Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
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ACGTcount: A:0.27, C:0.23, G:0.23, T:0.27
Warning! 357000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 2 of 402
Found at i:112998 original size:73 final size:73
Alignment explanation
Indices: 112904--113205 Score: 197
Period size: 73 Copynumber: 4.2 Consensus size: 73
112894 CGCAAATCAG
* ** *
112904 AAAATAAAAAATGACCGGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAAAGAGCAATTAGGACAACACCAC
1 AAAATAAAGAATGACTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAAAAAGCAATTAGGACAACACCAC
*
112969 AAGTTAAA
66 AAGTTCAA
* * * * * *
112977 AAAATAAAGAATGACTAGGATGATA-T-CATAAGTCAAAAAATAAAGAGCGACT-GACACAACAC
1 AAAATAAAGAATGACTAGGATGACACTGC--AAGTTAAAAAATAAAAAGCAATTAG-GACAACAC
**
113039 CTTAAG-TCAA
63 CACAAGTTCAA
* * * * * *** ** *
113049 AAAATAGAGAATGACTACGATGTCATTGCAAGATAAAAAATAATAAAATGATCGGGACAACACTA
1 AAAATAAAGAATGACTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAA-AAAGCAATTAGGACAACACCA
* *
113114 TAA-ATCAA
65 CAAGTTCAA
* * * ** *
113122 AAAATAAAAAATGACTGGGACGACACCACAAGTTAAAAAATAAAAAATG-AA-TAAGACAACACC
1 AAAATAAAGAATGACTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAAT-AAAAA-GCAATTAGGACAACACC
*
113185 ACAAGTT-AG
64 ACAAGTTCAA
113194 AAAATAAAGAAT
1 AAAATAAAGAAT
113206 AACAAAACAA
Statistics
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74 4 0.02
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Consensus pattern (73 bp):
AAAATAAAGAATGACTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAAAAAGCAATTAGGACAACACCAC
AAGTTCAA
Found at i:113142 original size:36 final size:36
Alignment explanation
Indices: 113083--113287 Score: 108
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113073 ATTGCAAGAT
* *
113083 AAAAAATAATAAAATGATCGGGACAACACTATAAATC
1 AAAAAATAA-AAAATGATCGGGACAACACCACAAATC
* * *
113120 AAAAAATAAAAAATGA-CTGGGACGACACCACAAGTT
1 AAAAAATAAAAAATGATC-GGGACAACACCACAAATC
** **
113156 AAAAAATAAAAAATGAAT-AAGACAACACCACAAGTTAGAAA
1 AAAAAATAAAAAATG-ATCGGGACAACACCAC-A---A-ATC
** * **
113197 ATAAAGAATAACAAAACAATCGGGACAACACCATATGTC
1 A-AAA-AATAA-AAAATGATCGGGACAACACCACAAATC
* * * * * *
113236 GAAAAATGAAGAATGATTGGGACAACACTACAAGTC
1 AAAAAATAAAAAATGATCGGGACAACACCACAAATC
*
113272 AAAAAATAAAGAATGA
1 AAAAAATAAAAAATGA
113288 CAAAATGACT
Statistics
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Consensus pattern (36 bp):
AAAAAATAAAAAATGATCGGGACAACACCACAAATC
Found at i:113302 original size:44 final size:44
Alignment explanation
Indices: 113247--113331 Score: 143
Period size: 44 Copynumber: 1.9 Consensus size: 44
113237 AAAAATGAAG
* *
113247 AATGATTGGGACAACACTACAAGTCAAAAAATAAAGAATGACAA
1 AATGACTGGGACAACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGACAA
*
113291 AATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGA
1 AATGACTGGGACAACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGA
113332 TTAGGATGAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
44 38 1.00
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Consensus pattern (44 bp):
AATGACTGGGACAACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGACAA
Found at i:113352 original size:160 final size:159
Alignment explanation
Indices: 113129--113522 Score: 432
Period size: 160 Copynumber: 2.5 Consensus size: 159
113119 CAAAAAATAA
* * * ** *
113129 AAAATGACTGGGACGACACCACAAGTTAAAAAATAAAAAATGAATAAGACAACACCACAAGTTAG
1 AAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAAGATGACACCGCAAGTTAG
* * *
113194 AAAATAAAGAATAACAAAACAATCGGGACAACAC-CATATGTCGAAAAATGAAGAATGATTGGGA
66 AAAATAAAGAACAACAAAACAATCGAGACAACACGCA-A-GTCGAAAAATGAAGAATGATAGGGA
*
113258 CAACA-CTACAAGTCAAAAAATAAAGAATGAC
129 CAACATC-ACAAGTAAAAAAATAAAGAATGAC
* *
113289 AAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAGGATGACACTGCAAGTTAG
1 AAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAAGATGACACCGCAAGTTAG
* ** * ** *
113354 AAAATAAAGAACAACAGAATGATCTAGATTACACTGCAAGTTGAAAAATGAAGAATGATAGGGAC
66 AAAATAAAGAACAACAAAACAATCGAGACAACAC-GCAAGTCGAAAAATGAAGAATGATAGGGAC
* *
113419 AACATCATAAGTAAAAAAATAAAGAATGAT
130 AACATCACAAGTAAAAAAATAAAGAATGAC
* * * * **** * * * * *
113449 AGAATGACCGAGATGACATTGTAAGTCAAAAAATAAAGAACGATCAAGATGATACCGTAAGTTAA
1 AAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAAGATGACACCGCAAGTTAG
113514 AAAATAAAG
66 AAAATAAAG
113523 CATGATCGAA
Statistics
Matches: 195, Mismatches: 36, Indels: 6
0.82 0.15 0.03
Matches are distributed among these distances:
160 191 0.98
161 2 0.01
162 2 0.01
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Consensus pattern (159 bp):
AAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAAGATGACACCGCAAGTTAG
AAAATAAAGAACAACAAAACAATCGAGACAACACGCAAGTCGAAAAATGAAGAATGATAGGGACA
ACATCACAAGTAAAAAAATAAAGAATGAC
Found at i:113375 original size:80 final size:79
Alignment explanation
Indices: 113115--113375 Score: 279
Period size: 80 Copynumber: 3.3 Consensus size: 79
113105 ACAACACTAT
* * * * * *
113115 AAATCAAAAAATAAAAAATGACTGGGACGACACCACAAGTTAAAAAATAAAAAATGAATAAGACA
1 AAAT-AAAGAATAACAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAGGACA
*
113180 ACACCACAAGTTAGA
65 ACACTACAAGTTAGA
** * * * * * * *
113195 AAATAAAGAATAACAAAACAATCGGGACAACACCATATGTCGAAAAATGAAGAATGATTGGGACA
1 AAATAAAGAATAACAAATGACT-GGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAGGACA
* *
113260 ACACTACAAGTCAAA
65 ACACTACAAGTTAGA
* **
113275 AAATAAAGAATGACAAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAGGATG
1 AAATAAAGAATAAC-AAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAGGACA
*
113340 ACACTGCAAGTTAGA
65 ACACTACAAGTTAGA
*
113355 AAATAAAGAACAACAGAATGA
1 AAATAAAGAATAACA-AATGA
113376 TCTAGATTAC
Statistics
Matches: 143, Mismatches: 35, Indels: 6
0.78 0.19 0.03
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79 14 0.10
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Consensus pattern (79 bp):
AAATAAAGAATAACAAATGACTGGGACGACACCACAAGTCAAAAAATAAAGAATGATTAGGACAA
CACTACAAGTTAGA
Found at i:113394 original size:80 final size:80
Alignment explanation
Indices: 113237--113522 Score: 211
Period size: 80 Copynumber: 3.6 Consensus size: 80
113227 CCATATGTCG
* * ** * * ** * * *
113237 AAAAATGAAGAATGATTGGGACAACACTACAAGTCAAAAAATAAAGAATGACAAAATGACTGGGA
1 AAAAATAAAGAATGATTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAAAGAACAACAGAATGACCGAGA
* **
113302 CGACACCACAAGTCA
66 TGACACTGCAAGTCA
* * *
113317 AAAAATAAAGAATGATTAGGATGACACTGCAAGTTAGAAAATAAAGAACAACAGAATGATCTAGA
1 AAAAATAAAGAATGATTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAAAGAACAACAGAATGACCGAGA
* **
113382 TTACACTGCAAGTTG
66 TGACACTGCAAGTCA
* * ** *
113397 AAAAATGAAGAATGA-TAGG--GACAACAT-CATAAGTAAAAAAATAAAGAATGATAGAATGACC
1 AAAAATAAAGAATGATTAGGATGAC-AC-TGC--AAGTTAAAAAATAAAGAACAACAGAATGACC
* *
113458 GAGATGACATTGTAAGTCA
62 GAGATGACACTGCAAGTCA
* * * * * *
113477 AAAAATAAAGAACGATCAAGATGATACCGTAAGTTAAAAAATAAAG
1 AAAAATAAAGAATGATTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAAAG
113523 CATGATCGAA
Statistics
Matches: 157, Mismatches: 41, Indels: 16
0.73 0.19 0.07
Matches are distributed among these distances:
77 3 0.02
78 3 0.02
79 5 0.03
80 140 0.89
81 2 0.01
82 2 0.01
83 2 0.01
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AAAAATAAAGAATGATTAGGATGACACTGCAAGTTAAAAAATAAAGAACAACAGAATGACCGAGA
TGACACTGCAAGTCA
Found at i:113673 original size:33 final size:32
Alignment explanation
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113604 CTTTAGTGCC
** *
113614 AGATAAACTGGGCTT-AAATTTTATTGAAAGCT
1 AGATAAACTAAGCTTAAAATTTCATTG-AAGCT
* * *
113646 AGCTAAACTAAGCTTAAAATTTCATTGAGGGT
1 AGATAAACTAAGCTTAAAATTTCATTGAAGCT
* *
113678 AGATAAATTAGGCTTAAAATTTTCATTG
1 AGATAAACTAAGCTTAAAA-TTTCATTG
113706 GGTGCCAGTT
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 9, Indels: 3
0.80 0.15 0.05
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32 31 0.63
33 18 0.37
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Consensus pattern (32 bp):
AGATAAACTAAGCTTAAAATTTCATTGAAGCT
Found at i:113741 original size:34 final size:33
Alignment explanation
Indices: 113678--113830 Score: 155
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113668 CATTGAGGGT
* * *
113678 AGATAAATTAGGCTTAAAATTTTCATTGGGTGCC
1 AGATAAATTGGGCTT-AAATTTTCTTTGGGGGCC
* * *
113712 AGTTAATTTGGGCTTAAATCTTTCTTTGGGGGCT
1 AGATAAATTGGGCTTAAAT-TTTCTTTGGGGGCC
* * *
113746 TGATAAATTGGGCTTAAAACTTTCCTTGGGGGCC
1 AGATAAATTGGGCTT-AAATTTTCTTTGGGGGCC
* * *
113780 AGATAAATAGAGCTTAAGATTTT-TTTAGGGGCC
1 AGATAAATTGGGCTTAA-ATTTTCTTTGGGGGCC
113813 AGATAAATTGGGCTTAAA
1 AGATAAATTGGGCTTAAA
113831 AATGGGTGCC
Statistics
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0.77 0.16 0.06
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Consensus pattern (33 bp):
AGATAAATTGGGCTTAAATTTTCTTTGGGGGCC
Found at i:113754 original size:68 final size:67
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Indices: 113678--113831 Score: 184
Period size: 68 Copynumber: 2.3 Consensus size: 67
113668 CATTGAGGGT
* * * * * * * *
113678 AGATAAATTAGGCTTAAAATTTTCATTGGGTGCCAGTTAATTTGGGCTTAA-ATCTTTCTTTGGG
1 AGATAAATTGGGCTTAAAACTTTCATTGGGGGCCAGATAAATAGAGCTTAAGAT-TTT-TTTAGG
*
113742 GGCT
64 GGCC
* *
113746 TGATAAATTGGGCTTAAAACTTTCCTTGGGGGCCAGATAAATAGAGCTTAAGATTTTTTTAGGGG
1 AGATAAATTGGGCTTAAAACTTTCATTGGGGGCCAGATAAATAGAGCTTAAGATTTTTTTAGGGG
113811 CC
66 CC
113813 AGATAAATTGGGCTTAAAA
1 AGATAAATTGGGCTTAAAA
113832 ATGGGTGCCA
Statistics
Matches: 73, Mismatches: 12, Indels: 3
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67 26 0.36
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Consensus pattern (67 bp):
AGATAAATTGGGCTTAAAACTTTCATTGGGGGCCAGATAAATAGAGCTTAAGATTTTTTTAGGGG
CC
Found at i:113885 original size:33 final size:32
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Indices: 113614--113985 Score: 171
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113604 CTTTAGTGCC
**
113614 AGATAAACTGGGCTT-AAATTTTATTGAAAGCT
1 AGATAAACTGGGCTTAAAATTTTATTG-GGGCT
* ** *
113646 AGCTAAACTAAGCTTAAAATTTCATTGAGGG-T
1 AGATAAACTGGGCTTAAAATTTTATTG-GGGCT
* * *
113678 AGATAAATTAGGCTTAAAATTTTCATTGGGTGCC
1 AGATAAACTGGGCTTAAAATTTT-ATTGGG-GCT
* ** *
113712 AGTTAATTTGGGCTT-AAATCTTTCTTTGGGGGCT
1 AGATAAACTGGGCTTAAAAT-TTT-ATT-GGGGCT
* * ** *
113746 TGATAAATTGGGCTTAAAACTTTCCTTGGGGGCC
1 AGATAAACTGGGCTTAAAA-TTTTATT-GGGGCT
* * * *
113780 AGATAAA-TAGAGCTTAAGATTTTTTTAGGGGCC
1 AGATAAACT-GGGCTTAAAATTTTATT-GGGGCT
* *
113813 AGATAAATTGGGCTTAAAA----A-TGGGTGCC
1 AGATAAACTGGGCTTAAAATTTTATTGGG-GCT
113841 A-ACTAAACTGGGCTTAAAATTTTATTGGGCGCT
1 AGA-TAAACTGGGCTTAAAATTTTATTGGG-GCT
* * ** *
113874 AGCTAAACTGGGCTTAAGATTTCCTTAGGGGAT
1 AGATAAACTGGGCTTAAAATTTTATT-GGGGCT
*
113907 AGATAAACTGGGCTTAAAA----A-TGAGTGCT
1 AGATAAACTGGGCTTAAAATTTTATTG-GGGCT
* * *
113935 AGCTAAACTAGGCTTAAAATTTTATTGGCGGCC
1 AGATAAACTGGGCTTAAAATTTTATTGG-GGCT
* *
113968 AGCTAAATTGGGCTTAAA
1 AGATAAACTGGGCTTAAA
113986 TTTGCACTAA
Statistics
Matches: 264, Mismatches: 50, Indels: 51
0.72 0.14 0.14
Matches are distributed among these distances:
27 5 0.02
28 41 0.16
32 37 0.14
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35 8 0.03
36 1 0.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.13, G:0.23, T:0.32
Consensus pattern (32 bp):
AGATAAACTGGGCTTAAAATTTTATTGGGGCT
Found at i:113895 original size:94 final size:94
Alignment explanation
Indices: 113756--113988 Score: 274
Period size: 94 Copynumber: 2.5 Consensus size: 94
113746 TGATAAATTG
** * * * ** *
113756 GGCTTAAAACTTTCCTTGGGGGCCAGATAAA-TAGAGCTTAAGATTTTTTTAGGGGCCAGATAAA
1 GGCTTAAAA-TTTTATTGGCGGCCAGCTAAACT-GGGCTTAAGATTTCCTTAGGGGACAGATAAA
* * *
113820 TTGGGCTTAAAAATGGGTGCCAACTAAACTG
64 CTGGGCTTAAAAATGAGTGCCAACTAAACTA
* *
113851 GGCTTAAAATTTTATTGG-GCGCTAGCTAAACTGGGCTTAAGATTTCCTTAGGGGATAGATAAAC
1 GGCTTAAAATTTTATTGGCG-GCCAGCTAAACTGGGCTTAAGATTTCCTTAGGGGACAGATAAAC
* *
113915 TGGGCTTAAAAATGAGTGCTAGCTAAACTA
65 TGGGCTTAAAAATGAGTGCCAACTAAACTA
*
113945 GGCTTAAAATTTTATTGGCGGCCAGCTAAATTGGGCTTAA-ATTT
1 GGCTTAAAATTTTATTGGCGGCCAGCTAAACTGGGCTTAAGATTT
113989 GCACTAAATG
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 16, Indels: 8
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
93 5 0.04
94 103 0.87
95 11 0.09
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.24, T:0.30
Consensus pattern (94 bp):
GGCTTAAAATTTTATTGGCGGCCAGCTAAACTGGGCTTAAGATTTCCTTAGGGGACAGATAAACT
GGGCTTAAAAATGAGTGCCAACTAAACTA
Found at i:114007 original size:94 final size:92
Alignment explanation
Indices: 113809--114018 Score: 235
Period size: 94 Copynumber: 2.2 Consensus size: 92
113799 TTTTTTTAGG
* * * * *
113809 GGCCAGATAAATTGGGCTTAAAAATGGGTGCCAACTAAACTGGGCTTAAAATTTTATTGGGCGCT
1 GGCCAAATAAACTGGGCTTAAAAATGAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAAATTTTATTGGGCGCC
*
113874 AGCTAAACTGGGCTTAAGATTTCCTTA
66 AGCTAAACTGGGCTTAAGATTTCCTAA
** * *
113901 GGGGATAGATAAACTGGGCTTAAAAATGAGTGCTAGCTAAACTAGGCTTAAAATTTTATT-GGCG
1 GGCCA-A-ATAAACTGGGCTTAAAAATGAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAAATTTTATTGGGC-
*
113965 GCCAGCTAAATTGGGCTTAA-ATTTGCACTAAA
63 GCCAGCTAAACTGGGCTTAAGATTT-C-CT-AA
* *
113997 TGCCAAATAAACTAGGCTTAAA
1 GGCCAAATAAACTGGGCTTAAA
114019 TTTTTATAGT
Statistics
Matches: 97, Mismatches: 15, Indels: 10
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
92 3 0.03
93 7 0.07
94 81 0.84
95 3 0.03
96 3 0.03
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.23, T:0.28
Consensus pattern (92 bp):
GGCCAAATAAACTGGGCTTAAAAATGAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAAATTTTATTGGGCGCC
AGCTAAACTGGGCTTAAGATTTCCTAA
Found at i:114386 original size:21 final size:22
Alignment explanation
Indices: 114316--114396 Score: 85
Period size: 22 Copynumber: 3.7 Consensus size: 22
114306 TATTGTTTTT
**
114316 AGCTAATTTATGCTTATATG-C
1 AGCTAATTTGGGCTTATATGTC
*
114337 TAACTAATTTGGGCTTATATGTC
1 -AGCTAATTTGGGCTTATATGTC
* *
114360 AGCTAAATTGGGCTTATGTGT-
1 AGCTAATTTGGGCTTATATGTC
*
114381 AGCTAATTTAGGCTTA
1 AGCTAATTTGGGCTTA
114397 AGACTTCATT
Statistics
Matches: 50, Mismatches: 8, Indels: 3
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
21 14 0.28
22 35 0.70
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ACGTcount: A:0.27, C:0.12, G:0.20, T:0.41
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AGCTAATTTGGGCTTATATGTC
Found at i:114985 original size:9 final size:9
Alignment explanation
Indices: 114971--114999 Score: 51
Period size: 9 Copynumber: 3.3 Consensus size: 9
114961 CATAGAGCCA
114971 TTTTTATTT
1 TTTTTATTT
114980 TTTTTA-TT
1 TTTTTATTT
114988 TTTTTATTT
1 TTTTTATTT
114997 TTT
1 TTT
115000 ATTAACATAG
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
8 8 0.42
9 11 0.58
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Consensus pattern (9 bp):
TTTTTATTT
Found at i:114990 original size:15 final size:15
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Indices: 114970--115002 Score: 50
Period size: 15 Copynumber: 2.2 Consensus size: 15
114960 CCATAGAGCC
114970 ATTTTTATT-TTTTTT
1 ATTTTT-TTATTTTTT
114985 ATTTTTTTATTTTTT
1 ATTTTTTTATTTTTT
115000 ATT
1 ATT
115003 AACATAGCAT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 2
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14 2 0.12
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ATTTTTTTATTTTTT
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Alignment explanation
Indices: 116288--116339 Score: 95
Period size: 22 Copynumber: 2.4 Consensus size: 22
116278 TTGTTTTTTT
*
116288 TTTTTGTTACAACCATTAATCA
1 TTTTTGTGACAACCATTAATCA
116310 TTTTTGTGACAACCATTAATCA
1 TTTTTGTGACAACCATTAATCA
116332 TTTTTGTG
1 TTTTTGTG
116340 TGACTGATGC
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 29 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.10, T:0.48
Consensus pattern (22 bp):
TTTTTGTGACAACCATTAATCA
Found at i:117928 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 117885--117940 Score: 103
Period size: 28 Copynumber: 2.0 Consensus size: 28
117875 ACCATGTCAA
*
117885 CAAAGTCTTTCGAGATATTCCCAATCAT
1 CAAAGTCTTTCAAGATATTCCCAATCAT
117913 CAAAGTCTTTCAAGATATTCCCAATCAT
1 CAAAGTCTTTCAAGATATTCCCAATCAT
117941 TCTTTTGTAA
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
28 27 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.25, G:0.09, T:0.32
Consensus pattern (28 bp):
CAAAGTCTTTCAAGATATTCCCAATCAT
Found at i:126294 original size:182 final size:180
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Indices: 126047--126622 Score: 478
Period size: 182 Copynumber: 3.2 Consensus size: 180
126037 ACTAAACTAA
* * * * * *
126047 TAATATTT-TAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGTTGAACTAGTTCAA
1 TAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TATTTATCGAA-TAGTTCAA
* * *
126111 ATAGTTAAGATTATTA-AGACAATTATCTCTTTAAAATCAGT-CTGACCATTT-ATGTAGTCATA
64 ATAGTTAAGACTATTAGA-ACAATTATCTATTTAAAATCAGTAC-GACCATTTGATGTA-TAATA
* * * **
126173 AAATAATTGTTT-TAGTTTATACATGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTATTTTTAT
126 AAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATA-TAACTTTAT
* *
126229 TAA-ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAATTCAA
1 TAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TATTTATCGAAT-AGTTCAA
* * * * * *
126293 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTACGACCTTTTGTTTTATAATAAAA
64 ATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCAGTACGACCATTTGATGTATAATAAAA
*
126358 TAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAGTATAACTTTAT
129 TAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATAACTTTAT
* **
126410 TAATATTTCAAAAATTGAA-AAGTTGGAGA-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAATTAGTTCA
1 TAATATTTAAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATTA-TTTATCGAA-TAGTTCA
* * * * * * ** * * * * *
126473 AATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATAAACTTTTGTTCTATCATAA
63 AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCAG-TACGACCATTTGATGTATAATAA
* * * *
126537 AACAATTTGTTT-TCA-TCATATAAGCCTAT-TCGAAATAAAATAATACTAA-TTTAT
127 AATAA-TTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATA-TAACTTTAT
* * *
126591 TAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTT
1 TAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
126623 GAACAATTAT
Statistics
Matches: 330, Mismatches: 46, Indels: 36
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
180 5 0.02
181 154 0.47
182 161 0.49
183 10 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATTATTTATCGAATAGTTCAAAT
AGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCAGTACGACCATTTGATGTATAATAAAATA
ATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATAACTTTAT
Found at i:126621 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 125574--126622 Score: 854
Period size: 181 Copynumber: 5.8 Consensus size: 181
125564 GGTCAATCAT
* * * * * *
125574 GTTATGACTATTTGAACCATTA-CTTAGTGT-AAATCATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAAC
1 GTTATGACTATTTGAACAATTATC-TA-TTTCAAATCGTTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAAC
* *
125637 AATTGTTTCTATTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTATTA-TT-ATAAA
64 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAA
* * * * * * * *
125700 ACTAATGAGTTGTAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAAAA
128 ATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATC-GAACTAGTTCAAATA
* * ** * * * * * *
125754 GTCATATGTCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATTGCTATGACATTTTTATTTTATCTTAAAA
1 GT--TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AAACTTTTGTTTTATCATAAAA
* ** * * **
125819 CAATTACTTT-TATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATGACACTAATTTATTAATGCTTCAAA
63 CAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
** * * *
125883 AATTAAT-A--A-GAGATTTAAAACCTAAA-TATGTTTACCGAGCTAGTTTAAATA
127 AATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTATCGAACTAGTTCAAATA
* * * * *
125934 GTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAA
1 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * ** * ** * *
125998 TTGTTTCTATTCGTACAAGCTTCTTCAAAGCAAAATATTACTAAACTAATAATATTT-TAAAATT
66 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
126062 AATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAA-TATGTTTGTTGAACTAGTTCAAATA
131 AATAAGTAGGAGATTT-AAAAAATAAATTA-GTTTATCGAACTAGTTCAAATA
* * * * * * * * * * *
126114 GTTAAGATTA-TTAAGACAATTATCTCTTTAAAATCAG-TCTGACCATTT-ATGTAGTCATAAAA
1 GTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATAAACTTTTGTTTTA-TCATAAAA
* * * * *
126176 TAATTGTTT-TAGTTTATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTTATTAA-ATTTAAA
63 CAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAA
* * *
126239 AAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAA-TAAATTCAAATA
126 AAATTAATAAGTAGGAGA-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACT-AGTTCAAATA
* * ** * * *
126296 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTACGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAA
1 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* *
126361 TTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAGTA-TAACTTTATTAATATTTCAAAAA
66 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAA
* *
126424 TTGAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAATTAGTTCAAATA
129 TT-AATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAACTAGTTCAAATA
* * * *
126477 ATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTGTTCTATCATAAAACAA
1 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * *
126542 TTTGTTT-TCA-TCATATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
66 -TTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
*
126605 TTAATGAGTAGGAGATTT
129 TTAATAAGTAGGAGATTT
126623 GAACAATTAT
Statistics
Matches: 688, Mismatches: 139, Indels: 83
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 12 0.02
176 56 0.08
177 1 0.00
178 32 0.05
179 11 0.02
180 96 0.14
181 209 0.30
182 179 0.26
183 76 0.11
184 15 0.02
185 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA
TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
AATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAACTAGTTCAAATA
Found at i:127228 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 126790--127997 Score: 895
Period size: 180 Copynumber: 6.7 Consensus size: 180
126780 GACAAACCAA
* * * * ** *
126790 TTCAAATAG-TAAGGCTATATGAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
126853 GTAAAACAAATGATTT-TGTTCAAATAAGTTTGTTCGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
65 ATAAAATAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
126917 TTTGAAAATTAATAAG---GGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTAC-CAAACTAG
129 TTTGAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTACTCGAACAAG
* * * * * * * *
126966 TTCAATTATTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCATTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
127031 TAAAACAATTATTTCTATTGATA-TAGTCTTATTCGAAATAAGATAATGCTAGTTTATTAATATT
66 TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
127095 TTGAAAATTAATAAGAAACAGATTTAAAAAATGAATATGTTGGCTTGACCAA-
130 TTGAAAATTAATAAGAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTT-ACTCGAACAAG
* * * *
127147 TGCAAATAGTTATGA-TGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * *
127211 CAAAATAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTAAAAATAACATAATTCTAATTTGTTAATATTT
66 TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * *
127276 TTAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAATTGAAGT-TGTTTA-TCGAACAAG
131 TGAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAA-T-AAATATG-TTACTCGAACAAG
* * * * *
127327 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTA-AACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
127391 TAAAAGAAAAT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTGTTAATA-
66 TAAAA-TAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * ** * **
127453 TTCAAACAATTAATAAGTAAATGATTTAGGAAATAAATCTGTTTAC-CGAGTAAG
129 TTTGAA-AATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTACTCGAACAAG
* * *
127507 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTAATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
127572 TAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
66 TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * *
127637 TGACAATTAATAAGTAAAGATGTT-AAAAATAAATATGTTTAC-C-ATATAAG
131 TGAAAATTAATAAGAAAAGAT-TTAAAAAATAAATATG-TTACTCGA-ACAAG
** * ** * * * * ** *
127687 TTCAAATAGTCGTAAAGATCTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTCATAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
127752 AAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
*** * * * * * *
127816 CCAAAAATTATTGAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT-TTA-TCAAACTAG
130 TTGAAAATTAAT-AAGAAAAGATTTAAAAAAT-AA-ATATGTTACTCGAACAAG
* ** * *
127868 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAATT-TCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGAC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
127932 ATAAAATAATTATTTTTGTTCACAGAAGCTTATTCCAAATAGAATAGTA-TATATTTATTAATAT
65 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATAT
127996 TT
129 TT
127998 CAATAGTTAT
Statistics
Matches: 809, Mismatches: 183, Indels: 75
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 12 0.01
177 99 0.12
178 1 0.00
179 26 0.03
180 398 0.49
181 256 0.32
182 14 0.02
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
TGAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTACTCGAACAAG
Found at i:127581 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 126890--127997 Score: 898
Period size: 361 Copynumber: 3.1 Consensus size: 360
126880 GTTTGTTCGG
* * *
126890 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---GGATTTAAAAAATAAATCT
1 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAGATGTAAAAAATAAATAT
* * * * * * * ** * * *
126952 ATTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACA-ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
66 GTTTACCATACAAGTTCAAATAGTCATAA-AGATCTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAA
* * * * * * * * * *
127016 TCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTGATA-TAGTCTTA-TTCGAAATAAGATAAT
130 CCTTTTGTTTCATAAAAAAACAATTGTAT-TAGTTCATACAAG-CTTATTTC-AAATAAAATAAT
* * * *** * * * **
127078 GCTAGTTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AAGAAACAGATTTAAAAAATGAA--TATGTTGGCT
192 ACAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTATC-
** * * * * * *
127140 TGACCAATGCAAATAGTTATGATGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATT
254 AAACTAGTTCAAATAGTTATGATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTT
* *
127205 TTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTAAA
319 TTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAA
* * *
127247 AATAACATAAT-TCTAATTTGTTAATATTTTTAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TAAAAAATTGAA
1 AATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAA-AGATGTAAAAAA-T-AA
* * * * * ** *
127310 GT-TGTTTATCGA-ACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCT
62 ATATGTTTA-CCATACAAGTTCAAATAGTCATAAAGATCTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCT
* *
127373 A-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAA-AATT-T-TCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAA
126 ATAACCTTTTG--TT-TCATAAAAAAACAATTGTAT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAA
* ** *
127433 ATAATACAAATTTGTTAATATT-CAAACAATTAAT-AAGTAA-ATGATTTAGGAAATAAATCTGT
187 ATAATACAAATTTATTAATATTCCAAA-AATTAATGAA-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTAT
** * * * * *
127495 TTA-CCGAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTAATGACT
249 TTATCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACA
* * ***
127559 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGG
312 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAA
* * *
127608 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAGATGTTAAAAATAAATAT
1 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAGATGTAAAAAATAAATAT
* * * * * * *
127673 GTTTACCATATAAGTTCAAATAGTCGTAAAGATCTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
66 GTTTACCATACAAGTTCAAATAGTCATAAAGATCTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAAC
* * * * *
127738 CTTTTGTTTCATAAAAAAACAATTGTATTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAGTAATACTA
131 CTTTTGTTTCATAAAAAAACAATTGTATTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAA
* *
127803 ATTTATTAATATTCCAAAAATTATTGAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCAAACTAG
196 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAG
* *
127868 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAATT-TCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGAC
261 TTCAAATAGTTATGA-TATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTC
* * * * * **
127932 ATAAAATAATTATTTTTGTTCACAGAAGCTTATTCCA
324 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAA
* *
127969 AATAGAATAGTA-TATATTTATTAATATTT
1 AATAAAATAATATTA-ATTTATTAATATTT
127998 CAATAGTTAT
Statistics
Matches: 606, Mismatches: 110, Indels: 66
0.77 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
356 1 0.00
357 38 0.06
358 10 0.02
359 16 0.03
360 146 0.24
361 360 0.59
362 28 0.05
363 7 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAGATGTAAAAAATAAATAT
GTTTACCATACAAGTTCAAATAGTCATAAAGATCTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAAC
CTTTTGTTTCATAAAAAAACAATTGTATTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAA
ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAG
TTCAAATAGTTATGATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCAT
AAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAA
Found at i:127814 original size:541 final size:542
Alignment explanation
Indices: 126942--127937 Score: 1165
Period size: 541 Copynumber: 1.8 Consensus size: 542
126932 GGGATTTAAA
* *
126942 AAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
1 AAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
* * *
127007 TTGTTATGATCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTGATATAGTCTTATTCGAAATAA
66 TTGTAATGATCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAGTCTTATTCGAAATAA
* * * * *
127072 GATAATGCTAGTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAACAGATTTAAAAAATGAATATGTTG
131 AATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAACAGATTTAAAAAATAAATATGTTA
* * * * * * *
127137 GCTTGACCAATGCAAATAGTTATGATGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTT
196 CCATGACCAATGCAAATAGTCATAAAGTCTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
** * * * * * * *
127202 ATTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTAAAAATAACATAATTCTAATTTG
261 ATTTCATAAAAAAACAATTGTATCTATTCATACAAGCTTATTAAAAATAACATAATACTAATTTA
*** * *
127267 TTAATATTTTTAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTAAAAAATTGAAGT-TGTTTATCGAACAAGTT
326 TTAATATTCCAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTAAAAAA-TGAA-TCTATTTATCAAACAAGTT
* * * *
127329 TAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTACCTATTTCAAATCGCTA-AACCTTTTGTTTTGTCAT
388 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATT-CCTATTTCAAATCACTATAACATTTTGTTTTGACAT
127392 AAAAGAAAATTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTGTTAATATTCA
452 AAAAGAAAATTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTGTTAATATTCA
127457 AACAATTAATAAGTAAATGATTTAGG
517 AACAATTAATAAGTAAATGATTTAGG
* * * * *
127483 AAATAAATCTGTTTACC-GAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
1 AAATAAATCTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * *
127547 ATTGTAATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCGGAT
65 ATTGTAATGATC-ATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATA-AAGTCTTATTCGAAA
* * *
127610 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AGATGTT-AAAAATAAATAT
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAACAGAT-TTAAAAAATAAATAT
* * * * *
127673 GTTTACCAT-A-TAAGTTCAAATAGTCGTAAAGATCTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
192 G-TTACCATGACCAA-TGCAAATAGTCATAAAG-TCTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * **
127736 ATCTTTTGTTTCATAAAAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAA-AGTAAT
254 ACCTTTTATTTCATAAAAAAACAATTGTATCTA-TTCATACAAGCTTATTAAAAATAACA-TAAT
*
127799 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTGAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCAAA
317 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCAAA
* * * * *
127864 CTAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAATTTCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTT
382 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATTCCTATTTCAAATCACTATAACATTTTGTTTT
127929 GACATAAAA
447 GACATAAAA
127938 TAATTATTTT
Statistics
Matches: 373, Mismatches: 68, Indels: 27
0.80 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
539 2 0.01
540 36 0.10
541 300 0.80
542 35 0.09
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (542 bp):
AAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
TTGTAATGATCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAGTCTTATTCGAAATAA
AATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAACAGATTTAAAAAATAAATATGTTA
CCATGACCAATGCAAATAGTCATAAAGTCTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
ATTTCATAAAAAAACAATTGTATCTATTCATACAAGCTTATTAAAAATAACATAATACTAATTTA
TTAATATTCCAAAAATTAATGAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCAAACAAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAAATTCCTATTTCAAATCACTATAACATTTTGTTTTGACATAAAA
GAAAATTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTGTTAATATTCAAACA
ATTAATAAGTAAATGATTTAGG
Found at i:128667 original size:359 final size:357
Alignment explanation
Indices: 127999--129404 Score: 1275
Period size: 359 Copynumber: 3.9 Consensus size: 357
127989 TTAATATTTC
* * ** * * * *
127999 AATAGTTATAACTATTTGAACTATTTCAGTAAAAAGATTTTGTTTTTAAATCTCTTA-TTA--AA
1 AATAGTCACAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTAAAT-TTTTATTTATTAA
* * * ** *
128061 TTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAATTTTTATGAATATG-AACAAT
64 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATA-GAAACAAT
** ** * * * *
128125 TGTTTTGCGACAAAAAAAAATGTCATAACGATTTAAAATAGATAATAATTCAAATGGACATGACT
128 T-TTTTATGAC-AAAAAAAATGTCATAACGATTCGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * *
128190 ATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTAGAATATT
191 ATTTGAACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
* * * *
128255 AATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAA
128319 AACAAAGAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTT
320 AACAAA-AATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTT
* * *
128358 AATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTAGGTAAACAGATTTATTTTTAAAATATTTTATTTATTAA
1 AATAGTCACAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAGATTTATTTTT-AAAT-TTTTATTTATTAA
* * *
128423 -TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGGTT-TTTGAATAGAAACAATT
64 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATT
* * *
128486 TGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTCGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
129 T-TTTATGACAAAAAAAAT-GTCATAACGATTCGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * *
128551 TTTGAACATGTTTAAAAAATATATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAACATTA
192 TTTGAACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * *
128615 ATAAATTTA-TATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGCATGAACATAACCAATTGTTTTATGACAAA
257 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
*** *
128679 ACAAAAGATCATAATGTTTTGAAATAGATAA--GTATTT
321 ACAAAA-ATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGT-TTT
* * * * * *
128716 AGATAGTTAGAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTTAATTCTCTTATTCT-T
1 A-ATAGTCACAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATT-T-TTATT-TAT
* * * *
128780 TAATTTTTGGAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTACATGAATTGAAAC
61 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTATATGAATAGAAAC
* * * *
128844 AATTATTTTATTACAAAATAAAATGTCATAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCATA
125 AATT-TTTTATGACAAAA-AAAATGTCATAACGATTCGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* *
128909 ACTATTTG-ACTTGTTTGATAAAC--A--TATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-GAA
188 ACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-A
* * * * * * * * *
128968 ATATTGATAGATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTCT-TATGGATAGAAATAATTATTTTAT
251 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * **
129032 AACAAAACAAAAAAGTCATAAGAATTTGAAATAAGTAATTGTTCA
315 GACAAAAC-AAAAA-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTT
* * *
129077 AATAGTCACAA-TGATTTGAAC-CTGTTCTGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTAGT
1 AATAGTCACAACT-ATTTGAACTC-GTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTTATTTATT
* * *
129140 AATTGTCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-TTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
62 AATT-T-TTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * * * * * * * *
129201 CAATCATTTTATGACAAACCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATCGACAATTATTCAAATGGTCAT
124 CAAT-TTTTTATGACAAA-AAAAATGTCATAACGATTCGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * ** * * *
129266 AATTATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAA
187 AACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * *
129331 TATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTATATGAACTA-AAATAATTTTTTTAT
252 TATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTAT
*
129394 GATAAAACAAA
315 GACAAAACAAA
129405 TGGCCGTAAC
Statistics
Matches: 854, Mismatches: 144, Indels: 96
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
357 10 0.01
358 100 0.12
359 296 0.35
360 177 0.21
361 104 0.12
362 151 0.18
363 16 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
AATAGTCACAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTTTTATTTATTAATT
TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTTT
TTATGACAAAAAAAATGTCATAACGATTCGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
AACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
AATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTT
Found at i:129052 original size:540 final size:538
Alignment explanation
Indices: 128133--129404 Score: 1351
Period size: 540 Copynumber: 2.4 Consensus size: 538
128123 ATTGTTTTGC
* ** * * *
128133 GACAAAAAAAAATG-TCATAACGATTTAAAATAGATAA-TAATTCAAATGGACATG-ACTATTTG
1 GACAAAACAAAA-GATCATAACGATTCCAAATAGACAAGT-ATTCAAATAGTCA-GAACTATTTG
* * *
128195 AACTTGTT-TAGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCT-TTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
63 AACTTGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAA-TTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * * *
128258 AAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
126 -AATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* ** *
128322 AAAGAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTTAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTAGG
189 AAAGAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTAGA
* * * *
128387 TAAACAGATTTATTTTTAAAATATTTTATTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
254 TAAACA-ATATATTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
* * * **
128452 TTATTCTGAATAAGGTTTTTGAATAGAAACAATTTGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATG-A
318 TTATTCTGAATAAGCTTTATGAATAGAAACAATTTGTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA-GAA
* * *
128516 TTCGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACATGTT-TAAAAAATATATTTA
382 TTCGAAATAAG-TAATTGTTCAAATAGTCACAA-TGATTTGAACATGTTCT-AAAAACAGATTTA
* * * **
128578 TTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTGGAACATTAATAAATTTATATTATTTTATTTTAA
444 GTTTTTAAATCTTTTACTTAGTAATTGTCTT--AACATTAATAAATTTATATTATTTT-TTCAAA
* * **
128640 ATAAGCTTGCATGAACATAACCAATTGTTTTAT
506 ATAAGCTTGCATGAACAGAAACAATCATTTTAT
* * ** * * * *
128673 GACAAAACAAAAGATCATAATGTTTTGAAATAGATAAGTATTTAGATAGTTAGAACTATTTGAAC
1 GACAAAACAAAAGATCATAACGATTCCAAATAGACAAGTATTCAAATAGTCAGAACTATTTGAAC
* * * *
128738 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTTAATTCTCTT-ATTCTTTAATTTTTGGAATATTAGTAGA
66 TTGTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAATT-ATTAATTTTTAGAATATTAATA-A
* * * *
128802 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTGAAACAATTATTTTATTACAAAATAAA-
128 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAG
* ** * * * * *
128866 ATGTCATAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGTTTGATAA
193 A-ATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTAGATAA
* * *
128930 AC-ATAT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTGATAGATTAATATTATTTTA
257 ACAATATATTTTTAAAATATTTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-
* *
128993 ATTC-GAATAAGCTCTTATGGATAGAAATAATTAT-TTTATAACAAAACAAAAAAGTCATAAGAA
320 ATTCTGAATAAGCT-TTATGAATAGAAACAATT-TGTTTATAACAAAAC-AAAAAGTCATAAGAA
* * **
129056 TTTGAAATAAGTAATTGTTCAAATAGTCACAATGATTTGAACCTGTTCTGTAAACAGATTTAGTT
382 TTCGAAATAAGTAATTGTTCAAATAGTCACAATGATTTGAACATGTTCTAAAAACAGATTTAGTT
*
129121 TTTAAATCTTTTACTTAGTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTATATTATTTTTTCAAAATAAGC
447 TTTAAATCTTTTACTTAGTAATTGTCTTAACATTAATAAATTTATATTATTTTTTCAAAATAAGC
*
129186 TTGTATGAACAGAAACAATCATTTTAT
512 TTGCATGAACAGAAACAATCATTTTAT
* * * * * * * * * *
129213 GACAAACCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATCGACAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAAC
1 GACAAAACAAAAGATCATAACGATTCCAAATAGACAAGTATTCAAATAGTCAGAACTATTTGAAC
* *
129278 TTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACAT
66 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-TT
* * * * * *
129343 AGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTATATGAACTAAAATAATTTTTTTATGATAAAACAAA
130 AGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
129405 TGGCCGTAAC
Statistics
Matches: 606, Mismatches: 102, Indels: 49
0.80 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
537 24 0.04
538 37 0.06
539 122 0.20
540 249 0.41
541 166 0.27
542 6 0.01
543 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (538 bp):
GACAAAACAAAAGATCATAACGATTCCAAATAGACAAGTATTCAAATAGTCAGAACTATTTGAAC
TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAATTA
GTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGAAT
CATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTAGATAAACAA
TATATTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTG
AATAAGCTTTATGAATAGAAACAATTTGTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAAGAATTCGAAATA
AGTAATTGTTCAAATAGTCACAATGATTTGAACATGTTCTAAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCT
TTTACTTAGTAATTGTCTTAACATTAATAAATTTATATTATTTTTTCAAAATAAGCTTGCATGAA
CAGAAACAATCATTTTAT
Found at i:129726 original size:309 final size:313
Alignment explanation
Indices: 129149--129752 Score: 701
Period size: 313 Copynumber: 1.9 Consensus size: 313
129139 TAATTGTCTT
* *
129149 AATATTAATAAATTTATATTATTTTTTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATCATTTTATG
1 AATATTAATAAATTTATATTATTTTATCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATCATTTTATA
* * * ** *
129214 ACAAACCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATCGACAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAACT
66 ACAAACCAAAAGGTCATAACAATTCCAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT
* * * *
129279 TATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACATA
131 GATTCGATAAACAAATTGATTTTTTAAATCTCTT-ATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACATA
* * * *
129344 GTATTATTTTATTTCAAATAACCTTATATGAACTAAAATAATTTTTTTATGATAAAACAAATGGC
195 GTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGC
* *
129409 CGTAACAATTT-AAAATAGAT-ATT-TTTTAATAGTTGACTATTTAAATAGTCAA
260 CATAACAATTTGAAAA-AGATAATTGTTTAAATAGTTGACTATTTAAATAGTCAA
* * * * *
129461 AATATTCATAAATTTGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACTATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTTATATTATTTT-ATCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATCATTTTAT
* ** * * * *
129526 AAGAGAA-C-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCATAATTATTTG
65 AACA-AACCAAAAG-GTCATAACAATTCCAAATAAACAATT-ATTCAAATAGTCATAATTATTTA
* *
129588 AACTGGTTTGATAAACAAATTGATTTTTTAAAT-T-TT-TTATTAATTTTT-GAAATATTAATAG
127 AACTGATTCGATAAACAAATTGATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAG-AATATTAATA-
* * * *
129649 A-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTTCTATGAACAAAAAT-ATTTATTTTATGACAAAACA
190 ACATAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTT-TTTTATGACAAAACA
**
129712 AAAGGTTATAACAATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAATAGT
254 AAAGGCCATAACAATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAATAGT
129753 CATAATTATT
Statistics
Matches: 244, Mismatches: 38, Indels: 21
0.81 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
308 5 0.02
309 89 0.36
310 8 0.03
311 11 0.05
312 28 0.11
313 99 0.41
314 4 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (313 bp):
AATATTAATAAATTTATATTATTTTATCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATCATTTTATA
ACAAACCAAAAGGTCATAACAATTCCAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT
GATTCGATAAACAAATTGATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACATAG
TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGCC
ATAACAATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAATAGTTGACTATTTAAATAGTCAA
Found at i:130811 original size:719 final size:708
Alignment explanation
Indices: 129460--134890 Score: 2669
Period size: 719 Copynumber: 7.7 Consensus size: 708
129450 TAAATAGTCA
* * * * *
129460 AAATATTCATAAATTTGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACTATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTTA
* * * *
129525 TAAGAGAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATATTCATAATTATTTGA
66 TGACA-AACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TTAAATAATCATAATTATTTGA
* * * *
129589 ACTGGTTTGATAAACAAATTGATTTTTTAAAT--TT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGAT
128 ACT-GTTAG-TAAATAAATTTA-TTTTTAAATCCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AT
** * *
129651 TAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTTCTATGAAC-AAAAATATTTATTTTATGACAAAACAAAA
189 TAGTATTA---TATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
129715 GGTTATAACAATTTGAAA-AAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTCGAGCTGGTTAGGTAA
250 GGTCATAACAATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA-ATTGTTTGGTAA
* * *
129779 ATAGAA--ATTTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATT
313 ACA-AATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATT
** * * * *
129840 TTATTTCAAATAAGCTGGTATGAA-TTAAGA-AGATTGTTTTATGACAAGACAAAAGGTCATAAC
376 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAA-ACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-
* * * * * * * **
129903 AATTTGAATTAAATAATTGTTTATATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAACAAATTTAT
438 TATTTTAA-TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTAT
* * * * *
129968 TTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTAGTTT-TTTTGTAT
502 TTTTTAAATCTCTTTGCTTATTAA-TTTTCAAATGTTA-TAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAAT
* * * * *
130031 AAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGGCATAACAAAAAATGTTATAATGATTTGAAGTA
565 AAGCTTGTATGAAT-GAAAAAATTATTTTATGAC-TAA-ACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAGTA
** * * * *
130096 TATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTCAAATCT
627 TATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TCATTTAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCT
130161 CTTACTTATTAATTTTTG
691 CTTACTTATTAATTTTTG
* * *
130179 AAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATCA-AAAGCAATTGTTAT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGATCAGAAA-CAATTGTTTT
* ***
130243 ATGACCAAACAAAAGGTGATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGA
65 ATGA-CAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT-AAATAATCATAATTATTTGA
* *
130308 ACTGATTCAGCAAATAAATTTACTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAT
128 ACTG-TT-AGTAAATAAATTTA-TTTTTAAATC-CTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAT
* * *
130373 TA-T-TTA-ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
189 TAGTATTATATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * *
130435 ATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTTTTTGATAAACAAA
254 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTTGGTAAACAAA
* * * *
130500 TTCATTTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTT
318 TT-ATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
130565 TGGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTCTTATGTCAAAACAAAAGGTTATATTGATTTTAC
382 TGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-ATTTTA-
130630 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTCAA
445 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTT-AA
* * * *
130695 ATCT-TTTGCTTATTAATTTTCCAAATGTTCATAAATTTGGATTAGTTTATTCTGAATAAGGTTG
509 ATCTCTTTGCTTATTAATTTT-CAAATGTT-ATAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * *
130759 TAAGACATGAAAAAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCTA-AACT-ATTTGAATTAGATAATT
572 TATGA-ATGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGT-TAGAA-TGATTTGAAGTATATAATT
* * * *
130822 ATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAATTAGTTTAGCAAACACATTTATTTTTAAAATCTCTTACTT
634 ATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATCA-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTT
130887 ATTAATTTTTG
698 ATTAATTTTTG
* * * * *
130898 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAA-CCAAATAAGCTTCTATGATTAGAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTT
* ** * * * * * * *
130962 ATGACAAACAAAA-ATTTTAACGATTCGAGATTGATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTT-AA
65 ATGACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT-AAATAATCATAATTATTTGAA
*
131025 CTCGTTTAGTAAATAAATTTATTGTTTAAAT-CTGCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAA
129 CT-G-TTAGTAAATAAATTTATT-TTTAAATCCT--TAATTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA
* * *
131089 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATG-A-TAAAAAATGATTGTTTTATGACAAAATAA
188 TTAGTATTA---TATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAAAA--ATTATTTTATGACAAAACAA
** * ** * * ** * *
131152 AA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTTACTGATTGGTAA
248 AAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGTTTGGTAA
* * * **
131216 ACAAATT-TATTTTTTAAATTTTTTACTTCTTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
313 ACAAATTAT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * *
131280 TATTTTGTCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTATTTTATGACTAATCAAAAGGTTATAACTAT
377 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TAT
* * * * * * * * * *
131345 TTTAAATAGACAATTATTCAAATAATAATAA-TAATATGAGCTTGTTCGATAAACAGATTTATAT
441 TTT-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTT
* * *
131409 TTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTAGAATGCTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAA
504 TTTAAATCTCTTTGCTTATTAATTTTCA-AATG-TTATAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAATAA
*
131473 ACTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATATA
567 GCTTGTATGAA-TGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATATA
* * *
131538 ATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAATCATTT-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTGTT
631 ATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTG-AATCATTTAG-TAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTT
* *
131602 GCTTATTAGTTTTTG
694 ACTTATTAATTTTTG
* ** * *
131617 AAATATT-ATAAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACAAACA-AAACAATTATTCT
1 AAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTT-T
* * * * * * * *
131680 TGTGACAAA-AGAAA--TTATCAACGATTT-AACATAGATAACCAT-TTATATAGTTCTTAACTA
64 TATGACAAACA-AAAGGTCAT-AACAATTTGAA-ATAGATAA--TTGTTAAATA-ATCATAATTA
* * * * * * **** * **
131740 TTTGAATTCGTTTCG-ACATTAGATTTTCTTTTTTAATTTTCCCCGGTTATT-A-GTTCAAAATA
123 TTTGAACT-G-TTAGTA-AATA-AATTT-ATTTTTAA--ATCCTTAATTATTAATTTTTGAAATA
* * * * ** * *
131802 TT-ATAATTTGCATTAATTTTTATTTCGAATAA---AATA-GTA-TAAATGCCAATTGGTTTGAT
181 TTAATAA-TT--AGT-A-TTATATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAA--AAAATT-ATTTTAT
* * *
131861 GACAAAATAAAAGGT--T-ACATGATTTGAAATACATAATTGATTCAAATAGTCA-AACTATTTG
238 GACAAAACAAAAGGTCATAACA--ATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATAGTCATAATTATTTG
* * * ***
131922 AAATGGTTTGGTAAGCATATTTACTTTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTTTTTAATATTA
300 -AATTGTTTGGTAAACA-AATTA-TTTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAA-TTTTCGAAATATTA
* * * * * * * *
131986 AT--ATCAGTATTATTTTATTCTCAA-AA-ATGTATATTAAC-AAAATAATTGTTTTATG--AAA
360 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAA
** * * * *
132044 ACAACAA-ACTATAATGA-TTGAATAGATTAATTGTGC-AATAGTTAATAA-TAATTTGAACTGG
424 ACAA-AAGGTTATAAT-ATTTTAATA-AATAATTGTTCAAATAG-TCATAACT-ATTTGAACT--
* * * * * * *
132105 TCTTTCATAAATAGAA-TTA----TT---T-TC----C-TA-AAATTTTAAAATATAAATAAA-T
482 TGTTTGATAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTTGCTTATTAATTTTCAAATGT-TATAAATT
* * * * *
132154 ACATCTTA-TTCTATTTTGAAATACGGGCTTGTTATGAGCTGAAAATAATT-GTTTATGA-TAAA
545 A-GTATTAGTT-TATTTTG-AATA--AGCTTG-TATGA-ATGAAAA-AATTATTTTATGACT-AA
* * * * *
132216 ACAAAATGTTATACATAATTTGAA-TAAATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAA-CTAGT
601 ACAAAAGGTTAGA-ATGATTTGAAGTATATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATC-A-T
* * * * **
132279 TT-GCAAACGAA--TATCTTTT-AAATC-CATAGTTA-TAA--TTAA
663 TTAGTAAACAAATTTAT-TTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
132318 AAATAATAATTTAA-TATTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATT-ATT
1 AAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
132379 TATGATAAATC-AGAGGTTATAA-AATTTGAAATACATAA--ATCATATAAT-ATAACTATTTGA
64 TATGACAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTAAATAATCATAATTATTTGA
** * * **
132439 A-TCGTATAAAAAAAACAATTTATTTTT-AAT-C-TCA-TA--AA-TTCAG-AATATT-ATAGAT
128 ACT-GT-TAGTAAATA-AATTTATTTTTAAATCCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AT
* *
132494 TAGATATTATTTTATTT-G-A-AAGAC-TACGT-TG-A--AAAATAATTTTTTTATGAC-AAACA
189 TAG-TATTA---TATTTCGAATAAG-CTTA--TATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACAAAACA
* * * * * * **
132550 AAAGGT-AT---AA-TT-AAATAGATAGTTGTTTAAATGGCCATGATTATTT-AA---ACT-G--
247 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGTTTGGTA
* * ** * *
132602 ----ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTACTATTT
312 AACAAATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * ** * *
132662 TATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGGAACAATTTTTTTAATGATAAAGTAAAAGGTCATAACAG
377 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTTATAATA-
* * * * *
132727 TTTTAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTGTTTGAACTTGTTT-AGTAAACATATTTATT
440 TTTT-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAAATTTATT
* * * ** ** *
132791 TTTTTAATTTC-TTGCTTTTTAATTTTTTGAATGTTAATAAAAGAGTATTATTTTATTTTGAATA
503 TTTTAAATCTCTTTGCTTATTAA-TTTTCAAATGTT-ATAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAATA
* * * * ** * *
132855 AGCATGTATGAACT-AGAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAAAACCATTTGAAATAGA
566 AGCTTGTATGAA-TGA-AAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATA
* *
132919 TAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-C------T------A-TTATTTTTTAAA--TC--
629 TAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATCATTTAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTT
132966 -CTTATTAATTTTT-
694 ACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * * * *
132979 AGAATACTATTAATTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAAATGTTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATG-ATCAGAAACAATTGTTT
* * * * * * *
133043 TAGGACAAAAAAAAGATCATACCAATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGA
64 TATGACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TTAAATAATCATAATTATTTGA
* * * * * **
133108 ACTGATTCGATAAAGAGATTTAGTTTTTAAAT-C-TCA-TATTAATTTTTGGAATAAAAATAACT
128 ACTG-TTAG-TAAATAAATTTA-TTTTTAAATCCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-T
* * *
133170 TAGTA-T-TATTT----T----TT-TATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGT
189 TAGTATTATATTTCGAATAAGCTTATATGAACTA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT
** * ** * * * * * * ** *
133223 CATAATGATTTGAAGTGGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTGTTTAATAAACAG
253 CATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTTGGTAAACAA
* * * * *
133288 ATTAATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTCTTAG-AACATTAATAAATTAGTATTGTTTTAT
317 ATTATTTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATT-TTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * *** * * *
133351 TTTGAATAAACTTGCACGAA-TACAAACAATTGTTTTATGATGTAACAAAAGATCATAACGATTT
380 TTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TATTT
* * * * * * * *
133415 GAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATTACAATTTGAATTTGCTTGGTAAACAGATTTA-TTTTT
443 -TAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTT
* ** * * * * *
133479 AAATCT-TTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATATCGAATAAACTT
507 AAATCTCTTTGCTTATTAATTTTCAAATGTT-ATAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAGCTT
* * ** * ** * * ** * * * *
133543 GTTTGAATAAAAATAATTGGTTTATGACAAAACAACTGGTCATAACAATTTCAAATATGTAATTG
571 GTATGAATGAAAA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATATAATTA
* * ** * * *
133608 TT-TAAATAGTCATAACTATTTGAAT-GTTTCAAAAAATAGATTTATTGTTT-AAAT-TTTTACT
635 TTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAATCATTT-AGTAAACAAATTTATT-TTTAAAATCTCTTACT
133669 TATTAATTTTTG
697 TATTAATTTTTG
* * * * *
133681 AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATAAACA-AAACCAATTG-TT
1 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGATCAGAAA-CAATTGTTT
* *** * *
133743 TATGACAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAATCATAACTATTTG
64 TATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TTAAATAATCATAATTATTTG
* * * * * * *
133808 AACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTTAATTCTT--TTGCACTTTAATTTTTGGAATACTAA
127 AAC-TG-TTAGTAAATAAATTTA-TTTTTAAATCCTTAATT--A--TTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * *
133871 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTTAAACAATTGTTTTATTACCAAA-
185 T-AATTAGTATTA---TATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACAAAAC
* ** * * * * * **
133935 AAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATT-TCTCCA
246 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGT-T-TG
* * * *
133999 ATAAACATATT-TATTTTTTAAATCAT-TTACTTATTAATTGTC-AATATATTAATAAATTAATA
309 GTAAACAAATTAT-TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTCGAA-ATATTAATAAATTAGTA
* ** * ** * * *
134061 TTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTGA
371 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTA
* * * * * * *
134126 TAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGAT
435 TAA-TATTT-TAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAAT
** * * *
134191 TT-TGTTTTTAAAATCT-TTTATTTCTTAATTGTCTCAATAT-TAATAAATGT-GTATTATTTTA
498 TTAT-TTTTT-AAATCTCTTTGCTTATTAATT-T-TCAA-ATGTTATAAAT-TAGTATTAGTTTA
** * * *
134252 -TTTGAAATAAGCCCGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGGTGT-G-ATGA
557 TTTTG-AATAAGCTTGTATGAAT-GAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAA-GGT-TAGAATGA
* ** * * * * * * * * *
134314 TTCT-AAATAGGTAATTATTCAAATAATCATAATTATTT-AAACTTGTTCAGTAAATAGATTCAT
618 TT-TGAAGTATATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATCAT-TT-AGTAAACAAATTTAT
* *
134377 TTTTGAAATCTCTTAATTATTAATTTTTG
680 TTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * * * *
134406 GAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTATACGAACTA-AAATAATTTTTT
1 AAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGATC-AGAAACAATTGTTT
* * * *
134469 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAACAATCATGACTATTTG
64 TATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-GTTAAATAATCATAATTATTTG
* * * * ** * **
134534 ATCTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
127 AAC-TG-TTAGTAAATAAATTTATTTTT-AAA-TCCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * ** * *
134599 CTTAGTATTATTTTAATCCAACTAAGCTTGTATGAA-TAGAAACTATTGTTTTATAACAAAA-AA
188 -TTAGTATTATATT--TCGAA-TAAGCTTATATGAACTA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * *
134662 AA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTA
248 AAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTTGGTA
* * * * *
134726 AACAGATT-TTTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAGATTAATATTATTT
312 AACAAATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
*** * * * *
134786 TATTCCAAATGAA-CTTATATCAAC-AAAAC-TTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA
377 TATTTTGAAT-AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-A
* * *
134848 TTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
440 TTTT-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
134891 GATTAGGTAA
Statistics
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Consensus pattern (708 bp):
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTTA
TGACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTAAATAATCATAATTATTTGAACT
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ATATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA
TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGTTTGGTAAACAAATTATTTTT
TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
TTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATATTTTAATAAATAATTG
TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTGCTT
ATTAATTTTCAAATGTTATAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAAAA
TTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATATAATTATTCTAATAGTCTTAAC
TATTTGAATCATTTAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
Found at i:130854 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 130801--130854 Score: 51
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130791 AAAAGGTCTA
*
130801 AACTATTTGAATTAG-AT
1 AACTATTTGAATTAGTTT
*
130818 AATTATTCT-AA-TAGTTTT
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1 AACTATTTGAATTAGTTT
130854 A
1 A
130855 GCAAACACAT
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 3, Indels: 9
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.37, C:0.06, G:0.09, T:0.48
Consensus pattern (18 bp):
AACTATTTGAATTAGTTT
Found at i:131579 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 129460--132950 Score: 1732
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129450 TAAATAGTCA
* * * * * ** **
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** * ** * * *
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** *
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* * ** * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAA-A-TTATTT
* ** * * * *
129700 TATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTCG
64 TATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * *
129765 AGCTGGTTAGGTAAATAGAA---ATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
129 AACTTATTTGATAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* ** * * *
129816 AAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTCAAATAAGCTGGTATGAATT-AAGAAGATTGTTT
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* ** * * * * *
129879 TATGAC-AAGACAAAAGGTCATAACAATTTGAATTAAATAATTGTTTATATAGTCTTAACTATTT
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* ** *
129943 AAAC-TAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTG
128 GAACTTA-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * *
129997 AAATATTATTAGATTAGTATTAGTTT-TTTTGTATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTA
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* * * * * *
130061 TGGCATAACAAAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTG
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* *
130126 AACTGATTT-AGTAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
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* * * * * *
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* * ** * * * *
130242 TATGACCAAACAAAAGGTGATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTG
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* * * * * * *
130307 AACTGA-TTCAGCAAATAAATTTACTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTTG
129 AACTTATTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* *
130360 GAATATTAAT-AATTA-T-TTA----ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTATTTT
* * ** * * * *
130417 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGA
65 ATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * **
130482 ATTTTTTTGATAAACAAATTCATTTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTCA
130 ACTTATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * *
130535 AAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTCTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTTA
* * * * * *
130600 TGTCAAAACAAAAGGTTATATTGATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
66 TGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * **
130665 CTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCC
131 CTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * * *
130717 AAATGTTCATAAATTTGGATTAGTTTATTCTGAATAAGGTTGTAAGACA-TGAAAAAAATATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATTGAAAAAATTATTTT
* * * **
130781 ATGACTAAACAAAAGGTCTA-AACT-ATTTGAATTAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTT
65 ATGACTAAACAAAAGGT-TATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
130844 GAA-TTAGTTT-AGCAAACACATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
128 GAACTTA-TTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* **** * * *
130898 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATG-ATTAGAAATAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAATT-GAAAAAATTATTT
* * * * * * * * *
130961 TATGAC-AAACAAAA-ATTTTAACGATTCGAGATTGATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTT-
64 TATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * *
131023 AACTCGTTT-AGTAAATAAATTTATTGTTTAAATCTGC-TACTTATTAATTTTTG
129 AACTTATTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTG
* ** * * *
131076 AAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATG-A-TAAAAAATGATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAA--ATTATTT
* * * ** * * * *
131139 TATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTT
64 TATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * **
131203 TACTGA-TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTCTTAATTTAGG
129 AACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * * *
131255 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTTA
* * * * * * *
131320 TGACTAATCAAAAGGTTATAACT-ATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAATAATAA-TAATATG
66 TGACTAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTG
* * * * * *
131383 AGCTTGTTCGATAAACAGATTTATATTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT-
129 AACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * *
131435 AGAATGCTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTT
* * * * * * *
131500 ATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGA
65 ATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
131565 AATCATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTGTTGCTTATTAGTTTTTG
130 ACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * **
131617 AAATATT-ATAAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTA-CAA-ACAAAACAATTATTC
1 AAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTATT-
* * *** * * *
131679 TTGTGAC-AAA-AGAAA--TTATCAACGATTT-AACATAGATAACCATTTATATAGTTCTTAACT
63 TTATGACTAAACA-AAAGGTTAT-AATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACT
* * * * * * * * ** * **
131739 ATTTGAA-TTCGTTTCGACATTA-GATTTTCTTTTTTAATTTTC-CCCGGTTATT-A-GTTCA
124 ATTTGAACTT-ATTT-GATA-AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC--TTATTAATTTTTG
* * * ** * * ** *
131797 AAATATT-AT-AATTTGCATTAATTTTTATTTCGAATAAAATAGTAT-AAATG--CCAATTGGTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATT-A-TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATT-ATT
* * * * *
131857 TGATGACAAAATAAAAGGTTA-CATGATTTGAAATACATAATTGATTCAAATAGTCA-AACTATT
63 TTATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * * *
131920 TGAAATGGTTTGGTAAGCATATTTACTTTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTTTT
127 TGAACTTATTTGATAAACAAATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAA-TTTTTG
* * * * * * *
131978 TAATATTAAT--ATCAGTATTATTTTATTCTCAA-AA--ATGTAT--ATTAACAAAATAATTGTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATT--GAAAA-AATTATT
** * *
132036 TTATGA--AAACAACAA-ACTATAATGA-TTG-AATAGATTAATTGTGC-AATAGTTAATAA-TA
63 TTATGACTAAACAA-AAGGTTATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAG-TCATAACT-
* * * *
132094 ATTTGAACTGGTCTTTCATAAATAGAA-TTA---TTT---TC-C-TA---A--AA-TTTTA
124 ATTTGAACT--TATTTGATAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * **
132140 AAATATAAATAAA-TACATCTTATTCTATTTTGAAATACGGGCTTGTTATGAGCTGAAAATAATT
1 AAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTATTTTG-AATA--AGCTTG-TATGAATTGAAAA-AATT
* * * * * *
132204 -GTTTATGA-TAAAACAAAATGTTATACATAATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGTCTTAAC
60 ATTTTATGACT-AAACAAAAGGTTATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * **
132266 TATTTGAAC-TAGTTTG-CAAACGAA--TATCTTTTAAATC-CATAGTTA-TAA--TTAA
123 TATTTGAACTTA-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** *
132318 AAATAATAATTTAA-TATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA--AAAAACAATTA-TT
1 AAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTATTT
* * * * * *
132379 TATGA-TAAATC-AGAGGTTATAA-AATTTGAAATACATAA---ATCATATAAT-ATAACTATTT
64 TATGACTAAA-CAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* *** * **
132437 GAATCGTATAAAAAAAAC-AATTTA-TTTTT-AATCTC--A--TA--AA-TTCAG
128 GAA-CTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
132482 -AATATT-ATAGATTAGATATTATTTTA-TTTG-A-AAGACTACGT-TGAA---AAATAATTTTT
1 AAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTTGAATAAG-CT-TGTATGAATTGAAAAAATTATT
* * *
132538 TTATGAC-AAACAAAAGG-TAT-A--A-TT-AAATAGATAGTTGTTTAAAT-GGC----C-A--T
63 TTATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * *
132588 G-A-TTA-TT--TAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTT
128 GAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * *
132637 AAATATTAATAAAGTAGTACTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGGAACAATTTTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTT-
* * * * * * *
132702 ATGA-TAAAGTAAAAGGTCATAA-CAGTTTTAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTGTTT
65 ATGACTAAA-CAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
132765 GAACTTGTTT-AGTAAACATATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTTTTAATTTTTTG
128 GAACTTATTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTG
* ** * * *
132820 -AATGTTAATAAAAGAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACT-AGAACAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGA-AAAAATTATTTT
* * ** * *
132883 ATAACTAAACAAAAGGTTAAAACCATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGA
65 ATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
132948 ACT
130 ACT
132951 ATTATTTTTT
Statistics
Matches: 2537, Mismatches: 561, Indels: 428
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
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146 5 0.00
147 5 0.00
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150 1 0.00
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152 2 0.00
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AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTTA
TGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
CTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
Found at i:132977 original size:18 final size:18
Alignment explanation
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132938 AACTATTTGA
*
132948 ACTATTATTTTTTA-AAT
1 ACTATTAATTTTTAGAAT
*
132965 CCTTATTAATTTTTAGAAT
1 AC-TATTAATTTTTAGAAT
132984 ACTATTAATTT
1 ACTATTAATTT
132995 AGCAATATTT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 3, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.34, C:0.09, G:0.02, T:0.55
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ACTATTAATTTTTAGAAT
Found at i:133922 original size:181 final size:180
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133174 ATTATTTTTT
* * * * *
133184 TATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAGTGGATAA-TAG
1 TATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-
* * * * * * **
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* * * ** *
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* * *** * *
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1 TATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * * * *
133430 TCAAATAGTCATTACAATTTGAATTTGCTTGGTAAACAGATT-TATTTTTAAATCTTTTACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTATTTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
133494 TAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATATCGAATAAACTTG
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* * * ** * * *
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* ** * *
133608 TTTAAATAGTCATAACTATTTGAA--TGTTTCAAAAAATAGATT-TATTGTTTAAAT-TTTTACT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-AGTAAACAGATTAT-TTTTTTAAATCTTTTACT
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* * * * * * *
133723 CATAAACAAAACCAATTG-TTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * *
133787 TTAGATAATCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTTAATTCTTTTGCAC-
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATT-ATTTTTTTAAATCTTTT--ACT
* * *
133851 T-TTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
127 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
133904 TATGAACTTAAACAATTGTTTTATTACCAAA-AAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTAT
1 TATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * ** * * *
133968 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATTTCTCCAATAAACATATT-TATTTTTTAAATCATTTACTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTAT-TTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * *
134032 TTAA-TTGTCAATATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTG
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* * * * * * * *
134084 TATAAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTGATAACAATTTGAAATAAATAATTG
1 TATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * *
134149 TTCAAATAGTCATAACGATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATT-TTGTTTTTAAAATCTTTTATT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTATT-TTTTT-AAATCTTTTACT
* * * * **
134213 TCTTAATTGTCT-CAATATTAATAAATGT-GTATTATTTTATTTGAAATAAGCCCG
127 TATTAATT-TTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* ** * * * * *
134267 TATGAATAGAAAAAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGGT-GTGATGATTCT-AAATAGGTAATT
1 TATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
134330 ATTCAAATAATCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCA-TTTTTGAAATCTCTTAAT
63 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATT-ATTTTTTTAAATCTTTTACT
* ** * *
134394 TATTAATTTTTGGAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTA
127 TATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * *
134448 TACGAACTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * * * * * * *
134513 TTAAACAATCATGACTATTTGATCTTGTTTGGTAAACATATT-TATTTTTAAAATTTTTTACTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTAT-TTTTTTAAATCTTTTACTTA
** * * * *
134577 TTAATTTTCAAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTAATCCAACTAAGCTTG
129 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * *
134629 TATGAATAGAAACTATTGTTTTATAACAAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTAT
1 TATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * *
134692 TTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATT-TTTTTTTAAATC---T-CTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTATTTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * *
134752 TAATTTTTGAAAGATTAATAGATTAATATTATTTTATTCCAAATGAA-CTTA
130 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTG
* * * * * *
134803 TATCAACAAAAC-TTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTATT
1 TATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* *
134867 CAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTAGGTAAACAGAGTTAT
66 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-GTAAACAGA-TTAT
134911 CAAAAAATTC
Statistics
Matches: 1238, Mismatches: 254, Indels: 113
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
172 15 0.01
173 11 0.01
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175 5 0.00
176 1 0.00
177 5 0.00
178 97 0.08
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184 3 0.00
185 2 0.00
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Consensus pattern (180 bp):
TATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATT
AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
Found at i:134512 original size:545 final size:539
Alignment explanation
Indices: 129460--134905 Score: 2002
Period size: 538 Copynumber: 10.3 Consensus size: 539
129450 TAAATAGTCA
* * * * * * * * *
129460 AAATATTCATAAATTTGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CTATTATTTT
1 AAATATTAATAAATGTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGAATAAACA-AAACCAATT-GTTT
* * ** * * * *
129524 ATAAGAGAAC-AAAGAGTCATAACAATT-TGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCATAATTATT
64 ATAACAAAACAAAAG-GTCATAA-TGTTCTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAATCATAACTATT
* * * * *
129586 TGAACTGGTTT-GATAAACAAATTGATTTTTTAAAT-TTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAAT
126 TAAACTTGTTTAG-TAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAAT
* * ** * * * * * *
129647 AGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTTCTATGAACAAAAATATTTATTTTATGACAAAACA
190 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * * ** **
129712 AAAGGTTATAACAATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTCGAGCTGGTTAGGT
255 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATTTCTT-GGT
*** * * * *
129777 -AA-ATAGAAATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTAT
319 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * * * * * * *
129839 TTTATTTCAAATAAGCTGGTATGAATTAAG-AA-GATTGTTTTATGACAAGAC-AAAAGGTCATA
382 TTTAATCCGAATAAGCTTGTAT-AA-AAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATA
* * * * * * * *
129901 ACAATTTGAATTAAATAATTGTTTATATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAACAAATTT
445 ACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT
* * *
129966 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTG
510 -TTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* * *** * * * * *
129997 AAATATTATTAGAT-TAGTATTAGTTTT-TT-TGTATAAGCTTGTATGAATAGAAA-TAATTATT
1 AAATATTAATAAATGTA-TATTA-TTTTATTCAAAATAAGCTTGAATAAACA-AAACCAATT-GT
** * * * * * ** *
130058 TTATGGCATAACAAAAAATGTTATAATGATT-TGAAGTATATAATTGCTCAAATAGTCATAACTA
62 TTATAACA-AA-ACAAAAGGTCATAATG-TTCTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTA
* * * * * * *
130122 TTTGAAC-TGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATT
124 TTTAAACTTG-TTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCT-TTAATTATTAATTTTTGGAATATT
* * * * * * *
130186 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATC-AAAAGCAATTGTTATATGACCA
187 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * * * * **
130250 AACAAAAGGTGATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATT
251 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATTTCTT
* * * * * ** * **
130315 CAGCAAATAAATTTACTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTA-T-T
316 -GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * *
130377 TAATTT--T--GAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA
379 TATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAT-AAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTCA
* * * * * * * * *
130436 TAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTTTTTGATAAACAAAT
443 TAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGAT
* * ** *
130501 TCATTTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTT-TCA
508 T--TTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCT-G
* **** * ** * *
130535 AAATATTAAGAAAT-TAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTGAAA-CAATTGTCT
1 AAATATTAATAAATGTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGAATAAAC-AAAACCAATTGT-T
** * * * * * * *
130598 TATGTCAAAACAAAAGGTTATATTGATT-TTACATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
63 TATAACAAAACAAAAGGTCATAATG-TTCTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT
* * * ** *** * *
130662 GAACTTGTTT-GATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAAATGTTCA
127 AAACTTGTTTAG-TAAACAGATTCATTTTTT-AAATC-TTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * * * * *
130726 TAAATTTGGATTAGTTTATTCTGAATAAGGTTGTAAG-ACATGAAAA-AAATATTTTATGACTAA
189 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAAC-T-AAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * ** *
130789 ACAAAAGGTC-TAAACTATTTGAATTAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAATTAGT-
252 ACAAAAGGTCAT-AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATT--TC
* * * * * * *
130852 TTAGCAAACACATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTA
314 TTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTA
* * * ** * *
130917 TTATTTTTAA-CCAAATAAGCTTCTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGAC-AAAC-AAAAA-TT
378 TTA-TTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTC
* * * * ** * * * * * * *
130978 TTAACGATTCGAGATTGATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTT-AACTCGTTTAGTAAATAAA
442 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGA
* ** * *
131042 TTTATTGTTTAAATCTGCTACTTATTAATTTTTG
507 TTT-TTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* **
131076 AAATATTAATCAAT-TAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-ATATGATAA-AAAA-TGATTG
1 AAATATTAATAAATGTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGA-AT-A-AACAAAACCAATTG
* * * *** *
131136 TTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATT-TGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTA
61 -TTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATG-TTCTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTA
** * * * * * * * *
131199 TTTTTAC-TGATTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTCTTAA-TTTAGGAAATATT
124 TTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAA-TCTTTAATTATTAATTTTTGG-AATATT
** * ** * * *
131262 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTATTTTATGACTAA
187 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * * * ** *
131327 TCAAAAGGTTATAACTATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAATAAT-AATAATATGAGCTTGTT
252 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACT-ATTTGAATTTCTT
* * * * **
131391 CGATAAACAGATTTATATTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTAGAATGCTAATAAATTAGTA
316 -GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTA
* * ** * * ** * * * * *
131455 TTAATTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACTAAAC-AAAAGGTTA
378 TTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTCA
* ** * * * * * * ** * * *
131519 GAATGATTTGAAGTATATAATTATTCT-AATAGTCTTAACCATTTGAAATCATTTGATAAACAAA
443 TAACAATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGA
* ** * *
131583 TTTATTTTTTAAATCTGTTGCTTATTAGTTTTTG
507 TTT-TTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* ** * * *
131617 AAATATT-ATAAAAT-TAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACAAACAAAA-CAATTATTC
1 AAATATTAAT-AAATGTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGAATAAACAAAACCAATT-GT-
* * * * * ** * * * *
131679 TTGTGACAAAA-GAAA--TTATCAACGATT-T-AACATAGATAACCATTTATATAGTTCTTAACT
62 TTATAACAAAACAAAAGGTCAT-AATG-TTCTGAA-ATAGATAATTATTCAAATA-ATCATAACT
* * ** ** * **
131739 ATTTGAA-TTCGTTTCG-ACATTAGATTTTC-TTTTTT-AAT-TTTCCCCGGTTATT-A-GTTCA
123 ATTTAAACTT-GTTTAGTA-AACAGA--TTCATTTTTTAAATCTTT----AATTATTAATTTTTG
* * * * * * *
131797 AAATATT-AT-AATTTGCATTAATTTTTATTTCGAATAA---AATA-GTA-TAAATGCCAATTGG
180 GAATATTAATAAATTAGTATT-A-TTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAACTAAA--ACAATT-G
* * * * *
131855 TTTGATGACAAAATAAAAGGT--TACATGATTTGAAATACATAATTGATTCAAATAGTCA-AACT
240 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATGACT
* * * **
131917 ATTTGAAATGGT-TTGGTAAGCATATTTACTTTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTTTTTA
303 ATTTG-AAT-TTCTTGGTAAACATATTTA--TTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAA--TTTTCAA
* * * * *
131980 ATATTAAT--ATCAGTATTATTTTATTCTC-AA-AA--ATGTATATTAACA-AAATAATTGTTTT
361 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC-CGAATAAGCTTGTATA--AAAAGAAACAATTGTTTT
* * ** * ** *
132038 ATG--AAAACAACAAACT-ATAATGA-TTG-AATAGATTAATTG-TGCAATAGTTAATAA-TAAT
423 ATGACAAAACAAAAAAGTCATAACAATTTGAAATA-AATAATTGTTTAAATAG-TCATAACT-AT
* ** ** * *
132096 TTGAACTGGTCTTTCATAAATAGAATTATTTTCCTAAA-ATTTTA---A--AA--TAT-
485 TTGAACT--TGTTTGGTAAATAG-ATT-TTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* * * * * * * * * *
132146 AAATA--AATACATCT-TATTCTATT-TT-GAAATACGGGCTTGTTATGAGCTGAAAA-TAATTG
1 AAATATTAATAAATGTATATTATTTTATTCAAAATA--AGCTTG-AATAAAC--AAAACCAATTG
* * * * * * * *
132205 TTTATGATAAAACAAAATGTTATACATAATT-TG-AATAAATAATTATTCAAATAGTCTTAACTA
61 TTTATAACAAAACAAAAGGTCATA-AT-GTTCTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTA
* * * * * ** * *** *
132268 TTTGAACTAGTTT-GCAAAC-GAAT-ATCTTTTAAATCCATAGTTA-TAA--TTAAAAATAATAA
124 TTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * ** * * * * * *
132327 TTTAA-TATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATT-ATTTATGATAAAT
189 -TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * * * *
132389 C-AGAGGTTATAA-AATTTGAAATACATAA--A-TCATATAAT-ATAACTATTTGAATCGTATAA
253 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAT-TTCT-T
*** * *
132448 AAAAAACA-ATTTA-TTTTT-AATC---T-C--A-TAA-ATTCAGAATATT-ATAGATTAGATAT
316 GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAG-TAT
** * * * * *
132501 TATTTT-ATTTG-A-AAGACTACGT-T--GAA-AAATAATTTTTTTATGAC-AAAC-AAAAGGT-
379 TATTTTAATCCGAATAAG-CT-TGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTC
* * * *
132556 AT---AA-TT-AAATAGATAGTTGTTTAAAT-GGC----C-A--TG-A-TT-ATT--TAAACT-G
442 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-TAG
* ** * *
132602 ATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTT
506 ATTT-TTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* **** ** * **
132637 AAATATTAATAAA-GTAGTACTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGGAA-CAATT-TTT
1 AAATATTAATAAATGTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGAATAAAC-AAAACCAATTGTTT
* * * * * * * *
132699 TTAATGATAAAGTAAAAGGTCATAACAGTT-TTAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTGT
64 ATAA-CA-AAA-CAAAAGGTCATAA-TGTTCTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTAT
* * * * * ** * * *
132763 TTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTTTTAATTTTTTGAATGTTAA
125 TTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCT-TTAATTATTAATTTTTGGAATATTAA
** * * * * * * *
132828 TAAAAGAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTAGAACAATTATTTTATAACTAAAC
189 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
132893 AAAAGGTTAAAACCATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTC-T---TA----ACTAT-TT-G-
254 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATTTCTTGGT
* * * * * *
132947 -AAC-TA-TTATTTTTTAAATC-----CTTATTAATTTTTAGAATACTATTAATTTAGCAATATT
319 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * * * *
133004 TTACTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAAATGTTTTAGGACAAAA-AAAAGA-TCATACCA
383 TTAATCCGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAACA
* * * * * *
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* *
133131 TTTTTAAATC--TCA--TATTAATTTTTG
511 TTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* ** * * *
133156 GAATAAAAATAACT-TAGTATTATTTT-TT-----T-A---TGAAT--A-GAAA-TAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATGTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGAATAAACAAAACCAATTG-TTT
* * * * * *
133206 ATGACAAAACAAAATGTCATAATGATT-TGAAGTGGATAA-TAGTTCAAATGGA-CATGACTATT
64 ATAACAAAACAAAAGGTCATAATG-TTCTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-AATCATAACTATT
* * * * * *
133268 TAAACTTGTTTAATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTCTTAGAACATTAAT
126 TAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTAA-TTATTAATTTTTGGAATATTAAT
* * ** ***
133333 AAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAACTTGCACGAA-TACAAACAATTGTTTTATGATGTAAC
190 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
133397 AAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATTACAATTTGAATTTGCTTGG
254 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATTT-CTTGG
* **
133462 TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
318 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * ***
133526 TTATAT-CGAATAAACTTGTTTGAATAA-AAATAATTGGTTTATGACAAAAC-AACTGGTCATAA
383 TTA-ATCCGAATAAGCTTGTAT-AAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAA
* ** ***
133588 CAATTTCAAATATGTAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA--TGTTTCAAAAAATAGATTT
446 CAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAATAGATTT
* * *
133651 ATTGTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG
510 -TTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* *
133681 AAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATAAACAAAACCAATTGTTTAT
1 AAATATTAATAAATGTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGAATAAACAAAACCAATTGTTTAT
* * * * * * *
133746 GACAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAATCATAACTATTTGAAC
66 AACAAAACAAAAGGTCATAATGTTCTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAAC
* * * *
133811 TTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTTAATTCTTTTGCACT-TTAATTTTTGGAATACTAATAAA
131 TTGTTTAGTAAACAGATTCA-TTTTTTAAATC-TTT-AATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
** * * * *
133875 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTTAAACAATTGTTTTATTACCAAA-AAAA
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* * * ***
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* * *
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* *
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* * *
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*
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* * ** *
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* * * *
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* * *
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124 TTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCT-TTAATTATTAATTTTTGGAATATTA
* * *
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* * * * *
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* * *
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315 TGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
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* * *
134668 TAACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAT
443 TAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGAT
* *
134733 TTTTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTG
508 TTTTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTCTG
* * * * *
134761 AAAGATTAATAGAT-TAATATTATTTTATTCCAAATGAA-CTT-ATATCAACAAAA-C-TTTGTT
1 AAATATTAATAAATGT-ATATTATTTTATTCAAAAT-AAGCTTGA-ATAAACAAAACCAATTG-T
* * * * *
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* *
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* *
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* * * *
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* * * * * * * *
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66 ATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAGCTTGTATGAATAAAAA
* * *
135141 TAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTATACA
131 TAATTATTATATGACAGAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAGTATACA
* * ** * * *
135189 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTATTT
1 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTCAACAAACAAATTCATTTTGTAAACCTCTTAGTT
* *
135254 ATTAGTTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAA
66 ATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAGCTTGTATGAAT-AAAA
* *
135318 ATGATTGTTATATGACCAG-ACAAAAGGTAATAA
130 ATAATTATTATATGA-CAGAACAAAAGGTAATAA
135351 CAATTTAAAA
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 26, Indels: 4
0.82 0.16 0.02
Matches are distributed among these distances:
177 2 0.01
178 130 0.97
179 2 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTCAACAAACAAATTCATTTTGTAAACCTCTTAGTT
ATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAGCTTGTATGAATAAAAA
TAATTATTATATGACAGAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAGTATACA
Found at i:135735 original size:297 final size:296
Alignment explanation
Indices: 135193--135757 Score: 644
Period size: 297 Copynumber: 1.9 Consensus size: 296
135183 TATACAGTTC
*
135193 AAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTATTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
*
135258 GTTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATAAAAAATGAT
66 GTTTTTGAAAGATTAAGAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATAAAAAA-GAT
* * * * * * *
135323 TGTTATATGACCAGACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTGAAATAGGCATAATT
130 TCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGGCATAAAT
* *
135388 ATTTAAACTAAATATGTAAATAGATCCATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGGAATATT
195 ATTTAAACTAAATATATAAACAGATCCATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGGAATATT
*
135453 TATAAATTATCATTACTTTATTTCCAATATGAACTGA
260 AATAAATTATCATTACTTTATTTCCAATATGAACTGA
* * *
135490 AAATAGTCATAATTATTTGAATTTG-TTC-GATAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTCAG-TAAACAAATTCA-TTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * **
135552 TTAGTTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTAATT-TGGATAAGCTT-TGATGAACTAAA
63 TTAGTTTTTGAAAGATTAAGAAATTAATATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGT-ATG-A-TAAA
* * * * * * *
135615 ACA-ATTCTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGCTCAAATAGTC
124 AAAGATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGGC
* * ** *** *
135679 ATAAATA-TTAGAACTTATTCA-ATAAACAG-TTTATTTTTTCAAATTTTTTGCTTATTAATTTT
189 ATAAATATTTA-AACTAAAT-ATATAAACAGATCCATTTTTT-AAATCACTTACTTATTAATTTT
* *
135741 TTGAATGTTAATAAATT
251 TGGAATATTAATAAATT
135758 TGGATTTTTT
Statistics
Matches: 222, Mismatches: 36, Indels: 20
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
296 13 0.06
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (296 bp):
AAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
GTTTTTGAAAGATTAAGAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATAAAAAAGATT
CTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGGCATAAATA
TTTAAACTAAATATATAAACAGATCCATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA
ATAAATTATCATTACTTTATTTCCAATATGAACTGA
Found at i:136307 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 135929--137700 Score: 435
Period size: 180 Copynumber: 9.8 Consensus size: 181
135919 GGAATATTAT
* *
135929 TAAATTAGTATTATTTT-TAATCAAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTG-TTTTATGA-AAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTCTATGATCA-AAACAATTGTTTTTATGACAAA
* *** * * ** * * *
135991 A-ATAAAGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATT
64 ACA-AAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATT
* * * ** * *
136055 CGATAAATAGATTTATTAGTTAAATTTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
128 CGATAAAAAGATTTATTAGTTAAATTTCTTACTTACTAATTTAGGAAAGAATAA
* *
136109 TCAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATCACAAACAATTGTTTTTTTGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATCA-AAACAATTGTTTTTATGACAAAA
* *
136174 CAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAAT-GACCATAATTATTTTAACTAATTC
65 CAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAG-CCATAACTATTTGAACTAATTC
**
136238 -AGTAAACAAG-TTTATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAATTTAGGAAAGAATAA
129 GA-TAAA-AAGATTTATTAGTTAAATTTCTTACTTACTAATTTAGGAAAGAATAA
* *** * * * *
136291 TAAATTAGCATTATTTTATTTCTTTTAAGCTTGTATTAACTAAAACAATT-TTTTTATGACAAAT
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATC-AAAACAATTGTTTTTATGACAAAA
* * * * * ** * ** * *** * **
136355 CAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTAAAATAATAATAACTATTTAAACTTGTTC-
65 CAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCG
* * * ** * * * *** * *
136419 AGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTTAATG-TTAA
130 A-TAAAAAGATTTATTAGTTAAATTTCTTACTTACTAA-TTTAGGAAAGAATAA
* * ** **
136472 TAATTTAGTATTAATTTA-TTCTAAATAAGC-T-TATGAATTGAAACAATTG-TTTTATGACTTA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTCTATG-ATCAAAACAATTGTTTTTATGACAAA
* * * * * * * * * * *
136533 ACAAAAGGTCAGAATGATTTG-AA-TAAAATATTATTCTAATAGTC-TGAACCATTTGAATTGAT
64 ACAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATA-ATCATTCAAATAGCCAT-AACTATTTGAACTAAT
* ** * ** * * *
136595 TTGATAAATAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TCAATTTTTGAAATATTAT
127 TCGATAAA-AAGATTTATTAGTTAAATTTCTTACTTACT-AATTTAGGAAAGAATAA
* * * * * * * *
136650 TAAATTAGTATTATTGTAATTCAAATAATCTTGTACGAACAAAACAATT-ATTTTATGACAAAAG
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATCAAAACAATTGTTTTTATGACAAAAC
* * * * * ** * * * * * ** * *
136714 AAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATATGAATTGGTTTGG
66 AAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCGA
** ** * ** * * * *
136779 TAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTGTTA-G-AATATTAT
131 TAAAAAGATTTATTAGTTAAATTTCTTACTTACTAA-T-TTAGGAAAGAATAA
* ** ** * * * * *
136830 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAGTATTAACGGAACCAATTG-TTTGATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATC-AAAACAATTGTTTTTATGACAAAA
** * * * * * * * * * * ** **
136894 TGAAAGTTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCAAAACTATTT-TACTTTTTAA
65 CAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCG
* * * * * *** * *
136958 ATTGAAAGCAGATTTACTT-TTTAAATCTCATA-TTGATTAATTTTCTAAATATTAA
130 A-T-AAA-AAGATTTA-TTAGTTAAATTTCTTACTT-ACTAATTTAGGAAAGAATAA
** * * * * *
137013 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTG-TTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATC-AAAACAATTGTTTTTATGACAAAA
** * * ** ** * **
137077 CAAAAG-T-AATAACGATTTGAAATGGATTATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTC
65 CAAAAGATCAA-AATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTC
* * * * ** * *
137140 AATAAATAA-AATTATT-TTCTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTTGAAATATTAA
129 GATAAA-AAGATTTATTAGT-TAAATTTCTTACTTACT-AATTTAGGAAAGAATAA
* * * ** * * * * *
137193 TAAATTAATTTTATTCTATTTTGAATAAGGTTGTATGAGCTGAAATAATTG-TTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATC-AAAACAATTGTTTTTATGACAAAA
* * ** ** * * * * **
137257 CAAAA-ATCAAAACAATTTAAAATAAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGACCTGGTTC
65 CAAAAGATCAAAATAATTTGAAAT-TGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTC
* * * * ** * * * *
137321 -AGCAAACATATTCATTTTTTAAA--TCTTAGC-TATTAATTTTTA-G-AATACTAC
129 GA-TAAAAAGATTTATTAGTTAAATTTCTTA-CTTACTAA--TTTAGGAAAGAATAA
** * * * * * *
137372 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATGAACAAAAACAATT-ATTTTATGATAGAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATC-AAAACAATTGTTTTTATGACAAAA
* * * * * * * * **
137436 TAAAAGGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
65 CAAAA-GATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTC
* * * * * * * *
137501 AACAAACAAAATTT-TT-TTTAAATGTCTTA--T--TAATTCT-TGAAATATTAA
129 GATAAA-AAGATTTATTAGTTAAATTTCTTACTTACTAATT-TAGGAAAGAATAA
* * * * * *
137549 TAAATTTGTATTATTTTATTTCCAAA-AAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTG-TTTTATAAAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTT-CAAATAAGCTTCTATGAT-CAAAACAATTGTTTTTATGACAAA
* * ** *** * * *
137612 ACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT
64 ACAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTC
**
137676 GATAAATAA-ATTTATTTTTTAAATT
129 GATAAA-AAGATTTATTAGTTAAATT
137701 AATTTTTGAA
Statistics
Matches: 1241, Mismatches: 281, Indels: 144
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 4 0.00
175 61 0.05
176 10 0.01
177 74 0.06
178 80 0.06
179 163 0.13
180 298 0.24
181 269 0.22
182 182 0.15
183 98 0.08
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATCAAAACAATTGTTTTTATGACAAAAC
AAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTCGA
TAAAAAGATTTATTAGTTAAATTTCTTACTTACTAATTTAGGAAAGAATAA
Found at i:136503 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 135490--148514 Score: 4901
Period size: 181 Copynumber: 71.7 Consensus size: 181
135480 TATGAACTGA
* * *
135490 AAATAGTCATAATTATTTGAATTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * **
135553 TAGTTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTAATT-TGGATAAGCTT-TGATGAACTAAAA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGT-ATGAACTAAAA
* * * * *
135616 CAATTCTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGCTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
135671 AAATAGTCATAAATATTAGAACTTATTCAATAAAC-AGTTTATTTTTTCAAATTTTTTGCTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATT
* * * * * * *
135735 AATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTTTTTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAAC
65 AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAAC
* * * * *
135798 AAATATTTTATGACTAAACAAAAGG-CTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * * *
135852 TAACAATTTTAACTATTTGAA-TTGGTT-TGACAAACATATTTATTTTTTAAA--T-AT-CTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * *
135911 TAATCTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAATC-AAATAAGCTTCTATG-ATTAGAAA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
** * * * *
135974 CAATTGTTTTATGA-AAAA-ATAAAGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTT
127 CAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * *
136028 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTC-GATAAATAGATTTATTAGTTAAATTTGTTACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * *
136091 TAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTCTATGATC-ACAAA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
* * * ** * **
136154 CAATTGTTTTTTTGACAAAACAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTC
127 CAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * *
136210 AAAT-GACCATAATTATTTTAACTAATTCAGTAAACAAGTTTATTTTTTAAATTTCTTACTTACT
1 AAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** * * * ** *
136274 AATTTAGGAAAGAATAATAAATTAGCATTATTTTATTTCT-TTTAAGCTTGTATTAACTAAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * * * * *
136338 ATTTTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTA
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
136391 AAATAATAATAACTATTTAAACTTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * * * * *
136456 ATTTTTTTAATGTTAATAATTTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGC-T-TATGAATTGAAACAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
** * * * *
136519 TGTTTTATGACTTAACAAAAGGTCAGAATGATTTG-AATA-AAATATTATTC
131 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA-ATTGTTC
* * * *
136569 TAATAGTC-TGAACCATTTGAA-TTGATT-TGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
1 AAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * *
136631 TCAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTGTAATTC-AAATAATCTTGTACGAAC-AAAA
63 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAA
* * * *
136694 CAATTATTTTATGACAAAAGAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** ** * * * **
136749 ATATAGTCTTAACTATATGAA-TTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * ** * * ** *
136813 AAGTGTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAAATAGTATTAACGGAACC
65 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
* ** * * * *
136876 AATTGTTTGATGACAAAATGAAAGTTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
136930 AAATTGTCAAAACTATTT-TACTTTTTAAATTGAAAGCAGATTTACTTTTTAAATCTCATA-TTG
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-CAGT-AAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-
* * * * * * *
136993 ATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAA
62 ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAA
* * *
137057 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAACGATTTGAAATGGATTATTGTTC
126 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
137112 AAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCAATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * * *
137177 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATTTTGAATAAGGTTGTATGAGCTGAAATAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * * *
137242 TGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCAAAACAATTTAAAATAAAATAATTGTTC
131 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTC
* * * * * * *
137293 ATATAGTCTTAACTATTTGACCTGGTTCAGCAAACATATTCATTTTTTAAA--TCTTAGC-TATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATT
* * * * * *
137355 AATTTTT-AGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATGAACAAAAACA
65 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * * * *
137419 ATTATTTTATGATAGAATAAAAGGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * *
137473 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAACAAACAAAATT-TTTTTTAAA--T-GT-CTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * ****
137533 ATTCTTGAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCCAAA-AAGCTTGTATGTTGAAAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * *
137597 TTGTTTTATAAAAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTC
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
137648 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAAATAAATTTATTTTTT--A------A---ATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * * *
137701 AATTTTTGAAGTATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTATATGAAC-AAAAGCA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CA
* * * *
137765 TTTGTTTAATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTTTT
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
137818 TAATAGTCATAATTAATTATTTGAACTAGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTTAAA-ATCTTAC
1 AAATAGTC---A-TAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAC
** * * * * * **
137881 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TT-TTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTT
60 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTAAAT-AA-GC-TTGTA-TGA
* * * ** ** * * * * * *
137943 ATTCCAAATAA--GCTAGTATGAATTCAAAA-AAAA-AAC-TTA--TTTTAAAATAAAACAAGTG
120 ACT-AAAACAATTG-TTTTATG-A--CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTG
*
138001 GTC
179 TTC
* * ** *
138004 ATAAT-GAT-TTGAAATAGAT-AA-TTGTTCA-TATAGTCTTAAATATTTGATTTGGTTTGGCAA
1 A-AATAG-TCAT-AACTATTTGAACTTGTTCAGTA-A-AC---AA-ATTT-ATTT--TTT-----
* * * * *
138064 AGAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTGTTATTTT
49 ---AA---ATCTCTT-A----CTTA-TTA--A-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * * *
138129 TTTCCAAGTAAACTTGTATGAAC-ATAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTAAAACAAT
99 ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * ** *
138193 TTCAAGTTTATAATTGCTC
163 TTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
138212 AAATAGTTATAACTATTTGAACTAT-TTTAGTAAACAGATTTATCTTTTAAATATTTTA-TTTTT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * ** *
138275 AATTTTTGAAAGA-TAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGAATGTTC-AAATAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAA-AC
* ** * * * * *
138337 AATTGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTG
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
138391 ACATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATT-TGATAAACAAATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * *
138450 TAAATTTTGGAATATTAATAAAGTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTGAAACA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * ** *
138515 ATTATTTTATGACAAAACAATATGTCATAACAATTTGAAGCAAATAATTGTTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* *** * ** * * *
138568 ATATAGTTGCAACTATTTGAGC-TGCTTTGGTAAACAAATATATTTTTTAAATATCTTAGTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
138632 AATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATGAACTAAAACAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * * * * *
138697 TTCTTTTATAATAGAATAATAA-GTTATAACAATTTTAAAATAGATAATTGTTC
130 TTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
138750 AAATAG---GAACTAGTT---C--G---A-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * ***
138803 ATTTTTGAAATATTAACAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAGGTTTGTATGATGAAAAACAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * * *
138868 TGTTTTGTAATAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
131 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * ** * *
138919 AAATGGCCATAATTATTTGAGC-CGATTC-GATAAACTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * * *
138982 CAATTTTTGAAATATTAATAAGTGA-TATT-GTTTATTTTGAATATGCTTTTATGAACTGAAACA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* *** * *
139045 ATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTT
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
139098 AAATTGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAATTTCTT-GTGTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT--AAATCTCTTACT-TA
* * * * *
139162 TTACTTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCATGTTTGAATTGAA
63 TTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACT-AA
* * * * * ** * *
139225 AA-AATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAAAAATTTGAAATAGATAACTATTC
125 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
139281 TAATAATCTTAACTATTTGAACTTGTTCAGCAAATACATTTATTTTTTAAATCACTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * * *
139346 ATTTTTAAAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTT-TGAATAAGCTTTTAT-AAGC-AGGAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAA-CTA-AAAC
* * * *
139408 AATTATTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTT-
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
139460 AAATACTTATAACTATTTGAA-TTGGTT-TGATAAATAGATTT-TGTTTTTAAA--TC-T-CTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * *
139518 TTCATTTTTAAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AGCTTTGTATGAA-TAGAA
63 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGC-TTGTATGAACTA-AA
* * * * * * *
139581 ACAATTATTTTATGATAAAATAAAATGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATAGTTC
126 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * * * **
139637 AAATGGACATGCCTAATTT-AACTTGTT-TGATGAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTAT
1 AAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * *
139700 TAATTTTT-AGAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAA
64 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
* * * *
139763 CAATTATTTTATGACAAAACAAATA-ATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** *** * * *
139818 AAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTT-AGTAAATGGATTTATTTTGTAAATATTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
139882 AATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTTTATGAACTGAAGCAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* *
139947 TTGGTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGCTT-
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTC
* * * * *
139999 AAATAGTCATAATTATTTGAACGTGTTCA-AAAATCATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* ** *
140062 AATTTTT-AGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTACATGAAC-AGAAC
65 AATTTTTGA-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
* * ** *
140124 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGCCAT-ATTATTTTGAAATAGATAATTATTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * ** * *
140179 AAAT-GTCATAACTATTCAAACATGTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAATTCTCTTACTCATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * *
140243 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTCTATGAACTAAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * *
140307 TTG-TTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* *
140358 AAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGAAAAACATATTAGTATTATTTTTTAAACAGATTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-------C-----AGTA--A-------A-CAAATTTAT
* * * * *
140423 TTTTAAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAAT
44 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAAT
* * *
140487 AAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
108 AAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
140551 ATAATTGTTC
172 ATAATTGTTC
* * * * * * *
140561 AAATA-TCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAATAGATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
140624 ATCTTTGGAATATTAGTAAATCTA-TATTATTTTATTCGT-AATAAACTTGTATGCA-TAGAAAC
66 ATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTC-TAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
* * * * * *
140686 AATTGTTTTATGGCAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGACAATTGTTT
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
140740 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *** * * * *
140805 ATTTTTGAAATAGTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCCATGTGAATTGATACAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
** * * *
140870 TGTTTTATGATGAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
131 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** *** *
140921 AAATAG-CTATTACTATTTGAACTTATTTTGTAAATGTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * *
140985 AATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGA-TCAAAATAAACTAGTATGAACAAAAATA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * *
141049 ATTGTTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * ** * * * * **
141102 AAATAATCATAACTGTTTGAAATTATTTGGTAAACAGATTCAAATAGGCTTGTATGAA--TAGTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATT----TA---TTTTTTAAATCTCTTA
*** * * * ** *
141165 AAAATT-ATTTTATGATAATACAAAAGGTT-ATAGCAATTTGAAATAGATAATTACTCAAAT-AG
59 CTTATTAATTTT-TGA-AAT-----A--TTAATA--AATTAGTATTATTTTATT-CT-AAATAAG
* * **** * * *** * ** * **
141227 CCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACTGTTTCTTTTTTTAAATC----TCTTATTAA-TTTT
111 -C-T---TGTATGAACTAAAAC----AATTG-TT-TTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATT
141287 TGGAATATTA-ATAAATTATGATT-
164 T-GAA-A-TAGAT-AA-T-TG-TTC
* * * * * * * * **
141310 ATATTATTCCA-AA-TAATT----TTGTATGAATAAAAACAATTGT-TTTGTGATAAAACT-AAA
1 A-AATAGT-CATAACTATTTGAACTTGT-TCAGTAAACA-AATT-TATTT-T-TTAAATCTCTTA
* * ** * * *** * * * * *
141367 GGTCA-TAATGATTCAAA-A-T-ATATAATT-GT-TCA-AACAATC-ATAAT-TGTTTGCATTGG
59 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTA-TGA
* *** ** * * * * ** * * * ** **
141423 TC-AGGCCAACAGATATATGTTCTAAATTCATTA-CTTATTA--ATTT-TTATA-AT-ATTAAT-
120 ACTAAAACAATTGTTTTATG-AC-AAA-ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * **
141480 AAATTAG-CATTACTTTATTTCAAATAAGACTAT-ATGAATGAAAC-AA-TTATTTTATAATAAA
1 AAA-TAGTCATAAC--TATTTGAACT-TG--T-TCA-G--T-AAACAAATTTATTTTTTAA-ATC
* ** *** * * * * *
141541 ACAAAAGGACTTAATGATTTGAAATA--AAT-AATT-GT-TCAAATAGTTATAACTAATTGAA-C
54 TCTTACTTA-TTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT--TAT-TTTAT-TCTAAAT-AAGC
* * * *** * ** * ** *
141600 TGGTTTG-GC--AAACAGATT-TATTT-TTTTAAATC----TCTTATTAA-TTTTTGAAATATTA
112 TTGTATGAACTAAAACA-ATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATA--G
* *
141655 ATAAATTACTATT
172 AT-AATT-GT-TC
** * * * * * ** * **** *
141668 ATTTTATTCAAAAC-A----AACTT-AT-ATGAAAAAAAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAAGT
1 A-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAAATT-TATTT-T-TTAAATCTCTTACT
** * ** *** * * * **
141725 TAACAATGATTTGAAATAGATAGTTGTCCGTGTAGTCATAATTTT-TT-GAAAT-AG-TTCTACA
61 TATTAAT-TTTTGAAAT--AT--TAATAAAT-TAGT-ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATG
* * * ** *
141786 AAC-ATAAATAATTGTTTTATGACAAAAGC-AAAGGTTATAACAATTTGAAATCTATAATTGTTT
119 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
141849 AAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTC-GTTAAACATATTTATTTTTTAAATCACCTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * *
141913 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAGGCTTTTATG-A-TGAATAAC
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AA-AAC
* * *
141976 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTT
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * ** * **
142030 AAATGGCCATAATTATTTCAA-TTGATT-TGATAAACTGATTTA-TTTTTATATCTCCAACTCT-
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TA
** * ** ** * * *
142091 TTGAACATGTTCAGAAA-A-TAGATTTAATTTTTAAAATTTTA--CTAATTAA-TTTTTA-GAA-
63 TT--A-AT-TTTTGAAATATTA-A-TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * ** * *
142149 TATTAAGAAAATTAAATTATT-TGATTC-GAA-ATAA-G-C-TTGC-A--TGAACA-AAACCAAT
122 TA--AA-ACAATT--GTT-TTATGA--CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGA-TAAT
*
142204 TGTTTT
177 TG-TTC
* * * * * * * * * *
142210 ATGATAGAACAAAACCAATTG---TT-TT-ATGATAAAACAAAATGTCATAATGTT---T-TGTG
1 A-AATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCA-G-T-AAAC-AAAT-TTAT-TTTTTAAATCTCTT
* * * * ** * * ** * *
142266 AC--AGTTAATTGTTCAAATAGTCAT-AATTA-T-TTGAACTTATTTGATAAACAATTTTTTTTT
58 ACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTA-TT-CTAAATAA-GCTTGTAT
* *** * * * ** * * ** * ** *
142326 TAATTCTCTTACTCATTAATTTT-TAGA-ATATTAATAA-ATTAGT-ATTATTTTACTTTAAATA
118 GAA--CTAAAAC-AATT-GTTTTAT-GACAAAACAA-AAGGTCA-TAACGATTTGA-AATAGATA
142387 A--GCTTC
175 ATTG-TTC
* * * * * ** * * * * ***
142393 -TAT-GAACTAAAACCAATT-ATTTTATT-A-CAAACGAAATGGTCATAATAATTTGAAAT-AGA
1 AAATAG-TC-ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-AAAT--T--T-AT-TTTTTAAATCTCT
* * * * * * ** *
142452 TAATTATTCAAATAGTTATG-ACTATTCA-AACTT-GTTCATTAAACATATTTATTTTTTA-AAT
57 TACTTATT--AAT--TTTTGAAATATTAATAAATTAG-T-ATT----AT-TTTATTCTAAATAAG
* ** ** * * *** **
142513 CTT-T-T--ACT-TATTAATTGTCAAAATATTA-ATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAAA
111 CTTGTATGAACTAAAACAATTGT---TTTATGACA-AAA-CAA-AAGGTCATAA--CG-AT----
* * *
142572 TTGTATGAACAGAACAATTGTTTTT
163 TTG-A--AATAG-ATAATTG--TTC
** ** * * *** * ** * *** * * *
142597 TGATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAACTTGTTCGGCAAACACATT-TATTTTTTAA-ATC-
1 AAAT-AGTC-ATAACT-ATTTGAACTTGTTC-AG-TAAAC-AA-A-TTTAT-TTTTTAAATCTCT
* * * ** * * ** *
142659 T-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACCCTGAATAAGCTTGTAT
57 TACTTA-TTA--ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT
* * * *
142723 GAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTCC
118 GAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * *
142786 AAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTTGGCAAACAAATTTAGTTTTGAAA--TC-T-CTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * **
142846 AATTTTTGGAATATTAATAAACTAATATCATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAAAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACA
** ** * * *
142910 ATTGTTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTT
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * * **
142963 GAATGGGCA-AGACTATTTGAACTTGTTTGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATT
1 AAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
143027 AAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTGAATAAAG-TTATATGAA-TAAAAA
65 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT-AAGCTTGTATGAACT-AAAA
* * * * * *
143089 CAATTGTTTTATGACAAAACAAACGATCCTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTT
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *** * *
143144 AAATAGTTATAATTATTTGAACTCGCTC-GATAAATGGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
143208 AATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTTTATGCA-TAGAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACA
* * * *
143272 ATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATACATAATTGTTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * * *
143325 AAATAGTCATAAATACTTGATCGTGCTCAGAAAATATATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
143389 ATTTTTGAAATATTAAGAAATTTA-AATTATTTTATT-TGAAATAAACTTGGATGAAC-AGAACC
66 ATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
* * * * * * *
143451 AATTGCTTTATGACAAAACCAAATGTCATAATGTTTTGAAATAAATAATTATTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
143505 AAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGA-TTCTTTTTTAATTTTGTTACTCATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * *
143569 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * *
143633 TTG-TTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTGATAATTATTC
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
143684 AAATAGTCATGACTCTTTGAACTTGTTC-GATAAACATATTTATTTTTTGAAATCTTTTACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTAT
* * * * *
143748 TAATTATTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAAC
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
* * * * **
143812 AATTGTTTTATGTCAAAATAAAAAGTCATAAC---------TAGTTAATTACTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** *
143857 AAATAGTCATAACAAGTTAAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCT-TGTACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCT-TACTTAT
* * * *
143921 TAACTACTTT--AATATTAATGAATTTGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTGTGAA-TAGA
64 TAA-T-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTA-A
* * * * * * *
143982 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAA-TGTTA
125 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
144038 AAACAGTCATAATTATTTAAACATGTTAAATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTA-TTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATT
* * * * *
144101 AATTTTT-AGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACA
65 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * *
144165 ATTCTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * *
144218 AAATAGTCATAATTACTTGATCTACTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATT
** * * *
144282 AATTGCCT-AAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAAT-AGCTTGTATGGA-TAGAAA
65 AATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
* ** * * * * * * *
144343 CAATTATTTTAAAATAGAACAAAAAGTGAAAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTC
* * * * * *
144398 GAATAGTCATAACTATTTGAAATAGTT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* ** * * * *
144458 AATTTTTGAAATA-TAATAGATTAGTATTACCTTATTCTAAACAAACTTATATGAAC-AAAAAAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* *
144521 TTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGCT-
130 -TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
144573 ACAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-AGATAAACATAA-TTATTTTTTAAATCTCCTACTTA
1 A-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * *
144636 TTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCAAA
63 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTT-GTATGAACT-AAA
* ** * * *
144700 AAAACTTACTTTATGAGAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATCATTGTTC
126 ACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
144757 ATAT-GTCTTAAATATTTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTACTTTTTAATTCTCTTAGTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
144821 ATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTTTTATTTTATTCTAAGTAAGCTTGTATGAA-TAAAAATAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAA
* * * * * * ** *
144885 TTGTTTTATGATAGAACAATAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTC
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
144937 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTC-GTAAACAAATTTATTTTTCAAATCGCTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * ** *
