Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01015331.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig15364, whole genome shotgun sequence
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*
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62 CGTGGTCAAAAAATTGAGGAAAATAATTCGGGTC
* * * **
617 TATTAGAAGCGTTAAAAGATCTTCAATATTTTTGGTGTTGAATTATATATTTTTATTAGTATTTT
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702 ATATTCCAGG
Statistics
Matches: 73, Mismatches: 7, Indels: 9
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GTCAAAAAATTGAGGAAAATAATTCGGGTC
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607 AATTCGGGTC
* ** * *
617 TATTAGAAGCGTTAAAAGATCTTCAATA-TTTTTGGTGTTGAATTATATA-TTTTTATTAGTATT
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* * * * *
680 TTGGTCAAAAAATTGAGGAAAAATATTCCAGGTCAATTTTTTGGAAACTTTTAGTCGAAATCGTG
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** * * * * * * **
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* * ** * * * * * *
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* * ** * * *
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255 TTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-G-AA
* *
934 AAAGCATTGGAAAAACGA
318 AAA-AATAGGAAAAACGA
* * * *
952 TATTAGAAACGTTAAAA-CCCTTCAAACTTTTTGTCATTGAATTATATGTTTTCTTAAGAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTT-TTATGAGTATT
*
1016 TCGGTTAAAAATT-ATGGAAAAATATTTCGGGTCAA-TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
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* * *
1079 ACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGCCACCGGTTCAGTTTTGAATGATT
128 ACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATT
* * * *
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193 TTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTG
* * * *
1209 AGGATTTGTTATTACGAGAATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCATAAATTAATTTATTAAAAAA
258 AGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-GAAAAAA
* *
1274 ATAGGCAACACGA
322 ATAGGAAAAACGA
*
1287 TATTAGAAGCGTTAAAAGCCCTTCAATA-TTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTAT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTA-
* * * * *
1351 TTTGGTCAAAATTTGAGGAAAAATAATCCTGGTCAATTTTTGCAAAATTATAGCCGAAATCGTGT
63 TTTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
** * * *
1416 ACTAACCATTC-CGGTTTCTT-GC-AAAAAATCGTGTTCCGAGGCACCGGCCCAGTTTTGCATGA
128 ACTAACCA-TCACGGTTT-TTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGA
* ** **
1478 TTTTTGGAACCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAAGAAAATCTCAGCCGTATTGGATT
191 TTTTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATT
* * **
1543 GGAGGATTTGTTTTTA-GAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAGATTTTAA-TTAGGAAAA
256 TGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-GAAAA
*
1606 AAGCATTGGAAAAACGA
320 AA--ATAGGAAAAACGA
* *
1623 TATTATAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATCA
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTAT-T
* * *
1688 TGG-CTAAAAATTGAGGAAAAATAATTCGGGTCAATTTTTGCAAAATGTTACCCGAAATCGTGTA
65 TGGTC-AAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
* * *
1752 CGTTAACCATCACGGTTTTTGGTTAAAAACGCGTGTTTCGGGTCACCGGCTCAGTTTTTCATGAT
129 C--TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGAT
* * *
1817 TTTTGGAGCGAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAATTCTCAGCCACATTAGATTT
192 TTTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTT
* * *
1882 GAGGATTTGTTTTTACGAGAATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCATAAATTAATTTAGGAAAAA
257 GAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAA
* * * *
1947 AGAGGGAACACCA
322 ATAGGAAAAACGA
* * * * *
1960 TATTAGAAGCGTTAAAAGACTTTCAATA-TTTTTGGTGTTGAATTATATA-TTTTTATTAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-T
* * * * *
2023 TTGGTCAAAAAATTGAGGAAAAATATTCCAGGTTAATTTTTGGAAAATTTTAGTCGAAATCGTGT
64 TTGGTC-AAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
