Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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153354 CTTCTCTTCT
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1 AAAAAAAACCAAAACAAAAACAAAA-AAC
* *
153392 AAAAAAAACAAAAAAACAAAACCAAAAAAC
1 AAAAAAAAC--CAAAACAAAAACAAAAAAC
*
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1 AAAAAA-AACCAAAACAAAAACAAAAAA
153448 GAGAAAAGAA
Statistics
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AAAAAAAACCAAAACAAAAACAAAAAAC
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153355 TTCTCTTCTA
153365 AAAAAAACCAAAA-C-AAAAACAAAACAAAAAAAAAAC
1 AAAAAAA-CAAAACCAAAAAACAAAA-AAAAAAAAAAC
* *
153401 AAAAAAACAAAACCAAAAAACAAAAAATAACAAAAC
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1 AAA-AAAA
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AAAAAAACAAAACCAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAC
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153369 AAACCAAAAC
153379 AAAAACAA
1 AAAAACAA
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1 AA-AAACAA
153395 AAAAACAA
1 AAAAACAA
153403 AAAAAC--
1 AAAAACAA
*
153409 -AAAACCA
1 AAAAACAA
153416 AAAAACAAA
1 AAAAAC-AA
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1 AAA-AACAA
*
153434 AACAAAGAA
1 AA-AAACAA
153443 AAAAA
1 AAAAA
153448 GAGAAAAGAA
Statistics
Matches: 51, Mismatches: 2, Indels: 16
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AAAAACAA
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154440 TCTCTCCTTT
*
154450 CACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATGTCTTTCAAAGCCCACACAAGTTGGTGG
1 CACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATGTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGG
* * * *
154505 CACCTTTTAGTCCTCAAAAAGCAAGATGCCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGG
1 CACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATGTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGG
** *
154560 CACCCTCCAGTCCTCGAAGAGCAGGATGCTTTTTTCTTTTAAAGCCCACACAA-TCTGGTGG
1 CACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATG------TCTTTTAAAGCCCACACAAGT-TGGTGG
* * *
154621 CA-CCTTCAGTCCTCAAAGAGTAGGACGCCTTCTTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGG
1 CACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGA-----T-GTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGG
*
154681 CA--CTTCCTAGTCCTCAAAGGGCAGGA
1 CACCCTT--TAGTCCTCAAAGAGCAGGA
154707 CGCTCTCTCC
Statistics
Matches: 167, Mismatches: 19, Indels: 26
0.79 0.09 0.12
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55 72 0.43
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CACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATGTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGG
Found at i:154660 original size:60 final size:60
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Indices: 154478--154709 Score: 255
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154468 GAGCAGGATG
* * * * *
154478 TCTTTCAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCTTTTAGTCCTCAAAAAGCA--A-G-ATGC-
1 TCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACC-TTCAGTCCTCAAAGAGCAGGACGCCTTCT
* * * * *
154534 -CTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCCTCCAGTCCTCGAAGAGCAGGATGCTTTTT
1 TCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCA-CCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGACGCCTTCT
*
154594 TCTTTTAAAGCCCACACAA-TCTGGTGGCACCTTCAGTCCTCAAAGAGTAGGACGCCTTCT
1 TCTTTTAAAGCCCACACAAGT-TGGTGGCACCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGACGCCTTCT
*
154654 TCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCA-CTTCCTAGTCCTCAAAGGGCAGGACGC
1 TCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCTT-C-AGTCCTCAAAGAGCAGGACGC
154710 TCTCTCCTTT
Statistics
Matches: 149, Mismatches: 16, Indels: 17
0.82 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
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TCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGACGCCTTCT
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154340 CTTCTCCTTC
* *
154350 CACTTTTCAGTCCTCAAAAAGCAGGATGCCTTTTCCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACC
1 CACTCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCCTTTT-CTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACC
* * * *
154415 TT-CTAGTCCTCAAAGAGTAGAACGCTCTCTCCTTTCACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATGT
65 TTCCTAGTCCTCAAAGGGTAGGACGCTCTCTCCTTTCACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAAGATGC
* * * *
154479 CTTTCAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCTTTTAGTCCTCAAAAAGCA-AGA-T-GCCTTTTAA
130 CTTTCAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCACC-TTCAGTCCTCAAAAAGCAGACACTCGCCTTCTAA
* **
154541 AGCCCACACAAGTTGGTGGCACCCTCCAGTCCTCGAAGAGCAGGATGCTTT-TTTCTTTTAAAGC
194 AGCCCACACAAGTTGGTGGCACCCTCCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTT-TTGCAAAGC
154605 CCACACAA-TCTGGTGG
258 CCACACAAGT-TGGTGG
* *
154621 CAC-CTTCAGTCCTCAAAGAGTAGGACGCCTTCTTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCA-C
1 CACTCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCCTT-TTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACC
* * *
154684 TTCCTAGTCCTCAAAGGGCAGGACGCTCTCTCCTTTCACCTTTTTGTCCTCAAAGAGCAAGATGC
65 TTCCTAGTCCTCAAAGGGTAGGACGCTCTCTCCTTTCACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAAGATGC
* * *
154749 CTTTTAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCACCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGACACCTTCTCCTTCT
130 CTTTCAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCACCTTCAGTCCTCAAAAAGCA-GACA-C-TCGCCTTCT
** **
154814 AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGCAAAG
192 AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCCTCCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGCAAAG
154879 CCCACACAAGTTGGTGG
257 CCCACACAAGTTGGTGG
* * *
154896 CACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATG-CTTTTTTTTTGCAAAGCCCACACAGGTTGGTGGCAC
1 CACTCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCCTTTTCTTTT--AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCAC
*
154960 CTTCC-AGTCCTTAAAGGGTAGGA
64 CTTCCTAGTCCTCAAAGGGTAGGA
154983 TGCCTTTTCT
Statistics
Matches: 316, Mismatches: 32, Indels: 23
0.85 0.09 0.06
Matches are distributed among these distances:
269 19 0.06
270 135 0.43
271 7 0.02
274 7 0.02
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277 5 0.02
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CACTCTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCCTTTTCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCT
TCCTAGTCCTCAAAGGGTAGGACGCTCTCTCCTTTCACCCTTTAGTCCTCAAAGAGCAAGATGCC
TTTCAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCACCTTCAGTCCTCAAAAAGCAGACACTCGCCTTCTAAAG
CCCACACAAGTTGGTGGCACCCTCCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGCAAAGCCCA
CACAAGTTGGTGG
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154495 AAGTTGGTGG
*
154505 CACCTTTTAGTCCTCAAAAAGCAAGATGCCTTTTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACCCTCCAG
1 CACCTTTTAGTCCTCAAAAAGCAAGATGCCTTTTAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCA-CCTCCAG
* ** * * * *
154570 TCCTCGAAGAGCAGGATGCTTTTTTCTTTTAAAGCCCACACAA-TCTGGTGGCAC-CTTCAGTCC
65 TCCTCAAAGAGCAGGACACCTTCTCCTTCTAAAGCCCACACAAGT-TGGTGGCACTCTTCAGTCC
* *
154633 TCAAAGAGTAGGACGCCTTCTTCTTT-TAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTC-CTAGTCCTC
129 TCAAAGAGCAGGACGCCTTCTT-TTTGCAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTCTC-AGTCCTC
*
154696 AAAGGGCAGGACGCTCTCTCCTTT
192 AAAGAGCAGGACGCTCTCTCCTTT
* * *
154720 CACCTTTTTGTCCTCAAAGAGCAAGATGCCTTTTAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCACCTTCAGT
1 CACCTTTTAGTCCTCAAAAAGCAAGATGCCTTTTAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCACCTCCAGT
* *
154785 CCTCAAAGAGCAGGACACCTTCTCCTTCTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTTAGTCCTC
66 CCTCAAAGAGCAGGACACCTTCTCCTTCTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTCTTCAGTCCTC
* * *
154850 AAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGCAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAG
131 AAAGAGCAGGACGCCTTCTTTTTGCAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTCTCAGTCCTCAAAG
154915 AGCAGGA
196 AGCAGGA
154922 TGCTTTTTTT
Statistics
Matches: 179, Mismatches: 19, Indels: 8
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
214 54 0.30
215 124 0.69
216 1 0.01
ACGTcount: A:0.26, C:0.29, G:0.19, T:0.26
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CACCTTTTAGTCCTCAAAAAGCAAGATGCCTTTTAAAGCCCACACAAGCTGGTGGCACCTCCAGT
CCTCAAAGAGCAGGACACCTTCTCCTTCTAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTCTTCAGTCCTC
AAAGAGCAGGACGCCTTCTTTTTGCAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTCTCAGTCCTCAAAG
AGCAGGACGCTCTCTCCTTT
Found at i:154879 original size:61 final size:61
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Indices: 154754--155043 Score: 372
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154744 GATGCCTTTT
* * ** * **
154754 AAAGCCCACACAAGCTGGTGGCAC-CTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGACACCTTCTCCTT-C
1 AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGC
*
154813 TAAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTTAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGC
1 -AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGC
*
154875 AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTTTTTTTGC
1 AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGC
* * * * * *
154936 AAAGCCCACACAGGTTGGTGGCACCTTCCAGTCCTTAAAGGGTAGGATGCCTTTTCTTTTTG-
1 AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATG-C-TTTCTTTTTGC
**
154998 -AAGCCCACATGAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGA
1 AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGA
155044 CTCACTTCCT
Statistics
Matches: 201, Mismatches: 25, Indels: 7
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
60 23 0.11
61 167 0.83
62 2 0.01
63 9 0.04
ACGTcount: A:0.25, C:0.26, G:0.22, T:0.27
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AAAGCCCACACAAGTTGGTGGCACTTTTCAGTCCTCAAAGAGCAGGATGCTTTCTTTTTGC
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Indices: 158226--158404 Score: 200
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158216 AAATTTCTAG
* *
158226 ATTTTTCAT-CTCGGGGATACTCCAA-TCCCGGTTTCATTTCCAAAACATCA
1 ATTTTTCATAATCGGGGATACTCCAACT-CCGATTT-ATTTCCAAAACA-CA
* * *
158276 ATTTTTCTTAATCGGGGATACTCCAACTCCGATCTTATTTCTAAAACACC
1 ATTTTTCATAATCGGGGATACTCCAACTCCGAT-TTATTTCCAAAACACA
* * * *
158326 CTTTTTCCATAATCGGGGATACTCCAACTCTGATTTTTTTTCCAAAACACCG
1 ATTTTT-CATAATCGGGGATACTCCAACTCCGA-TTTATTTCCAAAACA-CA
158378 ATTTTTCATAATCGGGGATACTCCAAC
1 ATTTTTCATAATCGGGGATACTCCAAC
158405 CCTGTTATTT
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 12, Indels: 11
0.83 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
50 14 0.13
51 87 0.78
52 10 0.09
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ATTTTTCATAATCGGGGATACTCCAACTCCGATTTATTTCCAAAACACA
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Indices: 158290--158562 Score: 374
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158280 TTCTTAATCG
* ** *
158290 GGGATACTCCAACTCCGATCTTATTTCTAAAACACCCTTTTTCCATAATCGGGGATACTCCAACT
1 GGGATACTCTAACTCCGATCTTATTTCTAAAACACCAATTCTCCATAATCGGGGATACTCCAACT
* * * *
158355 CTGATTTTTTTTCCAAAACACCGATTTTTCATAATCGGGGATACTCCAAC-CCTGTTA-TTT-TC
66 CCGATTTTATTTCCAAAACACCAATTTTTCACAATCGGGGATACTCCAACACC-GTTATTTTATC
158417 GA
130 -A
* *
158419 GGAGATACTCTAACTCC-AGTTTTATTTCTAAAACACCAATTCTCCATAATCGGGGATATTCCAA
1 GG-GATACTCTAACTCCGA-TCTTATTTCTAAAACACCAATTCTCCATAATCGGGGATACTCCAA
* *
158483 CTCCGATTTTATTTCCAAAACACTAATTTTTCACAATCGGGGATACTTCAACACCGTTATTTTAT
64 CTCCGATTTTATTTCCAAAACACCAATTTTTCACAATCGGGGATACTCCAACACCGTTATTTTAT
158548 CA
129 CA
158550 GGGATACTCTAAC
1 GGGATACTCTAAC
158563 CCCGTTATTT
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 12, Indels: 9
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
129 3 0.02
130 114 0.90
131 8 0.06
132 2 0.02
ACGTcount: A:0.29, C:0.25, G:0.12, T:0.34
Consensus pattern (130 bp):
GGGATACTCTAACTCCGATCTTATTTCTAAAACACCAATTCTCCATAATCGGGGATACTCCAACT
CCGATTTTATTTCCAAAACACCAATTTTTCACAATCGGGGATACTCCAACACCGTTATTTTATCA
Found at i:158521 original size:51 final size:51
Alignment explanation
Indices: 158430--158527 Score: 135
Period size: 51 Copynumber: 1.9 Consensus size: 51
158420 GAGATACTCT
* *
158430 AACTCCAGTTTTATTTCTAAAACACCAATTCTCCATAATCGGGGATATTCC
1 AACTCCAGTTTTATTTCCAAAACACCAATTCTCCACAATCGGGGATATTCC
* * *
158481 AACTCC-GATTTTATTTCCAAAACACTAATTTTTCACAATCGGGGATA
1 AACTCCAG-TTTTATTTCCAAAACACCAATTCTCCACAATCGGGGATA
158528 CTTCAACACC
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 5, Indels: 2
0.85 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
50 1 0.02
51 40 0.98
ACGTcount: A:0.33, C:0.23, G:0.10, T:0.34
Consensus pattern (51 bp):
AACTCCAGTTTTATTTCCAAAACACCAATTCTCCACAATCGGGGATATTCC
Found at i:158581 original size:28 final size:30
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Indices: 158521--158586 Score: 79
Period size: 28 Copynumber: 2.3 Consensus size: 30
158511 TTTCACAATC
158521 GGGGATACT-TCAACACCGTTATTTTATCA
1 GGGGATACTCTCAACACCGTTATTTTATCA
*
158550 -GGGATACTCT-AACCCCGTTA-TTT-TCGA
1 GGGGATACTCTCAACACCGTTATTTTATC-A
158577 GGGGATACTC
1 GGGGATACTC
158587 CAATCTCGGC
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 1, Indels: 7
0.80 0.02 0.17
Matches are distributed among these distances:
26 2 0.06
27 4 0.12
28 26 0.79
29 1 0.03
ACGTcount: A:0.24, C:0.23, G:0.21, T:0.32
Consensus pattern (30 bp):
GGGGATACTCTCAACACCGTTATTTTATCA
Found at i:161750 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 161732--161762 Score: 53
Period size: 13 Copynumber: 2.4 Consensus size: 13
161722 ACATTTCTTC
161732 ATGTATCGATACA
1 ATGTATCGATACA
161745 ATGTATCGATACA
1 ATGTATCGATACA
*
161758 TTGTA
1 ATGTA
161763 CCATGTATCG
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 17 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.16, T:0.35
Consensus pattern (13 bp):
ATGTATCGATACA
Found at i:164034 original size:485 final size:486
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Indices: 162162--165896 Score: 4912
Period size: 487 Copynumber: 7.7 Consensus size: 486
162152 AAATCCTAAT
* *
162162 AGTTATTTTATGAGATTTTAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGG
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGG
* *
162227 CCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTCCTTCCATGATTTGTGGATGGCTCCAAGCT
66 CCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT-TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
* * * *
162292 GATTTGGTGAGTTGACTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTATGGGTCAAAATGCAAATAT
130 GATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
** * * *
162357 GCAAAAATTTAAGGACTTCATTGCAATCG-TTGTTCCGTGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATG
195 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA-AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG
*** * * *
162421 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTCATTGATTTGAAATTAATTTAGATGCAGTGATAAGTTGTT
259 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGC-GTGATGAGGTGTT
* * * *
162486 TGCATGAGAAAATTCGTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTTTTTGTATCATAATGCTGA
323 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGA
* * *
162551 ATTGTTAAGTTACAAATCATTTTGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
388 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
* * *
162616 TTTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTAAATTATA
453 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
* *
162650 AGTTATTTAATGAGATTT-AATATTACAGGGATTAAATTGCAAAAATTA-AAAAGTCATACTTTA
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAA-ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA--AGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * * *
162713 TAGCCAAAAGGATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTCTTCCATGATATGTGGATGGTTTCGAA
63 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGG-TTCCAA
* * * * *
162778 -CTAATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTAGGATGTTGTGATTGGTTATGGGTCAAAATGCAAA
127 GCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAA
* * * *
162842 TATGC-AAAATTTAAGGACTTTGTTCCAAAGTTTGTTCCATGAAAATTT-TAATTTAGCTGAAAC
192 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATG-AAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
*
162905 ATGATCAACCATTTTGGCACGTTTTTCTTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGT
256 ATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTC-TTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGT
* * * *
162970 GTTTGCATGGGAAAACTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTTTTTGTATCATGATGC
320 GTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGC
* * * * *
163035 TGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCTGGGTCGAATCTGTTTGAAACTGATAAAGACGA
385 TGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGA
**
163100 TATTGTGCCCATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
450 TATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
* * * ** *
163137 AGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGTAAAAATTAAAAGTCAAGCTTTATGG
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGG
* * * **
163202 CCAAAACTATTTGACTGAGCCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATCTGTGGATAATTCCAAGCT
66 CCAAAAGTATTTGACCGAG-CCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
* *
163266 GATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT
130 GATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
* * ** * * *
163331 GGAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAATTTTTGGTCCGTGAAATTTTTTATTTAGCCGAAACATGA
195 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * *
163396 TCAACCATTTTGACAAGTTTTTCTTGC-AGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTT
260 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTA-ATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
* * * * * * *
163460 GCATAAGAAAATTCATGTAAAAGCAGGTAAAATTTCATTACATGTATTCGTATCATGGTGCTGAA
324 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
* * **
163525 TTGTTAAATTGCAAATCATTTAGATAGCGCGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT
389 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT
**
163590 GCCCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
454 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
*
163623 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTA-CGAGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATG
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAG-GGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATG
* * *
163687 GCCAAAAGCATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTATGATTTATGGATGGTTCCAAGCT
65 GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
* * * * *
163752 AATTTAGTGAATTGATTTTTTGTTTTTATGATG-TGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
130 GATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
* * *
163816 GCAAAACTTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAAGA
195 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * *
163881 TCAACCATTTTGGCATGTTTTCCTTACTAATTTGAAAATAATTTCGATGCGCGATGAGGTGTTTG
260 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * * *
163946 CATGAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTGTCATGATGCTGAGT
325 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* *
164011 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTA
390 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
* * *
164076 TGCTTACTTTTT-CCTTGGTATCTTGGTTTATA
455 TGCTTA-TTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
* *
164108 AGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTACAA-TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA-AATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATG
* * * *
164172 GCCAAAAGTATTTGGA-CGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTTCTAGGATTTGTGGATGCTTCCAAG
65 GCCAAAAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
* * *
164236 CTGATTTGGTGATTTGATTTTGTGTTTTTATGATGTTATGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAAT
128 CTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAT
* * * **
164301 ATGGAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGGTCTGTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
193 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
*
164366 GATCAACCATTTTGGC-TAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
258 GATCAACCATTTTGGCAT-GTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* * *
164430 TTGCAAGAGAATATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTA----T-TCAT-AT-C--
322 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTG
* * * * * *
164486 -A-TGGTG-GTTGCAAACCATTTAGATACCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTAATAAAGATGATG
387 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA
* *
164548 TTGTGCTTAATTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACA
452 TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
* * **
164583 AGTTATTTAACGAGATTTGAAATTGTAAAGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGG
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGG
* * *
164648 CTAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTCTTTCCTTGATTTGTGGATGCTTCCAAGCT
66 CCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT-TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
* * *
164713 GATTTAGTGATTTGATTATTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAATAGGGGTCAAAATGCAAATAT
130 GATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
* **
164778 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAACATGA
195 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * * *
164843 TCAA-CATTTTCGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAATTTAATTAAGATGCAGTGTTAAGCTGTT
260 TCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGC-GTGATGAGGTGTT
* * * * * * *
164907 AGCATGAGAAAATTCTTGTAACAGTAGGGGAAATTTTATTACATGTA-TTGTACCGTGATGCTGA
323 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGA
* * * * * *
164971 ATTGTTGAGTTGCAAGTTATTTAAATAGCTTGATCGAATCTGTTTGAAATTGACAAAGATTATAT
388 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
*
165036 TGTGCTTATTTTTTCCTTGATTTCCTT-ATTTATA
453 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT-CTTGATTTATA
* * *
165070 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGCCATGCTTTATGG
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGG
* *
165135 CCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
66 CCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
*
165200 GATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGA---TGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGTAAATAT
130 GATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
* * ** * * *
165262 GCAAAAATTTAAGGACTTGGCTACAAAGTTTGTTTTATGCAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGG
195 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * *
165327 TCAACCATTTTGACAT-TCATTTCTTTCTAATTTGAAATTAATTTAGGTACGTGATGAGGTGTTT
260 TCAACCATTTTGGCATGT-TTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
* * * * *
165391 GCATGAGAAAATTTTTGTAATAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTAATTGTATTATGATGCTGAA
324 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
* *
165456 TTGTTAAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT
389 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT
* * *
165521 GTGCTTATTTTTACCATGATTTCTTGATTTACA
454 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
* * * * *
165554 AGTTATTTAACGATATTTGAAATTGTTA-GGAGTAAAATGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATG
1 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATT-ATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATG
* ** * * * * *
165618 GCCAAAATTATTTGATTGAGCCTAGTGAAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTTCATGCT
65 GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
* * *
165683 GATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAAATGTAAATAT
130 GATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
* * *
165748 GCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATG-AATTTCTTATTTTGCCGAAACATGA
195 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * ** * *
165812 TCAACCATTTTGGAACGCGTTTCTTTCTAATTTGAAATTAATTTAGGTGCGTGATGAGGTGTTTG
260 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
165877 CATGAGAAAATTCTTGTAAA
325 CATGAGAAAATTCTTGTAAA
165897 GGATTTTTTT
Statistics
Matches: 2834, Mismatches: 360, Indels: 109
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
474 18 0.01
475 337 0.12
476 56 0.02
479 1 0.00
480 3 0.00
481 4 0.00
482 5 0.00
483 114 0.04
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485 486 0.17
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488 161 0.06
489 52 0.02
490 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (486 bp):
AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGG
CCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTG
ATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
Found at i:166129 original size:250 final size:250
Alignment explanation
Indices: 165645--166146 Score: 776
Period size: 250 Copynumber: 2.0 Consensus size: 250
165635 GAGCCTAGTG
* *
165645 AAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTTCATGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTT
1 AAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTT
* * * *
165710 ATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAAATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAA
66 ATGATGTTGTGATTGACTAGAGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACATGGTTGCAAA
* * * *
165775 GTTTGTTCCATGAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGAACGCGTTTCTTTCT
131 GTTTGTTCCATGAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGAACGCGTTTCTTGCT
* *
165840 AATTTGAAATTAATTTAGGTGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
196 AATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
* *
165895 AAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTT
1 AAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTT
* * *
165960 ATGATGTTGTGATTGATTAGAGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACATGGTTGCAAT
66 ATGATGTTGTGATTGACTAGAGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACATGGTTGCAAA
* *
166025 GTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCTGAAACATGATCAACCACTTT-GACAC-CTTTTTCTT
131 GTTTGTTCCATG-AATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGA-ACGC-GTTTCTT
*
166088 GCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGT-TTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
193 GCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
166145 AA
1 AA
166147 TGTAGGTGAA
Statistics
Matches: 229, Mismatches: 20, Indels: 6
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
250 158 0.69
251 71 0.31
ACGTcount: A:0.28, C:0.11, G:0.21, T:0.40
Consensus pattern (250 bp):
AAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTT
ATGATGTTGTGATTGACTAGAGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACATGGTTGCAAA
GTTTGTTCCATGAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGAACGCGTTTCTTGCT
AATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
Found at i:167913 original size:58 final size:57
Alignment explanation
Indices: 167810--168138 Score: 362
Period size: 58 Copynumber: 5.7 Consensus size: 57
167800 CACCCTTCAG
* ** *
167810 AAGCCCACAAGTCAGTGGCA-TCTTTTTCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACATTTA
1 AAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTTA
* *
167866 AAGCCCACAAATCAGTGGCACCCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCA
1 AAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTT-TCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTTA
* *
167924 AAGCCCACAAATCAGTGGCACCCTTTTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAA
1 AAGCCCACAAGTCAGTGGCACCC-TTTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTT-TA
* ** * *
167983 AAGCCCACAAGTCAGTGGCACTCTTTTTCAAAGCCCACAAATCAGTGGCACCCTTCTCCCA
1 AAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTT-T---A
* * * *
168044 AAGCCCACAAGTTAGTGGCAACC-TT-CAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTTCAA
1 AAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACC-TTT--A
* *
168102 AAGCCCACAAGTCAGTGGCAACC-TT-CAAAAGCCCACA
1 AAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTCCCAAAGCCCACA
168139 CAAGTTGGTG
Statistics
Matches: 243, Mismatches: 22, Indels: 14
0.87 0.08 0.05
Matches are distributed among these distances:
56 19 0.08
57 3 0.01
58 148 0.61
59 48 0.20
60 4 0.02
61 21 0.09
ACGTcount: A:0.32, C:0.34, G:0.16, T:0.18
Consensus pattern (57 bp):
AAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTTA
Found at i:168127 original size:89 final size:88
Alignment explanation
Indices: 167803--168127 Score: 428
Period size: 89 Copynumber: 3.7 Consensus size: 88
167793 TATTTCTCAC
* * * * *
167803 CCTTCAGAAGCCCACAAGTCAGTGGCATCTTTTTCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACATT-T--
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTTCAAAGCCCACAAATCAGTGGCAACCTTCTCC
* *
167865 -AAAGCCCACAAATCAGTGGCAC
66 CAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
* * * *
167887 CCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACC--TTCAAAGCCCACAAATCAGTGGCACCCTTT
1 CC-T-T-CAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTTCAAAGCCCACAAATCAGTGGCAACCTTC
167950 TCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
63 TCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
* *
167976 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACTCTTTTTCAAAGCCCACAAATCAGTGGCACCCTTCTC
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAC-CCTTTTCAAAGCCCACAAATCAGTGGCAACCTTCTC
*
168041 CCAAAGCCCACAAGTTAGTGGCAA
65 CCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
*
168065 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTC
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTTC-AAAGCCCACAAATCAGTGGCAACCTTC
168128 AAAAGCCCAC
Statistics
Matches: 213, Mismatches: 17, Indels: 17
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
84 2 0.01
85 27 0.13
86 24 0.11
87 24 0.11
88 7 0.03
89 129 0.61
ACGTcount: A:0.31, C:0.34, G:0.16, T:0.19
Consensus pattern (88 bp):
CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACCCTTTTCAAAGCCCACAAATCAGTGGCAACCTTCTCC
CAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
Found at i:168132 original size:147 final size:143
Alignment explanation
Indices: 167805--168138 Score: 526
Period size: 147 Copynumber: 2.3 Consensus size: 143
167795 TTTCTCACCC
* * *
167805 TTCAGAAGCCCACAAGTCAGTGGCATCTTTTTC-AAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACATTTAAAG
1 TTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAAC--CTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACATTTAAAG
167869 CCCACAAATCAGTGGCACCCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAGCCCACAA
64 CCCACAAATCAGTGGCACCCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAGCCCACAA
167934 ATCAGTGGCACCCTT
129 ATCAGTGGCACCCTT
* * *
167949 TTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCACTCTTTTTCAA
1 TT-CAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCA-AC-ATTT-AA
*
168014 AGCCCACAAATCAGTGGCACCCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTTAGTGGCAACCTTCAAAAGCCCA
62 AGCCCACAAATCAGTGGCACCCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTC-AAAGCCCA
*
168079 CAAGTCAGTGGCACCCTT
126 CAAATCAGTGGCACCCTT
168097 TTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAAGCCCACA
1 TTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAAGCCCACA
168139 CAAGTTGGTG
Statistics
Matches: 175, Mismatches: 9, Indels: 9
0.91 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
143 3 0.02
144 23 0.13
145 23 0.13
146 3 0.02
147 96 0.55
148 27 0.15
ACGTcount: A:0.32, C:0.34, G:0.16, T:0.19
Consensus pattern (143 bp):
TTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACATTTAAAGCC
CACAAATCAGTGGCACCCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAACCTTCAAAGCCCACAAAT
CAGTGGCACCCTT
Found at i:168151 original size:30 final size:28
Alignment explanation
Indices: 167803--168138 Score: 340
Period size: 31 Copynumber: 11.6 Consensus size: 28
167793 TATTTCTCAC
* *
167803 CCTTCAGAAGCCCACAAGTCAGTGGCAT
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
*
167831 CTTTTTC-AAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
1 C--CTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
* * * *
167860 CATT-TAAAGCCCACAAATCAGTGGCAC
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
*
167887 CCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
1 CC-T-T-CAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
* *
167918 CCTTC-AAAGCCCACAAATCAGTGGCAC
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
*
167945 CCTTTTCCCAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
1 CC--TT-CAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
167976 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGC-A
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
* *
168003 CTCTTTTTC-AAAGCCCACAAATCAGTGGCAC
1 C-C---TTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
* *
168034 CCTTCTCCCAAAGCCCACAAGTTAGTGGCAA
1 CC-T-T-CAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
*
168065 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAC
1 CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
168093 CCTTTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
1 CC--TTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
168123 CCTTCAAAAGCCCACA
1 CCTTCAAAAGCCCACA
168139 CAAGTTGGTG
Statistics
Matches: 263, Mismatches: 24, Indels: 42
0.80 0.07 0.13
Matches are distributed among these distances:
27 47 0.18
28 64 0.24
29 29 0.11
30 54 0.21
31 69 0.26
ACGTcount: A:0.32, C:0.34, G:0.16, T:0.18
Consensus pattern (28 bp):
CCTTCAAAAGCCCACAAGTCAGTGGCAA
Found at i:168227 original size:49 final size:49
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Indices: 168155--168434 Score: 277
Period size: 49 Copynumber: 5.8 Consensus size: 49
168145 GGTGGCATCT
* * *
168155 TCTTCTAAATCCAATATCCCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCA
1 TCTT-TAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCACATTGGCACCGTCA
* * *
168205 TCTTTAAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAACCAACACATT---A--G-CA
1 TCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCACATTGGCACCGTCA
* * *
168248 CCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCGTGAATCAGCATATTGGCACCGTCA
1 TCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCACATTGGCACCGTCA
* * * * *
168297 TCTTTAAGACCAATGTCGCTAGCCTTGAATCAGCACATTGGCATCTTCA
1 TCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCACATTGGCACCGTCA
*** * * *
168346 TCTTTAAGTCTGGTATCGTTGGCTTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCA
1 TCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCACATTGGCACCGTCA
* * * *
168395 TCTTTAAGAT-CAATGTCGCTAGCCATGAAGCAGCACATTG
1 TCTTTAAG-TCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCACATTG
168435 TCATTCTTCG
Statistics
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44 1 0.01
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49 138 0.76
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ACGTcount: A:0.26, C:0.26, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (49 bp):
TCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCACATTGGCACCGTCA
Found at i:168396 original size:98 final size:96
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Indices: 168147--168443 Score: 370
Period size: 98 Copynumber: 3.1 Consensus size: 96
168137 CACAAGTTGG
* *
168147 TGGCATCTT-CTTCTAAATCCAATATCCCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCATCTTTA
1 TGGCATCTTCCTT-TAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCATCTTTA
* * *
168211 AGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAACCAACACAT
65 AGACCAATGTCGCTAGCCTTGAACCAGCACAT
* *
168243 TAGCA----CCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCGTGAATCAGCATATTGGCACCGTCATCTTTAA
1 TGGCATCTTCCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCATCTTTAA
*
168304 GACCAATGTCGCTAGCCTTGAATCAGCACAT
66 GACCAATGTCGCTAGCCTTGAACCAGCACAT
*** * *
168335 TGGCATCTTCATCTTTAAGTCTGGTATCGTTGGCTTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCATCTTT
1 TGGCATCTTC--CTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCATCTTT
* * *
168400 AAGATCAATGTCGCTAGCCATGAAGCAGCACAT
64 AAGACCAATGTCGCTAGCCTTGAACCAGCACAT
*
168433 TGTCATTCTTC
1 TGGCA-TCTTC
168444 GCATCTTCGA
Statistics
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Consensus pattern (96 bp):
TGGCATCTTCCTTTAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCACCGTCATCTTTAA
GACCAATGTCGCTAGCCTTGAACCAGCACAT
Found at i:169165 original size:13 final size:13
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Indices: 169143--169199 Score: 51
Period size: 13 Copynumber: 3.9 Consensus size: 13
169133 CATAAAGTGT
*
169143 TGTATTGATACAA
1 TGTATCGATACAA
169156 TGTATCGATACATAA
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169171 GTGTTATATCGATACAA
1 -TG---TATCGATACAA
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169200 TAAGTTTTGT
Statistics
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Consensus pattern (13 bp):
TGTATCGATACAA
Found at i:169182 original size:19 final size:18
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Indices: 169125--169218 Score: 64
Period size: 19 Copynumber: 5.6 Consensus size: 18
169115 CAACGATTTG
169125 TATCGATACATAAAGTGTT
1 TATCGATACAT-AAGTGTT
*
169144 GTATTGATAC--AA-TG--
1 -TATCGATACATAAGTGTT
169158 TATCGATACATAAGTGTT
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169176 ATATCGATAC--AA-TG--
1 -TATCGATACATAAGTGTT
*
169190 TATCGATACATAAGTTTT
1 TATCGATACATAAGTGTT
169208 GTATCGATACA
1 -TATCGATACA
169219 ATGTAAGGTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (18 bp):
TATCGATACATAAGTGTT
Found at i:169185 original size:32 final size:32
Alignment explanation
Indices: 169123--169223 Score: 166
Period size: 32 Copynumber: 3.1 Consensus size: 32
169113 TTCAACGATT
*
169123 TGTATCGATACATAAAGTGTTGTATTGATACAA
1 TGTATCGATACAT-AAGTGTTGTATCGATACAA
*
169156 TGTATCGATACATAAGTGTTATATCGATACAA
1 TGTATCGATACATAAGTGTTGTATCGATACAA
*
169188 TGTATCGATACATAAGTTTTGTATCGATACAA
1 TGTATCGATACATAAGTGTTGTATCGATACAA
169220 TGTA
1 TGTA
169224 AGGTACTGCC
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 4, Indels: 1
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Consensus pattern (32 bp):
TGTATCGATACATAAGTGTTGTATCGATACAA
Found at i:169338 original size:52 final size:52
Alignment explanation
Indices: 169294--169422 Score: 213
Period size: 52 Copynumber: 2.5 Consensus size: 52
169284 CACTGATCTT
*
169294 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCATATGTATCGATACACTATAAAA
1 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
* *
169346 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGTCCAGATGTATCGATACACTATGAAA
1 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
* *
169398 TGTATCGATAGATGCAAGCAAATTT
1 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTT
169423 TCATATTTCG
Statistics
Matches: 72, Mismatches: 5, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
52 72 1.00
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Consensus pattern (52 bp):
TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
Found at i:172589 original size:53 final size:52
Alignment explanation
Indices: 172509--172659 Score: 169
Period size: 53 Copynumber: 3.1 Consensus size: 52
172499 TGGCACCTCC
172509 AAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTTGTCATCTTTT
1 AAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCC-TTGTCATCTTTT
* * *
172562 AAGTCCAATGTAGCTGGCCTTGAATCAGCACATTGGCACC---TC--C----
1 AAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTGTCATCTTTT
* *
172605 AAGTCCAATATCGTTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCAT-TTTT
1 AAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTT-GTCATCTTTT
172657 AAG
1 AAG
172660 ACCCAATATC
Statistics
Matches: 80, Mismatches: 8, Indels: 21
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Matches are distributed among these distances:
43 35 0.44
47 3 0.04
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52 3 0.04
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ACGTcount: A:0.23, C:0.25, G:0.21, T:0.32
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AAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTGTCATCTTTT
Found at i:172666 original size:96 final size:96
Alignment explanation
Indices: 172492--172666 Score: 298
Period size: 96 Copynumber: 1.8 Consensus size: 96
172482 CGTTACGACA
* *
172492 AGCACATTGGCACCTCCAAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTTGTCAT
1 AGCACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCAT
*
172557 CTTTTAAGTCCAATGTAGCTGGCCTTGAATC
66 CTTTTAAGCCCAATGTAGCTGGCCTTGAATC
*
172588 AGCACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGTTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCAT
1 AGCACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCAT
172653 -TTTTAAGACCCAAT
66 CTTTTAAG-CCCAAT
172667 ATCATTGGCC
Statistics
Matches: 74, Mismatches: 4, Indels: 2
0.93 0.05 0.03
Matches are distributed among these distances:
95 7 0.09
96 67 0.91
ACGTcount: A:0.23, C:0.27, G:0.19, T:0.30
Consensus pattern (96 bp):
AGCACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCAT
CTTTTAAGCCCAATGTAGCTGGCCTTGAATC
Found at i:172693 original size:96 final size:96
Alignment explanation
Indices: 172494--172686 Score: 282
Period size: 96 Copynumber: 2.0 Consensus size: 96
172484 TTACGACAAG
* *
172494 CACATTGGCACCTCCAAGTCCAATGTCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTTGTCATCT
1 CACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCATCT
* * * *
172559 TTTAAGTCCAATGTAGCTGGCCTTGAATCAG
66 TTTAAGCCCAATATAGCTGGCCGTGAATCAC
*
172590 CACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGTTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCAT-T
1 CACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCATCT
*
172654 TTTAAGACCCAATATCA-TTGGCCGTGAATCAC
66 TTTAAG-CCCAATAT-AGCTGGCCGTGAATCAC
172686 C
1 C
172687 GTATTGGTCC
Statistics
Matches: 87, Mismatches: 8, Indels: 4
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
95 7 0.08
96 79 0.91
97 1 0.01
ACGTcount: A:0.23, C:0.28, G:0.19, T:0.30
Consensus pattern (96 bp):
CACATTGGCACCTCCAAGTCCAATATCGCTGGCCTTGAATCAGCATATTGGCGCCTTCGTCATCT
TTTAAGCCCAATATAGCTGGCCGTGAATCAC
Found at i:173278 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 173235--173287 Score: 81
Period size: 19 Copynumber: 2.7 Consensus size: 20
173225 ATTTCAACGA
173235 TTTGTATCGATACATAAAGT
1 TTTGTATCGATACATAAAGT
* *
173255 GTTGTATTGATACAT-AAGT
1 TTTGTATCGATACATAAAGT
173274 TTTGTATCGATACA
1 TTTGTATCGATACA
173288 ATGTAAGCTA
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 4, Indels: 1
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
19 16 0.55
20 13 0.45
ACGTcount: A:0.32, C:0.09, G:0.17, T:0.42
Consensus pattern (20 bp):
TTTGTATCGATACATAAAGT
Found at i:173348 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 173330--173355 Score: 52
Period size: 13 Copynumber: 2.0 Consensus size: 13
173320 ATTACTCAAA
173330 TGTATCGATACAT
1 TGTATCGATACAT
173343 TGTATCGATACAT
1 TGTATCGATACAT
173356 GCAGGCAAAT
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 13 1.00
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Consensus pattern (13 bp):
TGTATCGATACAT
Found at i:173421 original size:52 final size:52
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Indices: 173343--173471 Score: 240
Period size: 52 Copynumber: 2.5 Consensus size: 52
173333 ATCGATACAT
173343 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
1 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
*
173395 TGTATCGATACAAGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
1 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
*
173447 TGTATCGATACATGCAGGCCAATTT
1 TGTATCGATACATGCAGGCAAATTT
173472 TCATATTTCG
Statistics
Matches: 74, Mismatches: 3, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
52 74 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.19, G:0.18, T:0.27
Consensus pattern (52 bp):
TGTATCGATACATGCAGGCAAATTTGCCCAGATGTATCGATACACTATAAAA
Found at i:184883 original size:971 final size:970
Alignment explanation
Indices: 180584--199158 Score: 19366
Period size: 971 Copynumber: 19.0 Consensus size: 970
180574 CTGTCCATGA
* * * * * *
180584 CTTGATTTACAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATTGTACGGAGTAAATTACAAAAAAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* *
180649 ATGCTTTTTGGCCAAAAGTATTTAACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGATGATTTGTGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC-ATGATTTGTGGAT
* * * *
180714 GGTTCCAAGTTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGATTAAGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * * * * *
180779 AATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAATTTATTCCATGAAATTTCTTATATAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * ** * * *
180844 CCATAGCGTGATCAATAATTTTGGCATGTTTTACTTGCTGATTTGAAATCAATTTAGATCCGTGA
260 CCA-AACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* *
180909 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGATGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCA
324 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCA
* *
180974 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA-CATTTAGATATCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
389 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
* *
181038 AGATGATATTGAGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATGTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAA
454 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAA
* *
181103 TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATTAATCCT
519 TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCT
* * * *
181168 TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATATGTGCATGGTTCCAAACAGATTTGCTGATTTGATTATGTGT
584 TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT
* * *
181233 GTTTATGATGTTGTGATTGTTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACATGGTTG
649 GTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG
* **
181298 CAAAGTTTGTTCCATG-AATTTCTTACTTT-GCCGAAACATGAGCAACCATTTTGGCATGCATTT
714 CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA-TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTT
* * *
181361 CTTTCTA-ATTTGAAATTAATTTAGCTGCGTGATGAGGTGCTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
778 CTTGC-AGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * * *
181425 GTAGATGAAAGTTCTTTGCATGTATTTGTATTATGATGCTGAATTGTTAAGTTACAAATCATTTA
842 GTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* * * * *
181490 TATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTTTTTTTTTACCATGAT
907 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGC--TTATTTTTGCCTTGAT
181555 TT
969 TT
* * * ** * *
181557 CTTCATGTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATCGTAAGGATTAAATTGTAAAAAAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * * *
181622 AAGCCTTATGACCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * **
181687 GTTCCAAGCTAATTTGGTGATTTGATTGTTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGTTGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* *
181752 ATGCAAATATCCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * * *
181817 AAAAACATGATCAACCTTTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAATTTAATTAAGATGCGTGTT
261 -CAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* * * * * * *
181882 GAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGGAGAAATTTTATTACA-ATA-TTGTACCAT
325 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCAT
* * * * * * *
181945 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAGTTATTTAAATAGCTTGATCGAATCTTTTTGAAATTGACAAA
390 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA
** * * *
182010 GATTTTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAAT
455 GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAAT
* * * * *
182075 TATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGCCATGCTTTATAGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTT
520 TATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTT
* * * * *
182140 GTAAAGAACTTTTGTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTTATTATGTGT
585 GTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT
* * * * *
182205 TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTG
649 GTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG
* **
182270 CAAAGTTTGTTCCATG-AATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGCATTTC
714 CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTC
* * *
182334 TTTCTA-ATTTGAAATTAATTTAGGTGCGTGATGAGGTG-TT-CATGAGAAAATTCTTATAAAAG
779 TTGC-AGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAG
* * *
182396 TAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATTATGATGCTGAATTGTTAAGTTACAAATCATTTAG
843 TAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAG
* * *
182461 ATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAGGATATTGTGCTTATTTTTACCATGATTT
908 ATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * ** * *
182525 CTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGTTTTGAAATCGTAAGGATTAAAGTGCAAAAAAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* *
182590 ATCCTTTATGGCCAAAGGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* *
182655 GTTCCAAGCCGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGAGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* *
182720 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACATGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * * *
182785 TGAAACATGATCAACCACTTTGACACGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAA
261 -CAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* * * * *
182850 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAATGTTGGTGAAATTTCTTTGCAAGTATTTGTGT-AA
325 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-TCCA
* * *
182914 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATATCTTCGTCGAATCTGTTTGAATTTGATAT
389 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
* * **
182979 AGATGATATTGAGCTTAATTTTGCCTTGATTTCTTGATGAATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAA
454 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAA
*
183044 TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAATCCT
519 TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCT
* * * * ** *
183109 TGTAAAAGATTTTTTTCCATGATATGTGGATGGTTGCAATCTGATTTGAAGATTTGATTATTTGT
584 TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT
* *
183174 GTTTGTGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTACGGACTTGGTTG
649 GTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG
** * * **
183239 CAAAGTTTGTTGAATGAAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCAACCATTTTGACATGCATTTC
714 CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTC
* *
183304 TTTCTA-ATTTGAAATTAATTTAGGA-GCGTAATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
779 TTGC-AGATTTGAAATTAATTTA-GATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * **
183367 GTAGGAGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATTATGATGCTGAATTGTTAAGTTATAAATCATTTA
842 GTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* *
183432 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTTCCATGATT
907 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCTTA-TTTTTGCCTTGATT
183497 T
970 T
* ** * *
183498 CTTGATTTACAAGTTATTTAACAAGATTTGAAATTGTTA-GGAGTAAATTGCAAAAAAGAAAAGT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATT-ATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGT
* * * *
183562 CAAGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTGGTGAAGGATTTTTTTTCCAAGATTTGTGGA
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGA
* *
183627 TGGTTCCAAGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTATATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * *
183692 AAATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * * * ** *
183757 GCCAAAACAAGGTCAACAATTTTGGAATGTTTTTCTTGCAAATTTGAAATTAATTTTGATGCGTG
259 GCC-AAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* *
183822 ATGAGTTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATATATTT-TTAC
323 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTT-C
* * *
183886 CATGATGATGAATTATT-ATGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGA
387 CATGATGCTGAATTGTTGA-GTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA
**
183950 TATAGATGATATTGCACTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTG
451 TATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTG
** *
184015 AAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAATGGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAG
516 AAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAG
* * * *
184080 CCTTGTAAGGGATGTTTTTCCATGATATGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTAATTATG
581 CCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATG
*
184145 TGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAATTTAAGGACCTGG
646 TGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* * * *
184209 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTGTTTAGCCGAAACATGATTAACCATTTTGACATGATT
711 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
*
184274 TTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTAATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
776 TTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * *
184339 AGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGCATCATGATGTTGAATTGTT-ATGTTACAAATCATA
841 AGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGA-GTTGCAAATCATT
* *
184403 TAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAAGGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGAT
905 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
184468 TT
969 TT
* * * * * * **
184470 CTTCATTTACAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATTGTACGGAGTAAATTATAAAAAAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* *
184535 ATGCTTTTTGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * *
184600 GTTCCAAGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGATTAGGGGTTAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* * * * * *
184665 ATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAATTTCTTATATAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * *
184730 CATAGCATGATGAACAATTTTGGCATGTTTTACTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
261 CA-AACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* *
184795 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGATGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCAT
325 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCAT
*
184860 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA-CATTTAGATATCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA
390 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA
* *
184924 GATGATATTGAGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATGTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAAT
455 GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAAT
* * *
184989 TATAGGGATTAAATTCCAAAAATGAAACGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGAAT-AATCCT
520 TATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTG-ATCAAGCCT
* * *
185053 TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATATGTGCATGGTTCCAAACAGATTTGGTGATTTGATTATGTGT
584 TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT
* * * *
185118 GTTTATGACGTTGTGATTGTTTATAGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACATGGTTG
649 GTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG
* * * * **
185183 CAATGTTTGTTCCAT-TAATTTCTTATTTTGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGCGTTTC
714 CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTC
* * *
185247 TTTCTA-ATTTGAAATTAATTTAGCTGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAAG
779 TTGC-AGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAG
* * * * *
185311 TAGGTGAAAGTTCTTTGCATGTATTTGTATTATGATGCTGAATTGTTAAGTTACAAATCATTTAT
843 TAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAG
* *
185376 ATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCCTGATTT
908 ATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* ** * * *
185440 CTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATCGTAAGGATTAAATTGTAAAACAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* *
185505 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGGGGCTTGTAAAGGATTTTGTTTCCATGATTTGTGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT-TTTCCATGATTTGTGGAT
* * * * *
185570 GGTCCCAAGCTGATTTGATGATTTGATTATGTGCTTGTATGATGTTGTGATTGATTAGAGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * * * *
185635 AACGCAAATATGCAAAAGTTTAAGGACATGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* *
185700 CTGAAACATGATCAACCATTTTGACATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
260 C-CAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * *
185765 AGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAATGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTGT-A
324 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-TCC
** *
185829 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATATTTTTGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
388 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* * * *
185894 TAGATGATACTGAGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTG-TTGAATATGTTATTTAACGAGATTTGA
453 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATT-TATATGTTATTTAAAGAGATTTGA
* * * * *
185958 AATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCAAGCTCTATGGCCAAAAGTATTTGATTAATC
517 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGC
* * *
186023 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATATGTGCATGGTTCCAAACAGATTTGGTGATTTGATTATGT
582 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* *
186088 GTGTTTATGATGTTGTGATTGTTTCTGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAATTTAAGGACTTGGT
647 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
** * ** * *
186152 TGCAAAGTTTGTTCCACAAAATTTCTAATTTAGTTGAAACATGATCAACCATTTTGCCAAGTTTT
712 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * *
186217 TCTTGCTA-ATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
777 TCTTGC-AGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * *
186281 AGTAGGTGAAATTT-TAATGCATGTATTTGTAGCTTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATT
841 AGTAGGTGAAATTTCT-TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* * * * * *
186345 AAGCTTA-CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGAAACTGTGCCTATTTTTACCTTGA
905 TAG-ATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGA
186409 TTT
968 TTT
* * * * ** * *
186412 CTTGACTTATACGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGACTAAAAAGCAAAAATGAAATGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* *
186477 ATGCTTTATCGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTCTTT--AGTGATTTGTGGA
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT-TTTCCA-TGATTTGTGGA
* * *
186540 TGGTTCCAAGCTGATTTGG-GTCTTTGAATT-TTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAAGGGT
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTG-ATTTG-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGT
* * * * *
186603 CCAAATGCAAATAAGAAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAATTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
192 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
* * * * * * *
186668 TAGACGAAACATGATCAATCATTTTGACAAGTTTTTGTTGCGGATTTGAAAATAATTTAGATGCG
257 TAG-CCAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
** * * * * *
186733 TGACAAGGTGTTTGCATGAGAAAATCCTTGAAAAAGTAAGTGAAATTTCATTGCTTGTATTCGTA
321 TGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-
* * * ** * *
186798 T-CACGGTGTTGAATTGTAAAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTG
385 TCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * *
186862 -TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
450 ATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTT
* * * * *
186926 GAAACTATAGGGCTTAAACTGCAAAGATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-CTG
515 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATC-A
* *
186990 AGCCCTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATT
579 AGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATT
*
187055 ATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATG-AAATATGCAAAAATTTATA-GAC
643 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA-AGGAC
* * *
187118 TTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTT
707 TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAT
** * * *
187183 GTTTTTC-T-CATTGATTTGAAATTAATTTAGATGTATGTTGAGCTATTTGCATGAGAAAATTCT
772 GTTTTTCTTGCA--GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCT
* * *
187246 TGTAAAAGTAGGTGAAATTT-TATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTACAA
835 TGTAAAAGTAGGTGAAATTTCT-TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAA
* * *** * * *
187310 ATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTT-TTTTTTATATAGATGAAATTGAGCTTATTTTTGC
899 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
187374 CTTGATTT
963 CTTGATTT
* * * * * *
187382 CTTGGTTTATACA-TTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGTAAAAATGAAATGT
1 CTTGATTTATA-AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGT
* * *
187446 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCTGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTT-CGTGATTTGTGGA
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGA
* * *
187510 TAGTTCCAAGCTGATTTGTTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * *
187575 AAATGAAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAATTCGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * *
187640 GCCGAAACATAATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATG
259 GCC-AAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * * ** **
187705 TTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTAAGGCATGTATTTGTAGC
323 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCC
* *
187770 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTTGATTA-CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
388 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGA-TAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * * * * *
187834 ATAGATGAAACTGTGCTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGACTTAT-TCGTTATTTTATGAGACTT
452 ATAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAT-GTTATTTAAAGAGATTT
* * * * ** *
187898 GAAATTATAGGGATTAAAATGAAAAAATTAAAAGTCATGTTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGA
515 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAA
* * * *
187963 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTAT--TTTTTGGATGGTTCCAAGCTAATTTGG-GTATTTGATTA
580 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG-ATTTGATTA
* * *
188025 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTC
644 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * * *
188090 GGTTGAAAAATTTGTTCCATGAAAATTCTTATTTAGCCGAAACAAGATCAACCATTTTGGCATGT
709 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
** *
188155 TTTTCTTGTGGATATGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
774 TTTTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
* * * * *
188220 AAAGTAGGTGAATTTTCGTTGCATGTATTTGCATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCGT
839 AAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
* *
188285 TTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAACGAAGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG-
904 TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGA
*
188349 TCAT
968 T-TT
* * * * *
188353 CTTAATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAAAGGATAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * * * *
188418 TTGCTTTATGCCCAAAAGTATTTGGA-TGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAAGATTTGGGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
* * * * *
188482 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTATTTTCATGATGTTGTGACTAATTATGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * *
188547 AATGAAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * * *
188612 CTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTCGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGT
260 C-CAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * *
188677 TGAGTTGTTTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCA
324 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCA
* * * *
188742 TGATGTTGAATTGTTGAGTTGCCAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAACTGATAT
389 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
* * *
188807 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTCATAAGTTATTTAAAGAGTTTTGAAA
454 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAA
* * * *
188872 TTAGAGGGATTAAATTGCGAAAATGAAAAGTCATGTTTTGTGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCT
519 TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCT
* *
188937 TGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGT
584 TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT
* * *
189001 GTTTAAGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATACAAAAATTTAAGGGCTTGGTTG
649 GTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG
* * *
189066 CAAAGTTTGTTCCATGAAATTAT-TAATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGAC-TAGTTTT
714 CAAAGTTTGTTCCATGAAATT-TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAT-GTTTT
* * * * * **
189129 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTCTACAAGCGACTATTCTTGTAAAA
777 TCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
* ** * * * *
189194 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCATACCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAACCATTTA
842 GTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* * *
189259 GATA-CTTAGGTCGAATATGTTTGAAGTTAATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
907 GATAGCTT-GGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
189323 T
970 T
* *
189324 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * * * * * *
189389 ATGCTTTATGGCCATAAGCATTAGA-CAAGGCTTGTGAAGGACATTTTTTCCATGATTTTGTGGA
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGA-TTTGTGGA
* * *
189453 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTGTGTGTTTTTATGACGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * * * * *
189518 AAATGGAAATATGCAAAAATTTAACGATTTGGTTGCAAAGTTTGCTCCACGAACTTTTTTATTTT
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * * ** *
189583 GCCAAAGCATGATCAACCATTTCGGCATTTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTGATTTAGATGAATT
259 GCCAAA-CATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * * * * * *
189648 AAGTGGTGTTCGCATGAGAAAATTCTTGTAAACGTAGGTGAAATATCATTACATGTAATTGTAT-
323 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-TC
* *
189712 GATGATG-TCGAATTGTTGAGTTCCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA
387 CATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA
* * * * * *
189776 TAAATATGATATTGTGCTTATTTTTACATTGATTTCTTGATTTATAAT-CTATTTAACGAGATTT
451 TATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT-ATGTTATTTAAAGAGATTT
** * * *
189840 GAAATTATAAAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGCCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTTGATCTA
515 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAA
* * * * *
189905 GCCTTGTAAAGGACTTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTCA-TT--TTA-
580 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTAT
* * * * * * *
189966 ---T-TATATG-TTTTGTAATTGATTAAGGGTTAAAATCCAAATATACAAAAATTTAAGGACTTG
645 GTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
* * * * * * **
190026 GTTGCAAAG-TTGTTCTATGAAATTGCTCACTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTAACATGTT
710 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTT
* *
190090 TTTCTTACTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
775 TTTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
* * * * *
190155 AAGTAGGTGAAATTT-TATTACATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGGGTTGCAAATAAT
840 AAGTAGGTGAAATTTCT-TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
* * * *
190219 TTAGATAGCATGGTCGAATCTGTTTAAAATTGATAA-A-G--A---TG---ACTTTTGCCTTGAC
904 TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
190274 TT
969 TT
* * * *
190276 CTTGATTTATATGTTATTCAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAGAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * *
190341 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTAACCGAGCCTTGCAAAAGATTTTTCTTCCATGATTTGTGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTT-TTCCATGATTTGTGGAT
* *
190406 GGTTCCAAGCTAATTTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
130 GGTTCCAAGCTGA-TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* ** * *
190471 AAAAGCAAATACACAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCATATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
** * * *
190536 GTTGAAACATGATCAACCAATTTGGCCTGTTATTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
259 G-CCAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* *
190601 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACC
323 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCC
* * *
190666 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCGAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCAGTTTGAAATTGATA
388 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* * * *
190731 -ATGATGATATTGTGCTTA-TTTTCCCCTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGA
453 TA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGA
* * * * * * *
190794 AATTATAAGGATTAAATTACAACAATGGAAAGTCATGCTTTATGACCAAAACTATTTGA-CGGAG
517 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATC-AAG
** * * * * *
190858 CCTCATAAAGGATTTGTTTCCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTTTG
581 CCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATG
* *
190923 TGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGTACTTGG
646 TGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* *
190988 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCC-AGAGCATGACCAACCATTTTGGCATGTT
711 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGA-AACATGATCAACCATTTTGGCATGTT
* ** * * *
191052 TTTCTTGCTGATTCCAACTTAATTTAGATGCGTGACGAGATGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
775 TTTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
* ** * * * *
191117 AAGTAGGTAAAATTTCACTACATGTATTTGTATTATGATGCTGATTTGTTGAGCTGCAAATCATT
840 AAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* *
191182 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTCATGAAGATGAT-GTGATGCTTATTTTTGCCTTG-
905 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTG-TGCTTATTTTTGCCTTGA
191245 TTAT
968 TT-T
* * * * *
191249 CTTGATTTGTTAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC-AAAAATAAAAGTT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAG-T
* * * *
191313 CATGCCTTATGGCCAAAGGTATTTGGA-TGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTGTGGA
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGA
* * * * *
191376 TGGTTCCAAGCTAATTTGGGGCTTTGATTATGTGTTTTTATTATGTTGTGATTGATTAGGGGTGA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
*
191441 AAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATTT
194 AAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
* *
191505 AGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGC--------CTCGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT
258 AGC-CAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT
* * **
191562 GACGAGGTGTTTGCAAGA-AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGCAC
322 GATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTC
* *
191626 CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAATTGAT
387 CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * * * *
191691 ATACATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATATCTTGGTTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGA
452 ATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGA
* * *
191756 AATTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAGGTCCTGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGC
517 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGC
* * * * * *
191821 CTTGTAAAGGATTCTTTTCCATGATATGTGGATGGTTCCAATCTGATTTGGGGATTTTGTTTTTG
582 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTTGATTATG
* *
191886 TGTGTTTATGATCTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
646 TGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* ** * *
191951 TTGCAAAGCTTGTTCTGTGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCCTGTTT
711 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
** * * *
192016 TTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTTTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
776 TTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * * *
192081 AGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGTGTTGCAAATCATTT
841 AGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * *
192146 AGATAGCATGGTTGAATCTATTTGAAATTGATAAATATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
906 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
192211 T
970 T
* * * *
192212 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGATATTTTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * * * *
192277 AGGCTTTGTGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGTTTTTTTTTCATGATTTATGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * *
192342 GTTCCAAGATGATTTGGTGATTTGTTTACGTGTTTTTATGATGTTGTGATT-ATTGAGAGGTCAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATT-AGGGGTCAA
** *
192406 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTCATTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * *
192471 CCAAAACATGATCAACCATGTTGGCGTGGTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATTCGTGA
260 CC-AAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * ** * *
192536 TAAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAACCAGTTGAAATTTC-TCTAG-ATGTATTTATAT
324 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCAT-T-GCATGTATTTGT-T
* * * * *
192599 -CATGATGCTAAATTGTTAAGTTACAAGTCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTCGAAGTTG
386 CCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTT-GAAATTG
* * * *
192663 ATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
450 ATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTT
* * * **
192728 -AAACTTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAATGTATTCGGCCA
515 GAAA-TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * * ** * *
192792 AGCCTTGTAATGGATATTTTTCCATGATTTATGGATTATTCCAAGCTAATTTGGTGATTTGATTA
579 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
* * * * *
192857 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTT
644 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * * * *
192922 GGTGGCAAAGTTTCTTCCATGAAATTTATTATTTAGTCGAAACATGATTAACCATTTTGGCATGT
709 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
* * * * *
192987 TTTTCTTACTGATTTGAAAATAATTCAGATGCGTGATGAGGTGTTCGCATGAGAAAATTCTTGTA
774 TTTTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
* * * * * *
193052 AAAGTATGTGAAATTTCATTGCAAGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTAT
839 AAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
* *
193117 TTAGATAACTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATAGTGCTTATTTTTGCCTTGA
904 TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGA
193182 TTT
968 TTT
* * ** *
193185 CTTGATTCATAAGTTCTTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * * *
193250 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCAATGATTTTTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * * **
193314 GCTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATTTGTGTTTT-TGTTGTTGTGATTGATTCTGGGTCAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * *
193378 AATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTTCGTGAAATTT-TTAATTTA
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT-ATTTA
* * *
193442 GCCGAGACATGATTAACCATTTTGGC-TAGTTTTTCTTGCT-AGTTTGAAATTAATTTAGATGCA
259 GCC-AAACATGATCAACCATTTTGGCAT-GTTTTTCTTGCTGA-TTTGAAATTAATTTAGATGCG
* ** *
193505 TGATGAGGTGTCTGCAAAAGAATATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTA
321 TGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-
* * * * * * * *
193570 T-CATGGTGTTGAACTGTTGAGTTGTAAACCATTTAGATACCTTGGTCGAATTTGTTTGAAATTC
385 TCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * * * * *
193634 ATAGAGATGATGTTGTGCTTATTTCTGCCTTCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
450 ATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTT
* * * *
193699 GAAATTCTTGGGATTAAATTGCAAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAATGTATTTGACCA
515 GAAATTATAGGGATTAAATTGC-AAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * *
193764 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCGTGATTTGTGGATGGTTCCTAGCTGATTTGGTGATTTGATT
579 AGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATT
* * *
193829 ATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATCAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACT
643 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACT
*
193894 T-GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATTATCAACCATTTTGGCATG
708 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATG
* * *
193958 CTTTTTTTTTTTTTTGCTA-ATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAA
773 -------TTTTTCTTGC-AGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAA
* *
194022 ATTCTTGTAAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGT
830 ATTCTTGT-AAAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGT
* *
194087 TGCAAATCATTTAGATTA-CTTAGTCGAATC----TG----T--T----TGA-ATTGTGCGTATT
894 TGCAAATCATTTAGA-TAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTGCTTATT
194136 TTTGCCTTGATTT
958 TTTGCCTTGATTT
* * * * *
194149 CTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTAGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * * * * * * *
194214 AAGCTGTATGGCCAAAAG-A--TGA--TA---TTGT----GCTTATTTTTGCCTTGGTTTCTTGA
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTT-CCATGATTTGTGGA
** * * * * * ** ** *
194267 T--TTATAAG-TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCA-
129 TGGTTCCAAGCTGATTT--GGTGATTTG--ATTAT-GTG-TT---TT--TATGATG--TTGTGAT
* * * *** *** ** * * *
194328 TGCTTTA-TGGCCAAAA-G-TTTTA-GACCAAGCCTTGTAAGGGACTTTTTTTCCATGATTTGTG
181 TG-ATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG--CAAAAATT-TAA-GGAC-TTGGTTGCA-AAGTT-T-
* * * * * ** * ** ** * *
194389 GGTGGTTC-TGACCTGATTTGGTGATTT-G--ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGAATGATTAG
237 -GT--TCCATGA---AATTT-CTTATTTAGCCA-AACATG-ATCAACCATTTTG-GCATG-TT--
** * * * ** * * * *
194450 GGGTCAAAATGC-AATAAT-AAAAAAATTTA-AAGACTTGGACGCA-ATGTTTGTTCCAT--GAA
289 -TTTC---TTGCTGAT-TTGAAATTAATTTAGATG-CGT-GATG-AGGTGTTTG---CATGAGAA
* ** * * ** *** * *** * *
194509 ATTTC-T-T--ATTTAGCTGAAACGTT-A-T-CAACTA-TTGAGGCATG-T-TTTTCTTGCTGAT
343 AATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA-TTTCATTGCATGTATTTGTTCCATGATGCTGAATTGTTGAG
* * * * * *
194564 TTG-AAATTAATTTAGAT-GCAT-GT-TAAGCTGTTTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGT
407 TTGCAAA-TCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTG--T-T-T--G-AAA---TTG--ATA-TAGAT
* * * * ** **
194625 GAAATTATAT-TGCATCTATTTGTGCCATGA-TGC-TGAATTT-T-TGGGT-TGCAAA-TTATTT
458 G--A-TAT-TGTGC-T-TATTTTTGCCTTGATTTCTTG-ATTTATAT-GTTATTTAAAGAGATTT
* * ** * * * **
194683 -AGA-TAGCTTGGTCGAATCT-GTTTG--AGATTGATAAAGACGAT--TTT-T-GCC--TTG-A-
515 GAAATTA--TAGG--G-AT-TAAATTGCAAAAATGA-AAAGTC-ATGCTTTATGGCCAAAAGTAT
** * * * * * **
194735 TT--TCTTG-ATTGATAAAGACGATTATGTT-AAGCTG-TTT-T-GATTGTT--TGA--GATTT-
572 TTGATCAAGCCTTG-TAAAG--GATTTTTTTCCA--TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTG
** * * *** * ** * * * * ** *
194788 GAAATTCTAATGAT-TAAATTACAAAAATGAATAGTCA-TGCTTTAT-GG-CCAAA--CCTATTT
632 GTGATT-TGATTATGTGTGTT--TATGATG--TTGTGATTG-ATTATGGGTCAAAATGCAAATAT
* *** * ** * * * * * * *
194847 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTCGATAGTTCCAAGCTAATTTGGTGATTT
691 G--CAAAAATT-T-AAGGACTTGGTTGCA--A--AGT---TTGTTCCATG-AAATTT-CTTATTT
** * ** * ** ** * *
194912 ----G-ATTATGAGTTTTAATGATGTTGTG-ATTGATTAGGGGTCAAAAAGCAAATATGCAAA--
743 AGCCGAAACATGA---TCAACCATTTTG-GCA-TG-TT---TTTC---TTGCAGATTTG-AAATT
* * * * * * * * ** *
194969 AATTTA-AGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT--GAAATTTCGTATTTAGCTGAAACAAGAT-
795 AATTTAGATG-CGT-GATG--AGGTGT-TTGCATGAGAAAATTC----TT-G-TAAAAGTAGGTG
* **** * * * * * * ** *
195030 CAACCAATTTGGCATGTTTTTCT-TGC-TGAT-TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
849 AAATTTCTTT-GCATGTATTTGTAT-CATGATGCTG-AATT-GTTGAGTTGC-AAATCA--T-TT
* * * * * * * * * **
195092 TGCATGAGAAAATTCTT-GT-AAATGTAG-GTGAAAATTTATTACATG-TAATTGT-ATCA-TGA
906 AG-AT-AG------CTTGGTCGAATCT-GTTTG-AAATTGATAAGATGAT-ATTGTGCTTATTTT
*
195151 TGCC--GAATT
960 TGCCTTGATTT
* * * ** * * * * * * *
195160 GTTCAGTTGCAAATCAATTAGAT-AGCTTGGTCG-AA-TCT---GTTTGAAATTG-ATAAAGATG
1 CTTGATTTATAAGTTATTTA-ATGAGATT--T-GAAATTATAGGGATT-AAATTGCA-AAA-AAG
** * ** * * **
195218 ATATTGTGCTTACCTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTTA-CGAGATTTGAAATTAT
59 A-AAAGT-C--A----TG-CTTTATGGC--CA---A-AAG-TATTTGACCGAGCCTTG----TA-
* * * * * *
195282 AGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT-CATGCTTTATGGCCAAAGGTATTTCATCTAGCCTTG-
103 AAGGATT---TT-------T-----TTCCATGATTTGTGG---ATGG---TTC--CAAG-C-TGA
** * ** * * *
195345 TAAAGGATGTTTTTCCACGATT-TGTGGATGGTTAGCTGAT-TTAGTGACTTGATTATGTGAT-T
143 T-TTGG-TG-ATTT----GATTATGT-G-TTTTTA--TGATGTT-GTGA-TTGATTA-GGGGTCA
** ** ** *** * ***
195407 TTATG-ATGT-TGCAATTGA-TTAATGGGCAAAATCTAAATATGCAAAAATTTAAGTACGTGGTT
194 AAATGCAAATATGCAA-AAATTTAA--GG----A-CTTGGT-TGC-AAAGTTT--GT---TCCAT
* *** * * * ** **** *
195469 GCAAAGTTTGTTCCAT-G--AAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT--CAACCATTT-TAGCAT
244 G-AAA-TTTCTTATTTAGCCAAA---C--A-TGA-TC-AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGC-T
* *** *
195528 GCTTT-TCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTT
298 GATTTGAAAT--T-A-AT---------TTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTT
* * * * * *
195592 GTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCCTGTTTTTGTAT-TATGATGCTGATTTGTTAAGTTGCAAA
350 GTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-TCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA
* *
195656 TCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTGCTAATTTTTGCC
414 TCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC
** * * * * *
195721 TTGATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTATACGGATTAAAATGCAAAAAAG
479 TTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATG
**
195786 AAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACCATTTGA-CTAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATT
544 AAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATC-AAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATT
* * * * *
195850 TGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTCATTATGTGT-TTT-T-ATGATGTGATTGATTAG
608 TGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAT
* * * * *
195912 GGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGGTTGTAAAGTTTGTTTCACGAAATTTC
673 GGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC
* * * *
195976 TGATTTAGCCGAAACATGATCAACCTTTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
737 TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAG
* * * * * * *
196041 ATGCGTGACGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATCAGAGTACGTGAAATTTCATTGCATGTAT
802 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTAT
* * * *
196106 TTGTACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAGTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAA
867 TTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAA
* * *
196171 ATTGACATAGATGATATTGTGCGTATTTTTTCCTTGATTT
932 ATTGATA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * * *
196211 CTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTTCAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * * * * *
196276 ACGCTTTATGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGCAAAGGATCTTTTTCCATGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * * * *
196341 GTTTCAATCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATATTGTGATCGATTATGGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* * * *
196406 ATGCAAATATGCAACAATTTAA-GACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAGTTTCTTGTTTAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * * * *
196470 CGAAACATGATCAATCATTTTGACAAGTTTTTCTCGCGGATTTAAAATTAATTTAGATGCGTGAT
261 C-AAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* * * *
196535 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATCCTTATAAAAGTAGGTAAAATTTCATTGCATGTATTCGTAT-CA
325 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-TCCA
* * * ** * * * *
196599 T-AGTGCTGAATTGTTAACTTGCAAATTATTTAGATAGCTTTATCAAATCTATTTGAAGTTCATA
389 TGA-TGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* * *
196663 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTTTCA-GTTATTTAATGAGATTTGA
453 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT-ATGTTATTTAAAGAGATTTGA
* * * * * * *
196727 AACTATAGGAATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCATACTTTATGGCCTAAAGTATTTGACCGAGC
517 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGC
*
196792 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
582 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* * *
196857 GTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGC
647 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG-
* * * *
196922 TT-CAAAGTTTGTTCCATCAAATTTCTT-TTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTCT
711 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * * * *
196985 TTCTTGCTGATGTCAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGTTGTTTGCATGGGAAAATTCTTGTAAA
776 TTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
* *
197050 AGTAGGTGAAATTT-TATTGCGTGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATT
841 AGTAGGTGAAATTTCT-TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* * * *
197114 TAGATAGCATGGTCGAATCTATTTGAAATTGATATAGATGAAACTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
905 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
197179 TT
969 TT
* * ** * * * *
197181 CTTGATTTATACGTTATTTTATGAGATTTGAAAAGATAGAGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* * ** * *
197246 ATACTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCTAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
197311 GTTCCAAGCTGATTTGGAT-ATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGG-TGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
*
197375 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * * * *
197440 CCGAAACATGAACAACCGTTTTGGCTTATTTTTCATGCTCATTTGAAATTAATTTA-AGTGCGTG
260 CC-AAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGA-TGCGTG
* * * * *
197504 AAGAGGTGTTTGCAAGCGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATGTCATTGCATGTATTTGTACC
323 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCC
* * *
197569 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGACTCTATTTGAAATTGACA
388 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* * * * * * *
197634 GAGATGATATTGTACGTATTTTTTCCTTGATGTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAA
453 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAA
* * *
197699 ATTATAGAGATTAAATTTCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCC
518 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCC
* * * * *
197764 TTGCAAAGGATCTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAATCTGATTTGGTGATTAGATTATATG
583 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTG
*
197829 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTT
648 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTT
* * * * *
197894 GCAAAGTTTGTTCCATGAATTTTCTTGTTTAGCCGAAACATGATCAATCATTTTGACAAGTTTTT
713 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTT
* * *
197959 CTCG-AGGATTTGAAATTAACTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGCA-AAAA-TCTTTGTAA
778 CTTGCA-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG-AGAAAATTC-TTGTAA
* * * * * *
198021 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCCGAATTGTTAAGTTGCAAATTATA
840 AAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
*
198086 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT-ACTAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGGCTTGA
905 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA-T-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGA
198150 TTT
968 TTT
* * * * *
198153 CTTGATTTATCAGTTATTTAGTGAGATTTGAAACTATAGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC
* *
198218 ATCCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAACCTTGTAAAGGATATTTTTTCCATGATTTGTGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGGAT
*
198283 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGCGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * *
198348 AATGAAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAACTTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * * * *
198413 CTGAAACATGATCAATCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGT
260 C-CAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * *
198478 TGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCGTGTATTTGTACCA
324 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCA
** * * * *
198543 TGATGCTGAATTGTTGAGTTTTAAATTATTTAGATAGCTTTGTCGAATCTATTTGAAAGTGATAT
389 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
* * * ** * *
198608 TGATGAAACTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAA
454 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAA
* * * * * * *
198673 TTATAGAGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGCTTTGTGGCCAAAACTATTTGGTCGAGCCT
519 TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCT
* * * ** *
198738 TGTAAAAGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGTTTTGG-GTATTTGATTATGTG
584 TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG-ATTTGATTATGTG
* * * *
198802 TTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTCAAGGACTTGGTT
648 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTT
* * * * *
198867 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTCGCCGAAACCTGATCAACCGTTTTGGCTTATTTTT
713 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTT
** * * * * * *
198932 CTTGCTCATTTTAAATTAATTTAGATGCGCGCA-GAGGTGTTTGTAAGCGAAAATTTTTGTAAAA
778 CTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * *
198996 GTAGGTGAAATTTCATTGCAT-TATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
842 GTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
*
199060 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGACATAGATGATATTGTGCATT-TTTTT-CCTTGATT
907 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATT
199123 T
970 T
* * *
199124 CTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATT
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Consensus pattern (970 bp):
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ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
CAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATG
AGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTTCCATG
ATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAG
ATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATT
ATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTG
TAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGT
TTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCA
AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTT
GCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAG
GTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATA
GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
Found at i:194322 original size:113 final size:113
Alignment explanation
Indices: 194124--194344 Score: 370
Period size: 113 Copynumber: 2.0 Consensus size: 113
194114 ATCTGTTTGA
*
194124 ATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTAGAAATTATAGG
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*
194189 GATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCAAGCTGTATGGCCAAAAGATGAT
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* * * *
194237 ATTGTGCTTATTTTTGCCTTGGTTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGG
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* *
194302 GATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAG
66 GATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAGCTGTATGGCCAAAAG
194345 TTTTAGACCA
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (113 bp):
ATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTAGAAATTATAGG
GATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAGCTGTATGGCCAAAAGATGAT
Found at i:196670 original size:485 final size:486
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194218 TGTATGGCCA
* *
194228 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGGTTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGA
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGA
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66 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT-GACCAAG
* * ** *
194357 CCTTGTAAGGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGGTGGTTCTGACCTGATTTGGTGATTTGATTAT
130 CCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTAT
* ** *
194422 GTGTTTTTATGATGTTGTGAATGATTAGGGGTCAAAATGC-AATAATAAAAAAATTTAAAGACTT
194 GTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAT-ATGCAAAAATTTAAGGACTT
** * * * * * **
194486 GGACGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACGTTATCAACTATTGAGGCATGT
258 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
* * * * *
194551 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTAAGCTGTTTGTATGAGAAAATTCTTGTA
323 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
* * * * *
194616 AAAGTAGGTGAAATTAT-ATTGCATCTATTTGTGCCATGATGCTGAATTTTTGGGTTGCAAATTA
388 AAAGTAGGTGAAATT-TCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
*
194680 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAGATTGAT
452 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * * **
194715 AAAGACGAT-TTTTGCCTTGATTTCTTG-ATTGATAAAGACGATT-ATGTTA-AGCTGTTTTGAT
1 AAAGATGATATTGTG-CTT-ATTT-TTGCCTTGAT---TTC--TTGAT-TTATAG--G--TT-AT
* * ** * *
194776 TGT-TTGAGATTTGAAATTCTAATGATTAAATTACAAAAATGAATAGTCATGCTTTATGGCCAAA
52 T-TAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
** * * * *
194840 CCTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTCGATAGTTCCAAGCTAATTTG
116 AGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTG
* * *
194905 GTGATTTGATTATGAGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAAGCAAATATGCAAAA
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* * *
194970 ATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCGTATTTAGCTGAAACAAGATCAACC
246 ATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACC
*
195035 AATTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAG
311 ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAG
* * * * * *
195100 AAAATTCTTGTAAATGTAGGTGAAAATTT-ATTACATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTC
376 AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTG-AAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTG
*
195164 AGTTGCAAATCAATTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
440 AGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
** * * * *
195211 AAAGATGATATTGTGCTTACCTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTTACGAGATTTGA
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGA
* * * *
195276 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAGGTATTTCATCTAGC
66 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGC
* * * *
195341 CTTGTAAAGGATGTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTT---AGCTGATTTAGTGACTTGATTATGT
131 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* ** * * *
195403 GATTTTATGATGTTGCAATTGATTAATGGG-CAAAAT-CTAAATATGCAAAAATTTAAGTACGTG
196 GTTTTTATGATGTTGTGATTGATT-AGGGGTCAAAATGC-AAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
* *
195466 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTAGCATGCT
259 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTT
*
195531 TTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
324 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
* * * ** * *
195596 AAGTAGGTGAAATTTCGTTGCCTGTTTTTGTATTATGATGCTGATTTGTTAAGTTGCAAATCATT
389 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
195661 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
454 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * ** *
195694 ACAGATGATATTGTGCTAATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGA
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGA
* * * ** *
195759 AATTATACGGATTAAAATGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACCATTTGACTAAGC
66 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGC
* *
195824 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTCATTATGT
131 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* *
195889 GTTTTTATGA---TGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGG
196 GTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGG
* * * * * *
195950 TTGTAAAGTTTGTTTCACGAAATTTCTGATTTAGCCGAAACATGATCAACCTTTTTGGCTTGTTT
260 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * *
196015 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATCAG
325 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
* * *
196080 AGTACGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAGTT
390 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* *
196145 AGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGAC
455 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * * * *
196177 ATAGATGATATTGTGCGTATTTTTTCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGA
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGA
* * * *
196242 AATTATAGGGATTAAATTTCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGC
66 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGC
* * * * *
196307 CTTGCAAAGGATCTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAATCTGATTTGGTGATTAGATTATGT
131 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* * * * * *
196372 GTGTTTATGATATTGTGATCGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAACAATTTAA-GACTTGCT
196 GTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
* * * * *
196436 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAGTTTCTTGTTTAGCCGAAACATGATCAATCATTTTGACAAGTTTT
261 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * * *
196501 TCTCGCGGATTTAAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATCCTTATAAAA
326 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * * * *
196566 GTAGGTAAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCAT-AGTGCTGAATTGTTAACTTGCAAATTATTT
391 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGA-TGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
** * * * *
196630 AGATAGCTTTATCAAATCTATTTGAAGTTCAT
455 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
*
196662 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTTTCA-GTTATTTAATGAGATTTG
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT-AGGTTATTTAATGAGATTTG
* * * * * *
196726 AAACTATAGGAATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCATACTTTATGGCCTAAAGTATTTGACCGAG
65 AAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAG
196791 CCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATG
130 CCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATG
*
196856 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
195 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* * * *
196921 CTT-CAAAGTTTGTTCCATCAAATTTCTT-TTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTC
260 -TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTT
* * * * * *
196984 TTTCTTGCTGATGTCAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGTTGTTTGCATGGGAAAATTCTTGTAA
324 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
* * * *
197049 AAGTAGGTGAAATTTTATTGCGTGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATT
389 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* *
197114 TAGATAGCATGGTCGAATCTATTTGAAATTGAT
454 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * * * *
197147 ATAGATGAAACTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATACGTTATTTTATGAGATTTGA
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGA
** * * * * * *
197212 AAAGATAGAGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATACTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCTAAGC
66 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGC
* *
197277 CTTGTAAAGGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGAT-ATTTGATTATG
131 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGG-TGATTTGATTATG
197341 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
195 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* * * * *
197406 TTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAACAACCGTTTTGGCTTATTT
260 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * *
197471 TTCATGCTCATTTGAAATTAATTTA-AGTGCGTGAAGAGGTGTTTGCAAGCGAAAATTCTTGTAA
325 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGA-TGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
*
197535 AAGTAGGTGAAATGTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
389 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* * *
197600 TAGATAGCTTGGTCGACTCTATTTGAAATTGAC
454 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * * * * * *
197633 AGAGATGATATTGTACGTATTTTTTCCTTGATGTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGA
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGA
* * * *
197698 AATTATAGAGATTAAATTTCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGC
66 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGC
* * * * *
197763 CTTGCAAAGGATCTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAATCTGATTTGGTGATTAGATTATAT
131 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* * *
197828 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCT
196 GTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
* * * * *
197893 TGCAAAGTTTGTTCCATGAATTTTCTTGTTTAGCCGAAACATGATCAATCATTTTGACAAGTTTT
261 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* ** * *
197958 TCTCGAGGATTTGAAATTAACTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGCA-AAAA-TCTTTGTAA
326 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG-AGAAAATTC-TTGTAA
* * * * * *
198021 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCCGAATTGTTAAGTTGCAAATTATA
389 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
198086 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT-ACT
454 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA-T
* *
198119 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGGCTTGATTTCTTGATTTATCA-GTTATTTAGTGAGATTTG
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT-AGGTTATTTAATGAGATTTG
* * *
198183 AAACTATAGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATCCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAA
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* *
198312 TGCGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGAAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
193 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * * * *
198377 GGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAACTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAATCATTTTGGCTTGT
258 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
* * * *
198442 TTTTCTTGCTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
323 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTA
* * ** *
198507 AAAGTAGGTGAAATTTTATTGCGTGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTTTAAATTAT
388 AAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
* * *
198572 TTAGATAGCTTTGTCGAATCTATTTGAAAGTGAT
453 TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
** * * ** *
198606 ATTGATGAAACTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGA
1 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGA
* * * * * ** *
198671 AATTATAGAGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGCTTTGTGGCCAAAACTATTTGGTCGAGC
66 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGC
* * * * *
198736 CTTGTAAAAGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGTTTTGG-GTATTTGATTATG
131 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTG-ATTTGATTATG
* *
198800 TGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTCAAGGACTTGG
195 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* * * * *
198865 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTCGCCGAAACCTGATCAACCGTTTTGGCTTATTT
260 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * * * *
198930 TTCTTGCTCATTTTAAATTAATTTAGATGCGCGCA-GAGGTGTTTGTAAGCGAAAATTTTTGTAA
325 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
*
198994 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCAT-TATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
389 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
*
199058 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAC
454 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * *
199091 ATAGATGATATTGTGCATT-TTTTT-CCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTG
1 AAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTG
199154 AAATT
65 AAATT
199159 GTTAGGATCT
Statistics
Matches: 3866, Mismatches: 516, Indels: 127
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
482 12 0.00
483 833 0.22
484 48 0.01
485 938 0.24
486 1154 0.30
487 440 0.11
488 11 0.00
489 4 0.00
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491 4 0.00
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494 4 0.00
495 7 0.00
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ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (486 bp):
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CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
GTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
Found at i:197774 original size:486 final size:486
Alignment explanation
Indices: 180584--194231 Score: 17688
Period size: 485 Copynumber: 28.2 Consensus size: 486
180574 CTGTCCATGA
* * * * * * *
180584 CTTGATTTACAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATTGTACGGAGTAAATTACAAAAAAGAAAAGTC
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* *
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66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC-ATGATTTGTGGAT
* * * *
180714 GGTTCCAAGTTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGATTAAGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * * * * *
180779 AATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAATTTATTCCATGAAATTTCTTATATAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * ** * * *
180844 CC-ATAGCGTGATCAATAATTTTGGCATGTTTTACTTGCTGATTTGAAATCAATTTAGATCCGTG
260 CCGA-AACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* *
180908 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGATGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-TC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTAT-
* *
180972 CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA-CATTTAGATATCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTGAT
388 CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
*
181036 ATAGATGATATTGAGCTTATTTTTGCCTTGATTT
453 ATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * *
181070 CTTGATGTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
*** * * *
181135 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATTAATCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATATGTGCATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * *
181200 GTTCCAAACAGATTTGCTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGTTTAGGGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
*
181265 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATG-AATTTCTTACTTT-G
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA-TTTAG
* ** * * *
181328 CCGAAACATGAGCAACCATTTTGGCATGCATTTCTTTCTAATTTGAAATTAATTTAGCTGCGTGA
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * * *
181393 TGAGGTGCTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGATGAAAGTTCTTTGCATGTATTTGTATTA
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA
* * * * *
181458 TGATGCTGAATTGTTAAGTTACAAATCATTTATATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAA
390 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
* * *
181523 AGATGATATTGTGCTTTTTTTTTTACCATGATTT
455 AGATGATATTGTGC--TTATTTTTGCCTTGATTT
* * * ** * * *
181557 CTTCATGTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATCGTAAGGATTAAATTGTAAAAAAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * *
181622 AAGCCTTATGACCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * **
181687 GTTCCAAGCTAATTTGGTGATTTGATTGTTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGTTGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* *
181752 ATGCAAATATCCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
** * * * *
181817 AAAAACATGATCAACCTTTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAATTTAATTAAGATGCGTGTT
261 CGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* * * * * * *
181882 GAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGGAGAAATTTTATTACA-ATA-TTGTACCAT
326 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCAT
* * * * * * *
181945 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAGTTATTTAAATAGCTTGATCGAATCTTTTTGAAATTGACAAA
391 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA
**
182010 GATTTTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
456 GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * *
182041 CTTCATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGCC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * *
182106 ATGCTTTATAGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGAACTTTTGTCCCATGATTTGTGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
*
182171 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTTATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * * *
182236 AATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATG-AATTTCTTATTTTG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
** * * *
182300 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGCATTTCTTTCTAATTTGAAATTAATTTAGGTGCGTGA
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * *
182365 TGAGGTG-TT-CATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATTA
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA
* * *
182428 TGATGCTGAATTGTTAAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA
390 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
* * *
182493 AGAGGATATTGTGCTTATTTTTACCATGATTT
455 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * ** * * *
182525 CTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGTTTTGAAATCGTAAGGATTAAAGTGCAAAAAAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* *
182590 ATCCTTTATGGCCAAAGGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* *
182655 GTTCCAAGCCGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGAGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* *
182720 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACATGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * * *
182785 TGAAACATGATCAACCACTTTGACACGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAA
261 CGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* * * * * *
182850 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAATGTTGGTGAAATTTCTTTGCAAGTATTTGTGTAAT
326 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCAT
* * *
182915 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATATCTTCGTCGAATCTGTTTGAATTTGATATA
391 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA
* *
182980 GATGATATTGAGCTTAATTTTGCCTTGATTT
456 GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
** * *
183011 CTTGATGAATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * * *
183076 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAATCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATATGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * ** * * * *
183141 GTTGCAATCTGATTTGAAGATTTGATTATTTGTGTTTGTGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* ** *
183206 ATGCAAATATGCAAAAATTTACGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGAATGAAATTTCTTATTTTGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* ** * * *
183271 CGAAACATGATCAACCATTTTGACATGCATTTCTTTCTAATTTGAAATTAATTTAGGA-GCGTAA
261 CGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTA-GATGCGTGA
* * *
183335 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTATTA
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA
* ** *
183400 TGATGCTGAATTGTTAAGTTATAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA
390 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
* *
183465 AGATGATATTGTGCTTATTTTTTTCCATGATTT
455 AGATGATATTGTGCTTA-TTTTTGCCTTGATTT
* ** * * *
183498 CTTGATTTACAAGTTATTTAACAAGATTTGAAATTGTTA-GGAGTAAATTGCAAAAAAGAAAAGT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATT-ATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
* * * *
183562 CAAGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTGGTGAAGGATTTTTTTTCCAAGATTTGTGGA
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGA
* *
183627 TGGTTCCAAGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTATATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * *
183692 AAATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * * * * ** *
183757 GCCAAAACAAGGTCAACAATTTTGGAATGTTTTTCTTGCAAATTTGAAATTAATTTTGATGCGTG
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * * *
183822 ATGAGTTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATATATTTTTACC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
* * *
183887 ATGATGATGAATTATT-ATGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGAT
389 ATGATGCTGAATTGTTGA-GTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
**
183951 ATAGATGATATTGCACTTATTTTTGCCTTGATTT
453 ATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * **
183985 CTTGATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAATGGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * * *
184050 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAGGGATGTTTTTCCATGATATGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * *
184115 GTTCCAAACTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* *
184180 ATGCAAATATGC-AAAATTTAAGGACCTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTGTTTAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * * *
184244 CGAAACATGATTAACCATTTTGACATGATTTTCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTAAT
261 CGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* *
184309 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGCATCAT
326 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCAT
* * * *
184374 GATGTTGAATTGTT-ATGTTACAAATCATATAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATA-
391 GATGCTGAATTGTTGA-GTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
*
184437 AGGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTT
455 A-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * * * * ** *
184470 CTTCATTTACAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATTGTACGGAGTAAATTATAAAAAAGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* *
184535 ATGCTTTTTGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * *
184600 GTTCCAAGCTGATTAGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGATTAGGGGTTAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* * * * * *
184665 ATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAATTTCTTATATAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * *
184730 C-ATAGCATGATGAACAATTTTGGCATGTTTTACTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
261 CGA-AACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* *
184794 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGATGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-TCC
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTAT-C
*
184858 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA-CATTTAGATATCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
*
184922 TAGATGATATTGAGCTTATTTTTGCCTTGATTT
454 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * * *
184955 CTTGATGTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTCCAAAAATGAAACGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
*** * * *
185020 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGAATAATCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATATGTGCATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * * **
185085 GTTCCAAACAGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGACGTTGTGATTGTTTATAGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* * * *
185150 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACATGGTTGCAATGTTTGTTCCAT-TAATTTCTTATTTTGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* ** * * *
185214 TGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGCGTTTCTTTCTAATTTGAAATTAATTTAGCTGCGTGAT
261 CGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* * * *
185279 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGGTGAAAGTTCTTTGCATGTATTTGTATTAT
326 GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCAT
* * * *
185344 GATGCTGAATTGTTAAGTTACAAATCATTTATATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAA
391 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA
* *
185409 GATGATATTGTGCTTATTTTTACCCTGATTT
456 GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* ** * *
185440 CTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATCGTAAGGATTAAATTGTAAAACA-GAAAAGT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA-ATGAAAAGT
* *
185504 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGGGGCTTGTAAAGGATTTTGTTTCCATGATTTGTGGA
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT-TTTCCATGATTTGTGGA
* * * * *
185569 TGGTCCCAAGCTGATTTGATGATTTGATTATGTGCTTGTATGATGTTGTGATTGATTAGAGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * *
185634 AAACGCAAATATGCAAAAGTTTAAGGACATGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* *
185699 GCTGAAACATGATCAACCATTTTGACATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * * * *
185764 AAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAATGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGTATTTGTGTA
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
** *
185829 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATATTTTTGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* *
185894 TAGATGATACTGAGCTTATTTTTGCCTTGATTT
454 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * *
185927 CTTG-TTGAATATGTTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGT
1 CTTGATT-TATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
* * *** * * *
185991 CAAGCTCTATGGCCAAAAGTATTTGATTAATCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATATGTGCAT
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
* * * * **
186056 GGTTCCAAACAGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGTTTCTGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
** *
186121 AATGCAAATATGC-AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACAAAATTTCTAATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
** * * * * *
186185 TTGAAACATGATCAACCATTTTGCCAAGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCATGT
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * * *
186250 TGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTAATGCATGTATTTGTAGCT
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA
* * *
186315 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTAAGCTTA-CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
390 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAG-ATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* * * *
186379 TAGATGAAACTGTGCCTATTTTTACCTTGATTT
454 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * * ** *
186412 CTTGACTTATACGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGACTAAAAAGCAAAAATGAAATGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* *
186477 ATGCTTTATCGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTCTTT--AGTGATTTGTGGA
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT-TTTCCA-TGATTTGTGGA
* * *
186540 TGGTTCCAAGCTGATTTGG-GTCTTTGAATT-TTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAAGGGT
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTG-ATTTG-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGT
* * * * *
186603 CCAAATGCAAATAAGAAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAATTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
192 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
* * * * * * *
186668 TAGACGAAACATGATCAATCATTTTGACAAGTTTTTGTTGCGGATTTGAAAATAATTTAGATGCG
257 TAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
** * * * * *
186733 TGACAAGGTGTTTGCATGAGAAAATCCTTGAAAAAGTAAGTGAAATTTCATTGCTTGTATTCGTA
322 TGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTA
* * * ** * *
186798 TCACGGTGTTGAATTGTAAAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTG-
387 TCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA
*
186862 TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
452 TATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * *
186897 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAACTATAGGGCTTAAACTGCAAAGATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* *
186962 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACTGAGCCCTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
*
187027 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
*
187092 AATG-AAATATGCAAAAATTTATA-GACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTA-AGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * *** **
187155 GCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTCATTGATTTGAAATTAATTTAGATGTATG
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * * * *
187220 TTGAGCTATTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
* * * * *** *
187285 ATGATGCTAAATTGTTGAGTTACAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTT-TTTTTTATA
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* *
187349 TAGATGAAATTGAGCTTATTTTTGCCTTGATTT
454 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * * *
187382 CTTGGTTTATACA-TTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGTAAAAATGAAATGT
1 CTTGATTTATA-AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
* * *
187446 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCTGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTT-CGTGATTTGTGGA
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGA
* * *
187510 TAGTTCCAAGCTGATTTGTTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * *
187575 AAATGAAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAATTCGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * *
187640 GCCGAAACATAATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATG
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * * ** *
187705 TTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTAAGGCATGTATTTGTAGC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
* *
187770 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTTGATTA-CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGA-TAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* *
187834 ATAGATGAAACTGTGCTTTATTTTTGCCTTGATTT
453 ATAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTT
* ** * * * * *
187869 CTTGACTTATTCGTTATTTTATGAGACTTGAAATTATAGGGATTAAAATGAAAAAATTAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * *
187934 ATGTTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTAT--TTTTTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
*
187997 GTTCCAAGCTAATTTGG-GTATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTG-ATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * * *
188061 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTCGGTTGAAAAATTTGTTCCATGAAAATTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* *
188126 CCGAAACAAGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTG-TGGATATGAAATTAATTTAGATGCGTG
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * *
188190 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAATTTTCGTTGCATGTATTTGCATC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
* * *
188255 ATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCGTTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* *
188320 -ACGAAGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG-TCAT
454 TA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT-TT
* * * * * *
188353 CTTAATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAAAGGATAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * * *
188418 TTGCTTTATGCCCAAAAGTATTTGGA-TGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAAGATTTGGGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
* * * * *
188482 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTATTTTCATGATGTTGTGACTAATTATGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * *
188547 AATGAAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * * *
188612 CTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTCGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGT
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * *
188677 TGAGTTGTTTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCA
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA
* * * *
188742 TGATGTTGAATTGTTGAGTTGCCAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAACTGATAT
390 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAT
188807 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
455 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * * *
188839 CTTGATTCATAAGTTATTTAAAGAGTTTTGAAATTAGAGGGATTAAATTGCGAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * * *
188904 ATGTTTTGTGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTTTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * *
188968 GTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* * *
189033 ATGCAAATATACAAAAATTTAAGGGCTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTAT-TAATTTAG
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT-TCTTATTTAG
* *
189097 CTGAAACATGATCAACCATTTTGAC-TAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAT-GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * * * ** ** *
189161 ATGAGGTGTCTACAAGCGACTATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCATACC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
* * * * * *
189226 ATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAACCATTTAGATA-CTTAGGTCGAATATGTTTGAAGTTAAT
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
189290 A-ATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
453 ATA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
*
189324 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * * * * *
189389 ATGCTTTATGGCCATAAGCATTAGA-CAAGGCTTGTGAAGGACATTTTTTCCATGATTTTGTGGA
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGA-TTTGTGGA
* * *
189453 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTGTGTGTTTTTATGACGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * * * * *
189518 AAATGGAAATATGCAAAAATTTAACGATTTGGTTGCAAAGTTTGCTCCACGAACTTTTTTATTTT
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * * **
189583 GCC-AAAGCATGATCAACCATTTCGGCATTTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTGATTTAGATGAAT
259 GCCGAAA-CATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT
* * * * * * * *
189647 TAAGTGGTGTTCGCATGAGAAAATTCTTGTAAACGTAGGTGAAATATCATTACATGTAATTGTAT
323 GATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTAT
* *
189712 GATGATG-TCGAATTGTTGAGTTCCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA
388 CATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA
* * * *
189776 TAAATATGATATTGTGCTTATTTTTACATTGATTT
452 TATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* ** *
189811 CTTGATTTATAA-TCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAAAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGC
1 CTTGATTTATAAGT-TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
* * * * *
189875 CATGCTTTATGCCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTCAATGATTTGTGGAT
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
* * * * *
189940 GGTTCCAAGCTGATTTAGTCATTTTATTATATGTTTTGTA--A---T-TGATT-A--A-GGGTTA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTT-TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * * *
189995 AAATCCAAATATACAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAG-TTGTTCTATGAAATTGCTCACTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * ** *
190059 GCTGAAACATGATCAACCAATTTAACATGTTTTTCTTACTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* * *
190124 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGTACC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
* * * * *
190189 ATGATGCTAAATTGTTGGGTTGCAAATAATTTAGATAGCATGGTCGAATCTGTTTAAAATTGATA
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* *
190254 -A-A-G--A---TG---ACTTTTGCCTTGACTT
454 TAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * *
190276 CTTGATTTATATGTTATTCAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAGAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * *
190341 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTAACCGAGCCTTGCAAAAGATTTTTCTTCCATGATTTGTGGAT
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTT-TTCCATGATTTGTGGAT
* *
190406 GGTTCCAAGCTAATTTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
130 GGTTCCAAGCTGA-TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* ** * *
190471 AAAAGCAAATACACAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCATATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
** * * *
190536 GTTGAAACATGATCAACCAATTTGGCCTGTTATTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG
* *
190601 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACC
324 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC
* * *
190666 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCGAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCAGTTTGAAATTGATA
389 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* *
190731 -ATGATGATATTGTGCTTA-TTTTCCCCTGATTT
454 TA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * *
190763 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTACAACAATGGAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * ** * *
190828 ATGCTTTATGACCAAAACTATTTGACGGAGCCTCATAAAGGATTTGTTTCCGTGATTTGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * * *
190893 GTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTTTGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAA
131 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
* *
190958 ACGCAAATATGCAAAAATTTAAGTACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
196 ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * ** *
191023 C-AGAGCATGACCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCCAACTTAATTTAGATGCGTGA
261 CGA-AACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * * * *
191087 CGAGATGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTCACTACATGTATTTGTATTA
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA
* * *
191152 TGATGCTGATTTGTTGAGCTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTCATGA
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*
191217 -AGATGAT-GTGATGCTTATTTTTGCCTTG-TTAT
454 TAGATGATATTG-TGCTTATTTTTGCCTTGATT-T
* * * *
191249 CTTGATTTGTTAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAAT-AAAAGTT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAG-T
* * * *
191313 CATGCCTTATGGCCAAAGGTATTTGGA-TGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTGTGGA
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* * * * *
191376 TGGTTCCAAGCTAATTTGGGGCTTTGATTATGTGTTTTTATTATGTTGTGATTGATTAGGGGTGA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
*
