Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01019199.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig19232, whole genome shotgun sequence
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4385 ATTTAATTAT
* * * * * *
4395 AAATTAATTTAGAAAAAAAAGAAAAATGAAATTAGAAGCGTGAAAAGCTCTACAATATTTTTGGC
1 AAATTAATGTAGAAAAAAAAGAAAAACGAAATTAGAAGCGTGAAAAACCCTACAATACTTTTGAC
* *
4460 TTTGAATAATATATTTCTAATGATTATCGTGGACAAAAATAAG
66 TTTGAATAATATATTTCTAATGAGTATCATGGACAAAAATAAG
** * *
4503 AAATTAATGTAGAAAAAAGGGAAAAACGAAATTAGAAGCGTGAAAAACCCTTCAATACTTTTGAT
1 AAATTAATGTAGAAAAAAAAGAAAAACGAAATTAGAAGCGTGAAAAACCCTACAATACTTTTGAC
* * * * *
4568 TTTGAATTATATTTTTTTTATGAGTATTAT-GACAAAAA
66 TTTGAATAATATATTTCTAATGAGTATCATGGACAAAAA
4606 ATTGAGGGAA
Statistics
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107 8 0.09
108 78 0.91
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AAATTAATGTAGAAAAAAAAGAAAAACGAAATTAGAAGCGTGAAAAACCCTACAATACTTTTGAC
TTTGAATAATATATTTCTAATGAGTATCATGGACAAAAATAAG
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4960 TCCAGATCAG
* * ** * *
4970 TTTGGCTAAAAACGCGTTCTGGGGCCCCAACTCAGTTTTGCAAGATTTTTGGTGCCAAGACTAAT
1 TTTGGCTAAAAACGCGTTC-CGGACCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGTGCCAAGACTCAT
* * * * * *
5035 TGAAATATCTATATTCATCTAACCATATCT-AATCGTCATTGGATTTAAGGATTTCTTTTTATGA
65 TGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGT-GACATTGTATTTAAGGATTTGTTTTTACGA
* * * * * *
5099 GCATCTGAATCATGTTTCAATTTTATCAGAAATTAATTCAGATAAAATTGGAAAAAAACGATATT
129 GCATCTGAATCATATTTCGATTTTATTAAAAATTAATTCAGA-AAAATAGG-GAAAAACGATATT
** * * * * *
5164 AGAAGCGTGAAAAGGTCTTTATTCTTTTCGGCGTTAAATTATATATTTTTTACGACTATTGTGGC
192 AGAAGCGTGAAAAGCCCTTCAATCTTTTTGGCATTAAATTATATATTTTTTACGAGTATTGTGGC
* * * *
5229 CAAAAATTGAGGAAACAAATTTTGGGGTCTA-TTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTATA-TT
257 CAAAAATTGAGGAAA-AATTTTTCGGGT-AAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTT
* *
5292 ATTCATTACAGTT
320 A-CCATCACAGTT
* * * ** *
5305 TTTGGCTAAAAACGTGTTCCGGGGCCTCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGACGCCAAGACTCCT
1 TTTGGCTAAAAACGCGTTCC-GGACCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGTGCCAAGACTCAT
* * * **
5370 GGAAAAATCTATATTTCATCTAACCAAATCTCAGAT-ACATTGAATTTAAAAATTTGTTTTTACG
65 TGAAATATCTATA-TTCATCTAACCAAATCTCAG-TGACATTGTATTTAAGGATTTGTTTTTACG
* * *
5434 AGCATCAT-AATCTTATTTCGATTTTATTAAAAATTAATTCAGAAAAAATA-GGAAATACGATTT
128 AGCATC-TGAATCATATTTCGATTTTATTAAAAATTAATTCAG-AAAAATAGGGAAAAACGATAT
* * * * *
5497 TAGAAGCGTGAAAAGCCTTTCAATCTTTTTGACATTGAATTATATAATTTTTACGAGTATTGTGT
191 TAGAAGCGTGAAAAGCCCTTCAATCTTTTTGGCATTAAATTATATATTTTTTACGAGTATTGTGG
*
5562 CCAAAAATTGAGGAAAATTTTTTCGGGTAAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTTA
256 CCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGGTAAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTT-
*
5627 ACCATCACAGAT
320 ACCATCACAGTT
*
5639 TTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGACCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGTGTCAAGACTCATT
1 TTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGACCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGTGCCAAGACTCATT
* * * *
5704 GAAATTTCTATATTCATCTAACTAAATCTTAGTGACATTGTATTTAAGGATTTATTTTTACGAGC
66 GAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTGACATTGTATTTAAGGATTTGTTTTTACGAGC
* * * *
5769 ATCTGAATCATATTTCGATTTAATAAAAAATTAATGT-AGAAAAA-AGGGAAAAATGAAATTAGA
131 ATCTGAATCATATTTCGATTTTATTAAAAATTAAT-TCAGAAAAATAGGGAAAAACGATATTAGA
* * * *
5832 AGCGTGAAAAGCCCTTAAATATTTTTGGC-TCTAAATTATATATATTTTTTATGAGTATTGTGAC
195 AGCGTGAAAAGCCCTTCAATCTTTTTGGCAT-TAAA-T-TATATATTTTTTACGAGTATTGTGGC
* * * * * *
5896 CAAAAATTGAGAAAAAAATATTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAAACTTTAGCCAAAATTGTGTACTG
257 CAAAAATTGAG-GAAAAATTTTTCGGGTAAGTTTTTGC-AAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACT-
5961 T-CCATCACAGTTTTT
319 TACCATCACAG---TT
* * * * * *
5976 TTTGGCTAAAAACGCGTTCTGAGACCCTGGCTCAATTTTGCATGAGTTTTGGTTCC-A-ACAC-T
