Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167926.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_19, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 113000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 117
Found at i:1573 original size:713 final size:714
Alignment explanation
Indices: 1--1790 Score: 2593
Period size: 713 Copynumber: 2.5 Consensus size: 714
* *
1 GAGTTTAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATATAAACAATTGTC--
1 GAGTTTAAAATAAATTTGTTTAC-GAAAAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTA
* * *
64 TTT-AAATCATTGTGA-CATCTA-TTTGTCATAAAACAATTGTTTGGCATTCCATACAAGCCTTA
65 TTTAAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GAATT-CATACAAG-CTTA
* *
126 GTCAAAATAACATAATACTAATTTATTAATATTCC-AAAATTAATAGGTAAGTGATTTAAAAAGT
127 GTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGT
* *
190 GAATCT-ATTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTC--A--A-CAATTATCAAATCGTT
192 GAATCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAAATTATCAATT-TCAAATCGTT
* *
249 ATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAAAAA
256 ATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTT-ATCATATATGTTTA-TTAAAATAAAATAA
*
314 TAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATTAATATTTTTACCAAG
319 TAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATTAATATGTTTACCAAG
*
376 CCAATTCAAATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTA
384 CCAATTCAAATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTA
441 GTCATAAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTAGATTTATTTAC
449 GTCATAAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTAGATTTATTTAC
* *
506 ATTCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATAT
514 A-T-AAAAAATTAAT-ACGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATAT
*
571 ATGACTACTTTGAAACAATTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGGTTTTGACATAAACACA
576 ATGACTACTTTGAAACAATTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGGTTTTGACATAAACAAA
636 ATTGTTCAGTTGCATAAAAAGCTTATCCAAAAAAAATAATACTAAATTCTTATAAATTCAAAAAT
641 ATTGTTCAGTTGCATAAAAAGCTTATCCAAAAAAAATAATACTAAATTCTTATAAATTCAAAAAT
*
701 TAATAATAA
706 TAATAACAA
*
710 GAGTTTAAAATAAATTTGTTTACCGAAAAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGCCTA
1 GAGTTTAAAATAAATTTGTTTA-CGAAAAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTA
* * * *
775 TTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAGAAAGCAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAATC
65 TTTAAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTC
* * *
840 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGCGAA
130 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAA
* *
905 T-TGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCTAAAGTTATCAATTTCAAATCATTAT
195 TCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTC-AAA-TTATCAATTTCAAATCGTTAT
*
969 TACCTTTTATTT-GTCATATAACAATTGCTTTTTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATA
258 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTG-TTTTTATCATATATGTTTATT-AAAATAAAATAATA
*
1033 GTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-TAAGTGTGTTTACCAAG
321 GTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATTAA-TATGTTTACCAAG
1097 CCAATTCAAATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTA
384 CCAATTCAAATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTA
* *
1162 GTCATAAAATATTTGTTTCTTATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTAGATTTA-TT-C
449 GTCATAAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTAGATTTATTTAC
* ** *
1225 GA-AATAAAA-TAAT-CTAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAAT
514 -ATAA-AAAATTAATACGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAAT-AT
*
1287 GATGACTA-TTTG-AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGACATAAA-AA
576 -ATGACTACTTTGAAACAATTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGGTTTTGACATAAACAA
* * * *
1348 AATTGTTTTAGTT-CGTAAAAA-CTTATCCAAAATTAAATAATACTAATTTCTTA-ATAATTCAA
640 AATTG-TTCAGTTGCATAAAAAGCTTATCCAAAA-AAAATAATACTAAATTCTTATA-AATTCAA
1410 AAATTAATAACCAA
702 AAATTAATAA-CAA
* *
1424 GAGTTTAAAATAAATTTCTTTAC-AAAGTAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTA
1 GAGTTTAAAATAAATTTGTTTACGAAA-AAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTA
1488 TTTAAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTC
65 TTTAAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTC
* * *
1553 AAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAGTGAA
130 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAA
* * * *
1618 TCTGTTTACTGAATCAGTT-AAGTAATTATGGTCATTTCAGCAATTATCAATTTCAAATTGTTAT
195 TCTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCA--AATTATCAATTTCAAATCGTTAT
* * * *
1682 CACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTTTTTTTATCATATATGCTTATTAAAA-AAAATAATAGT
258 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTATCATATATGTTTATTAAAATAAAATAATAGT
* *
1746 AATTTATTAATCTTTTAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
323 AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAA
1791 ATAAATTTGT
Statistics
Matches: 979, Mismatches: 67, Indels: 68
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
709 58 0.06
710 1 0.00
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712 100 0.10
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720 9 0.01
721 149 0.15
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Consensus pattern (714 bp):
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TTAAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTCA
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAAT
CTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAAATTATCAATTTCAAATCGTTATTAC
CTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTATCATATATGTTTATTAAAATAAAATAATAGTAAT
TTATTAATCTTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATTAATATGTTTACCAAGCCAATTC
AAATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAA
AATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTAGATTTATTTACATAAAAA
ATTAATACGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATATATGACTACTT
TGAAACAATTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGGTTTTGACATAAACAAAATTGTTCAGT
TGCATAAAAAGCTTATCCAAAAAAAATAATACTAAATTCTTATAAATTCAAAAATTAATAACAA
Found at i:1881 original size:359 final size:358
Alignment explanation
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1 GAGTTT
* * * * * * * *
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1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCATATTTCAAA
* * * * * *
70 TCATTGTGA-CATCT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTGGCATTCCATACAAGCCTTAGTCAAAA
66 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GAATT-CATACAAG-CTTATTCAAAA
* * * * *
133 TAACATAATACTAATTTATTAATATTCC-AAAATTAATAGGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCT-
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * *
196 ATTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTCAAC-A--AT-TA--TCAAATCGTTATTACC
193 TTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
255 TTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAAA-AATAGTA
257 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATCATATAAGCTTA-TTCAAA-AAAAATAATACTA
*
319 ATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
319 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * ** *
355 AAAATTAATATT-TTTACC-AAGCCAATTCAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATT-ATTAATT
1 AAAATAAAT-TTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTCA-T-ATT
* * * * * *
416 TCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTT-CATATCTTACAAGCTTATTCA
61 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAAT-TCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
480 AAATAAAATAAT-CTAGATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATA
125 AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATA
** *
543 AATCTACTTACCGAACAAGTTCAAAT-A-TATGACTACTTTGAAACAATTATTTA-TTCAAAATC
187 AATCTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTA-TTTG-AACAATTATCTATTTC-AAATC
* * ** * * *
605 ATTATGACCTTTTGGTTTTGACATAAACACAATTGTTCAGTT-GCATAAAAAGCTTATCCAAAAA
248 GTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAA-ACAATT-TT-TTTTATCAT-ATAAGCTTATTCAAAAA
* * *
669 AAATAATACTAAATTCTT-ATAAATTCAAAAATTAATAA-TAAGAG-TTT--
308 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
** * * * * *
716 AAAATAAATTTGTTTACCGAAAAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGCCTATTTAAA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-CATATTTCAA
* * * *
781 ATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAGAAAGCAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAATCAAAATA
65 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * ***
846 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGCGAAT-TGTT
130 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * * *
910 TACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCTAA-AGTTATCAATTTCAAATCATTATTACCT
195 TACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * *
974 TTT-ATTTGTCATATAACAATTGCTTTTTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAAT
258 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATCATATAAGCTTATTCAAAA-AAAATAATACTAAT
* *
1038 TTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
321 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * ** *
1076 AAAATAAGTGTGTTTACC-AAGCCAATTCAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATT-ATTAATTT
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTCA-T-ATTT
* * * * * ** * *
1138 CAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTT-CTTATCTTACAAGCTTATTCGA
62 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAAT-TCATACAAGCTTATTCAA
*
1202 AATAAAATAAT-CTAGATTTATTCGAA-A-T---AAAA-TAAT--CTAA-ATGATTTGAAAAAAT
126 AATAAAATAATACTA-ATTTATT--AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAAT
* * * * *
1257 AAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCAT
186 AAATCTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * * * *
1322 TATGACCTTTTGTTTTGACATAAAA-AAATTGTTTTAGTTCGTAAAAACTTATCCAAAATTAAAT
250 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA--TCATATAAGCTTATTCAAAA-AAAAT
* * **
1386 AATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAACCAAGAG-TTT--
312 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** * * * *
1430 AAAATAAATTTCTTTA-CAAAGTAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTC-TATTTAA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T-TCATATTTCA
* * *
1493 AATCATTGTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
1558 AAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAGTGAATCTGT
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
1623 TTACTGAATCAGTT-AAGTAATTATG-GTCATTTCAGCAATTATCAATTTCAAATTGTTATCACC
194 TTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
1686 TTTTGTTTGGTCATATAATAATTTTTTTTATCATATATGCTTATT-AAAAAAAATAATAGTAATT
257 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATCATATAAGCTTATTCAAAAAAAATAATACTAATT
* * *
1750 TATTAATCTTTTAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
322 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA
** * * * *
1788 AAAATAAATTTGTTTATTGAACCAGTTTATATAGTTATGACTATTTGAATAATTGCATACTGT-A
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-CATA-TTTCA
* * * * * * *** * *
1852 AATCATTATAACCGTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTTTTCAAAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* ** * * * *
1917 AAAATAATACTAATATAAAAATATTCCGAAAATTAATAACTAAGAGATTCAAAAAACAAAAT-TG
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTG
* * * * *
1981 TTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----
193 TTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * ** * *
2039 TTTTGTTTTATCATAAAGCAGTTTTTTCAATTCATACT-AGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATG
257 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCATA-TAAGCTTATTCA-AAAAAAATAATACT-
*
2102 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAA
318 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
2143 AAAAT-AATTCTGTTTGCCTAGCCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTC
1 AAAATAAATT-TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
* * * * * * * *
2206 AAATCACTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAAAATGTTTTTG--TTGATATAAGTTTGTTCAAA
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * *
2269 ATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATCT
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * ** * * **
2330 GTTTATCAAATCAGTTCAAA-AAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTACAA
192 GTTTACCGAA-CAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
** * * * * * * * ** **
2394 TTTTTTCTTCTATTACAAAACAATAATTTCAGTTTAT-A-A-AAACTTATTTGGATTAAAATAAT
255 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TTT--TTTTATCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAAT
* * *
2456 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTA
315 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
2500 AAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTAT-TTATTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T-TCATATTTCA
* * ** * * **
2564 AATCGTTATGAACTTTTGTTTTACCATAAAAAAATTGTTTTAGA-TCATATC-AGCTTATTTGAA
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-ATTCATA-CAAGCTTATTCAAA
* * * * *
2627 ATAAAATAATGCTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * * *
2692 ATTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAAC
192 GTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
** ** * ** *
2757 CTTTTG-TTTGTCACCAAATTATTTTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAA-AATA-T
256 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-T-TATCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATACT
** *
2818 AATTTATTAATA-TT-AACACAATTAATTGGTAAAAGATTTAA
318 AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * ** * * *
2859 AAAATAGATTTGTTTA-CTATACAAGTTCAAATTTTTATGACTAATTGATCTATT-ATTTATTTC
1 AAAATAAATTTGTTTACCGA-ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
** * * ** * *
2922 AAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAT
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
2987 TAAAA-AATATTAATATATAAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAACATAAATAT
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCT
* * * * * *
3051 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTGTGA
192 GTTTACCGAAC-AGTTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * *
3115 CCTTTTGTTTTGTAATAAAACGA-TTGTTTTAGTTCATATAAGGTTATTTGAAATAAAATAATAC
255 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA--TCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATAC
* *
3179 TAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAA
317 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * *
3221 AAAATTAATCTATTTACTGAA-CATGTTTAAATAATTATGACTATCTGGATAATTTTC-TATTTC
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA--TTCATATTTC
* * * * * ***
3284 AAAACATTATGAGCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGGTTCTG--TTCATGCAAGCTTATTTTG
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGAATTCATACAAGCTTATTCAA
** * *
3347 AATAAAATAATA-TAAATTGGTTAATATTACAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT
126 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
3410 ATGTTTTCAGAACACGTTCATATAGTTGTAACTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
190 CTGTTTACCGAACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
** * * * * ** *
3475 ATTTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTGTTTCTGT-TCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
254 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TTTATCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATA
* * * * *
3539 TTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAA
316 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA
* * * * * *
3583 AAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATT-ATTTCTTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
* * * ** * ** **
3647 AATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCACACAATTTTATTTGAAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* **
3712 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * * *
3777 TCACCGAACAAGTTTAAATAGTCATG-TTCGTTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTAT-AAC
194 TTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * **
3840 -ATTGTTTTGTCGTAAAATAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAA
257 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCATATAAGCTTATTCAAAA-AAAATAATACTAA
3904 TTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
320 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * ** * *
3939 AAAATTAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTGCTTCAACAATT-ATCTATCTC
1 AAAA-TAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
* * * ** * *
4003 AAACCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAG
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * ** *
4066 TAAAATATTGCTAAATCACTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * ** * * * * *
4131 TTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAGG
193 TTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-C
* * * * * *
4196 CTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-TTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTTGAAAAAAAATAATACT
256 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA--TCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATACT
* ** *
4260 AATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTTAA
318 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAA
* * * * *
4303 AAAATAAATCTGGTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATATATTTAT
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCATAT-TTCA-
** ** * ** * * * * **
4367 AAGAAGCATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATGATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
4432 AAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAA-AGATTTAAAAAATAAGT-T
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
4494 AGTTTATCAAATC-GCTTCAAATAATTACGGCT-GTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
192 -GTTTACCGAA-CAG-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * *
4557 AACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATAC
254 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATCATATAAGCTTATTCA-AAAAAAATAATAC
4622 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
317 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * *
4664 CAAATAAATCT-ATT--C--A-C---T-AAACCAGTT-T--CTATTTGAACAATT-ATCTATTTC
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
* * * * * * * ***
4715 AAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGGAA
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
4780 TAAAATAATACTATTTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTG
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * *
4845 TTTGCCGAAGCAATTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AGTTATGG
193 TTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATCGTTATGA
* * * *
4909 CCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATTTTTTTATCAT-TCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACT
255 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATCATAT-AAGCTTATTCAAAA-AAAATAATACT
*
4973 AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
318 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
5014 AAAATAAATATGTTTACCAAACTAG-TCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-CATATTTCAA
* * * * *** *
5076 ATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTCAAAATA
65 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * * *
5141 AAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTT
130 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * *
5206 TGCCAAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT
195 TACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * ** *
5271 TTGTTTTAG-CATAAAACAAGTTTTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-
259 TTGTTTT-GTCATAAAACAA--TTTTTTTTAT-CA--TATA--AGCTTA-TTCAAAAAAAATAAT
* *
5334 AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAA
315 ACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * *
5375 AAAAT-AATTATGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTC
1 AAAATAAATT-TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
* *** * * * ***
5438 AAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGA
63 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * *
5502 ATAAAGTAATATTAATCTGTTAATATTTCAAAAATTAAT-A-T--GAGATTTAAAAAATAAATCT
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
5563 ATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACT-TGTTG-----TT-T-TGTTATGAAA-C---A--
192 GTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATG
* * * *** * * *
5614 A--TTGT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAA-TTTATT-AATATTCCA
254 ACCTTTTGTTTTG-TCATA-AAAC-AATTT---TTTTTATCATA-TAAGCTTATTCAA-A---AA
* * * * * * * * * ** **
5674 ACA-AATAATAA-GTA-AAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGA
308 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTA-A
** *** * * * * **
5724 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCA
1 --AAA-A-T-A--A--ATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTG----AACA
* * * * ** * * * ** * **
5788 TATAAGCTTA-TTCAAAATAAATAACACTAAGTTATTAATATTT-TGA-AAATTAATAAGTAAGA
52 -AT--TCATATTTC-AAATCATTATGAC---CTT-TT-GT-TTTGTCATAAAACAAT-TGTTTGA
* * * * * * * * *
5850 GATTTAAAAAATGAATATGTTTGTCGAGCAACTTTAAATAAATA-TGACTATTTCAATAATTTTC
106 -ATTCATACAA-G---CT-TAT-TC-A--AA-ATAAAAT-AATACT-A--ATTT-ATTAATATTC
*** * ** ** * * *** ** *
5914 TTTTTGAAATTGCTATAAGCTTTTG-TTTTGTCATAAAAT-GAT-T-TTTTTTGTTCA-TACAAG
155 ---CAAAAATT--AATAAG--TAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAGTTCAA-
* * * * ** * ** * * * * * *
5974 TTTATTTTGAATAAAAT-AATAAAAATTTA-TT--AA-CATAAAGACACTTAATAAGTAAAACAT
210 ATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTT--T-TGT-----TT
* * * * * * **** * ** *
6034 T-T-AAAAAATAAATTTGTTTACCGA-ACAAG----TTCAAATCTTATGACTGTTTGAACAATTA
265 TGTCATAAAACAATTTTTTTTATC-ATATAAGCTTATTCAAAAAAAAT-AAT-ACT--A-ATTTA
* * ** ** ***
6092 TT--TATTTC-AAATTCTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
324 TTAATATTTCAAAAAT-TAAT-A-AGTAAGAGAT-T--TAA
*** * * ** * ** *
6130 AACAATTGTTTATGTTTATAC-AAGCTTA-TTCAAATTA-CAAT-AATA-TT-AATTTATTAATA
1 AA-AATAAATT-TGTTTA-CCGAA-C-CAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAA-CAATTCATA
* * * ***** ** * * *
6189 TTTCGACAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAG-C--AATA-AATATGTTT--TTTGA-ACAAG---
59 TTTC-A-AATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTGAATTCATACAAGCTT
** * * * ** **
6243 -TTC-AAAT--AATCCTGAC-AATTTGAATAAT-TATCTATTTTAAATCATT-GTGACCTTTTG-
120 ATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTT-ATTAATAT-TCCA----AAA--ATTAAT-A-AGTAAGA
** * ** * * * * ** *
6300 TTTTGTAATAAAA-CAAT-TGTTTTA--GTTCA-TACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATATCA
174 GATT-TAA-AAAATAAATCTG-TTTACCGAACAGTTCAA-ATAATTATG-ACT-ATTTGA-A-CA
*** * * ** * * * * *
6359 ATTTAT-TAATATTCCAAAAAATAATGA--GTAAG---AG-AATTAAAATATGAATTTGTTTA-C
231 A-TTATCT-AT-TT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACA--ATTTTTTTTATC
* * *** * * * * * *
6416 -TA-AA-CATATTTAAATAGTTATGACTATCTAAATAATGATCTATTTCAAAACATT-ATGACAT
289 ATATAAGCTTATTCAAA-AAAAAT-AATA-CTAATTTATTA-ATATTTCAAAA-ATTAAT-A-AG
** ** *
6477 TTTG-TTTTGTCAT
347 TAAGAGATT-T-AA
* * * * * * * *
6490 AAAAT-AATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAAAATAAATTTATTAATATTTGAG
1 AAAATAAATT--TGTT-TAC-CG-AA-C-CAGTTC-------AAAT--AGTTATGACTATTTGA-
** * ** ** * * *
6554 A-AA-TCAATAAGT-AAA-AATTTAAAAAATAAATATGTTTT-T--TGAACACGTTTAAATAGTT
49 ACAATTC-ATATTTCAAATCA-TTATGACCT---TTTGTTTTGTCAT-AAAAC-----AATTGTT
* * * *** * * *
6612 ATGACTATTTGAATA-ATTATC-TATTTCAAATTGTTATGA-CCT--TTTGTT--T-TGTCCTAA
103 -TGA--A-TT-CATACA--AGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCC-AA
** ** * * ** *
6669 ACCAATTGTTTTTGTTTATAAAAGCTTATTTGGAATAAAAT-AATACTAATTTA-TTAA-ATTTT
158 A--AATT-AATAAG----TAAGAG---ATTT--AA-AAAATAAAT-CT-GTTTACCGAACA-GTT
* * * ** ** **
6731 CAAA-AATT-T-A-TAATTGAAAAATTTTAAAAAT-AAATCTGTTTATCAAGCAAGTTTAAATAG
207 CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-G-TTAT---G-ACCTTT---T-G
** * ** * * * * * *
6791 TCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTGTGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT
262 TTTTG-TCA-TAAAACAATT-TTT-TTT---ATC-ATATAAGC--TTA---T-TCA-AAAA-AAA
** * * * * * *
6856 TTTTTCT-ATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTA-ATATTCTTAAAA
311 TAATACTAATTTAT-TAA-TAT-TTC---A-AAAAT--TAATAA-GTA--AGAGA-T-TT--AA
** * * * *
6918 TTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAGCAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCAT
1 --AA-AA--T--A-A---A---------TTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT
* * * ** **
6982 TTGAGCTATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTAT
45 TTGAACAATTCA--TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAAT
* ** * * * ***
7046 TAATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATCAATCTTTTGAAAA-T--TAAG-AAG
108 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * *
7107 GGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATC
173 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
7172 TATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTAT
237 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCATATAAGCTTA-
** ** * * * * * ** * *
7236 TTGGAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGCA-TCCTAAAAATTAATAA--CA-A-ATTTAA
300 TTCAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * *
7291 CAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAATTCAAAT-GATTATGACTATTAGAACAATT-ATCTATTTC
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
* * * * * * * * *
7354 AATTCGTTATGACATTTTATTTAGTCATAAAATAAGTT-TTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAA
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * ** * *
7418 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-AAAAAATTAATAAACAACAAATTTAAAAAATAAATCT
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * ***
7482 GTTTACTGAACAAGTTC----AA--ATG-CTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGA
192 GTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGA
* * * * * *
7539 CCTTTTGTTTTATAATAAAACAA-TTATTTTAGTTCATA-AATACTTATCTGAAATAAAATAATA
255 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA--TCATATAA-GCTTAT-TCAAAAAAAATAATA
* * * * *
7602 TTACTTTATCAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAA
316 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* ** * ** * * * *
7645 AAAATAAGTCAGTTTATCGAATTAGTTCAAATAATTTTGGCCATTT-AGACAATT-ATCTATTTC
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTCA--TATTTC
** * * * * ** * * *
7708 AAATCATTACAAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTTTCA-TCATACAAGCATGTTCGAA
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
7772 ATAAAGTAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * *
7837 ATTTACCAAACCAGTTC------------CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAT
192 GTTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * ** *
7890 CTATT-TTTTATTATAAAATAATTGTTGTAGTTTAT-ATA-AA-CTTATTTGGAATAAAATAATA
256 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TT-T--TTTATCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATA
* * * *
7951 CTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAA
316 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * *** * * * * * * *
7994 AAAATTAATCTGTTTGTTGAAGCAGTTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTACCTATTTCAA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTCATATTTCAA
* * ** * *
8059 ATCATTAAGATCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
65 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-
* *** * * * *
8124 AAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTGATAGTTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCT
129 -AA-AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * *** * * * *
8185 ATCTATCGAATCAAG-TCAAAAAATGATGGCCATGCCAATAATTATCTATTTGAAATCATTATTA
192 GTTTACCGAA-C-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * *
8249 CCTTTTG-TTTGCTCATATAACAATTATATTTGAACAT-TAAAGCTTACTCAAAATAAAATAATA
255 CCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-TTTTTTATCATAT-AAGCTTATTCAAAA-AAAATAATA
* * *
8312 CTAATTTATTAATCTTTCAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAA
316 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
** * * * * * *
8355 AAAATAAACCTATTTACCGAACTA-TCTCATATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-CATATTTCA
* * * * * *** **
8419 AGTCCTTATAACCTTTT-TTATTGTCACAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
64 AATCATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
8483 TAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTG
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * *
8548 TTTGCTGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
193 TTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * ** * *
8613 TTTTATTTTGTCATAAAATAAGATTTTTTGAATTCCTACT-AGCTTATTTGGAATAAAATAA-AA
257 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTTTTTTTA-TCATA-TAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATAC
8676 TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTTAA
317 T-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAA
* * * * * *
8719 AAAATAATTTTGTTTACCTAACCAAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAATAGTTTTC-TATTTA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA--ATTCATATTTC
* * * * * * * *
8782 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTTTG--TTCAAATAAGTTTGTTCAGA
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAA
*** *
8845 ATAAAGA-AATACT-ATTCTATTAATATTTTGAATATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAAT
127 ATAAA-ATAATACTAATT-TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
8904 CTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGAC-ATTTGAGCAA-CATTTATTTCAAATCG-T-TG
190 CTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * ** * * *
8965 A-CTTTT-TTTT-T-GTAAAACAATTGTTTTTGT-TTATGCAAGGTTATTTGGATTAAAACAA-A
254 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-TATCATATAAGCTTA-TT-CA--AAAAAAATA
* * * *
9024 ATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTA
313 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* ** * * * ** * * *
9070 AAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAATCCTGATTATTTCAATAATT-ATTTATTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
* ** * ** * * * * ***
9134 ACTCGCTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAGGAATTGTTTCAGTTTATATAAGCTTATTGGGAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
9199 AAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAACTAA-AAATAAAGAGATTTAAAAACTGAATCTG
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
** * * * * * *
9263 TTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAATC
193 TTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
9328 TTTTGTTTTGTTAT-AAACGAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAACAATACAA
257 TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTTA-TCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATACTA
* * *
9392 ATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAAGAAGTAAAAGAGTTAA
319 ATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** ** **
9432 AAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATAAGTGCAATT-ATTTATTTC
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
* ** * * **
9495 -AA-C-TTGCATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGTTTATTCGG
63 AAATCATT--ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * *
9557 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAT
126 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * *
9622 ATGTTTACAAAACAAATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATG
190 CTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * * * **
9687 ACTTTTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTAGTT-T-GTATAAGTTTGCTTGAACTAAAATAAT
254 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT--TTATCATATAAGCTT-ATTCAAAAAAAATAAT
* * * * * *
9750 ACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAACAATTAA
315 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** ** * * * *
9794 AAAA-AGAATCTATTTACTAAAATAGTTCAAATAGTTTTGACTATCTAAATAATT-ATCTATTTC
1 AAAATA-AATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
* * * * ** * **
9857 AAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTCTGAA
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* ** *
9922 TAAAATAAT-TTAAATTTATTAATA-TAAAAAAATTAATAAGTAA-AAATCTT-AAAAATAAATC
128 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATC
* *** * * * * * *
9983 TATTTTTTGAACATATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAGTATCTATTTCAAATCATTATAA
191 TGTTTACCGAACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * ** * ** *
10048 CCTTTTATTTTGTCATAAACCCATTGGTTTCAT-A-AT-AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
255 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATACTA
* * * *
10110 TTTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
319 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** * * *
10150 AAAATAAATCTATTTACC-AAGTGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATT-ATTTATTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCATAT-TTC-
* ** * * ** *
10213 AAAT-GTTACAATCTTTTGATTCT-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTC-A
63 AAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTA-TTCAA
* * **
10275 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATC
126 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * *** * * * * * *
10340 TGTTTACCAAATAAGTTTAAACGGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTAAAATCATTATGA
191 TGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * ** **
10405 CATTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACT
255 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCATATAAGCTTATTCAAAA-AAAATAATACT
10470 AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
318 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** * *
10507 AAACTAAATTTGCTTACAAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATCTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
** * * * * * *
10571 AATTGTTAGGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTGTATTCATACAAGCTTATTCAAAGT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * ** * ** * * * *
10635 AAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTAT
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * * *
10700 TTACTGAATCAATTCAAATAGTTAAGATTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCT
194 TTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
** * * * * * * * * *
10765 TTTGTTTAATAATAAAATAA-TTGTTTCAGTCCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAACACT-C
258 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-T-CATATAAGCTTATTC-AAAAAAAATAATACTAA
* * * *
10828 TTCTATTAACA-CTCAAAAAATTAATAAG-CAGAAAGTTTAAA
320 TT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AA
* * * ** * * *
10869 AAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATT-ATCTATTTAA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
** * * * * *
10933 AATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * * **
10998 AAAATAATATTAGTTTTTTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAG
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-G
** * * * * * *
11062 TTTATTGAATCAATTCAAATAATTATCACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTAAGATC
193 TTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
11127 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCTGAATAAAATAATACTAA
257 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATCATATAAGCTTATTC-AAAAAAAATAATACTAA
** *
11192 TTTATTAATATCCCAAAAATTAATACGTAAGAGATTTAA
320 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
** *
11231 AAAATAAAAATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTTGTATATTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TT-CATATTTCA
* * * * * * *
11295 AACCGTTATAACCTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATT-----
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAA
** * * * *
11354 TGGAATACA-A-TAA--TA-T--TA-T--GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAACAAATAAATTT
128 TAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
11409 TTTTACCGAACTAATTGAAATAGTTAAGGCTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
192 GTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * *
11474 CTTTTGTTTTGTCTTAAAACAAATGTTTTTTCTCATATAAGTTTCTTCAGAATAAAATAATATTA
256 CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTTATCATATAAGCTTATTCA-AAAAAAATAATACTA
**
11539 ATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
319 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
11575 AAAGTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATT-ATTTATTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
* * * * * * ** * * *
11639 AATCATTATAACCATTTATTTTTTTATAAAACAACT-TTTCTATTGATAC-AGTCTTATTCGAGA
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAG-CTTATTCAAAA
* * * * * *
11702 TAGAGTAATGCTAATCTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGGATTTAAAAAATGAATA
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATC
* * * * * ** *
11765 TGTTGAACTG-ACTAATACAAATAGTTAAAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-GGATTAT
191 TGTT-TACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTAT
* * *** * * * * * * *
11828 AACATTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTGTGT-TCATACAATCTGACTCGAAATAACATAA-
253 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TTTATCATATAAGCTTATTC-AAAAAAAATAAT
11891 ATCTAATTTATTAATA-TTC-AAAATTAATAA-TAAGAGATTT-A
315 A-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * *
11932 AAAATAAA-TTATTTATC-AATCAAGTTCAAATAGTTACT-ACTCTTTGAAC-ATTTATCTATTT
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTCA--TATTT
*** * * * **
11993 CAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-A
62 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTA-TTCAA
* * * * * * *
12057 ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
126 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
12121 CTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTTTTTTCAAATCATTAT
190 CTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ***
12186 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCGGATTGAAATAAT
253 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-TATCATATAAGCTTATTC-AAAAAAAATAAT
* ** * * **
12250 ATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTTC
315 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * *
12293 AAAATAAATATGTTTACC-AA--A-TTCTAATAGTCTA--A-TACTTGAATAATT-ATCTATTTC
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTC
** * * * * *
12350 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTCGTAATAAAA-AATTGTATT-AATTTATATAGGCTTATTCAAA
63 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTGAATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
12413 ATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAAATTTAAAATATGAATCT
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** * ** * * * *
12478 ATTTACTAAACGAGCTCAAATTGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAT
192 GTTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * *
12543 C-TTTATTTCGTCATAAAACAA-TTGTTCTATTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTA
256 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCATATAAGCTTATTCAAAA-AAAATAATACTA
* *
12606 ATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-A
319 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** * * * * *
12645 AAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAAT-GTCATGTCCATTTGAAAAATT-ATCTATTTTA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
** * *** * *
12708 AATCATTATGACCTTTTGCATTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-TAGAATTATTCAAAA
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAG-CTTATTCAAAA
* * * *** * ** *
12772 TAAAATAATACTGATTCATTAAGATTTTGAAAATTAATAAG--A-ACA-TTAAAAACCAAATCTA
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * *
12833 TTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGATC
193 TTTACCGAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-C
* * * * ** ** *
12898 C--TTATTTTGTCACAGAATAATTGTTTCTTT-TCATATAAGCTTATTTGGATTAAGATAATACT
256 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TTTATCATATAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATACT
*
12960 AA--T-TTAATA-AT-AAAAATT-A-AA-T--GAG------
318 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
** * *
12985 --------TTT-TTT--CGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACCATTAGAACAATT-ATCTATTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
* * * * * **
13038 AATCA-TA--ACCTTTTGTTTAGTCAAAAAACAATTATTTCAATTCATACATGCTTATTCCGAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
13100 AAAATTATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTG
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTG
** * * *
13165 TTTATTGAACAAGCTCAAATAGA-TAT-AGCTATCTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATT
193 TTTACCGAAC-AGTTCAAATA-ATTATGA-CTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * ** *
13227 ACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTATTTTTTATCATGCAAG-TTGTTCAAAATAAAATAATAC
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* *
13291 TAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
317 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * *
13333 AAAATAAATTT-TTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-CATATTTCAA
* * * * * **
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* ** * * * ** *
13461 GTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAGTATTCTTAAAATTAATAACTAAGAGATTT-A
116 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * ** * *
13525 AAAATAAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGCTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCA
181 AAAAT-AAATCTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * **
13590 AATCATTATGACCATTTCTTTTGTCATAAATCAATTTTTTCAATTCATACT-AGCTTATT-AAGA
244 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCATA-TAAGCTTATTCAA-A
*
13653 ATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTTAA
306 A-AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * **
13705 AAAATAATTTTATTTACCTAACCAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTGG
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
* * ** * * * **
13769 AATCATTATGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGAAAT
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *
13834 AAAATAATGCTAATCTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAGATAATCCT
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* * * * * * *
13895 -TTTATCAAACCAATTCAAGTAGTTATCGACATATTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
192 GTTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTAT-GAC-TA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
** * * * *
13959 GACCTTTTGTTTTGTTCAT-AAACAATTATTTAGT-TCATAAAAGCTTATCCAAAATGAAATGAT
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* * * *
14022 --T--TGTATTAATAATTACAAAAGTTAATAAGTAATAGATTTAAA
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* ** * * * * *
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1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTT-CAAA-TAGTTATGACTATTT-GAACAA-T-TCATATT
** * * *
14128 TCAAATTGTTATTACCTTTTG-TTT-TCATAAAA-AATTGCTTTTCAA-T-ATA-GAGCTTATTC
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* * * * *
14187 AAAATAAAACAATACTTATTTACTAATATTTCAAGAATT--T-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
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* * * *
14248 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTAT
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* * * * *
14313 AACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTGTT-T-ATATAAGCTTATTCAGAATAAAGTAA
253 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-T-TTATCATATAAGCTTATTCA-AAAAAAATAA
*
14376 TACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAA
314 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAA
** * * * * * *
14421 AAAATAAA-TCATTT-GCTAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATT-ATTTATTTCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
* *** * * * *
14483 AATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAA
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* ** *
14548 TAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATC
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * * *
14612 TGTTTGCTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAA
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* * * ** ** ** * *
14677 CTTTTTGTTTTGACATCAAACAATTGGTCCTATTCATACT-ATTTTATTTAGAATAAAATAATAC
255 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TCATA-TAAGCTTATTCA-AAAAAAATAATAC
* * * ** * *
14741 TAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAA
317 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT-TAA
* ** * * * ** ** *
14785 AAAATAAATCTAATTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATGATT-ATCTATTCCA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCA--TATTTCA
* * * * ** *
14849 AATCATTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCTGAT
64 AATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
14913 TAAAATAATGCTAATTTAATAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * ** * * * * *
14977 ATTTATCTAATCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATTGTT-TGAC
192 GTTTACCGAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * *
15041 ATTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT-T-ATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATA
256 CTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATT-TTT--TTTATCATATAAGCTTATTCA-AAAAAAATAATA
* * *
15103 CTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAA
316 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
15146 AAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCA-ATTTAA
1 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T-TCATATTTCA
* * * * * * * *
15210 AATCGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACATTTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATT--GA
64 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTT--ATTCAAA
*
15273 TTAAAATAATACTAATTTATTAATA
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA
15298 CTTACTAAAA
Statistics
Matches: 11312, Mismatches: 2598, Indels: 2052
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Consensus pattern (358 bp):
AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCATATTTCAAA
TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
ACCGAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATCATATAAGCTTATTCAAAAAAAATAATACTAATTTATT
AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
Found at i:2545 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 85--5593 Score: 2779
Period size: 181 Copynumber: 30.8 Consensus size: 180
75 GTGACATCTA
* * *** *
85 TTTGTCATAAAACAATTGTTTGGCA-TTCCATACAAGCCTTAGTCAAAATAACATAATACTAATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTT--CAGTT-CATACAAG-CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATT
* * ** * * *
149 TATTAATA-TTCCAAAATTAATAGGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCT-ATTACCGAATC-AGTT
62 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAA-CAAGTT
* * * * * **
211 CAAATAATTATGGCTATTTCAA-CA--A-TTA--TCAAATCGTTATTACCTTTTGT
125 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * ** * * * * * * *
261 TTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAAAAATAGTAATTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
326 AATCTTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATTAATATTTTTACCAAGCCAA-TTCAAA
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAA--CAAGTTCAAA
* * ** * * * * **
386 TAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGT
129 TAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * ***
438 TTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAGATTTA
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA-ATTTA
* * * * * **
501 TTTACA-TTCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTC
64 TTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTC
* * ** *
565 AAATA--TATGACTACTTTGAAACAATTATTTA-TTCAAAATCATTATGACCTTTTGGT
126 AAATAGTTATGACTA-TTTG-AATAATTATTTATTTC-AAATCGTTAT-AATTTTTTGT
** * *** * *
621 TTTGACATAAACACAATTG-TTCAGTTGCATAAAAAGCTTA-TCCAAAAAAAATAATACTAAATT
1 TTTGTTATAAA-ACAATTGTTTCAGTT-CAT-ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
684 CTT-ATAAATTCAAAAATTAATAA-TAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAAAAAATTC
63 ATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTC
* * * *** * * * ** *
744 AAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGCCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTAT
126 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * * ***
799 TTTGTCAGAAAGCAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * ** *** *
864 AATATTCCAAAAACTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGCGAAT-TGTTTACCAA-ATCAGTTCAAA
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAACA--AGTTCAAA
* * * * * ** * * ** *
927 TAATTATGGCCATTTCTAA-AGTTATCAATTTCAAATCATTATTACCTTTT-A
129 TAGTTATGACTATTT-GAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * * *** *
978 TTTGTCATATAACAATTGCTTT--TTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTA
1 TTTGTTATAAAACAATTG-TTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
1041 TTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAGTGTGTTTACCAAGCCAA-TTCA
64 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAA--CAAGTTCA
* * ** * * * **
1105 AATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGT
127 AATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * * * *
1159 TTAGTCATAAAATATTTGTTTC-TTATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAGATTTA
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA-ATTTA
* *
1222 TTCGAA-A--T--AAAA-TAAT--CTAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTT
64 TT--AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTT
* * * * * * **
1279 CAAATAATGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
125 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
** * * * * * **** * *
1335 TTTGACATAAAAAAATTGTTTTAGTTCGTAAAAACTTATCCAAAATTAAATAATACTAATTTCTT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * * * *
1400 AATAATTCAAAAATTAATAACCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTCTTTACAAAGTAA-TTCAAAT
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * ** *
1461 TGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTGTGACCTTTTAT
130 AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * *** *
1512 TTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTACT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
1577 AATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACTGAATC-AGTT-AAG
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAA-CAAGTTCAAA
* * * ** ** * * **
1640 TAATTATG-GTCATTTCAGCAATTATCAATTTCAAATTGTTATCACCTTTTGT
129 TAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * ** * * * * *
1692 TTGGTCATATAATAATT-TTT-TTTATCATATATGCTTA-TT-AAAAAAAATAATAGTAATTTAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * * *
1753 TAATCTTTTAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAGTTTAT
65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAA
*** * * ***
1818 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTGCATACTGT-AAATCATTATAACCGTTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTA-TTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * ** * ** * *
1871 TCTATCATAAAAAAATTATTTTTGTTCATATAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTAATATAA
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * * * *
1935 AAATATTCCGAAAATTAATAACTAAGAGATTCAAAAAACAAAAT-TGTTTGCCAAACTAGTTCAA
65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTT-ACGAACAAGTTCAA
* * * *
1999 ATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC------A-TTTTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * * * ** *
2045 TTTATCATAAAGCAGTTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * * * * *
2109 TAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTGCCTAGCCAA-TTTAA
65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGA-ACAAGTTCAA
* * * ** * ***
2173 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * ** * * * * *** * *
2226 TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTGATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
*
2290 AATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATC-AGTTCAAA
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAA-CAAGTTCAAA
* * * * * *
2350 AAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTACAATTTTTTCT
129 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * ** * * * *
2402 TCTATTACAAAACAATAATTTCAGTTTATAAAAACTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
2467 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAAT
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAAT
* * *
2532 AGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGT
130 AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTAT-AATTTTTTGT
*** * * * * * *
2583 TTTACCATAAAAAAATTGTTTTAGATCATATC-AGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAAGTTAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
2647 TAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTTAA
65 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAA
* * * * * * **
2711 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTG-
128 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* ** ** * * *
2763 TTTGTCACCAAATTATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAA-AATA-TAATTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * *
2826 AATA-TT-AACACAATTAATTGGTAAAAGATTTAAAAAATAGATTTGTTTACTATACAAGTTCAA
66 AATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGA-ACAAGTTCAA
** * * * * * *
2889 ATTTTTATGACTAATTG-ATCTATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTAT
128 ATAGTTATGACTATTTGAAT-AATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* ** * * *
2942 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAA-AATATTAATATAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
3005 AAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAACATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAA
65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAA
* * * * **
3070 ATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGT
128 ATAGT-TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * *
3123 TTTGTAATAAAACGATTGTTTTAGTTCATATAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
3188 AATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACTGAACATGTTTAAA
66 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAA
* * * * * * **
3252 TAATTATGACTATCTGGATAATT-TTCTATTTCAAAACATTATGAGCTTTTGT
129 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATT-TATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * **
3304 TTTGTTATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTGGT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * * *
3368 TAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCAGAACACGTTCATA
65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAA
* * * * * * *
3432 TAGTTGTAACTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGT
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* * * *
3484 TTTGTTATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
3549 AAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTCAAA
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* * * * *
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129 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * ** *
3666 TTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTA-TTCACACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
*** * *
3730 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCGAACAAGTTTAA
65 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAA
* * * * * * **
3794 ATAGTCATG-TTCGTTTGAGCT-ATTATCTATTTCAAATGGTTATAA--CATTGT
128 ATAGTTATGACT-ATTTGA-ATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
** * * * ** ***
3845 TTTGTCGTAAAATAATTATTTCTA-TTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
3909 TAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATTAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAA
65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAA
** * * * * * * *
3970 ATAGTTATGACTGCTTCAACAATTATCTATCTCAAACCGTTATGA-TCTTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * *
4022 TTTGTCATAAAACAA-TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGAAGTAAAATATTGCTAAATCA
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
4084 CTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAGTTCAA
64 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAACAAGTTCAA
** * * * * ***
4149 ATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAGGCTTTTGT
128 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTAT-AATTTTTTGT
* * * * * * *
4203 TTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTTGAAAAAAAATAATACTAATTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** *
4268 AACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAA-ATTTTTAAAAAATAAATCTGGTTACCGAACAAGTTC
66 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTC
* * * ** * * **
4331 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-CATGACCTTTTGT
126 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCA-AA-TCGTTATAATTTTTTGT
* * ** * * * * * *
4386 TTTATCATAAAATGATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* *
4451 AATATTTCAAAAATTGAA-AAG-ATAAAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATC-AA-ATCGCTT
66 AATATTTCAAAAATT-AATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-CGAACA-AG-TT
* * * * * * * * *
4511 CAAATAATTACGGCT-GTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-CTTTTAT
125 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTAT-AATTTTTTGT
* * **
4566 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTGTTATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTA
* * *
4629 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCT-ATT-C--AC----T-AAA
64 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAACAAGTTCAAA
* * * ** **
4685 CCAGTT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGT
129 -TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * *
4735 TTTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTATTTTAAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
4800 AATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTGTTTGCCGAAGCAA-TTCAAA
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAA-CAAGTTCAAA
* * * * * ****
4864 TAATTAAGACTATATGAACAATTATCTGT-TTATCAAA-AGTTATGGCCTTTTGT
129 TAGTTATGACTATTTGAATAATTAT-T-TATT-TCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * * * ***
4917 TTGGTCATATAACAAATTTTTTTA--TCATTCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTGTTATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
4980 TAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAG-TCAAA
65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAA
* * * ** * * **
5044 TA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
129 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * ** * *** * *
5094 TCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAAT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
5159 AATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAA
66 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAACAAGTTCAAA
* * * * * * * **
5223 TATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
129 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * * * * * *
5275 TTTAG-CATAAAACAAGTTTTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATG
1 TTT-GTTATAAAACAA------TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-
* * * * *
5338 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCTAACTA
58 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAA
* * * * * **
5399 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGT
122 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
* * ** * * * * * * *
5458 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATATTAATCTGTT
1 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
5523 AATATTTCAAAAATTAAT-A-T--GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAAT
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAAT
5584 AGTTATGACT
130 AGTTATGACT
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Statistics
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AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAACAAGTTCAAATA
GTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATTTTTTGT
Found at i:3040 original size:23 final size:25
Alignment explanation
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* *
2986 TTAAAAAATATTAATATATAAATAT
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*
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1 TTAAAAA-ATAA
3047 ATATGTTTAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* *
4527 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAT
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* * *
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* *
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* * * **
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* * ** * *
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* * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
4939 -TATCATTCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT
62 ACATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACT
* * * * * *
5003 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTCAAATATATAACTAT
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* ** * * * * * * ***
5055 TTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGT
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* * * * *
5119 TCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAG
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* *
5184 AGAATTAAAAAATAAAT
130 AGATTTAAAAAACAAAT
5201 TTGTTTGCCA
Statistics
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TTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTACAT
CATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGA
GATTTAAAAAACAAATCTATTCACTAAACCAGTTTCTAT
Found at i:5826 original size:159 final size:160
Alignment explanation
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5609 AAACAATTGT
* * * * *
5619 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAACAAATAAT
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* * * * * *
5683 AAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAAT-AGTCATGACTATTTGAA
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* *
5747 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
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* ** *
5780 TTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAATAACACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA
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* * * * * * *
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* * * *
5909 TTTTCTTTTTGAAATTGCTATAAGCTTTTG
131 TTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTG
5939 TTTTGTCATA
1 TTTTGTCATA
5949 AAATGATTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (160 bp):
TTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAAGTTATTAATATTTCCAAAAATAATAA
GTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAACATCAAATAAATATGACTATTTCAATAA
TTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTG
Found at i:6153 original size:180 final size:179
Alignment explanation
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5767 TTATGACCTT
* * * * * *
5777 TTGTTT-TG-TCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAATAACACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATT
* * * ** * * * ** *
5839 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTGTCGAGCAACTTTAAATAAATATGACTATTTC
64 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *** * **
5904 AATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTATAAGC-TTTTGTTTTGTCATAAAATGA
129 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** *
5955 TTTTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAACA-TAAAGACACT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAA-A-A-T
* * * *
6019 TAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTGTTT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
*
6083 GAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
128 GAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
6135 TTGTTTATGTTTATACAAGCTTATTCA-AATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAAT
** * *** * ** *
6199 TAATAAGTAAAAGATTTAAGCAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAATCCTGACAATTT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
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128 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
6316 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTCCAAAA
1 TTGTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT--AAAA
* * * * * * * ** *
6378 AATAATGAGTAAGAGAATTAAAATATGAATTTGTTTACTAAACATA-TTTAAATAGTTATGACTA
61 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
6442 TCTAAATAATGATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAA
125 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* *
6497 TTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAA-AATA--AATTTATTAATATTTGAGAAA
1 TT-GTTTATGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAA
* * *** * *
6557 TCAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATT
62 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * *
6621 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAACCAA
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* * * * *
6674 TTGTTTTTGTTTATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTCAAAAATT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATT-AAAAATT
* * * * * * *
6739 TATAATTGAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTGTTTATC-AAGCAAGTTTAAATAGTCATGATTATT
64 AATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * *
6802 TGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTGTGA-TCTTTTATTTTGTCATAAAACAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
6855 TTTTTTCTATTCATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCTTAAAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAAT
*** * ** * * *
6919 TAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAGCAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATT
* * * **
6983 TGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAACAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * * * * *
7036 TTGTTTCTATTAATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATCAATCTTTTGAAAA-T
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTAAAAATT
** * * * * * * *
7100 --TAAG-AAGGGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAGTTCTAATAGTTATGATTATTTG
64 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
7162 AACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAA
129 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * * * **
7212 TTATTTATATTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGCATCCTAAAAATT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA--ATATTAAAAATT
* * * *
7277 AAT-A--ACAA-ATTTAACAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAA-TTCAAAT-GATTATGACTATT
64 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATT
* * * * * * *
7336 AGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACATTTTATTTAGTCATAAAATAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
7389 GTT-TTTCA-GTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAT
1 -TTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAAT
** *
7452 TAATAAACAACAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTC--A-A---ATG-CTATT
63 TAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
7509 TGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAA
127 TGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
7562 TTATTT-TAGTTCATA-AATACTTATCT-GAAATAAAATAATATTACTTTATCAATATTTCAAAA
1 TTGTTTAT-GTTCATACAA-GCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAA
* * * * * * ** * * * *
7624 ATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAATTAGTTCAAATAATTTTGGCCAT
61 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * *
7689 TT-AGACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAAC-TTTTGTTTTATCATAAAATAA
126 TTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * * * *
7743 TTTTTTTTCATCATACAAGC--ATGTTCGAAATAAAGTAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAA
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTAT-TTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAA
* * * *
7806 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC--A-AA---C---CAG-T-T-CCTATT
62 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
** * * *
7859 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATCTATTTT-TTAT-T-ATAAAATAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
7911 TTGTTGTA-GTTTATATAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAAT
1 TTGTT-TATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAAT
* * * * *** * * * *
7975 TAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTGTTGAAGC-AGTTCAAACAATTAAGACTATA
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * **
8039 TGAACAACTACCTATTTCAAATCATTAAGA-TCTTTTGTTTCATCATAAAACAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
8092 TTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTGAT
1 TTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAATA--TTAAA
* * * * * * * * * * *
8156 AGTTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAACCTATCTATCGAATCAAG-TCAAAAAATGATGGCC
60 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
*** * * * * *
8216 ATGCCAATAATTATCTATTTGAAATCATTATTACCTTTTG-TTTGCTCATATAACAA
124 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG-TCATAAAACAA
* ** * * * * *
8272 TTATATT-TGAACATTA-AAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAT
1 TTGT-TTATGTTCA-TACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT-AAAAA
* * * * * *
8335 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAACTA-TCTCATATAGTTATGACTAT
62 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * * * * *
8399 TTGAACAATTGTAAACTTCAAGTCCTTATAACCTTTTT-TATTGTCACAAAACAA
126 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
8453 TTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAAT
* * * * * * * * * *
8517 TAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATAT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
** * * *
8582 GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAAGA
128 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-A
* * * *
8636 TT-TTT-TGAATTCCTACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAA
1 TTGTTTATG--TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TT-AAAA
* * * * *
8698 ATTAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAAG-TCAAATAATTATGACTA
61 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
8762 TTTGAATAGTTTTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAA
125 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * ***
8817 ATGTTT-TGTTCAAATAAGTTTGTTCAGAATAAAGA-AATACT-ATTCTATTAATATTTTGAA-T
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAA-ATAATACTAATT-TATTAATATTAAAAATT
* * * * *
8878 ATTAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGAC-ATTTG
64 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
8941 AGCAA-CATTTATTTCAAATC-GT-TGACTTTTT-TTTTG---TAAAACAA
129 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
8985 TTGTTTTTGTTTATGCAAGGTTATTTGGATTAAAACAAAATACTAATTTATTAATATTTCAACAA
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAA-ATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAA
* * * ** * * * ** *
9050 TTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAATCCTGATTATT
62 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * ** **
9115 TCAATAATTATTTATTTCAACTCGCTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAGGAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * *
9168 TTGTTTCA-GTTTATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAAC
1 TTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-AT-TAAAAAT
* * * ** * *
9232 TAA-AAATAAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATT
63 TAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* *** * *
9296 TGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTAT-AATCTTTTGTTTTGTTAT-AAACGAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA
* * * * *
9349 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAACAATACAAATTTATTAATATTAAGATAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAA-A-AAT
* * * * * * *
9413 TAAGAAGTAAAAGAGTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATA
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATT
* ** *
9477 AGTGCAATTATTTATTTC-AA-C-TTGCATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATT--ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** * *
9529 TTGTTTCTATCCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATT
* ** * * *
9594 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTACAAAACAAATTCAAATAGTCATAACTATTT
64 AATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
9659 GAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTCTTTTGTAATAAAATAA
128 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * * ** *
9711 TTGTTT-TAGTTTGTATAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAA
1 TTGTTTAT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAA
* * * * * * *
9774 TTAATGAGTAAAACAATTAAAAAA-AGAATCTATTTA-CTAAAATAGTTCAAATAGTTTTGACTA
62 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
9837 TCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAA
125 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
9892 TTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTCT-GAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATAAAAAAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TAAAAAT
* *** *
9955 TAATAAGTAAAA-ATCTT-AAAAATAAATCTATTTTTTGAACATA-TTCAAATAGTTATGATTAT
63 TAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
10017 TTGAACAAGTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAACCCA
126 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
10071 TTG---GT-TTCATA-ATAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTATTTTATTAAAATTCCAAAAAT
1 TTGTTTATGTTCATACA-AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAAT
* ** *
10131 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAGTGAGTTCAAATAGTTATGATTATT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
10195 TAAACAATTATTTA-TTCAAAAT-GTTA-CAATCTTTTGATTCT-TCATAAAACAA
127 TGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACT-TTTTG-TTTTGTCATAAAACAA
* * *
10247 TTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAAT
* *** * * * ** * * *
10311 TAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTTAAACGGTCATGTCCATTT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * *
10376 GAACTATTATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAA
128 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** * *
10428 TTATTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATT
* * * **
10493 AATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGCTTACAAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT
64 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** * * *
10553 GAACAATTATCTATCTCAAATTGTTAGGA-TCTTTATTTTGTCATAAAACAA
128 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * ** *
10604 TTATTTGTATTCATACAAGCTTATTCA-AAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAAT
* * * * * * * *
10668 TAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTATTTACTGAATCAA-TTCAAATAGTTAAGATTATT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * ** * *
10732 AGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAATAATAAAATAA
127 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
10785 TTGTTTCA-GTCCATACATGCTTA-TTCGAAATAAAATAACACT-CTTCTATTAACACTCAAAAA
1 TTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATT-TATTAATA-T-TAAAA
* * * * *
10847 ATTAATAAGCAGAAAG-TTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGATT
61 ATTAATAAGTA-AAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * *
10911 ATTTGAGCAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
124 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * * * *
10967 TTGTTTCA-ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAGTTTTTTAATATTTCAAAAAT
1 TTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAAT
* * *** ** * * *
11031 TGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACCAT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* *
11094 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTAAGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
126 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * *
11148 TTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATCCCAAAAAT
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT--TAAAAAT
* * ** *
11212 TAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
11277 GAA-AATTTGTATATTTCAAACCGTTATAACCTTTTGTTTTTTCATAAAATAA
128 GAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
11329 TTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAAT---A-CA-A-TAA--TA-T--TA-TGAAAATTAA
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAA
* * * * * * * * *
11382 TAACTAAGAGATTTAACAAATAAATTTTTTTACCGAACTAA-TTGAAATAGTTAAGGCTATATGA
66 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * *
11446 AAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAACAA
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTGTTTATGTTCATACAAG-CTTATTTAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATAT--TAAAAA
* * * * * * **
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** * * ***
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* * * * * * *
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1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTAAAAATT
* * * *
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* *** * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* *
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* ** * * * * *
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1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATT
** * * *
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64 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTT
* ** * * *
12333 GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCGTAATAAAA-AA
128 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
12384 TTGTATTAAT-TT-ATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAA
1 TTGT-TT-ATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAA
* * * * ** * * * *
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62 TTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
12511 TTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-TCTTTATTTCGTCATAAAACAA
126 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* *
12564 TTGTTCTA--TTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
1 TTGTT-TATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAAT
* ** * * * * * *
12627 TAATAGGTAGGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAAT-GTCATGTCCATTT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * ** *
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* * * * * * * * *
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1 TTGTTTATGTTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT-A-ATATTAAAAAT
* ** * * *
12806 TAATAAG---AACA-TTAAAAACCAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTTTTT
63 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * ** * * * *
12867 GAATAATTATATATCTCAAATCATTATGA-TCCTTATTTTGTCACAGAATAA
128 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
12918 TTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
1 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
12972 AAAATTAAAT
Statistics
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Alignment explanation
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5775 TTTTGTTTTG
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*** ** **
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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* ** * * * * ** * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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64 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * *
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*** * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * **
6865 TCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTGG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
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65 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTAT
* * ** * **
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* * ** * ** *
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194 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATA
* * * * *
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*
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* * * * * * * * ** * *
7222 TCATACAAGCTTATTTGGAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGCATCCTAAAAATTAATAA--CA-
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAG
* * ** *
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65 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
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** * **
7409 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTAAAAAATTAATAAACAACAAATTTAAAAA
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* *
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*** * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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191 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAA
* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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65 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * **
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* ** * * *
8114 ATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTGATAGTTAATAAGT---GATTTAAAA
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* * * * * * * * * * *** * *
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* * * * *
8240 TCATTATTACCTTTTG-TTTGCTCATATAACAATTATATTTGA-
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* * * * * *
8282 ACATTA-AAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAATTTAATAACTAA
1 TCA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
8346 GAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAACTA-TCTCATATAGTTATGACTATTTGAACAATTG
64 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** * * * * * * * *
8410 TAAACTTCAAGTCCTTATAACCTTTT-TTATTGTCACAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCT
128 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
** * * * *
8474 TATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAA-TTAAAA
192 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAA
* * * * * * *
8538 AATAAATTTGTTT-GCTGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA
254 AATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
8602 TTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAAGATTTTTTGAAT
318 TCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTTTTT-TAT
* * * * *
8646 TCCTACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
8710 -ATGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAATAGTT
64 GA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * * *
8773 TTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTT-TGTTCAAATAAGTT
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* * ** * *
8837 TGTTCAGAATAAAGA-AATACT-ATTCTATTAATATTTTGAATATTAAT-A--AAAGATTTAAAA
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* * * * * * *
8897 AATAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGAC-ATTTGAGCAA-CATTTATTTCAAAT
254 AATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* *
8960 CG-T-TGA-CTTTT-TTTT-T-GTAAAACAATTGTTTTTGT
319 CGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAT
* * * * * * * *
8995 TTATGCAAGGTTATTTGGATTAAAACAAAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTA
1 TCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAA-ATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * ** * * *
9060 AAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAATCCTGATTATTTCAATAATTA
63 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * ** * *
9125 TTTATTTCAACTCGCTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAGGAATTGTTTC-AGTTTATATAAGCT
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*** * * * *
9189 TATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAACTAA-AAATAAAGAGATTTAAAA
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* * * * *
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* * * *
9317 TTGCTATAATCTTTTGTTTTGTTAT-AAACGAATTTTTTCTAT
318 TCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTT-TAT
* * *
9359 TCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAACAATACAAATTTATTAATA-TTAAGATAATTAAGAAGTA
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* * * * * ** **
9422 AAAGAGTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATAAGTGCAATT
63 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATT
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9486 ATTTATTTCAACTTG-CATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGTT
127 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
** * *
9550 TATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAA
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** * * * * * * *
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* *
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* ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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192 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAA
* * * * *
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* *
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318 TCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-AT
* ** *
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1 TCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAA
** * * *
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64 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTA
* * * * * * * *
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128 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
