Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
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* * * * * * * *
191 TCCCTTTTTACCATTACAAACTGCCAAGACCA-CATTTCTCGCTCCGTCATCCC-TGTGGGCCCA
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* * * * *
254 TATCTCA-GGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGCTTTAGTTTTTTTTCAGTTAATAA
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* * * * * *
318 GGCTTTTCAAAATTTTTTTCAAAAATTATGTGACACGTCAACCCAAATACAACGAGATT--AAAA
321 GGCTTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAA
* * *
381 -AAAAATT-AAAAGATGAGGTGCAACACGAGAACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACT
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* * *
444 CTTGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGAGATCCTGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG
451 CTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG
* * *
509 CACCCATCCCCTTTTGCCATAAAAAACTACAAATACCATCCTTTGTCGCTCTGTCTCCCTTGTGG
516 CACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGG
* * *
574 GCCCGTGTCTCACGGGTTTATATTTTAGTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTCTTCAGGTA
581 GCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTT-TTCAGTTA
639 ATAAGGC-TTTC
645 ATAAGGCTTTTC
* *
650 TAAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTGAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
715 TAAAAAGATAGGGTGCAACATGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* *
780 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTACATTAGTGCTGTTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * *
845 CCTCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCCTATGGGCCCAT
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCCAT
* *
909 GTCTCACGGGTTTATGTTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAATAAGG
259 GTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-CAGTTAATAAGG
* * * *
974 CTTTTTGAATTTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCTAAATCCAACGAGGTTAAAAAATG
323 CTTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATA
* * * *
1039 AAAATTAAAAAGATGGGGTGTAGCACGAAGACTTCCCATGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
388 AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
* * **
1104 C-CCCAAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGAGTATTAGTGCTGGTATGATTAC
453 CGCCC-AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGC
* *
1168 A-CCATCCCCTTTTGCCATAACAAAATACAAATACCATCCTTTTTCGCTCTGTCACCCTTGTGGG
517 ACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGG
* *
1232 CCCATGTCTCACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAAT
582 CCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAAT
1297 AAGGCTTTTC
647 AAGGCTTTTC
* * * * * * *
1307 GAAATTTTTTTC-AAACATTATATGACACGTCAA-TCAAATACAACGAGATTAAAAAA-AAAAAA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
1369 TAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGT-CACCCATCCTAGTACTACTCTCGCC
* *
1434 CAAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATGGGATCCACTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
129 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
* *
1499 TCCCCTTTTG-CAGTAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCTTATGGGCCC
194 TCCCCTTTTGCCA-TAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCC
* * * *
1562 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCTGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAGTAAG
257 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAG
* *
1627 GGTTTTTGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT
322 GCTTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT
* *
1692 GAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC
387 AAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC
* * *
1757 TCGCCCAAGCACGCTTAACTGTGAAGTTCTGATGGGATCCGGTGTATTAGTGCTGGTATGATCGC
452 TCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGC
* * * * *
1822 ACCAATCCCTTTTTGCCATCACAAACTGCAAATACCATCATTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGG
517 ACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGG
** *
1887 CCTTTGTCTCCCGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCA-TCTGATTCGGTTTTTT-AGTTAA
582 CCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGT-TGATTCGGTTTTTTCAGTTAA
1950 TAAGGCTTTTC
646 TAAGGCTTTTC
* * * * * * *
1961 GAAATTTTTTTC-AAACAATATATGACACGTCAATCCAAATACAACGAGATTAAAAAATAAAACA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA-A
* * *
2025 TAAAAAATAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGTCTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACT
64 T------TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACT
*
2090 CTCG-CCGAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG
123 CTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG
*
2154 CACCCATCCCCTTTTGCAATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCTTGTG
188 CACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTG
* *
2218 GGCCCATGTCTCACGGGCTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GTTTTTTTAGTTA
252 GGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTA
* * *
2282 ATAAGGC-TTTCTGAAATTCTTTCCTAAAATTAT-TGACTCGTCAACCCAAATCCGACGACGTT-
317 ATAAGGCTTTTC-GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTA
* * * *
2344 --ACA-AAAAATTAATAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACAAGGTCACCCATTCTAGTA
381 AAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTA
* * * * * *
2406 TTACACTCGCCCAAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTAATGGGATGCTGTGCATTAGTG-TAGGTA
446 CTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT-GGTA
* * * * * * * *
2470 TGATCACACTCATCCCTTTTTACCATTACAAACTGCCAATACCATCATTTCTCGCTCTGTCATCC
510 TGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCA-CC
* * * *
2535 C-TGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGCTTTAGTTTTTT
574 CTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTG-ATTCGGTTTTT
2599 TCAGTTAATAAGGCTTTTC
638 TCAGTTAATAAGGCTTTTC
* * * * * * * *
2618 GAAATTTTTTTC-AAACATTATATGACACGTCAATCCGAATACAACGAGATTAAAAAATAAAAAA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* * *
2682 TAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACATCCCAAGAGGTCACCCATCCTTAGTACTACTCTCG-C
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCC-TAGTACTACTCTCGCC
* *
2746 CAAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTAATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
129 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
* * * *
2811 TCCCCTTTTGCAATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CTCTTATGGGCCCA
194 TCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCCA
* * *
2875 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCTGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAGTAAGG
258 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGG
* * * *
2940 CTTTTTGAAACTTTTTCCTAAAATTTTGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATG
323 CTTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATA
**
3005 AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGTTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
388 AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
* * *
3070 CGCCCAAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATGGGATCCGATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCA
453 CGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
* * * * *
3135 CCAATCCCTTTTTGCCATCACAAACTGCAAATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGC
518 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC
** *
3200 CTTTATCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCA-TCTGATTCGG-TTTTTCAG-TAAT
583 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGT-TGATTCGGTTTTTTCAGTTAAT
3262 AAGGC-TTTC
647 AAGGCTTTTC
* * * * * * * * *
3271 AAAATTTTTT-TTCAAACAATATATGACACGTCAATCCAGATACAACGAGATT-AAAAATAACAA
1 GAAATTTTTTCCT-AAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA-AA
* * *
3334 A-T-AAAAGATGAGGTTGCAACACGAGGTCTT-CCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
63 ATTAAAAAGATG-GGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
3396 -CCAAGGCACGCTTAACTGCGGAGTTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
127 CCCAA-GCACGCTTAACTGCGGAG-TTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
* *
3460 CCCATCCCCTTTTTCAATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCTTGTGGG
190 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGG
* *
3524 -CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAGTAAAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGTT
254 CCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGA-T-TAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTT
* *
3588 AGTAAGGCTTTTTGAAA-TTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGGTT
316 AATAAGGCTTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA-GGTT
* * *
3652 AAAAAATGAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAGCACGAGGACTTCCCACAAGGTCACCCATCCTAGT
380 AAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGT
* * *
3717 ACTACTCTCGCCAAAGCACGCTTAACTGCGG-GTTTTGATGGGATCCGGTGTATATTAGTGCT-G
445 ACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTG--CATTAGTGCTGG
* * *
3780 TATGATCGCACCCATCCCTTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATCATTTCTCGCTTCTGTCA
508 TATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC-TCTGTCA
**
3845 CCCTTGTGGGCCTTTGTCTCACGGTGTTTATATTTTACTCGATTTAAACGTCAGTTGATTCGGTT
572 CCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGG-GTTTATATTTTACTCGA-TTAAACGTCAGTTGATTCGG-T
* *
3910 TTTTTCGATATTAAGAAGGC-TTTC
634 TTTTTC-A-GTTAATAAGGCTTTTC
* * * * * *
3934 GAAATTTTTTTGCCCAAAATTATGAGGACTCGTCAATCCAACATCCAACGATGTTAAAGAAT-TA
1 GAAA-TTTTTT-CCTAAAATTATG-TGACTCGTCAACCCAA-ATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * *
3998 AATTAAAAAGATGGCGTGCAACTCGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCT-G
62 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * * *
4062 CCCAAGC-CGCTTAACTACGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGTATTAGTGC-GGATACGATCAC-C
127 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGG-TATGATCGCAC
* * *
4124 CCAT-CCCTTTTGCCACAACAAAACTACAATTACTATCCTTTCT--CTCTGTCACCCTTGT-GG-
191 CCATCCCCTTTTGCCATAAC-AAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC
* *
4184 CCATGTCTCACGGG-TTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATA
255 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATA
* * * * * **
4248 AGGCTTTTCGAAATTTTTTCC-CAAA-TATGAGGCTCGCCCAAACCAAATCCAGTGAGGTTAAAA
320 AGGCTTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCG-TCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAA
*
4311 ATATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAAC-CGAGGACCTCCCACTAGAGGTCACCCAAT--TAGT
384 A-ATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAC--GAGGTCACCC-ATCCTAGT
* * *
4373 ACTACTCTTGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTC-AATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTA
445 ACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTA
** * *
4437 TGATCGCACCCATCCTTTTTTGCAACA-AACGAACTACAAATATCAT-CTTTCTCGCTCTGTCA-
510 TGATCGCACCCATCCCCTTTTGC--CATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAC
* * * * * * *
4499 CGTTGTTGGCCGATATCTTACGAGTTTATA-TTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTT
573 CCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTT
* * * *
4563 TCAGGTATTAAAGCTTCT-
638 TCAGTTAATAAGGCTTTTC
** * *
4581 GAAAAATTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAGCCCAAATCCAACGAGGTTAAAAATTAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
*
4646 AAAAAAGATGGGGTGC-AC-CGAGTACTTCCCACGAGGTCACCCAT-CTAAGTACTACTCTCGCC
66 -AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCT-AGTACTACTCTCGCC
* * ** *
4708 CAAGCACGCTTAACTGCGAAGTTCT-ATGGGATCCTGTGCAATTAGTGCCAGTATGATCACACCC
129 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGC-ATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
* * * * *
4772 AT-CCCTTTTGCCATAAACAAACTACAAATACCATCATTTCTCTCCCCGTCACCCTTGTCGGCCC
193 ATCCCCTTTTGCCAT-AACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* * * * * * *
4836 AAGTCTCATGGGTTTAT-GTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGCTTCAGTTTTTTTCAGATAATAA
257 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GGTTTTTTCAGTTAATAA
* * * *
4900 GGCTTTCCAAAATTTTTT-CTAAAATTATGTGACAT-GTCAACCCAAATACAATGAGGTTAAAAA
321 GGCTTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGAC-TCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAA
*
4963 ATAAAAATTAAAAAGATGAGGTTGCAACACGAGGACTTCCCA-GAAGGTCACCCATCCTAGTACT
385 ATAAAAATTAAAAAGATG-GGGTGCAACACGAGGACTTCCCACG-AGGTCACCCATCCTAGTACT
* * * ** *
5027 ACTC-CTGCCCAAGCACGCTTAACTGCAGAATTCTGATGGCATCCTATGCATTAGTGCTAGTATG
448 ACTCTC-GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATG
* * * *
5091 ATCACACCCATCCCTTTTTGCCATAACAAACTTCAAATACCATCCTTTCTCGATCTGTCACCCTT
512 ATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTT
* * * *
5156 GTGGGTCCATGTCTCGCGGG-TTATATTTTACTCGATTAAACATCAGTTGATTCAGTTTTTTTCA
577 GTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GGTTTTTTCA
*
5220 GTTAATAAGGCTTTTT
641 GTTAATAAGGCTTTTC
**
5236 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAACGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
5301 AGAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGTTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCTA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
*** * *
5366 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATTTGGTGCGTTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * * * *
5431 CCTTTTTGCCATAACAAGCTACAAGTACCATCCTTTCTCACTCTGTCACCCTTATGGGCCTATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* *
5496 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATAAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATAAGGCT
* * ** **
5561 TTTTGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCGAACGATTTTAAAAAACGAA
325 TTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * * **
5626 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCATGAGATCACCCATCCTAGTACTACTCTTT
390 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * * *
5691 CCCAAGCACGCTTAACTGCGAAGTTCTAATGGGATCTGGTGCATTAGTGCTAGTATGATCGCACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
* * *
5756 CATCCCTTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATACTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* * * * *
5821 TTGTCTCACGGGTTTATAATTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCGGTTAAGAAG
585 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAG
*
5886 GTTTTTC
650 GCTTTTC
* * * *
5893 GAAATTTTTTCC-CAAATTATGGGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATGTTAAAGAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * * *
5956 AAAAAGATGGGATTGCAACACGAGGACTTCCCACAAGGTCAACCATACTAGTACTACTCTCACGC
66 AAAAAGATGGG-GTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * *
6021 AAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATTGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* *
6086 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCCCTGTCACCCTTGTGGGCCCGTG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
** *
6151 TCTCACGATTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAATG-T
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
* *
6215 TTTTGAAAATTTTTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT-AA
325 TTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * * *
6278 AATTAAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCTCG
390 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * * *
6343 CCCAAGCACGCTTAATTGTGGAGTTTTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
** * * *
6408 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATAGTACCCTTTCTCGCTCAGTCACCCTTGTGGGCTC
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* * * *
6473 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTTATTCGGTTTTTTTAGTTCATAAG
585 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAG
6538 GCTTTTC
650 GCTTTTC
* * * * *
6545 AAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCATATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAAATT
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* * *
