Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01016427.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig16460, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Period size: 2 Copynumber: 41.5 Consensus size: 2
1 TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC
1 TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC
43 TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC T
1 TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC TC T
84 GTGTGCGTGT
Statistics
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1.00 0.00 0.00
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2 81 1.00
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TC
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182 AGCACCACTG
192 TGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGTCTGTCTTCCTC
1 TGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGTCTGTCTTCCTC
*
226 TGTCTTCTCCTGTACCTTCGTGTCTGTCTTCCTC
1 TGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGTCTGTCTTCCTC
260 TGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGTCTGTCTTCCTC
1 TGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGTCTGTCTTCCTC
294 GCCTCCTGCG
Statistics
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34 66 1.00
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TGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGTCTGTCTTCCTC
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243 TCGTGTCTGT
* *
253 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGTCTGTCT-TCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
1 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTG-CTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
*
315 CTTCCTCTATCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
1 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
*
377 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTTGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
1 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
439 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
1 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
501 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
1 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
563 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTG
1 CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTG
596 TCGTGTCTTC
Statistics
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0.97 0.02 0.01
Matches are distributed among these distances:
61 2 0.01
62 272 0.99
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CTTCCTCTGTCTTCTCGTGTACCTTCGTGCCTGCTGGCCTCGCCTCCTGCGGAGGCCTCTTC
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2181 TTTTAGCCAT
* * * *
2191 AATACTCATAAAAAATATATAGTTCAATGCCAAAAATATTGAAAGCCTTTTCACGCTTCTAATAT
1 AATACTCATAAAAAATATATAATTCAAAGCCAAAAATATTGAAAGACTTTTAACGCTTCTAATAT
* *** * ** * * ** * *
2256 C-ATTTTCC-TAAAT-TTT-T-AATCAAAATCTAATTAAA-TAGAAACCAGTTTCTGATGCTCAG
66 CGTTTTTCCTTTTTTGTTTCTAAATTAATTTCTAATAAAACCA-AAATAAGATTCAGATGCTC-G
* * * * * ** * ** *
2315 -AAAAACAAATTCTTAAATCCAGTGT-GACTGAGATTTAATTAGATGGATATAGTTATTTC-CGA
129 TAAAAACAAATCCTTAAATACAATCTGGA-TAAGATTTGGTTAGATGAATATAGACATTTCAAG-
* * * * * *
2377 GAGTGTTGGAGCTAAAAATCCTGCAAAACTGAGTCGGGGCCTCGGAACGCATTTTTAGCGAAAAA
192 GAGTCTTGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAG-CTGGGCC-CGGAACGCATTTTTAGC--CAAA
* *
2442 AACAGTGATGAATAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTTGCAAAATCTGACTTGAAATATTTTTC
253 AACAGTGATGGATAGTACACGATTTTGGCTAAAA-TTTTGCAAAATCTGACTCGAAA-ATTTTTC
2507 CTAACTTTTTGACCAC
316 CTAACTTTTTGACCAC
* * * *
2523 AACACTCATAAAAAATATATAATTGAAAGCCAAAAATATTGAATGACTTTTAACGCTTCTAATTT
1 AATACTCATAAAAAATATATAATTCAAAGCCAAAAATATTGAAAGACTTTTAACGCTTCTAATAT
* * * *
2588 CGTTTTTCC-TTTTTGTTT-TAAATTAATTTCTGATTAAACCAAAATATGATTCAGATGCTCTTA
