Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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** * * * * *
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* * * * * *
230 CTGCCACAATGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATTTAGTTTTGATTTAATTAGAA
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* *
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* * * ** *
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251 GCGTTGAACTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAG-AAAAAATTTTCGGGTCAA
* * * * * * *
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315 TTTTTAGCCGAAATCGTGTA---CACTGTTTT-TGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCA
* * * *
487 GTTTTGCATGATTTTTGGCAG-GAAGCGTCCTTGAAATATCTGTATTCATCGAACCAAATCTCAG
376 GTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAAAC-TCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAG
**** * * * * * * **
551 CCACAAT-GGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAAT-TTAGTTTTGATTTAATTAGAAA
440 -TTGTATCGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTT-GTTTCGATTTAATTATATT
* * *
614 TAAATTCAGAAAAAAA-AGGAAAACGATATTGGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATCCGTTTTTTT-
503 TAAATTC-GAAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTGAAT---TTTTTTTG
** * * * * * * *
677 TAGTTGAATTAGATATTCTTTCTGAGTATTGTGGCAATAAATTTA-GAAAATA-TTTTCGTGTCA
564 GCGTTGAACTATATATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAA-ACTTTCCGTGTCA
740 ------CT----
628 GTTTTTCTAAAA
* * * * ** * * **
742 TTTTAGCTGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCCTAAAAA-TGCGTTTCGGGGACTTG
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGG-CAAAAAACT-CGCCTCGAGGCCCCG
* * * * * * *
806 -CTTCGTTTTGCATTATTTTTGGCAGAAAGCCTCCGTGAAATATCTGTAATCATCGAACCAAATC
64 ACTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATC
* * * *
870 TCAGCCACAATGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGTATCTGAA-TTTGTTTCGATTTAATTAGA
129 TCAGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTAGA
* * * * * *
934 AATAAATTCAGAAATAAAATGGAAAACGATATTGGAAGCATGAAAAACCCTTTAACTTCTTTTTT
194 AATAAATTC-G-GA-AAAA---AAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAA-TT-TTTTTG
* * * * * * * **
999 GCATTGAATTATATGTTTTTACCGAGTATTGTGGCCAAAAATTCAGAAAAAAAATTTTCATGTCA
251 GCGTTGAACTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATT-A-AGAAAAAATTTTCGGGTCA
*
1064 GTTTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCTAAAAAACGAGTTTCGAGGCCCC
314 ATTTTTAGCCGAAATCGTGTAC--A-C-T----GTTTTTGGCT-AAAAACGAGTTTCGAGGCCCC
* *
1129 GGCTCAATTTTGCATGATTTTTGGCAAAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAAT
370 GGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAAT
*
1194 CTCAGTTGTATCGAATTTAAGGATTTGATTTTAGGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAT
435 CTCAGTTGTATCGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAT
* * *
1259 ATTTAAATTCG-AAAAAATGGAAAAATGATATTAGAAGTGTGAAAAAACCC-TGCAATTTTTTTT
500 ATTTAAATTCGAAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTG-AAAAACCCTTG-AA-TTTTTTT
*
1322 TGGCGTTGAACTATATATATTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTC
562 TGGCGTTGAACTATATATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTC
1387 AGTTTTTCTAAAA
627 AGTTTTTCTAAAA
* * *
1400 TTTTAGCTGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAGCTCGCCTCGAGGCCCCGGC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGAC
** *
1465 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTTTTTAAAATATCTATATTCA--TAACCAAATCTC
66 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
* * *
1528 AGTCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGAAACTGAATTTTGTTTCGATTTAATTCAG-A
131 AGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATT-AGAA
* * * * * *
1592 TTAAATTTGG--GAAAAAATGATATTAGAAGCGTGAAAAA-TATTTAA-TTTTTTGGCGTTGAAC
195 ATAAATTCGGAAAAAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAATTTTTTTGGCGTTGAAC
* *
1653 TATATATTTTTCCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAATAATTTTCGGCTCAATTTTTAGCC
260 TATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAA-AATTTTCGGGTCAATTTTTAGCC
*
1718 GAAATCGTGAACACCATCACAGTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTGC
324 GAAATCGTGTACA-C-T----GTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTGC
* *
1783 ATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTGAGTTGTATTG
383 ATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTTGTATCG
*
1848 AATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGGTTTAATTATATTTAAATTCGAA
448 AATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAAATTCGAA
* *
1913 AAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGTGTGAAAAACCCTTGAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATTT
513 AAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTGAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATAT
* *
1978 ATATTTTCTAAGTATTCTGGCAAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTCTAAAA
578 ATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTCTAAAA
* * * *
2040 TTTTACCCGAAATCATGTACTAACCATCACAGATTTTGGCGAAAAGCTCGCCTCGAGGCCCCGAC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGAC
* *
2105 TTTGTTTTGCATGATTTTCGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTA
66 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
** * *
2170 AGCCACATTGGACTTAAGGATAGGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTCG-GA
131 AGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTAGAAA
* *
2234 TAAATTCGGGAAAAAAAACGATATTAAAAGCGTG-AAAACTCTTCAATTTCTTTTGGCGTTGAAC
196 TAAATTCGGAAAAAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAATTT-TTTTGGCGTTGAAC
*
2298 TATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAATCTTTCGGATCAATTTTTAGCC
260 TATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAAT-TTTCGGGTCAATTTTTAGCC
** * * *
2363 GAAATCGTGTACACTGTTTTTAACTAAATACGCGTTTCGAGGTCCCGGCTCAGTTTTGCATGATT
324 GAAATCGTGTACACTGTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATT
* *
2428 TTTGGCAGAAAAACTCCTTCAAATATCTATAATCATCTAACCAAATCTCAGTTGTATCGAATTTA
389 TTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTTGTATCGAATTTA
* *
2493 AGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTATTTCGATTTAATTATATTTAAATTCTTAAAAAAA
454 AGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAAATTC-GAAAAAAA
* * *
2558 TGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAATCC-TGCAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATATTTTT
518 TGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTG-AATTTTTTTTGGCGTTGAACTATATATTT
* *
2622 TTTCTAAGAATTGTGCCAAAAAAGTTGAGG-AAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTCTAAAA
582 TTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAA-TTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTCTAAAA
* * ** * *
2680 TTTTAACCGAAATCGTGTATTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAGGTCGCCTAGAGGCCCCGGC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGAC
* *
2745 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGAATCCTTGAAATATCCATATTCATCTAACCAAATCTC
66 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
* * * * *
2810 AGCCACATTGGACTTAAGGATTTGCTTTTATGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTCGGAT
131 AGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTAGAAA
*
2875 TAAATTC-GAAAAAAAAACGATATTAGAAGCGTG-AAAACTCTACAATTTTTTTTGGCGTTGAAC
196 TAAATTCGGAAAAAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAA-TTTTTTTGGCGTTGAAC
* *
2938 TATATA-TTTTTCTGAGTATTGTGGCACAAAATTGAGAAAAAATTGTTCGGGTCAATTTTTAGCC
260 TATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAATT-TTCGGGTCAATTTTTAGCC
* * * * *
3002 GAAATCGTGAACTAACCATCACAGTTTTT-GCGAAAAACGCGTTTCGAGGCCTCGACTCAGTTTT
324 GAAATCGTG---T----A-CACTGTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTTT
* * * * *
3066 GCATGATTTTTGGCAGTAAGACTTCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCT-A--AGCAT
381 GCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTTGTAT
* * * * * * **
3128 TGGATTTAAAGATTTGATTTTACAAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATAAATTCG
446 CGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAAATTCG
* * * * * * * *
3193 ATAAAAATGGG--AACGATATTAGAAGCGTAAAAAACCCTTCAATATTTTTTGTCTTTGAATTGT
511 AAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTGAATTTTTTTTGGCGTTGAACTAT
* ** * *
3256 ATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATAAAGGAAAAACTTTCCGAGTCAGTTTTTGTAAAA
576 ATATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTCTAAAA
* * * * * * * * ** ***
3320 TTTTAGCTGAAATTGTATACTAACCATCTCAGTTTTTTGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCTTTAC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGAC
** * * * * *
3385 TCAGTTTTGCATAATTTCT-GCAGTAAGACTTCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTT
66 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
* * * * * *
3449 AGCCACATTGGATTTAAGGATTTATTTTTCCGAGCATTTCAATGTTGTTTCGATTTAATTAGAAA
131 AGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTAGAAA
* * *
3514 TAAATTCGGAAAAAAAAAACAATATTAGAAGCGTGAAAAACTATTCAATGTTTTTTGGCATTGAA
196 TAAATTCGG-AAAAAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAAT-TTTTTTGGCGTTGAA
* *
3579 CTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAAATTTTCGGGTTAATTTTTAGT
259 CTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAG-AAAAAATTTTCGGGTCAATTTTTAGC
* * *
3644 CGAAATCGTGTACGTTACATCACGGTTTTTGGTTAAAAAACGAGTTTCGAGACCCCGGATCAGTT
323 CGAAATCGTGTAC---AC-T----GTTTTTGGCT-AAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTT
* * ****
3709 TTGCATGATTTTTGGCGGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACC-AATCTCAGCCAC
379 TTGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTTGT
* * * * * ***
3773 AT-TAGATTTGAGGATTTGATTTTACAAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATAAGAAAGAAAT
444 ATCGA-ATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAAAT
* * ** * * *
3837 TCGGGGAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTAAAAAACCCTACATTTTTTTATTGTCTTTG