6610 AAAAAGATTGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACACTCGCCTA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
6675 AGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATGAGAT-CTGTTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCACCCAT
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAG-TGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * * *
6739 CCCTTTTTGCCATCACAAACTACAAAAACCATCCTTTCTAGCTCTG-CAACCCTTGTGGGCCCTT
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTC-ACCCTTGTGGGCCCAT
* * * *
6803 GTCTCACGGGTTTATATTTTGCTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTAAGTTAAGAAGGC
259 GTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGC
* * * *
6868 TTTTCGAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATGTTAAAGAAT-A
324 TTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA
* * * *
6932 AAATTAAAAAGATGAGGTGCAAACACGAGGACTTCCCATGAGGTCACCCATACTAGCACTACTCT
389 AAATTAAAAAGATGGGGTGC-AACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
* * * * * ** *
6997 CACCCGAGCACGCTTAACTACGGAGTGCTGATGGTATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCA
453 CGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
* * *
7062 CCCAACCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTC-CCCTGTCACCCTTGTGGGC
518 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC
* * * *
7126 CCATTTCTCACGAGTTTATATTTTTCTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTCGGTTAAT
583 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAAT
* *
7191 AAGGTTTTTT
647 AAGGCTTTTC
*
7201 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCGAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
7265 AAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTTGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
7330 AGCATGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
7395 CCCTTTTCCCATAACAAACTACAAATACTACCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGAGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * *
7460 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTTATTCGGTTTTTTCAGTTCATAACGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* * *
7525 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCAAATCCAGCGAGGTT-AAAAATAAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
* *
7589 ATTAAAAGGATGGGGTGCAACACTGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCTCG
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACAC-GAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * * * *
7654 CCCAAGCACGCTTCACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCTGTGCATTAGTACTAGTATGATCACACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
* * * ** * *
7719 CATCTCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTTACCCCGTCACCCTTGTGGGCCC
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* * * * * * * *
7784 AAGTCTCATGGGATTATATTTTACTCGATCAAACATCAGTTGCTTTAGTTTTTTTCAGTTAATAA
585 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTG-ATTCGGTTTTTTCAGTTAATAA
*
7849 AGCTTTTC
649 GGCTTTTC
* * * ** *
7857 GAAATTTTTTTCTAAAATTATGTGACACCTCAACCCAAATAGAACGAGTTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
7922 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCGAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC-CAGCCC
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC-GCCC
* * *
7986 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTAATGGGATCCGGTGCTTTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* *
8051 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATAACATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* *
8116 TCTCACGGGTTTATATTTTAGTCGATTAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
* * * *
8181 TTTTGAAATTTTTTCCTGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCGACGAGGTTAAAAAACAAA
325 TTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * *
8246 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGTTCACCCATCCTAGTACTACTTTCG
390 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* **
8311 CCCAAGCACGCTTAACAGCGGAGTTCTGATGGGATATGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
* * *
8376 CATCCCTTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCT
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* * * * * *
8441 TTGTCTCACAGGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCAGTTAATTCGGTTTTTTTCGGTTAAGAA
585 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATAA
8506 GGCTTTTC
649 GGCTTTTC
* * * *
8514 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTCGACCCAAATCCAACGACGTTAAAGAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* *
8578 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCTCACCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * * * *
8643 AGCACGCTTAACTACAGAGTTCTAATAGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* *
8708 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTCCTCGCCCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* *
8773 CTCACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGTTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* *
8838 TTTGAAATTTTCTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
* * *
8902 ATTAAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
* * * * *
8967 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTAATGGGATCCGGTGCATTAGTGCGGGAACGGTCGCACCC
456 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
* * * *
9032 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTACCCTTTCTCGCTCGGTCACCCTTGTAGGCCCA
521 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
* ** * *
9097 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTAGATTAAACGTCAGTTTTTTCAGTTTTTTCAGTTCATAAGG
586 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGG
9162 CTTTTC
651 CTTTTC
* * * *
9168 AAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
9233 AAAAAGATGGGGAGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACACTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
9298 AGCACGCTTAACTACGGTGTTCTGATGGGAT-CTGTTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAG-TGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * * *
9362 CCCTTTTTGCCATCACAAACTACAAAAACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTATGGGCCCTTG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
** * * *
9427 TCTCACGGGTTTATATTTGGCTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCGGTTAAGAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
* * * *
9492 TTTCGAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATGTTAAAGAAT-AA
325 TTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * * *
9556 AATTAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGCACTACTCTCA
390 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * * ** *
9621 CCCGAGCACGCTTAACTACGGAGTGCTGATGGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
* * *
9686 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCCCTGTCACACATGTGGGCCC
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
*
9751 ATGTCTCACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAG
585 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAG
*
9816 GCTTTTT
650 GCTTTTC
* *
9823 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAGATATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
9887 AAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCCCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
9952 AGCATGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCACTAGTGCTGGTACGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* *
10017 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTACCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* ** *
10082 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTTATTCAATTTTTTCAGTTTATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* * *
10147 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
*
10212 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACACTCGC
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
* * * *
10277 CTAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGATATGATCGCACCC
456 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
** * * * * * *
10342 ATCCTTTTTTGCAACAACGAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCGTTGTTGGCCCA
521 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
* * * * * *
10407 TATCTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTCAAG-TATTAA
586 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTC-AGTTAATAA
10471 GGC-TTTC
649 GGCTTTTC
*
10478 TGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACCCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
*
10543 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * *
10608 AAGCACGCTTCACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCTGTGCATTAGTGCTAGTATGATCACACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * * ** * * *
10673 CTCTTTTTCCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTTACCCCGTCACCCTTGTGGGCCCAAG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * * * *
10738 TCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATCAAACATCAGTTGCTTCAGTTTTTTTCAGTTAATAAAGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GGTTTTTTCAGTTAATAAGGC
* * * *
10803 TTTTCGAAATTTTTTTCTAAAATTATGTGACACATCAACCCAAATACAACGAGGTTAAAAAATAA
324 TTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA
* *
10868 AAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCATAGTACTACACTC
389 AAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC
* * * *
10933 GCCTAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGATATGATCGCAC
454 GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCAC
** * * * * * *
10998 CCATCCTTTTTTGCAACAACGAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCGTTGTTGGCC
519 CCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCC
* * * * * * *
11063 CATATCTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGGTATTA
584 CATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATA
11128 AGGC-TTTC
648 AGGCTTTTC
*
11136 TGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACCCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
11201 TAAAAAGTTGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * * *
11266 AAGCACGCTTCACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCTGTGCATTAGTGCTAGTATGATCACGCCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * ** * * * *
11331 CTCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTTACCCCGTCACCCTCGTGGGCCCAAG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * * * * *
11396 TCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATCAAACATCAGTTGCTTTAGTTTTTTTCAGTTAATAAAGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTG-ATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGC
* * * *
11461 TTTTCGAAATTTTTTTCTAAAATTATGTGACACATCAACCCAAATACAACGAGGTTAAAAAATAA
324 TTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA
* * *
11526 AAATGAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC-C
389 AAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC
* * * *
11590 AGCCCAAGCACGCTTAATTGCGAAGTTTTGATGGGATCCGGTGCTTTAGTGCTGGTATGATCGCA
454 -GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
*
11655 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGC
518 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC
* * *
11720 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTAGTCGATTAAACATCAGTTGATTCAGTTTTTTTCAGTTAAT
583 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GGTTTTTTCAGTTAAT
*
11785 AAGGCTTTTT
647 AAGGCTTTTC
* * * * **
11795 GAAATTTTTTCCTGAAATTGTGTGACTCGTCAGCCCAAATCGAACGAGGTTAAAAAACGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
11860 AAAAAGATGGGGTGCAACACGTGGGCTTCCCACGAGTTCACCCATCCTAGTACTACTTTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * ***
11925 CGCACGCTTAACAGCGGTGTTCTGATGGGATATGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * *
11990 CATTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCATTGTTGGCCCATAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * * *
12055 CTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTAAGTTAAGAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* * * *
12120 TTCGAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTC-ACCCAAATCCAACGACGTTAAAGAAT-AAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
* *
12183 ATTAAAAAGATGGGGTGTAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCTCGC
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
* * ** *
12248 CCAAGCACGCTTAACTACGGAGTGCTGATGGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
456 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
* * *
12313 AACCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCCCTGTCACCCTTGTAGGCCCA
521 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
* * * * *
12378 TTTCTCATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACATTAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGTTAATAAG
586 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATAAG
*
12443 GCTTTCC
650 GCTTTTC
* * * * * *
12450 GAATTTTTTTTCTAAAATTATGTGACACGTCAACCCAAATACAATGAGGTT-AAAAATAAAAATC
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * *
12514 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACATCCCAGGAGGTCACCCATCTTAGTGCTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * * *
12579 AGCACACTTAACAGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCTTTAGTGCTGGTATGATAGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
12644 CCCTTTTGCCATAACAAACGACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAACCTTATGGGCTCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
*
12709 CTCACAGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* *
12774 TTTGAAATTTTTTCTTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
* * *
12839 ATTAAAATGATGGGTTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACACATCCTAGTACTACTCTCGC
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
* * * *
12904 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGGTATGATCGCATCG
456 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
** * * * * * ** *
12969 ATCCTTTTTTGCAACAACAAACTGCAAATATCATCCTTTCTCGCTCCGTCACTGTTGTTGGCCCA
521 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
* * * * ** *
13034 TATCTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAATTTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAATAAG
586 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-CAGTTAATAAG
*
13099 GCTTTTT
650 GCTTTTC
* * * * *
13106 GAATTTTTTTCCTAAATTTATGTGACTCGTCAACCTAAATCGAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
13171 AAAAAGATGGGGTGCAACGCGAGGACTTCCCTCGAGGTCACCCATCCTAGTACTAATCTCGCCAA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
13236 AGCACGCCTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * **
13301 CCCTTTTGCCATAACAAACAACAAATACCATCCTTTTTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTTATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* *
13366 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTCCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* * * * * * *
13431 TTCGAAATTTTTTTC-AAACATTATATGGCACGTCAATCCAAATACAACGAGATTAAAAAATAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * *
13495 AAATAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
390 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
*
13560 -CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATTGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
* *
13624 CATCCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCTTTGTGGGCC
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCC
* *
13688 CATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAA-C
584 CATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-CAGTTAATA
*
13752 AGAGCTTTTT
648 AG-GCTTTTC
* *
13762 GAATTTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * * *
13827 AAAAAGATGAGGTGCAACACAAGTACTTCCAACGAGGTCACCCATCCAAGTACTACTCTCGCCAA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
13892 AGCACGCTTAACTGAGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACTCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
*
13957 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCGTGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * *
14022 CTCACGGGCTTATATTTTACTCGACTAAACGTCAGTTGATTCAGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* *
14087 TTTGAAATTTTTTCTTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
* * *
14152 ATTAAAATGATGGGTTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACACATCCTAGTACTACTCTCGC
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
* * *
14217 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGGTATGATCGCACCG
456 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
** * * * * * ** *
14282 ATCCATTTTTGCAACAACAAACTGCAAATATCATCCTTTCTCGCTCCGTCACTGTTGTTGGCCCA
521 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
* * * * * *
14347 TATCTTACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCTGTTGATTCGGTTTTTTTCAGGTAATAA-
586 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATAAG
14411 -CTCTTTC
650 GCT-TTTC
* * * *
14418 TAAAATTTTTTCCTCAAATTCTGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATGAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* * *
14483 TAAAAAGATGGGGTGCAGCACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCATAGTACTACTCTCGCCA
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * *
14548 AAGCACGCCTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * **
14613 CCCCTTTTGCCATAACAAACTAAAAATACCATCATTTTTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTTATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * *
14678 TCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTCCAGTTAATAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
* * * * * *
14743 TTTCGAAATTTTTTTC-AAACATTATATGGCAT-GTCAATCCAAATACAACGAGATTAAAAAATA
325 TTTCGAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGAC-TCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATA
* * *
14806 AAAAATAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
388 AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
14871 CG-CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
453 CGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
*
14935 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCTTTGTGGG
518 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGG
* *
14999 CCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAAAGTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAA
582 CCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-CAGTTAA
* * *
15064 CAGGGCTTTTT
646 TAAGGCTTTTC
* * *
15075 GAATTTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATTCAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
15140 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGTACTTCCAACGAGGTCACCCATCCAAGTACTACTCTCG-CCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* *
15204 ATGCACGCTTAACTGAGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACCCAT
131 A-GCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
*
15269 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCGTGTGGGCCCATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * *
15334 TCTCACGGGCTTATATTTTACTCGACTAAACGTCAATTGATTCGGTTTTCTT-AGTTAATAAGGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTT-TTCAGTTAATAAGGC
* * * *
15398 ATTTCGAAATTTTTTTCTAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGA-GAGGTTAAAAAATT
324 TTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCA-ACGAGGTTAAAAAATA
* *
15462 AAAATTAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
388 AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT
* *
15527 CGCCCAAGCACGCTTGACTGCGGAGTTCTGATGTGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
453 CGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
* *
15592 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGCGC
518 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC
* * *
15657 CCATGTCTCACGGGTTTAAATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAAAA
583 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATA
15722 AGGCTTTTC
648 AGGCTTTTC
* * * *
15731 AAAATTTTTTCTTAAAATTATGTGACTCGTC-ACCGAAATCCAACGGGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
15795 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGCTCACCCATCATAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
15860 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTAGTACGATCGCACCCTTC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
*
15925 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTATGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * *
15990 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAATTGATTCAGTTTTTTTAGTTACTAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* * * *
16055 TTCAAAATTTTTTCCTGAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
* * *
16120 ATTAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGCACTACTCTCGC
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
* * *
16185 CGAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCACTAGTGCTGGTATGATCGCACGC
456 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
*
16250 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTATGGGCCCA
521 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
* * * *
16315 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTTGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTTAGTCAATAAG
586 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATAAG
16380 GCTTTTC
650 GCTTTTC
* * * *
16387 GAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAGAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
*
16452 AAAAAGATGGGGTACAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* *
16517 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGGTATGATCGCACCGATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * * ** * *
16582 CTTTTTTGCAACAACAAACTGCAAATATCATCCTTTCTCGCTTTGTCACTGTTGTTGGCCCATAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * *
16647 CTTACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCAGTTGATTCGGTTCTTTTCAGGTAATAAGGC-
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTT-TTTTCAGTTAATAAGGCT
*
16711 TTTCTAAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA
325 TTTC-GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA
* * *
16776 AAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGAACTTCCCACGCGGTCACCCATCTTAGTACTACTCTC
389 AAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC
* * * *** ** *
16841 GCCTAAACACACTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCTTATGCATTAGTGCTAATATGATCACAC
454 GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCAC
* * *
16906 CCAT-CCATTTCTGCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTCGCCCTGTCACCCTTGTGGGC
519 CCATCCCCTTT-TGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC
* * * * * *
16970 CCAAGTCTCATGGGTTTATGTTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGCTTCAGTTTTTTTTAGTTAAT
583 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GGTTTTTTCAGTTAAT
*
17035 AAGGCTTTCC
647 AAGGCTTTTC
* * *
17045 GAAATTTTTTTCTAAAATTATGTGACACGTCAACCCAAATACAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * * *
17110 AAAAAGATGAGGTGCAACAAGAGGACTTCCGAGGAGGTCACCTATCCTAGTACTACTCCCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * * * *
17175 AGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATGTGATCCGGTGCTTTAATGCTGGAATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * * *
17240 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCCCGCTCTGTCAACCTTATGGGCTCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
17305 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTCAGTTAATAAGGCT
* * *
17370 TTTTGAAATTTTTTCTTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTTAAAAATAAA
325 TTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * *
17435 AATTAAAAAGATGAGGTGCAACACGACGACTTCCCACGAGCTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
390 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * *
17500 CCCAAGCACGTTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
* *
17565 CATCCTCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTTGGCCC
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* *
17630 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCAATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAG
585 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAG
17695 GCTTTTC
650 GCTTTTC
* * *
17702 AAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
17767 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAAGACTTCCGAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCACCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
17832 AGCACCCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAATGCTGATATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* *
17897 CCCTTTTGCTATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * *
17962 CTCATGGGTTTATATTTTACTCGATTATACGTTAGTTTATTCAGTTTTTT-AGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* * * *
18026 TTGGAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
* * * * *
18091 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCGAGGAGGTCACCCATCCTAATACTACTCCCAC
391 ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
* *
18156 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAATGCTGATATGATCGCACCC
456 CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
* * *
18221 ATCCCCTTCTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTATGGGCCCA
521 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
* * *
18286 TGTCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTTATTCGGTTTTTT-AGTTAATAAGG
586 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGG
18350 CTTTTC
651 CTTTTC
* * **
18356 GAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGTGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
*
18421 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCAA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * * *
18486 ATCACGTTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGGTATGATAGCACGCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * * * * ** * *
18551 CTTTTTTGCAACATCAAACTGCAAATA--TTGCCTTTCTCGCTCCGCCACTGTTGTTGGCCCATA
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCAT-CCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * * * * *
18614 TCTTACGAGTTTATATTTTACTCAATTAAACATCAGTTGATTCAGTTTTTTTCCGGTAATAAGGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GGTTTTTTCAGTTAATAAGGC
** * *
18679 TTTTTAAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAGCCCAAATCCAATGAGGTTAAAAAATAA
324 TTTTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA
* *
18744 AAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCGCGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCAC
389 AAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC
**
18809 GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAATGCATTAGTGCTGGTATGATCGCAC
454 GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCAC
* * * ** *
18874 CCATCCTCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCACGCTCTTTC-CCCCGGTGGGCT
519 CCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCC
** *
18938 CATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAATTTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAATA
584 CATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-CAGTTAATA
*
19003 AGGCTTTTT
648 AGGCTTTTC
* * * * * *
19012 GCATTTTTTTCCTAAATTTATGTGACTCGTCAACCTAAATCGAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
19077 AAAAAGATGGGGTGCAACGCGAGGACTTCCCTCGAGGTCACCCATCCTAGTACTAATCTCGCCAA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
19142 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCAACCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
19207 CCCTTTTGCCATAACTAACTACAAATACTATCCTTTTTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCAATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * *
19272 CTTACAGGTTTATATTTTACTCAATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
* * * * * * *
19337 TTCGAAATTTTTTTC-AAGCATTATATGACACGTCAATCCAAATACAACGAGATTAAAAAATAAA
326 TTCGAAATTTTTTCCTAA-AATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* ** * * ** *
19401 AAATAAAAAGATAAGGTGCAACATGAGGACTTCCCAAGACTTCACCCATCCTAGTACTACTTTCG
390 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * *
19466 -CCAAGCACGCCTAACCGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCACC
455 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
19530 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGT
520 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGT
19580 TCCCCTTTGT
Statistics
Matches: 16854, Mismatches: 1854, Indels: 437
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
642 2 0.00
643 53 0.00
644 40 0.00
645 58 0.00
646 41 0.00
647 13 0.00
648 16 0.00
649 48 0.00
650 142 0.01
651 328 0.02
652 451 0.03
653 723 0.04
654 1566 0.09
655 4018 0.24
656 3125 0.19
657 3353 0.20
658 2309 0.14
659 62 0.00
660 62 0.00
661 177 0.01
662 36 0.00
663 81 0.00
664 43 0.00
665 33 0.00
666 29 0.00
667 45 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.24, G:0.17, T:0.31
Consensus pattern (656 bp):
GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
TTCGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA
ATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGC
CCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA
TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGG
CTTTTC
Found at i:1848 original size:328 final size:328
Alignment explanation
Indices: 1--19579 Score: 26595
Period size: 328 Copynumber: 59.7 Consensus size: 328
* *
1 GAAATTCTTTCCTAAAAATTATTTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTT---AAA-AAAAAT
1 GAAATTTTTTCCT-AAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* * * * *
62 TAAAAAGATGGGGTGCAACGCGAGGACTTCCCACAAGGTCACCCATTCTAGTATTACACTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * * * *
127 AAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTAATGGGATGCTGTGCATTAGTG-TAGGTATGATCACACTCA
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT-GGTATGATCGCACCCA
* * * * * * * *
191 TCCCTTTTTACCATTACAAACTGCCAAGACCA-CATTTCTCGCTCCGTCATCCC-TGTGGGCCCA
194 TCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCA-CCCTTGTGGGCCCA
* * * * *
254 TATCTCA-GGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGCTTTAGTTTTTTTTCAGTTAATAA
258 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTG-ATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAA
318 GGCTTTTC
321 GGCTTTTC
* * * * * *
326 AAAATTTTTTTCAAAAATTATGTGACACGTCAACCCAAATACAACGAGATT--AAAA-AAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
388 -AAAAGATGAGGTGCAACACGAGAACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTTGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* *
452 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGAGATCCTGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
517 CCCTTTTGCCATAAAAAACTACAAATACCATCCTTTGTCGCTCTGTCTCCCTTGTGGGCCCGTGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * *
582 CTCACGGGTTTATATTTTAGTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTCTTCAGGTAATAAGGC-
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTT-TTTAGTTAATAAGGCT
646 TTTC
325 TTTC
* *
650 TAAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTGAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
715 TAAAAAGATAGGGTGCAACATGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * *
780 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTACATTAGTGCTGTTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * *
845 CCTCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCCTATGGGCCCAT
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCCAT
* * *
909 GTCTCACGGGTTTATGTTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAATAAGG
259 GTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-TAGTTAATAAGG
*
974 CTTTTT
323 CTTTTC
* * *
980 GAATTTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCTAAATCCAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
1045 AAAAAGATGGGGTGTAGCACGAAGACTTCCCATGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC-CCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC-
* * **
1109 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGAGTATTAGTGCTGGTATGATTACA-CCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* *
1173 CCCCTTTTGCCATAACAAAATACAAATACCATCCTTTTTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * *
1238 TCTCACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
1303 TTTC
325 TTTC
* * * * * * *