1 TTTGGCTAAAAACGCGTTCCG-GACCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGTGCCAAGACTCAT
* * * * ** *
6038 TGAACTATCGATATGCAGCTAACCAAATCTCAGACACAATT-TATTTAATGATTTGTTTTTACGA
65 TGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTGAC-ATTGTATTTAAGGATTTGTTTTTACGA
* * *
6102 G-ACTCTAAAT-AT-TGTCTCTATTTTATTAGAAATTAATTCAGAAAAATA-GGAAAAACGATAT
129 GCA-TCTGAATCATAT-T-TCGATTTTATTAAAAATTAATTCAGAAAAATAGGGAAAAACGATAT
* * * * *
6163 TAGACGTGTGAAAAGCCCTTCAATCGTTTTGG-AGTTGAATTATATATTTTTTACAAGTATTGTG
191 TAGAAGCGTGAAAAGCCCTTCAATCTTTTTGGCA-TTAAATTATATATTTTTTACGAGTATTGTG
*
6227 GCCTAAAATTGAGGAAAACATTTT
255 GCCAAAAATTGAGGAAAA-ATTTT
6251 GAGTCAGTTT
Statistics
Matches: 789, Mismatches: 125, Indels: 66
0.81 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
330 2 0.00
331 48 0.06
332 83 0.11
333 159 0.20
334 144 0.18
335 211 0.27
336 87 0.11
337 25 0.03
338 30 0.04
ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.16, T:0.36
Consensus pattern (331 bp):
TTTGGCTAAAAACGCGTTCCGGACCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGTGCCAAGACTCATT
GAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGTGACATTGTATTTAAGGATTTGTTTTTACGAGC
ATCTGAATCATATTTCGATTTTATTAAAAATTAATTCAGAAAAATAGGGAAAAACGATATTAGAA
GCGTGAAAAGCCCTTCAATCTTTTTGGCATTAAATTATATATTTTTTACGAGTATTGTGGCCAAA
AATTGAGGAAAAATTTTTCGGGTAAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTTACCATC
ACAGTT
Found at i:7470 original size:333 final size:329
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Indices: 6258--12171 Score: 5392
Period size: 332 Copynumber: 17.9 Consensus size: 329
6248 TTTGAGTCAG
* * * * * **
6258 TTTGGCTAAAAACACG-TTCTGGGGCCCCGGCTCAGTTTCGCAAGATTTTTGGTGCCAAGACTAA
1 TTTGGCT-AAAA-ACGTTTC-GGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCC
* * * * * * * * *
6322 TTGAAATATTTATATTCATCTAGCCAAATCTAATCAACATTGGATTTAAGAATTTGTTTTTATGA
63 TTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
* * * * * *
6387 GCATCTAAATCATT-TTTCGATTTAATCAGAAAGTAATTTA-TATAAAATTGGAAAAACGATATT
128 GCATCTGAATC-TTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAA-TTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATATT
* * * ** * * ** * **
6450 AG-AAGCATGAAAAGGTCTTCATTC-TTTTTGACATTGAATTATATATTTTTTTACCACTATTGA
190 AGAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTG-CGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTATTTT
* * * * * *
6513 GGCCAAAAATTGAGGAAAATATTTTCGGGTCAATTTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTATATT
252 GGCCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACT
* * *
6578 ATCCGTCATGGTT
317 AACCATCACGGTT
* * * *
6591 TTTAGCTAAAAACGTGTTCAGGAGCCCCGTCTCAGTTTTGCATGATTTTTGACGCCAAGACTCCT
1 TTTGGCTAAAAACGT-TTC-GGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCT
* * *
6656 TGAAATATCTATATTTCATCTAACCAAATCTTAGCTACATTGGATTTAAGGATTTGTTTTTACGA
64 TGAAATATCTATA-TTCATCTAACCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
* * * **
6721 GCATATGAATCTTGTTTCGACGTT-ATTAAAAATTAATTCA-GAAAAAATAAGAAAAATGATATT
128 GCATCTGAATCTTGTTTC-A-TTTAATTAGAAATTAATT-AGGAAAAAATTGGAAAAATGATATT
* * ** * * *
6784 AG-AAGCGTGAAAAGCGTTTCAATCTTTTTGGCATTGAATTATATATTTTTTTACGAGTATTTTG
190 AGAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTATTTTG
* ** ** * * *
6848 TCCAAAAATTGAGGAAAATTTTTTTAGGTAAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTTTACTA
253 GCCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTA
6913 A-CAT-A-----
318 ACCATCACGGTT
* * * * * *
6918 ---GG-------C--TTCAG-GCACCGACTTAATTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCATTG
1 TTTGGCTAAAAACGTTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCTTG
* * * * *
6970 AAATACCTATATTCATCTAACTAAATCTCAG--ACACGCTGTATTTAAGGATGTGTTTTTACAAG
66 AAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCTACA-G-TGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAG
* * * * ** * *
7033 CATCTGAATCATATTTCAATTAATCAGAAATTAATTTTGATAAAAA-T--AAAAACGAAATTAG-
129 CATCTGAATCTTGTTTCATTTAATTAGAAATTAATTAGGA-AAAAATTGGAAAAATGATATTAGA
* * ** * ** * ** * *
7094 AAGCGTGAAAAGGTCTTCATTCTTTTTCACGTTGAACTATATATATTTTTACAACTATTGTGGCC
