Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01014772.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig14805, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 4365
ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.13, T:0.34
Found at i:767 original size:317 final size:317
Alignment explanation
Indices: 188--1114 Score: 809
Period size: 317 Copynumber: 2.9 Consensus size: 317
178 TAGTAAACGA
* *
188 TTTCGGTTAAAATTTTGCAAAAATGACTCGAAAAACTTTTCCGTCATTTTTGGCTAAAATACTAA
1 TTTCGGTTAAAATTTTGCAAAAATGACTCGAAAAACTTTTCCGTCATTTTTAGATAAAATACTAA
* * * * *
253 TAAAATATATATAATTTAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTCC
66 TAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAAAATTGAAGGACTTTTAACGCTTTTAATATCGTTTTCC
*
318 ATATTTTTCTAAATTAATTTCCAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATTC
131 ATATTTTTCTAAATTAATTTCCAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCC
* * *
383 TTAAATCCAATGTGACTGAGATTTAATTAGATGAATATGGATATCTCAAGGAGTCTTGGCGCCAA
196 TTAAATCCAATGTGACTGAGATTTAATTAGATGAATATAGATATCTCAAGGAGTCTTGCCACCAA
448 AAATCATGCAAAACTTAGTCGGGGTGCCGGAACGTGTTTTTAACAAAAAACCGTGAT
261 AAATCATGCAAAACTTAGTCGGGGTGCCGGAACGTGTTTTTAACAAAAAACCGTGAT
* *
505 TTTCGGTTAAAATTTTGTAAAAATTGAC-CTGAAAGA-TATTTCC-TCAATTTTTAGATAAAATA
1 TTTCGGTTAAAATTTTGCAAAAA-TGACTC-GAAAAACT-TTTCCGTC-ATTTTTAGATAAAATA
* * * * ** *
567 CTCATAAAAAATATATAATTCGACATCAAAAAGATTGAAGGGTTTTTAACGCTTTTAATATTGTT
62 CTAATAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAAAATTGAAGGACTTTTAACGCTTTTAATATCG-T
* * * *
632 TTTCCCATTTTTTTC-AAATTAATTTCTAATTAAATCTAAACAAGATTCAGATGCTCGT-AAAA-
126 TTT-CCATATTTTTCTAAATTAATTTCCAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAAC
* * ** * * *
694 AAATCCTTAAATCTAATGTGGCTGAGATTTGGTTAGATTAATATAGATATTTCAAGGAGTGTTGC
190 AAATCCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTAATTAGATGAATATAGATATCTCAAGGAGTCTTGC
* * * * * * * * **
759 CACCAAAAATTATGCAAAATTTAGTC-GAG-CCCAGGAATGCGTTTTTAGCCGAAAATCGTGATG
255 CACCAAAAATCATGCAAAACTTAGTCGGGGTGCC-GGAACGTGTTTTTA-AC-AAAA----AACC
822 GTTAGTTAGT
313 G-T-G--A-T
* * * * * *
832 ACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATCGACCCGAAAGATTTTTCC-TCGATTTCTGGCA-A
1 ------TTTCGGTTAAAATTTTGCAAAAAT-GACTCGAAAAACTTTTCCGTC-ATTTTTAG-ATA
* * * * * * * *
895 AAATACTCATAAAAGAAAATATAATTCAACGCCAATAAAATTAAAAGCATTTTTCACGCTTTTAA
57 AAATACTAATAAAA-AATATATAATTCAACACCAAAAAAATT-GAAGGACTTTTAACGCTTTTAA
* * * ** * * ** *
960 CATCATTTTTCATATTAGAT-TGAATT-ATTTCTAATTAAATC-AAATCAAGATTCTTATACTCG
120 TATCGTTTTCCATATT-TTTCTAAATTAATTTCCAATTAAATCGAAA-CAAGATTCAAATGCTCG
* * * * * * *
1022 TAAAAACAAATTCTTAAGTTCAATGTCACTGAGATTTGATTAGATGAATATAAATATTTCAAGGA
183 TAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTAATTAGATGAATATAGATATCTCAAGGA
* * *
1087 GTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACT
248 GTCTTGCCACCAAAAATCATGCAAAACT
1115 AAGCTGTGGT
Statistics
Matches: 493, Mismatches: 82, Indels: 52
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
