
62732 AGT--CACAT-AACTTTATGAAAAAAT-TT
956 AGTAAAATATAAAC-CCGTG-AGACATGGG
* ** * * * * ** ** * * **
62758 CCGA-AAGCCTAATTA-AGTGA-AAA-AACCGTATCAGCTAACG-TT-TAATCGAGTAAAATTTA
1 CCCACAAGGGTGA-CAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTG-T-A-GTTTGTTAT-G-GCAAAA-TGG
* *** * * * * * ** * *
62817 AACCCGTGAGA-CA-A-GAGCCCAC-AAGGGTG-A-CAGA-GCGAGAAAGGA-T-AGCAGTTGTA
59 GATGGGTGCGATCATACCAG--CACTAA---TGCACCGGATCCCA-TCAGAACTCCGCAG-T-TA
* ** * ** **
62873 ATTTGTCGTGGCAAAATGGGATAG-GT-GCGATCATACCGGCACT-AATGCACCGGATCCCATCA
116 A---G-CGT-GC---TTGGGCGAGAGTAG-TA-C-TA--GG-A-TGGGTG-ACC---T-CC-TGG
* * * ** * *** * ** ** * * * *
62935 AAACT-CT-GCAGTT--A-AGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTTGGATGGGTGAGCTCCTGGGA
160 GAAGTCCTCG-TGTTGCACCCCAT-CTT--TTTA-ATTTTTA-TT---T-TTTAACCTCGTTGG-
* * * * ** * * *** *** *
62995 AGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTC-TAATTTTTTTTTAACCTCGTTGGATTCGGGTTGACGTG
214 A-T--TTGGGTTG-A---CGAGTCACATAA--TTTTATGAA--AAATT---TTCGGAAAG-CCT-
* * *
63059 TCACATAATTTTATGAAAAAATTTTGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATAGAACCAGCTGACGT
263 T-A-TTAA-CTGA--AAAA----------A--C-------C-G----AAT-----CAGCTGACGT
* * * *
63124 TTAATCTAGTAAAATACAAGCCCGTGAAACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATG
294 TTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATG
* * *
63189 GCATTTGTAGTTTGTTTTGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATATCAGCACTAATGCACCGGATC
359 GTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC
* * * *
63254 CCATCAGAACTGCGTAGTTAAGAGTGCTTGGGCGAGAGTAGTAATAGGATGGGTGACCTCCTGGG
424 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG
*
63319 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCCCGTTGGATTTGGGTTGAC
489 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGAC
* * *
63384 GAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTAA
554 GAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGA
** *
63449 CGTTTAATAAAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGG
619 CGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGG
*
63514 ATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGGGTGCGATCATACCAGCACAAATGCACCG
684 ATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCG
*
63578 GATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCC
748 GATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCC
63643 TAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGT
813 T-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGT
* * * *
63708 TGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAG
877 TGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAG
* * *
63773 CTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACATGGG
942 CTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGGG
* *
63815 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATAGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * *
63880 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
*
63945 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
64010 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * *
64075 CTTATTAACTGAAAAAACAGAATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGAGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
64140 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-T
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGAT
* *
64204 GGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
*
64269 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
64334 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* *
64399 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
64464 GCATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GG
* * *
64529 GG-TGGGTGCGATCATACCAGCACCAAAGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
64593 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* *
64658 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * *
64723 CGCAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
64788 TGAGACATGGG
973 TGAGACATGGG
*
64799 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
64864 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
64928 ACAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
64993 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTCTCGCAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * * * *
65058 CCTTATTAATTGAAAAAGCTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * *
65123 AGGGGCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGTT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* *
65188 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGACCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
65253 GCGAGAGTAGTACCAGAATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
65317 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* *
65382 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
65447 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* *
65512 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-ATACTCTGCAGTTAAGCGTGC
715 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* * *
65576 TTGGG-TAGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTCGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* * * *
65640 TAATTTTTGTTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACACAATTTTATGAAAAATTTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * * * *
65705 CGCAAAGCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
65770 TGAGACATGGG
973 TGAGACATGGG
* *
65781 CACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* *
65846 GCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
65910 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* *
65975 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAA-TTTCGAAAAG
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAA-AATTTTCGGAAAG
* * *
66039 CCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAG-TCAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
66103 ATGGGCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
324 ATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGA
* *
66168 TGGGTGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTG
389 TGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* *
66233 AGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* *
66298 TTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCAG
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
* * * *
66363 AAAGCCTTATTAACTGAAGAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACTCGTGA
584 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
* * * *
66428 GACATGGGCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGG
* ** * * *
66493 GGATGGGTGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* * *
66558 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* * * * *
66623 TTATTTTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * *
66688 CGGAAAGCCTAATTAACTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
*
66753 TGAGACATGAG
973 TGAGACATGGG
* * * *
66764 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* ** * *
66829 GCGATCATACCAGCAGTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGT-CACAGTTAAGCATGCTTGGGCG
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
66893 AGAGTAGTACTCGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
130 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
66958 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAG
195 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
67023 CCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* * * * * *
67088 AGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * *
67153 GGGTACGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTG
* * * *
67217 GGCGAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAA
454 GGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
* * * *
67281 TTTTGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGG
519 TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
*
67346 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGG
584 AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
**
67411 GACATAAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATG
649 GACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-G
* * * * *
67476 GGG-TGGGTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGCTAAGCATG
713 GGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* *
67540 CTTGGGCCAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTT
778 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
* * *
67604 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTT
842 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATT
* * * * *
67669 TTGCAAAGCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCC
907 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
67734 GTGAGACATGGG
972 GTGAGACATGGG
* *
67746 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGAT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
67811 GCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
67876 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * * * *
67941 ATTTTTTAACCTCGTTAGATTTGGGTTGACGAGTCAGATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
*
68006 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * *
68071 GAGCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGGTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * *
68136 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT-CCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
68200 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
68265 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAA
521 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* *
68330 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAG
586 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACG-TTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
68395 ACATGGGCCCACAAGGGCGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGG
* * *
68460 GATGGGTGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCT
