Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWWV01005708.1 Corchorus capsularis cultivar CVL-1 contig05726, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 2295
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.15, T:0.33
Found at i:1281 original size:334 final size:329
Alignment explanation
Indices: 1--2286 Score: 2014
Period size: 334 Copynumber: 6.8 Consensus size: 329
* *
1 AACGCGTTTTTAGTCAAAAACCGTGTTGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTT-ACAAAAAT
1 AACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG-TAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGA-AAAAAT
* * * * * * * *
65 TG-ACACG-AGAAGTTTCTCCT-TATTTTCGGCCACCATAATCATAAAAAATAGATAATCCAACA
64 TGAACA-GAAAAAATTT-TCCTCAATTTTTGGCCA-TATACTCATAAAAAATATATAATTCAACA
* * * * * *
127 CCAAAGAGATTGAAGGGCT-TCTCTCGCTTCTAATATTGTTTATTTTGTTTTCAATTTTTCCGAA
126 CCAAAAAGATTGAAAGGCTAT-TCACGCTTCAAATATTG------TT-TTTCCTATTTTTCCGAA
* * * * * * * *
191 TTAATT-TCTAATTAGATCGAAA-TTGGATTGAGATACACGTAAAAACAAAACCATAAATCCAAT
183 TTAATTCT-TAATTAAATCGAAACAT-GATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAAT
* * * *
254 GTGGTTGACATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCGAAAATCATGCAA
246 GTGGGTAAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGCAA
* * ** * *
319 AACAGAGTCGAAGCCCCGG
311 AACTGAGCCGGGGCGCCAG
* *
338 AACGCGTTTTTAGCCAAAAATCGTGATGGT--TACACCGATTTCAGCTAAAATTTTGTAAAAATT
1 AACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTAGTACA-CGATTTCAGCTAAAATTTTGAAAAAATT
* * * *
401 GAATC-GAAATAATTTTCCTTAATTTTTTGCTACA-ATAATCATAAAAATATATATAATTCAACA
65 GAA-CAGAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGC--CATATACTCATAAAAA-ATATATAATTCAACA
* * * *
464 CTAAAAATATTGAAAGGCTATTCACGCTTCTAATATTGTCTTTCCTATTTTTCCGAATTAATTCT
126 CCAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCAAATATTGTTTTTCCTATTTTTCCGAATTAATTCT
* * *
529 TAATTGAATCGAAACATGATTCCTATGCTCGTAAAAACAAATCTTTAAATCCAATGTGGGTAAGA
191 TAATTAAATCGAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGGTAAGA
* * ** * * * *
594 TTTGGTTTGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCCAAAATATCGTGTAAAACCGAGCC
256 TTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCAAAA-ATCATGCAAAACTGAGCC
*
659 GGGGCGCCAA
320 GGGGCGCCAG
* * * *
669 AACGCGTTTTTACTTTTTAGTCAAGAACCGTGATGGTTAGTATACGATTTCAGCTAAAATTTTGC
1 AACGCG-------TTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG-TAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGA
* * * * * * *
734 AAAATTTG-ACCGAAAAAAATTCTACTCAATTTCTGGCCACTATATTCATTAAAAATATATAATT
58 AAAAATTGAACAG-AAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCA-TATACTCATAAAAAATATATAATT
* * * *
798 CAACGCCAAAAAGACT-AAAGGGCT-TCTCACGCTTCTAATATTGATTTTTTTTTCTATTTTTCC
121 CAACACCAAAAAGATTGAAA-GGCTAT-TCACGCTTC-AA-A-T-ATTGTTTTTCCTATTTTTCC
* ** * * *
861 GAATTAATT-TCTAATTAAATAGAAACCGGATTGAGATGCTCGTAAAAACTAATCCTTAAATCCA
180 GAATTAATTCT-TAATTAAATCGAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCA
* * * * * * * *
925 ATGTGGCTGAGATTTCGTTAGATAAATGTAGATATTGCAATGAGTTTTGGTGCCAAAAATCCTGG