315 2 0.00
316 14 0.03
317 105 0.21
318 87 0.18
319 44 0.09
320 10 0.02
322 2 0.00
323 1 0.00
324 1 0.00
326 1 0.00
327 1 0.00
332 4 0.01
333 93 0.19
334 37 0.08
335 91 0.18
ACGTcount: A:0.38, C:0.15, G:0.14, T:0.34
Consensus pattern (317 bp):
TTTCGGTTAAAATTTTGCAAAAATGACTCGAAAAACTTTTCCGTCATTTTTAGATAAAATACTAA
TAAAAAATATATAATTCAACACCAAAAAAATTGAAGGACTTTTAACGCTTTTAATATCGTTTTCC
ATATTTTTCTAAATTAATTTCCAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCC
TTAAATCCAATGTGACTGAGATTTAATTAGATGAATATAGATATCTCAAGGAGTCTTGCCACCAA
AAATCATGCAAAACTTAGTCGGGGTGCCGGAACGTGTTTTTAACAAAAAACCGTGAT
Found at i:1816 original size:334 final size:334
Alignment explanation
Indices: 1187--3342 Score: 1298
Period size: 334 Copynumber: 6.4 Consensus size: 334
1177 AGATTCACAC
* * * * *
1187 TTTAATATCGTTTTTCATATTTTTCTAAATTAATTTCCAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGC
1 TTTAATATCGTTTTTCCTTTTTTTCCAAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGC
* * * * *
1252 TCGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGGCTGAGATATAATTAGATGAATAT-G-GA-TATCT
66 TTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTATCT
* * * * * * *
1314 CAAGGAGTCTTAGCGCCAAAAATCATGCAAAACTTAGCTGGGGCCCCGTAACGCGTTTTTAGCCT
131 CAAAGAGTCTTAGCACAAAAAATCACGCAAAACTTAGCCGGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCA
* * *
1379 AAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGTAAAAATTGACCTGAAAGATATTT
196 AAAACTGTGATGATTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGCAAAAATTGACCTGAAAGATATTT
* * *
1444 CCTCAATTTTTGGCTAAAATACTCATAAAAAATATATAATT-AGACATCA-AAAAGATTGAAGGG
261 CCTCAATTTTTAGCCAAAATACTCATAAAAAATATATAATTCA-ACACCATAAAA-ATTGAA-GG
1507 C-TTTTAACGCT
323 CATTTTAACGCT
* * *
1518 TTTAATAGT-GTTTTTCCTTTTTTTCCCAATTAATTTCTAATTAAATCGAAAAAAAATTCAGATG
1 TTTAATA-TCGTTTTTCCTTTTTTTCCAAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATG
* * * * *
1582 CTTGTAAAAACAAATTCTTAAATCCAATGTAATTGTGATTTGATTAGATGAAAATAGATATTATC
65 CTTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTATC
* * * *
1647 TCAAAGAGTCTTGGCACAAAAAATCACGCAAACCTTATCCGGGG-CCTGAAACGCGTTTTTAGCC
130 TCAAAGAGTCTTAGCACAAAAAATCACGCAAAACTTAGCCGGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCC
* * * *
1711 AAAAAGCTGTGATGATTATTACATGATTTCGACTAGAATTTTGCAAAAATTGA-CTCGAAAGTTA
195 AAAAA-CTGTGATGATTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGCAAAAATTGACCT-GAAAGATA
* * ** *
1775 TTTCCTCAATTTTTAGCCACAATACTTATAAAATTTATATAATTCAACACCATAAAAATTGAATG
258 TTTCCTCAATTTTTAGCCAAAATACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCATAAAAATTGAAGG
* *
1840 CATTTTTATGCT
323 CATTTTAACGCT
* * * ** *
1852 TCTAATATCATTTTTCCTATTAGTTTT-CGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACTTGATTTAGA
1 TTTAATATCGTTTTTCCT-TT--TTTTCCAAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGA
* * * * *
1916 TGCTTGT-TTTACAAATCCTTAGATCCAATGTGACTGAGATTTGGTTAGATGAATATAGATA-T-
63 TGCTTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTA
* * * * * * * *
