Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01021261.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig21294, whole genome shotgun sequence
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* * * *
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* ** **
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* * * * *
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* * * * *
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315 TCGGCTAAAATTTTGC
* * *
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* ** * * * * * * *
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126 GAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAA
* * ***
6205 TGTGGTTGAGATTTGGTTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCTGACATAAAAAATCATGCA
191 TGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCTGACGCCAAAAATCATGCA
* * * *
6270 AAATTGACCCGGGCCCCGGAATGCGTTTTTAGCCGAAAACCGTGATGGTGTACACGATTTCGGCT
256 AAACTGACCCGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTGTACACGATTTCGGCT
6335 AAAATTTTG-
321 AAAATTTTGC
* * * * *
6344 TAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCGCAATTTCTAGCGAAAATACTCATAAAATTTATATAATTC
1 AAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCTCAATTTTTAGCTAAAATACTCATAAAATATATATAATTC
* * * * * **
6409 AACGCCAAAAAAATTGAAAGCATTTTTCATGCTTCTAATATCATTTTTCCTATTTTATTTCCAAA
66 AACGCCAAAAAAATTG-GAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTTT-TTTCTGAA
* * * * * * *
6474 TTAATTTTTGATTAAACCGAAACAAGATTTAGATACTCGTAAAAACAAATCCTTAAATACAGTGT
129 TTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGT
* * * * * * * * *
6539 GGCTCAAATTAGGTTAGCTGAATATAGATATATTTTAAGGAGTCTTGGCGCAAAAAAT-ATGCAA
194 GGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAG--ATATTTCAAGGAGTCCTGACGCCAAAAATCATGCAA
* * ** * *
6603 AATTGACCTAGGGATCCGAAACACGTTTTTAGCCAAAAAAAAACCATGAT-G-GTACACGATTTC
257 AACTGACC-CGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCC----AAAAACCGTGATGGTGTACACGATTTC
* * *
6666 GCCTAAAATATTAC
317 GGCTAAAATTTTGC
* * * * * *
6680 AAAAAATGACCCGAAATATTTT-TCTCAAATTTTTAGCCATAATACTCATAAAAAATATATAATT
1 AAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCTC-AATTTTTAGCTAAAATACTCATAAAATATATATAATT
* * * * * * * * *
6744 CAACGACAAAAAGATTGAAGGGCATCTCACGCTTTTAATATCGTTTGTCCT-TTTCTTTTC-AAA
65 CAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTT-TTTTCTGAA
* * * * **
6807 TTAATTTCTAATTAAATCGAAACATGATTCAAATGCTCGTAAAAA-GAATTCTTAAATTAAATGT
129 TTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGT
* * * * * ** ** * *
6871 GACTAAGATTTGCTTGGATGAATATAGATTTTTCAAGGAGTTTTTCCACAAAAAATCATGCAAAA
194 GGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCTGACGCCAAAAATCATGCAAAA
** * ** *
6936 CAAACACGGGGCCCCGAAACTTGTTTTTAGCCAAAAAGCCGTGAT-G-GTACACAATTTCGGCTA
259 CTGAC-CCGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAA-CCGTGATGGTGTACACGATTTCGGCTA
6999 AAATTTTGC
322 AAATTTTGC
* * * * *
7008 AAAAATTGATCCGAAATATTTTTCCTCAATTTTTAGCCACAATACTCATAATATATATATATATA
1 AAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCTCAATTTTTAGCTAAAATACTC---ATA-A-A-ATATATA
* * * * ** *
7073 TAATTTAACACCAAAAATATTGGAGGACTTTTCATGCTTTTAATATTGTTTTT-C-ATATTTTTC
60 TAATTCAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTTTTTTC
* * *
7136 TGAATTAATTTATAATTAAATCAAAACAAGATTCAGATGCTCGT-AAAACAAGA-CCTTAAATTC
125 TGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAA-ATCCTTAAATCC
* * * * * ** *
7199 AATATGGCCGAAATTTGATTAGATGAGTATAGATATGTCAAGGAGT-CTCGGTGCCAAGAATCAT