** * * * *
11351 ATT-----TGGAATACA-A-TAA--TATT-A---T-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAACAAA
193 ATTCAAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAA
* * * * * * * * *
11402 TAAATTTTTTTACCGAACTAA-TTGAAATAGTTAAGGCTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATC
256 TAAATCTGTTTATCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
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320 GTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTTAT
* * * * *
11506 TCATATAAGTTTCTTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAA
1 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
11566 GAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTAT
64 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * ** * ** *
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* *** * *
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* * * * *
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1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAG
* * *
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65 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTA
* * * * *
11986 TCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTT
128 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * *
12051 ATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAA
193 A-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCA-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAA
* * * * * *
12114 AATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTTTTTTCAAA
254 AATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAA
* *
12179 TCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
318 TCGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAT
* * * * * *
12221 TCATACAAGCTTATTCGGATTGAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAG
* ** * * * * *
12285 AAATTTTCAAAATAAATATGTTTA-C---CAAATTCTAATAGTCTA--A-TACTTGAATAATTAT
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* * * * * * *
12343 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCGTAATAAAA-AATTGTATT-AATTTATATAGGCTT
129 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTT
* * * *
12406 ATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAAATTTAAAATA
193 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAA
* * * * * * * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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** * ** * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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** * ** * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* ** * * * * **
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* * ** * * * ** **
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * *
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253 AAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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130 TGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTA
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* * * *
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* * * * * * ** *
11607 AGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTATTTTTTTATAAAACA
65 TGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTATTTCGTCATAAAACA
* * * * * * * * *
11672 ACT-TTTCTATTGATA-CAGTCTTATTCGAGATAGAGTAATGCTAATCTAT
129 ATTGTTTCTATTCATATAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * ** *
11721 TAATATCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGGATTTAAAAAATGAATATGTTGAACTGACTAA-TACA
1 TAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGA-AATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAAC-AAGTTCA
* ** * ** * * * * ***
11784 AATAGTTAAAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAGGATTATAACATTTTGTTTTGTTGCAAA
62 AATTGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTATTTCGTCATAAA
* * * * * * * *
11849 ACAATTGTTTGTGTTCATACAATCTGACTCGAAATAACATAA-ATCTAATTTAT
126 ACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTAT
* * * * *
11902 TAATATTC--AAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAATAAAT-TATTTATCAATCAAGTTCAAATA
1 TAATATTCTAAAAATTAATAGTAAGAAATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATT
* * * *** * * * *
11964 GTTACT-ACTCTTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
66 GTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTATTTCGTCATAAAACA
* * * *
12028 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTAT
129 ATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
12078 TAATATT-TAGACAACTAATTAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCA
1 TAATATTCTA-AAAATTAA-TAGTAAGAA-ATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
* * * * * * * *
12141 AATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
62 AATTGTTATGACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTATTTCGTCATAA
* * * ** * * *
12206 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTGAAATAATATTAATTTAT
125 AACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
12260 TAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTTCAAAATAAATATGTTTACC--A-AA-TTCTAA
1 TAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAAA-TTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * ** * *
12320 TAGTCTA--A-TACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCGTAATAAAA
64 TTGT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTATTTCGTCATAAAA
* * * *
12382 -AATTGTATT-AATTTATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTAT
127 CAATTGT-TTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
12433 TAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAAATTTAAAATATGAATCTATTTACTAAACGAGCTCAAA
1 TAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAAATTTAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * *
12498 TTGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTATTTCGTCATAAAAC
64 TTGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTATTTCGTCATAAAAC
* * *
12562 AATTG-TTCTATTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
128 AATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
12612 TAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAA-
1 TAATATTCTAAAAATTAATA-GTAAGAAATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
12676 TGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTT-TGCATT-ATCATAAAA
65 TGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAT---TTCGTCATAAAA
* * * *
12739 CAATTGTTTCTGTTCATAT-AGAATTATTCAAAATAAAATAATACTGATTCAT
127 CAATTGTTTCTATTCATATAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
12791 TAAGATTTTGAAAATT-A-A-TAAGAACA-TTAAAAACCAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAA
1 TAATATTCTAAAAATTAATAGTAAGAA-ATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * *
12852 TAGTTATGACTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGATCC-TTATTTTGTCACAGAAT
64 TTGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTATTTCGTCATAAAAC
* *** * * *
12916 AATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAGATAATACTAATTTAA
128 AATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
12967 TAATA
1 TAATA
12972 AAAATTAAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TAATATTCTAAAAATTAATAGTAAGAAATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATT
GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTATTTCGTCATAAAACAAT
TGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
Found at i:13328 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 12993--15297 Score: 1619
Period size: 181 Copynumber: 12.7 Consensus size: 182
12983 AGTTTTTTCG
* * *
12993 AACCAGTTCAAATAGTTA-AAACCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TA--ACCTTTTGT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * ** * ** *
13054 TTAGTCAAAAAACAATTA-TTTCAATTCATACATGCTTATTCCGAATAAAATTATACTAATTTAT
66 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
13118 TAA-AATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTG
130 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTACTA
* * * *
13172 AACAAGCTCAAATAGATATAG-CTATCTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTG
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * *
13235 TTTAGTCATATAACAATTATTTTTTATCATGCAAG-TTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTGAT
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*
13299 TAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTA-TCA
130 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-A
* * *
13351 AACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAAAAAAA
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC----A-TT------A
* * * * ** * **
13415 TAAACCTTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTATTTATGT-TCATACCGGTTTATTTGAAATAAAAT
55 T-GACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * *
13479 AATAGTAATTTAATAGTA-TTCTTAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAAATTTGTTTG
117 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTATTTA
**
13542 CCG
180 CTA
* * * * *
13545 AACCAGTTTAAATAGCTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTCT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* ** * *
13609 TTTGTCATAAATCAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATT-AAGAATAAAATAA-AATGAATTT
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*
13671 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCT-
128 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTA
* * ** *
13724 AACCAGTTCTAATAATTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTGGAATCATTATGACCTTTGGT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * ** * *
13788 TTTGTCATAAAACAA--ATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATGCTAATCTA
66 TTTGTCATAAAACAATTAT-TTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * *
13851 TTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAGATAATCCT-TTTA-TCA
129 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AAT-TTATTTACT-A
* * * * **
13902 AACCAATTCAAGTAGTTATCGACATATTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGAC-TA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
** * * * * *
13967 GTTTTGTTCAT-AAACAATTATTTAGT-TCATAAAAGCTTATCCAAAATGAAATGAT--T--TGT
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* * *
14026 ATTAATAATTACAAAAGTTAATAAGTAATAGATTTAAAAAAATAAA-TTAGTTTACTA
128 ATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTA-TTTACTA
* * * * * * ** *
14083 AATCAGTTACAAAGTAATTAT-GGCCATTTAAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTT
1 AACCAGTT-CAAA-TAGTTATAGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* ** * * *
14147 TG-TTT-TCATAAAA-AATTGCTTTTCAAT-ATA-GAGCTTATTCAAAATAAAACAATACTTATT
63 TGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * *
14207 TACTAATATTTCAAGAATT--T-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
127 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTA
* * ** *
14259 AACTAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
14323 TCTATCATAAAACAATTGTTTCTGTT-T-ATATAAGCTTATTCAGAATAAAGTAATACTAATTTA
66 TTTGTCATAAAACAATTATTT-T-TTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * *
14386 GTAATA-TTCTAAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTGCT-
129 TTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTA
* * * * *
14438 AACTAGTTTAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
14502 TTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGT-TAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTA
66 TTTGTCATAAAACAATT-ATTTTT-TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
14566 TTAATATTTTAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTGCTA
129 TTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTA
* * * * * *
14621 AACCATTTCAAATAGTT-TTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * ** ** * ** * * *
14685 TTTGACATCAAACAATT-GGTCCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAA
66 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * * * * * *
14749 TAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAAATAAATCTAATTGCTG
130 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT-TAAAAAATAAATTTATTTACTA
** ** * *
14804 AACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTACATGAATGATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTTC
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTG
* * * * ** * * *
14868 TTTTGTCGTAAAATAATTGTTTTAT-TCATACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATGCTAATTTAA
65 TTTTGTCATAAAACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
14932 TAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCT-
130 TAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTA
* * * * * ** *
14985 AATCAGTTCAAATGGTTA-AGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATTGTT-TGACATTTT-T
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
15047 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT-T-ATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTT
66 TTT-GTCATAAAACAATTATTT--TTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
15110 ATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG
128 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTA
* * * * * * * *
15165 AACAAGTTCAAATAGTTAT-TACTATTTGAACAATTGTCAATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGA
1 AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
15229 TTTGTCATAAAAC-ATT-TGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATT--GATTAAAATAATACTAATT
66 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTTA--TCATACAAGCTT--ATTCAAAATAAAATAATACTAATT
15290 TATTAATA
127 TATTAATA
15298 CTTACTAAAA
Statistics
Matches: 1691, Mismatches: 314, Indels: 240
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
173 32 0.02
174 14 0.01
175 16 0.01
176 47 0.03
177 70 0.04
178 61 0.04
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191 3 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (182 bp):
AACCAGTTCAAATAGTTATAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
TTTGTCATAAAACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTA
Found at i:13760 original size:18 final size:20
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Indices: 13737--13780 Score: 53
Period size: 17 Copynumber: 2.5 Consensus size: 20
13727 CAGTTCTAAT
13737 AATTATGACTATTT-GAA-C
1 AATTATGACTATTTGGAATC
13755 AATTAT--CTATTTGGAATC
1 AATTATGACTATTTGGAATC
13773 -ATTATGAC
1 AATTATGAC
13781 CTTTGGTTTT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 7
0.76 0.00 0.24
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.27
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ACGTcount: A:0.36, C:0.11, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (20 bp):
AATTATGACTATTTGGAATC
Found at i:17465 original size:180 final size:177
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Indices: 15303--23811 Score: 3194
Period size: 180 Copynumber: 47.9 Consensus size: 177
15293 TAATACTTAC
* ** * * * *
15303 TAAAAAATAAAT-TAGTTTATGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAATGATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATA-TTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * * *
15366 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATTTTTTTTTA-TCATACAATCTTATTTGA
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA
*
15430 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATT
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* ** * * * *
15480 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATC
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATT
* * * * * * * * *
15544 TCAAATTGTTAAGA-TCTATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAA-ATTCATTT
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT-ATTC
*** * *
15606 GGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
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* * ** * ** **
15660 TAAAAAATAAATGTGTTTATCGAGTCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAAAATAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT--AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* ** * * * * * * *
15724 TCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTCA
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTC-
* * * * *
15788 AAATAAAAGAAT-CTAAATTTATTAACT-TTCAAAGAACTAAAAAGGAAATGATT
127 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAA-TATT-AAA-AATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
15841 TGAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAATTCAAATTGTGATAACTATTTGAATAATTATTTATT
1 T-AAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* ** * ** * * * * * *
15906 TAAAATCATTATAACCGTTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCA
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-
* * * * *
15970 AAATAAAATAATATTAATTT-CT--TA-CAAAAATTAATAA--ACAAGCGTT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATT
* * ** * * * *
16016 T--AAAATAAATTTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* ** * * ** * *
16079 AAAATCATTATGACCTTTTGC-TTTGTCAT-AAACAATTGTTTGAATTCATGCAAGCTTAGTTAA
65 TAAATTGTTATGA-CTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA
16142 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATT
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
16190 TAAAAAGTGAATCTATTTACTAAATC-A-TTTCAAATAATTATGTCCATTTCAACAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAA-CAAGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
** * * * * * * * * *
16253 TTTAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATACATGTTTATTC
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* * * * * **
16317 AAAACAAAATAAAAGTAATTTATTAGTGTTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATT
127 -AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * *
16371 TAAAAAAATAAATCTATTTACCGAAA-TAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATAC
1 T-AAAAAATAAATATATTTA--TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * *
16435 TTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA
63 TTTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-
* * * *
16500 AAATAAAATAATACTAATATA-AAATATTACAAAAATTAATAACTAAGAGATT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * *
16552 T-AAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAG-TTAAATAGTTAAGGCTATTTGAATAATTATCTA-TT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * *
16614 TCAA-----ATCA-TTTTTGTTTTGACATAAAACAAAAT-TTTC-ACTTCATACTAA-CTTATTC
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTC
* * * *
16670 AAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATATGTAAGAGATT
127 -AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * ** * *
16724 TAAAAAATAATTCTATTTACCT-AATTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATATTTA--TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * * * * *
16788 TCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCCG
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CA
* * *
16853 AATAAAATAATGCCAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATT
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* * ** * * ** * *
16901 TAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTTGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTCTTT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
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* * * *
17029 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGCAAAA-TTT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
** * * * * * *
17079 TAAAAAATAAAT-TGCTTACCAAACTAGATTAAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * ** * * *
17143 CAAATCT-TTATGACCTTTT-TTTTGTTGTAAAA-AATTATTT-TAGTTCACATC-AGCATATTT
65 TAAAT-TGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTA-TT
* * * * *
17203 GAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGATATT
126 CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * *
17257 TAAAAAATGAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTGTTT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * ** * * *
17322 GAAATTGCTATAACTTTTTCTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTGTTACAA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAA
* * *
17387 ATAAAATAATAC-AACTTATTAATATTAAGACAATTAATAGGTAAAAGATC
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATT
* * * ** * * *
17437 TAAAACATAAATTTATTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * *
17502 TAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTGTTCATA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-A
* * * * *
17567 TTTAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAACATT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AA-AAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * *
17618 T-AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATGGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
** * * * * * * * *
17682 TAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAA
* * * ** * **
17747 ATAAAATAATACTAATTCATGAATATTCTAAAATTAATGTGTAAGAGAAC
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * *
17797 TAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAC-A-TTTCCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTT--AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* *** * * *
17860 TTCAAAGCATTATGAC-CTTTCATTTTGTCATAAAACAATTAG-TTCTATTCATGCAAGCTTATT
63 TTTAAATTGTTATGACTTTTTC-TTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-T
*
17923 TCAAATAAAATAACA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATT
125 TCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * *
17977 TAAAAAATAAATATATTTTTTGAACACA-TTTAAATGGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATA-TTTATAAACA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * *
18041 TCAAATCGTTACGAC-CTTTCATTTTATCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCG
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTC-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-
* *
18105 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTTAAAAATTAATAAATAAAAGATT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATT-AA-TATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* ** * * * * *
18158 TAAAAATAATAAATCTATTTACCCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATTTA
1 T-AAAA-AATAAATATATTTA--TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
**
18223 TTTTAAATTGTTATGA-TCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATT
62 TTTTAAATTGTTATGACT-TTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
** * * * ***
18287 TGAATGAAAAAAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAAAAAGTTGGAGATT
126 CAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
18341 TAAAAAATAAATCTATTCACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCACTTGAGCT-ATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATT
* * * ** * * * **
18405 TCAAATAGTTATGA-TATTTTATTTTGTTGTAAAACAATCAT-TTTCTATTTATAAAAAATTATT
64 TTAAATTGTTATGACT-TTTTCTTTTGTCATAAAATAAT--TGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
*
18468 CATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATT
126 CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
18517 TAAAAACA-AAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATCGTTATGACTATTTCAACAATTGTCTATC
1 TAAAAA-ATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * *
18581 TCAAATCT-TTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA
64 TTAAAT-TGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
** * * * *
18644 AAGTAAAAT-ATTGTGAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATT
128 AA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * *
18697 TAAAAAATAAATGTGTTTATCGAAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT--AAA-CAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* ** * * ** * * *
18761 TTCAAATCATTTTGACCTTTTTATTTAT-TTGTAAAATAATTTTTTC-AGTTCATATATGCTTAT
63 TTTAAATTGTTATGA-CTTTTTCTTT-TGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT
* **
18824 CCAAA-ATAAATAATACTAATTTATT-ATCATGTAGAAAATTAATAAACAAGAA-ATTT
125 TCAAATA-AAATAATACTAATTTATTAAT-AT-TA-AAAATTAATAAGTAA-AAGA-TT
* * * * *
18880 TAAAAAA-AAATTTGTTTACCAAACATGTTTACATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * *
18944 ATAAGA-AG-TGTGACCTTTTTTTTTTATCATAAAATGATTGTTTC-AGTTCATA-AAGCATT-T
65 -TAA-ATTGTTATGA-CTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGC-TTAT
* * *
19004 TCAAAATAAAATACAT--TACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAAAAGTTAAAGATT
125 TC-AAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * * *
19058 TAAGAAATAAGTCTATTTATTGAATC-ACTTCAAAATAATTATG-GTCATTTAAATTAATTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-T-AAACAAGTT-TAAATAGTTATGACT-ATTTGAA-TAATTATCT
* * * * * *
19121 ATTTCAAATAGTTAATGAAC--TTT-TGTTGTCATAAAAACAATTACTTT-TCA-TCATATAAGC
61 ATTTTAAATTGTT-ATG-ACTTTTTCTTTTGTCAT-AAAATAATT-GTTTCT-ATTCATACAAGC
* * *
19181 CTATTCGGAAT-AAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATT
121 TTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * ** *
19239 TAAAAAATAAATTTA-TT-T-----A-TTGAACCAGTT-T--CTATTTGAACAATTATCT-TATT
1 TAAAAAATAAATATATTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TT
** * * * * * *
19292 TAAATCATTATAACCTTTTATTGTGTTATAAAATAATTG-TT-TAGTTCATATAAGCTTATT--A
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * ** *
19353 ATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCCAAAAATTGATAACTAAGTGATG
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
19404 T-AAAAATAAATCTGTTTATGAA-TAG-TTAAACAATTAAGACTATATGAATAATTATCTGTTTA
1 TAAAAAATAAATATATTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-
*** * * * * * * * * *
19466 TAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATTCAAGCCTATTCAA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAA
* *
19530 ATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * ** *
19581 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AACTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAAC-AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* ** * * * ** * * * * *
19642 TCAAATCATTATAACCTTTTGC-TCTACCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCA
64 TTAAATTGTTATGA-CTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-
* * * * * * *
19706 AAATAAAATAATCCTAATCTAAT-ATATTCAAAATGAATAATTAAAA-AAT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * ** * * * * ** **
19755 TCAAAAAT-AATTTCTTTGGCCGAATCAA-TTCAAATATTTAAGA-TATAAG-AGCATTATCT-T
1 TAAAAAATAAATATATTT---ATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* ** * * * * *
19815 TTCAAAATCATTCACTGACCTTTTGT-TTTTATGCATAAAATAAGTTTTTTCCATTCATTCTAGC
63 TT-TAAATTGTT-A-TGA-CTTTT-TCTTTTGT-CATAAAATAA-TTGTTTCTATTCATACAAGC
** * *
19879 TTATTTGGATTAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATT
121 TTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * *
19935 T-AAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
1 TAAAAAATAAATATATTTA--TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * ** * * * * * * *
19998 TCAAATCGTTATGACCATTTGTCTTGTCATAAAACAA-TGCTTT-TGTTCATATAAGTTTGTTTC
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTT-ATTC
* * * * *
20061 GAATAAAGTAATACT-ATCTGTTAATATTTCAATAATTAATAAG----AGATT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * *
20109 TAAAAAATAAATCTATTTATCTAACAAGTTTAAATAGTTATG---A---G--CAATTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * *
20166 CAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGAT-ATAAAATAATTGTTTCCATTCATACAAGCCTAATTCA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCA
* * * * *
20230 CCAAT-TAATAAGA--AA---A--AAT-TTTAAAA--AATAA--ATATG-TT
128 --AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
20268 TACTAAACTAGATCAA-ATAGTCAT-GACTA-TTTGAATAATTAT--CTATTTCAATCATTATGA
1 TA--AAA--A-ATAAATATATTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT--
* *** * ** * ** * * * ** *
20328 C-CTTTTGTTTTGTCAAAAAATTATTTCAGTT-T-ATATAA-ACTT-ATTC-A-AAATA-AA-AT
59 CTATTTTAAATTGT-TATGACTT-TTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * * * * * * * * ***
20384 AATACTAAGTATTAATATTA-GAATTTAAT-A-ATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTATT
122 TATTC-AAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGT-AAAAGATT
* * * * * * * *
20442 GGTCAAACAAGTTTAAATA-A-TTAT-GACTA-TTTCAACAATTAT--CTTTTTG-A-AATT-GC
1 --T-AAA-AA--ATAAATATATTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* * * * * * * *
20498 TA-TA---ATT-TTTTG---TTTTC-----TCATCAAATGATTTTTTTTGTTCGTACAAGCTTAT
60 TATTTTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-
** * * * *
20550 TTTGAATTAAATAATACAAATTTATT-ATATAAAGACAATTAATAAGTAAAACATT
124 TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATT
* * * *
20605 TAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * *
20669 TAAATTCTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* *** **
20734 TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCCAATTAATAAGTAAAACTTT
130 -TAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
20785 TAAGAAATAAATATGTTTTTTGAATAAGTTCAAATAGTTCTGACTATTTAAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATAT-ATTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
** * * * * * * * * *
20850 TAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAAGCTCATTTTA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTA-TTCA
* * *
20915 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAAT
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * ** * *
20967 TAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCCGAACAATTATGTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* *** * ** * * **
21032 CAAAACATTATGACATTTTGGTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAA
*
21097 ATAAAATAATA-TAAAATTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAA-ATT
129 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * *
21147 TTAAAAATAAATATGTTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAAAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATAT-ATTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * ** * * * **
21211 TAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTTTTTCTATTTATAAAAGCTTATTTGGA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAA
*
21276 ATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
21327 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAGCAAGTTCAAATAGTTATAACTACTTGAACAATTATTTATTC
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* *** * * * *
21392 CAAATCACTATGA-TATTT-TGTT-T--TAAAATAATTGTTTCCATTCATATAAG-TTCATTCGA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTC-A
* **
21451 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTACT-AGTTGAAGATT
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAA-TTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
21503 TAAAAAACAAATTTGTTCATGAA-AAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTT-AAGCT-ATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATATTTATAAACAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAA--TAATTATCTAT
* * * * * * * **
21564 TTCAAATCGTTATGACATTATATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA-ATTAAACA
63 TTTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-
* *
21628 AAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
21677 TAAAGACTAAATCTGTTTATTGAACCAA-TTGT-AATAGTTATGATTATTTGAAGAATCATCTAT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-T-AAACAAGTT-TAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * * *
21740 CTTAAATTGTTAT-AATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATGCAAACTTATTTG
63 TTTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTC
* * * * * * *
21804 GAGTAAAATAGTGCTAAATTGA-TAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
127 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * ** * * * *
21857 TAAAAAATAAATATGTTTGCTGAATTAGTTCAAATAATTAAT-ACTA-TTAAACAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATATATTT-ATAAACAAGTTTAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * *
21920 TCATATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATTCG
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-
* * * ** *
21984 AAATAAAATCAGACTAATTTATTAACAATTAAAAAATTAATAAACAAAAAATTT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TT
* * * * * * * *
22038 TTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGGCTGTTTGAATTATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* *** * * * * *
22103 AAAATAAATATGACCTTTTGTTTAT-T-AT-AAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCTA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTT-TGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TC
* * * * * *
22164 AAATAAAATAATATTACTTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAACTTAGAGATT
127 AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * ** * * * * *
22218 TAAAAAATAAGT-TAGTTTATCGAA-TGGTTCAAATAATT-TTAGCCATTTGAACAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATA-TTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTAT
* ** * * * * *
22280 TTCAAATCATTACGAAC-TTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATT
63 TTTAAATTGTTATG-ACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT
* * * * *
22343 CGAAATAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAGA-ATT
126 C-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * * *
22397 TAAAAAATTAATTTGTTTACTAAA-ATAGTTGAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTGTTTATT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * ** * *
22461 TCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACCATTATTTC-AGTTCATACAAACTTATTCA
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-
*
22525 AAATAAATTAATAATAATAATATTTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGT----GATT
127 AAAT-AA--AATAATACT-A-A-TTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * * *** * *
22580 TAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACCATGCCAACAATTAACTATT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-T-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * * * *
22644 TGAAATAGTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAACAACTGTATT-TGA-ACATTCAAGCTTATTC
64 TTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTC
* * * *
22707 AAAATAAAATAATACTAATTAATT-CT-TCAAAAATTAATATGTAAAAGATT
127 -AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * **
22757 TAAAAAA-AAATCTATTTACTGAAA-TAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGT-AAAC
1 TAAAAAATAAATATATTTA-T-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
** * * ** * * * * * *
22819 TTAAATCATTATACACTTTTTGTGCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCA
64 TTAAATTGTTAT-GACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * * * *
22884 GAACAAAATAATAATAA-CTAATAATATTCCAAAATTAATAACTAAGAGAAT
128 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * ** * * * *
22935 T-AAAAATAAATTTGTTTGTCGAA-TTGTTCAAATA-TTATAGACTATATGAAACAATTATGTAT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTAT-GACTATTTG-AATAATTATCTAT
* ** * * * ** * *
22997 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTT
63 TTTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT
** * *
23062 GGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-AGATAAGAGATT
126 CAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAG-TAAAAGATT
* * * * ** *
23116 TAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAA--TCGAATAAG-TATGACTATTTGAACAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATATATTTA--TAAACAAGTTTAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* ** * * * * * * * * *
23178 TCTAAATCATTATGA-TCATCTATTTTATCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGA
63 TTTAAATTGTTATGACT-TTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-T
* ** * *
23240 CAAAAAAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-TATTAA-TAAGAGATT
126 CAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * ** *
23291 TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTAT-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * *
23356 CAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGA
65 TAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-A
* * * **
23421 TTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATTTT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * * * *
23472 TTAAAAATAAATGTGTTTACCAAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTT
1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * * * *
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** *
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* * * * * *
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1 TAAAAAATAAATATATTTA-TAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * * * * * * *
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*
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**** * *
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** * ** * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * *
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* *
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* * ** * **
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* *
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* * * * * * * * * *
16186 --GATTTAAAAAGTGAATCTATTTA-CTAAATC-ATTTCAAATAATTATGTCCATTTCAACAATT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * ** * * *
16247 ATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATACATGT
193 ATCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATAAAAGC
* * * * * **
16311 TTATTCAAAACAAAATAAAAGTAATTTATTAGTGTTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAA
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
16545 AGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTT-AAATAGTTAAGGCTATTTGAATAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * *
16608 TCTATTTCAAATCA--T----TTTTGTTTTGACATAAAACAAAAT-TTTCACTTCATACTAA-CT
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* * * *
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* ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *** * * * * ** *
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* * * * *
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** * *
17087 AAA-TTGCTTA-CCAAACTAGATT-AAATAGTCATGACT
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* * * ** *
17123 ATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCT-TTATGACCTTTT-TTTTGTTGTAAAA-AATTATTT-T
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* * *
17184 AGTTCACATC-AGCATAT-TTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATA
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* * * * * *
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* * * * * ** ** * * *
17311 ATTATCTGTTTGAAATTGC-TATAACTTTTTCTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACA
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* * * *
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* * **
17437 TAAAACATAAATTTATTTA-CTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACT
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* * * *
17482 AATTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
17547 TTCATACAAGCTTGTTCATATTTAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGTA
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* ** * *
17611 AAACATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATGGTTTTGACTATTTGAATAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * *
17675 TCTATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTT
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** * * * ** * **
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* * * *
17805 TAATTTGTTTA-TCAAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACT
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* * *** **
17842 ATCTGAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTAG-TTCT
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* * * *
17906 ATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAACA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
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* * ** * *
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* ** * *
18033 TATCTATTTCAAATC-GTTACGACCTTTCATTTTATCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATAAAA
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* * * *
18096 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAA
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* * * * *
18161 AAATAATAAATCTATTTACCCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACT
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* * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** * ** * * * **
18271 TTCATACAATTTTATTTGAATGAAAAAAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAAAAAGTTG
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* * * * * * * * * *
18335 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTCA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCACTTGAGCT-ATT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAATT
* ** * ** * *
18398 ATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATCAT-TTTCTATTTATAAAA
193 ATCTATTTCAAATCA-TT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TGTTTCAATTCATAAAA
** *
18461 AATTATTC-ATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAA
254 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * *
18520 AAACA-AAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAAATCGTTATGACT
318 AAA-ATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
18562 ATTTCAACAATTGTCTATCTCAAATCT-TTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * * *
18625 GTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAAT-ATTGTGAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAC
65 ATTCATACAAGCTTGTTCAAA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * *
18688 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * ** * * * *
18752 ATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-TATTTATTTGTAAAATAATTTTTTCAGTTCATAT
190 ATTATCTATTTCAAATCA-TTTAACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAA
* * **
18816 ATGCTTATCCAAAAT-AAATAATACTAATTTATT-ATCATGT-AGAAAATTAATAAACAAGAA-A
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* * * *
18877 TTTTAAAAAA-AAATTTGTTTA-CCAAACATGTTTACATAGTTATGACT
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* ** * * * **
18924 ATTTGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAG-TGTGACCTTTTTTTTTTATCATAAAATGATTGTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* *
18987 C-AGTTCATA-AAGCATT-TTCAAAATAAAATACAT--TACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAA
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* * * * * * * * * * *
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124 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTC-AAATAGTTATGACT-ATTTG
* *
19109 AATTAATTATTTATTTCAAAT-AGTTAATGAA-CTTTTG--TTGTCATAAAAACAATTACTTTTC
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* * ** *
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* **
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** * * * * *
19272 ATTTGAACAATTATCTTATTT-AAATCATTATAACCTTTTATTGTGTTATAAAATAATTG-TT-T
1 ATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * *
19334 AGTTCATATAAGCTTATT--AATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCCAAAAATTGATAACTA
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** * * * * * * * *
19397 AGTGATGT-AAAAATAAATCTGTTTAT-GAA-TAGTT-AAACAATTAAGACTATATGAATAATTA
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* * ** ** * * ** **
19458 TCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATTCAAGC
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* * *
19522 CTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
256 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * *
19586 AATAAATCTGTTTA--CTAACTAA-TTCAAATA--TATAACT
320 AATAAATTTATTTACCCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ** * * * ** * * *
19623 ATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGCTCTACCATAAAACAATTATTTTTG
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* * * * * * *
19688 TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATCTAAT-ATA-TTC-AAAATGAATAATTAA
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* * * * ** * * * ** **
19750 AA-AATTCAAAAAT-AATTTCTTTGGCCGAATCAA-TTCAAATATTTAAGA-TATAAG-AGCATT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * *
19810 ATCT-TTTCAAAATCATTCACTGACCTTTTGTTTTTATGCATAAAATAAGTTTTTTCCATTCATT
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** *** * *
19874 CTAGCTTATTTGGATTAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGAT
251 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * *
19934 TT-AAAAAT-AATTCTATTTA-CCTAACCAGTTCAAATAATTATGACT
314 TTAAAAAATAAATT-TATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
19979 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTCTTGTCATAAAACAA-TGCTTT-T
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT
* * * * * * * *
20042 GTTCATATAAGTTTGTTTCGAATAAAGTAATACT-ATCTGTTAATATTTCAATAATTAATAAG--
65 ATTCATACAAGCTTG-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
20104 --AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCTAACAAGTTTAAATAGTTATG---A---G--CAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* ** * * * * *
20159 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGAT-ATAAAATAATTGTTTCCATTCATACAAGCC
194 TCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAG-C
* * * * * * * *
20223 TAATTCACCAAT-TAATAAGA--AA---A--AAT-TT-TAAAA--AATAA--ATATG-TTTACTA
256 TTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AA
* * * ** ** * * ** *
20273 AACTAGA-TCAAATAGTCATGACTA-TTTGAATAATTAT--CT
319 AAATAAATTTATTTACCCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* *** * ** ** * ** * *
20312 ATTTCAATC-ATTATGACCT-TTT-GTTTTGTCAAAAAATTAT-TTCAGTTTATATAAACTTATT
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*** ** * * * * * * * *
20373 CAAAATAAAATAATACTAAG--TATT-AATATTAGAAT-TTAATAA-TTA--AGAGATTTAAAAA
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* * * **
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118 ATTAA--TA--AGT-AAA-AGA-TTTAAAAAATAAATATG--T-TTATCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * ** ** *
20486 TTTTGA--AATTGCTATAATTTTTTGTTTTCTCATCAAATGA--TTTT-TTTTGT--T----C--
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*** * * *
20538 --G--T--A--C----AAGCTTATTTTGAATTAAATAATACAAATTTATT-ATA-TAAAGACAAT
236 TTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AAT
* * *
20589 TAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TCAAACAAGTTCAAAT-CTTATGACT
299 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
20649 ATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTCTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA
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* * **
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** * * ** * * *
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129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * *
20843 TCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAAGCT
194 TCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AAAGCT
* ** * * *
20908 CATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAA
257 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * ** *
20973 ATGAATTTGTTTA-CTGAACATGTTCAAATAGTTATGACT
321 ATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * *** * * * *
21012 ATCCGAACAATTATGTATTTCAAAACATTATGACATTTTGGTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * ** * *
21077 TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAAATTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTA
66 TTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
21141 AAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAAAATT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
21203 ATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTTTTTCTATTTATAAAAGCT
193 ATCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCT
*** *
21268 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
257 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * *
21333 ATAAATCTATTTA-CTAAGCAAGTTCAAATAGTTATAACT
321 ATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *** ** * *
21372 ACTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATATTTTG--TT-T--TAAAATAATTGTTTCCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * *
21432 TTCATATAAG-TTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTTACT-AG
66 TTCATACAAGCTT-GTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-TTAATAAG
** * * * * * *
21494 TTGAAGATTTAAAAAACAAATTTGTTCAT-GAA-AAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTT-AAGCT
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAA--T
* * * * * * * *
21555 -ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTATATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA
189 AATTATCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-A
** * **
21619 AA--TTAAACAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTT
252 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * *** * ** *
21678 AAAGACTAAATCTGTTTATTGAACCAA-TTGTAATAGTTATGATT
316 AAAAAATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
21722 ATTTGAAGAATCATCTATCTT-AAATTGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT
1 ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * ** * * * * *
21785 ATTCATGCAAACTTATTTGGAGTAAAATAGTGCTAAATTGA-TAGTA-TTCTAAAAATTAATAAG
65 ATTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * ** * * *
21848 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAATTAGTTCAAATAATTAAT-ACTA-TTAAACA
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATA
* * * * * * * *
21910 ATTATCTATTTCATATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAT
190 ATTATCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAA
* * * * * ** * *
21975 GCTTATTCGAAATAAAATCAGACTAATTTATTAACAATTAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTTT
254 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTA
* * *
22040 AAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAATTCAAATAGTTATGGCT
317 AAAAATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ***
22083 GTTTGAATTATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTAT-T-AT-AAACAATTGTTTC-
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * *
22144 AGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAC
65 A-TTCATACAAGCTTGT-TCAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** * * * *
22209 TTAGAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCGAA-TGGTTCAAATAATT-TTAGCCATTTGAACA
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATA
* * *
22271 ATTATCTATTTCAAATCA-TTACGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTC-A-TCATA
190 ATTATCTATTTCAAATCATTTA--ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATA
* * * * * * * *
22333 CAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAGA-ATT
251 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * *
22397 TAAAAAATTAATTTGTTTA-CTAAA-ATAGTTGAAATAGTTAAGGCT
315 TAAAAAATAAATTTATTTACCCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
22442 ATATGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACCATTATTTC-A
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
22506 GTTCATACAAACTTATTCAAAATAAATTAATAATAATAATATTTTATTAATATTACAAAAATTAA
66 -TTCATACAAGCTTGTTC-AAAT-AA--AATAATACT-A-A-TTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * * * ***
22571 TAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACCATGCCA
123 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
22631 ACAATTAACTATTTGAAAT-AGTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAACAACTGTATTTGAA--C
187 ATAATTATCTATTTCAAATCA-TT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAATTC
** * * *
22693 ATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTA--ATTCTTCAAAAATTAATATGTAAAAGA
248 ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
* ** * *
22755 TTTAAAAAA-AAATCTATTTACTGAAA-TAGTTTAAATAGTTATGACT
313 TTTAAAAAATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ** ** * * *
22801 ATTTGAACAATTGTAAACTT-AAATCATTAT-ACACTTTTTGTGCTATCATAAAACAATTATTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-C-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * * * *
22864 TGTTCATATAAGCTTATTCAGAACAAAATAATAATAA-CTAATAATA-TTCCAAAATTAATAACT
64 TATTCATACAAGCTTGTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * ** * *
22927 AAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGTCGAA-TTGTTCAAATA-TTATAGACTATATGAAACAA
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTG-AATAA
* * * * * * **
22989 TTATGTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTGAATTTATACTA
191 TTATCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATAAAA
*** * * *
23054 GCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-AGATAAGAGATTT
254 GCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTT
* * * * *
23117 AAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAA--TCGAATAAG-TATGACT
316 AAAAAATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACT
** * * * * * * * *
23160 ATTTGAACAATTATCTA-TTCTAAATCATTATGATCATCTATTTTATCATAAAATAAATGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
23224 GTTCATATAAGTTTG-ACAAAAAAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAATATTAATAAG--
65 ATTCATACAAGCTTGTTCAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * **
23286 --AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* ** * * * * *
23349 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
194 TCTATTTCAAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTT
* * * * ** *
23414 ATTCAGATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAA
258 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
23479 TAAATGTGTTTA-CCAAACTAGATCAAATAATCATGATT
322 TAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
23517 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCT-TTATTA-CTTTT-ATTTATCATAAAAAGAATTGTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTC
* * * * ** * *
23579 CATTCATATACA-TTTATTGGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA
64 TATTCATACA-AGCTTGTT-CAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
23643 -TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTGAAC
126 GTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * * *
23706 AATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTCTATTCGTACA
189 AATTATCTATTTCAAATC-ATTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAA
* * * *
23771 AGCTCATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGCTTAAAATAATACTAATTTATT
253 AGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT---C---AAA-AAT--TAA-TAAGT
* * * ** * ** *
23835 AATATTTTGATAATTAATAAGTAAA-AGATTTTA---AAA-AA-AT-AAATATGTTTACCAAACA
307 AA-A---AGAT--TTAAAAAATAAATTTA-TTTACCCAAACAAGTTCAAATA-G-TTA--TGACT
* * * * * * ** ****
23893 AGTTCAA-ATAGTCT-TGACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATGACCTTT-TCTTT
1 ATTTGAACA-A-T-TAT--CTATTT-CA-AATT-GTTA--TGACCT-TTTGT----TTTGTC---
* * * * * *
23955 TGTAACAACAATTGTTT-TAGTTCTTATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAATACTAATTTATTAAT
48 -ATAA-AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTG-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * * *
24019 A-TTCGAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAAAGAATCTATTTA-CTAATAAGTTGAAATA
109 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATA
* ** * * * *
24082 GTTATGATTAGCTGAACAATTATCTATTTCGAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTCGACATAAAACA
172 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATT-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *** *
24146 ATTGGTTCTATTCGTACAAGCTTATTTTGAAT-AAATAAT-TTAAATTTATT-ATATTCCAAAAA
235 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAA
* * * *** *
24208 TTAATAAAT-AAACATTTTAAAAATAAATTTATTGT--TTGAACACGTTCAAATAGTTATGACT
298 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATT-TACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
24269 ATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCTATTGTTTCTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * *
24334 TTCATAAAAGCTTAAT-AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTA
66 TTCATACAAGCTTGTTCA--AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-
* * * * *
24398 AAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAAT-GAGCAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTAAATAA
128 AAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * *
24462 -TATTTATTTCAAAT--TTT-ACAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
191 TTATCTATTTCAAATCATTTAAC-CT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAA
* * * **
24523 GTTTATT-TAAATGAAAATAATACT-ATTTATTAATATATTCTAAAAATTAATAATTTGAA-ATT
254 GCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATT-A-ATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * *
24585 TAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAATAAGTTTAAAAAGTCATGTCT
315 TAAAAAATAAATTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * ** *
24630 ATTTAAACTTATTATCTATTTCAAATTATTATGATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTT
1 ATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * * *
24695 A-TCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-
65 ATTCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
24758 ---AGATTTAAAAACTAAAATTTGTTTA-CAAAATCAATTTCAATTAGTTATGACTATTTGAATA
128 AAAAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * ** * *
24819 ATTATCTATCTCAAATCATAATGATC-TTCATTTTGTCATAAAACAA-TGTTT-TA-TCATACAA
190 ATTATCTATTTCAAATCAT-TTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAA
* * ** * * * *
24880 GCTTATTCAAAAGTAAAATATTTCTAAAGTAATAGTATTTTAAAAATTAATATAGTAAGAGATTT
254 GCTTATTCAAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTT
* * * *** ** * *
24945 AAAAAATCAATGTGTTTA-TTGAACTTGTTTCAAATAGTTAAGAAT
316 AAAAAATAAATTTATTTACCCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACT
** * * *
24990 ATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACC-TTTGTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
25032 ACTATTAAAA
Statistics
Matches: 7140, Mismatches: 1578, Indels: 1218
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
322 3 0.00
323 11 0.00
324 3 0.00
325 2 0.00
328 2 0.00
329 3 0.00
330 8 0.00
331 9 0.00
332 22 0.00
333 41 0.01
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340 41 0.01
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343 33 0.00
344 40 0.01
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348 149 0.02
349 33 0.00
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365 35 0.00
366 27 0.00
367 3 0.00
368 6 0.00
370 6 0.00
371 9 0.00
372 7 0.00
373 7 0.00
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375 18 0.00
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379 6 0.00
380 8 0.00
381 4 0.00
382 6 0.00
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384 2 0.00
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386 3 0.00
389 1 0.00
390 2 0.00
391 8 0.00
392 20 0.00
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395 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
TTCATACAAGCTTGTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
TATTTCAAATCATTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATT
CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
TTTATTTACCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
Found at i:20743 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 20232--25014 Score: 2302
Period size: 180 Copynumber: 26.5 Consensus size: 179
20222 CTAATTCACC
* * * * *
20232 AATTAATAAG-AAAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACTAGATCAAATAGTCATGAC
1 AATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* *
20295 TATTTGAATAATTATCTATTTC-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC--AAAA-AATTATTTC-
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * * * *
20355 AGTTTATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-GTATTAATATT-AGA
129 A-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAA
* * * * * ** * *
20406 ATTTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTATTGGTCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * *** * ** * * * * * *
20471 TTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTGCTATAATTTTTTGTTTTCTCATCAAATGATTTTTTTTGT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* ** * *
20536 TCGTACAAGCTTATTTTGAATTAAATAATACAAATTTATT-ATA-TAAAGA
131 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAA-A
* * *
20585 CAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAAT-CTTATGACT
1 -AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
20649 ATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* ****
20713 ATTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCC
129 ATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAA
** * * * ** * *
20766 AATTAATAAGTAAAACTTTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAATAAGTTCAAATAGTTCTGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
20831 TTTAAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAAT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* * * *
20896 TCATATAAAGCTCATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
131 TCATA-CAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAA
* * * * * *
20948 AATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTA-CTGAACATGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * *
21012 ATCCGAACAATTATGTATTTCAAAACATTATGACATTTTGGTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* ** * *
21077 TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAAATTATTAATATTTGAAA
130 TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTAAAA
* * * *
21129 AATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * ** *
21192 ATTT-AAAAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTTTTTCTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * ** * *
21256 TTTATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAA
130 TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAA
* * * *
21308 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAGCAAGTTCAAATAGTTATAACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** *
21372 ACTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATATTTTG--TT-T--TAAAATAATTGTTTCCA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
*
21432 TTCATATAAG-TTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
130 TTCATACAAGCTT-ATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAA
* * ** * * * * *
21485 ATTTACT-AGTTGAAGATTTAAAAAACAAATTTGTTCAT-GAA-AAGTTCAAATAGTCAT-ATCC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * * *
21546 ATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTATATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCT
65 ATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* ** * **
21610 ATTCATACAA-ATTAAACAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAA
129 ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAA
* * * * * ** *
21662 AATTAATAAG----AGATTTAAAGACTAAATCTGTTTATTGAACCAA-TTGTAATAGTTATGATT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * *
21722 ATTTGAAGAATCATCTATCTT-AAATTGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT
65 ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * ** * * * * * *
21785 ATTCATGCAAACTTATTTGGAGTAAAATAGTGCTAAATTGA-TAGTATTCTAAA
129 ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-AAAA
* * * * ** *
21838 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAATTAGTTCAAATAATTAAT-AC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTT-ATGAC
* * * * *
21901 TA-TTAAACAATTATCTATTTCATATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * * *
21964 AGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATCAGACTAATTTATTAACAATTAAAA
129 A-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTAAAA
** * * * * * * *
22018 AATTAATAAACAAAAAATTTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGGCT
1 AATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * *
22083 GTTTGAATTATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTAT-T-AT-AAACAATTGTTTC-
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * * * *
22144 AGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTTATTAATATTTCAAA
129 A-TTCATACAAGCTTAT-TCAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA-TTAAAA
* * * * * * * ** * * *
22199 AATTGATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATCGAA-TGGTTCAAATAATT-TTAGCC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * * *
22262 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTC
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-
* * * * *
22327 A-TCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAAT
129 ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAA
* * * * * *
22379 AATTAATAACTAAGA-ATTTAAAAAATTAATTTGTTTA-CTAAA-ATAGTTGAAATAGTTAAGGC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * ** *
22441 TATATGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACCATTATTTC-
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* *
22505 AGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAATTAATAATAATAATATTTTATTAATATTACAAA
129 A-TTCATACAAGCTTATTC-AAAT-AA--AATAATACT-A-A-TTTATTAATATTA-AAA
* * * * * * * *
22565 AATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
*** * * * * * * * *
22625 ATGCCAACAATTAACTATTTGAAAT-AGTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAACAACTGTATT-
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTC
* * * * *
22688 TGA-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTA--ATTCTTCAAA
128 T-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAA
* * * * * *
22738 AATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAA-AAATCTATTTACTGAAA-TAGTTTAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ** * * * *
22801 ATTTGAACAATTGTAAACTT-AAATCATTAT-ACACTTTTTGTGCTATCATAAAACAATTATTTT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-C-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * * * **
22864 TGTTCATATAAGCTTATTCAGAACAAAATAATAATAA-CTAATAATATTCCAA
128 TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAA
* * * * * **
22916 AATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGTCGAA-TTGTTCAAATA-TTATAGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACT
* * * *
22978 ATATGAAACAATTATGTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTG
65 ATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTC
* * * ** *
23043 AATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTAAAA
128 TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTAAAA
* * * * *
23097 AATTAAT-AGATAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAA--TCGAATAAG-TATGA
1 AATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAAT-AGTTATGA
* * * * * *
23158 CTATTTGAACAATTATCTA-TTCTAAATCATTATGATCATCTATTTTATCATAAAATAAATGTTT
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * *
23222 TTGTTCATATAAG-TT-TGACAAAAAAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
127 CTATTCATACAAGCTTAT-TCAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATA-TTAAAA
* * * * *
23276 TATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * *
23337 TTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTAT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* * * *
23402 TCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAC
131 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAA
** * * * * * * * *
23453 AATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAATAAATGTGTTTACCAAACTAGATCAAATAATCATGATTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * *
23518 TTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATTA-CTTTT-ATTTATCATAAAAAGAATTGTTTCCA
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTCTA
* * ** **
23581 TTCATATACA-TTTATTGGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAA
130 TTCATACA-AGCTTATT-CAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTAAAA
* * * *
23634 AATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATGAC
1 AATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * * *
23697 TGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTCT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * *
23762 ATTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT--AA
129 ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAA
** ** * * *
23812 GCTTAA-AA-TAATACTA-ATTT-ATTAAT-ATTTTGATAATTAAT-AAGTAAAAGATTTTAAA-
1 AATTAATAAGTAA-A--AGATTTAAAAAATAAATTTG-T--TT-ATCAA--ACAAG--TTCAAAT
** * * * * * * ** *
23870 A-AAATAAATATGTTTACCAA--A-CAAGTTCAAAT-AGTCT-TGACGATTTGAATAATTAT-TT
55 AGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T-TATGACCTTTTG--T--TT-TGTC
* * ** * *** * ** **
23928 ATTTCAAATCACAATGACCTTTTCT-TTTGTAACAA-C-AATT-GTTTTAGTTCTTA-TAAGTTT
112 A--TAAAAT-A-ATTG----TTTCTATTCAT-ACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAA-TTT
* * *
23988 GTTTGA-ACTAAAA
167 -ATTAATATTAAAA
* * * * * * ** * * *
24001 TAA-TACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTA-AAAAAAAGAATCTATT
1 -AATTAATAA-GTA-AAAGATT-TAAAAAATAA--A-T--TTG-TTTATCAAACAAG-------T
* *
24064 TACTAATAAGTTGAAAT-AGTTATGATTAGCTGAACAATTATCTATTTCGAAAT-ATTATGACCT
49 T-CAAAT-AGTT---ATGA-CTA---TT---TGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCT
* * * * * ** *
24127 TTTGTTTCGACATAAAACAATTGGTTCTATTCGTACAAGCTTATTTTGAAT-AAATAAT-TTAAA
101 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AA
*
24190 TTTATT-ATATTCCAAA
164 TTTATTAATATT-AAAA
* * * * ** *
24206 AATTAATAAAT-AAACATTTTAAAAATAAATTTATTGT-TTGAACACGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
24269 ATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCT-ATTGTTTCT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTCT
* * * * *
24333 GTTCATAAAAGCTTAAT-AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAA
129 ATTCATACAAGCTTATTCA--AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAA
* * * *
24386 AATTGATAAGTAAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAAT-GAGCAAGTTCGAATAGTTATGA
1 AATTAATAAGT-AAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * ** * *
24450 CTATTTAAATAA-TATTTATTTCAAAT-TTTACAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * *
24512 TATTCATACAAGTTTATTTAAATGAAAATAATACT-ATTTATTAATATATTCTAAA
128 TATTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATT-A-ATATT-AAAA
* ** * * * * * *
24567 AATTAATAATTTGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAAAAGTCATGTCTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * ** * *
24631 TTTAAACTTATTATCTATTTCAAATTATTATGATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTA
66 TTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* ** * *
24696 -TCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTTATTAATATTTTAAA
130 TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA-TTAAAA
* * *
24748 AATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAAATTTGTTTA-CAAAATCAATTTCAATTAGTTATGA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * ** *
24808 CTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATAATGATC-TTCATTTTGTCATAAAACAA-TGTTT-
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * ** * * *
24870 TA-TCATACAAGCTTATTCAAAAGTAAAATATTTCTAAAGTAATAGTATTTTAAA
128 TATTCATACAAGCTTATTC-AAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAA
* * * ** ** * *
24924 AATTAATATAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACTTGTTTCAAATAGTTAAGAA
1 AATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGAC
** *
24989 TATTAAAATAATTATCTATTTCAAAT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
25015 TGTTCTAACC
Statistics
Matches: 3487, Mismatches: 839, Indels: 560
0.71 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
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174 133 0.04
175 99 0.03
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200 2 0.00
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214 14 0.00
215 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
TCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAA
Found at i:24002 original size:212 final size:212
Alignment explanation
Indices: 23604--24021 Score: 488
Period size: 212 Copynumber: 2.0 Consensus size: 212
23594 ATTGGGAATA
* *
23604 AAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
23669 TTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCT
66 TTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACAATAACCT
* * *
23734 TTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTCTATTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATACAAAT
131 TTTCTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATACAAAT
23799 TTATTAATATTAAGCTT
196 TTATTAATATTAAGCTT
* *** *
23816 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAA-AGATTTTAAAAAAATAAATA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATA
* * *
23880 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCT-TGAC-GATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAAT
63 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAAT-TATGACTG-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACAAT
* * * * * ** * *
23943 GACCTTTTCTTTTG-TA-ACAACAATTGTTT-TAGTTCTTATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAAT
126 AACCTTTTCTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAAATAAT
*
24005 ACTAATTTATTAATATT
190 ACAAATTTATTAATATT
24022 CGAAAAATTA
Statistics
Matches: 172, Mismatches: 28, Indels: 12
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
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212 86 0.50
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214 73 0.42
215 1 0.01
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Consensus pattern (212 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
TTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACAATAACCT
TTTCTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATACAAAT
TTATTAATATTAAGCTT
Found at i:24157 original size:393 final size:391
Alignment explanation
Indices: 23421--24200 Score: 932
Period size: 393 Copynumber: 2.0 Consensus size: 391
23411 CTTATTCAGA
* ** *
23421 TTAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAATAAATGT
1 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAAATAAATAT
* ** *** *
23486 GTTTACCAAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCTTTATTAC
66 GTTTACCAAACAAGATCAAATAATCATGACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATGAC
*
23551 TTTTATTTATCATAAAAAGAATTGTTTCCATTCATATACATTTATTGGGAATAAAAATAATACTA
131 TTTTATTTATCATAAAAACAATTGTTTCCATTCATATACATTTATTGGGAATAAAAATAATACTA
* * *
23616 ATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTAAACAAG
196 ATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTAAAAAAAAGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * **
23681 TTTAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTA
261 TTGAAATAATTATGACTGTCTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTCGACA
* **
23746 TAAAAGAATTTTTTCTATTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTA
326 TAAAACAATTGGTTCTATTCGTACAAGCTCATTTCAAAT-AAATAATACAAATTTATT-ATATTA
23811 AGC
389 AGC
** *
23814 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAAT
1 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AAA-ATTTTAAAAAAATAAAT
* * *
23879 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCTTGACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATG
64 ATGTTTACCAAACAAGATCAAATAATCATGACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATG
* * * * * * *
23944 ACCTTTTCTTT-T-GTAACAACAATTGTTT-TAGTTCTTATA-AGTTTGTT-TGAACT-AAAATA
129 A-CTTTTATTTATCATAAAAACAATTGTTTCCA-TTCATATACA-TTTATTGGGAA-TAAAAATA
* * *
24003 ATACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAATGAGT-AAGAGAATTAAAAAAAAGAATCTATTTAC
190 ATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAAT-AATAAAGAG-ATTAAAAAAAAGAATCTATTTAC
* * * * *
24067 T-AATAAGTTGAAATAGTTATGATTAG-CTGAACAATTATCTATTTCGAAAT-ATTATGACCTTT
253 TAAACAAGTTGAAATAATTATGACT-GTCTGAACAATTATCTATTT-GAAATCACTATAACCTTT
* ** **
24129 TGTTTCGACATAAAACAATTGGTTCTATTCGTACAAGCTTATTTTGAATAAATAATTTAAATTTA
316 TGTTTCGACATAAAACAATTGGTTCTATTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAATAATACAAATTTA
24194 TTATATT
381 TTATATT
24201 CCAAAAATTA
Statistics
Matches: 327, Mismatches: 50, Indels: 22
0.82 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
391 5 0.02
392 16 0.05
393 169 0.52
394 58 0.18
395 71 0.22
396 8 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (391 bp):
TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAAATAAATAT
GTTTACCAAACAAGATCAAATAATCATGACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATGAC
TTTTATTTATCATAAAAACAATTGTTTCCATTCATATACATTTATTGGGAATAAAAATAATACTA
ATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTAAAAAAAAGAATCTATTTACTAAACAAG
TTGAAATAATTATGACTGTCTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTCGACA
TAAAACAATTGGTTCTATTCGTACAAGCTCATTTCAAATAAATAATACAAATTTATTATATTAAG
C
Found at i:24285 original size:178 final size:180
Alignment explanation
Indices: 23815--24886 Score: 699
Period size: 178 Copynumber: 6.0 Consensus size: 180
23805 ATATTAAGCT
* *** * * * *
23815 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGAAAAACA-TTTAAAAAAATAAATT
* *** * * * **
23880 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATG
65 TATTTAATGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAA-CATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
23944 ACCTTTTCTTTTGT-A-ACAACAATTGTTT-TAGTTCTTATAAGTTTGTTT-GAA
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAA
* * * * * * *
23995 CTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAA-AGAAT
1 -TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGAAAAACATTTAAAAAAATA-AAT
* * * * * **
24059 CTATTTACT-AATAAGTTGAAATAGTTATGATTAGCTGAACAATTATCTATTTCGAAATATTATG
64 TTATTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-ATTATCTATTTC-AAATATTATG
* * * * *
24123 ACCTTTTGTTTCGACATAAAACAATTGGTTCTATTCGTACAAGCTTATTTTGAA
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA
* * * *
24177 T-AAATAAT-TTAAATTTATT-ATATTCCAAAAATTAATAA-ATAAACATTT-TAAAAATAAATT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGAAAAACATTTAAAAAAATAAATT
* *
24237 TATTGT-TTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATTATTATG
65 TATT-TAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-TTATCTATTTCAAA-TATTATG
* * * * * *
24301 ACCTTTTGTTTTGTCATAAACCTATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTAATAGGAA
127 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA
* *
24355 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAAGATTTAAAAAAATAAATT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAG-AAAAACATTTAAAAAAATAAATT
* * * * * * * * ** *
24420 TGTTTAATGAGCAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTAAATAATATTTATTTCAAATTTTACAATC
65 TATTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATTATCTATTTCAAATATTATGACC
* *
24485 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-AAA
130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA
* ****
24534 TGAAAATAATACT-ATTTATTAATATATTCTAAAAATTAATAATTTGAA-ATTT-AAAAAATAAA
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAA-A-ATTCCAAAAATTAATAAGAAAAACATTTAAAAAAATAAA
* *** * * * * * *
24596 TTTGTTTACCAAATAAGTTTAAAAAGTCATGTCTATTTAAACTTATTATCTATTTCAAATTATTA
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** * ** * * ** ***
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125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA
* * ** * *
24716 TAAAATAATAATAATTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAACTAAAAT
1 TAAAATAATACTAA-TTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGAAAAACATTTAAAAAAAT-AAAT
* * * * * * *
24776 TTGTTTACA-AAATCAATTTCAATTAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATAA
64 TTATTTA-ATGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CATTATCTATTTCAAAT-ATTA
* **
24840 TGATC-TTCATTTTGTCATAAAACAA-TGTTT-TA-TCATACAAGCTTATT
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
24887 CAAAAGTAAA
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TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGAAAAACATTTAAAAAAATAAATTT
ATTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATTATCTATTTCAAATATTATGACCT
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA
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*
24301 ACCTTTTGTTT-TG-TCATAA
1 ACCTATTGTTTCTGTTCATAA
24320 ACCTATTGTTTCTGTTCATAA
1 ACCTATTGTTTCTGTTCATAA
24341 A
1 A
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ACCTATTGTTTCTGTTCATAA
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24617 AAAAGTCATG
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24661 T
1 T
24662 GATATTTTAT
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TCTATTTCAAATTATTA
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* * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * *
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* * *
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* * *
26494 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATCATTATGA-TTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * **
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66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
* * * * *
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131 AAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
* * * **
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
26730 AAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCA
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* * * * * * * *
26795 AAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTA-CTAACAAGCT
130 AAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
* * * ** *
26845 CAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATTTTTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * *
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*
26974 AAATTAA-TAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
131 AAATTAATTA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
* * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * ** * * * *
27085 AAACAATTGTTTCTGTTCATATAA-ATTATTCAGAATAAAATAATACCGATTCATTAAGATTTTG
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
* * * *
27149 AAAATT-A--A-TAAGAG-TATTAAAAACTAAATCTGTTTACGAACT-AGTT
130 AAAATTAATTAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
* * * * * * *
27195 CAAATAGTTATGACTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
27259 GAA-AATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTCGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
27317 AAAATAAATG
Statistics
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CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
AAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
Found at i:27385 original size:149 final size:151
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27181 TTTACGAACT
** * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATATCTCAAATCATTATAACCTTT-TGTTTAG
* * * ** * * *
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130 AAATAAATGAGTTTTCCAAACC
* * *
27340 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATATCTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGT
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27462 TTAAAATTCA
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AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATATCTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGT
CAAAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAAA
AATAAATGAGTTTTCCAAACC
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27306 ATTTAATAAT
** * ** *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
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*
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130 ATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * * * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
27561 AAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTTTTTTTA-TCATACAAGGTTGTTCAAAA
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* **
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* * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
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66 --A--AATTA-TT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAG
** * * * * *
27802 CTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
120 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * ** * * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * ** * *
27929 AAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAA
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* *
27994 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
131 TAAAATAATACT-AATTTATTAA-AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
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1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * **
28110 AAATCATTATGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTT-TGAA
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * *
28174 TAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
131 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
*
28222 AAAAATAAATCTTTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * *
28286 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAA-TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAA
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
28349 ATAAAATAAT-GT--TGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTA
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
** * * * * * *
28399 AAAAATAAAT-TAGTTTA-CTAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAACTATCTATTT
1 AAAAATAAATCT-GTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
28462 CAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCAAT-ATAGAGGCTTATTCAA
65 CAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * *
28526 AATAAAACAATACTTATTTACTAATATTTCAAGAATT--T-A-TAAGAGATTTA
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * *
28576 AAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTC
1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * * *
28640 AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAGAACAATTGTTTCTGTTTATTCAAGCTTATTCAGAA
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
28705 TAAAGTAACT-TTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTA
131 TAAAATAA-TACTAATTTATTAAAATTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTA
* * * * * * *
28757 AAAAATAAATAC-ATTT-GCTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTT
1 AAAAATAAAT-CTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
28820 CAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAA
65 CAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * *
28885 AATAAAATAATACTAAGTTGTTAATATTTTAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTA
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTA
* * * * * ** *
28940 AAAAGTAAATCTGTTT-GCTAAACCATTTCCAATAGTTTTGACTATTTGATTAATTATCTATTTT
1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** ** * ** * *
29004 AAATCATTATAACTTTTTGTTTTGACATCAAACAATTGGTCCTATTCATACTATTTTATTTAGAA
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * ** * *
29069 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAA
131 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-CAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT-TA
* ** * * * ** ** *
29123 AAAAATAAATATAATT-GCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATGATTATCTATTCC
1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