145001 AATTTTTGAAAGATTAATAAATTA-TCATTGTTTTATTCTGAATAAGGTTGAATGTTCAAAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * *
145065 ATTGTTTTATGACCAAACAAAAGGTAATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTGTTG
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * * * * * * *
145118 ATAGAACCATAATTATTTGAGC-CGATTCAGTAAATAAATTCACTTTTTAAATCAC-T--TTA-T
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
145178 ACTTTTTGAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTC-GAATAAGGTTGTATGAACTAAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * * *
145242 ATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATACATAGTTGTTT
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * * ** * * * * * *
145295 ATGTAGTCTTAATTATTTAAACTACTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTATATCTCTCAGTTATTG
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * *
145360 ATTTTTGGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTATATGAACTGAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT-AAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * * *
145425 TTAG-TTTA--ATAGAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTC
130 TT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
145475 AAATAG---GAGCTAGTT---C--G---A-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATT
* *
145527 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATG-A-TGAAAAGC
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAA-C
** * * * * **
145590 AATTGTTTTATGATGAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAAAACATAATTGCCC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * ** * ** *
145644 AAAATGGGCATAATTATTT-AGGC-TGATTCAATAAACTCACTTGCTTTTTAAATCTCTAACTTA
1 -AAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * * * *
145707 TCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATT-TCCAATAAGCTTTTATGAATTGAAA
63 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAA
* * * *** * *
145771 CAATTGTTTTATGATAAAATAGAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTATTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * * * **
145826 ATATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATTTCTTGTTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * *
145891 ATTTTTTG-AATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATT-TCAAACAAGCATGTATGAACTAAAACA
66 A-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * * *
145954 ATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATTGATAATTATTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
146007 TAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATGTCTTACTTAGTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * ** *
146072 ATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGTAATATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
66 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * * *
146136 TTGTTTTAAGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAGTTGTTT
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
146187 AAATAGTCATAATTATTTG-AGTTAGTTC-GATAAACAGATTCAGTTTTTAAA--TC-T-CTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * ** *
146246 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTATATGAA-TAGAAAC
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAC
** * *
146310 AATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTATTTATGAC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA--T-TGT-T--C
* *
146370 AAAATAAAGGGTCATAA-TGATTTGAAATGGATAATTGTTCGAATAGTCAAAC-TATTTGACCAT
1 -AAAT--A--GTCATAACT-A-TT----T-GA-ACTTGTTC----AGT-AAACAAATTT----AT
** * * * * * * ** *
146433 GTTTAGAAAATATATTTAATTTTTAAATTTTTACTTATGAATTTTAGGAATATTAGAAATTTTAT
44 -TTT-TTAAATCT-CTTACTTATT-AA-TTTT--TGA--AATATTAATAA-ATTAG---TATTAT
* * * *
146498 ATTATTTTATT-TGAAATAAGCTCGCATGAAC-AGAACCAATTGTTTTATGACAAAACATAAGGT
96 -----TTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * *
146561 TATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTC
154 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * * * * * **
146589 AGTTAGTCATAACTATTTG-AGTATGTTCAATAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACACATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
146653 AATTTTTGGAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTCTT-TCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACA
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* * * * *
146716 ATTGTTTTATTACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTG-AATAAATAATTAG-TC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTC
* * *
146768 AAATAGTCA-AGACTATTTGAATTTGTTCCA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
1 AAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTT-CAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
** ** * * * *
146831 TAATCGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTGT-AA-AAAAACA
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* * * * *
146894 ATTGTTTTATGACTAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAGTTGTTT
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * * * * *
146947 AAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTT-GGATTAATATATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * **
147011 AATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGCTTACATGAA-TAGAAA
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* ** * * * * * *
147073 AAAAATCATTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATACCGATTTCAATTAGATAATTGTTT
125 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * ** * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTAT
* * * * * * * *
147193 TAATTTTGGCAATATTAATAAATTAGAATTATGTTGTTCTGAATAAGCTTGTA-CAAATAGAAAC
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* * * *
147257 AATTATCTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *** * * *
147311 AAACTA-TCATAATTATTTGCA-TTGGTCATGGT-AATGGATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTC
1 AAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA--GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * *
147373 TTAATTTTT-AGAATACTAAT-AATTAGGATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TATATCAA-TAGA
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* * * *
147434 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAATAGG-AATAATGGTTTGAAATAAATAATTGTTC
125 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
147491 AAATTA-TTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAAGAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATT
1 AAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** * * ** ** *
147551 AATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCAAACAAAATTAAATGAACAAAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * ** * * * *
147615 TTTGCTCTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTAAAATAGATAATTATTC
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * * *
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66 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACA
* * * ** * * *
147796 ATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATAATTTGAAATATATAATTATTT
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTAT
* * * * ***
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* * ** *
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128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * **
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* * * * ** * *
148090 TCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACTGAAGA
64 T-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAA
* * * * * *
148155 CATTTGTTTTATTATAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * * * * ** * * *
148210 AAATAAACTTGACTATTTGAATTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTT-GTTTTAATTTCTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATT
* * * * *
148274 AATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATT-TCAGATAAGCATGTATGAATTGAAA
65 AA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAA
* * * * *
148336 CAATTATTTTATGACTAAAC-AAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * *
148390 TAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * ** * *
148454 ATTTTAG-AAT-TTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
148515 AGATCATAAC
Statistics
Matches: 9642, Mismatches: 2378, Indels: 1653
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
165 1 0.00
166 5 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
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ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
Found at i:136793 original size:539 final size:536
Alignment explanation
Indices: 135490--141141 Score: 3040
Period size: 539 Copynumber: 10.4 Consensus size: 536
135480 TATGAACTGA
* * * *
135490 AAATAGTCATAATTATTTGAATTTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTAT
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* * ***
135553 TAGTTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTAATTTGGATAAGCTT-TGATGAACTAAAAC
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* * * * * * *
135617 AATTCTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATA
128 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
135682 AATATTAGAACTTATTCAATAAACAG-TTTATTTTTTCAAATTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAA
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* * * * * * * *
135746 TG-TTAATAAATTTGGATTTTTTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTAT
256 -GATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTATTTTAT
* * * * * * **
135809 GACTAAACAAAAGGCTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAATTTTAACTATTTGAA-
319 GACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTGAAC
* * * *
135873 TTGGTT-TGACAAACATATTTATTTTTTAAATATCTTATTAATCTTTGGAATATTATTAAATTAG
384 TT-GTTCAG-CAAACATATTTATTTTTTAAATATCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
135937 TATTATTTTTAATC-AAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAATAAAGGTT
447 TATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTATATGATT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTC
* * ** *
136001 TTAATGATTTGAGAT-TGATAATTGTTT
510 ATAACGATTTGA-ATAAAATAATTGTTC
* ** * *
136028 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTATTAGTTAAATTTGTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * *
136093 ATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGATC-ACAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAA
* * * ** ** *
136157 TTGTTTTTTTGACAAAACAAAAGATCAAAATAATTTGAAATTGATAATCATTCAAAT-GACCATA
130 TT-ATTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATA
* * * *
136221 ATTATTTTAACTAATTCAGTAAACA-AGTTTATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAA-TTTAGGAA
193 ACTATTTGAACTGATTCAGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTA-G-A
* * ** * *
136284 AGAATAATAAATTAGCATTATTTTATTTCTTTTAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTTTTTTATG
255 AGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATG
* * * * * * *
136349 AC-AAATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTAAAATAATAATAACTATTTAAAC
320 ACAAAAT-AAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTGAAC
* ** * *
136413 TTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAATTT
384 TTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAA----TATCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* **
136478 AGTATTAATTTATTCTAAATAAGC-T-TATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACTTAACAAAAGG
445 AGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATG-ATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-G
* * *
136541 TCAGAATGATTTGAATAAAAT-ATTATTC
508 TCATAACGATTTGAATAAAATAATTGTTC
* * * * *
136569 TAATAGTC-TGAACCATTTGAATTGATTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATC
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* * * *
136633 AATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTGTAATTCAAATAATCTTGTACGAAC-AAAACAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * * * *
136697 TTATTTTATGACAAAAGAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAC
130 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * ** ** * ** * *
136762 TATATGAATTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTGTTAGAATAT
195 TATTTGAACTGATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA-TTTTAGAAGAT
* * ** * * ** * * *
136827 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAGTATTAACGGAACCAATTGTTTGATGACAA
259 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAA
* * * ** * *
136892 AATGAAAGTTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCAA-AACTATTT-TACTTTT
324 AATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT-AATAACTATTTGAACTTGT
* * * *
136955 TAAATTG-AAAGCAGATTTACTTTTTAAATCTCATATTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAAT
388 T-CA--GCAAA-CATATTTATTTTTTAAA--T-ATCTT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAAT
* * * * * ***
137018 TAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
444 TAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATA-TGATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* ** *
137083 TAATAACGATTTGAA-ATGGATTATTGTTC
508 TCATAACGATTTGAATA-AAATAATTGTTC
* * * * * * *
137112 AAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCAATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * ** * * * *
137177 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATTTTGAATAAGGTTGTATGAGCTGAAATAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
137368 CTACTAAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAGGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGAT
258 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAC
* * * *
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322 AAAATAAAA-GGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTGAACTT
* * * * * *
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386 GTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATATCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
137561 ATTTTATTTCCAAA-AAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATAAAAAAACAAAAGTCATA
451 ATTTTA-TTCTAAATAAGCTTATATGATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATA
* *
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513 ACGATTTGAATA-AAATAATTGTTC
*
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * ** * * *
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* * * * * * * * **
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129 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC---A
* * * *
137830 TTAATTATTTGAACT-AGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATTTT
191 -TAACTATTTGAACTGA-TTCA-GTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT
* * *
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252 AG-AAGATTAATAAATT-A-----G---------T--ATT-ATTTTA---T-TT-CTAATAAGCT
* * * ** * * ** * *
137957 AGTATGAATTCAAAAAAAAAACTTATTTTAAAATAAAACAAGTGGTCATAATGATTTGAAATAGA
293 TGTATGAA--C--TAAAACAA-TTATTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGA
* * * ** * * ** * * * *
138022 TAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTG-ATTTGGTTTGGCAAAGAAATTTATTTTTTAATTCTC
353 TAATTATTCAAATAATAATAACTATTTGAACTT-GTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATATC
* * * * * * * *
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* * * * * * * * ** *
138151 CAT-AAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTAAAACAATTTCAAGT-TTATAATTGCTC
477 -TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAA-TAAAATAATTGTTC
* ** * * * * * *
138212 AAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTTTAGTAAACAGATTTATCTTTTAAATATTTTA-TTTTT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * ** *
138275 AATTTTTGAAAGA-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGAATGTTC-AAATAAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAA-ACA
* * ** * * ** ** * * * *
138338 ATTGTTATATGATGAAGCAAAAGGT-AATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTGACATGGCCATA
129 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAA-AACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
138402 ATTATTTGAACTGATT-TGATAAACAAATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAAATTTTGGAA
193 ACTATTTGAACTGATTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATT-AATTTTAGAA
* * * * *
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256 GATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATG
* * * * * ** * * * * *** *
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320 ACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTGAACT
** * * * *
138590 TGCTTTGGTAAACAAATATATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATT
385 TG-TTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATATC----TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * * * * *
138655 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATGAACTAAAACAATTCTTTTATAATAGAATAATAAG
445 AGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATG-ATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAG
* * *
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* * *
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* * * ** * * ***
138803 ATTTTTGAAATATTAACAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAGGTTTGTATGATGAAAAACAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * * * * * * * * * *
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131 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *** * * * ** * *
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323 AAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * *
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* * * * * * *
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446 GTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTATATG-ATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-G
* * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * * **
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * ** * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * *
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* * ** * *
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* * ** ** * * **
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * *
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*
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* * * * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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** * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * **
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* * * * * *
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434 CAAATTAGTATTATT-TTATTTGAATAGCT-TTGTATGAATAAAACAATT-TTTTATAATAAAAC
* * * * * * * * * * *
136713 GAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATATGAA-TTGGTTT
496 AAAAT-GTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTT
* ** * * *** * * *
136777 GGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTGTTAGAATATTATTAAATTAGTATT
560 GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* ** ** * ** * * ** * *
136842 ATTTTATTTCGAATAAAATAGTATTAACGGAACCAATTGTTTGATGACAAAATGAAAGTTTATAA
624 ATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* *
136907 TGATTTGAAATAGATAATTATTC
689 TAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * **
136930 AAATTGTCAAAACTATTT-TACTTTTTAAATTGAAAGCAGATTTACTTTTTAAATCTCATA-TTG
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-CAGT-AAA-TAGATTTA-TTTTTAAATATTTTACTT-
* * * **
136993 ATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACA-AA-CT-TATATTAACA
60 ATTAATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA-ATAAGCTGT-T-TGAATT
* * * * *
137054 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAACGATTTGAAATGGATTATTGT-TCAAATA
120 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAATA
* * * * * * *
137117 GTTATAATTATTTGAACTGGTTCA-ATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTT
183 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * ** * * ** *
137181 TTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATTTTGAATAAGGTTGTATGAGCTGAAATAATTGTT
247 TTAAAATATTATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTATT
* * * * * * * * *
137246 TTATGACAAAACAAAA-ATCAAAAC-AATTTAAAATAAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTAT
311 TTATGACAAAACAAAAGA-CCATACGATTTTGAAAT-AGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTAT
** * * * *
137309 T-TGACCTGGTTCAGCAAACATATTCATTTTTTAAATCT-TAGCTATTAATTTTT-AGAATACT-
373 TCAAACAT-GTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAATCTCT---TATTAATTTTTGA-AATATTA
* * *
137370 ACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGC-TTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAG
433 AC-AAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATA-GCTTTGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTATAATAA
* * * * * * * *
137434 AATAAAAGGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-
493 AACAAAA-TGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGA
** * * * * * *
137498 TTCAACAAACAAAATT-TTTTTTAAA--TGT--CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTTGT
557 TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGT
** * * * * * *
137558 ATTATTTTATTTCCAAAAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATAAAAAAACAAAA-GTC
621 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
137621 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTC
685 ATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* *
137648 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAAATAAATTTATTTTT---TA----A---ATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTAAATATTTTACTTATTA
* * * **
137702 ATTTTT-GAAGTATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACA-AA-CT-TATATGAA-CAAAA
64 ATTTTTGGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA-ATAAGCTGT-T-TGAATTGAAA
* * * * *
137762 GCATTTGTTTAATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTTTTTAATAGTCA
124 -CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAA-TTTCTAAATAGTC-
* * * * * * *
137827 TAATTAATTATTTGAACTAGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATT
186 --A-TAACTATTTGAACTTGTTCA-GAAAATATATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* *
137890 TTTGAAATATTAATAAATTCATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATAAG
246 TTT---A-A--AAT--ATT-A---TT--AAT-TTAGT--ATT-ATTTTA---T-TT--GAATAAG
* *** ** ** * ** ** *
137955 C-TAGTATGAATTCAAAAAAAAAACTTATTTTAAAATAAAACAAGTGGTCATAATGA-TTTGAAA
287 CTTA-CATGAACAGAACC----AA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGACCAT-ACGATTTTGAAA
* * * * * ** ** ** * ** *
138018 TAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATT-TGATTTGGTTTGGCAAAGAAATTTATTTTTTAAT
345 TAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTCAAACAT-GTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAA
* ** * * *
138082 TCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTGTTATTTT-TTTCCAAGTAAAC-TTG
408 TCTCTTA-TTA--A-TTTTTGAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTT-GAA-T-AGCTTTG
* * * * * * * * * ** **
138145 TATGAACATAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTAAAACAATTTCAAGTTTATAATTGC
466 TATGAATA-AAACAATT-TTTTATAATAAAACAAAATGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTAT
* ** * * * * * *
138210 TCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-T-ATTTTAGTAAACAGATTTATCTTTTAAATATTTTA-TT
529 TCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTT
* * * ** *
138272 TTTAATTTTTGAA-AGATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGAATG-TTCA-AA
593 ATTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAAT-AGAA
* * ** * * * * *
138334 TAAAATTGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTG
656 -ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
138391 ACATGGCCATAATTATTTGAACTGATT-TGATAAACAAATTCACTTTTT-AA-A--TCACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCAG-TAAATAGATTTA-TTTTTAAATATTTTACTTATT
* * * * * *
138451 AAATTTTGGAATATTAATAAAGTAGTTTTATTTTATTTTG-AATAAGCATGTATGAACTGAAACA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGC-TGTTTGAATTGAAACA
* * * ** * * ***
138515 ATTATTTTATGACAAAACAATATGTCATAACA-ATTTGAAGCAAATAATTGT-TCATATAGTTGC
126 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAATAGTCAT
* ** * * * * * * *
138578 AACTATTTGAGC-TGCTTTGGTAAACAAATATATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTGAA
188 AACTATTTGAACTTG-TTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* * *
138642 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-CTATGAACTA-AAACAATTCTTTTA
252 ATATTATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTAC-ATGAAC-AGAACCAATTATTTTA
* * * * ** * * * *
138705 TAATAGAATAATAAG-TTATAACAATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAA--T-AGGAAC---T--
314 TGACAAAACAA-AAGACCAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATCTCA-TAACTATTCA
* **
138761 ---A-GTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAACA
376 AACATGTTCAG-CAAACAAATTCCTTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAACA
* * *
138821 AATTTGTATTATTTTATTTTGAATAGGTTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTGTAATAAAACA
436 AATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAGCTTTGTATGAAT--AAAACAATT-TTTTATAATAAAACA
* * * * * * * *
138885 AAA-GTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAGC-CGATTCG
497 AAATG-TCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTG
* * * * *
138948 ATAAACTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAGTGA-TATT-
561 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
139011 GTTTATTTTGAATATGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAT
625 TTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * *
139075 TTATTTTAAATAGATAATTGTTT
689 TAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * **
139098 AAATTGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAATTTCTTGTGTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATATTT-TACT-TAT
* * *
139163 TACTTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCATGTTTGAATTGAAA
62 TAATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGC-TGTTTGAATTGAAA
* * * * * * * * *
139226 AAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAAAAATTTGAAATAGATAACTATTCT-AATAATCT
124 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAA-T-TTCTAAATAGTCA
* * *
139290 TAACTATTTGAACTTGTTCAGCAAATACATTTATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTAAA
187 TAACTATTTGAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* * ** *
139355 ATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTTTAT-AAGCAGGAA-TAATTATTTTA
252 ATATTATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTACATGAA-CA-GAACCAATTATTTTA
* * * * * **
139418 TGACAAAA-TAAAGATCATAACGA-TTTGAGATAGATAATTGTT-AAATACTTATAACTATTTGA
314 TGACAAAACAAAAGACCAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTCAA
* * * * * * * *
139480 A-TTGGTT-TGATAAATAGATT-TTGTTTTTAAATCTCTTATTCATTTTTAAAATATTAACAAAT
377 ACAT-GTTCAG-CAAACAAATTCCT-TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAAT
* *
139542 TAGTATTATTTTATTCTGAATAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAT
439 TAGTATTATTTTATT-TGAATAGCTTTGTATGAATA-AAACAATT-TTTTATAATAAAACAAAAT
* *
139607 GTCAAAACTATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGCCTAATTT-AACTTG-TTTGATG
501 GTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATGGACATGACT-ATTTGAACTTGATTTGATA
* *
139669 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATAGTAATAAATTAGTATTATTT
564 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * *
139734 TATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATA-ATCATAATGA
628 TATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATAA
*
139798 TTTGAAATAAATAATTGTTC
692 TTTGAAATAGATAATTGTTC
* *
139818 AAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTT-AGTAAATGGATTTATTTTGTAAATATTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT--GTTCAGTAAATAGATTTATTTT-TAAATATTTTACTTATT
* * * * *
139882 AATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTTTATGAACTGAAGCAA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTGTT-TGAATTGAAACAA
* * * * *
139947 TTGGTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGCTTAAATAGTCATAAT
127 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTTC-TAAATAGTCATAAC
* * *
140012 TATTTGAACGTGTTCA-AAAATCATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATA
191 TATTTGAACTTGTTCAGAAAAT-ATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* ** * *
140075 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTGTTTTATGAT
255 TT-ATTAATTTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTTATGAC
* ** *
140139 AAAACAAAAGGCCATATTATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATGTCATAACTATTCAAACATGT
318 AAAACAAAAGACCATACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATCTCATAACTATTCAAACATGT
* * * *
140204 TCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAA
383 TCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGTA
* * * * * *
140269 TTATTTTATTTCAAATAAGC-TTCTATGAACTAAAACAATTGTTTATTACAAAACAAAATGTCAC
444 TTATTTTATTT-GAAT-AGCTTTGTATGAA-TAAAACAATTTTTTATAATAAAACAAAATGTCAA
* *
140333 AA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGAAAAACATAT
506 AACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAAC---TT-G------AT-T
* * * *
140397 TAGTATTATTTTTTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGGAATTTTAAT
559 T-G----A-----TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-GAATATTAAT
* *
140462 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACA
613 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
*
140527 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
678 AAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* *
140561 AAATA-TCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAATAGATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAATAGATTTATT-TTTAAATATTTTACTTATTA
* * * * * * *
140624 ATCTTTGGAATATTAGTAAATCTA-TATTATTTTATTCGTAATAAACTTGTATGCATAGAAACAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTCGAAATAAGC-TGTTTGAATTGAAACAA
* * * * * *
140688 TTGTTTTATGGCAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAAC
127 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATT-TCTAAATAGTCATAAC
* * * * * *
140753 TATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATAG
191 TATTTGAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
* * ** ** ** * **
140818 TAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCCATGTGAATTGATA-CAATTGTTTTATGATG
256 TATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTACATGAACAGA-ACCAATTATTTTATGACA
*** * * ** *
140882 AAACAAAAGGTAATAAC-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCT-ATTACTATTTGAACTT
319 AAACAAAAGACCAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT--CTCATAACTATTCAAACAT
* ** * *** ** * * *
140945 ATTTTGTAAATGTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAA
381 GTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAG
*** * * * * *
141010 TATTATTTTGATCAAAATAAAC-TAGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAA-AAAACAAAAAG
442 TATTATTTT-ATTTGAAT-AGCTTTGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTAT-AATAAAACAAAATG
* * * * * * * *
141073 TCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-AATCATAACTGTTTGAAATT-ATTTGGTAA
502 TCAAAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGA-CATGACTATTTGAACTTGATTTGATAA
* * * ** ** * * *
141135 ACAGATTCAAATAGGCTTGTATGAAT-AGTAA-AAATT-ATTTTATG-ATAAT-ACAAA--AG-G
565 ACAGATT----TA---TTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTA
*** * * * * * *** * ***
141192 TTATAGCAATTTGAA-ATAGATAATTACTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTA-A
622 TTATTTTATTTTGAATA-AGCT-TTTA-T-GAATAG--A-AAC-AATTGTTTTATG-ACAAAACA
** * * * ** * *
141254 ACTGTTTC-T--T-TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
678 AAAG-GTCATAATAATTTGAAA--T-AGA-TAATTGTTC
* * * * * * * * *** *
141289 GAATATTAATAA--ATTATGATTA-TATT-ATTCCAAATA-ATTT-TGTATGAATA-AAAAC-AA
1 AAATAGTCATAACTATT-TGA--ACTGTTCAGT--AAATAGATTTATTTTTAAATATTTTACTTA
* * * * * * ** * *
141346 TT--GTTTTGTG-ATA-AAACTAAA--GGTCA-TA-ATGATTCAAAATATATAAT-TGTTCAA-A
61 TTAATTTTTG-GAATATTAA-TAAATTAGT-ATTATTTTATTCGAAATA-A-GCTGT-TTGAATT
* * * * * * * *
141401 CAATCATAATTGTTTGCATTGGTCAGGCCAACAGATATATGTTC-TAAATTCATTACTTATTAAT
120 GAA--ACAATTGTTT-TA-T-GACA---AAACA-A-A-A-GGTCATAAA--GATT--TGA--AA-
** * * * * * * *
141465 TTTTATAATATTAATAAATTAG-CATTACTTTATTTCAAATAAGACTAT-ATGAATGAA-ACAAT
166 -TAGATAAT-TT-CTAAA-TAGTCATAAC--TATTTGAACT-TG--T-TCA-GAA--AATATATT
* **** * * ** * *
141527 TATTTTATAATAAAACAAAAGGACTTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAA-ATAG--TTATA
218 TATTTT-T--TAAATC--TCTTACTTATTAATTT-TTA-AAAT-ATTATT-AATTTAGTATTAT-
** * * * ** * **** *
141589 ACTAATTGAACT--GGTT---TG-GCA-AA-CAGATTTATTTT-T-TTAAATC-TCTTA--TTA-
273 TTTATTTGAA-TAAGCTTACATGAACAGAACCA-A-TTATTTTATGACAAAACAAAAGACCATAC
* * * ** ** * * *
141640 -ATTTTTGAAATA-TTAATAAATT-ACTAT-T-AT-TTTATTCAAAACAAACTTATATGAAAAAA
335 GA-TTTTGAAATAGATAAT-TATTCA-AATCTCATAACTATTC-AAAC-ATGTT-CA-GCAAACA
* * * ** ** * ** **
141699 AATT-GTTTTATGACAAAACAAAAAGTTAACAATGATTTGAAATAGATAGTTGTC-CGTGTAGTC
393 AATTCCTTTT-T--TAAATC----TCTTATTAAT-TTTTG--A-A-ATA-TTAACAAAT-TAGT-
* * ** * * * * * *
141762 A-TAATTT-TTTGAAATAG--TTCTACAAACATAAATAATTGTTTTATGACAAAAGC-AAAGGTT
443 ATTATTTTATTTG-AATAGCTTTGTATGAATA-AAACAATT-TTTTATAATAAAA-CAAAATGTC
* * ** * * * * * * * * * *
141822 ATAACAATTTGAAATCTATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-TTCGTTAAACAT
504 AAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGATAAACAG
*
141886 ATTTATTTTTTAAATCACCT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
569 ATTTATTTTTTAAATC-TCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
*** * * *
141950 CAAAATAGGCTTTTATG-AT-GAATAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTT
632 TTGAATAAGCTTTTATGAATAG-A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTT
*
142013 GAAATAGATAATTGTTT
695 GAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * ***
142030 AAATGGCCATAATTATTTCAATTGATT-TGATAAACT-GATTTATTTTTATATCTCCAACTCT-T
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCAG-TAAA-TAGATTTATTTTTAAATATTTTACT-TAT
** * * *
142092 TGAACATGTTCAGAAAATAGATTTAATTTTTAAAATTTTACTAATTAATTTTTAGAATATTAAGA
62 T--A-AT-TTTTG-GAAT--A-TTAA----T-AAA--TTAGT-ATT-A--TTT----TATT-CG-
** * * ** **
142157 AAATTAAATTATTTG-ATTCGAAATAA--GCTTGCATGAACAAAACCAATTGTTTTATGATAGAA
102 AAA-TAAGCTGTTTGAATT-GAAACAATTG-TTTTATG-ACAAAA-C-A-------A--A-AGGT
* * *** ** * * * *
142219 CA-AAACCAATTGTTTTATGATAA-AACAAAAT-GTCATAATGTTTTGTGACAGTTAATTGTTCA
151 CATAAA-GATTTGAAATA-GATAATTTCTAAATAGTCATAA-CTATT-TG--A---ACTTGTTC-
* *
142281 AATAGTCATAATTATTTGAACTTATTTGATAAACAATTTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAAT
206 ---AG--A-AA--A--T--A--TA-TT--T-----A----TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * *
142346 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTTAAATAAGCTT-CTATGAACTAAAACCAAT
245 TTTTAAAATATTATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTAC-ATGAAC-AGAACCAAT
* * ** ** * * * *
142410 TATTTTATTAC-AAACGAAATGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGAC
307 TATTTTATGACAAAAC-AAAAGACCATACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAAC
* ** * ** * **
142474 TATTCAAACTTGTTCATTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATAT
370 TATTCAAACATGTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * *** * * *
142539 TAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAAATTGTATGAACAGAACAATTGTTT-T--T----
431 TAACAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAGCTTTGTATGAATAAAACAATTTTTTATAATAAAA
*
142597 -----TGAT-AAAAC-A----AAA-AG--------TC--AT----A--ACAATTTGAACTTG-TT
495 CAAAATG-TCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATT
* ** * * * ** * *
142633 CGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAA
559 TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTAT
*** * * *
142698 TATTTTACCCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATCATA
623 TATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * *
142762 ACGATTTGAGATAGATAATTGTCC
688 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * * * * * *
142786 AAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTTGGCAAACAAATTTAGTTTTGAA-A-TCT-CTTATTAA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAATATTTTACTTATTAA
* * * * ** * **
142848 TTTTTGGAATATTAATAAACTAATATCATTTTATTTTG-AATAATTTTGTATGAATAAAAACAAT
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAA-GCTGTTTGAATTGAAACAAT
** ** * * * * *
142912 TGTTTTACAACAAAACAAAATATCATAACA-AATTGAAATAGATAATTGTTTGAATGGGCA-AGA
128 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATT-TCTAAATAGTCATA-A
** ** * ** * *
142975 CTATTTGAACTTGTTTGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAAATTTTAGAATA
190 CTATTTGAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* * * * * * * *
143040 TTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTGAATAAAG-TTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAC
255 TTATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAAT-AAGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTTATGAC
* * * * * * * * **
143104 AAAACAAACGATCC-TAATGA-TTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAATTATTTGAAC-
318 AAAACAAAAGA-CCAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTCAAACA
* * *** ** * * *
143166 TCGCTC-GATAAATGGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAAT
380 T-GTTCAG-CAAACAAATTCCTTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAAT
* * * *
143230 TAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTT-TATGCATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAA
439 TAGTATTATTTTATT-TGAATA-GCTTTGTATGAATA-AAACAATT-TTTTATAATAAAACAAAA
* * * * * * * * * * * * * * **
143294 GGTCATAGCAATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATAAATACTTGATCGTGCTCAGA-AA
500 TGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGATAA
* * * * * * *
143358 ATATATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTTA-AATTATTT
565 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTT
* ** * * * * * **
143421 TA-TTTGAAATAAACTTGGATGAACAGAACCAATTGCTTTATGACAAAACCAAATGTCATAATGT
628 TATTTTG-AATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAA
* *
143485 TTTGAAATAAATAATTATTC
692 TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
143505 AAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAACAGATTCT-TTTTT-AATTTTGTTACTCATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAATAGATT-TATTTTTAAATATT-TTACTTATT
* *
143568 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTC-AAATAAGCT-TATATGAACTGAAAC
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTGT-T-TGAATTGAAAC
* * * *
143631 AATTG-TTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTGATAATTAT-TCAAATAGTCAT
125 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAATAGTCAT
* * * * * *
143694 GACTCTTTGAACTTGTTC-GATAAACATATTTATTTTTTGAAATCTTTTACTTATTAATTATTGA
188 AACTATTTGAACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * *** * ** * * *
143758 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
251 AATATTATTAATTTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTTAT
* * * * * * * *
143823 GTCAAAATAAAA-A--GT-C-A---T-AACTAGTTAATTACTCAAATAGTCATAACAAGTT-AAA
315 GACAAAACAAAAGACCATACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTA-TTCAAA
* ** * * ** * **
143878 CTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTGTACTTATTAACTACTTT--AATATTAATG
378 CATGTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTT-AAATC---T-CTTATTAA-T-TTTTGAAATATTAACA
* * * * *
143941 AATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGC-TTGTGTGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACA
436 AATTAGTATTATTTTATTTG-AAT-AGCTTTGTATGAATA-AAACAATT-TTTTATAATAAAACA
* * * * * * * * ** * * * * * **
144005 AAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAA-TGTTAAAACAGTCATAATTATTTAAACATG-TTAAA
497 AAATGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGA
* *
144068 TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTAGATTATTAATAAATTAGTATTA
562 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TAACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
144131 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTCTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAA
625 TTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* *
144195 TGATTTGAAATAGATAATTATTC
689 TAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
144218 AAATAGTCATAATTACTTGATCTACTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATATTT-TACTTATT
** * * * * * *
144282 AATTGCCT-AAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AAT-AGCTTGTATGGATAGAAAC
63 AATT-TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAAATAAGC-TGTTTGAATTGAAAC
* ** * * * * * * *
144344 AATTATTTTAAAATAGAACAAAAAGTGA-AAATGATTTGAAATAAATAATTGCTTGAATAGTCAT
125 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAA-GATTTGAAATAGATAATTTC-TAAATAGTCAT
* * * * *
144408 AACTATTTGAAATAGTT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAA
188 AACTATTTGAACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* ** * * * * ** *
144468 ATA-TAATAGA-TTAGTATTACCTTATTCTAAACAAACTTATATGAACA-AAAAAATTTGTTTTA
252 ATATTATTA-ATTTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTACATGAACAGAACCAA-TTATTTTA
* * * ** * * **
144530 TGACAAAACAAAAGGTCAAAACGA-TTTGAAATAGATAATTGCT-ACAATAGTCATAATTATTTG
314 TGACAAAACAAAA-GACCATACGATTTTGAAATAGATAATTATTCA-AAT-CTCATAACTATTCA
* * *
144593 AAC-TGGTT-AGATAAACATAATT-ATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATACTAA
376 AACAT-GTTCAG-CAAACA-AATTCCTTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * ** * * * * *
144655 TAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCAAAAAAACTTACTTTATGAGAA
434 CAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAT-AGCTTTGTATGAA-T-AAAACAA-TT-TTTTATAATAA
* ** * * * * * * * * *
144719 AACAAAAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATCATTGTTCATAT-GTCTTAAATATTTGAAC-TGGT
493 AACAAAATGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGAT
** * * * * * * * *
144782 TCAATAAACAAATTTACTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTT
558 TTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * * *
144847 TTATTTTATTCT-AAGTAAGCTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAATAGGTTA
622 TTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * ** *
144911 TAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTC
686 TAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ***
144937 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTC-GTAAACAAATTTATTTTTCAAATCGCTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTCAGTAAATAGATTTATTTTT-AAATATTTTACTTATT
* * * *
145001 AATTTTTGAAAGATTAATAAATTA-TCATTGTTTTATTCTG-AATAAG--G-TTGAATGTTCAAA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTC-GAAATAAGCTGTTTGAA--TT--GA
* * * *
145061 AACAATTGTTTTATGACCAAACAAAAGGTAATAACA-TTTTGAAATAGATAATTGT-T-GATAGA
122 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATT-TCTAAATAG-
* * * * * * * * * *
145123 ACCATAATTATTTGAGC-CGATTCAGTAAATAAATTCACTTTTTAAATCAC-T--TTA-TACTTT
184 -TCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * ** *
145183 TTGAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATAAGGTTGTATGAACTA-AAACAATTAT
247 TTAAAATATTATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTACATGAAC-AGAACCAATTAT
* * * * * * ** * * *
145247 TTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGA-TTTGAAATACATAGTTGTTTATGTAGTCTTAATTA
310 TTTATGACAAAACAAAA-GACCAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTA
* * * ** * * *
145310 TTTAAAC-TACTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTATATCTCTCAGTTATTGATTTTTGGAATATT
372 TTCAAACAT-GTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTA-A-ATCTC--TTATTAATTTTTGAAATATT
** * * * * ** *
145374 ATTAGATTAATATTATTTTATTCTGAATAAAGC-TTATATGAACTGAAACAATTAGTT-TAATAG
432 AACAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAT--AGCTTTGTATGAA-TAAAACAATTTTTTATAATAA
* * * * * *
145437 AATAAAAGGTTATAA-TGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGG--A-G-C----T--A---G
493 AACAAAATGTCAAAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GGACATGACTATTTGAACTTG
* *
145488 -TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
556 ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTA
*** * * **
145551 GTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATG-AT-GAAAAGCAATTGTTTTATGATGAAACAAAAG
619 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * **
145614 TTCATAATGATTTGAAAAACATAATTGCCC
682 GTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * ** * * *
145644 AAAATGGGCATAATTATTT-AGGCTGATTCAATAAACTCA-CTTGCTTTTTAAATCTCTAACTTA
1 -AAATAGTCATAACTATTTGA-ACTG-TTCAGTAAA-T-AGATTTATTTTTAAATATTTTACTTA
* * * * * * * *
145707 TCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTC-CAATAAGCTTTTATGAATTGAAA
61 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTGTT-TGAATTGAAA
* * * *** * *
145771 CAATTGTTTTATGATAAAATAGAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTAT-TCATATAGTCA
124 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAATAGTCA
* ** * * * * * ** **
145835 TAACTATTTAAACTTGTTTGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTGA
187 TAACTATTTGAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* * * * * * ** *
145900 ATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAACAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTAT
252 ATATTATTAATTTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTACATGAAC-AGAACCAATTATTTTAT
* * * * * * * * * **
145964 GACTAAACAAAAGGTCAAAAC-AATTTGAAATTGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA
315 GACAAAACAAAA-GACCATACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTCAAA
* * * * ** * **
146028 C-TAGTTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATGTCTTACTTAGTAATTTTT-AGAATATTATTAA
378 CAT-GTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGA-AATATTAACAA
* * ** * *
146091 TTTAGTAATATTTTACTCCGAATAAGC-TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTA-AGACAAAAC-
437 ATTAGTATTATTTTA-TTTGAAT-AGCTTTGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTATA-ATAAAACA
* * * * * * * * * * * *
146153 AAA-GATCATAACAATTTGAGATAGATAGTTGTTTAAATAGTCATAATTATTTG-AGTT-AGTTC
497 AAATG-TCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGA-TTT
* *
146215 GATAAACAGATTCAGTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
560 GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * ** *
146276 ATTTTGTTTTGAATAA-TTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATA
624 ATTTTATTTTGAATAAGCTTT-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** *
146340 ACGATTTGAAATAGATAATTTATTTATGAC
688 ATAATTTGAAATAGATAA--T-TGT-T--C
*
146370 AAAATAAAGGGTCATAA-TGATTTGAAATGGATAATTGTTCGAATAGTCAAACTATTTGACCATG
1 -AAAT--A--GTCATAACT-A-TT----T-G--AACTGTTC----AGT-AAA-TA---G---A--
* * * *
146434 TTTAGAAAATATATTTAATTTTTAAATTTTTACTTATGAATTTTAGGAATATTAGA-AATTTTA-
38 TTT-----AT-T-TTTAA-----ATA-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA-ATAA-ATTAG
* ** ** * * *
146497 TATTATTTTATTTGAAATAAGCTCGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACATAAGGTT
88 TATTATTTTATTCGAAATAAGCT-GTTTGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * ** *
146562 ATAATGTTTTGAAATAGATAATTGT-TCAGTTAGTCATAACTATTTG-AGTATGTTCA-ATAAAT
152 ATAAAGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGA-AAAT
* * * ** ** * * *
146624 AGATTCATTTTTTAATTCTCTTACACATTAATTTTTGGAATATTA-AAAATTAGTATTATTTTCT
213 ATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAATTTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * *
146688 TTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAATAAAAGGTCACA-ATGA-TT
278 TT-GAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GAC-CATACGATTT
* * * ** ** * * **
146751 TG-AATAAATAATTAGTCAAATAGTCA-AGACTATTTGAATTTGTTCCA-TAAACATATTTATTT
340 TGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATA-ACTATTCAAACATGTT-CAGCAAACAAATTCCTTT
** ** * * * *
146813 TTTAAATCTTTTACTTATTAATCGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAG
402 TTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAT-AG
* * * *
146878 CTTGTGTA--AA-AAAACAATTGTTTTATGACT-AAAC-AAATAGTCATAACAATTTGAAATAAA
461 CTT-TGTATGAATAAAACAATT-TTTTAT-AATAAAACAAAAT-GTCAAAACTATTTGAAATAGA
* * * * * * ** * * * * * *
146938 TAGTTGTTTAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTG-TTGGATTAATATATTTATTTTTCAAATCTT
522 TAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *** **
147002 TTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGCTTACATGA
587 TAACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGA
* ** * * *** * * *
147066 ATAGAAAAAAAATCATTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATACCGATTTCAATTAGATAATTGTTT
650 ATAG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * **
147130 AAATTGTCATAGCTATTTGAACTTGTTC-GATGAACAGATTCAGCTTTTAAATATTTGCCTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAG-TAAATAGATTTA-TTTTTAAATATTTTACTTATT
* * * *** *
147194 AA-TTTTGGCAATATTAATAAATTAGAATTATGTTGTTCTG-AATAAGCTTGTACAAATAGAAAC
63 AATTTTTGG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAATAAGC-TGTTTGAATTGAAAC
* * * *
147257 AATTATCTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAACTA-TCA
125 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAA-TAGTCA
* * * ** ** * * * *
147320 TAATTATTTGCA-TTGGTCATGGTAATGGATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTCTTAATTTTTAG
187 TAACTATTTGAACTTGTTCA-GAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * ** * * * * *
147384 AATACTAATAA-TTAGGATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAACAATTGTTTTA
251 AATATTATTAATTTAGTATTATTTTATT-TGAATAAG-CTTACATGAACAGAACCAATTATTTTA
* * * *
147447 TGACAAAACAAATAGGA--ATA--ATGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTATTATAACTAAT
314 TGACAAAACAAA-A-GACCATACGAT--TTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TCTCATAACT-AT
* * * * * ** ** *
147508 T-GAAC-TGGTTTAGTAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
373 TCAAACAT-GTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAACAA
* * * *** ** * * * *
147571 ATTAATATTATTTTATTTCAAACAAAATTAAATGAACAAAA-ACATTTGCTCTACAACAAAACAA
437 ATTAGTATTATTTTATTT-GAATAGCTTTGTATGAATAAAACA-ATTT--TTTATAATAAAACAA
* * * * * * * * * * * * **
147635 AAGGTCATAACAACTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCCTAACTATTTGAA-GTGGTTTGGC
498 AATGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGAT
* * * * *
147699 ATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTAATTTTCAT-AATATTATTATATTAGTATTAT
563 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTT--TGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
147763 TTTATTATGAATAAGCTTGTATTAACATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATA
626 TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA
* * *
147828 ATTTGAAATATATAATTATTT
691 ATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
147849 AAATTGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTAAATCTTCTACTCATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAATAGATTTATTTT-TAAATATTTTACTTATTA
* * * *
147914 ATTTTTGAAATACT-A-AAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAGGCTTTTATG-A-TGAAAAAC
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTGTT-TGAATTG--AAAC
* * ** * * *
147974 AATTGTTTTACGACAAATCAAAAATTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGCCAT
125 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAATAGTCAT
* ** *
148038 AATTATTTGAA-TTGATTC-GATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCAAACTT-TTCAAATTTT
188 AACTATTTGAACTTG-TTCAGA-AAA-TATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTT
* * ** * * ** * * * *
148099 GAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACTGAAGACATTTGTTT
249 AAAATATTATTAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTACATGAACAGAA-CCAATTATTT
* * * * * ** * *
148164 TATTATAAAACAAAATG-TCATAATGATTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAAACTTGACTATT
312 TATGACAAAACAAAA-GACCAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATT
** ** * ** ** * * *
148227 TGAATTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTGTTTTAATTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAA
374 CAAACATGTTCAGCAAACAAA--T-TCCTTT-TTTAAATCTCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
* * * * *
148291 TAGAA-TAGTATTATTTTATTTCAGATAAGC-ATGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACT-A
434 CA-AATTAGTATTATTTTATTTGA-AT-AGCTTTGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTAT-AATAA
* * * * * * * * * * *
148353 AAC-AAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG-T
493 AACAAAATGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGAT
** * * * * * ** * *
148416 TTGGCAAATACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAT-TTATTAGTTTAGCAA
558 TTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTAT
* ** *
148479 TATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAA-------A-G----------A--TCATA
623 TATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * *
148523 ACGACTTGAGATAGATAATTATTT
688 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
148547 AAATAGTTATAACTATTTGAA-TAGGTCTAGTAAACATATTTAGTTTTT-AA-A-TCT-CTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTC-AGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATATTTTACTTATT
* * ** * **
148607 AATTTTT-GAA-A-TACTAAACTAGTATTATTTTATTCTG-AATAATTTTGTATGAATAAAAACA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAATAA-GCTGTTTGAATTGAAACA
* * * *
148668 ATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAACA-ATTTGAAATAAATAATTGT-TCAAATAGTCAT
126 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATAGATAATT-TCT-AAATAGTCAT
* * * * * *
148731 AACTATTTGAATTTATTC-GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAA
188 AACTATTTGAACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* * * * * * *
148795 ATATTAATAA---A-T-TTATTTGA---AAATAAGCTTGCATCAAGAGAACCAATTGTTTTATGA
252 ATATTATTAATTTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTTATGA
* ** * * * * * *
148852 CAAAAAAAAAGGTCATTATG-TTTTGAAATAGATAATTTTTTAGATAGTCATAACTA-TCTGAAC
317 CAAAACAAAAGACCA-TACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTC-AAAC
* * * * * * * * *
148915 TTATTCGGTAAATAGATT-CTTCTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAA
379 ATGTTCAGCAAACAAATTCCTT-TTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGA-AATATTAACAAA
* ** * * * * * * *
148978 TTAGTATTATTTTACATCAAACAAAC-TTATATGAACTGAAACAATTATTTTATTACAAAA-GAA
438 TTAGTATTATTTTA-TTTGAA-TAGCTTTGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTATAATAAAACAAA
* * *
149041 ATGGTCAAAA-TAATTTGAAATAGATAATTACTT-AAAT-CATCATGACTATTTGAAC-TGGTTC
499 AT-GTCAAAACT-ATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATGGA-CATGACTATTTGAACTTGATTT
* * * * *** *
149102 AATAAACATATTTATTTTTT-AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATT
560 GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * *
149166 ATTTTAATTCAAATATGCTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA
624 ATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * **
149231 CAATTTAAAATAAATAATTACTC
689 TAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
149254 AAACAGTCATAAATATTTGAA-T-TT-ATTTGATATAAGATTTATTTTTTAA-A-TCT-CTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCA-GT-AAAT-AGATTTATTTTTAAATATTTTACTTATT
* * * * * * ***
149313 AATTTTT-TACATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAACAAACT-TATATGAAGAAAAAC
63 AATTTTTGGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTGT-T-TGAATTGAAAC
* * * * * * * *
149376 ATTTGTTTTACGACAAAGCAAATGGTCATAACA-ATTT-AAATTGGACAATTATTCATACA-A-C
125 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAA-TAGATAA-T-TTC-TAAATAGT
* * * ** * ** * * *
149437 CTTAATTATTTGAACTAGTTTGGCAACCAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTCA
185 CATAACTATTTGAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* ** * ** *
149502 TAATATTATTAGA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTT
250 AAATATTATTA-ATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTT
* ** * * * * * * *
149566 ATGATAAAAC-AAAG-CTTTTAATGA-TTTCAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT
313 ATGACAAAACAAAAGAC-CAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTC
* * * * * *
149628 GAA-TTGGTT-TGATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCTATTCCTTAATTTTTGAAATA-TAA
375 AAACAT-GTTCAG-CAAACAAATTCCTTTTTTAAATCT-C--TT-ATTAATTTTTGAAATATTAA
* * ** * * * *
149690 AAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAGGC-TTATA-CAATGAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
434 CAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATA-GCTTTGTATGAAT-AAAACAATT-TTTTATAATAAAA
* * * * * * *
149753 TAAAA-GTTCATAA-TGATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGAT
495 CAAAATG-TCAAAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGAT
* * * * * * * *
149815 TCGATAAACTGATTTATTTTTAAAATCACCAACTTCTTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATA
558 TTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
149880 ATATTTTATTTT-CATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTGTTATAAAACAAAAGGCCA
622 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* *
149943 TAATGATTTTAAATAGATAATTGTTC
686 TAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
149969 AAATAGACTTGACTATTTGAATTTGTTCATTAAATAGATTTATTTTT---TA----A---ATT--
1 AAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAATATTTTACTTATTAA
* * * * * * *
150022 TTTTT-G---CTTATTAAA-TAGTATTATTTTATTTTG-GATAAGCATGTATGAACTAAAACAAT
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGC-TGTTTGAATTGAAACAAT
* * * * *
150081 TATTTTATGACTAAATAAAAGGTCA-AAACAATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAA
128 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAA-GATTTGAAATAGATAA-T-TTCTAAATAGTCATAA
* ** * * * * *
150144 CTATTTGAA-TTATTTTGGCAAATACATTCATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAAT
190 CTATTTGAACTT-GTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * *** ** * * *
150207 ATTATTAGTTTTGCTA-TATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
254 ATTATTAATTTAG-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTTATGA
* * * * **
150271 CAAAA-AAAAGATCATAATGA-TTT-AAGATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTGAAC
317 CAAAACAAAAGACCAT-ACGATTTTGAA-ATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTCAAAC
* * * * **** * *
150333 -TAGTCCA-AAAATAGATTTAGCTTTTAAATCTTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
379 AT-GTTCAGCAAACAAATTCCTTTTTTAAATC-TCTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAG
* ** * * * ** * *
150396 TATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAATAAATAAAATAATTGTTTTACGACAAAACACAATGTCA
442 TATTATTTTATT-TGAATAGCTTTGTATGAATAAAACAATT-TTTTATAATAAAACAAAATGTCA
* * * * * * * ** * *
150461 TAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-ACATTCGGTAAACAGA
505 AAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGATAAACAGA
* *
150525 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TT
570 TTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * **
150588 TGAAATTAGCTTTCATCAACAGAAGCAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATTATGTTTTGA
633 TG-AATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGA
* *
150653 AATCAG-TAATTATTT
697 AAT-AGATAATTGTTC
* * *
150668 AGATAGTCATAACTATTTGAACTTTTCAATAAAT--A--TA---TT--A-A-TTT-C----T-A-
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAATATTTTACTTATTAAT
* * *
150715 -----GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATC-AAATAAGCT-TATATGAACTGACACAAT
66 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTGT-T-TGAATTGAAACAAT
* * *
150773 TGTTTTATTATCAAAGA-AAAA-GTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCATG
128 TGTTTTATGA-CAAA-ACAAAAGGTCATAAA-GATTTGAAATAGATAATTTCT-AAATAGTCATA
* * * * * *
150835 ACTATTAGAACTTGTT-TGAGAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTGAAA
189 ACTATTTGAACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAA
* * * * *** * * * * *
150898 TATTAATAAATTAATTTTATTTTAATCCAAATATA-CTTTCATGAACAGAAGCTATTGTTTTATA
253 TATTATTAATTTAGTATTATTTT-ATTTGAATA-AGCTTACATGAACAGAACCAATTATTTTATG
** * * * * ** * **
150962 ACGTAACAAAAAATCATAAC-AATTTGAAATAAATAATTGCTC-AATAGTCATAACTGCT-AGAA
316 ACAAAACAAAAGACCAT-ACGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-CTCATAACTATTCA-AA
** * * * ** ** *
151024 -ATGTTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAG
378 CATGTTCAG-CAAACAAATTCCTTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAG
* * * * * *
151088 TATTATTTTATTCCGAATAAGC-TAGTACGAATTGAAAA-AACTGTTTTATGACAAAACAAAA-G
442 TATTATTTTATT-TGAAT-AGCTTTGTATGAA-T-AAAACAA-TTTTTTATAATAAAACAAAATG
*** * * * * * * *
151150 ATTGTAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATCATTTG-A-TTCGGTTAGGT
502 -TCAAAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACT-ATTTGAACTT-GATTTGAT
* * *
151211 AAATAGAATTATTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTAT
563 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTAT
* * ** * * *
151271 TTAATTCAT-AATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
626 TTTATT-TTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
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ATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
CTAACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA
TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
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140210 AACAAATTCC
* *
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* * **
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* *
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196 CAGATTTA
* * * * *
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* *
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*
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140594 TAGATTTATT
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AAGCTTCTATGAACTAAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATAGAT
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CAGATTTA
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140857 GAATTGATAC
* * * *
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**
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* *
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** *
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** *
141127 TTTGGTAAACAGATTCAAATAGGCTTGTATGAATAGTAAA
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* *
141167 AATTATTTTATGAT-AATACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGCCAT
1 AATTATTTTATGATGAA-ACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGCCAT
* * *
141231 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACTGT-TTCT-TTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTTGGAA
65 AACTATTTGAACTTATTCGGTAAA-TGTATT-TATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTCTTGAAA
* ** * * *
141292 TATTAATAAATT-ATGATTATATT-ATTCCAAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTGT
128 TATTAATAAATTAAT-ATTATATTGA-TCAAAATAAACTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
141355 GATAAAACTAAAGGTCATAATGATTCAAAATATATAATTGTTCAAACAATCATAATTGTTTG
191 GAAAAAACAAAAAGTCATAATGATTCAAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTGTTTG
141417 CATTGGTCAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGCCATA
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TAATAAATTAATATTATATTGATCAAAATAAACTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAAAA
AACAAAAAGTCATAATGATTCAAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTGTTTGAAATTATC
AGGCAAACAGATTCAAATAGGCTTGTATGAATAGTAAA
Found at i:142225 original size:25 final size:25
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142181 AAGCTTGCAT
142191 GAACAAAACCAATTGTTTTATGATA
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1 GAACAAAACCAATTGTTTTATGATA
*
142241 AAACAAAA
1 GAACAAAA
142249 TGTCATAATG
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GAACAAAACCAATTGTTTTATGATA
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142482 CTTGTTCATT
* * * *
142492 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACAATATT
* * * *
142557 TTAATTCGAATAAAATTGTATGAACAGAACAATTGTTTTTTGATAAAACAAAAAGTCATAACAAT
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142622 TTGAACTTGTTCGGC
131 TTGAACTTGTTCGGC
* * * * ** *
142637 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATT
1 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACAATATT
* ** * * *
142702 TT-ACCCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGA-TCATAACG
66 TTAACTC-GAATAAAATTGTATGAACAG-AACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACA
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129 ATTTGA
142771 GATAGATAAT
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 21, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
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AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACAATATT
TTAACTCGAATAAAATTGTATGAACAGAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAAT
TTGAACTTGTTCGGC
Found at i:143508 original size:180 final size:180
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Indices: 142622--150691 Score: 3534
Period size: 181 Copynumber: 45.0 Consensus size: 180
142612 TCATAACAAT
* * * * *
142622 TTGAACTTGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* ** * * ** * *
142686 TTAGTTTAGCAATATTTTACCCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAA
65 ATAAATTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * *
142750 AC-AAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTCCAAATAGTCATAACTAT
128 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* ** * * * * *
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1 TTGAACTT-GCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * * **
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* ** ** * * *** *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * *
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1 TTGAACTTGCTCAGAAAACAT--ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * *
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127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * *
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1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
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* * * * * *
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130 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* ** * * * * * * *
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1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * *
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65 ATAAATT-ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * *
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* *
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* ** * * *
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* * * ** *
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* * ** * * *
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1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-T-TTTTGAAATAT
* * * * * *
143936 TAATGAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTGTGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAA
63 TAAT-AAATTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* *** * * * * *
144001 AACAAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAA-TGTTAAAACAGTCATAATTAT
127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * *
144054 TTAAACATG-TTAAATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTT-AGATTAT
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGA-AATAT
*
144115 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTCTTTTATGAC
63 TAATAAATTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC
* *
144178 AAAATAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
125 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * ** *
144234 TTGATC-TACTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATTAATTGCCT-AAACAT
1 TTGAACTTGC-TCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTT-TACTTATTAATT-TTTGAAATAT
* * * ** *
144296 TAATAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AAT-AGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTAAAATA
63 TAATAAATTA-TATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * * *
144359 GAACAAAAAGTGAAAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-GAATAGTCATAACTAT
126 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAATTAC
* * ** * *
144414 TTGAAATAG-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATA-TA
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* ** * * * *
144473 ATAGATTAGTATTACCTTATTCT-AAACAAACTTATATGAACA-AAAAAATTTGTTTTATGACAA
65 ATAAATTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAA
* * ** *
144536 AACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGCT-ACAATAGTCATAATTAT
127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAATTAC
* * * ** *
144590 TTGAAC-TGGTTAGATAAACATAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATACTA
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * ** *
144654 ATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCA-AAAAAACTTACTTTATGAG
65 ATAAA-TTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTA-TATGAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTATGAC
* * * * * * * *
144717 AAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATCATTGTTCATAT-GTCTTAAATAT
125 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * * * *
144772 TTGAACTGGTTCA-ATAAACAAATTTACTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * * * *
144836 TTAGATTAGTTTTATTTTATTCT-AAGTAAGCTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGATAGA
65 ATAAATTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * ** * * * *
144900 ACAATAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
128 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * ** *
144953 TTGAACTAGTTTC-GTAAACAAATTTATTTTTCAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTA
1 TTGAACTTG-CTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * *
145017 ATAAATTATCATTGTTTTATTCTG-AATAAGGTTGA-ATG-TTCAAAAACAATTGTTTTATGACC
65 ATAAATTAT-ATTATTTTATT-TGAAATAAGCTT-ATATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * ** *
145079 AAACAAAAGGTAATAA-CATTTTGAAATAGATAATTGTTGATAGAACCATAATTAT
126 AAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * * * * * *
145134 TTGAGC-CGATTCAGTAAATAAATTCACTTTTTAAATC----ACTT-TATACTTTTTGAACTATT
1 TTGAACTTG-CTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT-TAATTTTTGAAATATT
* * * *
145193 AATAAATTAGTATTATTTTACTTCG-AATAAGGTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACA
64 AATAAATTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * ** * *
145256 AAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATACATAGTTGTTTATGTAGTCTTAATTAT
126 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * * * * * *
145311 TTAAAC-TACTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTATATCTCTCAGTTATTGATTTTTGGAATATTA
1 TTGAACTTGC-TCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * *
145375 TTAGATTAATATTATTTTATTCTG-AATAAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTAG-TTTA--AT
65 ATAAATT-ATATTATTTTATT-TGAAAT-AAGCTTATATGAA-TAGAAACAATT-GTTTTATGAC
* * * * *
145435 AGAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG----------
125 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * *
145481 --GAGCTAGTTC-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
** * * **
145543 ATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATG-AT-GAAAAGCAATTGTTTTATGATGA
65 ATAAATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAG-AAA-CAATTGTTTTATGACAA
* * * *** * *
145606 AACAAAAGTTCATAATGATTTGAAAAACATAATTGCCCAAAATGGGCATAATTA-
127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAATTAC
* * * * ** * * * *
145660 TTTAGGC-TGATTCA-ATAAAC-TCACTTGCTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATA
1 TTGA-ACTTG-CTCAGA-AAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * ** * * *
145722 TTAATAAAGTAATATAATTTTATTTCCAATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATA
62 TTAATAAA-TTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
145787 AAATAGAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTAT
126 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * ** * * * ** *
145842 TTAAACTTGTTTGGCAAACAAAATTATTTTTTAAAT-TTCTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTT
1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATT
* * * * * * *
145905 AATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAACAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTA
64 AATAAATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* ** * * * * *
145969 AACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATTGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTAT
127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * * * * *
146023 TTGAACTAGTTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATGTCTTACTTAGTAATTTTT-AGAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * * ** * * * *
146087 TTAATTTAGTAATATTTTACTCCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAAGACAAA
65 ATAAATTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* ** * * * * *
146151 AC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAGTTGTTTAAATAGTCATAATTAT
128 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * *
146203 TTG-AGTTAGTTC-GATAAACAGATTCAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATT
1 TTGAACTT-GCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* ** **
146262 AATAAATTAGTATTATTTTGTTTTG-AATAATTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAA
64 AATAAATTA-TATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* *
146326 AACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTATTTATGACAAAATAAAGGGTCATAATGAT
127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTA--T-T--C-AAAT--A--GTCAT-A--A-
*
146391 TTGAAA
177 TT--AC
* * * * ** * * *
146397 TGGATAATTGTTC-GAATAGTCAAACTATTTGACCATGTTTAGAAAATATATTTAATTTTTAAAT
1 TTGA-ACTTGCTCAGAA-A---ACA-TATTT----AT-TTT-TTAAATCT-TTTACTTATT-AA-
* * ***
146461 TTTTACTTATGAATTTTAGGAATATTAGAAATTTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTCGCATG
51 TTTT--TGA--AATATT----A-A-T--AAA--TTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATG
* * * * * * *
146526 AACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACATAAGGTTATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAG
102 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * *
146591 TTAGTCATAACTAT
167 ATAGTCATAATTAC
* * * * * * * ** *
146605 TTG-AGTATGTTCA-ATAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACACATTAATTTTTGGAATATT
1 TTGAACT-TGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * *
146668 AA-AAATTAGTATTATTTTCTTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAA
64 AATAAATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
146731 AATAAAAGGTCACAATGATTTG-AATAAATAATTAGTCAAATAGTCA-AGACTAT
127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA-ATTAC
* * * ** **
146784 TTGAATTTGTTCCA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATCGTCAAAATATTA
1 TTGAACTTGCT-CAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * *
146848 ATAAATTAATATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTGT-AA-AAAAACAATTGTTTTATGACTAA
65 ATAAATT-ATATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
** * * * * ** *
146910 ACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAGTTGTTTAAATAGTCATAAAGAT
128 ACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
** * * *
146963 TTGAACTTG-TTGGATTAATATATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATAT
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATAT
* * ** * * ** *
147025 TAATAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGCTTACATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATGTC
63 TAATAAA-TTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAG--AAACAATTGTTTTATGAC
* ** * * * * * ** *
147090 AAAACAAAAGGTTATACCGATTTCAATTAGATAATTGTTTAAATTGTCATAGCTAT
125 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * ** * ** * *
147146 TTGAACTTGTTC-GATGAACAGATTCAGCTTTTAAATATTTGCCTTATTAATTTTGGCAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * ** * *
147210 ATAAATTAGAATTATGTTGTTCTG-AATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTATCTTATGACAAA
65 ATAAATTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * *
147274 ACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACTA-TCATAATTAT
128 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAATTAC
* * ** *** * * * *
147327 TTGCA-TTGGTCATGGTAATGGATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTCTTAATTTTT-AGAATACT
1 TTGAACTTGCTCA-GAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATT
* * ** *
147390 AAT-AATTAGGATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
64 AATAAATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
147453 AACAAATAGG-AATAATGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTA-TTATAACTAA
127 AACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAATTAC
* * * * * * **
147507 TTGAACTGGTTTAGTAAAGAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAA
1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * ** * * * * * * **
147568 TAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAAATTAAATGAACAAAAACATTTGCTCTACAACAAAAC
66 TAAATT-ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * * * * * *
147633 AAAAGGTCATAACAACTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCCTAACTAT
130 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * ** * * * * * * *
147684 TTGAAGTGGTTTGGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTAA-TTTTCATAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * * * * * * *
147748 TTATATTAGTATTATTTTATTATG-AATAAGCTTGTATTAACATAAATAATTATTTTATGACAAA
65 ATAAATTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * *
147812 ACAAATGGTTATAATAATTTGAAATATATAATTATTTAAATTGTCATAACTAT
128 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * * * * * * *
147865 TTGAA-TTGGTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTAAATCTTCTACTCATTAATTTTTGAAATACT-
1 TTGAACTT-GCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
147928 A-AAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAGGCTTTTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTACGACAA
65 ATAAATTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTATATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAA
* ** * * * * *
147990 ATCAAAAATTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTAT
127 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* *** *
148044 TTGAA-TTGATTC-GATAAAC-TAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTT-TTCAAATTTTGAAATA
1 TTGAACTTG-CTCAGA-AAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTGAAATA
* * * * *
148105 TTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG-CATAAGCTTTTATGAACT-GAAGACATTTGTTTTATT
62 TTAATAAA-TTATATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTATATGAA-TAGAA-ACAATTGTTTTATG
* * * * ** * * * *
148168 ATAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAAACTTGACTAT
123 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* ** * * * * *
148226 TTGAATTTATTCA-ATAAACAAATTTATTTTTT--GTTTTAATTTCTTATTAATTTTTTG-AATG
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTT--TTACTTATTAA-TTTTTGAAATA
* * * * * *
148287 TTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTCAGATAAGCATGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGAC
62 TTAATA-AATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * ** * * * * *
148351 TAAAC-AAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTAT
125 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * ** * * * * * *
148406 TTGAACTAGTTTGGCAAATACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AAT-TTAT
1 TTGAACTTGCTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
** * * * * * * *
148468 TAGTTTAGCAATATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAA-AG----AT--CATAAC
66 TAAATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** * * * * * *
148525 -----GAC-T--TGAGAT-AGATA-ATTATT-TA--AATAGTTATAACTAT
130 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* * * *
148563 TTGAA-TAGGTCTAGTAAACATATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTG-AA-A-TA
1 TTGAACTTGCTC-AGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * * *
148620 CTAAACTAGTATTATTTTATTCTG-AATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAA
65 ATAAATTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * ** * * * *
148684 ACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
128 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
* ** *
148737 TTGAATTTATTC-GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* ** * * * *
148801 AT-AA--AT-TTATTTGA----AAATAAGCTTGCATCAAGAGAACCAATTGTTTTATGACAAAAA
65 ATAAATTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
148858 AAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTTTTTAGATAGTCATAACTA-
130 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTAC
** * * * * * * *
148908 TCTGAACTTATTCGGTAAATAGATTCT-TCTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTT-AGAATAT
1 T-TGAACTTGCTCAGAAAACATATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATAT
** * * * * *
148971 TAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAACAAACTTATATGAACT-GAAACAATTATTTTATTACA
63 TAATAAATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
149035 AAAGAAATGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTACTT-AAATCA-TCATGACTAT
126 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-AGTCATAATTAC
* * * **
149090 TTGAACTGGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTT-AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTA
1 TTGAACTTGCTCAGA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * *
149153 ATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATATGCTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATAACAAAA
65 ATAAATT-ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * * * * *
149218 CAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATAT
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* *
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* * * ** * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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* ** * * * *
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* ** * * **
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* * * * * **
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * **
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* * * * ** *
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** * **
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* * * * * *** * *
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* * * * * ** * * * * * *
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** * * * * * * * **
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1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * *
146652 TAATTTTTGGAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTCTTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACA
65 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA
* * * *
146716 ATTGTTTTATTACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTG-AATAAATAATTAGTCAAATAGTCA-AG
130 ATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA-
* * * * * ** **