189 AATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCT-GACGCCAAAAATCAT
* **
7263 GCAAAACT-A--AGCTCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACACGATTT
253 GCAAAACTGACCCGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG-T-GTACACGATTT
** *
7325 CAACAAAAATTTTGC
316 CGGCTAAAATTTTGC
* ** * *
7340 AAAAAATGACATGAAAAATTTT-CCTCGATTTTT-GACTAAAATACTCATAATATATATATATAT
1 AAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCTCAATTTTTAG-CTAAAATACTCAT-A-A-A-ATATATAT
* * * * * *
7403 AATTTAACACCAAAAAGATTGGAGGAATTTTCACGCTTTTAATATCATTTTT-C-ATATTTTCCT
61 AATTCAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTTTTTTCT
* * * *
7466 TAATCAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAAT-TTTGAAATTCA
126 GAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTT-AAATCCA
** * * * * *
7530 ATGTACCTGAGATTTGATTAGATGAATATGGATATCTCAAAGAG-CCTTAGCGCCAAATATC-TG
190 ATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCTGA-CGCCAAAAATCATG
* * ** * * * * ** **
7593 CAAAACTTAGCCGGGGTACCGGAACACGTTTTTAACTAAAAACCATGTTTGATTAT-TACATAAT
254 CAAAACTGA-CCCGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACC--G--TGATGGTGTACACGAT
7657 TTCGGCTAAAATTTTGC
314 TTCGGCTAAAATTTTGC
* *
7674 AAAAATTGA-CCGAAA-AGTTATTTCCTCAATTTTTAG-TCACAATAAC-CATAAAA-ATTATAT
1 AAAAATTGACCCGAAAGA-TT-TTCCCTCAATTTTTAGCT-AAAAT-ACTCATAAAATA-TATAT
* * * * * * * *
7734 AATTCAACGCCAAAAATATTGAAGGATTTTTCATGCTTCTAATATCGTTTCTCCTATTATTTTCT
61 AATTCAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTTTTTTCT
* * * ** * *
7799 GAATTAATTTCTAATTAAATTGAAACATGATTCAGATGCTTGT-ATTACAAATTCTTAAATCTAA
126 GAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAA
* ** * * *
7863 TGTGGCTAAGATTTCCTTAGTTGAATATAGATATTACAAGGAGT-CTCGGCGCCAAAAATCATGC
191 TGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCT-GACGCCAAAAATCATGC
* * * *
7927 AACACTGAACCGAGGCCCCGGAACGCGTGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATTTCGACTAACGTACA
255 AAAACTGACCCG-GGCCCCGAAACGC--GTTTTTAGCCAAAAACCGTGA--T-G-GT---GTACA
* * *
7992 CAATTTCGGCTAATATTTTAC
310 CGATTTCGGCTAAAATTTTGC
* * * * * *
8013 AAAAATTGATCAGAAATATTTTTCCTC-ATTTTTTGTCTAAAATACTCAT-GAA-ATATATAATT
1 AAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCTCAATTTTTAG-CTAAAATACTCATAAAATATATATAATT
** * * * *
8075 CAA-TTCAAAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTT-C-A-TATTTTCTTAAT
65 CAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTTTTTTCTGAAT
* * * *
8136 TAATTTCTAATTAAATCAAAATAAGATTCAGATGCTCGT-AAAACAAATCCCTAAATGCAATGTG
130 TAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTG
* * * * ** *
8200 GCTGAGATTTGATTAGATGAATATATATATTTTATGGAGTCTTGACATCAAAAATCATACAAAAC
195 GCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCTGACGCCAAAAATCATGCAAAAC
* * * * * * * * *
8265 TAAGTCGGGGCCCCTAAACGCTTTTTTTAG-CAATAACCGTGAT-G-GTACTCGATTTCAGTTAA
260 TGA-CCCGGGCCCCGAAACGC-GTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTGTACACGATTTCGGCTAA
8327 AATTTTGCAC
323 AATTTTG--C
** * * * * *
8337 AAAAAAACAGACTCGAAAAATTTTTCCTCAATTTTTGGCTAAAATACTCATGAAATATATATAAT
1 --AAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCTCAATTTTTAGCTAAAATACTCATAAAATATATATAAT
* ** ** ** *
8402 TTAACGCCAAAAAGAAATACGAGGACTTTTCACGCTTATTTTTTTATCATTTTTTAAGATTTTTT
64 TCAACGCC-AAAA-AAATTGGAGGACTTTTCACGC---TTTTAATATCA--TTTT----TCCTAT
* *
8467 TAATTTTTCTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTTAGATGCTCGTAAAAGCAAATCC
118 T--TTTTTCTGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCC
* * * * * * *
8532 TTAAATGCAATGTGGCTGAGATTTGATTTGATGAATATGGATATCTCAAGGAGTCTTGGCGCTAA
