Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
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Warning! 357000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 402
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1296 TAGTATGAAC
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1296 TAGTATGAAC
* * *
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1 ATAACCAATTGTTTGATGACAA
*
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1 ATAACCAATTGTTTGATGACAA
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1 A
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Statistics
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* * * * *
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* * * * * * *
1714 TAATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* ** *** * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* *** * *
2020 ATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCATGTATGTTAA--AAAA
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* * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-A
* * * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * ** *
2657 AACTA-TTGAACTAGTTC-G-AAACAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
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* * ** * * *
2719 TATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTGAAA
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * * ***
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* * * * ** * *
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* ** * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
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* * * * *
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126 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAA
* * * * * *
3482 TAATTGTTTTA-GACAAAAC-AAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
** * * * *
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65 TAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAA-ACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATAATTTTT
* ** * * * *
3606 GAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATAAACAGAAA
126 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * *
3661 CAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-CTTTCAAATAGATAATTGTTC-AATAGTT
1 CAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * * * *
3723 ATAACTATTTGAACAT-GTTC-AAAAACA-ATTTTTGTTTTTTAAAT-TATTATTTATTAATTTT
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* * *
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* * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
** * * * * * **
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* * * * *
4144 ATATTAATAAATTAATGTTATTTTAATCCGAATAA-TTTGTATGAA-TAAAA
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* ** **
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
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* * * *
4320 G-AATATTGATTAAATTTGTTTTTATTTTAATT--GAAATAA-CTTGTAT-AAATAGAAA
126 GAAATATT-AATAAATTAG-TATTATTTT-ATTCCG-AATAAGCTTGTATGAACT-GAAA
* * * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
4439 AACTATTTGAACTT-GTTCGATAAATAG-ATTCAGTTTTTAAATATCTTA--T-TAATTTTTCAA
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** * *
4499 ATATTAATAAATTAAAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA
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* * * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * ** * *
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* * * * **
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* * * * * *
4731 AAATT-TTTTATAACAAAACAAATGGTCATAAGGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTA-TTA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCA
* ** * * * * * *
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* *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
5503 GACTATTTGAATTTGTTTGGTAAACA-AA-T-TTTTTT-AATGTCTTGCTTATTAATTTTTTG-A
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* * * * *
5563 ATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCATGTGTGAACTAAAA
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* * * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
5673 CAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACATATTTTGTTTTTTAAATATCTTAGC-TATTAATTTTAG
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* * * * * *
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* * * *
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5911 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTAT-AAATATAAA
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* * * * * *
5962 TAACTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTCAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
*** * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
6206 AACTATTT-AACTT-ATTCGGTAAACA-TATT-CTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAA
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* * * *
6267 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTACAT-CAAATAAGCTTATATGAACCGAAA
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* * * * *
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1 CAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTC
* * * * * * * **
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** * * * * * *
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1 CA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
6856 AAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGTCTT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * **
7165 AACTAATAAATAAGTGTTATTTTATTCCAAATAAGGTTGTAT-AACCAAAA
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* ** * * ** * * *
7215 AACATTGTAATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTGAAATAGCCA
1 CA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * * * *
7280 TAATTATTTGAATTAATTCGCTAAGCAG-ATGTA-CTTTTAAATCACTTA--T-TAATTTTTGAA
65 TAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACAGAAT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAA
* * *
7340 ATATTAATAAAGT-GTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATTGAAA
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * * * * * * *
7390 TAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATACTCGT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* ** * * *
7455 AACTATTTGAATTTGTTCAATAAACA-AATT-TATTTTTAAAACT-TTGCTTATTTATTTTTG-A
66 AACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACAGAATTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAA
* * ** *
7516 ATATTAAGATATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TATGAACTGAAA
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * * *
7567 CAATTG-TTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATATTCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *
7631 TAACTATTTAAACTT-GTTCGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTG
65 TAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTG
* * * * * * *
7694 -AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTA-GGATTGAAA
127 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * * * * * ** * **
7746 CAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCGTAATGATTTGAAATA-AAAATTATTTTAACAGTTTT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
7810 AACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACA-CA-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAGA
66 AACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGA-A
* * * * * *
7872 ATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATG-ATTAAAAA
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAA
* * *
7924 TAATTGTTTTATGAC--AA-AAAAGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
7985 AATTATTTTAATTGAG-TCGATAAACA-AATTTATTTTTTAAAAT-TTTTATTTAATAATTTATG
66 AACTATTTGAATTG-GTTCGGTAAACAGAA-TTATTTTTT-AAATCTCTTACTT-ATAATTTTTG
* * * * * *
8047 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCC-ATCTAAACTTGAATTAACTAAAA
127 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGA-ATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * * * * * * *
8101 CAATT-TTTTATGA-AAAAAAAAAGGTTATAATAATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAATAAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *
8164 AACTATTTGAACTT--TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTTTC-TATTAATTTTTT
66 AACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAAACAGAATTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTA-TAA-TTTTT
* * ** * *
8226 G-AATGTTAATAAATTAGTATTAGTTTATTCTAAATAAGCTTGCATGAACTAAAAA
126 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAA
* *
8281 CAA-TGATTTTATGACTAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATT-TTCTAATAGT
1 CAATTG-TTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGT
* *** * *
8344 CATAACCATTTGAA-CAATTCGCTAAA-TGAATTTATTTTTTAAATCTC-TA-TTATTAATTTTT
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* * * * ** * **
8405 AAAATATTATTAAATTAGTATTATTTGAATATG-ATAAGCTTCTACAAAC--AAA
126 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* ** * * *
8457 CAATTG-TTTACGAC-AAACGAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATAGATTATCGTTCATATTA-TC
1 CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTC
* * ** ** * * * ** * ** **
8519 TTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATGAGCTTCAAA
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* ** ** * *
8584 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAAC-AAAA
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * ** * * * * * * *
8635 TCAATTGTTTGATGATAAAATTAAAGATTATAATGGTTTGAAACAGTTAATTGATCAAATACTCA
1 -CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
8700 AAACTATTTGAAATGGTTTGATAAGCAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCT-A
65 TAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTT-TGA
* * * * * **
8764 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TT-GGAACAAACTTATATTAACAAAAA
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * ** * * * *
8815 CAATTGTTATATGGCAAAACAAAAAAATAACAATGATTTGAAA-AGATAA-TGTTTAAAT-GTTA
1 CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * * *
8877 TAA-T-TTTGGAACTGGTTCAATAAATATAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTGA
65 TAACTATTT-GAATTGGTTCGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-AATTTTTGA
* * * * *
8940 AATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCTGAATAAGCTTGTATGAGCTAAAA
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * * * ** * * ** *
8993 TAATTATTTTAT-ATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAAATTGTTTCATATTTTT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT-AATTG-TTCAAATAGTC
* * * ** * * ** *
9057 TTAACTATTT-AACTGGTTAGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTTA
64 ATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGA
* * * * * **
9121 GAATTTTACTAAATTATTATTTATTTTATTGCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAA
128 -AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA
* * * ** * * *
9176 TAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTGTAACGATTTGAAATAGATAA-TATTCAAAGAGTCAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* ** * * *
9240 AACTATTTGAAATGGTAAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TAATTCTTGAAAT
66 AACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAAT
* *
9302 GTT--TAAATTAGGATTATTTTATT-CGAATAAG-TTGTATG
131 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATG
9340 TTTGAAAAAC
Statistics
Matches: 6108, Mismatches: 1333, Indels: 737
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164 87 0.01
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Found at i:2162 original size:356 final size:355
Alignment explanation
Indices: 1355--9339 Score: 4965
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1345 GACAAATAAC
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * ** * *
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* * * *
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* * *
1908 TAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCCAATAGTCATAACTATTTGAACTG
195 TAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG
* * * *
1973 TTCGATAAATAGATTTAATTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTA
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* *
2038 TTTTATTTTAAATAAGCATGTATGTTAA-AAAA
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* * * * * *
2070 CAATCGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATGGCT-A
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* ** * * * *
2134 TAATTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTT-TTTTAAAAATCTCTTAGTTGTTAACTTTCGAA
66 TAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-A
* ** * * * *
2198 ATATTAACAAAGGAGTATTATTTT-TT-GGAA-AACCTTTTAAGAACTAAAACAATTGTTTTATG
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATG
* ** * * * *
2260 ACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAAAATATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
194 ATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-
* * * * *
2325 TGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AGTGTTAATAAAT
258 TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAA--TC--TCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * *
2389 TAGTATTATTTTGTTCCGAATAAGCTTGTATGACTTGAAA
317 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAA
* * * * * * * *
2429 CAATT-ATATATGACTAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG-TCT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
*
2492 TAACTATTTGAATTGGTTC-G----C-AA---A---TTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTTAGA
66 TAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGA
* * ** * * *
2541 ATATTATTAAATTAGCATTATTTT-TATCCAAATAAACTTGTATGATAAAAAACAATTATTTTAT
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
2605 GATAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTTAAATAGTTATAACTA-TTGAAC
193 GATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * *
2668 TAGTTCG--AAACAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGT
258 T-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
*** * * *
2731 AGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTGAAA
318 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * *
2770 TAATTGTTTTATAACAAAACAAAATGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAATTAG-TC
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTC
* * * *
2833 A-AATCTAGTTGAATTG-TTCAGTAAACAAATTTAATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTCATTTTT
65 ATAA-CTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTT
* * * * * *
2896 CGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAACT-AAATAATTCTTTT
127 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTT
* * * **
2960 ATGACT-AAAGAAAAGG-CTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTC-TAAACTATT
191 ATGA-TAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATT
* * * * * *
3022 TGAACTAGTT-TAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAT
253 TGAACT-GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * *
3086 TAAATTAGTATTAATTTAATCCTAATAAGGTTGTATGAAAAGAAA
312 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* * * * * *
3131 CAATTGTTTTATGATAAAA-TAAAGATCACATTGATTATG--ATAGATAATTCTTCAAATA--TC
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTC
* * * *
3191 ATAACTATTTGAATTGTTTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTCCAA
65 ATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TAG
* * * * ** * *
3252 AATATTAATAGATCAGTATTA--TT-TTGTAAATAAATTTGCATGAATAGCAACAATTGTTTTAT
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * *
3314 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGATTATATAAAC
193 GATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * *
3379 TTGTTCTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTATCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAA
258 -TG-T-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-C--T-TATTAATTTTTGA-AATATTAATAA
* * * *
3443 ATTAATATTATCTTA-TTGAAA-AA-CTTATATGAATAAAAA
315 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAA
* * * * * *
3482 TAATTGTTTTA-GACAAAAC-AAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAACA-ATC
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTC
** * * * *
3543 ATAACTATTTGAACTTCCTT-AGTAAGA-AAATTTATTTTTTAAGTCTTTTACTTTTTAATTTTT
65 ATAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAA-ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA
* * * * * *
3606 GAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATAAACAGAAACAATTAG-TT
128 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATT-GTTT
* ** * *
3670 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACTCTTTCAAATAGATAATTGTTC-AATAGTTATAACTATTTG
190 TATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
3734 AACATGTTC-AAAAACA-ATTTTTGTTTTTTAAATTATTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
255 AAC-TGTTCGATAAACAGA--TTTATTTTTTAAA-T-CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* *
3797 AATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
314 AA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA
* * * * *
3839 C-ATTG-TTTATGACGAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATATAAAATTGTTCAAATAG-TCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * * * * *
3901 TAACTATATGAACTTG-TTC-GATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTG
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* * * * * *
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129 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTT
* * * * *
4027 GTGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGA
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* * * * * **
4092 ACTTGTTCTATAAACATATTTA-TTTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAAT
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* * * * * *
4156 TAATGTTATTTTAATCCGAATAA-TTTGTATGAATAAAA
317 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA
* ** **
4194 CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAATCGCAATGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCAAATAG-TC
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGCTC
* * ** * * *
4257 A-AATTATTTAAACTT-ATTTGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTT
65 ATAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTA
* * * * * * * *
4320 GAATATTGATTAAATTTGTTTTTATTTTAAT-TGAAATAA-CTTGTATAAATAGAAAAAAGTATT
128 GAATATT-AATAAATTAG-TATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTT
* * * * *
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189 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
4447 GAACTTGTTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAATATCTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATT
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** * *
4512 AAAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
318 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* * * * * * *
4551 CAATTATTTTCTTACAAAACAAAAGGTTATAA-AATTTGAAATAGATAATTGCTCAAACAG-TCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * ** * * *
4614 TAACTATTT-ACACTGGTT-AGGCCAACAGATTCATTTTTTAAATC-CACTACTTATTAATTTTC
66 TAACTATTTGA-ATTGATTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTT-
* * * * ** *
4676 ATAATATTAATAAATTAGAATTACTTTATTCTGAATAAGATTGTACCAATAGAAAAAATT-TTTT
127 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTT
* * * * * * *
4740 ATAACAAAACAAATGGTCATAAGGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTA-TTATAACTAGTTG
191 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
4804 AATTGGTT-TAGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTAA-TTCTCAAATTATTAATAAA
255 AACT-GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAA
* * * * *
4867 TTAATATTATTTTATTTCAGACAAAC-TGATATGAACAAAA
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* ** * * * *
4907 -AGATT-TTTTATGAC-AAACTAAAAGTTCATAACAATTTAAAATATATAATTATTCATATAGC-
1 CA-ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCT
* * ** * * * *
4968 CTTAACTATTTGAACT-AGTTTGGCAAA-AATAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAACTTT
64 CATAACTATTTGAATTGA-TTCAGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * * * * * * * *
5031 CATAATATTATTAGATTGGTACTACTTTCTTC----T--GCTTGTAT-AATAAAATAATTGTTTT
126 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTT
* * * * *
5089 TTGA-GAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
191 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
5153 ACTGATTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCCTACTCATGAATTTTTGAAATATTAA-AAA
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* * ** *
5217 GTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTCATACG-ATGAACAA
316 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AA-AA
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5258 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGACATAGATAATTGTTCAAATGGC-CA
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* * * * * ** * ** *
5322 TAATTATTTAAACTAATTCAATAAACTGATTTATTTTTTAAATTTCCAACTTCTTAACTTTT-GA
66 TAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGA
* * * * * * * * * *
5386 ACATTAACAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATT
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
5451 ATAAAACAAAAGTTCATAACGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCTTGACTATTTGAATT
194 ATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C
* * * * *
5516 TGTTTGGTAAACA-A-AT-TTTTTTAATGTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-T
258 TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATT
* * *
5576 AGTATTATTTTATTT-GAATAAGCATGTGTGAACTAAAA
318 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * * * * *
5614 AAATTATTTTATG-----ACTAAAGGTTAGAATGAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TC-
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * * * *
5672 TCAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACATATTTTGTTTTTTAAATATCTTAGC-TATTAATTTTA
66 T-AACTATTTGAATTGATTCAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTA
* * * * * * * * *
5736 GAATATT-ATTAGTTCA--AATATCTTAGTCCGAGTAAGCTTGTATGAACATAAACAAGTGTTTT
128 GAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTT
* * *
5798 ATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATATT-AGATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAAC-ATTTG
191 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
5859 AACTAGTCCAATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
255 AACT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* ** *
5924 GTATTATTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATAAATATAAA
319 GTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* * * * * *
5962 TAACTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA-TTCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * * * * * *
6026 TAACTATTTGAACTCACTT-AGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTTTATA
66 TAACTATTTGAATTGA-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGA
* * * * *
6089 AAATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGATTGCATGAACAGAACCAATTGTTTTA
130 ATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
* * * * * *
6152 TGACAAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTT-AA
192 TGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
6216 CTTATTCGGTAAACATA-TT-CTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
257 C-TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
** * **
6279 TAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGAACCGAAA
317 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * * *
6319 CAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATTACTT-GAATAG-T
1 CAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGCT
* * * * * *
6381 CATGACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTC
64 CATAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TT
* ** * * * * * * *
6445 AAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAATCTGATTATGCTTGTATAAACAAAAAATATTATTTT
127 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAACA-ATTGTTTT
* * * * * * **
6510 ATAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTACA
191 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
6575 ACTTGTTTGATAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAA
256 AC-TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * *
6640 TATTTTTTTTATTTCAAACAAACTTATAT-AACAAAA
320 TA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA
* * *
6676 AAATTTGTTTTATGACAAAACATAAGGTCAT-GTCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-T
1 CAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCT
* * * *
6739 CATAATTATTTGAATT-AGTT-AGGTAAATAGAA-TTGTTTTTTAAA-CTCTTAATTATTAATTT
64 CATAACTATTTGAATTGA-TTCA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
6800 T-GAATTATTAATAGATTCA-TTTTATTTTATTCCT-AACAAGCTAGTATGAATTGAAAA-AATT
126 TAGAA-TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAACAATT
* * * * * * *
6861 ATTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACCA
186 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *
6926 TTTGAACTAGTTC-AGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATT
251 TTTGAACT-GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTGAAATATT
* * ** *
6990 ATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATGAAGCATGTATGAATAGAAA
310 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAATA-AAA
* * * * * ** * * *
7038 TAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGTTC-AATAG-TCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * * * * * * *
7101 TAACTATTT--ACTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTGATTTTTGAA
66 TAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-A
* * * * ** * * * **
7164 AAACTAATAAATAAGTGTTATTTTATTCCAAATAAGGTTGTAT-AACCAAAAAACATTGTAATAT
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACA-ATTGTTTTAT
** * * * * * * *
7228 GACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTGAAATAGCCATAATTATTTGAAT
193 GATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
7293 TAATTCGCTAAGCAGATGTA-CTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGT-GTA
258 T-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
*
7356 TTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATTGAAA
322 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * * * * *
7390 TAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATA-CTCG
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * * * *
7454 TAACTATTTGAATTTG-TTCAATAAACAAATTTA-TTTTTAAAACT-TTGCTTATTTATTTTTGA
66 TAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGA
* * * * *
7516 ATATTAAGATATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TATGAACTGAAACAATTG-TTTATG
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
7579 -TCAAAACAAAAGGTCATAAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTAAA
194 AT-AAAACAAAAGGTCAT-AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * *
7643 CTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAAT
257 C-TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC----TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * * *
7707 TTGGATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTAGGATTGAAA
317 TAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAAAA
* * * * * * ** * **
7746 CAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCGTAATGATTTGAAATA-AAAATTATTTTAACAG-TTT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* ** * *
7809 TAACTATTTGAACT-AGTTTGGCAAACACA--TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAG
66 TAACTATTTGAATTGA-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AG
* * ** * * *
7871 AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATGATTAAAAATAATTGTTTTA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTGTTTTA
* ** * * *
7935 TG--ACAA-AAAAGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTATAATTATTTTAA
192 TGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * *
7996 TTGAGTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TTTTATTTAATAATTTATGAAATATTAATAAA
257 CTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-TTAAT--TTT-TGAAATATTAATAAA
* * ** * * *
8060 TTAATATTATTTTATTCCATCTAAACTTGAATTAACTAAAA
316 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * * * * * *
8101 CAATT-TTTTATGA-AAAAAAAAAGGTTATAATAATTTTAAATAGACAATTATTCAAATA-ATAA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
** * * *
8163 TAACTATTTGAACTT--TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTTTC-TATTAATTTTT
66 TAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTT
* * * * *
8225 TGAATGTTAATAAATTAGTATTAGTTTATTCTAAATAAGCTTGCATGAACTAAAAACAA-TGATT
127 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAACAATTG-TT
* * *
8289 TTATGACT-AAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATT-TTCTAATAGTCATAACCA
189 TTATGA-TAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTA
** * * * *
8352 TTTGAACAATTCGCTAAA-TGAATTTATTTTTTAAATCTCTATTATTAATTTTTAAAATATTATT
251 TTTGAACTGTTCGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTC--TTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
8416 AAATTAGTATTATTTGA-AT-ATGATAAGCTTCTA-CAA-ACAAA
313 AAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* ** * * *
8457 CAATTG-TTTACGAC-AAACGAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATAGATTATCGTTCATATTA--T
1 CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGCT
* * * * ** * * * ** * ** * *
8518 CTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATGAGCTTCAA
64 CATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG
* * ** * * *
8583 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAACAAAATCAATTGTTTGAT
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAA-CAATTGTTTTAT
** * * * * * * * * * *
8648 GATAAAATTAAAGATTATAATGGTTTGAAACAGTTAATTGATCAAATACTCAAAACTATTTGAAA
193 GATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * *
8713 TGGTTTGATAAGCAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCT-AAATATTAATAAAT
258 T-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAAT
** * * *
8777 TAGTATTATTTT-TTGGAACA-AA-CTTATATTAACAAAAA
317 TAGTATTATTTTATTTCAA-ATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * ** * * * *
8815 CAATTGTTATATGGCAAAACAAAAAAATAACAATGATTTGAAA-AGATAA-TGTTTAAAT-G-TT
1 CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTC
* * * * * * *
8876 ATAA-T-TTTGGAACTGGTTCAATAAATATAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTT
65 ATAACTATTT-GAATTGATTCAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA
* * * * *
8938 GAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCTGAATAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTATTTT
128 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTT
* * * * ** **
9003 AT-ATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAAATTGTTTCATATTTTTTTAACTATTT
191 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-AATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
9067 -AACTGGTTAGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTTAGAATTTTACT
254 GAACT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * *
9131 AAATTATTATTTATTTTATTGCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAA
313 AAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* * * ** * * *
9176 TAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTGTAACGATTTGAAATAGATAA-TATTCAAAGAG-TCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
* * * * *
9239 TAACTATTTGAAATG-GTAAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTT-G
66 TAACTATTTGAATTGATTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAG
* *
9298 AA-ATGT-TTAAATTAGGATTATTTTATTC-GAATAAG-TTGTATG
129 AATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATG
9340 TTTGAAAAAC
Statistics
Matches: 5970, Mismatches: 1258, Indels: 800
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
340 8 0.00
341 65 0.01
342 69 0.01
343 28 0.00
344 16 0.00
345 41 0.01
346 43 0.01
347 63 0.01
348 118 0.02
349 49 0.01
350 127 0.02
351 236 0.04
352 349 0.06
353 328 0.05
354 324 0.05
355 413 0.07
356 1072 0.18
357 847 0.14
358 514 0.09
359 529 0.09
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363 27 0.00
364 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTCA
TAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGAT
AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT
TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA
Found at i:10669 original size:178 final size:179
Alignment explanation
Indices: 10351--12338 Score: 679
Period size: 181 Copynumber: 10.8 Consensus size: 179
10341 NNNNNNNNNN
* *
10351 TTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-ATATATTATTTTATTTCGAATAC
1 TTTTAAAA-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATA-
* * *
10415 A-CTTGTGTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTGTGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGAT
* * * *
10479 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACATATTTAT-
128 AATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACT-TGTTGAGAAAACAGATTCATA
* *
10530 TTTTAAAATTTTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAACAAATTTATATTATTTTA-TTCAAAATAA
1 TTTTAAAATTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTC-AAATAA
* * *
10594 GCTTGTGTGAACATAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACATTTGAAATAGATAA
65 GCTTGTGTGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAGATAA
* *
10659 TTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTTGAGTAAATAGATTCATA
130 TTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTTGAGAAAACAGATTCATA
* *
10709 TTTT-AAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTAAATT-TTTTATTTCAAATA
1 TTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATA
* * * * **
10772 AGCCTATATGAAC-TAATACAGTTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTGTGAACATAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAGAT
* * * * * * ** * * *
10836 AATTATTTAAATAGT-AT--GCATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTA
128 AATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTG-T--TGA-GAAAACAGAT-TCA-TA
* ** * * * *
10891 TTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTT-G-A-A--AATATATTTCTTATTAATTTTCAAA
1 TTTTAA--AATTT--T--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTT-ATATT-ATTTT----
* * * * ** * * *
10950 ATATT--AATAA-ATTAATAT-TATTTAATCCGAATGAGCTTGTATGAACAAAGACAATTATTTT
54 AT-TTCAAATAAGCTT-GTGTGAACATAA-AC-AAT-TG-TTTTATG-ACAAA-ACAA--A----
* * * * * *
11011 ATGACAAAACAAAAAGTTATAATAATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
105 AGGTCATAAC----A-TT-TGA-AA--T-AGAT----AATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGA
* * * * * ** *
11076 CCTTATTCAGTAAATAGATTTGTT
156 ACTTGTTGAGAAAACAGATTCATA
* * * * * *
11100 TTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTGTCT-GAATATTAATAAACTTATATTATTTTAATTGAAATA
1 TTTTAAA-ATTTTACTTATTAATT-TTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATA
* * * * * * * * * *
11164 AGCTTTTATGAATAGAAA-AAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAGCCATTTAAAATAGG
64 AGCTTGTGTGAACATAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ACATTTGAAATAGA
* * * * * *
11228 TAATTTTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTCA-A
127 TAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTT-GAGAAAACAGATTCATA
* * * * * ** ** *
11280 TTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTAGAATATTAATAAATTAAAATTACGTTATTTGGAATC
1 TTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATA
* * * * * * *
11345 AGCTTGTATGAATAGAAAGAGTTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTGATAACAATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTGTGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGAT
* * * ** ** * * **
11410 AATAGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCTA-TAAATTGATT--TA
128 AATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTT-GAGAAAACAGATTCATA
* * * ** ***
11460 TTTTCTATATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGA
1 TTTT-AAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAA
* * * * * *
11524 TAAGTTTTTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATA
62 TAAGCTTGTGTGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATA
* * ** * * *
11588 AATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAATA-A-ATTTATT
125 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTT-GAGAAA-ACAGATTCATA
* * * * * *
11643 TTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA-TTAGTATTAATTTA-TTCTGAC
1 TTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTC-AAA
* * * * *** *
11706 TTAGCTTGTATGAAC-TAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTGGAATGATTTGAAATA
62 TAAGCTTGTGTGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATA
* * * * * * * * *
11770 AAAAATTATTCTAATAGCCTTAACCATTTGAAC-TGATTCG-GCAAA-TGCATTTAT-
125 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTG-TT-GAGAAAACAG-ATTCATA
* ** * * *
11824 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAA-TTACCGCTATT-CTTTATATCC
1 TTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA----TATTATTTTAT-TTC
* * * * *
11887 AAAAAAGCTTTGTATGATCAAAAACAATT-TTGTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGA
59 AAATAAGC-TTGTGTGAACATAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGA
* * * * ** * * * *
11950 GATTGATATTTGTTCAAATGGTTGTAACTATTTGAACTAGTATG-GAAAATAGCGTT-AGT-
121 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGT-TGAGAAAACAG-ATTCA-TA
* * * *
12009 TTTT-AAATCTCTTGCTTCA-TAATTTTTGAAATATTAATAAA-ATAGTATTATTTTATTTCGAA
1 TTTTAAAAT-T-TTACTT-ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAA
* * * * * * *
12071 TAAG-TTCTAATGAA-TTGAATAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAATGATTT-AAATA
62 TAAGCTTGT-GTGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATA
* * * * * * * *
12132 GATAATTTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTCG-GTAAATATATTTATT
125 GATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTT-GAGAAAACAGATTCATA
* * ** * **
12188 TTTTAAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAAT
1 TTTTAAAA--TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAAT
* * * * * *
12252 AAGCTTATATGAAC-TAAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTGA-AACGATTTGAAATA
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* * *
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12339 TATCTAAACT
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10341 NNNNNNNNNN
* *
10351 TTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-ATATATTATTTTATTTCGAATAC
1 TTTTAAAA-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATA-
* * *
10415 A-CTTGTGTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTGTGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGAT
* * * *
10479 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTTAGAAAACATATTTAT
128 AATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAATGTGTTGAGAAAACAGATTCAT
* *
10530 TTTTAAAATTTTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAACAAATTTATATTATTTTA-TTCAAAATAA
1 TTTTAAAATTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTC-AAATAA
* * *
10594 GCTTGTGTGAACATAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACATTTGAAATAGATAA
65 GCTTGTGTGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAGATAA
* *
10659 TTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACT-TGTTGAGTAAATAGATTCAT
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* *
10708 ATTTT-AAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTAAATT-TTTTATTTCAAAT
1 -TTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAAT
* * * * **
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63 AAGCTTGTGTGAACATAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAGA
* *
10835 TAATTATTTAAATAGT
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CTTGTGTGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAGATAAT
TGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAATGTGTTGAGAAAACAGATTCAT
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10813 AGGTCATAAC
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*
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10872 ATT
1 ATT
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Statistics
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ATTTGAAATAGATAATT
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Period size: 32 Copynumber: 2.3 Consensus size: 34
10811 AAAGGTCATA
*
10821 ACATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG-TATG
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1 ACATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATG
10887 ACTATTTGAA
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10897 CTTGTTTGGT
Statistics
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ACATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATG
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Alignment explanation
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10633 AAAGTCATAA
* *
10643 CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTTGAGTAAATAGATTCAT
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* * *** * * *
10708 ATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTAAATTTTTTATTTCAAATAA
65 ATTTTAAATATATTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTTAAATTATTTAATCCAAATAA
* * * * ** * * * *
10773 GCCTATATGAACTAATACAGTTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATA
130 GCCTATATGAACAAAGACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAACA
*
10837 ATTATTTAAATAGTATG
195 ATTATTCAAATAGTATG
* * * *
10854 CATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTG-GTAAACATATT-T
1 CATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTG-TTGAGTAAACAGATTAT
* * *
10917 ATTTTGAAAATATATTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-TTAATATTATTTAATCCGAA
65 ATTTT--AAATATATTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTTAA-ATTATTTAATCCAAA
* * * *
10981 TGAGCTTGTATGAACAAAGACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATAATTTGAAATAA
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*
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Statistics
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CATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTTGAGTAAACAGATTATA
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CCTATATGAACAAAGACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAACAA
TTATTCAAATAGTATG
Found at i:11255 original size:181 final size:177
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Period size: 181 Copynumber: 8.2 Consensus size: 177
10845 AATAGTATGC
* * * * * *
10855 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGTAAATAAATTTATT
** * * * ** * ** *
10920 TTGAAAATATATTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTAATCCGAATGAG
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* * * *
10985 CTTGTATGAACA-AAGACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATA
128 CTTGTATGAATAGAA-ACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * * * * *
11035 ATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTATTCAGTAAATAGATTTGTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GTAAATAAATTTATT
* * * *
11100 TTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTGTCTGAATATTAATAAACTTATATTATTTTAATTGAAATAA
65 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTG-AATAA
* * *
11165 GCTTTTATGAATAGAAA-AAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAGCC
127 GCTTGTATGAATAGAAACAA-TTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * * * * * * *
11216 ATTTAAAATAGGTAATTTTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCAAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG-TAAATAAATTTATT
* * ** *
11281 TTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTAGAATATTAATAAATTAAAATTACGTTATTTGGAATCA
65 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTT-GAATAA
* * * * * *
11346 GCTTGTATGAATAGAAAGAGTTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTGATAACA
127 GCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * * * ** * **
11397 ATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCTATAAATTGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GTAAATAAATTTATT
* * * * *
11462 TTCTATATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAA
65 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTTGAATAA
* * *
11527 GTTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GTTCATAACA
127 GCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTT-ATAACA
* * * *
11578 ATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAATAAATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG-TAAATAAATTTATT
* * * *
11643 TTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGACTT
65 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT-TGAATA
** **
11708 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTTGGAATG
126 AGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTTATAACA
* * * * * * * * **
11760 ATTTGAAATAAAAAATTATTCTAATAGCCTTAACCATTTGAAC-TGATTCGGCAAATGCATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTC-GTAAATAAATTTAT
* * * ***
11824 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTACCGCTATTCTTTATATCCAA
64 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTA----TATTATTT-TATTTGA
* * * * * *
11889 AAAAGCTTTGTATG-ATCAAAAACAATT-TTGTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACG
123 ATAAGC-TTGTATGAAT-AGAAACAATTATT-TTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * * * ** * * * *** *
11944 ATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGGTTGTAACTATTTGAACTAGTATGGAAAATAGCGTTAGT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCGTAAATAAATTTATT
* *
12009 TTTTAAATCTCTTGCTTCA-TAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATA
65 TTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTT-GAATA
* * * * * * **
12073 AG-TTCTAATGAATTG-AATAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAATG
126 AGCTTGT-ATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * *
12123 ATTT-AAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTCGGTAAATATATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GTAAATAAATTTAT
* * * *
12187 TTTTTAAAACCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
64 TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTTGAAT
* * *
12252 AAGCTTATATGAACTA-AAATAATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTTGA-AACG
125 AAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTT-ATAACA
* * *
12305 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
12342 CTAAACTAAT
Statistics
Matches: 1029, Mismatches: 220, Indels: 114
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (177 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGTAAATAAATTTATTT
TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTGAATAAGCTT
GTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
Found at i:11837 original size:363 final size:360
Alignment explanation
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Period size: 362 Copynumber: 6.3 Consensus size: 360
10845 AATAGTATGC
* * * * *
10855 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATT
1 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATT
* * * * * * * * *
10920 TTGAAAATATATTTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATT-ATTTAATCCGAATGA
66 TT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCTGAATCA
* * *
10984 GCTTGTATGAAC-AAAGACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATAATTTGAAATAAAC
130 GCTTGTATGAACTAAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATAATTTGAAATAAAA
* * * * * *
11048 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTATTCAGTAAATAGATTTGTTTTTTAAATCTTTT
194 AATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAAT-GATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * **
11113 ACTTATTAGTTGTCTG-AATATTAATAAACTTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTTTATGAAT
258 ACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAAAGTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTTTATGAAT
* *
11177 AGAAAAAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAGCC
322 AGAAAAAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * * *
11216 ATTTAAAATAGGTAATTTTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCAAT
1 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATT-TAT
* * **
11281 TTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTAGAATATTAATAAATTAAAATTACGTTATT-TGGAATC
65 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCT-GAATC
* * * * * *
11345 AGCTTGTATGAA-TAGAAAGAGTTGTTTTGTGACAAAACAAAAGG-TGATAACAATTTGAAATAG
129 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTG-TAATAATTTGAAATAA
* * * * *
11408 ATAA-TAGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCTA-TAAATTGATTTATTTTCTATATC
192 AAAATTA-TTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTC-AGTAAA-TGATTTATTTTTTAAATC
* * *
11471 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAAAGTAGTATTATTTTATTTTG-GATAAGTTTTTA
254 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAAGTA-TATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTTTA
*
11534 TGAACT-GAAACAA-TTGTTTTATGATAAAACAAAA-GTTCATAACA
317 TGAA-TAGAAA-AAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTT-ATAACA
* * * * * * *
11578 ATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAATAAATTTATT
1 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTA-T
* * * * *
11643 TTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGACTT
65 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCTGAATC
* * *
11708 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTGGAATGATTTGAAATAAAA
129 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATAATTTGAAATAAAA
* * * * * *
11773 AATTATTCTAATAGCCTTAACCATTTGAACTGATTCGGCAAATGCATTTATTTTTTAAATCTCTT
194 AATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAATG-ATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * ** *
11838 ACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTACCG-CTATT-CTTTATATCCAAAAAAGCTTTGTA
258 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA--A--GTATATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTT-TA
* * * * *
11901 TG-ATCA-AAAACAATT-TTGTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACG
317 TGAAT-AGAAAA-AGTTATT-TTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * * * * * * * * * ***
11944 ATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGGTTGTAACTATTTGAACTAGTATGGA-AAATAGCGTTAG
1 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGT-TCGATAAACAAATTTA-
* * * *
12008 TTTTTAAATCTCTTGCTTCA-TAATTTTT-GAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCGA
64 TTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCT-GA
* * ** * * * ** *
12070 ATAAG-TTCTAATGAA-TTGAATAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAATGATTT-AAAT
126 ATCAGCTTGT-ATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATAATTTGAAAT
* * * * * * ** * *
12131 AGATAATTTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTCGGTAAATATATTTATTTTTTAAAA
190 A-AAAAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAAT-GATTTATTTTTT-AAA
* * * * * * *
12196 CCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTA
252 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAAGTA-TATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTT
*
12259 TATGAACTA-AAATAA-TTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTTGA-AACG
315 TATGAA-TAGAAA-AAGTTATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTT-ATAACA
* * * * ** *
12305 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACTATCTAAACTAATTCAGCA-AAACACATTT
1 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTC-G-ATAAACAAATTT
* ** * ** *
12368 ATTTTT--A---C-TA-TTA--AA---TTAG--TATT-AT--CTTAAT-CCAA-ATAAGCT-TAT
63 ATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCTGAAT
* ** ** * * ** * * ** * *
12413 -A---TGAAAAAAAAAAAACAATTGTTCTATG--ATTA-AATA--TTATAAGGATTTGACATAGA
128 CAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATAATTTGAAATAAA
* * ** * * ** * * *
12469 TAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACAGATTTAGTTTGTAAA--TC-
193 AAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAA-TGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
12531 T-CTTATTAATTTTTAAAATATCAAT-AAA-TAAGTATTATTTTATTTTG-AATAA-TTTTGTAT
257 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAAGT-A-TATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTT-TAT
* * * * * **
12591 GAATAGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATG
318 GAATAGAAAAAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
* * ** * * *
12634 ATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAATCA-ACATAACTATTTGAACTTGTT-TAGTGAATAAATTTA
1 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTA
* * * * * *
12696 TTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTACAATATTCATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
64 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCTGAAT
** * * * ** *
12761 -AAATATGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACT-ATTAGAAAT
128 CAGCT-TGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAA-TAATTTGAAAT
* * * * * *
12823 AAATAATTGTTCAAACAGCCATAACTATTAGAGCTTATTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATC
190 AAAAAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAAT-GATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * *
12887 TTTTGCTTATTAA-TTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCAACTAAGCTTGTAT
254 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAAGTA-TATTATTTTAATTGAAATAAGCTTTTAT
* ** * * * * * *
12950 GAACAGAAACAA-TTGGTTTATGACAAAATAAAATGTCAAAACT
318 GAATAGAAA-AAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
** * * * * *
12993 ATTCGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAATATATTTA
1 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-TGTTC-GATAAACAAATTTA
*
13056 TTTTTTAAAT-T-TGTACTTATTAATTTTT-GAAATAATAATAAATT
64 -TTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATT
13100 TATAAACAAT
Statistics
Matches: 1461, Mismatches: 303, Indels: 242
0.73 0.15 0.12
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368 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (360 bp):
ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATT
TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAATTTATTCTGAATCAG
CTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATAATTTGAAATAAAAAA
TTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAATGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAAGTATATTATTTTAATTGAAATAAGCTTTTATGAATAGAA
AAAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACA
Found at i:12774 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 12457--13099 Score: 655
Period size: 179 Copynumber: 3.6 Consensus size: 178
12447 TATTATAAGG
* * * * ** * *
12457 ATTTGACATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACAGATTTAGT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATT
* * *
12522 TTGTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAA-ATATCAATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATA
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATAT-TC-ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATA
* * *
12582 ATTTTGTATGAATAGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAA-T
128 A-ATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT
* * * *
12633 GATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAATCA-ACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTGAATAAATTTA
1 -ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
*
12696 TTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTACAATATTCATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTCATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT
*
12761 AAATATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GATCATAACT
127 AAAT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACT
* * * * * * *
12814 ATTAGAAATAAATAATTGTTCAAACAGCCATAACTATTAGAGCTTATTCAGTAAATAGATTTA-T
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATT
* * * * *
12878 TTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAACTAAG
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTCATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAA-
* * * * *
12943 CTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAATGTCAAAACT
129 ATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT
* * * * * *
12993 ATTCGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATATATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAATAGATTTAT
* *
13057 TTTTTAAAT-T-TGTACTTATTAATTTTTGAAATAATAATAAATT
65 TTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTT-AAATATTCATAAATT
13100 TATAAACAAT
Statistics
Matches: 393, Mismatches: 53, Indels: 37
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 49 0.12
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178 5 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATT
TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTCATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAAT
TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT
Found at i:12995 original size:179 final size:178
Alignment explanation
Indices: 12532--13099 Score: 639
Period size: 180 Copynumber: 3.2 Consensus size: 178
12522 TTGTAAATCT
* * * * *
12532 CTTATTAATTTTTAAAATATCAATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAA-ATTGTATGAATAG
* * *
12597 AAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAA-TGATTTGAAAT-AATAATTGTTCAAATCA
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT-ATTAGAAATAAATAATTGTTCAAA-CA
* * *
12660 -ACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTGAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
127 GACATAACTATTTG-ACTTGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * *
12712 CCTATTAATTTTT-ACAATATTCATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATATGTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAAT-TGTATGAATA
*
12776 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GATCATAACTATTAGAAATAAATAATTGTTCAAACA
63 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACTATTAGAAATAAATAATTGTTCAAACA
* * * * *
12840 GCCATAACTATTAGAGCTTATTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTG
127 GACATAACTATTTGA-CTTGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* *
12892 CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAACTAAGCTTGTATGAACAG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-TAA-ATTGTATGAATAG
* * * * * * *
12956 AAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAATGTCAAAACTATTCGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTAGAAATAAATAATTGTTCAAACAGA
* * * * * *
13021 TAAAACTATTTGAATGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAAT-TTGTA
129 CATAACTATTTGACT-TGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
*
13071 CTTATTAATTTTTGAAATAATAATAAATT
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
13100 TATAAACAAT
Statistics
Matches: 332, Mismatches: 41, Indels: 30
0.82 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
178 4 0.01
179 141 0.42
180 144 0.43
181 43 0.13
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAATAAATTGTATGAATAGAA
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTAGAAATAAATAATTGTTCAAACAGACA
TAACTATTTGACTTGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
Found at i:13134 original size:146 final size:148
Alignment explanation
Indices: 12956--13246 Score: 387
Period size: 146 Copynumber: 2.0 Consensus size: 148
12946 GTATGAACAG
* *
12956 AAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAATGTCAAAACTATTCGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAATGTCAAAACAATTCGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *
13021 TAAAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAAT-T-TGTACTTATTAATTTT
66 CAAAACTATTTGAACT-TGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTCATTAATTTT
*
13083 -TGAAATAATAATAAATTTAT
129 CAG-AATAATAATAAATTTAT
* * *
13103 AAACAATT-GTTTATGACAAAA-CAAATGGTCAAAACAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAT-GTCAAAACAATTCGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
13166 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTC
65 TCAAAACTATTTGAACTTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTC
*
13231 AGAATATTAATAAATT
130 AGAATAATAATAAATT
13247 AGTATTATTT
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 13, Indels: 10
0.85 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
145 4 0.03
146 84 0.67
147 36 0.29
148 2 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (148 bp):
AAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAATGTCAAAACAATTCGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CAAAACTATTTGAACTTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCA
GAATAATAATAAATTTAT
Found at i:13227 original size:506 final size:500
Alignment explanation
Indices: 12597--13600 Score: 1226
Period size: 506 Copynumber: 2.0 Consensus size: 500
12587 GTATGAATAG
* * * **
12597 AAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAATAATTGTTCAAATCAAC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAATAATTGTTCAAATCAAC
* * *
12662 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTGAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAC
66 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTCAC
* * *
12727 AATATTCATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
131 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
* * *
12792 GATAAAACAAAA-GATCATAACT-ATTAGAAATAAATAATTGTTCAAACAGCCATAACTATTA-G
196 AACAAAACAAAATG-TCATAA-TGATTAGAAATAAATAATTATTCAAACAGCCATAACTATTAGG
* * * *
12854 AGCTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTT-AAATCTTTTGCTTATTAATT-TTGAAATATTAATAA
259 A-CTTATT---TAAACACATTTATTTTTAAAAT-TGTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAA
* * * * * *
12917 ATTAGTATTATTTTATTTCAACTAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAA
319 ATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA-----TTATGACAAAACAAA
* * * * * *
12982 ATGTCAAAACT-ATTCGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA
379 ATGCCAAAA-TGATTCAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACT-TATTC-GA
*
13045 -AAATATATTTATTTTTTAAAT-TTGTACTTATTAATT-TTTGAAATAATAATAAATTTAT
441 TAAATATAATTATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATTGTTTG-AATAATAATAAATTTAT
*
13103 AAACAATTG-TTTATGACAAAAC-AAATGGTCAAAACAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAAT-A
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCAAAACAATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAATCA
* * *
13165 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTCATTAATTT
64 -ACATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCT-ATTAATTT
* * * * * *
13229 TCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTT
127 TCACAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * ** * *
13294 TTATAACGAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTT
192 TTATAACAAAACAAAATGTCATAATGATTAGAAATAAATAATTATTCAAACAGCCATAACTATTA
* *
13359 GGACTTCTTTGAACACATTTATTTTTAAAATTGTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATT
257 GGACTTATTTAAACACATTTATTTTTAAAATTGTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATT
*
13424 AATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGACAAAACAAAATGCCATA
322 AATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGACAAAACAAAATGCCAAA
* *
13489 ATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATATAATT
387 ATGATTCAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTTATTCGATAAATATAATT
* *
13554 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTT
452 ATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATTGTTTGAATAATAATAAATTT
13601 GTATTATTTT
Statistics
Matches: 428, Mismatches: 56, Indels: 34
0.83 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
498 3 0.01
499 81 0.19
500 29 0.07
501 4 0.01
503 27 0.06
504 63 0.15
505 32 0.07
506 186 0.43
507 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (500 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAATAATTGTTCAAATCAAC
ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTCAC
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
AACAAAACAAAATGTCATAATGATTAGAAATAAATAATTATTCAAACAGCCATAACTATTAGGAC
TTATTTAAACACATTTATTTTTAAAATTGTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATA
TTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGACAAAACAAAATGCCAAAATGA
TTCAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTTATTCGATAAATATAATTATTT
TTTAAATCTTGTACTTATTAATTGTTTGAATAATAATAAATTTAT
Found at i:13345 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 13103--17108 Score: 1872
Period size: 181 Copynumber: 22.1 Consensus size: 181
13093 ATAAATTTAT
* ** *
13103 AAACAATTG-TTTATGACAAAAC-AAATGGTCAAAACAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
*
13166 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTC
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * *
13231 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAATTG
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * * *
13283 ATACAATTGTTTTATAACGAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
13348 TATGACTATTTGGACTTCTT---TGAACACATTTATTTTTAAAAT-TGTTACTTATTAATTGTTG
66 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTC
* * * * * *
13409 A-AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAA
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * *
13460 AAACAA-----TTATGACAAAACAAAATGCCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
13520 CATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATATAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-
66 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTC
* * *
13584 TGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAG
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * * * * ** *
13636 AAA-AATTATTTCATCACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGATTATTGTTCCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAG
* ** * *
13700 TCAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTC
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * * * ** * *
13765 -GAAATAATAATAAGTTAGAATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG
130 AG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * * * *
13817 AAACAATTG-TTTAGTGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAACAG
1 AAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * *
13881 TCATAACTATTT-ACAC-TGGTCAAGCCAACAAATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAACT
65 TCATAACTATTTGA-ACTTGTTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT
* * * *
13943 TTCAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGAC-TGTATGAATAG
127 TTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTATATGAATAG
** * * *
13998 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAGAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * *
14062 TTA-AACTAATTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAATTCTCGTACTTATTAATTTTC
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * * * * * * * *
14126 AAAATACTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATTTGAACAA
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * * *
14178 AAACATTTG-CTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * ** *
14241 TCATAATTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAAAACTATTTTTTTAAATCTCTT-TTTGATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTT
* * ** *
14305 T-TGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTAGTAAGAACCTA-
128 TCAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAA--TAG
* ** * * * * * * *
14360 AAAAAATTGTTTTACAACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAAGAGTTGTTCATATAA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
14425 CCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTAGTTCTTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTT
* * * ** * * ** *
14490 TAGAATATTATTTATATTAGTATTAATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAACAATTTG
129 CAGAATATTA-ATAAATTAGTATT-ATTTTATTTC--AA-ATAAGCTTATATGAA-TAG
* ** * * * *
14549 AAATATATAATTGT-T--CAAATAGTCATAAT-T-ATTTGAACTGCTTTCGGTAAATAGATTTAT
1 AAACA-ATTGTTTTATGACAAA-A--CAAAATGTCA--T-AA-TGATTT--G-AAATAGA-TAAT
* * * * * * *** * *
14609 TTTTTAAAT-CTCCT-ACGTA-TT-AA-TT-TT-TG-AAAT--ATTAATAAATTAGTAT-TATT-
54 TGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTA-AATCTCTTA
*** * * * * ** *
14662 -TTATTTCGAATAGGCTTGTATGATGAA-AAA-TA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TTCA
117 CTTA-TT--AATTTTC-AGAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC--AA-ATAAGCTT-A
14721 TAACAATTAGAAATAG
173 T----A-T-G-AATAG
*** * * * * * * ** *
14737 ATAATTGTTCAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAAT-AAATGGTCATAA-TG
1 A-AACAATT---G-TTTTATG-AC-AAAACAA-AATGTCATAATGATTTGAAATAG--ATAATTG
* * * * * * *
14800 ATTTTAAATA--AATAA-T-TGTTCAAATAG-TC-ATAACT--ATTTGAACTTGTTTGGTAAATA
56 --TTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTT--A-TT-TTT--T----A
* * *
14857 GATTTATTTTTTCTAATTTCTTTTCGATTAATTTTCTA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
108 -A---A-----TCT-CTTAC--TT--ATTAATTTTC-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* *
14921 TTTCAAATAAGCATGTATGAACT-G
158 TTTCAAATAAGCTTATATGAA-TAG
* * *** *
14945 AAACAATTATTTTATGACTAAACAAACA-GTCGGGATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
15009 TCTTAACTATTTGAA-TTAGTTCGGTAAACACATTTGTTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * ** *
15072 -AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGGTTGCATGAACAG
129 CAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * * * *
15124 AAACAAATGTCTTAGGACAAAAC-AAA-GATCATAATGATTTGAGAT--ATAAGTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** *
15185 TTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAAGAGATTTAGCTATTAAATCTCTTA---A-TAATTTTC
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * ** *
15246 AAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATAG
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAATAG
** * ** * * * *
15298 AAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTAATAACAATTTGAAATATATAATAGTTCAAATGGA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
15363 CATGACTAGTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTAATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTC
* * *
15427 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATAAATAG
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* *
15479 AAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
15543 TC-TAACTATTT-AAATTCGCTT-GGTAAATAGATTTAATTTTTGAATCTTTTACTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTT-G-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * ** * * *
15605 T-GGAATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTTTGAATAG
128 TCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
*
15658 AAACAATTGGTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * *
15722 TCATAACTATTTGAACATGTTCTATAAAT-GAATTTATTTTTT-AATTTTTTACTTATT-ATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * *
15784 -TGAATATTAATAAATTTTTAATATTTTA-TTCGAATTAAGCTTATATGAATAG
129 CAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAATAG
* * * * * *
15836 AACCAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
15900 TCATAACTGTTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTTAATTCTCTTGCTCT-TTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTT
* ** *** * * *
15964 TTAGAATATTAATAAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTA-AATCTT-T-T-ACTTAT
128 TCAGAATATTAATAAA---TT-AGT-ATTAT-TTTATTTCAAATAAGCTTATATGA-ATAG
* *** *** * * * * * * * **
16021 TAATTTTTGAAATATTA-ATAAATTAATAT-TACTTATTAATTGTTCAAATAGTCATAACGAGTT
1 AAACAATTGTTTTATGACA-AAA-CAAAATGT-CATAATGA-T-TTGAAATAG--ATAA-TTGTT
* *
16084 CAACTTGTTCGATAAACATATTT--A-TTG-TC--T--A-A-A--TA-----T-----T-TTACT
58 CAAATAG-TC-AT-AAC-TATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* ** * * * ** *
16126 TATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTACAAACAG
119 TATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
** * * * * *
16189 AATA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 AA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
16253 TCATAATTATTTAAACTTATTTGATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* *
16317 GGAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACT-G
130 AGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TAG
* * * * *
16369 AAATAATT-TTTTATGACAATACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * * * * *
16433 CATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTATTTTCTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCA
66 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA
* * * * * * * * *
16498 AAATATTAATAAATTAGTAATATTTTAATTCGAATAAGCTTCTGTAAACAA
131 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * * * * * *
16549 AAACTATTGTTTTATAACAGAACAAAAAGTCATAA-GATTTAAAATAAATAATTGCTT-AAGTAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAG
* * * * * *
16612 TCATAACTATTT-AAATTAATTTGATAAATAGATATA-TTTTTCAAT-TC-T-CTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** ** ** *
16672 CAAAATATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTCAAGCAAATTTATATGAACA-
129 CAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* * * ** * * *
16724 AAACATTTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATCGATAATTATTCAAATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
16789 CATAATTATGTT-AACTGGTTCGGTAAATAGAATTATTTTTT-AATCTCTTGCTTATTAATTTT-
66 CATAACTAT-TTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * * *
16851 TGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCTAAATAAGCTAATATGATTTA-
130 AG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGA-ATAG
* ** * *
16904 AGAA-AATTG-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAG
1 A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
16967 TCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTTA-TTTTTAAATGTCTTAGTTATTAATTTTG
65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * * * ** * * *
17031 A-AAAATTATTAGATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAACTTGTATGAACAG
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAG
* *
17082 AAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
17109 AGGTTAACAA
Statistics
Matches: 2889, Mismatches: 672, Indels: 531
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
158 5 0.00
159 2 0.00
160 3 0.00
161 4 0.00
162 8 0.00
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164 1 0.00
165 17 0.01
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170 2 0.00
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Alignment explanation
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13093 ATAAATTTAT
* * ** *
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1 AAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
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* * * *
13233 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTAT
130 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAATAGA-AAAATTGTTTTAT
* * * * ** *
13298 AACGAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGAC
193 CACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TAAAACTATTTGAAC
* * * * * * *
13363 TTCTTT-G--AACACATTTATTTTTAAAAT-TGTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATT
257 TTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TCGAAATAATAATAAATT
* * *
13424 AATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAA
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* * * *
13460 AAACAA----TTATGACAAAACAAAATGCCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
1 AAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * * *
13521 ATAACTATTTAAACTTATTC-GATAAATATAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT
66 ATAACTATTTGAACTTGGTCAG-CAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TT
* * * *
13584 TGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAAAATTATTTCA
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* * * *
13649 TCACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGATTATTGTTCCAAATAGTCAAAACTATTTGA
192 TCACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT-CAAATAGT-AAAACTATTTGA
* *
13714 ACTTGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTCGAAATAATAATAAG
255 ACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTCGAAATAATAATAAA
* * *
13779 TTAGA-ATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG
319 TTA-ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA
* * * *
13817 AAACAATTGTTTAGTGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAACAGT
1 AAACAATTGTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
*
13882 CATAACTATTT-ACAC-TGGTCAAGCCAACAAATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAACTT
65 CATAACTATTTGA-ACTTGGTC-AGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TT
* * * *
13944 TCAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGAC-TGTATGAATAGAAACAATTGT
126 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAG-CTTATATGAATAGAAA-AATTGT
* * * * * *
14008 TTTATGACAAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAGAGTTAAACTAAT
188 TTTATCACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAAACTATT
* * * * *
14072 TGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAATTCTCGTACTTATTAATTTTCAAAATACTAAT
252 TGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTCGAAATAATAAT
* * * *
14137 AAATTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATTTGAACAA
316 AAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA
* * *
14178 AAACATTTGCTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** ** *
14242 CATAATTATTTGAAC-TGGTTTGGCAAACAAAACTATTTTTTTAAATCTCTT-TTTGATTAATTT
65 CATAACTATTTGAACTTGG-TCAGCAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTT
* * * *
14305 TTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTAGTAAGAACCTAAAAAAATT
127 TAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTA-TATGAA--TAGAAAAATT
* * * * * * * *
14368 GTTTTA-CAACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAAGAGTTGTTCATATAACCT-TAA
186 GTTTTATC-ACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-A-GTAAAA
* ** * * * * **
14431 CTATTTGAACTAGTTCGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTAGTTCTTAATTTTTAGAAT
247 CTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTCGA-AAT
* * * * ** * * * ** *
14496 ATTATTTATATTAGTATTAATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
310 AATA-ATAAATTAATATT-ATTTTATTTC-G-A-ATAAGCTTGTATGAA---CAA
* * ** * * * * *
14551 ATATATAATTGTTCA--A-ATAGTCATAA--TTATTTGAACTGCTTTCGGTAAATAGATTTATTT
1 A-A-ACAATTGTTTATGACA-AAACAAAAGGTCA--T-AA-TGATTT--G-AAATAGA-TAATTG
* * * ** * ** * ** **
14611 TTTAAAT-CTCCT-ACGTA-TT-AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
55 TTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGGT-CAGCA--AACAAATT--TATT-TTTTAAATCTC
* * ** * *** ****
14671 ATAGGCTT-GT-ATGAT-GAA-A--AAT-AATT-GTTTTATGACAAAACAA-AAG-TTCATAACA
113 TTA--CTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTT-AT----
** * * * ** * **
14726 ATTAGAAATAGATAATTGTTCAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAATAAATG
171 A-T-G-AATAGA-AA-AATT---G-TTTTAT-CAC-AAAACAA-AAGGTCAT-A-ACGAT---T-
* * *
14791 GTCATAAT-GATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA
218 -TGA-AATAGA---T-AAT---T-A---TTCAAATAGT-AAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAA
* * * ** *
14855 TAGATTTATTTTTTCTAATTTCTT--TTCGATTAATTTTCTAAATGTTAATAAATTAGTATTATT
269 TAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTT--ATTAA-TTTCGAAATAATAATAAATTAATATTATT
* * **
14918 TTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTG
330 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA
* * *** *
14945 AAACAATTATTTTATGACTAAACAAACA-GTCGGGATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
1 AAACAATT-GTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
15009 TCTTAACTATTTGAA-TTAGTTCGGTAAACACATTTGTTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTT
64 TCATAACTATTTGAACTT-GGTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *** * ** * * *
15072 AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGGTTGCATGAACAGAAACAAATGTCTT
128 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAA-AATTGTTTT
** * * * * * *
15137 AGGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGAT--ATAAGTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA
191 ATCACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TAAAACTATTTGA
* ** * ** * * *
15199 ACTGGTTCGGTAAAGAGATTTAGCTATTAAATCTCTTA---A-TAATTTTCAAAATAGTAATAAA
255 ACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTCGAAATAATAATAAA
* * ** * *
15260 TTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATAG
319 TTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAA
** * * ** * * * *
15298 AAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTAATAACAATTTGAAATATATAATAGTTCAAATGGA
1 AAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * * * *
15363 CATGACTAGTTGAACTT-GTTTGATAAATAGATTAATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTT
65 CATAACTATTTGAACTTGGTCAG-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAA-TTT
* * * *
15426 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT
127 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAATAGAAA-AATTGTTT
* * * * * * **
15491 TATGAGAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTAACTATTT-A
190 TATCACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAAACTATTTGA
* * * * * * * * **
15555 AATTCGCTTGGTAAATAGATTTAATTTTTGAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAATGTTAATAAA
255 ACTT-GTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTCGAAATAATAATAAA
** * * * * *
15620 TTAGCATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTTTGAATAG
319 TTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA
*
15658 AAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
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* * * ** * * *
15723 CATAACTATTTGAACATGTTCTA-TAAATGAATTTATTTTTT-AATTTTTTACTTATT-ATTTTT
65 CATAACTATTTGAACTTGGTC-AGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA
** * * * *
15785 GAATATTAATAAATTTTTAATATTTTATTCGAATTAAGCTTATATGAATAGAACCAATTGCTTTA
129 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAA-TAAGCTTATATGAATAGAA-AAATTGTTTTA
* * * * * * * *
15850 TGACAAAACAAAAGGTAATAA-TATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTGTTTGA
192 TCACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-AAAACTATTTGA
* * * * * * ** *
15914 ACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTTAATTCTCTTGCTCT-TTAATTTTTAGAATATTAATA
255 ACTTGTTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTCGA-AATAATAATA
* ** *** * *
15978 AATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTA-AATCTT-T-T--AC-T
317 AA---TT-AAT-ATTAT-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA
* ** ** * ** *
16018 TATTAA-T-TTT-TGA-AATATTAATAA-AT--TAAT-A-TT-ACTTA-TTAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTATGACAA-AACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
16072 TCATAACGAGTTCAACTTGTTC-GATAAACATATTTATTGTCTAAATATTTTACTTATTAATTGT
64 TCATAACTATTTGAACTTGGTCAG-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* * * ** * **
16136 CT-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTACAAACAGAATAAATCATT
127 -TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTATATGAATAGAA-AAATTGTT
* * ** * * *
16200 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
189 TTATCACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-AAAACTATTT
* * * * * * * * *
16265 AAACTTATTT-GATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAAT
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* * **
16328 AACA-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTG
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16434 ATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTATTTTCTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAA
66 ATAACTATTTGAACTTGGTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAG
* * * * * *
16499 AATATTAATAAATTAGTAATATTTTAATTCGAATAAGCTTCTGTAAACA-AAAACTATTGTTTTA
130 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAAA--ATTGTTTTA
* * * * * * * *
16563 TAACAGAACAAAAAGTCATAA-GATTTAAAATAAATAATTGCTT-AAGTAGTCATAACTATTT-A
192 TCACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGT-AAAACTATTTGA
* * * * * *
16625 AATTAATTT-GATAAATAGATATA-TTTTTCAAT-TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
255 ACTT-GTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTCGAAATAATAATA
** * * ** *
16685 GGTTAGTATTATTTTATTTC-AAGCAAATTTATATGAAC-A
317 AATTAATATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATGAACAA
* * * * ** * * *
16724 AAACATTTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATCGATAATTATTCAAATAGC
1 AAACAATT-GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
16789 CATAATTATGTT-AAC-TGGTTCGGTAAATAGAA-TTATTTTTT-AATCTCTTGCTTATTAATTT
65 CATAACTAT-TTGAACTTGG-TCAGCAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
16850 TTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTAAATAAGCTAATATGATTTA-AGAAAATTG
127 TAG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGA-ATAGA-AAAATTG
* * * * **
16913 -TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTAT
187 TTTTATCACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-AAAACTAT
* * * * * * * * * *
16977 TTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTTA-TTTTTAAATGTCTTAGTTATTAATTTTGAAA-AATTAT
251 TTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTCGAAATAA-TAA
* * * * * *
17040 TAGATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAACTTGTATGAACAG
315 TAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA
* *
17082 AAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAA
1 AAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAA
17109 AGGTTAACAA
Statistics
Matches: 2781, Mismatches: 626, Indels: 483
0.71 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
345 8 0.00
346 8 0.00
347 4 0.00
348 2 0.00
350 49 0.02
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352 67 0.02
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364 48 0.02
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370 11 0.00
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387 15 0.01
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389 11 0.00
390 21 0.01
391 11 0.00
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396 1 0.00
397 10 0.00
398 2 0.00
400 11 0.00
401 12 0.00
402 53 0.02
403 10 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
AAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTTGGTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAAAATTGTTTTATCAC
AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAAACTATTTGAACTTGT
TTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTCGAAATAATAATAAATTAATAT
TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA
Found at i:14284 original size:542 final size:532
Alignment explanation
Indices: 13103--14407 Score: 1318
Period size: 542 Copynumber: 2.4 Consensus size: 532
13093 ATAAATTTAT
* * *
13103 AAACAATTGTTTATGACAAAACAAATGGTCAAAACAATTTGAAATAGG-TAATTGTTCAAATAGT
1 AAACATTTG-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-GGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
13167 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTC-
64 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-AAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCG
* ** *
13231 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTT
128 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * **
13296 ATAACGAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGG
192 ATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAC
** * ** * *
13361 ACTTCTTTGAACACATTTATTTTTAAAATTGTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAA
257 ACTTCTAAGAACAAATTTATTTTTAAAATCATTACTTATTAACTGTTCAAATATTAATAAATTAA
* * *
13426 TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGACAAAACAAAATGCCATAAT
322 CATTACTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGACAAAACAAAATGCCATAAC
* * * * * *
13491 GATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATATAATTAT
387 AATTTAAAATAAATAATTATTCAAAGAGTCATAACTAATTAAACTTATTAGATAAATAGAATTAT
** ** * **
13556 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATA
452 TTTTTAAATCTCGTACTTATTAATTGTTAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAAATA
*
13621 AGCTTATATGAATAGA
517 AGCTTATATGAACAGA
* * * * * *
13637 AAA-ATTAT-TTCATCACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGATTATTGTTCCAAATAG
1 AAACATT-TGTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATGGATAATTGTT-CAAATAG
* * * * *
13700 TCAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTC
63 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * * * * *
13765 GAAATAATAATAAGTTAGAATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG-TTT
127 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * *
13829 AGTGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTA
192 A-TAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTA
*
13894 CACTGGTC-AAGCCAACAAATTTATTTTTTAAATCCATTACTTATTAACT-TTCAGAATATTAAT
256 CACT--TCTAAG--AACAAATTTATTTTTAAAAT-CATTACTTATTAACTGTTCA-AATATTAAT
* * * * * *
13957 AAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGAC-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
315 AAATTAACATTACTTTAATCCAAATAAG-CTTGTATGAACAAAAACAA-----TTATGACAAAAC
* * * *
14021 -AAATAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAGAGTTA-AACTAATTGAAC-TAGTTT
374 AAAAT-GCCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAGAGTCATAACTAATTAAACTTA--TT
* *
14083 AG-TAAATAGATTTATTTTTTAATTCTCGTACTTATTAATT-TTCAAAATACTAATAAATTAATA
436 AGATAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCGTACTTATTAATTGTT-AAAATACTAATAAATTAATA
*
14146 TTATTTTATTTCGAACA-AA-CTTATTTGAACA-A
500 TTATTTTATTT-GAA-ATAAGCTTATATGAACAGA
*
14178 AAACATTTGCTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGTC
1 AAACATTTG-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
14243 ATAATTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAAAACTATTTTTTTAAATCTCTT-TTTGATTAATTTTT
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-AAAATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTC
* * * *
14307 GAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTAGTAAGAACCTA-AAAAAATTG
127 GAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA-TATGAA-C-AGAAACAATTG
* * *
14369 TTTTACAACAAAACAAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
188 TTTTATAACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
14408 AAGAGTTGTT
Statistics
Matches: 625, Mismatches: 109, Indels: 64
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
532 3 0.00
533 42 0.07
534 168 0.27
535 2 0.00
536 2 0.00
537 21 0.03
538 58 0.09
539 1 0.00
541 44 0.07
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543 72 0.12
544 27 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (532 bp):
AAACATTTGTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCGAAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATAA
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTACACTT
CTAAGAACAAATTTATTTTTAAAATCATTACTTATTAACTGTTCAAATATTAATAAATTAACATT
ACTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGACAAAACAAAATGCCATAACAATT
TAAAATAAATAATTATTCAAAGAGTCATAACTAATTAAACTTATTAGATAAATAGAATTATTTTT
TAAATCTCGTACTTATTAATTGTTAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAAATAAGCT
TATATGAACAGA
Found at i:15083 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 15061--15096 Score: 56
Period size: 17 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
15051 AAATCCTTAC
15061 TTATTAATTTTAG-AATA
1 TTATTAA-TTTAGCAATA
15078 TTATTAATTTAGCAATA
1 TTATTAATTTAGCAATA
15095 TT
1 TT
15097 TTACTCCAAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 5 0.28
17 13 0.72
ACGTcount: A:0.39, C:0.03, G:0.06, T:0.53
Consensus pattern (17 bp):
TTATTAATTTAGCAATA
Found at i:15680 original size:360 final size:357
Alignment explanation
Indices: 14747--17108 Score: 1624
Period size: 360 Copynumber: 6.6 Consensus size: 357
14737 ATAATTGTTC
* * * * * * * * *
14747 AAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAATAAATGGTCATAATGATTTTAAATAAA
1 AAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAA
* * * * *
14812 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCTAATTTC
66 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTT-AAATCTC
* * * *
14877 TT-TTCGATTAATTTTCTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGA
129 TTCTT--ATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA
* * *** ** * *
14941 ACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAACA-GTCGGGATGATTTGAAATAGATAATTGTTCT
191 A-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCA
* * * * * *
15004 AATAGTCTTAACTATTTGAA-TTAGTTCGGTAAACACATTTGTTTTTTAAATC-CTTACTTATTA
254 AATAGTCATAACTAGTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * *
15067 ATTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAAT
318 ATTTTTGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTA-TTCAAAT
* * * * * * *
15108 AAGGTTGCATGAACAGAAACAAATGTCTTAGGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGAT--A
1 AAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAA
* * * * * * ** *
15170 TAAGTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAAGAGATTTAGCTATTAAA--TC-
66 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCTCT
* * * **
15232 TCTTAATAATTTTCAAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATA
130 TCTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATA
** * * *
15297 GAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTAATAACAATTTGAAATATATAATAGTTCAAATGG
194 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAG
* * * * * **
15362 ACATGACTAGTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTAATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTT
259 TCATAACTAGTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
*
15427 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
324 -GAATATTAATAAATTAGTAATATTTTA-TTCAAAT
* * *
15463 AAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAA
1 AAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAA
* * * *
15528 TAATTGTTCAAATAGTC-TAACTATTTAAATTCGCTTGGTAAATAGATTTAATTTTTGAATCTTT
66 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-GTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCTCT
** * * * * *
15592 TACTTATTAATTTTGGAATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTTTGAATA
130 T-CTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATA
* ** *
15657 GAAACAATTGGTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
194 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATA
* * * * *
15721 GTCATAACTATTTGAACATGTTCTATAAA-TGAATTTATTTTTT-AATTTTTTACTTATT-ATTT
258 GTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
** *
15783 TTGAATATTAATAAATTTTTAATATTTTATTCGAATT
322 TTGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTC-AAAT
* * * * * * * *
15820 AAGCTTATATGAATAGAACCAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAT-ATTTTGAAATAG
1 AAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA-TTTGAAATAA
* * * * ** * * * *
15884 ATAATTGTTTAGATAGTCATAACTGTTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTTAATTCT
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTGGTAAACAGATTTA-ATTTTTAAATCT
* ** ** *
15949 CTTGCTCT-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTA-AATCT
128 CTT-CT-TATTAA-TTTTAAAATATTAATAAA---TT-AGT-ATTAT-TTTATTTTAAATAAGCT
* * ** * ** * ** *
16012 T-T-T-ACT--TATTAA---TTTT-TGA-AATA-TTAA--T-A-AATTAATATT-ACTTA-TTAA
184 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-CAAT-TTGAAATAGATAA
* * * * * * *
16060 TTGTTCAAATAGTCATAACGAGTTCAACTTGTTCGATAAACATATTTATTGTCTAAATATTTTAC
247 TAGTTCAAATAGTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * *
16125 TTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAAT
312 TTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTA-TTCAAAT
* ** * * * * *
16173 AAGCTTGTACAAACAGAATA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAG
1 AAGCTTGTATAAACAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAA
* * * * * *
16237 ATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTTGATAAACA-AATTCATTTTTAAATCTC
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCTC
* ** ** *
16301 TTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGA
129 TT-CTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA
* * * *
16365 ACT-GAAATAATT-TTTTATGACAATACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCA
191 A-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCA
* * * * * * * *
16427 AATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTATTTTCTAAATTTTTTACTTATTAA
254 AATAGTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
*** *
16492 TTGTCAAAATATTAATAAATTAGTAATATTTTAATTCGAAT
319 TT-TTTGAATATTAATAAATTAGTAATATTTT-ATTCAAAT
* * * * * * *
16533 AAGCTTCTGTAAACAAAAACTATTGTTTTATAACAGAACAAAA-AGTCATAA-GATTTAAAATAA
1 AAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAA
* * * * * *
16596 ATAATTGCTT-AAGTAGTCATAACTATTTAAATTAATTTGATAAATAGATAT-ATTTTTCAAT-T
65 ATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-GTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCT
** * ** ** *
16658 C-TCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTCAAGCAAATTTATATGAA
128 CTTCTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
16722 CA-AAACATTTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATCGATAATTA-TTCAAA
192 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAA
* * * * * * * *
16785 TAGCCATAATTATGTT-AACTGGTTCGGTAAATAGAATTATTTTTT-AATCTCTTGCTTATTAAT
256 TAGTCATAACTA-GTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
**
16848 TTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTAAAT
320 TTTTG-AATATTAATAAATT-AGTAATATTTTATTC-AAAT
* ** **
16888 AAGCTAATATGATTTA-AG-AA-AATTG-TTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAGCGATTTGAAA
1 AAGCT--TGT-ATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
16948 TAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTT-ATTTTTAAAT
62 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAAT
* * * * * * *
17012 GTCTTAGTTATTAATTTTGAAAA-ATTATTAGATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAACTTGTAT
126 CTCTT-CTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTAT
* * *
17076 GAACAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAA
189 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
17109 AGGTTAACAA
Statistics
Matches: 1574, Mismatches: 341, Indels: 175
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
345 8 0.01
346 8 0.01
347 4 0.00
348 2 0.00
349 1 0.00
350 51 0.03
351 60 0.04
352 13 0.01
353 248 0.16
354 53 0.03
355 185 0.12
356 162 0.10
357 174 0.11
358 139 0.09
359 101 0.06
360 299 0.19
361 42 0.03
362 2 0.00
363 3 0.00
364 3 0.00
365 8 0.01
366 8 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
AAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAA
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCTCTT
CTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAGA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTC
ATAACTAGTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
ATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTCAAAT
Found at i:15693 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 14747--17107 Score: 1445
Period size: 179 Copynumber: 13.2 Consensus size: 179
14737 ATAATTGTTC
* * * * * *
14747 AAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGATAAAATAAATGGTCATAATGATTTTAAATAA
1 AAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * *
14811 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCTAATTT
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCGGTAAATAGATTTA-ATTTT-TAA-AT
* *
14876 CTTTT-C-GATTAATTTTCTA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
126 CTTTTACTTATTAA-TTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * ** ***
14929 AAGCATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAACAGTCGGGATGATTTGAAATAG
1 AAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * ** *
14993 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTAGTTCGGTAAACACATTTGTTTTTTAAATC-C
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-GTTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTT
* * * * * *
15057 TTACTTATTAATTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAAT
129 TTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * * * * * *
15108 AAGGTTGCATGAACAGAAACAAATGTCTTAGGACAAAACAAA-GATCATAATGATTTGAGAT--A
1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * ** *
15170 TAAGTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAAGAGATTTAGCTATTAAATC---
66 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTT
* * *
15232 T-CTTAATAATTTTCAAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAAT
130 TACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAAT
** ** * ** *
15282 AATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAT-GTAATAACAATTTGAAATAT
1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
15346 ATAATAGTTCAAATGGACATGACTAGTTGAACTTGTTTGATAAATAGA-TTAATTTTTTAAATCT
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTAAATTGTTCGGTAAATAGATTTAA-TTTTTAAATCT
**
15410 TCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
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* * * * * *
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1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGA
*
15528 TAATTGTTCAAATAGTC-TAACTATTTAAATTCGCTT-GGTAAATAGATTTAATTTTTGAATCTT
66 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-G-TTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTT
* * * ** *
15591 TTACTTATTAATTTTGGAATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGACT
129 TTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* *
15642 AAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGA
1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGA
** * *
15707 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACA-TGTTCTATAAAT-GAATTT-ATTTTTTAATTT
66 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA-ATTGTTCGGTAAATAG-ATTTAATTTTTAAATCT
* ** * *
15769 TTTACTTATT-ATTTTTGAATATTAATAAATTTTTAATATTTTA-TTCGAATT
128 TTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAAT
* * * * *
15820 AAGCTTATATGAATAGAACCAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAT-ATTTTGAAATAG
1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGA-TTTGAAATAG
* * * * * * * * * *
15884 ATAATTGTTTAGATAGTCATAACTGTTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTTAATTCT
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCGGTAAATAGATTTA-ATTTTTAAATCT
* * ** ***
15949 CTTGCTCT-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTA-
128 TTTACT-TATTAA-TTTTAGAATATTAATAAA---TT-AGT-ATTAT-TTTATTTCAAAT
* * * ** * ** ** **
16007 AATCTT-T-T-ACT--TATTAA---TTTT-TGA-AATATTAAT--AAATTAAT-A-TT-ACTTA-
1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCA-TAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * * *
16056 TTAATTGTTCAAATAGTCATAACGAGTTCAACTTGTTCGATAAACATATTT-ATTGTCTAAATAT
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* * *
16120 TTTACTTATTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAAT
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** * ** * * * *
16173 AAGCTTGTACAAACAGAATA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAG
1 AAGCTTGTATGAATAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * * *
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* * *
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129 TTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * * *
16353 AAGCTTATATGAACT-GAAATAATT-TTTTATGACAATACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
1 AAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * ** * * *
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65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT-T-GTTCGGTAAATAGATTTAATTTT-TAAATC
* * * * *
16479 TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTAATATTTTAATTCGAAT
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* * * * * * * * ** * *
16533 AAGCTTCTGTAAACAAAAACTATTGTTTTATAACAGAACAAAAAGTCATAA-GATTTAAAATAAA
1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * *
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66 TAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-GTTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTT
* * ** **
16658 CT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTCAAGC
129 TTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
** * * * * * ** *
16709 AAATTTATATGAACA-AAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAT-GTTATAACAATTTGAAATCG
1 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
16772 ATAATTATTCAAATAGCCATAATTATGTTAACTGGTTCGGTAAATAGAATT-ATTTTTTAATCTC
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTAAATTGTTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTT
* * *
16836 TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCTAAAT
129 TTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-AAAT
** * ** **
16888 AAGCTAATATGATTTA-AGAA-AATTG-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCGATTTGAAATA
1 AAGCTTGTATGA-ATAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
16950 GATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTT-ATTTTTAAATGT
64 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGTTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCT
* * * * * * **
17014 CTTAGTTATTAATTTT-GAAAAATTATTAGATTAGTATTATTTTGTTTTGAAT
128 TTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * *
17066 AAACTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAA
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17108 AAGGTTAACA
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ACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
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15906 CTGTTTGAAC
* *
15916 TTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTTAATTCTCTTGCTCTTTAATTTTTAGAATATTAATAAA
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* * *
15980 TTGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTT-GAAATATTAATAA
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64 A
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TTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTCTTTAATTTTTAGAATATTAATAAA
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1 TT
16264 TAAACTTATT
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16815 ATAGAATTAT
* * ** *
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* * *
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*
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* * **
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** * * *
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* * * *
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* *
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*
17377 TA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAG
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17114 AACAAATTTG
* * * * * *
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* ** * * * *
17187 GCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGT-TTAAACGATTTGAAATAGA
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* ** ** * *
17250 TAATTATTGTAATAGTTTTAACTATTTAAATTGGTTCGACAAACACATTTATT
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * *
17303 TTTTAAATCTATAACTTATTAATTTTGAAATATTAATTAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG
* * * * *
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* * * * * * * * ** * *
17432 ATTGTTCAAATGGCCATAATTTTTTTAACTGATTTGGCAAACATATCTATT
130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATA
* * * * * *
17547 AGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGAC
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * ** * * *
17612 AAATGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACCT-ATTCGGTAAACA-ATTTCTTT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTT-ATT
* * * * *
17664 TTTTAAATCTCATT-CATA-TAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCTAAAT
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* * * * * *
17726 AAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTAGAACGATTTGAAATAGA
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* * * * * * * * *
17791 TAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCAATAAACAAATTTATT
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* * * * * *
17844 TTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTGAATTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGATTAAG
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* * ** * * *
17906 CTTGTACGAAC-AAAATAATTGTTTTACAACCAAAGC-AAAGGTCATAATGATTTGGAATAGATA
66 CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* *** * * ** ** *
17969 ATCGTTCTTGTAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGCAATTAAATTTATT
130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
18020 TTTTAATTTTCTTAGC-TATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
1 TTTTAAATCTCTTA-CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
** * * * * * * * * *
18084 AAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAAGGTTATAATGATTTGAAATGGA
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
18149 TAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAA-TGGTTTGGTAAGCAAATTTACT
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * *
18202 TTTTAAATCTC-TAATTGATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCAAAAA
1 TTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* *** * * * * *
18265 AGCTTATATGTTGAACAGCATTTGTTTTATGACAAAACAATCAA--TAATAATGATTTGAAATAG
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA--AAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * * *
18328 ATAATTGTTTAAATAGGCATAATTATATGAACTGATT-TAGTAAACTGATTTATT
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGA-TAAACAGATTTATT
* * * *
18382 TTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
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* * * * * *
18447 GCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTGATGACAAAACAAATGGT-ATAATGATTTTAAATAGATA
65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * *
18511 AATGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCGCTAAATAGATTTATT
130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * *
18562 TTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAA
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* * * * *
18625 TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATGACAAAACAGAAGGTCTAGAACGATTTGAAATA
62 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * * **
18690 GATAACTATTCTAATAG--ATAACTATTTGAAATAGATAACGATTTGAATAGAAGCTA--
126 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGT-TCGA--TAAACAG-ATTTATT
* * * * ** * * * * * * * *
18746 GTTGAACAACAAACACATTTATT--TTTTAAAACTCTTAGTAATTTTAGAATATTA-TTAAATTA
1 TTTTAA-ATC--TCTTACTTATTAATTTTGAAA-TATTAATAA-ATTAG--TATTATTTTATTTC
* * * * * * * * * * * * ** * *
18808 GTATTA-TTTTTATCTAA-ATAAGC--TTGTATGATTA-GAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAA
59 GAATAAGCTTGTAT-GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCAT-----AAC--
* * * * * * *
18868 AGATCATAACAATTCGAGATTGATATT-TATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTAGTTCAGA-
115 -GAT-TTGA-AA-T--AGA-T-A-ATTGT-TC-AAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTC-GAT
* **
18931 AAATAG-TTTAGC
168 AAACAGATTTATT
* * *
18943 TTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT-AAGATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATA
** * * * * * *
19007 AATTTTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * * *
19072 AACTATTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACACTTATT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
19124 TTTTAAA---C-T-CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTATTATTATTTT-TATCTAAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
** * * * * * *
19183 AGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAACGATTCGAGATTA-A
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGA
* * * * * ** * * *
19246 TATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTCATTCAGA-AAATAGTTTTAGT
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTC-GATAAACAGATTTATT
* * *
19299 TTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT-AAGATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATA
** * ** * * * *
19363 AATTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAA-GTCATAACAACTTCAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * *
19427 AATTGTTCAAATAGTTA-AATCTATTTGTAGTT-GTTCGATAAAGAGATTTATT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * *
19479 TTTTGAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
1 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * * * * *
19543 AAGTTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTACGACCAAACAAATGGTCAAAACAACTTGAAATAGA
63 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
** * * * ** *
19608 TAATTGTTTTAATAGTC-TAA-TGATTTGAGTTGGTTTGGCAAACACA-TT-TT
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * *
19658 TTTTAAATCTCTTACATACTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
* * * *
19722 AGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTATAAC-AAA-AAAAGGATGATAACAATTTGAGATAGA
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGA
* * * ** * *
19783 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTC-AGTAAATAGATTTAGT
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGA-TAAACAGATTTATT
* * ** * *
19836 TTTTAAA--TCTT--TTATTAGTTTTCAAAATATTAATTGATCAGTATTATTTTA-TTCTAAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
** * * ** *
19896 ATTTTGCATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAAATCATAACGATATGAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * * *
19960 AGTTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTT-GTTTGATAAATAGATTTATT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * **
20012 GTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTCAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTT-TATTCTGAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTC-GAATA
* * * * * *
20075 AACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
** * * * * * *
20140 AATAATTCAAACAATCATAACTATTTAAACTT-GCTCGGTAAACAAATTTACT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * * * *
20192 TTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTTGGAATAT
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
* * * * * *
20257 GTTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAACTATTTGAAATAGATA
65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * *
20322 ATTGTTCAAGTAGTC-TAACTATTTGAA-CGTGTTC-ATAAAACATATTTATT
130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTG-GTTCGAT-AAACAGATTTATT
* *
20372 TTTTAAAT-TTTTA-TATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAA
1 TTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTGA-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AA
* * * * * * *
20433 TAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAGTAG
62 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * *
20498 ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAATT--TTCGATAAACAGATTCATA
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
20551 ATTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCGAATAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
* * *** * ** * *
20616 GCATATATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAA---C---A--ATTTAAAATATATA
65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * *
20673 ATTATTCAAGTAAAT-ATAAATATTTGAACTT-GTTTGATAAACATG-TTTATT
130 ATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACA-GATTTATT
* * * * *
20724 TTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
* *
20788 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAGAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAA
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
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* * * * *
20903 TTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTGTATG-AATATAAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAAAT
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AAT
* * * * * * *
20966 AAGCTTGTATGAA-TACAAGAATATATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATTA
63 AAGCTTGTATGAACAAAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TA
* * * * * **
21030 AATAATTGTTAAAAATAGTCATAACTATTTCAACTT-GTAT-GATAAACAAATTCAAA
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* * * *
21086 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTCGAGTCA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-A
* * * * * * * *
21151 A-CTTGTACGAACAGAAACAATTATTTTGTAACAATACAAAAGGTCATAATGCTTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * ** * * * *
21215 AATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGTACTGGTTAGGCT-AACAGATTCATT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTT-CGATAAACAGATTTATT
* * * * * *
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1 TTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * *
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64 AG-CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
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128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
* * * * * * *
21507 AGACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGATATAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATATA
64 AG-CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * *
21572 TAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAACATTTGTTTTATGACATAACAAAAAGGTCATAAC
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT--AA-A-TTG-GTT-CG--AT---AAACAGAT--TTA-
*
21637 TA
179 TT
* * * ** * *
21639 TTTGAAATACATAATTATTCATATAGCCTTAATTATTTGAATTAGTTCAGCAAATAAAT-TTA-T
1 TTTTAAAT-C-T-CTTA--C-T-TA---TTAA-T-TTTGAAATA-TT-AATAAATTAGTATTATT
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21702 TT-TTT-AAAT-CTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTAT-TTTTTTC-A
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* *** * * ** * * *
21762 AA--T-A-AACTTAGAAGAATATAAATAATTGTTTCACAACA-AAATAA-AAGGTTATAA--GGA
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* *
21819 TC--TAAA-ATATATAATT
163 TCGATAAACAGAT-TTATT
* * ** * * * *
21835 ATTCAAAT-AGTGA-TAACT-A-TTT-AAATTAGTTCAATAAGCA-TATTTATT-TTTTAATTCT
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAA-TA-TT-AATAA--ATTA-GTATTATTTT-ATT-T
* * * ** ** * * *** **** * * * *
21893 CCTACTTATTAA-TTTTTAAAAATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-GTCTTGTAT
58 -CGA---A-TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCAT-AAC
* ** * * * * * *
21955 GA--TGAAA-A-ACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAATTTATAA-TGATTTG--AAATAGA-
115 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC---TATTTA-AATTGGTTCGATAAACAGAT
*
22010 TAATT
176 TTATT
* * ** * * * * *
22015 GTTCAAATGGC-CA-TAATT-A-TTTGAACTGATTCAATAAACTGATTTATT-TTTTAAATTTTC
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAAT-ATT-AATAAA-TTA-GTATTATTTT--A-TTTC
** * * * ** * ** **** **
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59 GAA-----TAA-GCTTG---TATGAACAAA-AACAATTGTTTTATGACA-A-AA-C--AAAAGGT
* * *** ** * * * *
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*
22198 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT
167 T--AA-A--C---A-GATTT--A-TT
* * ** * * **
22224 GTTTAGTAAA-CAGAT-TTATTTTTTAAATTTCTTG-CTTATTAACTTTTTGAATGTTAATAAAA
1 -TTT--TAAATC---TCTTACTTATT-AA-TT-TTGAAATATTAA-----T-AA-ATTAGTATTA
* * * * * * ** *
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50 TTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAAC----AAAAAC---AA--TTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * **
22348 AGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAA-AGTCTTAACTA-CTATAACTAGTT-GGC
105 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTA-AATTGGTTCGAT
*
22410 AAACACATTTATT
168 AAACAGATTTATT
* * * ** * * *
22423 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTATTAGTTTAGCAATATTTTA-CTCTGAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
* * * * ** *
22487 AACTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-ATCATATTGATTTGAGATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
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22551 AATTATTGAACTAGTCATAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAATAGATTT-TGT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTAT-T
*
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
** * * * * * * **
22663 ATTTTGTATGAATAAAAATAATTATTTAATGACAAAACAAAATGTTATAGTGATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * *
22728 AATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATATATTTATT
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * *
22780 TTTTAAATCTC-CATCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
1 TTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * ** * * *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATA
* * * * * *
23025 ATCTT-TAATGAATAGAAACTATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGAC-ATTTGAAATAGA
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* * *
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* *
23135 TTTT---TCTC--A-TTAATT--TTTTG-AATATTAATAAATTTA-CATTATTTTA-TTCAAAAT
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* * * * * *
23189 AAGCTTGCATGAGCAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGA
63 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
23254 TAACTATTTAGATAGTCATAACTATTTAAACTT-ATTCGGTAAACAGATTCT-TT
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGGTTCGATAAACAGATT-TATT
* * * * * *
23307 TTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATACATTAGTATTATTTTACTTCAAATAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
* * * * * * *
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65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * ** * * * * * *
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130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTA-TT
* ** * *
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* * * * * * * * *
23551 TAAACATGTATGAACAAAAACAATT-ATTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACAATCTAAAATAA
62 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
** * * * * *
23615 ATAATTGCACAAATAGTTATAACAATTTGAACTT-GTTCGGTAAACATATTTATT
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * * *
23669 TTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTAATCCGAATAA
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65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
**** * * * * * *
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130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
23850 TTTTAAATCTCTTAC-TAAT-A-TTTGAAATACTAATAGATTAGTATTACTTTA-TTCTGAACAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAA
** * * * * * *
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65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
23976 ATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTGGTTAGGTAAATAGAATTATT
130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
24027 TTTTGAATCTCGTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * *
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** * * * * *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * * * ** *
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64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
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** * * * * *
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* *
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* ** * * ** * *
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65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* ** * * * ** *
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130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
* ** * * * * * **
24813 AGCTTATATGAACTGAAATAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
** *
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129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
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1 TTTTAAATCTCT-TACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * ** * * * *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATA
* *** * *
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* *
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129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
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25270 TTTTAAATTTGTTA-TTCATTAATTTTCTCAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
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25334 AGCATGTATAAACTAAAAA-AAGTATTTTGTGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTAAAATAGA
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128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
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131 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * *
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** * * * * * * ** *
25684 TTTTGAATGAATAGAAACAATTATTTTTTGACAAAACCAAATATCATAATGATTTGAAATAGATA
65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * ** * * * * *
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** * *
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* * ** * * * *
25865 ACTTGTATGAATAAAAATGATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATA
65 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * *
25930 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCGATAAACAAATTTATT
130 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * *
26045 AGCTTTTATGAACATAAACAATTGGTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * *
26110 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAATGTTTAGA-AAATATATTTA-T
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * * *
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1 TTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AAT
* * * * * ** * **
26223 AAGCATGCATAAAC-AAAACAAAATATTTTATGACAAAACAAAATTTGATAA-TTTTTGAAATAG
63 AAGCTTGTATGAACAAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
26286 ATAATTGTTTAGATAATCATAACTATTTGAACA-T-GTTTGGTAAATAGATTTTATT
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA-ATTGGTTCGATAAACAGA-TTTATT
* * *
26341 TTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATTA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAG---TA--TTA-TT----TTA
* * *** * * * ** *
26406 TTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATTACAAAA-AAAAGGTTACGATGATTT
55 TTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * * * *
26470 GAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTAATTGAACTT-GTTCAAAAAACATATTTATT
120 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
*** * * *
26531 TTTTAAAATCT-TCTACTTATTAATTGCCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTGAATT-GATA
1 TTTT-AAATCTCT-TACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-A
* * * * * * * * * *
26594 TAAGCATCTATG-ACAGAAACAATTGCTTTATGACTAAATAAAAAGCCATAACAATTTGAAATAA
62 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * ** * *
26658 ATAATTTTTCAAATACTCATAAAGATTTGAACTT-GTTCGATAAATAGATGTATTTTATT
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCGAT-AA-ACA-G-A-TTTATT
* * * * *
26717 TTTTCAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-TAATATTAATAAATT-TTATTATTTTA-TTCAAAAT
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAAT
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63 AAGCTTGTAT
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CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACAGATTTATT
Found at i:18724 original size:17 final size:16
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*
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ATTTGAATAGATAACT
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Alignment explanation
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17201 AAACAAATAT
* * * ** **
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* * * * * *
17275 TTAAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTATAACTTATTAATTTTGA-AATATTAA
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* * * * * *
17339 TTAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAA
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* * * * * * *** * * * * * **
17403 TAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTTTTTTAACTGATTTG
190 CAAAGA-TCATAACGATTTGAATTA-ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCATTCA
* * * * * * *** * *
17468 GCAAACATATCTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAATATTA
253 GAAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTA
** * * * * *
17533 TTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAA
318 TTTTATTTTGA-ATAAG-TTTTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
17597 CGATTTTAAATAGACAAATGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACCTATTCGGTAAACA-ATTTC
379 -TATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTT-
* * ** * *
17661 TTTTTTTAAATCTCAT-TCATATAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAA
442 ATTTTTTAAATCTCATCTTAT-TAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAA
* * * * * * * *
17725 TAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTAGAACGATTTGAAATAG
505 TAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAG
* * * * * * *
17790 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTG--A-ACTGA-TTCAATA-----AAC-AA-A-TTTAT
569 ATAATTGTT-TAATAG--ATAACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAAACACATT-T
* * * ** *
17843 TTTTTAAATCTCTTAT--TAATTTTTGAATTATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCGATTAAG
630 TTTTTAAAACTCTTATACTAATTTTAGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAG
* * * * * ** *
17906 CTTGTACGAACAAAATAATTGTTTTACAACCAAAGCAAAGG-TCATAATGATTTG-GAATAGATA
695 CTTGTA-TAAAAAAACAATTGTTTTATAA-CAAA-AAAAGGATCATAACAATTCGAG-ATAGATA
** *** * * * * * * * * ** *
17969 ATCGTTCTTGTAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGCAATTAAATTTATTTTTTAATTTTCTTA
756 ATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGAAAATAGATTTAGCTTTTAA--ATCTT-
* * * * * ** *
18034 GCTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATGAATAG
818 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTTATTT-AAATAAATTTTTATGAACAG
*
18099 AACCAATTG
880 AAACAATTG
* * * *
18108 TTTGATGACAAAATAAAAAGGTTATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTA
1 TTT-ATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
18173 TTTGAAATGGTTTGGTAAGCAAATTTACTTTTTAAATCTCTAATTGATTAATTCTT-GAAATATT
64 TTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC---TT-ATTAATTTTTAG-AATATT
* * * *
18237 AATAAATTAGTATTATTTTTTTC-AAAAAAGCTTATATG-TT-GAACAGCATTTGTTTTATGACA
124 AATAAATTAGTATTATTTTTATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAA-A-CAATTGTTTTATGACA
* * * * * ** * * * *
18299 AAACAATCA-ATAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGGCATAATTATATGAACTGA
187 AAACAA--AGATCATAACGATTTGAATTA-ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCA
* * * * *
18363 TTTAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAG
249 TTCAG-AAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAG
18427 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTGATGACAAAACAAATGGT-
313 TATTATTTTATTTTGAATAAG-TTTTATGAACTAAAACAATTGTTT-ATGACAAAACAAA-GGTC
* * * * *
18491 ATAATGATTTTAAATAGATAAATGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGCTAAATAGA
375 ATAAT-ATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGA
*
18556 TTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
439 TTTATTTTTT-AAATCTCAT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
* * * *
18621 TAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATGACAAAACAGAAGGTCTAGAACGATTTGA
501 TAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAACA-AAGGTC-AAAACAATTTGA
* *
18686 AATAGATAACTATTCTAATAGATAACTATTTGAAATAGATAACGATTTGAATAGAAGCTAGTTGA
564 AATAGATAATTGTT-TAATAGATAACTATTTGAAATA-AT---GATTTGAATAG--G-T--TTG-
*
18751 ACAACAAACACATTTATTTTTTAAAACTC-T-TAGTAATTTTAG-AATATTATTAAATTAGTATT
618 ---ACAAACACA-TT-TTTTTTAAAACTCTTATACTAATTTTAGAAATATTATTAAATTAGTATT
* * * * * *
18813 ATTTTTATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAA-GATCATAA
678 ATTTTAATCTAAATAAGCTTGTAT-A-AAAAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAGGATCATAA
* * * *
18877 CAATTCGAGATTGATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTAGTTCAGAAAATAG-TTTA
740 CAATTCGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGAAAATAGATTTA
18941 GCTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAAGAT
805 GCTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTTATTTAA-AT
*
19006 AAATTTTTATGAACAGAAACAATTA
864 AAATTTTTATGAACAGAAACAATTG
* * * * *
19031 TTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAACTATTCTAATATTCTTAACTAT
1 TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
19096 TTGAACTGGTTCGACAAACACACTTATTTTTTAAA-CTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAA
65 TTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA
* * *
19160 TTATTATTATTTTTATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAG
130 TTAGTATTATTTTTATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAG
* * *
19225 ATCATAACGATTCGAGATTAATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTCATTCAGAAAAT
195 ATCATAACGATTTGA-ATTAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCATTCAGAAAAT
* * * *
19290 AGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTA-
259 AGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAT
* * * * * * *
19354 TTTAAGATAAATTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTCATAACAACTTC
324 TTTGA-AT-AAGTTTTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAGGTCATAA-TATTTC
* * * *
19419 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA-AATCTATTTGTAGTTGTTCGATAAAGAGATTTATTTTTT
385 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * * *
19483 GAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTT
449 -AAATCTC-ATCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCT
* * * *
19548 TGTATGAACTAAAATAATTGTTTTACGACCAAACAAATGGTCAAAACAACTTGAAATAGATAATT
511 TGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA-GGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATT
* * * *
19613 GTTTTAATAG-T--C---------TAATGATTTGAGTTGGTTTGGCAAACACATTTTTTTTAAAT
575 G-TTTAATAGATAACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAAACACATTTTTTTTAAAA
* *
19666 CTCTTACATACTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTAT
639 CTCTT--ATACTAATTTTAGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTAT
* *
19731 AAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAGGATGATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAAT
702 AAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAGGATCATAACAATTCGAGATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * **
19796 AGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTATTAGTTTTCAA
767 AATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGAAAATAGATTTAGCTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGA
** *
19861 AATATTAATTGATCAGTATTATTTTATTCTAAAT-AATTTTGCATGAACA-AAACAATTG
832 AATATTAATAAAT-AGTATTATTTTATT-TAAATAAATTTT-TATGAACAGAAACAATTG
* ** * * * * * * *
19919 TTTTATGACAAAGCAAAAAATCATAACGATATGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGACATGACTAT
1 -TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
19984 TTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTGTTTAAATCTCCTACCTATTAA-TTTCAAAATATTAA
65 TTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CT---TATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * *
20048 TAAATTAGTA-TATTTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAA
126 TAAATTAGTATTATTTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
20112 CAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATAATTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGC--T
190 C-AAAGATCATAACGATTTG-AATTAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAA-TT-CATT
* * * * * * * * * *
20175 CGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAC
251 CAGAAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTAT
* * * *
20240 TATTTTATTTGGAATATGTTTGTATGAAC-AGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCAC
316 TATTTTATTTTGAATAAGTTT-TATGAACTA-AAACAATT-GTTTATGACAAAA-CAAAGGTCAT
* * * *
20304 AACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAGTC-TAACTATTTGAACGTGTTC-ATAAAACATAT
377 AA-TATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGAT-AAACAGAT
* * * *
20367 TTATTTTTTAAATTTTTAT-ATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTG
440 TTATTTTTTAAA-TCTCATCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT-
* * *
20430 AAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
502 AAATAAGCTTGTATGAACTA-AAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTCAAAACAATTTGAA
* * * * **
20494 GTAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAAT--T--TTCG-ATA-----AACAGATTCA
565 ATAGATAATTGTTT-AATAG--ATAACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAAACACA
** * * * * * * * * *
20549 --TAATTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTT-ATTTCG
627 TTTTTTTTAAAACTCTTA-T-ACTAATTTTAGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT-A
* * ** * * ** * ** *
20611 AATAAGCATATATGAATTGATACAATTGTTTTAT----GATGAA--A-CAAAACAATTTAAAATA
689 AATAAGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAGGATCATAACAATTCGAGATA
* * * * * * *
20669 TATAATTATTCAAGTAAAT-ATAAATATTTGAACTTGTT-TGATAAACATG-TTTA-TTTTTAAA
752 GATAATTATTCAAAT-AATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGA-AAATA-GATTTAGCTTTT-AA
* * * ** *
20730 ATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGT
813 ATC--TT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTT-ATTTAAATAAATTTTT
*
20795 ATGAACAAAAACAATTG
872 ATGAACAGAAACAATTG
** * * *
20812 TTTTATGACAGAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCGTAACTA
1 -TTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
** * * * * * *
20875 TTTGAACTTATTCGGTAAATATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAGTTGTATGAATATA
64 TTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATT--TT-TA-GAATATT
* * * * * *
20938 AATAAATTTGTATTATTTTAAT-TGAAATAAGCTTGTATGAATA-CAAGAATATATTTTATGACA
124 AATAAATTAGTATTATTTTTATCT-AAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAAT-TGTTTTATGACA
* * * * * * * *
21001 AAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATTAAATAATTGTTAAAAATAGTCATAACTATTTCAA--C
187 AAAC-AAAGATCATAACGATTTG-AATT-AATAATTATT-CAAATAATCATAACTATTTGAATTC
* * * * ** * ** *
21064 -TTGTATGATAAACAAATTCAAATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAAT
248 ATT-CA-GA-AAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAG
* * * * * * * * *
21128 TAGAATTATGTTATTTCGAGTCAACTTGTACGAAC-AGAAACAATTATTT-TGTAACAATACAAA
310 TAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTATG--ACAAAAC-AA
* * * * * * * *
21191 AGGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGTACTGGTTAGGCT-
370 AGGTCATAAT-ATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-CGATA
* * * * * *
21255 AACAGATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTAGAATATCATTAAATTAGCATTACT
433 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCA-T-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * *
21319 TTATTCCGAATAAGAC-TGTATCAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAATGGTCATAAT
496 TTATT-TAAATAAG-CTTGTATGAACT-AAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA-GGTCAAAAC
* * * * ** * **
21382 GATTTGAAATAAATAATTG-TTCA-A-AT---T-GTT---ATAACCATTTGAATTGGTTTGGTAA
557 AATTTGAAATAGATAATTGTTTAATAGATAACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAA
* * * * *
21437 ACAGATTTATTTTTTACATCTCTTAT--TAATTTTCA-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
622 ACACA-TT-TTTTTTAAAACTCTTATACTAATTTT-AGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * *
21499 TTC-AGAA-CAGACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGATATAACAAAATG-TCATAACTA
684 ATCTA-AATAAG-CTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTAT-A-ACAAAAAAAGGATCATAACAA
* * * * ** * * * *
21561 TTTGAAATATATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAACATTTGTTTTATGACATAACA-A
743 TTCGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTG-AAC--TAG-TTCA-GA-A-AATAGA
** * ** * * * * * * * * * * * *
21625 -AAAGGTCATAACTATTTGAAATACATAATTATTCATATAGCCTTAATTATTTGAATTAGTTCA-
801 TTTAGCTTTTAAATCTTT----TA-TTAATTTTTGAAATA---TTAATAAATAGTATTATTTTAT
** * * * **
21688 GCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATT-
858 TTAAATAAA--T-TTTTATGAA---C--AG-AAACAATTG
* * * * * ** * ** * * **
21727 TTCATAATATTATTAGATTA-GT-ATTATTTTTTTCAAATAAACTTAGAAGAATAT-AAATAATT
1 TTTATGACA--A-AACAAAAGGTCA-TAATGATTTGAAATAGA--T--AATTAT-TCAAAT-A--
* * ** ** * * ** *
21789 GTTTCACAACAAAAT-AAAAGG-TT-ATAAGGATCTAAAATATATAATTATTCAAAT-AGTGA-T
54 G--TCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAA--A-C--AAAT-T-T-ATTTTTTAAATCTCTTATT
* * * * * * *
21849 AACTATTTA-AATTAGTTCAATAAGCA-TATTTATTTTTTAATTCTCCTACTTATTAA-TTTTTA
109 AA-TTTTTAGAA-TA-TT-AATAA--ATTA-GTATTATTT--TTAT-CTA---AATAAGCTTGT-
** * * * ** * * * * * *
21911 AAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAGTCTTGTATGATGAAAAAC-AATTG-TTT
160 ATGATT-AGAAA-CA--ATTGTTTTA---TGACA-AAAC---AAAGAT-CATAACGATTTGAATT
* * ** ** * * **** * *** *
21973 TATGACAAAACAAA-AATTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATT
213 AATAATTATTCAAATAA-TCATAACT-ATTTG-AAT---TCATTCAGAAAATAGATTTACTT-TT
* * * * * * *
22036 TGAACTGAT-TCAATAAACTGATTTATTTTTTAAAT-TT--TCAACT--TCTTAATTTTTGAAAT
271 T-AA---ATCTC--T-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATT-A-TTTT---AT
* * ** * * * * *
22095 ATT-AATAAAGTATTATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTTTGAACTAAAACAATTGTTTTATGA
324 TTTGAAT-AAG--TT-TTA--TGAACTAAAACAA--TTGTTT--A-T--GAC-------------
* * *
22159 TAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT
363 -AAAACAAA-GGTCATAAT-ATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
22224 GTT-TAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAACTTTTTGAATGTTAATAAAATT
425 GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCAT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAAT-AAATT
** * * * *
22288 A-TATTATTGAATTTTGAATTAGCTTGTATGAACTAAAAT-TTTTTTTTATGACAAAACAAAAGG
487 AGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGG
* * *
22351 TCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAAAG-T--C---TT-AACTACT-A--T-AACTA-
550 TCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGATAACTATTTGAAATAATGATTTGAA-TAG
* * * * **
22404 G-TTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATTTTATTAGTTTA
613 GTTTGACAAACACA-TT-TTTTTTAAAACTCTTA--TACTAA-TTTTAGAAATATTATTAAATTA
* * * * * * * * *
22467 GCAATATTTTACTCTGAATAAACTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AAT
673 GTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAGGAT
*** * * * * * * * ** *
22531 CATATTGATTTGAGATAGATAATTATTGAACTAGTCATAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAATAG
735 CATAACAATTCGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGAAAATAG
* * ** * *
22596 ATTTTGTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAC
800 ATTTAGCTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTTATT-TAAA
* * * *
22661 T-AATTTTGTATGAATAAAAATAATTA
863 TAAATTTT-TATGAACAGAAACAATTG
* * * * * *
22687 TTTAATGACAAAACAAAATGTTATAGTGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTA
1 TTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
22751 TTTGAACTTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTCCATCTTATTAATTTTTAGAATATTA
64 TTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--T-C-TCTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * *
22816 ATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGTAACAATTATTTTATGACAAA
125 ATAAATTAGTATTATTTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * *
22880 ACAAAAGAAT-ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACT
189 AC-AAAG-ATCATAACGATTTG-AATTAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCA-T
* * * ** * *
22944 T--GTTAAATAGATTTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGTATTTTAATAAATTAGT
250 TCAG-AAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGT
** * *
23006 ATTATTTTTATTCCGCATAA-TCTTTAATGAA-TAGAAACTATTGGTTTATGACAAAACAAAAGG
314 ATTA-TTTTATTTTGAATAAGT-TTT-ATGAACTA-AAACAATT-GTTTATGACAAAAC-AAAGG
* * * * * * *
23069 TCATGACATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTGTTTGAACATATTCAGA-AAAC-
373 TCATAATATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACA
*
23132 -----A-TTTTT---T-TC-TC--ATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTA-CATTATTTTATT
437 GATTTATTTTTTAAATCTCATCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *** *
23183 CAAAATAAGCTTGCATGAGC-AAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTA
501 -TAAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-TAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTCAAAACAATTTG
* * *
23247 AAATAGATAACTATTTAGATAGTCATAACTATTT-AAACT--T-A--T---TCGG--T---AAAC
563 AAATAGATAATTGTTTA-ATAG--ATAACTATTTGAAA-TAATGATTTGAATAGGTTTGACAAAC
* ** * * * * * *
23298 AGATTCTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATACATTAGTATTATTTTAC
624 ACA-T-TTTTTTTAAAACTCTTA-T-ACTAATTTTAGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAA
* * * * * ** *
23363 T-TCAAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAATG-TCATAATGATTT
685 TCT-AAATAAGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAGGATCATAACAATTC
* * **** * * * ** * * * **
23426 GAAATAGATAATTATTCAGATTGGAATCACTGTTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTT
746 GAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGAAAATAGATTTA-GCTTT
* * * *
23491 TAAATCTTTTCATT-ATTAATTGTCAAAATATTAATAAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAA
810 TAAATCTTTT-ATTAATT--TT-T-GAAATATTAAT-AAA-TAGTATTATTTT-ATTTAAATAAA
** * * *
23555 CATGTATGAACAAAAACAATTA
867 TTTTTATGAACAGAAACAATTG
* * ** * * * *** * *
23577 TTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACAATCTAAAATAAATAATTGCACAAATAGTTATAACAATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
23642 TGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAAT
66 TGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * ** * * * * * *
23707 AAATTAGCATTATTTTAATCCGAATAAGCATGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATAATAGAACA
127 AAATTAGTATTATTTTTATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * ** * * * * *
23772 AAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATAACCCAAATAGTCATAATTATTTAAACT-AGTT-TG
192 AAGA-TCATAACGATTT-GAATTAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCA-TTCAG
* * * * * * *
23835 ATAAATAGATTGATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATATTTGAAATACTAATAGATTAGTATTA
254 A-AAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTA
* * * * * *
23896 CTTTATTCTGAACAAATTTATATGAA-TAAAAACATTTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
318 TTTTATTTTGAATAAGTTT-TATGAACT-AAAACA-ATTGTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAA
* * * * * * * *
23960 TGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTGGTTAGGTAAATAGAATTA
379 T-ATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA
* * * *
24025 TTTTTTGAATCTCGTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAA
443 TTTTTTAAATCTCAT-CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TAA
* * * * *
24088 ATAAGCTAGTATAAATTCAAATAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAA-GATTTGAA
504 ATAAGCTTGTATGAACTAAAAT-AA-TTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTCA-AAACAATTTGAA
* * * * *
24152 ATAGATAATTG-TTCAT-G-T-AGT-CTT---A-AAT-ATTTGAATTGGTTTGATAAACA-ATTT
565 ATAGATAATTGTTTAATAGATAACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAAACACA-TT
** * * * * * *
24206 TAGTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATATTTAG-AATATTATTAGATTAGTTTTATTTTATTTTG
629 T--TTTTTAAAACTCTTA--TACTAAT-TTTAGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTA
* * * * ** **
24270 AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAGGACAAAAAAAAAGG-TTATAATGATTTTA-A
689 AATAAGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTA-TA-ACAAAAAAAGGATCATAACAATTCGAGA
** * * * * * * **
24333 GTTTACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTC-GATAAACAAATTTATATTTTAA
750 -TAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGA-AAATAGATTTAGCTTTTAA
* ** ** *
24397 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTTA
813 A--TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTT-ATTTAAATAAATTTTT
**
24462 ATGTTCA-AATACAATTG
872 ATGAACAGAA-ACAATTG
* ** * * * * * * *
24479 TTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATATATAGTTGTTGACATGGCCATAA-TAA
1 TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-A
* ** * * * ** *
24543 TTTGAAGTTATTTGATAAACAACTTCACTTTTTAAATCAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
64 TTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
* * * * * *
24608 ATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACT-GAAACAATTCTTTTATCACAAAACA
129 ATTAGTATTATTTTTATCT-AAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * ** * ** * *
24671 AAAATTCATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTGTTTCGGC
192 AAGA-TCATAACGATTTGAATTA-ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCATTCAGA
* * * * * ** * * *
24736 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATG
255 AAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATT
* * * * * * * * *
24801 TTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTATAATAA
320 TTATTTTGAATAAG-TTTTATGAACTAAAACAATT-GTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAAT-A
* * * *
24866 TTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG----GA--A-TTG-----GTTCGGTAAACAGATTTATTT
381 TTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTT
* *
24919 TTTAAATCTTCCA-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATA
446 TTTAAATC-T-CATCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATA
* * *** * * * * **
24982 GGCTTGTGTGATGAAAAACACA-TGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCGTAACAATTTGAAATAGA
507 AGCTTGTATGAACTAAAATA-ATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGA
* * ** **
25046 TAATTGCTTAAATAGCCATAATTATTTG-AACCA--ATTTG-ATA-AATTG------AC-TTATT
570 TAATTG-TTTAATAG--ATAACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAAACACATT-TT
* * * * * * * * *
25099 TTTTAAATCTCTAACATA-TCAATTTTTGAAGTATTAATAAAGTAATATTATTTT-ATTTCATAT
631 TTTTAAAACTCT--TATACT-AATTTTAGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAAT
* *** *
25162 AAGCTTTTATGAACTGGAACAATTATTTTATGATA-AAACAAAAGG-TC-T----A----A-ATA
692 AAGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTAT-A-ACAAA-AAAAGGATCATAACAATTCGAGATA
* * * * * **
25215 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATT
752 GATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCAGA-AAATAGATTTAGCTTTTAAA--
* * *** *
25279 TGTTATTCATTAATTTTCT-CAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTAT
814 TCTT-TT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTTATTT-AAATAAATTTTTAT
* *
25343 AAACTA-AAAAAAGTAT-
874 GAAC-AGAAACAA-T-TG
* * * * * * * *
25359 TTTGTGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATTATACTAATAGTCTTAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
25424 TGAACTGATTTGACAAACACATTTATTTTTTGAATATCTTATT--TTTTTAGAATATTATTAATT
66 TGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT
* ** * * * *
25487 TAGTAATA-TTTTACTCCGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTG-TTTATAACAAAACAAAG
131 TAGTATTATTTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAG
* * * * * * * *
25550 ATCCTAATGATTTGAGA-TAGATAATTGTTTAAAAAATCATAATTATTTGAACT-AGTT-TGACA
195 ATCATAACGATTTGA-ATTA-ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCA-TTCAGA-A
* * * * *
25612 TATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATACT-ATAAATTAGTATTATTT
256 AATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTT
* * * * **
25672 TATTCTAAATAA-TTTTGAATGAA-TAGAAACAATTATTTTTTGACAAAACCAAATATCATAATG
321 TATTTTGAATAAGTTTT--ATGAACTA-AAACAATT-GTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAAT-
* * * * * * * * *
25735 ATTTGAAATAGATAATAGTTCAAAT--TGATAGGACTATTTGAGCTTATTTGGTGAACAAATTTA
380 ATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA--ACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA
* *
25798 TTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTACGAA
443 TTTTTTAAATCT-CATCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTA--AA
* * * * * * **
25862 TAAACTTGTATGAA-TAAAAATGATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTGAAATA
505 TAAGCTTGTATGAACT-AAAATAATTATTTTATGACAAAA-CAAAGGTCAAAACAATTTGAAATA
* * * * * * * *
25926 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--CG-CTCG-ATA-----AAC-AA-A-TTTA
568 GATAATTGTT-TAATAG--ATAACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAAACACATT-
* * * * * * * *
25979 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA-ATGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
629 TTTTTTAAAACTCTTA--TACTAATTTTAGAAATAT-TATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAA
* * * * * * *
26043 TAAGCTTTTATGAACATAAACAATTGGTTTATGACAAAGCAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATA
691 TAAGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTATAACAAA--AAAAGGATCATAACAATTCGAGATA
* * * * *
26107 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-AATGTTTAGAAAATATATTTA-TTTTTAAATA
752 GATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTA-GTTCAGAAAATAGATTTAGCTTTT-AA-A
* * * ** *** ** *
26170 TTTATTTATTCATTTTTGAAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTAATCGAAATAAGCATGCATA
814 TCT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA--TAGTATTATTTT-ATTTAAATAAATTTTTATG
26234 AACA-AAACAAAATAT-
875 AACAGAAAC--AAT-TG
** * * * * * *
26249 TTTATGACAAAACAAAATTTGATAAT-TTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAATCATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * *
26313 TGAACAT-GTTTGGTAAATAGATTTTATTTTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTT-GAAATATT
66 TGAAC-TGGTTTGATAAACA-AATTTATTTTTTAA--ATC-T-CTTATTAATTTTTAG-AATATT
* * *
26376 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATTATTTCAAATAAGCTTATATGAATT-GAAACAATTAT
124 AATAAATTAG---TA--TTATTT----TTATCT-AAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGT
* * * * ** * * * * * * *
26440 TTTATTACAAAAAAAAGGTTACGATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTAATT
178 TTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAATTA-ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT
* * * * * ***
26505 GAACTT-GTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAAATCT-TCTACTTATTAATTGCCAAAATATTA
242 GAA-TTCATTCAGAAAATAGATTTACTTTTT-AAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * *
26568 ATAAATTAATATTATTTGA-ATTGATATAAGCATCTATG-AC-AGAAACAATTGCTTTATGACTA
304 ATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAG-TTTTATGAACTA-AAACAATTG-TTTATGAC-A
* * * * * * * **
26630 AATA-AAAAGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATACTCATAAAGATTTGAACTTGT
364 AA-ACAAAGGTCATAA-TATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * ** *
26694 TCGATAAATAGATGTATTTTATTTTTTCAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAA
427 TCGAT-AA-ACA-G-A-TTTATTTTTTAAATCTCAT-CTTATTAATT-TTTTGAATATTAATAAA
* *
26758 TT-TTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT
485 TTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTAT
26789 TGTTACCTTT
Statistics
Matches: 6551, Mismatches: 1466, Indels: 1309
0.70 0.16 0.14
Matches are distributed among these distances:
868 3 0.00
869 1 0.00
870 83 0.01
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872 1 0.00
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874 2 0.00
875 57 0.01
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979 54 0.01
980 7 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (888 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
TGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT
TAGTATTATTTTTATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA
TCATAACGATTTGAATTAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTCATTCAGAAAATAG
ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT
TGAATAAGTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATATTTCAAATAG
ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
ATCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAACT
AAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAATAGAT
AACTATTTGAAATAATGATTTGAATAGGTTTGACAAACACATTTTTTTTAAAACTCTTATACTAA
TTTTAGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATAAAAAAACAATTGT
TTTATAACAAAAAAAGGATCATAACAATTCGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT
GAACTAGTTCAGAAAATAGATTTAGCTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATA
GTATTATTTTATTTAAATAAATTTTTATGAACAGAAACAATTG
Found at i:19425 original size:355 final size:356
Alignment explanation
Indices: 18754--21500 Score: 1248
Period size: 355 Copynumber: 7.7 Consensus size: 356
18744 TAGTTGAACA
*
18754 ACAAACACATTTATTTTTTAAAACTCTTAGTAA-TTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT
1 ACAAACACATTTATTTTTTAAAACTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT
18818 TATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACAATTC
66 TATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACAATTC
*
18883 GAGATTGATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTAGTTCAGAAAATAGTTTAGCTTTTA
131 GAGATTAATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTAGTTCAGAAAATAGTTTAGCTTTTA
18948 AATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAAGATAAATTTT
196 AATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAAGATAAATTTT
** * *
19013 TATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAACTAT
261 TATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAACTTCAAATAGATAACTAT
* * *
19078 TCTAATATTCTTAA-CTATTTGAACTGGTTCG
326 TCAAATAGT-TAAATCTATTTGAACTGGTTCG
* *
19109 ACAAACACACTTATTTTTT-AAACTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTATTATTATTTT
1 ACAAACACATTTATTTTTTAAAACTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT
*
19173 TATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACGATTC
66 TATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACAATTC
*
19238 GAGATTAATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTCA-TTCAGAAAATAGTTTTAGTTTT
131 GAGATTAATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATT-AGTTCAGAAAATAG-TTTAGCTTT
19302 TAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAAGATAAATT
194 TAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAAGATAAATT
* * * * * *
19367 TTTATGAACTGAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAA-GTCATAACAACTTCAAATAGATAATT
259 TTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAACTTCAAATAGATAACT
* * * *
19431 GTTCAAATAGTTAAATCTATTTGTAGTTGTTCG
324 ATTCAAATAGTTAAATCTATTTGAACTGGTTCG
* * * * * *
19464 ATAAAGAGATTTATTTTTTGAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
1 ACAAACACATTTATTTTTT-AAAACTC--T-T-ATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATT
* * * * * ** * *
19529 A-TTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTA-AAATAATTGTTTTACGACCAAACAAATGGTCAA
61 ATTTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAA-GATCAT
* * * ** * * * * ** *
19592 AACAACTT-GA-AATAGATAATTGTTTTAAT-AGTCTAA-TGATTTGAGTTGGTTTGGCAAACAC
123 AACAA-TTCGAGATTA-ATATTTATTCAAATAATTATAACT-ATTTGAATTAGTTCAG-AAA-AT
* * * * * *
19653 A-TTT--TTTTTAAATCTCTTACATACTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
183 AGTTTAGCTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-AT
* * ** * * * * * * * *
19715 CTGA-ATAAGCTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTTTATAAC-AAA-AAAAGGATGATAACAATTT
247 TTAAGATAAATTTTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGG-TCAGAACAACTT
* * * * **
19775 GAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTATTTC-
311 CAAATAGATAACTATTCAAATAGTTA-AATCTATTTGAACTGGTTCG
* * * * * * * * * * *
19820 AGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTATTAGTTTTCAAAATATTAATT-GATCAGTATTA-T
1 A-CAAACACATTTATTTTTTAAAACTCTTATTAATTTTTAGAATATT-ATTAAATTAGTATTATT
** * ** * * * * *
19883 TTTATTCTAAATAATTTTGCATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAAATCATAACG
64 TTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAACA
* * * * * * *
19947 ATAT-GA-AATAGATAGTTGTTCAAATGGA-CATGACTATTTGAACTT-GTT-TGATAAATAGAT
127 AT-TCGAGATTA-ATATTTATTCAAAT-AATTATAACTATTTGAA-TTAGTTCAGA-AAATAG-T
* * ** *
20007 TTA-TTGTTTAAATCTCCTACC-TATTAA-TTTCAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTTATT
186 TTAGCT-TTTAAATCT-CTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTA-TTTTATT
* * * * * * * * * * *
20068 CTGA-ATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTG
248 -TAAGATAAATTTTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAACTTC
* * * * * * *
20132 AAATAAATAA-TAATTCAAACAATCATAA-CTATTTAAACTTGCTCG
312 AAATAGATAACT-ATTCAAATAGTTA-AATCTATTTGAACTGGTTCG
** * * ** * * *
20177 GTAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTACTA
1 ACAAACACATTTATTTTTTAAA---ACT-CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTA
* * * * ** * * * * * *
20242 -TTTTATTTGGAATATGTTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAA
62 TTTTTATCT-AAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAA-CAAAGATCATAA
* * * * * * * * * *
20306 CTATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAGT-AGTCTAACTATTTGAACGT-GTTCATAAAACATA-T
125 CAATTCGAGATTA-ATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAA-TTAGTTCA-GAAA-ATAGT
** ** *
20367 TTATTTTTTAAAT-T-TTTATATATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
186 TTAGCTTTTAAATCTCTTCCT-TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAA-GTAGTATTATTTTATT
** * * * * * * * *
20428 TGAA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTG
248 T-AAGATAAATTTTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAACTTC
* * * * * * *
20492 AAGTAGATAATTGTTTAAATAGTCATAA-CTATTTGAAAT-TTTCG
312 AAATAGATAACTATTCAAATAGTTA-AATCTATTTGAACTGGTTCG
* * * ** * * *
20536 ATAAACAGATTCATAATTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA-TA
1 ACAAACACATTTATTTTTTAAAACT-CT--T-ATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTA
* * * * * * *
20600 ATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAATT-GATACAATTGTTTTATGATG-AAAC----A--A-A
62 TTTTTATCT-AAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAATAATTGTTTTATGA-GAAAACAAAGATCATA
* * * * * * * * *
20656 ACAATT-TAAAATATATAATTATTCAAGTAAATATAAATATTTGAACTT-GTT-TGATAAACATG
124 ACAATTCGAGATTA-ATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAA-TTAGTTCAGA-AAATA-G
* * * * * * *
20718 TTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATC
185 TTTAGCTTTT-AAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-ATT
** * * * * * * *
20782 TAA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAGAAA-AAAA-GTCATAACAATTTG
248 TAAGATAAATTTTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACA-AAACAAAAGGTCAGAACAACTTC
* * * **
20844 AAATAAATAATTATTTAAATAGTCGT-AA-CTATTTGAACTTATTCG
312 AAATAGATAACTATTCAAATAGT--TAAATCTATTTGAACTGGTTCG
** * * * * * * *
20889 GTAAATATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAGTTGTATGAATATAAATAAATTTGTATT
1 ACAAACACATTTATTTTTTAAAACTCTTA-TTAATT--TT-TA-GAATATTATTAAATTAGTATT
* * * * * * * *
20952 ATTTTAAT-TGAAATAAGCTTGTATGAATA-CAAGAATATATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
61 ATTTTTATCT-AAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAAT-TGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCAT
* * * * * * * * * * *
21015 AGCAATTTGAAATTAAATAATTGTTAAAAATAGTCATAACTATTTCAACTT-GTATGATAAACA-
123 AACAATTCGAGATT-AATATTTATT-CAAATAATTATAACTATTTGAA-TTAGT-TCAGAAA-AT
* * ** * * * * * *
21078 AATTCAAATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATT
183 AGTTTAGCTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * * **
21143 T-CGAGTCAACTTGTACGAACAGAAACAATTATTTTGTAACAATACAAAAGGTCATAA-TGCTTT
248 TAAGA-TAAATTTTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAAC-TT
* * * * * *
21206 GAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAA-CTATTTGTACTGGTTAG
311 CAAATAGATAACTATTCAAATAGTTA-AATCTATTTGAACTGGTTCG
* * * * * * *
21252 GCTAACAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGAATATCATTAAATTAGCATTA
1 ACAAACACATTTATTTTTTAAA---ACT-CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTA
* ** * * * * * * *
21317 -CTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATCAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAATGGTCATA
62 TTTTTA-TCTAAATAAG-CTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAA-GATCATA
** * * * * * ** * * ** * *
21380 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACCATTTGAATTGGTTTGGTAAACAGATTT
124 ACAATTCGAGATTAATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTAGTTCAGAAAATAG-TTT
** * ** * *
21445 ATTTTTTACA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
188 AGCTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT
21501 CAGAACAGAC
Statistics
Matches: 1914, Mismatches: 345, Indels: 263
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
348 4 0.00
349 3 0.00
350 10 0.01
351 88 0.05
352 192 0.10
353 139 0.07
354 41 0.02
355 246 0.13
356 189 0.10
357 87 0.05
358 45 0.02
359 163 0.09
360 200 0.10
361 175 0.09
362 160 0.08
363 80 0.04
364 73 0.04
365 8 0.00
366 2 0.00
367 3 0.00
368 6 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
ACAAACACATTTATTTTTTAAAACTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT
TATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACAATTC
GAGATTAATATTTATTCAAATAATTATAACTATTTGAATTAGTTCAGAAAATAGTTTAGCTTTTA
AATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAAGATAAATTTT
TATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAACTTCAAATAGATAACTAT
TCAAATAGTTAAATCTATTTGAACTGGTTCG
Found at i:20226 original size:712 final size:706
Alignment explanation
Indices: 18787--26772 Score: 3563
Period size: 722 Copynumber: 11.0 Consensus size: 706
18777 CTCTTAGTAA
* * * * * *
18787 TTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAATAAT
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGTTTGTATGAACTA-AAACAAT
* * * * * * * * * * *
18850 TGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAACAATTCGAGATTGATATTTATTCAAATAATTATAACT
64 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT-AGTCTAACT
* * * ** ** * * *
18914 ATTTGAATTAG-TTCAGAAAATAGTTTAGCTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATT
128 ATTTGAGTT-GTTTGA-AAAACAAATTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATT
* * ** * * *
18978 AATAAAGTAGTATTATTTTATTTAAGATAAATTTTTATGAACAGAAACAATTATTATATGACAAA
191 AATAAATTAGTATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTGTAT-AACAGAAACAATTATTTTATAAC-AA
* ** * * * * * *
19043 ACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAACTATTCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTC
253 A-AAAAGGTCATAACAATTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTC
* * * *
19108 -GACAAACACACTT-ATTTTTTAAA-C-TCTTATTAATTTTTAGAATATT-ATTAAATTATTATT
315 AGATAAACAGA-TTCA-TTTTTAAATCTTATTATTAATTTTTAGAATATTAATT-AATTAGTATT
* ** * * * * *
19168 ATTTT-TATCTAAATAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAGAAA-ACAAAGATCATA
377 ATTTTAT-TCTGAATAAGAATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAAATCATA
* * * * * * *
19231 ACGAT-TCGAGATTAATATTTATTCAAATA-ATTATAACTATTTGAA-TTCATTCAGA-AAATAG
440 A-GATAT-GAAATAAATAATTGTTCAAATAGA-TATAACTATTTGAACTT-GTT-TGATAAACAG
* * ** * *
19292 TTTTAGTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-
500 ATTTA-TTTTTAAATCTCTACC-TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
* * ** * * *
19356 TAAGATAAATTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTCATAACAACTTCAA
563 TAA-ATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * * *
19421 ATAGATAATTGTTCAAATAGTTA-AATCTATTTGTAGTTGTTCGATAAAGAGATTTATTTTTTGA
627 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTT-A
* * *
19485 AATCTCTTT-CTCATTAAT
689 AAT-TTTTTACTTATTAGT
* *
19503 TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTAAAATAATTG
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * * * *
19568 TTTTACGACCAAACAAATGGTCAAAACAACTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTCTAA-TGAT
66 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTAACT-AT
** * * * *
19632 TTGAGTTGGTTTGGCAAACACATT-TTTTTTAAATCTCTTACATACTAATTTTTGAAATATTATT
130 TTGAGTT-GTTTGAAAAACAAATTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * *
19696 AAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATAA-AAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAA
194 AAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATAACAGAAACAATTATTTTATAACAAAAAAA
* *
19760 GGATGATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAG-TA
258 GG-TCATAACAATTTGA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCAGATA
* * * * * * *
19824 AATAGATTTAGTTTTTAAATCTT-TTATTAGTTTTCAAAATATTAATTGATCAGTATTATTTTAT
320 AACAGATTCA-TTTTTAAATCTTATTATTAATTTTTAGAATATTAATTAATTAGTATTATTTTAT
* *** * *
19888 TCTAAATAATTTTGCATGAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAAATCATAACGATATG
384 TCTGAATAAGAATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-CAAAAAATCATAA-GATATG
* * * * * *
19952 AAATAGATAGTTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTGTTTA
447 AAATAAATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATT-TTTA
* *
20017 AATCTCCTACCTATTAA-TTTCAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTTATTCTGAATAAACTT
511 AATCT-CTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTTATTCTAAATAAACTT
* * * *
20080 GTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATAA
574 GTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTA
* * * *
20145 TTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGCTCGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTTACTTA
638 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTA
20210 TTAGT
702 TTAGT
* * *
20215 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTTGGAATATGTTTGTATGAAC-AGAAACAATT
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * * * *
20279 GGTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAGTCTAACTAT
65 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTAACTAT
* * *
20344 TTGAACG-TG-TTCATAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTATATATTAATTTTT-AGAATAT
130 TTG-A-GTTGTTTGA-AAAACA-AATTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGA-AATAT
*
20405 TAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATA
190 TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTAT-AACAGAAACAATTATTTTAT-A-A
* * * *
20469 GAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAGTAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAATTTT
250 CAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTT
* * * *
20534 C-GATAAACAGATTCATAATTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA
314 CAGATAAACAGATTCAT-TTTTAAATCT--TA-TTATTAATTTTTAGAATATTAATTAATTAGTA
* * * ** * *
20598 TAATTTTATT-TCGAATAAGCATATATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAACAAT-
375 TTATTTTATTCT-GAATAAGAATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAA-AATC
* * * * *
20661 -T----TA--AAATATATAATTATTCAAGTAAATATAAATATTTGAACTTGTTTGATAAACATG-
437 ATAAGATATGAAATAAATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACA-GA
* * * *
20718 TTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATC
501 TTTATTTTT-AAATC-TCTACCTATTAATT-TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
*
20782 TAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAGAAA-AAAAGTCATAACAATTTGAA
563 TAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGTCATAACAATTTGAA
* * * * *
20846 ATAAATAATTATTTAAATAGTCGTAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATATATTTATTTTTAAAT
627 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTAAAT
*
20911 CTTTTACTTATTAG-
692 TTTTTACTTATTAGT
* * * * * * *
20925 TTGTATGAATATAAATAAATTTGTATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAA-TACAAGAAT
1 TTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGTTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * * * *
20988 ATATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATTAAATAATTGTTAAAAATAGTCATA
64 -TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTT-TAAATAGTC-TA
* * * * ** * *
21053 ACTATTTCAACTTGTATGATAAACAAATTCAAATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAAAT
125 ACTATTT-GAGTTGTTTGAAAAACAAATT-ATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAAT
* * * * *
21118 ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTCGAGTCAA-CTTGTACGAACAGAAACAATTATTTTGTAA
188 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAT-AAGCTTGTA-TAACAGAAACAATTATTTTATAA
*** * * *
21182 CAATACAAAAGGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGTACTG
250 CAA-A-AAAAGGTCATAACAATTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* * *
21247 GTT-AGGCT-AACAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGAATA-TCATTAAAT
311 TTTCA-GATAAACAGATTCA-TTTTTAAAT-C-TTA-TTATTAATTTTTAGAATATTAATT-AAT
* * * * *
21309 TAGCATTACTTTATTCCGAATAAGACTGTATCAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-ATAAAT
370 TAGTATTATTTTATTCTGAATAAGAATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAA-
