Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01012650.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig12683, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 2290
ACGTcount: A:0.38, C:0.17, G:0.12, T:0.32
Found at i:1216 original size:325 final size:324
Alignment explanation
Indices: 1--1973 Score: 2557
Period size: 325 Copynumber: 6.1 Consensus size: 324
* * * * *
1 AAAACTGAGTCGATACATTAGAACGCGGTTTTAGCC-AAAAAACTGTGA---TAACATACACGAT
1 AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTA-ATACACGAT
** * * *
62 TTCAGCTAAAAACTGACCCGGAAATTTTTCCCTAAATTTTTT-TCCACAATATTCAGAAAAAATT
65 TTCAGCTAAAAACTGACCCAAAAAATTTTCCCTAAATTTTTTGT-CACAACATTCAGAAAAAATA
* * * *
126 TATAATTTAACTCCAGGAAGGTTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCA-TTTTTT
129 TATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTT
* *
190 CCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTTGTAATAACAAATCCTTAAATCT
194 CCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTCGTAATAACAAATCCTTAAATCC
* * * * *
255 CATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAAAGAATCTTTACGCCAAAATTCATT
259 CATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATG
320 C
324 C
* ** * * * * *
321 AAAACTGAGCCGGCGCCCCGGAACGCGTTTTTAGCC-AAAAAAC-ATAATGGTTAATACTCGATT
1 AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATT
* *
384 T-TGACTAAAACCTGACCCGAAAAAA-TTT-CCTACAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAAA
66 TCAG-CTAAAAACTGACCC-AAAAAATTTTCCCTA-AATTTTTTGTCACAACATTCAG--AAAAA
* * * *
446 ATATATAATTCAACGCCAAGAATATTGAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTT
126 ATATATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTT
*
511 TTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTAAA
191 TTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTCGTAATAACAAATCCTTAAA
*
576 TCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTTTTTATG-CAAAAAGT
256 TCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAA-T
640 CATGC
320 CATGC
* * * * *
645 AAAACTGAGCCGATGCACCGGAATGCATTTTTAGCCAAAAAAACT-TGATGGTTAATACATGATT
1 AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATT
** * * * ** *
709 TTGGCAAAAAACTGACCCGAAAATTTTTTTCTCAATTTTTTG-C-CAACATATTCAGAAAAAATA
66 TCAGCTAAAAACTGACCCAAAAAATTTTCCCTAAATTTTTTGTCACAAC--ATTCAGAAAAAATA
* * * * *
772 TATAATTCAATTCCAAGAAGAATGAAGAGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTC
129 TATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTT
* * * *
837 CCTAATTGATTGCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATCC
194 CCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTCGTAATAACAAATCCTTAAATCC
* *
902 CATATTGTTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATG
259 CATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATG
967 C
324 C
**
968 AAAACTGAGTCGATGCGGTGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGAT
1 AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTAGCC-AAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGAT
* *
1033 TTCAGCTAAAAACTTACCCAAAAAATTTTCCCTAAATTTTTTGTCAAAACATTCAGAAAAAATAT
65 TTCAGCTAAAAACTGACCCAAAAAATTTTCCCTAAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAATAT
* * * * * *
1098 ATAATTTAACACCAAGAATATTGAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCATTTTTCCTTTTTTTTC
130 ATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTTC
* * * *
1163 CTAAATAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAAATGCTCGCAATAACAAATCCTTAAATCCC
195 CTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTCGTAATAACAAATCCTTAAATCCC
* * *
1228 ATATTGTTGAGATTTCAATAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGC
260 ATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGC
* *
1293 AAAACCGAGTCGATGCACTTGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATT
1 AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATT
* * *
1358 TCAACTAAAAACTGACCCGAAAAAA-TTTCCCTAAATTTTTTGCCACAATATTCAGAAAAAAAAT
66 TCAGCTAAAAACTGACCC-AAAAAATTTTCCCTAAATTTTTTGTCACAACATTCAG--AAAAAAT
* *
1422 GTATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGATTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCA-TTTTT
128 ATATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTT
* * * * *
1486 TCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGGAAGAGGATTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATC
193 TCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTCGTAATAACAAATCCTTAAATC
* * *
1551 CCATATTGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATAATTT-AAGGAGTTTTTATGCCAAAAATCA
258 CCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGAT-ATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCA
1615 TGC
322 TGC
* * * * *
1618 AAAACTGAGTCGATGCTCTAGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAAACCGTGA---TAACAGACACGA
1 AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTAGCC-AAAAAAACTGTGATGGTTA-ATACACGA
* * * * * * * * *
1680 TTTCGGCTAAAAATTGAACCGAAAAATTTTCCCTCAATTTTTTCTCACAACATACAAAAAAAACA
64 TTTCAGCTAAAAACTGACCCAAAAAATTTTCCCTAAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAATA
* * *
1745 TATAATTCAACACCAAGAATATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTT
129 TATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTT
* * *
1810 CCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTGAATCT
194 CCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTCGTAATAACAAATCCTTAAATCC
* * * *
1875 CATATGGCTGATATTTCATTAGATGAATATAGATATTTAAAAGAGTCTTTACGCCAAAAATCATG
259 CATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATG
1940 C
324 C
* * * *
1941 ATAACTTAGCCGATGCCCTGGAACGCGTTTTTA
1 AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTA
1974 AAAAAAACCG
Statistics
Matches: 1450, Mismatches: 171, Indels: 61
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
319 2 0.00
320 39 0.03
321 45 0.03
322 70 0.05
323 434 0.30
324 292 0.20
325 487 0.34
326 78 0.05
327 3 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.17, G:0.12, T:0.32
Consensus pattern (324 bp):
AAAACTGAGTCGATGCACTGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATT
TCAGCTAAAAACTGACCCAAAAAATTTTCCCTAAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAATATA
TAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTTCC
TAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATACTCGTAATAACAAATCCTTAAATCCCA
TATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGC
Found at i:1309 original size:648 final size:646
Alignment explanation
Indices: 29--1973 Score: 2720
Period size: 648 Copynumber: 3.0 Consensus size: 646
19 TAGAACGCGG
* * * *
29 TTTTAGCC-AAAAAACTGTGA---TAACATACACGATTTCAGCTAAAAACTGACCCGGAAATTTT
1 TTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTA-ATACACGATTTCAACAAAAAACTGACCCGAAAATTTT
* * * * *
90 TCCCTAAATTTTTTTCCACAATATTCAGAAAAAATTTATAATTTAACTCCAGGAAGGTTAAAGGG
65 TCCCTAAATTTTTTGCCACAATATTCAGAAAAAATATATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAA-GG
*
155 TTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAA
129 TTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAA
* * * * *
220 GATTCAGATACTTGTAATAACAAATCCTTAAATCTCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATAT
194 GATTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCCATATTGCTGAGATTTCATTAGATGAATAT
* * * * * ** *
285 AGATATTTCAAAGAATCTTTACGCCAAAATTCATTCAAAACTGAGCCGGCGCCCCGGAACGCGTT
259 AGATATTTCAAAGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGATGCCCTGGAACGCGTT
* * * * * *