181 TTAAATCCAATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCTGACGCCAA
** * * * *
8597 AAATCATGCAAAACTGACCCGTGGCCAAGAAACGAGTGTTTTTAGGCAAAAACTGTGATGATGTA
246 AAATCATGCAAAACTGACCCG-GGCCCCGAAAC--GCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTGTA
* *
8662 CATGATTTTGGCT-AAATTTTGC
308 CACGATTTCGGCTAAAATTTTGC
** * * * * * * *
8684 AAAAAACGACCCGAAA-ACTTTTTCCTCAATTTTTTGATAAAATACTTATAAAGTGTATATGATT
1 AAAAATTGACCCGAAAGA-TTTTCCCTCAATTTTTAGCTAAAATACTCATAAAATATATATAATT
** * * * ** **
8748 CAACAACACAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATTATTTTTTATATTTTTTT-AAAAT
65 CAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTTTTTTCTGAAT
* * *
8812 TAATTTCTAATTAAATCGAAACAACATTCAGATGCTCATAAAAACAAATTCTTAAATCCAATGTG
130 TAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTG
* * * * *
8877 GCTGAAATTTGATTAGATGAATATGGATATCTT-AAGGAGTCTTGGCGGCAAAAATCATGCAAAA
195 GCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATAT-TTCAAGGAGTCCTGACGCCAAAAATCATGCAAAA
** * * * * * *
8941 CAAAGCCGGGGCCCCGGAACGCTTTTTTAGCCAAAAACTGTTATGGTTATTACACGATTTCGGCT
259 CTGA-CCCGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG-T-GTACACGATTTCGGCT
*
9006 -AAATTTTGT
321 AAAATTTTGC
* * *
9015 AAGAATTGACCCGAAAGATATTTCCC-CAATTTTT-GACTAAAATACTCATAAAAAATATATATT
1 AAAAATTGACCCGAAAGAT-TTTCCCTCAATTTTTAG-CTAAAATACTCATAAAATATATATAAT
* * * ** * *
9078 TCAATGCCAGAAAAGTT-GATGGGTTTTTTAC-ATTTCTAATATCATTTTTCCTATTTTTTT-TG
64 TCAACGCCAAAAAAATTGGA-GGACTTTTCACGCTTT-TAATATCATTTTTCCTATTTTTTTCTG
* * *
9140 AATTAATTTATAATTAAATCGAAACAATATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATTCTTAAATCCAAT
127 AATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAAT
* * *
9205 GTGACTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGTAGTCTCAGA-GCCAAAAATCATGCA
192 GTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTC-CTGACGCCAAAAATCATGCA
* * * * *
9269 AAATTGAGCCGGGTCCCCGGAATGCGTTTTTAGCCAAAAACCATGATGGTTAGTTGATACACGAT
256 AAACTGACCCGGG-CCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGAT-G---G-TG-TACACGAT
** *
9334 TTCAACTAAAATTTTAC
314 TTCGGCTAAAATTTTGC
* * *
9351 AAAAATTGACACAAAAGA-TTTCTCCTCAATTTTTGGCTAAAATACTCATAAAA-ATATATAATT
1 AAAAATTGACCCGAAAGATTTTC-CCTCAATTTTTAGCTAAAATACTCATAAAATATATATAATT
** ** * * * * * *
9414 CAATACCAAAAAGGTTGGAGGGCTTTTCACGCTTTAAATATCGTATTT--TATATTTTTCTAAAT
65 CAACGCCAAAAAAATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCATTTTTCCTATTTTTTTCTGAAT
9477 TAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAA
130 TAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAA
9518 TGTTGTTGAA
Statistics
Matches: 2836, Mismatches: 524, Indels: 293
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
322 19 0.01
324 1 0.00
326 34 0.01
327 14 0.00
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349 8 0.00
350 11 0.00
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Consensus pattern (330 bp):
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AATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTGG
CTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCCTGACGCCAAAAATCATGCAAAACT
GACCCGGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTGTACACGATTTCGGCTAAAAT
TTTGC
Found at i:7924 original size:995 final size:981
Alignment explanation
Indices: 5677--9517 Score: 3458
Period size: 995 Copynumber: 3.8 Consensus size: 981
5667 CCATGACGAT
* * * * ** *
5677 AAAAATGACCAGAAAGATTTTTCCTTAATATTTGGAAAAAATACTCAT-GAAATATATATAATTC
1 AAAAATGACCCGAAA-ATTTTTCCTCAATTTTTAGTCAAAATAC-CATAAAAATATATATAATTC
