Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
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Warning! 357000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 4 of 402
Found at i:284661 original size:46 final size:46
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284601 ATGTGAATCT
** **
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1 CTAAAATTTTTCAAATGAGAATCTTTGAAATTTTGGATGGGAAACC
* *
284657 CTAAAATTTTTCAAATGTGAAT-TTTGGAAATTTTGGATGTGAAACC
1 CTAAAATTTTTCAAATGAGAATCTTT-GAAATTTTGGATGGGAAACC
*
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CTAAAATTTTTCAAATGAGAATCTTTGAAATTTTGGATGGGAAACC
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* *
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* * * * * *
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1 TTTTAAAGTTATTTAGCCTCTGTATAGAGGAGCCCATTTCTTA
* *
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1 TTTTAAAGTTATTTAGCCTCTGTATAGAGGAGCCCATTTCTT
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Statistics
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TTTTAAAGTTATTTAGCCTCTGTATAGAGGAGCCCATTTCTTA
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285673 CTGTAAAGAG
* *
285683 AAACCCATTTCATATTTTAAAGTTGTTTAGCCTCTATATAGAGGAGCCCATTTCTTTTA
1 AAACCCATTTCATATTTTAAAGTTGTTTAGCCTCTATATAAAGGAGCCCACTTCTTTTA
* * **
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1 AAACCCATTTCATATTTTAAAGTTGTTTAGCCTCTATATAAAGGAGCCCACTTCTT
285798 AATTTAAATT
Statistics
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AAACCCATTTCATATTTTAAAGTTGTTTAGCCTCTATATAAAGGAGCCCACTTCTTTTA
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287535 ATACGTTATG
* * * * * *
287545 ATAAATTGAAACAATTATTCTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGACTTT-ATATAAATAATTGT
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* * * * * * *
287609 TCAAATAGT-AAAATCTATTTAAAGTTG-TTCGATAAACAAATTTACTTTTTTAAAATCTCTTGC
65 TCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTAGATAAATAGATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTAC
* ** * * * *
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* * * * * * * * *
287727 ACGAACTA-AAATAATTATTTTATGTCTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGGAATAGAAAATTGT
1 A-TAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * *
287791 GT-TAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGGTTCGACAGACACATTT-TTTTTTAAATCTCTTATTT
65 -TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* *** * * * * *
287853 TTTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTGTTATTTGAATCCAAATAAGCTTGT
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* * * * * * * *
287907 TTGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-TAAAGATTATAATGATTTGAGATAGATAATTGT
1 AT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
287970 TCAAAGAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTCAG-TAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTT
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* ** *
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129 ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT
* * ** * * * * *
288083 ATTAAA-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAACTTATAATGATTTGAAATATATAACTAT
1 A-TAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
288147 TCAAATGGACATGACTATTTGAACTTG-TTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * *
288211 TCAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATACGCATGT
130 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT
* *** * * * *
288264 ATGAATAGAAACAATTGGATAATGACAAAACAAAAGCTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTT
1 ATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
** * *
288329 CAAATAAACATAACTATTTGAACGTGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTAT
66 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * *
288392 TAATTTTTGAAAATATTAATAAATTTA-TATTATGTTATTCAAAATAAACTTGT
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* *
288445 ATAAATAGATACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
1 ATAAATAGAAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
288510 TTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCA-ATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * *
288574 TTAATATTCACAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTAT
130 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT
* ** *** *
288627 ATGAACTA-CTACAATTATTTTATGTTGAAACAGAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAA
1 AT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
288687 AATTAGTTAT
Statistics
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0.77 0.17 0.06
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TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT
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*
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* * **
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* * * ** * * ** * * *
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117 ATTAATAAATTAGTATTATGTTATTCAAAATAAACTTGCATTAA-AAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * *
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181 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT-TTAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * * *** *
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* * * *** * * ** *
287881 TGTTATTTGAATCCAAATAAGCTTGTTTGAAAAGAAACAATTGTTTT
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* * * * * **
287928 ATGATAAAATAAAGATTATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTAAA
1 ATGACAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAAA
* * *
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66 GTGTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGT
* * ** * * ** *
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131 ATTATGTTATTCAAAATAAACTTGCATTAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * *
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196 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAAA-
* *
288188 TTATTTTTTAAATCTCCTACTTATCAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
260 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* *
288253 AATACGCATGTATGAATAGAAACAATTGGATA
325 AATAAGCATGTATGAAAAGAAACAATTGGATA
* *
288285 ATGACAAAACAAAAGCTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAAACATAACTATTTG
1 ATGACAAAA-AAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTT-
* * * * *
288349 AACGTGTTT-AGAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAAATATTAATA
63 AAAGTGTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TCT-CTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATA
* *
288413 AATTTA-TATTATGTTATTCAAAATAAACTTGTA-TAAATAGATACAATTATTTTATGACAAAAA
124 AA-TTAGTATTATGTTATTCAAAATAAACTTGCATTAAA-AGAAACAATTATTTTATGAC-AAAA
** * *
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* * * * *
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251 ATAAATAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** ** ** *
288606 TTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTACTACAATTATTTTATG
315 TTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAA--AAGA-AACAATTGGATA
* * * ** * ** ** **
288651 TTGA-AACAGAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAA-AATT---AG--TTATGCCTA-TTAAA
1 ATGACAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAAA
* * *** * * * *
288707 CTATGTT-A-TTTACATA-TTA-TTTTTAAA---ATTATTAA---T--AGATATTAATAAATTAA
66 GTGT-TTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAG
* * * * *
288760 TA-TATTTTAATC-AAATAAATGTATGAATT-AAA-AAATAA-T-TTTTAT--C-AAACAAAAAG
130 TATTATGTTATTCAAAATAAA-CT-TGCATTAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAG
* * ** * * * *
288816 TTC-TAA-GA-TCGATTTTGA-AATT-ATT--AT-TTCA-AA-TAGTTT-AACTTATTC-ATAAA
192 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTTGTTCGAT-AA
* * *
288869 ATAATTTATTTTTTAAA--TC-AACTTATTAA-----AATAATA--AATAAATTTGTA-TA-TTT
255 ATAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * *
288922 A-ATTGAAATAAG-TTGTAGTTGAATAA-AAAAAATT--TTT
319 ATTTTG-AATAAGCATGTA--TGAA-AAGAAACAATTGGATA
* * * * *
288959 GTGA-AAAATTCAAAAGAT-ATAGT-ATTT-AAATAATTAACTAT-TTCAAATTG-TA-ATGA-T
1 ATGACAAAA---AAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAA-T-TGTTCAAA--GAAACATAACT
** * *
289016 -TTT-ACTTG-TTCA-TAAA-A-ATTT-GTTCTTAAATCT-TCTATTATATAATTT-AAAATATT
59 ATTTAAAGTGTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCT-TATTA-AT--TTTCAAAATATT
* * * * * * * * * *
289072 AA-AAATTA-AATTAAGGTTATTAATAAAT-AA-TT-TATGATAA-AAAGATTTAGTATTAAGAC
120 AATAAATTAGTATT-ATGTTATTCA-AAATAAACTTGCATTAAAAGAAACAATTA-TTTTATGAC
* * * * *
289131 AAAACAAAAGGT-A-ACA--ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATATGCAC-T
182 AAAACAAAAGGTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * ** *** * *
289191 GATCAAGCCAACGGATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTGT-AGAATATTAATAAATT
246 GTTCGA-TAAATAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TCAAAATATTAATAAATT
* * * * * * ** *
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308 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCA-TGTATGAAAAGAAACAATTGGATA
* * * * ***** * *
289304 ACGACAAAACAAATGGTCATCATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGA
1 ATGACAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAA
* * * * * * *
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65 AGT-GTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTA
** * * * * ** * * *
289433 AAATTATTTTATTTC-GAACAAACATATATCTACAA-AAAC-ATT-TGTTACGACAAAACAAAAG
129 GTATTATGTTA-TTCAAAATAAACTTGCAT-TAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * *
289494 ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CCTCAACTATTTGAAC-TGATTC-AGCA
192 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTG-TTCGA-TA
* * * * * *
289556 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTATAATATTATTATATTAGTATTATTT
254 AATAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * *
289621 TATTCTGAATAAGCTTGTTTGAACATAAATAATTGTG-TT
318 TATTTTGAATAAGCATGTATGAAAAGAAACAATTG-GATA
** ** * * ***
289660 ATGACAAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTAA
1 ATGACAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAA
* * * * * * ** *
289725 ACTAGTTT-GGTAAACAGA--TA--ATCT---CCTACTTATTAATTTTGGAAATATTAATGAATT
65 AGT-GTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT
** * * * * * *
289782 AG---TATG--------AATAGGCTTGTATGATGAA-AAACAATTGTTTTACGACAAATC-AAAG
128 AGTATTATGTTATTCAAAATAAACTTGCATTA-AAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * **
289834 TTCATAAAGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCTTAATTATTTGAAC-TGATTTAATAAA
192 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAA
* * ** * * * * * * *
289898 CTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTT-GAAATACTAATAAAGTAATATTATTTAA
256 -TAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * ** ** *
289962 TTTTGGATAAACTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTT
320 TTTTGAATAAGCATGTATGAAAAGAAACAATTGGATA
* * * * * * * ** * *
289999 ATGATAAAACAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAGTATTTGA
1 ATGACAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAA
* * * * *** *
290064 ACT-TGTTCTA-TAAACAAATTTATTTTATTAAATTCCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAAT
65 AGTGT-TTC-AGAAAACAGATTTAGTTT-TTAAA-T-C-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * *** * * * * * * *
290127 AAA-AAGGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTAATTTATGACTAAA
123 AAATTA-GTATTATGTTATTCAAAATAAACTTGCATTAA-AAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
* * ** *
290190 CAAAATGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTT
186 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-G-T
* * * * * * * ** *
290253 TGGA-AAACACATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAACTTTT-ATAATTTTATTAGTTTAGC
248 TCGATAAATA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGT
* * *** * * *** *
290316 AATA-TTTACTCCAAATAA-CTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTT
311 ATTATTTTATTTTGAATAAGC-ATGTATGAAAAGAAACAATTGGATA
* * * *** * * * *** *
290361 ATCAGAAAACAAAGATCATACCAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
1 ATGACAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAAA
* * * * * * * **
290426 CTGATCCTGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
66 GTGTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGT
* * * ** * * ** * *
290491 ATCATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAGTAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGACA
131 ATTATGTTATTCAAAATAAACTTGCATTAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
** * * * * * * *
290556 TAACAATTTGAAAT-GAATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGCTT-GGTAAACAT
196 TAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAATA-
* * ** * *
290619 ATTTATTTTTTAATTCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
258 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * ** *
290684 CGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
323 TGAATAAGCATGTATGAAAAGAAACAATTGGATA
* * * *
290718 ATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAACCATAACTATTTAA
1 ATGACAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAA
* * * * ** *
290783 ATTTGCTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAA
65 A-GTGTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
* *** * * * ** *
290847 ATTATTATTAT-TGTATTTTGAATAAGCTT--TTTATAGCAA-AAATAATTGGTTTATGATAAAA
125 ATTAGTATTATGT-TATTCAAAATAAACTTGCATTA-A--AAGAAACAATTATTTTATGA-CAAA
* * * * * *
290908 ATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACGTGTTC
185 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * ** *
290973 AAAAAAAAAGATTCATTTTTTAAATCT-TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTA-TA
250 GATAAATAA-ATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-TTAGTA
** * * * * *** *
291036 TTATTTTATTAGGAATATGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTT
312 TTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAAAAGAAACAATTGGATA
* * ** *
291081 ATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
1 ATGACAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTT
291125 TGGTAAACAA
Statistics
Matches: 2429, Mismatches: 556, Indels: 423
0.71 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
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311 17 0.01
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315 9 0.00
316 9 0.00
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ATGACAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAAACATAACTATTTAAA
GTGTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGT
ATTATGTTATTCAAAATAAACTTGCATTAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAAAT
TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
ATAAGCATGTATGAAAAGAAACAATTGGATA
Found at i:288760 original size:18 final size:19
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
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288737 ATTAATAGATATTAAT-AA
1 ATTAATAGATATTAATCAA
* *
288755 ATTAATATATTTTAATCAA
1 ATTAATAGATATTAATCAA
288774 AT
1 AT
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ATTAATAGATATTAATCAA
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Alignment explanation
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289118 TTAGTATTAA
* *
289128 GACAAAACAAAAGGT-A-ACA--ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATATGCA
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* ** * *
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* * * *
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* * * *
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1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATA-TGAA
* * ** * * *
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65 CT-GATCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATT
* * * *
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128 AGAATTATTTTATTCT-GAATAAGA-TTGTATCAATACAAAAA-ATTGTGTTAC
* * * * *
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1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATATGAA
* * * *
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65 CTGA-TCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAAT
* * * * * * * *
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127 TAGAATTATTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAATACAAAAAATTGTGTTAC
* ** * * * *
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1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAAC
* ** * * * *
289727 TAGTTTGGTAAAC--A--GA-----T-AATCTCCTACTTATTAATTTTGGAAATA-T--T-AA-T
66 T-GATCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATT
* * * * *
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128 AGAATTATTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAAT-ACAAAA-AATTGTGTTAC
* * * * * * * * *
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1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAAC
* ** ** ** * * * * *
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66 TGA-TCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTA
* * * * * ** * * *
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129 GA-ATTATTTTATTCTGAATAAGA-TTGTATCAATACAAAAAATTGTGTTAC
* * * * * * *
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1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAAC
* * * * ** *
290066 TTGTTCTA-TAAACAAATTTATTTTATTAAATTCCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA
66 -TGATC-AGCAAACAAATTTATTTT-TTAAA-TCTTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * * *
290130 -AAGGTATTATTTTATTTTGAATAAGCA-TGTATGAACTA-AAACAATTAAT-TTAT
126 TTA-GAATTATTTTATTCTGAATAAG-ATTGTATCAA-TACAAAAAATT-GTGTTAC
* * * ** * * * * *
290183 GACTAAACAAAATGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAT
1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAAC
* ** * * * * * * **
290248 TGGTTTGGAAAACACATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAACTTTTATAATTTTATTAGTTT
66 T-GATCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATT
* ** ** * * * * *
290313 AGCAA-TA-TTTACTCCAAATAACTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATC
128 AG-AATTATTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAATACAAAAAATTGTGTTA-C
* * *** * * * *
290364 -AGAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAAC
* * * * *
290427 TGATCCTGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATC--T-CTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
66 TGAT-CAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTA
* * * ** * * * * * * *
290489 GTATCATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAGTAGAAACAATTATTTTAT
129 GAATTATTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAATACAAAAAATTGTGTTAC
* * ** * * * * * *
290539 GACAAAACAAAATGACATAACAATTTGAAATGAATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAAC
1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAAC
* ** * * * ** *
290604 TTGCTTGGTAAACATATTTATTTTTTAATTCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
66 -TGATCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATT
* * * * * *
290669 AGTATTATTTTATT-TCGAATAA-ACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
128 AGAATTATTTTATTCT-GAATAAGA-TTGTATCAATACAAAAAATTGTGTTAC
* * * ** * *
290720 GACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAACCATAACTATTTAAAT
1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAA-
* * * * * * *
290785 TTGCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATT
65 CTGATCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATT
** * * * * *
290850 ATTATTATTGTATTTTGAATAAGCTT-T-T-TATAGCAAAAATAATTG-GTTTAT
128 AGAATTATTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAATA-C-AAAA-AATTGTG-TTAC
* * * * * * *
290901 GATAAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAA
1 GA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAA
* ** * * * * *
290966 CGTGTTCAAAAAAAAAGATTCATTTTTTAAATCTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAT
65 C-TGATCAGCAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAA-
* ** * * * * * * * *
291031 TTA-TATTATTTTATTAGGAATATGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTAT
126 TTAGAATTATTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAATACAAAAAATTGTGTTAC
* ** *
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1 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTT
291125 TGGTAAACAA
Statistics
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0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAAC
TGATCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGA
ATTATTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAATACAAAAAATTGTGTTAC
Found at i:290216 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 289786--291124 Score: 1113
Period size: 181 Copynumber: 7.4 Consensus size: 179
289776 TGAATTAGTA
* * * * * * *
289786 TGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTACGACAAATC-AAAGTTCATAA-AGGTTTG
1 TGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTG
* * * **
289848 AAATAGATAATTGTTCAAATAGCCTTAATTATTTGAAC-TGATTTAATAAACTGATTTATTTTTT
64 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTT-ATAAACAAATTTATTTTTT
** * * * * * *
289912 AAATCTCCAACTTCTCAA-TTTTGAAATACTAATAAAGTAATATTATTTAATTT
127 AAATC-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * ** *
289965 TGGATAAACTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCACAATGATTTTAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* *
290030 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTTGTTCTATAAACAAATTTATTTTATTAA
66 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TATAAACAAATTTATTTT-TTAA
* * *
290095 ATTCCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAA-AAGGTATTATTTTATTT
129 A-TCCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTATTT
* * * * *
290147 TGAATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTAATTTATGACTAAACAAAATGTCAGAACAATTTGA
1 TGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * *
290211 AATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTGGA-AAACACATTTATTTTTT
65 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTT--ATAAACAAATTTATTTTTT
* * * * ** * * * *
290274 AAATTTCTTACTTATTAACTTTT-ATAATTTTATTAGTTTAGCAATA-TTTACTC
127 AAA-TCCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * *
290327 CAAATAA-CTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATCAGAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGA
1 TGAATAAGC-TTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * *
290390 GATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TGATCCTGTAAACAAATTTAGTTTTTA
65 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-T-TTATAAACAAATTTATTTTTTA
* * *
290454 AAT-C-T-CTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTC
128 AATCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * *
290503 TAAATAATTTTGTATGAGTAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGACATAACAATTTGAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * ** *
290568 AT-GAATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGCTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
66 ATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTATAAACAAATTTATTTTTTAA
* **
290632 TTCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
129 ATC-CTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
290684 CGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * ** * * * *
290749 ATAAATAATTGTTTAAATAACCATAACTATTTAAATTTGCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
66 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-TAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * *
290814 TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTATTATTATTGTATTT
130 TC-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * ** * * **
290865 TGAATAAGCTTTTTATAGCA-A-AAATAATTGGTTTATGATAAAAATAAAAGGTCATAATGATTT
1 TGAATAAGC-TTGTAT-GAATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * * * *
290928 GAAATAGATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACGTGTTCAAAAAAAAAGATTCATTTTT
63 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TATAAACAA-ATTTATTTTT
* * * *
290993 TAAATCTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTA-TATTATTTTATTA
126 TAAATCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* * * *
291047 GGAATATGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
1 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
291112 ATAGATAATTGTT
66 ATAGATAATTGTT
291125 TGGTAAACAA
Statistics
Matches: 929, Mismatches: 186, Indels: 88
0.77 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
CCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
Found at i:291212 original size:149 final size:149
Alignment explanation
Indices: 290983--291269 Score: 330
Period size: 149 Copynumber: 1.9 Consensus size: 149
290973 AAAAAAAAAG
* ** * * *
290983 ATTCATTTTTTAAATCTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTATATTATTTTATTAG
1 ATTCATTTTTTAAATC--TACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTTATATTATTTTATTAC
* * * * *
291048 GAATATGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTATTTTATG-TCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
64 AAATAAGCCTATATGAACT-GAAACAATTATTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGA
*
291111 AATAGATAATTGTTTGGTAAACAA
126 AAAAGATAATTGTTTGGTAAACAA
*
291135 ATTCATTTTTTAAATC-ACTTATTAATTTTCAAAATATTAAT-AAGTTAGTATTATTTTATTTCA
1 ATTCATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTTA-TATTATTTTATTACA
* * * * *
291198 AATAAGCCTATATGAACTTATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTTATAACATTTGAAAAA
65 AATAAGCCTATATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAAAA
291263 GATAATT
130 GATAATT
291270 ATTCAAATAG
Statistics
Matches: 114, Mismatches: 18, Indels: 10
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
148 21 0.18
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ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (149 bp):
ATTCATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTTATATTATTTTATTACAA
ATAAGCCTATATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAAAAG
ATAATTGTTTGGTAAACAA
Found at i:291474 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 291126--291495 Score: 470
Period size: 181 Copynumber: 2.1 Consensus size: 181
291116 ATAATTGTTT
* **
291126 GGTAAACAAATTCATTTTTT-AAATC----ACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAGTTAGTAT
1 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATATTAATAAGTTAGTAT
* * ** * * *
291186 TATTTTATTTCAAATAAGCCTATATGAACTTATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTTATA
66 TATTTTAATCCAAATAAGCCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAAGTCATA
* * * *
291251 ACATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAGTTATTATTATTTGAACTTATTC
131 ACATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTC
*
291302 GGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATATTAATGAA-TTA-TA
1 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATATTAAT-AAGTTAGTA
* * *
291365 TTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAT-AAATTAAAAAGTCA
65 TTATTTTAATCCAAATAAGCCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATGAAA-CAAAAAGTCA
*
291429 TAACAATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTC
129 TAAC-ATTTGAAA-AAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTC
291483 GGTAAACAAATTT
1 GGTAAACAAATTT
291496 GAAATAAGCT
Statistics
Matches: 165, Mismatches: 20, Indels: 13
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 18 0.11
177 5 0.03
179 3 0.02
180 56 0.34
181 79 0.48
182 4 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
GGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATATTAATAAGTTAGTAT
TATTTTAATCCAAATAAGCCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAAGTCATA
ACATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTC
Found at i:291591 original size:120 final size:121
Alignment explanation
Indices: 291396--291614 Score: 314
Period size: 120 Copynumber: 1.8 Consensus size: 121
291386 TATATGAACA
* ** *
291396 AAAACAATTGTTTTATGATAAATTAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAA
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAA
* *
291461 TCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTCTAAATAG
66 TCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTCTAAATAG
* * * * * *
291517 AAAA-AATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTTATAGCAATTTAAAATAGATAATTTTTCAAATAA
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAA
*
291581 TCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACAAATT
66 TCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAACAAATT
291615 CATTTTTTAA
Statistics
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121 4 0.05
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AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAA
TCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTCTAAATAG
Found at i:291752 original size:301 final size:300
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Period size: 301 Copynumber: 1.8 Consensus size: 300
291211 GAACTTATAC
** * * *
291221 AATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTTATAACATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAGTTATTA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAATCATAA
* * * * * *
291286 TTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAAT
66 CTATTTAAACTTATTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGCCAAAAT
* * * * * *
291351 ATTAATGAATTATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATA
131 ACTAATAAATTAAATTATGTTAATCCGAATAAGCTTATACGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* *
291416 AATTAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTAT
196 AAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTAT
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261 TCGGTAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTCTAAATAGAAAA
* * * *
291521 AATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTTATAGCAATTT-AAAATAGATAATTTTTCAAATAATCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC-ATTTGAAAA-AGATAATTATTCAAATAATCAT
* *****
291585 AACTATTTAAACTTGTTCGATAAACAAATTCATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGA
64 AACTATTTAAACTTATTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGCCAAA
* * * *
291649 ATACTAATAAATTAGAATTATGTTATTCC-AAGTAAGCTTGTACGAACAGAAACAATTGTTTTGT
129 ATACTAATAAATTA-AATTATGTTAATCCGAA-TAAGCTTATACGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* ** * * *
291713 GACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTG
192 GACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTG
291775 CACTAGTTAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAATCATAA
CTATTTAAACTTATTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGCCAAAAT
ACTAATAAATTAAATTATGTTAATCCGAATAAGCTTATACGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
AAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTAT
TCGGTAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTCTAAATAGAAAA
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Period size: 181 Copynumber: 3.9 Consensus size: 175
291488 ACAAATTTGA
* * * * * * * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
* * * * * * *
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** *
291628 TCTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGAATTATGTTATTCC
128 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-AATTAT-TTATTCC
* * * * ** *
291678 AAGTAAGCTTGTACGAACAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAA
1 AA-TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA
* * * *
291743 TAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGCACTAGTTAGGACAATAGATACATTTTCTAAAT
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-GGA-AATAGATTCATTTTTTAAAT
* * *
291808 TCGTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATATTACTTTATTTCA
128 TC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAAATTA-TTTA-TTCC
* * * * * *
291859 AATAAGAC-TGTTTGAATATAAACGATTTTTTTATGACAAAA-AAATGGTTATAACAATTTGAAA
1 AATAAG-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA
* ** * *
291922 TAAATAATTGTTCAAATAGTTGTAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTGG-AAATAGATTCATTTTTTAAAT
* *
291986 TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTTTCG
128 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAA-ATTA-TTTATTCC
* * * * * * * * *
292034 AACAAACTCGTATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAGCGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
* * * ** *
292099 AGATAATTGTTCAAAT-GACATAATTATTTGAACTAATTCAACAAGCAGAATT-ATTTTTTAAA-
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTGGA-AA-TAG-ATTCATTTTTTAAAT
*
292161 TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
128 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
292193 TATTTTATTT
Statistics
Matches: 420, Mismatches: 81, Indels: 33
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AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTGGAAATAGATTCATTTTTTAAATTCT
TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAAATTATTTATTCC
Found at i:292016 original size:175 final size:177
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Indices: 291517--292215 Score: 625
Period size: 175 Copynumber: 3.9 Consensus size: 177
291507 GTCTAAATAG
* * * * * *
291517 AAAAA-ATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTTATAGCAATTTAAAATAGATAATTTTTCAAATAA
1 AAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
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66 TCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTT
** * * * * *
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130 AAAATATTAATAAATTA-TATTAT-TTATTTCAAATAAGAC-TGTATGAAC
* * * * * * ** * *
291696 AGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAACA
1 AAAAAC-ATTTTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
291761 GTCATAACTATTTGCACTAGTTAGGA-CAATAGATACATTTTCTAAATTCGTTACTTATTAATTT
65 GTCATAACTATTTGAACTAGTT-CGATAAACAGATTCATTTTTTAAATTC-TTACTTATTAATTT
* * *
291825 TCAAAATATTAATAAATTATATTACTTTATTTCAAATAAGACTGTTTGAAT
128 TTAAAATATTAATAAATTATATTA-TTTATTTCAAATAAGACTGTATGAAC
* *
291876 ATAAACGATTTTTTTATGAC-AAA-AAAATGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
1 AAAAAC-ATTTTTTTATGACAAAACAAAAT-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * * * * *
291939 AGTTGTAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTT
64 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTT
* * *
292001 TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTTTCGAACAA-ACTCGTATGAAC
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* * *
292051 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-
1 AAAAACATTT-TTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
292115 GACATAATTATTTGAACTAATTCAACAAGCAGAATT-ATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTT
65 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAG-ATTCATTTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTT
* *
292176 TGAAATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTTCTAAATAA
129 TAAAATATTAATAAA-TTATATTA-TTTATTTC-AAATAA
292216 AGTTTAGTAA
Statistics
Matches: 424, Mismatches: 79, Indels: 36
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (177 bp):
AAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTTTA
AAATATTAATAAATTATATTATTTATTTCAAATAAGACTGTATGAAC
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Indices: 293325--298962 Score: 2651
Period size: 181 Copynumber: 31.4 Consensus size: 180
293315 CGTCAAACAC
* * *
293325 ATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATC
* * *
293390 TGAATTAGCTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCAGAACAATTTCA
65 TGAATTAGCTTGTATGA-AAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* ** * * *
293454 AATTGATCTTTGTTTAAATAATCGTAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAG
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * *
293506 CTTTAATTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAT-T
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
** * * ** * ** *
293570 TCATATACGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTA
66 GAAT-TA-GCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * * * ** * *
293635 AATAAATAATTATTCAAATAGTCATATCTATTTCAACTTGTTTAGCAAACAA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
** *
293687 ATTTATTTTTTTAAA-CATCTTGTTTATTAATTTTATG-AATATTAATAAATTAGTAATATTTTA
1 ATTTA-TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * ** * * * *
293750 T-TCCAAATAGGTTGGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATT
63 TCT-GAATTAGCTT-GTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATT
* * * * * * *
293814 TGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGATTCAACAAACAT
126 TAAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTCAAAAAATAG
* * *
293869 ATTTATTTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATC
* * *
293934 TGAA-TACGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTAA
65 TGAATTA-GCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * ** * *
293997 GATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-AATTCGATAAATAG
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * * * *
294048 ATTTAGTTTTAAAATCTCTTA---A-TAA-TTTTCAAGCTAATAATAAAGTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * ** * * * * * * ** *
294108 TTCAA-TAATTCTGTTTGCATAGAAAC-ATTTTTTTATGATAAAACGAAATG-TCATAATGAGTT
64 CTGAATTAGCT-TGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACAATTT
* * * * * * * *
294170 GAAATAGATAAATGTTCAAATGGA-CATGACTATTTGAACTTGTTCGATAGATGG
127 AAAATAGATAATTGTTCAAAT-AATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * *** * *
294224 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATCAATTTGCAAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TC
* * * * * **
294289 TGAATAAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTAAGAAAAAACAAAAGAACATAATTATTTAA
65 TGAATTAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * *** *
294353 AATAAATAATTGTTTAAACAATCATAACTATTT-AAGCTTGCTCGGTAAATAA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA-CTTGTTCAAAAAATAG
* * *
294405 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
* * * * *
294470 CGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTAA
66 -GAATTAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * *
294534 AATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTAAACATGTTTAGAAAATAG
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* ** * * *
294586 ATATATTTTAAAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-T
** * * * * *
294649 CCAAATAAGCTTATATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTG
64 CTGAATTAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTA
* * * * * *** * *
294712 AAATAAATAATAT-TTCACATAGTCATAACTATTTGACCTTATTTGGTAAACT-T
128 AAATAGATAAT-TGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTT-GTTCAAAAAATAG
* * *
294765 TTTTTTTTTTTGAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTTGAAAT-TTAAATAAATTAATATTATTTTA
1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTGAAATATT-AATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * ** * * *
294828 TTTTAAATAAGCTTATAT-AAACTGACATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGA-CGTAACGAT
63 -TCTGAATTAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAAT
* * * * * **** * *
294891 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAT
125 TTAAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * ** * * *
294947 ATTTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTGAGAAATTAATATTATTTTAATC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATC
* * * * ***** *
295011 TAAATAAGCTTGTATGAAGAA-AAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAAAGTCATATGGGCTTG
65 TGAATTAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTA
* * * *** *
295074 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTTTATTCGGTAAACAG
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAC-TTGTTCAAAAAATAG
* *** * * *
295127 ATTTATTTTTAAAAAT-T-TTACTTATTAATTGCAG-AATATTAATAAATTTGTATAATTTTATT
1 ATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATC
* * * * * * *
295189 TGGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGA
65 T-GAATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * * ***
295254 AAGAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTCCTT-GGTAAATAG
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTT-GTTCAAAAAATAG
* * * * ** * *
295306 ATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAATAATAAATGAAAATTATGTTATT
1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATC
* * * * ** * * ** *
295371 TCATATAAGCATGTACGACTAGAAACAATTGTTTCATGATAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTG
65 TGA-ATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTA
* * * * * * *** *
295435 AAATTGATAACTATTCAAATAGTCATAACTATTTGCACTCG-TCAGGCTAACAG
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCA-AAAAATAG
** ** * *
295488 ATGCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * * **
295552 CTGAATAAGACTAT-T-TGAACACG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATT
64 CTGAATTAG-CT-TGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATT
* * * * * ** * * ** * *
295614 TGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTGTAACTAATTGAACTAG-TCTAGTAAACAT
126 TAAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTC-AAAAAATAG
* * ** * *
295669 ATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
* ** * * * * * * * *
295734 CAAACAAACTTATAT-AAACAAAAACATTTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
66 -GAATTAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * * * * *
295798 AATAAATAATAT-TGCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTGGACAACATA-
129 AATAGATAAT-TGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TT-CAAAAAATAG
* * *
295851 A-TTATTTTTTGAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-T
* * * ** * * * *
295914 CTGAATAAG-TTACTAAGAACTGAAA-ATATTATTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
64 CTGAATTAGCTT-GTATGAAAAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTT
* * * * * * ** * **** * *
295977 GAAATAAAGAACTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTGGCAAACAA
127 AAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTT-GTTCAAAAAATAG
* * * * * *
296031 ATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTT-ATAATATCATTACATTAGTATTAGTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * * * * * * * * * *
296095 CTAAATAAACTTGTGTGAACATAAATAATCGTTTTATGACATAACCAAAGGTCATAACAATTTGA
64 CTGAATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * **** * *
296160 AATATATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAT
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * *
296212 ATTTATTATTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
** * * * * * * *
296277 CGAAAAAGGCTTGAATGATCAA-AAACATTTGTTATATGACCAAACAAGAGGT-AGTAACAATTT
66 -GAATTA-GCTTGTATGA-AAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA-TAACAATTT
* * * * *** * * * *** *
296340 GAAATACATAATTATTGAAATGGCCATAATTATTTGAA-ATGATCCGGTAAACAG
127 AAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTCAAAAAATAG
* * * * *
296394 ATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTTA-TATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATC
* * ** * * * * * * ** *
296458 TCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACGAGTGTTTTATAACAAGACAAAAGGTCAAAATGATTTGA
65 T-GAATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
** * ** * ***
296523 AATAGATAATTGTTCATGTAGTTTTAACTATTTGGA-TTGCTTCGGCAAATAG
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTCAAAAAATAG
* * ** ** * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TC
** * ** * * * * * * * * * *
296640 CAAATAAGCTTGTATGAACTGAGACAAATATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAACGATTTAAA
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* ** * *** *
296705 ATAGGTAA---TT---AT--T--TAA--ATAGGAACTGGTTCGTCAAATCG
130 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * *
296744 ATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTGAAAAAATAATAAATTAGTATTATTCTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TC
* * * * * * *
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* * *** * * **** *
296872 AAATAGATAATTATTGAAATGGCCATAATTATTTGTA-TTGTTTTGGTAAATAA
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTCAAAAAATAG
* * ** * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
* * * * * * * ** *
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66 -GAATTAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * * *
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*
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
* * * * * * *
297170 CGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTA
66 -GAATTAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAA
* * * * * *** * *
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129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * *
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1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * ** * * * * * ** * * * *
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* * * ** * * * *
297411 AATAGATAATTATTCCAATAGTTTTAACTA-TTGAACTGGTT-AGACAAACAC
129 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCA-AAAAATAG
*
297462 ATTTATTTTTTTAAATCT-TGTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-
* * * * * ** * * * **
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* * * * ** * * *** * *
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* * * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
* * * ** ** * ** *
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66 GA-ATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAA
* * * * * * * * ** *
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130 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * *
297826 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCGTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAA-TAGTATTAATTTAA
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTA
* * * * * * * *
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63 TCTGAATTAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTT
* * * * * * * **** * *
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127 AAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* ** * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATC
* * * * ** *
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* * * * * * * ** *
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* * * ** * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATC
* * ** * * * * * *
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65 T-GAATTAGCTTGTATGAAAAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTT
* * * * * * * ** *
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127 AAAATAGATAATTGTT-CAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCA-AAAAATAG
*
298360 ATTTAGTTTTTAAAT-TGCTTA-TTGATTAA-TTTTGTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 ATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTT-ATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * * * * * * **
298422 GT-TCAAACAAACTTATATGAATAA-AAATAATTGTTTAATGATAAAACAAAAAAGTAATAATGA
63 -TCT-GAATTAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAA
* * ** * * * * * * *
298485 TTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCTATAAATAA
124 TTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT
* * ** * * * * *
298607 CGAATAAACTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACAACACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
66 -GAATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAA
* * * * * * * * * * *
298672 ATACATAATTGTTCATATAGTCTTAA-TTTTTTAAATCGGTAT-GACAAACAG
130 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-TGT-TCAAAAAATAG
* * * * ** * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TC
* * * * * * * * * * *
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65 TGAATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAA
* * * * * ** **
298853 ATAGAAAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTTAACCGGTTCAGTAAATAG
130 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAATAG
* *
298904 ATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
298963 TTCAAATAAG
Statistics
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Consensus pattern (180 bp):
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Found at i:293799 original size:362 final size:361
Alignment explanation
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* * * ** * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * * **
293936 AATACGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTT-AAGA
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-A
* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* *** * **
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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191 TATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * ** *
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255 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * *
294609 ACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCCA
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* ** *
294652 AATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * *** *
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* * **
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* * * * ** * * *
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190 GTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * **** * * * *
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* ** * * * *
294971 TTAATTGTCAAAATATTGAGAAATTAATATTATTTTA-ATCTA
320 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
*** * * * **
295013 AATAAGCTTGTATGAAGAAAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAAAGTCAT-ATGGGCTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAA
* * *
295077 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTT-TATTCGGTAAACAGATTTATTTTTAAA
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* ** * * ***
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128 AATCTTACTTATTAATTTTATGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * * * *
295204 TGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAAGAGATAATTGTT
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* * ** *** *
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* * * ** *
295332 TTAATTTTTAAAATAATAATAAATGAAAATTATGTTATTTCA
320 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * *
295374 TATAAGCATGTACG-ACTAGAAACAATTGTTTCATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
** * * * ** * **
295438 TTGATAACTATTCAAATAGTCATAACTATTTGCACTCGTCAGGCT-AACAGATGCATTTTTT-AA
65 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGG-TAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * **
295501 ATCCATTACTTATTAATTTTCA-AAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAGACTA
129 AT-C-TTACTTATTAATTTT-ATGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-CT-
* * * *
295565 T-T-TGAACACG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
189 TGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* ** * * ** * * *
295627 TATTTAAATAGTTGTAACTAATTGAACTAG-TCTAGTAAACATATTTAGTTTTTAAATCTCTTAC
253 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-AAAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* ** *
295691 TTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCA
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* * * * ** * * *
295736 AACAAACTTATATAAACAAAAACATTTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* *
295801 AAATAA-TATTGCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTGG-ACAACATAA-TTATTTTTTGA
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** * * **
295863 ATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCTGAATAAG-TT
127 AAATCTTACTTATTAATTTTAT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* * * * * * *