66 CGTTTTTCCTTTTTTGTTTCTAAATTAATTTCTAATAAAACCAAAATAAGATTCAGATGCTCGTA
* * * * * *
2651 AAAATAAATCCTTAAATCCATTCTGGTTGAGATTTGGTTAGATGAATATAGACATTTCAATGAGT
131 AAAACAAATCCTTAAATACAATCTGGATAAGATTTGGTTAGATGAATATAGACATTTCAAGGAGT
** * * *
2716 CTTGGC-CTTTAAAATCATGCAAAACTGAGCTGGTGCCCGTAACGCGTTTTTAGCCAAAAACTGT
196 CTTGGCGC-CAAAAATCATGCAAAACTGAGCTGG-GCCCGGAACGCATTTTTAGCCAAAAACAGT
* * ** * * *
2780 GATGGTTTGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAACTGACCCGAAGAATTTTTTCCTCGA-
259 GATGGATAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTGCAAAATCTGACTCGAA-AA-TTTTTCCT-AAC
*
2844 TTCTTGGA-CAC
321 TT-TTTGACCAC
* * * * * ** * *
2855 AATACTCGTAAAAAGTATATAATTCAATGCCAATAAGA--GAAAGGTTTTTCACGCTTCTGATAT
1 AATACTCATAAAAAATATATAATTCAAAGCCAAAAATATTGAAAGACTTTTAACGCTTCTAATAT
* * * * * *
2918 CGTTTTTCCTTTTTTTTTTCTGAATTAATTTTTAATAAAATCGAAATAAGATTCTGATGCTCGTA
66 CGTTTTTCCTTTTTTGTTTCTAAATTAATTTCTAATAAAACCAAAATAAGATTCAGATGCTCGTA
* * *
2983 AAAGCAAATCCTTAAATACAATGTGGATAAGATTTGGTTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGT
131 AAAACAAATCCTTAAATACAATCTGGATAAGATTTGGTTAGATGAATATAGACATTTCAAGGAGT
* *
3048 CTTGGCGCCAAAAATCATGCGAAACTGAGCTGAGGCCCTGGAACACATTTTTAGCCAAAAACAGT
196 CTTGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCTG-GGCCC-GGAACGCATTTTTAGCCAAAAACAGT
*
3113 GATGGATGGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTGCAAAAAT-TGACTCGAAAATTTTT--TAATCA
259 GATGGATAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTGC-AAAATCTGACTCGAAAATTTTTCCTAA-C-
*
3175 ATTTTTGGCCAC
321 -TTTTTGACCAC
* * * * * * * * ** *
3187 AATAGTCATAAAAGATGTATAATTCAACGTCAAAAATATTGAAGGGCTTATCGCGCTTTTAATAT
1 AATACTCATAAAAAATATATAATTCAAAGCCAAAAATATTGAAAGACTTTTAACGCTTCTAATAT
3252 CG-TTTTCCTATTTTT
66 CGTTTTTCCT-TTTTT
3267 TAAAGTAATT
Statistics
Matches: 600, Mismatches: 117, Indels: 52
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
328 1 0.00
329 1 0.00
330 28 0.05
331 35 0.06
332 293 0.49
333 82 0.14
334 53 0.09
335 105 0.17
336 2 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.16, G:0.15, T:0.34
Consensus pattern (331 bp):
AATACTCATAAAAAATATATAATTCAAAGCCAAAAATATTGAAAGACTTTTAACGCTTCTAATAT
CGTTTTTCCTTTTTTGTTTCTAAATTAATTTCTAATAAAACCAAAATAAGATTCAGATGCTCGTA
AAAACAAATCCTTAAATACAATCTGGATAAGATTTGGTTAGATGAATATAGACATTTCAAGGAGT
CTTGGCGCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCTGGGCCCGGAACGCATTTTTAGCCAAAAACAGTGA
TGGATAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTGCAAAATCTGACTCGAAAATTTTTCCTAACTTTTT
GACCAC
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3520 TAATTAATTA
3530 ATATTTAATTTA-ATACT
1 ATATTTAATTTATATACT
* *
3547 ATATTTTTATTTATATAGT
1 ATA-TTTAATTTATATACT
3566 ATATTT
1 ATATTT
3572 TTACTTAAAA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 3
0.81 0.08 0.12
Matches are distributed among these distances:
17 3 0.14
18 11 0.52
19 7 0.33
ACGTcount: A:0.36, C:0.02, G:0.02, T:0.60
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ATATTTAATTTATATACT
Found at i:3568 original size:19 final size:18
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3527 TTAATATTTA
3537 ATTTAATACTATATTTTT
1 ATTTAATACTATATTTTT
*
3555 ATTTATATAGTATATTTTT
1 ATTTA-ATACTATATTTTT
*
3574 ACTTAA
1 ATTTAA
3580 AAATTACTCA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
18 6 0.27
19 16 0.73
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ATTTAATACTATATTTTT
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3900 GTTGCATCCC
* * * * * *
3910 TAGATAATTCTATGAGTCTTGGCGC-ATAAAATCATGCAAAACTGAGTCGGGACCCCGGAACGCG
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTA-AAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACG
* * * * * * *
3974 TTTTTAGCCAAAACCCGTGAAAGTTAGTATACGATTTTGGCTAAAATTTCGCAAAAATTGGCCTG
65 TTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCG
* * * *
4039 TAAGCTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCAT-AAAT-ATATATAAGTCAACTCCAAAAAC
130 TAAG-ATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAG
* * * *
4102 AATGAAGGGGTGTTCACGCTTCAAATATTGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTA
194 ATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCG-TTTTCTTA-TTTTTT-TAAATTAATTTTTAATTA
*
4167 AATTGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCATTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGAT
256 AATTGAAACAA-ATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGAT
*
4232 CAGATGAATA
320 CATATGAATA
* * * * * *
4242 TAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCG-TAAAAAATCATACAAAACTGAGCCAGGGCACCGGAACACG
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCT-AAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACG
* * * * * * *
4306 TTTTTAGCCAAAAACTGTGGTGGATAATACACGATTTCGTCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCAG
65 TTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCG
* * * * *
4371 AAAGATTTTCTTCAAGTTTTAGGGCACAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAG
130 TAAGATTTTCCTCAA-TTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAG
* * * * *
4436 ATTGAAGGGCTTTTCACGTTTCTAATATCGTTTTCCTATTTTTTTTAATTAATTTCTAATTAAAT
194 ATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCTTATTTTTTTAAATTAATTTTTAATTAAAT
* * * * * * * * *
4501 TGAAATCAATTTCTGATGGTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAGTGTGGCTGAGATTTAATTAT
259 TGAAA-CAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCAT
4566 ATGAATA
323 ATGAATA
* * * * **
4573 TAGATATTTCAATGAGACTTGGTGCTGAAAATTATGCAAAACTGAGACAGGACCCCGGAAGGCGT
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACGT
* * * * * * *
4638 GTTTAGCCAAAAACCGTGATAG-TAGGACACTATTTCAGCTAAAATTTCGCAAAAACTGACCTGT
66 TTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGT
* *
4702 AAGTTTTTTTCATCAATTTTTGGTCAAAATACTCA-AAAA-AATATATAATTCAACGCCAAAAAG
131 AAG--ATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAG
* * * *
4765 GTTGAAGGGGTGTTCACGCTTATAAAATCGTTTTTCTTATTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTAA
194 ATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCG-TTTTCTTATTTTTT-TAAATTAATTTTTAATTAA
** * * * * *
4830 ATCAAAACAAGATTCGGATGATCGTAAAAACAAATCGTAAAATTTAATATTGCTAAGATTTGATC
257 ATTGAAACAA-ATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATC
* *
4895 AGATAAATA
321 ATATGAATA
* *
4904 TAGATATTTCAA-G-GACTCTCGGCG-TAAAAATCATGCAATACTGAGCCAGGGCCCCGGAACAC
1 TAGATATTTCAATGAGACT-T-GGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACAC
* * * * * * *
4966 GTTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGATAATACACGATTTCGTCTAAAATATTGCAAAATTTGA-CC
64 GTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCC
* * * * * * *
5030 GAAAATATTTTCCTCAAGTTTTGGGCACAATGCTCATAAAGTAATATATAATTCAA-GCCAAAAA
129 G-TAAGATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAA
* * * * * *
5094 GATTGAAGGGCTCTTCGCGCTTCTAATATCGTTGTCCTATTTTTTT-AATTAATTTATAATTAAA
193 GATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCTTATTTTTTTAAATTAATTTTTAATTAAA
** * * * * * * *
5158 TTGAAATCAGTTTCTGATGGTCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAGTGTGGCTGAGA-TTAATTA
258 TTGAAA-CAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCA
5222 TATGAATA
322 TATGAATA
* * * * * *
5230 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGTTAAAAATTATGCAAAACTGAGACGGGA-CCCAGAACGCGT
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACGT
*
5294 TTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGTAAAAATTGACCCGT
66 TTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGT
* * *
5359 AAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCAT-AAA-AGTATATAATTCAACGCCAAAAAGG