508 TC--GAAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTGAATTTTTT-TTGGCGTTG
* * * * * * * *
3902 AATTATATATTTTTTCTCAGTATTGTTGTAAGAAATTGA-GATAAAACTTTTCGGGTTAGTTTTT
570 AACTATATATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGA-AAAACTTTCCGTGTCAGTTTTT
3966 GC-AAAA
634 -CTAAAA
* * * * *
3972 TTTTAGCCGAAATCGTGTACACTATCCATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGT-G-TTCCG-GGACC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGT--ACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAAC-TCGCCT-CGAGG-CC
** * * * * *
4034 CCGACTCAGTTTGGCATGATTTTTGGTAGAAAGATTCCTTTG-AATATCTATATTCATGTAATCA
61 CCGACTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCC-TTGAAATATCTATATTCATCTAACCA
* * * *
4098 AATCTCAACCATATTGGA-TCTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTAAATTTTGATTCGATTTAA
125 AATCTCAGCCACATTGGACT-TAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAA
* * * * **
4162 TTAGAAATGAATTCGGAAAAATAGGAAAAACAATATTAGAAGCCTGAAAAACCCTTCAAAATTTT
189 TTAGAAATAAATTCGG--AAA-A--AAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAATTTTTT
* *
4227 TGGCGTTGAACTATATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAATTATGAAAAAAGTTTTCGGGTC
249 TGGCGTTGAACTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAA-TTTTCGGGTC
* * *
4292 AATTTTTAGCCGAAATCGTGTACGATCACGGTTTTTGGCTAAAAAACAAGTTTCGAGGCCCCAGC
313 AATTTTTAGCCGAAATCGTGT---A-CACTGTTTTTGGCT-AAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGC
* *
4357 TCAGTTTTGAATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAATCAAATCTC
373 TCAGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
* * * *
4422 AGTTCTATCGAATTTAAGGATTTAATTTTAGGAGCATTTGAATCTTGTTTCAATTTAATTATATT
438 AGTTGTATCGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATT
* * * * *
4487 TCAATTC-AAAAAAATGGAAAAACGATATTGGAAGCGTGAAAAATCC-TGCAATTTTTTTTTGCG
503 TAAATTCGAAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTG-AATTTTTTTTGGCG
* * *
4550 TTAAACTATATATATTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAAAATTGAGGAAAAACTTTTCGTGTCAGT
567 TTGAACTATATATTTTTTCTAAGTATTGTGGC--AAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGT
4615 TTTTCTAAAA
630 TTTTCTAAAA
*
4625 TTTTAGCCGAAATCGTGTACT--CCATCACAGATTTTGGCAAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGG
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGC-AAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGA
4688 CTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCT
65 CTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCT
* * *
4753 CAGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTATGTTTCGATTTAATTCGGA
130 CAGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTAGAA
* * * *
4818 TTAAATTTGGGATTAAAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAA-TCTTCAATTTTTTTTTTGCGTT
195 ATAAA-TTCGGA-AAAAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAA--TTTTTTTGGCGTT
* * * *
4882 GAACTATATATTTTTTCTTACTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAATTTTTCCGGTCAATTTTTA
256 GAACTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAATTTTCGGGTCAATTTTTA
* * *
4947 ACCGAAATTGTGTACTAACCATATCACGGTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCACGGCTCA
321 GCCGAAATCGTGTAC--A-C---T----GTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCA
* * * *
5012 GTTTTGCATGATTTTTGGCAGCAAGACACCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTAAGT
376 GTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGT
* * * * * * * * **
5077 CGCATTGGATTTAAAGATTTGATTTTACAAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATAA
441 TGTATCGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAA
* * * * *
5142 ATTCGGAAAAAAATGGG--AACGATATTAGAAGCGTAAAAAACCCTTCAATATTTTTTGTCTTTG
506 ATTC-GAAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTGAATTTTTTTTGGCGTTG
* * * * * * *
5205 AATTGTATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATAGAGGAAAAACTTTGCGAGTCAGTTTTTG
570 AACTATATATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTC
5270 TAAAA
635 TAAAA
* * * * * * * ** *
5275 TTTTAGACGAAATTGTGTACTAATCATCGCAGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCTGAC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGAC
** * * ** * *
5340 TCAGTTTTTCATAATTTTTGGCACTAAGACTTCTCGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
66 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
* * * *
5405 AGCCACATTGGATTTAAAGATTTGTTTTTACGAGCATTTGAATATTGTTTCGATTTAATTAGAAA
131 AGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTAGAAA
* * * *
5470 TAAATTCGGAAAAAAAAAGGAAAAACAATATTAGAAGCTTGAAAAACTATTCAATGTTTTTTGGT
196 TAAATTCGG-----AAAA--AAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAAT-TTTTTTGGC
* *
5535 ATTGAACTATATATTTTTCCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAAATTTTCGGGTCAATT
253 GTTGAACTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAG-AAAAAATTTTCGGGTCAATT
* * * * *
5600 TTTAGCCGAAATCGTGTACTA-AGTTTTTTGACTAAATACGTGTTTCGAGGCCCCGGTTCAGTTT
317 TTTAGCCGAAATCGTGTAC-ACTG-TTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTT
*
5664 TGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTTATCTAACCAAATCTCAGTTGTA
380 TGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTTGTA
* *
5729 TCGAATTTAATGATTTGATTTTATGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAAATTC
445 TCGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAAATTC
*
5794 G-AAAAAATGGAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCC-TGCAATTTTTTTTGGCGTTGAACT
510 GAAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTG-AATTTTTTTTGGCGTTGAACT
* * * *
5857 ATATTTTTTTTCTAAGTATTCTGCCAAAAAAGTTGAGG-AAAACTTTCCGTGTCAATTTTTCTAA
574 ATATATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAA-TTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTCTAA
5921 AA
638 AA
* * ** *
5923 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCGTTACAGATTTTGGCAAAAAGGTCGCCTCGAGGCCCCGGC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGAC
* *
5988 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAGTATCTATATTCATCTAACCCAATCTC
66 TTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTC
* *
6053 AGCCACATTGGACTAAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTTTTTCGATTTAATTCAG-A
131 AGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTTTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATT-AGAA
* *
6117 TTAAATTC-G-AAAAAAAATGATATTAGAAGCGTG-AAAACTCTTCAATTTTTTTTGGCGTTGAA
195 ATAAATTCGGAAAAAAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAA-TTTTTTTGGCGTTGAA
6179 CTATATA-TTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAGAAAAAAATTTTCGGGTCAATTTTTAGC
259 CTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAATTAAG-AAAAAATTTTCGGGTCAATTTTTAGC
* * *
6243 CGAAATCGTGTACTAATCATCATGGTTTTTGGTTAAAAACGTG-TTC-TGG----GG--C-----
323 CGAAATCGTG---T-A-CA-C-T-GTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTT
* * * * * * * ** * ****
6295 -G--TGACTTTT-GCCGTAAAGATTCCTTGAAATATTTATAATAAT-TGAGTCAAATCCCAACCA
380 TGCATGATTTTTGGCAG-AAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT-AACCAAATCTCAGTTG
* * * * * * * *
6355 CATTC-AATTTAAGGATTTGTTTTTACTAACATCTAAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATT-A
443 TA-TCGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTA-TATTTAA
* ** * * * *
6418 TTTCGAAAAAAATGAAAAAACGATATTAGAGGCGCGAAAAACCCATT-AATCTTTTTT-GCATTG
506 ATTCGAAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCC-TTGAATTTTTTTTGGCGTTG
* * * * * * *
6481 AATTTTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGAAAAAACTTTTCGGGTCAG-TTTT-
570 AACTATATATTTTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAAACTTTCCGTGTCAGTTTTTC
6544 T---A
635 TAAAA
* * * * * * ** * *
6546 ---T--CCGAAATCGTGTACAAATAA-TATCGCTGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGGGGTCCC
1 TTTTAGCCGAAATCGTGTAC---TAACCATCACAGATTTTGGCAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCC
* ** * * * * **
6605 GCCTCAGTTTTGCTTGATATTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTGATTAAAT
63 GACTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAAT
* * * * * *
6670 CTCAGCCGCATTGGATTTAA-AATTTTGATTTTACGAGTATCTGAATCTTT-TTTCGATATAATT
128 CTCAGCCACATTGGACTTAAGGA-TTTGTTTTTACGAGCATCTGAAT-TTTGTTTCGATTTAATT
* * * * * *
6733 GGAAATAAATTCAGAAAAAAAATGGAAAATGATATTAAAAGCGTAAAAAACCCTTCAA-TTTTTT
191 AGAAATAAATTC-G--GAAAAA---AAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACTCTTCAATTTTTTT
* * * * * * * *
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* * * **
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313 A------AT----TTTTAGCCGAAATCGTGTAC--A-C-T----GTTTTTGGCTAAAAACGAGTT
* * * *
6927 TCGAGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGACAGAAAGACTCCGTTG-AATATCTATATTTA
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*
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AATCGTGTACACTGTTTTTGGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTT
TGGCAGAAAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTTGTATCGAATTTAAG
GATTTGATTTTACGAGCATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTATATTTAAATTCGAAAAAAATGG
GAAAACGATATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTGAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATATATTTTTTC
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* * * * * *
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* * * *** * * * * *
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* * * * * **
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* * * * **
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**
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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127 CTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAAC-TCCTTGAA
* * * * * * **
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191 ATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGAT-TTTTTTTACGAATATC
* * * **
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255 TGAATCTT-GTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACGATATTAAAAGC
**
650 GTG
319 GCA
*** * * *
653 AAAAACCC-TTCAATCCGTTTTTTTTAGTTGAATTAG-ATATTCTTTCTGAGTATTGTGGCAATA
1 AAAAACCCATT-AAT-C-TTTTTGGCA-TTGAATT-GTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAA
* * * * * * * *
716 AATTTAGAAAATA-TTTTC-GTGTCACTTTTTAGCTGAAATCGTGTAC-TAACCATCACGGTTTT
61 AATTGAGAAAAAACTTTCCAG-GTCAGTTTTTATCCGAAATCGTATACATAA-CATCACAGTTTT
* * * ** * * * * ** *
778 TGGCCTAAAAATGCGTTTCGGGGACTTGCTTC-GTTTTGCATTATTTTTGGCAGAAAGCCTCCGT
124 TGG-CTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTT
* * * * * * * *
842 GAAATATCTGTAATCATCGAACCAAATCTCAGCCACAATGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGT
188 GAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGAT-TTTTTTTACGAAT
* * * **
907 ATCTGAAT-TTGTTTCGATTTAATTAGAAATAAATTCAGAAATAAAATGGAAAACGATATTGGAA
252 ATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACGATATTAAAA
***
971 GCATG
317 GCGCA
* * * *
976 AAAAACCCTTTAACTTCTTTTTTGCATTGAA-T-TATATGTTTTTACCGAGTATTGTGGCCAAAA
1 AAAAACCCATTAA--TCTTTTTGGCATTGAATTGTATAT-TTTTTA-TGAGTATTGTGGCAAAAA
* * * * * * *
1039 ATTCAGAAAAAAAATTTTCATGTCAGTTTTTAGCCGAAATCGTGTAC-TAACCATCACGGTTTTT
62 ATTGAG-AAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTTATCCGAAATCGTATACATAA-CATCACAGTTTTT
* * * * * *
1103 GGCTAAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAATTTTGCATGATTTTTGGCAAAAAAACTCCTTG
125 GGCT-AAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTG
** * * * * **
1168 AAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTTGTA-TCGAATTTAAGGATTTGATTTTAGGAGC
189 AAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAG-ATTTAAGGATTT-TTTTTACGAAT
* * * * *
1232 ATTTGAATCTTGTTTCGATTTAATTA-TATTTAAATTC-G--AAAAAATGGAAAAATGATATTAG
252 ATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATT-AATTCAGAAAAAAAAT-GAAAAACGATATTAA
* *
1293 AAGTGTGA
315 AAGCG-CA
* * * * * * * *
1301 AAAAACCC-TGCAATTTTTTTTTGGCGTTGAACTATATATATTTTCTAAGTATTGTGGCAAAAAA
1 AAAAACCCAT-TAA--TCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAA
* * *
1365 TTGAGGAAAAACTTTCC-GTGTCAGTTTTTCTAAAATTTTAGCTGAAATCGTGTAC-TAACCATC
63 TTGAGAAAAAACTTTCCAG-GTCAG-TTTT-T---A---T--CCGAAATCGTATACATAA-CATC
* * ** * ** * *
1428 ACAGATTTTGGC-AAAAAGCTCGCCTCGAGGCCCCGGCTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAA
116 ACAGTTTTTGGCTAAAAA-CGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAA
* ** * * * * * *
1492 GACTTTTTAAAATATCTATATTCA--TAACCAAATCTCAGTCACATTGGACTTAAGGATTTGTTT
180 AACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTT
* * * **
1555 TTACGAGA-AACTGAATTTTGTTTCGATTTAATTCAG--ATTAAATT-TGGGAAAAAAT------
244 TTACGA-ATATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATT-AGAAATT-AATTCAGAAAAAAAATGAAAAA
* **
1610 -GATATTAGAAGCGTG
306 CGATATTAAAAGCGCA
* * * * **
1625 AAAAA--TATTTAAT-TTTTTGGCGTTGAACTATATATTTTTCCTGAGTATTGTGGCAAAAAATT
1 AAAAACCCA-TTAATCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAATT
* * * * *
1687 AAGAAAATAA-TTTTC-GGCTCAATTTTTAGCCGAAATCGTGA-AC--ACCATCACAGTTTTTGG
65 GAGAAAA-AACTTTCCAGG-TCAGTTTTTATCCGAAATCGT-ATACATAACATCACAGTTTTTGG
* * * *
1747 CTAAAAACGAGTTTCGAGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAA
127 CTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAA
* ** * * * ** *
1812 TATCTATATTCATCTAACCAAATCTGAGTTGTA-TTGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATT
192 TATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAG-ATTTAAGGATTT-TTTTTACGAATATC
* * * * *
1876 TGAATCTTGTTTCGGTTTAATTA-TATTTAAATTC-G-AAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAG
255 TGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATT-AATTCAGAAAAAAAAT-GAAAAACGATATTAAAAG
* **
1938 TGTG
318 CGCA
* * * * *
1942 AAAAACCC-TTGAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATTTATATTTTCTA--AGTATTCTGGCAAAAA
1 AAAAACCCATT-AA-TCTTTTTGGCATTGAA-T-TGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAA
* * *
2004 ATTGAGGAAAAACTTTCC-GTGTCAGTTTTTCTAAAATTTTACCCGAAATCATGTAC-TAACCAT
62 ATTGAGAAAAAACTTTCCAG-GTCAG-TTTT-T---A---T--CCGAAATCGTATACATAA-CAT
* * * * ** * ** *
2067 CACAGATTTTGGCGAAAAGCTCGCCTCGAGGCCCCGACTTTGTTTTGCATGAT-TTTCGGCAGAA
115 CACAGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTT-GACAGAA
* * * * * * **
2131 AGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTAAGCCACATTGGACTTAAGGATAGGTT
179 AAACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGAT-TTTT
** * * * * **
2196 TTTACGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTCG-GATAAATTC-G---GGAAA--AAAAACG
243 TTTACGAATATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACG
*
2254 ATATTAAAAGCG-T
308 ATATTAAAAGCGCA
* * * * * * *
2267 GAAAACTC-TTCAATTTCTTTTGGCGTTGAACTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAAT
1 AAAAACCCATT-AATCT-TTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAAT
* * * * **
2331 TAAGAAAAAATCTTT-C-GGATCAATTTTTAGCCGAAATCGTGTAC---AC-T----GTTTTTAA
64 TGAGAAAAAA-CTTTCCAGG-TCAGTTTTTATCCGAAATCGTATACATAACATCACAGTTTTTGG
* * * * * *
2386 CTAAATACGCGTTTCGAGGTCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTCAAA
127 CTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAA
* ** * * * ** *
2451 TATCTATAATCATCTAACCAAATCTCAGTTGTA-TCGAATTTAAGGATTTGATTTTACGAGCATT
192 TATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAG-ATTTAAGGATTT-TTTTTACGAATATC
* * * ** *
2515 TGAATCTTATTTCGATTTAATTA-TATTTAAATTC-TTAAAAAAATGGAAAAACGATATTAGAAG
255 TGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATT-AATTCAGAAAAAAAAT-GAAAAACGATATTAAAAG
**
2578 CGTG
318 CGCA
* * * * * * * * * * *
2582 AAAAATCC-TGCAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATATTTTTTTTCTAAGAATTGTGCCAAAAAAG
1 AAAAACCCAT-TAA-TCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAA-
* * *
2646 TTGAG-GAAAACTTTCC-GTGTCAGTTTTTCTAAAATTTTAACCGAAATCGTGTA-TTAACCATC
63 TTGAGAAAAAACTTTCCAG-GTCAG-TTTT-T---A---T--CCGAAATCGTATACATAA-CATC
* * ** * * ** * *
2708 ACAGATTTTGGC-AAAAAGGTCGCCTAGAGGCCCCGGCTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAA
116 ACAGTTTTTGGCTAAAAACG-CGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAA
* * * * * *
2772 GAA-TCCTTGAAATATCCATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGACTTAAGGATTTGCT
180 -AACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TT
* ** * * *
2836 TTTATGAGCATCTGAATTTTGTTTCGATTTAATTCG-GATTAAATTC-G----AAAA--AAAAAC
243 TTTACGAATATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATT-AATTCAGAAAAAAAATGAAAAAC
* *
2893 GATATTAGAAGCG-T
307 GATATTAAAAGCGCA
* * * * * * * * *
2907 GAAAACTC-TACAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATATA-TTTTTCTGAGTATTGTGGCACAAAAT
1 AAAAACCCAT-TAA-TCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAAT
* * * *
2970 TGAGAAAAAA-TTGTTCGGGTCAATTTTTAGCCGAAATCGTGA-AC-TAACCATCACAGTTTTT-
64 TGAGAAAAAACTT-TCCAGGTCAGTTTTTATCCGAAATCGT-ATACATAA-CATCACAGTTTTTG
* * * * * * * *
3031 GCGAAAAACGCGTTTCGAGGCCTCGACTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCAGTAAGACTTCTTGAA
126 GCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAA
* * * * * *
3096 ATATCTATATTCATCTAACCAAATCT-A--AGCATTGGATTTAAAGATTTGATTTTAC-AAGCAT
191 ATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTTTTACGAA-TAT
* * ** *
3157 CTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATAAATTC-G-ATAAAAATG-GGAACGATATTAGAAGC
254 CTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACGATATTAAAAGC
*
3219 GTA
319 GCA
* * * *
3222 AAAAACCC-TTCAATATTTTTTGTCTTTGAATTGTATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAAT
1 AAAAACCCATT-AAT-CTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAAT
** * * * *
3286 AAAGGAAAAACTTTCC-GAGTCAGTTTTTGTAAAATTTTAGCTGAAATTGTATAC-TAACCATCT
64 TGAGAAAAAACTTTCCAG-GTCAG-TTTT-T---A---T--CCGAAATCGTATACATAA-CATCA
* **** * * *
3349 CAGTTTTTTGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCTTTACTCAGTTTTGCATAAT-TTCTG-CAGTAAG
117 CAGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATT-TGACAGAAAA
* * * * *
3412 ACTTCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATTTATTTT
181 ACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTTT
* ** * * * * * *
3477 TCCGAGCATTTCAATGTTGTTTCGATTTAATTAGAAATAAATTC-G--GAAAAA--AAAAACAAT
245 TACGAATATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACGAT
* **
3537 ATTAGAAGCGTG
310 ATTAAAAGCGCA
* * * * *
3549 AAAAA-CTATTCAATGTTTTTTGGCATTGAACTATATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAAT
1 AAAAACCCATT-AAT-CTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAAT
* * * * * * * * * * *
3613 TAAGAAAAAAATTTTCGGGTTAATTTTTAGT-CGAAATCGTGTACGTTACATCACGGTTTTTGGT
64 TGAGAAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTTA-TCCGAAATCGTATACATAACATCACAGTTTTTGGC
* * ** * * * *
3677 TAAAAAACGAGTTTCGAGACCCCGGATCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGGAAAGACTCCTTGAAA
128 T-AAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAA
* * * * * *
3742 TATCTATATTCATCTAACC-AATCTCAGCCACATTAGATTTGAGGATTTGATTTTAC-AAGCATT
192 TATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTTTTACGAA-TATC
* ** * ** * *
3805 TGAATCTTGTTTCGATTTAATAAGAAAGAAATTCGGGGAAAAAATGGGAAAACGATATTAGAAGC
255 TGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAAT-GAAAAACGATATTAAAAGC
*
3870 GTA
319 GCA
* * * * * * * * *
3873 AAAAACCC--TACATTTTTTTATTGTCTTTGAATTATATATTTTTTCTCAGTATTGTTGTAAGAA
1 AAAAACCCATTA-A--TCTTT-TTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAA
* * * * * *
3936 ATTGAGATAAAACTTTTCGGGTTAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACACTATCCAT
62 ATTGAGAAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTT-----A---T--CCGAAATCGTATACA-TA-ACAT
* * * * * * **
4001 CACGGTTTTTGGCTAAAAACGTGTTCCG-GGACCCCGACTCAGTTTGGCATGATTTTTGGTAGAA
115 CACAGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGAGG-CCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAA
* * * * * ** * * *
4065 AGATTCCTTTG-AATATCTATATTCATGTAATCAAATCTCAACCATATTGGATCTAAGGATTTGT
179 AAACTCC-TTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-T
** * * * * * * *
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* * *