** * * * * * * **
2088 ACTAACCATCATAGTTTTTGGATAGAAACGC--GTTCCGGGGC-CATGGCTTAGTTTTTC-TTCT
128 ACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCAC-CGGCTCAGTTTTGCATGAT
* * * * * * * *
2149 TCTTTCGCGCCGAGACTCCTTGA-AATATCAATATT-ATCAAATCAAATCTCAGCCACATTGGAT
192 T-TTTGGAGCCAAGAGTCGTT-ATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGAT
* * * * * *
2212 TTAAGGATATCTTTTTACGAGCTTCTGATTCTTGTTTCGATTTAATCAGAAACTAA-TTAGGTAA
255 TTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-G-AA
* *
2276 AAAGTATTGGAAAAACGA
318 AAA-AATAGGAAAAACGA
* * * *
2294 TATTAGAAACGTTAAAA-CCCTTCAAACTTTTTGGCATTGAATTATATGTTTTATTAAGAGAATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTT-TTATGAGTATT
* * *
2358 TCGGTCAAAAATTAAGGAAAATTATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAATTTAGCCGAAATCGTGTA
65 T-GGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
* * * * *
2423 GTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGAGGCACCGGTTCAATTTTGAATGATTT
129 CTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTT
* * * * *
2488 TTGGAGCCAATAGTCGTTATAATATCTAAATTCATCAAACCAATTCTCAGCCACATTAGATTTGA
194 TTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTGA
* * * * * **
2553 GGTTTTGTTATTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAGTAATAAATTAATTTATTAAAAAAT
259 GGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAAAT
* *
2618 AGGGAACACGA
324 AGGAAAAACGA
* *
2629 TATTAGAAGCGTTAAAAGCCCTTCAATA-TTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTATTAGTATG
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTAT-
** * * * * * * * *
2692 TTTCTAAAAAATTGTGGAAATATATTCCTGTTCAATTTTTGCAAAACTATAGCCGAAATCGTG--
64 TTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
* * * * *
2755 -T-A-CGTCACTGTTTTTAGCAAAAAACGC--GTTTCGGGGCACCGGCCCAGTTTTGCATGATTT
129 CTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTT
* * * * * * * *
2815 TCGGCGCCGAGAGTCGTTAAAATAACTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCATATTGGGTTGGA
194 TTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTGA
* * * ** *
2880 GGATTTGTTTTTCCGAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTCAATCAGATTTTAATTTA-AGAAAAAT
259 GGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAAAT
* *
2944 TGTAAAAACGA
324 AGGAAAAACGA
* * * * *
2955 TATTAGAAATGTTAATAGCCCATCAAACCTTTTGGCGTAGAATTATATATTTTTTTATGAGTATC
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTAT-
* * ** *
3020 ATGGCCAAAAATTGAGGAAAAATAAATCGTGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
64 TTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
* *
3085 CTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGTCACCGACTCAGTTTTGCATGATTT
129 CTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTT
** *
3150 TTGGAGCCAAGAGTCAATATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCATATTGGATTTGA
194 TTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTGA
* ** * *
3215 GGATTTGTTTTTACGAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAGATTTTCATTTAGGAAAAAAT
259 GGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAAAT
*
3280 TGGAAAAACGA
324 AGGAAAAACGA
* * * * *
3291 TATTAGAAACGTTAAAAGCCATTCAAAATTTGTGGCGTTGATTTATATATTTTTTTATGTGTA-T
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTATT
* * *
3355 CGTGTCCAAAAATTGAGG-AAAATAATTCGGGTCAATTTTTGAAAAATTTTAGCCGAAATCGTG-
65 TG-GT-CAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
** *
3418 --T-ACCATCACGGTTTTTTGGCTAAAAACGC--GTTTCGGGGCATAGGCTCAGTTTTGCATAAT
128 ACTAACCATCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGAT
* ** * * * * **
3478 TTTTGGTGCTGAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCACCTACCCAATTCTCAGCCACATAAGATTT
192 TTTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTT
* * * * *
3543 GAGGATTTGTTTTTACGAGCATCCGAATCTTATTTCGATTTAATCAAAAATTATTTTAGGAAAAA
257 GAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAA
* * *
3608 ATAGGGAACACAA
322 ATAGGAAAAACGA
* * * * *
3621 TATTAGTAGCGTTAAAATCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGTATTATTTATTTTTTTATGAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTA-T