146779 ACTATTTGAATTTGTTCCA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATCGTCAAAA
193 ACTATTTGAACTTATT-TAGTAAACAGA-TT-TTTTTT-AATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * **
146843 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTGT-AAAAAAACAATTGTTTTATGAC
254 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGAC
* * *
146907 TAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAGTTGTT
318 AAAACAAA-AGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* ** * * * *
146946 TAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTGGATTAATATATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * ** ** *
147011 AATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGCTTACATGAATAGAAAA
66 AATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAG--AA
* ** * * ** * * * * *
147074 AAAATCATTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATACCGATTTCAATTAGATAATTGTTTAAATTGTCA
127 ACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * ** * *
147139 TAGCTATTTGAACTT-GTTCGATGAACAGATTCAGCTTTTAAATATTTGCCTTATTAATTTTGGC
191 TAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAGATT---TTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * ** * *
147203 AATATTAATAAATTAGAATTATGTTGTTCTGAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTATCTTAT
252 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTAT
* * *
147268 GACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATT
315 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * ** * *
147310 CAAACTA-TCATAATTATTTGCA-TTGGTC-ATGGTA-ATGGATTCATTTTTTAAATCTGTTACT
1 CAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGAT-AAACAT--ATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * * ** * * *
147371 TCTTAATTTTT-AGAATACTAAT-AATTAGGATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TATATCAATAG
62 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTGTATGAACAG
* * * *
147433 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATAGG-AATAATGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTA
125 AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TA
* * ** * * * *
147497 -TTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAAGAGATTTATTTTTTAA--ATCT-CTTATTAATTTTC
187 GTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGA-TT-TTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTT
* * * ** ** ** * * *
147558 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAAATTAAATGAACAAAAACATTTGCTCT
250 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTT
** * * *
147623 ACAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTAAAATAGATAATTATT
313 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * ** * * * * *
147667 CATATAGCCCTAACTATTTGAAGTGGTTTGGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * * *
147732 AA-TTTTCATAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTATG-AATAAGCTTGTATTAACATAAAT
66 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAC
* * * * * * *
147795 AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATAATTTGAAATATATAATTATTTAAATTGTCATA
129 AATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * * * *
147860 ACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTAAATCTTCTACTCATTAATTTTTGAAA
193 ACTATTTGAACTT-ATTTAGTAAACAGATTT-TTTT-T-AATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
147924 TACT-A-AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTTTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTACG
254 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATG--AAACAATTGTTTTATG
* ** * *
147986 ACAAATCAAAAATTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
316 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * ***
148027 CAAATAGCCATAATTATTTGAA-TTGATTCGATAAAC-TAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTT-
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * *
148089 TTCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG-CATAAGCTTTTATGAACTGAA
64 TT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAA
* * * * * * **
148153 GACATTTGTTTTATTATAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAAAC
127 -ACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * ** *
148218 TTGACTATTTGAATTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTGTTTTAATTTCTTATTAATTTTTTG
190 ATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTT-TTTTTAATTTT--TTACTTATTAA-TTTTTG
* * * *
148283 -AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTCAGATAAGCATGTATGAATTGAAACAATTATTTT
251 AAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTT
* * *
148346 ATGACTAAAC-AAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
313 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * ** * * *
148389 CTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAATACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * ** * * * * *
148453 AATTTTAG-AAT-TTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAA
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
* * * * *
148515 -------A-G---------A--TCATAACGACTTGAGATAGATAATTATTTAAATAGTTATAACT
131 TTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * *
148561 ATTTGAA--TAGGTCTAGTAAACATATTTAGTTTTTAA--ATCT-CTTATTAATTTTTG-AA-A-
196 ATTTGAACTTA--TTTAGTAAACAGATTT--TTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * ** * *
148618 TACTAAACTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTACGACAA
257 TAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAA
* * *
148683 AACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * *
148720 CAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * *
148785 AATTTTTGAAATATTAAT-AA--A-T-TTATTTGA----AAATAAGCTTGCATCAAGAGAACCAA
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
* * * * *
148841 TTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTTTTTAGATAGTCATAAC
131 TTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* ** * *
148906 TATCTGAACTTATTCGGTAAATAGATTCTTCTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTT-AGAATA
195 TATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATT-TT-TTTTAATT-TTTTACTTATTAATTTTTGA-AATA
* * * * * *
148970 TTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAACAAACTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATTACA
256 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * *
149035 AAAGAAATGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTACTT
319 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-GTT
* * *
149074 -AAATCA-TCATGACTATTTGAACTGGTTCAATAAACATATTTATTTTTT-AATCTTTTACTTAT
1 CAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* ** * * * * * *
149136 TAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATATGCTTGTATGAATAGAAACT
65 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA
* * ** * * * *
149201 ATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAA
130 ATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * * *
149266 ATATTTGAATTTATTT-GATATA-AGATTTATTTTTTAA--ATCT-CTTATTAATTTTTTACATA
194 CTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAGA-TT-TTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * *
149326 TTAGTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAA-GAAAAACATTTGTTTTACGAC
256 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATG--AAACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
149390 AAAGCAAATGGTCATAACAATTT-AAATTGGACAATTATT
318 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTT
* * ** * * * * ** * *
149429 CATACAACCTTAATTATTTGAACTAGTTTGGCAACCAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTAT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTAT
* * * *
149493 TAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACATAAA
65 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * * ** * * * *
149556 TAATTGTTTTATGATAAAACAAAGCTTTTAATGATTTCAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATA
128 CAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * ** *
149621 ACTATTTGAA-TTGGTTT-GATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCTA-TTCCTTAATTTTTGA
193 ACTATTTGAACTT-ATTTAG-TAAACAGATT--TTTTTT-AATTTTTTACTT-ATTAATTTTTGA
* * * * *
149683 AATA-TAAAAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTATA-CAATGAAAACAATTGTTTTAT
252 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAATG-AAACAATTGTTTTAT
* * ** *
149746 GACAAAATAAAAGTTCATAATGATTTGAAAAAGATAATTGTT
315 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * **** *
149788 CAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAAC-TGATTTATTTTTAAAATCACCAACTTC
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * **
149851 TTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATAATATTTTATTT-TCATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
64 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAA
* * * * * * * *
149914 CAATTGTTTTGTTATAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTT
128 CAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
149979 GACTATTTGAATTTGTTCATTAAATAGA-----TTT-ATTTTTTA--AATT--TTTTTG----CT
192 AACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* *** * * * *
150030 TATTAAA-TAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTA
257 TAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * *
150094 AATAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATT
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * ** * * * * *
150131 CTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTATTTTGGCAAATACATTCATTTTTAAAATCTCTTACTTAT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * ** * * ** *
150195 TAATTTTAG-AATATTATTAGTTTTGCTA-TATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
65 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAC
* * *
150258 AATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAATAATCATG
129 AATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
** * * * * *
150322 ACTATTTGAAC-TAGTCCA-AAAATAGATTTAGCTTTTAAATCTTT--TTATTAATTTTTGAAAT
193 ACTATTTGAACTTA-TTTAGTAAACAGATTT--TTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
** * * * * *
150383 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAATAAATAAAATAATTGTTTTACGACA
255 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
150448 AAACACAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTT
319 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
*** * *
150486 CAAATAGTCATAACTATTTGAACACATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * *
150551 AATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATTAGCTT-TCATCAACAGAAGC
66 AATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGT-ATGAACAGAAAC
* * * * *
150614 AATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATCAG-TAATTATTTAGATAGTCAT
129 AATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGTCAT
* *
150678 AACTATTTGAAC---TTT--T---CA-A-------TAA----ATA--TATTAATTTCT-AGAATA
192 AACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATA
* * * *
150720 TTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGAACTGACACAATTGTTTTATTATC
256 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGA-C
* ** **
150785 AAAGA-AAAA-GTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTACT
318 AAA-ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * *
150823 CAAATAGTCATGACTATTAGAACTTGTTTGAGAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * ** *
150887 AATTATTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTTTAATCCAAATATA-CTT-TCATGAACAGAAGC
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATA-AGCTTGT-ATGAACAGAAAC
* * ** * **
150950 TATTGTTTTATAACGTAACAAAAAA--TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTC-AATAGTCA
129 AATTGTTTTATGAC--AA-AAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
** * * * * *
151012 TAACTGCTAGAAATGT-TTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAA--ATCT-CTTATTAATTTTTGA
191 TAACTATTTGAACT-TATTTAG-TAAACAGA-TT-TTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * * *
151072 AATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTAGTACGAATTGAAAAAACTGTTTTAT
252 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTAT
* ** **
151137 GACAAAACAAAAGATTGTAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
315 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *
151179 CAAATAGTCATAA-TCATTTG-A-TTCGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATC---T-CTT
1 CAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTT--GTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * **
151237 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTA-TTTAATTCATAATAAGCTAGTATGAATTGA
63 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTGA-AATAAGCTTGTATGAACAGA
* *
151300 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
126 AACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATA
151333 CAATTGTTTA
Statistics
Matches: 6445, Mismatches: 1468, Indels: 920
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
325 16 0.00
326 5 0.00
329 12 0.00
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340 4 0.00
341 10 0.00
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344 3 0.00
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348 15 0.00
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366 3 0.00
367 1 0.00
368 13 0.00
370 3 0.00
372 5 0.00
373 2 0.00
375 3 0.00
377 1 0.00
378 5 0.00
379 4 0.00
380 3 0.00
381 4 0.00
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388 1 0.00
389 4 0.00
390 1 0.00
391 2 0.00
392 1 0.00
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394 1 0.00
395 1 0.00
397 4 0.00
398 1 0.00
400 1 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
TTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
ATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
AAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
AGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
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Alignment explanation
Indices: 142610--149965 Score: 2515
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142600 TAAAACAAAA
** * * ** *
142610 AGTCATAACAATTTGAACTTGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
1 AGTCATAATTATTTGAAATAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTT
* * * * ** * *
142675 TT-AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACCCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
62 TTGA-AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGT
* * *
142739 TTTATAACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTCCAAATAGTCATAACTATT
126 TTTA-AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-----ATA-TCATAATTA-T
* * * ** * * * *
142803 TGAATTAGTTTGGCAAACA-AATTTAGTTTTGAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTGGAATATTAA
183 GGAACTAGTTAGATAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATACTAA
* * * *** * * ** ** *
142863 TAAACTAATATCATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-T-AAAAACAA-TTGTTTTACAACAA
247 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTAGTATGAATTCAAAAA-AACTTACTTTATGAGAA
** * * * * **** *
142925 AACAAAATATCATAACAAATTGAAATAGATAATTGTTTGAATGGGCA-AGACTATTTGAACTTG-
311 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAAACATAATTGCCCAAAT-GGCATA-AATATTTGAAC-TGA
*** * * * * * * * * *
142988 TTTGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAAATTTT-AGAATATTAATAAATTAG
373 TTCAATAAACAAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAAAGTAA
** * * *
143052 TATAATTTTATTTTGAATAAAG-TTATATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAACGA
437 TATAATTTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGATAAAACAAA-GG
** * * * * * * * * * * *
143115 TCCTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAATTATTTGAACTCG-CTCGATAAAT
499 TTATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAG-TAAAC
** * *
143179 GGATTTATTTTTCAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT
563 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTT--TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * ** * *
143242 A-TTCTGAATATGCTTTTATGCA-TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAA
625 ATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAA
* * * * * * * * * *
143305 TTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATAAATACTTGATCGT-GCTCAGAAAATATATTTATT
688 TTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAATTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAATAAATTTATT
* * * * *
143369 TTTTTAATTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAAGAAATTTA-AATTATTTTA-TTTGAAAT
752 TTTTAAATTCTTACTTA-TAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTACTTCG-AAT
* * * * ** * * *
143431 AAACTTGGATGAACAGAACCAATTGCTTTATGACAAAACCAAATGTCATAATGTTTTGAAATAAA
813 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTAAGACAAAA-CAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAA
* * *
143496 TAATTATTCAAAT
877 TAGTTGTTTAAAT
* * * * * * *
143509 AGTCATAACTATTT-AAACTTATTTAG-TAAACAGA-TTCTTTTTTAATTTTGTTACTCATTAAT
1 AGTCATAATTATTTGAAA--TAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAA--AT-CT-CTTATTAAT
* * * * *
143571 TTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAT
60 TTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTATATGAA-TAGAAACAAT
* * * * * *
143634 TG-TTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTGATAATTATTCAAATAGTCATGACT
123 TGTTTTA-AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-A--ATT--GATA-TCAT-AAT
* * * * * ** *
143698 CT-TTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTGAAATCTTTTACTTATTAATTATTGAAATA
180 -TATGGAACTAGTTAGATAAACAGAATTATTTTTT-AAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * **
143762 TTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTT-GTATGAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTAT
243 CTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT-AAGTTAGTATGAATTCA-AAAAAACTTACTTTAT
** * * ** * * * * *
143823 GTCAAAATAAAAAGTCATAAC----T-----AGTTAATTACTCAAATAGTCATAACA-AGTTAAA
306 GAGAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAAACATAATTGCCCAAAT-GGCATAA-ATATTTGAA
*** * * * * * *
143878 CTTG-TTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCT-TGTACTTATTAACTACTTT--AATATTAA
369 C-TGATTCAATAAACAAACTTACTTTTT-AAATCTCT-AACTTATCAA--ATTTTGAAATATTAA
* * ** * * * * *
143939 TGAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTGTGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAC
429 TAAAGTAATATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGATAAAAC
** * * * * * *
144004 AAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAA-TGTTAAAACAGTCATAATTATTTAAACATGTTAAA
494 -AAAGGTTATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAG
* * * *
144068 TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTTTTAGATTATTAATAAATTAGTATTAT
558 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTT-TTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * **
144132 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATG
622 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACA
* * * * * *
144197 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTACTTGATCTACTTCGGTAAACATATTTATT
687 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAAATTTATT
* ** * * *
144262 TTTTAAATTTTCTACTTATTAATTGCCTA-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAAT-
752 TTTTAAATTCT-TACTTA-TAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATA
* * * * * * * *
144325 AGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTAAAATAGAACAAAAAGTGAAAATGATTTGAAATAAAT
814 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTAAGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* * *
144390 AATTGCTTGAAT
878 AGTTGTTTAAAT
* * *
144402 AGTCATAACTATTTGAAATAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
1 AGTCATAATTATTTGAAATAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
** * * * *
144467 AATA-TAATAGATTAGTATTACCTTATTCTAAACAAACTTATATGAACA-AAAAAATTTGTTTTA
66 AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAA-TTGTTTTA
* * *
144530 TGACAAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGCTACAATAGTCATAATTATTTGAA
130 -AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-----ATA-TCATAATTA-TGGAA
* *
144595 CTGGTTAGATAAACATAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAAT
187 CTAGTTAGATAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAAT
* *
144660 TTGTTTTATTTTATTCCAAATAAGTTAGTATGAATTCAAAAAAACTTACTTTATGAGAAAACAAA
252 TAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTAGTATGAATTCAAAAAAACTTACTTTATGAGAAAACAAA
* * * * ** * * * *
144725 AGGTCGTAACGATTTGAAATAGATCATTGTTCATATGTCTTAAATATTTGAACTGGTTCAATAAA
317 AGGTCATAACGATTTGAAAAACATAATTGCCCAAATGGCATAAATATTTGAACTGATTCAATAAA
* * * * * * * * * * * * *
144790 CAAATTTACTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTTTTATTTTA
382 CAAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTA
* * *
144855 -TTCTAAGTAAGCTTGTATGAATA-AAAATAATTGTTTTATGATAGAACAATAGGTTATAATGAT
447 TTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGATAAAACAA-AGGTTATAATAAT
* * ** * * * *
144918 TTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTCGTAAACAAATTTATTTT
509 TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTT
* * * * *
144983 TCAAATCGCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAGATTAATAAATTA-TCATTGTTTTA-TTCTGAATA
574 TTAAATCTCTT-TTTATTAATTTTTTGAATG-TTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTC-GAATA
* * ** * * * *
145045 AGGTTGAATGTTCAAAAACAATTGTTTTATGACCAAACAAAAGGT-AATAACATTTTGAAATAGA
635 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAA-AACAATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
145109 TAATT-GT-TGATAGAACCATAATTATTTGAGC-CGATTCAGTAAATAAATTCACTTTTTAAA-T
699 TAATTATTCTAATAG--TCATAATTATTTGAACTAG-TTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATT
* *
145170 C--ACTTTATACTTTTT-GAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATAAGGTTGTATG
761 CTTAC-TTATAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * *
145232 AACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATACATAGTTGTTTAT
824 AACAAAAACAATTATTTTAAGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAGTTGTTTAA
*
145297 GT
888 AT
* * * * *
145299 AGTCTTAATTATTT-AAACTACTTC-AGCAAACAGATTTATTTTTTATATCTCTCAGTTATTGAT
1 AGTCATAATTATTTGAAA-TAGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTA-A-ATCTC--TTATTAAT
* * *
145362 TTTTGGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTATATGAACT-GAAACAAT
60 TTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAA-CTTATATGAA-TAGAAACAAT
* * * * * * *
145426 TAG-TTT-AATAGAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTG-T-TCA-AA-TA-GGAG
123 T-GTTTTAAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATATCATAATTATGGAA
* * * * *
145484 CTAGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
187 CTAGTTAGATAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAAT
* * * **
145549 TAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTT-GTATG-A-TGAAAAGCAA-TTGTTTTATGATG-AAAC
252 TAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCAAAA-AAACTTACTTTATGA-GAAAAC
* * * *
145609 AAAAGTTCATAATGATTTGAAAAACATAATTGCCCAAAATGGGCATAATTATTT-AGGCTGATTC
314 AAAAGGTCATAACGATTTGAAAAACATAATTGCCC-AAAT-GGCATAAATATTTGA-ACTGATTC
** *
145673 AATAAACTCACTTGCTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATA
376 AATAAACAAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATA
* * * * * * *
145738 ATTTTATTTCCAATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAGAAGGTCATAT
441 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACA-AAGGTTATAA
* * * * * *
145803 TTATTTTAAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGCAAACAAAATTA
505 TAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAAATTTA
* * * *
145868 TTTTTTAAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAAC
570 TTTTTTAAATCTCTT-TTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * *
145933 AAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATTGA
634 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGA
* * *
145998 TAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATGTCT
699 TAATTATTCTAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAT-TCT
* * * *
146063 TACTTAGTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTAATATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAAC
763 TACTTA-TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAAC
* ** * *
146128 AAAAACAATTGTTTTAAGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAGTTGTTTAAAT
827 AAAAACAATTATTTTAAGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAGTTGTTTAAAT
** * *
146191 AGTCATAATTATTTGAGTTAGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
1 AGTCATAATTATTTGAAATAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
* * * **
146256 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTAC
66 AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTA-
* * * * * **
146321 AACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTATTTATGACAAAATAAAGGGTCATA
130 AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA--TAT--CATAATTATGGAAC-TA
* * ** * * * * ** * ** * *
146386 ATGATTTGAAA-TGGATAATTGTTCGAATAGTCAAAC-TATTTGACCATGTTTAGAAAATATATT
190 GTTAGAT-AAACAGAATTATTTTTTAAAT-CTCCTACTTA-TT-A--AT-TTTTG--AA-ATA-C
* * ** *
146449 TAATTTTTAAATTTTTACTTATGAATTTTAGGAATATTAGAAATTTTATA-TTATTTTATTTGAA
244 TAA----TAAA---TTA-GTAT-TA-TTT-----TATTCCAAA---TA-AGTTA--GTA--TG-A
* * * * * * * *
146513 ATAAGCTCGCATGAACAGAAC-CAATTGTTTTATGACAAA-ACATAAGGTTATAATGTTTTGAAA
285 AT----T--CA--AA-AAAACTTACTT-TATGA-GA-AAACA-A-AAGGTCATAACGATTTGAAA
* * ** ** * * * * *
146576 TAGATAATTGTTCAGTTAGTCATAACTATTTGAGTA-TG-TTCAATAAATAGA-TTCATTTTTTA
336 AACATAATTGCCCAAAT-GGCATAAATATTTGA--ACTGATTCAATAAACAAACTT-ACTTTTTA
* * ** * * * * * * * *
146638 ATTCTCTTACACATTAATTTTTGGAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTCTTTCAAATAAGCTTA
397 AATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
146702 TATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAATAAAAGGTCACAATGA-TTTGAATAAATAATTA
462 TATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGATAAAA-CAAAGGTTATAATAATTTTAAATAGATAATT-
* * * *
146765 G-TCAAATAGTCA-AGACTATTTGAATTTGTTCCA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTTA
524 GTTCAAATAGTCATA-ACTATTTAAACTTGTT-TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTT-
** *** * * * * * *
146826 CTTATTAATCGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTTGTGT-AA-A
586 -TTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
146888 AAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAGTTGTT-TAAAT
649 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCT-AAT
** * * * * *
146951 AGTCATAAAGATTTGAACTTGTT-GGATTAATATATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATT
712 AGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGG-TAAATAAATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTA-TAATT
* * * ** * *
147015 GTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-ATCAAAATAAGCTTACATGAATAGAAAAAAA
774 -T-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTC-GAATAAGCTTGTATG-A-ACAAAAACA
* * * * ** * * * *
147077 ATCATTTTATGTCAAAACAAAAGGTTATACCGATTTCAATTAGATAATTGTTTAAAT
834 ATTATTTTAAGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAGTTGTTTAAAT
* ** * * * * * * *
147134 TGTCATAGCTATTTGAACTTGTTCGATGAACAGATTCAGCTTTTAAATATTTGCCTTATTAATTT
1 AGTCATAATTATTTGAAATAGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAA-ATCT--CTTATTAATTT
* * * * * * * * ** * *
147199 TGGCAATATTAATAAATTAGAATTATGTTGTTCTGAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTATC
62 TTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTT
* * * *
147264 TTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACTATCATAATTATTT
127 TTA-AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-A--ATT--GA-TATCATAATTA-TG
* * * * * * * ** *
147329 GCATTGGTCATGGT-AA-TGGATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTCTTAATTTTT-AGAATACTA
184 GAACTAGTTA-GATAAACAGAATT-ATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGA-AATACTA
* * * * * ** *
147391 AT-AATTAGGATTACTTTATTCCAAATAAGACTA-TATCAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTATGAC
246 ATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCA-AAAAAACTTACTTTATGAG
* * * ** *** * *
147451 AAAACAAATAGG-AATAATGGTTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATTATTATAACTAATTGAACT
309 AAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAA-AACATAATTGCCCAAA-TGGCATAAATATTTGAACT
* * * * * * * * * *
147514 GGTTTAGTAAAGAGATTTATTTTTTAAA--TCT--CTTAT-TAATTTTCAAAATATTAATAAATT
371 GATTCAATAAACAAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTT-GAAATATTAATAAAGT
* * ** ** * * * * ** *
147574 AATATTATTTTATTTCAAACAAAATTAAATGAACA-AAAACATTTGCTCTACAACAAAACAAAAG
435 AATATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGATAAAAC-AAAG
* * * * * * * * * * * * * *
147638 GTCATAACAACTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCCTAACTATTTGAAGTGGTTTGGCATAC
498 GTTATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAAC
** * * * *
147703 AAATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTAATTTTCAT-AATATTATTATATTAGTATTATTTTA
563 AAATTTATTTTTTAAATCTCT-TTTTATTAATTTT-TTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * *
147767 TTAT-GAATAAGCTTGTATTAAC-ATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATAAT
626 TT-TCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAAT
* * * * * *
147830 TTGAAATATATAATTATT-TAAATTGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAATAGATTTATTT
689 TTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAAATTTATTT
* * * *
147894 TCTAAA-TCTTCTACTCATTAATTTTT-GAA-A-TACTAAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
753 TTTAAATTC-T-TACTTA-TAATTTTTAGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTACTTCGAATA
* * ** * * * * * * *
147955 GGCTTTTATGATGAAAAACAATTGTTTTACGACAAATCAAAAATTCGTAACGATTTGAAATAGAT
814 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTAAGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* *
148020 AATTGTTCAAAT
878 AGTTGTTTAAAT
* *
148032 AGCCATAATTATTTG-AATTGATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCAAACTT-TTCAA
1 AGTCATAATTATTTGAAATAG-TTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCT----CTTATT-AA
* * * * * * * * *
148094 ATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACT-GAAGACAT
59 TTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAA-TAGAA-ACAA
* * * * *
148158 TTGTTTTATTATAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTG-T-TCAAATAAACTTG
122 TTGTTTTA-AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATATC--AT-AA--T-
* * ** * ** *
148221 ACTATTTGAATTTA-TTCA-ATAAACA-AATTTATTTTTT-GTTTTAATTTCTTATTAATTTTTT
180 --TA-TGGAA-CTAGTT-AGATAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCT-CCTACTTATTAA-TTTTT
** * * * * *
148282 G-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTCAGATAAG-CATGTATGAATT-GAAACAA-TTA
237 GAAATACTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTA-GTATGAATTCAAAAAAACTTA
* ** * * * * * ** * * * *
148342 TTTTATGACTAAAC-AAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTAT
300 CTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAAACATAATTGCCCAAAT-GGCATAAATAT
* * * * * *
148406 TTGAACTAGTTTGGCAA-ATAC--ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTAT-TAATTTTAGAATTT
364 TTGAACT-GATT--CAATAAACAAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTT-GAA-AT
* ** * * *
148466 ATTAGTTTAG-CA-AT-ATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAAA--G----ATCA
424 ATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
148521 T--AAC----G--------ACTTGAGATAGATAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAA-TAG
488 TAAAACAAAGGTTATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-T
* * * * * *
148571 GTCTAGTAAACATATTTAGTTTTTAAATCTC---TTATTAA-TTTTTGAA--ATACTAAACTAGT
552 GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGT
** * * *
148630 ATTATTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGT
617 ATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * * * *
148693 TATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-TTCGATAAACA
680 CAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAATTATTTGAA-CTAGTTCGGTAAATA
* * * *
148757 TATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT-GAAATATTAAT-AA--A-T-TTATTTGA-
744 AATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTA-TAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAC
* * * * * * * * * * *
148815 ---AAATAAGCTTGCATCAAGAGAACCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATTATGTTTTG
806 TTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTAAGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTG
* * * *
148877 AAATAGATAATTTTTTAGAT
870 AAATAAATAGTTGTTTAAAT
* * * * * * * *
148897 AGTCATAACTATCTGAACTTA-TTCGGTAAATAGATTCT-TCTTTTAATTCTTTTACTCATTAAT
1 AGTCATAATTATTTGAA-ATAGTTCGATAAACAGATT-TATTTTTTAAATC---T-CTTATTAAT
* * * *
148960 TTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATC-AAACAAACTTATATGAACT-GAAACAA
60 TTTTGA-AATATTAATAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTATATGAA-TAGAAACAA
* * * * * **
149022 TTATTTTATTACAAAAGAAATGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATT-ACTTAAATCATCATGA
122 TTGTTTTA-AACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA--T--ATCAT-A--A
* * * * * ** * **
149086 CTATTTGAACTGGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTT-AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAAT
179 TTA-TGGAACTAGTT-AGATAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * ** **
149149 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAATATGCTT-GTATGAA-T-AGAAACTA-TTGTTTT
242 ACTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCA-AAAAAACTTACTTT
* * * * * * * * *
149209 ATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTT-AAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATATTTG
304 ATGAGAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAA-ACATAATTGCCCAAA-TGGCATAAATATTTG
* * ** * * * * * * * * * *
149273 AATTTATTTGATATA-AGATTTATTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTTACATATTAGTAG
367 AACTGATTCAATAAACAAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAA
* * * * * * * * *
149333 ATTAGTATTATTTTA-TTCTAAACAAACTTATATG-A-AGAAAAACATTTGTTTTACGACAAAGC
432 AGTAATATAATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAA-A-TTGTTTTATGATAAAAC
* * * * * * * ** * * * * *
149395 AAATGGTCATAACAA-TTTAAATTGGACAATTATTCATACAACCTTAATTATTTGAACTAGTTTG
494 AAA-GGTTATAATAATTTTAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTA
* * * * * * * *
149459 GCAACCAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTCAT-AATATTATTAGATTAGTATT
557 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-TTTATTAATTTT-TTGAATGTTAATAAATTAGTATT
* * * * * ***
149523 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-ATAAATAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGCTTTTA
620 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAA
** * * * * * * * * * * * *
149586 ATGATTTCAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAAATTC
684 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAAATTT
* * * *
149651 ATTTTTTAAATCTCCTA-TTCCTTAATTTTT-GAA-ATATAAAAAATTATTATTATTTTA-TTCC
749 ATTTTTTAAAT-TCTTACTT--ATAATTTTTAGAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTACTT-C
* * * * ** * * *
149712 AAATAGGCTTATA-CAATGAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAATGATTTGAAA
809 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTAAGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAA
* *
149776 -AAGATAATTGTTCAAAT
873 TAA-ATAGTTGTTTAAAT
* * * * * * *
149793 GGCCATAATTATTTGAACT-GATTCGATAAACTGATTTATTTTTAAAATCACCAACTTCTTAATT
1 AGTCATAATTATTTGAAATAG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT---C-TCTTATTAATT
* * * * ** * *
149857 TTTGAAATATTAATAAAGTAATAATATTTTATT-TTCATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTG
61 TTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAA-TAGAAACAATTG
** * * * *
149920 TTTTGTTATAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTAAATAGATAATTG
125 TTTT-AAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
149966 TTCAAATAGA
Statistics
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AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTAA
ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATATCATAATTATGGAACTAGTTAGA
TAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTCCAAATAAGTTAGTATGAATTCAAAAAAACTTACTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAAAACATAATTGCCCAAATGGCATAAATATTTGAACTGATTCAATAAACAAACTTAC
TTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTCAAATA
AGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGTTATAATAATTTTAAATAGATA
ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTT
TTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAA
AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC
ATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATTCTTACTTATAATTTTTAGAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTAAGA
CAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAGTTGTTTAAAT
Found at i:146938 original size:179 final size:179
Alignment explanation
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146352 AGATAATTTA
* * * * *
146362 TTTATGACAAAATAAAGGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTGTTCGAATAGTCA-AACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
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66 TGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA-AAATATTA
* * * * *
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* * * * **
146541 TTTATGACAAAACATAAGGTTATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGTTAGTCATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * ** ***
146606 TG-AGTATGTTCAATAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACACATTAATTTTTGGAATATTAA
66 TGAACT-TGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
* * * **
146670 -AAATTAGTATTATTTT-CTTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGT
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* * * * *
146721 TTTATTACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTG-AATAAATAATTAG-TCAAATAGTCA-AGACTA
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATA-ACTA
* * **
146783 TTTGAATTTGTTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATCGTCAAAATATTA
64 TTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
* *
146848 ATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTGTAAAAAAACAATTGT
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* * * * * **
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1 TTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * **
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65 TTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
* * **
147028 TAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGCTTACATGAATAGAAAAAA-AATCAT
130 TAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTT--ATG--TA-AAAAAACAATTGT
* * * * * * * *
147082 TTTATGTCAAAACAAAAGGTTATACCGATTTCAATTAGATAATTGTTTAAATTGTCATAGCTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * ** * ** ***
147147 TGAACTTGTTCGATGAACAGATTCAGCTTTTAAATATTTGCCTTATTAATTTTGGCAATATTAAT
66 TGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * ** * * ** *
147212 AAATTAGAATTATGTTGTTCTGAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTAT
131 AAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTATGTAAA-A-AAACAATTGT
* * * *
147263 CTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACTA-TCATAATTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTAT
* * ** * * * * * *
147327 TTGCA-TTGGTC-ATGGTA-ATGGATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTCTTAATTTTTAGAATAC
65 TTGAACTTGTTCGAT-AAACAT--ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATAT
* * * * * *
147389 TAAT-AATTAGGATTACTTTATTCCAAATAAGACTATAT-CAATAGAAACAATTGT
127 TAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAG-CT-TATGTAA-AAAAACAATTGT
* * * * *
147443 TTTATGACAAAACAAATAGG-AATAATGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTA-TTATAACTA
1 TTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTA
* * * * *
147506 ATTGAACTGGTT-TAGTAAAGAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATT
64 TTTGAACTTGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATT
* * * ** * *
147566 AATAAATTAATATTATTTT-ATTTCAAACAAAATTAAATG-AACAAAAACATTTGC
128 AATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTT--ATGTAA-AAAAACAATTGT
* ** * * * * * * *
147620 TCTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCCTAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * ** * * * * * * *
147685 TGAAGTGGTTTGGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTAATTTTCATAATATTATT
66 TGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * * * * * *
147750 ATATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTAT-TAACATAAATAATTAT
131 AAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGC-T-TATGTAA-AAAAACAATTGT
* * ** * * * *
147801 TTTATGACAAAACAAATGGTTATAATAATTTGAAATATATAATTATTTAAATTGTCATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * ** *
147866 TGAA-TTGGTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTAAATCTTCTACTCATTAATTTTTGAAATACT-A
66 TGAACTT-GTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
* * * *
147929 -AAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAGGCTTTTATG-ATGAAAAACAATTGT
130 TAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGC--TTATGTA-AAAAAACAATTGT
* * ** * * *
147980 TTTACGACAAATCAAAAATTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
*** *
148045 TGAA-TTGATTCGATAAAC-TAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTT-TTCAAATTTT-GAAATAT
66 TGAACTTG-TTCGATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT--AATTTTCAAAATAT
* * * * ** * * *
148106 TAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATG-AACTGAAGACATTTGT
127 TAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGC--TTATGTAA--AAAAACAATTGT