715 GATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCT
* * *
68525 TCGGCGAGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTT
780 TGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTT
* *
68590 AATGTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTC
844 AATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC
* * *
68655 GTAAAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
909 GGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGT
*
68720 GAGACATGAG
974 GAGACATGGG
* *
68730 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
68795 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
68860 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
68925 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGAAAG
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAATTTTCGGAAAG
* * *
68989 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
260 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
69054 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGAT
325 TGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT
* * *
69119 GGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
390 GGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* *
69184 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * *
69248 TTTTATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* *
69313 AAGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
* *
69378 ACATGGGCCCATAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-G
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGG
** * * * *
69442 GGATGGGTGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTG
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTG
* *
69506 CTTAGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTT
778 CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTT
* * * * *
69571 TTAATTTTTAATTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATT
842 TTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATT
* * * *
69636 TCGGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCC
907 TCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC
*
69701 GTGAGACATGAG
972 GTGAGACATGGG
* * * *
69713 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * *
69778 GCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* *
69843 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
*
69908 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
* * * *
69973 CTTATTAATTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACAA
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
* * * * *
70037 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
*
70102 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * * *
70166 GCGAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAAT
455 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * * * * *
70230 TTTGATTTTTTAACCTCGTTGAATTTGGGTAGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGA
520 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
* *
70295 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCATGGG
585 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
70360 ACATGAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGG
650 ACATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGG
* *
70425 GG-TGGGTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
714 GGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGC
* *
70489 TTGGGCGAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGTA-CCCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
* * *
70553 TAATTTTTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * *
70618 TGCAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
70683 TGAGACATGGG
973 TGAGACATGGG
*
70694 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
* * * * *
70759 GCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCAACAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCGA
66 GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
* * *
70824 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTTGAAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
131 GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
* * *
70889 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTT---GAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGC
196 ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
*
70951 CTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
261 CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
*
71016 GAGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
326 GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
* * *
71081 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGG
391 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
71146 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGTCCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
456 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
71211 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAA
521 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* *
71276 AGCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
586 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
71341 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGG
651 CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
* *
71406 ATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCTAGTTAAGCGTGC
716 ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGC-AGTTAAGCGTGC
* **
71470 TTGGGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-TTCATCTTTT
779 TTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCC-TGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
*
71533 TAATTTTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTT
843 TAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTT
* * * *
71597 CGTAAAGCC-TATTAATTGAAAAAACCAAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
908 CGGAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCG
71661 TGAGACATGGG
973 TGAGACATGGG
*
71672 CCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGGG
1 CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAATGGGATGGG
* * * * *
71736 TGCGATCATACCAGCACTAATTGCACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGGC
65 TGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
71801 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
129 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
71866 TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAATATTTC-GAA
194 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAT-TTTCGGAA
* *
71930 AGCC-TATTAAGTGAAAAAAAACGTAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAAT-TAAACCCAGTG
258 AGCCTTATTAACTG-AAAAAACCG-AATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC-GTG
* * *
71993 AGACATGAGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCATTTGTAAGTTTGTTTATGGCGA
320 AGACATG-GGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGT-AGTTTG-TTATGGCAA
* *
72058 AAGGGGATGGGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCAGTTAAG
382 AAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGCAGTTAAG
* * ***
72122 CGTGCTTGGGC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCATTTCAT
446 CGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAT
* * *
72186 C-TTTTAATTTTTAATTTTTCAACCACGTAGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTATGAA
511 CTTTTTAATTTTT-ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTTATGAA
* *
72250 AAAATTTCGCAAAGCCTTATTAATTGAA
574 AAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAA
Statistics
Matches: 24359, Mismatches: 2437, Indels: 868
0.88 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
972 4 0.00
973 2 0.00
974 7 0.00
975 33 0.00
976 21 0.00
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989 14 0.00
990 9 0.00
991 10 0.00
992 9 0.00
993 10 0.00
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996 3 0.00
999 1 0.00
1000 1 0.00
1001 8 0.00
1003 2 0.00
1004 6 0.00
1005 6 0.00
1006 18 0.00
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1010 7 0.00
1011 12 0.00
1012 3 0.00
1013 6 0.00
1014 1 0.00
1015 5 0.00
1016 9 0.00
1017 3 0.00
1018 1 0.00
1019 4 0.00
1020 9 0.00
1021 4 0.00
1022 2 0.00
1023 6 0.00
1024 2 0.00
1025 15 0.00
1026 13 0.00
1027 4 0.00
1029 1 0.00
1030 7 0.00
1031 8 0.00
1032 2 0.00
1033 2 0.00
1034 8 0.00
1035 6 0.00
1036 1 0.00
1038 5 0.00
1039 13 0.00
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1041 2 0.00
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1045 9 0.00
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1050 5 0.00
1051 1 0.00
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1055 7 0.00
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1073 10 0.00
1074 14 0.00
1075 8 0.00
1076 11 0.00
1077 12 0.00
1078 19 0.00
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1081 141 0.01
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1083 5 0.00
1084 5 0.00
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1090 34 0.00
1091 8 0.00
1092 2 0.00
1093 4 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (983 bp):
CCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGGT
GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGA
GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTT
ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAGC
CTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACAT
GGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG
GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
CATGGGCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGG
ATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTT
GGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAA
TTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGG
AAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
GACATGGG
Found at i:62253 original size:100 final size:100
Alignment explanation
Indices: 62077--62276 Score: 321
Period size: 100 Copynumber: 2.0 Consensus size: 100
62067 TGAGACATGG