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** * * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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129 -AAAAACGCGTTTCGAGGCCCC-GCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAA
* * * * * * **
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192 TATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAG-CCGCACTAG-ATTTAAGGATTT-TTTTTACGAATAT
* * * * **
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254 CTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATT-AATTCAGAAAAAAAAT-GAAAAACGATATTAAAA
**
4520 GCGTG
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* * * * * * * * * * *
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1 AAAAACCCAT-TAA-TCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGC--AAAAA
* * * *
4589 ATTGAGGAAAAACTTTTC-GTGTCAGTTTTTCTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC-T-CCATC
62 ATTGAGAAAAAACTTTCCAG-GTCAG-TTTT-T---A---T--CCGAAATCGTATACATAACATC
* * * ** * ** * *
4651 ACAGATTTTGGCAAAAAAACTCGCCTCGAGGCCCCGGCTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAA
116 ACAGTTTTTGGC-TAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAA
* * * * *
4716 GACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGACTTAAGGATTTGTTT
180 AACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTT
** * * * ** **
4781 TTACGAGCATCTGAAT-TATGTTTCGATTTAATTCG-GATTAAATT-TG-GGATTAA--AAAAAC
244 TTACGAATATCTGAATCT-TGTTTCGATTTAATTAGAAATT-AATTCAGAAAAAAAATGAAAAAC
* **
4840 GATATTAGAAGCGTG
307 GATATTAAAAGCGCA
* * * * * * * * *
4855 AAAAA-TC-TTCAATTTTTTTTTTGCGTTGAACTATATATTTTTTCTTACTATTGTGGCAAAAAA
1 AAAAACCCATT-AA--TCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAA
* ** * * * * *
4918 TTAAGAAAAATTTTTCC-GGTCAATTTTTAACCGAAATTGTGTAC-TAACCATATCACGGTTTTT
63 TTGAGAAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTTATCCGAAATCGTATACATAA-C--ATCACAGTTTTT
* * * * * * * *
4981 GGCTAAAAACGAGTTTCGAGGCCACGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCAGCAAGACACCTTGA
125 GGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGA
* * * * * * *
5046 AATATCTATATTCATCTAACCAAATCTAAGTCGCATTGGATTTAAAGATTTGATTTTAC-AAGCA
190 AATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTTTTACGAA-TA
* * ** *
5110 TCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATAAATTC-GGAAAAAAATG-GGAACGATATTAGAAG
253 TCTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACGATATTAAAAG
*
5173 CGTA
318 CGCA
* * * *
5177 AAAAACCC-TTCAATATTTTTTGTCTTTGAATTGTATATTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAAT
1 AAAAACCCATT-AAT-CTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAAT
* * * * * * *
5241 AGAGGAAAAACTTTGC-GAGTCAGTTTTTGTAAAATTTTAGACGAAATTGTGTAC-TAATCATCG
64 TGAGAAAAAACTTTCCAG-GTCAG-TTTT-T---A---T--CCGAAATCGTATACATAA-CATCA
* * * * * * ** *
5304 CAGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCTGACTCAGTTTTTCATAATTTTTGGCACTAAGA
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* * * * * *
5369 CTTCTCGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCACATTGGATTTAAAGATTTGTTTTT
182 CTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTTTT
** * * * * * *
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* ***
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* * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * ** * *
5633 AAATACGTGTTTCGAGGCCCCGGTTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATA
129 AAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAATA
* ** * * * * * ** *
5698 TCTATATTTATCTAACCAAATCTCAGTTGTA-TCGAATTTAATGATTTGATTTTATGAGCATTTG
194 TCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAG-ATTTAAGGATTT-TTTTTACGAATATCTG
* * *
5762 AATCTTGTTTCGATTTAATTA-TATTTAAATTC-G--AAAAAATGGAAAAACGATATTAGAAGCG
257 AATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATT-AATTCAGAAAAAAAAT-GAAAAACGATATTAAAAGCG
**
5823 TG
320 CA
* * * * * * * * * *
5825 AAAAACCC-TGCAATTTTTTTTGGCGTTGAACTATATTTTTTTTCTAAGTATTCTGCCAAAAAAG
1 AAAAACCCAT-TAA-TCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAA-
* * * * *
5889 TTGAG-GAAAACTTTCC-GTGTCAATTTTTCTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC-TAACCGTT
63 TTGAGAAAAAACTTTCCAG-GTC-AGTTTT-T---A---T--CCGAAATCGTATACATAA-CATC
* * ** * ** * *
5951 ACAGATTTTGGC-AAAAAGGTCGCCTCGAGGCCCCGGCTTTGTTTTGCATGATTTTTGGCAGAAA
116 ACAGTTTTTGGCTAAAAACG-CGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAA
* * * * * * * *
6015 GACTCCTTGAAGTATCTATATTCATCTAACCCAATCTCAGCCACATTGGACTAAAGGATTTGTTT
180 AACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTT
** * *
6080 TTACGAGCATCTGAATTTTTTTTCGATTTAATTCAG--ATTAAATTC-GAAAAAAAAT-------
244 TTACGAATATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATT-AGAAATT-AATTCAGAAAAAAAATGAAAAAC
* *
6135 GATATTAGAAGCG-T
307 GATATTAAAAGCGCA
* * * * * * *
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1 AAAAACCCATT-AA-TCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAAT
* * * * * * * ** *
6212 TAAGAAAAAAATTTTCGGGTCAATTTTTAGCCGAAATCGTGTAC-TAATCATCATGGTTTTTGGT