295925 ACTAAGAACTGAAA-ATATTATTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAAC
190 -GTATGAACTGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * **** * * * *
295989 TATTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGT
253 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * *
296054 TATTAATTTTT-ATAATATCATTACATTAGTATTAGTTTA-TTCTA
318 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
* * * * * * **
296098 AATAAACTTGTGTGAACAT-AAATAATCGTTTTATGACATAACCAAAGGTCATAACAATTTGAAA
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* * * * * *
296162 TATATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACATATTTATTATTTAAAT
65 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-
* * * *
296227 CTCTTACTTATT-ATTTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGGCTTG
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* * ** * * * * * *
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* * * * * * * *** * * * *
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*
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320 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * *
296461 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACGAGTGTTTTATAACAAGACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * ** ** * * * * * *
296526 AGATAATTGTTCATGTAGTTTTAACTATTTGGA-TTGCTTCGGCAAATAGATTTATGTTTTAAAT
66 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-
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296590 CTCTTAGTTATTAATTTTCA-AAATATTCTTAAATTAGTATTCTTTAATTCCAAATAAGCTTGTA
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* * * * * * * * * *
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* *** * *
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* * * * *
296772 ATTTTTGAAAAAATAATAAATTAGTATTATTCTATTCCG
323 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
296937 AATCAGTTGCTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAACTATTATTATTTTATTTCAAATAAACTT
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* * * * * *
297001 ATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT-GTACAATT
190 GTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG-ATAATT
* * * *
297065 ATTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTCAAAAAA-ATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
254 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
*
297129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
319 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * ** *
297172 GATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * *
297237 AAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTCAAAT
66 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAAT
* * * * * ** *
297302 C-T-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCTAAATAAATTTGTTTGA
131 CTTACTTATTAATTTTATGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA
* * ** * * * *
297365 TA-TGAAAGAAATAATTTATGACTAAA-AAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCCA
196 -ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
** * * *
297428 ATAGTTTTAACTA-TTGAACTGGTT-AGACAAACACATTTATTTTTTTAAATCT-TGTACTTATT
260 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-AAAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCT-TACTTATT
* *
297490 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTA
322 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* *** ** * *
297530 AATAAGCTTGTAGGATAAAAAAACAATCATTTTAT-AAAAAAGTAAAAGGTCATAATGATTTGAA
1 AATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * *
297594 ATAAATAATTATTCAAACAGCCATAATTATTTTAA-TTGATTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTAA
64 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * *
297657 AATTTTTTACTTATCAATTTTA-GAAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCATATAAGCTT
128 AA--TCTTACTTATTAATTTTATG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* ** * * * * *
297721 GTATTAACTGAAACAATTACTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAACAATTTTAAATAGACAATTA
190 GTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * ** ** * * *
297786 TTCAACTAGTAATAGCTATTTAAACTTATTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCGT
255 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * *
297851 ATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAA-TAGTATTAATTTA-ATCTG
319 ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
* * * * * * *
297893 AATAAGCTTGTATAAACTGAAGCAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAGAT
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * *
297958 AGATAATTGTTCTAATA-TCTTAACCATATGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTACTTTTT-AAAT
66 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAAT
* * *
298021 C-T-CTTATTAATTTTCA-AAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTAT
131 CTTACTTATTAATTTT-ATGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * **
298082 GAAC-AAAAAAATTGTTTTAT-A-ACAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTGATAATCGTTCA
194 GAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * ** * * *
298144 TATAGTCTTAACAATTTGAACTGGTT-AGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT-CATTATT
259 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-AAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATT
* ** * *
298207 AAGTTTCAAAATATTATTAAAATAGTATTATTTTATTTCA
322 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
** * * * * * *
298247 AATAAAATAGTATGAA-T-AGAACTAATTATTTGATGACAAAACAAAATGTTATAATAATTTGAA
1 AATAAGCTTGTATGAACTGA-AAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * * *
298310 ATATATAATTATTACAAATAGTC--AACTATTTCAAATGGTTAGGTAAACAGATTTAGTTTTTAA
64 ATAAATAATTATT-CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * *
298373 ATTGCTTA-TTGATTAATTTTGTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTT-CAAACAAACTT
128 AAT-CTTACTT-ATTAATTTTATGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTT
* * * * * * * * *
298436 ATATGAA-TAAAAATAATTGTTTAATGATAAAACAAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAAATAAT
190 GTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * *
298500 TACTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCTATAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACT
253 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * *
298565 TATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTTCG
318 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * **
298609 AATAAACTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACAACACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * * ** * *
298674 ACATAATTGTTCATATAGTCTTAA-TTTTTTAAATCGGTATGACAAACAGATTTATTTTTTACAT
66 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA-AA
* * * * * * * * ** *
298738 CTCTTAGTAATGAATTTTCA-AAATATTATTAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAACTTGTA
129 ATCTTACTTATTAATTTT-ATGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * * * * * *
298802 TGAA-TAGAAATAAATGTTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGAAAATTATT
193 TGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * ** *
298866 TAAATAGTCATAACTATTTTAACCGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTACT
257 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
*
298927 AATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
322 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
298967 AATAAGC
1 AATAAGC
298974 AAGTATGTTG
Statistics
Matches: 4252, Mismatches: 950, Indels: 401
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
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349 7 0.00
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351 1 0.00
352 4 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (361 bp):
AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAAT
CTTACTTATTAATTTTATGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA
ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
Found at i:296867 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 296563--296891 Score: 398
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 169
296553 TTTGGATTGC
* * * **
296563 TTCGGCAAATAGATTTATGTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTCTTAAATTAGT
1 TTCGGCAAATAGATTTATGTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTCAAAATAATAATAAATTAGT
* * * * *
296628 ATTCTTTAATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAGACAAATATTTTATAATAGAATAAAAGGTTA
66 ATTATTTAATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTA
* *
296693 TAACGATTTAAAATAGGTAATTATTTAAATAGGAACTGG
131 TAACGATTTAAAATAGATAATTATTGAAATAGGAACTGG
* * * *
296732 TTCGTCAAATCGATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTGAAAA-AATAATAAATTAG
1 TTCGGCAAATAGATTTATGTTTTAAATCCCTTACTTATTAA-TTTTCAAAATAATAATAAATTAG
* * *
296796 TATTATTCT-ATTCCGAATAGGCTTGTATG-A-TGAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAA-
65 TATTATT-TAATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAAATATTTTATAACAAAACAAAAG
*
296857 GTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTGAAAT
127 GTT-ATAACGATTTAAAATAGATAATTATTGAAAT
296892 GGCCATAATT
Statistics
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0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (169 bp):
TTCGGCAAATAGATTTATGTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTCAAAATAATAATAAATTAGT
ATTATTTAATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTA
TAACGATTTAAAATAGATAATTATTGAAATAGGAACTGG
Found at i:299383 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 299050--300093 Score: 779
Period size: 181 Copynumber: 5.8 Consensus size: 179
299040 GGTAATAACA
* * * * * * * *
299050 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAAT
1 ATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAGTTCAT
* * * * * * ** *
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* *
299177 TTATTTTCTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAGTATT
126 TTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
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1 ATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAGTTCATAAT
* * * * * *
299296 AATTTTAAATAAATAATTATGCAAATAATCATAACTATTTGAATTTGTTCGATAATCAGATTTAT
66 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-AAACAGATTTAT
* *
299361 TTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATT
130 TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
299412 AATTTATTTT-GACTAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTT-AG
1 ATTTTATTTTAGA-TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-TAAA-AAAAAGTTCAT
* * * * * * * *
299475 AATGATTTGAAATAGAAAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAC-TGATTCGGCAAATACAT
63 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTC-GAAAACAGAT
* * *
299539 TTATTTTATAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTATTAAATTAGTATT
126 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
299593 -TTTTA-TTTAAATAAACTTGTATGATCAGAAACAATTTTTTTTTATGACAAAACAAAGATCATA
1 ATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAA--TTGTTTTATGATAAAAAAAAGTTCATA
* * * * ** ** * * * *
299656 ATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGGTTGTAATTATTTGAACTAGTATGGAAAACAGCTTT
64 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGT-TCGAAAACAGATTT
*** * * * * * * *
299721 GGGTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTCTAAAATACTAATAAAGTAGCATT
128 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * *
299773 ATTTTATTTTGGATAAG-TTCTGATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGCTT-AT
1 ATTTTATTTTAGATAAGCTTGT-ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAG-TTCAT
* * ** * * *
299836 AATGATATT-AAATAGATAATTATTCAAATACTCATATCTATTTGATTTTATTCAGTAAACATAT
63 AATGAT-TTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTC-GAAAACAGAT
*
299900 TTATTTTTTTTAAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATT
126 TTA--TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * * *
299956 ATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCGA-A
1 ATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAAAAAAGTTC-ATA
** * * * *
300020 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACTATCTGAACTTGTTCGACAAAACATATT
64 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCG--AAAACAGATT
300085 TATTTTTTA
127 TATTTTTTA
300094 TTATTAAGTT
Statistics
Matches: 669, Mismatches: 157, Indels: 74
0.74 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
179 31 0.05
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182 95 0.14
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184 31 0.05
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
ATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAGTTCATAAT
GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGAAAACAGATTTATT
TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
Found at i:301085 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 301053--301085 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
301043 ACAAAAGGTC
301053 ATAATGATTTGAAATAG
1 ATAATGATTTGAAATAG
*
301070 ATAATTATTT-AAATAG
1 ATAATGATTTGAAATAG
301086 TTATGACTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
ACGTcount: A:0.48, C:0.00, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (17 bp):
ATAATGATTTGAAATAG
Found at i:301086 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 300120--302259 Score: 1543
Period size: 180 Copynumber: 12.1 Consensus size: 180
300110 ATCTTAATAC
* * * * * * * * *
300120 GAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTCTATGATAAAA-TAAAGATCATAATAATTTG-AG
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * **
300183 TA-ATAATTGTTCAAATAGTCGTAATTATTTAAACTGGTTTGGTAAACATATTTAGATTTTAAAT
66 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
300247 CTCTTA-TTA--ATTTTTAAAATATCACTAAATCAATATTATTTTATTTT
131 CTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
** * * * *
300294 GAATAATTTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * * *
300359 TAGATACTTATTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTT-TAGTACATAGATTTATTCTTTAA
66 TAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAA
* *
300422 ATCTCCTA-TCTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
129 ATCTCTTACT-TATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * *
300475 AAATAA-ATATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAA--A---G--
1 GAATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * * * *
300532 -TAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTA-TTGAGCTTATT-TAGTAAACATATTTATTTTATAA
65 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * ** *
300594 ATATTTTACTTATCAATTTTTTTAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
129 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * *
300647 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTCAGAACT-ATTTG-A
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAA
* * *
300710 ATAGATAATTGTTCATATTGTCA-AAGCTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAACATATTTATTTTTT
65 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACT-TGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTT
* ** * **
300772 -AAT-TTTTACTTATTAATTTTTTAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCA
127 AAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * ** * *
300824 AAATAAGCTTATATGAAT-GAAAGAATT-GTTTATGACAAAACAAATCGTCAAAATGATTAGAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * *
300887 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCGATAAACAAATTCATTTTTAAAAT
66 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* *
300952 CTCTTACTCATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTT
131 CTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * **
301003 GAATAAGC-TATATGAATTGATACAATTATTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * *
301067 TAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGTTTGATAAATATATTTATTTTTTAAAT
66 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * **
301132 CTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
131 CTCTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * *
301183 AAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
301248 TAAACAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTAAACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
66 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* ** *
301312 CTTTTACTTATTAATTGTTTGAATATTATTAAATTTA-TATTATTTTA-TTT
131 CTCTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * **
301362 GAAATATGCTTGTATGAATAGAAA-AATCATTTCATCACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAA
1 G-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * *
301426 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTTGTT-TAGTAAATAGATTCATTTTTTAA
65 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * *
301490 ATCTCTTA-TTA--AGTTTCAGAATATTAAT-AGTTAG-ATTATGTTATTTCT
129 ATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-T
* * * * *
301538 -AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTATTGTGATAAAACAAAAGGT--T-AT-A-TTAAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * ** * * *** * * *
301597 TATATAATTGTTTAAACT-GTCATAACTATTTGCTCTGGTT-AAGCGGATAGATTCATTTTTTAA
66 TAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAA
* * *
301660 ATC-CATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCT
129 ATCTC-TTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * **
301713 GAATATGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAAAATAAATGGTCATAACAATTTGAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * *
301778 TAAAAAATTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTGAACTGGTT-TAGTAAATAGATTT-TTTTTT-AA
66 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * *
301839 TC-C--ACTTATTAATTTTGAAAATAGTAATAAATTAATATTCTTTTA-TTT
130 TCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * *
301887 -CA-AA-CTTATTTGAACAAAAAC-ATT-TGCTTATGACAAAA-AAAGAGGTCATAACGATTTGA
1 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT-TTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGA
* * * * * *
301946 AATATATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAGTTC-AGCAAACAAAATTATTTTTTA
64 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * *
302010 AATCTCTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCT
128 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * **
302064 AAATAAG-TTAGTAAGAACTAAAAAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
1 GAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * * *
302128 AATA-AGGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTC-AGCAAATAAATTTATTTTTT
64 AATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTT
* * * * ** *
302191 AAATCTCTTAGTTCTTAATTTTAGAATATTATTGCATTATTATTATTTTATTTT
127 AAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
*
302245 GAATTAGCTTGTATG
1 GAATAAGCTTGTATG
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CTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
Found at i:301097 original size:708 final size:699
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* * * *
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1 AATAAGCTTATATG-AATGAAACAATTGTT-TATGATAAAACAAAG-TCA-AAT-ATTAGAAATA
* * * * * * * * *
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* * * * *
300250 -T--TATTAATTTTTAAAATATCACTAAATCA-ATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA
124 TTACTATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAA-GTTGTATGAA
* * ** *
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187 TAGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * *
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252 AGTTATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATT-TTTAAATCTCCTACT-TATTAATT
* * * *
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315 TTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGAT-TGTATGAACAAAAACAATTG
* *
300504 TTTTATGATAAAACAAAAGATCATAA-A-GT-AAAT-AATTATTCAAACAGTCATAACTA-TTGA
378 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAGATGTAAAATAAATTATTCAAACAGT-ATAACTATTTAA
* * * * * *
300564 GCTTATTTAGTAAACATATTTATTTTATAAATATTTTACTTATCAATTTTTTTAATAATAATAAA
442 ACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTATAAATATTTTACTTATCAATTGTTTGAATAATAATAAA
*
300629 -TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTAGTTT-ATAACAAAACA
507 TTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-AATCA-TTTCATAACAAAACA
* * *
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* * * * *** * *
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692 TTATTTC-A
* *
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1 AATAAGCTTATATGAATGAAACAATTGTTTATGATAAAACAAA--GTC-AAAT-ATTAGAAATA-
300890 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCGATAAACAAATTCATTTTTAAAATCTC
61 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTT-GATAAACAAATTCATTTTT-AAATCTC
* *
300955 TTACTCATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTATATGAAT
124 TTACT-ATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGTTGTATGAAT
* * ** * *
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188 AGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * **
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253 GTTATGACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATT-
* * * *
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315 TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACAAAAACAATTGTT
* * * *
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* * * * *
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441 AACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTATAAATATTTTACTTATCAATTGTTTGAATAATAATAA
* * *
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506 ATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAATCATTTCATAACAAAACAAAA
* * * * *
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* * *
301474 TAGATTCATTTTTTAAATCTCTTATTAAGTTTCAGAATATTAATAGTTAGATTATGTTATTTCT
636 CAGATTCATTTTTTAAATCTCTTATTAAGTTTCAGAATATTAATAATTAGATTATGTTATTTCA
* * *
301538 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTATTGTGATAAAACAAAAGGT--TATATTA-AAATAT
1 AATAAGCTTATATGAAT-GAAACAATTGT-TTATGATAAAAC-AAA-GTCAAATATTAGAAATA-
* * * * *
301600 ATAATTGTTTAAACT-GTCATAACTATTTG-CTCTG--GTTAAGCGGATAGATTCATTTTTTAAA
61 ATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAATTTGTTGATAAAC--A-A-ATTCA-TTTTTAAA
* * * * *
301661 TC-CATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATATGATTGT
120 TCTC-TTAC-TATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAG-TTGT
* * ** * * *
301725 ATGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAAAATAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTGTT
182 ATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * *
301790 CAAATAGTTA-AACTAATTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTT-TTTTTTAA--TCC-ACTTATTA
247 CAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTAAATCTCCTACTTATTA
* * * *
301850 ATTTTGAAAATAGTAATAAATTAATATTCTTTTATTTCAAACT--TA-T-T-TGAACAAAAACAT
312 ATTTTG-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAA-TAAGATTGTATGAACAAAAACAA
* * * * *
301910 TTG-CTTATGACAAAA-AAAGAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAA
375 TTGTTTTATGACAAAACAAA-AGATCATAA-GATGT-AAA-ATA-AATTATTCAAACAG-TATAA
* * ** * * * * * *
301973 TTATTTGAAC-TAGTTCAGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATT-TTTGAAA
434 CTATTTAAACTTA-TTCAATAAACAAATTTATTTTATAAATATTTTACTTATCAATTGTTTG-AA
* * * * * * *
302036 TATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCT-AAATAAG-TTAGTAAGAACTAAAAAAAATTATTTTA
497 TAATAATAAATTTATATTATTTTATT-TGAAATAAGCTT-GTATGAAC--AGAAAAATCATTTCA
** * * * * * * * *
302099 CGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AGGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGA
558 TAACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGA
* * * * *
302163 ACTGGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
622 ACTTGTTCAGAAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTA
302201 GTTCTTAATT
Statistics
Matches: 1141, Mismatches: 175, Indels: 121
0.79 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
699 3 0.00
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Consensus pattern (699 bp):
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TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTGATAAACAAATTCATTTTTAAATCTCTTACTAT
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TTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGAC
TATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTGAAATATTA
ATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
CAAAAGATCATAAGATGTAAAATAAATTATTCAAACAGTATAACTATTTAAACTTATTCAATAAA
CAAATTTATTTTATAAATATTTTACTTATCAATTGTTTGAATAATAATAAATTTATATTATTTTA
TTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAATCATTTCATAACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTG
AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTTGTTCAGAAAACAGATTCATTTTTTA
AATCTCTTATTAAGTTTCAGAATATTAATAATTAGATTATGTTATTTCA
Found at i:301356 original size:360 final size:355
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* * * * * * *
300092 TATTATTAAGTTAATATTATCTTAATACGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTCTATGA
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* * * * ** * * * * **
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65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA
*** * ** * * * *
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** * * ** *
300281 ATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTCA
194 ATTATTTTATTTTGAATAA-GCTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * *
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258 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGAT
*
300411 TTATTCTTTAAATCTCCTA-TCTATTAATTTTCAGAA
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* * * *
300447 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAA-ATATGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TATATGAA-AAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
300511 ATAAAACAAAA-G-----ATCA-TAAAGTAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTA-TTGAGCTT