*** *
62077 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGCCGTAGTTTATTATGGCAAAAGGGGATGGG
62142 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
66 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
*
62177 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAATGAT-AGTAGCCGTAGTTTATTATGGCAAAAGGGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGA-TAGCCGTAGTTTATTATGGCAAAAGGGGATGG
* *
62241 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT
65 GTGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
62277 CAGAACTCCA
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 7, Indels: 2
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
99 1 0.01
100 91 0.99
ACGTcount: A:0.31, C:0.20, G:0.29, T:0.20
Consensus pattern (100 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATAGCCGTAGTTTATTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCAT
Found at i:65572 original size:327 final size:328
Alignment explanation
Indices: 38109--72277 Score: 39492
Period size: 328 Copynumber: 103.8 Consensus size: 328
38099 CGCATCCCAT
* * * *
38109 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTTTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
38174 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
38239 AGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
38304 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
38369 CCTTATCAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
38434 TGA
326 TGG
* * *
38437 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
38502 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
38567 AGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
38632 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
38697 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
38761 ATGG
325 ATGG
* *
38765 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
38830 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
38895 AGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
38960 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
39025 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
39090 TGG
326 TGG
39093 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
39157 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
39222 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
39287 TTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
39352 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
39417 ATGG
325 ATGG
* * *
39421 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
39486 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCTTCAGAACACCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
39550 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
39615 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
39680 CCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
39744 ATGG
325 ATGG
* *
39748 GCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
39813 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
39878 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
39943 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
40008 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
40073 TGG
326 TGG
* * * *
40076 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * ** * * *
40141 TGCGATCACAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
40206 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
40271 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
40336 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
40401 CGG
326 TGG
* *
40404 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTATAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
40469 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
40533 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCCTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
40598 TATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
40663 CCTTATTAACTGAAGAAACCAAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
40728 TGG
326 TGG
*
40731 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTGTGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
40795 GTGCGATCATACCTGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
40860 GAGAGTAGTACAAGGATAGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCTTGTTGCACCCCATC--TTT--TTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
40921 TT-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTAT-AAAAAATTTTCGCAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGGAA
* *
40984 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
41049 CATGG
324 CATGG
* *
41054 GCCCAGAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGG-ATTTGTAGTTTGTTATTGG-AAAATGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGAT-GGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* *
41117 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCA-AACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
41181 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
41246 TTTATTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGA
194 TTTA-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
41310 AAGCCTTATT-ACGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGT-AAATATAAACCCGTGA
258 AAGCCTTATTAAC-TGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGA
41373 GACATGG
322 GACATGG
* * *
41380 GCCCATAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATTGTATTTGTAGTTTTGTTATGGCAAAAGGGGAT-G
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAG-TTTGTTATGGCAAAAGGGGATGG
* * * * * **
41444 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTTCACAGTTTAGTGGGGCTTCTA
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAG-CGTGCTT-GG
* * *
41509 GCGAGAGTAGTACTTGGAT-GGTGACCTCCTGTGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAAT
128 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* *
41573 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTA
193 TTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGA
*
41638 AAGCCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
258 AAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAG
*
41703 ACATGA
323 ACATGG
*
41709 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
41774 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
41839 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
41904 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
41969 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
42034 TGA
326 TGG
*
42037 GCCC-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
42101 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACAATCAGAA-TCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
42165 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGT-C-CGTGTTGCACCCCATCTTTTTTA-TT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * * * *
42227 TTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * *
42292 GCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC-TGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
42356 ATGA
325 ATGG
* *
42360 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * * * **
42425 TGCGATAATACCAGCA-TAATGCACCGCATCCCA--AG--C-CCACGAGGGTGA-CAGAGCGAGA
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGC-A-GTTAAGC-GTGCTTG-
* * ** ** ** * ***** * * * * ** * **
42483 AAG-GATAGTAGTTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATG-CGT-GCGAT-CATACCAGC--AA
127 -GGCGAGAGTAG-TACTAGGATG-GGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTT
**** *** * * * * * * * * * ***
42542 TAATGCACCGAATCCCATCAGAACTC--CGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAG-AATATTACTAGG
189 TAAT---TTTTAT-TTTTTA-ACCTCGTTGGA-TT-TG-G-G-TT-GACGAGTCACA-TAATTTT
**** ** * * ** * * * * **
42604 ATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGT---TG----CACC---CCATCT---TTTTAAT--TT
242 ATGAAAAAATTTC-GGAAAG-CCTTAT-TAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAG
* ** * * **
42654 TTATTTTTTAACCTCGTTG-GATTTGG
304 TAAAATATAAACC-CG-TGAGACATGG
*** * * * **** * * * * * * *
42680 GTTGAC--GAGTCACATAATTTTTGAAA-AAT--T-TTCGGAAAGCCTTATTAACT-GAAGAAAC
1 GCCCACAAGGGTGACA-GA-GCGAGAAAGGATGGTATT-TG-TAG-TTTGTT-A-TGGCA-AAAG
*** ** * * * * * * * ** * ** * *
42738 CAAACAGCTGACGTTTAAATC-G-AGTTAAATACAAAACCGTGA-GACAT-GGGCCTACAAG-GG
58 GGGATGGGTG-CGATCATACCAGCA-CT-AATGC---ACCG-GATCCCATCAGAACT-C-CGCAG
* * *** ** * * ** ** ** * *
42798 TGACAAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTTTTATGGCAAAAGG-GA--TGGGTGCGATAATA
114 T--TAAGCGTGCTTGGGCGAGA---GTAG--TACTA-GG--ATGGGTGACCT-CCTGGGA-AGT-
* * ** * ** **** ***** * *** *** ** *
42860 CCAGCACTAATGCACCACATC----CCATGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAT--GAT-A-G
166 CC-TC-GTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTA-TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACG
** * * * * * * *
42917 TAGT--TGTAGTTTTTATGGCAAAAGGGGATGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCAACACGGA
228 -AGTCACATA-ATTTTAT-G-AAAA---AAT---TTCG--GA-A--AGC-CTTAT--TA-ACTGA
*** * * * * *** * * * * ** *
42980 TCCATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGAACTAGGATA--GGTGACCTCCT
274 AAAAACCGAA-T---CAGCTGA-CGT--TTAATC--GAGTA-AAATA-TAAACCCGTGA-GACAT
43043 GTG
327 G-G
* * * *** ** ** * * ** **** *
43046 AAGTCCTC--GTGTTG-C--A-C-CCCAA-CTTTTTAATTTTTA-TTTTTTA-ACCTCGTTGGGT
1 --GCCCACAAG-GGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGT-ATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGG
* *** * ** * ** ** * * **
43101 TTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAGCCTTAT-TAAGTGAAAAAACC
61 ATGGG-TG-CGA-T--CAT-A---CCAGCACTAA--T-G--CA-CCGGATCCCA-TCAGAACTCC
* * *** * * * *** ** * * *
43165 G-A-ATCAGC-TGACGTTTAATCGAGTA-AAATA-TA-AACCCGTGA-GACAT-GG--GCCCACA
110 GCAGTTAAGCGTG-C--TTGGGCGAG-AGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC-
* *** *** ** * * **
43220 AG-GGTGACAAAGCGAGAAAGGATGGT-ATTTGTAGTTTGTT-A--T-G--GCGA-AAGGG--GA
170 -GTGTTG-C--A-C--CCCATCTTTTTAATTTTTA-TTTTTTAACCTCGTTG-GATTTGGGTTGA
* * * * *** * ** * * * * **