193 AAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATAT-TTTTTATGAGTATTTTGGCC
* * * * * **
7159 AAAAATTTG-GGAAAAAATTTTCGTGTCAATTTTTGCAAAATTTTAGCCAAAATCGTATACTATT
256 AAAAA-TTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAC
*
7223 TATCACGGTT
320 CATCACGGTT
* * * * * *
7233 TCTGGCTAAAAACGTGTTCGGGGCCCCGGATCAGTTTTGCAAGATTTTTGACGGCAAGACTCCTT
1 TTTGGCTAAAAACGT-TTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCTT
** * * ** * * * *
7298 GAAATATCTATAATTCATCTAATAAAATATTAGCTACTTTGGATTTAAAGATTTGTTTTTATGAA
65 GAAATATCTAT-ATTCATCTAACCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAG
* * * * *
7363 CATCAGAATCTTGTTTCTTCTTTATTAGAAATTAATTCA-GAAAAAATAGGAAAAACGATATTAG
129 CATCTGAATCTTGTTTCAT-TTAATTAGAAATTAATT-AGGAAAAAATTGGAAAAATGATATTAG
* * * * * * * *
7427 -AAGCGTGAAAAGCCTTTCAATCTTTTTGGCATTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTGTGTCT
192 AAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGCC
** * * * * *
7491 AAAAATTGAGGAAAATTTTTTCGGATCAGTTTTTACAGAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAATC
256 AAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACC
*
7556 ATCACAGTT
321 ATCACGGTT
* * * * *** *
7565 TTTAGCTAAAAACGCGTTCCGG-G-CCCGACTCAGTTTTGCATAATTTTTGATATCAAGACTCAT
1 TTTGGCTAAAAA--CGTTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCT
* * * ** * * *
7628 TGAAATTTCTATATTCATCTAACTAAATCTTAGAGACATTGTATTTAAGGATTTGTTTTTACGAG
64 TGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAG
* * * * * * *
7693 CATCTGAATCATATTTAGATTTAATTATAAATTAATTTAGAAAAAAAAAT--AAAAATGAAATTA
129 CATCTGAATCTTGTTT-CATTTAATTAGAAATTAA-TTAG-GAAAAAATTGGAAAAATGATATTA
* * * * * * * * * * * *
7756 G-AAGCGTGAAAAGCCCTACAATATTTTTGGCTTTGAATAATATATTTCTAATGATTATTATGGA
191 GAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGC
* * * *
7820 CAAAAATTGATG-AAAAATAATTCGGGTAAGTTTTTGCAAAAATTTTAGCCGAAATC----ACTA
255 CAAAAATTGAGGAAAAAAT-TTTCGGGTCAGTTTTTGC-AAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTA
7880 ACCATCACGGTT
318 ACCATCACGGTT
* * * * * * ** * *
7892 TTTGGCGAAAAACGCATTTCAGAGGCCCGACTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCACCAAAAATCCT
1 TTTGGCTAAAAACG--TTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCT
* * * *
7957 AGAAATATCTATATTCATCT-ACAAAAATCTCAGCCAAAGTGGATTTAAGGATATG-TTTTACGA
64 TGAAATATCTATATTCATCTAAC-CAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
* * * *
8020 GCATCTGAATCTAGTTTCTATATAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATACTAG
128 GCATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATATTAG
* * * * * **
8085 AAAGGTTAAAAGCCCTTAAATCCTTTTTGTGTTGAATTATATATTTTTAATCAGGGAAAAATTTT
192 AAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTT--T-A-TG-AGTA-TTT
* * *** * **
8150 TCGGGTC---AGTTTTTG-CAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTAAAATCGTGT
251 T--GGCCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGT
8211 ACTAACCATCACGGTT
314 ACTAACCATCACGGTT
* * * * * * * * *
8227 TTTAGTTAAAACCGCGTTTCCGG-TCCCCGACTTAGTTTTGCATAATTTCTGGCGTCAGGACTCC
1 TTTGGCTAAAA--ACGTTT-CGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCC
** * *
8291 TTGAAATATCCGTATTCATCTAACCAAATCTCAACATGA-A-TAGATTTAAGGATATGTTTTTAC
63 TTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGC-T-ACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTAC
* * *
8354 GAGCATCAGAATCTTGTTTCGATTTAATCAAAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATATT
126 GAGCATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATATT
* *
8419 AG-AAGCGTTAGAAGCCCTTGAATCTTTTTTACGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGG
190 AGAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGG
* ** *** * *
8483 TCAAAGGTTGAGGAAATGTTTTTCGAGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAA
254 CCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAA
8548 CCATCACGGTT
319 CCATCACGGTT
* * * * * *
8559 TTTGGCGAAAAACGCATTTCGGAGTCCTGGCTCAGTTTTGCTTGACTTATGGCGTCAAAGA-TCC
1 TTTGGCTAAAAACG--TTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTC-AAGACTCC
* * * * * *
8623 TTGAAATATCTATATTCATC-AACCCAAATCACAGCCAAAGTAGATTTAAGAATATGGTTTTACG
