Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167926.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_19, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 20060819
ACGTcount: A:0.34, C:0.16, G:0.16, T:0.34
Warning! 113000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 2 of 117
Found at i:112352 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 111792--113425 Score: 1033
Period size: 181 Copynumber: 9.2 Consensus size: 181
111782 GTTTTATGTT
* * * * ** * *
111792 ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACAGGTTTGGCAAA-TAG
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACT-G
* * * * *
111856 AATTATTTTTTAAA---TAT-CTTATTTATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTT
65 AATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * ** * ** *
111917 TGAATAAG-TTACTAAGAAC--TCA-AATTGTTCTGCGGCAAAACAAAAGGTC
130 CAAATAAGCTT-GTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * ** * * *
111966 ATAAC-ATTTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCTTTAACTATTTGAACT-AGTTTGGCAAGC-
1 ATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGA-TTTGGTAAACT
* * * * * * * *
112028 AAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTTATTTTCATAATATTATTACAA-AAGTATTATTTT
64 GAA-TTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * *
112092 ATTCCGAATAAACTTGTGTGAACAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAATGTT
126 ATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * * * * *
112148 ATAATAATTTAAAATATATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACTGA
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACTGA
* * *
112213 ATTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTAAAATACTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTC
66 ATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* ** * * * *
112278 AAATAAGCTTGAATGTTCAAAAACATTTGTTATATGACGAAACAAAAGGTA
131 AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * *
112329 ACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCCTAAGTATTTGAAATGATTTGGTAAACAG-
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACTGA
* ** * ** *
112393 ATTCACTTTTTAAATCACTTACTTAATAATTTTTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT
66 ATT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
112458 CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACGATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTC
130 CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *** * * * ** *
112510 AAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTGTATAGTCTTAAATGCTTGAATTGCTTTGGTAAA-T-A
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACTGA
* * * * * *
112573 GATT-TTTTTT-AATTTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATGTTATTTTA-TT
66 -ATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* *** *** * * * *
112635 CTGAATAAGCTTACGTGAATTGAAACAATTATTTTAT-AGTAGAACAAAAGGTT
130 C-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTC
* * *
112688 ATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATA---A-AA--A-TTG----G-TTTGGTAAA-TAG
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACT-G
* ** *
112740 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
65 AATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * *
112805 CAAATAAGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTC
130 CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
112857 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GACCATAATTATTTG-ATCTGATTTGG-AAAAT
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CCATAACTATTTGAAT-TGATTTGGTAAACT
* * * *
112919 -AGATTCACTTTTTAAGTC----ACTTATTAA-TTTTAGGAATATTAATAAATTATTATTATTAT
64 GA-ATT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAAT-AA--ATTAGTATTAT
* ** *
112978 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
123 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * *
113037 ATAACGA-TTGATATAGATAATTGTTCAAATGGCCGTAATTATTTTAACTGATTTAGTAAAC-AA
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACTGA
* *
113100 ATTTATTTTTTAAATC---T-CTCATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
66 A-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
113160 CTATATAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
130 C-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
113213 ATAATGATTTTAAACAAGTTAATTATTCAAATAGTCATAACTAATT-AAGCTT-A-TTGGTAAAC
1 ATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA--TTGATTTGGTAAAC
* * * * ** * * *
113275 AGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTA
63 TGAATTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
113340 -TTCTGAATAAGCTTATAT-AATATGAAACAAATATTTTATGACTGAAAC--AAGGTC
127 TTTC-AAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTC
* * * *
113394 A-AACAATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAG
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
113426 TTTTACCTAT
Statistics
Matches: 1139, Mismatches: 252, Indels: 133
0.75 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
166 10 0.01
167 3 0.00
168 7 0.01
169 105 0.09
170 4 0.00
171 3 0.00
172 1 0.00
173 5 0.00
174 53 0.05
175 13 0.01
176 73 0.06
177 45 0.04
178 137 0.12
179 132 0.12
180 104 0.09
181 304 0.27
182 133 0.12
183 7 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACTGA
ATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
Found at i:112975 original size:177 final size:173
Alignment explanation
Indices: 112738--114124 Score: 1078
Period size: 177 Copynumber: 7.8 Consensus size: 173
112728 TTTGGTAAAT
*
112738 AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 AGATTTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * *
112803 TTCAAATAAGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACGATTTG
62 TTCGAATAAGCTTGTATGATG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * *
112868 AAATAGATAATTGTTGAAATGACCATAATTATTTGATCTGATTTGGAAAAT
125 AAATAGATAATTGTTCAAATGA-CATAATTATTTGAACTGA-TTAGAAAAC
* * * * * *
112919 AGATTCACTTTTTAAGTCACTTATTAATTTTAGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATT
1 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAAT-AA--ATTAGTATTATTTTATT
* *
112984 TCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTGA
63 TCGAATAAGCTTGTATG-A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * *
113048 TATAGATAATTGTTCAAATGGCCGTAATTATTTTAACTGATTTAGTAAAC
126 AATAGATAATTGTTCAAAT-GACATAATTATTTGAACTGA-TTAGAAAAC
* * * *
113098 AAATTTATTTTTTAAATCTCTCATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCT
1 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * *
113162 ATATAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAA
66 A-ATAAGCTTGTA-TGA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * * *
113227 CAAGTTAATTATTCAAATAGTCATAACTAATT-AAGCTTATTGGTAAAC
128 -TAGATAATTGTTCAAAT-GACATAATTATTTGAA-CTGATTAGAAAAC
* * * *
113275 AGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTT
1 AGATTTATTTTTT-AAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * **
113339 A-TTCTGAATAAGCTTATATAATATGAAACAAATATTTTATGACTGAAAC--AAGGTCA-AACAA
60 ATTTC-GAATAAGCTTGTAT--GATGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * *
113400 TTTAAAATAGATAATTATTC---T-A-AT-AGT-TTT-ACCT-ATTCA-AAAAC
121 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACATAATTATTTGAACTGATT-AGAAAAC
*
113444 ACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTCTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
1 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTT-TAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * * *
113508 AAATAAGCTTGTCTGATAAAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTAAAATGATTTGAAA
65 GAATAAGCTTGTATGAT--GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* *
113573 TAGATAATTGTTCAAATGATCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAAC
128 TAGATAATTGTTCAAATGA-CATAATTATTTGAACTGA-TTAGAAAAC
*
113621 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
1 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * * *
113686 TATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAAT
66 AATAAGCTTGTA-TGA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * *
113751 AGATAATTGTTCAAATAGTA-ATGACTATTTGAACCT-ATTCA-ATAAAT
129 AGATAATTGTTCAAAT-G-ACATAATTATTTGAA-CTGATT-AGA-AAAC
** * *
113798 AGATTTATTTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTA
1 AGATTTA-TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * *
113863 TTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAAGGCCATAATGATTT
61 TTTCGAATAAGCTTGTATG-A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * ** * * * *
113928 GAAATAGATAGTTATTCTAACAATCTTAACTTA--TGAACTGGTTTGATAAAT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATGA-CATAA-TTATTTGAACTGATTAGA-AAAC
* * * * * *
113979 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTAAA
1 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--A-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * ** ** * * * *
114044 ATCAAATAAGCTTGTACAAACAAA-AATTTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTAAAGATTTG
62 TTCGAATAAGCTTGTATGATGAAACAA--TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* *
114108 AAATTGATAATCGTTCA
125 AAATAGATAATTGTTCA
114125 TATAGTCTTA
Statistics
Matches: 975, Mismatches: 164, Indels: 136
0.76 0.13 0.11
Matches are distributed among these distances:
162 2 0.00
163 6 0.01
164 58 0.06
165 10 0.01
166 23 0.02
168 3 0.00
169 20 0.02
170 3 0.00
171 3 0.00
172 4 0.00
173 4 0.00
174 3 0.00
175 7 0.01
176 75 0.08
177 206 0.21
178 53 0.05
179 135 0.14
180 133 0.14
181 43 0.04
182 172 0.18
183 12 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (173 bp):
AGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
AATAAGCTTGTATGATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
ATAATTGTTCAAATGACATAATTATTTGAACTGATTAGAAAAC
Found at i:113613 original size:702 final size:700
Alignment explanation
Indices: 112081--114030 Score: 1943
Period size: 702 Copynumber: 2.8 Consensus size: 700
112071 TTATTACAAA
* * * * * * * * *
112081 AGTATTATTTTATTCCGAATAAACTTGTGTGA-ACAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAT
1 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATA-AAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAA-
* ** * * * * * * * *
112145 GTT-ATAATAATTTAAAATATATAATTGTTCAGAT-AGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAA
64 GTTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGA-CCATAATTATTTGAACTGATTTAGAAA
* * * * *
112208 ACTGAATT-ATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTA-AAATACTAGTAAATTAGTATTATT
128 AC-AAATTCACTTTTTAAATC----ACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** ** * * * * *
112271 TTATTTCAAATAAGCTTGAATGTTCAAAAACATTTGTTATATGACGAAACAAAAGGTAACAATGA
187 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * * *
112336 TTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCCTAAGTATTTGAAATGATTTGGTAAACAGATTCACTT
252 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAACAGATTTATTT
* * * * *
112401 TTTAAATCACTTACTTAATAATTTTTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAG
317 TTTAAAT--C-T-CTCATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAATAAG
* * * **
112466 CTTGTATGAACTAAAACGATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAA
377 CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* *** * ** * *
112531 TTGTTTGTATAGTCTTAAATGCTTGAATTGC-TTTGGTAAATAGA-TT-TTTTTT-AATTTTTTA
442 TTATTCAAATAGTCTTAACTAATT-AA--GCTTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-
* * *
112592 G-TTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAATGTTATTTTATTCTGAATAAGCTTACGTGAAT
503 GCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAAGGTTATTTTATTCTGAATAAGCTTACATGAAT
* * * ** * *
112655 TGAAACAATTATTTTATAGTAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATA
567 TGAAACAAATATTTTATACTAGAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATA
** *** * * * *
112720 AAAATTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
632 AAAATTCCTTTCAAAAACACATTTATTTTTTAAA-CTCCTACTTATTAATTTCTAAAATATTAAT
112785 AAATT
696 AAATT
* * * *
112790 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGT
1 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGT
* * * * *
112855 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGACCATAATTATTTGATCTGATTTGGAAAATA
66 TCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACCATAATTATTTGAACTGATTTAGAAAACA
* * * *
112920 GATTCACTTTTTAAGTCACTTATTAATTTTAGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATTT
131 AATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTAGAAATATTAAT-AA--ATTAGTATTATTTTATTT
* * *
112985 CGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTGAT
193 CGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * *
113049 ATAGATAATTGTTCAAATGGCCGTAATTATTTTAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
258 ATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
** *
113114 TCTCTCATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTATATAAGCTTGTATTAA
323 TCTCTCATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA-ATAAGCTTGTATGAA
* * *
113179 CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAACAAGTTAATTATTCAAA
387 CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAA
* *
113244 TAGTCATAACTAATTAAGCTTATTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATT
451 TAGTCTTAACTAATTAAGCTT-TTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATT
* * *
113309 TTTTGAATGTTAATATATT-AGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATAT-AATATGAAACAAAT
514 TTTTGAATATTAATAAATTAAGG-TTATTTTATTCTGAATAAGCTTACATGAAT-TGAAACAAAT
* * ***
113372 ATTTTATGACT-GAA-ACAAGGTCA-AACAATTTAAAATAGATAATTATTCTAAT-AGTTTTACC
577 ATTTTAT-ACTAGAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAAAAATT-CC
113433 TATTCAAAAACACATTTATTTTTTAAA-T-CT-CTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATT
640 T-TTCAAAAACACATTTATTTTTTAAACTCCTACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATT
*
113492 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTCTGATAAAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGG
1 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAA-G
* * * *
113557 TT-AAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGATCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAAC
65 TTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACCATAATTATTTGAACTGATTTAGAAAAC
* * *
113621 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
130 AAATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * * *
113686 TATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAAT
195 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* ** * * * *
113751 AGATAATTGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACCT-ATTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAA
260 AGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAA-CTGATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAA
* * * *
113815 TCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCGAATAAACTTGTA
323 TCTC-T-C--ATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAATAAGCTTGTA
* * * * *
113880 TGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAAGGCCATAATGATTTGAAATAGATAGTTATTC
383 TGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * *
113945 TAACAATCTTAACTTATGAA-CTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-
448 AAATAGTCTTAACTAATTAAGCT--TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTA
*
114008 ATTTTTTGAAATATTATTAAATT
511 ATTTTTTG-AATATTAATAAATT
114031 TGTATTATTT
Statistics
Matches: 1028, Mismatches: 178, Indels: 76
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
699 70 0.07
700 45 0.04
701 19 0.02
702 189 0.18
703 138 0.13
704 76 0.07
705 138 0.13
706 39 0.04
707 128 0.12
708 77 0.07
709 108 0.11
710 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (700 bp):
AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGT
TCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACCATAATTATTTGAACTGATTTAGAAAACA
AATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
GATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
CTCATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAATAAGCTTGTATGAACTAA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
TTAACTAATTAAGCTTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAA
TATTAATAAATTAAGGTTATTTTATTCTGAATAAGCTTACATGAATTGAAACAAATATTTTATAC
TAGAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAAAAATTCCTTTCAAAAACA
CATTTATTTTTTAAACTCCTACTTATTAATTTCTAAAATATTAATAAATT
Found at i:113665 original size:523 final size:526
Alignment explanation
Indices: 112733--113947 Score: 1414
Period size: 523 Copynumber: 2.3 Consensus size: 526
112723 ATTGGTTTGG
* * * * * *
112733 TAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGGATTA
* * * * * * * **
112797 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG--ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATA
66 ATTTATTTCGAATAAACTTATATGAAATG--AAACAAATATTTTATGACTAAATAAAAGGCCATA
* * * * * * ** * * *
112860 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGACCATAATTATTTGATCTGATTTGGAAAATAGATTC
129 ACAATTTAAAATAGATAATTATT---CT-A--AT-AGT-TTT-ACCT-A-TTCAAAAACACATTT
* * * * *
112925 ACTTTTTAAGTCACTTATTAATTTTAGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTTTATTTCGAAT
183 ATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAA-TATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
** * * * *
112990 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTGATATAGAT
247 AAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAACGATTGAAATAGAT
* *
113055 AATTGTTCAAATGGCCGTAATTATTTTAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTC
312 AATTGTTCAAATGACCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTC
113120 ATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTATATAAGCTTGTATTAACTAAA
377 ATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-ATATAAGCTTGTATTAACTAAA
* * *
113184 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAACAAGTTAATTATTCAAATAGTC
441 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAA-AAGATAATTATTCAAATAGTA
* **
113249 ATAACTAATT-AAGCTTATT-GG
505 ATAACTAATTGAA-CCTATTCAA
* * *
113270 TAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGGATTA
* * * * *
113335 TTTTA-TTCTGAATAAGCTTATAT-AATATGAAACAAATATTTTATGACTGAA-ACAAGGTCA-A
66 ATTTATTTC-GAATAAACTTATATGAA-ATGAAACAAATATTTTATGACTAAATAAAAGGCCATA
113396 ACAATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTACCTATTCAAAAACACATTTATTTTTTAAAT
129 ACAATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTACCTATTCAAAAACACATTTATTTTTTAAAT
* *
113461 CTCTTATTAATTTCTA-AAATATTAAT-AA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTCTG
194 CACTTATTAATTT-TAGAAATATTAATAAATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * *
113523 ATA-AAAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
258 A-ACAAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAACGA-TTGAAATAGATAATTGTTCA
* *
113587 AATGATCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTT
321 AATGACCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCATTAATTTT
* * *
113652 AGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTT
386 AAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTT
* * * * *
113717 TATTACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATGACTATTTG
451 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAAAAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTAATTG
113782 AACCTATTCAA
516 AACCTATTCAA
* * * *
113793 TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATTTTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGGATTA
* * * * *
113858 ATTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAAGGCCATAAT
66 ATTTATTTCGAATAAACTTATATGAAATGAAACAAATATTTTATGACTAAATAAAAGGCCATAAC
* * *
113923 GATTTGAAATAGATAGTTATTCTAA
131 AATTTAAAATAGATAATTATTCTAA
113948 CAATCTTAAC
Statistics
Matches: 582, Mismatches: 81, Indels: 42
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
522 94 0.16
523 267 0.46
524 17 0.03
525 64 0.11
526 3 0.01
527 3 0.01
528 3 0.01
529 2 0.00
530 2 0.00
532 1 0.00
533 1 0.00
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538 74 0.13
540 3 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (526 bp):
TAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGGATTA
ATTTATTTCGAATAAACTTATATGAAATGAAACAAATATTTTATGACTAAATAAAAGGCCATAAC
AATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTACCTATTCAAAAACACATTTATTTTTTAAATCA
CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
AAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAACGATTGAAATAGATAATTGTTCAAATGA
CCATAATTATTTTAACTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCATTAATTTTAAAAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAAAAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTAATTGAACCT
ATTCAA
Found at i:114290 original size:360 final size:357
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113606 ACTGATTTAG
*
113616 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTAA
** ** ** * *
113681 TTTCGTATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATAATTT
66 AATCAAATAAGCTTGTACAAAC-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTT
* * * * *
113746 TAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACCTATTCAATAAATAGATTTATTTTTT
130 GAAATAGATAATCGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAACTATTCAACAAATAGATTTATTTTTT
* * ** * * *
113811 TAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTAAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCGAATAAACT
195 TAAATCTCTTACTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATCTCGAATAAAAT
** * * * **
113876 TGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAAGGCCATAATGATTTGAAATAGATAGTT
260 AATATGAACTGAAACAATTGTTTGATCACTAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAGTT
113941 ATTCTAACAATCTTAACTTATGAACTGGTTTGA
325 ATTCTAACAATCTTAACTTATGAACTGGTTTGA
* * * *
113974 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--A-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *
114039 TTAAAATCAAATAAGCTTGTACAAAC-AAA-AATTTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTAA-
62 TTAAAATCAAATAAGCTTGTACAAACGAAACAA--TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * ** * * *
114101 AGATTTGAAATTGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTT-AAATTGGTTCAACAATTAGATTT
125 A-ATTTGAAATAGATAATCGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAACT-ATTCAACAAATAGATTT
* * * *
114165 A-TTTTTTAATTTTCTTAGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATT-ATTTCAATCT-
188 ATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTT--ATCTC
* * **
114227 GAATAAAATAATATGAA-TAGAACCTATTGTTTGATCA-TAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGA
251 GAATAAAATAATATGAACT-GAAACAATTGTTTGATCACT-AAACAAAAGGCCATAACAATTTGA