191441 AAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATTT
194 AAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
* *
191505 AGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGC--------CTCGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT
258 AGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT
* * * *
191562 GACGAGGTGTTTGCAAGA-AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGCAC
323 GATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTAT
* *
191626 CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAATTGAT
388 CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
* * *
191691 ATACATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATAT
453 ATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * * * *
191725 CTTGGTTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAGGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * * *
191790 CTGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTCTTTTCCATGATATGTGGATG
66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * * * *
191855 GTTCCAATCTGATTTGGGGATTTTGTTTTTGTGTGTTTATGATCTTGTGATTGATTATGGGTCAA
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* * **
191920 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGCTTGTTCTGTGAAATTTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * *
191985 CCAAAACATGATCAACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGA
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * *
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* * * * * *
192115 TGGTGCTGAATTGTTGTGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTTGAATCTATTTGAAATTGATAA
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*
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* * *
192212 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGATATTTTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * * *
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66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * *
192342 GTTCCAAGATGATTTGGTGATTTGTTTACGTGTTTTTATGATGTTGTGATT-ATTGAGAGGTCAA
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** *
192406 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTCATTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * * *
192471 CCAAAACATGATCAACCATGTTGGCGTGGTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATTCGTGA
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * ** * *
192536 TAAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAACCAGTTGAAATTTC-TCTAG-ATGTATTTATAT
325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCAT-T-GCATGTATTTGTAT
* * * * *
192599 CATGATGCTAAATTGTTAAGTTACAAGTCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTCGAAGTTGA
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* *
192664 TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTT
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*
192699 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT-AAACTTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAA-TTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
* * * * * * *
192763 CATGCTTTATGGCCAAATGTATTCGGCCAAGCCTTGTAATGGATATTTTTCCATGATTTATGGAT
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** *
192828 TATTCCAAGCTAATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
130 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * * * * *
192893 AATGTAAATATGCAAAATTTTAAAGACTTGGTGGCAAAGTTTCTTCCATGAAATTTATTATTTAG
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* * * * *
192958 TCGAAACATGATTAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTACTGATTTGAAAATAATTCAGATGCGTGA
260 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * * *
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325 TGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA
* *
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*
193153 AGATGATATAGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
455 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * **
193185 CTTGATTCATAAGTTCTTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * *
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66 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
* * * * * **
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* * *
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195 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT-ATTTA
* * *
193442 GCCGAGACATGATTAACCATTTTGGC-TAGTTTTTCTTGCT-AGTTTGAAATTAATTTAGATGCA
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAT-GTTTTTCTTGCTGA-TTTGAAATTAATTTAGATGCG
* ** *
193505 TGATGAGGTGTCTGCAAAAGAATATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTA
322 TGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTA
* * * * * * * *
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* * * *
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452 TATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* *
193670 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTCTTGGGATTAAATTGCAAAAAATGAAAAGT
1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGC-AAAAATGAAAAGT
* * *
193735 CATGCTTTATGGCCAAATGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCGTGATTTGTGGA
65 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGA
* *
193800 TGGTTCCTAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATCAGGGGTCA
129 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
193865 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT-GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
194 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * *
193929 GCCGAAACATTATCAACCATTTTGGCATGCTTTTTTTTTTTTTTGCTAATTTGAAATTAATTTAG
259 GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATG-------TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
* *
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* *
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*
194117 ----TG-T-T---TGA-ATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTT
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* * * *
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1 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* *
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ATGTATCGATACA
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** *
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* * * *
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* *
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* * *
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* *
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*
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* *
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* * * **
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* * *
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* * * * **
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* * * ** *
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* *
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1 AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
*
203825 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTCAAGGACTTGGTTGCAA
66 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA
* ** *
203890 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAATCATTTTTACAAGTTTTTCTCG
131 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCTTG
* * * * *
203955 CGGATTTGAAATTAATTTAGATGTATGATGAGGTGTTCGAATGA-AAAAATCTTTGTAAAAGTAG
196 CTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC-TTGTAAAAGTAG
* * * * *
204019 GTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCGTGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGATA
260 GTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATA
* * * *
204084 GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTTCATG
325 GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTG
* * * *
204149 ATTTAT-CGATTATTTAATCAGATTTGAAACTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCATG
390 ATTTATAC-ATTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATG
* * *
204213 CTTTATGGCCCAAAGT-TTTTGACTGAGCATTGT
454 CTTTATGGCCAAAAGTATTTGGAC-GAGCCTTGT
*
204246 AAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGTGATTTGATTATGTGTTT
1 AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGT-ATTTGATTATGTGTTT
* *
204310 TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCA
65 TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCA
* * *
204375 AAGTTTGTTCCATGAAATTACTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTA-TTTTTCT
130 AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGC-AAGTTTTTCT
* * * * * * * *
204439 TGTTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGCTATTTGCATGAGAAAGTTCTCGCAAAAGTA
194 TGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTA
* * * * * *
204504 GGTGAAATTTTATTGCGTGTATTTATACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATTAATTAGAT
259 GGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGAT
* * * *
204569 AGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATATAGATGAAATTGTGGTTATTTTTGCCTTAATTTCTT
324 AGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTT
*
204634 GATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATG
389 GATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATG
* * **
204699 ATTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCCCGT
454 CTTTATGGCCAAAAGTATTTGGACGAGCCTTGT
* * *
204732 AAAGGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGAGTTTT
1 AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
* *
204797 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAGAACTTGGTTGCAA
66 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA
* * * * * * * *
204862 AGTCTGTTCCACGAAATTTCTTTTTTAGCCAAAACATGATCAGCCATTTTGGC-ATTTTTTTTTA
131 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCTTG
* * * *
204926 CTGACTTGAAATTAATTTAGATACGTGATGAGGTGTTTGCATAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGG
196 CTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGG
* * * *
204991 TGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTTAAGTTGCAAATCATTTAGATAG
261 TGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAG
* * * *
205056 CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTGGCCTTGTTTTCTTGC
326 CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGA
* *
205121 TTTATA-AGTTATTTTATGAGATTTAAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGC
391 TTTATACA-TTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGC
205185 TTTATGGCCAAAAGTATTTGGACGAGCCTTGT
455 TTTATGGCCAAAAGTATTTGGACGAGCCTTGT
* * * *
205217 AAAGGATTTTGTTCCACGATTTG-GGTATGGTTTCAAGCT-ATTTTGGGGATTTGATTATGTGTT
1 AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGG-ATGGTTCCAAGCTGA-TTTGGGTATTTGATTATGTGTT
* * **
205280 TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATACGCAAAAATTTAAAGACTTGGCAGC
64 TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGC
* **
205345 AAAGTTCGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCT
129 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCT
* * * * * * *
205410 TGCTAATTTGAAATTTATTTAGATGCTTGTTGAGCTGTTTGCATGGGAAAATTCTTGTAAAGGTA
194 TGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTA
* * * * *
205475 GGTGAAATTTTAATGCACGTATTTGTAGCATGATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATTATTTAGAT
259 GGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGAT
* * * * *
205540 AGCTTAGTCAAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGAAATTGTGCTTACTTTTGCCTAGATTTCTT
324 AGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTT
* * * *
205605 GACTTATACGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAGTGAAAAGCCATG
389 GATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATG
* *
205670 CTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGACCCTTGT
454 CTTTATGGCCAAAAGTATTTGGACGAGCCTTGT
* * * * * *
205703 AAAGGATTTTTTTCTATGATTTGGGGATCGTTCCAAGTTGATTTGGGTATTTGATTATATGGTTT
1 AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
* * * *
205768 TATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAAGGCAAATATGCAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCAA
66 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA
* * * * * *** * *
205833 AGTTTGTTCAATTAAATTTCTTATCTAACCGAAACATGAGCAACCATTTCAACCAGTTTTTCATG
131 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCTTG
* * * * *
205898 CTGATTTCAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGCGAAAATTCTTCTAAAAGTAGG
196 CTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGG
* * *
205963 TGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGCTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATAATTTAGATAG
261 TGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAG
* * * *
206028 CTTGGTTGAATCTCTTTGAAATTGATAAAGATG--ATCGTGCTAATTTTTGCCTTGATTTCTTGA
326 CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGA
** * *
206091 TTTATATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCT
391 TTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCT
* * *
206156 TTATGGCCGAAAGTATTT-GATCTACCCTTGT
456 TTATGGCCAAAAGTATTTGGA-CGAGCCTTGT
* * *
206187 AAAAGACTTTTTTTCCCTGA--T-T---T-G-T------TGA--T-GG--TTTGATTCTGTGTTT
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* *
206233 TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCA
65 TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCA
* * * * *
206298 AAGTTTGTTCCACGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCTT
130 AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCTT
* * * * * *
206363 GGTGATTTAAAATTAATTTGGATGCGTAATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTCGTAAAAGTAG
195 GCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAG
* * * * * *
206428 GGGAAATTTTATTGCATGTATTTGCACCATGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATA
260 GTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATA
* * * * * * *
206493 GCTTGGTTGAATCTGTTTGAAACTGATATATATGATATTGTGCTTATTTTTGCGTTG-TCATCTT
325 GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT-TTCTT
* * ** * *
206557 GATTTATAAATTATATTATGAGATTTGAAATTATAATGATTAAAAGGCAAAAATGAATAGTCATG
389 GATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATG
* *
206622 CTTTATGGCCAAAAGCATTTGGACGAGCCTTGC
454 CTTTATGGCCAAAAGTATTTGGACGAGCCTTGT
* * * * *
206655 AAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCACGCAGATTTAGGG-ATTAGATTTTGTGTTT
1 AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGTATTTGATTATGTGTTT
* * *
206719 TTATGATGTTGTGA-TGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGGATGC
65 TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGC
206782 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA
129 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA
206818 GATAAGAAAA
Statistics
Matches: 3075, Mismatches: 419, Indels: 103
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
466 265 0.09
467 12 0.00
468 110 0.04
469 4 0.00
470 1 0.00
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473 1 0.00
474 1 0.00
475 1 0.00
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488 10 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (486 bp):
AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
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CTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGG
TGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAG
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TTATGGCCAAAAGTATTTGGACGAGCCTTGT
Found at i:204687 original size:972 final size:974
Alignment explanation
Indices: 202787--206817 Score: 5568
Period size: 971 Copynumber: 4.2 Consensus size: 974
202777 TCTAGGAGGA
* * * * *
202787 AAAGGATCTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA-TCTGATTT-GGTGATTAGATTATATGTG
1 AAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGT-TGATTTGGGT-ATTTGATTATGTGTT
* *
202850 TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGC
64 TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGC
* * *
202915 AAAGTTTGTTCCATGAATTTTCTTGTTTAGCCGAAACATGATCAATCATTTTGACAAGTTTTTCT
129 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGACAAGTTTTTCT
* * * *
202980 CGAGGATTTGAAATTAACTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATGCAAAAA-TCTTTGTAAAAGT
194 CGCGGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGAATGAAAAAATTC-TTGTAAAAGT
* *
203044 AGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCCGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGA
258 AGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGA
*
203109 TAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT-ACTAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGGCTTGATTTC
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* *
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387 TTGATTTATCGAGTTATTTAATGAGATTTGAAACTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * *
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*
203302 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGCGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
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* * *
203367 AATGAAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAACTTCTTATTTAG
582 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
*
203432 CTGAAACATGATCAATCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGT
647 CTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGT
* *
203497 TGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCGTGTATTTGTACCA
712 TGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCA
* ** * *
203562 TGATGCTGAATTTTTGAGTTTTAAATTATTTAGATAGCTTTGTCGAATCTATTTGAAAGTGATAT
777 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAT
* * *
203627 TGATGAAACTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAA
842 AGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTAATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAA
* * *
203692 TTATAGAGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGCTTTGTGGCCAAAACTATTTGGTCGAGCCT
907 TTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGGCCGAGCCT
203757 TGT
972 TGT
* * *
203760 AAAAGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGTTTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
1 AAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
*
203825 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTCAAGGACTTGGTTGCAA
66 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA
* *
203890 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAATCATTTTTACAAGTTTTTCTCG
131 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGACAAGTTTTTCTCG
* *
203955 CGGATTTGAAATTAATTTAGATGTATGATGAGGTGTTCGAATGAAAAAA-TCTTTGTAAAAGTAG
196 CGGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGAATGAAAAAATTC-TTGTAAAAGTAG
*
204019 GTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCGTGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGATA
260 GTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGATA
* * *
204084 GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTTCATG
325 GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTG
* *
204149 ATTTATCGA-TTATTTAATCAGATTTGAAACTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCATG
390 ATTTATCGAGTTATTTAATGAGATTTGAAACTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATG
* * * *
204213 CTTTATGGCCCAAAGTTTTTGACTGAGCATTGTAAAGTA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGT
455 CTTTATGGCCAAAAGTATTTGACTGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGT
204277 TCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAT
520 TCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAT
*
204342 GCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTACTTATTTAGCTG
585 GCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTG
* *
204407 AAACATGATCAACCATTTTGGCTTATTTTTCTTGTTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGA
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* * * * *
204472 GCTATTTGCATGAGAAAGTTCTCGCAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCGTGTATTTATACCATGA
715 GCTGTTTGCATGAGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCATGA
* *
204537 TGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATTAATTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATATAGA
780 TGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATATAGA
*
204602 TGAAATTGTGGTTATTTTTGCCTTAATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTA
845 TGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTAATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTA
* * **
204667 TAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGATTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCCCGT
910 TAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGGCCGAGCCTTGT
* * *
204732 AAAGGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGAGTTTT
1 AAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
* *
204797 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAGAACTTGGTTGCAA
66 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA
* * * * * * * * **
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131 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGACAAGTTTTTCTCG
* * * * *
204926 CTGACTTGAAATTAATTTAGATACGTGATGAGGTGTTTGCAT-AAGAAAATTCTTGTAAAAGTAG
196 CGGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGAATGAA-AAAATTCTTGTAAAAGTAG
* * * * * *
204990 GTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTTAAGTTGCAAATCATTTAGATA
260 GTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGATA
* *
205055 GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTGGCCTTGTTTTCTTG
325 GCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTG
* * * * * * *
205120 CTTTAT-AAGTTATTTTATGAGATTTAAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATG
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* *
205184 CTTTATGGCCAAAAGTATTTGGAC-GAGCCTTGTAAAGGA-TTTTGTTCCACGATTTG-GGTATG
455 CTTTATGGCCAAAAGTATTT-GACTGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGG-ATG
* *
205246 GTTTCAAGCT-ATTTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
518 GTTCCAAGCTGA-TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * *
205310 AATGCAAATACGCAAAAATTTAAAGACTTGGCAGCAAAGTTCGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
582 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * * *
205375 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTTATTTAGATGCTTGT
647 CTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGT
* * * * * *
205440 TGAGCTGTTTGCATGGGAAAATTCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTTAATGCACGTATTTGTAGCA
712 TGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCA
* * * *
205505 TGATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATTATTTAGATAGCTTAGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAT
777 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAT
* * *
205570 AGATGAAATTGTGCTTACTTTTGCC-TAGATTTCTTGACTTATACGTTATTTTATGAGATTTGAA
842 AGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTA-ATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAA
* * * * *
205634 ATTATAGGGATTAAAATGCAAAAGTGAAAAGCCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGACCC
906 ATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGGCCGAGCC
205699 TTGT
971 TTGT
* * * *
205703 AAAGGA-TTTTTTTCTATGATTTGGGGATCGTTCCAAGTTGATTTGGGTATTTGATTATATGGTT
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * * ** *
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194 CGCGGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTG-AATGAAAAAATTCTTGTAAAAGT
* * * *
205960 AGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGCTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATAATTTAGA
258 AGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGA
* * * *
206025 TAGCTTGGTTGAATCTCTTTGAAATTGATAAAGATG--ATCGTGCTAATTTTTGCCTTGATTTCT
323 TAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCT
*
206088 TGATTTAT--ATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
388 TGATTTATCGA-GTTATTTAATGAGATTTGAAACTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
* * * *
206151 ATGCTTTATGGCCGAAAGTATTTGATCT-ACCCTTGTAAAAGACTTTTTTTCCCTGA--T-T---
452 ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-CTGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGA
*
206209 T-G-T------TGA--T-G-G-TTTGATTCTGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
516 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * *
206261 AAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCATATTTA
581 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA
* * * * * * * *
206326 GCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGGTGATTTAAAATTAATTTGGATGCGTA
646 GCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATG
* * * *
206391 ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGGGAAATTTTATTGCATGTATTTGCACC
711 TTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACC
* * * * *
206456 ATGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAACTGATA
776 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATA
* * * * * * *
206521 TATATGATATTGTGCTTATTTTTGCGTT-GTCATCTTGATTTATAAATTATATTATGAGATTTGA
841 TAGATGAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTAAT-TTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGA
** * *
206585 AATTATAATGATTAAAAGGCAAAAATG-AATAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGC-ATTTGGACGA
905 AATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAT-GTCATGCTTTATGGCCAAAA-CTATTTGGCCGA
*
206648 GCCTTGC
968 GCCTTGT
* * * ** * *
206655 AAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCACGCAGATTTAGGG-ATTAGATTTTGTGTTT
1 AAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGATTT-GGGTATTTGATTATGTGTTT
* * *
206719 TTATGATGTTGTGA-TGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGGATGC
65 TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGC
206782 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA
129 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA
206818 GATAAGAAAA
Statistics
Matches: 2730, Mismatches: 299, Indels: 80
0.88 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
950 1 0.00
951 75 0.03
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953 12 0.00
954 1 0.00
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958 1 0.00
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964 1 0.00
965 1 0.00
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974 6 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (974 bp):
AAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTT
TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA
AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGACAAGTTTTTCTCG
CGGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGAATGAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGG
TGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATTATATAGATAG
CTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGA
TTTATCGAGTTATTTAATGAGATTTGAAACTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGC
TTTATGGCCAAAAGTATTTGACTGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT
CCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATG
CAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGA
AACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATGTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAG
CTGTTTGCATGAGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCATGAT
GCTGAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATATAGAT
GAAATTGTGCTTATTTTTGCCTTAATTTCTTGATTTATACATTATTTTATGAGATTTGAAATTAT
AGGGATTAAAATGCAAAAATGAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGGCCGAGCCTTGT
Found at i:207181 original size:415 final size:415
Alignment explanation
Indices: 206407--207232 Score: 1148
Period size: 415 Copynumber: 2.0 Consensus size: 415
206397 TGTTTGCATG
* * *
206407 AGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGGGAAATTTTATTGCATGTATTTGCACCATGATGTTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGGGAAATTTCATTGCATGTATTTGCACCATAATGTTCAATTGTT
* * *
206472 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAACTGATATATATGATATTGTGCT
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAACTGATATAGATGATATTGTGCT
* * * * *
206537 TATTTTTGCGTTGTCATCTTGATTTATAAATTATATTATGAGATTTGAAATTATAATGATTAAAA
131 TATTTTTGCCTTGTCATCTTGATTCATAAATTATATTAAGAGATTCGAAATTATAAGGATTAAAA
* *
206602 GGCAAAAATGAATAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGCATTTGGACGAGCCTTGCAAAGGATTTTTT
196 GGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGCATTTGGACAAGCCTTGCAAAGGATTTTTT
** * *
206667 TCCACGATTTGTGGATGGTTCCACGCAGATTTAGGGATTAGATTTTGTGTTTTTATGATGTTGTG
261 TCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACAGATTTAGGGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTG
* * **
206732 ATGATTAGGGGTGAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAGGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATG
326 ATGATTAGAGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAAGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATG
206797 AAATTTCTT-ATTTAGCCGAAAGATA
391 AAATTT-TTAATTTAGCCGAAAGATA
* * *
206822 AGAAAATTCTTGTAAAAAG-AGGTGAAATTTCATTGCCA-GTATTTGTACCATAATGTTCAATTG
1 AGAAAATTCTCGT-AAAAGTAGGGGAAATTTCATTG-CATGTATTTGCACCATAATGTTCAATTG
* * *
206885 TTGAGTTGCAAATGATTTAGATAGCTTGGTCGAGTCTATTTGAAACTGATGTAGATGATATTGTG
64 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAACTGATATAGATGATATTGTG
* * *
206950 CTTATTTTTGCCTTGAT-TTCTTGATTCATAAGTTAT-TTAAAGAGATTCGAAATTATAGGGATT
129 CTTATTTTTGCCTTG-TCATCTTGATTCATAAATTATATT-AAGAGATTCGAAATTATAAGGATT
** * * *
207013 AAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA-
192 AAAAGGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGCATTTGGA-CAAGCCTTGCAAAGGAT
* * *
207076 TTTTTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
256 TTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACAGATTTAGG-GATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
* *
207140 GTTGTGATTGATTATAGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTT
320 GTTGTGA-TGATTAGAGGTCAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAAGACTTGGATGCAAAGTTT
207204 GTTCCATGAAATTTTTAATTTAGCCGAAA
383 GTTCCATGAAATTTTTAATTTAGCCGAAA
207233 CATGATCAAC
Statistics
Matches: 362, Mismatches: 40, Indels: 18
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
413 2 0.01
414 67 0.19
415 284 0.78
416 9 0.02
ACGTcount: A:0.32, C:0.10, G:0.20, T:0.38
Consensus pattern (415 bp):
AGAAAATTCTCGTAAAAGTAGGGGAAATTTCATTGCATGTATTTGCACCATAATGTTCAATTGTT
GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAACTGATATAGATGATATTGTGCT
TATTTTTGCCTTGTCATCTTGATTCATAAATTATATTAAGAGATTCGAAATTATAAGGATTAAAA
GGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGCATTTGGACAAGCCTTGCAAAGGATTTTTT
TCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACAGATTTAGGGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTG
ATGATTAGAGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAAGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATG
AAATTTTTAATTTAGCCGAAAGATA
Found at i:208840 original size:486 final size:484
Alignment explanation
Indices: 206822--212861 Score: 7786
Period size: 485 Copynumber: 12.5 Consensus size: 484
206812 CCGAAAGATA
* * *
206822 AGAAAATTCTTGTAAAAAG-AGGTGAAATTTCATTGCCA-GTATTTGTACCATAATGTTCAATTG
1 AGAAAATTCTTGT-AAAAGTAGGTGAAATTTCATTG-CATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTG
* * * * *
206885 TTGAGTTGCAAATGATTTAGATAGCTTGGTCGAGTCTATTTGAAACTGATGTAGATGATATTGTG
64 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTG
* * *
206950 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTCATAAGTTATTTAAAGAGATTCGAAATTATAGGGATTAA
128 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
* *
207015 ATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTT
193 ATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGAT-GAGCCTTGTAAAGGATTTT
* * * *
207079 TTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTG
257 TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTG
** *
207144 TGATTGATTATAGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
322 TGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
207209 ATGAAATTT-TTAATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCCA-GTTTTTCTTGCTGATTTG
387 ATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG-CATGTTTTTCTTGCTGATTTG
* *
207272 AAATTAATTTATATGCGTGATGAGGTGTCTGCAAG
450 AAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
** * * * *
207307 AGACTATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGTTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * *
207372 GAGTTGCAAACCATTTAGATACCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAATGCTGATATTGTGCT
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCT
* **
207437 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATATTGATTAAAT
130 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* * * ** * * *
207502 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCCATAAGTATTAGACCATGGCTTGTGAAGGACATTTT
195 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATGA-GCCTTGTAAAGGA-TTTTT
** *
207567 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCAAATTTGGTGTTTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGT
258 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGT
** *
207632 GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATATAAAAATTTAAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCA
323 GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
* * **
207697 TGAAATTTATTATTTAGCTGAAACATGATCAATGATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
388 TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
* * * *
207762 TTAATTTAGATGCATG-TCGAGCTATTTGCATG
453 TTAATTTAGATGCGTGAT-GAGGTGTTTGCAAG
* *
207794 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTTCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * *
207859 GGGTTACAAATTATTTAGATAGCTTGGTAGAATCTGTTTGAAATTGATAA-A-G--A---TG---
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTGCTT
* * ** *
207914 ATTTTTTCCTTCACCTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATT
131 ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT
* * *
207979 GCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAAGATTCTTTT
196 GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-TGAGCCTTGTAAAGGATT-TTTT
** *
208044 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTCATGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTG
259 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTG
* * * *
208109 ACTGATTAAGGGTCAAAATACAAATACAG-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
324 ATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATA-TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
*
208173 TGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
388 TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
*
208238 TTAATTTAGATGCGTGACGAGG-GTTTGCAAG
453 TTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* ** * *
208269 AGAAAATTCTTGTAAAAGTTGGTGAAATTTTGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * *
208334 GAGTTGCAAAACATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTTTTTGAAATTGATGAAGATGATGTTGTGCT
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCT
* * *
208399 TATTTTTGCCTTG-TTATCTTGATTTATAAGTTATTTTATAAGATTTGAAATTATAGGGATCAAA
130 TATTTTTGCCTTGATT-TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* *
208463 ATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGATGAGCCTTGTAAAGCATTTTT
194 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT-GATGAGCCTTGTAAAGGATTTTT
* * *
208528 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTAGGTGTTTTTGTGATGTTGT
258 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGT
* * * * *
208593 GATTGATTAGGGGTGAAAACGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGGCTTGGTTGCAAAGTTTGTTTC
323 GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
* * * *
208657 ATGAAATTTCTTACTTAGCCG-AACCTGGATCAACCTTTTTGG-ATTGTTTTTCTTGCTCATTTG
387 ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT-GATCAACCATTTTGGCA-TGTTTTTCTTGCTGATTTG
*
208720 AAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCAAG
450 AAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * *
208755 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGTATTTGTACCATAATGGTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * * *
208820 GAGTAGCAAATCAATTAGATAGCTAGGTCGAATCTGTTTCAAATTGACATAA-ATGATATTGTGA
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG--ATAAGATGATATTGTGC
* * * * * *
208884 GTATTTTTGCCGTGATTTCTTCATTTATATGTTATTCAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
129 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* * * *
208949 TTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTT
194 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGAT-GAGCCTTGTAAAGGATTTTT
* * * *
209014 TTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGTTGTTGT
258 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGT
* * *
209078 GATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCA
323 GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
* * *
209143 TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTCGCCA-GTTTTTCTCGCTGATTTGTA
388 TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
* * *
209207 ATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTCCATG
452 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
** * * **
209240 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCGGGTATTTGTACCTTGAAGCTGAATTACT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * *
209305 GAGTTGCAAATCATTTTGATATCTTGGTCGAATCAGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCT
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCT
* *
209370 TATTTTTCCCTTGATTTCTTGGTTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
130 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* * * * * *
209435 TACAAACATGAAAAGTCCTGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTGTT
195 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-TGAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
* * ** ** *
209500 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAAATTATGTGAGTTTATGATGCTGTG
259 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTG
* * * * * *
209565 ACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTGAAGGATTTGGGTGCAAGGTTTGTTCCAT
324 ATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT
* * * * *
209630 GAAAATTCTTATTTAGCCAAAACAAGATCAACTATTTTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAAT
389 GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAAT
* * * *
209695 TAATTTAGACGCATGAAGAGGTGTTTGCATG
454 TAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* ** * * * * *
209726 AGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGGTATTTTATTACATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * *
209791 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCAAATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCT
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCT
* * * *
209856 TATTTTTGCATTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGATGTGAAATTATAGGGACTAAAT
130 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* * * *
209921 TGCAAAAATGAAAAGTCGTGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCCTATAAAGGATTTTTT
195 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGAT-GAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
* * * * *
209986 TCCATGATTTGTGGATAGTT---AGCTGATTTGGTGACTTGATTATGTGTTTCTATGACGTTGTA
259 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTG
* *
210048 ATTGATTA-GGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTCGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT
324 ATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT
* *
210112 GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTTTTGCTGATTTAAAAA
389 GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTT-GAAA
* * * *
210177 TCAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTACATG
453 TTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * *
210209 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCTTTGCATGT-TTTCGTATCATGATGCTGATTTGT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTT-GTACCATGATGCTGAATTGT
*
210273 TGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAACATGATATTGTGC
65 TGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGC
*
210338 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTCGAAATTATAGGGATTAAA
129 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
210403 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACTTGAGCCTTGTAAAGGATTTT
194 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA--TGAGCCTTGTAAAGGA-TTT
* * * * *
210468 TTTTCTATGATTTATGGATGGTTCTAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTCTTTATGATGTT
256 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTT
* * * *
210533 GTGATGTGATTAGGGGTGAAAACGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCATAGTTTGT
321 GTGAT-TGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGT
* * * *
210597 TCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGGTAAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTG-TACATT
384 TCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATT
** *
210661 TGAAATTAATTTAGATGCGTGAAAAGGTGTTTGCGAG
448 TGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * *
210698 AGAAAATTCTTGTAAATGTAGGTGAAATTTCATCGCATGTATTTGTACCATGATGGTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* *
210763 GAGTTGCAAATCAGTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGGCAT-AGATAATATTGTGC
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT-G-ATAAGATGATATTGTGC
* * * * *
210827 GTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATTGGGATTAAA
129 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* * * * * * *
210892 TTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGACGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTGTT
194 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGAT-GAGCCTTGTAAAGGATTTTT
* * * * *
210957 TTCC-TGGATTTGTTG-TTGCTCCAAGCTGATTTAGG-GATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTT
258 TTCCAT-GATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTT
* * * *
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* * **
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**
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450 AAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * * * *
211183 AGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATATATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * *
211248 GAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTC-AATCTGTTTGAAAATGATAAAGACGATATTGTGT
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-TCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGC
* * *
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129 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* * * ** * * *
211377 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCATAAGTGTTAGACCAAGGCTTGTGAAGGACATTT
194 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-TGAGCCTTGTAAAGGA-TTTT
**
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** *
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*
211571 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCTTTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
386 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
*
211636 AATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGAAAG
451 AATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * *
211670 AAAAAGAAAAAATTCTTGAAAAAATAGGTGAAATTTCATTGTATGTATTTGTA-CACTGATGCTG
1 ----AG--AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCA-TGATGCTG
** *
211734 AATTGTTGAGTTGTTAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAATTGATATAGATGATA
59 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATA
* * * * * *
211799 TTGTGCGTATTTTTGCCTTGATATCTTGGTTTATAGGTTATTTAAAGAGATTCGAAATTATAGGG
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* * * *
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188 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGAT-GAGCCTTGTAAAGG
* * ** * * *
211929 -TTTTTTTCCACGATTTTTGGATGGTTCCAAATTGATTTGCTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
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** * *
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317 TGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTT
* * *
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382 GTTCCATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAT-GTTTTTCTTGCTG
* * *
212120 AGTTTGAAATTAAATTAGATGCGTGATGAGGTGTCTGCAGG
445 A-TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * * * * * *
212161 GGAATATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTC
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * *
212226 GAGTTGCAAACCATTTAGATACCTTGGTCGAATTTGTTTGAAA-T--T-A-AT-A-A---AG-TT
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTGCTT
*** * *
212280 A-AAATACCTTGATTTCTTGATTTAGAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT
131 ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT
* * * * *
212344 GTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAAGGCCAAAAGTATTTAACTGAGCCTTGTGAGGGATTTTTTT
196 GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-TGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTT
* * * * *
212409 TCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAGGTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTAAGGTGTTGTG
259 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTG
212474 ATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT
324 ATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT
* * * *
212539 CAAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGGTCAACCATTTTGGCATGTTTTTTTTTGCTGATTTGAA
389 -GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATG-TTTTTCTTGCTGATTTGAA
212604 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
452 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * *
212637 GGAAAATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATAATGCTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * * *
212702 GAGTTACAAATCATTTAGATTGCTTGGT-AAATTTGTTTGAAATTGATATTA-ACGATATTGTGC
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA--AGATGATATTGTGC
* * * * *
212765 GTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTGAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAG
129 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* *
212830 TTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTGTATGGCCA
194 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
212862 GATGATGATA
Statistics
Matches: 4820, Mismatches: 622, Indels: 223
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
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473 3 0.00
474 121 0.03
475 157 0.03
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ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT
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ATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
Found at i:209590 original size:971 final size:972
Alignment explanation
Indices: 206822--212861 Score: 8143
Period size: 971 Copynumber: 6.2 Consensus size: 972
206812 CCGAAAGATA
* * *
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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*
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* * **
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* * * *
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* * *
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** *
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* * * * * **
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* *
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* * *
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** * ** * *
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*
207791 ATG
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* *
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1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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**
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* * * * *
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* *
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* * *
208236 AATTAATTTAGATGCGTGACGAGG-GTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGGTGAAATTTT
452 AATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
* * * * *
208300 GTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAAACATTTAGATAGCTTGGTTGA
517 ATTGCATGTATTCGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA
* *
208365 ATCTTTTTGAAATTGATGAA-GATGATGTTGTGCTTATTTTTGCCTTG-TTATCTTGATTTATAA
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* * * *
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* *
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* * * * *
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774 ATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATC
* * * * *
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* *
208686 TCAACCTTTTTGG-ATTGTTTTTCTTGCTCATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTT
904 TCAACCATTTTGGCA-TGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTT
208750 GCAAG
968 GCAAG
* * *
208755 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGTATTTGTACCATAATGGTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * * * *
208820 GAGTAGCAAATCAATTAGATAGCTAGGTCGAATCTGTTTCAAATTGACATAAATGATATTGTGAG
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAAATGATATTGTGCG
* * * *
208885 TATTTTTGCCGTGATTTCTTCATTTATATGTTATTCAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
131 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* *
208950 TGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
196 TGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
* * *
209015 TCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGTTGTTGTG
261 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTG
*
209079 ATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCAT
326 ATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT
* *
209144 GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTCGCCAGTTTTTCTCGCTGATTTGTAAT
391 GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAAT
* * *
209209 TAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTCCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATT
455 TAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATT
** * * * * ** * *
209274 GCGGGTATTTGTACCTTGAAGCTGAATTACTGAGTTGCAAATCATTTTGATATCTTGGTCGAATC
520 GCATGTATTCGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATC
* * *
209339 AGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGGTTTATAAGTTAT
585 TGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
* * *
209404 TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAACATGAAAAGTCCTGCTTTATGGCCAAAA
650 TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAA
* * * *
209469 CTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTGTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGG
715 GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGG
** ** * * *
209534 TGATTAAATTATGTGAGTTTATGATGCTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAA
780 TGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT-CTAAAA
* * * * * * *
209598 ATTGAAGGATTTGGGTGCAAGGTTTGTTCCATGAAAATTCTTATTTAGCCAAAACA-AGATCAAC
844 ATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGGATCAAC
* * * * *
209662 TATTTTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAGACGCATGAAGAGGTGTTTGCATG
909 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCAAG
* ** * * * * *
209726 AGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGGTATTTTATTACATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * *
209791 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCAAATCTGTTTGAAGTTGATA-AAGATGATATTGTGC
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAA-ATGATATTGTGC
* * * * *
209855 TTATTTTTGCATTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGATGTGAAATTATAGGGACTAAA
130 GTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* * * * *
209920 TTGCAAAAATGAAAAGTCGTGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCCTATAAAGGATTTTT
195 TTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTT
* * *
209985 TTCCATGATTTGTGGATAGTT---AGCTGATTTGGTGACTTGATTATGTGT-TTCTATGACGTTG
260 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTT-TATGATGTTG
* * * *
210046 TAATTGATTA-GGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTCGGTTGCAAAGTTTGTTCC
324 TGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
* * *
210110 ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTTTTGCTGATTTAAA
389 ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGCCA-GTTTTTCTTGCTGATTT-GA
* * * *
210175 AATCAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTACATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
452 AATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
* * *
210240 TTTGCATGTTTTCGTATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA
517 ATTGCATGTATTCGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA
**
210305 ATCTGTTTGAAATTGATAAACATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
582 ATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
*
210370 TATTTAATGAGATTCGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
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* * * *
210435 AAAGTATTTGACTTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTATGATTTATGGATGGTTCTAAGCTGA
712 AAAGTATTTGAC-CGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
210500 TTTGGGGATTTGATTATGTGTCTTTATGATGTTGTGATGTGATTAGGGGTGAAAACGCAAATATC
775 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGAT-TGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATC
* *
210565 TAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCATAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGG-
839 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGGA
* * * *
210629 TAAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTG-TACATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAAAGGTGTTT
904 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTT
*
210693 GCGAG
968 GCAAG
* * *
210698 AGAAAATTCTTGTAAATGTAGGTGAAATTTCATCGCATGTATTTGTACCATGATGGTGAATTGTT
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* ** * *
210763 GAGTTGCAAATCAGTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGGCATAGATAATATTGTGCG
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* * *
210828 TATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATTGGGATTAAAT
131 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* * * * *
210893 TGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGACGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTGTTT
196 TGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
* * * *
210958 TCC-TGGATTTGTTG-TTGCTCCAAGCTGATTTAGG-GATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTG
261 TCCAT-GATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTG
* *
211020 TGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCCAAGTTTGTTCC
324 TGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
* **
211085 ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGTTCAACCATTTTCGCCAGTTTTTCTTGCAAATTTGAA
389 ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCAGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
** *
211150 ATTAATTTAGATGCACGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
211215 TTGCATATATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTC-A
518 TTGCATGTATTCGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-TCGA
* * * * *
211279 ATCTGTTTGAAAATGATAAAGACGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGT
582 ATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* *
211344 TATTTAATGAGATTTGAAATAATAGGGATTCAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
647 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * * * * * **
211409 TAAGTGTTAGACCAAGGCTTGTGAAGGACATTTTTTCCATGATTTACGGATGGTTCCAAGCTGAT
712 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
** *
211474 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGGAAGTGCAAATATCTA
776 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTA
211539 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT-GATC
841 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGGATC
* * *
211603 AACCTTTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGAA
906 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCA
211668 AG
971 AG
* * *
211670 AAAAAGAAAAAATTCTTGAAAAAATAGGTGAAATTTCATTGTATGTATTTGTA-CACTGATGCTG
1 ----AG--AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCA-TGATGCTG
** * *
211734 AATTGTTGAGTTGTTAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAATTGATATAGATGATA
59 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAAATGATA
* * * *
211799 TTGTGCGTATTTTTGCCTTGATATCTTGGTTTATAGGTTATTTAAAGAGATTCGAAATTATAGGG
124 TTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGG
* *
211864 ATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGTCAAGCCTTGTAAAGG
189 ATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGG
* * ** * *
211929 -TTTTTTTCCACGATTTTTGGATGGTTCCAAATTGATTTGCTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
254 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGA
* * * *
211993 TGTTGTGATTGATTTTGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAGAGTTT
319 TGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTT
* * * *
212058 GTTCCCTGAAATTT-TTAATTTAGCTGAAACATGATCAACCGTTTTGGCTAGTTTTTCTTGCT-A
384 GTTCCATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCAGTTTTTCTTGCTGA
* * * * * *
212121 GTTTGAAATTAAATTAGATGCGTGATGAGGTGTCTGCAGGGGAATATTCTTGTAAAAGTAAGTGA
447 -TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGA
* * * *
212186 AATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTCGAGTTGCAAACCATTTAGATACCTT
511 AATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
* *** *
212251 GGTCGAATTTGTTTGAAA-T--TAAT-A--A-A----G-TTA-AAATACCTTGATTTCTTGATTT
576 GGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* *
212303 AGAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
641 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * * *
212368 AGGCCAAAAGTATTTAACTGAGCCTTGTGAGGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGCTCCTA
706 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* * *
212433 GGTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTAAGGTGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAA
770 GCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAA
* *
212498 TATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATCAAAATTTCTTAATTAGCCGAAA
835 TAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAA
* *
212562 CATGG-TCAACCATTTTGGCATGTTTTTTTTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAG
898 CATGGATCAACCATTTTGGCATG-TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAG
212626 GTGTTTGCAAG
962 GTGTTTGCAAG
* * *
212637 GGAAAATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATAATGCTGAATTGTT
1 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
* * * * * *
212702 GAGTTACAAATCATTTAGATTGCTTGGT-AAATTTGTTTGAAATTGATATTAACGATATTGTGCG
66 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAAATGATATTGTGCG
* * *
212766 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTGAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGT
131 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
*
212831 TGTAAAAATGAAAAGTCATGCTGTATGGCCA
196 TGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
212862 GATGATGATA
Statistics
Matches: 4440, Mismatches: 552, Indels: 164
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
960 125 0.03
961 486 0.11
962 231 0.05
963 203 0.05
964 5 0.00
965 226 0.05
966 44 0.01
967 56 0.01
968 107 0.02
969 290 0.07
970 197 0.04
971 749 0.17
972 714 0.16
973 82 0.02
974 287 0.06
975 111 0.03
976 5 0.00
977 24 0.01
978 498 0.11
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.21, T:0.39
Consensus pattern (972 bp):
AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTT
GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAAATGATATTGTGCG
TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
TGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTG
ATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT
GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGCCAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATT
AATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTG
CATGTATTCGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT
GTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATT
TAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAG
TATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGT
GATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAAT
TTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGGATCAACCA
TTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCAAG
Found at i:212958 original size:113 final size:113
Alignment explanation
Indices: 212766--212974 Score: 346
Period size: 113 Copynumber: 1.8 Consensus size: 113
212756 ATATTGTGCG
* *
212766 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTGAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGT
1 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTGAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* *
212831 TGTAAAAATGAAAAGTCATGCTGTATGGCCAGATGATGATATTATTCT
66 TGCAAAAATAAAAAGTCATGCTGTATGGCCAGATGATGATATTATTCT
* * *
212879 TATTTTTGCCTTGGTTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
1 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTGAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
*
212944 TGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
66 TGCAAAAATAAAAAGTCATGCTGTATGGCCA
212975 AAAGTGTTAG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 8, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
113 88 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.08, G:0.18, T:0.42
Consensus pattern (113 bp):
TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTGAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
TGCAAAAATAAAAAGTCATGCTGTATGGCCAGATGATGATATTATTCT
Found at i:213756 original size:220 final size:220
Alignment explanation
Indices: 213357--213759 Score: 598
Period size: 220 Copynumber: 1.8 Consensus size: 220
213347 GATAAAGATG
* * *
213357 ATTTTTGCCTTGATTTCTTTATTTATAAGTTATTTAATGAGATACGAAATTATAGGGACTAAATT
1 ATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATACGAAATTATAGGGACTAAATT
* * * * *
213422 GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACTAAGCCTTGTGAGGGATTTTTTT
66 GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTGTT
* *
213487 TCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAGATGATTTGGTAATTTGATTATGTGTTTTTAATCTGTTTGA
131 TCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAAATGATTTGGTAATTAGATTATGTGTTTTTAATCTGTTTGA
213552 AATTGATAATGATGATATTGTGCTT
196 AATTGATAATGATGATATTGTGCTT
* *
213577 ATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTC-AAATTATAGGGATTAAAT
1 ATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGA-TACGAAATTATAGGGACTAAAT
* *
213641 TAG-AAACATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTG
65 T-GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTG
* * * *
213704 TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCC-AAATGATTTGGTGATTAGATTATATGTGTTTA
129 TTTCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAAATGATTTGGTAATTAGATTATGTGTTTTTA
213760 TGATGTTGTG
Statistics
Matches: 163, Mismatches: 18, Indels: 6
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
218 27 0.17
219 26 0.16
220 107 0.66
221 3 0.02
ACGTcount: A:0.29, C:0.10, G:0.19, T:0.42
Consensus pattern (220 bp):
ATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATACGAAATTATAGGGACTAAATT
GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTGTT
TCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAAATGATTTGGTAATTAGATTATGTGTTTTTAATCTGTTTGA
AATTGATAATGATGATATTGTGCTT
Found at i:214225 original size:694 final size:692
Alignment explanation
Indices: 212863--214235 Score: 1759
Period size: 694 Copynumber: 2.0 Consensus size: 692
212853 GTATGGCCAG
* * * * *
212863 ATGATGATATTATTCTTATTTTTGCCTTGGTTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
1 ATGATGATATTATGCTTATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAA
* *
212928 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTGTTAGACCAAGCC
66 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCAAGCC
* * * * * * *
212993 TTGTAAAGGACTTTTTTTTCCATGATTTTTGGATGATTCTAAGCTGATTTGTTGATTTGATTATG
131 TTGTAAAGGAC-TTTGTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAGATGATTTGGTGATTAGATTATA
213058 TGTTTCTAAGATGTTGTGAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
195 TGTTTCTAAGATGTTGTGAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
*** * *
213123 ACGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTTGAAACATTATTAACTATTGAGGCAAGTTT
260 ACGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACTATTGAGGCAAGTTT
* *
213188 TTCATGCTGATCTGAAATAAAGCTAGATGCATGTTAAGCTGTTTGCATTAGAAAATTCTTGTAAA
325 TTCATGCTGATCTGAAATAAAGCTAGATGCATGTAAAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * *
213253 AGTAGGGGAAATTTTATTGCATCTATTTGCACCACGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTT
390 AGTAGGGGAAATTTTATTGCATCTAATTGCACCACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* *
213318 GGATAGCTTGGTCGAATATGTTTGAAATTGATAAAGATGATTTTTGCCTTGATTTCTTTATTTAT
455 AGATAGCTTGGTCGAATATGTTTGAAATTGATAAAGATGATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
* *
213383 AAGTTATTTAATGAGATACGAAATTATAGGGACTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
520 AAGCTATTTAACGAGATACGAAATTATAGGGACTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
* * *
213448 GCCAAAAGTATTTGACTAAGCCTTGTGAGGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAGA
585 GCCAAAAGTATTTGACTAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGA-TTGT-GA-GGCT-CTAGA
* *
213513 TGATTTGGTAATTTGATTATGTGTTTTTAATCTGTTTGAAATTGATA
646 TGATTTAGTAACTTGATTATGTGTTTTTAATCTGTTTGAAATTGATA
*
213560 ATGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAA
1 ATGATGATATTATGCTTATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAA
* * * *
213625 ATTATAGGGATTAAATTAG-AAACATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGC
66 ATTATAGGGATTAAATT-GCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCAAGC
*
213689 CTTGTAAAGGA-TTTGTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA-ATGATTTGGTGATTAGATTATA
130 CTTGTAAAGGACTTTGTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAGATGATTTGGTGATTAGATTATA
* * * *
213752 TGTGTT-TATGATGTTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTG
195 TGT-TTCTAAGATGTTGTGAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
** * * ** *
213816 GTTGCAAGGTTTGTTCCATGAAACTTT-TTATTTAGCCAAAACATGATCAACTGTTTTGGCATGT
259 GACGCAAAGTTTGTTCCATGAAA-TTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACTATTGAGGCAAGT
* * ** ** *
213880 TTTTCGTGCTGATTTGAAATTGATTTAGATGCATG-AAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGT
323 TTTTCATGCTGATCTGAAATAAAGCTAGATGCATGTAA-AGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGT
* * ** * * * * *
213944 TAAAGTAGGTGATGTTTTGTTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTT-AGTTGCAAATCA
387 AAAAGTAGGGGAAATTTTATTGCATCTAATTGCACCACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
* *
214008 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
452 TTTAGATAGCTTGGTCGAATATGTTTGAAATTGAT-AA-A-G--A---TG---ATTTTTGCCTTG
** * *
214073 ATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTAT-GGAGATTAAATTGTAAAAATGAA
506 ATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATACGAAATTATAGG-GACTAAATTGCAAAAATGAA
*
214137 AAGTCATGCTTTTTGGCCAAAAGTATTTGATCT-AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGA-T-
570 AAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-CTAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGATTG
* *
214199 T-A-G-T-TAGCTGATTTAGTGACTTGATTATGTGTTTTTA
634 TGAGGCTCTAGATGATTTAGTAACTTGATTATGTGTTTTTA
214236 TGACGTTGTA
Statistics
Matches: 583, Mismatches: 76, Indels: 37
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
693 43 0.07
694 248 0.43
695 32 0.05
696 2 0.00
697 127 0.22
698 2 0.00
699 1 0.00
701 3 0.01
702 1 0.00
703 2 0.00
704 120 0.21
705 2 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (692 bp):
ATGATGATATTATGCTTATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAA
ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCAAGCC
TTGTAAAGGACTTTGTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAGATGATTTGGTGATTAGATTATAT
GTTTCTAAGATGTTGTGAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGA
CGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACTATTGAGGCAAGTTTT
TCATGCTGATCTGAAATAAAGCTAGATGCATGTAAAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
GTAGGGGAAATTTTATTGCATCTAATTGCACCACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
GATAGCTTGGTCGAATATGTTTGAAATTGATAAAGATGATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
AGCTATTTAACGAGATACGAAATTATAGGGACTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGG
CCAAAAGTATTTGACTAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGATTGTGAGGCTCTAGATGATT
TAGTAACTTGATTATGTGTTTTTAATCTGTTTGAAATTGATA
Found at i:214958 original size:486 final size:485
Alignment explanation
Indices: 213541--228636 Score: 6585
Period size: 485 Copynumber: 30.9 Consensus size: 485
213531 ATGTGTTTTT
* * * *
213541 AATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* *
213606 TTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAATTAG-AAACATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT-GTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
213670 CAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTGTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA-ATGA
130 CAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
213734 TTTGGTGATTAGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
213799 AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAGGTTTGTTCCATGAAACTTT-TTATTTAGCCAAAACATGAT
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA-TTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
** * * *
213863 CAACTGTTTTGGCATGTTTTTCGTGCTGATTTGAAATTGATTTAGATGCATGA-AGAGGTGTTTG
323 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTG
* * ** ** * *
213927 CATGAGAAAATTCTTGTTAAAGTAGGTGATGTTTTGTTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAAT
387 CAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
213992 TGTT-AGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
452 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* *
214025 AATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * *
214090 CTATTTAACGAGATTTGAAATTAT-GGAGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTTTGGC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGG-GATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * *
214154 CAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGA--T-T--A--GTT---AGCTG
130 CAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTG
* * * * * *
214209 ATTTAGTGACTTGATTATGTGTTTTTATGACGTTGTAATTGATCAGGGTCAAAATCCAAATATGC
194 ATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGTCAAAATGCAAATATGC
*
214274 AAAAATTTAAGGACTCGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* *
214339 AACCATTTTGGCATGTTTTTTTTGCTGATTTGAAATCAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCA
324 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCA
* * *
214404 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTTTTTGTATCATGATGCTGATTTG
389 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
214469 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
454 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
*
214501 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * * *
214566 TTATGTAATGAGATTCGAAATTATAGAGATTAAATTGTAAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATAGC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGT-AAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * * *
214631 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTATGATTTATGGATGGTTTCGAGCTGA
130 CAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
214696 TTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATGTGACTAGGGTGAAAACGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGAT-TGATTAGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
214760 TAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCATAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGGT
259 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * *
214825 -AACCATTTTGGCTTCTTTTTTTTG-TACATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGA-AACGGTGTTT
323 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAA-GGTGTTT
* * * *
214887 GCGAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCAAGATGGTGAA
386 GCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
*
214952 TTGTTGAGTTGCAAATCAGTTAGATAGCTTGGTCG
451 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
** * * * *
214987 AATCTGTTTGAAATTGGCATAGATAATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * *
215052 TTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
215117 AAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTGTTTTCC-TGGATTTGTGG-TTGCTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAT-GATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
215180 TTTAGG-GATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
195 TTT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATG
* * * *
215244 CAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGTT
258 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* ** * *
215309 CAACCATTTTCGCCA-G-TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCACGGTTAGGTGTTTG
323 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTG
* * * *
215372 TAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAAT
387 CAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* * *
215437 TGTTGAGTTGAAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTG
452 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * *
215471 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGACGATATTTTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* *
215536 TTATTTAATGAGATTTGAAATAATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * * *** * *
215601 ATAAGTGTTAGACCAAGGCTTGTGAAGGACATTTTTTCCATGATTTACAGTTGGTTCCAAGTTGA
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
215666 TTTGGTGATTTGATTATGCGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG-GAGGAAATGCAAATAT-
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGTCA--AAATGCAAATATG
*
215729 CTAAAAATTTAAGGACTTGGTAGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
258 C-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * *
215794 TCAACCTTTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGAGTGATGAGGTGTTTG
322 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTG
* * * *
215859 AAAGAAAAAGAAAAAATTCTTGAAAAAATAGGTGAAATTTCATTGTATGTATTTGTA-CACTGAT
387 CAAG----AG--AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCA-TGAT
*
215923 GCTGAATTGTTGAGTTGTAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
445 GCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * * *
215964 AATTTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCGTATTTTTTCCTTGATATCTTGGTTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * **
216029 TTATTTAAAGACATTCAAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * **
216094 AAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTTTGGATGGTTCCAAATTGAT
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
216158 TTGCTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTCTGGGTCAAAATACAAATATGCA
196 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATT-AGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * *
216223 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAGAGTCTGTTCCCTGAAATTT-TTAATTTAGCTGAAACATGATC
260 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATC
* * * *
216287 AACCGTTTTGGC-TAGTTTTTCTTGCT-AGTTTGAAATTAAATTAGATGCGTGATGAGGTGTCTG
324 AACCATTTTGGCAT-GTTTTTCTTGCTGA-TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTG
* * * * *
216350 CAGGGGAATATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAAT
387 CAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* **
216415 TGTTGAGTTGCAAACCATTTAGATTCCTTGGTCG
452 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * *
216449 AATTTGTTTGAAATTAATAAAGTTGA-A--------A----TACCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
*
216501 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
** * * * *
216566 AAAAGTATTTGACTGAGCCTTGTGAGGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
216631 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTAAGATGATGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
216696 AAAAATTTGAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGGTC
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* *
216761 AACCATTTTGGCATGTTTTTTTTTTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
324 AACCATTTTGGCATG---TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTT
* * * *
216826 GCAAG-GGAAATCTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTT-ATTGCATGTATTTGTACCATAATGCTGA
386 GCAAGAGAAAAT-TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGA
* * *
216889 ATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATTGCTTGGT-A
450 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* ** * * * *
216924 AATTTGTTTGAAATTGATATTGACGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACATG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * * *
216989 TTATTCAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTGTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * * * * * * ** *
217054 AGATG-A--TGA--TA----T-T-ATGCATATTTTTCCCTTGGTTTCTTGAT--TTATAAG-TTA
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * ** * * *** * ** **
217105 TTTAATGAGATTTGAAATTATAG-G-GATTA--A-ATTG-CAAAAATAAAAAGTC---ATGC-TT
195 TTT--GGTGATTTG--ATTAT-GTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAT-TAGGGTCAAAATGCAAA
* ** * * * * *
217160 TATGGCCAAAAGTGTT-A-GACCAAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATG--ATTTGTGGATGG
254 TAT-G-CAAAAAT-TTAAGGA-CTTG-GTTGCAAA-G---TTTGTTCCATGAAATTTCT-TAT--
* * ***** ** * * * * *
217221 TT---CTAAGC-TGATTTGTTGA-TTTGATTATGTGTTTT-TAAGATG-TTGGGAA-TGA-TTAG
307 TTAGCCGAAACATGA-TCAACCATTTTG-GCATGT-TTTTCT-TGCTGATTTGAAATTAATTTAG
* * * * * * * * * * *
217277 --GGGTCA-AA-----ATGCAAATATGCAAAA--ATT-TAAGGACTTGGACGCAAAGTTT-GTTC
368 ATGCGTGATAAGGTGTTTGC-AAGA-G-AAAATTCTTGTAA-AAGTAGG-TG-AAA-TTTCATTG
* * * * *** * * **
217330 CATGAAATTTCT-T-AT-TTAGTTGAAACATT-A-TT--AACT-ATTGAGGCA-AG-TTTTTC-
426 CATG-TATTTGTATCATGAT-GCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA-G-ATAGCTTGGTCG
* ** *** * ** * * *
217383 -ATGCTGATCTGAAATAAAGCTAGATGCATGTTAAGC---TGTTTGCATTAGAAAATTCTTGTAA
1 AAT-CTG-TTTGAAATTGATAAAGATG-ATATTGTGCTTATTTTTGCCTT-G--ATTTCTTG---
* ** ** * * * ** * * ***** *
217444 ATGTAGGGGAAATTTTATTGCATCTATTTGCACCACGAT---G-CTGAATTGTTGGGTTGCAAA-
57 ATTTATAGGTTA-TTTAATG-A--GATTTG-A-AATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAG
* * * ** * * * *
217504 TTAT--TTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGA--AA---TTGATAAA-GATGATTTTTGCCTTT
116 TCATGCTT---TA---TGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCTTG-TAAAGGAT--TTTTTTCCATG
* ** ** * ** * *** * * **
217561 ATTTCTTTAT--TTATAAG-TTATTTAATGA---GA-TACGAAATTATA-G-GGATT-AAATTGC
172 ATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATG-TTGTGATTG-
** ** * ** * *
217616 AAAAATG-AAAAGTCATGC-TTTATGGGCAAAAGTATTT---GAC-CGAGCCTTGTAAAGGATTT
235 ATTAGGGTCAAA---ATGCAAATAT--GCAAAA--ATTTAAGGACTTG-G--TTGCAAA-G--TT
* * * * * ***** *
217675 TTTTCCATG--ATTTGTGGATGGTT--CC-AAGC-TAATTTGGGGA-TTT-G-ATTGTGTGTT-T
287 TGTTCCATGAAATTTCT-TAT--TTAGCCGAAACATGA-TCAACCATTTTGGCA-TGT-TTTTCT
** ** * * * * *** * ** *
217730 TAATGATGTTGTGATTGA-TTAG--GGGTCA-AA-ATG--CAAAAAAGAAAA-AATT-TAAAGAC
346 TGCTGAT-TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA-AG
* * * * * *** * *
217786 TTGGTCGCAAAGTTT-GTTCCATGAAATTTCGTAT--TTA-GCTGAA-ACATGA----CCAACCA
409 TAGGT-G-AAA-TTTCATTGCATG-TATTT-GTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC-
* **
217842 ATTTGGCAT-G-TTTTTC-
468 ATTTAG-ATAGCTTGGTCG
* ** * * * * * *
217858 -TTGCTGATTTGAAATT-AGTTTAGATG----TGTGATGAAGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTG-
1 AAT-CTG-TTTGAAATTGA-TAAAGATGATATTGTGCT-TA-TTTTTGCCT-TG--ATTTCTTGA
** * * * * ** ** ** *
217916 TAAAAGTAGGTGATATTT--TGTTGCATGT-AATTGTATCA-TGATGCCGAATTGTTGAGTTGCA
58 T-TTA-TAGGT--TATTTAATG-AG-ATTTGAAAT-TAT-AGGGAT--TAAATTGTAAAAATGAA
* ** * ** * **
217977 AA-TCAT--TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATAAAG--ATGATATTGTGATTAT
113 AAGTCATGCTT---TA---TGG-CCAA-AAG--T--ATTTGACCAAGCCTTG-TAAAG-GA-T-T
* * ** * * ***
218037 TTTTTCCTTGATTTCTGGAT--TTATAAGCT-ATTTAACGAGATTTGAAATTATG-GAGATTA--
162 TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT--GGTGATTTG--ATTATGTGTTTTTATG
* ** * ** ** * * *
218096 A-ATTGCAAAAATGA--AAAGTC---ATGC-TTTTTGGCCAAAAGTATTT---GATCTAGCCTTG
223 ATGTTG--TGATTGATTAGGGTCAAAATGCAAATAT-G-CAAAA--ATTTAAGGA-CTTG-GTTG
* * * * * *** *** *
218151 TAAAGGATTTTTTTCCACG--A----TTAGTTAGCTGATTTAGTGA-C-TGGATTAT-G--TGTT
280 CAAA-G--TTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA-TGATCAACCATTTTGGCATGTT
* * * * * * * * * *
218205 TAT-ATGATG--TTGTAAA-TGA-TTAG--G-GTCA-AA---ATCT-AAACGCGCAAAA--ATT-
341 TTTCTTGCTGATTTG-AAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAA-GAG-AAAATTCTTG
* * * * * ** * * *
218254 TAAGGACTTGGTCGCAAAGTTTGTTCATTACATATATTTGTCCCGTGATGCTGAGTTATTGAGTT
403 TAA-AAGTAGGT-G-AAA---T-TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
*
218319 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCA
461 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * *
218344 AATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* *
218409 TTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAATTAG-AAACATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT-GTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
218473 CAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTGTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA-ATGA
130 CAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
218537 TTTGGTGATTAGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * *
218602 AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAGGTTTGTTCCATGAAACTTCTTATTTAGCCAAAACATGATC
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * *
218667 AACCGTTTTGGCATGTTTTTCGTGCTGATTTGAATTTGATTTAGACGCATGA-AGAGGTGTTTGC
324 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGC
* * ** * *
218731 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGATATTTTGTTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATT
388 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* *
218796 GTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCA
453 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * *
218829 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATCATATTGTGATTATTTTTGCCTTGATTTCTGGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * * *
218894 CTATTTAACGAGATTTGAAATTAT-GGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTTTGGC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGG-GATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * *
218958 CAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGA--T-T--A--GTT---AGCTGA
130 CAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * * * ***
219013 TTTAGTGACTTGATTATGTGTTTATATGATGTTGTAAATGATTAGGGTCAAAAT-CTAAACGCGC
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGTCAAAATGC-AAATATGC
* *
219077 AAAAATTTAAGGACTCGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATC
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* ** * * *
219142 AACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATATGTGTTGAGCTGTTTGCA
324 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCA
* * * * * *
219207 TGAGAAAGTTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTTTTTGTGTCATGATGCTGATTTG
389 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
219272 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
454 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * *
219304 AATCCGTTTGAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTGATTTTTAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * * *
219369 TTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAA-TGATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * **
219433 AAAACTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGC
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * * *
219498 TTGGGGATTTGATTATGTGTTATTATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAAT-TTCT
196 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC-
* *
219562 AAAAATTTAAGGACTTGGTTG--TAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGACGAAACATGATC
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * *
219625 AACCATTTTGGCTTGTTTTCCTTGCTCATTGGAAACTAATTTAGATGCGTGA-AGAGGCGTTTGC
324 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGC
* * * * *
219689 GAGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATCGCATGTATTTGTACCATGATGGTGAATT
388 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* *
219754 GTTGAGTTGCAAATTAGTTAGATAGCTTGGTCG
453 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * * *
219787 AATCTGTTTGAAATTGACATAGATGATATTGTGCGTATTTTTACCTTGATTTCTTCATTTTTAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * *
219852 TTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
219917 AAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
219981 TTAGG-GATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTGTGATTGATCATGGGTCAAAATGCAAATATGC
196 TT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * *
220045 AAAAATTTAAAGATTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTATTTAGCCGAAACATGATC
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * ** * *
220110 AACCATTTTTGCCA-GTTTTTCTTGATGATTTGAAATTAATTTAGATGCACGGTGAGGTGTTTGC
324 AACCA-TTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGC
* ** *
220174 AAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCATATCATGGTGCTGAATT
388 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* *
220239 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTG
453 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * *
220272 AACCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAGAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * * * * *
220337 TTATTTAATGAGAATTGAAATAATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCTTGCCTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * * *
220402 ATAAGTATTAGCCCAAGGCTTGTGAAGGACATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAA
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
*
220467 TTTGGTGATTTGATTATGT-TGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATA
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATG
* * * * * * *
220531 TAAAAATTTAAAGACTTGGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTTATTATTTAGCTGAAAAATGAT
258 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * * *
220596 TAACGATTCTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAAGTTAGATGCATGTTAAGCTGTTTGC
323 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGC
* * * * * * * *
220661 ATGAGAAAAATCTTGTAAAAGTAGGGGAAATTTTATTACATCTATTTGCACCATGATGCTGAATT
388 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* * *
220726 GTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCG
453 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
*
220759 AATCTGTTTGAAATTGAT-AA-A-G--A---TG---ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * *
220813 TTATTTACTGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCT
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * *
220878 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
220943 TTAGG-GATTTAATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAATAT-C
196 TT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
221006 TAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCATAGTTTGTTCGATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
259 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* ** *
221071 CAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCACATTTGAAATTAATTTAGATGCATGA-AGAGGTGTTTG
323 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTG
* * * * *
221135 CGAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATCGCATGTATTTCTACCATGATGGTGAAT
387 CAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
*
221200 TGTTGAGTTGCAAATCAGTTAGATAGCTTGGTCG
452 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* ** * * *
221234 AATCTGTTTGAAATTGACATTGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATATG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
** * *
221299 TTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
221364 AAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGATTTGTAGAT-GTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
221428 TTAGG-GATTTGATTATGCGTGTTTATGCTGTTGTGATTGATCATGGGTCAAAATGCAAATATGC
196 TT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
221492 AAAAATTTAAAGATTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAAATTT-TTATTTAGCCGAAACATGAT
259 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATG-AAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* ** *
221556 CAACCATTTTTGCCA-GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCACGATGAGGTGTTTG
323 CAACCA-TTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTG
* * *
221620 CAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAAT
387 CAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* * *
221685 TGTTGAATTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTG
452 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * * * * ** * * *
221719 AATCTGTTTGAATTTGATATTAGCTGAAACATGAT-C-AACGATTCAGGCATGTTTTTCATGCTG
1 AATCTGTTTGAAATTGATA-AAGATGATA-TTG-TGCTTA--TTTTTGCCTTG-ATTTC-T--TG
* * ** * *
221782 ATTTGA-A-ATTAATTTAGATG-CATGTTGAGCTGTTTGCATGAGA--AAATTCTTGT-AAAA-G
57 ATTT-ATAGGTT-ATTTA-ATGAGAT-TTGAAAT-TAT--A-GGGATTAAA---TTGTAAAAATG
* * * *** * * * ** *** * *
221840 -TAGGTGAAATTTTAT---TACATGTATTTGTACCACGATG-C-TG-AATTG-TTGGGTTGCA-A
111 AAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTG-ACCA--A-GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* * * * * * * * *
221896 ATTATTTGGATAGCTTGGTCGAGTCTG-TTT-G-AAATTGATAAAGATGATTTTTGCCTTGAT-T
172 ATT-TGTGGAT-GGTT--CCAAG-CTGATTTGGTGATTTGATTATG-TG-TTTTT---ATGATGT
* * * ** * * * * * * * *****
221957 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATAAGGTTCGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA-AAATAAAAAG
227 T-GTGATTGATTAG--GGTCAA-AA--TGC-AAA-TAT--GCA-AAAATT-TAAGGACTTGGTTG
* * * ** * **
222021 TC-ATGCTTTATGGCCA--AAA---C-TATTT-GACCGAGCCTTG-T-AACCGATTTTTTTTCCA
280 -CAAAG-TTTGT-TCCATGAAATTTCTTATTTAG-CCGAAACATGATCAACC-A---TTTTGGCA
* * * * * ** ** * * * * ** * **
222076 TG-ATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGGAT--TTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAA
337 TGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTA--GATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGA-G--AAAA
* ** * * **
222138 TTGATTAGGGGTGAAAACGTAAATATCTAAATATTTAGGGACTTGGTTGCATAGTTTGT-TCCAT
397 TT-CTT----GT-AAAA-G----TAGGTGAA-ATTT---CA-TTGCATG--TA-TTTGTAT-CAT
* * * ** ** * * * * **
222202 GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG-ATCAACCATTTTGGCTTG-TTTTTCTTG
442 G--A-TGCTGAATT-GTTG--AGTTGCA--AATCA-TTTAGATAGCTTGGTC--G
* * * ** * * * * * *** * **
222255 -CTCAT-TTGGAAATTAATTTAGATGCGTGA-AGAG---GTGTTTGCGAGAGAAAATTCTTGAAA
1 AATC-TGTTTGAAATTGATAAAGATG-AT-ATTGTGCTTATTTTTGC-CTTG--ATTTCTTGATT
* * * * * * ** ** **
222314 AAGTAGGTGAATTTTCATCGCACGTATTTGTACCATGAT--GG--TGAATTGTTGAGTTGCTAA-
60 TA-TAGGT-TA-TTTAAT-G-A-G-ATTTG-A-AATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAG
* ** * * * * * * *** *
222374 TCA-G--TTA--G---ATAG-CGTGGTCGAA-TCTGTTTGAA--ATTGACATT-GATGATATTGT
116 TCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCT-TGTAAAGGATT-TTTTTCCATGAT-TTGT
** * ** * *
222426 GCGTATTTTTGCC---TTGATTTCTTCATTT-A-TA-G-GTTATTTAAAGA-GATT-TGAAATT-
178 G-G-ATGGTT-CCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTT-TTT-ATGATG-TTGTG--ATTG
* * * * * * * * *
222481 A-TAGGGATTAAATTGTAAATATG--AAAA-GTCATG-CTTGATGGCCAAAGTGTTTGATCAAGC
235 ATTAGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG-CAAA--GTTTGTTC---C
* * * *** **
222541 TTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGATTTGTGGATGTTCC-AAGC-TGATTTAGGGA-TTTGATTAT
293 -ATG--AA--A----TTT-CTT-A-TT-T--A-G--CCGAAACATGA-TCAACCATTTTG-GCAT
* * * * * *
222603 GTGTGTTT-ATGCTG-TTGTG--ATTGA-TT--ATGGGTCA-AA-----ATGCAAATATGAAAA-
338 GT-T-TTTCTTGCTGATT-TGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGC-AAGA-GAAAAT
** * * * * * * * * ***
222654 AATT-TAAAGAGTTGGTTGCCAAGTTT-GTTCCATGAAATTT-T-TTAT-TTAGCCGAA-ACATG
398 TCTTGTAAA-AGTAGG-TG--AAATTTCATTGCATG-TATTTGTATCATGAT-GCTGAATTGTTG
* * * ** **
222713 A--T-C-GACCATTTTTGCCAG-TTTTTC-
457 AGTTGCAAATCA-TTTAGATAGCTTGGTCG
* * ** * * * * *** * *
222737 -TTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCACGA-TGAG---GTGTTTGCAAGAGAAAATTCTT-CT
1 AAT-CTG-TTTGAAATTGATAAAGATG-A-TATTGTGCTTATTTTTGC-CTTG--ATTTCTTGAT
** * * * * * * *
222796 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCG-TATCAGGCT-GCTGAATAATTGAGTTGTAAAT
59 -TTA-TAGGT--TATTT-AATG-A-G-ATTTGAAATTA---TAG-GGATTAA---A-TTGTAAA-
* ** * ** * ** ** * * *
222859 CAT-TTAGGT-A-GCTTGGTTG--AATCTGTTTGAATTTGATAAAG--ATG-ACATTATGCTTAT
107 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA-AAG--T--ATTTGACCAAGCCTTGTA-A--AGGATT-T
* * * * * ** *** **
222916 TTTTGCCTTGATTTCTTGAT--TT--ATAGGTTATTTAATGA---GATT-TGAAATAATA-GA-G
163 TTTT-CCATGATTTGTGGATGGTTCCA-AGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATG
** ** ** * ** * *
222971 ATT-AAATTGCAAAAATG-AAAAGTCATGC-CTTATGGCCATAAGTATTAGACCAAGG-CTTGTG
226 -TTGTGATTG-ATTAGGGTCAAA---ATGCAAATAT-G-CA-AA-AATT----TAAGGACTTG-G
** * * * * * ***** **
223032 GAGGATA-TTTTTTCCATG--ATTTGTGGATGGTT---C-AAAGC-TGATTTGGTGA-TTTGATT
277 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT-TAT--TTAGCCGAAA-CATGA-TCAACCATTTTG-GC
* * ** * * * *
223088 ATGTGTTT-TT-ATGATGTTGCGATTGAA--TAG--GGGTCA-AA-----ATGCAA-ATATATAA
336 ATGTTTTTCTTGCTGAT-TTGAAATT-AATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGA-A-AA
*** * * * * * * * * * * ***
223140 AAATT-TAAGGACTTGGATGCTAAGTTT-GTTCCATGAAATT-TATTAT-TTAGCTGAA-ACCTG
397 TTCTTGTAA-AAGTAGG-TG--AAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGAT-GCTGAATTGTTG
* **
223200 A--T-C-AA-CGATTCTGGCAT-G-TTTTTC-
457 AGTTGCAAATC-ATT-TAG-ATAGCTTGGTCG
* * * ** * * * * * *
223224 -ATGTTGATTTAAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGC---TGTTTGCATGAGAAAATTCTT-ATA
1 AAT-CTG-TTTGAAATTGATAAAGATG-ATATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG--ATTTCTTGAT-
** * * * * * * ** *
223284 AAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGTACCATGAT-GCTGA--ACTGTTGGGTAGCAAAT
59 TTA-TAGGT--TA-TTTAAT-GA-G-ATTTG-A-AATTATAG-GGATTA-AATT--GTA-AAAAT
* *** * * * ** * * *
223346 TATTTG-GATAGC--T-TGGTCGAATCTGTTTGA--AA---TTGATAAA-GATGATTTTTGCCTT
110 GAAAAGTCAT-GCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCTTG-TAAAGGAT--TTTTTTCCAT
* * ** * * * * * ** ***
223401 GATTTCTTGAT--TTATAAG-TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT--TG-TAAA
171 GATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT--GGTGATTTG--ATTAT-GTGTTTTTATGATGTTGTG
* ** ** * ** * *
223460 AATGA--AAAGTC---ATGC-TTTATGGCCAAAA-TTATTTGAC-CGAGCCTTGTAAAGGATTTT
231 ATTGATTAGGGTCAAAATGCAAATAT-GCAAAAATTTA-AGGACTTG-G--TTGCAAA-G--TTT
* * * * * * ***** * ** * *
223517 TTTCCATG--ATTTGTCGATTGT-TCCG-AGC-TAATTTGGGGATTTCGTTATGTGTTT-TT-AT
288 GTTCCATGAAATTTCT-TATT-TAGCCGAAACATGA-TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT
** * * * * *** * * *
223575 GATGTTGTGATTGA-TTAG--GGGCGAAAACGCAAATAT-CTA-A-AAATTTAGGGACTTGGTTG
350 GAT-TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAA-G-GTGTTTGCAAGAGAAAATT-----CTT-G-T-
* * * * * ** * ** **
223634 CATAGTTTGCTCGATGAAATTTCTTATTTAGC-CGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTT
404 AAAAG-TAG---G-TGAAATTTC--A-TT-GCATG-TATTTG-T-ATC-ATGAT-GC-TG-AATT
* * * *
223698 CTTGCTCATTTG-AAATTAATTTAGAT-G-TGTGAAGTGG
453 GTTG---AGTTGCAAA-TCATTTAGATAGCT-TG--GTCG
** * ** * * * * *
223735 TGTTTGCCTGAGAAAATTCTTG-TAAAAGTAGGTGAATTTTCATCGCATGTATTTGTACCATGA-
1 AATCTG--TTTG-AAA---TTGAT-AAAG-A--TG-ATATT-GT-GC-T-TATTTTTGCCTTGAT
** * * * ** **
223798 -TGGTGAATTGT-TGAGGTGCA---AATCAG--TT-AGA-TAGCGTGG-TCGAATCTGTTTAAAA
51 TTCTTG-ATT-TAT-AGGT-TATTTAATGAGATTTGAAATTATAG-GGATTAAAT-TG--TAAAA
* * * * *** * * ** ** *
223853 TTGACATAGATGATACTGTGCGTATTTTTGCCTTGA-TTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAG
108 ATGA-A-A-A-G-T-C-ATGC-T-TTATGGCCAAAAGTAT-TTGA-CCA-AGCCT-TGTAAAG-G
** * * ** * *** * * * ** *
223917 ATTTGAAATTATATGTATTAAATTGTAAAT-ATGAAAAG-TCA--TGCTTGA-TGGACAAAAGTG
159 ATTT----TT-T-TCCA-TGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTG-GTGATTTGA-TTATGTG
* * * **** ** ** *** * * ** *
223977 -TTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTG-TTTTCCTTGACTTGTGGATGTTCCAAGCTGATTTACGG
215 TTTTTATGATG--TTGT----GATTGATTAGGGTCAAAATGCAAAT-ATGCAA--AAATTTAAGG
* * * * * *** * * * *
224040 ATTTGATT---ATGTGTGTT-TATGCTGTTGTCATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT-ATGAAA
271 ACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT-TC-TT-ATT-T-AGCCGAAA--C--ATGAT-CAA
** ** * ** * * ** *
224100 AAATTTAAAG-A-GTTGGTTGCCAAGTTTG-TTCCATGAAATTTTTTATTTAGCCGAAACATGAT
326 CCATTT-TGGCATGTT--TT-TCTTG-CTGATT---TGAAA---TTAATTTA---GATGCGTGAT
*** * ****** * * * ** **
224162 CGACCATTTTTGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATACGCGATAAGGTGTTTGC
377 --AAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT-C----TTG----TAA--AAG-TAGGTGA-AATTTCATTGC
* * ** * * * **
224227 AAGAGAAAATTT-T-TCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCT-GA
427 -A-TG--TATTTGTATC-ATGA-T-GCTG-AA-TT-GTTG-A-GT-TGCAAATCAT--T--TAG-
* * *
224289 ATTG-TTAAGTTGCA
474 ATAGCTT--GGT-CG
* * * ** ** *
224303 AATCATTTAGGTAGTTTGGTTGAATCTGTTTGAATTTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTG
1 AATC-------T-GTTT-G--AAAT-TG-ATAAAGATGATATTG-TG-C--T-T--AT-TTT-TG
* **
224368 CCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATAATAGGGATTAAATTACAAAAA
44 CCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAA
* * * * *
224433 TGAAAAGTCATGCCTTATGGCCATAAGTATTAGACCAAGGCTTGTGAAGGATATTTTTTCCATGA
109 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGA
*
224498 TTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAAT
173 TTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATT
** * *
224563 AGGGGTCAAAATGCAAATATATAAAAATTTAAGGACTTGGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTT
238 A-GGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTT
* * * * * * * *
224628 ATTATTTAGCTGAAACATGATCAACGATTCTGGCAAGTTTTTCATGTTGATTTAAAATTAATTTA
302 CTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTA
* * * * * *
224693 GATGCATGTTGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTA
367 GATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTA
* * * * *
224758 TTTGTA-CAGTGATGCTGAACTGTTGGGTTCCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCG
432 TTTGTATCA-TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* *
224812 AATCTGTTTGAAATTGAT-AA-A-G--A---TG---ATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
*
224866 TTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * *
224931 AAAATTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCAGAT
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
224996 TTAGG-GATATGATTACGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAATAT-C
196 TT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
225059 TAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTGT-TTAGTTAGCCGAAACATGA
259 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT-TCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * *
225123 TCAACCAATTTGGCTTGTTTTTCTTGCTCATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-ATTGGTGTTT
322 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTT
* * * * *
225187 GCAAGAGAAAATTCTTATAAAAGTA-GTGAAATTTCGTTACATGTATTTGTACCATGATGGTGAA
386 GCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
** * * *
225251 TTGTTGAGTTGCAAATCCGTGAGATAACTTTGTCG
451 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * * *
225286 AATCTCTTTGAAATTGACATAGATGATATTCTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * * * *
225351 TTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGTAAAGTCATGCTTGAAGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
225416 AAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGTTTTTTTTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
225480 TTGGGGATTTGATTAAGTGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCA
196 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
225545 AAAATTTAAAGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATCATCA
260 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * *
225610 ACCATTTTCGCCA-ATTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGAGCGATGATGTGTTTGCA
325 ACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCA
* * * * *
225674 AGAAAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTA
389 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
* *
225739 TTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTG
454 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * *
225771 AATCTGTTTGAAATTAACAAAGATGATATTGTGCTTAATTTTT-CCTTGATTTCTTGGTTTATAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTT-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAG
*
225835 GTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
65 GTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
225900 TAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TG
130 CAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTG
* *
225959 A-----T--TCTG--TA----TTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAAGCAAATATG
194 ATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATG
* * * *
226011 CAAACATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGAT
258 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * ** * * *
226076 C-ACGCATTGTGGCATGTTTTTCCTG-TCGATTTGAAATTAATTTAGATGTATGTTGAGCTGTTT
323 CAAC-CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTT
* * * *
226139 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAA
386 GCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
* * * *
226204 TTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTAGTCA
451 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * *
226239 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATTTTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
* * * * * *
226304 TTATTTAATGAGATTTGAAAATATTGGGATTAAATGGCAAAAACGAAAAGTCTTGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * *
226369 AAAACTATTTGACCGAGCCTTATAAAGGATTCTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
*
226434 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * ** *
226499 AAAAATTTAAGGAGC-TGGTTGCAAAGTTTGTTCCGTGAAATTTCGTATTTAGTTGAAATATGAT
259 AAAAATTTAAGGA-CTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
** * * *
226563 CAACCAACTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTGGATGCGTGATGAGGTGTTCGC
323 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGC
* * * * * *
226628 ATGAGAAAATTCTCGTTAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTAAATT
388 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
226693 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
453 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * *
226726 AATCTGTTTCAAATTGATAATGATGATATTGTGGTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
** * * *
226791 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAGAAATGAATAGTCATGCCTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
226856 AAAACTATTTGACCGAGCCCTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGAT
131 AAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
226921 TTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATTCAAATATGCA
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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*
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* * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * *
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** *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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*
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * ** *
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390 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCAT-TGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
228635 TT
454 TT
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Statistics
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Found at i:215678 original size:970 final size:968
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* * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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** * * *
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* ** ** * * * *
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* *
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* * * *
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** *
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* * *
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* * * * *
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* *
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*
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
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* * *
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259 C-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * *
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323 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAA-GGTGTT
*
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386 TGCGAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTG
* ** *
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451 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATA
*
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516 TTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGG
* *
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** *
215145 ATTGTTTTCCTGGATTTGTGGTTGCTCCAAGCTGATTTAGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGCT
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* * *
215210 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCCAAGTTTG
708 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTG
*
215275 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGTTCAACCATTTTCGCCAG-TTTTCTTGCTGATT
773 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCAGTTTTTCTTGCTGATT
** * * * *
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* *
215404 TTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGAAAATCATTTAGGTAGCTTGGT
902 TTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGT
*
215469 TG
967 CG
* * * *
215471 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGACGATATTTTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
*
215536 TTATTTAATGAGATTTGAAATAATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * * ** * *
215601 ATAAGTGTTAGACCAAGGCTTGTGAAGGACATTTTTTCCATGATTTACAGTTGGTTCCAAGTTGA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-ATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGA
* ***
215666 TTTGGTGATTTGATTATGCGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGAGGAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
*
215730 TAAAAATTTAAGGACTTGGTAGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * *
215795 CAACCTTTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGAGTGATGAGGTGTTTGA
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTG-
* * * * * *
215860 AAGAAAAAGAAAAAATTCTTGAAAAAATAGGTGAAATTTCATTGTATGTATTTGTA-CACTGATG
388 -CG----AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATG
* *
215924 CTGAATTGTTGAGTTGTAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAATTGATATAGATG
448 CTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATG
* * * * **
215989 ATATTGTGCGTATTTTTTCCTTGATATCTTGGTTTATAGGTTATTTAAAGACATTCAAAATTATA
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*
216054 GGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAA
578 GGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAA
* ** *
216119 AGGATTTTTTCCACGATTTTTGGATGGTTCCAAATTGATTT-GCTGATTAGATTATGTGTGTTTA
643 AGGATTTTTTCCACGA-TTTTGG-TTG-TCCAAGCTGATTTAG-TGATTTGATTATGTGTGTTTA
* *
216183 TGATGTTGTGATTGATTCTGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG-CAGA
704 TGCTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCA-A
* * * * *
216247 GTCTGTTCCCTGAAATTT-TTAATTTAGCTGAAACATGATCAACCGTTTTGGCTAGTTTTTCTTG
768 GTTTGTTCCATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCAGTTTTTCTTG
* * * * * *
216311 CT-AGTTTGAAATTAAATTAGATGCGTGATGAGGTGTCTGCAGGGGAATATTCTTGTAAAAGTAG
831 CTGA-TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAG
* *
216375 GTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAACCATTTAGATT
895 GTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATA
*
216440 CCTTGGTCG
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* * * * *
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216566 AAAAGTATTTGACTGAGCCTTGTGAGGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGCTCCTAGCTGA
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* *
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* *
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* *
216761 AACCATTTTGGCATGTTTTTTTTTTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
325 AACCATTTTGGCATG---TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTT
* * * *
216826 GCAAG-GGAAATCTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTT-ATTGCATGTATTTGTACCATA-ATGCTG
387 GCGAGAGAAAAT-TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTG
* * * * * *
216888 AATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATTGCTTGGT-AAATTTGTTTGAAATTGATATTGACGATA
451 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATA
* * *
216952 TTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACATGTTATTCAAAGAGATTTGAAATTATAGGG
516 TTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGG
* * * *
217017 ATTAAGTTGTAAAAATGAAAAGTCATGC-TGTATGGCCAGATG-A--TGAT--A----T-T-ATG
581 ATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTG-ATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAG
* * * ** * *
217070 CATATTTTTCC-C----TTGGTT-T-C---TTGATTTA-T-A--AG-TTAT-T-TAATGA-GAT-
645 GAT-TTTTTCCACGATTTTGGTTGTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTG
** * * * * * * * ** *
217116 TTGAAATT-A-TA-GGGATTAAATTGCAAAAAT--AAAAA-GTCATG-CTTTATGGCCAAAAGTG
709 TTGTGATTGATTATGGG-TCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCC--AAGT-
* *** ** * ** ** *** * * * **
217174 TTAG-ACCAAGCCTTGTAAAGGACTT-TTTTTCC-ATGATTTG-TGGATGGTTCT--AAGCTGAT
770 TT-GTTCC-A----TG-AAATTTCTTATTTAGCCGA-AACATGATCAACCATTTTGCCAGTTTTT
* * ** * * * * *
217233 -TTGTTGATTTGATTATGTGTTTTTAAGATGTTGGGAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
827 CTTGCTGATTTGA-AAT-T-AATTT-AGA---TGCG--TGATAAGGTGT----TTGC-AAGA-G-
* * * * * * * * * * * *
217297 AAAA--ATT-TAAGGACTTGGACGCAAAGTTT-GTTCCATGAAATTTCTTAT-TTAGT--TGAAA
876 AAAATTCTTGTAA-AAGTAGG-TG-AAA-TTTCATTGCATG-TA-TTCGTATCATGGTGCTGAAT
** * * **
217355 CATT-A-TT--AACT-ATTGAGGCA-AG-TTTTTC-
935 TGTTGAGTTGCAAATCATTTA-G-ATAGCTTGGTCG
* * * * ***
217383 -ATGCTGATCTG--AA--ATAAAGCT-AGA---TGC--ATGTTAAGC-TG-TTTGCATTAGA---
1 AAT-CTG-TTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTT-C-TT-GATTT
* ** * * * * ** **
217432 A-AA-TTCTTGTAAATGTAG--GGGAAATTTTATTGCATCT-ATTTGCACCACGATGCTGAA-T-
61 ATAAGTTATT-T-AATG-AGATTTGAAATTATA-GGGAT-TAAATTGCA--AAAATG-AAAAGTC
** * * * * * * *
217490 -TG-TTGGGTTG-C-AAATTATTTGGA--TAG-CTTGGT---CGAATCTGTTT-GA-AATTGATA
118 ATGCTT-TATGGCCAAAAGTATTT-GACCGAGCCTT-GTAAAGGAAT-TTTTTCCATGATT--TA
** * *** * ** * * * * **
217543 AAGATGATT-TTTGCCTTTATTTCTTTATTT-A-TAAGT-TATTTAATGA-GATACGAAATT-A-
177 TGGATGGTTCCAAG-C-TGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTTATGATG-T-TGTGATTGAT
* * * * * * * ** * *
217601 TAGGGATTAAATTGCAAAAATG--AAAA-GTCATG-CTTTATGGGCAAAAGTATT-TGACCGAGC
237 TAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT-TGC-AAAGT-TTGT-TCC-A--
* *** * * * * *
217661 CTTGTAAAGGATT-TT-TTT--CCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTGGGGAT-TTGAT
295 --TG-AAA--TTTCTTATTTAGCC--GA----AACAT-GAT-CAA-C-CATTTTGGCATGTT-TT
* * * ** * * * * * **
217721 T-GTG-TG-TTT-TAA-TGATGTT-G-TGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAAAAGAAAA-AAT
344 TCTTGCTGATTTGAAATTAAT-TTAGATGCGTGATAAGGTGT----TTGC--GAGAGAAAATTCT
* * * * * *** ***
217778 T-TAAAGACTTGGTCGCAAAGTTT-GTTCCATGAAATTTCGT---ATTTA-GCTGAA-ACATGA-
402 TGTAAA-AGTAGGT-G-AAA-TTTCATTGCATG-TATTT-GTACCACAGATGCTGAATTGTTGAG
* * * ** * *
217835 ---CCAACCAATTTGGCAT-G-TTTTTC--TTGCTGATTTGAAATT-AGTTTAGATG----TGTG
461 TTGCAAATC-ATTTAG-ATAGCTTGGTCGAAT-CTG-TTTGAAATTGA-TATAGATGATATTGTG
* * * * * * ** * * * *
217888 ATGAAGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTG-TAAAAGTAGGTGATATTT--TGTTGCATGT-AATTG
521 -CGTA-TTTTTGCCT-TG--ATTTCTTGAT-TTA-TAGGT--TATTTAAAG-AG-ATTTGAAAT-
* ** ** ** * * * * * * ** *
217949 TATCA-TGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAA-TCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTG---
574 TAT-AGGGAT--TAAATTGTAAAAATGAAAAGTCA--T-GCTTG-ATGGCCAAAAGTATTTGATC
* * * * *
218009 AAG--TTGATAAAGATGATATTGT----GATTATT--TTTTCC---TTGATTT-CTGGATTT-A-
632 AAGCCTTG-TAAAG--GATTTTTTCCACGATT-TTGGTTGTCCAAGCTGATTTAGT-GATTTGAT
* * * * * * * * * * * *
218060 TAAG-CTATTTA-ACGAGATT-TGA--AATTATGGAGATTAAATTGCAAAAATG--AAAA-GTCA
692 TATGTGTGTTTATGC-TG-TTGTGATTGATTATGG-G-TCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAA
* * * * *
218117 TG-CTT-TTTGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGATT-TT-TTT--CC---ACGATT
753 GGACTTGGTT-GCC--AAG--TTTG-T-T--CCATG-AAA--TTTCTTATTTAGCCGAAAC-ATG
* * * ** ** * *
218173 AGTTAGCTGATTTAGTGACTGGATTATGTGT-TTATATGATGTTGTAAA-TGA-TTAG--G-GTC
805 A-TCAAC-CATTT--TG-CCAG-TT-T-T-TCTT-GCTGAT-TTG-AAATTAATTTAGATGCGTG
* * * * * * * * * *
218232 A-AA---ATCT-AAACGCGCAAAA--ATT-TAAGGACTTGGTCGCAAAGTTTGTTCATTACATAT
858 ATAAGGTGTTTGCAA-GAG-AAAATTCTTGTAA-AAGTAGGT-G-AAA---T-TTCATTGCATGT
* ** * * * * *
218289 ATTTGTCCCGTGATGCTGAGTTATTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCA
914 ATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * *
218344 AATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCCTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* *
218409 TTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAATTAG-AAACATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT-GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * *
218473 CAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGG-ATTTGTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA-ATG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTT-TTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTG
* * * * *
218536 ATTTGGTGATTAGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
194 ATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * * *
218601 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAGGTTTGTTCCATGAAACTTCTTATTTAGCCAAAACATGAT
259 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * *
218666 CAACCGTTTTGGCATGTTTTTCGTGCTGATTTGAATTTGATTTAGACGCATGA-AGAGGTGTTTG
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTG
* ** * * * *
218730 C-ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGATATTTTGTTGCATGTAATTGTATCA-TGATGCCGA
388 CGA-GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGA
* * * *
218793 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATCATAT
452 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATAT
** * * * *
218858 TGTGATTATTTTTGCCTTGATTTCTGGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTAT-GGAG
517 TGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGG-G
* ** *
218922 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTTTGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGG
581 ATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGG
* * *
218987 ATTTTTTTCCACGA--TTAG-T-T---AGCTGATTTAGTGACTTGATTATGTGT-TTATATGATG
646 A-TTTTTTCCACGATTTTGGTTGTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTT-TATGCTG
* * *** * *
219044 TTGTAAATGATTA-GGGTCAAAAT-CTAAACGCGCAAAAATTTAAGGACTCGGTTGCAAAGTTTG
709 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATAC-AAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTG
*
219107 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTAG-CATGTTTTTCTTGCTGAT
773 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCA-GTTTTTCTTGCTGAT
** * * * * *
219171 TTGAAATTAATTTAGATATGTGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAGTTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
836 TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
219236 TTTCGTTGCATGTTTTTGTGTCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
901 TTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
219301 TCG
966 TCG
* * * * * *
219304 AATCCGTTTGAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTGATTTTTAAG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * *
219369 TTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAA-TGATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * **
219433 AAAACTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGC
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * * *
219498 TTGGGGATTTGATTATGTGTTATTATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAAT-TTCT
196 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-
* *
219562 AAAAATTTAAGGACTTGGTTG--TAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGACGAAACATGATC
260 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * *
219625 AACCATTTTGGCTTGTTTTCCTTGCTCATTGGAAACTAATTTAGATGCGTGA-AGAGGCGTTTGC
325 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGC
* * * *
219689 GAGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATCGCATGTATTTGTACCA-TGATGGTGAAT
389 GAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGAAT
* * *
219753 TGTTGAGTTGCAAATTAGTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGACATAGATGATATTG
454 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTG
* * *
219818 TGCGTATTTTTACCTTGATTTCTTCATTTTTAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATT
519 TGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* *
219883 AAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATT
584 AAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATT
** * *
219948 GTTTTCCTTGATTTGTGGATGTTCCAAGCTGATTTAGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTT
649 -TTTTCCACGATTT-TGGTTG-TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTT
* * * *
220013 GTGATTGATCATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCCAAGTTTGTTC
711 GTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTGTTC
* *
220078 CATGAAATTTTTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTTGCCAGTTTTTCTTGATGATTTGA
776 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCA-TTTTGCCAGTTTTTCTTGCTGATTTGA
** * * *
220143 AATTAATTTAGATGCACGGTGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTC
840 AATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
* * *
220208 ATTGCATGTATTCATATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTG
905 ATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * * *
220272 AACCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAGAGG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * *
220337 TTATTTAATGAGAATTGAAATAATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCTTGCCTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * * * *
220402 ATAAGTATTAGCCCAAGGCTTGTGAAGGACATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-ATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGA
*
220467 TTTGGTGATTTGATTATGT-TGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATA
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * * * * * *
220531 TAAAAATTTAAAGACTTGGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTTATTATTTAGCTGAAAAATGAT
259 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * * *
220596 TAACGATTCTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAAGTTAGATGCATGTTAAGCTGTTTGC
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGC
* * * * * * *
220661 -ATGAGAAAAATCTTGTAAAAGTAGGGGAAATTTTATTACATCTATTTGCACCA-TGATGCTGAA
389 GA-GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGAA
* * *
220724 TTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-A-A-G--A--
453 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATT
* **
220782 -T--G-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTACTGAGATTTGAAATTATAGGGAT
518 GTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * *
220843 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAT
583 TAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-
* * * * * * * *
220908 TTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGATTTAGGGATTTAATTATGTGTTTTTATGATG
647 TTTTTTCCACGATTT-TGG-TTG-TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTG
* * * * ** *
220973 TTGTAATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGGTTG-CATAGTTT
709 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCA-AGTTT
* ** **
221036 GTTCGATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCACAT
772 GTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCAGTTTTTCTTGCTGAT
* *
221101 TTGAAATTAATTTAGATGCATGA-AGAGGTGTTTGCGAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
836 TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * *
221165 ATTTCATCGCATGTATTTC-TACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAGTTAGATAGCTT
900 ATTTCATTGCATGTA-TTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
221229 GGTCG
964 GGTCG
* * ** * * * *
221234 AATCTGTTTGAAATTGACATTGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATATG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
** * * *
221299 TTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * *
221364 AAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGG-ATTGTTTTCCTTGATTTGTAGAT-GTTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATT-TTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * * *
221427 TTTAGG-GATTTGATTATGCGTGTTTATGCTGTTGTGATTGATCATGGGTCAAAATGCAAATATG
195 TTT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * *
221491 CAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAAATTT-TTATTTAGCCGAAACATGA
259 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATG-AAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* ** *
221555 TCAACCATTTTTGCCA-GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCACGATGAGGTGTTT
323 TCAACCA-TTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTT
* * * * * *
221619 GCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCA-TGGTGCTGA
387 GCGAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGA
* * * * * *
221683 ATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAATTTGATATTAGCTGAAA
452 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-TAGATGATA
* * ** * * * *
221748 CATGATCAACG-A-TTCAGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGA-A-ATTAATTT--AGATGCATGT
516 -TTG-T--GCGTATTTTTGCCTTG-ATTTC-T--TGATTT-ATAGGTT-ATTTAAAGA-G-AT-T
** * * ** * * * *
221807 TGAGCTGTTTGCATGAGA--AAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGTAC
568 TGAAAT-TAT--A-GGGATTAAA---TTGTAAAA--A--TGAAAAGTCA-TGCTTG-A--TG-GC
* * * * ** * ** *** *
221870 CACGATGCTGAATTG-T--TGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAGTCTGTTTGAAATT
617 CA-AAAG-T-ATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTT---T---TTCCACGA---T-TTTG--GTT
* * * ** * ** * * * *
221932 GAT-AAAGATGATTT-TTGCCTTGATT-TCT-TGATTTAT-AAG-T-T-ATTTAATAAGGTTCGA
667 G-TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTG-TTTATGCTGTTGTGATTGATTATGGGTC-A
* ** * * * * * *
221989 AATTATAGGGATTAA-ATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTT------TATG-GCCA--AAA---C
729 AA--ATA--CA--AATA-TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTC
** * * * * * * * ** ** *
222041 -TATTT-GACCGAGCCTTG-T-AACCGATTTTTTTTCCA-TGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
787 TTATTTAG-CCGAAACATGATCAACC-A---TTTTGCCAGT-TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * * ** * ** * * *
222101 TTTAGGGAT--TTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTGAAA--ACGT-AAA
846 TTTA--GATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGA-G--AAAATT-CTT----GTAAAAGTAGGTGAAA
* ** * * * * * * * * ** *
222161 TATC--TAAATAT-TTAGGGA-CTTGGT--TGCATAGTT-TGTTCCATGAA--ATTT-CTTA-TT
901 TTTCATTGCATGTATT-CGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCA--AATCATTTAGATAGCT
* *
222215 TAGCCG
963 TGGTCG
* * * * *** * * * * * ***** * ** ** *
222221 AAACATG-ATCAACCAT--TTTGGCTTGTTTTTCTTGCTCATTTGGAAATTAATTTAGATGCGTG
1 AATC-TGTTTGAA-AATGATAAAG-ATGATATT-GTGCTTATTTTTCCCTTGATTT-CTTGATTT
* * * * ** * * **
222283 A-AGAGGTGTTTGCGAGA-GAAAATTCTTGAAA-AAGTAGGTGAATTTTCATCGCACGTATTTGT
61 ATA-AGTTATTT---A-ATG-AGA-T-TTGAAATTA-TAGG-G-A-TTAAATTGCA--AAAATG-
* * * * * * ** * * * ** *
222345 ACCATGATGGTGAATTG-TTGAGTTGCTAATCAGTTAGAT-AGCGTGGTCGAATCTGT-TTGAAA
111 A--A--A-AGT-CA-TGCTTTA-TGGCCAA-AAG-TATTTGACCG-AG-C--CT-TGTAAAGGAA
** * * ** * ** *
222407 TTGACATT-GATGATATTGTGCGTATTTTTGCC---TTGATTTCTTCATTT-A-TA-G-GTTATT
161 TT--TTTTCCATGAT-TTATG-G-ATGGTT-CCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTT-TT
* * * * * * * * * *
222464 TAAAGA-GATT-TGAAATT-A-TAGGGATTAAATTGTAAATATG--AAAA-GTCATG-CTTGATG
219 T-ATGATG-TTGTG--ATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTT
* * *
222521 GCCAAAGTGTTTGATCAAGCTTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGATTTGTGGATGTTCC-AAGC-T
280 G-CAAA--GTTTGTTC---C-ATG--AA--A----TTT-CTT-A-TT-T--A-G--CCGAAACAT
* *** ** * * * * * *
222584 GATTTAGGGA-TTTGATTATGTGTGTTT-ATGCTG-TTGTG--ATTGA-TT--ATGGGTCAAAAT
321 GA-TCAACCATTTTG-GCATGT-T-TTTCTTGCTGATT-TGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAG
**** ** * * * * * **
222641 GCAAATATGA-A-AAAA---TT-TAAAGAGTTGGTTGCCAAGTTT-GTTCCATGAAATTT-T-TT
381 GTGTTTGCGAGAGAAAATTCTTGTAAA-AGTAGG-TG--AAATTTCATTGCATG-TATTTGTACC
*** * *** * * * ** ** *
222697 ATTTA-GCCGAA-ACATGA--T-C-GACCATTTTTGCCAG-TTTTTC--TTGCTGATTTGAAATT
441 ACAGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA-TTTAGATAGCTTGGTCGAAT-CTG-TTTGAAATT
* * * * * *** * * ** *
222753 AATTTAGATGCACGA-TGAG-G--TGTTTGCAAGAGAAAATTCTT-CTAAAAGTAGGTGAAATTT
503 GATATAGATG-A-TATTGTGCGTATTTTTGC-CTTG--ATTTCTTGAT-TTA-TAGGT--TATTT
** * * * * * * ** *
222813 CATTGCATGTATTCG-TATCAGGCT-GCTGAATAATTGAGTTGTAAATCAT-TTAGGT-A-GCTT
559 -AAAG-A-G-ATTTGAAATTA---TAG-GGATTAA---A-TTGTAAA-AATGAAAAGTCATGCTT
* * ** * * * * **
222873 GGTTG--AATCTGTTTGAATTTGATAAAG--ATG-ACATTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTT
611 GATGGCCAA-AAG--T--ATTTGATCAAGCCTTGTA-A--A-G--GATTTTTTCCACGA-TT-TT
* * * * * * ** **
222933 GATT-T--ATAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATAATAGAGAT-TAAATTGCAAAAATGAAAAGT
663 GGTTGTCCA-AGCTGATTT-A-GTGATTTG--ATTAT-GTG-TGTTTA-TGC-----TG--TTGT
* * * * ** * * *** * ** * *
222994 CA-TGCCTTAT-GGCCATAAGTA-TTAGA-CCAAGGCTTGTGGAGGA-TATTTTTTCCATGATTT
713 GATTG-ATTATGGGTCA-AAATACAAATATGCAAAAATT-T-AAGGACT-TGGTTGCCAAG-TTT
** * * ** ** * ** ** * * *
223054 G-TGGATGGTTCAAA--GCTGATTT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGA-TTGA
772 GTTCCAT-G---AAATTTCTTATTTAGCCGA----A--ACATG-ATCAACCATTTTGCCAGTT-T
* *** * * ** * * * *
223114 ATAGGGGTCAAAATGCAAATATATAAAAATTTAAGGACTTG-GATGCTAA-GT-TTGTTCCA-TG
825 TTCTTGCT-GATTTG--AA-AT-T---AATTT-A-GA--TGCG-TGATAAGGTGTT-TGCAAGAG
** * ** * * ** ** **
223175 -AAATT-TAT-T--ATTTAGCTGAAACCTGA-T-CAACG-ATTC-TGGCAT-GTTTTTCA-TGTT
876 AAAATTCT-TGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGC-ATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTT
** * * *
223229 GA-TTTAAAATTAATTTAGAT-GCAT-GTTG
939 GAGTTGCAAA-TCATTTAGATAGCTTGGTCG
* * * * * * * *
223257 -AGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGTACCAT
1 AATCTG-TT---T--GAAAA---TGAT-AAAG-A--TG--ATATT-GTGC-T-TATTTTTCCCTT
* * * *
223321 GA-TGC-TGAACTGTTGGGTAGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
48 GATTTCTTG-A---TT---TA-TAAGTTATTT--A-A---T-G-AG-A----TTTGAAATT-ATA
** * ** **** * * *
223384 AAGATGATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGG-GA
91 GGGATTA-AATTG-C---A-AAAATGA---A-AAGTCA--T-----G--CT----TTAT-GGCCA
** ** * * * * * * *
223448 TTAAATTGTAAAAATGA-AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAATTATTTGACCGA-GCCTTGTAAAG
132 --AAA--GT--ATTTGACCGAGCCTTG--TAAAGG----AATT-TTT-TCC-ATG-ATT-T-ATG
** * * *
223511 GATTTTTTTCC-A--TGATTT-GTCGATTGTTCCGAGCTAATTTGGGGATTTCGTTATG-TGTTT
179 GA--TGGTTCCAAGCTGATTTGGT-GA-T-TT--GA--T--TAT-GTG-TTT--TTATGATGTTG
* * ** * *** * * * ** *
223571 TTA-TGATGTTGTGATTGATTAGGGGCGAAA-ACGCAAATATCTAAAAATTTAGGGACTTGGTTG
229 TGATTGAT-TAG-GGGTCA--AAATGC-AAATATGCAAAAATTTAAGGACTT--------GGTTG
* * * * *
223634 CATAGTTTGCTCGATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTC
281 CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTC
* * * **
223699 TTGCTCATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGA-AGTGGTGTTTGCCTGAGAAAATTCTTGTAAAAG
346 TTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGCGAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
* * * * * *
223763 TAGGTGAATTTTCATCGCATGTATTTGTACCA-TGATGGTGAATTGTTGAGGTGCAAATCAGTTA
410 TAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* * * *
223827 GATAGCGTGGTCGAATCTGTTTAAAATTGACATAGATGATACTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTT
475 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTT
* * * *
223892 CTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATATGTATTAAATTGTAAATATGAAAAGTC
540 CTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTC
* * ** * *
223957 ATGCTTGATGGACAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGACTTGTGGATG
605 ATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTCCACGA-TTTTGGTTG
*
224022 TTCCAAGCTGATTTACG-GATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTGTCATTGATTATGGGTCAAA
668 -TCCAAGCTGATTTA-GTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAA
* * * * *
224086 ATGCAAATATGAAAAAATTTAAAGAGTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTATTTAGC
731 ATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * *
224151 CGAAACATGATCGACCATTTTTGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATACGCGAT
796 CGAAACATGATCAACCA-TTTTGCCAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* *
224216 AAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTTTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCAT
860 AAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCAT
* * * *
224281 GGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATCATTTAGGTAGTTTGGTTG
925 GGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
** * * *
224325 AATCTGTTTGAATTTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * *
224390 TTATTTAATGAGATTTGAAATAATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * *
224455 ATAAGTATTAGACCAAGGCTTGTGAAGGATATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-ATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGA
* **
224520 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAATAGGGGTCAAAATGCAAATATAT
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * *
224585 AAAAATTTAAGGACTTGGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTTATTATTTAGCTGAAACATGATC
260 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * * * * *
224650 AACGATTCTGGCAAGTTTTTCATGTTGATTTAAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGGTGTTTGC-
325 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCG
* * ** *
224714 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGTA-CAGTGATGCTGAAC
390 A-GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGAAT
* * * *
224778 TGTTGGGTTCCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-A-A-G--A---
454 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTG
* *
224835 T--G-ATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATA-AGATTTGAAATTATAGGGAT
519 TGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * *
224896 TAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAATTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAT
583 TAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-
* * * * * * * *
224961 TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCAGATTTAGGGATATGATTACGTGTTTTTATGATG