63 TTGAAATATCTATATTCATCTAA-CCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACG
* * * *
8687 AGCATCTGAATCTTGTTTTGATTTAAATAAAAATTAATTAGGAAAAAAATTGGAAAAATGATACT
127 AGCATCTGAATCTTG-TTTCATTTAATTAGAAATTAATTAGG-AAAAAATTGGAAAAATGATATT
* * *
8752 AGAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATTTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATTACTATTTTGGC
190 AGAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGC
* * * *
8817 CAAAAATTGAGAAAAAAAATTTTCCGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTTGTTGAAATCGTGTACGT-
255 CAAAAATTGAG-GAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTAC-TA
* *
8881 --TATCACTGTT
318 ACCATCACGGTT
* * * * ** *
8891 TTTAGCTAAAATCGCGTTTACGG-GCCCCAGCTCAGTTTTGCATAATTTTTGGCACCAGGACTCC
1 TTTGGCTAAAA--ACGTTT-CGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCC
* * * *
8955 TTGAAATATCCATATTCATCT-ACTCAAATCTCAGCAACAATGGATTTAAGGATATATTTTTACG
63 TTGAAATATCTATATTCATCTAAC-CAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACG
* *
9019 AGCATCAGAATCTTGTTTCAATTTAATCAGAAATTAATTAGGACAAAAAGTTGGAAAAATGATAT
127 AGCATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTAGGA-AAAAA-TTGGAAAAATGATAT
* * *
9084 TAGAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATC-TTCTAGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAATATTTTTG
189 TAGAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-TTTTG
* * *
9148 GCCAAGAATTGA-G-AAAAATTTTCTGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTA
253 GCCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTA
*
9211 ACCATCACAGTT
318 ACCATCACGGTT
* * * * * * * *
9223 TTTAGTTAAAACCGCGTTTCCGAGCCCCAGCTTAGTTTTGCATAATTTTTGGCGTCAGGACTCCT
1 TTTGGCTAAAA--ACGTTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCT
** * *
9288 TGAAATATCCGTATTCATCTAACCAAATCTTAGC-ATCAATGGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
64 TGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCTA-CAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
* * * * * *
9352 GCATCAGAATCTTGTTTGGATATAATCAAAAATTAATTAGGAAAAAAATTGGAAAAATGATATTT
128 GCATCTGAATCTTGTTT-CATTTAATTAGAAATTAATTAGG-AAAAAATTGGAAAAATGATATTA
* *
9417 G-AAGCGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTACGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGT
191 GAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGC
* ** * ** * * *
9481 CAAAAGTAAAAGAAAAGTTTTTCGAGTCAGTTTTAGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAA
255 CAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAC
*
9546 CATTACGGTT
320 CATCACGGTT
* * * * * * *
9556 TTAGGCAAAAAACGCATTTCGGAGCCCCGTCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCATCAAAGA-TCA
1 TTTGGCTAAAAACG--TTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTC-AAGACTCC
* * * *
9620 TTGAAATATCTATATTCATC-AACCCAAATCTTAGCCAAAGTGGATTTACGGATATGTTTTTACG
63 TTGAAATATCTATATTCATCTAA-CCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACG
* * *
9684 AGAATCTGAATCTTGTTTCGATTTAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATAATA
127 AGCATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATATTA
* * * * **
9749 GAAAGGTTAGAAGACCTTCATTCTTTTTTTGTGTTGAATTATATATTTTTTATGACTATTTTTCC
191 GAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATC-TTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGC
9814 CAAAAATTGA-GAAAAAAGTTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAA
255 CAAAAATTGAGGAAAAAA-TTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAA
*
9878 CCATTACGGTT
319 CCATCACGGTT
* * * * *
9889 TTTGGCTAAAAACGCATTTCGGAGTCTCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGGGTCAAAGA-TCC
1 TTTGGCTAAAAACG--TTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTC-AAGACTCC
* * * * *
9953 TTGGAATATCTATATTCATCAAACCAAATCTCAGCCAAAGTTGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
63 TTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
* * * * ** *
10018 GTATTTGAATCTTGTTTCAATTTAAATAAAAATTAATTAGGATAAAAATTTCAAAAATGATACTA
128 GCATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTAGGA-AAAAATTGGAAAAATGATATTA