* * * * * * *
3686 TTGGTCAAAATTTGAGGAAAAATATTCCTGGTCAATTTTTGCTAAATTATGGCCGAAATCTTGTA
64 TTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
* * * * * **
3751 CTAACCATCACGGTTTTTGACAAAAAAAAAACAACGCG-TTCCGGGCATTGGC-CTAGTTTTGCA
129 CTAACCATCACGGTTTTTGGC----TAAAAAC-GCGTGTTTCGGGGCACCGGCTC-AGTTTTGCA
* * * * * *
3814 TGATTTTTTGCGCCGAA-AGTCGTTAAAATAACTATATCCATCTAACCAAATCTCAGCCATATTG
188 TGATTTTTGGAGCC-AAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTG
* * * * *
3878 GATTTGAGAATTTGTTTTAACGAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAG-ATTTTATTTAGG
252 GATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-G
*
3942 AAAAAAGCATTGGAAAAACGA
316 AAAAAA--ATAGGAAAAACGA
* * *
3963 TATTATAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGTGTATCA
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTAT-T
* * *
4028 TGG-CTAAAAATTGAGGAAAAATAATTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTACCCGAAACCGTGTA
65 TGGTC-AAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
* * *
4092 CGT-----T-ACGGTTTTTAGTTAAAAACGCGTGTTTCGGGTCACCGGCTCAGTTTTGCATGATT
129 C-TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATT
* * * *
4151 TTTGGAGCTAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAATTCTCAGCCATATTAGATTTG
193 TTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTG
* * * *
4216 AGGATTTGTTTTTACGAG-ATTCTAAATCTTGTTTTGATTTAATCATAAATTAATTTAGGAAAAA
258 AGGATTTGTTTTTACGAGCA-TCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAA
* * * *
4280 AGAGGGAACACGT
322 ATAGGAAAAACGA
* * * *
4293 TATTAGAAGCGTTAAAAGACGTTCAATA-TTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTATTAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-T
* * * * *
4356 TTGATCAAAAAATTGAGGAAAAATATTCCAGGTCAATTTTTGGAAAATTTTAGTCGAAATCGTGT
64 TTGGTC-AAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
** * * * * * * * **
4421 ACTAACCATCATAGTTTTTGGCTAGAAATGC--GTTCCGGGATCA-CGGCTTAGTTTTTCTTCTT
128 ACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGG-GCACCGGCTCAGTTTTGCATGAT
* * * * * * * * *
4483 TTTTCGCGCCAAGACTCCTTGA-AATATCAATATTCATCAAATCAAATGTCATCCACATTGGATT
192 TTTTGGAGCCAAGAGTCGTT-ATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATT
** *** * *
4547 CAAGGATACATTTTTACGAGCTTCTGATTCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAA-TTAGGTAAA
256 TGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-G-AAA
* *
4611 AAGCATTGGAAAAACGA
319 AA-AATAGGAAAAACGA
* * * * *
4628 TATTAGAAACGTTAAAA-CCCTTCAAGCTTTTTGGCATTGAATTATATGTTATCTTAAGAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATT-TTTTATGAGTATT
* *
4692 TCGGTCAAAAATT-ATGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAACTTTTAGCCGAACTCGTGT
65 T-GGTCAAAAATTGA-GGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
* * *
4756 ACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACTGGTTCAGTTTTGAATGATT
128 ACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATT
* * * *
4821 TTTGGAGCCAATAGTCGTTATAATATCTATATTCATCAAACCAATTCTCAGCCACATTAGATTTG
193 TTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTG
** * * * * **
4886 AGGATTTGTTAGTACGAGCATCTGAATATTTTTTCGATTTAATAATAAATTAATTTACTAAAAAA
258 AGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAAA
* *
4951 TAGGGAACACGA
323 TAGGAAAAACGA
* * * *
4963 TATTAGAAGCGTTAAAAGCCCTTCAATA-TTTTT-ACAGTTGAATTATACA-TTTTTATTAGTAT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGC-GTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-
** ** * * *
5025 TTTGGTCAAAAATTGTTGAAAAATATGCCTGGTCAATTTTTGCAAAACTATAGCCGAAATCGTGT
63 TTTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
* * * *
5090 ACTTAACACCATCACGATTTTCGGC-AAATAACGC--GTTCCGGGGCACCGGC-CGAATTTTGCA
128 AC-T-A-ACCATCACGGTTTTTGGCTAAA-AACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTC-AGTTTTGCA
* * * * * * * *
5151 AGATTTTCGGCGCCGAGAGTCGTTAAAATAAT-TATATTCATTTAACAAAATCTCAGCCATATTG
188 TGATTTTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAAT-ATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTG
* * ** *