** * * * * *
21373 GGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACCATTTGAA-TTGGTTTGGTAA
433 AATCATAA-GATATGAAATAAATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGAACTT-GTTTGATAA
*
21437 ACAGATTTATTTTTTACATCTCT---TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
496 ACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * * * * * *
21499 TTC-AGAACAGACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGATATAACAAAATGTCATAACTATT
560 TTCTA-AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATT
* * * * * * *
21563 TGAAATATATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAACATTTGTTTTATGACATAACAAAAA
623 TGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-AAC--TTG--TT-CG--GTAA-ACAAA
*
21628 GGTCATAACTATTTGAAATACATAATTATTCATATAGCCTTAATTATTTGAAT
679 --T--T---TATTT----T-TA-AATT-TT--T-TA--CTT-ATTA---G--T
* *
21681 TAGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATT
1 T--TTTAG--AAT--A-TTA----ATAAA----TTAG-TATT-A--TT--T--TATT-TT-GA--
* * * * * ** *
21746 AGTATTA-TTTTTTTCAAATAAACTTAGAAGAATATAAATAATTGTTTCACAACAAAATAAAAGG
39 A-TA--AGTTTGTAT--GA---AC---------TA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * ** * * * * * * * * * *
21810 TTATAAGGATCTAAAATATATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTAAATTAG-TTCAATAAGC
86 TCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT-CTAACTATTTGAGTT-GTTTGAA-AAAC
* * ** * *
21874 ATATTTATTTTTTAATTCTCCTACTTATTAATTTTT-AAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
148 A-AATTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-
** * * * ** * **
21938 TTTGAAT-AGTCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTTATAATGATTT
211 TTTGAATAAG-CTTGTAT-AACAGAAACAATTATTTTATAAC-AAA-AAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * *
22002 GAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCA-ATAAACTGATTTATTTTT
272 G-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTCAGATAAACAGATTCA-TTTT
* * * * * *
22066 TAAATTTTCAACTTCTTAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATT-TCAGATAAG
334 TAAATCTT--A-TTATTAATTTTTAG-AATATTAATTAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAG
** * * * *** * * *
22129 CTTTTTTGAACT-AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATA
394 AATGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAAATCATAA-GATATGAAATAAATA
* * *
22193 ATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTAAACTTGTTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCT
456 ATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTC-
* * ** * ** * * * *
22256 TGCTTATTAACTTTT-TGAATGTTAATAAAATT-ATATTATTGAATTTTGAATTAGCTTGTATGA
517 TACCTATTAA-TTTTCAAAATATTAAT-AAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGA
* ** * * * *
22319 ACTAAAA-TTTTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA
580 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTC-AA
* * * * * * * *
22383 A-AGTCTTAACTACTAT-AACTAGTT-GGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
643 ATAGTCATAACTA-TTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAG
22445 T
706 T
* * ** * * * * **
22446 TTTTAGAATTTTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAACTTGTATGAAC-ATAAACAATT
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * *** * * * *
22510 ATTTTATGACAAAACAAAA-ATCATATTGATTTGAGATAGATAATTATTGAACTAGTCATAACTA
65 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC-TAACTA
* * ** * * * *
22574 TTTAAATTGGTTTGGTAAATAGATTTTGTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTTGAAATATTA
129 TTTGAGTT-GTTTGAAAAACAAATTAT-TTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTA
* ** * * * * *
22635 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGACTAATTTTGTATGAATAAAAATAATTATTTAATGACAAAA
192 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTAT-AACAGAAACAATTATTTTATAAC-AAA
* * *** * * * * *
22700 CAAAATGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTT-T
254 -AAAAGGTCATAACAATTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTCA
* * * * * *
22764 GGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTCCATCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
316 GATAAACAGATTCA-TTTTTAAATCT---TATTATTAATTTTTAGAATATTAATTAATTAGTATT
* * ** *
22829 ATTTTATTTTGAATAA-ACTTGTATGAATAGTAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGAAT-AT
377 ATTTTATTCTGAATAAGA-ATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAA-AATCAT
* *** * *
22892 AACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTCACTTGTTAAATAGAT
439 AA-GATATGAAATAAATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGAT
* * * * ** * * **
22956 TTATTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGTATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTATTCCG
502 TTATTTTTAAATC-TCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTTATTCTA
* * * * * * *
23021 CATAATCTT-TAATGAATAGAAACTATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGAC-ATTTGAAA
565 AATAAACTTGT-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAA
* * * * * * *
23084 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTGTTTGAACATATTCAG-AAA-ACATTT-TTTTCT-CA-
628 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTT-TAAAT
23144 ---TTA---A-T--T
692 TTTTTACTTATTAGT
* *** * * *
23150 TTTT-GAATATTAATAAATTTA-CATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAGC-AAAACCAAT
1 TTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTAAAA-CAAT
* *** * * * *
23212 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATAGTCATAACT
64 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC-TAACT
* * * * ** * * * * *
23277 ATTTAAACTTATTCGGTAAACAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTAC-TCATTAATTTTTGGAATAT
128 ATTT-GAGTTGTTTGAAAAACAAATT-ATTTTTTAAATCTTTTACAT-ATTAATTTTTGAAATAT
* ** * * * *
23341 TAATACATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTACA
190 TAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTAT-AAC-AGAAACAATTATTTTATAACA
* ** * * * ** * *
23405 AAAGAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAGATTGGAATCACTGTTTGAACTTGTT
252 AAA-AAAGGTCATAACAATTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TT
* * * * * * * * *
23470 -TGGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTCATTATTAATTGTCAAAATATTAATAAAATTAA
314 CAGATAAACAGATTCA--TTTTTAAATC--TT-ATTATTAATTTTTAGAATATTAAT-TAATTAG
* * * * * *
23534 TATTATTTTAATATGAATAA-ACATGTATGAACAAAAACAATT-ATTTATGATAAAACAAAAAGT
373 TATTATTTTATTCTGAATAAGA-ATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAAAT
* * * ** * * * * *
23597 CATAACAATCTAAAATAAATAATTGCACAAATAGTTATAACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACAT
436 CATAA-GATATGAAATAAATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAG
* * * ** *
23662 ATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTT-AAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTAAT
500 ATTTA-TTTTTAAA-TCTCTACCTATTAATT-TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
** * * * * * * * * * *
23726 CCGAATAAGCATGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAA
562 CTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGA
* ** * * * * * * * *
23791 AATAAATAATAACCCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTGATTTTTTAA
626 AATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTAA
* * *
23856 ATCTCTTAC-TAATA--
690 ATTTTTTACTTATTAGT
* * * * * * * * *
23870 TTTGA-AATACTAATAGATTAGTATTACTTTATTCTGAACAAATTTATATGAA-TAAAAACATTT
1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACT-AAAACAATT
* * ** * * * *
23933 TTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTA
65 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC-TAACTA
* * * * ** * * ** *
23998 TTTAAACTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTGAATCTCGTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
129 TTT-GAGTTGTTTGAAAAACA-AATTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTA
* ** * *
24063 ATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTCA-AATA-AACTTATTTTATGA
192 ATAAATT-AGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTAT-AA--CAGAA-ACAA-TTATTTTATAA
** * *
24125 CAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCATGTAGTCTTAAATATTTGAA-T
250 C-AAA-AAAAGGTCATAACA-ATTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
24188 TGGTT-TGATAAACA-ATTTTAGTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATATTTAGAATATT-ATTAG
311 T--TTCAGATAAACAGA-TTCA-TTTTTAA--ATCTTA-TTATTAATTTTTAGAATATTAATTA-
* * ** * * *
24250 ATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAGGACAAA-AAAA
368 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGAATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAA
* * * * ** * * * *
24314 AAGGTTATAATGATTTTAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGATA
433 AA--TCATAA-GATATGAAATAAATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGAACTTGTTTGATA
* * ** * *
24379 AACAAATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTT
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* * * ** * * *
24444 TAATCCAAATAAGCTT-TAATGTTCAAATACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAA
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* * * * * * * * * * * * *
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* * *
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684 TTTTAAATTTTTTACTTATTAGT
* * * * * *
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1 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTG
* ** * * * * *
24656 TTTTATCACAAAACAAAAATTCATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCATATAGTTTTAACTAT
66 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG-TCTAACTAT
** ** * ** * * *
24721 TTGAACTGTTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTTTGGAATATTAT
130 TTGAGTTGTTT-GAAAAACAAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
24786 TAAATTAGTATTATGTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTATTTTATAACAAAAT
193 TAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTAT-AACAGAAACAATTATTTTATAAC-AAA-
* * * * * *
24851 AAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG----GA--A-TTG----GTTC-GG
254 AAAAGGTCATAACAATTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTCAGA
* * *
24904 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCCACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTA
318 TAAACAGATTCA-TTTTTAAATCTT--A-TTATTAATTTTTAG-AATATTAATTAATTAGTATTA
* * ** * * ** *
24968 TTTTATTTTGAATAGGCTTGTGTG-ATGAAAAACACA-TGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCGTA
378 TTTTATTCTGAATAAGAATGTATGAAT-AAAAACA-ATTGTTTTATG-ACAAACAAAAAATCATA
* * * ** * *** ** *
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* * ** * *
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* * * *** * * *
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* * *
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* *
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* ** ** * * *
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1 TTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATT
* * * * * ** * * *
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65 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGT-TTAAATAGTC-TAACT
** * * * * * *
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128 ATTTGAGTTG-TTTGAAAAACA-AATTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATT
* * * ** * * * *
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* * ** * * * *
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254 A-AAAGGTCATAACAATTTGA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TTTC
* * * * * * *
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* *** * * * * * *
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* * * * ** * * * * *
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441 GATATGAAATAAATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-
* * * * * *
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* ** * **
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* * * * *
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*
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*
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* * * * * *
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** * * * ** *
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* * * * * * *
26193 TTAACAAATTTA-TATTATTTTAATCGAAATAAGCATGCATAAACA-AAACAAAATATTTTATGA
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** * ** * * *
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250 C-AAA-AAAAGGTCATAACAATTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T
* * * * *
26320 GTTT--GGTAAATAGATTTTATTTTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTT-GAAATATTAATAAA
311 -TTTCAGATAAACAGA-TTCA-TTTTTAA--ATCTTA-TTATTAATTTTTAG-AATATTAATTAA
* ** * ** * *
26382 TTAGTATTATTTTATTTCAAATTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATTA
369 TTAGTATTATTTTA-TTC--------T-GAATAAGAATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * * * *
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** * * * **
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * *
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*
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Statistics
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Consensus pattern (706 bp):
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ATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTACC
TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAA
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTAAATTTTTTACTTATTAGT
Found at i:20790 original size:173 final size:174
Alignment explanation
Indices: 18779--21364 Score: 948
Period size: 180 Copynumber: 14.5 Consensus size: 174
18769 TTTTAAAACT
* * * *
18779 CTTAGTAATT-TTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGATTA
1 CTTATTAATTGTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * ** * ** *
18842 GAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACAATTCGAGATTGATATTTATTCAAATAAT
64 AAAACAATTGTTTTATGA-CAGA-AAAG--CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAAT
* * * * * *
18907 TATAACTATTTGAA-TTAGTTC-AGAAA-ATAGTTTAGCTTTTAAATCTCTTC
125 CATAAATATTTGAACTTA-TTCGATAAACATA-TTTA-TTTTTAAATCTTTTA
* * * ** * *
18957 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-ATTTAAGATAAATTTTTATGAACA
1 CTTATTAATTGTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAA-ATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * ** * * * * *
19021 GAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAACTATTCTAATAT
64 AAAACAATTGTTTTATGAC---AGAAAA-G-CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAA
* * ** * * *
19086 TCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACACTTATTTTTTAAA-C---T-
124 TCATAAATATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
* * * * *
19133 CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTATTATTATTTTTA-TCTAAATAAGCTTGTATGATTA
1 CTTATTAATTGTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * ** * * *
19197 GAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACGATTCGAGATTAATATTTATTCAAATAAT
64 AAAACAATTGTTTTATGA-CAGA-AAAG--CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAAT
* * * * *
19262 TATAACTATTTGAA-TTCATTC-AGAAA-ATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTC
125 CATAAATATTTGAACTT-ATTCGATAAACATA--TTTA-TTTTTAAATCTTTTA
* * * ** *
19313 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-ATTTAAGATAAATTTTTATGAACT
1 CTTATTAATTGTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAA-ATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * * * * * *
19377 -GAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTCATAACAACTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAG
63 AAAAACAATTGTTTTATGAC---AGAAAAG-CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAA
* * * * *
19441 T--TAAATCTATTTGTAGTTGTTCGATAAAGAGATTTATTTTTTGAAATCTCTTT-
124 TCATAAA--TATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTA-TTTTT-AAATCT-TTTA
* * * ** *
19494 CTCATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACT-
1 CTTATTAA-TTGTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * * * * ** *
19558 AAAATAATTGTTTTACGACCAAACAAATGGTCAAAACAACTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAG
64 AAAACAATTGTTTTATGA-CAGA-AAA--G-CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAA
* * * ** * *
19623 TC-T-AATGATTTG-AGTTGGTTTGGCAAACACATTT-TTTTTAAATCTCTTA
124 TCATAAAT-ATTTGAACTT-ATTCGATAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTA
* * * * *
19672 CATACTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAA-TCTGAATAAGCTTGTAT-AA-A
1 CTTATTAATTGTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * *
19734 AAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAGGATGATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGT
64 AAAACAATTGTTTTATGAC-AGAAAAGCA--A-AACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAAT
* * *
19799 CATAACTATTTGAAC-TATTTC-AGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTA
125 CATAAATATTTGAACTTA-TTCGA-TAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
*** ** * ** * *
19850 -TTAGTT--TT-CAAAATATTAATTGATCAGTATTATTTT-ATTCTAAATAATTTTGCATGAA-C
1 CTTA-TTAATTGTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * *
19909 AAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAAATCATAACGATATGAAATAGATAGTTGTTCAAATGG
64 AAAACAATTGTTTTATGAC--AG---AAAAGCAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAT-A
* * * * * * **
19974 A-CATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTGTTTAAATCTCCTA
123 ATCATAAATATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATT-TTTAAATCTTTTA
* ** * * *
20026 CCTATTAATT-TCAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATA
1 CTTATTAATTGT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * *
20089 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATAATTCAAACAA
64 AAAACAATTGTTTTATGAC---AGAAAAG--CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAA
* * ** * * *
20154 TCATAACTATTTAAACTTGCTCGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATTTTTTA
124 TCATAAATATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
* * * * ** * * * *
20206 CTTATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTTGGAATATGTTTGTATGAACAG
1 CTTATTAATTGTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAA
* * * * * * * * *
20271 AAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAGT
65 AAACAATTGTTTTATGAC---AGAAAA-G-CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAAT
* * *
20336 C-TAACTATTTGAACGTGTTC-ATAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTA
125 CATAAATATTTGAACTTATTCGAT-AAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
* * * *
20385 -TATATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAAC
1 CT-TATTAATTGTT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * * * * *
20448 AGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAGTAGATAATTGTTTAAATA
63 AAAAACAATTGTTTTATGACAG---AAAA-G-CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATA
* * * * * * **
20513 GTCATAACTATTTGAAATT-TTCGATAAACAGATTCATAATTTAAATCTCCTA
123 ATCATAAATATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTAT-TTTTAAATCTTTTA
* * * * * * * **
20565 CTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAATTG
1 CTTATTAATTGTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAA
* * * *
20630 ATACAATTGTTTTATGA-TG-AAA-CAAAACAATTTAAAATATATAATTATTCAAGTAAAT-ATA
65 AAACAATTGTTTTATGACAGAAAAGCAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAT-AATCATA
* * *
20691 AATATTTGAACTTGTTTGATAAACATGTTTATTTTTAAAATCTTTTA
129 AATATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTT-AAATCTTTTA
* *
20738 CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAA-TCTAAATAAGCTTGTATGAACA
1 CTTATTAATTGTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
20802 AAAACAATTGTTTTATGACAGAAAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGT
64 AAAACAATTGTTTTATGACAG---AAAAG-CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAAT
* * * *
20867 CGTAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATATATTTATTTTTAAATCTTTTA
125 CATAAATATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTA
* * * *
20917 CTTATTAGTTGTATGAATATAAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAT-A
1 CTTATTAATTGT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAA
* * * * * * * * * *
20981 CAAGAATATATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATTAAATAATTGTTAAAAAT
65 AAACAAT-TGTTTTATGAC---AGAAAA-G-CAAAACAATTT-AAAATAAATAATTATT-CAAAT
* * * * * * *
21046 AGTCATAACTATTTCAACTTGTAT-GATAAACAAATTCAAATTTTAAATCTTTTA
122 AATCATAAATATTTGAACTTAT-TCGATAAACATATT-TATTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * *
21100 CTTATTAATT-TTGGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTCGAGTCAA-CTTGTACGAAC
1 CTTATTAATTGTT-G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAAT-AAGCTTGTATGAAT
* * * * * * *** * * *
21163 AGAAACAATTATTTTGTAACAATACAAAAGGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
63 AAAAACAATTGTTTTATGAC---AGAAAA-G-CAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATA
* * * ** * * * * **
21228 ATTATAACTATTTGTACTGGTTAGGCT-AACAGATTCATTTTTTAAATCCATTA
123 ATCATAAATATTTGAACTTATT-CGATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * *
21281 CTTATTAATTTTTAGAATATCATTAAATTAGCATTACTTT-ATTCCGAATAAGAC-TGTATCAAT
1 CTTATTAATTGTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAG-CTTGTATGAAT
21344 AAAAACAATTGTTTTATGACA
63 AAAAACAATTGTTTTATGACA
21365 AAATAAATGG
Statistics
Matches: 1888, Mismatches: 384, Indels: 272
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
172 46 0.02
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184 7 0.00
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Consensus pattern (174 bp):
CTTATTAATTGTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAA
AACAATTGTTTTATGACAGAAAAGCAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAAA
TATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTA
Found at i:21611 original size:77 final size:78
Alignment explanation
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Period size: 78 Copynumber: 2.0 Consensus size: 78
21513 ATATGAACAA
* * *
21523 AAACATTTGTTTTATGATATAAC-AAAATGTCATAACTATTTGAAATATATAATTATTCATATAG
1 AAACATTTGTTTTATGACATAACAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATACATAATTATTCATATAG
21587 CCTTAACTATTTG
66 CCTTAACTATTTG
21600 AAACATTTGTTTTATGACATAACAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATACATAATTATTCATATAG
1 AAACATTTGTTTTATGACATAACAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATACATAATTATTCATATAG
*
21665 CCTTAATTATTTG
66 CCTTAACTATTTG
21678 AA
1 AA
21680 TTAGTTCAGC
Statistics
Matches: 75, Mismatches: 4, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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AAACATTTGTTTTATGACATAACAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATACATAATTATTCATATAG
CCTTAACTATTTG
Found at i:25039 original size:169 final size:169
Alignment explanation
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Period size: 169 Copynumber: 2.0 Consensus size: 169
24720 TTTGAACTGT
* * * * *
24730 TTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTTTGGAATATTATTAAATTAGT
1 TTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAAT
* * *
24795 ATTATGTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTA
66 ATTATGTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAAAAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTA
* *
24860 TAATAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGGAATTGG
131 TAACAATTTGAAATAGATAATTGCTTAAATAGGAATTGG
* * *
24899 TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TCCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAA
1 TTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-CACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAA
* * * * * * *
24963 TATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTGTG-A-TGAAAAACACATGTTTTATGAA-AAAACAAAA-
65 TATTATGTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAAAA-A-ATATTTTAT-AACAAAACAAAAG
*
25024 GTTCGTAACAATTTGAAATAGATAATTGCTTAAATAG
127 GTT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTTAAATAG
25061 CCATAATTAT
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 21, Indels: 10
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
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168 6 0.04
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ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (169 bp):
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ATTATGTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAAAAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTA
TAACAATTTGAAATAGATAATTGCTTAAATAGGAATTGG
Found at i:28828 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 28507--37241 Score: 4168
Period size: 181 Copynumber: 48.4 Consensus size: 181
28497 CAAAAAATCA
* * * * * * *
28507 TTTTATGACATAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATT-TTCAAAATAGTCAAAATTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTA
* * * * * *
28571 TTTAAACTTA-TTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAA-TTTTCATAATAT
65 TTTGAAC-TAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATAT
* * * * *
28634 TAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTT
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * *
28688 TTTTCTGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATGACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * **
28753 TTGATCTAGTTCGGTAAACATATTTACTTTTTGAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
*** *
28818 TAAATTAGTATTATTTTAACCTAAATAACCTTGTATGAATAT-AAACAATTG
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTG
* * * * * * * * * *
28869 TTTTATAATAGAATAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAATCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * *
28934 TCGAGC-ACGTTTGATAAATATATTTACTTTTTAAA-ATCTT--TTATTAATTTTTAAAATATTA
66 TTGAACTA-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * * *** *
28995 ATAGATTAGTATTACTTTATTCTGAATAAACATATATGAACAAAAACATTTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
** ** * * *
29047 TTTTATGACAAAACAAAACTTCATAATGATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
29112 TTGAACTGGTTAGGTAAATAGAATTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATTGAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * ** * * * *
29177 TAAATTCA-TTTTAGTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTTA
131 TAAATT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATT-GAAACAA-TTG
** * * ** *
29230 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGATATAGTTTTTAAATA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTA
* * * *** * * *
29295 TTTAAATTGGTTCAACAAACAAATTTATATTTT-AATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATT
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* * * * *** ***
29359 ATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAATGTTTG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * ** *
29412 TTTTATGATAGAACAAAAGGTAATAACAATTT-AAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCAT-A-TA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *
29474 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAAGATTA
65 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * *
29538 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGAATG-A-TGAAAAAAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTG-AAACAATTG
* * ** * * *
29589 TTATATGACCAAACAAAAGGTCATAA-TTTTTGGTAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-G-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * ** * * ** * * *
29653 GTTTGAA-TTGCTTCAGAAAATTGGTATATTTTTTAAATCTT-TTTGTTGTCAATTTTGGAAATA
64 ATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* ** * ** * * * *
29716 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTCATATGAACTAAAAAAATTA
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * *
29771 TTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG-C--AAC---
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** *
29830 -TG--C---TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * *
29889 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTCTATG-ATGAGAAACAATTG
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTG
* * * * * ** * *
29940 TTTCATGACAAAACAAAAGTTCGTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCGAACGGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
30005 TTGAA-TCGATTTGATAAACTGGTTTATTTTTTAAA-----T-C-T-TTAA---CT----TATTA
66 TTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * *
30054 ATAAAGTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTTTATAAACTGAAACAATTT
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
*** *
30106 TTTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATGACT
1 TTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACAATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * ** *
30168 ATTTAAACTTA-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATTCCTTA-TTATCAATTTTTTTAATG
64 ATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * *
30231 TTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAG-TATGTATGAACTAAAACAATTA
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCT-TGTATGAATTGAAACAATTG
* * ** * *
30286 TTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTTTTC-AATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *** * * *
30350 TTAAATTGGTTTAATAAACACATTTATTTTTTAAA--T-TT-GTTATT-ATTTTTCATAATATTA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * * * ** * * * * *
30410 TTAATTTAGCAATATTTTA--CCATATAAGTTTGTATGAACAT-AAGCAGTTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAACAATTG
* * * * * * * *
30460 TCTTATAACAAAAC-AAAGATCATAAAAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTGT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * ** *
30524 TTGAACTGGTTCGATAAATAGATTTAACTTTTAAA--TC-T-CTTACTAATTTTTGAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * ** * **
30585 TAAATTAGTATTATTTTATTATGAGTAATTTTGTATGAATAGAAACAATCA
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * *** * ** * *
30636 TTCTATGATAAAACAAAATGTCATAGTGAGTTGAAATAGATAATAATTCAAATAGACATGACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * *
30701 TTGAACTTGTTCGATAGATAGATTTAATTTTTAAAATCTTC-AATTTATTAATTTTT-AGAATTT
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATAT
* * ** * * *
30764 TAATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAAATTGTGTGGATAGAAACAATTG
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
** ** * * * *
30818 TTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTTAAAGCA-TCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTA
* * * * *
30882 TTTGAACTCA-CTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-ATACTTATTAATTTTTGGAATTT
65 TTTGAACT-AGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
*** * * *
30945 TAATAAATTAGTATTATTTTATTAGGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTAG
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATT-G
* *
31000 -TTTATGACAAAACAAAAAAGGTCATAACAAGTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACT
1 TTTTATGACAAAAC--AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * *
31064 ATTAGAAC-ATGTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATTT-GTACTTATTAATTTTTGAAATAT
64 ATTTGAACTA-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* ** * * *
31127 TAATAAATTTA-TATTAGTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTG
128 TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * *** * * *** * *
31181 TTTAATGACAAAACATAAGGTCATAATGTTTTGAAATAAATAATTATTTTCATAGTCAGAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * ** *
31246 TTGAA-TATATTCAGTAAACAGATTAATCTTTT-AATTATCTTACTCATTAATTTTCAAAATAAT
66 TTGAACTA-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATT-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* *
31309 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * ** * * *
31362 TTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCTTTAA-TA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTA
* ** * * * **
31426 TTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTATTTAAT-ATTTGTCAAAATAT
65 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATAT
* * * *
31489 TAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * **
31543 TTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAATAAATGTTCAAATAGTCATAAAGA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
31607 TTTGAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATTTTGTTACTTTATTAATTGTCTT--AA
65 TTTG-AACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TTTCTTAC-TTATTAATT-T-TTGAAA
* * * **
31669 TATTAACTAAATTTA-TATTA-TTTA-TTCAAATAAGCTTGCATGAATAGAAA-AGATCA
125 TATTAA-TAAA-TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACA-ATTG
* * * *
31725 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAGCAATTTCAAATAGAATAACTGTTCAAATAGTCATAATT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * ** * * * * ** ** **
31790 ATTTAAACTTGGTTTCATTAACCAAAATGATTTTTT-AATGACAAAAACAAACAGGTCCATAATG
64 ATTTGAAC-TAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC--TTAC--TTA--T---TAAT-
* * * * * * ** * ** * *
31854 ATTTGCAATAGATAAT-TATTCAAATAATCATGACTATTTGATCT-AGTTTGGTAATCATATTGA
117 TTTTGAAATA-TTAATAAATT--AGT-ATTAT-TTTATTTTAAATAAGCTT-GT-ATGA-ATTGA
*** *
31917 TTTTTTAATTT
174 ---AACAATTG
* ** * * * ** *
31928 TTTTACTTATCAATTATTGAAATA-TTAATAAATTAGTATCATTTTAATCCAAATAAGCTTGTAT
1 TTTTA-TGA-CAA--A-ACAAA-AGGTCAT-AA-CA--AT--TTGAAAT--AGATAA--TTGT-T
* ** * * * ** * ** ** *
31992 -GAATAGAAACT-ATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTTATAACA-ATTTGA-AATAAATAATTA
49 CAAATAGTCA-TAACTATTTGA-ACTAGTTC-----GGTA-AACAGATTT-ATTTTTTA-AATTT
* ** * * * * * ** * *
32053 CTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGATAAA-CAAAATTATTTTTTAAGTCTTTTATTA
104 CTTACTTA-T--TAA-TTTTTGAAAT--ATTAATAAATTAGTATTA--TTTT-A-T-TTTAAATA
** * * **** *
32117 ATTTTGAAATATTAATAGATTGGTATTA
158 AGCTTG---TATGAATTGA-AACAATTG
* * ** * * * * * *
32145 TTTTAT-TCCAAACAAACATAT-ATGAACAA---AAACATTTG-T-TTTATGACAAAATGAAAGG
1 TTTTATGACAAAACAAA-AGGTCAT-AACAATTTGAA-A-TAGATAATTGT-TC-AAAT---AGT
* * * * * * * * *
32203 CTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAATTATTTGAATTGGT-TAGGTAAA
57 C-ATAACTATTTGAACTAG-T--TCGGT-AAACAGAT--TTATTTTTTAAATT--TCT---T--A
** * * * * * ** *
32266 CAAAATT-ATTTTTTAAATATCTTATTTATTAATTTTTTAATATGAATAAATTCATTTTATTTTA
108 C-TTATTAATTTTTGAAATA--TTA---A-TAA---ATTAGTAT---T-ATTTTATTTTAAATAA
** * *
32330 TTTTGCATAAGCCAATATGAATTGAAAATATTG
159 GCTTG--TATG--AAT-TG-A---AACA-ATTG
* ** ** * *
32363 TTTTATGACAAAGCAAAA---C-T---AATTTGAAATAGATAACAGTTCATGTAGTCTTAAATAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * ** *
32421 TTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTCAATCTCATT-GTTATTTATTTTCAAAATATTT
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * * *
32485 TTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAATAGAAATAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * *
32537 TTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGT-GCATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
32601 TTTAAAATAGTTTGGTAAACAGATTTATGTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAAGATTA
65 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * *
32662 ATAAATTACTATTATTTAATTCTAAATAAACTTGTAT-AATAGAAAGCAATCG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTG
* * * ** * *
32714 TTATATGATC-AAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATGGAAATGGCCATAA-TA
1 TTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-
* * * * ** * *
32777 ATTTGAACTACTTCGATAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTATTGTAATATT
64 ATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* *
32842 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * * * * * *
32895 TTTTATAATAAAATAAAAGATCATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAAACAGTCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTA
* * * * * * ** ** *
32960 TTTGAATTTGTTTGGTAAACAAATTCATTTTTTTAAACTT-TGGCTTATTAATTTTCAAAACATT
65 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* ** * * *
33024 AAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * *
33077 TTTTAT-ATCAAAACAAAAGATCATAATAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTA
1 TTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** ** * *
33141 TTTGAACTTGTTCAATAAATGGATTTATTTTTTCAAATATT-TTCCTTATTAATTTTTTG-AATG
65 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAAT-TTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATA
* * * * ** * * * *
33204 TTAGTAAATTTGGATTATTTAATTAAAAATAAGATTGT-T-AGATATGCAACAAATA
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-AT-TGAAACAATTG
* * ** * * * * **
33259 TTTTTTGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATATATAATTATTCTAATAGTTTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * ** *
33324 TTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAT
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
*** * * *
33389 TAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATG-ATCAGAAATAATTG
131 TAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTG
* * * * * * *
33440 TTTTATGACAAAA-TAGAGATCTTAACTATTTTAAATTA-ATAATTGCTCAAATAGTCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
33503 TTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAGTATTA
65 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * **
33568 AAAAATTAGTATTATTTTATTTCAACTAAGCTTGTATG-ATAAAAAACAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTG
* * * ** * * *
33620 TTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATGGATAATCATTCAAATGGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
33685 TTTAA-TTGATTGGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATTTCTTACGTATT-ATTTTAGGAAATATT
66 TTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATT
** *
33748 AATAAATTAGTATTATTTTATTCCATATAAGCTTG--T--ATT--AAC---TG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * * * *
33792 ----AT-AGAAATCAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTAATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * ** * * * ** *
33852 TTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTGTTATAAATCCCTTTCTTATTAATTTTTTAGATGCTC
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATT-TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * *
33917 ATATATTAGTATTAATTTATCTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * * * * * * *
33969 TTTTATAACTAAACAAAATGTCAGAACGATTTCAACTAGATAATTGTTCTAATAGTCCTAACCAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
34034 TTGAA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATT
66 TTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * ** * **
34097 ATTAAATTAATATTATTTTAATCAAAATAAGCTTGTACGAA-CAAAACAATTG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
** * * * * * ** * *
34149 TTTTACAACAAAAGAAAAGGTTACAACGATTTCAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** *** * ** * * ** *
34214 TTGAACT-GTTTGACAAGTGGATTTATTTTTT-AATTTTTTGGTTCTTAAGTTTCAAAATATTAT
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * ** * * * *
34277 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAATAGTATGAATAGAATCGATTG
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * ** * *
34328 TTTGATGATAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * *
34393 TTGAAATGGTTTGGTAAATAGTTTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCT-AAA-ATTA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTA
* * * ** * *** *
34456 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTACATTAACAAAAACAATTA
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * ** * * *
34508 TTTTATAACAAAATAAAAAGTAATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * ** * * * *
34573 TTGAGTTGGTTTGAAAAATAGAATTATTTTCTAAA--TC-T-CTTATAAATTTTTGAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * ** *
34634 TAAATTAGTTTTACTCTATTCCAAATAAGCTTG--T--A---AAATAATTG
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * *
34678 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTGT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *** * * * *
34743 TTGAATTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCAAGATATTA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATTA
* * * ** * * * *
34807 CTAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAAGAATATATAAATAGAAACAACTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * * *
34859 TTTTATTATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
34924 TTAAATTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
** *
34985 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAACAATTA
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTG--AAACAATTG
* * ** * * * *
35036 TTTTATGACAAAACAAAATGTAATAGTAATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * * *
35101 TTGAACTTA-TTTAGTAAACTGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTACTAACTTTCGAAATAATA
66 TTGAAC-TAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * * *
35161 AAAAAGTAGTATTATTTTCTTTTGGAA-AAGCTTTTATGAACTAAAACAATTA
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTT-AAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * ** * * *
35213 TTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
35278 TTGAACTAGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTAG-AATATTAT
66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
** * * * ** ***
35342 TAGTTTAGCAATATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAAAAACAATTG
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * * * *
35393 TTTTATGACAAAAC-ATAGATCATAAGAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACAAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * **
35457 TTCAACT-GGTCTAGTAAACATATTTAGATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTA
66 TTGAACTAGTTC-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** ** *
35517 ATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATAAAAATAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * * * * * * *
35569 TTTTATTA-TAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCATAGTTCAAATAGGT-ATGATTT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTA
* * * * ** ** * *
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65 TTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATAT
* ** * *
35694 TAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTG
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* * ** * * * * * *
35748 TTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAATCATAAATAG
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
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66 TTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* *** * **
35876 AATAAATTAATATTATTTTATTACGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAA-TG
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
* * **
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * * * * *
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66 TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
** ** * * * *
36052 TAAATTTTTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATAAATAGAACCAATTG
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* * *** * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
36168 TTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCT-TTTCTT-AATTCTCTTGCTCATTAATTTTTGAAATATT
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* * * ** *
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* ** * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * **
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** * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-A
* * * * * *
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* ** * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * *
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* * *
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36820 TTTTATGACTAAACAAAAGGGGAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTACTAGTCTTAACCAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * *
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* ** * * ** * *
36945 AT-AACTA-T-TTGAACTTGTTTGGTAAATAA-ATT-TAT-TTTTTAAA-TATT-
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* * *** * * * ** *
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1 TT--TTATGACA-AAACAAAAGGTCA-TAA-CAATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCAT
** * * * * * * * *
37053 AACTATTCAAATTGGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTACTTTTTGAAA
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* *
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125 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTG--AAACAATTG
* * * * *
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1 T-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
37239 TTT
65 TTT
37242 TATTCTAAAT
Statistics
Matches: 6492, Mismatches: 1636, Indels: 852
0.72 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
164 1 0.00
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191 6 0.00
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TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG
Found at i:28923 original size:16 final size:17
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28881 ATAAAAAGTC
28891 ATAACTATTTGAAATAA
1 ATAACTATTTGAAATAA
*
28908 ATAATTATTT-AAATAA
1 ATAACTATTTGAAATAA
28924 TCATAACTATT
1 --ATAACTATT
28935 CGAGCACGTT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.50, C:0.07, G:0.02, T:0.41
Consensus pattern (17 bp):
ATAACTATTTGAAATAA
Found at i:29749 original size:359 final size:355
Alignment explanation
Indices: 28508--31796 Score: 1470
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28498 AAAAAATCAT
* * ** * * *
28508 TTTATGACATAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATT-TTCAAAATAG-TC-AAAATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-ATATAGTTCTTAAA-T
* * * * * * * *
28570 ATTTAAACTT-ATTCGATAAACAGAT-TCATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTT-CATAAT
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* * * * * *
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* * * * *
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188 ACAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACT
* * * * * **
28760 AGTTCGGTAAACATATTTACTTTTTGAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA
250 -GTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTA
** * *
28825 GTATTATTTTA-ACCTAAATAACCTTGTATGAAT-ATAAACAATTG
313 GTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG-ATGA-AAAAAATTG
* * * * * * * * * * * *
28869 TTTTATAATAGAATAAAAAGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTTAAATA-ATCATAACT
1 -TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAAT
* * * ** * * * * * * **
28932 ATTCGAGCA-CG-TTTGATAAATATATTTACT-TTTTAAA-ATCTT--TTATTAATTTTTAAAAT
64 ATT-TA-AATTGCTTCAACAAACAAATATA-TATTTTAAATCTCTTAGTTATCAATTTTGGAAAT
* * *
28991 ATTAATAGATTAGTATTACTTTATTCTGAATAAACATATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC
126 ATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAACAAAAA-ATTTGTTTTATGAC
** * ** * *
29056 AAAACAAAACTTCATAATGATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGG
190 AAAACAAAAGGTAATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACT-G
* * *
29121 TTAGGTAAATAGAA-TTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTCA
251 TTCGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATT-A
* * * * * *
29185 -TTTTAGTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTTAT
313 GTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-A-TGAAAAAAA-TT-G
* *
29231 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGATATAGTTTTTAAATAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAATAT
* * * * *
29296 TTAAATTGGTTCAACAAACAAATTTATATTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAT
66 TTAAATTGCTTCAACAAACAAATATATATTTTAAATCTCTTAGTTATCAATTTTGGAAATATTAT
* * * * *
29361 TAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAATGTTTGTTTTATGATAGAAC
131 TAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAACAAAAA-ATTTGTTTTATGACAAAAC
** *
29426 AAAAGGTAATAACAATTTAAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATATATTTGAACTAGTTCGGTA
195 AAAAGGTAATAACAATTTAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATATATTTGAACT-GTTCGGTA
*
29491 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTT
258 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*
29556 ATTTCAAATAAGCTTGAATGATGAAAAAAATTG
323 ATTTCAAATAAGCTTGTATGATGAAAAAAATTG
* * *
29589 TTATATGACCAAACAAAAGGTCATAAT-TTTTGGTAAATAGATAATTGTTCATATAG-TCTTAAT
1 TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-G-AAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAA
* * **** * * * *
29652 TGTTTGAATTGCTTCAGA-AAATTGGTATATTTTTTAAATCTTTTTGTTGTCAATTTTGGAAATA
63 TATTTAAATTGCTTCA-ACAAACAAATATATATTTTAAATCTCTTAGTTATCAATTTTGGAAATA
* ** * * * *
29716 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTCATATGAACTAAAAAAATTATTTTATAACA
127 TTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAAC-AAAAAATTTGTTTTATGACA
* *
29781 AAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG-C--A-A-CTG--C--TTCG
191 AAACAAAAGGTAATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATATTTGAACTGTTCG
* *
29837 GTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
255 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* *
29902 TTTTA-TTCTAAATAAGCTTCTATGATGAGAAACAATTG
319 TTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGATGA-AAAAAATTG
* * ** * * ** * *
29940 TTTCATGACAAAACAAAAGTTCGTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCGA-A-CGGCCATAATT
1 TTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-ATATAGTTCTTAAAT
* * * ** * *** * *
30003 ATTTGAATCGATTTGATAAACTGGTTTATTTTTTAAATCT-TTA---A-C--TTATT---AATA-
64 ATTTAAATTGCTTCAACAAACAAATATATATTTTAAATCTCTTAGTTATCAATT-TTGGAAATAT
* * * * * *
30057 -A--AG--TAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTTTATAAACTGAAACAATTT-TTTTAT-A-A
128 TATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAAC--AAAAAATTTGTTTTATGACA
* *** * *
30114 TAAACAAAAGGTCATATTTATTCTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAACTTA
191 -AAACAAAAGGTAATAACAATT-TAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAAC-TG
* * * ** * *
30179 TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAT-TCCTTA-TTATCAATTTTTTTAATGTTAATAAATTG
251 TTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTA
* *
30242 GTATTATTTTATTTCAAATAAG-TATGTATGAACT-AAAACAATTAT
313 GTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATG-A-TGAAAAAAATT-G
* * * *
30287 TTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCA-ATAG-TCTTAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAATAT
* * * * * * * **
30350 TTAAATTGGTTTAATAAACACATTTATTTTTTAAA--T-TT-GTTAT-TATTTTTCATAATATTA
66 TTAAATTGCTTCAACAAACAAATATATATTTTAAATCTCTTAGTTATCAATTTTGGA-AATATTA
* * * ** * ** * * *
30410 TTA-ATTTAGCAATATTTTA--C-CATATAAGTTTGTATGAACATAAGCAGTTGTCTTATAACAA
130 TTAGA-TTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAACTTATATGAACA-AAAAATTTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
30471 AAC-AAAGATCATAAAAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTGTTTGAACTGGTT
192 AACAAAAGGTAATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATA-TATTTGAACT-GTT
* * * ** *
30535 CGATAAATAGATTTAACTTTTAAATCTCTTAC-TA--ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
253 CGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * **
30597 ATTTTATTAT-GAGTAATTTTGTATGAAT-AGAAACAATCA
318 ATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATG-ATGA-AAAAAATTG
* * * * ** * * * * *
30636 TTCTATGATAAAACAAAATGTCATAGTGAGTTGAAATAGATAATAATTCAAATAG-ACATGACTA
1 TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAATA
* * * * * * * * * * *
30700 TTTGAACTTG-TTCGATAGATAGATTTA-ATTTTTAAAATCT-TCAATTTATTAATTTT-TAGAA
65 TTT-AAATTGCTTCAACAAACAAATATATA-TTTT-AAATCTCT-TAGTTATCAATTTTGGA-AA
* * * * * * * * * *
30761 TTTTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAAATTGTGTGGATAGAAACAA-TTGTTTTATG
125 TATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATAT-GA-ACAAAAAATTTGTTTTATG
** * ** * * * *
30825 ACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTTAAAGCA-TCATAACTATTTGAAC
188 ACAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCAT-A-TATTTGAAC
** * *
30889 TCACTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TATACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAAT
249 T-GTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAAT
*** * * *
30953 TAGTATTATTTTATTAGGAATAAACTTTTATGAAT-AGAAACAATTAG
311 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATGA-AAAAAATT-G
** * * * * *
31000 TTTATGACAAAACAAAAAAGGTCATAACAAGTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG-TCATAACT
1 TTTATGACAAAAC--AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAAT
* * * * * * *
31064 A-TTAGAACATG-TTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAAT-T-TGTACTTATTAATTTTTGAAA
64 ATTTA-AA-TTGCTTCA-ACAAACAAATATATATTTTAAATCTCT-TAGTTATCAATTTTGGAAA
* * * ** * ** * * *
31124 TATTAATAAATTTA-TATTAGTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAA-TTGTTTAAT
125 TATTATTAGA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAACA-AA-AAATTTGTTTTAT
* * *** * * *** *
31187 GACAAAACATAAGGTCATAATGTTTTGAAATAAATAATTATTTTCATAGTCAGAATTATTTGAAT
187 GACAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TA-TATTTGAA-
* * * * * * * * * * *
31252 ATATTCAGTAAACAGATTAATCTTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTCAAAATAATAATAAATT
248 CTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATT
* *
31317 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTG-AAACAATTG
312 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-A-TGAAAAAAATTG
* * * * * * *
31362 TTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-CTCTTTAATA
1 -TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAATA
* * * * * * *
31426 TTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA-TT-T-AATATTTGTCAAAAT
65 TTT-AAATTGCTTCAACAAACAAATATATATTTTAAATCTCTTAGTTATCAAT-TTTG--GAAAT
* * * * * *
31487 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATG
126 ATTATTAGATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAACTTATATGAACA-AAA-AATTTGTTTTATG
* * * *
31550 AC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAATAAATGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAA
188 ACAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-AAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCAT--ATATTTG-AA
* * * * * *
31614 CTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATTTTGTTACTTTATTAATTGTCT-TAATATTAACT
248 C-TGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTCTTAC-TTATTAATT-T-TGAAATATTAA-T
* *
31677 AAATTTA-TATTA-TTTA-TTCAAATAAGCTTGCATGAAT-AGAAAAGATCAT-
307 AAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATGA-AAAAAAT--TG
* * * * * *
31726 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-GCAATTTCAAATAGAATAACTGTTCAAATAG-TCATAAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG--ATTTGAAATAG-ATAATTGTTCATATAGTTCTTAAA
31789 TATTTAAA
63 TATTTAAA
31797 CTTGGTTTCA
Statistics
Matches: 2314, Mismatches: 439, Indels: 346
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
333 1 0.00
334 40 0.02
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336 7 0.00
337 1 0.00
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339 1 0.00
340 1 0.00
341 5 0.00
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344 2 0.00
345 40 0.02
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTCTTAAATAT
TTAAATTGCTTCAACAAACAAATATATATTTTAAATCTCTTAGTTATCAATTTTGGAAATATTAT
TAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAACAAAAAATTTGTTTTATGACAAAACA
AAAGGTAATAACAATTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATATTTGAACTGTTCGGTAAAC
AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TCAAATAAGCTTGTATGATGAAAAAAATTG
Found at i:31624 original size:363 final size:360
Alignment explanation
Indices: 30049--31800 Score: 1368
Period size: 363 Copynumber: 4.9 Consensus size: 360
30039 ATCTTTAACT
* * * * * * *
30049 TATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTTTATAAACT-GAAACAATTTTTTTATA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
30113 ATAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAACT
65 ACAAACAAAAGGTCATAATAATT-TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT
* * * * * ** *
30177 TATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATT-CCTTA-TTATCAATTTTTTTAATGTTAATAAAT
129 TATTCAGTAAATAGA-TTAATCTTTT-AATTATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* *
30240 TGGTATTATTTTATTTCAAATAAG-TATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAA
192 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * * *
30303 AGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTTTTC-AATAGTCTTAACTATTT-AAATTGGTTTAATA
255 AGGTCATAATGAGTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTT-GTTCAATA
* *
30366 AACACATTTATTTTTTAAATTTGTTA-TT-AT--TTTTCATAA
319 AACATATTTATTTTTTAAATTT-TTATTTAATAATTTTCAAAA
* * ** * ** * * * * * * * *
30405 TATTATTAATTTAGCAATATTTT-A-CCATATAAGTTTGTATGAACATAAGCAGTTGTCTTATAA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * ** *
30468 CAAA-ACAAAGATCATAAAAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCA-AAACTGTTTGAACT
66 CAAACA-AAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAA-TATTTGAACT
** *
30531 GGTTC-GATAAATAGATTTAA-CTTTTAA--ATC-T-CTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
129 TATTCAG-TAAATAGA-TTAATCTTTTAATTATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * ** * * *
30590 TAGTATTATTTTATTAT-GAGTAATTTTGTATGAATAGAAACAATCATTCTATGATAAAACAAAA
192 TAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * *
30654 TGTCATAGTGAGTTGAAATAGATAATAATTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCGATAGA
256 GGTCATAATGAGTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTCAATAAA
* * * ** * * *
30719 TAGATTTAATTTTTAAAATCTTCAATTTATTAATTTTTAGAA
321 CATATTT-ATTTTTTAAAT-TTTTATTTAATAATTTTCAAAA
* * * * * ** * *
30761 TTTTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAAATTGTGTGGATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * * * *
30826 CAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTTAAAGCA-TCATAACTATTTGAACT
66 C-AAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA-TAGTCATAAATATTTGAACT
* * * * * * * * *
30890 CACTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAA--ATCTTATACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAAT
129 TATTCAGTAAATAGATTAATCTTTTAATTATC-T-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
*** * * *
30953 TAGTATTATTTTATTAGGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAA
192 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC--AAA
** * * * * *
31018 AGGTCATAACAAGTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTAGAACATGTTCAGA-A
255 AGGTCATAATGAGTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTCA-ATA
* * * **
31082 AACATATTTATTTTTTAAATTTGTACTTATTAATTTTTGAAA
319 AACATATTTATTTTTTAAATTTTTATTTAATAATTTTCAAAA
* * * * * *
31124 TATTAATAAATTTATATTAGTTT-ATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTAATG
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * *** * *
31188 ACAAAACATAAGGTCATAATGTTTTGAAATAAATAATTATTTTCATAGTCAGAATTATTTGAA-T
65 AC-AAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT
* * ** *
31252 ATATTCAGTAAACAGATTAATCTTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTCAAAATAATAATAAATT
129 -TATTCAGTAAATAGATTAATCTTTTAATTATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * *
31317 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAATG
193 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
* * *
31382 TCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCTTTAA-TATTTGAACTTGTTCAATAAAC
258 TCATAATGAGTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-TTAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC
31446 ATATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTAAT-ATTTGTCAAAA
322 ATATTTATTTTTTAAAT-TTTTATTTAATAATTT-TCAAAA
*
31486 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * *
31551 CAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAATAAATGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAACT
66 CAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAAT-AAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTG-AACT
* * * *
31616 TGTTCAGTAAATAGATTTAT-TTTTAAATTTTGTTACTTTATTAATTGTCTT--AATATTAACTA
129 TATTCAGTAAATAGATTAATCTTTT-AATTATCTTAC-TTATTAATT-T-TTGAAATATTAA-TA
* *
31678 AATTTA-TATTA-TTTA-TTCAAATAAGCTTGCATGAATAGAAA-AGATCATTTTATGACAAAAC
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* * * * * * * *
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TTATTTTTTAAATTTTTATTTAATAATTTTCAAAA
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* * * * * * * * ** *
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* **** * * **
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** * * * *
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* * * * *
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* ** * * ** *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* *** * *
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* * * * ** *
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** * * *
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* * * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGAT
* * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * *
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* *
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* * * * * * *
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* **
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* * * * * *
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* *
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** * *
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*
33975 AACT
702 GACT
* * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGAT
** * * * *
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66 TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *
34109 TTATTTTAATCAAAATAAGCTTGTACGAACA-AAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGGTTAC
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* * * * * * * ***
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* ** * * ** * *
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** * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * **
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* * * ** *
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* * * ** * * *
34560 TAGTTATAATTATTTG-AGTTGGTTTGAAAAATAGAATTATTTTCTAAA--TC--TCTTATAAAT
569 TAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAAT
* * * * * ** *
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633 TTTTTAGATATTAATAAATTAGTATTAATTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGT
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697 TTTATGACT
* * *
34687 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAATAGTCTTAACTGTTTGAATTG
1 -AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAATTG
* ** * * *
34751 GTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCAAGATATTACTAAATTA
64 ATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAATTA
* * * * ** * * * * * *
34815 GTGTTATTTTATTTTGAATAAGAATATATAAATAGAAACAACTGTTTTATTATAGAACAAAAGGT
128 GTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGT
* * * * * *
34880 TATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAATAG
193 TATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTTGATAAACAG
*
34945 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
257 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * ***
35006 CGAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTAATAGTAATTTGA
322 C-AATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * **
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385 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * * * * *
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449 ATTTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT--AATAAGCTTGT
* * ** *
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512 AT----T-AAAC----A--TGAT-AC-AAATCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * ** * * * *
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* ** * * * ** *
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*
35388 AATTGTTTTATGACA
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* * * * * * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGA
* * ** *
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* ** * * * * * *
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* * * * * *
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* ** ** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * **
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** ** * * *
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566 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTTCTTATT
* * ** * ** * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* ** * * * *
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* * * ** **
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* * *
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* * *
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*
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*
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** * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGAT
* * * * * *
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** * ** * * ** *
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* * * * *
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*
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37242 TATTCTAAAT
Statistics
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TTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTAT
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AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
TAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTT
ACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAATAAGCTTGTATTAAACAT
GATACAAATCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
ACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTAGATATTAATAAA
TTAGTATTAATTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACT
Found at i:34348 original size:179 final size:179
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34045 TGGTAAACAA
* *
34055 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATC
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATC
** * *
34120 AAAATAAGCTTGTACGAACAAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGGTTACAACGATTTCAAA
66 AAAATAAAATAGTACGAACAAAACAATTGTTTGACAACAAAAGAAAAGGTTACAACGATTTCAAA
* **
34185 TAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGTTTGACAAGTGG
131 TAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTGTTTGACAAGTGG
* ** * * *
34234 ATTTATTTTTT-AATTTTTTGGTTCTTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATC
** * * * * ** * * * * *
34298 TGAATAAAATAGTATGAATAGAATCGATTGTTTGATGATAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAA
66 AAAATAAAATAGTACGAACA-AAACAATTGTTTGACAACAAAAGAAAAGGTTACAACGATTTCAA
* * ** * *
34363 ATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAG
130 ATAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACT-GTTTGACAAGTGG
* * * * * * * *
34414 TTTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTA
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34475 TTTTGAACAA
Statistics
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ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATC
AAAATAAAATAGTACGAACAAAACAATTGTTTGACAACAAAAGAAAAGGTTACAACGATTTCAAA
TAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTGTTTGACAAGTGG
Found at i:35343 original size:17 final size:16
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35311 AATCTATTAC
35321 TTATTAATTTTAGAATA
1 TTATT-ATTTTAGAATA
*
35338 TTATTAGTTTAGCAATA
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35355 TT-TTATTTT-GAATA
1 TTATTATTTTAGAATA
35369 AATTTGTATG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTATTATTTTAGAATA
Found at i:35733 original size:355 final size:352
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34748 TTGGTTCAAC
* * * * * *
34758 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAGATATTACTAAATTAGTGTTATT
1 AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--ACTTTTGAA-ATATTAATAAATTAATATTATT
* * * * * * * *
34823 TTATTTTGAATAAGA-ATATATAAATAGAAACAACTGTTTTATTATAGAACAAAAGGTTATAACA
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* * * * * ** * * *
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* *
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190 TTTTAAATCTACAACTCATTAATT-TTAG-AATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGAATA
* *** * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
35116 AAAC-TGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAACTTTCGAAATAATAAAAAAGTAGTATTATTTTC
1 AAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* ** * * * **
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* * * * * *
35242 TTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACACATTTATTT
126 TTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACACATCTATTT
** * * ** * * *
35307 TTTAAATCTATTACTTATTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTATTTTGAATAAAT
191 TTTAAATCTACAACTCATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGAATAAAC
*
35372 TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACATAGATCATAAGAATTTGAGATAGATAATT
256 TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AGAT-ATAAGAATTTGAAATAGATAATT
* *
35437 ATTCAAATAGCCATAACAATTTCAACTGGTCTAGT
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** *
35472 AAACATATTTAGATTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
1 AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
* * *
35537 TCTAAATAATTTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATTATAAACAAAATGTCATAACAATTTGA
66 TCTAAATAAATTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATTATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * * *
35602 AATAGATCATAGTTCAAATAGGT-ATGATTTTTTAAACTTGTTC-GATAAACAGA-CTACTTTTT
131 AATAGATAATAGTTCAAATA-GTCATAACTATTTAAACTAGTTCAG-TAAACACATCTA-TTTTT
** * * **
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193 TAAATCTACAACTCATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGAATAAACTT
* * * * *
35729 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAATG-ATTTGAAATAAATAACT
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** * * *
35793 ATTCAAATAATCATAAATAGTTGAATTCG-CTTGGT
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* *
35828 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATT
1 AAACATATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
* * * * * *
35893 TTATTAC-GAATAAACTTGTATGAACAGAAACAA-TG--GT-TTAT-AACAAAAGGTAATAACAA
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* ** * * * * * * *
35952 TTTGAAATAGATAATTGCGCAAATAGTCATAACTATTTGAACGAGTTAAGAAAATAGATTTATTT
126 TTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACACATCTATTT
** ** * ** * *
36017 TTTAAAAT-T-TTACTTTTTAAGTTTTGGAATATTAATAAATTTTTATTATTTTA-TTCAAAATA
191 TTT-AAATCTACAACTCATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTC-GAATA
* * * * * * * * *
36079 AGCTTGCATAAATAGAACCAATTGTTTTAAGACAAAACAGAAGGTCATAATG-TTTTGAAATAGA
253 AACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC--AAGAT-ATAA-GAATTTGAAATAGA
* * * * * * *
36143 TAATTTTTTAGATAGTCATAACTATTTAAACTTGT-TCAGT
314 TAATTATTCAAATAGCCATAA-AATTTGAACTCGTCT-AGT
* * * * * * *
36183 AAATAGATTCT-TTTCTTAATTCTCTTGCTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTAT
1 AAACATATT-TATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
** ** * **
36247 TTTACTTC-AAATAAGCTCATATGAATTAAAACAATTGTTTTA-T-T--ACAAAAGGTCATAATG
61 TTTA-TTCTAAATAAATTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATTATAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * *
36307 ATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATTACTATTTGAACTTA-TTC-GACAAACATATTT
125 ATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TAGTTCAG-TAAACACATCT
* *** * * * * *
36369 ATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTA-AAATTATTTTA-ATCTG
187 ATTTTTTAAATCTACAACTCATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTAA-TATTTTATTTC-G
** * * * * * *
36432 AATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAAT
249 AATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAGA-T-ATAAGAATTTGAAAT
* ** * * * * *
36497 AAATAATTGCTCAAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTTTGGT
311 AGATAATTATTCAAATAGCCATAA-AATTTGAACTCGTCTAGT
* ** * **
36540 AAACATATTTATTTTTTTAAAATCTTTTATTAA-TTGTCT-TCATCTTAATAAATTTGTATTATT
1 AAACATATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTATTAACTT-T-TGAAATATTAATAAATTAATATTATT
* ** * ** * *
36603 TTATTCAAAATAAGCTTGTATTAACT-AAAACAATTGTTTTACCACAAATC-AAAGGTTATAACA
62 TTATTCTAAATAAATTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATTATAAA-CAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * * *
36666 ATTCT-AAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTT-TGATAAATAGATTTA
125 ATT-TGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAG-TAAACACATCTA
**** * * * * * * *
36729 TTTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAA
188 -TTTTTTAAATCTACAACTCATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGAA
* * * *
36794 TAAGCTTGTATGAACTAAAGCAATTGTTTTATGACTAAACAA
251 TAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
36836 AAGGGGAAAA
Statistics
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0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
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352 2 0.00
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Consensus pattern (352 bp):
AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
TCTAAATAAATTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATTATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
AATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACACATCTATTTTTTAA
ATCTACAACTCATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTTCGAATAAACTTGTA
TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAGATATAAGAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
TAGCCATAAAATTTGAACTCGTCTAGT
Found at i:35745 original size:535 final size:537
Alignment explanation
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Period size: 531 Copynumber: 9.5 Consensus size: 537
31812 CAAAATGATT
** * * * * * *
31822 TTTTAATGACAAAAACAAACAGGTCCATAATGATTTGCAATAGATAATTATTCAAATAATCATGA
1 TTTT-ATGAC-AAAACAAA-AGGT-CATAACAATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATAGTAATAA
* * * * * * * * * * * *
31887 CTATTTGATCTAGTTTG-GTAATCATATTGA-TTTTTTAATTTTTTTACTTATCAATTATTGAAA
62 CTATTTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAATTTCTTACTCATTAATT-TT-TAA
* * * * * *
31950 TATTAATAAATTAGTATCATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACTATTATTTTAT-
125 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATG
* * * ** ** * * *
32013 AATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
189 ACTA-AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC
* * * * *
32078 TGGTTTGATAAACAAAATTATTTTTTAAGTC--TT--TTATTAATTTT-GAAATATTAATAGATT
253 TAGTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATT
* * *** * ** * * * *
32138 GGTATTATTTTATTCCAAACAAACATATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAATGAAAG-
316 AGTAATATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGA
* * * * * *
32202 GCTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGG-TTAGGTAAA
380 TC-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTA-GTAAA
* * * * * *
32266 CAAAATTATTTTTTAAATATCTTATTTATTAATTTTT-TAATATGAATAAATTCA-TTTTATTTT
443 CAGATTTATTTTTTAAA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTT
**** *** * *
32329 ATTTTGCATAAGCCAATATGAATTGAAAA-TATTG
504 ATTCAAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTG
* * ** ** ** *
32363 TTTTATGACAAAGCAAAA---C-T---AATTTGAAATAGATAACAGTTCATGTAGTCTTAAATAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATAGTAATAACTAT
* * * * * * * * * * *
32421 TTGAACTAGTTTG-GCAAACAAATTTA-TTTTTTCAATCTCATT-GTTATTTATTTTCAAAATAT
66 TTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAATTTC-TTACTCATTAATTTT--TAATAT
** * * *
32483 TTTTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGA-T
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACT
* ** * ** * * * * *
32546 AGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTGCATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATAG
192 A-AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG
* * * * * *
32611 TTTGGTAAACAGATTTATGTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTACT
256 -TTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * * *
32672 ATTATTTAATTCTAAATAAACTTGTAT-AATAGAAAGCAATCGTTATATGATC-AAACAAAAGGT
319 AATATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAA-CAATTGTTTTATGA-CAAAAC-AAAGAT
* * * * * ** *
32735 AATAACAATTTGAAATAGATAATT-ATGGAAATGGCCATAA-TAATTTGAACT-ACTTCGATAAA
381 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGCT-CAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTTAG-TAAA
* * * *
32797 CAGATTCACTTTTT-AAATCACTTACTTATTAATTATTGTAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
443 CAGATTTATTTTTTAAAAT--C-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*** *
32861 ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTG
504 ATTCAAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTG
* * * * * * * * *
32895 TTTTATAATAAAATAAAAGATCATAACGATTTTAAATAGA-CAATTATTCAAAACAGTCATAACT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATC-ATTGTTC-AAATAGTAATAACT
* * * * * * * ** * * *
32959 ATTTGAATTTGTTTG-GTAAACAAATTCATTTTTTTAAACTT-TGGCTTATTAATTTTCAAAACA
64 ATTTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAATTTCTTACTCATTAATTTT--TAATA
* * * * * *
33022 TTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTAT-ATC
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA-C
* * * * * * * *
33086 AAAACAAAAGATCATAATAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTG
191 TAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG
* *** * * * * * *
33151 TTCAATAAATGGATTTATTTTTTCAAATATTTTCCTTATTAATTTTTTGAATGTTAGTAAATTTG
256 TTC-GTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAG
* * * *** * * * * * *
33216 GATTATTTAATTAAAAATAAGA-TTGT-TAGATA-TGCAACAAATATTTTTTGACTAAACAAAAG
318 TAATATTTTATTTTGAATAA-ATTTGTAT-GA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAG
* ** * * ** * ** *
33278 GTCATAATGATTTAAAATATATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAC
379 ATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAAC
* *
33343 ATATTTATTTTTT-AAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-
444 AGATTTATTTTTTAAAAT--C-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * *
33406 TAACCAAATAAGCTTCTATG-ATCAGAAATAATTG
505 T-TCAAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTG
* * * * * * * * *
33440 TTTTATGACAAAA-TAGAGATCTTAACTATTTTAAATTA-ATAATTGCTCAAATAGTCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATCATTGTTCAAATAGTAATAACTA
* * * * *
33503 TTTGAA-TTGGTTTG-GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAGTA
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* *
33565 TTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTC-AACTAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGA
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGA
* * * ** ** * * * * * * *
33628 CAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATGGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAA-TT
190 CTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTA
* * *
33692 GATTGGGTAAACAAATTTACTTTTTAAAT-TTCTTACGTATT-ATTTTAGGAAATATTAATAAAT
255 G-TT-CGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTA-G-AATATTAATAAAT
* ** ** * * * *
33755 TAGTATTATTTTA-TTCCATATAAGCTTGTATTAACTGATAGAA-------AT--C---A-AAAG
315 TAGTAATATTTTATTTTGA-ATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAG
* * * * * * * * * *
33806 GTTATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT
379 ATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAAC
* * * ** * * *
33871 AGATTTA-TTGTTATAAATCCCTTTCTTATTAATTTTTTAGATGCTCATATATTAGTATTAATTT
444 AGATTTATTTTTTA-AAAT--C--TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
**
33935 A-TCTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTG
504 ATTC-AAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTG
* * * * * * * * * ** *
33969 TTTTATAACTAAACAAAATGTCAGAACGATTTCAACTAGATAATTGTTCTAATAGTCCTAACCAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATAGTAATAACTAT
* * * *
34034 TTGAA-TTGATTTG-GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATA
66 TTAAACTTG-TTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAAT-TTCTTACTCATTAATTTTT--AATA
* * * * * **
34095 TTATTAAATTAATATTATTTTA-ATCAAAATAAGCTTGTACGAAC-AAAACAATTGTTTTACAAC
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * **
34158 AAAAGAAAAGGTTACAACGATTTCAAATAGATAATCATTC-ATATAGTCTTAACTATTTGAACT-
191 TAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTA-ATAGTCTTAACTATTTGAACTA
* *** * ** * * * *
34221 GTTTG-ACAAGTGGATTTATTTTTT-AATTTTTTGGTTCTTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTA
255 GTTCGTA-AA-CAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTA
* * * * * * * * * * *
34284 GTATTATTTTATTCTGAATAAAATAGTATGAATAGAATCGATTGTTTGATGATAAAATAAAAGGT
317 GTAATATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGAT
* ** ** * * * *
34349 TATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAG
381 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAG
* *
34414 TTTTACTTTTT-AAATCTCTTACTAATTAATTTTCT-AAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
446 ATTTATTTTTTAAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
*** * * ** * * *
34476 TTTGAACAAACTTACATTAACAAAAACAATTA
506 TCAAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTG
* * * * ** * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATAGTAATAACTAT
* * * * * * * *
34573 TT-GAGTTGGTTTGA-AAAATAGAATTA-TTTTCTAAATCTCTTA-T-A--AATTTTTGAAATAT
66 TTAAACTT-GTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAATTTCTTACTCATTAATTTTT--AATAT
* * * * * *
34631 TAATAAATTAGTTTTACTCTATTCCAAATAAGC---T-TG---TAAAATAATTGTTTTATGA-TA
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACT-
** * * *
34688 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAATAGTCTTAACTGTTTGAATTGG
192 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAACTAG
** * * *
34752 TTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCA-AGATATTACTAAATTAG
256 TTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-AGA-ATATTAATAAATTAG
** * * * * * * * * *
34816 TGTTATTTTATTTTGAATAAGA-ATATATAAATAGAAACAACTGTTTTATTATAGAACAAAAGGT
318 TAATATTTTATTTTGAATAA-ATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAT
* * * * * * * *
34880 TATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAATAG
381 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAG
* *
34945 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-G
446 ATTTATTTTTTAAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAA
* *
35008 AATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTA
510 AATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTG
* * ** * ** *
35036 TTTTATGACAAAACAAAATGTAATAGTAATTTGAAATAGAT-AGTTGTTCAAATGGCCATAATTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATCA-TTGTTCAAATAGTAATAACTA
* * * * * * ** *
35100 TTTGAACTTATT-TAGTAAACTGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-A--ACTTTCGAAATAAT
65 TTTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAATTTCTTACTCATTAATTT-TTAATATT
* * * * * *
35160 AAAAAAGTAGTATTATTTTCTTTTGGAA-AAGCTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTA
129 AATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTA
*
35224 AACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTT
193 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTT
* * * ** *
35289 CAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAAT
258 C-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTAAT
* * *
35354 ATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACATAGATCATAAG
322 ATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAAC
* ** * * * * * *
35419 AATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACAATTTCAACTGGTCTAGTAAACATATTTAG
387 AATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAGATTTAT
* * * **
35484 ATTTT-AAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAATT
452 TTTTTAAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGC
*
35548 TTGTATGAATAAAAATAATTG
517 TTGTATGAATAAAAACAATTG
* * * * * * *
35569 TTTTATTA-TAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCATAGTTCAAATAGGT-ATGATTT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATA-GTAATAACTA
* ** ** *
35632 TTTAAACTTGTTCGA-TAAACAGA-CTACTTTTTTACGTTTCCAACTCATTAATTTTATTATATT
65 TTTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAATTTCTTACTCATTAATTTT-TAATATT
* * *
35695 AATAAATTAGTAATATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
129 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACTA
* * * * * * * * * * *
35759 AACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAATCATAAATAGTTGAATTCGCT
193 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG-T
* * * *
35824 TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTT-GAAATTTTAATAAATTAATA
257 TCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAG-AATATTAATAAATTAGTA
* ** * * * * *
35888 TTATTTTATTACGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAA-TGGTTTAT---AACA-AAAGGTAATA
320 ATATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATA
* * * *
35948 ACAATTTGAAATAGATAATTGCGCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-GAGTTAAGAAAATAGATT
385 ACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTTAGTAAACAGATT
* * * * **
36012 TATTTTTTAAAATTTTACTTTTTAAGTTTTGGAATATTAATAAATTTTTATTATTTTATTCAAAA
449 TATTTTTTAAAA-TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAA
* * * *
36077 TAAGCTTGCATAAATAGAACCAATTG
512 TAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTG
* * *** * * * * *
36103 TTTTAAGACAAAACAGAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTTTTTAGATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATAGTAATAACTAT
* *
36168 TTAAACTTGTTC-AGTAAATAGA-TT-CTTTTCTT-AATTCTCTTGCTCATTAATTTTTGAAATA
66 TTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTT-TTAAATT-TCTTACTCATTAATTTTT--AATA
* * * ** *
36229 TTAATAAATTAGTTTTATTTTACTTCAAATAAGCTCATATGAATTAAAACAATTGTTTTAT---T
127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACT
* * *
