Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01014589.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig14622, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
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ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.16, T:0.36
Found at i:927 original size:225 final size:224
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Indices: 515--959 Score: 698
Period size: 225 Copynumber: 2.0 Consensus size: 224
505 TGAATACAAA
* * * *
515 TATTTCAACGAGTCTTGCGCCAAAAATCATGCAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACGTGTTTTTAG
1 TATTTCAACAAGTCTCGCGCCAAAAATCATGCAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACGCGTTTTTAA
* *
580 CCAAAAACTGTGATGGTTAGTACATGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGAATCGAAAATTT
66 CCAAAAACTGTGATGGCTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGAATCGAAAATTT
* * *
645 TTCTCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATATTAATTCAATGCTAATAAGATTGAAAG
131 TTCCCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATATAAATTCAATGCCAATAAGATTGAAAG
*
710 GCTTTTCACACTTT-TAATATCATTTCGGC
196 GCTATTCACA-TTTCTAATATCATTTCGGC
* * * *
739 TATTTCAACAAGTCCTCGCGCCAAAAATCATGCAAATTTGAGTCGGGTTGCCGGAACGCGTTTTT
1 TATTTCAACAAGT-CTCGCGCCAAAAATCATGCAAA-CTGAGTCGAGATCCCGGAACGCGTTTTT
804 AACCAAAAACTGTGATGGCTAGTACACGATTTCGG-TAAAATTTTGCAAAAATTGAATCGAAAAT
64 AACCAAAAACTGTGATGGCTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGAATCGAAAAT
*
868 TTTTCCCTCAATTTTTGGCATAATTCTC-TAAAAACGTATATAAATTCAATGCCAATAAGATTGA
129 TTTTCCCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAA-ATATATAAATTCAATGCCAATAAGATTGA
932 AAGGCTATTCACATTTCTAATATCATTT
193 AAGGCTATTCACATTTCTAATATCATTT
960 ATCCTATTTT
Statistics
Matches: 202, Mismatches: 15, Indels: 7
0.90 0.07 0.03
Matches are distributed among these distances:
224 21 0.10
225 126 0.62
226 55 0.27
ACGTcount: A:0.34, C:0.17, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (224 bp):
TATTTCAACAAGTCTCGCGCCAAAAATCATGCAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACGCGTTTTTAA
CCAAAAACTGTGATGGCTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGAATCGAAAATTT
TTCCCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATATAAATTCAATGCCAATAAGATTGAAAG
GCTATTCACATTTCTAATATCATTTCGGC
Found at i:2002 original size:334 final size:332
Alignment explanation
Indices: 739--2261 Score: 1683
Period size: 331 Copynumber: 4.7 Consensus size: 332
729 TCATTTCGGC
* * * *
739 TATTTCAACAAGTCCTCGCGCCAAAAATCATGCAAATTTGAGTCGGGTTGCCGGAACGCGTTTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
* * * *
804 AACCAAAAACTGTGATGGCTAGTACACGATTTCGG-TAAAATTTTGCAAAAATTGAATCGAAA-A
66 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTT-CCAAAATTGAATCGAAAGG
* * ** * *
867 TTTTTCCCTCAATTTTTGG-CATAATTCTC-TAAAAACGTATATAAATTCAATGCCAATAAGATT
130 TTTTT-CCTCAATTTTTGGCCACAAATCTCATAAAAAAATATAT-AATTCAACGCCAAAAAGATT
* * * * * *
930 GAAA-GGCTATTCACATTTCTAATATCATTTATCCTATTTTTTCCGAATTAATTTCTATTTAAAT
193 -AAAGGGCTTTTCACACTTCTAATATCATATATCATATTTTTTTCGAATTAATTTCTAATTAAAT
* * * * * * * *
994 CGAAACATGATTCTGATGCTCATGAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTGGCTGAGAATTGGTGTT
257 CAAAACAAGATTCTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAAAATTGGTATG
1059 ATGAATACAGA
322 ATGAATACAGA
* * *
1070 TATTT---CAA----T---GCCAAAAATCATGCAAAAATGAGTCAGGTTCCCAGAACGTGTTTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
* * * *
1125 AGCCAAAAACTGTGATAGTTAGTACA-GAATTTCGACTAAAATTTTGCAAAAATTGACTCGAAAG
66 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACG-ATTTCGGCTAAAATTTT-CCAAAATTGAATCGAAAG
* * * * *
1189 ATTTTTCCT-AATTTTTTGCTAC-AATCTCAT-AAAAAATATATAATTCAACGCCATAAAGATTG
129 GTTTTTCCTCAATTTTTGGCCACAAATCTCATAAAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATTA
* *