114290 AATAGATA
314 AATAGATA
114298 ATTACTACAA
Statistics
Matches: 263, Mismatches: 49, Indels: 22
0.79 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
358 27 0.10
359 11 0.04
360 104 0.40
361 76 0.29
362 45 0.17
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (357 bp):
TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTAA
AATCAAATAAGCTTGTACAAACGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTG
AAATAGATAATCGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAACTATTCAACAAATAGATTTATTTTTTT
AAATCTCTTACTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATCTCGAATAAAATA
ATATGAACTGAAACAATTGTTTGATCACTAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAGTTA
TTCTAACAATCTTAACTTATGAACTGGTTTGA
Found at i:114770 original size:19 final size:21
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Period size: 21 Copynumber: 2.5 Consensus size: 21
114706 AATAAGCTTG
114716 TATGAACTAAAACAATAGTTT
1 TATGAACTAAAACAATAGTTT
114737 TATGAACTAAAACAATAGTTT
1 TATGAACTAAAACAATAGTTT
114758 TATG-ACTAAA
1 TATGAACTAAA
114768 CAAAAAGTTA
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 0, Indels: 1
0.97 0.00 0.03
Matches are distributed among these distances:
20 6 0.19
21 25 0.81
ACGTcount: A:0.48, C:0.10, G:0.10, T:0.33
Consensus pattern (21 bp):
TATGAACTAAAACAATAGTTT
Found at i:115412 original size:287 final size:286
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Period size: 287 Copynumber: 1.9 Consensus size: 286
114887 AATAGAAGCA
* * * ** *
114897 ATTGTTTTATGATAAAATAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGA
1 ATTGTTTCATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGACATGA
* * * * * *
114962 CTAGTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTCTAGAATA
66 CTAATTGAACTTATTGGGTAAACAGATTTATATTTAAAATCTCTTACCTATTAATTTCTAAAATA
* *
115027 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTGGTATGAAAAGAAACAATCATTTTATGACA
131 TTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAACTGATATGAAAAGAAACAATCATTTTATGACA
* *
115092 AAATAAAAGATCATAACTATTTAAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAGCCTAT
196 AAAAAAAAGATCATAACTATTTAAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGAGCCTAT
115157 TCAGTAAGCCTATATGAATTGATACC
261 TCAGTAAGCCTATATGAATTGATACC
* * **
115183 ATTGTTTCATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGTAGATAATTACTCAAGTAGTTATG
1 ATTGTTTCATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTACTCAAATAGACATG
* * *
115248 AC-AATTAGAACTTGTTGGGTAAACATATTTATATTTAAAATCT-TTCACTTATTAATTGTC-AA
65 ACTAATT-GAACTTATTGGGTAAACAGATTTATATTTAAAATCTCTT-ACCTATTAATT-TCTAA
* * * **
115310 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TTAATAACCTTATATGAACAA-AAACAATTGTTTT
127 AATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCTGAATAAACTGATATGAA-AAGAAACAATCATTTT
* * *
115373 ATGATAAAACAAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAAA-AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
190 ATGACAAAA-AAAAAGATCATAACT-ATTT-AAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAACTATT
115435 TGA
252 TGA
115438 ACTTATTTAG
Statistics
Matches: 215, Mismatches: 31, Indels: 17
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
286 42 0.20
287 157 0.73
288 16 0.07
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (286 bp):
ATTGTTTCATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGACATGA
CTAATTGAACTTATTGGGTAAACAGATTTATATTTAAAATCTCTTACCTATTAATTTCTAAAATA
TTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAACTGATATGAAAAGAAACAATCATTTTATGACA
AAAAAAAAGATCATAACTATTTAAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGAGCCTAT
TCAGTAAGCCTATATGAATTGATACC
Found at i:117383 original size:181 final size:180
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115159 AGTAAGCCTA
* * * * ** * *
115169 TATGAATTGATACCATTGTTTCATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGTAGATAATTA
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTG
* * * * * * * * * * * *
115234 CTCAAGTAGTTATGACAATTAGAACTTGTTGGGTAAACATATTTATATTTAAAATCTTTCACTTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* ** * * * *
115299 TTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTTAATAACCTTA
130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTG
* * * * * * * *
115351 TATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAAATAATTAT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
115416 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTTTTACTAA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * *
115480 TTAGTTGTCTCAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAACTTG
130 TTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTG
* * * * * * * * *
115533 TATGAATAGAAAAAAATATTTTATAATAAAACAAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAAATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
115598 TTCAAAGAGT-AGTAACTATTTGAACTTGATT-GATAAACAAATTCAGTTTTTAAATCTCTTACT
65 TTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * * * **
115661 TATTAATTTTTGGAATATTTATAAATTAG-ATT-TTGTTATTTTGAGTCAGGATG
128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTA-TTTGAATAAGCTTG
** * * * * *
115714 TACAAACAGAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAAGTTATAAC-ACTTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** * * * *
115778 TTCAAAAAGTTATAATTATTT-ATA-TTGGTC-AGTCTGATATATTCATTTTTTAAAT-TCGTTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCGA-T-AAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTA
* * * * * *
115839 CTTCTTAATTTTT-AGGATATTAACATATT-GTCATTACTTTATTTTGAATAAGCCTG
126 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
115895 TATCAATAGAAACAACTATTTTATGACAAAATAAATGGTTATAATGATTTAAAATAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
115960 TCAAATTGTTATAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* ** * * * *
116020 TTAATCTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAACAAACTTA
130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTG
* * * * * *
116072 TATGAACA-ACAACATTTGTTTTACGACAAAATAAAAGGTCATAACGGTTTGAAATAGATAATTA
1 TATGAATAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * ** * * *
116136 TTCATATAGCCTTAATTATTTGAA-TTGGTTTGGCAAA-AAAATTATTTTTCAAATCTCTTGA-T
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTACT
* * * * *
116198 TACTAATTTTT-ATAATATTATTAGATTAGTATTACTATATTCTGAATAAGCTTG
128 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTG
* * * * * * * *
116252 TATGAATATAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAGATTATAACGATTTGAAATATATAAATAT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
116317 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * * *
116382 TAATTTTTAAAATATTAAAAAATAAGTGTTA---T-TTT--ACAAGTTTG
131 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTG
* * * **
116426 TATG-ATGAAAAACATTTGTTTTACGA-AAAA-AAAAGGATCATAAATATTTGAAATAGATAATT
1 TATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * ** * **
116488 ATTCAAATGGTAATAATTATTTGAAC-TGATTCGATTAATTATTTAATTAATTTTTTAAATCTCC
64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA-TAA--A-CAAATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * * *
116552 AACTTCA-CAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT
124 TACTT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTG
* * *
116610 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAGCGATTTTAAATAGATAATTG
1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * *
116674 TTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAA-CTTCTTGCT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTT-TTACT
** * ** * *
116738 TACCAATTTTCTG-AATGTTAATAAAAGAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATG
128 TATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTG
* * * *
116792 TATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATATG-TAATT
1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA-GATAATT
* * * * * * * * *
116855 ATTCTAATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACACATTGATTTTTT-AA--GTTT-CTT
64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * *
116916 ATTAATTTTTAAAATATTATTAATTTTGCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTG
129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTG
* * * * * *
116969 TATGAATGGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAACA--TCATAGCAATTTGAGATAGATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
117032 TTCAAATAGTCATAACTAATTGAA-ATGATTTTG-TAAACAAATTTAGTTTTTAAATC---T-CT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG--TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * *
117091 TATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC-T-
128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTG
* * ** * *
117143 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATTTTAACAATTTGAAATAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* *
117208 TTAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTGCTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* ** *
117272 TTAATTTTTGAAA-ATTTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAATTAAGCTTT
130 TTAATTTTTGAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAA-TAAGCTTG
* * * *
117324 TATGAATAGAAACAATGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *
117389 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACAT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* **
117451 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTCAAAATAAGCTTG
129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTG
* ** * * * * * *
117504 CATGAATAGATCCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGAGAAATGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * ** * * * * * *
117569 TTAGCTAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAACAAATAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTACTCA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* *** * *
117633 TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATCAGTATTATTTTAGTCCAAATAAACTTA
130 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTG
* * ***
117685 TAAGAACTA-AAACAATTGTTTTATTACAAAAGCAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATT
1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
117748 ATTC-AA-AGCCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAATATATTTATTTTTTAAAATTTTTTACT
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* * * *
117811 TATTAATTATCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAACTTG
128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTG
* * * * * *
117865 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAGTTGC
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-
* * * * * * * *
117930 AT-AAATAGTCAAAACGATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAATTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
*
117994 TTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTG
130 TTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTG
* * * * * * * * * *
118046 TATGAATAGAAAAAATTCTTTTATAACAAAATAAAAGGTTATAGCAATTTCAAGTAGATTATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
118111 TCAAACAGTCATAATTATTTAAATTTGTTC-AGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTT
* * * ** * * *
118174 ATTTATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAACATA
129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTG
* * * * * *
118227 TATGAACTA-AAACAATTCTTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTA
1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** * * *
118291 TTCAAATAATCATGATTATTTGATCTAATTCGGTAAACATATTTATTTTTGAAAAT-TTTTACTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTT-TAAATCTTTTACTT
* * * *
118355 ATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTGCTTTAATCTGAATAAGCTTG
129 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTGAATAAGCTTG
* * * * * *
118408 TATGAATAGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGC
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * * *
118473 TCAAATAGTCATAATTATTTAAACCAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAAATC--TT--TTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTA
* * * * * *
118534 TTAATATTTGAAATATGAATAGATTAGTATTACTTCTT-TTTGAACAAACTTA
130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TT-TTATTTGAATAAGCTTG
* * * * * * * *
118586 TATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAACGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * *
118651 TCAAATAGTCATAATTA-TTCAGACTGGTTAGGTAAACAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TC
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCGATAAAC-AAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-
* * ** *
118714 TATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAG
128 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTG
* * * *
118768 TGTAAATTCA-AAACAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
1 TATGAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
118832 TGTTCATATAGTCTTTAA-TATTTGAACTGGTT-TAGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTTTTA
63 TGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * *
118895 GTTATT-ATTAATTGGAATATTATTAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
126 CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTG
* * * * * * * ** *
118951 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
119016 TCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTTCGGT-AA-ATATATATTTTTTAAAATCTTTTACATA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTA
* * * *
119078 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAGGTTTA
130 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTG
* * * **
119130 TATG-ATGAAAAACAATT-TTTTGATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTCTAATAGATAATT
1 TATGAAT-AGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* ** * * * * *** * ***
119193 TTTTTAAT-GGCTTTAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAATTGATTTAGTTTTTAAATCTACAAC
64 GTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * * * * * *
119256 TTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTA-TTTATTTTGGATAAGCTTT
127 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTG
* * * *
119310 TATGAACTA-AAACAATTATTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATT
1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATT
* * * * * * *
119373 GTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGGTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTTTAAT-TTCTTA
64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTA--TTTTTTAAATCTT-TTA
* * * * * * *
119437 CTTACTAATTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAACATG
126 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
119492 TATTAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
** * * *
119557 TTTAATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTC
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
119587 AGCAAACACA
Statistics
Matches: 3335, Mismatches: 723, Indels: 356
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
172 6 0.00
173 55 0.02
174 63 0.02
175 68 0.02
176 118 0.04
177 233 0.07
178 162 0.05
179 215 0.06
180 589 0.18
181 1011 0.30
182 493 0.15
183 154 0.05
184 100 0.03
185 59 0.02
186 9 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTG
Found at i:118016 original size:722 final size:710
Alignment explanation
Indices: 115197--119599 Score: 2764
Period size: 722 Copynumber: 6.1 Consensus size: 710
115187 TTTCATGATG
** * ** * * * * * *
115197 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGTAGATAATTACTCAAGTAGTTATGACAATTAGAACTTG
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG
** * * * * * * *** *
115262 TTGGGTAAACATATTTATATTTAAAATCTTTCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
65 TTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA-TTATT-ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
** * * *
115327 ATTATTTTAATTTTAATAACCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAAGTC
128 ATTATTTT-ATTCAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAGGTC
* * *
115391 ATAATGATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACA-A
190 ATAATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTA--AAA-ATA
* * * * *
115455 ATT-TATTTTTAAAATCTTTTACTAATTAGTTGTCTCAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAA
252 ATTAT-TTTTTAAATTC-TTTACT-ATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA
* * * * * * * ***
115519 T-TGAAATAAACTTGTATGAATAGAAAAAAATATTTTATAATAAAACAAAAAGGTTATAGCAATT
313 TCT-AAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAA-GTCATAATGATT
* * ** * * * * * * *
115583 TGAAATAAATAATTGTTCAA-AGAGTAGTAACTATTTGAACTTGATTGATAAACAAATTCAGTTT
374 TGAAATAGATAATTATTCAATAG-CCA-TAATTATTTAAAC-TGTTTGATAAATATATTTATTTT
* * * *
115647 TT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTTATAAATTAG-ATT-TTGTTATTTTGAGTCA
436 TTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTA-TTTGAAT-A
* * ** * * * * * * *
115709 GGA-TGTACAAACAGAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAAGTTATAACACTTTGAAATAGAT
498 -AACTTTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAT
* * * * * ** * *
115773 AATTGT-TCAAAAAGTTATAATTATTT-ATA-TTGGTCAGTCTGATATATTCATTTTTTAAAT-T
562 AATTGTAT-AAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCGGT-AAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * * * *** * *
115834 CGTTACTTCTTAATTTTTAGGATATTAACATATTGTCATTACTTTATTTTGAATAAGCCTGTATC
624 -TTTAATTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG
*
115899 AATAGAAACAACTATTTTATGACA
687 AATAGAAACAATTATTTTATGACA
* * * ** * * * *
115923 AAATAAATGGTTATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAATTGGT
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT
** * * * * * *** *
115988 TTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTA--ATCTTCAAAATATTAATAAATTAATATT
66 TCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTATTATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
116051 ATTTTATT-ATGAACAAACTTATATGAACAACAACATTTGTTTTACGACAAAATAAAAGGTCATA
131 ATTTTATTCA--AATAAGCTTATATGAATAA-AACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * *
116115 ACGGTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAATTATTTGAA-TTGGTTTGGCAAAAA-AAT
193 ATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTT---AAAAATAAT
* * * * * * * * * *
116178 TATTTTTCAAATCTCTTGATTACTAATTTTT-ATAATATTATTAGATTAGTATTACTATATTCTG
254 TATTTTTTAAAT-TCTTTACTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTA
* * * * * *
116242 AATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAGATTATAACGATTTGAAAT
317 AATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * **
116307 ATATAAATATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTT-AAAT
380 AGATAATTATTC-AATAGCCATAATTATTTAAACT-GTTTGATAAATATATTTATTTTTTAAAAT
* * * * * * *
116371 CTCTTACTTCTTAATTTTTAAAATATTAAAAAATAAGTGTTATTTTA---CAAGT----TTGTAT
443 CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAA-TAAACTT-TAT
* * * * * * *
116429 G-ATGAAAAACATTTGTTTTACGA-AAAA-AAAAGGATCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTAT
506 GAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACA-ATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * * * **
116490 -TCAAATGGTAATAATTATTTGAAC-TGATTCGATTAATTATTTAATTAATTTTTTAAATC-TCC
568 AT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCG-GTAA--A-TAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * **** *
116552 AACTTCA-CAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA
627 AA-TT-ATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA
* *
116616 CTA-AAACAATTGTTTTATGATA
689 -TAGAAACAATTATTTTATGACA
* * * * * *
116638 AAACAAAAGGTCATAGCGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGT
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT
* * * * * ** * **
116703 TCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAA-CTTCTTGCTTACCAATTTTCT-GAATGTTAATAAAAGA
66 TCAGCAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTT-TT-ATTA-TTATTTT-TGGAATATTAATAAATTA
* * * * *
116766 GTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGT
126 GTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGT
* * * *** * * * * ** * *
116831 TAGAACGATTTGAAATATGTAATTATTCTAATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACAC
189 CATAATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAA-AAATA-
* * * * * * * * * *
116896 ATTGATTTTTTAAGTT-TCT--TATTAATTTTTAAAATATTATTAATTTTGCAATATTTTACTTT
252 ATT-ATTTTTTAAATTCTTTACTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT
* * * * * * *** *
116958 GAATAAGCTTGTATGAATGGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAACA-TCATAGCAATTTGAGA
316 AAATAAGCTTATATGAAT-AAAACAATTGTTTTATAACAAAA-CAAAAGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
117022 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAA-TGATTTTG-TAAACAAATTTAGTTTTT-A
379 TAGATAATTATTC-AATAGCCATAA-TTATTTAAACTG--TTTGATAAATATATTTATTTTTTAA
* *
117084 AATC---T-CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC-TT
440 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTT
* * **
117144 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAAGATTTTAACAATTTGAAATAAATAATTGT
504 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * *
117208 TTAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTGCTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
568 ATAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAATTA
* * *
117272 TTAATTTTTGAAAATTTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAAC
632 TTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
***
117337 AATGGGTTTATGACA
696 AATTATTTTATGACA
**
117352 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTG
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-G
* * * * *
117416 TTCAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-
65 TTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA-TTATT-ATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAG
* ** **
117479 AATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGATCCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTC
127 TATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTC
* * * * * * **
117544 ATAATGTTTTAAAATAGAGAAATGTTTAGCTAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAACAAATAGA
190 ATAATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAA-AAATA-A
* * * *
117609 TTCTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATCAGTATTATTTTAGTC
253 TTATTTTTTAAATTCT-TTACT-ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC
* * * * **
117673 CAAATAAACTTATAAGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAAGCAAAAGTCATTGTGATTTGAA
315 TAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATAACAAAA-CAAAAGTCATAATGATTTGAA
* *
117738 ATAGATAATTATTCAA-AGCCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAATATATTTATTTTTTAAAA
378 ATAGATAATTATTCAATAGCCATAATTATTTAAAC-TGTTTGATAAATATATTTATTTTTTAAAA
* * * *
117802 TTTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTA
442 TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAACTT-TA
* * * * *
117867 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAGTTGCAT
505 TGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTAT
* * * *
117932 AAATAGTCAAAACGATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAATTATTA
570 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAATTATTA
** *
117997 ATTGTCTT-AATATTAATAAATT-TGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAA
635 ATT-T-TTGAATATTAATAAATTAT-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* *
118060 ATTCTTTTATAACA
697 ATTATTTTATGACA
* * * * * * * * * * * *
118074 AAATAAAAGGTTATAGCAATTTCAAGTAGATTATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAATTTGT
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT
* * *
118139 TCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTTATTATTTATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTA
66 TCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTATTA-TTATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * *
118204 TTATTTTATTCCCAATAAACATATATGAACTAAAACAATTCTTTTATGAT-AAAAGAAAAGGTCA
129 TTATTTTATT-CAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * *
118268 TAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGATCTAATTCGGTAAACATAT
191 TAATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT---TAAAAATAA
* * **
118333 TTATTTTTGAAAATT-TTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTGCTTTAATCT
253 TTATTTTT-TAAATTCTTTAC-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT
* * * **
118397 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA
316 AAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAA
* ** * * *
118462 TAAATAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACCAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAAA
379 TAGATAATTATTC-AATAGCCATAATTATTTAAA-CTGTTTGATAAATATATTTATTTTTTAAAA
* * * *
118527 TC--TT--TTATTAATATTTGAAATATGAATAGATTAGTATTACTTCTT-TTTGAACAAACTTAT
442 TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TT-TTATTTGAATAAACTT-T
* * * ** ** * * *
118587 ATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAACGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTAT-
504 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTA
* * * * * * *
118651 TCAAATAGTCATAATTA-TTCAGACTGGTTAGGTAAACAAAAATTATTTTTTAAATCTCTT-ATC
569 T-AAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCGGTAAA-TAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAAT-
* * * *
118714 TATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTCATT-TTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTGTAAATTCA
630 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-ATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-T-A
118778 -AAACAACTTATTTTATGACA
691 GAAACAA-TTATTTTATGACA
* * *
118798 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTTAA-TATTTGAACTGG
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGG
* * * * *
118862 TTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTTTTAGTTATTATTAATTGGAATATTATTAAATTATT
65 TTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA-TTATTATT-TTTGGAATATTAATAAATTAGT
* * ** *
118927 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTA
128 ATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCA
* ** *
118992 TAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAATAT-
191 TAATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TT---TAAAAATA
* *
119054 A-TATTTTTTAAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
252 ATTATTTTTTAAATTC-TTTAC-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC
* * * *
119118 TAAATAGGTTTATATG-ATGAAAAACAATT-TTTTGATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTC
315 TAAATAAGCTTATATGAAT--AAAACAATTGTTTT-ATAACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTG
* * * * ** * *
119181 TAATAGATAATTTTTTTAATGGCTTTAATTATTTGAACTGATTTGATAAAT-TGATTTAGTTTTT
376 AAATAGATAA-TTATTCAATAGCCATAATTATTTAAACTG-TTTGATAAATAT-ATTTATTTTTT
*** * * * * * * *
119245 -AAATCTACAACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTA-TTTATTTTGGATAAGCT
438 AAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAAC-
* * * * * *
119308 TTTATGAACTA-AAACAATTATTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAA
501 TTTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-CAATTTGAAATAAATAA
* * * * *
119371 TTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGGTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTTTAAT-TTCT
564 TTGTATAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTA--TTTTTTAAATCTT-T
* * * * * * * * * *
119435 TACTTACTAATTTTTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAACATGTATTAATT
626 TAATTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATA
* *
119500 GAAATAATTATTTTATGACT
691 GAAACAATTATTTTATGACA
* * ** * *
119520 AAACAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTTAATAGCCTTAACTATTTGAACTGGT
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*
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TAAATTCTTTACTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTT
ATATGAATAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
CAATAGCCATAATTATTTAAACTGTTTGATAAATATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTA
ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAACTTTATGAATAGAAACAATTA
TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTATAAATAGTCATAACTAT
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AAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACA
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1 A
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* * * * * ** *
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* * * * *
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** *
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* *
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* * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* ** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
128939 TATCAAATAGTTATAATTATTTAAACTAGTTTAGTAAATAGAATT-ATTTATT
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* * * * *
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1 -AATCTCTTACTCAT-TAATTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA-TT
* * * * *
129056 -GTATGAGCTA-AAA-AATTGTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATGATGATTTGAAATAAATAAT
63 AGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATTATCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * * * * * * *
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* * * * * * * *
129171 AAATCTCTTAGTTATGAATTTTTTGAATATTACTAAGTCAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTT
1 -AATCTCTTACTCATTAATTTTAT-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA-TT
* * * * * *** * ** *
129236 A-TATGAATAGAAATAATTGCTTTATGATAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATT
63 AGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATTATCATAATGATTTGAAATAAATAATT
* ** * *
129300 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAATAAATTTATTTTTT
128 -TTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTTGTTTGGTAAATAGA-TTAATTTTT
* * * * *
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1 -AATCTCTTACTCATTAATTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATTAG
* * * *
129409 TATG-TTGAAAAACAATTGTTTGATGATAAAACA
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AAATAGTCATAACTATTTAACTTGTTTGGTAAATAGATTAATTTTT
Found at i:129463 original size:67 final size:67
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* * * *
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129452 ACA
65 ACA
* *
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1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTAAAAAACAATTGTTTGATAACAAAACAAAAGGTAATAA
129520 CA
66 CA
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CA
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129445 AGTAATAACA
** * * * * *
129455 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTAA--AAAACAATTGTTTTATAACAAATCAAAAGGTAAT
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* * * * * ****
129518 AACAATTTGAAATAAATAATTGTACAAA-AGGCTATCACTATTTGAACTTATTAAAAAAACTA-A
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*
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* * * * *
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1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * *
129701 CAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
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* * ** * *
129766 TTTTTTCAAATGT-TATGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAA-AAATTAATATT
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* ** * * ** * *
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1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATA
* * * * * * * ** * * *
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65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT
* * * *
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130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * *
129994 GATTTTA-TCTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACTA-TGTTTTATGACAATAC-AAAGATCATA
1 -ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * * * * *
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65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGA-TT
* * * ** * *
130120 TAGTTTCTAAATATCTTGTTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
130173 ATTTTATTTT-AGATAAGTTTTTATGAACTTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAA
1 ATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * * ** ** *
130237 ACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATATTGATATA-TGTTTGAACTCGTTTGACAAATAAATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATT
** ** *
130301 TATTTTTTCAAATCTCTTGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
129 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
130355 ATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * * * * ** * *
130420 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGATTTGACAAACACATTTA
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * *
130485 TTTTTTTAATTTCTTA-TGTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT
131 TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * ** * * *
130536 ATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAAAAT-AAATAATTGTCCTATGATAAAA-GAAAGATCATA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * * * *
130599 ACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATATTTGAA-TTGGTTTGGTAAACATATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTGGTAAATAGATT
*
130663 TATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * *
130712 ATTTTAATTTTGAATAATTCTT-TATGAACAAAAATAATTGTTTAACGACAAAACAAAATTTCAT
1 ATTTT-ATTTTGAATAA-GCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT
* * * * * * * * * * *
130776 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGATTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAAGT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATT
* * ** *
130841 TATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTCCAAAATATTCATAAATTAGTA-T
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* *
130893 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG-----ATAAAA---C-T-
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * ** * *
130947 ---ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCAAAACTATTT-ATGCTTGCTCGGTAAATAAATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTATTTGGTAAATAGATT
* * * *
131008 TATTTTTTTAATCTTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
131061 ATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTCTAACAAAATAAAAAGGTCAT
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTTCAT
** * * * * * * ***
131125 AACTTTTTGAAA-AGATAATTATACAAATAGTTAAAACTATTTGAACGTGTTTAAAAAATAGATT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATT
* * * *
131189 TATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATT-TTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
*** * * * * *
131239 -TTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAGCAT-AAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * * * * *
131302 ATGATTTAAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCGTAACCATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTC
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT
* * * * *
131367 A--TTTTATATATCTT--TTAATAATTTTTAGAATATTAATATATTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
131415 ATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATA
* * * ** * * * * *
131479 ACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT
* * * * *** * * *
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* **** ** * * * *
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1 ATTTTATTTTG-AATAAGCTT-GTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCA
* * * * * *
131659 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAATTTATTTGGTAAACAAAT
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* * * *
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* * * *
131777 GTTTTA-TTTGAAATAAGCTTCTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-A
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** * * * * * * **
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* * *
131903 TTCA-TTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATT
127 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * *
131953 ATGTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATT-AT
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TTCAT
* * * * * * *** **
132016 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACACTTATAACTATTTGCACTAATCAAGCCAATAG-TT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATT
* * * * *
132080 TCATTTTTTAAATATGTCATTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATT
129 T-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* *** ** * * * *
132134 ACTTTATTCAAAATAAGGC-AATATGAACAGAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAATGATCATA
1 ATTTTATTTTGAATAA-GCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * ** * * * *
132198 ACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAGGTAATTGGAC-TAGTTTAGCAAATAGATT
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* * *
132262 TATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * ** *
132315 ATTTTATTCCGAACAATCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * * * *
132380 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGTAC-TAGTTTGGCAAATAGAATT
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAATAGATTT
* *
132444 A-TTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTCTT-AAATATTAATAAATTTGT-TT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* *** * * ** *
132494 TTTTTATTCCAAAT-AGCTTAGTAAGAACT-AAAAAATTTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCAT
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAACTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT
* * * * * * * * *
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* * * *
132620 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATT
127 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
132675 ATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGGACAGAAATC-ATTTTTTTATGATAGAAA-AAAAGGTT-A
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACA-AAACAAAA-GTTCA
** * * * ** *** ** *
132737 TTGCAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAGCAAAT
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* * * *
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*** * *
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1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT
* * * * * * *
132918 AACGATTTGAAATAGATATTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCGATAAACTA-AT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAA-TAGAT
* * * * * * * *
132982 TT-TTTTTTAAATCTCTAACTCATGAGTTTTTGAAATATTAACAAAGTAATATT
128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
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1 ATTTTA-TTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * * * * *
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65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTA-AATAGATT
* * ** ** *
133163 TATTTTTTTAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * *
133216 ATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTT-AGA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATA
* * * * ***
133280 ATGAGTT--AA-A-AT--TTGTTC-AATA--AATAA--ATTT--A-TT-TTT-TTAAATCTCTTT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT
* * * ** * * *
133329 -TTTATT-AATTTTTTAAATGTTAATA------A-A-T--T--AGTAGTA--
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * *
133365 A-TTTATTCTGAATAAGCTTCTATGAGTTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * * * * * * * * *
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* *
133491 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT
131 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * *
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1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * * * * * *
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66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAATAGATTT
* * * * * * *
133669 ACTTTTTAATTTTCTTAGTTATT-ATGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTAGT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * *
133721 ATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAACAT-AACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTT-AT
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCAT
* * * * ** *
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* * *
133848 TACTTTTTAAATCTCTTACTGACTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGT-TT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * *
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* * *
133962 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTATGGTAAATAGA
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* * *
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* * * *
134077 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAAT
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT
* * * * * * * *
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* * *
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128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
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1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * ** * * *
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** * * *
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130 ATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
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1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATA
* * * * * * * ** * **
134503 ATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATAATCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAAACACTTTT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT
* * ** *
134568 CTTTTTTAAA--TC-T-CTTATTGATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * *
134616 ATTTT-TATCCGAATAAGCTTGTAT-AATTAGACACAATTATTTTATGAGAAAAC-AAA-TATCA
1 ATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCA
* * * ** * * ** * *
134677 TAATGATTTGAGATTGATGTTTGTTCAAATTA-TCATAATTATTTGAAC-TAGTT-CAAAAAACA
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* * * *
134739 ACTTTAGTTTTTAAATATCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA--AG---T
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* * * * *
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* * * *
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** * * ** * *
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* * * * * * *
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* * ** * ** ** *
135031 CGATTTGAACTAGATAATTATT-ATAATAGTTTTAACTGTTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTT
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT
* * * * * *
135095 ATTTTTTAAATATTTTACTGATTAAGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATT
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* * * ** * * * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * *
135275 AGTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATCAATATC
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * ** * *
135323 ATTTTATTTTGGATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * * * * * **
135388 CAATTTGAATTAGATAATTGTTCAAATGGACATAATTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * * *
135453 TTTTTTAAATCTCCTACCTATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTGGTATT
131 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* *** * * *
135504 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAAGAAAAACAACTATTTTATGAC-AAATAAAAGATT-ATA
1 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TTCATA
* * * * * * * *
135567 ACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTTGATAAACAAATTT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT
* ** *
135632 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
135684 AATTTA-TTTCAACTATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAA-TGGCAT
1 ATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCAT
*
135747 AACTATTTGAA
64 AACGATTTGAA
135758 CGTGTTCAGA
Statistics
Matches: 4785, Mismatches: 1091, Indels: 492
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129591 AAATCTCTTA
*
129601 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGCAGAT--GCTTTTATGAA-
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* ** * *
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*
129793 TTTTTAATGTTAA-AAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTAT
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* *
129857 TTGATGATTAAACAAAACATTAA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTAT
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* *
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* * **
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* ** * * * *
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512 TGGAAAACATA-TTTA-TTTCTAAA-ATC-T
* *
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1 -CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACT
* * *
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* * * *
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130 TCATA-ACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCT-TATGCTTATTAATT
* * ** * *
