Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01017759.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig17792, whole genome shotgun sequence
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* * *
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* * * *
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* * *
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* *
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* * *
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* *
2354 AT AT AT AT AC AT AT AT AT AT AT AT AC AT AT AT AT AT
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* *
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* * *
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* * ** * * * * *
2639 ATTTTTGGCTATAAATGTGTTCCGCGGCCCCGGTTCAGTTTTAG-ATGATTTTTA-GAGTCAAGA
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* * * *
2702 CTCCTTGAAAAATCTATAT-TTATCAAACCAAATCTCAGCCACAATTGATTTATAGACTTGTGTT
323 CTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATTGATTTATAGACTTGTTTT
* * * * *
2766 TACAAGGATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAGTACAAAAAAATAATGAAAAATGA
388 TACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATACAAAAAAAT-AGGAAAAACGA
* ** * *
2831 TATTAAAAGCACGTAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTATATAATTTTTACAACTATCG
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* *
2896 TGTCCAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCAGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTG
517 TGTCAAAAAATTAAGGAAAAATTTTTC-GGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTA
* *
2961 CTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGAGCCCAGATACAGTTTTGCATAATTTTTG
581 CTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGCCCAGGTACAGTTTTGCATAATTTTTG
* * *
3026 GCGCCAAGACTCGTTGAAATATATATATTCATATAATCAAATCTCAGTCACAATGGATTTAAGGA
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* * * * *
3091 TTTCTTTTTACGAGTATCAGAATCTTGTTTCGTTTTTTATTAGAAATTAATTCAAAAATATAGGA
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* * *
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*
3221 GACTATTGTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTC-AGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAA
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* * * *
3285 ATCGTGCACTAACCATCATAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGAACCAGGCACAGTTTTGCAT
903 ATCGTGTACT-ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCAGACACAGTTTTGCAT
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* * * **
3376 ATATATAT-TT-ATCA-AACCAAATCTCAGCCACAATTGATTTAAAGACGTGTTTTTACGAACAT
1 ATATATATATTCAT-ATAACCAAATCTCAGTCACAATGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACAT
* ** * * * *
3438 CGGAATCTTGTTTCGAATTCTATTAGAAATTAATT-AAAAAATAGTAAAAACGATATTAGAAGCG
65 CAGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATTAAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCG
* * * *
3502 TGAAAAGCCTTTTGATCTTTTTGGCATTGAATTATATAATTTTTACGACTATTGTGTGAAAAAAT
130 TGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATACTTTTTACGACTATTATGTCAAAAAAT
*
3567 TGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGC-CAAATTCGTGTACTAACCATCAC
195 TGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTCAAA-TCGTGTACTAACCATCAC
** * * * *
3631 AGTTTTTAACTAAATATACGTTCCGGGCCCTGATACAGTTTTGCATAATTTAT-GGCTCCAAGAC
259 AGTTTTTGGCTAAAAATACGTTCCGGGCCCCGATACAGTTTTGCATAATTTTTAGGCGCCAAGAC
** * * *
3695 TCGATGAAATATATATATATTCATCTAACCAAATATCAGTCAC-ATTGGATTTA-AGGATTTGTT
324 TCCTTGAAATATATATATATT-ATCAAACCAAATATCAGCCACAATT-GATTTATA-GACTTGTT
* * * * * * * * **
3758 TTTATGTGCATCAGAAACTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATTCAAATAAATAGGAAAAATA
386 TTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATACAAAAAAATAGGAAAAACG
* * * * *
3823 ATATTAGAAGCGTGAGAACTGAAAAGGCTTTTAATTTTTTTGGCATTGAATTATATACTTTTTAC
451 ATATTAGAAGC----G---TGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTATATAATTTTTAC
* * * * **
3888 GACTATTATGT-AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTCCAAAATTTTAGCTTAAA
509 AACTATTGTGTCAAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAA
* * *** * * * **
3952 TCGTGTACTATCCATCACAGTTTTTGGCTAAAAATGTGTTCTGGGGCCCCGGTTCAGTTTTAAAT
574 TCATGTACTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTC-CGGGCCCAGGTACAGTTTTGCAT
* * * * * *
4017 GATTTTCGGGGCCAAGACTCCTTGAAATATCTATATTTATCA-AACCAAATCTCAGCCACAATTG
638 AATTTTTGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATTCAT-ATAACCAAATCTCAGCCACAATGG
* * * * *
4081 ATTTATA-GACTTGTTCTTACGAGGATCATAATCATGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATACAA
702 ATTTA-AGGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATTCAA
** *
4145 AAAATAGGAAAAATGATATTAAAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTT-TGGA-ATCGAATTATA
766 AAAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAAT-TTTTAT-GACATCGAATTATA
* *
4208 TAATTTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCCGGCTCAGTTTTTGCAAAAT
829 TAATTTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTT-CGACTCAGTTTTTGCAAAAT
* *
4273 TTTAGCCGAAATCGTGTGCT-CCATCACAGTTGTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCAGACAC
893 TTTAACCGAAATCGTGTACTACCATCACAGTT-TTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCAGACAC
*
4337 AGTTTTGCATAATTTTTGGC-CCAAGACTCGTTGAA
957 AGTTTTGCATAATTTTTGGCGACAAGACTCGTTGAA
* **
4372 ATATATATATTCATATAACCAAATTTCAGTCACAATGGATTTAAGGATTCCT-TTTTTACGAGTA
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAATGGATTTAAGGATT--TGTTTTTACGAACA
* *
4436 TCGGAATCTTGTTTCGTTTTTTATTAGAAATTAATTCAAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAAG
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* * *
4501 CGTGAAAA-CCTTTTAAT-TTTTATGACATTGAATTATATACTTTTTATGACTATTGTGTCAAAA
128 CGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTT-TGGCATTGAATTATATACTTTTTACGACTATTATGTCAAAA
* *
4564 AATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGC-AAATTTTAAC-CGAAATTGTGTACTAACCAT
192 AATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTC-AAATCGTGTACTAACCAT
* * * * * *
4627 CACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCTGGG-CCCAAGCACAGATTTGCATAATTTTT-GGCGACA
256 CACAGTTTTTGGCTAAAAATACGTTCCGGGCCCCGA-TACAGTTTTGCATAATTTTTAGGCGCCA
** * * *
4690 AGACTAGTTGAAATATATATATATATATATATATATATATATTCATCAAAGCAAATCTCAGCCAA
320 AGACTCCTTG----------------A-A-ATATATATATATT-ATCAAACCAAATATCAGCCAC
* * * * *
4755 AATTGATTTAAAGAC--ATTTTTACGAGCAACAGAATCTTGTTTCGATTTTTATTAAAAATTAAT
366 AATTGATTTATAGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAAT
* *
4818 A-AAAAAAATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATT
431 ACAAAAAAATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATT
* * * * * * * * *
4882 ATATACTTTGTCCGACTGTTGTGTGAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTCTCAATTTTTGCAAA
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* * * * * ****
4947 ATTTTAGCCGAAATCGTGTAC-GA-TATCACGGTTTATGGAC-AAAATGGTGTTCCGGGGCACC-
561 ATTTTAGCCGAAATCATGTACTAACCATCACAGTTTTTGG-CTAAAAACACGTTCC-GGGC-CCA
* * * * * *
5008 GGTTCAGTTTTGCATGATTTTAGACGCCAAGACTCCTTGAAATATCTATATTTATCA-AACCAAA
623 GGTACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATTCAT-ATAACCAAA
* * * * *
5072 TCTCAGCTA-AATTGATTTAAAGACGTGTTTTTACGAGCATCGGAATCTTGTTTCGATTTCTATT
687 TCTCAGCCACAATGGATTTAAGGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATT
* * * *
5136 AGAAATTAATT-AAAAAATGGGAAAAGCGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAACATTTT-TG
752 AGAAATTAATTCAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAA-TTTTTATG
* * * *
5199 GCATCGAATTATATAATTTTGACGACTATTGTGTGAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAG
816 ACATCGAATTATATAATTTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAG
* ** *
5264 TTTTTGCAAAATTTTAGCC-AAATTCGTGTACTAACCATCACAGTTTTTAACTAAAAATACGTTC
881 TTTTTGCAAAATTTTAACCGAAA-TCGTGTACT-ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTC
* * * ** *
5328 CGGGCCCTGATACAGTTTTGCATAATTTTTGGCTCCAAGACTCGATGAA
944 CGGGACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGACAAGACTCGTTGAA
* * * **
5377 ATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGTCACATTGGATTTAAGGATTTGTTTTTATGAGTATC
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAATGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACATC
*
5442 AGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATTCAAAAAAATAGGAAAAATAATATTAGAAGCG
66 AGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATT-AAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAAGC-
* * *
5507 TGAGAACTGAAAAGGCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATACTTTTTATGACTATTATTTC
129 ---G---TGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATACTTTTTACGACTATTATGTC
* * ** **
5572 AAAAAATTGAGGAAAATTTTTTTGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTTTAATCGTGTACTATT
188 AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTCAAATCGTGTACTAAC
** * * * ** * * *
5637 CATCACAGTTTTTGGCTAAAAATGTGTTCTGGGGCCCCGGTTCAGTTTTAAATGA-TTTTCGGGG
253 CATCACAGTTTTTGGCTAAAAATACGTTC-CGGGCCCCGATACAGTTTTGCATAATTTTTAGGCG
* * *
5701 CCAAGACTCCTTGAAATATCTATAT-TTATCAAATCAAATCTCAGCCACAATTGATTTATAGACT
317 CCAAGACTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATTGATTTATAGACT
*
5765 TGTTTTTACGAGGATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATACAAAGAAAA-AGGAA
382 TGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATACAAA-AAAATAGGAA
*
5829 AAACGATATTAAAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTATATAATTTTTACAA
446 AAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTATATAATTTTTACAA
* * *
5894 CTATTTTGTCAAAAAATTAAGGATAAGTTTTTCCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAT
511 CTATTGTGTCAAAAAATTAAGGAAAAATTTTT-CGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAT
* * * *
5959 CATGTGCTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACATTCCGGGCCTAGGCACAGTTTTGCATAA
575 CATGTACTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGCCCAGGTACAGTTTTGCATAA
* * ** *
6024 TTTTTGGCGCCAAGACTCGTTGAAATTTATATATTCATATAACCAAATCTTGGTCACAATGGATT
640 TTTTTGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGCCACAATGGATT
* * *
6089 TAAGGATTTCTTTTTTATGAGCATCAGAATCTTGTTTCG-TTTCTTATTAGAAATTAATTCAAAA
705 TAAGGACTT-GTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTC-TATTAGAAATTAATTC-AAA
* * *
6153 AAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAAAGCC----AATTTTTATGACATTGAGTTATATAC
767 AAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATTTTTATGACATCGAATTATATAA
*
6214 TTTTTACGAA-TATTGTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAATTTTTGCAAAATTTT
832 TTTTTAC-AACTATTGTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTT
*
6278 AACCGAAATCGTGTACTGACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGCCCAGACACAGT
896 AACCGAAATCGTGTACT-ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCAGACACAGT
** * *
6343 TTCACATAATTTTTGGCGAGAAGACTAGTTGAAATATATATA
960 TTTGCATAATTTTTGGCGACAAGACTCGTTG--------A-A
* * * * **
6385 TATATATATATATAATCATCAAACCAAATCTCAGCCACAATTGATTTAAAGA--CATTTTTACGA
1 -ATATATATAT-TCAT-AT--AACCAAATCTCAGTCACAATGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGA
* * * * * * * * * * **
6448 GCATCAGAATCATGTTTCG-ATTTAATTAAAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAATATCGTTATT
61 ACATCAGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATT---AAAAAAATAGGAAAAACAATATT
* * * * * * * * *
6512 AGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTTGGCGTTGAATTATACATATTTTTTA--AGTGTTTTG
123 AGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTAT--ATACTTTTTACGACTATTATG
* * * * ** * * * ** * *
6575 GCCAAAGATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTAAAATTTTTTTAAGATTTTAGC-CGAAATCGTTTAC
186 TCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCT-CAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTC-AAATCGTGTAC
* * ** * * * *
6639 TAACGTTATATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGATCCGGGGCCACAAGTA-AGTTTT-CAATGA