43274 TGGGTGC-GATCATCCCA-GCACTAA-TGCGCCG-GATCC-CA-T--C--AAAACTCCG---CAG
226 CGAGT-CACATAATTTTATGAAAAAATTTCG--GAAAGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAG
* * *** * * * * *
43326 TTAAGCGTGCTTGGGCAGAGT--AGTACTAGGATCGGTGA-ACTCCTGGG
288 CTGA-CGT--TTAATC-GAGTAAAATA-TA-AACCCGTGAGA--CAT-GG
* * ** * ** * **** * ** * ** * ***
43373 AAGTCCTC-CTGTTGCATCCCATCTTTTTAA--TTTTTATTTTTCAACCTCG-T-TGG--ATTTG
1 --GCCCACAAGGGTG-A-CAGAGC-GAGAAAGGATGGTATTTGT--AGTTTGTTATGGCAAAAGG
* * * * ** ** *** ** * * *
43431 GGTTGACGAGCCA-CATAATTTTATG-AAAAAT-TTTCGGAAAGCC-TTATTAACT--GAAG--A
59 GGATG-GGTGCGATCAT-A--CCA-GCACTAATGCACCGG-ATCCCATCA-GAACTCCGCAGTTA
* * ** ** * * * *** ** * *
43488 AAC-CGAATCAGCTGA-CGT-TTAAT-GGAGTTAAAT-ACAAAACCGTGAGACATAGGCCTACAA
117 AGCGTGCTTGGGC-GAGAGTAGTACTAGGA--TGGGTGAC--CTCC-TG-G-GA-AGTCCT-C--
* *** ***** * * ** *** *
43548 G-GGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTTGTTTGTTATGGCAAAAG-GGGA--TGGG-TG-
170 GTGTTG-C--A-CCCCATCTTTTTA-ATTT-TTATTT-TT-TAAC-CTCGTTGGATTTGGGTTGA
** * ** * * ** ** * * *
43607 CGA-T-A-ATACCAGCACTAATGCACCACATCCCATGCCCACAAGGGTGA-CAGAGC-G-AGAAA
226 CGAGTCACATA--A--TTTTATG-AAAAAAT----TTCGGA-AAGCCTTATTA-A-CTGAAAAAA
* * * * **** *** *
43666 -TGATAGT-AGTTGTA-GTTTGTTAT-G-GCAAAA-GGGGATGGGTGCGATCAT--
279 CCGA-A-TCAGCTG-ACG-TT-TAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA-CATGG
* * ** * *** * * *** * ** *
43714 ACCAGCACTAATGCACCG-GATCCTATC-AGAACTCCACAGTTAAGCGT-GCTTGGGCGA-GAGT
1 GCC--CAC-AA-G---GGTGA-CAGAGCGAGAA-AGGA-TGGTATTTGTAG-TT-TGTTATG-GC
*** * * * * * ** ** * *** * ** **
43775 AGAACTAGGATAGGTGAC-CTCCT-CCTGAATCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTA-ATTTTTA
53 A-AAAGGGGATGGGTG-CGATCATACC---A-GCAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCC
**** * * * * * ** **** ** * **
43837 TTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTG-TGAAAAAATTTC-GTAAAG-
110 GCAGTTAA--GCG-T-G-CTTGGG-CGA-GAGT-A-GTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGT
** * * * * *** *** **
43899 CCTTAT-TAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATAAAACC-CG-TGAGA
166 CCTCGTGT---TG----CACC---CCATCT---TTTTAAT-TTTTATTTTTTAACCTCGTTG-GA
** *** * * * **** * ** * * * * **
43961 CAT-GGCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGACATTT--G-TAG-TTTGTT-A-TGGCAA
216 TTTGGGTTGAC--GAGTCACATA--ATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACTGAAAA
** * * * * * * ** ** * **
44019 AAGGGGAT-GGGTG-CG-ATAATACCAGCACTA-ATGCA-CCG-CATCCCAT--
277 AACCGAATCAGCTGACGTTTAAT-CGAGTAAAATATAAACCCGTGA-GACATGG
* *
44065 -CCCACAAGGGTGACCAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTT-TTATTGGCAAAAGGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGA-CAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTA-TGGCAAAAGGGGATG
* * *
44128 CGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTAGG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * * *
44193 CGAGAGTATTACTAGGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTTCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAAT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
44258 TTTATTTTTCAACCTCG-TGGATTTGGGTTGACGAGCCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
*
44321 AGCCTTATCAACTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCG-GTAAAATATAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
44384 CATGA
324 CATGG
* * *
44389 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTG-TATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
44453 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * * *
44518 AGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
44583 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
44648 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
44712 ATGG
325 ATGG
* *
44716 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
44781 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
44846 AGAGTTGTTCTAGGATGAGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
44911 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTC-AAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAA-TTTCGGAAA
* *
44975 GCTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
45040 ATGG
325 ATGG
45044 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
45108 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
45173 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAATT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
45238 TTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGGCGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
45303 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
45368 ATGG
325 ATGG
* * *
45372 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
45437 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
45501 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
45566 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGTGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
45631 CCATATCAACTGAAAAAACTGAATCAG-TCAACATTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
45695 ATGG
325 ATGG
* *
45699 GCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
45764 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
45829 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCAATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
45894 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
45959 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
46024 TGG
326 TGG
* * * *
46027 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
46092 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
46157 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
46222 TATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
46287 CCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
46352 TGA
326 TGG
* * * * *
46355 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
** * * *
46420 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTTGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
46485 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
46550 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
46615 CCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
46680 AGG
326 TGG
* * * * * *
46683 GCCCATAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
46748 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
46812 GAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
46876 TGATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAAGTTTATGAAAAAGTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
*
46941 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGGGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
**
47006 ATAA
325 ATGG
*
47010 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAAGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
47074 GTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
47139 GAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * * * *
47203 TTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTCATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
47268 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
47333 ATGG
325 ATGG
* *
47337 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
47402 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
47467 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
47532 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
47597 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
47662 TGA
326 TGG
*
47665 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
47730 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTTCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
47795 AGAGTAGTACTGGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
47860 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
47925 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
47990 TGG
326 TGG
*
47993 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * *
48058 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
48122 AGAGTAGTACTAGGATCGGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
131 AGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
*
48186 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
48251 GCCTTATTAACTGAAAATATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
48316 ATGG
325 ATGG
*
48320 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * * *
48384 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
48448 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTTTTGCA-CCCATCTTTTTTATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * * *
48512 TTTATTTTTTAACGTCATTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * * *
48577 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
48642 CATGA
324 CATGG
* * * * * *
48647 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
48712 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
48777 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
48842 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
48907 CCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
48972 TGG
326 TGG
* *
48975 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
49040 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
49105 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
49170 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
49235 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
49300 TGA
326 TGG
*
49303 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
** * * *
49368 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACAAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
49433 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
49498 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAAATTTCGGAAA
* * * *
49562 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTTAAATACAAACCCATGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
49627 ATGG
325 ATGG
*
49631 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
49696 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