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* * * * * * * * *
300568 ATTTAGTAAACATATTTATTTTATAAATATTTTACTTATCAATTTTTTTAATAATAATAAATTAG
129 ATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAG
* *
300633 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTC
193 TATTATTTTATTTTGAATAAGC-TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * *
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257 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAA-CTATTTGAACT-TGTTTAGTAAATA
* * * **
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320 GATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTCAAA
* ** *
300796 TATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTATATGAATGAAAGAATTG-TTTATGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAAAAAAACAATTGTTTTATGA
** * * *
300859 CAAAACAAATCGTCAAAATGATTAGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTA-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * *
300924 GTTCGATAAACAAATTCATTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAG
129 ATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAG
* * * * **
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193 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
301054 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGTTT-GATAAATATA
258 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAATAGA
*
301118 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAA
322 TTTATTTTTTAAATC--TTACTTATTAATT-TTCAAA
* * * *
301155 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
301220 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAACAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTAAACTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * *
301284 ATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTGAATATTATTAAATTTA
129 ATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAA-TTA
* * * *
301349 -TATTATTTTA-TTTGAAATATGCTTGTATGAATAGAAA-AATCATTTCATCACAAAACAAAAGG
192 GTATTATTTTATTTTG-AATAAGC-TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGG
* * * *
301411 TTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTTGTTTAGTAAATA
255 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATA
* *
301476 GATTCATTTTTTAAATC-T-CTTATTAAGTTTCAGAA
320 GATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTCA-AA
* * * * * * * *
301511 TATTAAT-AGTT-AGATTATGTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTATTGTGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGA
* * * ** *
301574 TAAAACAAAAGGT--T-AT-ATTAAAATATATAATTGTTTAAACT-GTCATAACTATTTGCTCTG
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTAAAATAAATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTT
* *** * * * *
301634 GTT-AAGCGGATAGATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT
129 ATTCAA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATT
* * * * * * * *
301697 AGCATTACTTTATTCTGAATATGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAAAATAAATGG
191 AGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGG
* * * * *
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255 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATA
* *
301826 GATTT-TTTTTT-AATC-CACTTATTAATTTTGAAAA
320 GATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTT-CAAA
* * * * *
301860 TAGTAATAAATTAATATTCTTTTATTTC--A-AA-CTTATTTGAACAAAAACATTTG-CTTATGA
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
301920 CAAAA-AAAGAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAAC-
65 CAAAACAAA-AGGTCATAATGA-TTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * *
301983 TAGTTCAGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
128 TA-TTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT
* * * * * * * * ** *
302048 TGTTTTATTTTATTCTAAATAAGTTAGTAAGAACTAAAAAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAG
191 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-GTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAG
* * * * * * *
302113 GTCATAACAATTTGAAATA-AGGAATTGTTCATATAGCCT-TAACTATTTGAACTGGTTCAGCAA
254 GTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAA
* * *
302176 ATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTCTTAATTTT-AGAA
317 ATAGATTTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTTCA-AA
* ** *
302217 TATTATTGCATTATTATTATTTTATTT
1 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
302244 TGAATTAGCT
Statistics
Matches: 1437, Mismatches: 283, Indels: 152
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
345 3 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (355 bp):
TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAAAAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAATGATTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAT
TCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTTTGAATAAGCTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTA
TTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTCAAA
Found at i:302317 original size:75 final size:74
Alignment explanation
Indices: 302191--302343 Score: 209
Period size: 75 Copynumber: 2.1 Consensus size: 74
302181 TTTATTTTTT
* * * * *
302191 AAATCTCTTAGTTCTTAATTTTAGAATATTATTGCATTATTATTATTTTATTTTGAATTAGCTTG
1 AAATCTCTTAGTTATTAATTTTAGAATATTATTGCATTAATATTATTTTATTATGAATAAGCATG
*
302256 TATGTACAA
66 TATGAACAA
*
302265 AAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAG-ATTAATATTATTTTATTATGAATAAGCA
1 AAATCTCTTAGTTATTAATTTT-AGAATATTATT-GCATTAATATTATTTTATTATGAATAAGCA
*
302329 TGTATGAACAT
64 TGTATGAACAA
302340 AAAT
1 AAAT
302344 AATTGTTTTA
Statistics
Matches: 69, Mismatches: 8, Indels: 3
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
74 21 0.30
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ACGTcount: A:0.36, C:0.07, G:0.08, T:0.48
Consensus pattern (74 bp):
AAATCTCTTAGTTATTAATTTTAGAATATTATTGCATTAATATTATTTTATTATGAATAAGCATG
TATGAACAA
Found at i:302592 original size:255 final size:250
Alignment explanation
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Period size: 250 Copynumber: 2.0 Consensus size: 250
302321 AATAAGCATG
*
302331 TATGAACAT-AAATAATTGTTTTATGACATAAAA-AAA-AGTTATAACAATTT-AAAGTATATAA
1 TATGAAC-TGAAATAATTGTTTTATG--ATAAAATAAAGAGTCATAACAATTTCAAA-TATATAA
* ** * * *
302392 TTGTTCAAGTAGTCATAACTTTTTGAA-CTGCTTTGGTAAACAAATTTAGGTTTTAAATCTCTT-
62 TAGTTCAA--A--CATAACTAGTTGAATCTG-TTCGATAAACAAATTAAGGTTTTAAAT-T-TTA
* **
302455 ACATA-TTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAGGCTTATATG-
120 AC-TAGTTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTATATGA
* * *
302516 ATGAAAAACAATTACTTTATTACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAA
182 AT-AAAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATACATAATTGTTCAA
302581 ACTTT
246 ACTTT
*
302586 TATGAACTGAAATAATTGTTTTATGATAAAATAAAGGGTCATAACAATTTCAAATATATAATAGT
1 TATGAACTGAAATAATTGTTTTATGATAAAATAAAGAGTCATAACAATTTCAAATATATAATAGT
* * * ** *
302651 TTAAACATGACTAGTTGAATTTGTTCGATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTTAACTAGTTAATT
66 TCAAACATAACTAGTTGAATCTGTTCGATAAACAAATTAAGGTTTTAAATTTTAACTAGTTAATT
* * **
302716 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGT
131 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAAAAACAATTAC
** * *
302781 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATACTTAATTGTTCAAA
196 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATACATAATTGTTCAAA
302832 TAGTCAGAAC
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TATGAACTGAAATAATTGTTTTATGATAAAATAAAGAGTCATAACAATTTCAAATATATAATAGT
TCAAACATAACTAGTTGAATCTGTTCGATAAACAAATTAAGGTTTTAAATTTTAACTAGTTAATT
TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAAAAACAATTAC
TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATACATAATTGTTCAAACTTT
Found at i:302913 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 302586--303274 Score: 682
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302576 TTCAAACTTT
* * * * ** * * *
302586 TATGAACT-GAAATAATTGTTTTATGATAAAATAAAGGGTCATAACAATTTCAAATATATAATAG
1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
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65 TTAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTACTTA-T
*
302711 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTG
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* **
302762 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATACTTAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * *
302827 TCAAATAGTCAGAACTATTTGAACTCGCTCGATAAACAAATTTGTTTTTTGAATCTTTTACTTAT
66 T-AAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTAT
* *
302892 TAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTC
128 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTG
* * * * * *
302942 TTTGAATAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAATGGTCATAATGATTTG-CATAGATAATTTT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
** *
303006 TAAAATAGTCATAACTATTTGAACATATTCAGA-AAA-TGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTAT
66 T-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTC-GATAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTACTTAT
* *
303069 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TAATATTTTA-TTCAAATTAAGCTTG
128 TAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAA-TAAGCTTG
* * * * * * *
303120 CATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATGTTTTGAAATAGATAATTGC
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-
* * * * *
303185 TTAAATAGTCATAATTGTTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTCATTTTTTTAATTCTCTTACTTT
65 TTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATT-T-TTACTTA
* *
303250 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATT
127 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
303275 GTTTAGTAAA
Statistics
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
TAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTACTTATTAA
TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
Found at i:303975 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 303287--308975 Score: 4110
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303277 TTAGTAAACA
* * * *
303287 TATTTTTTAAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
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* * * * * **
303352 GAATAAGCTTGAATGAACAGAAACAATTG-TTTATGGTAAAAGAAAAAGTCATAATAATTTGAAA
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* * * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * * * *
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64 -GAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * *
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* * * * * * *
303650 CATTTTTTAAATTTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATT-ATAGCA-TAGTATTATTTTATTTCA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTAATTCG
* * ** * * *
303713 AATAAGCTTATATAAACTGAAATAATT-TTTTATCACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * ** *
303777 AGACAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGTTCTAGTTCGATAAACATATT
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* * * * * * * *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* * * *
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66 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * *
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* ** ** *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* * * * * * *
304067 TTACAAACTTATATGAACAAAAAC-A-TGTTTTTAATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTCA
66 --ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTT-ATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * *** * * *
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* * * *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATTCG
* ** * * *
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65 AATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * *
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* * * * * * *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
** * * * * * * *
304431 ATAAATTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTA
66 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * ** ** *
304496 TACAATTGTTTAAATAGTCATTATTATTTGAACCGGTTCGGCAAACAAATTT
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* * *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CG
* * * * ** * * *
304612 AATAAGCTTATGTGATAAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTCAAA
65 AATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
304730 CATATTTTAAATCACCTACATATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATATTATTTTG-
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* * ** *
304794 ATAAGCTTATATGAACTAAAACAATAATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-ACGATTTTAAATA
66 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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1 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCG
* * *** * ***
304973 GATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTG-TTTATG-TCAAAATAAATTATCATAACGA-TTGTAA
65 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTG-AA
* * * *
305035 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGATAAATAGAAT
128 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGATAAACAGATT
* * * * *
305089 TATTTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTATTTT-ATTC
1 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-
* ** * * * * *
305152 CAAATAAGCTTGTAAT-ATA-TGAAACAAATATTTTATGACT-AAACAATAGAT-TTGAACGATT
63 CGAATAAGCTTGT-ATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCAT-AACGATT
* * * ** * * * *
305213 TAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATATAAACTGGTTCGACAAAC--ATT
124 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATT
** * *
305269 TATTTTAGAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAA-CC
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAATTC
* * * * * * ** * *
305328 GAATAAACTTATATG---AGAAACAATTGTTTTATCAAAAAAC-AAAGATTTTAATGATTTGATA
64 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * *
305389 TTGATATTTGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATATATT
129 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATT
* * * * *
305442 TATTATTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* *
305507 ATAAGCTTGTATGATA-AAAAAGAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
66 ATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
** * * * *
305571 AGATAATCATTCAAATAGCCATAATTATTTTAACT-GATTC-AGTAAACAGATC
130 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGA-TAAACAGATT
* * * * *
305623 TATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAA-TTTGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCCA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* * * * * * * * *
305686 ACTAAGCTTGTATTAACTGAAAA-AATTGTTTAATGACAAATCAAAATGTTATAATGATTTTAAA
66 A-TAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
305750 TAGACAATTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATT
129 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATT
* *
305803 TATTTTTTTAAATCTCCTT-CTTA-TAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTT-ATT
1 TA-TTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
* * * * *
305864 CTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACT-AAACAAAATGTCAAAACGATTTG
63 C-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * * * * * * *
305928 AAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACCATTTAAACTAATTTGGTAAGCAAATT
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATT
* ** *
305984 TATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAGTTTTCCAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* * * * *
306045 ATAAGCTTGTATGAAC-AAAATAATTTTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
66 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * ** **
306109 GAAAATCGTTTATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAATTAGATT
131 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATT
* * * * * * * * *
306160 TATTTTTTAATTTTCTTGGC-TATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTTTG
1 TATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCG
** * * * * * * *
306224 AATAAAATAGTATGAAC-AGATCTAATT-TTTTATGATAAAATAAAAGATTATAATGATTTGAAA
65 AATAAGCTTGTATGAACAAAAAC-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * * *
306287 TAGATAATT-ATCCAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAGCAAATT
129 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATT
* * * * * **
306339 TACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAAGTTTTGAATTATTAATAAATTAATATTATTTTTTTTC-A
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* *** * * * *
306403 AAAAGGCTTGTATGTTGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAATAGGTAATAACGATTTGAAAT
66 ATAA-GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
306468 AGATAGTTGTTTAAAT-GACCATAATTATTTGAACTAATTCAATAAACTA-ATT
130 AGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAAC-AGATT
** * * * *
306520 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGG
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* * * ** * * *
306585 ATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTGATGGCAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATA
66 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * *
306650 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATT
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* * * * *
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** * * * *
306765 GAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGACT-AAATAAAAGGTCAGAACGATTTGAA
64 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* ** * * * * * *
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* * * * *
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1 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* ** * * *
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64 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
** * * * * * *
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* *
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* * * *
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1 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * ** * * * *
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64 -GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* ** * * * * * ** *
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* * * *
307422 TTTTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCAA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGA
* * * * * *
307487 ATAAGTTTGTATGAA-AAGAAACAATAGTTTTATGA-CAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAGAT
66 ATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
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* * * * * * *
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1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-
** * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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64 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * *
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* * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * **
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* * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* *** * * *
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*
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* * * * ***
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * **
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** * * * * *
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* * *
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* * * * ** * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* * ** ** *
306121 TATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTTGGCAATTAGATT
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* * *
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** * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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*** * * * * *
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* * * * ** *
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* * *** * *
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1 TATTTTTTAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * ** * * *
306585 ATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTGATGGCAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATA
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*
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * ** * * * *
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* * *** * * **
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* * *
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* * * * * * * ** * *
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* * * ** * * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * *
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** * * * ** * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *** * * **
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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129 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * **
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * *
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*** * * * *
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* * *
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*
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AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAA
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* * *
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* * * * *
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AC
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* * *
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*
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * ** *
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**
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* *
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*
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* * * ** *
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* * * *
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* * ** * **
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* * * * * * *
311863 AATCA-TGTCAAATAATCATGGCCATTTCAACAATTATTTATTTCAAAT
128 AACCAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT
* * * * *
311911 TGTTATTACCTTTTGTT-TGGTCATATAACAAATGTTTTCAATCATTCAAGCTTGTTT-AGAATA
1 TGTTATAACCTTTTGTTCT-GTCATA-AA-AAATATTTT-ATTCATACAAGCTTATTTAAGAATA
* * * * ** * * *
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* * *
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* * * *
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1 TGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAA-AA-TATTT-TATTCATACAAGCTTATTTAAGAATAA
* * *
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63 AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACT
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* * * * *
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** * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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*
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* * *
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** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * **
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* * * * * *
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* * * * * **
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*
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* * * * * **
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64 TTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAA-GCTT
** * * *** *** **
314242 ATTTTATTAACAT--T-C-AAAAAATTAATA-AGCAAGAAATTAA-AAAAAAA
128 ATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AAATTAATAAGTAAA
* * * * *
314289 ACCTG-TTTACTGAACAAGTTTAAAT-AG-TTATG-ACTATTTGAACA-A-TTAT--CTATTTTA
1 A---GATTTA---AA-AA--ATAAATCTGTTTATGAACTAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGA
* * **** * * * * * *
314346 AGTAAATA-TGACCTTTTGTTTTATTATAAAACA-ATTGTTTCAGTTCAT-AAA-AGTT-TATCC
56 A-TAATTATTTA--TTTCAAATCATTAT--GACATTTTGTTT-TG-TCATAAAACAATTGT-TTC
* * * * ** * * * * * * *
314406 AAAATAAAATAATATTACTT-TATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGTTAGAGA-TTTAAAAATT
113 -TATTCATATAAGCTTA-TTCGAATAA-A-AT--AATACTAATTTA-TTA-ATATTTTAAAAATT
* *
314468 AGTTTA-TCAAA
170 A-ATAAGT-AAA
* * * ** * *
314479 TTA-ATTCAAATAAT-TATGGC-CATT-TGAAC-AATT--AATAATTAT--CTATTT---T-ATC
1 --AGATTTAAAAAATAAAT--CTGTTTATGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT-
* * *** * * *
314531 TA--T-TTT-AAATCGTTATAACCA-TTTGTTCCATTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATCTAA
61 TATTTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAA
* * * * * * *
314590 GTTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATGAATAACTAAG
124 GCTTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * *
314647 AGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTGCTGAAGC-AGTTCAAACAGTTAAGACT-TTATGAATAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAATAATTA
* * * ** * * *
314710 TCTATTTCCAATCGTTATGACCCTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCC
63 TTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCT
* * *
314773 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
127 TATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* ** * * * * * * * * *
314827 TGATTTAAAATGTGAATCTATTTATTGAA-TCAATTAAAATAATTATGGCCATGTCAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * * *
314891 CTATTTCAAATTATTATTACCTTTCG-TTTGATCATATAACAATTGTTTTTGA-ACAT-TCAACC
64 TTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAT-AAGC
* * * * * *
314953 CTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAACATTAATAAGTAAG
126 TTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * * *
315008 AGATTTAAAAAATAAATATGTATATTGTACTAATTTAAATAATTATGACTGTTTGAATAATTGTA