647 TTTTTTCCACGATTT-TGG-TTG-TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTG
* * * ** * *
225026 TTGTGATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCAAAGTTTG
709 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTG
* * ** *
225090 TTCCATGAAATTGT-TTAGTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCTTGTTTTTCTTGCTCAT
773 TTCCATGAAATT-TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACC-ATTTTGCCAGTTTTTCTTGCTGAT
* *
225154 TTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-ATTGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATAAAAGTA-GTGAA
836 TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * * ** * * *
225217 ATTTCGTTACATGTATTTGTACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCAAATCCGTGAGATAACTTT
900 ATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
225282 GTCG
965 GTCG
* * * * * * * * *
225286 AATCTCTTTGAAATTGACATAGATGATATTCTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * *
225351 TTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGTAAAGTCATGCTTGAAGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * ** * *
225416 AAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGTTTTTTTTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
225480 TTGGGGATTTGATTAAGTGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCA
196 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
225545 AAAATTTAAAGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATCATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * * *
225610 ACCATTTTCGCCA-ATTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGAGCGATGATGTGTTTGCA
326 ACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCG
* * * * * *
225674 AGAAAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCA-TGGTGCTGAATT
390 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGAATT
* * * * * *
225738 ATTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTAACAAAGATGATATTGT
455 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGT
* * *
225803 GCTTAATTTTT-CCTTGATTTCTTGGTTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT
520 GCGT-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* * * * *
225867 AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGACT
584 AAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--
* * * * *
225932 TTTTTTCCATGA---T--TTGT----G--GA--T-G-G-TTTGATTCTGTATTTTTATGATGTTG
647 TTTTTTCCACGATTTTGGTTGTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTG
* * * * *
225981 TGATTGATTAGGGGTCAAAA-AGCAAATATGCAAACATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTC
712 TGATTGATTATGGGTCAAAATA-CAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTGTTC
* * * *
226045 CATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATC-ACGCATTGTGGCATGTTTTTCCTG-TCGATTT
776 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC-CATTTTGCCA-GTTTTTCTTGCT-GATTT
** * * * *
226108 GAAATTAATTTAGATGTATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATT
838 GAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATT
* * * * * * * *
226173 TTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTAGTC
903 TCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTC
*
226238 A
968 G
* * * *
226239 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATTTTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * *
226304 TTATTTAATGAGATTTGAAAATATTGGGATTAAATGGCAAAAACGAAAAGTCTTGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
226369 AAAACTATTTGACCGAGCCTTATAAAGGATTCTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAAT-TTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGA
*
226434 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
195 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * ** *
226499 AAAAATTTAAGGAGC-TGGTTGCAAAGTTTGTTCCGTGAAATTTCGTATTTAGTTGAAATATGAT
260 AAAAATTTAAGGA-CTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
** * * *
226563 CAACCAACTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTGGATGCGTGATGAGGTGTTCGC
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGC
* * ** *
226628 -ATGAGAAAATTCTCGTTAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACC-GTGATGCTAAA
389 GA-GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGAA
*
226691 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTCAAATTGATA-ATGATGATAT
453 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA-GATGATAT
*
226755 TGTG-GTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGG
517 TGTGCG-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGG
** * * * * * *
226819 ATTAAATTACAGAAATGAATAGTCATGCCTT-ATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCCTGTAAAG
581 ATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATG-CTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAG
* * * * * *
226883 GATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTACG
645 GA-TTTTTTCCACGATTT-TGG-TTG-TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATG
* * * *
226948 ATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATTCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTT
706 CTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTT
* * * * * * *
227013 TTTTTCACGAAATTTCTTATTCAACCGAAACTTGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA
771 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGCCA-GTTTTTCTTGCTGA
* * * * * *
227078 TTAGAAATTAATTTAGATGCATTAAAAGGTGTTTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
835 TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * *
227143 ATATCGTTACATGTAATT-GTATCATGATG-TCGAATTGTTGAGTTGAAAATCATTTAGATAGCT
900 ATTTCATTGCATGT-ATTCGTATCATGGTGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCT
227206 TGGTCG
963 TGGTCG
* * **
227212 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTTTTTTTGGCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * ** * *
227277 CTATTAAACAAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCT
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * *
227342 AAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAGGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * * * *
227407 ATAGTGATTTGATTATGTATTTTTGTGATGTTGTAATTGATTAGGTGTCAAAATCCAAATATGCA
196 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * *
227472 ATAATTTAAGGACTTGGTTTCAATGTTTATTCCATGAAATTTCCTT-TTTAGCGGAAACATGATC
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTT-CTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * *
227536 AACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
325 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCG
* * * * * *
227601 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGCTAAAATTTCATT-CGATGTATTTGTATCA-TGATGCTGATT
390 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGC-ATGTATTTGTACCACAGATGCTGAAT
* * * *
227664 TGTTGAGTTGTAAATCATTTAGATAGCTTCGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATACTG
454 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTG
* * * * * *
227729 TGCTTATTTATGCCTTGATTTCATGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATT
519 TGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* * * * ** *
227794 AAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTG-GCCGGCCCTGTAAAGGATT
584 AAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-T
* * ** * *
227858 TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTTTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGT
648 TTTTTCCACGATTT-TGG-TTG-TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGT
* * * * *
227923 TGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAACAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGT
710 TGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTGT
* * ** * * *
227987 TCCATGAAATTTCTTTTTTAGCCGAAACCTGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTACTTATTG
774 TCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GCCAGTTTTTCTTGCTGATTT
* * * * * * *
228052 GAAAGTATTTTTGATGTGTGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGAAATT
838 GAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATT
* * * * * *
228117 TCATTACATATATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGGAAATCATTTAGATAGCTTGGTC
903 TCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTC
228182 G
968 G
* * *
228183 AATTTGTTTGAAAATGATATAGATGATATTGTGCTTTTTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
228248 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
228313 AAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTTAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
228377 TTGG-GATTTGACTATCTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAAGCAAATATGCA
196 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * *
228441 AAAATTTAAGGGCTTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGATATTTGTTATTTAGCCAAAACATGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * ** * *
228506 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATAACGAGATGTTTGCAA
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCGA
*
228571 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAGTTTC
391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
228603 TCTCCAAGTA
Statistics
Matches: 10821, Mismatches: 2241, Indels: 2071
0.72 0.15 0.14
Matches are distributed among these distances:
922 5 0.00
923 4 0.00
924 12 0.00
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1112 9 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.21, T:0.39
Consensus pattern (968 bp):
AATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGAT
TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCGA
GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCACAGATGCTGAATTG
TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG
CGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
ATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTT
TTCCACGATTTTGGTTGTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTGTGAT
TGATTATGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGA
AATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGCCAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
TTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCA
TGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
Found at i:217151 original size:113 final size:113
Alignment explanation
Indices: 216948--217167 Score: 332
Period size: 113 Copynumber: 1.9 Consensus size: 113
216938 TGATATTGAC
* * * *
216948 GATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACATGTTATTCAAAGAGATTTGAAATTAT
1 GATATTATGCATATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTCAAAGAGATTTGAAATTAT
* * *
217013 AGGGATTAAGTTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTGTATGGCCAGATGAT
66 AGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTGTATGGCCAGATGAT
* * * *
217061 GATATTATGCATATTTTTCCCTTGGTTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTAT
1 GATATTATGCATATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTCAAAGAGATTTGAAATTAT
*
217126 AGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
66 AGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTGTATGGCCA
217168 AAAGTGTTAG
Statistics
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0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
113 95 1.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.09, G:0.19, T:0.40
Consensus pattern (113 bp):
GATATTATGCATATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTCAAAGAGATTTGAAATTAT
AGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTGTATGGCCAGATGAT
Found at i:217992 original size:475 final size:481
Alignment explanation
Indices: 217072--218172 Score: 1477
Period size: 475 Copynumber: 2.3 Consensus size: 481
217062 ATATTATGCA
* *
217072 TATTTTTCCCTTGGTTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
1 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* * *
217137 TGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTGTTAGACCAAGCCTTGTAAAGGACTTTTT
66 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTT
* * **
217202 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAGCTGATTTGTTGATTTGATTATGTGTTTTTAAGATGTTGG
130 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTAAGATGTTGG
* * * *
217267 GAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGACGCAAAGTTTGTTCCA
195 GAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAAAAAGAAAAAATTTAAAGACTTGGACGCAAAGTTTGTTCCA
* * * ** *
217332 TGAAATTTCTTATTTAGTTGAAACATTATTAACTATTGAGGCAAGTTTTTCATGCTGATCTGAAA
260 TGAAATTTCGTATTTAGCTGAAACATGACCAACAATTGAGGCAAGTTTTTCATGCTGATCTGAAA
* * *
217397 TAAAGCTAGATGCATGTTAAGCTGTTTGCATTAGAAAATTCTTGTAAATGTAGGGGAAATTTTAT
325 TAAAGCTAGATGCATGTGAAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGGGAAATTTTAT
* * * * *
217462 TGCATCTATTTGCACCACGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAAT
390 TGCATCTAATTGCACCACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAAT
217527 CTGTTTGAAATTGAT-AA-A-G-A-TG
455 CTGTTTGAAATTGATAAAGATGAATTG
* * **
217549 -ATTTTTGCCTTTATTTCTTTATTTATAAGTTATTTAATGAGATACGAAATTATAGGGATTAAAT
1 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* *
217613 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGGCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
66 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
* *
217678 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTGGGGATTTGATTGTGTG-TTTTAATGATGTTGT
131 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTAA-GATGTTGG
* *
217742 GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAAAAGAAAAAATTTAAAGACTTGGTCGCAAAGTTTGTTCCA
195 GAATGATTAGGGGTCAAAATGCAAAAAAGAAAAAATTTAAAGACTTGGACGCAAAGTTTGTTCCA
* * * *
217807 TGAAATTTCGTATTTAGCTGAAACATGACCAACCAATT-TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
260 TGAAATTTCGTATTTAGCTGAAACATGACCAA-CAATTGAGGCAAGTTTTTCATGCTGATCTGAA
* * ** * *
217871 AT-TAGTTTAGATGTGTGATGAAG-TGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGATATTT
324 ATAAAG-CTAGATGCATG-TGAAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGGGAAATTT
* * * * *
217934 TGTTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
387 TATTGCATCTAATTGCACCACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
*
217999 AATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTG
452 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGA-A-T-TG
* * * *
218032 ATTATTTTTTCCTTGATTTCTGGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTAT-GGAGATTA
1 --TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGG-GATTA
* * *
218096 AATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTTTGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTT
63 AATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTT
*
218161 TTTTCCACGATT
128 TTTTCCATGATT
218173 AGTTAGCTGA
Statistics
Matches: 542, Mismatches: 66, Indels: 23
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
474 8 0.01
475 283 0.52
476 122 0.23
477 1 0.00
478 1 0.00
480 1 0.00
483 2 0.00
485 2 0.00
486 122 0.23
ACGTcount: A:0.31, C:0.10, G:0.21, T:0.39
Consensus pattern (481 bp):
TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTAAGATGTTGGG
AATGATTAGGGGTCAAAATGCAAAAAAGAAAAAATTTAAAGACTTGGACGCAAAGTTTGTTCCAT
GAAATTTCGTATTTAGCTGAAACATGACCAACAATTGAGGCAAGTTTTTCATGCTGATCTGAAAT
AAAGCTAGATGCATGTGAAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGGGAAATTTTATT
GCATCTAATTGCACCACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATC
TGTTTGAAATTGATAAAGATGAATTG
Found at i:221884 original size:198 final size:198
Alignment explanation
Indices: 221540--221935 Score: 553
Period size: 198 Copynumber: 2.0 Consensus size: 198
221530 AAATTTTTAT
** *
221540 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTTGCCAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTCAGCCAGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* *
221605 ACGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGT
66 ACGATGAGCTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTCGT
* * * * *
221670 ATCATGGTGCTGAATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGG-TAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAATTT
131 ACCACGATGCTGAATTGTTGAATTGCAAATCATTT-GGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
221734 GATA
195 GATA
* * *
221738 TTAGCTGAAACATGATCAACGA-TTCAGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTCAGCCA-GTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
* * * * * *
221802 CATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTG
65 CACGATGAGCTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTCG
** * *
221867 TACCACGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAGTCTGTTTGAAATT
130 TACCACGATGCTGAATTGTTGAATTGCAAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
221932 GATA
195 GATA
221936 AAGATGATTT
Statistics
Matches: 173, Mismatches: 23, Indels: 4
0.87 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
197 7 0.04
198 166 0.96
ACGTcount: A:0.29, C:0.11, G:0.21, T:0.38
Consensus pattern (198 bp):
TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTCAGCCAGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
ACGATGAGCTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTCGT
ACCACGATGCTGAATTGTTGAATTGCAAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
ATA
Found at i:222723 original size:485 final size:485
Alignment explanation
Indices: 221738--228602 Score: 8754
Period size: 485 Copynumber: 14.2 Consensus size: 485
221728 GAATTTGATA
* * ** *
221738 TTAGCTGAAACATGATCAACGATTCAGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * * *
221803 ATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * * *
221868 ACCACGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAGTCTGTTTGAAATTG
131 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * *
221933 AT-AA-A-G--A---T--G-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATAAGGTTC
196 ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
* *
221987 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
261 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
**
222052 GCCTTGTAACCGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGGATTTGATTA
326 GCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTA
* * * * * *
222117 TGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTGAAAACGTAAATAT-CTAAATATTTAGGGACT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACT
*
222181 TGGTTGCATAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
453 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* *
222214 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTCATTTGGAAATTAATTTAGATG
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTT-GAAATTAATTTAGATG
* * * * * *
222279 CGTGAAGAGGTGTTTGCGAGAGAAAATTCTTGAAAAAGTAGGTGAATTTTCATCGCACGTATTTG
65 CGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* * * *
222344 TACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCTAATCAGTTAGATAGCGTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
130 TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* ** * * *
222409 GACATTGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* * * * * *
222474 TGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC-AAAGTGTTTGATCA
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* * *
222538 AGCTTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGATTTAGGGATTTGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTA
* * * * * *
222602 TGTGTGTTTATGCTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAAGAGTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* *
222667 GGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTAT
454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* *
222699 TTAGCCGAAACATGATCGACCATTTTTGCCA-GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCA-TTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
** * *
222763 CACGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCG
65 CGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* * * ** * * * *
222828 TATCAGGCTGCTGAATAATTGAGTTGTAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAATTT
130 TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* * * *
222893 GATAAAGATGACATTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* * * * * *
222958 TGAAATAATAGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCCATAAGTATTAGACCA
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* ** *
223023 AGGCTTGTGGAGGATATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCAAAGCTGATTTGGTGATTTGATT
325 AGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGG-GATTTGATT
* * **
223088 ATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGAATAGGGGTCAAAATGCAAATATATAAAAATTTAAGGACT
388 ATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACT
* * *
223153 TGGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTTATTAT
453 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * * * * *
223186 TTAGCTGAAACCTGATCAACGATTCTGGCATGTTTTTCATGTTGATTTAAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * * * *
223251 ATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * * *
223316 ACCATGATGCTGAACTGTTGGGTAGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
131 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
223381 AT-AA-A-G--A---T--G-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
196 ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
* *
223435 GAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAATTATTTGACCGA
261 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
* * * *
223500 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTCGATTGTTCCGAGCTAATTTGGGGATTTCG-TTA
326 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTT-GATTA
* *
223564 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG-CGAAAACGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGAC
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTC-AAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGAC
* * *
223627 TTGGTTGCATAGTTTGCTCGATGAAATTTCTTAT
452 TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * *
223661 TTAGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTCATTTGAAATTAATTTAGATGT
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * ** * *
223726 GTGAAGTGGTGTTTGCCTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAATTTTCATCGCATGTATTTGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * * *
223791 ACCATGATGGTGAATTGTTGAGGTGCAAATCAGTTAGATAGCGTGGTCGAATCTGTTTAAAATTG
131 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * * * * *
223856 ACATAGATGATACTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTT
196 ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
* * * * * * * * *
223921 GAAATTATATGTATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGACAAAAGTGTTTGATCAA
261 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
* * * *
223986 GCCTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGACTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGATTTACGGATTTGATTAT
326 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTAT
* * * * * * *
224050 GTGTGTTTATGCTGTTGTCATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAAGAGTTG
390 GTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
* *
224115 GTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTAT
455 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * *
224146 TTAGCCGAAACATGATCGACCATTTTTGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATAC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * *
224211 GCGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTTTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * * * * *
224276 ATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATCATTTAGGTAGTTTGGTTGAATCTGTTTGAATTTG
131 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * *
224341 ATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTT
196 ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
* * * * * *
224406 GAAATAATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCCATAAGTATTAGACCAA
261 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
* *
224471 GGCTTGTGAAGGATATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTA
326 GCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGG-GATTTGATTA
* **
224536 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAATAGGGGTCAAAATGCAAATATATAAAAATTTAAGGACTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * *
224601 GGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTTATTAT
454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * * * * *
224633 TTAGCTGAAACATGATCAACGATTCTGGCAAGTTTTTCATGTTGATTTAAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * *
224698 ATGTTGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * * *
224763 A-CAGTGATGCTGAACTGTTGGGTTCCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
131 ACCA-TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* *
224827 GAT-AA-A-G--A---T--G-ATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATAAGATT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* *
224881 TGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAATTATTTGACCG
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* *
224946 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCAGATTTAGGGATATGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTA
* * * * *
225011 CGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACT
*
225075 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTGT-TTAG
453 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT-TCTTAT
* * *
225108 TTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCTTGTTTTTCTTGCTCATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * *
225173 GTGAAT-TGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATAAAAGTA-GTGAAATTTCGTTACATGTATTTG
66 GTG-ATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* ** * * * *
225236 TACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCAAATCCGTGAGATAACTTTGTCGAATCTCTTTGAAATT
130 TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* * * * * *
225301 GACATAGATGATATTCTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* * * * * * * *
225366 TGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGTAAAGTCATGCTTGAAGGCCAAAAGTGTTTGATCA
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* *
225431 AGCCTTGTAAAGGTTTTTTTTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTA
* * * * * *
225495 AGTGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGATTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
225560 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * *
225592 TTAGCCGAAACATCATCAACCATTTTCGCCA-ATTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATG
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
* * * * * *
225656 AGCGATGATGTGTTTGCAAGAAAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCG
65 CGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* * * * *
225721 TATCATGGTGCTGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATT
130 TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* * * * *
225786 AACAAAGATGATATTGTGCTTAATTTTT-CCTTGATTTCTTGGTTTATAGGTTATTTAATGAGAT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGT-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGAT
* *
225850 TTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAAGTATTTGATC
259 TTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACC
* * *
225915 TAGCCTTGTAAAAGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TGA--T----TCTG--T
324 GAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGATTTGATT
* * *
225966 A----TTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAAGCAAATATGCAAACATTTTAGGACT
388 ATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACT
*
226027 TGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
453 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * *
226060 TTAGCTGAAACATGATC-ACGCATTGTGGCATGTTTTTCCTG-TCGATTTGAAATTAATTTAGAT
1 TTAGCCGAAACATGATCAAC-CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGAT
** * * * *
226123 GTATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTT
64 GCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTT
* * * * *
226188 GTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTAGTCAAATCTGTTTGAAAT
129 GTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAAT
* * *
226253 TGATAAAGATGATTTTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGAT
194 TGATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGAT
* * * * * *
226318 TTGAAAATATTGGGATTAAATGGCAAAAACGAAAAGTCTTGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACC
259 TTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACC
*
226383 GAGCCTTATAAAGGATTCTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGAT
324 GAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGG-GATTTGAT
*
226448 TATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAG
387 TATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-
* *
226513 C-TGGTTGCAAAGTTTGTTCCGTGAAATTTCGTAT
451 CTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
** * ** *
226547 TTAGTTGAAATATGATCAACCAACTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTGGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * *
226612 GTGATGAGGTGTTCGCATGAGAAAATTCTCGTTAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * *
226677 ACCGTGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTCAAATTG
131 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* *
226742 ATAATGATGATATTGTG-GTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATT
196 ATAAAGATGATATTGTGCG-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* * * * *
226806 TGAAATTATAGGGATTAAATTACAGAAATGAATAGTCATGCCTTATGGCCAAAACTATTTGACCG
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* * *
226871 AGCCCTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGG-GATTTGATTA
* * * * *
226936 TGTGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATTCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * *
227001 GGTTGCAAAGTTTTTTTCACGAAATTTCTTAT
454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * *
227033 TCAACCGAAACTTGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTAGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * ** * * * * * *
227098 ATTAAAAGGTGTTTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCGTTACATGTAATTGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* *
227163 ATCATGATG-TCGAATTGTTGAGTTGAAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
131 ACCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* * * * * **
227227 GATAAAGATGATATTGTGCTTTTTTTTGGCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTAAACAAGATT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* * *
227292 TGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAAGTATTTGATCG
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* * * *
227357 AGCCTTGTAAGGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATATAGTGATTTGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT-TTGGGATTTGATTA
* * * * * *
227422 TGTATTTTTGTGATGTTGTAATTGATTAGGTGTCAAAATCCAAATATGCAATAATTTAAGGACTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * *
227487 GGTTTCAATGTTTATTCCATGAAATTTCCTT-T
454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTT-CTTAT
* *
227519 TTAGCGGAAACATGATCAACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * *
227584 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGCTAAAATTTCATT-CGATGTATTTG
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGC-ATGTATTTG
* * * *
227648 TATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGTAAATCATTTAGATAGCTTCGTCGAATCTGTTTGAAATT
130 TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* * * * *
227713 GATAAAGATGATACTGTGCTTATTTATGCCTTGATTTCATGATTTATAAGTTATTTTATGAGATT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* *
227778 TGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCG
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* **
227843 -GCCCTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTTTGATTTGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA-TTTGGGATTTGATTA
* *
227907 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAACAATTTAAGGACT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACT
*
227971 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTTT
453 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * * * * * * *
228004 TTAGCCGAAACCTGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTACTTATTGGAAAGTATTTTTGATGT
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * *
228069 GTGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGAAATTTCATTACATATATTTGT
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * *
228134 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGGAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAAATG
131 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * * *
228199 ATATAGATGATATTGTGCTTTTTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
196 ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
*
228264 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGA
261 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
* * * *
228329 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCTTGATTTGTGGAT-GTTCCAAGCTTATTTGGGATTTGACTATC
326 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGATTTGATTATG
* *
228393 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAAGCAAATATGCAAAAATTTAAGGGCTTGG
391 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* * *
228458 TTGCAAAGTTTGTTCAATGATATTTGTTAT
456 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
*
228488 TTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * *
228553 ATAACGAGATGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAGTTTC
66 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
228603 TCTCCAAGTA
Statistics
Matches: 5504, Mismatches: 779, Indels: 204
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
467 14 0.00
468 385 0.07
472 2 0.00
474 81 0.01
475 508 0.09
476 274 0.05
477 129 0.02
478 1 0.00
479 5 0.00
480 2 0.00
481 6 0.00
482 4 0.00
483 6 0.00
484 621 0.11
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487 953 0.17
488 88 0.02
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.21, T:0.40
Consensus pattern (485 bp):
TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGATTTGATTATG
TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
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Alignment explanation
Indices: 221738--228636 Score: 8783
Period size: 972 Copynumber: 7.2 Consensus size: 970
221728 GAATTTGATA
* * ** *
221738 TTAGCTGAAACATGATCAACGATTCAGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * *
221803 ATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGT
66 ATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * * *
221868 ACCACGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAGTCTGTTTGAAATTG
131 ATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * * *
221933 AT-AA-A-G--A---T--G-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATAAGGTTC
196 ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTT
* *
221987 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
261 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
**
222052 GCCTTGTAACCGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGGATTTGATTA
326 GCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTA
* * * * * *
222117 TGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTGAAAACGTAAATATCTAAATATTTAGGGACTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAGGACTT
* *
222182 GGTTGCATAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGT
454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
* *
222247 TTTTCTTGCTCATTTGGAAATTAATTTAGATGCGTGA-AGAGGTGTTTGCGAGAGAAAATTCTTG
519 TTTTCTTGCTGATTT-GAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
* * ** * * *
222311 AAAAAGTAGGTGAATTTTCATCGCACGTATTTGTACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCTAATC
582 TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
* * * ** *
222376 AGTTAGATAGCGTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGACATTGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTT
647 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTT
* * * * *
222441 GATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGAA
712 GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAA
* * * * * * *
222506 AAGTCATGCTTGATGGCC-AAAGTGTTTGATCAAGCTTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGATTTGT
777 AAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGT
* * *
222570 GGATGTTCCAAGCTGATTTAGG-GATTTGATTATGTGTGTTTATGCTGTTGTGATTGATTATGGG
842 GGATGTTCCAAGCTGATTT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
* * * * *
222634 TCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAAGAGTTGGTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTAT
906 TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* *
222699 TTAGCCGAAACATGATCGACCATTTTTGCCA-GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCA-TTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
* * *
222763 CACGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCG
65 CATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* * ** * * *
222828 TATCAGGCTGCTGAATAATTGAGTTGTAAATCATTTAGG-TAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAATT
130 TATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT-GGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAAT
* * *
222892 TGATAAAGATGACATTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGAT
194 TGATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGAT
* * * * *
222957 TTGAAATAATAGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCCATAAGTATTAGACC
259 TTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACC
* * ** *
223022 AAGGCTTGTGGAGGATATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCAAAGCTGATTTGGTGATTTGAT
324 GAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGG-GATTTGAT
* * *
223087 TATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGAATAGGGGTCAAAATGCAAATATATAAAAATTTAAGGAC
387 TATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAGGAC
* * * * * * *
223152 TTGGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTTATTATTTAGCTGAAACCTGATCAACGATTCTGGCAT
452 TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAT
* * * * * * * * *
223217 GTTTTTCATGTTGATTTAAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTA
517 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
* * * * *
223282 TAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAACTGTTGGGTAGCAAATT
582 TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
*
223347 ATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AA-A-G--A---TG---ATTTTTGCCTT
647 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTT
*
223401 GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAA
712 GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAA
*
223466 AAGTCATGCTTTATGGCCAAAATTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGT
777 AAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGT
* * * *
223531 CGATTGTTCCGAGCTAATTTGGGGATTTCG-TTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG
842 GGA-TGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTT-GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG
* * * * *
223595 G-CGAAAACGCAAATAT-CTAAAAATTTAGGGACTTGGTTGCATAGTTTGCTCGATGAAATTTCT
905 GTC-AAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
223658 TAT
968 TAT
* * * *
223661 TTAGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTCATTTGAAATTAATTTAGATGT
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * ** * *
223726 GTGAAGTGGTGTTTGCCTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAATTTTCATCGCATGTATTTGT
66 ATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * * * * *
223791 ACCATGATGGTGAATTGTTGAGGTGCAAATCAGTTAGATAGCGTGGTCGAATCTGTTTAAAATTG
131 ATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * * * *
223856 ACATAGATGATACTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTT
196 ATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTT
* * * * * * * * *
223921 GAAATTATATGTATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGACAAAAGTGTTTGATCAA
261 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA
* * * *
223986 GCCTTGTAAAGGATTGTTTTCCTTGACTTGTGGAT-GTTCCAAGCTGATTTACGGATTTGATTAT
326 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTAT
* * * * ** * *
224050 GTGTGTTTATGCTGTTGTCATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAAGAGTTG
390 GTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAGGACTTG
* * * * *
224115 GTTGCCAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTATTTAGCCGAAACATGATCGACCATTTTTGCAAGTT
455 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTT
* * * *
224180 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATACGCGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTTTTCTAA
520 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAA
* * * * *
224245 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATCATT
585 AAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* * * * *
224310 TAGGTAGTTTGGTTGAATCTGTTTGAATTTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
650 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
* * *
224375 TTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATAATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAG
715 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAG
* * * * * *
224440 TCATGCCTTATGGCCATAAGTATTAGACCAAGGCTTGTGAAGGATATTTTTTCCATGATTTGTGG
780 TCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGG
*
224505 ATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAATAGGGGTC
844 AT-GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTC
** * * *
224570 AAAATGCAAATATATAAAAATTTAAGGACTTGGATGCTAAGTTTGTTCCATGAAATTTATTAT
908 AAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * * * * *
224633 TTAGCTGAAACATGATCAACGATTCTGGCAAGTTTTTCATGTTGATTTAAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * *
224698 ATGTTGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATGTATTTGT
66 ATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * * *
224763 A-CAGTGATGCTGAACTGTTGGGTTCCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
131 ATCA-TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* * *
224827 GAT-AA-A-G--A---T--G-ATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATAAGATT
195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATT
* *
224881 TGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAATTATTTGACCG
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* *
224946 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCAGATTTAGGGATATGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGGATTTGATTA
* * * * *
225011 CGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTGAAAACGCAAATATCTAAAAATTTAGGGACTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAGGACTT
* * *
225076 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTGT-TTAGTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCTTG
454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT-TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATG
* * *
225140 TTTTTCTTGCTCATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-ATTGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTA
518 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATA-AGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
* *
225204 TAAAAGTA-GTGAAATTTCGTTACATGTATTTGTACCATGATGGTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
582 TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
** * * * * * * * *
225268 CGTGAGATAACTTTGTCGAATCTCTTTGAAATTGACATAGATGATATTCTGCGTATTTTTGCCTT
647 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTT
* * * * * *
225333 GATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAATATGTA
712 GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAA
* * * * * * *
225398 AAGTCATGCTTGAAGGCCAAAAGTGTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGTTTTTTTTCCTTGATTTGT
777 AAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGT
* * * * *
225463 GGATGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTAAGTGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGT
842 GGATGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGT
* *
225528 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
907 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* * * *
225592 TTAGCCGAAACATCATCAACCATTTTCGCCA-ATTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATG
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
* * * * *
225656 -AGCGATGATGTGTTTGCAAGAAAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTC
65 CA-TGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTT
* * *
225720 GTATCATGGTGCTGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGG-TAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAA
129 GTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT-GGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAA
* * * *
225784 TTAACAAAGATGATATTGTGCTTAATTTTT-CCTTGATTTCTTGGTTTATAGGTTATTTAATGAG
193 TTGATAAAGATGATATTGTGCGT-ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAG
*
225848 ATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAAGTATTTGA
257 ATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA
* * * *
225913 TCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TGA--T----TCTG-
322 CCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGATTTGA
* * *
225965 -TA----TTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAAAGCAAATATGC-AAACATTTTAGG
386 TTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGG
* * *
226024 ACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATC-ACGCATTGTGG
450 ACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC-CATTTTGG
* ** * * * *
226088 CATGTTTTTCCTG-TCGATTTGAAATTAATTTAGATGTATGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATT
514 CATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
* * * *
226152 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCA
578 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* * * *
226217 AATTATTTAGATAGCTTAGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATTTTGTGCTTATTTTTG
643 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * *
226282 CCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAAATATTGGGATTAAATGGCAAAAA
708 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * *
226347 CGAAAAGTCTTGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTATAAAGGATTCTTTTTCCATGA
773 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCCATGA
*
226412 TTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATT
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*
226477 AGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAGC-TGGTTGCAAAGTTTGTTCCGTGAAATT
901 AGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-CTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
*
226541 TCGTAT
965 TCTTAT
** * ** *
226547 TTAGTTGAAATATGATCAACCAACTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTGGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * *
226612 GTGATGAGGTGTTCGCATGAGAAAATTCTCGTTAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
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* * * * *
226677 ACCGTGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTCAAATTG
131 ATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
*
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
226936 TGTGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATTCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATT
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* * * * * *
227000 TGGTTGCAAAGTTTTTTTCACGAAATTTCTTATTCAACCGAAACTTGATCAACCATTTTGGCATG
453 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATG
* * * * * *
227065 TTTTTCTTGCTGATTAGAAATTAATTTAGATGCATTAAAAGGTGTTTGTATGAGAAAATTCTTGT
518 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGT
* * * * *
227130 AAAAGTAGGTGAAATATCGTTACATGTAATTGTATCATGATG-TCGAATTGTTGAGTTGAAAATC
583 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATC
* *
227194 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTTTTTTTGGCTT
647 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTT
* * ** *
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712 GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAA
* * * *
227324 AAGTCATGCTTTATGGCTAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAGGGATTTTTTTCCATGATTTAT
777 AAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGT
* * * * * *
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842 GGAT-GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
* * * * *
227454 TCAAAATCCAAATATGCAATAATTTAAGGACTTGGTTTCAATGTTTATTCCATGAAATTTCCTT-
906 TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTT-CTTA
227518 T
970 T
* *
227519 TTAGCGGAAACATGATCAACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * *
227584 GTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGCTAAAATTTCATT-CGATGTATTTG
66 ATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGC-ATGTATTTG
* * * *
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130 TATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
* * * * * *
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195 GATAAAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAGGTTATTTAATGAGATT
* *
227778 TGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCG
260 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCG
* **
227843 -GCCCTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTTTGATTTGATTA
325 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA-TTTGGGATTTGATTA
* *
227907 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATATCTAACAATTTAAGGACTT
389 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAGGACTT
* * *
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454 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
* * * * * * * * *
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519 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTA
* * *
228102 AAAATAGGTGAAATTTCATTACATATATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGGAAATCAT
584 AAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
* * * * *
228167 TTAGATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAAATGATATAGATGATATTGTGCTTTTTTTTCCCTTGA
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714 TTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAA
* *
228297 GTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCTTGATTTGTGG
779 GTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGG
* * *
228362 ATGTTCCAAGCTTATTTGG-GATTTGACTATCTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
844 ATGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCA
* * * * *
228426 AAAAGCAAATATGCAAAAATTTAAGGGCTTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGATATTTGTTAT
909 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
*
228488 TTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
1 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * * * * *
228553 ATAACGAGATGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAGTTTC-TCTCCAAGTATTTA
66 ATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCAT-TGCATGTATTTG
* *
228617 CATCATGATGCTGAGTTGTT
130 TATCATGATGCTGAATTGTT
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Statistics
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TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
AGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
Found at i:229058 original size:13 final size:13
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1 ATGTATCGATACA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATGTATCGATACA
Found at i:229063 original size:32 final size:33
Alignment explanation
Indices: 229022--229085 Score: 103
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229012 TAGCCAAACT
**
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* * * * *
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** * * * * *
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* *
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* ** *
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* * * * * *
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*
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * ** * *
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* * *
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** * ** *
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* * * *
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*
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* * * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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* * * *
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389 TAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATG
* *
241485 T-ATTCGTATCATTG-TGCTGAAATGTTGAGATG
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* *
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* * * *
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* *** *
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* ** **
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*
241905 ATAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCAT
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* * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * *** *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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*
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* * ** * *
242730 TTAGGGGTCAAAATGCAGATATGAAAAAATTTTTGAACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
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** * * *
242795 TTCTTATTTAGCTAAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTCGCCGATTTGAAATTAATT
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* * * *
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* * *
242906 T--TTGTACCCTGATGCTGAAATGTTG-GATTG
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* * *
242936 TAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
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* *
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* * * * *
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* * * *
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*
243195 TAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
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* *
243260 TCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCCTTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTT
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* * *
243325 AGATGCATGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGG-GTAGATTTCATTGCATG
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* * *
243389 TATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAATTG
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* * *
243421 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATTTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTT
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* * * * * *
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* * * *
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* * * **
243615 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGAATTGATTATGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGAT
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* * *
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* *
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* * * * *
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389 TAGATGCGTGATGAGG-TGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCAT
* * * *
243874 GT-ATTCGTATCATGGTGCTAAATCGGTGAGTTG
453 GTAATT-GTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* *
243907 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATGTTGTG
1 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTG
243963 GCCAAAAATT
Statistics
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ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (485 bp):
CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA
TTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATT
AGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTT
CTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTA
GATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTA
ATTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
Found at i:244105 original size:261 final size:264
Alignment explanation
Indices: 243702--244224 Score: 748
Period size: 261 Copynumber: 2.0 Consensus size: 264
243692 TTCAAATATG
* * * *
243702 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
1 CAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCACTGAAATTTCTTATTTACCCAAAACATGA
* * *
243767 TCAACCATTTTGTCCTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCTTGATGAGGCTTTTA
66 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGCTTTTA
* * * ** * *
243832 CAAGACAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTAAAT
131 CAAGACAAAATTCTGGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAATGCATGTATTCAAACCATGATGCTAAAT
* * *
243897 CGGTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATGTTG
196 CGGTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAAATGATATTG
243961 TGGC
261 TGGC
* *
243965 CAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCA-TGAAATTTCTTTTTTACCCAAAACATGG
1 CAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCACTGAAATTTCTTATTTACCCAAAACATGA
*
244029 TCAACCATTTTGGCAT-TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGG-TGTTT
66 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGCT-TTT
* * * * *
244092 GCAAGAGAAAATTCTGGTAAGAGTAGGTGAAATTTCAATGCATGTATTTAAACCATGATGCTAAA
130 ACAAGACAAAATTCTGGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAATGCATGTATTCAAACCATGATGCTAAA
* * * *
244157 TTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAAATTGATATAAATGATATT
195 TCGGTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAAATGATATT
244222 GTG
260 GTG
244225 TGTATTTTTG
Statistics
Matches: 229, Mismatches: 29, Indels: 5
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
260 1 0.00
261 145 0.63
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ACGTcount: A:0.30, C:0.12, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (264 bp):
CAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCACTGAAATTTCTTATTTACCCAAAACATGA
TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGCTTTTA
CAAGACAAAATTCTGGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAATGCATGTATTCAAACCATGATGCTAAAT
CGGTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAAATGATATTG
TGGC
Found at i:246172 original size:485 final size:485
Alignment explanation
Indices: 243965--247617 Score: 4785
Period size: 485 Copynumber: 7.5 Consensus size: 485
243955 ATGTTGTGGC
* * * * * *
243965 CAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTTTTTACCCAAAACATGGT
1 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* *
244030 CAACCATTTTGGCAT-TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
66 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC
* * * *
244094 AAGAGAAAATTCTGGTAAGAGTAGGTGAAATTTCAATGCATGTATT-TAAACCATGATGCTAAAT
131 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTGT--ATCATGATGCTAAAT
* *
244158 TGTTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAAATTGATATAA-ATGATATT
194 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AAGATGATATT
* * *
244222 GTG-TGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGA
258 GTGCT-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
* * * * *
244286 TTAAACTG-TAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTACTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA
322 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGA
* * * *
244350 TTTTCTTCCACGATTTTTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATATGTGTTTATGAT
387 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
244415 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATTTG
452 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
* * * *
244449 CAAAAATTTAAGGATTTGATTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAATATGAG
1 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * *
244514 CAACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGTGGTGTTTGC
66 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC
* * *
244579 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGATGCCAAATT
131 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATTGTATCATGATGCTAAATT
* *
244644 GTTGAGTTGCAAATCATTTTGATAGCTTGGTCGAATCTGTCTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
195 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
*
244709 GCTTATTTTT-CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTGATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
260 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
* * *
244773 AATTGCAAAAATGAAAAGCCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGATCGAGACTTGTAAAGGA-TT
325 AATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGATTT
* * * *
244837 TTTTCCATGATTTGCGAATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGT
390 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGT
* *
244901 TCTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
454 TGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
** * * * * * * *
244933 CAAAAATTTAAGGACATGGTTGCGAAGTTTATTCCTTTAAATTTCTTATTTAACTGAAATATGAT
1 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * *
244998 CATCCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATACGTGATGAGGTGTTTAC
66 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC
** * * * * * * *
245063 TTGAGGAAAGTCTTGTAAATGTAGGAGAAATTTCGTTGCTTGTATTTGTATCATGATGCT-GATT
131 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTA-TTGTATCATGATGCTAAATT
* *
245127 AGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTCGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
195 -GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
* * * * * *
245192 TGCTTATTTTTGTCATGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTTAAATTATAAGAATT
259 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT
** *
245257 AAAAAGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-CTGAGCATTGTAAAGGA-
324 AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATC-GAGCCTTGTAAAGGAT
* * * * * * *
245320 TTTTTTCCACGATTTGTGGACGGTTCCAAGTTAATTTGGGGATTTGA-T-TGTGTTTTTATGATG
388 TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATG
* * *
245383 TTGTGACTGATTAGGGGTAAAAATGCAAATAT-
453 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
* * *
245415 CTAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAGTTTCTTATGTAGCCGAAACATGA
1 C-AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * *
245480 TCAACCATTTTGCCTTGTTTTTCATT-CTGATTTGAAAGTAATTTCGATGCGTGATGAGGTGTTT
65 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTC-TTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTT
* * **
245544 GCAAGCGCAAAA-TCTTGCAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCGGA
129 GCAAGAG-AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTA-TTGTATCATGATGCTAA
* * * * *
245608 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATATGTTTGAAACTGATATAGGTTATAT
192 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
* * ** *
245673 TGTACTTA-TTTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGTTAAATAAAGAGATTTGAAATTATAGGGA
257 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
* * *
245737 TTAAATTGCAAAAATGAAAACTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA
322 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGA
* ** * * * *
245802 TTTTCTTCCACAATTTTTGGATGGTTCGAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATATATGTTTATGAT
387 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
** * *
245867 GTTGTGATTGATTACAGGTCAAAATTCAAATTTG
452 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
* * *
245901 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTACAAAGTTTATTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGAT
1 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* **
245966 CAACCATTTTGGCCTAATTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTT-GATGCATGATGAGGTGTTTGC
66 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC
* * * * * *
246030 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAATGCATGTATGCGCATCATGGTGCTAAATT
131 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAT-TGTATCATGATGCTAAATT
* * *
246095 GTTGAGTTGCAAATCATATAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAAATGATAAAGATGATATTGT
195 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
* *
246160 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTTTAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGCTTA
260 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
* * * *
246225 AATTGCAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTATGCCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
325 AATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGATTT
*
246290 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
390 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
246355 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
455 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
* *
246386 CAAAAATTTAAGGGTTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGAT
1 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * *
246451 AAACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGTGGTGTTTGC
66 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC
* * * * * * * ** **
246516 ACGAAAAAATTCTTGTAAAATTAGGTGATATATCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCGAACA
131 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATTGTATCATGATGCTAAATT
* * * *
246581 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGACAAGCTTGGTCGAATCAGTTTGAAATTGGTAATGATGATATTG
195 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGA-TAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
* * *
246646 TGCCAAAGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTTATTTATAGGCTT-TTTAACGAGATTTGAAATTAT
259 T------GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG-TTATTTAATGAGATTTGAAATTAT
*
246710 AGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTA
317 AGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTA
* * * * * *
246775 AAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAACTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGCTC
382 AAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT
* * *
246840 ATGAGGCTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAGATATG
447 ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
* **
246879 CAAAAATTTAAGGATTTCGTTGCAAAGTCGGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
1 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* **
246944 CAACCATTCTGG-ACTAATTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTT-GATGCATGATGAGGTGTTTG
66 CAACCATTTTGGCA-TGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTG
** * * * * *
247007 CTTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAGTGCATGTATGCGCATCATGGTGCTAAAT
130 CAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAT-TGTATCATGATGCTAAAT
* *
247072 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATGTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
194 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
* *
247137 TCCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGCTT
259 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* * * * *
247202 AAATTACAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTATGCCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATT
324 AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGATT
* * *
247267 TTTTTTC-TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATCATGT
389 TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGT
* *
247331 GGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATA
454 TGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
* * * *
247363 CGAAAATTTAAGGATTTGGTAGGAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGAT
1 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * *
247428 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATGTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGC
66 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC
* * * * * **
247493 ACGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCAAAACG
131 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATTGTATCATGATGCTAAATT
* * * *
247558 GTTGGGTGGCAAATGATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGAT
195 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGAT
247618 CTAGCCTTTT
Statistics
Matches: 2750, Mismatches: 378, Indels: 81
0.86 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
482 106 0.04
483 307 0.11
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494 2 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (485 bp):
CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC
AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTGTATCATGATGCTAAATTG
TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
ATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAAAGGATTTT
TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTG
TGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
Found at i:250267 original size:486 final size:486
Alignment explanation
Indices: 247984--290472 Score: 49258
Period size: 486 Copynumber: 87.5 Consensus size: 486
247974 TGATAGAGAT
247984 GATCTAGCCATT-TAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
1 GATCTAGCC-TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
248048 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT-A
* * * *
248113 AGG-TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTATTTGGCCGAATCATGATAAACCATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * *
248177 GGCATCTTTTTCTTCCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGCGGTGTTTGCACGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * * * *
248242 TCTTGTAAAGGTAGGAGAAATTTCAATGCATGT-ATGCGCACCGTGGTGCTC-AATTGTTGAGCT
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGC-CAAATTGTTGAGTT
* * * * * *
248305 GCAAATCATTTAGATAGCTTGCTTGAATCTGTTTGAAATTGAGAAATATTATATTCTGCTTATTT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* *
248370 TTGCCTTGGTTTCTTGATTTATAAGTTATTTGATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
248435 AATTGAAAAGTCATGCTTTATACCCAAAAGTATTT
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
248470 GATCTAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * * * *
248535 GATTATGTATGCTTATGAGGCTCTGACTGATTATGGGTCAAATTCCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
*
248600 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTCA-TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* ** * * * * *
248664 CCTAATTTTATTGCTGATTTGAAATTAATTT-GATGCA-TACTGAGGTGTTTGCATAAGAAAATT
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTA-AGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * *
248727 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAGTGCATGT-ATGTGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAATTGC
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* *
248791 AAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAGAGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * *
248856 GCCTTGATTTCTTGATTT-TACGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGCTTAATTTGCAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* *
248920 ATGAAAAGTCAGGCTTTATGCCCAAAAGTGTTA
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* *
248953 GACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
249018 GATTATGTGTGTTTATGGTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * **
249083 GATTTGGTTGTAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCAG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* *
249148 CATGTTTTCCTTGCTACTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * **
249213 TTGTAAAAGTAGGTCAAATATCATTGCTTGTATTTGTATTATGCTGCCAAACGGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* * *
249278 ATCATTTAGATAGCTTCGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTCTGCTTGTGCTAAT
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA------TTGTGCTTAT
* * *
249343 TTTTGCCTTGATTTCTAGATTTATAAGCTATTTAACT-AGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATG
385 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG
* * *
249407 CAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTATTG-CCAAAAGTGTTT
449 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTATTA
* * * *
249445 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGATTTGTGAATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* * * * *
249510 TGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTA-GGAGTGAAAATGCAAATA-GATAAAAATTT
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAATATG-CAAAAATTT
** * * *
249573 AAGGACCTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTAGCCGTAACATGATCAACCATTT
128 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* ** * * * * *
249638 TGGCCTAATTTTCTTGCTGATTTGC-AATTAATTT-GTTGCATGATGACGTGTTTGCATGAGAAA
193 TGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTT-CAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAA
* * * * * * *
249701 ATTCTTGTAAAGGTAGGAGAAATTTCAATGCATGT-ATGCGCAGCATGGTGCTAAATTGTTGAGT
257 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGT
* *
249765 TGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTCTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATT
321 TGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATT
* * * * *
249830 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTTTAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTTTAAGGCTTGAATTGCA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* *
249895 AAAATTAAAAGTCAGGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
451 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
*
249931 GA-CTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTAATT
1 GATCT-AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
** * *
249995 ACCTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTAATTATGGGTCAAAATGCAAATGTGCAAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * *
250060 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCTGAAACATGATAAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * *
250125 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTTAAATTAATTTAGATGCATTAAGTGGTGTTTGCACGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * * * * *
250190 CTTGTAAAATTAGGTGATATATCATTGCATGTAATTATATTATGCTGCCGAACTGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * *
250255 AATCAGTTAGATAGCTTGGTCAAAT-TAGTTTGAAATTGGTAAAGATGATATTTTGCCTGTGCTT
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT-GTTTGAAATTGATAAAGATGATA---T---TGTGCTT
* * *
250319 ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGAATTAAATT
383 ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT
* *
250384 GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT
448 GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
250423 GATCTAGTCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * *
250487 GATTATGTGTGCTTATGAGGCTGTAACTGATTATGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * * *
250552 GATTTCGCTGCAAAGTTTGTTCCAAGAAATTTCTTGTTTAGCCGAAACAAGATCAACTATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * * * * * * *
250617 CCTATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTT-GATGCATGATGAGGTGTTAGCTTGAGGAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * *
250681 TTATAAAAATTGGAGAAATTTC-TGTGCATGT--TTGCGGATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTG
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCAT-TGCATGTAATT--GTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* * *
250743 CAAATCTTTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGGTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * *
250808 TGCCTTGATTTCTCGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATAAAATTCCAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
250873 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
250907 GACCGAGCCTTGTGAAGGA-TTTTTTCCCTGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* *
250971 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGATCAAAATGCAAATATGTAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * *
251036 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCTTGTTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* *
251101 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTCTGCACGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * *
251166 TTGTAAAAGTAGGTGAAATATT-ATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCAAAATGGTTGAGTTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAAT-TTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
*
251230 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTGTGCTTA
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA------TTGTGCTTA
* * * * *
251295 TTTTTGCCTTGATTTCTAGATTTATAAGCTATTTAACGAGACTTGAAATTATAGGGATTAAATTA
384 TTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG
** *
251360 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGGCAAAAGTTTTTA
449 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAG-TATTA
* * * *
251399 -ATCTAGCCTTGTAAAGGGTTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
251463 GGTTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTA-GGAGTGAAAATGCAAATA-GCTAAAAATTTA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
* ** * ** *
251526 AAGACCTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCAAAAACATGATCTACCATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * * * *
251591 AGCTTGTTTTTCTTACTAG-ATTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
194 GGCATGTTTTTCTTGCT-GCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* * * * *
251655 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTTG
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* * *
251720 CAAATCTTTTAAATAGCTTGG-CGGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGCTTATTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* *
251784 TTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
251849 AAATGAAAACTTA-GCCTTTATGCCAAAAAGTATTA
452 AAATGAAAAGTCATG-CTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *** *
251884 GACCGT-GCCTTGTACAGGATTTTTTTTTGTGATTTGTGGATGGTTCCAAACT-AGTTTCGTGAT
1 GATC-TAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGA-TTTGGTGAT
* *
251947 TAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATAACGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
64 TAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
* * *
252012 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTCGTCGACACATGATCAACCATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * *
252077 GGCATGTTTTTCTTGTTCCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCACGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * *
252142 TCTTGTAAAAGTAGGTGATATATCATTGCATGTAATGGTATTATGCTGCCGAATTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
252207 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
*
252272 GCCTTGATTTCTGGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
252337 ATGAAAAGTC-TGGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
454 ATGAAAAGTCAT-GCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
252370 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTATCGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
252435 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAAACGCGAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
252500 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
**
252565 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCACAAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * *
252630 TTGTAAAAGTAGGTGATATATCATTTGCATGTAATTGTATTATGTTGCCGAACTGTTGAGTTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA-TTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* ** *
252695 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGATCTTGTTAAAGATGATATTGTGCTTGTGCTTA
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA------TTGTGCTTA
* * * * *
252760 TTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTAAAATTACAAGGATTAAATTG
384 TTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG
* *
252825 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT
449 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* *
252863 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * **
252928 GATTATGTGTGCTTT-TGAGGCTGTGACAGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTG-TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * *
252992 CGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAATATGATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * ** * * * * *
253057 CCCTAATTTTCTTGCT-CATTTGAAATTAATTT-GATGCATGATGAGGTGTTTACTTGAGAAAAT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGC-TTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * *
253120 TCTTGTAAAAATAGGAGAAATTTCAGTGCATGT-ATGTGCATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTG
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* * *
253184 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATGTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTTTGCTTATTTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * *
253249 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGCTTATATTGCTAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* *
253314 AATGAAAAGTCAGGCTTTATGCCCAAAATTATTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * * *
253348 GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCCTAATTTCTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
253412 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * *
253477 GATTTGGTTGCAACGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGGTCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* *
253542 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTTA-TT---T--A--AAGAGGTGTTTGCACGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* ** * * * ** *
253599 TTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTTTATGTAATTGTATTATGCTGCAAAACGGTTAGGGTTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTT-GAGTTGCA
*
253664 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTCTGCTTA
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA-T-TG----TGCTTA
* * * * * *
253729 TTTTGGCCTTGATTTCTAGATTTATAAGCTATTTAACGAGAGTTGAAATTATAGGGATTAAATGG
384 TTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG
* * *
253794 CAAAAATGAAAAGTCAAGCTTTATGGCCAAAAGTATTT
449 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
253832 GATCTACCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAATTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
253897 GATTATGTGTGCTTATGAGGTTGTGACTGATTATGGGTCAAATTGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
** *
253962 GACCTGGTTGCACAA-TTTGTTGCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
131 GATTTGGTTGCA-AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * ** * * * *
254026 GCCTAG-TTTTATTGCTAATGTGAAATTAATTT-GATGCATGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
195 GCAT-GTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * *
254089 TCATGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAGTGCATGT-ATGCGCACCATGGT-CCTAAATTGTTGAGTT
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGCC-AAATTGTTGAGTT
* * *
254152 GCAAATCA-TTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGAGAAAGATTATATTGTGCTTATTT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* *
254216 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTGATTAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
254281 AATTGACAAGTCATGCTTTACTGCCCAAAAGTATTT
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTATTA
* * * *
254317 GATCTAGCCTTGTGAAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * *
254382 GATTATGTGTGCTTATG-TGGCTGTGACTGATTATGGGTCAAATTGCAAATATGCTAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGAT-GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
*
254446 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTCATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* ** * * * * ***
254511 GCCTAATTTTATTGCTGATCTGAAATTAATTT-GATGCATGCTGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * *
254575 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAGTGCATGT-ATGCGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGC
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * *
254639 CAATCATTTAGATTGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
254704 GCCTTGGA-TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
389 GCCTT-GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * *
254768 AATTAAAAGTCAAGCTTTATACCCAAAAGTATTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *
254802 CACCGT-GCC-T-TAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTCGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
1 GATC-TAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* **
254864 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAAATGTGAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
*
254929 GGATTTGGTTGGAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * *
254994 GCATGTTTTTCTTGTTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTCGCACGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * *
255059 CTTGTAAAAGTAGGTGATATATCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCAAACTGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
** *
255124 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGATCTTGGTAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * *
255189 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGTGATTAAATTGCAAAAT
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* *
255254 TGAAAAGTCATGCCTTATGGCCAAAAGTAGTT-
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTA-TTA
* *
255286 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * *
255351 GATTATGTGTGCTTATGAGGCTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAC
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
** * **
255416 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAATTTGAT---GCATGAT-G
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * * * * * * ***
255477 -AGGTGTTTGCTTG-AG----AAAATT-CTTGTA-A--AAATAGGAGAAATTT-CAGTGCATG--
196 CATGT-TTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATT-TAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCA-TG-A-GAA
* * ** * ** * * ** * * * *
255529 TATGCGCGTCATGGT-GCT-AAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGT--CGAATGT
256 AATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA-T-TTCA-TTGCATGT-AATT-G-TATCATGGTGCCAAAT-T
* * * * * ** * * *
255590 GTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT-ATAAGTT-A
314 G-TTG-AGTTG--CAA-ATCAT-TT-AG-ATA-GCTTG-GTCGA-ATC-TG-TTTGA-AA-TTGA
** * * ** * * *** * *** *
255653 TTTA-ATGATGTTAG-G---ATTTTGGTTTTGA--T-ATAACAAATCAA-CTAAAAAAT-ATATT
364 TAAAGATGATATT-GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT-AAGTTATTTAATGAGATT
*** ** * * * * *
255708 TGTTTTTATAAAGA--AAATTTG--AATATCACAAAAT-ATG--TTAT---CATAA--CTTA
427 TGAAATTATAGGGATTAAA-TTGCAAAAATGA-AAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * ** * ****** * * * * *
255758 TAT-T--TCTCT-AAAACCATGTGACAAAATGA-TT-T-CA-AGTAT-CAAGA-TGTTTTAGAGA
1 GATCTAGCCT-TGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGT-TCCAA-ACTGATTTGGTGA
* * * * *** * ** * ** * * **
255813 -TATGATTATATGTTTTTCAATCAAAGAAATAATGTTTTTCTAAGTAAAAATACGTAT-TGTATC
63 TTA-GATTATGTGTGTTT--AT-GATGTTGTGAT-TGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG---C
* * ** * * * * ** ** **
255876 AATACATATACTATTGG-TATT-AATACATAAGGTTGACTTAGGC-TACAAAGGTCAAAACT--C
120 AA-A-A-AT-TTA-AGGAT-TTGGTTGCA-AAGTTTG--TT--CCAT-GAAATTTCTTATTTAGC
* * * *** * *
255936 TGAAA-A-GTATCGATACACATTTAAAT-GTATCGATATAGATTGCATAG-TATCGATACA-CAC
173 CGAAACATG-ATC-A-AC-CATTT---TGGCAT-G-TTTTTCTTGC-T-GCTTTC-A-A-ATTA-
** *** * * ** ****
255996 AAATATGTAT-CGA-TACA-AGACATTGGCA-GTAGCCAAA-T-TTGT-ATCGATACACACAATA
223 ATTTA-G-ATGC-ATTA-AGAGGTGTTTGCATG-AG-AAAATTCTTGTAAAAG-TA-GGTGAA-A
* * * * * *
256054 TGTATCGA-TACAGGTCATTG--GCA--GTAGCCAAATTTGTATCGA--TACACAAT-ATGTATC
279 T-T-TC-ATTGCATGTAATTGTATCATGGT-GCCAAA-TTGT-T-GAGTTGCA-AATCAT-T-TA
* * *
256111 GATA-CACTGGTCAAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTGTGCTTATTTTTGCC
334 GATAGC-TTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA------TTGTGCTTATTTTTGCC
* * * * * **
256175 TTGATTTCTAGATTTACAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGTATTAAAGGGCAAAAATG
392 TTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATG
* *
256240 AAAAGTCATGCCTTATGCCCAAAAGTATTT
457 AAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *
256270 GATCTAGCCTTTTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGCGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
256335 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTC-AAATGCAAATATGCAAATATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * *
256399 GGTTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAATCATGATAAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
256464 CATCTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGTGGTGTTTGCACGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * ** * * * * *
256529 TTGTAAAAGCAGGTGATACATCATTGCACGT-ATGCGCACCATGGTGCTC-AATTGTTGAGCTGC
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGC-CAAATTGTTGAGTTGC
* * * * *
256592 AAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGAGAAATATTATATTGTGGTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
256657 GCCATCG-TTTCTTGATTTATAAGTTATTTGATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGC-AA
389 GCC-TTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * *
256720 AATCGAAAAGTCATGCTTTATACCCAAAAATATTT
453 AAT-GAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
256755 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCGATGATTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * *
256820 GATTATGTATGCTTATGAGGCTGTGACTGATTATGGGTCAAATTGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
256885 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTCACTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* ** * * * * * * *
256950 CCTAATTTTATTGCTGATTTGAAATTAATTT-GATGCA-TACTGAGGTGTTTACTTCAGAAAATT
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTA-AGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * *
257013 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCAGTGCATGT-ATGCGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT-TGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * *
257077 AAATCATTTAGATAGCTTGCTTGAATCTGTTTGAAATTGATAGAGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * * *
257142 GCCTTGATTTCTTGATTT-TACGTTATTTAATGAGGTTTGAAATTACAGGGCTGAAATTGCAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
257206 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
257239 GACCGAGCCTTGTGAAGGA-TTTTTTCCCTGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
257303 GATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGGAAATATGTAAACATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * *
257368 GATTTGGCTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCTTATTTGGTCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* *
257433 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTCTGCACGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * *
257498 TTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCAAATGGTTGTGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
257563 ATCATTTAGATAGGTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTGTGCTTAT
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA------TTGTGCTTAT
* * * *
257628 TTTTGCCTTGATTTCTAGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTAC
385 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGC
** *
257693 AAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGGCAAAAGTTTTTA
450 AAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAG-TATTA
* * *
257731 -ATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * *
257795 GGTTATGTGT-TCTTATGATGTTGTAATTAATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-GCTAGAAATTTA
66 GATTATGTGTGT-TTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
** ** * * ** *
257858 AAAACCTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCAAAAACATGATCTACCATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * *** *
257923 AGCTTGTTTTTCTTACTAG-TTTGAGAGTAATTTAGATGCGCGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
194 GGCATGTTTTTCTTGCT-GCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* * * * * * *
257987 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTTCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTCTTGAGTTG
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* * * * *
258052 CAAATCCTTTAAATAGCTTGG-CGGATTCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTATGCTTATTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * *
258116 TTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGAGATTAAATTGCAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* *
258181 AAATGAAAACTTA-GCCTTTATGCCCAAAAGTATTA
452 AAATGAAAAGTCATG-CTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
258216 -AACTGTGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGGTTTCGTGATT
1 GATCT-AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* *
258280 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTCATTACGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* *
258345 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTCGTCGAAACATGATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * *
258410 GCATGTTTTTCTTGTTCCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCACGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * * *
258475 CTTGTAAAAGTAGGTGATATATCATTGCATGTAATGGTATTATGCTGCCGAATTGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
258540 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * *
258605 CCTTCATTTCTTGAATTATAAGTTTTTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
*
258670 TGAAAAGTC-TGGCTTTATGCCCAAAAATATTA
455 TGAAAAGTCAT-GCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * * *
258702 GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCCTAATTTGTGTATGGTTCCAAACTGATTTAGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* *
258766 GATTATGAGTGTTTATGATGTTGGGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
*
258831 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * *
258896 CAAGTTTTTCTTACTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCACGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * ** *
258961 TTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCAAACGGTTGAGTTGTAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
*
259026 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * * *
259091 CTTGATTTCTAGATTTATAAGCTATTTAACGAGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
* * *
259156 GAAAAGTGATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT
456 GAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* *
259187 GATCTAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* * * * *
259252 TGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-GCTAAAAATTTA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
* ** * * *
259316 AAGACCTGGTCGCAAAGTTTTGTTCCATGGAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAG-TTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * ** * * * *
259381 TAGCTTGTTTTTCTTACTAG-TTTGGAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAA
193 TGGCATGTTTTTCTTGCT-GCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAA
* * * * *
259445 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTT
257 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* * * * *
259510 GCAAATCATTTAAATTGCTT-GTCCGAATCTTTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATTCTTATT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGT-CGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATT
* *
259574 TTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
*
259639 AAAATGAAAAGTGA-GCCTTTATGCCCAAAAGTATTA
451 AAAATGAAAAGTCATG-CTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *
259675 GACCGT-GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGGTTTCGTGATT
1 GATC-TAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* *
259739 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGAGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * * * *
259804 GGATTTGGTTGGAAAGTTTGTTCCAAGAAATTTCTTATTTGGCCGAACCATAATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * *
259869 CCATGTTTTTCTTG-TTCTTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCACGAGAAAAT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGC-TTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * * *
259933 GCTTGTAAAAGCAAGTGATATATCATTGCATGTAATTGTA-CTATGCTGCCGAATTGTTGAGTTG
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATC-ATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* *
259997 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTGGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATATT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
*
260062 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* *
260127 AATGAAAAGTCAGGCTTTGTGCCCAAAAGTATTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* *
260161 GACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
260226 GATTATGCGTGTTTATGATGTTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCGAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * *
260291 GATTTGGTTACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCAACCTTTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
260356 CATATTTTTCTTGCTACTTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAAAGGTG-TT---T--G------
196 CATGTTTTTCTTGCTGC-TTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * *
260409 C----AAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCAAATGGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* *
260470 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGAGAAATG-TGATATTGTGCTTGTGCTT
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAA-GATGATA------TTGTGCTT
* * * *
260534 ATTTTTGCCTTGATTTCTAGATTTATAAGCTATTT-A-GCAGGGTTTGAAATTATAAGGATTAAA
383 ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG-A-GATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* * *
260597 TTGCAAACATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT
446 TTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* *
260638 GATCTAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* * * * *
260703 TGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-GCTAAAAATTTA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
* ** **
260767 AAGACCTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGATGAAACATGATCAACCATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * ** * *
260832 AGCTTGTGTTTCTTACTAG-TTTGAAAGTAATTTAGATGGGTGATA-AGGTGTTTGCATGGGAAA
194 GGCATGTTTTTCTTGCT-GCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTA-AGAGGTGTTTGCATGAGAAA
* * * *
260895 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTT
257 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* * * *
260960 GCAAATCATTTAAATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGTTTA-TT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * *
261024 TTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAG
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
*
261089 AAATGAAAAGT--TGGCCTTTATGCCCAAAAGCATTA
452 AAATGAAAAGTCAT-G-CTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *
261124 GACCGT-GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAACT-AGTTTCGTGAT
1 GATC-TAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGA-TTTGGTGAT
* * * * **
261187 TAGATTATATATGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAATGCAAATGTGCCGAAATTTA
64 TAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
* * * *
261252 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGTCGAAACGTGATCAACCTTTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * *
261317 GGCATGTTTTTCTTG-TACCTTTCAAATTAATTTAGAAGCATTAAGAGGTGTTTGCACGAGAACA
194 GGCATGTTTTTCTTGCT-GCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* * * * * *
261381 TTCTTGTAAAAGCAGGTGATATATCATTGCATGTAATTGTA-CTATGGTACCGAATTATTGAGTT
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATC-ATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
261445 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
*
261510 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* *
261575 AAATGAAAAGTTAGGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *
261610 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* *
261675 GATTATCTGTGTTTATGATGTTGTGATTGGTTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* **
261740 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGTAGAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* *
261805 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAAATAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCACGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
** * * *
261870 TTGTAAAAGTAGGTGAAATACCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCAAATGGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
261935 ATCATTTAGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAAGATATTGTGCTCATTTTTG
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * * * * *
261999 CCTTGATTTCTAGGTTTATAAGCTATTTAACGAGGTTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGTAAAAA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * *
262064 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGCATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *
262096 GATCTAGCCTTGTAAAGGTTCTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGAGT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-T
* * * * * *
262161 T-GATTATGCGTTTTTATTATGTTGTAATTGATTA-GGGTTGAAAATGCAAAT-TGTTAAAAATT
64 TAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG-TCAAAATGCAAATATG-CAAAAATT
** * * *
262223 TAAGGGCTTGGTCGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCTGAAACATGATCAACCATT
127 TAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATT
* * ** * ** * * *
262288 TTGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGAAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAA
192 TTGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAA
* * * * * * *
262353 ATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTCGTTGCACGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTT
257 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* *
262418 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGGATGATATTATGCTTATTT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * * * * *
262483 TTGCCTTGATTTCTTGATTTCTATGTTATTTTATGAGATTTGAAGTTATAGGGATTAAAATGTAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * *
262548 AAATGAAAAGTCACGCTTTACGGCCAAAAGTATTT
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * *
262583 GCCCGAGCCTTGTAAATGATTTTTTTCCATGATTTGTGGGTGGTTCCAAGCTGATTTGG-GAATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG-ATT
* * * *
262647 TGATTATGTGTTTTTATGTTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCTAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* *
262712 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGTCGAAACATGATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * *
262777 GCACGTTTTTTTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGAAGCATTGAGAGGTGCTTGCATGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * * *
262842 CATGTAAAAGTAAGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * *
262907 AATCATTAAGATAGTTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTAATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * *
262972 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAAAA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * *
263037 GGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGCATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
263069 GATCTAGCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * *
263134 GATTATGTGTTTTTATGATTTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * **
263199 GAGTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAAGATCAACCTTTTTAA
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
** * * * * * *
263264 CATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGGGTTTGCTTGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
** ** * * * *** *
263329 TTGTGCAAGTAGGTGAAATTTTGTTGCATGTATTTGTGTCGT-GTCGTTGATTTGTTGA-TTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGT-GCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * *
263392 AATCATTTTGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGAGATTGTGCTTATTTTT
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
263456 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
263521 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTTTTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
263554 G-GCTGAGCCTTGTAATGAATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-CTGGAT
1 GATCT-AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGT-GAT
* * * * *
263617 TAGTTTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAAAAT-CTAAAAATTT
64 TAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTT
* * ** *
263681 AAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAACATGATCAGCCATTT
128 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * * * ** * * *
263746 TGGCTTGCTTTTCTTACTGATTTGAAACAAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATTAGAAAA
193 TGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* * * *
263811 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTTG
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* *
263876 CAAATCATTTAGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAAGATATTGTGCTCATTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * * ** * * *
263940 TTGCCTTGAGTTCTTGAATTATATGTTATTTTTTGAGATTTGAAATTATACGGATTAAAATGTAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
264005 AAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAAG-ATTT
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTAT-GCCCAAAAGTATTA
* * * *
264040 G-GCTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAAGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATT
1 GATCT-AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-T
* * * * * * *
264104 TA-ATTTTGTGTTTTTATGTTGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAACTAT-CTAAAAATTC
64 TAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTT
** * *
264167 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTTTGAAATTTTTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTT
128 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
*
264232 TGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGGATGAGAAAA
193 TGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* * * * *
264297 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCACGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGGGTTG
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* * *
264362 CAAATCATTTAGATAGCTTGGCCGAATCTCTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * ** *
264427 TGCCGTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTAAACAAGATTTGAAATTATAGGCATTAAATTGCAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* *
264492 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTT
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * *
264526 GGCCGAGCCTTATAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* ** * * * *
264590 GACTATGTGT-TATTACAATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATACAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGT-TTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * * * *
264654 GGAATTGGTTGCAAGGTTTGTTCCATGAAATTTCTTTTTTAGCCGAAACATGATCAACCCTTTTA
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * * * * * * *
264719 GCATGTTTTTCTTGCTGATATGAAATTAATTTACATGCGTGATGCGAG-GTTTGCTTCAGAAAAT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAG-GTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * * * **** *
264783 TCTAGTACAAGTAGGTGAAATTTCGTTACATGTATTTGTGTCATGTTAATGATTTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* *
264848 AAATCATTTTGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * *
264912 TGCCTTGAGTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * *
264976 AAATGAAAAATCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * ** * *
265011 G-GCTGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCGAGTTGGTTTGGGGATT
1 GATCT-AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* * * *
265074 AGATTATCTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
* * * *
265138 AGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTTTTATTTAGCCGAAACAGGATCAA-C-TTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * ** * * * * * * * ** *
265201 CGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTGCGTGAGAAAA
194 -GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* **
265266 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATT-TATCCCATGATGCTGAATTGTTGAGT
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTAT--CATGGTGCCAAATTGTTGAGT
* * *
265329 TGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTAT
321 TGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTAT
* * *
265394 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTAC
385 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGC
* * ** *
265459 AAAAATGCAAAGTCACGCTTTATTG-TGAAAACTATTTA
450 AAAAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* *
265497 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* *
265561 GATTCTGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
** *
265626 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTCGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
265691 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * *
265756 CTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
265821 ATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * *
265886 CTTGATTTCTTGATTTATAAGCTACTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
265950 TGAAAAATCAAGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * *
265982 GGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
266046 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * * * *
266110 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCTTGAAATTTCTTATTTAACCGAAACAGGATCAA-C-TTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * ** * * * * * * * ** * *
266173 GGCTTG-TTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTGCGTGAAAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* **
266237 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATT-TATCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTAT--CATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* * *
266300 GCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTATT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATT
* * *
266365 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* * **** *
266430 AAAATGTAAAGTCACGCTTTATTATGAAAACTATTTA
451 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTA-TTA
* *
266467 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
266531 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
** *
266596 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTCGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * *
266661 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTACATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * *
266726 CTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
266791 ATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * * * *
266856 CGTGATTTCTTGATTTATAAGCTACTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGCATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
266920 TGAAAAATCAAGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * * *
266952 GGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
267016 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * * * *
267080 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCTTGAAATTTCTTATTTAACCGAAACATGATCAA-CTTTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * ** * * * * * * **
267144 GCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGAGGCATTTGCATGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* ** * **
267209 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * *
267274 AATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTATTTTT
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATTTTT
* * * * *
267339 GCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTAGAAGGATTAAACTACAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * ** ** *
267404 TTGTAAAGTCACACTTTATTG-TGAAAACTATTTA
454 ATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* *
267438 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
*
267502 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * * *
267567 GGATTTGGTTGCAAAGTTTATTCCGTGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * *
267632 GAATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * * *
267697 -TCTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGC
260 CT-TGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * *
267761 AAATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * *
267826 GCCTTCATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGCAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * *
267890 AATGAAAACTCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * *
267924 GGCCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
267988 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* *
268052 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA-C-TTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * ** * * * ** * * ** * *
268115 GGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGTGTGATGAGGCATTTACGTGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * ** * ***
268180 TCTTGGAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGATGAATTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * *
268245 AAATCATATAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTATTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATTTT
* * *
268310 TGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * *
268375 AATGTAAAGTCACGCTTTATTG-CGAAAACTATTTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* * *
268410 -ACCGAACCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
268474 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
268539 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
268604 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * * *
268669 CTCTAAAAGGAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
268734 ATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * *
268799 CGTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
268863 TGAAAAATCAAGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * *
268895 GGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
268959 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * *
269023 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAGGATCAA-C-TTTT
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTT-CCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * ** * * * * * * * ** *
269086 CGGCTTG-TTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTGCGTGAGAAAA
194 -GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* **
269150 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATT-TATCCCATGATGCTGAATTGTTGAGT
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTAT--CATGGTGCCAAATTGTTGAGT
* * *
269213 TGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTAT
321 TGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTAT
* * *
269278 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTAC
385 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGC
* * ** *
269343 AAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTG-TGAAAACTATTTA
450 AAAAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* *
269381 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
269445 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
269510 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
269575 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * *
269640 CTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
269705 ATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * *
269770 CGTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
269834 TGAAAAATCAAGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * *
269866 GGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
269930 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * *
269994 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTT-CTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAGGATCAA-C-TTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * ** * * * * * * * ** *
270056 GGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTGCGTGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* **
270121 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATT-TATCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTAT--CATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* * *
270184 GCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTATT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATT
* * *
270249 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* * ** *
270314 AAAATGTAAAGTCACGCTTTATTG-TGAAAACTATTTA
451 AAAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* *
270351 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
270415 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
270480 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
270545 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * *
270610 CTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
270675 ATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* *
270740 CTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
270804 TGAAAAATCAAGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * *
270836 GGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
270900 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* *
270964 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA-C-TTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * ** * * * * * * * ** *
271027 GGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTGCGTGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* **
271092 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATT-TATCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTAT--CATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* * *
271155 GCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTATT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATT
* * *
271220 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* * * *
271285 AAAATGTAAAGTCACGCTTTATTG-CGAAAACTATTTA
451 AAAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* * *
271322 -ACCGATCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
271386 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
271451 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
271516 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * * *
271581 CTCTAAAAGGAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* * *
271646 ATCATTTAGATAGGTTAGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * *
271711 CGTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * *
271775 TGAAAAATCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * *
271807 GGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* *
271871 GATTATGTGT-TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * * * *
271934 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCTTGAAATTTCTTATTTAACCGAAACAGGATCAA-C-TTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * ** * * * * * * * ** * *
271997 GGCTTG-TTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTGCGTGAAAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* **
272061 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATT-TATCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTAT--CATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* * *
272124 GCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTATT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATT
* * *
272189 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* * **** *
272254 AAAATGTAAAGTCACGCTTTATTATGAAAACTATTTA
451 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTA-TTA
* *
272291 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
272355 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
272420 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
272485 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * * *
272550 CTCTAAAAGGAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* * *
272615 ATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
** * * *
272680 CTTCTTTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * *
272744 TGAAAACTCATGCTTTCTAG-CCAAAAATATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTAT-GCCCAAAAGTATTA
** * * * * *
272776 GGCCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
272840 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * *
272904 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTACTTAGCCGAAACATGATCAA-C-TTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * ** * * * ** * * ** * *
272967 GGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGTGTGATGAGGCATTTACGTGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * ** * ***
273032 TCTTGGAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGATGAATTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * *
273097 AAATCATATAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTATGCTTATTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATTTT
* * *
273162 TGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * *
273227 AATGTAAAGTCACGCTTTATTG-CGAAAACTATTTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* * *
273262 -ACCGAACCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
273326 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
273391 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
273456 AATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * * *
273521 CTCTAAAAGGAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* * *
273586 ATCATTTAGATAGGTTAGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* *
273651 CTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
273715 TGAAAAATCAAGCTTTCTGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * * * *
273747 GGCCGAGACTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATGGTTTGTGGATGGTTCCGAGCTGGTTTGGGGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
273811 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * *
273875 GGACTTGGTTACAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA-C-TTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * ** * * * * * ** *
273938 GGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGCATTTGCGTGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * ** ** **
274003 TCTTGTAAAACTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATAATGCTGAATTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * * *
274068 AAATCATTTAGATGGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATAATGATGGATATTATGCTTATTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTGTGCTTATTTT
* * * *
274133 TGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAAATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * ** *
274198 AATGTAAAGTCACGCTCTATTG-AGAAAACTATTTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTA-TGCCCAAAAGTA-TTA
* *
274233 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
274297 GATTATGTGTGATTATGATGTCGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * **
274362 GATTTAGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCAG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * *
274427 AATGTTTTTCTTGTTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * * * *
274492 CTCTAAGAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTATTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
274557 ATCATTTAGATAGGTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * * *
274622 CTTGATTTCTTGATTTACAAGCTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCGAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
*
274686 TGAAAAGTCGTGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * *
274718 GGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTATTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAACAGATTTGGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * **
274783 GATTATGTGT-TTCAATGATGATGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAACGTGCAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTT-TATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * * * * * *
274847 GGAATTGGTTG-AAGCGTTTGTACCTTGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTT
130 GGATTTGGTTGCAA-AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * ** * * *
274911 GGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGCGTTTGCATGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* ** * ** *
274976 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGCTGAGTTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * *
275041 AAATCATTTAGATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTCATAATGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * * * *
275106 TCCTTAATTTTTTCACTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAGAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
275171 ATGAAAAGTCATGCTTTATG-GCAACAACTATTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAA-AAGTATTA
* * * * *
275204 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACAGATTTAGG-GAT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGTGAT
* *
275268 TAGATTATGGGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTA
64 TAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
* * *
275333 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGACCAACCATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * *
275398 GGCATGTTTTTCCTGCTCCTTT-AGAATTAGA-TTAGATGCATTAAGAGGTGTTCGCATGAGAAA
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCA-AATTA-ATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAA
* * * * * ** * *
275461 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCGTGCATTTGTACCATGATGCTGAACTGTTGGGTT
257 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* * *
275526 GCAAATTATTTATATAGCTAGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
322 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * * * *
275591 TTGCTTTGATTCCTTGATTTATAGGCTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAA
387 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * *
275656 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCATAACTATTT
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * ** * * *
275691 GACCGAGCCTT-TCAAAGGA-TTTTTTCCATCCTTTGGGGAAGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATT
1 GATCTAGCCTTGT-AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-T
* * * ** *
275754 TA-ATTTTGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAACACAAATATACAAAAATTT
64 TAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
* * * **
275817 AAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTA-CTTAAAGACATGATCAACCAT
128 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC-CGAA-ACATGATCAACCAT
* * * * * * * * * **
275881 TTTGGCCTATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAAATGCGTGATGAGGTGTTTACAAAAGAA
191 TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAA
* * * * * **
275946 AATTCTTGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATATACTCGTATCATGGTGCTGAA-TGTTGAGT
256 AATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGT
* ** * *
276010 AGCAAAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCATAT
321 TGC-AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAT
* *
276075 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTAC
385 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGC
*** * * *
276140 AAAAATGAAAAGTCACATTTTATGGCCAAAACTATTT
450 AAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * * * *
276177 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGA-TTGTGGATGGTTTCAAACAGATTTTGCGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
276241 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGCGATCGATTATGGGTCAAAATGCAACTATGCAAAATTTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * * * *
276306 GATATGGCTGCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTGTTATATAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGC
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * * * * * *
276371 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAGAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* ** * ** *
276436 TTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-ATTCGTCCCATGATGCTGAATTGTTAAGTTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT-GTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * * *
276500 AATCATTTAGATAGTTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCGTATTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * * *
276565 CCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGCAAATA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * *
276630 TGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAGAAGTATTTA
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTA-TTA
* * * ** * * *
276663 -ACCAAGCCTTGCAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGGCGGTTTCAAACTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
276727 GATTATGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAACTATGCAAAAATTTAAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * *
276792 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAACCAAAACAAGATCCACCGTTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * * ** * * * **
276857 CCTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAAATGTGTGATGAGGTATTTGCAAAAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * **
276922 TTGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-ATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT-GTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC-
** *
276986 AAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
*
277051 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAATAAATTGCAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
277116 ATGAAAAGTCATGGTTTATGGCCAAAAGTGTTA
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * *
277149 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACAGATTTGGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TT
*
277214 A-ATTATCTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * * *
277278 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAGTCTCTTATTTGGTCGAAACATGATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * *
277343 GCAAGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * * *
277408 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGCAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTAAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * *
277473 AATCTTTTAGATGGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGTTGATATTGTGCTTATTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * * *
277538 CCTTGATTTCTTGATTTATATGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATTGGAATTAAATTGCAAAAA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* *
277603 TGAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAAGTATTA
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
277635 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCCGATTTAGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * *
277700 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATACGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
*
277765 GATTTGCTTGCAAAGTGTGTTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCGGAAAC
131 GA------T------T-TG---G-TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
* * **
277830 ATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGAT-CCCTAATGAGGT
179 ATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAA-GAGGT
* * ** *
277894 GTTTGCTTGAGAAAATTC-TGATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTACATCATGATG
243 GTTTGCATGAGAAAATTCTTG-TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTG
** * *
277958 ATAATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATG
307 CCAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATG
*
278023 ATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATA
372 ATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATA
** * * * * *
278088 GGGATTAAAACGTAAAATTGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTT
437 GGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * *
278138 GGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* ** * *
278203 GATTATGTGTTTTTATGGGGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