5215 GATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGAATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAGATTTTAATTTAGG
252 GATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGA
*
5280 AAAAAATTGGAAAAACGA
317 AAAAAATAGGAAAAACGA
* * * * * *
5298 TATTAGAAAAGTTAAAAACCCTTGAAACTCTTTGGTGTTGAATTATATATTTTTTCACGAGTATC
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTT-ATGAGTAT-
* * ** * *
5363 GTGGCCAAAAATTTTGGAAAAATAATTCGGGTCTATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
64 TTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
*
5428 C--A--ATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGTCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTT
129 CTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTT
* * * * * *
5489 TTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAAACAATTGTCAGTCACATTAGATTTGC
194 TTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTGA
* * * * *
5554 GGATTTGTTTTTACGAGAATCTGAATCTTATTTCGATTTAATCATAAATTAATTTAGGAAAAAAG
259 GGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAAAT
* *
5619 AGGGAACACGA
324 AGGAAAAACGA
* * * *
5630 TATTAGAAGCGTTAAAAGACCTTCAATA-TTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTATAAGCATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-T
* * * *
5693 TTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTCCAGGTCAATTTTTGGAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTA
64 TTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTA
* * * * * * **
5758 CTAACCATCACAGTTTTTGGCT-AAAA--CTTGTTTCGAGGC-CACGACTTAGCTTTT-CTTCTT
129 CTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCAC-CGGCTCAG-TTTTGCAT-GA
* * * * * * * * * *
5818 TTTTTCGCGCCGAGACTCCTTGA-AATATCAATATTCATCAAATCAAATCTTAGCCACATCGGAT
191 TTTTTGGAGCCAAGAGTCGTT-ATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGAT
* * * * * *
5882 TTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTTTGATTCTTTTTTCGATTTAATCAGAAATTAA-TTAGGAAA
255 TTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-GAAA
* *
5946 AAAGCATTGGAAAAATGA
319 AAA--ATAGGAAAAACGA
* * *
5964 CATTAGAAACGTTAAAA-CCCTTCAAACTTTTTGGCATTGAATTATATATTTTTTAAGAGTATTT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTT
* * *
6028 CGGTTAAAAATTGTGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCTGAAATCGTG---
66 -GGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC
* *
6090 ------TCACGGTTTTTGGCTAAAAACGTGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGAATGATTTT
130 TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTTT
* * * * * * *
6149 TAGAGCCAATAGTCGTTATAATATCTATATTCATCAAACCAATTCTCAACTACATTAGATTTGAG
195 TGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTGAG
* * * * *
6214 GATTTGTTATTACGAGCATCTGAATCTTGTTTAGATTTAATCATAAATTAATTTACTAAAAAACT
260 GATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTA-GAAAAAAAT
* *
6279 AGGGAACACGA
324 AGGAAAAACGA
* * * *
6290 TATTAGAAGCGTTAAAAACCCTTCAATA-TTTTTGACGTTGAATTATATA-TTTTTATTAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-T
** * * * * * *
6353 TTGGTCAAAAATTGTTTG-AAAATATTCCTGGTCAATTTTTGCAAAACTATAGACGAAATCATGT
64 TTGGTCAAAAATTG-AGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT
* * * * * *
6417 ACTAACCATCACGGTTTTTGACAAAAAACGC--GTTCCGGGGCACCGGCCCAGATTTGCAAGATT
128 ACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATT
* * ** * * *
6480 TTCGGCGCCGGGAGTCGTTAAAATAACTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCATATTGGATTTG
193 TTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTG
* * * * ** *
6545 AGGATTTGTTTTTAAGAGCATATAAATCTTATTTCGATTTAATCAGATTTTAATTTAGGAAAAAA
258 AGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAAA
* **
6610 TTGGGGAAACGA
323 TAGGAAAAACGA
* *
6622 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTTAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATCG
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTAT-T
* * *
6687 TGGCCAAAAATTGAGGAAAAATAATTCGGGTTAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC
65 TGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC
* * ** * *