249 TAAC----CATCACAGTTTTTGGCTAAAAATACGTTCC-GGGCCCCGA-TACAGTTTTGC-ATAA
* * ** * * * * *
6702 TATTT-GGCCCCGGGACTCCTTGACATATCTATAT-TCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGC
307 TTTTTAGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATTG-
* * * * * *
6764 ATTTA-AGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATTAAAAATTAATTCGG
371 ATTTATA-GACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATAC--
* * * * * * * *
6827 AAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCATTGAATTAT
433 AAAAAAATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTAT
* * * * * * ** * ** * *
6892 AT-ATATTCTATAAGTGTTTTGGCCCAAGATT--GTGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAA
498 ATAAT-TTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTAAG-GAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAA
* * * *
6954 ATTTTAGCCGAAATC--GT-GT-ACCATCACCGTTATTTGGCTAAAAACGCGTTTCGGTGCCCCA
561 ATTTTAGCCGAAATCATGTACTAACCATCACAGTT-TTTGGCTAAAAACACGTTCCGG-G-CCCA
** * * * * *
7015 ACT-CAGTTTT-CAATGATTTTTGGC-CCTGAGACTCCTTGAGATATCTATATTCATCTAACCAA
623 GGTACAGTTTTGC-ATAATTTTTGGCGCC-AAGACTCCTTGAAATATATATATTCATATAACC-A
* * ** * * *
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* * * * * * * * * *
7139 ATAAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCATGAAAAACCCTTCAA-TC
749 ATTAGAAATTAATTC--AAA-AAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATTT
* ** * * * * * * * *
7203 TTATTGACGTTAAATTATACATATTCTGT--AAGTGGTT-TAG-CCAAAAGTTGTGGAAAAAATC
811 TTA-TGACATCGAATTATATA-ATT-TTTACAACT-ATTGT-GTCAAAAAATTGAGG-AAAAATT
* * * * *
7264 TTTC-AGGTCAATTTTTACAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATCAC-GATTTTTGGCT
870 TTTCGA-CTCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACT-ACCATCACAG-TTTTTGGCT
* * * * * ** * ** * * *
7327 AAAAACGCGTTCCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTGAC
932 AAAAACACGTTCCG-GGACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGACAAGACTCGTTGAA
* * * **
7389 ATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGGGCAT
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAA-TGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACAT
* * * * * * * *
7453 CAGAATCATGTTTCG-ATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
65 CAGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATT---AAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAA
* * ** * * ** * *
7517 GCGTGAACAA-CCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGATTTATATATATATATATATTCTATAAGTGTT
127 GCGTGAA-AAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGA---AT-TATATA-CT-T-TT-TACGACTATT
* * * * * * * * *
7581 TTGGCCAAAGATTGTGGAAAAA--GTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAG-TCGAAATCATGT
183 ATGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTC-AAATCGTGT
* * * ** * ** *
7643 ACTAATCATCACGGTTTTAGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCT-CAGTTTTTAATGATTT
247 ACTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAATACGTTCC-GGGCCCC-GATACAGTTTTGCATAATTT
* * * * * * * *
7707 TTTGGCCCCGAGACTCCTTGACATATATATAT-TCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AGTTGGATT
310 TTAGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATT-GATT
* * * * * * *
7770 TA-AGGATTTGATTTTACGGGCATGAGAATCATT-TTTCGATTT-AATCAGAAATTAATTCGGAA
374 TATA-GACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATC-TTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATAC--AA
* * * * * * * **
7832 AGATATAGGAAAATCAATATTAGAAGCGTGAACAA-CCCTTCAAACTTTTT-GACATTTAATTAT
435 AAAAATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAA-AAGCCTTTTAATCTTTTTGGA-ATCGAATTAT
* * * * * * * * * * ** * * *
7895 AT-ATACTCTATAAGTGTTTTGGCGAAAGAGTGTGGAAAACA-CTTTAGTG-TCAGTTTTTTCAA
498 ATAAT-TTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTAAGGAAAA-ATTTTTCG-GCTCAGTTTTTGCAA
* * * *
7957 AATCTTAGCCGAAATC--GT--T-ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCTTTCCTGGG-CCAC
560 AATTTTAGCCGAAATCATGTACTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCC-GGGCCCA-
* *** * * * *
8016 GGCT-CAGTTTT-CAATTATTTTT-GATTCGAGACTCCTTGATATATCTATACTCATATAA-CAA
623 GG-TACAGTTTTGC-ATAATTTTTGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATTCATATAACCAA
* * * * * *
8077 ATTCTCAGCGA-AATTGGATTTAAGGATTTGATTTTATGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTT-A
686 A-TCTCAGCCACAA-TGGATTTAAGGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCT
* * * * * * *
8140 ATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAAAAGCGTCAAAAACCCTTTAATCA
749 ATTAGAAATTAATTC--AAA-AAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAAT--
* * * * * * * * * ** * ** *
8205 TTTT-TGGCATTGAATTATAT-GTATTCTATAAGTGTTTTGGCCGAAGATTTTGGAATAAAAATT
809 TTTTATGACATCGAATTATATAAT-TTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTGAGG-A-AAAATTT
* * * * * * *
8268 TTGGA-TCAATTTTCGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTATTAACCATCACGGTTTTTTGGCTGA
871 TTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACT-ACCATCACAG-TTTTTGGCTAA
** * * * * ** * ** ** * *
8332 AAATGCGTTCTGGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGA-TTTTGGCCCCGGGACTCCTTGAC
934 AAACACGTTCCGGGACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGACAAGACTCGTTGAA
* * * * *
8390 TTATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAG-C-CAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAA--TGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACA
* * ** * * * *
8453 TCAGAATCATGTTTCGATTTAAAC-AGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
64 TCAGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATT---AAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGA
* * ** * * * * * * * * **
8517 AGCGTAAAAAACCCATCAATCTTTTTGACGTTAAATAATGCATACTCTATAAGTGGT-TTA-G-C
126 AGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTAT--ATACTTTTTACG-ACTATTATGTC
** *** * * * * *
8579 TGAAAATTGTTTAAAAAATCTTTCGGATCAATTTTAGCAAAATTTTAGC-CGAAATCGT-TAACA
188 AAAAAATTG-AGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTC-AAATCGTGT-ACT
* ** ** *
8642 AACCATCACGGTTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGACTA-AGTTTTTAATGATTTTT
250 AACCATCACAG-TTTTTGGCTAAAAATACGTTCC-GGGCCCCGA-TACAGTTTTGCATAATTTTT
* * * * * * ** * **
8706 -GGC-CCTGAGAGTCCTTGACATATCTATAT-TCATCTAATAAAATCTCAGCCA-TGTTGGATTT
312 AGGCGCC-AAGACTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATT-GATTT
* * * * * ** * * * *
8767 A-AGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATATTTCGATTT-AATCGGAAACTAATTCGAAAAG
375 ATA-GACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATACAAAAAA
* * * * * * ** *
8830 AT-GTATTCAAATCGATATTAGAAGTGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCGTTGAATTATATA
439 ATAGGA---AAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTATATA
* ** * * * * * * ** * * *
8894 AATTCAATAAGTGTTTTGGCAAAAAAATTATGGAAAAAACTTTCGGATCAATTTTTGCAAATTTT
501 ATTTTTACAACTATTGTGTC-AAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTT
* ** * * * **
8959 TAGCCGAAATCTTGTACTAACCATCAGGGTTTTTTGGTTAAAAACGCATTATGGGGCCTC-GGCT
565 TAGCCGAAATCATGTACTAACCATCACAG-TTTTTGGCTAAAAACACGTT-CCGGGCC-CAGG-T
* * * * * * * * *
9023 -CAATTATT-AATGATTTTTGGCCCCGAGTCTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCT
626 ACAGTT-TTGCATAATTTTTGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATTCATATAACCAAATCT
* * * * * **
9086 CAGCCA-AGTTGGATTTAA-GAATTTTATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATCG
690 CAGCCACA-ATGGATTTAAGGACTTGT-TTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTA
** * * * *
9148 GAAATTAATTCGAAAAGATATAGGAAACTCGATATTAGAAGCGTTAAAAATCC-TTCAATCTTTT
753 GAAATTAATTC-AAAA-A-ATAGGAAAAACAATATTAGAAGCG-TGAAAAGCCTTTTAAT-TTTT
** * * * * * * * * ** * * *
9212 -TCG-TGTTGAATTATATAAATTCTATAAGTTTTTTGGCCGAAAATTGTGGAAAAAACTTTTAG-
813 AT-GACATCGAATTATATAATTTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTGAGG-AAAAATTTTTCGA
* * * ** *
9274 TTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT-C-ACGGT-----TTTTTGGCT-AAAACGCG
876 CTCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACTACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACG
* * * * * ** * * * ** *
9331 TTCTGGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGC-CCTAAGAGTCCATGAC
941 TTC-CGGGACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGAC-AAGACTCGTTGAA
* * * * *** * * *
9384 ATATCTATATTCATCTAATCAAATCTCAGCCATGTTGGATTTAAGAATTTGATTTTACGAGCATC
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAATGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACATC
* * * * * * * *
9449 AGAATCATGTTTCG--ATTTAATAAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGTA
66 AGAATCTTGTTTCGTTTTTTACT-AGAAATTAATT---AAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAA
* * * * * *** * * * **
9512 GTGTGAAAAACCGTTCAATCTTATTGATGTTAAATTATACATA-TTCTATAAGTGGT-TTA-G-C
127 GCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTAT--ATACTT-TTTACG-ACTATTATGTC
* * * * * * * *
9573 CAAAAATTGTGAAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCGAAATTTTAGC-CGAAATCGTTTACTAA
188 AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTC-AAATCGTGTACTAA
* * * * *
9637 CCATCAC-GGTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCCCAGCT-CAGTTTT-TATTGATTTTT-G
252 CCATCACAGTTTTTGGCTAAAAATACGTTCCGGG-CCCC-GATACAGTTTTGCA-TAATTTTTAG
* * * * * * * *
9698 GC-CTCGAGACTTCTTGACATATCTATAT-TCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGA-TTAA
314 GCGC-CAAGACTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATT-GATTTAT
* * * ** * *
9759 AGGATTTGGTTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGA-TT-TAGCCAGAAATTAATTCGGAAAGA
377 A-GACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTA-TTAGAAATTAATAC--AAAAA
* * * * * * * * *
9822 GATAGTAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCATTGAATTATA-CAT
438 AATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTATATAAT
* * * * * * * * *
9886 ATTCTATAAGTGTTTTGGTC-AAAAATTATGGAAAAAATCTTTCGGGTCATTTTTTGCAAAATTT
503 -TTTTACAACTATTGT-GTCAAAAAATTAAGG-AAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTT
** * * * *
9950 TA---G---TC--G-A--AACGGT-----TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCTGGACCCCGGCT-CA
565 TAGCCGAAATCATGTACTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGCCCAGG-TACA
** * * * * * * *
9998 GTTTTTAATGATTCTTGGCCCCGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGC
629 GTTTTGCATAATTTTTGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGC
* * * ** * * **
10063 CA-AGTTTGATTTAAGGATTTCATTTTACGAGCGTCAAAATCTTGTTTCGA-TTGAATTAGAAAT
694 CACA-ATGGATTTAAGGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAAT
* * * * * *
10126 TAATTCGGAAAGATATAGGAAAATA-GATATTAGAAGTC-TGAAAAACCCTTCAA-TCTTATTGA
758 TAATTC--AAA-AAATAGGAAAA-ACAATATTAGAAG-CGTGAAAAGCCTTTTAATTTTTA-TGA
* ** * * * * * * *
10188 CGTTAAATTATA-CATATTCTATAAGTGGTT-TAG-CCAAAAATT-ATGGAAAAAATCTTTC-AC
817 CATCGAATTATATAAT-TTTTACAACT-ATTGT-GTCAAAAAATTGA-GG-AAAAATTTTTCGAC
* *** * * * * * *
10248 GTCAATTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTTTACTAACAATAACGGTTTTTGACTAAAAACGC
877 -TCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACT-ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACAC
* * * * * ** * * * *
10313 GTTCCGGGGCCCCGACTCAGTTTT-TATCGATTTTTGGCCCCGAGACACCTTGAC
940 GTTCC-GGGACCAGACACAGTTTTGCAT-AATTTTTGGCGACAAGACTCGTTGAA
* * * *
10367 ATATCTATATTCATATAACCAAATCACAGCCA-AATTGGATTTAAGGATTTGGTTTTACGAACAT
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAA-TGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACAT
* * * * * * ** *
10431 CAGAACCATGTTTCG--ATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAATTCAATATGAGA
65 CAGAATCTTGTTTCGTTTTTTACT-AGAAATTAATT---AAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGA
* * * * *
10494 AGCGTGAACAA-CCCTTCAATCTTTTTGGAATTGAATTATATA--TATT----C---TA--TCCA
126 AGCGTGAA-AAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATACTTTTTACGACTATTATGTCAA
* * ** *
10547 AAGATTGTGGAAAAA-ACTT----TC-G--TTT-C--AATTTTAGC-CGAAATCGTTTACTAACC
190 AAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTC-AAATCGTGTACTAACC
* * * * ** *
10600 ATAACGGTTTTT-ACTAAAAACACGTTCCGTGGCCCCGACTTA-A-TTTTAAATGATTTTT-GGC
254 ATCACAGTTTTTGGCTAAAAATACGTTCCG-GGCCCCGA--TACAGTTTTGCATAATTTTTAGGC
* *** ** * * * * * *
10661 CCCGCTACTCCTTGTCATATCTATGT-TCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AGTTGGATTTA-AGG
316 GCCAAGACTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATT-GATTTATA-G
* * * * ** * * *
10723 ATTTGATTTTACGAGCGTCAGAATCATGTTTCGA-TTGGATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATA
379 ACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATAC--AAAAAAATA
* * * * * ** *
10787 GGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCATTCAATCTTATT-GACATTAAATTATA-CATATT
442 GGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGA-ATCGAATTATATAAT-TT
* * * * * * ** * * * *
10850 CTATAAGTGGTTTTG-CCAAAAATTGTGGAAAAAGTCTTTCTGATCAATTTTTGCAAAATTTTAG
505 TTACAACT-ATTGTGTCAAAAAATTAAGGAAAAA-TTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAG
* * * * * *
10914 CCGAAATCGTTTACTAACCATCACAGTTTTTGGCAAAAAACACGTTCCAAGGCCCCGGCT-CAAT
568 CCGAAATCATGTACTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCC-GGGCCCAGG-TACAGT
* * * * * * *
10978 TTT-TATTGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCC
631 TTTGCA-TAATTTTTGGCGCCAAGACTCCTTGAAATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGCC
* * * * *
11042 A-AATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATCAGAAATT
695 ACAA-TGGATTTAAGGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATT
* ** * * ** **
11105 AATTCGGAAAGATATAGGAAATTCAATATTAGAAGCATGAACAACCCTTCAAACCTTT-TGACAT
759 AATTC--AAA-AAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAA-AAGCCTTTTAATTTTTATGACAT
* * * * * * * * * * * **
11169 TGAATCATAT-ATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAGA--GTGGAAAAA-ACTT----TC-G--T
820 CGAATTATATAAT-TTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTT
* * * * * *
11223 TT-C--AATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATAACGGTTTTT-ACTAAAAACACGTTTCGTG
884 TTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACT-ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCG-G
* * ** * ** * ** *** * **
11284 GCCCCGACTTAATTTTAAATGATTTTTGGCCCCGCTACTCCTTGTC
947 GACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGACAAGACTCGTTGAA
* * * * * *
11330 ATATCTATGTTCATCTAACCAAATCTCAG-C-CAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCG
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAA--TGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACA
* * * ** * * * * *
11393 TCAAAATCATGTTTCG-ATTGAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
64 TCAGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATT---AAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGA
* * * * * * *
11457 AGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATAAATATTCTATAAGTGGTTTAGCCAA
126 AGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTAT--ATA--C--T---T--TTTA--C--
* * ** * * ** * *
11522 AAATTGGATTTAAGTGTTTTGGCCTAAGATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAT
176 -GACT--A-TT-A-TG---T--CAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAAT
* ** * *
11587 TTTAGC-CGAAATCGTGTACTAATCATCACCCTTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGGCCCGAC
230 TTTAGCTC-AAATCGTGTACTAACCATCA-CAGTTTTTGGCTAAAAATACGTTCCGGGCCCCGA-
* * * * * *
11651 T-CAGTTTT-CAATGATTTTT-GGC-CCTGAGACTCCTTGAGATATCTATAT-TCATCTAACCAA
292 TACAGTTTTGC-ATAATTTTTAGGCGCC-AAGACTCCTTGAAATATATATATATTATCAAACCAA
* ** * * * * * *
11711 ATATCAGCCA-AATTGGATATAGGGATTTGATTTTACGAGCGTTAGAATCATGTTTCGATTT-AA
355 ATATCAGCCACAATT-GATTTATAGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTA
* * * * * * * * *
11774 TCAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTT
419 TTAGAAATTAATAC--AAAAAAATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTT
* * * * * * * * * * ** **
11839 TTTAGAATTGAGTTATAT-ATATTTTATAAGTGTTTTGGCCAAATATTGTGGAAAAAACTTTCGG
482 TTTGGAATCGAATTATATAAT-TTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCGG
* * * * * * * * *
11903 GTCAATTTTTGCAAAATTTGAGCCGACATCGTTTAGTAACCATCACGGTTTTTTGGCTAAAAACG
546 CTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTACTAACCATCACAG-TTTTTGGCTAAAAACA
* * * * * * *
11968 CGTTCTGGGCCCCGGCT-CAGTATTT-AATGA-TTTT--C-CTCGAGACTCCTTGACATATCTAT
610 CGTTCCGGGCCCAGG-TACAGT-TTTGCATAATTTTTGGCGC-CAAGACTCCTTGAAATATATAT
* * * * * * * *
12027 ATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AGTTGGGTTTAAGGATTTGATTTTATGAGCGTCAGAATCA
672 ATTCATATAACCAAATCTCAGCCACA-ATGGATTTAAGGACTTGTTTTTACGAGCATCAGAATCT
** * * * *
12091 TGTTTCGA-TTGAATTAAAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAA
736 TGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATTC--AAA-AAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAA
* * * * * ** * * * * *
12155 AACCCTTCAA-TCTTATTGACGTTAAATTATA-CATATTCTATAAGTGATT-TAG-CCAAAAATT
798 AGCCTTTTAATTTTTA-TGACATCGAATTATATAAT-TTTTACAACT-ATTGT-GTCAAAAAATT
* * ** * * *
12216 GTGGAAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATCACA
859 GAGG-AAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACT-ACCATCACA
* * * * * ** * * * *
12281 GTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCTGGCTCAGTTTTTTATGATTTTTGGCGCCGAGTCT
922 GTTTTTGGCTAAAAACACGTTCC-GGGACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGACAAGACT
** *
12346 CCATGAC
986 CGTTGAA
* * * *
12353 ATATCTATATTTATCTAACCAAATCTCAGTCA-AACTGGATTTAAGGATTTGATTTTACG
1 ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAA-TGGATTTAAGGATTTGTTTTTACG
12412 GGTATGAGAA
Statistics
Matches: 7550, Mismatches: 1050, Indels: 845
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
960 8 0.00
961 273 0.04
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1023 99 0.01
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ACGTcount: A:0.33, C:0.16, G:0.16, T:0.35
Consensus pattern (992 bp):
ATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGTCACAATGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGAACATC
AGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATTAAAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCGT
GAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATACTTTTTACGACTATTATGTCAAAAAATT
GAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTCAAATCGTGTACTAACCATCACAG
TTTTTGGCTAAAAATACGTTCCGGGCCCCGATACAGTTTTGCATAATTTTTAGGCGCCAAGACTC
CTTGAAATATATATATATTATCAAACCAAATATCAGCCACAATTGATTTATAGACTTGTTTTTAC
GAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATACAAAAAAATAGGAAAAACGATATT
AGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGAATCGAATTATATAATTTTTACAACTATTGTGTC
AAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTACTAAC
CATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGCCCAGGTACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGCC
AAGACTCCTTGAAATATATATATTCATATAACCAAATCTCAGCCACAATGGATTTAAGGACTTGT
TTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATTCAAAAAATAGGAAAAACA
ATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATTTTTATGACATCGAATTATATAATTTTTACAACTATT
GTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTA
CTACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTGG
CGACAAGACTCGTTGAA
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4692 ACTAGTTGAA
4702 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
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AT
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* * * * * * * ** * * * *
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*** *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* ** * * * * * * * * * * **
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126 TAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTGAATTATATATA-TTCTATAAGTGTTTT
* * ** ** * * * * *
2897 GTCCAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCAGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTGC
189 GGCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTC-GGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTAC
* * * * * ** *
2962 TAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGAG-CCCAGATACAGTTTTGCATAATTTTTG
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* * *
3026 GCGCCAAGACTCGTTG
317 GCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * ** *
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1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
* * * * * * *
3106 ATCAGAATCTTGTTTCGTTTTTTATTAGAAATTAATTC--AAAAATATAGGAAAAAACAATATTA
65 ATCAGAATCATGTTTCG-ATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-AAAATCGATATTA
* * * * * * ** * * * *
3169 GAAGTGTGAAAAGCCTTTTAAT-TTTTATGACATTGAATTATATACT-TTTTACGACTATTGTGT
128 GAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTT-TGACGTTGAATTATATA-TATTCTATAAGTGTTTTGG
* * * ** * * * * **
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191 CCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAA
** * ** * * ** * **
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256 CCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCC
* *
3362 CAAGACTCGTTG
321 CGAGACTCCTTG
* * * * ** * *
3374 A-A-ATATATATTTATCAAACCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTAAAGACGTGTTTTTACGAAC
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
* * * * * *
3436 ATCGGAATCTTGTTTCGAATTCT-ATTAGAAATTAATT---AAA-AAATAGTAAAAACGATATTA
65 ATCAGAATCATGTTTCG-ATT-TAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTA
* * ** * * * * * *
3496 GAAGCGTGAAAAGCCTTTTGATCTTTTTGGCATTGAATTATATA-ATT-TTTACGACTATTGTGT
128 GAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATA--AGTGTTTTG-
* * * ** ** * *
3559 G-AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCC-AAATTCGTGTACT
190 GCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAA-TCGTTTACT
* ** * ** * * ** * *
3622 AACCATCACAGTTTTTAACTAAATATACGTTCCGGG-CCCTGATACAGTTTTGCATAATTTATGG
254 AACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCT-CAGTTTTTAATGATTTTTGG
* * **
3686 CTCCAAGACTCGATG
318 CCCCGAGACTCCTTG
* * * * * * * *
3701 AAATATATATATATTCATCTAACCAAATATCAGTCACATTGGATTTAAGGATTTGTTTTTATGTG
1 --ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAG
* * ** * * *
3766 CATCAGAAACTTGTTTCG-TTTTTTACTAGAAATTAATTC--AAATAAATAGGAAAAAT-AATAT
64 CATCAGAATCATGTTTCGATTTAAT-C-AGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-AAAATCGATAT
* * * * * * * ** *
3827 TAGAAGCGTGAGAACTGAAAAGGCTTTTAATTTTTTTGGCATTGAATTATATACT-TTTTACGAC
126 TAGAAGCGT--G-A---AAAA-CCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATA-TATTCTATAAG
* * ** * * ** * * * **
3891 TATTAT-GTAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTCCAAAATTTTAGCTTAAATCG
183 TGTTTTGGCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG
* * * * * * * *
3955 TGTACTATCCATCACAGTTTTTGGCTAAAAATGTGTTCTGGGGCCCCGGTTCAGTTTTAAATGAT
248 TTTACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTC-CGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGAT
* ** *
4020 TTTCGGGGCCAAGACTCCTTG
312 TTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * *
4041 AAATATCTATATTTATCAAACCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTATA-GACTTG-TTCTTACGA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTA-AGGATTTGATT-TTACGA
* * * * * *
4103 GGATCATAATCATGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATAC--AAA-AAATAGGAAAAAT-GATAT
63 GCATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-AAAATCGATAT
* * * * * * * * * * *
4164 TAAAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGA-ATCGAATTATATA-ATTTTTACAACTATTGT
126 TAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTGAATTATATATA-TTCTATAAGTGTTTT
* * * ** ** * * * *
4227 GTCAAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTGC
189 GGCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTT-CGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTAC
* * * * * * ** *
