Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01020819.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig20852, whole genome shotgun sequence
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325 CTTTTTGGC
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* * *
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* * **
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* * * * * *
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* *
657 TTTGTGGT
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* * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * * *
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196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
*
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* **
987 ATTTTTGTT
325 CTTTTTGGC
* * * * * *
996 GTTGAATTACAAATTTATTATGAGTATTGTAGCCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTCGATTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * **
1061 TTTGAAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCAAAAAACGCGTTCCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * * ** * *
1126 GGCCCCAGCTTAGTTTAGGATGATTTTTGGCACCAAAACTCCTTGTGATATCTATATTTATTTAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* *
1191 TCAAGTTTTAACCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTC
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT-
* * * * * *
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260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
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325 CTTTTTGGC
* * * *
1329 GTTGAATTATAAGTTTTTTATGAGTACTGTGGCCGAAAAA-TGAAGAAAAATTTTCCGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCC-AAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGT
* * * *
1393 TTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTATACTAATCATCACGGTTTCTGGCAGAAAACGCGTTCCG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * *
1458 GGGCCCCAGCTCAGTTTTGTAAGATTTTTGGCGCCGAGACTCCTTGAAATATCTATATAT-ATTT
130 GGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT-TCATCT
* * * * *
1522 CATAAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATATTGTTTCGAC
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGAT
* * *
1587 TTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGAAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGCCCATAAA
259 TTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
1652 TCTTTTTGGC
324 TCTTTTTGGC
* * * *
1662 GTTGTATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGCCCGAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
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* * * *
1726 TTTGCAAAATTTTAGCTGAAAACGTGTACTAACACATCACTGTTTCTGGCTGACAACGCGTTCCG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAC-CATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * * *
1791 GGACCCCGGCTAAGTTTTACATGATTTTTGGCGCCGAAACCCCTTGAAATATCTATATTCATATA
130 GGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * ** * *
1856 ATCAAATATTAGCCACATAAGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATTTTGTTTCGATT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
* *
1921 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAACATGAAAAGCCATTAAA
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
*
1985 TATTTTTGGC
324 TCTTTTTGGC
* * *
1995 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATAGAGGAAAAAATTTTT-TGTTCAAT
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2059 TTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAATATCACAATTTTTGGCTGAAAAACGCGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTG-AAAACGCGTTCC
* * * *
2124 GTGGCGCCGGCTCAGTTTTGCATGGTTTTTGGCATCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
129 GGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* * * * * * * * *
2189 AATCAAATCTCAGCAACACTGGACTAAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATATTGGTTCGAT
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGAT
* *
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259 TTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGA-AAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAA
**
2318 ATCTTTTTGTT
323 ATCTTTTTGGC
* * * * * *
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1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * ** *
2393 TTTGAAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCAAAAAACACGTTCCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * * *
2458 GGCCCCAGCTTAGTTTAGGATGATTTTTGGCGCCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTTATTTAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * *
2523 TAAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAA-CATTGTTTCGACT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATC-TTGTTTCGATT
*
2587 TAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAGCCATTAAA
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*
2650 TATTTTTGGC
324 TCTTTTTGGC
* * * *
2660 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGTGGCCAAAAATTAATGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
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2725 TTTGCAAAATTTTAGCTGAAAACGTGTACTAACCATCACTGTTTCTGACTGACAACGCGTTCCGG
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* * * * * *
2790 GACCCCAGCTAAGTTTTACATGATTTTTGGCACCGAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATGTAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * * * *
2855 TCAAATATTAGCCACATTGGATTTAAGAAAATGTTTTTACGAGCTTCTGAATTTTGTTTTGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* *
2920 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAGCCATTAAGT
261 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
2984 CTTTTTGGC
325 CTTTTTGGC
*
2993 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * * * * *
3058 TTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCATGATTTCTAGCTGAAAACGCTTTCCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * *
3123 GGACCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGACCCCGAGAATCCTTGAAATTTCTATATTCATCTAC
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * * * *
3188 TCAAATCTCAGCAACACTAGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCT-AGATCTTGTTTCGATT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGA-ATCTTGTTTCGATT
* * *
3252 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAATAATTAGG-AAAACTATATGTGAAGCTTGAAAAGCCCTTAAA
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAA-AAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
***
3316 TCTTTTTATT
324 TCTTTTTGGC
* * * *
3326 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGT-GCTCGAAAATTGAGG-AAAATTTTTTGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGC-CAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGT
* * *
3389 TTTTGCATAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACTGTTT-TCGGCAGAAAACGCGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCT-GGCTGAAAACGCGTTCC