36291 --ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATT-ACTATTTGAACTTA
192 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTC-TTAACTATTTGAAC-TA
* * * * *
36353 -TTCGACAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTA-
255 GTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAG
* * * * * * *
36416 AAATTATTTTAATCTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGT
318 TAA-TATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-T
* * * *
36481 CATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
381 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTTAGTAAACA
* * * * *
36545 TATTTATTTTTTTAAAATCTTTTATTAATTGTCTT--CATCTTAATAAATTTGTATTATTTTATT
445 GATTTA-TTTTTTAAAATCTCTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
*
36608 CAAAATAAGCTTGTATTAACT-AAAACAATTG
507 CAAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTG
** * *
36639 TTTTACCACAAATC-AAAGGTTATAACAATTCT-AAATAGA-CAATTGTTCAAATAGTAATAACT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT-TGAAATAGATC-ATTGTTCAAATAGTAATAACT
* * * * * * *
36701 ATTTGAACTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTT-TTTCTTATTAATTTTTTGAGT
64 ATTTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAAT-TTCTTACTCATTAA-TTTTT-AAT
* * * *
36764 GTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAGCAATTGTTTTATGAC
126 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAC
** * ** * * * *
36829 TAAACAAAAGGGGAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTACTAGTCTTAACCATTTGAA-TTG
191 TAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG
*
36893 ATTCGATAAACAAATTTATTCTTTAAATCT
256 -TTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
36923 CTTATTAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (537 bp):
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATCATTGTTCAAATAGTAATAACTAT
TTAAACTTGTTCGAGTAAACAGATTTACTTTTTTAAATTTCTTACTCATTAATTTTTAATATTAA
TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAAC
AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGT
AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTAATATTT
TATTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACAATT
TGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAGATTTATTTTT
TAAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGT
ATGAATAAAAACAATTG
Found at i:36944 original size:68 final size:68
Alignment explanation
Indices: 36860--36988 Score: 170
Period size: 68 Copynumber: 1.9 Consensus size: 68
36850 TTGAAATAGA
* * *
36860 TAATTGTTCTACTAGTCTTAACCATTTGAA-TTGATTCGATAAACAAATTTATTCTTTAAATCTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTATTCTTTAAATCTC
36924 TTAT
65 TTAT
* * * * *
36928 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTCTTTAAAT
36989 ATTTTACGTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (68 bp):
TAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTCTTTAAATCTCT
TAT
Found at i:37119 original size:106 final size:106
Alignment explanation
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36920 TCTCTTATTA
* * * * *
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1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAAATTGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATATCTTA
*
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*
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1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAAATT-GTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATATCTT
* * * *
37100 ACTTATTACTT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
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37141 ATTTCAAATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAAATTGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATATCTTA
CGTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTC
Found at i:37487 original size:180 final size:176
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37253 AAATAGTACA
* * * *
37263 AATAAAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTTAA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
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*
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66 AATAGTCATAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTAATCTCTT-CT-ATTAAT
* *
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* * * *
37443 AATAAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAAG-TAATAATGATTTGATATATATAATTGTTCA
1 AATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * *
37507 AATAGTTATAATTATTT-AAACT-AGTTTGGTAAATAGAATTT-TTTTAAAAATATCTTTCT-TA
66 AATAGTCATAACTATTTGAAA-TGA-TTTGGTAAACA-AATTTATTTT--TAATCTC-TTCTAT-
* * * * * *
37568 TAATATTTTTAAATATTAACAATTTTA-TTTTATTTTATTTTGAAGAAACTTGTATG
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* ** * * * * *
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1 AATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGATAATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * *
37688 ATATAGTCTTAACTATCTGAACTGGTTTGGCAAACGAATTTATTTTTTAAATCTC-T-TATGAAT
65 AAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATTTA-TTTTT-AATCTCTTCTATTAAT
* * *
37751 TTTC-AGACTATTATTAAATTAGTATT-TTTT-TTTAATAAATTTGTATG
128 TTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAACAAATTTGTATG
* * * * * * * * *
37798 AACAGAAATAATTATTTTATGACAGAGC-AGAAGATTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCA
1 AATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* *
37862 AATAGTAATAAATATTT
66 AATAGTCATAACTATTT
37879 AAACTGGTCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.10, T:0.41
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AATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
AATAGTCATAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTAATCTCTTCTATTAATTTT
CTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAACAAATTTGTATG
Found at i:38427 original size:20 final size:20
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38394 TATTTTGAAT
38404 AATT-TTGTATGAACAAAAAC
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*
38424 AATTGTTTTATGACAAAA
1 AATTGTTGTATGACAAAA
38442 CAAAAGGTCA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 1, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
20 10 0.62
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Consensus pattern (20 bp):
AATTGTTGTATGACAAAAAC
Found at i:38631 original size:177 final size:177
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Indices: 38055--39933 Score: 1337
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38045 AATATGTTAG
* ** * * *
38055 AAAATAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * * **
38120 CCATAATTATTTGATTTGATTTGGTATACTGATTTATTTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTT
66 ATATAACTATTTGAATTGATTT-ATAAACAAATTTATTTTTTAAAT--C-TACTTATTAA-TTTT
* ** * * *
38185 TA-AATATTAATAAAGTAGTGCTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTAT--ACT
126 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
38234 AAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGTTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA-
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
*
38298 ATCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAA-AAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAAT
66 AT-ATAACTATTTGAA-TTGATTTA-TAAACAA-ATTTATTTTTT-AAA--TC-TACTTATTAAT
* * * ** *
38361 TTTTAGAATGTTAATAAATTAGTTTTTTTTTTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAACA
123 TTTTAGAATATTAATAAATTAG---TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
38419 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCTAATGG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
38484 ATATGACTATTTGAATTGATTTGATAAACAAATTAACTTTTTAAATC-ACTTATTAATTTTTAGA
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* * *
38548 TTATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCTTG-AGTTAACT
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-TGAACT
* * * *
38596 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATA-
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * * * ** *
38660 ATTGTAACTATTTAAATTTTTTTAGCAAATAAATTTA--TTTAAAATTTTTTTTATTAA-TTTTG
66 A-TATAACTATTTGAATTGATTTA-TAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTACTTATTAATTTTTA
* * * *
38722 GAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTT-AGATAAGCTTTTATAAATT
128 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
38773 GAAACAATTGTTTTACGTCAAAGCAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATA-
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* * *
38837 ATCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATT
66 AT-ATAACTATTTGAA-TTGATT-TATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC---TACTTATTAATT
* * * * * * *
38901 TTCCA-AATGTTAATAAATTTGAATTATTTTATTCTGAATAACCTTGTAAGATA-T
124 TT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACT
* * * * * * * *
38955 GAAACAAATATTTT-TGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
39019 TTTTATCTATTTGAACTGGTTCTACAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
66 ATATAACTATTTGAATTGATT-TATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTT
* * * * * * * * *
39084 AAAATGTTATTAAATTAGTAATATTTT-TAATCGAATAAGTTTCTATGATC-
127 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
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1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
39198 G-TCATAACTATTTGAATTGGTTCAATAAATAGATTTATTTCTTAAAACTTTTACTTATTAATTT
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* * ** * * *
39262 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTTCAAATAAACTTGTATGATCA
125 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * ** *
39315 AAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAAGCCATAACAATTTAAAATAGATAATCATTCAAATG
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** * * * * * * *
39380 GCCATAATTATTTTAA-TAATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTCTTATTTATTAATTT
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** *
39443 AGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTA-GTAACT
127 A-G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATG-AACT
* * ** * * * *
39496 GAAATAATTGTTTTATGACAAATTAAAAGGTTATAAAGATTT-AAATAGACAATTGTTAAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
39560 -TAATAACTATTTGAACTT-ATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTGTTTCTTATTAATT
66 AT-ATAACTATTTGAA-TTGATTT-ATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC---TACTTATTAATT
* * * *
39623 TTCA-AATATT-ATTAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACT
124 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
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1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
39740 TTTTAACCATTTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTT-G
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* * *** *
39803 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAAT-AGCTTGTATGGA-T
129 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* ** * *
39851 AAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
*
39916 -TCATAATTATTTGAATTG
66 AT-ATAACTATTTGAATTG
39934 GTTTGGAAAG
Statistics
Matches: 1357, Mismatches: 263, Indels: 164
0.76 0.15 0.09
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AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
ATATAACTATTTGAATTGATTTATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTAGAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
Found at i:39151 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 39122--39160 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
39112 AATCGAATAA
39122 GTTTCTATGATCAGAAACAATT
1 GTTTCTATGA-CA-AAACAATT
39144 GTTT-TATGACAAAACAA
1 GTTTCTATGACAAAACAA
39161 AGATCTTAAC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.13, G:0.13, T:0.33
Consensus pattern (20 bp):
GTTTCTATGACAAAACAATT
Found at i:39417 original size:361 final size:356
Alignment explanation
Indices: 38095--39930 Score: 1197
Period size: 361 Copynumber: 5.1 Consensus size: 356
38085 TAATAATGAT
* * * * *** *
38095 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTG-ATTTGATTTGGTATACT-GATTTA-T
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATA-AATAGATTTATT
* * * * ** * *
38157 TTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTGCTATTTTATTTTGGATA
64 TTTTTAAATC-TTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
** * * ** * * ** *
38222 AGTTTTTAT-A-CTAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGTTCATAATGATTTTAAATAGAT
128 AACTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * * *
38285 AATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAAAAGATTTATTTTTTCAAATCTC
193 AATTATTCTAATAGT-TTAATTATTTTAAC-TGATTCAATAAACATATTTATTTTTT-AAAT-TC
* * * * * * ** **
38349 TTGCTTATTAATTTTT-AGAATGTTAATAAATTAGTTTTTTTTTTTTATTTTGAATAATTTTGTA
254 TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTATTAAATTAG---TATTATTTTA-ATCCAATAAGCTTGTA
* * * * * *
38413 TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
314 TGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAT-TTAA-CAA
* * * * ** * * **
38459 TTGAAATAGATAATTGCTCTAATGGAT-ATGACTATTTGAA-TTGATTTGATAAACA-AATTAAC
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAATAGATTTATT
* * * *
38521 TTTTTAAATC---ACTTATTAATTTTT-AGATTATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTGAATA
64 TTTTTAAATCTTTTCTTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * ** * * * * *
38582 AGCTTG-AGTTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGA
128 AACTTGTA-TGATCAAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGA
* * * * * * * ** * ** * * *
38646 CAATTGTTCAAATAATTGTAACTATTTAAATTTTTTTAGCAAATAAATTTA--TTTAAAATT-TT
192 TAATTATTCTAATAGTT-TAATTATTTTAACTGATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTCTT
** * ** * ** * *
38708 TTTTATTAATTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATAAAT-
256 ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCA-ATAAGCTTGTAT-GATC
* * * * * * * *
38772 TGAAACAATTGTTTTACGTCAAAGCAAAAGGTCATAATGAT
319 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAT-TTAA-CAA
* * * * *
38813 TTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTT
* * * *
38878 TTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAAATGTTAATAAATTTGAATTATTTTA-TTCTGAATAA
66 TTTAAATCTTTT-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAA
* * * * * *
38942 CCTTGTAAGAT-ATGAAACAAATATTTT-TGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGAT
129 ACTTGTATGATCA-AAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGAT
* * * * *
39005 AATTATTCTAATAGTTTTATCTATTTGAACTGGTTCTACAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTT
193 AATTATTCTAATAGTTTAAT-TATTTTAACTGATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTT
* * * * * *
39070 ACTTATTAATTTTTAAAATGTTATTAAATTAGTAATATTTTTAATCGAATAAGTTTCTATGATCA
256 ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTTAATCCAATAAGCTTGTATGATCA
39135 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCTTAACAA
320 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAT-TTAACAA
* * *
39173 TTGGAGATTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCAATAAATAGATTTA-T
1 TT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAATAAATAGATTTATT
* * * * *
39236 TTCTTAAAACTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTTCAAATA
64 TTTTTAAATCTTTT-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * *
39301 AACTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAAGCCATAACAATTTAAAATAGA
128 AACTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACTAAA-CAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGA
* * * ** *
39366 TAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAA-TAATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTCT
192 TAATTATTCTAATAG-TTTAATTATTTTAACTGATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAA-TTCT
* ** * * * *
39430 TATTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTA-GTAA
255 TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCA-ATAAGCTTGTATG-AT
* * *
39494 CTGAAATAATTGTTTTATGACAAATTA-AAAGGTTATAA-AGA
318 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAA--ACAAAGATT-TAACA-A
* * * * * ***
39535 TTTAAATAGACAATTGTTAAAATAGTAATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTT
* * * *
39600 TTTAAATCTGTTTCTTATTAA-TTTTCAAATATT-ATTAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAG
66 TTTAAATCT-TTTCTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAA
* * * **
39663 TTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAA
130 CTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAA
* ** * *
39728 TTGTTCTAATAGTTTTAACCATTTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TC-T-C
195 TTATTCTAATAG-TTTAATTATTTT-AACTGATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTCTTAC
39790 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAA-ATAGCTTGTATGGAT-A-
258 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAATA-AGCTTGTAT-GATCAG
* ** * * *
39852 AAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAAAGTAATAACGAT
321 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-T-TTAAC-AA
*
39891 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
39931 TTGGTTTGGA
Statistics
Matches: 1175, Mismatches: 239, Indels: 124
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
353 6 0.01
354 96 0.08
355 40 0.03
356 43 0.04
357 72 0.06
358 69 0.06
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365 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (356 bp):
TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTT
TTTAAATCTTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAC
TTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAAT
TATTCTAATAGTTTAATTATTTTAACTGATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTCTTACTTA
TTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAATAAGCTTGTATGATCAGAAACA
ATTGTTTTATGACAAAACAAAGATTTAACAA
Found at i:41064 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 40691--45343 Score: 3543
Period size: 181 Copynumber: 25.9 Consensus size: 181
40681 ATCAAATTCA
* * * * * * * * * * *
40691 AATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTC
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * * ** * *
40756 AATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATGACAATTGTTTTTGATCA-
66 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* *
40820 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTGTTC-AAAAATT
131 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCTAAAAATT
* **
40871 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * ** * * * * *
40936 AGCAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTATTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCAT
66 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * *
41001 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATCTAATAATATTCTAAAAATT
131 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* *
41052 AAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAAATAATAT-TGTTT-GCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTA
1 AATAAG-TAAGAGATTT-AAAAAATAA-ATCTGTTTAG-CAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * **
41114 TATGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTCAAT
62 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* * *
41179 TCATACTAGCTTATT-TAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATT-TCAAAAATT
127 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * * *
41234 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTACTTG
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * *
41299 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAT
66 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * * * *
41364 ATAAGTTTGTTTGAAATGAAATAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATT
131 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * * *
41415 AATAAG--A-A-TTTTAAAAAAATAAAACTATTTATCAAATCGGTTC-AA-A-TTAAGACTATTT
1 AATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
41473 -AAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTCTGTTC
65 GAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * * * * * *
41537 ATACAAGCTTATTCGGATTAAACTAATACAAATTTATTAATATTTTGACAATT
129 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * * *
41590 AGTAAGTAAAAAATGTAAGAAAATAAAT-T-ATT-G--AACTAGATCAAAGAGTCATGACTATTT
1 AATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * **
41650 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTCTTCTATCATAAAA-AA-TATTTCAATTCA
65 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * * * *
41713 TATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTATGAAAATT
130 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * *
41765 AATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTA-CTGATCAAGTTTAAATAATTATG-CTTATT
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGAC-TATT
* * * * ** * *
41828 TGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGCTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTG
64 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
*
41893 ATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTATTTAATA-T-TAAGACAATT
129 ATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATATTCTAA-A-AATT
* * * *
41946 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTT
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTT
* * ** * * * *
42010 GAATAATTATTTATTTCAAATTGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTCTATTCA
65 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* *
42075 TACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAACAATTT
130 TACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AAATT
** * * * *
42128 AA-ATTTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTT
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
42191 GAATAATTTTCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTT-TAGTTC
65 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTC
* * * * * * *
42255 ATATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTCATTGATTAATATTCCAAAAATT
129 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * * * *
42308 AA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGCTTACCAATCAAGTTGAAATATTTATGACTATA
1 AATA-AGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * **
42372 TAAATAATTATCAATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGGCTCTGTTC
64 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * * * * *
42437 TTGCCAGCGTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-CAAAATT
129 ATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * *
42489 AATAAGTAA-A-ATTTTAGAAAATAAAACTATTT-TCTTAA-CACGTTCAAATAGTTATAACTAT
1 AATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAGC-AAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
42550 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTAGTTCTGTCATAAAACCAATTGTTTCTAT
63 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTGT
* * * * * *
42615 TCAAATAAGCTTATTTGGAAT-AAATAATTCTAATTTATTAATATTC-CAAAATT
127 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * *
42668 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * ** * *
42732 GAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCATATAATTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
65 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * *
42797 TACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTAACATTCTAAAAATT
130 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * * *
42849 AATAAG-ATGAAGATATAAAAAATTAAT-TAGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATT
1 AATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
42912 TGAACCATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGT-AAATAATTGTTTCTATTC
64 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
** * * * *
42976 ATACAAAATTATT-TACAATAAAATAACACAAATTTATTATTATTC-AAAAA-T
129 ATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * *
43027 --TAA-TAAGAGATTTAAACTACTAAATCTCTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTT
1 AATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
43089 AAATAATTATCTATCTCAAATCATTATAATC-TTTATTTTGTCTTAAAACATTTGTTTCTGTTCA
65 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * * *
43153 TACAAGCTTATTCGGAGTAAAATACTACTAAGTTAATAACATTCTAAAAATT
130 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * *
43205 AATAAGTAAG-GATTTAAAAAATGAATGTGTTT-GTCGATCCAATTCAAATAGTTAAGACTATTA
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAG-CAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** * * * *
43268 GAATAATTATCTATTTCAAATTTTTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAATAATTGTTTCAGTTCA
65 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * * **
43332 TACATGCTTATTTGAAATAAAATAGTACTAATTTATTAACACTAAAAAAATT
130 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * ** * * *
43384 AATAAGCAAG-GAATTTTAAAAAAAAAAT-TGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATT
1 AATAAGTAAGAG-A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * * *
43447 TGAAAAATTATCCATCTAAAATCATTACGACCTTTTATTTTATCACAAAACAATTGTTTCAGATC
64 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * * ** * *
43512 ATAAAAGCTTATCCCAAATAAAATAATGTTACTTTATTAATATTTTAAAAATT
129 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * * * * *
43565 GATAAGTTACAGATTTAAAACATAAATCAGTTTATCGAATCAGTT-AAAAAATTAT-AGCCATTT
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTT
* * * * * **
43628 TAACATTTATC-ATTTTCAAATCGTTATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAT
65 GAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* * * * *
43692 CATACTAGCCTGTTCGTAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT
128 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * *
43746 AATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTG
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
43811 ---TATT-TC-AATT----TC-TTATAACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTCTATTCAT
66 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* ** * * * *
43866 AAAAATTTATTTGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATT
131 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * *
43917 AATAACTAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACCAGTTCAAATAGTTAATG-CTATA
1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGC-AAACCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATT
** * * ** * * * * * *
43980 TGAACAATCCTTTATTTTAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAATAATTTTTTCAGTTC
64 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * **
44045 TTACTAA-CATATTC-AGAATAAAATAA-AAAAATTTATTAATATT-TCAAAAATT
129 ATAC-AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * * *
44097 AATCAA-TAAGAGATTTAATAAAT-AATAATGTTT-GCTGAACCAGTTGAAATAATTATAAGTAT
1 AAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTAGC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
44159 TTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCCTTTCTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTT
63 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* * * * * * *
44224 CAAATAAGATTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT
128 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * *
44278 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAA-AAGA-C-ATTTA-CTAAACCAGTTCAATTAGTTATAATTATT
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* * ** * *
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* * *
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1 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
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66 AACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTC
* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * **
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65 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
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Statistics
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* *
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** * * *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAT-CAAGTTCAAATAGTTATG-CTATT
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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189 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * **
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253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
** * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * **
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191 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
45952 TATCTT-AAATCATTCTGATC-GTTATTTTGTCATAGAACAATT-TTT-T-TGT-ATA-AA-CTT
255 TAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTT
* * * * * ***
46009 ATT-TGAAATGAGATAATACTAATTTAATAATA-AAAATAAATGT
318 ATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAT-T
** ** * * * * * * * *
46052 GTTTTGCCAAACCAG-TTCAAATAATTAATACTATTAGAAC-AATTATTTA-TTCCAAATTGTTC
1 AATAAG-TAAA--AGATTTAAAAAATAAAT-CTGTT--TACTAATCA---AGTT-CAAATAG-T-
** * ** ** * * **
46114 TAACCTTTAGTTTAGTCATAAAACAAT-TATTTCAGTTCA-TACT-AGC--TT-ATTTGGAATAA
54 TATGC--TA-TTT-G--A-ACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * ** ** *
46173 AAAAATATTAATTTAT-TAACATTAAAAAAATTAATAAGCAAGATATTTAAAA-AA-ATAAATCT
111 AACAAT-TT--TTTCTGT-TCA-T-ACAAGCTT-AT-TTC--GA-A--TAAAATAATATAAATTT
* * * * * * ** * * * * *
46235 GTT--TACTGAACAAGCTCAAATATA-TATGACTATTTGAATAAT-TATCTATTTA--AAATCAT
163 ATTAATATTCAA-AA-AT-TAATA-AGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CA-
* *** * * * ** * * * ** ****
46294 TA-TGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTAT--CC-AAAAT
221 -AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCA-AATCA-TTATGACCTTTTGT
**** * ** * ** * *** * *
46353 AAAATAATACTAC-ATTATTAATATTTCAAACATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAA-AGTT
281 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT-ATTCAGA-A--T-AAAA-TAATA-TT
* **
46416 -GTTT-TTCGAACTAGGTC-AAA-T
338 AATTTATT--AA-TATTTCAAAATT
* ** * ** * * * *
46437 AGT---TACAACTATTTCAACAAAT--ATCAATCT-CAAATC--GTT-ACGAT-CTT-TG-T-TT
1 AATAAGTA-AAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCA-AATAGTTATGCTATT
** ** * * ** * * * * ** **
46489 TGTCATA-AAAAAAATGTTTCTAATCA-TACAAGC--TT-ATTCG-GATAAAA-AA--AATTAAG
63 TG--A-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTG
* * ** **
46545 TT-A-ATAA---TATTTC-AA-AAATTAATAAGTAAGGGATTTA--AA-AAACAAATGTGTTTGC
125 TTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAAT-A-TAA---ATTTATTAATATTCAAA---AATT--
* * * * * *
46600 CAAATCAGTTCAAATGGTTAGAACTATTAAAATAAT-TATCTATTT--CAAATC--GTTCTAA-C
180 --AATAAG-T-AAA-----AG-A-T-TTAAAA-AATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATA
* * ** ** * * * * * *** ***
46659 CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTCTTAGTTCATA-CA--A-G-CTTATTTGGAATAAAATAA
231 GTTATGACTA-T--TTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAA
* ** * * **
46719 TACTAATT-TATTAAC-ATTCA-A-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCCATTT
291 AAC-AATTGT-TT--CTATTCATACAAGCTT-AT--TC-AGA-A--TAAAATAAT--ATTAATTT
*
46780 ATTGAACTAGTTC-AAA-T
343 ATT-AA-TATTTCAAAATT
* * * ** * * ** * * * * *
46797 AGT-TGT-GATTATTTGAACAAT-TCTCTATTTA-AAATC-A-TT-ATGA-ACTTTTG--ATTTG
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCA-AATAGTTATGCTATTTG
* * * * ** * ***** *** *
46852 -TC-ATTAAACAATTGTTTCAATTCA-TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTA
65 AACAATT-ATC---TATTTCAAATCATTATGACCTT-T-TGTTTTGTCATAA-A--AC--AATT-
* * * ** * * *
46914 ATATTTCAAATATTAATAAGTAAG-AGATTT--AA-AAAATAA-ATTAGTTTACTGAATAGTTCA
118 -T-TTTC---TGTTCAT-A-CAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTA-TTAATA-TTCA
* *** * ** * *
46974 AATTATGGTCATTTGAATAA-TTATTTATTTCAAATCATTATTACCTTTCGTTTTCTCATA-AA-
174 AA--A-----A-TT-AATAAGTAAAAGATTT-AAA--A--AATAAATTT-GTTTAC-CAAACAAG
* ** * * * ** *
47036 ---AAA-A-TTAT---T-TTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAATGTTATTTCCTTTCGT
223 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATC-TATTTCAAAT---CA--TTATGACCTTTTGT
* * * *
47092 TTTGTC-T------ATT-TTTC-A-ACCTACAAACTTATT-TGAAATAAAATAATATTAATTTAT
281 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTAT
47146 TAATATTTCAAGAATT
345 TAATATTTCAA-AATT
* * * * *
47162 AGTAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCAAATAGTTAT-GCTATTTG
** * * * *
47223 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTT-TGTCCA
65 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTCA
* * * * * *
47287 TACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCTAAAAATTCATAAATAAGAG
129 TACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAG
** * * * * * *
47351 ATTTAAAAAATAAATCCGTTTGCCAAACTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTA
192 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
47416 TTTCAAATCGTTAGGA-CATTTGTTTTGTCATAAGACAATTATTT-TAGCTCATACAAGTTTATT
257 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT
* * *
47479 CAGAATAAAATAATACTAA-TTATGAATATTTATAAAATT
321 CAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-CAAAATT
* * * * * *
47518 AATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATC-ATTTCAAATAGTTTTGGCTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAATCAAGTTCAAATAGTTAT-GCTATTT
* ** * * * * * * ** *
47582 GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATGATGATACCATTGGTTCTATTCA
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCA
* ** * * **
47647 TACTATTTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGA
129 TACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-A
* * * ** * * * * * *
47710 A-AATAAAAAAATAAATCTAATTA-AAGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGATTATATAAACGATTA
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * *
47772 TCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAACAAATT-TTTTTATTCATATAAGCT
253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCT
**
47836 TATTCAGAATAAAATAATACAAATTTCA-TAATATTTCAAAAATT
317 TATTCAGAATAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTTC-AAAATT
* * * * * * *
47880 AATAAG----AGATTTGAAAAATAAATTTGTTTATTGAA-CTAGTTCATATGGTTAAGACTATTA
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATT-
* * * * ** **
47940 T-AACAATTATCTATTTCAAGTTATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGCTTAAGTTC
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTC
* *** * * * *
48004 ATACAAACTTATCAGGAATAAATTAATACT-AATTTATCAACATTCAAAAAATTAAAAAG-AAAG
128 ATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAA-
* * * * * **
48067 AGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTAAT-TCTTATTTGAACAGCTA
190 AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTA
** * * *
48131 TCTA-TTCAAAATTGTTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACTAGC
253 TCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGC
* *
48194 TTATAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATT
316 TTAT-TCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * * * * *
48239 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACTGAATCAA-TTAAAATAATTATGGCCATTC
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTAT-GCTATTT
* * ** * * * *
48303 AAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATGACCTTCTGTTTTGTTATAAAACAATTAGTTT-TGATC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTC
* *
48367 ATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAG
128 ATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * ** *
48430 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTGAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATC
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** * * * *
48495 AATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAA-TA-TGTTTTTGA-TCATAAAAGCTT
255 TAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT
* * * * *
48555 ATTC-GATTAAAAATAATAATAATTGAATAATATTCCAAAAATT
318 ATTCAGAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * ** * * ** *
48598 AATAAG----AGATTTCAAAAATAAATATGCTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAG
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCAAATAGTT-ATGCTATTTG
** * * * *
48659 AATTATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTT-TTTAGTCAT--AA-AA-------T-ATCAT
65 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCAT
* * * * * * *
48712 ACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATCTGAATATATTAACATTCAAAAATTAATAAATAAGAGAT
130 ACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * * *
48776 TTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGCTC-AAT--TTAAGACTATTTGAGCAATTGTATAT
194 TT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
48838 TTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGCCACAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTC-
258 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* *
48902 GAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATT
323 G-AATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT
* * * * * * *
48941 AATAAGT----GAATTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATTAA-TTCAAATAATTATGATAATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTATGCT-ATTT
* ** * * * * * **
49001 TAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACGAACATTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTT-TCATC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTC
*
49065 ATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----
128 ATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
49124 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGTTC--TTA-TT-T---TAGTT-----ATTACC
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * *
49177 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATAGTTTC-AGTTCATACAAGCTTA
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* * * **
49241 TTCAAAATAAAA-ATATACTAATTTAATAATATTAAAAAATTT
319 TTCAGAATAAAATA-ATATTAATTTATTAATATTTCAAAA-TT
* * * *** * *
49283 AATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTA-TTT
* ** * * * *
49348 -AACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATCATTTT-AGTCC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTCTGTTC
* * *
49411 ATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAGAAATTAATAAGT----
128 ATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * * * * * * * * *
49471 GATTTAGAAAGTGAATCTATTTATCGAATCATG-TCAAAAAATCATGGCCATTTCAACAATTATC
191 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * *
49535 TATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTGA-TCATTCAAGCTTA
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA
* * * * *
49599 GTCAAAATAAAATGATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATT
319 TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * *
49641 AATAAG----AGATTTAAAAATTAAAT-TGTTTATTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * ** * *
49700 GAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTCTATCATAAAACAATTATTTT-TGTT
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTT
* * * *
49763 CATAGAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-TGA
127 CATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGT-A
* * * * * * *
49825 AAAGAATT-AAAAATAAATTTGCTTACCAAACTAGTTCAAAAATTTAAGACTATAAT-AACAATT
188 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATT
* * * * *
49888 ATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACAAG
252 ATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * *
49951 CTTATTCGGGATAAAAGAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT
315 CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * * * *
49997 AGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAATTTTGTTTCCCTAA-CTAA-TTCAAATAATTATGACTAT
1 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTT-ACTAATC-AAGTTCAAATAGTTATG-CTAT
* * *
50060 TTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TGT
62 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTCTGT
* * * * ** *
50124 TCATATAAGTTTA-TTCGGAATAAAGTAATACT-AATCTATTAATATTTTGAAAACTAATAAG--
126 TCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
50185 --AGACTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATT
188 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATT
* * * * *
50247 ATTTATTTCAAATCGTTATGA-ATTTTGTTTTG-CTATAAAACAATTGTTTCTGTTAATACAAGC
252 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * *
50310 TTATTC-GAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATT
316 TTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT
* * * * * * * * *
50355 AATAAGTGAAA-ATTTCAAAAAATAAGTATGTTTACCAAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * ** * * ** *
50419 AAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAGTTCA
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCA
* * ** * * ** * *
50484 TATAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACCAACTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAG
129 TACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAG
* ** ** * * * * *
50548 ATTTAAAAAAATGAATTTGTTTTTCGGACAAGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTT
192 ATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * *
50613 ATTTGAAATCACTATAACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTCTTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
256 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTAT
** * *
50678 TTTGAA-AGAAATAATATAAATTTATTAATA-TTAAGACAATT
320 TCAGAATA-AAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-A-AATT
* * * **
50719 AATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAAG-TCAAATCCTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * ** * * *
50783 GAATAATTATTTATTTGAAATTTTTAT-AACTTTT-TTTTGCCATAAAATAATTATTTTCAT-TT
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTC-TGTT
* * * * ** * **
50845 -GTACAAGGTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTGGACAATTAATAAGTGGA
127 CATACAAGCTTATTTCGAA-TAAAATAATATAAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * *
50908 CGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTGAAATAGTCATGAC-ATTTGAATAATTAAC
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** * *
50972 TATTTCAAATCATTATAAACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTACTTC-AGTTCAAATAAGCTT
255 TATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT
* * * *
51035 ATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
318 ATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAATT
* * * * * *
51078 AATGAG-AAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACTAA-C-CG-T---GT--TTATGACTATCT
1 AATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * * * *
51134 AAACAATTATCTATTTTCAAA-CATTATGACATTTCGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTT-TCTT
64 GAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTT
* *
51197 CATGCAAGCTTA-TTCTGAA-AAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATAAGTAAA
127 CATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAA
* * *** ** * **
51260 A-ATTTTAAAAATAAATGTG-TT-CTTGACACTTTCAAATAGTGACAACTATTT-AACAATTATC
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
*** ** * * *
51321 TATTTCAAATTGCTATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTA-
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * *
51385 TCCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATT
320 TCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * *
51427 AATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAGT-GAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * ** * ** *
51491 GAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTGTCAAACAATTGCTTCTATTCA
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCA
*
51556 TACAAGC-TACTTCGAAATAAAATAATACT-AATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAG----A
129 TACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* ** ** * * * *
51614 GATTTAAAAATTAAATCCGTTTATTGAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATA
191 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** * * * * * * * *
51678 TACTTCAAATTTTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTGCTGTTCATAGAAGCTTAT
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * *
51743 TAAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAGAAATT
320 TCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-A-AAATT
* * * * * * * * * * * *
51784 AAT-AGCGAAGAGAATT-AAAAGTAAATTTGTTTACCAAACTAGTTTAAATATTTAAGACTATAA
1 AATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTAT-T
* * * * ** **
51847 T-AACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACTTTTTCTTTTATCATAAAACAAAATTTTCAATT
63 TGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTT
* * * * *
51910 CATACTAGCTTA-TTCGGGATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGT--A
127 CATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * *
51972 AGATTTAAAAAAATAATTTTGTTTCCCCAACCAA-TTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTA
190 AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * ** *
52036 TCTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATGTTTTTGTTCATTTAAGTTT
253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * *
52101 ATTTAGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATACTTTGAAAATT
318 ATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT
* * * *
52144 AATAAG----AGACTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * * * * *
52204 -ATCAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTCTG-CTATAAAACGATTGTTTCTATT
64 GAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTTTTTCTGTT
* ** *
52266 CATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTGA
127 CATACAAGCTTATTTCGAA-TAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGT-A
* * * * * * * * *
52329 AAA-ATTCAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAA-TA
188 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * * *
52392 TTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGTT
253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT
* * ** ** *
52456 TATTCAAAATAAAATAGTACCAATTTATCGATATTTTGAAAATT
317 TATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT
* * * * * * * * * *
52500 AATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTATTTTCCAGA-CAAGTTTAAATAATTATGACAATT
1 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTA-ATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATT
* * * * * * * * * *
52564 TAAACAATTATTTATTTGAAATCACTATAACTTTTTCTTTTATCATAAAATAGTTCTTTT-TGTT
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTT
* * *
52628 CATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATCTAAATTTATTAATATT-AAGTCAATTAATAAGTAAA
127 CATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAA--AAATTAATAAGTAAA
* * * * ** * *
52692 ATATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAAG-TCAAATTCTTATGATTATTTGAATAATTAT
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** * * * * * * ** *
52756 TTATTTGAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGCCATAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGGTTA
254 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * *
52821 TT-GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGACAATT
319 TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAA-TATTTCAAAATT
* ** * * * * * *
52862 AATAAATGGACGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTGAAATAGTCATGACAATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * ** * * * * *
52926 GAATAATTAACTATTTCATATTGTTATAACCCTTTGTTTTGTAATGAAACAATTGTTTCAT-TTC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-TGTTC
* * * ** * * *
52990 AAATAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAG-AAGG
128 ATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-A
* * * * * * * *
53053 AGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACC-AACCA-TT----T--TTTTAACTATCTAAACAATTATC
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
53110 TATTTTCAAA-CATTACGACCTTTCGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTA
255 TA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
** * *
53174 TTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATT
319 TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * * **
53216 AATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAAT-TTTTGTTCTTGA-CACTTTCAAATAGTTATGACTATT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TAC-TAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATT
*** ** * * *
53278 T-AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTCTCTGTTC
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTC
* * *
53342 ATAAAAGTTTA-TTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
128 ATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* ** * * * ** * * * *
53405 ATATTTTTAAAATAAATCTATTTACCTAATGAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATT
190 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * *
53470 TATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTCTCGTAAAA-AATTGCTTCTATTCATACAAGCTTAG
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-
* *
53534 TTGA-AATAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATT
319 TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * * *
53574 AATAAG----AGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTGAA-CCAGTTCAAATGGTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * ** * * * * * *
53634 GAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCGTAAAACAATTATTTAC-ATTC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTC
* * * * * * *
53698 ATAGAAGTTTA-TTCAAAATAAAATCATACT-AATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-CAAA
128 ATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
53760 GTGAATT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATTA
190 -AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTA
* * * * * *
53823 TCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTCTTTTATCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGC
253 TCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *
53886 TTATTCAGGAA-AAAATAAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT
316 TTATTCA-GAATAAAAT-AATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * * * * * *
53932 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAGTAAGTTTGTTTCCCCAACCAA-TTTAAATAATTATGACTAT
1 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAA-TAAATCTGTTT-ACTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTAT
* * *** * *
53996 TTGAACAGTTATCTATTTTAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TAT
62 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTCTGT
* * * * ** *
54060 TCATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAGTAATACT-AATCTATTAATATTTTGAAAACTAAT--G--
126 TCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
54119 AGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCACTTCAAATAGTTATAACTGTTT-AACAAATT
188 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATT
* * * *
54183 AT-TCATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTCTG-CTATAAAAAAAATATTTCTATTCATACAAG
252 ATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * *
54245 CTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATT
315 CTTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT
* * * * * * *
54291 AATAAGTGAAA-ATTTCAAAAAATAAATATATTTACTGAA-CTAGATCAATTAGTCATGACTATT
1 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATT
* * * ** * * * *
54354 TAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTC
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTC
* * * ** * ** * *
54419 ATATAAGTTTA-TTCGAAATTAAATAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGA
128 ATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * * *
54483 GATTTAAAAAAATGAATTTGTTTTCCAGACAAGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATT
191 GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * * *
54548 TATTTGAAATCACTATAACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTCTTTTTGTTCATACAAGCTT-T
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
** * *
54612 TTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTAAGACAATT
320 TCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-A-AATT
* * * * **
54653 ACTAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAAG-TCAAATTCTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * ** * * * * ** *
54717 GAATAATTATTTATTTGAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGCCATAAAATAATGGCTTT-TGTTT
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTCTGTTC
* * * * * * ** * * * *
54781 GTACAAGGTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTGACAATTAATAAATAGATGA
128 ATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
* * * * * * *
54846 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTGAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTAACTAT
193 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * *
54911 TTCATATCGTTATAACCCTTTGTTTTGTAATGAAACAATTGTTTC-ATTTCAAATAAGTTTATTT
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* * *
54975 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
322 AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT
* * * * * * * *
55014 AATGAG-AAGGAGAATTAAAAAATGAATCTATTTACCAA-CCA-TT----T--TTATGACTATCT
1 AATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * * * *
55070 AAACAATTATCTATTTTAAAACATTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTC
* *
55134 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAG-ATAAA
128 ATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTA-AAA
* * *** ** * *
55198 -ATTTTAAAAATAAATCTGTGTT-CTTGACACTTTCAAATAGTTATAACTATTT-AACTATTATC
191 GATTTAAAAAATAAATTTGT-TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* *** ** * * * ** *
55260 TATTTTAAATTGCTATGACAATTTGCTTTGTTATAAACCAATTGTTTCCGTTCATAAAAGCTTAT
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
*
55325 TC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
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* * *
55366 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAGT-GAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * * * * ** *
55430 GAATAATTATTTCTTTGAAATAATTATGATCC-TTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGCTTCTATTC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTC
* ***
55494 ATACAAGCTTAGTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTA-TAATA-TC----A-TAA-AAGTTGGA
128 ATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* ** * * * *
55549 GATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGGACAAGTTCAAATAGTCATG-TTGATTTAAACTATTATC
191 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATC
* * * * * * * **
55613 CATTTTAAATCATTATGACATTTTG-TTTCTCGTAAAAAAATTGTTTCTATTCATATAAAATTAT
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
*
55677 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAA--
320 TCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATT
* * * * * *
55714 AATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTATCTAA-CTAGTTTAAATAGTTATGACTATT
1 AA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAATCAAGTTCAAATAGTTATG-CTATT
* * * ** *
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* * * * * * * *
55840 CATAGATGCTTATTTGGAGTAAAATATTACTAAA-TTAGTAATATAAT-AAAAATTTATAAGTAG
127 CATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT--TCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *** * ** *
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189 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTA
* * * ** * * * * * *
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253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT
* **
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* * * * ** * * *
56076 AATGAG-CAGA-ATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAT-ACAGATCAAATAGTTATAACCATTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATCA-AGTTCAAATAGTTAT-GCTATTT
* * * *
56138 GAAC-ATTAAATCT-TTT--TAT-A-TATG-CC-TTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTT
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
56241 ATTT-AAAAATAAGTTAGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTAT-T
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** * * **
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* *
56366 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
319 TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
** * * * *
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1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAATC-AAGTTCAAATAGTTATGCTATTTG
* * * *** * * *
56460 AATAATTATCTATTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTTCCATTATAAAATAATTGTTTT-GGTTCA
65 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTGTTCA
* * * * * * * *
56524 TATAAGCTT-TTTTGAAATAAAA-AATACT-AATTTAATAATTTTTTAAAAATGAATAACTAAGA
129 TACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* ** * * * * * * * *
56586 GATTTAAAAATTAAAACTATTTGCCGAAGC-AGTTCAAACAATCAAGACT-TTATGAATAATTAT
191 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTAT
* * *
56649 CTATTTCAAATCGTTATGACCCTTTTGTTTTGTTATAAAAACAATTGTTT-TAGTTTATACAAGC
254 CTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGC
* * * *
56713 CTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGTCAAAAATT
316 TTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
56758 AATAAGT
1 AATAAGT
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Statistics
Matches: 12066, Mismatches: 2689, Indels: 1927
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
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TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATT
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Alignment explanation
Indices: 40691--56764 Score: 8199
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40681 ATCAAATTCA
* * * * * * *
40691 AATAAGTAAGTG-ATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACC-AATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * ** * *
40754 TCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATGACAATTGTTTTTGATC
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
***
40819 A-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TGTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
130 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAA-A
* * ** * * * *
40882 GATTTAAAAAATAAATCTATTTAGC-AAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTGTA
192 -ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* ** * * * * * * *
40946 TACTTCAAATTGTTATAACCTATTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTAT
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTAT
* * * * *
41011 TCGAAATAAAATAATAATAATCTAATAATATTCTAAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAA-
320 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
41074 ATAATATTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAATC
383 A-AAT-TTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *
41139 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTCAATTCATACTAGCTTATTTAGAATAAAA
446 ATTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* *
41204 TAAAATAAATTTATTAATATT-TCAAAAATT
510 TAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * *
41234 AATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAAT-AATTATGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAC
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATT-TGTTTACC-AATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
41296 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTT
64 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* * *
41361 CATATAAG-TT-TGTTTGAAATGAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
129 CATACAAGCTTAT-TTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
41422 ATTTTAAAAAAATAAAACTATTTA-TCAA-ATCGGTTC-AA-A-TTA-AGACTATTT-AAGCAAT
191 AATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAA-CAAT
* * * * * * * *
41480 TATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTCTGTTCATACAAGC
251 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGC
** * * * * * * * *
41545 TTATTCGGATTAAACTAATACAAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAAATGTAAGA
316 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-A
* * * * * * *
41610 AAATAAA-----TTATTGAACTAGATCAAAGAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
379 AAATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * *
41670 TCATTATGACATTT-TCTTCTATCATAAAA-AA-TATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATA
444 TCATTATGACATTTGT-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATA
* * *
41732 AAATAATATTAAGTTATTAATATTATGAAAATT
507 AAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * ** * *
41765 AATAATTAAGAG-ATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGATCAAGTTTAAATAATTATG-CTTATT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATT
* * * ** * *
41828 TGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGCTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTG
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* *
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130 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAATTTA-TTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT-AA
* ** * *
41956 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAATAATTAT
191 A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * *
42020 TTATTTCAAATTGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
254 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTA
* * * **
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319 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * *
42149 TAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCA
382 TAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
42214 TTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCCTATTTGAAATAAAA
447 TTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * *
42278 TAATATTCATTGATTAATATTCCAAAAATT
510 TAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * *
42308 AA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGCTTACCAATCAAGTTGAAATATTTATGACTATA
1 AATA-AGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * **
42372 TAAATAATTATCAATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGGCTCTGTTC
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * * * *
42437 TTGCCAGCGTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAAAT
130 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-
* * * * * *
42501 TTTAGAAAATAAAACTATTTTCTTAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
193 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
42566 TTCAAATCATTATGACCATTAGTTCTGTCATAAAACCAATTGTTTCTATTCAAATAAGCTTATTT
258 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTATTC
** * **
42631 GGAAT-AAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
322 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
42695 TTGTTTACTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
387 TTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* ** * * *
42760 ATCATATAATTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATAC
452 A-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAT
* *
42825 TAATTTGTTAACATTCTAAAAATT
516 TAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * * *
42849 AATAAG-ATGA-AGA-TATAAAAAATTAATTAGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCAT
1 AATAAGTAAGAGA-ATTA-AAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
42911 TTGAACCATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGT-AAATAATTGTTTCTATT
64 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
** ** * * * *
42975 CATACAAAATTATTTACAATAAAATAACACAAATTTATTATTA-TTCAAAAATTAATAAG--AGA
129 CATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * ** * * * *
43037 TTTAAACTACTAAATCTCTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATCTA
193 TTTAAA-AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
43102 TCTCAAATCATTATAATC-TTTATTTTGTCTTAAAACATTTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC
257 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTATTC
** * * * * * * *
43166 GGAGTAAAATACTACTAAGTTAATAACATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAATGAA
322 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * ** *
43230 TGTGTTT-GTCGATCCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTTTTT
386 TTTGTTTACT-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
43294 TGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAG
450 TGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * **
43357 TACTAATTTATTAACACTAAAAAAATT
513 TATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * *
43384 AATAAGCAAG-GAATTTTAAAAAAA--AAATTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATTA
1 AATAAGTAAGAGAA--TTAAAAAAATGAATTTGTTTACC-AATCAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * * * *
43445 TTTGAAAAATTATCCATCTAAAATCATTACGACCTTTTATTTTATCACAAAACAATTGTTTCAGA
63 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* **** * * * *
43510 TCATAAAAGCTTATCCCAAATAAAATAATGTTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAC
128 TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TA-
* * * * * * * * *
43575 AGATTTAAAACATAAATCAGTTTA-TCGAATC-AGTT-AAAAAATTATAGCCATTTTAACATTTA
190 AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
* * * * *
43637 TC-ATTTTCAAATCGTTATGAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACTAG
253 TCTA-TTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCAAACAAG
* * ** * **
43700 CCTGTTCGTAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAA
315 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * *
43765 AAATAAATCTGTTTA-TCAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTG---TATT-TC-AATT---
379 AAATAAATTTGTTTACT-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * **
43821 -TC-TTATAACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAATTTATTTGGAATA
443 ATCATTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATA
* * *
43884 AAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATT
507 AAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * * *
43917 AATAACTAATAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAATG-CTATA
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATT
** * * * * * * * * *
43980 TGAACAATCCTTTATTTTAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAATAATTTTTTCAGTTC
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * ** * *
44045 TTACTAA-CATATTCAGAATAAAATAAAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAA-TAAGA
130 ATAC-AAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAA-A
* * * * * * * *
44108 GATTTAATAAAT-AATAATGTTTGCTGAACCAGTTGAAATAATTATAAGTATTTGAATAATTATC
192 -ATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
44172 TATTTAAAATCATTATGACCCTTTCTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAAATAAGATTAT
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTAT
* * * *
44237 TCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAA-A
320 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
** * * * *
44301 AGA--CATTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCAT
384 A-ATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * ** *
44364 AATGACTATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAATCTTATTCAGAATAAAGTA
448 TATGAC-ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATA
** *
44429 ATGCTAATTTATTAATATTCTAGAAATT
512 ATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * *
44457 AATAAGTAATG-GATTTAAAAAAA-GAATCTG-TTAGCCTAA-CCAGTGT-AAATAGTTATGACT
1 AATAAGTAA-GAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTA-CC-AATCAAGT-TCAAATAGTTATGACT
* * * *
44517 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-ATCCCTTTGTTTTATCATGAAACAATTGTTTCT
62 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
44581 GTTCATGCAAGCTTA-TTTGAAATAACATACTTCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-
126 GTTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATA-ATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
44644 -AGATTTAAAAAATGAATCTGTTCA-TCGAACAAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTA
189 AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
* * **
44707 TCTATTTCAAATCACTATAATATTTTGTTTTGTCATAGAAA-AATT-TATTCTATTCATAA-AAG
253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGT-TTCTATTCA-AACAAG
* * * * *
44769 CTTGTTTC-AAATAAAATAATACAAATTTGTTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAT
315 CTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-
* * * ** * *
44833 AAAAATAAATATATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTA
377 AAAAATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * *
44898 AATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAT
442 AATCATTATGAC-ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-
*
44962 TAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGATAATT
505 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTA-AAAATT
** * * * * * * *
44997 AATAAGTAA-A-ATATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAAT-AAGTCCAAATAATCATAACAAT
1 AATAAGTAAGAGA-ATTAAAAAAATGAATTTGTTTACC-AATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * *
45059 TTGAATAACTATCTACTTT-AAATCGTTATGACC-TTTGTTTCATTATAAAACAATTG-TACTAG
64 TTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-G
* * * * ** * *
45121 TACTTATAGGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGCA
127 TTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T
* * * *
45185 AAAGATTT-AAAAATGAATCTGTTTACTGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
189 AAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
* * * *
45249 TCTGTTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGCTT
253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTT
** * *
45314 ATTCTGAATAAAATAATA-TAAATTTATT-A-A-GTAGAAATT--TAA--AAAA-A--T---AAA
318 ATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
** * *
45365 TCTATTT-TTTGAC---A--TGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCCATTTCAAAT-
382 TAAATTTGTTT-ACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
45423 ATTTATGACATTTTGTTTAGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA
446 A-TTATGACA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
45488 ATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT
509 ATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * * * ** *
45519 AATATGTAAAAG-ATTTAAGAAATAAATTTGTTTACTAAGCAACCTCAAATAGTTATGACTGTTT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
45583 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTCTAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCA
66 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA
* ** * * ** * *
45648 TACAAGTTTATTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGA
131 TACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA--AAA
* * * * *
45713 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTGATATCCATTTGAACAATTATCTAT
193 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
45778 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCGTAAAATAATTTTTTTTGTTCATATAGAA--TTATT
258 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-A-ACAAGCTTATT
* * * *
45841 CAAAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTAAAATT--TAA-TAAAAGATTTAAAAACTAAA
321 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
45903 TATGTTTACTGATCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTC
386 TTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTA
* * * * * *
45967 TGATC-GTTATTTTGTCATAGAACAATT-TTT-T-TGT-ATA-AA-CTTATTTGAAATGAGATAA
450 TGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * **
46025 TACTAATTTAATAATA--AAAATAAATGT
513 TATTAATTTATTAATATTCTAA-AAAT-T
** ** * * * * * * * * * * * * *
46052 GTTTTGCCAA-ACCAGTTCAAATAATTAATACTATTAGAACAATTATTTA-TTCCAAATTGTTCT
1 AATAAG-TAAGA-GAATTAAAAAAATGAAT-TTGTT-TACCAATCA---AGTT-CAAATAGTTAT
* * ** ** * * * **
46115 AACCTTTAGTTTAGTCATAAAACAAT-TATTTCAGTTC-ATACT-AGC--TT-ATTTGGAATAAA
58 GA-C--TA-TTT-G--A-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * ** * * * **
46174 A-AAATATTAAT-TT-AT-TAA-C--A--TT-AAAAAAATTA-ATAA-GCA--AGATATTT-AAA
114 ACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAATTTATTA-ATATTTCAAA
* *** *** * * *
46224 AA--AATAAAT-CTGTTTACTGAA-CAA---G----CT---CAA----ATATA--TATGACTATT
178 AATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
* *
46269 TGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTT
243 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * *
46333 CATAA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACA-TTATTAATATTTCAAACATTATTAAGTAA
307 CA-AACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * ** * *
46396 GAGATTTAAAAACTAAAGTTGTTT-TTCGAACTAGGTCAAATAGTTACAACTATTTCAACAAATA
369 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
46460 TCAATCTCAAATCGTTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTCTAATCATACAAGCTT
433 TCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * *
46524 ATTCGG-ATAAAA-AAAATTAAGTTAATAATATT-TCAAAAATT
497 ATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * *
46565 AATAAGTAAGGGATTTAAAAAACA--AATGTGTTTGCCAAATC-AGTTCAAATGGTTA-GAACTA
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAA-ATGAATTTGTTTACC-AATCAAGTTCAAATAGTTATG-ACTA
** * * * * * *
46626 TTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTCTT-AG
63 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTG
* * *
46690 TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCA
127 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
** * * * * *
46754 AGAGATTTAAAAAAATAAATCCATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTGTGATTATTTGAACAATT
190 A-A-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
* * * * * *
46819 CTCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGATTTGTCATTAAACAATTGTTTCAATTCATAA-AAGC
252 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-AACAAGC
* * * *
46883 TTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAATATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
316 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
46948 AATAAATTAGTTTACTGAA-TAGTTC-AA-A-TTATG-GTCATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
380 AATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * *
47008 TCATTATTACCTTTCGTTTTCTCATAAAAAAATTATTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATA
444 TCATTATGACATTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAAT-
** ** * ** * ** **
47072 AAAATGTTATTTCCTTTCGTTTTGTCTATTTTTCAACCT
506 AAAATAATA-TT-AATT--TATT-AATATTCTAAAAATT
* *** * * * * *
47111 ACA-AACTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAGTAAGAAATTTA
1 A-ATAA-GTAAGAGAATTAAAA-AA-ATGAATTTGTT--TA---C--CAA-T--CAAG----TT-
* * * * * *
47175 AAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAA-ATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
47 -CAAAT--A---G-TTA-T-GACTATTTGAACA-A-TTAT--CTATTTC---AA--ATC--GTT-
* * * * * * *
47239 AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTCCATACAAGTTTATTTAGAA
91 --A-TG-----ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAA
* * * *
47304 TAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTCATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCC
148 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * * * *
47368 GTTTGCCAAACTAGTTTAAACAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAGGA
209 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * * *
47432 -CATTTGTTTTGTCATAAGACAATTATTT-TAGCTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAC
273 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
47495 TAA-TTATGAATATTTATAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATC
337 TAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACC
* * * * ** * * *
47559 ATTTCAAATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTAT
401 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTGTTTTGT
* * * * * * ** * * *
47624 GATGATACCATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
465 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
*
47689 T-TCAAAACTT
530 TCT-AAAAATT
** * * ** * ** * * * *
47699 AATAACCAAGA-AAATAAAAAAATAAATCTAATTAAAGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGATTATA
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAAT-TTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
47762 TAAACGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAACAAATT-TTTTTATT
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTT
* ** * *
47826 CATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTCA-TAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG
129 CATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
47888 ATTTGAAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAGTTCATATGGTTA-AGACTATTAT-AACAATTATC
192 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATT-TGAACAATTATC
* * * * * * * *
47951 TATTTCAAGTTATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGCTT-AAGTTCATACAAACTTA
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAAACAAGCTTA
* * * * * *
48015 -TCAGGAATAAATTAATACTAATTTATCAACATTCAAAAAATTAAAAAG-AAAGAGATTTTAAAA
319 TTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAA-AGA-TTTAAAA
* * ** * * * **
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380 AATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTC-AA
** * * * * *
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*
48205 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-AAAATT
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* * * * * * * *
48239 AATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGCTTACTGAATCAA-TTAAAATAATTATGGCCATT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTAC-CAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
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* *
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129 CATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-
* * * ** * *
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191 A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
* ** * * *
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254 CTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA-AACAAGC
* * * * * * *
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* * ** * ** * ** *
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379 AAATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * ***
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* * * *
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508 AATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * *
48762 AATAAATAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGCTC-AAT--TTAAGACTATT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTA-CCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * **
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65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* * * *
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130 ATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * *
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193 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAACAATTATCT
** * * * * * * *
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256 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCAAACAAGCTTAT
** *
49077 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTTAAAAAATA
320 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
49138 AATATGTTTA-TCGAACTAGTTC--TTA-TT-T---TAGTT-----ATTACCTATTTCAAATCAT
384 AATTTGTTTACT-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * ***
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448 TATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * *
49253 ATATACTAATTTAATAATATT-AAAAAATTT
511 A-ATATTAATTTATTAATATTCTAAAAA-TT
* * * * * * *** * *
49283 AATAACTAAAAGAATT-AAAAAATAAATCTGTTTGCTAAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTACAT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT
* * * ** *
49347 T-AACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATCATTT-TAGTC
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTT
*** * * *
49410 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAGAAATTAATAAGT--GA
129 CATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * * * ** * *
49473 TTTAGAAAGTGAATCTATTTA-TCGAATCATG-TCAAAAAATCATGGCCATTTCAACAATTATCT
193 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * ** *
49536 ATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTGA-TCATTCAAGCTTAG
256 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCAAACAAGCTTAT
* * *
49600 TCAAAATAAAATGATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAATTA
320 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * * **
49661 AA-TTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTGTT
384 AATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * * ***
49725 ATAACCTTTTTTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
449 ATGACATTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * *
49790 TACTAATCTAATAATATTCTAAAAATT
513 TATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * *
49817 AATAA-TGAAAAGAATT--AAAAATAAATTTGCTTACCAAACTAGTTCAAAAATTTAAGACTATA
1 AATAAGT-AAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-
* * * * **
49879 AT-AACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAACAAAAT-TTTCAA
64 TTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTG
** * * * *
49941 TTCATACAAGCTTATTCGGGATAAAAGAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAA
127 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
50006 GAGATTTAAAAAAATAATTTTGTTTCCCT-AACTAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
191 -A-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTT-ACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
50069 TATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGT
251 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGC
** * * * * *
50134 TTATTCGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAACTAATAAG----AGACTTAAAA
316 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * *
50195 AATAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATTATTTATTTCAA
380 AATAAATTTGTTTACT-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAA
* * * *
50258 ATCGTTATGA-ATTTTGTTTTG-CTATAAAACAATTGTTTCTGTTAATACAAGCTTA-TTCGAAT
443 ATCATTATGACA-TTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-
* * * *
50320 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATT
505 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * *
50355 AATAAGTGAA-A-ATTTCAAAAAAT-AAGTATGTTTACCAAACTAGATCAATTAGTCATGACTAT
1 AATAAGT-AAGAGAATTAAAAAAATGAA-TTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
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64 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* * * * * * ** *
50482 CATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACCAACTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAG
129 CATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-
* * * * * * * * *
50546 AGATTTAAAAAAATGAATTTGTTT-TTCGGACAAGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTA
191 A-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * * *
50610 TTTATTTGAAATCACTATAACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTCTTTTTTGTTCATACAAGCT
253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCAAACAAGCT
** * *
50675 TATTTTGAAA-GAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAA
317 TA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * ** * * *
50737 AAAATAAATCTGTTTA-TCGAACCAAG-TCAAATCCTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTG
378 AAAATAAATTTGTTTACT-AAACC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * ** *
50800 AAATTTTTATAAC-TTTTTTTTGCCATAAAATAATTATTT-TCATTTGTACAAGGTTATTT-GAA
441 AAATCATTATGACATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAA
* * *
50862 TTAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTTTGGACAATT
505 -TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * *
50898 AATAAGT-GGACG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAT-AAGTTGAAATAGTCATGAC-AT
1 AATAAGTAAGA-GAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACC-AATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * ** *
50959 TTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATAAACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTACTTCAGT
64 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* * ** * *
51023 TCAAATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGAAA
128 TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
51087 GAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACT-AAC-CG-T---GT--TTATGACTATCTAAACAATTAT
191 -A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * **
51144 CTATTTTCAAA-CATTATGACATTTCGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTTTCTTCATGCAAGCTT
254 CTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTT
** * * *
51208 ATTCTGAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATAAGTAAAA-ATTTTAAAA
318 ATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* ** * * **
51270 ATAAATGTG-TT-CTTGA-CACTTTCAAATAGTGACAACTATTT-AACAATTATCTATTTCAAAT
381 ATAAATTTGTTTACTAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
*** * * * ** *
51331 TGCTATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATCCGAAATAAA
445 CATTATGAC-ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
* * *
51396 ATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATT
509 ATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * *
51427 AATAAGTAA-A-ATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAGT-GAGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 AATAAGTAAGAGA-ATTAAAAAAATGAATTTGTTTACC-AATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * ** * * *
51489 TTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTGTCAAACAATTGCTTCTATT
64 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* * *
51554 CATACAAGC-TACTTCGAAATAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG
129 CATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
51615 ATTTAAAAATTAAATCCGTTTATTGAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATAT
192 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT
* ** * * * * * * * * *
51679 ACTTCAAATTTTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTGCTGTTCATAGAAGCTTATT
256 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTATT
* * * * * * * *
51744 AAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAGAAATTAAT-AGCGAAGAGAATT-AAAAGTA
321 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
51807 AATTTGTTTACCAAACTAGTTTAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAAT-G
384 AATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTC-AAATCA
* * * * * * * *
51870 TTATGACTTTTTCTTTTATCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCGGGATAAAA
447 TTATGAC-ATTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* *
51934 TAAAATGAATTTATTAATATT-TCAAAAATT
510 TAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * *
51964 AGTAAGT-A-AGATTTAAAAAAAT-AATTTTGTTTCCCCAACCAA-TTCAAATAATTATGATTAT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAA-TTTGTTT-ACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