350 TTTAGCC--AAAAAACATAATGGTTAATACTCGATTT-TGACTAAAACCTGACCCGAAAAAA-TT
324 TTTAGCCAAAAAAAACGTGATGGTTAATACACGATTTCAG-CTAAAAACTTACCC-AAAAAATTT
*
411 T-CCTACAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAAAATATATAATTCAACGCCAAGAATATTGAA
387 TCCCTA-AATTTTTTGTCACAACATTCAG--AAAAAATATATAATTCAACACCAAGAATATTGAA
475 GGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAA
449 GGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAA
540 ACAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGA
514 ACAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGA
* * *
605 ATATAGATATTTCAATGAGTTTTTATG-CAAAAAGTCATGCAAAACTGAGCCGATGCACCGGAAT
579 ATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAA-TCATGCAAAACCGAGCCGATGCACCGGAAC
669 GCAT
643 GCAT
* ***
673 TTTTAGCCAAAAAAACT-TGATGGTTAATACATGATTTTGGCAAAAAACTGACCCGAAAATTTTT
1 TTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATTTCAACAAAAAACTGACCCGAAAATTTTT
** * * * *
737 TTCTCAATTTTTTGCCA-ACATATTCAGAAAAAATATATAATTCAATTCCAAGAAGAATGAAGAG
66 CCCTAAATTTTTTGCCACA-ATATTCAGAAAAAATATATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAG-G
* *
801 TTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTCCCTAATTGATTGCTAAATAAAACGAAACA
129 TTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTT-CCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACA
*
866 AGATTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCCATATTGTTGAGATTTCATTAGATGAATA
193 AGATTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCCATATTGCTGAGATTTCATTAGATGAATA
* **
931 TAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGATGCGGTGGAACGCGT
258 TAGATATTTCAAAGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGATGCCCTGGAACGCGT
996 TTTTAGCCAAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATTTCAGCTAAAAACTTACCCAAAAAATTT
323 TTTTAGCCAAAAAAAAC-GTGATGGTTAATACACGATTTCAGCTAAAAACTTACCCAAAAAATTT
* *
1061 TCCCTAAATTTTTTGTCAAAACATTCAGAAAAAATATATAATTTAACACCAAGAATATTGAAGGG
387 TCCCTAAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAATATATAATTCAACACCAAGAATATTGAAGGG
* * * *
1126 TTTTTCACACTTCTAATATCATTTTTCCTTTTTTTTCCTAAATAATTTCTAAATAAAACGAAACA
452 TTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACA
* * * * *
1191 AGATTCAAATGCTCGCAATAACAAATCCTTAAATCCCATATTGTTGAGATTTCAATAGATGAATA
517 AGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATA
* ** *
1256 TAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACCGAGTCGATGCACTTGAACGCGT
582 TAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACCGAGCCGATGCACCGGAACGCAT
* **
1321 TTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATTTCAACTAAAAACTGACCCGAAAAAATTT
1 TTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATTTCAACAAAAAACTGACCCGAAAATTTTT
*
1386 CCCTAAATTTTTTGCCACAATATTCAGAAAAAAAATGTATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGG
66 CCCTAAATTTTTTGCCACAATATTCAG--AAAAAATATATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGG
* *
1451 ATTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGGAAGA
129 -TTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACA
*
1516 GGATTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCCATATTGCTGAGATTTCATTAGATGAATA
193 AGATTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCCATATTGCTGAGATTTCATTAGATGAATA
* * * *
1581 TAGATAATTT-AAGGAGTTTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGATGCTCTAGAACGCG
258 TAGAT-ATTTCAAAGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGATGCCCTGGAACGCG
* * * * *
1645 TTTTTAGCCAAAAAAAACCGTGA---TAACAGACACGATTTCGGCTAAAAA-TTGAACCGAAAAA
322 TTTTTAGCCAAAAAAAA-CGTGATGGTTA-ATACACGATTTCAGCTAAAAACTT-ACCCAAAAAA
* * * * * *
1706 TTTTCCCTCAATTTTTTCTCACAACATACAAAAAAAACATATAATTCAACACCAAGAATATTAAA