131 AAG-ATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAGA
* *
5422 TTGAA------TTCACGCTTCTAATATCATTTTTCTTATTTTTTCTAAATCAATTTTTAATTAAA
195 TTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATC-GTTTTCTTATTTTTT-TAAATTAATTTTTAATTAAA
* * *
5481 TCGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCG
258 TTGAAACAA-ATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCA
5546 TATGAATA
322 TATGAATA
* * * * *
5554 TAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCG-TAAAAAATCATGCAAAACTGAGTCAGGACCTCGGAACACG
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCT-AAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACG
* * * * * * *
5618 TTTTTAGGCAAAAACCGTGATGGATAGTACACGAATTCGTCTAAAATTTTGTAAAAATTGA-CCA
65 TTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCG
* * *
5682 TAAAGATTTTCTTCAAGTTTTGGGT-ACAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAA
130 T-AAGATTTTCCTCAA-TTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAA
* * ** * * * * *
5746 GATTG-ACGGCTTTTCGTGCTACTAATATTGTTTTCCTATTTTTTAAAATTAATTTCTAATTAAA
193 GATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCTTATTTTTTTAAATTAATTTTTAATTAAA
** * * * * * * * * *
5810 TTGAAACCAGTTTTC-GATGGTCGTAAAAACAAGTCCTAAAATTTAGTGTGGCTGAGATGT-AAC
258 TTGAAA-CA-AATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATC
5873 TATATGAATA
321 -ATATGAATA
* * * * * * *
5883 TAGTTAATTCAATGAGATTTGGCGCTAAAAATTATGCAAAACTTAGAC-GAGACCCCGGAACGCG
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAG-GACCCCGGAACACG
* *
5947 TTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATGTCGGCTAAAATTTTTCAAAAATTGACCCG
65 TTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCG
* ** *
6012 TAAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACAAAT-AAA-AATATATAATTCAATGCCAAAAAG
130 TAAG-ATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAG
* *
6075 GTTGAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTA
194 ATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCG-TTTTCTTA-TTTTTT-TAAATTAATTTTTAATTA
* *
6140 AATCGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGAT
256 AATTGAAACAA-ATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGAT
*
6205 CAGATGAATA
320 CATATGAATA
* * ** * * *
6215 TAGATATTTCAAGGAGTCTCAGCG-TAAAAAATCATTTC-AAACTGAGCCATGTCCCCGGAACAC
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCT-AAAAATCA-TGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACAC
* * *
6278 G-TTTTAACAAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTCGCAAAAATTGACCC
64 GTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCC
* * * *
6342 GTAAGTTTTTTCCTCAATTTTTGTTCAAAATACTCAT-TAA-AATATATAATTCAATGCCAAAAA
129 GTAAG-ATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAA
* * *
6405 GTTTGAAGGGATTTTCACGCTT-TCAATATCGTTTTTCTTATTTTTTCTAAATTAATTTCTAATT
193 GATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCT-AATATCG-TTTTCTTATTTTTT-TAAATTAATTTTTAATT
* * *
6469 AAATCGAAACAAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATTCTTAAA-TCAAATGTTGCTGAGATTTG
255 AAATTGAAAC-AAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTC-AATGTTGCTAAGATTTG
* *
6533 ATCAGACGAATA
318 ATCATATGAATA
* * * * * * * *
6545 TAGATGTTTC-ATG-GAGTGTCGGTGTTAAAAATGATGAAAAACTGAGCTAGGGCCCCGGAACAC
1 TAGATATTTCAATGAGACT-T-GGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACAC
* * * * **
6608 GTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGATAGTACTA-GATTTCGTCTAAAATTTTGCAAAAAGTGATT
64 GTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTAC-ACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACC
* * * * *
6672 GGAAAGATTTTCC-CAAAGTTTT-GTGCACAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACTCCAAA
128 CGTAAGATTTTCCTC-AATTTTTGGT-CAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAA
* * * *
