Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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Warning! 895791 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 5 of 33
Found at i:636181 original size:48 final size:48
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636053 TGATGAAGGC
* * **
636063 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
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* * * * * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
636208 GCCAATATGTTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
636483 CGTCCCCACA
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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635999 ATGAGAAGAA
* ** ** * *
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1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATT-GGACTT--AAA-GGTG-AGGTGCCAATATGCT
* * ** * * * *
636074 GAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGA
61 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTA
* *
636139 CATTGGACTTAAAGATGAGG
125 TATTGGACTTAAAGGTGAGG
* *
636159 TGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGTTGATTC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
* *
636224 AAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGG
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
*
636289 ACTCAAAGGTGAGG
131 ACTTAAAGGTGAGG
* *
636303 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
636368 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
636433 ACTTAAAGGTGATAAAGG
131 ACTTAAAGGTG----AGG
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1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
636475 GCTATATTCG
Statistics
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TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
ACTTAAAGGTGAGG
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637061 TGATGAAGGC
* * * **
637071 GCCAATATGCTGAGTAAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * *
637120 GCCAATGTGTTGAGTCAATGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * * * *
637168 GCGAATATGCTGATTCAATGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
637216 GCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
637264 GCCAATATACTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
637312 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
637360 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
637408 GCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
*
637460 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
637491 CGTCCCCACA
Statistics
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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638015 ATGAGAAGAA
* * **
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* * *
638078 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGG
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGGACTTAAAGATGAAGG
* * * *
638127 TGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATG-AGG
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGGACTTAAAGATGAAGG
* * * *
638175 TGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTG-AGG
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* * * * * * *
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* * * *
638271 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTG-AGG
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGGACTTAAAGATGAAGG
** * * * *
638319 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGG
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGGACTTAAA---GATGAAGG
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638395 GCTATATTCG
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TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGGACTTAAAGATGAAGG
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*
638070 GATGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
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* * * * * *
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* * * *
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1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * *
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1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * *
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* * *
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1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
638360 GGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
1 ---GAT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
638403 CGTCCCCAAA
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GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
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637150 TGGACTTAAA
* * * * * * **
637160 GATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATATG
* * * * * *
637225 CTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAACT
66 CTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * *
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131 ACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* * *
637355 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
196 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
* *
637420 ATTCAAGG-CTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
261 ATTCAAGGCCT-GCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
*
637484 CTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATT
325 CTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATT
* * *
637549 GGCCTGGACAAAATGAAGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCA-TTTCTGAGTATCAGGAACAG
390 GGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGG-CAGTTTCTGAGTATCAGGAACAG
*
637613 GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTT
454 GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTT
637678 CGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC
519 CGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC
*
637743 CCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
584 CCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
637808 TGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCT
649 TGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCT
* * *
637873 GCCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGG
714 GCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGG
637938 CCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAG
779 CCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAG
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844 TTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAA
638068 AT
909 AT
*
638070 GATGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATA
* *
638135 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
638200 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGTTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
129 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
638265 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
194 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
638330 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
259 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
638395 GCTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAAT
324 GCTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAAT
638460 TGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAG
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454 GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTT
*
638590 CGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC
519 CGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC
*
638655 CCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGGCCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
584 CCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
*
638720 TGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGGCACTGTGCAGATTCAAGGCCT
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* *
638785 GCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGTGTGATAAAAGGACCAGTTCGTTGATTCACGG
714 GCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGG
638850 CCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAG
779 CCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAG
638915 TTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAA
844 TTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAA
638980 AT
909 AT
*
638982 GATGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATA
* *
639047 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
639112 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGTTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
129 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
* *
639177 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACATAAAGGTGAGGTGGCAATATGC
194 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
639242 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
259 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
639307 GCTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAAT
324 GCTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAAT
*
639372 TGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAATAG
389 TGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAG
*
639437 GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGTGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTT
454 GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTT
639502 CGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC
519 CGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC
639567 CCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
584 CCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
639632 TGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCT
649 TGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCT
639697 GCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGG
714 GCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGG
639762 CCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTG----A-T-T------C--
779 CCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAG
* * * * **
639813 ----AC--G--GA--AG--G--TGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT--AA
844 TTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAA
639861 A-
909 AT
* * * * * **
639862 GATGAGGTGCGAATATGCTTATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATATG
* * * * * *
639927 TTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
66 CTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * *
639992 ATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
131 ACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* *
640057 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
196 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
*
640122 ATTCAAGG-CTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAA-GTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
261 ATTCAAGGCCT-GCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
* *
640185 CTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTAGAAAATT
325 CTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATT
* * *
640250 GGCCTGGAAAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCCTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGG
390 GGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGG
*
640315 CCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTC
455 CCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTTC
* *
640380 GCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCC
520 GTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCC
*
640445 CTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTT
585 CAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTT
640510 GGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTG
650 GGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTG
* * *
640575 CCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
715 CCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
* *
640640 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATGCACGGTCAGCAACAGT
780 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAGT
640705 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAA
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640770 T
910 T
* * *
640771 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATA
* * * *
640836 TGTTGAGTCAATGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
640901 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
129 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
* *
640966 GTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
194 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
* * * *
641031 TGATTTAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTA
259 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
** ** ** *** * ** *
641092 GCTATATT-GAACTTAAAGGTGAT--AAAGGTGCCA-ATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATTC
324 GCTATATTCGTCCCCAAATATG-TCGAATCCT-CCACCTA--CT-AGCT-AGGCC--CTAAATT-
** * * * ** * ** * * **** *
641153 GTCCCCACATATGTCGAATCCTC-CACCTACTAGCTAGG-CCCTAAATTGTTGAAAAT-TGGCCT
380 GT--TGA-AAAT-T-G--GCC-CGGACAAAAT-G--AGGTGTCTACA--GCTGCCCCTCT---TT
* * * * ** * *
641215 GGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGG--CCGTTTCTAAGTATC-AAGA-ACAGGC
429 GG-C------A-GTTTCT-GAG-TA----TC--AGGAACAG-GCCAAAG-A-CAAATAGACA--C
** * * * * ** ** *
641276 CA--AAGACAAAT-AGACAC-CATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGC
473 CATTTTGTC---TGCGGC-CGCA---TGTC-A-TG-AAC-T-T-TGGT--------GATTAATGC
* * * *
641337 TTAGCCGTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCT
517 TTCGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCT
* * *
641402 TCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCGAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAG
582 TCCCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAG
*
641467 TTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACGGTGCAGATTCAAGGC
647 TTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGC
* * * *
641532 CTGCTACGCTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCAC
712 CTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCAC
641597 GGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATA--C-G-----C--T--G--AC
777 GGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAAC
* * * * * **
641648 ---T-CAC--G--GA--AG--G--TGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT--
842 AGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAA
641696 AAA-
907 AAAT
* * * * **
641699 GATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATATG
* * * * * *
641764 TTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
66 CTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * * *
641829 ATATTGGACTCAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
131 ACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* * * *
641894 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
196 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
* *
641959 ATTCAAGG-CTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
261 ATTCAAGGCCT-GCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
* * *
642023 CTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCTTAAATTGTTCAAAATT
325 CTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATT
* *
642088 GGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGG
390 GGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGG
*
642153 CCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTC
455 CCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTTC
* *
642218 GCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCC
520 GTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCC
*
642283 CTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTT
585 CAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTT
* *
642348 GGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCGCTGTGCAGATTTAAGGCCTG
650 GGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTG
* * *
642413 CCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
715 CCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
*
642478 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGT
780 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAGT
642543 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAA
845 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAA
642608 T
910 T
* * *
642609 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATA
* * * *
642674 TGTTGAGTCAATGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
642739 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
129 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
*
642804 GTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
194 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
* *
642869 TGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
259 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
** ** * * * * * * * *
642930 GCTATATT-GAACTTAAAGGTGAGGTGCCAAT-ATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTA
324 GCTATATTCGTCCCCAAA--T-ATGT-CGAATCCT-C-CA-CCTA--CTAGC--TA--GGCCCTA
* * * * * * *
642993 GA--GGTGATAAAGTT-G--C---CAATATGCTGAT-TC-A-AG--GCCAACTATATT--C-G-T
376 AATTGTTGA-AAA-TTGGCCCGGACAAAATG-AGGTGTCTACAGCTGCC-CCTCT-TTGGCAGTT
* ** * *** ** *** ** * ** * *
643041 CCCCACATATGTCGAATC-CTCCACCTACTAGCTAGGC-CCTAAATTGT-TGAAAATTGGCCTGG
436 TCTGA-GTATCAGGAA-CAGGCCAAAGAC-AAATAGACACC-ATTTTGTCTG-----CGGCC-GC
**** * * **** * * *** *
643103 ACAAAATGAAGTGTCTACAGCT-ACCCCT-CTTTGGCCGT--TTCTGAGT--ATCAGG-AACAGG
491 ATGTCATGAACT-T-T---GGTGATTAATGC-TTCGTCGTGATGAAGAGTGCATC-GGTGAC-GG
* ** * ***** * * * * ** * *
643161 ---CCAAAGACAAAT-AGACACCA--TTTTGTCTGCGGCC-GC-ATGTCAT-GACCTTTGGTGAT
548 TTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC--CCAACTAGGTTTTGGA-ATTT--T--C
* * * * * *
643217 TAATGCTT--CGTCGTGATGA-AGAGTG--CATCGGTG-ACG-GTTT----C-GA---TGGAA-A
606 TAAGGCTTGACCTCCTTA-GATAG-GTGTAGATTGGTGTA-GAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGA
* ** * * * *
643266 A-ATGAGTTTGTAGGGTTTGTC--T-TCCCTACTAGGTTTTGGA-ATTTTCTAAGGCTTG--AC-
668 ATACG-GTCAGTA--TTTTG-CAATGTGCC-ACT--G---TGCAGA--TTC-AAGGCCTGCCACA
* * * * * * ** * ** *
643323 CT--CCTTAGATAGGTG-TAGATTGG-TGTAGAGT-TTGGAACGGATTA-T-GGAAGAAT-ACGG
720 CTAGACTTA-A-AGATGAT-GA--GGATGAAGAGTGAT-AAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGG
* * * **** * *** * **
643380 TC-A-G-TATT---TTGCAATG-TG-GCACTGTGCAGAT-TC-A-AGGCCTGCCACACTAGACTT
779 CCAACGATATTGGGTT-TAAAGATGAG-AAAAAG--GATGTCAATATG-CTGATTCACT-GTCAG
* * * * * * * * * **
643434 AAAGATGATGAGGA--TGAAG-TGTGATAAAAGGACCAGT-TCGTTGATTCACGGCCAACGATAT
838 CAACA-G-TTA-GACTTGAAGATGAGA-AGAATG-CCAATGT-GCTGATTCAAGGCCAACGGCAT
*
643495 TGGG-TTTAAAGAT
897 TGGGTTTTAAAAAT
* ** * * * * * *
643508 GA-GAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
1 GATG----AGG-TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATA-TTGGACTTAAAGACGAG--G--
* * * * **
643572 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGTGCCAATATGCT
56 TGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT--AAA-GATG-AGGTGCCAATATGCT
* * * * ** * * * * * *
643637 GATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGA
116 GATTCAAGGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTG-AGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTA
* * * * * *
643702 CATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTG
180 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTG
* * * * *
643767 AGGGGCCAATATGTTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATG
245 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATG
* * ** ** * * * * ** * * *
643828 CTGATTCAAGGCTAACTATATT-G-GACTTAA-AGGT-GAGGTGC-CAATATGCTGATTCAAGGC
310 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCAAATATGTCGA-ATCCTCCACCTACT-A-GCTAGGC
* ** * * * * * *
643888 CAGCTATATTGGACTT-AAAGGTGAG---GTGCCAATATGCTGAT-TC-A-AG--GCCAGCTATA
372 C--CTAAATT-G--TTGAAAATTG-GCCCG-GACAAAATG-AGGTGTCTACAGCTGCC-CCTCT-
* ** * *
643944 TTGG-ACTTAAAGGTGAGGTGCCAAT-ATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
427 TTGGCAGTT---TCTGA-GT----ATCA-G--GA-AC-AGGC---C-A-A--AGAC--AAA--T-
* * * * * * ** * * **
644007 ATAAAGTGCCAATATG-CTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATAT-GTCGAATCCT-C
467 AGACA---CCATTTTGTCTG---C--GGCC-GC-AT-GTCAT--GAAC-TTTGGT-GATTAATGC
** * * * ** ** * * *** * * * * **
644069 CACCTAC-TAGCT-AGGCCCTAAATTGTTGA-AAATTGGCCTGGAAAAAATGAGGTGTCTACAG-
517 TTCGT-CGT-GATGAAG-AGTGCATCGGTGACGGTTTCG-ATGG-AAAAATGA-GTTTGTAGGGT
* ** * ** **** * * * * *
644130 CTGCCCCTCCTTGGCAGTTTCT-GAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACAC-CATTTTG
576 TTG----T-CTTCCCA---ACTAG-GT-TTTGGAA-TTTTCTAAGGC---TTGAC-CTC-CTTAG
* * * * * * *
644193 TCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTA-ATGCTTCG--C-CA-TGAT-AAAGAGTGCAT
625 -AT--AG--G--TGT-A-GA---TTGGTG--TAGA-GTTTGGAACGGATTG-TGGAAGAAT--A-
* * * * *** * * * ** * **
644252 CGGTGACG--GTTT-CGATG-G-AAAAATG-AGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTG
671 CGGTCA-GTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATT-CAAGGCCTG-C--CAC-ACTA-GACTT-
* ** ** * * ** ** * *** ** *
644311 GAATTTTCTAAGGCTTG-A-CCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT--TGG--AACG-
728 AAAGATGATGAGG-ATGAAGAGT-GATA-AAAGGACCAG-TACGT-T-GA-TTCACGGCCAACGA
* *** * * **** * * * * ** * * * *
644369 GATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACAC
786 TATTG-GGTTTAA-A-GATGAG-AAAAAG-GATGT--CAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAG
* * * * *
644434 TT-GACTTAAAGATGATGAGGATGAAAATTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACG
844 TTAGACTTGAAGATGA-GA--A-G--AA-TG---CCA--A--TGT--GCTGATTCAAGGCCAACG
** *
644498 ATATTGGG-TTTAAAGAT
893 GCATTGGGTTTTAAAAAT
* * * * * * * *
644515 GA-GAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
1 GATG----AGG-TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATA-TTGGACTTAAAGACGAG--G--
* * * * ** *
644579 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCT
56 TGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT--AAA-GATG-AGGTGCCAATATGCT
* * * * * ** * * * * *
644644 GAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAATG-CCAGCG
116 GATTCAAGGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTG-AGGGGCCAATATGCTGATTCAA-GACCAGCT
* * * * * * *
644708 ACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAACTACATTCGACTTAAAGGT
179 ATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGT
* * *
644773 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATAT
244 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATAT
* * ** ** * * * * ** * **
644834 ACTGATTCAAGGCCAACTATATT-G-GACTTAA-AGGT-GAGGTGC-CAATATGCTGATTTAAGG
309 GCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCAAATATGTCGA-ATCCTCCACCTACT-AGCT-AGG
* ** * * * * *
644894 CCAGCTATATTGGACTT-AAAGGTGAG---GTGCCAATATGCTGAT-TC-A-AGGCTAG---CTA
371 CC--CTAAATT-G--TTGAAAATTG-GCCCG-GACAAAATG-AGGTGTCTACA-GCT-GCCCCTC
* * *** * * * * * * * *
644949 TATT-GAACTTAAAG-GTGATAAAGGTGGCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATTCGTCCCC
426 T-TTGGCAGTTTCTGAGT-AT-CA---GG-AACAGGC-CA---AA-G--A-C-A-AATAG-ACAC
* * ** * * * * * * * * * **
645012 ACATATATCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCT-AA-ATTGTTGA-AAATTGGCCTGGACAA
473 -CAT-T-TTG--T-CTGCGGC--C--GC-ATGTCATGAACTTTGGTGATTAA-T-GCTTCGTCGT
* * *** ** ** * * * * **
645074 AATG-AG-GTGTC-TACAGCT-AC-CCCTCTTTGG------CCGTTTCTA-AGTATCAAGAACAG
525 GATGAAGAGTG-CAT-C-GGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGT-T--TG-TCTT
* ** **** * * * * * * * * * *
645127 GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGT-GAT-TAATGC
583 CCCAACTAGGTTTTG-GA--A-TTT-TCTA-AG--GCTTGACCT--CCTTAGATAGGTGT-A-GA
* * * * * **
645190 TTAGCCGTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGA-GTTTGTC-G-GGTTTG
636 TT-G--GTG-T--AGAGT---TTGG-AACGGATT-G-TGGAAGAAT-ACG---GTCAGTATTTTG
* * * * **
645252 TC--T-TCCCTACTAGGTTTTC-GAATTTTCGAAGGCTTGACCTC-CTTAGA-TAGGTGTAGATT
685 -CAATGTGCC-ACT--G--TGCAG-A--TTC-AAGGCCTG-CCACAC-TAGACT---TAAAGA-T
* * * **
645311 GGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGA-AGAATACGG-TCAGTATTTTGCAATGTGCCACGGTGC
734 GATG-AG-G-AT-GAA--GA--GT-GATA-AA-A-GGACCAGTACGTTG--AT-T--CAC-G-GC
* ** * *
645374 AGATTCAAGGCCTGCTACACTT-GACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGT
780 -----CAA---C-G--ATA-TTGGGTTTAAAGATGA-GA--A--AA-AG-GAT-----G-TCAAT
* * * * * * * * ** * *
645438 ACGTTGATTCACGGCCAACGATA-TTGGGTTTAAAGATGAG-A-AA----AA-G-GATG--TCAA
820 ATGCTGATTCACTGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAA
* * ** * **
645492 ----TA-TGC--T--G-ACT--CACG
885 GGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
* * * * * *
645506 GA--AGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATG
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATATG
* * * * * * *
645569 CTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGTTGATTCAAGACCAGCT
66 CTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * * * *
645634 ATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTCAAAGGT
131 ACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* *
645699 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
196 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
* *
645764 ATTCAAGGCCAGCTATA-TTGAACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAG
261 ATTCAAGGCCTGCTATATTTG-ACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
** ** ** *** * * * *
645824 CTATATT-GGACTTAAAGGTGAT--AAAGGTGCCA-ATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCG
325 CTATATTCGTCCCCAAATATG-TCGAATCCT-CCACCTA--CT-A-GCTAGGCC--CTAAATT-G
*** * * *** * * * * ** *
645885 TCCCCACATAT-G-TC-GA-ATCCTCCA----CCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTG
381 T-TGAAAAT-TGGCCCGGACAAAAT-GAGGTGTCTAC-AGCT-GCCCCT---CT-TTGGCAGTT-
* * * * * * *** ****** *
645942 GCCTG-G-A-CA-AAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAAC
436 -TCTGAGTATCAGGAA-CA-G-G-CCAAAG--ACAAATAGACACCA-TTT-T--G--TC-TG--C
* * * * * * *
646003 AGGCC-AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTT--TGGTGATTAA
485 -GGCCGCATGTC--AT-GA-A-C----T-T-T--GG-TG-AT-TAATG--CTTCGTCGTGATGAA
** *
646065 TGCTTCGCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTG
531 -GAGT-G-C---AT--CG-GT--------GACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTG
*
646130 TCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTA
579 TCTTCCCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTA
*
646195 GAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCGCTGTGCAGATTCAA
644 GAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAA
* * *
646260 GGCCTGCCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATT
709 GGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATT
*
646325 CACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGC
774 CACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGC
646390 AACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTT
839 AACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTT
646455 TAAAAAT
904 TAAAAAT
* * *
646462 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATA
* * * *
646527 TGTTGAGTCAATGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
* *
646592 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATACGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
129 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
* *
646657 GTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
194 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
* * * *
646722 TGATTTAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTA
259 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
** ** ** *** * ** *
646783 GCTATATT-GAACTTAAAGGTGAT--AAAGGTGCCA-ATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATTC
324 GCTATATTCGTCCCCAAATATG-TCGAATCCT-CCACCTA--CT-AGCT-AGGCC--CTAAATT-
** * * * ** * ** * * **** *
646844 GTCCCCACATATGTCGAATCCTC-CACCTACTAGCTAGG-CCCTAAATTGTTGAAAAT-TGGCCT
380 GT--TGA-AAAT-T-G--GCC-CGGACAAAAT-G--AGGTGTCTACA--GCTGCCCCTCT---TT
* * * * ** * *
646906 GGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGG--CCGTTTCTAAGTATC-AAGA-ACAGGC
429 GG-C------A-GTTTCT-GAG-TA----TC--AGGAACAG-GCCAAAG-A-CAAATAGACA--C
** * * * * ** ** *
646967 CA--AAGACAAAT-AGACAC-CATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGC
473 CATTTTGTC---TGCGGC-CGCA---TGTC-A-TG-AAC-T-T-TGGT--------GATTAATGC
* * * *
647028 TTAGCCGTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCT
517 TTCGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCT
* * *
647093 TCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCGAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAG
582 TCCCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAG
* *
647158 TTT-GAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTT-CAATGTGCCACGGTGCAGAGTCAAGGC
647 TTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGC
* * *
647221 CTGCTACACTTGACTTAAAGATGATGGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCA-TACGTTGATTCA
712 CTGCCACACTAGACTTAAAGATGAT-GAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCA
* * * *
647285 CGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGAGGAGAAACAGGATGTCAATCTGCTGACTCCAC-G---G--
776 CGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGA-TTCACTGTCAGCA
* * * * * ** * *
647344 A-AGGT-G-C---CA-AT--G-TG-TTG---A-GT--AGA-TCAAGGCCCGCGCCATT-GGTCTT
840 ACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTT
**
647390 ---ACC
905 AAAAAT
* * * * * * ** * **
647393 GATGCGGTGGCGATATTGCTGATTCACGG-CACCTACCTTGGACTTCAAGGTGGAGGTGCC-ATA
1 GATGAGGTGCCAATA-TGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTT-AAAGACGAGGTGCCAATA
* * * * * * *
647456 TGTTGATTCCA-GCCAGC-TCTCTTGGACTT-AAGGTGAGGTGCCAATATGCTAATTCAAGGCCA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGAC-ATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
* * * * *
647518 ACTATATTGGACTCAAAGGTGAGGTGGCCAATATGTTGATTCAAGGCACAGCTATATTGGACTTA
128 ACTACATTCGACTTAAAGGTGAGG-GGCCAATATGCTGATTCAAGAC-CAGCTATATTGGACTTA
* * *
647583 AAGGTGAGGTGCC-ATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGTGCCAATA
191 AAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATA
*
647647 TGCTGATTCAAGG-CTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAG
256 TGCTGATTCAAGGCCT-GCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAG
* *
647711 GCCAACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGA
320 GCCAGCTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGA
*
647776 AAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGA
385 AAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGA
*
647841 ACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAAT
450 ACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAAT
* *
647906 GCTTCGCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGT
515 GCTTCGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGT
*
647971 CTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAG
580 CTTCCCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAG
*
648036 AGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCGCTGTGCAGATTCAAG
645 AGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAG
* * *
648101 GCCTGCCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTC
710 GCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTC
*
648166 ACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCA
775 ACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCA
648231 ACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTT
840 ACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTT
648296 AAAAAT
905 AAAAAT
* * *
648302 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATA
* * * *
648367 TGTTGAGTCAATGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
648432 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
129 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
* *
648497 GTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
194 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
* * * *
648562 TGATTTAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTA
259 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
** ** ** *** * ** *
648623 GCTATATT-GAACTTAAAGGTGAT--AAAGGTGCCA-ATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATTC
324 GCTATATTCGTCCCCAAATATG-TCGAATCCT-CCACCTA--CT-AGCT-AGGCC--CTAAATT-
** * * * ** * ** * * **** *
648684 GTCCCCACATATGTCGAATCCTC-CACCTACTAGCTAGG-CCCTAAATTGTTGAAAAT-TGGCCT
380 GT--TGA-AAAT-T-G--GCC-CGGACAAAAT-G--AGGTGTCTACA--GCTGCCCCTCT---TT
* * * * *** * *
648746 GGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGG-CCATTTCTAAGTATC-AAGA-ACAGGCC
429 GG-C------A-GTTTCT-GAG-TA----TC--AGGAACAGGCCAAAG-A-CAAATAGACA--CC
** * * * * ** ** *
648808 A--AAGACAAAT-AGACAC-CATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCT
474 ATTTTGTC---TGCGGC-CGCA---TGTC-A-TG-AAC-T-T-TGGT--------GATTAATGCT
* * * *
648869 TAGCCGTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTT
518 TCGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTT
* * *
648934 CCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCGAAGGCTTGACCTCCTTAG--A----T--A--GGTGTAGAGT
583 CCCAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
*
648989 TTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAG-ATTTTGCAATGTGCCACGGTGCAGATTCAAGGCC
648 TTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCC
* * * *
649053 TGCTACGCTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACG
713 TGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
649118 GCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATA--C-G-----C--T--G--AC-
778 GCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACA
* * * * * **
649168 --T-CAC--G--GA--AG--G--TGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT--A
843 GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAA
649217 AA-
908 AAT
* * * * **
649219 GATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATATG
* * * * * *
649284 TTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
66 CTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * * *
649349 ATATTGGACTCAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
131 ACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* * * *
649414 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
196 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
* *
649479 ATTCAAGG-CTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
261 ATTCAAGGCCT-GCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
* *
649543 CTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTCAAAATT
325 CTATATTCGTCCCCAAATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATT
* *
649608 GGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGG
390 GGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGG
*
649673 CCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTC
455 CCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTTC
* *
649738 GCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCC
520 GTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCC
*
649803 CTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTT
585 CAACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTT
*
649868 GGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCGCTGTGCAGATTCAAGGCCTG
650 GGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTG
* * *
649933 CCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
715 CCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
*
649998 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGT
780 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAGT
650063 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAA
845 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAA
650128 T
910 T
* * *
650129 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATA
* * * *
650194 TGTTGAGTCAATGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAA
64 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
650259 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
129 CTACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAG
* *
650324 GTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
194 GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGC
* *
650389 TGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
259 TGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
** ** * * * * * * * *
650450 GCTATATT-GAACTTAAAGGTGAGGTGCCAAT-ATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTA
324 GCTATATTCGTCCCCAAA--T-ATGT-CGAATCCT-C-CA-CCTA--CTAGC--TA--GGCCCTA
* * * * * * * * *
650513 AA--GGTGATAAA--GG---TGCCAATATGCTGAT-TC-A-AG--GCCAACTATATT--C-G-TC
376 AATTGTTGA-AAATTGGCCCGGACAAAATG-AGGTGTCTACAGCTGCC-CCTCT-TTGGCAGTTT
** * *** ** *** ** * ** * *
650562 CCCACATATGTCGAATC-CTCCACCTACTAGCTAGGC-CCTAAATTGT-TGAAAATTGGCCTGGA
437 CTGA-GTATCAGGAA-CAGGCCAAAGAC-AAATAGACACC-ATTTTGTCTG-----CGGCC-GCA
**** * * **** * * *** *
650624 CAAAATGAAGTGTCTACAGCT-ACCCCT-CTTTGGCCGT--TTCTGAGT--ATCAGG-AACAGG-
492 TGTCATGAACT-T-T---GGTGATTAATGC-TTCGTCGTGATGAAGAGTGCATC-GGTGAC-GGT
* ** * ***** * * * * ** * *
650681 --CCAAAGACAAAT-AGACACCA--TTTTGTCTGCGGCC-GC-ATGTCAT-GACCTTTGGTGATT
549 TTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTC--CCAACTAGGTTTTGGA-ATTT--T--CT
* * * * * *
650738 AATGCTT--CGTCGTGATGA-AGAGTG--CATCGGTG-ACG-GTTT----C-GA---TGGAA-AA
607 AAGGCTTGACCTCCTTA-GATAG-GTGTAGATTGGTGTA-GAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAA
* ** * * * * *
650787 -ATGAGTTTGTAGGGTTTGTC--T-TCCCTACTAGGTTTTGGA-ATTTTCGAAGGCTTGACCTC-
669 TACG-GTCAGTA--TTTTG-CAATGTGCC-ACT--G---TGCAGA--TTC-AAGGCCTG-CCACA
** * * * **
650846 CTTAGA-TAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGA-AGAATACGG-TCAGTATT
720 C-TAGACT---TAAAGA-TGATG-AG-G-AT-GAA--GA--GT-GATA-AA-A-GGACCAGTACG
* **
650908 TTGCAATGTGCCACGGTGCAGATTCAAGGCCTGCTACACTT-GACTTAAAGATGATGAGGATGAA
768 TTG--AT-T--CAC-G-GC-----CAA---C-G--ATA-TTGGGTTTAAAGATGA-GA--A--AA
* * * * * * * * * * ** *
650972 GAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATA-TTGGGTTTAAAGATGAG-A-AA
809 -AG-GAT-----G-TCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
* * * ** * **
651034 ----AA-G-GATG--TCAA----TA-TGC--T--G-ACT--CACG
866 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
* * * * * *
651059 GA--AGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATG
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATATG
* * * * * * *
651122 CTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGTTGATTCAAGACCAGCT
66 CTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * * * * *
651187 ATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTCAAAGGG
131 ACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* *
651252 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
196 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
* *
651317 ATTCAAGGCCAGCTATA-TTGAACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAG
261 ATTCAAGGCCTGCTATATTTG-ACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
** ** ** *** * * * *
651377 CTATATT-GGACTTAAAGGTGAT--AAAGGTGCCA-ATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCG
325 CTATATTCGTCCCCAAATATG-TCGAATCCT-CCACCTA--CT-A-GCTAGGCC--CTAAATT-G
*** * * *** * * * * ** *
651438 TCCCCACATAT-G-TC-GA-ATCCTCCA----CCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTG
381 T-TGAAAAT-TGGCCCGGACAAAAT-GAGGTGTCTAC-AGCT-GCCCCT---CT-TTGGCAGTT-
* * * ***** ** * * * *** * *
651495 GCCTG-G-A-CA-AAATGAGG-TGTCTACAGCT-G-C-CCCTCTTTGGCAGTTTCTG-AGTATCA
436 -TCTGAGTATCAGGAA-CAGGCCAAAGACAAATAGACACCAT-TTTGTCTGCGGCCGCA-TGTCA
* * * ** * ** **
651551 GGAAC--AGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTC-TGCGGCCGCA-TGTCATGACCTTTGGT
497 TGAACTTTGG----TGATTAAT-G----C--TTCGTCGTGATGAAG-AGTG-CAT---C---GGT
* * * * ** * * **** *
651612 GATTAATGCTTCGTCG-TGATGAAGAGTGCA-TCGGTGACGGTTTCG-ATGGAAAAATGAGTTTG
543 G----ACGGTT--TCGATG--GAAAAATG-AGTTTGT-AGGGTTT-GTCTTCCCAACT-AG---G
* *
651674 TAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCGAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAG
593 T----TTTG-------GA--A----------TTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAG
*
651739 ATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACGGTG
635 ATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTG
* * *
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700 CAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGT
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765 ACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTC
* * * *
651930 AC--T------C------AC--G--GA--AG--G--TGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGAC
830 ACTGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGC
**
651971 ATT-GGACTT--AAA-
895 ATTGGGTTTTAAAAAT
* * * * **
651983 GATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATATG
* * * * * *
652048 TTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
66 CTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * * * *
652113 ATATTGGACTCAAAGGGGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
131 ACATTCGACTTAAAGGTGAGGGGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* * *
652178 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
196 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
* *
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*
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*
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*
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* * *
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*
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*
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* * * * *
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*
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780 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACAGT
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845 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAA
652892 T
910 T
* * *
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* * * *
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*
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* *
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* * *
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Statistics
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*
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* * * * * *
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* * *
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* *
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* *
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*
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* * * * *
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* * *
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*
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* * *
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*
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* *
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*
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* *
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* *
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* * **
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* * * * * * *
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*
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* * *
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*
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*
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* * * *
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* * * * * *
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*
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*
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* * * *
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AAGGCCAACTATA
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* * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* * * * * *
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* * *
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* *
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* *
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* *
649415 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACCTAAAGGTG
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*
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*
649511 ATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATT
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647420 GGCACCTACC
* * * *
647430 TTGGACTTC-AAGGTGGAGGTGCC-ATATGTTGATTCCAGCCAGCTCTCTTGGACTT-AAGGTGA
1 TTGGAC-TCAAAGGT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA
* * *
647492 GGTGCCAATATGCTAATTCAAGGCCAACTATATTGGA-CTCAAAGGTGAGGTGGCCAATATGTTG
64 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACCT-AAAGGTGAGGT-GCCAATATGCTG
647556 ATTCAAGGCACAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC-ATATGCTGATTCAAGGCCAGCTAT
127 ATTCAAGGC-CAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTAT
*
647620 ATTGAACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA
191 ATTGAACTTAAA-GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAA-GCTAGCTATATTGAACTTAAAGGTGA
647685 TAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCAC
254 TAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCAC
*
647750 CTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCC
319 CTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCC
* * *
647815 TCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCC
384 TCTTTGGCAGTTTCTAAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCC
*
647880 GCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGA
449 GCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGA
* *
647945 TGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCT
514 TGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCGAAGGCTTGACCT
648010 CCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTT
579 CCTTAGA-A---GTA-A-TGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTT
* *
648075 GCAATGTGCCGCTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAG
638 GCAATGTGCCACGGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAG
648140 TGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGAT
703 TGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGAT
* * * *
648205 GTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTG
768 GTCAATACGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTAAAGATGAG-AG-ATGCCAATATGCTG
* ** *
648270 ATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAG
831 ATTCAAGGCCAACGACATTGGGACTT-AAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGACCAG
* * * *
648335 CGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAATGCCAGCGACA
895 CGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGACA
* * * * * *
648389 TTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAATGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTGAG
1 TTGGACTCAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAA-GCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAG
* * *
648454 GTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATT
65 GTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATT
* *
648519 CAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATTG
130 CAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTG
*
648584 GACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGAACTTAAAGGTGATAAA
195 AACTTAAA-GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAA-GCTAGCTATATTGAACTTAAAGGTGATAAA
* *
648649 GGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTAC
258 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTAC
648714 TAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTT
323 TAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTT
648779 TGGCCA-TTTCTAAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCA
388 TGG-CAGTTTCTAAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCA
* *
648843 TGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGG
452 TGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGG
*
648908 AAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCGAAGGCTTGACCTCCT
517 AAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCGAAGGCTTGACCTCCT
648973 TAG-A-T-A-GGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAG-ATTTTGCAATGTGC
582 TAGAAGTAATGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGC
* * *
649033 CACGGTGCAGATTCAAGGCCTGCTACGCTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAG
647 CACGGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAAAGTGATAACAG
649098 GACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATACG
712 GACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATACG
*
649163 CTGACTCACGGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAG-G-
777 CTGACTCAC----GGT--C---------AG-CAA---CA--G---TTAGACTTAAAGATGAGAGA
* * * * *
649226 TGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATT-GGACTT-AAA-GGTG-AGGTGCCAATATGTTG
818 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGGGACTTAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTG
* * ** * * *
649287 ATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTAT
883 AGTCAAGACCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGAC
649351 A
948 A
649352 TTGGACTCAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAG
1 TTGGACTCAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAA-GCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAG
*
649417 GTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATT
65 GTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATT
* *
649482 CAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTAT
130 CAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTAT
649547 ATT
191 ATT
649550 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 1049, Mismatches: 77, Indels: 62
0.88 0.06 0.05
Matches are distributed among these distances:
949 146 0.14
950 40 0.04
952 1 0.00
953 3 0.00
954 1 0.00
955 1 0.00
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971 1 0.00
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TTGGACTCAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGG
TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGA
ACTTAAAGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGCTAGCTATATTGAACTTAAAGGTGATAAAGGT
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAG
CTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGG
CAGTTTCTAAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTC
ATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATAAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAA
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AGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATACGCTGA
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* * * * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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*
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*
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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* * *
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* * *
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*
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* * * *
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** ** * * *
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* * ** * * * * * * *
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* ** * * * * *
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186 TCAAAGGGGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCA
* * *
653051 ATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGC
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* * *
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* *
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* * *
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*
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*
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*
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* *
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*
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* *
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*
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* *
655111 GCCAATATACTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
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*
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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* * **
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* * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * *
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TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGGACTTAAAGATGAAGG
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*
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* * * * * *
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** * * *
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* * * *
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* * *
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1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * *
656159 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATATTTGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
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GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
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* * * * * *
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1 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
* * * *
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* * *
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*
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*
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*
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AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
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657696 TTTTAAAAAT
*
657706 GATGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
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* * * * * *
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1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * *
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1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * *
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* * *
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* * *
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*
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GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
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656746 TCACGGAAGG
* * * * ** *
656756 TGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT--AAA-GATG-AGGTGCGAATATGCT
1 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGTGCCAATATGCT
* * * * ** * * * * *
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* * * *
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*
656945 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
657010 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGG-CTAGCTATA
261 TTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCT-GCTATA
*
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*
657138 ATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTAGAAAAAATGAGG
390 ATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCAGAAAAAATGAGG
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*
657268 CATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTCGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATAAAGAGTGCA
520 CATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTCGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATAAAGAGTGCA
*
657333 TCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATT
585 TCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCAACTAGGTTTTGGAATT
*
657398 TTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGA
650 TTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTAGAACGGATTGTGGAAGA
*
657463 ATACGATCAGTATTTTGCAATGTGGCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGA
715 ATACGATCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGA
* * *
657528 TGATAAGGATGAAGTGTGATAAAAGGACCAGTTCGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAA
780 TGATAAGGACGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAA
* * *
657593 AGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACTGTCAGCAACTGTTAGACTTGAAGATGAGAA
845 AGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAA
657658 GAA
910 GAA
* *
657661 TGCCAAAGTGCTGATTCAATGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGTGCCAATATGCT
1 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGTGCCAATATGCT
*
657726 GATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGA
66 GATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCAA
*
657791 CATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTCGACTTAAAGGTG
131 CATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTG
* *
657856 AGGGGCCAATATGTTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
657921 TTCAAGGCTAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATAT
261 TTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATAT
*
657986 TTGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCAAATA
326 TGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCAAATA
* *
658051 TGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGT
391 TGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCAGAAAAAATGAGGT
*
658116 GTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACC
456 GTCTACAGCTGCCCCTCCTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACC
* *
658181 ATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCAT
521 ATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTCGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATAAAGAGTGCAT
658246 CGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCAACTAGGTTTTGGAATTT
586 CGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCAACTAGGTTTTGGAATTT
658311 TCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTAGAACGGATTGTGGAAGAA
651 TCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTAGAACGGATTGTGGAAGAA
* * *
658376 TATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGTT
716 TACGATCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGAT
* *
658441 TATGAGGACGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAA
781 GATAAGGACGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAA
658506 GATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAG
846 GATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAG
658571 AA
911 AA
*
658573 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCT
1 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGTGCCAATATGCT
* *
658638 GAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCGGCAA
66 GATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCAA
* *
658703 CATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGATGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAATGTG
131 CATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTG
* * *
658768 AGGTGCCGATTTGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTAA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* *
658833 TTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATAT
261 TTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATAT
658898 TGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
326 TGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
658947 GAACTTAAAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.30, C:0.17, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (912 bp):
TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGTGCCAATATGCT
GATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCAA
CATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTG
AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
TTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCTGCTATAT
TGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCAAATA
TGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCAGAAAAAATGAGGT
GTCTACAGCTGCCCCTCCTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACC
ATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGAACTTCGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATAAAGAGTGCAT
CGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCAACTAGGTTTTGGAATTT
TCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTAGAACGGATTGTGGAAGAA
TACGATCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGAT
GATAAGGACGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAA
GATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAG
AA
Found at i:658745 original size:48 final size:48
Alignment explanation
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Period size: 48 Copynumber: 8.6 Consensus size: 48
658617 TGATGAAGGC
* * **
658627 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
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* * * * * * *
658676 GCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * * * *
658724 GCGAATATGATGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAATGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * *
658772 GCCGATTTGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* **
658820 GCCAATATGCTAATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
658916 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
658964 GCCAATATGCTGATTAAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
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*
659016 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
659047 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 328, Mismatches: 39, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:658860 original size:144 final size:144
Alignment explanation
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Period size: 144 Copynumber: 3.2 Consensus size: 144
658563 ATGAGAAGAA
* ** ** * *
658573 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCT
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATT-GGACTT--AAA-GGTG-AGGTGCCAATATGCT
* * ** * * * * *
658638 GAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCGGCAA
61 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTA
*
658703 CATTGGACTTAAAGATGAGG
125 TATTGGACTTAAAGATGAGG
* * * * *
658723 TGCGAATATGATGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAATGTGAGGTGCCGATTTGCTGATTC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
* * **
658788 AAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTAATTCAAGGCCAATTATATTGG
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
*
658853 ACTTAAAGGTGAGG
131 ACTTAAAGATGAGG
* *
658867 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
* * *
658932 AAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCTAGCTATATTGG
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
*
658997 ACTTAAAGGTGATAAAGG
131 ACTTAAA---GAT-GAGG
659015 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
659043 TATTCGTCCC
Statistics
Matches: 272, Mismatches: 44, Indels: 10
0.83 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
144 164 0.60
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TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
ACTTAAAGATGAGG
Found at i:658980 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 658855--658983 Score: 66
Period size: 26 Copynumber: 5.3 Consensus size: 26
658845 TATATTGGAC
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* ** *
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1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT-GA
658902 CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* ** *
658929 TTCAAGGCCA---G-CTATAT--TGAA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG-A
658950 CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
658977 TTAAAGG
1 TTAAAGG
658984 CTAGCTATAT
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 16, Indels: 32
0.60 0.13 0.27
Matches are distributed among these distances:
20 3 0.04
21 3 0.04
22 24 0.34
23 2 0.03
25 2 0.03
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27 3 0.04
28 3 0.04
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.27, T:0.27
Consensus pattern (26 bp):
TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
Found at i:659754 original size:48 final size:47
Alignment explanation
Indices: 659626--659910 Score: 277
Period size: 48 Copynumber: 5.8 Consensus size: 47
659616 TTTTAAAAAT
* * *
659626 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTT-AAGGCCAGCGATATTCGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGA-TTCAAGGCCAG-TATATTGGACTTAAA
* * * * * *
659675 GACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCTAGGCCAGTGACATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGT-ATATTGGACTTAAA
* * * **
659724 AATGACGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATAAGGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC-AGTATATTGGACTTAAA
659772 GGA-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 -GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG-TATATTGGACTTAAA
*
659820 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG-TATATTGGACTTAAA
* *
659868 GGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATT
1 ---GAT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG-TATATT
659911 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 197, Mismatches: 29, Indels: 17
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
47 2 0.01
48 117 0.59
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Consensus pattern (47 bp):
GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGTATATTGGACTTAAA
Found at i:659819 original size:96 final size:96
Alignment explanation
Indices: 659635--659910 Score: 324
Period size: 96 Copynumber: 2.8 Consensus size: 96
659625 TGATGAAGGC
* * * * *
659635 GCCAATATGCTGAGTT-AAGGCCAGCGATATTCGACTTAAA-GACGAAGGTGCCAATGTGTTGAG
1 GCCAATATGCTGA-TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGA-G-AGGTGCCAATATGCTGAT
* *
659698 TCTAGGCCAG-TGACATTGGACTTAAAAATGACGT
63 TCAAGGCCAGCT-ATATTGGACTTAAAAATGACGT
* **
659732 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATAAGGGACTTAAAGGAGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGAGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
** *
659797 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
66 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAAATGACGT
*
659828 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGA
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA-G-G--AGAGGTGCCAATATGCTGA
*
659893 TTTAAGGCCAGCTATATT
62 TTCAAGGCCAGCTATATT
659911 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 154, Mismatches: 18, Indels: 11
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
96 81 0.53
97 35 0.23
98 3 0.02
100 35 0.23
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.26, T:0.26
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGAGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAAATGACGT
Found at i:660484 original size:864 final size:864
Alignment explanation
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Period size: 864 Copynumber: 2.3 Consensus size: 864
658769 GGTGCCGATT
* * * * ** * * * *
658779 TGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCTAATTCAAGGCCA
1 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTCGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCA
*** * * *
658843 ATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
66 GCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
*
658908 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
131 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
* *
658973 CTGATTAAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
196 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
*
659038 AACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
261 AGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
* * *
659103 TTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACA
326 TTGGCCCGGACAAAATAAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACA
* *
659168 GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGAATAATGCT
391 GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGAGAATAAAGCT
* * *
659233 TCGTCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCT
456 TCGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTCTAGGGTATGTCCT
659298 CCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
521 CCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
659363 TTGAAACGGATTGTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTATGCAGATTCAAGGCC
586 TTGAAACGGATTGTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTATGCAGATTCAAGGCC
* *
659428 TGCCACACTGGACTTAAAGATGGTGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
651 TGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
*
659493 GCCAACGATATTGGGTTTAAAAATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACA
716 GCCAACGATATTGGGTTTAAAAATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACA
659558 GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAA
781 GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAA
659623 AATGATGAAGGCGCCAATA
846 AATGATGAAGGCGCCAATA
* *
659642 TGCTGAGTTAAGGCCAGCGATATTCGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCTAGGCCA
1 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTCGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCA
** * * **
659707 GTGACATTGGACTTAAAAATGACGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATAAGGGACTTAAA
66 GCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
*
659772 GGAGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
131 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
*
659837 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCC
196 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
*
659902 AGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGTTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
261 AGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
*
659967 TTGGCCCGGACAAAATAAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACA
326 TTGGCCCGGACAAAATAAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACA
* *
660032 GGCCAAAGACAAATGGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGAGATTAAAGCT
391 GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGAGAATAAAGCT
*
660097 TCGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTCTAGGGTATGTCTT
456 TCGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTCTAGGGTATGTCCT
* * *
660162 CCGTGCTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGTCCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
521 CCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
*
660227 TT-AGAACGGATTGTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGC
586 TTGA-AACGGATTGTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTATGCAGATTCAAGGC
* *
660291 CTGCCACACTAGACTTAAAGTTTATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCAC
650 CTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCAC
*
660356 GGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAAC
715 GGCCAACGATATTGGGTTTAAAAATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAAC
660421 AGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAA
780 AGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAA
660486 AAATGATGAAGGCGCCAATA
845 AAATGATGAAGGCGCCAATA
* *
660506 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCG
1 TGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTCGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCA
* * *
660571 GCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGATGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAA
66 GCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
* * * *
660636 TGTGAGGTGCCGATTTGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
131 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
**
660701 CTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
196 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
660762 AGCTATATT
261 AGCTATATT
660771 GGACTTAAAG
Statistics
Matches: 1056, Mismatches: 71, Indels: 7
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
860 34 0.03
863 31 0.03
864 991 0.94
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (864 bp):
TGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTCGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCA
GCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
AGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
TTGGCCCGGACAAAATAAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACA
GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGAGAATAAAGCT
TCGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTCTAGGGTATGTCCT
CCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
TTGAAACGGATTGTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTATGCAGATTCAAGGCC
TGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
GCCAACGATATTGGGTTTAAAAATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACA
GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAA
AATGATGAAGGCGCCAATA
Found at i:660617 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 660499--660870 Score: 492
Period size: 48 Copynumber: 7.6 Consensus size: 48
660489 TGATGAAGGC
* * **
660499 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * *
660548 GCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * * * *
660596 GCGAATATGATGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAATGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * *
660644 GCCGATTTGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
**
660692 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
660740 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
660788 GCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
*
660840 GCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
660871 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 286, Mismatches: 33, Indels: 5
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 215 0.75
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ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (48 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:661539 original size:960 final size:960
Alignment explanation
Indices: 659712--662384 Score: 4887
Period size: 960 Copynumber: 2.8 Consensus size: 960
659702 GGCCAGTGAC
** * * ** *
659712 ATTGGACTTAAAAATGACGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATAAGGGACTTAAAGGAGA
1 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGA
659777 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGAT
66 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGAT
*
659842 TCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTA
131 TCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTA
*
659907 TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGTTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGC
196 TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGC
* * * * *
659972 CCGGACAAAATAAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCA
261 CTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCA
* * * * *
660037 AAGACAAATGGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGAGATTAAAGCTTCGCC
326 AAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCC
* * * * * *
660102 GTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTCTAGGGTATGTCTTCCGTG
391 GTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTA
* * *
660167 CTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGTCCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTAGA
456 CTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGA
* *
660232 ACGGATTGTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCA
521 ACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTA
* * * *
660297 CACTAGACTTAAAGTTTATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAA
586 CACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAA
660362 CGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAG
651 CGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAG
660427 ACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGA
716 ACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGA
660492 TGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTG
781 TGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTG
*
660557 TTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGATGATTCAAGGCCAACT
846 TTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGAGAATATGATGATTCAAGGCCAACT
* * *
660622 ACATTGGACTTAAATGTGAGGTGCCGATTTGCTGATTCAAGACCAGCTAT
911 ACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTAT
660672 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGA
1 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGA
660737 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGAT
66 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGAT
660802 TCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTA
131 TCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTA
660867 TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGC
196 TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGC
*
660932 CTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAAGAACAGGCCA
261 CTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCA
660997 AAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCC
326 AAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCC
661062 GTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTA
391 GTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTA
*
661127 CTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGCTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGA
456 CTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGA
*
661192 ACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACGGTGCAGATTCAAGGCCTGCTA
521 ACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTA
*
661257 CACTTGACTTGAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAA
586 CACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAA
661322 CGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAG
651 CGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAG
661387 ACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGA
716 ACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGA
*
661452 TGAAGGCGCTAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTG
781 TGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTG
661517 TTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGAGAATATGATGATTCAAGGCCAACT
846 TTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGAGAATATGATGATTCAAGGCCAACT
661582 ACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTAT
911 ACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTAT
* *
661632 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTAGACTTAAAGGTAA
1 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGA
*
661697 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCAAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGAT
66 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGAT
661762 TCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTA
131 TCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTA
661827 TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGC
196 TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGC
661892 CTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCA
261 CTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCA
661957 AAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCC
326 AAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCC
662022 GTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTA
391 GTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTA
662087 CTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGA
456 CTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGA
662152 ACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTA
521 ACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTA
*
662217 CACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCGGTACGTTGATTCACGGCCAA
586 CACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAA
* * * *
662282 CGATATTAGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGGTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAG
651 CGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAG
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716 ACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAG
662385 AGCAGCTATA
Statistics
Matches: 1658, Mismatches: 55, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
960 1658 1.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.18, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (960 bp):
ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGA
GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGAT
TCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTA
TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGC
CTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCA
AAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCC
GTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTA
CTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGA
ACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTA
CACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAA
CGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAG
ACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGA
TGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTG
TTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGAGAATATGATGATTCAAGGCCAACT
ACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTAT
Found at i:661586 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 661462--661830 Score: 477
Period size: 48 Copynumber: 7.6 Consensus size: 48
661452 TGAAGGCGCT
* * **
661462 AATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCC
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCC
* * * * * * * **
661511 AATGTGTTGAGTCAAGGCCGGCAACATTGGACTTAAAGATGAGGTGAG
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
* * *
661559 AATATGATGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
*
661607 AATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
** * *
661655 AATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTAGACTTAAAGGTAAGGTGCC
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
*
661703 AATATGCTGATTCAAGGCAAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
*
661751 AATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCC
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCC
*
661803 AATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATT
1 AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
661831 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 282, Mismatches: 34, Indels: 5
0.88 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 214 0.76
49 35 0.12
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ACGTcount: A:0.33, C:0.15, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (48 bp):
AATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCC
Found at i:661719 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 661690--661767 Score: 60
Period size: 26 Copynumber: 3.2 Consensus size: 26
661680 ATTAGACTTA
661690 AAGGTAAGGTGCCAATATGCTGATTC
1 AAGGTAAGGTGCCAATATGCTGATTC
* * *
661716 AAGGCAA---G-CTATAT--TGGACTTA
1 AAGGTAAGGTGCCAATATGCT-GA-TTC
*
661738 AAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
1 AAGGTAAGGTGCCAATATGCTGATTC
661764 AAGG
1 AAGG
661768 CTAGCTATAT
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 7, Indels: 16
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Matches are distributed among these distances:
20 1 0.03
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ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.28, T:0.26
Consensus pattern (26 bp):
AAGGTAAGGTGCCAATATGCTGATTC
Found at i:662871 original size:566 final size:566
Alignment explanation
Indices: 661799--662954 Score: 2003
Period size: 566 Copynumber: 2.0 Consensus size: 566
661789 GTGATAAAGG
* *
661799 TGCCAATATGCTGATTTAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTA
1 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTA
* *
661864 GCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTG
66 GCTAGGCCCTAAATTGTTAAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTG
* *
661929 GCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGT
131 GCCATTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACCGCCGCATGT
* **
661994 CATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATGAAGCGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAA
196 CATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGCAACGGTTTCGATGGAAA
* * *
662059 AATGAGTTTGTCGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAG
261 AATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTGAG
*
662124 ATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATG
326 ATAGGTGTACATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATG
662189 TGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAA
391 TGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAA
662254 CAGGACCGGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTAGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
