Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: AWUE01008798.1 Corchorus olitorius cultivar O-4 contig08825, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 2158
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.18, T:0.36
Found at i:622 original size:333 final size:333
Alignment explanation
Indices: 1--2158 Score: 2681
Period size: 333 Copynumber: 6.6 Consensus size: 333
* * * *
1 CGTTTCGGGGCCGCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCTCCGAGACTCCTTGAAATTTCTATAT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT
* *
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGAGA-TTAAGGATATGCTTTTACGAGCTTGTGAATATTG
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTG-GATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTG
* * *
130 TTTCGATTTAATCAAAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGC
130 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGTATGAAAAGC
* *
194 CCTTAAATCTTTTTGTTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGT-GCCAAAAAATT-ATGGA
195 CCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCC-AAAAATTGA-GGA
* * *
257 AAAATTTTTT-GATTCAGTTTTTGCCAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCTCGGTTTC
258 AAAATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAA-CATCACGGTTTC
* *
321 TGGCAGAAAACA
322 TGGCTGAAAACG
* * * * * * *
333 CATTCCGAGGCCCCGGCTTAGTTTAGGAAGATTTTTGGCACCAAAAATCCTTGAAATATCTATAT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT
* * * * * * *
398 TTATTTAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTGT
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTGT
* * * *
463 TTCGATTTAATTAAAAATTATTTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGTATGAAAAGCC
131 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGTATGAAAAGCC
* * **
528 CTTAAATCTTTGTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTTCTGTGGCTGAAAATTGAGGAAAA
196 CTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAA
*
593 ATTTTCT-GTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTG--------T----GTTTCTGGC
261 ATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACATCACGGTTTCTGGC
*
645 AGAAAACG
326 TGAAAACG
* * * *
653 CGTTCCGGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCAAT-ATTTTTGGCGCTGAGACTCCTTGAAATATCTATA
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGC-ATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATA
* * * * * ** *
717 TTTATTTAATCAAGTCTTAGCCACTTTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTTG
65 TTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTG
* * *
782 TTTCGATTTAATTAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGC
130 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGTATGAAAAGC
* *
847 CCTTTAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCAAAAAATTGAGGAAA
195 CCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAA
* * **
912 AA-TTTTTCGGTTCAGTTTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAGCATCACAATTTCTG
260 AATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAA-CATCACGGTTTCTG
976 GCTGAAAACG
324 GCTGAAAACG
* * * *
986 CGTTCCGGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGGTTTTTGG-ATCCGAGACTACTTGAAATATCTATA
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCA-CCGAGACTCCTTGAAATATCTATA
* * * *
1050 TTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTAGACTTAAGGATATGCTTTTACGAGCTTGTGAATATTG
65 TTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTG
* *
1115 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAAC
130 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGTATGAAAAGC
* *
1180 CCTTAAATCTTTTTGTTCTTGAATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAA
195 CCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAA
* * *
1244 AATTTTTT-GATTT-AGTTTTTGCAAAATTTTATCCGAAATCGTCTACTATTCATCACGGTTTCT
260 AATTTTTTCG-TTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTA-ACATCACGGTTTCT
1307 GGCTGAAAACG
323 GGCTGAAAACG
* * * * *
1318 CGTTCCGGGGCCCCGGCTAAGTTTCGTATGATTTTTGGCACCGAG---CC-T---CT-TCTATTT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT
* *
1375 TCATCTAATCAAGTCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTTCGAGCTTCTGAATATTGT
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTGT
* * *
1440 TTCAATTTAATCAGAATTTAATTTGGAAAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGTAGCT-TGAAAA
131 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGG--AAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAG-TATGAAAA
* *
1504 GCCCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTA-AAATCATTTTATGAGTACTGTGGCCCAAAATTGAGG
193 GCCCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAAT-TTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGG
*
1568 AAAAAATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCC-AAA------A-T--CGTCACGGTTT
257 -AAAAATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACATCACGGTTT
*
1623 CTTGCTGAAAACG
321 CTGGCTGAAAACG
* * * * * * * * * *