6752 TAACCATTACAGTTTTTGGCTAAAAACGC--GTTTCGGGGCATAGGCTCAGTTTTGTAGGATTTT
130 TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTTT
* * * **
6815 CT-GTGCCGAA-AGTCGTTATAATATCTATATTCATCTACCCAATTCTCAGCCACATAAGATTTG
195 -TGGAGCC-AAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTG
* * * * * * * *
6878 AGAATTTATTTTTACGAGTATCTAAATCTTATTTCAATTTAATCAAAAATTAATTTAGGAAAAAA
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* *
6943 TAGGGAACACGA
323 TAGGAAAAACGA
* * * *
6955 TATTAGAAACGTTAAAATCCTTTCAAACTTTTTGGTGTTGTATTATATATTTTTTTATGAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTATT
** * * * * * * * **
7020 TTATCAAAATTTGAGGAAAAATATTCCTGATCCATTTTTGAAAAATTATAGCCGAAATTATGTAC
65 TGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC
*
7085 TAACCATCATGGTTTTTG
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Statistics
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GAAAAACGA
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* * * * * *
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* * ** * * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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508 GCCT-AGTTTTGCATGATTTTTGGCGCCGAAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCATCTAACCAAA
* * *
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* ** * * *
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* * *
1287 TATTAGAAGCGTTAAAAGCCCTTCAATATTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTATC
* * * * *
1352 TTGGT-CAAAATTTGAGGAAAAATAATCCTGGTCAATTTTTGCAAAATTATAGCCGAAATCGTGT
66 GT-GTCCAAAAATTGAGGAAAAATAATTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTG-
* * * * *
1416 ACTAACCATTC-CGGTTTCTT-GCAAAAAATCGTGTTCCGAGGCACCGGCCCAGTTTTGCATGAT
129 A-TAACCA-TCACGGTTT-TTGGCTAAAAA-CGCGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGAT
* ** * ** * *
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190 TTTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAATTCTCAGCCACATTAGATTT
* **
1544 GAGGATTTGTTTTTA-GAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAGATTTTAA-TTAGGAAAAA
255 GAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGG-AAAA
* * * *
1607 AGCATTGGAAAAACGATATTATAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATA
319 A--ATAGGGAACACGATATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATA
** *
1672 -TTTTTTATGAGTATCATGG-CTAAAAATTGAGGAAAAATAATT-CGGGTCAATTTTTGCAAAAT
382 TTTTTTTATGAGTATTTTGGTC-AAAAATTGAGGAAAAAT-ATTCCTGGTCAATTTTTGCAAAAT
* * *
1734 GT-TACCCGAAATCGTGTACGTTAACCATCACGGTTTTTGGTTAAAAAC-GCGTGTTTCGGGTCA
445 -TATAGCCGAAATCGTGTAC--TAACCATCACGGTTTTTGG-CAAAAACAACGTGTTTCGGG-CA
* * *
1797 CCGG-CTCAGTTTTTCATGATTTTTGGAG-CGAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACC
505 CCGGCCT-AGTTTTGCATGATTTTTGGCGCCGAAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCATCTAACC
* * *
1860 AATTCTCAGCCACATTAGATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGAATCTGAATCTTGTTTCGATTTAA
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* ** * * *
1925 TCATAAATTAATTTAGGAAAAAAGAGGGAACACCA
634 TCAGAAATTAATTTAGGAAAAAATTGGAAAAACGA
* * * * * * *
1960 TATTAGAAGCGTTAAAAGACTTTCAATATTTTTGGTGTTGAATTATATA--TTTTTATTAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTATC
* * * * * *
2023 TTGGTCAAAAAATTGAGGAAAAAT-ATTCCAGGTTAATTTTTGGAAAATTTTAGTCGAAATCGTG
66 GT-GTCCAAAAATTGAGGAAAAATAATT-CGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTG
** * * * * * * **
2087 TACTAACCATCATAGTTTTTGGATAGAAACGCGTTCCGGGGC-CATGGCTTAGTTTTTC-TTCTT
129 -A-TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGGGGCAC-CGGCTCAGTTTTGCATGATT
* * * * * * * * * *
2150 CTTTCGCGCCGAGACTCCTTGA-AATATCAATATT-ATCAAATCAAATCTCAGCCACATTGGATT
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* * * * * *
2213 TAAGGATATCTTTTTACGAGCTTCTGATTCTTGTTTCGATTTAATCAGAAACTAA-TTAGGTAAA
254 TGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGG-AAA
* * * *
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318 AA--ATAGGGAACACGATATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATAT
* * * * * * * * *
