Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01018359.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig18392, whole genome shotgun sequence
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1 GCTA
*
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*
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62 ATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATAT
* * * *
134 TTTTTCTGAATTAATTTTTAATTAATTCAAAACACGATTCAAATGCTCGTAAAAAAAAATCCTTA
127 TTTTTCTGAATTAA-TTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTA
* ** * *
199 AATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAG-TCGATTATTCATATTTCAAGGCGTCTTGACGCAAAAA
191 AATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGAT-GAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAA
* ** * * * * *
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255 ATCATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACA
* *
328 CGATTTTAGAT
320 CGATTTTGGCT
* *
339 AAAATTTTG-TAAAAATGACCGCAAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAATAT
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAATAT
* * *
403 ATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACACATTTAATATCATTTTTCATATTTTT
66 ATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATA--TTT
* * *
468 TTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTTAAATGCTCGTAAAAACAAATCGTTGAAT
129 TTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAAT
533 GCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATCA
194 GCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATCA
* *
598 TGCAAAATTGATTCAGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACC----------GT----GA-
259 TGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGAT
648 --TGGCT
324 TTTGGCT
* * *
653 AAAATTTTGCAAAAAATGAACGCG-GAAATTTTTACCTCAA-TTTTGGATAAAATGCTCATAAAA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTT-CCTCAATTTTTGGATAAAATACTCAT--AA
* * * * *
716 TAAATATAATTTAACGCCAAAAAGTTTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTATTATCATTTTTAATATT
63 TATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
* *
781 TTTTCTGAATTAATTTTTAATTAAATCGAAACAAGATTGAAATGCTCGTAAAAACATATCCTTAA
128 TTTTCTGAATTAA-TTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAA
*
846 ATGCAATGTGGCTAAGTTCTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAAT
192 ATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAAT
* * *
911 CATGGAAAATTGATTCGGGACCTCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACG
257 CATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACG
976 ATTTTGGCT
322 ATTTTGGCT
* * *
985 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGGAAATTTTTTCCTCAA-TTTTGGATAAAATGCTCATAAAAT
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCAT--AAT
* * * *
1049 ATATATAATTTAACGCCAAAAAGTTTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTATTATCATTTTTAATA-TT
64 ATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATTT
* * *
1113 TTTCTGAATTAATTTTTATTTAAATCGAAACAAGATTGAAATGCTCGTAAAAACATATCCTTAAA
129 TTTCTGAATTAA-TTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAA
1178 TGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATC
193 TGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATC
* *
1243 ATGCAAAACTGATTCGGGACCTCGAAACGCGTTTTTAACCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGA
258 ATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGA
1308 TTTTGGCT
323 TTTTGGCT
*
1316 AAAATTTTGCAAAAAAATGACCGCGAAAATTTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAAA
1 AAAATTTTGC-AAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCAT--AA
* * * * * *
1381 TATATATAATTTAACACCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATTGTTTTTTTATAA
63 TATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCG-TTTTTCATAT
* *
1446 TTTTTCTGAATT-ATTTCTAATTATTAAATCGAAACAAGATTCAGATCCTCGTAAAAACAAATCC
127 TTTTTCTGAATTAATTT-T-A--ATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCC
* *
1510 TTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATATCAAGTAGTCTTGACGCCAA
188 TTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAA
* * * * * * * *
1575 AAATCATGCAAAACTGAGCTAGGG-TCCTGGAACGCGTTTTTAGCCAATAACAGTGATGGTTAAT
253 AAATCATGCAAAACTGA-TTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGT
*
1639 ACGCGATTTTGGCT
317 ACACGATTTTGGCT
1653 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCCGAAATTTTGCAAAGAATAACCGCGAAAAATTTTTCCTCAAT
1 AAAATTTTGC----AA--A------AAA---T-----G----ACCGCGAAAAATTTTTCCTCAAT
* * * ** *
1718 TTTTGGATAAAATACTCATTTGATTTATATTATTTAACGCCAAAATTATTGGAGGACTTTTCACG
42 TTTTGGATAAAATACTCA--TAATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACG
* * * *
1783 CTTTTAATATAGTTTTTTAGATTTTTTCTGAATTTATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAA
105 CTTTTAATATCGTTTTTCATATTTTTTCTGAATTAATTT-TAATTAAATCGAAACAAGATTCAAA
1848 TGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTT
169 TGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTT
* * * *
1913 CAAGGAGTCTTGATGCAAAAAATCATGCAAAATTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAACCA
234 CAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATCATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCA
* *