** *
278267 GGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATTATCAA-CATTTTC
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-
* * * ** * * * * * * *
278331 GACTTGTTTATCTTATTGATTTGAAAGTATTTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * *** * *
278396 TCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATATATTTGTATCATGATGGGGATTTGTTGGGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* *
278461 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCGGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
*
278526 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGCATTAAATTGCAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
278591 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* *
278624 GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
278688 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATTTGC-AAAATTTAAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT-AA
* *
278752 GTATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* ** *
278817 GAATGTTTTTCTTGCT-CATTTGGAATTAGTTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGC-TTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * ** ** *
278881 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCGTGCATTTGTACCATGATGCTGAACAGTTGGGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * *
278946 AAATTATTTAGATAGCTAGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAAATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * * * * *
279011 GCTTTGATTTCTTGATTTATATGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATCGGAATTAAATTGTAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
*
279076 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTA
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
279109 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAGCCGATTTAGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * *
279174 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCGAATACGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * *
279239 GATTTGCTTACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCGGAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * *
279304 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC-GTAATGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATT
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAA-GAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * ** * ** *
279368 CTGGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTACATCATGATGATAATTTGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
279433 AATCATTTAGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* ** *
279497 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAACGTAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
** *
279562 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAAGTATTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * *
279595 GGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATT-
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * *
279659 GATTATGTGTTTTTATG-TGGTTGTGTTTGATTAGGGGTGAAAATACAAATAT-CTAAAAATTTA
66 GATTATGTGTGTTTATGAT-GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
* ** *
279722 CGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTACCCGAAACATGATCAA-CATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* ** * * * * * *
279786 CGGCTTGTTTTTCTTATTGATTTGAAAGT-ATATTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAA
194 -GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAAT-TTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAA
* * * * * * *
279850 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATATATTTGTATCATGATGCTAATTTGATGAGTT
257 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
* *
279915 GCAAATCATTTAAGATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGCTTATT
322 GCAAATCATTT-AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATT
* * ** * * *
279980 TTTGCCTTGATTTCTTTATTTGTAAGTTATTT-ATGAGATTCAAAACTATAGGGATTAAAATGTA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* * *
280044 AAAATGAAAAGTCATGCTTTACGGCCAAAAGTATTT
451 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * *
280080 GGCCGACCCTTGTAAAGTG-CTTTTTTCCATGATTTGTGGTTGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAG-GATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* * * * * * *
280144 TGATTATGTGTTTTTATGTTGTTTTGAATGATTAGGGGTTAAAATGCAAATAT-CAAAAAATTTA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
** * * *
280208 AGGGCTTAGTTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCTTTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * * * *
280273 GGCTTGTTTTTCTTACTGATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTCCATGAG-AAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * * * ** *
280337 TCTTGTAAAAGTAGATGAAATTTCATTACCTGTATTTGTATCGTGATACTGATTTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * *
280402 AAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAAAAAGATGATATTCTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
280467 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAA-TATTAGGGATTAAACTGCGAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTA-TAGGGATTAAATTGCAAA
** * * ** *
280531 AGCGAAAAGTCAAGCTTTATGGCC-TTAGCTATTT
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAG-TATTA
* * * * * * *
280565 GACCGAGCCTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGAAGGTTCCAAGCGGATTTGGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* *
280629 GATTATGTGT-TTTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * * * * * *
280693 GGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCGTGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATAATCAACAAATTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * ** * *
280758 GCACGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * * *
280823 CTTGTAAAAGTAGTTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
*
280888 AATCATTTAAGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGCTTATTTT
325 AATCATTT-AGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * * * * * *
280952 TGCCTTGATTTCTTTATTTGTAAGTTATTT-ATAAGATTTAAAACTATAGGGTTTAAAATGTAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * *
281016 AATGAAAAGTCATGCTTTACGGCCAAAAGTATTT
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * * *
281050 GGCCGAGCCTTGTAAAGGGTTTTTTTTGCATGATTTGTGGTTGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAA-GGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* * * * * * * * *
281115 TGATTTTGTGTTTTTATGTTGTTTTGAATGATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-ACAAAAAATTTA
65 AGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
** * * *
281179 AGGGCTTGGTTGCAAAGTTTGTTTCATAAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCTTTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * * * * *
281244 GGCTTCTTTTTCTTACTGATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTCCATGAG-AAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * * ** *
281308 TCTTGTAAAAGTAGATGAAATTTCATTACCTGTATTTGTATCATGATACTGATTTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * * *
281373 AAATCTTTTAGATAGTTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAAAAAGATGATATTCTGTTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * *
281438 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTGCGAGA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * * *
281503 ATGAAAAGTCAAGCTTTGTGGCCAAAACTATTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* ** *
281536 GA-CTGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGATTTGATGATT
1 GATCT-AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
* * *
281600 TGATTATGTGT-TTTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
65 AGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
* * * * *
281664 AGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * ** * * * *
281729 GGCATGTTTTTCTTGCCGGTTTGAAATTAATTTTGATGTGTGATGAGGCGTTTGCATCAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * ** * *** *
281794 TCTTGTAAAAGTAGTTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGATGAATTATTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * *
281859 AAATCATTTTGATACCTTAGTCGAATCTGTTCGAAA-T--T---GAT-A-ATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
281916 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * * *
281981 ATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTCTTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
282014 GACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTAATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
282079 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATAAGCAAAAA-TTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * *
282143 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTACATGAAATTTCTTACTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGC
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * *
282208 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATCAACTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAGAA-T
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAA-AATT
* * * * *** *
282272 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCTTGATGTTGAATTGTTGAATTGCA
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * *
282337 AATCATTTAGATAGCTTGCTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * * * * *
282402 CCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAATTTATAGGGATTGAATTGTAAATA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * *
282467 TGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
282499 GATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTTCCAAACAGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * *
282564 GATTTTGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGACTAAGGGCCAAAATGAAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
*
282629 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCC-ATAACAAGATCAACCATTTTG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGA-AACATGATCAACCATTTTG
* ** * * * *
282693 GCCTGTTTTTCTTGCT-AATTCGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTC-AAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * ** *** *
282757 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATG-CATTCAAATCATGGTGTTGAATTGTTGAGTTA
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT-GTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* * * * * *
282821 CAAATCATTTAGATAGCTCGATTGAATCTATTTGAAACTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* *
282886 TGCCTTGATTTCTTGATTGATCAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* *
282951 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCAAAAAGTATTA
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * *
282985 GGCCGAGCCTTGTAAAGGATTGTTTCCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
283050 GATTACGTGT-TTTAATGATGTTGTCATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTCAA
66 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * ** *
283114 GGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTTAAACATGATCAACCAATTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * ** * * *
283179 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGCGTTTGCATGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * **
283244 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-CCAATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATC-ATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* *
283308 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTA
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * **
283373 GCCTTGATTTCTTGATTTGTAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGAATTAAACTATAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * *
283438 ATGAAAAGTCACGCTTTATGGCGAAAACTATTTA
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTA-TTA
* * * *
283472 -ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAAGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
** *
283536 GATTATGTACGTTTATGATGTTGTGATTGATTATAGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
283601 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
283666 AATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATAAATAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * **
283731 TTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAAATATATTATGATGCGGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
283796 ATAATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAAATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
** * * * *
283861 CTTGATTTCTTGATTTATTGGCTATTTAACGAGATTTGAAATCATAGGGATTAAATTACAAAAAT
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
* * * *
283926 GAAAAGTCATGTTTTATGGCCAAAGGGATTA
456 GAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * *
283957 GGCCGAGCCCTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTTGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
284022 GATTATGTGT-TTTAATGATGATGTGACTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
* * * * *
284086 GGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACAAGATCAACCAATTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * ** * * *
284151 GCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGGATGAGAAAATT
195 GCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * **
284216 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGT-CCTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
260 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATC-ATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * *
284280 AAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * ** * * *
284345 GCCTTAATTTTTTGATTTATAAGTTATTTAAGGAGACATGAAACTATAGGGATTAAACTACAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
** * * * *
284410 ATGAAAAGTCGCGCTTTATGGCGAAAACTATTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * * *
284443 GACCGAGCCTTGCAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAATTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
284508 GATTATGGGTGTTTATGATGTCGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* ** *
284573 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCTAAAACATGATCAACCATTTAGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
284638 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTCGCTTGTGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
** * * * * * *
284703 TTCAAAAAGCAAGTGAAATATCATTGCATGTAATTTTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
284768 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * *
284833 CTTGA---CTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATCA-GAATTAAATTGCAAAAA
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTAT-AGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
284894 CGAAAAGTCATGCTTTATGGCCATAACTATTT
455 TGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * * *
284926 GACCGAGCCTTTTAAAAGA-TTTTTTCCATCATTTAG-GGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTT-GTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-T
* * *
284989 TA-ATTTTGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTT
64 TAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
* * * * *
285052 AAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGTCCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATAATAAACCATTT
128 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
** * * * * * * * * *
285117 TACCACGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATCTAGATGCGTGATGAGATGTTTGCTTGAGAAAA
193 TGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* * * * ** * *
285182 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATTTATTTGCATCATGATGCTGATTTGTTGCGTTG
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTG
* * * *
285247 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTAAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTAATTTT
323 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * * * * *
285312 TACCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTTATTAGATTCGAAGTTATAGGGATTCAAA-TGCAG
388 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT-AAATTGCAA
* * *
285376 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGACCAAAAGTGTTT
452 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
** * * * * *
285411 GGCCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
285475 GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGATGAAAATGCAAATAT-CTAAAATTTTA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG-TCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTA
* ** * * * **
285538 AAGACATGGTCGCAAAGTTTGTTCCTTGAAAATTCTTATTTAGCTAAAACATGATCAACCATTTT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * * *
285603 GGCTTGTTTTTCTTACTGATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * *** *
285668 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGATGAGTTGTTGAGTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * *
285733 AAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCGGTTTGAAATTGATAAAGTTGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
*
285798 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATTAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * *
285863 GTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * ** * *
285896 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTGTGATTTGGGGATGGTTCGAAACTGATTTGGT-ATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
285960 GAGTATGTGTGTTTATGATGTTGGGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAATTTTAGG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * *
286025 GATTTGGTAGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTACCCCAAACATGATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * ** *
286090 CATGCTTTTCTTGCTGATTTGGAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGGATGAGAAAATT-
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * * * * *
286154 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCCTGCATTTGTACCA-GATGCTAAACTGTTGGGTTGTAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* * *
286218 ATTATTTAGATAGCTAGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTAC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* *
286283 CTTGATTTCTTGATATATATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
* * * *
286348 GAAAAGTCATGCTTTATGGCCATAACTATTT
456 GAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
286379 GATCGAGCCTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATCATTTGGGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TT
* * * * * *
286443 A-ATTTTGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCGAAATGCAACTATGCAAAAATTTG
65 AGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
* * * * ** * * *
286506 GGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTAGCTTAAACAAGATCAACCAATCT
129 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * *
286571 GGCA-GCTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
194 GGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* ** ** * ** * ** *
286635 TATTGTAAAAGTACATGAAATTTCATTGCGCGTATTTGTCCCATGATGCTGAATTGTTGACTTGC
259 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGC
* * * * * *
286700 AAATCATTTAGATTGTTTGGCCGAATCTCTTTGAAATTCATAATGATGATATTGTGCTTATTTTT
324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
286765 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGA-TTGAAAATTATA-GGATTAAACTACAAA
389 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTG-AAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * *
286828 AATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAATTATT-
453 AATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* ** * * * *
286861 --T-GA-CC--G---A-G----CCTTCCATGATATGCGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
286912 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
286977 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCGGAAACATGATCAACCACTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * *** * *
287042 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTAAGATGCGCGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* ** * **
287107 TTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-ATTCGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT-GTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCA
* * * * *
287171 AATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGACGATATTGTGCGTACTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
** ** * * * * *
287236 CCTTCTTTTCTACATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGTAAATA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
287301 TGAAACA-TCACGCTTGATGGCCAAATGTATTT
455 TGAAA-AGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * * *
287333 GACCGAGCCTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATCATTTAG-GGATAGTTCCAAGCTGATTTGGTGATT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTT-GTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-T
* * * *
287396 TA-ATTATCTGT-TTTAATGATGTTGAGATTGACTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
64 TAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
* * * * *
287459 AAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATT
128 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * * * * * * *
287524 TGGCTTGCTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGAGGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
193 TGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
* * * * ** *
287589 ATCTAGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-ATTAGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAGTT
258 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT-GTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTT
** * *
287653 GCAAAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGGTT-TT
322 GC-AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATT
* * *
287717 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGGGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACA
386 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* ** *** * *
287782 AAAATGAATAGTCACACTTTATGGTGAAAAATATTT
451 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * *
287818 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTA
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* ** * * *
287883 GATTATGGGTGTTTACAATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATAGGCAAAAATGTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* ** *
287948 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCTAAAACATAATCAACCATTTTGG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* *
288013 CATGTTTTTCTTGCTGCTTGCAAATTATTTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * *
288078 TTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTTTATCTTGATGCCAAATTGTTAAGTTACAA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTGAGTTGCAA
* *
288143 ATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
326 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * * * * * * *
288208 CTTGA---CTTGATTCATGAGCTATTTAACGAGAGTTGAAATTATAGGGATTAATTTGTAAATAT
391 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
* * *
288270 GAAAAGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTT
456 GAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * * *
288301 GATCTAGCCTTGTAAGGGATTTCTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAGCTGATTTAGTGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * *
288366 GATTATCTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATCCAAAAATTTAAG
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
** * * *
288431 GACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGGAACATGATCAACCATTTTAG
131 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * * ** * * * *
288496 CACGTTTTTCTTGCTGTTTTGAAATTAATCTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGCTTAAGAAAATTC
196 CATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * ** *
288561 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTACTTGTATCATGATGCTGATTTGTTGCA-TTGCA
261 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGGTGCCAAATTGTTG-AGTTGCA
* *
288625 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTAATTTTTG
325 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* *
288690 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATATT-ATGAGATTCGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAA
390 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT-TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * * *
288754 TTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTGTTT
454 ATGAAAAGTCATGCTTTATGCCCAAAAGTATTA
* * * * *
288787 GATCGAGCCTTGTAAAGG-GTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTT
1 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
288851 GATTACGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAA
* * * * * * *
288915 AGACTTGGTCGCAAAGTTTGTTCCTTCAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCGTTTTG
130 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * * * *
288980 GCTTGTTTTTCTAT-CTGATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
195 GCATGTTTTTCT-TGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * ** *
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* * *
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324 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
*
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* * *
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* * * * *
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* *
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*
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* * * ** * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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66 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * ** * * * *
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* * * * *
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* * *
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** * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* ** * *
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
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* * * * * *
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261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * * *
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* * * * ** *
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391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGT
* * *
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456 TGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA------
* * *
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515 TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGG
* * * * * *
257683 ATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGGCAAAAGTTTTTA-ATCTAGCCTTGTAAAG
580 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAA-CTATTAGACCGAGCCTTGTAAAG
* * * *
257747 GATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGGTTATGTGT-TCTTAT
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* * * * * ** ** *
257811 GATGTTGTAATTAATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-GCTAGAAATTTAAAAACCTGGTTGCAATG
707 GATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAG
* ** * * * *
257875 TTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCAAAAACATGATCTACCATTTTAGCTTGTTTTTCTTACT
771 TTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT
* * ***
257940 -AGTTTGAGAGTAATTTAGATGCGCGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGT
836 GA-TTTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGT
* * * * *
258004 GAAATTTCGTTTCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTCTTGAGTTGCAAATCCTTTAAATAGC
900 GAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAA-TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGC
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964 TTGGC-G
* * * *
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1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * *
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** * * * * *
258205 CAAAAGTATTAAACTGTGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGG
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* * * *
258270 TTTCGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTCATTACGGGTCAAAATGCAAATATGC
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
258335 AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTCGTCGAAACATGATC
260 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* ** * * * *
258400 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGTTCCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCA
325 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* * * * * * * *
258465 CGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGATATATCATTGCATGTAATGGTATTATGCTGCCGAATTG
390 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
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455 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
* * *
258595 CTTATTTTTGCCTTCATTTCTTGAATTATAAGTTTTTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
* *
258660 ATTGCAAAAATGAAAAGTCTGGCTTTATGCCCAAAAATATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTT
585 ATTGCAAAAATGAAAAGTCT-GCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT
* * * * *
258724 TTTCCCTAATTTGTGTATGGTTCCAAACTGATTTAGTGATTAGATTATGAGTGTTTATGATGTTG
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*
258789 GGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
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* * * * *
258854 ATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCTTACTGCTTTCAA
779 ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
* * *
258919 ATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCACGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
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* * * * ** *
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* *
259047 AATCTGTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTAGATTTATAAG
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* * *
259112 CTATTTAACGAGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTGATGCTTTATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* *
259177 AAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
259242 TTTTGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-GC
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * * *
259306 TAAAAATTTAAAGACCTGGTCGCAAAGTTTTGTTCCATGGAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGA
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAG-TTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * *
259371 TCAACCATTTTAGCTTGTTTTTCTTACT-AGTTTGGAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
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*
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* * *
259499 TTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATTGCTT-GTCCGAATCTTTTTGAAATTGATAAAGATGATA
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* * * *
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** * * *
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* *
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* * *
259758 TGTTGTGATTGATTACGAGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGGAAAGTTT
709 TGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTT
* * * * * * **
259823 GTTCCAAGAAATTTCTTATTTGGCCGAACCATAATCAACCATTTTGCCATGTTTTTCTTGTTCTT
774 GTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGAT
* * * * * * *
259888 TTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCACGAGAAAATGCTTGTAAAAGCAAGTGATA
839 TTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * *
259953 TATCATTGCATGTAATTGTA-CTATGCTGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
904 TTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
260017 GTCG
967 G-CG
* *
260021 AATCTGTTGGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATATTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * *
260086 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTGTGCCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * *
260151 AAAAGTATTAGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
260216 TTGGTGATTAGATTATGCGTGTTTATGATGTTGTGACTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCG
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
260281 AAAATTTAAGGATTTGGTTACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * **
260346 ACCTTTTTGGCATATTTTTCTTGCT-ACTTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAAAGGTG-TT--
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA--TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
* * * * ** *
260407 -T--G------C----AAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCAAATG
389 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* *
260459 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGAGAAATG-TGATATTG
454 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAA-GATGATA---
* * *
260523 TGCTTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTAGATTTATAAGCTATTT-A-GCAGGGTTTGAAATTA
515 ---TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG-A-GATTTGAAATTA
* * * * * *
260586 TAAGGATTAAATTGCAAACATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGT
575 TAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGT
* * * *
260651 AAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGATTTGATTATGTGTTT
639 AAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGT
* * * * **
260716 TTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-GCTAAAAATTTAAAGACCTGGTTGC
703 TTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGGTTGC
** * * *
260780 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGATGAAACATGATCAACCATTTTAGCTTGTGTTTCT
767 AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCT
* * ** * * *
260845 TACT-AGTTTGAAAGTAATTTAGATGGGTGATAAGGTGTTTGCATGGGAAAATTCTTGTAAAAGT
832 TGCTGA-TTTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGT
*
260909 AGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAA
896 AGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAA-TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGA
260974 TAGCTTGGCCG
960 TAGCTTGG-CG
* * *
260985 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGTTTA-TTTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
261049 TTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAGAAATGAAAAGT--TGGCCTTTATGC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAT-G-CTTTATGG
* * * * *
261112 CCAAAAGCATTAGACCGTGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAACT-
129 CCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTG
* * * * * *
261176 AGTTTCGTGATTAGATTATATATGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAATGCAAATGT
194 A-TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
** * * * *
261241 GCCGAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGTCGAAACGTGA
258 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * * *
261306 TCAACCTTTTTGGCATGTTTTTCTTG-T-ACCTTTCAAATTAATTTAGAAGCATTAAGAGGTGTT
323 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA--TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* * * * * * * * *
261369 TGCACGAGAACATTCTTGTAAAAGCAGGTGATATATCATTGCATGTAATTGTA-CTATGGTACCG
386 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCTG
*
261433 AATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA
450 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA
*
261498 TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGG
515 TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGG
* *
261563 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT-TAGGCTTTATGCCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAG
580 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCT--GCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAG
* *
261627 GATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAACTGATTTGGTGATTAGATTATCTGTGTTTATG
643 GATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATG
*
261692 ATGTTGTGATTGGTTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTT
708 ATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTT
* ** *
261757 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGTAGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGC
773 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA
* * * *
261822 TTTCAAAATAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCACGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
838 TTTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
** * * * * *
261887 ATACCATTGCATGTAATTGTATTATGCTGCCAAATGGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
903 ATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
261952 GCTG
967 GC-G
* * * *
261956 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGAAGATATTGTGCTCATTTTTGCCTTGATTTCTAGGTTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
262021 CTATTTAACGAGGTTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
262086 AAAAGCATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGTTCTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * * * *
262151 TTTTGTGAGTT-GATTATGCGTTTTTATTATGTTGTAATTGATTAGGGTTGAAAATGCAAAT-TG
195 TTTGGTGA-TTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * * * *
262214 TTAAAAATTTAAGGGCTTGGTCGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCTGAAACATGA
259 -CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * **
262279 TCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGAAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
323 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * *
262344 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTCGTTGCACGTATTTGTATCATGATGCT-AAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA-
*
262408 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAGGATGATATT
452 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT
* * * * *
262473 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTCTATGTTATTTTATGAGATTTGAAGTTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * * * * *
262538 TAAAATGTAAAAATGAAAAGTCACGCTTTACGGCCAAAAGTATTTGCCCGAGCCTTGTAAATGAT
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGAT
* * * * *
262603 TTTTTTCCATGATTTGTGGGTGGTTCCAAGCTGATTTGG-GAATTTGATTATGTGTTTTTATGTT
646 TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG-ATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
262667 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCTAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * * * *
262732 TTCCATGAAATTTCTTATTTGGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCACGTTTTTTTTGCTGCTT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
262797 TCAAATTAATTTAGAAGCATTGA-GAGGTGCTTGCATGAGAAAATTCATGTAAAAGTAAGTGAAA
840 TGAAATTAATTTAGATGCATT-ATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
262861 TATCATTGCATGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTAAGATAGTTTGG
904 TTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
262926 TCG
968 -CG
*
262929 AATCTGTTTGAAATTAATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * *
262994 CTATTTAACGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAAAAGGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
263059 AAAAGCATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
263124 TTTGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATTTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* *
263189 AAAATTTAAGGAGTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAAGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* ** * * *
263254 ACCTTTTTAACATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGGGTTTGCTT
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
** ** * * * *
263319 GAGAAAATTCTTGTGCAAGTAGGTGAAATTTTGTTGCATGTATTTGTGTCGTG-TCGTTGATTTG
391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGAT-GCTGAATTG
* * *
263383 TTGA-TTGCAAATCATTTTGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGAGATTGT
455 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
*
263446 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
519 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
* * * * * * * *
263511 AAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTTTTTGGCTGAGCCTTGTAATGAATTT
584 AATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
* * * *
263576 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT-CTGGATTAGTTTATGTGTTTTTATGATGT
648 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGT-GATTAGATTATGTGTGTTTATGATGT
* * * *
263640 TGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAAAAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGT
712 TGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGT
* ** * * * *
263704 TGCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAACATGATCAGCCATTTTGGCTTGCTTTTCTTACTGATTT
776 TCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTT
** * *
263769 GAAACAAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCATTAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATT
841 GAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATT
263834 TCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCT
906 TCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAA-TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGC-
263899 G
969 G
* * * * *
263900 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGAAGATATTGTGCTCATTTTTGCCTTGAGTTCTTGAATTATATG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* ** * * * *
263965 TTATTTTTTGAGATTTGAAATTATACGGATTAAAATGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * *
264030 AAAAAG-ATTTGGCTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAAGGTTCCAAGCTGA
131 -AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * * *
264094 TTTGGGGATTTA-ATTTTGTGTTTTTATGTTGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAACTAT-
195 TTTGGTGA-TTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * ** * *
264157 CTAAAAATTCAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTTTGAAATTTTTTATTTAGCTGAAACATGA
259 C-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * *
264222 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTG
323 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * * * *
264287 GATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCACGTAATTGTATTATGATGCCGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* * * *
264352 TGTTGGGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCCGAATCTCTTTGAAGTTGATAAAGATGATATTG
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
* * * ** *
264417 TGCTTATTTTTGCCGTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTAAACAAGATTTGAAATTATAGGCATT
518 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* * * *
264482 AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTATAAAGGA-T
583 AAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATT
* * * * **
264546 TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTTGTGATTTGACTATGTGT-TATTACAATG
647 TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGT-TTATGATG
* * * * * *
264610 TTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATACAAAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAGGTTTGT
711 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGT
* * * *
264675 TCCATGAAATTTCTTTTTTAGCCGAAACATGATCAACCCTTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATAT
776 TCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTT
* * * * * * * *
264740 GAAATTAATTTACATGCGTGATGCGAG-GTTTGCTTCAGAAAATTCTAGTACAAGTAGGTGAAAT
841 GAAATTAATTTAGATGCATTATGAG-GTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * ** * *
264804 TTCGTTACATGTATTTGTGTCATGTTAATGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTTGATAGCTTGGC
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGC
264869 TG
969 -G
* *
264871 AATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAGTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * *
264936 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCATGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * * * *
265000 CAAAAGTATTTGGCTGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCGAGTTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * *
265064 TTTGGGGATTAGATTATCTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
265128 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTTTTATTTAGCCGAAACAGGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * **
265193 CAA-C-TTTTCGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTG
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * **
265256 CGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTATCCCATGATGCTGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* *
265321 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* *
265386 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * * **
265451 TAAACTACAAAAATGCAAAGTCACGCTTTATTGTGAAAACTATTTA-ACCGAGCCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
*
265515 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTCTGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
265580 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
** * *
265645 TTCCATGAAATTTCTTATTCGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * *
265710 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAAAGTAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * *
265775 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
265840 CG
968 CG
265842 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * *
265907 CTACTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCAAGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
265971 CAAAAGTATTTGGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
266035 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * *
266099 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCTTGAAATTTCTTATTTAACCGAAACAGGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * **
266164 CAA-C-TTTTCGGCTTG-TTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTG
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * * **
266226 CGTGAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTATCCCATGATGCTGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* *
266291 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* *
266356 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * ****
266421 TAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTATGAAAACTATTTA-ACCGAGCCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
266485 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
266550 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
** * *
266615 TTCCATGAAATTTCTTATTCGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
266680 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTACATGAGAAAATTCCTCTAAAAGTAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * *
266745 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
266810 CG
968 CG
*
266812 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCGTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * *
266877 CTACTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGCATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCAAGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * * *
266941 CAAAAGTATTTGGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
267005 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
267069 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCTTGAAATTTCTTATTTAACCGAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * **
267134 CAA-CTTTTTGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGAGGCATTTGC
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
**
267198 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGCTGAATT
389 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* * *
267263 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATTA
454 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATTG
* * *
267328 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTAGAAGGATT
518 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* * * * ** * **
267393 AAACTACAAAATTGTAAAGTCACACTTTATTGTGAAAACTATTTA-ACCGAGCCTTGTAAAGGAT
583 AAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-
267457 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
* *
267522 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTA
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * * *
267587 TTCCGTGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * *
267652 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATT-TCTCTAAAAGTAGGTGAAA
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCT-TGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
267716 TATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAG
904 TTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-G
*
267781 TCG
967 GCG
* *
267784 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTCATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
267849 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGCAAAAATGAAAACTCATGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * *
267913 CAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
267977 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
*
268041 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * ** *
268106 CAA-C-TTTTCGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGTGTGATGAGGCATTTA
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * ** *
268169 CGTGAGAAAATTCTTGGAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGATGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* * *
268234 TGTTGAGTTGCAAATCATATAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* *
268299 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * * * *
268364 TAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTGCGAAAACTATTTA-ACCGAACCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
268428 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
268493 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * *
268558 TTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
268623 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAAAGGAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * *
268688 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
268753 CG
968 CG
*
268755 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCGTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
268820 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCAAGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
268884 CAAAAGTATTTGGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
268948 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
269012 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAGGA
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTT-CCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * * * **
269077 TCAA-C-TTTTCGGCTTG-TTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTT
323 TCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
* * **
269139 GCGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTATCCCATGATGCTGAA
387 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
* *
269204 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATAT
452 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATAT
* *
269269 TATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
516 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
* * * * * **
269334 TTAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTGTGAAAACTATTTA-ACCGAGCCTTGTAAAGG
581 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGG
269398 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
644 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
*
269463 TGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTT
709 TGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTT
* * *
269528 GTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGAT
774 GTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGAT
* * * *
269593 TTCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAAAGTAGGTGAAA
839 TTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
269658 TATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAG
904 TTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-G
*
269723 TCG
967 GCG
*
269726 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCGTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
269791 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCAAGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
269855 CAAAAGTATTTGGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
269919 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
269983 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTT-CTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAGGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * **
270047 CAA-C-TTTTCGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTG
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * **
270110 CGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTATCCCATGATGCTGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* *
270175 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* *
270240 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * * **
270305 TAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTGTGAAAACTATTTA-ACCGAGCCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
270369 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
270434 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * *
270499 TTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * *
270564 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAAAGTAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * *
270629 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
270694 CG
968 CG
270696 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
270761 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCAAGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
270825 CAAAAGTATTTGGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
270889 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
*
270953 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * **
271018 CAA-C-TTTTCGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTG
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * **
271081 CGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTATCCCATGATGCTGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* *
271146 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* *
271211 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * * * *
271276 TAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTGCGAAAACTATTTA-ACCGATCCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
271340 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
271405 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * *
271470 TTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
271535 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAAAGGAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * *
271600 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
*
271665 TG
968 CG
*
271667 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCGTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * *
271732 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCATGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
271796 CAAAAGTATTTGGCCGAGACTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
271860 TTTGGGGATTAGATTATGTG-TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * *
271923 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTGCTTGAAATTTCTTATTTAACCGAAACAGGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * **
271988 CAA-C-TTTTCGGCTTG-TTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGCGTGATGCGGCATTTG
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * * **
272050 CGTGAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTATCCCATGATGCTGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* *
272115 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* *
272180 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * ****
272245 TAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTATGAAAACTATTTA-ACCGAGCCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
272309 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
272374 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * *
272439 TTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
272504 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAAAGGAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * *
272569 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
272634 CG
968 CG
* **
272636 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTCTTTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * *
272701 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGCAAAAATGAAAACTCATGCTTTCTAGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * *
272765 CAAAAATATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
272829 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
272893 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTACTTAGCCGAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * ** *
272958 CAA-C-TTTTCGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGACGTGTGATGAGGCATTTA
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * ** *
273021 CGTGAGAAAATTCTTGGAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGATGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* * *
273086 TGTTGAGTTGCAAATCATATAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* *
273151 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * * * *
273216 TAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTTTATTGCGAAAACTATTTA-ACCGAACCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
273280 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
273345 GTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * *
273410 TTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCGGAATGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
273475 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAAAGGAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * *
273540 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
*
273605 TG
968 CG
273607 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
273672 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAATCAAGCTTTCTGGC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * * * *
273736 CAAAAGTATTTGGCCGAGACTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATGGTTTGTGGATGGTTCCGAGCTGG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
273800 TTTGGGGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
273864 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTACAAAGTTTGTTCCTTGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * **
273929 CAA-C-TTTTCGGCTTGTTTTTCTTACTAATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGCATTTG
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * ** *
273992 CGTGAGAAAATTCTTGTAAAACTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATAATGCTGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* * * *
274057 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATGGCTTAGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATAATGATGGATATT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGAT-GATATT
* * *
274122 ATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAGTTATTTAATGAAATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * * * * **
274187 TAAACTACAAAAATGTAAAGTCACGCTCTATTGAGAAAACTATTTA-ACCGAGCCTTGTAAAGGA
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
*
274251 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGATTATGAT
645 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
* * *
274316 GTCGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTAGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* ** * *
274381 TTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTCAGAATGTTTTTCTTGTTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
274446 TCAAATTAATTTAGATGCATTAGGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCCTCTAAGAGTAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * * * *
274511 ATCATTGCATGTAATTGAATTATGATGCCGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGGTTAGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GG
274576 CG
968 CG
*
274578 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTACAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
274643 CTATTTAACT-AGGTTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCGAAAATGAAAAGTCGTGCTTTATGCC
66 CTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * * * * *
274707 CAAAAGTATTAGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTATTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAACAGA
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* ** * **
274772 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTCAATGATGATGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAACGTGC
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * * * *
274837 AAAAATTTAAGGAATTGGTTG-AAGCGTTTGTACCTTGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGAT
260 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA-AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * *
274901 CAACCAATTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGCGTTTGC
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
** *
274966 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGCTGAGTT
389 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* * *
275031 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTCATAATGATGATATTGT
454 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
* * * * *
275096 GCTTATTTTTTCCTTAATTTTTTCACTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
519 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
* *
275161 AATTGCAGAAATGAAAAGTCATGCTTTATGG-CAACAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATT
584 AATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAA-AACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-T
* * * *
275225 TTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACAGATTTAGG-GATTAGATTATGGGTGTTTATGAT
646 TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
*
275289 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * * * **
275354 TTCCACGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGACCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTCCTT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* *
275419 T-AGAATTAGA-TTAGATGCATTAAGAGGTGTTCGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
840 TGA-AATTA-ATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * * * *
275482 ATTTCATTGCGTGCATTTGTACCATGATGCTGAACTGTTGGGTTGCAAATTATTTATATAGCTAG
903 ATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
275547 GTCG
967 G-CG
* * *
275551 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCTTTGATTCCTTGATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
*
275616 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * ** * *
275681 ATAACTATTTGACCGAGCCTT-TCAAAGGA-TTTTTTCCATCCTTTGGGGAAGGTTCCAAGCTGA
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGT-AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * ** *
275744 TTTGGTGATTTA-ATTTTGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAACACAAATATA
195 TTTGGTGA-TTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * * **
275808 CAAAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTA-CTTAAAGACATG
259 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC-CGAA-ACATG
* * *
275872 ATCAACCATTTTGGCCTATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAAATGCGTGATGAGGTGTTT
322 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
* ** * * * * * *
275937 ACAAAAGAAAATTCTTGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATATACTCGTATCATGGTGCTGAA
387 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
* ** *
276002 -TGTTGAGTAGCAAAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATAT
452 TTGTTGAGTTGC-AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
*
276066 TGTGCATATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
516 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
* * * *
276131 TTAAACTACAAAAATGAAAAGTC-ACATTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGG
581 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCTGC--TTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGG
* * * * *
276195 ATTTTTTCCCATGA-TTGTGGATGGTTTCAAACAGATTTTGCGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
644 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
* * * * * *
276259 TGTTGCGATCGATTATGGGTCAAAATGCAACTATGCAAAATTTTAAGGATATGGCTGCAAAGTTT
709 TGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTT
* * * * *
276324 GCTCCATGAAATTTGTTATATAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGCCATGTTTTTCTTGCTGAT
774 GTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGAT
* * * * * *
276389 TTGAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAGAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAA
839 TTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* ** * *
276454 TTTCATTGCATGTATTCGTCCCATGATGCTGAATTGTTAAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGG
904 TTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
*
276519 TCA
968 -CG
* * * *
276522 AATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * *
276587 TTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGCAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * ** * *
276652 AGAAGTATTTAACCAAGCCTTGCAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGGCGGTTTCAAACTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * ** *
276717 TTGGGGATTTGATTATGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAACTATGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * * *
276782 AAAATTTAAAGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAACCAAAACAAGATCC
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * *
276847 ACCGTTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAAATGTGTGATGAGGTATTTGCAA
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * * * *
276912 AAGAAAATTCTTGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGT
391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGT
** *
276977 TGAGTTGCAAAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTATG
456 TGAGTTGC-AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
*
277042 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAATAA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
* * *
277107 ATTGCAAAAATGAAAAGTCATGGTTTATGGCCAAAAGTGTTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT
585 ATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT
* * *
277172 TTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACAGATTTGGTGATTTA-ATTATCTGTGTTTATGATGTT
649 TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
277236 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
713 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
* * * * * *
277301 CATGAAGTCTCTTATTTGGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTCA
778 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
* * *
277366 AATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATC
843 AATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
* * * * * * *
277431 ATTGCATGCAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTAAGTTGCAAATCTTTTAGATGGCTTGGTCG
908 ATTGCATGTATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-CG
* *
277495 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGTTGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
277560 CTATTTAACGAGATTTGAAATTATTGGAATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTCTATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
277625 AAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCCGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
277690 TTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATACGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
277755 AAAATTTAAGGATTTGCTTGCAAAGTGTGTTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
261 AAAATTTAAGGA--------C----T-TG---G-TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
* * *
277820 TAGCGGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATCCC
309 TAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
* * **
277885 TAATGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTC-TGATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTAC
374 TGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTG-TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* *
277949 ATCATGATGAT-AATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATT
438 ATCATGATGCTGAA-TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT
*
278013 GATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATT
502 GATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
** * * * * * *
278078 TGAAATTATAGGGATTAAAACGTAAAATTGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGGCCG
567 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCG
* * *
278143 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTA
631 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTA
* ** * * **
278208 TGTGTTTTTATGGGGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACA
696 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATT
* * *
278272 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATTATCAA-CATTTTCGACTT
760 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GGCAT
* ** * * * *
278336 GTTTATCTTATTGATTTGAAAGTATTTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTG
824 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTG
* * * ** * *
278401 TAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATATATTTGTATCATGATGGGGATTTGTTGGGTTGCAAATC
889 TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGAT-GCTAATTGTTGAGTTGCAAATC
*
278466 ATTTAGATAGCTTGGTCA
953 ATTTAGATAGCTTGG-CG
*
278484 AATCGGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* *
278549 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGCATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* *
278614 AAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
278678 TTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATTTGC-
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
278742 AAAATTTAAAGTATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
261 AAAATTT-AAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * * *
278807 AACCATTTTGGAATGTTTTTCTTGCTCATTTGGAATTAGTTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCA
325 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* * * **
278872 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCGTGCATTTGTACCATGATGCTGAACAG
390 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
* * * * *
278937 TTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTAGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAAATGATATTGTG
455 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
* * * * * *
279002 CTTATTTTTGCTTTGATTTCTTGATTTATATGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATCGGAATTAA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
* * * *
279067 ATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTT
585 ATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT
* * * * * *
279132 TTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAGCCGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTG
649 TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTG
* * * * * * *
279197 TAATTGATTAGGGGTCAAAATCCGAATACGCAAAAATTTAAGGATTTGCTTACAAAGTTTGTTCC
714 TGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
*
279262 ATGAAATTTCTTATTTAGCGGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
779 ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
* * * * *
279327 ATTAATTTAGATGCGTAATGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTGGTAAAAGTAGGTGAAATTTCG
844 ATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
** *
279392 TTGCATGTATTTACATCATGATGATAATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCTG
909 TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAA-TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGC-G
279455 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * ** * *
279520 TTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAACGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGAC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* *
279585 AAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
279650 TTGGGGATT-GATTATGTGTTTTTATG-TGGTTGTGTTTGATTAGGGGTGAAAATACAAATAT-C
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGAT-GTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
279712 TAAAAATTTACGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTACCCGAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* ** *
279777 CAA-CATTTTCGGCTTGTTTTTCTTATTGATTTGAAAGT-ATATTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
324 CAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT-TTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
* *
279840 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATATATTTGTATCATGATGCT-AA
387 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA
* *
279904 TTTGATGAGTTGCAAATCATTTAAGATAGCTTGGCCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA
452 -TTGTTGAGTTGCAAATCATTT-AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA
* * * ** *
279969 TTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTTATTTGTAAGTTATTT-ATGAGATTCAAAACTATAGGG
515 TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGG
* * * * * * *
280033 ATTAAAATGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTACGGCCAAAAGTATTTGGCCGACCCTTGTAAAGT
580 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAG-
* * * * * *
280098 G-CTTTTTTCCATGATTTGTGGTTGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATG
643 GATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATG
* * * * * ** *
280162 TTGTTTTGAATGATTAGGGGTTAAAATGCAAATAT-CAAAAAATTTAAGGGCTTAGTTGCAAAGT
708 ATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGT
* * * *
280226 TTGTTTCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCTTTTTGGCTTGTTTTTCTTACTG
772 TTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTG
* * * * *
280291 ATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTCCATGAG-AAATTCTTGTAAAAGTAGATGA
837 ATTTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGA
* * * * * *
280355 AATTTCATTACCTGTATTTGTATCGTGATACTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTT
902 AATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
280420 GGTCG
966 GG-CG
* *
280425 AATCTGTTTGAAATTGAAAAAGATGATATTCTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * ** *
280490 TTATTTAATGAGATTTGAAA-TATTAGGGATTAAACTGCGAAAGCGAAAAGTCAAGCTTTATGGC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTA-TAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
** * * *
280554 C-TTAGCTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGAAGGTTCCAAGCGG
130 CAAAAG-TATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTG
* * *
280617 ATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
194 ATTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * * * *
280682 CAAAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCGTGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATAAT
259 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * *
280747 CAACAAATTTGGCACGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGC
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
* *
280812 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGTTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATT
389 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAA-T
280876 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAAGATAGCTTGG-CTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
453 TGTTGAGTTGCAAATCATTT-AGATAGCTTGGTC-GAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
* * * * * * *
280940 TATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTTATTTGTAAGTTATTT-ATAAGATTTAAAACTATAGGGT
516 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
* * * * * *
281004 TTAAAATGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTACGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGG
581 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAA-GG
* * * * * * * * *
281069 TTTTTTTTGCATGATTTGTGGTTGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTTTGTGTTTTTATGT
644 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
* * * * * **
281134 TGTTTTGAATGATTAGGGGTGAAAATGCAAATA-ACAAAAAATTTAAGGGCTTGGTTGCAAAGTT
709 TGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTT
* * * * * *
281198 TGTTTCATAAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCTTTTTGGCTTCTTTTTCTTACTGA
773 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA
* * * * *
281263 TTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTCCATGAG-AAATTCTTGTAAAAGTAGATGAA
838 TTTGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * *
281327 ATTTCATTACCTGTATTTGTATCATGATACTGATTTGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGTTTG
903 ATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
281392 GTCG
967 G-CG
* * *
281396 AATCTGTTTGAAATTGAAAAAGATGATATTCTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * *
281461 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTGCGAGAATGAAAAGTCAAGCTTTGTGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
281526 AAAACTATTTGACTGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGTTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
281591 TTGATGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * *
281656 AAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * *
281721 ACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCCGGTTTGAAATTAATTTTGATGTGTGATGAGGCGTTTGCAT
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * ** * *
281786 CAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGTTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCCATGATGATGAATTAT
391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGT
* * * *
281851 TGAGTTGCAAATCATTTTGATACCTTAGTCGAATCTGTTCGAAA-T--T---GAT-A-ATTGTGC
456 TGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC
281908 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
521 TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
* * * * * *
281973 CTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTCTTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTT
586 TTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTT
* * *
282038 TCCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGT
650 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGT
* *
282103 GATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATAAGCAAAAA-TTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTACA
715 GATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
* * *
282167 TGAAATTTCTTACTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGCCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
780 TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
* * *
282232 TCAACTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAGAA-TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
845 TTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAA-AATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
282296 TTGCATGTATTTGTACCTTGATGTTGAATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGATAGCTTGCTCG
909 TTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG-GCG
* * * *
282359 AATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * * *
282424 TTATTTAAAGAGATTTGAATTTATAGGGATTGAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
282489 AAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTTCCAAACAGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * ** * * * *
282554 TTGGGGATTTGATTTTGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGACTAAGGGCCAAAATGAAAATATGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* *
282619 AAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCC-ATAACAAGATC
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGA-AACATGATC
* * *
282683 AACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTAATTCGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
325 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* * * *** * *
282748 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGCATTCAAATCATGGTGTTGAATTG
390 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
* * * * * * *
282813 TTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTCGATTGAATCTATTTGAAACTGATAAAGACGATATTGTG
455 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
* *
282878 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTGATCAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
* * * *
282943 ATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCAAAAAGTATTAGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTGT
585 ATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT
* * * *
283008 TTCCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTACGTGT-TTTAATGATGTT
649 TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTT
* * * *
283072 GTCATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTCAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTC
713 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
* ** *
283137 CATGAAATTTCATATTTAGCTTAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
778 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
** * *
283202 AATTAATTTAGATGTGTGATGAGGCGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
843 AATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
*
283267 ATTGCATGTATTTGT-CCAATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG
908 ATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-CG
* * *
283331 AATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTAGCCTTGATTTCTTGATTTGTAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * ** * *
283396 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGAATTAAACTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCG
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
283461 AAAACTATTTAACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAAGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*** **
283526 TTGGTGATTAGATTATGTACGTTTATGATGTTGTGATTGATTATAGGTCAAAATGCAAATATGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
283591 AAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * *
283656 ACCATTTTGGAATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATAAAT-AGGTGTTTGCA
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT-GATGAGGTGTTTGCA
* * ** * * *
283720 TGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAAATATATTATGATGCGGAATTG
390 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
* *
283785 TTGAGTTGCAAATAATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAAATGATATTGTG
455 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
** * * *
283850 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATTGGCTATTTAACGAGATTTGAAATCATAGGGATTAA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
* * *** * *
283915 ATTACAAAAATGAAAAGTCATGTTTTATGGCCAAAGGGATTAGGCCGAGCCCTGTAAAGGATTTT
585 ATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTT
* * *
283980 TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTTGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGAT
649 TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTT
* * *
284044 GTGACTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTC
713 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
* * * * *
284109 CATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACAAGATCAACCAATTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGA
778 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
** * *
284174 AATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGGATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
843 AATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
* * *
284239 ATTACATGTATTTGT-CCTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCG
908 ATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-CG
* * * *
284303 AATCTATTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTAATTTTTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * ** * * * ** *
284368 TTATTTAAGGAGACATGAAACTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCGCGCTTTATGGCG
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * **
284433 AAAACTATTTGACCGAGCCTTGCAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAATTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
284498 TTGGTGATTAGATTATGGGTGTTTATGATGTCGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * **
284563 AAAATTTAAAGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCTAAAACATGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * * *
284628 ACCATTTAGGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTCGCTT
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* ** * * * *
284693 GTGAAAATTCTTCAAAAAGCAAGTGAAATATCATTGCATGTAATTT-TATCATGATGCCGAATTG
391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATTTGTATCATGATGCTGAATTG
284757 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
455 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
* * *
284822 CTTATTTTTGCCTTGA---CTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATCA-GAATTA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTAT-AGGGATTA
* * * * *
284883 AATTGCAAAAACGAAAAGTCATGCTTTATGGCCATAACTATTTGACCGAGCCTTTTAAAAGA-TT
584 AATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
* * *
284947 TTTTCCATCATTTAG-GGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTA-ATTTTGTGT-TTTAATGAT
648 TTTTCCATGATTT-GTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTT-ATGAT
* * * *
285009 GTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTG
710 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * * ** *
285074 TCCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATAATAAACCATTTTACCACGTTTTTCTTGCTGATT
775 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * *
285139 TGAAATTAATCTAGATGCGTGATGAGATGTTTGCTTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
840 TGAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * *
285204 TTCATTGCATTTATTTGCATCATGATGCTGATTTGTTGCGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGT
905 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-
*
285269 CA
968 CG
* * * * *
285271 AATCTGTTTAAAATTGATAAAGACGATATTGTGCTAATTTTTACCTTGATTTCTTGATTTACAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * * *
285336 TTATTTTATTAGATTCGAAGTTATAGGGATTCAAA-TGCAGAAATGAAAAGTCATGCTTTATGAC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT-AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * *
285400 CAAAAGTGTTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAA
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
285464 TTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGATGAAAATGCAAATAT-C
195 TTTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * * * * **
285528 TAAAATTTTAAAGACATGGTCGCAAAGTTTGTTCCTTGAAAATTCTTATTTAGCTAAAACATGAT
260 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * *
285593 CAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTTACTGATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
324 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
* * *
285658 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGATGAGTT
389 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATT
* * *
285723 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCGGTTTGAAATTGATAAAGTTGATATTGT
454 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
*
285788 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATTAGATTTGAAATTATAGGGATTA
519 GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
* *
285853 AATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
584 AATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
** * * *
285918 TTTTCTGTGATTTGGGGATGGTTCGAAACTGATTTGGT-ATTAGAGTATGTGTGTTTATGATGTT
648 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
* * * *
285982 GGGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAATTTTAGGGATTTGGTAGCAAAGTTTGTTC
713 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
* * * * *
286047 CACGAAATTTCTTATTTACCCCAAACATGATCAACCATTTTGGCATGCTTTTCTTGCTGATTTGG
778 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
* * *
286112 AATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGGATGAGAAAATT-TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTT
843 AATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
* * * * * * * *
286176 ATTGCCTGCATTTGTACCA-GATGCTAAACTGTTGGGTTGTAAATTATTTAGATAGCTAGGTCG
908 ATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-CG
* * *
286239 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTTCTTGATATATATG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
*
286304 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * * *
286369 ATAACTATTTGATCGAGCCTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATCATTTGGGGATGGTTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
286433 TTGGTGATTTA-ATTTTGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCGAAATGCAACTATGC
196 TTGGTGA-TTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
** * * * ** *
286497 AAAAATTTGGGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTAGCTTAAACAAGATC
260 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * *
286562 AACCAATCTGGCA-GCTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
325 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* ** ** **
286626 TGAGAAAATTATTGTAAAAGTACATGAAATTTCATTGCGCGTATTTGTCCCATGATGCTGAATTG
390 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTG
* * * * * * *
286691 TTGACTTGCAAATCATTTAGATTGTTTGGCCGAATCTCTTTGAAATTCATAATGATGATATTGTG
455 TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
286756 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGA-TTGAAAATTATA-GGATTA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTG-AAATTATAGGGATTA
* * * * *
286819 AACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAATTATTTGACCGAGCC-------------
584 AATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
* * * *
286871 --TTCCATGATATGCGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
648 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
286934 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
713 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
* *
286999 CATGAAATTTCTTATTTAGCGGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
778 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
* *** * *
287064 AATTAATTAAGATGCGCGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTC
843 AATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC
* ** *
287129 ATTGCATGTATTCGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCG
908 ATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-CG
* * * * ** ** *
287193 AATCTGTTTGAAATTGATATAGACGATATTGTGCGTACTTTTGCCTTCTTTTCTACATTTATAGG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * * *
287258 TTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGTAAATATGAAACA-TCACGCTTGATGGC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAA-AGTCATGCTTTATGGC
* * * *
287322 CAAATGTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGA-TTTTTTCCATCATTTAG-GGATAGTTCCAAGCTG
130 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTT-GTGGATGGTTCCAAGCTG
* * * *
287385 ATTTGGTGATTTA-ATTATCTGTTTTAATGATGTTGAGATTGACTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
194 ATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT
* * * *
287449 GCAAAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGA
258 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * *
287514 TCAACCAATTTGGCTTGCTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGAGGCGTGATGAGGTGTTTG
323 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* * * * * * *
287579 CAAGAGAAAAATCTAGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTAGTATCATGGTGCTGAAT
388 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
* ** *
287644 TGTTAAGTTGCAAAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATT
453 TGTTGAGTTGC-AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT
* *
287709 GTGGTT-TTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGGGATTTGAAATTATAGGGAT
517 GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGAT
* * * ** ** * *
287773 TAAACTACAAAAATGAATAGTCACACTTTATGGTGAAAAATATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAT
582 TAAATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGAT
* * **
287838 TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGGGTGTTTACAATG
646 TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATG
* * *
287903 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATACAAATAGGCAAAAATGTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGT
711 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGT
* ** * *
287968 TCCATGAAATTTCTTATTTTGCTAAAACATAATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTG-CTT
776 TCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTT
* * *
288032 GCAAATTATTTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTCTAAAAGTAGGTGAAAT
841 G-AAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
* * * * * *
288097 ATCATTGCATGTAATTT-TATCTTGATGCCAAATTGTTAAGTTACAAATCATTTAGATAGTTTGG
905 TTCATTGCATGT-ATTTGTATCATGATG-CTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
288161 TCG
968 -CG
* * *
288164 AATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGA---CTTGATTCATGAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * * *
288226 CTATTTAACGAGAGTTGAAATTATAGGGATTAATTTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTAATGGCC
66 CTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
288291 AAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAGGGATTTCTTTCCATGATTTGTGGATGATTCCAAGCTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * * *
288356 TTAGTGATTTGATTATCTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATCCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
288421 AAAATTTAAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGGAACATGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * *
288486 ACCATTTTAGCACGTTTTTCTTGCTGTTTTGAAATTAATCTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGCTT
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * *
288551 AAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTACTTGTATCATGATGCTGATTTGT
391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGT
*
288616 TGCA-TTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTG
456 TG-AGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
* *
288680 CTAATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATATT-ATGAGATTCGAAATTATAGGGATTA
520 CTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT-TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
* * * * * * * *
288744 AAATGCAAAATTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTGTTTGATCGAGCCTTGTAAAGG-GTT
584 AATTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
* * * * *
288808 TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTACGTGTTTTTATGATGTT
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* * * * *
288873 GTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAAGACTTGGTCGCAAAGTTTGTT
713 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTT
* * * * *
288937 CCTTCAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCGTTTTGGCTTGTTTTTCTAT-CTGATTT
777 CCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCT-TGCTGATTT
* * * *
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841 GAAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATT
* *
289066 TCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTC
906 TCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-C
289131 G
969 G
* * * *
289132 AATCGGTTTGAAATTGATAAACATGATATTGTGCTTGTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
*
289197 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
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* * * *
289262 AAAACTATTTGACCGAGTCTTATAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGAT
131 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
289327 ATGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGTTTACGGGTCAAAATGCAAATATGCA
196 TTGGTGATTAGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* *
289392 AAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
261 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * * *
289457 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTACGGATTTGGAATTAATTTAGATGCTTTAAGAGGTGTTTGGAC
326 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * * * *
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391 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGT
* * * * *
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456 TGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC
* * *
289652 TTATTTTCGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGCTTAAA
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* * * * *
289717 TTGCAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTATGGCCAGAACTATTTGACCGAGCCTTTTACAGGA-TTTT
586 TTGCAAAAATGAAAAGTC-TGCTTTATGGCCAAAACTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTT
* * * * * *
289781 TTCCATCATTTAG-GGATGGTTCTAAGCTGATTTGGTGATTTA-ATTTTCTAT-TTTAATGATGT
650 TTCCATGATTT-GTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGT
* * * *
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712 TGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTT
* * * * * * *
289908 CAATGAAATTTCATATTTAGCTGAAA-ATAACCAACCAATTTGGCATGCTTTTCTTGCTGATTTG
777 CCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTG
* * * *
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842 AAATTAATTTAGATGCATTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTT
* ** *
290037 CATTGCGTGTATTTGTCCCATGATGCTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCG
907 CATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG-CG
* * * *
290101 AATCTCTTTGAAATTGATAATGATGATATTATGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
1 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * * *
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*
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* * *
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* *
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*
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AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
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AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
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TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAA
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GCATGTATTTGTATCATGATGCTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGCG
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*
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Statistics
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GTGATTGATTATGTC
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*
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1 TT
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* * * * * *
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**
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* * * *
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*
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* * * * * **
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*
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* * * *
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* *
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GGAGTATCCCCAATT
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* * * * *
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* * * * *
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* ** *
291556 GCGAAATCAATATTTTGGGAATAAAGCC
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* **
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* *
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*
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* * *
291742 GGGGTTGGAGTATCCCTTTGGAAATAACGGGGTTGGAGTATCTCGGATTAT-AGAAA
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291798 ATTAGTGTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TAGGAAATAAAGTAGGGATTGGAGTATCCCCTCGAAAATAACGGGGTTGGAGTATCCCCAATTAT
GAGAAATCAATATTTTAAGAATAAAGCA
Found at i:294307 original size:19 final size:19
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*
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*
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** *
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TGTATCGATACAAAACTTA
Found at i:294313 original size:32 final size:32
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Indices: 294272--294343 Score: 126
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294262 GCTTCCTAGT
*
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*
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Statistics
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0.95 0.05 0.00
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32 38 1.00
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GATACATTGTATCGATACAAAACTTATGTATC
Found at i:294316 original size:13 final size:13
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294288 ACAAAACTTA
294298 TGTATCGATACAT
1 TGTATCGATACAT
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1 TGTATCGATACA
294323 ACACTTATGT
Statistics
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1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 12 1.00
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Consensus pattern (13 bp):
TGTATCGATACAT
Found at i:295199 original size:28 final size:28
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295158 TGAGGACTAA
295168 AAAGTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTG
1 AAAGTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTG
** *
295196 AAAG-G-CATCCTGCTC-TTTGAGGAC--TG
1 AAAGTGCCA-CCAACTCGTGTG-GG-CTTTG
*
295222 AAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTG
1 AAA-GTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTG
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1 AAAG
295255 GCATCCTGCT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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27 10 0.23
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AAAGTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTG
Found at i:295223 original size:26 final size:26
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295184 GTGTGGGCTT
295194 TGAAAGGCATCCTGCTCTTTGAGGAC
1 TGAAAGGCATCCTGCTCTTTGAGGAC
** * * *
295220 TGAAAGGTGCCA-CCAACT-TGTGTGGGC
1 TGAAA-G-G-CATCCTGCTCTTTGAGGAC
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1 --TGAAAGGCATCCTGCTCTTTGAGGAC
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1 TGAAAGG
295282 TGCCACCAAC
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 10, Indels: 14
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Matches are distributed among these distances:
26 14 0.31
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TGAAAGGCATCCTGCTCTTTGAGGAC
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Indices: 295147--296323 Score: 1446
Period size: 55 Copynumber: 21.0 Consensus size: 55
295137 AATAAAGTGT
* * * *
295147 ATCCGGCTCTTTGAGGACTAAAAAGTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTGAAAGGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
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1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
*
295257 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT-AAGAGGT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAA-AGGC
* * * *
295312 GTCCTGCTTTTTGAGGACTGGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
* * *
295367 GTCCTACTCTTTGGGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
*
295422 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT-AAGAGGT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAA-AGGC
* * ** *
295477 GTCCTGCTTTTTGAGGACTGAAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
* * *
295532 GTCCTGCTCTTTGGGGACTGAAAGGTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTGAAAAGAAAAAGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTG-AAAG-----GC
*
295593 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT-AAGAGGT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAA-AGGC
* * *
295648 GTCCTGCTCTTTGAGGACTGGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
* *
295703 GTCCTGCTCTTTGGGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAAGAAAAAGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTG-AAAG-----GC
*
295764 ATCCTGCTCTTTGAGGACTAGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
* *
295819 ATCTTGCTCTTTGAGGACTGGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
* **
295874 ATCTTGCTCTTTGAGGACTGAAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGAGAAGGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT-----GA-AAGGC
* *
295935 ATCCTGCTCTTTGAGGACTG-AAGGTGCCACTAACTTGTGTGGGCTTT-AAGAGGT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAA-AGGC
* * **
295989 GTCCTGCTCTTTGAGGACTGGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGAT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
* * * **
296044 GTCTTGCTCTTT-AGGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTAGGCTTTGAAAGAT
1 ATCCTGCTCTTTGA-GGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
* * * *
296099 GTCTTGCTCTTTGGGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTATGTGGGCTTTGAAAAGAAAAAGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTG-AAAG-----GC
* **
296160 ATCCTGCTCTTTGAGGACTAGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGAT
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
*
296215 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
*
296270 ATCCTGCTCTTTGAGGACTGGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGG
1 ATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGG
296324 AGAAGGCGTC
Statistics
Matches: 1010, Mismatches: 68, Indels: 88
0.87 0.06 0.08
Matches are distributed among these distances:
53 1 0.00
54 43 0.04
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59 2 0.00
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62 8 0.01
ACGTcount: A:0.24, C:0.20, G:0.28, T:0.28
Consensus pattern (55 bp):
ATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGC
Found at i:295676 original size:171 final size:166
Alignment explanation
Indices: 295152--296317 Score: 1679
Period size: 171 Copynumber: 6.9 Consensus size: 166
295142 AGTGTATCCG
* * ** *
295152 GCTCTTTGAGGACT-AAAAAGTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTGAAAGGCATCCTGCTCTTTGA
1 GCTCTTTGAGGACTGGAAAA-TGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGG
295216 GGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAG-GCATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAA
65 GGACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGAGCATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAA
295280 GGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
130 GGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
* *
295317 GCTTTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTACTCTTTGGG
1 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
295382 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAG-GCATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAG
66 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGAGCATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAG
295446 GTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
131 GTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
* *
295482 GCTTTTTGAGGACTGAAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
1 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
*
295547 GACTGAAAGGTGCCACCAACTCGTGTGGGCTTTGAAAAGAAAAAGCATCCTGCTCTTTGAGGACT
66 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTG-AAAG----AGCATCCTGCTCTTTGAGGACT
295612 GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
126 GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
295653 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
1 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
295718 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAAGAAAAAGCATCCTGCTCTTTGAGGACT
66 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTG-AAAG----AGCATCCTGCTCTTTGAGGACT
* ** *
295783 AGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAA-AGGCATCTT
126 -GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT-AAGAGGTGTCCT
** * *
295824 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGCATCTTGCTCTTTGAG
1 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
**
295889 GACTGAAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGAGAAGGCATCCTGCTCTTTGAGGACT
66 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTG-AA--AG-A-GCATCCTGCTCTTTGAGGACT
*
295954 G-AAGGTGCCACTAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
126 GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
* * *
295994 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGATGTCTTGCTCTTTAGG
1 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
* * *
296059 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTAGGCTTTGAAAGATG--TCTTGCTCTTTGGGGACTGAAA
66 GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGA-GCATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAA
* * **
296122 GGTGCCACCAACTTATGTGGGCTTTGAAAAGAAAAAGCATCCT
130 GGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT---AAG---AGGTGTCCT
* * * *
296165 GCTCTTTGAGGACTAGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGATATCCTGCTCTTTGAG
1 GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
*
296230 GACTGGAAA-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAG-GCATCCTGCTCTTTGAGGACTGGAA
66 GACT-GAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGAGCATCCTGCTCTTTGAGGACT-GAA
*
296293 A-ATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
129 AGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
296318 GAAAGGAGAA
Statistics
Matches: 921, Mismatches: 55, Indels: 44
0.90 0.05 0.04
Matches are distributed among these distances:
164 17 0.02
165 274 0.30
166 10 0.01
167 2 0.00
168 3 0.00
169 7 0.01
170 122 0.13
171 470 0.51
172 14 0.02
173 2 0.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.20, G:0.28, T:0.28
Consensus pattern (166 bp):
GCTCTTTGAGGACTGGAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGGTGTCCTGCTCTTTGGG
GACTGAAAGGTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTGAAAGAGCATCCTGCTCTTTGAGGACTGAAAG
GTGCCACCAACTTGTGTGGGCTTTAAGAGGTGTCCT
Found at i:296211 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 296180--296321 Score: 80
Period size: 28 Copynumber: 5.1 Consensus size: 28
296170 TTGAGGACTA
296180 GAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
1 GAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
* ** * * * *
296208 GAAAGATATCCTGC-TCTT-TGAGGAC-TG
1 GAAA-AT-GCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
296235 GAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
1 GAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
* ** * * * *
296263 G-AAA-GGCATCCTGCTCTTTGAGGAC-TG
1 GAAAATGCCA-CCAACT-TGTGTGGGCTTT
296290 GAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
1 GAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
296318 GAAA
1 GAAA
296322 GGAGAAGGCG
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 28, Indels: 20
0.61 0.23 0.16
Matches are distributed among these distances:
25 3 0.04
26 8 0.11
27 25 0.33
28 29 0.38
29 8 0.11
30 3 0.04
ACGTcount: A:0.26, C:0.20, G:0.26, T:0.27
Consensus pattern (28 bp):
GAAAATGCCACCAACTTGTGTGGGCTTT
Found at i:309610 original size:486 final size:485
Alignment explanation
Indices: 308216--311221 Score: 4058
Period size: 486 Copynumber: 6.2 Consensus size: 485
308206 AGGGAATCAC
* * *
308216 ATGCGAGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTACATGTAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* * * * *
308281 TCGTCCCACGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTGAA
66 TCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAA
* * *
308346 ATTGATAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAGTGAG
131 ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
*
308411 ATTTGAAATTATAGGGATTAAACTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
196 ATTTGAAATTATAGGGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
* **
308476 CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTACA
261 CCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGA
* * * *
308541 TTTTGTGAGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA
325 TTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA
* * * **
308606 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCTAATCAACCACTTTGGGT
390 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCA
*
308671 TGTTTTTCTTACTGATTTGAAATTAATTTAG
455 TGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
*
308702 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* * *
308767 TCGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTC-ATATCTGTTTAA
66 TCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA-ATCTGTTTGA
* * ** * * * * *
308831 AATTGATATAA-ATGATATTATGCGTATTTTTGCCTTTTTTTCATCATTTATAGGTTTTTTAAAG
130 AATTGATA-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG
* * * * * *
308895 AGATTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGTAAATATGAAAAGTCACGCTTGAAGGCCAAAAGTATTT
194 AGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTT
* * * *
308960 GACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATC-ATTTGGGGATAGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTT
259 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCA-CGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTT
* * * * *
309024 AATTATGTGT-TCTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAATTTTAA
323 GATTATGTGTGT-TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
** *
309088 GGATTTGCCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTG
387 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTG
309153 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
452 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
* *
309187 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* * * * **
309252 TCGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAAATCATTTAAATAGCTTGGTTAAATCTGTTTGA
66 TCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC-AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGA
*
309317 AATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGA
130 AATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGA
* * * * * * * * *
309382 GATTTGATATTATAGAGATTAAATTACAAAAATTAAAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTGTTAG
195 GATTTGAAATTATAGGGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTG
309447 ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTG
260 ACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTG
*
309512 ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGA-TGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGG
324 ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGG
* *
309576 ATTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGC
389 ATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGC
* *
309641 ATGTTTTTCTTGTTGA-TTCAGAATTAATTTAG
454 ATGTTTTTCTTGCTGATTTGA-AATTAATTTAG
* * ** * * * * *
309673 ATGCATTAAAAGGTGTTTGGATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGCAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* * * * * * *
309738 TTGTACCATGATGCTGAACTGTTGGGCTGCAAATTATTTAGATAGCTAGGTCGAATCCGTTTGAA
66 TCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAA
*
309803 ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAATGAG
131 ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
* * * *
309868 ATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCATAACTCTTTGA
196 ATTTGAAATTATAGGGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
* * ** * * * * *
309933 CCGAGCCTTTTAAAAGATTTTTTCCATC-ATTTACGCAGGGTTCCAAGCTGATATGGTGATTTAA
261 CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCA-CGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGA
* * *
309997 TTTTGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTGAGG
325 TTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGG
* * * * * * * *
310061 AATTGGTTGTAAAGTTTGTTCAATGAAATTCCATATTGAGCTGAAACATAATCAACCAATTTGGC
389 ATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGC
* * *
310126 ATGCTTTTCATGCTGATTAGAAATTAATTTAG
454 ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
* * * * * *
310158 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGACAATTATTGTAAAAGTATGTGTAATTTCATTGCGTGTAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* * * * *
310223 TTGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTAAA
66 TCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAA
* *
310288 ATTGATAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
131 ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
* * *
310353 ATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGGCAAAACTATTTGA
196 ATTTGAAATTATAGGGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
* * * * *
310418 CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGCGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTCGA
261 CCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGA
* *
310483 TTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAATGA
325 TTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA
* * * * *
310548 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACTTGATTAACCATTTTGGCA
390 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCA
*
310613 TGTTTTTCTTGCTGATTTTAAATTAATTTAG
455 TGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
* * * * * *
310644 ATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCGTTGCATGTAA
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-A
* * * *
310709 TT-GT-CATATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTG
65 TTCGTAC-CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTG
* * *
310772 AAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACG
129 AAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG
* * * * *
310837 AGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTA
194 AGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTT
* * * * * *
310902 GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTG
259 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTG
* * * *
310967 ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTAATTAGGGGT-AAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGG
324 ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGG
* * * *
311031 ACTTT-CTTGCAAAGTTAGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
389 A-TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGG
*
311095 CATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
453 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
* * *
311128 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTA-AAATTTCGTTGCATGTA
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGG-AGAAATTTCATTGCATGTA
* * * *
311192 TTTGTATCTTGATGCTGATTTGTTGAGTTG
65 TTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
311222 TGATTTCTTG
Statistics
Matches: 2205, Mismatches: 291, Indels: 50
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
483 6 0.00
484 243 0.11
485 875 0.40
486 1010 0.46
487 70 0.03
488 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (485 bp):
ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
TCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAA
ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
ATTTGAAATTATAGGGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGAT
TATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAT
TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCAT
GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
Found at i:310109 original size:971 final size:969
Alignment explanation
Indices: 308216--311221 Score: 4415
Period size: 971 Copynumber: 3.1 Consensus size: 969
308206 AGGGAATCAC
* *
308216 ATGCGAGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTACATGTAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* *
308281 TCGTCCCACGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTGAA
66 TCGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTGAA
*
308346 ATTGATAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAGTGAG
131 ATTGATAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
*
308411 ATTTGAAATTATAGGGATTAAACTATAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
196 ATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
*
308476 CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTACA
261 CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTAGA
* * *
308541 TTTTGTGAGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA
326 TTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA
* * * **
308606 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCTAATCAACCACTTTGGGT
391 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCA
* * * * * *
308671 TGTTTTTCTTACTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTT
456 TGTTTTTCTTGCTGATTAG-AATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTT
* * *
308736 GTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAAT
520 GTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-CCATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAAT
* * * * *
308801 CATTTAGATAGTTTGGTC-ATATCTGTTTAAAATTGATATAA-ATGATATTATGCGTATTTTTGC
584 CATTTAGATAGCTTGGTCGA-ATCCGTTTGAAATTGATA-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * * * * * *
308864 CTTTTTTTCATCATTTATAGGTTTTTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAGTTGTAAATAT
647 CTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAAT
* * *
308929 GAAAAGTCACGCTTGAAGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATCATTT
712 GAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATCATTT
** * *
308994 GGGGATAGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTCTAATGATGTTGTGATTGACTAGG
777 ACGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGG
* * *
309059 GGTCAAAATCCAAATATGCAAAATTTTAAGGATTTGCCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT
842 GGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT
* *
309124 ATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
907 ATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAG
*
309187 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTTAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* * * * ** *
309252 TCGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAAATCATTTAAATAGCTTGGTTAAATCTGTTTGA
66 TCGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGC-AAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTGA
*
309317 AATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTT-CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG
130 AATTGATAATGATGATATTGTGCTT-TTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG
* * * * * * * * *
309381 AGATTTGATATTATAGAGATTAAATTACAAAAATTAAAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTGTTA
194 AGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTT
* *
309446 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTT
259 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTA
309511 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGA-TGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
324 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* *
309575 GATTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGG
389 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGG
* * *
309640 CATGTTTTTCTTGTTGATTCAGAATTAATTTAGATGCATTAAAAGGTGTTTGGATGAGAAAATTC
454 CATGTTTTTCTTGCTGATT-AGAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * *
309705 TTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGCATTTGTACCATGATGCTGAACTGTTGGGCTGCAA
518 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGT-CCATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAA
* *
309770 ATTATTTAGATAGCTAGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
582 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * *
309835 CTTGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAAT
647 CTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAAT
* * * *
309900 GAAAAGTCATGCTTTATGGCCATAACTCTTTGACCGAGCCTTTTAAAAGATTTTTTCCATCATTT
712 GAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATCATTT
* * * *
309965 ACGCAGGGTTCCAAGCTGATATGGTGATTTAATTTTGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGG
777 ACGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGG
* * * * * * *
310030 GGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTGAGGAATTGGTTGTAAAGTTTGTTCAATGAAATTCCAT
842 GGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT
* * * * *
310095 ATTGAGCTGAAACATAATCAACCAATTTGGCATGCTTTTCATGCTGATTAGAAATTAATTTAG
907 ATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAG
* * * * * * *
310158 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGACAATTATTGTAAAAGTATGTGTAATTTCATTGCGTGTAT
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
* * * *
310223 TTGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTAAA
66 TCGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTGAA
310288 ATTGATAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
131 ATTGATAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
*
310353 ATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGGCAAAACTATTTGA
196 ATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
* * * *
310418 CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGCGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTCGA
261 CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTAGA
*
310483 TTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAATGA
326 TTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA
* * * * *
310548 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACTTGATTAACCATTTTGGCA
391 TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCA
310613 TGTTTTTCTTGCTGATTTTA-AATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCT
456 TGTTTTTCTTGCTGA--TTAGAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCT
* * * *
310677 TGTAAAAGTAGGTGAAATATCGTTGCATGTAATTGTCATATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAA
519 TGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTC-CATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAA
*
310742 TCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC
583 TCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC
* * *
310807 TTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGTAAAAATG
648 TTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATG
* * * * *
310872 AAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTA
713 AAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATCATTTA
* * * * * * *
310937 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTAATTAGGG
778 CGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGG
* * * *
311002 GT-AAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAGTTAGTTCCACGAAATTTCTTA
843 GTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
* *
311066 TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
908 TTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAG
** * *
311128 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTA-AAATTTCGTTGCATGTA
1 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGG-AGAAATTTCATTGCATGTA
* * * * *
311192 TTTGTATCTTGATGCTGATTTGTTGAGTTG
65 TTCGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTG
311222 TGATTTCTTG
Statistics
Matches: 1807, Mismatches: 217, Indels: 23
0.88 0.11 0.01
Matches are distributed among these distances:
969 6 0.00
970 414 0.23
971 1152 0.64
972 227 0.13
973 8 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (969 bp):
ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTAT
TCGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTCTTTGAA
ATTGATAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAG
ATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA
CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGTGATTAGA
TTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA
TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCA
TGTTTTTCTTGCTGATTAGAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTG
TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTCCATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCA
TTTAGATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTT
ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
AGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATCATTTACGG
ATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTC
AAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
AGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCATGCTGATTTGAAATTAATTTAG
Found at i:312136 original size:874 final size:874
Alignment explanation
Indices: 310413--312112 Score: 2450
Period size: 874 Copynumber: 1.9 Consensus size: 874
310403 GGCAAAACTA
* *
310413 TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGCGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGA
1 TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTACGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGA
* *
310478 TTCGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
66 TTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
* * * * * * *
310543 AATGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACTTGATTAACCATTT
131 AATGACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCACTT
* * *
310608 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTTAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
196 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * * * *
310673 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCGTTGCATGTAATTGTCATATGATGCTGAATTGTTGGGTTG
261 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATTGTCACACGATGCTGAATTGTTGAGTTG
*
310738 CAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
326 CAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * **
310803 TGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGTAAA
391 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAA
* * *
310868 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGA
456 AATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTAGATCCAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGA
* * * *
310933 TTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTAATT
521 TTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTAATTAATT
* *
310998 AGGGGTAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAGTTAGTTCCACGAAATTTC
586 AGGGGTAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAATTAGCTCCACGAAATTTC
*
311063 TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
651 TTAATTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
** * * *
311128 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTAAAATTTCGTTGCATGTAT
716 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGCACGTAAAATTTCATTGCACGTAT
* * * * ** * ** **
311193 TTGTATCTTGATGCTGATTTGTTGAGTTGTGATTTCTTGTTTTATAAGCTATTTAACGAGATTTG
781 TTGTACCATGATGATGAATTGTTGAGTTGTGAAATCATGTTAGATAAGCTATCGAACGAGATTTG
311258 AAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGG
846 AAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGG
* * * * * *
311287 TTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGG-T
1 TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTACGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGCG
* * * *
311351 ATTTGATTGCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAAT
65 ATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAAT
*
311415 TTAA-GTACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCA
129 TTAATG-ACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCA
* *
311479 CTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGA
193 CTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGA
* *
311544 AAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-ATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGA
258 AAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATT-GTCACACGATGCTGAATTGTTGA
* *
311608 GTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTC-TTTGAAATTGAGAATGATGATATTGTGCTT
322 GTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATC-CGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGCTT
* * *
311672 TTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACT
386 ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACT
*
311737 ACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA-CCAGGCCTTGTAAAGGATTTTTT
451 ACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTAGATCCA-GCCTTGTAAAGGA-TTTTT
* * *
311801 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTG
514 TCCATGATTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTA
* * * * * *
311866 ATTGATTATGTGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-TTTGGTTGCAAAATTTGCTCCA
579 ATTAATTAGGGGT-AAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTT-CTTGCAAAATTAGCTCCA
* * *
311930 CGAAATTTCTTAATTAGTCGAAACCTGATCAACCAATTTT-GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
642 CGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACC-ATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAA
* *
311994 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTACGTGAAATTTCA
706 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGCACGTAAAATTTCA
312059 TTGCACGTATTTGTACCATGATGATGAATTGTTGA-TT-TGCAAATCAT-TTAGATA
771 TTGCACGTATTTGTACCATGATGATGAATTGTTGAGTTGTG-AAATCATGTTAGATA
312113 GCTTGCCCGA
Statistics
Matches: 731, Mismatches: 84, Indels: 22
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
873 7 0.01
874 450 0.62
875 85 0.12
876 184 0.25
877 5 0.01
ACGTcount: A:0.29, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (874 bp):
TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTACGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGA
TTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
AATGACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCACTT
TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATTGTCACACGATGCTGAATTGTTGAGTTG
CAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAA
AATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTAGATCCAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGA
TTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTAATTAATT
AGGGGTAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAATTAGCTCCACGAAATTTC
TTAATTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGCACGTAAAATTTCATTGCACGTAT
TTGTACCATGATGATGAATTGTTGAGTTGTGAAATCATGTTAGATAAGCTATCGAACGAGATTTG
AAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGG
Found at i:312207 original size:486 final size:484
Alignment explanation
Indices: 311295--313277 Score: 1765
Period size: 486 Copynumber: 4.1 Consensus size: 484
311285 GGTTTGGCCG
* * * *
311295 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGT-ATTTGATT
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGTGATTTGATT
** * * * * *
311359 GCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGTAC
65 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGAT
* * *
311423 TTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCAT
129 TTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC-TGATCAACCA-TTTGGCAT
*
311488 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
192 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
* * * *
311553 TAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
257 TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
* * *
311618 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTCTTTGAAATTGAGA-ATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCT
322 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT
* ** * **
311682 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGA
386 TGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGA
* * * *
311747 AAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCA
451 AAAGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * *
311781 GGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAGTAGATTA
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
*
311846 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGTGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
66 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
* * * * *
311911 GGTTGCAAAATTTGCTCCACGAAATTTCTTAATTAGTCGAAACCTGATCAACCAATTTTGCATGT
131 GGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA-CTGATCAACC-ATTTGGCATGT
*
311976 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTA
194 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTA
* * * *
312041 AAAGTACGTGAAATTTCATTGCACGTATTTGTACCATGATGATGAATTGTTGATTTGCAAATCAT
259 AAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
**
312106 TTAGATAGCTTGCCCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTTTGCCTTG
324 TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTG
* *** *
312170 ATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATACACATTAAATTGTAAATATGAAA
388 ATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
* * *
312235 AGTCATGCTTAATGGCAAAAAGTTTTTAATCA
453 AGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * *
312267 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTGGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGGGATTTGATTA
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
* *
312332 TGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTACGGATTT
66 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
* * * * * * ** ** * *
312397 GGTTGCAAAGA-TTGATCCATGAACGTGGCATGTTTTTCTTGTTG-ATTTGAAGTTAA--TTTTG
131 GGTTGCAAA-ATTTGTTCCATGAA-AT---TTCTTATT-TAGCCGAAACTG-A-TCAACCATTTG
* * * * * * * * ** *
312458 ATGCATGATGAGGTGT-TTGCAAGA---GAAAATT-CTTGTAAAAGTA-GGTGAAATTTCATTGC
188 --GCATG-T---TTTTCTTGC-TGATTTG-AAATTAATT-TAGATGCATGATGAGGTGT--TTGC
* * ** * * ** * * * * *
312517 -A-TG--TA-T-TTGTACCA-T-GATG---CTGAATTG-TTG-ATTTGCA-AATCAT--TTAGAT
242 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGA-AT
* * * * * * * *
312566 AGCTTG-G-T-CGAATC-TGTTTGA-A-ATTGAT---AT-AG-ATGATATTG---T-G-TG-TAT
306 TG-TTGAGTTGCAAATCAT-TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATAT
** *** * *
312614 T-T--TTACCTTGAT------TTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATATGGA
369 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGA
*
312670 TTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
434 TTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* ** * * *
312721 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGACTTGTGGACAGTTCAAAACTAATTTGGGGATTTGATT
1 AGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATT
** *
312786 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACAGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATT
65 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATT
** * * *
312851 TCATTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACGTGATCAACCATTTTGGCATG
130 TGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC-TGATCAACCA-TTTGGCATG
* * * * * * * ** *
312916 TTTTTCTTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGCATTAAGAGGTTTTTACATTAGAAAATTCTTAT
193 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGT
* ** ** ** ** *
312981 AAAAGTAGGTGAAATATCATTGGGTGTAAATGTATTATGATGCCAAATCGTTGAGTTGCAAATCA
258 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
* * * *
313046 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTATGCTTATTTTTGCCTTG
323 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
* * ** * *
313111 ATTTCTTGATTTATAAGTCATTTAATGAGATTTCATATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
388 ATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
** **
313176 AGTCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTTGATTG
453 AGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * * * * * *
313208 AGCCTTGTGAAGTATTTTTTTTCATGATTTGTGGTTGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAACTA
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
313273 TGTGT
66 TGTGT
313278 TCCAAGCTGA
Statistics
Matches: 1186, Mismatches: 228, Indels: 166
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
447 3 0.00
448 7 0.01
449 9 0.01
450 15 0.01
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459 4 0.00
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475 2 0.00
476 10 0.01
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481 6 0.01
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494 4 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (484 bp):
AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
GGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACTGATCAACCATTTGGCATGTTT
TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
TCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGT
CATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
Found at i:314383 original size:486 final size:485
Alignment explanation
Indices: 313337--316132 Score: 3812
Period size: 486 Copynumber: 5.8 Consensus size: 485
313327 AATTAATGAG
* * * ** *
313337 ATTTCGTTGCATGTATTTGCATCATGATGCT-AATCTGCGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCAT
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
** * * *
313401 GGTCGAATCAATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTT--ATGTGCATTTCTTGAT
65 GGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG-ATTTCTTGAT
* * * * *
313464 TTATAAGTTATTTTATGAGATTTTAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAATTGAAAAGTCATGCTT
128 TTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTT
* * *
313529 TATGGCCAAAAGTATTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTCTTTTT-CAATGGTTTGTGGATGGTTC
193 TATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTAC-ATGATTTGTGGATGGTTC
* * * * * *
313593 CAAGCTGATTTGGGGATTTGACTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGATGAGAATG
256 CAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG-TCAAAATG
** * * *
313657 CAAATAT-CTAAAAATTTTGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCATATTTAGCTG
320 CAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCG
* * * * * * *
313721 AAACATGGTCAACCATTTTGTCCTCTTTTTCTTACTGATTTAAAAATAATTTAGATGCGTGATGA
384 AAACATGATCAACCA-TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGA
* * *
313786 GGTGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGGAGGTGAA
448 GGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
313824 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * *
313889 GTCGAATCTGTTTGAAACTAATATAGCTTATATTGTGCTTATTTGTGCCCTT-ATTTCTTGATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-CCTTGATTTCTTGATTT
313953 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
*
314018 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTACATGATTTTTGGATGGTTCCA
195 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTACATGATTTGTGGATGGTTCCA
314083 AGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
258 AGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
*
314148 A-ATGCAAAAATTTAAGGACTT-CTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
323 ATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
* ** * * * *
314211 ATTATCAACCATTTCAACCTGTTTTTCTTGCTGACTTGAAATTAATTTAGTTGCGTGATGACGTG
388 ATGATCAACCATTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
* * * *
314276 TCTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAG
452 TTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * * * *
314310 ATTTCTTTGCATGTACTCGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
314375 CTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
314440 TAAGTTATTTAATA-AGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
131 TAAGTTATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * *
314504 TGG-CAAAAATATTTGAACGAGCGTTGTAAAGTATTTTTTT-CAATAATTTGTGGATGGTTCCAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTAC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* **
314567 GCTGATTTGGTGATTTA-ATT-T-TGTGCTTTAGGATGTTGTGATTGATTGGGGGTCAAAATGCA
259 GCTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTG-TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCA
* *
314629 AATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAA
322 AATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA
* * * *
314694 CCTTATCAACCATTTTGGCATGTTGTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACCG-GG
387 CATGATCAACCA-TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-TGAGG
314758 TGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
450 TGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* *
314794 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAGAATTGTTGAGTTGCGAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * *
314859 GTCGAATTTGTTTGAAGTTGATATAGATGATACTGTGCATATTTTTGCCTTCATTTCATCATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * * *
314924 TAGGTTACTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGAT
131 TAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * *
314989 GGCCAAAAGTGTATGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
196 GGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTACATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
*
315054 TGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * *
315118 ACGCGAAAATTTTAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
315183 GATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
390 GATCAACCA-TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
*
315248 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAA
454 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * *
315280 ATTTCATTGCATGTATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * *
315345 GTCGAATCTCTTTGAAATTGAGA-ATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* * * *
315409 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * *
315474 TGGCCAAAACTATTTGACCAGGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTACATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
* *
315539 CTGATTTGGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGTGTCAAAATGCAAAT
260 CTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * * * * *
315604 ATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAATTTGCTCCACGAAATTTCTTAATTAGTCGAAACCT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
*
315669 GATCAACCAATTTTGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
390 GATCAACC-ATTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
*
315734 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTACGTGAA
454 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
315766 ATTTCATTGCACGTATTTGTACCATGATGATGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
** *
315831 CCCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* * *** * * *
315895 ATAGGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATACACATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTAA
130 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * *
315960 TGGCAAAAAGTTTTTAATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTGGTGGATGGTTCCAAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTACATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
* * * *
316025 CTAATTTGGGGATTTGATTATGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
260 CTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * *
316090 ATGCAAAAATTTACGGATTTGGTTGCAAAGATTGATCCATGAA
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
316133 CGTGGCATGT
Statistics
Matches: 2048, Mismatches: 229, Indels: 65
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
481 4 0.00
482 37 0.02
483 63 0.03
484 298 0.15
485 108 0.05
486 1226 0.60
487 221 0.11
488 83 0.04
489 7 0.00
490 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (485 bp):
ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
TAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
GGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTACATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
TGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATA
TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG
ATCAACCATTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
CAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
Found at i:315222 original size:970 final size:969
Alignment explanation
Indices: 313337--316990 Score: 4746
Period size: 970 Copynumber: 3.8 Consensus size: 969
313327 AATTAATGAG
* * * * ** *
313337 ATTTCGTTGCATGTATTTGCATCATGATGCT-AATCTGCGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCAT
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
** * *
313401 GGTCGAATCAATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTT--ATGTGCATTTCTTGAT
65 GGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG-ATTTCTTGAT
* * * * *
313464 TTATAAGTTATTTTATGAGATTTTAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAATTGAAAAGTCATGCTT
128 TTATAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTT
** *
313529 TATGGCCAAAAGTATTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTCTTTTTCAATGGTTTGTGGATGGTTCC
193 TATGGCCAAAAGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCC
* * * * * * *
313594 AAGCTGATTTGGGGATTTGACTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGATGAGAATGCA
257 AAACTGATTTGGGGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCA
** * * * *
313659 AATAT-CTAAAAATTTTGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCATATTTAGCTGAA
322 AATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAA
* * * * * * * *
313723 ACATGGTCAACCATTTTGTCCTCTTTTTCTTACTGATTTAAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGG
386 ACCTGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGG
* * *
313788 TGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGGAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATG
451 TGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATG
* * * * *
313853 CTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAACTAATATAGCTT
516 CAGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATG
* *
313918 ATATTGTGCTTATTTGTGCCCTT-ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTAT
581 ATATTGTGCTTATTTTTG-CCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTAT
*
313982 AGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTA
645 AGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTA
* * *
314047 AAGGATTTTTTTTTACATGATTTTTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGT
710 AAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGT
* *
314112 TTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA-ATGCAAAAATTTAAGGACTTCTTGCAA
773 TTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAATTTTAGGACAT-TTGCAA
* ** *
314176 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATTATCAACCA-TTTCAACCTGTTTTTCTT
836 AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTT-GGCATGTTTTTCTT
* * * * * *
314240 GCTGACTTGAAATTAATTTAGTTGCGTGATGACGTGTCTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAG
900 GCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAG
*
314305 GTGAG
965 GTGAA
* * * * * * *
314310 ATTTCTTTGCATGTACTCGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
*
314375 CTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
314440 TAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
131 TAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * *
314505 GG-CAAAAATATTTGAACGAGCGTTGTAAAGTATTTTTTTCAATAATTTGTGGATGGTTCCAAGC
196 GGCCAAAAGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
* * *
314569 TGATTTGGTGATTTAATT-T-TGTGCTTTAGGATGTTGTGATTGATTGGGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGGGATTTAATTATGTGTG-TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAT
*
314632 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACCT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCT
* * *
314697 TATCAACCATTTTGGCATGTTGTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACCG-GGTGT
390 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-TGAGGTGT
314761 TTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAG
454 TTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAG
* * *
314826 AATTGTTGAGTTGCGAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAGTTGATATAGATGATA
519 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATA
* * * * * *
314891 CTGTGCATATTTTTGCCTTCATTTCATCATTTATAGGTTACTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGG
584 TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGG
* * *
314956 ATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTGTATGATCAAGCCTTGTAAAGG
649 ATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGG
315021 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATG
714 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTT-ATG
*
315085 ATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATACGCGAAAATTTTAGGACATGGTTGCAAAGTT
778 ATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAATTTTAGGACAT--TTGCAAAGTT
315150 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA
840 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA
*
315215 TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAA
905 TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
315280 ATTTCATTGCATGTATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * *
315345 GTCGAATCTCTTTGAAATTGAGAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * * *
315410 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTAT
131 TAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * *
315475 GGCCAAAACTATTTG-ACCAGGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
196 GGCCAAAAGTATTTGAACGA-GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* * * *
315539 CTGATTTGGTGA-GTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGTGTCAAAATGCAAA
260 CTGATTTGGGGATTTA-ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAA
* * * * * * *
315603 TATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAATTTGCTCCACGAAATTTCTTAATTAGTCGAAACC
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACC
315668 TGATCAACCAATTTT-GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
389 TGATCAACC-ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
* *
315732 TTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTACGTGAAATTTCATTGCACGTATTTGTACCATGATG-A
453 TTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCA
* **
315796 TGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGCCCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGA
518 -GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGA
* *
315861 TATTGTG-TGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATA
582 TATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATA
*** * * * * *
315925 CACATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTAATGGCAAAAAGTTTTTAATCAAGCCTTGTAA
646 GGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAA
* * * * *
315990 AGGATTTTTTTCCATGATTGGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGGGATTTGATTATGTGTGCTTA
711 AGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTA
*
316055 TGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTACGG--ATTTG----G-T
776 TGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAATTTTA-GGACATTTGCAAAGTT
* * *
316113 TG---CA--AAGA--T-TGA--T---C----CATG----A--AC-GTGGCATGTTTTTCTTGTTG
840 TGTTCCATGAA-ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTG
* * *
316154 ATTTGAAGTTAATTTTGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGA
904 ATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGA
316219 A
969 A
* *
316220 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * *
316285 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTTTACCTTGATTTCTTCATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* * * * * *
316349 ATAGGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATATGGATTAAATTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTAA
130 ATAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * ** *
316414 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGACTTGTGGACAGTTCAAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* * ** *
316479 ACTAATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACAGGTTAAAATGCAAA
259 ACTGATTTGGGGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAA
* * *
316544 TATGCAAAAATTTAAGGA-TTTCATTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAAC
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGC-TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
* * * * * * * *
316608 GTGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGCATTAAGAGGTT
388 CTGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
* ** * * ** ** **
316673 TTTACATTAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATATCATTGGGTGTAAATGTATTATGATGCC
453 TTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATG-C
* * *
316738 A-AATCGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAAATTGATAAAGATGA
517 AGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGA
* * * * * * *
316802 AATTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTCATTTAATGAGATTTCATATTATAG
582 TATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAG
* ** *
316867 GGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTTGATTGAGCCTTGTGAA
647 GGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAA
* * * * *
316932 GTATTTTTTTTCATGATTTGTGGTTGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAACTATGTGT
712 GGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT
316991 TCCAAGCTGA
Statistics
Matches: 2371, Mismatches: 278, Indels: 96
0.86 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
939 1 0.00
940 285 0.12
941 452 0.19
942 2 0.00
943 2 0.00
947 4 0.00
951 1 0.00
954 1 0.00
956 2 0.00
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960 2 0.00
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964 1 0.00
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974 5 0.00
975 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (969 bp):
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GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
TAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
GGCCAAAAGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
TGATTTGGGGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATA
TGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCTG
ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
GCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAGAA
TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATT
GTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGAT
TAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGAT
TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATG
TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAATTTTAGGACATTTGCAAAGTTTGTTCC
ATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
Found at i:320534 original size:485 final size:486
Alignment explanation
Indices: 317050--321945 Score: 6515
Period size: 486 Copynumber: 10.1 Consensus size: 486
317040 AATTAATGAG
* * * **
317050 ATTTCGTTGCATGTATTTGCATCATGATGCT-AATCTGCGGAGTTGCAAATCATTTAGATAG-TA
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCT-
** * *
317113 TGGTCGAATCAATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTT--ATGTGCATTTCTTGA
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* * * *
317176 TTTATAAGTTATTTTATGAGATTTTAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAATTGAAAAGTCATGCT
127 TTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCT
** * *
317241 TTATGGCCAAAAGTATTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTCTTTTTCAATGGTTTGTGGATGGTTC
192 TTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTC
* * * * *
317306 CAAGCTGATTTGGGGATTTGACTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGATGAGAATG
256 CAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG-TCAAAATG
** * * *
317370 CAAATAT-CTAAAAATTTTGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCATATTTAGCTG
320 CAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCG
* * * * * * *
317434 AAACATGGTCAACCATTTTGTCCTCTTTTTCTTACTGATTTAAAAATAATTTAGATGCGTGATGA
384 AAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGA
* *
317499 GGTGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGGAGGTGAA
449 GGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
317537 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * *
317602 GTCGAATCTGTTTGAAACTAATATAGCTTATATTGTGCTTATTTGTGCCCTT-ATTTCTTGATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-CCTTGATTTCTTGATTT
*
317666 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * *
317731 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTACATGATTTTTGGATGGTTCCA
195 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCA
*
317796 AGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
258 AGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
*
317861 A-ATGCAAAAATTTAAGGACTT-CTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
323 ATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
* *** * * * *
317924 ATTATCAACCATTTCAACCTGTTTTTCTTGCTGACTTGAAATTAATTTAGTTGCGTGATGACGTG
388 ATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
* * *
317989 TCTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAG
453 TTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * * * *
318023 ATTTCTTTGCATGTACTCGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
*
318088 CTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
*
318153 TAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * * *
318218 GG-CAAAAATATTTGAACGAGCGTTGTAAAGTATTTTTTTCAATAATTTGTGGATGGTTCCAAGC
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
* * **
318282 TGATTTGGTGATTTAATT-T-TGTGCTTTAGGATGTTGTGATTGATTGGGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGTGATTTGATTATGTGTG-TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * *
318345 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACCT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* * *
318410 TATCAACCATTTTGGCATGTTGTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACCG-GGTGT
390 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-TGAGGTGT
*
318474 TTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
454 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* *
318507 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAGAATTGTTGAGTTGCGAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * * *
318572 GTCGAATTTGTTTGAAGTTGATATAGATGATACTGTGCATATTTTTGCCTTCATTTCATCATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * * * *
318637 TAGGTTACTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * *
318702 GGCCAAAAGTGTATGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
318767 TGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * *
318831 ACGCGAAAATTTTAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
*
318896 GATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
390 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* *
318961 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAA
455 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
318993 ATTTCATTGCATGTATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * *
319058 GTCGAATCTCTTTGAAATTGAGAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * *
319123 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * *
319188 GGCCAAAACTATTTGACC-AGGCCTTGAAAAGGATTTTTCTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAA
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGA-GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
* * ** * * * *
319252 ATGATTTGGCGATTACATTTTATGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGTAAAT
260 CTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* *
319317 ATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* *
319382 GATCAACCACTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
390 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* * *
319447 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAACTAGGAGAA
455 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
319479 ATTTCATTGCATGTATTCGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * ** * *
319544 GTCAAATCTGTTTGAAATTGATATAA-ATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTTTTTTCATCATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* * * * * * * *
319608 ATAGGTTTTTTAAAGAGATTTAAAATTATAGGGATTAAGTTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTGA
130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * *
319673 AGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTT-TCAAAGGA--TTTTTCCATCATTTGGGGATAGTTCCAA
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* * * * *
319735 GCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGT-TTTAATGACGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAAATGTAA
259 GCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
* * *
319799 ATATGCAAAAATTT-A-GATTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAAC
323 ATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
*
319862 ATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
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* * * * * *
319927 TTTGGAAGGGAAAATTATTGTTAAAGTAGGAGAA
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* * *
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** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
320156 CGGCCAAAAGTGTTAGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTGCACGATTTATGGATGGTTCCAAA
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* * * *
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* *
320286 ATGCAAAAATTTAAGGA-TTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACAT
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* * * * *
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* *
320415 TGGATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAA
455 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * * *
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1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * ** * *
320769 TATGCAAAAATTTGAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATGCCATATTTAGCTGAAACA
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * * * *
320834 TAATCAACCAATTTGGCATGCTTTTCATGCTGATTAGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGT
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* * *
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* * *
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1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * *
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* * * * *
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131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * *
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196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
* * *
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261 TGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATA
* * *
321255 TGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACATG
326 TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG
* * * * *
321320 ATTAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTT
391 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
**
321385 GCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAA
456 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * * * *
321416 ATATCATTGTAGGTAATTGT-CTTATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCATTTAAATAGCTC
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTAC-CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
* * * *
321480 AGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTTATTTCTTGATTT
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* * * *
321545 ATAAGCTCTTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * *
321610 TGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTATCGATGGTTCCAAG
195 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
* * * *
321674 CTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTA-GGAGTCAAAATCCAAA
260 CTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAA
* ** *
321738 TATGCAAAATTTTAAGGACTTTCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACA
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * *
321803 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCGTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGACGAGGTGT
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* *
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454 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * *
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1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
321946 TGATTTCTTG
Statistics
Matches: 3858, Mismatches: 509, Indels: 86
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GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
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Alignment explanation
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317040 AATTAATGAG
* * **
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** **
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* * * * *
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* ** *
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* * * * * * *
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** * * **
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* * * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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*
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* * *
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* * *
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* ** *
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* * * * *
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*
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* * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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* * * **
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* *
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* * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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*
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* *
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318992 A
968 A
* ** *
318993 ATTTCATTGCATGTATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
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* *
319058 GTCGAATCTCTTTGAAATTGAGAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
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*
319123 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTAT
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* * *
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* ** * * *
319252 ATGATTTGGCGATTACATTTTATGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGTAAAT
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* * *
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* * *
319382 GATCAACCACTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
387 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTT
* * * * *
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* *
319512 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATATAA-ATGATA
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * *
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* *
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** * * * * *
320026 GGTTAAATTTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCTTTATTTGTTGATTT
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* * * * *
320091 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGATATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATTAAAAGTCAGGCTTTA
129 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTA
* * * * * * *
320156 CGGCCAAAAGTGTTAGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTGCACGATTTATGGATGGTTCCAAA
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* *
320221 CTAATTTGGTCATTTGATTATATGTGTTTATGAAGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
258 CTGATTTGG-CATTTGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
*
320286 ATGCAAAAATTTAAGGA-TTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACAT
322 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACAT
* * * *
320350 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCGGAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTT
387 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTT
* * * *
320415 TGGATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGCATTTGTACCATGATGCTGA
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* * * * * *
320480 ACTGTTGGGCTGCAAATTATTTAGATAGCCTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
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* * * *
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* * * * * * *
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* *
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* *
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* ** * * * * * *
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* * * *
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* ** *
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131 AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATG
* * * *
321127 ACCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGATAGTTTCAAACTG
196 GCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTG
* * *
321192 ATTTGGCGATTCGGTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
261 ATTTGGC-ATTTGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
* *
321257 CAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACATGAT
325 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGAT
* * * *
321322 TAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGC
390 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGC
** * * * * *
321387 ATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTGTAGGTAATTGT-CTTATGATGCTGAAT
455 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTAC-CATGATGCTGAAT
* * ** *
321451 TGTTGGGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCAGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
519 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
* * * *
321516 TGCTTATTGTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTCTTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATT
584 TGCTTATTTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* *
321581 AAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATT
649 AAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATT
** * * * *
321646 TTTTCCACGATTTA-TCGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGT
714 TTTTCCATAATTTAGGC-ATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGT
* * * * * **
321710 TGTAATTGATTAGGAGTCAAAATCCAAATATGCAAAATTTTAAGGACTTTCTTGCAAAGTTTGTT
778 TGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTT
* * *
321775 CCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCGTGCTGATTTG
843 CCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTG
* * * *
321840 AAATTAATTTAGATGTGTGACGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAA
908 AAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
321901 ATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
321946 TGATTTCTTG
Statistics
Matches: 3471, Mismatches: 408, Indels: 92
0.87 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
966 1 0.00
967 10 0.00
968 678 0.20
969 1077 0.31
970 829 0.24
971 282 0.08
972 416 0.12
973 164 0.05
974 12 0.00
975 2 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (968 bp):
ATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
GTCGAATCTCTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATG
GCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTG
ATTTGGCATTTGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC
AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATC
AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAGAGGTGTTTGCA
TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTG
TTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG
CTTATTTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAA
ATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTT
TTCCATAATTTAGGCATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGT
GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
TTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
Found at i:322792 original size:899 final size:900
Alignment explanation
Indices: 321046--322828 Score: 2502
Period size: 899 Copynumber: 2.0 Consensus size: 900
321036 TTTTTTGCCT
* * *
321046 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTAAAATTATAAGGATTAAACTACAAAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTAAAATTATAAGGATTAAAATACAAAAATGA
* *
321111 AAAGTCACGCTTTATGACCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGT
66 AAAGTCACGCTTTATGACCAAAAATATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTAT
* * * *
321176 GGATAGTTTCAAACTGATTTGGCGATTCGGTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG
131 GGATAGTTCCAAACTGATTTGGCGATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
* *
321241 TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
196 TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* *
321306 TTGGCCAAAACATGATTAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGC
261 TTAGCCAAAACATGAATAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGC
* ** **
321371 ATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTGTAGGTAATTGT
326 ATGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTACAGGTAATTGT
* * *
321436 CTTATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCAGTCGAATCCGTTTGAAATTG
391 CTCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCAGTCAAATCCGTTTGAAATTG
*
321501 ATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTCTTTAACGAGATTT
456 ATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTT
* * * * * *
321566 GAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTA
521 GAAATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTATTAGACCGA
* * *
321631 GCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTATCGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATG
586 GCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTATCGATGGTTCCAAACTAATTTAGTGATTTGATTATA
* * * *
321696 TGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGAGTCAAAATCCAAATATGCAAAATTTTAAGGACTTTC
651 TGTGTTTATGAAGTTGTAATTGATTAGGAGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGC
* * * *
321761 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
716 GTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGAATGTTT
* ** * * *
321826 TTCGTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGACGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTTGTAAA
781 TTCGTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTATAAA
* * *
321891 AGTAGGTAAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
846 AGTAGGTAAAATTTCATTGCATGCATTTGTACCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
* * * *
321946 TGATTTCTTGTTTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC-AAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTAAAATTATAAGGATTAAAATACAAAAATGA
* * * ** * *
322010 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAATGTTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTA
66 AAAGTCACGCTTTATGACCAAAAATATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTA
* * * * * *
322075 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGG-TATTTGATTGCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG
130 TGGATAGTTCCAAACTGATTT-GGCGATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG
* *
322139 GGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGTACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
194 GGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
** *
322203 TATTTAGCTGAAACATGAATAACCATTTTGGC-TTTTTTTCTTGCTGA-TTCGAAATTAATTTAG
258 TATTTAGCCAAAACATGAATAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTC-AAATTAATTTAG
* * * ** * * *
322266 ATGCGTGAGGAGGCATTTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTAT
322 ATGCATGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTACAGGTAA
* * ** * **
322331 TTGTAC-CATGATGCTGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATTTGTTTGA
387 TTGT-CTCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCAGTCAAATCCGTTTGA
* * * * *
322395 AATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCTTTATTTGTTGATTTATAAGTTATTTAATGA
451 AATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGA
* * *
322460 GATTTGATATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATTAAAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTGTTAG
516 GATTTGAAATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTATTAG
* * *
322525 ACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTGCACGATTTATGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTTG
581 ACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTATCGATGGTTCCAAACTAATTTAGTGATTTG
* *
322590 ATTATATGTGTTTATGAAGTTGTGATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
645 ATTATATGTGTTTATGAAGTTGTAATTGATTA-GGAGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAG
*
322654 GA-TTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGG
709 GACTTGCGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * *
322718 AATGTTTTTCTTGCTGATTCGGAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGGATGAGAAAATTC
774 AATGTTTTTCGTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* *
322783 TTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGCATTTGTACCATGATG
839 TTATAAAAGTAGGTAAAATTTCATTGCATGCATTTGTACCATGATG
322829 CAGAACTGTT
Statistics
Matches: 771, Mismatches: 105, Indels: 15
0.87 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
898 3 0.00
899 465 0.60
900 299 0.39
901 4 0.01
ACGTcount: A:0.31, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (900 bp):
TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTAAAATTATAAGGATTAAAATACAAAAATGA
AAAGTCACGCTTTATGACCAAAAATATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTAT
GGATAGTTCCAAACTGATTTGGCGATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
TTAGCCAAAACATGAATAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGC
ATGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTACAGGTAATTGT
CTCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCAGTCAAATCCGTTTGAAATTG
ATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTT
GAAATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTATTAGACCGA
GCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTATCGATGGTTCCAAACTAATTTAGTGATTTGATTATA
TGTGTTTATGAAGTTGTAATTGATTAGGAGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGC
GTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGAATGTTT
TTCGTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTATAAA
AGTAGGTAAAATTTCATTGCATGCATTTGTACCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
Found at i:322880 original size:485 final size:486
Alignment explanation
Indices: 321946--324299 Score: 3150
Period size: 485 Copynumber: 4.9 Consensus size: 486
321936 TGTTGAGTTG
* * * *
321946 TGATTTCTTGTTTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC-AAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGA
* * ** * *
322010 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAATGTTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTA
66 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTA
** *
322075 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGT-ATTTGATTGCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG
131 TGGATGGTTCCAAGCTGATTT-GGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG
* * *
322139 GGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGTACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
195 GGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
* *
322203 TATTTAGCTGAAACATGAAT-AACCATTTTGGC-TTTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAG
259 TATTTAGCCGAAACATG-ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAG
* ** * *
322266 ATGCGTGAGGAGGCATTTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTAT
323 ATGCGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAT
* ** *
322331 TTGTACCATGATGCTGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTAAATTTGTTTGAA
388 TTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTCGTTTGAA
322396 ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCT
453 ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCT
* * * * *
322430 TTATTTGTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGATATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATTA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGA
* * * * * * *
322495 AAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTGTTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTGCACGATTTA
66 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTA
* * * * *
322560 TGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTTGATTATATGTGTTTATGAAGTTGTGATTGATTATGG
131 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG
*
322625 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-TTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
196 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
* * *
322689 TTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGAATGTTTTTCTTGCTGATTCGGAATTAATTTAGATG
261 TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATG
* * * * * *
322754 CATTAAGAGGTGTTTGGATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGCATTTG
326 CGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* * * * * *
322819 TACCATGATGCAGAACTGTTGGGCTGCAAATTATTTAGATAGCCTGGTCGAATTCGTTTGAAATT
391 TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTCGTTTGAAATT
*
322884 GATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCT
456 GATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCT
* *
322915 TGATTTCTTGATTTATATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGA
* * * * *
322980 AAAGTCATGCTTTATGGCCATAACTCTTTGACCGAGCCTTTTAAAAGA-TTTTTTCCATCATTTA
66 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTA
* * * * * * *
323044 CGCATGGTTCCAAGCTAATATGGTGATTTAATTTTGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGACTAGG
131 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGG
* * * * * *
323108 GGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTGAGGAATTGGTTGTAAAGTTTGTTCAATGAAATTCCAT
195 GGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT
* * * * * * *
323173 ATTGAGCTGAAACATAATCAACCAATTTGGCATGCTTTTCATGCTGATTAGAAATTAATTTAGAT
260 ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGAT
* * * * * * *
323238 GCGTGATGAGGTGTTCGCATGAGACAATTATTGTAAAAGTATGTGTAATTTCATTGCGTGTATTT
325 GCGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTT
* * *
323303 GTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTGGTCGAATCTC-TTTAAAA
390 GTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAAT-TCGTTTGAAA
*
323367 TTGATAATGATGATATTGTGCTT-TTTTTTGCCT
454 TTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTT-CCT
* *
323400 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGA
* * *
323465 AAAGTCACGCTTTATGGGCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTG
66 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTA
* * * * * *
323530 CGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTCGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGG
131 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG
* *
323595 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAATGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
196 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
* * * * **
323660 TTTGGCCAAAACTTGATTAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTTAAATTAATTTAGATG
261 TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATG
* * * * *
323725 CATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCGTTGCATGTAATTG
326 CGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* * * *
323790 T-CATATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAAT
391 TAC-CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTCGTTTGAAAT
*
323854 TGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT
455 TGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCT
* * * * *
323886 TTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGTAAAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGA
* * * *
323951 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTA
66 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTA
* * * *
324015 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTAATTAGGG
131 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG
* ** * *
324080 GT-AAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAGTTAGTTCCACGAAATTTCTTA
196 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
* *
324144 TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
261 TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATG
* * * * *
324209 CGTGATGAGGTGTTTGCGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTAAAATTTCGTTGCATGTATTTG
326 CGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
* * *
324274 TATCTTGATGCTGATTTGTTGAGTTG
391 TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
324300 TGATTTCTTG
Statistics
Matches: 1621, Mismatches: 234, Indels: 30
0.86 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
483 5 0.00
484 398 0.25
485 801 0.49
486 409 0.25
487 8 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (486 bp):
TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGA
AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTA
TGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG
GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATG
CGTGAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTG
TACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATTCGTTTGAAATT
GATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCT
Found at i:325214 original size:874 final size:874
Alignment explanation
Indices: 323491--325190 Score: 2441
Period size: 874 Copynumber: 1.9 Consensus size: 874
323481 GGCAAAACTA
* *
323491 TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGCGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGA
1 TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTACGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGA
* *
323556 TTCGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
66 TTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
* * * * * * *
323621 AATGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACTTGATTAACCATTT
131 AATGACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCACTT
* * *
323686 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTTAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAA
196 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * * * *
323751 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCGTTGCATGTAATTGTCATATGATGCTGAATTGTTGGGTTG
261 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATTGTCACACGATGCTGAATTGTTGAGTTG
*
323816 CAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
326 CAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * **
323881 TGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGTAAA
391 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAA
* * *
323946 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGA
456 AATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTAGATCCAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGA
* * * *
324011 TTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTAATT
521 TTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTAATTAATT
* *
324076 AGGGGTAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAGTTAGTTCCACGAAATTTC
586 AGGGGTAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAATTAGCTCCACGAAATTTC
*
324141 TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
651 TTAATTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
** * * *
324206 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTAAAATTTCGTTGCATGTAT
716 ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGCACGTAAAATTTCATTGCACGTAT
* * * * ** * ** **
324271 TTGTATCTTGATGCTGATTTGTTGAGTTGTGATTTCTTGTTTTATAAGCTATTTAACGAGATTTG
781 TTGTACCATGATGATGAATTGTTGAGTTGTGAAATCATGTTAGATAAGCTATCGAACGAGATTTG
324336 AAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGG
846 AAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGG
* * * * * *
324365 TTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGG-T
1 TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTACGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGCG
* * * *
324429 ATTTGATTGCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAAT
65 ATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAAT
*
324493 TTAA-GTACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCA
129 TTAATG-ACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCA
* *
324557 CTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGA
193 CTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGA
* *
324622 AAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-ATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGA
258 AAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATT-GTCACACGATGCTGAATTGTTGA
* *
324686 GTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTC-TTTGAAATTGAGAATGATGATATTGTGCTT
322 GTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATC-CGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGCTT
* * *
324750 TTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACT
386 ATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACT
*
324815 ACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA-CCAGGCCTTGTAAAGGATTTTTT
451 ACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTAGATCCA-GCCTTGTAAAGGA-TTTTT
* * *
324879 TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTG
514 TCCATGATTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTA
* * * * * *
324944 ATTGATTATGTGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-TTTGGTTGCAAAATTTGCTCCA
579 ATTAATTAGGGGT-AAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTT-CTTGCAAAATTAGCTCCA
* * * *
325008 TGAAATTTCTTAATTAGTCGAAACCTGATCAACCAATTTT-GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
642 CGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACC-ATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAA
* *
325072 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTACGTGAAATTTCA
706 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGCACGTAAAATTTCA
325137 TTGCACGTATTTGTACCATGATGATGAATTGTTGA-TT-TGCAAATCAT-TTAGATA
771 TTGCACGTATTTGTACCATGATGATGAATTGTTGAGTTGTG-AAATCATGTTAGATA
325191 GCTTGCCCGA
Statistics
Matches: 730, Mismatches: 85, Indels: 22
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
873 7 0.01
874 450 0.62
875 85 0.12
876 183 0.25
877 5 0.01
ACGTcount: A:0.29, C:0.11, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (874 bp):
TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTACGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGA
TTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT
AATGACTTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCACTT
TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATTGTCACACGATGCTGAATTGTTGAGTTG
CAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAA
AATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTAGATCCAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGA
TTTATGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGAGTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTAATTAATT
AGGGGTAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTCTTGCAAAATTAGCTCCACGAAATTTC
TTAATTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTGATTTGAAATTAATTTAG
ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGCACGTAAAATTTCATTGCACGTAT
TTGTACCATGATGATGAATTGTTGAGTTGTGAAATCATGTTAGATAAGCTATCGAACGAGATTTG
AAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGG
Found at i:325285 original size:486 final size:484
Alignment explanation
Indices: 324373--326355 Score: 2472
Period size: 486 Copynumber: 4.1 Consensus size: 484
324363 GGTTTGGCCG
* * * *
324373 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGT-ATTTGATT
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGTGATTTGATT
** * * * * *
324437 GCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGTAC
65 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGAT
* * * * *
324501 TTAGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCAT
129 TTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAAC-TGATCAACCA-TTTTGCAT
*
324566 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
192 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
* * * *
324631 TAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
257 TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
* * *
324696 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTCTTTGAAATTGAGA-ATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCT
322 ATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT
* ** * **
324760 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGA
386 TGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGA
* * * *
324825 AAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCA
451 AAAGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * *
324859 GGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAGTAGATTA
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
*
324924 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGTGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
66 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
* *
324989 GGTTGCAAAATTTGCTCCATGAAATTTCTTAATTAGTCGAAACCTGATCAACCAATTTTGCATGT
131 GGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAA-CTGATCAACC-ATTTTGCATGT
*
325054 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTA
194 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTA
* * * *
325119 AAAGTACGTGAAATTTCATTGCACGTATTTGTACCATGATGATGAATTGTTGATTTGCAAATCAT
259 AAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
**
325184 TTAGATAGCTTGCCCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTTTGCCTTG
324 TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTG
* *** *
325248 ATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATACACATTAAATTGTAAATATGAAA
388 ATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
* * *
325313 AGTCATGCTTAATGGCAAAAAGTTTTTAATCA
453 AGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * *
325345 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTGGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGGGATTTGATTA
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
* *
325410 TGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTACGGATTT
66 TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
*
325475 GGTTGCAAAGA-TTGATCCATG----------A--A--CG----TG------------GCATGTT
131 GGTTGCAAA-ATTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACTGATCAACCATTTTGCATGTT
* * *
325509 TTTCTTGTTGATTTGAAGTTAATTTTGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAA
195 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAA
*
325574 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGATTTGCAAATCATT
260 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
*
325639 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTTTACCTTGA
325 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGA
* * *
325703 TTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATATGGATTAAATTGTAAATATGAAAA
389 TTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAA
325768 GTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
454 GTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* ** * * *
325799 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGACTTGTGGACAGTTCAAAACTAATTTGGGGATTTGATT
1 AGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATT
** *
325864 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACAGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATT
65 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATT
** * * * *
325929 TCATTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACGTGATCAACCATTTTGGCATG
130 TGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAAC-TGATCAACCATTTT-GCATG
* * * * * * * ** *
325994 TTTTTCTTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGCATTAAGAGGTTTTTACATTAGAAAATTCTTAT
193 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGT
* ** ** ** ** *
326059 AAAAGTAGGTGAAATATCATTGGGTGTAAATGTATTATGATGCCAAATCGTTGAGTTGCAAATCA
258 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
* * * *
326124 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTATGCTTATTTTTGCCTTG
323 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
* * ** * *
326189 ATTTCTTGATTTATAAGTCATTTAATGAGATTTCATATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
388 ATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
** **
326254 AGTCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTTGATTG
453 AGTCATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
* * * * * * *
326286 AGCCTTGTGAAGTATTTTTTTTCATGATTTGTGGTTGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAACTA
1 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
326351 TGTGT
66 TGTGT
326356 TCCAAGCTGA
Statistics
Matches: 1304, Mismatches: 151, Indels: 84
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
454 295 0.23
455 121 0.09
467 2 0.00
469 2 0.00
472 2 0.00
474 3 0.00
476 1 0.00
485 4 0.00
486 603 0.46
487 270 0.21
488 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (484 bp):
AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTTGATTA
TGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTT
GGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACTGATCAACCATTTTGCATGTTT
TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
TCTTCATTTATAAGTTATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGT
CATGCTTAATGGCCAAAAGTATTTGATCA
Found at i:327461 original size:486 final size:485
Alignment explanation
Indices: 326415--330178 Score: 5103
Period size: 486 Copynumber: 7.8 Consensus size: 485
326405 AATTAATGAG
* * * * ** *
326415 ATTTCGTTGCATGTATTTGCATCATGATGCT-AATCTGCGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCAT
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
** * * *
326479 GGTCGAATCAATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTT--ATGTGCATTTCTTGAT
65 GGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG-ATTTCTTGAT
* * * * *
326542 TTATAAGTTATTTTATGAGATTTTAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAATTGAAAAGTCATGCTT
128 TTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTT
* * * *
326607 TATGGCCAAAAGTATTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTCTTTTTCAATGGTTTGTGGATGGTTCC
193 TATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCC
* * * * * *
326672 AAGCTGATTTGGGGATTTGACTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGATGAGAATGC
257 AAGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG-TCAAAATGC
** * * *
326736 AAATAT-CTAAAAATTTTGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCATATTTAGCTGA
321 AAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGA
* * * * * * *
326800 AACATGGTCAACCATTTTGTCCTCTTTTTCTTACTGATTTAAAAATAATTTAGATGCGTGATGAG
385 AACATGATCAACCA-TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAG
* * *
326865 GTGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGGAGGTGAA
449 GTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
*
326902 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * *
326967 GTCGAATCTGTTTGAAACTAATATAGCTTATATTGTGCTTATTTGTGCCCTT-ATTTCTTGATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-CCTTGATTTCTTGATTT
327031 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* *
327096 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTACATGATTTTTGGATGGTTCCA
195 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCA
327161 AGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
258 AGCTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
*
327226 A-ATGCAAAAATTTAAGGACTT-CTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
323 ATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
* ** * * * *
327289 ATTATCAACCATTTCAACCTGTTTTTCTTGCTGACTTGAAATTAATTTAGTTGCGTGATGACGTG
388 ATGATCAACCATTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
* * * *
327354 TCTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAG
452 TTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * * * *
327388 ATTTCTTTGCATGTACTCGTATCATGGTGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
327453 CTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
327518 TAAGTTATTTAATA-AGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
131 TAAGTTATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * * *
327582 TGG-CAAAAATATTTGAACGAGCGTTGTAAAGTATTTTTTTCAATAATTTGTGGATGGTTCCAAG
195 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
* **
327646 CTGATTTGGTGATTTA-ATT-T-TGTGCTTTAGGATGTTGTGATTGATTGGGGGTCAAAATGCAA
260 CTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTG-TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
* *
327708 ATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAAC
323 ATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
* * * *
327773 CTTATCAACCATTTTGGCATGTTGTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACCG-GGT
388 ATGATCAACCA-TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-TGAGGT
327837 GTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
451 GTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
327872 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAGAATTGTTGAGTTGCGAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * *
327937 GTCGAATTTGTTTGAAGTTGATATAGATGATACTGTGCATATTTTTGCCTTCATTTCATCATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * * *
328002 TAGGTTACTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGAT
131 TAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* *
328067 GGCCAAAAGTGTATGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
196 GGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGC
*
328132 TGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * *
328196 ACGCGAAAATTTTAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
328261 GATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
390 GATCAACCA-TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
*
328326 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAA
454 TGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* *
328358 ATTTCATTGCATGTATTCGTCCCACGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTCGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * *
328423 GTCGAATCTCTTTGAAATTGAGA-ATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATATA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* * * *
328487 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * * *
328552 TGGCCAAAACTATTTGACCAGGCCTTGAAAAGGATTTTTCTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
* * * * * * *
328617 ATGATTTGGCGATTACATTTTATGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGTAAAT
260 CTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* *
328682 ATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCT
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*
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* *
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* *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * *
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*
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*
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* * * *
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** *
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* * *** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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**
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* ** *
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* * * * * *
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*
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* * * * * * *
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* *
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* *
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* * * * * * *
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* * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* *
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* *
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*
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* *
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* * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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*
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* *
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* * * * *
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* * *
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** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * ** *
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*
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* * * * *
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* *
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* * *
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* *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* **
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* ** * * * * *
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* * * ** *
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* * ** *
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* ** * * *
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* * * * * * *
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* ** * * ** ** **
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* * * *
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* * * * * * * *
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** ** *
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* * * * *
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CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCTGAT
CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
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GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGT
GCGTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
AATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTT
TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTATGATGTTG
TGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA
TTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
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* * * * *
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* * **
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** **
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* * *
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* * * * *
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** * ** * * * *
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*
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* * * * * * *
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66 TTCTTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGCATGA-AGAGGTGTTTACAAGAGAAAATTCTTATAA
* ** * *
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* * * *
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* * *
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*
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* *
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TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACCTGATCAACCATTTTGGCATGTTG
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Found at i:333221 original size:485 final size:485
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* * *
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*
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* *
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * **
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* *
331538 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTT
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* * * *
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* * *
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* *
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* * *
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* ** * ** * * *
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*
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453 AAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
* * * *
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* * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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*
332475 AAAATGTAAATATGCAAAAATTT-A-GATTTGG
453 AAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
* *
332506 CTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * *
332571 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGGAAGGGAAAATTATTGTTAA
66 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * *
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* ** ** * *
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195 TAGATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
* * * *
332766 TTGTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGATATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATTAAAAG
260 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAG
* * * * * * *
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* * * * *
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332961 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-TTGG
454 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
*
332992 GTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * * * * *
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66 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * * * *
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* *
333187 AGATAGCCTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATT
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*
333252 TCTTGATTTATATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
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* * * * * * *
333317 CATGCTTTACGGCCATAACTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATAATTTAG-GCAG
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* * * *
333381 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTTTGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCA
390 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCA
* *
333445 AAATGCAAATATGCAAAAATTTGAGGAATTGG
454 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
* ** * ** * * *
333477 TTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATGCCATATTTAGCTGAAACATAATCAACCAATTTGGCATGCTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * * *
333542 TTCATGCTGATTAGAAATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGCATGAGACAATTATTGTAAA
66 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * *
333607 AGTACGTGAAATTTCATTGCGTGTATTTGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
131 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * *
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* * *
333735 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAACTACAAAAATGAAAAG
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* * *
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* * * * * *
333865 AGTTTCAAACTGATTTGGCGATTCGGTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAA
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455 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
* *
333961 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACATGATTAACCATTTTGGCATGTTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * * **
334026 TTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAA
66 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * * * *
334091 AGTAGGTGAAATATCATTGTAGGTAATTGT-CTTATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCATT
131 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTAC-CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* * * *
334155 TAAATAGCTCGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTTAT
195 TAGATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
* * * *
334220 TTCTTGATTTATAAGCTCTTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAG
260 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAG
* * * * * *
334285 TCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTATCGAT
325 TCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGAT
* * * *
334350 GGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAA
390 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAA
* * *
334415 AATCCAAATATGCAAAATTTTAAGGACTTT-C
455 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-TTTGG
* *
334446 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * **
334511 TTCGTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGACGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTTGTAAA
66 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * * *
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334631 TGATTTCTTG
Statistics
Matches: 2707, Mismatches: 357, Indels: 59
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (485 bp):
TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
AGATAGCTTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGATG
GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAA
ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
Found at i:333749 original size:969 final size:969
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Period size: 969 Copynumber: 3.7 Consensus size: 969
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* * *
331052 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACCTTATCAACCATTTTGGCATGTTG
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* * * *
331117 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACCG-GGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAA
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* *
331181 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAGAATTGTTGAGTTGCGAATCATT
130 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* ** * * * * *
331246 TAGATAGCTTGGTCGAATTTGTTTGAAGTTGATATAGATGATACTGTGCATATTTTTGCCTTCAT
195 TAGATAGCCTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTTAT
*
331311 TTCATCATTTATAGGTTACTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAG
260 TTCATCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAG
* * * * *
331376 TCATGCTTGATGGCCAAAAGTGTATGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTT-GTGG
325 TCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTAG-GC
* * *
331440 ATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTATGGGTC
388 ATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTC
* *
331505 AAAATGCAAATACGCGAAAATTTTAGGACA-TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
453 AAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAGGA-ATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
331569 TAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
516 TAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
* * *
331634 TGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTC
581 TGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTATTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTA
* *
331699 CCACGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTCTTTGAAATTGA
646 CCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTCTTTGAAATTGA
*
331764 GAATGATGATATTGTGCTTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTG
711 TAATGATGATATTGTGC-TTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTG
*
331829 AAATTATAGGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACC-AG
775 AAATTATAGAGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA-
* * * * *
331893 GCCTTGAAAAGGATTTTTCTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAAATGATTTGGCGATTACATTTT
839 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTAGATTAT
* *
331958 ATGTGTTTACGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGTAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTG
904 ATGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTG
332023 G
969 G
* * * *
332024 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACCTGATCAACCACTTTGGCTTGTTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * *
332089 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
66 TTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATAAA
* * * *
332154 ACTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTCCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
131 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
** * * * *
332219 AGATAGTTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATATAA-ATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTTTT
196 AGATAGCCTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATA-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTTAT
* * * *
332283 TTCATCATTTATAGGTTTTTTAAAGAGATTTAAAATTATAGGGATTAAGTTGTAAATATGAAAAG
260 TTCATCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAG
* * * *
332348 TCATGCTTGAAGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTT-TCAAAGGA-TTTTTCCATCATTTGGGGA
325 TCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGT-AAAGGATTTTTTCCATGATTTAGGCA
* *
332411 TAGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGACGTTGTGATTGACTAGGGGTCA
389 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCA
* * *
332476 AAATGTAAATATGCAAAAATTTA-GATTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
454 AAATGCAAATATGCAAAAATTTAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
*
332540 CCAAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
519 CCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA
* * * * *
332605 TGAGGTGTTTGGAAGGGAAAATTATTGTTAAAGTAGGAGAAATTTCAATGCATGTATTTGTATCA
584 TGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTATTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCA
* * ** * *
332670 TGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAAATCATTTAGATAGCTTCGTTAAATTTGTTTGAAATTGATA
649 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGC-AAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTCTTTGAAATTGATA
* * * * *
332735 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCTTTATTTGTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAT
713 ATGATGATATTGTGCTT-TTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * * * * * *
332800 ATTATAGAGATTAAATTGCAAAAATTAAAAGTCAGGCTTTACGGCCAAAAGTGTTAGACCGAGCC
777 ATTATAGAGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCC
* * * * * *
332865 TTGTAAAGGATTTTTTTGCACGATTTATGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTC-ATTTGATTATAT
842 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGG-CGATTAGATTATAT
*
332929 GTGTTTATGAAGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-TTGG
906 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
*
332992 GTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * *
333057 TTCTTGCTGATTCGGAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGGATGAGAAAATTCTTATAAA
66 TTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATAAA
* * * * * *
333122 AGTAGGTGAAATTTCATTGCTTGCATTTGTACCATGATGCTGAACTGTTGGGCTGCAAATTATTT
131 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* *
333187 AGATAGCCTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATT
196 AGATAGCCTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTTATT
* * * * *
333252 TCTTGATTTATATGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
261 TCATCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGT
* * * * * * *
333317 CATGCTTTACGGCCATAACTATTTGACCGAGCCTTTTAAAGGATTTTTTCCATAATTTAGGCAGG
326 CATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTAGGCATG
*
333382 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTTTGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAA
391 GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAA
* ** *
333447 ATGCAAATATGCAAAAATTTGAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCAATGAAATGCCATATTTAGC
456 ATGCAAATATGCAAAAATTT-AGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
* * * * * * *
333512 TGAAACATAATCAACCAATTTGGCATGCTTTTCATGCTGATTAGAAATTAATTTAGATGTGTGAT
520 CGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT
* * * * * *
333577 GAGGTGTTTGCATGAGACAATTATTGTAAAAGTACGTGAAATTTCATTGCGTGTATTTGTCCCAT
585 GAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTATTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCAT
*
333642 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTAGTCGAATCTCTTTGAAATTGATAAT
650 GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTCTTTGAAATTGATAAT
*
333707 GATGATATTGTGCGTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATT
715 GATGATATTGTGCTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATT
*
333772 ATA-AGGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGACCAAAACTATTTGACCGAGCCTT
780 ATAGA-GATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTT
* * * *
333836 GTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATAGTTTCAAACTGATTTGGCGATTCGGTTATGTGTG
844 GTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTAGATTATATGTG
333900 TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
909 TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
* *
333961 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACATGATTAACCATTTTGGCATGTTT
1 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * *
334026 TTCTTGCTGATTTC-AAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTAAAA
66 TTCTTGCTGA-TTCGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATAA
* * * * * *
334090 AAGTAGGTGAAATATCATTGTAGGTAATTGT-CTTATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCAT
130 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTAC-CATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
* *
334154 TTAAATAG-CTCGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTT
194 TTAGATAGCCT-GGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTT
* * * * * *
334218 ATTTCTTGATTTATAAGCTCTTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
258 ATTTCATCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
* * * * * *
334283 AGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTA-TC
323 AGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTAGGC
* * * * *
334347 GATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGT
388 -ATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGT
* * * **
334412 CAAAATCCAAATATGCAAAATTTTAAGGACTTTCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
452 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTT-AGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
* * * *
334477 TAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCGTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTG
516 TAGCCGAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
* ** * *
334542 TGACGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTA-AAATTTCGTTGCATGTATTTGT
581 TGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTATTGTAAAAGTAGG-AGAAATTTCATTGCATGTATTTGT
* * *
334606 ATCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
645 ACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
334631 TGATTTCTTG
Statistics
Matches: 2318, Mismatches: 267, Indels: 47
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
967 3 0.00
968 609 0.26
969 1059 0.46
970 145 0.06
971 170 0.07
972 331 0.14
973 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.11, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (969 bp):
TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
TTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATGCATGAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTATAAA
AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
AGATAGCCTGGTCGAATCCGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTTATT
TCATCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGT
CATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTAGGCATG
GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGACTAGGGGTCAAA
ATGCAAATATGCAAAAATTTAGGAATTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCC
GAAACATGATCAACCACTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATG
AGGTGTTTGCAAGAGAAAATTATTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATG
ATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTCTTTGAAATTGATAATG
ATGATATTGTGCTTTTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTA
TAGAGATTAAACTACAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGT
AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAACTGATTTGGCGATTAGATTATATGTGTT
TATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
Found at i:335468 original size:900 final size:900
Alignment explanation
Indices: 333731--335487 Score: 2465
Period size: 900 Copynumber: 2.0 Consensus size: 900
333721 TTTTTTGCCT
* * *
333731 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAACTACAAAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAAATACAAAAATGA
* *
333796 AAAGTCACGCTTTATGACCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGT
66 AAAGTCACGCTTTATGACCAAAAATATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTAT
* * * *
333861 GGATAGTTTCAAACTGATTTGGCGATTCGGTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG
131 GGATAGTTCCAAACTGATTTGGCGATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
* *
333926 TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
196 TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* *
333991 TTGGCCAAAACATGATTAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGC
261 TTAGCCAAAACATGAATAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGC
* ** **
334056 ATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTGTAGGTAATTGT
326 ATGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTACAGGTAATTGT
* *
334121 CTTATGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCGGTCGAATCCGTTTGAAATTG
391 CTCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCGGTCGAATCCGTTTGAAATTG
** * * * * *
334186 ATAAAGATGATATTGTGCTTATTGTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGCTCTTTAACGAGATTT
456 ATAAAGACAATATTGTGCTTATTGTTGCCTTGATTTCATCATTTATAAGCTATTTAAAGAGATTT
* * *
334251 GAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCTA
521 GAAATTATACGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATTAGATCAA
* * * * *
334316 GCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTATCGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATG
586 GCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTATCGACGGTTCAAAACTAATTTAGGGATTTGATTATG
* ** *
334381 TGTTTTTATGATGTTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAATTTTAAGGACTTTC
651 TGTATTTATGATGTTGTAATTGATTACAGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTC
*
334446 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
716 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * * *
334511 TTCGTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGACGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTTGTAAA
781 TTCGTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGAGTGAAGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTTATAAA
334576 AGTAGGTAAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
846 AGTAGGTAAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
* * *
334631 TGATTTCTTGTTTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC-AAAATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAAATACAAAAATGA
* * * ** * *
334695 AAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAATGTTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTA
66 AAAGTCACGCTTTATGACCAAAAATATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTA
* * * * * *
334760 TGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGG-TATTTGATTGCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG
130 TGGATAGTTCCAAACTGATTT-GGCGATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG
* *
334824 GGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGTACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
194 GGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
** *
334888 TATTTAGCTGAAACATGAATAACCATTTTGGC-TTTTTTTCTTGCTGA-TTCGAAATTAATTTAG
258 TATTTAGCCAAAACATGAATAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTC-AAATTAATTTAG
* * ** * * *
334951 ATGCGTGAGGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTAT
322 ATGCATGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTACAGGTAA
* * * *
335016 TTGTAC-CATGATGCTGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGA
387 TTGT-CTCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCGGTCGAATCCGTTTGA
* * *
335080 AATTGATATAGACAATATTGTG-TGTATAT-TTGGCTTGATTTCATCATTTATAGGCTATTTAAA
451 AATTGATAAAGACAATATTGTGCT-TAT-TGTTGCCTTGATTTCATCATTTATAAGCTATTTAAA
* *
335143 GAGATTTGAAATTATACGGATTAAGTTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATT
514 GAGATTTGAAATTATACGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATT
* * * * *
335208 TGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGACGGTTCAAAACTAATTTGGGGATT
579 AGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCACGATTTATCGACGGTTCAAAACTAATTTAGGGATT
* * *
335273 TGATTATGTGTATTTATGATGTTGTGATTGATTACAGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
643 TGATTATGTGTATTTATGATGTTGTAATTGATTACAGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAA
* * *
335338 GGA-TTTCGTTGCAAAGTTTGTTTCTTGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTT
708 GGACTTTC-TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* *
335402 GGCATGTTTTTCTTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGCAGT-AAGTGGTGTTTGCATT-AGAAA
772 GGCATGTTTTTCGTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATG-AGTGAAGAGGTGTTTGC-TTGAGAAA
*
335465 ATTCTTATAAAAGTAGGTGAAAT
835 ATTCTTATAAAAGTAGGTAAAAT
335488 ATCATTAGGT
Statistics
Matches: 749, Mismatches: 97, Indels: 22
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
898 4 0.01
899 317 0.42
900 422 0.56
901 6 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (900 bp):
TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAAATACAAAAATGA
AAAGTCACGCTTTATGACCAAAAATATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTAT
GGATAGTTCCAAACTGATTTGGCGATTCGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
TTAGCCAAAACATGAATAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGC
ATGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAATATCATTACAGGTAATTGT
CTCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTCGGTCGAATCCGTTTGAAATTG
ATAAAGACAATATTGTGCTTATTGTTGCCTTGATTTCATCATTTATAAGCTATTTAAAGAGATTT
GAAATTATACGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATTAGATCAA
GCCTTGTAAAGGATTTTTTCCACGATTTATCGACGGTTCAAAACTAATTTAGGGATTTGATTATG
TGTATTTATGATGTTGTAATTGATTACAGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTTC
TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
TTCGTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGAGTGAAGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATTCTTATAAA
AGTAGGTAAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGTTGATTTGTTGAGTTG
Found at i:335652 original size:486 final size:483
Alignment explanation
Indices: 334631--335865 Score: 1649
Period size: 486 Copynumber: 2.5 Consensus size: 483
334621 TGTTGAGTTG
* * * *
334631 TGATTTCTTGTTTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAATGAA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAATGAA
* * * * * * *
334696 AAGTCATGCTTTATGGCCAAAAATGTTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCTTGATTTAT
66 AAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCATGATTTGT
* * **
334761 GGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGTATTTGATTGCGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
131 GGACGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
* * *
334826 TGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGTACTTGGCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
196 TCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTT-GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
* * * * *
334890 TTTAGCTGAAACATGAATAACCATTTTGGCTTTTTTTCTTGCTGATTCGAAATTAATTTAGATGC
259 TTTGGCCGAAACATGAATAACCATTTTGGCTGTTTTTCTTGCTAATTCGAAATCAATTTAGATGC
* * * *
334955 GTGAGGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGT
324 GTGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATATCATTACATGTAATTGT
** *
335020 ACCATGATGCTGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
389 ACCATGATGCCAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* *
335085 ATATAGACAATATTGTGTGTATATTTGGCT
454 ATAAAGACAATATTGTGTGTATATTTGCCT
* * * * *
335115 TGATTTCATCATTTATAGGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTATACGGATTAAGTTGTAAATATGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAA-ATGA
*
335180 AAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTG
65 AAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCATGATTTG
* * * * * **
335245 TGGACGGTTCAAAACTAATTTGGGGATTTGATTATGTGTATTTATGATGTTGTGATTGATTACAG
130 TGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG
* * * *
335310 GTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTCGTTGCAAAGTTTGTTTCTTGAAATTTCTTA
195 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT-GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
335375 TTTGGCCGAAACATG-ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTC-AAATCAATTTAGA
259 TTTGGCCGAAACATGAAT-AACCATTTTGGC-TGTTTTTCTTGCTAA-TTCGAAATCAATTTAGA
* ** * **
335438 TGCAGT-AAGTGGTGTTTGCATTAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATATCATTAGGTGTAA
321 TGC-GTGAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATATCATTACATGTAA
** *
335502 TTGTATTATGATGCCAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAA
385 TTGTACCATGATGCCAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAA
* *
335567 ATTGATAAAGATGAA-ATTGTGCT-TATTTTTGCCT
450 ATTGATAAAGA-CAATATTGTG-TGTATATTTGCCT
* * * *
335601 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCATATTATAGGGATTAAATTGTAAAAGTGA
1 TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAA-TGA
* *
335666 AAAGTCATGCTTTC-TGGCCAAAAGTATTTGA-CAGAGCCTTGTGAAGTATTTTTTTTTCATGAT
65 AAAGTCATGC-TTCATGGCCAAAAGTATTTGATCA-AGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTTCATGAT
* * *
335729 TTGTGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGTTATTTAACTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA
127 TTGTGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA
*
335794 GGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC
192 GGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG-TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC
335859 TTATTTG
256 TTATTTG
335866 AAATTAATGA
Statistics
Matches: 651, Mismatches: 87, Indels: 23
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
484 53 0.08
485 199 0.31
486 255 0.39
487 144 0.22
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (483 bp):
TGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAATGAA
AAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCATGATTTGT
GGACGGTTCCAAGCTGATTTGGGTATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
TGGCCGAAACATGAATAACCATTTTGGCTGTTTTTCTTGCTAATTCGAAATCAATTTAGATGCGT
GAAGAGGCATTTGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATATCATTACATGTAATTGTAC
CATGATGCCAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT
AAAGACAATATTGTGTGTATATTTGCCT
Found at i:336230 original size:391 final size:390
Alignment explanation
Indices: 335525--336255 Score: 1083
Period size: 391 Copynumber: 1.9 Consensus size: 390
335515 CCAAATTGTT
* * *
335525 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCT
1 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGAAATTATGCT
* * *
335590 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCATATTATAGGGATTAAAT
66 TATTTTT-CATTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAAA
* * * * * *
335655 TGTAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTTGACAGAGCCTTGTGAAGTATTTTTT
130 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACAGAGCCTTGTAAAGGATTTCTT
**
335720 TTTCATGATTTGTGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGTTATTTAACTATGTGTTTTTATGATGTTGT
195 TTTCATGATTTGTGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAACTATGTGTTTTTATGATGTTGT
335785 GATTGATTAGGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCA
260 GATTGATTAGGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCA
*
335850 TGAAATTTCTTATTTGAAATTAATGAGCTTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATCTGT
325 TGAAATTTCATATTTGAAATTAATGAGCTTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATCTGT
335915 G
390 G
*
335916 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGCT
1 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGAAATTATGCT
* * *
335981 TATTTTT-ATGTGCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGATATTTGAAATTATAGGGATTAAA
66 TATTTTTCAT-TG-ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAA
* * * *
336045 ATGCAAAAATGAAAGGTCATGCTTTATGGCCAACAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGA-TTCT
129 ATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACAGAGCCTTGTAAAGGATTTCT
* * * *
336109 TTTTCAATGGTTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTT
194 TTTTC-ATGATTTGTGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAACTATGTGTTTTTATGATGTT
* * ** *
336174 GTGATTGATTAGGGATG-AGAATGCAAATAT-CTAAAAATTTTGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGT
258 GTGATTGATTAGGG-GGCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGT
*
336237 TCTATGAAATTTCATATTT
321 TCCATGAAATTTCATATTT
336256 ATCTGAAACA
Statistics
Matches: 302, Mismatches: 33, Indels: 10
0.88 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
389 1 0.00
390 11 0.04
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392 1 0.00
ACGTcount: A:0.29, C:0.09, G:0.21, T:0.41
Consensus pattern (390 bp):
GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGAAATTATGCT
TATTTTTCATTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAAAT
GCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACAGAGCCTTGTAAAGGATTTCTTT
TTCATGATTTGTGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAACTATGTGTTTTTATGATGTTGTG
ATTGATTAGGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCAT
GAAATTTCATATTTGAAATTAATGAGCTTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATCTGTG
Found at i:336716 original size:878 final size:876
Alignment explanation
Indices: 335009--336742 Score: 2391
Period size: 878 Copynumber: 2.0 Consensus size: 876
334999 AATTTCATTA
* * *
335009 CATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGATTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT
1 CATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATCT
* * * *
335074 GTTTGAAATTGATATAGACAATATTGTGTGTATATTTGGCTTGATTTCATCATTTATAGGCTATT
66 ATTTGAAATTGATAAAGACAATATTATGTGTATATTTGGC-TGATTTCATCATTTATAAGCTATT
** * *
335139 TAAAGAGATTTGAAATTATACGGATTAAGTTGTAAATATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAG
130 TAAAGAGATTTGAAATTATACGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAG
* *
335204 TATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGACGGTTCAAAACTAATTTGGG
195 TATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCAATGATTTGTGGACGGTTCAAAACTAATTTGGG
*
335269 GATTTGATTATGTGTATTTATGATGTTGTGATTGATTACAGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAAT
260 GATTTGATTATGTGTATTTATGATGTTGTGATTGATTACAGGTGAAAATGCAAATATGCAAAAAT
* * *
335334 TTAAGGATTTCGTTGCAAAGTTTGTTTCTTGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCAT
325 TTAAGGACTTCGTTGCAAAGTTTGTTTCTTGAAATTTCATATTTAGCCGAAACATGATCAACCAT
* * *
335399 TTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTCAAATCAATTTAGATGCAGTAAGTGGTGTTTGCATTAGAA
390 TTTGGCATGTTTTTCTTACTAATTTAAAATCAATTTAGATGCAGTAAGAGGTGTTTGCATTAGAA
* * * ** *
335464 AATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATATCATTAGGTGTAATTGTATTATGATGCCAAATTGTTGAGT
455 AATTCTTATAAAAGAAGGTGAAATATCATTAGATGTAATTATACCACGATGCCAAATTGTTGAGT
* *
335529 TGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTGAAATTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATT
520 TGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTCAAACTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATT
* * * *
335594 TTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTCATATTATAGGGATTAAATTGTA
585 TGTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* * * *
335659 AAAGTGAAAAGTCATGCTTTCTGGCCAAAAGTATTTGACAGAGCCTTGTGAAGTATTTTTTTTTC
650 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACAGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTC
* * * * *
335724 ATGATTTGTGGACGGTTCCAAGCTGATTTGGTTATTTAACTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATT
715 ATGATTTGTGGACGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTTAACTATGTGTGTTTATGATGTTGTGAAT
335789 GATTAGGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
780 GATTAGGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
335854 ATTTCTTATTTGAAATTAATGAGCTTTCGTTG
845 ATTTCTTATTTGAAATTAATGAGCTTTCGTTG
*
335886 CATGTATTTGTATCATGATGCTG-ATCTGTGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATC
1 CATGTATTTGTACCATGATGCTGAAT-TGTGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATC
** * * * * *
335950 TATTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGCT-TATTTTTATG-TGCATTTCTTGATTTATAAGTT
65 TATTTGAAATTGATAAAGACAATATTATG-TGTATATTT-GGCTG-ATTTCATCATTTATAAGCT
* * * * * *
336013 ATTTTATGATATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAGGTCATGCTTTATGGCCAA
127 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATACGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAA
* * * * * * * *
336078 CAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTCTTTTTCAATGGTTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
192 AAGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCAATGATTTGTGGACGGTTCAAAACTAATT
* * *
336143 TGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGATGAGAATGCAAATAT-CT
256 TGGGGATTTGATTATGTGTATTTATGATGTTGTGATTGATTACAGG-TGAAAATGCAAATATGC-
** * * *
336206 AAAAATTTTGGGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TTCTATGAAATTTCATATTTATCTGAAACATGAT
319 AAAAATTTAAGGACTTCGTTGCAAAGTTTGTTTCT-TGAAATTTCATATTTAGCCGAAACATGAT
* * * *
336270 CAACCATTTTGTCCTGTTTTTCTTACTGATTTAAAAAT-AATTTAGATGC-GTGATGAGGTGTTT
383 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTACTAATTT-AAAATCAATTTAGATGCAGT-AAGAGGTGTTT
* * * **
336333 GCATGT-GAAAATTCTTGTAAAAGAAGGTGAAATTTCATT-GCATGTATTTATACCACGATGCTG
446 GCAT-TAGAAAATTCTTATAAAAGAAGGTGAAATATCATTAG-ATGTAATTATACCACGATGCCA
* * * *
336396 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAAT-TTGTTTCAAACTGATATAGCTTAT
509 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTT-TTTCAAACTGATAAAGATGAA
*
336460 ATTGTGCTTATTTGTGCCCTT-ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAG
573 ATTGTGCTTATTTGTG-CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTCAAATTATAG
336524 GGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCA-AGCCTTGTAA
637 GGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGA-CAGAGCCTTGTAA
* * *
336588 AGGATTTTTTTTTTCATGATTTTTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGT
701 AGGA-TTTTTTTTTCATGATTTGTGGACGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTTA-ACTATGTGTGT
* *
336652 TTATGATGTTGTGAATGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT-CTTGCA
764 TTATGATGTTGTGAATGATTAGGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCA
336716 AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
829 AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
336743 AGCCGAAACA
Statistics
Matches: 750, Mismatches: 90, Indels: 33
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
876 4 0.01
877 194 0.26
878 438 0.58
879 114 0.15
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (876 bp):
CATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATCT
ATTTGAAATTGATAAAGACAATATTATGTGTATATTTGGCTGATTTCATCATTTATAAGCTATTT
AAAGAGATTTGAAATTATACGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTCATGGCCAAAAGT
ATTTGACCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCAATGATTTGTGGACGGTTCAAAACTAATTTGGGG
ATTTGATTATGTGTATTTATGATGTTGTGATTGATTACAGGTGAAAATGCAAATATGCAAAAATT
TAAGGACTTCGTTGCAAAGTTTGTTTCTTGAAATTTCATATTTAGCCGAAACATGATCAACCATT
TTGGCATGTTTTTCTTACTAATTTAAAATCAATTTAGATGCAGTAAGAGGTGTTTGCATTAGAAA
ATTCTTATAAAAGAAGGTGAAATATCATTAGATGTAATTATACCACGATGCCAAATTGTTGAGTT
GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTTTTTCAAACTGATAAAGATGAAATTGTGCTTATTT
GTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTCAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACAGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTCA
TGATTTGTGGACGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTTAACTATGTGTGTTTATGATGTTGTGAATG
ATTAGGGGGCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
TTTCTTATTTGAAATTAATGAGCTTTCGTTG
Found at i:338288 original size:486 final size:486
Alignment explanation
Indices: 335878--342054 Score: 7861
Period size: 487 Copynumber: 12.8 Consensus size: 486
335868 ATTAATGAGC
* * *
335878 TTTCGTTGCATGTATTTGTA-TCATGATGCTG-ATCTGTGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCAT
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACT-ATGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
* * *
335941 GGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTATGCTTATTTTT--ATGTGCATTTCTTGAT
64 GGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG-ATTTCTTGAT
* * * *
336004 TTATAAGTTATTTTATGATATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAGGTCATGCTT
127 TTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTT
* * * *
336069 TATGGCCAACAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTCTTTTTCAATGGTTTGTGGATGGTTCC
192 TATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATT-TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCC
* * * * * *
336134 AAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGATGAGAATGC
256 AAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGG-TCAAAATGC
** * * * *
336198 AAATAT-CTAAAAATTTTGGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCATATTTATCTGA
320 AAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGA
* * * * *
336262 AACATGATCAACCATTTTGTCCTGTTTTTCTTACTGATTTAAAAATAATTTAGATGCGTGATGAG
384 AACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAG
* *
336327 GTGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGAAGGTGAAA
449 GTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * *
336365 TTTCATTGCATGTATTTATACCACGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
* * * * * * *
336430 TCGAATTTGTTTCAAACTGATATAGCTTATATTGTGCTTATTTGTGCCCTT-ATTTCTTGATTTA
66 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-CCTTGATTTCTTGATTTA
*
336494 TAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
130 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * *
336559 GGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTTCATGATTTTTGGATGGTTCCAA
195 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* *
336624 ACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGAATGATTATGGGTCAAAATGCAAA
258 ACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
*
336689 TATGCAAAAATTTAAGGACTT-CTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
323 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * * ** * *
336753 TTATCAACTATTTCGAC-TGGTTTTTCTTGCTGACATGAAATTAAATTAGTTGCGTGATGAGGTG
388 TGATCAACCATTTTGGCAT-GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
* * *
336817 TCTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAGA
452 TTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
336852 TTTCTTTGCATGTACTCGTA-TCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACT-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
336916 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
65 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
*
336981 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAAATATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTT-
129 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * ** * * *
337045 TTGACAAAAACATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATAATTTGTGGATGGTTCCAAG
194 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* **
337110 TTGATTTGGTGATTTA-ATTATGTGT-TTTATGATGTTGTGATTGATTGGGGGTCAAAATGCAAA
259 CTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* *
337173 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACC
323 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
*
337238 TTATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATCGA-GTG
388 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT-GAGGTG
*
337302 TTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
452 TTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * ** *** *
337337 TTTCATTGCATGTATTTTTACCAT-A--AAGAAAAATTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
* * * * * * *
337399 TCGAATCTATTTGAAGTTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTGCCTTCATTTCATCATTTAT
66 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
* * * * * * *
337464 AGGTTACTTAAAGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGTAAGAATGAAAAGTCATGCTTGATG
131 AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
* * * * *
337529 GCCAAAATTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTATGGATAGGTTCCAAG
196 GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGAT-GGTTCCAAA
* *
337594 CTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAA
259 CTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* * * *
337658 TACGCGAAAATTTTAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGACATTTCTTATTTAGCCGAAACA
323 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * *
337723 AGATCAACCATTTTGGCCTATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTCATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
388 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* * *
337788 TTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGGAGAAA
453 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* *
337822 TTTCATTGCATGTATTCGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
* * * * * *
337887 TCGAATCTGTTTGAAACTGATATAGCTTATATTGTGCTTATTTGTGCCCTGATTTCTTGATTTAT
66 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
* * * * * *
337952 ATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAACTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATG
131 AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
* *
338017 GCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACT
196 GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACT
* * *
338082 GATTTGGTGATTAGATTGA-GTGTGTTTATGATGTTGTGACTAATTATGGGCCAAAATGCAAATA
261 GATTTGGTGATTAGATT-ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATA
* * * * *
338146 TGCAAAAATTTAAGGATTTCGTTGCGAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACATG
325 TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG
* *
338211 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACGGGGTGTTT
390 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
* * *
338276 ACAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTGAAA
455 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * ** *
338308 TTTCATTGCATGTA----TACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGTGAATCA--TAGATAACTTGG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
** * * * * * *
338367 TCGAATCTGTTTGATGTTGATAGAGATGATATTATACGTATTTTTGCCTTCATTTCTTCATTTAT
66 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
* * * *
338432 AGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATG-TTTGAT
131 AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTT-AT
* * *
338496 GGCCAAAAGTTTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
195 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* * *
338561 CTAATTTGG-GAATTAGATTATGTGCGTTTATGATGTTGTGAATGATTATGGGTCAAAATGCAAA
259 CTGATTTGGTG-ATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* * * **
338625 TATGCAAAAAATTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCTAAAACA
323 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * *
338690 TGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
388 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* *
338755 TTGCAAGGGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
453 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
** * * *
338789 TTTCATTGCATGTA-TTCAAATCATGGTGCTTAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACT-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
*
338853 GTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATA-T-TGCTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
65 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* * **
338916 ATAAGTTATTTAATGAGATTTAAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATATTTTA
129 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * *
338981 TGGCGAAAAGTAGTAGACCGAGCCTTGTAAAGTACTTTTTTTCCAAGA-TT-T--AT-G------
194 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* **
339035 ---GA--TGGT--TT-GATTATGTGTTTTTACAATGTTGTGATTGATTA-GTGGTCAAAATGCAA
258 ACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATG-GGTCAAAATGCAA
* * **
339091 ATATGCAAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAA
322 ATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA
** *** * * ** * * *
339156 TGTGATCAACCATAGCGACATCTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTAATTTAGATGAGTGTTGAGCT
386 CATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGT
* *
339221 GTTTGCATGAG-AAATTCTTGCAAAAATAGGTGAAA
451 GTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
339256 TTTTATTGCATGTATTTGTACCCA-GATGTTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAAATAGCTTG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTA-CTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * *
339320 GTCGAATCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTCTTTTTTCTTTTATTTCTTGATTTA
65 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * *
339385 TAAGCTATTTAACGAGATTTCG-AATTGTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGC-TTA
130 TAAGTTATTTAATGAGATTT-GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * * *
339448 CGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAAG
194 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
** * * * * *
339513 CTGATTCAGTGATTTGATTA--TGTG----T--T-TTGTAATTGATTAGGGGTTAAAATCCAAAT
259 CTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * **
339569 ATACAAAAATTTAAGTACCTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAAACGAAACAT
324 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* * ** * * *
339634 GATTAACCAATTTAACAAGTTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGGGGTGTT
389 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* *
339699 TGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAT
454 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
339732 TTTCATTACATGTATTTGCACCACGATGCTGAACTGTTGAGTTGCAAATCATCTAGATAGCTTGG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
*
339797 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAATA-ATGATATAGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * *
339861 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATTGGGATTAAATTACAAAAACGAAAAGTCATGCTTTAT
130 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * *
339926 GGACAAAACTATTTGACCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTCGATGGTTCCAAAC
195 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
* *
339991 TGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCTAAATGGAAATA
260 TGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATA
* * * * * * *
340056 TGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCCGAAGCCT
325 TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG-CCGAAACAT
* * * * * *
340121 GATCAACCATTTTGTCTTTTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTT
389 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* *
340186 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAACGTGGGTGAAA
454 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * *
340219 TATCATTGCATGTAATTGTATTATGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
* * *
340284 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATACTGTGCCTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTAT
66 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
* * *
340349 AAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGTATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
131 AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
* * * *
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196 GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACT
* * *
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261 GATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATAT
* * * * * *
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326 GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * ** * * *
340609 TCACCCAATTTAACATGTTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCATGATGGGGTGTTTG
391 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
*
340674 CATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGT-AAA
456 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
340704 TTTTCACTACATGTATTTGTACCATGATGCTAAACTGTTGAGTTGCAAATCATCTAGATAGCTTG
1 -TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
340769 GTCGAATATGTTTGAAATTGATAATA-ATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTCGATTTCTTGATTT
65 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* *
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129 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * *
340898 TGGACAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTCGATGGTTCCAA
194 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* * *
340963 ACTAATTTAGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGGAAA
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* * * * * *
341028 TATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCGAAGCA
323 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * *
341093 TGATCAACCATTTTGGCCTATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATCAGGTGT
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* *
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* * * *
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1 TTTCATTGCATGTATTTGTACT-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * *
341255 GTTGAATTTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATGTT
65 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGAT-TT
*
341320 -TAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
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* * *
341384 TCGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAATGATTTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
194 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTT-CCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* *
341449 ACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAA
258 ACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* * * * * * *
341514 TATGCAAAAATTTAAGGATTTAGTTGCAAACTTTGTTCTAAGAAATTTCTTATTTGGCTGAAACA
323 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * * * *
341579 TGATCAACCATTTGGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGT
388 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
*
341644 TTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
453 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
* * * * * *
341678 TATCATTACTTGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
1 TTTCATTGCATGTATTTGTACTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGG
* * * * *
341743 TCAAATCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCATGATTTCTTGATATAT
66 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
* * *
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131 AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
* * *
341873 GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTCGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCT
196 GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACT
* * *
341938 GATTTGGTGATTTA-ATTATTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATA
261 GATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATA
* * *
342002 TGCAAAAATTTAAGGACTTGCTCGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTT
325 TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
342055 GAAATTAATG
Statistics
Matches: 4950, Mismatches: 641, Indels: 199
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Matches are distributed among these distances:
466 11 0.00
467 177 0.04
468 196 0.04
469 2 0.00
470 5 0.00
471 1 0.00
472 1 0.00
475 113 0.02
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CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA
Found at i:341119 original size:973 final size:972
Alignment explanation
Indices: 335886--342054 Score: 7959
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* *
335886 CATGTATTTGTATCATGATGCTG-ATCTGTGGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATC
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* *
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706 TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGAT
* *
336659 GTTGTGAATGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT-CTTGCAAAGTTTG
771 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTG
* *
336723 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATTATCAA-CTATTTCGAC-TGGTTTTTCTTGCTGA
836 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTT-GACAT-GTTTTTCTTGCTGA
** * * * * *
336786 CATGAAATTAAATTAGTTGCGTGATGAGGTGTCTGTATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAG
899 TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* *
336851 ATTTCTTTG
964 ATTTCATTA
* * * * *
336860 CATGTACTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTGGTCGAATCT
1 CATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT
336925 GTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
66 GTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
* *
336990 TTAATGAGATTTGAAAATATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTT-TTGACAAAA
130 TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAA
** * * **
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**
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260 TGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAA
* * * *
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*
337247 ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATCGA-GTGTTTGCAAGA
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* ** ***
337311 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTTTACCAT-A--AAGAAAAATTG
453 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTA-TTGTACCATGATGCTGAATTGTTG
* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
337568 TCCATGATTTATGGATAGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTG
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* * * *
337632 TGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAATACGCGAAAATTTTAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC
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* * * * * *
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* * * *
337762 ATTCATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGGAGAAATTTCA
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*
337827 TTG
970 TTA
* *
337830 CATGTATTCGTA-CTATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATC
1 CATGTATTTGTATC-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATC
* * * * * * *
337894 TGTTTGAAACTGATATAGCTTATATTGTGCTTATTTGTGCCCTGATTTCTTGATTTATATGTTAT
65 TGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
* * * * * *
337959 TTAAAGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAACTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAA
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* *
338024 GTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGG
195 GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGG
* * *
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* * * * *
338153 ATTTAAGGATTTCGTTGCGAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCAAAACATGATCAACC
324 ATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCAACC
* * * *
338218 ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACGGGGTGTTTACAAGAG
389 ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAG
* *
338283 AAAATTCTTGTAAAAGCAGGTGAAATTTCATTGCATGTA---TACCATGATGCTAAATTGTTGAG
454 AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAG
** * ** * * * *
338345 TTGTGAATCA--TAGATAACTTGGTCGAATCTGTTTGATGTTGATAGAGATGATATTATACGTAT
519 TTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAT
* * *
338408 TTTTGCCTTCATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGT
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*
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*
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* * *
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* ** * * * * *
338666 GAAATTTCTTAATTAGCTAAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTTATTTGAAAT
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* *
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*
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972 A
*** * * *
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66 GTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
* * **
338925 TTAATGAGATTTAAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATATTTTATGG-CGAAA
130 TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGAC-AAA
* * * *
338989 AGTAGTAGACCGAGCCTTGTAAAGTACTTTTTTTCCAAGA-TT-T--AT-G---------GA--T
194 AGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT
* **
339038 GGT--TT-GATTATGTGTTTTTACAATGTTGTGATTGATTA-GTGGTCAAAATGCAAATATGCAA
258 GGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATG-GGTCAAAATGCAAATATGC-A
* * * ** **
339099 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAATGTGATCA
321 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCA
*** * * ** * *
339164 ACCATAGCGACATCTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTAATTTAGATG-AGTGTTGAGCTGTTTGCA
386 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCA-TGATGAGGTGTTTGCA
* * * * *
339228 TGAG-AAATTCTTGCAAAAATAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCCA-GATGTTGAATT
450 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTA-TTGTA-CCATGATGCTGAATT
* * * * *
339291 GTTGGGTTGCAAATTATTTAAATAGCTTGGTCGAATCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGT
513 GTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
* * * * * * * * *
339356 GTTTCTTTTTTCTTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTCG-AATTGTAGGGATT
578 GCTTATTTTTGCCTTCATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTT-GAAATTATAGGGATT
* * *
339420 AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGC-TTACGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGA-C
642 AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATT
* * * ** *
339483 TTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTCAGTGATTTGATTA--TGTG----T--T-
707 TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATG
* * * * * * *
339539 TTGTAATTGATTAGGGGTTAAAATCCAAATATACAAAAATTTAAGTACCTGGTTGCAAAGTTTGT
772 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGT
** * * *
339604 TCCATGAAATTTCTTATTTAAACGAAACATGATTAACCAATTTAACAAGTTTTTCTTGCTGATTT
837 TCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGACATGTTTTTCTTGCTGATTT
* * * *
339669 GATATTAATTTAGATGCGTGATGGGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAATTT
902 GAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATT
339734 TCATTA
967 TCATTA
* * * * *
339740 CATGTATTTGCACCACGATGCTGAACTGTTGAGTTGCAAATCATCTAGATAGCTTGGTCGAATCT
1 CATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT
*
339805 GTTTGAAATTGATAATA-ATGATATAGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
66 GTTTGAAATTGATAA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
* * *
339869 TTAATGAGATTTGAAATTATTGGGATTAAATTACAAAAACGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAA
130 TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAA
* * *
339934 CTATTTGACCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTCGATGGTTCCAAACTGATTTGG
195 GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGG
* *
339999 TGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCTAAATGGAAATATGCAAAAA
260 TGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAA
* * * * * *
340064 TTTAAGGATTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCCGAAGCCTGATCAACC
325 TTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTG-CCGAAACATGATCAACC
* * * * * *
340129 ATTTTGTCTTTTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAG
389 ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAG
* * * ** *
340194 AAAATTCTTGTAAACGTGGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGATGTTGAATTGTTGA
454 AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATTGTACCATGATGCTGAATTGTTGA
* *
340259 GTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATACTGTGCCTA
518 GTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTA
* * * *
340324 TTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGTATTAAATTG
583 TTTTTGCCTTCATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG
* *
340389 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGA-CTTTTTT
648 CAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTT
* *
340453 CAATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGA
713 CCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGA
* * * * * * *
340518 TTGAATATGGGTCAAAATGGAAATAGGTAAAAATTTAAAGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACG
778 TTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATG
* * * * *
340583 AAGTTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCACCCAATTTAACATGTTTTTCTTGCTGATTTGATATT
843 AAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGACATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATT
* * * *
340648 AATTTAGATGCATGATGGGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGT-AAATTTTCACT
908 AATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA-TTTCATT
340712 A
972 A
* * * * *
340713 CATGTATTTGTACCATGATGCTAAACTGTTGAGTTGCAAATCATCTAGATAGCTTGGTCGAATAT
1 CATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT
* *
340778 GTTTGAAATTGATAATA-ATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTCGATTTCTTGATTTAAAAGTTAT
66 GTTTGAAATTGATAA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTAT
*
340842 TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAA
130 TTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAA
* * * *
340907 CTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTCGATGGTTCCAAACTAATTTA
195 GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTG
*
340972 GTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGGAAATATGCAAAA
259 GTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAA
* * * * *
341037 ATTTAAGGATTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCGAAGCATGATCAACC
324 ATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCAACC
* * *
341102 ATTTTGGCCTATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATCAGGTGTTTGCAAGAG
389 ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAG
* * * *
341167 AAAATTCTTGT-AAAGTAAGG-AAAATTTCATTGCAAGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTG
454 AAAATTCTTGTAAAAGT-AGGTGAAATTTCATTGCATGTATT-GTACCATGATGCTGAATTGTTG
* * * *
341230 AGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATTTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTT
517 AGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTT
* * *
341295 ATTTTTGCCTTGATTTCTTCATGTT-TAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
582 ATTTTTGCCTTCATTTCTTCAT-TTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* * * * *
341359 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATCGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAATGATTTTTT
646 TGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTT
*
341424 TCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGT
711 TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGT
* * * * *
341489 GATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTAGTTGCAAACTTTGTTCTA
776 GATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
* * * * * *
341554 AGAAATTTCTTATTTGGCTGAAACATGATCAACC-ATTTGGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTCAA
841 TGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTT-GACATGTTTTTCTTGCTGATTTGAA
* * * * *
341618 ATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
905 ATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
341683 TTA
970 TTA
* * * * *
341686 CTTGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCT
1 CATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT
* * * *
341751 GTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCATGATTTCTTGATATATAAGTTATT
66 GTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATT
* * * *
341816 TAATAAGATTTGAAATTATTGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAAAAG
131 TAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAAG
* * *
341881 TATTTGACCGAGCCTCGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGT
196 TATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGT
* * *
341946 GATTTA-ATTATTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAA
261 GA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAA
* * *
342010 TTTAAGGACTTGCTCGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTT
325 TTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
342055 GAAATTAATG
Statistics
Matches: 4558, Mismatches: 542, Indels: 192
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
943 259 0.06
944 117 0.03
945 5 0.00
946 1 0.00
947 4 0.00
948 79 0.02
949 112 0.02
950 3 0.00
951 4 0.00
952 65 0.01
953 38 0.01
954 115 0.03
955 1 0.00
957 2 0.00
959 4 0.00
961 47 0.01
962 113 0.02
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965 5 0.00
966 114 0.03
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974 265 0.06
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976 2 0.00
977 1 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (972 bp):
CATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCT
GTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATT
TAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAAG
TATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGT
GATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAT
TTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCAACCAT
TTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAA
AATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
TTGCCTTCATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCA
TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTG
ATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCAATTTGACATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
TTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTA
Found at i:342055 original size:486 final size:486
Alignment explanation
Indices: 339043--342054 Score: 3899
Period size: 486 Copynumber: 6.2 Consensus size: 486
339033 TGGATGGTTT
* ** *
339043 GATTATGTGTTTTTACAATGTTGTGATTGATTA-GTGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAATTTT
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* ** ** ***
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* * ** * * *
339172 GACATCTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTAATTTAGATGAGTGTTGAGCTGTTTGCATGAG-AAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
* * * * * * *
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194 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTA-TCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * * * * *
339300 CAAATTATTTAAATAGCTTGGTCGAATCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTCTTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * * * *
339365 TTCTTTTATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTCG-AATTGTAGGGATTAAATTGCAA
323 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT-GAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * * *
339429 AAATGAAAAGTCATGC-TTACGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTCAAT
387 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAT
* ** *
339493 GATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTCAGTGATTT
452 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * *
339528 GATTA--TGTG----T--T-TTGTAATTGATTAGGGGTTAAAATCCAAATATACAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * ** * * **
339584 TACCTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAAACGAAACATGATTAACCAATTTAA
66 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
339649 CAAGTTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGGGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
131 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * * *
339714 TTATAAAAGTAGGTGAATTTTCATTACATGTATTTGCACCACGATGCTGAACTGTTGAGTTGCAA
196 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAA
* *
339779 ATCATCTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAATA-ATGATATAGTGCTTATTTTTG
261 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* *
339843 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATTGGGATTAAATTACAAAAA
325 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * *
339908 CGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAACTATTTGACCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTCCATGAT
390 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT
*
339973 TTGTCGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
455 TTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* *
340005 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCTAAATGGAAATATGCAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * * * *
340070 GATTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCCGAAGCCTGATCAACCATTTTG
66 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG-CCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * * *
340135 TCTTTTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
* * * * *
340200 CTTGTAAACGTGGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTATGATGTTGAATTGTTGAGTTGCA
195 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* *
340265 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATACTGTGCCTATTTTTG
260 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * *
340330 CCTTGATTTCTTCATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGTATTAAATTGCAAAAA
325 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * *
340395 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTCAATGAT
390 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT
340460 TTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
455 TTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * *
340492 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAATATGGGTCAAAATGGAAATAGGTAAAAATTTAAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * * * **
340557 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCACCCAATTTAA
66 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * *
340622 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCATGATGGGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
131 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * * * *
340687 TTATAAAAGTAGGT-AAATTTTCACTACATGTATTTGTACCATGATGCTAAACTGTTGAGTTGCA
196 TTGTAAAAGTAGGTGAAA-TTTCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* *
340751 AATCATCTAGATAGCTTGGTCGAATATGTTTGAAATTGATAATA-ATGATATTGTGCTTATTTTT
260 AATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-AGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * *
340815 GCCTCGATTTCTTGATTTAAAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAA
324 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* *
340880 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATG
389 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATG
* * *
340945 ATTTGTCGATGGTTCCAAACTAATTTAGTGATTA
453 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
340979 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGGAAATATGCAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * * *
341044 GATTTGGTTGCAAAATTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCGAAGCATGATCAACCATTTTGG
66 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * * *
341109 CCTATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATCAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTC
131 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * *
341174 TTGT-AAAGTAAGG-AAAATTTCATTGCAAGT-ATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTAC
196 TTGTAAAAGT-AGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT-GTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* * *
341236 AAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATTTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
341301 GCCTTGATTTCTTCATGTT-TAGGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
324 GCCTTGATTTCTTGAT-TTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * *
341365 AATGAAAAGTCATGCTTTATCGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAATGATTTTTTTCCCAT
388 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTT-CCAT
*
341430 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTA
452 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
*
341465 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTTAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * * * * * * *
341530 GATTTAGTTGCAAACTTTGTTCTAAGAAATTTCTTATTTGGCTGAAACATGATCAACCATTTGGG
66 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
* * * * * *
341595 CATGTTTTTCTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGTGAAAATTC
131 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
* * * * *
341660 TTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTACTTGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAA
196 TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAA
* * *
341725 ATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTAC
261 ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
* * * *
341790 CATGATTTCTTGATATATAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATTGGGATTAAATTGCAAAAAT
326 CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
* * *
341855 GAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTCGTAAAGTATTTTTTTCCATGATT
391 GAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATT
*
341920 TGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTA
456 TGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTA
* * *
341952 -ATTATTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
* * *
342016 GACTTGCTCGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTT
66 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
342055 GAAATTAATG
Statistics
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Consensus pattern (486 bp):
GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTC
TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAA
ATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC
CTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT
GAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATT
TGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
Found at i:342300 original size:390 final size:391
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Period size: 390 Copynumber: 1.9 Consensus size: 391
341678 TATCATTACT
* * * *
341688 TGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCAAATCTGT
1 TGTAATTGTATTATGATGCCGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCATGGTCAAATCTAT
341753 TTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCATGATTTCTTGATATATAAGTTATTTA
66 TTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCATGATTTCTTGATATATAAGTTATTTA
* * * *
341818 ATAAGATTTGAAATTATTGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAAAAGTA
131 ATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGAAAAAACGAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAAAAGTA
* *
341883 TTTGACCGAGCCTCGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGA
196 TTTGACCGAGCCTCGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGA
*
341948 TTTAATTATTTGT-TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAAT
261 TTTAATTATGTGTGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATAT-CTAAAAAT
* * *
342011 TTAAGGACTT-GCTCGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTTGAAATTAATGAGATTTCGTT
325 TTAAGGACTTGGAT-GCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATTTGAAATTAATGAGATTTCGTT
342075 GCA
389 GCA
* * *
342078 TGTATTTGTATTATGATGCTG-ATCTATTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCATGGTCGAATCTA
1 TGTAATTGTATTATGATGCCGAAT-TATTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCATGGTCAAATCTA
* * * ** * *
342142 TTTGAAATTTATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTA-TGTGCATTTCTTGATTTATAAGTTCTT
65 TTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCATG-ATTTCTTGATATATAAGTTATT
* * *
342206 TTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGAAAAAACGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAG
129 TAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGAAAAAACGAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAAAAG
* * *
342271 TATTTGGCCGAGTCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGG
194 TATTTGACCGAGCCTCGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGG
* * *
342336 GATTTGATTATGTGTGTTTTATGATGTTGTGTTTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATATCTAAAAA
259 GATTTAATTATGTGTGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAA
* *
342401 TTTATGGACTTGGATGCAACGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATT
324 TTTAAGGACTTGGATGCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATT
342445 CAACCAAAAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.41
Consensus pattern (391 bp):
TGTAATTGTATTATGATGCCGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCATGGTCAAATCTAT
TTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCATGATTTCTTGATATATAAGTTATTTA
ATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGAAAAAACGAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAAAAGTA
TTTGACCGAGCCTCGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGA
TTTAATTATGTGTGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATCTAAAAATT
TAAGGACTTGGATGCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATTTGAAATTAATGAGATTTCGTTGC
A
Found at i:342996 original size:487 final size:486
Alignment explanation
Indices: 342067--349211 Score: 9177
Period size: 486 Copynumber: 14.8 Consensus size: 486
342057 AATTAATGAG
* ** * * *
342067 ATTTCGTTGCATGTATTTGTATTATGATGCTG-ATCTATTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCAT
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
* * * *
342131 GGTCGAATCTATTTGAAATTTATAATGATGATATTGTGCTTATTTTT--ATGTGCATTTCTTGAT
65 GGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG-ATTTCTTGAT
* * * * *
342194 TTATAAGTTCTTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGAAAAAACGAAAAGTCATGCTT
128 TTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTT
* *
342259 TATGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGTCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCA
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* * * * * *
342324 AGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTTATGATGTTGTGTTTGATTAGGGGTGAAAATGCA
258 AACTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTG-TTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCA
* * * * * * *
342389 AATAT-CTAAAAATTTATGGACTTGGATGCAACGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATTCAACCAAA
322 AATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAA
* * * *
342453 ACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTACTAGTTTGAAAATAATTCAGATGCGTGATGAGG
386 ACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGG
*
342518 TGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
451 TGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
342554 ATTTCATTACATGTATTTGCACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * *
342619 AG-GGAATCTGTTTGCAACTGATATAGGTTATATTGTGCTTATTTTTGCCCTGATTTCTTGATTT
66 -GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
342683 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* *
342748 TGGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
* * * * * * *
342813 GCTAATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTTGTGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAACATGCCAA
259 ACTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* * ** *
342878 TATGCAAAAATTTAAGAACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAAGA
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * * *
342943 TAATCAACCAATCTGGCATGTTTTTCTTGCAAATTTGAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
389 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* *
343008 TTGC-TAGTGAAAATTCTTGTAAGAGTAGGTGAA
454 TTGCAT-GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * *
343041 ATTTCATTGCATGTATTTGTTCCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATGGCTTC
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * *
343106 CTCGAATCTGTTTGAAATTCATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * * * ** *
343171 TAGGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAGTATGAAAAGTCATGCTTGAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * *
343236 GGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTATAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
* * * *
343301 TGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAATA
261 TGATTTGGTGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATA
* * * * * * *
343366 TGCAAAAATTTAAGGATTTCGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGACAAAAGATG
326 TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG
* * * *
343431 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTT
391 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
*
343496 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGATGAA
456 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* ** ** * * * *
343527 ATATCATTGCATGTAACTGTATTATGATGCCGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGAAAGTTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * *
343592 GTCGAATCTATTTGAAATTGATAAACATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTCAATTCTTCACTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * * * * * *
343657 TAGGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTAAA
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * *
343722 GGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAAC
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
* *
343787 TGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTGTGATCTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGTGATTTA-ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * * * *
343851 ATGAAAAAATTTAAAGG-TTTCGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTCCTTACTTGGCCGAAACA
325 ATGCAAAAATTT-AAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * * *
343915 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGT
389 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
*
343980 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAA
454 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
** * ** * * * * * *
344013 ACATCATTGCATGTAATTGTATTATGATACCGGATTATTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTT
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
344078 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTTCTTGATTTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
344143 TAAGTTATTT-ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * * **
344207 GGCCAAAACTATTTAACCAAGCATTGTAAAGGATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGTTCCATGC
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
* * * *
344272 TGATTTGGTGATTTGATTTTGTGT-TTTATTGACGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGTGATTTAATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* **
344336 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATATCTTATTTAGTTGAAACAT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* * *
344401 GATCAACCAATTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
390 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
**
344466 TGTTTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
455 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * *
344498 ATTTCATTGTATGTATTTGTACCATGAAGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * *
344563 GTCGAATCTATTTGAAATTGATAATA-ATGATATTGTGCTTATTTATGCCTTGATTTATTGATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* * * * *
344627 ATAAGTTATTTAATGTGATTTGAAATTATACGGATTGAATTACAAAAAGGAAAAGTCATGCTTTA
130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * *
344692 TGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAATGATTTTTTTCCATGATTTCTGGATGGTTCCAAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* *
344757 CTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAATATGGGTCAAAATGGAAA
260 CTGATTTGGTGATTTA-ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* * * *
344821 TATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCGAAACA
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* *
344886 TGATCACCCATTTTGGCATGTATTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
389 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* **
344951 TTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAATGAA
454 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * *
344984 ATTTCATTGCATGTATTTTTACCATGATGTTGAATTGTTAAGTTGCAAATCATATAGTTAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * * *
345049 GTCGAATCTGTTTGAAGTTTATATAGATGACATTGTGCGTATTTTTGCCCTCATTTCTTCATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * * ** * * *
345114 TAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAGTTGCAGGGATTAAATTGTAAAAATGGAAAGTCATGCTTGAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * *
345179 GGCCAAAAGTTTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTATGGATGGCTCCAAA
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* * * *
345244 CTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGCTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAAT
260 CTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * *
345309 ATGAAAAAAATTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACAT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* * *
345374 GATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
390 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* *
345439 TCCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
455 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * *
345471 ATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTTAATTGTTGAGTTGCATATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
345536 GTTGAATCTGTTTGAAATTGATAACGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* * *
345601 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAACTATAGGGATTAAATCGCAAAAATGAAAAGTCATGTTTTAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* ** * *
345666 AGTGAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGTACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT-----
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* *
345726 -TGATTCT-GTG-TTT--TTA--------CA--ATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAA
260 CTGATT-TGGTGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* ** * * * * * *
345776 TATTCAAAAATTTTTGGACTTGGATGTAAAGTTTGTTCCATGAATTTTTTTATTTAGCTGAAACG
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * ** * * * * *
345841 TGATCAACCATTGTGGCATCTTTTTTTTGCCGACTTGAAATTACTTTAGATGCGTGTTGAGCTAT
389 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* *
345906 TTACATGAGAAAATTCTTGCAAATA-TAGGTGAA
454 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA-AGTAGGTGAA
* * * *
345939 ATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * * * *
346004 GTCAAATTTGGTTAAAATTGATAAGGACGATATTGTGCTTGTTTTTTCCATT-ATTTCTTAATTT
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC-TTGATTTCTTGATTT
* * *
346068 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATATGGATTAAA-TGCAAAAAGGAAAAGTCATGCTTGA
130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * *
346132 TGGCCAAAAGTATTTGATCC-AGCCTTGTAACGGATTTTTTTCTACGATTTGTGGATGGTTTCAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGA-CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAA
** * * * *
346196 ACTGATTTGGCAATTTGATTATGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGCCAAAATGAAAA
259 ACTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAA
* *
346261 TATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGA
324 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* * * * * * **
346326 AGATCAACCATTTTGGCCTATTTTTCTTGTTGATTTAAAATTAAGCTAGATGCGTGATGAGGTGT
389 TGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* * *
346391 TTGCAAGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGGAGAA
454 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * ** * *
346424 ATTTTATTGCTTGTATTCGTATAATGGTGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* ** *
346489 GTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACGTTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
* *
346554 TAAGTTATTTAATGAGAATTGAAACTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * ** *
346619 GGCCAAAAGTACTGGACCGAGCCTTGCCAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTAGATGGTTCCAAAC
196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
* *
346684 TGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGATTATGATGTTGCGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
261 TGATTTGGTGATTTA-ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * *
346748 ATGCAAAAATTTAAGGATTTCGTTGCAAACTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACAT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* * * ** * * * *
346813 GATCAAACATTTTGGCTTCTTTTTCAAGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTT
390 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
346878 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
455 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * *
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* * *
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* * * *
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131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* *
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196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* *
347170 CTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTATGTTTATGATGTTGTGATTGAATATGGGTCAAAAT-CGAA
260 CTGATTTGGTGATTTA-ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGC-AA
* * * * *
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*
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* *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
347527 TATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGAT
131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * *
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196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* * * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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*
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* * * * * *
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* *
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* * *
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131 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* *
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196 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
** *
348138 -TGATTT--TG---------TGT-T-TTTACAATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAT
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* *
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* * * *** *
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1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * *
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66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC-TTGATTTCTTGATTT
*
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130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* *
348543 TGGCCAAAAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
195 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
*
348607 CTGATTTGAG-GA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAATGCAA
260 CTGATTTG-GTGATTTA-ATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAA
* * * ** * *
348670 ATACGCAAAAATTTAAGTATTTCATTGCAAACTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAAC
323 ATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAC
* * * * * *
348735 ATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCATGCTAATTTCAGATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTG
388 ATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
*
348800 GTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
453 TTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * *
348834 ATATCATTGCATGTAATTGTACTATGATG-TCGAATTGTTGAGATGCAAATCATTTAGATAGCTT
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
* * *
348898 GGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTCATTT
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* ** *
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130 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * *
349028 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGACGGCTCCAAG
195 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* * *
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260 CTGATTTGGTGATTTAATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* *
349158 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGATGCAAAGATTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
325 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
349212 GAGATTAATG
Statistics
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GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
Found at i:345686 original size:973 final size:970
Alignment explanation
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342057 AATTAATGAG
* ** * * *
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* * ***
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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* *
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*
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* * * *
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* * * * * * *
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** * * * *
342906 AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAAGATAATCAACCAATCTGGCATGTTTTTCTT
836 AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTT
* * * *
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965 GGTGAA
* * * *
343041 ATTTCATTGCATGTATTTGTTCCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATGGCTTC
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * *
343106 CTCGAATCTGTTTGAAATTCATATAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTA
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* * * ** *
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* * *
343236 GGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTATAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
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* *
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260 TGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATA
* * * * * * *
343366 TGCAAAAATTTAAGGATTTCGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGACAAAAGATG
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* * * * *
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* * ** ** *
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455 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAA
* * * *
343561 TTATTGAGTTGCAAATCATTTAGAAAGTTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAACATGATATT
520 TTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGAT-AAGATGATATT
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* *
343821 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAAGG-TTTCGTTGCAAAGTTTG
779 TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT-AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
* * * *
343885 TTCCATGAAATTCCTTACTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCCTGCTAATT
843 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATT
* * * * *
343950 TCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAA
908 TGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
** * ** * * * * * *
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1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * *
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*
344143 TAAGTTATTT-ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
130 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * * **
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195 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
* * * *
344272 TGATTTGGTGATTTGATTTTGTGT-TTTATTGACGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAAT
260 TGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* **
344336 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATATCTTATTTAGTTGAAACAT
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* * *
344401 GATCAACCAATTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
389 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
** * *
344466 TGTTTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGTATGTATTTGTACCATGAAGCTGA
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* *
344531 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAATAATGATAT
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* * * *
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* * * * *
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*
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* *
344791 GTTGTGATTGAATATGGGTCAAAATGGAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTG
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* * * * *
344856 TTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCGAAACATGATCACCCATTTTGGCATGTATTTCTTGCTAATT
843 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATT
* **
344921 TGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAATGAA
908 TGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * *
344984 ATTTCATTGCATGTATTTTTACCATGATGTTGAATTGTTAAGTTGCAAATCATATAGTTAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * *
345049 GTCGAATCTGTTTGAAGTTTATATAGATGACATTGTGCGTATTTTTGCCCTCATTTCTTCATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTA
* * * ** * *
345114 TAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAGTTGCAGGGATTAAATTGTAAAAATGGAAAGTCATGCTTGAT
130 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * * *
345179 GGCCAAAAGTTTTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTATGGATGGCTCCAAA
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* *
345244 CTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGCTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAAT
259 CTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * *
345309 ATGAAAAAAATTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACAT
324 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* *
345374 GATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
389 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* * * * * *
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* * *
345504 ATTGTTGAGTTGCATATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAACGATGATAT
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*
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* **
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* * ** * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * *
345875 TTGAAATTACTTTAGATGCGTGTTGAGCTATTTACATGAGAAAATTCTTGCAAATA-TAGGTGAA
907 TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA-AGTAGGTGAA
* * * *
345939 ATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* * * * * * * * *
346004 GTCAAATTTGGTTAAAATTGATAAGGACGATATTGTGCTTGTTTTTTCCATTATTTCTTAATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTA
* * * *
346069 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATATGGATTAAA-TGCAAAAAGGAAAAGTCATGCTTGAT
130 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* * * *
346133 GGCCAAAAGTATTTGATCC-AGCCTTGTAACGGATTTTTTTCTACGATTTGTGGATGGTTTCAAA
195 GGCCAAAAGTATTTGA-CCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
** * * *
346197 CTGATTTGGCAATTTGATTATGTGTGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGCCAAAATGAAAAT
259 CTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * *
346262 ATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGAA
324 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* * * **
346327 GATCAACCATTTTGGCCTATTTTTCTTG-TTGATTTAAAATTAAGCTAGATGCGTGATGAGGTGT
389 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTT-ATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGT
* * * * * * ** * *
346391 TTGCAAGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGGAGAAATTTTATTGCTTGTATTCGTATAATGGTGTTG
453 TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTG
* * **
346456 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACG
518 AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGAT-AAGATGATA
* * *
346521 TTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGAATTGAAACTATAGGG
582 TTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGG
* * **
346586 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTACTGGACCGAGCCTTGCCAAGG
647 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGG
* *
346651 ATTTTTTTCCATGATTTGTAGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGATTATGA
712 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
* * *
346716 TGTTGCGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTCGTTGCAAACTTT
777 TGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTT
* * * * **
346781 GTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAAACATTTTGGCTTCTTTTTCAAGCTAAT
842 GTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAAT
* * * *
346846 TTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
907 TTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * * *
346910 ATGTCATTGCATGTAATTGTACTAAGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
346975 GTAGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGGGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTA
* ** * *
347040 TAAGTTATTTAATAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTTATGTTTTAT
130 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* *
347105 AGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
195 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* * * *
347170 CTGATTTGGTGATTAGATTATGTATGTTTATGATGTTGTGATTGAATATGGGTCAAAAT-CGAAA
259 CTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGC-AAA
* * * * *
347234 TATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAACTTTGTTCCACGAAGTTTCTTATTTTGCCGAAACA
323 TATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACA
* *
347299 TGATC-ACCTATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGATG
388 TGATCAACC-ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTG
* * * *
347363 TTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTCTTTGCATGTATTTGTACCATGATTCT
452 TTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCT
* *
347428 GAATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAGTTGATATAGATGAT
517 GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATA-AGATGAT
* * * * * * * *
347493 ATAGTGCATATTTTTGCCCTCATTTCTTCATTTATATGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTGTAGG
581 ATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGG
* * * * *
347558 GATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTTTTTGATCAAGCCTTGTAAAG
646 GATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAG
* * * **
347623 GATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGGGATTTGATTATGTGCCTTTAT
711 GA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTAT
* * *
347688 GATGTTGTGATTGATTATGGATGAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAGGATTTGGTTGCAAAGT
775 GATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGT
* * * * * *
347753 TTGTTCCATGAAATTTCTAAATTAGTCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTTGCTT
840 TTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTA
* *
347818 ATTTGAAATTAACTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGA
905 ATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGA
347883 A
970 A
* * * * * *
347884 ATTTTATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTTAATTGTTGAGTTGCATATCATTTAGATAGCTTG
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTG
* *
347949 GTTGAATCTGTTTGAAATTGATAACGATGATATTGTGCTTA-TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTA
66 GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTA
* *
348013 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGTTTTAA
130 TAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT
* *
348078 GGCGAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT-----
195 GGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
** *
348138 -TGA--T-----TTTG----TGT-T-TTTACAATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAT
259 CTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* * * * * *
348189 ATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCGAAGTTTGTTCCATGAATTTTCTTATTTAGCTGAAACGT
324 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAT
* * ** * * * *
348254 GATCAACCATTATGGCATCTTTTTCTTGCCGATTAGAAATTAATTTAGATGCGTGTTGAGCTATT
389 GATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTT
* * * *
348319 TGCATGAGAAAGTTCTTGCAAAA-TAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGA
454 TGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGA
* *** * *
348383 ATTGTTGGGTTGCAAATTGCTTAGATAGATTGGTCGAATCTATTTAAAATTGATGAAGATGATAT
519 ATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGAT-AAGATGATAT
*
348448 TGTGCTTATTTTTTCCATT-ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAA-TATAGGG
583 TGTGCTTATTTTTGCC-TTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGG
* * *
348511 ATTAAATTGCAAAAATGGAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGG
647 ATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGG
348576 A-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGAG-GATTAGATTATGTGTGTTTATG
712 ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTG-GTGATTAGATTATGTGTGTTTATG
* * * ** *
348639 ATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAATGCAAATACGCAAAAATTTAAGTATTTCATTGCAAACTT
776 ATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTT
* *
348704 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCATGCTAA
841 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAA
* * * * * *
348769 TTTCAGATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGGTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
906 TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
* * * *
348834 ATATCATTGCATGTAATTGTACTATGATG-TCGAATTGTTGAGATGCAAATCATTTAGATAGCTT
1 ATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
* *
348898 GGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTCATTT
65 GGTCGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTT
* * *
348963 ATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTTTAAAAATAAAAAGTCATGCTTTA
129 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * *
349028 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGACGGCTCCAAG
194 TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
* * * * *
349093 CTGATTTGGTGATTTAATTATTTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAAT
259 CTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAAT
* *
349158 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGATGCAAAGATTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
324 ATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
349212 GAGATTAATG
Statistics
Matches: 5339, Mismatches: 751, Indels: 167
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (970 bp):
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AAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
GCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACT
GATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATAT
GCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAAT
TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAGATGATATTGT
GCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTA
AATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT
TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGA
AATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
Found at i:350003 original size:838 final size:842
Alignment explanation
Indices: 348403--350049 Score: 2289
Period size: 838 Copynumber: 2.0 Consensus size: 842
348393 TGCAAATTGC
* * **
348403 TTAGATAGATTGGTCGAATCTATTTAAAATTGATGAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCATTA
1 TTAGATAGATTGGTCGAATCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTATCCAGCA
*
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131 TCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGAT
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* * * *
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* * * *
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326 CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCATACTAATTTCAAAATAATTTAGATGCATGA
* *
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391 AGAGGTGGTT--AT-AG-AAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGCACCA
* *
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517 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAA
* * * *
348988 TTATAGGGATTAAATTTTAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCT
582 TTATAGAGATTAAATTATAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAAGTATTTGACCAAGCCT
* ** *
349053 TGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGACGGCTCCAAGCTGATTTGGTGATTTAATTATTTGT
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* * *
349118 TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGATG
712 TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGCATG
*
349183 CAAAGATTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGAGATTAATGATGCTGATCTGTTGAGTTGTAAATCT
777 CAAAGATTGTTCCATAAAATTTCTTATTTGAGATTAATGATGCTGATCTGTTGAGTTGTAAATCT
349248 T
842 T
* * * *
349249 TTAGATAGCA-TGGTCGAATCTGTTTGAAATTTATAAAGATGATATTGTGCTTACTTTTATGC-G
1 TTAGATAG-ATTGGTCGAATCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTA-TTTTATCCAG
* *
349312 CATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCCAAAAT-GA
64 CATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAA-TATAGGGATTAAAATGCAAAAATGGA
* *
349376 AAGGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTG-GCTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATT
128 AA-GTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATC-GAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATT
* * * * * * *
349440 TGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGTTTGTTTAG
189 TGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGAGGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAC
* * * * ** * *
349505 GGGTGAAAATGCCAATATC-TAAAATTTTAAGGACTTGGTTGAAAAGTTTGTTCCCTGAAATTTC
254 GGGTCAAAATGCAAATA-CGCAAAAATTTAAGGACTTCATTGAAAACTTTGTTCCATGAAATTTC
* * * * *
349569 TTATTCAGG-CGAAACATGATCAACTATTTTGGCCTGTTTTTCTTACTGATTTGAAAATAATTTA
318 TTATT-AGGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCATACTAATTTCAAAATAATTTA
* * * * * * * *
349633 GTTGCGTGATGAGGT-GTT-T-G-CA-T-TTG-AAAAGTAGGTGACATTTCATTGCGTGTATTTG
382 GATGCATGAAGAGGTGGTTATAGAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTG
* * *
349691 CACCATGATG-CTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTCGGTGGAATCTGTTTGAAAC
447 CACCATGATGTC-GAATTGTTGAGATGCAAATCATTTAGATAGCTCGGTCGAATCTATTTGAAAC
* * * * * * * *
349755 TGATATAGGTTATATTGTTCTTATTTTTTCCCTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGAT
511 TGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAACGAGAT
* * *
349820 TTGAAATTATCGAGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT-GACAACAGGTATTTGAC
576 TTGAAATTATAGAGATTAAATTATAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGACAA-AAGTATTTGAC
* * *
349884 CAAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCTAGCAAATTTGGTGATTTAAT
640 CAAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTATGGACGGCTCCAAGCAAATTTGGTGATTTAAT
*
349949 TATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCCAATATGCAAAAATTTAAGAAC
705 TATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGAAC
* *
350014 TTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATAAAATTTCTTATTT
770 TTGCATGCAAAGATTGTTCCATAAAATTTCTTATTT
350050 AGCTGAAAGA
Statistics
Matches: 705, Mismatches: 85, Indels: 30
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
837 5 0.01
838 344 0.49
839 3 0.00
840 1 0.00
841 1 0.00
843 1 0.00
845 1 0.00
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849 186 0.26
850 3 0.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (842 bp):
TTAGATAGATTGGTCGAATCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTATCCAGCA
TTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATATAGGGATTAAAATGCAAAAATGGAAAG
TCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGAT
GGTTCCAAACTGATTTGAGGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAA
AATGCAAATACGCAAAAATTTAAGGACTTCATTGAAAACTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTAGG
CCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCATACTAATTTCAAAATAATTTAGATGCATGA
AGAGGTGGTTATAGAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGCACCATGAT
GTCGAATTGTTGAGATGCAAATCATTTAGATAGCTCGGTCGAATCTATTTGAAACTGATAAAGAT
GATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTCATTTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATTAT
AGAGATTAAATTATAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGACAAAAGTATTTGACCAAGCCTTGTA
AAGTATTTTTTTCCATGATTTATGGACGGCTCCAAGCAAATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTT
ATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGCATGCAAA
GATTGTTCCATAAAATTTCTTATTTGAGATTAATGATGCTGATCTGTTGAGTTGTAAATCTT
Found at i:351254 original size:957 final size:947
Alignment explanation
Indices: 349220--352432 Score: 3929
Period size: 957 Copynumber: 3.4 Consensus size: 947
349210 TTGAGATTAA
* * *
349220 TGATGCTG-ATCTGTTGAGTTGTAAATCTTTTAGATAGCATGGTCGAATCTGTTTGAAATTTATA
1 TGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* *
349284 AAGATGATATTGTGCTTACTTTTATG-CGCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGA
65 AAGATGATATTGTGCTTA-TTTT-TGCCTCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGA
* * * * *
349348 AATTATAGGGATTAAAATGCCAAAATGAAAGGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTG-GCTGAG
128 AATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATC-AAG
*
349412 CCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTAT
192 CCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAATTAT
** * * * * * *
349477 GTGTTTTTATGATGTTGTGTTTGTTTAGGGGTGAAAATGCCAATAT-CTAAAATTTTAAGGACTT
256 GTGCGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTT
* * *
349541 GGTTGA-AAAGTTTGTTCCCTGAAATTTCTT-ATTCAGGCGAAACATGATCAACTATTTTGGCCT
320 GGTT-ACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATT-AGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTT
* * *
349604 GTTTTTCTTACTGATTTGAAAATAATTTAGTTGCGTGATGAGGTGTTTGC--------A-T-TTG
383 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTG
* * * * * *
349659 -AAAAGTAGGTGACATTTCATTGCGTGTATTTGCACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
448 TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC
* * * * * * *
349723 ATTTAGATAGCTCGGTGGAATCTGTTTGAAACTGATATAGGTTATATTGTTCTTATTTTTTCCCT
513 ATTTAGATAGCTCGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATA-AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTT
* * **
349788 GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATCGAGATTAAATTATAAAAATGAA
577 GATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAA
* * * * *
349853 AAGTCATGCTTTATGACAACAGGTATTTGACCAAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTAT
642 AAGTCATGCTTTATGGCAA-AAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA-TT-T
*
349918 GGATGGTTCCTAGCAAATTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
704 -G-TGG-ACCT-G-----TT--TG-----ATTATGTG-TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG
* * * *
349983 TCAAAACGCCAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATAAAATTTCTTAT
752 TCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAT
* *
350048 TTAGCTGAAAGATGATCAATCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGC
817 TTAGCTGAAACATGATCAA-CCATTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGC
* * * *
350113 ATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAACGTGGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGT
881 ATT-TGA-GTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTTATTGCATGTATTTGT
350178 AC-C
944 ACAC
*
350181 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATA
1 -TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* * * * * *
350246 TAGATGATAATGTGCGTATTTTTGCCCTCATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAA
65 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-CCTCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * * *
350311 ATTGTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAGAAGTTTTTGATCAAGCC
129 ATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCC
* * *
350376 TTGTAAAGGATTTTTTCTCCATGATTTGCGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTTGATTATGT
194 TTGTAAAGGATTTTTT-TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAATTATGT
* * * *
350441 GCGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAGGATTTTGT
258 GCGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
*
350506 TACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACTATTGTGGCTTGTTTT
323 TACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTT
*
350571 TCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
388 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * **
350636 GTGGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTTAATTGATGAGTTGCAAATTGTTTA
453 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
** *
350701 GATAGCTTAGTTGAATCTTTTTTGAAATTGATAACGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
518 GATAGCTCGGTTGAATC-TGTTTGAAATTGATAA-GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
*
350766 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
581 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
*
350831 CATGTTTTATGGCGAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGACCTTTTTTTCCATGATTTGTGG
646 CATGCTTTATGGC-AAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGG
** *
350896 ACC-GTTTGATTATGTGTTTGTACAATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
708 ACCTGTTTGATTATGTGTTT-TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAA
* *
350960 AATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAAC
772 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAAC
* ** *
351025 CATTTAGGCATCTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGCTGTTTACATGA
837 CATTT-GGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCAT-TTGAG-TGTTTGCATGA
* *
351090 GAAAATTCTTGCAAAAATAGGAGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACAC
899 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACAC
* * *
351139 TGATACTGAATTGTTGGGTTGCAAAT-TCTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTAAAATTGATA
1 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCT-TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATA
* *
351203 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
65 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC-TCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * *
351268 ATTATATGGATTAAAATGCAAAAAAGAAAAGTCGTGCTTGATGGCCAAAAGTATTTAATCAAGCC
129 ATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCC
* * * * ** *
351333 TTGTAAAAGA-TTTTTTCCACGATTTGTGGACGGTTCCAATCTGATTTGGCAATTTAATTATCT-
194 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAATTATGTG
* * *
351396 CTGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTGAGGATTTGGT
259 C-GTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
* ** * * *
351461 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTGTTTAGCCGAAAGAAGATCAACCATTTTGGCTTGTTTT
323 TACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTT
* * *
351526 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTGGATGCGTGATGATGTGCTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
388 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
*
351591 GTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
453 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
*
351656 GATAGCTCGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTT-TTTTTGCCTTGATTT
518 GATAGCTCGGTTGAATCTGTTTGAAATTGAT-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
*
351720 ATTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
582 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
*
351785 AAT-CTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGAT
647 -ATGCTTTATGG-CAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGA-
*
351849 GGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAA
709 -----C---C-----T-GT--TT-GATTATGTGT-TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAA
* * * ** *
351914 AACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTTGTTGCAAACTTTGTTCCCCGAAATTTCTTATTTGG
756 AACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG
* * * *
351979 C-CAAACGTGATCAACCATTTTGGCATGTTTGTCTTACTAATTTGAAATTAATTTAGATGCATTT
821 CTGAAACATGATCAACCA-TTTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCATTT
* * * * *
352043 AGAG-G-TTGCATGAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATTGTATTA-
885 -GAGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTTATTGCATGTATTTGTA-CAC
*
352105 TGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATC--------A--TT--T---A-------GAAATTGATAA
1 TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA
*
352148 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAA
66 AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC-TCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAA
* * * *
352213 TTATAGGGATTAAATTGCAAAAAT-AAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGA-CC
130 TTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAA-GTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCC
* * *
352276 TTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGTTTTAATTATGTG
194 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAATTATGTG
** * *
352341 TTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTT
259 CGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
* *
352406 GCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTCTTA
324 ACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
352433 TTTGAAATTA
Statistics
Matches: 1972, Mismatches: 217, Indels: 142
0.85 0.09 0.06
Matches are distributed among these distances:
943 14 0.01
944 248 0.13
951 21 0.01
953 114 0.06
954 32 0.02
955 293 0.15
956 19 0.01
957 376 0.19
958 3 0.00
960 3 0.00
961 11 0.01
962 366 0.19
963 7 0.00
964 2 0.00
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968 2 0.00
969 56 0.03
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971 5 0.00
972 6 0.00
973 74 0.04
974 133 0.07
975 4 0.00
976 13 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (947 bp):
TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAA
AGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAAT
TATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTT
GTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTAATTATGTGCG
TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTAC
AAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCT
TGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTA
GGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGAT
AGCTCGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTG
ATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGC
TTTATGGCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGACCTGTTT
GATTATGTGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGG
ACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTGGCA
TGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCATTTGAGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGT
AAAAGTAGGAGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACAC
Found at i:351635 original size:485 final size:479
Alignment explanation
Indices: 349219--352435 Score: 3568
Period size: 485 Copynumber: 6.7 Consensus size: 479
349209 TTTGAGATTA
* * *
349219 ATGATGCTG-ATCTGTTGAGTTGTAAATCTTTTAGATAGCATGGTCGAATCTGTTTGAAATTTAT
1 ATGATGCTGAAT-TGTTGAGTTGCAAATC-TTTAGATAGCTTGGT-GAATCTGTTT-AAATTGAT
*
349283 AAAGATGATATTGTGCTTACTTTTATG-C--GCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATT
62 AAAGATGATATTGTGCTTA-TTTT-TGCCTTG-ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
* * * * ** *
349345 TGAAATTATAGGGATTAAAATGCCAAAATGAAAGGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCTG
124 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTAACCG
* * * *
349410 AGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATT
189 AGCCTTGTAAAAGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTAATT
* * * * * *
349475 ATGTGTTTTTATGATGTTGTGTTTGTTTAGGGGTGAAAATGCCAATAT-CTAAAATTTTAAGGAC
252 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGAC
* * * * * * *
349539 TTGGTTGAAAAGTTTGTTCCCTGAAATTTCTTATTCAGGCGAAACATGATCAACTATTTTGGCCT
316 TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCATTTTGGCAT
* * * * * *
349604 GTTTTTCTTACTGATTTGAAAATAATTTAGTTGCGTGATGAGGTGTT---T--G--CA-T-TTG-
381 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGA-GTGTTGCATGAGAAAATTCTTGT
* * * * *
349659 AAAAGTAGGTGACATTTCATTGCGTGTATTTGCACC
445 AAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTA-TTGTATC
* *
349695 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTCGGTGGAATCTGTTTGAAACTGATA
1 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC-TTTAGATAGCTTGGT-GAATCTGTTT-AAATTGATA
* * * * * *
349760 TAGGTTATATTGTTCTTATTTTTTCCCTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
63 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * ** * * * * *
349825 ATTATCGAGATTAAATTATAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAT-GACAACAGGTATTTGACCAAGC
128 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA-AAGTATTTAACCGAGC
* * * ** *
349889 CTTGT-AAAGTATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCTAGCAAATTTGGTGATTTAATTATG
192 CTTGTAAAAG-A-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTAATTATG
* * * * *
349953 TGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCCAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGC
255 TGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* * * *
350018 TTGCAAAGTTTGTTCCATAAAATTTCTTATTTAGCTGAAAGATGATCAATCAATTTGGCATGTTT
320 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* *
350083 TTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCAT-TAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
385 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGT-TGA-GTG-TTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
* * * * *
350147 ACGTGGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACC
447 AAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTA-TTGTATC
*
350181 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAGTTGATA
1 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC-TTTAGATAGCTTGGT-GAATCTGTTT-AAATTGATA
* * * * * * * *
350246 TAGATGATAATGTGCGTATTTTTGCCCTCATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAA
63 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * * * * * * *
350311 ATTGTAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAGAAGTTTTTGATCAAGCC
128 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTAACCGAGCC
* * * *
350376 TTGTAAAGGATTTTTTCTCCATGATTTGCGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTTGATTATGT
193 TTGTAAAAGA-TTTTT-TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTAATTATGT
* * * * * *
350441 GCGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAGGATTTTGT
256 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
* * * * * *
350506 TACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACTATTGTGGCTTGTTTT
321 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * *
350571 TCTTGCTTATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
386 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGA-GTG-TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
* *
350636 GTGGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATC
449 GTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATT-GTATC
* * * * * *
350668 ATGGTGCTTAATTGATGAGTTGCAAATTGTTTAGATAGCTTAGTTGAATCTTTTTTGAAATTGAT
1 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA-TCTTTAGATAGCTT-GGTGAATC-TGTTT-AAATTGAT
*
350733 AACGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGA
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* * * *
350798 AATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGTTTTATGGCGAAAAGTA-TTAGACCGAG
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*
350862 CCTTGTAAAGGACCTTTTTTTCCATGATTTGTGGA------C---C-G-TTT---G-----ATTA
191 CCTTGTAAAAGA---TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTAATTA
** *
350908 TGTGT-TTGTACAATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACT
253 TGTGTGTT-TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACT
* * * * *
350972 TGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTAGGCATC
317 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCATTTTGGCATG
* * *
351037 TTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGCTGTTTACATGAGAAAATTCTTGC
382 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAG-TG-TTGCATGAGAAAATTCTTGT
* *
351102 AAAAATAGGAGAAATTTTATTGCATGTATTTGTA-C
445 AAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTA-TTGTATC
* *
351137 ACTGATACTGAATTGTTGGGTTGCAAATTCTTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTAAAATTGAT
1 A-TGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA-TCTTTAGATAGCTTGGT-GAATCTGTTT-AAATTGAT
* *
351202 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTTCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGA
62 AAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGA
* * * * * *
351267 AATTATATGGATTAAAATGCAAAAAAGAAAAGTCGTGCTTGATGGCCAAAAGTATTTAATCAAGC
127 AATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTAACCGAGC
* * * * * *
351332 CTTGTAAAAGATTTTTTCCACGATTTGTGGACGGTTCCAATCTGATTTGGCAATTTAATTATCTC
192 CTTGTAAAAGATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTAATTATGTG
* * * *
351397 TGCTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTGAGGATTTGGTT
257 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTT
* * *
351462 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTGTTTAGCCGAAAGAAGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTT
322 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTT
* * * *
351527 CTTGCTGATTTGAAATTAATTTGGATGCGTGATGATGTGCTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
387 CTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGA-GTG-TTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAG
351592 TAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATC
450 TAGGAGAAATTTCATTGCATGTATT-GTATC
* *
351623 ATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTCGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATA
1 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATC-TTTAGATAGCTTGG-TGAATCTGTTT-AAATTGATA
* *
351688 AAGATGACATTGTGCTT-TTTTTGCCTTGATTTATTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
63 AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
*
351752 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAT-CTTTATGGCCAAAAGTA-TTAGACCGAG
128 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTC-ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTA-ACCGAG
* *
351815 CCTTGTAAAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTAGATTAT
191 CCTTGTAAAAGATTTTTT-CCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTA-ATTAT
* * * *
351879 GTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTT
254 GTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
* ** *
351944 GTTGCAAACTTTGTTCCCCGAAATTTCTTATTTGGCC-AAACG-TGATCAACCATTTTGGCATGT
319 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA-GATGATCAACCATTTTGGCATGT
* * * *
352007 TTGTCTTACTAATTTGAAATTAATTTAGATGCAT-TTAGAG-GTTGCATGAAAAAATTCTTGTAA
383 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTT-GAGTGTTGCATGAGAAAATTCTTGTAA
* *
352070 AAGTAGGAGAAATATCATTGCATGTAATTGTATT
447 AAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGT-ATTGTATC
*
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1 ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCTTTAGATAGCTTGGTGAATCTGTTTAAATTGATAAAG
*
352150 ATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATT
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* *
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131 ATAGGGATTAAATTGCAAAAA-AGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTAACCGAGCCTT
* * * *
352278 GT-AAAGTATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGTTTTAATTATGTGT
195 GTAAAAG-A-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTAATTATGTGT
* *
352342 TTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTG
258 GTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG
*
352407 CAAAGTTTGCTCCATGAAATTTCTTATTT
323 CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
352436 GAAATTAATG
Statistics
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474 1 0.00
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480 1 0.00
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ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (479 bp):
ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCTTTAGATAGCTTGGTGAATCTGTTTAAATTGATAAAG
ATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATT
ATAGGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTAACCGAGCCTTG
TAAAAGATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGCGATTTAATTATGTGTGTT
TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAA
AGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTG
CTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTGAGTGTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAG
AAATTTCATTGCATGTATTGTATC
Found at i:353373 original size:487 final size:485
Alignment explanation
Indices: 352454--353927 Score: 1996
Period size: 487 Copynumber: 3.0 Consensus size: 485
352444 TGAGATTTCG
* ** *
352454 TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATCTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAA
1 TTGCATGTA-TTGTATCATGATGCCGAAATGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* ** * *
352519 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGAGGTTGTGCTTATTTTTAT-GTG-TATTCTTGATTTATAA-G
65 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCTTGAT-TTCTTGATTTATAAGG
* * *
352581 TCATTTTATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCAAGCTTTATGGCC
129 T-ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
** *
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193 AAAAGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * *
352711 TTTGGGGATTTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG
258 TTTAGTGA-TTAGATTATGTG-TTTTATGATGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAATATG
* * ** * ** * *
352775 TAAAAATTGAAGGACTTGCCTGGAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACGTTAT
321 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAACATGAT
* * * *
352840 CAACCATTTTTGCCTGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTATTTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
386 CAACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
* *
352905 AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAAGTTCA
451 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAGTTCA
* * * * * * *
352940 TTGCATGTATTCGTGTCGTGGTG-CTAAATTGTTGAGTTGCAAGTCATCTT-GATAGCTTAGTTG
1 TTGCATGTATT-GTATCATGATGCCGAAA-TGTTGAGTTGCAAATCAT-TTAGATAGCTTGGTCG
353003 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAG
63 AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* ** *
353068 GTATTTGATGAGATTTGAAATTATAAAGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGGCATGCTTTATGGCC
128 GTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * * *
353133 AAAAGTATTAGATCGAGCCATGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTGCAAACTGA
193 AAAAGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
*
353198 TTTAGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAATGCAAATATGC
258 TTTAGTGATTAGATTATGTGT-TTTATGATGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
353263 AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAATGTTTGTTCCCTGAAATTTCTTATTTAGCTAAAACATGATC
322 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAACATGATC
* * * * * *
353328 AACCATTTTGGTATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCA
387 AACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
353393 TGAGAAAATTCTTGTAATAA-TAGGTGAAAGATCA
452 TGAGAAAATTCTTGTAA-AAGTAGGTGAAAGTTCA
* * *
353427 TTGCATGCAATTGTATTATGATGCCGAAATGTTGAGTTGCAAATCTTTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATG-TATTGTATCATGATGCCGAAATGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
353492 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
65 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAGGT
* *
353557 ATTTAACGAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
130 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* **
353622 AAGTTTTTGAAATAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
195 AAGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
353687 TTAGTGATTTGATTATGTGTTTT-T-ATGATGTAATTGATTAAGGGTCAAAATCCAAATATGCAA
259 TTAGTGATTAGATTATGTGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* *
353750 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTTAG-TCAAAATATGATCA
324 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCT-AAAACATGATCA
* * * * *
353814 ACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAAATAATTTAGATGCGAGGTGAGGTGTTGGCTT
388 ACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* *
353879 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCG
453 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAGTTCA
*
353912 TTGCGTGTATTTGTAT
1 TTGCATGTA-TTGTAT
353928 TATAGGGATT
Statistics
Matches: 864, Mismatches: 108, Indels: 33
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
484 4 0.00
485 188 0.22
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ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.21, T:0.40
Consensus pattern (485 bp):
TTGCATGTATTGTATCATGATGCCGAAATGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAAT
CTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTATAAGGTA
TTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
AGTATTTGAACGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
AGTGATTAGATTATGTGTTTTATGATGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAA
ATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTAAAACATGATCAACC
ATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAG
AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAGTTCA
Found at i:354225 original size:353 final size:351
Alignment explanation
Indices: 353578--354268 Score: 1039
Period size: 353 Copynumber: 2.0 Consensus size: 351
353568 TTTGAAATTT
** * *
353578 TAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTTTTTGAAATAGCCTTGT
1 TAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAACTTTATGGCCAAAACTATTTGAAATAGCCTTGT
* *
353643 AAAGGATTTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTATGTGTT
66 AAAGGA-TTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGATTAGATTATGTGTT
*
353708 TTTATGATGTAATTGATTAAGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAA
130 TTGATGATGTAATTGATTAAGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAA
* * * * *
353773 GTTTGTTCTATGAAATTTCTTATTTAGTCAAAATATGATCAACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGC
195 GTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTAGAATGTTTTTCTTGC
**
353838 TGATTTGAAAATAATTTAGATGCGAGGTGAGGTGTTGGCTTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGT
260 TGATTTGAAAATAATTTAGATGCGAGGTGAGGTGTTGGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGT
*
353903 GAAATTTCGTTGCGTGTATTTGTATTA
325 GAAATTTCATTGCGTGTATTTGTATTA
* *
353930 TAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCAAACTTTATGGCCAAAACTATTTGACCA-AGCCTTG
1 TAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAACTTTATGGCCAAAACTATTTGA-AATAGCCTTG
*
353994 TAAAGG-TTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTG
65 TAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGATTAGATTATGTGT-
* * * * * *
354058 TATATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGG
129 T-T-TGATGATGTAATTGATTAAGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGC
*
354123 AAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGAATGTTTTTCT
192 AAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTAGAATGTTTTTCT
* * *
354188 TGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGC-A-TTAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
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354251 TAGGTGAAATTTCATTGC
320 TAGGTGAAATTTCATTGC
354269 CTATATATTG
Statistics
Matches: 305, Mismatches: 28, Indels: 11
0.89 0.08 0.03
Matches are distributed among these distances:
350 54 0.18
351 2 0.01
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353 185 0.61
ACGTcount: A:0.32, C:0.10, G:0.21, T:0.38
Consensus pattern (351 bp):
TAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAACTTTATGGCCAAAACTATTTGAAATAGCCTTGT
AAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTAGTGATTAGATTATGTGTTT
TGATGATGTAATTGATTAAGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAG
TTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTAGAATGTTTTTCTTGCT
GATTTGAAAATAATTTAGATGCGAGGTGAGGTGTTGGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTG
AAATTTCATTGCGTGTATTTGTATTA
Found at i:355177 original size:486 final size:486
Alignment explanation
Indices: 353926--363851 Score: 13446
Period size: 487 Copynumber: 20.5 Consensus size: 486
353916 GTGTATTTGT
* ** * *
353926 ATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCAAACTTTATGGCCAAAACTATTTGACCAAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
*
353991 TTGTAAAGGTTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
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*
354056 TGTATATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
* * * *
354121 GGAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTGGAATGTTTTT
196 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTT
* * *
354186 CTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
261 CTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
* * * * *
354251 TAGGTGAAATTTCATTGCCTATATATTGTACCATGATGCTGAATTGTT-AGGTTGAAAATTATTT
326 TAGGTGAAATTTCATTGCATGTAT-TTGTATCATGATGCTGAATTGTTGA-GTTGCAAATCATTT
* * *
354315 AGATAGCTAGGTCGAATCTCTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* *
354380 TCTTAATTTATATGTTATTTAATGAGATTTGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* ** * * *
354413 ATTATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGGGATGCTGTATGGCCAAAACTATTTGACCAAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* * * * * *
354478 TT-TGAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGGGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTTATTTGATTATGT
66 TTGT-AAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* * *
354542 GT-TTTAATGATTTTGTGGTTGATTA-GGCGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAATTG
130 GTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTG
* * * * *
354605 GTCGCAAAGTTTGTTCAATGAAATTT-TATATTTAGCTGAAACATGTTCAACCAATTTGGCATGT
193 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT-TATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
*
354669 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTG-AATGAGAAAATTCTTGT
257 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAA-GAGAAAATTCTTGT
* * ** *
354733 AAAAGTAGGTGTAATTTCATTGCATGTGTTTGTCCCATGTTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
321 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
* * * *
354798 TTTTGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATT-ATTAATGACGATGTTAG-GCTTATTTTTGCCT
386 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA-TAAAGATGATATT-GTGCTTATTTTTGCCT
354861 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
449 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * *
354899 ATTATAGGGATTTAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGATCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* * * *
354964 ATGTGAAGGATTTTTTTCCATGATTTTGCGGATAGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA-TTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* * *
355029 GTGTTTATGATGTTGTGATGGATTATAGGTCAAAATGAAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
* * * *
355094 TGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTACTTAGTCGAAACATG-TCAACCATTTTGGCTTGTTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * * * * * *
355158 TCTTGTTGAATTAAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * *
355223 GTATGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATACTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* * *
355288 GATAGCTTGGTCGAAAT-TGTTTGAAATTGATAATGATCATGTTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
390 GATAGCTTGGTCG-AATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
*
355352 TCTTGATTTATAAGTTATTGAATGAGATTTGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * * * *
355385 AGTGTAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGCCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACTGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* * *
355450 TTGTGAAGGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCGAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
* * * *
355515 TGTTTATGATATTGTGACTGATTATGGGTCAAAATACAAAAATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
* * * *
355580 GCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGGTCAACCAATTTGGCATGTTTTT
196 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTT
* * *
355645 CTTGCTGATTTGAAGTTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
261 CTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
* * * *
355710 TAGGTGAAATTTCATTGCAT-TTTTTTTACCATGATGCAGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAG
326 TAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAG
* * * * *
355774 ATAGCTTGCTCAAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTTTGCCCTAATTT
391 ATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATTT
* *
355838 CTTCATTTATAGGTTATTT-ATAGAGATTTGAA
455 CTTGATTTATAAGTTATTTAAT-GAGATTTGAA
* ** * * * *
355870 ATTATAGGGATTAAATTGTAAGTATG-AAAGTCATGCTTAATTGG-AAAAAGTATTTGATCAAGC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGC
* *
355933 CTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTTGATTATG
65 CTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATG
* * * * * *
355998 TGCT-TTTATAACGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAAAGCAAATTTGCAAAAAATAAAGGATTTG
129 TG-TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTG
* * * *
356062 GTTGCAAAGTTTATTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGATCAACTATTTTGGCCTGTT
193 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATG--
** * *
356127 TTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTAATTTAGATACGTGATGAGGTGCTTGCAAGAGAAAACTT-TT
256 -TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA-TTCTT
* * *
356191 GTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTTAATTGTTGAGTTGCAAAT
319 GTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAAT
*
356256 CATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT
384 CATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT
* *
356321 TGATTTCTTGATTTGTATGTTATTTAATGAGATTTGAA
449 TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * ** * *
356359 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAACGAAAAGTCATGTTTTATGGTGAAAAGTATTAGACCAAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
*
356424 TTGTAAAGGACCTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TGA--T--T-A-T-G----TGT
66 TTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* * * * * *
356472 -T-TTTACGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGAAGTTGGA
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
* * * * * * ** * *
356535 TGCAACGTTTGTTCCATGAAATTTCTTGTTGAGCTGAAACGTCATCAACTGTTGTGGCATCTTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * * * *
356600 TCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAAATGCGTGTTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGCAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * * * * * *
356665 ATAGGAGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTAATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTA
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* * * * * * *
356730 GATGGCTTGGTCAAATTTGTTTAAAATTGATAAAGATAATATTAG-GCTTATTTTTGACTTTATT
390 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT-GTGCTTATTTTTGCCTTGATT
356794 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * *
356827 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAATTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATATGACCGAGCT
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* * *
356892 TTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATT-GAATTACGT
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAG-ATTATGT
* * * * * *
356956 GTTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAAGGGTCAAAATGCAAATCTGCAAAAATTAAAGGACTAGG
130 GTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGG
* * ** * **
357021 TTGCAAACTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGTTGAAACATGATGAACCAACTTGGCATGTTT
194 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * *
357086 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
259 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* *
357151 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGACTTGCAAATCATTT
324 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
*
357216 AGATAGCTTGGTCGAATCTGCTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* *
357281 TCTTGATTTATAAGCTATTT-TTCGAGATTTGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAAT-GAGATTTGAA
* * * * *
357314 ATTATAGGGATTAAACTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTGTGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCA
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* * * * * *
357379 TTGTAAAGGACTTTTTTCAATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGATTA--TG
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
* * * * *
357442 TG----T--T-TTGTAATTGATTAGGGGTCAAAATCCAAAT-GGACAAAAATTTAAGGACTTGGT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG-CAAAAATTTAAGGATTTGGT
* * *
357499 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCAATTTAGCATGTTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * *
357564 TCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCGTCATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTAGTAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * *
357629 GTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGTTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* *
357694 GATAGCTTGGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
390 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* *
357759 CTTGATTTATAAGTTA-TTAATGATATTTTAA
455 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * * *
357790 AGTATAAGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCA
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* *
357855 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTCGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTAGATTATGTG
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
* * * * * *
357920 TGTTTCTGATGTTGTGACTGATTCTGGGTGAAAATACAAATATGCATAAATTTAAGGATTTGGTT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
* * * * *
357985 GGAAAGTTTGTTTCACGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTT
196 GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTT
*
358050 CTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
261 CTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAG
* * * * *
358115 TAGGTTAAATCTCATTGCATGTTTTTGTA-CGAAGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
326 TAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* *
358179 GATAGCTTGCTCGAATCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTG-TCTATTTTTGCCTTGATT
390 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATT
* * * * *
358243 TCTTCATTTATAGGTTTTTTAAAGAGATTTAAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * *
358276 ATTATAAGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGGCCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
358341 TTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
66 TTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* *
358406 GTGTTTATGATGTTGTCATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCTAAAATTTAAGGATTTGGT
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
** * * *
358471 TGCAAAGTTTGTTCCGCGAAGTTTCCTA-TTATGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATTTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA-GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* *
358535 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTCGTAAA
259 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * ** * * *
358600 AGTATGAGAAATTTCATCACATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTTTTGAGTTGCAAATCATTT
324 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * *
358665 AGATAGCTTAGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* * *
358730 TCTTGATTTACAAGTTATTTAATGCGATTAGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * *
358763 ATTATAGGGATTAAATTGTAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* *
358828 TTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGT
66 TTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* *
358893 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGG
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGG
* * * * *
358957 TTGCAAAGTTTGTACCATGAATTTTCTTATTCAACCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTT
194 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
** * * * * * *
359022 TTCTTATTGATTTGAAAATAATATAGATGTGTGATAAGGTGTTTCCATGAGAAAATTCTTGTAAA
259 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * *
359087 AGTATGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
324 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * *
359152 AGATAACTTGGTTGAACCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
*
359217 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATATGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * *
359250 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTAATAGACCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
*
359315 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTAGATTATGTG
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
* * * * * * ** ** *
359380 TGCTTATGTTGTTGTGACTGATTCTAGGTCAAAGTAAAAACGTGCATAAATTTAAGGATTTGGTT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
* * *
359445 GCAAAGTTTGTTTC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCAATTTGGCATGTTTT
196 GCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
*
359509 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * *
359574 GTAGGTGAAATCTCATTGCATGTTTTTGTA-CGAAGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* *
359638 AGATAGCTTGCTCGAATCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTG-TCTATTTTTGCCTTGAT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGAT
* * * * *
359702 TTCTTCATTTATAGGTTTTTTAAAGAGATTTAAA
453 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * *
359736 ATTATAAGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGGCCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
*
359801 TTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGT
66 TTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* * *
359866 GTGTTTATGATGTTGTCATTGATTATGCGTCAAAATGCAAATATGCTAAAATTTAAGGATTTGGT
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
** * * *
359931 TGCAAAGTTTGTTCCGCGAAGTTTCCTA-TTATGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATTTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA-GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* *
359995 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTCGTAAA
259 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * ** * * *
360060 AGTATGAGAAATTTCATCACATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTTTTGAGTTGCAAATCATTT
324 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * *
360125 AGATAGCTTAGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* * *
360190 TCTTGATTTACAAGTTATTTAATGCGATTAGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * *
360223 ATTATAGGGATTAAATTGTAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* *
360288 TTGTAAAGGATTTTTTTTCCACGATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGT
66 TTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* *
360353 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGG
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGG
* * * * *
360417 TTGCAAAGTTTGTACCATGAATTTTCTTATTCAACCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTT
194 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
** * * * * * *
360482 TTCTTATTGATTTGAAAATAATATAGATGTGTGATAAGGTGTTTCCATGAGAAAATTCTTGTAAA
259 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * *
360547 AGTATGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
324 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * *
360612 AGATAACTTGGTTGAACCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
*
360677 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATATGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * *
360710 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTAATAGACCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
*
360775 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTAGATTATGTG
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
* * * ** ** *
360840 TGTTTATGATGTTGTGACTGATTCTAGGTCAAAATAAAAACGTGCATAAATTTAAGGATTTGGTT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
* * *
360905 GCAAAGTTTGTTTC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCAATTTGGCATGTTTT
196 GCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
*
360969 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * *
361034 GTAGGTGAAATCTCATTGCATGTTTTTGTA-CGAAGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* *
361098 AGATAGCTTGCTCGAATCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTG-TCTATTTTTGCCTTGAT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGAT
* * * * *
361162 TTCTTCATTTATAGGTTTTTTAAAGAGATTTAAA
453 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * * *
361196 ATTATAAGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGTCCAAAACTATTTGGCCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
361261 TTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
66 TTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* *
361326 GTGTTTATGATGTTGTCATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCTAAAATTTAAGGATTTGGT
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
** * * *
361391 TGCAAAGTTTGTTCCGCGAAGTTTCCTA-TTATGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATTTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTA-GCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* *
361455 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTCGTAAA
259 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * ** * * *
361520 AGTATGAGAAATTTCATCACATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTTTTGAGTTGCAAATCATTT
324 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * *
361585 AGATAGCTTAGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* * *
361650 TCTTGATTTACAAGTTATTTAATGCGATTAGAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * *
361683 ATTATAGGGATTAAATTGTAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
** *
361748 TTGTAAAGGATTTTTTTTCCACAATTTGTGGATGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGATTATGT
66 TTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* *
361813 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGG
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGATTTGG
* * * * *
361877 TTGCAAAGTTTGTACCATGAATTTTCTTATTCAACCGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTT
194 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
** * * * * * * *
361942 TTCTTATTGATTTGAAAATAATATAAATGTGTGATAAGGTGTTTCCATGAGAAAATTCTTGTAAA
259 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * *
362007 AGTATGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAATTCATTT
324 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * *
362072 AGATAACTTGGTTGAACCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
389 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* *
362137 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATATAAA
454 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * *
362170 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTAATAGACCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
*
362235 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTAGATTATGTG
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
* * * ** ** *
362300 TGTTTATGATGTTGTGACTGATTCTAGGTCAAAATAAAAACGTGCATAAATTTAAGGATTTGGTT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTT
* * *
362365 GCAAAGTTTGTTTC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAAGATGATCAACCAATTTGGCATGTTTT
196 GCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
*
362429 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * *
362494 GTAGGTGAAATCTCATTGCATGTTTTTGTA-CGAAT-ATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC--ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* *
362557 TAGATAGCTTGCTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTTTGCCTTGA
388 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGA
* * *
362621 TTTCTTCATTTAT-CGATTATTTAAAGAGATTTGAA
452 TTTCTTGATTTATAAG-TTATTTAATGAGATTTGAA
* * * * *
362656 ATTATTGGGATTAAATTGCAAATATGAAAAGTCACGC-TTAGTGGCCAAAAGTATTTGATCAAGC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGGCCAAAAGTATTTGACCGAGC
* * *
362720 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTTGATTGTGT
65 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGT
* *
362785 GTGCTTAAGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
130 GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
* * * * * *
362850 TACAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACAAGATCAACAATTTTGGCCTGCTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * * *
362915 TCTTTCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATAAGTTGTTTGCAAGTGAAAATTCTTGTAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * *
362980 GTATGAGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* * * *
363045 GATAGCTTGCTTGAATCTGCTTGAAATTGATAAA-ATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
390 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
363109 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
455 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * * *
363141 ATTATAGGGATTAAATTCCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTAATAGACCGAGCC
1 ATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCC
* *
363206 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAATTGATTTGGTGATTAGATTATATG
66 TTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTG
* * *
363271 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATAGGTCAAAATGCAAATATG-AAAAAATTAATGGATTTCGT
131 TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA-GGATTTGGT
* * * *
363335 TGCAAACTTTGTTCCATGAAATTTTTTATTTCGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGCTTT
195 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * * * *
363400 TCTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAA
260 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * * * * *
363465 GTAGGTGAAATATCATAGCATGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTACAAATCATTTA
325 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
* * * * *
363530 GATAGCTTAGTCGAATCTGTTTCAAACTGATAAAGATGATATTGTTCTTATTTTTGCCTGGATTT
390 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
*
363595 CTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAA
455 CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAA
* * *
363627 ATTTTAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCC
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* ** *
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* ** * * * *
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Statistics
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* ** * **
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * * * * * * *
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*
357432 TTT
969 TTA
* * * * *
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1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATG-CATAAATTTAA
* * *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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358396 TA
970 TA
*
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1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAT-AAATTTAA
* * *
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* *
358526 GGCATTTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
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* * ** * * *
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* *
358656 AAATCATTTAGATAGCTTAGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * *
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* *
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*
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* * *
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* * * ** * *
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* *
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* *
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* * *
359240 GAGATATGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTAAT
841 GAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATT
*
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906 AGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
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971 A
* * * * * * ** **
359371 GATTATGTGTGCTTATGTTGTTGTGACTGATTCTAGGTCAAAGTAAAAACGTGCATAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * *
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66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGG
*
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* * * * *
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*
359630 AATCATTTAGATAGCTTGCTCGAATCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTG-TCTATTTTT
260 AATCATTTAGATAGCTTG-TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTT
* * * * * * *
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323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
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388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATG
* *
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452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * * ** *
359889 TATGCGTCAAAATGCAAATATGCTAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCGCGAAGTT
517 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* *
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** * * **
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* * *
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*
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* * * *
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* *
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970 TA
* *
360345 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-ATAAATTTAA
* * * * *
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* ** * * * * * *
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* *
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* * * *
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*
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* *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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*
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* * *
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* *
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* * ** * * *
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* *
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* * * *
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* **
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*
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* * *
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* * * ** * *
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* * *
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* * * *
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971 A
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* * *
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*
362421 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGTAAGAGAAAATTC
131 CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTC
* * * *
362486 TTGTAAAAGTAGGTGAAATCTCATTGCATGTTTTTGTA-CGAAT-ATGTTGAATTGTTGAGTTGC
196 TTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC--ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
*
362549 AAATCATTTAGATAGCTTGCTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTG-TGTATTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTTG-TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTT
* * * *
362613 TGCCTTGATTTCTTCATTTAT-CGATTATTTAAAGAGATTTGAAATTATTGGGATTAAATTGCAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG-TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * * *
362677 ATATGAAAAGTCACGC-TTAGTGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTA-TGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA
* * * * *
362741 TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGGGATTTGATTGTGTGTGCTTAAGATGTTGTGATTG
450 TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTG
* * *
362806 ATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTACAAAGTTTGTTTCATGAAA
515 ATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* * * * *
362871 TTTCTTATTTAGCCGAAACAAGATCAACAATTTTGGCCTGCTTTTCTTTCTGATTTGAAATTAAT
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
* *
362936 TTAGATGTGTGATAAGTTGTTTGCAAGTGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * *
363001 GTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGCTTGAATCTGCT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTT
363066 TGAAATTGATAAA-ATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
775 TGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
* * *
363130 TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTCCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAACAGTAA
840 TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTAT
*
363195 TAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAATTGATTTGGTGAT
905 TAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAT
363260 TA
970 TA
* * * *
363262 GATTATATGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATAGGTCAAAATGCAAATATG-AAAAAATTAAT
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA-
* * * *
363326 GGATTTCGTTGCAAACTTTGTTCCAT-GAAATTTTTTATTTCGCCGAAACATGATCAACCATTTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * *
363390 GGCATGCTTTTCTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * * * * *
363455 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATAGCATGTAATTGTATTATGATGCCGAATTGTTGAGTTAC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* * *
363520 AAATCATTTAGATAGCTTAGTCGAATCTGTTTCAAACTGATAAAGATGATATTGTTCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * *
363585 GCCTGGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAACGAGATTTGAAATTTTAGGGATGAAATTGCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * **
363650 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCGAGCCTTGTAATGTTTTTTTTTCCATGA
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA
* * **
363715 TTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTACGATTGAT
453 TTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * *
363779 TAGGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
517 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* * *
363844 TCTTATTT----GAAA-TTAATGAGA-C-TTCGTT-GCATGTATTTGTATCATGATGCTGATCTG
582 TCTTATTTAGCCGAAACATGATCA-ACCATT--TTGGCATG--TTT-T-TC-T--TGCTGA--T-
* * ** ** * * * *
363901 TTGAGCTGCAAATCATTTAGATAGCATG-GCCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGT
634 TTGA-----AATTAATTTAGAT-G--TGTG-ATAAGGTGTTTGCAA--GAGAAA-AT--T-CT-T
**** * * * * * * * * * * *
363965 GCTTATTTTTATGTG-CATTTC-TTG-ATTTATAAGTTATTTTATGAGAT-TTGACCTTATAGGG
683 G--TAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATGTAT---TTGTATCATG-G-TGCTGA-ATTGTTGAG
* *** * * ** * **
364026 ATT-AAAATGCAAAAATGAAAAGTCTTGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGGCCGATCCTTG-TAAA
740 -TTGCAAAT-CATTTA-G-ATAG-CTTG--GT-T-G---AATCTGTTT----GA-AATTGATAAA
* * * * *** *
364089 G--GA-TTTTTTCTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGT-TT
788 GATGACATTGTGCT--T-ATTT-T---T-G--CC---TTGATTTCTTGATTT-A-TAAGT-TATT
* * * * * * * * * *
364150 TTATGACG-TTGTG--ATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATATCTAAAAATTTAAGGACTTGGAT
837 TAATGA-GATT-TGAAATT-A-TAGGGATTAAATTGCAAA-A-ATGAAAA-GTCATG-CTT-TAT
** * ** *** ** * ** *
364212 -G-C-AAAGT-TT-GTACCATGAATTTTCTTATTCAGCCGAAACATGATCAACCATTT-TGGCTT
893 GGCCAAAAGTATTAG-ACC--G-A--GCCTTGTAAAG--G-ATTTTTTTCCATGATTTGTGG-AT
* * ** * ** *
364271 GTTTTTCTTATTGATTT-GAAAATA
948 G-GTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * ** * *
364295 -ATT-TAGATGTGTGATAAGGTGTT-TGCATGAGAAATATCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCAT
1 GATTAT-G-TGTGT-TTATGATGTTGTG-AT-TG-ATTAT-GGGTCAAA--ATG-CAAA--T-A-
** *** * **
364357 TGCATGTATTCGTATCATGCTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAA-TCATT-TAAAT--AACTTGGTT
52 TGCATAAATT--TA--A----G--G-A-T-TTG-GTTGCAAAGT--TTGTTCCTCGAAATTTCTT
* ** * ** * * *
364418 GAATCT-GTTTGAAA-TTGAT-AAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT-
101 --ATTTAG-CCGAAACATGATCAACCAT---TTTG-GCATGTTTTT--CTTG----C-TGATTTG
* * * *
364479 ATAAGTT-ATTTA-ATGAGATTTGAAATTATAGG-GATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCC
152 A-AA-TTAATTTAGATGCG---TG--A-T-GAGGTG--T---TTG-CAAGA-GAAAA-T--T--C
* ** ***** * * * * * * * * *
364541 TTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGAT-TTG--TGGGTG-
196 -T-T-G-TAAAAGTAGGAGAAATTTCATTG-CATGTA-TTTGTAT-CATGATGCTGAATTGTTGA
* * * * * * * * *
364602 GTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGGTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAA
254 GTTGCAAA-TCATTT--AGA-TA-GCT-TGT-CG---A--AT-CTGT--TTGA-AATTGAT-AAA
* * * * *** * * ** *** * *
364667 -ATGCA-AATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTCGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTTTTCTTTG
302 GATG-ATATTGTGC------TT-A--TTTTTG-C-CTTGATTTCTT-GAT-TTATAAGTTATTTA
* * * * *** * * ** * * *
364730 GTCGAAAGATGATGAACCATTTTAGGATGTTTTTGTTGC-TAATTTCAAATTAAT--TTAGAT-G
353 AT-G--AGAT-TTGAA--ATTATAGG--GATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTT-TATGG
* * * * ** * *
364791 -CATTAAGAGGTGTTTG-CCTGAGAAAATTCTTGTAAGAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAAT
409 CCA--AA-A-GTATTAGACC-GAG-----CCTTGT-A-A--A-G-G--ATTTTTTTCCATG-ATT
** * * * * * * ** *
364854 TGTATTACGATGCCGAATTG--TTGAGTTGCA-AAGCATT-TAGATAGCTTGGTCGAAT-CTGTT
455 TGT-GGATGGTTCCAAACTGATTTG-G-TG-ATTAG-ATTAT-G-T-G--T-GT-TTATGATG-T
* * *** * ** ** * *
364914 TGAAATCGATAATGATGATACTGTGCCTATTTTTTC-CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATT
507 TG---T-GAT--TGAT--TA-TGGGTC-A-AAATGCAAAT-ATGCA-AA--AATTTAA-G-GACT
* ** ** ** * ** ** * *
364978 TGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGA-CA
555 TG--GTTGCAAAG-TT-TGTT-C---CATGAAATTTC-TTATTTA--GCCGAAA-CA-T-GATCA
* * * * *
365042 GAGCC-TTGTATAGG-AT-TTTTTCCAACGATTTG-TGGGTGGTTCCAAACTGATTT-GGTGAT-
606 -A-CCATT-T-T-GGCATGTTTTT----C---TTGCT-GAT--TT-GAAATTAATTTAGATG-TG
* * *** ** ** ** * * * ***
365101 TAGATTACGTGTGTTT--ATGATG-TTGTGATTG-ATTA-TGGGACAAAATGCAAATATGCAAAA
654 T-GA-TAAG-GTGTTTGCAAGA-GAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTC--AT-TGCATGT
* * * * * * ** * ** *
365161 ATTTAAGGAT-TTGGT--TGCAA-AGTT-TGTTCCATGAT-ATTT-CTTA-TTTGGCCGAAACAT
712 ATTT--GTATCATGGTGCTG-AATTGTTGAGTTGCA-AATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATC-T
* * ** * *** *** * * * * **
365218 G-AT-CAACCGTTTTGGCATGTTTTTCTAGCTTAATTTAGATGCATGATGAGGTGT-TTGCA-AG
772 GTTTGAAATTGATAAAG-ATGACATTGT-GCTT-ATTT--TTGCCT--TGA--TTTCTTG-ATTT
* * * * ** * * * * ** * *
365279 AGAAAATTCTTGTAA-AAGTAGGTGAAATT-TCATTGCATGT--ATTTCTACCATG--ATGCTGA
827 A-TAAGTTATT-TAATGAG-ATTTGAAATTAT-A-GGGAT-TAAATTGCAAAAATGAAAAG-T-C
* * * ** *
365338 ATTG-TTGAGTTG-C-AAA-TCATTTAGA--TAG-CTTGCTCGAATCTG-TTTGAAATTGATACA
884 A-TGCTTTA-TGGCCAAAAGT-A-TTAGACCGAGCCTTG-T--AA-AGGATTT----TT--TTC-
* ** * ***** ** *
365395 GATGATATTGTGTCT-TTTTTTGCCTTGATTTCTTCATT-
934 CATGAT-TTGTGGATGGTTCCAAAC-TGATTTGGTGATTA
* * * * * * * * * * * *
365433 TA-TAGGT-TATTTAAAGA-GATT-TAAAATT-A-TAAGGATTAAATTACAAAAATG-A-AAAGT
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATG-TTGT--GATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATT
* * ** * ** * *
365490 CATGCCTTATGG--CCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTT-TT-TTT-TCCATGATT
62 TAAGGATT-TGGTTGC-AAAGT-TT-----GTTCCTCG--AA--ATTTCTTATTTAGCC--GA--
**** * * * * * *
365550 TGTGGGTGGTTCCAAACTAATTTGG--TGATTAGGTTATGTG-TG-TTT---A-TGATGTT-G-T
111 --AACAT-GAT-C-AACCATTTTGGCATG-TT--TTTCT-TGCTGATTTGAAATTAAT-TTAGAT
** * * * * * * * * *
365605 GATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGCAAAA--ATT-TAAGGATTTGGTCGCAAAATTT-G
166 GCGTGATGA-GGTGT----TTGC-AAGA-G-AAAATTCTTGTAA-AAGTAGG-AG--AAATTTCA
* * * * * * * * * *
365665 TTCCATGAAATTT-TTTC-T-TTGGTCGAA-AGATGA--TG--AACCATTTTAGGAT-G-TTTTT
219 TTGCATG-TATTTGTATCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCA-TTTA-GATAGCTTGTC
* * * * ** * ** *** *
365720 G-TTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATG-CATTAAG-AGGTGTTTGCC-TGA------GA---A-
280 GAAT-CT-GTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAT
* ** * * * ** **
365771 AA-TTCTTGTAA-GAGTAGGTGAAA-TATCATTGCATGT-AATTGTATTACGATGCCGAA-T--T
343 AAGTTATT-TAATGAG-ATTTGAAATTAT-A-GGGAT-TAAATTGCA--AAAATG-AAAAGTCAT
* * * * * * * *** *
365829 G-TTGAGTTG-C-AAAGCATTTAGA--TAG-CTTGGT--CGAATCTGTTTGAAATCGATAATGAT
400 GCTTTA-TGGCCAAAAGTA-TTAGACCGAGCCTT-GTAAAGGAT-TTTTTTCCAT-GAT-TTG-T
** * ** ** * *
365886 -GATACTGTGC---CT-ATTTTTTCCTT-GATTTATAAGT-TATTTAATGA-GATT-TGA--AAT
458 GGATGGT-TCCAAACTGATTTGGTGATTAGA-TTAT--GTGTGTTT-ATGATG-TTGTGATTGAT
* * * * * * ** * *
365940 TATAGGGATTAAATTGCAAAAATG--AAAA-GTCATG-CTTTATGGCCAAAAG--TATT--A-GA
517 TAT-GGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG-C-AAAGTTTGTTCCATGA
** * * ** ** * * * * *** *
365996 CAGA-GCCTTGTATAG--G--ATTTTTTCCAACGATTTGTGG-GTG-GTTCCAAACTGATTTGGT
578 -A-ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT-CAACCATTT-TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTT-GA
* * * * * * *
366054 GATTAGA-TTACG-TGTGTTTATGATGTTGTGATTG-ATTATGGGACAAAATGCAAATATGCAAA
638 AATTA-ATTTA-GATGTG-TGAT-AAG--GTGTTTGCA--A---GAGAAAATTC---T-TGTAAA
* * * * ** * * * * *
366116 AATTTAAG-GATTTGGTTGCA--AAGTTTGT-TCCA---TGAT-ATTTCTT-ATTTGGCCGAAA-
688 AGTATGAGAAATTTCATTGCATGTA-TTTGTAT-CATGGTGCTGAATTGTTGAGTT-G-C-AAAT
* * * * * ** * ** *** *
366171 CA--T-GATCAACCATT--TTGGCATGTTTTTCTAGCTTAATTTAGATG-CA-TGATG-AGGTGT
748 CATTTAGAT--AGC-TTGGTT-GAATCTGTTT-GAAATTGATAAAGATGACATTG-TGCTTATTT
*** * ** * * * * * *
366228 TTGCAAGAGAAAATTCTTG-TAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTCTACCATGAT---
807 TTGC-CTTG--ATTTCTTGAT-TTA-TAAGT--TATTT-AATG-A-G-ATTT-GA-AATTATAGG
* * *** ** * * * ** * *
366289 G-CTGAATTGTTGAGTTGCAAA-TCA---TTTA--G---ATAG-CTT-G-CTCGAATCTGTTTGA
859 GATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGAC-CGAGCCT-TGTAA
** * * ** * ***** ** *
366341 A--A-TTGATACAGATGATATTGTGTCT-TTTTTTGCCTTGATTTCTTCATT-
922 AGGATTTTTTTC-CATGAT-TTGTGGATGGTTCCAAAC-TGATTTGGTGATTA
* * * * * * * * * * * *
366389 TA-TAGGT-TATTTAAAGA-GATT-TAAAATT-A-TAAGGATTAAATTACAAAAATG-A-AAA-G
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATG-TTGT--GATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATT
* * * * ** ** * ** *** ** * **
366445 TCATGCTTT-ATTGCCAAAAGTATT-TGAC-CG--A-GCCTTGTAAAG--G-ATTTTTTTCCATG
62 TAAGGATTTGGTTG-C-AAAGT-TTGTTCCTCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACC
*** * * ** * * *
366501 ATTTGTGG-ATGGTTCCAAAC-TGAT--TTGGTGATTAGA-TTATG-TGTGTTTATGATGTTGTC
124 ATTT-TGGCAT-GTT--TTTCTTGCTGATTTGAAATTA-ATTTA-GATGCG-TGATGA-GGTGT-
* * * *** * ** *
366560 ATTG-ATTATGAGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG-GATTTGGTTGCA--AAGTTTGT-
180 -TTGCA--A-GAG--AAAATTC---T-TGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTA-TTTGTA
* * ** ** * * ** * *** * *
366620 TCCATGAAGTTTCCT-ATTTTGCCGAAACATG-ATCAACCATTTTGGCAT-TTTTTTCTTGTTTA
234 T-CATG-A---TGCTGA-ATTGTTG--AGTTGCA--AATCA-TTTAG-ATAGCTTGTCGAATCTG
** * ** ** * * * * * ** *
366682 TTTGAAATT-ATTTTAGATG-CATTAAGAGT-TGTTTGCATGAGAAAATTCCTG-TAAACGTAGG
287 TTTGAAATTGA-TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG--ATTTCTTGATTTA--TAAG
* * * * * * * ** *** ** *
366743 TGAAATATCATTG-CATGT-AATTGTATCA-TGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAA-TCA---TT
346 T--TAT-TTAATGAGATTTGAAAT-TAT-AGGGAT--TAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTT
* * ** ** * * ** **** * * **
366801 TA-----AATAG-CTT-GGTCGAATCTGTTTGAA--ATTGATAAAGAGGATATTGT-GCTTATTC
404 TATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCT-TGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT-TTGTGGATGGTTC
**** ** * * ** * * * * *
366856 TTGCCTTGATTTCTTCA-T-GTATAACCTAT-TTAACGA-GATT-TGA--AATTATAGGGATTAA
467 CAAAC-TGATTTGGTGATTAG-ATTATGTGTGTTTATGATG-TTGTGATTGATTAT-GGG-TCAA
* * * * * ** * * ** **
366914 ATTGCAAAAATG--AAAA-GTCATG-CTTTATGGCCAAAAGTATTAG-ACC--G--A-GCCTTGG
527 AATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG-C-AAAGT-TT-GTTCCATGAAATTTCTTAT
** **** ** * ** * * *** **
366969 AAAG--GATTTTTTTTCCATGATTTATGG-ATG-GTTCCAAACTGATTTGGTGATT-ATATTATG
588 TTAGCCGAAACATGATCAACCATTT-TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTT-GAAATTAAT-TTA-G
* * * * * * * **
367029 -TGTGTTTATGATGTTGTGATTG-ATTATGAGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAT-TTAGGGATT
649 ATGTG-TGAT-AAG--GTGTTTGCA--A-GAG--AAAATTC---T-TGTAAAAGTATGAGAAATT
* ** * * * * * * * **
367091 TTATTGCA-AAATTTGTTTCATGAAATTTCT-TA-T-TTG-GTCG-AAA-CATGATCA-ACCATT
701 TCATTGCATGTATTTGTATCATG---GTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT--TTAGA-TAGC
* ** * * * * * * ***
367148 TTGGGATGTTTTTG-TTGCTAATT--TCAA-ATTA-ATTTAGAGGC--A-TTATGAGGTG-TTTA
760 TT-GGTTGAATCTGTTTG-AAATTGATAAAGATGACA-TT-G-TGCTTATTTTTGCCTTGATTT-
* * * * * ** * * * **
367204 CATGA--GA-AAATTCTTGT-AGGAGTAGGTGAAA-TATTATTGCATGT-AATTGTATTACGATG
819 CTTGATTTATAAGTTATT-TAATGAG-ATTTGAAATTA-TA-GGGAT-TAAATTGCA--AAAATG
** * * * * * * * *
367263 CCGAA-T--TG-TTGAGTTG-C-AAA-TCATTTAGA--TA-TCTTGGT---CGA---ATCTCCTT
877 -AAAAGTCATGCTTTA-TGGCCAAAAGT-A-TTAGACCGAGCCTT-GTAAAGGATTTTTTTCCAT
* * * **** * * *
367312 GAAATTGATAAAGATGATAT-TGTGCTTATTT-TTGCCTT-
937 G-ATTTG-T--GGATGGT-TCCAAACTGATTTGGTG-ATTA
* * * * * *
367350 GATTTATAAGT-TATTTAATGA-GATT-TGA--AATTATAGGATTAAATTGCAAAAATG-A-AAA
1 GA-TTAT--GTGTGTTT-ATGATG-TTGTGATTGATTAT-GGGTCAAAATGCAAATATGCATAAA
** ** * * * * * **
367408 GTCTT--GCTTTATGG--GCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAATGTATTTTTTTTCCTTGATT
60 -T-TTAAGGATT-TGGTTGC-AAAG--TTT----GTTCCTCGAAATTTCTTATTTAGCC--GA--
**** * * * * *
367469 TGTGGTTGGTTGCAAGC-TGATTTGG--TGATTTAATT-ATG-TGATTT--TA-TGATGTT-G-T
111 --AACAT-GAT-CAACCAT--TTTGGCATG-TTT--TTCTTGCTGATTTGAAATTAAT-TTAGAT
** * * * * * * * * ** *
367524 GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAA--ATT-TAAGGACTTGCTTGCAAAGTTT-GT
166 GCGTGATGAGGTGT----TTGC-AAGA-G-AAAATTCTTGTAA-AAGTAG-GAG-AAA-TTTCAT
* * * * ** * * *
367585 TCCATGAAATTTCTTAT-TTGAAATTAATGAGACTTTGTTGCATGTATTTGTATCATGATGTT-G
220 TGCATG-TATTT-GTATCATG--A-TGCTGA-A--TTGTTG-A-G---TTGCA-AATCAT-TTAG
* * * * * ** *
367648 ATCTG-TTGAGTTGCAAATCAT-TTAGATAGCATGGTTGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGA
270 AT-AGCTT--G-T-CGAATC-TGTTTGA-A--ATTGAT-AA-AGA-TG----------------A
* *
367711 TATTGTGCTTATTTTT--ATGTGCATTTCTTGATTTATAAGTTATTTTATGAGATTTGAAATTAT
307 TATTGTGCTTATTTTTGCCT-TG-ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTAT
* * * * *
367774 AGGGATTAAAATGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTACGGCCAAAAGTATTTGGCCGATCCTTGTA
370 AGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTA
* * * *
367839 AAGGATTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGG-GATTTGATTATGTGTTTT
435 AAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGTGATTAGATTATGTGTGTT
* *
367903 TATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCA
499 TATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCA
* * *
367967 AAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCTTGTTTTTCTT
563 AAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTT
** * * *
368032 ATTGATTTGAAAGTAATTTAGTTGTGTCGCA-AA-GTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGT
628 GCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGT-G-ATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGT
* * * * *
368095 AGGTGAAATTTCATTGCCTGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGA
691 ATGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGA
* * * *
368160 TAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAGATGACATTGTGCATATTTTTG-CTTCATTTCT
756 TAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCT
* * *
368224 TTATTTATAGGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAT
821 TGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAT
* * * * * * *
368289 GCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAACCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAAGTTTTTTGGATGGT
886 GCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGT
* *
368354 TCCAAGCTGATTTGGTGGTTA
951 TCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * *
368375 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGGGATTGATTAGGGGACAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * * ** * * *
368440 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATATCATATTTAGTTGAAACTTGCTCAACCAATTTG
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
*
368504 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
** * *
368569 CTTGTAAAAGTAGTTGAAATTTCAATGCATGTATTTGTATCATGCTGCTGAATTGTTGAGTTGCA
195 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* * * * * *
368634 AATCATTTAAATAACTTGGTTGAATATGTTTAAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTG
260 AATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
*
368699 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAA
324 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
368764 TGAAAAGTCATGCCTTT-TGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATG
389 TGAAAAGTCATG-CTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATG
* * *
368828 ATTTGTGGGTGGTTCCAAACTAATTTGGTGATTAGGTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * *
368893 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTCGCAAAATTTGTTCCATGAAATT
517 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* * * * * * * * *
368958 TTTTCTTTGGTCGAAAGATGATGAACCATTTTAGG-ATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATT
582 TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATT
** * ** * * * *
369022 TAGATGCATTA-AGAGGTGTTTGCCTGAGAAAATTCTTGTAAGAGTAGGTGAAATATCATTGCAT
646 TAGATGTGTGATA-AGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * * * * * *
369086 GTAATTGTATTACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAAGCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTT
* * *
369151 TGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGTTTTATAAGCTATTTAA
775 TGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
** * *
369216 CAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGGAAAGTCATCCTTTATGGCCAAAAGTAT
840 TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTAT
* * * * * * * *
369281 TTGATCTAACCTTGTAAAGGACTTTTTTCAATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGAT
905 TAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAT
*
369346 TT
970 TA
* * * *
369348 GATTA--TGTG----T--T-TCGTAATTGATTA-GAGGTCAAAATCCAAATATACCA-AAATTTA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATG-GGTCAAAATGCAAATAT-GCATAAATTTA
* * * * *
369402 AGGACTTGGTTGCAACGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTGTTTAGCCGAAACATGATCATCCAATT
64 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * * * *
369466 TAGCATGGTTTTCTGGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTCGCATGAGAAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * * * * * *
369531 TTCATGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCACGTATTTGTATCCTGATGTTGATTTGTTGAGTTG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * *
369596 CAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAATTTGTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTGTGCTTATTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * * * *
369661 TGCCTTGTTTTCCTAATTTATAAGTTATTTAATGAGGTTTGAAATTATAGGGATTAAA--ACGAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * * * * *
369724 AATGAAAAGTCAAGCTTTATGGCCAAAAGTTTTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTGTTTCCGTA
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* * * * *
369789 ATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAT
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * *
369854 TA-GTGGT-AAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTGAGGACTTGGTTGCGATGTTTGTTCCATGAAA
517 TATG-GGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* * * *
369916 TTTCTTATTTAGCCGAAACATTATCAACCATTTTAGCTTGTTTTTCTTACTGATTTGAAAGTT-A
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA-TTAA
* * * * * ** * *
369980 GTTAGATGCGTGATGAGGTGATTACGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCA
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* ** * * * * ** *
370045 CGTATTTGTGCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCGTTTAGATAACTTAGTCAAATCTAT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* * * * *
370110 TTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * * * *
370175 AAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGAAAAAATGAAAAGTCACGCTTGATGGCAAAAACTA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
* * * * * * *
370240 TTTGATCAAGCCTTATAATA-GATTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAACTGATTTGGGG
904 TTAGACCGAGCCTTGTAA-AGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
*
370304 ATTT
968 ATTA
* ** * * *
370308 GATTGTGTGCATTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* *
370373 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGAACAACCATTTTG
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * *
370437 GCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGATGCATGATGTGGTGTTTGCAAGTGAAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
* * * * ** * * * *
370502 CTTGAAAAAGTTGGTGAAATTTCGTTGCACCTATTTGTATCCTGATGTTGATTTGTTGAGCTGCA
195 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* * *
370567 AATCATTTAGAAAACTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTGTGCTTATTTTTG
260 AATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * *
370632 CCTTGTTTTCCTGATTTATAAGTTATTTAATGAGGTTTGAAATTATAGGGATTAAAATG--AAAA
324 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * ** * *
370695 TGAAAAGTCAAGCTTTATGGCCAAAAGTTTTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTTGTTTCCATAAT
389 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT
* * * *
370760 TTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA
454 TTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA
* * * * *
370825 -GTGGT-GAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTGAGGACTTGGTTGCGATGTTTGTTCTATGAAATT
519 TG-GGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* * * * * * *
370887 TCTTATATAGCCGAAACATTATCAACCATTTTAGCTTGTTTTTCTTACTGACTTGAAAGTT-GTT
582 TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA-TTAATT
* * * * * ** * *
370951 TAAATGCGTGATGAGGTGATTACGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATG
646 TAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATG
** * * * ** *
371016 TATTTGTGCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTAGTCAAATCTATTT
711 TATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTT
* * * * * *
371081 GAAATTGATATAGATGATATTGTGCGTT-TTTTTTCCATGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTAA
776 GAAATTGATAAAGATGACATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
* * * *
371145 AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGAAAAAATGAAAAGTCACGCTTGATGGCCAAAAGTAT
840 TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTAT
* *** * * *
371210 TTGATTAAGCCTTGTAATGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGTTTTGGGGAT
905 TAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAT
*
371275 TT
970 TA
* * *
371277 GATTATGTGCGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGCCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
*
371342 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTCA-TTAGCCGAAACACGATCAACCATTTT
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * * *
371405 GGCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGACGCTTAATGGCCAAACGTATTTGATTAAG
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT-G----AGGTGTTTG--CAAG
* * * * * * *
371470 CCTTGTAATGGATTTTTTTTCCAAGATTTGT-GGATGGTTTCAAACTGTT--TTGGGGATTTGAT
187 ---AG-AA---AATTCTTGT--AA-A--AGTAGGA--G----AAA-T-TTCATT--GCATGT-AT
* * * * *
371532 TATGTGCGTTTATGATGTTGTGAA-TGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAGGA
229 T-TGT---ATCATGATG--CTGAATTG--T-TGAGT-----TGC-AA-AT-C-----ATTTA-GA
* * * * ** ** * ** ** ** *
371596 TTTGGTTG-CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACACGAACAACCATTTTGGC
271 -TAGCTTGTCGAA-TCTGTT---TGAAA-TTGATAA--AGATGATA-TTGTGC--TTATTTTTGC
* * ** * ** * *
371660 C-TGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGATGCATGA--TGAGGTGTTTGCAAGAGA--AA
325 CTTG-ATTTCTTGATTTA-T-AAGTT-ATTTA-ATG-A-GATTTGAAAT-TAT---AGGGATTAA
* * * * ** * * * * * * *
371720 ATT-CTTAAAAAAG-TAGGTGA-AATTTCAT---TACATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGT
379 ATTGC--AAAAATGAAAAGTCATGCTTT-ATGGCCAAAAGTATTAG-A-C--CGAGC---CTTG-
* * ** ** * * * * ** * ** * *
371779 TAAGATGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAGTTTGTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTACGC
433 TAA-A-G-GATTTTTTTCCAT-GATTTG-TG-GATGGTTCCAAACTGAT-TTGGTGA--TTA-GA
* * ** * * * * * *
371844 TTATTTTTGCCT-TGAT-TTCTTGATTTA-TA-AGGT-ATTTAATG-AGATTTG---AAATTATA
488 TTATGTGTGTTTATGATGTT-GTGATTGATTATGGGTCA--AAATGCAAATATGCAAAAATT-TA
* ** ** ** * ** * * * * *
371900 GGGA-TTAAATTGCAAA-AATG-AAC-GGTCA-TGCTT-TATGGCCGAAAGTATTAGATCGAGCC
549 AGGACTT-GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAA-CA-T-GATC-AACC
* ** **
371959 -TTTTAAAGG-ACTTTTTTTCTAAGATTTG-TGGATGGTTTGATTTTGTGTTTTTATGATGTTGC
609 ATTTT---GGCA-TGTTTTTC------TTGCT-GA---TTTGA-AAT-T-AATTTA-GATG-T--
* * * * * *
372021 GATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGAATGCAAAGTTTGTTCCA
653 G--TGATAAGGTGT----TTGC-AAGA-G--AAAA--TT----CTTG--T-AAAAGTATG----A
* ** ** * *
372086 TGAAATTTCTAATTTAGC-TGAAACATG-ATCATCCAGTGTGGCATGTTTTTCTTGACAATTTG-
695 -GAAATTTC--A-TT-GCATG-TATTTGTATCAT---G-GT-GC-TG-AATTGTTG---AGTTGC
* * * * * *
372148 AAATTAATTCAGAT-GCAT-GTTGAGCTGTGTGCATGTGAAAATTCTTG-TAAAGGTAGGTGAAA
744 AAA-TCATTTAGATAGCTTGGTTGA-ATCTGT---T-TG-AAA---TTGATAAA-G-A--TGACA
* * * * * * ** *
372210 TTTTATTGCATGTATTTATACCCTGATGTTGAATTGTTAGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGG
795 --TT-GTGC-T-TATTTTTGCCTTGAT-TT--CTTG--A-TTTATAAGTTATTT--A-A---T-G
* ** * * **** ** ** * *
372275 TCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTCATTTCTTGATTTAT
842 -AG-A----TTTGAAATT-ATAGGGATTA-AAT-TGC--AAAAATG---AAAAGTCATGCTTTAT
* * ** *** * * *
372340 AAGCCATTTAACAAGACTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAAAAAAAAGTCATGCTTTATG
893 -GGCC----AA-AAG---T---ATTAGACCGA--GCCTTG--------TAAAG-GAT--TTT-TT
* ** * * *
372405 GCCAAAACTATT-T-GATCTAGCCTTACAAAAGACTGTTTTCCAGGATTTGTGGATGGTTCCAA
932 TCCATGA-T-TTGTGGA--T-G-GTT-C-CAA-AC-----T----GA-TT-TGG-TGATT---A
* * * * * * * *
372467 GCTAATTTAGTGATTTGATTATG-TGTTTTGTAACTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGAAAA
1 G---A-TTA-TG-TGTGTTTATGATG--TTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATA
* **
372531 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAAGAAATTTCTTA-TTAGCCGAAACATGATCAAC
58 AATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * *
372595 CATTTTAGCATGTTTTTCTTGCT-ACTTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTTCATG
123 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA-TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
* * * * *
372659 AGAAAATTCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCTTGATGCTGATTTGTT
187 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTT
* *
372724 GTGTTGTAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT
252 GAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT
*
372789 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATAAAAT
316 TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAT
* * *
372854 TGCAACAAA-GAAAGGTCATGTTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCCTGTAAAGGACTTTT
381 TGCAA-AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTT
*
372918 TTCTCCATGA-TT-T--AT-G---------GA--TGGT--TT-GATTATGTGTTTTTATGATGTT
444 TT-TCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTT
* * * ** *
372964 GTGATTGATTAGGGGTC-AAATGCAAATATGCAAAACTTTTAGGACTTGGACGCAAAGTCTGTTC
508 GTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTC
* * * *
373028 CATAAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCGGATTTGA
573 CATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGA
* * * * * * * * *
373093 AATTAAGTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAGTTTTTGCAAAAGTAGGTGAAATTTC
638 AATTAATTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTC
* * * *
373158 ATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA
703 ATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGA
* * *
373223 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAGC
768 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
*
373288 TATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
833 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * ** * * * * *
373353 AACGTATTTGATCTTGCCTGGTAAAAGACTTTTTTCCATGACTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
898 AAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATT
373418 TAGG-GATTTA
963 T-GGTGA-TTA
* * * * * * *
373428 -ATT-T-TATG-TT-T--TG--G-AACTAATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTT-AA
* * * *
373483 GG-TTTCGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTCCTTACTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * *
373546 GGCATGGTTTTCTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * * *
373611 TCTTGTAAAAGTAGGAGAACA-TTCATTGCATGTAATTGTATTATGATAC-GGATTATTGAGTTG
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAA-ATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* *
373674 CAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * *
373739 TACCTTGATTTCTTGATTTTTAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC--A
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * * *
373802 AATGAAAATTCATGCTTTATGGCCCAAAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCAGT
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA-T
* * * *
373867 AATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGCG-GATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTG
451 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTG-GTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTG
* * * *
373931 ATT-GGGTGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAAGGACTTGGTTGTAGAGTTTGTTCCATGA
515 ATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGA
* * * ** *
373994 AATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTCGGCTTGTTTTTCTTATTGATTTGAAAGTA
578 AATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTA
* * * * *
374059 ATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGC
643 ATTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGC
* * * * * *
374124 ATATATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGCTGCAAATCATTTAGATAGCCTT-GTCGAATGT
708 ATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAG-CTTGGTTGAATCT
* * * *
374188 GTTTGAAACT-AGTATAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTT-TTCGATTTATAAGTTA
772 GTTTGAAATTGA-TAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTT-GATTTATAAGTTA
* *
374251 TTTAATGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGCAAAAAAG-AAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
835 TTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
* * * * *
374315 AGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTCTTCCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTG
900 AGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTG
374380 GTGATTTA
965 GTGA-TTA
* * * * * * *
374388 -ATTATGTGTTTTTTTTATGTTGTGATTGATTATAGGACAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * * *
374452 GACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGGAACATTATCAACCATTTTA
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * **
374516 GCATGTTTTTCTTACTGGTTTGAAAATAATTTAAATGCGTGATGAGGTGTTTGCATTTCA-AAAA
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA--AGAGAAAA
* * * * *
374580 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGCACCATGATGCTGAATTATTGAGTTG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * * * * *
374645 CAAATCATTTAGACAGCTTGGTCGATTCTATTTGAAGA-TGATATAGGTTATATTGTGCTTATTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAA-ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * *
374709 TTGCCCTGATTTCTTAATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
374774 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAAGTATTTG-CTCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCC
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGAC-CGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCC
* * *
374838 ATGATTTTTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTAGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGATT
449 ATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATT
* * *
374903 GATTATTGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
514 GATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
* * * * * * *
374968 ATTTTTTATTTAGCTGAAACGTTATCAACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTACTGAATTGAAATTAA
579 ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * * * * * *
375033 TTTAGATGCGTGATGAGGTGTCTGCAAGAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAGATTTCATTGCA
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * * * * * *
375098 TGCACTCGTATCATGGTGCTAAACTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTGGTCGAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* * *
375163 TTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTTTTGATTTATAAGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * * *
375228 ACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAGCTTTATGGCCAAAGGTA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
* *
375293 TTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTTTTTTCTATGA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT-
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
375341 -TTA
968 ATTA
* * * * *
375344 -ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* *
375408 GACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
66 GA-TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * *
375471 GGCATATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACG-GGTGGTTGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* *
375535 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTTG
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAG-TTG
* * *
375600 -AAATCATTTGGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATATAA-ATAATATTGTGCCTATTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATA-AAGATGATATTGTGCTTATTT
* * * * * *
375663 TTGCCTTCATTTCTTCATTTATAGGCTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
375728 AAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGTAGTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA-TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA
* * *
375792 TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTAGG-GATTTGATTATGAGAGTTTATGATGTTGTGATT
450 TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT-GGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATT
* * *
375856 GATTATCGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTCCATGAA
514 GATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
* * * * * * *
375921 ATTTGTTAATTT-GCCGATACATGATCAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTAGCTAACTTGAAATTA
579 ATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTA
* ** * * * * *
375985 ATTTACATGCATGATGAGGTTTTTGCAAGAGAAAATTCTTGAAAAAGT-TGGTGAAATTTCGTTG
643 ATTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAT-GAGAAATTTCATTG
*
376049 CATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCT
707 CATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCT
* * * * * * *
376114 GTTTGAAATTGAGAAATATG---TTGTGCTCAGTTTTGCCCTGATTTCATGATTTATAACTTATT
772 GTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATT
* * *
376176 TAATGAGATTTGAAATTGTAGGGGTTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGTTTTATGGCCAAAAG
837 TAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAG
*
376241 TATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TGA--T
902 TATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA---TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT
376298 --T-A-T-
964 GGTGATTA
* * * *
376301 G--TA--T-T-TTTACGGTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * * ** * *
376360 GACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTCTTTAGTAGAAACGTGATCAACCATTGTG
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * * * * *
376424 ACATCTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGTTGAGATGTTTTCATGAGAAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
* * * * * * * *
376489 CTTGCAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATTTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGCGTTGTA
195 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* * * * * *
376554 AATTATTTAGATAGCTTGGCCAAATCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGAGCTTATTTTTG
260 AATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * * *
376619 CCTTTATTTTTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAT
324 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA
* * * * *
376684 TGAAAAGTCGTGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGAAAATGATTTTTTTCCATGAT
389 TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT
* ** *
376749 TTGAGGATGGTTCCAGGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATT
454 TTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATT
* * * * *
376813 AGGGGTCAAAATGAAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATAT
518 ATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTT
* ** * * *
376878 CATATTTAGTTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTCCTTGCAGATTTGAAATTAATTTA
583 CTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTA
* * * * * *
376943 GATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATCCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTA
648 GATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATGTA
* * *
377008 TTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGA
713 TTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGA
* * * *
377073 AATTGATAAAGATGATATTGTGATTATCTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGA
778 AATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGA
* * * *
377138 GATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC--AAATGAAAAGTCATTCTTTATGGCTAAAAGTATTTG
843 GATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAG
* * * * * *
377201 GCCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTTCCATAATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTT
908 ACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * * * * *
377266 GATTATGCGTTTTTATGATGTTGTCATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC-ATAAATTTAA
* * *
377330 GAACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATAAACCATTTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * ** * * * *
377394 GGCTTATTTTTCTTAATGATTGGAAAGTAATTTAGATGCGTGGTGAGGTGTTTGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * * *
377459 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGTTGAATTGTTGAGTTTC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* * * *
377524 AAATCATTTAGATAGCTTTGTCAAATCTGTTTGAAACTAATATAGATGATATTGTGCTTTATTTT
259 AAATCATTTAGATAGC-TTGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTT
* *
377589 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGTGATTTGAAATTATAGCGATTAAATTGCAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* *
377654 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATG
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
*
377719 ATTTGTGGATGGTT------TGA--T--T-A-T-G----TGT-T-TTTATGATGTTGTGAATGAT
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * * * * *
377765 TAGGGGTCAAAAT-CAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTAGATGAAAAGTTTGTTCCAAGAAATT
517 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* * * ** *
377829 TCTAATTTAGCTGAAACATGATCATCCATTGTT-GCATGTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTATTT
582 TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATT-TTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATT
* * * * * ** * * * * *
377893 TAGATGCGTGTTGAGCTGTTCGCTTGTGAAAATTCTTTTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATG
646 TAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATG
* * * * * * *
377958 TATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCACATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTT
711 TATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTT
* *
378023 GAAATTAATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAT
776 GAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAT
* * * *
378088 GAGATTTGAAATTACAGGGATTAAATTGCAAAAGTCAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATT
841 GAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATT
* * *
378153 TGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATT
906 AGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
*
378218 T
971 A
* *
378219 GATTATGTGT-TTTAATTATGTTGTGATTGATTA-GGTGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTA
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTA
* * * *
378282 AGGACTTGGTAGCAAAGTTTATTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTT
64 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * * * * *
378346 TAGCGA-GGTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATATACATGTGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAA
128 TGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAA
* * *
378410 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTTGAGTT
192 ATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
*
378475 GCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
257 GCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* *
378540 TTG-C-------CTTGATTTATAAGTTATTTAATGACATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * * * * *
378597 AAATGAAAAGTCATGCTTTGTGGCCAAAAGTGTTTGACTGAGCCTTGTGAAGTATTTTTTTTCAT
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAT
* * * * * *
378662 GATTTGTGGATGGCTCCGAGCTGATTTGGTGATTTA-ATAATGTATTTTTATGATGTTGTGATTG
451 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTG
* * ***
378726 ATTAGGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTACATGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
515 ATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* *
378791 -TTCATTATTTGGCCGAAACATTATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
580 TTTC-TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * *
378855 TTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCA
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
** * * **
378920 TGTATTTGTGCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCAAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* * * * *
378985 TTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * *
379050 AAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGAAAAAATGAAAAGTCACG-TTTGATGGCCAAAACT
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTT-ATGGCCAAAAGT
* * * * *
379114 ATTTGATC-AGGCCTTGTAATGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAACTAATTTAG
903 ATTAGACCGA-GCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT-G
*
379178 G-GATTT
965 GTGATTA
* * * * * *
379184 GATTTTGTGCGTTTATGATTTTGTGATTGGTTATGGGTCAAAATGAAAATATGCA-AAGAATTAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAA-ATTTAA
* *
379248 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTAATTAGCGGAAACATGATCAACCATTTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * *
379312 AGCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * * * **
379377 TCTTGAAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAAATGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* * * * *
379442 AAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAGTTTGTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTATGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
379507 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGGTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTACATTGCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
379572 ATGAAAGGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCAAG
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATG
*
379637 A-TT-T-G-T-G-----AAC------GGT--TT-GATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGAT
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * *
379683 T-GGGGCTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
517 TATGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * * * * * * ** * *
379747 TTCTAATTTAGCTGAAACATGATCATCTAGTGTGGCATTTTTTTCCAGC-CAATTGAAATTAATT
581 TTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATT
* * * * * * * * * *
379811 TAGATGCGTGTTGAGCTGTTTGCATGTGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTACATG
646 TAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATG
* * * * * * * *
379876 TATTTGTACCTTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGTATCCGTTT
711 TATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTT
* * *
379941 GAAATCGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTTATTTAAT
776 GAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAT
*
380006 GAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATT
841 GAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATT
* * * * * * * *
380071 TGATCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGTGATT
906 AGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATT
*
380136 T
971 A
* * * *
380137 GATTA--TGTG----T--T-TTGTAACTGATTA-GGTGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * *
380192 GGAGTTGGTTGCGAAGTTTGTTCCGT-GAAATTTCTTATTTA-CCTGAAACATTATCAACCATTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCC-GAAACATGATCAACCATTT
* * * * *
380255 TAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTTGATGCGTGATGACGTGTTTGCATGAGAAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * * *
380320 TTCTTGTAAAAGTAGGTA-AAATTTCGTTACACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
193 TTCTTGTAAAAGTAGG-AGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
* * * * *
380384 GAAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAATCTATTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTCTTT
257 GCAAATCATTTAGATAGC-TTGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
*
380449 TTGCCTTGATTTCTTGA-TTATAAGCTT-TTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG-TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA
* * * * * *
380512 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTTCGA
385 AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA
* * * * * * * ***
380577 GGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTAGAGATTTGATTA--TGTGTTT-CG-T-AACT-A-T-
450 TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTG
* * * *
380634 -TTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATAAAA
515 ATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* * * * * *
380698 TTTTTTATTTCGCTGAAACATGATCAACCATTTTAGCGA-GTTTTTCTTGCTGTTTTGATATTAA
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * * * *
380762 TTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCA
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * * * *
380827 TGTATATGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATAATTTAGATAGCTTGCTCGAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* * * *
380892 TTGAAATTGATACAGATGATATTGTG-TCTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGTTTTTT
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTT
* * * *
380956 AAAGAGATTTGAAATTATAGGGGTTAAATTGCAAATATGAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT
838 AATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT
* * * * * ** * * * *
381021 ATTTGATCTAGCCTTGCAAAAGACCTTTTT-CTTGGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATTTAGT
903 ATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAT-GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGT
*
381085 GATTT
967 GATTA
* * * *
381090 GATTA--TGTG----T--T-TTGTAACTGATTA-GTGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATG-GGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
*
381145 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTA-TTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * **
381208 AGG-ATGTTTTTCTTGCTGCTTTGATATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGCTTGAGAAAA
129 -GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * * * * *
381272 TTCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTATCAAGATGCTGATTTGTTGTGTTG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
381337 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
*
381402 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGAATTAAATTGCAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * *
381467 GATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATG
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* ** * * *
381532 ATTTGTGGATGGTTCGAGGCTAATTTGGTGATTTA-ATGATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGA
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA-TTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGA
* * * **
381596 TTA-GTGGTCAAAATACAAATATGTAAAAATTTCAGGACTTGCCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
516 TTATG-GGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
** * *
381660 TTTCTTATTTAGCCGAAATGTTATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTTAAATTAAT
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
* * * ** * * *
381725 TTAGATGCGTGATGAGGTATTTGCCGGAGAAAATTCTTGTAAACGTAGGTGAAATTTCATTGCAT
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * ** * *
381790 GTATTTGTACCATGATGCTGAATTAATGAGTGGCAAATCATTTAGATAGCTTAG-TGAAATCTGT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTG-AATCTGT
* * * * * * *
381854 TTGAAATTGATAGAGATGATATTATGCGTATTTTTGCCTTGATTACTTCATTTATAGGTTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
** * * *
381919 AAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCAAAAGGA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
* * * * * * ** *
381984 TTCGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTATGGATGGTTCCGAGTTGATTTGGGGA
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA
*
382049 TTT
969 TTA
* * * *
382052 GATTATGTCAT-TTTATGATGTTGGGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAAATTAA
1 GATTATGT-GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * * *
382116 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTTTTTAGCCAAAACATGATCAACCATTTTA
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * **
382181 GCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCTTGAGAAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
** *
382246 CTTGTAAAAGTAGGTA-AAATTTTGTTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGC
195 CTTGTAAAAGTAGG-AGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
*
382310 AAATCATTTAGATAGTTTAGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* ** * *
382375 GCCTTGATTTGTTGATTTATAAGTTATTTTTTGAGATTGGAAATTGTAGGGATTAAA-TGCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
*** * * * * * * *
382439 ATGAAAAGTCACAATTAATAGCCAAAAGTATTTGGCCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTTCGTGA
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA
* * *
382504 TTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTCGATTATGTGT-TTTAATGATGTTATGATTGAT
453 TTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGAT
* * ** *
382568 TACGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTAAACTTTTAAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
517 TA-TGGGTCAAAATGCAAATATGC-AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* ** * *
382632 TTACTTATTTAGCTAAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAAT
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
** * * * * * * *
382697 TTAGATGCCTGTTGAGCTGCTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCAT
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * * * * * * **
382762 GTATTTGTACCCTGATGCTGAGTTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCAAATCTGTT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTT
* * *
382827 TGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
775 TGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
* * * *
382892 TGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTAT
840 TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTAT
* * * * *
382957 TTGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTTTCCATGATTTGTGGTTTGTTCCAAGCTGATTTGGTG
905 TAGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
*
383022 ATTT
968 ATTA
* * * * * *
383026 GATTAT-TTTTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATACGCAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * * *
383090 GGCTTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCATATTTAGCGGAAACATGATCAACCAATTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * *
383154 GGCAAGTTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTTTTTACATA-AGAAAA
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA-AGAGAAAA
* * * * *
383218 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTCTTTGTATCATGAAGCAGAATTGTTGAGCTG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * * *
383283 CAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGAGGATATTTTACTTATTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * *
383348 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * *
383413 AATAAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* * *
383478 ATTTGTGGATTGTTCCAAGA-TGATTTGGAGATTTGATTATGTG-GTTTAATGATGTTGTGATTG
452 ATTTGTGGATGGTTCCAA-ACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTG
* * * *
383541 ATTAGGGGTCAAAACGCAAATAAGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAA
515 ATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* * * * * *
383606 TTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCA-ATTGGCAAGTTTTTCTTGTTCATTTGAAATTAAT
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
* ** * * * **
383670 TTTGATGCATGATGAGGTGTTTACATA-AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTCAAATTTCATTGCA
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCA-AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * * *
383734 TTGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTA
709 -TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTG
* * *
383799 TTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGCTATTT
773 TTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTT
* * * * *
383864 AACGAGAATTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAGGT
838 AATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT
* * *
383929 ATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTTTTTTCTAGGA-TT-T-GA-GG------A-T-A----GT
903 ATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGT
383978 --TTA
967 GATTA
* * ** * * *
383981 -ATTATGT-T-TTT-TTATGATGCCATT-AGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGA-TTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
** * * * *
384041 GGACCTGGATGCAACGTTTGTTCCAT-GAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * *
384105 GGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * *
384170 TCTTGTAAAAGTAAGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* *
384235 AAATCATTTAGGTAACTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * *
384300 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGC-AAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * *
384364 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTCTTTTCTATG
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATG
* * *
384429 A-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--TTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGGT
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * * * *
384475 TAGGGGTAAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATT
517 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* * * *
384540 TCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTACTTT
582 TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTT
* * * * * * *
384605 AGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT
647 AGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATGT
* * * * *
384670 ATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTG
712 ATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTG
* * * **
384735 AAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACA
777 AAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG
* * * *
384800 AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAGGCT-TT
842 AGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAG-TATT
* * *
384864 AGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGA-TT-T-G-TGG------A-TGA-----T--T
906 AGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAT
384911 TA
970 TA
* * * * *
384913 -ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * *
384977 GACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGTG
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
** ** * * * *
385041 GCATGTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTAATTTAGATTTGTGCTAAGCTGTTTGCATGAGAAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
* * * * * * *
385106 CTTGT-AAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGCTGTA
195 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* * * * *
385170 AATTATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATAATATTGTGTTTATTTTTG
260 AATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* *
385235 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTACAGAAA
324 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAA
* * *
385300 A-GAAAAGCCATGC-TTATGG-CAAAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATATTTTTCCATG
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAA-GTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
** * * * *
385362 ATTTGTGGATTATTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTG-ATTCATTGATGTTGTGATTGA
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGA
* * **
385426 TTACGGGTCAAAATGCAAAAACACAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
516 TTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * * * *
385491 TTCATT-TTAAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTAAAATTAAT
581 TTC-TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
* * * * *
385555 TTTGATGTGTGATGAGGTGTTTACATA-AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCA
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCA-AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * * *
385619 TGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* *
385684 TTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
** * * * *
385749 ACAAGATTTGATATTATAAGGATAAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAGGTA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
* * * *
385814 TTAGACCAAGCCTCGTAAAGGACTTCTTTTCTATGA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT-
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
385862 -TTA
968 ATTA
* * * * *
385865 -ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * * *
385929 GACTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGTG
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * *
385993 GCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTG-AATGAGAAAAT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAA-GAGAAAAT
* * *
386057 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* *
386122 AAATCATTTAGGTAACTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * **
386187 GCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
386252 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGA
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA
* * * * * *
386317 TTTGTGGATTGTTCCAAGCTAATTTGGAGATTTGATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGAT
453 TTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGAT
** *
386381 TA-GGGTTCAAAGCGCAAATATGCAAAAATTTGAA-GACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCAAGAAA
517 TATGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT-AAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* * * * *
386443 TTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCAAGTTTTTCTTACAT-ATTTGAAACTAA
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGC-TGATTTGAAATTAA
* * * * * * * *
386507 TTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATA-AGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGAAATTTCAGTGC
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCA-AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGC
* * * * * *
386571 ATGTATTTGTACCATGATGATAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTG
708 ATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTG
* *
386636 TTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTT
773 TTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTT
* * * * * * *
386701 AACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAGTAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACT
838 AATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT
** * * * *
386766 ATTTCACCGAGCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCAATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGA
903 ATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGT
*
386831 GATTT
967 GATTA
* * * * *
386836 GATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTTA
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * ** * *
386900 -GCTCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACTTGATCAACCATTA
65 GGAT-TTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * * **
386963 TGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAACTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGTGAGAAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * * *
387028 TTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTGG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * *
387093 CAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAATATGATATTGTGCTTAGTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* ** * *
387158 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * * * * * *
387223 AATGAAAAGTCATGATTTATGGCTAAAGGTTTTAGGCCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTAT
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCAT
* *
387288 GA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--TTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGG
451 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGA
* * *
387334 TTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
516 TTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * *
387399 TTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATT
581 TTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATT
* * * * * *
387464 TAGATGCGTGCTGAGCTGTTTG-AATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCAT
646 TAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAA-GAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * * * * **
387528 GTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGT-GACTTCGTCAAATCTGT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAG-CTTGGTTGAATCTGT
* *
387592 TTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * *
387657 ACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAACT
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAA-GTCATGCTTTATGGCCAAAAGT
* * * *
387722 ATTTGACCGAG-CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGAG
903 ATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
*
387786 ATTT
968 ATTA
* *
387790 GATTATGTGT-TTTAATTGATGTTGTGATTGATTACGGGGTCAAAA-GTCAAATACGCA-AAAGT
1 GATTATGTGTGTTT-A-TGATGTTGTGATTGATTA-TGGGTCAAAATG-CAAATATGCATAAA-T
* * *
387852 TTAAGGACTTGGATTGCAACGTTTGTTCC-CTGAAATTTC-TATTTTAAGCTGAAACATGATCAA
61 TTAAGGATTTGG-TTGCAAAGTTTGTTCCTC-GAAATTTCTTA-TTT-AGCCGAAACATGATCAA
* *
387915 CCA-TTTGGCAATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTG-TGAGGCTGTTTACA
122 CCATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGG-TGTTTGCA
* * * *
387978 TA-AGAAAATTCTTAGTAAAAGTAGGTGAAATTTCAGTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAAT
185 -AGAGAAAATTCTT-GTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAAT
*
388042 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
248 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
* * * * *
388107 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGGTTTGATATTATAGGGATG
312 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATT
* * * ** *
388172 AAATTGCAAAAGTAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTCACCGAGCCTTGTAAAAGATT
377 AAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATT
* * * * *
388237 TTTTTCCAATGACTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATGAT
442 TTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGAT
* * * * * * **
388301 GTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTTAGGTCTTGGATGCAGCGTTTG
505 GTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTG
* * *
388366 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACTTGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATT
570 TTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATT
* * * * ** * *
388431 TGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGTGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAT
635 TGAAATTAATTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAAT
* * * * *
388496 TTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTGGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGT
700 TTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGT
* * * *
388561 CGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
765 TGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATA
* * * * * *
388626 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAATTTACAGAAAA-AAAAAGCCATGCTCTATG
830 AGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATG
* * *
388690 G-CAAAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGC
894 GCCAAAA-GTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAAC
*
388754 TGATTTGGTGATTT
958 TGATTTGGTGATTA
* * * *
388768 GATTATGTGT-TTTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGCAAATACGCAAAAATTTA
1 GATTATGTGTGTTT-A-TGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTA
* * * * *
388832 AGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCAT-GAAATTTCATT-TTAAGCTGAAACATGATCAACCAATT
64 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCTCGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * *
388895 TGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATA-AGAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA-AGAGAAA
* * * * *
388959 ATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAATT
192 ATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
* *
389024 GCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTT
257 GCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* ** * *
389089 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * * * * *
389154 AAATGAAAAGTCATGATTTATGGCTAAAGGTTTTAGGCCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTTCT
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCC
* *
389219 ATGATTTGTGGATGGTT------T-AATT-ATG-TT-G---AT-T-T-TTTATGATGTTGTGATT
449 ATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATT
* * * * *
389268 GGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTGTTCCATGAA
514 GATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
* *
389333 ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAA
579 ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * * * * * *
389398 TTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA-TTCATTGCA
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * *
389462 TGTATTTGTACCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* *
389526 TTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
** ** *
389591 ACAAGATTTGATAATTATAGGGACGAAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAAG
839 ATGAGATTTGA-AATTATAGGGA-TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAG
* * * * *
389656 T-TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGAT-GTT----AGT-AATT-G
902 TATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGG
389713 -GA-T-
966 TGATTA
* * * *
389716 GA-TATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTT-
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATT-ATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTA
* * * *
389778 AGGACTTGGATGCAGAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAG-CGAAACATGATCAACCATTG
64 AGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * * *
389841 TGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGCTGAGCTG-TTGCATGAGAAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
** * * *
389905 TTCTTGTAAAAGTAGGTTAAAATTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * * *
389970 CAAATTATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTAGTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * ** * *
390035 TGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCTATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * * * *
390100 AATGAAAAGTCA-GCTTTATGGCTAAAGGTTTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTAT
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCAT
* *
390164 GA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--TTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGG
451 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGA
* * *
390210 TTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
516 TTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * *
390275 TTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATT
581 TTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATT
* * * * * * * *
390340 TAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAATTCATTGCATG
646 TAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATG
* * * * *
390405 TATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTT
711 TATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTT
* * * * * *
390470 GAAATTGATGAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCTATTTAAC
776 GAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAT
* * * * * *
390535 AAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAGGTTTT
841 GAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATT
* * *
390600 AGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--T
906 AGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAT
390647 TA
970 TA
* * * * *
390649 -ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * *
390713 GACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGT
66 GA-TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * *
390776 GGCATGTTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAA
129 GGCATG-TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * *
390841 TTCTTGT-AAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
*
390905 CAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * **
390970 TGCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* *
391035 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* * * * * * * *
391100 ATTTGTGGATTGTTTCAAGCTAATTGGGAGATTTGATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGA
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGA
*
391164 TTA-GGGTTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAATGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAA
516 TTATGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* * * * * * *
391227 TTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAAT
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
* * * * * * * *
391292 TTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATA-AGAAAATTCTTCTAAAAGCAGGTGAAATTTCATTGCA
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCA-AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * *
391356 TGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATG-TAGCTTGGTCGAATCTG
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA-GATAGCTTGGTTGAATCTG
** *
391420 TTTGAAATTGATAAAGATGGTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTT
773 TTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTT
* ** *
391485 AACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACT
838 AATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT
* * * * * * * *
391550 ATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTGTGGATTGTTTCAAGCTAATTGGGAG
903 ATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
*
391615 ATTT
968 ATTA
* * * ** * *
391619 GATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACACAAATATGCAAAAATTTTA
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* ** * *
391683 GG-TCTTGGATGCAGCGTTTATTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTG
65 GGAT-TTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * *
391746 TGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
** * * *
391811 TTCTTGTAAAAGTAGGTTAAAATTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTG
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * *
391876 CAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTAGTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * ** * *
391941 TGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCTATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * * * *
392006 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAGGTTTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTAT
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCAT
* *
392071 GA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--TTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGG
451 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGA
* * *
392117 TTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
516 TTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * *
392182 TTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATT
581 TTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATT
* * * * * * * *
392247 TAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAATTCATTGCATG
646 TAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATG
* * * * *
392312 TATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTT
711 TATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTT
* * * * *
392377 GAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCTATTTAAC
776 GAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAT
* * * * * *
392442 AAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAGGTTTT
841 GAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATT
* * *
392507 AGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--T
906 AGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGAT
392554 TA
970 TA
* * * * *
392556 -ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * *
392620 GACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGT
66 GA-TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * *
392683 GGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * *
392748 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
*
392813 AAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * **
392878 GCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * *
392943 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCACAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGA
* * * * * * * *
393008 TTTGTGGATTGTTTCAAGCTAATTGGGAGATTTGATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGAT
453 TTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGAT
*
393072 TA-GGGTTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAATGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAAT
517 TATGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * * * * * *
393135 TTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAATT
581 TTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATT
* * * * * * * * *
393200 TTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATA-AGAAAATTCTTCTAACAGCAGGTGAAATTTCATTGCAT
646 TAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCA-AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * * *
393264 GTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATG-TAGCTTGGTCGAATCTGT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA-GATAGCTTGGTTGAATCTGT
** *
393328 TTGAAATTGATAAAGATGGTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * * * * * *
393393 ACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAACTT
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
** * * *
393458 TTTCACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGAG
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
*
393523 ATTT
968 ATTA
* * * *
393527 GATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTTA
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* ** *
393591 GG-TCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTG
65 GGAT-TTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * * **
393654 TGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGTGAGAAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAA
* * *
393719 TTCTTGTAAAAGCAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTA-CGGTGATGCTGAATTGTTGAGTT
193 TTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCTGAATTGTTGAGTT
** *
393783 GCAAATCATTTAGGGAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTT
257 GCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * ** * *
393848 TTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCTATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * * * * *
393913 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAGGTTTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTA
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCA
*
393978 TGA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--TTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTG
450 TGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTG
* * * *
394024 GTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
515 ATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAA
* * *
394089 TTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAAT
580 TTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
* * * * * * *
394154 TTAGATGCGTGCTAAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCAT
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * **** * * * * *
394219 GTATTCGTACCCCAATGCTGAATTGTTGGGTTGTAAATTATTTAGATAGCTTAGTTGAATCTATT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTT
* *
394284 TGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
775 TGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
* * * *
394349 TGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTACAGAAAA-GAAAAGCCATGCTCTATGG-CAAAAGGT
840 TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAA-GT
* * * *
394412 ATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTCTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGTG
903 ATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
*
394477 ATTT
968 ATTA
* * * * * *
394481 GATTATGTGT-TTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGTAAATACGCAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * * * * *
394545 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCATT-TTAAGCTGAAATATGATCAACTAATT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * *
394608 TGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATA-AGAAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA-AGAGAAA
* * *
394672 ATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTT
192 ATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
* * *
394737 GCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAATTTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTT
257 GCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * * *
394802 TTGCCTTGATTTCTTGATTTAAAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATGAAATTGCAA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
394867 AAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAT
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAT
* * * ** * *
394932 GATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGAGATTTCATAATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTG
451 GATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTG
* *
394996 ATTA-GGGTTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAA
515 ATTATGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
* * * * * * * *
395059 ATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCGACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAA
579 ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * * * *
395124 TTTTGATGCGTGATAAGGTGTTTACATA-AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGC
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCA-AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGC
* * * * ** *
395188 ATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGACTTGCAAATCATTTAGGCAGCTTGGTCGAATCTG
708 ATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTG
* * *
395253 TTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTAATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTT
773 TTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTT
* * * * * * *
395318 AACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGTAAAAATAAAAAGTCATGCTTTACGGCCAAAACT
838 AATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT
* * * * * * **
395383 ATTTGACCGCGCCTTGTAAAGGCTTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCGGATTTGGAA
903 ATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
*
395448 ATTT
968 ATTA
* *
395452 GATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTA-GCGGTCAAAACGCAAATACGCA-AAAGTTT
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATG-GGTCAAAATGCAAATATGCATAAA-TTT
* ** * * * *
395514 TAGGGCTTGGATGCTACGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAACCATT
63 AAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATT
* * * * *
395578 GTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT-CTGAGCTGTTTGCATGAGAAA
127 TTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAA
* * * * * *
395642 ATTCTTGTAAAAGCAGGTGAAATTTCATTACATGTATTTGTACCATGTTGTTGAATTGTTGAGTT
192 ATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTT
*
395707 GCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
257 GCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTT
* * * * *
395772 TTGCCTTAATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAA
321 TTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAA
* * *
395837 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTTCT
386 AAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCC
395902 ATGATTTGTGGATGGTT------T-A-------ATT--ATT-TGT-T-TTTATGATGTTGTGATT
449 ATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATT
** * * *
395948 GGCTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAA
514 GATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
* * *
396013 ATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAA
579 ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * * * * * *
396078 TTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCA
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * * * *
396143 TGTATTTGTACCGTGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* * * * *
396208 TTGATATTGATAAAGATGATAATGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * * * *
396273 ACGAGATTTGATATTACAAGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAGGTA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
** * *
396338 TTAGACCGAGCCTCATAAAGGTCTTTTTTTCTATGA-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT-
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGG-ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTG
396386 -TTA
968 ATTA
* * * * *
396389 -ATTATGTGTTTTTACGATGTTGTGATTGGTTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA-AATCTTTTA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAA-ATTTAA
* * * * * *
396451 GGACTTGGATGCAAAATTTGTT-CTATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTGT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCT-CGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * *
396515 GGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTATTTGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * *
396580 TCTAGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* * *
396645 AAATCATTTAGGTAGCTTCGTCAAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATCATATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * * * *
396710 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGATATTGTAGGGATGAAATTGCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* *
396775 AT-AAAATGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
388 ATGAAAA-GTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* * * *
396839 ATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGA
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGA
* * * * * * * *
396903 TTAGGGGTCAAAATGCAAATACGCAAAAGTTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTCTTCCCTGAAAT
516 TTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * *
396968 TTCTTATTTAGTCAAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTG-TCGATTTGAAATTAAT
581 TTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAAT
* * * * * * * * *
397032 TTAGATGCGTGTTGAGCTGTTGGCATGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCAT
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * * * **
397097 GTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCAAATCTGTT
710 GTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTT
* * * *
397162 TGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGATTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAA
775 TGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA
** * * *
397227 CAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAGGTAT
840 TGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTAT
* * * *
397292 TAGACCGAGCCTCGTAAGGGACCTTTTTTCTATGATTT-T---T-G---------GA--TGGT--
905 TAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA
397339 TTA
969 TTA
* * * * * *
397342 -ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGAAAATATGCAAAAATTTTAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * * * * *
397406 GACTTGGATGCAATGTTTGTTCCGT-GAAATTTCTTTTTTAGCCGAAACATGATCGACCATTGTG
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
* * * * * * *
397470 GAATGTTTTTCTTGCCGAATTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGGAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
* * * * * *
397535 CTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGTA
195 CTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCA
* * *
397600 AATTATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTG
260 AATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG
* * *
397665 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAATTTACAGAAA
324 CCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAA
* * * *
397730 A-AAAAAGCCATGCTCTATGG-CAAAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAA-GTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* * * *
397793 ATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGTGT-TTCATTGATGTTGTGATTGA
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGA
* * *
397857 TTACGGGTCAAAACGCAAATACGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
516 TTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAAT
* * * *
397922 TTCATT-TTAAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
581 TTC-TTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAAT
* * * * * * *
397986 TTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATA-AGAAAATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCA
645 TTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCA-AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * * * *
398050 TGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* * *
398115 TTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATGAGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * * *
398180 ACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
* * * * *
398245 TTTGACTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGAGA
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA
*
398310 TTT
969 TTA
* * * * *
398313 GATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATACGCAAAAATTTTA
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * * * *
398377 GGACTTGGATGCAACGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTGT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * *
398441 GGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTATTGGCATGAGAAAAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * * * *
398506 TCTTGTAAAAATAGGTGGAATTTCATTGCATGTATTTCTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* * * *
398571 AAATCCTTTAGGTAGCTTGGTCGAATCTGTATGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* ** * * *
398636 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATAAAATTTCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * * * *
398701 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAAAGGTTTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATG
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATG
* *
398766 A-TT-T-G-T-G---------GA--TGGT--TTA-ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGT
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * *
398812 TAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
517 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* ** * *
398877 TCTTTTTTAGCTAAAACATGATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTT
582 TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTT
* * * * * * *
398942 AGATGTGTGCTGAGCTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATTTTATTGCATGT
647 AGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATGT
** * * * * * * * *
399007 ATTTGTGCCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGTAAATTATTTAAATAGCTTGGTCGAATCTATTTG
712 ATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTG
* * *
399072 AAATTGACAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG
777 AAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATG
* * ** * * *
399137 AGATTTGAAGTTATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTT
842 AGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTA
* * * * *
399202 GACCGAGCTTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTT
907 GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
* * *
399267 GATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* ** *** ** * * * *
399331 GGACTTGGTTGCAGAAATATAAGGATTAAATTGCCAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTA
65 GGATTTGGTTGC------A-AA-G-TT-TGTT-CCTCGAAATTTC-T--TATTTAGCCGAAAC-A
* * ** * * ** * *
399396 TTTGATCGAGCC-TTGT-AAAGGATTTTT-TTCCATGATTTGTGGATT-GTTCCA-A-GC-TGAT
115 --TGATC-AACCATTTTGGCATG-TTTTTCTTGC-TGATTTG-AAATTAATT-TAGATGCGTGAT
** * ** * ** * * *** *
399454 TTGGTGATTTG-ATTATATGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGCCAAAACGCAAATATGG
173 GAGGTG-TTTGCA--AGA-G--AAAAT--TCTTGT-A-AAAGTAGGAG--AAATTTC--AT-TGC
*** * * * * ** * * * *
399518 AAAAATTTAAGGA-CTTGGTTGC-AAAGTTTGTT-CCTTG-AACTTTCATATTTAGCTGAAACAT
223 ATGTATTT--GTATCAT-GATGCTGAA--TTGTTGAGTTGCAA--ATC--ATTTAGAT--AGCTT
* ** * ** *** * *** * * *****
399579 GATC-AACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGAT-TTGAAATTAATTTTG-ATAAGTGAGGAGGT
277 G-TCGAATCTGTTT-G-AAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT---TGATTTCTT
* * ** * * * * **
399641 G-TTTACGTAAGAAAATTCTTATAA-AAGTAGGTGAAATT-TCATTGCATGT-ATTTGTACCATG
336 GATTTA--TAAG----TTATT-TAATGAG-ATTTGAAATTAT-A-GGGAT-TAAATTG--CAAAA
* * * ** ** * *
399702 ATGCAGAA-T--TG-TTGAGTTG-CAACTCATTTAGATAGCTT-GGTCGAATCTGTTTGAA--AT
388 ATG-AAAAGTCATGCTTTA-TGGCCAA---A---AG-TA--TTAGACCGAGCCT-TGTAAAGGAT
** **** * ** * ** * * * *
399759 TGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC---TTGATTTCCTGATT-TA-TAAGCTAT-TTAA
441 TTTTTTCCATGAT-TTGTG--GATGGTT-CCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATG-TGTGTTTA
* * * * * * * * * * ** *
399818 CGA-GATT-CGA--AATTATAGGGATGAAATTGCAAAAAAG--AAAA-GTCATG-CTTTATGGCC
501 TGATG-TTGTGATTGATTAT-GGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTG-C
* ** * * *
399875 AAAAGTATTTGATCTGTCCTTGTAAAAGTCTT-TTCT--CCATGATTTCTAGATGGTTCCAAGCT
562 -AAAG--TTTG---T-TCCATG-AAATTTCTTATT-TAGCC--GA----AACAT-GAT-CAA-C-
* * * * * * * * * * ** * **
399937 GATTTAGTG-AT-TTGATT-GTG-TGTTTTGTAACTAA-TTAG--GGGTCAAAATCTAAATAGGC
608 CATTTTG-GCATGTT-TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATAAGGT--GTTTGC
* ** * * * * **
399995 AA-AAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTGCATGAAATTTCTTATTTAGC-CGAAACATGA
669 AAGAGA---AAATTCTT-G-T-AAAAG--T-ATG-A-GAAATTTC--A-TT-GCATG-TATTTG-
* ** ** * * * * *
400058 TCAGCCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTG-ATATTAATTTAGAT-GCGTGATGAGGTG--
717 T-A-TCATGGT-GC-TG-AATTGTTG-AG--TTGCA-AATCATTTAGATAGC-T--TG-GTTGAA
* ** * *
400119 TTTGCATGAGAAAGTTCTTG-TAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTAT-CATGATG
769 TCTG--TTTGAAA----TTGATAAA-G-A--TGACA-TT-G-TGC-T-TATTT-T-TGC---CT-
* * ** * * * ** * **
400182 CTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATG-GCTTGGTCG-AATCTAT-TTGA--AATTTATAA
813 -TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA-ATGAGATT--T-GAAAT-TATAGGGATTAAATTGCAA
* ** * ** * * ** *
400242 AGATGATATTGTGCTAATCTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA-A-TGAGATTTGA
872 AAATGA-AAAGT-C--A----TG-CTTTATGGC--CA---A-AAG-TA-TTAGACCGAGCCTTGT
** * * * **
400305 AATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGG--CCAAAACT-ATTTGACCG
920 AA----A-GGATT-TTTTTC--CA-TG---A-T-TTG-TGGATGGTTCC-AAACTGATTTG---G
* *
400367 AGCCTTGTA
966 TG--AT-TA
* * * * * * * ** * *
400376 AAGTAT-TTTTTTTCCATGAT-TTGTGGATGGTTGCAAGCTGATTTGGT-GATTTG--ATTTTG-
1 GATTATGTGTGTTT--ATGATGTTGT-GA---TTG--A--TTA-TGGGTCAAAATGCAAATATGC
** * * * * * * ** * *
400435 -T-GTTTTAATGATGTT-G-TG-ATTAA-TTAG-GCGTC-AAAATGCAAATAT-G-C-AAAAAT-
55 ATAAATTTAAGGAT-TTGGTTGCA--AAGTTTGTTCCTCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG
* ** * *
400488 -TTAAGGACTTGGTT-GCAAAGTTTGTTC---C--A--TGAAATATCATATTTAGCTGAAACCTG
117 ATCAACCA-TT--TTGGC-ATGTTT-TTCTTGCTGATTTGAAAT-T-A-ATTTAGATG----C-G
* * * * * *
400544 ATCAACCAATTTGGCAAGCTTTTCTTGCTAATTTAAAATTAATT-TAGATGCGTAATGAGGTGGT
169 -T-----GA--T-G--AG-GTGT-TTGC-AA--GAGAA--AATTCT---T--GTAA--A---AG-
* * ** * ** * * *
400608 TGCATGAGAAAATTCATGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGA
205 T--AGGAGAAATTTCAT-TGCATGTATTTG---TATCA-TG-ATG--CT-G-A--AT--TGTTGA
* * * * * ** * * * *
400673 ATTGGTAAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTTGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATAT
254 GTT-GCAA-AT-C-ATTTAGATAGCTTG--T---CGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
* *
400738 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGGTATTTAATGAGATTTAAAATTATAGGGA
310 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGA
* * * *
400803 TTAAATTACAAAAATGAAAAGTCATGCTTTAAGGCCAAAACTCTTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
375 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA
* * *
400868 CTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGG--------T-A-----TGATT--A-TCTGCGTGTTTATAA
440 -TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGA
* * * *
400916 TGCTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTT
504 TGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTT
* * * * * *
400981 GTTCCATGAAATTTCTTGTTTGGTCGAAACGTGATCAACCATTTTCGGC-TGTCTTTCTTGCCGA
569 GTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGA
* * * * * * *
401045 TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGTTGAGCTATTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGT-TGGTGA
633 TTTGAAATTAATTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAT-GAGA
* * * * * * * * *
401109 AATTTTAGTGCTTGTATTCGAATCATGGTGCTGAGTTGTTGAGTTGCAAACCCTTTAGATACCTT
697 AATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTT
* * * *
401174 GGTCGAATCTGTTTAAAATTAATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
762 GGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTT
* *
401239 ATAAGTTA-TTAATGAGATTTGAAATTATATGGATTAAATTGCGAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
827 ATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTA
* * * * *
401303 TCGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAG
892 TGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAA
*
401367 CTAATTTGGTGATTTA
957 CTGATTTGGTGA-TTA
* * * *
401383 G-TTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAG
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAAG
* * ** * * **
401447 GACTTGCTCACATAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCATATTTAGCTAAAACATGATCAACCATTTTG
66 GATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTG
*
401511 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
130 GCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATT
*
401576 CTTGTAAAAGTA-GATGAAATTTCACTGCATGTATTTGTA-CAATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
195 CTTGTAAAAGTAGGA-GAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTG
* * * *
401639 CAAATCATTTAGATAACTTGGTCTAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCGTATTTT
258 CAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTT
* * * *
401704 TGCCTTAATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAGGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGTAAA
322 TGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * * * * * *
401769 AATGAAATGTCATGCCTTATCGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAAGA-TTTTTTCCATG
387 AATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATG
* *
401833 ATTTTTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTAAGATGTTGTGATTGAT
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGAT
* * *
401898 TATGAGTCAAAATGAAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
517 TATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT
* * *
401963 TCTTATCTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATATTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTT
582 TCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTT
** * * * * * *
402028 AGATGCATTA-AGAGGTGTTCGCTTA-AGAAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATATCATTGCAT
647 AGATGTGTGATA-AGGTGTTTGC-AAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCAT
* * * * *
402091 GTAATTGTATCATGATG-TCGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAATCTGT
710 GTATTTGTATCATGGTGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* * * *
402155 TTGAAATTGATAAAGATG--ATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTAATTTATATGCTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
* * * *
402218 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTTCAAGAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCCGAAAGTA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
* * * * *
402283 TTTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGA----TCCAAGCTGATTTAGTGA
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA
*
402344 TTT
969 TTA
* * * *
402347 GA-T-TGTGTTTTTATGATGTTGT-ATTTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGA-TTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * *
402409 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATAAACCAATTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
** * *
402473 AACATGTTTTTCTTGCTGATTTG------A---A-ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAGT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * * *
402528 TCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTGTCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
* * * * *
402593 AAATCATTTAGATGGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTTATAAAGATGATATTGTGCTAATCTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* *
402658 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATCTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAA
* * * *
402723 GTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTTCCATG
388 ATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATG
* * * *
402788 ATTTGTGGATGGTTGCAAGCTGATTTGGTGATTTGA-TAT-TGTGTTTTAATGATGTTGTGATTA
452 ATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTG-TTT-ATGATGTTGTGATTG
402851 ATTA-GGCGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
515 ATTATGG-GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
* * * * *
402915 ATATCATATTTAGCTGAAACCTGATCAACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
579 ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
* * * *
402980 TTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCA
644 TTTAGATGTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCA
* * * *
403045 TGTATTCGTAT-ATGCTGCTGAATTGTTGAGTTACAAATGATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
709 TGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGT
* *
403109 TTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGACTTATAAGTTATTTA
774 TTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA
*
403174 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTA
839 ATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTA
* * * * *
403239 TTTGACCGAGCTTTGTAAATGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGT-A
904 TTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGA
*
403303 TTTT
969 -TTA
* * * *
403307 GATTATGTGCT-TTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA
1 GATTATGTG-TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* * * * * *
403371 -GAGCTTGGTTACAAAGTTTGTTCCAT-GAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACAAATT
65 GGA-TTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTT
* * *
403434 TAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATG-TTACGGTGTTTG-AATGAGAA
128 TGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGA-GGTGTTTGCAA-GAGAA
* *
403497 AATTCTTGTAAAAGTAGGTA-AAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATAATGCTGAATTGTTGAG
191 AATTCTTGTAAAAGTAGG-AGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAG
* * * *
403561 TTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAAATGATAATGACGATATTGTGCTTAT
255 TTGCAAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAT
*
403626 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTAC
319 TTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGC
* * * * * **
403691 AAAAACGAAAAGTCATGCTTT-TGGCCTAAACTATTTGACCGAGCCTTGTCAAGGATTTTTTTTA
384 AAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC
* * *
403755 ATGATTTGTGGATGGTTTCGAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTGTGATGTTGTGATT
449 ATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATT
* *
403820 GATTATGGGTCAAAATGCAAACATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
514 GATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAA
* *
403885 ATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAA
579 ATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAA
** * * * * * *
403950 TTTAGATGCATTA-AGAGGCGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGC
644 TTTAGATGTGTGATA-AGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGC
* * ** * * * * *
404014 ATGTAATTATATCA-AATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATATAGCTTTGTCGAATTTG
708 ATGTATTTGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTG
* * * *
404078 TTTGAATTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTCGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTT
773 TTTGAAATTGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTT
404143 AACT-AGATTTGAAATTATAGGG-TTGAAATTG-AGAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
838 AA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATT-AAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
* * * * * *
404205 AGTTAGT-GATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTTGATGGTTCCAAGCTAATTT
900 AG-TATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTT
* *
404269 AGTGATTT
964 GGTGATTA
* * * * * *
404277 GATTATGCGTTTTTATGATGCTGTAATTGATTA-GCGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTA
1 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATG-GGTCAAAATGCAAATATGCATAAATTTAA
* *
404341 GGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAT-TAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
65 GGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCC-TCGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTT
* * * * * * *
404405 TGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGGGAATAT
129 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAAT
* * * *
404470 TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGC
194 TCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGC
404535 AAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
259 AAATCATTTAGATAGCTT-GTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTT
* * *
404600 GTCTTGATTTCTTGATTTGTAA-TCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG-AAA
323 GCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT-TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA
* * *
404663 AATTAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT-TTATGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA
387 AA-TGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTA-GACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA
404727 TGATGTTGT
450 TGAT-TTGT
404736 AATTGATTAG
Statistics
Matches: 39121, Mismatches: 5731, Indels: 4899
0.79 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
931 1 0.00
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CATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTC
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ATCATTTAGATAGCTTGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC
TTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATG
AAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTT
GTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATG
GGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT
ATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGAT
GTGTGATAAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCATTGCATGTATTT
GTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAAT
TGATAAAGATGACATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGAT
TTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTAGACC
GAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTA
Found at i:364201 original size:390 final size:390
Alignment explanation
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363472 AAATATCATA
* * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* *
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* *
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* * * *
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* * **
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* * ** * *
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* * *
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* ** * *
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* *
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GCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGCTACAAATCATTTAGATAGCATAGCCGAATC
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GGATTTAATTATGTGTTTTTATGACGTTACGATTGATTAGGGGTCAAAATACAAATATGCAAAAA
TTTAAGGACTTGCATGCAAAGTTTGTACCATGAAATTTCTTATTTGAAATTAATGAGACTTCGTT
Found at i:364874 original size:487 final size:486
Alignment explanation
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* * * * *
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* *
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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323 -AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGAT
* * ** * * * ** *
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* * *
364320 CATGAG-AAATATCTTGTAAAAGTATGAGAAATTTCA
451 CATGAGAAAAT-TCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
* * * * *
364356 TTGCATGT-ATTCGTATCATGCTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAACTTGGTTGA
1 TTGCATGTAATT-GTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA
*
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* *
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*
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*
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259 TTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * * * *
364680 AAAATTTAAGGATTTGGTCGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTTTTCTTTGGTCGAAAGATGATGA
324 AAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCA
*
364745 ACCATTTTAGG-ATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCC
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*
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* * *
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1 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * * *
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66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTA
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131 TTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
* * *
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196 AGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCC-ATGATTTGTGGGTGGTTCCAAACTGATT
* *
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260 TGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
*
365159 AAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGATATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAA
* * * * *
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390 CCATTTTGGCATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATG
*
365279 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
455 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
* * * * *
365311 TTGCATGTATTTCTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGCTCGAA
1 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
365376 TCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTGTCTT-TTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG-CTTATTTTTG-CTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * *
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129 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
*
365505 AAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTTCCATGATTTGTGGGTGGTTCCAAACTAA
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*
365570 TTTGGTGATTAGGTTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC
258 TTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * * * * *
365635 AAAAATTTAAGGATTTGGTCGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTTTTCTTTGGTCGAAAGATGATG
323 AAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATC
365700 AACCATTTTAGG-ATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGC
388 AACCATTTT-GGCATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGC
* *
365764 CTGAGAAAATTCTTGTAAGAGTAGGTGAAATATCA
452 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
* * *
365799 TTGCATGTAATTGTATTACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAAGCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * * *
365864 TCTGTTTGAAATCGATAATGATGATACTGTGCCTA---TT--TT--TTCCTTGATTTATAAGTTA
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTA
365922 TTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
131 TTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
* * *
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196 AGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCC-ATGATTTGTGGGTGGTTCCAAACTGATT
* *
366050 TGGTGATTAGATTACGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGACAAAATGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
*
366115 AAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGATATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAA
* * * *
366180 CCATTTTGGCATG--TTT-TT-CT-A--GC---TTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATG
*
366235 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
455 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
* * * * *
366267 TTGCATGTATTTCTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGCTCGAA
1 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
366332 TCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTGTCTT-TTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTG-CTTATTTTTG-CTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * *
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129 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* *
366461 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGAT
194 AAAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGGTGGTTCCAAACTGAT
* *
366525 TTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTCATTGATTATGAGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
366590 AAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAGTTTCCTATTTTGCCGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCA
* * * * * * *
366655 ACCATTTTGGCATTTTTTTCTTGTTTATTTGAAATTATTTTAGATGCATTAAGAGTTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCAT
* *
366720 GAGAAAATTCCTGTAAACGTAGGTGAAATATCA
454 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
*
366753 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAAATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * * **
366818 TCTGTTTGAAATTGATAAAGAGGATATTGTGCTTATTCTTGCCTTGATTTCTTCATGTATAACCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-CTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
*
366883 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
130 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * *
366948 AAGTATTAGACCGAGCCTTGGAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAACTGATT
195 AAGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGGTGGTTCCAAACTGATT
* *
367013 TGGTGATTATATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGAGTCAAAATGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* ** * * *
367078 AAATTTAGGGATTTTATTGCAAAATTTGTTTCATGAAATTTCTTATTTGGTCGAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTGGCCGAAACATGATCAA
* * * *
367143 CCATTTTGGGATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGAGGCATTATGAGGTGTTTACATG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATG
** *
367208 AGAAAATTCTTGTAGGAGTAGGTGAAATATTA
455 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
* * *
367240 TTGCATGTAATTGTATTACGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATATCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
**
367305 TCTCCTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGC-------CTTGATTTATAAGTTA
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTA
* *
367363 TTTAATGAGATTTGAAATTATA-GGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCTTGCTTTATGGGCAAA
131 TTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAA
* * * * * * *
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*
367492 GGTGATTTA-ATTATGTGAT-TTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
261 GGTGA-TTAGATTATGTG-TGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* *
367555 AAAATTTAAGGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTG
324 AAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTG
367605 AAATTAATGA
Statistics
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0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (486 bp):
TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTA
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AGTATTAGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGGTGGTTCCAAACTGATTT
GGTGATTAGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
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CATTTTGGCATGTTTTTGTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGA
GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
Found at i:367951 original size:390 final size:382
Alignment explanation
Indices: 367269--367993 Score: 1123
Period size: 390 Copynumber: 1.9 Consensus size: 382
367259 GATGCCGAAT
* * *
367269 TGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATATCTTGGTCGAATCTCCTTGAAATTGATAAAGATGATATTG
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*
367334 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGATTAAATTGCAA
66 TGCTTATTTTTGCCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGATTAAAATGCAA
* * * * * * *
367399 AAATGAAAAGTCTTGCTTTATGGGCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAATGTATTTTTTTTCCT
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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* *
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Statistics
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* * * *
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* *
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* * *
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* * *
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*
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* *
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* ** * * *
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*
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* * * * * *
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*
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* * * * *
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* * ** * *
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* *
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*
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* * * * * *
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* * *
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*
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* ** * * *
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* *
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** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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** * * * * *
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* * *
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* * *
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* ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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*** * * *
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* ** * *
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* *
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* * * * *
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* * * * ** ** **
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* ** * ** ** *
371514 CTGTTTTGGGGATTTG-ATTATG-TGC-G--TT-TATGATGTTGTGAATGA-TT--AT-G---GG
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* ** * ** * ** *
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* *** ** *** ** * *** * *** * *
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** * * * ** * *** * * *
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* * ** * * * * * ** * **
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* * ** * ** * ** ** *** *
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* * * * *** * *
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* * ** ** * ** *
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*** ** ** * * * *
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** * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * ** ** * * ** * *
372194 GTAAAGGTAGGTGAAATTTTATTGCATGTATTTATACCCTGATGTTGAATTG--TTAG-GTTGCA
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** * ** * * * * *
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* * * ** * * *
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* ** * * ** * * * * ***
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*** * * * * * * * *
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* * * * ****** * * * *
372501 TGA-TTAG--GGGTCAAAATCCAAATATGAAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCA
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372563 AGAAATTTCTTA
476 -GAAATTTC--A
* * ** ** ** * * * *
372575 TTAGC-CGAAACATGATCAACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTACTTTG-ATATTAATTTAGAT
1 TT-GCATG-TATTTG-T--ACCATGAT-GC-TG-AATTGTTG--A-GTTGCA-AATCATTTAGAT
* * * * * *
372638 -GCGTGAT-GAGGTGTTTTCATGAGAAAATTCTTG-TAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTA
54 AGCTTGGTCGA-ATCTGTT--T--G-AAA---TTGATAAA-G-A--TGATA-TT-G-TGC-T-TA
* * * * * * *
372700 TTTGTAT-CTTGATGCTGATTTGTTG-TGTTGTAAATCATTTAGAT-AGCTTGGTCG-AA-TCT-
101 TTT-T-TGC---CT--TGATTTCTTGAT-TTATAAGTTATTTA-ATGAGATT--T-GAAATTATA
* ** * ** *
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** ** * *** * * * **
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* * *** * * * * *
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* * **** ** * *** * *
372945 TATGTGTTTTTATG-ATGT-TGTGATTGATTAGGGGTCAAATGCAAATATGCAAAACTTTTAGGA
300 TAGGGGTCAAAATGCAAATATG-CAAAAATT-----T--AA-G-GAC------------TT-GG-
* * * *
373008 CTTGGACGCAAAGTCTGTTCCATAAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCA
341 -TT----GCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCA
* * * * *
373073 TGTTTTTCTTGCGGATTTGAAATTAAGTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAGTTTTT
401 TGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATGAGAAAATTCTT
*
373138 GCAAAAGTAGGTGAAATTTCA
464 GTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
*
373159 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
373224 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
*
373289 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * ** * * * *
373354 ACGTATTTGATCTTGCCTGGTAAAAGACTTTTTTCCATGACTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * *
373419 AGG-GATTT-A--A-----TTTTATG-TTTTG-GAACTAATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGAA
261 -GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTG-ATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * *
373473 AAAATTTAAAGG-TTTCGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTCCTTACTTGGCCGAAACATGATC
324 AAAATTT-AAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * *
373537 AACCATTTTGGCATGGTTTTCTTGCTAATTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCA
388 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAA-A-GTGTTTGCA
*
373602 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAACA-TTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA-ATTTCA
* ** * * * *
373636 TTGCATGTAATTGTATTATGATAC-GGATTATTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
373700 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTTCTTGATTTTTAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
373765 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC--AAATGAAAATTCATGCTTTATGGCCCA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * *
373828 AAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCAGTAATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCA-TGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
*
373893 TGCG-GATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATT-GGGTGTGAAAATGCAAATAT-C
260 TG-GTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG-GTCAAAATGCAAATATGC
* * *
373955 TAAAAATTTAAGGACTTGGTTGTAGAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGAT
323 -AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * ** * *
374020 CAACCATTTCGGCTTGTTTTTCTTATTGATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
387 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGC
374085 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
374120 TTGCATATATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGCTGCAAATCATTTAGATAGCCTT-GTCGA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAG-CTTGGTCGA
* * * *
374184 ATGTGTTTGAAACT-AGTATAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTT-TTCGATTTATAA
65 ATCTGTTTGAAATTGA-TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTT-GATTTATAA
* *
374247 GTTATTTAATGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGCAAAAAAG-AAAGTCATGCTTTATGGC
128 GTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
* * *
374311 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTCTTCCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
193 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * ** * *
374376 TTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTTTTTATGTTGTGATTGATTATAGGACAAAATACAAATATGC
258 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
374441 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGGAACATTATC
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * *
374506 AACCATTTTAGCATGTTTTTCTTACTGGTTTGAAAATAATTTAAATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
388 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCA
* *
374571 TTTCA-AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCG
451 --TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
374606 TTGCATGTATTTGCACCATGATGCTGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCTTGGTCGAT
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * * * *
374671 TCTATTTGAAGA-TGATATAGGTTATATTGTGCTTATTTTTGCCCTGATTTCTTAATTTATAAGT
66 TCTGTTTGAA-ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* *
374735 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* *
374800 AAAGTATTTG-CTCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAGCTGA
195 AAAGTATTTGAC-CGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * **
374864 TTTGGTGATTAGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATTGGTCAAAATGCAAATATGC
258 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * * * *
374929 AAAAATTTAAAGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTATTTAGCTGAAACGTTATC
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * *
374994 AACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTACTGAATTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTCTGCA
388 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCA
* * *
375059 AGAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAGATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * * * *
375093 TTGCATGCACTCGTATCATGGTGCTAAACTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
375158 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTTTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
375223 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
375288 AGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--T
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
*
375341 T--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* *
375399 AAATTTTAGGACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCA
325 AAATTTAAGGACTT-GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* ** *
375463 ACCATTTTGGCATATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACGGGTGGTTGCATG
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-AAGTGTTTGCATG
375528 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
*
375560 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTTG-AAATCATTTGGATAGCTTGGTCGA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAG-TTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA
* * * * *
375624 ATCTGTTTGAAATTGATATAA-ATAATATTGTGCCTATTTTTGCCTTCATTTCTTCATTTATAGG
65 ATCTGTTTGAAATTGATA-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
375688 CTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
129 TTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* * * *
375753 AAAAGTAGTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGAT
194 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* ** **
375818 TTAGG-GATTTGATTATGAGAGTTTATGATGTTGTGATTGATTATCGGTCAAAATGCAAATATGC
259 TT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * *
375882 AAAAAATTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTGTTAATTT-GCCGATACATGAT
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * * * *
375946 CAACTATTTTGGCTTGTTTTTCTAGCTAACTTGAAATTAATTTACATGCATGATGAGGTTTTTGC
387 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGC
* * * *
376011 AAGAGAAAATTCTTGAAAAAGTTGGTGAAATTTCG
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
376046 TTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * * * * *
376111 TCTGTTTGAAATTGA-GAA-AT-ATGTTGTGCTCAGTTTTGCCCTGATTTCATGATTTATAACTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
376173 ATTTAATGAGATTTGAAATTGTAGGGGTTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGTTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* *
376238 AAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TGA
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA---TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * *
376297 --T--T-A--TG--TA----TTTTTACGGTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC
258 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * ** *
376349 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTCTTTAGTAGAAACGTGATC
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * ** *
376414 AACCATTGTGACATCTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGTTGAGATGTTTTCA
388 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCA
* *
376479 TGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGGTGAAATTTTA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * *
376513 TTGCATTTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGCGTTGTAAATTATTTAGATAGCTTGGCCAAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * * *
376578 TCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGAGCTTATTTTTGCCTTTATTTTTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
376643 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAATTGAAAAGTCGTGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
376708 AACTATTTGACCGAGCCTTGAAAATGATTTTTTTCCATGATTTGAGGATGGTTCCAGGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* *
376773 GGTGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGAAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * * * **
376838 AATTTAAAGACTTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATATCATATTTAGTTGAAACATGATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * *
376903 CAATTTGGCATGTTTTCCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGA
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATGA
*
376968 GAAAATCCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
376999 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
377064 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGATTATCTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
377129 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC--AAATGAAAAGTCATTCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * *
377192 AAGTATTTGGCCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTTCCATAATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *
377257 TGGGGATTTGATTATGCGTTTTTATGATGTTGTCATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC-A
* *
377321 AAAATTTAAGAACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATAA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * ** * * * *
377386 ACCATTTTGGCTTATTTTTCTTAATGATTGGAAAGTAATTTAGATGCGTGGTGAGGTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT-G-AAAGTGTTTGCAT
377451 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
377484 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGTTGAATTGTTGAGTTTCAAATCATTTAGATAGCTTTGTCAAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
377549 TCTGTTTGAAACTAATATAGATGATATTGTGCTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* *
377614 TATTTAATGTGATTTGAAATTATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
*
377679 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGA--T-T---T-G-T----G--GA--
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
*
377728 T-G-G-TTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGAATGATTAGGGGTCAAAAT-CAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * * * * *
377789 AAATTTTAGGACTTAGATGAAAAGTTTGTTCCAAGAAATTTCTAATTTAGCTGAAACATGATCAT
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
** * ** * *
377854 CCATTGTT-GCATGTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTATTTTAGATGCGTGTTGAGCTGTTCGCTT
390 CCATT-TTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
* * *
377918 GTGAAAATTCTTTTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
377951 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCACATTATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
378016 TCTGTTTGAAATTAATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
378081 ATTTAATGAGATTTGAAATTACAGGGATTAAATTGCAAAAGTCAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* *
378146 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * *
378211 GGTGATTTGATTATGTGTTTTAATTATGTTGTGATTGATTAGGTGTCAAAATGCAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * *
378276 AATTTAAGGACTTGGTAGCAAAGTTTATTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * * * * *
378341 CATTTTAGCGA-GGTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATATACATGTGTGATGAGGTGTTTGCATG
391 CATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATG
*
378405 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCG
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
378437 TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
378502 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-C-------CTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
378559 ATTTAATGACATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTGTGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * * * *
378624 AAGTGTTTGACTGAGCCTTGTGAAGTATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGCTCCGAGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * *
378689 GGTGATTTAATAATGTATTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATACAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
*** * *
378754 AATTTAAGGACTTACATGCAAAGTTTGTTCCATGAAA-TTCATTATTTGGCCGAAACATTATCAA
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* *
378818 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATG
*
378883 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
378915 TTGCATGTATTTGTGCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCAAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * *
378980 TCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
379045 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGAAAAAATGAAAAGTCACG-TTTGATGGCCA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTT-ATGGCCA
* * * * * *
379109 AAACTATTTGATC-AGGCCTTGTAATGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAACTAA
195 AAAGTATTTGACCGA-GCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* ** * * * *
379173 TTTAGG-GATTTGATTTTGTGCGTTTATGATTTTGTGATTGGTTATGGGTCAAAATGAAAATATG
258 TTT-GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
* * *
379237 CAAAGAA-TTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCGGAAACATGA
322 CAAA-AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGA
* * * * *
379301 TCAACCATTTTAGCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTG
386 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTG
* *
379366 CAAGAGAAAATTCTTGAAAAAGTAGGTGAAATTTCA
449 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * ** * *
379402 TTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAAATGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAG
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * *
379467 TTTGTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* *
379532 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTACATTGCAAAAATGAAAGGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * *
379597 AAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCAAGA-TT-T-G-T-G----AA-C-----
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
379647 --G-G-TTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATT-GGGGCTCAAAATGCAAATATGCA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGG-TCAAAATGCAAATATGCA
* * * *
379707 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTAATTTAGCTGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * ** * * **
379772 TCTAGTGTGGCATTTTTTTCCAGC-CAATTGAAATTAATTTAGATGCGTGTTGAGCTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
* *
379836 GTGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
379869 TTACATGTATTTGTACCTTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGTA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
379934 TCCGTTTGAAATCGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
*
379999 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
380064 AAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * *
380129 AGTGATTTGATTATGTG------T--T-TTGTAACTGATTAGGTGTCAAAATCCAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * * *
380185 AATTTAAGGAGTTGGTTGCGAAGTTTGTTCCGTGAAATTTCTTATTTA-CCTGAAACATTATCAA
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCC-GAAACATGATCAA
* * * *
380249 CCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTTGATGCGTGATGACGTGTTTGCATG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATG
* *
380314 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTCG
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
380346 TTACACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGAAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
380411 TCTATTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTCTTTTTGCCTTGATTTCTTGA-TTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG-T
*
380475 T-TTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * * * * *
380539 AAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTTCGAGGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATT
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * * *
380604 TAGAGATTTGATTATGTGTTTCGTA--A----CT-A-T--TTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTT-TTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * *
380659 AAAATTTAAGAACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATAAAATTTTTTATTTCGCTGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * *
380724 ACCATTTTAGCGA-GTTTTTCTTGCTGTTTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
389 ACCATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCA
380788 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
380822 TTGCATGTATATGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATAATTTAGATAGCTTGCTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
380887 TCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTG-TCTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * *
380951 TTTTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGGTTAAATTGCAAATATGAAATGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * * ** * *
381016 AAAGTATTTGATCTAGCCTTGCAAAAGACCTTTTT-CTTGGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAAT
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAT-GATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
381080 TTAGTGATTTGATTATGTG------T--T-TTGTAACTGATTAGTGGTCAAAATCCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
381136 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA-TTAGCCGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * *
381200 ACCATTTTAGG-ATGTTTTTCTTGCTGCTTTGATATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGCT
389 ACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCA
* *
381264 TGAGAAAATTCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCG
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
381298 TTGCATGTATTTGTATCAAGATGCTGATTTGTTGTGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
381363 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* *
381428 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGAATTAAATTGCAAAGATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
381493 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCGAGGCTAATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * *
381558 GGTGATTTAATGATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGTGGTCAAAATACAAATATGTAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* ** ** *
381623 AATTTCAGGACTTGCCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAATGTTATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * **
381688 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTTAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTATTTGCCGGA
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATGA
*
381753 GAAAATTCTTGTAAACGTAGGTGAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
** * *
381784 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTAATGAGTGGCAAATCATTTAGATAGCTTAGT-GAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG-A
* * * * * *
381848 ATCTGTTTGAAATTGATAGAGATGATATTATGCGTATTTTTGCCTTGATTACTTCATTTATAGGT
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
** * *
381913 TATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * * * * * *
381978 AAAGGATTCGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTATGGATGGTTCCGAGTTGATT
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* ** * *
382043 TGGGGATTTGATTATGTCATTTTATGATGTTGGGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * *
382108 AAAATTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTTTTTAGCCAAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * *
382173 CCATTTTAGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCTTG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATG
* **
382238 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTTG
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
382270 TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTAGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
382335 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTGTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *** * *
382400 ATTTTTTGAGATTGGAAATTGTAGGGATTAAA-TGCAAAAATGAAAAGTCACAATTAATAGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
382464 AAGTATTTGGCCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * *
382529 GGTGATTCGATTATGTGTTTTAATGATGTTATGATTGATTACGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGGTCAAAATGCAAATATGC-A
** * * **
382593 AACTTTTAAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTACTTATTTAGCTAAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * ** * *
382658 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCCTGTTGAGCTGCTTGCAA
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
*
382723 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
382756 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAGTTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCAAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
382821 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
382886 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTCTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
382951 AACTATTTGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTTTCCATGATTTGTGGTTTGTTCCAAGCTGAT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
383016 TTGGTGATTTGATTAT-TTTTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATACGC
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
383080 AAAAATTTAAGG-CTTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCGGAAACATGAT
323 AAAAATTTAAGGAC-TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * *
383144 CAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTTTTTAC
387 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGC
*
383209 ATAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
383244 TTGCATGTCTTTGTATCATGAAGCAGAATTGTTGAGCTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * * *
383309 TCTATTTGAAATTGATAAAGAGGATATTTTACTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
383374 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * *
383439 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGATGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * *
383504 GGAGATTTGATTATGTGGTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATAAGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * *
383569 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * * * * * * *
383634 CA-ATTGGCAAGTTTTTCTTGTTCATTTGAAATTAATTTTGATGCATGATGAGGTGTTTACATAA
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATGA
*
383698 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTCAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
*
383729 TTGCATTGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGA
1 TTGCA-TGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGA
* * *
383794 ATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * *
383859 TATTTAACGAGAATTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * *
383924 AAGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTTTTTT-C-T-A-----GGAT--TT--GAG--GA-
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * **
383974 -T--AG-TTTAATTATGT-TTTTT-T-ATGATGCCATT-AGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGA-TTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * * *
384031 AAAAATTTTAGGACCTGGATGCAACGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATC
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * **
384096 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCA
388 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCA
*
384161 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
384195 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAACTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
384260 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
384325 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGC-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
384389 AGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTCTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--T
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * *
384442 T--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGGTTAGGGGTAAAAATGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * *
384500 AAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * **
384565 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTACTTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATG
384630 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
384662 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
384727 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *
384792 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
384857 AGGCT-TTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGA-TT-T-G-TGG-----A--TGA-
196 AAG-TATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
384909 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* *
384967 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* ** ** *
385032 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTAATTTAGATTTGTGCTAAGCTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
*
385097 GAGAAAATTCTTGT-AAAGTAGGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
385129 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGCTGTAAATTATTTAGATAGCTTGGTTGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
385194 TCTATTTGAAATTGATAAAGATAATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
385259 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTACAGAAAA-GAAAAGCCATGC-TTATGG-CA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * **
385321 AAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATATTTTTCCATGATTTGTGGATTATTCCAAGCTGAT
195 AAA-GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * **
385386 TTGGTGATTTGATTATGTG-ATTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAATGCAAAAACAC
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTA-TGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
385450 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAACATGAT
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * * *
385514 CAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTAAAATTAATTTTGATGTGTGATGAGGTGTTTAC
387 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGC
*
385579 ATAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
385614 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
385679 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *
385744 ATTTAACAAGATTTGATATTATAAGGATAAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
385809 AGGTATTAGACCAAGCCTCGTAAAGGACTTCTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--T
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
*
385862 T--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * *
385920 AAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * ** *
385985 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGAATG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATG
386050 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
386082 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAACTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
386147 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* **
386212 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
386277 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTAATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * **
386342 GGAGATTTGATTATCTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAGCGCAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * *
386407 AATTTGAA-GACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCAAGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAA
326 AATTT-AAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * * *
386470 CCATTTTGGCAAGTTTTTCTTACAT-ATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACAT
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGC-TGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCAT
* *
386534 AAGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
386567 GTGCATGTATTTGTACCATGATGATAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
386632 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
386697 ATTTAACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAGTAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
386762 AACTATTTCACCGAGCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCAATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *
386827 TGGAGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* ** * ** *
386892 AAATTTTAGCTCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACTTGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * ** *
386957 CCATTATGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAACTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGTG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATG
387022 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
387054 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTGGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
387119 TCTGTTTGAAATTGATAAATATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * * *
387184 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGATTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
387249 AGGT-TTTAGGCCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
387301 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
387359 AAAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * ** *
387424 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGAAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
387489 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
387522 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGT-GACTTCGTCAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAG-CTTGGTCGA
*
387586 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * *
387651 TATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAATGTCATGCTTTATGGCC
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAA-GTCATGCTTTATGGCC
* *
387716 AAAACTATTTGACCGAG-CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGAT
194 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
387780 TTGGAGATTTGATTATGTGTTTTAATTGATGTTGTGATTGATTACGGGGTCAAAA-GTCAAATAC
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTA-TGATGTTGTGATTGATTA-GGGGTCAAAATG-CAAATAT
* * * *
387844 GCAAAAGTTTAAGGACTTGGATTGCAACGTTTGTTCCCTGAAATTTC-TATTTTAAGCTGAAACA
321 GCAAAAATTTAAGGACTTGG-TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA-TTT-AGCCGAAACA
* * *
387908 TGATCAACCA-TTTGGCAATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGTGAGGCTG
383 TGATCAACCATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TG
* *
387972 TTTACATAAGAAAATTCTTAGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
445 TTTGCATGAGAAAATTCTT-GTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
388013 GTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
388078 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
388143 ATTTAACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAGTAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
388208 AACTATTTCACCGAGCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCAATGACTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *
388273 TGGAGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * ** *
388338 AAATTTTAGGTCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACTTGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * ** *
388403 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGTG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATG
388468 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
388500 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTGGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
388565 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
388630 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAATTTACAGAAAA-AAAAAGCCATGCTCTATGG-CA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * *
388693 AAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGAT
195 AAA-GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
388758 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGCAAATACGC
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTA-TGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
388823 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTT-CATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAACATGAT
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * *
388886 CAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTAC
387 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGC
* *
388951 ATAAGAAAATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
388986 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
389051 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * * *
389116 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGATTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
389181 AGGT-TTTAGGCCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTT------T-A
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * *
389238 ATT-ATG--TTG---A--T-TTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
258 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
389294 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * **
389359 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCA
388 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCA
389424 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA-TTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
*
389457 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
*
389521 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** ** *
389586 ATTTAACAAGATTTGATAATTATAGGGACGAAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCT
131 ATTTAATGAGATTTGA-AATTATAGGGA-TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
* *
389651 AAAAGT-TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGAT-GTT---AG-T-A
194 AAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * *
389709 ATT-G-GA--TGA-TATCTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAAGGGGTCAAAACGCAAATATG
258 TTTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATT-AGGGGTCAAAATGCAAATATG
* *
389769 CAAAAATTT-AGGACTTGGATGCAGAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG-CGAAACATGAT
322 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * **
389832 CAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGCTGAGCTG-TTGC
387 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGC
* *
389896 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTTAAAATTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
389931 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * *
389996 TCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *
390061 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCA-GCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
390125 AGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
390177 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
390235 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * **
390300 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
*
390365 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAATTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
390398 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * *
390463 TCTGTTTGAAATTGATGAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *
390528 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
390593 AGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
390645 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* *
390703 AAAATTTTAGGACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATC
324 AAAATTTAAGGACTT-GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * **
390767 AACCATTGTGGCATGTTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGC
388 AACCATTTTGGCATG-TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGC
390832 ATGAGAAAATTCTTGT-AAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
390866 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
390931 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* **
390996 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
391061 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTTCAAGCTAATTG
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * *
391126 GGAGATTTGATTATCTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAATGCAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * *
391191 AATTTAATGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * * * * * * *
391255 CAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATAA
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATGA
* *
391320 GAAAATTCTTCTAAAAGCAGGTGAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
*
391351 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATG-TAGCTTGGTCGA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA-GATAGCTTGGTCGA
* *
391415 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGGTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* **
391480 TATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * * *
391545 AAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTGTGGATTGTTTCAAGCTAATT
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * * * **
391610 GGGAGATTTGATTATCTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACACAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * ** *
391675 AAATTTTAGGTCTTGGATGCAGCGTTTATTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * **
391740 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATG
* *
391805 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTTAAAATTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
391837 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * *
391902 TCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *
391967 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
392032 AGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
392084 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
392142 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * **
392207 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
*
392272 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAATTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
392305 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
392370 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *
392435 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
392500 AGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
392552 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* *
392610 AAAATTTTAGGACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATC
324 AAAATTTAAGGACTT-GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * **
392674 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCA
388 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCA
392739 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
392773 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
392838 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* ** *
392903 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAC
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
392968 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTTCAAGCTAATTG
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * *
393033 GGAGATTTGATTATCTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAATGCAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * *
393098 AATTTAATGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * * * * * * *
393162 CAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACATAA
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGCATGA
* * *
393227 GAAAATTCTTCTAACAGCAGGTGAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
*
393258 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATG-TAGCTTGGTCGA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA-GATAGCTTGGTCGA
* *
393322 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGGTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * * *
393387 TATTTAACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
130 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * *
393452 AAACTTTTTCACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGAT
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
393517 TTGGAGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * **
393582 AAAATTTTAGGTCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * ** *
393647 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
*
393712 GAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
** **
393745 TTGCATGTATTTGTACGGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGGAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
393810 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * *
393875 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
393940 AGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
393992 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
394050 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * *
394115 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTAAGCTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
*
394180 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *** * * * * *
394213 TTGCATGTATTCGTACCCCAATGCTGAATTGTTGGGTTGTAAATTATTTAGATAGCTTAGTTGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
394278 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
394343 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTACAGAAAA-GAAAAGCCATGCTCTATGG-CA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * * *
394406 AAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTCTGGATTGTTCCAAGCTGAT
195 AAA-GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
394471 TTGGTGATTTGATTATGTG-TTTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGTAAATACGC
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTA-TGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
394535 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAATATGAT
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * *
394599 CAACTAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTAC
387 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA--AAGTGTTTGC
*
394664 ATAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
394699 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * *
394764 TCTGTTTGAATTTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAAAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
394829 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* *
394894 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * * * *
394959 GGAGATTTCATAATCTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAACGCAAATATGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * * *
395024 AATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCGAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * * * * * *
395088 CAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATAAGGTGTTTACATAA
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGA-AA-GTGTTTGCATGA
395153 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * **
395184 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGACTTGCAAATCATTTAGGCAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
395249 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTAATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
395314 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGTAAAAATAAAAAGTCATGCTTTACGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * *
395379 AACTATTTGACCGCGCCTTGTAAAGGCTTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCGGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
** * * * *
395444 GGAAATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGCGGTCAAAACGCAAATACGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * * * * * *
395509 AGTTTTAGGGCTTGGATGCTACGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * ***
395574 CATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTCTGAGCTGTTTGCATGAG
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAAAG-TGTTTGCATGAG
*
395639 AAAATTCTTGTAAAAGCAGGTGAAATTTCA
455 AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
395669 TTACATGTATTTGTACCATGTTGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
395734 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTAATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
395799 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
395864 AGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTT------T-A-
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
**
395921 ------A-TT-A-T-T-TGTTTTTATGATGTTGTGATTGGCTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
395975 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * **
396040 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
396105 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
396138 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * * *
396203 TCTGTTTGATATTGATAAAGATGATAATGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
396268 ATTTAACGAGATTTGATATTACAAGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * ** * *
396333 AGGTATTAGACCGAGCCTCATAAAGGTCTTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--T
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGG-ATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
396386 T--T-A----ATTATGTGTTTTTACGATGTTGTGATTGGTTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
** * * * * *
396443 ATCTTTTAGGACTTGGATGCAAAATTTGTTCTATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * ** *
396508 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTATTTGCATG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATG
*
396573 AGAAAATTCTAGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
396605 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTCGTCAAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
396670 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATCATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
396735 ATTTAACGAGATTTGATATTGTAGGGATGAAATTGCAAAAAT-AAAATGTCATGCTTTATGGCCA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAA-GTCATGCTTTATGGCCA
* *
396799 AAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
195 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * *
396864 TGGAGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATACGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * * * * *
396929 AAGTTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTCTTCCCTGAAATTTCTTATTTAGTCAAAACATGATCAA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* ** *
396994 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTG-TCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGTTGAGCTGTTGGCAT
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
*
397058 GAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
397091 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCAAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
397156 TCTGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGATTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * *
397221 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
397286 AGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAGGGACCTTTTTTCTATGA--T-T---T--TT----G--GA--
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * *
397335 T-G-G-TTTAATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGAAAATATGCAA
260 TGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * * *
397397 AAATTTTAGGACTTGGATGCAATGTTTGTTCCGTGAAATTTCTTTTTTAGCCGAAACATGATCGA
325 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * **
397462 CCATTGTGGAATGTTTTTCTTGCCGAATTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATG
390 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATG
* *
397527 AGGAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
397559 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGTAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
397624 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
397689 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAATTTACAGAAAA-AAAAAGCCATGCTCTATGG-CA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
* * *
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195 AAA-GTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
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259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTA-TGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
397881 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAACATGAT
323 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * *
397945 CAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTAC
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* *
398010 ATAAGAAAATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
398045 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* *
398110 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATGAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
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131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * *
398240 AACTATTTGACTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * *
398305 GGAGATTTGATTATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATACGCAAA
261 GGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * * *
398370 AATTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAAC
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * ** * *
398435 CATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTATTGGCATGA
391 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCATGA
* *
398500 GAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGGAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
398531 TTGCATGTATTTCTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCCTTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
398596 TCTGTATGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** * * * *
398661 ATTTAACAAGATTTGATATTATAGGGATAAAATTTCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTAA
131 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
* * * *
398726 AGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G--
196 AAGTATTT-GACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
*
398778 TT--T-A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TTGGTGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * **
398836 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTTTTTAGCTAAAACATGATCA
324 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * **
398901 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGCTGAGCTGTTTGCAT
389 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTG-AAAG-TGTTTGCAT
* *
398966 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
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1 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
* * *
399064 TCTATTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * ** *
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* * * *
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* *
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399324 AATTTAAGGACTTGGTTGCA
326 AATTTAAGGACTTGGTTGCA
399344 GAAATATAAG
Statistics
Matches: 26909, Mismatches: 3261, Indels: 2132
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
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** * *
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* * *
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* *
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* ** * * * *
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*
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* * *
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* * ** * *
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*
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*
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
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258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * * * * * *
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322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * *
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387 ACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
369046 TGAGAAAATTCTTGTAAGAGTAGGTGAAATATCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * ** * * * *
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1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
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*
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*
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* *
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451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
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1 TTGCACGTATTTGTA-CCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGA
* * * * *
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65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * *
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130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* ** * * * *
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195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTT-TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
*
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259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAG-GGTCAAAATGCAAATATGC-A
* * * *
369877 AAAATTTGAGGACTTGGTTGCGATGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATTATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * *
369942 ACCATTTTAGCTTGTTTTTCTTACTGATTTGAAAGTT-AGTTAGATGCGTGATGAGGTGATTACG
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451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
370040 TTGCACGTATTTGTGCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCGTTTAGATAACTTAGTCAAA
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* * * * *
370105 TCTATTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTT
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* * *
370170 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGAAAAAATGAAAAGTCACGCTTGATGGCAAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * *
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196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAA-AGGATTTTTT-CCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* **
370299 TGGGGATTTGATTGTGTGCATTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * *
370364 AAAATTAAAGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCCGAAACATGAACAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * *
370429 CCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGATGCATGATGTGGTGTTTGCAAG
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
* * * *
370494 TGAAAATTCTTGAAAAAGTTGGTGAAATTTCG
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
370526 TTGCACCTATTTGTATCC-TGATGTTGATTTGTTGAGCTGCAAATCATTTAGAAAACTTGGTCGA
1 TTGCACGTATTTGTA-CCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGA
* * *
370590 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTGTGCTTATTTTTGCCTTGTTTTCCTGATTTATAAGT
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * *
370655 TATTTAATGAGGTTTGAAATTATAGGGATTAAAATG--AAAATGAAAAGTCAAGCTTTATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * *
370718 AAAGTTTTTGGTCGAGCCTTGTAAAGGATTTGTTTCCATAATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTT-TTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
370783 TGGGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGTGGT-GAAATGCAAATAT-CTA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAG-GGTCAAAATGCAAATATGC-A
* * * * * *
370846 AAAATTTGAGGACTTGGTTGCGATGTTTGTTCTATGAAATTTCTTATATAGCCGAAACATTATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * * * *
370911 ACCATTTTAGCTTGTTTTTCTTACTGACTTGAAAGTT-GTTTAAATGCGTGATGAGGTGATTACG
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAA-TTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
370975 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
371009 TTGCATGTATTTGTGCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTAGTCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * * * *
371074 TCTATTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCGTT-TTTTTTCCATGATTTCTTCATTTATAGGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* *
371138 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGAAAAAATGAAAAGTCACGCTTGATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * *
371203 AAAGTATTTGATTAAGCCTTGTAATGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGTTT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
371268 TGGGGATTTGATTATGTGCGTTTATGATGTTGTGATTGATTATGGGCCAAAATGCAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* *
371333 AAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTCA-TTAGCCGAAACACGATCA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * *
371397 ACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGACGCTTAATGGCCAAACGTATT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGAT-G----AGGTGTT
* * * * ** ** **
371462 TG-ATTAAGCCTTGTAATGGATTTTTTTTCCAAGATTTGTGGATGGTTTCA
447 TGCA-T--G---AG-AA---AATTCTTGTAAAAG-TAGGT-GA-AATTTCA
* *** * ** ** * * * *
371512 ---AACTGT-TTTGGGGATTTGATTATG-TGCGTT-TATGATGTTGTGAATGATTATGGGTCAAA
1 TTGCAC-GTATTT---G-TACCATGATGCTGAATTGT-TGA-GTTGCAAATCATT-TAGAT-AAC
* * * * ** * ** *
371571 AT-G-CAAATATG---CAAA-AAATTAAG--GAT-TTGGTTGCAAAGTTTGTT-CCATGAAATTT
57 TTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATT-G-TGCTTA-TTT-TTGCCTTG--ATTT
* * ** *** * ** *** * * *
371626 CTT-AATTAGCCGAA-ACACGAACAACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATT--AA
116 CTTGATTTA---TAAGTTATTTA-AA-GAGATT----TGAAATTATAG--GGATT-AAATTGCAA
* * * * * ** * ** * *
371687 TTTAGATG-CATGATGA-GGTGTT-T-G-CAAGAGAAAATTCTTAAAAAAG--TAGGTGAA--AT
169 ---AAATGAAAAG-TCACGCT-TTATGGCCAA-A-AGTA-T-TTGATCAAGCCT-TGTAAAGGAT
* * ** *** *** * *
371743 TTCATTACATGTATTTGTATCATGG-T----GCTGAATTGTTAAGATGCAAATCATTTAGATAGC
224 TT-TTTCCATG-ATTTGT-GGATGGTTCCAAGCTG-ATT-TGGGGAT-TTGATTATGT-G-T-G-
* * ** * ** ** ***
371803 TTGGT-TGA-GTT-TGTTTGAAATT--GAT-AAAGATG-ATGTTACGCTTATTTTTGCCTTGATT
279 TT--TATGATGTTGTGATTG--ATTAGGGTCAAA-ATGCA-AATATGCAAAAATTT--AAGGA--
* * * * * *** * *
371861 TCTTGATT-TATAAGGTAT-TT-AATGAGATTTGAAATTATAG-GGATTAA-ATTGCAAAAATGA
334 -CTTGGTTGCA-AA-GTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT-TAGCCGA--AACA-TG-----ATCA
* * ** * **
371921 ACGGTCATGCTTTATGGCCGAAAGTATTAGATCGAGCCT--TTTAAAGGACTTTTTTTCTAAGAT
387 AC---CA---TTT-TGG-C--ATGT-TT--TTCTTG-CTGATTTGAA--A--TTAATT-T-AGAT
** * ** * ** ** * * * *
371984 TTGTGGATG-GTTTGATTTTGTGTTTTTATG-ATGTTGCGATTG-ATTAG-GGGTCAAAATGCAA
432 GCGT-GATGAG---G-TGTT-TG-CATGA-GAAAATT-C--TTGTAAAAGTAGGTGAAATTTC--
372045 A
484 A
*** * * * * *
372046 TATGCAAAAATTT-TAGGACTTGAATGC-AAAGTTTGTTCCA--TG-AAATTTCTAATTTAGCTG
1 T-TGCACGTATTTGTA--CCATG-ATGCTGAA--TTGTT-GAGTTGCAAA--TC--ATTTAGAT-
* * * * ** * ***** * * ** *
372106 AAACATGATC--ATCCAGTGTGGCA-TGTTTTTCTTGACAATT-TGAAATTAATTCAGATGCATG
54 -AACTTGGTCGAAT-CTGTTTGAAATTGATAAAGATGA-TATTGTG--CTT-ATT--TTTGC--C
** * * * * ** * * * *
372167 TTGAGCTGTGTGCATGTGA-AAATTCTTGTAAAG-GTAGGTGAAATTTTATTGCATGT--ATT-T
109 TTGATTTCT-TG-AT-TTATAAGTTATT-TAAAGAG-ATTTGAAATTATA-GGGAT-TAAATTGC
*** * * ** * * * * *
372227 ATACCCTG--ATGTTGA-ATTGTTA-GGTTGC-AAATTATTTAGAT--AG-CTTGGT--CGAATC
167 A-AAAATGAAAAG-TCACGCT-TTATGG--CCAAAAGTATTT-GATCAAGCCTT-GTAAAGGATT
* * * * *** * ** ** * *
372282 TGTT---TGAAATTGATAAAGATGATAT-TGTGCTTATTT-TTGCCTTCATT-TCT-TGATTTAT
225 TTTTCCATG-ATTTG-T--GGATGGT-TCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTG-TTTAT
** * * * ** * *
372340 AAGCCAT-TTAACAAGACTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAA-A--AAAAAAAGTCATG-CT
284 --G--ATGTT---GTGA-TTG--A-T-TAGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACT
** * ** * *** ** * * **
372400 TTATGGCCAAA-ACTATT---TG--A--TCTAGCCTTA-CAAAAGAC-TGTTTTCCAGGATTTGT
336 TGGTTG-CAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT-TATTTAGCCGAA-ACATG--ATCAACCATTT-T
* * ** * * * * * * * * *
372455 GG-ATG-GTTCCAAGCTAATTTAGTGATTTGATTATGTGTTTTGTAAC-TGATTAGGGGTCAAAA
395 GGCATGTTTTTCTTGCTGATTT-G-AAATTAATT-T-AG--ATG---CGTGATGAGGTGT----T
* * * * *
372517 TCCAAATATGAAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCAAGAAATTTCTTA
447 TGC----ATGAGAAAA-TT-----CTT-G-T-AAAAG-TAGGT----GAAATTTC--A
* ** ** ** * * * *
372575 TTAGC-CGAAACATGATCAACCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTACTTTG-ATATTAATTTAGAT
1 TT-GCACG-TATTTG-T--ACCATGAT-GC-TG-AATTGTTG--A-GTTGCA-AATCATTTAGAT
* * * * * * *
372638 -GCGTGAT-GAGGTGTTTTCATGAGAAAATTCTTG-TAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTA
54 AACTTGGTCGA-ATCTGTT--T--G-AAA---TTGATAAA-G-A--TGATA-TT-G-TGC-T-TA
* * * * * * * * *
372700 TTTGTAT-CTTGATGCTGATTTGTTG-TGTTGTAAATCATTTAGATAGCTTGGTCG-AA-TCT--
101 TTT-T-TGC---CT--TGATTTCTTGAT-TTATAAGTTATTTAAAGAGATT--T-GAAATTATAG
* ** * * *** * *
372759 -GTTTGAAATTG-ATAAAGATGATATTGT---GCTTATTTTTGCCTTGA-TTTCTTGATTTATAA
155 GGATT-AAATTGCA-AAA-ATGA-AAAGTCACGC-T-TTATGGCCAAAAGTAT-TTGA--T-CAA
* * * *** * * ** * * ** **
372818 G-TTATTTAATGAGA--TTTGAAATTA-TAG-GGATAAAATTGCAA-CAAAGA-AAGGTCATGTT
210 GCCT-TGTAAAG-GATTTTTTCCATGATTTGTGGAT--GGTTCCAAGC--TGATTTGGGGAT-TT
**** * * * ** ***** * *** * * * ** *
372876 --TTATG-G-CCAAAAG-TATT-AGACCGAGCCCTGT--AAAGGACTTTTTTCTCCATGATTTAT
268 GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGTCAAAATG-CAAATAT-GCAAAAATTTAA
* * ** * **
372933 GGA--TGGTTTG-ATTATGTGTT-TT-TATGATGTTGTGATTGA-TTAGGGGTCAAATGCAAAT-
331 GGACTTGG-TTGCA--AAGT-TTGTTCCATGAAATT-T-CTT-ATTTAGCCG--AAA--C--ATG
* * **** ** * * *
372991 ATGCAA-AACTTTTAGGACTTG-GACGCAAAGTCTG-TTCCATAAAATTTCTTATTTAGCTGAAA
383 AT-CAACCA-TTTT-GG-CATGTTTTTC-TTG-CTGATT---TGAAA--T-TAATTTAGATG---
* * **** ****** *
373053 CATGATCAACCAATTTGGCATGTTTTTCTTGCGGATTTGAAATTAAGTTAGATGCGTGATGAGGT
433 CGTGAT-GAGGTGTTT-GCATGAGAAAATT-C----TTGTAA--AAG-T--A-G-GTGA--A---
*
373118 GTTTGCA
479 ATTT-CA
* * * * * * * * * *
373125 TGAGAAAGTTTTTGCA-AAAG-TAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAAT
1 T-TGCACGTATTTGTACCATGAT-GCTG-AA-TT-GTTG-A-G---TTG---CA-AAT-C---A-
* * * * * *
373188 TGTTGAGTTACAAATCATT--TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATAT
47 T-TT-AG--A-TAA-C-TTGGTCGA-ATC-TGTTTGAA----ATTG--A-T---AAAGATGATAT
* * *
373251 TGTGCTTATTTTTCCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGA
93 TGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGA
* * ** * *
373316 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAACGTATTTGATCTTGCCTGGTAAAAGA
158 TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA
* *
373381 CTTTTTTCCATGACTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTAGGGATTT-A--A----T-TTTATG-T
223 -TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGAT
* * * * * *
373437 TTTG-GAACTAATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAAGG-TTTCGTTGCAAAGTT
287 GTTGTG-ATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTT-AAGGACTTGGTTGCAAAGTT
* * * * *
373500 TGTTCCATGAAATTCCTTACTTGGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGGTTTTCTTGCTAA
349 TGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGA
* * * * *
373565 TTTCAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAA
414 TTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAA
373630 CA-TTCA
479 -ATTTCA
* * ** * * * * *
373636 TTGCATGTAATTGTATTATGATAC-GGATTATTGAGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
373700 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTTCTTGATTTTTAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
373765 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC--AAATGAAAATTCATGCTTTATGGCCCA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
** * * *
373828 AAGTATTTGGCCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCAGTAATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCA-TGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *
373893 TGCGGATTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTGGGTGTGAAAATGCAAATAT-CTA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG-GTCAAAATGCAAATATGC-A
* * *
373957 AAAATTTAAGGACTTGGTTGTAGAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * ** *
374022 ACCATTTCGGCTTGTTTTTCTTATTGATTTGAAAGTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
374087 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
** * *
374120 TTGCATATATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGCTGCAAATCATTTAGATAGCCTT-GTCGA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATA-ACTTGGTCGA
* * * *
374184 ATGTGTTTGAAACT-AGTATAGATGATATTGTGCTTATTTTTACCTTGATTT-TTCGATTTATAA
65 ATCTGTTTGAAATTGA-TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTT-GATTTATAA
* * * *
374247 GTTATTTAATGAGATTTGAAATTGTAGGGATTAAATTGCAAAAAAG-AAAGTCATGCTTTATGGC
128 GTTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGC
* * * *
374311 CAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTCTTCCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
193 CAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTT-TTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * * * * * *
374376 TTTGGTGATTTAATTATGTGTTTTTTTTATGTTGTGATTGATTATAGGACAAAATACAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
374441 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGGAACATTATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * *
374506 AACCATTTTAGCATGTTTTTCTTACTGGTTTGAAAATAATTTAAATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
374571 TTTCA-AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCG
451 --TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
374606 TTGCATGTATTTGCACCATGATGCTGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGACAGCTTGGTCGAT
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * * * *
374671 TCTATTTGAAGA-TGATATAGGTTATATTGTGCTTATTTTTGCCCTGATTTCTTAATTTATAAGT
66 TCTGTTTGAA-ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* *
374735 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* *
374800 AAAGTATTTGCTCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAGCTGAT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
374865 TTGGTGATTAGATTATATGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTATTGGTCAAAATGCAAATATGCA
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * * *
374930 AAAATTTAAAGACTTGCTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTTTTATTTAGCTGAAACGTTATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * *
374995 ACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTACTGAATTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTCTGCAA
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* *
375060 GAAAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAGATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * * * * *
375093 TTGCATGCACTCGTATCATGGTGCTAAACTGTTGAGTTGCAAATCATGTAGATACCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
375158 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTTTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
375223 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCAAGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
375288 AGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-TT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
375342 T----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* *
375399 AAATTTTAGGACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCA
323 AAATTTAAGGACTT-GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * *
375463 ACCATTTTGGCATATTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGACG-GGTGGTTGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
375527 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
375560 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTTG-AAATCATTTGGATAGCTTGGTCGA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAG-TTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGA
* * * * *
375624 ATCTGTTTGAAATTGATATAA-ATAATATTGTGCCTATTTTTGCCTTCATTTCTTCATTTATAGG
65 ATCTGTTTGAAATTGATA-AAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG
* * * *
375688 CTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCC
129 TTATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCC
* *
375753 AAAAGTAGTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAACTGAT
194 AAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
375818 TTAGGGATTTGATTATGAGAGTTTATGATGTTGTGATTGATTATCGGTCAAAATGCAAATATGCA
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * *
375883 AAAAATTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTCCATGAAATTTGTTAATTT-GCCGATACATGATC
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTT-ATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * * * *
375947 AACTATTTTGGCTTGTTTTTCTAGCTAACTTGAAATTAATTTACATGCATGATGAGGTTTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* * * *
376012 AGAGAAAATTCTTGAAAAAGTTGGTGAAATTTCG
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
376046 TTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * * * * *
376111 TCTGTTTGAAATTGA-GAA-AT-ATGTTGTGCTCAGTTTTGCCCTGATTTCATGATTTATAACTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
376173 ATTTAATGAGATTTGAAATTGTAGGGGTTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGTTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* *
376238 AAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TGA
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA----TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
376297 -TT----A--TG--TA--T-T-TTTACGGTGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * ** *
376349 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTCTTTAGTAGAAACGTGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * * * *
376414 AACCATTGTGACATCTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGTTGAGATGTTTTCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
376479 TGAGAAAATTCTTGCAAAAGTAGGTGAAATTTTA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
** * * * * * * *
376513 TTGCATTTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGCGTTGTAAATTATTTAGATAGCTTGGCCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * * *
376578 TCTATTTAAAATTGATAAAGATGATATTGAGCTTATTTTTGCCTTTATTTTTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * **
376643 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAATTGAAAAGTCGTGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * * *
376708 AACTATTTGACCGAGCCTTGAAAATGATTTTTTTCCATGATTTGAGGATGGTTCCAGGCTGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* *
376773 GGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGAAAATATGCAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * **
376837 AAATTTAAAGACTTGGTTGCAATGTTTGTTCCATGAAATATCATATTTAGTTGAAACATGATCAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * *
376902 CCAATTTGGCATGTTTTCCTTGCAGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
*
376967 AGAAAATCCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* *
376999 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
377064 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGATTATCTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * ** *
377129 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAAATGC--AAATGAAAAGTCATTCTTTATGGCTAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
** * * *
377192 AAGTATTTGGCCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTTCCATAATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *
377257 TGGGGATTTGATTATGCGTTTTTATGATGTTGTCATTGATTAGGGGTGAAAATGCAAATAT-CTA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC-A
* *
377321 AAAATTTAAGAACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATAA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * ** * * *
377386 ACCATTTTGGCTTATTTTTCTTAATGATTGGAAAGTAATTTAGATGCGTGGTGAGGTGTTTGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
377451 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * *
377484 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGTTGAATTGTTGAGTTTCAAATCATTTAGATAGCTTTGTCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
377549 TCTGTTTGAAACTAATATAGATGATATTGTGCTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGC-TTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * *
377614 TATTTAATGTGATTTGAAATTATAGCGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * *
377679 AAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTT------TGA-T
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
*
377737 T----A--TG----TGT-T-TTTATGATGTTGTGAATGATTAGGGGTCAAAAT-CAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * * * * *
377789 AAATTTTAGGACTTAGATGAAAAGTTTGTTCCAAGAAATTTCTAATTTAGCTGAAACATGATCAT
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
** * * * * *
377854 CCATTGTT-GCATGTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTATTTTAGATGCGTGTTGAGCTGTTCGCTT
388 CCATT-TTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * *
377918 GTGAAAATTCTTTTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
377951 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCACATTATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
378016 TCTGTTTGAAATTAATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
378081 ATTTAATGAGATTTGAAATTACAGGGATTAAATTGCAAAAGTCAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * *
378146 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGAATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGG-ATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* *
378211 GGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATTATGTTGTGATTGATTAGGTGTCAAAATGCAAATATGCAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGG-GTCAAAATGCAAATATGCAA
* * *
378275 AAATTTAAGGACTTGGTAGCAAAGTTTATTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * * *
378340 CCATTTTAGCGA-GGTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATATACATGTGTGATGAGGTGTTTGCAT
388 CCATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
*
378404 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCG
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
378437 TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
378502 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTG-C-------CTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
378559 ATTTAATGACATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTGTGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * * *
378624 AAGTGTTTGA-CTGAGCCTTGTGAAGTATTTTTTTTCATGATTTGTGGATGGCTCCGAGCTGATT
196 AAGTATTTGATC-AAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * * * *
378688 TGGTGATTTAATAATGTATTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATACAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
*** * *
378753 AAATTTAAGGACTTACATGCAAAGTTTGTTCCATGAAA-TTCATTATTTGGCCGAAACATTATCA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGATCA
*
378817 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAA
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
*
378882 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGAGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
378915 TTGCATGTATTTGTGCCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTAGTCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
378980 TCTGTTTGAAATTGATATAGATGATATTGTGCATATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAGGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
*
379045 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGAAAAAATGAAAAGTCACG-TTTGATGGCCA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTT-ATGGCCA
* * * * * *
379109 AAACTATTTGATCAGGCCTTGTAATGGATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCTAAACTAAT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * * *
379174 TTAGGGATTTGATTTTGTGCGTTTATGATTTTGTGATTGGTTATGGGTCAAAATGAAAATATGCA
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
379239 AAGAA-TTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTAATTAGCGGAAACATGATC
322 AA-AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * *
379303 AACCATTTTAGCCTGTTTTTCTTGCTGAATTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
379368 AGAGAAAATTCTTGAAAAAGTAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * ** * * *
379402 TTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGTTAAAATGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTTGAG
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
379467 TTTGTTTGAAATTGATAAAGATGATGTTATGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
379532 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTACATTGCAAAAATGAAAGGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * *
379597 AAGTATTAGATCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCAAGA-TT-T-G-T-G----AA-C-----
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
379647 ---GG-TTTGATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTGGGGCTCAAAATGCAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGG-TCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * *
379708 AAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTAATTTAGCTGAAACATGATCAT
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * ** * * * *
379773 CTAGTGTGGCATTTTTTTCCAGC-CAATTGAAATTAATTTAGATGCGTGTTGAGCTGTTTGCATG
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
* *
379837 TGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * *
379869 TTACATGTATTTGTACCTTGATGCTGAATTGTTGGGTTGCAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGTA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
379934 TCCGTTTGAAATCGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
379999 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * *
380064 AAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTCCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * *
380129 AGTGATTTGATTA--TGTG----T--T-TTGTAACTGATTAGGTGTCAAAATCCAAATATGCAAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG-GTCAAAATGCAAATATGCAAA
* * * *
380185 AATTTAAGGAGTTGGTTGCGAAGTTTGTTCCGTGAAATTTCTTATTTA-CCTGAAACATTATCAA
324 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCC-GAAACATGATCAA
* * * *
380249 CCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTCAAATTAATTTTGATGCGTGATGACGTGTTTGCATG
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
* *
380314 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTCG
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
380346 TTACACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGAAAATCATTTAGATAGCATGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
380411 TCTATTTGAAGTTGATAAAGATGATATTGTGCTTCTTTTTGCCTTGATTTCTTGA-TTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAG-T
* *
380475 T-TTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
380539 AAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAAGACTTTTTTCGAGGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAATT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *** *
380604 TAGAGATTTGATTA--TGTGTTT-CG-T-AACT-A-T--TTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * *
380660 AAATTTAAGAACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATAAAATTTTTTATTTCGCTGAAACATGATCAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * *
380725 CCATTTTAGCGA-GTTTTTCTTGCTGTTTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
388 CCATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
380789 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
380822 TTGCATGTATATGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATAATTTAGATAGCTTGCTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
380887 TCTGTTTGAAATTGATACAGATGATATTGTG-TCTATTTTTGCCTTGATTTCTTCATTTATAAGT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCT-TATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * *
380951 TTTTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGGTTAAATTGCAAATATGAAATGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * *
381016 AAAGTATTTGATCTAGCCTTGCAAAAGACCTTTTT-CTTGGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTAAT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCAT-GATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
381080 TTAGTGATTTGATTA--TGTG----T--T-TTGTAACTGATTAGTGGTCAAAATCCAAATATGCA
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAG-GGTCAAAATGCAAATATGCA
381136 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA-TTAGCCGAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * *
381200 ACCATTTTAGG-ATGTTTTTCTTGCTGCTTTGATATTAATTTAGATGTGTGATGAGGTGTTTGCT
387 ACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
381264 TGAGAAAATTCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCG
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
381298 TTGCATGTATTTGTATCAAGATGCTGATTTGTTGTGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
381363 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
381428 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGAATTAAATTGCAAAGATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
381493 AAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCGAGGCTAATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * * *
381558 GGTGATTTAATGATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGTGGTCAAAATACAAATATGTAAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAG-GGTCAAAATGCAAATATGCAAA
* ** ** *
381623 AATTTCAGGACTTGCCTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAATGTTATCAAC
324 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * **
381688 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTTAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTATTTGCCGGA
389 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGA
*
381753 GAAAATTCTTGTAAACGTAGGTGAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* ** * * *
381784 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTAATGAGTGGCAAATCATTTAGATAGCTTAGT-GAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCG-A
* * * * * *
381848 ATCTGTTTGAAATTGATAGAGATGATATTATGCGTATTTTTGCCTTGATTACTTCATTTATAGGT
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * *
381913 TATTTAAAAAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGTAAAAATGAAAAGTCATGCTTGATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * *
381978 AAAGGATTCGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTATGGATGGTTCCGAGTTGATT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
382043 TGGGGATTTGATTATGTCAT-TTTATGATGTTGGGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TGGGGATTTGATTATGT-GTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * *
382107 AAAAATTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCACGAAATTTCTTTTTTAGCCAAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * *
382172 ACCATTTTAGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGATATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCTT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* **
382237 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTTG
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * ** *
382270 TTGCATGTATTTGTATCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGTTTAGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
382335 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTGTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
*** * * ** * *
382400 ATTTTTTGAGATTGGAAATTGTAGGGATTAAA-TGCAAAAATGAAAAGTCACAATTAATAGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
** * * * *
382464 AAGTATTTGGCCGAGCCTTATAAAGGATTTTTTTTCGTGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * *
382529 GGTGATTCGATTATGTGT-TTTAATGATGTTATGATTGATTACGGGGTGAAAATGCAAATAT-CT
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA--GGGTCAAAATGCAAATATGC-
** * * **
382592 AAACTTTTAAGGACATGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTACTTATTTAGCTAAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * *
382657 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCCTGTTGAGCTGCTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
382722 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * * *
382756 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAGTTGTTGGGTTGCAAATTATTTGGATAGCTTGGTCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
382821 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTTATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
382886 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGCAAAAAAGAAAAGTCATGCTCTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
382951 AACTATTTGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTTTCCATGATTTGTGGTTTGTTCCAAGCTGAT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA---TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
383016 TTGGTGATTTGATTAT-TTTTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATACGC
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
383080 AAAAATTTAAGG-CTTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCGGAAACATGAT
321 AAAAATTTAAGGAC-TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * *
383144 CAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTTTTTAC
385 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
*
383209 ATAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * *
383244 TTGCATGTCTTTGTATCATGAAGCAGAATTGTTGAGCTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * * *
383309 TCTATTTGAAATTGATAAAGAGGATATTTTACTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
383374 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTAGGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * *
383439 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGATGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * *
383504 GGAGATTTGATTATGTG-GTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATAAGCAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * *
383568 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAATTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * * * * *
383633 CCA-ATTGGCAAGTTTTTCTTGTTCATTTGAAATTAATTTTGATGCATGATGAGGTGTTTACATA
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
*
383697 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTCAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
383729 TTGCATTGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGA
1 TTGCA-CGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGA
* * *
383794 ATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCATGATTTCTTGATTTATAAGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * *
383859 TATTTAACGAGAATTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * * *
383924 AAGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTTTTTTC-T-A-----GGAT--TT--GAG--GA--
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * * **
383974 T--AG-TTTAATTATGT-T-TTT-TTATGATGCCATT-AGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGA-TTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * *
384032 AAAATTTTAGGACCTGGATGCAACGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * *
384097 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
*
384162 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
384195 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAACTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
384260 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
384325 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGC-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
384389 AGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACTTCTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-TT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TT-TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *
384443 T----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGCGATTGGTTAGGGGTAAAAATGCAAATATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * *
384500 AAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTTCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * *
384565 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTACTTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCATG
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
384630 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
384662 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
384727 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
384792 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * *
384856 AAGGCT-TTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGA-TT-T-G-TGG-----A--TGA
195 AAAG-TATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
384909 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
384966 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* ** ** * * *
385031 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCAATTTGAAATTAATTTAGATTTGTGCTAAGCTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
385096 TGAGAAAATTCTTGT-AAAGTAGGTGAAATTTTA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * * *
385129 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGCTGTAAATTATTTAGATAGCTTGGTTGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
385194 TCTATTTGAAATTGATAAAGATAATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
385259 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTACAGAAAA-GAAAAGCCATGC-TTATGG-CA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * **
385321 AAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATATTTTTCCATGATTTGTGGATTATTCCAAGCTGAT
195 AAA-GTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * **
385386 TTGGTGATTTGATTATGTG-ATTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAATGCAAAAACAC
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
385450 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAACATGAT
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * * *
385514 CAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTAAAATTAATTTTGATGTGTGATGAGGTGTTTAC
385 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
*
385579 ATAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
385614 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
385679 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
385744 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAAGGATAAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
385808 AAGGTATTAGACCAAGCCTCGTAAAGGACTTCTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-T
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TT-TTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* *
385862 TT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
385919 AAAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * *
385984 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGAAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
386049 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
386082 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAACTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
386147 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* ** *
386212 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
386277 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCACGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTAATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * **
386342 GGAGATTTGATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAGCGCAAATATGCAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGGG-TCAAAATGCAAATATGCAA
* * *
386406 AAATTTGAA-GACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCAAGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCA
323 AAATTT-AAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * *
386469 ACCATTTTGGCAAGTTTTTCTTACAT-ATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACA
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGC-TGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
386533 TAAGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
386567 GTGCATGTATTTGTACCATGATGATAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
386632 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * * *
386697 ATTTAACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAGTAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
386762 AACTATTTCACCGAGCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCAATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * *
386827 TGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACGCAAATATGCA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* ** * ** *
386891 AAAATTTTAGCTCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACTTGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * *
386956 ACCATTATGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAACTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
387021 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
387054 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTGGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
387119 TCTGTTTGAAATTGATAAATATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
387184 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGATTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* ** * * *
387248 AAGGT-TTTAGGCCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
387301 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
387358 AAAAATTTTAGGACTTGGGTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * *
387423 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGAA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
387488 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
387522 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTGACTTCGTCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
387587 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
387652 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAATGTCATGCTTTATGGCCA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAA-GTCACGCTTTATGGCCA
* * * *
387717 AAACTATTTGACCGAG-CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
387781 TGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATTGATGTTGTGATTGATTACGGGGTCAAAA-GTCAAATAC
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-A-TGATGTTGTGATTGATTA--GGGTCAAAATG-CAAATAT
* * * *
387844 GCAAAAGTTTAAGGACTTGGATTGCAACGTTTGTTCCCTGAAATTTC-TATTTTAAGCTGAAACA
319 GCAAAAATTTAAGGACTTGG-TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA-TTT-AGCCGAAACA
*
387908 TGATCAACCA-TTTGGCAATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTG-TGAGGCT
381 TGATCAACCATTTTGGC-ATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGG-T
* *
387971 GTTTACATAAGAAAATTCTTAGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
444 GTTTGCATGAGAAAATTCTT-GTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
388013 GTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
388078 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * * *
388143 ATTTAACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAGTAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * * *
388208 AACTATTTCACCGAGCCTTGTAAAAGATTTTTTTCCAATGACTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * *
388273 TGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACGCAAATATGCA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * ** *
388337 AAAATTTTAGGTCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACTTGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * *
388402 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCGT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
388467 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
388500 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTGGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
388565 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * * * *
388630 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAATTTACAGAAAA-AAAAAGCCATGCTCTATGG-CA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
388693 AAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGAT
195 AAA-GTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * *
388758 TTGGTGATTTGATTATGTGT-TTTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGCAAATACG
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-A-TGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATG
* *
388822 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTT-CATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAACATGA
320 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGA
* * * *
388885 TCAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTA
384 TCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
* *
388950 CATAAGAAAATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
449 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
388986 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
389051 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
389116 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGATTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* ** * * * *
389180 AAGGT-TTTAGGCCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTT-TAA--T-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA---TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTG
* *
389240 -TAT---G--TTG---AT-T-T-TTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATG
256 ATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATG
* * *
389293 CAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
320 CAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * *
389358 CAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGC
385 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
389423 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAA-TTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
389457 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCT-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
389521 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** *
389586 ATTTAACA-AGATTTGATAATTATAGGGACGAAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGC
131 ATTTAA-AGAGATTTGA-AATTATAGGGA-TTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGC
* * * *
389650 TAAAAGT-TTTGACCGAGCCTTGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGAT-GTT---AG-T-
193 CAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTG
* * *
389708 AATT--GGA--TGA-TATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAAGGGGTCAAAACGCAAATA
256 ATTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATT-A-GGGTCAAAATGCAAATA
* *
389767 TGCAAAAATTT-AGGACTTGGATGCAGAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG-CGAAACATG
318 TGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATG
* * * * *
389830 ATCAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGCTGAGCTG-TT
383 ATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTT
* *
389894 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTTAAAATTCA
448 GCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
389931 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATTATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
389996 TCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
390061 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCA-GCTTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
390124 AAGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
390177 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
390234 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * *
390299 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
390364 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAATTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
390398 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
390463 TCTGTTTGAAATTGATGAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
390528 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
390592 AAGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
390645 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
390702 AAAAATTTTAGGACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGAT
321 AAAAATTTAAGGACTT-GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * *
390766 CAACCATTGTGGCATGTTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTG
385 CAACCATTTTGGCATG-TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTG
390831 CATGAGAAAATTCTTGT-AAAGTAGGTGAAATTTCA
449 CATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
390866 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
390931 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* ** *
390996 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
391061 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTTCAAGCT-AATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
*
391125 GGGAGATTTGATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAATGCAAATATGCA
260 GGG-GATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGGG-TCAAAATGCAAATATGCA
* * *
391189 AAAATTTAATGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * *
391253 ACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * *
391318 AAGAAAATTCTTCTAAAAGCAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
391351 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATG-TAGCTTGGTCGA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA-GATAACTTGGTCGA
* *
391415 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGGTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* ** *
391480 TATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * * *
391545 AAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCGTGATTTGTGGATTGTTTCAAGCT-AAT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * **
391609 TGGGAGATTTGATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATAAGGGGTCAAAACACAAATATGC
259 TGGG-GATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * ** *
391673 AAAAATTTTAGGTCTTGGATGCAGCGTTTATTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * *
391738 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
391803 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTTAAAATTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
391837 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
391902 TCTGTTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
391967 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
392031 AAGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
392084 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
392141 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * *
392206 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
392271 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAAATTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
392305 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
392370 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
392435 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
392499 AAGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
392552 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
392609 AAAAATTTTAGGACTTAGG-TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGAT
321 AAAAATTTAAGGACTT-GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * *
392673 CAACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGC
385 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
392738 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
392773 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
392838 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATCTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* ** * *
392903 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGACGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAC
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
392968 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTTCAAGCT-AATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
*
393032 GGGAGATTTGATTATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAATGCAAATATGCA
260 GGG-GATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGGG-TCAAAATGCAAATATGCA
* * *
393096 AAAATTTAATGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * * *
393160 ACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTACAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * * *
393225 AAGAAAATTCTTCTAACAGCAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *
393258 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATG-TAGCTTGGTCGA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA-GATAACTTGGTCGA
* *
393322 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGGTATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * *
393387 TATTTAACGAGGTTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * *
393452 AAACTTTTTCACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCAATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGAT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCC-ATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* *
393517 TTGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGC
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * **
393581 AAAAATTTTAGGTCTTGGATGCAGCGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * *
393646 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCG
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
393711 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* ** ** *
393745 TTGCATGTATTTGTACGGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGGAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
393810 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGAGTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
393875 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
393939 AAGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
393992 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
394049 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * *
394114 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTAAGCTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
394179 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * *** * * * * * *
394213 TTGCATGTATTCGTACCCCAATGCTGAATTGTTGGGTTGTAAATTATTTAGATAGCTTAGTTGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
394278 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
394343 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTACAGAAAA-GAAAAGCCATGCTCTATGG-CA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * *
394406 AAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTCTGGATTGTTCCAAGCTGAT
195 AAA-GTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * * *
394471 TTGGTGATTTGATTATGTGT-TTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGTAAATACGC
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * *
394535 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAATATGAT
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * * *
394599 CAACTAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTAC
385 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
*
394664 ATAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
394699 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
394764 TCTGTTTGAATTTGATAAAGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTAAAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
394829 ATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * *
394894 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * * * *
394959 GGAGATTTCATAATCTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGTTCAAAACGCAAATATGCAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGGG-TCAAAATGCAAATATGCAA
* * * *
395023 AAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTG-TCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCGA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * * * * * *
395087 CCAATTTGGCAAGTTTTTCTTACAGATTTGAAACTAATTTTGATGCGTGATAAGGTGTTTACATA
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
395152 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * ** *
395184 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGACTTGCAAATCATTTAGGCAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
395249 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTAATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * * *
395314 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGTAAAAATAAAAAGTCATGCTTTACGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * ** * * *
395379 AACTATTTGACCGCGCCTTGTAAAGGCTTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCGGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGG-ATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
** * *
395444 GGAAATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGCGGTCAAAACGCAAATACGCAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTAG-GGTCAAAATGCAAATATGCAA
* * * * * * *
395508 AAGTTTTAGGGCTTGGATGCTACGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCAAAACATGATCAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * *
395573 CCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGT-CTGAGCTGTTTGCATG
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
*
395637 AGAAAATTCTTGTAAAAGCAGGTGAAATTTCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
395669 TTACATGTATTTGTACCATGTTGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
395734 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTAATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * *
395799 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
395864 AGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTTCTATGATTTGTGGATGGTT------T-A-
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA---TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
**
395921 ------A-TT-ATT-TGT-T-TTTATGATGTTGTGATTGGCTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
395975 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * *
396040 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
396105 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
396138 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGTTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
396203 TCTGTTTGATATTGATAAAGATGATAATGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * *
396268 ATTTAACGAGATTTGATATTACAAGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * ** * *
396333 AGGTATTAGACCGAGCCTCATAAAGGTCTTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-TT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGG--ATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * *
396387 T----A----ATTATGTGTTTTTACGATGTTGTGATTGGTTAGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGTCAAAATGCAAATATGCAAA
** * * * * *
396444 TCTTTTAGGACTTGGATGCAAAATTTGTTCTATGAAATTTCCTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
324 AATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAAC
* * * * *
396509 CATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTATTTGCATGA
389 CATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGA
*
396574 GAAAATTCTAGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
454 GAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
396605 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTCGTCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
396670 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATCATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
396735 ATTTAACGAGATTTGATATTGTAGGGATGAAATTGCAAAAAT-AAAATGTCATGCTTTATGGCCA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAA-GTCACGCTTTATGGCCA
* * * *
396799 AAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
396864 TGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATACGCA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * * * * *
396928 AAAGTTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTCTTCCCTGAAATTTCTTATTTAGTCAAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * *
396993 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTG-TCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGTTGAGCTGTTGGCA
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCT-GATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
397057 TGAGAAAATTCTTATAAAAGTAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
397091 TTGCATGTATTTGTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCAAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
397156 TCTGTTTGAAATTGAGAAAGATGATATTGTGATTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * *
397221 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * * * *
397285 AAGGTATTAGACCGAGCCTCGTAAGGGACCTTTTTTCTATGA--T-T---T--TT----G--GA-
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
397335 -T--GG-TTTAATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGAAAATATGCA
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * * * *
397396 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAATGTTTGTTCCGTGAAATTTCTTTTTTAGCCGAAACATGATCG
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * *
397461 ACCATTGTGGAATGTTTTTCTTGCCGAATTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTGTTTGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* *
397526 GAGGAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTTA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
397559 TTGCATGTATTTGTACCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGTAAATTATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
397624 TCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * * * *
397689 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAAGGATTAATTTACAGAAAA-AAAAAGCCATGCTCTATGG-CA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCA-AAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
397752 AAAGGTATTAGACCGAGCTTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGAT
195 AAA-GTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGAT
* * * *
397817 TTGGTGATTTGATTATGTGT-TTCATTGATGTTGTGATTGATTACGGGTCAAAACGCAAATACGC
258 TTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTA-TGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* *
397881 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATT-TTAAGCTGAAACATGAT
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTC-TTATTTAGCCGAAACATGAT
* * * *
397945 CAACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGATGCGTGATGAGGTGTTTAC
385 CAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGC
* *
398010 ATAAGAAAATTTTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
398045 TTGCATGTATTTGTACCATGATGCTAAATTGTTGAATTGCAAATCATTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
398110 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATGAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
398175 ATTTAACGAGATTTGATATTATAGGGATGAAATTGCAAAAATAAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * *
398240 AACTATTTGA-CTGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGATC-AAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * *
398304 TGGAGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATACGCA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * * *
398368 AAAATTTTAGGACTTGGATGCAACGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* * * * * *
398433 ACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGCTGAGCTATTGGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* *
398498 GAGAAAATTCTTGTAAAAATAGGTGGAATTTCA
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * *
398531 TTGCATGTATTTCTACCGTGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCCTTTAGGTAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
398596 TCTGTATGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAGTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
398661 ATTTAACA-AGATTTGATATTATAGGGATAAAATTTCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCTA
131 ATTTAA-AGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
* * * * *
398725 AAGGT-TTTAGACCGAGCCTCGTAAAGGACCTTTTTTCTATGATTTGTGGA----T----G--G-
195 AAAGTATTT-GATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* *
398778 TTT----A----ATTATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGGTTAGGGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGC
* * * **
398835 AAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTTTTTAGCTAAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * *
398900 AACCATTGTGGCATGTTTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGTGTGCTGAGCTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* *
398965 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATTTTA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * * *
398999 TTGCATGTATTTGTGCCCTGATGCTGAATTGTTGGGTTGTAAATTATTTAAATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
399064 TCTATTTGAAATTGACAAAGATGATATTGTGTTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * ** * *
399129 ATTTAATGAGATTTGAAGTTATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
399194 AACTATTTGACCGAGCTTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* *
399259 GGTGATTTGATTATGTGT-TTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAA
260 GGGGATTTGATTATGTGTGTTT-ATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
** ** ** * * *
399323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAGAAATATAAGGATTAAATTGCCAAAAAAAGTCATGCTCTATGGC
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGC------A-AA-G-TT-TGTT-CCATGAAATTTC-T--TATTTAGC
* * * ** * * ** * *
399388 CAAAACTATTTGATCGAGCC-TTGT-AAAGGATTTTT-TTCCATGATTTGTGGATT-GTTCCA-A
374 CGAAAC-A--TGATC-AACCATTTTGGCATG-TTTTTCTTGC-TGATTTG-AAATTAATT-TAGA
** * ** * ** * * ***
399448 -GC-TGATTTGGTGATTTG-ATTATATGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGCCAAAACGC
431 TGCGTGATGAGGTG-TTTGCA-T-GA-G--AAAAT--TCTTGT-A-AAAGTAGGTG--AAATTTC
399510 AAA
484 --A
* *** * * * * ** * *
399513 TATGGAAAAATTTAAGGA-CTTGGTTGC-AAAGTTTGTT-CCTTG-AACTTTCATATTTAGCTGA
1 T-TGCACGTATTT--GTACCAT-GATGCTGAA--TTGTTGAGTTGCAA--ATC--ATTTAGAT--
* * * ** * ** *** * *** * * *
399574 AACATGATC-AACCAATTTGGCAAGTTTTTCTTGCTGAT-TTGAAATTAATTTTG-ATAAGTGAG
54 AACTTGGTCGAATCTGTTT-G-AAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT---TGAT
**** * ** * * *
399636 GAGGTG-TTTACGTAAGAAAATTCTTATAAA-AGTAGGTGAAATT-TCATTGCATGT-ATTTGTA
114 TTCTTGATTTA--TAAG----TTATT-TAAAGAG-ATTTGAAATTAT-A-GGGAT-TAAATTG--
* ** * * * * * * * * *
399697 CCATGATGCAGAA-T--TG-TTGAGTTG-CAACTCATTTAGATAGCTTGGTCGAA-TCTGTTTGA
166 CAAAAATG-AAAAGTCACGCTTTA-TGGCCAA---A---AG-TA-TTTGATC-AAGCCT-TGTAA
* **** * ** * *** * *
399756 A--ATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCC---TTGATTTCCTGATTT-A-TAAGCTAT
219 AGGATT-TTTTCCATGAT-TTGTG--GATGGTT-CCAAGCTGATTTGGGGATTTGATTATG-TGT
* * ** * * * * * * * **
399814 -TTAACGA-GATTCGAAATT-A-TAGGGATGAAATTGCAAAAAAG--AAAA-GTCATG-CTTTAT
278 GTTTATGATG-TT-GTGATTGATTAGGG-TCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
* * ** * * *
399871 GGCCAAAAGTATTTGATCTGTCCTTGTAAAAGTCTT-TTCT--CCATGATTTCTAGATGGTTCCA
340 TG-C-AAAG--TTTG---T-TCCATG-AAATTTCTTATT-TAGCC--GA----AACAT-GAT-CA
* * * * * * * * * ** ** *
399933 AGCTGATTTAGTG-AT-TTGATT-GTG-TGTTTTGTAACTAA-TTAG--GGGTCAAAATCTAAAT
387 A-C-CATTTTG-GCATGTT-TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGT--GT
** * * ** * *
399991 AGGCA-AAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTGCATGAAATTTCTTA
446 TTGCATGAGA---AAATTCTT-G-T-AAAAG-TAG--G--TGAAATTTC--A
* ** ** ** * * * *
400042 TTTAGC-CGAAACATGATCAGCCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTG-ATATTAATTTAGA
1 -TT-GCACG-TATTTG-T-A-CCATGAT-GC-TG-AATTGTTG-AG--TTGCA-AATCATTTAGA
* * * ** *
400105 T-GCGTGAT-G-AGGTGTTTGCATGAGAAAGTTCTTG-TAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATG
53 TAACTTGGTCGAATCTG-TT---T--GAAA----TTGATAAA-G-A--TGATA-TT-G-TGC-T-
* * * ** * * * *
400166 TATTTGTAT-CATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATG-GCTTGGTCG-AATCTA
99 TATTT-T-TGC---CT--TGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTA-AAGAGATT--T-GAAAT-TA
** * ** * ** * ** *
400228 T-TTGA--AATTTATAAAGATGATATTGTGCTAATCTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTA
152 TAGGGATTAAATTGCAAAAATGA-AAAGT-C--A-C---G-CTTTATGGC--CA---A-AAG-TA
* * ** * * * * * **
400290 TTTAAT-GAGATTTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGG--CC
201 TTTGATCAAGCCTTGTAA----A-GGATT--TTTTC--CA-TG---A-T-TTG-TGGATGGTTCC
* ** * * * * *
400352 AAAACT-ATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTAT-TTTTTTTCCATGAT-TTGTG---GA-T-GGTTG
250 -AAGCTGATTTG---G-GGATT-T-GATTATGTGTGTTT--ATGATGTTGTGATTGATTAGGGT-
** * *** * * ** *
400409 C--AA-GCTGATTTG--GTGATTT---GA-TT--TTG---TG-TT-TT-AATGATGTTGTGATTA
305 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATT-T-CTTA
* * ** * * * * ** *
400457 ATTAGGCGTCAAA-ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG-GTTGCAAAGTTTG-TTCCATG
368 TTTAGCCG--AAACATG-----AT-CAACCATTT-TGG-CATGTTTTTC-TTG-CTGATT---TG
* * * **** ***
400519 AAATATCATATTTAGCTGAAACCTGATCAACCAATTTGGCA--AG-CTTTTCTTGCT--AA-T--
418 AAAT-T-A-ATTTAGATG---CGTGAT-GAGGTGTTT-GCATGAGAAAATTCTTG-TAAAAGTAG
* * *
400576 -TTAAAATTAA
474 GTGAAATTTCA
* ** * * * * * * *
400586 TT-TA-G-ATGCGTA--ATGA-GGTG-GTTGCATGA---GAAAATTCATGTA-A-AAGTAGGT-G
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTG-TTGAGTTGCAAA-TCATTTAGATAACTTGGTCG
* ** * ** * * ** *** **
400638 AAATTTCATTG-CA-TG-TATTCG-T-ATCATGGTGCTGAATTGGTAAGTTGCAAATC---ATTT
64 -AATCTGTTTGAAATTGATA-AAGATGAT-ATTGTGCT-TATTTTTGCCTTG-ATTTCTTGATTT
** * *** ** * * ***** **** * ** *
400695 AGGT-AGCTTGGTTGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTAT-TTTTGCCTTGA
124 A--TAAG-TTATTTAAAGAGATTTGAAATT-ATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGC
* *** * * * ** * * * * * **
400758 TTTCTTGATTTATAAGGTATTTAAT-GAGATTTAAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAA
185 TTT-ATG-GCCA-AAAGTATTTGATCAAGCCTT----GTA-AAGGATT--TTTTC---CATGATT
* * * * * * * ** * * * *
400822 AGT-CATGCTTTAAGGCCAAAACT-CTTAGACCGAGCCTTG-TAAAGGACTTTTTTTCCATGAT-
237 TGTGGATG-GTT----CC-AAGCTGATTTG---GGGATTTGAT-TATG--TGTGTTT--ATGATG
* * **** * * *
400883 TTGTG---GA-T--GGT----ATG-ATTATCTGC-GTGTTTATAATG-CTGTGATTG-ATTAG--
288 TTGTGATTGATTAGGGTCAAAATGCA-AATATGCAAAAATT-TAAGGACT-TGGTTGCA-AAGTT
* * * * ** * ** *
400932 GGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAG--G--ACTTGGATGCAA--AGTTTGTTCCATGAA
349 TGTTC--CATG-AAAT-TTC--TTA-TTTAGCCGAAACAT-GAT-CAACCA-TTT-TGGCATG-T
* * * * * * ** * * * ** * **
400991 ATTTCTTGTTTG-GTCGAAACGTGATCAACCATTTTCG-GCTG-TCTTTCTTGCCGATTTG-AAA
402 TTTTCTTG-CTGATTTGAAA-TTAATTTA-GA--TGCGTGATGAGGTGT-TTG-C-ATGAGAAAA
* ** * *
401052 TTAATT-TAGATGCGT-GTTGAGCTATTTGCA
459 TT-CTTGTA-A-AAGTAGGTGA--AATTT-CA
* * ** * * * * *** * * *
401082 TGAGAAAAT-TCTTGTA-AAAGTTGGTGAAATT-TT-AG-TGCTTGT-A-TTCGA-ATCATGGTG
1 T-TGCACGTAT-TTGTACCATGATGCTG-AATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGT-
* * *** ** *** * *
401139 CTGAGT-TG-TTG-AGTTGCA-AACCCTTTAGATACCTTG-GTCGAATCTGTTTAAAATTAATAA
62 C-GAATCTGTTTGAAATTG-ATAA--AGAT-GATA--TTGTG-CTTAT-T-TTT-GCCTTGAT-T
*** * ** * * **
401199 AGATGATATTGT--GCTTATTT-TTGCCTTGATTTCTTG-ATTTATAAGTTATTAATGAGATTTG
115 TCTTGAT-TTATAAG-TTATTTAAAG---AGA--T-TTGAAATTAT-AGGGATT-A--A-A-TTG
* * * * *** * *
401260 -AAATTATATG--GATTAAATTGCGAAAATGAAAAGTCATGCTTTATCGCCAAAAGTATTTGACC
166 CAAA--A-ATGAAAAGT-CA-CGCTTTAT-----------G-------GCCAAAAGTATTTGATC
* * * * *
401322 GAGCCTTGTAAAGTATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAGCTAATTTGGTGATTT-AGTT
208 AAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGGGATTTGA-TT
* *
401386 ATGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAGGACT
272 ATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACT
* ** * * **
401451 TGCTCACATAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTAAAACATGATCAACCATTTTGGCATG
336 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATG
* *
401516 TTTTTCTTGCTGATTTGAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGT
401 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGT
*
401581 AAAAGTAGATGAAATTTCA
466 AAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
401600 CTGCATGTATTTGTACAATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCTAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
401665 TCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTAATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * * * *
401730 ATTTAAGGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGTAAAAATGAAATGTCATGCCTTATCGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * *
401795 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAAGATTTTTTCCATGATTTTTGGATGGTTCCAAACTGATTTG
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTG
* * * * *
401860 GTGATTAGATTATGTGTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTATGAGTCAAAATGAAAATATGCAAAA
261 GGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAAAA
* *
401925 ATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATCTAGCCGAAACATGATCAACC
325 ATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACC
* * * * * * * *
401990 ATTTTGGCATATTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTCGCTTAAG
390 ATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAG
* *
402055 AAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATATCA
455 AAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
402085 TTGCATGTAATTGTATCATGATG-TCGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGA
* * * *
402149 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATG--ATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTAATTTATATGC
65 ATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT
* * * * * *
402212 TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTTCAAGAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCCG
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCA
*
402277 AAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGA----TCCAAGCTGATT
195 AAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* * * *
402338 TAGTGATTTGA-T-TGTGTTTTTATGATGTTGT-ATTTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGA-TTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
*
402400 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATAA
322 AAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCA
* **
402465 ACCAATTTAACATGTTTTTCTTGCTGATTTG------A---A-ATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
387 ACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAT
* * *
402520 GAGAAAGTTCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCG
452 GAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* ** * **
402553 TTGCATGTATTTGTGTCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATGGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
402618 TCTATTTGAAATTTATAAAGATGATATTGTGCTAATCTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
402683 ATTTAATGAGATCTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * *
402748 AACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTGCAAGCTGATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA--TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATT
* *
402813 TGGTGATTTGA-TAT-TGTGTTTTAATGATGTTGTGATTAATTAGGCGTCAAAATGCAAATATGC
259 TGGGGATTTGATTATGTGTG-TTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGG-GTCAAAATGCAAATATGC
* * * *
402876 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATATCATATTTAGCTGAAACCTGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
*
402941 AACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
*
403006 AGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * * *
403040 TTGCATGTATTCGTA-TATGCTGCTGAATTGTTGAGTTACAAATGATTTAGATAGCTTGGTTGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
*
403104 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGACTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* *
403169 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * * *
403234 AACTATTTGACCGAGCTTTGTAAATGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTT
* * *
403299 -GGTATTTTGATTATGTGCT-TTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCA
260 GGGGA-TTTGATTATGTG-TGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCA
* * *
403362 AAAATTTAA-GAGCTTGGTTACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATC
322 AAAATTTAAGGA-CTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * * * *
403426 AACAAATTTAGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATG-TTACGGTGTTTGA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGA-GGTGTTTGC
*
403490 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTAAAATTTCA
450 ATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * *
403525 TTGCATGTATTTGTACCATAATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * *
403590 TCTGTTTGAAAATGATAATGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
* * * * *
403655 ATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAACGAAAAGTCATGCTTT-TGGCCTA
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCCAA
* * * * ** *
403719 AACTATTTGACCGAGCCTTGTCAAGGATTTTTTTTAATGATTTGTGGATGGTTTCGAA-CTGATT
196 AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGG-TTCCAAGCTGATT
* * * *
403783 TGGTGATTAGATTATGTGTGTTTGTGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAACATGCAA
259 TGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTA-GGGTCAAAATGCAAATATGCAA
* *
403848 AAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGTCGAAACATGATCAA
323 AAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAA
* * * * *
403913 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGCGTTTGCATG
388 CCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATG
*
403978 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
453 AGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * * * * * *
404010 TTGCATGTAATTATATCA-AATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATATAGCTTTGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* * * *
404074 TTTGTTTGAATTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTCGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCT
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
** *
404139 ATTTAACTAGATTTGAAATTATAGGG-TTGAAATTG-AGAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCC
131 ATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATT-AAATTGCA-AAAATGAAAAGTCACGCTTTATGGCC
* * * *
404202 AAAAGT-TAGTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTTGATGGTTCCAAGCTAA
194 AAAAGTAT-TTGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGA
* * * * * *
404266 TTTAGTGATTTGATTATGCGTTTTTATGATGCTGTAATTGATTAGCGGTCAAAATGCAAATATGC
257 TTTGGGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAG-GGTCAAAATGCAAATATGC
* *
404331 AAAAATTTTAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATTAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
321 AAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATC
* * * *
404396 AACCATTTTTGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCA
386 AACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCA
* * *
404461 TGGGAATATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCA
451 TGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
* * * * *
404495 TTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAA
1 TTGCACGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAA
* *
404560 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCTTGATTTCTTGATTTGTAA-TC
66 TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGT-
* * *
404624 TATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG-AAAAATTAAAAAGTCATGCTTTATGGCC
130 TATTTAAAGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA-TGAAAAGTCACGCTTTATGGCC
*
404688 AAAAGT-TTATGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATGTTGT
194 AAAAGTATT-TGATCAAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTCCATGAT-TTGT
404736 AATTGATTAG
Statistics
Matches: 30816, Mismatches: 4170, Indels: 3283
0.81 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
464 98 0.00
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TCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTT
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AAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAGGATTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTG
GGGATTTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAA
TTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCA
TTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGA
AAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCA
Found at i:399486 original size:197 final size:198
Alignment explanation
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399138 GATTTGAAGT
*
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*
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*
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194 AGAAA
* *
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1 TATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGT
*
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*
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TATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGT
AAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATATGTTTT
AATGATGTTGTGATTGATTAGGGGCCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAG
AAA
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* *
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* *
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* *
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453 ATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGA-TTATGT
* * * *
401390 GTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAGGACTTGCT
1 GTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
** * * *
401455 CACATAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
66 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* *
401520 TCTTGCTGATTTGAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
131 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* *
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196 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATC-ATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * * *
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260 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* * * *
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* * * * * *
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390 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
* *
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455 GGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* * * *
401875 GTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTATGAGTCAAAATGAAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
1 GTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
* * *
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66 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * * *
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131 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGC-AAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * *
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195 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
*
402133 TAGATAACTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATG--ATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
259 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
* * * * * *
402196 TTCCTAATTTATATGCTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTTCAAGAATGAAAAG
324 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAG
* * * *
402261 TCATGCCTTATGGCCGAAAGTATTTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGA
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*
402326 ----TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGA-T-TGT
454 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* * *
402353 GTTTTTATGATGTTGT-ATTTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
1 GTGTTTAAGATGTTGTGA-TTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGG
* * * **
402417 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATAAACCAATTTAACATGTTT
65 TTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * *
402482 TTCTTGCTGATTTG------A---A-ATGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAGTTCTTGTAAA
130 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * *
402537 GGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTGTCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTT
195 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * * *
402602 AGATGGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTTATAAAGATGATATTGTGCTAATCTTTGCCTTGATT
260 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
* * *
402667 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATCTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGT
325 TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGT
* *
402732 CATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTTCCATGATTTGTGGA
390 CATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGA
*
402797 TGGTTGCAAGCTGATTTGGTGATTTGA-TAT-T
454 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* *
402828 GTGTTTTAATGATGTTGTGATTAATTAGGCGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
1 GTG-TTTAA-GATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
* * * *
402893 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATATCATATTTAGCTGAAACCTGATCAACCATTTTGGCCTGTT
64 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTT
*
402958 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAA
129 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAA
* * * *
403023 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTAT-ATGCTGCTGAATTGTTGAGTTACAAATGATT
194 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
*
403087 TAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
259 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
*
403152 TTCTTGACTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAG
324 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAG
* * * *
403217 TCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCTTTGTAAATGATTTTTTTCCATGATTTATGGA
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403282 TGGTTCCAAGCTGATTTGGT-ATTTTGATTATGT
454 TGGTTCCAAGCTGATTTGGTGA-TTTGATTATGT
* *
403315 G-CTTTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA-GAGCTTG
1 GTGTTTAA-GATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-CTTG
* * * * *
403378 GTTACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACAAATTTAGCATGTT
64 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTT
*
403443 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATG-TTACGGTGTTTG-AATGAGAAAATTCTTGT
129 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGA-GGTGTTTGCAA-GAGAAAATTCTTGT
* * * *
403506 AAAAGTAGGTAAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATAATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATCA
192 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
* * *
403571 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAAATGATAATGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
257 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
* *
403636 ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAACGAAA
322 ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAA
* * * **
403701 AGTCATGCTTT-TGGCCTAAACTATTTGACCGAGCCTTGTCAAGGATTTTTTTTAATGATTTGTG
387 AGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTG
* *
403765 GATGGTTTCGAA-CTGATTTGGTGATTAGATTATGT
452 GATGG-TTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
** * * *
403800 GTGTTTGTGATGTTGTGATTGATTATGGGTCAAAATGCAAACATGCAAAAATTTAAGGATTTGGT
1 GTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
403865 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAG-TCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
66 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCT-GAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTT
* * * * *
403929 TTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGCGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAA
130 TTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAA
* * * * *
403994 AGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTATATCA-AATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
195 AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
* * * * *
404058 ATATAGCTTTGTCGAATTTGTTTGAATTTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTCGCCTTGATT
260 AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
*
404123 TCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGATTTGAAATTATAGGG-TTGAAATTG-AGAAAATGAAA
325 TCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTTGAAATTATAGGGATT-AAATTGCA-AAAATGAAA
* * *
404185 AGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT-TAGTGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGT
387 AGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTAT-TTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGT
* * * *
404249 TGATGGTTCCAAGCTAATTTAGTGATTTGATTATGC
451 GGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
* * * * * *
404285 GTTTTTATGATGCTGTAATTGATTAGCGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGT
1 GTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
* * *
404350 TGCAAAGTTTGTTCCATTAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTTGCATGTTTT
66 TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
* * * * *
404415 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATTAAGAGGTGTTTGCATGGGAATATTCTTGTAAAA
131 TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
* * *
404480 GTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
196 GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
*
404545 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCTTGATTT
261 GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
* * *
404610 CTTGATTTGTAA-TCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTG-AAAAATTAAAAAG
326 CTTGATTTATAAGT-TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAA-TGAAAAG
* *
404673 TCATGCTTTATGGCCAAAAGT-TTATGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATGTTGT
389 TCATGCTTTATGGCCAAAAGTATT-TGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT-TTGT
404736 AATTGATTAG
Statistics
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0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.40
Consensus pattern (486 bp):
GTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
TGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCTGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTT
TCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAA
GTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTA
GATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTT
CTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTC
ATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATG
GTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
Found at i:404040 original size:970 final size:970
Alignment explanation
Indices: 399344--404735 Score: 7182
Period size: 970 Copynumber: 5.6 Consensus size: 970
399334 CTTGGTTGCA
* * * *
399344 GAAA-TATAAGGATTAAATTGC-CAAA--AAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGATCGA
1 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
*
399405 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTAT
66 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTAT
* * * *
399470 ATGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGCCAAAACGCAAATATGGAAAAATTTAAGGACTTG
131 GTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
* * *
399535 GTTGCAAAGTTTGTTCCTTGAACTTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCAAGTT
196 GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTT
* * * * * *
399600 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTTGAT-AAGTGAGGAGGTGTTT-ACGTAAGAAAATTCTTAT
261 TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCA-TG-TGAGGTGTTTGA-ATGAGAAAATTCTTGT
* *
399663 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCAGAATTGTTGAGTTGCAACTCA
323 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
399728 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
388 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
* * * * * * *
399793 ATTTCCTGATTTATAAGCTATTTAACGAGATTCGAAATTATAGGGATGAAATTGCAAAAAAGAAA
453 ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAA
* * * * * *
399858 AGTCATGCTTTATGGCCAAAAGTATTTGATCTG-TCCTTGTAAAAG-TCTTTTCTCCATGATTTC
518 AGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGA-CCGAGCCTTGTAAAGGAT-TTTTTTCCATGATTTG
* * * * * *
399921 TAGATGG-TTCCAAGCTGATTTAGTGATTTGA-T-TGTGTG----T--T-TTGTAACTAATTAGG
581 TGGATGGTTTCGAA-CTGATTTGGTGA-TTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGG
* * * *
399976 GGTCAAAAT-CTAAATAGGCAAAAATTTAAAGACTTGGTTGCAAAGTTTGCTGCATGAAATTTCT
644 GGTCAAAATGC-AAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCT
* * * *
400040 TATTTAGCCGAAACATGATCAGCCATTTTAGCATGTTTTTCTTGCTGCTTTGATATTAATTTAGA
708 TATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGA
* * * * *
400105 TGCGTGATGAGGTGTTTGCATGAGAAAGTTCTTGTAAAGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATT
773 TGCGTTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAAT
* * * *
400170 TGTATCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATGGCTTGGTCGAATCTATTTGAAA
838 TATATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAA
* * *
400235 TTTATAAAGATGATATTGTGCTAATCTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGA
903 TTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGA
400300 TTT
968 TTT
* *
400303 GAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
1 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
* * *
400368 GCCTTGTAAAGTATTTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTGCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTT
66 GCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTA
* *
400433 TGTGTTTTAATGATGTTGTGATTAATTAGGCGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
130 TGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * * *
400498 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATATCATATTTAGCTGAAACCTGATCAACCAATTTGGCAAGC
195 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGT
* * * * * * *
400563 TTTTCTTGCTAATTTAAAATTAATTTAGATGCGTAATGAGGTGGTTGCATGAGAAAATTCATGTA
260 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCAT-GTGAGGTGTTTGAATGAGAAAATTCTTGTA
* * * * *
400628 AAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTCGTATCATGGTGCTGAATTGGTAAGTTGCAAATCAT
324 AAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCAT
* * *
400693 TTAGGTAGCTTGGTTGAATCTATTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGA
389 TTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGA
* *
400758 TTTCTTGATTTATAAGGTATTTAATGAGATTTAAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAA
454 TTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAA
* * *
400823 GTCATGCTTTAAGGCCAAAACTCTTAGACCGAGCCTTGTAAAGGACTTTTTTTCCATGATTTGTG
519 GTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTG
* * * *
400888 GAT-G----G---T-A-----TGATT-A-TCTGCGTGTTTATAATGCTGTGATTGATTAGGGGTC
583 GATGGTTTCGAACTGATTTGGTGATTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTC
* * *
400937 AAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGACTTGGATGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTGTTT
648 AAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTT
* * * * *
401002 GGTCGAAACGTGATCAACCATTTTCGGC-TGTCTTTCTTGCCGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
713 AGCCGAAACATGATCAACCATTTT-GGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
* * * * * *
401066 TGT-TGAGCTATTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTTGGTGAAATTTTAGTGCTTGT-ATTCG
777 T-TATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT--
* * * * * *
401129 A-ATCATGGTGCTGAGTTGTTGAGTTGCAAACCCTTTAGATACCTTGGTCGAATCTGTTTAAAAT
839 ATATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAAT
*
401193 TAATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTA-TTAATGAGAT
904 TGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGAT
401257 TT
969 TT
* * * *
401259 GAAATTATATGGATTAAATTGCGAAAATGAAAAGTCATGCTTTATCGCCAAAAGTATTTGACCGA
1 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
* * *
401324 GCCTTGTAAAGTA-TTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTTCAAGCTAATTTGGTGATTT-AGTTA
66 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGA-TTA
* *
401387 TGTGTTTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGAAAAAATTTAAGGACTT
130 TGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* ** * * *
401452 GCTCACATAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTAAAACATGATCAACCATTTTGGCATGT
195 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGT
* *
401517 TTTTCTTGCTGATTTGAAAATAATTTAGATGCGTGATGAGGTGTTTGCAA-GAGAAAATTCTTGT
260 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATG-TGAGGTGTTTG-AATGAGAAAATTCTTGT
* * *
401581 AAAAGTAGATGAAATTTCACTGCATGTATTTGTACAATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
323 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
* * * * *
401646 TTTAGATAACTTGGTCTAATCTGTTTGAAATTGATAATGATGATATTGTGCGTATTTTTGCCTTA
388 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
* * **
401711 ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAAGGAGATTTGAAATTATAAGGATTAAATTGTAAAAATGAAA
453 ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAA
* * * * * * * *
401776 TGTCATGCCTTATCGCCAAAAGTATTTGATCAAGCCTTGTAAAAGA-TTTTTTCCATGATTTTTG
518 AGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTG
* * * * *
401840 GATGGTTCCAAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTAAGATGTTGTGATTGATTATGAGT
583 GATGGTTTCGAACTGATTTGGTGATT-GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGT
* * *
401905 CAAAATGAAAATATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATC
647 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
* * *
401970 TAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATATTTTTCTTGCTAATTTGAAATTAATTTAGATGCA
712 TAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
* * * * * * *
402035 TTAAGAGGTGTTCGCTTAAGAAAATTCTTGTAAAAGTAAGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTA
777 TTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTATA
* *
402100 TCATGATG-TCGAATTATTGAGTTGCAAATCATTTAGATAACTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
842 TCATGATGCT-GAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTG
* * * *
402164 ATAAAGATG--ATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCCTAATTTATATGCTATTTAATGAGATTT
906 ATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
* * * * * * *
402227 GAAATTATAGGGATTAAATTTCAAGAATGAAAAGTCATGCCTTATGGCCGAAAGTATTTGATCTA
1 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
*
402292 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGA----TCCAAGCTGATTTAGTGATTTGA-T-T
66 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTAT
* *
402351 GTGTTTTTATGATGTTGT-ATTTGATTAGGGGTCAAAATCCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
131 GTGTTTTAATGATGTTGTGA-TTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTT
* * * **
402415 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATAAACCAATTTAACATGT
195 GGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGT
** * *
402480 TTTTCTTGCTGATTTG--A--AA-TGCG-TG-A--TGAGGTGTTTGCATGAGAAAGTTCTTGTAA
260 TTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTGAGGTGTTTGAATGAGAAAATTCTTGTAA
* * ** *
402536 AGGTAGGTGAAATTTCGTTGCATGTATTTGTGTCATGATGCTGATTTGTTGAGTTGCAAATCATT
325 AAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATT
* * * * *
402601 TAGATGGCTTGGTCGAATCTATTTGAAATTTATAAAGATGATATTGTGCTAATCTTTGCCTTGAT
390 TAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGAT
* * * *
402666 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATCTGAAATTTTAGGGATTAAATTGCAAAAGTGAAAAG
455 TTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAG
*
402731 TCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGTATTTTTTTTCCATGATTTGTGG
520 TCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGA-TTTTTTTCCATGATTTGTGG
* * *
402796 ATGGTTGC-AAGCTGATTTGGTGATTTGA-TAT-TGTGTTTTAATGATGTTGTGATTAATTAGGC
584 ATGGTTTCGAA-CTGATTTGGTGA-TTGATTATGTGTG-TTT-ATGATGTTGTGATTGATTAGGG
* *
402858 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATATCATA
645 GTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTA
* * *
402923 TTTAGCTGAAACCTGATCAACCATTTTGGCCTGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
710 TTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATG
* *
402988 CGTGATGAGGTGTTTGCAAGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGT-ATTC
775 CGTTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATT-
* * * * *
403052 GTAT-ATGCTGCTGAATTGTTGAGTTACAAATGATTTAGATAGCTTGGTTGAATCTGTTTGAAAT
839 ATATCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAAT
*
403116 TGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGACTTATAAGTTATTTAATGAGAT
904 TGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGAT
403181 TT
969 TT
403183 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
1 GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
* * *
403248 GCTTTGTAAATGATTTTTTTCCATGATTTATGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGT-ATTTTGATTA
66 GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGA-TTTGATTA
* *
403312 TGTGCTTTAATGATGTTATGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAA-GAGCT
130 TGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGA-CT
* * *
403376 TGGTTACAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACAAATTTAGCATG
194 TGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATG
*
403441 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTTACGGTGTTTGAATGAGAAAATTCTTGT
259 TTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTGA-GGTGTTTGAATGAGAAAATTCTTGT
* * *
403506 AAAAGTAGGTAAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATAATGCTGAATTGTTGAGTTACAAATCA
323 AAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCA
* * *
403571 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAAATGATAATGACGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
388 TTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTG
*
403636 ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAACGAAA
453 ATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAA
* * **
403701 AGTCATGCTTT-TGGCCTAAACTATTTGACCGAGCCTTGTCAAGGATTTTTTTTAATGATTTGTG
518 AGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTG
* *
403765 GATGGTTTCGAACTGATTTGGTGATTAGATTATGTGTGTTTGTGATGTTGTGATTGATTATGGGT
583 GATGGTTTCGAACTGATTTGGTGATT-GATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGT
* *
403830 CAAAATGCAAACATGCAAAAATTTAAGGATTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
647 CAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATT
* * *
403895 TAGTCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGTTGATTTGAAATTAATTTAGATGCA
712 TAGCCGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCG
* * *
403960 TTAAGAGGCGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTATA
777 TTATGAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTATA
* * * * * *
404025 TCA-AATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTATATAGCTTTGTCGAATTTGTTTGAATTTGA
842 TCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGA
* *
404089 TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTCGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGCTATTTAACT-AGATTT
907 TAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAA-TGAGATTT
* * *
404153 GAAATTATAGGG-TTGAAATTG-AGAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT-TAGTGAT
1 GAAATTATAGGGATT-AAATTGCA-AAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTAT-TTGAC
* * * *
404215 CTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTTGATGGTTCCAAGCTAATTTAGTGATTTGAT
63 CGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGAT
* * * * * *
404280 TATGCGTTTTTATGATGCTGTAATTGATTAGCGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTTAGGAC
128 TATGTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGAC
* * * * *
404345 TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATTAAATTTCTTATTTAGCCGAAACATGATCAACCATTTTTGCAT
193 TTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCAT
* * *
404410 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCAT-TAAGAGGTGTTTGCATGGGAATATTCTT
258 GTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGT--GAGGTGTTTGAATGAGAAAATTCTT
* * * *
404474 GTAAAAGTAGGTGAAATATCATTGCATGTAATTGTATCATGATGCCGAATTGTTGAGTTGCAAAT
321 GTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAAT
*
404539 CATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGTCT
386 CATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCT
* * *
404604 TGATTTCTTGATTTGTAA-TCTATTTAACGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTGA-AAAATT
451 TGATTTCTTGATTTATAAGT-TATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATT-ACAAAAAT
* * * *
404667 AAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAAGT-TTATGATCTAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT
514 GAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATT-TGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGAT
404731 GTTGT
578 -TTGT
404736 AATTGATTAG
Statistics
Matches: 3877, Mismatches: 454, Indels: 191
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
949 2 0.00
950 7 0.00
951 3 0.00
952 21 0.01
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ACGTcount: A:0.30, C:0.10, G:0.20, T:0.39
Consensus pattern (970 bp):
GAAATTATAGGGATTAAATTGCAAAAATGAAAAGTCATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGA
GCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATGGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTAT
GTGTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTG
GTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCATATTTAGCTGAAACATGATCAACCAATTTGGCATGTT
TTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCATGTGAGGTGTTTGAATGAGAAAATTCTTGTAAA
AGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTATTTGTACCATGATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTT
AGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAAGATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATT
TCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTTGAAATTATAGGGATTAAATTACAAAAATGAAAAGT
CATGCTTTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGCCTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGAT
GGTTTCGAACTGATTTGGTGATTGATTATGTGTGTTTATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAA
ATGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGTTGCAAAGTTTGTTCCATGAAATTTCTTATTTAGC
CGAAACATGATCAACCATTTTGGCATGTTTTTCTTGCTGATTTGAAATTAATTTAGATGCGTTAT
GAGGTGTTTGCATGAGAAAATTCTTGTAAAAGTAGGTGAAATTTCATTGCATGTAATTATATCAT
GATGCTGAATTGTTGAGTTGCAAATCATTTAGATAGCTTGGTCGAATCTGTTTGAAATTGATAAA
GATGATATTGTGCTTATTTTTGCCTTGATTTCTTGATTTATAAGTTATTTAATGAGATTT
Found at i:406306 original size:197 final size:199
Alignment explanation
Indices: 405964--406355 Score: 707
Period size: 197 Copynumber: 2.0 Consensus size: 199
405954 AATGAGATTT
405964 GAAATAATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGC
1 GAAATAATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGC
* * *
406029 TTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCTGATTTGGTGATTTGATTATGT
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*
406094 GTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGGACTTGGT
131 GTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGGT
406159 AGCA
196 AGCA
*
406163 GAAAT-ATAAGGATTAAATTGC-CAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGC
1 GAAATAATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGC
*
406226 CTTGTAAAGGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCGGATTTGGTGATTTGATTATAT
66 CTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCGGATTTGGTGATTTGATTATAT
*
406291 GTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGGAAAAATTTAAGAACTTGGT
131 GTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGGT
406356 TGCAAAGTTT
Statistics
Matches: 186, Mismatches: 7, Indels: 2
0.95 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
197 165 0.89
198 16 0.09
199 5 0.03
ACGTcount: A:0.33, C:0.11, G:0.21, T:0.35
Consensus pattern (199 bp):
GAAATAATAAGGATTAAATTGCAAAAAAAAAGTCATGCTCTATGGCCAAAACTATTTGACCGAGC
CTTGTAAAAGATTTTTTTCCATGATTTGTGGATTGTTCCAAGCGGATTTGGTGATTTGATTATAT
GTTTTAATGATGTTGTGATTGATTAGGGGTCAAAACGCAAATATGCAAAAATTTAAGAACTTGGT
AGCA
Done.