52025 TTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATGTTTTTGTT
64 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
** * * * * * *
52090 CATTTAAGTTTATTTAGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATACTTT-GAAAATTAATAAG--AG
129 CATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
52152 ACTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-ATCAAATTATT
192 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-AATTATC
* * * *
52215 TATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTCTG-CTATAAAACGATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTA
* * * *
52278 TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTGAAAA-ATTCAAAAAA
319 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAA
* ** * * * * * * * **
52342 TAAATATGTTTACCGAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAA-TATTTATTTCAAATTG
382 TAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * ***
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447 TTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* ** ** * *
52470 TAGTACCAATTTATCGATATTTTGAAAATT
510 TAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * *
52500 AATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTATTTTCCAGA-CAAGTTTAAATAATTATGACAATT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCA-ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * ** * * * * * * * *
52564 TAAACAATTATTTATTTGAAATCACTATAACTTTTTCTTTTATCATAAAATAGTTCTTTTTGTTC
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
* *
52629 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATCTAAATTTATTAATA-TT-AAGTCAATTAATAAGTAAA
130 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAA--AAATTAATAAGT-AA
** * * *
52692 ATATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACCAAG-TCAAATTCTTATGATTATTTGAATAATTA
191 A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
* * ** * * * * * * *** *
52755 TTTATTTGAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGCCATAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGGTT
253 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTT
** * * * * * * ** *
52820 ATT-GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGACAATTAATAAATGGACGATTTAAAAAA
318 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * * * * * * *
52884 TAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTGAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTAACTATTTCATATT
382 TAAATTTGTTTACT-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * **
52948 GTTATAACCCTTTGTTTTGTAATGAAACAATTGTTTC-ATTTCAAATAAGTTTATTTAAAATAAA
446 ATTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
* *
53012 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
509 ATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * *
53043 AATGAG-AAGGAGAATT-AAAAAATGAATCTGTTTACCAA-CCA-TT----T--TTTTAACTATC
1 AATAAGTAA-GAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
53098 TAAACAATTATCTATTTTCAAA-CATTACGACCTTTCGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTT
65 TGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* *
53162 CATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA
129 CATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAA
* * * ** *
53227 ATTTTAAAAATAAAT-TTTTGTTCTTG-ACACTTTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATC
192 ATTTAAAAAATAAATCTGTT-TAC-TGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
*** ** * * * *
53289 TATTTCAAATTGCTATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTCTCTGTTCATAA-AAGTTTA
255 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-AACAAGCTTA
** * * **
53353 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAAT
319 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* * ** * * * *
53418 AAATCTATTTACCT-AATGAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCA
383 AAATTTGTTTA-CTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
53482 TTATGATCTTTTGTTTTCTCGTAAAA-AATTGCTTCTATTCATACAAGCTTAGTTGAAATAAAAT
447 TTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
*
53546 AATACTAATTTA-TAATATT-TCAAAAA-T
511 AATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT
* * * * * ** * *
53573 --TAA-TAAGAG-ATTTAAAAATTAAATCTATTTATTGAA-CCAGTTCAAATGGTTATGACTATT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTA-CCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * * *
53633 TGAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCGTAAAACAATTATTTAC-ATT
65 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTGTT
* * *** * * * *
53697 CATAGAAGTTTATTCAAAATAAAATCATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAA-CAAA
129 CATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* * ** * * *
53760 GTGAATT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATATTTA-AGACTATAAT-AACAATT
192 ---ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT-TTGAACAATT
* * * * * * *
53822 ATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTCTTTTATCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAG
252 ATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCAAACAAG
* * * *
53885 CTTATTCAGGAA-AAAATAAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
315 CTTATTCA-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-
* * ** * * * *
53949 AAAAAAGTAAGTTTGTTTCCCCAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTT
376 AAAAAA-TAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* *** * * * * * * *
54014 TAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTATTCGAA
440 CAAATCATTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA
* * * * * *
54079 ATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAACT
504 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * * * * *
54115 AAT--G--AGAGACTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCACTTCAAATAGTTATAACTGTTT
1 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
54175 -AACAAATTAT-TCATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTCTG-CTATAAAAAAAATATTTCTAT
66 GAAC-AATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTGT
** ** *
54236 TCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTGA
128 TCATACAAGCTTATTTTGAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A
* * * * * * * * *
54300 AAATTTCAAAAAATAAATATATTTACTGAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAATTAT
190 AAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * * *
54365 TTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGTTT
254 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAAACAAGCTT
* * * * * * *
54429 ATTCGAAATTAAATAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA
318 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA
* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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*
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* * * * * * **
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1 AATAAGTAAGAGA-ATTAAAAAAATGAATTTGTTTA-CCAATCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
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** * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* *
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** * * ** ** *
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* * * * ** * * * *
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* *
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* *** * *
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* * * * * * *
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* * ***
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* *** * * * * * * *
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* * * * ** **
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*
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** * * ** * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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*
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* * * * **
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** ***
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* * * * *
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* * *** * * * * * *
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** * * * * * *
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TATTAATATTCTAAAAATT
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*
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* **
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Found at i:46405 original size:182 final size:179
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** * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** *
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* ** *
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* * * * * * *
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*
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* * * * *
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* * **** * * * * **
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* * *** *** * *
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* * * * * * * * *** *
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* ** ** * * ** * * * ** *
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** * *
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* **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * ** * *
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* ** * * * ** ** *
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* * * * * ** * * *
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* * *
47805 CATAAAACAAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTCA-TAAT
65 CATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAAT
* *
47868 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTATTGAACT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACT
* * * * * * * *
47917 AGTTCATATGGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAGTTATTCTGACCTTTTGTTTAG
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
47981 TCATAAAACAATTGCTTAAGTTCATACAAACTTA-TCAGGAATAAATTAATACTAATTTATCAAC
64 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
48045 A-TTCAAAAAATTAAAAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
128 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * ** ** *
48099 AGTTCAAATAGTAAT-TCTTATTTGAACAGCTATCTA-TTCAAAATTGTTATGACCTTTTTTTTT
1 AGTTCAAATA-TTATGAC-TATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * *
48162 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACTAGCTTATAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
63 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *
48226 TATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACTGAA-T
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACT
* * * * ** * * ** *
48279 CAATTAAAATAATTATGGCCATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATGACCTTCTGTTTTG
1 -AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* *
48344 TTATAAAACAATTAGTTTT-GATCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
48407 TATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACT
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACT
** * * * ** *
48461 AGTTTGAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTGTTTTG
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
48524 TCATAAAA-TA-TGTTTTTGATCATAAAAGCTTATTC-GATTAAAAATAATAATAATTGAATAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** *
48586 ATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTCAAAAATAAATATGCTTGTTAAACT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
** * * * * *
48635 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATTATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTT-TTTAGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
48699 CAT--AA-AA------TA--TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTGAATATATTAACA
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* *
48752 -TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA-TTGTTTACT-GAACT
* * ** * * * * *
48804 AGCTC-AAT-TTAAGACTATTTGAGCAATTGTATATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGCC
1 AGTTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
48867 ACAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATAATAATTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
48931 TTTAAAAATTAATAAGT--GA-A-TTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATT
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * ** * * * *
48978 AATTCAAATAATTATGA-TAATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACGAACATTTGTTTTA
1 AGTTCAAAT-ATTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* *** *
49042 TCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*
49106 ATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACT
* * * * *
49155 AGTTC------T-T-A-T-TTT-AGTTATTACCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTC
1 AGTTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
49209 ATAAAATAATAGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA-ATATACTAATTTAATAATA-
66 ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
49272 TTAAAAAATTTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAAGT
130 TTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * **
49324 AGTTCAAATAGTTAAGACTACATT-AACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATA-TTATGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * *
49388 TCATCAAACAATCATTTTAGTCCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
49453 TTTCAGAAATTAATAAGT----GATTTAGAAAGTGAATCTATTTA-TCGAA-T
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACT
* * * * * * * * *
49500 CA-TGTCAAAAAATCATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTG
1 -AGT-TC-AAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
49564 GTCATATAACAAATGTTTTTGATCATTCAAGCTTAGTCAAAATAAAATGATACTAATTTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
49629 CTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATTGTTTATTGAACT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACTGAACT
* * * ** * *
49677 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTCTA
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TG
* * * * * *
49741 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * **
49806 -TTCTAAAAATTAATAA-TGAAAAGAATT-AAAAATAAATTTGCTTACCAAACT
129 TTTC-AAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACT
* * * * *
49857 AGTTCAAAAATTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
49920 ATCGTAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCGGGATAAAAGAA-AATGAATTTATTA
63 GTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * *
49983 ATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAATTTTGTTTCCCT-AACT
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA-ATTGTTT-ACTGAACT
* * * *
50039 AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
50104 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
50169 TT-TGAAA--ACTAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACC
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACT
* * * * *
50216 AGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-ATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
*
50279 -CTATAAAACAATTGTTTCT-GTTAATACAAGCTTATTC-GAATTAAAATAATACTAATTTATTA
64 TC-ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTA
** * * **
50341 ATATTTTGATAATTAATAAGTGAA-A-ATTTCAAAAAATAAGTATGTTTACCAAACT
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * ** *
50396 AGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
50461 CATAAAATAATTGCTTCAGTTCATATAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACCAACTTATCAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * *
50525 TTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTGTTT-TTCGGACA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATTGTTTACT-GAACT
* * * * * * * * * *
50578 AGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTTATTTGAAATCACTATAACTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * **
50643 CATAAAACAATTCTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAA-AGAAATAATA-TAAATTTATTAA
65 CATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACT-AATTTATTAA
* * *
50706 TA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACCA
127 TATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAA-CT
* * * ** * *
50761 AG-TCAAATCCTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTTTTAT-AACTTTT-TTTTGC
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * *
50823 CATAAAATAATTATTTTCA-TTTGTACAAGGTTATT-TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
65 CATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * *
50886 TTTTGGACAATTAATAAGT-GGACGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-T
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * *
50938 AAGTTGAAATAGTCATGAC-ATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATAAACC-TTTGTTTT
1 -AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTT
* ** * * * * *
51001 GTAATAAAACAATTACTTCAGTTCAAATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
51066 A-TTCTAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACT-AAC-
128 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * * *
51117 CG-T---GT-TTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTTCAAA-CATTATGACATTTCGTTTTGT
1 AGTTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
51176 CAAAAAATAATTGTTTTTCTTCATGCAAGCTTATTCTGAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * *
51239 TTCCAAAAAATAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAA-TGTGTT-CTTGACACT
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTGT-TTAC-TGA-ACT
* ** * *** **
51290 --TTCAAATAGTGACAACTATTT-AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACAATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
51352 CATAAACCAATTGTTTCT-GTTCATAAAAGCTTA-TCCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
65 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
51415 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCT--AGT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTA-CTGAACT
* *
51467 GAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * *
51532 TTGTCAAACAATTGCTTCTA-TTCATACAAGC-TACTTC-GAAATAAAATAATACTAATTTA-TA
64 TCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
51593 ATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCCGTTTATTGAACC
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * ** * * *
51644 AATTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTTTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
51709 CATAAAATAATTATTGCT-GTTCATAGAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
65 CATAAAACAATTGTT-TTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * **
51773 -TTCTAGAAATTAAT-AGCGAAGAGAATT-AAAAGTAAATTTGTTTACCAAACT
129 TTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACT
* * * * * * *
51824 AGTTTAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACTTTTTCTTTT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
51887 ATCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCGGGATAAAATAA-AATGAATTTATTA
63 GTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * ** *
51950 ATATTTCAAAAATTAGTAAGT-A-AGATTTAAAAAAATAATTTTGTTTCCCCAACC
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA-ATTGTTTACTGAACT
* * * * * *
52004 AATTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * * *
52069 CACAAAACAAATGTTTTTGTTCATTTAAGTTTATTTAGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATAC
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * *
52134 TTT-GAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACC
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACT
* * *
52181 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ATCAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTCT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAAT--AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
*
52243 G-CTATAAAACGATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATT
63 GTC-ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATT
** * * * *
52305 AATATTTTGACAATTAATAAGTGAA-AAATTCAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT
125 AATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * ** *
52361 AGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAA-TATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * **
52425 CATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAGTACCAATTTATCGATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
52490 TTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTATTTTC-CAGACA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATTGTTTACTGA-ACT
* * * * * * * * * * *
52542 AGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTTATTTGAAATCACTATAACTTTTTCTTTTAT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * **
52607 CATAAAATAGTTCTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * *
52671 -TT-AAGTCAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACCA
129 TTTCAA--AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAA-CT
* * * * ** * * *
52724 AG-TCAAATTCTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGC
1 AGTTCAAA-TATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * * *
52788 CATAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGGTTATT-GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTT
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
52852 TTTGACAATTAATAAAT-GGACGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACT
* * * * * ** * *
52903 AGTTGAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTAACTATTTCATATTGTTATAACCCTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
52968 AATGAAACAATTGTTTCATTTCAAATAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
53033 TTTAAAAATTAATGAG-AAGGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTAC-CAACC
130 TTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * * *
53083 A-TT----T-TTTTAACTATCTAAACAATTATCTATTTTCAAA-CATTACGACCTTTCGTTTTGT
1 AGTTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * **
53141 CATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
53205 TTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTTTGTTCTTGACACT
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTGTT-TAC-TGA-ACT
* *** **
53258 --TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACAATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
53320 CATAAACCAATTGTCTCT-GTTCATAAAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A
65 CATAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** *
53383 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATCTATTTACCT-AA-T
129 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTA-CTGAACT
* * * *
53435 GAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTC
1 -AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
53500 TCGTAAAA-AATTGCTTCTA-TTCATACAAGCTTAGTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA-TAA
64 TCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
53561 TATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTGAACC
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * ** * * *
53611 AGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
53676 CGTAAAACAATT-ATTTACATTCATAGAAGTTTATTCAAAATAAAATCATACTAATCTAATAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * **
53740 -TTCTAAAAATTAATAACAAAGTGAATT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACT
129 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACT
* * * * *
53791 AGTTCAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTCTTTT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
53854 ATCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGGAA-AAAATAAAAATGAATTTATT
63 GTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * ** *
53917 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAGTAAGTTTGTTTCCCCAACC
125 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAA-TAA-ATTGTTTACTGAACT
* * * * * ***
53975 AATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTTAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
54040 CATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTATTC-GAAATAAAGTAATACTAATCTATTAAT
65 CATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * *
54103 ATTTTGAAAACTAAT--G--AGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACC
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACT
* * * * *
54152 ACTTCAAATAGTTATAACTGTTT-AACAAATTAT-TCATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTCT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAA-TAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * *
54214 G-CTATAAAAAAAATATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATT
63 GTC-ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATT
** * *
54276 AATATTTTGACAATTAATAAGTGAA-A-ATTTCAAAAAATAAATATATTTACTGAACT
125 AATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * ** *
54332 AGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
54397 CATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTC-GAAATTAAATAATACCAATTTATCAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * *
54461 TTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTGTTTTC-CAGACA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATTGTTTACTGA-ACT
* * * * * * * * * *
54514 AGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTTATTTGAAATCACTATAACTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * **
54579 CATAAAATAATTCTTTTTGTTCATACAAGCTT-TTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
54642 -TT-AAGACAATTACTAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAACCA
129 TTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAA-CT
* * * ** * * *
54695 AG-TCAAATTCTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGC
1 AGTTCAAA-TATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * *
54759 CATAAAATAATGGCTTTT-GTTTGTACAAGGTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT-
65 CATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * *
54822 TTTTGACAATTAATAAAT-AGATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * * * *
54874 AGTTGAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTAACTATTTCATATCGTTATAACCCTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
54939 AATGAAACAATTGTTTCATTTCAAATAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
55004 TTTAAAAATTAATGAG-AAGGAGAATTAAAAAATGAATCTATTTAC-CAACC
130 TTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
* * * * * *
55054 A-TT----T-TTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTTAAAACATTACGACCTTTTGTTTTGTC
1 AGTTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* **
55113 ATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
66 ATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* *
55176 TTTCAAAAAATAATAAGATAA-A-ATTTTAAAAATAAATCTGTGTT-CTTGACACT
129 TTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGT-TTAC-TGA-ACT
* * *** ** *
55229 --TTCAAATAGTTATAACTATTT-AACT-ATTATCTATTTTAAATTGCTATGACAATTTGCTTTG
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** *
55290 TTATAAACCAATTGTTTCCGTTCATAAAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
55354 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCT--AGT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTA-CTGAACT
* * * *
55406 GAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTCTTTGAAATAATTATGATCC-TTTGTTTT
1 -AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * *
55470 GTCGTAAAACAATTGCTTCTA-TTCATACAAGCTTAGTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA-TA
63 GTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
** * * * *
55532 ATA--TC----A-TAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGGACA
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACTGAACT
* * * * * *
55579 AGTTCAAATAGTCATG-TTGATTTAAACT-ATTATCCATTTTAAATCATTATGACATTTTG-TTT
1 AGTTCAAATA-TTATGACT-ATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * **
55641 CTCGTAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATATAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
63 GTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
55705 TATTT-AAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTATCT-AACT
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTA-CTGAACT
* * * ** *
55755 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATTATG-TTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * * *
55819 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATAGATGCTTATTTGGAGTAAAATATTACTAAATTAGTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** *
55884 AAT-AAAAATTTATAAGTAGGAGATTTAAACAATAAATGTGTTTGTTAAACT
130 -TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACT
** * * * ** * * *
55935 AGTTCAAATAGTT-TAGACTATTAAAACT-ATTATTTGTTTGAAATTGTTCTCACCTTTTGTTTA
1 AGTTCAAATA-TTAT-GACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
55998 GTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACATGCTTATTCCA-AA-AAAATAAATTACCAATATATT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAAT-AA-TACTAATTTATT
** * * * *
56061 AGCA-TTCAAAAAATTAATGAG-CAGA-ATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGATAC-
125 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGA-ACT
* * * * *
56115 AGATCAAATAGTTATAACCATTTGAA-CATTAAATCT-TTT--TAT-A-TATG-CC-TTTG-TTT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATT--ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
56171 ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
56232 AAGTTAGAGA
Statistics
Matches: 7707, Mismatches: 1677, Indels: 1212
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AGTTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACTGAACT
Found at i:46573 original size:178 final size:180
Alignment explanation
Indices: 46040--46976 Score: 665
Period size: 182 Copynumber: 5.2 Consensus size: 180
46030 ATTTAATAAT
* * * * *
46040 AAAAATAAATGTGTTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTA-ATACTA-TTAGAACAATTATTTATT
1 AAAAATAAAT-TGTTTT-TCGAACTAGTTCAAATAGTTACA-ACTATTTA-AACAATTATCTATT
* * * * * * * * * *
46103 CCAAATTGTT-CTAACCTTTAGTTTAGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACTAGCTTATTT
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* * * ** * *
46166 GGAATAAAAAAATATTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGCAAGATATTTAA
125 GG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * ** * *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTTTC-GAACTAGTTCAAATAGT-TACAACTATTTAAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * *
46286 AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCCAA
63 CAAATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTATTC-G
* * *
46350 AATAAAATAATACTACA-TTATTAATATTTCAAACATTATTAAGTAAGAGATTT-A
126 GATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
46404 AAAACTAAAGTTGTTTTTCGAACTAGGTCAAATAGTTACAACTATTTCAACAAATATCAATCTCA
1 AAAAATAAA-TTGTTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACAATTATCTATTTCA
* *
46469 AATCGTTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCGGATA
65 AATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCGGATA
* * * * *
46533 AAA-AAAATTAAGTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGGGATTT-A
130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
46582 AAAAACAAA-TGTGTTTGCCAAATCAGTTCAAATGGTTAGAACTATTAAAATAATTATCTATTTC
1 AAAAATAAATTGT-TTTTCGAACT-AGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
46646 AAATCGTT-CTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTCT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGG
64 AAATCGTTACGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTATTCGG
* *
46709 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAA
127 -ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
** *** * * * *
46764 AAAAATAAATCCATTTATT-GAACTAGTTCAAATAGTTGTGATTATTTGAACAATTCTCTATTTA
1 AAAAATAAAT-TGTTT-TTCGAACTAGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * **
46828 AAATCATTATGAACTTTTGATTTGTCATTAAACAATTGTTTC-AATTCATAAAAGCTTATCCAAA
64 AAATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTAA-TCATACAAGCTTATTC-GG
* *
46892 ATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAATATTAATAAGTAAGAGATTT-A
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
*
46945 AAAAATAAATTAG-TTTACTGAA-TAGTTCAAAT
1 AAAAATAAATT-GTTTTTC-GAACTAGTTCAAAT
46977 TATGGTCATT
Statistics
Matches: 591, Mismatches: 130, Indels: 69
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
176 3 0.01
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184 2 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.09, T:0.37
Consensus pattern (180 bp):
AAAAATAAATTGTTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA
ATCGTTACGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCGGATAA
AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
Found at i:47620 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 47125--56231 Score: 6055
Period size: 180 Copynumber: 51.1 Consensus size: 180
47115 ACTTATTTGA
* * * *
47125 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * *
47186 TGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * * * * *
47251 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTCCATACAAGTTTATTTAG
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
47302 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTCATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
47367 CGTTTGCCAAACTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAGGA
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * * *
47432 -CATTTGTTTTGTCATAAGACAATTATTTTAGCTCATACAAGTTTATTCAG
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* *
47482 AATAAAATAATACTAA-TTATGAATATTTATAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
47546 TATTTACCAAA-TCATTTCAAATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
65 TGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * * ** *
47610 ACCTTTTGTTTTATGATGATACCATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATT-TG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * ** * * *
47661 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATAAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * * * * **
47726 CTAATTA-AAGAACCAATTCAAATAGTTAAGATTATATAAACGATTATCAATTTCAAATCATTAT
64 CTGTTTACCA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * *
47790 GACCTTTTATTTTGCCATAAAACAAATTTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTCAG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* *
47843 AATAAAATAATACAAATTTCA-TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* *** * * * * * *
47903 TTGTTTATTGAACTAGTTCATATGGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAGTTATTCT
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * *
47967 GACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGCTTAAGTTCATACAAACTTA-TCAGG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-G
* * * * * *
48020 AATAAATTAATACTAATTTATCAACATTCAAAAAATTAAAAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT
* * * * * **
48085 CTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTAAT-TCTTATTTGAACAGCTATCTA-TTCAAAATTGTTA
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTA
* * * *
48148 TGACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACTAGCTTATAT-GG
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TCAG
* *
48202 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * ** * *
48267 TGCTTACTGAA-TCAATTAAAATAATTATGGCCATTCAAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATG
65 TGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * *
48331 ACCTTCTGTTTTGTTATAAAACAATTAGTTTT-GATCATACAAGCTTATTC-G
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
*
48382 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * *
48447 CTATTTATCAAACTAGTTTGAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAATTGTTAT
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTGTTAT
* * * * *
48511 GATC-TTTGTTTTGTCATAAAA-TA-TGTTTTTGATCATAAAAGCTTATTC-G
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * * *
48560 ATTAAAAATAATAATAATTGAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTCAAAAATAAAT
1 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * *** ** * ** * ** *
48621 ATGCTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATTATTATCTACTTCAAATCATTCTG
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* *
48686 ACCTTTT-TTTAGTCAT--AA-AA------TA--TCATACAAGCTTATTCAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
48726 AATAAAATAAT-CTGAATATATTAACATTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTGAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * **
48790 TTGTTTATCGAACAAGCTC-AAT--TTAAGACTATTTGAGCAATTGTATATTTAAAATCATTATG
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * *
48852 ACATTTTGTTTTGCCACAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTC-G
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
48903 AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT--GA-A-TTAAAAAGTGAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * *
48964 CTATTTACTGAATTAATTCAAATAATTATGA-TAATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAC
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * *** *
49028 GAACATTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATT-TG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
*
49080 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * ** *
49141 ATGTTTATCGAACTAGTTC--TTA-TT-T---TAGTT-----ATTACCTATTTCAAATCATTATA
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * *
49194 ACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATAGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * *
49246 AATAAAA-ATATACTAATTTAATAATATTAAAAAATTTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTTAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
49310 CTGTTTGCTAAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATT-AACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* ** * *
49374 GACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATCATTTTAGTCCATACAAGCTTATTCAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * *
49427 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAGAAATTAATAAGT----GATTTAGAAAGTGAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * *
49488 TATTTATCGAA-TCA-TGTCAAAAAATCATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
65 TGTTTACCAAACT-AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * * * *
49551 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTGATCATTCAAGCTTAGTCAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
49604 AATAAAATGATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAAT-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
*** * * * *
49664 TGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAA
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * * *
49729 CCTTTT-TTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAGAAGCTTATTCAA
130 CCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
49780 AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-TGAAAAGAATT-AAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
49843 TTGCTTACCAAACTAGTTCAAAAATTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAATGTTAT
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * *
49907 GACCTTTTGTTTTATCGTAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCGG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * *
49960 GATAAAAGAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * *
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63 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * *
50089 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * ** * *
50142 AATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTTGAAA--ACTAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATCT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
50204 ATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
66 GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* *
50268 -ATTTTGTTTTG-CTATAAAACAATTGTTTCT-GTTAATACAAGCTTATTC-G
130 CCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* *
50317 AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTGAA-A-ATTTCAAAAAATAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATAA
* * * * * * * *
50380 GTATGTTTACCAAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTA
62 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * *
50445 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAGTTCATATAAGTTTATTC-G
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * * *
50498 AAATAAAATAATACCAACTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* ** ** * * * * * * * ***
50563 TTTGTTTTTCGGACAAGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTTATTTGAAATCACTAT
63 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * **
50628 AACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTCTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* *
50682 AA-AGAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAA
1 AATA-AAATAATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * ** * * * *
50744 ATCTGTTTATCGAACCAAG-TCAAATCCTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTTTT
62 ATCTGTTTA-CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * ** * *
50808 AT-AACTTTT-TTTTGCCATAAAATAATTATTTTCA-TTTGTACAAGGTTATT-TG
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * *
50860 AATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTGGACAATTAATAAGT-GGACGATTTAAAAAATAAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAA
* * * * * * **
50924 TATGTTTACCGAA-TAAGTTGAAATAGTCATGAC-ATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTA
63 TCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * ** * * * * *
50987 TAAACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTACTTCAGTTCAAATAAGCTTATTTAA
127 T-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
51041 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATGAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * **
51106 TGTTTA-CTAAC-CG-T---GT--TTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTTCAAA-CATTATG
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATG
* * * * ** * *
51162 ACATTTCGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTTTCTTCATGCAAGCTTATTCTG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
51214 AA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * ** *
51276 GTGTTCT-TGACACT--TTCAAATAGTGACAACTATTT-AACAATTATCTATTTCAAATTGCTAT
64 CTGTT-TACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
** * * *
51337 GACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-GTTCATAAAAGCTTA-TCCG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
51389 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * **
51454 CTATTTACC-TAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTAT
64 CTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* ** * *
51518 GATCTTTTGTTTTGTTGTCAAACAATTGCTTCTA-TTCATACAAGC-TACTTC-G
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAG
*
51570 AAATAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* *** * * * * * * * *
51630 CCGTTTATTGAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTTTTATA
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * * *
51695 ACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTGCT-GTTCATAGAAGCTTATTAAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * * *
51747 AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAGAAATTAAT-AGCGAAGAGAATT-AAAAGTAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
51810 TTGTTTACCAAACTAGTTTAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAATGTTAT
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * * *
51874 GACTTTTTCTTTTATCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCGG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
51927 GATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGT-A-AGATTTAAAAAAATAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * * * *
51989 TTTGTTTCCCCAACCAATTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTAT
63 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * ** * *
52054 GACTTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATGTTTTTGTTCATTTAAGTTTATTTAG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
52107 AATAAAGTAATACTAATCTATTAATACTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
52168 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-ATCAAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* *
52232 A-CTTTTGTTCTG-CTATAAAACGATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-
129 ACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
52282 AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTGAA-AAATTCAAAAAATAAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
52346 TATGTTTACCGAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAA-TATTTATTTCAAATTGTTAT
63 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * *
52410 GATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTCAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * ** * * *
52463 AATAAAATAGTACCAATTTATCGATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * * *** *
52528 TTATTTTCCAGACAAGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTTATTTGAAATCACTATA
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * * **
52593 ACTTTTTCTTTTATCATAAAATAGTTCTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
52645 AATAAAATAAT-CTAAATTTATTAATA-TTAAGTCAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAA--AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * * *
52708 TCTGTTTATCGAACCAAG-TCAAATTCTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTGTTA
63 TCTGTTTA-CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * ** * *
52772 TAACTTTTTGTTTTGCCATAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGGTTATT-GG
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * * * *
52825 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGACAATTAATAAAT-GGACGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
52889 ATGTTTATCAAACAAGTTGAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTAACTATTTCATATTGTTATA
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * * * * *
52954 ACCCTTTGTTTTGTAATGAAACAATTGTTTCATTTCAAATAAGTTTATTTAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
53006 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAG-AAGGAGAATTAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** *
53070 CTGTTTACC-AACCA-TT----T--TTTTAACTATCTAAACAATTATCTATTTTCAAA-CATTAC
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTAT
* * * * **
53126 GACCTTTCGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
53179 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-
* ** * *
53242 TTTTGTTCT-TGACACT--TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATCTATTTCAAATTGCT
63 -TCTGTT-TACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
** * * * * *
53303 ATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTCTCT-GTTCATAAAAGTTTATTCGG
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * **
53358 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * **
53423 TATTTACCTAA-TGAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG
65 TGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * *
53487 ATCTTTTGTTTTCTCGTAAAA-AATTGCTTCTA-TTCATACAAGCTTAGTTGA-
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAG
*
53538 AATAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* *** * * * * * *
53598 TATTTATTGAACCAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAA
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * * * * * *
53663 CCTTTTGTTCTATCGTAAAACAATT-ATTTACATTCATAGAAGTTTATTCAA
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * ** * * *
53714 AATAAAATCATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGTGAATT-AAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * *
53778 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATTATCTATTTCAAAATGTTATG
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * *
53842 ACCTTTTCTTTTATCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-G
* *
53895 AA-AAAATAAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAGTAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAA-TAA
* * * * * * * * * * *
53959 GTTTGTTTCCCCAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTTAAATTGCTA
62 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * *
54024 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTATTC-G
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * *
54077 AAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAACTAAT--G--AGAGACTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * **
54138 CTATTTATCAAACCACTTCAAATAGTTATAACTGTTT-AACAAATTAT-TCATTTCAAATCATTA
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCT-ATTTCAAATTGTTA
* * * *
54201 TGA-CTTTTGTTCTG-CTATAAAAAAAATATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-
127 TGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* *
54253 AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTGAA-A-ATTTCAAAAAATAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATAA
* * ** * * * * * *
54316 ATATATTTACTGAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTA
62 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * *
54381 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTC-G
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * * *
54434 AAATTAAATAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * * * * * ***
54499 TTTGTTTTCCAGACAAGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTTATTTGAAATCACTAT
63 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * **
54564 AACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTCTTTTTGTTCATACAAGCTT-TTTTG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
54616 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTACTAAGTAAAACATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * *
54679 TCTGTTTATCAAACCAAG-TCAAATTCTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTGTTA
63 TCTGTTTACCAAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * ** * *
54743 TAACTTTTTGTTTTGCCATAAAATAATGGCTTTT-GTTTGTACAAGGTTATTTAG
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * * * *
54797 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTGACAATTAATAAAT-AGATGATTTAAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * *
54861 TGTTTACTAAACAAGTTGAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTAACTATTTCATATCGTTATAA
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * * * * * * * *
54926 CCCTTTGTTTTGTAATGAAACAATTGTTTCATTTCAAATAAGTTTATTTAA
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
54977 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAG-AAGGAGAATTAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *** *
55041 CTATTTACC-AACCA-TT----T--TTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTTAAAACATTACG
64 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* **
55098 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* *
55150 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGATAA-A-ATTTTAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
55212 TCTGTGTT-CTTGACACT--TTCAAATAGTTATAACTATTT-AACTATTATCTATTTTAAATTGC
63 TCTGT-TTAC--CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
** * * * ** *
55273 TATGACAATTTGCTTTGTTATAAACCAATTGTTTCCGTTCATAAAAGCTTATTC-G
125 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
*
55328 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * **
55393 CTATTTACC-TAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTCTTTGAAATAATTAT
64 CTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * *
55457 GATCC-TTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGCTTCTA-TTCATACAAGCTTAGTTGA-
128 GA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAG
* ** *
55510 AATAAAATAATACTAATTTA-TAATA--T---CA-TAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * * * * * **
55567 GTTCACCGGACAAGTTCAAATAGTCATG-TTGATTTAAACTATTATCCATTTTAAATCATTATGA
66 GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
* * * * * **
55631 CATTTTG-TTTCTCGTAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATATAAAATTATTCAG
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * *
55681 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * ** *
55743 ATTTATCTAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATTATG-T
66 GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
* * * * * * **
55807 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAGATGCTTATTTGG
131 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* * * * * * * * *
55857 AGTAAAATATTACTAAATTAGTAATATAATAAAAATTTATAAGTAGGAGATTTAAACAATAAATG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
*** ** * * * * * *
55922 TGTTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTT-TAGACTATTAAAACTATTATTTGTTTGAAATTGTTCTC
65 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * *
55986 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACATGCTTATTCCA-
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-CAG
* * ** * * * *
56038 AA-AAAATAAATTACCAATATATTAGCATTCAAAAAATTAATGAG-CAGA-ATTAAAAAAATAAA
1 AATAAAAT-AA-TACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
56100 TCTGTTTACCGATAC-AGATCAAATAGTTATAACCATTTGAAC-ATTAAATCT-TTT--TA-T-A
63 TCTGTTTACC-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT--ATCTATTTCAAATTGT
* * * *
56158 TATG-CC-TTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCTG
125 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
* *
56210 AAATAAAATAATATTACTTTAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTAT
56232 AAGTTAGAGA
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AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAG
Found at i:47719 original size:952 final size:953
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46149 TTCATACTAG
*
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1 CTTATTTGAAATAAAAAAATATTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAG-AAGATATTTAAA
* * *
46224 AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGCTCAAATATATATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA
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* * * * *
46289 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATA
130 ATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTAGTCCATAAAAACTTATCCAAAATA
* * * * *
46354 AAATAATACTACATTATTAATATTTCAAACATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAGTTGTT
195 AAATAATACTACATTAATAATATTTCAAAAATTATTAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAGTCGTT
** * * *
46419 TTTCGAACTAGGTCAAATAGTTACAACTATTTCAACAAATATCAATCTCAAATCGTTACGATCTT
260 TGCCAAACTAGGTCAAACAGTTACAACTATATCAACAAATATCAATCTCAAATCGTTACGATCTT
* * *
46484 TGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCGGATAAAAAAAATTAAGTTAA
325 TGTTTTGTCATAAAAAAAATATTTCTAATCATACAAGCTTATTCGAATAAAAAAAACTAAGTTAA
* * * *
46549 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGGGATTTAAAAAACAAATGTGTTTGCCAAATCAGTTCAAA
390 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAATCAGTTCAAA
* *
46614 TGGTTAGAACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAT
455 TGGTTAGAACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC
* *
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520 AATTGTCTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAA
* ** * ** * * **
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585 TTAATAACCAAGAGAAATAAAAAAATAAATCCAATTAAAGAACCAATTCAAATAGTTAAGATTAT
* * * * * *
46809 TTGAACAATTCTCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGA-TTTGTCATTAAAC-AATTGTTTCAA
650 ATAAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGAACTTTT-ATTTTGCCATAAAACAAATT-TTTCAA
* *
46872 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTT-ATTAATATTTCAAATATTAATAAGTA
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773 AGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAACTAGTTCAAATTATGGTCATTTGAATAATTATTT
47000 ATTTCAAATCATTATTACCTTTCGTTTTCTCATAAAAAAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATT
838 ATTTCAAATCATTATTACCTTTCGTTTTCTCATAAAAAAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATT
47065 TGAAATAAAAATGTTATTTCCTTTCGTTTTGTCTATTTTTCAACCTACAAA
903 TGAAATAAAAATGTTATTTCCTTTCGTTTTGTCTATTTTTCAACCTACAAA
* * ** * *
47116 CTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAGTAAG-A-A-ATTT-AAA
1 CTTATTTGAAATAAAAAAATATTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAGATATTTAAAA
* * * *
47177 AAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
66 AAATAAATCTGTTTACTAAACAAGCTCAAATA-TATATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
** * * ** ** *
47241 ATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTCCATACAAGTTTATTTAGAATA
130 ATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTAGTCCATAAAAACTTATCCAAAATA
47306 AAATAATACTA-ATTTAATAATA-TTCTAAAAATTCA-TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-TC
195 AAATAATACTACA-TTAATAATATTTC-AAAAATT-ATTAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAGT-
* * * * * * *
47367 CGTTTGCCAAACTAGTTTAAACAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAGG
256 CGTTTGCCAAACTAGGTCAAACAGTTACA-ACTATATCAACAAATATCAATCTCAAATCGTTACG
* * * * * *
47431 A-CATTTGTTTTGTCATAAGACAATTATTT-TAGCTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATA
320 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAAATATTTCTA-ATCATACAAGCTTATTC-GAATAAAA-AAAA
* *
47494 CTAA-TT-ATGAATATTT-ATAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA
381 CTAAGTTAAT-AATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAA
* * * * ** *
47556 ATCATTTCAAATAGTTTTG-GCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTT
444 ATCAGTTCAAAT-GGTTAGAACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG-T
* * * * * **
47620 TTA-TGATGATACCATTGGT-TCTA-TTCATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
507 TTAGTCATAAAACAATT-GTCT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * *
47682 ATAATATTTC-AAAACTTAATAACCAAGA-AAATAAAAAAATAAATCTAATTAAAGAACCAATTC
570 ATAACA-TTCAAAAAATTAATAACCAAGAGAAATAAAAAAATAAATCCAATTAAAGAACCAATTC
* * *
47745 AAATAGTTAAGATTATATAAACGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGCCATAA
634 AAATAGTTAAGATTATATAAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTGCCATAA
** * * *
47810 AACAAATTTTTTTATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTCATAATATTTCAA
699 AACAAATTTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACAAATTTCATAATATTTCAA
* * * *
47875 AAATTAATAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAGTTCA
764 AAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAACTAGTTCA
47923 TATGGTTAAG
Statistics
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0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (953 bp):
CTTATTTGAAATAAAAAAATATTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAGATATTTAAAA
AAATAAATCTGTTTACTAAACAAGCTCAAATATATATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
TCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTAGTCCATAAAAACTTATCCAAAATAA
AATAATACTACATTAATAATATTTCAAAAATTATTAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAGTCGTTT
GCCAAACTAGGTCAAACAGTTACAACTATATCAACAAATATCAATCTCAAATCGTTACGATCTTT
GTTTTGTCATAAAAAAAATATTTCTAATCATACAAGCTTATTCGAATAAAAAAAACTAAGTTAAT
AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAATCAGTTCAAAT
GGTTAGAACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA
ATTGTCTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAAT
TAATAACCAAGAGAAATAAAAAAATAAATCCAATTAAAGAACCAATTCAAATAGTTAAGATTATA
TAAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGAACTTTTATTTTGCCATAAAACAAATTTTTCAATTC
ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACAAATTTCATAATATTTCAAAAAATAATAAGAGATTT
AAAAAATAAATTAGTTTACTGAACTAGTTCAAATTATGGTCATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
TCATTATTACCTTTCGTTTTCTCATAAAAAAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAA
AAATGTTATTTCCTTTCGTTTTGTCTATTTTTCAACCTACAAA
Found at i:49536 original size:523 final size:518
Alignment explanation
Indices: 47172--55535 Score: 2653
Period size: 533 Copynumber: 15.6 Consensus size: 518
47162 AGTAAGAAAT
* *
47172 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTAT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATA-TTA-AGACTAATT-AACAATTATCTAT
* * * * ** * * *
47236 TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTCCATACAAGTTTATT-T
62 TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
47300 AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTCATAAATAAGAGATTTAAAAAATAA
127 A-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATGA
** ** * * * * * * *
47364 ATCCGTTTGCCAAACTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
189 ATCTATTTATCGAACTAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * *
47429 GGA-CATTTGTTTTGTCATAAGACAATTATTTTAGCTCATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAA
254 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAA
* * * *
47492 TACTAA-TTATGAATATTT-ATAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA
318 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCA
* * * * * **
47555 AA-TCATTTCAAATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGT
378 AACT-AGTTC----A---TT-ACT-TTT-AGTTATTATCTACTTCAAATCATTATAACCTTTT-T
* * * ** * * * ** ** *
47619 TTTATGATGATACCATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAA
431 TCTGTCAT-A-AAAAAT-ATT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAATATAA
* * *
47683 TAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAA-AA
491 TAATA-TTAAAAAATTAATAA-TAA-AAGAA
* * ** * * * * * * *
47713 TAAAAAAATAAATCTAATTA-AAGAACCAATTCAAATAGTTAAGATTATATAAACGATTATCAAT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AA-TAGTTCAAATA-TTAAGACTA-ATTAACAATTATCTAT
* ** * * * *
47777 TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAACAAATT-TTTTTATTCATATAAGCTTATTC
62 TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTC
* *
47841 -AGAATAAAATAATACAAATTTCA-TAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTGAAAAATAA
126 GA-AATAAAATAATACAAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAAATGA
* * * * * ** * * **
47901 ATTTGTTTATTGAACTAGTTCATATGGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAGTTATT
189 ATCTATTTATCGAACTAATTCAAATAATTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * ** * * * *
47965 CTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGCTTAAGTTCATACAAACTTA-TCAGGAATAAATTA
253 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATA
* * * * * *
48029 ATACTAATTTATCAACA-TTCAAAAAATTAAAAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTAC
317 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT---AA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTAT
* * * * * ** *
48093 CGAACAAGTTCAAATAGTAATTCTTATTTGAACAGCTATCTA-TTCAAAATTGTTATGACCTTTT
376 CAAACTAGTTC--AT--TACTT-TTAGTT----A-TTATCTACTTC-AAATCATTATAACC-TTT
* * * * ** *
48157 TTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACTAGCTTATAT-GGAATAAAATAATACTAATTT
429 TTTCTGTCATAAAA-AA-T-ATTTAGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAAT-ATACTAATAT
* ** * *
48221 ATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGAT
489 AATAATA-TTAAAAAATTAATAA-TAAAAGAA
* ** * * * * * *
48253 TTAAAAAATAAATTTGCTTACTGAATCAATTAAAATAATTATGGC-CATTCAAACAATTATTTAT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAT-AGTTCAAAT-ATTAAGACTAATT--AACAATTATCTAT
* * * * *
48317 TTCAAATTTTTATGACCTTCTGTTTTGTTATAAAACAATTAGTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC
62 TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTTAATTCATACAAGCTTATTC
* *
48381 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
126 GAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATGAA
* * ** ** * *
48446 TCTATTTATCAAACTAGTTTGAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAATTGTTA
190 TCTATTTATCGAACTAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTA
* * * *
48510 TGATC-TTTGTTTTGTCAT-AAA-ATATGTTTTTGATCATAAAAGCTTATTCG-ATTAAAAATAA
254 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAA
* * * * * * * *
48571 TAATAATTGAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTCAAAAATAAATATGCTTGTTAAACTA
318 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACTA
* * *
48636 GTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATTATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTTTT-TAGTC
383 GTTC----A-TT---ACTTTTAG--TTATTATCTACTTCAAATCATTATAACCTTTTTTCT-GTC
* * *
48700 AT---AAA-A--TA--TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA-ATCTGAATATATTAACATTCA
437 ATAAAAAATATTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATATA-CT-AATATAATAATATTAA
* *
48756 AAAATTAATAAATAAGAGAT
500 AAAATTAAT-AATAAAAGAA
* * * * * *
48776 TTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA-AGCTC-AAT-TTAAGACTATTTGAGCAATTGTATAT
1 TT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CCAA-ATAGTTCAAATATTAAGACTAATT-AACAATTATCTAT
** * * * * * *
48838 TTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGCCACAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTCG
62 TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
48903 AAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATTTTAAAAA-T-TAA-TAAGTGAATTAAAAAGTGAAT
127 AAATAAAATAATACA-AATTTATTAATATTTCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
* * *
48964 CTATTTA-CTGAATTAATTCAAATAATTATGA-TAATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
191 CTATTTATC-GAACTAATTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * *
49027 CGAACATTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
254 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
* *
49092 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAG
319 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACTAG
* *
49157 TTC-TTA-TTTTAGTTATTACCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATA
384 TTCATTACTTTTAGTTATTATCTACTTCAAATCATTATAACCTTTT-TTCTGTCATAAAA-AATA
*
49220 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAATATACTAATTTAATAATATTAAAAAATTTAA
447 -TTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATATACTAATATAATAATATTAAAAAA-TTAA
49285 TAACTAAAAGAA
508 TAA-TAAAAGAA
* * *
49297 TTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATTAACAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATA-TTAAGACTA-ATTAACAATTATCTATT
* * * * *
49362 TAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATCATTTTAGTCCATACAAGCTTATTCAA
63 TAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCGA
* * * *
49427 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAGAAA-T-TAA-TAAGTGATTTAGAAAGTGAATCT
128 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
* * * * * * *
49489 ATTTATCGAA-TCATGTCAAAAAATCATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA
193 ATTTATCGAACTAAT-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * *
49553 CCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTGATCATTCAAGCTTAGTCAAAATAAAATGATACT
257 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * **
49618 AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTAAAT-TGTTTATTGAACTAGTTC
322 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACTAGTTC
*** * ** *
49682 AAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTTTTCTATCATAA
387 ----A--T-T-ACT-TTT-AGTTATTATCTACTTCAAATCATTATAACC-TTTTTTCTGTCATAA
* * * *
49747 AACAATTATTTTTGTTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAA
441 AA-AA-TA-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAATATAATAATATT-AAA
49812 AAATTAATAATGAAAAGAA
501 AAATTAATAAT-AAAAGAA
* * *
49831 TT-AAAAATAAATTTGCTTACCAAACTAGTTCAAAAATTTAAGACTATAATAACAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATA-TTAAGACTA-ATTAACAATTATCTATT
* * *
49895 TCAAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAACAA-AATTTTCAATTCATACAAGCTTATTC
63 T-AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-AATTCATACAAGCTTATTC
** * * ** *
49958 GGGATAAAAGAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAT-A
126 GAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-TAACTAAGAGATTT-AAAAAATGA
* * ** * *
50022 ATTTTGTTTCCCTAACTAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTT
189 A-TCTATTTATCGAACTAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * *
50087 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGGAATAAAGTAA
253 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* ** * * * * *
50152 TACTAATCTATTAATATTTTGAAAACTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA
318 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACTA
* *** * * * *
50217 GTTTAAATAGTTATGACTATTTAACAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAA--TTTTGTTTTG-
383 G-TT---CA--T-T-ACT-TTT-AGTTATTATCTACTTCAAATCATTAT-AACCTTTT-TTCTGT
* * * * * * *
50279 CTATAAAACAATTGTTTCTGTTAATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
436 C-ATAAAA-AA-TATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAATATAATAATA
** * * *
50344 TTTTGATAATTAATAAGTGAAA-AT
496 -TTAAAAAATTAATAA-TAAAAGAA
* * * * * * * * *
50368 TTCAAAAAATAAGTATGTTTACCAAACTAGATCAATTAGTCATGACTATTTAAATAATTATTTAT
1 TT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATA-TTAAGACTAATT-AACAATTATCTAT
* * * ** * * * *
50433 TTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAGTTCATATAAGTTTATTCG
62 TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCG
* * * ** *
50498 AAATAAAATAATACCAACTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAA
127 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAACTAAGAGATTT-AAAAAATGAA
* * * * * * * * * **
50563 TTTGTTTTTCGGAC-AAGTTTAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATTTATTTGAAATCACTA
190 TCTATTTATCGAACTAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * *
50627 TAACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTCTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAAA-GAAATA
254 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-GTTTTTGATCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATA
* *
50691 ATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
317 ATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
* * * * * * * * **
50753 TCGAACCAAGTCAAATCCTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTTTTATAA-CTTTT
375 TC-AAACTAGT----T-C--ATTACT-TTT-AGTTATTATCTACTTCAAATCATTATAACCTTTT
* * ** * ** * * *
50817 TTTTGCCATAAAATAATTATTTTCA-TTTGTACAAGGTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTA
430 TTCTGTCATAAAA-AA-TA-TTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAATATA
* * ** * ** * *
50881 TTAATTTTTGGACAATTAATAAGTGGACGAT
490 ATAA-TATTAAAAAATTAATAA-TAAAAGAA
* * * * * * * *
50912 TTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTGAAATAGTCATGAC-ATTTGAATAATTAACTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAT-AGTTCAAATA-TTAAGACTAATT-AACAATTATCTATT
* ** * * * * * * * **
50976 TCAAATCATTATAAACC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTACTTCAGTTCAAATAAGCTTATTTA
63 TAAAATTGTTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCG
* * ** *
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127 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATGAA
* ** ** * * *
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* * * * * ** *
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254 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAA
* * * * *
51223 TA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATGTGTTCTTGAC
318 TACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATG-T-TT---
* *** * *** * *
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374 A---TCAAACTAGT-TCATTACT-TTTAGTTATTATCTACTTCAAATCATTATAAC-CTTT-TTT
* * * * * * * *
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* * * *
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493 ATATT-AAAAAATTAATAA-TAAAAGAA
* * * * * * * *
51441 TTAAAAAATAAATCTATTTACCTAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAT-AGTTCAAATA-TTAAGACTAATT-AACAATTATCTATT
* ** * ** * * *
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* * *
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** * * * * * * * ** *
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* * * * * ** * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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381 TAG-TTCATTACTTTTAG----T--T----ATTATCTACTTC-AAATCATTATAACCTTTT-TTC
* * * * *** * * * *
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* * *
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494 TA-TTAAAAAATTAATAA-TAAAAGAA
* * ** * * * *
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1 TT-AAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAATAGTTCAAAT-ATTAAGACTAATT-AACAATTATCTAT
* * * * * * ** ** * *
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* * * * * *
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127 A-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAAATGAA
* * * * * *
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190 TCTATTTATCGAACTAATTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * *
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254 TGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAAATGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAAT
** * * * *
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* * ** * * * ** * *
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* * * * * *
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432 CTGTCATAAAA-AA-TATTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA-TACTAATATAAT-
* ** * *
52485 GATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGAT
492 AATA-TTAAAAAATTAATAA-TAAAAGAA
* * * * * *
52514 TTAAAAAAATGAATTTATTTTCCAGACA-AGTTTAAATAATTATGAC-AATTTAAACAATTATTT
1 TT-AAAAAATAAATTTGTTTACCA-A-ATAGTTCAAAT-ATTAAGACTAA-TT-AACAATTATCT
* *** * * * * * * * **
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* * * * *
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124 TCGAAATAAAATAATAC-AAATTTATTAATATTTCAA--AAATT-ATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * ** * * * * *
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185 ATGAATCTATTTATCGAACTAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * ** * * *
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* * * * * * * * **
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376 CAAAC----T--AGT--TCATTAC--TTTTAGTTATTATCTACTTCAAATCATTATAA-CCTTT-
* * * * * * * * *
52962 TTT-TGTAATGAAACAATTGTTTCATTTCAAATAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
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* * * * *
53026 TTAATATTTTAAAAATTAATGAGAAGGAGAA
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* * ** * *
53057 TTAAAAAATGAATCTGTTTACCAACCA-TT----TTTTTA-ACT-ATCTAAACAATTATCTATTT
1 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAGTTCAAATATTAAGACTAAT-T-AACAATTATCTA-TT
* ** * * * * ** * *
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63 TAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTA-TTCG
* * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * * * *
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254 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
* * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ***
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* * * * * ** * ** *
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* * ** ** * * *
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* * * * * * * * **
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* * * * *
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* *** * *
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* * ** * * * * *** *
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* * * *
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** * * * * * * * **
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* * * *
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TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACTAGTTCATTA
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52528 TTATTTTCCA
*
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Statistics
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GACAAGTTTAAACAATTAT
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54500 TTGTTTTCCA
*
54510 GACAAGTTTAAATAATTAT
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1 GACAAGTTTAAACAATTAT
54547 TTATTTGAAA
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18 12 0.71
19 5 0.29
ACGTcount: A:0.49, C:0.08, G:0.08, T:0.35
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GACAAGTTTAAACAATTAT
Found at i:55780 original size:18 final size:19
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55742 TATTTATCTA
*
55752 ACTAGTTTAAATAGTTATG
1 ACTAGTTTAAATAATTATG
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1 ACTAGTTTAAATAATTAT
55788 CTATCTCAAA
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ACTAGTTTAAATAATTATG
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56278 AATTATGGCC
* *
56288 ATTTGAATAATTAT-TATTTCAAAT-TGTTATGAA-CTTTTGTTTGATCATAAAACAATTGTTTT
1 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCT-TTATGAACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTTTT
*** *
56350 TCATCATACAAGCAAATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
65 AGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *
56415 -AGCATATTTAAAAAAT-AAATTGCTTACCGAACCAATTC-C-T-
130 AAG-AGATTTAAAAAATAAAACTACTTACCGAACCAATTCACATA
* * *
56455 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTAT-AACCTTTTGTTCCATTATAAAATAATTGTTTTG
1 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTTTTA
* * * ** * * * * *
56519 GTTCATATAAGCTTTTTTGAAATAAAA-AATACTAATTTAATAATTTTTTAAAAATGAATAACTA
66 GTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
56583 AGAGATTTAAAAATTAAAACTATTTGCCGAAGCAGTTCAAACAATCAA
131 AGAGATTTAAAAAATAAAACTACTTACCGAACCAATTC--AC-AT--A
* * **
56631 GACTTTATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCCTTTTGTTTTGTTATAAAAACAATTG
1 -A--TT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAACCTTTTGTTTCATTAT-AAAACAATTG
* * *
56696 TTTTAGTTTATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGTCAAAAATTAAT
61 TTTTAGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
56761 AAGT
126 AAGT
56765 GTTCGATTAT
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ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTTTTA
GTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
AGAGATTTAAAAAATAAAACTACTTACCGAACCAATTCACATA
Found at i:56595 original size:167 final size:167
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Period size: 167 Copynumber: 1.9 Consensus size: 167
56278 AATTATGGCC
** *
56288 ATTTGAATAATTATTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTGATCATAAAACAATTGTTTTTCA
1 ATTTGAATAATTATTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTCCATCATAAAACAATTGTTTTGCA
* * *
56353 TCATACAAGCAAATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGC
66 TCATACAAGCAAATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATGAATAACTAGC
*
56418 ATATTTAAAAAATAAATTGCTTACCGAACCAATTCCT
131 AGATTTAAAAAATAAATTGCTTACCGAACCAATTCCT
* *
56455 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCT-TTAT-AACCTTTTGTTCCATTATAAAATAATTGTTTT
1 ATTTGAATAATTAT-TATTTCAAAT-TGTTATGAA-CTTTTGTTCCATCATAAAACAATTGTTTT
** * *** ** * *
56518 GGTTCATATAAGCTTTTTTGAAATAAAA-AATACTAATTTAATAATTTTTTAAAAATGAATAACT
63 GCATCATACAAGCAAATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATGAATAACT
*
56582 AAG-AGATTTAAAAATTAAA
128 -AGCAGATTTAAAAAATAAA
56601 ACTATTTGCC
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ATTTGAATAATTATTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTCCATCATAAAACAATTGTTTTGCA
TCATACAAGCAAATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATGAATAACTAGC
AGATTTAAAAAATAAATTGCTTACCGAACCAATTCCT
Found at i:57765 original size:20 final size:20
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57730 TTTTCCAGAA
*
57740 AAGGGATCGATCCCCTACA-T
1 AAGGGATCGATCCCCTA-AGC
*
57760 AAGGGATCGATCACCTAAGGC
1 AAGGGATCGATCCCCTAA-GC
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1 AAGGGATCGATCCCCT
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AAGGGATCGATCCCCTAAGC
Found at i:58003 original size:21 final size:21
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57967 TCATGAACCA
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57998 ATCGATCCCCTAAGGGAGGGG
1 ATCGATCCCCTAAGGGAGGGG
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58035 TCAGAAACTC
Statistics
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ATCGATCCCCTAAGGGAGGGG
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Indices: 65658--65705 Score: 96
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65648 AAGGGGAGAA
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1 ATATTGGTATGAAAATTTGATGAT
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1 ATATTGGTATGAAAATTTGATGAT
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ATATTGGTATGAAAATTTGATGAT
Found at i:65814 original size:25 final size:26
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65756 ATTTTATGCC
* *
65766 TAAATTCAGGGGGAGTTTGCTTTTCA
1 TAAAATCAGGGGGAGATTGCTTTTCA
65792 TAAAATCAGGGGGAGATTG-TTTTCA
1 TAAAATCAGGGGGAGATTGCTTTTCA
65817 AAAGGAAAAA
Statistics
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25 6 0.26
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Consensus pattern (26 bp):
TAAAATCAGGGGGAGATTGCTTTTCA
Found at i:67644 original size:181 final size:179
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Period size: 181 Copynumber: 4.2 Consensus size: 179
67197 TGGCCATGTC
* ** * * *
67207 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTATTT-TTTAACA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAATT--CA
* * * * *
67271 TTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
64 TACTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *** *
67336 TTTAAAAAGTAAATCTGTTTATCGAAATGGTT---ATGGTT--G--T-TTG
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATTG
* ** * * * * * *
67379 AACAATTGTAAACTTCAAATCATCATAACCTTTCGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-AATTCAT
* * * * * *
67444 ACTAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGAT
65 ACTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * *
67509 TTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATG
130 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTAT-TG
* *
67560 AACATTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTGTTTAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTAATTCAT
* *
67625 ACTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 ACTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * *
67689 TTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAACCAGTTCAAATAATTAGGATTATTTG
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTA-TTG
* * * * * ** *
67741 AACAATAATTTATTTCAAAT-ATCATGACCTTTGGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTGTTCACA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAATTCATA
* * * * * *
67805 -TAAGTTTGTTCATAATAAAATAATACTATTCTTATTAATATTTTAAAAATT-A-AA--AAGTGA
66 CT-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATC-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *
67865 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATA-ACTACTTG
129 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGATTA-TTG
* * *
67917 AGCAATTATTTACTTCAAATCATTATGACCTTTT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
67951 TTTCTATTAT
Statistics
Matches: 469, Mismatches: 84, Indels: 33
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
172 129 0.28
174 2 0.00
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177 12 0.03
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179 32 0.07
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ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAATTCATA
CTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATTG
Found at i:68521 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 68283--70505 Score: 1191
Period size: 180 Copynumber: 12.2 Consensus size: 180
68273 TAGTCATGCA
* *
68283 AGAATAAAATAACA-TACATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAA
1 AGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
* * * *
68346 ATCTGTTTTCTTAACATGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
65 ATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* ** ** *
68411 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAAATTATTT
129 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
* * *
68463 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAAA
1 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
68528 TCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA-CTTAGTTT-AAATCATT
66 TCTGTTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TA-TTTCAAATCATT
* * * * * *
68591 A-GA-CTATTTGAACAATTACTTAGT-TTAAATCATTATAATATTTTGTTTTGTCATA-AAAC-A
128 ATGACCT-TTTG-----TT--TT-GTCATAAAACA--AT--T-GTTT-TTAT-TCATACAAGCTT
*
68651 ACT-
177 ATTC
** ** * * * * * * * **
68654 A-TTTCTATTCATAC-AAGTTTATTCAA-A-AT-AAAATAATACTAATTTATTATTATTATAAAA
1 AGAATAAAATAATACTAA-TTTATT-AATATTTCAAAA-ATTAATAA-GTA-AAAGATT-TAAAA
* * *** * * * * * * *
68714 TTAATGAGT-TGTAGACTTAAAAAATT--AATATGTTTACTGAACAAGTTCAA-AGA--GTCATA
60 --AATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATA-G-TTA-TG-ACTATTTGAACA-ATTATC-TA
* ** * * * *
68773 TGTCCATTTCAATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTCT
116 T-TTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTAT
68837 TC
179 TC
* * * ** * *
68839 GGAGTAAAATATTACTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAA
1 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * ** * * * *
68899 TATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTACAATAATTATCTTTTTAAAATCATTCT
66 TCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
68964 GACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTG-TTTCAGTTCATACATA-CTTATTC
130 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA-AGCTTATTC
* * * * *
69015 AAAATAAAAAAAATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAAA
1 AGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAA
* * * **
69079 TAAATCTGTTTTCTGAACAAATTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTG
62 TAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** * * *
69144 TTATGACCTTTTGTTTTATAATAAATTAATT-TTTTTATTCATAAAAACTTATTT
126 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
* * * *** * *
69198 AAAATAAAATAAT-GTAACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTGGAGATTCAAAAACTAA
1 AGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
* * * *
69262 ATCAGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
65 ATCTGTTT-TCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * *
69326 ATGAACTTTTGTTCTATCAT-AAACAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTC
128 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTC
* * *
69378 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATAAA
1 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
69443 TCTGTTTACAAAGCTATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATGATTATTTGAACGACTA
66 TCTGTTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG---AA-CA--ATTA--T------C--
* * * * *
69508 TATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTAAGTTTATACAAGTT
114 --TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCT
69572 TATT-
176 TATTC
* * * * * * * *
69576 TGAA-ATAAATAATA-TCAATCTAATAATATTAT-GAACATTAATAACTAAGATATTTAAAAAAT
1 AGAATA-AAATAATACT-AATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
69638 AAATTTGTTTGCCAA-ATTAGTTCAAATAG-TAAGGCTATATAAATAATTAT-TAATTTCAAATC
63 AAATCTGTTTTCGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATC
* ** * * * * * * *
69700 GTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAACCAAATGTTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTC
125 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
* * * *
69756 AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTTAAAAATAAG
1 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
69817 TCTGTTTATCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT
66 TCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * ** * *
69882 GATCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCCATTGATA-TAGTCTTATTC
130 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-CTTATTC
* * * * *
69933 AGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAA
1 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* *
69998 TCTGTTGGCTT-GACCAA-TGT-AAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
66 TCTGTT---TTCGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * *
70060 TATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTGTT-
127 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
* * ** * ** * * *
70113 TGAAATAATATAATTTTAATTTGTTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTGA
1 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * * *
70178 AGT-TGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAATTAAATAGTTACCTTTTTCAAATCATT
64 AATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * *
70242 A-AACCTTTTGTTTTGT-ATAAAAAGAATT-TTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTC
128 ATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTC
* * * * * *
70295 A-ATTACAATAATA-TAAATTTATTAACA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAGTA
1 AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * * *
70357 AATCTGTTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTTAGATTATA
64 AATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * *
70422 ATGA-CTCTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
128 ATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
* * * *
70475 GGATTAAACTAATATTAATTTATTAATATTT
1 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
70506 TTAAAAATAA
Statistics
Matches: 1546, Mismatches: 353, Indels: 286
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
175 10 0.01
176 77 0.05
177 135 0.09
178 28 0.02
179 79 0.05
180 404 0.26
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182 58 0.04
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185 5 0.00
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199 20 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
TCTGTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
Found at i:68602 original size:34 final size:34
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Period size: 34 Copynumber: 2.0 Consensus size: 34
68549 AATAGTTATA
68559 ACTATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCATTAG
1 ACTATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCATTAG
68593 ACTATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCATTA
1 ACTATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCATTA
68626 TAATATTTTG
Statistics
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1.00 0.00 0.00
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ACTATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCATTAG
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68561 TATTTGAACA
68571 ATTACTTAGTTTAAATC
1 ATTACTTAGTTTAAATC
*
68588 ATTAGAC-TA-TTTGAA-C
1 ATT--ACTTAGTTTAAATC
68604 AATTACTTAGTTTAAATC
1 -ATTACTTAGTTTAAATC
68622 ATTA
1 ATTA
68626 TAATATTTTG
Statistics
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ATTACTTAGTTTAAATC
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68544 GTTCAAATAG
68554 TTATAACTATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCA
1 TTATAA-TATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCA
* *
68589 TTAGACTATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCA
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68623 TTATAATATTT
1 TTATAATATTT
68634 TGTTTTGTCA
Statistics
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TTATAATATTTGAACAATTACTTAGTTTAAATCA
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68622 ATTATAATAT
* *
68632 TTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAA
* * * * * *
68697 TTATTATTATTATAAAATTAATGAGTTGTAGACTTAAAAAATTAATATGTTTACTGAACAAGTTC
66 CTAATAATATTATAAAATTAAT-A--AG-AGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
68762 AAAGAGTCATATGTCCATTTCAATTATGATC
127 AAAGAGTCATATGTCCATTTCAATTATGATC
* * * * ** * *
68793 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTCTTCGGAGTAAAATATTACTAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAA
* * * *
68858 CTAATAATATTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAA
66 CTAATAATATTATAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAA
68922 TAGTTAAGAC
Statistics
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TTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAA
CTAATAATATTATAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAAG
AGTCATATGTCCATTTCAATTATGATC
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69454 AGCTATTTCA
*
69464 AATAGTTATGACTATTTG
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*
69482 AATAATTATGATTATTTG
1 AATAATTATGACTATTTG
69500 AA
1 AA
69502 CGACTATATA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
18 18 1.00
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AATAATTATGACTATTTG
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69472 TGACTATTTG
* * * * * *
69482 AATAATTATGATTATTTGAACGACTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
1 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * * * * *
69547 ACAATTATTT-AAGTTTATACAAGTTTATT-TGAAATAAATAATATCAATCTAATAATATTATGA
66 ATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAATAAT-TTAATTTATTAATATTTTAA
* * * * * * * *
69610 ACATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTT--TGCCAA-ATTAGTTCA
128 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTGTTACT-CGAACAAT-G-T-A
* * * * * * **
69662 AATAG-TAAGGCTATATAAATAATTAT-TAATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAA
1 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * * * * *
69725 ACCAAATGTTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAA
65 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAATAAT-TTAATTTATTAATATTTTAA
* * *
69790 AAATTAATAAG----AGATTTTAAAAAT-AAGTCTGTTTA-TCAAACTA-GTTCA
128 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAA-TCTG-TTACTCGAACAATG-T-A
* * * * * * *
69838 ATTATTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCATTTGTTTTGTCATAAA
1 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * *
69903 ATAATTGTTTCCATTGATA-TAGTCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTAA
66 ATAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAA-TAAT-TTAATTTATTAATATTTTAA
* * * *
69967 AAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAATGTA
128 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTGTT-ACTCGAACAATGTA
* *
70019 AATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAA
1 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
70084 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTGTT-TGAAATAATATAATTTTAATTTGTTAATATTTTGA
66 ATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAA-ATAA-TTTAATTTATTAATATTTTAA
* * *
70148 TAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTGAAGT-TGTTTA-TCGAACAA-GTTCA
128 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAA-TCTG-TTACTCGAACAATG-T-A
* * * * * * *
70200 AATAGTTATGACTAATTAAATAGTTACCTTTTTCAAATCATTA-AACCTTTTGTTTTGT-ATAAA
1 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA
* * * * * * *
70263 AAGAATTTTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTCA-ATTACAATAATATAAATTTATTAACA-TTCA
65 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATA-AATAAT-TTAATTTATTAATATTTTA
* * * * * * *
70326 GACAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAGTAAATCTGTTTAC-CAAATAAGTTTA
127 -AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTG-TTACTCGAACAA-TGTA
* * * * * * *
70380 AATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTTAGATTATAATGA-CTCTTTGTTTTATCATAA
1 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAA
* * * *
70444 AATAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAACTAATATTAATTTATTAATATTTTTA
65 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAA-TAAT-TTAATTTATTAATA-TTTTA
*
70509 AAAATAAATA
127 AAAATTAATA
70519 TGTTTACCAA
Statistics
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Consensus pattern (178 bp):
AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
ATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATAATTTAATTTATTAATATTTTAAAAA
TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTGTTACTCGAACAATGTA
Found at i:71378 original size:182 final size:180
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Period size: 181 Copynumber: 47.5 Consensus size: 180
70841 TTCAATGGTT
* * * * *
70851 ATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAAGAGAGTTAATTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTG
1 ATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * ** * * * *
70911 AAATAGTAATAAATTAGTATTA-TTT-TCTAAATAATTTTGTAAGAATATAAACAATTGTTTTAC
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * ** * * * * *
70974 AACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATAGTTCAAATGGGC
130 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * ** *
71025 ATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTAATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * *
71090 AATATTTATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAATAATTATTTTAT
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
*
71155 GACAAAAC-AAAGGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTC
130 GACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
*** * * * * * *
71206 ATAACTATTTGAACTCACTCGATGAAC-GAATTTATTTTTAAAATATTTTATTTATTGA-TTTTG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
71269 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGGTTTTTTTTTAATAGAAACAATTGGTT
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAA-G-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* *
71334 TATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * **
71388 ATAACTATTTGAACGTGTTCCAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TGTTACTTATTAATTTTTGG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * *
71452 AACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTAAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTGTTTT
66 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CAATTGTTTT
* * *
71515 ATGACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * *
71568 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTT
* * ** *** **
71632 GAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTACATGAATTTAAACAATCATTTT
64 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * *
71697 ATTACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * *
71750 ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC--A-TT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAGTTGTCAA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * *
71811 AATATTTATAGATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTGTATGGAA-AGAAATAATTGTTTTA
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTAT-GAACAGAAACAATTGTTTTA
* * *
71875 TTACAAAACAAAAAAGTCATAA-GAATTTG-AATAAATAATTGTTTAAATAGTC
129 TGACAAAAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* *
71927 ATAACAATTTGAACTTGTTC-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-T
** **
71991 T--AATATTAATAAATTTTTATTATTTT-TTTGGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATCATTT
63 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* * ** ** * * *
72053 TATGACAAATCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATTGATAATTGTTGAAATAGTT
127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * * * * *
72107 ATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATATTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * ** **
72172 AATGTTAATAACA-TAATATTATTTTATTTCAAAGAACCTTATATGAATTGAAGTAATT-TTTTA
66 AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * *
72235 TGACAAAATAATAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGCC
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * * * * * *
72287 ATGATTATTTGAGCTAGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTATATTTTTTAGTTATTAATTGTCAA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * *
72351 AATATTAATAAATTGGTGTTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * *
72416 AATAGAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATATTC
130 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* *
72467 ATAACTATTTGAAC-TGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTTAAA---TAT-CTTATTAATTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
** * * * * * *
72527 AAAATATTAATATCTTAGTATTATTTTACTTTGAATAATCATATATGAGCAAAAACATTTGTTTT
64 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
*
72592 ATGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * ** * * * *
72644 ATAATTATTTGAACTAGTTCGGCAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * *
72709 AATATTAATAATTTTA-TTTTATTTTATTTCGAATAAG-TTAGTAGGAACTGAAAAAATTATTTT
66 AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTT-GTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* ** * * * *
72772 ACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AATAAAGAATTGTTCATATAG-C
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * *
72823 ----C---TT-AGC-TATT---T--A-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTAATAATTTTTAG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * *
72872 AATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAAC-TGTATGAACAGAAATAATTGTTTTA
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAT-AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * ** * *
72936 TGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTC
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * *
72988 ATATCTATTTGAACTGGTT-GCATAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCCTAGTTATTACTTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCG-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTT
* * ** * *
73051 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTTTT
64 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
73116 ATGGCAAAACAAAAGTTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATGGCC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * * *
73169 ATAATTATTTGAAC-TGATT-TAGTAAACTGATTTATGTTTTAAATCTCTAAATTATGAATTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTG-TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * **
73232 ACAATATTAATAAAGTAATATTGTTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTT
64 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * ** * *
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128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTA
* * *** * * *
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* * *
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* ** * * *
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1 ATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * * * *
73591 GAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAAATGTTTTA
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * * ** *
73656 GGATAGAACAAAA-AT-ATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTC
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* * * * *
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1 ATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * ** * *
73766 AAATAGTAATAAATTAGTATGATTTT-TTTCAAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTT
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT--GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * * *
73830 ACGACAAAACAAAATGCCATAATGACTTGAAAAAGATAATAGTTCAAATAGAC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * **
73883 ATGACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAATAGATTAATTGTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * *
73947 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAACTTGTATGAATAGAAACATTTATTTTA
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
** * * * * *
74012 TGACAAAAC-AAAGGATCGCAACGAATTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
129 TGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
*** * *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * **
74127 GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAGGTTTTTTGAATAGAAACAATTGGCTTA
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** * * *
74192 CAACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
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* * * * * * **
74244 ATAACTCTTTGAACGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGG
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* * * *
74308 AACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCATGCATGAATA-AAACCAATTGTTTT
66 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CAATTGTTTT
* * * * * *
74371 ATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAGTT
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * *
74424 ATAACTATTTGAACTTATT-TAGTAAACATATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTT
** * * ** **
74487 TGGAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCCATGATTTA-AAACAATTGTT
63 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTT
* * * *
74551 TTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTC
126 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * *
74606 GTGAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAAC--A--TATTTTTTAAAATATTTTACTTATTAA-TTGT
1 AT-AACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * *
74666 AGAAATATTAATAAATTAATATTATGTTAATTCGAATAAGCTCATATGGACAAAAACAATTGTTT
64 A-AAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* * * * *
74731 TATGACAAAACGAAAAAGTCATTA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATC
127 TATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * *
74786 ATAACGATTTGGACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TT
* * * * **
74851 --AATATTAGTAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-ATATCATTT
64 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACA-ATTGTTT
* * ** ** * * *
74913 TATGACAAACCAAAAGGTTATAACAATTCCAAATAGTTAATTGTTCAAATGGTC
127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * *
74967 ATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCA-TTTTTAAAT-TTCTTAATTATTAATTTTCA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
75030 GAATATTAATAACA-TAGTATTA-TTTATTTCAAATGACCTTATATGAACTGAAATAATT-TTTT
65 AAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * *
75092 ATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * * * * *
75145 ATGATTATTTGATCTAGTGT-GGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCA
1 ATAACTATTTGAACTTGT-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * * * *
75209 AAACATTCATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTAGTATGAATAGAAACTATTATTTTT
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * ** * * *
75274 TAAGAGAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATATTC
129 TGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * *
75326 ATAATTATTTGAA-TTGGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTA
1 ATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * *
75386 AAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTCTATGAACA-AAGACATTTATTTT
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAA-ACAATTGTTTT
* ** * * **
75450 ATGACAAAACAATAGGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTGTTCCAATAGTC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * * ** *
75503 ATAATTATTTGAACTGGTTAGGT-AA-ATA-TAATTTTTTTAATCTCGTACTTATTAATTTTTGA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* ** * ** *
75565 AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTA
66 AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * * *
75629 TGATAAGACAAAAGGTCATAACGATTTGAATTAGATAATTGTTCT-TATAGTC
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGTC
* * * * * * * * * *
75681 TTAACTATTTAAACTGGTT-TAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAATAATTTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * *
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* ** * * * * * * *
75808 TATGACATAACAAAAATTTATAATGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAACAATC
127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * *
75862 ATGACTATTTGAACTAGTTCGGTGAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * *
75927 AAGATTAACAAATTAGTATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-AGAAAACAATTGCTAT
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAG-AAACAATTGTTTT
* * * * * *
75991 ATGACGAAACAAAATGTGATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAAT-GGC
128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * * *** *
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1 ATAACTATTTGAACTTG-TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * *
76101 GAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACGATTGTTT
64 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTT
* * * *
76165 TATGGCAAAACAAAAGGTCATAACT-AGTTT-AAATAAACAATTGTTCAAATAGTC
127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGA-TTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * * * *
76219 GTAACTATTTGAATTTTTTCAATAAACAAATTTATTTTTTGAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTCA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
** * * ** *
76283 AAATATTAGGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTA
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
** ** * * * * * * *
76348 TTTCAAAACAAAATATTATAACGATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGTT
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * **
76400 ATAACTATTT-AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCC
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
76464 AAATGTTCATAAATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAG-ACATGAAACAAATATTTT
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACA-GAAACAATTGTTTT
* * * *
76528 ATGACTAAACAAAAGGTC-TAAATGATTTGAACTAGATAATTATTCT-AATAGTT
128 ATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGTC
* * * * * * *
76581 TTAACTATTTAAACTGGTT-TAGCAAATACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * **** * * ** *
76641 GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAACCAAATCAGCTTCTATGATTAGAAATAATTGTTTTA
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* ** * * *
76706 TGACAAAA-TAAAGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTC
129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * *
76757 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * *
76822 AATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATA-AAAGAATAATTATTTT
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* * ** * *
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128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG-TC
* * * * **
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* ** * * * *
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* * * ** * * * *
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* * *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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128 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGTC
* * * ** * *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTA
* * * * *
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65 AAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * ** *** * *
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* * ** * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * ** * *** *
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* * * * **
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * *** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 -ATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
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* * *
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* * * * * * * * * * *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * *
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66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * *
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129 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * *
78916 ATAACTATTTGAAGTGGTTCAGA-AAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
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64 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTT
* * * * *
79042 TATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACCTT-AAATAGATAATTATTCAAAAAGTC
127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * * * *
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1 ATAA-CTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTT
** * * * **
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* * * * * *
79224 TATGATAAAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAATATATAATTGTTCTAGA-A-TC
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* * * * * **
79277 TTAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACACATTTATTTTTTAAA---TTT-CTTACTAATTTTTGG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * *
79338 AATATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTGAATA
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATA
79372 CAATTGTTTT
Statistics
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AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
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Found at i:71690 original size:362 final size:359
Alignment explanation
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70887 TTTTAAATCT
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70897 CTTATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTATTA-TTT-TCT-AAATAATTTTGTAAGAATAT
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70959 AAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATAGTTCAAATGGG
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
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131 CATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTT
* * * * * * *
71088 AGAATATTTATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAATAATTATTTT
194 AAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTT
* * *
71153 ATGACAAAAC-AAAGGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTG
257 ATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
*** * * * * * *
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321 AACTTGTTTGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
71256 TTTATTGA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGGTTTTTTTTTAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAA-G-CTTGTATGAA
* * *
71319 TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
63 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
71384 AGTCATAACTATTTGAACGTGTTCCAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TGTTACTTATTAATTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * ** *
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192 TTAAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAA-CAATTGTT
* * * * *
71513 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTT
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* *
71578 GAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTTAATTCTCTTA
320 GAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA
* ** *
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1 CT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* ** * * * *
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* * * * * * * *
71748 TCATGACTATTTGAACTTGTTTGGT-AA-ACA-TT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAGTTGTC
130 TCATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
71809 AAAATATTTATAGATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTGTATGGAA-AGAAATAATTGTTT
194 AAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GAACA-AAACAATTGTTT
* * * * * *
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** * *
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** * *
71977 CTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTTTATTATTTT-TTTGGAATAAGCTTGTATGAAC
1 CTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
** * * * ** * *
72039 AGAAACAATCATTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATTGATAATTGTTGAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
72104 GTTATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATATTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * ** **
72169 TAGAATGTTAATAACATAATATTATTTTATTTCAAAGAACCTTATATGAATTGAAGTAATT-TTT
193 TAAAATATTAATAA-ATTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTT
* * * * * *
72233 TATGACAAAATAATAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGCCATGATTATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
72298 AGCTAGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTATATTTTTTA
321 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * * * *
72336 GTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTGGTGTTATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAACA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * *
72400 AAAATAATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATA
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATA
* * *
72464 TTCATAACTATTTGAAC-TGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTTAAA--T-AT-CTTATTAATT
129 GTCATAACTATTTGAACTTG--TTGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
** * * * * *
72524 TTTAAAATATTAATATCTTAGTATTATTTTACTTT-GAATAATCATATATGAGCAAAAACATTTG
191 TTTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTG
* * * *
72588 TTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
72652 TTGAACTAGTTCGGCAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA
318 TTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
72694 CTGATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTTA-TTTTATTTTATTTCGAATAAG-TTAGTAGGAAC
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAA-
* * * * * * *
72757 T-GAAAAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AATAAAGAATTGTTCATAT
63 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
72820 AG-C----C---TT-AGC-TATT--T--A-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTAATAATTTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
72869 TAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAAC-TGTATGAACAGAAATAATTGTT
193 TAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTT
* * * ** * * *
72933 TTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
72998 GAAC-TGGTTGCATAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCCTA
320 GAACTTGTTTG-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
73038 GTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-ATGA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-A
* * * * * * * *
73102 AAAATAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGTTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATGG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
73167 CCATAATTATTTGAAC-TGATTTAGTAAACT-GATTTATGTTTTAAATCTCTAAATTATGAATTT
130 TCATAACTATTTGAACTTG-TTGA-TAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * **
73230 TTACAATATTAATAAAGTAATATTGTTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTT
192 TTAAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTT
* * ** * * *
73295 TTATGATAAAATAAAAGGTCATAGCGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
73360 GAACTTGTTTGGTAAATAGA-TT-TTTTTT-AATTTATTA
320 GAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *** *
73397 CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCAAATA-CAAGC
1 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA--
* * * * * * *
73460 TA-AAGCAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAT
63 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * * *
73524 AGTCATAACTATTTGAAC-TGATTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATG
128 AGTCATAACTATTTGAACTTG--TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * * * *
73587 TTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-CTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAAATG
191 TTTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTG
* * * * ** * * *
73651 TTTTAGGATAGAACAAAA-AT-ATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
*** * *
73714 TTGAA-TTGGTTCAATAAAGAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-
318 TTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * * **
73752 CTTATTACTTTTCAAAATAGTAATAAATTAGTATGATTTT-TTTCAAAATAATTTTGTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * *
73816 GAAACAATTATTTTACGACAAAACAAAATGCCATAATGACTTGAAAAAGATAATAGTTCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
73881 ACATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTAATTGTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTT
* ** * * * *
73945 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAACTTGTATGAATAGAAACATTTATTT
193 TAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTT
** * * *
74010 TATGACAAAAC-AAAGGATCGCAACGAATTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
256 TATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
*** ** * *
74074 GAACTCACTCAGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTTA
320 GAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
74114 CTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTAT-GAATAAGGTTTTTTGAATA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAATA
** ** * * *
74177 GAAACAATTGGCTTACAACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
74242 TCATAACTCTTTGAACGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
** * * * *
74306 GGAACATTAATAAATTTATATTATTTTATTT-GAAATAAGCATGCATGAATAAAACCAATTGTTT
194 AAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTT
* * * *
74370 TATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAGTTATAACTATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
74435 AACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAATTCTCTTA
321 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA
* * * ** *
74475 CTCT-TTAATTTTTGGAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCCATGATTT
1 CT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-AT
* * * *
74539 A-AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
74603 GTCGTGAACTATTTGAATTTGTTTGGT-AA-ACA--TATTTTTTAAAATATTTTACTTATTAA-T
129 GTCAT-AACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** *
74663 TGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATGTTAATTCGAATAAGCTCATATGGACAAAAACAATTG
191 TTTA-AAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTG
* * * * * *
74728 TTTTATGACAAAACGAAAAAGTCATTA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACG
253 TTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * *
74792 ATTTGGACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
316 ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* *
74836 CTTATTAATTATCTT--AATATTAGTAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAA
1 CTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAA
** * * * ** *
74898 TAGAAA-ATATCATTTTATGACAAACCAAAAGGTTATAACAATTCCAAATAGTTAATTGTTCAAA
63 TAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
74962 TGGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCA-TTTTTAAATTTCTTAATTATTAATT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * * *
75026 TTCAGAATATTAATAACA-TAGTATTA-TTTATTTCAAATGACCTTATATGAACTGAAATAATT-
191 TTTAAAATATTAATAA-ATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTG
* * * * *
75088 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
75153 TTGATCTAGTGTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTA
318 TTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * * * *
75195 CTTATTAATTGTCAAAACATTCATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTAGTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * *
75259 GAAACTATTATTTTTTAAGAGAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAAT
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAAT
* * * *
75322 ATTCATAATTATTTGAA-TTGGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATT
128 AGTCATAACTATTTGAACTT-G-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
75382 TTTAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTCTATGAACAAAGACATTTAT
191 TTTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAA-ACAATTGT
* ** * * * * *
75447 TTTATGACAAAACAATAGGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTGTTCCAATAGTCATAATTATT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
75512 TGAACTGGTTAGGT-AA-ATA-TAATTTTTTTAATCTCGTA
319 TGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
75550 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATT
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * **
75614 GAAAAAATTGTTTTATGATAAGACAAAAGGTCATAACGATTTGAATTAGATAATTGTTCTTATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
75679 TCTTAACTATTTAAACTGGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAATAATTTTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
75744 TAAATATT-ATAAGATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGTTTGTAT-AAGCAGAAATAATTGTT
194 AAAATATTAATAA-ATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CA-AAACAATTGTT
* ** * * * * * * * *
75807 TTATGACATAACAAAAATTTATAATGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAACAATCATGACTATTT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
75872 GAACTAGTTCGGTGAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
320 GAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
75912 CTTATTAATTTTTGAAAGATTAACAAATTAGTATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-A
* * * * * * * *
75976 GAAAACAATTGCTATATGACGAAACAAAATGTGATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAAT-
65 G-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * ** *
76040 GGC--CA-TATTT-AA-GTGATTCAGCAAATAGATTCA-CTTTTACATAACTTAATTATTAATTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
76099 TTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACGATTGTT
192 TTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTT
* * * * *
76164 TTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACT-AGTTT-AAATAAACAATTGTTCAAATAGTCGTAACTAT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * *
76227 TTGAA-TTTTTTCAATAAACAAATTTATTTTTTGAAA-CTCTTG
318 TTGAACTTGTTT-GGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTA
** ** * * * *
76269 CTTATTAATTTTCAAAATATTAGGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* ** ** * * * *
76334 AAAAAATTGTTTTATTTCAAAACAAAATATTATAACGATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
76399 TATAACTATTT-AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTC
131 CATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
76463 CAAATGTTCATAAATT-TGGATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTAAG-ACATGAAACAAATAT
194 AAAATATTAATAAATTAT--ATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACA--AAACAATTGT
* * * **
76525 TTTATGACTAAACAAAAGGTC-TAAATGATTTGAACTAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTAT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
76589 TTAAACTGGTTTAGCAAATACATTTATTTTTTAAA--TC-T-
318 TTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * * *
76627 CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATCAGCTTCTATGATT
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * ** * * *
76690 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
76754 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
76819 TGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATAAAAGAATAATTATT
193 TAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAA-AACAATTGTT
* * * * *
76884 TTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAAAT-GATAATAATTATT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATT
* *
76948 TTAA-TTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTA
319 TGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * ** *
76989 CTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTCTAAGCTTGTATTAACT-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * ** * *
77053 GAGACAATTATTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATAA
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
77118 TAATAACTATTTGAACTTATTCAGTCAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTACTAATTTTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * ** * *
77183 GAAATGTTAATAAATTAATATTAATTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATCAATTGAAACAATAGTTA
194 AAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTT
* * * * * ** * * *
77247 TATGACTAAATAAAAGGTCAGAATGATTTGAAGTATATAATTATTCTCATATTCTTAACCATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * *
77312 AAATAATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTA
321 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *
77351 CTTATTAATTTTTGAAATATT-ATGAAAGTAGTATTATTTTA-ATCGAAATAAGCTTGTA-CAA-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * *** *
77412 AAAAACAATTGTTTTGTGACAAAAGAAAAGATCATAGCGATTT-AAGATAGATAACCATTCATAT
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * ** *
77476 AGTCTTAACTATTTGAA-TTAGTTCGACAATTAGATTT-TTTTTAAAAT-TTTCTGGTTATTAAG
128 AGTCATAACTATTTGAACTT-GTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAAT
* * * * * *
77538 TTTTGAAATATTATTAAATT-TGCATTATTTTA-TTCTGAATAA-ATTAGTATAAATAGAACCAA
190 TTTTAAAATATTAATAAATTAT--ATTATTTTATTTC-GAATAAGCTT-GTATGAACA-AAACAA
* * * * * * * *
77600 TGGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATATTGATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAAAAC
250 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * * **
77665 TATTTAAAATAGTTTGGCAAGCAGATTTGCTTTTTAAATCTCTTA
315 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
77710 CTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAAAAAACTTATATTAAAA
1 CTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
77773 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
77838 TTATAATTATTTGAACTGATTTTG-TAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTTAGTTCTAAATTTT
130 TCATAACTATTTGAACT--TGTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * *
77902 TGAAATATTAATAAACTAATTTTATTCTATTTTGAATAGGCTTGTATGACACAGAATAATTGTTT
193 TAAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAACAATTGTTT
* ** * * * *
77967 TATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTA
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * **
78032 AACTAGTTCGGCAAAC-GAATTTATATTTTAAATCTCACA
321 AACTTGTTTGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
78071 GTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTATTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGATTA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
78135 GAAACAATTGTTTTATGATAGAAC-AAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
78199 TCATAACTATTTGAACTTGATCAGCAAATAGATTTCTTTTCT-AA-GTC-T-CTTATTAATTCTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * * *
78260 GAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAAAAACCTTGTATGTTGA-AAAATAATTATTT
194 AAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG--AACAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
78324 TATGACAAAA-AAAAGGTAAT-ATCGATTTAAAATAGATAGTTGTTTAAAT-GGCTATGATTATT
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATT
*
78386 TGAAC-TGATTTGGTAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTG
319 TGAACTTG-TTTGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
78427 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAATTA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * ** * * *
78492 -AAACAATTTTTTTATGACAAAATAAATGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGCTGAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
78556 CCGTAACTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTT
130 TCATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * * ** * * ** * * *
78621 TTGAATGTCAGTAAATTAGTATTATTTTATACCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAATAATTATTA
193 TAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTT
* * * * *
78686 TATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTA
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
78751 AACTGGTTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCATA
321 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
78790 C-TA--ACTTTTAG-AATATTATTAAATTAGTATAATTTT-TGTCTGAATAAGCTTGTATG-ATC
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAT-
* * * * * * * *
78849 AAAAATAATTGTTTTATGAGAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
78913 GTCATAACTATTTGAAGTGGTTCAGA-AAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTT--GATAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * *
78976 TTTGAAATATTAATAAAATGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGAT
191 TTTAAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTT
* * *
79041 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACCTT-AAATAGATAATTATTCAAAAAGTCA-AATCTAT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTAT
* *
79104 TTCAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATATCTTA
318 TTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
79147 -TTCATTAATATTTCG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAAC
1 CTT-ATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-
** * * * * *
79210 T-GAATTAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAATATATAATTGTTCTAGA
63 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAA
* * * * *
79274 -A-TCTTAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACACATTTATTTTTTAAA--T-TT-CTTACTAATT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
** * * * *
79333 TTTGGAATATTATTAAA-T-TAGTA--TTA--TC--TTAA-----T-TG---AATACAATTGTTT
191 TTTAAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
79381 TATGACTAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTATCCATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
*
79446 AA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
321 AACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * *
79485 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAAGAATAAGCTAGTATGAACA-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * ** * * * * * ** *
79549 AAATAATTATTGTACAACAAAAGAAAAAGTGATAATGATTTCAAATAGATAATCATTCATATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * * * ** *
79614 CTTAGCTATTTGAACTAGTTAGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCATGGTTATTAAGTTTTA
131 CATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * ** * * *
79679 GAATCTTATTAAATTAATATTATTTTATTACAAATAAAATAGTTTGAACAAAATCAATTGTTTGA
195 AAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTTTA
* * ** * *
79744 TGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAA
258 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * *
79809 ATGGTTT-GTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA
323 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * *
79845 CTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTGTTTCAAATAAACTT-TATTAACA-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * *
79908 AAAGCAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAAGTAATAAAGATTT-AGAATAAACAATTATTCAAATA
66 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
79972 GTTATAATTAATTGAA-TTGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTAAATAGAATTAT
129 GTCATAACTATTTGAACTT-G-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-T---T--ACTTA-
* * *
80036 TTTCTAAATCTCTTACTTATAAACTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTTTTTCCAAAT
185 --T-T-AA----TT--TT-T--A------AAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTT-CGAAT
* ** *
80101 AAGCTTGTAT-AAGCTAAAATAATTGTTTTATG-----ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA
229 AAGCTTGTATGAA-C-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * ** * * * * *** * *
80160 ATAGTTATTCATATAGTTTTAATTGTTTGACCTGGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATATC
292 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
80225 TTA
357 TTA
* * *
80228 GTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-TTCATATGAAT
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAAT
* * * * * ** * *
80291 AGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTACAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
80356 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCT
129 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
80417 TGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGTTGA-AAAACAATTATT
193 TAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG--AACAAAACAATTGTT
* * * * *
80481 TTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAAT-GGCTATAATTATT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATT
** ** * * * * * ***
80545 TGAACTAATTCAGTAAACAGAATAAGCTTGTATGAA-CTGAAA
319 TGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTA
** ** * * * * * **
80587 CAATTATTATATGAGTAAACAATATGTCAGAACGATTTGAACTATGTAATTATTCTAACAGTCCT
1 C--TTATTA-AT-TTTTGA-AATAT-TAATAA--ATTAGTATTAT-T--TTATT-T--C-G-AAT
* *** * ** * **
80652 AA-CTAT-T-TGAATTAGCTTGGAAAAAATAT-TTATT-TTTTAAATC----TCTTATTAA-TTT
50 AAGCT-TGTATGAA-TA-----GAAACAAT-TGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGAT
* * * ** * * ** * * *
80707 TTGAAATATTATTAAATTAG-T--ATTATTTTTATCCAAAT-AATCTTGTATGATCAAAAACAAT
105 TTGAAATA-GA-T-AATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGT-TGAT-AAATAGATT
* * ** ** * * * * * * *** * * *
80768 TGTTTTATGACAA-AACAAAGATCA-TAATGGTTTGAGAT-TGATATTTGTTCA-AATA-GTCAT
163 TATTTT-TTA-AATCTCTTA-CTTATTAAT-TTTTAAAATATTA-ATAAATT-ATATTATTTTAT
** ** * * **** * *
80828 AAC-AATTTGAATTGGT-TCG-A-AAAACAACTTTAGTTTT-T---AAATCTCTTGCTTATTAAT
222 TTCGAATAAG-CTT-GTAT-GAACAAAACAA--TT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAAT
* * ** * * *
80885 -TTTTGAAATATTAATAACGTAGTATT-ATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGAAC-TGAAATAA
280 GATTTGAAATA--GATAA--T--TATTCA-AATA-GTC--ATAA-CTATT-TGAACTTG---T--
* * * *** **** *
80947 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACT-TTA
328 TTG--GTA-AACAGATTTATTTTTTA-AAT--CTCTTA
** ** * * * * *
80984 AATATGTAATTGCT-CAA-ATT--T-AATTAGTATTAATTTA-TTCTAAATATGCTTGTGTGAAC
1 CTTAT-TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-
* * * * * * * * *
81043 TA-AAATAATTATTTTATGACTAAAGAAAAGTTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAAT
63 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
81107 AGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCT-AACACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTG-TT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
**** * * * * *
81167 TACGGAATACTATTAAATTAGTATTATTTAATTT-GAATAAACTTGTATCAA-AGGAAACAATTG
191 TTTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA--AAACAATTG
* * * * *
81230 TTTTATGATAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
81294 GTGAA-TTGTTTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAA--TC-T-
318 TTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * * * * *** *
81332 CTTATTAATTTTCAAAACATTAATAGATTAATATTATTTT-TTTTGAATATTTTTGCATGAATAG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * **
81396 AAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGGAAATCGATTAATTGTGGATAA
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTT-GAAATAGA-TAATTGTTCA-AA
* * * * * * * * *
81461 GTGGAGCCAGTGATTATATAAACATGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATT
127 -T--AGTCA-TAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * ** *
81526 AATTTTCAGAATATTAATTAATTAATATTATTTTATTAT-GAATAAATTTGTATGAATAGAAACA
187 AATTTTTAAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACA
* * * * *
81590 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATTATA
249 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * *
81654 ATTATTTGAACTTGCTTGGTAAATAGACTTATCTTTTAAATCTTTTA
313 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
81701 CTTATTAATTTTTTG-AATATTATTAAACTAGTGTTTTTTTATTTTGAATATGCTTGTATGAATA
1 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
81765 GAAACAATTAG-TTCATGACAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 GAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* *
81829 GTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAATA-ATTT-TTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATT
129 GTCATAACTATTTGAACT-TGTT--GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
** * * *
81889 TTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGT
191 TTTAAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGT
* * * * * * * * * *
81954 TTTATGTCAAAGCAAAATGTCTTAAGGATTTGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTC
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
82019 TAAACTTGTTCGATAAATAGATTCACTTTTTAAA-CTCTTA
319 TGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
82059 CTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAATTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * ** * * * * * * *
82124 ATACAATTGCTTCATGATGAAATAAAAGATTATGACAATTTGAAATAGCTAATTATTCAAATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
82189 TATGACTACTTGAACTTGTTTGGTAAACATATATATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCA
131 CATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * ** * * *
82254 AAATATTAATAAAATAATATTATTCTA-ATCTAAATAAATTTATATGAAAAACAAACATTTGTTT
195 AAATATTAAT-AAATTATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-AACA-AAACAATTGTTT
* * * * ** * *
82318 TGTGATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * * *
82383 ACCTTATTCAGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA
321 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
82422 CTTATTAATTGTTTG-AATATTGATAAATTTGTTTTATTTTA-ATCGAAATAAGCTTGTATGAAT
1 CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * * *
82485 A-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGATAATTGTTTAAAGA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
82549 GTCATAGCTATATGAACTTGTTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAATAT-TTGCCTTATTAATTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTT
** * * ** * * *
82613 TTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGCTGCTTT-GAATAAGCTTGTACGAATAAAAACAATTAT
192 TTAAAATATTAATAAATTA-TATTAT-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGT
* * *
82677 TTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAGCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACTA-TCATAATTT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTA
* * * ** * * * *
82740 TTTGCACTAGTATGGCCAACAGATTCATTTTCTAAATTTGTTA
317 TTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
82783 CCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTA-TTTATTTTGAATAAGATTGTATCAATA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * *
82846 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGAG-AATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATT
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
82910 GTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAAGAGATTTATTTTTT-AA------A--TATTAA----
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *** *
82962 T--AA-A-T--T--A--ATATTATTTTATTTTGAACAAACTCAAATGAACAAAAACATTTGTTTT
193 TAAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTT
** * * * * * *
83017 ACAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATACAGCCTTAACTATTT-A
257 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
83081 AATTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTAA
322 ACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
83120 GTTATTAA-TCTTCATAATATTATTAGAA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATTAAT
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * ** *
83183 ATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
83248 GTCATAACTATTTAAACTAGTTGGAAAAACATATTTATTTTTCAAATCT-TCTACTCATTAATTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTT
* * * * * * *
83312 TTGAAATATTAA-AAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAGGCTTATACGATGA-AAAACAATTGT
192 TTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA--ACAAAACAATTGT
* ** * * * * *
83375 TTTATGACAAATCAAAATTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTACT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * **
83440 CGAAC-TGATTCGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCCAA
319 TGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * *
83481 CTT-TTCAAATTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTTTTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACT
1 CTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * * *
83545 AAAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCGTAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
83610 -TACTTGACTATTTGAATTTGTTCGGTAAATATATATT-TTTTTTAAATTTCTCACTTATTAATT
129 GT-CATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
** * * * * *
83673 TTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTA
191 TTTAAAATATTAATA-AATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTG
* * * ** * * * * *
83737 TTTTATGACTAAACAAAAGATCAGAACAATTTAAAATTGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
83802 TGGAACTAGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA
318 TTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * ** * * * * *
83844 CTTATTAACTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAATAG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *
83908 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
83972 CATAACTATTTAAACTGGTCTGGTAAACATATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTG
131 CATAACTATTTGAACTTGT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* ** * *
84033 AAATATTAATAAATTAGATTATTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTA
195 AAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTA
* * * ** * * *
84097 CGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAA
258 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * *
84162 -TTCGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
323 CTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *
84198 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATCAAT
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * * *
84261 AGAACCATTTGTTTAATGAC--AACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * **
84324 GTCATAACTATTTGAAATTATTCGGTAAACAAATTCT-TTTTTTAATTCTTTTACCCATTAATTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * *
84388 TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAAA-AATTAT
192 TTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC--AAAACAATTGT
* * * * * *
84452 TTTATTACAAAACAAAAGATCAAAATAATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCATGACTATT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * *
84517 TGAACCTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAATAAT-TTA
319 TGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTCTTA
** ** * * * * * * * *
84558 CTTATTAATAGTCAAAATATTCATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAACAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * *
84623 AAACTATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
84688 CATAACTATTTGAA-TTGGTTTGTTATATAGATTTATTTTCTAAA--TC-T-CTTATTGATTTTT
131 CATAACTATTTGAACTT-G-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * * *
84748 GACATATTAGTAGATTAGTA-GA----A---C--A-AA--TTTTATGAAGAAAAACATTTGTTTT
194 AAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
84800 ATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTAATT-ATATAGCCTTAATTATTTG
257 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
84864 AACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
321 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * *
84903 GTTATTAA--TTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATAAACA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * * *
84966 TAAATAATTGTTTTATGAGAAACCAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATAAAAATGATCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
85031 TCATAAGTATTTAAACTGGTTCGGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCTACTCT-TTAATTTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTT
* *
85095 TGAAATATTAA-AAATTAGTATGATTTTATT
193 TAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (359 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTTGTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
AATATTAATAAATTATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
Found at i:72278 original size:17 final size:18
Alignment explanation
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Period size: 17 Copynumber: 2.7 Consensus size: 18
72241 AATAATAGGT
*
72251 CATAATGATTTGAAATAG
1 CATAATTATTTGAAATAG
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1 CATAATTATTTGAAATAG
*
72285 CCATGATTATTTGA
1 -CATAATTATTTGA
72299 GCTAGTTCGG
Statistics
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Consensus pattern (18 bp):
CATAATTATTTGAAATAG
Found at i:72948 original size:163 final size:163
Alignment explanation
Indices: 72675--72985 Score: 378
Period size: 163 Copynumber: 1.9 Consensus size: 163
72665 GCAAACAGAA
* * *
72675 TTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTTATTTTATTTTATTTCG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTAATGAATAATTTTTGAAATATTAATAA-TTTATATTATTTTATTTCG
** *
72740 AATAAGTTAGTAGGAACTGAAAAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAT
65 AATAAACTAGTAGGAACAGAAAAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
*
72804 AAAGAATTGTTCATATAGCCTTAGCTATTTAAAT
130 AAAGAATTGTTCAAATAGCCTTAGCTATTTAAAT
* *
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTAATGAATAATTTTTGA-AATATTAATA-ATTTA-TATTATTTTATTT
* * * * * * * *
72901 TGAATAAAACT-GTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGA
63 CGAAT-AAACTAGTAGGAACAGAAAAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* *
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72986 TCATATCTAT
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Consensus pattern (163 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTAATGAATAATTTTTGAAATATTAATAATTTATATTATTTTATTTCGA
ATAAACTAGTAGGAACAGAAAAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
AAGAATTGTTCAAATAGCCTTAGCTATTTAAAT
Found at i:76209 original size:538 final size:537
Alignment explanation
Indices: 75551--76571 Score: 1215
Period size: 538 Copynumber: 1.9 Consensus size: 537
75541 AATCTCGTAC
** *
75551 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCAAATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAACTGA
* * * * * **
75616 AAAAATTGTTTTATGATAAGACAAAAGGTCATAACGATTTGAATTAGATAATTGTTCTTATAGTC
66 AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTC
* *
75681 TTAACTATTTAAACTGGTTT-AGCAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAG-TTAATAATTTT
131 GTAACTATTTAAA-TGGTTTCAACAAACAAATTTATTTTTTGAAA-CTCTT-GCTTAATAATTTT
** * * *
75743 TTAAATATTA-TAAGATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAG-TTTGTAT-AAGCAGAAATAATTG
193 CAAAATATTAGGAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT-TATGAA-CAGAAAAAATTG
* * * *
75805 TTTTATGACATAACAAAA-ATTTATAATGATTTGA-AGTATACAATTGTTCAAACAATCATGACT
255 TTTTATGACAAAACAAAATA-TTATAACGATTTGACA-TAAACAATTGTTCAAACAATCATAACT
* **
75868 ATTTGAACTAGTTCGGTGAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-GA
318 ATTT-AACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTCCAAATG-
* * * * * *
75931 TTAACAAATTAGTATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAGAAAACAATTGCTATATGAC
381 TTAACAAATTAGGATTATGTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGACAAG-AAACAAATACTATATGAC
*
75996 GAAACAAAATGTGAT-AATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATGGCCATATTTAAGTGATTCA
445 GAAACAAAAGGT-ATAAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATGGCCATATTTAAGTGATTCA
76060 GCAAATAGATTCACTTTTACATAACTTAA
509 GCAAATAGATTCACTTTTACATAACTTAA
*** *
76089 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-AATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAACTG
* * *
76152 AAAACGATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACTAGTTT-AAATAAACAATTGTTCAAATA
65 AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAAACAATTGTTCAAATA
* ** * *
76216 GTCGTAACTATTTGAATTTTTTCAATAAACAAATTTATTTTTTGAAACTCTTGCTTATTAATTTT
128 GTCGTAACTATTTAAATGGTTTCAACAAACAAATTTATTTTTTGAAACTCTTGCTTAATAATTTT
**
76281 CAAAATATTAGGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTT
193 CAAAATATTAGGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACAGAAAAAATTGTTT
** * * * * *
76346 TATTTCAAAACAAAATATTATAACGATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTA
258 TATGACAAAACAAAATATTATAACGATTTGACATAAACAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTA
* * * * * *
76411 ACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAAATGTTCATAA
323 ACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTCCAAATGTTAACAA
* * * * * *
76476 ATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGACATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAA
388 ATTAGGATTATGTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGACAAGAAACAAATACTATATGACGAAACAAA
* *
76541 AGGTCTAAATGATTTGAACTAGATAATTATT
453 AGGTATAAATGATTTGAAATAGATAATTATT
76572 CTAATAGTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (537 bp):
TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCAAATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAACTGA
AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTC
GTAACTATTTAAATGGTTTCAACAAACAAATTTATTTTTTGAAACTCTTGCTTAATAATTTTCAA
AATATTAGGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACAGAAAAAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAATATTATAACGATTTGACATAAACAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTAACT
AGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTCCAAATGTTAACAAATT
AGGATTATGTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGACAAGAAACAAATACTATATGACGAAACAAAAGG
TATAAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATGGCCATATTTAAGTGATTCAGCAAATAGATTC
ACTTTTACATAACTTAA
Found at i:76747 original size:538 final size:536
Alignment explanation
Indices: 72836--95913 Score: 6662
Period size: 539 Copynumber: 42.3 Consensus size: 536
72826 AGCTATTTAA
* *
72836 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTAATAATTTTTAGAATATTATTACATTAGTATTA-TTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTT-A-T--TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
** * ** * * * * **
72900 TTGAATAAAAC-TGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTG
62 TCAAAT-AAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACA-AAAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * ** * * *
72964 AAATATATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAACTGGTTGCATAAATAGATTTATTTTTTA
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTTTTG-GTAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * * *
73029 AATTTCCTAGTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTG
189 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTT
* *
73094 TATG-AT-GAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGTTAATAACGATTTGAAATAGATAATT
254 TATGAATAG-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * * * *
73157 ATTTAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTTAGTAAACTGATTTATGTTTTAAATCTCTAAAT
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * * * *
73221 TATGAATTTTT-ACAATATTAATAAAGTAATATTGTTTTATT-TCAAATAAGCTTTTATGAATTG
380 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * ** * *
73284 AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAGCGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
442 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * *
73349 CAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
507 CATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* *
73379 A-TT-TTTTTTAATTTAT-TACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT
1 ATTTATTTTTTAA---ATCT-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
** *** ** * * * * * *
73440 TTGAATAAGCAAATACAAGCTA-AAGCAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAATGATTTG
62 TCAAATAAGCTTGTATGA-TTAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTG
* ** * *
73504 AAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGCAAACACATTTATTTTTTA
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * * * *
73569 AATC-CTTACTTATTAATGTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGCTT
189 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * * * * *
73632 GTATGAATAGAAATAAA-TGTTTTAGGATAGAACAAAAAT-ATAACAATTTGAGATAGATAATTG
253 TTATGAATAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* *** * *
73695 TTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCAATAAAGAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTT
317 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* ** * * * ** **
73755 ATTACTTTTCAAAATAGTAATAAATTAGTATGATTTTTTTCAAAATAATTTTGTATGAATAGAAA
381 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAA
* * ** * * *
73820 CAATTATTTTACGACAAAACAAAATGCCATAATGACTTGAAAAAGATAA-TAGTTCAAATAGACA
445 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCA
* * *
73884 TGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAG
509 TAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* *
73912 ATTAATTGTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATC-T---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
** * * * * * ** * *
73976 TTTAATAAACTTGTATGAATAGAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAGGATCGCAACGAATTGA
62 TCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGG-TCATAATGATTTGA
* * *** ** * *
74041 AATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCAGTAAACAGATTTATTTTTAAA
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * *
74106 ATCTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAGGTTTT
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTT
* * ** ** * * *
74170 TTGAATAGAAACAATTGGCTTACAACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
255 ATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * **** * *
74235 CAAATAGTCATAACTCTTTGAACGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATT
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * *
74299 AATTTTTGGAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCATGCATGAATAAAACC
384 AATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATGAAA-C
* * * * * *
74362 AATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAGTTATA
446 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
** * *
74427 ACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAT
511 ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * *
74453 ATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCTTTAATTTTTGGAATAATAATAAATTAGTATTA-TTTTAT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA----TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
** *
74517 TTCAAATAAGCTTCCATGATTTA-AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
61 TTCAAATAAGCTTGTATGA-TTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTT
* * *
74581 GAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCGTGAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAAC--A--TATTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAATTT-TTTGGTAAACAAATTTATTTTT
* * * * * * * *
74642 TAAAATATTTTACTTATTAATTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATGTTAATTCGAATAAGC
187 T-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
** * * * *
74707 TCATATGGACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAAAGTCATTA-GAATTTGAAATAAAT
251 TTTTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAAC--AAAAGTCATAACG-ATTTGAAATAGAT
* * * *
74770 AATTGTTCAAATAATCATAACGATTTGGACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
312 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* *
74835 ACTTATTAATTATCTT--AATATTAGTAAATTTGTATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATGA
377 ACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGA
* * ** ** * *
74897 ATAGAAA-ATATCATTTTATGACAAACCAAAAGGTTATAACAATTCCAAATAGTTAATTGTTCAA
439 AT-GAAACA-ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * **
74961 ATGGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAG
502 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * *
74996 ATTCA-TTTTTAAATTTCTTAATTATTAATTTTCAGAATATTAATAACA-TAGTATTA--TTTAT
1 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTTAT
* * * * * * *
75057 TTCAAATGACCTTATATGAACT-GAAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTT
61 TTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * *
75120 AAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTG-ATCTAGTGTGGTAAACATATTTATTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-T-TTTTGGTAAACAAATTTATTTTT
* * * * ** * * * * *
75184 AAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAACATTCATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCT
187 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
** ** * * * * * * *
75249 AGTATGAATAGAAACTATTATTTTTTAAGAGAACAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT
252 TTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
75314 GCTT-AAATATTCATAATTATTTGAA-TTGGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAATC---T-C
316 G-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * * **
75373 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATT-TCGAACAAACTTCTATGAACAA
379 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATGA
* * * ** * * * *
75437 AGACATTTATTTTATGACAAAACAATAGGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTGTTCCAATAGT
443 A-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *
75502 CATAATTATTTGAACTGG-TTAGGTAAATAT
507 CATAACTATTTGAACTGGTTTA-GTAAATAG
* * *
75532 A-AT-TTTTTTAATCTCGTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTCA-TTTTA-TTTTAT
1 ATTTATTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTTAT
* * * * * *
75592 TCCAAATAAGCTAGTATGAATT-GAAAAAATTGTTTTATGATAAGACAAAAGGTCATAACGATTT
61 TTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAA-AAAAAAGGTCATAATGATTT
* ** * * ** * *
75656 GAATTAGATAATTGTTCTTATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * *
75721 AAATCTCTTAGTTAATAATTTTTTAAATATT-ATAAGATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAG-T
188 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * * * * *
75784 TTGTAT-AAGCAGAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAATTTATAATGATTTGAAGTATACAA
252 TT-TATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * *
75848 TTGTTCAAACAATCATGACTATTTGAACTAGTTCGGTGAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
314 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * *
75913 TTATTAATTTTTGAAAGATTAACAAATTAGTATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAGA
379 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATG-
** * * * * * *
75978 AAACAATTGCTATATGACGAAACAAAATGTGATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAAT-GG
442 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * *
76042 C--CA-TATTT-AAGTGATTCAGCAAATAG
507 CATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * * *
76068 ATTCA-CTTTTACATAACTTAATTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTTAT
1 ATTTATTTTTTA-A-ATC-T-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
** * * *
76130 TTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACGATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACT-AGT
61 TTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAA-TGA-T
* * * **
76193 TT-AAATAAACAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTTTTCAATAAACAAATTTATTTT
122 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTTTT-GGTAAACAAATTTATTTT
* ** ** *
76257 TTGAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAGGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAG
186 TT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
* ** * * * * *
76321 CTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATTTCAAAACAAAATATTATAACGATTTTACATAAATAA
250 CTTTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* *
76386 TTGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTG
314 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTA
** * * * * *
76450 CTTATTAATTTTCCAAATGTTCATAAATTTGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGACATG
378 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATG
* * * *
76515 AAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCTA-AATGATTTGAACTAGATAATTATTCTAATAG
442 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT-TATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
** * * *
76579 TTTTAACTATTTAAACTGGTTTAGCAAATAC
506 TCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* **
76610 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTA-ACCAA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAA
* * * * ** * *
76674 ATCAGCTTCTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAGGTTTTAATGATTTGAGATTG
66 ATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * *
76739 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTGTTTAAATCTG
131 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* *
76804 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG-A
195 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA
* * * ** **
76868 TAAAAGAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAA
260 TAGAA-AA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * *
76933 AT-GATAATAATTATTTTAA-TTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATT
322 ATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATT
** * ** * *
76995 AATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTCTAAGCTTGTATTAACTGAGACAA
384 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAA
* * ** * * * *
77060 TTATTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATAATAATAAC
448 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
** * * *
77125 TATTTGAACTTATTCAGTCAACAG
513 TATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * *
77149 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTACTAATTTTT-GAAATGTTAATAAATTAATATTA-ATTTA-
1 ATTTATTTTTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * * * *
77211 TTCTAAATAAGCTTGTATCAATT-GAAACAATAGTTATATGACTAAATAAAAGGTCAGAATGATT
61 TTC-AAATAAGCTTGTAT-GATTAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATT
* * * ** * * * ** * *
77275 TGAAGTATATAATTATTCTCATATTCTTAACCATTTGAAATAATTCGATAAACAAATTTATTTTT
123 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTT
* * * *
77340 TAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATGAAAGTAGTATTATTTTA-ATCGAAATAAG
187 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAG
* * * * *
77403 CTTGTA-CAA-A-AAAACAATTGTTTTGTGACAAAAGAAAAGATCATAGCGATTT-AAGATAGAT
250 CTTTTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAA-ATAGAT
*** * * * ** ** *
77464 AACCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTAGTTCGACAATTAGATTT-TTTTTAAAAT-TTT
312 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
** * * * * * *
77526 CTGGTTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTTGCATTATTTTATTCTGAATAA-ATTAGTATAA
376 -TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTT-GTATGA
* ** * * * * *
77590 ATAGAACCAATGGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATATTGATTTAAAATAGATAATTATTTAAA
439 AT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * * * **
77655 TAGTCAAAACTATTTAAAATAGTTTGGCAAGCAG
503 TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
** *
77689 ATTTGCTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTAT-T
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * * * ** * * * *
77752 TTGAAA-AAACTTATATTAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTG
61 TTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * *
77816 AAATAGATAATTGTGCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGATTTT-GTAAATAAAATTATTTTCT
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T-TTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * * * * *
77880 AAATCTCTTAGTTCTAAATTTTTGAAATATTAATAAACTAATTTTATTCTATTTTGAATAGGCTT
188 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * * * *
77945 GTATGACACAG-AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATT
253 TTATGA-ATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *** *
78009 ATTCATATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCGGCAAAC-GAATTTATATTTTAAATCTCACAGT
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * *
78073 TATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTATTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGATTAGA
380 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GA
* * * ** *
78137 AACAATTGTTTTATGATAGAAC-AAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
443 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * *
78201 ATAACTATTTGAACTTGATCAGCAAATAG
508 ATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * * *
78230 ATTTCTTTTCTAAGTCTCTTATTAATTCTT-GAAATATTAATAAATTAGCATTA-TTTTATTTCA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCA
* * * * * * *
78293 AAAAACCTTGTATG-TTGAAAAATAATTATTTTATGACAAAAAAAAGGTAAT-ATCGATTTAAAA
65 AATAAGCTTGTATGATT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAA
* * * * * ** *
78356 TAGATAGTTGTTTAAAT-GGCTATGATTATTTGAACTGATTTGGTAAACTAATTTATTTTTTAAA
128 TAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * *
78420 TCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTA
191 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTA
* * * * * ** * *
78485 TAAATTA-AAACAATTTTTTTATGACAAAATAAATGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGCT
256 TGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * ** *
78549 GAAATAGCCGTAACTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTAT
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTAT
* * * * ** * *
78614 TAATTTTTTG-AATGTCAGTAAATTAGTATTATTTTATACCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAAT
383 TAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAC
* * * * * *
78678 AATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTA
446 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * *
78743 ACTATTTAAACTGGTTTGGTAAATAC
511 ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * * * * * *
78769 ATTTATTTTTTAAATCTCATACTAACTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATAATTTTTGTCT-GA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAA
* * * * * * * * *
78833 ATAAGCTTGTATGATCAAAAATAATTGTTTTATGAGAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGATTG
66 ATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* ** ** * * * *
78898 ATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAGTGGTTCAGAAAACAACTTTAGTTTTTAAATCTT
131 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * ** *
78963 TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAAT-GTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTATGAA
195 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA
* * * * * *
79027 CTA-AAACAATTGATTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACCTT-AAATAGATAATTATTCAA
260 -TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * *
79090 AAAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATATCTTA-TTCATT
322 ATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTT-ATT
* * * * **
79153 AATATTTCG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAATTA
384 AAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACA
* * * * * * * *
79217 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAATATATAATTGTTCTAGA-A-TCTTA
447 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCATA
* *
79280 ACTATTTGAACTGGTTT-GATAAACAC
511 ACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
* * * *
79306 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAG---TA---TTA--TC--
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAA
*
79361 TTAA--TTG-A--A-T----ACAATTGTTTTATGACTAAAGAAAAA-GTCATAATGATTTGAAAT
66 ATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * *
79415 AGATAATTATTCTAATAGTCTTATCCATTTGAATTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
129 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-TTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * ** **
79480 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAAGAATAAGCTAGTATG
193 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATG
* * * * ** * * * * ** *
79545 AACA-AAATAATTATTGTACAACAAAAGAAAAAGTGATAATGATTTCAAATAGATAATCATTCAT
258 AATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * ** **
79609 ATAGTCTTAGCTATTTGAACTAGTTAGGCAATTAGATTTATTTTTT-AAT-TTTCATGGTTATTA
322 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT--TACTTATTA
* * * * * ** * * **
79672 AGTTTT-AGAATCTTATTAAATTAATATTATTTTATTAC-AAATAAAATAGTTTGAACAAAATCA
385 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAATGAAA-CA
* * * ** *
79735 ATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAA
447 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * *
79800 CTATTTAAAATGGTTT-GTAAACAG
512 CTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * *
79824 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTGTTA-TTTTGT
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * ** * * * * *
79887 TTCAAATAAACTT-TATTAACA-AAAGCAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAAGTAATAAAGATTT
61 TTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * *
79950 -AGAATAAACAATTATTCAAATAGTTATAATTAATTGAATTGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTC
124 GA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-TTTTGG----T--AA--A----C
* *
80014 TAAATCTCTTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAACTTTTGAAATATTAATAAAT
175 -AAA----TT---T---A-T-TTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * *
80079 TAGTTTTATTTT-TTTTCCAAATAAGCTTGTAT-AAGCTA-AAATAATTGTTTTATGAC---A-A
226 TAGTATTATTTTATTTT--GAATAAGCTTTTATGAA--TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * ** * * * * ***
80137 AAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAGTTATTCATATAGTTTTAATTGTTTGACCTGGTTCAATA
287 AAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTA
* * * * *
80202 AACATATTTATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATTATT
352 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
80266 TTATT-TCGAATAAG-TTCATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTACAAA
416 TTATTCT-GAATAAGCTT-GTATGAAT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT
* * * * * * *
80329 AATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAG
478 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * *
80388 ATTTAATTTTTAAATCTCTTATTAATTCTT-GAAATATTAGTAAATTAGTATTA-TTTTATTTCA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCA
* * * *
80451 AATAGGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAA
65 AATAAGCTTGTATGATT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * ** ** * * *
80515 TAGATAGTTGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACAGAA-TAAGCTTGTAT
128 TAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACA-AATTTA--TTTTTT
* *** ** ** * * * * * *
80578 GAA-CTGAAACAATTATTATATGAGTAAACAATATGTCAGAACGATTTGAACTATGTAATTATTC
188 AAATCTCTTAC--TTATTA-AT-TTTTGA-AATAT-TAATAA--ATTAGTATTAT-T--TTATTT
* * *** * ** *
80642 TAACAGTCCTAA-CTATT-TGAATTAGCTTGGAAAAAATAT-TTATT-TTTTAAATC---TCTTA
242 TGA-A----TAAGCTTTTATGAA-TA-----GAAAAAAT-TGTT-TTATGACAAAACAAAAGTCA
** * * * ** * * ** * *
80700 TTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAG-T--ATTATTTTTATCCAAAT-AATCTTGTATGATCA
294 -TAACGATTTGAAATA-GA-T-AATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTTGGT-A
* * * * * * **** * * **
80760 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCA-TAATGGTTTGAGATTGATATTTGTTCAAA-T
352 AACAGATTTATTTT-T--TAAATCTTTTACTTATTAAT-TTTTGA-A---ATA-TTAAT-AAATT
*** * * **
80822 AGTCA-TA-ACAATT-TGAAT----TGGT-TCGAA--AAACAACTTTAGTTTT-T---AAATCTC
407 AGT-ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAT-GAATGAAACAA--TTA-TTTTATGACAAAACAA
** * * * ** * * *
80873 TTGCTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAACGTAGTATT-ATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATG
467 AAGGTTA-TAATGATTTGAAATA--GATAA--T--TATTCA-AATA-GTC--ATAA-CTATT-TG
* * *
80936 AACT-G--AAAT-AATTG
519 AACTGGTTTAGTAAATAG
* ***** ** * * * * *
80950 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTAAATATGTAAT-TGCTCAAATTTAATTAGTAT
1 ATTTAT----TTTTTAAATCTC-TTATTAATTT--TTA-G-AATAT--T--AA-TAAATTAGTAT
* * * * * * * *
81014 TA-ATTTA-TTCTAAATATGCTTGTGTGAACTA-AAATAATTATTTTATGACTAAAGAAAAGTTC
52 TATTTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTC
* * * * ** *
81076 AGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCT-AACAC
114 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGG-TAAACAA
** * * * *
81140 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTACGGAATACTATTAAATTAGTATTA-TTTAATT
177 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
81200 TGAATAAACTTGTATCAA-AGGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGA
242 TGAATAAGCTTTTATGAATA-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGA
* * * *
81263 GATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATGTGAA-TTGTTTTGGTAAACAAATTTAATTTTTA
305 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTA
** * * * * ***
81327 AATC---T-CTTATTAATTTTCAAAACATTAATAGATTAATATTATTTT-TTTTGAATATTTTTG
369 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG
* ** * *
81387 CATGAATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGGAAATCGATTAAT
434 TATGAAT-GAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATAATGATTT-GAAATAGA-TAAT
* ** * * * * * * *
81452 TGTGGATAAGTGGAGCCAGTGATTATATAAACAT-G-TTCGATAAATAA
495 TATTCA-AA-T--AGTCA-TAACTATTTGAAC-TGGTTTAG-TAAATAG
* * *
81499 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAGAATATTAATTAATTAATATTA-TTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCT-CT---TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
* ** * *
81563 AT-GAATAAATTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTT
62 -TCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAA-TGATTT
* * * * * * ** * * * *
81626 GAAATAAATAATTATTCAAACAATTATAATTATTTGAACTTGCTTGGTAAATAGACTTATCTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * * *
81691 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTATTAAACTAGTGTTTTTTTATTTTGAATATGCT
188 AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * *
81755 TGTATGAATAGAAACAATTAG-TTCATGACAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAAT
252 TTTATGAATAGAAAAAATT-GTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
** * * *
81819 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATA-ATTT-TTTTTTTAAT-TTTTAC
315 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
*
81880 TTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGGAATAAGCTTATATGAAT
379 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * * *
81942 AGAAACAATTGTTTTATGTCAAAGCAAAATGTCT-TAAGGATTTGAAATATAAAATTGTTCAAAT
441 -GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT-TATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * *
82006 AGTCATAACTCTCTAAACTTG-TTCGATAAATAG
504 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
* * * *
82039 ATTCACTTTTTAAACTCTTACTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTT
* * * * * * * * * * * **
82103 CGAATAAGCCTATATGAATT-GATACAATTGCTTCATGATGAAATAAAAGATTATGACAATTTGA
63 CAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * * * *
82167 AATAGCTAATTATTCAAATAGTTATGACTACTTGAACTTGTTTGGTAAACATATATATTTTTTAA
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * ** * * * * * * *
82232 ATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAAATAATATTATTCTAATCTAAATAA-ATTTA
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTT-
* * * * *
82296 TATGAA-A-AACAAACATTTGTTTTGTGATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAAT
254 TATGAATAGAA-AAA-A-TTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * ** * *
82359 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTATTCAGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
315 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * * *
82424 TATTAATTGTTTG-AATATTGATAAATTTGTTTTATTTTAATC-GAAATAAGCTTGTATGAATAA
380 TATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATGA
* *** * * * *
82487 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGATAATTGTTTAAAGAGTC
443 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * *
82552 ATAGCTATATGAACTTG-TTCGATAAATAG
508 ATAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
* * * * * ** **
82581 ATTCAGTTTTTAAATATTTGCCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGCTGCTT
1 ATTTA-TTTTTTAA-ATCT--CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
* * * * * *
82646 T-GAATAAGCTTGTACGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AAGCGATTTG
62 TCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAA-TGATTTG
* * * * ** * ** * * *
82709 AAATAGATAATTATTCAAACTA-TCATAATTTTTTGCACTAGTATGGCCAACAGATTCATTTTCT
125 AAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTG-AATTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * *
82773 AAATTTGTTACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTA-TTTATTTTGAATAAGAT
188 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * *
82836 TGTATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGAG-AATAATGATTTGAAATAAATAAT
252 TTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA--AGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * *
82900 TGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAAGAGATTTATTTTTT-AA------A--
315 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * *** **
82956 TATTAA----T--AA-A-T--T--A--A-TATTATTTTATTTTGAACAAACTCAAATGAACAAAA
380 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAA
* * ** * * * * * * *
83006 ACATTTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATACAGCCT
444 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * *
83071 TAACTATTTAAATTGGTTTGGCAAACAA
509 TAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * * *
83099 ATTTATTTTTTAAATTTCTAAGTTATTAATCTTCATAATATTATTAGAA-TAGTATTA-TTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTTAT
* * * * * * * *
83162 TTCAAATAAGCTTATATTAATATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAGAATAATTTG
61 TTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTG
* * * ** * * *
83227 AAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTGGAAAAACATATTTATTTTTCA
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTTTTGG-TAAACAAATTTATTTTTTA
* * *** *
83292 AATCT-TCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAGGCTT
189 AATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * * *
83355 ATACG-AT-GAAAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAATTTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
253 TTATGAATAG-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * ***
83418 TGTTCAAATGGCCATAATTACTCGAAC-TGATTCGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCCAAC
315 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * * * * *
83482 TT-TTCAAATTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTTTTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACTA
379 TTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-T-
* * * * ** * *
83546 AAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCGTAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA-
441 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * ** *
83610 TACTTGACTATTTGAATTTGTTCGGTAAATAT
506 T-CATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* *
83642 ATATT-TTTTTTAAATTTCTCACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTA-TTTTA
1 AT-TTATTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTTA
*** * * * * * * **
83704 TTTTGGATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAGAACAATT
60 TTTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * ** * * *
83768 TAAAATTGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTGGAACTAGTTTAGCAAACACATTTATTTTT
123 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTT
* * * ** * * * ***
83833 TAAATCTCTTACTTATTAACTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCT
187 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * *
83897 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATT
252 TTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
83961 ATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTCTGGTAAACATATTTAGTTTTTAAATC---T-CTT
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
** *
84022 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAA
381 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAA
* * * * ** * * *
84086 TAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTCAT
445 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * ** * *
84151 AACTATTTGAATTCGTTCGGTAAACAA
510 AACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
84178 ATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTTA-TATTA-TTTTA
1 ATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTTA
* * * * * * * * *
84239 -TTCAAAATAAGCTTGCATCAATAGAACCATTTGTTTAATGAC-AACAAAAGGTCATTATGTTTT
60 TTTC-AAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * *
84302 GAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAAATTATTCGGTAAACAAATTCT-TTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTTTTTGGTAAACAAATT-TATTTTT
* * ** * * *
84366 TAATTCTTTTACCCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATAAGCT
187 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * **
84431 TATATGAACT-GAAAAAATTATTTTATTACAAAACAAAAGATCAAAATAATTTGAAATAGATAAT
252 TTTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAAT
** * * * * **
84495 TACTCAAATAGTCATGACTATTTGAACCTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAATAATTTACT
315 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
** ** * * * ** * **
84560 TATTAATAGTCAAAATATTCATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAACAAAA
380 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAA
* * * * ** * **
84625 ACTATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCA
444 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* *
84690 TAACTATTTGAATTGGTTT-GTTATATAG
509 TAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
* * * * *
84718 ATTTATTTTCTAAATCTCTTATTGATTTTT-GACATATTAGTAGATTAGTA-GA-----A---CA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCA
** * * * *
84773 AAT----TT-TATGAAGAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTAAAAT
65 AATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * ** *
84833 AGATAATTAATT-ATATAGCCTTAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAAT
129 AGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
84897 CTCTTAGTTATTAA--TTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTA
192 CTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTA
* * * * * * * * * * * *
84960 TAAACATAAATAATTGTTTTATGAGAAACCAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATAAAAATGATC
256 TGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * **
85025 AAATAGTCATAAGTATTTAAACTGGTTCGGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCTACTCT-TT
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-TATT
* ** * * * * *
85089 AATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTATGATTTTATTCCAAATAGGCTTATA-CAAAGAAA-ACC
384 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAACA-A
** ** ** ** * * **
85151 TATAGTTTTATTG-TTAGCCTTGAA--TTGATCCTTATTTTGAAAT-GACAAAACATT--AA-AG
448 T-TA-TTTTA-TGACAAAAC-AAAAGGTT-ATAATGA-TTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
85209 -C-TAAATAAACTTGATCAAGATTTTG-AAAAAGG
506 TCATAACT--ATTTGAAC-TGGTTTAGTAAATA-G
** * * * * * * * * * * *
85241 ATTTATTTAGTACATGTTCTTAAGTTTTATATTTTGGTACATAAATAAA-TAATATGATTTTCAA
1 ATTTATTTTTTAAAT-CTCTT-A--TTAAT-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
** * * * *** * * * ** *
85305 AGCTAAACAAACCTT-TCT--TT-GTTTCCA-T-ATTTCT--CAACCAAAA--TC-T-AT-CTTT
61 TTC-AAA-TAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * ** **** * * ** ** *
85357 AAAAGAGTTATTTATTTGAGGCTTCAATGAC-AGTCCAATTGTTGTTTTTAAA-AGTGAACTTAT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAATT-TT-TTGGTAAACA---AATTTAT
*** * * ** *
85420 TCAATTGACTTAAATAAATT-TTTGATAATATGTTTTTAGAAATAGATTTAA-AAAAAAGT-TTG
183 T---TT---TTAAATCTCTTACTT-AT--TA-ATTTTT-GAAAT--A-TTAATAAATTAGTATTA
**** * * * *** * * ** *
85482 TTTTAACAAGAACATAG--TTTA-CATATTGAACTTATT-TAATTATCTGTATTAATTCAGAAAT
234 TTTTATTTTGAATA-AGCTTTTATGA-ATAGAAAAAATTGT--TT-TATG-A-CAAAACA-AAAG
** * * * ** * * **
85543 TTTTAA-TATTT-AAAT--TTTATATGTTGGAA-AGCTCTTTAAGTCTACTTTCTAA--TGGAT-
291 TCATAACGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAG-TC-ATAA--CTA-TTT-GAACTTGTTTG
** * * ** ** ** * ** * * * *
85600 AAAAAAAAATTTATAAATCCAAAAATTTTA-TAAGAAAAAATTTTG-AATCTTTACTAGAACTGC
349 GTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACT--TATTAATTTTTGAAAT-ATTAATA-AA-T-T
* ** * * * *** * *
85663 AGT-TGTAAATAGTTAAAACTATAAGGAAACTT-T-TGAAAATTTCACTATAATTTGTAT--CAA
407 AGTAT-T--AT--TTTATTCT-GAA-TAAGCTTGTATG--AATGAAACAATTATTT-TATGACAA
* * * * * ** ** *
85723 TAATAGATGATGGATTTTTATATGGTTAGAAATACCTTTAATCTATTTTCTAAATCTTCA-AAGG
462 -AACA-A--AAGG--TTATA-ATGATTTGAAATA--GATAAT-TA--TTC-AAATAGTCATAA-C
* * **
85787 T-TTTGATA-AGGATTA-TATTTA-
513 TATTTGA-ACTGGTTTAGTAAATAG
** ** * * * * ** * * * * *
85808 AAATA-TGATTAAATTTAGTTGAGTAA-GTCAAAAAGGA-TAATAACA-CAGCATTGACAATATC
1 ATTTATTTTTTAAATCT-CTT-ATTAATTTTTAGAA-TATTAATAA-ATTAGTATT----AT-TT
* *** * *** * **** *** * ** *
85869 TCATGGAAAATCGATAG-TAGTCATGATT--TTTCAAGTGAAAAATGTTTAAAAAATGAACACAA
57 TTATTTCAAAT--A-AGCTTGT-ATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAA
* * *** * * * **
85931 TTCAATTCTCAAGCA-AGGGATCGACCGGTTC---TAGGCGAAAAC-ACTCCAACGGCTACTTTT
118 -T-GATT-TGAA--ATA--GAT--AATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA----T--TTTT
*** * * * * *
85991 TGGTGCTTCCAATGGCTATTTTCTTCTCCCAAA-CACTTCCAATGGCTATT--TTCTTCTCCCAA
167 TGGT-AAACAAAT--TTA-TTT-TT-T---AAATCTCTT--ACT---TATTAATT-TT-T--GAA
* ** * * * ** ** * ** * * * * *
86053 ACACTT--CCAA-TGGCTACCTCTTCAATTTCTCTATAA-ATTGGGCACTCCAACACACCAAGA-
214 ATA-TTAATAAATTAG-TA-TTATTTTATTT-TGAATAAGCTT--TTA-T-GAATAGA-AAAAAT
* * * * * * ** * * *
86113 TGATTGATGAATCAAGAGAGCAAGAG-C-CAAC-A--AGTAATATTTTCATTCTCTCAAATAATC
270 TGTTTTATG-A-CAA-A-A-CAAAAGTCATAACGATTTGAAATA-GATAATTGT-TCAAATAGTC
* * * * * * ** * * ** *
86173 A-AGAGT-TTT-TAC-AG-CT--TCAA-AG-TCTATATCTTTGTATTTATTGTATCCAAATTATT
328 ATA-ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGAT-T-TAT-TTTTTAAATCTT-T-TACTTATTAAT
* * * ** * * * * * **
86229 TTTTG--TTGTTCATTCATCA-T-TT-TCTTA-TCT--AT-ACCATTGTGT-ACT-TCA-AATTA
387 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGC-TTGTATGAATGAAACAATTA
*** ** * * * * * * * * * *
86282 -GCAAACACCCAACCTTTGAGAGGTTCTTA-GAGTTTGCAA-A-A-CACT-TT-AAA-A-T--TT
451 TTTTATGA-CAAAAC---AAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
** ** * ** * **
86336 TTTATTGTGTGCTTGTACACTTAAGGGGGAGG
511 ACTATT-TGAACTGGTTTA-GTAA---ATA-G
* *** * * * * * * * * * * *
86368 A-TAACCCTTAAAAGTGTGTAGTGTTGAGTTTGTA-AAGCT-TTGAGAAGCTT-GTTTGTAATCT
1 ATTTATTTTTTAAA-TCTCT--TATT-AATTTTTAGAA--TATTAATAA-ATTAGTAT-T-ATTT
* * * * * * * * *
86429 TTA--ACACAT-AG--TG---GATTTG-AGC-CTTGGTGT-GGACAACCAAGAGAAAGGACATAG
57 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAA--AA-A-AAAGGTCATA-
* * * ** * ** **
86483 GTGCCTTGTGGAGAAGGACCGAACCTTTATAAATCACTGTGTTTGATTTCTCTATCCCTATCTCC
117 ATG-ATT-T-GA-AA-TA--G-------AT--A--A-T-TGTTCAAATAGTC-ATAACTA--T--
* * * *** * * * *
86548 TTATAATTTATTGTTGTCCATATTTGA--TTTTAAGT-TCATTAATTGTT-ATTGTTTGCATTAT
157 TT-GAATTTTTTGGTAAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT-TTTG-A--A-
* * * * * * *** ** * **
86609 ATTTTCATCAAA--AGTGTT-TATTGTCTT-AATTTCCATTCAACT-ATATTGAAATCATTG-TT
214 ATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-TTTTA-TGA-ATAGAAAAAATTGTTT
** *** * * ** * ** *
86668 TGGGA-AGAATTTGGAGAGATCCAATTTACCCCCCCTTTTGGATCACCATCTAAACTATAAAGCT
275 TATGACA-AA--ACAAAAG-T-C-A--TA----ACGATTT-GA--A--A--TAGA-TA-ATTGTT
* * ** * * * * * * *
86732 -AACATTTATGACAAAAGAAAAGTTCATA-GTGATTT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAATGGC-
319 CAA-A--TA-GTC-ATA-ACTATTTGA-ACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT--CT
** * * * * ** ** ** ** * *
86791 CATAATTATTTGAACTGATTTGATAA-ACTGATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTCTTAATTTAT
374 TTTACTTA-TT-AA-T-TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT-T-TTA-TTCTGAA--TAA
* * * * ***** * * *
86855 GAAATAT-TAAT-AATGTAA-TATTATTTT-TGTCTTGTTGTAAAA---CAAAATGCCATAATGA
429 G--CT-TGT-ATGAATGAAACAATTATTTTATGAC--AAAACAAAAGGTTATAATG--AT-TTGA
** * * ***** * * * * * **
86913 TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTGACTATTTGAATTTGTTT-GATAACCAG
485 -AATAGATA-ATTATTCAAATAGT---CATAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
* * * *
86970 ATTTATTTTTATAAATTTTTTGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTA-TTTTA
1 ATTTATTTTT-TAAA---TCT-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTTA
** * * * * * * *
87033 TTTTGAATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAACGATT
60 TTTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATT
* ** * * ** * *
87097 TGAGATAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCAGTAAATATATTTATTTTT
123 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-TTTTGGTAAACAAATTTATTTTT
* * * * * * *
87162 AAAATCTCTTACTTTTTAATTTTAG-AATATT-ATCAGTCTAGCTA-TATTTTACTCTGAATAAG
187 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAG-TATTATTTTATTTTGAATAAG
* * * * *
87224 CTTGTATGAACA-AAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATA
250 CTTTTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * *** * * ***
87287 ATTATTTAATTAGTCATAACTATTT-AGACTGGTTCAATAAAAAAATTTAGCCTTTAAATC---T
313 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* ** *
87348 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATGAATTAGTATTATTTTATTCT-ACATAATTTTGTATAAAC
377 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAA-
** * * * * * * * *
87411 AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCACATA
440 TGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * ** * * *
87476 GTCATAACTATCTAAACTCATTTGGTAGACAG
505 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
*
87508 ATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTA-TTTTA
1 ATTTA-TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTTA
* ** * * * * *
87571 TTTGAAATAAGCTTACATCAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATGTTTT
60 TTTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * *** * * *
87636 GAAATAGATAATTGTTTAGATAATCATAATTATTTGAACTTATTCAATAAATAGA-TTCTTTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * * ** **
87700 AATTCTTTTCCTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTT
188 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * * * *
87765 ATATGAACT-GAAACAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATAGATAAT
253 TTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTA-TGACAAAA-CAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
** * * *
87828 TACTCAAATAGTCATGACTATTTGAATTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
315 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * *
87893 TATTAATTATCGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTC-GAATATA-CTTGTATGAATAG
380 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATA-AGCTTGTATGAAT-G
* * ** * * * ** * * *
87956 AATCTATCGTTTTATAACATAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAA
442 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAG
* * *
88020 TCATAAATATTTGAACT-ATTTTGATAAATAG
506 TCATAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
* * * *
88051 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-GAAATATTATTACATTAGCATTA-TTTTATTCCA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCA
* * * * ** * * *
88114 AACAAACTTATATGAATA-AAACCTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGACA
65 AATAAGCTTGTATGATTAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * ** * * *
88178 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTCTTTG-ATCTGGGTAGGTAAACAATTTTTTTTTTTAAA
128 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-T-TTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * **
88242 TCTCTTACTTATTAATTTATGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCCT-AATAAGCTAG
191 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TTGAATAAGCTTT
* * **
88305 TATGAATTGAAAAAATTGATTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
254 TATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * * * * * *
88370 TCATATAGTTTTAACTATTTGAACTAGATCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTAT
318 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * * *
88435 TAATTTTTGAAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATA
383 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACA
* * * * * * * *
88500 ATTTTTTTATGATAGAACAATAGGTTATAACGATTTG--ATATACAATTGTTCAAATAGTCATAA
447 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * *
88563 CTATTTAAACTGG-TTCGATAAACAG
512 CTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
* * * *
88588 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAAGTTTT-GAAAGATTAATAAAATATTATTA-TTTTA-T
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
* * * * *
88650 TCTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTG
62 TC-AAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * ** * * * * * *
88715 AAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAATAGA-TCACTTTTTA
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA
* * * *
88779 AATTTCTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATGTTATTTTGAATAAGCTTG
189 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTT
* * * * * ** * * *
88844 TATGAACT-GTAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTTTAAGAGACAATTT
254 TATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * ** *
88908 TTCTAATAGT-AGTAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA-CTCATGCTT
317 TTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * * *
88971 ATTAATTTTTTAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGATTTTATAAACTGAAA
381 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAA
* * * * * * * *
89036 CAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAAGTCATGATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
445 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * *
89101 AACTATTTAAACTTGTTCT-GTAAACAG
510 AACTATTTGAACTGGTT-TAGTAAATAG
* * * *
89128 ATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTA-TAATTTTCT-TAATGTTAATTAAATTTGGATTA--TTT
1 ATTTATTTTTT-AAATC---T-CTTATTAATTTT-TAGAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTT
* * *** * **
89189 ATTCCAAATAAGCTTGTAAGTAATTA-AATTTGGATT-ATTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGTAT
59 ATTTCAAATAAGCTTGT-A-TGATTAGAA--ACAATTGTTTTATGACAAA-AA------AA--A-
** * * * * ** * * * *
89252 GAAACA-AAT-ATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAAAGACTAGAAATAGAAAATTATTCT-AA
110 G-GTCATAATGATTTGA--AATAGA-TAATTGT--TCAA-A-TAG---T-CATAACTATT-TGAA
** * * * ***
89314 TAGTTTTTACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACTCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
162 T--TTTTTGGTA----AAC---------AAATTTATTTTTTAAA----TCTCTTACTTATTAATT
* * **** * *
89379 TTT-AGAATATTATTAATTTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTTTATGATTAGAAACAATT
208 TTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAAAAATT
* * ** * * *
89442 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTAAAATAGGTAATCATTCAAATGGCCATAATTA
271 GTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * * ** *
89507 TTTTAA-TTGAGTCGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTAATAATTTAGGAAGTATT
335 TTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * *
89571 AATAAATTAGTATTATTTTATTCT-ATCTAAGCTTATATTAATTGAAACATTTGTTTTATGACAA
399 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACAA
* ** * * * * * *
89635 ATCAAAAGGTTATAACAATTTTATATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTAAACTTGTT
462 AACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
*
89700 T-GATAAACAG
527 TAG-TAAATAG
*
89710 ATTTACTTTTTTAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTTA-AATGTTAATAAATTAGTATTCA--TTT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTC--T-T-ATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTT
* * * *
89772 A-TTCTAAATAAGTTTGTATGGACT-GAAACAATTGTTTTAT-A-AATAAACAAAAGTCAAAATG
59 ATTTC-AAATAAGCTTGTAT-GATTAGAAACAATTGTTTTATGACAA-AAA-AAAGGTCATAATG
* * * * * * * *
89833 ATTTGAAATAGATAATTTTTCTAATTGTCTTAACCATTTAAATTGATTTGGTAAACAAATTTTTT
120 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-TTTTGGTAAACAAATTTATT
* * ***
89898 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAA
184 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * * * *
89958 GCTTGTATGAACA-AAACAATTG-TTTATGAGAAAAGAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATT
249 GCTTTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATA
** * * * * ** * ** * * * *
90021 ATCATTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGCAATTAGACTTATTTTTTAATTTTTTTG
313 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * ** **
90086 GTTATTTAGTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTGTTATTTTATT-TCAAATAAAATAATATGAAT
378 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * *
90149 AGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGCTTATAATAATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATA
441 -GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * ** *
90214 GTCAAAACTATTTGAAATAGTTTGGTAAGCAA
505 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* *
90246 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAATATTA-TTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * * * * ** * ** * *
90309 TTCGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATAATTTAATGACAAAATAGAAA-GTAATAATGATTT
61 TTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-A-AAAGGTCATAATGATTT
* * * ** * *
90373 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTAAACTAGTTTGGTAAATAGAA-TTATTTTC
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACA-AATTTATTTTT
** * * * * * *** *
90437 TAACCCTCTTACTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAACTAGTTTTATTCTATTCCAAATAGGCT
187 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * *
90502 TGTA-AAAGCT-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
252 TTTATGAA--TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * ** * *
90565 TTATTCATATAATCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
314 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * * *
90630 TTATTAATTTTT-AGAATTTTACTAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTTTATAAACA
379 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * **
90693 GAAACAATTATTTTGTGATAGAACTAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
441 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* **
90758 TCATAACTATTTGTAA-TGGTTCAACAAATAG
506 TCATAACTATTTG-AACTGGTTTAGTAAATAG
* *
90789 ATTTATTTTTTAAATCAT-TTATTAATTCTT-GAAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTTATTTC
1 ATTTATTTTTTAAATC-TCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTC
* * * * *
90851 AAATAAGCTTGTATGTTTTA-AAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAATGATTTGAA
64 AAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * *** * *** * **
90915 ATAGATAGTTGTTCAAAT-GACCATTTTTATTTGAATTGATTCAATAAGCTGATTTATTTTTTAA
127 ATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAATT-TTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * *
90979 ATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTT
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTT
* * * * * * *
91044 ATGAACTA-AAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTGATAATGATTTTAAATTGATAATTGT
255 ATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * ** *
91108 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAGA-TGCATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTT
318 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAG-ATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTT
** *
91172 ATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAGCAAGCTTGTATGAACTAA
381 ATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TGA
* * * * * * *
91235 AACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATATTC
443 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
91300 TTAACTATTTGAATTAGTTCAGCAAACAC
508 ATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * * * *
91329 ATTTATTTTTTAAATCACTTATTAAGTTTTGGAAAATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTT-GA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAA
* * * * * * * *
91393 ATAAGCTTGTATGATCAGAAATAACTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAACT-ATTTGAGATT
66 ATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATA
* * * * * * * ** ** * * * *
91457 GATATTTGTTCTAATATTTATAATTATTTAAACTAGTT-CAAAAAAATAGCTTTAGTTTTTGAGT
130 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTTTTGGTAAACAA-A--TTTATTTTTTAAAT
*** * *
91521 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTTA
192 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTTTA
** * * *
91586 TGAACCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGGCTTT-AAATAGATAATTGTT
256 TGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * *
91650 CAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTAGCAAACAAATTTATATTTTTAAATCTTTTGCTCA
319 CAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * *
91714 TTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAAAAGCTTATATGAACTAAAAT
382 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAC
** * * * * * *
91779 AATTGCTTTATGACTAAACAAAAGGTCCA-AATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTT
446 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT-TATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * *
91843 AAGTATTTGAAATGGTTTGGCAAATAC
510 AACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * *
91870 ATTTATCTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTAGAATTTTATTAAATTAGTATTA-TTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T--TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
* * ** * * ** *
91934 CCCAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATGACAAAATAAAGGTCATAACAATTTGAG
62 TCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * *
91999 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAATATTTGAACTATTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAA
127 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * *
92064 ATCTC---C-TATTAATTTTTAAAATATTAATATATCAGTATTATTTTATTTTGAATAA--TTTT
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTT
* *
92123 GCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTG
255 --ATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * ** *
92188 TTCAAATGGACATGACTATTTGAAC----TT-ATAAAAATATTTATTTTTTAAGTCTCCTACCTA
317 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * *
92248 TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTATTATT-TTTTATTTTGAATAAACGTGTATGAATAAAAA
382 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAA
* * * * * * *
92311 TAATTATTTTATCACAAAATGAAAA-ATCATAA-GTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
445 CAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTTATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
** *** *
92374 ATAACTATTCAAACTTACTTGGTAAAT-G
508 ATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * *
92402 ATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTCAT
1 ATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* ** * * * *
92465 TTCAAATATGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATGACT-ATTT
61 TTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCAT-AATGATTT
* * ** * * *
92529 GAAATAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAGAAAATAAATTTGTTTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TTTTTGGTAAACAAATTT-ATTTTT
* * * * *** *
92594 TAAAT-TTTTTCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAACA-TA-TATTATTTTCTTCAAAATAAAC
187 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * * *
92656 TTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-GAATTTGACATAGATAA
251 TTTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACG-ATTTGAAATAGATAA
* * * * *
92720 TTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATATTCTAAATCTCTTAC
314 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* ** * * * * * * * *
92785 TCAAGAATTTTTGGAATATCATTCAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGGC-TATACGAACTG
379 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA-GCTTGTATGAA-TG
* * * * *
92849 ATACAATTGTTTTTTAATGA-AAAA-ACAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
442 AAACAA-T-TATTTT-ATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * *
92911 AGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAACAT
504 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * * * *
92944 ATTTATTTTTAAAATATTACTTACTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT
1 ATTTATTTTTTAAAT-CT-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTT
* * ** * * * * *
93008 -GAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCACAATGAATTGAA
63 CAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
93072 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTCTTTTTTAAA
127 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * **
93137 TCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATGGGCAACT-AGTCA
191 TCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AA-TAAG-C-
** * * * * *** * *** * * * **
93200 TAACTACTCGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTACTTTTTGAA
251 T-TTTA-T-GAA-TAG---AAAAAATTG-TTT-TATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAA
* ** * * * ***
93265 CTATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AA-TAAGCTTGAA--TG-ATCAAAAACA-ATTT
306 --A-TAGAT-AATT-GT-TCA-AATA-GTCATAACT-A-TTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT
* * *** * * *** * *
93323 -TTTTATAACAAAAC-AAAAGGTCATATTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGCCTA-TAAT
361 ATTTT-T--TAAATCTTTTA---CTTATTAATTTTTGA-A-AT-ATTAAT-AAAT---TAGTATT
** * * * * * * *
93385 ATTTTATTCTGAATAAAATAGTATGAATAAAACTAATTGTCTGATGAAAAAACAAAAGGTTAAAA
413 ATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
** * * * ** * **
93450 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACCATTTGAAATGAATTGGTAAGCAG
477 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
** *
93510 ATTTACATTTTAAGTCTCTTACTGATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * * * ** * * * *
93573 TTCGAACAAACTTATATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAATAAAAA-GTAATAATGATTTG
61 TTCAAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-AAAAAGGTCATAATGATTTG
** * * * * * ** * * * ***
93637 AAATAGATAATTGTTTGAATATTTATAATTATGTAAACTGGTTCGATAAATAAAATTT-TTTAAA
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAA-CAAATTTATTTTTT
* * * * * * *
93701 AAATCTCTT-CTTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCTGCATAAACT
188 AAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
** * * * *
93765 TGCATGAGTTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATCGATAATT
252 TTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
93830 -ATCATATAGTCTTAACTATTTAAAC-GGTTTGGCAAACGGATTTATTTTTTAAAATCTCTTAGT
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACT
* * * * * ** *
93893 TATGAATTTTT-AGATAATTATTAAATTAGTATTATTTTTTTC-AAATAAATTTGTATGAACAGA
380 TATTAATTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGA
* * * * * * * * *
93956 AATAATTGTTTTATGATAGAACAGACA-GTTAAAATAATTTGAAATAGTTAATTGTTCAAATAGT
443 AACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *
94020 AATAACTATTTGAACTGATCATAACTATTTAAACAGGTTTGGTAAATAG
507 CATAACTA-TT----TG-----AAC----T-----GGTTTAGTAAATAG
* * *
94069 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTCTT-GAAATATTAAAAAATTAGTATTA-TTTTATTTCA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCA
* * * * * *
94132 AATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTTATA
65 AATAAGCTTGTATGATT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAA
** * * * * * ** * **
94196 TA-ATAAGCTTG-T-ATGTTG-GAAAAC-AATTG--TTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAACAA
128 TAGATAA--TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTTTTG-GTAAAC-AAA--T--TTA-TT
* * * * * * *
94254 TTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATGGCCATAATTATTTGATCTAAT-TTAGTAAACTGATTTAT
184 TTTTAAAT--CT-CTTACTT---AT-----TAATT-TTTGA---AATATTAATAAA-TTA-GTAT
* * * *
94317 T-TTTTAAATCTCTT-ATTTATTAA-TTTTTGAAAGATTA-ATAAAGTAGTATTCTTTTATTTTG
232 TATTTT--AT-T-TTGA---A-TAAGCTTTT--ATGAATAGA-AAA--A--ATTGTTTTA---T-
* * * * **** ** * *
94378 GATAAGTTTTATACCGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA-CGATTTTAAATAG
278 GACAA-----A-A-C-AAA-AGTCA---TA--ACGATTTGAAA-TAGATAATTG--TTCAAATAG
* * ** * * * * * **
94442 ATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTAAACTGATTTGATAAACAAATTAACTTTTTAAATCAC
326 -TCA----T-AACT--ATTTGA--A-CT----TG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT
* * * * *
94507 TTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCTCGTATGAA
375 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
94572 TAAAAGAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT
440 TGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* ** * * * ** * *
94637 AATTGTAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACAA
504 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * *
94670 ATTTATTTTTTTTAAACTTCTGCTTATTAA-TTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTAGTA-TTTTA
1 ATTTA--TTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA
* * * * * * **
94733 -TTCTAGATATGCTTTTATAAATGTAG--ATAATT-TTGTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACA
60 TTTC-AAATAAGCTTGTAT-GAT-TAGAAACAATTGTT-TTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATG
* * * * * * * * *
94794 ATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAAGAGATTTATT
120 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATT
* * * * * * * *
94859 TTTTCAAATCTTTTGCTTATTTATTTTTTG-AGTGTTAATAAGTTTGAATTATTTTATTTTGAAT
184 TTTT-AAATCTCTTACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
*** * * * * *
94923 AAGCTCGCAAG-ATATGAAACAAA-TATTTT-TGACCAAAGAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATA
247 AAGCTTTTATGAATA-GAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATA
*** * ** * * * * ** *
94985 GATAATAACTCTAATAGTTTTATCTATTTGAAATGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCT
309 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * *
95050 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAAT-TGAATAAGTTTCTATT
374 TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATG
* * * * * * *
95114 ATTAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATTTTAACGATTTG-AGTTGATAATTATTCAA
438 AAT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * *
95177 ATAGTCATAACTATTTGAACAGG-TTCGATAAACAT
502 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAG
*
95212 ATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTT-T
1 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * * * * **
95274 TTCAAATAAACTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGACAATACAAAAGGTCACAACAATTT
61 TTCAAATAAGCTTGTATGAT-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA-AAAAAAGGTCATAATGATTT
* ** * * * * ** ***
95339 AAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTCAATAAACAAATTTATTTTTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * ** * * **
95404 AAATTTCTTACATATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGTCTAAGCTT
188 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * * * * * * * * *
95469 GTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAATCAACAGGTTATAAAGATTTTAAATAAACAATT
253 TTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * *
95533 GTTAAAATAGTAATAACTATTTGAACTTTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTT-C
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TTTAC
* * * * * *
95597 TTATTAATTTTTCAAATATT-ATTAATTATTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAACTGA
379 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGA
* * * *
95661 AACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC
443 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * ** * *
95726 TTAACCATTTAAACTGATACAGTAAACAA
508 ATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAG
* * * * * * * *
95755 ATTTATTTTTTAAATTTCTTATTAATTTTGA-AATATTATTAACTTATTATTA-TTTTAATCCGA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAA
* * * ** * * *
95818 ATCAGCTTGTACAGA-TA-AAACAATTATTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAAT
66 ATAAGCTTGTA-TGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
*
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129 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
95914 CTGGTTCAAA
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ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAA
ATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAAT
AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTATTTTA
TGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
CTGGTTTAGTAAATAG
Found at i:77653 original size:17 final size:18
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.6 Consensus size: 18
77621 GGTTATATTG
* *
77631 ATTTAAAATAG-ATAATT
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Statistics
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ATTTAAAATAGCAAAACT
Found at i:79473 original size:157 final size:160
Alignment explanation
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Period size: 158 Copynumber: 2.0 Consensus size: 160
79206 GAACTGAATT
* * *
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* * * *
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* *
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1 AATTGTTTTATGA-TAAA-ACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAGA-A-TC
* * * *
79435 TTATCCATTTGAATTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
62 TTAACCATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTACTAATTTTTGA
*
79500 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
126 AATATTATTAAATTAGTATTATCTTAAT
79528 AAGAATAAGC
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 14, Indels: 11
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AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAGAATCTTAA
CCATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTTACTTACTAATTTTTGAAATAT
TATTAAATTAGTATTATCTTAATTGAATAC
Found at i:79895 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 79372--80024 Score: 577
Period size: 180 Copynumber: 3.6 Consensus size: 180
79362 TAATTGAATA
* * * * * *
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1 CAATTGTTTGATGACAAAAGAAAAAGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * *
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** * * *
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* ** * * * * * *
79553 -AATT-ATTGTACAACAAAAGAAAAAGTGATAATGATTTCAAATAGATAATCATTCATATAGTCT
1 CAATTGTTTG-ATGACAAAAGAAAAAGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * ** * * * ** *
79616 TAGCTATTTGAACTAGTTAGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCATGGTTATTAA-GTTTTAG
65 TAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTA-
* * * *
79680 AATCTTATTAAATTAATATTATTTTATTACAAATAAAATAGTTTGAACAAAAT
129 AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TTTCAAATAAACTAGTTTGAACAAAAT
* * * * *
79733 CAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAA
1 CAATTGTTTGATGACAAAAGAAAAAGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * *
79798 AACTATTTAAAATGGTTT-GTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAA
66 AACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAA
* * * *
79862 TATTAATAAATTAGTGTTATTTTGTTTCAAATAAACT--TTATTAACAAAAG
131 TATTATTAAATTAGTATTATTTT-TTTCAAATAAACTAGTT-TGAACAAAAT
* * * *
79912 CAATTGTTTTG-TGATAAAACAAAAAGTAATAA-AGATTT-AGAATAAACAATTATTCAAATAGT
1 CAATTG-TTTGATGACAAAAGAAAAAGTAATAATA-ATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
79974 TATAATTAATTGAATTGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTA
63 CATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
80025 AATAGAATTA
Statistics
Matches: 371, Mismatches: 90, Indels: 23
0.77 0.19 0.05
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
CAATTGTTTGATGACAAAAGAAAAAGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAA
TATTATTAAATTAGTATTATTTTTTTCAAATAAACTAGTTTGAACAAAAT
Found at i:80027 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 79997--80050 Score: 108
Period size: 26 Copynumber: 2.1 Consensus size: 26
79987 ATTGGTTTGG
79997 TAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCT
1 TAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCT
80023 TAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCT
1 TAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCT
80049 TA
1 TA
80051 CTTATAAACT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (26 bp):
TAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCT
Found at i:80434 original size:177 final size:177
Alignment explanation
Indices: 80051--80565 Score: 422
Period size: 177 Copynumber: 2.9 Consensus size: 177
80041 AAATCTCTTA
* * * * * *
80051 CTTATAAACTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTTTTATTTTTTTTCCAAATAAGCTTGTAT-AAG
1 CTTATTAA-TTTTGAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTT-CAAATAAGCTTATATGATG
* * * * * * * * *
80114 CTAAAATAATTGTTTTATG-----ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAGTTATTCATAT
64 -AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
* * * * * * ** * * *
80174 AGTTTTAATTGTTTGACCTGGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATATCTT
128 GGCTATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAACAGATTTAATTTTT-AA-ATC-T
* * *
80227 AGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-TTCATATGAAT
1 -CTTATTAATTTTGAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-ATATG-AT
* * * * *
80291 -AGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTACAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATT
63 GAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
* * **
80355 AG-TCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCT
128 GGCT-ATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCT
* * * *
80405 CTTATTAATTCTTGA-AATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGTTGA
1 CTTATTAATT-TTGAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGATGA
* ** * *
80469 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGG
65 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGG
*
80534 CTATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACAGA
130 CTATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAACAGA
80566 ATAAGCTTGT
Statistics
Matches: 272, Mismatches: 52, Indels: 28
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
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176 30 0.11
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179 3 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
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AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGC
TATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAACAGATTTAATTTTTAAATCT
Found at i:81166 original size:461 final size:454
Alignment explanation
Indices: 80565--81434 Score: 1088
Period size: 461 Copynumber: 1.9 Consensus size: 454
80555 CAGTAAACAG
* * * *
80565 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGAGTAAACAATATGTCAGAACGATTTGAACT
1 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAATGTCAGAACGATTTGAAAT
* *
80630 ATGTAATTATTCTAACAGTCCTAACTATTTGAATTAGCTTGGAAAAAATATTTATTTTTTAAATC
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** * * * *
80695 TCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATAATCTTGTATGATCA
131 TCTTATTAATTTACGAAATACTATTAAATTAGTATTA-TTTAATCCAAATAAACTTGTATCA--A
* * *
80760 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGGTTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAG
193 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
80824 TCATAACAATTTGAATTGGTTCGAAAAACAACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
258 TCATAACAATGTGAATTGGTTCGAAAAACAAATTTAATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTC
* * * * * *
80889 GAAATATTAATA-ACGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTT-ATGAACT-GAAATAATTGT
319 AAAACATTAATAGA-GTAATATTATTTT-TTTCGAAT-A-TTTTTCATGAA-TAGAAACAATTGC
80951 TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGACTTTAAATATGTAATTGCTCAAATTTAATTAGTATT
379 TTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGACTTTAAATATGTAATTGCTCAAATTTAATTAGTATT
81015 AATTTATTCTA
444 AATTTATTCTA
* * * * * *
81026 AATATGCTTGTGTGAACTAAAATAATTATTTTATGACTAAAGAAAA-GTTCAGAATGATTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAATG-TCAGAACGATTTGAAA
* * * * ** *
81090 TA-GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCTAACACATTTATTTTTTAAA
65 TATG-TAATTATTCTAACAGTCCTAACTATTTGAACTAGCTTGGAAAAAACATTTATTTTTTAAA
* ***
81154 TCTCTTATTAATTTACGGAATACTATTAAATTAGTATTATTTAATTTGAATAAACTTGTATCAAA
129 TCTCTTATTAATTTACGAAATACTATTAAATTAGTATTATTTAATCCAAATAAACTTGTATCAAA
* *
81219 GGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAG
194 -GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * **
81284 TCATAACTATGTGAATTGTTTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAA
258 TCATAACAATGTGAATTGGTTCGAAAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAA
* *
81349 CATTAATAGATTAATATTATTTTTTTTGAATATTTTTGCATGAATAGAAACAATTGCTTTATGAC
323 CATTAATAGAGTAATATTATTTTTTTCGAATATTTTT-CATGAATAGAAACAATTGCTTTATGAC
81414 AAAACAAAAAGGTCATAATGA
387 AAAACAAAAAGGTCATAATGA
81435 TTTGGAAATC
Statistics
Matches: 349, Mismatches: 51, Indels: 23
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
453 5 0.01
454 2 0.01
455 33 0.09
456 48 0.14
457 2 0.01
458 4 0.01
460 115 0.33
461 140 0.40
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (454 bp):
AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAATGTCAGAACGATTTGAAAT
ATGTAATTATTCTAACAGTCCTAACTATTTGAACTAGCTTGGAAAAAACATTTATTTTTTAAATC
TCTTATTAATTTACGAAATACTATTAAATTAGTATTATTTAATCCAAATAAACTTGTATCAAAGA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACAATGTGAATTGGTTCGAAAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAACAT
TAATAGAGTAATATTATTTTTTTCGAATATTTTTCATGAATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAA
CAAAAAGGTCATAATGACTTTAAATATGTAATTGCTCAAATTTAATTAGTATTAATTTATTCTA
Found at i:81743 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 81005--82956 Score: 1428
Period size: 180 Copynumber: 10.8 Consensus size: 179
80995 GCTCAAATTT
* * * * * * * *
81005 AATTAGTATTAATTTATTCTAAATATGCTTGTGTGAACTA-AAATAATTATTTTATGACTAAAGA
1 AATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * ** * * * * * *
81069 AAAGTTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGC
64 AAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGG-
* * *** * *
81134 TAACACA-TTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTACGGAATACTATTA
128 TAA-ATAGATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * * *
81182 AATTAGTATTATTTAATTTGAATAAACTTGTATCAA-AGGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-TA
1 AATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * *
81245 AAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATGTGAA-TTGTTTTGGT
65 AAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGT
* * * * * *
81309 AAACAAATTTAATTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAACATTAATA
129 AAATAGA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * *** * *
81357 GATTAATATTATTTTTTTTGAATATTTTTGCATGAATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAA
1 AATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AA
* ** * * ** * * * * * *
81422 AAGGTCATAATGATTTGGAAATCGATTAATTGTGGATAAGTGGAGCCAGTGATTATATAAACATG
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* * ** * * *
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* **
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * * * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * ** *
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* * ** * * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * *
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* ** ** * * * **
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*
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* * *
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** * * **
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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** * * * ***
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* * * * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * * *
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193 T-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCGAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * *
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*
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* * * * *
88069 TTATTAATTTTTGAAATATTATTACATTAGCATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAATAAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAA
*** * *
88134 ACCTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGACATAGATAATTGTTCAAATAGTC
66 A-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
88199 ATAATTCTTTGATCTGGGTAGGTAAACA-ATTTTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTATG
130 ATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTATG
* * * * * * *
88263 AAATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTCCTAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGATTTA
195 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
* * * * ** *
88328 CAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAA
259 TAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA
** * * *
88393 CTAGATCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAG
324 CTATTTCGATAAATAGA-TTATTTTTTAAATC--TTAC
* * *** *
88431 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA-A
* * * * * * * *
88496 AATAATTTTTTTATGATAGAACAATAGGTTATAACGATTTG--ATATACAATTGTTCAAATAGTC
65 AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* *
88559 ATAACTATTTAAACTGGTTCGATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAAGTTT-T
130 ATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTAT
* * * * *
88621 GAAAGATTAATAAAATATTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTGTTA
194 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTT
* * * * **
88685 TATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAATTATTTG
257 TATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTG
* *
88750 AACTGA-TTCGATAAATAGATCACTTTTTAAATTTCTTAC
322 AACT-ATTTCGATAAATAGATTATTTTTTAAA--TCTTAC
* * * *** * **
88789 CTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGT
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAC-AA
* * * * ** * * * *
88854 AACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTTTAAGAGACAATTTTTCTAATAGT-
65 AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
88918 AGTAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACATA-TTTATTTTTTAAA-CTCATGCTTATTAATTTTT
130 A-TAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTAT
* * * * * * * *
88981 TAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGATTTTATAAACT-GAAACAATTGTTT
194 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTT
** * * * * * * *
89045 TATGGCAAAACAAAAAGTCATGATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
257 TATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTG
* *
89110 AACT-TGTTCTG-TAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGC
322 AACTAT-TTC-GATAAATAGA-TTATTTTTT-AAATC--TTAC
* * * * * * *
89151 TTA-TAATTTTCT-TAATGTTAATTAAATTTGGATTA-TTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGTA-A
1 TTATTAATTTT-TGAAATATT-ATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA
** * ** ** * * * *
89212 TTAAATTTGGATTATTTATTCCAAATAAGCTTGTAA-GT-ATGAAACAAATATTTTATGACTAAA
64 AAAAAATT-G--T-TTTATGAC-AA-AA-C--AAAAGGTCAT--AAC---GATTTGA--AATAGA
* ** * * * * * * * *
89275 CAAAAGGTCATAAAGACTAGAAATAGAAAATTATTCT-AA-TAGTTT--T-TAC-TATTTGAACT
113 -TAATTGT--TCAA-A-TAG---T-CATAACTATT-TAAACTGGTTTGGTAAACAGATTT-TA-T
* * * * *
89334 GGTTTGGTAAA-CTCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTT
166 --TTT-TTAAATCTC--TTACTTATT-AA--T-TTA-TGA--AA-TATT---A-A-TA--AA-TT
* ** * * * * *
89398 AGTATTATTTTTAACCAAATAAGCTTTTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA
210 AATATTA-TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGG
* ** ** *** * * * * *
89463 TCATAACGATTTAAAATAGGTAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGA-GTCGGTAAAC
274 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACT-ATTTCGATAAAT
* * *
89527 AAATTTATTTTTAAAATTTTTTAC
338 AGA-TTATTTTTTAAA--TCTTAC
* ** * * * ** * **
89551 TTAATAATTTAGGAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTATCTAAGCTTATATTAATTGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAA-CAA
* * * * * * * * * *
89616 AACATTTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACAATTTTATATAGATAATTATTCAAATAATA
65 AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
89681 ATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGA-TTTACTTTTTTAAATCTCTTTCTCATTAATTTTT
130 ATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTAT
* * * * * *
89745 TAAATGTTAATAAATTAGTATTCA-TTTATTCTAAATAAGTTTGTATGGACT-GAAACAATTGTT
194 GAAATATTAATAAATTAATATT-ATTTTATTC-GAATAAGCTTGTAT-GAATAGAAACAATTGTT
* * * * * ** * **
89808 TTATAA-ATAAACAAAA-GTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCTAATTGTCTTAACCATT
256 TTATAACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATT
* * * * * *
89871 TAAATTGATTT-GGTAAACAAATTTTTTTTTTAAATC-T-C
320 TGAACT-ATTTCGATAAATAGA-TTATTTTTTAAATCTTAC
* *
89909 TTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAA
* * * * * ** * * *
89973 ACAATTG-TTTATGAGAAAAGAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATTATCATTCATATAATCT
66 AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * ** * * * * ** *
90037 TAACTATTTGAACTGGTTCAGCAATTAGA-CTTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTTAGTTT-T-
131 TAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTATG
* * * * ** ** * *
90099 AGAATATTATTAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAAATAATATGAATAGAACCAATTGTTTG
195 A-AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
* * * * ** ** * * * *
90164 ATGACAAAATAAAAGCTTATAATAATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGA
258 ATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGA
* * ** * *
90229 AATAGTTT-GGTAAGCAAATTTACTTTTTAAATCTCTTAC
323 ACTA-TTTCGATAAATAGA-TTATTTTTTAAA--TCTTAC
* * * * * * * * *
90268 TGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATTAACAAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAA
** * * * *
90333 AACAATAATTTAATGACAAAATAGAAA-GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
66 AA-AATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * ** * *
90397 TATAATTATTTAAACTAGTTTGGTAAATAGA-ATTATTTTCTAACCCTCTTACTTATAAATTTTT
129 CATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTAT
* * * * * * * * *
90461 AAAATATTAATAAACTAGTTTTATTCTATTCCAAATAGGCTTGTA-AAAGCT-GAAATAATTGTT
194 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAA--TAGAAACAATTGTT
* * * * * * *
90524 TTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAATCTTAACTATTT
256 TTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTT
** * *
90589 GAACTAGTTT-GGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
321 GAACTA-TTTCGATAAATAGA-TTATTTTTTAAA--TCTTAC
* * * * *
90630 TTATTAATTTTT-AGAATTTTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATAAACAG
1 TTATTAATTTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA-
* * * * * * * * *
90694 AAACAATTATTTTGTGATAGAACTAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
64 AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* **** * *
90759 CATAACTATTTGTAA-TGGTTCAACAAATAGA-TTTATTTTTTAAA--TC--ATTTATTAATTCT
129 CATAACTATTT-AAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* ** * *
90818 -TGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTTTA-AAATAATTT
192 ATGAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAATTG
* * * * * * * * **
90880 TTTTATGACAAAACAAAATGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGACCATTTTTAT
254 TTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTAT
* * *
90945 TTGAATTGA-TTCAATAAGCT-GATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
319 TTGAACT-ATTTCGATAA-ATAGA-TTATTTTTTAAA--TCTTAC
* * * **** * *
90988 TTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAC-AA
* * * * * * *
91053 AACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTGATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTC
65 AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
91118 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAGA-TGCA-TTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTT
130 ATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAG-ATTTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * ** *
91181 TTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAGCAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTAT
192 ATGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGT
* * * * * * * * * * *
91244 TATATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATATTCTTAACTATT
255 TTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATT
* * * * *
91309 TGAATTAGTTC-AGCAAACACATTTATTTTTTAAATC--AC
320 TGAACTATTTCGA-TAAATAGA-TTATTTTTTAAATCTTAC
* ** * *
91347 TTATTAAGTTTTGGAAA-ATTATTAAATTAGTATTATTTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGATCA
1 TTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA
* * * * * * * * * *
91410 GAAATAACTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAACTATTTGAGATTGATATTTGTTCTAATAT
64 -AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *** * * * * * *
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128 TCATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGA-TTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* *** * * * **
91538 TTGAAATATTAATAGGGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTTATGAACCGAAACAATTGT
192 ATGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * * *
91603 TTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGGCTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTA
255 TTTATAACAAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAAT-TA
* * * * * * *
91666 TTTCAACTTGTTTAG-CAAACAAATTTATATTTTTAAATCTTTTGC
318 TTTGAAC-TATTTCGATAAATAGA-TTAT-TTTTTAAATC--TTAC
* * * * *
91711 TCATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGCTTATATGAACTA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTC-CAAATAAGCTTATATGAAC-A
* * * * * *
91775 AAATAATTGCTTTATGACTAAACAAAAGGTCCA-AATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAG
64 AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
91839 TCTTAAGTATTTGAAA-TGGTTTGGCAAATACA-TTTATCTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTT
128 TCATAACTATTT-AAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * *
91902 -TTAGAATTTTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCCAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGC
192 ATGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * * * * *
91966 TTTATGACAAAA-TAAAGGTCATAACAATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAATAT
255 TTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCAT-AATTAT
* * * *
92030 TTGAACTATTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC-T-C
319 TTGAACTATTTCGATAAATAGA-TTATTTTTTAAATCTTAC
* * * * * *** ** ** *
92069 CTATTAATTTTTAAAATATTAATATATCAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA-A
* * * *
92134 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGAC
65 AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
92199 ATGACTATTTGAAC----TT-ATAAA-A-ATATTTATTTTTTAAGTCTCCTACCTATTAATTT-T
130 ATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGAT-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTAT
* * * * * * * *
92256 TAGAATATTAATAAATTATTATT-TTTTATTTTGAATAAACGTGTATGAATAAAAATAATTATTT
194 GA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
* * * * *
92320 TATCACAAAATGAAAA-ATCATAA-GTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
257 TATAACAAAA-CAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATT
** * * * *
92383 CAAACTTACTT-GGTAAAT-GATTTATTTTTAAAATTTTTTAC
320 TGAAC-TATTTCGATAAATAGA-TTATTTTTTAAA--TCTTAC
* * * * *
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1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAA
* * * * *
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66 AA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * * * * * * *
92554 ATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATAAATTTGT-TTTTTTAAAT-TTTTTCTTATCAATTTT
130 ATAACTATTTAAACTG-GTTTGGTAAACAGATTT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTA
* * * * *
92616 TGAAATATTAATAACA-T-ATATTATTTTCTTCAAAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATT
193 TGAAATATTAATAA-ATTAATATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * * * *
92679 TTATGACAAAACAAAATGTCATAA-GAATTTGACATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATT
256 TTATAACAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATT
* * * * *
92743 TGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTCATATTCTAAATCTCTTAC
320 TGAACTAT-TTCGATAAATAGATT-ATTTTTTAAA--TCTTAC
* ** * * * *** * * *
92785 TCAAGAATTTTTGGAATATCATTCAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGGC-TATACGAACTG
1 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-GCTTATATGAAC-A
* * * * * *
92849 ATACAATTGTTTTTTAATGA-AAAA-ACAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
64 AAAAAATTG--TTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * ** * * * * *
92911 AGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAACATA-TTTA-TTTTTAAA-ATATTACTTACTAATT
126 AGTCATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *
92973 GT-TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTG
191 -TATGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * * * * * * *
93037 TTTTATGATAAAACAAAAAGTCACAATGAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
254 TTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTAT
* *
93102 TTGAACTTATTTAG-TAAATAGATTTCTTTTTTAAATCTTTTAC
319 TTGAAC-TATTTCGATAAATAGA-TTATTTTTTAAATC--TTAC
* * *
93145 TTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA
1 TTATTAATT-TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
93185 ATGGGCAACT
Statistics
Matches: 4556, Mismatches: 1005, Indels: 546
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Consensus pattern (358 bp):
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AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTATGA
AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATA
ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACT
ATTTCGATAAATAGATTATTTTTTAAATCTTAC
Found at i:88356 original size:539 final size:533
Alignment explanation
Indices: 86906--95916 Score: 3300
Period size: 540 Copynumber: 16.4 Consensus size: 533
86896 ACAAAATGCC
* * * * * * ** * *
86906 ATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTGACTATTTGAATTTGTTTGATAACCAGA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTATTTGATAAACAGA
* * *
86971 TTTATTTTTATAAATTTTTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTAT
65 TTTATTTTT-TAAA---TCT-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTA-TATTATTTTAT
*** * * * * * * *
87034 TTTGAATAAGCATGTATGAACTAAAA-CAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAACGATTT
122 TCCAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* ** * * * * *
87098 GAGATAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCAG-TAAATATATTTATTTTT
186 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATT-AGATAAATAGA-TTATTTTT
* * * * * *
87162 AAAATCTCTTACTTTTTAATTTTAG-AATATT-ATCAGTCTAGCTA-TATTTTACTCTGAATAAG
249 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAG-TATTATTTTATTCT-AATAAG
* ** * ** * * * *
87224 CTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAA
311 CTAGTATGAACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * ** * * ***
87288 TTATTTAATTAGTCATAACTATTT-AGACTGGTTCAATAAAAAAATTTAGCCTTTAAATC---T-
376 TTATTCAAATAGT-ATAACTATTTGA-ATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * ** *
87348 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATGAATTAGTATTATTTT-ATTCTACATAATTTTGTATAAACA
439 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGA-ATAAGCTTGTATGAA-A
* * *
87412 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTC
502 AGAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
* * * *
87444 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCACATAGTCATAACTATCTAAACTCATTTGGTAGACAGA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-ATTTGATAAACAGA
* *
87509 TTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT
65 TTTA-TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTC
* * * * * *
87574 GAAATAAGCTTACATCAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAA
124 CAAATAAGCTTATATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
87639 ATAGATAATTGTTTAGATAATCATAATTATTTGAACTTATTCA-ATAAATAGATTCTTTTTTAAT
189 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATT-AGATAAATAGATTATTTTTTAAA
* * * * * *
87703 TCTTTTCCTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTA-T
253 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAATAAGC-TAGT
* * * * * * *
87767 ATGAACTGAAACAATTGTTTTACTACAAAAGAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTACT
316 ATGAACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* *
87832 CAAATAGTCATGACTATTTGAATTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
381 CAAATAGT-ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * *
87897 AATTATCGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATATA-CTTGTATGAATAGAATCT
445 AATTTTTGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATA-AGCTTGTATGAAAAGAAT-A
* * *
87961 ATCGTTTTATAACATAACAAAAAGTT
508 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
* * * * *
87987 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAATCATAAATATTTGAACTATTTTGATAAATAG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTA-TTTGATAAACAG
* * *
88051 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTACATTAGCATTATTTTATTCCAAA
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAA
* * ** * * *
88116 CAAACTTATATGAATAAAACCTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGACATAG
128 TAAGCTTATATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * ** * * *
88181 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTCTTTGATCTGGGTAGGTAAACA-ATTTTTTTTTTTAAATCT
193 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGA--TTATTTTTTAAATCT
* *
88245 CTTACTTATTAATTTATGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCCTAATAAGCTAGTATG
256 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-CTAATAAGCTAGTATG
* * * * * *
88309 AATTGAAAAAATTGATTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
319 AACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * *
88374 ATAGTTTTAACTATTTGAACTAGATCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAAT
384 ATAG-TATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * *
88439 TTTTGAAATATT-ATTAGATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATT
448 TTTTGAAATATTAATGA-ATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAG-AATAATT
* * * * *
88503 TTTTTATGATAGAACAATAGGTT
511 GTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
* * * *
88526 ATAACGATTTG--ATATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCGATAAACAGA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-ATTTGATAAACAGA
* * * **
88589 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAAGTTTTGAAAGATTAATAAAATATTATTATTTTATTCTG
65 TTTATTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCA
* * * *
88654 AATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAA
126 AATAAGCTTATATGAAT-AAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
88718 TAAATAATTGTTGAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATCACTTTTTAAATT
190 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGATTATTTTTTAAATC
* * * *
88783 TCTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATGTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
255 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AATAAGCTAGTATG
* * * ** * * * *
88848 AACTGTAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTTTAAGAGACAATTTTTCTA
319 AACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* ** *
88913 ATAGTAGTAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA-CTCATGCTTATTAAT
384 ATAGTA-TAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * * * * * *
88977 TTTTTAAATATTAA-GAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGATTTTAT-AAACTGAAACAAT
448 TTTTGAAATATTAATG-AATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAA-AG-AATAAT
* *
89040 TGTTTTATGGCAAAACAAAAAGTC
510 TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
* * * *
89064 ATGATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCTG-TAAACAG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TATT-TGATAAACAG
* *
89128 ATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTA-TAATTTTCT-TAATGTTAATTAAATT-TGGATTA-TTT
64 ATTTATTTTTT-AAATC---T-CTTATTAATTTT-TGAAATATTAA-TAAATTAT--ATTATTTT
* * **** * * * * * **
89189 ATTCCAAATAAGCTTGTAAGTAATTAAATTTGGATT-ATTTAT-TC-CAA-ATAAGCTTGTAA-G
120 ATTCCAAATAAGCTTATATG-AA-TAAA-ACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * ** * * * *
89249 -TATGAAACAAAT-ATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAAAGACTAGAAATAGAAAATTA-TTC
182 ATTTGAAATAGATAATTGT-T--C---A-AATA-GTCATAATTATTTGAACT-G---ATTAGAT-
* * * * * * * * * *
89311 TAATAG-TTTTTACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACTCATTTATTTTTTAAATCTCT--T-ACTT
234 AAATAGATTATT--T-TTT-AAAT-CTCT--T--ACTTATTAATTTTTGAAATAT-TAATAAATT
* * * ** * ** * * * * **
89372 ATTAATT-TTTAGAATAT-TATTAATTTAGTATTATTTTTAACCAAATAAGCTTTTATGATTAGA
289 AGT-ATTATTT--TAT-TCTAATAAGCTAGTATGA-ACTGAAAC-AAT-TG-TTTTA-CAACA-A
** * * * * **** * * ** * * *
89435 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTAAAATAGGTAATCATTCAAATGGCC
344 AACAAAAG-GTAATAACGATTTGAAATA-GATAATTA-TTCAAATA-GT-AT-A-AC-TAT----
* * * * * * * **
89500 ATAATTATTTTAATTGAGTCGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTAATAATTTAGGA
397 TTGA--ATTT-----G-TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * * * **
89565 AGTATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTATCTAAGCTTATATTAATTGAA-ACATTTGTTTT
454 AATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGA-ATAAGCTTGTATGAAAAGAATA-A-TTGTTTT
* *
89628 ATGACAAATCAAAAGGTT
516 ATGACAAAACAAAAAGTT
* * * * * * * *
89646 ATAACAATTTTATATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TATTTGATAAACAGA
* *
89711 TTTACTTTTTTAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTCA-TTTATT
65 TTTA-TTTTTTAAATCTC--T-T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATT-ATTTTATT
* * * * * * *
89775 CTAAATAAGTTTGTATGGACTGAAA-CAATTGTTTTAT-AAATAAACAAAA-GTCAAAATGATTT
123 CCAAATAAGCTTATAT-GAATAAAACCAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * ** * * * * * * *
89837 GAAATAGATAATTTTTCTAATTGTCTTAACCATTTAAATTGATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTT
186 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGA-TTATTTTTT
* * * *
89902 AAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTT
250 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAATAAGCTA
* ** * * * * *
89962 GTATGAAC-AAAACAATTG-TTTATGAGAAAAGAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATTATCA
314 GTATGAACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * * ** * * * * **
90025 TTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGCAATTAGACTTATTTTTTAATTTTTTTGGTTA
379 TTCAAATAGT-ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * * * * ** ** *
90090 TTTAGTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAAATAATATGAATAGAAC
443 TTAATTTTTGA-AATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAGAA-
* * *
90154 CAATTGTTTGATGACAAAA-TAAAAGCTT
506 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TT
** ** * * * * *
90182 ATAATAATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAA-TAGTTTGGTAAGCAA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTA-TTTGATAAACAG
* * *
90246 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
64 ATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTC
* * * * * * ** * * *
90311 CGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATAATTTAATGACAAAATAGAAA-GTAATAATGATTTGA
124 CAAATAAGCTTATATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * *
90375 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTAAACT-AGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTA
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGA-TTAGATAAATAG-ATTATTTTTTA
** * * * * * * * *
90439 ACCCTCTTACTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAACTAGTTTTATTCTATTCCAAATAGGCTTG
251 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CTAATAAGCTAG
* * ** * * * *
90504 TA-AAAGCTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTA
315 TATGAA-CTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * * *** * *
90568 TTCATATAATCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
379 TTCAAATAGT-ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * * *
90633 TTAATTTTT-AGAATTTTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTAT-AAACAGAA
443 TTAATTTTTGA-AATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAA-AG-A
* * * * * * *
90696 ACAATTATTTTGTGATAGAACTAAAGGTT
505 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
* * * * * ** * *
90725 ATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGTAA-TGGTTCAACAAATAG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACT-ATTTGATAAACAG
* * *
90789 ATTTATTTTTTAAATCAT-TTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAA
64 ATTTATTTTTTAAATC-TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAA
* ** * * * *
90853 ATAAGCTTGTATGTTTTAAAA-TAATTTTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAATGATTTGAAAT
127 ATAAGCTTATATG-AATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * ** * *
90917 AGATAGTTGTTCAAAT-GACCATTTTTATTTGAATTGATTCA-ATAAGCT-GATTTATTTTTTAA
191 AGATAATTGTTCAAATAG-TCATAATTATTTGAACTGATT-AGATAA-ATAGA-TTATTTTTTAA
* * * * * **
90979 ATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTT
252 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AATAAGCTAGT
* *** * * * * * *
91044 ATGAACTAAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTGATAATGATTTTAAATTGATAATTGTT
316 ATGAACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* ** * *** ** *
91109 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAGATGCATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTAT
381 CAAATAGT-ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTAT
* * * **
91174 TAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAGCAAGCTTGTATGAACTAA-AA
444 TAA-TTTTTGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAA--AAGAA
* * * * * *
91237 CAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTC
506 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
* * * * * * * * * * * * *
91265 AGAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATATTCTTAACTATTTGAATTAGTTCAGCAAACACA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTATTTGA-TAAACAGA
* * * **
91330 TTTATTTTTTAAATCACTTATTAAGTTTTGGAAA-ATTATTAAATTAGTATTATTTTTATT-TGA
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTA-TTTTATTCCAA
* * * * * *
91393 ATAAGCTTGTATG-ATCAGAAA-TAACTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAACT-ATTTGAG
127 ATAAGCTTATATGAAT-A-AAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAA
* * * * * * * * * * *
91454 ATTGATATTTGTTCTAATATTTATAATTATTTAAACT-AGTTCAAAAAAATAGCTTTAGTTTTTG
189 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGA-TT-AGATAAATAG-ATTATTTTTTA
* *** * * *
91518 AGTCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTT
251 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAATAAG-CTA
* * ** * * * *
91583 TTATGAACCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGGCTTT-AAATAGATAATT
314 GTATGAACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAA-CGATTTGAAATAGATAATT
* * * ** * * *
91647 GTTCAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTAGCAAACAAATTTATATTTTTAAATCTTTTGC
378 ATTCAAATAGT-ATAA-CTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTAT-TTTTTAAATCTTTTAC
* * * * * * *
91711 TCATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAAAAAGCTTATATGAACTA
440 TTATTAATTTTTGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAA--A
* * * *
91775 A-AATAATTGCTTTATGACTAAACAAAAGGTCC
502 AGAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGT-T
* * * * * * * ** * *
91807 A-AATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAGTATTTGAAA-TGGTTTGGCAAATAC
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACT-ATTTGATAAACAG
* * * *
91870 ATTTATCTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTT-AGAATTTTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T--TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT
* * * * * **
91934 CCCAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGCTTTATGACAAAA-TAAAGGTCATAACAATTTG
123 CCAAATAAGCTTATATGAATAA-AACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * *
91997 AGATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAATATTTGAACT-ATTTTGGTAAACAGATTTAGTTTT
187 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATTATTTGAACTGA-TTAGATAAATAGA-TTATTTTT
* * * * **
92061 TAAATCTC---C-TATTAATTTTTAAAATATTAATATATCAGTATTATTTTATTTTGAATAATTT
249 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AATAAGCT
* * * ** *
92122 TGCATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAAT
313 AGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * ** *
92186 TGTTCAAATGGACATGACTATTTGAA---CTT--ATAAAAATATTTATTTTTTAAGTCTCCTACC
377 TATTCAAATAG-TATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * * * * *
92246 TATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTATTATT-TTTTATTTTGAATAAACGTGTATGAATAAA
441 TATTAATTTTTGA-AATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAA-AAG
* * * *
92309 AATAATTATTTTATCACAAAATGAAAAA-TC
504 AATAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAAGTT
* * * *
92339 ATAA-GTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTTACTTGGTAAA-TG
1 ATAACG-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TATTTGATAAACAG
* * * *
92402 ATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTT
64 ATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTC
* * * * * * *
92467 CAAATATGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATGACT-ATTTGA
124 CAAATAAGCTTATATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGA
* * * * *
92531 AATAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAATAAATTTGTTTTTT
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTG-ATT-AGATAAATAGA-TT-ATTTTT
* * * * * *
92594 TAAAT-TTTTTCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAACA-TA-TATTATTTTCTTCAAAATAAAC
249 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTC-TAATAAGC
* * * ** * * *
92656 TTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-GAATTTGACATAGATA
312 TAGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACG-ATTTGAAATAGATA
* * * * * * * * *
92719 ATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATATTCTAAATCTCTTA
375 ATTATTCAAATAGT-ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* ** * * * * * * * * * * **
92784 CTCAAGAATTTTTGGAATATCATTCAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGGC-TATACGAACT
439 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATAA-GCTTGTATGAAAA
* * * * * *
92848 GATACAATTGTTTTTTAATGAAAA-AACAAGTC
503 GA-ATAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAAGTT
* * * * * * * *
92880 ATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT-TGTTCAGCAAACAT
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAT-TTGA-TAAACAG
* * * * *
92944 ATTTATTTTTAAAATATTACTTACTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-T
64 ATTTATTTTTTAAAT-CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTT-ATTCC
* * * * * * * * *
93008 GAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCACAATGAATTGAAA
125 AAATAAGCTTATATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * *
93073 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAATAGATTTCTTTTTTAAA
190 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGA-TTAGATAAATAGA-TTATTTTTTAAA
* * * *
93137 TCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATGGGC-AACT-AGTC
253 TCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT--TCTAA-TAAG-C