1978 AAAACCGTGATGGTTAGTACACAATTTTGACT
299 AAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTTGGCT
* * * * *
2010 AAAATTTTGCAAAAAATGATCGCGAAAAATTTTTCCTTAATTTCTGGATAAAATACTAAAAAATA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACT--CATA-A
* *
2075 TATATATAATTTAACACCAAAAAGATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
63 TATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
* * *
2140 TTTCCTGAATT-ATTTCTAATTATTAAATCGAAACAAGATTCAAATCCTCGTAAAAACAATTCCT
128 TTTTCTGAATTAATTT-T-A--ATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCT
* * * * *
2204 TAAATGCAATTTGGCTAAGTTTTTAATAGATGAATATAGATATATCAAGTAGTCTTGACGTCAAA
189 TAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAA
* * ** * * *
2269 AATCATGCAAAACTGA-GCAGGAGCCTTGGAACGCGTTTTTAGCCAATAACAGTGATGGTTAGTA
254 AATCATGCAAAACTGATTCGGGA-CCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTA
*
2333 CACTATTTTGGCT
318 CACGATTTTGGCT
* *
2346 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCTG--AAGTTTCTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATTATA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGC-GAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCA-TA-A
* * *
2409 TATATACAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAAGGCTTTTCACGCTTTTATTATCGTTTTTCATA-T
63 TATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
*
2473 TTTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACCAATCCTTAAA
128 TTTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAA
* * * *
2538 TGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATCTAGATATTTCAAGGCGTTTTGACGCCAAAAATG
193 TGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATC
** * * * * *
2603 ATGCAAAACTGAGCCGGGGCCCCGAAATGTGTTTTTAGCCAAAAACTGTGATGGTTAGTACACCA
258 ATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGA
*
2668 TTTTAGCT
323 TTTTGGCT
*
2676 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTAAATTTTTGGATAAAATACTCATATGAT
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATA--AT
* * * * * *
2741 TTATATAATTTAACGCCAAAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATAGTTTTTTAGA-TT
64 ATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATTT
*
2805 TTTCTGAATTAATTTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATACTCGTAAAAACAAATCCTTAAA
129 TTTCTGAATTAA-TTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAA
* *
2870 TGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGATGTCAAAAATC
193 TGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATC
* * *
2935 ATGCAAAATTGATTCGGGACACCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACATGA
258 ATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGA
3000 TTTTGGCT
323 TTTTGGCT
* * *
3008 AAAATTTTG-TAAAAATGACCGCGAAAAA-TTTTCCTTAATTTTTGGATAAAATACTCAAAAATA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTC--ATA-A
* * **
3071 TATATATAATTTAACCCCAAAAAGATTGGAGGACTTTTCACATTTTTAATATCGTTTTTCATATT
63 TATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
* *
3136 TTTTCTGAATT-ATTACTAATTATTAAATCGAAACAAGATTCAAATCCTCGTAAAAACAAATCCT
128 TTTTCTGAATTAATT--T--TAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCT
* * * *
3200 TAGATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAAAATAGATATATCAAGTAGTCTTGACGCCAAA
189 TAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAA
** * * * * **
3265 AATCATGCAAAACTGAGCCGGGGCCCTGGAACGCGTTTTTAGCCAATAACAATGATGGTTAGTAC
254 AATCATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTAC
3330 ACGATTTTGGCT
319 ACGATTTTGGCT
*
3342 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCTG-AAATTTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAAA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGC-GAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCAT--AA
* * * *
3406 TATATATAATTTAACGCCAAAAATATTGGAAGGCTTTTTACGCTTTTATTATCGTTTTTCATATT
63 TATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
*
3471 TTTTCAGAATTAATTTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAA
128 TTTTCTGAATTAA-TTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAA
*
3536 ATGCAATGTGGCTAAGTTTTTGTTAGATGAATATAGATATTTCAA-GACGTCTTGAC
192 ATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGA-GTCTTGAC
3592 ACCATGAATG
Statistics
Matches: 2891, Mismatches: 269, Indels: 187
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
314 53 0.02
315 173 0.06
316 59 0.02
317 2 0.00
321 2 0.00
325 2 0.00
329 64 0.02
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340 3 0.00
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345 3 0.00
348 3 0.00
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353 2 0.00
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360 95 0.03
362 1 0.00
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AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAATAT
ATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATTTTT
TCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATGC
AATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATCATG
CAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTT
TGGCT
Found at i:1686 original size:24 final size:23
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1644 ATTTTGGCTA
*
1654 AAATTTTGCAAAAAATGACCGCCG
1 AAATTTTGCAAAAAATAACCG-CG