49760 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
49825 TATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
49890 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAATTATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
49955 TGG
326 TGG
* *
49958 GCCCATAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
** * * * * *
50022 GTGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
50086 CGAGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
50151 TTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * * * *
50216 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAACTAACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
50281 CATGA
324 CATGG
* * * * *
50286 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAATTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
50351 TGCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCTGCAGTTAAGCATGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
50416 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
50481 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTTGCAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
50546 CCTTATTAATTG-AAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
50610 AGG
326 TGG
* * *
50613 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTAGTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGCG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
50678 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGAATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
50743 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGAGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
50808 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
50873 CCATATCAACTAAAAAAACCGAATCAG-TCGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
50937 ATGG
325 ATGG
* * * *
50941 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATTGCAAAAAGGGATCGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
51006 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
51071 AGAGTTGTTCTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * * *
51136 TCTTTTTTAACCTCGTTGGATTTGAGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTTGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
51201 CTTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGATGACGTTTAGTCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
51266 TGG
326 TGG
51269 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
51333 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
51398 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTTGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
51463 TTATTTTTTAACCTCTTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAATGTTATGAAAAATTTTCGAAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
51528 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
51593 ATGG
325 ATGG
* * * *
51597 GCACACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
51662 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
51726 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCGCCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
51791 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
51856 CCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAG-TCAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
51920 ATGA
325 ATGG
* *
51924 GCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
51989 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
52054 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
52119 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCAGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
52184 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
52249 TGG
326 TGG
* * * *
52252 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
52317 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
52382 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
52447 TATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
52512 CCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
52577 TGA
326 TGG
* * * * *
52580 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
** *
52645 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGT-CGCAGTTAAGCATGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
52709 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
52774 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
52839 GCCTTATTAATTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGGGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
52904 AAGG
325 ATGG
* * * * * *
52908 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAACGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
52973 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
53037 GAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
53101 TGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
*
53166 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGGGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
***
53231 ACAA
325 ATGG
53235 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * * *
53299 GTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
53364 GAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
53428 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
53493 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
53558 ATGG
325 ATGG
* *
53562 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
53627 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
53692 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
53757 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
53822 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
53887 TGA
326 TGG
*
53890 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
53955 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
54020 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
54085 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
54150 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
54215 TGG
326 TGG
*
54218 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * *
54283 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGTCGGAACCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
54347 AGAGTAGTACTAGGATCTGG-GACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
131 AGAGTAGTACTAGGAT-GGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
*
54411 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
*
54476 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTGAA-CGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTT-AATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
54540 CATGG
324 CATGG
*
54545 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * * *
54609 GCGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTAAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
54673 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * * * *
54738 TTTATTTTTTAACGTCTTTGGATTTGGGTTTACGAGTCACATAACTTTATTAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * * *
54803 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
54868 CATGA
324 CATGG
* * * * * *
54873 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
54938 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
55003 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCTTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
*
55068 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
55133 CCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACATTTAATTGAGTAAAATACAAAACCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
55198 TGG
326 TGG
* *
55201 GCCCATAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
55266 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
55331 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
55396 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
55461 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
55526 TGA
326 TGG
*
55529 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
55594 TGCGATCGTACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
55659 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGCGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
55724 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAAATTTCGGAAA
* * * *
55788 GCCTTATCAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
55853 ATGG
325 ATGG
*
55857 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
55922 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
55986 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
56051 TATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
56116 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
56181 TGG
326 TGG
* * *
56184 GCCCATAAGGGTGACTGGGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
** * * * * *
56248 GTGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* * *
56312 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCATGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
56377 TTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * *
56442 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
56507 CATGA
324 CATGG
* * * * *
56512 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
56577 TGCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
56642 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
56707 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
56772 CCTTATTAATTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
56836 AGG
326 TGG
* * * * * *
56839 GCCCACAAGGGTGACAGAGTGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
56904 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
56968 GAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * * *
57032 TGATTTTTTAACCTCGTTGAATTTGGGTAGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
57097 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCATGGGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
57162 ATGA
325 ATGG
57166 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGATGG
* *
57230 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