4292 T--CCATCACAGTTGTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCAGACACAGTTTTGCATAATTTTTG
253 TAACCATCACGGTT-TTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTG
* *
4355 G-CCCAAGACTCGTTG
317 GCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * *
4370 AAATATATATATTCATATAACCAAATTTCAGTCACAA-TGGATTTAAGGATTCCT-TTTTTACGA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGATT--TGATTTTACGA
* * * * * * * * * *
4433 GTATCGGAATCTTGTTTCGTTTTTTATTAGAAATTAATTC--AAAAAAATAGGAAAAACAATATT
63 GCATCAGAATCATGTTTCG-ATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATT
* * * * * * * *
4496 AGAAGCGTG-AAAACCTTTTAAT-TTTTATGACATTGAATTATATACT-TTTTATGACTATTGTG
127 AGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTT-TGACGTTGAATTATATA-TATTCTATAAGTGTTTTG
* * * * ** * * * * *
4558 TCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGC-AAATTTTAACCGAAATTGTGTACTA
190 GCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTA
* * * ** * * ** * *
4622 ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCTGGGCCCAAGCACAGATTTGCATAATTTTTGGCG
255 ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCC
* * **
4687 ACAAGACTAGTTG
320 CCGAGACTCCTTG
* * * *
4700 AAATATATATATATATATATATATATATATATTCATCAAAGCAAATCTCAGCCAAAATT-GATTT
1 --------------------ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCC-AAATTGGATTT
* ** * * * * * * *
4764 AAAGACAT--TTTTACGAGCAACAGAATCTTGTTTCGATTTTTATTAAAAATTAA-T--AAAAAA
45 AAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGA-TTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGA
* * * * * * *
4824 AATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATACT
109 TATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATA-T
* *** * * * * * ** **
4889 -TTGTCCGACTGTTGTGTG-AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTCTCAATTTTTGCAAAATTTT
173 ATTCTATAAGTGTTTTG-GCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTT
* * * * ** * * *
4952 AGCCGAAATCGTGTAC-GA-TATCACGGTTTATGGAC-AAAATGGTGTTCCGGGGCACCGGTTCA
237 AGCCGAAATCGTTTACTAACCATCACGGTTTTTGG-CTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCA
** * * * *
5014 GTTTTGCATGATTTTAGACGCCAAGACTCCTTG
300 GTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * ** *
5047 AAATATCTATATTTATCAAACCAAATCTCAGCTAAATT-GATTTAAAGACGTGTTTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * * * * *
5111 TCGGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATT---AAA-AAATGGGAAAAGCGATATTAGA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTT-AATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
* * * * * * * ** * * *
5172 AGCGTGAAAAGCCTTTTAA-CATTTTTGGCATCGAATTATATA-ATTTTGACGACTATTGTGTG-
130 AGCGTGAAAAACCCTTCAATC-TTTTTGACGTTGAATTATATATATTCT-ATAAGTGTTTTG-GC
* * * ** ** * *
5234 AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCC-AAATTCGTGTACTAA
192 CAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAA-TCGTTTACTAA
* ** ** * * ** * *
5298 CCATCACAGTTTTTAACTAAAAATACGTTCCGGG-CCCTGATACAGTTTTGCATAATTTTTGGCT
256 CCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCT-CAGTTTTTAATGATTTTTGGCC
* **
5362 CCAAGACTCGATG
320 CCGAGACTCCTTG
* * * * * * *
5375 AAATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGTCACATTGGATTTAAGGATTTGTTTTTATGAGTA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* ** * * *
5440 TCAGAATCTTGTTTCG-TTTTTTACTAGAAATTAATTC--AAAAAAATAGGAAAAAT-AATATTA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAAT-C-AGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-AAAATCGATATTA
* * * * * * * * *
5501 GAAGCGTGAGAACTGAAAAGGCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATACT-TTTTATGACTA
128 GAAGCGT--G-A---AAAA-CCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATA-TATTCTATAAGTG
* * * * *** * * * ***
5565 TTATT-TCAAAAAATTGAGGAAAATTTTTTTGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTTTAATCGT
185 TT-TTGGCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGT
* ** * * * * * *
5629 GTACTATTCATCACAGTTTTTGGCTAAAAATGTGTTCTGGGGCCCCGGTTCAGTTTTAAATGATT
249 TTACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTC-CGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATT
* ** *
5694 TTCGGGGCCAAGACTCCTTG
313 TTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * *
5714 AAATATCTATATTTATCAAATCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTATA-GACTTGTTTTTACGAG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTA-AGGATTTGATTTTACGAG
* * * * * * * *
5777 GATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATAC--AAAGAAAAAGGAAAAACGATATTA
64 CATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTA
* * * * * * * * * * *
5840 AAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGA-ATCGAATTATATA-ATTTTTACAACTATTTTGT
128 GAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTGAATTATATATA-TTCTATAAGTGTTTTGG
* * ** * *** * * * * *
5903 CAAAAAATTAAGGATAAGTTTTTCCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTGCTA
191 CCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTT-CGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTA
* * * ** * ** * *
5968 ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACATTCCGGGCCTAGGCACAGTTTTGCATAATTTTTGGCG
255 ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCC
* *
6033 CCAAGACTCGTTG
320 CCGAGACTCCTTG
* * * * ** * ** *
6046 AAATTTATATATTCATATAACCAAATCTTGGTCACAA-TGGATTTAAGGATTTCTTTTTTATGAG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGATTT-GATTTTACGAG
* * * * * * * *
6110 CATCAGAATCTTGTTTCGTTTCTTATTAGAAATTAATTC--AAAAAAATAGGAAAAACAATATTA
64 CATCAGAATCATGTTTCGATT-TAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTA
* * * * * * *
6173 GAAGCGTG-AAAA-GC--CAAT-TTTTATGACATTGAGTTATATACT-TTTTACGAA-TATTGTG
128 GAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTT-TGACGTTGAATTATATA-TATTCTA-TAAGTGTTTTG
* * * * ** ** * * *
6231 TCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAATTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACTG
190 GCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTA
* * * * * * *
6296 ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGCCCAGACACAG-TTTCACATAATTTTTGG-
255 ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTA-ATGATTTTTGGC
** **
6359 CGAGAAGACTAGTTG
319 CCCG-AGACTCCTTG
* * * * *
6374 AAATATATATATATATATATATATAATCATCAAACCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTAAAGAC
1 ------------ACATATCTATAT--TCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGAT
* * *
6438 AT--TTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAAAAATTAATTCGGAAAGATATAGGA
51 TTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGA
* * * * * * *
6501 ATATCGTTATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTTGGCGTTGAATTATACATATTTTTTA
116 AAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATA
* ** *
6566 AGTGTTTTGGCC-AAAGATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTAAAATTTTTTTAAGATTTTAGCCGAA
181 AGTGTTTTGGCCAAAAG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGT-CAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAA
* * ** *
6630 ATCGTTTACTAACGTTATATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGATCCGGGGCCACAAG-TAAGTT
244 ATCGTTTACTAAC----CATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCC-CCGGCTCAGTT
* * *
6694 TTCAATGATATTTGGCCCCGGGACTCCTTG
303 TTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
*
6724 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGCATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
6789 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * *
6854 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCC-CA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
*
6918 AGATTGT-GAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG--T-GT-ACCAT
196 AG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * ** * *
6978 CACCGTTATTTGGCTAAAAACGCGTTTCGGTGCCCCAACTCAGTTTTCAATGATTTTTGGCCCTG
260 CACGGTT-TTTGGCTAAAAACGCGTTCCGG-GCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
7043 AGACTCCTTG
323 AGACTCCTTG
*
7053 AGATATCTATATTCATCTAACCAAAAT-TCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
1 ACATATCTATATTCATCTAACC-AAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
** * * * *
7117 ATTTGAATCATGTTTCGAGTTAATAAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGA
65 ATCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
* * * * * * *
7182 AGCATGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATACATATTCTGTAAGTGGTTTAGCCAA
130 AGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
* *
7247 AAGTTGTGGAAAAAATCTTTCAGGTCAATTTTTACAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
195 AAGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
*
7312 TCACGATTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
259 TCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
7377 AGACTCCTTG
323 AGACTCCTTG
* *
7387 ACATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGGGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
*
7452 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* ** *
7517 GCGTGAACAACCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGATTTATATATATATATATATTCTATAAGTGTTT
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTG------A-AT-TATATATATTCTATAAGTGTTT
* * * *
7582 TGGCC-AAAGATTGTGG-AAAAA-GTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCATGTA
188 TGGCCAAAAG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTA
* *
7644 CTAATCATCACGGTTTTAGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTT
252 CTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGA-TTTT
7709 TGGCCCCGAGACTCCTTG
315 TGGCCCCGAGACTCCTTG
* * *
7727 ACATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGGGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
7792 TGAGAATCATTTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCAATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * * *
7857 GCGTGAACAACCCTTCAAACTTTTTGACATTTAATTATATATACTCTATAAGTGTTTTGGCGAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* * * * * *
7922 GAG-TGTGGAAAACACTTTAGTGTCAGTTTTTTCAAAATCTTAGCCGAAATCG--T--T-ACCAT
196 -AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * * * ***
7981 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCTTTCCTGGGCCACGGCTCAGTTTTCAATTATTTTT-GATTCGA
260 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
8045 GACTCCTTG
324 GACTCCTTG
* * * * *
8054 ATATATCTATACTCATATAA-CAAATTCTCAGCGAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTATGAGC
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAA-TCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
* *
8118 ATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAAA
65 ATCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
* * * * *
8183 AGCGTCAAAAACCCTTTAATCATTTTTGGCATTGAATTATATGTATTCTATAAGTGTTTTGGCC-
130 AGCGTGAAAAACCCTTCAATC-TTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCA
* * * * * * * *
8247 GAAGATTTTGGAATAAAAATTTTGGATCAATTTTCGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTATTAAC
194 AAAG-TTGTGGAA-AAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAAC
* * * *
8312 CATCACGGTTTTTTGGCTGAAAATGCGTTCTGGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGA-TTTTGGCCC
257 CATCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCC
*
8376 CGGGACTCCTTG
321 CGAGACTCCTTG
* *
8388 ACTTATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
*
8453 TCAGAATCATGTTTCGATTTAAACAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * ** * * * *
8518 GCGTAAAAAACCCATCAATCTTTTTGACGTTAAATAATGCATACTCTATAAGTGGTTTAGCTGAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGC-CAA
** * * * *
8583 AA-TTGTTTAAAAAATCTTTCGGATCAATTTTAGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTAACAAACCA
195 AAGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * *
8647 TCACGGTTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGACTAAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCT
259 TCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCC
*
8712 GAGAGTCCTTG
322 GAGACTCCTTG