384 TTTTCCCTAAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAATATATAATTCAACACCAAGAATATTGAA
1771 GGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAA
449 GGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAA
* * *
1836 ACAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTGAATCTCATATGGCTGATATTTCATTAGATGA
514 ACAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGA
* * * * **
1901 ATATAGATATTTAAAAGAGTCTTTACGCCAAAAATCATGCATAACTTAGCCGATGC-CCTGGAAC
579 ATATAGATATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACCGAGCCGATGCACC-GGAAC
*
1965 GCGT
643 GCAT
1969 TTTTA
1 TTTTA
1974 AAAAAAACCG
Statistics
Matches: 1156, Mismatches: 121, Indels: 44
0.88 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
644 11 0.01
645 10 0.01
646 116 0.10
647 155 0.13
648 488 0.42
649 81 0.07
650 219 0.19
651 76 0.07
ACGTcount: A:0.38, C:0.17, G:0.12, T:0.32
Consensus pattern (646 bp):
TTTTAGCCAAAAAAACTGTGATGGTTAATACACGATTTCAACAAAAAACTGACCCGAAAATTTTT
CCCTAAATTTTTTGCCACAATATTCAGAAAAAATATATAATTCAACTCCAAGAAGATTAAAGGTT
TTTCACACTTCTAATATCGTTTTTCCATTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGA
TTCAGATAATCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCCATATTGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAG
ATATTTCAAAGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGATGCCCTGGAACGCGTTTT
TAGCCAAAAAAAACGTGATGGTTAATACACGATTTCAGCTAAAAACTTACCCAAAAAATTTTCCC
TAAATTTTTTGTCACAACATTCAGAAAAAATATATAATTCAACACCAAGAATATTGAAGGGTTTT
TCACACTTCTAATATCGTTTTCCCATTTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGAT
TCAGATGCTCGTAATAACAAATCCTTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGATGAATATAGA
TATTTCAATGAGTCTTTATGCCAAAAATCATGCAAAACCGAGCCGATGCACCGGAACGCAT
Found at i:2237 original size:273 final size:273
Alignment explanation
Indices: 1737--2263 Score: 799
Period size: 273 Copynumber: 1.9 Consensus size: 273
1727 CAACATACAA
*
1737 AAAAAACATATAATTCAACACCAAGAATATTAAAGGGTTTTTCACACTTCTAATATCGTTTTCCC
1 AAAAAACATATAATTCAACACCAAGAATATTAAAGGGTTTTTCACACTTCAAATATCGTTTTCCC
* *
1802 ATTTTTTTCCTAATTAATTTCTAAATAAAACGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCC
66 ATTTTTTTCCTAATTAATTACTAAATAAAACGAAAAAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCC
* * * * *
1867 TTGAATCTCATATGGCTGATATTTCATTAGATGAATATAGATATTTAAAAGAGTCTTTACGCCAA
131 TTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGAAGAATATAGATAGTTAAAAGAGTCTTTACGCCAA
* * **
1932 AAATCATGCATAACTTAGCCGATGCCCTGGAACGCGTTTTTA-AAAAAAACCGTGATAGTTAGTT
196 AAATCATGCAAAACTAAGCCGACACCCTGGAACGCGTTTTTACAAAAAAACCGTGATAGTTAGTT
1996 AATACACATTCAG
261 AATACACATTCAG
* * *
2009 AAAAAATATATAATTCAACGCCAAGAATATTGAAA-GGTTTTTCACACTTCAAATATCGTTTTTC
1 AAAAAACATATAATTCAACACCAAGAATATT-AAAGGGTTTTTCACACTTCAAATATCGTTTTCC
*
2073 CATTTTTTTCCTAATTAATTACTAAATAAAATGAAAGAAAGATGT-AGATGCTCGTAATAACAAA
65 CATTTTTTTCCTAATTAATTACTAAATAAAACGAAA-AAAGAT-TCAGATGCTCGTAATAACAAA
* * * *
2137 TCCTTAAATCCCATATTGTTGAGATTTCATTAGAAGAATATAGATAGTTCAAGGAGTCTTTACGC
128 TCCTTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGAAGAATATAGATAGTTAAAAGAGTCTTTACGC
* *
2202 CAAAAATCATGCAAAACTAAGCCGGCACCCTGGAACGCGTTTTTAGCCAAAAAACCGTGATA
193 CAAAAATCATGCAAAACTAAGCCGACACCCTGGAACGCGTTTTTA-CAAAAAAACCGTGATA
2264 ACATACACGA
Statistics
Matches: 228, Mismatches: 22, Indels: 7
0.89 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
272 90 0.39
273 123 0.54
274 1 0.00
275 14 0.06
ACGTcount: A:0.39, C:0.17, G:0.13, T:0.31
Consensus pattern (273 bp):
AAAAAACATATAATTCAACACCAAGAATATTAAAGGGTTTTTCACACTTCAAATATCGTTTTCCC
ATTTTTTTCCTAATTAATTACTAAATAAAACGAAAAAAGATTCAGATGCTCGTAATAACAAATCC
TTAAATCCCATATGGCTGAGATTTCATTAGAAGAATATAGATAGTTAAAAGAGTCTTTACGCCAA
AAATCATGCAAAACTAAGCCGACACCCTGGAACGCGTTTTTACAAAAAAACCGTGATAGTTAGTT
AATACACATTCAG
Done.