1978 T-TCAAGGAGTCTCGACGC-C-AAAAATCATGCAACACTGAACC-GGGTCCC-ATAATGCGTTTT
128 TCTCAAAGAGTCT-TA-GCACAAAAAATCACGCAAAACTTAGCCGGGGCCCCGA-AACGCGTTTT
* * * * * **
2038 TAACCAAAAAAAACCGTGATTTTGACTAACATACACGATTTTG-GGAAATATTTTGCAAAAATTG
190 TAGCC---AAAAACTGTGA---TGA-TTA-GTACACGATTTCGACTAAA-ATTTTGCAAAAATTG
* * * * * * * *
2102 ACCAGAAATATTTTTCCTCAATTTTTATCTAAGATGCTCATAAAAAATATATATATATATATATA
246 ACCTGAAAGATATTTCCTCAATTTTTAGCCAAAATACTCAT---AAA-A-A-ATATATA-AT-TC
* * *
2167 ATTAAATTCCA-AAAATATTGGAGG-ACTTTTCACGCT
303 A--ACA--CCATAAAA-ATTGAAGGCA-TTTTAACGCT
* * * ** *
2203 TTTAATATTGTTTTTCATATTTTTCTGAATTAAATTTC-AATTAAATCGAAATAAGATTCAGATG
1 TTTAATATCGTTTTTCCTTTTTTTCCAAATT-AATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATG
* * * * *
2267 CTCGTAAAAACAAATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGATTTGATTAGGTGAATATAGATATTTCA
65 CTTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACT--GA---GATT---TG-AT-TAG--------
* * ** * * * *
2332 AGTGAATATAGATGAATATAGATATTCCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTAAGC
112 A-TGAATATAGAT--AT-T--AT-CT-CAAAGAGTCTTAGCACAAAAAATCACGCAAAACTTAGC
* * * * * *
2397 CGGGGCCCCGAAACGTGTTTTTAGCAAAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAGT
169 CGGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGC-CAAAAACTGTGATGATTAGTACACGATTTCGACTAAAAT
* * * * * *
2462 TTTACAAAAAAAATGACCTGAAA-AAATTTTCCTCAATTTTTAACCACAAGACTCATAAAAAATA
233 TTTGC--AAAAATTGACCTGAAAGATA-TTTCCTCAATTTTTAGCCAAAATACTCATAAAAAATA
* ** * * * *
2526 TGTAATTCAATGCTA-AAAAGATTGATGGGCTTTTTCACGCT
295 TATAATTCAACACCATAAAA-ATTGA-AGGCATTTTAACGCT
* * * * * **
2567 TCTAATATCGTTTTT-CTTATTTTGTTCGAATTAATTTCTAATTAAAACGAAATATTATTCAGA-
1 TTTAATATCGTTTTTCCTT-TTTT-TCCAAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGAT
* * * *
2630 -----T-AT------TTGTAAAAT-CAATG-G-CTGAGATTTGGTTAGATTAATATA-A-A-TAT
64 GCTTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTAT
* * * * ** *
2677 TTCAAGGAGTCTCGATGC-C-AAAAATTATTCAAAA-TTGAACC-GGGCCCCAGAAA-GCGTTTT
129 CTCAAAGAGTCT-TA-GCACAAAAAATCACGCAAAACTT-AGCCGGGGCCCC-GAAACGCGTTTT
* * * ** * *
2737 TAGCC-AAAAGTCGTGATGATTATTACACGACTTCGGTTAAAATTTTACAAAAATTGACCCGAAA
190 TAGCCAAAAACT-GTGATGATTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGCAAAAATTGACCTGAAA
* * * * *
2801 GATATTTCCTCAATTTTTAGCCATAATACTCATAAAAAATTTATAATTTAACGCCCA-AAAGATT
254 GATATTTCCTCAATTTTTAGCCAAAATACTCATAAAAAATATATAATTCAAC-ACCATAAAAATT
*
2865 GAAGGGC-TTTTCACGCT
318 GAA-GGCATTTTAACGCT
* ** *
2882 TTTAATATCGTTTTTCATATTTTTTTCTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAAATTCAGAT
1 TTTAATATCGTTTTTC--CTTTTTTTCCAAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGAT
** * * * * *
2947 GCTCATAA-AA-AAAATCTTAAATGCAATGTGGCTAAGATTTTATTAGATGAATATAGATA-TAT
64 GCTTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTAT
* * * ** * * * ** *
3009 TTCAAGGAGTGTCGGCGCCAAAAACCATTCAAAACTGAGCCGGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGC
129 CTCAAAGAGTCTTAGCACAAAAAATCACGCAAAACTTAGCCGGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGC
* * * * * * * *
3074 TAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTACAAAAAAAATGACC-CAAAAAT
194 CAAAAACTGTGATGATTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGC--AAAAATTGACCTGAAAGAT
* * * ** * * * *
3138 TTTTCTATCAATTTTTGGATAAAATACTAATAAAATAA-ATAGAATTTAACGCCA-AAAAGATTG
257 ATTTC-CTCAATTTTTAGCCAAAATACTCATAAAA-AATATATAATTCAACACCATAAAA-ATTG
** *
3201 AAGGGTTTTTGACG-T
319 AAGGCATTTTAACGCT
* * * *
3216 TTCTAATATCGTTTTTCCTATTTTTCCAAATTAATTTCTAATTAAATCAAAATAAGATTTAGATG
1 TT-TAATATCGTTTTTCCTTTTTTTCCAAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATG
* * * * * *
3281 CTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGCCTGAAATTTGATTAGATGAATGTAGATATT
65 CTTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATT
3343 TCAAGTAGTT
Statistics
Matches: 1432, Mismatches: 262, Indels: 257
0.73 0.13 0.13
Matches are distributed among these distances:
315 24 0.02
316 96 0.07
317 15 0.01
318 33 0.02
319 18 0.01
320 30 0.02
321 3 0.00
322 5 0.00
323 1 0.00
324 1 0.00
326 1 0.00
327 6 0.00
328 5 0.00
329 2 0.00
330 29 0.02
331 107 0.07
332 79 0.06
333 126 0.09
334 194 0.14
335 167 0.12
336 41 0.03
337 7 0.00
338 4 0.00
339 57 0.04
340 2 0.00
341 2 0.00
342 3 0.00
343 1 0.00
344 4 0.00
345 6 0.00
346 2 0.00
347 4 0.00
348 4 0.00
349 35 0.02
350 35 0.02
351 36 0.03
352 8 0.01
355 4 0.00
358 3 0.00
359 2 0.00
360 3 0.00
363 11 0.01
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365 28 0.02
367 2 0.00
368 3 0.00
369 17 0.01
370 1 0.00
371 2 0.00
372 3 0.00
373 17 0.01
374 6 0.00
375 39 0.03
376 1 0.00
377 2 0.00
378 13 0.01
379 29 0.02
380 17 0.01
381 1 0.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.15, G:0.14, T:0.34
Consensus pattern (334 bp):
TTTAATATCGTTTTTCCTTTTTTTCCAAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGC
TTGTAATAACAAATTCTTAAATCCAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTATCT
CAAAGAGTCTTAGCACAAAAAATCACGCAAAACTTAGCCGGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCA
AAAACTGTGATGATTAGTACACGATTTCGACTAAAATTTTGCAAAAATTGACCTGAAAGATATTT
CCTCAATTTTTAGCCAAAATACTCATAAAAAATATATAATTCAACACCATAAAAATTGAAGGCAT
TTTAACGCT
Found at i:3282 original size:333 final size:324
Alignment explanation
Indices: 2340--3424 Score: 1083
Period size: 333 Copynumber: 3.3 Consensus size: 324
2330 CAAGTGAATA
* *
2340 TAGATGAATATAGATATTCCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTAAGCCGGGGCCC
1 TAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCCGGGGCCC
* *
2405 CGAAACGTGTTTTTAGCAAAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAGTTTTACAAA
66 CGAAA-GCGTTTTTAGC-AAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTACAAA
* * * * * *
2470 AAAAATGACCTGAAAAAATTTTCCTCAATTTTTAACCACAAGACTCAT-AAAAAATATGTAATTC
129 AAAAATGACC-CAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGA-CAAAATACTCATAAAAAAATA-G-AATTT
* * * * * *
2534 AATGCTAAAAAGATTGATGGGCTTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTGTTCGAATT
190 AACGCCAAAAAGATTGAAGGG-TTTTTCACGTTTCTAATATCGTTTTTCATATTTT-TCCGAATT
* * * ** * * *
2599 AATTTCTAATTAAAACGAAAT--A-TT--AT--TC--AGATATTTGTAAAATCAA--TGGCTGAG
253 AATTTCTAATTAAATCGAAATAAATTTAGATGCTCTAAAAAAAATCTTAAATCAATGTGGCTAAG
*
2653 ATTTGGT
318 ATTTGAT
* * ** * * * *
2660 TAGATTAATATAAATATTTCAAGGAGTCTCGATGCCAAAAATTATTCAAAATTGAACC-GGGCCC
1 TAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCCGGGGCCC
* ** * * * *
2724 CAGAAAGCGTTTTTAGCCAAAAGTCGTGATGATTATTACACGACTTCGGTTAAAATTTTAC--AA
66 C-GAAAGCGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTACAAAA
* * * * * * *
2787 AAATTGACCCGAAAGATATTTCCTCAATTTTTAGCCATAATACTCATAAAAAATTTATAATTTAA
130 AAAATGACCC-AAAAATTTTTCCTCAATTTTT-GACAAAATACTCATAAAAAA-ATAGAATTTAA
* * *
2852 CGCCCAAAAGATTGAAGGGCTTTTCACGCTTT-TAATATCGTTTTTCATATTTTTTTCTGAATTA
192 CGCCAAAAAGATTGAAGGGTTTTTCACG-TTTCTAATATCGTTTTTCATA--TTTTTCCGAATTA
* *
2916 ATTTCTAATTAAATCGAAACAAAATTCAGATGCTCATAAAAAAAATCTTAAATGCAATGTGGCTA
254 ATTTCTAATTAAATCGAAA-TAAATTTAGATGCTC-TAAAAAAAATCTTAAAT-CAATGTGGCTA
*
2981 AGATTTTAT
316 AGATTTGAT
* * *
2990 TAGATGAATATAGATATATTTCAAGGAGTGTCGGCGCCAAAAACCATTCAAAACTGAGCCGGGGC
1 TAGATGAATATAG--ATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCCGGGGC
* * *
3055 CCCGAAACGCGTTTTTAGCTAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTACAA
64 CCCGAAA-GCGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTACAA
* * *
3120 AAAAAATGACCCAAAAATTTTTCTATCAATTTTTGGATAAAATACTAATAAAATAAATAGAATTT
128 AAAAAATGACCCAAAAATTTTTC-CTCAATTTTT-GACAAAATACTCATAAAA-AAATAGAATTT
* * *
3185 AACGCCAAAAAGATTGAAGGGTTTTTGACGTTTCTAATATCGTTTTTCCTATTTTTCCAAATTAA
190 AACGCCAAAAAGATTGAAGGGTTTTTCACGTTTCTAATATCGTTTTTCATATTTTTCCGAATTAA
* *
3250 TTTCTAATTAAATCAAAATAAGATTTAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGCCT
255 TTTCTAATTAAATCGAAATAA-ATTTAGATGCTC-TAAAAA-AAAT-CTTAAAT-CAATGTGGCT
3315 GAA-ATTTGAT
315 -AAGATTTGAT
* * * * * * *
3325 TAGATGAATGTAGATATTTCAAGTAGTTTCGGAGCC-AAAATCATGCAAAATTGAGCCAGGTCCC
1 TAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCCGGGGCCC
*
3389 CGAAA-CATTTTTAGCCAAAAAACCGTGATGGTTAGT
66 CGAAAGCGTTTTTAG-CAAAAAACCGTGATGGTTAGT
3425 TAGTATACAA
Statistics
Matches: 623, Mismatches: 106, Indels: 61
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
315 24 0.04
316 86 0.14
317 9 0.01
318 38 0.06
319 18 0.03
320 53 0.09
322 2 0.00
324 2 0.00
327 9 0.01
328 3 0.00
330 31 0.05
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332 72 0.12
333 119 0.19
334 16 0.03
335 118 0.19
336 4 0.01
ACGTcount: A:0.37, C:0.15, G:0.15, T:0.32
Consensus pattern (324 bp):
TAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCCGGGGCCC
CGAAAGCGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTACAAAAA
AAATGACCCAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGACAAAATACTCATAAAAAAATAGAATTTAACGCC
AAAAAGATTGAAGGGTTTTTCACGTTTCTAATATCGTTTTTCATATTTTTCCGAATTAATTTCTA
ATTAAATCGAAATAAATTTAGATGCTCTAAAAAAAATCTTAAATCAATGTGGCTAAGATTTGAT
Done.