29187 AAATCATTATGACCTTTT-TCTT-TCACCGCAAAATAA-TTGTTTTACTT-ATACAAGCTTATTC
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** * * * *
29248 TGATTAAAATAATGCTAATTTAATAAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * *
29304 AAAAATAAATTTATTTATCT-AATCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTG
1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** *
29368 AAATTGTTTTGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATTCAAAA
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
29433 TAAATTAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTA
131 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * *
29485 AAAAATAAATCTATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTGTCACTATTTGAACAATTGTCAATTTA
1 AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * *
29549 AAATTGTTACAACCTTTTGATTTGTCATAAAAC-ATTTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATT--
66 AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATACAAGCTT--ATTCA
* *
29611 GATTAAAATAATACTAATTTATTAA
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
29636 TGCTTACTAA
Statistics
Matches: 1703, Mismatches: 357, Indels: 158
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 12 0.01
174 9 0.01
175 19 0.01
176 115 0.07
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179 11 0.01
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AAAAATAAATCTGTTTATCTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
AAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
Found at i:28460 original size:177 final size:179
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27750 TAAAAAATAA
* * **
27760 ACCTTTTGTTCTGTCATAAAA-AATT-ATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * * * **
27823 GTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAAT-TTGTTTGCCGA
64 GT-ATCTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAA
* * * *
27886 ACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * *
27940 ACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT--AA
* * *
28004 TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCT-A
63 TGTATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-CTAA
* * * * *
28067 ACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATG
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * **
28121 ACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGTT-TGAATAAAATAATG
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATG
* *
28184 CTAATCTATTAATATTCCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTA-TCAAA
65 -T-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACT-AAA
*
28244 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* *
28297 ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATGT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGT
* * **
28361 -TGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTAAATTA
66 ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAACCA
* * * * * * * *
28424 GTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAACTATCTATTTCAAATTGTTATT
130 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * *
28474 ACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCA-AT-ATAGAGGCTTATTCAAAATAAAACAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * *
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64 --GTATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAA
* * * *
28598 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATA
127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * *
28651 ACCTTTTGTTCTATCATAGAACAATTGTTTCT-GTTTATTCAAGCTTATTCAGAATAAAGTAACT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-T
* * * * *
28715 TTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAGCTAAGAGATTTAAAAAATAAATAC-A-TTTGCTA
64 GT-ATCTATTAATATTTC-AAAAATTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTAGTTTACTA
* * * * *
28777 AACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATG
125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * *
28832 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * * * *
28897 CTAAGT-TGTTAATATTTTAGAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCT-GTTTGCTA
64 GT-A-TCTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTA
* * * ** * * *
28960 AACCATTTCCAATAGTTTTGACTATTTGATTAATTATCTATTTTAAATCATTATA
125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * ** * ** * *
29015 ACTTTTTGTTTTGACATCAAACAATTGGTCCTA-TTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * * * * * * * * * * *
29079 CTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAAATAAATATA-ATTGCTG
64 GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAG-AGATT-TAAAAAATAAATCTAGTTTACTA
* ** ** * *
29143 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATGATTATCTATTCCAAATCATTATG
125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * ** *
29198 ACCTTTT-TCTT-TCACCGCAAAATAATTGTTTTACTT-ATACAAGCTTATTCTGATTAAAATAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCA---TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * *
29260 TGCTAATTTAATAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTATC
63 TG-T-ATCTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-C
* * * * * * * *
29323 T-AATCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTTTG
123 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * *
29379 ACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-G
* * ** * * *
29444 TAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAAC
65 T-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAAC
* * * * * * * **
29508 AAGTTCAAATAGTTGTCACTATTTGAACAATTGTCAATTTAAAATTGTTACA
128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * *
29560 ACCTTTTGATTTGTCATAAAACATTTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATT--GATTAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT--ATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * *
29623 ACTAATTTATTAATGCTTACTAAAAA-T-A-AAT--TAG-TTT-----ATCGAAT-TAG-TTAAT
64 -GT-ATCTATTAAT-ATTTC-AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTAGTTTACT
* * * * *
29675 ATA--A-TT---ATAGCCATT-TGAATGA-TT-ATCTATT-T------CAAATTGTTATG
124 AAACCAGTTCAAATAG---TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * **
29719 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTATCATACAATCTTATTTGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * * * * * *
29783 TTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCAAA
64 GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAA
* * * *
29847 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATTGTTAAG
127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTATTATG
* * * * * ****
29900 AGC-TATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATCATAGAA-ATTCATT-TGGTTAAAAATAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAAT-AAAATAA
* * * * *
29961 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATGT-GTTTA-TC
63 T-GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACT-
* ** * ** ** * * * *
30024 GAGTCAATTCAAATAGTTAAAACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTA
124 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * * *
30080 ACTTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAAGAATC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATG
* * * * * *
30144 TAAATTTATTAA-CTTTCAAAGAACTAAAAAGGAA-ATGATTTGAAAAAATAAATCT-GTTTATT
65 T--ATCTATTAATATTTCAAA-AATTAATAA-TAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTACT
* * * * * * * * * * *
30206 GAACAAATTCAAATTGTGATAACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATA
124 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * *
30262 ACCGTTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA--T
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGT
* * * * * ** *
30325 AT-TAATT--TCTTACAAAAATTAATAAACAAGCG-TTT--AAAATAAAT-TTGTTTACCCAACA
66 ATCT-ATTAATATTTCAAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAACC
* * * *
30383 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATG
129 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * *
30434 ACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATGCAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAT-
* * * * * *
30498 CTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTA-TTTACTAAAT
64 GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAAC
* * * * * * * *
30559 CATTTCAAATAATTATGTCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATT
128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * * * *
30611 ACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATACATGTTTATTCAAAACAAAATAAAAG
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-AATG
* * * * *
30676 TAATTTATTAGTGTTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAA
65 T-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTA-CTAA
* * * * * *
30740 A-TAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTT-AAATTGTTATA
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTATTATG
* * *
30793 ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * ** * * *
30857 CTAATATAAAAATATTACAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTT-GTCAA
64 GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACT-AA
* * * * *
30920 ACTAGTT-AAATAGTTAAGGCTATTTGAATAATTATCTATTTC-AA--ATCAT-
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * *
30969 ---TTTTGTTTTGACATAAAACAAAAT-TTTCACTTCATACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAAT--A
* * * * *
31029 ATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCT-
62 ATGTATCTATTAATATTTCAAAAATTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-CTA
** * * **
31092 AATTAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATG
125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * **
31147 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTTTGTTCCGAATAAAATAATG
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATG
*
31211 CCAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAT---AGATTTAAAAAATAAAT-T-GTTTA-TCAAA
65 --TATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACT-AAA
** * * * *
31270 CTTGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-
127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
** * * * * ** * * *
31322 -TTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCAGATTAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * * * * *
31385 CTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAAT-T-GCTTACCAA
64 GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAA
* * * * *
31446 ACTAGATT-AAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCT-TTATG
126 ACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TATTATG
** * * * **
31500 ACCTTTT-TTTTGTTGTAAAA-AATTATTTTAGTTCACATC-AGCATATTTGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * * *
31562 CTAAGT-TATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGATATTTAAAAAATGAATAT-GTTTA-TC
64 GT-A-TCTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACT-
* * * * * * ** *
31623 AAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTGTTTGAAATTGCTATA
124 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * ** ** * *
31679 ACTTTTTCTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTGTT-ACAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAAT
** * * * * * *
31742 ACAACTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATCTAAAACATAAATTTA-TTTACTA
64 GTATC-TATTAATATTTCAA-A-AATTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTA
* ** * * * *
31804 AACAAGTTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATG
125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * *
31859 ACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTGTTCATATTTAAATAAT
1 AC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * * *
31923 ATTAATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATTG
64 -GT-ATCTATTAATATTTCAA-AAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTA
* * * * * * * *
31986 AACAAGTTCAAATGGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTA
125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * ** *
32041 ACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-G
* * ** ** * *
32106 TAAT-TCATGAATA-TTCTAAAATTAATGTGTAAGAGAACTAAAAAATTAAT-TTGTTTA-TCAA
65 T-ATCT-ATTAATATTTCAAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACT-AA
* * * **
32167 A-CATTTCCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATG
126 ACCAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
** * *
32221 ACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTAGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT-A-
** * * * * ** *
32284 ATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATA-TTTTTTGA
62 ATGTATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAA
* * * ** *
32347 ACACA-TTTAAATGGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACG
126 AC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
** * * *
32401 ACCTTTCATTTTATCAT-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * *
32464 ACTAATTTATTAA-ATTTTTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAATAATAAATCTA-TTTAC
64 -GT-ATCTATTAATA-TTTCAAAAATTAAT-AATAAGAGATTT-AAAA-AATAAATCTAGTTTAC
** * * * * * * *
32527 CGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATG
123 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * ** * *
32584 ATCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAATTTTATTTGAATGAAAAAAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAA--AATAAAATA
* * * * ** * *
32648 CT-AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAAAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTCACTG
62 ATGTATCTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTA
* * * * * * *
32710 AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCACTTGAGCTATTATCTATTTCAAA-TAGTTATG
125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATG
** * ** ** * * ** *
32765 ATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATCATTTCTA-TTTATAAAAAATTATTCATAAA-AATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAA-AATAA
* *
32828 T-AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTA-TTTA-TCAA
63 TGTATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTAGTTTACT-AA
* * * *
32886 ACCAGTTCAAATCGTTATGACTATTTCAACAATTGTCTATCTCAAATCT-TTATG
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TATTATG
* * * *
32940 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTG
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATG
* *
33003 TGA--AATTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTA-TC
65 T-ATCTATTAAT-AT-TTC-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACT-
* * * * * *
33064 GAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTG
124 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* ** * * * * *
33120 ACCTTTT-TATTTATTTGTAAAATAATT-TTTCAGTTCATATATGCTTATCCAAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * *
33183 ACTAATTTATT-ATCATGT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAA-AAAT-TTGTTTAC
64 -GT-ATCTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAAT-AATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTTAC
* * * * ** * *
33244 CAAA-CATGTTTACATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAGTGTG
123 TAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATTATTATG
* * ** * *
33301 ACCTTTTTTTTTTTATCATAAAATGATTGTTTCAGTTCATAAAAGCATT-TTCAAAATAAAATAA
1 ACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAAT-A
* * * * *
33365 CAT-TACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAAAAGTTAA-AGATTTAAGAAATAAGTCTA-TTTAT
62 -ATGTA-TCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTAC
* * * * * * * *
33426 TGAATCACTTCAAATAATTATG-GTCATTTAAATAATTATTTATTTCAAA-TAGTTATG
123 TAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATG
* * * * **
33483 AACTTTTG--TTGTCATAAAACAATTACTTTTCA--TCATATAAGCCTATTCGGAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * *
33544 ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTA-TTTATTGA
64 -GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAA
* * * *
33607 A-C----C----AGTT-T--CTATTTGAACAATTATTTATTTCAACTCATTATA
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * *
33649 ACCTTTTATTGTGTTATAAAATAATTGTTTAAGTTCATATAAGCTTATT---AATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-G
* * * * * * * * * *
33711 TAATTTAATAACATTCCAAAAATTGATAACTAAGTGATGTAAAAAATAAATCT-GTTTATTGAAG
65 T-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAAC
* * * * * * * * **
33775 TAGTTTAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTGTTTATAAAAAATTATG
128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATTATTATG
* * * * * * * *
33828 GCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATTCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-G
* * *
33893 TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAGC
65 T-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAAC
* * * * ** * * *
33957 TAATTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATA
128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * ** * * *
34007 ACCTTTTGCTCTACCATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-G
* * * ** * **
34071 TAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATTAA-AAAATTAAAAAATAAAT-TTCTTTGCCGAA
65 T-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAA
* * * * ** * *
34134 TCAATTCAAATATTTAAGA-TATAAGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATG
127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * *** *
34186 ACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATTCTAGCTTATTTGGATTAAAATAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT--A
* * *
34251 ATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGAGATTT-AAAAATAATTCTA-TTTACCT-A
62 ATGTATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-CTAA
* * **
34310 ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * * *
34364 ACCATTTGTCTTGTCATAAAACAAATGCTTTT-GTTCATATAAGTTTGTTTC-GAATAAAGTAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAAT
* * *
34427 ACTAATCTGTTAATATTTCAATAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCT-A
64 -GT-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-CTAA
* * * *
34487 ACAAGTTTAAATAGTTATG---A---G--CAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * *
34533 ACTTTTTGTTTTGAT-ATAAAATAATTGTTTCCA-TTCATACAAGCCTATTCA
1 ACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA
34584 CCAATTAATA
Statistics
Matches: 5221, Mismatches: 1054, Indels: 749
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
157 7 0.00
158 5 0.00
159 71 0.01
160 2 0.00
161 1 0.00
163 2 0.00
164 2 0.00
165 45 0.01
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167 10 0.00
168 43 0.01
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185 2 0.00
186 9 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGT
ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACTAAACCAG
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
Found at i:29040 original size:364 final size:357
Alignment explanation
Indices: 27335--29606 Score: 1877
Period size: 364 Copynumber: 6.3 Consensus size: 357
27325 TGAGTTTTCC
** * * * *
27335 AAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGT
1 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
* * * ** * * * *
27400 TTAGTCAAAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTAAT
* ** * * * * *
27464 AAAATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTT-ATCAAACAAGCTCAA
130 AATATTTTAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTGCT-AAACCAGTTCAA
* * * * * * *
27528 ATAGATATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAA
192 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AA
* * * * * * *
27593 CAATTTTTTTTA-TCATACAAGGTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAA
256 CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTT-AAAA
*
27657 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT--TTTTA-T
319 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATACATTTACT
* * * *
27693 CAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAAAAAAT
1 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC--A--AATTA-TT-----AT
* * * * * * **
27758 AAACCTTTTGTTCTGTCATAAAA-AATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
56 -GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * **
27822 AGTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAA
120 ACTAAT-TAATAATATTTTAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAA
* * * ** *
27887 CCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTT
183 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * **
27952 GTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAATGAATTTATTAAT
248 GTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCT-AATTTATTAAT
*
28017 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCT
311 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAC-ATTTA-CT
* * * * * *
28066 -AACCAATTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCTTTGGT
1 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
* * * * * ** * *
28130 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTT-TGAATAAAATAATGCTAATCTATT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TAAT
** **
28194 AATATTCCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTATCAAACCAGTTCAAAT
130 AATATTTTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCT-AAACCAGTTCAAAT
28255 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAA
194 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAA
* * * * * *
28320 TTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATGT--TGTATTAATATTTCAAAAGTT
259 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTAATTTATTAATATTT-AAAAATT
*
28382 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACT
322 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TACATTTACT
** * * * * * * * *
28418 AAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGT
1 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
* * * * *
28483 TTTCTCATAAAACAATTG-CTTT-TCAATATAGAGGCTTATTCAAAATAAAACAATACTTATTTA
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATA-A-GCTTATTCAAAATAAAATAATAC-TAATTA
* * * * * *
28546 CTAATATTTCAAGAATT--T-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAA
128 ATAATATTTTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACCAGTTCAAA
* * * *
28608 TAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAGAAC
193 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAC
* * * * * *
28673 AATTGTTTCTGTTTATTCAAGCTTATTCAGAATAAAGTAACTTTAATTTAGTAATATTCTAAAAA
257 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-TCTAATTTATTAATATT-TAAAAA
*
28738 TTAAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAATAAATACATTTGCT
320 TTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATACATTTACT
* * * * *
28776 AAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
1 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
* * **
28841 TTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTGT
66 TTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTAA
* * *
28906 TAATATTTTAGAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTGCTAAACCATTTCCA
129 TAATATTTTA-AAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACCAGTTCAA
* ** * ** * * *
28971 ATAGTTTTGACTATTTGATTAATTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGACATCAAA
192 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA
* * * ** * * *
29036 CAATTGGTCCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA
256 CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATT-TAAAA
* ** * * * * *
29101 CTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAAATAAATATAATTGCT
319 ATTAATAAGTAAG-AGATT-TAAAAAATAAATACATTTACT
* * ** ** * *
29142 GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATGATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTT-T
1 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
* * * ** * ** * *
29206 CTT-TCACCGCAAAATAATTGTTTTACTT-ATACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATGCTAATTT
66 TTTGTCA---TAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TT
* * * *
29269 AATAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCT-AATCAGTT
127 AATAATATTTT-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GCTAAACCAGTT
* * * * * * * *
29332 CAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTTTGACATTTTGTTTAGTCATA
189 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-
* * * * * *
29397 AAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTAAA
253 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATT-TA
* *
29462 AAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTACT
316 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAC-ATTTACT
* * * * * * * * ** *
29504 GAACAAGTTCAAATAGTTGTCACTATTTGAACAATTGTCAATTTAAAATTGTTACAACCTTTTGA
1 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
* ** *
29569 TTTGTCATAAAACATTTGTTTCAGTTAATACAAGCTTA
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTA
29607 GATTGATTAA
Statistics
Matches: 1544, Mismatches: 304, Indels: 128
0.78 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
351 6 0.00
352 6 0.00
353 117 0.08
354 120 0.08
355 44 0.03
356 43 0.03
357 91 0.06
358 156 0.10
359 32 0.02
360 11 0.01
361 71 0.05
362 101 0.07
363 11 0.01
364 308 0.20
365 42 0.03
366 78 0.05
367 11 0.01
368 120 0.08
369 133 0.09
370 1 0.00
371 4 0.00
372 37 0.02
373 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (357 bp):
AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGT
TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATA
ATATTTTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAG
TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATT
GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATA
AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATACATTTACT
Found at i:30480 original size:172 final size:172
Alignment explanation
Indices: 30188--30504 Score: 429
Period size: 172 Copynumber: 1.8 Consensus size: 172
30178 ATGATTTGAA
*** * * *
30188 AAAATAAATCTGTTTATTGAACAAATTCAAATTGTGATAACTATTTGAATAATTATTTATTTAAA
1 AAAATAAATCTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTGATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * *
30253 ATCATTATAACCGTTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAAT
66 ATCATTATAACCGTTTGCTTTGACATAAAACAATTGTTTGAATTCATAAAAGCTTAGT-CAAAAT
*
30317 AAAATAATATTAATTTCTTACAAAAATTAATAAACAAGCGTTT
130 AAAATAATACTAATTTCTTACAAAAATTAATAAACAAGCGTTT
* * * *
30360 AAAATAAATTTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAA
1 AAAATAAATCTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTGATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * ** *
30425 ATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATGCAAGCTTAGTTAAAATA
66 ATCATTATAACCGTTTGCTTTGACATAAAACAATTGTTTGAATTCATAAAAGCTTAGTCAAAATA
30490 AAATAATACTAATTT
131 AAATAATACTAATTT
30505 ATTAATATTT
Statistics
Matches: 123, Mismatches: 21, Indels: 2
0.84 0.14 0.01
Matches are distributed among these distances:
172 122 0.99
173 1 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (172 bp):
AAAATAAATCTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTGATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
ATCATTATAACCGTTTGCTTTGACATAAAACAATTGTTTGAATTCATAAAAGCTTAGTCAAAATA
AAATAATACTAATTTCTTACAAAAATTAATAAACAAGCGTTT
Found at i:31223 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 29687--34583 Score: 3073
Period size: 180 Copynumber: 27.5 Consensus size: 180
29677 AATTATAGCC
**
29687 ATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ** * *
29751 TATCATACAATCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTA
66 T-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
29816 AAAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * *
29868 ATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATTGTTAAGAGC-TATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * **** *
29931 GA-TCATAGAA-ATTCATT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA
64 TATTCATATAAGCTT-ATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * ** * * **
29993 GTAAGAGATTTGAAAAATAAATGTGTTTATCGAGTCAATTCAAATAGTTAAAACT
127 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
** * ** * * * * * * *
30048 ATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * *
30112 TATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAAGAAT-CTAAATTTATTAA-CTTTCAAAGAACTAAAAAG
66 T-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAG
* * * * * * * * *
30175 GAA-ATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAATTCAAATTGTGATAACT
128 TAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTATTTACT-AACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * *
30230 ATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATAACCGTTTGTTTTGACATAAAACATTTG-TTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * **
30294 GTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTT-CT--TA---CAAAAATTAATAAACA
66 -TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
30353 AGCG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTTATGACT
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * ** * **
30402 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
**
30467 TTCATGCAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-
66 TTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
30530 ---GATTTAAAAAGTGAATCTATTTACTAAATCA-TTTCAAATAATTATGTCC
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AACCAGTTT-AAATAGTTATGACT
* * ** * * * *
30579 ATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-
* * * * * * * *
30644 A-TCATACATGTTTATTCAAAACAAAATAAAAGTAATTTATTAGTGTTTCAAAAATTAATAAGTA
65 ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * **
30708 TGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATAGTTTAAATAGTTATGACT
130 AGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
30761 ATTTGAACAATTGTATACTTT-AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * *
30825 GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTACAAAAATTAATAACTA
65 ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
30890 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAG-TTAAATAGTTAAGGCT
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * ** *
30941 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAA---TCAT----TTTTGTTTTGACATAAAACAA-AATTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * *
30998 CTTCATACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATATG
66 -TTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* ** *
31061 TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAATTAGTTTAAATAATTATGACT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* *
31115 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ** * * *
31180 TTCATATAAGTTTGTTCCGAATAAAATAATGCCAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * *
31242 -AGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCAAACTTGTTCAAAAAGTTATGACT
131 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * ** * * * * ** *
31291 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT--TTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
31354 TTCATAAAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGCAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
** * * * *
31419 -A-ATTTTAAAAAATAAAT-TGCTTACCAAACTAGATTAAATAGTCATGACT
131 GAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * ** *
31468 ATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCT-TTATGACCTTTT-TTTTGTTGTAAAA-AATT-ATTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * *
31529 AGTTCACATCAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAT
65 A-TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
31593 TAAGATATTTAAAAAATGAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAATTATGACT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * * * * * ** **
31647 ATTTGAATAATTATCTGTTTGAAATTGCTATAACTTTTTCTTTTGTCACCAAATGATT-TTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
* * * *
31711 ATTCATACAAGCTTGTT-ACAAATAAAATAATAC-AACTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAG
65 ATTCATATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* * * * * * **
31772 GTAAAAGATCTAAAACATAAATTTATTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACT
127 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * * *
31827 AATTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * * *
31892 ATTCATACAAGCTTGTTCATATTTAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGT
65 ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
31956 AAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATGGTTTTGACT
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * ** * * * * **
32009 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
** * * * **
32074 TTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATA-TTCTAAAATTAATGTGTAA
66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
** * * * *
32138 GAGAACTAAAAAATTAATTTGTTTA-TCAAACA-TTTCCAAATAGTTATGACT
131 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AACCAGTTT--AAATAGTTATGACT
* * *** ** *
32189 ATCTGAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTAG-TTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTT
** * *
32253 ATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAACA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
65 ATTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** *
32316 TAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTTTTTGAACACA-TTTAAATGGTTATGACT
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAC-CAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * ** * *
32369 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACCTTTCATTTTATCAT-AAACTAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTT
* * * *
32433 ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTTTAAAAATTAATAAAT
65 ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
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* * * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* ** ** * *
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** * * * * * *
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129 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * * ** * ** ** *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ** *
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* * *
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* * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * * *
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* * * * * *
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* ** * * ** *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTT
* * * *
33150 CAGTTCATATATGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-ATCATGT-AGAAAATTAATA
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** * * * * * *
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* ** * * * **
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TTGTTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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1 -ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTT
* * ** *
33513 CA-TCATATAAGCCTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
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* * *
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* * ** * * * * * *
33617 ATTTGAACAATTATTTATTTCAACTCATTATAACCTTTTATTGTGTTATAAAATAATTG-TTTAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *** * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* *
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* * * * *
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* ** * ** * * * ** *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
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66 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTA
* * * * * * * * * * *
34104 A-AAAATTAAAAAATAAATTTCTTTGCCGAATCAATTCAAATATTTAAGA-T
130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
** * ** * *
34154 ATAAGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGTT-TTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTT
* *** * *
34218 CAATTCAT-TCTAGCTTATTTGGATTAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TA
65 --ATTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * *
34278 A-TAAGAGATTT-AAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACT
126 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * * *
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66 TTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
*
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130 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACCAGTTTAAATAGTTATGACT
* * * **
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTT
* *
34565 ATTCATACAAGCCTATTCA
65 ATTCATATAAGCTTATTCA
34584 CCAATTAATA
Statistics
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171 1 0.00
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Alignment explanation
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* * *
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** * *
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* * * * ** ** *
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* * * * *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
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* * * *
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* * * * *
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1 AAAAATAAA-TTGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * ** ** **
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* * * * * * * * * *
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** * * * ** * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* ** *
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** * * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * **
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* * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * ** * * * * **
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*
31552 TAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGATATTTA
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* * * * * * *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * ** *** * *
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* * *
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* * * * ** * * *
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1 AAAAATAAA-TTGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * ** * * * *
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64 AATTGTTAT-AC-CTTTTGTTCTATCATAAAACAA-AATTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
31914 TTAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAAATAATAAGTAAAACATTTA
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*** * * * * *
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** * * * * * ** * **
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* * * * **
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* * * * *
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*** ** * * * * **
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* * *
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* *** * * *
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* * ** * ** * *
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*
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* * * * * * *
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* * * * * ** * ** **
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* *
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* * ** * * * * * * *
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* ** * * * ** * * * ** *
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*
32818 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * ** * ** * *
33109 AAATCATTTTGACCTTTT-TATTTATTTGTAAAATAATTTTTC-AGTTCATATATGCTTATCCAA
63 AAATTGTTAT-ACCTTTTGT-TCTA-TCATAAAACAAAATTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCAA
* *
33172 AATAAAATAATACTAATTTATT-ATCATGT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTA
124 AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAAT-AA-TAG--A-TTTA
* *
33227 AAAAA-AAATTTGTTTACCAAAC-ATGTTTACATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-
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* * * *
33351 TCAAAATAAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAAAAGTTAAAGATTTA
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33408 AGAAATAAGTCTATTTATTGAA-TCACTTCAAATAATTATG-GTCATTTAAATAATTATTTATTT
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33471 CAAATAGTTATGAACTTTTG-T-TGTCATAAAACAATTACTTT-TCA-TCATATAAGCCTATTCG
62 CAAATTGTTAT-ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAA--AATTTCT-ATTCATATAAGCTTATTCA
* * *
33532 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA
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** *
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1 AAAAATAAATTGT-TTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* ** * * * * * *
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* * * * *
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125 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-A--GATTTA
*** * * * * * * *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-C
*** * * * ** * *
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*
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123 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTA
* * * * * ** *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * ** * * * *
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64 AATTGTTAT-ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAAAATTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * * *
34062 AAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATTAAAAAATTA
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* * * * * * ** *
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** * * ** * * **
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* * * *
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123 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTA
* * * * * *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
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* * * * *
34416 AATAAAGTAATACTAATCTGTTAATATTTCAATAATTAATAAGAGATTTA
124 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTA
* * * * *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * ** * * * *
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* * * *
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125 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTA
* * * **** * * * * *
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1 -AAAAATAAATTGTTTA-CCA-AACTAGTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * *
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* *
34734 ATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TT-AGAAATTTAATAATTAAGAGATTTA
125 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAA-T---AGATTTA
* ** * * * * *
34786 AAAAATGAATT-TATTGGTCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTG
1 AAAAATAAATTGT-TT-ACCAAACTAG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * ***** * * * * ***
34850 AAATTGCTATAATTTTTTGTTTTCTCATCAAATGATTTTTTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTTTG
63 AAATTGTTAT-ACCTTTTGTTCTATCAT-AAA--ACAAAATTTCTATTCATATAAGCTTATTCAA
* * *
34915 AAT-AAATAATACAAATTTATTAATA--TAAAGACAATTAATAAGTAAAACATTTA
124 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA-T---AGATTTA
* * * * * * *
34968 AAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTA
1 AAAAATAAA-TTGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
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64 AATTGTTAT-ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAA-AATTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAAT
* ** *
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* **** * * *
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACT-AGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * ** * * **
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* * *
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* ** ** *
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*** * * * * ** ***
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* * *
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124 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--AGATTTA
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* *
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* * * * * * * *
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*** ** *** * *
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* *
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* * ** * * * *
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1 AAAAATAAA-TTGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGA-CTATTTGAA-CAATTATCTATTT
* * * * * * * * ** * ** **
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1 AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTC
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* * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** *
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*** * * ** *
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* * *
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* * * * * * *
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** * * * * * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * *
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* *
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* * *** * * * * *** * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * **
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1 AAAAATAAAT-TGTTTAC-CAAACTAG-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT
** * * * * *
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62 CAAATTGTTAT-ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAA-AATTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
37250 ACAAAATAATAATAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTA
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** * * * * *
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1 AAAAATAAA-TTGTTTACCAAACTAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * *
37367 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAAT
64 AATTGTTAT-ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAAAAT
37404 GAATTTATTA
Statistics
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* * * * *
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* * * * *
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* *** * * *
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**** * * *
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* * ** * * **
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** * * ** * * * * * *
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* * * * * *
30112 TATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAAGAAT-CTAAATTTATTAA-CTTTCAAAGAACTAAAAAG
66 T-TCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAG
* * * ** * * * * *
30175 GAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAATTCAAATTGTGATAACTATTTGAATAA
127 TAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * *** ** * * * *
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191 TTATCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAA
* * * * *
30304 GCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTT-CT--TA--CAAAAATTAATAA--ACAAGCGTTT--
254 GCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAA
* ** * *
30360 AAAATAAATTTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTTATGACT
317 AAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * **
30402 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* *
30467 TTCATGCAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--
66 TTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
30530 --GATTTAAAAAGTGAATCTATTTA-CTAAATC-A-TTTCAAATAATTATGTCCATTTCAACAAT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAA-CAAGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * * *
30590 TATCTATTTTAAA-T-CATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATACA
192 TATCTATTTCAAATTGC-TTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCT-ATTCATAAA
* * * * * * * **
30652 TGTTTATTCAAAACAAAATAAAAGTAATTTATTAGTGTTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTA
253 AGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-
* * *
30717 AAAAAATAAATCTATTTACCGAAA-TAGTTTAAATAGTTATGACT
315 AAAAAATAAATTTATTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
30761 ATTTGAACAATTGTATACTTT-AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCT
1 ATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * ** * *
30825 GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTACAAAAATTAATAACTA
65 ATTCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
30890 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAG-TTAAATAGTTAAGGCTATTTGAATAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * *
30954 TCTATTTCAAA-T-C---A-TTTTTGTTTTGACATAAAACAAAAT-TTTC-ACTTCATACTAA-C
194 TCTATTTCAAATTGCTTAACTTTTTGTTTTGTCACAAAA-TAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGC
* * * *
31010 TTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATATGTAAGAGATTTAAA
256 TTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * *
31074 AAAT-AATTCTATTTACCT-AATTAGTTTAAATAATTATGACT
318 AAATAAATT-TATTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
31115 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
31180 TTCATATAAGTTTGTTCCGAATAAAATAATGCCAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--
66 TTCATACAAGCTTGTT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
** * * **
31242 -AGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCAAACTTGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAATTAT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* ** * * * * **
31305 TTATTTCAAATTG-TTATTTTTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAGCTTAT
195 CTATTTCAAATTGCTTAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAT
* * * *
31369 TCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGCAAAA-TTTTAAAAAATA
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** * *
31433 AA-TTGCTTACCAAACTAGATT-AAATAGTCATGACT
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* * ** *
31468 ATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCT-TTATGACCTTTT-TTTTGTTGTAAAA-AATTATTT-T
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
31529 AGTTCACATC-AGCATAT-TTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATA
65 A-TTCATA-CAAGC-T-TGTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
* * * * *
31591 ATTAAGATATTTAAAAAATGAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATA
125 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * *
31656 ATTATCTGTTTGAAATTGCTATAACTTTTTCTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAA
190 ATTATCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAA
* * * *
31721 GCTTGTTACAAATAAAATAATAC-AACTTATTAATATT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATCTA
254 GCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * **
31784 AAACATAAATTTATTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACT
316 AAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
31827 AATTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *
31892 ATTCATACAAGCTTGTTCATATTTAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGT
65 ATTCATACAAGCTTGTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGT
* ** * * *
31956 AAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATGGTTTTGACTATTTGAATAATT
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
32021 ATCTATTTTAAATCATTC-TAACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGC
193 ATCTATTTCAAAT--TGCTTAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGC
* * * * ** * **
32085 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTCTAAAATTAATGTGTAAGAGAACTAAAAA
256 TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * *
32150 ATTAATTTGTTTA-TCAAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACT
320 ATAAATTTATTTACT-AAACTAGTT-CAAATAGTTATGACT
* * * *** **
32189 ATCTGAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTAG-TTCT
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCT
* * * *
32253 ATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAACA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
65 ATTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * ** *
32317 AAAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTTTTGAACACA-TTTAAATGGTTATGACTATTTGAATAAT
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * ** * * *
32380 TATCTATTTCAAATCG-TTACGACCTTTCATTTTATCATAAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAG
192 TATCTATTTCAAATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAG
* * *
32444 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAA
255 CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA
* ** * * *
32509 AATAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACT
317 AA-AATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
32552 TTTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGATCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** * ** * * *
32617 TTCATACAATTTTATTTGAATGAAAAAAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAAAAGTT
66 TTCATACAAGCTTGTTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
** * * * * * * * * * *
32681 GGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCACTTGAGCT-AT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAAT
* * *** * ** *
32744 TATCTATTTCAAATAG-TTATGA-TATTTTATTTTGTTGTAAAACAATCATTTCTATTTATAAAA
192 TATCTATTTCAAATTGCTTA--ACT-TTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAA
** *
32807 AATTATTCATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAA
254 GCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * *
32867 AACA-AAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAAATCGTTATGACT
318 AA-ATAAATTTATTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
32908 ATTTCAACAATTGTCTATCTCAAATCT-TTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * * *
32971 GTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAAT-ATTGTGAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAC
65 ATTCATACAAGCTTGTTCAAA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
33034 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * ***
33098 TTATCTATTTCAAATCAT-TTTGACCTTTTTATTTAT-TTGTAAAATAATT-TTTC-AGTTCATA
191 TTATCTATTTCAAAT--TGCTT-AACTTTTTGTTT-TGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * **
33159 TATGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-ATCATGT-AGAAAATTAATAAACAAGAA-
251 AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-AT-TCA-AAAATTAATAAGTAA-AAG
* * * *
33221 ATTTTAAAAAA-AAATTTGTTTACCAAAC-ATGTTTACATAGTTATGACT
311 A-TTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * **
33269 ATTTGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAG-TGTGACCTTTTTTTTTTTATCATAAAATGATTGTT
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCA-AA-TTGTTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
33332 TC-AGTTCATAAAAGCATT-TTCAAAATAAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAA
62 TCTA-TTCATACAAGC-TTGTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * * * * * *
33394 AAGTTAAAGATTTAAGAAATAAGTCTATTTATTGAATC-ACTTCAAATAATTATG-GTCATTTAA
124 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACT-ATTTGA
* * * * * *
33457 ATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAAC-TTTTG--TTGTCATAAAACAATTACTTT-TCA-TC
187 ATAATTATCTATTTCAAATTGCT-T-AACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATT-GTTTCT-ATTC
* * * *
33517 ATATAAGCCTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-
248 ATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAG
**
33581 ATTTAAAAAATAAATTTATTTA-T----T-G---AACCAGTT-T--CT
311 ATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * *
33617 ATTTGAACAATTATTTATTTCAACTCATTATAACCTTTTATTGTGTTATAAAATAATTGTTT-AA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
33681 GTTCATATAAGCTTATT--AATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCCAAAAATTGATAACTAA
66 -TTCATACAAGCTTGTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
** * * ** ** * * *
33744 GTGATGTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAAGTAGTTTAAATAATTAAGACTATATGAATAATTAT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* **** * * * * * * * **
33809 CTGTTT-ATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATTCAAGC
195 CTATTTCA-AATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGC
* * *
33872 CTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
256 TTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * *
33937 AATAAATCTGTTTACTAAGCTAATTCAAATA--TATAACT
319 AATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ** * * * ** * *
33975 ATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGCTCTACCATAAAACAATT-TTTTTG
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
34039 TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATTA
66 TTCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTA
* * * ** * * * * ** **
34104 AAA-AATTAAAAAATAAATTTCTTTGCCGAATCAA-TTCAAATATTTAAGA-TATAAGAGCAATT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * ***
34166 ATCTATTTCAAA-T-CATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATTCT
193 ATCTATTTCAAATTGC-TTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAA--TTGTTTCTATTCATAAA
** * *
34229 AGCTTATTTGGATTAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT
253 AGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* *
34289 -AAAAAT-AATTCTATTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATGACT
315 AAAAAATAAATT-TATTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
34332 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTCTTGTCATAAAACAAATGCTTT-T
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT
* * * * * * * *
34396 GTTCATATAAGTTTGTTTCGAATAAAGTAATACTAATCTGTTAATATTTCAATAATTAATAAG--
65 ATTCATACAAGCTTG-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
34459 --AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCTAACAAGTTTAAATAGTTATG---A---G--CAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * *
34514 TTTATTTCAAATTG-TTATGACTTTTTGTTTTGAT-ATAAAATAATTGTTTCCATTCATACAAGC
194 TCTATTTCAAATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTG-TCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGC
* * * * * * * * *
34577 CTATTCACCAATTAATAAGAA-A-AAATTT-TAAAAAAT-AAATATGT--TTACTAAACTAGA-T
256 TTATTCA--AA-TAA-AATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAT-TAATAAGTAAA--AGATT
* * * * * * *
34635 CAAATAGT-CATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT
314 TAAAAAATAAAT--TTATTT-ACTAA--A-CTAGTTCAAAT-AGTTATGA-CT
* **** * * * * ***
34686 -TTTG--------TTT-TGTCAAA-AAAAATTA--TTTCAG-TTTAT-AT-AAACTTATTCAAAA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAAC-AATT--GTT
** * * * * * * * *
34735 TAAAATAATACTAAG-TTATT-AATATTAGAAAT-TTAATAA-TTA--AGAGATTTAAAAAATGA
62 TCTATTCATAC-AAGCTTGTTCAA-A-TA-AAATAATACTAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTA
* * ** *
34794 ATTTATTGGTCAAACA-AGTTT---AAATAATTATGACTATT-TC-AACAA--TT--ATCTTTTT
122 A--TA--AGT-AAA-AGA-TTTAAAAAATAAATATG--T-TTATCAAACAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * * ** **** * * * ** * *
34849 GA--AATTGCTATAATTTTTTGTTTTCTCATCAAATGA-TTTTTTTTTTGT-TC-GTACAAG---
177 GACTATTTG-AATAATTATCT-ATTTCAAATTGCTTAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGT
* * *
34906 --C---T--T---A--TT-TT-GAAT-AAATAATACAAATTTATTAATA-TAAAGACAATTAATA
240 TTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATA
* * *
34955 AGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TCAAACAAGTTCAAAT-CTTATGACT
303 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
35010 ATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTCTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * **
35075 TTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTC-CCAATTAATAAGTA
66 TTCATACAAGCTTGTTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTA
** * * ** * * *
35139 AAACTTTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAATAAGTTCAAATAGTTCTGACTATTTGAATAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* *** * * * * * *
35204 TCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAAGCT
194 TCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCT
* * * * * *
35269 CATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA
257 TA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * *
35334 TGAATTTGTTTACTGAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACT
321 TAAATTTATTTACTAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
** * *** * * * *
35372 ATCCGAACAATTATGTATTTCAAAACATTATGACATTTTGGTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * ** * *
35437 TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAAATTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTA
66 TTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
35501 AAA-ATTT-AAAAATAAATATGTTT-TCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * ** * *
35563 ATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTTTTTCTATTTATAAAAGCT
193 ATCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCT
** *
35628 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
257 TA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * *
35693 ATAAATCTATTTACTAAGCAAGTTCAAATAGTTATAACT
320 ATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *** ** * *
35732 ACTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATATTTTG--TT-T--TAAAATAATTGTTTCCA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * *
35792 TTCATATAAG-TTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTTACT-AG
66 TTCATACAAGCTT-GTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-TTAATAAG
** * * * * * * *
35854 TTGAAGATTTAAAAAACAAATTTGTTCAT-GAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTT-AAGCT
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAA--T
* * * * * *
35916 -ATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACATTATATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
189 AATTATCTATTTCAAATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATA-
* ** * **
35979 AAA-ATTAAACAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATT
251 AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * ** *
36039 TAAAGACTAAATCTGTTTATTGAACCAATTGTAATAGTTATGATT
314 TAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
36084 ATTTGAAGAATCATCTATCTT-AAATTGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT
1 ATTTGAACAATTATTTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * ** * * * * *
36147 ATTCATGCAAACTTATTTGGAGTAAAATAGTGCTAAATTGA-TAGTA-TTCTAAAAATTAATAAG
65 ATTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * ** * * * *
36210 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAATTAGTTCAAATAATTAAT-ACTA-TTAAACA
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTT-ATGACTATTTGAATA
* * * * * * * *
36272 ATTATCTATTTCATATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACA
190 ATTATCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAA
* * * * * ** *
36336 TGCTTATTCGAAATAAAATCAGACTAATTTATTAACAATTAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTT
253 AGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT
* * * * * *
36401 TAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGGCT
315 AAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * *** * *
36445 GTTTGAATTATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATTAT-AAACAATTGTTTC-A
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
36508 GTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAACT
66 -TTCATACAAGCTTGT-TCAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * * * *
36573 TAGAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCGAA-TGGTTCAAATAATT-TTAGCCATTTGAACAA
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAA
* * *
36635 TTATCTATTTCAAA-T-CATTACGAAC-TTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATA
191 TTATCTATTTCAAATTGC-TT---AACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCT-ATTCATA
* * * * * * *
36696 CAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAATAATTAATAACTAAGA-ATT
251 AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * *
36760 TAAAAAATTAATTTGTTTACTAAAATAGTTGAAATAGTTAAGGCT
314 TAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
36805 ATATGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCATTATTTC-A
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
36869 GTTCATACAAACTTATTCAAAATAAATTAATAATAATAATATTTTATTAATATTACAAAAATTAA
66 -TTCATACAAGCTTGTTC-AAAT-AA--AATAATACT-A-A-TTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * * * * ***
36934 TAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACCATGCCA
123 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * * *
36994 ACAATTAACTATTTGAAATAG-TTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAACAACTGTATT-TGA-AC
187 ATAATTATCTATTTCAAATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGT-TTCT-ATTC
** * * *
37056 ATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTAAT-CT-TTCAAAAATTAATATGTAAAAGA
248 ATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
* *
37118 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAA-TAGTTTAAATAGTTATGACT
312 TTTAAAAAATAAATTTATTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** ** * ** * * *
37165 ATTTGAACAATTGTAAACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTGCTATCATAAAACAATTATTTTT
1 ATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * * *
37229 GTTCATATAAGCTTATTCAGAACAAAATAATAATAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTA
65 ATTCATACAAGCTTGTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** * * * *
37294 AGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTTGTTCAAATA-TTAAGACTATATGAACAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
37358 TGTATTTCAAA-T-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAATGAATTTATTAATAT-TT
194 TCTATTTCAAATTGC-TTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAAT-AATTG--TTT-CT-AT-TCAT
** * * * * * * * *
37420 AAAAAATTAAT-AGATAAGAGATTTAAAAAATAATTT-TGT-TTA-CCTAACCAATCCGAATAAG
250 AAAAGCTTATTCAAATAA-A-A--T-AATACTAATTTAT-TAATATTC-AA-AAAT--TAATAAG
* ** * * * * *
37481 TATGACTATTTGAACAAT-TATCTA-TT-CTAAA-TCA-TT---AT-G--ATCATCT
305 TA-AAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * ** * * * ** * * * ** *
37527 ATTTTATC-A-TA---AAAT-AAA-TGTTTTTGTTCATATAAG-TTTGACA-AAAAAAAGTAATA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTG-TTATG-ACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
37583 CTAATTTAT-TAA--TAT-TTCAAATATTAATAAGA--GATTTA--AA-A----AATAAATCTAT
63 CT-ATTCATACAAGCT-TGTTCAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAAT-TAA
* * * * * * ** *
37635 TTA-TCAAACCAG-TTTAAATAGTTATGACTAT-TTGAGCAATTATTTA-TTTCAAATTGTTATG
123 TAAGT-AAA--AGATTTAAA-A--AATAAATATGTTTATCAA--A-CAAGTTT-AAATAGTTATG
* * * *** * * * *
37696 ACTTTTTG--T-TTTGT-TATAAAACAATTG-TT-TCTATTCATACAAGCTTAT-TCAGATTAAA
178 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATTGCTTAACT-TT--T---TG-TTTTGTC--A-CAAA
* * * * *
37754 ATAA-TG---CTAATTTAT-TAA---TATTTCAACA-ATTAATAAGTA-AAATTTTTTAA-A---
232 ATAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTA-TTCAA-ATA-AAATAA-TACTAATTTATTAATATTC
** * ** * * * * * *
37805 AATAAATGTGTTTACCAAACTAGA-TCAAATAAT-CATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAA
292 AA-AAAT-TAATAAGTAAA--AGATTTAAAAAATAAAT--TTATTT-ACTAA--A-CTAGTTCAA
** *
37868 ATCTTTATTACTTTTT
347 ATAGTTATGAC----T
* * ** * * * ** * * * ** * **
37884 ATTTTATCATAAAAGAATTGTTTC-CATTCATA-GA-CATTT-ATTGGGAATAAAATAATACTAA
1 ATTTGA--A-CAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TGT
* * * * * * * * **
37945 TT-TATT-A-ATAA------TCCAA-AAATTAATAATAA---A--GAGATTTAAAAAATGAATCT
61 TTCTATTCATACAAGCTTGTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
37995 GTTTACTAAACAAGTTTAAATAAT-TATGACTGTTTGAACAATTATCTA-TTTGAAATCGCTATA
126 G--TA--AAA-GA-TTTAAAAAATAAAT-A-TGTTT-ATCAA--A-CAAGTTT-AAATAGTTATG
* * * * * ** *
38058 ACCT-TTTG--T--TT-TGT-TAT-AAA-AG---AATTTTTTCTATTTGT-ACAAGCTCATT-TC
178 A-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTTAACTTTTTGT-TTTGTCACAAAATAATTGT-
* ** * * * * **
38109 AAATAAAATAATACAAA-TTTATTAATATTAAGCTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGA
240 --TTCTATTCATA-AAAGCTTATT--CA--AA---TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAA
* * * * *
38173 CAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCT-TG
294 AAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGT-TATG
*
38237 ACG
356 ACT
* **** * *
38240 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGT-A-ACAACAATTGTTT-TA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
38302 GTTCTTATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCGAAAAATTAATGAGT
66 -TTCATACAAGCTTG-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * ** *
38366 AAGAGAATTAAAAAAAAGAATCTATTTA-CTAAATAAGTTGAAATAGTTATGATTAGCTGAACAA
128 AAAAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * * *
38430 TTATCTATTTCGAAATAT--TATGACCTTTTGTTTCGACATAAAACAATTGGTTCTATTCGTACA
191 TTATCTATTTC-AAAT-TGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAA
** * * *
38493 AGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT-AAACATTT
253 AGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * *
38556 TAAAAATAAATTTATTGT-TTGAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACT
315 AAAAAATAAATTTATT-TACTAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
38600 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCTATTGTTTCTG
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * *
38665 TTCATAAAAGCTTAAT-AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTA
66 TTCATACAAGCTTGTTCA--AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * ** *
38729 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAAT-GAGCAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTAAATAATT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * *
38793 ATTTATTTCAAATTG-TTACAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGT
193 ATCTATTTCAAATTGCTTA-ACT-TTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGC
* * * **
38857 TTATTTGAAATGAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGAAGATTTAAAA
256 TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
38922 AATAAATTTGTTTACCAAA-TAAGTTTAAAAAGTCATGTCT
319 AATAAATTTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * ** * ** *
38962 ATTTAAATTATTATCTATTTCAAATTATTATGATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * *
39027 TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
66 TTCATACAAGCTTGTTC-AAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *
39092 ----AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAAA-ATCA-TTTCAATTAGTTATGACTATTTGAAT
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACA--AGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * *
39150 AATTATCTATCTCAAA-T-CATAA-TGATCTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
189 AATTATCTATTTCAAATTGCTTAACT--T-TTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATA
* * * ** * * * *
39212 CAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTTCTAAAGTAATAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
251 AAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * *
39277 TAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACTTGTTCAAATAGTTAAGAAT
314 TAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * ** * * * *
39322 ATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTACTTATTAAATAATTATTTC-A
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * ** *
39386 GTTCTTACATA-TTTATTTGAAATAAAATAATACTCTTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAG
66 -TTCATACA-AGCTT-GTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * *
39449 CAAGAAG-TTTAAAAAAATAAATCTGTTT-TCTGAACAAG-TTCAATAGTTATGACTATTTGAAC
127 TAA-AAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
39511 AATTATCTATTTAAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATA
189 AATTATCTATTTCAAATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATA
* ** * * ** ***
39574 AAAGCTTATCCAAAATAAAATAGCATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGTTAAGTTGGAGATT
251 AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
** * * * * *
39639 TAAAAAATAAATCAATTTATCGAATC-AGTTGAAATAATTATCGTC-
314 TAAAAAATAAATTTATTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTAT-GACT
* * * *
39684 ATCTGAATAATTATCTATTTCAAATAT-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTT
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TGTTT
*
39748 C-A-TCATACAAGCTTGTTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
63 CTATTCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** ** * * * *
39811 TAGGAGATTTAAAAAATAAATATAATTA-CTGAACCAGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAACAA
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
** *** * * * * * *
39875 TTAAATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAG
191 TTATCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAG
* * * * *
39940 CTTATTCAAAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATAAAAATTAATAACG--AGAGATTTAA
255 CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAA-GTAAAAGATTTAA
* ** * * * *
40003 AAAATAAATTTTTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGGCT
317 AAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
40045 ATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTGTTTTGTCGTAAAAGAAATGTTGT-T
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCT
* * * * * * **
40109 GTTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--
65 ATTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
40172 --AGATTTACAAAGTAAATCTGTTTA-CTAAACCAGTTCAAAGAGTTATAACAATTTGAACAATT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
40234 ATTTATTTCAAA-T-CATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGAT-ACAG
193 ATCTATTTCAAATTGC-TTA-ACT-TTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAG
* * * ** *
40296 TCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATCTA-T-ATCCT-AAAAATTAATAAATAACAA-ATTTCA
255 -CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTT-A
* * * * * * * * * * *
40357 AAAAATGAATTTGTTGAACT-GACCAATACAAACAATTATAATT
316 AAAAATAAATTTATT-TACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * ***
40400 GTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * *
40465 TTCATACATGC-TGATTTGGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
66 TTCATACAAGCTTG--TTCAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * * *
40528 AAGAGATTTAAAAACTAATTCTGTTTATTGATCAAGTTCAAATAGTTACT-ACTCTTTGAACAAT
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTA-TGACTATTTGAATAAT
* * * * *
40592 TGTC-ATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAACTT-TTTCTATTAATACAAG
192 TATCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAA-TTGTTTCTATTCATAAAAG
* * * * * * *
40655 CTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAGACAACTAATTAGTACAAGATTTAAA
255 CTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* **
40720 AAATAAATCTATTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACT
318 AAATAAATTTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * *
40761 ATTTGAACAATT-TTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * ** **
40825 TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATTATTAATAAGTAA
66 TTCATACAAGCTTGTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A
* * * * * * * * * *
40890 AAAAATTT-AAATATAAATATATTTACCGAACGAGTTCT-AATTGTCATAACTATTTGAGTAATT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTT-TAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * *
40953 ATCTATTTCAAA-T-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTATC-AGTTCATATAG
193 ATCTATTTCAAATTGC-TTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAA
* * *** * * * * * ** * * *
41015 GCTTACTGAACA-AGCTTAA-A-T-AGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTT-
254 GCTTATTCAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTA-ATAAGTAAAAGATTTA
*** ** ** * *** *
41075 -CTGAT-CTTTTATTTTGT-CA-TAAAAC-AATTGTT-T--CT
316 AAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *** * * * * *
41110 A-TTCATACAA--GTTT-CTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCTTAAAATTAAT
1 ATTTGA-ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CCT--TTTGTT--T-TGTCATAAAA-CAAT
* **** * * * ** * * * * * *
41170 AGGAAGGATATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACT-AAATAAGTTCAAATAGTTATGT-CTATTTG
58 -TG-TTTCTA-TTCATACA-AGCT-TGTTCAAATAAAATAA-TACTAAT--TTAT-TAATATTTC
* * ** * **** ** ** ** * * * ** ***
41232 AATAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACCT-TTTATTTTGTAGTAAAACAATTGCTTCTATTCA
114 AAAAATTA-ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT-TA-TCAAACAA--GTTTAAATAGT
* * * * ** * *
41296 TATAGAATTATTTAAAATAAAATAATAT-TGATTCTTTAAGATT--TTGAAAATTAATAAGAGTA
174 TAT-G-ACTATTT-GAAT--AAT--TATCT-A-T-TTCAA-ATTGCTT--AACTT--TTTG-TTT
* ** * * *** *
41358 T-T-A-AAAACTAAATTTGTTTACCAAACTAGCTCAAATAG-TTA-T-GACT-TTTTGA-AC--A
223 TGTCACAAAA-T-AA-TTGTTT-CTATTC-A--T-AAA-AGCTTATTCAAATAAAATAATACTAA
* * *** *** * ** * *
41413 GTTA-T-ATATCTCAAATAGTTATGATCTTTATTTG-TCATAAAACAAT-TGTTTCTTTTCATAT
279 TTTATTAATAT-TCAAA-AATTA--ATAAGTAAAAGAT-TTAAAA-AATAAATTTATTTAC-TA-
* ** *
41474 AAGCTTATTTGGATTAAGTTA-GTACT
336 AA-C-TAGTTCAAAT-AGTTATG-ACT
** ** ** * ** * * *
41500 AATTT-AATGA-TA-AAAAAT-AAATGTGTTTTG-CCAAACTAGTTCAAATAGT--TAAAACTAT
1 -ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGACC--TTTTGTT----TTGTCATAAAACAAT
* ** * * * *
41558 TAGAACAATTATCTATTTCAAATGGTTCTGATATTTTGTTTAGTCATAAAACAAT--TATTTTAG
58 T-G-----TT-TCTA-TTC--A---TAC--A-AGCTTGTTCA--AATAAAATAATACTAATTTA-
* ** * ** *
41621 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAA--AATAA-TACTA-ATTTATTAAAATTCAAA-AAATTAAT-
104 TT-A-A-TA---T-TTCA-AA-AATTAATAAGTAAAAGATTTA--AAAAAT-AAATATGTTTATC
* ** * * * * ** * * *
41680 AGGTAA-GAGATTTAAA-A-AAATAAATATGTTTATTGAA-TA---AGCTCAAATAGATATGACT
157 A---AACAAG-TTTAAATAGTTATGACTAT-TTGAAT-AATTATCTATTTCAAATTGCT-TAACT
* * * * ** ** ***
41738 ATTTGAATAATTT-TCTATTTAAAATCATTATGACCT-TTTGT-TTTG-TTA-T-AAA-AACAAT
215 TTTTG--T--TTTGTC-A--CAAAATAATTGT-TTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAA-AAT
** ** * * * * * *
41796 TGTTTTAGTTCATAAAAACTTGTCTAAAGTAAAATAAAACTACTTTAAAAAATTATTAAGTGAGA
271 AATACTAATTTATTAATA--T-TC-------A----AAA--A--TT-----A--A-TAAGTAAAA
* ** ** * * ** *
41861 GATTTAAAAACTAAAACTATTTTTTGAACTAGTTCAATTAGTTACAACC
310 GATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * *
41910 ATTTGAACAAATATCAATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCA-AAAAAAATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATTTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * ** * * *
41972 GA-TCATATAAGTTTATTCGGATAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAAT
65 -ATTCATACAAGCTTGTTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
42036 AATAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTGTTGAATC-AGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAAT
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * *
42099 TATCTATTTCAAGTTGTTTTAACGTTTTGTTTAGTCATAAAACT-ATTGTTTC-AGTTCATACAA
192 TATCTATTTCAAATTG-CTTAACTTTTTGTTTTGTCACAAAA-TAATTGTTTCTA-TTCATAAAA
* * *
42162 GCTTATT----TAGAATAAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-CAAAGATTTAA
254 GCTTATTCAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-A
* * * *
42222 AAAAATAAATTTGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTTATGATT
316 AAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
42265 ATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-A
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
42329 GTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTTCAAAAACTAGTAAGT
66 -TTCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
42394 AATAGATTTAAAAACTAAAT-TAGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACA
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATCAAA-CAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAATA
* * * * *
42456 A-AATC-A-TT---A--G--T-ACTTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TCA-ACATACAA
190 ATTATCTATTTCAAATTGCTTAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCT-ATTCATA-AA
* * * * **
42508 A-TTTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTAAAGAA-T--T-AGTAATTGATTTA
253 AGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * *
42568 AAAAGTAAATATGTTTACCAAACCAG-TCTAAATAATTATGACT
316 AAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTC-AAATAGTTATGACT
* * * * * * *
42611 ATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTG-CATAAAAACAATTATTTTT
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCT
* * * * * ** * *
42675 GTTCATA-AAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTA
65 ATTCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * * *
42739 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * ** * * * * ** *
42804 TCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAGACAATTGTCTC-AGCTCATCTAAGT
194 TCTATTTCAAATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGC
** * * * * *
42867 TTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAA
256 TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * ** * * *
42932 AAT-AATTCAATTTACTGAACCGGTTCAAATAATTGTAACT
319 AATAAATT-TATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * *
42972 ATTTCAATAATTACCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-T-
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
43035 TGTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATACTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-
66 T-TCATACAAGCTTG-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAG
* * * * *
43098 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTA-CAAACAA-TTTCAAATAGTTTTAACTATTTGTAATA
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTT-AAATAGTTATGACTATTTG-AATA
* * * * * * *
43161 ATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATC-AAACAATATGTTT-TATTCATAT
190 ATTATCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCA-CAAAATAAT-TGTTTCTATTCATAA
* ** * * * * ** *
43224 TATTTTATTTAGAATGAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTCAAAACTCAATAACCAAGAA-AA
252 AAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGAT
* * * * * *
43287 CTAAAAAATAAATCTT-CTTGCTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
313 TTAAAAAATAAAT-TTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** ** * * * *
43333 ATATAAATGATTATCAATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAACAAAAT-TTT-T
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCT
** * **** * ** *
43396 ATTTGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAACAATATTTCAAAAATCAATAAGTA
65 ATTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
43461 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAA--TT-CATAGGTTAAGACTATTAGAGTAAT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAA-CAAGTTTAAATA-GTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * *
43523 TATCTACTTT-AAATCGTTATAAGC-TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTTATATA
192 TATCTA-TTTCAAATTGCT-TAA-CTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAA
* * * * * * * *
43585 AGTTTTATTAAGAATAAATTAAAACTAATTTATTAAAATTTAAAAAAACTAATAAG-AAGGAGAT
253 AG-CTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CAAAAATTAATAAGTAA-AAGAT
* * * * *
43649 TTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAGGTTCAAACAGTCATTACT
313 TT-AAAAAATAAATTTATTTACTAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
43696 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTATCATAAAATAATTGTTTC-A
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
43760 GTTAATACAATCTTATACGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAG--
66 -TTCATACAAGCTTGTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * * * * *
43823 --AGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACTGAATTAA-TTAAAATAATCATGGCCATTTGAATAATT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * * * * *
43885 ATCTATTTCAAATCAT-TTTGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TTTATCAGACAAG
193 ATCTATTTCAAAT--TGCTTAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTAT-TCATAAAAG
*
43948 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAA
255 CTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * *
44009 AAATAAATGTGTTTTC-AAA-TAGTT---A-A---A--ACT
318 AAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * *
44039 ATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATT-TGACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * **
44100 ATATCATACAAGCTTATTTAGAATAAAGTCATCCTAATATATTAGCA-TTCAAAAATTTAATAAG
65 AT-TCATACAAGCTTGTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAG
* * * * * *
44164 CAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGCTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
127 TAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * **
44229 TTA-CTTATTT-AAAAT-CATTATGACCTTTTTGTTTTATCATAAAATAACTGTTTC-AGTAAAT
191 TTATC-TATTTCAAATTGC-TTA--A-CTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTA-TTCAT
** * *
44290 GCAAGCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAG---AA-AT
250 AAAAGCTTAT-TCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * *
44351 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TCAGTTAAAATAATTATGACC
313 TTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
44397 ATTTAAATAATTATCTATATCAAA-TGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-A
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
44460 GTGCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAA
66 -TTCATACAAGCTT-GTTCAAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * * **
44525 GTAAGTA-ATTTAAAAAGTGAATCTGTTTA-CAGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTTTA
126 GTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCA-AA-CAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * * *
44587 CAATTAGCTATTTCAAATAG-TTACGAATTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTCA-CCAT
188 TAATTATCTATTTCAAATTGCTTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCT-ATTCAT
* ** * **
44650 ACAAGCTTATTTGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGAT
250 AAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * *
44715 TTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAACTAGTTC------------CT
313 TTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * ** * * * *
44748 ATTTGAAAAATTACCTATTTCAAATCGTTATAATATTTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTCA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * *
44812 ATTCACACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-CA
65 ATTCATACAAGCTT-GTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** ** * * * * * * *
44876 AAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGTAGTTAAAACATTTAAGGCTATATGAACAATT
129 AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
44941 ATCTATTTCAAATTGTTTTGAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATCGTTTCAATTCATACAAGC
193 ATCTATTTCAAATTG-CTT-AACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGC
*