456 CAGGACCGGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTAGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
*
662319 ATGGTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
521 ATGCTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
* * *
662365 TGCCAATGTGCTGATTCAAGAG-CAGCTATATTCGTCCCGATATATGTTGAATCCTCCACCTACT
1 TGCCAATGTGCTGATTCAAG-GCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACT
662429 AGCTAGGCCCTAAATTGTTAAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTT
65 AGCTAGGCCCTAAATTGTTAAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTT
* * * *
662494 GGCCATTTTTGAGTATTC-AGAACAGGCCAAAGACAAATATACACCATTTTGTTTGCCGCCGCAT
130 GGCCATTTCTGAGTA-TCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACCGCCGCAT
* *
662558 GTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCAACGG-TTCTGATGG
194 GTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGCAACGGTTTC-GATGG
*
662622 AAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCT
258 AAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCT
* *
662687 GAGATAGGTGTACATTGGTGTAGAGTTTGGAATGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTTTTTTGCA
323 GAGATAGGTGTACATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCA
*
662752 ATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTAGACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGA
388 ATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGA
* *
662817 TAACAGGACCGGTACGTTGATTCACGGCCAATGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTC
453 TAACAGGACCGGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTAGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTC
662882 AATATGCTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
518 AATATGCTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
662931 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCA
1 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCA
662955 ACGGCATTGG
Statistics
Matches: 557, Mismatches: 29, Indels: 8
0.94 0.05 0.01
Matches are distributed among these distances:
565 4 0.01
566 550 0.99
567 3 0.01
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.25, T:0.29
Consensus pattern (566 bp):
TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTA
GCTAGGCCCTAAATTGTTAAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTG
GCCATTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACCGCCGCATGT
CATGACCTTTGGTGATTAATGCTTAGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGCAACGGTTTCGATGGAAA
AATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTCGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTGAG
ATAGGTGTACATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATG
TGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTACACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAA
CAGGACCGGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTAGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
ATGCTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA
Found at i:663106 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 662985--663356 Score: 564
Period size: 48 Copynumber: 7.6 Consensus size: 48
662975 TGATGAAGGC
* * **
662985 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * *
663034 GCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
663082 GCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
663130 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
663178 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
663226 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAAGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
663274 GCTAATATGCTGATTCAAGGCGAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
*
663326 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
663357 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 298, Mismatches: 21, Indels: 5
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 228 0.77
49 39 0.13
52 31 0.10
ACGTcount: A:0.31, C:0.17, G:0.26, T:0.26
Consensus pattern (48 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:663303 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 663230--663303 Score: 53
Period size: 22 Copynumber: 3.2 Consensus size: 22
663220 TGAGGTGCCA
*
663230 ATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
1 ATATGCTGATTCAAGGCGAGCT
* *
663252 ATAT--TGGACTTAAAGGTGAAGTGCT
1 ATATGCT-GA-TTCAAGGCG-A--GCT
663277 AATATGCTGATTCAAGGCGAGCT
1 -ATATGCTGATTCAAGGCGAGCT
663300 ATAT
1 ATAT
663304 TGGACTTAAA
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 5, Indels: 16
0.65 0.08 0.27
Matches are distributed among these distances:
20 1 0.03
21 2 0.05
22 14 0.36
23 4 0.10
25 4 0.10
26 11 0.28
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Consensus pattern (22 bp):
ATATGCTGATTCAAGGCGAGCT
Found at i:663315 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 663242--663315 Score: 53
Period size: 22 Copynumber: 3.2 Consensus size: 22
663232 ATGCTGATTC
*
663242 AAGGCCAGCTATATTGGACTTA
1 AAGGCGAGCTATATTGGACTTA
* *
663264 AAGGTGAAGTGCTA-ATATGCTGA-TTC
1 AAGGCG-A--GCTATAT-TG--GACTTA
663290 AAGGCGAGCTATATTGGACTTA
1 AAGGCGAGCTATATTGGACTTA
663312 AAGG
1 AAGG
663316 TGATAAAGGT
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 5, Indels: 16
0.65 0.08 0.27
Matches are distributed among these distances:
21 2 0.05
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Consensus pattern (22 bp):
AAGGCGAGCTATATTGGACTTA
Found at i:664082 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 663945--664364 Score: 534
Period size: 48 Copynumber: 8.6 Consensus size: 48
663935 TGATGAAGGC
* * * **
663945 GCCAATATGGTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * *
663994 GCCAATGTGTTGAGTCAAAGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * * * * *
664042 GCTAATATGCTGATTCAGGGCCAACTACATTCGACCTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
664090 GCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * ** *
664138 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATAATAAACTCAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
664186 GCTAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
664234 GCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
664282 GCCAATATGCTGATTCAAGGCGAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
*
664334 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
664365 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 325, Mismatches: 42, Indels: 5
0.87 0.11 0.01
Matches are distributed among these distances:
48 253 0.78
49 39 0.12
52 33 0.10
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (48 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:664224 original size:960 final size:960
Alignment explanation
Indices: 662365--674156 Score: 12419
Period size: 960 Copynumber: 12.0 Consensus size: 960
662355 ATGAGAAGAA
* * * *
662365 TGCCAATGTGCTGATTCAAGAG-CAGCTATATTCGTCCCGATATATGTTGAATCCTCCACCTACT
1 TGCCAATATGCTGATTCAAG-GCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACT
* *
662429 AGCTAGGCCCTAAATTGTTAAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTT
65 AGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTT
* * * *
662494 GGCCATTTTTGAGTATTCA-GAACAGGCCAAAGACAAATATACACCATTTTGTTTGCCGCCGCAT
130 GGCCGTTTTTGAGTA-TCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCAT
* * *
662558 GTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCAACGG-TTCTGATGG
194 GTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTTC-GATGG
662622 AAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCT
258 AAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCT
* * * * * *
662687 GAGATAGGTGTACATTGGTGTAGAGTTTGGAATGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTTTTTTGCA
323 TAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCA
* * *
662752 ATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCTAGACTTGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGA
388 ATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGA
* * *
662817 TAACAGGACCGGTACGTTGATTCACGGCCAATGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTC
453 TAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTC
*
662882 AATATGCTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATT
518 AATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATT
662947 CAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGA
583 CAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGA
*
663012 TATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGGT
648 TATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGAT
* * * *
663077 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
713 GAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTG
* * *
663142 ATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATA
778 ATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATA
*
663207 TTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAA
843 TTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAG
* *
663272 GTGCTAATATGCTGATTCAAGGCGAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
908 GTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
*
663325 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTA
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTA
*
663390 GCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGAACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTG
66 GCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTG
*
663455 GCCGTTTTTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTTTGCGGCCGCATGT
131 GCCGTTTTTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGT
* * * * *
663520 CATGACCTTTGGTGATTAACGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAA
196 CATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTTCGATGGAAA
*
663585 AATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAG
261 AATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAG
* *
663650 ATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATG
326 ATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATG
* * *
663715 TGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTTGACTTAAAGTTGATGAGGATGAAGCGTGATAA
391 TGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAA
* * *
663780 CAGGACCAGAACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAC
456 AAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
* *
663845 AAGCTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAA
521 ATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAA
*
663910 GGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGGTGAGTCAAGGCCAGCGATAT
586 GGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATAT
*
663975 TGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAAGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAG
651 TGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAG
* * * *
664040 GTGCTAATATGCTGATTCAGGGCCAACTACATTCGACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATT
716 GTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATT
* *
664105 CAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATAATA
781 CAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTG
* * *
664170 AACTCAAAGGTGAGGTGCTAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTG
846 GACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTG
* *
664235 CCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGAACTTAAAGGTG----AGG
911 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
* ** ** * *** *
664281 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCGAGCTATATT-GGACTTA-A-AGGT-GATAAAGGTGCCA-ATA
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCG--AATCCT-CCACCTA
* * * *** * * *** * *
664341 TGCTGATTCAAGGCCAACTATATTCGTCCCCACATAT-G--TCGA-ATCCTCCA----CCTACTA
63 --CT-A-GCTAGGCC--CTAAATT-GT-TGAAAAT-TGGCCTGGACAAAAT-GAGGTGTCTAC-A
* ** ** *** * * * * * ***
664398 GCTAGGCCCTAAATT-GTTGAAAATTG-GCCTAAACA-AAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCT
117 GCTA-CCCCT-CTTTGGCCG-TTTTTGAG--T-ATCAGGAA-CA-G-G-CCAAAG--A---CAAA
* * ** * * * * * ***
664460 TTGGC-CGTTTTTGAGTATCAGGAACAGGCC-AAAGACAAATAGACACCATTTTGTTTGCGGCCG
167 TAGACACCATTTT--G--TC-TG--C-GGCCGCATGTC--AT-G--ACC--TTTG---G-TGATT
* * * * * *
664523 CATGTCATGACCTTTGGTGATTA-ACGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGA
213 AATG-CTTCACC-ATGATGA--AGA-G--T-G-C---AT----TG-G---C---GACGGTTTCGA
*
664587 TGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCT
255 TGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCT
* *
664652 CCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTT
320 CCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTT
* * *
664717 GCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTTGACTTAAAGTTGATGAGGATGAAGCG
385 GCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAG
* *
664782 TGATAACAGGACCAGAACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGAT
450 TGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGAT
* * *
664847 GTCAACAAGCTGATTCGCGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTG
515 GTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTG
664912 ATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAG
580 ATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAG
* * *
664977 CGATATTGGACTTTAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCGAGCGATATTGGACTTAAA
645 CGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAA
665042 GATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
710 GATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATG
* * *
665107 CTGATTTAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGTTCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
775 CTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * *
665172 ATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCTAATATGCTTATTCAAGGCCAGCTATGTTGGACTTAAAGGT
840 ATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGT
* *
665237 GAGGTGCCAATATGCAGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTG----AGG
905 GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
* ** * * * * * * ** *
665289 TGCCAATATGCTAATTCAAGGCCAGCTATATT-G-GACTA-AAAGGT-GAGGTGC-CAATATGCT
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGA-ATCCTCCACCTACT
* * * ** **** * * * * *
665349 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTT-AAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGAT-TCAAGGCC
65 -A-GCTAGGCC--CTAAATT-G--TTGAAAATTG--GCCTG-GACAAAATG-AGGTGTCTA---C
*** * *** * * * * * *** * * * * **
665412 AGCTA-TATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCTACCTACTA-G-CTAGGCCCTAAATTGTTA-
116 AGCTACCCCTCTTTGGC-CGT-TTTTGAGT-ATC-AGGAAC-AGGCCAAAG-AC-AAATAGACAC
* ** * ** ** ** * ** * *
665473 AAAATTG---GC--CCG---GACA--AAATGGGGTG-TCTACAACTGCCCCTCTTTGGCTGTTTC
174 CATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGAT-T--AA-TGCTTCACCAT-GATG---A
* * * * ** * ***** *** ** *
665527 TGAGT--ATCAGG-AACAGG---CCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTTTG-CGGCCGC-ATGT
231 AGAGTGCAT-TGGCGAC-GGTTTCGATGGAAAAAT-GAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCC-CTA-CT
** ** * * * *
665584 CATGACCTTTGG--TGAT-TAATGCTT---CGCCGT-GATGAAGAGTGTA-A-TGGCG-ACG-GT
291 -A-G-GTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGAT--AG-GTGTAGATTGGTGTA-GAGT
** * * * ** * * * * * *
665638 TCCGATGGAAAAATGAGTTTGTATGGCT-TGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCT
349 T----TGG--AACGGATTTTGGAAGAATATG--GT--C-AGTA--TTTTGCAATGTGC-CA--CT
*** * ** ****** * ** * *
665702 -TGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACAGAT--TTTGGAAGAATATGGT
398 GTG--CAGATT-CA-AGGCCT-G-CCACACTAGA-CTT--AA-AGATGATGAGGATGAAGA--GT
* * * ** ** * ** * * **
665764 CAGTATTTTGCAATGTG-CCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTT-GACTTAAAGATGATA
451 --G-A---T-AAAAG-GACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATA-TTGGGTTTAAAGATG---
* * * * * * *** * * ** * *
665827 AGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAATGATA-TTGGGTTTAAAAAT
504 A-GA--AAAAG-GAT-----G-TCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGAT
* * * * ** * ** * ** * *
665891 GAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTTAGCAACAGTT-AGACTTGAAGATGA-GAAGA
559 GAG---AAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCA-TTGGGTTTTAAAAATGATGAAG-
** * * * ** ** * * ** *
665954 ATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTAGGTTTTGAAAATGATGAAGGCGCCAATAAGC
619 GCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATT-GGACTT--AAA-GACGAAGGTGCCAATGTGT
* * * * * * * * * *
666019 TGAGTCAAGGCCAACGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTCAGTCAATGCC-AGT
680 TGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATG-AGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACT
* * * * *
666083 GACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTGAAGGCCAACTATATTGGACTAAAAGG
744 -ACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGG
* * *
666148 AGTGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
808 TGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
666213 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTAT
873 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTAT
*
666278 ATTGGACTTAACGGTG----AGG
938 ATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
* ** ** * *
666297 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATT-GGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCT
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACA--T-AT----GT--CGA-AT-C-
* ** * * * * * * *
666361 GATTCCAGGCC-AGCTATATTCGTCCGC-ACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAG-CTAGGCCC
54 --CTCCA--CCTA-CTA-GCTAGGCC-CTAAAT-TGTTGAA------A---ATTGGCCT-GG-AC
* ** * * ** **** * * * *
666423 TAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTATAGCTGCCCCTCTTTGGCAGTTTCT
100 -AAA---ATG--AGGT-G-TC-TAC-AGCT-ACCCCTCT-T---TGGCCGT-TTTTG-AGTATC-
* * * * * *
666488 GAGTATCAGG--AACAGGCCAATGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGGCC
147 -AGGAACAGGCCAA-AGACAAAT-AGA------CACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACC
* * * * * *
666551 TTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACAGTTTCGAGGGAAAAATGAGT
203 TTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGT
*
666616 TTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTG
268 TTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTG
* * *
666681 TAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACAGATTGTGGAAGAATACGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACT
333 TAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACT
* *
666746 GTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGAGGATGAGGATGAAGAGTGACAAAAGGACC
398 GTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACC
* * * *
666811 AGTTCGTTGACTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAGGATGAGAAAAATGATGTCAATATGCTGA
463 AGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGA
666876 TTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAAC
528 TTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAAC
*
666941 GGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTG
593 GGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTT
*
667006 AAAGACGAAGTTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAA
658 AAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAA
* * * * *
667071 TGTGCTGATTCAAAGCCAACTGCATTCGACATAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACC
723 TATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACC
* *
667136 AGCTAAATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTCAA
788 AGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAA
667201 AGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATAT
853 AGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATAT
*
667266 GCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGCACTTAAA-G-G-T-AAGG
918 GCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
* * ** ** * *
667305 TACCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATT-GGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCT
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACA--T-AT----GT--CGA-AT-C-
* * * ** * * * * *
667369 GATTCAAGGCCAACTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAA
54 --CTCCA--CCTACTA-GCTAGGCCCTAAAT-TGTTGAA------A---A-T---T-GG-CC---
* * ** ** *** ** ** * * * *
667434 ATTGTTGA-AAATTG-GCCTGGATA-AAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTTT
95 --TG--GACAAAATGAG-GTGTCTACAGCT-A--CCCCT-C-TTTGGCCGT-TTTTG-AG--TAT
* * * * * * *
667496 GAGTATCAGG--AACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTTTGCGGCCGCATGTCATGACC
146 CAGGAACAGGCCAA-A-GACAAATAGA------CACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACC
* * * *
667559 TTTGGTGATTAATGCTTCACCGTGATGAAAAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGT
203 TTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGT
*
667624 TTGTAGGGTTTGTCTTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTG
268 TTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTG
* *
667689 TACATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTTAGTATTTTGCAATGTGCCACT
333 TAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACT
* *
667754 GTGCAGATTCAAGGCCTGCGACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAACAGGACC
398 GTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACC
667819 AGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGA
463 AGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGA
* *
667884 TTCGCGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAAC
528 TTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAAC
*
667949 GGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTAGACTT
593 GGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTT
*
668014 AAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTAAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAA
658 AAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAA
* *
668079 TATGCTAATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATCCAAGACC
723 TATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACC
*
668144 AGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTACCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAA
788 AGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAA
**
668209 AGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATAT
853 AGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATAT
668274 GCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGG
918 GCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
* ** ** * *** *
668313 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATT-GGACTTA-A-AGGT-GATAAAGGTGCCA-ATA
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCG--AATCCT-CCACCTA
* * * * *** * * *** * *
668373 TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCATCCCCACATAT-G--TCGA-ATCCTCCA----CCTACTA
63 --CT-A-GCTAGGCC--CTAAATT-GT-TGAAAAT-TGGCCTGGACAAAAT-GAGGTGTCTAC-A
* * **** * * * * * ***
668430 GCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCTTG-G-A-CA-AAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTC
117 GCTA-CCCCT---CT-TTGGCCGTT--TTTGAGTATCAGGAA-CA-G-G-CCAAAG--ACAAAT-
***** * * * * * * ***
668491 TTTGGCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCC-AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCG
168 AGACACCATTT-T--G--TC-TG--C-GGCCGCATGTC--AT-G--ACC--TTTG---G-TGATT
* * * * * * * ** * * ****
668555 CATGTCATGACCTTTGGTGATTA-ATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGA
213 AATG-CTTCACC-ATGATGA--AGA-G-TGCA--TTGGCGACG-GT---TT--CGATGG-AAAAA
*** ** *** *
668619 TGGAAAAATG-A--GTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGA
263 T-G-AGTTTGTAGGGTTTGT--CCTCCCTACT-------AGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGA
* *
668681 CCTCCTTAGATCGGTGTAGATTGGGGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTAT
317 CCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTAT
* * *
668746 TTTGCTATGTGCCATTGTCCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAA
382 TTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAA
** * * * *
668811 GAGTGATAAAAGGACCAGTACAATGATTGACGGCCAACGATATTGCGTTTCAAGACGAGAAAAAG
447 GAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAG
*
668876 GATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTG
512 GATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTG
668941 CTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGC
577 CTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGC
*
669006 CAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCGGCGACATTGGACTT
642 CAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTT
* *
669071 AAAGATGAGGTGCGAATATGTTGATTTAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAAT
707 AAAGATGAGGTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAAT
*
669136 ATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTTCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
772 ATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
*
669201 ATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
837 ACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
669266 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
902 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
*
669325 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCATATATGTCGAATCCTCCACCTACTA
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTA
*
669390 GCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCTTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTG
66 GCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTG
* *
669455 GCCGTTTCTGAGTATCAAGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGT
131 GCCGTTTTTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGT
*
669520 CATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAA
196 CATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTTCGATGGAAA
669585 AATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAG
261 AATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAG
* *
669650 ATAGGTGTACATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTTAGTATTTTGCAATG
326 ATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATG
*
669715 TGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCGACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAA
391 TGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAA
*
669780 CAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
456 AAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
* *
669845 ATGCTGATTCGCGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAA
521 ATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAA
669910 GGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATAT
586 GGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATAT
* *
669975 TAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTAAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAG
651 TGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAG
*
670040 GTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATC
716 GTGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATT
*
670105 CAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTACCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTG
781 CAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTG
**
670170 GACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTG
846 GACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTG
670235 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGG
911 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
* ** ** * *
670281 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATT-GGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCT
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACA--T-AT----GT--CGA-AT-C-
* * ** * * * * * * *
670345 GATTCAAGGCC-AGCTATATTCA-TCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAG-CTAGGCCC
54 --CTCCA--CCTA-CTA-GCT-AGGCCCTAAAT-TGTTGAA------A---ATTGGCCT-GG-AC
* ** * ** *** ** ** * * * *
670407 TAAATTGTTGAAAATTGGCTTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCT
100 -AAA---ATG--AGGTGTC-T--AC-AGCT-A--CCCCT-C-TTTGGCCGT-TTTTG-AGTATC-
* * * * *
670472 GAGTATCAGG--AACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACC
147 -AGGAACAGGCCAA-A-GACAAATAGA------CACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACC
*
670535 TTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGT
203 TTTGGTGATTAATGCTTCACCATGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGT
*