244 ATGTGGGTAAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGC
* * *
990 AAAACTGAGCTGAGGAC-CCGG
309 AAAACTGAGCCG-GGGCGCCAG
* * * ** * *
1011 AACGCATTTTTAGCCAAAAACTGTGATAGGTAGTGCACCGATTTTGGCTAAAAAATTTAAAAAAA
1 AACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGAT-GGTAGTACA-CGATTTCAGCT-AAAATTTTGAAAAAA
* * *
1076 TTGAACAGAAAGAATTTTCGTCAATTTTTGGTCATGATACTCATAAAAAATATATAATTCAACAC
63 TTGAACAGAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCAT-ATACTCATAAAAAATATATAATTCAACAC
* ** * *
1141 CAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTGAAATATCATTTTTCCTATTTTTTCGGAAGTAATTCT
127 CAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCAAATATTGTTTTTCCTA-TTTTTCCGAATTAATTCT
* *
1206 TAATTAAA-CTGAAACATGATTCATATACTCGTAAAAGCAAATCCTTAAATCCAATGTGGGTAAG
191 TAATTAAATC-GAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGGTAAG
* ** * * * * * *
1270 ATTTAGTTAGATGGATATAGATATTTCAGTGAGACTTGGCACCAAAAATCGTGCAAAACTAAGCT
255 ATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCC
* *
1335 GGGGCTCTAG
320 GGGGCGCCAG
* * * * ** *
1345 AATGCGTTTTTAGTCAAAAACCGCGATAGTTAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTGTAAAAATT
1 AACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGAT-GGTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGAAAAAATT
* * *** * * *
1410 GACCCGAAAGTGTTTTTCTCAATTTTTAGCCACGATACTCATAAAAATATATATAATTCAACACC
65 GAACAGAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCA-TATACTCATAAAAA-ATATATAATTCAACACC
* *
1475 AAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCTAGTATTGTTTTTCCTATTTTTTTCCGAATTAATTC
128 -AAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCAAATATTGTTTTTCCTA--TTTTTCCGAATTAATTC
* * *
1540 TTAATTGAATCGAAACATGATTCATATGCTCGTTAAAAAAAAATCCTTAAATCGAATGTGGGTAA
190 TTAATTAAATCGAAACATGATTCATATGCTCG-TAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGGTAA
* ** * * * *
1605 GATTTGGTTAGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTTGCGCCAAAAATCATGCAAAACCGAAC
254 GATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGC
*
1670 CGGGGCGCTAG
319 CGGGGCGCCAG
* * ** * * * * * *
1681 AACTCTTTTTTAGTTAAGAACCGTGATGGTTAATATATGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAATTT
1 AACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG-TAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGAAAAAATT
* * ** * * *
1746 GACCCA-AAAAAATTCTCCTCAATTTCCGGCCACTATACTCATTAAAAATATATGATTCAACGCC
65 GA-ACAGAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCA-TATACTCATAAAAAATATATAATTCAACACC
* *
1810 AAAAAGATT-AAAGGGCT-TCTCACGCTTCTAATATTGTTTTTTTTTCTATTTTTCCGAATTAA-
128 AAAAAGATTGAAA-GGCTAT-TCACGCTTCAAATATTG---TTTTTCCTATTTTTCCGAATTAAT
* ** * * *
1872 TCTCTAATTAAATAGAAACCGGATTGAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCT
188 TCT-TAATTAAATCGAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGGT
* * *
1937 GAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTTTTGGTGCC-AAAATCATGCAAAACTGA
252 AAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGA
* * * *
2001 GCCGAAGAC-ACGG
317 GCCG-GGGCGCCAG
* * * * *