45005 TTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAA
256 TTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * ** ** * * * * *
45066 AGTGAATTTGCTTACCGAA-TCATTTTAAATACTTAGGACC
319 AATAAATTTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * * *
45106 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
** * * *
45171 A-TCATTTAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATGTA
65 ATTCATACAAGCTTGTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
45235 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* ** * * * * * * * *
45300 TATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTATTCACATAAGTTT
194 TCTATTTCAAATTGCT-TAACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT
* * * ** * *
45365 ATTCGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAA
258 ATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAA
* * * * * *
45430 TAAATTTGTTTGCCAAACTAGTGCAAATAGTTAAGGCT
321 TAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
45468 ATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGCCGTAGAACAAATT-TTT-T
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCT
* * * * *
45531 AGTTCTTAGTAA-CTTATTCAGAATAAAATTAA-ACAAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAA
65 A-TTCATA-CAAGCTTGTTCA-AATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
45594 GTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTGTCAAACTAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAA-AA
126 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * *
45658 TTTATTTATTTTAAATCGTTAGGACATAAAACAATATTTTTGTTCAT-TCATAAAACAAATGTTT
191 -TTATCTATTTCAAA---TT--G-C-T-TAAC----TTTTTGTT-TTGTCACAAAATAATTGTTT
* * * * * * * * *
45722 TTGTTCATATAAATTCGT-TTGAAATAAAATAAGATTAATTTATTAATATTTTGAAAAA-TAAGA
242 CTATTCATA-AAA-GCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCAAAAATTAATA
* * * * *
45785 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-CTACTAAACTAGTTCAATTAGTTATAACT
303 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
45840 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
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66 TTCATACAAGCTTGTTCA--AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * *** ** * ** * * *
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128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * ** *
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193 ATCTATTTCAAATTGC-TTA--ACTTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAG
* * * **
46096 CATATTGAAAATAACATAATTTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAA
255 CTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAA
* * * *
46160 AAGATTAATTTATTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATAACT
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* * * * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
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TTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
Found at i:34101 original size:8 final size:8
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*
34096 ATAAATTA
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34104 AAAAATTA
1 AAAAATTA
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1 AAAAAT
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AAAAATTA
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34576 CCTATTCACC
* * * * *
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* * *
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* * * * **
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* * * * * ** * *
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* * * *** * ** * * * * *
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* * ** * **** *
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* * *
34947 AATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
35011 TTTGAATAATTATTTATTTTAAATTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* **
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130 TTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
** * * * ** * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
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66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* * * *
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* * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * *
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* ** * **
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* * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * ** *
35551 ATTTAAAAAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTTTTTCTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * ** * *
35616 TTTATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCCAAA
130 TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * *
35668 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAGCAAGTTCAAATAGTTATAACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** *
35732 ACTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATATTTTG--TT-T--TAAAATAATTGTTTCCA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * *
35792 TTCATATAAG-TTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
130 TTCATACAAGCTT-ATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* ** * * * *
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1 AA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C
* * * * * * *
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64 TATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
** ** * *
35970 TATTCATACAAAATTAAACAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAA
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* * * * * ** *
36024 AATTAATAAG----AGATTTAAAGACTAAATCTGTTTATTGAACCAA-TTGTAATAGTTATGATT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * *
36084 ATTTGAAGAATCATCTATCTT-AAATTGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT
65 ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * ** * * * * * * *
36147 ATTCATGCAAACTTATTTGGAGTAAAATAGTGCTAAATTGA-TAGTATTCTAAA
129 ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTCAA
* * * * ** *
36200 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAATTAGTTCAAATAATTAAT-AC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTT-ATGAC
* * * * *
36263 TA-TTAAACAATTATCTATTTCATATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * * * * **
36326 AGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATCAGACTAATTTATTAACAATTAAAA
129 A-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
** * * * * * * *
36380 AATTAATAAACAAAAAATTTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGGCT
1 AATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * *
36445 GTTTGAATTATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATTAT-AAACAATTGTTTC-A
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * * *
36508 GTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTTATTAATA-TTTCAAA
130 -TTCATACAAGCTTAT-TCAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * * * * ** * * *
36562 AATTGATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATCGAA-TGGTTCAAATAATT-TTAGCC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * * *
36625 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTC
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* * * *
36690 A-TCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTCAATAATA-TTCCAA
129 ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * *
36741 TAATTAATAACTAAGA-ATTTAAAAAATTAATTTGTTTA-CTAAA-ATAGTTGAAATAGTTAAGG
1 -AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTTATGA
* * * ** ** *
36803 CTATATGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCATTATTTC
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * *
36868 -AGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAATTAATAATAATAATATTTTATTAATA-TTACAAA
128 TA-TTCATACAAGCTTATTC-AAAT-AA--AATAATACT-A-A-TTTATTAATATTTTC-AA
* * * * * * * *
36928 AATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACC
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*** * * * * * * * *
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65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTC
* * *
37051 TGA-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A---ATTAAT-CTTTCAAA
128 T-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * * *
37101 AATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAA-TAGTTTAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ** * * * *
37165 ATTTGAACAATTGTAAACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTGCTATCATAAAACAATTATTTTT
65 ATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * * * * * *
37229 GTTCATATAAGCTTATTCAGAACAAAATAATAATAATCTAATAATA-TTCCAAA
129 ATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * * ** *
37282 AATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACTTGTTCAAATA-TTAAGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
37346 TATGAACAATTATGTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAATGAATT-T
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTG-TTTCT
* * ** * ** **
37410 ATT-A-A-TA-TTTA-AAAAAT-TAATAGATAAGAGATTTAAAAAATAATTTT---
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1 AATTA-AT-AAGTAA--AAGATTTA-AAAAATAAATT-TGTT-TATCAAA-CAAGTTCAAATAGT
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT--TTGTTT-ATCAA--A-CAAGTTCAAATAGTTA
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117 -ATAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTATTCAA--ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
* *
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* *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
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* ** * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* *
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65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTCT
* * * * *
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* * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
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* * * * *
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* ** * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
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* ** * *
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* * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACA--AGTTCAAATAGTTATGAC
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* * ** * * *
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* * * ** ** * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
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* * * ** * ***
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130 TTCATACA-AGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * *
39439 AATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAAAAATAAATCTGTTT-TCTGAACAAGTTC-AATAGTTATGA
1 AATTAATAAGTAA-AAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
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63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * ** * *
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128 TA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
** *** *** * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAT-GAC
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64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAAT-TGTT
* *
39747 TC-A-TCATACAAGCTTGTTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAA
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** * ** * * * *
39801 AATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATAATTA-CTGAACCAGTTTAAATAGCTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * *
39865 ATTTGAACAATTAAATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATG
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * * * *
39930 TTCATACAAGCTTATTCAAAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATAAA
130 TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * *
39982 AATTAATAACG--AGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGC
1 AATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * * *
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64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT-TC
* * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
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40222 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * * * ** *
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130 TTCATACAAG-CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * * * * * *
40335 AATTAATAAATAACAA-ATTTCAAAAAATGAATTTGTTGAACTGACCAA-TACAAACAATTATAA
1 AATTAATAAGTAA-AAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA
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* * ** *
40517 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACT-AATTCTGTTTATTGATCAAGTTCAAATAGTTACT-AC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTA-TGAC
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* * * ** *
40643 TATTAATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAGAC
128 TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
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* * * *
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131 TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * * * * * * * *
40877 TATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAATATAAATATATTTACCGAACGAGTTCTAATTGTCATAACT
1 AATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * *
40941 ATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTATC-A
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* * * * * **
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130 -TTCATACAAGCTTA-T--TCAA--ATAAA-A-TAAT-ACTAATTT-ATTAA-TA--T-TTTCAA
* ** *** ** * * *
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1 A-A-TTAAT-AAGTAAAAGATT-T-AAAAAATAAATTTG-TT-TA-TCAAACAAG----TTC-AA
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53 AT--AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCAT
* * * * * **
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* *
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167 -A-T--TAAT-A--TTTTCAA
** * * ** * * * ** *
41268 TTTGTAGTAA--AACAATTGCTTCTATTCATATAGAA-TTATTTA--AAATAAAAT-AATATTGA
1 AAT-TAATAAGTAA-AA--GATT-TA-AAAAATA-AATTTGTTTATCAAACAAGTTCAA-ATAG-
* * ** ** * **
41327 TTCTTTAAGATTTTGAA-AATTA---A--T-AAGAGT-ATTAAAAACTAAATTTG-TTTACCA-A
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* * * * * ** * *
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115 A--A-AT--AATTGTT-T--C-TATTCATACAAG--CT-TAT-TCAAATA-AAATAATAC--TAA
* *
41444 TTGTCATAAAACAATTGTTTC--
164 TT-T-AT-TAA-TA-T-TTTCAA
** *** ** * * * ** *
41465 TTTTCATATAAGCTTATTTGGA-TTAAGTTAGTACTAATTTAATGATAAAAAATAAATGTGTTTT
1 AATT-A-ATAAG--TA-AAAGATTTAA-AAAATA--AATTT-GT-TTATCAAA-CAA---G--TT
* ** * ** * **
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* * *
41592 TTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
101 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAA
* ***
41656 TTTATTAAAATTCAAAA
164 TTTATTAATATTTTCAA
* * * ** * * *
41673 AATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATTGAATAAGCTCAAATAGATATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
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65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTCT
* * * * *
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41846 AATTATTAAGTGAGAGATTTAAAAACTAAAACTATTTTTTGAACTAGTTCAATTAGTTACAACCA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
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41911 TTTGAACAAATATCAATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCA-AAAAAAATTGTTTTTG
66 TTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-
* * ** * *
41973 A-TCATATAAGTTTATTCGGATAAAAAAAATACTAATTTAATAATA-TTTCAAA
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* * * * * * * *
42025 AATTAATAAATAATAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTGTTGAATC-AGTTCAAATGGTTAAGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * *
42088 ATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTAACGTTTTGTTTAGTCATAAAACT-ATTGTTTC-
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCT
* * ***
42151 AGTTCATACAAGCTTATT----TAGAATAAATACTAATTTATTAACATTCAAAA
129 A-TTCATACAAGCTTATTCAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * *
42201 AATTAATAAG-CAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTTATGATT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * *
42265 ATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-A
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * * *
42329 GTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATA-TTTCAAA
130 -TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * * * *
42383 AACTAGTAAGTAATAGATTTAAAAACTAAATTAGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTAT-AGC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-C
* *
42446 CATTTG----A--A-C-A----AAATCATTA-GTA-CTTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTT-GTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* ** * *
42497 -TCA-ACATACAAATTTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTTATTAATA-TTT--A
127 CT-ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * ** * * * * *
42548 AA-GAATTAGTAATTGATTTAAAAAGTAAATATGTTTACCAAACCAG-TCTAAATAATTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTC-AAATAGTTATGACT
* * * * * * *
42611 ATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTG-CATAAAAACAATTATTTTT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTCT
* * * * *
42675 GTTCATA-AAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAA
129 ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * ** * *
42727 AATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
42792 TATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAGACAATTGTCTC-AG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-
* * ** * *
42856 CTCAT-CTAAGTTTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATA-TTTCAA
130 TTCATAC-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * ** * ** * * *
42907 AATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCAATTTA-CTGAACCGGTTCAAATAATTGTAA
1 AA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * ** * * * *
42970 CTATTTCAATAATTACCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * * **
43034 T-TGTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATACTACTAATTTATTAATATTTAGAA
128 TAT-TCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * *
43088 AATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTA-CAAACAATTTCAAATAGTTTTAACT
1 AATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
43151 ATTTGTAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATCAAACAATATGTTT-
65 ATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTC
** ** * *
43215 TATTCATATTATTTTATTTAGAATGAAATAATACTAATTTCA-TAATA-TTTCAA
128 TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTTCAA
* ** ** * ** * *
43268 AACTCAATAACCAAGAA-AACTAAAAAATAAATCTTCTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGA
1 AA-TTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * ** * * * *
43331 CTATATAAATGATTATCAATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAACAAAAT-TTT
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTT
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43395 -TATTTGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAACAATA-TTTCAAA
127 CTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * *
43449 AATCAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAA-TTC--ATAGGTTAAGAC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATA-GTTATGAC
* ** * * * *
43511 TATTAGAGTAATTATCTACTTT-AAATCGTTATAAGCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC
64 TATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * * * * **
43575 -AGTTTATATAAGTTTTATTAAGAATAAATTAAAACTAATTTATTAAAATTTAAAAA
128 TA-TTCATACAAG-CTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TCAA
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43631 AACTAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAGGTTCAAACAGTCATTAC
1 AATTAATAAGTAA-AAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
43695 TATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT-AGTTATGACCTTTTCTTTTATCATAAAATAATTGTTTC
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * *
43759 -AGTTAATACAATCTTATACGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCTAA
128 TA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * ** * * * * *
43813 AATTAATAAG----AGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACTGAATTAA-TTAAAATAATCATGGCC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
43873 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* *
43937 TATCAGACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAA
130 T-TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* *
43990 AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCAAA-TAGTT---A-A---A--ACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
44040 TTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATT-TGACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-A
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* * * * * **
44101 TATCATACAAGCTTATTTAGAATAAAGTCATCCTAATATATTAGCA--TTCAAA
130 T-TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * *
44153 AATTTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGCTT-AAATAGTTATGA
1 AA-TTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGA
* * *
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** * *
44281 TC-AGTAAATGCAAGCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCTAA
126 TCTA-TTCATACAAGCTTAT-TCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * *
44337 AATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC-AGTTAAAATAATTATGACC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
44397 ATTTAAATAATTATCTATATCAAAT-GTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-A
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * * *
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130 -TTCATACAAGCTTA-TTCAAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * * *
44516 AATTAATAAGTAAGTA-ATTTAAAAAGTGAATCTGTTTA-CAGAATC-AGTTCAAATAATTATGG
1 AATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * ** * *
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63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * ** *
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127 CT-ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
** * *
44697 AATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C---CAA---C---TAG-T-T-CCTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * ** * * *
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* ** *
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130 TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * ** ** * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * *
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*
44994 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTCAAA
130 TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-AA
* * * * * * * * * *
45046 AATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATTTGCTTACCGAATC-ATTTTAAATACTTAGGACC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
45106 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTG
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-
** *
45171 A-TCATTTAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTCAAA
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* *
45223 AATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
45288 TTTGAACAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTAT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* * * * * * * *
45353 TCACATAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCT-GA
131 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * ** * * * *
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* * * * * *
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65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AA-ATAATTGTTTC
* * *
45530 TAGTTCTTAGTAA-CTTATTCAGAATAAAATTAA-ACAAATTTATTAATA-TTTCAA
128 TA-TTCATA-CAAGCTTATTCA-AATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * * *
45584 AATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTGTCAAACTAGTTTAAATAATTATAAC
1 AA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
45648 TATTTGAA-AATTTATTTATTTTAAATCGTTAGGACATAAAACAATATTT-TTGTTCATTCATAA
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* * * * * * * * * * *
45711 AACAAATGTTTTTGTTCATATAA-ATTCGTTTGAAATAAAATAAGATTAATTTATTAATATTTTG
116 AATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT--ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC
45775 AA
179 AA
* * * * ** * * *
45777 AAATAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ACTA-CTAAACTAGTTCAATTAGTTATAACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * *
45840 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTA
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* * * *
45905 TTCATACAATCTTATT-AGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCT-AA
130 TTCATACAAGCTTATTCA--AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * *** ** * * *
45956 AAGTTAATAAGTAACATATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAGTGCAAATAGTTATGATT
1 AA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
46021 GTTTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAATAGTTTCTA
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** * * * * ** * *
46086 TTTGTATAAGCATATTGAAAATAACATAATTTTAATTTATTAATATTCTAAA
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* * * * * *
46138 AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAGATTAATTTATTTA-CTGAATAAGTTCAAATAGTTATAAC
1 AATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
46201 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGCTATAACTTTTTTATTTTGTCATAAAA-ATTTTTTT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* *
46264 CTATTCATAAAAACTTATTTCAAATAAAATTAATA
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46299 AGTAAAATAT
Statistics
Matches: 8629, Mismatches: 2143, Indels: 1521
0.70 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
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Found at i:35616 original size:541 final size:539
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* * * *
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* *
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* * * * * ** * *
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129 AATTCATATAAAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAAT-AGT
* * * *
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* * * * * ** * * * * * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * *
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*
35093 AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCC
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** * ** *
35127 AATTAATAAGTAAAACTTTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAA-TAAGTTCAAATAGTTCTGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
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**
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* *
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* * * * * *
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* *
35451 TTTTGAATAAAATAATATAAAATTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAATAA
323 TTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAATAA
*
35516 ATATGTTT-TCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTTAAATCGTT
388 ATATGTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATCGTT
* * * * * *
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453 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAA
* *
35645 TACTAATTTATTAA-A-ATTCCAAA
517 TATTAATTTATTAATATTTTCC--A
* * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CTAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * ** *
35731 TACTTGAACAATTATTTATTCCAAATCACTATGATATTTTG--TT-T--TAAAATAATTGTTTCC
65 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCA
* *
35791 ATTCATAT-AAGTTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTACTAGT
130 ATTCATATAAAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TTAATAGT
* ** * * * * *
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193 AAG-AGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTA-TCAA-CAA
* * * *
35917 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTATATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAA
254 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ***** * *
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319 CTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTGAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAA
* * * ** * * * *
36043 GACTAAATCTGTTTAT-TGAAC-CAATTGTAATAGTTATGATTATTTGAAGAATCATCTATCTTA
383 -AATAAATATGTTTATCTGAACAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTTA
* * * * * * * *
36106 AATTGTTATAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATGCAAACTTATTTGGAGT
446 AATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAT
* * * * * * **
36170 AAAATAGTGCTAAATTGA-TAGTATTCTAAA
510 AAAATAAT-ATTAATTTATTAATATTTTCCA
* * * *
36200 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAA-TTAGTTCAAATAATTAAT-AC
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* * * * * *
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65 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCA
* * * * * * * ** **
36327 GTTCATA-CATGCTTATTCGAAATAAAATCAGACTAATTTATTAACAATTAAAAAATTAATAAAC
130 ATTCATATAAAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCTAAAATTAAT-AGT
* * * * * * ** * * * * **
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193 AAGAGA-TTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC--TATCAACAAT
* *** * * * * *
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255 TATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* ** * ** * * * * *
36519 CTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAACTTAGAGATTTAA
319 CTTATTTTGAATAAAATAATA-CAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAA-GTAAAAATTT-A
* ** * * * *
36584 AAAATAAGT-TAGTTTATC-GAA-TGGTTCAAATAATT-TTAGCCATTTGAACAATTATCTATTT
381 AAAATAAATAT-GTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAAAAATTATCTATTT
* * * * * * * *
36645 CAAATCATTACGAA-CTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCG
444 TAAATCGTTA-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCG
* * *
36708 AAATAAAATAATACTAATTCAATAATA--TTCCAA
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* * * * * * * * *
36741 TAATTAATAACTAAGA-ATTTAAAAAATTAATTTGTTTACTAAAAT-AGTTGAAATAGTTAAGGC
1 -AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * ** *
36804 TATATGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCATTATTTCA
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* * * * * *
36869 GTTCATACAAA-CTTATTCAAAATAAATTAATAATAATAATATTTTATTAATATTACAAAAATT-
130 ATTCATATAAAGCTCATTCGAAAT-AA--AATAATACT-A-A-TTTATTAATATT-CTAAAATTA
* * * * * * *
36932 A-A-TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACCATGCCA
188 ATAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT--CA
* * * * * * * * * *
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* *** * * * *
37057 TTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC----TAATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAAAGA
313 TACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAA-A
* * * * * * **
37118 TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAA-ATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAA
377 TTT-AAAAATAAATATGTTTATCTGAACA-CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCT
* * ** * * * *
37181 ACTTTAAATCATTATAACCTTTTGTGCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATT
440 ATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * *
37246 CAGAACAAAATAATAATAATCTAATAATA--TTCCAAA
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *** *** ** **
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* * ** * *** * * * *
37462 CCTAACCA-ATCCGAATAAGTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCTAAATCA-TTATGA-TC
191 -GTAA-GAGAT-TTAA-AA-AATGA--ATTTGTTTACTGAACAAGTTC-AAAT-AGTTATGACT-
* ** ** * * ** * * * ** *
37523 ATCTA-TTTTATCATAAAAT-AAAT-GTTTTTGTTCATATAAG-TTTGACA-AAAAAAAGTAATA
246 ATCAACAATTATC-T-ATTTCAAATCG-TTATG-ACAT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
37583 CTAATTTAT-TAA---TA-TTTCAA-ATATTAATA-AGAGATTTA--AA-A----AATAAATCTA
306 CT-ATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACA-A-ATTTATTAATATTTGAA-AAAT-TA
* * * ** ** * * * ** * *
37634 TTTA-TCAAACCAGTTT--AAATAGTTATGACTATTTGAGCA-ATT-ATTTA-TT-TCA-AATTG
366 ATAAGT-AAA--AATTTAAAAATAAATATGTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATT-
* ** * * * * * ** * *
37691 TTATGACTT-TTTGTTTT--GT--TATA-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC--TTA-TTCA
427 TGAAAAATTATCTATTTTAAATCGT-TATAACCTTTTGTTT-T-GTCATA-AAACAATTATTTC-
* * * * * * * * * * * * **
37747 GATTAAAATAATGCTAATT-TATTAATATTTCAACAATTAA-TAAGTAAAATTTTTTAAA
487 TATTCATACAA-GCTTATTCGAATAA-A-AT-AA-TATTAATTTA-T-TAATATTTTCCA
* ** * * * * * **
37805 AATAAATGTGTTTACCAA-A-CTAGATCAAAT-AATCATGATTATTTGAA-TAA-TT-ATTTA-T
1 AATTAATAAG--TA-AAAGATTTA-A-AAAATAAAT-ATGTTTA-CTGAACTAAGTTCAAATAGT
* * * ** * * * * * * * *
37863 T-TCA-AATCTTTATTACTT-TTTATTT--TATCATAAAAGA---ATTGTTTCCAT-TCATAGAC
59 TATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTT---TGTAATA-AA
* ** * * * * * * ** *
37919 AT--TTATTGGGAA-TAAAATAATA-CTAATT---TAT-TAATAAT-CCAA-AAATTAATA--AT
118 ATAATTGTT-TCAATTCATATAA-AGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT
* * * * * *
37972 AAAGA--GAT--T--TA-A-----AAAATGAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGAC
181 AAA-ATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * *
38025 TGTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTCT
245 --TATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
** * ** *
38090 ATTTGTACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGCTTAAAATAATACT
308 ATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T----TTGAAA-AAT--T
* * * **
38155 AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTT-TACCAAA
365 -A---A-T-A-A--GT-A-AA--AAT--TTAAAA-A---T----AAAT--ATGT-TTAT-CTGAA
* ** * * * * *** * *
38219 CAAGTTCAAATAGTCTTGACGATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTT
403 CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
38284 GT-A-ACAACAATTGTTT-TAGTTCTTATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAATACTAATTTATTAA
468 GTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAA
****
38346 TATTCGAAA
531 TATTTTCCA
* * * * * * * * *
38355 AATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAAAGAATCTATTTACT-AAATAAGTTGAAATAGTTATGAT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGAC
** * * *
38419 TAGCTGAACAATTATCTATTTCGAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTCG-ACATAAAACAATTGGTT
65 TATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTA-ATAAAATAATTGTTT
* * * * * * *
38482 CTATTCGTA-CAAGCTTATTTTG-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
128 CAATTCATATAAAGCTCA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAAATTAAT
* * * * * * * *
38544 AAATAA-ACATTTTAAAAATAAATTTATTGT-TTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
190 -AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA--TCAA
** * * *
38607 CAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCT-ATTGTTTCTGTTCATA
251 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTCTATTCATA
* * ** * * ** *
38671 AAAGCTTAATAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATT
315 CAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAA-ATT
* * * * * *
38736 TAAAAAATAAATTTGTTTA-ATGAGCAAGTTCGAATAGTTATGACTATTT-AAATAATTATTTAT
379 T-AAAAATAAATATGTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAA-AATTATCTAT
* * * * * * *
38799 TTCAAATTGTTACAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTG
442 TTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCG
* * * **
38864 AAATGAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
507 -AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCA
* ** * * * * * * *
38898 AATTAATAATTTGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAATAAGTTTAAAAAGTCATGTCT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * ** * ** * **
38962 ATTTAAATTATTATCTATTTCAAATTATTATGATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTA
66 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAA
** * * * * *
39027 TTCATGCAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATT-A-A-
131 TTCATATAAAGCTCATTCGAAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAG
* * ** * * * *
39088 TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATC-ATTTCAATTAGTTATGACTATTTGAATAA
192 TAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA--TCAACAA
* * * ** *
39152 TTATCTATCTCAAATCATAATG--ATCTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
254 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * * * * *
39215 GCTTA-TTCAAAGTAAAATATTTCTAAA-GTAATAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
318 GCTTATTTTGAA-TAAAATAATAC-AAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT
* * ** * * *
39278 AAAAAATCAATGTGTTTAT-TGAACTTGTTCAAATAGTTAAGAATA-TTAAAATAATTATCTATT
380 -AAAAATAAATATGTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAA-AATTATCTATT
* * * ** * * * * * *
39341 TCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTACTTATTAAATAATTATTTC-AGTTCTTACATA-TTTATTT
443 TTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACA-AGCTTATTC
* ** * ****
39404 GAAATAAAATAATACTCTTTTATTAACATTCAAAA
506 G-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCA
* * *
39439 AATTAATAAGCAAGAAG-TTTAAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAAC-AAGTTC-AATAGTTATGA
1 AATTAATAAGTAA-AAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
39501 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTT
64 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC
* * * * ** * * * **
39566 AGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAGCATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGTTAAG
129 AATTCATATAAAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAAT-AG
** * *** * * * *
39630 TTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-TCGAATC-AGTTGAAATAATTATCGTC-ATCTGAAT
192 TAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATC--AAC
** * * *
39692 AATTATCTATTTCAAATATTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTC-A-TCATA
252 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-TAAT-TGTTTCTATTCATA
* * * * * *
39755 CAAGCTTGTTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATT
315 CAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTA-AAAATT
** * * * **
39820 TAAAAAATAAATATAATTA-CTGAAC-CAGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTAAATAT
379 T-AAAAATAAATATGTTTATCTGAACAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTAT
* * * * *
39883 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCA
442 TTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC-
* * * * * * **
39948 AAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATAAA
506 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCA
* * * * * * *
39982 AATTAATAACG--AGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGC
1 AATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * ** * *
40044 TATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTGTTTTGTCGTAAAAGAAATGTTGT-
65 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTT-TC
** * * * * *
40108 TGTTCATAT-AAGTTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-A-A-T
129 AATTCATATAAAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAGT
* * * * * * * * * *
40169 AAGAGATTTACAAAGTAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAAGAGTTATAACAATTTGAACAATT
193 AAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC--TATCAACAATT
* * * * *
40234 ATTTATTTCAAATCATTATAATCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGT
256 ATCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG-
*** * * * * ** *
40297 CTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATCTA-T-AT-CCT-AAAAATTAATAAATAACAAATTTCAA
319 CTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT--A
* * * * * * * * * * * * * *
40358 AAAATGAATTTGTTGAACTGACCA-ATACAAACAATTATAATTGTTTGAATAATTATCTATTTCA
381 AAAATAAATATGTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTTA
* *** * * * *
40422 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTATTCATACATGCTGATTTGGAAT
446 AATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAT
*
40487 AACATAA-ATCTAATTTATTAATA--TTCCAAA
510 AAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTCC--A
* * * * * *
40517 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAATTCTGTTTATTGATC-AAGTTCAAATAGTTACT-AC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTA-TGAC
* * *** * *
40580 TCTTTGAACAATTGTC-ATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAACTT-TTTC
65 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAA-TTGTTTC
* * * * *
40643 TATT-A-ATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAAT
129 AATTCATATA-AAGCTCA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-A-AATTAA-
* * * * * *
40704 TAGTACA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
189 TAGTA-AGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA--TCAA
* * * * * * * *
40768 CAATT-TTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
251 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
** * ** **
40832 AAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTG-ATTATTAATAAGTAAAAAAAT
316 AAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTGAAAAATTAATAAGT--AAAAAT
* * * * * * * **
40896 TTAAATATAAATATATTTA-CCGAACGA-GTTCTAATTGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTAT
378 TTAAAAATAAATATGTTTATCTGAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTAT
* * * * * * * *
40959 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTATC-AGTTCATATAGGCTTACT-
442 TTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC
* * * ** *
41022 GAACAAGCTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCA
506 G---AA--TAAAATA-ATATTA--ATTT-ATTAA-TA-TT-TTCCA
** ** *** ** * * * *
41068 AATAGTTCTGATCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTCTATTCATAC-AAGTTTCTTCAA
1 AAT--TAAT-AAGTAAAAGATT-T-AAAAAATAAATATG-TT-TACTGA-ACTAAG----TTC-A
* * ** * * * * * ** *
41130 AATAAAATAAT-ACTAATTT-ATTAA-TAT-T-CTTAAAATTAATAGGA----AGGATATT-TAA
53 AAT--AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTAA
* * *
41185 -AAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATG-TCTATTTG-AATAATTATCTATTT
114 TAAAAT-AAT-TGTTT-C-----AA-TTC--ATA-TAAAGCTC-ATTCGAAATAA--A---A--T
* ** * ** * *
41247 CAATTCGTTATGACCTTTTATTTTGTAGTAAAACAATTGCTTCTATTCA-TATAGAATTATTTAA
159 -AATAC--TA--A---TTTA-TTAATATTCTAA-AA-----T-TAAT-AGTA-AG-A-GATTT--
* * * ** * * * * * *
41311 AATAAAAT-AATATTGATT-CTTTAAGATTTTGAAA-A-TTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATT
202 AA-AAAATGAAT-TTGTTTAC-TGAACAAGTTCAAATAGTT-AT--GACTATCAACAA-T-TATC
* * * * * * * * * * * * * *
41372 TGTTTACCAAACTAGCTCA-AATAGTTATGACTTTT-TGA-ACAGTTATATATCTCAAAT-AGTT
259 TATTT--CAAA-TCG-TTATGACA-TTTTG--TTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTCTATTCA--T
** * * * ***** * * *
41433 ATGATCTT-TATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAGTTAGT
314 ACAAGCTTAT-TTTG-AATAAAATAA-T-ACAAATTT-AT-TAA---TATTT-GA-AAAATTAAT
* * * * ** **
41497 -ACTAATTTAATGATAAAAAATAAATGTGTTT-TGCCAAACTA-GTTCAAATAGTTAAAACTATT
368 AAGTAA--AAAT--TTAAAAATAAATATGTTTAT-CTGAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * ** *
41559 AGAACAATTATCTATTTCAAATGGTTCTGATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTT
427 TGAAAAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TT
* * ****
41623 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAA
491 CATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCA
* * * * *
41673 AATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATTGAA-TAAGCTCAAATAGATATGAC
1 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
41737 TATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAACAATTGTTTT
65 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAAT-AAAATAATTGTTTC
* * * * * * *
41802 AGTTCATA-AAAACT--TGTCTAAAGTAAAATAAAACTACTTTA--AAAAAT-T---ATT-A-AG
129 AATTCATATAAAGCTCAT-TCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAG
* * * ** * ** * * ** * * *
41856 TGAGAGATTTAAAAACTAAAACTATTTTTTGAACTAGTTCAATTAGTTACAACCATTTGAACAAA
192 TAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C-TATCAACAAT
* * * * *
41921 TATCAATCTT-AAATTGTTATG--ATCTTTGTTTTGTCA-AAAAAAATTGTTTTTGA-TCATATA
255 TATCTAT-TTCAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * * * * * * * *
41981 AGTTTA-TTCGGATAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAATAGATTT
317 AGCTTATTTTGAAT-AAAATAATACAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT
* * * * * *
42045 AAAAATAAATGTGTTTGT-TGAATCA-GTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTT
380 AAAAATAAATATGTTTATCTGAA-CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTT
* * * * * * * *
42108 CAAGTTGTTTTAACGTTTTGTTTAGTCATAAAACTATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATT---
444 TAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGA
* * * ****
42169 -TAGAATAAATACTAATTTATTAACATTCAAAA
508 ATAAAAT-AATATTAATTTATTAATATTTTCCA
* * * * *
42201 AATTAATAAG-CAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGAT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * * *
42264 TATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCA
65 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCA
* * * * * * * * *
42329 GTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTAATATTTCAAAAACTAGTAAG
130 ATTCATATAAAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA-TTCTAAAATTAAT-AG
* * * * ** * *
42393 TAATAGATTTAAAAACTAAATTAGTTTACCAAATC-AGTTCAAATA---AT---TAT-AGCCATT
192 TAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATCAACAATT
* * * * *
42450 -T-GA--ACAAAATCATTA-GTAC-TTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TCA-ACATACA
256 ATCTATTTC-AAATCGTTATG-ACATTTT-GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACA
** ** * * * **
42507 AATTTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTT-AAAGAATTAGTAA-T--TGATTTA
317 AGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTGAAA-AATTAATAAGTAAAAATTTA
** * * *
42568 AAAAGTAAATATGTTTA-CCAAAC-CAG-TCTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATT
381 AAAA-TAAATATGTTTATCTGAACAC-GTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATT
* ** * * * *
42630 TCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTG-CATAAAAACAATTATTTTTGTTCATA-AAGTTTATTCG
443 TTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCG
* * * **
42693 AAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAA
507 -AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTCCA
* * * * * ** *
42727 AATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * *
42791 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAGACAATTGTCTCAG
66 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAA
* * * * * * * * *
42856 CTCATCT-AAGTTTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATT-TCAAAATTTTATAAGT
131 TTCATATAAAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TTAAT-AGT
** ** * * * *
42919 AAGAGATTTAAAAAAT-AATTCAATTTACTGAACCGGTTCAAATAATTGTAACTATTTCAATAAT
193 AAGAGATTTAAAAAATGAATT-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA--TCAACAAT
* * * * * * *
42983 TACCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-T-TGTCATATAAG
255 TATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATACAAG
* * *
43046 -TT-TGTTTGAAATAAAATACTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATT
319 CTTAT-TTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTGA-AAAATTAAT-AAGTAA-AAATT
* * ** * * *
43107 TAAAAAGTAAATCTGTTTA-C-AAACAATTTCAAATAGTTTTAACTATTTGTAATAATTATCTAT
379 TAAAAA-TAAATATGTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AAAAATTATCTAT
* * * ** **
43170 TTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATCAAACAA-TATGTTTTATTCATATTATTTTATTT
442 TTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTCTATTCATACAAGCTTA-TT
* * * *
43234 AGAATGAAATAATACTAATTTCA-TAATA-TTTCAA
505 CGAATAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTTTCCA
* ** ** * * *
43268 AACTCAATAACCAAGAA-AACTAAAAAATAAATCT-TCTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTATG
1 AA-TTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGT-TTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * ** * * *
43330 ACTATATAAATGATTATCAATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAACAAAATT-T
63 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAAT-AAA-ATAATTGT
* * * *** * ** * *
43394 TT--ATT--TGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAACAATATTTCAAAAATCAA
126 TTCAATTCATATA-AAGCTCATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAA
* * ** * *
43455 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAA-TTC--ATAGGTTAAGACTATTAG
189 T-AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATA-GTTATGACTATCA-
* * *
43517 AGTAATTATCTACTTT-AAATCGTTATAAGC-TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTT
250 A-CAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TT
* * * ** * * * * * *
43579 TATATAAGTTTTATTAAGAATAAATTAAAACTAATTTATTAAAATTTAAAAAAACTAATAAG-AA
311 CATACAAG-CTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-GAAAAATTAATAAGTAA
* * * ** * * * * * *
43643 GGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAATAGGTTCAAACAGTCATTACTATTTGAACAAT
374 --AAATTT--AAAAATAAATATGTTTATCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAAT
* * * * * * * * *
43707 TATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTAATACAAT
435 TATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAG
* * *
43771 CTTATACGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCTAA
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * *
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380 AAAAATAAATATGTTTATCTGAACACG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATC-TATT
* * * * * * * ** *
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* *
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* * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* ** * * * * * * *
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* * *
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506 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTC-CA
* * * * ** * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGAC
* ** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * **
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256 ATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGC
** * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * ***
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * **
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* * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* ** * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * ** *
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*** * * ** * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * * * *
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* * * *
38506 TAAAATAATTTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAACATTTTAAAAATAAATTTAT
1 TAAAATAATCT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAAGATTTAAAAAATAAATTTAT
* * *
38571 TGT-TTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
65 T-TATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * *
38635 TTTTGTTTTGTCATAAACCTATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTAATAGGAATAAAATAATACTAA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
38700 TTTATTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAATGAGCAAGT
194 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGT
* * * * ** * *
38765 TCGAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTACAATCTTTTGTTTTGTCAT
259 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* *
38830 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAA
324 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * *
38867 TGAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGAAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-ATAAAGATTTAAAAAATAAATTTA
* * * * * * * * * **
38932 TTTACCAAATAAGTTTAAAAAGTCATGTCTATTTAAATTATTATCTATTTCAAATTATTATGATA
64 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* ** * * ***
38997 TTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAA--TTATTCAAAATAAAATAATAAT
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT--AAAAGCTTATTTGGAAT--AA-AATAAT
* ** * * **
39060 AATAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAA
189 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA
* * * * * * * **
39121 TC-ATTTCAATTAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATAATGATC-TTCATTT
254 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* *
39184 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAG
318 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* ** * * * * * * *
39227 TAAAATATTTCTAAAGTAATAGTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTG
1 TAAAATA-ATCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAA-AGATTTAAAAAATAAATTTA
* ** * * ** * * *
39292 TTTATTGAACTTGTTCAAATAGTTAAGAATATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACC
64 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
** * * * * * * * * * *
39357 TTTTGTTTACTTATTAAATAATTATTTCAGTTCTTACATA-TTTATTTGAAATAAAATAATACTC
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
* * * * *
39421 TTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACA
193 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * *
39485 AGTTC-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTAT
256 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT
* * **
39549 CATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA
321 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAA
* ** * ** *
39589 TAAAATAGCAT-TACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGTTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATC
1 TAAAATA--ATCTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA-ATAAAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * *
39652 AATTTATCGAATC-AGTTGAAATAATTATCGTC-ATCTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTTA
62 TATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTA
* * * ** * *
39714 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTCATCATACAAGCTTGTTCT-GAATAAAATAA
124 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATT-TGGAATAAAATAA
* * * **
39778 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATAATTACTGA
188 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA
* * * **
39843 ACCAGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTAAATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
253 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * * * *
39908 TGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
318 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * ** * *
39951 TACAATAATACTAATCTAATAATATTATAAAAATTAATAACGAGAGATTTAAAAAATAAATTTTT
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAAGATTTAAAAAATAAATTTAT
* * * * * *
40016 TTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC
65 TTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * * * * * *
40080 TCTTGTTTTGTCGTAAAAGAAATGTTGT-TGTTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATATTA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
*** * * * *
40144 ATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTACAAAGTAAATCTGTTTACTAAACCAG
193 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG
* * * * * *
40205 TTCAAAGAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAATCATTTGTTTTGTCA
258 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA
* *
40270 TAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTCAAAA
323 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTAAAA
* * * * *
40308 TAAAGTAATGCTAA--T-CT-ATATCCTAAAAATTAATAAATAACAAATTTCAAAAAATGAATTT
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAA-AGATTT-AAAAAATAAATTT
* * * * * * * * * * * *
40369 GTTGAACTGACCAA-TACAAACAATTATAATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
63 ATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
*** * * * * *
40433 CCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTATTCATACATGCTGATTTGGAATAACATAA-ATC
127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA-C
* * * *
40497 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAATTCTGTTTATTGATCA
191 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * ***
40562 AGTTCAAATAGTTACT-ACTCTTTGAACAATTGTC-ATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTG
256 AGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG
* * * *
40625 TCATAAAATAACTT-TTTCTATTAATACAAGCTTATTTCAAT
320 TCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * * *
40666 TAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAATTAGTACAAGATTTAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAATA-AAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * *
40730 ATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TTTTTTTCAAATCATTATGAC
63 ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
* * * * ** * *
40794 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTA
128 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
*** ** * * * * * * *
40859 ATTTATTAATATTTTGATTATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAATATAAATATATTTACCGAACGA
193 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAA
* * * * ** *
40923 GTTCTAATTGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
257 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
40988 ATAAAACAATTGTATC-AGTTCATATAGGCTTACTGAACAA
322 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAA-AA
* * * * ** ** **
41028 GCTTAAATAGTTATGACT-ATTTAAACAATTATTTATT-TCAAATAGTT-CTGATCTTTTATTTT
1 ---TAAA-A-TAAT--CTAATTT-----ATTA-ATATTCT-AAA-AATTAAT-A-AATAAAGATT
* * * *
41090 GTCATAAAA-CAATTGT-TTCTATTC-ATACAAGTTTCTTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTT-A
49 -T-AAAAAATAAATT-TATT-TA-TCGA-ACAAG----TTC-AAAT--AGTTATGACT-ATTTGA
* * * * * ** * * *
41150 TTAA-TAT-T-CTTAAAATTAATAGGA----AGGATATT-T-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
100 ATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTT-C----
*
41206 TAAGTTCA-AATAGTTATG-TCTATTT-GAATAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACCTTTTAT
157 T--GTTCATAA-A---A-GCT-TATTTGGAATAA--A---A--T-AATAC--TA--A---TTTA-
** * * * * * *
41268 TTTGTAGT-AAAACAATTGCTTCTATTCA-TATAGAATTATTTAAAATAAAATAATAT-TGATT-
198 TTAATATTCCAAA-AA-----T-TAATAAGTA-AG-A-GATTT--AA-AAAATAA-ATCTGTTTA
* * ** * * ** * **
41329 CTTTAAGATTTTGAAA-A-TTAATAAGAGTATTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAACTAGCTCAA
249 C-TGAACAAGTTCAAATAGTT-AT--GACTATT-TGAAC--AA-----TT----ATCTATTTCAA
* * * * * *
41392 AT-AGTTATGACTTTTTGAACAGTTATATATC-TCAAATAGTTATGATCTT-TATTTGTCATA-A
298 ATCA-TTATAACCTTTT-----GTT-T-TGTCATAAAACA-AT-TG-T-TTCTA--T-TCATACA
* * ****
41453 AACAATTGTTTCTTT
348 AGC--TTATTTAAAA
* * * * ** **
41468 TCATATAAGCTTATTTGGATTAAGT-TAGTACTAATT--T-AAT---GA--TAAAAAATAAATGT
1 TAAAATAATCTAATTT--ATTAA-TATTCTAAAAATTAATAAATAAAGATTTAAAAAATAAAT-T
** * * ** * * ** *
41524 GT-TTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATGGTTCTG
62 -TATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATG
** * * * **
41588 ATATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
126 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
* * * * *
41652 CTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATTGAA
190 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAA
* * * * * * *
41717 TAAGCTCAAATAGATATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
254 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT
* * * * * *
41782 GTTATAAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTGTCTAAAG
319 GTCAT-AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * * **
41825 TAAAATAA---AA-CTACTT--TA----AAAAATTATTAAGTGAGAGATTTAAAAACTAAAACTA
1 TAAAATAATCTAATTTA-TTAATATTCTAAAAATTAATAAAT-AAAGATTTAAAAAATAAATTTA
* * * * ** * * * * * *
41880 TTTTTTGAACTAGTTCAATTAGTTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTT-AAATTGTTATGAT
64 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATTATTATGAC
* * * * * * *
41944 C-TTTGTTTTGTCA-AAAAAAATTGTTTTTGATCATATAAGTTTATTCGG-ATAAAAAAAATACT
128 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAATACT
* * * * * **
42006 AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAATAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTGTTGAATC-
192 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CA
* * * * * ** * * *
42069 AGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTTTTAACGTTTTGTTTAGT
256 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT
* *
42134 CATAAAACTATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
321 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * ** *
42174 T-AAAT-A-CTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGT
1 TAAAATAATCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAAGATTT-AAAAAATAAATTTAT
** * * * * *
42236 TTATTAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTATGAACT
65 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCT
* * **** *
42301 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACT
130 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA-A
* * * * * * **
42366 TTTTTTAATATTTCAAAAACTAGTAAGTAATAGATTTAAAAACTAAAT-TAGTTTACCAAATC-A
194 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAA-CAA
* *
42429 GTTCAAATAATTAT-AGCCATTTG----A--A-C-A----AAATCATTAGT-A-CTTTTCGTTTT
257 GTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTTT-GTTTT
* **
42479 GTCATAAAACAATTGTTT-TCA-ACATACAAATTTATTTAAAA
319 GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * * *
42520 TAAAATAGTACTAATTTATTAATATT-TAAAGAATTAGT-AAT--TGATTTAAAAAGTAAATATG
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAATAAAGATTTAAAAAATAAATTTA
* * * * * * * *
42581 TTTACCAAACCAG-TCTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAAT
64 TTTATCGAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
* * * * *
42645 CTTTTGTTTTG-CATAAAAACAATTATTTTTGTTCAT-AAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACT
128 CTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * *** * * * ** *
42708 AATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTA
192 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAA
* * * *
42773 GTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
257 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * **
42838 TTAAGACAATTGTCTC-AGCTCAT-CTAAGTTTATTTGGAA
322 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTTAAAA
* * * * *
42877 TAAAATAAAACTAATTTGTTAATATT-TCAAAATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTC
1 TAAAAT-AATCTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAA-AGATTTAAAAAATAAATT-
* ** * * * * * * *
42940 AATTTA-CTGAACCGGTTCAAATAATTGTAACTATTTCAATAATTACCTATTTCAAATTGTTATT
62 TATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * * *
43004 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTG-TCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATACTAC
126 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* * *
43068 TAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAC-AAA
191 TAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA
* * * * * *
43130 CAATTTCAAATAGTTTTAACTATTTGTAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTT
254 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * ** ** *
43195 TATCATCAAACAATATGTTT-TATTCATATTATTTTATTTAGAA
318 TGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * ** * **
43238 TGAAATAATACTAATTTCA-TAATATT-TCAAAACTCAATAACCAAGAAAACTAAAAAATAAATC
1 TAAAATAAT-CTAATTT-ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAA-AGATTTAAAAAATAAAT-
* ** * * * * *
43301 TTCTTGCT-GAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATATAAATGATTATCAATTTCAAATTTTTAT
61 TTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * * * **
43364 GACCTTTTGTTTTATTATAAAACAAAATT-TTTAT-TT-GTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAA
125 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC--AATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* ** * * * * **
43426 TACAAATTTAACAATATTTCAAAAATCAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAA
188 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA
* * ** * *
43491 ACCAA-TTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAGTAATTATCTACTTT-AAATCGTTATAAGCTTTTG
253 A-CAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * * *
43552 TTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTTATATAAG-TTTTATTAAGAA
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TTAA-AA
* * * * *
43599 TAAATTAAAACTAATTTATTAAAATT-TAAAAAAACTAATAAGA-AGGAGATTTAAAAAAATAAA
1 TAAAAT-AATCTAATTTATTAATATTCT--AAAAATTAATAA-ATA-AAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
43662 TCTATTTACCAAATAGGTTCAAACAGTCATTACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATAGTTA
60 TTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTA
* * * * * * * ** *
43726 TGACCTTTTCTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATACAATCTTATACGAAATAAAATAAT
124 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
* * * *
43791 ACTAATTTATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACTGAA
189 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA
* * * * * * * * * *
43852 TTAA-TTAAAATAATCATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTT
254 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * * *
43916 TGTTATAAAACAATTGTTT-TTTATCAGACAAGCTTATTTGAAA
318 TGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAAAA
* * *
43959 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT--A-AGAGATTTAAAAAATAAATGTG
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAAGATTTAAAAAATAAATTTA
* * *
44020 TTT-TC-AA-ATAGTT---A-A---A--ACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATT-TGAC
64 TTTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
* * * * * * * *
44072 C--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTTAGAATAAAGTCATCC
128 CTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
* ** * * *
44134 TAATATATTAGCATT-CAAAAATTTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGA
191 TAATTTATTAATATTCCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-GA
* * *
44197 ATAAGCTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTG
253 ACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATAACC-TTTTG
* * * ** * * *
44260 TTTTATCATAAAATAACTGTTTC-AGTAAATGCAAGCTTATATGAAA
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAA
* *
44306 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-AAAATTAAT-AA-GAA-ATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAATAAAGATTTAAAAAATAAATTTA
* * * * * *
44367 TTTA-CTGAATC-AGTTAAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCTATATCAAA-TGTTATGA
64 TTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * *
44429 CCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTGCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAAT
127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAAT--AA-AATAAT
* * * * *
44494 AATAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTA-ATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACAGA
189 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA
* * * ** * * *
44558 ATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTTTACAATTAGCTATTTCAAAT-AGTTACGAA-TTTTTG
253 A-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA-TAACCTTTTG
* * * **
44620 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTCA-CCATACAAGCTTATTTGGAA
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * *
44666 TAAAGTAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATA-AAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * ** * *
44730 GTTTA-C---CAA---C---TAG-T-T-CCTATTTGAAAAATTACCTATTTCAAATCGTTATAAT
63 ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
* * * * ** * *
44782 ATTTTGTTCT-ACTATAAAATAATTGTTTCAATTCACACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
128 CTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT
* * ** * * ** **
44846 AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGTA
192 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAA
* * * * * * ** * *
44911 GTTAAAACATTTAAGGCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGAA-CTTTTGTTTTAT
257 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGT
* * *
44975 CATAAAACAATCGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAA
321 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * ** **
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * ***
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* * * *
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* ** * * * * * * * * *
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* * * * * **
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128 CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCT-GTTCATA-AAAGCTTATTTGGAATAAAA-TAAT
* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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1 TAAAATAA-TCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAA-AGATTTAAAAAATAAATTTA
* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * ** * ** ** ** ** *
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* * * * * * * * *** * * **
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* * * ** *
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* * * *** * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * *
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* * **
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * ** * ** * * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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1 T
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* *
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** * * * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * ** *
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* *
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* *
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*
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* *
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65 CATAAAACAATTGTTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * *
41665 ATTCAAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATTGAATAAGCTCAAATAG
129 TTTC-AAAAATTAATA-GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CAAATCAGTTCAAATA-
* * * * * *
41730 A-TATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAC
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*** * * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * *
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367 TTGAAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTACT-ATAAAAATAATTGTTTC
* * * * *
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430 AT--TCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA
* * *** * *
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492 CA-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATT-GAACA
* * * *
42097 ATTATCTATTTCAAGTTGTT-TTAACGTTTTG-TTTAGTCATAAAACTATTGTTTCAGTTCATAC
554 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAC
* *
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617 AAGCTTATTAAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG---AGATTT
* *
42220 AAAAAAATAAATTTGTTTA-TTAAAC
677 -AAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC
* * * * * * *
42245 AAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTA
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
42310 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCA-AAATAAAATAATACTACTTTTTTTAA
64 TCATAAAACAATTGTTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA
* * * * *
42374 TATTTCAAAAACTAGTAAGTAATAGATTTAAAAACTAAATTAGTTTACCAAATCAGTTCAAATAA
127 TATTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CAAATCAGTTCAAATAA
*
42439 TTAT-AGCCATTTGAACAA--A---A--TC----A-TTAGTACTTTTCGTTTTGTCATAAAACAA
190 TTATGA-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAGAACTTTT-GTTTTGTCATAAAACAA
* * ** *
42491 TTG-TTTTCAACATACAAATTTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTT-AAAGAAT
253 TTGTTTTTCATCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AAT
* * * * * * *
42554 TAGTAAT--TGATTTAAAAAGTAAATATGTTTACCAAACCAGTCTAAATAATTATGACTATTTTA
317 TAATAATAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AACTAGTATAACT-ATT-TG---A----A
* * * * * **
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372 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTACTATAAAAATAATT-GTTTCATTCAT
* * * * ** * *
42681 A-AAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGAT
436 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAAGAGAT
42745 TTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATT
501 TTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAA-TAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
42810 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAGACAATTGTCTCAGCTCAT-CTAAGTTTATTTG
564 TCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAC-AAGCTTA-TTA
* * * *
42874 GAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
627 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA--AT-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** *
42938 TCAATTTACTGAACC
688 T-TGTTTACTGAATC
* * * * * *
42953 GGTTCAAATAATTGTAACTATTTCAATAATTACCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * *
43018 CATAAAACAATTATTTTTGTCATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATACTACTAATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCAGTCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
43082 TT-AGAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACAAA-CAATTTCAAATAGTT
130 TTCA-AAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACAAATC-AGTTCAAATAATT
* * * * * * * * *
43145 TTAACTATTTGTAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATCAAACAATA
192 ATGACCATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATAGTTAGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-
** * * * *
43210 TG-TTTT-ATTCATATTATTTTATTTAGAATGAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTCAAAACT
254 TGTTTTTCA-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * *
43272 CAATAACCAAGAAAACTAAAAAATAAATCTTCTTGCTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATAT
317 TAATAA--TAGAGATTTAAAAAATAAATC-TGTT--T--ACCAA--C---TAG-TATAACTATTT
** * ** * ** * *
43337 -AAATGATTATCAATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAACAAAATT-TTT-ATT
369 GAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTACTATAAAA-ATAATTGTTTCATT
** ** * * * **
43399 TGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATACAAATTTAACAATATTTCAAAAATCAATAAGTAAGA
433 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAAGA
* * * * * **
43464 GATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAATTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAGTAATTATC
498 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAA-TAGTTCAAATA-GTTAAGACTATT-GAACAATTATC
* * * *
43527 TACTTT-AAATCGTTAT-AAGCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTTATATAAGTT
560 TA-TTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG-C
* * * * *
43589 TTATTAAGAATAAATTAAAACTAATTTATTAAAATTTAAAAAAACTAATAAGAAGGAGATTTAAA
621 TTATTAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAAA-T--TAATAA-GAGATTT-AA
* * **
43654 AAAATAAATCTATTTACCAAAT-
679 AAAATAAATTTGTTTACTGAATC
* * * * * * * * *
43676 AGGTTCAAACAGTCATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTA
1 A-GTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
43741 TCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATACAATCTTATAC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
43805 ATTTCTAAAATT-A-A-TAAGAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACTGAATTAATTAAAATAATC
128 ATTTCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-AAATCAGTTCAAATAATT
* * * * * * *
43867 ATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTG
192 ATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
43932 TTTTTTATCAGACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
256 TTTTTCATCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * *
43997 -A-AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCAAATAGTTAAAACTATTAG-AATAATTATTTATT
321 AATAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAACTAG-TATAACTATTTGAAACAATTATCTATT
* ** * *
44058 TCAAATCATT-T--GACCTTGTTTTAGTCAT-AAAATATTTGTTTCATATCATACAAGCTTATTT
385 TCAAATCATTATAATATTTTGTTTTACT-ATAAAAATAATTGTTTCAT-TCATACAAGCTTATTT
* * * * * * **
44119 AGAATAAAGTCATCCTAATATATTAGCA-TTCAAAAATTTAATAAGCAAA-AGATTTGAAAAAAT
448 GGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-TTAATAA-CAAAGAGATTT-AAAAAAT
* ** * * *
44182 AAATTTGTTTATCGAATAAGCTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATC
510 AAATCTGTTTGCCAAAT-AG-TTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATC-TATTTCAAATC
* * * * ** * *
44245 ATTATGACCTTTTTGTTTTATCATAAAATAACTGTTTCAGTAAATGCAAGCTTATATGAAATAAA
571 GTTATGAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAA
* *
44310 ATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA
634 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA
44375 ATC
699 ATC
* * * * *
44378 AGTTAAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCTATATCAAATGTTATGACCTTTTCTTTTGTC
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
44443 ATAAAATAATTGTTTCAGTGCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAA
66 ATAAAACAATTGTTTCAGT-CATACAAGCTTATTCAGAAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
44507 TATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTA-ATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACAGAATCAGTTCAAATA
127 TATTTCAAAAATTAAT-AGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACA-AATCAGTTCAAATA
* ** * * *
44571 ATTATGGCCATTTTTACAATTAGCTATTTCAAATAGTTACGAATTTTTGTTTTGTTATAAAACAA
189 ATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTA-GAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *
44636 TTGTTTTTCACCATACAAGCTTATTTGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
253 TTGTTTTTCATCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* *
44701 AATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAACTAGT-T-CCTATTTGAAA-AATTACC
318 AATAA-TA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAACTAGTATAACTATTTGAAACAATTATC
* * *
44763 TATTTCAAATCGTTATAATATTTTGTTCTACTAT-AAAATAATTGTTTCAATTCACACAAGCTTA
381 TATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTACTATAAAAATAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTA
*
44827 TTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAAGATATTTAAAAAAT
445 TTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
44892 AAATCTGTTTGCCAAAGTAGTTAAAACATTTAAGGCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
510 AAATCTGTTTGCCAAA-TAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * *
44957 TTTGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATCGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
573 TATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATA
* * * * * *
45022 ATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGCTTACCGAATC
637 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC
* * * * * * * * *
45087 ATTTTAAATACTTAGGACCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** ** *
45152 CATATAACAAATGTTTTTGATCATTTAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
45216 TTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTT
129 TTTCAAAAATTAATA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CAAATCAGTTCAAATAATT
* * * *
45281 ATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTA-TTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATT
192 ATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTAGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * **
45345 ATTTCT-ATTCACATAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTGAAATTA
255 GTTTTTCA-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *
45408 ATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTGCAAATAGTTAAGGCTATATG
319 ATAA-T-AGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACC-AACTA--G----TA--TAA--CTATTTG
* * * * ** * ** * *
45473 -AACAATTCTTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGCCGTAGAACA-AATT-TTTTAGTT
370 AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTACTATA-AAAATAATTGTTTCA-TT
* * ** * * * **
45535 CTTAGTAA-CTTATTCAGAATAAAATTAA-ACAAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAA
433 CATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAA-TAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAA
* * * * *
45598 GAGATTTAAAAAATAATTCTATTTGTCAAACTAGTTTAAATAATTATA-ACTATTTGAA-AATTT
496 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAA-TAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTGAACAA-TT
* * * * **
45661 ATTTATTTTAAATCGTTAGGACATAAAACAATATTT-TTGTTCATTCATAAAACAAATGTTTTTG
557 ATCTATTTCAAATCGTT-----AT-GAAC--T-TTTGTT-TT-A-TCATAAAACAATTGTTTCAG
* * * * * * * *
45725 TTCATATAA-ATTCGTTTGAAATAAAATAAGATTAATTTATTAATATTTTGAAAAATAAGAAGTA
610 TTCATACAAGCTT--ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAAT--TAA-TA
* ** *
45789 AGAGATTTAAAAAATAAATCT-ACTACT-AAAC
669 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC
* * * * * * *
45820 TAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
45885 TTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATCTTATT-AGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTC-AGTCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * ** ** * * *
45949 A-TTCTAAAAGTTAATAAGTAACATATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAGTGCAAATAG
128 ATTTC-AAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TACAAATCAGTTCAAATAA
*** * * * * *
46013 TTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTCCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAA
190 TTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA-GAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * ** * * **
46077 TAGTTTCT-ATTTGTATAAGCATA-TTGAAAATAACATAATTTTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
253 TTGTTTTTCA-TCATACAAGTTTATTTG-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * *
46139 ATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAGATTAATTTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTAT
315 ATTAATAA-T-AGAGATTTAAAA-AATAA---A--T-CTG-TTTA--CCAACTAG-TATAACTAT
* * * *
46204 TTG-AACAATTATCTATTTCAAAT-AGCTATAACTTTTTTATTTT-GTCAT--AAA-AA-T-TTT
367 TTGAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAA-TATTTTGTTTTACT-ATAAAAATAATTGTTT
* * * *
46261 --TT--T-----C-TA-TT--CAT--AA-AA-ACTTATTT--CAA-A--T--AAAATTAATAAGT
429 CATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-C
* * * *
46302 AAA-ATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAATAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAAAAA
493 AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAT-AGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTGAACAA
* * ***
46365 TTATTTATTTCAAAT-GTTATG-ACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAA
555 TTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA
* ** * * * *
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619 GCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTT--CAA-AAATTAA-TAAGAGATTT
* * **
46491 -TAAAATAAATTTGTTTACCGAAAA
677 AAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC
* * * * * **
46515 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCTTTCAT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
46580 TATAAAACAATTGATTT-AGTTCATATAGGCTAATTC-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 CATAAAACAATTG-TTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * * *
46643 ATTTTAAAAATTAACAGGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTGCTTACTGAGCAAGTTCAATTAG
128 ATTTCAAAAATTAATA-GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACAAATC-AGTTCAAATAA
* * * * *
46708 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTCTCATAAAGCAA
190 TTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA-GAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *** * *
46772 TTGTTTCT-ACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAAT--TAAATTTGTTAATATTCCAAAAA
253 TTGTTTTTCA-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
46834 TTAATAAGTA-AAAGTTAAAAAAATAAATCTGTTTTTTGAACTTGTTTAAATATTTATGACTATT
316 TTAATAA-TAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTG---TTT--AC-------CA-A-CTA-G--TA--
* ** **
46898 TAACTA-TTGGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACCTTTTGTATTGT-C-AT-AAACCA
360 TAACTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAATATTTTGT-TT-TACTATAAAAATA
* * *
46958 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
422 ATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
* * * *** * * **
47023 TAATAAGTAAA-ATATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAGCA-AGTTAAAATAGTTATTACTAT
486 TAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GCCA-AATAGTTCAAATAGTTAAGACTA-
* * * * * *
47086 TTGAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATG-CCATTTTGTTTTGTCAT--AACAATTATTTCTA-
547 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AG
* * ** * *** *
47147 TTCAAACAAGTTTATTCTGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTTTGCAATTTAATAGGTAG
610 TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA---A-
* * *
47212 GAGATTTAAATAATAAATCTATTTACTGAA-C
670 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC
47243 AAGTTCAAATA
1 -AGTTCAAATA
47254 GTCGCATTCA
Statistics
Matches: 3885, Mismatches: 789, Indels: 648
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
686 3 0.00
687 1 0.00
688 1 0.00
689 1 0.00
690 1 0.00
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700 77 0.02
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715 4 0.00
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727 9 0.00
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741 3 0.00
742 1 0.00
743 4 0.00
744 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (701 bp):
AGTTCAAATAATTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTGTTTCAGTCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACAAATCAGTTCAAATAATTATGA
CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
CATCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAG
AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAACTAGTATAACTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAAT
CATTATAATATTTTGTTTTACTATAAAAATAATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
ATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTG
CCAAATAGTTCAAATAGTTAAGACTATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGT
TTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC
Found at i:45714 original size:24 final size:25
Alignment explanation
Indices: 45682--45729 Score: 80
Period size: 25 Copynumber: 2.0 Consensus size: 25
45672 ATCGTTAGGA
45682 CATAAAAC-AATATTTTTGTTCATT
1 CATAAAACAAATATTTTTGTTCATT
*
45706 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCAT
1 CATAAAACAAATATTTTTGTTCAT
45730 ATAAATTCGT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 1
0.92 0.04 0.04
Matches are distributed among these distances:
24 8 0.36
25 14 0.64
ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.06, T:0.44
Consensus pattern (25 bp):
CATAAAACAAATATTTTTGTTCATT
Found at i:46200 original size:553 final size:553
Alignment explanation
Indices: 44795--46226 Score: 1275
Period size: 553 Copynumber: 2.6 Consensus size: 553
44785 TTGTTCTACT
* * * * * *
44795 ATAAAATAATTGTTTCAATTCACACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
1 ATAAAACAATTATTTCTATTCACACAAGTTTATTAGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-T
* * * * ** ** * *
44860 TCAAAAATTAATAAC-AA-AGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGTAGTTAAAACATTT
65 TCTAAAATTAATAACTAACAGAT-TTAAAAAAATAAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAGTT
* * ** * * * * *
44923 AAGGCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATCG
129 AAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTACCACAAAACAA-AG
* * * *
44988 TTTC-AATTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAA-TAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
193 TTTCTAGTTCTTAGTAA-CATATTCAAAATAAAATTAA-ACAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * ** *
45050 AATAAGT--G--ATTTAAAAAGTGAATT-TGCTTAC-CGAATCATTTTAAATACTTAGGACCATT
256 AATAAGTAAGAAATTTAAAAAAT-AATTCT-ATTTCTC-AAACAGTTCAAATAATTATAACTATT
* * * * * *
45109 TCAACAATTATCTATTTCAAATCATT-----AT--CAC-CTTTTGTTTGGTCA-T-AT--AACAA
318 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATAAAACAATATT-TTTGTTCATTCATAAAACAA
* * * * * *
45162 ATGTTTTTGATCATTTAAGCTT--ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA
382 ATGTTTTTGTTCATATAA-ATTCGTTTGA-AATAAAATAAGACTAATTTAATAATATTTCAAAAA
* * * ** *
45225 TTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
445 TTAAGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGACTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATT
*
45290 TGAACAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTATGTC
510 TGAACAATTATATATTTCAAATTATTATAACCATTTGTTATGTC
* *
45334 ATAAAACAATTATTTCTATTCACATAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATT
1 ATAAAACAATTATTTCTATTCACACAAGTTTATTAGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATT
* * * * * *
45399 CTGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTGCAAATAGTTAA
66 CTAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAAATAAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAGTTAA
* * * * * * ** * *
45464 GGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGCCGTAGAACAAATTTT
131 GACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTACCACAAAACAAAGTTT
* * * *
45529 TTAGTTCTTAGTAACTTATTCAGAATAAAATTAAACAAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAA
196 CTAGTTCTTAGTAACATATTCAAAATAAAATTAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * *
45594 GTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTGTCAAACTAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAA-AA
261 GTAAGAAATTTAAAAAATAATTCTATTTCTCAAAC-AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAA
* *
45658 TTTATTTATTTTAAATCGTTAGGACATAAAACAATATTTTTGTTCATTCATAAAACAAATGTTTT
325 -TTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATAAAACAATATTTTTGTTCATTCATAAAACAAATGTTTT
* * *
45723 TGTTCATATAAATTCGTTTGAAATAAAATAAGATTAATTTATTAATATTTTGAAAAA-TAAGAAG
389 TGTTCATATAAATTCGTTTGAAATAAAATAAGACTAATTTAATAATA-TTTCAAAAATTAAGAAG
* * *
45787 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ACTA-CTAAACTAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACAA
453 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGACTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * * * *
45850 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTT
517 TTATATATTTCAAATTATTATAACCATTTGTTATGTC
* * * * * * *
45887 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA-TCTTATTAGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATAT
1 ATAAAACAATTATTTCTATTCACACAAGT-TTATTAGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATAT
* * * **
45951 TCTAAAAGTTAATAAGTAACATATTT-AAAAAATGAATCTATTGGCCTGACCAGTGCAAATAGTT
65 TCTAAAA-TTAATAACTAACAGATTTAAAAAAATAAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAGTT
* * * * * *
46015 ATGATTGTTTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAATAG
129 AAGACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTACCACAAAACAA-AG
* * ***
46080 TTTCTA-TT-TGTA-TAAGCATATTGAAAATAACA-TAATTTTAATTTATTAATA-TTCTAAAAA
193 TTTCTAGTTCT-TAGTAA-CATATTCAAAATAAAATTAA-ACAAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * *
46140 TTAATAAGTAAGAAATTTAAAAGATTAATT-TATTTACTGAATA-AGTTCAAATAGTTATAACTA
254 TTAATAAGTAAGAAATTTAAAA-AATAATTCTATTT-CTCAA-ACAGTTCAAATAATTATAACTA
46203 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
316 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
46227 AGCTATAACT
Statistics
Matches: 725, Mismatches: 128, Indels: 66
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
538 17 0.02
539 198 0.27
540 9 0.01
541 1 0.00
542 11 0.02
543 48 0.07
548 2 0.00
550 9 0.01
551 4 0.01
552 14 0.02
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554 102 0.14
555 12 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (553 bp):
ATAAAACAATTATTTCTATTCACACAAGTTTATTAGGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATT
CTAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAAATAAATCTATTGGCCAAACCAGTGCAAATAGTTAA
GACTATATGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTACCACAAAACAAAGTTT
CTAGTTCTTAGTAACATATTCAAAATAAAATTAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
GTAAGAAATTTAAAAAATAATTCTATTTCTCAAACAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAAT
TATCTATTTCAAATCGTTAGGACATAAAACAATATTTTTGTTCATTCATAAAACAAATGTTTTTG
TTCATATAAATTCGTTTGAAATAAAATAAGACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAA
AAGATTTAAAAAATAAATCTGACTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
ATATTTCAAATTATTATAACCATTTGTTATGTC
Found at i:46564 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 46517--46564 Score: 53
Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 17
46507 ACCGAAAAAG
*
46517 TTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTCAAATAGT--TATCTAT
*
46536 TT-AAATAATTATCTAT
1 TTCAAATAGTTATCTAT
46552 TTCAAATAGTTAT
1 TTCAAATAGTTAT
46565 GACCTTTTCT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 3, Indels: 4
0.78 0.09 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 8 0.32
17 9 0.36
18 6 0.24
19 2 0.08
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.04, T:0.44
Consensus pattern (17 bp):
TTCAAATAGTTATCTAT
Found at i:46647 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 46289--47308 Score: 915
Period size: 179 Copynumber: 5.6 Consensus size: 181
46279 TATTTCAAAT
* *
46289 AAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCT-AATAAGTTCAAATAGTTATAA
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATAA
* * * *
46353 CTATTTGAAA-AATTATTTATTTCAAAT-GTTATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTT
65 CTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGATT
* * * * * * *
46416 TTCTTCATACAAACTTATT-TGGATTAAAAGAATA-TGAATTTATTAATATTTTG
129 CTATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTA
** * * * * *
46469 CCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATTTGTTTACCGAAAAAGTTCAAATAGTCATAAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAAC
* * * *
46533 TATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCTTTCATTATAAAACAATTGATT-T
66 TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGATTCT
* * *
46597 AGTTCATATAGGCTAATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
131 A-TTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
* * * * * * * * *
46649 AAAATTAACAGGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATTTGCTTACTGAGCAAGTTCAATTAGTTATGA
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAA
* * * * *
46714 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTCTCATAAAGCAATTGTTT
65 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGATT
* * * **
46778 CTACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAAT--TAAATTTGTTAATATTCCA
129 CTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTA
* ** ** * * *
46830 AAAATTAATAAGTAAAAG-TTAAAAAAATAAATCTGTTTTTTGAACTTGTTTAAATATTTATGAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAAC
* * * *
46894 TATTTAACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAACCAA
66 TA-TT---TA----AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* **
46959 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
123 TTGATTCTATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
* * * * * *
47018 AAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAGCAAGTTAAAATAGTTATTAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAAC
* * * *
47083 TATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATG-CCATTTTGTTTTGTCAT--AACAATT-ATTT
66 TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGA-TT
* * * * *
47144 CTATTCAAACAAGTTTATTCTGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTTTG
129 CTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
* * * ** * * *
47197 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAATAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCGCAT-
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT--TATA
* * ** * *
47261 TC-ACTCGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTAT
64 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTAT
47309 TGTAAAAAAT
Statistics
Matches: 689, Mismatches: 121, Indels: 61
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
178 4 0.01
179 228 0.33
180 115 0.17
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182 111 0.16
183 4 0.01
185 1 0.00
186 1 0.00
187 80 0.12
188 35 0.05
189 40 0.06
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAAC
TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGATTCT
ATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
Found at i:46941 original size:187 final size:188
Alignment explanation
Indices: 46713--47061 Score: 524
Period size: 187 Copynumber: 1.9 Consensus size: 188
46703 ATTAGTTATG
* * * *
46713 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTCTCATAAAGCAATTGTTT
1 ACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATATTCTCATAAACCAATTGTTT
*
46778 CTACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATTA-AATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAG
66 CTACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAA-TACAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * *
46842 TAAAA-GTTAAAAAAATAAATCTGTTTTTTGAACTTGTTTAAATATTTATGACTATTTA
130 TAAAATATTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTTGTTTAAATATTTATGACTATTTA
* *
46900 ACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAACCAATTGTT
1 ACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTATATTCTCATAAACCAATTGTT
* **
46964 TCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
65 TCTACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
*
47029 GTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGA
129 GTAAAATATTAAAAAAATAAATCTATTTATTGA
47062 GCAAGTTAAA
Statistics
Matches: 144, Mismatches: 14, Indels: 6
0.88 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
186 3 0.02
187 86 0.60
188 33 0.23
189 22 0.15
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.06, T:0.41
Consensus pattern (188 bp):
ACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATATTCTCATAAACCAATTGTTT
CTACTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATACAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
AAAATATTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTTGTTTAAATATTTATGACTATTTA
Found at i:47460 original size:145 final size:145
Alignment explanation
Indices: 47197--47462 Score: 361
Period size: 145 Copynumber: 1.8 Consensus size: 145
47187 TAATATTTTG
* * ** * *
47197 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAATAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCGCATT
1 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAAACAAATTCAAATAGTCACATT
* * **
47262 CACTCGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATTGTAAAAAATTATTTTTG
66 CACTCGAACAATTACCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAAAATTATTTTTG
47327 TTCATACATTTTCTA
131 TTCATACATTTTCTA
* * * * **
47342 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGGTTACCAAACAAATTGACATAGTCATGTT
1 CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAAACAAATTCAAATAGTCACATT
* * *
47407 CACTTGAACAATTACCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAA
66 CACTCGAACAATTACCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAAAA
47463 ATTGTTTCTA
Statistics
Matches: 102, Mismatches: 19, Indels: 0
0.84 0.16 0.00
Matches are distributed among these distances:
145 102 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (145 bp):
CAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAAACAAATTCAAATAGTCACATT
CACTCGAACAATTACCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAAAATTATTTTTG
TTCATACATTTTCTA
Found at i:47653 original size:152 final size:156
Alignment explanation
Indices: 47449--47760 Score: 365
Period size: 152 Copynumber: 2.0 Consensus size: 156
47439 GACCTTTTGT
* *
47449 TTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAAATTATTGAAAATTAAATAATATTGATTTATT
1 TTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAAATTATTGAAAATTAAATAATATTAATTTAAT
*
47514 AATATT-TTGAAATT-TAA-TAAGAGATTTAAAA-ACTAAATCA-ATTT-TCT-AACCAATTCAA
66 AATATTCTAGAAATTATAATTAAGAGATTTAAAATA-TAAAT-ATATTTGT-TGAACCAATTCAA
** *
47572 ATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTA
128 ATAGTTAGAACTATTAGAACAATTATCTA
* * * * *
47601 TTTGTCATAGAACAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCA-TATT-TAGATTAAAATAATATTAATTT
1 TTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTT-ATACAA-AATTATTGAAAATT-AAATAATATTAATTT
*
47663 AATAATATTCTAGAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAATATAAATATATTTGTTGAACTAATTCA
63 AATAATATTCTAGAAATT-ATAATTAAGAGATTTAAAATATAAATATATTTGTTGAACCAATTCA
* *
47728 AATAGTTAGAACTATTAGAATAGTTATCTA
127 AATAGTTAGAACTATTAGAACAATTATCTA
47758 TTT
1 TTT
47761 CAAATTGTTC
Statistics
Matches: 135, Mismatches: 14, Indels: 17
0.81 0.08 0.10
Matches are distributed among these distances:
151 7 0.05
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ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (156 bp):
TTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAAATTATTGAAAATTAAATAATATTAATTTAAT
AATATTCTAGAAATTATAATTAAGAGATTTAAAATATAAATATATTTGTTGAACCAATTCAAATA
GTTAGAACTATTAGAACAATTATCTA
Found at i:47889 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 47604--48106 Score: 496
Period size: 182 Copynumber: 2.8 Consensus size: 177
47594 TTATCTATTT
* ** * * * *
47604 GTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTTAGATTAAAATAATATTAATTTAATAAT
1 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
47669 ATTCTAGAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAATATAAATATATTTGTTGAACTAATTCAAATAGT
65 ATT-TA-AAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAAATAAATATATTT-TTGAACTAATTCAAATAGT
* * * *
47734 TA-GAACTATTAGAATAGTTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTA
127 TATG-ACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTA
* *
47785 GTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAAAAAATAATACTAATTTATTAACT
1 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-T
* * * * *
47850 -TTTGAAAAGTTAGTAACTAAGAAATTTAAAAAAATAAATATGTTTACT-AAATAAGTTCAAATA
65 ATTT-AAAA-TTAATAAATAAGAAATTT-AAAAAATAAATATATTT-TTGAACTAA-TTCAAATA
* * *
47913 GATATGACTATTTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTT
125 GTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTA
* * * * *
47967 GTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA-AATACTTATATGAAATAAAATAATACTATTTTATTAA
1 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA-GCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
48031 TATTTCAAAAATTATTAAATAA-AAGATTTAAAAACTAAA-ACTATTTTTCGAACTAGTTTAAAT
64 TATTT--AAAATTAATAAATAAGAA-ATTTAAAAAATAAATA-TATTTTT-GAACTAATTCAAAT
48094 AGTTATGACTATT
124 AGTTATGACTATT
48107 TAAACAAATA
Statistics
Matches: 266, Mismatches: 41, Indels: 30
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
179 4 0.02
180 43 0.16
181 72 0.27
182 99 0.37
183 44 0.17
184 4 0.02
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
TTTAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTTTGAACTAATTCAAATAGTTATG
ACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTA
Found at i:49288 original size:175 final size:176
Alignment explanation
Indices: 48231--49476 Score: 715
Period size: 181 Copynumber: 7.0 Consensus size: 176
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* * * ** * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * **
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*** * * * * *
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* *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * ** ** *
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*
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63 AATTTATTAATATT
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* * * *
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* ** *
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* * * * **
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * ** * *
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* * ** ** * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * *
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* *
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* * * * *
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* * * ** ** ***
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130 CAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTACCTATTTCAAATTATTATGAC
* * * * * * * * * *
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** * * ** * * **
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* * * * * * * *
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* * ** **
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *** * *
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1 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-CTTATTTTAAATAAAATAATAC
* * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * **
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1 A-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAACTTATTTTAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * ** * * **
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* * *** * * * *
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* * * *
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* ** * * * * * ** * ** **
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*** * * ** *
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* * ** ** *** *** *
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* * * ** ** * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * *
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* *
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* * ** *
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* * * * * *
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1 ATTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTTA-AATAAAATAATAC
*** * * * * *
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* * * ** *
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* * * ** * * * * **** ** * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * ** * * * *
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* * *
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* *
58510 ACA-TTCAAATAGTTA-AACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGATC
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** * * * *
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1 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTTAAATAAAATAATACTA
* * * *
58628 ATTGATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-TTAAGC-A
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* * * ** *
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* ** **
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* * *** * * *
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* * * * *
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* * * ** * **
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*
58988 AATATATTAATATT
65 AATTTATTAATATT
59002 TTGAAAATTC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
171 6 0.00
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Statistics
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* * ** ** * * * *
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* * ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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** * * *
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* *** * *
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* *** * * * * ** **
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* * * * * * *
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* * * * ** * * * ** **
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* ** * *** * ** *
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* ** *
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* * *
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* * * * * * ** ** *
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* * * * * * * * * * *
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* ** ** * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * *** * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * **
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* * * * * **
56963 TCAAACATTTGTTTT-TCATCAAACAAGCCTATTTGGAATA
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** * *
57003 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAATAAGTAGGAGA-TT-----AT--CTAT-T
1 AAATAATA-TAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * *
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* * * * * ***
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126 TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTT-CTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * * * **
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* * * * * ** **
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* *
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* * * ** * * * * ** **
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* * ** * * ** * * *
57547 TTATTAATATTCTAAAATTTAATAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATATGTTGGCTTGACCCA-T
188 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-GAACATAAAAAATAAATATATT-TATTAAGCAAGT
* * * ** *
57611 GT-AAATTGTTATGACTGTTTGAA-ATATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATC
250 -TCAAATAGCTATGACTATTTGAACA-ATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGTC
* * * *
57674 ACAAAACAATTGTTTCT-TT-AGTATAAGCTTATTTAGAATA
312 ATAAAAAAATTGTTT-TATTCA-TACAAGCTTATTCAGAATA
* * *** * * * * * *
57714 ACATAATTCTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAATTGAATCTATT
1 AAATAA-TATAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * ** * *
57779 TATTGAACAAGTT-ATAATTGTTATGACTATTTGAACAATTCCCTATTTCAAATCACTATAACCT
64 TATAGAACAAGTTCA-AATAG-TAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
** * * * * *
57843 TTTGTTTTGTCAGT-AAATTATTTTTCTATTCATACAAGCCTATTTC-AATTAAAATAATACAAA
126 TTT-TTTTGTCA-TAAAACAATTGTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** *
57906 TTTATTAATATTC-AAACAACTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-TAA
188 -TTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAGAACA--TAAAAAATAAATATATTTA-TTAAGCAA
57969 GTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTATGTTTTGTC
248 GTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTT-TGTTTTGTC
* * *
58034 ATAAAACAATTGTTTTTATTTATACAAGCTTATTCAGATTA
312 ATAAAAAAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* *
58075 AAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTT
1 AAATAATA-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* *
58140 TATTA-AACAAGTTCAAATAGGTATAACTATTTGAATAATTAT-TCATTTCAAATCGTTGTGACC
64 TA-TAGAACAAGTTCAAATA-GTAT-ACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACC
* * ** * * * ** * *
58203 TTATGTCTCATCATATAACAATTGTATCAATTCACATTGGCTTATTCAAAATAAAAGAATGCTAA
125 TT-TTTTTTGTCATAAAACAATTGT-TCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * * * *
58268 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGATTCTATTTTTTGATCAAGT
188 -TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AGA-ACATAAAAAATAAATATATTTATTAAGCAAGT
* * *
58333 TCAAATAGGTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTTGTCA
250 TCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTT-GTTTTGTCA
* * * * *
58398 TAAAACAAAAT-TTCTATTCATACAACCTTAGTCTGAATA
313 TAAAA-AAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
** * * *
58437 AAATAATATAAATTTATTAATA-TTCCAGAAATTAATAAGTAAAAATTTCAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATAT-AATTTATTAATATTTTGA-AAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAA--TATG
* * *
58501 TTTCT-GAACACA-TTCAAATAGTTAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAT
62 TTTATAGAACA-AGTTCAAATAG-TATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
** * * * **
58563 CTTTTGTTTTGTCATAATCCATTTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTTGAAATAAAATAATACTA
124 CTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTG-TTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * *
58628 ATTGATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATTAAGCAAG
187 ATT-ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGAACA--TAAAAAATAAATATATTTATTAAGCAAG
* * * * *
58693 TTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATTATCTTTTGTTTTGTCA
249 TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCA
* *
58758 TAAAAAAATTGTTTTATTCATACAAGTTTATTCAAAATA
313 TAAAAAAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * * *
58797 AAATAATACTAGTTTTATAAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGT
1 AAATAATA-TA-ATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * *
58862 TTATAGAACAAGTTCAAATAGTCATGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTC
63 TTATAGAACAAGTTCAAATAGT-ATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-
* * **
58927 TTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTGCTATTCATGTAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATA
126 TTTTTTTGTCATAAAACAATTGTT-CTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-
* *
58992 TATTAATATTTTGAAAATT
189 TATTAATATTCTAAAAATT
59011 CAGCTTGTAC
Statistics
Matches: 2372, Mismatches: 553, Indels: 308
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
349 3 0.00
350 2 0.00
351 1 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (351 bp):
AAATAATATAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
TAGAACAAGTTCAAATAGTATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTT
TTGTCATAAAACAATTGTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTATTAAT
ATTCTAAAAATTAATAAGTAGAACATAAAAAATAAATATATTTATTAAGCAAGTTCAAATAGCTA
TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTT
TTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
Found at i:60252 original size:351 final size:351
Alignment explanation
Indices: 59594--60421 Score: 880
Period size: 351 Copynumber: 2.3 Consensus size: 351
59584 TATAAAGATT
* * * *
59594 TTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAACTAACTGTTTTTATTCATA-AAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTAG-CA-AAA-TAA---TTTTTATTCATACAAA
*
59658 ACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAA
60 A-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAATT-CAAAAA--ATTAA-TAAAAAATTTTAA
* * * * *
59723 AAATAAATCTATTTGCCTAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAA
120 AAATAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATCTCAAA
* * * *
59788 TCATTATGATCTCTTGTTTTGTCATTAAACATATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAA
185 TCATTATGATCTCTTGTTTTGTCATAAAAAATATGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAA
** * *** *
59853 AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTGGAGATTTAAAAAATAAAATCTATT
250 AATAATACTAAAATAATAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATATT
* ** * * *
59918 TACTGATTAAATTCAAATAATCATGTCCATTTAAATTA
314 TACCGAACAAATTCAAATAATCAAGACCATTTAAATAA
* * *
59956 TTATCTATTTCAAATCATTATGATGTTTTTGTTTA-C-AAATTATTTTTATTCATACAAAATCAT
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTAGCAAAATAATTTTTATTCATACAAAATTAT
* *
60019 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAAAGA-TTTAAAAACTAAAT
65 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCAAAAAATTAATAAAAAATTTTAAAAA-TAAAT
* * * *
60083 CTGCTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATCTCAAATTATTAT
128 CTACTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATCATTAT
* * * *
60147 GAT-TTTTGTTTTGTCATAAAAAA-ATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCAG-AGTAAAATAT
192 GATCTCTTGTTTTGTCATAAAAAATA-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAA
* * *
60209 TGCTAAAATAATAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGA
255 TACTAAAATAATAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGA
* * * * * *
60274 ACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAA
320 ACAAATTCAAATAATCAAGACCATTTAAATAA
*
60306 TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGCTTTAGTTCATACATA
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTAG-C--AAAATAATT--TTTA-TTCATACAAA
* ** * *
60371 CTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAGTCAAAAAATTAATAA
60 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCAAAAAATTAATAA
60422 GTAAGATATT
Statistics
Matches: 391, Mismatches: 60, Indels: 35
0.80 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
349 10 0.03
350 57 0.15
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353 6 0.02
354 7 0.02
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359 3 0.01
361 1 0.00
362 21 0.05
363 8 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.06, T:0.41
Consensus pattern (351 bp):
TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTAGCAAAATAATTTTTATTCATACAAAATTATT
CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTCAAAAAATTAATAAAAAATTTTAAAAATAAATCTA
CTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATCATTATGATC
TCTTGTTTTGTCATAAAAAATATGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
AATAATAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAAT
TCAAATAATCAAGACCATTTAAATAA
Found at i:60285 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 59594--60459 Score: 808
Period size: 180 Copynumber: 4.8 Consensus size: 180
59584 TATAAAGATT
* * * ** * * *
59594 TTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAACTAACTGTTTTTATTCATAAAAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAA
* * * *
59659 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAA
65 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAA
* * * * *
59723 AAATAAATCTATTTGCCTAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAA
130 AAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
* * * *
59774 TTATTTATTTCAAATCATTATGATCTCTTGTTTTGTCAT-TAAACATATGTTTCTATTCATACAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGAT-TTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT-TGTTTCTATTCATACAA
** ** ***
59838 GTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTGGAGATTTAA
64 ACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAA
* ** * * * * *
59903 AAAATAAAATCTATTTACTGATTAAATTCAAATAATCATGTCCATTTAAATTA
129 AAAAT-AAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
* * * * * *
59956 TTATCTATTTCAAATCATTATGA--TGT-TTTTGT--T-TACAAATTATTTTTATTCATACAAAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAAC
*
60015 TCATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAAT----AAAAGATTTAAA
66 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAA
* ** * *
60075 AACTAAATCTGCTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
130 AAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
* * * * *
60126 TTATTTATCTCAAATTATTATGATTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAGC
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAAC
* * * * ** * *
60191 TTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAAATAATAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAA
66 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
60256 AATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAA
131 AATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
* * * *
60306 TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGCTT-TAGTTCATACAT
1 TTATCTATTTCAAATCATTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAA
** * * * * * * *
60370 ACTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAGTCAAAAAATTAATAAGTAAGATATTTTA
64 ACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGA-TTT-
* *
60435 AAAAAATAAAT-TTTTTATCGAACAA
127 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
60460 TTGTTTTAGT
Statistics
Matches: 549, Mismatches: 117, Indels: 38
0.78 0.17 0.05
Matches are distributed among these distances:
170 55 0.10
171 12 0.02
172 2 0.00
173 6 0.01
174 1 0.00
175 59 0.11
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177 1 0.00
178 6 0.01
179 3 0.01
180 157 0.29
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182 71 0.13
183 11 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.06, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAAC
TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAA
AATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
Found at i:60546 original size:108 final size:108
Alignment explanation
Indices: 60350--60546 Score: 240
Period size: 108 Copynumber: 1.8 Consensus size: 108
60340 GTCATAAAAT
** *
60350 AATTGCTTTAGTTCATACATACTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAGTCAAAAAA
1 AATTGCTTTAGTTCATACATACTTATTCCAAATAAAATAATACTATTGTATTAACAGTCAAAAAA
* *
60415 TTAATAAGTAAGATATTTTAAAAAAATAAATTTTTTATCGAAC
66 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTTTTATCGAAC
* * * *
60458 AATTGTTTTAGTTCATA-ATAGCTTA-TCCAACATAAAATAATATTATTGTATTAATATTTC-AA
1 AATTGCTTTAGTTCATACATA-CTTATTCCAA-ATAAAATAATACTATTGTATTAACA-GTCAAA
*
60520 AAATTGAA-AAGTTAGAGATTTAAAAAA
63 AAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
60547 TAAATCAGTT
Statistics
Matches: 75, Mismatches: 10, Indels: 8
0.81 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
107 6 0.08
108 65 0.87
109 4 0.05
ACGTcount: A:0.46, C:0.08, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (108 bp):
AATTGCTTTAGTTCATACATACTTATTCCAAATAAAATAATACTATTGTATTAACAGTCAAAAAA
TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATTTTTTATCGAAC
Found at i:60761 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 60455--61689 Score: 937
Period size: 181 Copynumber: 6.9 Consensus size: 181
60445 TTTTTTATCG
* ** *
60455 AACAATTGTTTTAGTTCATA-ATAGCTTA-TCCAACATAAAATAATA-TTATTGTATTAATATTT
1 AACAATTGTTTTTGTTCATACA-AGCTTATTCGGA-ATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTT
* * *
60517 CAAAAATTGAA-AAGT-TAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCGAATCAGTTCAAATAATT
63 CAAAAATT-AATAAGTAT-GAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTT
** * *
60579 ATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAACCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAA
125 ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
60636 AACAATTGTTTTTCATT-GTACAAGCTAATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAGTTCA
1 AACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * ** * * *
60700 AAAATTTATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTATTGAACCAGTTCAAGTAATTATGAC
65 AAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAAC
* * *
60765 TATTTAAATAATTATATATTTCAAAT-AGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
130 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
60817 AATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-G
1 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCA
* * ** * * **
60881 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA-ATTGTTTGCCAAACGAATTCAAATAGTTATGG
65 AAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAA
* *
60945 CTATATGAACAATTCTCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
129 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * ** * **
60998 AACAAATGTTTTGGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGA
1 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * * *
61063 AAATTAATAA--A--AGATTTAAAAAATAAATCTG--TATAAAAGCAATTTAATTAGTTTTAACA
66 AAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACT
* * * *
61122 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAA
131 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * *** * * * *
61173 AACAA-AATTTCTATTTATACGTTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAA-TTACTAATA-TTCTA
1 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-A
* * * * ** * * *
61235 AAAACTAGTAAGTAATG-GATTTAAAAAATTAATCTG-TTGGCATGACTAGTACAAATAGTTATA
65 AAAATTAATAAGT-ATGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCA-AACCAGTTCAAATAGTTATA
* * * * * *
61298 ACTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTATTTTTTCACAA
128 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
61352 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-TTGATTGGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTTCA
1 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * *
61416 AAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATAAC
65 AAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAAC
* * * *
61481 TATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGC-TT-TAGCTTTTTGTTTTGTTATAA
130 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T-CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
61533 AATATTTTTTTTCTATTCATATAAGCTTGTTTC--AATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-T
1 AACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTT-ATTCGGAA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * * * **
61594 TCATATAACTAATAAGTA-AAAATTTTAAAAAAAATGAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAG
62 TCA-AAAATTAATAAGTATGAGA-TTT--AAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAG
* * *
61658 TTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAA
123 TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
61690 CTGTTAAGAA
Statistics
Matches: 831, Mismatches: 184, Indels: 75
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
172 2 0.00
173 17 0.02
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176 1 0.00
177 36 0.04
178 2 0.00
179 63 0.08
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184 58 0.07
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
AAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACT
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
Found at i:60778 original size:18 final size:17
Alignment explanation
Indices: 60749--60797 Score: 55
Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 17
60739 ATTGAACCAG
*
60749 TTCAAGTAATTATGACTAT
1 TTCAAATAATTAT-A-TAT
60768 TT-AAATAATTATATAT
1 TTCAAATAATTATATAT
*
60784 TTCAAATAGTTATA
1 TTCAAATAATTATA
60798 ACCTTTTGTT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 2, Indels: 4
0.82 0.06 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 5 0.19
17 11 0.41
18 9 0.33
19 2 0.07
ACGTcount: A:0.43, C:0.06, G:0.06, T:0.45
Consensus pattern (17 bp):
TTCAAATAATTATATAT
Found at i:62057 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 61753--62196 Score: 555
Period size: 179 Copynumber: 2.5 Consensus size: 181
61743 AAACAATTTT
* * * *** *
61753 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTAAGTAATTTTTCCAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
61817 ATAAGTTTGTATGAACAAAAACAATATGTTTATAACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAG
66 ATAAGTTTGTATGAACAAAAACAATATGTTTATAACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAG
* *
61882 ATAATTGTTTAAATAGTTATAAC-TATTTGA-ATGTATTCAGAAAATAGATTT
131 ATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTTGACATGTA-T-AGAAAATAGATTC
* * **
61933 ATTTTTTAAGTTTC-TACTAAGTAATTTTTCCAATATTAATAAATTTCTATTATTTTA-TTCGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTAAGTAATTTTTCCAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * *
61996 ATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTAT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAA
66 ATAAGTTTGTATGAACAAAAACAA-TATGTTTATAAC-AAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAA
* * *
62059 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTTGACCTTGTATGGTAAATAGATTC
128 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTTGA-CATGTATAGAAAATAGATTC
* * **
62114 ATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-A
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTAAGTAATTTTTCCAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
*
62178 ATAAGTTTATATG-ACAAAA
66 ATAAGTTTGTATGAACAAAA
62197 CAAAAGTAAT
Statistics
Matches: 226, Mismatches: 29, Indels: 17
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 3 0.01
179 67 0.30
180 63 0.28
181 35 0.15
182 50 0.22
183 8 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
ATTTTTTAAATCTCTTACTAAGTAATTTTTCCAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
ATAAGTTTGTATGAACAAAAACAATATGTTTATAACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAG
ATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTTGACATGTATAGAAAATAGATTC
Found at i:62313 original size:159 final size:161
Alignment explanation
Indices: 62026--62356 Score: 407
Period size: 159 Copynumber: 2.1 Consensus size: 161
62016 ATAATTATTT
* *
62026 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTT
* * * *****
62091 GACCTTGTATGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATA
66 GAACTTGTATGATAAAAAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGCCAAAATATTAATA
* * * *
62156 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTA
131 AATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTA
* * *
62187 TATGACAAAACAAAA-GTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTGTGAC-TATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTT
* * * * * *
62250 GAACTTGTTTGATAAAAATATTTA-TTTTTAAATTCTTTTTCTTATTAATTGCCAAAATATTAAT
66 GAACTTGTATGATAAAAAGATTCATTTTTTAAA-TCTCTTACTCATTAATTGCCAAAATATTAAT
*
62314 AAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTG
130 AAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTA
62346 TATGAACAAAA
1 TATG-ACAAAA
62357 ACAATTGTTT
Statistics
Matches: 144, Mismatches: 24, Indels: 5
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
158 8 0.06
159 77 0.53
160 44 0.31
161 15 0.10
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (161 bp):
TATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTT
GAACTTGTATGATAAAAAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGCCAAAATATTAATA
AATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTA
Found at i:62480 original size:340 final size:340
Alignment explanation
Indices: 61853--62512 Score: 834
Period size: 340 Copynumber: 1.9 Consensus size: 340
61843 TGTTTATAAC
* *
61853 AAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATGTAT
1 AAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATGTAT
* * **
61918 TCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAGTTTCTACTAAGTAATTTTTCCAATATTAATAAATTTCTAT
66 TCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAGTTTCTACTAAGTAA-TTTGCCAATATTAATAAATTAATAT
* * *
61983 TATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
130 TATTTTATCCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * * * * **
62048 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTTGACCTTGTATGGTAAATAGATT
195 ATGATTTAAAATAAATAATTGTCCAAATAATCATAACTTATTTGAACTTGTATAATAAATAGATT
* *
62113 CATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATT-TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
260 CATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGTTT-AAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
62177 AATAAGTTTATATGACA
324 AATAAGTTTATATGACA
* *
62194 AAACAAAA-GTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTGTGACTATTTGAACTTGT
1 AAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAA--TGT
* * * * * * * *
62258 -TTGATAAAA-ATATTTATTTTTAAATTCTTTTTCTTATTAA-TTGCCAAAATATTAATAAATTA
64 ATTCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAGT-TTCTACTAAGTAATTTGCC--AATATTAATAAATTA
* *
62320 ATATTATTTTAATCCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACTAAAA-
126 ATATTATTTT-ATCCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAG
*
62383 ATCATAATGGTTTAAAATAAATAATTGTCCAAATAATCATAAC-TATTTGAACTTGT-TCAATAA
189 ATCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTCCAAATAATCATAACTTATTTGAACTTGTAT-AATAA
* * * * *
62446 ATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTAAATAATAATAAATTTGTATTCTTTT
253 ATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGTTTAAATAATAATAAATTAGTATTATTTT
62511 AT
318 AT
62513 ATGAAATAAA
Statistics
Matches: 273, Mismatches: 37, Indels: 19
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
339 5 0.02
340 132 0.48
341 125 0.46
342 11 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (340 bp):
AAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAATGTAT
TCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAGTTTCTACTAAGTAATTTGCCAATATTAATAAATTAATATT
ATTTTATCCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
TGATTTAAAATAAATAATTGTCCAAATAATCATAACTTATTTGAACTTGTATAATAAATAGATTC
ATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGTTTAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
TAAGTTTATATGACA
Found at i:62638 original size:178 final size:178
Alignment explanation
Indices: 62182--62643 Score: 479
Period size: 181 Copynumber: 2.6 Consensus size: 178
62172 TTTCGAATAA
* ** *
62182 GTTTATATGACAAAACAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTGTGACTA
1 GTTT-TATGACAAAACAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *
62247 TTTGAACTTGTTTGATAAAAATATTTA-TTTTTAAATTCTTTTTCTTATTAATTGCCAAAATATT
65 TTTGAACTTGTTTGATAAAAAT-TTTATTTTTTAAA-TCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATAAT
*
62311 AATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
128 AATAAATTAATATTATTTTAAT-CGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATT
* * * * * * * * *
62363 GTTTTATGAGAAAACTAAAAATCATAATGGTTTAAAATAAATAATTGTCCAAATAATCATAACTA
1 GTTTTATGACAAAAC-AAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
** ***
62428 TTTGAACTTGTTCAATAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTAAATAAT
65 TTTGAACTTGTTTGATAAA-A-ATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATAAT
** * * *
62492 AATAAATTTGTATTCTTTTATAT-GAAATAAACTT-TGA-GTA-GAAAA-AATT
128 AATAAATTAATATTATTTTA-ATCG-AATAAACTTGT-ATGAACAAAAACAATT
* * *
62541 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
1 GTTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* **
62606 TTTGAACTTGTTTGGTAAGCATTTTCATTTTTTAAATC
65 TTTGAACTTGTTTGATAAAAATTTT-ATTTTTTAAATC
62644 CATTATCTAT
Statistics
Matches: 229, Mismatches: 42, Indels: 23
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 1 0.00
177 7 0.03
178 80 0.35
179 4 0.02
180 14 0.06
181 111 0.48
182 11 0.05
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
GTTTTATGACAAAACAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTTGTTTGATAAAAATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATAATAAT
AAATTAATATTATTTTAATCGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATT
Found at i:62995 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 62734--67270 Score: 2756
Period size: 180 Copynumber: 25.4 Consensus size: 179
62724 CTGATTTATG
** * * *
62734 TTTTAAATTTCCAACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAACTAGTATTATTTT-TTTTGAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * * * * *
62798 GCTTTTATAAATTGAAACAAATT-TTTTACGATAAAATAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGAT
65 GCTTGTATGAATTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
*
62862 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAATTTTT
129 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTTT
* * * * *
62913 TTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTATGAATGTTCATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * * *
62978 GCATGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGCCAGAACGATTCGAAATAGATA
65 GCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
** * * * * * * *
63043 CCTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGTA-TTGTTTTGGTAAACACATTCATT
130 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATT-TTT
* * * * * * * ***
63094 TTTTAAAATT-TTACTTATTAGTTTTTAGAATATTATTAATTTAGGAATATTTTACTCAAAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* ** * * * * **
63158 ACTTGTATGAACAGAAACAAATGTTTTAAGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGTGATAGATA
65 GCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * *
63222 ATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAAGAGATTTAGT
130 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAAATTT-TT
* * * * * * * * *
63273 TTTT-AA-GT-GT-CTTATCAGTTTTTGAAATAGTAATAAATTAATGTTATTTTATTCTAAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
** * * * * * *
63334 TTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAATGTCTTAATGATTTAAAATAGATA
65 GCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
** * ** * *
63399 A-TAGTTCAAATAAACATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAGTTAATT
130 ATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATT-TTT
* * * * **
63450 TTTTAAATCTTC-AACTTATTGATTTTTAGAATAATAACAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATA
1 TTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * *** * * * *
63514 AACTTGTATGAATAGAAATAAAAACTTTTATGATAAAACAAAAAGATCATAACGACTTGAAATAA
64 AGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * *
63579 ATAATTATTGAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTT-GGTAAATAGATTTATT
127 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTT-TT
* *
63633 TTTTAAATATT-TTACATATTAATTTTT-AACTATTAATAAATTGGTATTATTTTA-TTTGAATA
1 TTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * * *
63695 AACTTGTTTGAATAG-AACAAATTGGTTTATGACAAAATAAATGATCATAACGATTTGAAATAGA
64 AGCTTGTATGAATTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * ** * * *
63759 AAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TGAATTTAGAAAATAGATTTATT
128 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG--TTCGGTAAACAAATTT-TT
* **
63812 TTTTAAAATT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TGGGAAAT
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AAT
* ** * * *
63874 AAGCTTGCATGAA-CAAAACCAATTGTTTTATGAGAAAACAAAA-GTCATAATGTTTTGAAATAG
63 AAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
63937 AT-TTTTTTACACACA--CATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCATT
127 ATAATTATT-CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATT-TTT
* * **
63989 TTTT-AATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTAATTTCAAAT
1 TTTTAAATT-TCTTACT-TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * ** *
64052 AAGGTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAATGGTCACCATGATTTGAAATAG
63 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAG
* * *
64117 ATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATT
127 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTT-TT
* *** * * * *
64171 TTTAAAAATTT-TTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTAATATGAATA
1 TTT-TAAATTTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * * *
64235 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGA-GATAAAACAAAAAGTTAGAACAATTTGAAATAAA
64 AGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * *
64299 TAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTATT
128 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTT-TT
* ***
64352 TTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAAT
1 TTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
** * ** * * * * ** *
64415 AAGCTTGTATGAACAGAAAAAAATCATTTAATGACAAAGCAAAAGATTATAGTGATTTCAAATAG
63 AAGCTTGTATGAATTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * *
64480 ATAATTGTTCAAATAATCATAATTA-TTGAAACTTGTTTGATAAATAGAATCATTT
127 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTTGTTCGGTAAACA-AAT-TTTT
* * * * *
64535 TTTAAAATCTT-TTAATTATTAATTTTCAGAATATTAACAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATA
1 TTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * *
64599 AGCTTATGTGAATTGAAATAATTTTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * **
64664 AATTATTCAAATACTCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATGTTTATT
129 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTT-TT
* * * * * *
64716 TTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * *** * * * * ** ** *
64781 CCATATATGAACAAAAACTATTGTTTTATAACAGAACAAAAAGTCATAATAATTTGAACGAAATA
65 GCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
** * * * * * * **
64846 ATTGCTCAAATAGTCATAACTACTTGAAATGGTTTGTTAAGC-AATTTACC
130 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTT-TT
* * * *
64896 TTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAACA
1 TTTTAAATTTCTTACTT-ATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * * * *
64960 AACTTATATTACCA-T-AAACAATTGTTTTATGAAAAAATAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAG
64 AGCTTGTATGA--ATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * *
65023 ATAATTATTC-AATAGTTATAATTCTTTGAACTGGTTCGATAAATAGAATTATT
127 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACA-AATTTTT
* * * * * * ***
65076 TTCTAAATCTCATACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCAAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * *
65141 GCTTCTAT-AAGATGAAAAAATTGTTTTATGATAAGACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
65 GCTTGTATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * ** ****
65205 AATTGTTC--ATAGTCTTAACTATTTGAACAGGTTTAACAAACAAATTTATT
129 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTT-TT
* * * * * * * *
65255 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTTTTAATTTTATTATATTAGTACTATTTTATTTCGAATA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAA--TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* *** * * * * * * * * * * *
65320 AACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTCATGACATAATAAAAAGTTATAGCAATTTGAAGTATAC
64 AGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * *
65385 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTTGGTAAATAGATTTATT
129 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTT-TT
* * * * * ** *
65437 TTTAAAATCTCTTACCTAATAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAATTATTTTATTATGAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * ** * * * *
65502 ACTTGTATTAA--AAAACAATTGTTATATGACCGAATAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATA
65 GCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * **
65565 ATTGTTGAAATGGAT-AAAATTATTTGAA------C--T-AATTAATTTTT
130 ATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTTT
** * ** *
65606 TTAAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA-AGGTTAATAAATTAAAACTATTTTATTTTGAATA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAATA--TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* ** * * * * *
65670 AACTTGTAT-AA-AAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGAT
64 AGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * * ** ** * *
65733 AATTGTTAAAATGGAT-AAAATTATTTAAACTAATTCAATAAACAGATTCATT
129 AATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATT-TTT
* * **
65785 TTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AATTAGTATTAATTTATTTCAAATAA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * *
65845 GTTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTAT-AGCAGAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGAC
65 GCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * *
65909 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTTGGTAAACAAATTTATTT
129 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAA-TT-TTT
* ** * *
65962 TTTTAAA-CTCTTGTTTATTAATTTTGGAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTT-AGACA
1 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATA
* * * * * * *
66024 AGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAA
64 AGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
66089 TAATTATTC-AATAGTAATAACTATTTTAACTTGTTCGATACACAGATTCATT
128 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATT-TTT
* ** * **
66141 TTTCAAATCTT-TTGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTTCAAAT
1 TTTTAAAT-TTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * ** * *
66204 AAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGATTAAACAAGAGGTCAGAACGATTTGAAAT--
63 AAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* ** * * * * *
66266 ATAATTATTCTAATAGTTTTAACT-TTTCAACTAGGTCGGTAAACACATTTAT
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* * * * * *
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* * * * * ****
67845 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAAA
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * *
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65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAG-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAAGTCATAA
* * * * * ** * *
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126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
** * * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * ** *
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65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * *
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** * *
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1 AAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * * * * * * * * *
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63 TTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * * * **
68379 GATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTCGAC
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* *
68432 AAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTA-T
* * * * * *
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64 TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * **
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** * * * *
68607 AAAATAGCTTTAGGTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTGT
1 -AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
68672 TTTATTTCGAAGAAGTTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTAATAAT
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * *
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127 GA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * **
68788 AAATAGATATATATTTTTAAGTCTCTTGTGC--ATTAATTTTTCAAATGCTAATAAATTAGTATT
1 AAACAGATTTAT-TTTTTAAATCT-TT-TACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * ** * * *
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62 ATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* ** * * * * * *
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126 -CGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
68971 AAACACATTTATTGTTTAAATCTCTTATTTATT-ATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * *
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65 TT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* *
69097 TTTGAGATAGAT-ATT-TATCTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TTTAGT
129 TTTGAAATAGATAATTGT-TC-AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGT
* * * * * ** * *
69148 AAATAGATATT-TATTTTAAATTTTTTAC-TA--ACTTTTAAAATATCGATAGATTACTATTATT
1 AAACAGAT-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * *
69209 TTATTCTAAATAATTTTGCATTAACAAAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * *
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** * *
69326 AAATAGATTTATTTTATAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATATATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * *
69391 TTATTCCCAATAAACTTTTATGAATA-AAAACAATTGTTTTCTAACAAAACAAAAGGTCATAACT
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * *
69455 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCCTAAGTATTTGTACTTGTTCGAT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * *
69507 AAATAGATTTATATTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * * **
69572 TTATTTCAAATATGTTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATTA
65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
** * * * * *
69637 TTTGACGTTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTTAG-
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
69687 AAAAAAATTTATTTTTCAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAACAAATTTA-TATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAA-TTAGTATTAT
** * * * * * * *
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* * * * *
69814 AATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGAT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * *
69867 AAACAAATTCA-TATTTAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTACTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * ** * *
69930 TTTATTTCAAATAAGCCTATATGAATTGATAAAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACA
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * *
69995 AATTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTATGATTATTTGAACTTGTTCGGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
70047 AAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTAGATATATTAATAAATTAATATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-A-ATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * * *
70111 TTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATTA-AAACAATTGTTTTTTTAACAAAACGAAAACTCGTAA
64 TTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAAAAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * * * *
70175 TGATTTGAAATA-AAAATTTGTTCAAATAGCCATTACTATTTGAATTTATTCGAT
126 CGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * *
70229 AAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTGAATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
70293 TTAATTGAAATAAGCTTTTATGAATAGAAAAAA-TCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAA
65 TTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * *
70357 TTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTGAACTTGTTCGAT
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * *
70409 AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTCACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATG
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * *
70474 TTATTCCAAATAAGCTAGTATGAACA-TAAAAATTGTTTTGTGACAAGACAAATA-TCATAACGA
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * *** *
70537 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTTATAACTATTTGTA-TTGGTCAAGC
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
** * * *** * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * ** * *
70653 TTATTTCGAATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAGATGGCCATAATG
65 TTATTT-GAATAAG-CTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * *
70717 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGAT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
70769 AAATAGATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTTTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
70830 TTATTTTGCACAAACTTATATGAACA-AAAATATTTTTTTTACGACAAAACAAAAAGTCATAATG
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * ** *
70894 ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGGCTTAACTATTTTAA-TTGATTCAGC
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
* * * * * * * *
70946 AAACAAATTTATCTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAAGATTATTAGATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
71011 TTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTAT-AGCAAAACAAAAGGTTATTACA
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * *
71075 ATTTGATAGATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * *
71127 AAGCATATTTATTTTTTAAAT-TTCCTACTTATTAATTTTAAAAAATTAAAAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * ** * *
71191 TTATTTTCAATAGGCTTATATGATTA-AAAATAATTGTTTTACGACAAAAC-AAAAGTTTATAAC
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAAC
* * * * * * * *
71254 TATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTAATTCGAT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
** * * *** * * * * *
71307 AAATTGATTCACTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATA
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
71372 TTATTTTGGATAAGCTTTTATGATCTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATG
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * **
71436 ATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTGTTCGAACTTGTTCAGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
71488 AAACA-AGTTTATTTTTTAAAATTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTA
1 AAACAGA-TTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
71552 TTTTATTTTGAATAAACTTGTATAAAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAAC-AAAGGTCAGAA
63 TTTTA-TTTGAATAAGCTTGTAT-GAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * * * ** *
71616 CAATTTGACATAGATAATTATTCTAACAGTCTTAATTATTTGAAC-TGATTCAGC
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
* * ** * *
71670 AAACATATTTATTTTTTTAAATC-TTT--TT-TTAATTTTTAGAATATTATTACTTTAGCAATAT
1 AAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * ** * * *
71731 TTTACTCTAAATAAGCTTATATGAACAAAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC---TA-T-
64 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC--AGA-A-AAAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAAGTC
* * ** * * * * * * * *
71791 TTGAACTGGTTTGGTATACA-AATTTAGTTTTTAAAT-CTCTTATTAA-TTTTTCAA-AT-ATTA
122 AT-AAC-GATTTGAAATAGATAA-TT-G--TTCAAATAGTC--A-TAACTATTTGAACTTGTTTG
*
71851 AT
178 GT
* * * ** **
71853 AAATTAG-TATTATTTTATTCTAAATAATTTT--TTATGAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAA
1 AAA-CAGAT-TTA-TTT-TT-TAAAT-CTTTTACTTAT---T------AATT-TTTAAATATTAA
* ** * * ** * * * * *
71915 CAAAATGTCACAATGATTTGAAAT-AGATAATAGCTTGAATGGATATGACTATTTAAACTTGTTC
50 -TAAAT-T-AGTATTATTTTATTTGA-AT-A-AGCTTGTATGAACA-GA--A---AAAATTGTTT
* * * *** * ** * * * **
71979 GAT-A-AATAGATTTATTTTTGAAATCTCCAACTTTTAATTTTTAGA-ATATTAAT-AAATTAGT
103 TATGACAAAACAAAAAGTCAT--AA----CGA-TTTGAA---ATAGATA-ATTGTTCAAA-TAGT
** * * *
72040 -ATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAAT
156 CA-TA-ACTA--TT---TGAACTTGTTTG-GT
* * * * * * *** ** ** * * *
72071 AGAAAAAATTGTTTTTT-GA-C-AAAAC--AAAAGATCATGACAAT-TTAAAACAAATA--ATTA
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA-ATTTTTA-AATATTAATA-AATTAGTATTA
* * * * * * *****
72128 TTTAAATAGTCATAA-CTAT-T-TAAACTCACTTCGTAAACAAATT-TATTT-TTA-AAATTTTT
63 TTTTATTTG-AATAAGCT-TGTATGAA--CA----G-AAA-AAATTGT-TTTATGACAAAACAAA
* * * ** ** **
72187 TACTTATTAA-TTTTTGAAAT---T--TTAAT-AAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAA-TATGCT
117 AAGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCA-TA-ACTA-TTTGAACT-TG--
*
72243 TTTATGCAT
174 -TT-TG-GT
** ** * *** * * * * *
72252 AGAAACA-ATTGGTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA-TAATGTTTTGAAATAGATAGT-TATTCA
1 --AAACAGATTTATTT-T-TTAAATCTTTTA-CTTATTAAT-TTTT-AAATA-TTAATAAATT-A
* ** * * * * ** ***
72313 GATAGTCATAACTATTT--A-AA-C-T-TAT--TCGGTAAATAGATT-TTTT-T--TAATTCTCT
57 G-TA-TTAT-TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAG-AAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * ** * *** * * * ** * *
72366 TACTCATTAA-TTTTTGAAATA-TTAA-TAAACTAATA-TTATTTTACTTCAAAT-AAGCTTATA
117 AAGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA--TAAC-T-ATTTGAA-CTTGTT
*
72426 TGAACT
176 TG--GT
* ** *** * * * * *
72432 GAAACA-A-TTATTTCAATTACAAAATAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
1 -AAACAGATTTATTT--TTTA-AATCTTTTA-CTTATTAA--TTTTTAAATA-TTAA-TA---AA
** * * * *
72494 AAAGTCATTA--CTATTTGAACT-TG-TTCGTA--AACATATATATTTTTAAATATTTTACTTAT
54 TTAGT-ATTATTTTATTTGAA-TAAGCTT-GTATGAACAGA-A-A-----AAAT-TGTT--TTA-
* * * * ** * * *
72553 TAATTATTGAAACATTAATAAATTA-ATATTATTT-TAATCCAAATAACCTTGTAT-GAATAG--
105 TGA-CA---AAACA--AA-AAGTCATA-ACGATTTGAAAT--AGATAA--TTGT-TCAAATAGTC
*
72613 A-AA-TAATTG---TT-TTAT-GT
157 ATAACTATTTGAACTTGTT-TGGT
* * * * * * *
72630 CAAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGCAATATTATTAGATTAGTATTA
1 --AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * *
72695 CTTTATTCTAAAGAAGCTTGTATCAACA-AAAATAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTATAA
63 TTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * **
72759 CAATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGT
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
*
72813 AAAC--ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAGA-TAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * *
72875 TTA-TTGCAAATAAGCTTGAATGTTCA-AAAACAATTGTTATATGACCAAAC-AAAGGTAATAAT
65 TTATTTG--AATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * * *
72937 GATTTCAAATTGATAACTGTTGATAAT-GTCATAATTATTTGAAC-TGATTCGAT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
* * * ** * *
72990 AAACAAATTCA-CTTTTAAATCACTTACTTTTTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
73054 TTATTTCAAATAAACTTGTATGAAC-TAAAACATTGGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAACA
65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * ** * ** ** *
73117 ATTCGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAATTATTTGAACTACTTCAGC
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
73169 AAACAGATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
*** * * * * * *** * * * * *
73234 TTACTCCAAATAAGCTTATATG-ACTTGAAACAATTATTTTATAATGGAATAAAAGGTTAAAACA
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * *
73298 ATTTG--AT--ATAA---AT-AACTATTCA-AA-TA--AGAACTAGTTCGAT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * **
73338 AAGCAAATTTATTTTTTAGATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * *
73403 TTACTTTGAATAAGCTTGTATG-A-TGAAAAGCAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAAC
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA--AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * ***
73466 -ATTTTAAAATACG-TAATTGCTCAAAT-GGCATAATTATTTGAAC-CGATTCAAT
127 GA-TTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
** * * * * **
73518 AAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAAAATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * **
73583 TTATTTTCG-ATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAAGCTCATATT
65 TTA-TTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAAC
* * * * * *
73646 TATTTTAAATAGATCAATAT-TT-AGATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGAT
127 GATTTGAAATAGAT-AAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** ** *** * ** * *
73699 AAACATAATTATTTTAAAAAAAATTTGGTTTATTAATTTTATGAACGTTAATAAATTATTATTAC
1 AAACAGATTTATTTT-TTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * * * * * *
73764 TTTATTTCAAGTAAGCATGTATGAACTA-AAACTATTATTTCATGACTAATCAAAAGGTTAGAGC
64 TTTATTTGAA-TAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * * ****
73828 AATTTGAAATAGATAATTTTTCTAGTAGTCTTAACTA-TTGAACTGGTTCAAC
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * *** *
73880 AAATAGATTTATTTTTTAAATATCAAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAATTTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
73945 CTATTTCAAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * * * *
74010 TTTGAAATA-AAAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTGGCTCT-AT
129 TTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
* * * *
74061 AAAAAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGAATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * *
74126 TTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAGAAGGTCATAACGA
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * ****
74191 TTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAAA
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGT
* * * *
74242 AAATAGATTTATTTTTTAAA-ATTTTACTTATT-ATTGTTAAAATATTAATAAATTTA-AATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * * * * *
74304 TTTATTTGAAATAAACTTGCAT--CCATAAAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATAA
64 TTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAAA--AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * * * * **
74367 TGTTTTGAAATATATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCAGT
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * * *
74421 GAATAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATGTTAT
1 AAACAGATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * *
74485 TTTACTTCAAATAAGCTTATATGAAC-GAAAATACTTATTTTAATTACAAAAGAAAAGGGTCATA
64 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTT-ATGACAAAACAAAA-AGTCATA
* * * * * * *
74549 ATGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGTTCGAT
125 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * ** *
74604 AAACATATGTATTTTTTAAATCTTTCACTTTTTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * *
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65 TT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * *
74734 GTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAA-TAATATGAATTTGTTTGGT
129 TTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTGGT
* * *
74785 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATCTTAATAAATTTGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * * * * *
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64 TTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * ***
74914 ATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTATTCAAT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * *
74966 AAATAGAATCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTAGATTATTAATAAATTAGTTTTAG
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * *
75030 TTTATTTCGAATAAGCTTATTTGAATTGAAACAATTCTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAAC
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAAC
* * * * * * * **
75094 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGATCTAGTTCAGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * *
75147 CAACATATTTATGTTTTAAATTTTTTACTTATTAATCGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-TTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * ** * * *
75212 TTCATCAG-ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAGTCATAATGA
65 TT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * *
75276 TTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTAGATTGGT
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * **
75326 AAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAACTTTTAAAATATTAAT-GATTAGTTTTACC
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * * * * * *
75386 TTATTCCGAACAAATTTATATCAACA-AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATG
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * *
75450 ATTTGAAATAGATATTTGTTAAAATAGTCATAATTGTTT-AAATTGGTTATAG-
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT-TGGT
* * ** * * *
75502 AAATAGAATTATTTTTTAAATCACTTACATATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTTGT-TTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
*** * * *
75566 TTATCCCAAATAAGCTAGTATGAATTCA-AAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
65 TTAT-TTGAATAAGCTTGTATGAA--CAGAAAAAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * * * * * *
75630 TGATTTAAAATAGATAATTGTTCATACAATCTTAAATATTTAAACTAGTTCGGT
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * *
75684 AAACA-A---A---TTT--A----TT--TT-TTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
75733 TTTTTTGAATAAGCTTGTATCAACA-AAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGA
65 TTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * * * * **
75797 TTTGAAGTTTG-CAATTGATCACATAGCCATAACTATTT-AA-TTAGTTCAGT
129 TTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
* *
75847 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * *
75912 TTATTTTGAATAAGCTTGAATGTTCA-AAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACA
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * ** *
75976 ATTTGACATAGATAATTGTTGACAA-GGTCATAATTATTTGAACTAATTCGGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * ** * *
76028 AAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
76093 TTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACTGAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGA
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * * * * *
76158 TTTGAAATAGATAATTGTTCATATGGTCTTAATTGTTTTTGAAGCTAGCTTTGGC
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA--CTATTTGAA-CTTG-TTTGGT
* * **
76213 AAAGCAAAATTTAATTTTTCAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTTTGATA-T-ATAAATTAGTAT
1 AAA-C-AGATTT-ATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * * *
76275 TATTTTATTTGGAATAAGCTATATATCAACTG-AACAATAT-TTTTATAATAGAACAAAAGGTTA
61 TATTTTATTT-GAATAAGCT-TGTATGAACAGAAAAAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCA
* * * * *
76338 TAATGGTTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAG---GAACTA---G-A-----TCGGT
123 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* *
76383 TAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * *
76444 TTATTCTGAAT-AGACTTGTATG-ATGGAAAGCAATTCTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAA
65 TTATT-TGAATAAG-CTTGTATGAACAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAA
* * * * *
76506 TGATTTGAAATACATAATTGCTT-AAAT-GGCTATAATTATTTGAA-TTGATTTGAT
126 CGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
** * * * * * *
76560 AAATTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTACTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * ***
76625 ATATTTCAAATAAGCTTTTATGAACCA-AAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAAGGTCATATTT
65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * *
76687 ATTTTAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGAT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * **
76739 AAATAGAATTATTTTTTTAAAT-TTCTTGTTTATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAG-AGTT
1 AAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTA-TT
* * * * * * * *
76802 ATTTTATTTCGAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTATCTCATGACTAAACAAAAAGTCAAAA
62 ATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
** * * * * ****
76867 TAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TGAACTATTTGAACTGGCTCAAC
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * * * *
76921 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATGTTTAGAATATTATTAATTTAGGAATATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
76986 TTACTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TTATAATG
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * **
77050 ATTT-AAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGCTTCAT
128 ATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
* *
77102 AAACAGATTTATTTTGTAAA---TAT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * *
77163 TTATTTTGAATAATG-TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAAT
65 TTA-TTTGAATAA-GCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAAC
* *
77226 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TGTGTTTAG-
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGT
* * * * *
77278 AAACCATATTTATTTTTTGAAT-TTTTATTTATTCATTTTTGAAATATTAGTAAATTTA-TATTA
1 AAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTA
** * ** * * * *
77341 TTTTATTCAAAAATGAGCTTCCATGAACA-AAACCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGTTAT
63 TTTTATT--TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-GTCAT
* * * * * * *
77405 AATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTATATAATCATAGCTATTTGAA-TATGTTCT-AT
124 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT-TGGT
* * * * * *
77461 TAACATATTCATTTTTTAACTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * * * * * * *
77526 TTATTTCAAATAAGTTTATATGACCTGAAACAATTATTTTATTATAAAATAGAAACTCATAATGT
65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * *
77591 TTTGAAATAAATAATTAGCT-AAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTTGGT
129 TTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** *
77642 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTATACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
77707 TTAATCTAAACAAGCTTGGATGGACA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATAGTCATAACA
65 TT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * *
77771 ATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTTGGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
77823 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATTGTCTT-AACATTACTAAATTTGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * **
77887 TTTAATTGAACTAAGCTTGTATGAACAGAAAAGGATCATTTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAGT
64 TTTATTTGAA-TAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * *
77952 GATTTCAAATCGATAATTGTTTAAATAAG-CATAATTATTTAAACTTGTTTGGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
78005 AAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAAATTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
78070 TTATTTTGAATAAGCTTAG-ATGAACTGAAATAACTT-CTTTATAACAAAACTAAAGGTTATAAC
65 TTA-TTTGAATAAGCTT-GTATGAACAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * * *
78133 GA--TAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTGTTTCATCTAGTTTGGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * *
78184 AAATATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAACTATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAA-TATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
78249 TTAATCTAAATATGCTTGTATGAACA-AAAACTATTGTTTTATAATAAAATAAAAAGTCATAACA
65 TT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * *
78313 ATTTGAAATAAATAATTGCTCAAGTAGTCATAACTTTTTGAACTAGTTTGAT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
78365 AAATAGGTTTATTTTTTATATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ****
78426 TTATTTTGAACAAAC-TGATATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAACCAAATAAC
65 TTA-TTTGAATAAGCTTG-TATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* *** * * * * *
78489 AATCCAAAATAGATAATTGTTCAAAGAGTTATAATTATTT-AAATTGGTTAGGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
* * * ** * *
78542 AAGCACAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TATTGT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-AGTATTAT
* ** * * *
78606 TTTATTCT-AATTAAGCTAT-TGTGAATTGAAAAAATAGCTTTATAACAAAAC-AAAA--C-T-A
64 TTTATT-TGAA-TAAGCT-TGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* ** * * *
78664 C---TTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTTGAA-TTGGTTAGGC
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
* * ** * * *
78715 AAACAAATTTA-TTTTTAATTCTCCTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
78779 TTATTCTGAATAACCTTGTGTGATA-A-AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* ** * * * *
78842 GATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGC
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
78895 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTGCAAGATTAATAAATTAGTGTTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * **
78959 TTTATTCAT-TATAAACTTATATGATC-----AAA------TATGACCAAACAAAAGGTTATAGT
64 TTTATT--TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* ** * * * * ** **
79012 GATTTAAAATAGATAATTACTGAAAT-GATGAGAATTATTTGAACTAATTCAGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * *
79065 AAACA-AGTTCACTTTTGAAAT-TATTTAC---TT-A---TT--A-ATTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAGA-TTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * **
79118 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATT
64 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * ** * * *
79183 ATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTTGTAACTCTTTGAATTTGTTTAGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
79235 AAACAAATTTATTTTTTTTAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTAA
1 AAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
79299 TTTATTTAGGATAAGCTTTTATGAACTGATACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAAGTCATAATG
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * *
79364 ATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* ** * * * *
79416 AAACTGATTTATTTTTTCAAGCCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTGGATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
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64 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * ** ****
79544 CGATTGGAAAATAGATAATTATTCTATTAGTTTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAAC
126 CGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
* * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTA-
* * * ** * * * * *
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* * * * *
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
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** * * *
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* **
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** * * ** * * * * *
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63 TTTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * **
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127 GATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** * * * * * * *
80125 AAATAGA-TTGTTTTAAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAGTAAATATTAAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
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65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCA-TAAC
* * * * * * ** *
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127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * ** * * * * *
80366 TTATTTTAAATAAAATAGTTTGAACATAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAACAA
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* * * * *
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* * * ** * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * **
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* * * * * ***
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTAT-TAT
* * * * * * *
80722 TCTATTTCGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAAGAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAACA
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * ** * *
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* * * * * *
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1 AAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