** **
8723 ACATATCTATATTCATCTAATAAAATCTCAGCCATGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * * * ***
8788 TCAGAATCATATTTCGATTTAATCGGAAACTAATTCGAAAAGATGTATTCAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * *
8853 GTGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCGTTGAATTATATAAATTCAATAAGTGTTTTGGCAAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGC-CAA
* * * *
8918 AAATTATGGAAAAAACTTTCGGATCAATTTTTGCAAATTTTTAGCCGAAATC-TTGTACTAACCA
195 AAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTT-TACTAACCA
* * * ** * * *
8982 TCAGGGTTTTTTGGTTAAAAACGCATTATGGGGCCTCGGCTCAATTATTAATGATTTTTGGCCCC
259 TCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTT-CCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCC
*
9047 GAGTCTCCTTG
322 GAGACTCCTTG
* * *
9058 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGAATTTTATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
9123 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCGGAAATTAATTCGAAAAGATATAGGAAACTCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * *
9188 GCGTTAAAAATCCTTCAATCTTTTTCG-TGTTGAATTATATAAATTCTATAAGTTTTTTGGCCGA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCC-A
** * *
9252 AAA-TTGTGGAAAAAACTTTTAGTTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG-----T----G
194 AAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* *
9307 TCACGGTTTTTTGGCT-AAAACGCGTTCTGGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCT
259 TCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTC-CGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCC
* * *
9371 AAGAGTCCATG
322 GAGACTCCTTG
* ** *
9382 ACATATCTATATTCATCTAATCAAATCTCAGCCATGTTGGATTTAAGAATTTGATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* *
9447 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATAAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGTA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * * * * *
9512 GTGTGAAAAACCGTTCAATCTTATTGATGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGGTTTAGCCAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* * *
9577 AATTGT-GAAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCGAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
196 AGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * * *
9641 CACGG-TTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCCCAGCTCAGTTTTTATTGATTTTTGGCCTCGA
260 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGG-CCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
*
9705 GACTTCTTG
324 GACTCCTTG
* *
9714 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTAAAGGATTTGGTTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
** * *
9779 TCAGAATCATGTTTCGATTTAGCCAGAAATTAATTCGGAAAGAGATAGTAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * *
9844 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCATTGAATTATACATATTCTATAAGTGTTTTGGTCAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* * *
9909 AATTATGGAAAAAATCTTTCGGGTCATTTTTTGCAAAATTTTA---G---TCG-------A--A-
196 AGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * *
9958 -ACGGTTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCTGGACCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTCTTGGCCCCGA
260 CACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
10022 GACTCCTTG
324 GACTCCTTG
* * * *
10031 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTTGATTTAAGGATTTCATTTTACGAGCG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * * *
10096 TCAAAATCTTGTTTCGATTGAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATAGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * *
10161 GTC-TGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGGTTTAGCCAA
131 G-CGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
* * ** ** *
10225 AAATTATGGAAAAAATCTTTCACGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTTTACTAACAA
195 AAGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * *
10290 TAACGGTTTTTGACTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGACTCAGTTTTT-ATCGATTTTTGGCCCC
259 TCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAAT-GATTTTTGGCCCC
*
10354 GAGACACCTTG
322 GAGACTCCTTG
* * * *
10365 ACATATCTATATTCATATAACCAAATCACAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGGTTTTACGAACA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * *
10430 TCAGAACCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAATTCAATATGAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* *
10495 GCGTGAACAACCCTTCAATCTTTTTGGA-ATTGAATTATATATATTC--T-A------T--CC-A
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
10547 AAGATTGTGGAAAAAACTTTC--G------TTT-C--AATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
195 AAG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * * * * * *
10601 TAACGGTTTTT-ACTAAAAACACGTTCCGTGGCCCCGACTTAATTTTAAATGATTTTTGGCCCCG
259 TCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
**
10665 CTACTCCTTG
323 AGACTCCTTG
* * * *
10675 TCATATCTATGTTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
** *
10740 TCAGAATCATGTTTCGATTGGATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * *
10805 GCGTGAAAAACCATTCAATCTTATTGACATTAAATTATACATATTCTATAAGTGGTTTT-GCCAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGT-GTTTTGGCCAA
* * * *
10869 AAATTGTGGAAAAAGTCTTTCTGATCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
195 AAGTTGTGGAAAAA-ACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * * * * *
10934 TCACAGTTTTTGGCAAAAAACACGTTCCAAGGCCCCGGCTCAATTTTTATTGATTTTTGGCCCCG
259 TCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
10999 AGACTCCTTG
323 AGACTCCTTG
11009 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* *
11074 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAATTCAATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * * *
11139 GCATGAACAACCCTTCAAACCTTTTGACATTGAATCATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCC-AA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* *
11203 AG-AGTGGAAAAAACTTTC--G------TTT-C--AATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATA
196 AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATC
* * * * * * * **
11256 ACGGTTTTT-ACTAAAAACACGTTTCGTGGCCCCGACTTAATTTTAAATGATTTTTGGCCCCGCT
261 ACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAG
11320 ACTCCTTG
325 ACTCCTTG
* * * *
11328 TCATATCTATGTTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
11393 TCAAAATCATGTTTCGATTGAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* *
11458 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATAAATATTCTATAAGTGGTTTAGCCAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAA-T-T--ATA---TAT-A-----TT---C---
*
11523 AATTGGATTTAAGTGTTTTGGCC-TAAGATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAT
177 ---T--A--TAAGTGTTTTGGCCAAAAG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAT
* * ** * * *
11587 TTTAGCCGAAATCGTGTACTAATCATCACCCTTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGGCCCGACT
234 TTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATCA-CGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCT
* *
11652 CAGTTTTCAATGATTTTTGGCCCTGAGACTCCTTG
298 CAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * *
11687 AGATATCTATATTCATCTAACCAAATATCAGCCAAATTGGATATAGGGATTTGATTTTACGAGCG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
11752 TTAGAATCATGTTTCGATTTAATCAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * *
11817 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTAGA-ATTGAGTTATATATATTTTATAAGTGTTTTGGCCAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
* * *
11881 ATA-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTGAGCCGACATCGTTTAGTAACCA
195 A-AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * *
11945 TCACGGTTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCTGGGCCCCGGCTCAGTATTTAATGA-TTTT--CCTCG
259 TCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
12007 AGACTCCTTG
323 AGACTCCTTG
* * * *
12017 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGGTTTAAGGATTTGATTTTATGAGCG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
12082 TCAGAATCATGTTTCGATTGAATTAAAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * *
12147 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGATTTAGCCAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* *
12212 AATTGTGGAAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
196 AGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * * *
12277 CACAGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCTGGCTCAGTTTTTTATGATTTTTGGCGCCGA
260 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
* *
12342 GTCTCCATG
324 GACTCCTTG
* * * * *
12351 ACATATCTATATTTATCTAACCAAATCTCAGTCAAACTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGGGTA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * * *
12416 TGAGAATCATATTTCGATTTAACCATAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCAATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * *
12481 GCATGAACAACCCTTCAAACTTTTTG-CGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCC-AA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
** * * *
12544 AGATTGTATAAAAAACTATCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTAC---CCAT
196 AG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * * * ***
12606 CACGGTTTTTGGCTTAAAACGCGTTGCTGGGCCTCGGCTCAGTTTTCAATGATTTTTGATTCCGA
260 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTT-CCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
12671 GACTCCTTG
324 GACTCCTTG
* * * *
12680 ACATATCTATACTCAACTAA-CAAATTCTCAGCCAAATTGGAATTCAGGATTTGATTTTACGAGC
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAA-TCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
* * * * *
12744 ATCAGAATCATGTTTCGATTTACTCAGAAATTTATTCGAAAACATATAGGTAAATCGATATTAGA
65 ATCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
* * * *
12809 AGCGTGAAAAACCCTTCATTCCTTTTGGCGTTAAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
130 AGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
* * *
12874 AAATTATGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAGTTTAGCCGAA
195 AAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAA
12923 TTCCGGGCCC
Statistics
Matches: 8615, Mismatches: 1208, Indels: 783
0.81 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
309 3 0.00
310 204 0.02
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312 1 0.00
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317 249 0.03
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352 3 0.00
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356 1 0.00
357 1 0.00
358 29 0.00
359 188 0.02
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ACGTcount: A:0.33, C:0.16, G:0.16, T:0.35
Consensus pattern (332 bp):
ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATC
ACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGA
CTCCTTG
Found at i:7489 original size:663 final size:661
Alignment explanation
Indices: 2378--12922 Score: 8530
Period size: 663 Copynumber: 15.9 Consensus size: 661
2368 ATATATATAT
* * * * * *
2378 ACATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGTCACATTGGATTTAAGGATTTGTTTTTATGAACA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* ** * * * *
2443 TCAGAATCTTGTTTCG-TTTTTTACTAGAAATTAAATC--AAAAAAATAGGAAAAAT-AATATTA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAAT-C-AGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-AAAATCGATATTA
* * * * * * ** * * * *
2504 GAAGCATGAAAAGA-CTTTTAATCGTTTTGGCATTGAATTATATACT-TTTTACGACTATTATGT
128 GAAGCGTGAAAA-ACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATA-TATTCTATAAGTGTTTTGG
* * ** * * ** *
2567 CAAAAAATT-TAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGCAAAA-TTTAGCTTAAATCGTGTACTA
191 CCAAAAGTTGT-GGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTA
* ** * * * * *
2630 TCCATCACAATTTTTGGCTATAAATGTGTTCCGCGGCCCCGGTTCAG-TTTTAGATGATTTTTAG
255 ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GGCCCCGGCTCAGTTTTTA-ATGATTTTTGG