* * * * *
3453 GGGGCCCTGGCTCAGTATTGCAAGATTTTTGG-AGCCGAGACTCTTTGAAATATCTATATTTAGT
129 GGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCA-CCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCA-T
*
3517 -TAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAACTTGTTTCG
192 CTAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCG
* * *
3581 ATTTAAGT-AGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATATGAAGAATGAAAAGCCCTT
257 ATTTAA-TCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTT
3645 AAATCTTTTTGGC
321 AAATCTTTTTGGC
* * *
3658 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAATAATTTTTTGGTTCAATT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* ** ** * ** *
3723 TTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAATATCACAATTTTTGGCTGAAAACGTTTTCCGA
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * *
3788 GGCCCCGGCTCAATTTTGCATGATTTTTGCCACCGAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATATAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * *
3853 TCAAATATTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAT-TTCGTTTCGATT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTT-GTTTCGATT
* * * *
3917 TAATTAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGTAAAAACCATAT-TCGAAGGATGAAAAGCCATTAAA
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
3981 TCTTTTTGGC
324 TCTTTTTGGC
* *
3991 ATTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * * *
4056 TTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAATCATCACGATTTCTGGCTGAAAACGCTTTCCGG
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* * * * * * * *
4121 GGCACCTGCTAAGTTTTGCATGATTTTTGACCCCGAGAATCCTTGAAATATCTATATTTATATAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * *
4186 TCAAGTCTTAGCCACTTTGGATTTAAGGATATGTTTTTATGAGCTTTTGAAACTTGTTTCGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* * *
4251 AAGT-AGAAATTAATTTGGGAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAACCCTTAAAT
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325 CTTTTTGGC
*
4324 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTAAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * * * ** * *
4389 TTTGTAAAATTTTAGCCGAAATTGTGTACTAAACATCACGATTTCTAACTGAAAACGCTTTCCAG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * * *
4454 GGCACCTGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGACCCCGAGAATCCTTGAAATTTCTATATTCATCTAC
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * * *
4519 TCAAATCTCAGCAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCT-AGATCTTGTTTCGATT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGA-ATCTTGTTTCGATT
* *
4583 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATTAGG-AAAACTATATGTGAAGCTTGAAAAGCCCTTAAA
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***
4647 TCTTTTTATT
324 TCTTTTTGGC
* * *
4657 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGT-GCTCGAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGC-CAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGT
** * *
4721 TTTTGCATGATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCATGGTTT-TCGGCAGAAAACGCGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCT-GGCTGAAAACGCGTTCC
* * * * * *
4785 GGGGCCCCGTCTCAGTTTTGCAAT-ATTTTTGACGCCAAGTCTCCTTGAAATATCTATATTTATC
129 GGGGCCCCGGCTCAGTTTTGC-ATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATC
* *
4849 TAATCAAGTCTTAGCCACATTGCATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTTTGAAT-TTGGTTTCG
193 TAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTT-GTTTCG
* *
4913 ATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCAAAGCATGAAAAGCCATT
257 ATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCTT
*
4976 AAATCATTTTGGC
321 AAATCTTTTTGGC
* *
4989 GTTGAATTAT-AATTCTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATT-ATGGAAAAATTTTTCGATTTAG
1 GTTGAATTATAAATT-TTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGA-GGAAAAATTTTTCGGTTCAG
* * * * *
5052 TTTTTGCCAAATTTTAGCCGTAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAAAACGCATTCC
64 TTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCC
* * * * * * * * * *
5117 GGAGCACCGTCTCAGTTTAGGATGATTTTTGTCACCAAGACTTCTTGAAATATCTATATTTATTT
129 GGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* * *
5182 AATCAAGTCTTAGCCACTTTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTTTGAAACTTGTTTCGAT
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGAT
* *
5247 TTAAGT-AGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAACCCTTAA
259 TTAA-TCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAA
5311 ATCTTTTTGGC
323 ATCTTTTTGGC
5322 GTTGAATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * * * *
5386 TTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACGAAACATCACGGTTTCTTGCTGAAAACGCGTTCTGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* ** * * *
5451 AGCCCCAACTCAGTTTTTGCAAGATTTTTAGCACCGAGACTCCTTGTAATATCTATATTCATCTA
131 GGCCCCGGCTCAG-TTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * * ** * * * *
5516 ATCAAATCTCAGCAACACAGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATATTGTTTCGAAT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
*
5581 TAATCAGAAATTAATTTGG--AAAAATA-AAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAA-CCCTTAAAT
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
**
5642 CTTTTTGTT
325 CTTTTTGGC
*
5651 GTTGAATTATAAATTTTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTCTTCGGTTCAG
1 GTTGAATTATAAA--TTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAG
* * * *
5716 GTTTTGCAAAATGTTAGCCGAAAATCGTGTACTAACCGTCACGGTTTCTGGCTG-AAACGTGTTC
64 TTTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTC
** * * * * * *
5780 CGGGATCCCGACTAAGTTTTGCATGATTTTTGGCGCCGAAACTCCTTGAAATATCTATAATCATA
128 CGGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATC
* * ** * *
5845 TAATCAAATCTCT-GTCGTATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGATTCTGAATCTTTGTTTC
193 TAATCAAGTCT-TAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATC-TTGTTTC
* *
5909 GCTTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAACACCATAT-TCGAAGCATGAAAAGCCCT
256 GATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCT
*
5973 TAAATTTTTTTGGC
320 TAAATCTTTTTGGC
* * *
5987 ATTGAATTATAAATTTATTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGAAACAAATTTTTCGGTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAA-AAATTTTTCGGTTCAGT
* * * * **
6052 TTTGGTAAAATTTTAGCTGAAAT--TGT-GT-ACCATCACTATTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * *
6113 GGACCCCTGCTAAGTTTTACATGATTTTTGGCGCCGA-AGCTCCTTGAAATATCTATATTCATAT
130 GGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGA-CTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* *
6177 AATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAT-TTCGTTTCGA
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTT-GTTTCGA