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT
* * * * * * * * *
315073 AACTTCAAATCATTATAACCTTTTACTTTT-TCGTAAGATAATTATTTCTATTCATACT-AGCTT
65 TATTTCAAATCATTATGACATTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-TAAGCTT
* * * ** *
315136 ATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAACATTCCAAAAATTAATAACTAAA
128 ATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
315189 AGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCTGAA-TCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * *
315253 CTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTAATTCATACT-AGCT
64 TTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA-TAAGCT
* *
315317 TATTCATAATAAAATGAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
127 TATTC-GAATAAAAT-AATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * ** * *
315367 AGATTTAAATAATAAATCTATTTATCAAACCAACTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT
* *
315432 TACTTCAAATCATTATGAC-TTTTTTTTTGT
65 TATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
315462 TATATGTTCA
Statistics
Matches: 2126, Mismatches: 495, Indels: 328
0.72 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
166 2 0.00
167 10 0.00
168 16 0.01
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170 14 0.01
171 19 0.01
172 33 0.02
173 33 0.02
174 24 0.01
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176 8 0.00
177 76 0.04
178 79 0.04
179 76 0.04
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183 25 0.01
184 5 0.00
185 5 0.00
186 2 0.00
187 2 0.00
188 11 0.01
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190 4 0.00
192 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTT
ATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATT
CGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
Found at i:313807 original size:543 final size:533
Alignment explanation
Indices: 312498--314213 Score: 1704
Period size: 543 Copynumber: 3.2 Consensus size: 533
312488 ATACTAATCT
* * * * *
312498 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCAAACT-AGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-TAACTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTA
* * * *
312561 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGCTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
64 TTTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT
* * *
312626 ATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAA
127 ATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * * *
312691 TAAATCTGTTTA-CTGAACTAGATCAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATT
192 TAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACAATTTGAATAATTATTTATTTAAAATC
*
312755 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAA
255 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATATAAG-TTATTCGAAATAAAA
* * * *
312820 TAATACTAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTAT
318 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-AT-A-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTAC
* * * * * * * * *
312885 CAGATAAGTTTAAATAATTATGA-TAATTTGAATACTTATTTATTTGAAATCACTATAACCTTTT
380 CA-A-CAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * ** *
312949 ATTTTATCATAAAATAATTTTTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTT
442 ATTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATGT
* *
313014 ATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAA
506 ATTAATATCAAGACAAATAATAAGTAAA
* * * * *
313042 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTTAAATCGTTATGACTATCTGAATAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAACTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* *
313107 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTCGTTTAGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGGTTAT
66 TATTTCAAATTGTTATGACTTTT-GTTTTG-CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAT
* * * *
313172 TCGAATTATAATAATATTAATTTATT-ATTTTTTGAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
129 TCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* ** * * * ** * *
313236 AATATGTTTATTAAACAAGTTGAAATAGTCATGGCAATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCGTT
194 AATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACAATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATT
* * * *
313301 ATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGCTCAAATAAGTTCATTTGAAATAAAATAA
258 ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATATAAGTT-ATTCGAAATAAAATAA
* * * *
313366 TACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTATTGAGTAAAAGGTTTAAAAAATGAATCTGTTTACCAA
321 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA-T-A-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCAA
* * * * * *
313431 CCATGTTCAAACAGTTATAACTATCTGAACAATTATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTT
383 -CA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTT
* ** * *
313496 TGTCACAAAATAATTGTTTTCATTCATGCAAGCTTGTTTTGAATAAAATAATATAAATGTATTAT
446 TGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATGTATTAA
313561 TACTCCAA-A-AAATAATAAGTAAA
511 TA-T-CAAGACAAATAATAAGTAAA
* *
313584 A-ATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTTG-A-CACTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC--GAATAACTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
313645 ATTTATTTC-AATTCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCAATTTATAAAAGC
63 ATTTATTTCAAATT-GTTATGAC-TTTTGTTTTG-CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGC
* * * ***
313709 TTTTTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
125 -TTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA
* * * * * *
313773 AAAACAAATCTATTTATCGAGCGAGTTCAAATAGTTATAAATATTTGAATAATTATTTATTTTAA
188 AAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATACA-ATTTGAATAATTATTTATTTAAA
* * * * * *
313838 ATCATTGTGAGATTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAAATTATTCAAAATA
252 ATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATAT-AAGTTATTCGAAATA
* * * *
313903 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA-ATAAGAGATTTAAATAGTAAATCTATTTAT
315 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTATATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTA-
* * * *
313967 CGAATCAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA--TTTTT
379 CCAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTA
* * * * * *
314030 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATATGGAGTAAAATATTTCTAAAT-TA
443 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATA-ATATAAATGTA
* * * * *
314094 ATAATAT-AATAAAAATTGATAAGTAAG
507 TTAATATCAAGACAAA-TAATAAGTAAA
* * * * * * * * * * *
314121 AGATTTAAACAATAAATGTGTTTGTTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACTATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAACTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* *
314186 TATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTT
66 TATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTT
314214 AGTTATATAT
Statistics
Matches: 965, Mismatches: 173, Indels: 74
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
534 2 0.00
535 1 0.00
536 4 0.00
537 66 0.07
538 68 0.07
539 74 0.08
540 16 0.02
541 108 0.11
542 102 0.11
543 383 0.40
544 138 0.14
545 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (533 bp):
AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAACTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
TATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC
GAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
TCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATACAATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATG
ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTCATATAAGTTATTCGAAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTTTAAAAATTATATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCAACAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA
TAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATGTATTAATATCAAGACA
AATAATAAGTAAA
Found at i:315925 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 315584--316573 Score: 866
Period size: 181 Copynumber: 5.5 Consensus size: 179
315574 CATTATGACC
* * * * *
315584 TTCTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-GTAGTTAATATTCCAAAAA-TAAT
1 TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTA-TTAATATT--AAAAATTAAT
* * * ** * *
315647 AATTAATAGATTTAAAAAATGAATATATTTATTGAACAAATT-AAATAATTATGACTATTTGAAT
63 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * ** *
315711 AATTATTTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATTAAATGATTTT
128 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * ** ***
315763 TTTTGTTCATGCAAGTTTATTTTCAATAAAATAATGCAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATA
1 TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATA
* *
315828 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAAC
64 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAAT
* * * *
315892 AATTATTTATTTCAACTTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAAAAATTAT
128 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * * * * *
315944 TTTTGTTCATACAAGCTTCTTTGGATTAAAATGATTTTAATTTATTAATATGTTGACAATTAATA
1 TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATA
* * * *
316009 AGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
64 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
** * * * * * *
316074 ATTATTTATTTCAAATCATTATCACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTGT
129 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * *
316125 TTCAGTGT-ATATAAGCCTATTT-GAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
1 TTCTGT-TCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAA
* * * * * * * * * *
316188 TGAGTAAGAGAATTAAAAAA-AGAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATCTAA
62 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** *
316252 ATAATTATCTATTTCAAAATATTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAG
126 ATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * *
316306 TTCTGTT--T--ATGC--A---AGAATAAAATAATATAAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATA
1 TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATA
* ** * *
316362 AGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTTA-TTAACATA-CTCAAATAGTTTTGACTATTTGAA
64 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
316424 TAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTCTGTTTTGCCATAAACCAATTAT
127 TAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * *
316477 TTCTGTTCATACAAACTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATA
1 TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATA
* *
316542 AGTAAAAGATTAAAAAAATAAATCTATTTACC
64 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACC
316574 AAGCTATCAT
Statistics
Matches: 656, Mismatches: 126, Indels: 56
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
170 2 0.00
171 85 0.13
172 45 0.07
173 4 0.01
175 3 0.00
177 6 0.01
178 1 0.00
179 42 0.06
180 97 0.15
181 366 0.56
182 2 0.00
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAG
TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
TATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
Found at i:319788 original size:145 final size:147
Alignment explanation
Indices: 319595--319860 Score: 347
Period size: 145 Copynumber: 1.8 Consensus size: 147
319585 GATTTTAAAA
* * ***
319595 CACCAAAAATCATGAAATATTAAAAAAATTAAGATTTGGAAAATTTCATGAAAATTTGAGCTCAA
1 CACCAAAAATCATGAAATATTAAAAAAATTAAGATCTAGAAAATTTCATGAAAATCCAAGCTCAA
*
319660 AAAAGCCAATTTACAAAAATACCCCTATAAAGGTATTTTAGTAATTTCACA-TTTCTCATGGTAC
66 AAAAGCCAAATTACAAAAATACCCCTATAAAGGTATTTTAGTAATTTCACACTTTCTCATGGTAC
319724 TGCTATGATTTCAAATG
131 TGCTATGATTTCAAATG
* ** * ***
319741 CACCAAAAGTCATGAAATATT-ATGAAATTGAGATCTAGAAAATTTCATGAAAATCCAAGCTTGG
1 CACCAAAAATCATGAAATATTAAAAAAATTAAGATCTAGAAAATTTCATGAAAATCCAAGCTCAA
* * * ** *
319805 TAAATCCAAATTACAAAAATACCCTTATAGGGGTATTTTGGTAATTTCACACTTTC
66 AAAAGCCAAATTACAAAAATACCCCTATAAAGGTATTTTAGTAATTTCACACTTTC
319861 CTTGGTATAA
Statistics
Matches: 100, Mismatches: 19, Indels: 2
0.83 0.16 0.02
Matches are distributed among these distances:
145 76 0.76
146 24 0.24
ACGTcount: A:0.42, C:0.15, G:0.12, T:0.31
Consensus pattern (147 bp):
CACCAAAAATCATGAAATATTAAAAAAATTAAGATCTAGAAAATTTCATGAAAATCCAAGCTCAA
AAAAGCCAAATTACAAAAATACCCCTATAAAGGTATTTTAGTAATTTCACACTTTCTCATGGTAC
TGCTATGATTTCAAATG
Found at i:320349 original size:36 final size:36
Alignment explanation
Indices: 320309--320426 Score: 112
Period size: 36 Copynumber: 3.3 Consensus size: 36
320299 ACATCACAGT
**
320309 TCAAAAAATAAAAAATGACCGAGATGACATCGTAAA
1 TCAAAAAATAAAAAATGACCGAGACAACATCGTAAA
* * * * *
320345 TC-AAAAATAAAGAATGACTGGGACAACACCGTAAG
1 TCAAAAAATAAAAAATGACCGAGACAACATCGTAAA
* * * **
320380 TTAAAAAATAAAAAGTGACCAAGACAACATCACAAA
1 TCAAAAAATAAAAAATGACCGAGACAACATCGTAAA
*
320416 TCAAAACATAA
1 TCAAAAAATAA
320427 GGAATGATAG
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 19, Indels: 2
0.75 0.23 0.02
Matches are distributed among these distances:
35 27 0.44
36 35 0.56
ACGTcount: A:0.56, C:0.16, G:0.13, T:0.15
Consensus pattern (36 bp):
TCAAAAAATAAAAAATGACCGAGACAACATCGTAAA
Found at i:320453 original size:72 final size:71
Alignment explanation
Indices: 320298--320681 Score: 231
Period size: 73 Copynumber: 5.3 Consensus size: 71
320288 TTTTGACTCT
* * * ** **
320298 AACATCAC-AGTTCAAAAAATAAAAAATGACCGAGATGACATCGTAAATCAAAAATAAAGAATGA
1 AACACCACAAGTT-AAAAAATAAAAAGTGACCAAGACAACATCACAAATCAAAAATAAAGAATGA
320362 CTGGGAC
65 CTGGGAC
** *
320369 AACACCGTAAGTTAAAAAATAAAAAGTGACCAAGACAACATCACAAATCAAAACATAAGGAATGA
1 AACACCACAAGTTAAAAAATAAAAAGTGACCAAGACAACATCACAAATCAAAA-ATAAAGAATGA
320434 -TAGGGAC
65 CT-GGGAC
* * ** * * * * *
320441 AACACCACAAGTTAGAAAATAAAGAGTGA-CTGGCATAACA-CCCTAAGTAAAAAAATAGAGAAT
1 AACACCACAAGTTAAAAAATAAAAAGTGACCAAG-ACAACATCAC-AAAT-CAAAAATAAAGAAT
* *
320504 GACTGTGAT
63 GACTGGGAC
* * * * * *
320513 GACACCACAAGATGAAAAATAATACAA-TGACCAAGACAACA-CTGCAAGTCAAAAAATAAAAAA
1 AACACCACAAGTTAAAAAATAA-A-AAGTGACCAAGACAACATC-ACAAATC-AAAAATAAAGAA
** *
320576 CAACTAGGAC
62 TGACTGGGAC
* * ** * * * * *
320586 AACACTACAAGTCAAAAAATAAAAAAACGATCAAGACAACACCACAAGTCAAAAAATAAAAAATA
1 AACACCACAAGTTAAAAAAT-AAAAAGTGACCAAGACAACATCACAAATC-AAAAATAAAGAATG
*
320651 ACTGGGAT
64 ACTGGGAC
* * *
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TGGGAC
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*** * * * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* *** * ** *
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* ** * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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AAAAATAAAGAATGACTGTGATAACACCACAAGTAA
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* * *
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* * * * **
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* * *
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* **
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* * * * * *
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*
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CTAGGACA
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* *
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* * * * * * *
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* ** * * * * * * *
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AACAATAGAATAACT
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* * * * * * *
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* * *
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*
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** *
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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*
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*
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* *
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* **
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* * * * *
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* * *
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* *
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* *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * *
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* *
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*
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1 CTAATCTAGGCTTA
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* * * *
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*
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** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
333098 TCGTAAAACAATTATTTTTATTCACACAAAATTATTCAATATAAAATAACACTAATCTATTAATG
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* * * ** * *
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128 ATT-ATAAAATTAATGAGAGTAAACTTAAAAAATAAATATGTTTACTGA-ATA
* *
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ATAAAATTAATGAGAGTAAACTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAATA
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1 AA
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* * * *
333505 GAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAGATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCAT
1 GAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT
* * * *
333570 GACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTGTGACCTTTTG-TTT-T-ATAATAA-AA----
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA-AATAATTGT
* * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * ** * *
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* * * * *
334187 TTGTTCAAATAA-ATTTTTTCGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTT
130 TTGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTC
* * * *
334239 GAAAA-T--T-AGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAA
1 GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
334299 CAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCATTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
66 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
* * * * * * *
334364 TATTGATA-TAGTCTTA-TTCATAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTT
131 TGTTCATACAAG-CTTATTTGA-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC
* * ** ** * * *
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1 GAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
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65 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * ** * * * *
334544 ATGTTCGTACAAGTTTATTCAAAATAACATAATTCTAACTTGTTAATATTTT
130 TTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC
** * * * *
334596 GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAATTTGAAGT-TATTTATCAAA-TAAGTTTAAATAGTTAT
1 GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTAT
* * * *
334659 GACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTA-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATT-TT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * *
334722 TTATGTTCATACAAGTTTATTTCAATTAAAAAAATACAAATTTATTAATA-TTC
129 TT-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC
* * ** * * * *
334775 AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAGGAAATAAATCTATTTATC-AAGTAAGTTCAAATAGTCAT
1 -GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
334839 GACTATTTGAACAATTA--TATTCCAAATCATAATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATT
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* *
334902 TTTGTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTT
129 TTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTC
* * * *
334955 GACAATTAATAAGTAA-AGATGTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAA-TAAGTTCCAATAGTTGT
1 GAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTAT
* ** * * ** * * *
335017 AAAGATTTGAATAATCATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTA
64 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * *
335082 TTAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
129 TTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC
* *
335135 AAAAATTATTGAA-TAAGAGATTT--AAAA-AAA-------ACCAAACTAGTTCAAATAGTTATG
1 GAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
335189 ACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTT
65 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* ** *
335254 CTGTTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATAT
130 TTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATAT
335303 CTCAATAGTA
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GAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
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TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC
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*
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1 AATAATTATGACTATTTG
333950 AA
1 AA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATAATTATGACTATTTG
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333935 AATTATGATT
* * * *** * * * *
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1 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-
* * * * * *
334009 GTTTATACAAATTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-ATGGAAATTAATAACT
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* * * * * * * * *
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** ** * * * * * *
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* * *
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*
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* *
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* * * * **
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** * * * * * *
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* * * * *
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188 TA--TATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAG
* * * * *
334557 TTTATTCAAAATAACATAAT-TCTAACTTGTTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
250 CTTATTCGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAA
* * * * * **
334621 AATTTGAAGTTATTTATCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACT
313 AA-AT-AAATTGTTTACCAAATAAG-TTCAATAGTTAT-AAA
* ** * * *
334663 ATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTA-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATT-TTTTAT
1 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-
* * * *
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* * *
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128 AAAGATTTA--AAATAAATCTATTCA-CAACTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* *
334856 TATTCCAAATCATAATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAT
190 TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAT
* * *
334921 TTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAGATGTTAAAAATAA
255 TCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAGAT-TTAAAAATAA
*
334986 ATATGTTTACCAAATAAGTTCCAATAGTTGTAAA
319 AT-TGTTTACCAAATAAGTT-CAATAGTTATAAA
* * * * *
335020 GATTTGAATAATCATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTATTA
1 -ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA
* * *
335085 GTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTATTGAA-
65 GTTCATA-AAGTTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAGAAAATTAAT-AAG
* * *
335148 TAAGAGATTTAAAA-AAA---A-CCA-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTT
126 TAAAAGATTTAAAATAAATCTATTCACAACTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA--TT
* * * * *
335206 CTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTA
189 ATATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTA
* *
335271 TTCCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATAT
254 TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
335303 CTCAATAGTA
Statistics
Matches: 810, Mismatches: 148, Indels: 93
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
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353 1 0.00
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ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAG
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GATTTAAAATAAATCTATTCACAACTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATTTC
AAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA
TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAATAAATTGTTT
ACCAAATAAGTTCAATAGTTATAAA
Found at i:336751 original size:18 final size:19
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* *
336700 AAATGGTCATAACGATTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTA
*
336719 AAATAG--ATAATTATTT-
1 AAATAGTCATAACTATTTA
336735 AAATAGTCATAACTATTT
1 AAATAGTCATAACTATTT
336753 GATCTAGTTT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 4, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAGTCATAACTATTTA
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335296 TTAATATCTC
* * * * *
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* * * *
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* * * * *
335429 ATTGTTTTATCG-C-AGA-AATATGTCATAACGATTTGAAATAGCTAA-TAGTTCA
128 ATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCA
* * * * * * * * * * *
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1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTA
* * *
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* * * * *
335608 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTA
128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *** * * * *
335662 ATTAGTCATAACTATTTGAACTCGCTAAATAAATGGATTTATTTTTAAAATCTTTTATTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * *
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* * * * *
335790 TGGTTTATGACAAAAC-AATGGTCATAATAATTTGAAATACATAATTGTTCA
130 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
*** * *
335841 AATAGTCATAACTATTTGAAC-ATGTTCAAAAAATAGATTAATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
335904 ATTTTTG-GAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTACTT-GAAATAAGCTTGCATGAAC-ATAAC