1636 CTTTCCGGGGCACCGGCTAAGTTTTGCATGATTTTTGACGCTGAGATTCCTTGAAGTTTCTATAT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT
* * * * *
1701 TCATCTACTCAAATCTCAGTAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTAAATCTTGT
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTGT
* * ** *
1766 TTCGATTTAATCGGAAATTAATTTGGAAAAAAATTAAG-AAAATTATATGCGAAGCT-TGAAAAG
131 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAA-TAGGAAAAACCATATGTGAAG-TATGAAAAG
* *
1829 CCCTTAAATCTTTTTGTTGTTGAATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGGGGAA
194 CCCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAA
* *
1893 AAA-TTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAATCGTGTACTAACCATGACGGTTTC
259 AAATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAA-CATCACGGTTTC
*
1957 TGGCTGAAAACA
322 TGGCTGAAAACG
* * * * *
1969 CGTTCCGGGGCCCCAGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGAGTCATTGAAATTTTTATAT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT
* * *
2034 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGGA-TTAAGGATATCTTTTTACGAACTTGTGAATATTG
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACT-GGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTG
2098 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGG-AAAACCATATGTGAAGTATGAAAA
130 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGTATGAAAA
Statistics
Matches: 1599, Mismatches: 170, Indels: 115
0.85 0.09 0.06
Matches are distributed among these distances:
318 60 0.04
319 4 0.00
320 288 0.18
321 35 0.02
322 7 0.00
323 31 0.02
324 144 0.09
325 11 0.01
326 145 0.09
327 29 0.02
328 18 0.01
329 24 0.02
330 2 0.00
331 24 0.02
332 268 0.17
333 503 0.31
334 6 0.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.18, T:0.36
Consensus pattern (333 bp):
CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCCTTGAAATATCTATAT
TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATATTGT
TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGTATGAAAAGCC
CTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCCAAAAATTGAGGAAAA
ATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACATCACGGTTTCTGGC
TGAAAACG
Found at i:2025 original size:983 final size:981
Alignment explanation
Indices: 1--2158 Score: 3112
Period size: 983 Copynumber: 2.2 Consensus size: 981
* * * *
1 CGTTTCGGGGCCGCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCTCCGAGACTCCTTGAAATTTCTATAT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCATTGAAATTTCTATAT
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGAGATTAAGGATATGCTTTTACGAGCTTGTGAATATTGT
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGAGATTAAGGATATGCTTTTACGAGCTTGTGAATATTGT
* * *
131 TTCGATTTAATCAAAAATTAATTTGGAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAGCCC
131 TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAACCC
* *
196 TTAAATCTTTTTGTTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTATTGTGCCAAAAAATTATGGAAAAA
196 TTAAATCTTTTTGTTCTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGCCAAAAAATTATGGAAAAA
* * *
261 TTTTTTGATTCAGTTTTTGCCAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCTCGGTTTCTGGCA
261 TTTTTTGATTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTCTACTAACCATCACGGTTTCTGGCA
* *
326 GAAAACACATTCCGAGGCCCCGGCTTAGTTTAGGAAGATTTTTGGCACCAAAAATCCTTGAAATA
326 GAAAACACATTCCGAGGCCCCGGCTAAGTTTAGGAAGATTTTTGGCACC--AAAGCCTT--AATA
* * * *
391 TCTATATTTATTTAATCAAGTCTTAGCCACATTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGA
387 TCTATATTTATCTAATCAAGTCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGA
* * * *
456 ATCTTGTTTCGATTTAATTAAAAATTATTTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGTATG
452 ATATTGTTTCAATTTAATCAAAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGTATG
* * **
521 AAAAGCCCTTAAATCTTTGTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTTCTGTGGCTGAAAATTG
517 AAAAGCCCTTAAATCTTTGTGGTGTTGAATTATAAATATTTTATGAGTACTGTGGCCCAAAATTG
*
586 AGGAAAAATTTTCTGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTGTTTCTGGCAGAAAA
582 AGGAAAAATTTTCTGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCAAAATCGTGTGTTTCTGGCAGAAAA
* * *
651 CGCGTTCCGGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCAATATTTTTGGCGCTGAGACTCCTTGAAATATCTAT
647 CGCGTTCCGGGGCACCGGCTAAGTTTTGCAATATTTTTGACGCTGAGACTCCTTGAAATATCTAT
* * * * * ** * *
716 ATTTATTTAATCAAGTCTTAGCCACTTTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATCTT
712 ATTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTAAATCTT
* * *
781 GTTTCGATTTAATTAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGCATGAAAAG
777 GTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAAGAAAAACCACATGCGAAGCATGAAAAG
*
846 CCCTTTAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCAAAAAATTGAGGAA
842 CCCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCAAAAAATTGAGGAA
* *
911 AAATTTTTCGGTTCAGTTTTTGTAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAAGCATCACAATTTCTG
907 AAATTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAATTTCTG
*
976 GCTGAAAACG
972 GCTGAAAACA
* * * *
986 CGTTCCGGGGCCCCGGCTCAGTTTTGCATGGTTTTTGG-ATCCGAGACT-ACTTGAAATATCTAT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCA-CCGAGACTCA-TTGAAATTTCTAT
1049 ATTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACT-AGACTTAAGGATATGCTTTTACGAGCTTGTGAATAT
64 ATTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGAGA-TTAAGGATATGCTTTTACGAGCTTGTGAATAT
1113 TGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAA
128 TGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGG-AAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAA
1178 ACCCTTAAATCTTTTTGTTCTTGAATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGGCC-AAAAATTGA-G
192 ACCCTTAAATCTTTTTGTTCTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGT-GCCAAAAAATT-ATG
* * **
1240 GAAAAATTTTTTGATTTAGTTTTTGCAAAATTTTATCCGAAATCGTCTACTATTCATCACGGTTT
255 GAAAAATTTTTTGATTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTCTACTAACCATCACGGTTT
* * * * * * * * *
1305 CTGGCTGAAAACGCGTTCCGGGGCCCCGGCTAAGTTTCGTATGATTTTTGGCACC-GAGCC-T-C
320 CTGGCAGAAAACACATTCCGAGGCCCCGGCTAAGTTTAGGAAGATTTTTGGCACCAAAGCCTTAA
*
1367 T-TCTAT-TTTCATCTAATCAAGTCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTTCGAGCTTC
385 TATCTATATTT-ATCTAATCAAGTCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTC
* * * *
1430 TGAATATTGTTTCAATTTAATCAGAATTTAATTTGGAAAAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGTA
449 TGAATATTGTTTCAATTTAATCAAAAATTAATTTGG--AAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAA
*
1495 GCT-TGAAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTA-AAATCATTTTATGAGTACTGTGGCCC
512 G-TATGAAAAGCCCTTAAATCTTTGTGGTGTTGAATTATAAAT-ATTTTATGAGTACTGTGGCCC
*
1558 AAAATTGAGGAAAAAATTTTTTCGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCAAAATCGTCACG-GTT
575 AAAATTGAGG-AAAAATTTTCT-GTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCAAAATCGT---GTGTT
* * * *
1622 TCTTGCTGAAAACGCTTTCCGGGGCACCGGCTAAGTTTTGC-ATGATTTTTGACGCTGAGATTCC
635 TCTGGCAGAAAACGCGTTCCGGGGCACCGGCTAAGTTTTGCAAT-ATTTTTGACGCTGAGACTCC
* * * *
1686 TTGAAGTTTCTATATTCATCTACTCAAATCTCAGTAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGA
699 TTGAAATATCTATATTCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGA
* ** *
1751 GCTTCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCGGAAATTAATTTGGAAAAAAATTAAG-AAAATTATATG
764 GCTTCTAAATCTTGTTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAA-TAAGAAAAACCACATG
* *
1815 CGAAGCTTGAAAAGCCCTTAAATCTTTTTGTTGTTGAATTATAAA-TTTTTATGAGTACTGTGGC
828 CGAAGCATGAAAAGCCCTTAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGC
* *
1879 CAAAAATTGGGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAAATCGTGTACTAA
893 AAAAAATTGAGGAAAAATTTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCG-AAATCGTGTACTAA
* **
1944 CCATGACGGTTTCTGGCTGAAAACA
957 CCATCACAATTTCTGGCTGAAAACA
* * *
1969 CGTTCCGGGGCCCCAGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGAGTCATTGAAATTTTTATAT
1 CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCATTGAAATTTCTATAT
* *
2034 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGGATTAAGGATAT-CTTTTTACGAACTTGTGAATATTG
66 TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGAGATTAAGGATATGC-TTTTACGAGCTTGTGAATATTG
*
2098 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAATAGG-AAAACCATATGTGAAGTATGAAAA
130 TTTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAA
Statistics
Matches: 1051, Mismatches: 99, Indels: 50
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
976 3 0.00
977 83 0.08
978 5 0.00
979 86 0.08
980 11 0.01
981 57 0.05
982 82 0.08
983 376 0.36
984 11 0.01
985 269 0.26
986 68 0.06
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.18, T:0.36
Consensus pattern (981 bp):
CGTTCCGGGGCCCCGGCTTAGTTTAGCATGATTTTTGGCACCGAGACTCATTGAAATTTCTATAT
TCATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGAGATTAAGGATATGCTTTTACGAGCTTGTGAATATTGT
TTCGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAATAGGAAAAACCATATGTGAAGCATGAAAAACCC
TTAAATCTTTTTGTTCTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGCCAAAAAATTATGGAAAAA
TTTTTTGATTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTCTACTAACCATCACGGTTTCTGGCA
GAAAACACATTCCGAGGCCCCGGCTAAGTTTAGGAAGATTTTTGGCACCAAAGCCTTAATATCTA
TATTTATCTAATCAAGTCTCAGCAACACTGGATTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTGAATAT
TGTTTCAATTTAATCAAAAATTAATTTGGAAAAAAATAGGAAAAACCACATGTGAAGTATGAAAA
GCCCTTAAATCTTTGTGGTGTTGAATTATAAATATTTTATGAGTACTGTGGCCCAAAATTGAGGA
AAAATTTTCTGTTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCAAAATCGTGTGTTTCTGGCAGAAAACGCG
TTCCGGGGCACCGGCTAAGTTTTGCAATATTTTTGACGCTGAGACTCCTTGAAATATCTATATTC
ATCTAATCAAATCTCAGCAACACTGGACTTAAGGATATGTTTTTACGAGCTTCTAAATCTTGTTT
CGATTTAATCAGAAATTAATTTGGAAAAAAATAAGAAAAACCACATGCGAAGCATGAAAAGCCCT
TAAATCTTTTTGGTGTTGAATTATAAATTTTTTATGAGTACTGTGGCAAAAAATTGAGGAAAAAT
TTTTCGGTTCAGTTTTTGCAAAATTTTAGCCGAAATCGTGTACTAACCATCACAATTTCTGGCTG
AAAACA
Done.