* * * * * *
6241 TTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAAATAGTAAAACCCATATTTCAATCATGAAAAGCCATTA
258 TTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTA
6306 AATCTTTTTGGC
322 AATCTTTTTGGC
*
6318 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTTGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
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* * * *
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* *
6448 AGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGGTTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * *** * * * *
6513 TCAAATCTCAATAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATATTGTTTCGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* *
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261 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
**
6643 TTTTTGTT
326 TTTTTGGC
* * * * *
6651 TTTGAGTTATAATTTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGATTTAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* *
6716 TTTACAAAATTTTAGCCAAAATCGTGTACGT--CCATCACGGTTT-TCGGCAT-AAAACGCGTTC
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC-TAACCATCACGGTTTCT-GGC-TGAAAACGCGTTC
* * * * ** * * *
6777 CGGGGCTCCGACTCAATTTTGCAAGATTTTTGGTGCCGAGACTCCTTGTAATATATATTTTCATC
128 CGGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATC
* * * * *
6842 TAATCAAGTCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGACCTTCTGAATCTTGTTTTGA
193 TAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGA
* * *
6907 TTTAATTAGAAATTAATTTGGAAAAAAAATAGGAAAAACCATACGTGAAGCATGAAAAGCCCTGA
258 TTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTA
6972 AATCTTTTTGGTC
322 AATCTTTTTGG-C
* *
6985 -TTGAATTATAGATTTTTTATGAGTACCGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
** * * *
7049 TTTGCAAAATTTTAG-C-----C--G-----------ACGGTTTCTGGCAAAAAATGCATTTCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * * * * *
7095 GGCCCCGACTTAGTTTAGGATGATTTTTGGCACCAAGACTTCTTGAAATATCTATATTTATTTGA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
7160 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* * *
7225 AATTAAAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
261 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
**
7289 TTTTTGTT
326 TTTTTGGC
* * * * * * *
7297 TTTGGATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTTG-CAGAAATTGAAGAAAAATTTTTCGATTTAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* *
7361 TTTGCTAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTAGCTGAAAACGCGTTCCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * *
7426 GGCCCCCGCTCAGTTTTGTATAATTTTTGACACCGAGACTCCTTGTAATATCTATTTTCATCTAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * * * * *
7491 TTAAGTCTCAGCAACACTAGATTTAAGGATATGTTTTTACGACCTTCTGAATCTTGTTTTGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* * * * *
7556 AATTATAAATTAATTTGGAAAAAAAAATAGGTAAAACCATACGTGAAGCATGAAAAGCCCTGAAA
261 AATCAGAAATTAATTTGG--AAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
*
7621 TCTTTTTGGT
324 TCTTTTTGGC
* *
7631 GTTGAATTATAGAATTTTTTATGAGTACCGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTTGGTTCAGT
1 GTTGAATTATA-AATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGT
* *
7696 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAATCGTGTACT---CATCACGGTTTCTTGCTGAAAACACGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCC
* * * * *
7758 GGGGCCCCAGCTCAGTTTTGCAAGATTTTTAGCACCAAGACTCCTTGTAATATCTATATTCATCT
129 GGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* * * * * * *
7823 AATCAAATCTCAGCAACACTGGGA-TTAAGGATATGTTTTTTCGAGCTTGTGAATATTGTTTCGA
194 AATCAAGTCTTAGCCACA-TTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGA
* * *
7887 TTTAATCAGAAATTAATTTGCATAAAAATACG-AAAACCATATGTG-A--AT--------CTT--
258 TTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAA
*
7938 -T-TTGTT---
323 ATCTTTTTGGC
* * * * * * * *
7944 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGTGCCCAAATATTGTGGAAAATTTTTTTGATTCAATT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * **
8009 TTTGCAAAATTTTAGACGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCAGAAAAACGCAATCCG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTG-AAAACGCGTTCCG
* * * * ** * *
8074 GGGCCCCGACTTAGTTTAGGATGA-TTTTGGCACAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTTATTTA
130 GGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * *
8138 ATCAAGTCTCAGCCACATTGGATTTAAGAATATGTATTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
* * *
8203 TAATTAAAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
* *
8268 CATTTTGCC
325 CTTTTTGGC
* * *
8277 GTTGAAATATAAATTTTTTATGAGTACTATGGCCAATAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * * * * *
8342 TTTGCAAATTTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTAAAAATGCGATCCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * *
8407 GGCCCCTGCTAAGTTTTGCATGGTTTTTGGCAACGAGACTCCTTGAAATTTCTATATTCATCCAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * * * * * * *
8472 TCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATATTTTTACGAGCTTGTGAATATTGTTTCAAATT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* *
8537 AATCAGAAGTTAATTTGGAAAAAAATAGAAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
261 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
**
8602 TTTTTGTT
326 TTTTTGGC
* *
8610 GTTGAATTATAAATTTTTGTA--AGTATTGTGGCCAAAAATTGAGG-AAAA-TTTTCAGTTCAG-
1 GTTGAATTATAAATTTTT-TATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGT
*
8670 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAATAGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCC
* * * * *
8735 GTGGTCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTCGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
129 GGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* * *
8800 AATCAAGT-TTCAGCCACA-TGGATTTAAGAATATGTTTTAACGAGTTTCTGAATCTTGTTTCGA
194 AATCAAGTCTT-AGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGA
* * *
8863 TTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATATGAAGAACCATATGTGAAACATGAAAAGCCCTTAA
258 TTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAA
8928 ATCTTTTTGGC
323 ATCTTTTTGGC
*** * * * ** *
8939 GTTGAATTA-AAAAAATTTATGAATATTGTGGTCACTAATTGAGGAAAAATTTTTCGATTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAG-T
* * * *
9003 TTTTGCAAAATTTTAGCCAAAATCGTGTACCAAACATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCTTTCCG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * * * *
9068 GGGCTCCGGCTCTGTTTTGCATGATTTTTGACACCGAAACTCCCTGCAATTTCTATATTCATTTA
130 GGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * * * * * * *
9133 ATCAAATCTCAACAACACTGGACTAAAAGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATC-TGTTTCGATT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
*
9197 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTGAAT
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
*
9262 CTTTTTGGT
325 CTTTTTGGC
* *
9271 GTTGAATTATAAATTTTTGATGAGTACTGTGG-CAAAAA-T--------A--TTTCGATTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * * * ** *
9324 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAGTCGTATACCAACCATCACGGTTTCTGGCAGAAAATACGTTACGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * ** * **
9389 GACCCCAGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCATGGAGACCCCTTTTAATATCTATATTCATCTAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * *
9454 TCAAGTATTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGGTTTTACGAGCTTCTAATTTTTGAATCTTGTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTC-------TGAATCTTGTT
9519 TCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAGCC
254 TCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCC
9583 CTTAAATCTTTTTGGC
318 CTTAAATCTTTTTGGC
* * * *
9599 GTTGAATTATATATTTTTTATGAGTACTGTGGCCATAAATTGGGGAAAAATTTTTCGGTTCTGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
*** * * ** * *
9664 TTTGCAAAATTTTATTTGAAGTCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTAGCTGAAAATACATTACGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * ** * **
9729 GACCCCAGCTTAGTTTTGCAAGCTTTTTGGCATGGAGATTCCTTTTAATATCTATATTCATCTAA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* **
9794 TCAAGTCTTAGTCACATTGGATTTAAAAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
*
9859 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGTAAAGCCCTTAAATC
261 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
**
9924 TTTTTGTT
326 TTTTTGGC
* * *
9932 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGCCCAAAAATTGTGGAAAAATTTTTACGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTT-CGGTTCAGT
* * ** *
9997 TTTTGCAAAATTTTAGCGGAAGTCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAATACGTTACG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * **
10062 GGACCCCGGCTTAGTTTTGCAAGATTTTTGGCGCGGAGACTCCTTTTAATATCTATATTCATCTA
130 GGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * * *
10127 ATTAAGTGTTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGGTTTTACGAGCTTCTAATTTATGAATCTTGT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTC-------TGAATCTTGT
10192 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAG
253 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAG
10256 CCCTTAAATCTTTTTGGC
316 CCCTTAAATCTTTTTGGC
* *
10274 GTTGAATTATATATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTTAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
* * * ** *
10339 TTTTCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTAAAAATACGTTACGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * ** * **
10404 GACCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGC-GGGAAGACCCCTTTTAATATCTATATTCATCTA
131 GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCG-AGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* *
10468 ATCAAGTCTTAACCACATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
10533 TAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
10596 TCTTTTTGGC
324 TCTTTTTGGC
*
10606 GTTGAATTA-AATATTTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAACTTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAG
1 GTTGAATTATAA-A-TTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAG
** **
10670 ----T------TTTT-GCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAATACGTTAA
64 TTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCC
* * ** * * * **
10724 GGGACCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGTGCGGACACCCCTTTTAATATCTATATTCATCT
129 GGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* *
10789 AATCGAGTCTTATCCACATTGGATTT
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTT
10815 TTGGTGACGA
Statistics
Matches: 9076, Mismatches: 1204, Indels: 413
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
311 12 0.00
312 105 0.01
313 92 0.01
314 128 0.01
315 187 0.02
316 6 0.00
317 1 0.00
318 3 0.00
320 147 0.02
321 11 0.00
322 129 0.01
323 7 0.00
325 1 0.00
326 3 0.00
327 10 0.00
328 117 0.01
329 232 0.03
330 326 0.04
331 887 0.10
332 1940 0.21
333 3136 0.35
334 936 0.10
335 93 0.01
336 71 0.01
337 12 0.00
338 1 0.00
340 174 0.02
341 207 0.02
342 102 0.01
ACGTcount: A:0.32, C:0.15, G:0.17, T:0.36
Consensus pattern (333 bp):
GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
GGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
TTTTTGGC
Found at i:3123 original size:665 final size:665
Alignment explanation
Indices: 1--10814 Score: 12942
Period size: 665 Copynumber: 16.3 Consensus size: 665
* * * *
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGCCCAAAAATTGTGAAAAAATTTTTCATTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
* * * ** **
66 TTTGCAAAAATTTTAGCTGAAGTCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGTTGAAAATACGTTAAG
66 TTTGC-AAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * * **
131 GGACCCCGGCTTAGTTTTGCAAGATTTTTGGCGCGGAGACTCCTTTTAATATCTATATTCATCTA
130 GGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* *
196 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGTGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
* *
261 TAAACAGAAATTAATTTGGAAAAAAA-AGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGGCCTTAAAT
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
** * * * *
325 CTTTTTGTTGTTGAATTATAAATTTTTCATGAGTACTTTAGCCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTC
325 CTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTC
* * * *
390 GATTCAGTTTCTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCAC-AGTATCTGGCTGAAAA
390 GGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGA-TTTCTGGCTGAAAA
* * * * * *
454 CGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGGATGATTTTTGGCCCCAAAACTCCTTGAAATATCAAT
454 CGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTAT
* * * * *
519 ATTTATTTAATGAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGCTATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTT
519 ATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA-CTT
** * * * * *
584 GTTTCGAAATAATTAAAAATTATTTTGG-AAAAAA-AGGAAAAACCACATGTGAAGTATGAAAAG
583 GTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAG
* *
647 CCCTTAAATATTTGTGGT
648 CCCTTAAATCTTTTTGGT
* * * *
665 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCTAAAAATTGAGGAAAAATTTTTTGGTTCAATT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
* * ** * * *
730 TTTGTAAAATTTTAGCTGAAATCGTGTACTAAATATCACGATTTATGGCTGAAAACGCGTTCCGA
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * *
795 TGCCCGA-CTCAGTTTTGCATGGTTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
131 GGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * * * * * * * *
859 TCAAATCTCATCAACACTGAACTTAAGGATATG-TTTTACGAGCTTGTGAATATTTTTTCGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
*