1251 AAGGGCTTTT--CAC-GC---T-TC---TA--ATATTTTTTTCGAATTATTTTCTAATTAAATCA
194 AAGGGCTTTTCACACTTCTAATATCATATATCATATTTTTTTCGAATTAATTTCTAATTAAATCA
* * * * * * * *
1304 AAATAATATTCTGATGCTCGTAAAAACAAATCATTAATTCCAACGTGGTTGAGAATTGGTTTGAT
259 AAACAAGATTCTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAAAATTGGTATGAT
*
1369 GAATACATA
324 GAATACAGA
* *
1378 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGACTTGGGTTCCCAGAACGCG-TTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
* *
1442 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTCCAAAATTTAAATCGAAAGG
66 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAAAA-TTGAATCGAAAGG
* * * * * *
1507 TTTTTCCTCTATTTTCGGCCACAAAACT--TATAAAAGTATATTATTCAACGCCAAAAAGATTAA
130 TTTTTCCTCAATTTTTGGCCACAAATCTCATAAAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATTAA
* * * *
1570 AGGGCTTTTCACGCTTCTAATATCA-ATTATCATAAATTTTTTCGAAGTAATTTTTAATTAAATC
195 AGGGCTTTTCACACTTCTAATATCATA-TATCAT-ATTTTTTTCGAATTAATTTCTAATTAAATC
* * *
1634 AAAACAAGATTCTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCATTGTGGTTCAAAATTGGTATGA
258 AAAACAAGATTCTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAAAATTGGTATGA
1699 TGAATACAGA
323 TGAATACAGA
1709 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
* * *
1774 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAATATACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAAGAATTAAATCGAAAGG
66 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAA-AATTGAATCGAAAGG
* * * *
1839 TTTTTCCTCAATTTTCGGCCACAAAACTCATAAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAATATTAA
130 TTTTTCCTCAATTTTTGGCCACAAATCTCATAAAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATTAA
** *
1904 AGGGCTTTTCATGCTTCTAATATCATATATCATATTTTTTTTCGAATTAATTTCTAATTAAATCG
195 AGGGCTTTTCACACTTCTAATATCATATATCATA-TTTTTTTCGAATTAATTTCTAATTAAATCA
* * *
1969 AAACAAGATT-TCGATGCTTGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCT-AAGATTTGCTCA-
259 AAACAAGATTCT-GATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAA-AATTGGT-AT
* *
2031 AATGAATACAAA
321 GATGAATACAGA
* * ** * * * * *
2043 TATTTCAACGAGT-CTTGCGCCAAAAATCATGTGAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACGTGTTTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
* * *
2107 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACATGATTTTGGCTAAAATTTTGCCAAAATTGAATCGAAAAG
66 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTT-CCAAAATTGAATCGAAAGG
* * * *
2172 -TTTTCTCTCAATTTTTGG-CATAATTCTCAT-AAAAAATATATAAATTCAATGCCAATAAGATT
130 TTTTTC-CTCAATTTTTGGCCACAAATCTCATAAAAAAATATAT-AATTCAACGCCAAAAAGATT
*
2234 GAAA-GGTTTTTCACACTTCTAATATCAT
193 -AAAGGGCTTTTCACACTTCTAATATCAT
2262 TTCGGTTATT
Statistics
Matches: 1016, Mismatches: 129, Indels: 93
0.82 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
308 94 0.09
310 2 0.00
311 3 0.00
313 2 0.00
314 1 0.00
315 1 0.00
316 5 0.00
317 64 0.06
318 85 0.08
319 6 0.01
320 26 0.03
321 92 0.09
322 31 0.03
323 6 0.01
324 2 0.00
325 2 0.00
328 5 0.00
330 2 0.00
331 165 0.16
332 141 0.14
333 117 0.12
334 162 0.16
335 2 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.14, T:0.33
Consensus pattern (332 bp):
TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAAAATTGAATCGAAAGGT
TTTTCCTCAATTTTTGGCCACAAATCTCATAAAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATTAAA
GGGCTTTTCACACTTCTAATATCATATATCATATTTTTTTCGAATTAATTTCTAATTAAATCAAA
ACAAGATTCTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAAAATTGGTATGATGA
ATACAGA
Found at i:2434 original size:225 final size:224
Alignment explanation
Indices: 2043--2482 Score: 598
Period size: 225 Copynumber: 2.0 Consensus size: 224
2033 TGAATACAAA
* ** **
2043 TATTTCAACGAGTCTTGCGCCAAAAATCATGTGAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACGTGTTTTTA
1 TATTTCAACAAGTCTTGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACCCGTTTTTA
* *
2108 GCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACATGATTTTGGCTAAAATTTTGCCAAAATTGAATCGAAAAGT
66 GCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCCAAAATTGAATCGAAAAGT
* * * *** *
2173 TTTCTCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATATAAATTCAATGCCAATAAGATTGAAA
131 TTTCCCTCAATTTTTGGCACAATACTCATAAAAAATATAT-AATTCAACAACAAAAAGATTGAAA
*
2238 GGTTTTTCACACTTCTAATATCATTTCGGT
195 GGCTTTTCACACTTCTAATATCATTTCGGT
* * * * * *
2268 TATTTCAACAAGTCCTTGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGCTGCGGGAACCCGTTTTT
1 TATTTCAACAAGT-CTTGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACCCGTTTTT
*
2333 AG-CAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGGTTTCGGCTAAAATTTTG-CAAAGATTGAATCGAAAA
65 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCCAAA-ATTGAATCGAAAA
*
2396 -TTTTCCCTCAATTTTTGGCCACAATACTCATAAAAAATATATAATTCAACAACAAAAATATTGA
129 GTTTTCCCTCAATTTTTGG-CACAATACTCATAAAAAATATATAATTCAACAACAAAAAGATTGA
* *
2460 AGGGCTTTTCACGCTTCTAATAT
193 AAGGCTTTTCACACTTCTAATAT
2483 TTTTTTCGAA
Statistics
Matches: 187, Mismatches: 25, Indels: 7
0.85 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
224 58 0.31
225 86 0.46
226 43 0.23
ACGTcount: A:0.34, C:0.17, G:0.16, T:0.33
Consensus pattern (224 bp):
TATTTCAACAAGTCTTGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGTCGAGATCCCGGAACCCGTTTTTA
GCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCCAAAATTGAATCGAAAAGT
TTTCCCTCAATTTTTGGCACAATACTCATAAAAAATATATAATTCAACAACAAAAAGATTGAAAG
GCTTTTCACACTTCTAATATCATTTCGGT
Found at i:3316 original size:558 final size:551
Alignment explanation
Indices: 1709--3360 Score: 2292
Period size: 545 Copynumber: 3.0 Consensus size: 551
1699 TGAATACAGA
* * *
1709 TATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCAGAACGCGTTTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTCGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTGCCGGAACGCGTTTTT
* *
1774 AGCCAAAAACTGTGATGGTTAATATACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAAGAATTAAATCGAAAGG
66 AG-CAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAA-AATTAAATCGAAAGG
1839 TTTTTCCTCAATTTTCGGCCACAAAACTCATAAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAATATTAA
129 TTTTTCCTCAATTTTCGGCCACAAAACTCAT-AAAAAATATATAATTCAACACCAAAAATATTAA
*
1904 AGGGCTTTTCATGCTTCTAATATCATATATCATATTTTTTTTCGAATTAATTTCTAATTAAATCG
193 AGGGCTTTTCACGCTTCTAATATCAT-TATCATA-TTTTTTT-GAATTAATTTCTAATTAAATCG
* * * * *
1969 AAACAAGATTTCGATGCTTGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCT-AAGATTTGCTCAAA
255 AAACAAGATCT-GATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAA-ATTTGGTTAGA
* * *
2033 TGAATACAAATATTTCAACGAGT-CTTGCGCCAAAAATCATGTGAAACTGAGTCGAGATCCCGGA
318 TGAATACAGATATTTCAACGAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGTGAAACTGAGTCGGGATCCCGGA
* * * *
2097 ACGTGTTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACATGATTTTGGCTAAAATTTTGCCAAAATTG
383 ACGTGTTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGCGAAAATTG
*
2162 AATCGAAAAGTTTTCTCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATATAAATTCAATGCCAA
448 AATCGAAAATTTTTC-CTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATAT-AATTCAATGCCAA
* **
2227 TAAGATTGAAAGGTTTTTCACACTTCTAATATCATTTCGGT
511 TAAGATTGAAAGGATTTTCACACTTCTAATATCATTTCGAC
* * * * *
2268 TATTTCAACAAGTCCTTGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGCTGCGGGAACCCGTTTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTCGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTGCCGGAACGCGTTTTT
* * * *
2333 AGCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGGTTTCGGCTAAAATTTTGCAAAGATTGAATCGAAA-AT
66 AGCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAAA-ATTAAATCGAAAGGT
* * * * *
2397 TTTCCCTCAATTTTTGGCCACAATACTCATAAAAAATATATAATTCAACAACAAAAATATTGAAG