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* * *
335965 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAAATAATTATTCA
126 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
336021 GATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATT
*** * ** * *
336085 AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAAATGAATTGAAACAA
64 AATTTTGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * *
336150 TTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCA
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* * * * * * *
336203 AATACTCATGACTATTTGAACTTGTTCGGT--AGACATATATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
** * * * * * * * *
336266 TCGTCAAAATATTAATAGATTAATATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTCGTAT-AGGC-AGAAATA
66 TTTTGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA-ACTA-AAACA
* * *
336328 ATTGTTTTATAACAAAACAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTATTCA
128 ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * ** * * *
336383 AATAGTTACAA-TAATTTGAGCTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
1 AATAGTCATAACT-ATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* *** * *
336447 ATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTT-TTTTGAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACA
65 ATTTTGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACTA-AAACA
** * * * *
336510 ATCATTTTATGACAAACCAAAAGGT--TAAGGA--T-CAAT-TATAA-T-TT-A
128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
336555 AATAATCATAATTATTTAAATTTA-TTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
336619 ATTTTTAGAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCGAATAACCTTATATGAACTAAAATAA
65 ATTTTGAAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * *
336683 TTTTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTTA
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * ** * *
336736 AATAGTCATAACTATTTGATCTAGTTTGGTAAATATATTTATTTTAAAAATTTTTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * *
336801 TTGTGAAAATATTCATAACTTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACTA
66 TTTTGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAA
* * * * * ** *
336864 TTATTTTATAAGAGAA-TAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTACTT-A
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCA
* * * * * *
336917 AATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAAATTT-TTTTTT--ATTTCTTACTTATTAT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * *
336979 TTTTTAAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCGAATAAACTAGTATGAATTAAGAA-AA
66 TTTTGAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAA-AACAA
* * * * * *
337042 TTATTTTATGACAAGACAAAAGGTCATAACGATTTGAATTAAATAATTGTTCA
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * * *
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1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * * * *
337160 TTTTTG-GAACATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGCTTATATGAA-TAGAAATAA
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* * * * * **
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* * *
337278 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAGATTTAGTTTTCAAATCTCTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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1 AATAGTC-ATAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
337522 AATTTTTG-GAATATTAATAAATTAGAATTATTTAATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACA
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* * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * *
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** * * * * *
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* * * * * * *
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* * **
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* * * * * * *
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** * ** ** ** *
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* * ** * * * ** **
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * *
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1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
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66 CATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
** * * *
346860 TTTCTAAATTAATAAGTAATAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-T
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* * * ** * *
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* * * *** * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * *
347156 CATAAAAAAATTATTTCTGATT-ATAGAAGCTTATTTGATTAAAAATAATTCTAATTTAATAATA
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* * * * *
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** ** * * ** * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *** * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
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66 CATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * *
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* ** * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * *
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66 CATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * *
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* * * ** * * * **
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1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
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65 TCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCA--AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
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* * * * * *
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65 TCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-
* * * * ** *
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* * * * * ** * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
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* * * * *
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* * *
348350 -GTTCAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGTCCTTTTG--TTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
348412 CATAAAACAA--ATGTTCTGGTTCATATC-AGTTTGTTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAA
66 CATAAAATAATTAT-TTC-AGTTCATA-CAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *
348474 TATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAACT
127 TA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACT
* * * * * * * * * ** * * *
348524 AATTCAAATAATAATTATTATTTGAGCAATTAT-TTTTTAAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * *
348588 TATAAAATAA-TAGTTTTTGTTCATATAAGCCTATTCGGATTAAAA-ATTTACTAATTTATTAAT
66 CATAAAATAATTA-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATA-ATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
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66 CATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA
* * *
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* * * * * *** *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
348949 CATAAAATAATTTTTTCTA-CTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA
66 CATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** *
349013 -TTAAGGCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACA
129 TTTAA--AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT
* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGACCTT-TTGTTTT
* * * * * * * *
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64 GTCATAAAATAATTATTT-CAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * *
349310 TAATAAAACAATTATTTTAGTTCATATATGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAACTGATTACTA
65 TCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
349375 TTCTGAAAATTAATAAG--AGA-A-TTAAAAAA-AGAATCTGCTTACT-AAAT
129 TT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACTGAACT
* *
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* * * ** *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * * * * * *
349604 A-ATAAAAAAATT-TTACTATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATTATAATGACCTTTTATTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * *
349667 CATAAACGAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATACTACTAATTTATTAA-A
66 CATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
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* * * * ** *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
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66 CATAAAATAATTATTTCA-GTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAAT
** * * ** **
349911 A-TTATAAAATTAATGAA-TTGGAGGTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAAA
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* * * * * ** **
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** ** *
350028 CGTAAAACAATCATTTTTA-TTCATGTAAAATTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
66 CATAAAATAATTA-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
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** * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** *
350203 TCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATTCAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTACTAAACTAATAAT
65 TCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
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128 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT
* ** * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
350380 CATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTACTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATAT
66 CATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
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* * * * ** * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
345774 TA-TTCTAAAAAATAATAACTAATAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGT-GAACTAGTTTAAAT
129 TATTTC-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAAT
** * * * * * * * *
345837 AGTTAAAACTATAT-ATATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCATTTGTTTTGTTATAACAT
191 AGTTATTACTATTTGA-ACAATTATATATTT-AAAATATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * *
345901 AATTATTTC-AGCTCGTACAAGCTTATTC-AAAAAAGAATAAAACTAATTTATTAATA-TTTCAA
254 AATTATTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGAAATAA-AATAATACTAATTTAATAATATTTTCAA
* ** * * * * ** *
345963 AATTTTATAAGTACGAGATTTAGAAAAT-AATGCTATTTAC-CAA-AAGAGTTCAAGCAATTATA
317 AA-TTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACTGAACAA-A-TTCAAATAGTTATA
* * * *
346025 TCTATTTGAATAATTATCTATTTCACATCATTATTA-CTTCTTG--TTGTCATAAAATAATTGTT
377 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T
* * * * * *
346087 TTC-ATTAATATAAGTTTGTTGAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAAT
440 TTCAATTCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAAT
* * *
346150 CAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAA
503 --A-AA-TGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAA
* * * * * * * * *
346186 CTATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGA-TAT-AACTTTT-TAT
1 C-AGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGT-T
** ** * ** ** * *
346248 TTGTCATCGAACAATTGGTTCTAG-TCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAT
63 TTGTCATAAAACAATTCTTTCTTGATCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * ** * *
346312 AATATTCTGAAACA-TAACAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTACCAAACTAGTTCAA
127 AATATT-TCAAAAATTAATAA-TAAG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAA
** * * * * * * * * *
346376 ATAGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTGTATCGTAAAA
189 ATAGTTATTACTATTTGAACAATTATATATTTAAAAT-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * ** *
346441 CAATTATTT-TATTCTTACAAGCTTATTC-AAATTAAAACAAAACTTGTTTAATAATATTTTAAA
253 TAATTATTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTCAA
* * * * * *
346504 AATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAA-ATCAGTTCAAATGGTTA-AGA
317 AATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA--AATTCAAATAGTTATA-A
** * * * * * * * * * * *
346566 CTATTAAAACAATTTTCAATTTCAAATCATTCTAACATTTTATTTAGTCATAAAATAACTATTTC
378 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * ** * * **
346631 AGTTCATATAAGCTTATTCAAACTAAGTTAATACTAATTTAGTAACATTCAAAAAATTAATAAGA
443 AATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT---A
* * * * *
346696 AAGAGATTTAAAAAAAT-AGCTATGTTTATCGAA
504 AA-TGATTT-AAAAAATGA-ATCTGTTTACCAAA
* * * * * * * * *
346729 CAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACATTTTGATTT
1 C-AGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
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* * * * * * *
346856 ATATTTTC-TAAATTAATAAGTAATAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTAAAA
128 ATA-TTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAA
* * * ** * ** * * *
346919 TAATTA-TAGCCATTTAAATGATTAT-TGAGTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTATTATAAA
190 TAGTTATTA-CTATTTGAACAATTATAT-A-TTTAAAATATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * *
346982 ACAATTATTTTTTTATCATATAAGCTTATTCGTAATATAATAATACTAATTTATTAAAATTTTAA
252 ATAATTATTTCTAT-TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTCA
* * * * ** * * * *
347047 AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAACTAAATTTGTTTACTAAACCTATTTAAATAATTATGATT
316 AAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATAACT
* * * * * * * * *
347111 ATTTGAACAATTATCAATCTCAAATTATTAAGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTG
380 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-A
* ** * * * * * *
347175 ATT-ATAGAAGCTTATTTGATTAAAAATAATTCTAATTTAATAATAATTCAAAAACTAATAAGTA
444 ATTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA--A
* * * * **
347239 AGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAA
506 TG--ATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAA
* ** * ** * * ** *
347270 CTAGTTCAAATAGTTAAAACTA-TTAGAGTAATTGTCCATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTT
1 C-AGTTCAAATAATTATGACCATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * ** * * * * *
347334 AGTCATAAAA-TATT-TATTCTACATCTTACAAGCTTTTTTAGAATAAAATAATCCAAATTTACT
64 TGTCATAAAACAATTCT-TTCTTGATCATACAAGC-TTATTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * * * * * *
347397 AACATTGGAAAAACTAATAAGAAAAAGATTCAAAAAAATAAATTTATTTATAAAACAAGTTCAAA
127 AATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATT-TAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAA
* * * *** * *
347462 TAGTTATTACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATAATAATTTATTTTGACATAAAAT
190 TAGTTATTACTATTTGAACAATTATATATTTAAAAT-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * * * ** *
347527 AATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTTAAAAA
254 AATTATTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTCAAAA
* * *
347592 TTAATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-AAATTCAAATAGTTACAACTATTT
319 TTAATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * * * *
347656 AAATAATTGTCCATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCAGTTCA
384 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
* * *
347721 TACAAACTAATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATGATTTA
449 TACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATGATTTA
* * *
347786 AAAAGTGAATCTATTTACCGAAT
513 AAAAATGAATCTGTTTACC-AAA
* ** * * * **
347809 CAGTTCAAATAATTATGGCCATTGCAACAATTATCTACTTCAAATCATTATTACCTTTTGCTTAC
1 CAGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
*
347874 TCATATAACAATTCTTTCTTGATCATACAAGCTTATTAGGAATAAAA-AATACTAATTTATTAAT
66 TCATAAAACAATTCTTTCTTGATCATACAAGCTTATTA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
347938 CTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACCAGTTTAAATAGT
130 ATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
348003 TATAACTATTTAAACAATTGTATACTTT-AAATCATTACAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAAT
194 TATTACTATTTGAACAATTATATA-TTTAAAAT-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * *
348067 TATTTCTGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATACTACTAATATAATAATAATCTCAAAATTA
257 TATTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTCAAAATTA
* * * * ** * * * * * *
348132 ATAATTAAGAGATTTAAAAAATATATTTGTTTGTTAAACTAGTTCAAATAATTA-AGACCATATG
322 ATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
* * * *
348196 AATGATTATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-T-TTTCAATTCAT
385 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
348258 ACTAG-TTGATTCAGAATAAAATAA-AATAACTTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAATAAAAT
450 ACAAGCTT-ATTCA-AATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAAT----G
**
348320 ATTTAAAAAAT-AATTCTGTTTACCTTA
508 ATTTAAAAAATGAA-TCTGTTTACCAAA
* * *
348347 CGTGTTCAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGTCCTTTTG--TT
1 C-AGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
348410 GTCATAAAACAAAT-GTTCTGGTTCATATC-AGTTTGTTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTA
65 GTCATAAAACAATTCTTTCTTGATCATA-CAAGCTT-ATTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *
348473 ATATTTTAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAA-TTCAAATA
128 ATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAAC-AAGTTCAAATA
* * * * * * * * * * *
348534 ATAATTATTATTTGAGCAATTAT-TTTTTAAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAA
192 GTTATTACTATTTGAACAATTATATATTTAAAA-TATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
348661 TTAATAAGTAAAGAATTTTAAAAATAAATATATTTACAGAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTAT
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* * * * * *
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* * *
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* * **
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506 TGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAA
* * * * * *** *
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1 C-AGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * *
349674 GAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATACTACTAATTTATTAA-ATTTTCAAA
253 TAATTATTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTC-AA
* * * * * * *
349738 AATTAATAAGTGAAAATTTTAAAATATAAATCTATTCACT-AAGCGAGTTCAAATAGTTATAACT
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* ** * *
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380 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-
* * * * * *
349866 ATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAA-AAGTGCTAATTTACTAATATTAT-AAAATTAATGAAT
444 ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AAA
* *
349929 TGGAGGTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAA
506 T-GA--TTTAAAAAATGAATCTGTTTACC-AAA
* * * * * * ** **
349962 AAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTG
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* ** ** *
350027 TCGTAAAACAA-TCATTT-TT-ATTCATGTAAAATTATTCA-AATTAAAATAATATTAATTTATT
66 TCATAAAACAATTC-TTTCTTGA-TCATACAAGCTTATT-AGAA-TAAAATAATACTAATTTATT
* * *** *
350088 AATATTTCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGGACTAGTTCAAATA
127 AATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
350150 GTTATGACTATTCGAATAATTATCTATGTCAAATATTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAA
192 GTTATTACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * ** *
350214 TTGTTTCTATTCAT-TCAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTACTAAACTAATAATATTCT-AAAAT
256 TTATTTCTATTCATAT-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTCAAAAT
* * * * * * **
350277 TAATAAG--AGA-TTTAAAAAGTAAATATGTTTCCCGAACTAATTCAAATAGTTAAAACTATTAA
320 TAATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * * * *
350339 AATAGTTATCTATTTCAAATTATTTTGACTTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCAT
385 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
350404 ACATGCTTACTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTAAAAAATTAATAA
450 ACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
350460 GTACGAAATT
Statistics
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TTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATGATTTAAAAAATGA
ATCTGTTTACCAAA
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345637 TTATCAAGCC
* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
346133 ATATTTAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACTATTTTAAAT
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* * * * **
346197 AGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGA-TAT-AACTTTT-TATTTGTCATCGAA
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* * * * ** * * *
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* * ** * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * *
346498 TTTAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAATC-AGTTCAAATGGT
129 -TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAGT
* ** * * * * * * * *
346561 TAAGACTATTAAAACAATT-TTCAATTTCAAATCATTCTAACATTTTATTTAGTCATAAAATAAC
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* ** * *
346625 TATTTCAGTTCATATAAGCTTATTC-AAACTAAGTTAATACTAATTTAGTAACA-TTCAAAAAAT
255 TATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* ** * *
346688 TAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAGCTATGTTTA-TCGAACA
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* * * * * * * *
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* * *
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** * * *
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129 --TTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
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190 TTATGA-CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
** * * * *
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* * *
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* * * * ** * *
347093 A-TTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATTATTAAGA-TTTTTGTTTTGT
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* * * ** * * *
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* ** * * ** * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *** * *
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* * * * * * *
347519 CATAAAATAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATAT
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* *
347584 TTTAAAAATTAATAAGCAAAAG-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAA-AA-TTCAAATAGTT
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** * * ** * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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* **
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** *
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** ** *
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* * *
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** * ** *
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* * * * * *
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* * * * ** ** *
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* *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * ** * ** * *****
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*
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* *
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* *
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*
360989 TTTTTTGTTCAA
1 TTTTTTGTTTAA
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1 TTTTTTGTTTAA
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1 TTTTTTGTTT
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*
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*
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1 CATGACTAATATTACGTTT
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** *
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*
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* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *
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65 ATAAAACAATTG-TTTATGTTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*
362085 TTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
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* ** * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
362204 TAAAATAATTATTTATGTTCATAGAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAACCTAATAATATTA
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* * * * * * * *
362269 T-AAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAAAAAAATTTATCTACCAAACTAT
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * *
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* * * * * * * **
362378 CGTAAAACAAATGTTTTTATTCGTATAAGTTTATTTGGTATAAAATAATA-TCAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * *
362442 TTTTAAAAATTAAT-A--AA-AGATTT--AAAA-AAATCTGTTTACCAAACTAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * *
362489 TTCAATTAATTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTATTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCT-TTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
362553 ATAAAATAATTATTCTA--TTGATA-TAGTCATATAT-AGAACAAAATAATGC-CATATTATTAA
65 ATAAAACAATTGTT-TATGTTCATACAAG-CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAA
** * * * ** *** *
362613 TATTTTGAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTCAAAAATGAATCTATTGGCCTGGCCAC
126 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * *
362669 TGCAAATAGTTATGA-TGGTTTAAATAGTTATCTACTTCAAATCGTTATGACGTTTTGTCTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *** * * * **
362733 ACAAAACCATTGTTTCTATTTGGATAAGCTTATTCGAAATAACATAATTTTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
362798 ACAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAA-CAA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
** * * * * * ** *
362849 GTTCAAATAACTATAACTATTTGAACAACTACCTATTTCAAATAGTTACAACCTTTTGCTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