*** * * * * * *
2694 AGTCAAGACTCCTTGAAAAATCTATATTTATCAAACCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTATA-G
318 CCCCGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AGTTGGATTTA-AGG
* * * * * * * ** *
2757 ACTTG-TGTTTACAAGGATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAGTACAAAAAAATA-
381 ATTTGAT-TTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATTAGAAATTAATTCGGAAAGATAT
* * ** * * * * * **
2820 ATGAAAAAT-GATATTAAAAGCACGTAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGA-ATCGAATTATATA-AT
444 A-GGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTAAATTATATATA-
* * * * ** * ** ** * *
2882 TTTTACAACTATCGTGTCCAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCAGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTA
506 TTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTC-GGGTCAATTTTTGCAAAATTTTA
* * * *
2947 GCCGAAATCATGTGCTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGAGCCCAGA-TACAGT
570 GCCGAAATC--GTG-TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGACT-CAGT
** * * * *
3011 TTTGCATAATTTTTGGCGCCAAGACTCGTTG
631 TTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * ** *
3042 AAATATATATATTCATATAATCAAATCTCAGTCACAA-TGGATTTAAGGATTTCTTTTTACGAGT
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
* * * * * * *
3106 ATCAGAATCTTGTTTCGTTTTTTATTAGAAATTAATTC--AAAAATATAGGAAAAAACAATATTA
65 ATCAGAATCATGTTTCG-ATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-AAAATCGATATTA
* * * * * ** * * * *
3169 GAAGTGTGAAAAGCCTTTTAAT-TTTTATGACATTGAATTATATACT-TTTTACGACTATTGTGT
128 GAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTT-TGACATTGAATTATATA-TATTCTATAAGTGTTTTGG
* * * ** * * * * **
3232 CAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCAGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTGCACTAA
191 CCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAA
** * ** * * ** * **
3297 CCATCATAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGAACCAGGCACAGTTTTGCATAATTTTTGGCGA
256 CCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCC
* * * * * * * **
3362 CAAGACTCGTTGA-A-ATATATATTTATCAAACCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTAAAGACGT
321 CGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AGTTGGATTTAAGGATTT
* * * * * *
3424 GTTTTTACGAACATCGGAATCTTGTTTCGAATTCT-ATTAGAAATTAATT---AAA-AAATAGTA
385 GATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCG-ATT-TAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGA
* * * ** * * * *
3484 AAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTGATCTTTTTGGCATTGAATTATATA-ATT-TTTA
448 AAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATA
* * * * * ** ** *
3547 CGACTATTGTGTG-AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCC-A
513 --AGTGTTTTG-GCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGA
* ** * ** * *
3610 AATTCGTGTACTAACCATCACAGTTTTTAACTAAATATACGTTCCGGGCCCTGA-TACAGTTTTG
575 AA-TCGTG---TAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGACT-CAGTTTTT
* * * * * **
3674 CATAATTTATGGCTCCAAGACTCGATG
635 AATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * * * *
3701 AAATATATATATATTCATCTAACCAAATATCAGTCACATTGGATTTAAGGATTTGTTTTTATGTG
1 --ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAG
* * ** * * *
3766 CATCAGAAACTTGTTTCG-TTTTTTACTAGAAATTAATTC--AAATAAATAGGAAAAAT-AATAT
64 CATCAGAATCATGTTTCGATTTAAT-C-AGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-AAAATCGATAT
* * * * * * ** *
3827 TAGAAGCGTGAGAACTGAAAAGGCTTTTAATTTTTTTGGCATTGAATTATATACT-TTTTACGAC
126 TAGAAGCGT--G-A---AAAA-CCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATA-TATTCTATAAG
* * ** * * ** * * * **
3891 TATTAT-GTAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTCCAAAATTTTAGCTTAAATCG
183 TGTTTTGGCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG
* * * * * * * *
3955 TGTACTATCCATCACAGTTTTTGGCTAAAAATGTGTTCTGGGGCCCCGGTTCAGTTTTAAATGAT
248 TTTACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTC-CGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGAT
* ** * * * * *
4020 TTTCGGGGCCAAGACTCCTTGAAATATCTATATTTATCAAACCAAATCTCAGCCACAATT-GATT
312 TTTTGGCCCCGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AGTTGGATT
* * * * *
4084 TATA-GACTTG-TTCTTACGAGGATCATAATCATGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATAC--AA
376 TA-AGGATTTGATT-TTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATTAGAAATTAATTCGGAA
* * * * * * **
4145 A-AAATAGGAAAAAT-GATATTAAAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGA-ATCGAATTAT
438 AGATATAGG-AAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACGTTAAATTAT
* * * * * * * ** ** * *
4207 ATA-ATTTTTACAACTATTGTGTCAAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCCGGCTCAGTTTTTGCAAA
501 ATATA-TTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTT-CGGGTCAATTTTTGCAAA
** * * * * *
4271 ATTTTAGCCGAAATCGTGTGCTCCATCACAGTTGTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCAGACA
564 ATTTTAGCCGAAATCGTGT-AACCATCACGGTT-TTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGACT
** * * *
4336 CAGTTTTGCATAATTTTTGG-CCCAAGACTCGTTG
627 CAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * *
4370 AAATATATATATTCATATAACCAAATTTCAGTCACAA-TGGATTTAAGGATTCCT-TTTTTACGA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGATT--TGATTTTACGA
* * * * * * * * * *
4433 GTATCGGAATCTTGTTTCGTTTTTTATTAGAAATTAATTC--AAAAAAATAGGAAAAACAATATT
63 GCATCAGAATCATGTTTCG-ATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATT
* * * * * * *
4496 AGAAGCGTG-AAAACCTTTTAAT-TTTTATGACATTGAATTATATACT-TTTTATGACTATTGTG
127 AGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTT-TGACATTGAATTATATA-TATTCTATAAGTGTTTTG
* * * * ** * * * * *
4558 TCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGCTCAGTTTTTGC-AAATTTTAACCGAAATTGTGTACTA
190 GCCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTA
* * * ** * * ** * *
4622 ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCTGGGCCCAAGCACAGATTTGCATAATTTTTGGCG
255 ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCC
* * ** * * * *
4687 ACAAGACTAGTTGAAATATATATATATATATATATATATATATATTCATCAAAGCAAATCTCAGC
320 CCGAGACTCCTTG--------------------ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGC
* * ** * * * *
4752 CAAAATT-GATTTAAAGACAT--TTTTACGAGCAACAGAATCTTGTTTCGATTTTTATTAAAAAT
365 C-AAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGA-TTTAATTAGAAAT
* * * * * * * * *
4814 TAA-T--AAAAAAAATAGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGCAT
428 TAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGT
* * *** * * * * ** **
4876 TGAATTATATACT-TTGTCCGACTGTTGTGTG-AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTCTCAATT
493 TAAATTATATA-TATTCTATAAGTGTTTTG-GCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATT
* * ** *
4939 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGT-ACGATATCACGGTTTATGGAC-AAAATGGTGTTCCGG
556 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAAC--CATCACGGTTTTTGG-CTAAAAACGCGTTCC-G
* ** ** * * * *
5002 GGCACCGGTTCAGTTTTGCATGATTTTAGACGCCAAGACTCCTTG
617 GGCCCCGACTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * ** *
5047 AAATATCTATATTTATCAAACCAAATCTCAGCTAAATT-GATTTAAAGACGTGTTTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * * * * *
5111 TCGGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATT---AAA-AAATGGGAAAAGCGATATTAGA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTT-AATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
* * * * * * ** * * *
5172 AGCGTGAAAAGCCTTTTAA-CATTTTTGGCATCGAATTATATA-ATTTTGACGACTATTGTGTG-
130 AGCGTGAAAAACCCTTCAATC-TTTTTGACATTGAATTATATATATTCT-ATAAGTGTTTTG-GC
* * * ** ** * *
5234 AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCC-AAATTCGTGTACTAA
192 CAAAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAA-TCGTTTACTAA
* ** ** * * ** * *
5298 CCATCACAGTTTTTAACTAAAAATACGTTCCGGG-CCCTGATACAGTTTTGCATAATTTTTGGCT
256 CCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCT-CAGTTTTTAATGATTTTTGGCC
* ** * * *
5362 CCAAGACTCGATGAAATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGTCACA-TTGGATTTAAGGATT
320 CCGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AGTTGGATTTAAGGATT
* * * * * * * * *
5426 TGTTTTTATGAGTATCAGAATCTTGTTTCGTTTTTTACTAGAAATTAATTC--AAAAAAATAGGA
384 TGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCG-ATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGG-
* * * * * * *
5489 AAAAT-AATATTAGAAGCGTGAGAACTGAAAAGGCTTTTAATCTTTTTGGCATTGAATTATATAC
447 AAAATCGATATTAGAAGCGT--G-A---AAAA-CCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATA-
* * * * * * * *** * * *
5553 T-TTTTATGACTATTATT-TCAAAAAATTGAGGAAAATTTTTTTGGCTCAGTTTTTGCAAAATTT
504 TATTCTATAAGTGTT-TTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTT
*** * * * * * **
5616 TAGCTTTAATCGTGTACTATTCATCACAGTTTTTGGCTAAAAATGTGTTCTGGGGCCCCGGTTCA
568 TAGCCGAAATCGTGTA--A-CCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTC-CGGGCCCCGACTCA
* * ** *
5681 GTTTTAAATGATTTTCGGGGCCAAGACTCCTTG
629 GTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * * *
5714 AAATATCTATATTTATCAAATCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTATA-GACTTGTTTTTACGAG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTA-AGGATTTGATTTTACGAG
* * * * * * * *
5777 GATCAGAATCTTGTTTCGATTTCTATTAGAAATTAATAC--AAAGAAAAAGGAAAAACGATATTA
64 CATCAGAATCATGTTTCGATTT-AATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTA
* * * * * * * * * *
5840 AAAGCGTGAAAAGCCTTTTAATCTTTTTGGA-ATCGAATTATATA-ATTTTTACAACTATTTTGT
128 GAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACATTGAATTATATATA-TTCTATAAGTGTTTTGG
* * ** * *** * * * * *
5903 CAAAAAATTAAGGATAAGTTTTTCCGGCTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTGCTA
191 CCAAAAGTTGTGGAAAAAACTTT-CGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTA
* * * ** * ** * *
5968 ACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACATTCCGGGCCTAGGCACAGTTTTGCATAATTTTTGGCG
255 ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCC
* * * * * * **
6033 CCAAGACTCGTTGAAATTTATATATTCATATAACCAAATCTTGGTCACAA--TGGATTTAAGGAT
320 CCGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAG-C-CAAGTTGGATTTAAGGAT
** * * * * * *
6096 TTCTTTTTTATGAGCATCAGAATCTTGTTTCGTTTCTTATTAGAAATTAATTC--AAAAAAATAG
383 TT-GATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATT-TAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAG
* * * * * * *
6159 GAAAAACAATATTAGAAGCGTG-AAAA-GC--CAAT-TTTTATGACATTGAGTTATATACT-TTT
446 GAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTT-TGACGTTAAATTATATA-TATTC
* * * * * * ** ** *
6218 TACGAA-TATTGTGTCAAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGACTCAATTTTTGCAAAATTTTAACC
509 TA-TAAGTGTTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCC
* * * * *
6282 GAAATCGTGTACTGACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGCCCAGACACAG-TTTC
573 GAAATCGTGTA---ACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGACTCAGTTTTT
* ** **
6346 ACATAATTTTTGG-CGAGAAGACTAGTTG
635 A-ATGATTTTTGGCCCCG-AGACTCCTTG
* * * * *
6374 AAATATATATATATATATATATATAATCATCAAACCAAATCTCAGCCACAATT-GATTTAAAGAC
1 ------------ACATATCTATAT--TCATCTAACCAAATCTCAGCCA-AATTGGATTTAAGGAT
* * *
6438 AT--TTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAAAAATTAATTCGGAAAGATATAGGA
51 TTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGA
* * * * * * * *
6501 ATATCGTTATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTTGGCGTTGAATTATACATATTTTTTA
116 AAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATA
* ** *
6566 AGTGTTTTGGCC-AAAGATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTAAAATTTTTTTAAGATTTTAGCCGAA
181 AGTGTTTTGGCCAAAAG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGT-CAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAA
* * ** *
6630 ATCGTTTACTAACGTTATATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGATCCGGGGCCACAAG-TAAGTT
244 ATCGTTTACTAAC----CATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCC-CCGGCTCAGTT
* * *