130 TTTTCCTCAATTTTCGGCCACAAAACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAATATTAAAG
* * **
2462 GGCTTTTCACGCTTC-----T-A--AT-AT-TTTTTTCGAATTATTTTCTAATTAAATAAAAACA
195 GGCTTTTCACGCTTCTAATATCATTATCATATTTTTTTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACA
* * * *
2517 AGATTCTGATACTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGGTTAGCTGAAAT
260 AGA-TCTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAAATTTGGTTAGATG-AAT
* * * *
2582 ACAGATATTTCAACGAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGTGAAACTCATTCGGGATCTCGGAACGTG
323 ACAGATATTTCAACGAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGTGAAACTGAGTCGGGATCCCGGAACGTG
*
2647 TTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTC-AGCTAAAATTTTGTGAAAATTGAATC
388 TTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGA-CTAAAATTTTGCGAAAATTGAATC
* *
2711 GAAAATTTTTCCCTCAATTTTCGGCATAATTCTAATAAAAAATATATACATTCAATGCCAATAAG
452 GAAAATTTTT-CCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATATA-ATTCAATGCCAATAAG
*
2776 ATTGAAAGGCTTTTCACACTTCTAATATCATTTCGAC
515 ATTGAAAGGATTTTCACACTTCTAATATCATTTCGAC
*
2813 TATTTCAACAAGTCCTCGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGTGTTGCCGGAACGCGTTTTT
1 TATTTCAACAAGTCCTCGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTGCCGGAACGCGTTTTT
2878 AGCTAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAGAAATTAAATCGAAAGG
66 AGC-AAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCA-AAATTAAATCGAAAGG
* * * *
2943 TTTTTCCTCTATTTTCGGCCACAAAACTTATAAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATTAAA
129 TTTTTCCTCAATTTTCGGCCACAAAACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAATATTAAA
3008 GGGCTTTTCACGCTTCTAATATCATTTATCATGATTTTTTTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAA
194 GGGCTTTTCACGCTTCTAATATCA-TTATCAT-ATTTTTTTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAA
* * * *
3073 ACAAGATACTGATGCTCGTAAAAACAAATTCTTAAATCCAATGTGGTTGAAAATTGGTTTGATGA
257 ACAAGAT-CTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAAATTTGGTTAGATGA
* ** * *
3138 ATACAGATATTTCAACAAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTCCCGGAACG
321 ATACAGATATTTCAACGAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGTGAAACTGAGTCGGGATCCCGGAACG
* * * *
3203 CGTTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTATACGATTTCGACTAAAAATTTGCGAAAATTGACT
386 TGTTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGCGAAAATTGAAT
* * * *
3268 CGAAAGATTTTTCCT-AATTTTTGGCCACAATACTCATAAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAA
451 CGAAA-ATTTTTCCTCAATTTTTGG-CATAATTCTCATAAAAAATATATAATTCAATGCCAATAA
* *
3332 TATT-AAAGGGATTTTCACTCTTCTAATAT
514 GATTGAAA-GGATTTTCACACTTCTAATAT
3361 TTTTTTCGAA
Statistics
Matches: 961, Mismatches: 104, Indels: 58
0.86 0.09 0.05
Matches are distributed among these distances:
543 71 0.07
544 30 0.03
545 252 0.26
546 56 0.06
547 76 0.08
550 1 0.00
551 1 0.00
552 1 0.00
553 1 0.00
556 52 0.05
557 74 0.08
558 198 0.21
559 148 0.15
ACGTcount: A:0.36, C:0.17, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (551 bp):
TATTTCAACAAGTCCTCGCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGGTTGCCGGAACGCGTTTTT
AGCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTCCAAAATTAAATCGAAAGGTT
TTTCCTCAATTTTCGGCCACAAAACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAATATTAAAGG
GCTTTTCACGCTTCTAATATCATTATCATATTTTTTTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAA
GATCTGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAAATTTGGTTAGATGAATACA
GATATTTCAACGAGTCCTGGCGCCAAAAATCATGTGAAACTGAGTCGGGATCCCGGAACGTGTTT
TTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGCGAAAATTGAATCGAAA
ATTTTTCCTCAATTTTTGGCATAATTCTCATAAAAAATATATAATTCAATGCCAATAAGATTGAA
AGGATTTTCACACTTCTAATATCATTTCGAC
Done.