362914 ATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAACCTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * ** *
362977 TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTATAAAATAAATCCCTTTACCAAA-TAA
129 TTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * ** *
363030 GTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCTTTATGACTTTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGAC-CTTTTGTTTTGT
* * * * * *
363095 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAAAATATTAATTTATTAATAT
64 CATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * * *
363160 TTTGACAATTAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CATG
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* * * * * * *
363213 TTCAAATAGTCATAATTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATC-AGTATGACATTTT-TTTCGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
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65 ATAAAACAATTGT-TTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** *
363340 TTCAAAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTACTTACCGAA-CAA
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* * * * * ** *
363392 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATTGTTATGATATTTTATTTTGTC
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* * * * * * *
363457 ATAAAACAATTATTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAATTAATA-TAAATTTATTATTAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
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129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * * * * ** ***
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* * * *
363638 ATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAG-TATATTTAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATA-
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* * *
363701 TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCAAA
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * *
363755 TTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
363820 TAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTT-AGAATTAAATAATATTAGTTTATTACTA-C
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
363883 TCTGAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAACATAAATTTGTTTACCAAA-CAA
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * * *** *
363936 GTTTAAATAATCATGTCCAATTGAATAATTATCTATTTCAAATAGCTATGACCTTTTACATTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * *
364001 ATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTT-AGAATAAAATAATATTAATCTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
364065 TTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATCTAAAAACTAAAT-TCATTTACGAAAACAA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACCAA
* * * * * * *
364114 TTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATAGTTATAATCTTTAT-TTTT-TC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTT-TGTTTTGTC
* * * * * * * *
364177 ATAAAACAATTGCTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCATATTCAAATAATATTAATTTAATAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
364241 TTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATATATGTATTTGCCGAACTAA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* ** * * * *
364294 TTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTCTGACATTTTATTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * *
364358 ATAAAACAATTATTTCA-ATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAACA-
65 ATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * *
364421 TTCAAAAAATTAATAAGCGAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAA
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * *
364475 GTTAAAATAGATT-TGATTATTTTAACAATTAT-TAATTT-AAAGTC-ATTATGACCTTTTGTTT
1 -TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAA-TCGA-TATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * * **
364536 TGTTATAAAACAATTGTTTCA-GTTCAAAAAAACATATCTGAAGTCAAATAATACTGCTTTATTA
61 TGTCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
364600 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTATAAACTAAAGCTATCTT-CTAAACTAG
125 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACCAAACCAA
* * * * * * * * * * *
364657 TTGAAATAGTTATAATTATTTAAACAAATATCAATCTCAAGTCGTTATGA-TTTTTGTTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
364721 TAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCG-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
364785 CCAAAAACTAAT-A--AAG-GATTTAAAAAATAAATATTTTTATCAAACCAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* ** * * * * * * * * *
364833 TTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTCTGACCTTTTCTGTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** *
364898 TATAATAATTGTTTCA-GTTCATACAAG-TGTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-
66 TAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
364960 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAGAAAATAAATTTGTTTA-TAGAA-TAA
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCA-AACCAA
* * * * * * ** *
365014 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTCTCTATTTAAAATAGTTATAATATTTTGTTTTGTT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** *
365079 ATAAAAAAATTGTTTA-GTTCATA-AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
365142 TCAAAAGTTAGTAAGTAAGAGATTTTACAAA-AAATCTGTTTACTAAATCAA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * *
365193 TTCAAATAATTAT-AGCCATTTAAACAACTATCTATCTCAAATC-ATTATTACCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *** * ** *
365256 TATAAAACAATTATTTTTCAACATATAAGCTTGA-TCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATA
64 CATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *** ** *
365320 TTTCAAGAATT-A-AA--AAGTGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTAATGAATTAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
365369 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-TATTATAACATTTTATTCTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** *
365433 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-T
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * ** *
365497 TCTGAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTTGCTGAACTAA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * *
365550 TTCAAA-AATTAAGAATATATGAACAATTATTTATTTCAAAT-TATTATAATCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** ** * *
365613 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAATTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTAGTAATA-T
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
365677 TCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAA
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * * *
365732 TTCAAACAATTAAGAATATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
365797 TAAAATAATTATTTCA-GCTT-ATACAAGCTTA-TTCATAATAGAATAA-ACCTAATTTATTAAT
66 TAAAACAATTGTTT-ATG-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAAT
* * * * * * *
365858 ATTTCAAAATTTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAATTTTATTTACCAAACCAG
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
365913 TTCAAATAATTATAATTATTTTAAAAATTATATATTTCAAATC-ATTATTACTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *** *
365977 CTAAAATAATAGTTTTTGTTAATATATGTTTGTCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
366042 T-ATAAAATTAATCAGTAAGAAATTTAAAAAGTAAATATATTTACCAAATCAT
130 TCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * *
366094 TTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT-AATTTTAACATTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * **
366158 ATCAAAA-TATTGGTTCTATTCATACTACGC-T-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTAACAATA
65 AT-AAAACAATTGTTTATGTTCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * **
366220 TTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATT-AAAAATAAATCT-TATTACTGAACCAA
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACCAAACCAA
* * * * *
366273 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATTTATTTCAAATC-ATCATAACCTTCTT-TTTT-T
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGAT-ATGACCTT-TTGTTTTGT
** * * * * *
366335 CGCAAAACAATTGTTTTAT-TT-GTACAAACTTATTTTG-ATTAAAATAATATTAATTTAATAAT
64 CATAAAACAATTG-TTTATGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
366397 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAG
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
** * * * * * * *
366452 TTCAAA-AGGTTAAAACTATTAGAACAATTATCAATTTGAAATCGTTTTGACCTTTTATTTAGTC
1 TTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
366516 ATAAAATAATTGTGTCA-ATTCATATAAACATATTT-AGAATAAATTAATACTAATTTATGAATA
65 ATAAAACAATTGT-TTATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
366579 -TTCAGAAAATCAATAAGAAAGAAATTGAAAAAAATAAATCTATTTA-CAGAA-TAA
128 TTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTACCA-AACCAA
* * * * * *** *
366633 GTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATC-ATCATAATCTTTTAAATTGC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGAT-ATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** *
366697 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATATAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTGTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * ** ** *
366761 TTTCATAAATTAGTAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTACGGAATTAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * ** * * *
366815 TT-ACA-A-TTATGGCCATTTAAATGATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
366877 TCAAATAATTATTTTTGATCACACAAGCATATTCGAAATAAAATAATAAC-AATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATT
* * * *
366941 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTACCAAATCAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * ** * * *
366993 TTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCAATCACAAATCGTTAAGA-TTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * *
367057 TAAAAACAATTGTTTCTGATCATAAAAGCTTA-TTCAGTTAAAAATGATACTAATTT-TATAACA
66 T-AAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATA
* * * * * ** *
367120 TTTTAAAAATTAATAAGTATGAGATCTAAAAACTAAATGTGTTTGTCAAACCAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
** * * * * * * * * * *
367174 TTCAAATAGTTAAAATTATTAGAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
367239 -AAAATATTTGTTTCAT-ATCTTACAACCTTA-TTCAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACA
66 TAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * *
367300 -TTCAAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTGAAAAAAATAAATTTATTTACCAAA-CAA
128 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * ** * * * * * *
367355 GTTCAAATAATTATGATTATTT--TTAGTTATTTATTTAAAATC-ATTATGACATTTTATTTTGA
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * *
367417 CATAAAACAATTGGTTCA-ATTCATAAAAGCTTA-TCCAAAAATAAATAATATTAATTTTTTAAT
64 CATAAAACAATT-GTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA-AAATAATACTAATTTATTAAT
** *
367480 ATTTCAAAAATTAATAAACAAGA-ATTTAAAAAAATAAAAT-TGTTTACCAAACAAA
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
367535 TTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
367600 TAAAATAATTGTTTCA-GTTTATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
367664 TCTAAAAA-TAATAAATAA-ATGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCGAATCAG
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * ** *
367716 TTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTGTTTGGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
367781 TATAACAGTTGCTTT-TTTATCATACAAG-----TCG--CT-CAATAACACTAATTTCTTAATCT
66 TAAAACAATTG-TTTATGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
367837 TTCAAAAATTAATGAGTAAGATATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * ***
367890 TTTAAAAAGTTATAACTATTTAAACAATTGA-ATACTTCAAATC-ATTATAACATTTTGTTCAAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * ** *
367953 CATGAAATAATTATTTATGTTCGTATAAACTTAATTGAAATAAAATAATACTAATCAAATAATAT
64 CATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
368018 TTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTACAAAATAAATATGTTTACTAAACTAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * *
368071 TTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA---AT-TG--GTTTT-TTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * *
368128 TAAAACAATTTTTTAAATTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATAAATTTACTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * *
368192 TCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTCTACCTAACCAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
** * * * *
368244 TTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * ** *
368308 TAAAACAAATG-TTATTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCCAATAATATT
66 TAAAACAATTGTTTA-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * *
368372 TTAAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAAAATAAATCTTTTTATTATACCAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
368421 TTTAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATC-ATTATAACTTTTTGTTTTATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
368485 ATAAAACAATAGTTTTTGTTTATACAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * ** *
368549 TTCGACAATTAATAAGTAA-AGACTTTAAAACATAAATATATTTACCGGACTAGA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * * * * * * * *
368603 -CCAAATACTCATGGCTATTTAAATAATTATCTATTCCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
368667 TAAAAAAATTATTTCA-GTTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAA-AAT
66 TAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
368730 TCTAAAAATTAATAATTAAGATATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCGAA-TAA
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * * *
368782 GTTTATATAATTATGACTACTTGAATAATTATTTATTTAAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * * *
368847 GTAAAATTATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG-AATGAAATAATACAAATTTATTAATA-
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
368910 TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAA-TAA
129 TTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
** * * ** * *** *** *
368963 GTTCAAATCTTTTTGATTATTTGAATGATTATTTATTTCAAATTTTTATGATGATTGGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
369028 AT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACAAAAC-TA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
65 ATAAAAC-AATTGTTTATGTTCATAC-AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * ** **
369090 ATTTCAACAAA-TAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAATAAA
127 ATTTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * *
369145 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCAATGTAACCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
369210 TAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
369274 CCAAAAATTAATGAGTAAGAAAATTAAAATATGAATCTGTTTACCAAA--AA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * *
369324 TGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTTTTTCAAAAT--ATTATGACATTTTATTTT
1 --TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGA-TATGACCTTTTGTTTT
* * ** * * * * * * *
369387 GTCATGAAATAACCGGTTCTGTTCATGCAAGTTTGTTTCG-AAT-AAATAGTA-TAAATTTATAA
62 GTCATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * *
369449 ATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAACATAAATATGTTTTCTAAA-CATG
125 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * *
369505 TTCAAAAAATTATGACTATTT-AAGTAATTATCTATTTCAAATC-ATTAT-AGCCTTTTGTTTTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGA-CCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * * *
369567 TCAT-AAACTAATTATCTCTGTTCATAAAAACTTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTCTAAAA
63 TCATAAAAC-AATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
369631 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAGTCTGTTTACC-AAGCAA
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
369685 GTTTAAATAGTTATCACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTTTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
369750 ATAAAACAATTATTTCTATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-A
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * *
369814 TCTAAAAATTCATAAGTTGGAGATTTGAAAAATAAAAT-TGTTTACCAAA-CATG
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * * * * * * * *
369867 TTCAAATAGTCATG-TTCATTAGACCTATTATCTATTTGAAATC-ATTATTACATTTTGTTTTAT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGT
** * *
369930 CAT-AAACAATTGTTTCTATG-T-ATACAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATAAC-AATTTAGTA
64 CATAAAACAATTG-TT-TATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAAT-ACTAATTTATTA
* ** *
369990 ATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAACTAAATCTATTTATTAAACTAA
125 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * *
370044 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * ** * *
370108 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAACTT-TTTCGAAGTAAAATATTGTTAA-ATAATAATATT
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ***
370171 AT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATTTTTACCGAGCTTG
130 -TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* ** * * ** **
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
370287 ATAAAATAATTATTTCA-GTTCATGCATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-
65 ATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * *
370350 TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-CAA
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * ** * *
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1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * *
370469 ATAAAATAATTGTTTCA-ATTCATAAAAAGTTTATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTT-ATGTTCAT-ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
370533 TTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAATCGA
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * **
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ***
370652 TAGAATAATTGTTTTTCAACATACAAG-TCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
370716 TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATATATATGTTTACCGAACCAA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * *
370768 TTC------------CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
370821 TAAAATAATT-ATTCTGTTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTACTTTAATAATA-TT
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* *** *
370884 CTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAAT-TGTTTGTTGAAA-CAG
131 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTT-ACCAAACCAA
* * * * * * * *
370936 TTCAAACAGTTAAGATTATATAAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATAATCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
371000 ATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
371064 TTC-AAAA--AATAA-TATGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCGAATCAA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * *
371113 TTCAAATAATTATG-GTCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTCTTACCTTTTG-TTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
371175 CATATAACAATTGTTTTTTTATCATTCAATCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 CATAAAACAATTGTTTATGT-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * * ** * *
371239 A----AAATAATACTAATTTA-TTA-ATCTTTCAAAAATTAATAAG--TA--AGA--GA
127 ATTTCAAA-AAT--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * *
371286 TTTAAATA-TTA--AATTTGTTTACCAA--A-CTAGTTCAAATAGTTATGA----TT-ATTTG--
1 TTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * ** * * **
371338 ----AACAATTGTAAACTTCA-AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTG
65 ATAAAACAATTGT----TT-ATGTTCA-TACAAGC--TT-ATTTGAAATAAAATAA-TACTAAT-
* * * ** * * * **
371398 TTCATGCAAGTTTGTTC-AAAATAAAATAA-TATTA-ATCT-AATAAT-ATTCTGTAAATTAATA
119 TT-AT-TAA-TAT-TTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT---TT-ACC
**
371458 ATTAAGAGAA
175 A--AA-CCAA
* * * ** * * *
371468 TTAAAAATAAATT-T-ATTTACCT-AACCAATTCGA-ATATTT-AAGA-CTATATGAACAATTAT
1 TT-CAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAA-CAATT--ATCTATTTCAA-ATCGATATG-AC-CTT-T
** * ** * * * ** *
371527 CTGTTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTT-TG-TCATAAAATAAGTTTTTTTG-AAT-TCATACT
56 -TGTTT--TGTCA-TA-AAACAATTGTTTATGTTCAT---ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
* * * *** *
371588 AGCTTATTTTGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATA-TCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATT
113 A-C-TAATTT-ATTAATATTTCA-AAA---ATTAATA-AGT-AAGAGATT--TAA--AA-A-A--
** * * *
371651 TAAAAAATAATTCTGTTTACCTAACCGA
161 T-AAATCT-GTT-----TACCAAACCAA
* * * * * * * * *
371679 TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCGATTACAAATCGTTATAACCTTTTTTTTTTATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACC-TTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * * *
371744 ATAAAACAAATATTTTTATTCATATAAGTTTA-TTCAGAATAAAGTAATAGTAATCTATTCATAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** ** *
371808 TTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAATTAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * *
371857 TTCAAATAGTTATGTCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC-ATTATGGCTTTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * *
371921 ATAAAATAATAATTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAACAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * ** *
371985 TTTAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * * * * * *
372039 -TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATATATTTTAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
372103 TAAAAAAATTCTTT-TAGTTCATATAAACTTATTTGAAATGAAATATTACTAAGCTATTAATACT
66 TAAAACAATTGTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *** *
372167 ACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTATTTATTGAA-TAA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * *
372218 GTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATCGCA-ATAACCTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-ATATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * * * *
372282 CATAAAATGATTTTTTCTGTTCATATAAGCTTACTTCAAACAAAATAATACAAATTTATTAAT-G
64 CATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *
372346 TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAA
129 TTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
** * * * * * * * * *
372400 GTTCAAATCTTTATGATTATTTGAACAATTATATATTTTAAATTGTTATGGCTTTTTCTTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
372465 ATAAAACAATTATTTTTGTACATACAAGTTTATTCGAATTAGAATAATATTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
372530 TCAACAAA-TAATGATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAA
130 TCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * *
372581 GTTTAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTGTCTATTTCAAATC-ATTGTGACTTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
372645 AATAAAACAATTAGTTCAT-TTCATATAAGCTTATTTGAAA-ATAAATAATACTAATTTATTAAT
64 CATAAAACAATT-GTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA-AAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * * * * *
372708 ATTCCGAAAATTAATGTGTAAAAAAATTAAAAAAT-AATCTATTTACCAAA-CATG
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * * * * * * *
372762 TTCAAATAATTATGACTATCTGAATAATTTTTTATTTCAAAAC-ATTGTGACTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
***
372826 ATAAAACAATTGATTT-TGTTCATGTGAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
65 ATAAAACAATTG-TTTATGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * * *
372888 ATTTCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTAAA-CACG
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * * * *
372942 TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
373007 TAAACCAATTGTTTTTGTTTATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAAAATTT
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * ** *
373072 TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTGAGCAA
131 CAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * **
373123 GTTTAAATAGTTATTG-CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC-ATTATGATTTTTTGTTTTG
1 -TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * **
373186 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
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* ** * * *
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128 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
373305 TTCAAATAGTCAT-ATCCATTAGACCTATTATCTATTTCAAATCGTTATTACATTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * ** * *
373369 ATATAACAATTATTTCTATTTATATAAAATTATTCAAAATAAAATAATAATAAATAATAATTTAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATT-----TGAAATAA-AAT-AATACTAATTTAT
* *** *
373434 TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAACTAA
123 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * * *
373553 TAAAATGATCGTTTCTATTCATAC-AGCTTATTTGAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ***
373616 TCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCTTG
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* ** * *
373669 TTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTCTGACCTTTTGTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * *
373733 ATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AATGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAACA
65 ATAAAACAATTGTTTAT-GTTCATACAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** *
373796 -TTCAAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAA
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* * ** * * *
373851 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTAAAATAAACATAACCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
373916 TAAAATAATTGTTTCA-GTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAGTATTACTTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * * * *
373980 TCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATATTTCAGTTTATCGAATCGA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * * *
374096 ATAAAACAATTATTTTTCATCATATAAACCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
374161 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
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66 TAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * *
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* * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
374442 ATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAACTGATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
374506 TTCAAAAACTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCAAATCAG
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* * * * * * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
374623 ATATAACAATTGTTTTTGAAT-ATTCAAGTTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCT
65 ATAAAACAATTGTTTATG-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
374687 TTTAAAAATTAATAAGTAAGA-AATTAAAAAA-AAA-ATGTTTACCGAACTAG
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* * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
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* * * * * ** *
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129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
374982 ATAAAACAAATATTTTTG-TCTATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTATGTTC-ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
375046 TT--TAAA--AATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * ** * * ** * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * *
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* * * * * * * * *
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130 TCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCA-A
* * * * * * * * * *
375267 -T-AAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTCTTTTAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** **
375330 TAAAAGAATTATTTCA-GTTCATATAAATTTATTCAAAATAAAATAATAAC-AATTTATTAATAA
66 TAAAACAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAAT-A
* * * * * *
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128 TTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
* * * * * * *
375446 TTTAAATAATTGTGACTGTTTAAACAATTATCTATTTGAAATC-ACTAT-AGCCTTTCGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGA-CCTTTTGTTTTGT
* * * * *
375509 CATAAAATAATT-TTT-T-CTGATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACAAATTTATTAATAT
64 CATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
375571 T
129 T
375572 AGACAATTGA
Statistics
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TAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
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* * * * *
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* * * *
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123 GATATAACCTTTTATTTTGCCATAAAACAAATATTTATATTCATAGAAGTTTA
* ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
362362 TTACCTTTTATTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTATTCGTATAAGTTTA
127 TAACCTTTTATTTTGCCATAAAACAAATATTTATATTCATAGAAGTTTA
*
362411 TTTGGTATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-A-AGATTTAAAAAAA
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Statistics
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*
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* * * * * ** * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *** * * **
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* * * * * * **
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* * * ** * *
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* * *
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* ** *
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* * *
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* * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTC
* * * * * *
363457 ATAAAACAATTATTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAATTAATA-TAAATTTATTATTA
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* * * * * * * * *
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* * * ** *** **
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* * *
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* *
363712 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCAAA
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* *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *** *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CTTTTTGTTTTGT
* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* ** * * * ** * * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
364961 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAGAAAATAAATTTGTTTA-TAGAATAAGTTCAAATAGT
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCA-AACATGTTCAAATAGT
* * * * ** * *
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* * *
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* * * * *
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319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAG
* * * * * * * *
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* *** * * *
365257 ATAAAACAATTATTTTTCAACATATAAGCTTGA-TCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *** *
365321 TTCAAGAATT-A-AA--AAGTGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTAATGAA-TTAGTTCAAATAGTT
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* * * * * * * *
365380 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTA-TTATAACATTTTATTCTATCATAAAACAATT
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* * **
365444 GTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAATTAA
257 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAA
* * * **
365508 TAACTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTTGCTGAACTAA-
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* * * * * * * *
365550 TTCAAA-AATTAAGAATATATGAACAATTATTTATTTCAAATTATTAT-AATCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTC
* * ** * * *
365613 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAATTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTAGTAATA-T
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* * * * * * *
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130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAT-GTTCAAATAG
* * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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*
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* * * * *
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* * * * * * * ** * *
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* * * ** * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * ** * *
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* * * ** * *
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* * * * * **
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** * * * * * * * * * *
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* * *
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* * *
367310 TATTAAGTAAAAGATTTGAAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAG
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* * ** * * * * * *
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* *** * * * * *
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** **
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
367781 TATAACAGTTGCTTTTT-TATCATACAAG-----TCG--CT-CAATAACACTAATTTCTTAATCT
66 TAAAACAATTG-TTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
367837 TTCAAAAATTAATGAGTAAGATATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAAT-TT-AAAAAGT
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAAC-ATGTTCAAATAGT
* * * * * * *** *
367900 TATAACTATTTAAACAATTGA-ATACTTCAAATCA-TTATAACATTTTGTTCAATCATGAAATAA
192 TATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * * * * * ** * **
367963 TTATTTATGTTCGTATAAACTTAATTGAAATAAAATAATACTAATCAAATAATATTTTGAAAATT
255 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATT
* * * * * *
368028 AATAATTAAGAGATTTACAAAATAAATATGTTTACTAAACTAG
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * *
368071 TTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--A-T-TG--GTTTT-TTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
** * * * *
368128 TAAAACAATT-TTTTAAATTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATAAATTTACTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * **
368191 TTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTCTACCTAACCA-GTTCAAATAACT
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACATGTTCAAATAGTT
* * * * *
368255 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTGTTTTATCATAAAACAAATG
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * ** ** * *
368319 TTAT-TGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCCAATAATATTTTAAAAATTAA
258 TT-TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAA
* * ** * *
368383 TAAG----ATATTTAAAAAAATAAATCTTTTTATTATACCAG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
368421 TTTAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * *
368486 TAAAACAATAGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTC-ATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ** ** * *
368550 TCGACAATTAATAAGTAA-AGACTTTAAAACATAAATATATTTACCGGAC-TAGACCAAATACTC
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAT-GTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
368613 ATGGCTATTTAAATAATTATCTATTCCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTA
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * *
368678 TTTC-AGTTCATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAAATTCTAAAAATTA
258 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTA
* * * * * * * *
368741 ATAATTAAGATATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCGAATAAG
320 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * ** * * * *
368783 TTTATATAATTATGACTACTTGAATAATTATTTATTTAAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
** * * * *
368848 TAAAATTATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG-AATGAAATAATACAAATTTATTAATA-
66 TAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * **
368910 TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAATAAGTTCAAATCTT
129 TTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGT
* * ** * ** *** * *
368974 TTTGATTATTTGAATGATTATTTATTTCAAATTTTTATGATGATTGGTTTTGTCATAAACTAATT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * *
369039 GTTTCTATTCATACAAAAC-TA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAAA-
257 GTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAA-AAAT
* * * * ** * *
369101 TAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAATAAA
318 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
369145 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCAATGTAACCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
369210 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
369275 CAAAAATTAATGAGTAAGAAAATTAAAATATGAATCTGTTTACCAAAAATGTTCAAATAGTTATG
131 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * ** *
369340 ACTATCTAAACAATTATCTTTTTCAAAATA-TTATGACATTTTATTTTGTCATGAAATAACCGGT
196 ACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * * *
369404 TCTGTTCATGCAAGTTTGTTTCGAAT-AAATAGTA-TAAATTTATAAATATTCTAAAAATTAATA
260 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC-AAAAATTAATA
* * * * * *
369467 AGTAAAA-ATTTTAAACATAAATATGTTTTCTAAACATG
323 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * *
369505 TTCAAAAAATTATGACTATTT-AAGTAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AGCCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * *
369568 CAT-AAACTAATTATCTCTGTTCATAAAAACTTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTCTAAAAA
64 CATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
369632 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAGTCTGTTTACCAAGCAAGTTTAAATAGTT
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
369697 ATCACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTA
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * *
369762 TTTCTATTCATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAATCTAAAAATTCA
258 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAA
*** * *
369826 TAAGTTGGAGATTTGAAAAATAAAAT-TGTTTACCAAACATG
321 TAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * * *
369867 TTCAAATAGTCATG-TTCATTAGACCTATTATCTATTTGAAATCATTATTACATTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTC
** *
369931 AT-AAACAATTGTTTCTATG-T-ATACAAAATTATTC-AGAATAAAATAATAAC-AATTTAGTAA
65 ATAAAACAATTGTTT-T-TGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAT-ACTAATTTATTAA
* ** *
369991 TATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAACTAAATCTATTTATTAAAC-TAATTCAAAT
126 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACAT-GTTCAAAT
* * *
370051 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAATA
189 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * ** * * *
370115 ATTGTTTCTGTTCATACAAACTT-TTTCGAAGTAAAATATTGTTAA-ATAATAATATTATAAAAA
254 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAA
* * * * * **
370178 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATTTTTACCGAGCTTG
317 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* ** * * * ** **
370223 TTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTAATTTAATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * *
370288 TAAAATAATTATTTCAGTTCATGCATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TT
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * *
370352 CAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAAAAGTTA
131 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTA
* * * ** * *
370417 TGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTTTTTTATCATAAAATAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * * *
370482 TTCAATTCATAAAAAGTTTA-TCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGA
259 TTCTATTCAT-ACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAA
* * * * * * *
370546 TAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAATCGA-
321 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAAG
* * * * * ** *
370587 TTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAATTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * *** *
370652 TAGAATAATTGTTTTTCAACATACAAG-TCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
370716 TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATATATATGTTTACCGAAC-----C--A-A--T-T
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
370770 -CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATTATAAAATAATT-AT
195 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * *
370833 TCTGTTCATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTACTTTAATAATATTCTAAAAATTAATA
260 TCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATA
* * ***
370897 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAAAT-TGTTTGTTGAAAC-AG
323 AGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTT-ACCAAACAAG
* * * * * * *
370936 TTCAAACAGTTAAGATTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AATCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTC
* * * *
371000 ATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
371065 TC-AAAA--AATAA-TATGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCGAATCA-ATTCAAATAATTA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACATGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
371125 TG-GTCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTTACCTTTTG-TTTGTCATATAACAATT
194 TGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* ** *
371187 GTTTTTTTATCATTCAATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAAATAATACTAA
257 G----TTTCT-ATTC-A---TA--C-----AAGCT--TA-T--TTCA--AATAAAATAATACTAA
* * * * * *
371252 TTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAATATTAAATTTGTTTACCAAACTAG
299 TTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * ** * * *
371316 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
371381 TAAAACAATTATTTTTGTTCATGCAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATCTAATAATA-TT
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * * * * *
371445 CTGTAAATTAATAATTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTATTTACCTAACCA-ATTCGAATATTTA
131 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACATGTTCAAATAGTTA
* * * * *
371508 AGACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAATCA-CTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TT
* * ** *
371572 -TTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTTGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATATCAAAAAT
257 GTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TCAAAAAT
* * * *
371635 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAAC-CG
318 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
371678 ATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCGATTACAAATCGTTATAACCTTTTTTTTTTAT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * *
371743 TATAAAACAAATATTTTTATTCATATAAGTTTATTC-AGAATAAAGTAATAGTAATCTATTCATA
64 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** *
371807 TTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAA-TTAGTTCAAATAGT
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAT-GTTCAAATAGT
* * * * *
371867 TATGTCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGGCTTTTTGTTTTGTTATAAAATAAT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
** * * * *
371931 AATTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAACATTTTAATAATT
256 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATT
* * * ** *
371995 AATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAG
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
372038 ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATATATTTTAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * ** * *
372103 TAAAAAAATTCTTTTAGTTCATATAAACTTATTTGAAATGAAATATTACTAAGCTATTAATACTA
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *** * * * *
372168 CAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTATTTATTGAATAAGTTTAAATAATTATG
131 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG
* * * * * ** * * *
372233 ATTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATCGCAATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTT
196 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * *
372298 CTGTTCATATAAGCTTACTTCAAACAAAATAATACAAATTTATTAATGTT-AAGACAATTAATAA
261 CTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAA
*
372362 GTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
324 GTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
** * * * ** * * *
372401 TTCAAATCTTTATGATTATTTGAACAATTATATATTTTAAATTGTTATGGCTTTTTCTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
372466 TAAAACAATTATTTTTGTACATACAAGTTTATTCGAATTAGAATAATATTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
372531 CAACAAA-TAATGATTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCAT
131 CAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
372595 GACTATTTAAATAATTGTCTATTTCAAATCA-TTGTGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTAG
195 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-G
* * *
372659 -TTC-ATTTCATATAAGCTTATTTGAAA-ATAAATAATACTAATTTATTAATATTCCGAAAATTA
258 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTA
** * * * *
372721 ATGTGTAAAAAAATTAAAAAAT-AATCTATTTACCAAACATG
320 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
372762 TTCAAATAATTATGACTATCTGAATAATTTTTTATTTCAAAACATTGTGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* *** *
372827 TAAAACAATTGATTTTGTTCATGTGAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * * * *
372890 TTCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTAAACACGTTCAAATAATTA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTA
* * * * **
372954 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * * * *
373019 TTTTGTTTATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAAAATTTTAAAAATTAATA
259 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* * ** *
373084 AGTAAAAGATTTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAGCAAG
323 AGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * *
373124 TTTAAATAGTTATTG-CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
373188 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
65 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * ** *
373252 TCTAAAAATTCATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTCA
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * *
373317 T-ATCCATTAGACCTATTATCTATTTCAAATCGTTATTACATTTTGTTTTGTCATATAACAATTA
194 TGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * ** * *
373381 TTTCTATTTATATAAAATTATTCAAAATAAAATAATAATAAATAATAATTTATTAATATTTCAAA
258 TTTCTATTCATACAAGCTTATT-----TCAAATAA-AAT-AATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* ***
373446 AATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAACTAA-
315 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AAG
* * * * * * * *
373489 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATCTCTAATCGTTAT-AATCTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * * * *
373553 TAAAATGATCGTTTCTATTCATAC-AGCTTATTTGAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
373616 TCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCTTGTTCAAATAGTTA
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTA
* ** * *
373681 AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * *
373745 TTT-TAGTTCATA-AATGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAACATTCAAAAAATT
258 TTTCTA-TTCATACAA-GCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATT
* * * * ** *
373807 AATAAATAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAA
319 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * ** * * *
373851 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTAAAATAAACATAACCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * * *
373916 TAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAGTATTACTTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * * *
373980 TCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATATTTCAGTTTATC-GA-ATCGATTCAAATAATT
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAT-G-TTCAAATAGTT
* * * * ** * * * *
374043 AT-AGCCATTTGAACAATTATATTTTTTAAACCGTTACGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
193 ATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * *
374107 ATTTTTCA-TCATATAAACCTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
257 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATT
* * * *
374170 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAG
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * ** * * *
374213 TTC------CTAT--C-A----AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTATTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * * *
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*
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* *
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AAAAAAATAC
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*
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* *
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AAAAAATAAACAAACAAATAAAAAAATACAAAAAAAACCA
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* * * * * * *
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*
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* *
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*
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** ** * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * **
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* *
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* * * * *
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** * * *
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*
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* * ** *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * * * **
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* * ** * *
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* * * *
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*
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*
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* * * * *
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** * * * ***
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* * * * * * ** *
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* *
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*
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* *
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* *
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* * * * * * ** *
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* * **
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*
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*
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1 TTT
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*
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1 AAAAAATA
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*
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1 ATAAAAAAAT
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*
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*
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*
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1 AAAAAA-ATC
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*
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1 A
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*
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*
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421509 AGTTTATTAG
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 2, Indels: 4
0.85 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
28 23 0.68
29 11 0.32
ACGTcount: A:0.38, C:0.00, G:0.05, T:0.58
Consensus pattern (29 bp):
TTTGTATATATATTTAAAATAAATTTTTA
Done.