670600 TTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATCGGTG
268 TTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTG
* * *
670665 TAGATTGGGGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCTATGTGCCATT
333 TAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACT
* * *
670730 GTCCAGATTCAAGGCCTACCACACTGGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACC
398 GTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTAGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACC
* *
670795 AGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGCGTTTCAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGA
463 AGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGA
*
670860 CTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAAC
528 TTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAAC
670925 GGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTT
593 GGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTT
*
670990 AAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCGGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAA
658 AAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAA
* *
671055 TATGTTGATTTAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACC
723 TATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACC
* *
671120 AGCTATATTGGACTTAAAAGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAA
788 AGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAA
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*
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*
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* *
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* *
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* * *
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* *
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** * * *
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*
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*
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*
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* *
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* *
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*
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*
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*
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* *
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* *
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* * *
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* * *
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* * *
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456 AAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
*
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*
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* *
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* *
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* * *
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*
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*
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* * * *
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* * *
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* *
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456 AAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAAT
*
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*
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* *
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* * * *
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* ** *
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*
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* *
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* * * **
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* *
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* * *
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* *
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* *
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:666138 original size:48 final size:48
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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*
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*
666194 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
666242 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAC
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
666290 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
666338 GGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCCAGGCCAGCTATATT
1 ---GAT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
666381 CGTCCGCACA
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Found at i:667106 original size:48 final size:48
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* ** ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* *
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* *
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* * * *
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* * * *
667305 TACCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
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Statistics
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TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGG
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666959 TGATGAAGGC
* * * ** * * * *
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* * * * * * *
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130 ACATAAAGGTGAGGT
* *
667114 GCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTAAATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
* * * * *
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66 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTCGA
*
667244 CTTAAAGGTGAGGT
131 CATAAAGGTGAGGT
* * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
* *
667323 AGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATAT
66 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACAT
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127 TCG
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ACGTcount: A:0.32, C:0.18, G:0.26, T:0.25
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTCGA
CATAAAGGTGAGGT
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* * * **
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* * * * * * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * * *
668074 GCGAATATGCTAATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
668122 GCCAATATGCTGATCCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
668170 ACCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
**
668218 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
668266 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
668314 GCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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667913 ATGAGAAGAA
* ** ** * *
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* * * ** * * * * *
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* *
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* * *
668073 TGCGAATATGCTAATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATCC
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* * *
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* *
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1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
*
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Statistics
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149 4 0.01
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ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.26, T:0.26
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TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
ACTTAAAGGTGAGG
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* * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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*
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* **
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
669274 GCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
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669357 CGTCCCCATA
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:669233 original size:144 final size:145
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668921 ATGAGAAGAA
* ** ** * *
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1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATT-GGACTT--AAA-GGTG-AGGTGCCAATATGCT
* * ** * * * **
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126 CATTGGACTTAAAGATGAGG
* * *
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* * ** *
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*
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131 GACTTAAAGATGAGG
* *
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*
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669349 GCTATATTCG
Statistics
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GACTTAAAGATGAGG
Found at i:670072 original size:48 final size:48
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* * * **
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* * * * * * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * *
670042 GCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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* *
670090 GCCAATATGCTGATCCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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* *
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**
670186 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
670282 GCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
670365 CATCCCCACA
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Matches: 338, Mismatches: 29, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
48 266 0.79
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:670258 original size:144 final size:144
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Indices: 669891--670356 Score: 599
Period size: 144 Copynumber: 3.2 Consensus size: 144
669881 ATGAGAAGAA
* ** ** * *
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1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATT-GGACTT--AAA-GGTG-AGGTGCCAATATGCT
* * * ** * * * * *
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61 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTA
* *
670021 CATTGGACTTAAAGATGAGG
125 TATTGGACTTAAAGGTGAGG
* *
670041 TGCGAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATCC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
* * *
670106 AAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTACCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGG
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
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131 ACTTAAAGGTGAGG
* *
670185 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
*
670250 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGG
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
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131 ACTTAAAGGTG----AGG
670333 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
670357 GCTATATTCA
Statistics
Matches: 280, Mismatches: 32, Indels: 10
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
144 175 0.62
145 40 0.14
146 3 0.01
147 3 0.01
148 27 0.10
149 4 0.01
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ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.26, T:0.26
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ACTTAAAGGTGAGG
Found at i:671070 original size:48 final size:48
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Period size: 48 Copynumber: 7.8 Consensus size: 48
670934 TTTTAAAAAT
* * *
670944 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * * * * *
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1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * * *
671042 GATGAGGTGCGAATATGTTGATTTAAGGCCAACTACATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
671090 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
**
671138 -AGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAA
1 GA-TGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
671186 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
671234 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
671282 GGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
1 ---GAT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
671325 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 294, Mismatches: 32, Indels: 9
0.88 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
48 212 0.72
49 46 0.16
51 2 0.01
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ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.27, T:0.26
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Found at i:671193 original size:144 final size:144
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Period size: 144 Copynumber: 2.8 Consensus size: 144
670889 ATGAGAAGAA
* ** ** * *
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* * * * * * **
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61 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA-A-GTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACG
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124 ACATTGGACTTAAAGATGAGG
* * *
671049 TGCGAATATGTTGATTTAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
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* ** *
671114 AAGACCAGCTATATTGGACTTAAAAGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGG
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAAGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTGG
*
671179 ACTTAAAGGTGAGG
131 ACTTAAAGATGAGG
* *
671193 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
* *
671258 AAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAAGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
671317 GCTATATTCG
Statistics
Matches: 232, Mismatches: 31, Indels: 12
0.84 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
143 1 0.00
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ACTTAAAGATGAGG
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* * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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*
672058 GCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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* **
672106 TCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
672154 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
672202 GCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
672254 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
672285 CGTCCCCATA
Statistics
Matches: 290, Mismatches: 29, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
48 218 0.75
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Alignment explanation
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* ** ** * *
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671989 CATTGGACTTAAAGATGAGG
126 CATTGGACTTAAAGATGAGG
* * *
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1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
* * ** *
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66 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTG
*
672138 GACTTAAAGGTGAGG
131 GACTTAAAGATGAGG
* *
672153 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
1 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
*
672218 AAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
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AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACGACATTG
GACTTAAAGATGAGG
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* * **
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* * * * * * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * * * *
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*
673018 GCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
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* * *
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 AAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
** * * *
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1 AAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
** * *
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AAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
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* ** ** * *
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* * ** * * * *
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126 CATTGGACTTAAAGATGAGG
* * *
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* *
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*
673098 GACTTAAAGGTGAGG
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* *
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* *
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AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATATGTTGATTCAAGGCCAGCTACATTG
GACTTAAAGATGAGG
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673823 TGATGAAGGC
* * * **
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* * * * * *
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*
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**
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*
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674157 CGTCCCCACA
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Alignment explanation
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672906 ACTTAAAGAC
* * * * * * *
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* * * *
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*
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* * *
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*
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326 ATATTCGTCCCCACATATGTCAAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
* *
673305 CTTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCC
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*
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*
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521 CATGATGAAGAGTGCATCGGCGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
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586 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATCGGTGTAGATTGGGGTAGAGTTTGG
*
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* *
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673825 AT
911 AT
* *
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1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGT
*
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**
673957 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
674022 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
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326 ATATTCGTCCCCACATATGTCAAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
674217 CCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTATTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCC
391 CCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTATTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCC
* *
674282 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGGATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
456 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCAC
* * *
674347 CGTGATGAAGAGTGCATCGGTGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCTTCCCT
521 CATGATGAAGAGTGCATCGGCGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
674412 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATCGGTGTAGATTGGGGTAGAGTTTGG
586 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATCGGTGTAGATTGGGGTAGAGTTTGG
*
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651 AAT-GGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCATTGTCCAGATTCAAGGCCTGC
*
674541 CACACTGGATTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
715 CACACTGGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
* *
674606 AACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATACGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT
780 AACGATATTGCGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATACGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTT
674671 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
845 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
674736 GAT
910 GAT
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1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGT
* * * **
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66 TGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTA
*
674869 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAGGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
* *
674934 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGGTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
674999 TTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
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326 ATATT
675065 GGACTTAAAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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911 45 0.04
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ACGTcount: A:0.29, C:0.17, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (912 bp):
GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGT
TGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTA
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AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
ATATTCGTCCCCACATATGTCAAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
CCTGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTACCCCTATTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCC
AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCAC
CATGATGAAGAGTGCATCGGCGACGGTTTCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATCGGTGTAGATTGGGGTAGAGTTTGG
AATGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCATTGTCCAGATTCAAGGCCTGCC
ACACTGGACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCA
ACGATATTGCGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATACGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTA
GACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATG
AT
Found at i:674777 original size:53 final size:50
Alignment explanation
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674682 TGAGAAGAAT
* * * * ** *
674692 GCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGC
1 GCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGGACTT--AAA-GACGAAGGC
* * *
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* * *
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* * * *** * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * * ** *
675082 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT-GGACTTAAAGGTG-AGGT
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* * * * * ** *
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* * * * *
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675217 GGGTGAGGTG
Statistics
Matches: 437, Mismatches: 33, Indels: 9
0.91 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 358 0.82
49 47 0.11
50 3 0.01
52 4 0.01
53 25 0.06
ACGTcount: A:0.30, C:0.17, G:0.27, T:0.26
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Found at i:674861 original size:48 final size:48
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674735 TGATGAAGGC
* * * **
674745 GCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * *
674794 GCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACATAAAGATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
**
674842 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAATTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
674890 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAGGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
674938 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGGTATATTAGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
674986 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGAACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
675178 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAGGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
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* *
675278 GCCAATATGCTGATTTAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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*
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*
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*
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*
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
675518 GCCAATATGCTGATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
675566 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
* *
675618 GCCAATATGCTGATTTAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
675666 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTGTATTGGACTTAAGGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
*
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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* * * * **
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*
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* ** *
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* * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
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* * *
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131 CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
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261 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAGGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGG
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*
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
* *
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*
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326 ACTTAAAGGTGAGGT
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* *
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CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGG
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ACTTAAAGGTGAGGT
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** * *
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Statistics
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AAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTC
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676462 CTTTAAAAAT
* * *
676472 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
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* * * * * * *
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1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
676570 GATGAGGTGCCAATATGCTGATACAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
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* * *
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*
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* * *
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* *
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675556 AAGGTGAGGT
* * ** * *
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* * * * * * * * *
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* ** *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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*
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* * *
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582 TAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTATAGATTGGTGTAGAGTTTGGAA
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*
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1 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTC
*
676546 AAGGCGAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATACAAGGCCAACTATATTGG
66 AAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATACAAGGCCAACTATATTGG
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*
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456 AAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGAT
*
677001 GAAGAGTGCGTTGGCGACGGTTCTGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGG
521 GAAGAGTGCGTTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGG
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651 TTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCTATGTGCCATTGTCCAGATTCAAGGCCTGCCACACTG
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716 GACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATA
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781 TTGCGTTTCAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTG
677326 AAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTAATTCACGGCCAACGGCAATGGGCTTTAAAAATGATGAAG
846 AAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTAATTCACGGCCAACGGCAATGGGCTTTAAAAATGATGAAG
677391 GC
911 GC
*
677393 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGATGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTC
1 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTC
*
677458 AAGGCGAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATACAAGGCCAACTATATTGG
66 AAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATACAAGGCCAACTATATTGG
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131 ACTTAAAGGAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACATAAAGGTGAGGTGC
677588 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGAGCCAATATGCTAATTCAAG
196 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGAGCCAATATGCTAATTCAAG
*
677653 GCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTGTATTT
261 GCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTT
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326 GTCCCCACATATGTCGATTCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTATTAAAAATCGGCCCGGA
677783 CAAAATGTGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCTATTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGAC
391 CAAAATGTGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCTATTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGAC
*
677848 AAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCTGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGAT
456 AAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGAT
677913 GAAGAGTGCGTTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGG
521 GAAGAGTGCGTTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGG
677978 TTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTATAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGA
586 TTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTATAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGA
* * * *
678043 TTTTGGAAGAATATTGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTG
651 TTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCTATGTGCCATTGTCCAGATTCAAGGCCTGCCACACTG
* * *
678108 GACTTAAAGATGATGAGGATGAAGTGTAATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACAGCCAACGATA
716 GACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATA
* * * * *
678173 TTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGCCAATATGCTGATTCACAGTCAGCAACAGTTAGACTTG
781 TTGCGTTTCAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTG
* * * *
678238 AAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAG
846 AAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTAATTCACGGCCAACGGCAATGGGCTTTAAAAATGATGAAG
678303 GC
911 GC
*
678305 GCCAATATACTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTC
1 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTC
* * *
678370 AAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGAAGAGGTGCCAATATGCCT-ATTCAGGGCCAACTATATTG
66 AAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATG-CTGATACAAGGCCAACTATATTG
** * * *
678434 GACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTTATTCAAGGCCAACTATATTCGACTTAAAGGTGAGGTG
130 GACTTAAAGGAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACATAAAGGTGAGGTG
** * *
678499 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGCTGCCAATATGCTGATACAA
195 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGAGCCAATATGCTAATTCAA
678564 GGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
260 GGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
678625 GGACTTAAAG
Statistics
Matches: 2062, Mismatches: 80, Indels: 11
0.96 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
908 34 0.02
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ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (912 bp):
GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTC
AAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATACAAGGCCAACTATATTGG
ACTTAAAGGAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACATAAAGGTGAGGTGC
CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGAGCCAATATGCTAATTCAAG
GCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTT
GTCCCCACATATGTCGATTCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTATTAAAAATCGGCCCGGA
CAAAATGTGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCTATTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGAC
AAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGAT
GAAGAGTGCGTTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGG
TTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTATAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGA
TTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCTATGTGCCATTGTCCAGATTCAAGGCCTGCCACACTG
GACTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATA
TTGCGTTTCAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGACTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTG
AAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTAATTCACGGCCAACGGCAATGGGCTTTAAAAATGATGAAG
GC
Found at i:677509 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 677384--677716 Score: 416
Period size: 48 Copynumber: 6.8 Consensus size: 48
677374 CTTTAAAAAT
* * *
677384 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * * * *
677433 GATGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCGAGCGACATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
677482 GATGAGGTGCCAATATGCTGATACAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * *
677530 GGA-AAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACATAAA
1 -GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
677578 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * *
677626 GGTGAGGAGCCAATATGCTAATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
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Statistics
Matches: 251, Mismatches: 27, Indels: 9
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GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
Found at i:678424 original size:48 final size:48
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678295 TGATGAAGGC
* * * **
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * **
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
678402 GCCAATATGCCT-ATTCAGGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATG-CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* * *
678450 GCCAATATGCTTATTCAAGGCCAACTATATTCGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
678498 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGCT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
678546 GCCAATATGCTGATACAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
678594 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGCT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
678642 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
* *
678694 GCCAATATGCTGATTCAAGGGCAACTATATT
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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678588 TGAGGTGCCA
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1 ATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
* **
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678642 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
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ATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
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678600 ATGCTGATTC
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1 AAGGCCAGCTATATTGGACTTA
** *
678632 AAGGTGAGCTGCCA-ATATGCTGA-TTC
1 AAGGCCAGCT---ATAT-TG--GACTTA
678658 AAGGCCAGCTATATTGGACTTA
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1 AAGG
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AAGGCCAGCTATATTGGACTTA
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679302 TGATGAAGGC
* **
679312 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGA-TCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * *
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1 GCCAATATGCTGA-TCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
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* *
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1 GCCAATATGCTGAT-CAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGT
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679588 CGTCCCCACA
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GCCAATATGCTGATCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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679752 CCACTGTGCA
* * * * *
679762 GATTCAAGGCCTGCCACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCT
1 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
* *
679810 GATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
1 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
* *
679858 GATTCAAGACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTACCAATATGCT
1 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
*
679906 GATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
1 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
* * * *
679954 GATTCAAGGCCAGCAATATTAGACTTAAAGATGAGGTGCGAATATGCT
1 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
* *
680002 GATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
1 GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
*
680050 GATTCAAGGCTAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCT
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* *
680102 GATTCAAAGCCAGGTATATT
1 GATTCAAGGCCAGCTATATT
680122 TGTCCCCACA
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GATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT
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680692 TTTTAAAAAT
* * * *
680702 GATGAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * * * * * *
680751 GACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
680800 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGAC-TAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
680847 GGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
680895 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
680943 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGAC-TAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
680990 GGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
1 -G--AT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
681020 AGCTAGGTAT
Statistics
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GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
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Indices: 680711--681019 Score: 399
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680701 TGATGAAGGC
* * * * * * *
680711 GCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACG-AAGGTGTCAATGTGTTGAGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAG--GTAAGGTGCCAATATGCTGATT
* * * *
680775 CAAGGTCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGT
64 CAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
680808 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGAC-TAAAGGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCA
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTAAGGTGCCAATATGCTGATTCA
680872 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
66 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
680903 GCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTAAGGTGCCAATATGCTGATTCA
*
680968 AGGCCAGCTATATTGGAC-TAAAGGTCATAAAGGT
66 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGT
681002 GCCAATATGCTGATTCAA
1 GCCAATATGCTGATTCAA
681020 AGCTAGGTAT
Statistics
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94 1 0.01
95 83 0.44
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTAAGGTGCCAATATGCTGATTCA
AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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680880 TATATTGGAC
680890 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
** *
680916 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT-GA
680937 CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
680964 TTCAAGG
1 TTAAAGG
680971 CCAGCTATAT
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 7, Indels: 16
0.63 0.11 0.25
Matches are distributed among these distances:
20 1 0.03
21 2 0.05
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23 1 0.03
25 1 0.03
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TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
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Indices: 680706--681019 Score: 443
Period size: 143 Copynumber: 2.2 Consensus size: 145
680696 AAAAATGATG
* * * * * *
680706 AAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGTT
1 AAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATATGCT
* *
680771 GAGTCAAGGTCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTAT
66 GAGTAAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTAT
680836 ATTGGACTAAAGGTC
131 ATTGGACTAAAGGTC
* **
680851 -AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCT
1 AAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATATGCT
* * * * *
680914 GATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTAT
66 GAGTAAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTAT
680979 ATTGGACTAAAGGTC
131 ATTGGACTAAAGGTC
680994 ATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
1 ---AAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
681020 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 149, Mismatches: 16, Indels: 6
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
143 85 0.57
144 42 0.28
147 22 0.15
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.26, T:0.25
Consensus pattern (145 bp):
AAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATATGCT
GAGTAAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTAT
ATTGGACTAAAGGTC
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Indices: 679802--681848 Score: 3501
Period size: 911 Copynumber: 2.2 Consensus size: 912
679792 ATGAGGTGCG
* * * * ** * * *
679802 AATATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAG
1 AATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAG
* * * * *
679866 ACCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTACCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACT
66 GCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACT
* * * *
679931 TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCAATATTAGACTTAAAGATGAGGTGCGAA
131 TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCAAA
* * *
679996 TATGCTGATTCAAGGCCAACTACATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCT
196 TATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
* *
680061 AGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGGTATATTTGTC
261 AGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGGTATATTCGTC
680126 CCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCTTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGAAAA
326 CCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCTTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGAAAA
*
680191 CATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAA
391 CATGAGGTGTCTACAGCAGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAA
* *
680256 TAGACAACATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCTGTGATGAA
456 TAGACAACATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAA
680321 GAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCACTACTAGGTTT
521 GAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCACTACTAGGTTT
* * *
680386 TAGAATTTTCTGAGGCTTGACCTCTTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTCGAGTTTGGAACGGATTT
586 TAGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTT
680451 TGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGGGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGAC
651 TGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGGGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGAC
680516 TTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAAGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTG
716 TTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAAGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTG
* *
680581 GGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTTAGCAACAGTTAGACTTGAAG
781 GGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAG
680646 ATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAATCAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGC
846 ATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAA-CAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGC
680711 GCC
910 GCC
* *
680714 AATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAG
1 AATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAG
*
680779 GTCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGAC-
66 GCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACT
* *
680843 TAAAGGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAA
131 TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCAAA
*
680908 TATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
196 TATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
*
680973 AGCTATATTGGAC-TAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCTAGGTATATTCGTC
261 AGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGGTATATTCGTC
*
681037 CCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCTTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAA
326 CCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCTTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGA-AA
*
681102 A-ATGAGGTGTCTACAGCAGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACATGCCAAAGACAA
390 ACATGAGGTGTCTACAGCAGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAA
*
681166 ATAGACACCATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGA
455 ATAGACAACATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGA
* * * *
681231 CGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTT
520 AGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCACTACTAGGTT
*
681296 TTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATT
585 TTAGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATT
*
681361 TTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGA
650 TTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGGGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGA
*
681426 CTTCAAA-ATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATAT
715 CTT-AAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAAGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATAT
*
681490 TGGGTTTAATGATGAGAAAAAGGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGA
779 TGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGA
*
681555 AGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGG
844 AGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGG
681620 CGCC
909 CGCC
* *
681624 AATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGACGATGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAG
1 AATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAG
* *
681689 GCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACT
66 GCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACT
681754 TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTG
131 TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTG
*
681819 CAAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATT
192 CAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
681849 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 1067, Mismatches: 60, Indels: 13
0.94 0.05 0.01
Matches are distributed among these distances:
910 153 0.14
911 631 0.59
912 174 0.16
913 77 0.07
915 32 0.03
ACGTcount: A:0.30, C:0.17, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (912 bp):
AATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAG
GCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACT
TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCAAA
TATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
AGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGGTATATTCGTC
CCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCTTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGAAAA
CATGAGGTGTCTACAGCAGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAA
TAGACAACATTTTGTCTACGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAA
GAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCACTACTAGGTTT
TAGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTT
TGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGGGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGAC
TTAAAGATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAAGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTG
GGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAG
ATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCG
CC
Found at i:681738 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 681517--681838 Score: 257
Period size: 48 Copynumber: 6.4 Consensus size: 48
681507 AAAAGGATAT
* * * * *
681517 CAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGC
1 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGACA-TTGGACTTAAAGATGAG--G--TGC
* * * ** *
681570 CAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGC
1 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT--AAA-GATG-AGGTGC
* * * *
681623 CAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGACGATGGTGC
1 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGA-GGTGC
* * * *
681672 CAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGC
1 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGC
* * * * *
681720 CAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGC
1 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGC
* * *
681768 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGC
1 CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAA---GAT-GAGGTGC
*
681820 AAATATGCTGATTCAAGGC
1 CAATATGCTGATTCAAGGC
681839 TAGCTATATT
Statistics
Matches: 218, Mismatches: 41, Indels: 21
0.78 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
48 81 0.37
49 44 0.20
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51 2 0.01
52 30 0.14
53 49 0.22
55 3 0.01
56 4 0.02
57 2 0.01
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.26, T:0.25
Consensus pattern (48 bp):
CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGC
Found at i:681804 original size:96 final size:100
Alignment explanation
Indices: 681567--681848 Score: 293
Period size: 97 Copynumber: 2.8 Consensus size: 100
681557 ATGAGAAGAA
* * * * ** * * *
681567 TGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCT
1 TGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATT-GGACTT-AAAGTGATAAAGGTGCCAATATGCT
* * **
681632 GAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGACGATGG
64 GATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGACGATGG
* * *
681669 TGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAA-T-AT-GAGGTGCCAATATGCTGA
1 TGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGA
* **
681731 TTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGA-GG
66 TTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGACGATGG
* * * *
681765 TGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCAAATATGCTG
1 TGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAA-GTGATAAAGGTGCCAATATGCTG
*
681830 ATTCAAGGCTAGCTATATT
65 ATTCAAGGCCAGCTATATT
681849 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 152, Mismatches: 24, Indels: 10
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
96 38 0.25
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99 3 0.02
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102 28 0.18
ACGTcount: A:0.31, C:0.17, G:0.26, T:0.26
Consensus pattern (100 bp):
TGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGA
TTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGACGATGG
Found at i:682422 original size:816 final size:815
Alignment explanation
Indices: 680800--682660 Score: 3351
Period size: 816 Copynumber: 2.3 Consensus size: 815
680790 TGGACTTAAA
* * * * * *
680800 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGAC-TAAAGGTC-AGGTGCCAATA
1 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCGGACTTAAA-GACGAGGTGCCAATG
* * * * ** * *
680862 TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAG
65 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
680927 CTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGAC-TAAAG
130 CTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAG
* * * *
680991 GTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCTAGGTATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCT
195 GTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCT
*
681056 CCACCTACTAGCTAGGCCTTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCAG
260 CCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCAG
*
681121 CCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACATGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTAC
325 CCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTAC
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455 CCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTG
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520 ACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAA
681381 TTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGA
585 TTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGA
681446 AGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAA
650 AGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAA
681511 GGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGT
715 GGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGT
681576 GCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
780 GCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
*
681612 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGACGATGGTGCCAATG
1 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCGGACTTAAAGACGA-GGTGCCAATG
681677 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
65 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
681742 CTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAG
130 CTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAG
*
681807 GTGATAAAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCT
195 GTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCT
*
681872 CCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTG
260 CCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCAG
* * *
681937 CCCTTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGGACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGC
325 CCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTAC
*
682002 TGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGACGAGTGCATTGGTGACTGTT
390 GGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGACGAGTGCATTGGTGACTGTT
682067 CCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTG
455 CCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTG
682132 ACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAA
520 ACCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAA
682197 TTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGA
585 TTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGA
682262 AGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAA
650 AGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAA
682327 GGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGT
715 GGATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGT
682392 GCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
780 GCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
* *
682428 GGTGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCGGACTTAAAGACG-AGGTGCCAATG
682493 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
65 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
682558 CTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAG
130 CTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAG
* *
682623 GTG----AGGTGCCAATATGCTGATCCAAGGCCAGCTATATT