6735 AACATTGAAGGGTTTTTCGCGCTTCTAATATCG---T-TT-TTTTTTTAAATTAATTTCTAATTA
191 AAGATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCTTATTTTTTTAAATTAATTTTTAATTA
* ** * * * * * *
6795 AATTGAAACCAATTTTTGATGGTTGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAGTGTGGCTAAGATTTAAT
256 AATTGAAA-CAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGAT
* **
6860 TATACAAATA
320 CATATGAATA
* * * * *
6870 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATTATGCAAAACTGAGACGGGACCCCAGAACGCGT
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACGT
* **
6935 TTTTAGCCAAAAACCGTTATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTCACAAAAATTGACCCGT
66 TTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGT
* * *
7000 AAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTTAAAATACTCAT-AAA-AATATATAATTCAACGCCAAAAAGG
131 AAG-ATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAGA
* *
7063 TTGAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTTCTAAATTAAGTTTTAATTA
195 TTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCG-TTTTCTTA--TTTTTT-TAAATTAATTTTTAATTA
* * *
7128 AATCGAAACAATATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTCGCTAAGATTTGAT
256 AATTGAAACAA-ATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGAT
7193 CATATGAATA
320 CATATGAATA
* * * * * *
7203 TAGATATTTCAAGGAGTCTCGAC-ATAAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCAGAACACG
1 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCT-AAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACG
* * * * * *
7267 TTTTTAGCAAAAAACTGTGATTGATAGTACACGATTTCGTCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCAG
65 TTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCG
* * * *
7332 -AAGGATTTTTCTCAAGTTTTTGG-CACAATACTCAAAAAATAATATATAATTCAACACCAAAAA
130 TAA-GATTTTCCTCAA-TTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAA
* * * * * * *
7395 TATTGAAGGGATTTTCGCGCTTCTAATATCGGTTTCCTA-TTTTTTAAAATATTTTTTAATTAAA
193 GATTGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCTTATTTTTTTAAATTAATTTTTAATTAAA
* * * ** *
7459 TCGAAACAAGATTCTGATGATCATAAAAACAAATCGATAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATAA
258 TTGAAACAA-ATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCA
*
7524 GATGAATA
322 TATGAATA
* * * *
7532 TAGATATTTCAAGGAGTA-TCGGCG-TAAAAAATCATGCAAAATTGAGCCAGGGCCCCGGAACAC
1 TAGATATTTCAATGAG-ACTTGGCGCT-AAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACAC
* * * *
7595 GTTTTTGGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTATACGATTTCGGCTAAAATTTCGCAAAAACTGACCC
64 GTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCC
*
7660 GTAAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCA
129 GTAAG-ATTTTCCTCAATTTTTGGTCA
Statistics
Matches: 2852, Mismatches: 491, Indels: 206
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
320 16 0.01
321 12 0.00
322 3 0.00
323 62 0.02
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ACGTcount: A:0.36, C:0.15, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (329 bp):
TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCGGAACACGT
TTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGT
AAGATTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCAAAAAGAT
TGAAGGGGTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCTTATTTTTTTAAATTAATTTTTAATTAAATTG
AAACAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCATATG
AATA
Found at i:7457 original size:987 final size:984
Alignment explanation
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Period size: 987 Copynumber: 3.8 Consensus size: 984
3900 GTTGCATCCC
* * *
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1 TAGATAATTCAATGAGACTTGGCGCTA-AAAATCATGCAAAACTGAGACGGGACCCCGGAACGCG
* * * * * *
3974 TTTTTAGCCAAAACCCGTGAAAGTTAGTATACGATTTTGGCTAAAATTTCGCAAAAATTGGCCTG