57295 GAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGTA-CCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
57359 TTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
57424 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
57489 ATGG
325 ATGG
* * *
57493 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGGTAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
57558 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
57623 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCACCTTGAAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
57688 TATTTTTTAACCTCGTTGGATATGGGTT---GAGTCACATAATTTTGTGAAAAAAATTTCGTAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAAATTTCGGAAA
* *
57750 GCTTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
57815 ATGA
325 ATGG
*
57819 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
57884 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
57949 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGTCCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
58014 TATTTTTTAACATCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTAACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
58079 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
58144 TGG
326 TGG
*
58147 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
58212 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
58276 -AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
58340 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
58405 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
58470 ATGG
325 ATGG
*
58474 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * *
58538 GTGCGATCATACCAGCACTAATTG-ACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
* *
58602 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAGGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * *
58667 TTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAATATTTCAGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * * *
58732 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGTTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
58797 CATGA
324 CATGG
* * * * * * *
58802 GCCTACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATAGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
58867 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCATACTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
58932 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCCCCTGGGAAGTCCTCGTGTGGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
58997 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACGTAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * * *
59062 CCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGCGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
* *
59127 AGA
326 TGG
* * *
59130 GCCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
59195 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACAGGA-CCGCATCAGAACTCTGTAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
59259 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
59323 TGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACGTAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
59388 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGCGTAAAATACAATCCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
* *
59453 AAGA
325 ATGG
* * *
59457 GCCCACAAGGGTGACAGAACGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
59522 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACAGGA-CCGCATCAGAACTCTGTAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
59586 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
59650 TGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * *
59715 GTCTTATTAAATGAATAAACCGAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
59780 ATGG
325 ATGG
* *
59784 GCCCACAAGGGCGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
59848 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
59913 GAGAGTAGTACTAGAATGGGTGATCTCCTAGGAAGTCCTCGGGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
59978 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTCGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
60043 GCCTTATTATCTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAG-AAAA-ATACAACCCGTGAGA
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATA-AACCCGTGAGA
60106 CATGG
324 CATGG
* *
60111 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
60176 TGCGATCATACCAGCACTAATACACCGGATCCCATCAAAACTCAGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
60241 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
60306 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTGGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
60371 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
60436 TGA
326 TGG
* *
60439 GCCCACAAGGGTAACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
60504 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGAGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGGGC
*
60568 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
60633 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTGGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * *
60698 GCCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACTGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
60763 ATGG
325 ATGG
* *
60767 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
60832 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
60897 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
60962 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
61027 CCTTATTAACTGAAAAAATCAAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
61092 TGG
326 TGG
* *
61095 GCCCACAACGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
61160 TGCGATCATACCAGCACTAATGCGCCGGATCCTATCA-ATACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * * * *
61223 TAGTGTAGTACTAGGATCGGAGACCTCCTCGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
61288 TTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACA-CATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
61352 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGTTGACGTTTAGAT-GAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTA-ATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
61416 CATGG
324 CATGG
* *
61421 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * **
61486 TGCGATCATCCCAGCACTAATTG-ACTGGATCCCATTAGAACTTCATAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
61550 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATCT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
61615 TTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * * *
61680 GCCTTATTAAATGAAAAAACCGAATCAACTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTCAAAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
61745 ATGG
325 ATGG
* *
61749 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
61814 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGAGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGGGC
*
61878 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
61943 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTGGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * *
62008 GCCTTATTAACTGAAAAAACTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAAACTGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
62073 ATGG
325 ATGG
*
62077 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGATATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * **** * **
62142 TGCGATAATACCAGCACTAATGCACCGCATCCCATGCCCACAAGGGTGACAG---AGCGAGAAAT
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCAT---CAGAACTCCG-CAGTTAAGCGTG-CTT
*** * * * ** * * * **
62204 GATAGTAGCCGTAGTTTATTATGGCAAAAGGG-GA--TGGGTGCGATCA-TACCAGCACTAATGC
126 GGGCG-AG-AGTAG--TACTA-GG---ATGGGTGACCT-CCTGGGA--AGT-CC-TC-GTGTTGC
** *** * ** ** *** * * * * **
62265 ACCGGATCCCATCAGAACTCCA-CCGTTAA--GCG-T-G-CTTGGG-TGA-GAGT-A-GTACTAG
177 ACCCCATCTTTTTA-ATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTT
* *** ** * * **** * * *
62320 GAT-AGGTGACCTCCTGGGAAGTCC------ACGTG-TTGCACC---CCAACT---TTTTAAT--
241 TATGA-AAAAATTTC-GGAAAG-CCTTATTAAC-TGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCG
** * ** * * **
62369 TTTTATTTTTTAACCTCGTTG-GATTTGG
302 AGTAAAATATAAACC-CG-TGAGACATGG
*** * * * ** * * * * **
62397 GTTGAC--GAGTCACATAATTTTGTGAAA--A---AATTTCGTAAAGCCTTATTAACTGAAAAAA
1 GCCCACAAGGGTGACA-GA--GCGAGAAAGGATGGTATTT-GT--AG-TTTGTT-A-TGGCAAAA
** * * * * * * * * * ** * * * * ****
62455 TCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTA-AAAT--A--TAAACCCGTGAG-ACATGCGCCCACAAG
57 GGGGAT-GGGTG-CGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAG
* * * * * ** *** ** *** *
62514 GGTGAC-AGAGCGAGA-AAGGA-T-GGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAAGGGAT-G-GGTGC
119 CGTG-CTTGGGCGAGAGTAGTACTAGG-ATGGGT-G-ACCTCCTGG--G-AAGTCCTCGTGTTGC
** * *** * * * * *
62573 GATCATACCAGCA-CTAATTGA-CCGTATCCCATTTGAACTTCG-TAG-TTAAGCGTGCTTGGGC
177 -A-C---CC--CATCTTTTTAATTTTTAT---TTTTTAACCTCGTTGGATT-TG-G-G-TT--G-
* * * *** *** ** * ** *
62634 AAGAGT-A-GTACTAGGATGGGTGACCTCTT-GGGAAGTCCTCGTGT---TG---CAACC----C
225 ACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAAAT-TTCGGAAAG-CCTTAT-TAACTGAAAAAACCGAATC
* * ** * ** * * * **
62686 ATCT---TTTTAAT--TTTTATTTTTTAACCTCATTG-GATTTGG
286 AGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACC-C-GTGAGACATGG
*** * * * * * ** ** * * ** ** **
62725 GTTGAC--GAGTCACATAACTTTATGAAAAAAT--T-TCCGAAAGCCTAATTAAGTGAAAAAACC
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGC--GA-GAAAGGATGGTATTTG-TAG-TTTGTT-A-TGGCAAAAGG
* * * * * * * * * ** ** * *
62785 GTATCAGCTAACGTTTA-ATCGAGTA-AAATTTAAACCCGTGA-GACA--AG-A-GCC-CA--CA
59 GGAT-GGGT-GCGATCATA-CCAGCACTAA--TGCA-CCG-GATCCCATCAGAACTCCGCAGTTA
* * * * * * * * * ****
62840 AGGGTGAC-AGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTCGTGGCAAAATGGGATAGGTGCGAT
117 AGCGTG-CTTGGGCGAG--A-G-TAGTACTAG-GA--TG-GGTGACCTCCTGGGA-A-GT-C---