2341 GTTTTATTAAGAGAATTTCGGTCAAAAATTAAGGAAAATTATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAAT
381 ATTTTTTTATGAGTATTTTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTCCTGGTCAATTTTTGC-AAAAT
* *
2406 T-TAGCCGAAATCGTGTAGTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAAC-GCGTGTTTCGAGGCACCG
445 TATAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGC-AAAAACAACGTGTTTCG-GGCACCG
* * * * * * * * *
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508 GCCT-AGTTTTGCATGATTTTTGGCGCCGAAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCATCTAACCAAA
* * * * *
2532 TCTCAGCCACATTAGATTTGAGGTTTTGTTATTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAGTAA
572 TCTCAGCCACATTGGATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCA
* ** * * *
2597 TAAATTAATTTATTAAAAAATAGGGAACACGA
637 GAAATTAATTTAGGAAAAAATTGGAAAAACGA
* * *
2629 TATTAGAAGCGTTAAAAGCCCTTCAATATTTTTGGCGTTGAATTATATA--TTTTTATTAGTAT-
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTATC
* * * * * * * *
2691 GTTTCTAAAAAATTGTGGAAATAT-ATTCCTGTTCAATTTTTGCAAAACTATAGCCGAAATCGTG
66 GTGTC-CAAAAATTGAGGAAAAATAATT-CGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTG
* * * * * *
2755 -T-A-CGTCACTGTTTTTAGCAAAAAACGCGTTTCGGGGCACCGGCCCAGTTTTGCATGATTTTC
129 ATAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTT
* * * * * * * * *
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* * * ** * *
2882 ATTTGTTTTTCCGAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTCAATCAGATTTTAATTTAAG-AAAAATTG
259 ATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGGAAAAAATAG
** * * * * * *
2946 TAAAAACGATATTAGAAATGTTAATAGCCCATCAAACCTTTTGGCGTAGAATTATATATTTTTTT
324 GGAACACGATATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTT
** * * * *
3011 ATGAGTATCATGGCCAAAAATTGAGGAAAAATAAATCGT-GTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCG
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* *
3075 AAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAAC-GCGTGTTTCGGGTCACC-GACTCAGT
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* ** *
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* * ** *
3202 ATATTGGATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAGATTTTCA
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* * * *
3291 TATTAGAAACGTTAAAAGCCATTCAAAATTTGTGGCGTTGATTTATATATTTTTTTATGTGTATC
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTATC
*
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66 GTGTCCAAAAATTGAGGAAAAATAATTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGAT
** *
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* ** * * * *
3483 GTGCTGAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCACCTACCCAATTCTCAGCCACATAAGATTTGAGGA
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* * * *
3548 TTTGTTTTTACGAGCATCCGAATCTTATTTCGATTTAATCAAAAATTATTTTAGGAAAAAATAGG
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* * * * * *
3613 GAACACAATATTAGTAGCGTTAAAATCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGTATTATTTATTTTTTTA
325 GAACACGATATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTA
* * *
3678 TGAGTATTTTGGTCAAAATTTGAGGAAAAATATTCCTGGTCAATTTTTGCTAAATTATGGCCGAA
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* * * * **
3743 ATCTTGTACTAACCATCACGGTTTTTGACAAAAAAAAAACAACGCGTTCCGGGCATTGGCCTAGT
455 ATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGC-----AAAAACAACGTGTTTCGGGCACCGGCCTAGT
* * *
3808 TTTGCATGATTTTTTGCGCCGAA-AGTCGTTAAAATAACTATATCCATCTAACCAAATCTCAGCC
515 TTTGCATGATTTTTGGCGCCGAAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCC
* * * * * *
3872 ATATTGGATTTGAGAATTTGTTTTAACGAGCATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAG-ATTTTA
580 ACATTGGATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAA
3936 TTTAGGAAAAAAGCATTGGAAAAACGA
645 TTTAGG-AAAAA--ATTGGAAAAACGA
* * *
3963 TATTATAAACGTTAAAAGCCCTTCAAACTTTTTGGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGTGTATC
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTATC
* * * * *