65 TTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTCGCAAAAATTGACCCG
* * * * * *
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130 TAAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGAT
* *
4104 TGAAGGGGTGTTCACGCTTCAAATATTGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTAAA
195 TGAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTAAA
* *
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260 TCGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCA
* * * * *
4234 GATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGTAAAAAATCATACAAAACTGAGCCAGGGCACCG
325 GATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGACGTAAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCA
* * * * * *
4299 GAACACGTTTTTAGCCAAAAACTGTGGTGGATAATACACGATTTCGTCTAAAATTTTGCAAAAAT
390 GAACACGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAAT
* * * *
4364 TGACCAGAAAGA-TTTTCTTCAAGTTTTAGGGCACAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACG
455 TGACCAGTAAGATTTTTCCTCAA-TTTT-TGGCAAAATACTCA-AAAA-AATATATAATTCAACG
* * * *
4428 CCAAAAAGATTGAAGGGCTTTTCACGTTTCTAATATCGTTTTCCTATTTTTTTTAATTAATTTCT
516 CCAAAAAGATTGAAGGGATTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCCTATTTTTTTAAAATAATTTCT
* * * * * * * * *
4493 AATTAAATTGAAATC-AATTTCTGATGGTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAGTGTGGCTGAGA
581 AATTAAATCGAAA-CAAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGA
* * * * * * *
4557 TTTAATTATATGAATATAGATATTTCAATGAGACTT-GGTGCT-GAAAATTATGCAAAACTGAGA
645 TTTGATCAGATGAATATAGATATTTCAA-G-GAGTTCGGCG-TAAAAAATCATGCAAAACTGAG-
** * * *
4620 C-AGGACCCCGGAAGGCGTGTTTAGCCAAAAACCGTGATAG-TAGGACACTATTTCAG-CTAAAA
706 CTAGGACCCCGGAACACGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTC-GTCTAAAA
* * * * *
4682 TTTCGCAAAAACTGACCTGTAAGTTTTTTTCATCAATTTTTGGTCAAAATACTCA-AAAA-AATA
770 TTTCGCAAAAACTGA-CTGAAAGATTTTCTCA--AAGTTTTGG-CACAATACTCATAAAATAATA
* * * * * *
4745 TATAATTCAACGCCAAAAAGGTTGAAGGGGTGTTCACGCTTATAAAATCGTTTTTCTTATTTTTT
831 TATAATTCAACGCCAAAAAGATTGAAGGGCTTTTCGCGCTTCTAATATCG-TTTTC---TTTTTT
* * * ** * *
4810 CTAAATTAATTTTTAATTAAA-TCAAAACAAGATTCGGATGATCGTAAAAACAAATCGTAAAATT
892 -TAAATTAATTTCTAATTAAATTGAAACCAATTTTC-GATGGTCGTAAAAACAAATCCTAAAATT
* * * * * *
4874 TAATATTGCTAAGATTTGATCAGATAAATA
955 TAGTGTGGCTAAGATTTAATTATATAAATA
* * * *
4904 TAGATATTTCAA-G-GACTCTCGGCG-TAAAAATCATGCAATACTGAGCCAGGG-CCCCGGAACA
1 TAGATAATTCAATGAGACT-T-GGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGAC-GGGACCCCGGAACG
* * * * * *
4965 CGTTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGATAATACACGATTTCGTCTAAAATATT-GCAAAATTTGA-
63 CGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAAT-TTCGCAAAAATTGAC
* * * * * * *
5028 CCGAAAATATTTTCCTCAAGTTTTGGGCACAATGCTCATAAAGTAATATATAATTCAA-GCCAAA
127 CCGTAAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAA--AATATATAATTCAACGCCAAA
* * * * * *
5092 AAGATTGAAGGGCTCTTCGCGCTTCTAATATCG-TTGTCCTA-TTTTTT-T-AATTAATTTATAA
190 AAGATTGAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAA
* * * * * * * *
5153 TTAAATTGAAATC-AGTTTCTGATGGTCGTAAAAACAAATCCTTAAATTCAGTGTGGCTGAGA-T
255 TTAAATCGAAA-CAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATT
* * * * * * * * * * *
5216 TAATTATATGAATATAGATATTTCAATGAGACTTGGCGTTAAAAATTATGCAAAACTGAGACGGG
319 TGATCAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGACGTAAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGG
* * * *
5281 A-CCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGT
384 ACCCCAGAACACGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGC
* * * *
5345 AAAAATTGACCCGTAAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAAGTATATAATTCA
449 AAAAATTGACCAGTAAGATTTTTCCTCAATTTTTGG-CAAAATACTCAAAAAAATATATAATTCA
* * *
5410 ACGCCAAAAAGGTTG-A---A--TTCACGCTTCTAATATCATTTTTCTTATTTTTTCT-AAATCA