195 GTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATT
682661 GGACTTAAAG
Statistics
Matches: 1009, Mismatches: 34, Indels: 12
0.96 0.03 0.01
Matches are distributed among these distances:
812 36 0.04
813 36 0.04
814 5 0.00
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816 807 0.80
817 1 0.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.18, G:0.25, T:0.27
Consensus pattern (815 bp):
GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCGGACTTAAAGACGAGGTGCCAATGT
GTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAAC
TATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG
TGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTC
CACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCAGC
CCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTACG
GCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGACGAGTGCATTGGTGACTGTTC
CGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGA
CCTCCTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAAT
TTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGAA
GAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAAG
GATATCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTG
CTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
Found at i:682553 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 682437--682812 Score: 473
Period size: 48 Copynumber: 7.6 Consensus size: 48
682427 TGGTGAAGGC
* * * ** *
682437 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCAGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATG-AGGT
* * * * * *
682486 GCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGT
* * *
682534 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGT
*
682582 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGT
* *
682630 GCCAATATGCTGATCCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGT
*
682678 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA---GAT-GAGGT
* * *
682730 GCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA---GAT-GAGGT
682782 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
682813 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 297, Mismatches: 26, Indels: 5
0.91 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 175 0.59
49 36 0.12
51 2 0.01
52 84 0.28
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.25, T:0.26
Consensus pattern (48 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGT
Found at i:682628 original size:96 final size:98
Alignment explanation
Indices: 682428--682812 Score: 526
Period size: 96 Copynumber: 3.9 Consensus size: 98
682418 TTTTAAAAAT
* * * * ** *
682428 GGTGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATA
* * * *
682493 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAA
66 TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
**
682526 TATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATA
1 GGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATA
682589 TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
66 TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * *
682622 GGTG-AGGTGCCAATATGCTGATCCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATA
1 GGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATA
682685 TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
66 TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
682718 GGTGATAAAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATAAAGGTG
1 GGTG---AAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTG---AAGGTG
682783 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
60 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
682813 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 258, Mismatches: 21, Indels: 10
0.89 0.07 0.03
Matches are distributed among these distances:
96 134 0.52
97 42 0.16
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104 35 0.14
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.26, T:0.25
Consensus pattern (98 bp):
GGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATA
TGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
Found at i:682668 original size:144 final size:145
Alignment explanation
Indices: 682428--682812 Score: 522
Period size: 144 Copynumber: 2.6 Consensus size: 145
682418 TTTTAAAAAT
* * * * * ** *
682428 GGTGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGATATCAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATG
1 GGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATA
* * * *
682493 TGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
66 TGCTGA-TCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
682558 CTATATTAGACTTAAA
130 CTATATTAGACTTAAA
*
682574 GGTG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATA
1 GGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATA
* *
682637 TGCTGATCCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAG
66 TGCTGAT-CAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAA
*
682702 CTATATTGGACTTAAA
130 CTATATTAGACTTAAA
*
682718 GGTGATAAAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATAAAGGTG
1 GGTG---AAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTG---AAGGTG
682783 CCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
60 CCAATATGCTGA-TCAAGGCCAGCTATATT
682813 CGTCCCCACA
Statistics
Matches: 211, Mismatches: 18, Indels: 14
0.87 0.07 0.06
Matches are distributed among these distances:
143 1 0.00
144 86 0.41
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153 1 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.26, T:0.25
Consensus pattern (145 bp):
GGTGAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGAAGGTGCCAATA
TGCTGATCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAAC
TATATTAGACTTAAA
Found at i:683532 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 683390--683709 Score: 406
Period size: 48 Copynumber: 6.5 Consensus size: 48
683380 TTTTAAAAAT
* * * *
683390 GATGAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * * * * * * *
683439 GACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
683488 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
683536 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
683584 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
683632 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
683680 GGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
1 -G--AT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
683710 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 244, Mismatches: 23, Indels: 5
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 175 0.72
49 46 0.19
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ACGTcount: A:0.32, C:0.16, G:0.27, T:0.26
Consensus pattern (48 bp):
GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
Found at i:683560 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 683531--683659 Score: 75
Period size: 26 Copynumber: 5.3 Consensus size: 26
683521 TATATTGGAC
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1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
** *
683557 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT-GA
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** *
683605 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT-GA
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1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
683653 TTCAAGG
1 TTAAAGG
683660 CCAGCTATAT
Statistics
Matches: 74, Mismatches: 13, Indels: 32
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Matches are distributed among these distances:
20 2 0.03
21 4 0.05
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Consensus pattern (26 bp):
TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
Found at i:683573 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 683548--683621 Score: 53
Period size: 22 Copynumber: 3.2 Consensus size: 22
683538 TGAGGTGCCA
683548 ATATGCTGATTAAAGGCCAGCT
1 ATATGCTGATTAAAGGCCAGCT
** *
683570 ATAT--TGGACTTAAAGGTGAGGTGCCA
1 ATATGCT-GA-TTAAAGGCCA---G-CT
683596 ATATGCTGATTAAAGGCCAGCT
1 ATATGCTGATTAAAGGCCAGCT
683618 ATAT
1 ATAT
683622 TGGACTTAAA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 6, Indels: 16
0.63 0.10 0.27
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (22 bp):
ATATGCTGATTAAAGGCCAGCT
Found at i:683692 original size:962 final size:963
Alignment explanation
Indices: 681621--683709 Score: 3607
Period size: 962 Copynumber: 2.2 Consensus size: 963
681611 TGATGAAGGC
* * * ** * * *
681621 GCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGACGATGGTGCCAATGTGTTGAGTC
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA-GGTGCCAATATGCTGATTC
* * ** * *
681686 AAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAG
65 AAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGG
* *
681751 ACTTAAAGG--T-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATA
130 ACTTAAAGGTATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATA
*
681813 AAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCTAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCT
195 AAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCT
*
681878 ACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCTTC
260 ACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTC
*
681943 TTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGGACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCTGCCGC
325 TTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCTGCCGC
* * *
682008 ATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGACGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATG
390 ATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATG
682073 GAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCC
455 GAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCC
682138 TTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGC
520 TTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGC
* *
682203 AATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGAAGAGTG
585 AATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGAAGAGAG
* *
682268 ATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAAGGATAT
650 ATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATAT
* *
682333 CAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGAT
715 CAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGAT
* *
682398 TCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAATGGTGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACG
780 TCAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACG
*
682463 ATATCAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATA
845 ATATCAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGA
682528 TGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAGGT
910 TGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAGGT
*
682582 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATCCA
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
682647 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGA
66 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGA
*
682712 CTTAAAGGTGATAAAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATA
131 CTTAAAGGT-ATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATA
*
682777 AAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCT
195 AAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCT
682842 ACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTC
260 ACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTC
682907 TTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTG-TGGCCG
325 TTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCT-GCCG
** *
682971 CATGTTTTGACCTTTGGTGATTAATGCTTC-CTGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGAT
389 CATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGAT
*
683035 GGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGAGCTC
454 GGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTC
* * *
683100 CTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAATGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTG
519 CTTAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTG
683165 CAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTT-AAAGATGATGAGGATGAAGAG
584 CAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAA-ATGATGAGGATGAAGAG
683229 AGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGAT
648 AGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGAT
*
683294 GTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA-GCCAATGTACTG
713 ATCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTG
* * *
683358 ATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAG
778 ATTCAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAA
** * * *
683423 CGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAA
843 CGATATCAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAA
*
683488 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
908 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAGGT
* *
683544 GCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAA
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
683609 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGA
66 AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGA
683674 CTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
131 CTTAAAGGT-ATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
683710 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 1066, Mismatches: 56, Indels: 11
0.94 0.05 0.01
Matches are distributed among these distances:
960 83 0.08
961 40 0.04
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963 329 0.31
964 265 0.25
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (963 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCA
AGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGA
CTTAAAGGTATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATAA
AGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTA
CTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCT
TTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACAGGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCTGCCGCA
TGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGG
AAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCT
TAGATAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCA
ATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGAAGAGAGA
TAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATATC
AATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATT
CAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAACGA
TATCAGACTTAAAGACGAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGAT
GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:684444 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 684302--684621 Score: 390
Period size: 48 Copynumber: 6.5 Consensus size: 48
684292 TTTTAAAAAT
* * * *
684302 GATGAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * * * * * * *
684351 GACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
684400 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
684448 GGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
684496 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
684544 -AGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GA-TGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
684592 GGTCATAAAGGTGCCAATATTCTGATTCAA
1 -G--AT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
684622 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 239, Mismatches: 26, Indels: 9
0.87 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
48 171 0.72
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ACGTcount: A:0.32, C:0.16, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (48 bp):
GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
Found at i:684594 original size:912 final size:913
Alignment explanation
Indices: 682480--695781 Score: 11092
Period size: 912 Copynumber: 14.3 Consensus size: 913
682470 ACTTAAAGAC
* * * * * * * *
682480 GAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAATATG-AGGTGCCAATATGC
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
* * * * * * * *
682544 TGATTCAAGGCCAACTATATTAGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
*
682609 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATCCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
* *
682674 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCAAATATG
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATG
* * *
682739 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC
257 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCC
*
682804 AGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
322 AGCTATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
* *
682869 TTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTGAGTATCAGGAACA
387 TTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATA
* **
682934 GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGTGGCCGCATGTTTTGACCTTTGGTGATTAATGCT
452 GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCT
* * *
682999 TC-CTGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCT
517 TCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCT
* **
683063 CCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGAGCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
582 CCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
*
683128 TTGGAATGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCC
647 TTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCC
683193 TGCCACACTGGACTT-AAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCAC
712 TGCCACACTGGACTTCAAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCAC
*
683257 GGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAAC
777 GGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAAC
683322 AGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAA-GCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAA
842 AGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAA
683386 AAATGAT
907 AAATGAT
683393 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
683458 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
*
683523 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
683588 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* *
683653 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCTAGGT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGCT
683718 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
326 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
683783 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
391 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
683848 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
456 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
683913 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
521 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
683978 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
586 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
684043 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
651 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
684108 ACACTGGACTT-AAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
716 ACACTGGACTTCAAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
*
684172 AACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTT
781 AACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT
684237 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAAT
846 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAAT
684302 GAT
911 GAT
684305 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
684370 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
*
684435 TATTGGACTTAAAGGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
*
684500 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAAGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* * *
684565 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATTCTGATTCAAAGCTAGGT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGCT
684630 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
326 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
684695 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
391 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
684760 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
456 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
684825 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
521 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
684890 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
586 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
684955 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
651 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
685020 ACACTGGTACTT-AAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
716 ACACTGG-ACTTCAAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGC
* * * *
685084 CAACGATAATGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAACATGCTGAGTCACGATCAGCAACAGT
780 CAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGT
685149 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAA
845 TAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAA
685214 TGAT
910 TGAT
685218 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
685283 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
* *
685348 TATTGGACTTAAAGGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAGGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
685413 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* *
685478 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCTAGGT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGCT
685543 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
326 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
685608 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
391 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
685673 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
456 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
685738 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
521 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
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586 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
685867 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
651 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
685932 ACACTGGACTT-AAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
716 ACACTGGACTTCAAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
* *
685996 AACGATATTGGGATTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTT
781 AACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT
686061 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAAT
846 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAAT
686126 GAT
911 GAT
686129 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
686194 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
* *
686259 TATTGGACATAAAGGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
686324 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* *
686389 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCTAGGT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGCT
686454 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
326 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
686519 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
391 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
686584 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
456 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
686649 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
521 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
* * **
686714 ACTAGGTTTTTGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
586 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
* *
686779 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
651 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
* *
686844 ACACTGGACTTCAAA-ATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGC
716 ACACTGGACTTCAAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
*
686908 AACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT
781 AACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT
* * *
686973 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
846 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAAT
687038 GAT
911 GAT
* * * *
687041 GAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGATGAAGGTGCCAATGTGT
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
* * *
687106 TGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGTTGATTCAAGGCCAACTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
687171 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
*
687236 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* *
687301 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGCT
** ** * * * * * ** * * * *
687362 ATATT-GGACTTA--AAGGT-GAGGTGC-CAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTT-
326 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGA-ATCCTCCACCTACT-A-GCTAGGCC--CTAAATT-G--TTG
** **** * * * * * * *
687421 AAAGGTGATAAAGGTGCAAATATGCTGAT-TC-A-AG--GCCAGCTATATTGGAC--TT-AAAGG
383 AAAATTG-GCCCGG-ACAAA-ATG-AGGTGTCTACAGCTGCC-CCTCT-TTGGCCGTTTCTAA-G
* * * * * * *
687478 TGAT-A--AA-GGTGCCAATATG-CTGATTCAAGGCCAGCTATATTCGTC--C--CCACATATGT
441 T-ATCAGGAATAG-GCCAA-A-GAC-AAAT--A-GACA-CCAT-TTTGTCTGCGGCCGC--ATGT
**** * ** * * *** * * *
687534 C--GAATCCTCCACCT-ACT-A-GCTAGGCC---CT-AA-ATTG--TTGAAAATTG-GCC--CGG
494 CATG-A-CCT-TTGGTGATTAATGCTTCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGG
* * ** * * * ** *** *
687584 ACAAAATGAGGTGTCTACAG-CTGCCCCTCTTTGGCCATTTCT-GAGTATCAGGAACAGGTCAAA
556 A-AAAATGA-GTTTGTAGGGTTTG-TCCTC-----CC--TACTAG-GT-TTTGGAA-TTTTCTAA
* * * * * * ** * ** *
687647 GACAAATAGA-CACCATTTTGTC-TGTGGCCGCA-T-GT-TATGACCTTTGGTGATTAATGCTTC
608 GGC---TTGATCTCC--TTAGACAGGT-GTAG-ATTGGTGTA-GA-GTTT-G-GA--ACGGATT-
* ** * * * *** * * * **
687707 CTGTGATGAAGAGTGCATTGG-C-G-ACGGTTCCGATG-G-AAAAATG-AGTTTGTAGGGTTTGT
659 -T-TG--GAAGAAT--A-TGGTCAGTA-TTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATT-CAAGGCCTG-
* ** ** ** ** * * ***** ** *** **
687766 CCTCCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTG-AGCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTA
714 -C-CAC-ACT-GGACTTCAAAGATGATGAGG-ATGAAGAGAGATA-AAAGGACCAG-TACGT-T-
* * ** * * * **** * *** *
687830 GAGTT--TGG--AACGGATTTTGGAAGAAT-ATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGA
770 GA-TTCACGGCCAAC-GATATTGG--GTTTAAAGATGAG-AAAAAG-GATGT--CAATATGCTGA
* * * * * *
687890 TTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTAAAGA-TGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACC-A-GTA
827 TTCACGGTCAG-CA-AC---AGTT--AGACT--TGAAGATG-AGA-AG----AATG-CCAATGTA
* * * * *
687952 CGTTGATTCACGGCCAAC-GATATTGGG-TTTAAAGATGACAA
876 C--TGATTCAAGGCCATCAG-CATTGGGTTTTAAAAATG--AT
* * * * * * ** * * * * *
687993 AAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGA-GAAGAATGCCA
1 GAAGG-CGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATA-TTGGACTT-AA-A-GACGAAG-GTGTCA
** * * * * ** * * *
688057 ATGTACTGATTCAAGGCCATC-AGCATTGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCCAATATGTTGAGT
60 ATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGA-CATT-TGACTT--AAA-GATG-AGGTGCCAATATGCTGATT
* * ** * * * * * * *
688121 CAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATT
119 CAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
* * * ** *
688186 TGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAAATATATTGGACCTAAAGGTGAGGT
183 GGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
688251 GCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGTGCCAATATGCTGA
248 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGA
* * *** ** * * * * *
688312 TT-AAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCC-AGCTAT
313 TTCAAA-GCCAGCTATATTCGTC-CCCACCT-A--TGTCGA-AT-C---CTCCA--CCTA-CTAG
* * * * * * * * * * *
688375 ATTGGACTTAAA--GGTGATAAA-GGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCT-AGGTATATTCA--T-
365 CTAGGCCCTAAATTGTTGA-AAATTG-GCC------CGGA--CAAA-ATGAGGTGTCTACAGCTG
* * * * * ** * * *
688433 CCCCACCTAT-GTCGAATCCTCCACCTA-CTA-G-CTAGGCCTTAAATTGTTGA-AAATTGGC-C
419 CCCC-TCTTTGGCCG--T-TTCTAAGTATC-AGGAATAGGCC--AAA-----GACAAATAGACAC
** * * * *** * * * * * *
688492 CGGAAAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTT-ATGAGTATCAGGAACAT-GCC
