Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: AWWV01001203.1 Corchorus capsularis cultivar CVL-1 contig01203, whole genome shotgun sequence

Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000

Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 832

Length: 1388
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.11, T:0.38


Found at i:1151 original size:3 final size:3

Alignment explanation


    Indices: 1143--1176  Score: 68
    Period size: 3  Copynumber: 11.3  Consensus size: 3

       1133 CAATCTAGCC

                                                         
       1143 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT A
          1 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT A

       1177 GATTAGATAT


Statistics
Matches: 31,  Mismatches: 0, Indels: 0
        1.00            0.00        0.00

Matches are distributed among these distances:
   3   31  1.00

ACGTcount: A:0.35, C:0.00, G:0.00, T:0.65


Consensus pattern (3 bp):   
ATT

Done.