923 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATA-GAATAAAACATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
261 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAA-AAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
* ** * * * * *
987 ATTTTTGTTGTTGAATTACAAATTTATTATGAGTATTGTAGCCAAAAATTGAGGAAAAAATTTTC
325 CTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTC
* * * * * **
1052 GATTCAGTTTTTGAAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCAAAAAAC
390 GGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAAAAC
* * * * * **
1117 GCGTTCCGGGGCCCCAGCTTAGTTTAGGATGATTTTTGGCACCAAAACTCCTTGTGATATCTATA
455 GCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATA
* * * * *
1182 TTTATTTAATCAAGTTTTAACCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTG
520 TTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA-CTTG
* * * * * *
1247 TTTCGATTCGAGT-AAAAATTAATTTGGAAAAAAATATGATAAACCACATGTGAAGCATGAAAAG
584 TTTCGATT-TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAG
*
1311 CCCTTAAATCTTTTTGGC
648 CCCTTAAATCTTTTTGGT
* * *
1329 GTTGAATTATAAGTTTTTTATGAGTACTGTGGCCGAAAAA-TGAAGAAAAATTTTCCGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCC-AAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGT
* * * *
1393 TTTTGCAAAATTTTAACCGAAATCGTATACTAATCATCACGGTTTCTGGCAGAAAACGCGTTCCG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * *
1458 GGGCCCCAGCTCAGTTTTGTAAGATTTTTGGCGCCGAGACTCCTTGAAATATCTATATAT-ATTT
130 GGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT-TCATCT
* * * * *
1522 CATAAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATATTGTTTCGAC
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGAT
* * *
1587 TTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGAAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGCCCATAAA
259 TTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
* * *
1652 TCTTTTTGGCGTTGTATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGCCCGAAAATTGAGGAAAAATTTTT
324 TCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTT
* * * *
1716 CGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCTGAAAACGTGTACTAACACATCACTG-TTTCTGGCTGAC
389 CGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAA-ACATCAC-GATTTCTGGCTGAA
* * * * * *
1780 AACGCGTTCCGGGACCCCGGCTAAGTTTTACATGATTTTTGGCGCCGAAACCCCTTGAAATATCT
452 AACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCT
* * ** * *
1845 ATATTCATATAATCAAATATTAGCCACATAAGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATT
517 ATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA-C
*
1910 TTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAACATGAA
581 TTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAA
* * *
1974 AAGCCATTAAATATTTTTGGC
645 AAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* * *
1995 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATAGAGGAAAAAATTTTTTG-TTCAAT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGG-AAAAATTTTTCGTTTCAGT
* ** ** *
2059 TTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAATATCACAATTTTTGGCTGAAAAACGCGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTG-AAAACGCGTTCC
* * * * *
2124 GTGGCGCCGGCTCAGTTTTGCATGGTTTTTGGCATCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
129 GGGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* * * * * * * * *
2189 AATCAAATCTCAGCAACACTGGACTAAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATATTGGTTCGAT
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGAT
* *
2254 TTAATCAGAAATTAATTTAGAAAAAAATAGAATAAAACC-TATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAA
259 TTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGA-AAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAA
** * * * * *
2318 ATCTTTTTGTTGTTGAATTACAAATTTATTATGAGTATTGTAGCAAAAAATTGAGG-AAAATTTT
323 ATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTT
* * * * * **
2382 TCGATTCAGTTTTTGAAAAATTTTAGTCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCAAAAA
388 TCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAAA
* * * * *
2447 ACACGTTCCGGGGCCCCAGCTTAGTTTAGGATGATTTTTGGCGCCGAGACTCCTTGAAATATCTA
453 ACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTA
* * *
2512 TATTTATTTAAT-AAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAACA
518 TATTCATCTAATCAAA-TCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAC-
*
2576 TTGTTTCGACTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAA
581 TTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAA
* * *
2639 AAGCCATTAAATATTTTTGGC
645 AAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* * *
2660 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGTGGCCAAAAATTAATGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
* * * * *
2725 TTTGCAAAATTTTAGCTGAAAACGTGTACTAACCATCACTGTTTCTGACTGACAACGCGTTCCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * *
2790 GACCCCAGCTAAGTTTTACATGATTTTTGGCACCGAAACTCCTTGAAATATCTATATTCATGTAA
131 GGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * * * *
2855 TCAAATATTAGCCACATTGGATTTAAGAAAATGTTTTTACGAGCTTCTGAATTTTGTTTTGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* *
2920 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAGCCATTAAGT
261 AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
*
2984 CTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTAAGGAAAAATTTTTC
325 CTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTC
* * *
3049 GGTTCAGTTTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCATGATTTCTAGCTGAAAAC
390 GGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAAAAC
* * * * * * *
3114 GCTTTCCGGGGACCCGGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGACCCCGAGAATCCTTGAAATTTCTATA
455 GCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATA
* * * * * * *
3179 TTCATCTACTCAAATCTCAGCAACACTAGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTAGATCTTG
520 TTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCT-GAACTTG
* * *
3244 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAATAATTAGG-AAAACTATATGTGAAGCTTGAAAAG
584 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAA-AAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAG
**
3308 CCCTTAAATCTTTTTATT
648 CCCTTAAATCTTTTTGGT
* * *
3326 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGT-GCTCGAAAATTGAGG-AAAATTTTTTGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGC-CAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGT
* * *
3389 TTTTGCATAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACTGTTT-TCGGCAGAAAACGCGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCT-GGCTGAAAACGCGTTCC
** * * * *
3453 GGGGCCCTGGCTCAGTATTGCAAGATTTTTGG-AGCCGAGACTCTTTGAAATATCTATATTTAGT
129 GGGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCA-CCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCA-T
*
3517 -TAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAACTTGTTTCG
192 CTAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCG
* * *
3581 ATTTAAGT-AGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATATGAAGAATGAAAAGCCCTT
257 ATTTAA-TCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTT
*
3645 AAATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAATAATT
321 AAATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATT
* * * * * *
3710 TTTTGGTTCAATTTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAATATCACAATTTTTGGCTGA
386 TTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGA
** * * * * *
3775 AAACGTTTTCCGAGGCCCCGGCTCAATTTTGCATGATTTTTGCCACCGAAACTCCTTGAAATATC
451 AAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATC
* * * *
3840 TATATTCATATAATCAAATATTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAT
516 TATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAC
* * *
3905 TTCGTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGTAAAAACCATAT-TCGAAGGATGA
581 TT-GTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGA
* *
3969 AAAGCCATTAAATCTTTTTGGC
644 AAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* * *
3991 ATTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGTCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
* * * *
4056 TTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAATCATCACGATTTCTGGCTGAAAACGCTTTCCGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * * * * *
4121 GGCACCTGCTAAGTTTTGCATGATTTTTGACCCCGAGAATCCTTGAAATATCTATATTTATATAA
131 GGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * * *
4186 TCAAGTCTTAGCCACTTTGGATTTAAGGATATGTTTTTATGAGCTTTTGAAACTTGTTTCGATTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
* * *
4251 AAGT-AGAAATTAATTTGGGAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAACCCTTAAAT
261 AA-TCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
*
4315 CTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTAAGGAAAAATTTTTC
325 CTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTC
* * **
4380 GGTTCAGTTTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATTGTGTACTAAACATCACGATTTCTAACTGAAAAC
390 GGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAAAAC
* * * * * * * * *
4445 GCTTTCCAGGGCACCTGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGACCCCGAGAATCCTTGAAATTTCTATA
455 GCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATA
* * * * * *
4510 TTCATCTACTCAAATCTCAGCAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTAGATCTTG
520 TTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCT-GAACTTG
* *
4575 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATTAGG-AAAACTATATGTGAAGCTTGAAAAG
584 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAA-TAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAG
**
4639 CCCTTAAATCTTTTTATT
648 CCCTTAAATCTTTTTGGT
* *
4657 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGT-GCTCGAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGC-CAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGT
** * *
4721 TTTTGCATGATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCATGGTTT-TCGGCAGAAAACGCGTTCC
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCT-GGCTGAAAACGCGTTCC
* * * * *
4785 GGGGCCCC-GTCTCAGTTTTGCAAT-ATTTTTGACGCCAAGTCTCCTTGAAATATCTATATTTAT
129 GGGGCCCCAG-CTCAGTTTTGC-ATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCAT
* *
4848 CTAATCAAGTCTTAGCCACATTGCATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTTTGAAT-TTGGTTTC
192 CTAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTT-GTTTC
* *
4912 GATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCAAAGCATGAAAAGCCAT
256 GATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCCCT
*
4975 TAAATCATTTTGGCGTTGAATTAT-AATTCTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATT-ATGGAAAA
320 TAAATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATT-TTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGA-GGAAAA
* * * *
5038 ATTTTTCGATTTAGTTTTTGCCAAATTTTAGCCGTAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGC
383 ATTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGC
* * * * * * * * * *
5103 TGAAAACGCATTCCGGAGCACCGTCTCAGTTTAGGATGATTTTTGTCACCAAGACTTCTTGAAAT
448 TGAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAAT
* * * * *
5168 ATCTATATTTATTTAATCAAGTCTTAGCCACTTTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTTTG
513 ATCTATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTG
*
5233 AAACTTGTTTCGATTTAAGT-AGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCA
578 -AACTTGTTTCGATTTAA-TCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCA
* *
5297 TGAAAAACCCTTAAATCTTTTTGGC
641 TGAAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
*
5322 GTTGAATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
* * * * *
5386 TTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACGAAACATCACGGTTTCTTGCTGAAAACGCGTTCTGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * * * *
5451 AGCCCCAACTCAGTTTTTGCAAGATTTTTAGCACCGAGACTCCTTGTAATATCTATATTCATCTA
131 GGCCCCAGCTCAG-TTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * * ** * * * *
5516 ATCAAATCTCAGCAACACAGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATATTGTTTCGAAT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
*
5581 TAATCAGAAATTAATTTGG--AAAAATA-AAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAA-CCCTTAAAT
260 TAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAAT
** *
5642 CTTTTTGTTGTTGAATTATAAATTTTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTCT
325 CTTTTTGGCGTTGAATTATAAA--TTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTT
* * * * *
5707 TCGGTTCAGGTTTTGCAAAATGTTAGCCGAAAATCGTGTACTAACCGTCACGGTTTCTGGCTG-A
388 TCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAA
* ** * * * *
5771 AACGTGTTCCGGGATCCCGACTAAGTTTTGCATGATTTTTGGCGCCGAAACTCCTTGAAATATCT
452 AACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCT
* * * ** * *
5836 ATAATCATATAATCAAATCTCT-GTCGTATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGATTCTGAAT
517 ATATTCATCTAATCAAATCT-TAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA-
* *
5900 CTTTGTTTCGCTTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAACACCATAT-TCGAAGCATG
580 C-TTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATG
* *
5964 AAAAGCCCTTAAATTTTTTTGGC
643 AAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* * * *
5987 ATTGAATTATAAATTTATTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGAAACAAATTTTTCGGTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAA-AAATTTTTCGTTTCAGT
* * * * **
6052 TTTGGTAAAATTTTAGCTGAAAT--TGT-GT-ACCATCACTATTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * *
6113 GGACCCCTGCTAAGTTTTACATGATTTTTGGCGCCGA-AGCTCCTTGAAATATCTATATTCATAT
130 GGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGA-CTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* *