64 TGAGAAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTTATCCGAAATCGTATACATAA-CATCACAGTTTTTGGC
* * * * * *
6276 TAAAAACGTG-TTCTG-GG----GCGTGACTTTTGC-CG-TA----A-AG----ATTCCTTGAAA
128 TAAAAACGCGTTTC-GAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAA
* * * ** * * * * * *
6324 TATTTATAATAAT-TGAGTCAAATCCCAACCACATTCA-ATTTAAGGATTTGTTTTTACTAACAT
192 TATCTATATTCATCT-AACCAAATCTCAGCCGCACT-AGATTTAAGGATTT-TTTTTACGAATAT
* * * *
6387 CTAAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTATTTC-G-AAAAAAATGAAAAAACGATATTAGAGG
254 CTGAATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATG-AAAAACGATATTAAAAG
*
6450 CGCG
318 CGCA
* *
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1 AAAAACCCATTAATCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAATTG
* * * * * *
6519 AGAAAAAACTTTTCGGGTCAGTTTTTATCCGAAATCGTGTACAAATAATATCGCTGTTTTTGGCT
66 AGAAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTTATCCGAAATCGTATAC--ATAACATCACAGTTTTTGGCT
* * * *
6584 AAAAACGCGTTTCGGGGTCCCGCCTCAGTTTTGCTTGATATTTGGCAGAAAAACTCCTTGAAATA
129 AAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAATA
* ** * * * *
6649 TCTATATTCATCTGATTAAATCTCAGCCGCATTGGATTTAA-AATTTTGATTTTACGAGTATCTG
194 TCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTTT--TTTTACGAATATCTG
* * * * * * *
6713 AATCTTTTTTCGATATAATTGGAAATAAATTCAGAAAAAAAATGGAAAATGATATTAAAAGCGTA
257 AATCTTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACGATATTAAAAGCGCA
* * *
6778 AAAAACCC-TTCAAT-TTTTTGGTCTTTGAATTGTATGTTTTTTCTGAGTATTGTGGCAAAAAAT
1 AAAAACCCATT-AATCTTTTTGG-CATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAAT
* *
6841 TGAGGAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTTATAAAATTTTATCCTAAATCGTATAC-TAACCATCAC
64 TGAGAAAAAACTTTCCAGGTCAG------T----TTTTATCCGAAATCGTATACATAA-CATCAC
* * * * *
6905 AGTTTTTGGCTAAAAACTCGTTTCGAGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGACAGAAAGAC
118 AGTTTTTGGCTAAAAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAAC
* *
6970 TCCGTTG-AATATCTATATTTATCTAACCGAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTTATTTTT
183 TCC-TTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTT-TTTTT
* * *
7034 ACGATTATCTGAATATTGTTTC-ATTTTAATTAGAAATTAATTCATAAAAAAAATGAAAAA
246 ACGAATATCTGAATCTTGTTTCGA-TTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAA
7094 AAAATATTAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.33, C:0.15, G:0.17, T:0.36
Consensus pattern (321 bp):
AAAAACCCATTAATCTTTTTGGCATTGAATTGTATATTTTTTATGAGTATTGTGGCAAAAAATTG
AGAAAAAACTTTCCAGGTCAGTTTTTATCCGAAATCGTATACATAACATCACAGTTTTTGGCTAA
AAACGCGTTTCGAGGCCCCGCCTCAGTTTTGCATGATATTTGACAGAAAAACTCCTTGAAATATC
TATATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCACTAGATTTAAGGATTTTTTTTACGAATATCTGAATC
TTGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTCAGAAAAAAAATGAAAAACGATATTAAAAGCGCA
Found at i:9412 original size:138 final size:138
Alignment explanation
Indices: 9164--9633 Score: 742
Period size: 138 Copynumber: 3.4 Consensus size: 138
9154 TATTCCAAAG
* * * * **
9164 CTCATCATCTTCTTCATTGGCGCTAGATTGATTTTGAACCCCATCAAAGTCATCATTAAAACCGG
1 CTCATCATCATGTTCATTGGTGCTAGATTGATTTTGAACCCCATCAAAGTCACCATTAAAACCAC
*** * *
9229 AAAAATTTGAGGAGTTATCACAAGAAGGCACATACTCCTCGTGCATGTATGGTAGTAGTGTTGAA
66 AAAAAACAGAGGAATTATCACAAGAAGGCACATGCTCCTCGTGCATGTATGGTAGTAGTGTTGAA
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131 GAGTGTAA
* *
9302 CTCATCATCCTGTTCATTGGTGCTAGATTGATTTTGAACCCTATCAAAGTCACCATTAAAACCAC
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* * *
9367 AAAAAACAGAGGAATTATCACAAGAAGGCACATGCTCCTCGTGCATTTGTGGTATTAGTGTTGAA
66 AAAAAACAGAGGAATTATCACAAGAAGGCACATGCTCCTCGTGCATGTATGGTAGTAGTGTTGAA
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131 GAGTGTAA
* * *
9440 CTCATCATCATGTTTATTGGAGCTAGATTGATTTTGAACCCCATCAAAGTCACCATTAAAACCAT
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*
9505 AAAAAACAGAGGAATTATCACAAGAAGGCACATGCTCCTCGTGCATGTCTGGTAGTAGTGTTGAA
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131 GAGTGTAA
* *
9578 CTCATCATCATGTTCATTGGTGCTAGATTGATTTTGAATCCCATCAAAGTTACCAT
1 CTCATCATCATGTTCATTGGTGCTAGATTGATTTTGAACCCCATCAAAGTCACCAT
9634 CGAAATCATA
Statistics
Matches: 305, Mismatches: 27, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
138 305 1.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.19, G:0.19, T:0.30
Consensus pattern (138 bp):
CTCATCATCATGTTCATTGGTGCTAGATTGATTTTGAACCCCATCAAAGTCACCATTAAAACCAC
AAAAAACAGAGGAATTATCACAAGAAGGCACATGCTCCTCGTGCATGTATGGTAGTAGTGTTGAA
GAGTGTAA
Found at i:11508 original size:25 final size:25
Alignment explanation
Indices: 11479--11529 Score: 75
Period size: 25 Copynumber: 2.0 Consensus size: 25
11469 CCTTTGACAA
* *
11479 AAACAAAATAAAATGGGTGTTTTTC
1 AAACAAAATAAAACGGGTGCTTTTC
*
11504 AAACAAAATAAAGCGGGTGCTTTTC
1 AAACAAAATAAAACGGGTGCTTTTC
11529 A
1 A
11530 TCATCTCAAA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
25 23 1.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.12, G:0.18, T:0.27
Consensus pattern (25 bp):
AAACAAAATAAAACGGGTGCTTTTC
Done.