** ** ** ** * **** * *
62904 CATACCG-GCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCT-GCAGTTAA--GCG-T-G-CTTGGG-
167 C-T--CGTG---T--TGCACCCCAT-CTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGT
* * * ** **** ** * * * * *** **** *
62961 CGA-GAGT-A-GTACTTGGATGGGTGAGCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTCTA
223 TGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTC-GGAAAG-CCT--TATT-AACTGAAAAAACCGA
**** * * * *** * ***** * * *
63023 ATTTTTTTTTAACCTCGTTGGATTCGGGTTGACGTGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTTG
283 A---TCAGCTGA---CGTT-TAATC-----GA-GTAAAATATAAACCCGTG-AGACA--TGG
** * * * * * *** ** * * * ***
63085 G---A-AAGCCTTATTA-A-CTGA-AAA-AATAGAACCAGCTGACGTTTAATCTAGTAAAA-TAC
1 GCCCACAAGGGTGA-CAGAGC-GAGAAAGGATGGTATTTG-T-A-GTTTGTTATGGCAAAAGGGG
* * * * * * * ** ** ** * * **
63141 AAGCCCGTG-AAACATGGGCCCA-CAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGCATTTGTAGTTTG-
61 ATG--GGTGCGATCAT---ACCAGC-A--CT-A-A-TGC---ACCGGATCCCATCAGAACTCCGC
** * * * * * * * * * *
63203 TTTTGGCAAAAG-GGGATGGGTGCGATCATATCAGCACTAATGCACCGGAT-CCCATCAGAACTG
112 AGTT-----AAGCGTGCTTGG-GCGA-GA-GT-AGTACT-A-GGA-TGGGTGACC-TC----CTG
* * **** ** * *** ** *** *** * * * *
63266 CGTAGTTAAGAGTGCTTG--GGCGAGAGTAGTAA-TAGGA-TGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTC
160 GGAAG-TCCTCGTG-TTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAACCTCGTTGG-A-T--TT
* * * * *** *** ** *****
63327 GTGTTG-C-A-CCCCAT-CTTTT-T-AATTTTTATTTTTTAACCCCGTTGGATT---TGGGTTGA
219 GGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAA--AAAATTTCGGAAAGCC-TT--ATTAACTGAAAAAA
* * * * * * *
63383 -CGAGTCA-CATAAC-TTT-AT-GA-AAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAAC-TGAAAAAATCG
279 CCGAATCAGC-TGACGTTTAATCGAGTAAAATAT---AAA-CC-------CGTG-AGACATGG
*** ** * * *** * ** ** ** **
63439 AATCAGCTAACGTTTAATAAAGTAAAATATAAACCCGTGA-GACATGGGCCCATAAGGGTGACA-
1 GCCCA-C-AA-GGGT--GACAG--AGCGAGAAA---G-GATGGTATTTG----T-AGTTTGTTAT
* ** * *** * * **** * * * * *
63502 GAGCGAGAAA--GGATGGTATTTGTAGT-TTGTTATG-GCAAAATGGGGTGGGTGCGATCATACC
50 G-GC-A-AAAGGGGATGG-GTGCG-A-TCATACCA-GCAC-TAATGCACCGGATCCCATCAGAAC
** * * ** * * **** ** * * **
63563 AGCACAAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTA-CT
107 TCCGC-AGTTAAGC-G-T-GC-T-TGGGC-GAG-AG-T-A--GTACTAGGATG-G-GT-G-ACCT
** ** * * *** * ** * * **
63627 AGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTTTATTTTTTAAC
156 --CCT-GG-GAAGTCCT----CGT-GT--TGCACCCCATCTTTTTAA---TTTTTATTTTTTAAC
* * * *
63692 CTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAAGCCTTATTAACT
207 CTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAGCCTTATTAACT
* * *
63757 GAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGACATGG
272 GAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACATGG
* * *
63814 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATAGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
63879 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
63944 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
64009 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
64074 CCTTATTAACTGAAAAAACAGAATCAGCTGACCTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGAGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
64139 TGG
326 TGG
64142 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* *
64206 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
64271 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * *
64336 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
64401 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGGC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
64466 ATGG
325 ATGG
64470 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * *
64534 GTGCGATCATACCAGCACCAAAGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
*
64599 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * *
64664 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
64729 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
64794 ATGG
325 ATGG
* *
64798 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
64863 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCG-ATGTTAAGCGTGCTTGAGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCA-GTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
64927 GACAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
*
64992 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTCTCGCAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATT-TCGGAA
* * * * *
65056 AGCCTTATTAATTGAAAAAGCTGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
65121 CAAGG
324 CATGG
* * *
65126 GGCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGTTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
65191 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGACCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
65256 AGAGTAGTACCAGAATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
65320 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
65385 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
65450 TGG
326 TGG
*
65453 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
65518 TGCGATCATACCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-ATACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGG-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGA-ACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
65581 TAGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTCGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
65646 TTGTTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACACAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * * * *
65711 GCCTTATTAGCTGAAAAAACCAAATCAGCTCAAGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
65776 ATGG
325 ATGG
* * *
65780 GCACACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
65845 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGAAT-CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
65909 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCGTGGGAAGTCTTCGTGTTGCACCTCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * *
65974 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAATAATTTCGAAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
66039 CCATATCAACTGAAAAAACCGAATCAG-TCAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCT-GACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
66103 ATGG
325 ATGG
* *
66107 GCCCACAAAGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTATTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
66172 TGCGATCATACCAGCATTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
66237 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
66302 GATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCAGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
66367 CCTTATTAACTGAAGAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAACGAGTAAAATATAAACTCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
66432 TGG
326 TGG
* * * *
66435 GCACACAAGGGTGACTGAGCGAGAAATGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * * *
66500 TGCGATCATAACAGCACTAATTAACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * * *
66565 AGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTACACCCCAACTTTTTTATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
66630 TATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * * *
66695 CCTAATTAACTGAAAAAACCGTATCAGCTGACATTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
66760 TGA
326 TGG
* * * * *
66763 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* ** * *
66828 TGCGATCATACCAGCAGTAATGCACCGGATCTTATCAGAACGT-CACAGTTAAGCATGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAAC-TCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* *
66892 GAGAGTAGTACTCGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* *
66957 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
67022 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
67087 AAGG
325 ATGG
* * * * *
67091 GCCCACAAGGGTGACAGAGCAAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
67156 TACGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCTGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
67220 GAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * *
67284 TGATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTAGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
*
67349 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGGGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
**
67414 ATAA
325 ATGG
67418 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAA-GGGGATGG
* * * * *
67482 GTGCGATCATACCAACACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGCTAAGCATGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
67547 CAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
67611 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTCACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* * *
67676 GCCTTATTAATTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
67741 ATGG
325 ATGG
* * *
67745 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGA
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
67810 TGCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
67875 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGAAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTATTTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
67940 TATTTTTTAACCTCGTTAGATTTGGGTTGACGAGTCAGATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
68005 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
68070 TGA
326 TGG
* *
68073 GCCCACAAGGGTGACATAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGGTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
68138 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT-CCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
68202 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
68267 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
68332 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACG-TTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