* * * * * ** * *
148162 TTTATTATAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAAACTTGACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * *** *
148227 TGAATTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTT--GTTTTAATTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTA
66 TGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTT--TTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
* * ** *
148290 ATAGAA-TAGTATTATTTT-ATTTCAGATAAGCATGTATG-AATTGAAACAATTAT
129 ATA-AATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGC-T-TATGTAA-AAAAACAATTGT
* * * * * *
148343 TTTATGACTAAAC-AAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** * * *
148407 TGAACTAGTTTGGCAAATACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
66 TGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
148459 AGAATTTATT
Statistics
Matches: 1470, Mismatches: 369, Indels: 158
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 27 0.02
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
TGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
AAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTATGTAAAAAAACAATTGT
Found at i:149408 original size:176 final size:177
Alignment explanation
Indices: 148948--149415 Score: 446
Period size: 180 Copynumber: 2.6 Consensus size: 177
148938 TTTAATTCTT
* *
148948 TTACTCATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAACAAACTTATATGA
1 TTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAACAAACTTATATGA
* * * * * * * * *
149012 ACTGAAACAATTATTTTATTACAAAAG-AAATGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTACTTAA
64 ACAGAAACATTTGTTTTATAAC-AAAGCAAATGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTACTCAA
* * * *
149076 ATCATCATGACTATTTGAACTGGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAATC
128 ATCATCATAAATATTTGAACTGATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAATC
* ** * * ** *
149126 TTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATATGCTTGTATG
1 --TTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAACAAACTTATATG
* * **
149191 AATAGAAAC-TATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTACTCA
63 AACAGAAACAT-TTGTTTTATAACAAAGCAAATGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTACTCA
* * ** *
149255 AA-CAGTCATAAATATTTGAATTTATTTGATATA-AGATTTATTTTTTAAATC
127 AATCA-TCATAAATATTTGAACTGATTCAATAAACAGATTTATTTTTT-AATC
* * *
149306 -T-CTTATTAATTTTTTACATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAACAAACTTATATGAA
* * **
149369 GAAAAACATTTGTTTTACGACAAAGCAAATGGTCATAACAATTTAAA
65 CAGAAACATTTGTTTTATAACAAAGCAAATGGTCATAACAATTTAAA
149416 TTGGACAATT
Statistics
Matches: 230, Mismatches: 50, Indels: 20
0.77 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 4 0.02
176 84 0.37
177 2 0.01
179 17 0.07
180 119 0.52
181 4 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAACAAACTTATATGAAC
AGAAACATTTGTTTTATAACAAAGCAAATGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTACTCAAATC
ATCATAAATATTTGAACTGATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAATC
Found at i:149565 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 149111--149566 Score: 430
Period size: 176 Copynumber: 2.6 Consensus size: 180
149101 CAATAAACAT
* * * * *
149111 ATTTATTTTTT-AATCTT-TTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
149174 TCAAATATGCTTGTATGAATAGAAACT-ATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTA
65 TTAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTA
* ** * *
149238 AAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATATTTGAATTTATTTGATATAAG
129 AAATAAACAATTACTCAAACAACCATAAATATTTGAATCTATTTGATACAAG
* *
149290 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTT-TTACATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTCATA-ATATTAATAGATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * **
149350 CTAAACAAACTTATATGAAGAAAAACATTTGTTTTACGACAAAGCAAATGGTCATAACAATTTAA
65 TTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAA
* ** * * * *
149415 ATTGGACAATTATTCATACAACCTTAATTATTTGAA-CTAGTTTGGCA-ACCAA-
130 AATAAACAATTACTCAAACAACCATAAATATTTGAATCTA-TTT-G-ATA-CAAG
*
149467 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTT
* *
149532 TGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTA
66 TAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTA
149567 TGATAAAACA
Statistics
Matches: 219, Mismatches: 45, Indels: 24
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.03
176 109 0.50
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179 13 0.06
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182 2 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.07, T:0.44
Consensus pattern (180 bp):
ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTT
TAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAA
ATAAACAATTACTCAAACAACCATAAATATTTGAATCTATTTGATACAAG
Found at i:149823 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 149535--149989 Score: 447
Period size: 179 Copynumber: 2.5 Consensus size: 179
149525 TTTATTTTGA
* * * * *
149535 ATAAGCTTGTATGAAC-ATAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAGCTT-TTAATGATTTCAAAT
1 ATAAGCTTATATCAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAG-TTCATAATGATTTCAAAT
* ** * * * *
149598 ATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAAATTCATTTTTTAAATC
64 AGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTCATTTTTAAAATC
* * * * *
149663 TCCTA-TTCCTTAATTTTTGAAATA-TAAAAAATTATTATTATTTTA-TTCC
129 ACCAACTT-CTTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAATAATATTTTATTTCC
* * *
149712 AAATAGGCTTATA-CAA-TGAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAATGATTTGAA
1 --ATAAGCTTATATCAACT-AAAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAGTTCATAATGATTTCAA
* * * ** *
149775 AAAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACTGATTTATTTTTAAAA
62 ATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTCATTTTTAAAA
* *
149840 TCACCAACTTCTTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATAATATTTTATTTTC
127 TCACCAACTTCTTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAATAATATTTTATTTCC
* * * * ** *
149893 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTGTTATAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTAAATA
1 ATAAGCTTATATCAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAGTTCATAATGATTTCAAATA
* * *
149958 GATAATTGTTCAAATAGACTTGACTATTTGAA
65 GATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
149990 TTTGTTCATT
Statistics
Matches: 223, Mismatches: 44, Indels: 17
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 24 0.11
179 107 0.48
180 88 0.39
181 4 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
ATAAGCTTATATCAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAGTTCATAATGATTTCAAATAG
ATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTCATTTTTAAAATCAC
CAACTTCTTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAATAATATTTTATTTCC
Found at i:150504 original size:176 final size:179
Alignment explanation
Indices: 150249--150587 Score: 440
Period size: 176 Copynumber: 1.9 Consensus size: 179
150239 AGCTTGTATG
* * *
150249 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAA
1 AATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAAAAAAGATCATAACGATTTAAGATAAATAATTATTCAAA
* * *
150314 TAATCATGACTATTTGAAC-TAGTCCAAAAATAGATTTAGCTTTTAAATC-TTT-TTATTAATTT
66 TAATCATAACTATTTGAACACAGTCCAAAAACAGATTTAGCTTTTAAATCTTTTATTATTAATTT
150376 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAATA
131 TTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAATA
* * *
150425 AATA-AAATAATTGTTTTACGACAAAACACAATG-TCATAACGATTTGAA-ATAAATAATTGTTC
1 AATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAA-A-AAAGATCATAACGATTT-AAGATAAATAATTATTC
* * *** **
150487 AAATAGTCATAACTATTTGAACACATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
63 AAATAATCATAACTATTTGAACACAGTCCAAAAACAGATTTAGCTTTTAAATCTTTTA-TTATTA
150552 ATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT
127 ATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT
150588 TGAAATTAGC
Statistics
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178 3 0.02
180 38 0.27
181 3 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
AATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAAAAAAGATCATAACGATTTAAGATAAATAATTATTCAAA
TAATCATAACTATTTGAACACAGTCCAAAAACAGATTTAGCTTTTAAATCTTTTATTATTAATTT
TTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAATA
Found at i:151069 original size:692 final size:686
Alignment explanation
Indices: 148654--151332 Score: 1714
Period size: 692 Copynumber: 3.8 Consensus size: 686
148644 AATAATTTTG
* * * * * * * * *
148654 TATGAA-TAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTG
1 TATGAACT-AAAACAATTATTTTATGACTAAAGAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTA
* * * ** * * * * *
148718 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTT
65 CTCAAATAGTCATAACTATTAGAA-TTAGTTTGGCAAACACATTCATTTTTAAAATCTCTTACTT
* * * * * *
148782 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-T---T-TA-TTTGA---AAATAAGCTTGCATCAAGAGAAC
129 ATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAACTATATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * *** * * * *
148838 CAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTTTTTAGATAGTCAT
193 CAATTGTTTTATAAC-AAAAAAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
148903 AACTATCTGAACT-TATTCGGTAAATAGATTCT-TCTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTT-A
256 AACTATTTGAAATGT-TT-GATAAATAGATT-TATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGA
* * * * * *
148965 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACAT-CAAACAAACTT-ATATGAACTGAAACAATTATTT
314 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTGA-AT-AAATGAAAAAATTGTTT
* * * * * * * * *
149028 TATTACAAAAGAAATGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTACTT-AAATCA-TCATGACTATT
375 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATT-GTTCAAAT-AGTCAT-AATATT
* ** * * **
149091 TGAACTGGTTCAATAAACATATTTATTTTTT-AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAAT
437 TGAAC-GATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * *
149155 AAATTAATATTATTTTAATTCAAATATGCTTGTATGAA-TAGAAACTATTGTTTTATAACAAAAC
498 AAATTAATATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATCAACTA-AAACAATTGTTTTGTGACAAAAC
* * ** * * * * * * * * *
149219 AAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATATTTGAATTTATTTGA
561 AAAAGGCCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTT-GTTCA
** * **
149284 TATAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTTACATATTAGTAGATTAGTATTATTTTA-
625 -ATAA-A--TA-GATTT-AATTTC-TA--AATTGATT--A-A-TA--A-A-TAGTATTATTTTAC
* * * *
149348 TTCTAAACAAACTTA
673 ATC-AAATAAGCATA
** * * * ** * * *
149363 TATGAAGAAAAACATTTGTTTTACGAC-AAAGCAAATGGTCATAACAATTT-AAATTGGACAATT
1 TATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAAG-AAAAAGTCAAAACAATTTGAAA-TAGATAATT
* * * ** * * * * * * * * *
149426 ATTCATACAACCTTAATTATTTGAACTAGTTTGGCAACCAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTT
64 ACTCAAATAGTCATAACTATTAGAATTAGTTTGGCAAACACATTCATTTTTAAAATCTCTTACTT
* * * * * *** *
149491 ATTAATTTTCATAATATTATTAGATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAA
129 ATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAACTA-TATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAA
* * * * * ** ** * *
149555 ATAATTGTTTTATGATAAAACAAAGCTTTTAATGATTTCAAATATATAATTGTTCAAATAGTTAT
192 ACAATTGTTTTATAACAAAAAAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
149620 AACTATTTGAATTGGTTTGATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCCTATTCCTTAATTTTTGAAA
256 AACTATTTGAAAT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-C--TT-ATTAATTTTTGAAA
* * *
149685 TA-TAAAAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAGGCTT--ATACAATGAAAACAATTGTTTTATG
316 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATA-AATGAAAA-AATTGTTTTATG
* * * *
149747 ACAAAATAAAAGTTCATAATGATTTGAAA-AAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC
379 ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAAC
* * * * * *
149811 TGATTCGATAAACTGATTTATTTTTAAAATCACCAACTTCTTAATTTTTGAAATATTAATAAAGT
442 -GATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT---CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* ** * * *
149876 AATAATATTTTATTTTCATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTGTTATAAAACAAAAGGC
503 AATATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATCAACTAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGC
* * * * *
149941 CATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTGACTATTTGAATTTGTTCATTAAATAG
568 CATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAG
* * * * ** *** *
150006 ATTTATTTTTTAAATTTTTTTGCTTATTAAATAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCATG
633 ATTTAATTTCTAAA-----TTGATTAATAAATAGTATTATTTTACATCAAATAAGCATA
* * *
150065 TATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAAGAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTAC
* * * * *
150130 TCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTATTTTGGCAAATACATTCATTTTTAAAATCTCTTACTTAT
66 TCAAATAGTCATAACTATTAGAATTAGTTTGGCAAACACATTCATTTTTAAAATCTCTTACTTAT
* ** ** * *
150195 TAATTTTAGAATATTATTAGTTTTGCTATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
131 TAATTTTAGAATATTAATAAATTAACTATATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
* ** * * * *
150260 TTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAATCATGACT
196 TTGTTTTATAACAAAAAAAAGATCATAACAATTTAA-ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* ** * ** *
150325 ATTTGAACTAG-TCCAAAAATAGATTTAGCTTTTAAATCTTTTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
260 ATTTGAAAT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** *
150389 AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAATAAAT-AAAATAATTGTTTTACGACAAAACA
323 AAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATAAATGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACA
* * *
150453 CAATG-TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACACATTCGG
387 -AAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAAC-GATTCGG
*
150517 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTAT
449 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
* * * * *
150582 TTTATTTGAAATTAGCTT-TCATCAAC-AGAAGCAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATTA
511 TTTATTT-AAATAAGCTTGT-ATCAACTA-AAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGCCATAA
* * * *
150645 TG-TTTTGAAATCAG-TAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTCAATAAATATA-T
573 TGATTTT-AAAT-AGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATT
*
150706 TAATTTCTAGAA-T-ATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTA
636 TAATTTCTA-AATTGATTAATAAA-TAGTATTATTTTACATCAAATAAGCATA
* * * * **
150757 TATGAACTGACACAATTGTTTTATTA-TCAAAGAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTA
1 TATGAACTAAAACAATTATTTTATGACT-AAAGAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTA
* * * *
150821 CTCAAATAGTCATGACTATTAGAACTT-GTTTGAG-AAACATATTTATTTTT-AAATCTTTTACT
65 CTCAAATAGTCATAACTATTAGAA-TTAGTTTG-GCAAACACATTCATTTTTAAAATCTCTTACT
* *
150883 TATTAATTATT-GAAATATTAATAAATTAATTTTATTTTAATCCAAATATA-CTT-TCATGAACA
128 TATTAATT-TTAG-AATATTAATAAATTAACTATATTTTAATCCAAATA-AGCTTGT-ATGAACA
* * * *
150945 GAAGCTATTGTTTTATAACGTAACAAAAA-ATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTC-AATA
189 GAAACAATTGTTTTATAAC--AAAAAAAAGATCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATA
** *
151008 GTCATAACTGCTAGAAATGTTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAA
251 GTCATAACTATTTGAAATG-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAA
* * * * ** * *
151073 ATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTAGTACGAATTGAAAAAACTGTTTTATG
315 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG-AATAAATGAAAAAATTGTTTTATG
** * *
151138 ACAAAACAAAAGATTGTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATCATTTGATTC
379 ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-ATTTGA-AC
* * * * * *
151203 GGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATT
442 GATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATA
* * * * * * * *
151267 TTATTTAATTCATAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
507 TTATTTTATTTA-AATAAGCTTGTATCAACT-AAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGCCA
151331 TA
570 TA
151333 CAATTGTTTA
Statistics
Matches: 1562, Mismatches: 328, Indels: 180
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
688 1 0.00
689 77 0.05
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691 31 0.02
692 235 0.15
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719 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (686 bp):
TATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAAGAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTAC
TCAAATAGTCATAACTATTAGAATTAGTTTGGCAAACACATTCATTTTTAAAATCTCTTACTTAT
TAATTTTAGAATATTAATAAATTAACTATATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
TTGTTTTATAACAAAAAAAAGATCATAACAATTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
TTTGAAATGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATAAATGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
ATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACGATTCGGTAAACAG
ATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTAAA
TAAGCTTGTATCAACTAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTAAATAG
ATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTAATTTCTAAATTGA
TTAATAAATAGTATTATTTTACATCAAATAAGCATA
Found at i:151135 original size:176 final size:176
Alignment explanation
Indices: 150953--151325 Score: 439
Period size: 177 Copynumber: 2.1 Consensus size: 176
150943 CAGAAGCTAT
**
150953 TGTTTTATAACGTAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTC-AATAGTCATAACT
1 TGTTTTATAACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA-T
* * * *
151017 GC-TAGAAAT-GTTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAG
65 -CATAG-AATCGGTTAGATAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * *
151080 TAGATT-AGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTAGTACGAATTGAAAAAAC
128 TAAATTCA-TATTATTTAATTCAGAATAAGCTAGTACGAATTGAAAAAAC
* * ** ** * *
151129 TGTTTTATGACAAAACAAAAGATTGTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATC
1 TGTTTTATAACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAATC
* * *
151194 ATTTGATTCGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
66 A-TAGAATCGGTTAGATAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
151259 AATTCATTTTATTTAATTCATAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAAT
130 AATTCATATTATTTAATTCAGAATAAGCTAGTACGAATTGAAAAAAC
* *
151306 TATTTTATGACAAAACAAAA
1 TGTTTTATAACAAAACAAAA
151326 GGTCATACAA
Statistics
Matches: 167, Mismatches: 25, Indels: 9
0.83 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.01
176 44 0.26
177 121 0.72
178 1 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
TGTTTTATAACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAATC
ATAGAATCGGTTAGATAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
ATTCATATTATTTAATTCAGAATAAGCTAGTACGAATTGAAAAAAC
Found at i:152022 original size:363 final size:357
Alignment explanation
Indices: 151336--156275 Score: 2572
Period size: 363 Copynumber: 13.9 Consensus size: 357
151326 GGTCATACAA
* * * * * * *
151336 TTGTTTAGTCATAAAACAAATT-TTTTTATTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAAT
* * ** *
151400 CTATTAATATTTTAAAAATTAATA--AAACATTTA-AAAATTAAATCTATTTA-TCAAATCGA-T
65 TTATTAATATTTTGAAAATTAATATTAAAGTTTTAGAAAA-TAAAT-TATTTACT-AAA-CAAGT
* * * * * * * *
151460 TC-AA-A-TTAAGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTA
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
151521 TAAAATAATAGTTTCGGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAACACAAATTTATTAATATTT
190 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
** * * * * * * *
151586 TGACAATTAATAAGTAAAA-ATATAAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACTAGATCAAACAATCA
253 CAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTA
*
151649 -AGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
316 TA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * * *
151691 TT-TCTTTGTCTTAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTAGAAATAAAATCATATTAAG
1 TTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAAT
* * *
151755 TTATTAATATTTTGAAAATTGATGATTAAGAGTTTTAGAAAATGAATCTATTTACTTAACAAAGT
65 TTATTAATATTTTGAAAATTAAT-ATTAA-AGTTTTAGAAAATAAAT-TATTTACTAAAC-AAGT
* * * * * * *
151820 TTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTTTCTATTTGAAATCATTATAATCTTTTGCTTTGTCAT
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
151885 AAAATTATTTTTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGTATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-A
191 AAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCA
* * * * *
151949 AGACAACTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATCA-TTAT
255 A-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTAT
* ** *
152013 AAGTATTTGAACAATTATTTATTTC-AATTGTTATGACTTT
317 AACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * *
152053 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATATTAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATATTAAT
* * * * * *
152117 TTTTTAATATTTTGACAATTTATATGTAAAAGATTT-GAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAG
65 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAT-T-AAAGTTTTAG-AAAATAAAT-TATTTACT-AAACAAG
* * * *
152180 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAA
125 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * ** *
152245 TAAAATAATTGTTTCAGTTCATGTAAGCCTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTGATTAATATTT
190 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * *
152310 CAAAAATTAA-AGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AAATGAATTTGCTTACCGATCAAGTTGAAATAG
253 CAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT--A--TGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
152373 TTATGACTATCTAAATAATTATCTATTT-AAAACATTATGACATT
313 TTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * * *
152417 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCATATTTTG-AATAAAATAATATAAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATATTAAT
*** * * * *
152481 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAGAAAATAAAGTTATTTTCTAAACACGTTC
65 TTATTAATATTTTGAAAATTAAT-ATTAAAGTTTTAGAAAATAAA-TTATTTACTAAACAAGTTC
* *
152546 AAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATCTGTTTTGTCATAA
128 AAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * * * * *
152611 ACCAATTGCTTCTGTTCAAACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATTCTATTTTATTAAAATTCCAA
193 AATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAAA
* * *** *
152676 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCTAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTA
257 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
*
152741 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTT
322 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * *
152777 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAG-TTATTTA-TAATAAAATAACACTAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATATTAA
* ** * * ** *
152840 TTTATTACTATTTCAAAAATTAA-A--AAGAGATTTA-AAAACTAAATCTCTTTACCGAACTAGT
64 TTTATTAATATTTTGAAAATTAATATTAA-AGTTTTAGAAAA-TAAAT-TATTTACTAAACAAGT
* * * * * * *
152901 TTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCATTATAATCTTTATTTTGTCCTA
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTAT-T----TC---A-AATC---ATTATGACC--
* * * * * * * *
152966 AATCATTTGTTTCGTCCTAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTG
177 --T--TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATA
* * * * * * **
153031 CTAAGTTA-AAATAATT-ATAAATATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCGA
237 CAAATTTATTAAT-ATTCA-AAA-ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGA
* * * * ** * *
153093 TCAA-TTTAAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCAATTTCAAATCGTTCTGACCTT
299 ACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * *
153151 TTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCTTGTTTGAAATAAAATAAT-TCTAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATAT-TAA
* *** ** ** * * * **
153214 TTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGT
64 TTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-ATTAA-AGTTTTAGAAAATAAA-TTATTTACTAAACAAGT
* * * *
153279 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATCTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCAT
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *** ** *
153344 AAAACAAATGTTT-TAGATCATAAAAGCTTGTCCCAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
191 AAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* ** * * * *
153408 TAAAAATTGGTAAGTTAAAGATTTAAAACATAAATCA-GTTTATCGAATC-AGTTAAAATAATTA
253 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
153471 TAGCCATTTGAACATTTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTT
316 TAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATG-ACCTT
* * ** * * *
153514 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTCGTCATACAAGCCTATTCGTAATAAAATAATATTAATT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAATT
** * * * * * * *
153579 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAA-TT
66 TATTAATATTTTGAAAATTAAT-ATTA-AAGTTTTAGAAAATAAA-TTATTTACTAAAC-AAGTT
* * * * * * * * *
153643 CAAATAATTATGACTATTTG--T-ATT-GC-AATT----TC-TTATAACTTTTTGTTCTATCGTA
127 CAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * **
153698 AAAAAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTG
192 AAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCA
* * * * * *
153763 AAATTTAATAAGCAATAGATTTAAAAAAT-AAT-T-TTTTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTA-A
255 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-C-GAACAAGTTCAAATAGTTATA
* * * * * * ** *
153824 GGCTATATAAATAATTCTTTATTTTAAATTGTTATGACATT
318 -ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * * * **
153865 TTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCAATTCTTACTAA-CTTATTCA-TAATAAAAT-TTAAAAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATT-AGAAATAAAATAATATTAA
** * * * * * * *
153927 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAATAAGAGATTTA-ATAAATAATTCTGTTTGCTGAACCAG
64 TTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-ATTAA-AGTTTTAGA-AAATAAAT-TATTTACTAAACAAG
* * * ** *
153991 TTGAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
125 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * **
154056 TAAAACAAATATTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
190 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
* * * * * * * *
154121 TAAAACTTAATAAG----AGAATTAAAAAAT---TTTATTTA-CTAAACTAGTTCAATTAGTTAT
253 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT
* *
154178 AACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTAT
317 AACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCT-T
* * * * * * * **
154219 TTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTAATCATACTATCTTATTCA-AAATAAAGTAATGCTAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATATTAAT
* * * * * * * *
154283 TTATTAATATTCT-AAAAGTTAAGAAGTAATGGATTTA-AAAAAAGAATCT-TTTGGCCTAACCA
65 TTATTAATATTTTGAAAA-TTAA-TATTAA-AGTTTTAGAAAATA-AAT-TATTT--ACTAAACA
* * * ** * *
154345 A-TGT-AAAAAGTTATGA-CAGTTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCATTTGTTTT
123 AGT-TCAAATAGTTATGATTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
154407 ATCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAAT
186 GTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAAT
* * * * *
154472 ATTCTAGAAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAATGAAA-CTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAG
250 ATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG
* * * ** * * *
154532 TTATGATTATTTGAAAAATTAACTATTTTAAATCACTATAACCTT
313 TTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * ** **
154577 TTGTTTTGTCATAGAATAATT-TATTCTATTCATAGAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAAT
* *** * * *
154641 TTGTTAATATTCAAAAAATTAAT-CT---G-TTTACAGAAT--A--A---A-T-------TT-AA
65 TTATTAATATTTTGAAAATTAATATTAAAGTTTTAGAAAATAAATTATTTACTAAACAAGTTCAA
* * * * * * *
154685 ATAGTTATGACTATTTGGACAATTATTTATTTTAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
130 ATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * ** ** * *
154750 CAGTTGTTTCTATTCATACAAGCCTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGATA
195 TAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACAAATTTATTAATATTCA-AAA
* ** * *
154815 ATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTA
258 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * * ** * *
154879 TTTGAATAACTATCTACTTCAAATTGTTATAACATT
322 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
** * * * * * * *
154915 TTGTTTCATTACAAAACAATTG-TACTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAAT
*** * * * * **
154979 TTATTAATATTTT-AACAATTAATGGGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAACAAGT
65 TTATTAATATTTTGAA-AATTAAT-ATTAA-AGTTTTAGAAAATAAAT-TATTTACTAAACAAGT
* * * * * ** *
155043 TCAAATAGTTATGACTATTTGGACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCAT
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
155108 AAAATAATTTTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCC
191 AAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-C
** ** * * * * * * *
155173 AAATTTTGTTAAGTAGAA-ATTT-AAAAATAAATCTATTTTTTG-ACATGTTCAAATAGTTATGA
254 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAA
* *
155235 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATGACATT
319 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCTT
* *
155274 TTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAATT
** * * * * *
155338 TATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTA-AGAAATAAATTTGTTTA-TCGAGCAAGC
66 TATTAATATTTTGAAAATTAATAT-T-AAAGTTTTAGA-AAATAAA-TTATTTACT-AAACAAGT
* * **
155401 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATTTTTTGTTTTGTCA
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * *
155465 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
190 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
** * ** * * * *
155530 TGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATG
253 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATA
* * * * *
155595 TCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATT
318 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* **
155635 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTACTT-ATACAAAATTATTTAG-AAT---A-AA-A-TAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATATTAA
* * * * **
155692 --TACTAATATTTTGAAAATTAATA--AGAGATTTA-AAAACTAAATCTGTTTACCGAACTAA-T
64 TTTATTAATATTTTGAAAATTAATATTAAAGTTTTAGAAAA-TAAAT-TATTTACTAAAC-AAGT
* * * * * *
155751 TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGATC-TTTATTTTGTCAT
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * * *
155815 AGAACAATTGTTTTTTTTTTCATATAAACTTATTCGAATTAAGATAATACTAATTTAATAATA--
191 AAAATAATTG--TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACAAATTTATTAATATT
* * *
155878 -AAAAA-T-A-AA-T----G-TGT------T---T-TG--T-T-GAACCAGTTCAGATAGTTA-A
253 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATA
* * ** * *
155918 GACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTT
318 -ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * * *
155959 TTGTTTAGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAA-AATATTAAC
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAAT
* * * * * ** *
156022 TTATTAACA-TTAGAAAAATTAATA--AGAGATTTAAAAGAAATAAATCTATTTACCGAACAAGC
65 TTATTAATATTTTG-AAAATTAATATTAAAG-TTTTAGA-AAATAAAT-TATTTACTAAACAAGT
* * * * * *
156084 TCAAATAGATATGACTATTTAAATAATTTTTTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
126 TCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
156149 AAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC
191 AAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTC
* * * *
156214 AAAAATTATTAAG-AAAGAGATTTAAAAACTAAAGT-TGTTTTTCGAATAAGTTCAAATAGTTA
254 AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
156276 CAATTGTCAT
Statistics
Matches: 3592, Mismatches: 733, Indels: 516
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
323 7 0.00
324 81 0.02
326 1 0.00
327 3 0.00
328 3 0.00
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330 3 0.00
331 20 0.01
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341 1 0.00
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344 3 0.00
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346 1 0.00
347 5 0.00
349 29 0.01
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369 11 0.00
370 1 0.00
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376 11 0.00
378 55 0.02
379 5 0.00
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Consensus pattern (357 bp):
TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAATT
TATTAATATTTTGAAAATTAATATTAAAGTTTTAGAAAATAAATTATTTACTAAACAAGTTCAAA
TAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAAAAATT
AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
Found at i:152524 original size:543 final size:539
Alignment explanation
Indices: 151336--156275 Score: 3317
Period size: 543 Copynumber: 9.3 Consensus size: 539
151326 GGTCATACAA
* * * *
151336 TTGTTTAGTCATAAAACAAATT-TTTTTATTCATATAAG-TT-TGTTCGAAATAAAATAATACT-
1 TTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TTCG-AATAAAATAATA-TA
* ** * *
151397 AATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAA--AACATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAATCGA-
62 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAA-TAAATCTATTTATCAAA-CAAG
* * *
151459 TTC-AA-A-TTA-AGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTAT
125 TTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAA-CAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * ** *** * * **
151519 TATAAAATAATAGTTTCGGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAACACAAATTTATTAATAT
188 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * * * *
151584 TTTGACAATTAATAAGTAAAA-ATATAAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACTAGATCAAACAAT
253 TTTGAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
151647 CAAGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-TCTTTGTCTTAAAAAAAT
316 TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT-TTTATCATAAAACAAT
* * * * * * ** *
151711 TATTTCAATTCATATAAGCTTATTAGAAATAAAATCATATTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTG
380 TGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * ** * * *
151776 ATGATTAAGAGTTTTAGAAAATGAATCTATTTACTTAACAAAGTTTAAATAATTATGATTATTTG
445 AAGAGTAAGAGATTAAAAAAAT-AATCTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
151841 AATAATTTTCTATTTGAAATCATTATAATC-TT
508 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATT
* ** * * * *
151873 TTGCTTTGTCATAAAATTATTTTTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGTATAAAATAATACAAATT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATT
* *
151938 TATTAATATT--AAGACAACTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGT
66 TATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAGT-AAA-ATTT-AAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGT
* *
152001 TCAAATCA-TTATAAGTATTTGAACAATTATTTATTTC-AATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
126 TCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* *
152064 TAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTT
190 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
* * * * *
152129 TGACAATTTATATGTAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATG
255 TGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
152194 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTT
320 ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
* * * *
152259 C-AGTTCATGTAAGCCTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAAAGA
385 CTA-TTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAGA
* * * * * * *
152323 GTAAAAGAATTAAAAAAAAATGAATTTGCTTACCGATCAAGTTGAAATAGTTATGACTATCTAAA
449 GTAAGAG-ATT--AAAAAAAT-AATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* *
152388 TAATTATCTATTT-AAAACATTATGACATT
510 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATT
* * * * *
152417 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCATATTTTGAATAAAATAATATAAATT
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATT
*
152482 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAGAAAATAAAGT-TATTT-TCTAAACACGTT
66 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTA-AAAATAAA-TCTATTTATC-AAACAAGTT
* * * * * ** *
152545 CAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATCTGTTTTGTCATA
127 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *** * * *
152610 AACCAATTGCTTCTGTTCAAACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-TCTATTTTATTAA-AATTC
192 AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTT
* * * ***
152673 CAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCTAGTGAGTTCAAATAGTTATGA
256 GAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
*
152738 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
321 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * *
152803 TATTCATACAAAG-TTATTT-ATAATAAAATAACACTAATTTATTACTATTTCAAAAATT-AA-A
386 TATTCATA-TAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAGA
* * * * * * *
152864 --AAGAGATTTAAAAACTAAATCTCTTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACAA
449 GTAAGAGATTAAAAAAAT-AATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *
152927 TTATCTATCTCAAATCATTATAATCTTTATT
513 TTATCTATTTCAAATCATTATGA-C---ATT
* * * * *
152958 TTGTCCTAAATCATTTGTTTCGTCCTAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAGTA
1 TTG------------T-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATA
* * * * ** * * *
153023 AAATATTGCT-AAGTTA-AAATAATTATAAATATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATGTAT
52 AAATAAT-ATAAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AATTT-AAAAATAAATCTAT
** * * * * * ** * *
153086 TTGCCGATCAA-TTTAAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCAATTTCAAATCGTTCTGACC
113 TTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACT
* * * * * **
153149 TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTGTTTGAAATAAAATAAT-TCTA
177 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT-TA
* * *** * * * *
153213 TTTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAA
241 ATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAA
* * * * * *
153277 GTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATCTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATC
305 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * * *** * * *
153342 ATAAAACAAATGTTT-TAGATCATAAAAGCTTGTCCCAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATAT
370 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
153406 TTTAAAAATTGGTAAG-TTAA-AGATTTAAAACATAAATCAGTTTATCGAATC-AGTTAAAATAA
434 TTCAAAAATT--AAAGAGTAAGAGATTAAAAAAAT-AATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * *
153468 TTAT-AGCCATTTGAACATTTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTT
495 TTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACATT
* * * *
153514 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTCG-TCATACAAGCCTA-TTCGTAATAAAATAATATTAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATATAAA
* * * * **
153577 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAA-
64 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA--AAATTT-AAAAATAAATCTATTTATCAAAC-AAG
* * * * * * *
153641 TTCAAATA---AT---TA--TG-ACTATT-TGTATTGCAATTTC-TTATAACTTTTTGTTCTATC
125 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA-ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
153695 GTAAAAAAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATT
189 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
* * * * * *
153760 TTGAAATTTAATAAGCAATAGATTTAAAAAAT-AAT-T-TTTTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTT
254 TTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-C-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * *
153822 AAGGCTATATAAATAATTCTTTATTTTAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAATAATTT
317 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * **
153887 TTTCAATTCTTACTAA-CTTA-TTCATAATAAAAT-TTAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
382 TTTCTATTCATA-TAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** * * * * * * * *
153949 ATCAATAAGAGATTTAATAAATAATTCTGTTTGCTGAACCAGTTGAAATAATTATGACTATTTGA
445 AAGAGTAAGAGATTAAAAAAATAA-TCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * *
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509 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATT
* * * * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATATAAAT
** * * * * *
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* * * *
154169 ATTAGTTATAACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTATTTGTTTTGTTATAAA
129 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA
* ** * * * ** *
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* ** * ** * *
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259 AA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATATGTTT-ATCGAA-CAAGT-TCAAATAGTTAT
* * * *
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319 GACTA-TTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAAT
* * * * *
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* * * **
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* * * * * * *