1307 GAAATTTTTTTC-AAACATTATATGACACGTCAA-TCAAATACAACGAGATTAAAAAA-AAAAAA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
1369 TAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGT-CACCCATCCTAGTACTACTCTCGCC
* **
1434 CAAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATGGGATCCACTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
129 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
* *
1499 TCCCCTTTTG-CAGTAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCTTATGGGCCC
194 TCCCCTTTTGCCA-TAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCC
* * *
1562 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCTGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAGTAAG
257 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAG
* *
1627 GGTTTTT
322 GCTTTTC
*
1634 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
*
1699 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
1764 AGCACGCTTAACTGTGAAGTTCTGATGGGATCCGGTGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCAATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * * **
1829 CCTTTTTGCCATCACAAACTGCAAATACCATCATTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCTTTGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
*
1894 CTCCCGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCA-TCTGATTCGG-TTTTTTAGTTAATAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGT-TGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
1957 TTTC
325 TTTC
* * * * * * *
1961 GAAATTTTTTTC-AAACAATATATGACACGTCAATCCAAATACAACGAGATTAAAAAATAAAACA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA-A
* * *
2025 TAAAAAATAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGTCTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACT
64 T------TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACT
* *
2090 CTCG-CCGAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG
123 CTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG
*
2154 CACCCATCCCCTTTTGCAATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCTTGTG
188 CACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTG
*
2218 GGCCCATGTCTCACGGGCTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTC-GTTTTTTTAGTTA
252 GGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTA
2282 ATAAGGC-TTTC
317 ATAAGGCTTTTC
* * * *
2293 TGAAATTCTTTCCTAAAATTAT-TGACTCGTCAACCCAAATCCGACGACGTT---ACA-AAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* * * * *
2353 TAATAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACAAGGTCACCCATTCTAGTATTACACTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * * * *
2418 AAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTAATGGGATGCTGTGCATTAGTG-TAGGTATGATCACACTCA
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCT-GGTATGATCGCACCCA
* * * * * *
2482 TCCCTTTTTACCATTACAAACTGCCAATACCATCATTTCTCGCTCTGTCATCCC-TGTGGGCCCA
194 TCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCA-CCCTTGTGGGCCCA
* * **
2546 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGCTTTAGTTTTTTTCAGTTAATAAG
258 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAG
2611 GCTTTTC
322 GCTTTTC
* * * * * * * *
2618 GAAATTTTTTTC-AAACATTATATGACACGTCAATCCGAATACAACGAGATTAAAAAATAAAAAA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* * *
2682 TAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACATCCCAAGAGGTCACCCATCCTTAGTACTACTCTCG-C
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCC-TAGTACTACTCTCGCC
* * *
2746 CAAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTAATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
129 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
* * * *
2811 TCCCCTTTTGCAATAACAAACTACAAATACTATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CTCTTATGGGCCCA
194 TCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCCA
* * * *
2875 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCTGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAGTAAGG
258 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGG
*
2940 CTTTTT
323 CTTTTC
* * *
2946 GAAACTTTTTCCTAAAATTTTGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
**
3011 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGTTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
3076 AGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATGGGATCCGATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCAATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * * ** *
3141 CCTTTTTGCCATCACAAACTGCAAATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCTTTAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
*
3206 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCA-TCTGATTCGG-TTTTTCAG-TAATAAGGC-
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGT-TGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
3267 TTTC
325 TTTC
* * * * * * * * *
3271 AAAATTTTTT-TTCAAACAATATATGACACGTCAATCCAGATACAACGAGATT-AAAAATAACAA
1 GAAATTTTTTCCT-AAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAA-AA
* * *
3334 A-T-AAAAGATGAGGTTGCAACACGAGGTCTT-CCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
63 ATTAAAAAGATG-GGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
*
3396 -CCAAGGCACGCTTAACTGCGGAGTTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
127 CCCAA-GCACGCTTAACTGCGGAG-TTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCA
* *
3460 CCCATCCCCTTTTTCAATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCCTTGTGGG
190 CCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGG
* *
3524 -CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAGTAAAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGTT
254 CCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGA-T-TAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTT
* *
3588 AGTAAGGCTTTTT
316 AATAAGGCTTTTC
*
3601 GAAA-TTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGGTTAAAAAATGAAAAT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGA-GGTTAAAAAATAAAAAT
* * *
3665 TAAAAAGATGGGGTGCAGCACGAGGACTTCCCACAAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCA
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* *
3730 AAGCACGCTTAACTGCGG-GTTTTGATGGGATCCGGTGTATATTAGTGCT-GTATGATCGCACCC
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTG--CATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
* * * *
3793 ATCCCTTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATCATTTCTCGCTTCTGTCACCCTTGTGGGCCT
193 ATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC-TCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* *
3858 TTGTCTCACGGTGTTTATATTTTACTCGATTTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTCGATATTA
257 ATGTCTCACGG-GTTTATATTTTACTCGA-TTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT--A-GTTA
*
3923 AGAAGGC-TTTC
317 ATAAGGCTTTTC
* * * * * *
3934 GAAATTTTTTTGCCCAAAATTATGAGGACTCGTCAATCCAACATCCAACGATGTTAAAGAAT-TA
1 GAAA-TTTTTT-CCTAAAATTATG-TGACTCGTCAACCCAA-ATCCAACGAGGTTAAAAAATAAA
* * *
3998 AATTAAAAAGATGGCGTGCAACTCGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCT-G
62 AATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG
* * * * *
4062 CCCAAGC-CGCTTAACTACGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGTATTAGTGC-GGATACGATCAC-C
127 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGG-TATGATCGCAC
* * *
4124 CCAT-CCCTTTTGCCACAACAAAACTACAATTACTATCCTTTCT--CTCTGTCACCCTTGT-GG-
191 CCATCCCCTTTTGCCATAAC-AAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC
*
4184 CCATGTCTCACGGG-TTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATA
255 CCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATA
4248 AGGCTTTTC
320 AGGCTTTTC
* * * * * **
4257 GAAATTTTTTCC-CAAA-TATGAGGCTCGCCCAAACCAAATCCAGTGAGGTTAAAAATATAAAAA
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCG-TCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAA-ATAAAAA
* *
4320 TTAAAAAGATGGGGTGCAAC-CGAGGACCTCCCACTAGAGGTCACCCAAT--TAGTACTACTCTT
64 TTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAC--GAGGTCACCC-ATCCTAGTACTACTCTC
* *
4382 GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTC-AATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCAC
126 GCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCAC
** * * * *
4446 CCATCCTTTTTTGCAACA-AACGAACTACAAATATCAT-CTTTCTCGCTCTGTCA-CGTTGTTGG
191 CCATCCCCTTTTGC--CATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGG
* * * * * * * *
4508 CCGATATCTTACGAGTTTATA-TTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTCAGGTATT
254 CCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAAT
* *
4572 AAAGCTTCT-
319 AAGGCTTTTC
** * *
4581 GAAAAATTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAGCCCAAATCCAACGAGGTTAAAAATTAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
*
4646 AAAAAAGATGGGGTGC-AC-CGAGTACTTCCCACGAGGTCACCCAT-CTAAGTACTACTCTCGCC
66 -AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCT-AGTACTACTCTCGCC
* * ** *
4708 CAAGCACGCTTAACTGCGAAGTTCT-ATGGGATCCTGTGCAATTAGTGCCAGTATGATCACACCC
129 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGC-ATTAGTGCTGGTATGATCGCACCC
* * * * *
4772 AT-CCCTTTTGCCATAAACAAACTACAAATACCATCATTTCTCTCCCCGTCACCCTTGTCGGCCC
193 ATCCCCTTTTGCCAT-AACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* * * * * * *
4836 AAGTCTCATGGGTTTAT-GTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGCTTCAGTTTTTTTCAGATAATAA
257 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAA
*
4900 GGCTTTCC
321 GGCTTTTC
* * *
4908 AAAATTTTTT-CTAAAATTATGTGACAT-GTCAACCCAAATACAATGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGAC-TCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
*
4971 TAAAAAGATGAGGTTGCAACACGAGGACTTCCCA-GAAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC-CTG
65 TAAAAAGATG-GGGTGCAACACGAGGACTTCCCACG-AGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC-G
* * * ** * *
5034 CCCAAGCACGCTTAACTGCAGAATTCTGATGGCATCCTATGCATTAGTGCTAGTATGATCACACC
127 CCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACC
* * * *
5099 CATCCCTTTTTGCCATAACAAACTTCAAATACCATCCTTTCTCGATCTGTCACCCTTGTGGGTCC
192 CATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCC
* * *
5164 ATGTCTCGCGGG-TTATATTTTACTCGATTAAACATCAGTTGATTCAGTTTTTTTCAGTTAATAA
257 ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAA
*
5228 GGCTTTTT
321 GGCTTTTC
**
5236 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAACGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
5301 AGAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGTTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCTA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
** * *
5366 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATTTGGTGCGTTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * * * *
5431 CCTTTTTGCCATAACAAGCTACAAGTACCATCCTTTCTCACTCTGTCACCCTTATGGGCCTATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* *
5496 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATAAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGCT
*
5561 TTTT
325 TTTC
* ** **
5565 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCGAACGATTTTAAAAAACGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * **
5630 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCATGAGATCACCCATCCTAGTACTACTCTTTCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
5695 AGCACGCTTAACTGCGAAGTTCTAATGGGATCTGGTGCATTAGTGCTAGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
5760 CCTTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATACTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCTTGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * ** * *
5825 CTCACGGGTTTATAATTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCGGTTAAGAAGGTTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
5890 TTC
326 TTC
* * * *
5893 GAAATTTTTTCC-CAAATTATGGGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATGTTAAAGAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * * *
5956 AAAAAGATGGGATTGCAACACGAGGACTTCCCACAAGGTCAACCATACTAGTACTACTCTCACGC
66 AAAAAGATGGG-GTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * ** *
6021 AAGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATTGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* *
6086 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCCCTGTCACCCTTGTGGGCCCGTG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
** * *
6151 TCTCACGATTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAATG-T
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
*
6215 TTTT
325 TTTC
*
6219 GAAAATTTTTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
6282 AAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
6347 AGCACGCTTAATTGTGGAGTTTTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * *
6412 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATAGTACCCTTTCTCGCTCAGTCACCCTTGTGGGCTCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * *
6477 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTTATTCGGTTTTTTTAGTTCATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
6542 TTC
326 TTC
* * * * *
6545 AAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCATATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
6610 AAAAAGATTGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACACTCGCCTA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * * *
6675 AGCACGCTTAACTACGGAGTTCTGATGAGATCTGTTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * * *
6740 CCTTTTTGCCATCACAAACTACAAAAACCATCCTTTCTAGCTCTG-CAACCCTTGTGGGCCCTTG
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTC-ACCCTTGTGGGCCCATG
* * * *
6804 TCTCACGGGTTTATATTTTGCTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTAAGTTAAGAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
6869 TTTC
325 TTTC
* * * *
6873 GAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATGTTAAAGAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * *
6937 AAAAAGATGAGGTGCAAACACGAGGACTTCCCATGAGGTCACCCATACTAGCACTACTCTCACCC
66 AAAAAGATGGGGTGC-AACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * * ** * *
7002 GAGCACGCTTAACTACGGAGTGCTGATGGTATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAA
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * *
7067 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTC-CCCTGTCACCCTTGTGGGCCCATT
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * *
7131 TCTCACGAGTTTATATTTTTCTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTCGGTTAATAAGGT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGC
*
7196 TTTTT
324 TTTTC
*
7201 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCGAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
7265 AAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTTGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* *
7330 AGCATGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
7395 CCCTTTTCCCATAACAAACTACAAATACTACCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGAGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * *
7460 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTTATTCGGTTTTTTCAGTTCATAACGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
7525 TTC
326 TTC
* * *
7528 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCAAATCCAGCGAGGTT-AAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* *
7592 AAAAGGATGGGGTGCAACACTGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCTCGCCC
66 AAAAAGATGGGGTGCAACAC-GAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * * *
7657 AAGCACGCTTCACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCTGTGCATTAGTACTAGTATGATCACACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * ** * * *
7722 CTCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTTACCCCGTCACCCTTGTGGGCCCAAG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * * * ** *
7787 TCTCATGGGATTATATTTTACTCGATCAAACATCAGTTGCTTTAGTTTTTTTCAGTTAATAAAGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGC
7852 TTTTC
324 TTTTC
* * * ** *
7857 GAAATTTTTTTCTAAAATTATGTGACACCTCAACCCAAATAGAACGAGTTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
7922 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCGAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC-CAGCCC
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC-GCCC
* *
7986 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTAATGGGATCCGGTGCTTTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* *