80904 TTTATTTCGAACAAGCTTATGTGAATA-AAAACACTGTAACAATTTGAAAT-A-AATAATTTTTC
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGT-----TTT---ATGACAA-AA-----C
* * * * * * * *
80966 AAATAGTCATAACTATTTGAACT--AT-TTTAG-T-AAATAG--ATTTATTTTTTAAATCTCT-T
114 AAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAA-CT-TGT
*
81023 AT--T
175 TTGGT
* * ** * * * * * * * *
81026 AATTCTTGAAATGTTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTATGT--ATGTTGAAAAAC
1 AA-AC---AGAT-TTATT-TTTTA--AATCTTTTACTT--ATTAA-TTTTTAAATATT--AATA-
* *** **** * *** *** * * *
81089 AATT-GTTTTATGACAAAACAA-AAGGTAAAAATGATTTGATATAGATAGTTGTT-T-A-AATAA
52 AATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCT-TGTATGAACAGA-AAAAATTGTT-TTATGACAA-AA
* * * * ** * * * *
81149 CCATAA-TTATTTGAACTGATTCAATAAACATATTTTATT-TCTTAACT-CTCTTATTAAC--TT
113 CAAAAAGTCA--T-AAC-GATT---TGAA-ATAGATAATTGT-TCAAATAGTC--A-TAACTATT
* ** * **
81209 TCAAAAT-ATTAAT
166 TGAACTTGTTTGGT
* * * * * ** ** *
81222 AAAGGAGTATTTTTTTTTTTTGGAAAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACA
1 AAA-CAG-A--TTTATTTTTT---AAATC-TTT-T--ACT-TATTAATTTTTAAAT-A-TTAATA
** ** * * *
81287 AATGTCA-TAACGATTTTA--AAAATATAAC-TGT-TCAA-ATAATCATAACTATTTGAACTTGT
52 AAT-T-AGT-ATTATTTTATTTGAATA-AGCTTGTATGAACAGAA--A-AA--A-TTG---TT-T
** ** ** * * * **
81346 T-TG-GTAAACAAATTTTATTTTTTCAA--ATCTCT-TACTA-ACTAATTTTTTGAAT-GT--TA
103 TATGACAAAACAAA----AAGTCAT-AACGAT-T-TGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * **
81402 ACAAATT-AATATTATTTTATT
160 ACTATTTGAA-CTT-GTTTGGT
* **** * ** * **** *
81423 CCGAATA-AGCATGTATGAGCTAAAACAATTA-TTATATGACTAAACCAAAGGTCATAACAATTT
1 ---AA-ACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT-T-AAT-TTTTAAA--T-AT--TAA--T
* * * ** * ***
81486 GAAA-TAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-CTCTTTAAACTAGTTTAGAAAACACATT-TATTT
51 -AAATTAG-T-ATTATTTTATTTG-AATAAGCT-TGT--A-T-GAACAGAAAA-A-ATTGT-TTT
* * ** ** * ** ** * * * * *
81548 TTTA-AATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTTTTATTTTTATCCAAATAAG-CT
104 ATGACAA-AAC--AAAAAGTCATA-ACGATT-TGAAA-TAG--ATAATTGT-T-CAAAT-AGTCA
* *** * *
81611 TGTA-TGATCAAAACAATGGTTTTATGAT
158 T-AACT-ATTTGAAC--T--TGTT-TGGT
* * * * * ** * * ** * ***
81639 AAAACAAAAATCATAATGATTTGAGAT-TGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTGAATTGGT
1 -AAAC--AGAT--TTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATT--AAT--TTTTAAATATT-AA-TAAA
* * * ** * ** * *
81703 TTAGAAATAGTTTTATTTTTTAA-ATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTGGTAAAGTAGTA
54 TTAGTATTA-TTTTA--TTTGAATA-AGCTTG--TATGAA---CAG-AA-A-----AAA-TTGTT
*** ***** * ** * * ** * ** * *
81767 TTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTAAAATA-ATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
102 TTATGACA-AAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C---A-AATA-GTCA
* * * * *
81831 TAACAATTTTAAATAGATAATTGTT
158 TAACTATTTGAACTTG-T--TTGGT
* * * * * * * ** *
81856 CAAATAG-TTAAATCTATTTGAAT-TTATT-C-TATAAATAGATTT--ATTTTTTTAAATCGCTT
1 -AAACAGATT-TAT-TTTTTAAATCTT-TTACTTATTAAT--TTTTAAATATTAATAAAT---TA
* * * * * * * * *
81915 GCTCATTAATTT-TTCGAAT--G-TT-AATAAATTAGTAATAATT-TATTCT-A-AATAAGCTTA
57 G-T-ATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAAAAATTGTTTTATGACAA-AA-C--A
* * * ** *** * * * * *
81972 TATGAGGTGA-AATAATTGTTTTATAGCTAA-AG---AAA-AGGTCA-AAATGATTTGAAATAGA
115 -A-AAAGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACT-ATTTGAACTTG-
**
82030 TAATTATT
174 T--TTGGT
* * * * * *
82038 CTAATAG-TCTTAACTGTTTGAA-CTAGTTCAGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTCTTAA
1 -AAACAGAT-TT-ATTTTTTAAATCT--TT-------TAC--TTA----TT-AAT-T-TT-TAAA
* * * * * ** * * ** *
82101 TATTTGGAATACTATTA-AATGAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCT-TGTATTA-AAAAACAAT
44 TA-TT--AATA-AATTAGTATTA-TTTTATTTGAATAAG-CT-TG-TATG-AACAGAAAAA-ATT
* * **
82163 -TGTTT-TAAGATAAA-TTAAAGATCATAACGATTT-AAGATAGATAA----T-AAATAGTCATA
99 GT-TTTATGACA-AAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
*
82219 AGTATTTGAACTAT-TTTGGT
160 ACTATTTGAACT-TGTTTGGT
* * * ** * *
82239 AAACAAATTTAGTTTTGAAATC---T-CTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * *
82300 TT-TTTGAATAATTTTGCATGAGCA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGA
65 TTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * * * * *
82363 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGATTATATGAACTTGTTTAGT
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* ** * * *
82414 AAACAGATTTATTTTTTTAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATC
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
82479 TTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAACTATTTTATGACAAGAAAAAAAAGATCAAAAC
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAAG-TCATAAC
* * * * * * * *
82544 TATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAGCTATTTGAACTTGCTCGGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
82597 AAACAAATTTATTTTTTAAGTCTTTTACTTTTTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * **
82662 TTATTTCAA-ATA-CTTGTATGAAC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTC
65 TTATTTGAATA-AGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * * * *
82724 TTTCAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTAGA
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
82775 AAACATATTTATTTTTTAAAT-TATTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTGT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * * * * * *
82838 TTTATTTGGAATAAGCTTGCATGAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAATAAAATGTCATAATG
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * ***
82903 ATTTAAAATATAAAATTGCTCAAATAGTCATAACTATCTGAACTTGGTCATT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
82955 AAATAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * ** * *
83019 TTATTTCGAATAAACCTATATGAACTGATATAATTGCTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACAA
65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * * *
83084 TTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-TATTCGGT
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * ** ** * * * * * *
83133 AAACATATTTATTTTTAAAATAATAGA-TTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTATTTGGT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT--AAT--TTTTAAATA-TT-AA-TAAATTAGT
** * * * * * * *
83197 AAACATATTTATTTTTAA-AATCTTTTACTTATTAATTGTCGACATATTAATAAATTAATATTAT
59 -ATTAT-TTTA-TTTGAATAA------GCTT-GT-A-TG--AACAGA--AA-AAATT-GTTTTAT
*** ** ** * * * ** * * * *
83261 TTTAATCCAAATAAG-C-TTGC-A--TGAATAAAAACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAAAT
106 GACAAAACAAA-AAGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC---TATT
**
83319 TGTAAC-AATTT-G-
166 TG-AACTTGTTTGGT
* * * * * * * * ** * *
83331 AAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTAAACTTATTT-GGTA--AACAAATTTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAAT-CT-TTTACTTA-TT-AA-TT-TTTAAATATTAATAAA-TTA-G
* * * * * * * ***
83391 TTTTAAATCTTTACTT-ATTAA--TTGTTTGAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTAATTAA-AA
58 TATT--AT-TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACA-GAA-AAAATTGTTTTATGACAA--AACAA
* * * * * * * * * * * * * *
83452 TAAG-CTTGTATGAATAGAAAGAAATTATTTTATGACAACAAAATA-TTATAGCGATTTGAAATA
116 AAAGTCAT-AACGATTTGAAATAGATAATTGT-T-----C-AAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* **
83515 GGTAATTATT
172 TGT--TTGGT
* * * * * * * ** ** *
83525 CAAATAG-TCATAACTATTT-AAGCTTGTT-C-GATAAACAGATTTAGTTTTTAA-AATATCT--
1 -AAACAGAT--TTATTTTTTAAATCTT-TTACTTAT-TA-ATTTTTAAATATTAATAA-AT-TAG
* * ** * * * * *
83583 TATTA-ATT-TTTGAA-ATA--TT-AAT-AA-A-TTAAAATTATGTTAT-TCCAAA-T--AAG-C
58 TATTATTTTATTTGAATA-AGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTC
* * * * * * * *** *
83634 TTGTACGAATAGAAACA-ACT-A---TTCAAATAGTCATAACTATTTGCACTGGTCAAGC
122 AT-AACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * ** * * * *
83689 CAATAAATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTCATAATATTAAAAAATTAGCATTACT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * **
83754 TTATTCTGAATAAGAC-TGTATCAATA-AAAACAATTGTTTAATGACAAAA-AAATGGTCATAAC
65 TTATT-TGAATAAG-CTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * *
83816 GATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATTGTTATAACTAGTTGAA-TTGGTTTAGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
** *
83869 AAGTAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * * *
83930 TTGTTCCAAACAAACTTATATGAA-A-AAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * * *
83993 ATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGC
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * ** *
84045 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATT-ATTTTTCATAATATTCTTATATTAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-A-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
84109 ATTATTCCGAATAAGCTTGTATAAACATAAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAATG
64 TTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * * * * *
84173 ATTTGAAATATATAATTTTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTTGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
84225 AAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTCACTCATTAATTTTTGGAATATTAA-AAATTAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * *
84288 TTTATTCCAAATAGGCTTATACG-A-TGAACAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTTCATA
64 TTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAA-AA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATA
* * * * * ** * *
84350 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAACTAATTCGAT
125 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * * * **
84405 AAACTGATTTTATTTTTTAAATCTCTAACTTCTCAACTTTTGAAATATTAATAGCCCTTAG--TT
1 AAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATA--AATTAGTATT
** ** * * * *** * * * * * ** *
84468 A-GGTA----AA-AAG-AAGAATG-TC---TACCTTTATTCTATGAGGTAAAGCTAGGAG-CACA
62 ATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGA--CAAAACAAAAAGTCATA
* ** * * * * *
84521 A-GAGTCTTCTCAGCTAGCCTATATAGTTGTGC--CTTG-CTTAGCACCTTTCCTTCG--CTTGC
125 ACGA---TT-TGAAATAG---ATA-A-TTGTTCAAATAGTCATA--A-CTAT--TT-GAACTTG-
*
84580 TTCCTTGCAT
174 -T--TTG-GT
** * * ** **** * * * ** **** * * * *
84590 GGATAGCTACCAAGCCTAAAATCTGTT-CATGCTAA-GACCAGGAAGGA-CACA-AAAGTAATAT
1 AAACAGAT-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA--AA-TATTA-ATAAATTAGTAT
* * * * * * * *
84651 TATTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATTATAAAACATAAGGTCAT
61 TATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACA-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT
* * * * *
84715 AATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATTTATTTGGT
124 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
** * * *
84771 AAACA-A--T-TTTTTTGCAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTA
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATA-AATTAGTATTA
* ** * * * * **
84830 TTTTAATTTCGAATAAGCATGTATGAAGTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGGA
63 TTTT-ATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * * *
84895 TGATTTGAAATAGAAAATTGCTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGC
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * ** * *
84949 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGCATATTATTAGTTTAGCAATATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
** ** * * * *
85013 TTACTCCGAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGA
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * ***
85077 TTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTCCAGT
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* *
85128 AAACAGATTTAGTCTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * *
85189 TTCTTCTGAATAATTTTGTATAAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAGG
65 TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* * ***
85253 ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTTGGT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
** * * *
85305 AAATGGATTTA-TTTTGAAGTCTTTTACTTATTAATTTTTAGAACATTAATAAATTTA-TATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * * * * * * *
85368 TTT-TTTAAATAAGCTTGCATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATGT
64 TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * *
85431 TTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGT
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * *
85482 AAACATATTCT-TTATTT-AA--TTAT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAGATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * * * * *
85542 TTTACATCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTACT-AC-AAA-AAAAGGTTAGAAT
64 TTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAAGTCATAAC
** ** ** ***
85604 GATTTGAAATAGATAATTACTGGAATAGTCATGGCTATTTGAACTTGTTCAAT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* *** *
85657 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGCCAAAATATTAATCAATT-GATATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAG-TATTAT
* ** ** * * *
85721 TTTA-ATGCAATTGTGCTTGTATGAACA-AAACTATTTTTTTAT-AGTAGAACAAAAAGTCATAA
64 TTTATTTG-AA-TAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * *
85783 CGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATTACTATTAGAACTTGCTTGAT
126 CGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
85837 ACAA-AGATTTGTCTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTTT
1 A-AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTA--TT
* * * * * * * *
85897 TTTTTGTTTCAAACAAACTTATATGAACA-AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA
62 ATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * *
85961 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGT
125 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGT
* * * * ** *
86016 AAATAGA-ATAGTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGTTTCA-TTTTA
1 AAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-AGTATTA
** * ** * * *
86079 TTTTATTCCT-AATAAGCGAGTATTAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAA
63 TTTTATT--TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* ***
86143 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTAGTCCAGTCCAGT
126 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--T---GTTTGGT
** * * *
86202 AAATGGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTA-T
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * ** * *
86262 TTATTTCAAATAATTTTGTATAAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATTGTCACAATG
65 TTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
* *** * *
86326 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGAT
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* *
86378 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAAAATTAATAAATTTA-TATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * * * * * * * * *
86442 TTTATTCGAATAAGCTTGCATGAAGAG-AACACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATGT
64 TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * *
86506 TTTGAAATAAAATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAA-GTGATTTGGT
129 TTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGT
* * * * *
86558 AAACAAATTTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * *
86623 TTACATCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTACT-ACCAAAA-AAAAAGGTCAGAA
65 TTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTA-TGA-CAAAACAAAAA-GTCATAA
* * * * ***
86686 TGATTTGAAATAGATAATTACTT-AAATAGTCATGACTATTTGAACCTGTTCAAT
126 CGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* ** *
86740 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * ** ** * *** *
86805 TAAATCCGATTATGCTTGTATGAACA-AAACTATAATTTTATAATGGAACAAAAAGTCATAATGA
65 T-TATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * * * *
86869 TTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAATCATTACTATTAGAACTTGTTTGAT
129 TTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
86920 AAATAG----A---TTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTTTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTA-TTAT
* * * * * * *
86974 TTTATTTCAAACAAACTTATATGAGCA-AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
64 TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * *
87038 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AAATAATTTAAACTGGTTAGGT
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTGGT
* * * *
87091 AAATAGAATTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTCA-TTTTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-AGTATTAT
* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGT-ATTAT
* * * * * * ** *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT
* * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * ** * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * * * **
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* * * * ** * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * ** * * ** * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT---A-A--AT-A---TT--AATA--
* * * ** * * *
88590 AATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAGA
52 AAT----TAGTATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
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* *
88719 CGGC
176 TGGT
* * * *
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* * * * * * *
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* * ** * **
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*
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Statistics
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* * *** * *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * * * *
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* **
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** ** ** * *
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* ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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128 ACAATTATT-CAATAG-TCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGAATT-ATTTTCTAAATC
* * * * ** * ** *
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** * * * * * *
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* * *** ***
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* * ** * *
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* * ** * * ** * * ** * *
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* * * * *
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** ** * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * **** *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * ** ** * *
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* * * * * * *
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** * * * *
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192 A-TACTAATAAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAATTATTCTATTACAAATAAACTTCTAT-A
** * * * * ** * * * * **
66559 TCA-AAAACAATTTTTTTATAACAAAACAAAACATTATAATGATTTGAAGTAGATAATCATTCAA
255 AGAGAAAA-AATTGTTATATGACAAGACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * ** * * *
66623 ATGGCCAT-AATTATTTTAACTGATTTAGTAAATAGATTT-GT
319 A-GG--ATAAACTATTTGAACAGGTTTAACAAACAAATTTATT
* * *** * * *
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1 TTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTTCGAAC-
* * * ** * * * * * *
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64 AAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTCATGAAAAAAT-AAAAAGTAATAACAATTTGAAATAG
* * * * * * *
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* * * * * ** * *
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** * * * * * ** * *
66916 ATGAATTGAAATAGTTGTTTTATGACTAAG-CAAAAGGTTAGAACGATTTGCAATAAATAATTAT
252 AT-AAGAGAAAAAATTGTTATATGAC-AAGACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGT
** * * * * * * *
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315 T-CAA-AGGATAAACTATTTGAACAGGTTTAACAAACAAATTTATT
* * * * * *
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** ** * * * * *
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65 AACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTC-ATGAAAAAATAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * *** * * * *
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* * * * * * * * ** * *** * **
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* * * * ** * * *
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* * ** ** * *
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* * * *
67369 TTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCGAACAA
1 TTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTTCGAACAA
* * * * ** *
67434 AATTATATTAACAAAAACAATTGTTTTAT-AACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGAT
66 ACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTCATGAA-AAAATAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGAC
* * * * * * *
67498 AATTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTT-TAGCAAATAGAATTATTTTCTAAA-CTCT
130 AATTATTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGA-TAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCA
* *** * * * * * *
67561 TACCT-ATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTCCGAATAAGCTTTTATGAG
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** * * * * * ** *
67625 CTAAAATATTTATTTTATAACAA-AGCAAAAGGTTATAAAAATTTAAAATAAATAATTGTTCATA
257 AGAAAA-AATTGTTATATGACAAGA-CAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCA-A
** * * * ** * **** ***
67689 TAGTTTTAATTCTTTGAATTGATTCGGTAAATGGATTTATT
319 -AGGATAAACTATTTGAACAGGTTTAACAAACAAATTTATT
* * * *
67730 TTTTAAATCTCTTAGTT-ATTAGTTTT-TAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
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* * * * * * * * ** *
67793 AAGCTTGTATG-ACTAGACACAATTATTTTATGATAGAA-AAAAAGCTTGTAATAATTTGAAATA
64 AAACTTATATGAAC-AAAAACAATTGTTTCATGAAAAAATAAAAAG-TAATAACAATTTGAAATA
* * * * * * *
67856 GATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAAAAAATA-AATTTATTTTTTAAATC
127 GACAATTATTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGAA-TTATTTTCTAAATC
* * * ** * * * *
67920 TC-T--T-ATTAATTCTTGAAAAATTAATAAATTAGTATT-TTTTATTTCAAATAAGCTTTTATA
190 TCATACTAATAAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAATTATTCTATTACAAATAAACTTCTATA
* * * * * *
67980 TTGA-AAAACAATTGTTTTATGA-AAAACCAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGAAAATTGGTC
255 -AGAGAAAA-AATTGTTATATGACAAGA-CAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTC
* ** * * ** * *** *
68043 AAATGGCCAT-AATTATTAAAACTGATTCGATAAATTGATTAATT
317 AAA-GG--ATAAACTATTTGAACAGGTTTAACAAACAAATTTATT
* * * * * * * * *
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* * * * * * ** **
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192 ATAC-TAATAAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAATTATTCTATTAC-AAATAAACTTCTATA
* * * * * * *
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** * ** *
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* * * * *
68504 AAGCTTTTATGCACAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAA
64 AAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTCATGAAAAAA
68542 CAAAGATCAT
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ATTATTCAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCATAC
TAATAAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAATTATTCTATTACAAATAAACTTCTATAAGAGAA
AAAATTGTTATATGACAAGACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAGGATAA
ACTATTTGAACAGGTTTAACAAACAAATTTATT
Found at i:65713 original size:169 final size:168
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65425 AATAGATTTA
*
65435 TTTTTAAAATCTCTTACCTAATAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAATTATTTTATTATGAAT
1 TTTTTAAAATCTCTTACCTAATAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAACTATTTTATTATGAAT
* * *
65500 AAACTTGTATTAAAAAACAATTGTTATATGACCGAATAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATA
66 AAACTTGTATAAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATA
* *
65565 ATTGTTGAAATGGATAAAATTATTTGAACTAATTAATT
131 ATTGTTAAAATGGATAAAATTATTTAAACTAATTAATT
* * * *
65603 TTTTTAAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGGTTAATAAATTAAAACTATTTTATTTTGAA
1 TTTTT-AAAATCTCTTACCTAATAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAACTATTTTATTATGAA
65668 TAAACTTGTATAAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGAT
65 TAAACTTGTATAAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGAT
65733 AATTGTTAAAATGGATAAAATTATTTAAACTAATT
130 AATTGTTAAAATGGATAAAATTATTTAAACTAATT
65768 CAATAAACAG
Statistics
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TTTTTAAAATCTCTTACCTAATAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAAAACTATTTTATTATGAAT
AAACTTGTATAAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATA
ATTGTTAAAATGGATAAAATTATTTAAACTAATTAATT
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66344 CAAAATACTA
* * *
66354 TTAAATTAGTATTATTTTTAATCAAATAAGCTTCTATGATCAGAAACAACTATTTTATGACAAAA
1 TTAAATTAGCATTATTTTTAATCAAATAAGCTTCTATGATCAAAAACAACTATTTTATAACAAAA
* * * * ** *
66419 TAAAGATTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACATTTAAACTAATTTGAT
66 AAAACATTATAATGATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAGCCATAACATTTAAACTAATTTGAT
*
66484 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAAT
131 AAACAAATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAAT
* * * *
66520 TTAAATTAGCATTA-TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTTTTTTATAACAAA
1 TTAAATTAGCATTATTTTTA-ATCAAATAAGCTTCTATGATCAAAAACAACTATTTTATAACAAA
* * * *
66584 ACAAAACATTATAATGATTTGA-AGTAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATT
65 A-AAAACATTATAATGATTTGAGA-TAGATAATCATTCAAATAGCCATAA-CATTTAAACTAATT
* * * *
66648 T-AGTAAATAGATTT-GTTTTTAAATTTTTTACTTATTAAT
127 TGA-TAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAAT
66687 TTA
1 TTA
66690 GGAAATATTA
Statistics
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TTAAATTAGCATTATTTTTAATCAAATAAGCTTCTATGATCAAAAACAACTATTTTATAACAAAA
AAAACATTATAATGATTTGAGATAGATAATCATTCAAATAGCCATAACATTTAAACTAATTTGAT
AAACAAATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAAT
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67480 TAATGATTTG
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Statistics
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AAATAGTATAATTATTC
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Indices: 67304--80936 Score: 5664
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67294 TTCAATAATG
* ** *
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1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTG-AATTAT-TCGATAAATAGATTTA
* * ** *
67367 CTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCGAAC
63 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAAT
** * * * * * *
67432 AAAATTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGA
125 AAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * ** * * * *
67497 TAATTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAA-TTGGTTTAGCAAATAGAATTATTTTCTAAA-CTC
190 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
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254 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATATGA
* * * * * * * **
67624 GCT-AAAATATTTATTTTATAACAAAGCAAAAGGTTATAAAA
318 -ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * ** * * * *
67665 ATTTAAAATAAATAATTGTTCATATAGTTTTAATTCTTTGAATTGATTCGGTAAATGGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-ATTCGATAAATAGATTTA-T
* * * * *
67730 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAGTTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAA
* * * * *
67795 GCTTGTATG-AC-TAGACACAATTATTTTATGATAGAAA-AAAAGCTTGTAATAATTTGAAATAG
127 GCTTGTATGAACATA-A-ACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * *** * *
67857 ATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAAAAAATAAATTTATTTTTTAAA--TC
189 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* *
67920 -T-CTTATTAATTCTTGAAAA-ATTAATAAATTAGTATT-TTTTA-TTTCAAATAAGCTTTTAT-
254 TTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATATG
* * *
67979 ATTGAAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACCAAAAGGTAATAACG
317 AAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACT
* ** * * * ** * * *
68022 ATTTGAAATAGAAAATTGGTCAAATGGCCATAATTATTAAAACTGATTCGATAAATTGATTAATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTATT
* * * * **
68087 ATTTAAATATTTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT-TTTTATTTTGGATAA
65 -TTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAA
* * * * *
68151 GCTTTTATGAAC-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTTAAATAGAT
127 GCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * *
68215 AATT-GT--GATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAGACAGACTTATTTTTTCAAATCTCA
191 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCT
** * * * * ** *
68277 TACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCTAAATAGGCTGGTATAAA
255 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAA
* * * * * *
68341 CT-GAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCA-GACG
319 -TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * ** * * *
68380 ATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA-T
* * * * *
68445 TTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAG
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAAATAAG
* * * * * * * * *
68507 CTTTTATGCACAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATAT
128 CTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * **
68571 TTGTTCAAATTGTCATAACTATTGGAA-TTGGTTC-ATAAAATAGCTTTAGGTTTTAAATCTCTT
193 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGT-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
68634 GCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTGTTTTA-TTTCGAAGAAGTTTTTATGAAC
256 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATATGAA-
*
68698 T-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAA-T
319 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * *
68735 GACTTT-AAATATATAATTGTTTAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATAT
1 -A-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGAT-T
* * * ** *
68798 ATATTTTTAAGTCTCTT-GTGCATTAATTTTTCAAATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTGTG
61 -TATTTTTAAATCTCTTACT-TATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TA
* * * * ** * *
68862 AATAAACTTGTATAAAC-TGAAATAATTATTTTATGATTAAACAAAAGGTTAGAATCATTTTGAA
122 AATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAA
* * ** * * * * * * * * *
68926 ATACATAATTGTTTTAATAGTCTTAATTATCTAAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTGTTTAAA
185 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * * *
68991 TCTCTTATTTATT-ATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTT-TA
250 TCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATA
* * * * * *
69054 TGAA-AAGAAGCAATT-TTTTATGATAAAATAAATA--CCATAGCG
315 TGAATAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACT
* * * **
69096 ATTTGAGATAGATATTTA-TCTAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTTAGTAAATAGATATT-
1 ATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAACTATTTGAATTATTCGA-TAAATAGAT-TTA
* * ** * *
69159 TATTTTAAAT-T-TT--TTACTAACTTTTAAAATATCGATAGATTACTATTATTTTATTCTAAAT
63 T-TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT
** * * * * * *
69220 AATTTTGCATTAACAAAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAG
125 AAGCTTGTATGAACATAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * *
69285 ATAATTATTCAAATGGACATGATTATTAGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTATAAATCTC
189 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * ** * *
69350 CTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATATATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAACTTTTATGAA
254 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAA
* *
69415 TAAAAACAATTGTTTTCTAACAAAACAAAAGGTCATAACT
319 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * *
69455 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCCTAAGTATTTGTACTTGTTCGATAAATAGATTTATA
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTATTCGATAAATAGATTTAT-
* * *
69520 TTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAT
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAA
* * * * * * ** *
69585 GTTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATTATTTGACGTTGATA
127 GCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATA
* * ** * * * *
69650 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTTAG-AAAAAAATTTATTTTTCAAAT-TTTTA
192 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *** * *
69713 CTTATTAATTTTTAGAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAAAAAAGCTTGTATGAAT
257 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TTCAATAAGCTTATATGAAT
* * * * *
69777 AGAGACAATTATTTTA-GAAAAAACAAAAGGTCATAACA
320 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * *
69815 ATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTCATA
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTATT
** *
69880 TTTAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAA
65 TTTAAATCTCTTACTT-ATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAA
* * * ** * ** *
69944 GCCTATATGAA-TTGATAA-AATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAATAGA
127 GCTTGTATGAACAT-A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
70007 TAATTATTCTAATAGTTATGATTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTT
190 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * *
70072 TACTTATTAA-TTGTAGATATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATTCAAATAAGCTTGTATGA
255 TACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATATGA
* * * * *
70135 ATTAAAACAATTGTTTTTTTAACAAAACGAAAA-CTCGTAA-T
318 ATAAAAACAATTG-TTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACT
* * * * *
70176 GATTTGAAATA-AAAATTTGTTCAAATAGCCATTACTATTTGAATTTATTCGATAAACAGATTTA
1 -ATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA
* * * * *
70240 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTGAATTATTTTAATTGAAATA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATA
* * * * * *** *
70305 AGCTTTTATGAATAGAAA-AAATCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGT
126 AGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
* * *
70369 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCT
191 AATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * * *
70434 CACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTA-TTCCAAATAAGC-TAGTATGA
255 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTA-TATGA
* * * * *
70497 ACATAAA-AATTGTTTTGTGACAAGACAAATA--TCATAACG
318 ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACT
* * * * ** * *** *
70536 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTTATAACTATTTGTATTGGTCAAGCCTATAGATTCATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATTCGA-TAAATAGATTTA-T
* * * * * *
70601 TTTTAAATC-CACTATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATA
64 TTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATA
* * * * * * ** *
70665 AGAC-TGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAGATGGCCATAATGATTTGAAATAAA
126 AG-CTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
70729 TAATTATTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCT
190 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * *
70792 T--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTTTTTTATTTTGCACA-AA-CTTATATGA
255 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-CA-ATAAGCTTATATGA
* * * * * *
70853 ACAAAAATATTTTTTTTACGACAAAACAAAAAGTCATAA-T
318 ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * *
70893 GATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGGCTTAACTATTTTAATTGATTC-AGCAAACAAATTTA
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-ATTCGA-TAAATAGATTTA
* * * *
70957 TCTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAAGATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
63 T-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT
* * ** * * *
71022 AAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTAT-AGCAAAACAAAAGGTTATTACAATTTGATAGAT
125 AAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * *
71086 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATTTC
189 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
71151 CTACTTATTAA-TTTTAAAAAATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAGGCTTATATGAT
254 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAA
* * * *
71215 TAAAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGTTTATAACT
319 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * *
71255 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAATTAATTCGATAAATTGATTCACT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-ATTCGATAAATAGATTTA-T
** * * * * * * **
71320 TTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATATTATTTTGGATAA
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAA
* * * *
71385 GCTTTTATGATC-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGAT
127 GCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * *
71449 AATTATTCAAATAGTCATAACTGTTCGAACTTGTTCAGTAAACA-AGTTTATTTTTTAAAATTTT
191 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTT-AAATCTC
* ** * * * * *
71513 TTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTAT-AA
254 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAA
* * * * *
71577 -AACTGAAATAATTATTTTATGACTAAAC-AAAGGTCAGAACA
319 TAA---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * * *
71618 ATTTGACATAGATAATTATTCTAACAGTCTTAATTATTTGAACTGATTC-AGCAAACATATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGA-TAAATAGATTTA-
* * ** * * *
71682 TTTTTTAAATCT-TT--TT-TTAATTTTTAGAATATTATTACTTTAGCAATATTTTACTCTAAAT
63 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAAT
* * ** * * * *
71743 AAGCTTATATGAACA-AAGATAGATAATTGT-T--C---A-AATA-GTCATAACT-ATTTGAACT
125 AAGCTTGTATGAACATAA-ACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAAT
* * *** * ** * * * ** * *
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* * * * * * ** *** ** **** * *
71862 TTATTTT--AT-TCTAAATAATT-TTTTATGAATAAAAACAATTGTTTTACG-ACAAACAAAATG
241 TT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTAA-AATATTAA-TAAATTA-GTATTATTTTATTT
* * * * * * ** * *** * *
71922 TC-ACAA--TGATTTGAAATAGATAATAGCTTGAATGGATATGACTATTTAAACTTGTTCGATAA
301 TCAATAAGCTTATATG-AATA-AAAACA-ATTG--T-TTTATGACAAAACAAA--AGGTC-ATAA
*
71984 AT
357 CT
** * * * * * * *
71986 AGATTT-ATTTTTGA-AA-TCTCCAACT--T-TTAA-TTTTTAGAA-TATT-AATAAATTAG-TA
1 --ATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-GAATTATTCGATAAA-TAGAT-
* * * * * * ***
72041 TTA-TTTT--AT-T-TTA--AATAAACTTGTAT-GAATA-GAAAAAATT-GT-TT-TTTGACAAA
60 TTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT-T-TCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTA
* * * * * * * * * * * * * *
72094 ACAAAAGATCATGACAATTTAAAACAAATAATTATTTAAATAGTCATAAC--TA-TTTA-AACTC
122 A-ATAAG--CTTG--TA-TGAACATAAACAATTGTTT-TAT-GACAAAACAAAAGGTTATAA-TG
* * * * * * * * * * **
72155 ACTTCGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATT-TT-AATAAAT
178 A-TTTG-AAATAGA-TAATTATTCAAA-----TAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-
* * ** ** * *
72217 TAG---TATTATTTT--AT-T-TTGA-ATA-T-GCTTTTATGCATA-GAA-ACAATTGGT-TTAT
233 CAGATTTATT-TTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATA-AATTAGTATTAT
*** *** * * ** ** * * * ** * *
72269 GACA-AAACAA-AAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAGTTATTCA-GA-TAGTCATAA-CT-AT
294 TTTATTTTCAATAAGCTTAT-ATGAATAAAAACA-ATTGTT-TT-ATGACAAAACAAAAGGTCA-
72328 TTAAACTT
354 -T-AAC-T
* ** *** * * * *
72336 ATTCGGTAAATAGATTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTTGAAATATT-AATAAACTA-
1 ATT-TG-AAATAGA---TAATT-ATTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAATTATTCGATAAA-TAG
* * ** * **
72398 ATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTCAATTACAAAATAAAAGG
58 AT-TTA-TTT--TT-AAAT---C-TCT-T--ACT-TATTAA-T-TTTCAAATA-TTAAT-AAA--
* * *
72463 TCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AAGTCATTACTATTTGAACTTGTTCGTAAAC
104 T--T-A-GTA-TT---AT---T--TTATTTAAATAAG-C-TT-GTA--TGAA------CATAAAC
* * * * * **** * * * * *
72526 -ATATATATTTTTA-AATATTTTA-CTTATTAATTA-TTGAAACA-TTAATAAATT-AATATTA-
145 AAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA-TAATGATTTGAAATAGATAAT-TATTCAA-A-TAG
** * ** * * * * * *
72584 TTTTAATCCAAAT-AACCTTGTAT-GAATAGAA-ATAATTGTTTTATGTCAAAACAAAT-TTATT
205 TCATAA-CTATTTGAA-CTTGT-TCG-GTA-AACAGATTTATTTT-T-T-AAATC---TCTTACT
* ** * * *
72645 TTTTAATTCTCTT-AGTTATTAATTTTTGCAATATTATTAGATTAGTATTACTTTATTCTAAAGA
259 TATTAATT-T-TTAAAATATTAA----T--AA-ATTAGT--ATTA-TTTTA--TT-TTC--AATA
* * * * * * * * *
72709 AGCTTGTATCAACAAAAATAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTATAACA
307 AGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * *
72761 ATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC-AGT-AA-ACATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTA-TTCGA-TAAATAGATTTA-
* * * *
72823 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAGA-TAATAAATTAGTATTATTTTATTGCAAATA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATA
* ** * * * * * *
72887 AGCTTGAATGTTCAAAAACAATTGTTATATGACCAAAC-AAAGGTAATAATGATTTCAAATTGAT
126 AGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * *
72951 AACTGTTGATAAT-GTCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACAAATTCA-CTTTTAAATCAC
191 AATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
73013 TTACTTTTTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAACTTGTATGA
254 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATATGA
* *
73077 ACT-AAAAC-ATTGGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAACA
318 A-TAAAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * ** * * * *
73117 ATTCGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAATTATTTGAACTACTTC-AGCAAACAGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTA-TTCGA-TAAATAGATTTAT
* ** * **
73181 TTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATA
64 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATA
* * * * *** * * **
73246 AGCTTATATG-ACTTGAAACAATTATTTTATAATGGAATAAAAGGTTAAAACAATTTG--AT--A
126 AGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * *
73306 TAA--A-T-AACTATTCA-AA-TA--AGAACTAGTTCGATAAGCAAATTTATTTTTTAGATCTCC
190 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
73363 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTTGAATAAGCTTGTATG-AT
255 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAAT
* * **
73427 GAAAAGCAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAAC-
320 -AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* ** * * ** * *
73466 ATTTTAAAATACG-TAATTGCTCAAAT-GGCATAATTATTTGAACCGATTCAATAAATTGATTTA
1 A-TTTGAAATA-GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA
* * * * ** **
73529 TTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAAAATTATTTTATTTTCGAT
63 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAAT
* * * * * * *
73594 AAGCTTTTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGCTCATATTTATTTTAAATAG
125 AAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * ** **
73658 ATCAA-TATTTAGATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAACATAATTATTTTAAAAAAAA
189 AT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTT-TTAAATC
** * ** * * * *
73722 T-TTGGTTTATTAA-TTTTATGAACGTTAATAAATTATTATTACTTTA-TTTCAAGTAAGCATGT
252 TCTT-ACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAA-TAAGCTTAT
* * * * * * * * *
73784 ATGAACT-AAAACTATTATTTCATGACTAATCAAAAGGTTAGAGCA
314 ATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * ** * *
73829 ATTTGAAATAGATAATTTTTCTAGTAGTCTTAACTA-TTGAACTGGTTCAACAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA-T
* ** * * *
73893 TTTTAAATATCAAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAATTTAGTATTATTCTATTTCAAATAA
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAA
* * * * * * * *
73958 ACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA-AAA
127 GCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * ** * *
74022 ATTTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTGGCTCTATAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
192 A-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * * *
74087 ACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGAATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTTTATGAAT
256 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATATGAAT
* * * * *
74151 AGAAACAATTGGTTTATGACAAAATAGAAGGTCATAACG
320 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * *
74190 ATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAAAAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TATTCGATAAATAGATTTA-T
* *
74255 TTTTAAAAT-T-TTACTTATT-ATTGTTAAAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTTGAAAT
64 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-TTCAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT-AAAT
* * * * * * *
74316 AAACTTGCAT--CCATAAAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGAAATA
125 AAGCTTGTATGAACAT-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
74379 TATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCAGTGAATAGATTCT-TTTTTTAATTC
188 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATC
* * * * *
74443 TCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATGTTATTTTA-CTTCAAATAAGCTTATAT
252 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATAT
** * * * * *
74507 GAACGAAAATACTTATTTTAATTACAAAAGAAAAGGGTCATAA-T
316 GAATAAAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAA-GGTCATAACT
* * * * * * *
74551 GATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGTTCGATAAACATATGTAT
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA-
* * * *
74616 TTTTTAAATCT-TTCACTTTTTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATACGAA
63 TTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTA--AA
* * * * * * * * ** * *
74679 TAACCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTCTATGTCAAAACAAAAAGTCATCACAAGTTGAAATAA
124 TAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * *
74744 ATAATTGCTT-AAATAGTCATAA-TAATATGAATTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
189 ATAATT-ATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * *** *
74807 TTTTACTTATTAATTGTCTT--AATCTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTTTA
252 TCTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATA
* * * * * * * * * *
74870 TGAACAGAAAA-TATTATTTTGTAAAAAAACAAAAAGTTATAGCA
315 TGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * *
74914 ATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTATTCAATAAATAGAATCATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA-T
* * * * *
74979 TTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTAGATTATTAATAAATTAGTTTTAGTTTATTTCGAATA
64 TTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATA
* * * * * * **
75043 AGCTTATTTGAA-TTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGA
126 AGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * * * *
75107 TAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGATCTAGTTCAGTCAACATATTTATGTTTTAAATTTTT
190 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
** * * *
75172 TACTTATTAATCGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCA---TCAGATAAGCTTGTATAA
255 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTCA-ATAAGCTTATATGA
* ** * * *
75234 ATAGAAACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAGTCATAA-T
318 ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* ** * * *
75274 GATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGACTAGATT-GGTAAATAGATTTAT
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TATTCGATAAATAGATTTA-
* * * * ** ** *
75338 TTTTTAAATCTCTTA-TTA--ACTTTTAAAATATTAAT-GATTAGTTTTACCTTATTCCGAACAA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAA
** * * * *
75399 ATTTATATCAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATA
127 GCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * ** * * *
75464 TTTGTTAAAATAGTCATAATTGTTT-AAATTGGTTATAG-AAATAGAATTATTTTTTAAATCACT
192 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT-CGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * **
75527 TACATATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTTGT-TTATTTTA-TCCCAAATAAGC-TAGTATGA
255 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTA-TATGA
*
75589 ATTCAAAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-T
318 A-T-AAAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * * * * *
75631 GATTTAAAATAGATAATTGTTCATACAATCTTAAATATTTAAACTAGTTCGGTAAACA-A---A-
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTA-TTCGATAAATAGATTTAT
* ** * * * *
75691 -TTT--AT-T-TT--TTA--ATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTTTTTGAATAAGC
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGC
* * * * * * * * *
75747 TTGTATCAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAGTTTG-CAA
129 TTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA-ATAGATAA
* * *
75811 TTGA-TCACATAGCCATAACTATTT-AA-TTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
193 TT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * *
75873 ACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGA-ATG-TT
256 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTT-ATATGAAT
* * * *
75936 CAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACA
320 -AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * *
75976 ATTTGACATAGATAATTGTTGACAA-GGTCATAATTATTTGAACTAATTCGGTAAATAGATTCAC
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA-
* * * * *
76040 TTTTTAAATCACTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATA
* * * * * *
76105 AGCTTTTATGAAC-TGAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
126 AGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * * * *
76169 TAATTGTTCATATGGTCTTAATTGTTTTTGAAGCTAGCTTTGGCAAAGCAAAATTTAATTTTTCA
190 TAATTATTCAAATAGTCATAA--CTATTTGAA-CTTG-TTCGGTAAA-C-AGATTT-ATTTTTTA
*** **
76234 AATCTCTTTA-TTATTAATTTTTTTGATA-T-ATAAATTAGTATTATTTTATTTGGAATAAGCTA
248 AATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCT-
* * * * * *
76296 TATATCAACT--GAACAATAT-TTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAA-T
311 TATATGAA-TAAAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * *
76342 GGTTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAG---GAACTA---G----A-TCGGTTAATAGATTTATT
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATTCGATAAATAGATTTA-T
* * *
76396 TTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AG
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAG
** * * *
76457 ACTTGTATGATGGA-AAGCAATTCTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATACA
128 -CTTGTATGA-ACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * ** *
76520 TAATTGCTT-AAAT-GGCTATAATTATTTGAA-TTGATTTGATAAATTGACTTATTTTTTAAATC
190 TAATT-ATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * * *
76582 TCTAACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTACTATTATTATA-TTTCAAATAAGCTTTTAT
252 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATAT
** * * **
76646 GAACCAAAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAAGGTCATATTT
316 GAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * *
76687 ATTTTAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGAATTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAG-ATT-TA
* ** *
76752 TTTTTAAATTTCTTGTTTATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAG-AGTTATTTTATTTCGAAT
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTT-AAAT
* * * * * * * * *
76816 AAGCATGTATGAAC-TGAAACAATTATCTCATGACTAAACAAAAAGTCAAAATAATTTGAAATAG
125 AAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * *** *
76880 ATAATTATTCTAATAGTC-TGAACTATTTGAACTGGCTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCT
189 ATAATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * * *
76944 CTTACTAATTAATGTTTAGAATATTATTAATTTAGGAATATTTTA-CTTCGAATAAGCTTGTATG
253 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATATG
* * * *
77008 AACAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATTATAA-T
317 AA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * *
77049 GATTT-AAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGCTTC-ATAAACAGATTT
1 -ATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT--ATTCGATAAATAGATTT
* * * *
77112 ATTTTGTAAATATCTTA-TTA--ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
62 ATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAAT
* * * *
77174 AATG-TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAG
125 AA-GCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * ** * *
77238 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TGTGTTTAG-AAACCATATTTATTTTTTGAAT-
189 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * * *** * **
77300 TTTTATTTATTCATTTTTGAAATATTAGTAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAAATGAGCTTCCA
252 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TTCAATAAGCTTATA
* * * * *
77364 TGAACAAAACCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGTTATAA-T
315 TGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * * * * * *
77408 GTTTTGAAATAGATAATTGTTTATATAATCATAGCTATTTGAATATGTTCTATTAACATATTCAT
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TATTCGATAAATAGATTTA-
* * *
77473 TTTTTAACTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATA
* * * * * * * * * * *
77538 AGTTTATATG-ACCTGAAACAATTATTTTATTATAAAATAGAAA-CTCATAATGTTTTGAAATAA
126 AGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * *
77601 ATAATTA-GCTAAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
189 ATAATTATTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * **
77665 -TATACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAACAAGCTTGGATG
253 CT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATG
* * * *
77729 GACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATA-GTCATAACA
317 AATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACT
* ** * * * * *
77771 ATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTCGATAAATAGATTTA-T
* * * * * * *
77836 TTTTAAATCT-TGTACTTATTAATTGTCTTAACATTACTAAATTTGTATTATTTTAATTGAACTA
64 TTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATA
* ** * * * * *
77900 AGCTTGTATGAACAGAAA-AGGATCATTTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAGTGATTTCAAATCG
126 AGCTTGTATGAACATAAACA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * *
77964 ATAATTGTTTAAATAAG-CATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCT
189 ATAATTATTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
78028 CTTAATTATTAAATTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTAGATGA
253 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGA
* * * * *
78093 ACTGAAATAAC--TT-CTTTATAACAAAACTAAAGGTTATAACG
318 A-T-AAA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * *
78134 A--TAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTGTTT-CATCTAGTTTGGTAAATATATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TA-TTCGATAAATAGATTTAT
* * * *
78196 TTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATA
64 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATA
* * * * * * * * ** *
78261 TGCTTGTATGAACAAAAACTATTGTTTTATAATAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAT
126 AGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
** * * * * * * * *
78326 AATTGCTCAAGTAGTCATAACTTTTTGAACTAGTTTGATAAATAGGTTTATTTTTT--ATATC-T
191 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
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256 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAATA
**** *
78452 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAACCAAATAACA
321 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
*** * * * * * * * * ** * *
78490 ATCCAAAATAGATAATTGTTCAAAGAGTTATAATTATTTAAATTGGTTAGGTAAGCACAATTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-ATTCGATAAATAGATTTA-T
* * * * *
78555 TTTTAAATCCCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TATTGTTTTATTCTAATTA
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TAAATA
* * * * * * * *
78619 AGCTAT-TGTGAA-TTGAAAAAATAGCTTTATAACAAAAC--AA----A-ACT-ACTTGAAATAG
126 AGCT-TGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * ** * * * * *
78674 ATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTTGAA-TTGGTTAGGCAAACAAATTTA-TTTTTAATTCT
189 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * * * *
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253 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGA
* *
78801 ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-T
318 AT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* ** * * * ** *
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1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTA-TTCGATAAATAGATTTA-
* * * * *
78907 TTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGC-AAGATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTCATTAT
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-CAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTA-AAT
* * * * * *
78971 AAACTTATATG---AT---CAA-----ATATGACCAAACAAAAGGTTATAGTGATTTAAAATAGA
125 AAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * ** * * * *
79025 TAATTACTGAAAT-GATGAGAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACA-AGTTCACTTTTGAAA---
190 TAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCT
* * * * *
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253 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGA
* * * *
79142 ACT-GAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATT
318 A-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * ** * ** * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAT-TCGA-TAAATAGATTTA-
* * * * *
79247 TTTTTTTAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTAATTTATTTAGGAT
63 -TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTA-AAT
* * * * * * *
79311 AAGCTTTTATGAAC-TGATACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAA
125 AAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * **
79375 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACTGATTTATTTTTTCAAGCCT
189 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCT
* * ** * * * * * *
79440 TTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTGGATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTAAG-
253 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGA
* * * * * * * *
79504 ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAGCG
318 ATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * ** * * * * *
79546 ATTGGAAAATAGATAATTATTCTATTAGTTTTAACTATTTGAATTGGTTCAACAAACACATTTAC
1 ATTTG-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-ATTCGATAAATAGATTTA-
* * * * * *
79611 TTTTTAAATCTTTTACTTA--ATTTTTGAAATATT-ATAAAGTTACTATTATTTTTAATTGAATA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAA-TTAGTATTA-TTTTATTTAAATA
* * ** * * * * * * *
79673 ATCTTCTATGATTAGAAATAGTTGTTTTATGACAAAACAAGATG-T-TAATGATTTGAGATTGAT
126 AGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * *
79736 AATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTGC-
191 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CT
* * * *
79800 TACTTATTAATTTTTGAAATATTGATAAATTAATATTATTTTA-TTTCATATAAGCTTGTATG-A
255 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCA-ATAAGCTTATATGAA
* *
79863 TCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGGCATAACA
319 T-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * *
79904 ATTTGAAATAGATAATCATTCAAAT-GGC-T-A-TAATT--A-T-TTC---AAATAGATTTATTT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATTCGATAAATAGATTTA-TT
* ** * **
79958 TTTAAATTTCTTAC-TAGTTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAA
65 TTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTT-TCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAA
* * * * * *
80022 GCTTGTATTAACTTAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAATGTTATAATAATTTTAAATAG-TC
127 GCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT-
* * * * * * ** *
80086 AATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAAATAGA-TTGTTTTAAAAATCTTTT
191 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* ** * * * * * * * *
80150 TCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAGTAAATATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT
256 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAA-T
* * **
80215 -AAAACAATTGTTTTATGACTAATCAAAAATTCAGT-A-T
320 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACT
* * * * * * * *
80252 GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACCAATTGAACTAATTTAGTTAACA-A-ATTT
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTA-TTCGATAA-ATAGATTT
* * * *
80315 ATTTTCTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTGAAAAATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAT
62 ATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAAT
** * * * * * ** *
80377 AAAATAGTTTGAACATAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTT-AAATAAA
125 AAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
80441 TAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAACAAATTTACTTTTTATATCTCC
190 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * *
80506 TACTGATTAATTTTCT-AAATATTAAGAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAA
255 TACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAA
* * * **
80570 CAAAAACAATTATTTTATGA-AAAA-AAAA-GTAATAAAA
319 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * *
80607 ATTTGGAATAGACAATTTTTCAAGTAGTTAT-ACTTATTTGAACTGTTC-ACTAAATAGAATTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAATTATTCGA-TAAATAGATTTAT
* * * *
80670 TTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TGTATTCTATTTCGAAT
64 TTT-TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTAT-TATTTTATTT-AAAT
* * * * ** *
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125 AAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * ** * * * * *
80798 ATAATTGTTCATATAGTTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAAC-GAATTTAATTTTTAACTC
189 ATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * *
80862 TTTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTATATTGGTATTATTTTA-TTTCGAACAAGCTTATGT
252 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTTATAT
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TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTT
GTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTA
TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTATATGAATAAAAAC
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
Found at i:71735 original size:16 final size:16
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1 TTTAG-AATATTATTAC
71736 T
1 T
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TTTAGAATATTATTAC
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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** * * * *
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* * * ** * * * * *
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325 TATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAACAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCA
** * *
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390 AACTACTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATA
* * *
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455 AAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATAAAAC-GAAACAATTAGTTTATGACAAAACA
* * * *
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519 AAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAGTCATAACTATTTAAACTGATTCAGCA
** * * *** *
71671 AACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTTTTAATTTTT-AGAATATTATTACTTTAGCAATATTTTA
584 AACATAGATATTTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAACTAACAATATTTTA
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648 CTTC-AAATAAGCTTATATGAACAAAGATAG
*
71765 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTATA-CAAATTTAGTTTTTAAA-T-
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTA-AGCAAATTTAGTTTTTAAATTC
* * * ** *
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65 CTACTTATTAA-TTTTAAAAAATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAA
71891 TAAAAACAATTGTTTTACGAC-AAACAAAA-TGTCACAA-TGATTTGAAATAGATAA-TAGCTT-
129 TAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGT-TCACAACT-ATTTGAAATAGATAATTA--TTC
* * * * *
71951 GAATGGATATGACTATTTAAACTT-GTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTGAAATCTCCAACTT-T
190 AAATGGACATAACTATTTAAA-TTAATTCGATAAATAGATTCACTTTTT-AAATCTCCAACTTCT
* * * *
72013 TAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAA
253 CAATTTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATATTATTTTAAATAAACTTGTATGATATA-AAA
* * *
72076 AAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGATCATGACAATTTAAAACAAATAATTATTTAAATAGTCAT
316 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAACAAATAATTATTCAAATAGTCAT
*
72141 AACTATTTAAACTCACTTC-GTAAACAAATTTA-TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTTG
381 AACTATTCAAACT-ACTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTTG
* * ** * * * *
72203 AAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATGCATA-GAAACAATTGGTTT
445 -AATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTAT-AAAACGAAACAATTAGTTT
* *** * *
72267 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAGTTATTC-AGATAGTCATAACTATTTA
508 ATGACAAAAC-AAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ACAGTCATAACTATTTA
* ** *
72331 AACTTATTC-GGTAA-ATAGAT-TTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATA
571 AACTGATTCAGCAAACATAGATATTTTTTTAAATCT-TT--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATA
* *
72393 AACTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAAC
632 AACTAACAATATTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAAC
72431 TGAAACAATT
Statistics
Matches: 557, Mismatches: 88, Indels: 47
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (677 bp):
ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAGCAAATTTAGTTTTTAAATTCC
TACTTATTAATTTTAAAAAATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATA
AAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGTTCACAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGG
ACATAACTATTTAAATTAATTCGATAAATAGATTCACTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTT
GAAATATTAATAAAGTAATATTATATTATTTTAAATAAACTTGTATGATATAAAAAAATTGTTTT
ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAACAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCAA
ACTACTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAA
AATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATAAAACGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAA
GGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAGTCATAACTATTTAAACTGATTCAGCAAA
CATAGATATTTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAACAATATTTTACTT
CAAATAAGCTTATATGAACAAAGATAG
Found at i:72509 original size:180 final size:179
Alignment explanation
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71751 ATGAACAAAG
* * * * *
71761 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-TTGGTATACAAATTTAGTTTTT-A
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT--TATTCGTAAACAGATTTA-TTTTTAA
* * **
71824 AA--TC-T-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTT
63 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT
* * * * *
71884 TTATGAATAAAAACAATTG-TT-TTACGACAAACAAAATGTCACAATGATTTGAA
127 GTATGAATAGAAACAATTGTTTATTAC-A-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
71937 ATAGATAA-TAGCTT-GAATGGAT-ATGACTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTG
1 ATAGATAATTA--TTCAAATAG-TCATAACTATTTAAACTTATTCG-TAAACAGATTTATTTTTA
** * * *
71999 AAATCTCCAACTT-TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACT
62 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * * * * *
72062 TGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGATCATGACAATTTAAA
126 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTATT-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * *
72117 ACAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACTTCGTAAACAAATTTATTTTTAAAA
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTCGTAAACAGATTTATTTTTAAAA
* * * * ** * *
72182 TTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTA
65 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA
* * * *
72247 TGCATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAA
130 TGAATAGAAACAATT-GTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * *
72298 ATAGATAGTTATTCAGATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAGATTT-TTTTT-AAT
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTC-GTAAACAGATTTATTTTTAAAA
* * * *
72361 TCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATA
65 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA
* *
72426 TGAACT-GAAACAATTATTTCAATTACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAA
130 TGAA-TAGAAACAATTGTTT--ATTACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
72478 ATAGATAATTATTCAAAAAGTCATTACTATTTGAACTTGTTCGTAAACATATATATTTTTAAATA
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGTAAACAGATTTATTTTTAAA-A
* * * * *
72543 T-T-TTACTTATTAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTGTA
65 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA
*
72606 TGAATAGAAATAATTGTTTTATGT-CAAAACAAA
130 TGAATAGAAACAATTG-TTTAT-TACAAAACAAA
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CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
GAATAGAAACAATTGTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
Found at i:72523 original size:360 final size:356
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71751 ATGAACAAAG
* * * *
71761 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTATACAAATTTAGTTTTTAAA
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGTAAACAAATTTA-TTTTTAAA
* * *
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* * * *
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128 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATA-CTTC
* * * *
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192 AATAGATATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTGAAATCTCCAACTATTAAT
* * * * * *
72017 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAAAAAATTG
257 TTTTAGAATATTAATAAACTAATATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAAAAATTA
* *
72082 TTTTTTGACAAAACAAAAGATCATGACAATTTAAA
322 TTTATTGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAA
* * * * *
72117 ACAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACTTCGTAAACAAATTTATTTTTAAAA
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCGTAAACAAATTTATTTTT-AAA
* * *
72182 TTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTA
64 -TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAT-CTTTTA
* * * * *
72247 TGCATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAGTTA-TT
127 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATA-ATACTT
* * **
72311 CAGATAG-TCATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAGATTT-TTTTT-AATTCTCTTACTCAT
191 CA-ATAGAT-ATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTGAAATCTCCAACT-AT
*
72373 TAATTTTT-GAAATATTAATAAACTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAA
253 TAATTTTTAG-AATATTAATAAACTAATATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAA-TAGAAA
* * * * *
72436 CAATTATTTCAATT-ACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAA
316 AAATTATTT--ATTGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAA
* * * * *
72478 ATAGATAATTATTCAAAAAGTCATTACTATTTGAACTTGTTCGTAAACATATATATTTTTAAATA
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGTAAACAAATTTATTTTTAAAT-
* * * * * * *
72543 TTTTACTTATTAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTGTATG
65 TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT-ATCTTTTATG
* *
72608 AATAGAAATAATTGTTTTATGTCAAAACAAA
129 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
72639 TTTATTTTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGTAAACAAATTTATTTTTAAATT
TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATATCTTTTATGAA
TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATACTTCAATA
GATATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTGAAATCTCCAACTATTAATTTTT
AGAATATTAATAAACTAATATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAAAAATTATTTA
TTGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAA
Found at i:81959 original size:536 final size:532
Alignment explanation
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80930 AAAAACACTG
* * * * * *
80940 TAACAATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTTAGTAAATAGAT
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* * * *
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* * * * *
81070 AG-TATGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAAAAATGATTTGATATAGA
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* ** * * * * * *
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194 TA-TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-TAGAAATA-ATTTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
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256 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTCATGAACTAA
* * * * *
81264 AATAATTTTTTTATGACAAAAC-AAATGTCATAACGATTTTAAAAATATAACTGTTCAAATAATC
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* * * * *
81328 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTTATTTTTTCAAATCTCTTACTAACTAATTTTT
386 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGA-TTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTT
* * * * * * * * * * *
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449 TGAATATTAATAAATTAGTAATAATTTATTCCAAATAAACTTATATGAGCTAAAATAATTATTTT
*
81458 ATGACTAAACCAAAGGTCA
514 ATGACTAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
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1 TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACACAT
* *
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66 TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAT-TCCAAAT
* * * *
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130 AAGCTTGTATGATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAGATAGAT
* * *
81670 ATTTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTGAATTGGTTTAGAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTG
195 A-TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGAAATAATTTTATTTTTTAAA--TC-T-
** ** * *
81734 CTTATTAATTTTTGAAATATTGGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTA
255 CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTCATGAACTA
*
81799 AAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
320 AAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
81864 TA-AATCTATTTGAATTTATTCTA-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCGCTTGCTCATTAATTT
385 CATAA-CTATTTGAACTTGTT-TAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTT
* * * * * *
81927 TTCGAATGTTAATAAATTAGTAATAATTTATTCTAAATAAGCTTATATGAGGTGAAATAATTGTT
448 TT-GAATATTAATAAATTAGTAATAATTTATTCCAAATAAACTTATATGAGCTAAAATAATTATT
*
81992 TTAT-AGCTAAAGAAAAGGTCA
512 TTATGA-CTAAACAAAAGGTCA
* ** * * * * *
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1 TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACACAT
* * * * * *
82078 TTATTTTTTAAATCTCTTCTTAATATTTGGAATACTATTAAATGAGTATTATTTTAATCCGAATA
66 TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
* * * ** * *
82143 AGCTTGTATTA-AAAAACAATTGTTTTAAGA-TAAATTAAAGATCATAACGATTTAAGATAGATA
131 AGCTTGTATGATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATA
* * ** * * * * *
82206 ---AT-AAATAGTCATAAGTATTTGAACTATTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTGAAATCTCTTAT
196 TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAG-AAATAATTTTATTTTTTAAATCTCTTAT
* * * * * *
82267 TAAGTTTCAAAATATTAATAGA-TCAGTATTA-TTT-TTTTGAATAA-TTTTGCATGAGCAAAAA
260 TAATTTTCAAAATATTAATAAAGT-AGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT-CATGAACTAAAA
* * * * * * * *
82328 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACAT
323 TAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *
82393 GATTATATGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTT-AATCTCCTAC-CTATTAATTTTTAG
388 AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTC-ATTAATTTTT-G
* * * * * *
82456 AATATTAATAAATTAG-CATTATCTTATTCTAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAATAACTATTTT
451 AATATTAATAAATTAGTAATAAT-TTATTCCAAATAAACTTATATGAGCTA-AAATAATTATTTT
* * *
82519 ATGACAAGAAAAAAAAGATCA
514 ATGAC--TAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * *
82540 AAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAGCTATTTGAACTTGCTCGGTAAACAAAT
1 TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACACAT
* * * * *
82605 TTATTTTTTAAGTCTTTTACTTTTTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCA
66 TTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCA
* * * * *
82670 AAT-A-CTTGTATGA-ACGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-CTTTCAAA
127 AATAAGCTTGTATGATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAGA
* * *
82731 TATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTAGAAA-ACATATTTATTTTTTAAA
190 TAGAT-ATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGAAATA-AT-TTTATTTTTTAAA
* * ** * * *
82795 TTATTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTGTTTTA-TTTGGAATAAGCTTGC
252 -T-CT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-GTAGTATTATTTTATTTTGG-ATAAGCTTTC
** * * * * * * *
82858 ATGAA-TAGAAATAATTGCTTTATGACAAAATAAAATGTCATAATGATTTAAAATATAAAATTGC
312 ATGAACTA-AAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGT
* * * * * *
82922 TCAAATAGTCATAACTATCTGAACTTGGTCATTAAATAGATTCA--TTTTTAAATCTCTTACTCA
376 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCA
* * * * * * * *
82985 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTATATGAACTGATAT
441 TTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTAATAATTTATTCCAAATAAACTTATATGAGCTAAAAT
**
83050 AATTGCTTTATGA-TGAAACAAAAGGTCA
505 AATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTCA
* * * *
83078 TAACAATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTA-TTCGGTAAACATAT
1 TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACACAT
*
83141 TTATTTTTAAAAT
66 TTATTTTTTAAAT
83154 AATAGATTAT
Statistics
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0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
524 6 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (532 bp):
TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACACAT
TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
AGCTTGTATGATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATA
TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGAAATAATTTTATTTTTTAAATCTCTTATT
AATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTCATGAACTAAAATAA
TTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
TATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAATAT
TAATAAATTAGTAATAATTTATTCCAAATAAACTTATATGAGCTAAAATAATTATTTTATGACTA
AACAAAAGGTCA
Found at i:82821 original size:22 final size:23
Alignment explanation
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82770 TTAGAAAACA
* *
82780 TATTTATTTTTTAAATTATTATT
1 TATTAATTTTTGAAATTATTATT
82803 TATTAATTTTTGAAA-TATTA
1 TATTAATTTTTGAAATTATTA
82823 ATAAATTTAT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (23 bp):
TATTAATTTTTGAAATTATTATT
Found at i:82932 original size:180 final size:181
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Indices: 80940--83153 Score: 1284
Period size: 177 Copynumber: 12.4 Consensus size: 181
80930 AAAAACACTG
* * * *
80940 TAACAATTTGAAATA-AATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TTTAGTAAATAG
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* * *
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* * * * *
81064 CAAAT-AAGTATGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-A
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* * * * * * * * ** * * *
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* * ** ** * *
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** * * ** *
81241 TTGGAA-AAGCTTTTATGAACTA-AAATAATTTTTTTATGACAAAAC-AAATGTCA
127 TTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * ** *
81294 TAACGATTTTAAAAATATAACTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAAT
1 TAACTATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGA-
* * * * *
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* * * * * * * * *
81423 CCGAATAAGCATGTATGAGCTA-AAACAATT-ATTATATGACTAAACCAAAGGTCA
128 TCAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAATAATTGCTT-TATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * * *
81477 TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTCTTTAAACTAGTTTAGAAAACACAT
1 TAACTATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGAT
* * *
81542 TTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTTTTATTTT-TATC
66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TT
* * * * * *
81601 CAAATAAGCTTGTATG-ATCA-AAACAATGGTTTTATGATAAAACAAAA-ATCA
129 CAAATAAACTTGTATGAAT-AGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
81652 TAA-TGATTTGAGAT-TGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTGAA-TTGGTTTAG-AAATA
1 TAACT-ATTTGAAATAT-AAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACA
* * ** *
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*** ** * **
81777 TTGGATAAGTTTTTATGAACTA-AAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
128 TCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * *
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1 TAACTATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACAG
* * * * * *
81894 ATTTATTTTTTTAAATCGCTTGCTCATTAATTTTTCG-AATGTTAATAAATTAGTAATAATTTA-
64 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * *
81957 TTCTAAATAAGCTTATATGAGGT-GAAATAATTGTTTTAT-AGCTAAAGAAAAGGTCA
127 TTC-AAATAAACTTGTATGA-ATAGAAATAATTGCTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * *
82013 -AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTTCAGCAAATACA
1 TAACT-ATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGA
* * * * * * *
82077 TTTATTTTTTAAATCTCTT-C---TTAATATTTGGAATACTATTAAATGAGTATTATTTTAATCC
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * ** *
82138 GAATAAGCTTGTATTAA-A-AAACAATTGTTTTAAGA-TAAATTAAAGATCA
130 AAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * ** *
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1 TAACTATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACAGA
* * * ** * *
82246 TTTAGTTTTGAAA--TC-T-CTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTT-TTT-
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* ** * ** * * **
82305 GAATAATTTTGCATGAGCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
130 AAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * *
82357 -AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGATTATATGAACTTGTTTAGTAAACAGA
1 TAACT-ATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGA
* * * * *
82421 TTTATTTTTTTAATCTCCTACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTATCTTA-TT
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * *
82484 CTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAACTATTTTATGACAAGAAAAAAAAGATCA
129 C-AAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGCTTTATGAC-A-AAACAAAAGGTCA
* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* *
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* * * * **
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* *
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* ** * * ** * * * *
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* ** ** ***
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* ***** ** * * * **** * *
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** * * * *
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* ** * ** **
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* * * * * ***
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* * ** *
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* * * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* *
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* * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA
* ** ** *
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* * * *
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* *** * *** * *
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* * ** * *
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* *
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* * * ** * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTATTA
* ***
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* * *
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* ** * ** * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA
* * * * * ** * *
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* * * * * * *
85750 ACTATTTTTTTAT-AGTAGAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTG
125 ACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * **
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* * * *
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** * * * * *
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* * * *
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* * * * ** *
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** * *
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* *** * * *
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1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTT
* ** * *
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* ***
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* * * * * * ** *
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** *
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* * * *
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* * ** * ***
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *** * ***
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** * **** * * * *** *
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66 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATT
* * *
87901 GTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAA-ATGATAATTG
131 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-GATAATTG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATC---T-CTT
* * * ***
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* * * * **
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123 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * ** * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA
* * * * ** * * * ***
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65 AT--TTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAAAAAAAC
* ** * ** *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA--TC--TCTT
** * * * * * * **
88375 ATTAATTTTTTTATTGTTAATAAATTA-TATTAATTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACTAAAA
61 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAAAAAAA
* * * *
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126 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
** * *
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1 TTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CT
* *
88554 TATTAATTTTTGAAATATTATAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATA
60 TATTAATTTTTG--A-A--AT-A---TT--AATA--AAT----TAGTATTATTTTATTCCAAATA
* * *** * * * *
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108 AGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
88684 AATTG
173 AATTG
* * * * ** * *
88689 TTCAAATAGTCATATCTATTT-AAGCTTGCTCGGCAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCT
1 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-CTGGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA--TC-T-CT
* *** * **
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60 TATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAAAAA
* * * * * *
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* * * * *
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1 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAATAA
* * * *
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66 TTTAAACTGGTTAGGCAAACAGAATTATTTTTGAAATCTCTTTATTAATTTTTGAAATACTAATA
*
87139 GATTCAT-TTTATTTTATTCCTCATAAGTAAGTATGAATTGAAAA
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* * * * * * *
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** * **
87247 ATTTGCATTGGTTCTGCAAACA-AATTTATTTTTGAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAC
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*
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TTTAAACTGGTTAGGCAAACAGAATTATTTTTGAAATCTCTTTATTAATTTTTGAAATACTAATA
GATTATAATTATTTTATTCCTCATAAGTAAGTATGAATTGAAAA
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87264 AAACAAATTT
*
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88568 ATATTATAAC
* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * *
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* * ** *
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88911 ATTTATTTTT
* * * * *
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* * * * ** *
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* * *
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129 T-GTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATT
* ** ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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383 ATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * ** * *
89362 TGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTACTCGGTAAATAGATTTATTTTT
448 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTT
** *** *
89427 TTAAATC-TTTACTTATTGGTTTTTGGAT
512 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCATAA
* * * *
89455 TATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACAATAATAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
89520 TAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTTATAA-TTATTTAAATA
65 CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAAT-
* * * * ** *
89584 TGTTTAGAAAACGTATTTATTTTTTAAAT-TTATACTTAGTAATTTTTGGAATATTAATAAATTT
129 TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTA
** ** * *
89648 ATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAGCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT
193 ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * ** * **
89713 CAAAACAATTTGCAATAGATAATTAATCAAATTGTCTTAACTATTTGAACTTGTAGGGTAAACTG
258 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAA
* * ** * * *
89778 ATACATTTTTTAAATATGTTCCTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT
323 ATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
89843 TGAATAAGCCTACATGAACTGATACAATTGTTTCATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
387 TGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
** * * * * * * * *
89908 ATAGGTATTTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATATATTTATTTTTAAAA
452 ATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * *
89973 TTTTTTACTTATTAATTAGT-AAAA
517 TCTTTTACTTATTAATT-TTCATAA
* * * *
89997 TATTAATAAATTAATATTATTTCAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * *
90062 CAAAGCAAAAAGTCATAATC-ATTTAAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACT
65 CAAAACAAAAAGTCATAA-CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAAT
* * ** *
90126 TATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTTTTAATATTAATAAATTT
129 TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTA
* * *
90191 GTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTCTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGCT
193 ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* ** * *
90256 TATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAA
258 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAA
** * * * * * * *
90321 ATTCATTTTTAAATCTATTACTTA-TAACTTTCAGAATTTTAATAAATGAGAATTATATTATCTT
323 ATTCATTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * *
90385 GAATAAGCTTATACGAACATAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAA
388 GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * ** * *
90450 TAGATAATTGTTGAAACAATCATAAACTATTTGCACTAG-TCAAGCCAACAGATTCAATTTTTAA
453 TAAATAATTGTTCAAATAATCAT-AACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAA
* *
90514 GTCTATTACTTATTAATTTTCATAA
516 ATCTTTTACTTATTAATTTTCATAA
* * **
90539 TATTAATAAATTTGCATTATTTTA-TTC--TAA------AT----AAAAATAAAGGTTTTATGAC
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAC
* * *** * * * *
90591 AGAACAAATAGTCATAGTGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATATCTAAATG-AATTG
66 AAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAATT-
* * * * *
90655 GTTTAGTAAATATATCTATTTTTTAATTCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAA
130 GTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAA
* ** * * * * * * *
90720 TATGATTTTATTCCAAACAAACTTATTTGAACCA-AAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
194 TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * *
90784 CATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCAACAAGCAA
258 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAAC-A
* * * ** *
90849 AATT-ATTTTATATATCTCCTGCTGATTAATTTTT-GAAATATTAATTATTTTA-TTTTATTTTA
322 AATTCATTTT-TAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTA
*** * * ** * * * * * *
90911 TTCCAAATAA-ATTAGTAAGAATGGAAAAAATTATTTTACGACAAAAGAAAAGGTCATAATAATT
384 TTTTGAATAAGCTTA-TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * ** * * ** * *
90975 TGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTGAACAAATTTATTTTT
448 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTT
* * *
91040 TAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAG
513 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTCATAA
* * *
91068 TATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTGTATGAAC-AGAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
91132 CAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTA
65 CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAATT
* * * * * * * * *
91197 ATTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTATTCAAATATTAATAAATTAG
130 GTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAA
* * *
91262 TATTTTTTTATTCT-AAATAGGCTTGTATG-AT-GAAAAAAATTGTTTTATGAC-AAACTAAAGG
194 TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * *
91323 TTTATAAC-AATTGAAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTAGAAC-TGATTTGATAA
257 -TCATAACGATTTG-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAA
* * * * * * *
91386 ACTAATTTATGTTTTAAATCT-CTAACATATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTT
319 ACAAATTCAT-TTTTAAATCTCCT-ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * *
91450 T-TTTT-AGATAAAATT-TAATGAGCTGAAACAATTGGTTTATGATAAAATAAAAGATCATAATG
382 TATTTTGA-ATAAGCTTAT-ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * ** * *
91512 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATTATCATAATTATTTGAACTTGTTGGGCAAACATATTTATT
445 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-T
* * *
91577 TATTTTTAAT-TTAT-CGTTTATTAATTTT-TTGAA
509 T-TTTTAAATCTTTTAC--TTATTAATTTTCAT-AA
* * * * * *** * *
91610 TGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACCTGTATAAATTGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * * *** ** * * * * *
91675 CTATAC-AAAAGGCTAGAACAATACAAAATGGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAATATTTGAACT
65 CAAAACAAAAAGTC-ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAAT
* ** * *** ** * * * *
91739 AGTTGGGCAAA-A-ACACATTTTTTAAA-AACCATAATTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTT
129 TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTC-TACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATT
** * * * ** * **
91801 AGCAATATTTTACTCTG-AATAAGTTTGTATGAATAGAAACAAA-T-ACTTAGGACAAAA-TGAA
192 AATATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * *
91862 GATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATTGTTACAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAA
255 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAA
* * * * * *
91926 A-ACGATTTAGTTTTTAAATGT--T--TTATTAATTTTT-GAAATAGTAGTAAATTAATATTATT
319 ACA-AATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * *
91985 TTATTTTGAATAATTTTATATGAATAG-AACAATTCTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATAA
381 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * *
92049 TTTAAAATAGAA-AATAGTTCAAAT-GTACATGACTATTTGAACTTGTT-TGATAAACAGATTAA
446 TTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAAT-CATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTA
** * * *
92111 TTTTTTAAATCTTCAACTTATTGATTTTTAGAA
508 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCATAA
* * * * * * *
92144 TATGAATAAATTAGTACTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAACAATTGTTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * * *
92208 CAAAAC-AAAAGATCTTAACAACTTGAAATAAATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
65 CAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAAT
** * * * * * **
92272 TACTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGTAATATTAATAAATTAA
129 TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAA
* ** * *** * * **
92337 TATTTTTTTATTCT-AAATAAAATTGT-TCAAATACTCATAA-TG-ATT-T----AAAC---TTG
194 TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTAT-GAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * ** *
92390 T--T--C--TGT-AAATAGATTTATTTTTTAAAT-CT-TTTACT-TTTGAA-TTGTCTTAATGTT
257 TCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCGA--TA
* * ** * *** * * * * *
92444 AATAAATTTGTATTAGTTT--AT-TCGGA-ATAAGCATGTAT-GAATA-GAAAAAATTA-TTTTA
318 AACAAA-TT-CATT--TTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *** ** **** * * ** *
92502 TGTCAAAAT-AA-AAATTTATAGTGATTTCAAATAA--ATAAT-TG-T---TCAAATA-GTCATA
379 TTTTATTTTGAATAAGCTTATA-TGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA-AGGTCATA
* * * * * * * * * **
92557 ATTA-TT----T-AA-ACTTGTT-TAGTAATCAT-ATTCATTT---TTTATATCATTTAA-TTA-
442 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACT-ATTTGAACTTGT-TCAGTAAACAGAT
* * * *
92608 TTAATTTTTAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTT-ATTTCGAA
505 TTATTTTTTA-AATCTT--TTACTTA-T-TAATTTTCA--T--AA
* * * ** * ** **
92652 TAAGCTTATATCAATT-GAATT-TTTT-TTGACAA-AA-C--AAAAGGTCATAACAAT--TTGAA
1 T-A--TTA-ATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAACA-AA-AATAATTGTT
* * * * * ** * * * *
92708 ATA-GATAATTATTCAAATAGTCATGAA-TATTTGATCT-AGT--TTGGT-AAACA-T-ATTTA-
59 TTATGACAA--A-ACAAAAAGTCAT-AACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-TAAC
** * ** ** * *
92764 TTTTTTAAATT-TTT--TATGCATTAATTGTCAAAATATTAATATATTAGTA-TTATTTTAATCT
119 TAATTGAAATTGTTTAGTAAACA-T-ATT-T--ATTTTTTAA-ATATT-CTACTTA--TTAAT-T
* * ** * * * * * * * * * *
92825 GAATAAGCACGTACGAATAGAAATTATTGTT-TTGTAATAGAACAAAAAGTCAT-AATGATTTGA
174 --TTAA--A-ATATTAAT--AAATTAATATTATTTTATTTG-A-AATAAG-CTTGTATGAATAGA
* * ** * * * ** * *
92888 AATAAA-----TAATTAC-TTA-AATA-GTCATAACTATTTGAACTCATTTGATAAATGGTTTAT
229 AA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA---A-TAGAT-AATTATTCAA
* ** * * * * ** * ** * *
92945 TTTTTCA-ATCTCTTATTAA-TT-TTTGA-AATATTAATAT-ATTAGTATT-ACT-TTATTCTGA
288 ATAGTCATAACTATT-TGAACTTGTTCGATAA-ACAAAT-TCATT--T-TTAAATCTCCTACT-T
** * * * * * **** * * *
93003 ACAAATTTATATAA-A-CAA-AAA-CA-T-TTGTTTTATGACAAAGCAAGGTCATAACAATTTGA
346 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAA-G-C-T---TATATGA
* * ** ** ** ** ** * * * *
93062 A-ATAAATAATTGTTCAAAAATAAATTAGTATTTTATTCTAAATAATTTTATATGAATAGAAAAA
404 ACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA---T-AATGA-TTT-GA--AATA-AATAA
* * * * * * **
93126 TTATTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAAAAGATAATAATTCAAATGGACATGA-
460 -T-TGTT----C--AA-ATAA--TCATAACTATTTG---AA-CT--T-GTTC-AGTAAACA-GAT
* * * *
93190 CTATTTAAACTTGTTTGATAAACATATTTATTTTTAAAATTTTCAACTTATTAATTTTTAGAA
505 TTA-TT-------TTT--T----A-A---A----T---CTTTT--ACTTATTAATTTTCATAA
* * ** *
93253 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* ** * * * * *
93318 TAAAACAAAATA-TCATAAGGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA-TCTTTACTATTTGAGCA
65 CAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGA-AA
* * * * * * * * * *
93381 -CGCTTAGTAAATAGATTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTGAAATTTTAATAAATT
128 TTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTA-ATTTTAAAATATTAATAAATT
* * * * * *
93445 AATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTTTATGAACATAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAG
192 AATATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
*
93509 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAACTATTTAAACGT
256 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG--AAC----T-----T
* * **
93574 GTTCAGA-AAACAAGTTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATT
310 GTTC-GATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-T
*** * * * * *
93636 TA-TATTATTTTATTCAAAATAAGTTTACATG--CATGAACCAATTGTTTAATGACAAAACAAAA
371 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACA-GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA
* * * * * * * * **
93698 TGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTTGTAAA
435 GGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA
* * * * ** * ***
93763 TAGATTCATTTCTTAACTCCCTTACTCT-TTAGTTTTTGGAA
500 CAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTCATAA
* * ** * *
93804 TATTAATAAATTAATATT-TTTT-TTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* ** * * * * **
93867 AAAAACAATTATTCA-AAGAATCATG-ACTATTTGAACTTGTT----T-G--ATAA--ACA-TG-
65 CAAAACAAAAAGTCATAACAAT-TTGAAATAAAT-AA-TTGTTCAAATAGTCATAACTA-ATTGA
** * * * * * *
93919 --TT-TTTTTTTAATAT-TTTACTTATTAATTA-TC-A---A--AATATT--AATA--AATTAAA
126 AATTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATTTTAAAATATTAA-TAAA
* * * * * *
93969 TT--TA-T-TTTAATCT-AAATAAACATATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
190 TTAATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
94029 AGTCAAAAC-A----AAGTA-A-AATAAAT-AATTATTCA-AA-TA----AA--TG---GAT---
255 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAA
* ** *
94072 ----TTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTT
320 CAAATTCATTTTTAAATCTCCTACTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * ** * * *
94131 ATTTTAAATAAGGTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATT
383 ATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATT
** * * * * ** * * * *
94196 TTTAATAAGTAATTGTTGAAATAGTCATAA-TAATTTAAACTTGTTTGGCAAACAAATTCATTGT
448 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACT-ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTT
* * * **
94260 TTAAATCTCTTAGTTATTCATTTTTGTAA
512 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCATAA
* * * *** *
94289 TATTAATAACTTAGTATTATGTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAATAGTT-TTTTCATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTT-ATG
* * * * * **
94353 ATAAAAC-AAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTTGATC
64 ACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAA
* * * * * * *
94417 TAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATGTTTTTCTTATTAATTGTTAAAATATTAAAAAATT
128 TTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATT
* * * * * * * *
94482 AGTATTATTTTAATATG-ACTAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTATAATAGAAA-AAAA
192 AATATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACA-AAACAAAA
* * * ** ** **
94545 -GTGATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCATTTTATAAA
255 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAA
* * * * * * *
94609 TAGATTTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTT-GAAATAATAATATATTAGTGTTACTTT
320 CAAATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*** * * * * * *
94669 ATTGCAAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATT
383 ATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * * *** * *
94734 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTCAACCAATT-AGGTAAACAAAATTA-TTT
448 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAGATTTATTTT
* * *
94797 TTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGA-AA
512 TTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCATAA
* * *
94826 TATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCAAAATAAG-TTAGTATGAGTTCAAAAA-AACTTATT
1 TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC--AATAAGCTT-GTATGA--ACAAAAATAA-TT-GT
** * ** * * * *
94887 TTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATACGTGTTCATATAGTCTTAAATAT
58 TTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAA
* * * * * * * **
94951 TTGAACTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAATTA-TCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTA
122 TTGAAATTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTC-TACTTATTAA-TTTTAAAATATTA
* * ** * * * *
95015 TTAGATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA-AAAATAATTGTTTTATGATAGA
185 ATAAATTAATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAA
* * * * ** * * * *
95079 ACAAAATGTTATAACAATTT-AGAGTTTACAATTATTCACACAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTT
249 ACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * * * *
95141 TGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-T--T-CTTATTAATTTTT-GAAAGATCAATAAATTAGTA
313 CGATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * * * ** *
95201 TTATTTTATTTTGAATAAGCATAAATGATCA-AAACCAATTATTATATGACCAAACAAAAGGCCA
376 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * ** **
95265 TAAT-TTTTGGTAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTACTTTGGTAAACTA
440 TAATGATTT-G-AAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-A
*
95329 -ATTTATTTTTTAAATC---T-C---CT-A---TCGA-AA
502 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTC-ATAA
* * * * *** * * *
95356 TATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * * * ** * *
95421 TAGAACCAAAGGTTATAAGGA-TTGAAAATAGATAATTGTTCAAATAG---GAAC----TG--A-
65 CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAAT
* * * * * *
95475 --TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
129 TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTA
* * * * ** *
95538 ATATTCTTTTGTTCCG-AATAGGCTTGTATG-ACGGAAAACAATTATTTTAAT-ACAAAACAAAA
193 ATATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTT-ATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * *
95600 GTTCATAATGATTTGACATAGATAATTATTTAAATGGCCATAATTATTT-AAATCGATTCGATAA
255 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAA
* * * * * *
95664 ACTGACTT-ATTTTTTAAATCT-TTACCTTATCAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAATATTAT
319 AC-AAATTCA-TTTTTAAATCTCCTA-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * *** * *
95726 TTTATTTCAAATAAGCTTTTGTGATTTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTT
380 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * ** * * *
95791 ATTCT-AAATAGATAATAGTTCAAA-AGTCATGACTATTTAAACTTAATCAATAAATAAATTTAT
445 ATT-TGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTAT
* * * * * *
95854 TTTTTAAA--ATTT-GTTGTT--TGTTAATAT
509 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCATAA
* * * * * * **** *
95881 TATGAATGAAATTAGGATTATTGTATTTTGAATAAGCATGGATG-AGTTGAA-AATTATTTTATG
1 TATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
* * * * * * * * *
95944 ACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATCGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTGAAC
64 ACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTAATTGAAA
** * * * * * *
96008 TAATTTAGCAAAC-TCATTTATTTTTTAAAT-CTCTTTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAT
128 TTGTTTAGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATATTC-TACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAA
** * * * * *
96071 TTAGCAATATTTTACTCT-AAATAATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAC-AA
190 TTAATATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * *
96134 AGATCATAATGATTTGAGATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTC-AT
254 AGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGAT
* *
96196 AAACAGATTTAATTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
317 AAACA-AATTCATTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** ** * * * **
96256 TTAATTCTAAATAATTTTATATGAATGGAAACAATTGTTTGATGACAAAACAAAATGTCATAACA
380 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * ** ** *
96321 ATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGAA-CATGACTATTTCAACTTATTTGGTAAATGGGTTTAT
445 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-AATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTAT
* ** *
96385 TTTTTAAAT-ATCCATCTTATTAATTTT-AGAA
509 TTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTCATAA
* * * *** * *
96416 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAACCTTTTATGAATGGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
96481 CAAAACAAAATA-TCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAGACTTATAACTATTTGAACT
65 CAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAAT
* * * * * * * *
96545 CGCTCAATAAACATATTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGGAATTTTAATAAATT
129 TGTTTAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATATTCTACTTATTAATTTTA-AAATATTAATAAATT
* ** * * * * *
96610 AGTATT-TTTTATTCCAAAAAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAATG
192 AATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * *
96673 GTCATAGCGATTT-AAATAAATATTTGTTCAAATAGTGATAACCATTTGAA-TGTGTTTAGA-AA
256 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TG-TTCGATAA
* ** * * *
96735 ACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATT
319 ACAAATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATT
* ** * * *
96798 CTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTGTTTTTTGACAAAACCAAAGGTCATAAT
381 TTATTTTG-AATAAGCTTATATGAACAGAAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * *
96861 -ATTTTGAAATAGATCATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTCT
444 GA-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATT-T
* * * * *
96925 TTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTAGAA
507 ATTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTCATAA
** * * * *** * *
96959 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATATAAAATAATCTTATATTAATTGAAATAAATGTTTTATTA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * ** * * * *
97024 CAAAA-AAAAGGTAACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATGACT-ATTTAAACT
65 CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAA-T
** * * *
97087 TGTTT-GATAAATGTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT
129 TGTTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATT
* ** * * * *
97151 AATATTATTTTA-ATCCAATAAGCTTGAATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG
192 AATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * *
97215 TCATAAC-AATT----T-G----TTGTTCAAATACTCATAACAATTTGAACTTGCTCGATAAACA
257 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACA
* ** * **
97270 AATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTTTATTATTTTA-
322 AATTCATTTTT-AAATCTCCTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* ** * * *
97333 TTTGAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAAAGT--TATTGCAAT
385 TTTG-AATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATG--AT
* * * * * * ** *
97396 TTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAGTAGATTCATTTT
447 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTT
* *
97461 TTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGA-AA
511 TTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCATAA
* * * * *
97491 TATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATT-TTTTTTGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* * * * *
97555 C-AAA-AAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTG-ATTT
65 CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAATT
* * * * *
97617 AGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA
130 -GTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTCTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTA
* * * ** * *
97682 GTATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTACGAATATAAACTATTGTTTTAT-A-ATAGACAAAAA
193 ATATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAG
* * ** * * *
97744 GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAA
256 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAA
* * * * *
97808 -AAGATTTACTTTTTAAAT-T--T--TTATTAATTTTTTAAAATATAAATAGATTAGTATTGTTT
320 CAA-ATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * **
97867 TGTTTCGAACAAACTTATAGGAACAGAAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
382 TATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGAT
* * * * * * * * *
97932 TTAAAATAAATAATTGTGCAAATAGTCACAATTATTAGAACTAGTT-AGGTAAATAGAATTATTT
447 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAGATTTATTT
* *
97996 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TTAAA
511 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAT-AA
* * * ** * *
98026 TATTAATAAATTCA-TTTTATTTTGTTTCGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAT-TTTTTTTTAT
1 TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAA-CAAAAATAATTGTTTTAT
* * * * * ** *
98089 AATAAAAC-AAAAGCTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTG-A
63 GACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAA
* ** * * * * * * * *
98152 ACTGTTTCAACAAACAAATTTAATTTTTAAAT-CTCTTAATTATTAATTTTTGAACTATTATTAG
127 ATTGTTT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTC-TACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAA
* * * * * * ***
98216 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACATAAATAACAATTTTATGACATAATA-A
189 ATTAATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACA-AA-ACA
* * * ** * * * *
98280 AAAGTTTAATTTTTAAATAATTGATTTGAGGTATACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
252 AAAG--------GT-CATAA-CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * * * * *
98345 ATGGTTTGGTTAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTT-GAAAGATTAATAAA
307 CTTGTTCGATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA
* * * * *
98409 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATTGCTATATGACT-AAACAA
370 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAA
* * * * *** *
98472 AAAGTAAT-ATCAATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCAG
433 AAGGTCATAAT-GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG
* * * ***
98535 TAAATAGATTCACTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTTGGAA
496 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCATAA
* * * *** * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * **
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* * * * ** * * * * *
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* * ***
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* * * *
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* ** * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* * ** * * * * *
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*** ** * * * **
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* * * * * ** * *
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* * ** ** * ** * * *
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* *
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* * * *
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* **
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* * * * *
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* * * * * **
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** * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGATGAAAAAAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTCAAA
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90685 TTTACTTATT
* * * * *
90695 AATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATGATTTTA-TTCCAA-ACAAACTTATTTGAACCA-AAA
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* *
90757 CATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCAT
63 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCAT
** * * * * * *
90822 AATTATTTGAACTAGTTCAACAAGCAAAATTATTTTATATATCTCCTGCTGATTAATTTTTGAAA
128 AATTATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTATAAATCTCCTACTGATTAATTATTCAAA
* * *
90887 TATTAATTATTTTATTTTATTTTATTCCAAATAAATTAGTAAGAATGGAAAAAATTATTTTACGA
193 TATTAATAATTGTATTTTATTTTATTCCAAATAAATTAGTAAGAATGAAAAAAATTATTTTACGA
* * * * *
90952 CAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTG
258 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTAGAACTG
* * * * * ** *
91017 GTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATT
323 ATTTGATAAACAAATTTATGTTTTAAATCTCTAACATATC
* * * * * * ** *
91057 AATTTTCATAGTATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTCAATAAGCTTGTATGAACAG-AATAA
1 AATTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTCAATAAAATTGTATGAACAGAAACAA
* * * *
91121 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGCCATAAC
66 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
* * * * * *
91186 TATTTGAACTAATTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTATTCAAATAT
131 TATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTATAAATCTCCTACTGATTAATTATTCAAATAT
* ** * * *
91251 TAATAAATTAGTA-TTT-TTTTATTCTAAATAGGCTT-GTATG-ATGAAAAAAATTGTTTTATGA
196 TAAT-AATT-GTATTTTATTTTATTCCAAATA-AATTAGTAAGAATGAAAAAAATTATTTTACGA
* * * * * *
91312 C-AAACTAAAGGTTTATAACAA-TTGAAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTAGAAC
258 CAAAACAAAAGG-TCATAACAATTTG-AAATAAAGAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTAGAAC
*
91375 TGATTTGATAAACTAATTTATGTTTTAAATCTCTAACATATC
321 TGATTTGATAAACAAATTTATGTTTTAAATCTCTAACATATC
* * *
91417 AATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTT-AGATAAAATT-TAATGAGCTGAAAC
1 AATTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTCA-ATAAAATTGT-ATGAACAGAAAC
* * * * * * *
91479 AATTGGTTTATGATAAAATAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATTA-TCAT
64 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAA-TAGTCAT
* * *
91543 AATTATTTGAACTTGTTGGGCAAACATATTTATTT
128 AATTATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTT
91578 ATTTTTAATT
Statistics
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Consensus pattern (362 bp):
AATTTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTCAATAAAATTGTATGAACAGAAACAA
TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
TATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTATAAATCTCCTACTGATTAATTATTCAAATAT
TAATAATTGTATTTTATTTTATTCCAAATAAATTAGTAAGAATGAAAAAAATTATTTTACGACAA
AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTAGAACTGATT
TGATAAACAAATTTATGTTTTAAATCTCTAACATATC
Found at i:91809 original size:17 final size:17
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91762 AAAAACCATA
91772 ATTATTAATTTTTAGAAT
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91807 ATT
1 ATT
91810 TTACTCTGAA
Statistics
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Consensus pattern (17 bp):
ATTATTAATTTTAGAAT
Found at i:92922 original size:181 final size:175
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 3.2 Consensus size: 175
92347 TTCTAAATAA
* * * * * * *
92357 AATTGTTCAAATACTCATAATGATTTAAACTTGTTCT-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTT
1 AATTATTCAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTAGTT-TAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTT
* ** * * * * * *
92421 TA-CTTTTGAATTGTCTTAATGTTAATAAATTTGTATTAGTTTATTCGGAATAAGCATGTATGAA
64 TATC-ATT-AATTGTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCATGTACGAA
* * * * * * *
92485 TAGAAAAAATTATTTTATGTCAAAATAAAAATTTATAGTGATTTCAAATAAAT
126 TAG---AAATTATTTTTTGTAAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* * * * * *
92538 AATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTAGTAATCATATTCATTTTTTATATCATTT
1 AATTATTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT-ATTT
* * * * * * * *
92603 AATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTATATC-AA
64 TATCATTAATTGTCAAAATATTAATAA-TTAGTATTATTTTAATCT-GAATAAGCATGTA-CGAA
* * ** *
92666 TTG-AATT-TTTTTTG-ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
126 TAGAAATTATTTTTTGTA-AAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* * *
92714 AATTATTCAAATAGTCATGAATATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTT
1 AATTATTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTTT
*
92779 ATGCATTAATTGTCAAAATATTAATATATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCACGTACGAATA
65 AT-CATTAATTGTCAAAATATTAATA-ATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCATGTACGAATA
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128 GAAATTATT-TTTTGTAA-A-AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT
92895 AATTACTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACT
1 AATTA-TTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACT
92926 CATTTGATAA
Statistics
Matches: 308, Mismatches: 59, Indels: 42
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (175 bp):
AATTATTCAAATAGTCATAATATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTA
TCATTAATTGTCAAAATATTAATAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCATGTACGAATAGAA
ATTATTTTTTGTAAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT
Found at i:93401 original size:180 final size:181
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93205 TGATAAACAT
93215 ATTTATTTTTAAAATTTTCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTAAAATTTTCAACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * *
93279 TTGAATAA-ATTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAAGGATTTG
65 CTAAATAAGATTT-TATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATCATAAGGATTTG
* *
93343 AAATAAATAATTATTCAAATA-TCTTTACTATTTGAGCACGCTTAGTAAATAG
129 AAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCACGCTTAGTAAATAG
* ** * *
93395 ATTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTAAAATTTTCAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
* * * *
93460 TAAATAAGCTTTTATGAACATAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
66 TAAATAAGATTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATCATAAGGATTTGAA
* * * * *
93525 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAACA-
131 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG--AGC-------ACG-CTT-AGTAAATAG
* * *
93586 AGTTTATTTTTTAAATTTT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT
1 A-TTTATTTTTAAAATTTTCAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * * *
93650 CAAAATAAG-TTTACATG--CATGAACCAATT-GTTTAATGACAAAACAAAATG-TCATAATGTT
65 CTAAATAAGATTT-TATGAACA-AAAACAATTGGTTT-ATGATAAAACAAAA-GATCATAAGGAT
* * * * * * *
93710 TTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTTGTAAATAG
126 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCACGCTTAGTAAATAG
* * * * *
93766 ATTCATTTCTT-AACTCCCTT--ACTCT-TTAGTTTTTGGAATATTAATAAATTAATATT-TTTT
1 ATTTATTT-TTAAAAT--TTTCAACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * ** * * *
93826 TTTC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTAAAAAACAA
62 ATTCTAAATAAGATTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAA
93875 TTATTCAAAG
Statistics
Matches: 399, Mismatches: 53, Indels: 57
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Consensus pattern (181 bp):
ATTTATTTTTAAAATTTTCAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
TAAATAAGATTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATCATAAGGATTTGAA
ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCACGCTTAGTAAATAG
Found at i:93747 original size:190 final size:191
Alignment explanation
Indices: 93396--93749 Score: 536
Period size: 190 Copynumber: 1.9 Consensus size: 191
93386 AGTAAATAGA
* * *
93396 TTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTCT
1 TTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCA
* *
93461 AAATAAGCTTTTATGAACATAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
66 AAATAAGCTTTCATG-ACATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
93526 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAG
130 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAG
* *
93588 TTTATTTTTTAAA-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCA
1 TTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCA
* * *
93652 AAATAAG-TTTACATG-CATGAACCAATT-GTTTAATGACAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGA
66 AAATAAGCTTT-CATGACAT-AAACAATTGGTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* *
93714 AATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAA
128 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
93750 CATGTTTTGT
Statistics
Matches: 147, Mismatches: 12, Indels: 8
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (191 bp):
TTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCA
AAATAAGCTTTCATGACATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAG
Found at i:94392 original size:181 final size:180
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 32.3 Consensus size: 180
94060 AAATAAATGG
* * *
94070 ATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * * * *
94133 TTTAAATAAGGTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAA-AGTTATAATGATTT
64 TTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTT
** * * *
94197 TTAATA-AGTAATTGTTGAAATAGTCATAATAATTTAAACTTGTTTGGCAAACAA
128 GAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * * * *
94251 ATTCATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTCATTTTTGTAATATTAATAACTTAGTATTATGTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
94316 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAATAGTT-TTTTCATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGA
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTT-ATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGA
* * * ** *
94380 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAGTAAACAT
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * * * * *
94432 ATTTATTTTTAAAATGTTTTTCTTATTAATTGTTAAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAATA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT
* * * * * * * *
94497 T-GACTAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTATAATAGAAA-AAAAG-TGATAACAATTTG
65 TCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAGATCATAACGATTTG
* * ** ** * *
94559 AAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCATTTTATAAATAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * *
94612 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATAATAATATATTAGTGTTACTTTATTG
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *** * * * *
94673 CAAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAA
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAA
* *** *
94738 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTCAACCAATTAGGTAAACAA
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * *
94789 AATTA-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-T
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * * *
94851 TCAAAATAAG-TTAGTATGAGTTCAAAAAAACTTATTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA
65 TC-GAATAAGCTTA-TATGAATT-GAAACAA-TTA-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGA
** * * * ** *
94915 TTTGAAATAGATACGTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTCAGCAAACAA
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * * * * *
94972 ATTTATTTTTTAATTATCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* *** * * * * * *
95037 CAAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATG-TTATAACAATTT-A
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGA
* ** * * * * * * *
95100 GAGTTTACAATTATTCACACAGTCAT-ATATTTGAACTAGTTTGGTAAATAG
130 -AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* *
95151 ATTTATTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAATTTTTGAAAGATCAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * ** * * ** **
95212 TGAATAAGCATAAATG-ATCAAAACCAATTATTATATGACCAAACAAAAGGCCATAA-TTTTTGG
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTT-G
* * ** *
95275 TAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTACTTTGGTAAACTA
129 -AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* *
95329 ATTTATTTTTTAAATCTC---C----T-A---TCGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * *
95383 TGAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAATAGAACCAAAGGTTATAAGGA-TTGAA
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTG-A
* * *
95447 AATAGATAATTGTTCAAATAG-----------GAAC-TGATTTAGTAAATAG
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAA
* * *
95487 ATTTATTTTTTAAATCTCCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTCTTTTGTT
1 ATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * *
95551 CCGAATAGGCTTGTATG-ACGGAAAACAATTATTTTAAT-ACAAAACAAAAGTTCATAATGATTT
65 TCGAATAAGCTTATATGAATTG-AAACAATTATTTT-ATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTT
* * * * * * * * * **
95614 GACATAGATAATTATTTAAATGGCCATAATTATTT-AAATCGATTCGATAAACTG
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAA
* * * *
95668 ACTTATTTTTTAAATCT-TTACCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * ***
95732 TCAAATAAGCTTTTGTGATTTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-
65 TCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATT-TG
* * * ** *** *
95796 AAATAGATAATAGTTCAAA-AGTCATGACTATTTAAACTTAATCAATAAATAA
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * * * *
95848 ATTTATTTTTTAAA-AT-TT-GTT-GT--TTGTT-AATATTATGAATGAAATTAGGATTATTGTA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA-A-TATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA
* * ** * * * *
95906 TTTTGAATAAGCATGGATGAGTTG-AA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTT
63 TTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTT
* * ** * * **
95969 GAAATAGATAATCGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTAGCAAACTC
128 GAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * * *
96023 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-C
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
96086 TCTAAATAATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAC-AAAGATCATAATGATTTG
65 TC-GAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTG
* * ** *
96150 AGATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCATAAACAG
129 AAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * *
96202 ATTTAATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTAATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * * *
96262 CTAAATAATTTTATATGAATGGAAACAATTGTTTGATGACAAAACAAAATG-TCATAACAATTTG
66 C-GAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTG
* * * * * ***
96326 AAATAGATAATAGTTCAAAT-GAACATGACTATTTCAACTTATTTGGTAAATGG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCAT-AATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * *
96379 GTTTATTTTTTAAATATC-CATCTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
96442 CCGAATAACCTTTTATGAATGGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTAA
65 TCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGA
* * * * * * * *** *
96507 AATAAATAATTATTCAAAGACTTATAACTATTTGAACTCGCTCAATAAACAT
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * *
96559 ATTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGGAATTTTAATAAATTAGTATT-TTTTATT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * ** * * * *
96623 CCAAAAAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAGCGATTT-A
65 TCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGA
* * * * * *
96687 AATAAATATTTGTTCAAATAGTGATAACCATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACAA
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAA
* * * * *
96739 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTCTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAT
** ** * * * * *
96802 TT-GAAATAAGCTTGCATGAA-CAAAACCAATTGTTTTTTGACAAAACCAAAGGTCATAA-TATT
64 TTCG-AATAAGCTTATATGAATTGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGA-T
* * * *
96864 TTGAAATAGATCATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAT
126 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* *
96920 ATTCTTTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 ATT-TATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * * * * * * * * *
96983 TATAAAATAATCTTATATTAATTGAAATAAATGTTTTATTACAAAA-AAAAGGTAACAATGATTT
63 TTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTT
* * * * ***
97047 GAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATGACTATTTAAACTTGTTTGATAAATGT
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * ** * *
97101 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-AT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
97165 CCAATAAGCTTGA-ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAAC-AATT-
66 CGAATAAGCTT-ATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTG
* * * * *
97226 ---T-G----TTGTTCAAATACTCATAACAATTTGAACTTGCTCGATAAACAA
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * **
97271 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTTTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * ** *
97335 T-GAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAAAGTTATTGCAATTT
65 TCG-AATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTT
* * * ** *
97398 CAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAGTAG
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * *
97452 ATTCATTTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
97517 TTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATT-TTTTTTGACAAAA-AAAAG-TCATAACAATTTGA
65 TCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGA
* * * *
97579 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTG-ATTTAGTTTGGTAAACAT
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAA
* * * * **
97631 ATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT
* * * * * *
97696 T-GAATAAGCTTGTACGAATAT-AAACTATTGTTTTAT-A-ATAGACAAAA-AGTCATAATGATT
65 TCGAATAAGCTTATATGAAT-TGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAGA-TCATAACGATT
* * * *
97756 TGAAATAAATAATTGCTCAAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAA-AA
127 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAA
* * * * * *
97810 GATTTACTTTTTAAA--T-TT--TTATTAATTTTTTAAAATATAAATAGATTAGTATTGTTTTGT
1 -ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * ** * * * * * *
97870 TTCGAACAAACTTATAGGAACAGAAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTA
64 TTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTG
* * * * * * *
97935 AAATAAATAATTGTGCAAATAGTCACAATTATTAGAACTAGTTAGGTAAATAGA
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-A
* * *
97989 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTGTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * * *
98052 TCGAATAAGC-TAGTATGAATTGAAA-ATTTTTTTTTATAATAAAACAAAAGCTCATAACGATTT
65 TCGAATAAGCTTA-TATGAATTGAAACA-ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTT
* ** ***
98115 GAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAAC-TGTTTCAACAAACAA
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTT-GGTAAACAA
* * * * *
98169 ATTTAATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAACTATTATTAGATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * ** *
98234 CAAATAAACTTGTATGAACAT-AAATAACAATTTTATGACATAATA-AAAAGTTTAATTTTTAAA
66 CGAATAAGCTTATATGAA-TTGAAACAATTATTTTATGACA-AA-ACAAAAG----A----T-CA
* ** * * * * * * * *
98297 TAATTGATTTGAGGTATACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAATGGTTTGGTTAATAG
119 TAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* *
98361 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
98426 TGAATAAGCTTGTATG-A-T-AAAAAATAATTGCTATATGACTAAACAAAA-AGTAATATCAATT
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATT--T-TATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATT
* * * * ** * *
98487 TGAAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCAGTAAATAG
127 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAA
* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
98603 CAAACAAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAA
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAA
*
98668 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAACAA
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
** * * *
98719 ATTTATTTTTTAAAAAT-TTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * *** * * * * ** * *
98783 TGGATAAGCTTTTATGAACCAAAACAAATGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTGTAACCATTTTAA
66 CGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAA
** ** *
98848 ATCA-ATAATTGTTCACTTAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAT
131 AT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * * * *
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1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * *
98962 TTCTAAATAACCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACGAAATATCATAACGATC
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* * * ** * * ** *
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127 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTA-AA-CAA
* * * * *
99080 ATTT-TTTTTTAAA--TCGT--TTGTTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
* * * ** * * * *
99139 TCAAATAACCTTCTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCTTAATGATTTG
65 TCGAATAAGCTTATATGAAT-TGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTG
* * * *
99202 AGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAT
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * *
99255 ATATATATTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATCAGCATTATTTTATT
1 ATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** ** ** *
99320 TC-AATAAGCTTGTATG-A-T-AAA-AAAAAAATTATGATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
65 TCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGA
** * * *
99380 AATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAAC-TGATTTGGTAAACATA
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGGTAAACA-A
* * ** *
99433 TTTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTAAAAATATAAATAAATTAG---TA-TTT-TTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * *
99493 CCACTTAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTATTTTATGATAAATCAAAATG-TTATAACAATTTT
66 CGA-ATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTG
* * *
99557 AAATAGACAATTGTTCAAATAG-CAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* *
99610 ATTTATTTTTGTAAATCTCTGT-CTTATTAATTTTTCG-AATGTTAA-AATATTAGTATTAATTT
1 ATTTATTTTT-TAAATCTCT-TACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTT
* * * * * * * *
99672 A-TTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTAATAACTAAACAAAAGGTGAGAACAAT
62 ATTTC-GAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGAT
* ** * * * * *** *
99736 TTGAAATAGATAATTTTTTGTAATAGTCTTAACCATTTGAAGTTATTCAATAAAAAA
126 TTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
* * * * *
99793 ATTTATTTTCTAAATCCCTTGCTTATTAATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
99852 CTAATCCGAA
Statistics
Matches: 4360, Mismatches: 971, Indels: 539
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
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159 1 0.00
161 1 0.00
165 1 0.00
166 1 0.00
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169 87 0.02
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181 981 0.22
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189 10 0.00
190 2 0.00
191 12 0.00
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Consensus pattern (180 bp):
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ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
Found at i:94747 original size:357 final size:355
Alignment explanation
Indices: 94069--99851 Score: 3458
Period size: 357 Copynumber: 16.2 Consensus size: 355
94059 CAAATAAATG
* *
94069 GATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA
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* * * * * * *
94132 TTTTAAATAAGGTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTT
64 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAAC-AAA-AAAAAGTCATAACGATTT
** * * * ** * * * *
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127 GAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TATTTGATAAATAGATTTATTTT
* * * *
94260 TTAAATCTCTTAGTTATTCATTTTTGTAATATTAATAACTTAGTATTATGTTATTTCGAATAAGC
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* * * * * *
94325 TTATATGAATTGAAATAGTT-TTTTCATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
250 TTATATGAATAGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* *
94389 TTGTTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAGTAAACA
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* * * * * * *
94431 TATTTATTTTTAAAATGTTTTTCTTATTAATTGTTAAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAAT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
94496 ATGACTAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTATAATAGAAAAAAAGTGATAACAATTTGAA
66 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACA-AAAAAAAGTCATAACGATTTGAA
* * *
94561 ATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCATTTTATAAATAGATTTATTTTTTAAA
130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
94626 TCTCTTATTAATTTTTGAAATAATAATATATTAGTGTTACTTTATTGCAAATAAACTTATATGAA
194 TCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA
* * * * *
94691 CAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
259 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
94756 AGTCATAATTATTTCAACCAATT-AGGTAAACA
324 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-GTAAACA
* * * * * *
94788 AAATTA-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTAT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAT
*** * * * *
94851 TCAAAATAAG-TTAGTATGAGTTCA-AAAAAACTTATTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
65 TTTGAATAAGCTT-GTATGA-AT-AGAAACAA-TTA-TTTTATAACAAAA-AAAAG-TCATAACG
** * * * * * * * *
94914 ATTTGAAATAGATACGTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTCAGCAAACAAATTTATT
123 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTGA-TAAATAGATTTATT
* * * * * *
94979 TTTTAATTATCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTCCAAATAA
187 TTTTAA--ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
* * * * * * * ** * ** *
95044 GCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTT-AGAGTTTAC
248 GCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAGAT
* * * ** *
95108 AATTATTCACACAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTTGGTAAATA
312 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
* * *
95150 GATTTATTTTTTAAA---TTT-CTTATTAATTTTTGAAAGATCAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * * * **
95211 TTGAATAAGCATAAATG-ATCA-AAACCAATTATTATATGACCAAACAAAAGGCCATAA-TTTTT
66 TTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAA-CAATTATTTTAT-AACAAA-AAAAAGTCATAACGATTT
* * * *
95273 GGTAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTACTTTGGTAAACTA-ATTTATTT
127 -G-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTTGATAAA-TAGATTTATTT
* * * ** *
95337 TTTAAATCTC---CT-A---TCGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTA
188 TTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * * * * * * *
95395 TATGAATTGAAACAATTATTTTATAATAGAACCAAAGGTTATAAGGA-TTGAAAATAGATAATTG
253 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTG
* *
95459 TTCAAATAG---GAAC----TG-A-T--TT-AGTAAATA
317 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
* * * * *
95486 GATTTATTTTTTAAATCTCCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTCTTTTGT
1 GATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * ** *
95550 TCCGAATAGGCTTGTATG-ACGGAAAACAATTATTTTA-ATACAAAACAAAAGTTCATAATGATT
65 TTTGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTATTTTATA-ACAAAA-AAAAG-TCATAACGATT
* * * * * * * * * *
95613 TGACATAGATAATTATTTAAATGGCCATAATTATTTAAATCGATTCGATAAACT-GACTTATTTT
126 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTATTTGATAAA-TAGATTTATTTT
* * *
95677 TTAAATCTTTACCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGC
189 TTAAATC--T--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * *
95742 TTTTGTGATTTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGATAA
250 TTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAA
* * * * * *
95806 TAGTTCAAA-AGTCATGACTATTTAAACTTA-ATCAATAAATA
314 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAGTAAACA
* * * * * * * * *
95847 AATTTATTTTTTAAA--ATTT-GTT-GT--TTGTTAATATTATGAATGAAATTAGGATTATTGTA
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
95906 TTTTGAATAAGCATGGATGAGTTG-AA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTT
64 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAAC-AAA-AAAAAGTCATAACGATTT
* * * *
95969 GAAATAGATAATCGTT-ATAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTAGCA-AACT-CATTTATTT
127 GAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTT-G-ATAAATAGATTTATTT
* * * * *
96031 TTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-CTCTAAATA
188 TTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATA
* * * * *
96094 ATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGAT
247 AGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* *
96158 AAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCA-TAAACA
312 -AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
* * *
96201 GATTTAATTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTAATT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * ** * * * * * *
96262 CTAAATAATTTTATATGAATGGAAACAATTGTTTGATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGA
66 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAA-AAAA-GTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
96327 AATAGATAATAGTTCAAAT-GAACATGACTATTTCAACTTATTTGGTAAATGGGTTTATTTTTTA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TATTTGATAAATAGATTTATTTTTT-
* * * * *
96391 AATATCCATCTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAACCTTT
191 AA-AT-C-TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * ** ** * * *
96455 TATGAATGGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTAAAATAAATAATTAT
253 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
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* * *
96558 TATTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGGAATTTTAATAAATTAGTATT-TTTTA
1 GATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
*** * * * * * * *
96621 TTCCAAAAAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAGCGATTT
64 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAA-AAA-AGTCATAACGATTT
* * * * * * * *
96686 -AAATAAATATTTGTTCAAATAGTGATAACCATTTGAATGTGTTTAGA-AAACAAATTTATTTTT
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTATTT-GATAAATAGATTTATTTTT
* * * * *
96749 TAAATTTTTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTCTATTTGAAATAAGC
190 TAAA---TCTCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
** * * * *
96813 TTGCATGAACA-AAACCAATTGTTTTTTGACAAAACCAAAGGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATC
250 TTATATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATA
* * * *
96876 ATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA
313 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
* * * * *
96919 TATTCTTTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 GATT-TATTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * * * * * * * * * *
96983 TATAAAATAATCTTATATTAATTGAAATAAATGTTTTATTACAAAAAAAAGGTAACAATGATTTG
64 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAAAAAA-GTCATAACGATTTG
* * * *
97048 AAATAGATAATTGTTCAAATATTCATGACTATTTAAACTTGTTTGATAAAT-GTATTTATTTTTT
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTTGATAAATAG-ATTTATTTTTT
* ** * * *
97112 AAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCCAATAAGCTT
191 AAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * *
97176 GA-ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-CAATT----T-G----TT
252 -ATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
97230 GTTCAAATACTCATAACAATTTGAACTTGCTC-GATAAACA
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACA
* * * * **
97270 AATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTTTATTATTTTA-
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * ** *
97333 TTTGAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAAAGTTATTGCAATTT
65 TTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTAT-A-ACAAAAAAAAGTCATAACGATTT
* * * * * *
97398 CAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT-TGTTCGGTAAGTAGATTCATTTTT
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TT-GATAAATAGATTTA-TTTT
* * **
97462 TTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
189 TTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * **
97527 TTATATGAACTA-AAATAATT-TTTTTTGACAAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAA
250 TTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * ** **
97588 TTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATTTAGTTTGGTAAACA
314 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
* * * * * *
97630 TATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
97695 TTGAATAAGCTTGTACGAATATAAACTATTGTTTTATAATAGACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
66 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACA-AAAAAAAGTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
97760 ATAAATAATTGCTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAAAAGATTTACTTTTTAAA
130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * * * * * *
97825 T-TTTTATTAATTTTTTAAAATATAAATAGATTAGTATTGTTTTGTTTCGAACAAACTTATAGGA
194 TCTCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA
* * * ** * * *
97889 ACAGAAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTGCAAA
258 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * *
97954 TAGTCACAATTATTAGAACTAGTT-AGGTAAATA
323 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-GTAAACA
* * * * *
97987 GAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTGT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAT
* * * * * *
98051 TTCGAATAAGCTAGTATGAATTGAAA-ATTTTTTTTTATAATAAAACAAAAGCTCATAACGATTT
65 TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATTATTTTATAACAAAA-AAAAG-TCATAACGATTT
* ** * * * * * *
98115 GAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTGTTTCAACAAACAAATTTAATTTTT
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTT-GATAAATAGATTTATTTTTT
* * * *
98180 AAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAACTATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTT
191 AAATCTC----TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * *** * *
98245 GTATGAACATAAATAACAATTTTATGACATAATA-AAAAGTTTAATTTTTAAATAATTGATTTGA
252 ATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA-AA-ACAAAAG--------GT-CATAA-TGATTTGA
** * * * * * ** * *
98309 GGTATACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAATGGTTTGGTTAATA
305 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
* * * *
98360 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
98425 TTGAATAAGCTTGTATG-ATA-AAA-AATAATTGCTATATGACTAAACAAAAAGTAATATCAATT
66 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATT--T-TATAAC-AAA-AAAAAGTCATAACGATT
* * * * * * * *
98487 TGAAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAACTGA-TTCAGTAAATAGATTCACTTT
126 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTGA-TAAATAGATTTATTTT
* * * *
98551 TTAAATCACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTCAAACAAGCTTAT
189 TTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAT
* * *
98616 ATGAATTGAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTT
254 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * **
98681 CAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAACA
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
* ** * * *
98718 AATTTATTTTTTAAA-AATTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * ** ** * *
98782 TTGGATAAGCTTTTATGAACCA-AAACAAATGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTTGTAACCATTTT
66 TTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATAACAAAA-AAAA-GTCATAACGATTTG
** * * *
98846 AAATCA-ATAATTGTTCACTTAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACATATTTATTTTT
128 AAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TTGA-TAAATAGATTTATTTTT
* * * * *
98909 TCCAATCTTTTGCTCATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTA-TTCTAAATAA
190 T-AAATC---T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAA
* * * * * * * ** * * *
98972 CCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACGAAATATCATAACGATCTGAAATAAAT
248 GCTTATATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * ** * * * * * *
99036 AATTATTCTAAT-GTTTTAATTATTTAAATTGGTTCCA-CAAGCA
312 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-CAGTAAACA
* * * ** *
99079 CATTT-TTTTTTAAATC--GT--TTGTTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TA
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-
* ** * * * * * * * * *
99138 ATCAAATAACCTTCTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCTTAATGATTTG
65 TTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATAACAAAA-AAAAGTCATAACGATTTG
* * * * * *
99202 AGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACATATATATATTTTT
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTTGATAAATAGATTTAT-TTTTT
* *
99267 AAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATCAGCATTATTTTATTTC-AATAAGCTT
191 AAATCTCTTA--T-T-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* **** ** * **
99331 GTATG-ATA-AAA-AA-AAAATTATGATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCA
252 ATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * **
99392 TTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT-GATTTGGTAAACA
317 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAACA
* * * *
99431 TATTTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTAAAAATATAAATAAATTAGTATT-TTTTC
1 GA-TTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
*** * * * * * * *
99494 CACT---TAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTATTTTATGATAAATCAAAATGTTATAACAATTT
64 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAA--AAAAAGTCATAACGATTT
* * * *
99556 TAAATAGACAATTGTTCAAATAG-CAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTT
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAAC-TATTTGATAAATAGATTTATTTTT
* * *
99620 GTAAATCTCTGTCTTATTAATTTTTCG-AATGTTAA-AATATTAGTATTAATTTA-TTCTGAATA
190 -TAAA--TC--TCTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTC-AAATA
* * * * * * * * **
99682 AGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTAATAACTAAACAAAAGGTGAGAACAATTTGAAATAGAT
247 AGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* ** * * * * *
99747 AATTTTTTGTAATAGTCTTAACCATTTGAAGTTA-TTCAATAAAAA
312 AA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCAGTAAACA
* * ** * * * *
99792 AATTTATTTTCTAAATCCCTTGCTTATTAATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTATTATT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
99852 CTAATCCGAA
Statistics
Matches: 4214, Mismatches: 926, Indels: 563
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
336 22 0.01
337 2 0.00
338 2 0.00
339 62 0.01
340 71 0.02
341 9 0.00
343 1 0.00
344 1 0.00
345 2 0.00
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347 2 0.00
349 6 0.00
350 180 0.04
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352 102 0.02
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357 607 0.14
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362 415 0.10
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368 7 0.00
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371 5 0.00
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375 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (355 bp):
GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAAAAAAGTCATAACGATTTGAAA
TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC
TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATA
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA
Found at i:97405 original size:532 final size:530
Alignment explanation
Indices: 96023--99336 Score: 1615
Period size: 536 Copynumber: 6.2 Consensus size: 530
96013 TAGCAAACTC
* * * * * * * *
96023 ATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACT
1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
* * * * *
96087 CTAAATAATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGA
65 C-CAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAT-A----A
* * * * *
96151 GATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TGGT-TCA-TAAACAGATTTAATTTT
124 -AT--AT-ATTTGTTCAAATACTCATAACAATTTGAATGT-GTCT-AGAAAACAAATTT-ATTTT
* * ** *
96212 T-AAA--TCT-CTTATTAATT-TTTTAAATATTAATAAA-TTAGTATTATT-TAATTCT-AAATA
182 TAAAATTTTTACTTATTAATTGTCTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTCT-ATT-TGAAATA
** ** ** * * * *
96269 ATTTTATATGAATGGAAA-CAATTGTTTGATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGA
244 AGCTTGCATGAA-CAAAACCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACAATTTCAAATAGA
* * * * * ** ** * * *
96333 TAA-TAGTTCAAAT-GAACATGACTATTTCAACTTATTTGGTAAATGGGTTTA-TTTTTTAAATA
308 TAATTA-TTCAAATAG-TCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATC
* * * *
96395 TC-CATCTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAACCTTTTAT
371 TCTTA-ATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-AGAATAACCTTATAT
* * * * * * *
96458 GAATGGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCA
434 GAATTGAAATAAAT-TTTTATTACAAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * **
96523 AAGACTT-ATAACTATTTGAACTCGCTCAATAAACAT
496 AATA-TTCATGACTATTT-AACTTGTTTGATAAACAT
* * * *
96559 ATTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTAGGAATTTTAATAAATTAGTATT-TTTTAT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA
* * * * **
96622 TCCAAAAAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAGCGATTTA
64 TCC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA---A--TA
* * * * *
96687 AATAAATATTTGTTCAAATAGTGATAACCATTTGAATGTGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAA
123 AAT--ATATTTGTTCAAATACTCATAACAATTTGAATGTGTCTAGAAAACAAATTTATTTTTAAA
* * *
96752 ATTTTTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTATATCATTCTATTTGAAATAAGCTTGC
186 ATTTTTACTTATTAATTGTCTGGAATATTAATAAATTTATATCATTCTATTTGAAATAAGCTTGC
* ** * * * * *
96817 ATGAACAAAACCAATTGTTTTTTGACAAAACCAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATCATTATT
251 ATGAACAAAACCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTATT
* * * * * *
96882 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTCTTTTTTTTAATTCTCTTACTCT-
316 CAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTAAT-TA
* * *
96946 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATATAAAATAATCTTATATTAATTGAAAT
380 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TAGAATAACCTTATATGAATTGAAAT
* * ** *
97011 AAATGTTTTATTACAAAAAAAAGGTAACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATGA
444 AAAT-TTTTATTACAAAAAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATTCATGA
**
97076 CTATTTAAACTTGTTTGATAAATGT
507 CTATTT-AACTTGTTTGATAAACAT
*
97101 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATC
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC
* *
97166 CAATAAGCTTGAATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-CAAT-T-TG
66 CAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAAATATAT-
*
97228 TTGTTCAAATACTCATAACAATTTGAACT-TG-CTCGATAAACAAATTTATTTTTAAAATCTTTT
130 TTGTTCAAATACTCATAACAATTTGAA-TGTGTCTAGA-AAACAAATTTATTTTTAAAAT-TTTT
* * * *
97291 ACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTTTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAAT
192 ACTTATTAATTGTCTGGAATATTAATAAATTTATATCATTCTATTTGAAATAAGCTTGCATGAA-
** * * ** *
97355 TGAAA-CAATTGTTTTATGATAAAAAAAAAAGTTATTGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAAT
256 CAAAACCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAAT
* ** *
97419 AGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAGTAGATTCATTTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATT
321 AGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT
* * * * *
97484 TTT-GAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAAT-AATT
386 TTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAACCTTATATGAATTGAAATAAATT
* *
97547 TTTTTTGACAAAAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTT
449 TTTATT-ACAAAAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATTCATGACTATTT
* * *
97612 GATTTAGTTTGGTAAACAT
513 AACTT-GTTTGATAAACAT
* *
97631 ATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-T
** * * * * *
97696 TGAATAAGCTTGTACGAATATAAACTATTGTTTTAT-A-ATAGACAAAAAGTCATAATGATTTGA
65 CCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAAGTCAT-A--A--T-A
* * **
97759 AATAAATAATTGCTCAAATAGC-CATAATTATTTGAACTGAT-T-T-GATAAA-AAGATTTACTT
123 AAT--ATATTTGTTCAAATA-CTCATAACAATTTGAA-TG-TGTCTAGA-AAACAA-ATTTA-TT
** * * ** * *
97819 TTT-AAATTTTTA-TTAATT--TT-T-TAAAATATAAATAGA-TTAGTATTGTTTTGTTTCGAAC
180 TTTAAAATTTTTACTT-ATTAATTGTCTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTCTATTT-GAA-
** * * * * * *
97877 A-AA-CTTATAGGAACAGAAA-CATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAAT
241 ATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACAATTTCAAAT
* * * * * *
97939 AAATAATTGTGCAAATAGTCACAATTA-TTAGAACTAGTT-AGGTAAATAGAATT-A-TTTTTTA
305 AGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTA-AACTTGTTCA-GTAAACAG-ATTCATTTTTTTA
* * * * *
98000 AATCTCTTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTGTTTCGAATAAGC-
367 AATCTCTTAATTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTT-ATTAGAATAACCT
*** * * *
98062 TAGTATGAATTGAAAATTTTTTTTTATAATAAAACAAAAGCTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
429 TA-TATGAATTG-AAATAAATTTTTATTACAAAA-AAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * *
98127 TGTTCATATAGTT-TTAACTATTTGAAC-TGTTTCAACAAACAA
490 TATTCAAATA-TTCATGACTATTT-AACTTGTTT-GATAAACAT
* * * * ** * * * *
98169 ATTTAATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAACTATTATTAGATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-AT
* * * * * ** * * *
98234 CAAATAAACTTGTATGAACATAAATAACAATTTTATGACATAATAAAAAGTTTAATTTTTAAATA
65 CCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG--TCA----T-AATA
* * * * * ** * *
98299 ATTGATTTGAGGTATACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAATG-GTTTGGTTAATAGAT
123 A---A--T-A--TAT----TTGTTCAAATACTCATAACAATTTG-AATGTGTCTAGAAAACAAAT
* * * * * *
98363 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTGT-TGAAAGATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
175 TTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTCTA-TT
* ** * * * * * * *
98426 TG-AATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATTGCTATATGACTAAACAAAAAGTAATATCAATTTG
237 TGAAATAAGCTTGCATGA-ACAAAACCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACAATTTC
* * * * * * * *
98489 AAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCAGTAAATAGATTCA-CTTTT
301 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTCAGTAAACAGATTCATTTTTT
* * * *
98552 TAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTCA-AACAAGC
365 TAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T-AGAATAACC
* * * * ** *
98612 TTATATGAATTGAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAAT
428 TTATATGAATTGAAATAAAT-TTTTATTACAAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
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490 TATTCAAATATTCATGACTATTT-AACTTGTTTGATAAACAT
** * * ** * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-AT
*** * * * * * * **
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65 CCAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA---AGT---CATAATA
* ** * * * *
98847 AATCAATAATTGTTCACTTAGTCATAACTATTTGAACT-TGT-TCAGTAAACATATTTATTTTTT
123 AAT--ATATTTGTTCAAATACTCATAACAATTTGAA-TGTGTCT-AGAAAACAAATTTA-TTTTT
** * * * * * ** * * *
98910 CCAATCTTTTGCTCATTAATT-TTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCT-AAATAAC
183 AAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCTGGAATATTAATAAATTTATATCATTCTATT-TGAAATAAG
* * ** * * ** * * * * *
98973 CTTGTAAGATATGAAA-CAAATATTTTATGACTAAACGAAATA-TCATAACGATCTGAAATAAAT
246 CTTGCATGA-ACAAAACCAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAAAGTCATAACAATTTCAAATAGAT
* ** * * *
99036 AATTATTCTAAT-GTTTTAATTATTTAAA-TTGGTTCCA-CAAGCACATT--TTTTTTTAAA--T
309 AATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-GTT-CAGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATCT
* * * * * *
99094 CGT--TTGTTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAATCA-AATAACCTTCTATG
372 CTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTT-ATTAGAATAACCTTATATG
** * * * * ** * * *
99156 -ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAA
435 AAT-TGAAATAAAT-TTTTATTACAAAA-AAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * *
99220 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAT
497 ATATTCATGACTATTT-AACTTGTTTGATAAACAT
* * * * ** * * *
99255 ATATATATTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATCAGCATTATTTTATT
1 ATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
*
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TGTTCAAATACTCATAACAATTTGAATGTGTCTAGAAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTT
ATTAATTGTCTGGAATATTAATAAATTTATATCATTCTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACAAAA
CCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
TAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAG
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAGAATAACCTTATATGAATTGAAATAAATTTTTATTA
CAAAAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATTCATGACTATTTAACTTGTT
TGATAAACAT
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98236 AATAAACTTG
* *
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1 TA
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99488 TTTTTCCACT
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CTGTCTTATTAATTTTTCGAATGTTAAAATATTAGTATTAATTTATTCTGAA
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99914 TTTATCATAA
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* * ** * * * * **
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**
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* * * *
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* * *
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319 TCAATCTCAAATCATTAAAATAATTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTGGATCATACAAGCTTA
* *
100309 TTCGATTAAAAATAATACTCATTTAGTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
384 TTCGATTAAAAATAATACTAATTCAGTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
** * * * * *
100374 AAATGTGTTTACCAACCTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
449 AAATCCGTTTACCAACCTAATTCAAACAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATACTTCAAATCAT
* * * * * * * **
100439 TTTGACCTCTTGTTTAATCATAAAATATTTGTTTAATATCTTGCAAGTTTATTTGAAATAAAATT
514 TATAACCTCTTGTTTAATCATAAAACAATTATTTAATATCATACAAGTTTATTCAAAATAAAA-T
* * * * *
100504 A-TCCAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTAC
578 AGTACAAATCTAATAAAATTAAAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTAC
* * ** * *
100568 CGAATAAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATAGTTATAACATTTTC
638 CGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTA--TGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACATTTTC
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701 TTTTG
* * *
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* * *
100699 CAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTACAA
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* *
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125 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTCTGTC-ATAAAACAATTGT
* *
100827 TTAAGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATA
189 TTAAGGTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * *
100891 GGT-GATTTAAAAAATGAATCTTG-TATTGAATCACTTCAAATAATTATGTCCATTTCAATAGTT
254 AGTAGATTTAAAAAATAAAT-TTGCTATCGAAACAATTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATT
** * * ** ** * *** *
100954 ATTTATTTTAAATCATTATTATCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTTTCATACAAGTT
318 ATCAATCTCAAATCATTAAAAT-AATTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTGGATCATACAAGCT
* * * * *
101019 TATTCGGGA-T-AAAATAGTATTAATTCATTAATCTTTCAAATATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
382 TATTC--GATTAAAAATAATACTAATTCAGTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
** * * *
101082 AAATAAATCCGTTTACCAAACC-AATTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAGTTGTATACTTCAA
445 AAATAAATCCGTTTACC-AACCTAATTCAAACAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATACTTCAA
* * * * * * *
101146 ATTATTATAACCTTTTG-TTATGTCATGAAGCAATTATTT-CTGTTCATACAAGTTTATTCAAAA
509 ATCATTATAACCTCTTGTTTA-ATCATAAAACAATTATTTAAT-ATCATACAAGTTTATTCAAAA
* * *
101209 TAAAATAGTACTAATCTAATAAAATTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTG
572 TAAAATAGTACAAATCTAATAAAATTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
** * * * * * *
101274 TTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
637 CCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACATTTTCT
101339 TTTG
702 TTTG
* * *
101343 TCATAAAACAATTTTTTCAACTTATAGAAGCTTATTCGAAATACAATAAAACTAATTTATTAATA
1 ------AACAATTTTTTCAACTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATA
** * * * * * * *
101408 TTTCAAAAATTTGTAAGTGATTTAGAAAATAATTTTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATAA
60 TTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACAAATTCAAATAATTACAA
* * * * *
101473 CTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATTACTTTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGTT
125 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTCTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * * **
101538 TTTGGTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATC
190 TAAGGTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-
* * * * * * * * *
101602 AA-TAAAAGATTTATAAAGTAAA-TCGCTTAAC-AAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAG
253 AAGT---AGATTTAAAAAATAAATTTGC-TATCGAAA-CAATTCAAATAATTATGACCATTTCAA
*** * * * * ** * * * * * *
101664 CAATTATTTCTTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATAT
313 CAATTATCAATCTCAAATCATTA-AAATAATTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTGGATCATAC
* * * ** * * *
101729 AAGCTTATTCAGATT-GAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATT
377 AAGCTTATTC-GATTAAAAATAATACTAATTCAGTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * * ** * * * * *
101793 TTAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CTAGA-TCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTAT
441 TAAAAAATAAATCCGTTTA-CCAACCTA-ATTCAAACAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATAC
* * * * * * * * *
101856 TTCAAATCGTTATGA--TCTTTTTTTATAATAAAAAAATTATTTCAGT-TCATATAAGCTTATTC
504 TTCAAATCATTATAACCTCTTGTTTAATCATAAAACAATTATTT-AATATCATACAAGTTTATTC
* * ** * * * *
101918 AAAATAAAATAATACTAAGT-TGTTAATATTCTGAAAATTAA-TAATTAAAAGATTTTAAAAAT-
568 AAAATAAAATAGTAC-AAATCTAATAA-AAT-T-AAAA-AAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
* * ** * * * *
101980 GATTATATTTA-TTAGACAAGTTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAACA
627 AATT-TGTTTACCGA-ACAAG-TTCAAATAGTTAAGACTA--TGAACAATTATCTATTTAAAATA
* *
102043 -CTATAATC-TTTTGCTTTGTC
687 GTTATAA-CATTTT-CTTT-TG
**** * *** * * *
102063 ATTA-AATGATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAGA-AAATATAATAAT
1 A--ACAAT--TTTTTCAACTT-ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-ACTAATTTATTAAT
* * * * * * * *
102126 A-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTAATAACCAAATAAGTTCAAATC
59 ATTTCAA-A-AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACAAATTCAAATA
** * * * * ** * *
102189 ATTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGA-CTTTTTGTTT-TATCATAAAAC
118 ATTACAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTCTGTCATAAAAC
* * * * * * * *
102252 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATATTTATTTATTACTATTTCAAT
183 AATTGTTT-AAGGTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
102315 AATTAATAAGTAAAATTTTTTTAAAAATAAATATCT-TTACCG-AACAAGTTCCAATAGTCATGA
246 AATTAATAAGT-AGA---TTTAAAAAATAAAT-T-TGCTATCGAAACAA-TTCAAATAATTATGA
** * * * * ** * * * *
102378 TTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT-TTTTTTTTGTAATAAAACAATTG-TT
304 CCATTTCAACAATTATCAATCTCAAATCATTA--AAATAATTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * * * *
102441 TCAATTCATATAAGCTTGTTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-A
367 TGGA-TCATACAAGCTTATTCGATTA-AAAATAATACTAATTCAGTAATATTTCAAAAATTAATA
* * ** * * * ** *
102504 TACTAAGAGAATTGT-AAAAAT-GATTTGTTTATCGAA-C-AAGTTCTAATAGTTATGAGTATGT
430 -AGTAAGAG-ATT-TAAAAAATAAATCCGTTTA-CCAACCTAA-TTCAAACAGTTAAAACTAT-T
* * * * * * ** * **
102565 AAAACAA--ATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGT-
489 AGAACAATTATATACTTC-AAATCATTATAACCTCTTGTTTAATCATAAAACAATT-ATTTAATA
* * * * * * * * **
102626 TCATGCAAGCTTATTTC-CAATAACATAATATC-AATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
552 TCATACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAGTA-CAAATCTAATAAAATTAAAAAAATTAATAAG--
* * * ** ****
102689 AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAATTCTTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAAATT
613 -AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA-AGACTA--TGAAC-AATT
* * * * *
102753 -TTTATTTCAATTCA-TTATGACCATTTTGTTTTG
673 ATCTATTTAAAAT-AGTTAT-AACATTTTCTTTTG
* * * * *
102786 TCATAAACCAATTTGTTCTA-TTCA-AACAAGTTTATTCGAAATAAAA-AAATATTAATTTATTA
1 -----AA-CAATTTTTTCAACTT-ATAA-AAGCTTATTCAAAATAAAATAAA-ACTAATTTATTA
* * * * * *
102848 ATA-CTAAAAAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAGCAAGTTCAAATA
57 ATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACAAATTCAAATA
* ** * * * * *
102912 GTTATGACTATTTGAACAATCATTTATTTCAAGTCATTATGA--TATTTTGTTT-TATCATAAAA
118 ATTACAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT-TTTTGTTTCTGTCATAAAA
* * * * * ** *
102974 CAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTTTTA-CTCTAA
182 CAATTGTTT-AAGGTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
* * * * * *
103037 AAATTAATAATTTGAAGATTTAAAAAATTAATTTG-TTTACTAAACAAGTTCAAATAATCATGTC
245 AAATTAATAA---GTAGATTTAAAAAATAAATTTGCTAT-CGAAACAA-TTCAAATAATTATGAC
* * * * * * * ** *
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305 CATTTCAACAATTATCAATCTCAAATCATTAA-A-ATAATTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTT-
** ** * * * **
103165 T--ATTCATACAAAATTGCTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTGCTATTTCAAAAA-T--TA
367 TGGA-TCATACAAGCTTATTC-GATTAAAAATAATACTAATTCAGTAATATTTCAAAAATTAATA
* ** * * ** *
103224 A-TAAGACATTTAAAAAATAAATCTC-TTTATTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
430 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-CGTTTA-CCAACCTAATTCAAACAGTTAAAACTATTAGAA
* * * * * ** * * * *
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*** * * * **
103348 ACAAGTTTATTTTGAGTAAAATATTACTAAAT-TAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAT
556 ACAAGTTTATTCAAAATAAAATAGTAC-AAATCTAATAAAATTAAAAAAATTAATAAG--AG-AT
* * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
103569 TT-AGAAAATTAATAAATAAGAAATTTTTAAAAAATAAATTTGTTGACTAAATAAGTTCAAATAG
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** * * *
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119 TTACAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTCTGTCATAAAACA
* ** * ** * * *
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184 ATTGTTTAAGGTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
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* * ** * * * * ** * **
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* * * * * * * * **
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370 ATCATACAAGCTTA-TTCGATTAAAAATAATACTAATTCAGTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* *** * * **
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* * * * * *
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496 TTATATACTTCAAATCATTATAACCTCTTGTT-TAATCATAAAACAATTATTTAATA-TCATACA
* *** * * * * * * *
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* * *
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*
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT
* * * * ** * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
101749 AATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATC
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * **
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT
* ** * * **
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* *
102651 TAATA-TCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * * **
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* ** * * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * ** **
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1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT
** * * * *
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* ** *
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * **
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * * * *
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** * * ** * **
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* * * * ** ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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104400 CA
180 CA
** * * * * * * * *
104402 TTATGACCTTTTGTTTTGTGTTAAAACAAATGATTTTATTCAAATAAGTTTGTTCAAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT
* * * * *
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** * *
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130 CGAACTAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA
* * * * * * * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* ** * * ** * * *
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* *
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* * * * * * * * *
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*
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* * * **
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127 TATCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA
* * ** *
105143 TTATGA-CTTTTAGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGGATTAAAA
1 TTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
* *** * *
105207 TAATATTAATTTATTAATATTTTGGCAATTAATAAGAAAAAGAATTT-AAAAATAAATATGTTT-
65 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAA-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * ** * * *
105270 GCTAAACAAGTTCAAATAGTCACAACTACTTGAATAATTATTTATTTCAAACCA
129 TC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA
* ** * * ** * * ** * *
105324 TTATGACCTTTTGCTTCATCATAAAATAATTGTATCAGTTCACATAAATTTATT-TGAAATATAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAA
** * * * * * *
105388 TAATACTAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTGAAAAATGAATCTATTTA-
65 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
* * * * * * *
105452 CCATACAAATTCAAATATTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
130 CGA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA
* *
105505 TTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAA
* * * * *
105569 TAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAAGT-AGAAATTTAAAAAA-AAATCTATTTT
65 TAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * *
105631 TTGAAC-ACATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAT-A
129 TCGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA
* * * * *
105683 GCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTATGTTCATACAAACTTATT-TGAAATAAA
1 -TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAA
* * ** * *
105747 ATAATATTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
64 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * *
105811 TCGAGCAAGCTCAAATAGTTATGA
129 TCGAACTAGTTCAAATAGTTATGA
105835 TTGCTTGACA
Statistics
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0.75 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
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172 1 0.00
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203 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT
AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA
Found at i:102602 original size:723 final size:720
Alignment explanation
Indices: 101456--105806 Score: 1923
Period size: 723 Copynumber: 6.0 Consensus size: 720
101446 TTACTGAACC
* * *
101456 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATT-ACTTTTTTGTTTT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATT-TTGAC-TTTTTG-TTT
* * ** * * *
101520 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGGTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
62 TATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
101585 TATTTAGAAAATTAATCAATAAAAGATTTATAAAGTAAATCGCTTAACAAACCATTTCAAATAGT
127 TATTTAGAAAATTAATCAATAAAAGATTTATAAAATAAATAGCTTAACAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
101650 TATGACTATTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATA
192 CATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATA
*** * * ** *
101715 GTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAGATTGAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAA
257 GTTTCAATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * *
101780 TAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAATAGTCATGATTATTTGAA
322 TAACTAAAAAATTGTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGAGTATGTGAA
** * * *
101845 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTTTTTATAATAAAAAAATT-ATTTCAGTTCATAT
387 TAAAAATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTATAATAAAAAAATTGATTT-AGTTCATAC
* * *
101908 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAA-GTTGTTAATA-TTCTGAAAATTAATAATTAAAAG
451 AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATC-AATG-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-
* * * * *
101969 ATTTTAAAAATGATTATATTTAT-TAGACA-AGTTTC-AATAATTATGACTATTTGAAC-AATTA
511 ATTTAAAAAATAAATATATTT-TCTA-A-ATACTTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAAATT-
* * ** * * * *
102030 TCTATTTGAA-ACACTATAATC-TTTTGCTTTGTCATTAAA-TGATTTTTTTTGTTCATACAAGC
572 TCTATTTCAATACACTATAACCATTTTGCTTTGTCA-TAAACCAATTTGTTCTATTCAAACAAGC
* * * *
102092 TTATTTTG-AATAAAATAATAGAAAATATAATAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAA
636 TTA-TTCGAAATAAAAAAATA-AAAATATAATAATACTAA-AAAATTAATAAGTAAAACATTTAA
*
102156 AAAATAAATCTAATAACCAAATA
698 AAAATAAATCTAATAACCAAACA
* **
102179 AGTTCAAATCATTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACTTTTTGTTTTAT
* * * * * *
102244 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTTATTTATTACTAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * * * *
102309 TTCA-ATAATTAAT-AAGTAAAATTTTTTTAAAAATAAATATCTTTACCGAACAAGTTCCAATAG
130 TT-AGAAAATTAATCAA-TAAAAGATTTAT-AAAATAAATAGC-TTAACAAACAAGTTCAAATAG
* * *
102372 TCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTT-TTTTGTAATAAAACAA
191 TCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
* * *
102436 TTGTTTCAATTCATATAAGCTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
255 TAGTTTCAATTCATATAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
102500 TAA-ATACTAAGAGAATTGTAAAAAT-GATTTGTTTATCGAACAAGTTCTAATAGTTATGAGTAT
319 TAATA-ACTAA-AAAATTGTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGAGTAT
* * * * *
102563 GT-AA-AACAAATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTG
382 GTGAATAA-AAATCTATTTC-AAATCATTATGACC-TTTTTTTTATAATAAAAAAATTGATTTAG
* * *
102625 TTCATGCAAGCTTATTTCCAATAACATAATATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
444 TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
102690 AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAATTCTTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATTTT
509 AAATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAATACTTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAAATTTC
* * * * *
102755 TATTTCAATTCATTATGACCATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTCAAACAAGTTTA
574 TATTTCAATACACTATAACCATTTTGCTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTCAAACAAGCTTA
** * * * *
102820 TTCGAAATAAAAAAATATTAATTTATTAATACTAAAAAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATA
639 TTCGAAATAAAAAAATAAAAATATAATAATACTAAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATA
* ** * * *
102885 AATTTGTTTACTAAGCA
704 AATCTAATAACCAAACA
* * * *
102902 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTATTTCAAGTCATTATGA-TATTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACT-TTTTGTTTTA
*** * **
102966 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTTTTA
64 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * * *
103031 CTCTA-AAAATTAAT-AATTTGAAGATTTAAAAAATTAATTTG-TTTACTAAACAAGTTCAAATA
129 -TTTAGAAAATTAATCAA-TAAAAGATTTATAAAA-TAAATAGCTTAAC-AAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * * * **
103093 ATCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATCAAGACATTTTGTTTTATCTTAAAACAA
190 GTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
* * * ** ** **
103158 TTGTTTCTATTCATACAAAATTGCTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTGCTATTTCAAAAA-T
255 TAGTTTCAATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * * *
103222 --TAA-TAAGACATT-TAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
320 AATAACTAAAAAATTGT-AAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGAGTATGT
* ** * ** * * ** * * *
103283 GAACAATTATGTATCACAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCTAG-TC
384 GAATAAAAATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTATAATAAAAAAATTGATT-TAGTTC
* ** * * * * *
103346 ATACAAGTTTATTTTGAGTAAAATATTACTAAAT-TAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAG
447 ATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TCAATGTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * * * * *
103409 AATTTAAAAAATGAATGTGTTTACCAAA-CCAATGCAAATAGTTA-AGACTATTAGAA-AAAGTA
510 AATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAATAC-TTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAAA-TT
*** * ** ** *
103471 TCTATTTCAA-ATTGTTCTGGCC-TTTTG-TTTAGTCATAAAATAA-TTGTT-TCAGTTCATACA
572 TCTATTTCAATA-CACTATAACCATTTTGCTTT-GTCATAAACCAATTTGTTCT-A-TTCAAACA
* * * ** * * * * *
103531 TGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATGAACATTTAGAAAATTAATAAATAAGAA-ATT
633 AGCTTATTCGAAATAAAAAAATAAAAATATAAT-AATA-CTAAAAAATTAATAAGTAA-AACA--
* ** * * *
103594 TTTAAAAAATAAATTTGTTGACTAAATA
693 TTTAAAAAATAAATCTAATAACCAAACA
* * * * * * *
103622 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTAGTTTTT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGA-CTTTTTGTTTTA
* ** * * * *
103687 TCATAAAACATTTGTTTAAATTCATAAAAGCTTA-TCAGAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** *
103751 ATTT-TAAAATTGAT-AAGATAGAGATTTA-AAATATAAATCAATTTATCAAATCAA-TTCAAAT
128 ATTTAGAAAATTAATCAATA-AAAGATTTATAAA-ATAAAT-AGCTTAACAAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * ** * **
103812 AATCATGGCCATTTAAAAAATTATTTATTTTAAACCATTATGAAATTTTGTTTTTTCGTAAAACA
189 AGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACA
* * * ** * * *
103877 ATTGTTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATGCCAGTTTATTAATA-TTCTAAA
254 ATAG--TTTCAATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
** * ** * * * * * * * * *
103939 AAAAAATAAGTAGGAGATT-TAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
316 AATTAATAACTAAAAAATTGT-AAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGAGT
* * * ** * * * * * *
104003 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATT-ATTTCT
380 ATGTGAATAAAAATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTATAATAAAAAAATTGA-TT-T
** * * * * *
104067 A-TTCATACAAGCTTATTTGGAATATAAGAAT-GCTAATGTAATAATATTAT-GAAAATTAATAA
442 AGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATC-AATGTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA
* * * * * * * * * *
104129 CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAAC
505 GTAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAATAC-TTTCAAATAATTATAA-CTATTTGAAC
* * * ** *
104192 -AATTATTTATTTCAA-ATCATTATGACC-TTTTG-TTCTGTCATAAAATAAATTTAAATAAATT
567 AAATT-TCTATTTCAATA-CACTATAACCATTTTGCTT-TGTCAT-AAACCAA--T---T---TG
* ** * * * * *
104253 TTTTAGTTCTTACTAA-CTTATTCGAAATAAAATAAA-ATAAATTTATTAGTACTTGAAAAATTA
620 TTCTA-TTCAAAC-AAGCTTATTCGAAATAAAA-AAATAAAAATATAATAATAC-TAAAAAATTA
* * ** ** *
104316 ATCAA-TAAGAA-ATTTGAAAAAT-AATACTGATCGCTGAACT
681 AT-AAGTAA-AACATTTAAAAAATAAAT-CTAATAACCAAACA
* * * * * *
104356 AGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACTTTTTGTTTTAT
** * * * * * *
104421 GTTAAAACAAATGATTT-TATTCAAATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA
65 CATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
104485 TTTTGAAAA-T--T-AATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTA-TTTATTA-AAAC-AGTTC-AATA
129 TTTAGAAAATTAATCAATAAAAGATTTATAAAATAAA--TAGCTTA--ACAAACAAGTTCAAAT-
* * * * * ** * * * *
104542 AGTTATAACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTATTGTTATTAAATA
189 AGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACA
* ** * * * *
104607 ATTGTTTCTGTTTATAT-AGTCTTATTCAAAATAAAAGTAATGCCAATTTATTAATA-TTCTAAA
254 ATAGTTTCAATTCATATAAG-CTTATTCAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * ** * * * ** * * *
104670 AATTATTAAGTAATGAATT-TAAAAAATGAATTTATTGGCTTG-ACTA-ATGCAAATAGTTATGA
316 AATTAATAACTAAAAAATTGT-AAAAATAAATATGTT-TATCGAACAAGAT-CAAATAGTCATGA
* * ** * * * * * * ** *
104732 CTATTTGAATAATTATTTAATTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTCATCACAAATCAATTGTTTT
378 GTATGTGAATAAAAATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTATAATAAAAAAATTGATTT
* ** * * * *
104797 TGTTTGTACAAACTTA-TTCAAAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAAAGTTAATAG
442 AGTTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATC-AATGTATTAATATT-TCAAA---AAT--
* * * * * * **
104860 GTAATAGACAATAGATTTAAAAATTGAATTTACAAAATGAATCTATTTACCAAACAAATTCAAAT
499 -TAAT-----A-AG---T--AAA---AATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAATACTTTCAAAT
* * * * * *
104925 AGTTATGACTATTTGAA-TAATTATGTATTTCAA-ATCGCTATAACCA-TTTGATTTGTCATAAA
549 AATTATAACTATTTGAACAAATT-TCTATTTCAATA-CACTATAACCATTTTGCTTTGTCAT-AA
** * * * * * * * * *
104987 ATAAATTTTTTCTACTCATACAAGCTTATTTC-ATATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAA
611 ACCAATTTGTTCTATTCAAACAAGCTTA-TTCGAAATAAAAAAATAAAAATATAATAATA-CTAA
* * * *** *
105051 ACAATTAATAAGTAACAA-ATTT-AAAAATAAATCTATTTATTGAATA
674 AAAATTAATAAGTAA-AACATTTAAAAAATAAATCTAATAACCAAACA
* * * ** * * *
105097 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTAGTTTTCT
1 AGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACTTTTTGTTTTAT
* * * * *** * *
105162 CATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * **
105227 TTTGGCAATTAAT-AAGAAAAAGAATTTA-AAAATAAATATG-TTTGCTAAACAAGTTCAAATAG
130 TTAGAAAATTAATCAA-TAAAAG-ATTTATAAAATAAATA-GCTTAAC-AAACAAGTTCAAATAG
** * * * * * * ** * *
105289 TCACAACTACTTGAATAATTATTTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGCTTCATCATAAAATAAT
191 TCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAAT
* * * * ** * * **
105354 TGTATCAGTTCACATAAATTTATT-TGAAATATAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAAAATT
256 AGTTTCAATTCATATAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * * * * *
105418 AATGAGTAAGAGATT-TGAAAAATGAATCTATTTA-CCATACAA-ATTCAAATATTTATAACTAT
320 AATAACTAAAAAATTGT-AAAAATAAATATGTTTATCGA-ACAAGA-TCAAATAGTCATGAGTAT
* ** * * * * * *
105480 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATTGTTTTTGTT
382 GTGAATAAAAATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTATAATAAAAAAATTGATTTAGTT
* * * * *
105545 CATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAAGTAGAA
446 CATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * * * * *
105610 ATTTAAAAAA-AAATCTATTTTTTGAACACATTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TAATTATCT
511 ATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAATACTTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAAATT-TCT
* * * * * *
105673 ATTTTAAATA-GCTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAACCAA-TTGTT-TATGTTCATACAAACT
575 A-TTTCAATACACTATAACCATTTTGCTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTA--TTCAAACAAGCT
* * ** * * * * *
105734 TATTTGAAATAAAATAATATTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAA
637 TATTCGAAATAAAAAAATAAAAATATAATAATACT-AAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAA
105798 ATAAATCTA
701 ATAAATCTA
105807 TTTATCGAGC
Statistics
Matches: 2848, Mismatches: 598, Indels: 366
0.75 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
715 1 0.00
716 12 0.00
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752 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (720 bp):
AGTTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACTTTTTGTTTTATC
ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TAGAAAATTAATCAATAAAAGATTTATAAAATAAATAGCTTAACAAACAAGTTCAAATAGTCATG
ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATAGTTT
CAATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAC
TAAAAAATTGTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGATCAAATAGTCATGAGTATGTGAATAAA
AATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTATAATAAAAAAATTGATTTAGTTCATACAAGCT
TATTTCAAATAAAATAATATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA
TAAATATATTTTCTAAATACTTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAAATTTCTATTTCAATACA
CTATAACCATTTTGCTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAA
AAATAAAAATATAATAATACTAAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTAATAACC
AAACA
Found at i:103877 original size:901 final size:899
Alignment explanation
Indices: 100085--104236 Score: 2290
Period size: 901 Copynumber: 4.6 Consensus size: 899
100075 CGTTATGATG
* * * * * * * *
100085 TTTTATTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TGTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATATTA
* * * ****
100149 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAACAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTATCGAAA-C
65 ATTTATTAATA-CTAAAAAATTAATAGA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-C-AAAGC
* * * * * * * ** * * * *
100212 AA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCGTTA--AAATAATTGTTTT
126 AAGTTCAAATAATCATGACCATTTAAAAAATCATTTATTTCAAACCATTATGAAAT-TTTGTTTT
* * * * * * *
100274 GTCATAAAACAATTGTTT-TGGATCATAGAAGCTTA-TTCGATTAAAAATAATACTC-ATTTAGT
190 ATCATAAAACAATTGTTTCT-CATCATACAAGCCTATTTGGAAT-AAAATAATAC-CAATTTATT
* ** * * * *
100336 AATA-TTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAACCTAGTTCAA
252 AATACTCT-AAAAAAAAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * ** * * ** * * * *
100399 ATAGTTAAAACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTCTTGTTTAATCATAAA
315 ATAATCATGACCATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTATCATAAA
* * * * * * * * * *
100463 ATATTTGTTT-AATATCTTGCAAGTTTATT-TGAAATAAAATTATCCAAATTTATTAAC-A-TTC
379 ACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATT-ACTATTTC
* * * * *
100524 AAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTAT
441 -AAAAATTAATAAG---AA-ATTT-AAAAAATAAATATCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
100589 TACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAAT-AGTTATAACATTTTCTTTTG-------ACATTTGT
500 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * ** ** *
100646 TTC-AGTTCATAAAAGGTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTTTAATATTTCCAAAATT-AA
564 TTCAAG-TCATACAAGCTTGTTTGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAAA
* ** * * * * *
100708 TAAGC-AAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTACA-ACTAT-T
628 T-A-CTAAGAGAATTGTAAAAAT-GATGTGTTTACCAAACAAGTGCAAATAGTTA-AGACTATGT
** * *
100769 TGAACAATTGTCTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTTGTTCT-G-CTATAAAATAATT-GTTTA
689 AAAACAA--ATCTATTTCAAAAT-ATTATGACC-TTTTGTT-TAGTC-ATAAAACAATTGGTTT-
* * * * **
100830 AGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATA-CTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAGG
747 AGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATC-AATGTATGAACATTTCAAAAATTAATAAA
* * * * * * * ** * * * *
100893 T---GATTTAAAAAATGAATC--TTGTATTGAATCACTTCAAATAATTATGTCCATTTCAA-TAG
811 TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTG-ACTAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAA
* * * *
100952 TTATTTATTTTAAATCATTATTATC-
875 TT-TCTATTTAAAATCATTATAACCA
* * * * * * ** * *
100977 TTTTGTTTGGTCATATAACAA-TTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTCGGGATAAAATAGTATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTG-TTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATATTA
* * * * ** *
101041 ATTCATTAAT-CTTTCAAATATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTACCAAACC
65 ATTTATTAATAC--TAAAAAATTAATAGA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-CAAAGC
* * * * * * * ** * * ** * *
101104 AA-TTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAGTTGTATACTTCAAATTATTAT-AACCTTTTGTTAT
126 AAGTTCAAATAATCATGACCATTTAAAAAATCATTTATTTCAAACCATTATGAA-ATTTTGTTTT
* * * * ** ** *** * * * *
101167 GTCATGAAGCAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAGTACTAATCTAATAA-
190 ATCATAAAACAATTGTTTCTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACCAATTTATTAAT
* * * * **** * *
101231 AAT-T-AAAAAAATTAA-TA-AGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAG
255 ACTCTAAAAAAAAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAA
* * * * * * * * *
101292 TTAAGA-C-TATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
319 TCATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* * * * * *
101355 TTTTTCAACTT-ATAGAAGCTTATTC-GAAATACAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
384 TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAAT
** ** * * * * * * * *
101418 TTGTAAGTGATTTAGAAAATAATTTTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAAT
447 TAATAAGAAATTTAAAAAATAAATATCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *** *
101483 AATTATCTATTTTAAATCATTATTACTTTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGGTAATA
512 AATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAGTCATA
* * ** * * * *
101548 TAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATT-AATCAATAAAAG-
575 CAAGCTTGTTTGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTCA-AAAATTAAAT-ACTAAGAGA
* * * * * * * * * ** * *
101610 ATT-TATAAAGTAAAT-CGCTTAACAAACCATTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAGCAATTATT
638 ATTGTA-AAAAT-GATGTGTTTACCAAACAAGTGCAAATAGTTAAGACTATGTAAAACAA--ATC
* * * * * * * * *
101672 TCTTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATATAAGCTTA-
699 TATTTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTAGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * ** * * *
101736 TTCAGATTGAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAA
764 TTCA-AATAAAATAATATC-AATGTATGAACATTTCAAAAATTAATAAAT-AAAAATTTAAAAAA
* * * * * * * * * *
101800 TAAATATGTTTATCGAACT-AGATCAAATAGTCATGATTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAAT
826 TAAATCTGTTGA-CTAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATT-TCTATTTAAAAT
* * *
101863 CGTTATGATC-
889 CATTATAACCA
* * * * * * * *
101873 -TTT-TTTTATAATAAAAAAATTAT-TTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TGTTCTA-TTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATATT
* * * * * * **
101934 AAGTTGTTAATATTCT-GAAAATTAATA-ATTAAAAGATTTTAAAAAT-GATTATATTTA-TTAG
64 AATTTATTAATA--CTAAAAAATTAATAGA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACAAAG
* * * * * * * * * *
101995 ACAAGTTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-CACTAT-AATCTTTTGC
125 -CAAG-TTCAAATAATCATGACCATTTAAAAAATCATTTATTTCAAACCATTATGAA-ATTTTGT
* * ** * * ** * * ** * *
102057 TTTGTCATTAAATGATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAGAAAATATAA
187 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATA-CCAATTTAT
** * * * * * *
102122 TAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTAATAACCAAATAAGTTCA
251 TAATACTCTAA-A-AAAAAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCA
* * * * * ** ** * *
102185 AATCATTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTTATCATAAA
314 AATAATCATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTATCATAAA
* * * * *
102250 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTTATTTATTACTATTTCAAT
379 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAA
* * * * *
102315 AATTAATAAGTAAAATTTTTTTAAAAATAAATATCTTTACCGAACAAGTTCCAATAGTCATGATT
444 AATTAATAAG--AAA---TTTAAAAAATAAATATCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
102380 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
504 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAA
* * * *
102445 TTCATATAAGCTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAATACTAA
569 GTCATACAAGCTTGTTTGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAAATACTAA
* * * * * * *
102510 GAGAATTGTAAAAATGATTTGTTTATCGAACAAGTTCTAATAGTTATGAGTATGTAAAACAAATC
634 GAGAATTGTAAAAATGATGTGTTTACCAAACAAGTGCAAATAGTTAAGACTATGTAAAACAAATC
* * * *
102575 TATTTCAAAATATTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTAT
699 TATTTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTAGTTCATACAAGCTTAT
* * * * *
102640 TTCCAATAACATAATATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
764 TTCAAATAAAATAATATCAATGTATGAACATTTCAAAAATTAATAAATAAAAATTTAAAAAATAA
** *** * * *
102705 ATCTGTTTTCTAAATTCTTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATTTTTATTTCAATTCATTA
829 ATCTGTTGACTAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATTTCTATTTAAAATCATTA
*
102770 TGACCA
894 TAACCA
* *
102776 TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTCAAACAAGTTTATTCGAAATAAAAAAATATTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTGTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATATTAA
* *** *
102841 TTTATTAATACTAAAAAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAGCAAGTT
66 TTTATTAATACTAAAAAATTAATAGATAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACAAAGCAAGTT
* * * * * ** *
102906 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTATTTCAAGTCATTATGATATTTTGTTTTATCATA
131 CAAATAATCATGACCATTTAAAAAATCATTTATTTCAAACCATTATGAAATTTTGTTTTATCATA
** * * **
102971 AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTTTTACTCT
196 AAACAATTGTTTCTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACCAATTTATTAATACTCT
** * * * * * *
103035 AAAAATTAATAATTTGAAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAATCATGT
260 AAAAAAAAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGA
* * * *
103100 CCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATCA-AGACATTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTT
325 CCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATCATA-ACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
** ** *
103164 CTATTCATACAAAATTGCTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTGCTATTTCAAAAATTAATAAG
389 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
103229 ACATTTAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATG
454 AAATTTAAAAAATAAATATCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** * * * * * *
103294 TATCACAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCTAGTCATACAAGTTTAT
519 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAGTCATACAAGCTT-G
* * *
103358 TTTG-AGTAAAATATTACTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATT-AATAAGT-A-AGAATT-TAAA
583 TTTGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTC-AAAAATTAAAT-ACTAAGAGAATTGT-AA
103417 AAATGAATGTGTTTACCAAACCAA-TGCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAAA-AAGTATCTATTTC
645 AAATG-ATGTGTTTACCAAA-CAAGTGCAAATAGTTAAGACTATGTA-AAACAA--ATCTATTTC
* * * * * *
103479 AAATTGTTCTGGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-GTTTCAGTTCATACATGCTTA-TTCAA
705 AAAATATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTC-A
*
103542 AATAAAATAATA-CTAATTTATGAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAAATTTTTAAAAAATA
768 AATAAAATAATATC-AATGTATGAACATTTCA-AAAATTAATAAATAA-AAA--TTTAAAAAATA
* *
103605 AATTTGTTGACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTAAAATCAT
828 AATCTGTTGACTAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATT-TCTATTTAAAATCAT
103669 TATAACC-
892 TATAACCA
* *
103676 TTTTAGTTTTTTCATAAAAC-ATTTGTT-TAAATTCATAA-AAGCTTA-TCAGAAATAAAATAAT
1 TTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTTGTTCT--ATTCA-AACAAGCTTATTC-GAAATAAAAAAAT
* * ** * * *
103737 ATTACTTTATTAATATTTTAAAATTGATAAGAT-AGAGATTTAAAATATAAATCAATTTATCAAA
61 ATTAATTTATTAATACTAAAAAATTAAT-AGATAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-CAAA
* * * *
103801 TCAA-TTCAAATAATCATGGCCATTTAAAAAATTATTTATTTTAAACCATTATGAAATTTTGTTT
124 GCAAGTTCAAATAATCATGACCATTTAAAAAATCATTTATTTCAAACCATTATGAAATTTTGTTT
* * * * *
103865 TTTCGTAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATGCCAGTTTATTAA
189 TATCATAAAACAATTGTTTCTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACCAATTTATTAA
* * * *
103930 TATTCTAAAAAAAAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAGTTCAAATAG
254 TACTCTAAAAAAAAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAA
* * * * * * * *
103995 TTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAAT
319 TCATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* ** * * * * * * *
104060 TATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATATAAGAATGCTAATGTAATAATATTATGAAAATTA
384 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATT-TCAAAA--A
* * * * * * *
104125 ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTA-AAGCTATATG
446 TTAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATATCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTG
* *
104189 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAA
509 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
104237 TAAATTTAAA
Statistics
Matches: 2560, Mismatches: 570, Indels: 246
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
882 64 0.03
883 9 0.00
884 5 0.00
886 1 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (899 bp):
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTGTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATATTAA
TTTATTAATACTAAAAAATTAATAGATAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACAAAGCAAGTT
CAAATAATCATGACCATTTAAAAAATCATTTATTTCAAACCATTATGAAATTTTGTTTTATCATA
AAACAATTGTTTCTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACCAATTTATTAATACTCTA
AAAAAAAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGAC
CATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT
ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAGAA
ATTTAAAAAATAAATATCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAGTCATACAAGCTTGTTT
GAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAAATACTAAGAGAATTGTAAAAATGA
TGTGTTTACCAAACAAGTGCAAATAGTTAAGACTATGTAAAACAAATCTATTTCAAAATATTATG
ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAT
CAATGTATGAACATTTCAAAAATTAATAAATAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTGACTAAATAA
GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATTTCTATTTAAAATCATTATAACCA
Found at i:104637 original size:177 final size:178
Alignment explanation
Indices: 104356--104679 Score: 390
Period size: 177 Copynumber: 1.8 Consensus size: 178
104346 TCGCTGAACT
* * * *
104356 AGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAATTAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTATTGT
* **
104421 GTTAAAACAAATGATTTTATTCAAATAAGTTTGTTCAAAATAAAA-TAATATTAATTTATTAACA
66 GTTAAAACAAATGATTTTATTCAAATAAGTTTATTCAAAATAAAAGTAATACCAATTTATTAACA
* *
104485 TTTTGAAAATTAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATTAAAAC
131 TTCTAAAAATTAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATTAAAAC
*
104533 AGTTC-AATAAGTTATA-ACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTATT
1 AGTTCAAATAA-TTA-AGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTATT
* * * * * * *
104596 GT-TATTAAATAATTG-TTTCTGTTTATAT-AGTCTTATTCAAAATAAAAGTAATGCCAATTTAT
64 GTGT-TAAAACAAATGATTT-TATTCAAATAAGT-TTATTCAAAATAAAAGTAATACCAATTTAT
* *
104658 TAATATTCTAAAAATTATTAAG
126 TAACATTCTAAAAATTAATAAG
104680 TAATGAATTT
Statistics
Matches: 122, Mismatches: 19, Indels: 11
0.80 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 12 0.10
177 80 0.66
178 30 0.25
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
AGTTCAAATAATTAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTATTGT
GTTAAAACAAATGATTTTATTCAAATAAGTTTATTCAAAATAAAAGTAATACCAATTTATTAACA
TTCTAAAAATTAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATTAAAAC
Found at i:106179 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 105862--106217 Score: 441
Period size: 182 Copynumber: 2.0 Consensus size: 181
105852 AGTTATAATG
* * * * *
105862 ATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGAAAGCATATTCATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGGAAAACAGATTCAGT
** * * * * * *
105927 TTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAAGTGAAACAA
66 TTTTAAATCTCATACTTATTAATTATTTGAATATAAATAAATTAGAATTATGTTAAGTCAAACAA
*
105992 GCTTGTATGAATAGAAAA-AATATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTAGAGCA
131 GCTTGTATGAACA-AAAACAAT-TATTTTATAACAAAACAAAAGGTTAGAGCA
* * *
106044 ATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTT-GATAAACAGATTTAG
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGGA-AAACAGATTCAG
* * *
106108 TTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTTGAATATAAATAAATTAGAATTATGTT-ATTCCCAAT
65 TTTTTAAATCTCATACTTATTAATTATTTGAATATAAATAAATTAGAATTATGTTAAGT--CAAA
* *
106172 C-AGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGT
128 CAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGT
106218 CATAACAGAA
Statistics
Matches: 148, Mismatches: 22, Indels: 9
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
181 29 0.20
182 116 0.78
183 3 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGGAAAACAGATTCAGT
TTTTAAATCTCATACTTATTAATTATTTGAATATAAATAAATTAGAATTATGTTAAGTCAAACAA
GCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTAGAGCA
Found at i:106513 original size:170 final size:169
Alignment explanation
Indices: 106304--106824 Score: 467
Period size: 170 Copynumber: 3.0 Consensus size: 169
106294 TCATTATTTA
* * ** *
106304 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATCAGCATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAATAGAAAT
1 TTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAACA-AAAT
* *
106369 -TTTGTTTTATGACAAAACAAAATGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATTGTTAT
64 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTAT
*
106433 AACTAATTGAACTAGTTTTATACATATTTATTTTTTAAATCTC
128 AACTATTTGAACTAGTTTTA-ACATATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *
106476 -TAATTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAA-ACTTATATCAACAAAATC
1 TTAATTTTAAAATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGA-TTGTATCAACAAAAT-
* ** * * * * *
106539 ATTTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTTATATAGCTGTA
64 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATA
* * * *
106604 ACTATTTGAATTCG-TTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
129 ACTATTTGAACTAGTTTTA--ACAT--ATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
106648 TTAGTTATTAATTTTTATTATATTATTAGATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA
1 TTAATT-TTAA-----A--ATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAA
* * * * *
106713 CATAAATAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAAT
58 CA-AAATATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAAT
* * * *
106777 AGTCATAATTATTTGAACTGGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTGAAAT
122 AGTTATAACTATTTGAACTAGTTT--TAA-CATATTTATTTTTTAAAT
106825 ATTAATAAAT
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170 91 0.33
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TTAATTTTAAAATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAACAAAATAT
TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAAC
TATTTGAACTAGTTTTAACATATTTATTTTTTAAATCTC
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106657 AATTTTTATT
* * * * *
106667 ATATTATTAGATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATG
1 ATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGTTATG
* * * *
106732 ACAAAA-AAAAGGTT-ATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAAC
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106795 TGGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTGAA
130 TGGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTGAA
* * ** ** *
106823 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATTGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTGTTATG
1 ATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGTTATG
* *
106888 ACAAAACAAAAGTTCATAACGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACT
66 ACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT
106953 G
131 G
106954 ATTCAATAAA
Statistics
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ATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGTTATG
ACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT
GGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTGAA
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Indices: 106667--106981 Score: 364
Period size: 157 Copynumber: 2.0 Consensus size: 155
106657 AATTTTTATT
* * * * *
106667 ATATTATTAGATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATG
1 ATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGTTATG
* * * *
106732 ACAAAAAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTG
66 ACAAAAAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTG
* ***
106797 GTTTGGTAAGCATATTTATTTTTGAA
131 ATTCAATAA-CATATTTATTTTTGAA
* * ** ** *
106823 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATTGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTGTTATG
1 ATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGTTATG
* *
106888 ACAAAACAAAA-GTTCATAACGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC
66 ACAAAA-AAAAGGTT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAAC
*
106952 TGATTCAATAA-ATTGATTTATTTTTTAA
129 TGATTCAATAACA-T-ATTTATTTTTGAA
106980 AT
1 AT
106982 CTCCAACTTC
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 23, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
155 1 0.01
156 63 0.48
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ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.12, T:0.41
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ATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATGTTATG
ACAAAAAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTG
ATTCAATAACATATTTATTTTTGAA
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Period size: 361 Copynumber: 8.4 Consensus size: 362
107085 ATAAACAGAT
* * * * *
107095 TTAT-TTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAAATTTTT-TAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATT
1 TTATATTTTT-AAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * *
107158 TCAAATAAG-TATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAC-TAACAAAATGTCATAATGATTTG
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* * * ** * *
107221 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGATTTGGTTC-AGCAAAC-ATATTTATTTT
128 AAATAGATAATTGTTTAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTGATTCGA-TAAACTAT-TTTA-TTT
* * * * ** ** * *
107283 TTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTATTATTTTAGCAATATTTTA-CTCAGAATAA
189 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCA-AATAA
* * * * * * * *
107347 ACTTGTATAAATAGAAAC-AATTTTTTTTATGACAAAAGAAAAATCATAATGATTTGAGATAAAT
253 GCTTGTATGAATAGAAACTAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGAT
* * ** * ** * *
107411 AATTGTTTAAATAGTCATAATTAATTTGACTTGGTTTGGTAAGTAGA
317 AATTGTTTAAATAGTCATAACTACTTAAAC-TCGTTCAGCAAATAGA
* *
107458 TTAGA-TTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGT-
1 TTATATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TC
** * * * ** *
107516 TGAATAATG-TTGTATGTATAAAAAC-A--A-TTTAT----AGGCAAAATGTCATAACGATTTGA
65 CAAATAA-GCTTTTATGAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
107572 AATAGATAATAGTTCAAATGGATATGATTATTTAAACTTAATC-AGTAAA-TATATTTATTTTTT
129 AATAGATAATTGTTTAAATGGCTATAATTATTTGAACTGATTCGA-TAAACTAT-TTTATTTTTT
*** * * *
107635 AAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-TGTATTATTTTATTTCAAATAAACT
192 AAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* * *
107699 TGTATGAATAGAAACTTA-TGTTTTATGACAAAACAAGATATCATAACGATTTGAAATAAATAAT
256 TGTATGAATAGAAACTAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGATCATAACGATTTGAAATAGATAAT
*
107763 TGTTTAAATAGTCATAACTACTTAAACTCGCT-AGGCAAATAGA
320 TGTTTAAATAGTCATAACTACTTAAACTCGTTCA-GCAAATAGA
* ** * * * * *
107806 TT-T-TTTTAAAAAAATTTTACTCATTAATTTTTGAAATTTTAGTAAATTATTATTATTTTATTC
1 TTATATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
* * * *
107869 CAAATAAGCTTTTATGAA-CAAACACAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGA
65 CAAATAAGCTTTTATGAATTAAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* *
107933 AATAGATAATTGTTTAAATGGCTATAATTATTTGAAGTGATTCGATAAACTGTTTTATTTTTTAA
129 AATAGATAATTGTTTAAATGGCTATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACTATTTTATTTTTTAA
* * * *** * *
107998 ATCTTTTACTTATTGATATTCAAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTT
194 ATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* * * * *
108063 ATGAACT-GAAAC-AATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTTAAATAGATAATTG
259 ATGAA-TAGAAACTAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * ** * * *
108126 TTCAAATATTCATCACTATTTGAAC-CTATTTGGTAAACAAA
322 TTTAAATAGTCATAACTACTTAAACTC-GTTCAGCAAATAGA
* * * *
108167 TT-TATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTCAAA-AGTTAATAAATTAATATTATTTTCT
1 TTATA-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAAATTAATATTATTTTAT
* * * * * *
108230 TCCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGT-ACAATTT
63 TCCAAATAAGCTTTTATGAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTT
* * * * * * * * *
108294 GAAATAAATAATTATTCT-AATAGTCT-TAACTATTTGAAATGATTTGGTAAAC-ACATTTAGTT
127 GAAATAGATAATTGTT-TAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACTA-TTTTATTT
* * * * * *
108356 TTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTCAAAATAATATTAAATTATTATTATTTT-TATCCAAATCA
189 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTAT-TTCAAATAA
* * * * * *
108420 GCTTGTATG-ATCAAAAAC-AATTATGTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATTGAT
253 GCTTGTATGAAT-AGAAACTAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGAT
** * * * **
108483 GTTTGTTTAAATAGTTATAACTACTTGAACTGGTTCAAAAAATAG-
317 AATTGTTTAAATAGTCATAACTACTTAAACTCGTTCAGCAAATAGA
* * * * * * *
108528 TTCTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAA-ATTAATGAAGTACTATTATTTTATTT
1 TTATA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
* * * * * *
108592 CAAATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTTTAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAA
65 CAAATAAGCTTTTATGAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * *
108657 ATAGATAATTGTTTAAATAGTTATATTTATTTGACCTTG-TTC-AGTAAA-TAGCTTTATTTTTT
130 ATAGATAATTGTTTAAATGGCTATAATTATTTGAAC-TGATTCGA-TAAACTA-TTTTATTTTTT
* ** * ** * ** *
108719 TAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGCATTAGTTTATTTTGAATTAGC
192 AAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* ** * * *
108782 TTGTATGAATTGAAA-TAATTGTTTTATGACTAAATGAAAGGTCAGAACGATTTAAAATAGATAA
255 TTGTATGAATAGAAACTAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * ** *
108846 TTATTCT-AATAGTCCA-AACCATTTAAACAGGTTCAGCAAATATA
319 TTGTT-TAAATAGT-CATAACTACTTAAACTCGTTCAGCAAATAGA
* * *
108890 TT-TATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAAGTATTATTAAATTAATATTATTTTAATC
1 TTATATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
* * * * * * *
108954 CAAATATGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGA
65 CAAATAAGCTTTTATGAATTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * *
109017 GATAAATAATTGTTTAAATAG-TCATAATTATTTGAACCTG-TTCGATAAACAAATTTT-TTTTT
129 AATAGATAATTGTTTAAATGGCT-ATAATTATTTGAA-CTGATTCGATAAAC-TATTTTATTTTT
* * * * * *
109079 TCAAAT-TTATTGCTTATTAATTTTTCAAAA-GTTAATAAATTATAATTATTTTCTTCCAAATAT
191 T-AAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAA
* * * * *
109142 GCTTGTATGAACT-G-AAGTAATTATTTTATGA-ATAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAG
253 GCTTGTATGAA-TAGAAACTAATTGTTTTATGACA-AAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
109204 ATAATTATTCT-AATAGCCTTAATTA-TTAAAACT-GATTCGGTAAACACA
315 ATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTACTT-AAACTCG-TTCAGCAAATAGA
* * *
109252 TT-TATTTTTTAAATCT-TGTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TA
1 TTATA-TTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-
* * * * * * *
109314 TCTAAATCAGCTTGTATG-ATCAGAAACAATTACTTTATTACAAAACAATTA--TCATAACGATT
63 TCCAAATAAGCTTTTATGAATTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGATT
* * * * * * * * * *
109376 T-AAGATTGATATTTGTTTAAATAG-TCATAACTATTTAAACT-AGTT-TAAAAAATAGCTTTAG
126 TGAA-ATAGATAATTGTTTAAATGGCT-ATAATTATTTGAACTGA-TTCGATAAACTA-TTTTAT
* * ** ** * ** * *
109437 TTTTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTGGTATTAATTTATTTCAGATA
187 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATA
* * * * * * * *
109502 AGTTTTTATGAACT-GAAAC-AATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAA
252 AGCTTGTATGAA-TAGAAACTAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * * *
109565 ATAATTATTCAAATAGTTATATA-TATTTGAACTCATTTAGTAAACAGA
315 ATAATTGTTTAAATAGTCATA-ACTACTTAAACTCGTTCAGCAAATAGA
* * ** * * * *
109613 TTTATTTTTTTAAATTTCTTGTTTACTAGCTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 -TTATATTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * ** * *
109677 TCGAATAAGCTTGTATGAACT-AAA-GTTTATTTTATG-----ACAAAAGATCAAAACGATTTGA
64 CCAAATAAGCTTTTATGAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* ** ** * * *
109735 AATAGATAATTATTCT-AAT-AATCCAACTATTTGAATTGGTTCAGCA-AATA-TATTTTA-TTT
129 AATAGATAATTGTT-TAAATGGCTATAATTATTTGAACTGATTC-G-ATAA-ACTATTTTATTTT
* *** * * * * *
109795 TTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGC
190 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * *
109860 TTGTATGAAAAGAAAC-AATTGTTCTATGACAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAAATAAT
255 TTGTATGAATAGAAACTAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
109924 TGTTAAAATAGTCATAACTATTTTAAACTGGTT-AGATAAACAAA
320 TGTTTAAATAGTCATAACTA-CTTAAACTCGTTCAG-CAAATAGA
* *
109968 TT-TAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTT
1 TTATA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TT
* * * * ** *
110028 TC-AATAA-TTTTGTAT-AAATAGAAACAATTTTTTTACAACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTT
64 CCAAATAAGCTTT-TATGAATTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
*
110089 TAAATAGATAATTGTT
127 GAAATAGATAATTGTT
110105 CAAGTGAACA
Statistics
Matches: 2063, Mismatches: 451, Indels: 273
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
347 3 0.00
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351 9 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (362 bp):
TTATATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCC
AAATAAGCTTTTATGAATTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
TAGATAATTGTTTAAATGGCTATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACTATTTTATTTTTTAAAT
CTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
GAATAGAAACTAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTA
AATAGTCATAACTACTTAAACTCGTTCAGCAAATAGA
Found at i:108087 original size:181 final size:181
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Indices: 107081--110104 Score: 1507
Period size: 181 Copynumber: 16.9 Consensus size: 181
107071 AAAACAATTG
* * * ** * *
107081 TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TTCTTGCTTATTAAATTTT-TTAATGTTAATAAAAT
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* * * * *
107144 AATATTATTTTATTTCAAATAAG-TATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAC-TAACAAAAT
63 ATTATTATTTTATTCCAAATAAGCT-TGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
* * ** *
107207 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGATTTGG
127 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG-CTATAACTATTTGAACTGA
* * * * * * **
107262 TTC-AGCAAACAT-ATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTATTATTTT
1 TTCGA-TAAAC-TGTTTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT
** * * * * * *
107325 AGCAATATTTTACT-CAGAATAAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTTTTTTTATGACAAAAGAAA
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* * * * * *
107388 A-ATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAG-TCATAATTAATTTG-ACTTGG
125 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCT-ATAACT-ATTTGAAC-TGA
* * * * ** * *
107445 TTTGGT-AAGTAG-ATTAGATTTTAAATC---T-CTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAG
1 TTCGATAAACT-GTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAT
** * * * ** *
107503 TATTATTTTATGT-TGAATAATG-TTGTATGTA-T-AAA-AA-CAATTTAT----AGGCAAAATG
65 TATTATTTTAT-TCCAAATAA-GCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * *
107558 TCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGATATGATTATTTAAACTTA
128 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCTATAACTATTTGAACTGA
* * *** * *
107612 ATC-AGTAAA-TATATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-
1 TTCGA-TAAACTGT-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTA
* * *
107674 TGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAAC--TTATGTTTTATGACAAAACAAG
64 T-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTA--TTTTATGACAAAACAAA
** * * *
107736 ATATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAG-TCATAACTACTTAAACTCG-
125 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCT-ATAACTATTTGAACT-GA
* * ** * ** ** * ** * *
107793 CTAGGCAAA-TAGATTT-TTTTAAAAAAATTTTACTCATTAATTTTTGAAATTTTAGTAAATTAT
1 TTCGATAAACT-GTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAT
* * *
107856 TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAAC-AAACACAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGT
65 TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * *
107920 AATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGCTATAATTATTTGAAGTGA
129 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCTATAACTATTTGAACTGA
* * *
107973 TTCGATAAACTGTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTGATATTCAAAATATTAATAAAGTATT
1 TTCGATAAACTGTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATT
**** * * * * *
108038 ATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCA
66 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
108103 AAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA-TTCATCACTATTTGAACCT-A
131 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCT-ATAACTATTTGAA-CTGA
* * *** * *
108154 TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTCAAAA-GTTAATAAATTA
1 TTCGATAAACTGTTTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTA
* * * * * *
108218 ATATTATTTTCTTCCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGT
64 TTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * *
108283 TAGT-ACAATTTGAAATAAATAATTATTCT-AATAGTCT-TAACTATTTGAAATGA
129 CA-TAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAG-CTATAACTATTTGAACTGA
* * *** * * * * *
108336 TTTGGTAAACACATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTCAAAATAATATTAAATTATT
1 TTCGATAAACTGTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATT
* * ** * *
108401 ATTATTTT-TATCCAAATCAGCTTGTATGATCAAAAACAATTATGTTATGACAAAAC-AAAGATC
66 ATTATTTTAT-TCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * ** * * *
108464 ATAATGATTTGAGATTGATGTTTGTTTAAATAGTTATAACTACTTGAACTGG
130 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCTATAACTATTTGAACTGA
* * * * * * * ** * * *
108516 TTC-AAAAAATAGTTCTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAA-ATTAATGAAGTAC
1 TTCGATAAACT-GTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAT
* * * * * * *
108579 TATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTTTAATAAAACAAAAGGTC
65 TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * ** *
108644 ATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATATTTATTTGACCTTG-
130 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCTATAACTATTTGAAC-TGA
* * ** *
108696 TTC-AGTAAA-TAGCTTTATTTTTTTAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAAT
1 TTCGA-TAAACT-GTTTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAAT
** * *** * * * * * **
108757 TAGCATTAGTTTATTTTGAATTAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAATGAAAG
62 TATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * *
108822 GTCAGAACGATTTAAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCCA-AACCATTTAAACAGG
127 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAG-CTATAACTATTTGAACTGA
* * * ** * *
108877 TTC-AGCAAA-TATATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAAGTATTATTAAATT
1 TTCGA-TAAACTGT-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATT
* * * ** * * *
108939 AATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAAC-AAAGA
63 ATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * *
109003 TCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAG-TCATAATTATTTGAACCTG-
128 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCT-ATAACTATTTGAA-CTGA
** * *
109057 TTCGATAAACAAATTTT-TTTTTTCAAAT-TTATTGCTTATTAATTTTTCAAAA-GTTAATAAAT
1 TTCGATAAAC-TGTTTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAAT
* * * **
109119 TATAATTATTTTCTTCCAAATATGCTTGTATGAACTGAAGTAATTATTTTATGA-ATAAACAAAA
62 TATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAA
* * * * **
109183 GGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGCCT-TAATTATTAAAACTGA
126 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAG-CTATAACTATTTGAACTGA
* *** * * * *
109239 TTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGT
1 TTCGATAAACTGTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATT
* * * * * * *
109304 ATTATTTT-TATCTAAATCAGCTTGTATGATCAGAAACAATTACTTTATTACAAAACAATTA--T
66 ATTATTTTAT-TCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGT
* * *
109366 CATAACGATTT-AAGATTGATATTTGTTTAAATAG-TCATAACTATTTAAACT-A
129 CATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTTAAATAGCT-ATAACTATTTGAACTGA
* * * * * * * ** ** * *
109418 GTT-TAAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTG
1 -TTCGATAAACT-GTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTA
* * * * * * * *
109482 GTATTAATTTATTTCAGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGT
64 TTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * * *
109547 TATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATATA-TATTTGAACTCA
129 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCTATA-ACTATTTGAACTGA
* * * ** * * ** *
109600 TT-TAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAAT-TTCTTGTTTACTAGCTTTTTGAAA-GTTAATAAAT
1 TTCGA-TAAACTGTTTTA-TTTTTTAAATCTT-TTACTTATTA-ATTTTCAAAATATTAATAAAT
* * * **
109662 TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-AAA-GTTTATTTTATG-----ACAAAAG
62 TATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * ** * *
109720 ATCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATA-ATCCAACTATTTGAATTGG
127 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGCTATAACTATTTGAACTGA
* * *** *
109774 TTCAGCA-AATA-TATTTTA-TTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATT
1 TTC-G-ATAA-ACTGTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT
* * * ** * * * *
109836 AATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTCTATGACAAAA-TAAAGA
63 ATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * *
109900 TCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTAAAATAG-TCATAACTATTTTAAACTGG
128 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCT-ATAACTA-TTTGAACTGA
* *** * * * *
109955 TTAGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAAT
1 TTCGATAAACTGTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATT
* ** * * **
110016 ATTATTTTATTTTC-AATAATTTTGTAT-AAATAGAAACAATTTTTTTACAACAAAAC-AAAGGT
66 ATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT
* *
110078 CATAACAATTTTAAATAGATAATTGTT
129 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
110105 CAAGTGAACA
Statistics
Matches: 2167, Mismatches: 526, Indels: 304
0.72 0.18 0.10
Matches are distributed among these distances:
167 13 0.01
168 50 0.02
169 1 0.00
171 5 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
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ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGCTATAACTATTTGAACTGA
Found at i:108661 original size:723 final size:706
Alignment explanation
Indices: 107624--114220 Score: 1935
Period size: 723 Copynumber: 9.3 Consensus size: 706
107614 CAGTAAATAT
*** * * *
107624 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-TGTATTA-TTTTAT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATA-TATTAAATTAT-TATTATTTTTA-
* ** * * *
107687 TTCAAATAAACTTGTATGA-ATAGAAACTTATGT-TTTATGACAAAACAAGATATCATAACGATT
62 TCCAAATATGCTTGTATGACA-A-AAAC-AAT-TATTTATGACAAAACAA-AGATCATAATGATT
* * * * * * *
107750 TGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTACTTAAACTCGCTAGGCAAATAGATTT--TTTT
122 TGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTA-TTAAACT-GGT--TCAAAAAAATTTAGTTTT
* ** * * * * * * *
107813 AAAAAAATTTTACTCATTAATTTTTGAAATTTTAGTAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGC
183 -TAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * *
107878 TTTTATGAACA-AACACAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAA
245 TTTTATGAATAGAA-ACAATTATTTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAA
* * *
107942 TTGTTTAAATGGCTATAATTATTTGAAGTGATTCGATAAACT-GTTTTATTTTTTAAATCTTTTA
309 TTGTTTAAATAG-TATAATTATTTGAACTGATTC-ATAAA-TAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * ** * * *
108006 CTTATTGATATTCAAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAACTG
371 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG
* * *
108071 AAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA-T
436 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGT
*
108135 TCATCACTATTTGAACCTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTT
501 TCAT-ACTATTTGAACCTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTGCTTATTAATTTT
* * * * *
108200 TCAAAAGTTAATAAATTAATATTATTTTCTTCCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTT
564 T-GAAAGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTATTT
* *
108265 TATGACTAAACAAAAGGTTAGTACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTG
628 TATGAC-AAACAAAAGATCA-TACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTC-TAACTATTTG
* *
108330 AAATGATTTGGTAAACAC
690 AAATG-TTCGGTAAACAA
* *
108348 ATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTCAAAATAATATTAAATTATTATTATTTTTATC
1 ATTTA-TTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAAT-ATATTAAATTATTATTATTTTTATC
108413 CAAATCA-GCTTGTATGATCAAAAACAATTATGTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAG
64 CAAAT-ATGCTTGTATGA-CAAAAACAATTAT-TTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAG
* ** *
108477 ATTGATGTTTGTTTAAATAGTTATAACTACTTGAACTGGTTCAAAAAATAGTTCTAGTTTTTAAA
126 ATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTA-TTAAACTGGTTCAAAAAA-A-TT-TAGTTTTTAAA
* * * * *
108542 TCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAA-ATTAATGAAGTACTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTA
187 TCTCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTA
* *
108606 TGAATTGAAACAATTATTTTTTAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTT
250 TGAATAGAAACAATTATTTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTT
* * *
108671 AAATAGTTATATTTATTTGACCTTG-TTCAGTAAATAGCTTTATTTTTTTAAT-TTCTTACTTAT
315 AAATAG-TATAATTATTTGAAC-TGATTCA-TAAATAGCTTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTAT
* * * * * * * * *
108734 TAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGCATTAGTTTATTTTGAATTAGCTTGTATGAATTGAAAT
376 TAA-TTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAAC
* ** * * * * * *
108798 AATTGTTTTATGACTAAATGAAAGGTCAGAACGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCCAA
440 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTCAT
* * *** * * * * * * *
108863 ACCATTTAAACAGGTTCAGCAAATATATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAAG
505 ACTATTTGAACCTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAAG
* * * * * *
108927 TATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTGTGA
570 --TTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTATTTTATGA
* * *
108992 CAAA-ACAAAGATCATA-ATGATTTGAGATAAATAATTGTT-TAAATAGTCATAATTATTTGAAC
633 CAAACA-AAAGATCATACA--ATTTGAAATAAATAATTATTCT-AATAGTC-TAACTATTTGAA-
* *
109054 CTGTTCGATAAACAA
692 ATGTTCGGTAAACAA
* * * * *
109069 ATTTTTTTTTTCAAATTTATTGCTTATTAATTTTTCAAAAGT-TAATAAATTATAATTATTTTCT
1 A-TTTATTTTT-AAATCTATTACTTATTAA-TTTTCAAAA-TATATTAAATTATTATTATTTT-T
** ** * * * *
109133 -TCCAAATATGCTTGTATGAACTGAAGTAATTATTTTATGA-ATAAACAAAAGGTTAGAACGATT
61 ATCCAAATATGCTTGTATG-ACAAAAACAATTA-TTTATGACA-AAAC-AAAGATCATAATGATT
* * * * * * * *
109196 TGAAATAGATAATTATTCT-AATAGCCT-TAATTATTAAAACTGATTCGGTAAACACATTTATTT
122 TGAGATAGATAATTGTT-TAAATAG-TTATAACTATT-AAACTGGTTC---AAAAAAATTTAGTT
* * * *
109259 TTTAAATCT-TGTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTAAATC
181 TTTAAATCTCT-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTATTTC-AAATA
* * *
109322 AGCTTGTATG-ATCAGAAACAATTACTTTATT-ACAAAACAATTA--TCATAACGA-TTTAAGAT
242 AGCTTTTATGAAT-AGAAACAATTA-TTTTTTAACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTTAA-AT
* * * * * * * *
109382 TGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTAAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATC
303 AGATAATTGTTTAAATAGT-ATAATTATTTGAACT-GATTCATAAATAGCTTTATTTTTTAAATC
* * ** * ** *
109447 TCTTACCTAACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTGGTATTAATTTATTTCAGATAAGTTTTTATG
366 TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATG
* * * *
109512 AACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTT-ATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCA
431 AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCA
* * *
109576 AATAGTT-ATATATATTTGAA-CTCATTTAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAAT-TTCTTGTTTA
495 AATAGTTCATA-CTATTTGAACCT-ATTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTT-TTGCTTA
* * * * * *
109638 CTAGCTTTTTGAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-AAA-
556 TTA-ATTTTTGAAAGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAATGAAAC
** * * * * *
109701 GTTTATTTTATG----ACAAAAGATCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCCAAC
620 AATTATTTTATGACAAACAAAAGATC-ATACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTAAC
* * * *
109762 TATTTGAATTGGTTCAGCAAATATA
684 TATTTGAAAT-GTTCGGTAAACA-A
* * * *** * *
109787 TTTTATTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCC
1 ATTTATTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATA-TATTAAATTATTATTATTTTTATCC
* * *
109852 AAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTCTATGACAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGAT
65 AAATATGCTTGTATGACAA-AAACAATTATT-TATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGAT
* * * *
109917 AAATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTTAAACTGGTTAGATAAACAAATTTAGTTTTTAAA-
128 AGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTA--TTAAACTGGTT-CA-AAA-AAATTTAGTTTTTAAAT
*
109981 -TC-TCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTTC-AATAA-TTTTGTA
188 CTCTTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT-AATATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTT-TA
* * *
110042 TAAATAGAAACAATT-TTTTTACAACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTT
250 TGAATAGAAACAATTATTTTT-TAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTT
* * ** * * * * * ** ** *
110105 CAAGTGAACACAACTATGTCAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTAT
314 TAAAT-AGTATAATTATTTGAAC-TGATTCA-TAAATAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * *
110169 TAA--ATTGCAGA-ATT--T---GTA-TA--AA--CA------A-AA------AT-AA-T-----
376 TAATTTTTG-AAATATTAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAAC
** * * * * * * * ** *
110201 --TT-TTTTACAAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCGAGT-GGACGT
440 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTCAT
* ** ** * ** ***
110261 GACTATTTGAACCTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCAATTAAATTGCAGAA
505 -ACTATTTGAACCTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATT-AATTTTTGAA
* * * * * *
110326 TA-TTAATAAATTAGTATGATTTTATT-TAGAATAAACTTGTTTG-AATAGAAATAATTATTTTA
568 -AGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCA-AATAAGCTTGTATGAAAT-GAAACAATTATTTTA
* * * * * * * *
110388 TGACAAAACAAAAGAGCATAACTATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAACAGTCATTACTATTTTAA
630 TGAC-AAACAAAAGATCAT-ACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTC-TAACTATTTGAA
* * ** * *
110453 CTTGCTCAATAAATAG
692 -ATGTTCGGTAAACAA
* * * ** * * *
110469 ATTTATTTTTTAAATATTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-TT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATA-TATTAAATTATTATTATTTTTATC
* * * * * * * * *
110533 CGAATAAGCTTGTATTGAATAGAAAACAATTGGTTTATGATAAAATAAAAGCGTCAAAATTATTT
64 CAAATATGCTTGTA-TG-ACA-AAAACAATT-ATTTATGACAAAA-CAAAG-ATCATAATGA-TT
* * * *
110598 TGAAATAGGATAATTGTTCAAATAGTTATAATCATCATTAATCATGATATCAAAGGTTAAAA--T
122 TGAGATA-GATAATTGTTTAAATAGTTATAA-C-T-ATTAAAC-TGGT-TCAAA----AAAATTT
* * * * ** * * * *
110661 AG-ATTTATATTTTAACTACTTA-TAA-TTTTGCAATATTAA-CATTTA-ATTATTTTA--TAAG
177 AGTTTTTA-AATCT--CTTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATAATATTATTTTATTTCA-
** * * * * *
110719 AAT-AG-TTTGTAATGAATAGAAACAATT-TGCTTCATGACAATA-AAAAGTTCATAACAATTTG
238 AATAAGCTTT-T-ATGAATAGAAACAATTAT--TTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTT
* * * ** *
110780 AAATAGATAACTATTCAAATAGTA-AA--A-TTGATACATTG-TTCAGTAAGCAG-ATTATTTTT
299 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTATAATTATTTGA-AC--TGATTCA-TAAATAGCTTTA-TTTT
* * * * *
110839 TTAAAT-TCTTACTTGTTAATTTTAT-AAA-A-TAA-AATA-TGGTATTATTTTA-TTTGAAATA
359 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAA-AGTAGTATTAATTTATTTTG-GATA
* * * *
110897 TGC-ATTATGAACT-AATACAA-TGTTTTTAT-A-TAAACAAAAATGTT--ATACGA-TTTAAAT
421 AGCTTTTATGAACTGAA-ACAATTG-TTTTATGACAAAAC-AAAA-GTTCAAAACGATTTTAAAT
* * * * *
110954 AG-TAAATTATTTAAATAGTT-ATAACTATTCGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA--TTTTAAA
482 AGAT-AATTATTCAAATAGTTCAT-ACTATTTGAACCTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
* **** * * * * *
111015 TCTTTTACTTATTAATTGGCAAAATATTAATAAATTCATATTCTTTTAATCCAAATAAGTTTGTA
545 TCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAA-GTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * *
111080 TG-AA-GAAAAATAGTTGTTTTATGATAAAACAAAA-ATGTAATA-ATGATTTGAAATAAATAAT
609 TGAAATGAAACA-A-TTATTTTATGA-CAAACAAAAGA--TCATACA--ATTTGAAATAAATAAT
* * * * * *
111141 TTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGGTAAACAG
667 TATTCTAATAGTC-TAACTATTTGAA-ATGTTCGGTAAACAA
* *
111183 ATTTA-TTTT---T-TA--A---A-T-ATTTT---ACT-TATT--A--ATT-TTA---TT-T-GA
1 ATTTATTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATATATTAAATTATTATTATTTTTATCCA
* * * * * **
111222 AATATGCTTGTATGAATAGAAAACAAATTGTTTTACGACAAAATAAAAAGATAATAGCGATTTGA
66 AATATGCTTGTATG-ACA-AAAAC-AATT-ATTTATGAC-AAA-ACAAAGATCATAATGATTTGA
* * * ** * * * * *
111287 AATAGATAATTGGTCAAATCTTTA-AGACTATTTGAACTTGTT-AGGTAAATAGATTAATTTTTT
125 GATAGATAATTGTTTAAATAGTTATA-ACTA-TTAAACTGGTTCA---AAA-AAATTTAGTTTTT
* *
111350 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATTTCGAATATA-C
184 AAATCTCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TA-ATATTATTTTATTTCAAATA-AGC
* ** * * * * * * ** *
111413 TTGTACAAATAGAAATAATTATTTTGTGATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGGAATAGACAAT
245 TTTTATGAATAGAAACAATTATTTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAAT
* * ** * * * * * ** * * **
111478 TATTCAAGCAATCATAACTATTTGCA-TTAGTCAGGCCAATAGATTCA-TTTTTAAATCCATTAC
310 TGTTTAAATAGT-ATAATTATTTGAACTGATTCA--TAAATAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * * ** * *
111541 TTATTAACTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAA-TA
372 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-
* * * * * * * *
111604 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGT--ATACTGCTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
435 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAAC-GATTTTAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
111667 GTT-ATAACTAATT-AAACTGGTTTAGGTATAACTAA-TCA---CTT--A-C--TT-CTTA-T--
499 GTTCAT-ACTATTTGAACCT-ATTTA-GTA-AACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAA
** * * *** * ** * * *
111717 TTTTCAAAATATTAATAAATTAATCTTATTTTATTTTGAACAAATTTATATGAACA-AAAACATT
560 TTTTTGAAA-GTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-ATGAAACAAT
* ** ** * * *
111781 TGTTTTATG---------TTAT-A-ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
623 TATTTTATGACAAACAAAAGATCATACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTC-TAACTAT
* * * *
111835 TTGAACAGGTTTGGCAAATAGA
687 TTGAA-ATGTTCGGTAAACA-A
* ** * *
111857 A-TTATTTTTTAAA--TA-T-CTTATTTATTTTTGAAATATTAATAAATT-TGTTTTA-TTTTAT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATA-TATTAAATTAT-TATTATTTTTA-
*** * * * *** * ** * * *
111915 TTTGAATAAG-TTACTAAGA-ACTCA-AATTGTTCTGCGGCAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTT
62 TCCAAATATGCTT-GTATGACAAAAACAATTATT-TATGACAAAAC-AAAGATCATAATGA-TTT
* * * * * * * ** *
111976 GAAATAAAGAATTGTTCATATAGCTT-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAGCAAATTTATTTTT
123 GAGATAGATAATTGTTTAAATAG-TTATAACTA-TTAAACT-GGTT--CAAAAAAATTTA-GTTT
* * * * * * * *
112040 TTAAATCTCTTAGTTATTTATTTTCATAATATTATTACAA-AAGTATTATTTTATTCCGAATAAA
182 TTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATA-AATAA-TATTATTTTATTTCAAATAAG
* * * * * * * * * ** * *
112104 CTTGTGTGAACAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAATGTTATAATAATTTAAAATATATAA
244 CTTTTATGAATAGAAACAATTATTTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAA
* * * * * * **
112169 TTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACT-GAATTATTTTTTAAATCTTTTA
309 TTGTTTAAATAGT-ATAATTATTTGAACTGATTCA-TAAA-TAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * *** ** ** **
112233 CATATTAATTTTTAAAATACTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGAATGTTCAA
371 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG
* * * * * * * *
112298 AAACATTTGTTATATGACGAAACAAAAGGT-AACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-G
436 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAA-AACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
** * * * * * * * ** * *
112361 GCCCTAAGTATTTGAA-ATGATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTAATAATTT
500 TTCAT-ACTATTTGAACCT-ATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAA-TT
** * * * * *
112425 TTTGAATA-TTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACGATTGT
562 TTTGAA-AGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTAT
* * * * * * **
112489 TTTATGACAGAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT-TGTATAGTCTTAAATGC
626 TTTATGACA-AACAAAAGATC-ATACAATTTGAAATAAATAATTATTCT-AATAGTC-TAACTAT
* * * *
112553 TTGAATTGCTTTGGTAAATAG
687 TTGAAATG-TTCGGTAAACAA
* * * ** * *
112574 ATTT-TTTTT-AATTTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATGTTA-TTTTATTC
1 ATTTATTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATA-TATTAAATTATTATTATTTTTA-TC
** * *** * * * * *
112636 TGAATAAGCTTACGTGA-ATTGAAACAATTATTTTAT-AGTAGAACAAAAGGTTATAATGATTTG
64 CAAATATGCTTGTATGACA--AAAACAATTA-TTTATGA-CAAAAC-AAAGATCATAATGATTTG
* * * * **** * * *
112699 AAATAGGTAATTATTCAAATA---A-AA--ATTGGTTTGG-T-AAATAGATTTATTTTTTAAATC
124 AGATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTAAACTGGTTCAAAAAAATTTAGTTTTTAAATC
* * * *
112756 TCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
189 T-CTTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATG
* * * * * * * *
112821 -ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGA
252 AAT-AGAAACAATTATTTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTA
** * * * * * *
112885 AATGACCATAATTATTTGATCTGATTTGGA-AAATAGATTCACTTTTTAAGTC----ACTTATTA
316 AAT-AGTATAATTATTTGAACTGA-TT-CATAAATAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * *
112945 ATTTTAGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC
378 ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTA--A-TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAAC
* * * * * * ** *
113010 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTGATATAGATAATTGTTCAAAT-GGCCGT
440 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTCAT
* * * **
113073 AATTATTTTAA-CTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTCATTAATTTTAAAA
505 -ACTATTTGAACCT-ATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAA
* * * * * * * *
113133 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTATATAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATG
568 A-GTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTATTTTATG
* * * * * *
113198 ACAAAACAAAAGGTCATA-ATGATTTTAAACAAGTTAATTATTCAAATAGTCATAACTAATT-AA
632 AC-AAACAAAAGATCATACA--ATTTGAAATAA-ATAATTATTCTAATAGTC-TAACTATTTGAA
* * *
113261 GCT-TATTGGTAAACAG
692 -ATGT-TCGGTAAACAA
* * *** * * * **
113277 ATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTA-TTTTAT
1 ATTTA-TTTTT-AAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAAT-ATATTAAATTATTATTATTTTTA-
** * * * * * * * * ** *
113341 TCTGAATAAGCTTATATAATATGAAACAAATATTTTATGACTGAAAC-AAGGTCA-AACAATTTA
62 TCCAAATATGCTTGTATGACA-AAAACAATTA-TTTATGAC-AAAACAAAGATCATAATGATTTG
* * * * * * * *
113404 AAATAGATAATTATTCT-AATAGTTTTACCTATTCAA-------AAACACATTTATTTTTTAAA-
124 AGATAGATAATTGTT-TAAATAGTTATAACTATTAAACTGGTTCAAAAAAATTTAGTTTTTAAAT
* * * *
113460 -TC-TCTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTCTG
188 CTCTTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATG
* * * * * * * * *
113523 -ATAAAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
252 AAT-AGAAACAATTATTTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTA
* * * **
113587 AAT-GATCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTA
316 AATAG-T-ATAATTATTTGAACTGATTCA-TAAATAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * *
113647 ATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTATAAGCTTGTATTAACTGAAACAAT
378 ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAAT
* * * ** * *
113712 TGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TAATGAC
443 TGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTCAT-AC
* * * * * * * *
113776 TATTTGAACCTATTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATT
507 TATTTGAACCTATTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAA-G
* * * * * * *
113841 TTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACT
570 TTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTATTTTATGAC-
* ** * * * * * *
113906 AAATAAAAGGCCATA-ATGATTTGAAATAGATAGTTATTCTAACAATCTTAACT-TATGAACTGG
634 AAACAAAAGATCATACA--ATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTC-TAACTATTTGAAAT-G
* * *
113969 TTTGATAAATAA
695 TTCGGTAAACAA
* * ** **
113981 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTTGAAATATTATTAAATT-TGTATTATTTAAAA
1 ATTTA-TTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATA-TATTAAATTAT-TATTATTT-TTA
* ** ** * * * *
114045 T-CAAATAAGCTTGTACAAACAAAAA-TTTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTAAAGATTTG
62 TCCAAATATGCTTGTA-TGACAAAAACAATTA-TTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTG
* * * * * * * *
114108 AAATTGATAATCGTTCATATAGTCT-TAACTATTTAAATTGGTTCAACAATTAGATTTATTTTTT
124 AGATAGATAATTGTTTAAATAGT-TATAACTA-TTAAACTGGTTCAA-AA--AAATTTAGTTTTT
* * * * * * *
114172 AATTTTCTTAGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTT
184 AAATCTCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TAATATTATTT
114221 CAATCTGAAT
Statistics
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Consensus pattern (706 bp):
ATTTATTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCAAAATATATTAAATTATTATTATTTTTATCCA
AATATGCTTGTATGACAAAAACAATTATTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAGA
TAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTAAACTGGTTCAAAAAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTCTT
ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAAC
AATTATTTTTTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTATAA
TTATTTGAACTGATTCATAAATAGCTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
TAATAAAGTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAA
AACAAAAGTTCAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTCATACTATTTGAACCTATT
TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAAGTTAATAAATTAATATT
ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTATTTTATGACAAACAAAAGATCATACA
ATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTAACTATTTGAAATGTTCGGTAAACAA
Found at i:109028 original size:903 final size:897
Alignment explanation
Indices: 108070--110023 Score: 2709
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108060 TTTATGAACT
* * * * * * * *
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* * * *
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*
108200 TCAAAAGTTAATAAATTAATATTATTTTCTTCCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTT
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* * * *
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*
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*
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* * * * * *
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* * * * *
108522 AAATAG-TTCTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAA-ATTAATGAAGTACTATTAT
452 AAATAGCTT-TAGTTTTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTACTATTAA
* *
108585 TTTATTTCAAATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTATTTT-TTAATAAAACAAAAGGTCATAAC
516 TTTATTTCAAATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATT-ACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * ** * *
108649 GATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATATTTATTTGACCTTGTTCAGTAAATAGCTTTAT
580 AATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATATATATTTGAACTCATTCAGTAAACAGATTTAT
* * *
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* * * * *
108778 TAGCTTGTATGAATTGAAA-TAATTGTTTTATGACTAAATGAAAGGTCAGAACGATTTAAAATAG
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*
108842 ATAATTATTCTAATAGTCCAAACCATTTAAACAGGTTCAGCAAATATA-TTTATTTTTAAATCTC
767 ATAATTATTCTAATAATCC-AACCATTTAAACAGGTTCAGCAAATATATTTTATTTTTAAATCTC
*
108906 TTACTTATTAATTTTTGGAAGTATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGA
831 TTAATTATTAATTTTTGGAA-TATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGA
108971 AAA
895 AAA
* *
108974 GAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAGT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTAAAATAGT
* * *
109039 CATAATTATTTGAACCTGTTCGATAAACAAATTTTTTTTTTCAAAT-TTATTGCTTATTAATTTT
66 CATAACTATTTGAACCTGTTAGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTT-TTGCTTATTAATTTT
** * **
109103 TCAAAAGTTAATAAATT-ATAATTATTTTCTTCCAAATATGCTTGTATGAACTGAAGTAATTATT
130 TCAAAAGTTAATAAATTAAT-ATTATTTTCTTCCAAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTATT
* * *
109167 TTATGAATAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGCCTTAATTATTA
194 TTATGAATAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGCCTTAACTATTA
* * * *
109232 AAACTGATTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTA
259 AAACTGATTCGGTAAACACATTTAGTTTTTAAATCTTGTACTTACTAATTTTCAAAATAATATTA
* * *
109297 AATTAGTATTATTTTTATCTAAATCAGCTTGTATGATCAGAAACAATTACTTTATTACAAAACAA
324 AATTAGTATTATTTTTATCCAAATCAGCTTGTATGATCAAAAACAATTACTTTATGACAAAACAA
** * *
109362 TTATCATAACGATTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTAAAAA
389 AGATCATAACGATTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTACTTAAACTAGTTCAAAAA
**
109427 ATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTGGTATTAATTT
454 ATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTACTATTAATTT
* * *
109492 ATTTCAGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAACAATT
519 ATTTCAAATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
*
109557 TTAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATATATATTTGAACTCATTTAGTAAACAGATTTATTTTT
584 TTAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATATATATTTGAACTCATTCAGTAAACAGATTTATTTTT
** * * *
109622 TTAAATTTCTTGTTTACTAGCTTTTTGAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
649 TTAAATTTCTTACTTACTAACTTTTTGAAAGTTAATAAATTAGCATTAGTTTATTTCGAATAAGC
*
109687 TTGTATGAACTAAAGTTTATTTTATGACAAAAGATCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
714 TTGTATGAACTAAAGTTTATTTTATGACAAAAGATCAAAACGATTTAAAATAGATAATTATTCTA
* * ** *
109752 ATAATCCAACTATTTGAATTGGTTCAGCAAATATATTTTATTTTTAAATCTTTTAATTATTAATT
779 ATAATCCAACCATTTAAACAGGTTCAGCAAATATATTTTATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT
109817 TTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAA
844 TTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAA
* *
109871 GAAACAATTGTTCTATGACAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTAAAATAGT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTAAAATAGT
* * *
109936 CATAACTATTTTAAACTGGTTAGATAAACAAATTTAGTTTTT-AAATC---T-CTTATTAATTTT
66 CATAACTATTTGAACCT-GTTAGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTT
* *
109996 T-AAAATATTAATAAATCAATATTATTTT
130 TCAAAA-GTTAATAAATTAATATTATTTT
110024 ATTTTCAATA
Statistics
Matches: 932, Mismatches: 103, Indels: 41
0.87 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
892 4 0.00
893 30 0.03
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (897 bp):
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTAAAATAGT
CATAACTATTTGAACCTGTTAGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT
CAAAAGTTAATAAATTAATATTATTTTCTTCCAAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTATTTT
ATGAATAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGCCTTAACTATTAAA
ACTGATTCGGTAAACACATTTAGTTTTTAAATCTTGTACTTACTAATTTTCAAAATAATATTAAA
TTAGTATTATTTTTATCCAAATCAGCTTGTATGATCAAAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAG
ATCATAACGATTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTACTTAAACTAGTTCAAAAAAT
AGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTACTATTAATTTAT
TTCAAATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTT
AAATAAATAATTATTCAAATAGTTATATATATTTGAACTCATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTT
AAATTTCTTACTTACTAACTTTTTGAAAGTTAATAAATTAGCATTAGTTTATTTCGAATAAGCTT
GTATGAACTAAAGTTTATTTTATGACAAAAGATCAAAACGATTTAAAATAGATAATTATTCTAAT
AATCCAACCATTTAAACAGGTTCAGCAAATATATTTTATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT
TGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAA
Found at i:110205 original size:145 final size:145
Alignment explanation
Indices: 110036--110326 Score: 440
Period size: 145 Copynumber: 2.0 Consensus size: 145
110026 TTTCAATAAT
* * *
110036 TTTGTATAAATAGAAACAATTTTTTTACAACAAA-ACAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAA
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*
110100 TTGTTCAAGTGAACACAACTATGTCAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAC
65 TTGTTCAAGTGAACACAACTATGTCAACCTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAC
*
110165 CTATTAAATTGCAGAA
130 CAATTAAATTGCAGAA
*
110181 TTTGTATAAACAAAAATAATTTTTTTACAACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
1 TTTGTATAAACAAAAACAATTTTTTTACAACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * *** * * *
110246 TGTTCGAGTGGACGTGACTATTTGAACCTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
66 TGTTCAAGTGAACACAACTATGTCAACCTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
110311 AATTAAATTGCAGAA
131 AATTAAATTGCAGAA
110326 T
1 T
110327 ATTAATAAAT
Statistics
Matches: 131, Mismatches: 14, Indels: 2
0.89 0.10 0.01
Matches are distributed among these distances:
145 130 0.99
146 1 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.13, G:0.11, T:0.35
Consensus pattern (145 bp):
TTTGTATAAACAAAAACAATTTTTTTACAACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
TGTTCAAGTGAACACAACTATGTCAACCTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
AATTAAATTGCAGAA
Done.