68397 ATGG
325 ATGG
* *
68401 GCCCACAAGGGCGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
68466 TGCGATCATACTAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTCGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
68531 AGAGTAGTACTAGGATAGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATGTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
68596 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
68661 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGATGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
68726 TGA
326 TGG
*
68729 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
68794 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCAGATCACATCAGAACTCCGCAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
68859 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
68924 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGGGTCACATAATTTT-TGGAAAAATTTTCGGAAA
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTAT-GAAAAAATTTCGGAAA
* * *
68988 GCCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCATGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
69053 ATGG
325 ATGG
*
69057 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
69122 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC-
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
69186 AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* * * *
69251 TATTTTTCAACATCGTTGGATTTGGGTTGATGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
69316 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAAGCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
69381 TGG
326 TGG
* *
69384 GCCCATAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
** * * * * *
69448 GTGTAATCATAACAGCACTAATTG-ACCGGATCCCATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
69512 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCAACTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* * * * *
69577 TTTAATTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACAAAACTTTATGAAAATATTTCGGAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * * *
69642 AGCCTAATTAAGTGAAAAAACCGTATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATTTAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
*
69707 CATGA
324 CATGG
* * * * *
69712 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCAGTTGTAATTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * *
69777 TGCGATCATACCAACACTAATGCACCGGATCCTATCAGAACGCCGCAGTTAAGCATGCTTGGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* *
69842 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGCCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
69907 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAATTTTCGCAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* * *
69972 CCTTATTAATTG-AAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAATCCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
70036 AGG
326 TGG
* * * * *
70039 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGAAGTTTGGTATGGCAAAAAGAGCTGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
*
70104 TGCGATCATACCAGCACTAATGTACCGGA-CCGCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCC-CATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * * *
70168 GAGAGTAGTACCAGGATGGGAGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCA-CTCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * * *
70232 TGATTTTTTAACCTCGTTGAATTTGGGTAGACGAGCCACATAACTTTATGAAAAAGTTTCGGAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
70297 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCATGGGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
*
70362 ATGA
325 ATGG
70366 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAAGGGG-TGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGC-AAAAGGGGATGG
* *
70430 GTGCGATCATACCAGCACCAATGCACCGGATCCCATCAAAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
65 GTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC
* * *
70495 GAGATTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTAGGAAGTCCTCGTGTTGTA-CCCATCTTTTTAATTT
130 GAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTT
* * * * *
70559 TTATTTGTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATGTTATGAAAAATTTTTGCAAA
195 TTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAA
* *
70624 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTCACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGAC
260 GCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGAC
70689 ATGG
325 ATGG
* *
70693 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAATGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * * * *
70758 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACTGGATCCCAACAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGCTTGAGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
* * *
70823 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTTGAAAGTCCTCGTGCTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
70888 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTT---GAGTCACATAATTTTGTGAAAAAATTTCGTAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
*
70950 CCTTATTAAGTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
*
71015 TGA
326 TGG
71018 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* * *
71083 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCACAGTTTAGCGTGCTTAGGCG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
*
71148 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGTCCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
131 AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
* *
71213 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTTGAAAAATTTTCGGAAAG
196 TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
* *
71278 CCTTATTAACTGAAAAAATCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATACAAACCCGTGAGACA
261 CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
71343 TGG
326 TGG
*
71346 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCGAAAGGGGATGGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
* *
71411 TGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCTAGTTAAGCGTGCTTGGG
66 TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGC-AGTTAAGCGTGCTTGGG
* * **
71475 C-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCA-TTCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
71538 TTTATTTTTCAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATG-AAAAATTTCGTAA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAA
* * *
71602 AGCC-TATTAATTGAAAAAACCAAATCAGCTAACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
259 AGCCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGA
71666 CATGG
324 CATGG
*
71671 GCCCACAAGGGTGACTGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAGAAA-GGGATGG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCA-AAAGGGGATGG
* * * * *
71735 GTGCGATCATACCAGCACTAATTGCACCGGATCCAATTAGAACTTCGTAGTTAAGCGTGCTTAGG
65 GTGCGATCATACCAGCACTAA-TGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGG
*
71800 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGATCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
129 CGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATT
* *
71865 TTTATTTTTTAACCTCATTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAACTTTATGAAAAATATTTC-GA
194 TTTATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAA-ATTTCGGA
* *
71929 AAGCC-TATTAAGTGAAAAAAAACGTAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAAT-TAAACCCAGT
258 AAGCCTTATTAACTG-AAAAAACCG-AATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCC-GT
71992 GAGACATGAG
320 GAGACATG-G
* * *
72002 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATAGCATTTGTAAGTTTGTTTATGGCGAAAGGGGATG
1 GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGT-AGTTTG-TTATGGCAAAAGGGGATG
* *
72067 GGTGCGATCATCCCAGCACTAATGCGCCGGATCCCATCA-AAGCTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
64 GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAA-CTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGG
* * ***
72131 GC-AGAGTAGTACTAGGATCGGTGACCTCCTTGGAAGTCCTCGTGTTGCATTTCATC-TTTTAAT
128 GCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAAT
* * *
72194 TTTTAATTTTTCAACCACGTAGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTTATGAAAAAATTTCG
193 TTTT-ATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAA-TTTTATGAAAAAATTTCG
* *
72259 CAAAGCCTTATTAATTGAA
256 GAAAGCCTTATTAACTGAA
Statistics
Matches: 29284, Mismatches: 3655, Indels: 1800
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
307 2 0.00
308 3 0.00
309 4 0.00
310 1 0.00
311 3 0.00
312 5 0.00
313 3 0.00
314 13 0.00
315 11 0.00
316 18 0.00
317 16 0.00
318 50 0.00
319 54 0.00
320 56 0.00
321 40 0.00
322 130 0.00
323 404 0.01
324 285 0.01
325 544 0.02
326 1007 0.03
327 9348 0.32
328 15522 0.53
329 423 0.01
330 90 0.00
331 174 0.01
332 96 0.00
333 74 0.00
334 33 0.00
335 30 0.00
336 17 0.00
337 28 0.00
338 23 0.00
339 12 0.00
340 24 0.00
341 29 0.00
342 8 0.00
343 20 0.00
344 22 0.00
345 24 0.00
346 10 0.00
347 11 0.00
348 13 0.00
349 15 0.00
350 13 0.00
351 14 0.00
352 6 0.00
353 17 0.00
354 16 0.00
355 19 0.00
356 28 0.00
357 30 0.00
358 29 0.00
359 18 0.00
360 35 0.00
361 25 0.00
362 24 0.00
363 19 0.00
364 23 0.00
365 21 0.00
366 23 0.00
367 19 0.00
368 28 0.00
369 19 0.00
370 16 0.00
371 8 0.00
372 21 0.00
373 16 0.00
374 11 0.00
375 11 0.00
376 5 0.00
377 6 0.00
378 4 0.00
379 2 0.00
380 9 0.00
381 24 0.00
382 12 0.00
383 9 0.00
384 2 0.00
385 2 0.00
386 5 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.24, T:0.28
Consensus pattern (328 bp):
GCCCACAAGGGTGACAGAGCGAGAAAGGATGGTATTTGTAGTTTGTTATGGCAAAAGGGGATGGG
TGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCG
AGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCACCCCATCTTTTTAATTTT
TATTTTTTAACCTCGTTGGATTTGGGTTGACGAGTCACATAATTTTATGAAAAAATTTCGGAAAG
CCTTATTAACTGAAAAAACCGAATCAGCTGACGTTTAATCGAGTAAAATATAAACCCGTGAGACA
TGG
Done.