2014 AACGCGTTTTTAGCCAAAAATCGTTATAGTTACTACACCGATTT--GCTAAAAATTTTTTAAAAA
1 AACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGAT-GGTAGTACA-CGATTTCAGCT-AAAA-TTTTGAAAAA
* * *
2077 ATTG-ACTTGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGCCATGTTACTCATAAAAAATATATAATTCAAC
62 ATTGAAC-AGAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCAT-ATACTCATAAAAAATATATAATTCAAC
* * *
2141 AACAAAAATATTGAAAGGCTATTCACGCTTCTAATATTGTTTTTCCTATTTTTTTTTCCGAATTA
125 ACCAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCAAATATTGTTTTTCCTA----TTTTTCCGAATTA
* * *
2206 ATTCCTAATTGAATCGAAACATGATTCATACGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGG
186 ATTCTTAATTAAATCGAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGG
* *
2271 TAAGGTTTGGTTAGAT
251 TAAGATTTCGTTAGAT
2287 GGATATAAA
Statistics
Matches: 1588, Mismatches: 286, Indels: 152
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
330 110 0.07
331 36 0.02
332 55 0.03
333 96 0.06
334 389 0.24
335 239 0.15
336 221 0.14
337 162 0.10
338 37 0.02
339 38 0.02
340 57 0.04
341 4 0.00
342 24 0.02
343 120 0.08
ACGTcount: A:0.35, C:0.16, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (329 bp):
AACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGAAAAAATTG
AACAGAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCATATACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCAAA
AAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCAAATATTGTTTTTCCTATTTTTCCGAATTAATTCTTAATT
AAATCGAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGGTAAGATTTCG
TTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCCGGGGCG
CCAG
Found at i:1909 original size:670 final size:661
Alignment explanation
Indices: 1--2286 Score: 2255
Period size: 670 Copynumber: 3.4 Consensus size: 661
* * *
1 AACGCGTTTTTAGTCAAAAACCGTGTTGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTACAAAAATT
1 AACGCGTTTTTAGTCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATT
* * * * * * * * *
66 GACACGAGAAGTTTCTCCT-TATTTTCGGCCACCATAATCATAAAAAATAGATAATCCAACACCA
66 GACCCGAAAAATTTCTCCTCAATTTTTGGCCACGATACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCA
* * * * ** *
130 AAGAGATTGAAGGGCTTCTCTCGCTTCTAATATTGTTTATTTTGTTTTCAATTTTTCCGAATTAA
131 AAAAGATTGAAAGGCTTCTCACGCTTCTAATATTGATT-TTTCCTATT--ATTTTTCCGAATTAA
* * * * *
195 TTTCTAATT-AGATCGAAA-TTGGATTGAGATACACGTAAAAACAAAA-CCATAAATCCAATGTG
193 TTTCTAATTGA-ATCGAAACAT-GATTCAGATGCTCGTAAAAA-AAAATCCTTAAATCCAATGTG
* * * * *
257 GTTGACATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTCTTGGCGCCGAAAATCATGCAAAAC
255 GGTAAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAG-CTTTGCGCCAAAAATCATGCAAAAC
* * * * * * *
322 AGAGTCGAAGCCCCGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAATCGTGATGGTT-ACACCGATTTCAGCTAA
319 AGAGCCG-GGGCCCGGAACGCATTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAATAACGATTTCAGCTAA
* * * * * * * *
386 AATTTTGTAAAAATTGAATCGAAATAATTTTCCTTAATTTTTTGCTACAATAATCATAAAAATAT
383 AATTTTGAAAAAATTGAA-CAAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCACTATACTCATAAAAA-AT
* * *
451 ATATAATTCAACACTAAAAATATTGAAAGGCTATTCACGCTTCTAATATTG-TCTTTCCTATTTT
446 ATATAATTCAACACCAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCTAATATTGTTTTTTCCTATTTT
* * *
515 TCCGAATTAATTCTTAATTGAATCGAAACATGATTCCTATGCTCGTAAAAACAAATCTTTAAATC
511 TCCGAATTAATTCTTAATTAAAT-GAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATC
* *
580 CAATGTGGGTAAGATTTGGTTTGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCCAAAATATCG
575 CAATGTGGGTAAGATTTAGTTAGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCCAAAA-ATCG
* * * *
645 TGTAAAACCGAGCCGGGGCGCCAA
639 TGCAAAACTGAGCCGGGGC-ACAG
* * *
669 AACGCGTTTTTACTTTTTAGTCAAGAACCGTGATGGTTAGTATACGATTTCAGCTAAAATTTTGC
1 AACGCG-------TTTTTAGTCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGC
* * * * * * *
734 AAAATTTGA-CCGAAAAAAATTCTACTCAATTTCTGGCCACTATATTCATTAAAAATATATAATT
59 AAAAATTGACCCG-AAAAATTTCTCCTCAATTTTTGGCCACGATACTCATAAAAAATATATAATT
* * * *
798 CAACGCCAAAAAGACT-AAAGGGCTTCTCACGCTTCTAATATTGATTTTT-TTTTCTATTTTTCC
123 CAACACCAAAAAGATTGAAA-GGCTTCTCACGCTTCTAATATTGATTTTTCCTAT-TATTTTTCC
* * ** * **
861 GAATTAATTTCTAATTAAATAGAAACCGGATTGAGATGCTCGTAAAAACTAATCCTTAAATCCAA
186 GAATTAATTTCTAATTGAATCGAAACATGATTCAGATGCTCGTAAAAAAAAATCCTTAAATCCAA
* * * * * * * *
926 TGTGGCTGAGATTTCGTTAGATAAATGTAGATATTGCAATGAGTTTTGGTGCCAAAAATCCTGGA
251 TGTGGGTAAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGCTTT-GCGCCAAAAATCATGCA
* * * * * *
991 AAACTGAGCTGAGGACCCGGAACGCATTTTTAGCCAAAAACTGTGATAGG-TAGTGCACCGATTT
315 AAACAGAGCCG-GGGCCCGGAACGCATTTTTAGCCAAAAACCGTGAT-GGTTAAT--AACGATTT
** * * * * *
1055 TGGCTAAAAAATTTAAAAAAATTGAACAGAAAGAATTTTCGTCAATTTTTGGTCA-TGATACTCA
376 CAGCT-AAAATTTTGAAAAAATTGAACA-AAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCACT-ATACTCA
** **
1119 TAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTGAAATA-TCATTTTT
438 TAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCTAATATTGTTTTTT
* * * *
1183 CCTATTTTTTCGGAAGTAATTCTTAATTAAACTGAAACATGATTCATATACTCGTAAAAGCAAAT
503 CCTA-TTTTTCCGAATTAATTCTTAATTAAA-TGAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAAT
* *
1248 CCTTAAATCCAATGTGGGTAAGATTTAGTTAGATGGATATAGATATTTCAGTGAGACTTGGCACC
566 CCTTAAATCCAATGTGGGTAAGATTTAGTTAGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCC
* * *
1313 AAAAATCGTGCAAAACTAAGCTGGGGCTCTAG
631 AAAAATCGTGCAAAACTGAGCCGGGGCAC-AG
* * ** *
1345 AATGCGTTTTTAGTCAAAAACCGCGATAGTTAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTGTAAAAATT
1 AACGCGTTTTTAGTCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATT
* * * *
1410 GACCCG-AAAGTGTTTTTCTCAATTTTTAGCCACGATACTCATAAAAATATATATAATTCAACAC
66 GACCCGAAAAAT-TTCTCCTCAATTTTTGGCCACGATACTCATAAAAA-ATATATAATTCAACAC
*
1474 CAAAAAAGATTGAAAGGCTAT-TCACGCTTCTAGTATTG-TTTTTCCTATT-TTTTTCCGAATTA
129 C-AAAAAGATTGAAAGGCT-TCTCACGCTTCTAATATTGATTTTTCCTATTATTTTTCCGAATTA
* *
1536 A-TTCTTAATTGAATCGAAACATGATTCATATGCTCGTTAAAAAAAAATCCTTAAATCGAATGTG
192 ATTTC-TAATTGAATCGAAACATGATTCAGATGCTCG-TAAAAAAAAATCCTTAAATCCAATGTG
* **
1600 GGTAAGATTTGGTTAGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTTGCGCCAAAAATCATGCAAAAC