472 C-------AT--TTTGTCTGCGGCCGCATGTC-ATGACC-TTTGGTGA-T-TAATG--CTTCGCC
** ** *** * * * ** * *
688555 AAAGACAAATAGACACCATT-TTGTCTACG-GCCGCAT-G--TCATGACCTTTG--GTGATTAAT
522 -GTGA-TGA-AGAGTGCATTGGTGACT--GTTCCG-ATGGAAAAATGA-GTTTGTAG-GGTT--T
* * * ** ** * * * * **
688613 G-CTTCGCCGTGA-TGAAG---AGGGCTTTGGT--GAC-TG-T-TCCGATGGAAAAATG-AG-TT
577 GTCCTC-CC-T-ACT-AGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCC-TTAGACAGGTGTAGATT
* ** *** * * * *
688666 --TGTAGGGTTTGTCCTCCTTACTAGG-TTTTGGAATTTTCTAAGG-C-TTGA-TCT-C-CT-TA
637 GGTGTAGAGTTTG------GAAC--GGATTTTGGAA--GAATATGGTCAGT-ATTTTGCAATGT-
* * * ** ** * * ** *
688722 GACA-GGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTG-GA-AC-GGATTTTGGAAGA--AT-ATGG-T-CAGA-
690 GCCACCGTGCAGA-T--TCAAG-GCCTGCCACACTGGA-CTTCAAAGATGATGA-GGATGAAGAG
** * * * * ** * ** * * * * *
688777 ATTTTGCAATGTG-CCACTATGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGAT
749 A-GAT-AAAAG-GACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGG-GTT-TAAA-GATGA-GA-
* * * * * * * * * ** *
688841 GAAGAGTGATAAAAGGACTAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATA-TT-GGGTTTAATGATGAGA
806 -AAAAG-GAT-----GTC-AATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAA-GATGAG-
* * * * * * * * ** * *
688904 AAGAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT-AGACTTGAAGATGA-
861 AAGA--ATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCA-TTGGGTTTTAAAAATGAT
** * * * * ** * * *
688958 GAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGGCATCAGCG-T-TGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCC
1 GAAG-GCGCCAATATGTTGAGTCAA-GGC--CAGCGATATTGGACTT--AAA-GACGAAGGTGTC
* * * * * * * * *
689021 AATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAG
59 AATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAG
* * * * * * ** *
689086 GTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAAATATATTGGACC
123 GCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACT
* * *
689151 TAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAGGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAA
188 TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAA
* *
689216 TATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
253 TATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
* ** ** * * * *** * ***
689277 GGCCAGCTATATT-GGACTTA--AAGGTCATAAAGGTGCCA-ATA-T-GCTA-ATTC-AAA--GC
318 AGCCAGCTATATTCGTCCCCACCTATGTC-GAATCCT-CCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTG-
* * * * ** * * * * ***
689332 TAGGTATATTCGTCCC---C-ACCT-A--TGTCGA-ATCCT-CCACCTACTAGCTAGGCCCTAAA
380 T-TGAAAATT-GGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACA-GCTGCC-CCT-CT---TTGGCCGTTTC
* * * * ** *
689388 T-TGT-TGA-AAATTGGCC-CGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCT
437 TAAGTATCAGGAATAGGCCAAAGAC-AAAT-A---G---ACA-----CCAT-TTT----G--TCT
*** * * * * ** * *** * * * *
689449 AAGTATCAGGAATAGGCCAAAGACAAATAGACACCATT-TTGTCTGCGGCCGCATG-TCATGA--
482 --GCGGC-CGCAT--GTC-ATGAC-CTTTG--GTGATTAATG-CTTC-GCCG--TGATGAAGAGT
* * * ** *** * ** *
689510 CCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCG-T-GATGAA-GAGTGCATTGGTGACTGT--T-CCGA-T-GG
534 GCATTGGTG---ACTG-TT--CCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGG-GTTTGTCCTCCCTACTAGG
*** * * * * * * * ** *
689567 AAAAAT-G-AGTTTGTAGGGTTTG-TCCTCCCT--ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGAT
592 --TTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGAT-CTCCTTAGAC-AGG-TGTAG-A-TTGGT---G-TAGA-
* * * * * * * * * *
689627 CTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG-AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTAT
645 GT--TTGGA-ACG-G-A-TTTTG-GAAGAATATGGTCA-GTATTTTG------------------
689691 TTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTT-AAAGATGATGAGGATGA
684 ----CAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAGATGATGAGGATGA
689755 AGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAA
745 AGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAA
*
689820 GGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGT
810 GGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGT
689885 ACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAATGAT
875 ACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAATGAT
689924 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
689989 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
* *
690054 TATTGGACATAAAGGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
690119 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* *
690184 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCTAGGT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGCT
690249 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
326 ATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAATTGG
690314 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
391 CCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATAGGCC
690379 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
456 AAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTTCGC
690444 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
521 CGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCCT
* * **
690509 ACTAGGTTTTTGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
586 ACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGG
* * *
690574 AACGAATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
651 AACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCC
* *
690639 ACACTGGACTTCAAA-ATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGGC
716 ACACTGGACTTCAAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCC
*
690703 AACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT
781 AACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTT
* * *
690768 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAAAAT
846 AGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAAT
690833 GAT
911 GAT
* * * *
690836 GAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGATGAAGGTGCCAATGTGT
1 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
* * *
690901 TGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGTTGATTCAAGGCCAACTA
66 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
*
690966 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATCCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
131 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
*
691031 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
196 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
* * *
691096 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCT
261 TTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCAGCT
* * ** * * *** * * * *
691161 ATATTAG-ACTTA--AAGGT-GATAAAGGTGCCA-ATATGCTGATTCAAGG-CC---A--GCT--
326 ATATTCGTCCCCACCTATGTCG--AATCCT-CCACCTA--CT-A-GCTAGGCCCTAAATTGTTGA
* * * * * * * *** *
691213 ATATTCGTCCC---C-ACAT-A--TGTCGA-ATCCT-CCACCTACTAGCTAGGCCCTAAAT-TGT
384 AAATT-GGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACA-GCTGCC-CCT-CT---TTGGCCGTTTCTAAGT
* * * ** ** * * * *** * *
691268 -TGA-AAATTGGCC-CGGACAAA-ATG-----A-GGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCATTT
442 ATCAGGAATAGGCCAAAGACAAATA-GACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTC-ATGACC-TTT
* * * *** *** ** *** * ** * **
691323 -CTGAGTATCAGGAACAGGGCAAAGACAAATAGACACCATT-TTTTCTGTGGCCGCAT-G--TTA
504 GGTGA-T-TAATG--CTTCGCCGTGA-TGA-AGAGTGCATTGGTGACTGT-TCCG-ATGGAAAAA
* * ** * * * * **** * ** * * **
691383 TGACCTTTG--GTGATTAATGCTTCCT-GTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGG--T--TC-CGAT
561 TGA-GTTTGTAG-GGTTTGTCCTCCCTACT-AGGTTTTG-GAATTTTCTAAGGCTTGATCTCCTT
* * ** * ** *** * *
691440 GGAAAAATG-AG-TT--TGTAGGGTTTGTCCTCCCTACTAGG-TTTTGGAATTTTCTAAGGCTTG
622 AGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTG------GAAC--GGATTTTGGAA--GAATATGG--TC
** * * ** ** * * **
691500 AGCTCCTTAG--AT-TG-----GTGTAGATTGGTGTAGAGTTTG-GA-AC-GGATTTTGGAAGA-
675 AG-TATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGA-T--TCAAG-GCCTGCCACACTGGA-CTTCAAAGAT
* *** * * ** * ** * * * *
691553 -AT-ATGG-T-CAGTA-TTTTGCAATGTG-CCACCGT--GCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGA
734 GATGA-GGATGAAG-AGAGAT-AAAAG-GACCA--GTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGG
* * * * * * * * *
691610 CTTAAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATA-T
793 TTTAAAGATGA-GA--A--AA-AG-GAT-----G-TCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGT
** * * * * * * ** * * * **
691674 T-GGGTTAAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAGTT-AGACTT
845 TAGACTT-GAAGATGAG---AAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCATCAGCA-TTGGGTTTT
* *
691737 GAAGATGA-
905 AAAAATGAT
** * ** * * ** * * *
691745 GAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGGCATCAGCG-T-TGGGTTTTAAAAATGATGAAGGCGCC
1 GAAG-GCGCCAATATGTTGAGTCAA-GGC--CAGCGATATTGGACTT--AAA-GACGAAGGTGTC
* * * * * * * * *
691808 AATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAG
59 AATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAG
* * * * * * ** *
691873 GTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAAATATATTGGACC
123 GCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACT
* *
691938 TAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAA
188 TAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAA
* *
692003 TATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
253 TATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
* ** ** * * * *** * ***
692064 GGCCAGCTATATT-GGACTTA--AAGGTCATAAAGGTGCCA-ATA-T-GCT-GATTC-AAA--GC
318 AGCCAGCTATATTCGTCCCCACCTATGTC-GAATCCT-CCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTG-
* * * * ** * * *
692119 TAGGTATATTCGTCCC---C-ACCT-A--TGTCGA-ATCCT-CCACCTACTAGCTAGGCC--TT-
380 T-TGAAAATT-GGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACA-GCTGCC-CCT-CT---TTGGCCGTTTC
* * * * ** *
692172 AAATTGT-TGA-AAATTGGCC-CGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTT
437 TAA--GTATCAGGAATAGGCCAAAGAC-AAAT-A---G---ACA-----CCAT-TTT----G--T
* * * * * * ** * *** * * * *
692234 ATGAGTATCAGGAACATGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTAT-CTACGGCCGCATG-TCATGA
480 CTGCG--GC-CG--CATGTC-ATGAC-CTTTG--GTGA-TTAATGCTTC-GCCG--TGATGAAGA
* * * ** **** * ** *
692297 --CCTTTGGTGATTAATGCTTCGCCG-T-GATGAA-GAGGGCATTGGTGACTGT--T-CCGA-T-
532 GTGCATTGGTG---ACTG-TT--CCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGG-GTTTGTCCTCCCTACTA
*** * * * * *
692352 GGAAAAAT-G-AGTTTGTAGGGTTTGTCCTCCTTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGATC
590 GG--TTTTGGAATTTTCTAAGGCTTG------A------------------------------TC
*
692415 TCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTT
617 TCCTTAGACAGGTGTAGATTGGTGTAGAGTTTGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTT
**
692480 TGCAATGTGCCACTATGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAA-ATGATGAGGATGAAG
682 TGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCTGCCACACTGGACTTCAAAGATGATGAGGATGAAG
* * * *
692544 AGTGATAAAAGGACTAGTACGTTGATTCACGGGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAAGG
747 AGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGGCCAACGATATTGGGTTTAAAGATGAGAAAAAGG
*
692609 ATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGC
812 ATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACAGTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTAC
* *
692674 TGATTCAAGGGCATCAGCGTTGGGTTTTAAAAATGAT
877 TGATTCAAGGCCATCAGCATTGGGTTTTAAAAATGAT
692711 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
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*
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** *** ** * **** * * ** *
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*
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*
687376 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
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*
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* * * * * * * * *
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** *
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*
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*
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** *
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*
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TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
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* * * **
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* * * * * * * * *
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** *
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* *
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*
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*
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*
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GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
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** *
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*
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TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
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689911 TTTTAAAAAT
* * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* *
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* *
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*
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*
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1 -G--AT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAA
690241 AGCTAGGTAT
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GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
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690100 TATATTGGAC
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** *
690136 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
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*
690184 TTCAAGG
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690191 CCAGCTATAT
Statistics
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TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
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690823 TTTTAAAAAT
* * * *
690833 GATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAA
1 GATG-AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * * * *
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* *
690931 GATGAGGTGCCAATATGTTGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* *
690979 GGTGAGGTGCCAATATCCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
691027 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
691075 GGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
1 GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
* * *
691123 GGTGATAAAGGTGCAAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAA
1 ---GAT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
*
691175 GGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
1 ---GAT-GAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATT
691218 CGTCCCCACA
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GATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAA
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689914 TAAAAATGAT
* * * * * *
689924 GAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGTGTCAATGTGT
1 GAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATG-AGGTGCCAATATGT
* * * * * * * * *
689989 TGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAACTA
65 TGATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTA
* *
690054 TATTGGACATAAAGGTCAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
130 TATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG
*
690119 AGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG----AGGTGCCAATATG
195 AGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATG
* *
690180 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCT
260 CTGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCC
* *
690245 AGGTATATTCGTCCCCACCTATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
325 AGCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAA
* *
690310 TTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCGTTTCTAAGTATCAGGAATA
390 TTGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCATTTCTAAGTATCAGGAACA
690375 GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCT
455 GGCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCT
* *
690440 TCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGTGACTGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCT
520 TCGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCT
*
690505 CCCTACTAGGTTTTTGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
585 CCCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGT
*
690570 TTGGAACGAATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACTGTGCAGATTCAAGGCC
650 TTGGAACGAATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCC
*
690635 TGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGAAGAGTGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
715 TGCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
* * * *
690700 GGCAACGATATTGGGTTTAATGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGGTCAGCAACA
780 GCCAACGATATTGGGTTAAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACA
* *
690765 GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTGCTGATTCAAGGCCAACGGCATTGGGTTTTAAA
845 GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAA
*
690830 AATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGAT
910 AATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGAC
690885 GAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGTT
1 GAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGTT
*
690950 GATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATCCTGATTCAAGGCCAGCTAT
66 GATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTAT
691015 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA
131 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA
*
691080 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCAAATATGC
196 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGC
* *
691145 TGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCA
261 TGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCA
691210 GCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAAT
326 GCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAAT
*
691275 TGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCATTTCTGAGTATCAGGAACAG
391 TGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCATTTCTAAGTATCAGGAACAG
* * * *
691340 GGCAAAGACAAATAGACACCATTTTTTCTGTGGCCGCATGTTATGACCTTTGGTGATTAATGCTT
456 GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTT
*
691405 C-CTGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTC
521 CGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTC
*
691469 CCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGAGCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
586 CCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
* *
691534 TGGAACGGATTTTGGAAGAATATGGTCAGTATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCT
651 TGGAACGAATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCT
691599 GCCACACTGGACTT-AAAGATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
716 GCCACACTGGACTTCAAA-ATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACG
691663 GCCAACGATATTGGGTTAAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACA
780 GCCAACGATATTGGGTTAAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACA
* * *
691728 GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGGCATCAGCGTTGGGTTTTAAA
845 GTTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAA
* *
691793 AATGATGAAGGCGCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGAC
910 AATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGAC
* * * *
691848 GAAGGTGTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGCT
1 GAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGTT
* *
691913 GATTCAAGGCCAAATATATTGGACCTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTAT
66 GATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTAT
*
691978 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA
131 ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA
*
692043 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGC
196 GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGC
692108 TGATTCAA
261 TGATTCAA
692116 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 1163, Mismatches: 63, Indels: 8
0.94 0.05 0.01
Matches are distributed among these distances:
960 178 0.15
961 46 0.04
962 3 0.00
963 675 0.58
964 261 0.22
ACGTcount: A:0.30, C:0.17, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (964 bp):
GAAGGTGCCAATGTGTTGAGTCAAGGCCAGCGACATTGGACTTAAAGATGAGGTGCCAATATGTT
GATTCAAGGCCAACTATATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTAT
ATTGGACTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGA
GGTGCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGATAAAGGTGCCAATATGC
TGATTCAAGGCCAGCTATATTAGACTTAAAGGTCATAAAGGTGCCAATATGCTGATTCAAAGCCA
GCTATATTCGTCCCCACATATGTCGAATCCTCCACCTACTAGCTAGGCCCTAAATTGTTGAAAAT
TGGCCCGGACAAAATGAGGTGTCTACAGCTGCCCCTCTTTGGCCATTTCTAAGTATCAGGAACAG
GCCAAAGACAAATAGACACCATTTTGTCTGCGGCCGCATGTCATGACCTTTGGTGATTAATGCTT
CGCCGTGATGAAGAGTGCATTGGCGACGGTTCCGATGGAAAAATGAGTTTGTAGGGTTTGTCCTC
CCTACTAGGTTTTGGAATTTTCTAAGGCTTGACCTCCTTAGATTGGTGTAGATTGGTGTAGAGTT
TGGAACGAATTTTGGAAGAATATGGTCAGAATTTTGCAATGTGCCACCGTGCAGATTCAAGGCCT
GCCACACTGGACTTCAAAATGATGAGGATGAAGAGAGATAAAAGGACCAGTACGTTGATTCACGG
CCAACGATATTGGGTTAAAAGATGAGAAAAAGGATGTCAATATGCTGATTCACGATCAGCAACAG
TTAGACTTGAAGATGAGAAGAATGCCAATGTACTGATTCAAGGCCAACAGCATTGGGTTTTAAAA
ATGATGAAGGCGCCAATATGCTGAGTCAAGGCCAGCGATATCGGACTTAAAGAC
Found at i:691942 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 691805--692115 Score: 397
Period size: 48 Copynumber: 6.4 Consensus size: 48
691795 TGATGAAGGC
* * * **
691805 GCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * * * *
691854 GTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
** *
691902 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAAATATATTGGACCTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
691950 GCCAATATACTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
691998 GCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
692046 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGT
692098 GCCAATATGCTGATTCAA
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692116 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 232, Mismatches: 26, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
48 171 0.74
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ACGTcount: A:0.32, C:0.16, G:0.26, T:0.26
Consensus pattern (48 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:692014 original size:26 final size:26
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Indices: 691985--692065 Score: 66
Period size: 26 Copynumber: 3.3 Consensus size: 26
691975 TATATTGGAC
691985 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
** *
692011 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT-GA
692032 CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
692059 TTCAAGG
1 TTAAAGG
692066 CCAGCTATAT
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 7, Indels: 16
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Matches are distributed among these distances:
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21 2 0.05
22 13 0.32
23 1 0.03
25 1 0.03
26 19 0.47
27 2 0.05
28 1 0.03
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.28, T:0.27
Consensus pattern (26 bp):
TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
Found at i:692854 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 692717--693027 Score: 388
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692707 TGATGAAGGC
* * * **
692717 GCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * * * *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
** *
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1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
692862 GCCAATATACTGATTCAGGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
692910 GCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
692958 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGT
693010 GCCAATATGCTGATTCAA
1 GCCAATATGCTGATTCAA
693028 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 230, Mismatches: 28, Indels: 5
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 169 0.73
49 38 0.17
51 1 0.00
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Consensus pattern (48 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:692926 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 692897--692977 Score: 66
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692887 TATATTGGAC
692897 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
** *
692923 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT-GA
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1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
692971 TTCAAGG
1 TTAAAGG
692978 CCAGCTATAT
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 7, Indels: 16
0.63 0.11 0.25
Matches are distributed among these distances:
20 1 0.03
21 2 0.05
22 13 0.32
23 1 0.03
25 1 0.03
26 19 0.47
27 2 0.05
28 1 0.03
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.28, T:0.27
Consensus pattern (26 bp):
TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
Found at i:693766 original size:48 final size:48
Alignment explanation
Indices: 693629--693939 Score: 388
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693619 TGATGAAGGC
* * * **
693629 GCCAATATGTTGAGTCAAGGCCAGCGATATTGGACTTAAAGACGAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTG-AGGT
* * * * * * * * *
693678 GTCAATGTGTTGAGTCAAGGTCAGCGACATTTGACTTAAAGATGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
** *
693726 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAAATATATTGGACCTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
* *
693774 GCCAATATACTGATTCAGGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
693822 GCCAATATGCTGATTAAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
*
693870 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTCATAAAGGT
1 GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGG---T-GAGGT
693922 GCCAATATGCTGATTCAA
1 GCCAATATGCTGATTCAA
693940 AGCTAGGTAT
Statistics
Matches: 230, Mismatches: 28, Indels: 5
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
48 169 0.73
49 38 0.17
51 1 0.00
52 22 0.10
ACGTcount: A:0.32, C:0.16, G:0.26, T:0.26
Consensus pattern (48 bp):
GCCAATATGCTGATTCAAGGCCAGCTATATTGGACTTAAAGGTGAGGT
Found at i:693838 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 693809--693889 Score: 66
Period size: 26 Copynumber: 3.3 Consensus size: 26
693799 TATATTGGAC
693809 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
** *
693835 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCT-GA
693856 CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
693883 TTCAAGG
1 TTAAAGG
693890 CCAGCTATAT
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 7, Indels: 16
0.63 0.11 0.25
Matches are distributed among these distances:
20 1 0.03
21 2 0.05
22 13 0.32
23 1 0.03
25 1 0.03
26 19 0.47
27 2 0.05
28 1 0.03
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.28, T:0.27
Consensus pattern (26 bp):
TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
Found at i:694750 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 694721--694801 Score: 66
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694711 TATATTGGAC
694721 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
** *
694747 TTAAAGGCCA---G-CTATAT--TGGA
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694768 CTTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
1 -TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
*
694795 TTCAAGG
1 TTAAAGG
694802 CCAGCTATAT
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 7, Indels: 16
0.63 0.11 0.25
Matches are distributed among these distances:
20 1 0.03
21 2 0.05
22 13 0.32
23 1 0.03
25 1 0.03
26 19 0.47
27 2 0.05
28 1 0.03
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.28, T:0.27
Consensus pattern (26 bp):
TTAAAGGTGAGGTGCCAATATGCTGA
Done.