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194 ACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAA
* ** * * *
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259 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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452 AGAGATTAAAAAAAT-AATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** *
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* * * * *
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** ** *** *
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* * ** * *
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* * * **
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* * * * *
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** *
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* ** * ** *
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* * * * * *
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*
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* * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * **
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* * * *
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* * * * *
156106 ATAATTTTTTATTTTAAATCATTATGACCTT
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* * * * *
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1 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * ** * **
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * * * ** *
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* *
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* ** * * * *
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* * *
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* * **
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * * * *
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*
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* * * *
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* ** * *
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* * *
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* * * * * * * *** * *
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** * * ** *
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* * * * * *
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128 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTT
* * * * * *
153514 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTCG-TCATACAAGCCTATTCGTAATAAAATAATAT-TAA
1 TTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TCTAA
* * * **
153577 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAA-
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1 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATTCTAAT
* * * * * * * * * ** *
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* * * * **
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * *
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**
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* **
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* *
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* *
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* *
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* *
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* * *
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*
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*
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1 A
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*
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* ** *
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* ***
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* * * * * ***
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* *
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * *
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* * * ** * * * * *
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* * * *
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* * * * ** *
177915 AATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTT-
128 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTG
* ** * * * ** * *
177966 TAATAAT-ATTCAAACAATTGGTTT-TGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAAAAATAATAATT
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* * ** ** ** * **
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** * * *
178093 AAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCAATTTCAAAT--TT-TG------G
127 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTG
* * * * *** * * *
178137 TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTA-TTCGTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCAAATTTAA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
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66 TAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAA
* * * * ** *
178265 ATGGTTAAGACTATTAT-AATAATTATTTATTTCAAATTGTTCTGACCTTT-
129 ATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTG
* * * * * *
178315 TTTTAGTCATAAAACAATTGCTTAAGTTCATACAAACTTATCCAGAATAAATTAATACTAATTTA
1 TTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
178380 TCAAT-GTTCAAAAGATTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAATTC
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* ** * * *
178444 AAATCGTTATTCCTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
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* * * * * * ** *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** *
178562 TAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAATTAGTTAAA
66 TAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAA
* * * * *
178626 ATAATTATGGCAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
129 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
* ** * *
178678 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATT-ATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* ***
178742 TTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACCTATCGAA-CAGTT-AG
65 TTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCA-
* * *
178805 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTG
128 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTG
* * * * * ** *
178857 TTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATTC-AGTTAAAAATAATACTAATTGA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTA
* * * * * ** *
178921 ATAATATTCCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTAAACTAGTTCAAA
65 TTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAA
** * * *
178983 TAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTT-
130 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTG
* * * * *
179032 TTGTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAAATA
1 TT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATT
* * * *
179095 TATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAG
63 TATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAG
* * **
179158 CTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTG
124 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
** * * * * *
179215 TTTTGTCATAAAACAATCATTTTAGTTCAAAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATGCTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
179280 TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATATGATT-TCTAAACAAATTTAA
66 TAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAA
* * * * * *
179344 CTAGTTACGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCGTTATGACCTTTTG
129 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
* * *
179396 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * ** * **
179461 TAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGTAA-CTATTTGCCAAATGAGTTCAA
66 TAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAA
* * * * * * *
179525 ATAATTATGGCAATTTTAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACTTTTG
129 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTG
* ** *
179577 TCTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
179640 ATTAATATTTTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-C----C--
64 ATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAA
** * * * *
179695 --AGTT-T--CTATTTGAGTAATTATATATTTCAAATCGTTATAACATTTTG
129 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTG
* * * * * * * *
179742 TTCTGTTATAAAATAATAGTTTCAATTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTAA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * **
179807 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAGTAGTTCAAA
66 TAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAA
* * * ** * * * ** *
179872 CAATTAAGACTACATAAACAATTATCTTTTTTAAATTGTTATAACCTTTTG
130 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
* * ** * * *
179923 TGTTGTCATCAAACAATCATTTTAGTCCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
179988 TAATATTTCAAAAATTAATAAGT---A-ATTTGAAAAGTGAATCTATTTACCGAATCA-TGTCAA
66 TAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGT-TCAA
* * * * * * * *
180048 ATAATCATGGCCATTTCAACAATTTTCCATTTCAAATCATTATTACCTTTTG
129 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
* * * * ** * * * *
180100 TTTAGTTATATAACAAATGTTTTTGATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATGATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
180165 TAATCTTTC-AAA--AATTAGTAAGACATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCAAACCAATTCAAAT
66 TAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAAT
* * * * * ** *
180227 AGTTATGATTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTATTG
131 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTG
* * * * * * * * *
180277 TTCTATCATAAAATAATTATTTCTGTTTATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
180342 TAATATTTAAAAAATTAATAACTAAAAGAATT-AAAAATAAATTTATTTATCGAACCA-TATCAA
66 TAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGT-TCAA
* * * * * * *
180405 ATATTTAAGACTATAAT-AACAGTTATCTATTTCAAAACTTTATGACTTTTTG
129 ATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTG
* * *** * * * *** * *
180457 TTTTATCATAAAATAAAAATTTCAATTCATACTAGCATATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
180522 TAATATTTCAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAATTTTATTTACCTG-ACCAATTC
66 TAATATTTCA-AAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTC
* * *
180586 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTG
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* * ** * * * *** * *
180640 TTTTGTCACAAAACAAATGTTTTTGTTTATATAAGTTTATTTGGAATAAAGTAATACTAATCTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
180705 TAATATTTTGAAAACTAATAAG---G-GATTTAAAAAATAAATCTATATATCAAACCAGTGCAAA
66 TAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTC-AA
* *
180766 ATAGTTATGACTATTT-AACAAATTATTTATTTCAAATCATTAAGACTCTTTG
129 ATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTG
* * * * *
180818 TTCTGT-ATAAAACAATTGTTT-ATGCTCATAAAAGCTTACTCAAATTAAAATAATACTAATTTA
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* * * * * * * ** **
180881 TTAATATTTTGACAATAAATAAGTATA-AAATTCAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAATAAATCA
65 TTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCA
* * * * * *
180944 ATTTGTCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
128 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
* * * * * * *
180997 TTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAACAATACCAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * * * *
181062 CAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTCTTT-GCTGGACAAGTTTA
66 TAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCA
* * * * *
181126 AATAATTATGA-TAATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCACTATAACCTTTTG
128 AATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
* * * *
181179 TTTTATCATAAAATAATTTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-ACAAATAAAATAATA-TAAATT
1 TTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACT-AATT
* * * ** *
181242 TATTAAGA--T---AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA-AAATTTGTTTATTAAACAAGTTCA
63 TATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCA
* * * * ** *
181300 AATCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACTTTTTG
128 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTG
* * * * * * *
181353 TTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTGTTCGTACAAGGTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
181418 TAATTTTTCAATAATTAATAAG-CAGAAGATCTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTGAA
66 TAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAA
* * * * * * *
181482 ATAGTCATGGCAATTTGAATAATTAACTATTGCAAATTATTATGACCTTTTGG
129 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTT-G
* * * * ** *
181535 TTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCAAATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATATTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
181600 TAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAAT-TGGTTTA-CCAACCATGTTCA
66 TAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAACCA-GTTCA
* * * * * * *
181663 AGTAGTTATGGCTATCTAAACAATTATCTATTTTAAAACATTATAACCTTTTG
128 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTG
* * * * * ***
181716 TTCTGTCACAAAATAATTGTTTTCA-TTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * *
181779 AGTAATATTCCAAAAAGTATTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCT
64 ATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
181825 ACTTTCTTGA
Statistics
Matches: 3462, Mismatches: 767, Indels: 336
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
163 5 0.00
164 2 0.00
165 86 0.02
166 4 0.00
167 1 0.00
168 7 0.00
169 81 0.02
170 66 0.02
171 3 0.00
172 3 0.00
173 51 0.01
174 72 0.02
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179 238 0.07
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182 332 0.10
183 191 0.06
184 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
TAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAAT
AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTG
Found at i:179137 original size:717 final size:720
Alignment explanation
Indices: 177249--181822 Score: 3495
Period size: 717 Copynumber: 6.4 Consensus size: 720
177239 TTACCTTTCA
* * * * ** **
177249 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAATC-TACGAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
177313 TTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTTAA
66 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAA
* * * *
177374 ATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAA
131 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
177438 ATAATTATTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGA
195 ATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTCA
* * *** *
177502 AAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGGCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT
258 AAAAT-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT
* * *
177567 A-TATGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTGTT-TTGTCATAAGATAATTATTTCA
322 ATTA-GAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TTGTAGTCATAAAATAATTGTTTCA
** * * * * * * *
177630 GCTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACT-AATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGT
385 TATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT-AATCTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
177694 AAAAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTATCGAACCATTTCAAATAAG-TATAACTATTTGAACAA
448 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * *
177757 TTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTGATAAAATAGTTGTTTT-TGTCCATATAA
511 TTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATGTTTTAGGTCCATACAA
* * * *
177821 GTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAGAATTAATCAA-TAAGAGATTT
575 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAA-AGATTT
* * * * *
177884 AAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATTTATTTC
637 AAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAGTTAAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATTTATTTC
** *
177949 AAATTGTTATAACC-TTT-
702 AAATCATTATGACCTTTTG
** ** * * ** * *
177966 TAATAATATTCAAACAATTGGTTTTG-TTCATACT-ATTTTATTCAAAATAAAAAAATAATAATT
1 TTTTGTTA-TAAAACAATTGTTTTTGATTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * ** ** * ***
178029 TAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGA-AAATAAAAAATAAATCTAATTGTTAAACCAGTTC
64 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTC
** * * *
178093 AAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCAATTTCAAAT--TT-TG-------GTTTTGTCATAA
129 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
178148 AATAATT-TTT-TTATTCGTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTCA
194 AATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA
* * * ** * *
178211 AAAATTAATAAGTAAGAGATCTGAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCATATGGTTAAGAC
258 AAAA-T-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGAC
* * * * * * * *
178276 TATTATAATAATTATTTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGCTTAAG
321 TATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTAGTCATAAAATAATTGTTTCA-
* * * * * *
178341 T-TCATACAAACTTATCCAGAATAAATTAATACT-AATTTATCAATGTTCAAAAGATTAATAAGA
385 TATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAATATTCAAAA-ATTAATAAGT
* * * ** *
178404 AAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAATTCAAATCGTTATTCCTATTTGAATAAT
448 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * *
178469 TGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAACTGTTTTAGGT-AATACAAG
512 TATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TGTTTTAGGTCCATACAAG
* ** * *
178533 CTTATACGGAAT-AAATAATATTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
576 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAA
* * ** * *
178597 AAATAAATTTGTTTACTAAATTAGTTAAAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
640 AAATAAATCTATTTACTAAACCAGTTAAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
*
178662 TCGTTATGACCTTTTG
705 TCATTATGACCTTTTG
*
178678 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATT-ATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* ** * *
178742 TTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACCTATCGAA-CAGTT-AG
66 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCA-
* * * *
178805 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTTATAAA
130 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* ** * *
178869 ATAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATTC-AGTTAAAAATAATACTAATTGAATAATATTCCAA
195 ATAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA
* * *
178933 AAAT-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTAT
259 AAATATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT
* * * * *
178996 TAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTTGTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATC
324 TAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTAGTCATAAAATAATTGTTTCATATC
* * *
179061 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTAAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAG
389 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTAAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* *
179126 ATTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-C
453 ATTT-AAAAAATAAATTTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * *
179189 TTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCATTTTA-GTTCAAAAAAGCTT
516 -TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-GTTTTAGGTCCATACAAGCTT
* * *
179253 ATCCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAA
579 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAA
* * * * * * * * * *
179318 TAAATATGATTT-CTAAACAAATTTAACTAGTTACGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATC
643 TAAATCT-ATTTACTAAACCAGTTAAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC
*
179382 GTTATGACCTTTTG
707 ATTATGACCTTTTG
* ** * * *
179396 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTA
1 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * **
179460 TTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGTAA-CTATTTGCCAAATGAGTTC
66 TTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACCAAACCAGTTC
* * * * * * * *
179523 AAATAATTATGGCAATTTTAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTCTTGTCATAA
129 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
179588 AACAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAA
194 AATAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA
* * * * *
179653 AAAT-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC-----C----AGTT---TCTAT
259 AAATATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT
* ** * * * * * *
179704 TTGAGTAATTATATATTTCAAATCGTTAT-AACATTTTGTTCTGTTATAAAATAATAGTTTCA-A
324 TAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-T-AGTCATAAAATAATTGTTTCATA
* * * * *
179767 TTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATAC-CAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTA
387 -TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * ** *
179831 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAGTAGTTCAAACAATTAAGACTACATAAACAATTA
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* * * * * *
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* * *
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578 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAA
* ** * * * * * * *
180022 TGAATCTATTTACCGAATCA-TGTCAAATAATCATGGCCATTTCAACAATT-TTCCATTTCAAAT
643 TAAATCTATTTACTAAACCAGT-TAAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATT-TATTTCAAAT
*
180085 CATTATTACCTTTTG
706 CATTATGACCTTTTG
* * * * *
180100 TTTAGTTATATAACAAATGTTTTTGA-TCAT-TCAAGCTTATTCGAAATAAAATGATACTAATTT
1 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
180163 ATTAATCTTTCAAAAA-T--T-AGTAAGACATTTAAAAAATAAATC-AGTTTACCAAACCAATTC
65 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACCAGTTC
* * * * * ** * * * *
180223 AAATAGTTATGATTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTATTGTTCTATCATAA
129 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
180288 AATAATTATTTCTGTTTATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTAAA
194 AATAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA
* * * * * * *
180353 AAATTAATAACTAAAAGAATT-AAAAATAAATTTATTTATCGAACCA-TATCAAATATTTAAGAC
259 AAA-T-ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGT-TCAAATAGTTAAGAC
* * * * * * ***
180416 TATAATAACAGTTATCTATTTCAAAACTTTATGA-CTTTTTGTTTTA-TCATAAAATAAAAATTT
321 TATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG---TAGTCATAAAATAATTGTTT
* * ** * *
180479 CA-ATTCATACTAGCATATTTGGAATAAAATAAAAC-AAATTTATTAATATTTCAGAAATTAATA
383 CATA-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT-AATCTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* * * *
180542 AGTAAGAGATTTAAAAAAAATAATTTTATTTACCTGACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGA
445 AGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * **
180606 ACAATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATGTTTT-TGTTTAT
507 ACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATGTTTTAGGTCCAT
* * *** * * ** * *
180670 ATAAGTTTATTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAACTAATAAG---GGATT
571 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATT
* * *
180732 TAAAAAATAAATCTATATA-TCAAACCAGTGCAAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATTATTTA
636 TAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACCAGT-TAAAATAGTTATGGCTATTTGAAC-AATTATTTA
*
180795 TTTCAAATCATTAAGA-CTCTTTG
698 TTTCAAATCATTATGACCT-TTTG
* * * * * *
180818 TTCTG-TATAAAACAATTGTTTATG-CTCATAAAAGCTTACTCAAATTAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
** * * * * * * * **
180881 TTAATATTTTGACAATAAATAAGTATA-AAATTCAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-TAAATCA
66 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCA
* * * * * *
180944 ATTTGTCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
130 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * *
181009 AGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAACAATACCAATTT-ATCAATATTTTG
195 ATAATTGTTTCT-GATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATA-TTTC
* * * * * * * * * *
181072 AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTCTTTGCTGGACAAGTTTAAATAATTATGA
257 AAAAAT-ATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
* * ** * * *
181137 -TAATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTTTT
320 CT-ATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC-TTT-TTGTAGTCATAAAATAA-TTGT
* * *
181200 TTC-TGTTCATACAAGCTTATTACA-AATAAAATAATATAAATTTATTAAGA-T----AATTAAT
381 TTCAT-ATCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATCTAAATTTATTAATATTCAAAAATTAAT
* * ** * *
181258 AAGTAAAAGATTT-AAAAA-AAATTTGTTTATTAAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAT
444 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* ** * * * *
181321 AATTATTTATTTCTAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCT--GTTCGTA
509 AATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TGTTT-TAGGTCCATA
* * * * * * * *
181384 CAAGGTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTCAATAATTAATAAGCAGAAGATC
572 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAGATT
* * * * * * * * **
181449 TAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTGAAATAGTCATGGCAATTTGAATAATTAACTATT
636 TAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACCAGTTAAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATTTATT
* *
181513 GCAAATTATTATGACCTTTTGG
700 TCAAATCATTATGACCTTTT-G
* ** * * ** *
181535 TTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAG-TTCAAATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATATTAATTTA
1 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
181599 TTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAAT-TGGTTTACC-AACCATGTTC
66 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAACCA-GTTC
* * * * * * * * *
181662 AAGTAGTTATGGCTATCTAAACAATTATCTATTTTAAAACATTATAACCTTTTGTTCTGTCACAA
129 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
181727 AATAATTGTTT-TCATTCATGCAAGTTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTAGTAATATTC
194 AATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTT
* * *
181789 CAAAAAGTATTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAAT
256 CAAAAA-TA-TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
181823 CTACTTTCTT
Statistics
Matches: 3059, Mismatches: 649, Indels: 298
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
699 3 0.00
700 130 0.04
701 2 0.00
703 32 0.01
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725 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (720 bp):
TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
TAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
ATATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA
GAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTAGTCATAAAATAATTGTTTCATATCAT
ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
TAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATGTTTTAGGTCCATACAAGCTTATTCAAA
ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACTAAACCAGTTAAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC
TTTTG
Found at i:179774 original size:165 final size:167
Alignment explanation
Indices: 179544--179849 Score: 390
Period size: 165 Copynumber: 1.8 Consensus size: 167
179534 GCAATTTTAA
* * *
179544 TAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTCTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATAC
1 TAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTCTTGTCATAAAACAATAG-TTTTCATCATAC
* ** ** * **
179609 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTA
65 AACCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTATAACTAAGAGATTTA
179671 AAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTTCTATTTGAG
130 AAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTTCTATTTGAG
* * *
179709 TAATTATATATTTCAAATCGTTAT-AACATTTTGT-TCTGTTATAAAATAATAG-TTTCAATTCA
1 TAATTATATATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTCT-TGTCATAAAACAATAGTTTTC-A-TCA
179771 TACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGA
62 TACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATT-ATAACTAAGAGA
179836 TTTAAAAAATAAAT
126 TTTAAAAAATAAAT
179850 TTGTTTGTCG
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 14, Indels: 12
0.82 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
163 4 0.03
164 5 0.04
165 85 0.71
166 1 0.01
168 3 0.03
169 21 0.18
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.06, T:0.41
Consensus pattern (167 bp):
TAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTCTTGTCATAAAACAATAGTTTTCATCATACA
ACCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAA
AAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTTCTATTTGAG
Found at i:180248 original size:177 final size:176
Alignment explanation
Indices: 179767--181794 Score: 939
Period size: 177 Copynumber: 11.3 Consensus size: 176
179757 ATAGTTTCAA
* * * * * *
179767 TTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AGTAA
** ** * ** * * * * ** *
179832 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAGTAGTTCAAACAATTAAGACTACATAAACAATTAT
62 GAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTT
* * ** * * * *
179897 CTTTTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTGTT-GTCATCAAAC-AATCATTTTAG
126 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTAGTCATAAAACAAAT-GTTTTTG
* * * *
179948 TCCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAG-AG
* * * * * * * * * * *
180012 ATTTGAAAAGTGAATCTATTTACCGAATC-ATGTCAAATAATCATGGCCATTTCAACAATTTTCC
65 ATTTAAAAAATAAATC-ATTTACCAAACCAAT-TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTCT
* * *
180076 ATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTAGTTATATAACAAATGTTTTTG
128 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * *
180125 ATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATGATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAGTAAGACA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGA
* * * *
180190 TTTAAAAAATAAATCAGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTGTATAC
66 TTTAAAAAATAAATCA-TTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTAT
** * * * * * *
180255 TTCAAATTGTTATAACCTATTGTTCTA-TCATAAAATAATTATTTCTG
130 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * * * *
180302 TTTATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTAAAAAATTAATAACTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AGTAA
* * * * * * * * *
180367 AAGAATT-AAAAATAAATTTATTTATCGAACC-ATATCAAATATTTAAGACTA-TAATAACAGTT
62 GAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTACCAAACCAAT-TCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATT
* * * * * ** ***
180429 ATCTATTTCAAAACTTTATGACTTTTTGTTTTA-TCATAAAATAAAAATTTCAA
124 TTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * * * *
180482 TTCATACTAGCATATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAGAAATTAATAAGTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAA--AATTAGTAA
* * ** * *
180547 GAGATTTAAAAAAAATAATTTTATTTACCTGACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
62 GAGATTT--AAAAAATAA-ATCATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATT
* * * * *
180612 ATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATGTTTTTG
124 TTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * * * * ** * * *
180665 TTTATATAAGTTTATTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAACTAATAAGGGA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGA
* * * *
180730 TTTAAAAAATAAATCTATATATCAAACCAGTGCAAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATTATT-
66 TTTAAAAAATAAATC-ATTTACCAAACCAATTC-AAATAGTTATGACTATTTAAAC-AATT-TTC
* * *
180793 TATTTCAAATCATTAAGA-CTCTTTGTTCT-GT-ATAAAACAATTGTTTATG
127 TATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTT-TAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * *
180842 CTCATAAAAGCTTACTC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATAAATAAGTA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT--CAA-AAATTAGTA
* * * * * * * * * *
180906 TA-AAATTCAAAAAATAAAT-ATGTTTACCAAA-TAAATCAATTTGTCATGATTATTTGAATAAT
61 -AGAGATTTAAAAAATAAATCA--TTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAT
* * * *
180968 TATT-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAG
123 T-TTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * * * * *
181022 TTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAACAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-CAAA--AATTAGTAA
* * *** * * *
181087 GAGATTTAAAAAAATGAATTTC-TTTGCTGGA-CAAGTTTAAATAATTATGA-TAATTTGAACAA
62 GAGATTT-AAAAAAT-AA-ATCATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT-ATTTAAACAA
* * * * * *
181149 TTATT-TATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTTTTTTCTG
122 TT-TTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAAATGTTTT-TG
* * * *
181205 TTCATACAAGCTTATTAC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAGA--T-AATTAATAAGTAAA
1 TTCATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-AAATTAGTAAG
* ** ** * * *
181265 AGATTTAAAAAA-AATTTGTTTATTAAA-CAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATT
63 AGATTTAAAAAATAAATCATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATT-TT
* ** * * * * *
181328 -TATTTCTAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTG
126 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * * * *
181378 TTCGTACAAGGTTATTC-AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTCAATAATTAATAAGCA
1 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGT-A--A
* * * * * * * * *
181442 GAAGATCTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAA-CAAGTTGAAATAGTCATGGCAATTTGAATAAT
62 G-AGATTTAAAAAATAAATCA--TTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAT
** * * * * * **
181505 TAACTATTGCAAATTATTATGACCTTTTGGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAG
123 TTTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * * *
181560 TTCAAATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AGTAA
* * ** * * * * *
181625 GAGAATTAAAAAATGAATTGGTTTACC-AACCATGTTCAAGTAGTTATGGCTATCTAAACAATTA
62 GAGATTTAAAAAAT-AAATCATTTACCAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTT
* * * * * * **
181689 TCTATTTTAAAACATTATAACCTTTTGTTCT-GTCACAAAATAATTGTTTTCA
125 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * *
181741 TTCATGCAAGTTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTAGTAATATTCCAAAAA
1 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
181795 GTATTAAGTA
Statistics
Matches: 1421, Mismatches: 336, Indels: 180
0.73 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
172 2 0.00
173 42 0.03
174 70 0.05
175 8 0.01
176 18 0.01
177 342 0.24
178 62 0.04
179 79 0.06
180 199 0.14
181 224 0.16
182 201 0.14
183 164 0.12
184 6 0.00
185 2 0.00
186 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (176 bp):
TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGA
TTTAAAAAATAAATCATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATT
TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAATGTTTTTG
Found at i:180979 original size:540 final size:535
Alignment explanation
Indices: 177249--181787 Score: 2843
Period size: 540 Copynumber: 8.5 Consensus size: 535
177239 TTACCTTTCA
* * * * *
177249 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-ATC-TACGAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACTAGCTTATTCGAAATAAAATAATACAAATTT
* * * * * *
177312 ATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTT
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTATTTACCG-ACCAATTC
* ** * * *
177372 AAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATAACCTTTTGTTCTATCATA
128 AAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
177436 AAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTG
192 AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-
* * * ** *
177501 AAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGGCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGAC
256 AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
177566 TATATGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAGATAATTATTTCA
318 TAT-TTAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTAAGACTCTTTGTTCTGT-ATAAAACAATTGTTT-A
* * * * * * *
177630 -GCTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGT
380 TGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * **
177694 AAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCGAACCATTTCAAATAAGT-ATA-ACTATTTGAACAA
445 -AAAGATTCAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAACAAATCAAAT-AGTCA-AGACTATTTGAACAA
* * *
177757 TTATCTATTTC-AAATTGTTATTACTTTTTG
506 TTATCTATTTCAAAACT-TTATGACCTTTTG
* * * ** * * * *
177787 TTTTGTGATAAAATAGTTGTTTTTGTCCATA-TAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACT-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACAAATTTA
* * * * *
177851 TTAATATTT-AGAGAATTAATCAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTT
65 TTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTATTTACC-GACCAATT
* * * * * ** ** **
177913 CAAATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-AATAAT-ATT
127 CAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA-T
* * * ** ** * * * **
177976 CAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAAAAATAATAATTTAATAATATTCC
191 AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
* * ** * * * ** *
178041 AAAACTTAATAACCAAGAAAATAAAAAATAAATCTAATTGTTAAACCAGTTCAAATAGTTAAAAA
256 AAAAATTAATAA--GAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * * *
178106 TATATGAACAATTATCAATTTCAAATT-TT--G-GT-TTTG-TC---ATAAAATAATT-TTTTTA
318 TAT-TTAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTAAGACTCTTTGTTCTGTATAAAACAATTGTTTATG
* * *** * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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** ** * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *** * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* * *
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** *
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*
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* * * * *
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* * * * * * *
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AATAAAAATATAATAGATAAATAAT
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183553 TAATAATTAA
183563 ATAATAATATATAAATAGATAAATAATAATAAATACATATAT
1 ATAATAATATATAAATAGATAAATAATAATAAATACATATAT
*
183605 ATAATAATATATAAATAGAT--A-AATAATAAATATATATAT
1 ATAATAATATATAAATAGATAAATAATAATAAATACATATAT
* * * *
183644 -TAACAGATAAATAAAAAAATAAATAA-AATAAAT--ATATAT
1 ATAATA-ATATATAAATAGATAAATAATAATAAATACATATAT
183683 -TAATAA-ATAGT-AATA-ATAAATAAATAAATAAATACATA
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ATAATAATATATAAATAGATAAATAATAATAAATACATATAT
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183495 TTAAAAGAAA
* * *
183505 ATAATTAGATAAATAAAAATAGTAATAGATA-A-ATAATAATA-AT-AACA-AT-AATAATTAAA
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183564 TAATAATAT
63 T-AT-ATAT
*
183573 ATAAATAGATAAATAATAATAAATACATATATATAATAATATATAAATAGATAAATAATAAATAT
1 ATAAATAGATAAATAAAAATAAATACATATATATAATAATATATAAATAGATAAATAATAAATAT
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66 ATAT
* * * * *
183642 ATTAACAGATAAATAAAAAAATAAATA-AAATAAATATATATTA-ATAAATAG-T-AATAATAAA
1 ATAAATAGATAAAT--AAAAATAAATACATATATATA-ATAATATATAAATAGATAAATAATAAA
* *
183703 TAAATAA
63 TATATAT
* * * * *
183710 ATAAATACATAAGATACAAA-AAATAAATAAATA-AATAA-ATACAAATA
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ATAT
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183544 TAATAACAAT
* * *
183554 AATA ATTA AAT- AAT- AATA TATA AATA GATA AAT- AAT- AATA AATA
1 AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA
* * * * * * *
183598 CATA TATA TAAT- AATA TATA AATA GATA AAT- AATA AATA TATA TATT
1 AATA AATA -AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA AATA
* * * *
183645 AACA GATA AATA AAAA AATA AATAA AATA AATA TATATT AATA AATA GTAAT-
1 AATA AATA AATA AATA AATA AAT-A AATA AATA -A-ATA AATA AATA --AATA
* *
183697 AATA AATA AATA AATA AATA CATA AGATA CAAAA AATA AATA AATA AATA
1 AATA AATA AATA AATA AATA AATA A-ATA -AATA AATA AATA AATA AATA
* *
183747 AATA CAA-A TATAA AATA CAA-A AATAA AATA AA-A ATTA AA-A AATA
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AATA
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* *
183533 ATAAAT-AATAAT-AATAACAAT-AATA-ATTAAATAATA
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*
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* * *
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* * *
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* *
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*
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183500 AGAAAATAAT
* *
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* *
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* *
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*
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* *
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*
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*
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*
183774 ATAAA-AATTAAA-AAATA-A-AAAATA
1 ATAAATAAATAAATAAATACATAAAATA
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183708 AAATAAATAC
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*
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* *
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Done.