6177 AATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTTCTGAAT-TTCGTTTCGA
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTT-GTTTCGA
* * * * * *
6241 TTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAAATAGTAAAACCCATATTTCAATCATGAAAAGCCATTA
258 TTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTA
*
6306 AATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTTGCCAAAAATTGAGGAAAAATTT
322 AATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTT
* *
6371 TTCGGTTCAGTTTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTATACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAA
387 TTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAA
* * *
6436 AACGCGTTCCGGAGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGGTTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCT
452 AACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCT
* *** * * * *
6501 ATATTCATCTAATCAAATCTCAATAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTGTGAATA
517 ATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA-C
*
6566 TTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTCGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAA
581 TTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAA
* *
6631 AGCCCTTTAATCTTTTTGTT
646 AGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* * *
6651 TTTGAGTTATAATTTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGATTT-AGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCG-TTTCAGT
* *
6715 TTTTACAAAATTTTAGCCAAAATCGTGTACGT--CCATCACGGTTT-TCGGCAT-AAAACGCGTT
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTAC-TAACCATCACGGTTTCT-GGC-TGAAAACGCGTT
* * * ** * * *
6776 CCGGGGCTCC-GACTCAATTTTGCAAGATTTTTGGTGCCGAGACTCCTTGTAATATATATTTTCA
127 CCGGGGCCCCAG-CTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCA
* * * * *
6840 TCTAATCAAGTCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGACCTTCTGAATCTTGTTTT
191 TCTAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTC
* *
6905 GATTTAATTAGAAATTAATTTGGAAAAAAAATAGGAAAAACCATACGTGAAGCATGAAAAGCCCT
256 GATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCT
* * *
6970 GAAATCTTTTTGGTC-TTGAATTATAGATTTTTTATGAGTACCGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAA
320 TAAATCTTTTTGG-CGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAA
*
7034 TTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCG--A-C--G-------------G-TTTCTGGCA
384 TTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCT
* * * * * * * * *
7080 AAAAATGCATTTCGGGGCCCCGACTTAGTTTAGGATGATTTTTGGCACCAAGACTTCTTGAAATA
449 GAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATA
* * * *
7145 TCTATATTTATTTGATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGA
514 TCTATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGA
* * *
7210 ATCTTGTTTCGATTTAATTAAAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATG
579 A-CTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATG
*
7274 AAAAGCCCTTAAATCTTTTTGTT
643 AAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* * * * *
7297 TTTGGATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTTG-CAGAAATTGAAGAAAAATTTTTCGATTT-AGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCG-TTTCAGT
* *
7360 TTTTGCTAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTAGCTGAAAACGCGTTCCG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * *
7425 GGGCCCCCGCTCAGTTTTGTATAATTTTTGACACCGAGACTCCTTGTAATATCTATTTTCATCTA
130 GGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * * * * * *
7490 ATTAAGTCTCAGCAACACTAGATTTAAGGATATGTTTTTACGACCTTCTGAATCTTGTTTTGATT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATT
* * * * *
7555 TAATTATAAATTAATTTGGAAAAAAAAATAGGTAAAACCATACGTGAAGCATGAAAAGCCCTGAA
260 TAATCAGAAATTAATTTGG--AAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAA
* *
7620 ATCTTTTTGGTGTTGAATTATAGAATTTTTTATGAGTACCGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTT
323 ATCTTTTTGGCGTTGAATTATA-AATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTT
* * *
7685 TTTGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAATCGTGTACT---CATCACGGTTTCTTGCTGA
387 TTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGA
* * * * * * *
7747 AAACACGTTCCGGGGCCCCAGCTCAGTTTTGCAAGATTTTTAGCACCAAGACTCCTTGTAATATC
451 AAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATC
* * * * *
7812 TATATTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGGA-TTAAGGATATGTTTTTTCGAGCTTGTGAA
516 TATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACA-TTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA
* * * *
7876 TATTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGCATAAAAATACG-AAAACCATA--T---G--T--
580 -CTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGA
*
7931 ---G------AATCTTTTTGTT
644 AAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* * * * * * * *
7944 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGTGCCCAAATATTGTGGAAAATTTTTTTGATTCAATT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
* * **
8009 TTTGCAAAATTTTAGACGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCAGAAAAACGCAATCCG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTG-AAAACGCGTTCCG
* * * ** * *
8074 GGGCCCC-GACTTAGTTTAGGATGA-TTTTGGCACAAAGACTCCTTGAAATATCTATATTTATTT
130 GGGCCCCAG-CTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* * *
8137 AATCAAGTCTCAGCCACATTGGATTTAAGAATATGTATTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGAT
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGAT
* * *
8202 TTAATTAAAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
259 TTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAA
* * * * *
8267 TCATTTTGCCGTTGAAATATAAATTTTTTATGAGTACTATGGCCAATAATTGAGGAAAAATTTTT
324 TCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTT
* *
8332 CGGTTCAGTTTTTGCAAATTTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTAAAAA
389 CGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAAAA
* * * * * * *
8397 TGCGATCCGGGGCCCCTGCTAAGTTTTGCATGGTTTTTGGCAACGAGACTCCTTGAAATTTCTAT
454 CGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTAT
* * * * * * *
8462 ATTCATCCAATCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATATTTTTACGAGCTTGTGAATATT
519 ATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA-CTT
* * * *
8527 GTTTCAAATTAATCAGAAGTTAATTTGGAAAAAAATAGAAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAG
583 GTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAG
*
8592 CCCTTAAATCTTTTTGTT
648 CCCTTAAATCTTTTTGGT
*
8610 GTTGAATTATAAATTTTTGTA--AGTATTGTGGCCAAAAATTGAGG-AAAA-TTTTCAG-TTCAG
1 GTTGAATTATAAATTTTT-TATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTC-GTTTCAG
*
8670 -TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAATAGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTC
64 TTTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTC
* * * * * *
