Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01017765.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig17798, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 4947
ACGTcount: A:0.35, C:0.16, G:0.15, T:0.34
Found at i:608 original size:331 final size:331
Alignment explanation
Indices: 1--4947 Score: 6900
Period size: 331 Copynumber: 14.9 Consensus size: 331
* * * * *
1 TTGGGAAAAATACTCATAGAGATTATATAATTCAGTACCTAAAACATTGGAAGGCTATTT-ACGG
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCT-TTTCACGG
* *
65 TTCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCAAATTAAATCGAAAACAGTTTCAGAT
65 TTCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
* * *
130 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAGTCCAACGTGGCTGGGATTTAATTAGATAAATATAGATATTTC
130 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
* * * ** *
195 AATGAGTCTC-ATCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGTCCCTGGAACGCAG-TTTTAACCA
195 AAGGAGTCTCGGT-GCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGC-GTTTTTAGCCA
*
258 AAAACCGGGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTT
258 AAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTT
*
323 CTTTGATTT
323 CTTTAATTT
** * * *
332 TTGGCAAAAATACTCATTGAGATTATATAATTCAGTACCTAAAACATTGGAGGGCTATTCACGGT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
*
397 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTATTTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
66 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
* * * *
462 CACGTAAAAACATATCCCTTAGTCCAACGTGGCTGGGACTTGATTAGATAAATATAGATATTTCA
131 CTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTCA
*
527 AGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGTAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAAA
196 AGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAAA
592 ACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTCTT
261 ACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTCTT
*
657 TGATTT
326 TAATTT
663 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
*
728 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTTTAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
66 TCTAATATCATTTTCCCTA-TTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
* * *
793 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAGTCCAATGTGGCTGGGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
130 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
* *
858 AAGGCGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGATCCCAGAACGCGTTTTTAGCC-AA
195 AAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
* * * *
922 AACCGTGATGCTTAGTACACGATTTCAGCTGAAATTTTACAAAAATTGACCAGAAATATTTTTCT
260 AACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTCT
987 TTAATTT
325 TTAATTT
* * * * *
994 TTGGCGAAAATACTCATAAAAATAATATAA-TCAAATACC-ATAAAGGTTGGAGGGCTTTTCATG
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTC-AGTACCTA-AAAGATTGGAGGGCTTTTCACG
* * *
1057 ATTCTAATATCATTTTCCCTATATTTTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATAGAAACCAATTT
64 GTTCTAATATCATTTTCCC--TA--TTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTT
** * * *
1122 CAGATGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATTTAATGTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGAT
125 CAGATGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGAT
* * * * * * *
1187 ATTTCAAGGAGTCTTGGCT-TCTAAAATCA-GTCAAAACTGTGTTGTG--CCCAGAACACGTTTT
190 ATTTCAAGGAGTCTCGG-TGCCAAAAATCATG-CAAAATTGAGTCG-GACCCCAGAACGCGTTTT
** * *
1248 TAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTTGGCTAAAATTTTACAAAAATTGACCTGAAAT
252 TAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAAT
*
1313 AATTTTCTTTAATTT
317 ATTTTTCTTTAATTT
* * * * *
1328 TTGGCAAAAACACAT-ATAAAAATTATATAATTAAGTAGCTAAAAGATTGGAGCGCTTTTCACGA
1 TTGGCAAAAATAC-TCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGG
* * * *
1392 TTTTCATATCGTTTTCCCTATTTTTTTAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
65 TTCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
* * * *
1457 GCTCGTAAAAACATATCCTTTAGTCCAACGTGGCTGGGATTTGATTAGATAAATATAAATATTTC
130 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
* *
1522 AAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGATTCGGATCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
195 AAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
* * * * *
1587 AACCGTGATGATTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAGAAATTAACCAGAAATATATATT-
260 AACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATAT-TTTTC
1651 TTTAATTT
324 TTTAATTT