* *
10083 GAAAGGTTAGAAGCCCTTCAAT-TTTTTTGTGTTGAATTATATATTTTTTATGAATATTTTTGGC
191 GAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-TTTTGGC
* * *
10147 CAAGAATTGA-G-AAAAATTTTTGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAAC
255 CAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAC
10210 CATCACGGTTT
320 CATCACGG-TT
* * * * * * * * * * *
10221 TTTAGTTAAAACCGCGTTTC-CAGGCCCCGGCTTAGATTTGCGTAATTTTTGGCGTTAGGACTCT
1 TTTGGCTAAAA--ACGTTTCGGA-GCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCC
** *
10285 TTGAAATATCCGTATTCATCTAACCAAATCTCAGC-ATCAATGGATTTAAGGATATGTTTTTACG
63 TTGAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCTA-CAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACG
* * * * *
10349 AGCATCAGAATCTTATTTCGATTTAATCAAAAATTAATTATGAAAAAAATTGGAAAAATGATATT
127 AGCATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTA-GGAAAAAATTGGAAAAATGATATT
* ** *
10414 A-AAAGCGTTAGAAGCCTTTCAATCTTTTTTAAGTTGAATTATTTATTTTTTATGAGTATTTTGG
190 AGAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGG
* * ** * * *
10478 TCAAAAGTTGAGGAAAAGTTTTTCGGGTTAGTTTCTGCAAAATTTTTGTCGAAATCGTGTAGCTG
254 CCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTA-CT-
10543 AA--A-CA-----
317 AACCATCACGGTT
* * *
10548 ----G-------CGTTTCCGGAGCCCCGGCTCAG-TTTGCATAATTTTTGGTGCCAAGACTCCTT
1 TTTGGCTAAAAACGTTT-CGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCTT
* * * * * * *
10601 GAAATATCCATATTCATCTACCCAGATCTTAGCAACAATGGATTTAAGGATATGTTTGTACGAGC
65 GAAATATCTATATTCATCTAACCAAATCTCAGCTACAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGC
* * *
10666 ATCAGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTAGGAAAAAAATGG-AAAATGATATTAG-A
130 ATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATATTAGAA
* * * *
10729 AGCGTTAGAAACCCTTCAATCTATTTTGCGTTGAATTATATATTTTCTATGAGTAGTTTT-GCCC
194 AG-GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-TTTTGGCCA
* * * * * * *
10793 GAAATTAAGG--GAATTTTTCGAGTCAGTTTTTACAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCA
257 AAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCA
*
10856 TCACGATT
322 TCACGGTT
* * ** * * * * * * *
10864 TTTGGCGAAAAACGCATTTCGAAGCCCCGAATCAGTTTTGCTTGACTTTTGGTGCCAATAATCTT
1 TTTGGCTAAAAACG--TTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTCAAGACTCCT
* *
10929 TGAAATATCTATATTCATCTACCCAAATCTCAG-TCAAAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGA
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* * * *
10993 GTATCTGAATCTTGTTTCGATTTAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAAATTGAAAAAATGATACTA
128 GCATCTGAATCTTGTTTC-ATTTAATTAGAAATTAATTAGG-AAAAAATTGGAAAAATGATATTA
* *
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191 GAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATA-TTTTTTATGAGTATTTTGGC
* * * *
11123 CAAAAATTGAGAAAAAAAATTTTCGAGTCAGTTTTTACAAAATTTTAATCGAAATCGTGTACTAA
255 CAAAAATTGAG-GAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAA
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
11328 AGCATCTGAATCTAGTTTTGATTTAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAAATGGAAAAATGATACTA
127 AGCATCTGAATCTTG-TTTCATTTAATTAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATATTA
* *
11393 GAAAGGTTAGAAGCCCTTTAATCTTTATTGCGTTTG-ATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGC
191 GAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCG-TTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGC
* * * **
11457 C-AAAATTTAGAAAAAAATTTTCGGATCAGGATTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAC
255 CAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAC
*
11521 CATTACGGTT
320 CATCACGGTT
* * *
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* * * * *
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* * * *
11660 GCATCTGAATCTTGTTTGC-TTTAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAAATTCGAAAAATGGTACTA
128 GCATCTGAATCTTGTTT-CATTTAATTAGAAATTAATTAGG-AAAAAATTGGAAAAATGATATTA
*
11724 GAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTGTTTTATGATTATTTTGGC
191 GAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATT-TTTTATGAGTATTTTGGC
*
11789 CAAAAATTGAGAAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAC
255 CAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAC
11854 CATCACGGTTT
320 CATCACGG-TT
* * ** * * *
11865 TTTGGCGAAAAACGCATTTCGAAGGGCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGCCGTCAAAGA-TCC
1 TTTGGCTAAAAACG--TTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCGTC-AAGACTCC
* * * * *
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* * * * *
11994 GAATCTGAATCTTGTTTGATTTAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAATTTGGAAAATTGATACTAG
128 GCATCTGAATCTTGTTTCATTTAATTAGAAATTAATTAGGAAAAAA-TTGGAAAAATGATATTAG
* * *
12059 AAAGGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCATTGAATTGTATATTGTTTTATGATTATTTTGGCC
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*
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GTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGCCAAAAA
TTGAGGAAAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCAC
GGTT
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* * * *
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** * * * ** *
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** * ** * *
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* * * * * *** * *
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* * ** * * *
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* ** * * * *** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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508 AAGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGC-CAAAATTGA-
* * * * ** * *
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*** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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255 GTCAGTTTTTGC-AAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCGAAAAACG
* * * ** * *
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*
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* * *
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* * * * ** * **
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512 CCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTT--T-A-TG-AGTA-TTTT--GGCCAAAATT
** * *
8162 TTGCAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTAAAATCGTGTACTAACCATCACGGTT
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * ** ** *
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*
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* * *
8577 TCGGAGTCCTGGCTCAGTTTTGCTTGACTTATGGCGTCAAAGATCCTTGAAATATCTATATTCAT
323 TCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCGTCAAAGATCCTTGAAATATCTATATTCAT
* * * * * *
8642 CAACCCAAATCACAGCCAAAGTAGATTTAAGAATATGGTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTTG
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*
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* * *
8772 AATTTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATTACTATTTTGGCCAAAAATTGAGAAAAAAAAT
517 AATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGCC-AAAATTGAG---AAAAAT
* * * *
8837 TTTCCGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTTGTTGAAATCGTGTACGT---TATCACTGTTTTTAGCTA
578 TTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTAC-TAACCATCACGGTTTTTAGCTA
* *
8899 AAATCGCGTTTACGGGCC
642 AAAACGCGTTTCCGGGCC
** * *
8917 CC-AGCTCAGTTTTGCATAATTTTTGGCACCAGGACTCCTTGAAATATCCATATTCATCT-ACTC
1 CCGA-CTCAGTTTTGCATAATTTTTGGCGTCAAGACTCATTGAAATATCCATATTCATCTAAC-C
* * *
8980 AAATCTCAGCAACAATGGATTTAAGGATATATTTTTACGAGCATCAGAATCTTGTTTCAATTTAA
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*
9045 TCAGAAATTAATTAGGACAAAAAGTTGGAAAAATGATATTAGAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATC
128 TCAGAAATTAATTAGGA-AAAAA-TTGGAAAAATGATAATAGAAAGCGTTAGAAGCCCTTCAATC
* * * * *
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191 TTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGACTA-TTTTGGCCAAAAATTGAGAAAAATTTTCGG
* * * ** *