4027 ATGGCTAAAAATTGAGGAAAAATAATTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTACCCGAAACCGTG-T
66 GTGTCCAAAAATTGAGGAAAAATAATTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGAT
* * * * *
4091 -A-CGTTACGGTTTTTAGTTAAAAACGCGTGTTTCGGGTCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTT
131 AACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGC--GTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTT
* *
4154 GGAGCTAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAATTCTCAGCCATATTAGATTTGAGG
194 GGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAATTCTCAGCCACATTAGATTTGAGG
* * * *
4219 ATTTGTTTTTACGAG-ATTCTAAATCTTGTTTTGATTTAATCATAAATTAATTTAGGAAAAAAGA
259 ATTTGTTTTTACGAGCA-TCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTAGGAAAAAATA
* * * *
4283 GGGAACACGTTATTAGAAGCGTTAAAAGACGTTCAATA-TTTTTGGCGTTGAATTATATA--TTT
323 GGGAACACGATATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAA-ACTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTT
* * * * * *
4345 TTATTAGTATTTTGATCAAAAAATTGAGGAAAAATATTCCAGGTCAATTTTTGGAAAATTTTAGT
387 TTATGAGTATTTTGGTC-AAAAATTGAGGAAAAATATTCCTGGTCAATTTTTGCAAAATTATAGC
** * * * * * *
4410 CGAAATCGTGTACTAACCATCATAGTTTTTGGC-TAGA-AATGCGTTCCGGG-ATCACGGCTTAG
451 CGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCAAAAACAACGTGTTTCGGGCA-C-CGGCCTAG
* * ** * * * * * * * * *
4472 TTTTTCTTCTTTTTTCGCGCC-AAGACTCCTTGAAATATCAATATTCATCAAATCAAATGTCATC
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** *** * *
4536 CACATTGGATTCAAGGATACATTTTTACGAGCTTCTGATTCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTA
579 CACATTGGATTTGAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTA
4601 A-TTAGGTAAAAAGCATTGGAAAAACGA
644 ATTTAGG-AAAAA--ATTGGAAAAACGA
** * * * * *
4628 TATTAGAAACGTTAAAA-CCCTTCAAGCTTTTTGGCATTGAATTATATGTTATCTTAAGAGTATT
1 TATTAGAAACGTTAAAAGCCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTTATGAGTA--
* * *
4692 TCG-GT-CAAAAATT-ATGGAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAACTTTTAGCCGAACTCGT
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* * *
4754 GTACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTGTTTCGGGGCACTGGTTCAGTTTTGAATGA
128 G-A-TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGC--GTTTCGGGGCACCGGCTCAGTTTTGCATGA
* *
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189 TTTTTGGAGCCAAGAGTCGTTATAATATCTATATTCATCTAACCAATTCTCAGCCACATTAGATT
** * * * * **
4884 TGAGGATTTGTTAGTACGAGCATCTGAATATTTTTTCGATTTAATAATAAATTAATTTACTAAAA
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* * *
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* ** * *
5012 --TTTTTATTAGTATTTTGGTCAAAAATTGTTGAAAAATATGCCTGGTCAATTTTTGCAAAACTA
382 TTTTTTTATGAGTATTTTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTCCTGGTCAATTTTTGCAAAATTA
* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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**
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* * * * * * * *
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* ** *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * * * *
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515 TTTGCAT-GATTTTTGGCGCCGAAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGC
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*
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * **
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**
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* *
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* *
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* * ** * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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GAGTATTTTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATATTCCTGGTCAATTTTTGCAAAATTATAGCCGAAA
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TGATTTTTGGCGCCGAAGAGTCGTTAAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTG
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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Done.