* * * * * * *
1659 TTGGCAAAAACACTCAT----A--ATATAA-TCAAATACCAAAAAGGTTGGAGGGCTTTTTAAGA
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTC-AGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGG
* * * *
1717 TTTTAATATCCA-TTTCCCTGTTTTTTCAGAATAAATTTCTAATAAAATCGAAACC-GATTTCAG
65 TTCTAATAT-CATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAG-TTTCAG
* ** * *
1780 ATGCTCGTAAAAATATATCCCTTAATTTAATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATT
128 ATGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATT
* * * * * * * * * *
1845 TCAAGGAGTCTCGGCT-TCTAAAATCATTCAAAACTGTG-C-TATGCCCGGAACACGTTTTTAAC
193 TCAAGGAGTCTCGG-TGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGA-CCCCAGAACGCGTTTTTAGC
* * ** * ** *
1907 CAAAAAACGTGATCGTTAGTACACGATTTTGGCAAAAATTTAACAAAAATTGACCTGAAATATTT
256 CAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTT
*
1972 TTCATTAATTT
321 TTCTTTAATTT
* ** * * * * *
1983 CTGGCAAAAACGCTCATAAAAATTATATAATTAAGTACCAAAAAGGTTGGAGGGCTTTTTACGAT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
* * * *
2048 TTTAATCTCGTTTTCCCTATTTAATTTAAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGA
66 TCTAATATCATTTTCCCTATTT--TTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGA
* * *
2113 TGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGGGACTTGATTAGATAAATATAGATATCT
129 TGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTT
*
2178 CAAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTAAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAA
194 CAAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAA
* * * *
2243 AAATCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAGTGGACCCGAATTATTTTTC
259 AAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTC
*
2308 TTCAATTT
324 TTTAATTT
* * * * * *
2316 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCAAAAAGGTTGCATGGTTTTTCACGAT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
* * *
2381 T-TGAATATCATTTTTCCTATTTTTTTCAGAAATAATTTCTAATTAAATCGAAACCTGTTTCAGA
66 TCT-AATATCATTTTCCCTA-TTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGA
* * * *
2445 TGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAATGTGGTTAAGATTTGATTAGATGAAA-GTAGATATT
129 TGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGAT-AAATATAGATATT
* * * *
2509 TCAAGGAGTCTCGACT-TCTAAAATCATGCAAAATTGAGTCGAACCCCAGAACGCGTTTTTAGCC
193 TCAAGGAGTCTCG-GTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCC
* * *
2573 AAAAATCGTGACGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGAAAAAATTGACCCG-AATGATTT
257 AAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAAT-ATTT
*
2637 TTCTTTAATTC
321 TTCTTTAATTT
*
2648 TTGGCAAAAATGA-TCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGATTTTCACGG
1 TTGGCAAAAAT-ACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGG
* * ** *
2712 TTTTGATATCAATTTT-GATATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACTAGTTTCAGA
65 TTCTAATATC-ATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGA
* *
2776 TGCTCGTAAAAACAAATCCCTTAATCAAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTT
129 TGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATA-TT
* * *
2841 TTAAGGAGTCTC-ATCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGAACCCC--AACGCGTTTTTAGCC
193 TCAAGGAGTCTCGGT-GCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCC
* * * * *
2903 AAAAACCATGATCGTTAGTTCACGATTTCAGCTAATATTTTGCAAAAATTGACCCGAATTATTTT
257 AAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTT
2968 TCTTTAATTT
322 TCTTTAATTT
*
2978 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTAACGGT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
3043 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
66 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
*
3108 CTCGTAAAAACATATCCCTTATTCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTCA
131 CTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTCA
* * *
3173 AGGAGTCTC-ATCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCGGAACGCGGTTTTAGCCAAA
196 AGGAGTCTCGGT-GCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
* *
3237 AACCGTAATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAATTATTTTTCT
260 AACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTCT
3302 TTAATTT
325 TTAATTT
* *
3309 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGCGCTTTTAACGGT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
* *
3374 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACTAATTTCAGATG
66 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
3439 CTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTCA
131 CTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTCA
* *
3504 AGGAGTTTC-ATCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
196 AGGAGTCTCGGT-GCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
* *
3568 AACCGTGACGGTTAGTACATGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCC-AAATTATTTTTC
260 AACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAA-TATTTTTC
3632 TTTAATTT
324 TTTAATTT
* * * * * * *
3640 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTTAGTACCAAAAAGGTTGGAGCGTTTTTTACGAT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACG-G
* *
3705 TTTTAATATCATTTTCCCTACTTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGTTTCAGA
65 TTCTAATATCATTTTCCCTA-TTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGA
* *
3770 TGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGCCCGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTT
129 TGCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTT
* * * *
3835 CAAGGAGTCTCGGTGACAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACACCAGAACACGCTTTTAGCCAA
194 CAAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAA
* *
3900 AAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTTAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAATTA-TTTTC
259 AAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTC
*
3964 TTTGATTT
324 TTTAATTT
* * * * *
3972 TTGGCAAAAATACTCATAGAGATTATATAATTCAGTACCTAAAACATTGGACGGCTATTCACGGT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
*
4037 TCTAATATCATTTTCCCTATATTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
66 TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
* * *
4102 CTCGTAAAAACATATCCCTTAGTCCAACGTGGCTCGGGATTTAATTAGATAAATATAGATATTTC
131 CTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCT-GAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
* *
4167 AAGGAGTCTC-ATCGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGATCCC-GTAACGCGTTTTTAGCCA
195 AAGGAGTCTCGGT-GCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAG-AACGCGTTTTTAGCCA
* *
4230 AAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAAAATGTCCCGAAATATTTT
258 AAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGC-AAAAATTGACCCGAAATATTTT
*
4295 TCTTTGATTT
322 TCTTTAATTT
* * * *
4305 TTGGCAAATATACTCGTAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGAACGGCTTTTCACGGT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
4370 TCTAATATCATTTTCCC-ATTTTTTTCAGAATTAA-TTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
66 TCTAATATCATTTTCCCTA-TTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
* * *
4433 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAGTCCAACGTGGCTGGGATTTAATTAGATAAATATAGATATTTC
130 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
* * * * ** *
4498 AAGGAGTCTTGGTGCCAAAAATCATGTAAAATTAAGTCGGACCCCAGAATGCACTTTTAGCTAAA
195 AAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
** * *
4563 AACCGTGATGGTTA-TACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACATGAATTGTTTTTCT
260 AACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTCT
4627 TTAATTT
325 TTAATTT
** * * * * * *
4634 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATAAAGTAGCAAAAAGGTTGGAGCGTTTTTCACGAT
1 TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACG-G
* * *
4699 TTTTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAATTTCAGAT
65 TTCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGAT
4764 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
130 GCTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTC
* * * *
4829 AAGGAGTCTAGGTGCCAAAAATTATGCAAAATTGAGTCGGATCCCGGAACGCGTTTTTAGCCAAA
195 AAGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAA
4894 AACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGA
260 AACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGA
Statistics
Matches: 4145, Mismatches: 395, Indels: 151
0.88 0.08 0.03
Matches are distributed among these distances:
323 4 0.00
324 93 0.02
325 169 0.04
326 2 0.00
327 1 0.00
328 1 0.00
329 133 0.03
330 575 0.14
331 1577 0.38
332 815 0.20
333 501 0.12
334 269 0.06
335 5 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.16, G:0.15, T:0.34
Consensus pattern (331 bp):
TTGGCAAAAATACTCATAAAAATTATATAATTCAGTACCTAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGGT
TCTAATATCATTTTCCCTATTTTTTCAGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACCAGTTTCAGATG
CTCGTAAAAACATATCCCTTAATCCAACGTGGCTGAGATTTGATTAGATAAATATAGATATTTCA
AGGAGTCTCGGTGCCAAAAATCATGCAAAATTGAGTCGGACCCCAGAACGCGTTTTTAGCCAAAA
ACCGTGATGGTTAGTACACGATTTCAGCTAAAATTTTGCAAAAATTGACCCGAAATATTTTTCTT
TAATTT
Done.