9173 GTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCATCACAGTTTTTAGTTAAAACCGC
255 GTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCGAAAAACGC
* * * * * * * * **
9238 GTTTCCGAGCCCCAGCTTAGTTTTGCATAATTTTTGGCGTC-AGGACTCCTTGAAATATCCGTAT
320 ATTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCGTCAAAGA-TCCTTGAAATATCTATAT
* * *
9302 TCATCTAACCAAATCTTAG-CATCAA-TGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCAGAATCTT
384 TCATCAAACCAAATCTCAGCCA--AAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTT
* * * * *
9365 GTTTGGATAT-AATCAAAAATTAATTAGGAAAAAAATTGGAAAAATGATATTTG-AAGCGTTAGA
447 GTTTCGATTTAAAT-AGAAATTAATTAGG-AAAAAATTGGAAAAATGATACTAGAAAG-GTTAGA
* * **
9428 AGCCCTTCAATCTTTTTTACGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGTCAAAAGTAAAAG
509 AGCCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGCCAAAA-T-TGAG
* * * * * *
9493 AAAAGTTTTTCGAGTCAGTTTTAGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAAACATTACGG-TTT
572 AAAA-ATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTT
* *
9557 TAGGCAAAAAACGCATTT-CGGAGCC
636 TA-GCTAAAAACGCGTTTCCGG-GCC
* * * * * *
9582 CCGTCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCATCAAAGA-TCATTGAAATATCTATATTCATC-AACCC
1 CCGACTCAGTTTTGCATAATTTTTGGCGTC-AAGACTCATTGAAATATCCATATTCATCTAA-CC
* * *
9645 AAATCTTAGC-CAAAGTGGATTTACGGATATGTTTTTACGAGAATCTGAATCTTGTTTCGATTTA
64 AAATCTCAGCAC-AA-TGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTT-
* *
9709 AAT-AGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATAATAGAAAG-GTTAGAAGACCTTCATTC
126 AATCAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATAATAGAAAGCGTTAGAAGCCCTTCAATC
* **
9772 TTTTTTTGTGTTGAATTATATATTTTTTATGACTATTTTTCCCAAAAATTGAGAAAAAAGTTTTC
191 -TTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGACTATTTTGGCCAAAAATTGAG-AAAAA-TTTTC
* *
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* * * *
9902 GCATTTCGGAGTCTCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGGGTCAAAGATCCTTGGAATATCTATA
318 GCATTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCGTCAAAGATCCTTGAAATATCTATA
* * *
9967 TTCATCAAACCAAATCTCAGCCAAAGTTGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGTATTTGAATCTTG
383 TTCATCAAACCAAATCTCAGCCAAAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTG
* * **
10032 TTTCAATTTAAATAAAAATTAATTAGGATAAAAATTTCAAAAATGATACTAGAAAGGTTAGAAGC
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* *
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*
10161 AATTTTTGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTTAG
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* * *
10226 TTAAAACCGCGTTTCCAGGCC
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* * * * * * * *
10247 CCGGCTTAGATTTGCGTAATTTTTGGCGTTAGGACTCTTTGAAATATCCGTATTCATCTAACCAA
1 CCGACTCAGTTTTGCATAATTTTTGGCGTCAAGACTCATTGAAATATCCATATTCATCTAACCAA
* *
10312 ATCTCAGCATCAATGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCAGAATCTTATTTCGATTTAATC
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* * * *
10377 AAAAATTAATTATGAAAAAAATTGGAAAAATGATATTA-AAAGCGTTAGAAGCCTTTCAATCTTT
130 AGAAATTAATTA-GGAAAAAATTGGAAAAATGATAATAGAAAGCGTTAGAAGCCCTTCAATCTTT
** * * * * *
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194 TTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGACTATTTTGGCCAAAAATTGA-GAAAA-ATTTTCGGGT
* * * * * *
10506 TAGTTTCTGCAAAATTTTTGTCGAAATCGTG---------T-A--G---CT---GAAACA-GCGT
257 CAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCGAAAAACGCAT
* * * * * *
10552 TTCCGGAGCCCCGGCTCAG-TTTGCATAATTTTTGGTG-CCAAGACTCCTTGAAATATCCATATT
322 TT-CGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCGTCAAAGA-TCCTTGAAATATCTATATT
* * * * * * *
10615 CATCTACCCAGATCTTAG-CAACAATGGATTTAAGGATATGTTTGTACGAGCATCAGAATCTTGT
385 CATCAAACCAAATCTCAGCCAA-AGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGT
* * *
10679 TTCGATTT-AATCAGAAATTAATTAGGAAAAAAATGG-AAAATGATATTAG-AAGCGTTAGAAAC
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* * * * * **
10741 CCTTCAATCTATTTTGCGTTGAATTATATATTTTCTATGAGTAGTTTTGCCCGAAATTAAGGGAA