* * *
5741 AACGCCAAAAAGATTGTAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTGTTTTCATATTTTTTCTGAATT
64 AACGACAAAAAGATTGAAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGT-TTTTCATATTTTTTCTAAATT
* ** * *
5806 AATTT-TCGATTAAA-CTGAAACAAGATTCAGATGCAAGTAAAAAAAATCCTTAAAATATAATGT
128 AATTTCT-AATTAAATC-GAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAAAAATTCTT-AAATCTAATGT
* * * * * *
5869 GGTTGAGATTTGATTAGATGAATAAAAATATTTCCAGGAGTCTCAGCGCCAAAAATCATGCAAAA
190 GGCTAAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAA
* * * ** * * *
5934 CAGAGCCGTGGCCCCGTAACGCATTTTTAGCCAAAAAAAACTGTGATGGTTAGTACACGATTTCG
255 CA-AACCGGGGCCCCGAAACGTGTTTTTAGCC---AAAAACCGTGATCG--AGTACACAATTTCG
*
5999 GCTAAAATTTTGCAAAAATTGA-CTCGAAAGATATTTCCTCAATTTTTTGGCTAAAATACTCATA
314 GCTAAAATTTTGCAAAAATTGATC-CGAAAGATATTTCCTCAA-TTTTTGACTAAAATACTCATA
* * * * * * *
6063 AAAAT-T-TATATAATTGACATCAAAAAAGATTGAAGGGCTTTTAACGCTTCTAATATTAGTTTT
377 AAAATATATATATAATTAACA-CCAAAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTCTAATA-TCGTTTT
* * * * *
6126 CCTATTTTTTTTCCGAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAA
440 TC-A-TATTTTTCTGAATTAATTTATAATTAAATCAAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAA
* *
6191 ATCCTTAAATCCAATGTGGTTGAGATTTGGTTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTC-C--TG
503 ATCCTTAAATCCAATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGTG
* * * * * * *
6253 ACATAAAAAATCATGCAAAATTGACCCGGGCCCCGGAATGCGTTTTTAGCCGAAAACCGTGATGG
568 -C--CAAAAATCATGCAAAACTAAGCC-GGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG
** * * ** * * *
6318 TGTACACGATTTCGGCTAAAATTTTG-TAAAATTGACCCGAAAGATTTTCCCGCAATTTCT-AGC
629 TGTACACGATTTCAACTAAAATTTTGCAAAAAATGACATGAAAAATTTT-CCTCAATTTTTGA-C
* * * * * * * * *
6381 GAAAATACTCATAAAATTTATATAATTCAACGCCAAAAAAATTGAAAGCATTTTTCATGCTTCTA
692 TAAAATACTCATAAAATATATATAATTCAACACCAAAAAGATTG-GAGGACTTTTCACGCTTTTA
* * * * * *
6446 ATATCATTTTTCCTATTTTAT-TTCCAAATTAATTTTTGATTAAACCGAAACAAGATTTAGATAC
756 ATATCATTTTTCATATTTT-TCTT---AATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGC
* * * * * * * * *
6510 TCGTAAAAACAAATCCTTAAATACAGTGTGGCTCAAATTAGGTTAGCTGAATATAGATATATTTT
817 TCGTAAAAACAAATCCTTAAATACAATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATAT-G-GATATCTC
* *
6575 AAGGAGTCTTGGCGCAAAAAATATGCAAAA-TT-GACCTAGGGATCCGAAACACGTTTTTAGCCA
880 AAGGAGTCTTGGCGCAAAAAATCTGCAAAACTTAG-CC-GGGGA-CCGAAACACGTTTTTAG-CA
* **** * * * * *
6638 AAAAAAAACCATGATGGTACACGATTTCGCCTAAAATATTACA
941 AAAACATGTGATTAT--TACATGATTTCGGCTAAAATTTTGCA
* *
6681 AAAAATGACCCGAAATATTTTT-CTCAAATTTTTAGCCATAATACTCATAAAAA-ATATATAATT
1 AAAAATGACCCGAAA-ATTTTTCCTC-AATTTTTAGTCAAAATAC-CATAAAAATATATATAATT
* * * * * *
6744 CAACGACAAAAAGATTGAAGGGCATCTCACGCTTTTAATATCGTTTGTCCTTTTCTTTTC-AAAT
63 CAACGACAAAAAGATTGAAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCGTTTTTCATATT-TTTTCTAAAT
* * *
6808 TAATTTCTAATTAAATCGAAACATGATTCAAATGCTCGTAAAAAGAATTCTTAAAT-TAAATGTG
127 TAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAAAAATTCTTAAATCT-AATGTG
* * * * * *** * *
6872 ACTAAGATTTGCTTGGATGAATATAGATTTTTCAAGGAGTTTTTCCACAAAAAATCATGCAAAAC
191 GCTAAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAAC
*
6937 AAACACGGGGCCCCGAAACTTGTTTTTAGCCAAAAAGCCGTGAT-G-GTACACAATTTCGGCTAA
256 AAAC-CGGGGCCCCGAAACGTGTTTTTAGCCAAAAA-CCGTGATCGAGTACACAATTTCGGCTAA
* * * *
7000 AATTTTGCAAAAATTGATCCGAAATATTTTTCCTCAATTTTT-AGCCACAATACTCATAATATAT
319 AATTTTGCAAAAATTGATCCGAAAGATATTTCCTCAATTTTTGA-CTAAAATACTCATAA-A-A-
* * *