* * ***** * *** * * * **
93199 ATAACTACTCGAACTGGTTTAATA-AATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTACTTTTT
312 -T-AGTA-T-GAACT-G---AA-ACAATTG-TTT-TACAACAAAAC-AAAAGGTAATAACGATTT
* ** * * * * **
93262 GAACTATTA-ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGAA--TGATC-AAAAACA-AT
365 GAA--A-TAGAT-AATTA-T-TCA-AATAGTAT-AACT-A-TTTGAATTTGTTCGGTAAACATAT
* *** ** * * *
93321 TT-TTTTAT-AA-C-AAAACAAAAGGTCATATTGATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAATGCCTA
420 TTATTTTTTAAATCTTTTAC-TTA--TTA-ATT--TTTGAAATA-TTAATGAATT--AA----TA
** * * * * *
93381 TAATATTTT-ATTCTGAATAAAATAGTATGAATAA-AACTAATTGTCTGATGAAAAAACAAAAGG
472 T--TATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAA-TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG
93444 TT
532 TT
* * * * * * * * *
93446 AAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACCATTTGAAA-TGAATTGGTAAGCAG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACT-ATTTGATAAACAG
** *
93510 ATTTACATTTTAAGTCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
64 ATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT
* * * * * ** * *
93574 TCGAACAAACTTATATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAATA-AAAA-GTAATAATGATTTG
123 CCAAATAAGCTTATATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTCATAATGATTTG
** * * * * * * *
93637 AAATAGATAATTGTTTGAATATTTATAATTATGTAAACTGGTTCGATAAATA-A-AATTTTTTAA
187 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGATTATTTTTT--
* * * * * *
93700 AAAATCTCTT-CTTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCTGCATAAAC
250 -AAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AATAAGC
* * ** * ** * * *
93764 TTGCATGAGTTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATCGATAAT
312 TAGTATGAACTGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * *** * * ** * *
93829 TA-TCATATAGTCTTAACTATTT-AAACGGTTTGGCAAACGGATTTATTTTTTAAAATCTCTTAG
377 TATTCAAATAGT-ATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTAC
* * * * * * * ** *
93892 TTATGAATTTTT-AGATAATTATTAAATTAGTATTATTTT-TTTCAAATAAATTTGTATGAACAG
440 TTATTAATTTTTGAAAT-ATTAATGAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAAAG
* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * ** * *
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* * *
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* *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* ** * *
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* * * * * ** * ** * *
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** ** * * * ** * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * *** * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * ***
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* *** * * *
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* * * * * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** ** * * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* *
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** * * *
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662 AGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * ** * * * * *
89461 GATCATAACGATTTAAAATAGGTAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGAG-TCGGTAA
725 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-AGTTCAGTAA
* * * * * *
89525 ACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTAATAATTTAGGAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTT
789 ACAGATTTATTTTTTAAA---TCTACTTATTAATTTTGGAA-AATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * *
89590 ATTCT-ATCTAAGCTTATATTAATTGAAACATTTGTTTTATGAC
850 ATTCTGA-ATAAGCTTGTATTAACTGAAATAATTGTTTTATGAC
* * * * * * *
89633 AAATCAAAAGGTTATAACAATTTTATATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTAAACTTG
1 AAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTAG
* * * * *
89698 TTTGATAAACAGATTTACTTTTTTAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAG
65 TTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* *
89763 TATTCA-TTTA-TTCTAAATAAG-TTTGTATGGACTGAAACAATTGTTTTATAA-ATAAACAAAA
129 TATT-ATTTTATTTC-AAATAAGCTTT-TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACA-AAACAAAA
* * * * * * * * * ****
89824 -GTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCTAATTGTCTTAACCATTTAAATTGATTTGGTAAA
190 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGGTTCAACAAA
* * * *
89888 CAAATTTTTTTTTTAAATC-TCTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATC
254 CAAATTTATTTTTTAAATCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
89951 CAAATAAGCTTGTATG-AACAAAACAA-TTGTTTATGAGAAAAGAAAAGGTTATAACGATTTGAA
319 CAAATAAGCTTGTATGAAATAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* ** * * * ** * * *
90014 ATAGATTATCATTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGCAATTAGACTTATTTTTTAAT
384 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGTTCAATAACT-GATTTATTTTTTAAA
* * ** * * * * *
90079 TTTTTTGGTTATTTAGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAAATAATA
447 TCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGATTATA
* * * **
90144 TGAATAGAACCAATTG-TTTGATGACAAAATAAAAGCTTATAATAATTTGAAATAGTTAATTATT
511 TGAATAGAAACAATTGTTTTG-TGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATT
* * * * *
90208 CAAATAGTCAAAACTATTTGAAATAGTTTGGT-AA-GCAAATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGA
575 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATGC--ATTTATTTTTTAAATCTC-TACTTA
* * * * * * *
90271 TTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATTAACAAAAAC
637 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
** * * * *
90336 AATAATTTAATGACAAAATAGAAA-GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
702 AATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * ** * * * * * **
90400 AATTATTTAAACTAGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAACCCTCTTACTTATAAATTTTTAAAA
766 AACTATTTGAATTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAA--ATC-TACTTATTAATTTTGGAAA
* * * ** * *
90465 TATTAATAAACTAGTTTTATTCTATTCCAAATAGGCTTGTA-AAAGCTGAAATAATTGTTTTATG
828 -ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATTAA-CTGAAATAATTGTTTTATG
90529 AC
891 AC
* * *
90531 AAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAATCTTAACTATTTGAACTAG
1 AAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTAG
** * * * *
90596 TTTGGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATTTTACTAAATTAG
65 TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG
* * * * * * * *
90660 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATAAACAGAAACAATTATTTTGTGATAGAACTAAAGGTT
129 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTC
* * * *
90725 ATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGTAA-TGGTTCAACAAATAG
194 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TT-TAACTGGTTCAACAAACAA
* * *
90789 ATTTATTTTTTAAATCAT-TTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAA
257 ATTTATTTTTTAAATCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
*** * * *
90853 ATAAGCTTGTATGTTTTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAATGATTTGAAATA
322 ATAAGCTTGTATGAAATAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * **
90918 GATAGTTGTTCAAAT-GACCATT-TTTATTTGAATTGATTCAATAAGCTGATTTATTTTTTAAAT
387 GATAATTGTTCAAATAG-TC-TTAACTATTTGAATTG-TTCAATAA-CTGATTTATTTTTTAAAT
* * ** * *
90981 CTCTTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTA
448 CTCTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGATTATA
* * * ** *
91045 TGAACTA-AAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTGATAATGATTTTAAATTGATAATTGTT
511 TGAA-TAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATT
* * *
91109 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAGATGCATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTAT
575 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATGCATTTATTTTTT-AAATCTC-TACTTAT
**
91174 TAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAGCAAGCTTGTATGAACTAAAACA
638 TAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * * * * * *
91239 ATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATATTCTTAA
703 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* *
91304 CTATTTGAATTAGTTCAGCAAACACATTTATTTTTTAAATC-ACTTATTAAGTTTTGGAAAATTA
768 CTATTTGAATTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAA-TTTTGGAAAATTA
* * * * * *
91368 TTAAATTAGTATTATTTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGATCAGAAATAACTGTTTTATGAG
832 ATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATTAACTGAAATAATTGTTTTATGAC
* * ** * * * * * *
91429 AAAAC-AAAGATCATAACTATTTGAGATTGATATTTGTTCTAATATTTATAATTATTTAAACTAG
1 AAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTAG
** * * * * * ***
91493 TTCAAAAAAATAGCTTTAGTTTTTGAGTCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGGTAG
65 TT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * *
91558 TATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTTATGAACCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGT
129 TATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGT
* * * * *
91623 CATAATGGCTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTAGCAAAC
193 CATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTT-AACTGGTTCAACAAAC
* * *
91686 AAATTTATATTTTTAAATCTTTTGCTCATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
255 AAATTTAT-TTTTTAAATC--TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * ** *
91751 TTCTGAAA-AAGCTTATATGAACTAAAATAATTGCTTTATGACTAAACAAAAGGTCCA-AATGAT
316 TT-TCAAATAAGCTTGTATGAAATAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAATGAT
* * * *
91814 TTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAGTATTTGAAATGGTTTGGCAA-ATAC--ATTTAT
379 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTG-AATTG-TT--CAATA-ACTGATTTAT
* * * **
91876 CTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTAGAATTTTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCCAATA
439 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAATA
* * * * * * *
91941 AGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATGACAAAAT-AAAGGTCATAACAATTTGAGATAAAT
503 AGATTATATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAAT
* * * *
92005 AATTGTTCAAATAGTCATAAAATATTTGAACTAT-TTTGGTAAACAG-ATTTAGTTTTTAAATCT
568 AATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAA-TGCATTTATTTTTTAAATCT
** * * * ** *
92068 C--C-TATTAATTTTTAAAATATTAATATATCAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAA
630 CTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
* * *
92130 -TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
695 CTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
92194 TGGACATGACTATTTGAACTTA--T-A--AAA-ATATTTATTTTTTAAGTCTCCTACCTATTAAT
759 TAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAA--AT-CTACTTATTAA-
* * * * * * * *
92253 TTTTAGAATATTAATAAATTATTATT-TTTTATTTTGAATAAACGTGTATGAA-TAAAAATAATT
819 TTTTGGAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATTAACT-GAAATAATT
* *
92316 ATTTTATCAC
883 GTTTTATGAC
* * ** * * *
92326 AAAATGAAAAATCATAAGTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTTA
1 AAAA-CAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAAC-TA
* * * * *
92391 -CTTGGTAAAT-GATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
64 GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * *
92454 TATTATTTCATTTCAAATATGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTC
129 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTC
* * * *
92519 ATGACTATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAATA
194 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTG-GTTCA-ACAAACA
* * * *
92582 AATTTGTTTTTTTAAATTTTTTCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAACA-TA-TATTATTTT-C
256 AATTT-ATTTTTTAAA--TCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTAT
* * *
92644 TTCAAAATAAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-GAAT
317 TTC-AAATAAGCTTGTATGAAATA-AAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-AT
* ** *** * * *
92707 TTGACATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATATT
379 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGTTCAAT-AACTGATTTATTTT
* * ** * * * * * *
92772 CTAAATCTCTTACTCAAGAATTTTTGGAATATCATTCAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGG
442 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGA
* * * * * * *
92837 CTATACGAACT-GATACAATTGTTTTTTAATGAAAA-AACAA-GTCATAATGATTTGAAATAAAT
506 TTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTGTGA-CAAAATAA-AAGGTCATAATAATTTGAAATAAAT
* * ** * *** * *
92899 AATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTAAAATAT-TA
568 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATGCATTTATTTTTTAAATCTCTA
* * * *
92963 CTTACTAA-TTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATAAAC
633 CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * *
93026 AAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCACAATGAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
696 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
93091 GTCATAACTATTTGAACTTA-TTTAGTAAATAGATTTCTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTG
761 GTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTATTAATT-
* * * ** ** *
93155 TCT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATGGGCAACT-AGTCATAACTACTCGAACTGGTT
821 T-TGGAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AA-TAAG-C-T-TGTA-T-TAACT-G--
* * * ***
93218 TAATAAATAGATTTATTTTTT
875 AAAT-AATTG-TTT-TATGAC
* *** * * * ** * * * **
93239 AAATCTCTTACTTATTACTTTTTGAACTATTAATAA--ATT--AGT-ATTAT-TTTATTTCAAA-
1 AAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGAA--ATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT-AAAC
* * * *** ** * * ***
93297 TAAGCTTGAATGATCAAAAACAATTT-TTTTATAACAAAACAAAAGGTCATATTGATTTGAAATA
62 T-AG-TT---TGAT-AAATA-GATTTATTTTTTAA-ATCTC-TTA---CTTATTAATTTTTGA-A
* * * ** ** *
93361 GATAATTATTCAAATGCCTA-TAATATTTTA-TTCTGAATAAAATAGTATGAATA-AAACTAATT
114 -AT-ATTAAT-AAAT---TAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTTTATGAACAGAAAC-AATT
* * * * * * * *
93423 GTCTGATGAA-AAAACAAAAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACC
171 GTTTTAT-AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * *** * * ** * *
93487 ATTTGAAATGAATT-GGTAAGCAGATTTACATTTTAAGTCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATA
235 ATTT-AACTG-GTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAA--ATCTT-CTTATTAATTTT-TGAAATA
* * * * * *
93550 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAACA-AAAATAATTATTTTATGAC
294 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-ATAAAACAATTTTTTTATGAC
* ** * * * *
93614 AAATA-AAAA-GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTGAATA-TTTATAATTATGTAAACT
358 AAA-ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAA-T
* * * ** * * **
93676 GGTTCGATAAAT-A-AAATTTTTTAAAAAATCTCTT-CTTTATAAAATTTT-GAAATATTAACAA
420 TGTTCAATAACTGATTTATTTTTT---AAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTAG-AATATTATTAA
* ** * * * * *
93737 ATTAGTTTTATTTTATTCTGC-ATAA-ACTTGCATGAGTTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACA
480 ATTAGTATTATTTTATT-T-CAATAAGA-TTATATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATA
* ** ** * * * * *
93800 AAATGTCATAACGATTTGAAATCGATAATTA-TCATATAGTCTTAACTATTTAAAC-GGTTTGGC
542 AAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * *
93863 AAACGGATTTATTTTTTAAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAG-ATAATTATTAAATTAGTATTA
607 AAATGCATTTATTTTTT-AAATCTC-TACTTATTAATTTTTTGAAT-ATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * * *
93927 TTTT-TTTCAAATAAATTTGTATGAAC-AGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAGACA-GTTAAA
669 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATA
* * * *
93989 ATAATTTGAAATAGTTAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGATCATAACTATTTAAAC
732 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TT----TGA--AT---TAGTT---C
* * *
94054 AGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTAATTCTT-GAAATATTAAAAAATTAG
784 A------GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATT-TTGGAAA-ATTAATAAATTAG
* * *
94117 TATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGT---TGAAAAACAATTATTTTATGAC
841 TATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTAT-TAACTG--AAATAATTGTTTTATGAC
* * * *
94169 AAAACAAAAGGTAATAACGATTTTATATAATAAGCTTGTATGTTGGAAAACAATTGTTTTATGAC
1 AAAACAAAA-GTCATAAC-AATTT-GA-AATAA------A---T-------AA-----TTAT-TC
* * * *
94234 AAAACGAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGATCTAA
40 -AAA--TAA--TCATAACTATTT--AA-A-CT-A--G-T----T-------------TGA--TAA
* * *
94299 TTTAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGTAGT
73 ---A-T--A--GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* *** * * * *
94364 ATTCTTTTATTTTGGATAAG-TTTTAT--ACCGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
130 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCA
* * * * ** *
94426 TAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTAAACTGATTTGATAAACAAAT
195 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGGTTCAACAAACAAAT
* * * * * **
94491 TAACTTTTTAAATCACTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGTTTTATTTTATTTTG
259 TTATTTTTTAAAT--CTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * *
94556 AATAAGCTCGTATG-AATAAAAGAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAA
321 AATAAGCTTGTATGAAATAAAA-CAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * ** **
94620 TAGATAATTGTTCAAATAAT-TGTAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTTA
385 TAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAA-TTGTTCAAT-AACTGATTTA--TTTTTTA
* * ** * * *
94684 AA-CT-TCTGCTTATTAA-TTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTAGTATTTTA-TTCTAGATATGC
445 AATCTCT-TACTTATTAATTTTTAG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTC-A-ATAAGA
* * * * * * * * *
94745 TTTTATAAAT-GTAGATAATT-TTGTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATA
506 TTATATGAATAG-AAACAATTGTT-TTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATA
* * * * * * *
94808 ATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAA-GAGATTTATTTTTTCAAATCTTT
569 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATG-CATTTATTTTTT-AAATC-TC
* * * * * * * * * * *
94872 TGCTTATTTATTTTTTGAGTGTTAATAAGTTTGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTCGCAAGATA
631 TACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-A
* * * * * * * *** *
94937 -TGAAACAAATATTTT-TGACCAAAGAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATAACTCTAAT
695 CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * * * * *
95000 AGTTTTATCTATTTGAAATGGTTC-GACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
760 AGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAATT
** * * * * * *
95064 TTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAAT-TGAATAAGTTTCTATT-ATTAGAAACAATT
821 TTGGAAA-ATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATTAACT-GAAATAATT
*
95127 TTTTTATGAC
883 GTTTTATGAC
** * * ** * *
95137 AAAAC-AAAGATTTTAACGATTTG-AGTTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-AG
1 AAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTA-
* * * *
95199 GTTCGATAAACATATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
64 GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
95264 TATTATTTT-TTTCAAATAAACTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGACAATACAAAAGGT
129 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGT
* * * ** * * * ** *
95328 CACAACAATTTAAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTCAATAAACAA
193 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTAACTGGTTCAACAAACAA
* ** *
95393 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACATATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TT
257 ATTTATTTTTTAAA--TCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
*** * * * * * * * * * *
95457 CTGTCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAATCAACAGGTTATAAAGATTTTA
319 C-AAATAAGCTTGTATGAAATAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * ** * *** *
95522 AATAAACAATTGTTAAAATAGTAATAACTATTTGAACTTTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTA
383 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGTTCAAT-AACTGATTTA-TTTTTTA
* * * * *
95587 AATCTCTTTCTTATTAATTTTTCA-AATATTATT-AATTATTATTAATTTATTTTGAATAAGCTT
445 AATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGATT
* * * * * * * * *
95650 GTATAAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATT
508 ATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATT
* * * * *** ***
95714 ATTCTAATAGTCTTAACCATTTAAAC-TGATACAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-T-T-CTT
572 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATGCATTTATTTTTTAAATCTCTACTT
* * * * * * *
95775 ATTAA--TTTTGAAATATTATTAACTTATTATTATTTTAATCCGAATCAGCTTGTA-CAGA-TAA
636 ATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACTAA
* ** * * *
95836 AACAATTATTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
699 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
*
95901 ATAATTATTTGAA
764 ATAACTATTTGAA
95914 CTGGTTCAAA
Statistics
Matches: 6202, Mismatches: 1438, Indels: 965
0.72 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
891 3 0.00
892 18 0.00
893 188 0.03
894 87 0.01
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AAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTAGT
TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
TTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCAT
AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAACTGGTTCAACAAACAAATTT
ATTTTTTAAATCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
GCTTGTATGAAATAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
ATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGTTCAATAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
TATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAATAAGATTATATGAATAGAAA
CAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATGCATTTATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTTGAAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAG
TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTGGAAAATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATTAACTGAAATAATTGTTTTATGAC
Found at i:93271 original size:105 final size:105
Alignment explanation
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93079 ATTGTTCAAA
* * * * * *
93089 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTCTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
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*
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* *
93194 TAGTCATAACTACTCGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTACTT
1 TAGTCATAACTACTCGAACTGATTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
*
93259 -TTTGAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTA
66 GTCTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTA
93290 TTTCAAATAA
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TAGTCATAACTACTCGAACTGATTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
GTCTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATGGGCAAC
Found at i:94229 original size:65 final size:65
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*
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1 AATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTTATAT
* * *
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94257 GAAATAGATA
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Matches are distributed among these distances:
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AATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTTATAT
Found at i:94634 original size:181 final size:180
Alignment explanation
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94187 GATTTTATAT
* * * * * *
94197 AATAAGCTTGTATG-TTGGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAACAATTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAAT--AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA
* * * * * * * **
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64 TAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * *
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* * *** *
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1 AATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATA
* * * * *
94441 GATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTAAACTGATTTGATAAACAAATTAACTTTTTAAATCA
66 GATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * *
94506 CTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGTTTTATTTTATTTTG
131 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* * * *
94556 AATAAGCTCGTATGAATAAAAGAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAATAAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
** * *
94621 AGATAATTGTTCAAATA-ATTGTAACTATTTAAATTTG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTTA
65 AGATAATTGTTCAAATAGA-CATAACTATTTAAA-CTGATTCGATAAACAAATTTA--TTTTTTA
* * * * *
94684 AA-CT-TCTGCTTATTAATTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTAGTATTTTATTCT-
126 AATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* * * * * * * *
94737 AGATATGCTTTTATAAATGTAGATAATT-TTGTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAA
1 A-ATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTATT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAA
* * *
94801 ATAAATAATTGTTCAAATAGTA-ATAACTATTTAAACTTG-TTCGATAAAGAGATTTATTTTTTC
63 ATAGATAATTGTTCAAATAG-ACATAACTATTTAAAC-TGATTCGATAAACAAATTTATTTTTT-
* * * * * * * *
94864 AAATCTTTTGCTTATTTATTTTTTG-AGTGTTAATAAGTTTGAATTATTTTATTTTG
125 AAATCTCTTACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* * * * * * * * *
94920 AATAAGCTCGCAAGATATGAAACAAATATTTT-TGACCAAAGAAAAGGTCAGAACGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
*** * *** * * * *
94984 AGATAATAACTCTAATAGTTTTATCTATTTGAAA-TGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAAT
65 AGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTT-AAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * *
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129 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTG
* * * * * * ** * *
95100 AATAAGTTTCTATTATTAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATTTTAACGA-TTTGAGT
1 AATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
* * * * * * * *
95163 TGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAGGTTCGATAAACATATTTATTTCTTAAATC
65 AGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
**
95228 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCA
130 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* * * * * * *
95278 AATAAACTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGACAATACAAAAGGTCACAACAATTTAAAA
1 AATAAGCTTGTATG--AATAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA
** * * * * * *
95343 TAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
64 TAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * ** * *
95408 TTCTTACATATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTG
129 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
** * * * * * * * *
95460 TCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAATCAACAGGTTATAAAGATTTTAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
* * * * ** * * *
95525 AAACAATTGTTAAAATAGTA-ATAACTATTTGAACTTTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA
65 AGATAATTGTTCAAATAG-ACATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAA
* * * * *
95589 TCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATATT-ATTAATTATTATTAATTTATTTTG
128 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* * * * * *
95641 AATAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
* * * * * *
95706 AGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTAAACTGATAC-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-
65 AGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * **
95769 -T-TT-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAACTTATTATTATTTTAATCCG
129 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* * ** * * * * *
95817 AATCAGCTTGTA-CAGATAAAACAATTATTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
* * *
95881 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTG
65 AGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACTG
95917 GTTCAAAAAG
Statistics
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0.76 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATA
GATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
Found at i:95548 original size:722 final size:722
Alignment explanation
Indices: 94311--95910 Score: 1719
Period size: 722 Copynumber: 2.2 Consensus size: 722
94301 TAGTAAACTG
* * * * * *
94311 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGTAGTATT-CTTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATA
* *
94375 TTGGATAAGTTTTATACCGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTTAAAT
66 TTGAATAAGTTTTATACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTTAAAT
* * * *
94440 AGATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTAAACTGATTTGATAAACAAATTAACTTTTTAAATC
131 AGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTAAACAGATTCGATAAACAAATTAACTTTTTAAATC
* * * ** *
94505 ACTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCTCGTATG
196 ACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTCGTATG
* * ** * **
94570 AATAAAAGAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAA
261 AATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAACAATTTAAAATAGATAATCATTCAA
*** * ** ** * *
94635 ATAATTGTAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTTAAACTTCTGCTTATTAA
326 ATAACCATAACTATTTAAACTAATTCAATAAACAAATTTA-TTTTTTTAAACTTCTACATATTAA
* * * * * *
94700 TTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTAGTATTTTATTCTAGATATGCTTTTATAAATGTAGATAATT
390 TTTAGGAAATATTAAGAAATTAATAGTATTTTATTCTAGATAAGCTTGTATAAATGTAAACAATT
** * *
94765 TTGTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTAATAACTA
455 TTGTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTAAAATAGTAATAACTA
* * ** * *
94830 TTTAAACTTGTTCGATAAAGAGATTTATTTTTTCAAATCT-TTTGCTTATTTATTTTTTGAGTGT
520 TTTAAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTCAAATAT
*
94894 TAATAAGTT-TGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTCGCA-AGATA-TGAAACAAATATTTT-TGA
584 TAATAA-TTAT-AATTAATTTATTTTGAATAAGCTCGCATA-A-ACTGAAACAAATATTTTATGA
* * * * *
94955 CCAAAGAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATAACTCTAATAGTTTTATCTATTTGAAA-T
645 CCAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATAACTCTAATAGTCTTAACCATTT-AAACT
* * *
95019 GGTTC-GACAAACAC
709 GATACAG-CAAACAA
*
95033 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTA-A
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATA
* * *
95097 TTGAATAAGTTTCTATTATTAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATT-TTAACGA-TTT
66 TTGAATAAGTTT-TA-TA-CAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TTCATAACGATTTT
* * * * * * * *
95159 GAGTTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAGGTTCGATAAACATATTTA-TTTCTT
127 AAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTAAACAGATTCGATAAACAAATTAACTTT-TT
* *
95223 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCAAATAAACTT
191 AAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTC
*
95287 GTATG-ATAAAAAAACAATTGTTTTATGACAATACAAAAGGTCACAACAATTTAAAATAGATAAT
256 GTATGAAT-AAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAACAATTTAAAATAGATAAT
** * * *
95351 CATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTCAATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATTTCTTAC
319 CATTCAAATAACCATAACTATTTAAACTAATTCAATAAACAAATTTATTTTTTTAAACTTC-TAC
* * * *
95415 ATATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-GTCTAAGCTTGTATTAACTG
383 ATATTAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAATAGTATTTTATTCTAG-ATAAGCTTGTA-TAAATG
* * *
95479 -AAACAATTGTT-TTATAACAAATCAACAGGTTATAA-AGATTTTAAATAAACAATTGTTAAAAT
446 TAAACAATT-TTGTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTTAAATAAACAATTGTTAAAAT
* * * * *
95541 AGTAATAACTATTTGAACTTTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATT
509 AGTAATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTTCTTATTAATT
* * * * *
95606 TTTCAAATATTATTAATTATTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATT
574 TTTCAAATATTAATAATTATAATTAATTTATTTTGAATAAGCTCGCATAAACTGAAACAAATATT
* * * *
95671 TTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTT
639 TTATGACCAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATAACTCTAATAGTCTTAACCATTT
*
95736 AAACTGATACAGTAAACAA
704 AAACTGATACAGCAAACAA
* *
95755 ATTTATTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAACTTATTATTA-TTTTA-A
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATA
* * * * ** * * *
95813 TCCGAATCAG-CTTGTACAGATAAAACAATTATTTTACAATAAAACAAAAAG-TAATAATGATTT
66 T-TGAATAAGTTTTATACAG---AAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACGATTT
* * * *
95876 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
126 TAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTT
95911 GAACTGGTTC
Statistics
Matches: 728, Mismatches: 122, Indels: 60
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
713 2 0.00
714 2 0.00
715 1 0.00
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719 2 0.00
720 2 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (722 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATA
TTGAATAAGTTTTATACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTTAAAT
AGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTAAACAGATTCGATAAACAAATTAACTTTTTAAATC
ACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTCGTATG
AATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAACAATTTAAAATAGATAATCATTCAA
ATAACCATAACTATTTAAACTAATTCAATAAACAAATTTATTTTTTTAAACTTCTACATATTAAT
TTAGGAAATATTAAGAAATTAATAGTATTTTATTCTAGATAAGCTTGTATAAATGTAAACAATTT
TGTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTAAAATAGTAATAACTAT
TTAAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTA
ATAATTATAATTAATTTATTTTGAATAAGCTCGCATAAACTGAAACAAATATTTTATGACCAAAC
AAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATAACTCTAATAGTCTTAACCATTTAAACTGATACAG
CAAACAA
Found at i:95555 original size:541 final size:533
Alignment explanation
Indices: 94214--95915 Score: 1482
Period size: 541 Copynumber: 3.2 Consensus size: 533
94204 TTGTATGTTG
* * *
94214 GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
1 GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * * * * * *
94279 GCCATAATTATTTGATCTAATTTAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTT
66 GCCATAATTATTTAAACTAATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
94344 TGAAAGATTAATAAAGTAGTATTCTTTTATTTTGGATAAG-TTTTAT-ACCGAAACAATTATTTT
131 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAACTGAAACAATTATTTT
* * *
94407 ATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG-ACATGACTATTT-
196 ATAAC-AAACAAAGGTT-ATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTA-ATAACTATTTG
* * * * * *
94470 AAACTGATTTGATAAACAAATTAACTTTTTAAATCACTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
258 AAA-TGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTA
* * * * * * *
94535 TATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCTCGTATGAATA-AAAGAAATTGTTTTATGACAAAACA
322 AATTAGTATTATTTT-TATTGAATAAGTTC-TATAAATAGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACA
* * * ** * * *
94599 AAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATTGTAACTATTTAAATTTGTTCGGT
384 AAAGGTCATAATGA-TTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCGAT
* * *
94664 AAACAAATTTATTTTTTTTAAACTTCTGCTTATTAATTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTAGTAT
448 AAACAAATTTA--TTTTTTAAACTT-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* **
94729 TTTATTCTAGATATGCTTTTATAAA
509 TTTATTCTAAATAAACTTTTATAAA
* * * * * *
94754 TGTAGATAATT-TTGTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAA
1 -GAAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAA
* ** * ** * * *
94818 TAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAAGAGATTTATTTTTTCAAATCTT-TTGCTTATTTA
64 TGGCCATAATTATTTAAACTAATTCAATAAACAGATTTATTTTTT-AAAT-TTCTTACTTA-TTA
* * * * * * * *
94882 TTTTTTG-AGTGTTAATAAGTTTGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTCGCA-AGATATGAAACA
126 ATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATA-A-CTGAAACA
* * * * * * *** * ** *
94944 AATATTTT-TGACCAAAGAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATAACTCTAATAGTTTTAT
188 ATTATTTTAT-AACAAA-CAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAA
* * * *
95008 CTATTTGAAATGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATA
251 CTATTTGAAATGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* * *
95073 TTATTAAATTAGTATTATTTTTAATTGAATAAGTTTCTATTATTAGAAACAATTTTTTTATGACA
316 TTATTAAATTAGTATTATTTTT-ATTGAATAAG-TTCTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACA
* ** * * * * *
95138 AAAC-AAAGATTTTAACGATTTGAGTTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAGGTT
379 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTT
* *
95202 CGATAAACATATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
444 CGATAAACAAATTTATTTTTTAAA-CT-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
*
95267 TATTTTTTTC-AAATAAACTTGTATGATAAA
506 TATTTTATTCTAAATAAACTT-T-T-ATAAA
* * **
95297 -AAAACAATTGTTTTATGACAATACAAAAGGTCACAACAATTTAAAATAGATAATCATTCAAATG
1 GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * * *
95361 GCCATAATTATTTTAACTAATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACATATTAATTTA
66 GCCATAATTATTTAAACTAATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT
* * ** *
95426 GGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGTCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTT
131 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-TAACTGAAACAATTATTT
* * * *
95491 TATAACAAATCAACAGGTTATAAAGATTTTAAATAAACAATTGTTAAAATAGTAATAACTATTTG
195 TATAACAAA-CAA-AGGTTATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTG
* ** * * * *
95556 AACTTTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTATT-
258 AAATGATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTA
* * *
95620 AATTATTATTAATTTATT-TTGAATAAGCTTGTATAAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAAC
322 AATTAGTATT-ATTT-TTATTGAATAAG-TTCTATAAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * * *
95683 AAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTAAACTGATAC-A
383 AAAAGGTCATAATGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCGA
* * *
95747 GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TTTCTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAACTTATTATTATTT
447 -TAAACAAATTTATTTTTTAAACTTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** * * * * *
95810 TAATCCGAATCAGCTTGTACAGA
511 TATTCTAAATAAACTTTTATAAA
* * ** * * * ** * *
95833 TAAAACAATTATTTTACAATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
* *
95898 GTCATAATTATTTGAACT
66 GCCATAATTATTTAAACT
95916 GGTTCAAAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (533 bp):
GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
GCCATAATTATTTAAACTAATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT
TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAACTGAAACAATTATTTT
ATAACAAACAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAA
TGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATT
AGTATTATTTTTATTGAATAAGTTCTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
ATAATGATTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCGATAAACAAAT
TTATTTTTTAAACTTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
AAACTTTTATAAA
Found at i:95885 original size:175 final size:178
Alignment explanation
Indices: 95566--95900 Score: 439
Period size: 175 Copynumber: 1.9 Consensus size: 178
95556 AACTTTTTTG
*
95566 GTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTATTAATTATTATTA
1 GTAAACAAATTTATTTTTTTAAA---CTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTATTAATTATTATTA
* ** * * * * *
95631 ATTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAAT
63 ATTTAATCCGAATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTATTTTATCAATAAACAAAAAGTCAAAAT
*
95696 GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTAAACTGATACA
128 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACCATTTAAACTGATACA
* *
95747 GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA-TTTCTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAACTTATTATTATT
1 GTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTATTAA-TTATTATTAAT
* *
95809 TTAATCCGAATCAGCTTGTACAGA-TAAAACAATTATTTTA-CAATAAAACAAAAAGT-AATAAT
65 TTAATCCGAATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTATTTTATCAAT-AAACAAAAAGTCAA-AAT
*
95871 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
128 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
95901 ATAATTATTT
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 15, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
174 4 0.03
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
GTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTTTCTTATTAATTTTTCAAATATTATTAATTATTATTAATT
TAATCCGAATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTATTTTATCAATAAACAAAAAGTCAAAATGAT
TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACCATTTAAACTGATACA
Found at i:96582 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 96049--96664 Score: 492
Period size: 181 Copynumber: 3.4 Consensus size: 178
96039 CTTTGTTTGA
* * * * * *
96049 AATAAAATAATATTAATTT-ATAAATATTT-AGAAAATAAATCCATAAGAGATTTAAAAAGTAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTCA-AAAATTAAT-AAGAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * ** * * * *
96112 TCTACTTACCAAACTATTTTAAGTAGTTTTGACTATT-TCAATAATTATTATTTGAAATCATTAT
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* * * * **
96176 AACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTTAG
127 AACCTTTCATTTAGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAG
* * * *
96229 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-GAA-AAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** *
96294 CTAATTGCCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTTTATGAATGATTATCAATTTCAAAT--TGCTA
64 CTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTTTATGAATAATT-TTTATTTCAAATCATTCTA
* * * ** *
96357 TTACCTTTTCTTTTA-TCGTAAAACAATTGTTCTGTTTGTACAAGCTTATTTGG
128 --ACC-TTTCATTTAGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAG
* * *
96410 ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * *
96475 TATTTACTAAA-TCAGTTCAAATGATTAAGATTATTA-GAATAATTGTTTATTTTAAATCATTCT
65 TATTTACCAAACT-AGTTCAAATAATTAAGACT-TTATGAATAATT-TTTATTTCAAATCATTCT
* * * *
96538 AATCTTTCGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAT
127 AACCTTTCATTTAGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * ** *
96591 AATAAATTAATGCTAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATATGAAAGAGATTTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAAA-AGA-TTTAAAAAATAAAT
96656 CTATTTACC
64 CTATTTACC
96665 GAATAAATTC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
179 10 0.03
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ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
ATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTTTATGAATAATTTTTATTTCAAATCATTCTAACC
TTTCATTTAGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAG
Found at i:96995 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 96676--97349 Score: 579
Period size: 181 Copynumber: 3.7 Consensus size: 178
96666 AATAAATTCA
* * * * * * * * * **
96676 AATAAGTAAGTGAATTAAAAAGTGAA-TATGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTATGACCATTT
1 AATAAGCAAGAGATTTAAAAAAT-AATTATGTTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTATAATTATTT
* * * * *** * *
96740 CAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATCTGACAAT-TGCTTTTGA-C
65 GAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAT--TTCT-ATT
* *
96803 CATATAAGCTTATTCGGAATAAAATATTACTGATTTATTAATCTTTCAAAAATT
127 CATACAAGCTTATTCGGAATAAAATA-TACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATT
* * ** *
96857 ATTAAGCATGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATAATTGTTTG
1 AATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTATAATTATTTG
** * * * * * *
96922 AGCAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCTT
66 AATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TATTTCTATTCAT
* * * *
96987 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATT
130 ACAAGCTTATTCGGAATAAAAT-ATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATT
* * ** *
97038 AAT-AGCTAAGAGATTTAAAATATAA-AATTGTTTGTCAAACCGGTTCAAATAGTTA-AGACTAT
1 AATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAATTA-TGTTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTATA-ATTAT
* * ** * *
97100 ATGAATAATTATTTATTTCAAATCATTA-AGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATACTTTCAAT
63 TTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATA-TTTCTAT
* ** * *
97164 TCATACTAGCTTATTTAGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
126 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATATACT-AATTTATTAAT-TTTCAAAAATT
* * * * *
97219 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCGGTTCAAATAATTATGATTATTTG
1 AATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTATAATTATTTG
* * *
97284 AATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTCTATTCAT
66 AATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATATTTCTATTCAT
97349 A
130 A
97350 TAAGTTTGTT
Statistics
Matches: 387, Mismatches: 88, Indels: 36
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
180 17 0.04
181 359 0.93
182 10 0.03
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
AATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTATAATTATTTG
AATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATATTTCTATTCATA
CAAGCTTATTCGGAATAAAATATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATT
Found at i:97501 original size:311 final size:313
Alignment explanation
Indices: 97106--97686 Score: 774
Period size: 312 Copynumber: 1.9 Consensus size: 313
97096 CTATATGAAT
* * *
97106 AATTATTTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATACTTTCAATTCATACT
1 AATTATTTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATACTTTCAATTCATACA
* * * * *
97171 AGCTTATTTAGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TT
66 AGCTTATTTAGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATGTA
* * * * * * *
97235 AAAAAATAATTTTGTTTACCT-AACCGGTTCAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTT
131 AAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACCAGATCAAACAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * *
97299 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA-TGTTTCTATTCATATAAGTTTGTTTGG
195 CAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAA-AAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGA
*
97363 AATGAAATAATAGTAATAATAGTATCAAACCAGTTCAAATTAAGGCTATTTAAGC
259 AATAAAATAATAGTAATAATAGTATCAAACCAGTTCAAATTAAGGCTATTTAAGC
** * * * *
97418 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTCTATTATAAAACAATATTTTCTATTCATACA
1 AATTATTTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATACTTTCAATTCATACA
* * * ** *
97482 AGCTTATTTGGATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAACTAAAAAATGTA
66 AGCTTATTTAGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATGTA
* * * *
97547 AAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAACAGTCCTGACTATTTTAATAATTATCTATTTC
131 AAAAAATAAATATGTTTACTGAACCAGATCAAACAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
97612 AAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA
196 AAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA
97677 TAAAATAATA
261 TAAAATAATA
97687 TTAAGTTATT
Statistics
Matches: 228, Mismatches: 38, Indels: 6
0.84 0.14 0.02
Matches are distributed among these distances:
311 89 0.39
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (313 bp):
AATTATTTATTTCAAATCATTAAGACTTTTTGTTCTATCATAAAACAATACTTTCAATTCATACA
AGCTTATTTAGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATGTA
AAAAAATAAATATGTTTACTGAACCAGATCAAACAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
AAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA
TAAAATAATAGTAATAATAGTATCAAACCAGTTCAAATTAAGGCTATTTAAGC
Found at i:97964 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 97408--101902 Score: 3374
Period size: 181 Copynumber: 25.1 Consensus size: 180
97398 CAAATTAAGG
* ** * * *
97408 CTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTCTATTATAAAACAATAT-TT
1 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTT
* * * * * *
97470 TCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAA
64 TCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAA
* * * * * * * **
97535 CTAAAAAATGTAAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAACAGTCCTGA
128 GTAAAAAAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * * *
97589 CTATTTTAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
97654 AATTCATATAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATATTAAGTTATTAAATATTCTAAAAATTAATAA
66 TATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATT-AATATTATAAAAATTAATAA
* * * * * *
97718 TTAAAAGATTTAAAAAATGAATATGTTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGA
128 GTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * ** * * * *
97771 TTATATGAACAATTATTTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTTTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * ** *
97836 TGTTCATACAAGCCTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAGGACAATTAATAAGT
66 TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGT
* * *
97901 AAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATCGTTATGA
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * * * *
97952 CTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTTATAAAATAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
98017 TGTTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAATTTATAAG
66 TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTATA-AAAATTAATAAG
* * * * * *
98081 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCACGA
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
98133 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * ***
98198 AATTCATATAAGCCT-GTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACGGG
66 TATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
98262 TAAGAGAATTAAAAAAATAAATTTGCTTATCGATCAAGTTGAAATAGTTATAA
129 TAA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
98315 CTATCT-AACAATTATCTCTTTCAAAACACTATGACATTTTGTTTTGCCATATAACAATTGGTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * **
98379 TGTTCATGCAAGCATATTTTGAACAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
66 TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
98444 -AAAATTTTAGAAAATAAAGCTATTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTATGA
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * ** *
98494 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTGTTTTATCATAAGCCAATTGTTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
98559 TGTTCAAATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGT
66 TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAGT
* * ** *
98623 -AAAAATTTAAAAAATAAATTTGTCTA-CG---GTGTTTAAATAGTTATGA
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * *
98669 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTGTGATCTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
98734 CTATTCGTACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAG
65 CTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAAG
** * * * * *
98799 TTGAAGATTTAAAAAATCAATCAGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATG-
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
98850 TTCATTAGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 CT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** ** * *
98915 CTATTTGTACAAAATTATTAT-AATAAAATAATACTAATTTATTATTATT-TCAAAAATTAATAA
65 CTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAA
* * * ** * * *
98978 G----AGATTTAAAAACTAAATCTCTTTACTAAACTAGTTTAAATAATTATGA
128 GTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
99027 CTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTTC-TAAAACATTTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTT
* * *** * * * * * * * *
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** * * * * * *
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129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
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* * * * *
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* * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *** * * * *
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65 CTATTCATACAAGCTTATTTTGAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
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** * * *
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* * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *** * * * * *
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** * * **** * *
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* * * * ** * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *** *
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* * * * * *** * * *
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* * * * * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
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* * * * * *
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* **
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * * * * *
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*** * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * ** * *
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* * * * ** * * *
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** * * *
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*** * ** * * *
101409 CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAGTTGATATG
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* * * * * *
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* *
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** * ** *
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* * **
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1 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** ** * * *
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* * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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* *
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* * *
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* * *
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* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT-TTAAATCATTATGAACTTTT-GTTTTG
* *
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* * * *
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** * ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
103379 TTTCAAATCGAAATGACCTTTAT-TT-TGTCATAAGACAATTATTTCAGCTCA
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* * *
103430 TACAAGTTTATTCGAAAAAAAATAAAACTAATTT-GTAATATTTCAAAATTTA-TAAGAGATTTA
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* * *
103493 AAAAATAATTCTATTTACCAAATTAGTTTAAATAAGTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
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* ** * * * * * * * * *
103558 AATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTTA-TTCA
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* ** * *
103605 T--AAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTTCTAATATTTAAAAAATTAATCAATAAGAGA
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
103733 TTT-AAATC-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTGGTTT-TGTTCA
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* * * *
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103063 GTTTTTAACC
* * * *
103073 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAGTAAAAGATTTT
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* ** * * **
103138 TTAAAAAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTG
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* * *
103203 AATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATATAAGTTTATTCGGAAT
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* *
103268 AAAATAATACTAATTTAAAAATATTCTGAAAATTCATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAATCCAT
194 AAAATAATACTAATTTAAAAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAATCCAT
* * * *
103333 TTGCTAAACTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATGTATTTCAAATCGAAATGACCT
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* * *
103430 TACAAGTTTATTCGAAAAAAAATAAAACTAATTT-GTAATATTTCAA-AATTTA-TAAGAGA-TT
1 TACAAGTTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTTCAAGAA-TTAGTAAAAGATTT
* *
103491 TAAAAAATAATTCTATTTACCAAATTAGTTTAAATAAG-TATAACTATTTGAACAATTATCTATT
65 TAAAAAA-AA-TCTATTTACCAAACTAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
103555 TCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTTATTC-ATAAGTTTGTTCGAA
127 TCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATAATAAAATAATTATTTCTATTCAATAAGTTTATTCGAA
*** * *
103619 ATAAAATAATACTAATTTTCTAATATT-TAAAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAATGAAT
192 ATAAAATAATACTAATTTAAAAATATTCT-AAAAATTAAT-AACAAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * ** * * * *
103682 CTGTTTACCAAACTATTTCAAATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATCTAATTT-AAATC-ATTA
255 CCATTTACCAAACTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGA-AA
* * * * *
103745 TAACCTTTTGTTTTGTCATCAA-ATAATTGGTTT-TGTTCA
318 TAACC-TTTATTTTGTCAT-AAGACAATT-ATTTCAGCTCA
* *
103784 TAGC-ATTTTATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAGTAATATTT
1 TA-CAAGTTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTT
103828 TGAAACTCAA
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Consensus pattern (355 bp):
TACAAGTTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTAGTAATATTTCAAGAATTAGTAAAAGATTTT
AAAAAAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
ATTGTTATAACCTTTTGTTCTATAATAAAATAATTATTTCTATTCAATAAGTTTATTCGAAATAA
AATAATACTAATTTAAAAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTT
ACCAAACTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGAAATAACCTTT
ATTTTGTCATAAGACAATTATTTCAGCTCA
Found at i:104449 original size:181 final size:181
Alignment explanation
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-
* * * * * *
104123 AGAATAAATTAATACTAATTTATCAATGTTCCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAA
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAA
* * * ** *
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* * * * *
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1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TC
** * * * *
104305 GGAATAAAATGATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAG
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
104370 TTTGTTTACTGAATAAGTTAAAATAATTATGCCCATTAGAACAATTATTTAT
130 TCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
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1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
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* ** *
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* * * * * *
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1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * *
104666 -GATTAAGAATAATACT-ATTGAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTCAAAAATAA
65 AAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * ** * *
104729 ATCTTTTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTAT
129 ATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
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* * * * *
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* ** *
104908 ATAAATTTGTTTACAAAACAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTAT
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* * * * * * * *
104965 TTAAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCAAAAAAAGCTTATCC
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTC-ATACAAGCTTATTC
**
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* * * * * *
105095 TCTATTTTCTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATAT
130 TCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
105147 TTCAAATCGTTATGA---TCT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
105208 AAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** ** * * * *
105272 TCTATTTTCCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCAATTTTAACAATTATCTAT
130 TCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *** * *
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*
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* * * * ** *
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* * * * * * ** * *
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* *
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* ** ** * ** *
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* * * ** * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT
** * * * * * *
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64 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
106149 AATTTGTTCA-TAGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATGATCTAT
128 AATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTAT
* * * ** * *
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* * ** ** *
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59 --TTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTA--T--TA-A----TATTTC-AA-AAATTAATA--
* * * * * * *
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* *
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* *** * * * *
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1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-
* * * *
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* * * * * *
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129 ATCT-GTTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *** *
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* * * * *
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* * * *
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130 TCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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1 TTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * ** *
107024 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATT--TAA-TAAGTGATTTAAAATGTGAA
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
107085 TCTGTTTATTGAATCAA-TTGAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTATCTAT
130 TCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * ** * *
107137 TTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCCTATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * *
107202 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * *
107267 TTGTTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAAATTATCTAT
131 CTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTAT
* * * * * *
107319 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACTAGCTTATT-A
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* **
107383 ATAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAACTAATAA
66 A-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
107443 ATCTATTTA-TCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTACTTGAGCAATTATTTAC
129 ATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* *
107496 TTCAAATCATTATGACTTTTTGTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
107520 CTGTTATATG
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:105037 original size:544 final size:539
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* * * * * * *
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* * ** * * *
104339 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTTTGTTTACTGAATAAGTTAAAATAATTATGCCC
254 AAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACAAAACAAGCTAAAATAATTATGACC
* * * * * * *
104404 ATTAGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTG
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* * * * * *
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* * *
104533 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACCAATTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
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104597 ATCA-ATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTT
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* * * * * * *
104628 GTCATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATAGAAGCTTATTC-GATTAAGAATAATACT-ATTGAATA
1 GTCATAAAACAATTATTTC-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA-AATAATAATAATTGAATA
**
104690 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTCAAAAA-TAAATCT-TTTTGTTAAACTAGTTCAAA
64 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAGTAAATCTATTTT-CCAAACTAGTTCAAA
* * * * * * *
104753 TAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTT-TTTAT-TTATAAAA
127 TAATTAAAACAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTT-TGTCATAAAA
* *
104816 TATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCGAATATATTAACA-TTCAAA
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* * *
104879 AAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAAATAAATTTGTTTACAAAACAAGCTCAAATAGTTATG
254 AAATTAATAAGCAAAAGATTT---AAAAAATAAATTTGTTTACAAAACAAGCTAAAATAATTATG
* * ** *
104944 ACTATTTGAACAATTACTTATTTAAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT
316 ACCATTAGAACAATTACTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * *
105009 TAGTTCAAAAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
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*
105074 ACAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
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* * *
105139 TTGTATATTTCAAATCGTTATGATCTTTTT
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* *
105169 GTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAAT
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* * * *
105234 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTTCCAAATTAGTTCAAATAAT
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*** **
105299 TATGGCAATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAATAATT
131 TAAAACAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAATAATT
* * * * * * *
105364 GTTTTTCATCATACATGCTTATTCGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
196 GTTTATCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACGAATATATTAACATTTCAAAAATTAA
* * **** * * *
105429 TAAG----AGATTT-AAAAATAAATCTATTTAC----C--G---AACCGGTTCT---CATTTGAG
261 TAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACAAAACAAGCTAAAATAATTATGACCATTAGAA
* * * * * * * * * * **
105477 TAATTACCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTAGAAAATAA-TA-GTTACAATTCCT
326 CAATTACTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTA-GA-TCAA
* * * * *
105540 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAAT-AACTAAGAGA
389 AAAAGCTTATCCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAAC-AAGAGA
* * * ** * * * ** * *
105604 TTTAAAAAATAAATATGTTTGT-TGAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATAATTATCTA
453 TTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATA
* ** *
105668 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
517 TCTCAAATCATTATGA---TCT-TTTT
* * * * * * * * * *
105695 ATCATCAAACAATCATTTTAGTCCACACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAA
1 GTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAAT-AATTGAATAA
* * * *
105759 TATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCGAATC-A-TGTCAAAT
65 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTT-TCCAAACTAGT-TCAAAT
* *** * ** * * * * * *
105818 AATCATGGCCATTTCAACAGTTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTT-GTTTGATCATATAAC
128 AATTAAAACAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTG-TCATAAAAT
* * * * * *
105882 AAATGTTT-TCGATCATTCAAGCTTATTCAAAATAAAGTGATACTAATTTATTAATC-TTTCAAA
192 AATTGTTTATC-ATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACGAATATATTAA-CATTTCAAA
*
105945 AATTAATAAG----AGATTTAAAAATTAAATTTGTTT
255 AATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
105978 GCCGAACCAA
Statistics
Matches: 1119, Mismatches: 188, Indels: 106
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
521 13 0.01
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531 1 0.00
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545 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (539 bp):
GTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTGAATAAT
ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTTCCAAACTAGTTCAAATAAT
TAAAACAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAATAATT
GTTTATCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACGAATATATTAACATTTCAAAAATTAA
TAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACAAAACAAGCTAAAATAATTATGACCATTAGAA
CAATTACTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGATCAAAA
AAGCTTATCCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAACAAGAGATTT
AAAAAATAAATCTATTTTCTAAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTC
AAATCATTATGATCTTTTT
Found at i:107282 original size:528 final size:527
Alignment explanation
Indices: 106278--107272 Score: 1220
Period size: 528 Copynumber: 1.9 Consensus size: 527
106268 TTGTTTAGTC
* * * *
106278 ATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACATGCTTATTTCAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATT
1 ATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATT
* * * * *
106343 TAAAAAATTAATAAGCTAGAAATTAAAAAAATAAATCAATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTAT
66 TAAAAAATGAATAAGCTAGAAATTAAAAAAATAAATCAATTTATCAAACAAGTTCAAACAGTTAA
* *
106408 GACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGGCATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
131 GACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGCCACTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
106473 TTAGTTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAA
196 TTAGTACATAAAAGCCTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
106538 GTTAAAGATTTAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAAT
261 GTT--AGATTTAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAAT
* * * * *
106603 TACTATTTCAAAACATTATGAACTTTTTTTTTATCATATAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCA
324 TACTATTTCAAAACATTATCAACTTTTGTTTGATCATATAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCA
*
106668 TATTCAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAATAGCATATTTAAAAA
389 TATTCAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAATAGCAGATTTAAAAA
106733 ATAAATCTGTTTACCAAACTAGCTTCTATTTGAATAATTACCTATTTTAAATCGTTATAACCATT
454 ATAAATCTGTTTACCAAACTAGCTTCTATTTGAATAATTACCTATTTTAAATCGTTATAACCATT
106798 TCTTCCATT
519 TCTTCCATT
* *
106807 ATAAAATAATTGTTTTAGTTCAT-CTAAG-TTTTTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
1 ATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTAATAACA
* * * * ** *
106870 TTTTAAAAATGAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCAAAGC-AGTTCAAACAG
64 TTTAAAAAATGAATAAGCT-AGAAATTAAAAAAATAAATCAATTTATCAAA-CAAGTTCAAACAG
* * * *** * * *
106933 TTAAGACT-TTATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCCCTTTGTTTTGTCATAAAATA
127 TTAAGACTATT-TAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATG-CCACTTTGTTTTATCATAAAACA
* * *
106997 ATTGTTTTAGTACATACAAGCCTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAT
190 ATTGTTTTAGTACATAAAAGCCTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** *
107061 TTAATAAG-T-GATTTAAAATGTGAA-TCT-GTTTATTGAATCAATTGAAATAATTATGGCCATG
254 TTAATAAGTTAGATTTAAAA-AT-AAGT-TAGTTTATCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATG
* * * * *
107122 TCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTTTTGAAC
316 TCAACAATTA-CTATTTCAAAACATTATCAACTTTTGTTTGATCATATAACAATTGTTTTTCAAC
* * * * *
107187 ATTCAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAG-A
380 ATACAAGCATATTCAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAAT-AGCA
*
107251 GATTTAAAAAATAAATTTGTTT
444 GATTTAAAAAATAAATCTGTTT
107273 GTTAAACTAG
Statistics
Matches: 391, Mismatches: 63, Indels: 25
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
526 9 0.02
527 39 0.10
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529 130 0.33
530 80 0.20
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (527 bp):
ATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATT
TAAAAAATGAATAAGCTAGAAATTAAAAAAATAAATCAATTTATCAAACAAGTTCAAACAGTTAA
GACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGCCACTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
TTAGTACATAAAAGCCTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
GTTAGATTTAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTA
CTATTTCAAAACATTATCAACTTTTGTTTGATCATATAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCATA
TTCAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAATAGCAGATTTAAAAAAT
AAATCTGTTTACCAAACTAGCTTCTATTTGAATAATTACCTATTTTAAATCGTTATAACCATTTC
TTCCATT
Found at i:107391 original size:182 final size:176
Alignment explanation
Indices: 106843--107519 Score: 675
Period size: 178 Copynumber: 3.8 Consensus size: 176
106833 AGTTTTTTCG
* * *
106843 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATGAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT--TTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
106908 CTGTTTGTCAAAGC-AGTTCAAACAGTTAAGACTTTATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
63 CTGTTTATCAAA-CTAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * *
106972 GACCCCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTACATACAAGCCTATTCA
127 GA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAAT-CATACAAGCCTATT-A
* * ** *
107025 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTTAATAAGTGATTTAAAATGTGAATCTG
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
** * * * * * * * *
107089 TTTATTGAA-TCAATTGAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCAC
66 TTTATCAAACT-AATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
107153 CTTTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTTTTGAA-CATTCAAGCCTATTCA
130 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTT-AATCATACAAGCCTATT-A
* *
107202 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
107267 TTGTTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAAATTATCTATTTCAAATCATTAT
63 CTGTTTATCAAACTAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * *
107332 GACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACTAGCTTATTA
127 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAA-TCATACAAGCCTATTA
* **
107383 ATAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGAGATTTAACTAATAAATC
1 A-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
107446 TATTTATCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTACT-TGAGCAATTATTTACTTCAAATCATTATG
64 TGTTTATCAAACTAATTCAAATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
*
107510 ACTTTTTGTT
128 ACCTTTTGTT
107520 CTGTTATATG
Statistics
Matches: 406, Mismatches: 74, Indels: 35
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 94 0.23
178 127 0.31
179 6 0.01
180 3 0.01
181 61 0.15
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
TTTATCAAACTAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATCATACAAGCCTATTA
Found at i:107528 original size:359 final size:356
Alignment explanation
Indices: 103878--107527 Score: 1651
Period size: 359 Copynumber: 10.1 Consensus size: 356
103868 ACGGAACCAG
* * * * * * * *
103878 TTCAAATCATTCTGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTA-TTCGTAT-AAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAA-TTGTTTTAGTTCAT-TCAAGCTTATT
* * * * * * *
103941 TGAAATAAAATAATTCAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTGAAAAATAA
64 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * * * * **
104006 ATTTGTTTAACAAACCAGTTTATATGGTTAAGATTGTTAT-AATAATTATCTTTTTCAAATTGTT
129 ATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * ** * * *
104070 CTAACCA-TTTATTTAGTCATAAAACAA-TTGCTTAAGTTCATACAAACTTATCTAGAATAAATT
193 ATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAAT
* * * * *
104133 AATACTAATTTATCAATGTTCCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTAC
255 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---CAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAT
* * ** *
104198 CGAA-CAAGTTTAAATAGTTATTTCTATTTGAACAATTATCGAT
316 CAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTA-TT-AACAATTATCTAT
* * * * * * * *
104241 TTAAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACGAGCTTATAT-
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATTCAAGCTTAT-TC
* * * * * *
104305 GGAATAAAATGATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAG
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
104370 TTTGTTT-ACTGAA-TAAGTTAAAATAATTATGCCCAT-TAGAACAATTATTTATTTTAAATCAT
130 TTTGTTTGTC-AAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATAT-GAATAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * *
104432 TATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTGTTCGAAATAAAAC
192 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAAT
* *
104496 AATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
255 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT--TAA-TAAGCAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
** *
104560 CAAACCAATTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAAT
316 CAAACCAATTCAAATAGTTATGACTA-TT-AACAATTATCTAT
* * * * * * * **
104603 CTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GATCATAGAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATTCAAGCTTATTC
* * * * * *
104666 G-ATTAAGAATAATACT-ATTGAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTCAAAAATAA
65 GAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * **
104729 ATCTT-TTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATTGT
129 AT-TTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATAT-GAATAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * *
104792 TCTGACCTTTT-TTTAT-TTATAAAAT-ATTTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
192 TATGACATTTTGTTT-TGTCATAAAATAATTTTTTTAAT-TCATACAAGCTTATT-AAAATAAAA
* * * * * *
104854 TAATCCGAATATATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAAATAAATTTGT
254 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGC---AGATTT---AAAAAATAAATCTAT
* *
104918 TTA-CAAAACAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTAT
312 TTATCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTA-TT-AACAATTATC-TAT
* ** * * * * * * *** *
104965 TTAAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCAAAAAAAGCTTATCC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTTAGTTC-ATTCAAGCTTATTC
* **
105030 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * * *
105095 TCTATTT-TCTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATATTTCAAATCGTTA
130 TTTGTTTGTC-AAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
105159 TG--A-TCT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
194 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAAT
* * * *
105220 AATAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTT-TCCA
258 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-CA--GATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-CA
** * * * *
105283 AATTAGTTCAAATAATTATGGCAATTTTAACAATTATCTAT
318 AACCAATTCAAATAGTTAT-G-ACTATTAACAATTATCTAT
* * * * * * * *** * *
105324 TTCAAATCGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACATGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATTCAAGCTTATTCG
*
105389 AAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * ** * * * *
105449 CTATTTACCGAACCGGTTC-------T----C-ATTTGAGTAATTACCTATTTCAAATCATTATA
131 TTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * ** ** *
105502 ACCTTTTGTTTTGTTAGAAAATAATAGTTACAATTCCTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
196 ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATAC
* * * * ** *
105567 TAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTTGAAG
260 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAC
* * * * *
105631 TAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATAATTATCTAT
321 CAATTCAAATAGTTATGACT--ATTAACAATTATCTAT
** * * * ** * **
105669 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATCAAACAATCATTTTAGTCCACACAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATTCAAGCTTATTCG
* * *
105734 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAA
66 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * * * * *
105794 TCTATTTATCGAA-TCA-TGTCAAATAATCATGGCCATTTCAACAGTTATCTATTTCAAATCGTT
130 TTTGTTTGTCAAACT-AGT-TCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** * *
105857 ATTACCTTTTG-TTTGATCATATAACA-AATGTTTTCGA-TCATTCAAGCTTATTCAAAATAAAG
193 ATGACATTTTGTTTTG-TCATA-AA-ATAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAA
* * * * * ** *
105919 TGATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGA
254 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAA
* * * *
105983 ACCAATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTGTATAC
319 ACCAATTCAAATAGTTATGACT-ATT-AACAATTATCTAT
** * * * * **
106023 TTCAAATTGTTATAACCTTTTTTTCTATCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATAGAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATTCAAGCTTATTC
* * * * * * *
106087 GGAATAAAATAATATTAATCTAATAATA-TTCTAAAATTTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * *
106150 ATTTGTTCAT-AGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATAAT-AACAATGATCTATTTCAAAAT-G
129 ATTTGTTTGTCA-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-ATGAATAATTATCTATTTC-AAATCA
* * * * ***
106212 TTATGATC-TTTTGTTTTATCATAAAA-ATATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTT-TT-GTT
191 TTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATA-ATT-T-T-TTT-AATTCATAC-AAGCTTATTAAAA
** * * * * * * ** * *
106273 TAGTCATAA-AATAATTT-TT-TTAGTTCATACATGCTTAT-TTCA-A-ATAAAATAATACTAT-
249 TA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT--TAATAAGCAGATTTAAAA-AATA-AATC
* * ** * ** ** * *
106331 TTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGCTAGAAATTAAAAAAATAAATCAATTTATCGAACAAGT
309 TAT-TTATCA---AACCAATTCA-AA--TAG---TTATGACTATTAA-CAA-TTAT----CTA-T
* * *
106396 TT-AAAT-AGTTATGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGGCATTTTGTTTTAT
1 TTCAAATCA-TTATGACCT-TTT------GT-TCTA-TT---ATAAA-A---CAATTG---TT-T
* * *
106458 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
45 --T------A--G-TTCA-TTC----AAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
106522 TTTCAAAAATTGATAAGTTAA-AGATTT-AAAAATAAGTTAGTTTATCAAA-TCAGTTCAAATAA
93 TTTCAAAAATTAATAA-TTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACT-AGTTCAAATAG
* * * * * * * *
106584 TTATGGCCATTTGAATAATTA-CTATTTCAAAACATTATGA-ACTTTTTTTTTATCATATAATAA
156 TTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * *
106647 TTGTTTTTCA-TCATACAAGCATATTCAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAC
220 TT-TTTTTAATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *
106711 TAATAAATAGCATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGCTTC---TA-TT-TGA--A-T
283 TAAT--A-AGCAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATT
*
106768 ---AATTACCTAT
344 AACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
106778 TTTAAATCGTTATAACCATTTCTTCCATTATAAAATAATTGTTTTAGTTCA-TCTAAGTTTTTTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATTC-AAGCTTATTC
* * *
106842 GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATGAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
106907 TCTGTTTGTCAAAGC-AGTTCAAACAGTTAAGACTTTATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
130 TTTGTTTGTCAAA-CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
** * * * *
106971 TGACCCCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTACATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAA
194 TGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAA
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107036 TACTAATTTATTAATATTTTAAAATTTAATAAG-TGATTTAAAATGTGAATCTGTTTATTGAATC
257 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACC
* * * *
107100 AATTGAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTATCTAT
322 AATTCAAATAGTTATGACTAT-T-AACAATTATCTAT
* * * * ** *
107137 TTCAAATCATTATCACCTTTTGTT-TGGTTATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCCTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCT-ATTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATTCAAGCTTATTC
* *
107201 -AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAA
65 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA
* *
107265 ATTTGTTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAAATTATCTATTTCAAATCATT
129 ATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATT
*
107330 ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACTAGCTTATTAATAATAAAATAA
193 ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATTAA-AATAAAATAA
* **
107395 -AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTAACTAATAAATCTATTTATCAAAC
257 TACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAC
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107458 CAATTCAAATAGTTATGACTACTTGAGCAATTATTTAC
321 CAATTCAAATAGTTATGACTA-TT-AACAATTATCTAT
* *
107496 TTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTGTTATA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATA
107528 TGTTCAAACA
Statistics
Matches: 2532, Mismatches: 529, Indels: 456
0.72 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
341 25 0.01
342 1 0.00
343 2 0.00
344 4 0.00
345 218 0.09
346 28 0.01
347 27 0.01
348 51 0.02
349 48 0.02
350 23 0.01
351 74 0.03
353 30 0.01
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356 8 0.00
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367 8 0.00
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392 1 0.00
393 1 0.00
395 1 0.00
396 2 0.00
398 1 0.00
400 2 0.00
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402 10 0.00
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408 16 0.01
409 7 0.00
410 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (356 bp):
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATTCAAGCTTATTCG
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
TTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATT
CAAATAGTTATGACTATTAACAATTATCTAT
Done.