255 GGTAAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAG-CTTTGCGCCAAAAATCATGCAAAAC
* * ** * * ** * *
1665 CGAACCGGGGCGCTAGAACTCTTTTTTAGTTAAGAACCGTGATGGTTAATATATGATTTCAGCTA
319 AGAGCCGGGGC-CCGGAACGCATTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAATA-ACGATTTCAGCTA
* * * * ** *
1730 AAATTTTGCAAAATTTGACCCAAAAAAATTCTCCTCAATTTCCGGCCACTATACTCATTAAAAAT
382 AAATTTTGAAAAAATTGA-ACAAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCACTATACTCATAAAAAAT
* * *
1795 ATATGATTCAACGCCAAAAAGATT-AAAGGGCT-TCTCACGCTTCTAATATTGTTTTTTTTTCTA
446 ATATAATTCAACACCAAAAAGATTGAAA-GGCTAT-TCACGCTTCTAATATTG--TTTTTTCCTA
** * *
1858 TTTTTCCGAATTAA-TCTCTAATTAAATAGAAACCGGATTGAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTT
507 TTTTTCCGAATTAATTCT-TAATTAAAT-GAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTT
* * * ** ** *
1922 AAATCCAATGTGGCTGAGATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGTTTTGGTGCC-AAA
570 AAATCCAATGTGGGTAAGATTTAGTTAGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCCAAAA
* * * *
1986 ATCATGCAAAACTGAGCCGAAGACACGG
635 ATCGTGCAAAACTGAGCCG-GGGCACAG
* * * * **
2014 AACGCGTTTTTAGCCAAAAATCGTTATAGTTACTACACCGATTT--GCTAAAAATTTTTTAAAAA
1 AACGCGTTTTTAGTCAAAAACCGTGATAGTTAGTACA-CGATTTCAGCT-AAAA-TTTTGCAAAA
** * * *
2077 ATTGACTTGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGCCATGTTACTCATAAAAAATATATAATTCAACA
63 ATTGACCCGAAAAATTTCTCCTCAATTTTTGGCCACGATACTCATAAAAAATATATAATTCAACA
* * *
2142 ACAAAAATATTGAAAGGCTAT-TCACGCTTCTAATATTG-TTTTTCCTATTTTTTTTTCCGAATT
128 CCAAAAAGATTGAAAGGCT-TCTCACGCTTCTAATATTGATTTTTCCTA-TTATTTTTCCGAATT
* * * *
2205 AATTCCTAATTGAATCGAAACATGATTCATACGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGG
191 AATTTCTAATTGAATCGAAACATGATTCAGATGCTCGTAAAAAAAAATCCTTAAATCCAATGTGG
* *
2270 GTAAGGTTTGGTTAGAT
256 GTAAGATTTCGTTAGAT
2287 GGATATAAA
Statistics
Matches: 1345, Mismatches: 217, Indels: 111
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
667 4 0.00
668 146 0.11
669 256 0.19
670 329 0.24
671 47 0.03
672 8 0.01
673 151 0.11
674 8 0.01
675 73 0.05
676 157 0.12
677 165 0.12
678 1 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.16, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (661 bp):
AACGCGTTTTTAGTCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATT
GACCCGAAAAATTTCTCCTCAATTTTTGGCCACGATACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCA
AAAAGATTGAAAGGCTTCTCACGCTTCTAATATTGATTTTTCCTATTATTTTTCCGAATTAATTT
CTAATTGAATCGAAACATGATTCAGATGCTCGTAAAAAAAAATCCTTAAATCCAATGTGGGTAAG
ATTTCGTTAGATAAATATAGATATTTCAATGAGCTTTGCGCCAAAAATCATGCAAAACAGAGCCG
GGGCCCGGAACGCATTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAATAACGATTTCAGCTAAAATTTTGA
AAAAATTGAACAAAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGCCACTATACTCATAAAAAATATATAATTCA
ACACCAAAAAGATTGAAAGGCTATTCACGCTTCTAATATTGTTTTTTCCTATTTTTCCGAATTAA
TTCTTAATTAAATGAAACATGATTCATATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGGTA
AGATTTAGTTAGATGGATATAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCCAAAAATCGTGCAAAACTGAG
CCGGGGCACAG
Done.