513 ACGCCAAAAAGATTGAAGGGATTTTCACGCTTCTAATATC-GTTTTCCTATTTTTT-TAAAAT-A
* *
5468 ATTTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGC
575 ATTTCTAATTAAATCGAAACAAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGC
5533 TAAGATTTGATC-GTATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGTAAAAAATCATGCAAAACT
640 TAAGATTTGATCAG-ATGAATATAGATATTTCAAGGAGT-TCGGCGTAAAAAATCATGCAAAACT
* * * *
5597 GAG-TCAGGACCTCGGAACACGTTTTTAGGCAAAAACCGTGATGGATAGTACACGAATTCGTCTA
703 GAGCT-AGGACCCCGGAACACGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGTCTA
* * * *
5661 AAATTTTGTAAAAATTGACCAT-AAAGATTTTCTTC-AAGTTTTGGGTACAATACTCATAAAATA
767 AAATTTCGCAAAAACTGA-C-TGAAAGATTTTC-TCAAAGTTTT-GGCACAATACTCATAAAATA
* * * *
5724 ATATATAATTCAACGCCAAAAAGATTG-ACGGCTTTTCGTGCTACTAATATTGTTTTCCTATTTT
828 ATATATAATTCAACGCCAAAAAGATTGAAGGGCTTTTCGCGCTTCTAATATCGTTTT-CT-TTTT
* *
5788 TTAAAATTAATTTCTAATTAAATTGAAACCAGTTTTCGATGGTCGTAAAAACAAGTCCTAAAATT
891 TT-AAATTAATTTCTAATTAAATTGAAACCAATTTTCGATGGTCGTAAAAACAAATCCTAAAATT
* * * *
5853 TAGTGTGGCTGAGATGTAACTATATGAATA
955 TAGTGTGGCTAAGATTTAATTATATAAATA
* * * * *
5883 TAGTTAATTCAATGAGATTTGGCGCTAAAAATTATGCAAAACTTAGACGAGACCCCGGAACGCGT
1 TAGATAATTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGACGGGACCCCGGAACGCGT
* **
5948 TTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATGTCGGCTAAAATTTTTCAAAAATTGACCCGT
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** * *
6013 AAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACAAATAAAAATATATAATTCAATGCCAAAAAGGTT
131 AAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATT
6078 GAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTAAAT
196 GAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTAAAT
6143 CGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCAG
261 CGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCAG
* * *
6208 ATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTC-AGCGTAAAAAATCATTTC-AAACTGAGCCATGTCCCC
326 ATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGA-CGTAAAAAATCA-TGCAAAACTGAGCCAGGACCCC
* * * *
6271 GGAACACG-TTTTAACAAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTCGCAAAAA
389 AGAACACGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAA
* * * ** *
6335 TTGACCCGTAAGTTTTTTCCTCAATTTTTGTTCAAAATACTCATTAAAATATATAATTCAATGCC
454 TTGACCAGTAAGATTTTTCCTCAATTTTTG-GCAAAATACTCAAAAAAATATATAATTCAACGCC
* * *
6400 AAAAAGTTTGAAGGGATTTTCACGCTT-TCAATATCGTTTTTCTTATTTTTTCTAAATTAATTTC
518 AAAAAGATTGAAGGGATTTTCACGCTTCT-AATATCG-TTTTCCTATTTTTT-TAAAATAATTTC
*
6464 TAATTAAATCGAAACAAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATTC-TTAAA-TCAAATGTTGCTGA
580 TAATTAAATCGAAACAAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAA-TCGTTAAATTC-AATGTTGCTAA
* * * * * * *
6527 GATTTGATCAGACGAATATAGATGTTTCATGGAGTGTCGGTGTTAAAAATGATGAAAAACTGAGC
643 GATTTGATCAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGT-TCGGCGTAAAAAATCATGCAAAACTGAGC
* *
6592 TAGGGCCCCGGAACACGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGATAGTACTA-GATTTCGTCTAAAAT
707 TAGGACCCCGGAACACGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGATAGTAC-ACGATTTCGTCTAAAAT
* * * *
6656 TTTGCAAAAAGTGATTGGAAAGATTTTCCCAAAGTTTTGTGCACAATACTCATAAAATAATATAT
771 TTCGCAAAAACTGACT-GAAAGATTTTCTCAAAGTTTTG-GCACAATACTCATAAAATAATATAT
* * *
6721 AATTCAACTCCAAAAACATTGAAGGGTTTTTCGCGCTTCTAATATCG-TTT-TTTTTTTAAATTA
834 AATTCAACGCCAAAAAGATTGAAGGGCTTTTCGCGCTTCTAATATCGTTTTCTTTTTTTAAATTA
* * * **
6784 ATTTCTAATTAAATTGAAACCAATTTTTGATGGTTGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAGTGTGGC
899 ATTTCTAATTAAATTGAAACCAATTTTCGATGGTCGTAAAAACAAATCCTAAAATTTAGTGTGGC
*
6849 TAAGATTTAATTATACAAATA
964 TAAGATTTAATTATATAAATA
* * *
6870 TAGATATTTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATTATGCAAAACTGAGACGGGACCCCAGAACGCGT