8734 CGTGGTCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTCGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATC
128 CGGGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATC
* * *
8799 TAATCAAGT-TTCAGCCACA-TGGATTTAAGAATATGTTTTAACGAGTTTCTGAATCTTGTTTCG
193 TAATCAAGTCTT-AGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCG
* * *
8862 ATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATATGAAGAACCATATGTGAAACATGAAAAGCCCTTA
257 ATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTA
*** * * * **
8927 AATCTTTTTGGCGTTGAATTA-AAAAAATTTATGAATATTGTGGTCACTAATTGAGGAAAAATTT
322 AATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTT
* * * *
8991 TTCGATTCAGTTTTTTGCAAAATTTTAGCCAAAATCGTGTACCAAACATCACGGTTTCTGGCTGA
387 TTCGGTTCAG-TTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGA
* * * * * * *
9056 AAACGCTTTCCGGGGCTCCGGCTCT-GTTTTGCATGATTTTTGACACCGAAACTCCCTGCAATTT
451 AAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCT-TAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATAT
* * * * * * * *
9120 CTATATTCATTTAATCAAATCTCAACAACACTGGACTAAAAGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA
515 CTATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAA
9185 -TCTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGA
580 CT-TGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGA
*
9249 AAAGCCCTTGAATCTTTTTGGT
644 AAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* *
9271 GTTGAATTATAAATTTTTGATGAGTACTGTGG-CAAAAA-T--------A--TTTCGATTCAGTT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
* * * * ** *
9324 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAGTCGTATACCAACCATCACGGTTTCTGGCAGAAAATACGTTACGG
66 TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
* * ** * **
9389 GACCCCAGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCATGGAGACCCCTTTTAATATCTATATTCATCTAA
131 GGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
* * *
9454 TCAAGTATTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGGTTTTACGAGCTTCTAATTTTTGAATCTTGTT
196 TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTC-------TGAATCTTGTT
9519 TCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAGCC
254 TCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAGCC
* * *
9583 CTTAAATCTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTACTGTGGCCATAAATTGGGGAAAA
318 CTTAAATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAA
* *** * * * *
9648 ATTTTTCGGTTCTGTTTTTGCAAAATTTTATTTGAAGTCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTAGC
383 ATTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGC
** * * * * * * ** * **
9713 TGAAAATACATTACGGGACCCCAGCTTAGTTTTGCAAGCTTTTTGGCATGGAGATTCCTTTTAAT
448 TGAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAAT
* * **
9778 ATCTATATTCATCTAATCAAGTCTTAGTCACATTGGATTTAAAAATATGTTTTTACGAGCTTCTG
513 ATCTATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTG
9843 AATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCAT
578 AA-CTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCAT
* *
9908 GTAAAGCCCTTAAATCTTTTTGTT
642 GAAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* *
9932 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGCCCAAAAATTGTGGAAAAATTTTTACGTTTCAGT
1 GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTT-CGTTTCAGT
* * ** *
9997 TTTTGCAAAATTTTAGCGGAAGTCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAATACGTTACG
65 TTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCG
* * * * * * **
10062 GGACCCCGGCTTAGTTTTGCAAGATTTTTGGCGCGGAGACTCCTTTTAATATCTATATTCATCTA
130 GGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTA
* * * *
10127 ATTAAGTGTTAGCCACATTGGATTTAAGAATATGGTTTTACGAGCTTCTAATTTATGAATCTTGT
195 ATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTC-------TGAATCTTGT
10192 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAAGCATGAAAAG
253 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAAGCATGAAAAG
*
10256 CCCTTAAATCTTTTTGGCGTTGAATTATATATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAA
316 CCCTTAAATCTTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAA
* * * * *
10321 AAATTTTTCGGTTTAGTTTTTTCAAAATTTTAACCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTG
381 AAATTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTG
* ** * * ** * **
10386 GCTAAAAATACGTTACGGGACCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGC-GGGAAGACCCCTTTT
446 GCTGAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCG-AGACTCCTTGA
* * *
10450 AATATCTATATTCATCTAATCAAGTCTTAACCACATTGGATTTAAGAATATGTTTTTACGAGCTT
510 AATATCTATATTCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTT
10515 CTGAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCATAT-TCGAA
575 CTGAA-CTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGT-GAA
*
10578 GCATGAAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGC
638 GCATGAAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGT
* *
10606 GTTGAATTA-AATATTTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAACTTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAG
1 GTTGAATTATAA-A-TTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAG
** **
10670 ----T------TTTT-GCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAATACGTTAA
64 TTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCC
* * * ** * * * **
10724 GGGACCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGTGCGGACACCCCTTTTAATATCTATATTCATCT
129 GGGGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCT
* *
10789 AATCGAGTCTTATCCACATTGGATTT
194 AATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTT
10815 TTGGTGACGA
Statistics
Matches: 8838, Mismatches: 1111, Indels: 403
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
644 13 0.00
645 124 0.01
646 303 0.03
647 411 0.05
648 257 0.03
649 29 0.00
650 1 0.00
651 2 0.00
652 116 0.01
653 51 0.01
654 1 0.00
655 1 0.00
658 1 0.00
659 2 0.00
660 245 0.03
661 355 0.04
662 843 0.10
663 382 0.04
664 905 0.10
665 2006 0.23
666 1772 0.20
667 346 0.04
668 31 0.00
670 1 0.00
671 1 0.00
673 6 0.00
674 285 0.03
675 348 0.04
ACGTcount: A:0.32, C:0.15, G:0.17, T:0.36
Consensus pattern (665 bp):
GTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGTTTCAGTT
TTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACGGTTTCTGGCTGAAAACGCGTTCCGG
GGCCCCAGCTCAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATATTCATCTAA
TCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGTTTCGATTT
AATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATC
TTTTTGGCGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCG
GTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAACATCACGATTTCTGGCTGAAAACG
CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTTGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT
TCATCTAATCAAATCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAACTTGTT
TCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAGCCC
TTAAATCTTTTTGGT
Done.