8051 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATAACATCCTTTCTCGCTCCGTCACCCTTGTGGGCCCATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * *
8116 TCTCACGGGTTTATATTTTAGTCGATTAAACATCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
*
8181 TTTT
325 TTTC
* * *
8185 GAAATTTTTTCCTGAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCGACGAGGTTAAAAAACAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
8250 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGTTCACCCATCCTAGTACTACTTTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* **
8315 AGCACGCTTAACAGCGGAGTTCTGATGGGATATGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * **
8380 CCTTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCTTTGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * *
8445 CTCACAGGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCAGTTAATTCGGTTTTTTTCGGTTAAGAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGCT
8510 TTTC
325 TTTC
* * * *
8514 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTCGACCCAAATCCAACGACGTTAAAGAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* *
8578 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCTCACCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * * ** *
8643 AGCACGCTTAACTACAGAGTTCTAATAGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* *
8708 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTCCTCGCCCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * *
8773 CTCACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGTTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
*
8838 TTT
326 TTC
*
8841 GAAATTTTCTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
8905 AAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * * *
8970 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTAATGGGATCCGGTGCATTAGTGCGGGAACGGTCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
9035 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTACCCTTTCTCGCTCGGTCACCCTTGTAGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* ** * * *
9100 CTCACGGGTTTATATTTTACTAGATTAAACGTCAGTTTTTTCAGTTTTTTCAGTTCATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
9165 TTC
326 TTC
* * * *
9168 AAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
9233 AAAAAGATGGGGAGCAACACGAGGGCTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACACTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
9298 AGCACGCTTAACTACGGTGTTCTGATGGGATCTGTTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * * *
9363 CCTTTTTGCCATCACAAACTACAAAAACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTATGGGCCCTTGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
** * ** *
9428 CTCACGGGTTTATATTTGGCTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCGGTTAAGAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
9493 TTC
326 TTC
* * * *
9496 GAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAACGATGTTAAAGAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * *
9560 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGCACTACTCTCACCCG
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * ** *
9625 AGCACGCTTAACTACGGAGTGCTGATGGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * *
9690 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCCCTGTCACACATGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* *
9755 CTCACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
*
9820 TTT
326 TTC
* *
9823 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGT-ACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAGATATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
9887 AAAAAGATGAGGCGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCCCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
9952 AGCATGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCACTAGTGCTGGTACGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* *
10017 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACTACCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* ** * *
10082 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTTATTCAATTTTTTCAGTTTATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
10147 TTC
326 TTC
* * *
10150 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGAGACTCGTTAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* *
10215 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACACTCGCCTA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
10280 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGATATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * * * *
10345 CTTTTTTGCAACAACGAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCGTTGTTGGCCCATAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * *
10410 CTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTCAAG-TATTAAGGC
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT--AGTTAATAAGGC
10474 -TTTC
324 TTTTC
*
10478 TGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACCCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
*
10543 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * *
10608 AAGCACGCTTCACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCTGTGCATTAGTGCTAGTATGATCACACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * * ** * * *
10673 CTCTTTTTCCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTTACCCCGTCACCCTTGTGGGCCCAAG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * * * *
10738 TCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATCAAACATCAGTTGCTTCAGTTTTTTTCAGTTAATAAAGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGC
10803 TTTTC
324 TTTTC
* * * *
10808 GAAATTTTTTTCTAAAATTATGTGACACATCAACCCAAATACAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
10873 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCATAGTACTACACTCGCCTA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
10938 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGATATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * * * *
11003 CTTTTTTGCAACAACGAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCGTTGTTGGCCCATAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * * *
11068 CTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGGTATTAAGGC-
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGCT
11132 TTTC
325 TTTC
*
11136 TGAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACCCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
11201 TAAAAAGTTGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* * * * *
11266 AAGCACGCTTCACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCTGTGCATTAGTGCTAGTATGATCACGCCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * ** * * * *
11331 CTCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCATTTCTTACCCCGTCACCCTCGTGGGCCCAAG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * * ** *
11396 TCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATCAAACATCAGTTGCTTTAGTTTTTTTCAGTTAATAAAGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGC
11461 TTTTC
324 TTTTC
* * * * *
11466 GAAATTTTTTTCTAAAATTATGTGACACATCAACCCAAATACAACGAGGTTAAAAAATAAAAATG
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* *
11531 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC-CAGCCC
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTC-GCCC
* * * *
11595 AAGCACGCTTAATTGCGAAGTTTTGATGGGATCCGGTGCTTTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
*
11660 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * *
11725 TCTCACGGGTTTATATTTTAGTCGATTAAACATCAGTTGATTCAGTTTTTTTCAGTTAATAAGGC
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGC
*
11790 TTTTT
324 TTTTC
* * * * **
11795 GAAATTTTTTCCTGAAATTGTGTGACTCGTCAGCCCAAATCGAACGAGGTTAAAAAACGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
11860 AAAAAGATGGGGTGCAACACGTGGGCTTCCCACGAGTTCACCCATCCTAGTACTACTTTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * **
11925 CGCACGCTTAACAGCGGTGTTCTGATGGGATATGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * *
11990 CATTTTTGCCATCACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCCGTCACCATTGTTGGCCCATAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * * *
12055 CTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTTAAGTTAAGAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
12120 TTC
326 TTC
* * * *
12123 GAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTC-ACCCAAATCCAACGACGTTAAAGAAT-AAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* *
12186 AAAAAGATGGGGTGTAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATACTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * ** * *
12251 AGCACGCTTAACTACGGAGTGCTGATGGGATCCAATGTATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAAC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * *
12316 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCCCTGTCACCCTTGTAGGCCCATTT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * *
12381 CTCATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACATTAGTTGATTCGGTTTTTTTCAGTTAATAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGCT
*
12446 TTCC
325 TTTC
* * * * * *
12450 GAATTTTTTTTCTAAAATTATGTGACACGTCAACCCAAATACAATGAGGTT-AAAAATAAAAATC
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * *
12514 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACATCCCAGGAGGTCACCCATCTTAGTGCTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
12579 AGCACACTTAACAGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCTTTAGTGCTGGTATGATAGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * * *
12644 CCCTTTTGCCATAACAAACGACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCAACCTTATGGGCTCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* *
12709 CTCACAGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
*
12774 TTT
326 TTC
*
12777 GAAATTTTTTCTTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
12842 AAAATGATGGGTTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACACATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
12907 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGGTATGATCGCATCGATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * * ** * *
12972 CTTTTTTGCAACAACAAACTGCAAATATCATCCTTTCTCGCTCCGTCACTGTTGTTGGCCCATAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * ** * *
13037 CTTATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAATTTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAATAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-TAGTTAATAAGGCT
*
13102 TTTT
325 TTTC
* * * * *
13106 GAATTTTTTTCCTAAATTTATGTGACTCGTCAACCTAAATCGAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
13171 AAAAAGATGGGGTGCAACGCGAGGACTTCCCTCGAGGTCACCCATCCTAGTACTAATCTCGCCAA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* *
13236 AGCACGCCTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCACCCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
* * **
13301 CCCTTTTGCCATAACAAACAACAAATACCATCCTTTTTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTTATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* **
13366 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTCCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
13431 TTC
326 TTC
* * * * * * * *
13434 GAAATTTTTTTC-AAACATTATATGGCACGTCAATCCAAATACAACGAGATTAAAAAATAAAAAA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
13498 TAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG-CC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
*
13562 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATTGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* *
13627 CCCTTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCTTTGTGGGCCCAT
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCCAT
* * *
13691 GTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAA-CAGA
259 GTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-TAGTTAATAAG-
*
13755 GCTTTTT
322 GCTTTTC
* *
13762 GAATTTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * * * *
13827 AAAAAGATGAGGTGCAACACAAGTACTTCCAACGAGGTCACCCATCCAAGTACTACTCTCGCCAA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
13892 AGCACGCTTAACTGAGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACTCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
*
13957 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCGTGTGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * *
14022 CTCACGGGCTTATATTTTACTCGACTAAACGTCAGTTGATTCAGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
*
14087 TTT
326 TTC
*
14090 GAAATTTTTTCTTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
14155 AAAATGATGGGTTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACACATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
14220 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGTTGGTATGATCGCACCGATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
** * * * * * ** * *
14285 CATTTTTGCAACAACAAACTGCAAATATCATCCTTTCTCGCTCCGTCACTGTTGTTGGCCCATAT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * * * *
14350 CTTACGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACATCTGTTGATTCGGTTTTTTTCAGGTAATAA--CT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTT-AGTTAATAAGGCT
14413 CTTTC
325 -TTTC
* * * *
14418 TAAAATTTTTTCCTCAAATTCTGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATGAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* * *
14483 TAAAAAGATGGGGTGCAGCACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCATAGTACTACTCTCGCCA
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* *
14548 AAGCACGCCTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATTGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* * * **
14613 CCCCTTTTGCCATAACAAACTAAAAATACCATCATTTTTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTTATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * **
14678 TCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATTAAATGTCAGTTGATTCGGTTTTTCCAGTTAATAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
14743 TTTC
325 TTTC
* * * * * *
14747 GAAATTTTTTTC-AAACATTATATGGCAT-GTCAATCCAAATACAACGAGATTAAAAAATAAAAA
1 GAAATTTTTTCCTAAA-ATTATGTGAC-TCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAA
* * *
14810 ATAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCG-C
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14874 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
129 CAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCA
*
14939 TCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTTC-CCTTTGTGGGCCCA
194 TCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTG-TCACCCTTGTGGGCCCA
* * * * *
15003 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAAAGTCAGTTGATTCGATTTTTTACAGTTAACAGG
258 TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTT-TAGTTAATAAG
*
15068 GCTTTTT
322 GCTTTTC
* * *
15075 GAATTTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATTCAACGAGGTTAAAAAATGAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
15140 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGTACTTCCAACGAGGTCACCCATCCAAGTACTACTCTCG-CCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * *
15204 ATGCACGCTTAACTGAGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTGGTACGATCGCACCCAT
131 A-GCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
*
15269 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCGTGTGGGCCCATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* * * * *
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260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
15399 TTTC
325 TTTC
* * *
15403 GAAATTTTTTTCTAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGA-GAGGTTAAAAAATTAAAAT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCA-ACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* *
15467 TAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
65 TAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC
* *
15532 AAGCACGCTTGACTGCGGAGTTCTGATGTGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
130 AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCAT
* *
15597 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGCGCCCATG
195 CCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATG
* *
15662 TCTCACGGGTTTAAATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAAAAAGGCT
260 TCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCT
15727 TTTC