512 CCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTA-TTTTGGCCAAAATTGAGAAAA
* * * * * *
10806 TTTTTCGAGTCAGTTTTTACAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCATCACGATTTTTGGCG
576 ATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTAGCT
* *
10871 AAAAACGCATTT-CGAAGCC
641 AAAAACGCGTTTCCG-GGCC
* * * * * * * * * * *
10890 CCGAATCAGTTTTGCTTGACTTTTGGTGCCAATAATCTTTGAAATATCTATATTCATCTACCCAA
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*
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* * *
11019 T-AGAAATTAATTAGGAAAAAAATTGAAAAAATGATACTAGAAAG-GTTATAAGCCCTTCAATCT
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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512 CCTTCAATCTTTTTTGCG-TTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGCCAAAA-TT-GAGAA
* ** * * *
11471 AAATTTTCGGATCAGGATTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATTACGGTTTTTGG
574 AAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTAG
**
11536 CTAAAAACGTATTT-CGGAGCC
639 CTAAAAACGCGTTTCCGG-GCC
* * * * * * * ** *
11557 TCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCGTCAAAGA-TCCTTGGAATATTTATATTCATCAAACCA
1 CCGACTCAGTTTTGCATAATTTTTGGCGTC-AAGACTCATTGAAATATCCATATTCATCTAACCA
*
11621 AATCTCAGC-CAAAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTT-GCTTTAA
65 AATCTCAGCAC-AA-TGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTT-A
* * *
11684 AT-AGAAATTAATTAGGAAAAAAATTCGAAAAATGGTACTAGAAAG-GTTAGAAGCCCTTCAATC
127 ATCAGAAATTAATTAGG-AAAAAATTGGAAAAATGATAATAGAAAGCGTTAGAAGCCCTTCAATC
*
11747 TTTTTTGCGTTGAATTATATATTGTTTTATGATTATTTTGGCCAAAAATTGAGAAAAAAATTTTC
191 TTTTTTGCGTTGAATTATATATT-TTTTATGACTATTTTGGCCAAAAATTGAG--AAAAATTTTC
11812 GGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTTGGCGAAAAA
253 GGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGG-TTTTTGGCGAAAAA
* ** * * *
11877 CGCATTTCGAAGGGCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGCCGTCAAAGATCCTTGGAATATATAT
317 CGCATTTCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCGTCAAAGATCCTTGAAATATCTAT
* * *
11942 ATTCATCAAACGAAATCTCAGCTAAAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGAATCTGAATCTT
382 ATTCATCAAACCAAATCTCAGCCAAAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTT
*
12007 GTTT-GATTTAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAATTTGGAAAATTGATACTAGAAAGGTTAGAAG
447 GTTTCGATTTAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAA-TTGGAAAAATGATACTAGAAAGGTTAGAAG
* * *
12071 CCCTTCAATCTTTTTTGCATTGAATTGTATATTGTTTTATGATTATTTTGGCCAAAAATTGAGAA
511 CCCTTCAATCTTTTTTGCGTTGAATTATATATT-TTTTATGAGTATTTTGGCC-AAAATTGAG--
12136 AAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGT
572 AAAAATTTTCGGGTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGT
12171 C
Statistics
Matches: 3854, Mismatches: 576, Indels: 297
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
642 4 0.00
643 190 0.05
644 123 0.03
645 89 0.02
646 111 0.03
647 18 0.00
650 1 0.00
653 1 0.00
654 1 0.00
655 2 0.00
656 1 0.00
657 2 0.00
658 95 0.02
659 59 0.02
660 148 0.04
661 35 0.01
662 116 0.03
663 201 0.05
664 763 0.20
665 842 0.22
666 583 0.15
667 355 0.09
668 47 0.01
669 67 0.02
ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.17, T:0.36
Consensus pattern (659 bp):
CCGACTCAGTTTTGCATAATTTTTGGCGTCAAGACTCATTGAAATATCCATATTCATCTAACCAA
ATCTCAGCACAATGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATTTAATCA
GAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATAATAGAAAGCGTTAGAAGCCCTTCAATCTTTTT
TGCGTTGAATTATATATTTTTTATGACTATTTTGGCCAAAAATTGAGAAAAATTTTCGGGTCAGT
TTTTGCAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTGGCGAAAAACGCATTTCG
GAGCCCCGGCTCAGTTTTGCTTGACTTTTGGCGTCAAAGATCCTTGAAATATCTATATTCATCAA
ACCAAATCTCAGCCAAAGTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCATCTGAATCTTGTTTCGATT
TAAATAGAAATTAATTAGGAAAAAATTGGAAAAATGATACTAGAAAGGTTAGAAGCCCTTCAATC
TTTTTTGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTATTTTGGCCAAAATTGAGAAAAATTTTCGGGT
CAGTTTTTGCAAAATTTTAGTTGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTTTAGCTAAAAACGCGT
TTCCGGGCC
Done.