*
1678 AAATTTTGCAAAGAATAACCGCG
1 AAATTTTGCAAAAAATAACCGCG
1701 AAA
1 AAA
1704 AATTTTTCCT
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 1
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
23 5 0.21
24 19 0.79
ACGTcount: A:0.46, C:0.18, G:0.16, T:0.20
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AAATTTTGCAAAAAATAACCGCG
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Indices: 5--3591 Score: 4721
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1 GCTA
*
5 AAAATTTTGCAAAAAATGACGGCGAAAACATTTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAA-A-TTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAA
* * *
70 ATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTATTATCGTTTTTCATAT
64 ATATATATAATTTAACGCCAAAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATAT
* * * *
135 TTTTCTGAATTAATTTTTAATTAATTCAAAACACGATTCAAATGCTCGTAAAAAAAAATCCTTAA
129 TTTTCTGAATTAATTTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAA
* ** * *
200 ATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAG-TCGATTATTCATATTTCAAGGCGTCTTGACGCAAAAAA
194 ATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGAT-GAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAA
* ** * * * * *
264 TGATGCAAAACTGAGCCGGGGCCCCGAAATGCGTTTTTAGCCATAAACCGTGTTAGTTAGTACAC
258 TCATGCAAAACTGATTC-GGGACCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACAC
* * *
329 GATTTTAGATAAAATTTTG-TAAAAATGACCGCAAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATA
322 GATTTTGGCTAAAATTTTGATAAAAATGACCGCGAAAAA-TTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATA
* * * *
393 CTCATA-ATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGGCTTTTCACACATTTAATATCATTT
386 CTCATATATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTT
*
457 TTCATATTTTTTTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTTAAATGCTCGTAAAAACA
451 TTCATA--TTTTTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACA
* *
522 AATCGTTGAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGAC
514 AATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGAC
* *
587 GCCAAAAATCATGCAAAATTGATTCAGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACC--G-T-G-
579 GCCAAAAATCATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGT
647 -A-T----G-----GCT
644 TAGTACACGATTTTGCT
* * *
653 AAAATTTTGCAAAAAATGAACGCG-GAAATTTTTACCTCAA-TTTTGGATAAAATGCTCATAAAA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTT-CCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAAA
* * * * *
716 TAAATATAATTTAACGCCAAAAAGT-TTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTATTATCATTTTTAATAT
65 TATATATAATTTAACGCCAAAAA-TATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATA-
* *
780 TTTTTCTGAATTAATTTTTAATTAAATCGAAACAAGATTGAAATGCTCGTAAAAACATATCCTTA
128 TTTTTCTGAATTAATTTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTA
*
845 AATGCAATGTGGCTAAGTTCTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAA
193 AATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAA
* *
910 TCATGGAAAATTGATTCGGGACCTCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACAC
258 TCATGCAAAACTGATTCGGGACC-CGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACAC
**
975 GATTTTGGCTAAAATTTTGCA-AAAAATGACCGCGGAAATTTTTTCCTCAA-TTTTGGATAAAAT
322 GATTTTGGCTAAAATTTTG-ATAAAAATGACCGC-GAAAAATTTTCCTCAATTTTTGGATAAAAT
* * * * * *
1038 GCTCATAAAATATATATAATTTAACGCCAAAAAGTTTGGAGGGCTTTTCACGCTTTTATTATCAT
385 ACTCAT-ATATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGT
* * *
1103 TTTTAATA-TTTTTCTGAATTAATTTTTATTTAAATCGAAACAAGATTGAAATGCTCGTAAAAAC
449 TTTTCATATTTTTTCTGAATTAA-TTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAAC
*
1167 ATATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGA
513 AAATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGA
* *
1232 CGCCAAAAATCATGCAAAACTGATTCGGGACCTCGAAACGCGTTTTTAACCAAAAACCGTGATGG
578 CGCCAAAAATCATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG
1297 TTAGTACACGATTTTGGCT
643 TTAGTACACGATTTT-GCT
*
1316 AAAATTTTGCAAAAAAATGACCGCGAAAATTTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAAA
1 AAAATTTTGC-AAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAAA
* * * *
1381 TATATATAATTTAACACCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATTGTTTTTTTATAA
65 TATATATAATTTAACGCCAAAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCG-TTTTTCAT-A
* * *
1446 TTTTTCTGAATT-ATTTCTAATTATTAAATCGAAACAAGATTCAGATCCTCGTAAAAACAAATCC
128 TTTTTCTGAATTAATTT-T--TAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCC
* *
1510 TTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATATCAAGTAGTCTTGACGCCAA
190 TTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAA
* * * * * * * *
1575 AAATCATGCAAAACTGAGCTAGGGTCCTGGAACGCGTTTTTAGCCAATAACAGTGATGGTTAATA
255 AAATCATGCAAAACTGA-TTCGGGACCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTA
* *
1640 CGCGATTTTGGCTAAAATTTTGCAAAAAATGACCGCCGAAATTTTGCAAAGAATAACCGCGAAAA
319 CACGATTTTGGCTAAAA-TTT--------T-------G--A---T--AAA-AATGACCGCGAAAA
* * * **
1705 ATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATTTGATTTATATTATTTAACGCCAAAATTATTGG
360 A-TTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAT-ATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGG
* * * *
1770 AGGACTTTTCACGCTTTTAATATAGTTTTTTAGATTTTTTCTGAATTTATTTCTAATTAAATCGA
423 AGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATTTTTTCTGAATTAATTT-TAATTAAATCGA
1835 AACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATG
487 AACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATG
* * *
1900 AATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGATGCAAAAAATCATGCAAAATTGATTCGGGACCCCGAAAC
552 AATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAAATCATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAAC
* *
1965 GCGTTTTTAACCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACAATTTTGACT
617 GCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTTTG-CT
* * * * *
2010 AAAATTTTGCAAAAAATGATCGCGAAAAATTTTTCCTTAATTTCTGGATAAAATACTAAAAAATA
1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAA-A
* *
2075 TATATATAATTTAACACCAAAAAGATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
65 TATATATAATTTAACGCCAAAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT
* * *
2140 TTTCCTGAATT-ATTTCTAATTATTAAATCGAAACAAGATTCAAATCCTCGTAAAAACAATTCCT
130 TTT-CTGAATTAATTT-T--TAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACAAATCCT
* * * * *
2204 TAAATGCAATTTGGCTAAGTTTTTAATAGATGAATATAGATATATCAAGTAGTCTTGACGTCAAA
191 TAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAA
* * * * * *
2269 AATCATGCAAAACTGA-GCAGGAGCCTTGGAACGCGTTTTTAGCCAATAACAGTGATGGTTAGTA
256 AATCATGCAAAACTGATTCGGGA-CC-CGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTA
* *
2333 CACTATTTTGGCTAAAATTTTGCA-AAAAATGACCGCTG--AAGTTTCTCCTCAATTTTTGGATA
319 CACGATTTTGGCTAAAATTTTG-ATAAAAATGACCGC-GAAAAATTT-TCCTCAATTTTTGGATA
* *
2395 AAATACTCATTATATATATACAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAAGG-CTTTTCACGCTTTTATT
381 AAATACTCA-TATATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGG-AGGACTTTTCACGCTTTTAAT
2459 ATCGTTTTTCATA-TTTTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAA
444 ATCGTTTTTCATATTTTTTCTGAATTAATTTTAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAA
* * * *
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* ** * * * *
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*
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* **
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* * * *
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*
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* *
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* *
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*
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* * **
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* *
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453 CATATTTTTTCTGAATTAATT--T--TAATTAAATCGAAACAAGATTCAAATGCTCGTAAAAACA
* * * *
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514 AATCCTTAAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGAC
** * * * * **
3259 GCCAAAAATCATGCAAAACTGAGCCGGGGCCCTGGAACGCGTTTTTAGCCAATAACAATGATGGT
579 GCCAAAAATCATGCAAAACTGATTCGGGACCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGT
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*
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1 AAAATTTTGCAAAAAATGACCGC-GAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGATAAAATACTCATAAAA
* *
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65 TATATATAATTTAACGCCAAAAATATTGG-AGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATA-
*
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*
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ATATATATATAATTTAACGCCAAAAAGATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCAT
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AAATGCAATGTGGCTAAGTTTTTATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTTGACGCCAAAA
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15457 AAGTTTTTTT
*
15467 GAAGCGTAAAAAGCCCTTCAA-TATTTTAGGCATTGAATTATATA-TTTTTGTGAGTATTGTGCC
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* *
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*
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* * * * * *
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* *
15725 GTTTTTACGAGCATCTGAATCATGTTCCGATTTACTTAAAAATAATTTGGAAAAATTTTGAAAAA
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15790 CGATATTA
318 CGATATTA
*
15798 GAAGCGTAAAAAGCCCTTACAATTTTTTTTGGCTATTGAATTATATATTTTTTGTGTAGTATTGT
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* ** *
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* * * * * *
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127 TCATGATTTTTGGCTAAAAAAGCGCTA-TGGGACC-CGGCTAAGTTTTGCATGATTTTTAGTGCC
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* * * *
16055 TTTTGCGAGCATCTGAATCATGTTTAGATTTTAGTTAAAAATTAAATTGGAAAAAATTTTGAAAG
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317 ACGATATTA
* * *
16129 GAAGCGTGAAAA-CCCTTCAATTATTTTGGCATTGAATTATATAATTTTTTATGAGTATTGCGGC
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* * *
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CCTTGAAATATCTTTATTCATCTAACCAAATCTCAGCCGCAATGGATTTAAGGATTTGTTTTTAC
GAGCATCTGAATCATGTTCAGATTTACTTAAAAATAAATTGGAAAAATTTTGAAAAACGATATTA
Done.