325 TTTC
* * * *
15731 AAAATTTTTTCTTAAAATTATGTGACTCGTC-ACCGAAATCCAACGGGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * *
15795 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGCTCACCCATCATAGTACTACTCTCGCCCA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* * * *
15860 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGTGCATTAGTGCTAGTACGATCGCACCCTTC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
*
15925 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTATGGGCCCATGT
196 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCATGT
* * *
15990 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAATTGATTCAGTTTTTTTAGTTACTAAGGCTT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGTTTTTTTAGTTAATAAGGCTT
16055 TTC
326 TTC
* * * *
16058 AAAATTTTTTCCTGAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAAAAATAAAAATT
1 GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATT
* * * *
16123 AAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGCACTACTCTCGCCGA
66 AAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
* *
16188 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCACTAGTGCTGGTATGATCGCACGCATC
131 AGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATC
*
16253 CCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTATGGGCCCATGT
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* * *
16318 CTCACGGGTTTATATTTTACTTGATTAAACGTTAGTTGATTCGGTTTTTTTTAGTCAATAAGGCT
261 CTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGG-TTTTTTTAGTTAATAAGGCT
16383 TTTC
325 TTTC
* * * *
16387 GAAATTTTTTCCCAAAATTATGAGACTCGTCAACCCAAATCCAGCGAGGTTAAGAAATAAAAATT
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*
16452 AAAAAGATGGGGTACAACACGAGGACTTCCCACGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCA
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* * *
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** * * * * * ** * *
16582 CTTTTTTGCAACAACAAACTGCAAATATCATCCTTTCTCGCTTTGTCACTGTTGTTGGCCCATAT
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* * * * *
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*
16715 TAAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
1 -GAAATTTTTTCCTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAAT
* * * *
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* * *** ** *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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* * *
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* * *
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* *
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*
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* * *
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* * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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*
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* * **
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*
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** * * * * * * * ** * *
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* * * * * * *
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*
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* * *
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* *
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**
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* * * ** *
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** * *
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*
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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326 TTC
* * * * * * * *
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** * * ** *
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* * *
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* *
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*
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* * *
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* * * *
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* * * *
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*
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*
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* * ** *
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*
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* * *
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*
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*
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** * *
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* * * *
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* * * * * *
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325 TCTG
* * *
30911 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTCATATTTTACTTGATTAAACGTCAGCTGATTTGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * *
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* *
31041 AACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATAGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACC
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31106 CATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTA
196 CATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTA
*
31171 GTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAA-ACCATCCTTTCTCGGT
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326 CTG
** * **
31238 TTTCCCTTGTGGGCCCATGTCCCGTGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* *
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* *
31367 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACATGAAGACTTCCCAAGAGGTCAC
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* * * **
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* *
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*
31561 TCAG
325 TCTG
** * * *
31565 TTTCCCTTGTGGGCTCATGTCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTAATTCGGT
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* * * *
31630 TTTTTCAGTTAATAAGGCATTC-CAATATTTTTCCGTAAAATTATGTGACTCATCAACCCAAATC
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* * *
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** * * *
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* * * *
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325 TCTG
* * *
31892 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTTCTCGATTAAACGTCAGCTAATTCGAT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * * * *
31957 TTTTACAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTTGTAAAATTATGTGGCTCATCAACCCAAATCT
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* *
32022 AACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACC
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*
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* * * *
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326 CTG
* * *
32220 TTC-CCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGAATCGA
1 -TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG
* * * *
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* * * *
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*
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* *
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** * ** *
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1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * * *
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*
32677 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACATGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
*
32742 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTAATGGGATCCGGTGCATT
195 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
* *
32807 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAGAAACTACAAATGCCATCCTTTCTCGC
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32872 TCTG
325 TCTG
* * * *
32876 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGAGTTTATATTTTACACGATTAAACGTAAGCTGATTCGAT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * *
32941 TTTTTTAGTAAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
66 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAA-TTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
* * * * * *
33006 CATCGGAGCTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGAGGTGCAACACGAGGACTTCTCAGGAGGTCAC
130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
* * * *
33071 CCATCCTAGTACTACTTTCGCCTAAGCACGCTTAACTGCAGAGTTCTGATGAGATCCGGTGCATT
195 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
* *
33136 AGTGCTGGTATGATCGCACGCATCCCCTTTTGCCATAACAAACGACAAATACCATCCTTTCTCGC
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33201 TCTG
325 TCTG
* * *
33205 TCACCCTTTTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTAAATTTTACTCGATTAAACATCAGCTGATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
*
33270 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTC-GAAAATTTGTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
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* * * *
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130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
* * * * *
33399 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTTACTACGGAGTTCAGATGAGATCCGGTGTATT
195 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
* * *
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325 TCTG
* * *
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1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* **
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*
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*
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*
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326 CTG
** * * *
33857 TTTCCCTTGTGGGCCCATGTCTCATGAGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGTTGATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * *
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* *
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*
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34179 CTCTG
324 CTCTG
* * *
34184 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATAAAACGTTAGCTAATTCGG-
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* *
34248 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAAATTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCA
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*
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*
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** *
34510 TTTCCCTTGTGGGCCCATGTCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * * * *
34575 TTTTTCAATTAATGAGGCATTC-AAATATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTGAACCCAAATC
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34639 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
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*
34704 CCATCCTAGTACTACTCTCGTCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
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* * * * *
34769 AGAGTTGCTATGATCGCACCCATCCCCTTTTAG-CATAACAAACGACAAAAACCATCCTTTCTCG
260 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTT-GCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCG
34833 CTCTG
324 CTCTG
*
34838 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTCATATTTTACTCGATTAAAACGTCAGCTGATTCGG
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATT-AAACGTCAGCTGATTCGG
* *
34903 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTAAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGGCTCGTCAACCCAAATC
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* * *
34968 CAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATAGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAAGTCAC
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*
35098 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAC-AACTACAAA-ACCATCCTTTCTCGG
260 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC
*
35161 TTTG
325 TCTG
** * ** * *
35165 TTTCCCTTGTGGGCCCATGTCCCGTGGGTTTATATTTTACTCAATTAAACGTCAACTGATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG-
* *
35230 TTTTTTCAGTTAATAAGGCATTC-CAATATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT
65 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAA-ATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT
*
35294 CCAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACATGAGGACTTCCCAAGAGGGTC
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* *
35359 ACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTAATGGGATCCGATGCA
193 ACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCA
*
35424 TTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTACCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTC
258 TTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTC
35489 GCTCTG
323 GCTCTG
* * * * *
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1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
*
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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325 TCTG
* *
35822 TCACCCTTTTGGGCCCATGTCTCACGGG-TTA-ATTTTACTCGATTAAACATCAGCTGATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
35885 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTC-GAAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
66 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTG-AAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
* * * *
35949 C-ACGAGGTTTAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGATTTCCCAGGAGGTCAC
130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
* * * * *
36013 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACTCTTTACTACGGAGTTCTGATGAGATCCGGTGTATT
195 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
* * *
36078 AGTGCTAGTATGATTGCACCCATCCCCGTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC
260 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC
36143 TCTG
325 TCTG
* * *
36147 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTTACTCGATAAAACGTTAGCTAATTCGG
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATA-TTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG
*
36212 -TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAAATTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
65 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
* *
36276 AAACGAAGTTAAAAAAAAAAAATT-AAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
*
36340 CCATCCTAGTACCACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
195 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
*
36405 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAA-ACCATCCTTTCTCGG
260 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC
36469 TCTG
325 TCTG
** * *
36473 TTTCCCTTGTGAGCCCATGTCTCATGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTC-GT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * * * *
36537 TTCTTCAATTAATGAGGCATTC-GAATATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTTAACCCAAATC
66 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAA-ATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
36601 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATT-AAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
* * *
36665 CCATCCTAGTACTACTCTCG-CCATGCACGCTT-ACTGCAGAGTTCTGATGGGATCCGATGCAAT
195 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGC-AT
* * *
36728 TAGTGCTGGTAATGATCGCACCCATCTCTTTTTGCCATAACAAACAACAAA-ACCATCCTTTCTC
259 TAGTGCTGGT-ATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTC
*
36792 GATCTG
323 GCTCTG
** * *
36798 TTTCCCTTGTGGGCCCATGTCTCATGGGTTTATATTTTTACTCGATTAAACGTGAGCTGATTCGG
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATA-TTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG
* * *
36863 TTTTTTTCAATTAATGAGGCATTC-G-AATATTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAA
65 -TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAAT-TTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAA
*
36926 TCCAACGAAGTTAAAAAA-GAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCCAAGAGGT
128 TCCAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTT-CCCAAGAGGT
*
36990 CACCCATCACTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCAGT
192 CACCCATC-CTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTT-AACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGT
* * *
37055 GCATTAGAGCTGCTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTAATAAATACCATCCTT
255 GCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACT-ACAAATACCATCCTT
37120 TCTCGCTCTG
319 TCTCGCTCTG
* * * * *
37130 TTACCCTTATGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTAATTCGAT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCG-G
* *
37195 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTTTCCGAAATTTTTTTGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCC-AA
65 TTTTTTCAGTTAATAAGGC--TTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAA
*
37259 TCCAACGAAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGTAACACGAGGACTTCCC-AGAAGG
128 TCCAACG-AAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAG-AGG
*
37323 TCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCTAAGCACGCTTAACTGCAGAGTTCTGATGGGATCCGGT
191 TCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCC-AAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGT
* * * *
37388 GCATTTGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCC-TAACAAACGACAACTACTATCCTTT
255 GCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTT
37452 CTCGCTCTG
320 CTCGCTCTG
* * * *
37461 TAACACTTGTGGG-CCATGTCTTACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGAT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCG-G
* *
37525 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAATTTTTTTGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
65 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATC
* *
37590 C-ACGAAGTTAAAAAATAAAAATT-AAAAGAT-GGGTGTAACACGAGGACTT-CC-AGAAGGTCG
130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAG-AGGTCA
* * * * *
37650 CCCATCTTAGTACTACTCTCGCCTAAGCCCTCTTAACTGCAGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAT
194 CCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAT
* * *
37715 TAGAGCTGCTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACAACAAATACCATCCTTTCTCG
259 TAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCG
37780 CTCTG
324 CTCTG
* * * *
37785 TTACCCTTATGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTC-GA
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * *
37849 TTTTCCAGTTAATAAGACTTTCCGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT-C
66 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCC
* * *
37913 AACGAAGTGAAAAAATAAAAA--AAAAATATGGGGTGCAACACGAGGACTTCGC-AGAAGGTCAC
131 AACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAG-AGGTCAC
* * * *
37975 CCATCCTAGTATTACTCTCGCCTAAGCACGCTTAACTGCAGAGTTCTGATGGGATTCGGTGCATT
195 CCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATT
* * * * *
38040 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTACAATAACAAACGATAAAAACCATCCTTTCTCGC
260 AGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGC
38105 TCTG
325 TCTG
*
38109 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCGGCTGATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * * * *
38174 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTC-CAAAATTTTTCATCAAGTTATGTGACTCGTCAACCCAAATCC
66 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCC
* * * *
38238 AACGAGGTTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATAGGGCGCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCCA
131 AACGAAG-TTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGT-CA
* ** * *
38303 CCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCGAGCACGCTTAACTGTAGAGTTCTAATGGGATCC-GAGCAT
194 CCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCAT
* *
38367 TAGTGCAGGTGTGATCGCACCCAT-CCCTGTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTC
259 TAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCT-TTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTC
38431 G-TCTG
323 GCTCTG
* * * **
38436 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTTTATGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGCTGATTCTA
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTC-TCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGG
* * * * * *
38501 TTTTTTCAGTTGATAAGGCTTTCCGAAAATTTTATCATAAGATTAT-TGACTCGTCATCCCAAAT
65 TTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTG-AAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAAT
* * * * *
38565 CCAACTAGGTTAAAAAATAAAAAGTAAAAAGATGGGGTGAAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCA
129 CCAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCA
* * * ***
38630 CCCATCCTAGTAATACTCTCGCGCAAGCACACTTAACTGTAAAGTTCTGATGGGATCCGGTAG-A
194 CCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGT-GCA
* **
38694 TTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAACTATTATCCTTTCCT
258 TTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTT-CT
38759 CGCTCTG
322 CGCTCTG
* * * * * *
38766 TCACCATTGCGGGCTCATGTCTCACGTGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTTAGCTGATTTGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
* * * *
38831 TTTTTCACTTAATAAGGCTTT-TCGAATTTTTTTCATAAAATTATGCGACTCGTCCAACCCAAAT
66 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCT-GAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGT-CAACCCAAAT
* * *
38895 CCAACGACGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGTTGGGGTGCAACACGAGAACTTCCCAA-AGGTCA
129 CCAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCA
* * * *
38959 CCCCATCCTAGTACTACTCTCGCCTAAGTACGCTTAACTACGGAGTTCTGATTGGATCCGGTGCA
194 -CCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCA
* * *
39024 TTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTT-CGATAAAAAAACTACAAATATCATCCTTTCT
258 TTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCAT-AACAAACTACAAATACCATCCTTTCT
39088 CGCTCTG
322 CGCTCTG
* * *
39095 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGCTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCGGCTTATTCGGT
1 TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
** * * *
39160 TTTTTCAGTTAAT-AGGCTTTCCAAAATTTTCTCATAAAGTTATGGTGACTCGTCAA-CCAAATC
66 TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTAT-GTGACTCGTCAACCCAAATC
* * * * *
39223 CAATGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAA-A--GGGTGCAACACGAGAACTTCCCAGGAGCTCAC
130 CAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCAC
* * *
39285 CCATCCTAAT-CTA-TACTCGCCCAAAGCTCGCTTAACTACGGAGTTCTGTTCTGATGGGA--CG
195 CCATCCTAGTACTACT-CTCGCCC-AAGCACGCTTAACTGCGGA-----GTTCTGATGGGATCCG
* * *
39346 GTGCA-TCGTGCTGGTATGATCGCACCCATCACCTTTTGCCATAACAAACTACAAATAGCATCCT
253 GTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCT
*
39410 TTCTCGCATCCTTTC
318 TTCTCGC-T-C--TG
* * *
39425 TCGCACTCTATCACCCTGGGCCCATTGTCTCACGGGTTTATTTTTTACTCGATTAAACGTCAGCT
1 T--CACCCT-T----GTGGGCCCA-TGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCT
* * * *
39490 TA-GCGGTTTTTTCAGTTAAT-AGGCTTTCCGAAATTTTTTCAT-AAATTATGTGATCTCGTCAA
58 GATTCGGTTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGA-CTCGTCAA
**
39552 CCCCCATCCAACG-AGTTAAAAAATAAAAATTAAAAA-ATGGGGTGCAAC
122 CCCAAATCCAACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAAC
39600 CAGTCAAAAA
Statistics
Matches: 8809, Mismatches: 723, Indels: 270
0.90 0.07 0.03
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.29, C:0.24, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (328 bp):
TCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGT
TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCTGAAATTTTTTCGTAAAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCC
AACGAAGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACC
CATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGATCCGGTGCATTA
GTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAAACTACAAATACCATCCTTTCTCGCT
CTG
Found at i:39420 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 39403--39429 Score: 54
Period size: 12 Copynumber: 2.2 Consensus size: 12
39393 ACTACAAATA
39403 GCATCCTTTCTC
1 GCATCCTTTCTC
39415 GCATCCTTTCTC
1 GCATCCTTTCTC
39427 GCA
1 GCA
39430 CTCTATCACC
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
12 15 1.00
ACGTcount: A:0.11, C:0.41, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (12 bp):
GCATCCTTTCTC
Found at i:42088 original size:974 final size:968
Alignment explanation
Indices: 39624--42512 Score: 4272
Period size: 974 Copynumber: 3.0 Consensus size: 968
39614 AATTAAAAAA
* *
39624 ATGGGATCCGGTGTATTAGTGCTGGTATGATCGCCACCCATCCCCCTTTGCCAAAACAAACTACA
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG-CACCCATCCCCTTTTGCCAAAACAAACTACA
*** *
39689 AATACCAGCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCGTTGTCTCAT-GGTTTGTTTTTTACTCG
65 AATACC-GCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTT-TGTTTTACTCG
39753 ATTAAACGTCAGCTGATTCGATTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAATATTTTTCATAAAATTA
128 ATTAAACGTCAGCTGATTCGATTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAATATTTTTCATAAAATTA
* * *
39818 TGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAA-A-ATAAAATTAAAAAGATGGGGTGCAACA
193 TGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC-AGGTTAAAATATAAAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCAACA
* * * * *
39881 CGAGGACTTCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTAATCTGCGCCGAAGCACGCTTAACTGCAAAG
257 CGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT-CGCCCAAGCACGCTTAACTACAGAG
* * * * * * * * *
39946 TTCTGA-CGGA-TCGGTGTATTAGTGCTAGT-TAATCGCACCCATCCCCTTTTTCCCT-AACAAC
321 TTCTGATGGGATTCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATTCCCATTTGCCATAAAAAAC
* * * * *
40007 TGA-AACTA-TATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTG-CGGCTCATGTCTCACGGGTTT-TATTTT
386 T-ACAAATACCATCC-TTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTT
* * * ** * **
40068 AATCGATTAAACGT-TGCTGATTTGGTTTTTTCACTTAATAAGGCTTTCCGAATTTTTTTCAATA
449 ACTCGATTAAACGTCGGATGATTCAG-TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCC-AAACTTTTTC-ATA
* *
40132 --TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAATTAAAAAGTTGGGGTG-A
511 GGTTATGTGACTCGTCAACCAAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAATTAAAAA-ATGGGGTGCA
* * * *
40194 ACACGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTA-AACTACTCTCGCCCA-GCACGCTT-ACTACG
575 TCACGAGGACTT-CCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGCG
* ** * *
40256 GAGTTCTGATTGGATCCGGTGCTTTAGTGATGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAAA
639 GAGTTCTGA-TGGATCCGGTGCATTAGTGCCGGTATGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCAT-AAC
* * * ** * *
40321 AAACTACAATATCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA-GTCTCA--CGTTTAT-AT
702 ATA-TACAATACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTT
* * * * * * *
40382 TTACTCGATTAAACGTCGGCTGATTCG-GTTTTTCA-GTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTGATA
766 TTACTCGATTAAACGTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTCATA
*
40445 AAGTTA-GTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGA-T-GGGT
831 AAATTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTT-AAAAATAAAAATTAAAAA-ATTAGGGT
*
40507 GCAACACGAGGACTT-CCAGGAGGTCACCCCTCCTA-TCTACTCTTCGCCCAAGCACGCTTAACT
894 GCAACACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTCTACTC-TCGCCCAAGCACGCTTAACT
40570 GCGGAGTTCTG
958 GCGGAGTTCTG
* *
40581 TTGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGATATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCAAAACAAACTACAA
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCAAAACAAACTACAA
* * * * *
40646 ATACCAACTTTTCTCGCTCTGTCACCC-TGTGGGCTCA--TCTCACGGGTTTGTATTTTACTCGA
66 ATACC-GCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTT-TGTTTTACTCGA
* * *
40708 TTAAACGTCAACTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAAATTTTTCATAAAATTA
129 TTAAACGTCAGCTGATTCGATTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCG-AATATTTTTCATAAAATTA
*
40773 TGTGACTCGTCAACCCAAATACAACGAGGTTAAAATAT-AAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCAACA
193 TGTGACTCGTCAACCCAAATCCAAC-AGGTTAAAATATAAAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCAACA
*
40837 CGAGGACTTCCAGGAGGTCACCC-TCCTAGTACTACTCTCG-CCAAG--CGCTTAA-AACAGAGT
257 CGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTACAGAGT
40897 TCTGATGGGATTCGGTGCA-TAGTGCTGGTATGATCGCA-CCATTCCCATTTGCCATAAAAAAAC
322 TCTGATGGGATTCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATTCCCATTTGCCAT-AAAAAAC
*
40960 TGCAAATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTA
386 TACAAATACCATCC-TTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTA
41025 CTCGATTAAACGTCGGATGATTCAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAC-TTTTCATAAGGT
450 CTCGATTAAACGTCGGATGATTCAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAACTTTTTCAT-AGGT
41089 TATGTGACTCGTCAACCCAAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAGTTAAAAAATGGGGTGCATC
514 TATGTGACTCGTCAA-CCAAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAA-TTAAAAAATGGGGTGCATC
41154 ACGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGCGGAG
577 ACGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGCGGAG
41219 TTCTGATGGGATCCGGTGCATTAGTGCCGGTATGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACATAT
642 TTCTGAT-GGATCCGGTGCATTAGTGCCGGTATGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACATAT
*
41284 ACAA-ACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTTATGGGTTTATGTTTTACT
706 ACAATACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTTACT
41348 CGATT-AACGTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTTCATAAAAT
771 CGATTAAACGTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAA-TTTTTTCATAAAAT
41412 TATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAACA
835 TATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAACA
*
41477 CGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAG
900 CGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGT-CTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAG
41542 TTCTG
964 TTCTG
* *
41547 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAATA-TACA
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCAAAACAA-ACTACA
41611 AATACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTACTACT
65 AATACCG-CCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTT-TGTTT--TACT
* * * *
41676 CGATTAAACGTCAGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAAGGCTTTTCGAATTTTTTTCATAAAA
126 CGATTAAACGTCAGCTGATTCGATTTTTTCAGTTAAT-AAGGCTTTCCGAATATTTTTCATAAAA
41741 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAA-AGGTTAAAATATAAAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCAA
190 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACAGGTTAAAATATAAAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCAA
41805 CACGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTACAGA
255 CACGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTACAGA
41870 GTTCTGATGGGATTCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATTCCCATTTGCCATAAAAAA
320 GTTCTGATGGGATTCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATTCCCATTTGCCATAAAAAA
41935 CTACAAATACCATCC-TCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTA
385 CTACAAATACCATCCTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTA
41999 CTCGATTAAACGTCGGATGATTCAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAACTTTTTCATAGGT
450 CTCGATTAAACGTCGGATGATTCAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCC-AAACTTTTTCATAGGT
*
42064 TATGTGACTCGTCAACCTAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAATGGGGTGCATCA
514 TATGTGACTCGTCAACCAAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT-AAAATTAAAAAATGGGGTGCATCA
42129 CGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGC-GAGT
578 CGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGCGGAGT
42193 TCTGATGGATCCGGTGCATTAGTGCCGGTATGGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAATAT
643 TCTGATGGATCCGGTGCATTAGTGCCGGTAT-GACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAC-ATAT
42258 ACAAATACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTTAC
706 AC-AATACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTTAC
42323 TCGATTAAACGTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTCATAAAAT
770 TCGATTAAACGTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTCATAAAAT
*
42388 TATGTGACTCGTCAACCCAATCATCC-ACGAGTTTAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAA
835 TATGTGACTCGTCAACCCAA--ATCCAACGAGGTTAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAA
42452 CACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTCCTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACT
898 CACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGT-CTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACT
42513 TTGTAACAAA
Statistics
Matches: 1768, Mismatches: 101, Indels: 106
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
950 10 0.01
951 32 0.02
952 14 0.01
953 21 0.01
954 92 0.05
955 94 0.05
956 159 0.09
957 123 0.07
958 43 0.02
959 13 0.01
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977 157 0.09
978 4 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.24, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (968 bp):
ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCAAAACAAACTACAA
ATACCGCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTTGTTTTACTCGATT
AAACGTCAGCTGATTCGATTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAATATTTTTCATAAAATTATGT
GACTCGTCAACCCAAATCCAACAGGTTAAAATATAAAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCAACACGAG
GACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTACAGAGTTCTG
ATGGGATTCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATTCCCATTTGCCATAAAAAACTACAA
ATACCATCCTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAT
TAAACGTCGGATGATTCAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAACTTTTTCATAGGTTATGTGA
CTCGTCAACCAAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAATTAAAAAATGGGGTGCATCACGAGGACT
TCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGG
ATCCGGTGCATTAGTGCCGGTATGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACATATACAATACCGT
CCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTTACTCGATTAAACG
TCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTCG
TCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAACACGAGGACTTCC
CAGGAGGTCACCCATCCTAGTCTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTG
Found at i:42181 original size:322 final size:325
Alignment explanation
Indices: 39624--42512 Score: 3757
Period size: 323 Copynumber: 9.0 Consensus size: 325
39614 AATTAAAAAA
* *
39624 ATGGGATCCGGTGTATTAGTGCTGGTATGATCGCCACCCATCCCCCTTTGCCA-AAACAAACTAC
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCG-CACCCATCCCCTTTTGCCATAAA-AAACTAC
* * * * *
39688 AAATACCAGCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGC-CGTTGTCTCA-TGGTTTGTTTTTTACT
64 AAATACCATCC-TTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTC-ATGTCTCACGGGTTTATATTTTACT
* * *
39751 CGATTAAACGTCAGCTGATTCGATTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCC-GAATATTTTTCATAAAA
127 CGATTAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAAT-TTTTTCATAAAA
39815 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT-AAAATTAAAAAGATGGGGTGCAA
191 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAA-ATGGGGTGCAA
* * * **
39879 CACGAGGACTTCCAAGAGGTCACCCATCCTAGTACTAATCTGCGCCGAAGCACGCTTAACTGCAA
255 CACGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCT-CGCCCAAGCACGCTTAACTGCGG
39944 AGTTCTG
319 AGTTCTG
* * * * * * *
39951 A-CGGAT-CGGTGTATTAGTGCTAGT-TAATCGCACCCATCCCCTTTTTCCCT-AACAACTGA-A
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAAAAACT-ACA
* * * *
40011 ACTA-TATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTG-CGGCTCATGTCTCACGGGTTT-TATTTTAATCG
65 AATACCATCC-TTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCG
* * * * * *
40073 ATTAAACGT-TGCTGATTTG-GTTTTTTCACTTAATAAGGCTTTCCGAATTTTTTTC--AATATT
129 ATTAAACGTCGGCTGATTCGAG-TTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAATT
*
40134 ATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT-AAAATTAAAAAGTTGGGGTG-AACA
193 ATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAA-ATGGGGTGCAACA
* * *
40197 CGAGGACTTCCCAAGAGGTCACCCATCCTA-AACTACTCTCGCCC-AGCACGCTT-ACTACGGAG
257 CGAGGACTT-CCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAG
40259 TTCTG
321 TTCTG
* * *
40264 ATTGGATCCGGTGCTTTAGTGATGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAAAAAACTAC-
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCAT-AAAAAACTACA
* *
40328 AATATCATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCCCA-GTCTCAC--GTTTATA-TTTACTCG
65 AATACCATCC-TTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCG
* *
40389 ATTAAACGTCGGCTGATTCG-GTTTTTCAG-TAATAAGGCTTTCCAAAA-TTTTTGATAAAGTTA
129 ATTAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAATTA
40451 -GTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGAT-GGGTGCAACAC
194 TGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAA-ATGGGGTGCAACAC
*
40514 GAGGACTTCCAGGAGGTCACCCCTCCTA-T-CTACTCTTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGT
258 GAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTC-TCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGT
40577 TCTG
322 TCTG
* *
40581 TTGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGATATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCA-AAACAAACTACA
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAA-AAACTACA
* * *
40645 AATACCAACTTTTCTCGCTCTGTCACCC-TGTGGGCTCA--TCTCACGGGTTTGTATTTTACTCG
65 AATACCATC-CTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCG
** *
40707 ATTAAACGTCAACTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCGAAAAATTTTTCATAAAATT
129 ATTAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCC-AAAATTTTTTCATAAAATT
* * **
40772 ATGTGACTCGTCAACCCAAATACAACGAGGTTAAAATATAAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCAACA
193 ATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTA-AAAAATGGGGTGCAACA
** *
40837 CGAGGACTTCCAGGAGGTCACCC-TCCTAGTACTACTCTCG-CCAAG--CGCTTAA-AACAGAGT
257 CGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGT
40897 TCTG
322 TCTG
* * * *
40901 ATGGGATTCGGTGCA-TAGTGCTGGTATGATCGCA-CCATTCCCATTTGCCATAAAAAAACTGCA
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCAT-AAAAAACTACA
* *
40964 AATACCATCCTTTCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCG
65 AATACCATCC-TTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCG
* * **
41029 ATTAAACGTCGGATGATTC-AGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCC-AAA-CTTTTCATAAGGTTA
129 ATTAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAATTA
* *
41091 TGTGACTCGTCAACCCAAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAGTTAAAAAATGGGGTGCATCAC
194 TGTGACTCGTCAACCC-AAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAATGGGGTGCAACAC
*
41156 GAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGCGGAGTT
258 GAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTT
41221 CTG
323 CTG
* * * *
41224 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCCGGTATGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACATA-TAC-A
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAAAAACTACAA
* * * * *
41287 A-ACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTTATGGGTTTATGTTTTACTCGA
66 ATACCATCC-TTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGA
* * * * * *
41351 TT-AACGTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTTCATAAAATTAT
130 TTAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAATTAT
*
41415 GTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTT-AAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAACACG
195 GTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAA-TGGGGTGCAACACG
*
41479 AGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTT
259 AGGACTT-CCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTT
41544 CTG
323 CTG
* *
41547 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAATA-TACA
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAA-AAAACTACA
* * * *
41611 AATACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTACTACT
65 AATACCATCC-TTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTT--TACT
* * * * * * *
41676 CGATTAAACGTCAGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAAGGCTTTTCGAATTTTTTTCATAAAA
127 CGATTAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAAT-AAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAA
* **
41741 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAA--AGGTTAAAATATAAAAAATTAGAAAGTTGGGGTGCA
191 TTATGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAAT-AAAAATTA-AAAAATGGGGTGCA
* *
41804 ACACGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTACAG
254 ACACGAGGACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGG
41869 AGTTCTG
319 AGTTCTG
* * *
41876 ATGGGATTCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATTCCCATTTGCCATAAAAAACTACAA
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAAAAACTACAA
* *
41941 ATACCATCC-TCTCGCTCTATCACCCTTGTGGGCCCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAT
66 ATACCATCCTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAT
* * **
42005 TAAACGTCGGATGATTC-AGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAACTTTTTCAT-AGGTTATG
131 TAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAATTATG
* *
42068 TGACTCGTCAACCTAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAATGGGGTGCATCACGAG
196 TGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAATGGGGTGCAACACGAG
*
42133 GACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCATGCACGCTTAACTGC-GAGTTCTG
261 GACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTG
* * *
42197 AT-GGATCCGGTGCATTAGTGCCGGTATGGACCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAACAATA-TAC
1 ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTAT-GATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAA-AAAACTAC
* * * *
42260 AAATACCGTCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTTACTC
64 AAATACCATCC-TTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTC
* * * * *
42325 GATTAAACGTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTC-GAATTTTTTCATAAAATT
128 GATTAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAATT
* *
42389 ATGTGACTCGTCAACCCAATCATCC-ACGA-GTTTAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAA
193 ATGTGACTCGTCAACCCAA--ATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAA-TGGGGTGCAA
*
42452 CACGAGGACTTCCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTCCTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACT
255 CACGAGGACTT-CCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACT
42513 TTGTAACAAA
Statistics
Matches: 2281, Mismatches: 200, Indels: 163
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
313 12 0.01
314 24 0.01
315 109 0.05
316 126 0.06
317 188 0.08
318 143 0.06
319 146 0.06
320 118 0.05
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322 207 0.09
323 340 0.15
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325 85 0.04
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330 82 0.04
331 3 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.24, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (325 bp):
ATGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCATAAAAAACTACAA
ATACCATCCTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTTTATATTTTACTCGAT
TAAACGTCGGCTGATTCGAGTTTTTCAGTTAATAAGGCTTTCCAAAATTTTTTCATAAAATTATG
TGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAATGGGGTGCAACACGAG
GACTTCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTG
Found at i:42770 original size:262 final size:266
Alignment explanation
Indices: 42268--42774 Score: 805
Period size: 262 Copynumber: 1.9 Consensus size: 266
42258 ACAAATACCG
* * *
42268 TCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCATGGGTTTATGTTTTACTCGATTAAAC
1 TCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCACGGGTATATATTTTACTCGATTAAAC
* *
42333 GTCGGCTAATTCGATTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTC
66 GTCAGCTAATTCGAGTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTC
*
42398 GTCAACCCAATCATCCACGAGTTTAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAACACGAGGACTT
131 GTCAACCCAA-CATCCACGAGTTCAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAACACGAGGACTT
* * *
42463 CCCAGGAGGTCACCCATCCTAGTCCTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTTTGTAACAAACTACA
195 CCAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACTTTGTAACAAACTACA
42528 ACTACTA
260 ACTACTA
*
42535 TCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTT-TGGGCTCATGTCTCACGGGTATATATTTTACTCGATTAAAC
1 TCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCACGGGTATATATTTTACTCGATTAAAC
*
42599 GTCAGCTGATTCG-GTTTTTCACTTAA-AAGGCTTTTCGAAATTTTTTCATAAAATTA-GTGACT
66 GTCAGCTAATTCGAGTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCG-AATTTTTTCATAAAATTATGTGACT
*
42661 CGTCAACCCAA-ATCCAATGAGGTTCAAAAATAAAAATT-AAAAATT-GGTGTGCAACACGA-GA
130 CGTCAACCCAACATCC-ACGA-GTTCAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGG-GTGCAACACGAGGA
42722 CTTCCAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACT
192 CTTCCAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACT
42775 ACGGAGTTCT
Statistics
Matches: 224, Mismatches: 12, Indels: 13
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
262 58 0.26
263 21 0.09
264 44 0.20
265 30 0.13
266 48 0.21
267 23 0.10
ACGTcount: A:0.29, C:0.24, G:0.15, T:0.32
Consensus pattern (266 bp):
TCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTTGTGGGCTAATGTCTCACGGGTATATATTTTACTCGATTAAAC
GTCAGCTAATTCGAGTTTTTCACTTAATAAGGCTTTTCGAATTTTTTCATAAAATTATGTGACTC
GTCAACCCAACATCCACGAGTTCAAAAATAAAAATTAAAAAATTAGGGTGCAACACGAGGACTTC
CAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACTTTGTAACAAACTACAA
CTACTA
Found at i:43106 original size:321 final size:321
Alignment explanation
Indices: 42516--43205 Score: 1022
Period size: 321 Copynumber: 2.1 Consensus size: 321
42506 CTTAACTTTG
*
42516 TAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACCCTT-TGGGCTCATGTCTCACGGGTAT
1 TAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACACTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTAT
*
42580 ATATTTTACTCGATTAAACGTCAGCTGATTCGGTTTTTCACTTAAAAGGCTTTTCGAAATTTTTT
66 ATATTTTACTCGATTAAACGTCA-CTGATTCGGTTTTTCACTTAAAAAGCTTTTCGAAATTTTTT
* *
42645 CATAAAATTAGTGACTCGTCAACCCAAATCCAATGAGGTTCAAAAATAAAAATTAAAAATTGGTG
130 CATAAAATTAGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAATTGGTG
42710 TGCAACACGAGACTTCCAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACT
195 TGCAACACGAGACTTCCAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACT
* *
42775 ACGGAGTTCTGATAGGATCCGGTGAATT-TGCTGGTATGATCGCACCCATCCCCTTTTGCCA
260 ACGGAGTTCTGATAGGATCCGGTGAATTATGCTGATATAATCGCACCCATCCCCTTTTGCCA
* * *
42836 TAACAAAACTACAACTACTATCC-TTCTCGCTCTATCACACTTGTGGGCTCATGTCTCATGGGTT
1 TAAC-AAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACACTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTA
42900 TATA-TTTACTCGATTAAACGTC-CTGATTCGGTTTTATCACTTAATAAAGC-TTTCAGAAATTT
65 TATATTTTACTCGATTAAACGTCACTGATTCGGTTTT-TCACTTAA-AAAGCTTTTC-GAAATTT
*
42962 TTTCATAAAATTAGTGCCTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAAGTT
127 TTTCATAAAATTAGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAA-TT
* * * *
43027 AGG-GTGCAACACGAGGAACTT-C-ATGAGGTCTCTCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACG
191 -GGTGTGCAACACGA-G-ACTTCCAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACG
* * * * *
43089 CTTTACTGCGGAGTTCTGATGGGATCTGGTGCATTAGTGCTGATATAATCGCACCCATCCCCTTT
253 CTTAACTACGGAGTTCTGATAGGATCCGGTGAATTA-TGCTGATATAATCGCACCCATCCCCTTT
43154 TGCCA
317 TGCCA
* * *
43159 AAACAAACTACAAATAC-ATCCTTTCTCGCTCTGTCACTCTTGTGGGC
1 TAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACACTTGTGGGC
43206 C
Statistics
Matches: 335, Mismatches: 23, Indels: 22
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
318 13 0.04
319 12 0.04
320 109 0.33
321 124 0.37
322 39 0.12
323 38 0.11
ACGTcount: A:0.29, C:0.25, G:0.16, T:0.31
Consensus pattern (321 bp):
TAACAAACTACAACTACTATCCTTTCTCGCTCTGTCACACTTGTGGGCTCATGTCTCACGGGTAT
ATATTTTACTCGATTAAACGTCACTGATTCGGTTTTTCACTTAAAAAGCTTTTCGAAATTTTTTC
ATAAAATTAGTGACTCGTCAACCCAAATCCAACGAGGTTAAAAAATAAAAATTAAAAATTGGTGT
GCAACACGAGACTTCCAAGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCCCCCAAGCACGCTTAACTA
CGGAGTTCTGATAGGATCCGGTGAATTATGCTGATATAATCGCACCCATCCCCTTTTGCCA
Done.