6694 TTCAATGATATTTGGCCCCGGGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAA
303 TTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAA
* * *
6759 ATTGCATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAAAAATTAATT
368 GTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATT
* * * *
6824 CGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCATTGAAT
433 CGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAAT
* *
6889 TATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCCAAGATTGT-GAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAA
498 TATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAA
* * *
6953 AATTTTAGCCGAAATCGTGT-ACCATCACCGTTATTTGGCTAAAAACGCGTTTCGGTGCCCCAAC
563 AATTTTAGCCGAAATCGTGTAACCATCACGGTT-TTTGGCTAAAAACGCGTTCCGG-GCCCCGAC
* *
7017 TCAGTTTTCAATGATTTTTGGCCCTGAGACTCCTTG
626 TCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
*
7053 AGATATCTATATTCATCTAACCAAAAT-TCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
1 ACATATCTATATTCATCTAACC-AAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGC
** * * * *
7117 ATTTGAATCATGTTTCGAGTTAATAAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGA
65 ATCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGA
* * * * * * * *
7182 AGCATGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATACATATTCTGTAAGTGGTTTAGCCAA
130 AGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
* *
7247 AAGTTGTGGAAAAAATCTTTCAGGTCAATTTTTACAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
195 AAGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
*
7312 TCACGATTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
259 TCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
* *
7377 AGACTCCTTGACATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGAT
323 AGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGAT
*
7442 TTTACGGGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
388 TTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
* ** *
7507 GATATTAGAAGCGTGAACAACCCTTCAAAATTTTTGGCGTTGATTTATATATATATATATATTCT
453 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGAC---G--TTA-A-AT-TATATATATTCT
* * *
7572 ATAAGTGTTTTGGCCAAAGATTGTGG-AAAAA-GTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGTCGA
510 ATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGA
* * * *
7635 AATCATGTACTAATCATCACGGTTTTAGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTCAGTTTTTA
575 AATC--GT-GTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGACTCAGTTTTTA
7700 ATGATTTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
636 ATGA-TTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * *
7727 ACATATATATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGGGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
7792 TGAGAATCATTTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCAATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * *
7857 GCGTGAACAACCCTTCAAACTTTTTGACATTTAATTATATATACTCTATAAGTGTTTTGGCGAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* * * * * *
7922 GAG-TGTGGAAAACACTTTAGTGTCAGTTTTTTCAAAATCTTAGCCGAAATCG--T--T-ACCAT
196 -AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * * * ***
7981 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCTTTCCTGGGCCACGGCTCAGTTTTCAATTATTTTT-GATTCGA
260 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
* * * * *
8045 GACTCCTTGATATATCTATACTCATATAA-CAAATTCTCAGCGAAATTGGATTTAAGGATTTGAT
324 GACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAA-TCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGAT
*
8109 TTTATGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
388 TTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
* * * * * * *
8174 GATATTAAAAGCGTCAAAAACCCTTTAATCATTTTTGGCATTGAATTATATGTATTCTATAAGTG
453 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATC-TTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGTG
* * * * * * *
8239 TTTTGGCCGAAGATTTTGGAATAAAAATTTTGGATCAATTTTCGCAAAATTTTAGCCGAAATCGT
517 TTTTGGCCAAAAATTGTGGAA-AAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGT
* * *
8304 GTATTAACCATCACGGTTTTTTGGCTGAAAATGCGTTCTGGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGA-T
581 G---TAACCATCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGATT
*
8368 TTTGGCCCCGGGACTCCTTG
642 TTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* *
8388 ACTTATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
*
8453 TCAGAATCATGTTTCGATTTAAACAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * * ** * * * *
8518 GCGTAAAAAACCCATCAATCTTTTTGACGTTAAATAATGCATACTCTATAAGTGGTTTAGCTGAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGC-CAA
** * * * *
8583 AA-TTGTTTAAAAAATCTTTCGGATCAATTTTAGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTAACAAACCA
195 AAGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * *
8647 TCACGGTTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGACTAAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCT
259 TCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCC
* ** *
8712 GAGAGTCCTTGACATATCTATATTCATCTAATAAAATCTCAGCCATGTTGGATTTAAGGATTTGA
322 GAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGA
* ** * * * ***
8777 TTTTACGAGCATCAGAATCATATTTCGATTTAATCGGAAACTAATTCGAAAAGATGTATTCAAAT
387 TTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAAT
* * * * *
8842 CGATATTAGAAGTGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCGTTGAATTATATAAATTCAATAAGTG
452 CGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGTG
* * * *
8907 TTTTGGCAAAAAAATTATGGAAAAAACTTTCGGATCAATTTTTGCAAATTTTTAGCCGAAATCTT
517 TTTTGGC-CAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATC--
* * * * ** * * * *
8972 GTACTAACCATCAGGGTTTTTTGGTTAAAAACGCATTATGGGGCCTCGGCTCAATTATTAATGAT
579 GT-GTAACCATCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTT-CCGGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGAT
*
9037 TTTTGGCCCCGAGTCTCCTTG
641 TTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * *
9058 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGAATTTTATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
9123 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCGGAAATTAATTCGAAAAGATATAGGAAACTCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * ** * *
9188 GCGTTAAAAATCCTTCAATCTTTTTCG-TGTTGAATTATATAAATTCTATAAGTTTTTTGGCCGA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCC-A
** * *
9252 AAA-TTGTGGAAAAAACTTTTAGTTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG-----T----G
194 AAAGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* *
9307 TCACGGTTTTTTGGCT-AAAACGCGTTCTGGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCT
259 TCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTC-CGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCC
* * * * * *
9371 AAGAGTCCATGACATATCTATATTCATCTAATCAAATCTCAGCCATGTTGGATTTAAGAATTTGA
322 GAGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGA
*
9436 TTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATAAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAAT
387 TTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAAT
* * * * * *
9501 CGATATTAGTAGTGTGAAAAACCGTTCAATCTTATTGATGTTAAATTATACATATTCTATAAGTG
452 CGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGTG
* * * *
9566 GTTTAGCCAAAAATTGT-GAAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCGAAATTTTAGCCGAAATCGT
517 TTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG-
* * *
9630 TTACTAACCATCACGG-TTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGACCCC-AGCTCAGTTTTTATTGAT
580 -T-GTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGG-CCCCGA-CTCAGTTTTTAATGAT
* *
9693 TTTTGGCCTCGAGACTTCTTG
641 TTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* *
9714 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTAAAGGATTTGGTTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
** * *
9779 TCAGAATCATGTTTCGATTTAGCCAGAAATTAATTCGGAAAGAGATAGTAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * *
9844 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGGCATTGAATTATACATATTCTATAAGTGTTTTGGTCAAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* * *
9909 AATTATGGAAAAAATCTTTCGGGTCATTTTTTGCAAAATTTTA---G---TCG-------A--A-
196 AGTTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * *
9958 -ACGGTTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCTGGACCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTCTTGGCCCCGA
260 CACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
* *
10022 GACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTTGATTTAAGGATTTCATT
324 GACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATT
* * * * *
10087 TTACGAGCGTCAAAATCTTGTTTCGATTGAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATAG
389 TTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCG
* * *
10152 ATATTAGAAGTC-TGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGG
454 ATATTAGAAG-CGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGTGT
* * ** **
10216 TTTAGCCAAAAATTATGGAAAAAATCTTTCACGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTT
518 TTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG--
* * * *
10281 TACTAACAATAACGGTTTTTGACTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGACTCAGTTTTT-ATCGATT
580 T-GTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGACTCAGTTTTTAAT-GATT
*
10345 TTTGGCCCCGAGACACCTTG
642 TTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * *
10365 ACATATCTATATTCATATAACCAAATCACAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGGTTTTACGAACA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * *
10430 TCAGAACCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAATTCAATATGAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
*
10495 GCGTGAACAACCCTTCAATCTTTTTGGA-ATTGAATTATATATATTC--T-A------T--CC-A
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
10547 AAGATTGTGGAAAAAACTTTC--G------TTT-C--AATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
195 AAG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * * * * * *
10601 TAACGGTTTTT-ACTAAAAACACGTTCCGTGGCCCCGACTTAATTTTAAATGATTTTTGGCCCCG
259 TCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
** * *
10665 CTACTCCTTGTCATATCTATGTTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGAT
323 AGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGAT
* **
10730 TTTACGAGCGTCAGAATCATGTTTCGATTGGATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
388 TTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
* * * *
10795 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCATTCAATCTTATTGACATTAAATTATACATATTCTATAAGTGG
453 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGT-G
* * *
10860 TTTT-GCCAAAAATTGTGGAAAAAGTCTTTCTGATCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGT
517 TTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAA-ACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG-
* * * * * * * *
10924 TTACTAACCATCACAGTTTTTGGCAAAAAACACGTTCCAAGGCCCCGGCTCAATTTTTATTGATT
580 -T-GTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGATT
10989 TTTGGCCCCGAGACTCCTTG
642 TTTGGCCCCGAGACTCCTTG
11009 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* *
11074 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAATTCAATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * * *
11139 GCATGAACAACCCTTCAAACCTTTTGACATTGAATCATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCC-AA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
* *
11203 AG-AGTGGAAAAAACTTTC--G------TTT-C--AATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATA
196 AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATC
* * * * * * * **
11256 ACGGTTTTT-ACTAAAAACACGTTTCGTGGCCCCGACTTAATTTTAAATGATTTTTGGCCCCGCT
261 ACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAG
* *
11320 ACTCCTTGTCATATCTATGTTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTT
325 ACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTT
* * *
11385 TACGAGCGTCAAAATCATGTTTCGATTGAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGA
390 TACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGA
*
11450 TATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATAAATATTCTATAAGTGGTT
455 TATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAA-T-T--ATA---TAT-A-----T
* *
11515 TAGCCAAAAATTGGATTTAAGTGTTTTGGCCTAAGATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTT
507 T---C------T--A--TAAGTGTTTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTT
* ** * *
11580 GCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAATCATCACCCTTTTTTGGCTAAAAACACGTTCCGGGG
559 GCAAAATTTTAGCCGAAATCGTG---TAACCATCA-CGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGC
* *
11645 CCCGACTCAGTTTTCAATGATTTTTGGCCCTGAGACTCCTTG
620 CCCGACTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * *
11687 AGATATCTATATTCATCTAACCAAATATCAGCCAAATTGGATATAGGGATTTGATTTTACGAGCG
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * *
11752 TTAGAATCATGTTTCGATTTAATCAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* *
11817 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTAGA-ATTGAGTTATATATATTTTATAAGTGTTTTGGCCAA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTT-GACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
* * *
11881 ATA-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTGAGCCGACATCGTTTAGTAACCA
195 A-AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCA
* * *
11945 TCACGGTTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCTGGGCCCCGGCTCAGTATTTAATGA-TTTT--CCTCG
259 TCACGG-TTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCG
*
12007 AGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGGTTTAAGGATTTGAT
323 AGACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGAT
* * * *
12072 TTTATGAGCGTCAGAATCATGTTTCGATTGAATTAAAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
388 TTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
* * *
12137 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTATTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGA
453 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGTGT
* *
12202 TTTAGCCAAAAATTGTGGAAAAAATATTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTT
518 TTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAA-CTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCG--
* * * * *
12267 TACTAACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGGCCCTGGCTCAGTTTTTTATGATTT
580 T-GTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGATTT
* * *
12332 TTGGCGCCGAGTCTCCATG
643 TTGGCCCCGAGACTCCTTG
* * * * *
12351 ACATATCTATATTTATCTAACCAAATCTCAGTCAAACTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGGGTA
1 ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
* * * * *
12416 TGAGAATCATATTTCGATTTAACCATAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCAATATTAGAA
66 TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
* * * *
12481 GCATGAACAACCCTTCAAACTTTTTG-CGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCC-AA
131 GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
** * * *
12544 AGATTGTATAAAAAACTATCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTAC---CCAT
196 AG-TTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCAT
* * * * ***
12606 CACGGTTTTTGGCTTAAAACGCGTTGCTGGGCCTCGGCTCAGTTTTCAATGATTTTTGATTCCGA
260 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTT-CCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGA
* * * * *
12671 GACTCCTTGACATATCTATACTCAACTAA-CAAATTCTCAGCCAAATTGGAATTCAGGATTTGAT
324 GACTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAA-TCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGAT
* * * * * *
12735 TTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTACTCAGAAATTTATTCGAAAACATATAGGTAAATC
388 TTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATC
* * *
12800 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCATTCCTTTTGGCGTTAAATTATATATATTCTATAAGTGT
453 GATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGTGT
* *
12865 TTTGGCCAAAAATTATGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAGTTTAGCCGAA
518 TTTGGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAA
12923 TTCCGGGCCC
Statistics
Matches: 8443, Mismatches: 1075, Indels: 728
0.82 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
628 7 0.00
630 1 0.00
631 4 0.00
634 3 0.00
637 1 0.00
639 8 0.00
640 12 0.00
641 1 0.00
642 1 0.00
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692 23 0.00
693 13 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.16, G:0.16, T:0.35
Consensus pattern (661 bp):
ACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAATTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCA
TCAGAATCATGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGATATTAGAA
GCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAA
AGTTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTAACCATC
ACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGA
CTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCAAGTTGGATTTAAGGATTTGATTTT
ACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCGAT
ATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCTTTTTGACGTTAAATTATATATATTCTATAAGTGTTTT
GGCCAAAAATTGTGGAAAAAACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAAC
CATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGGCCCCGACTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCC
GAGACTCCTTG
Found at i:13179 original size:293 final size:294
Alignment explanation
Indices: 12643--13215 Score: 821
Period size: 293 Copynumber: 2.0 Consensus size: 294
12633 TGGGCCTCGG
* ** * * *
12643 CTCAGTTTTCAATGATTTTTGATTCCGAGACTCCTTGACATATCTATACTCAACTAACAAATTCT
1 CTCAGTATTCAATGATTTTTGAGCCCCAGACTCCTTAACATATCTATACTCAACTAACAAATTAT
* * *
12708 CAGCCAAATTGGAATTCAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTTACTCAGAA
66 CAGCCAAATTGGAATTCAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCAATTTAATCAAAA
* * * *
12773 ATTTATTCGAAAACATATAGGTAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCATTCCTTTTGGC
131 ATTAATTCGAAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTTCGC
*
12838 GTTAAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTATGGAAAAAACTTTCGGGTCAATT
196 ATTAAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTATGGAAAAAACTTTCGGGTCAATT
12903 TTTGCAAAAGTTTAGCCGAATTCCGGGCCCCCGA
261 TTTGCAAAAGTTTAGCCGAATTCCGGGCCCCCGA
* * *
12937 CTCAGTATTCAATGATTTTTG-GCCCTCAGACTCCTTAAGATATCTATATTCATCTAACAAA-TA
1 CTCAGTATTCAATGATTTTTGAGCCC-CAGACTCCTTAACATATCTATACTCAACTAACAAATTA
* * *
13000 TCAGCCAAATTGG-ATAT-AGGGATTTGATTTTCCGAGCGTTAGAATCATGTTTCAATTTAATCA
65 TCAGCCAAATTGGAAT-TCA-GGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCAATTTAATCA
* * *
13063 AAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGCAAAACCCTTCAATCTTTTT
128 AAAATTAATTCGAAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTT
* * * * *
13128 CGCATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGTCAAAGATTGTGGAAAAAACTTTTGGGTCA
193 CGCATTAAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTATGGAAAAAACTTTCGGGTCA
* *
13193 ATTTTTGCAAAATTTTCGCCGAA
258 ATTTTTGCAAAAGTTTAGCCGAA
13216 ATCGTGTACA
Statistics
Matches: 246, Mismatches: 30, Indels: 7
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
292 3 0.01
293 193 0.78
294 50 0.20
ACGTcount: A:0.33, C:0.17, G:0.16, T:0.35
Consensus pattern (294 bp):
CTCAGTATTCAATGATTTTTGAGCCCCAGACTCCTTAACATATCTATACTCAACTAACAAATTAT
CAGCCAAATTGGAATTCAGGATTTGATTTTACGAGCATCAGAATCATGTTTCAATTTAATCAAAA
ATTAATTCGAAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTTCGC
ATTAAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAAATTATGGAAAAAACTTTCGGGTCAATT
TTTGCAAAAGTTTAGCCGAATTCCGGGCCCCCGA
Found at i:13483 original size:621 final size:623
Alignment explanation
Indices: 12353--13544 Score: 1713
Period size: 621 Copynumber: 1.9 Consensus size: 623
12343 TCTCCATGAC
* * * *
12353 ATATCTATATTTATCTAACCAAATCTCAGTCAAACTGGATTTAAGGATTTGATTTTACGGGTATG
1 ATATCTATATTCATCTAACCAAATATCAGCCAAACTGGATATAAGGATTTGATTTTACGGGTATG
* * *
12418 AGAATCATATTTCGATTTAACCATAAATTAATTCGGAAAGATATAGGAAAATCAATATTAGAAGC
66 AGAATCATATTTCAATTTAACCAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCAATATTAGAAGC
*
12483 ATGAACAACCCTTCAAACTTTTTGCGTTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAGAT
131 ATGAACAACCCTTCAAACTTTTTGCATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAGAT
*
12548 TGTATAAAAAACTATCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTACCCATCACGGTT
196 TGTAGAAAAAACTATCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTA-CCATCACGGTT
* * **
12613 TTTGGCTTAAAACGCGTTGCTGGGCCTCGGCTCAGTTTTCAATGATTTTTGATTCCGAGACTCCT
260 TTTGGCTAAAAACACGTTGCTGGGCCTCGGCTCAGTTTTCAATGATTTTTGACCCCGAGACTCCT
*
12678 TGACATATCTATACTCAACTAACAAATTCTCAGCCAAATTGGAATTCAGGATTTGATTTTACGAG
325 TGACATATCTATACTCAACTAACAAATTCTCAGCCAAATTGGAATTAAGGATTTGATTTTACGAG
* * * * *
12743 CATCAGAATCATGTTTCGATTTACTCAGAAATTTATTCGAAAACATATAGGTAAATCGATATTAG
390 CATCAGAATCATGTTTCGATTGAATAAGAAATTAATTCGAAAACATATAGGTAAATCGATATTAA
* * * * *
12808 AAGCGTGAAAAACCCTTCATTCCTTTTGGCGTTAAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCA
455 AAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGGTTTAGCCA
*
12873 AAAATTATGGAAAAA-ACTTTCGGGTCAATTTTTGCAAAAGTTTAGCCGAATTCCGGGCCCCCGA
520 AAAATTATGGAAAAAGACTTTCGGATCAATTTTTGCAAAAGTTTAGCCGAATTCCGGGCCCCCGA
12937 CTCAGTATTCAATGATTTTTGGCCCTCAGACTCCTTAAG
585 CTCAGTATTCAATGATTTTTGGCCCTCAGACTCCTTAAG
* * *
12976 ATATCTATATTCATCTAA-CAAATATCAGCCAAATTGGATATAGGGATTTGATTTTCCGAGCGT-
1 ATATCTATATTCATCTAACCAAATATCAGCCAAACTGGATATAAGGATTTGATTTTACG-G-GTA
* * *
13039 T-AGAATCATGTTTCAATTTAATCAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCGATATTAGAA
64 TGAGAATCATATTTCAATTTAACCAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCAATATTAGAA
* * *
13103 GCGTGCAA-AACCCTTCAATCTTTTTCGCATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGTCAA
129 GCATG-AACAACCCTTCAAACTTTTT-GCATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAA
* * * * *
13167 AGATTGTGGAAAAAACTTTTGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTCGCCGAAATCGTGTA-CATCACA
192 AGATTGTAGAAAAAACTATCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTACCATCAC-
* * * * *
13231 GTTTTTTGGCTAAAAACATGTT-CTGGATCC-CGGCTCAGTTTTTAATGATTTTTGGCCCCGAGA
256 GGTTTTTGGCTAAAAACACGTTGCTGG-GCCTCGGCTCAGTTTTCAATGATTTTTGACCCCGAGA
* * ** *
13294 CTCCTTGACATATCTATATTCATCTAACCAAA-TCTCAGCCATGTTGGATTTAAGGATTTGATTT
320 CTCCTTGACATATCTATACTCAACTAA-CAAATTCTCAGCCAAATTGGAATTAAGGATTTGATTT
* * *
13358 TACGAGCGTCAGAATCATGTTTCGATTGAATAAGAAATTAATTCGGAAAGATATA-GTAAAATCG
384 TACGAGCATCAGAATCATGTTTCGATTGAATAAGAAATTAATTCGAAAACATATAGGT-AAATCG
13422 ATATTAAAAGCGTGAAAAACCCTTCAAT-CTTATTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGG
448 ATATTAAAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTT-TTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGG
* * * *
13486 TTTAGCCAAAAATTGTGGAAAAAGTCTTTCTGATCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAA
512 TTTAGCCAAAAATTATGGAAAAAGACTTTCGGATCAATTTTTGCAAAAGTTTAGCCGAA
13545 ATCGTTTACT
Statistics
Matches: 503, Mismatches: 56, Indels: 21
0.87 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
620 5 0.01
621 222 0.44
622 166 0.33
623 108 0.21
624 2 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.16, G:0.16, T:0.35
Consensus pattern (623 bp):
ATATCTATATTCATCTAACCAAATATCAGCCAAACTGGATATAAGGATTTGATTTTACGGGTATG
AGAATCATATTTCAATTTAACCAAAAATTAATTCGGAAACATATAGGAAAATCAATATTAGAAGC
ATGAACAACCCTTCAAACTTTTTGCATTGAATTATATATATTCTATAAGTGTTTTGGCCAAAGAT
TGTAGAAAAAACTATCGGGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCATGTACCATCACGGTTT
TTGGCTAAAAACACGTTGCTGGGCCTCGGCTCAGTTTTCAATGATTTTTGACCCCGAGACTCCTT
GACATATCTATACTCAACTAACAAATTCTCAGCCAAATTGGAATTAAGGATTTGATTTTACGAGC
ATCAGAATCATGTTTCGATTGAATAAGAAATTAATTCGAAAACATATAGGTAAATCGATATTAAA
AGCGTGAAAAACCCTTCAATCCTTTTGACGTTAAATTATACATATTCTATAAGTGGTTTAGCCAA
AAATTATGGAAAAAGACTTTCGGATCAATTTTTGCAAAAGTTTAGCCGAATTCCGGGCCCCCGAC
TCAGTATTCAATGATTTTTGGCCCTCAGACTCCTTAAG
Done.