7064 ATATATATATAATTTAACACCAAAAATATTGGAGGACTTTTCATGCTTTTAATATTGTTTTTCAT
380 ATATATATATAA-TTAACACCAAAAATATTGGAGGACTTTTCACGCTTCTAATATCGTTTTTCAT
7129 ATTTTTCTGAATTAATTTATAATTAAATCAAAACAAGATTCAGATGCTCGT-AAAACAAGA-CCT
444 ATTTTTCTGAATTAATTTATAATTAAATCAAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAA-ATCCT
* * * * * * *
7192 TAAATTCAATATGGCCGAAATTTGATTAGATGAGTATAGATATGTCAAGGAGTCTCGGTGCCAAG
508 TAAATCCAATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGTGCCAAA
*
7257 AATCATGCAAAACTAAG-C-TCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGGTTAGTACAC
573 AATCATGCAAAACTAAGCCGGCCCCGAAACGCGTTTTTAGCCAAAAACCGTGATGG-T-GTACAC
* *
7320 GATTTCAACAAAAATTTTGCAAAAAATGACATGAAAAATTTTCCTCGATTTTTGACTAAAATACT
636 GATTTCAACTAAAATTTTGCAAAAAATGACATGAAAAATTTTCCTCAATTTTTGACTAAAATACT
* *
7385 CATAATATATATATATATAATTTAACACCAAAAAGATTGGAGGAATTTTCACGCTTTTAATATCA
701 CAT-A-A-A-ATATATATAATTCAACACCAAAAAGATTGGAGGACTTTTCACGCTTTTAATATCA
* *
7450 TTTTTCATATTTTCCTTAATCAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAAC
762 TTTTTCATATTTTTCTTAATTAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAAC
* * ** * * *
7515 AAAT-TTTGAAATTCAATGTACCTGAGATTTGATTAGATGAATATGGATATCTCAAAGAGCCTTA
827 AAATCCTT-AAATACAATGTGGCTGAGATTTGATTAGATGAATATGGATATCTCAAGGAGTCTTG
* * * *
7579 GCGCCAAATATCTGCAAAACTTAGCCGGGGTACCGGAACACGTTTTTAACTAAAAACCATGTTTG
891 GCGCAAAAAATCTGCAAAACTTAGCCGGGG-ACCGAAACACGTTTTTAGC-AAAAA-CATG--TG
*
7644 ATTATTACATAATTTCGGCTAAAATTTTGCA
951 ATTATTACATGATTTCGGCTAAAATTTTGCA
* *
7675 AAAATTGA-CCGAAAAGTTATTTCCTCAATTTTTAGTCACAATAACCATAAAAAT-TATATAATT
1 AAAAATGACCCGAAAA-TT-TTTCCTCAATTTTTAGTCAAAAT-ACCATAAAAATATATATAATT
* * * * * * * *
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* * * ** *
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127 TAATTTCTAATTAAATCGAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAAAAATTCTTAAATCTAATGTGG
** * * *
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192 CTAAGATTTGATTAGATGAATATAGATATTTCAAGGAGTCTCGGCGCCAAAAATCATGCAAAAC-
* * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * *
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* * * * * * ****
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* ** * *
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* * * **
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* *
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* * * * ** *
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* * *
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** * ** * ** *
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* * * * *
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442 ATA-TTTTTCTGAATTAATTTATAATTAAATCAAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATC
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* *
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TAATTTATAATTAAATCAAAACAAGATTCAGATGCTCGTAAAAACAAATCCTTAAATCCAATGTG
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TTTGCA
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9897 ATATTATAAT-TAAAT
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1 ATATTATAATCTAAA
9927 AATAATTATT
Statistics
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* *
10167 TAAGA T-AG- TAAGA TATGA TAAGA TAAGA TAAGA TAAGA CAAGA
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Statistics
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*
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Statistics
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Done.