1 TAGATAATTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGACGGGACCCCGGAACGCGT
* *
6935 TTTTAGCCAAAAACCGTTATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTCACAAAAATTGACCCGT
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* *
7000 AAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTTAAAATACTCATAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGGTT
131 AAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATT
*
7065 GAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTTCTAAATTAAGTTTTAATTAAA
196 GAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTA-TTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTAAA
* *
7130 TCGAAACAATATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTCGCTAAGATTTGATCA
260 TCGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCA
* *
7195 TATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGACATAAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCA
325 GATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGACGTAAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCA
* * *
7260 GAACACGTTTTTAGCAAAAAACTGTGATTGATAGTACACGATTTCGTCTAAAATTTTGCAAAAAT
390 GAACACGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAAT
* *
7325 TGACCAG-AAGGATTTTT-CTCAAGTTTTTGGCACAATACTCAAAAAATAATATATAATTCAACA
455 TGACCAGTAA-GATTTTTCCTCAA-TTTTTGGCAAAATACTC-AAAAA-AATATATAATTCAACG
* * * * *
7388 CCAAAAATATTGAAGGGATTTTCGCGCTTCTAATATCGGTTTCCTA-TTTTTTAAAATATTTTTT
516 CCAAAAAGATTGAAGGGATTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCCTATTTTTTTAAAATAATTTCT
* * * *
7452 AATTAAATCGAAACAAGATTCTGATGATCATAAAAACAAATCGATAAATTCAATGTTGCTAAGAT
581 AATTAAATCGAAACAAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGAT
* * *
7517 TTGATAAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTATCGGCGTAAAAAATCATGCAAAATTGAGCCAG
646 TTGATCAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGT-TCGGCGTAAAAAATCATGCAAAACTGAGCTAG
* * * * *
7582 GGCCCCGGAACACGTTTTTGGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTATACGATTTCGGCTAAAATTTCG
710 GACCCCGGAACACGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGTCTAAAATTTCG
7647 CAAAAACTGAC
775 CAAAAACTGAC
7658 CCGTAAGTTT
Statistics
Matches: 2352, Mismatches: 323, Indels: 165
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
978 2 0.00
979 119 0.05
980 165 0.07
981 203 0.09
982 71 0.03
983 5 0.00
984 65 0.03
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994 32 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.15, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (984 bp):
TAGATAATTCAATGAGACTTGGCGCTAAAAATCATGCAAAACTGAGACGGGACCCCGGAACGCGT
TTTTAGCCAAAAACCGTGATAGTTAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTCGCAAAAATTGACCCGT
AAGTTTTTTCCTCAATTTTTGGTCAAAATACTCATAAAAATATATAATTCAACGCCAAAAAGATT
GAAGGGGTGTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCTTATTTTTTTCTAAATTAATTTTTAATTAAAT
CGAAACAAGATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGATCAG
ATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGACGTAAAAAATCATGCAAAACTGAGCCAGGACCCCAG
AACACGTTTTTAGCAAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTGCAAAAATT
GACCAGTAAGATTTTTCCTCAATTTTTGGCAAAATACTCAAAAAAATATATAATTCAACGCCAAA
AAGATTGAAGGGATTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTCCTATTTTTTTAAAATAATTTCTAATTA
AATCGAAACAAAATTCAGATGATCGTAAAAACAAATCGTTAAATTCAATGTTGCTAAGATTTGAT
CAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTTCGGCGTAAAAAATCATGCAAAACTGAGCTAGGACCCC
GGAACACGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATAGATAGTACACGATTTCGTCTAAAATTTCGCAAAAA
CTGACTGAAAGATTTTCTCAAAGTTTTGGCACAATACTCATAAAATAATATATAATTCAACGCCA
AAAAGATTGAAGGGCTTTTCGCGCTTCTAATATCGTTTTCTTTTTTTAAATTAATTTCTAATTAA
ATTGAAACCAATTTTCGATGGTCGTAAAAACAAATCCTAAAATTTAGTGTGGCTAAGATTTAATT
ATATAAATA
Done.