130330 TTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATAATTAT
193 TTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTAT
* * *
130395 TTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATT
258 TTGATGACTAAACAAAAAGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATT
* * * * * *
130460 TAAACTGATTTGACAAACACATTTATTTTTTTAATTTCTTATGTATTAATTTTTGAAATATTATT
323 TAAACTAATTCGACAAACACAATTATTTTTCTAATATC-TATGTATTAATTTTTGAAATACTATT
* *
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387 AAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAAAATAAATAATTGTCCTATGACAAAACA
* * * *
130590 AAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATATTTGAATTGGTTTGGTA
452 AAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATAGTTGAACTGATTTGGAA
* *
130655 AACATATTTATTTTTTAAATCT
517 AACATATTTATTTCTAAAATCT
130677 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TCAGTATTATTTTAATTTT-GAATAA-TTCTTTATGA
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGT-AGTATTATTTT-ATTTTAG-ATAAGTT-TTTATGA
** * * * * ** *
130739 ACAAAAATAATTGTTTAACGACAAAACAAAATTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
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* * * * ** * ** * * ** * *
130804 TGGA-CATGATTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAAGTTATTTTTT-AAATCTCCTACCTATTAA
127 T-AATCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAA
**** * * * * ** *
130867 TTTCCAAAATATTCATAAATTAGTA-TATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAAT
191 TTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAAT
* * * * * **
130930 TGTTTTATGA-T--------A--AA-ACT-ATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAATAGTCAAAAC
255 TATTTGATGACTAAACAAAAAGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAAC
** *** ** * * * * *
130981 TATTTATGCTTGCTCGGTAAATA-AATTTATTTTTTTAATCTTTTACT-CATTAATTTTTGAAAT
319 TATTTAAACTAATTCGACAAACACAA-TTATTTTTCTAAT-ATCTA-TGTATTAATTTTTGAAAT
* * * * * * * * *
131044 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTCTA--
381 ACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAAAATAAATAATT-G-TCCTATG
* * ** * * * ** *
131107 ACAAAATAAAAAGGTCATAACTTTTTGA-AAAGATAATTATACAAATAGTTA-AAACTATTTGAA
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** * * * *
131170 CGTG-TTTAAAAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTT
506 C-TGATTTGGAAAACATATTTATTTCTAAAA--TCT
* ** ** * * * * *
131205 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA-TTTTATT-TTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAGCA
1 -CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACT
* * * ** * * *
131267 TAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGGTAATTGTTCAAATAG
65 TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAA
* * * * ** * * * * * *
131332 TCGTAACCATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTCATTTTAT-ATATC-T-T--TTAATAATTTT
130 TCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAATTTT
* * * * * ** * * * * *
131392 TAGAATATTAATATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTT
195 TTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTT
* * * * * * * **
131457 TATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGT-TATGGCTATTT
260 GATGACTAAACAAAAAGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACTATTT
* ** * * * ** * * ** * **** **
131521 GAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACATATTAGTTGCCAAAATA-TGAAA
324 AAACTAATTCGACAAACACAATTATTTTTCTAAT-ATCTATGTATTAATTTTTGAAATACT-ATT
* * * * * * ** *
131585 AAATTAATATTATTTAAACCCGAAATAAGCTTGGT-TGAACAA-AAATAATTATTTTATGATAAA
387 AAATTAGTATTATTTTAATCTG-AATAAGCTT-GTACGAA-AATAAATAATTGTCCTATGACAAA
* ** ** * * * * * * *
131648 ACAAAAAGTTGTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAATTTATTT
449 ACAAAGA-TCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATAGTTGAACTGATTT
* * * *
131713 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
513 GGAAAACATATTTATTTCTAAAATC---T
* * * * * * * * *
131742 ACTTATTAATTGTTT-GAATATTATTAATGT-GCATTGTTTTATTTGAAATAAGCTTCTATGAA-
1 -CTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAAC
* * * *** * *
131804 TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAGTGATTTGAAAT-GCATAATTGTTTAA
64 T-TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACAATTTTAAATAG-ATAATTGTTCAA
* * * ** * * ** * *
131867 ATAGTCATAATTGTTTGAACTTGTTCGATAAGCAGATTCA-TTTTT-AAATC---T-CTTATTAA
126 ATAATCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAA
* * * ** **
131926 -TTTTTGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAGAAACA
191 TTTTTTG-AATGTTAATAAATTA-ATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACA
* * * ** * * * *
131988 ATTATTTTATGA-TAAA-ACAAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACACT-TA
253 ATTATTTGATGACTAAACA-AAAAG-TAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-
** * * * ** * *
132050 TAACTATTTGCACTAA-TCAAGCCAATA-GTTTCATTTTT-TAAATATGTCATTTATTAATTTTT
315 TAACTATTTAAACTAATTCGA-CAAACACAATT-ATTTTTCT-AATATCT-ATGTATTAATTTTT
* * * * * * ** ** * * * * *
132112 AAAATATTAATAAATTAGAATTACTTTATTCAAAATAAGGC-AATATGAACAGAAACAATTGT-T
376 GAAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAA-GCTTGTACGAAAATAAATAATTGTCC
* * * ** ** *
132175 TAATGACAAAACAAATGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAGGTAATT
440 T-ATGACAAAACAAA-GATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATAGTT
* * * * * * *
132240 GGACT-AGTTTAGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
503 GAACTGA-TTTGGAAAACATATTTA-TTTCTAAA-ATC-T
* * * ** * *
132279 GCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCCGA-ACAATCTTATATGAA
1 -CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATA-AGT-TTTTATGAA
** * ** *
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* * * * *
132407 AGTCATAATTATTTGTACT-AGTTTGGCAAATAGAA-TTA-TTTTTAAATATCTTA--CTTATTA
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* * * ** * * *
132467 ATTTCTTAAATATTAATAAATTTGT-TTTTTTTAT-TCCAAAT-AGCTTAGTAAGAACT-AAAAA
190 ATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCT-CAAATAAGCTT-GTATGAACTGAAACA
* * ** * * * * * * * * *
132528 ATTTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTC-ATATAGCCTT
253 A-TTATTTGATGACTAAACAAAAAGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTT
* * * * * **
132592 AACTATTTAAACTAGTTGGGCAAACA-AGTTTATTTTT-TAA-ATCTCTTAGTTATTAATTTTCA
316 AACTATTTAAACTAATTCGACAAACACA-ATTATTTTTCTAATATCT-AT-G-TATTAATTTTTG
* * * * * * * * * * **
132654 AAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGGACAGAAATCATTTTTTTA
377 AAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAAAATAAATAATTGTCCTA
* * * * ** * * ** * *
132719 TGATAGAAAAAAAGGTTATTGCAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAA
442 TGACA-AAACAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATAGTTGAA
* * * * **
132784 CTG-GTT-CAATAAGCAAATTTATTTTTTAGATCTCCT
506 CTGATTTGGAA-AA-CATATTTA-TTTCTA-AAAT-CT
* * * ** * * * * ***
132820 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTATTCCAAATAGGCTTGTATGATGA
1 -CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACT
* * * * * **
132884 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTGAAATAGATATTTGTTCAAATGG
65 TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAA
* * * * * * * * *
132949 CCATAATTATTTGAACTAATTCGATAAACT-AATTT-TTTTTT-AAATCTCTA-ACTCA-TGAGT
130 TCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAA-TAAATTTATTTTTTCAAATCT-TATGCTTATTAATT
* * * * *** * * * * *
133009 TTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTATTTTATTTTTGATAAGCTTTTATGAATTTAAATAATTG
193 TTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTA
** * * * * *
133074 TTTTTTGA-TAAA-ATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCGAATAGT-TATAAC
257 TTTGATGACTAAACA-AAAA-GTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAAC
** ** ** * *
133136 TATTCGAACTTGTTCG--GTACACTAATTTATTTTTTTAATTTCT-TGTTTATTAATTTTTTG-A
319 TATTTAAACTAATTCGACAAACAC-AA-TTATTTTTCTAATATCTATG--TATTAA-TTTTTGAA
** * * * * * * * **
133197 ATGTTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCATGTATG-AACTGAAATAATTATTTTA
379 ATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT-GAATAAGCTTGTACGAAAAT-AAATAATTGTCCTA
* * * * *
133260 TGACTAAACAAAAGGT--T-AGAA--TGAGTTA-A-AATTTGTTC-AATA--AATAAAT--TT--
442 TGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAA-TTGTTCAAATAGCCATAAATAGTTGA
* *
133311 A-T--TTT--------T-TTAAATCTCT----T-T
505 ACTGATTTGGAAAACATATT-TATTTCTAAAATCT
* * * * * * * * * *
133329 TTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTAGTAATTTATTCT-GAATAAGCTTCTATG-AGT
1 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGTTTTTATGAACT
* * * ** *
133392 TGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATC--AA-AATGATAAATAGATAATTGTTCTAATA
65 T-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
133454 GTCTTAACCAATTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCT-TACTTATTAA-T
129 ATCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCT-TATGCTTATTAATT
* * * * * * * * *
133516 TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATAAAAAAAGCTTGTATGAAC-AAAATAATTG
193 TTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTA
* * * * * *
133579 TTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-ATATAGTCTTAACTA
257 TTTGATGACTAAACAAAAAGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAACTA
* * * ** * * * * **
133643 TTTGAACTAGTT-TAGCAATTAGATTTACTTTT-TAATTTTCT-TAGTTATT-ATGTTTCAAAAT
321 TTTAAACTAATTCGA-CAAACACAATTATTTTTCTAA-TATCTAT-G-TATTAAT-TTTTGAAAT
* * * * ** * * * ** *
133704 ATTATTAAATTAGTAGTATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAACATAACCAATTGT-TTGATGA
381 ACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAAAATAAATAATTGTCCT-ATGA
* * * ** * * * * *
133768 CAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TCA-AAACTATTTGAAAT
445 CAAAA-CAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAA-TAGTTGAACT
* * * *
133831 GGTTTGGTAAATAGT-TTTACTTT-TTAAATCT
508 GATTTGGAAAACA-TATTTA-TTTCTAAAATCT
* * **
133862 CTTACTGACTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGT-TTATTTTA-TTTCGA-ACA-TACTAAT
1 CTTA-T---TAATTTT-TAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATA-AGT--TTTT
* * * * ** * *
133922 ATTAAC-AAAAGCAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGATAATTA
58 ATGAACTTAAA-CAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTG
* * ** *
133985 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTATGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATC---T-CT
121 TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTCA-TTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCT
* * * * * ** *
134044 TATTAA-TTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG--TTGA
185 TATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTG-
* * * * * * * *
134106 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACT-ATCTGAAATAGAT-ATGTATTCAAAT
248 -AAACAATTATTTGATGACTAAACAAAAAGTAAGAA-TGATTTGAAATAGATAAT-TATTCTAAT
* * * * * * * *** * *
134169 GGTCATAATTATTTGAACTGATT-TAGTAAATTGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACT-TATTAA
310 AGTCTTAACTATTTAAACTAATTCGA-CAAACACAATTATTTTTCT-AATATC-TA-TGTATTAA
* ** * * * * * * * * * *
134231 CTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTCTTTTATTTTGGAGAAG-TT-TTC-ATAAACTAAAACA
371 TTTTTGAAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGA-AAA-T-AAATA
** * ** * * **
134293 ATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAA
433 ATTGTCCTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * ** * * * * *
134358 CTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTAATTTTTTCAAATCTCT
497 ATAGTTGAAC-TGATTTGGAAAACATATTTA-TTTCT-AAA-ATCT
* * * * * *
134403 CGCTTATTCATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTT-GAATAAGCTTATATGAA
1 --CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGTTTTTATGAA
* * * * * * ** * * * *
134466 CTGAAACAATTCTTATATGAC-TAACAAAAATATCAGAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAA
63 CTTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * ** * *
134530 TAATCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAAACACTTTTCTTTTTT-AAATC---T-CTTATTGAT
127 TAATCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAAT
* * * * * * *
134590 TTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATC-CGAATAAGCTTGTAT-AATTAGACACAAT
192 TTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTA-TTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAAT
* ** * * * * * ** * * * *
134653 TATTTTATGAGAAAACAAATA-TCATAATGATTTGAGATTGATGTTTGTTCAAATTA-TCATAAT
255 TATTTGATGACTAAACAAAAAGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAA-TAGTCTTAAC
* * * *
134716 TATTTGAACTAGTTC-A-AAAAACAACTTTAGTTTTT-AAATATCT-TGCTTATTAATTTTTGAA
319 TATTTAAACTAATTCGACAAACACAA--TTA-TTTTTCTAATATCTATG--TATTAATTTTTGAA
* * * * * * * * * **
134777 ATATTAAT-AA--AGTAGTA--TT--T-TGAAAAAGTTTTTATG-AACTGAAACAATTGTTTTAT
379 ATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAAAAT-AAATAATTGTCCTAT
* * ** * *
134833 GACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTGA-ATAGATAATTATTCAAATAATCA-AATCTATTTG-
443 GACAAAAC-AAAGATCATAACAA-TTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA-ATAGTTGA
* * * * *
134895 A--G-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCT
505 ACTGATTTGGAAAACATATTTA-TTTCTAAAATCT
* * ** * * * *
134927 CTTACCCACTATTTTTTTGAATGTTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTAT-
1 CTT----ATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGTTTTTATG
* * * * * * * * *
134990 AAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGATCAGAACGATTTGAACTAGATAATTATT-A
61 AACTT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCA
* ** * ** * * * *
135054 TAATAGTTTTAACTGTTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTTATTTTTT-AAATATTTTACTGATT
125 -AATAATCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATT
* * * * * * * * *
135118 AAGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTCTTATAAT-TCAAATAAGCTTATATGGAA-AGAAAC
189 AATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATT-TTATCTCAAATAAGCTTGTAT-GAACTGAAAC
* * *** * * * *
135181 AATTGTTCT-ATGAC-AAA-ATAAAGATCTTAACGATTTGCAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
252 AATTATT-TGATGACTAAACAAAAAG-TAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT
* * * * * * *
135243 CAACTATTTGAACTAATTCAATAAACA-AATTTAGTTTT-TAA-ATCT-TTTATTAATTTTTAAA
315 TAACTATTTAAACTAATTCGACAAACACAA-TTATTTTTCTAATATCTATGTATTAATTTTTGAA
* * * * * * * * * ** * * * **
135304 ATATTAATAGATCAATATCATTTTATTTTGGATAATTTTGCATGAACAA-AAACAATTGTTTTAT
379 ATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAA-AATAAATAATTGTCCTAT
* * * * * *
135368 GACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGA-ATTAGATAATTGTTCAAATGGACATAATTATTTGAA
443 GACAAAA-CAAAGATCATAACAATTTGAGA-TAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATAGTTGAA
** * * * * *
135432 CTTG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
506 C-TGATTTGGAAAACATATTTATTTCTAAAATCT
* * * * * ** *
135465 CCTACCTATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTGGTATTATTTTATTTT-GAATAAACTTGTATG
1 -CT---TATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGTTTTTATG
*** * * * * * * *
135529 AAGAAAAACAACTATTTTATGAC-AAATAAAAGATT-ATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCA
61 AACTTAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCA
* * ** * * * *
135592 AATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTA
125 AATAATCATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTA
* * * * * * * * *
135656 ATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTAATTTATTTCAACTATGCTTGTATGAACAGAAACAAT
190 ATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAAT
* *
135721 TGGTTT-ATGACAAAACAAAA
255 T-ATTTGATGACTAAACAAAA
135741 TGGCATAACT
Statistics
Matches: 4376, Mismatches: 885, Indels: 682
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
503 1 0.00
504 10 0.00
505 137 0.03
506 75 0.02
507 52 0.01
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533 13 0.00
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543 85 0.02
544 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (538 bp):
CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACTT
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
CATAACTATTTGAACTCATTTGACAAATAAATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAATTTTT
TGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTG
ATGACTAAACAAAAAGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAA
ACTAATTCGACAAACACAATTATTTTTCTAATATCTATGTATTAATTTTTGAAATACTATTAAAT
TAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTACGAAAATAAATAATTGTCCTATGACAAAACAAAGA
TCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAATAGTTGAACTGATTTGGAAAACA
TATTTATTTCTAAAATCT
Found at i:130966 original size:167 final size:167
Alignment explanation
Indices: 130780--131099 Score: 403
Period size: 167 Copynumber: 1.9 Consensus size: 167
130770 TTTCATAATG
* * ** * *
130780 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGATTATTTGAAT-TTGTTCGGTAAACAAAGTTAT
1 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACAAAACTATTT--ATCTTGCTCGGTAAACAAAGTTAT
* * *
130844 TTTTTAAATCTCCTAC-CTATTAATTTCCAAAATATTCATAAATTAGTA-TATTTTATTTTGAAT
64 TTTTTAAATCTCCTACTC-ATTAATTTCCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
130907 AAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACT
128 AAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACT
* * * *
130947 ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCAAAACTATTTATGCTTGCTCGGTAAATAAATTTATT
1 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACAAAACTATTTAT-CTTGCTCGGTAAACAAAGTTATT
* ** ***
131012 TTTTTAATCTTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
65 TTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTCCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
*
131077 GCTTGTATGAATAGAAACAATTG
130 ACTTGTATGAATAGAAACAATTG
131100 GTTTCTAACA
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 20, Indels: 7
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
165 2 0.02
167 89 0.69
168 38 0.29
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (167 bp):
ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACAAAACTATTTATCTTGCTCGGTAAACAAAGTTATTT
TTTAAATCTCCTACTCATTAATTTCCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAA
CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACT
Found at i:133431 original size:148 final size:147
Alignment explanation
Indices: 133159--133431 Score: 395
Period size: 148 Copynumber: 1.9 Consensus size: 147
133149 TCGGTACACT
* * * *
133159 AATTTATTTTTTTAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 AATTTATTTTTTTAATCTCTTGTTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTAGTAATTTATT
* * * * *
133224 TCAAATAAGCATGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGAGTTAA
66 TCAAATAAGCATCTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAATGAGTTAA
133289 AATTTGTTCAATAAATA
131 AATTTGTTCAATAAATA
*
133306 AATTTATTTTTTTAAATCTCTTTTTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTAGTAATTTA-
1 AATTTATTTTTTT-AATCTCTTGTTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTAGTAATTTAT
* * **
133370 TTCTGAATAAGCTTCTATGAGTTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAATGA
65 TTC-AAATAAGCATCTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAATGA
133432 TAAATAGATA
Statistics
Matches: 110, Mismatches: 14, Indels: 3
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
147 16 0.15
148 94 0.85
ACGTcount: A:0.39, C:0.06, G:0.10, T:0.46
Consensus pattern (147 bp):
AATTTATTTTTTTAATCTCTTGTTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTAGTAATTTATT
TCAAATAAGCATCTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAAAATGAGTTAA
AATTTGTTCAATAAATA
Found at i:135627 original size:357 final size:357
Alignment explanation
Indices: 133294--135757 Score: 1805
Period size: 357 Copynumber: 6.9 Consensus size: 357
133284 GTTAAAATTT
* *** ** *
133294 GTTCAATAAATAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTTTTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTA
1 GTTCAGTAAATAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTA
* * * * *** * *
133359 GTAGTAATTTATTCTGAATAAGCTTCTATGAGTTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGAT
65 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT
* * * * * * * *
133424 CA-AA--ATGAT-AAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCAATTGAACTGATTCGATAAACA
130 TATAACTAT-TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTGATAAACA
* * *
133485 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-A
193 AATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * *
133549 TAAAAAAAGCTTGTATGAAC-AAAATAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGA
254 TTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* *
133613 AATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTA
319 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * * * * * ** *
133652 GTTTAGCAATTAGATTTACTTTTTAATTTTCTTAGTTATT-ATGTTTCAAAATATTATTAAATTA
1 GTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAAT-TTTCAAAATATTAATAAATTA
* * * ** * * * * * *
133716 GTAGTATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAACATAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGT
65 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT
* * * *
133781 TATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATA
130 TATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAACA
** * *
133844 GTTTTACTTTTTAAATCTCTTACTGACTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGT-TTATTTTAT
193 AATTTATTTTTTAAATCT-TT--T-ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * ** * * * * *
133907 TTCGAACATA-CTAATATTAACAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTAATAATGATTT
253 TTTGAATA-AGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
133971 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
317 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * *
134012 GTAT-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-T---TATTAATTCTT-GAAATATTAGTAAATT
1 GT-TCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATT-TTCAAAATATTAATAAATT
*** * * *
134071 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGTTGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
64 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA
* * * *
134136 TAATAACTATCTGAAATAGAT-ATGTATTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTT-AGTAAA
129 TTATAACTATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTGA-TAAA
*** * * * *
134199 TTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTCTTTTA
191 CAAATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * *
134264 TTTTGGAGAAG-TTTTCATAAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATGATT
252 TTTTGAATAAGCTTGT-ATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * *
134328 TTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT
316 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * ** * * *
134370 GTTCAGTAAACAAATTAATTTTTTCAAATCTCTCGCTTATTCATTTTTC-AAATGTTAATAAATT
1 GTTCAGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACCTATT-AATTTTCAAAATATTAATAAATT
* * * * *
134434 AGTA-TATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTATATGAC-TAACAAAA-A
64 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA
* * * * * *
134496 -TATCAGAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATAATCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAA
129 TTAT-A-ACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTGATAA
** * * * ** *
134560 ACACTTTTCTTTTTTAAATCTCTTATTGATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAT
190 ACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
** ** * * * *
134624 CCGAATAAGCTTGTATAATTAGACACAATTATTTTATGAGAAAACAAATA--TCATAATGATTTG
254 TTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTG
* * ** * *
134687 AGATTGATGTTTGTTCAAATTA-TCATAATTATTTGAACTA
318 AAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTA
** * * * * * * **
134727 GTTCAAAAAACAACTTTAGTTTTTAAATATCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA--AG
1 GTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAG
* * * * * * *
134789 ---TA--GTATTTTGAAAAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
66 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATT
* * * * *
134849 ATAACAACTTTG-AATAGATAATTATTCAAATAATCA-AATCTATTTG-A--GTTTGGTAAATAG
131 ATAACTA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGTTTGATAAACAA
* * * ** * *
134909 ATTTATTTTTTCAAATCTCTTACCCACTATTTTTTTGAATGTTAATAAAGTAGTATTATTTTATT
194 ATTTATTTTTT-AAATCT-TT---TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* *** * * * * *
134974 CTGAATAAGCTTGTATAAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGATCAGAACGATTTGA
254 TTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* ** * *
135039 ACTAGATAATTATT-ATAATAGTTTTAACTGTTTGAACTG
319 AATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * * * *
135078 GTT-TGACAAATAAATTTATTTTTTAAATATTTTA-CTGATTAAGTTTT-AGAATATTATTAAAT
1 GTTCAG-TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCT-ATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAAT
* * * ** * * *
135140 TAGTATTCTTATAATTCAAATAAGCTTATATGGAA-AGAAACAATTGTTCTATGACAAAA-TAAA
63 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * **
135203 GATCT-TAACGATTTGCAATAGATAATTATTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTAATTCAATAA
127 GAT-TATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAA
* * * * *
135267 ACAAATTTAGTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATCAATATCATTTTATTT
190 ACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * * **
135332 TGGATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAA
255 TGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
135397 TTAGATAATTGTTCAAATGGACATAATTATTTGAACTT
320 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * * *
135435 GTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTGG
1 GTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
135500 TATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAAGAAAAACAACTATTTTATGAC-AAATAAAAGATT
66 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATT
* *
135564 ATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTTGATAAACAAA
131 ATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAACAAA
** * *
135629 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTAATTTA-TTT
195 TTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * *
135693 CAACTATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGG-CATAACT-ATTTG
256 GAA-TAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAA-TGATTTG
135756 AA
318 AA
135758 CGTGTTCAGA
Statistics
Matches: 1651, Mismatches: 358, Indels: 191
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
345 17 0.01
346 7 0.00
347 1 0.00
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349 69 0.04
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354 2 0.00
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364 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
GTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAG
TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATT
ATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTGATAAACAAAT
TTATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
AGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
Found at i:135757 original size:146 final size:145
Alignment explanation
Indices: 135598--135893 Score: 380
Period size: 145 Copynumber: 2.0 Consensus size: 145
135588 TTCAAATAGT
* * *
135598 CATAACTAATTGAACTTGTT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
1 CATAACTAATTGAACGTGTTCAGA-AAACAAATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
135662 GGAATATTAATAAA-CTAGTATTAATTTATTTCAACTATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTT
64 GGAATATTAATAAATCTA-TAATAATTTATTTCAAATAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGGTT
135726 TATGACAAAACAAAATGG
128 TATGACAAAACAAAATGG
* * * * *
135744 CATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTAGTTATTTATTTTTGG
1 CATAACTAATTGAACGTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGG
* * * * *
135809 AATATTAATAAATTTATAATATTTTATTTGAAATAAGCTTGTACGAACAAAAATAATTGTTTTAT
66 AATATTAATAAATCTATAATAATTTATTTCAAATAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGGTTTAT
*
135874 GACAAAACAAAATGT
131 GACAAAACAAAATGG
135889 CATAA
1 CATAA
135894 TGATTTAAAA
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 19, Indels: 5
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
145 89 0.69
146 38 0.29
147 2 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (145 bp):
CATAACTAATTGAACGTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGG
AATATTAATAAATCTATAATAATTTATTTCAAATAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGGTTTAT
GACAAAACAAAATGG
Found at i:135806 original size:145 final size:146
Alignment explanation
Indices: 135628--135893 Score: 383
Period size: 145 Copynumber: 1.8 Consensus size: 146
135618 TGATAAACAA
* *
135628 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-CTAGTATTAATTTATT
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATCTA-TAATAATTTATT
* * * *
135692 TCAACTATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGGCATAACTATTTGA
65 TCAAATAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGGCATAACTATTTGA
135757 ACGTGTTCAGAAAATAG
130 ACGTGTTCAGAAAATAG
* * * *
135774 ATTTATTTTTAAAAT-TTTTAGTTATTTATTTTTGGAATATTAATAAATTTATAATATTTTATTT
1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATCTATAATAATTTATTT
* * * *
135838 GAAATAAGCTTGTACGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA
66 CAAATAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGGCATAA
135894 TGATTTAAAA
Statistics
Matches: 105, Mismatches: 14, Indels: 3
0.86 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
145 89 0.85
146 16 0.15
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (146 bp):
ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATCTATAATAATTTATTT
CAAATAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGGCATAACTATTTGAA
CGTGTTCAGAAAATAG
Found at i:136097 original size:157 final size:157
Alignment explanation
Indices: 135878--136193 Score: 366
Period size: 157 Copynumber: 2.0 Consensus size: 157
135868 TTTTATGACA
* ** * *
135878 AAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGT
* * * *
135943 TTAGTCAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAATAA-TCTTCAGAATATTAATAAATTAGT
66 TTAGTAAACAGATTCATTTTTAAAATCTCTTACTCAATAATTCTTCA-AATATTAATAAATTAAT
136007 ATTATTTT-ATTTCGAATAAGCCTATATG
130 ATTATTTTAATTT-GAATAAGCCTATATG
* * * * *
136035 AAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATCATTATTCAAATAGTTATGACCATTTGAACTTGT
1 AAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGT
* * * * * *** * *
136100 TTCGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTGTTACTTGTTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATA
66 TTAGTAAACAGATTCATTTTTAAAATCTCTTACTCAATAATTCTTCAAATATTAATAAATTAATA
* *
136165 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATG
131 TTATTTTAATTTGAATAAGCCTATATG
136192 AA
1 AA
136194 TAAAAACAAT
Statistics
Matches: 131, Mismatches: 26, Indels: 4
0.81 0.16 0.02
Matches are distributed among these distances:
157 123 0.94
158 8 0.06
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (157 bp):
AAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGT
TTAGTAAACAGATTCATTTTTAAAATCTCTTACTCAATAATTCTTCAAATATTAATAAATTAATA
TTATTTTAATTTGAATAAGCCTATATG
Found at i:136532 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 136035--137686 Score: 1152
Period size: 180 Copynumber: 9.2 Consensus size: 178
136025 AGCCTATATG
* * * * * * ** *
136035 AAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATCATTATTCAAATAGTTATGACCATTTGAACTTGT
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-
* * * * * * *
136100 TTCG-TAAACATATTTATTTTTAAAATTTGTTACTTGTTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAAT
65 TT-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGT
* *
136164 ATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACA
128 ATTATTTT-ATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-AATTGTTTTATGACA
* * *
136216 AAACCAAA-GTCATAAC-AGTTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATAATTTGAACTTG
1 AAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG
* * * * * *
136279 TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAAATGTCTT-AATATTAAGAAATATA
65 TT-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AAT-TTTTAAATATTAATAAAT-TA
* * *
136343 -TATTATTTTATTCGAAATAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACA
126 GTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTGTTTTATGACA
* * * *
136396 AAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATTA-TCATAATTATTTAAACTTG
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-TAGTCATAATTATTTAAACTTG
** * * * * * * *
136460 TCCAGTAAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTATTAAATTGGC
65 TTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGT
* *
136525 ATTATTTTATTTC--AATATA-CTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTATGACA
128 ATTATTTTA-TTCGAAATA-AGCTTGTATGAACAAAAA-AATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
136576 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGAT-ATGACTAATTGATCTAG
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG-TCATAATTATTTAAACTTG
* * * * **
136640 CTTGGTAACCATATTTATTTTTAAAAT-T-TTCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAG
65 -TTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
136703 TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAATA
127 TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATT-GTTTTATGACA
* * * * *
136757 GAACAAAAAGTCATAAGGATTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTAT-TCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG
* * * * ** *
136821 TTTGATAAATAGATTTATTTTTTATATCTCTTA-TTAGT--TTTCAAAATATTAATATATTAGTA
65 -TTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *
136883 TTACTTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTTTTTATGACA
129 TTA-TTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTGTTTTATGACA
* * * *
136934 AAACAAAA-GTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGG
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-G
* * * * *
136997 TTAGGTAAACAAAATAATATTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTGAAATATTAATAAATTCA-
65 TT-GATAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATT-AG
* * * *
137061 TTTTATTTTATTTTG-AATAAACTAGTATGAATTC-AAAAAATTGTTTTATGACA
127 TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAA--CAAAAAAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
137114 AAATAAAAAGTCATGAC-ATTTTGAAATAGATAATTGTT-ATTATAGTCTTAAATATTTGAAA-T
1 AAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAAATAATTATTCA-AATAGTCATAATTATTT-AAACT
* * * * * *
137176 GGTTTGACAAACAAATTTA-TTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTA
63 TG-TTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTA
*
137240 GTATT-TATTTATTCTG-AATAAGCTTGTAT-AAAAAGAAATAATTGTTTTATGACA
126 GTATTAT-TTTATTC-GAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAA-AATTGTTTTATGACA
* * ** * * * * *
137294 GAACAAAAGGTTATAATAACTTGAAGTATAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA-AATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG
* * * *
137357 ATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAG
65 --TTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAG
* * * * * * * *
137418 TATCATTTTATTTG-AATAAGCTTGAATGATCGAAAACATTTGTTATATGACC
127 TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACA
* ** * * * * * * *
137470 AAGCAAAACATAAAAACAATTTGAAAT-AATAAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAA--T
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAT-AATTATTCAAATAGTCATAATTATTT-AAACTT
* * * * * * * *
137532 GTTTTAGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTT
64 G-TTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTA
* * *
137597 GTATCATTTTATTTC-AAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACA
126 GTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACA
* *
137651 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATACATAATTA
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTA
137687 GTCATGTAGT
Statistics
Matches: 1175, Mismatches: 221, Indels: 150
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
175 6 0.01
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177 71 0.06
178 43 0.04
179 136 0.12
180 440 0.37
181 318 0.27
182 16 0.01
183 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGT
TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTGTTTTATGACA
Found at i:136764 original size:361 final size:355
Alignment explanation
Indices: 136146--136992 Score: 879
Period size: 361 Copynumber: 2.4 Consensus size: 355
136136 TTAATTGTTG
* ** * * * *
136146 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA
1 AAATACTAATAAATTAGCATTATTTT-ATTTAAATAA-CTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTA
*
136211 TGACAAAACCAAAGTCATAAC-AGTTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATAATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAGTCATAACGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATAATTTGAA
* * * * **
136275 CTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAAATGTCTTAATATTAAGAAAT
128 CTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTCACATATTAAATGTCAAAATATTAAGAAAT
* * * * * * *
136340 ATATATTATTTTATTCGAAATAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
193 ATATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAA
* * * *
136405 GTTAT-AGCGATTTCAAATAGATAATTAT-TCAAATTA-TCATAATTATTTAAACTTGTCCAG-T
258 GTCATAAG-GATTTCAAATAAATAATT-TGTCAAA-TAGTCATAACTATTTAAACTAGT-CAGAT
*
136466 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTA
319 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTC----TTATTAATTTTCA
* * * *
136507 GAATACTATTAAATTGGCATTATTTTATTTCAATATACTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTAT
1 AAATACTAATAAATTAGCATTATTTTATTTAAATA-ACTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTAT
* *
136572 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGAT-ATGACTAA-TTGA
65 GACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG-TCAT-AATAATTTGA
* * * * * * *
136635 TCTAGCTT-GGTAACCATATTTATTTTTAAAAT-TTTCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAA
127 ACTAG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTCACATATTAAATGTCAAAATATTAAGAA
* * * *
136698 AT-TAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAATAGAACA
191 ATATA-TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAAAAATT-ATTTTATAACAAAACA
* **
136762 AAAAGTCATAAGGATTTGAAATAAATAATTTGTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGAT
254 AAAAGTCATAAGGATTTCAAATAAATAATTTGTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTCAGAT
* * * * * *
136827 AAATAGATTTATTTTTTATATCTCTTATTAGTTTTCA
319 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTATTAATTTTCA
* * * * *
136864 AAATATTAATATATTAGTATTACTTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTTTTTT
1 AAATACTAATAAATTAGCATTA-TTTTATT-TAAA-TAACTTATATGAACAAAAACAATTCTTTT
* * * *
136928 ATGACAAAACAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
63 ATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATAATTTGAA
136993 TTGGTTAGGT
Statistics
Matches: 402, Mismatches: 67, Indels: 38
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
356 4 0.01
357 65 0.16
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359 23 0.06
360 112 0.28
361 160 0.40
362 10 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (355 bp):
AAATACTAATAAATTAGCATTATTTTATTTAAATAACTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTATG
ACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATAATTTGAACTA
GTTCGATAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTCACATATTAAATGTCAAAATATTAAGAAATATA
TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTC
ATAAGGATTTCAAATAAATAATTTGTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTCAGATAAACAAA
TTCATTTTTCAAATCTCTTATTAATTTTCA
Found at i:137196 original size:357 final size:358
Alignment explanation
Indices: 136105--137713 Score: 891
Period size: 357 Copynumber: 4.5 Consensus size: 358
136095 CTTGTTTCGT
* * * * * *
136105 AAACATATTTATTTTTAAAATT-TGTTACTTGTTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAATA-TT
1 AAACAAATTTATTTTT--AATTATCTTACTTATTAATT-TTCAAAATATTAATAGATTAGTATTT
* * * * * * * *
136167 ATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACCAAA-GTCATA
63 A-TTT-ATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
* * * *
136230 AC-AGTTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-TAATTTGAACTTG-TTCGATAAA-TAG
125 ACGA-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-TTGATT-GGTAAACAAA
* * *
136291 ATTTATTTTTTAAATCTTTTAC-ATATTAAATGTCTT--AATATTAAGAAATATA-TATTATTTT
186 ATATA-TTTTTAAATCTCTTACTA-ATT-AAT-T-TTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTT
* ** * * * * * * *
136352 ATTCGAAATAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-AGCGA
245 ATTTG-AATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAAGC-A
* * * * ** *
136415 TTTCAAATAGATAATTAT-TCAAATTA-TCATAATTATTTAAACTTG-TCCAGT
308 TTTGAAATAAATAATT-TGTCAAA-TAGTCATAAATATTTAAACTAGTTTGA-C
* * * * * * * * * * *
136466 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTATTAAATTGGCA-TTAT
1 AAACAAATTTATTTTT-AATTATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTTA-
* * * *
136530 TTTATT-TCAATATACTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
64 TTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACG
* * * * * * * *
136594 ATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGAT-ATGACTAATTG-ATCTAGCTTGGT-AACCATATTT
128 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAT-T-GATTGGTAAACAAAATAT
* ** ***
136656 ATTTTTAAAAT-T-TTCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAA
190 ATTTTT-AAATCTCTT-ACTAATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGA
* * * *
136719 ATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAAGGATTTGAAAT
251 ATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAAGCATTTGAAAT
* *
136784 AAATAATTTGTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGAT
316 AAATAATTTGTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTAGTTTGAC
* * * * *
136827 AAATAGATTTATTTTTTA-TATC-T-CTTATTAGTTTTCAAAATATTAATATATTAGTA-TTACT
1 AAACAAATTTATTTTTAATTATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTTA--
*
136888 TTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAACGA
64 TTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA
* * *
136952 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTAGGTAAACAAAATAATAT
129 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATT-GGTAAACAAAAT-ATAT
*
137017 TTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTGAATAA
192 TTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTA-TTTGAATAA
* * *
137081 AC-TAGTATGAATTCA-AAA-AATT-GTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATGA-CATTTTGAAAT
255 ACTTA-TATGAA--CAGAAACAATTGGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAAGCA-TTTGAAAT
* * * * *
137141 AGATAA-TTGTTATTATAGTCTTAAATATTTGAAA-TGGTTTGAC
316 AAATAATTTGTCA-AATAGTCATAAATATTT-AAACTAGTTTGAC
* *** *
137184 AAACAAATTTATTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTTATT
1 AAACAAATTTATTTTTAATTATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTTATT
* * * * * * * * **
137249 TATTCTGAATAAGCTTGTAT-AAAAAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATAA
66 TATTCTAAACAAACTTATATGAACAA-AAA-CATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA
* * * * * *
137313 CTTGAAGTATAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAA-TAGATTTAT
129 TTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGA-TTGGTAAACAAAATATA-
* * * *
137376 TTTTTAAATCTCTTATTAA-T--TTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTGAATAAG
191 TTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAA
* * * * * * * *
137438 CTTGA-ATGATC-GAAA-ACATTTGTTATATGACCAAGCAAAACA-T-AAAAACAATTTGAAAT-
256 CTT-ATATGAACAGAAACA-ATTGGTTTTATAACAAAACAAAA-AGTCATAAGC-ATTTGAAATA
* * * * * * *
137497 AATAAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAA-T-GTTTTAGT
317 AATAATTTG-TCAAATAGTCATAAATATTT-AAACTAGTTTGA-C
* * * * *** * * *
137540 AAATAGATTCACTTTTTAAATCA-CTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTGTA-TCA
1 AAACAAATTTA-TTTTT-AATTATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTTA
* * * * * * *
137603 TTTTATT-TCAAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
64 -TTTATTCT-AAACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
* * ** * *
137667 CAATTTGAAATACATAATTAG-TCATGTAGTCTTAACTGTTTGAATTG
126 CGATTTGAAATAAATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG
137714 CTAAATATTA
Statistics
Matches: 1004, Mismatches: 175, Indels: 142
0.76 0.13 0.11
Matches are distributed among these distances:
354 5 0.00
355 14 0.01
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357 299 0.30
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359 80 0.08
360 184 0.18
361 226 0.23
362 12 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
AAACAAATTTATTTTTAATTATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTTATT
TATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATT
TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTGGTAAACAAAATATATTTTT
AAATCTCTTACTAATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAACTTAT
ATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAAGCATTTGAAATAAATAATTTG
TCAAATAGTCATAAATATTTAAACTAGTTTGAC
Found at i:137392 original size:537 final size:529
Alignment explanation
Indices: 136105--137691 Score: 1521
Period size: 537 Copynumber: 2.9 Consensus size: 529
136095 CTTGTTTCGT
* *
136105 AAACATATTTATTTTTAAAATTTGTTACTTGTTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACATATTTATTTTT-AAATTT-TTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * *
136170 TTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACCAAAGTCATAACA
64 TT-ATTCTGAATAAGCTTGTAT-AAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGTCATAACA
* *
136233 GTTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-TAATTTGAACTTG-TTCGATAAATAGATTTA
127 ATTTGAAATAAATAATT-TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TGATTTGATAAATAGATTTA
* * ** * *
136296 TTTTTTAAATCTTTTACATATTAAATGTCTTAATATTAAGAAATATA-TATTATTTTATTCGAAA
189 TTTTTTAAATCTCTTA-TTATT---T-TCAAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTCTAAA
* * * * * * * *
136360 TAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAG
248 TAAGCTTATATGAACA-AAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAACGTTATAACGATTTGAAATAG
* * * *
136425 ATAATTATTCAAATTA-TCATAATTATTTAAACTT-GTCCAGTAAACAAATTCATTTTTCAAATC
312 ATAATTGTTCAAA-TAGTCATAATTATTTGAA-TTGGT-TAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC
* * * * * *
136488 TCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTATTAAATTGGCA-TTATTTTA-TTTCAATATACTTA-TA
374 TCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATT--CATTTATTTTATTTTAAATAAAC-TAGTA
*
136550 TGAA-CAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATT
435 TGAATC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAAATAATTATT
* * ** **
136614 CATATAGATATGACTAATTGATCTAGCTTGGT
498 CATATAGATATAAATAATTGAAATAGCTTGAC
* * **
136646 AACCATATTTATTTTTAAAATTTTCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AAACATATTTATTTTT-AAATTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** * * * * * **
136711 TAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAAGGA
65 TATTCTGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATT-GTTTTATGACAGAAC-AAAAGTCATAACAA
*
136776 TTTGAAATAAATAATTTGTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-AGTTTGATAAATAGATTTATT
128 TTTGAAATAAATAATTT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTTGATAAATAGATTTATT
* * * *
136840 TTTTATATCTCTTATTAGTTTTCAAAATATTAATATATTAGTATTACTTTTATTCTAAACAAACT
191 TTTTAAATCTCTTATTA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCT
136905 TATATGAACAAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAACGATTTGAAATAGATAATTG
254 TATATGAACAAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAACGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * *
136969 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTAGGTAAACAAAATAATATTTTTAAATCTCTTACTA
319 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTA-GTAAACAAATTCAT-TTTTTAAATCTCTTACTT
*
137034 ATTAATTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTTGAATAAACTAGTATGAATTCAAAA
382 ATTAATTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTATTTTATTTTAAATAAACTAGTATGAA-TCAAAA
* * * * *
137099 -AATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATGACATTTTGAAATAGATAATTGTT-ATTATAG-TC
445 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-TTTGAAATAAATAATTATTCA-TATAGAT-
* * * *
137161 TTAAATATTTGAAATGGTTTGAC
507 ATAAATAATTGAAATAGCTTGAC
* * * * *
137184 AAACAAATTTATTTTT-AATTCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATT-TA
1 AAACATATTTATTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-
* * *
137247 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATA
63 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAGAACAAAA-GTCATAACA
* * *
137312 ACTTGAAGTATAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTAT
127 ATTTGAAATA-AATAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGATAAATAGATTTAT
** * * *
137376 TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATCATTTTATT-TGAATAAGCT
190 TTTTTAAATCTCTTATT-ATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * * * * * * *
137440 TGA-ATGATCGAAAACATTTGTTATATGACCAAGCAAAACATAAAAACAATTTGAAATA-ATAAA
254 T-ATATGAACAAAAACATTT-TTTTATGACAAAACAAAACGTTATAACGATTTGAAATAGAT-AA
* * * * * * * * *
137503 TTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAATGTTTTAGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTAC
316 TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTG-GTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAC
* ** * * *
137568 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTGTATCATTTTATTTCAAATAAGC-ATGTATGAA-CT
380 TTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTCAT-TTATTTTATTTTAAATAAACTA-GTATGAATC-
* *
137631 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATACATAATTAGTCAT
441 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAAATAATTATTCAT
137692 GTAGTCTTAA
Statistics
Matches: 866, Mismatches: 136, Indels: 92
0.79 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
535 25 0.03
536 65 0.08
537 338 0.39
538 230 0.27
539 31 0.04
540 59 0.07
541 38 0.04
542 79 0.09
543 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (529 bp):
AAACATATTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
ATTCTGAATAAGCTTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGTCATAACAATTT
GAAATAAATAATTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTA
AATCTCTTATTATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGA
ACAAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAACGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
AGTCATAATTATTTGAATTGGTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
GAAATATTAATAAATTCATTTATTTTATTTTAAATAAACTAGTATGAATCAAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGATATAAATAATTGAAA
TAGCTTGAC
Found at i:137675 original size:718 final size:718
Alignment explanation
Indices: 136129--137686 Score: 1550
Period size: 718 Copynumber: 2.2 Consensus size: 718
136119 TTAAAATTTG
* * * *
136129 TTACTTGTTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* *
136193 A-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACCAAAGTCATAACAGTTTGAAATAAATAATTATTCAAA
65 ACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* * * * * *
136257 TAGTCATAATAATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAAAT
129 TAGTCATAATAATTTGAACTTGTTAGATAAACAAAATAATTTTTTAAATCTCTTACATATTAAAT
** * *
136322 GTCTTAATATTAAGAAATATATATTATTTTATTCGAAATAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATTAT
194 GTCTTAATATTAAGAAATATATATTATTTTATTCGAAATAAACTAGTATGAATACAAAAAATTAT
* * *
136387 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATTATCATAATTATT
259 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATTATCATAAATATT
* *
136452 TAAACTTGTCCAGTAAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTATT
324 TAAACTGGTCCAGCAAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTATT
* *
136517 AAATTGGCATTATTTTATTTCAATATACTTATATGAACAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAA
389 AAATTAGCATTATTTTATTTCAATATACTTATATGAAAAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAA
* * * * *
136582 AAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGATATGACTAATTGATCTAGCTTGGTA
454 AAGGTCATAACAACTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGATATAACTAATTGAACTAGCTTGGTA
* * * *
136647 ACCATATTTATTTTTAAAATTTTCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
519 AACAGATTTATTTTTAAAA--TTCACTTATTAATTGTCAAAAGATTAATAAATTAGTATCATTTT
* * * * **
136712 AATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAAGGAT
582 AATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTATATAACAGAACAAAAAGTAAAAACAAT
* * * *
136777 TTGAAATAAATAATTTGTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTT
647 TTGAAATAAATAAATTGTCAAATAGCCATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTCACTTT
*
136842 TTATATC
712 TTAAATC
* ** * * * *
136849 -T-CTTATTAGTTTTCAAAATATTAATATATTAGTATTACTTTTA-TTCTAAACAAACTTATATG
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
136911 AACAAAAAC-ATTTTTTTATGACAAAACAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
64 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* *
136975 TAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGTAAACAAAATAATATTTTTAAATCTCTTAC-TAATT-
129 TAGTCATAATAATTTGAACTT-GTTAGATAAACAAAATAAT-TTTTTAAATCTCTTACAT-ATTA
* * * *
137037 AAT-T-TTGAAATATTAATAAAT-TCATTTTATTTTATTTTG-AATAAACTAGTATGAATTCAAA
191 AATGTCTT--AATATTAAGAAATAT-ATATTATTTTA-TTCGAAATAAACTAGTATGAATACAAA
* * * * *
137098 AAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCAT-GAC-ATTTTGAAATAGATAATTGTT--ATTATAG
252 AAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAG-CGA-TTTCAAATAGATAATTATTCAAAT-TA-
* ** * * *
137159 TCTTAAATATTTGAAA-TGGT-TTGACAAACAAATTTATTTTT-AATTCTCTTACTTATTAATTT
313 TCATAAATATTT-AAACTGGTCCAG-CAAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTT
* * * * * * *
137221 TTGGAATATTATTAGATTAGTATT-TATTTATTCTGAATA-AGCTTGTAT-AAAAAGAAATAATT
376 TTAGAATACTATTAAATTAGCATTAT-TTTATT-TCAATATA-CTTATATGAAAAA-AAACAATT
* * * * * *
137283 GTTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATAACTTGAAGTATAA-AATTGTTCAAATAG-TCATAAC
437 CTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTGAAATA-AATAATTATTCAAATAGAT-ATAAC
* * * * * * **
137346 TATTTGAACT-GATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTTATTAATTTTTGAAAGATTA
500 TAATTGAACTAG-CTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAAATTCACTTATTAATTGTCAAAAGATTA
*** * * *
137409 ATAAATTAGTATCATTTT-ATTTGAATAAGCTTGA-ATGATC-GAAA-ACATTTGTTATATGACC
564 ATAAATTAGTATCATTTTAATCCAAATAAGCTT-ATATGAACAGAAACA-ATTGGTTATAT-AAC
* * * *
137470 A-AGCAAAACA-TAAAAACAATTTGAAAT-AATAAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAA-
626 AGAACAAAA-AGTAAAAACAATTTGAAATAAATAAATTG-TCAAATAGCCATAACTATTT-AAAC
*
137531 T-GTTTTAGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCAC
688 TAGTTTGA-TAAATAGATTCACTTTTTAAAT--C
* * * *
137564 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTGTATCATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
*
137629 CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATACATAATTA
66 CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTA
137687 GTCATGTAGT
Statistics
Matches: 678, Mismatches: 122, Indels: 78
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
712 14 0.02
713 68 0.10
714 22 0.03
715 39 0.06
716 30 0.04
717 115 0.17
718 341 0.50
719 49 0.07
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (718 bp):
TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
GTCATAATAATTTGAACTTGTTAGATAAACAAAATAATTTTTTAAATCTCTTACATATTAAATGT
CTTAATATTAAGAAATATATATTATTTTATTCGAAATAAACTAGTATGAATACAAAAAATTATTT
TATGACAAAACAAAAAGTCATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATTATCATAAATATTTA
AACTGGTCCAGCAAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTATTAA
ATTAGCATTATTTTATTTCAATATACTTATATGAAAAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAA
GGTCATAACAACTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGATATAACTAATTGAACTAGCTTGGTAAA
CAGATTTATTTTTAAAATTCACTTATTAATTGTCAAAAGATTAATAAATTAGTATCATTTTAATC
CAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTATATAACAGAACAAAAAGTAAAAACAATTTGA
AATAAATAAATTGTCAAATAGCCATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTCACTTTTTAA
ATC
Found at i:138426 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 138010--140080 Score: 1380
Period size: 181 Copynumber: 11.6 Consensus size: 178
138000 ATAGTTTCAC
* * *
138010 TTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATTATTATTTTATT-TCAAAT
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAAT
** ** * * ** * *
138074 AAAATTGTATGAACTGAAGCAATTATTTTATGACAAAACAATAGGTCATAATGATTTTAAATATA
64 AAGCTTGTATGAAC-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * *
138139 TAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAATTTGTTCAGA-AAACAGATTAACT
127 TAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTA-T
* * * * *
138192 TTTTTAAATGTTTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATA
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
* * * *
138257 AGCTTTTATGAATCGAAATGATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTTAAATA-AGT
65 AGCTTGTATGAA-CGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGA-T
*
138321 AATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTCGATAAACAAATTTAT
128 AATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTAT
** * * *
138372 TTTTTCAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCTGAAT
1 TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
* * * * * * * **
138437 AAGTTTGTATGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAA-AAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGAT
64 AAGCTTGTATGA-ACGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGAT
** ** * *
138501 AATT-ATTCTTATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTC-ATAAACACATTTAT
128 AATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTAT
* * * **
138552 TTTTCAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAAT
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAAT
* * *
138612 AAGC--------A-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-CCATAACAATTTGAGATTGATA
64 AAGCTTGTATGAACGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * ** * * *
138667 ATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTCAAACTAGTTTGATAAACAGATTTAT
129 ATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTAT
* *
138717 TTTTTAAATCTC-T-C--ATTAATTTTTGAAATATTAATGAATTAATATTATTTTATT-TGAATA
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
* ** * * * *
138777 AGCTTGTACGATAAAAAAGAATTGTTTTATAACAAATCAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
65 AGCTTGTATGA-ACGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATA
** * * * * *
138842 ATT-ATTTGAATGGCCATAATTATTTTAAC-TGATTCAATAAACAAATTTAT
129 ATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTAT
* * *
138892 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAAATTAATAAATTAGTATTATTTGATTCCT--ATA
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CTGAATA
* ** * *
138955 AGCTTGTACT-AACTGAAATAATTGTTTTATGCCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATA
65 AGCTTGTA-TGAAC-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * * *
139019 CAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGATTTAT
127 TAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTAT
** * * * **
139071 TTTTTAAAATCTCTTTGTTATTAAATTTTTGAATGTTAATAGATTAGTATTAATTTATTCCAAAT
1 TTTTT-AAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
* * * * * * **
139136 AAGCTTGTATGAACTTAAACAATTATTTTTTGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGA
64 AAGCTTGTATGAAC-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGA
* * **
139201 TAATTG-TTATAATAGTCTTAA-TCATAAGAA-TTGGTTC-AGTAAACAAATTTAT
127 TAATTGATCA-AATAGTCATAACT-ATTTGAACTT-GTTCGA-TAAACAAATTTAT
* * * ** * *
139253 TTTTCAAATCTCTTACCTATTAATTTTTGAAATGTTCTTAAATTTGTATTATTTTAATCTGAATA
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
* * * *
139318 AGCTTGTATGAAC-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAATAGGTCATAACAATTTGAAATTGATA
65 AGCTTGTATGAACGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * ** *
139382 A-TCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTC-AGCAATTAGATTTA-
129 ATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTAT
* * * ** * * * **
139431 TTTTTCATTTTCTTGGTTAATAAGTTTTAT-AACATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCAAAAT
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
** * * ** * * * * ** *
139495 AAAATAGTATGGACAGAACCAACTATTTGATGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATCGA
64 AAGCTTGTATGAAC-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * * * * *
139560 TAAGT-ATTCAAATAGCCAAAACTATTTGAAATGGTT-TAGTAAAGAGATTTAC
127 TAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTAT
* *
139612 TCTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTATAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAA
1 TTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAA
* * * * * * **
139675 -CAGACTTATATGAACACAAATAATTGTTTGATGATAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATA
63 TAAG-CTTGTATGAAC-GAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGAAATA
* * ** * *
139739 GGTAATT-ATTCAAATAGTTATATTTATTTGAACTGGTTC-AGTAAATATAA-TTAT
125 GATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACA-AATTTAT
* * * * * *
139793 TTTTTAAATTTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATT-TCAAAT
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAAT
* * * * *
139857 AAAG-TTGTAAGAGCTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACAATTTAAAATAG
64 -AAGCTTGTATGAAC-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAG
* * * * * * * ***
139921 ATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAATGGATTTAT
126 ATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTAT
* * * *
139974 TTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTATTCTGAATA
1 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
* * * * *
140039 AACTTGTACGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAA
65 AGCTTGTATGAAC-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
140081 TAAAACTATT
Statistics
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0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
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183 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
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TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA
GCTTGTATGAACGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
TGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTAT
Found at i:140720 original size:359 final size:355
Alignment explanation
Indices: 140173--141163 Score: 937
Period size: 359 Copynumber: 2.8 Consensus size: 355
140163 TAACTATTTA
* * * *
140173 AACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTTTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAAT
* * *
140236 ATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTAGTAAGAG
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* * * * * * *
140299 ATTGAAAAAGTAAATCTATTAACCAAACCATTTCAAATAGTTTTA-ACTATTTGAATAATTATCT
125 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCATTTCAAAT-GATTAAGACTATTTGAATAATTATCT
* ** * **
140363 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGCCATCAGACAATTGGTTCTGTTCATAC-TATTTTAT
189 ATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAGACAATTGGTTCAATTCATACAAAGCTTAT
* *** *
140427 TTAGAATAAAATAATATTAATTTAATAACATTTTGAAACTCAATAGCCAAGAAAATT-AAAAATA
254 TTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTAAAAAAATCAAT----AAGAAAATTAAAAAATA
* * * *
140491 AATGTAATTGCCTAACTAGTTCAAATAGTCAATATTATATG
315 AATGTAATTACCGAACAAGTTCAAATAGTCAATACTATATG
* * * * **
140532 AACGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATCTTTTTTTGTTTG
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTTGTTAA
* * *
140597 TACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
65 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * *
140662 AAAAATAAAATTTGTTTACCAAACCATTTCAAATGGTTAAGACTACTTGAACAATTATCTATTTC
130 AAAAAT-AAATTTGTTTACCAAACCATTTCAAATGATTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTA
* * * * * * *
140727 AAATCATTCTGA-CTTTTCATTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAATTCATACAAAGCTTATTTGG
194 AAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGCCATAAGACAATTGGTTCAATTCATACAAAGCTTATTTAG
* * * * * *
140791 AATAAATTAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTAT
258 AATAAAATAATACTAATTTAATAACATTAAAAAAATCAATAAGAAAATT-AAAAAATAAATGTAA
* * * * *
140856 TTATCGGACAAGTTCAAATAGTTAGTACTATTTG
322 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTCAATACTATATG
* * * *
140890 ACCAATTGTCTA-TTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTGTTTTAGTTAAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAAT
* * * * *
140953 ACAAGCCTATACAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAA
66 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * ** * * * * * * * *
141018 AAAACAAATTTGTTTATCAAATTAGTTAAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTTAA
131 AAAATAAATTTGTTTACCAAACCATTTCAAATGATTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA
** * * * ** *
141083 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATAC-AAGATTATTT-GAA
196 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAGACAATTG-GTTCAATTCATACAAAGCTTATTTAG-A
141145 ATAAAATAATACTAATTTA
259 ATAAAATAATACTAATTTA
141164 TTAATATTTC
Statistics
Matches: 516, Mismatches: 102, Indels: 34
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
352 1 0.00
353 28 0.05
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363 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (355 bp):
AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAAT
ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
AAAATAAATTTGTTTACCAAACCATTTCAAATGATTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA
ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAGACAATTGGTTCAATTCATACAAAGCTTATTTAGAAT
AAAATAATACTAATTTAATAACATTAAAAAAATCAATAAGAAAATTAAAAAATAAATGTAATTAC
CGAACAAGTTCAAATAGTCAATACTATATG
Found at i:140785 original size:179 final size:177
Alignment explanation
Indices: 140145--141253 Score: 860
Period size: 179 Copynumber: 6.2 Consensus size: 177
140135 CTATCTACTG
* * * * * *
140145 AACCAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATTACTTTTTGT
1 AACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
** * * * *
140208 TTTGTCATAAAA-AATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * *
140272 AATATTT-AGAAAATTAATTAGTAAGAGATTGAAAAAGTAAATCTATTAACCA
130 AATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCA
* * * *
140324 AACCATTTCAAATAGTTTTA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGT
1 AACCAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * ** *
140388 TTTGCCATCAGACAATTGGTTCT-GTTCATACTATTTTATTT-AGAATAAAATAATATTAATTTA
65 TTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * ** * * * * * * ** * *
140451 ATAACATTTTGAAACTCAATAGCCAAGAAAATT-AAAAATAAATGTAATTGCCT
128 TTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCA
* * * * * * * *
140504 AACTAGTTCAAATAGTCAATATTATATGAACGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
1 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** ** * *
140569 TTGCCATAAAACAATCTTTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATA-TAAATTTAA
66 TTGTCATAAAACAAT-TGTTTTAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTAT
140633 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTACCA
129 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA-AAAATTTGTTTACCA
* * * * * *
140683 AACCATTTCAAATGGTTAAGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGA-CTTTTCAT
1 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTT-GT
* * * * *
140747 TTAGTCATAAGACAATTGTTTCAATTCATACAAAGCTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTAT
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * * *
140812 TAACATTAAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTATCG
129 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAA-AAATTTGTTTACCA
* * * *
140862 GACAAGTTCAAATAGTT-AGTACTATTTGACCAATTGTCTA-TTAAAATCATTATGACCTTTTGT
1 AACCAGTTCAAATAGTTAAG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *** *
140925 TTTGTCATAAAAC-ATTGTTTTAGTTAATACAAGCCTATACAAAATAAAATAATACAAATTTATT
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
140989 AATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTATCA
130 AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCA
** * * * * * * * * *
141037 AATTAGTTAAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTT
1 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
141102 TTGTTATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
66 TTGTCATAAAACAATTG-TTTTAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
141166 AATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAGAAATATGTTTACTA
130 AATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCA
* * * *
141218 AACCAATTCGAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
1 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA
141254 AAATAATAGA
Statistics
Matches: 732, Mismatches: 167, Indels: 60
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 37 0.05
176 89 0.12
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179 212 0.29
180 112 0.15
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182 5 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCA
Found at i:141288 original size:106 final size:106
Alignment explanation
Indices: 141146--141359 Score: 317
Period size: 106 Copynumber: 2.0 Consensus size: 106
141136 TTATTTGAAA
* *
141146 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAGAAATATG
1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATATG
* *
141211 TTTACTAAACCAA-TTCGAA-TAGTTATGACTATTTGAATAAT
66 TTTACCAAA-CAAGTTC-AACTAGTTATGACTATTTGAACAAT
* *
141252 TAAAATAATAGAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATAT
1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATAT
*
141316 GTTTACCAAATAAGTTCAACTAGTTATGACTATTTGAACAAT
65 GTTTACCAAACAAGTTCAACTAGTTATGACTATTTGAACAAT
141358 TA
1 TA
141360 TTTATTTCAA
Statistics
Matches: 98, Mismatches: 7, Indels: 6
0.88 0.06 0.05
Matches are distributed among these distances:
105 8 0.08
106 90 0.92
ACGTcount: A:0.49, C:0.07, G:0.09, T:0.35
Consensus pattern (106 bp):
TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATATG
TTTACCAAACAAGTTCAACTAGTTATGACTATTTGAACAAT
Found at i:141496 original size:286 final size:283
Alignment explanation
Indices: 140969--141539 Score: 720
Period size: 286 Copynumber: 2.0 Consensus size: 283
140959 CTATACAAAA
*
140969 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTA
1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTA
* * * * *
141034 TCAAATTAGTTAAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT
66 CCAAATAAGTTAAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * *
141099 GTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
131 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
141164 TTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAGAAATATGTTTACTAAACCAA-TTCG
196 TTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCAAA-CAAGTTCA
*
141228 AATAGT-TATGACTATTTGAATAAT
260 AATAGTCT-TAACTATTTGAATAAT
* *
141252 TAAAATAATAGAAATTTATTAATA-TTC-AGACAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATA
1 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTA-A-AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAACAAATA
* * * * * *
141315 TGTTTACCAAATAAGTTCAACTAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
60 TGTTTACCAAATAAGTTAAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * *
141380 -CTTTTGTTTTGTCATAGAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATATT
125 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATACT
** * * * *
141444 AATTTATTAATATTTTGACAAGTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATGCTTACCAAACAA
190 AATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCAAACAA
141509 GTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATAAT
255 GTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAATAAT
141538 TA
1 TA
141540 TCTATTTTAA
Statistics
Matches: 245, Mismatches: 35, Indels: 13
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
281 1 0.00
282 4 0.02
283 25 0.10
284 1 0.00
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287 75 0.31
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (283 bp):
TAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTA
CCAAATAAGTTAAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
TTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAGAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAA
ATAGTCTTAACTATTTGAATAAT
Found at i:141845 original size:645 final size:637
Alignment explanation
Indices: 140611--141897 Score: 1409
Period size: 645 Copynumber: 2.0 Consensus size: 637
140601 AGCTTATTTG
* * *
140611 AATTAAAATAATATAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAATTTG
1 AATTAAAATAATAGAAATTTAATAATATTTCAAAAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAAATATG
* * * *
140676 TTTACCAAACCATTTCAAATGGTTAAGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACT
66 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT
* *
140741 TTTCATTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAATTCATACAAAGCTTATTTGGAATAAATTAATACTA
131 TTTCATTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAATTCATACAAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTA
* * * * **
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* * * ***
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** *
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* *
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* * * * * *
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* * ***
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* * ** * * *
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* * *
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* * * * *** *
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* **** * *
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* * *
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* * *
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* * * * ** * * *
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* *
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* * * *
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* * ** * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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** * * * * *** *
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* * * *
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* * * * * ** * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ***
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*
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* * * * * * *
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* * * *** * *
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* * *
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128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* *
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* ** * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCA
* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * **
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** * * ** * * ** *
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*** * ***
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* * * ** ** * *
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* * * * *
146101 TAAAAAAAATACTAATCTACTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAACAAATCT
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-
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* * * * * * * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-
* * * * * * * *
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65 -TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * ** **
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* * * * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAT
* * * * * * * *
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* * * * * **
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* *
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1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-T
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63 CATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * ** **
146755 CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTTATACAAAATTATTCAAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * *
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65 TTTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGAC
* ** * * * * * *
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128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT--GTTCATAC-AAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
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1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA--AT
* * * * * *
147050 -ATTTA-CATAACCA-TGTCAAATAATTATGACAATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTAT
63 CATTTATC-GAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTAT
* * * * *
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125 GACCTTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * *
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1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-
* * * * * * * *
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64 ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * * * * *
147292 -CTTCTTGTTTTGTTATAAAATAATAG-TTTTGTTCATACAAGCATAATCGGAT
127 CCTT-TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
** * * *
147344 TAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAAT-A
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA
* * * * * *
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65 --TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
** * **
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* * * * *
147523 TTAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGATAATTAAAAAA-AGCATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATC-
* * * * * * * * *
147587 ATTTACCAAATAAGTTCATATAATTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATAATGAC
64 ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATATTATGAC
* * * * *
147652 CTTTTGTTTTGTCATAAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTCAAA
128 CTTTTGTTTTATCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAA
*
147706 TAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-TTTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * *** * * *
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64 -ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * **
147834 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTGATACAAAATTATTT-AGAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* ** **
147887 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAACTTATTTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCA
* ** * * * *
147948 TTTA-CTAGACTTGTTCAAATAGTTATGATTATCTAAACAATTATCTCTCTT-AAACTATTATGA
65 TTTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAA-TATTATGA
* * * * ** * *
148011 --TCTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTTGTACAAGCTTATTTGGAG
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * **
148062 TAAAATATTGCTAA---ATT-A-A--T----AAGT--T-GGT---A-ATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
* * * * * * *
148109 TTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATCTCAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGGC
65 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * * ** **
148173 ATTTTGTTTT-TCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAAATTATTCAAAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* *
148224 TAAAATAATACTAGTTTATTAA-ATTTCAAAAA-T--TAA-TAACAGATTTAAAAAATAAAT-AT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-
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65 -TTTATCG-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-ATTAT
* * *
148345 GATC-TTTGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAG
125 GACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * * * **
148399 TAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CA
* * * * * * * * *
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65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACC
* * ** * * * *
148529 TTTTG-TTTAGTCAGAAAATAATTGTTTCAGTTCACACATGCTTCTTCGAAA
129 TTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * ** * * *
148580 TAAAATAGCT-CTAATTTATTAACA-TCCAAAAAATTAATAAACAAGA-A-AT-GAAAA-AAATA
1 TAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
148639 ATTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTGTGACTATCTGAATAATTATTTATTTAAAATAAATATGG
64 ATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * *
148703 CCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAT-TTCATAAAAGCTTATCTGAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * *
148756 TAAAATAATATTACTTTATTAATTTTTTAAAATTTGATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAGTCAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* ** * * * * * *
148821 TTTATCGAATC-ATTTCAAATAACTATGGCCATTTGAGCAATTATATATTTCAAATTGTTATGAA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGAC
* * * * *
148885 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTACTG-TGATA-TAGGTCTA-TTCAGAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCT-TATTTGA-AA
* * * * *
148937 TAAAATAATATTAGTATT-TTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAACA-AAATC
1 TAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATC
* * * * *
149000 TATTTAT----CAA-TGC----AG-T-T-CCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATAA
64 -ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * ** * **
149053 TCTTTT-TTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * **
149105 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTCATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
** * * * * * * * *
149170 TTTGCCAAAGC-AGTTTAAACAGTTAAGGCCATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * * *
149234 CATTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
149286 TAAAATAATATTAATTTAGTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGCATAT-
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT--AAATC
* * ** * * * * *
149350 GTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGTCAATAATTATCTATTTCAAATTATTATTA
64 ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGA
** * * * *
149414 CCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTT-TAACATTCAAGCTTA-TTCAGAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * * **
149467 T-AAGTAATACTAATTTACTAATCTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
* * * * * * * * * *
149531 TTTATTGAACTACTCCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCAATATAAC
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * * * **
149595 CTTTTGTTCTATCACAAAATAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTCAAAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * ** * * * *
149647 AAAAATAATACTAATCTACCAATATTTCAAAAATTAATAACTAATAGAATTAAAAAATAAATTTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
* * * * *
149712 TTTA-CTAAACTAGTTCAAATATTTA-AAGCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
65 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
** * * * * * **
149775 CCCCTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTTTTTACTTCATACTAGCTTATTTGGGA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-----TTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
149834 TAAAATAA-ACAAATTTATTAATATTTCAATACTTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCA
* ** * * * * *
149898 TTTGTATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAATTCATTATAAC
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * * * *
149962 CTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTATTGATATAAGTTTGTTCTG-AA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAAA
** * * *
150014 TAAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTTCAAAAGTTAAT-AG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
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150073 TTTA-CCAATTTAGTTCAAATAGTTATGTCTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * ** * * * *
150136 CTTTTTGTTCTATTTTAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTG--T
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* *
150187 TGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGT-AGAAATTTTAAAAAATAAATC
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
150251 TGTTTACCCAACAAGTTTACATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA
64 -ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * *
150316 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * **
150368 -ATAA-AATA--AATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * * * * * *
150429 TTTA-CTTAACAAGTTTAAATAG-TCTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGAC
65 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * * ** **
150492 ATTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
*
150544 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA----
** * * * * * * * * *
150605 TCATAAAGCTAATAAATCTATCATGAAGCCAATTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAAAAATTATC
62 TCATTTATCGAA-CAA-GT-TCA--AA--TAGTT---AT-G--ACT-A-TTTG--AACAATTATC
* *
150669 TATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
110 TAT-TTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* *
150732 TTTGGAG
173 TTTGAAA
* * * * *
150739 TAAAATATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA--T
* * * * * * *
150803 -GTTT-GCTGAGCCAA-TTCAAATAGTTA-AACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTT
63 CATTTATC-GA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTAT
* ** * ** * **
150864 AACCTTTTG-TTTAGTCACGAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAA
125 GACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* ** * *
150919 TAAAATAACT-CTAATTTATT-ATAATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAAATAAT
1 TAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAA
* * ** * * ** *
150982 TCTATTT-TCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAGTACATAAATAATTATCTATTGAAAATAAATA
62 TC-ATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTA
* * * * * ** * *
151046 CGTCCTTTTATTTTATCGTAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATGAAA
124 TGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
151102 TAAAATAATATTATTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * * * * * * *
151167 TTTATTGAATGAA-TTTAAATAATT-T-AGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTACGA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * *
151229 ACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTG-TCATAGAAGCCTA-TTCAGAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* *
151282 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * ***
151347 TTTACCG-AC-----C-CA-A--T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCCAACC
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACC
* * ** * * *
151400 TTTTGTTTTGTTATAAAGTAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTTGAAA
129 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
151451 AAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
** * ** * * * *
151516 TTTGCCAAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACC
* * * *
151581 TTTT-TGTTTATCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCATAGAAACTTATTCGAAA
129 TTTTGT-TTTATCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* **
151632 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAGAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
* * * * * * * *
151693 TTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCAATATAAC
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * *
151757 CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTT-TTGATACAAGCTTATTTGGAAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAAA
* * * * * ** *
151809 -AAAA-ATTACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAACTAAAAAATAAATTTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
* * * * *
151872 TTTGTCGAACCAGTTCAAATA-TGTAAGACTATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATGAC
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * ** * **
151936 CTTTTGTTTTGTTATAAAATAAATT-TTTTAATTCATACTAGCTTATTTGGGA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * *
151988 TAAAACAA-ACAAATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
** * * *
152052 TTTATATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTACTTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * *
152115 CCTTTTCGTTTTGTCATAAAACCAA-TGTTTGTGTTGATATAAGTTTGTTT-AGAA
127 CCTTTT-GTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
** * * ** *
152169 TAAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTT-TGAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
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152229 TTTA-CCAATCTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAAT-TGCTATGA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAT--TATGA
* * ** *
152292 CTTTTTGTTCTATTTTAAAAC-ATT-TTTTTG-TCTATACAAGCTTATTTG-GA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC-ATACAAGCTTATTTGAAA
* * * *
152342 TGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAAATTAAAAATTAAATC
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
152406 TATTTACCCAGCAAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA
64 -ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * *
152471 TCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * **
152523 -ATAA-AATA--AATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * * * * * *
152584 TTTA-CTTAACAAGTTTAAATAG-TCTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGAC
65 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * * ** **
152647 ATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
*
152699 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * *
152760 TTTGT-GAAACCAA-TACAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCTATCTT-AAATCATTATG
65 TTTATCG-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-ATTATG
* * * * * * * *
152822 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAG
126 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
152875 TAAAAT-ATTCTTAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTGAAAAAATAAAT-G
1 TAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA
** * * * * ** * *
152938 TGGTTGCCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTGTTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGA
65 T--TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGA
* * ** **
153003 CCTTTTG-TTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTCATA-AATG-TATATTAAAAA
127 CCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA-GCT-TATTTGAAA
* * ** * *
153056 TAAAATAACT-CTAATTTACTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAATT
1 TAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * *
153119 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATAAATATG
63 C-ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * *** * * * *
153184 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTGTCAATTAATAAAAGTTTATCTGAAA
126 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
*** * * * * * *
153238 TAAAATGGCATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
** * * ** * * * *
153303 TTTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCGTTT-AAGTAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAA
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * *** * * *
153367 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCATGCAAG-TCCATTTGAAG
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-TATTTGAAA
* * * * *
153419 TAAAATAATACTGATTTATTAATATTTTAAAAATTACTAAGTATGAGATTTAAAAAGTAAAT-AT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAT
* * * * *
153483 GTT-T--AACAA--TC---CAG-T-T-CCTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
66 -TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACC
* * * * * *
153537 TTTTGTTCTGTTAT-AAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTTGAAA
129 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAA
* * * *
153588 AAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATC-
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA
* *
153651 TGTT-TGCTGAAGCAA-TTCAAATAGTTATGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
65 T-TTAT-C-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTAT
* * * *
153714 GACC-TTTGTTTTATCCTAAAACAATTTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAA
125 GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
153769 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
** * * * * *
153834 TTTA-CTGAATTAGTTTAAATAATTATGACT-TTGTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTA
65 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGA
** * ** * **
153897 CCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* **
153950 TAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
* * * * * * *
154011 TTTA-CTAAGCTAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAATTTCAAATCATTATAA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * * *
154074 CTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTTTTGATACAAGCTTA-TTCAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * * *
154126 -AAAA-AATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATCAAAAAATAAAT--T
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAT
* * * * * * * *
154187 TGTTTCCTAAACCAGTTCAAATATTTAAT-ACTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACG
66 T-TAT-C-GAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
154251 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TATTTGAATTCATACTAGTTTTATTT-AGGA
126 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTTTG--TTCATACAAG-CTTATTTGA-AA
* * * *
154308 TAAAATAA-A-TGAAGTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-
** * * *
154371 ATTTATATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTACTTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
64 ATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* * * * * *
154434 ACCTTTTCGTTTTGTCATAAAACCAA-TGTTTGTGTTGATATAAGTTTGTTT-AGAA
126 ACCTTTT-GTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
** * * ** *
154489 TAAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTT-TGAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * * *
154549 TTTA-CCAATCTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAAT-TGCTATGA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAT--TATGA
* * ** *
154612 CTTTTTGTTCTATTTTAAAAC-ATT-TTTTTG-TCTATACAAGCTTATTTG-GA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC-ATACAAGCTTATTTGAAA
* * * *
154662 TGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAAATTAAAAATTAAATC
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
154726 TATTTACCCAGCAAGTTCACATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA
64 -ATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * **
154791 TCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * ** *
154844 TAAAATAATATTAATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGACATTTAAAAAATAAAT-AT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAT
* * * * * *
154908 GTT-TACTGAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATCATCTATTTCAAATCATTATGA
66 -TTAT-C-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * * ** **
154972 -ATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCAAACAAAATTATTCAAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
*
155024 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATCCG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CA
* *
155085 TTTAT-GAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATCTT-AAATATTATGA
65 TTTATCG-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATATTATGA
* * *
155147 TCTTTT-TTTT-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAG
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * * * **
155198 TAAAATATTCCTAAATTATTAATATTCCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CA
* * * * * * *
155263 TTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTCTTTCAAATTGTTCTGACC
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACC
* * *
155328 TTTTG-TTTAGTCATGAAATAA------TTGTT-AT----GCTTATTTGAGA
129 TTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * ** * *
155368 TAAAATAACT-CTAGTTTCTTAACA-TGCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAATT
1 TAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * * *
155431 GTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATGATCTATTTAAAATAAATATG
63 -CATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATG
* *** * **
155496 ACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTTATCCGAAA
126 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * *
155550 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAATTTTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * * *
155615 TTTATTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTT-AAGCAATTATATATTTCAAATCGTTATGA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * * * *
155678 ACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTTCT-ATCATACGAG-TCTATTTGGAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCATACAAGCT-TATTTGAAA
*
155731 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAAT--
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCA
* * *
155794 TTGT-TC--AC-TGATC---TAG-T-T-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
65 TT-TATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
* * * ** * *
155849 CTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCATATTTGAAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * **
155901 TAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
** ** * ** * * *
155966 TTTGCCGAAGC-AGTTCAAATAGTTAAAACCATATAAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGA
65 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * *
156030 CCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCAGTTCATAAAAGTTTATTCGAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
156083 TAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATAAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCAC
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-
* ** * * * * * *
156148 TTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TCTCAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTAC
65 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGAC
** * ** * *
156212 CTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTA-TTCAGAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * *
156264 TAAAATAATACTAATTTCTTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CA
* * * * * *
156325 TTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTA-CAAACTTCAAATCATTAT-A
65 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-ATTATGA
* * * * ** * * *
156387 GCCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTGATGTATGCTT-GTTCAAA
127 -CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * * **
156440 AAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
* * * * *
156505 TTTA-CTGAACCAA-TTCAAATATTTAAGACTATATGAATAGTTATCTATTTCAAATAATTATGA
65 TTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* * ** * * * **
156568 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTACTTTTTAATTCGTACTAGCTTATTTGGGA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
156623 TAAAATAA-ACAAATTTCTTAATATTTCAAAACTTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAATTCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
** * * * * * * *
156687 TTTATATAACTAA-TTTAAATAATTTTGACTATTTTAACAATTATCTATTTTAGATCATTATAAC
65 TTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC
** * * * * * * *
156751 CTTTTCATTTATCATAGAACAAATGTTTTTGTTGATATAAGTTTGTTCGAAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
** * * * *
156803 TAAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAGAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * *
156863 TTTA-CCAATCTAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGA
65 TTTATCGAA-C-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA
* ** * * * *
156926 CC-TTTGTTCTATTTTAAAATAATTGATTCT-ATCTATACAAGCTTATTTG-AA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC-ATACAAGCTTATTTGAAA
* * *
156977 TGAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAAATAAATT
1 T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAA-T
** * * * * * *
157041 TGTTTA-CCAAGTAAGTTCACATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG
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* * * * * **
157105 ATCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTGTATTCATATAAGCTTATTCAAAA
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* * * *
157159 TAAAATAATACTAATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * *
157224 TTTA-CTAAACAAGTTCAGATAGCCTTAT--CTATTTGAACTATTATC-ATTTCAAATCATTATG
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* * * * * ** **
157285 ACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAA
126 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
*
157339 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-A-A-ATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* *
157400 TTTGT-GAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGA
65 TTTATCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-ATTATGA
* * * * * *
157463 TC-TTTATTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAG
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * * ** ***
157515 TAAAATATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAA-TATCTA-A--TAATATTCCTAAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAA-A-AAATAAA
* * * * * * *
157575 T-GTGTT-TGCCATGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATTATT
62 TCAT-TTAT-CGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATT
* * * *** * **
157638 CTGACCTTTTG-TTTAGTCAT-GAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAA
123 ATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * ** * * *
157694 TAAAATAACT-TTAATTTGTTAA-AATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAAAAATT
1 TAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
157757 ATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATATG
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* ** * *
157822 ACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCAATTCATAAAAGCTTATTGGAAA
126 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
157876 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-
* * * * * * *
157940 ATTTATCGAATC-AGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGA
64 ATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGA
* * ** **
158004 ACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAG-TCTATTCAAAA
127 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-TATTTGAAA
* * *
158057 TAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAA-T--TCA-TAAGAGATTTAAAAAATTAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-A
* * * *
158118 TTTA-C---CAA--TC---CAG-T-T-CCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
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* * * * * * * * **
158171 TTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGTTTATTGGGGA
129 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * **
158222 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCA
** ** * ** * * *
158287 TTTGCCGAAGTAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAGTCTTTATGACC
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* ** * *
158352 TTTTGTTTTGTCATAAAACCAA-TGTTTCAGTTCATACAAGTTTATTCGAAA
129 TTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * ** * * **
158403 TAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTTATTTAAAAAGTGAATTTG
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* ** * * * * * *
158468 TTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TATCAACAATTATCAATTTTAAATCATTATTAC
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** * ** * *
158532 CTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCTAA-CTTATTTGGAA
128 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC-AAGCTTATTTGAAA
158584 TAAAATAA
1 TAAAATAA
158592 ATGTTTACTG
Statistics
Matches: 13362, Mismatches: 2958, Indels: 1679
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
160 5 0.00
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* * * ***
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* * * ** * * *
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* * * * * ** * **
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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**
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * **** * *
142487 TTAATACAAGCTTATTTGGATTAAAAAAAATACTAATTTAATAAAATTCCAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAAATAATACTAATTT-AT----TT-CAAA
* * * * *
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1 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
142605 A-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTATTATTTAGTCATAAAACAATT-ATTTTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * *
142668 TTTCATACAAGCTTATTCAAAATACAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAA
130 -TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T----TTC-AAA
* * * ** * * *
142721 AATTAATGAGCAAAAGATTTTTTAAAA-AAATCTATTTACCGAA-CAAGTTTAAATAGATT-TGA
1 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAG-TTATGA
* * *
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* *
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* * * * * * * * *
142901 AATTAATAAGCAAGGGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTCTGAACCAGTTTAAATAATTATGAATA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
142966 TTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA--TATTAATTTTCTAATAAAACAACTGTTTTT-
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* *
143028 TATCA-AACAAGCTTA-CCCAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAA
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* * * * * * *
143081 AA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAGATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCTAATAGTTAAGATTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * ** * * *
143142 TTAGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAATCATATAATAATTG-TTTCAG
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* * ** *
143206 TTCATACAAGGTTATTTGAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAA
130 TTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTAA--T-TT---ATTTCAAA
* * * * * * * * *
143258 AATTAGTAAGCATGAGATTTGAAAAAAATAAATATATTT-GTCCAA-TAAGTACAAATAGTTATG
1 AATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAA-TTCAAATAGTTATG
* *
143321 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAACCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
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* * *
143386 TTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATATTAGTACTTTATTTCAAA
127 TTA-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTCAAA
* * * * * *
143436 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTATGGCCA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * *
143501 TTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA
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* * * * *
143566 -ACATATAAGCTTATTCGAAATAAACTAAT-CTCAATTTATTAACATTTCAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-AA--T-TT---ATTTCAAA
* * * *
143617 AATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATATATCTATTTACCT-AACTATTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * *
143677 ATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCACAAAA-AATTATTTCTA
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143741 TTTATACAAGCTTATCCGTAATAAAATAATACTAATTTAGTAAAATTCTAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T----TTC-AAA
* * * * * * *
143793 AATTAATAAG--AGAG--TTAAAAAATAAATCTATTTGCCGAACCAGTTCAAATAGCTAAGATTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
** * ** * ** * * * *
143854 TAAGTATGATTATTTATTAAAAAAT-TTTATGACCTTTTATTTTGACATGAAACAATT-ATTTTA
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* * * * * *
143917 GCTT-ATACAATCTTATTCAGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAA
130 --TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* ** * * * * * * *
143970 AATTTATAAGTAAGAGATTTGGAAAATAATTCTATTTATTGAACTAGTTCAAATAATTATAACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * ** * * * *
144035 TTCGAATAATTATCTATTTAAAATCATTGTTATGTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * *
144100 TGATATAAA-TTTGT-TAGAAATAAAATGATACTAATTTATTAAT-ATTTGGAA
131 TCATA-AAAGCTTATCCA-AAATAAAATAATACTAATTTATT--TCA-----AA
* * * * * * *
144151 AATTAATCAGTAA-AGGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTACTAAACCATTTCAACTAGTTTTGACT
1 AATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
144215 ATTTGAATAATTAACTGTTTCAAATCACTATAACCTTTTATTTTATCATTAAACAATTGATTTTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
** * *
144280 TTCATACTA-TTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAA
130 TTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTAA--T--T--TATTTCAAA
* * * * ** * * * *
144331 ACTTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTG
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* ** * ** * * * * *
144396 TATGAATGATAATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTCTTTT-ACATCAAACAATTGTTTTTTT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
** * * * * *
144460 TTGTACAAGCTTATTCGAATTCAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAA
131 TCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA--T--T--TATTTCAAA
* * * * * *
144511 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAGTTCAAATGGTTAAGACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
** * * * * * **
144576 TTAAAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTTTGGT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
** * *
144640 TCATACAAA-CTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTCAAAA
131 TCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA--T-TT-AT-TTC-AAA
* * * * * *
144691 AATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATTAT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* ** * * * *
144755 TATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAATAATTG-TTTC
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ***** * **
144819 AGTTAATACAAGTTTAGATGGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTA
129 A-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* * * * * * * * *
144873 AATTATTAAATAAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACTG-ACTTAATTAAAATAATTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-CAATTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * *
144937 ATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
145001 TATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAACA
130 T-TCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T----TTCAA-A
* * * * * * * *
145054 AATTAACAAGCAAAATATTTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAA-CAAGTTTAAATAGCTATAA
1 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAA-TTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
145117 TTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTC
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * **
145182 AATTCATAAAA-CTTTATCAAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTGAA
128 TATTCATAAAAGC-TTATCCAAAATAAAATAATACTAA----TT--TATTTCAAA
* * * ** * *
145236 ACTTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTACGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * * * * **
145300 ATTGGAACGATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTGTT-TTTTATTATAAAATAATTGTTTCAA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ***
145364 TTCATACAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTCAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA----TT--TATTTCAAA
* * * * * * * * * *
145416 AATTAATAGGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAGTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * * * *
145481 TTTCAGCAAATATTTATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTGGTTATATAGCAATT-TTTTTA-
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * *
145544 TCATACAATCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTATTTTTTCAAA
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* * * * **
145595 AATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAATCAGTTTGAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
145659 ATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAATCTTTCA-TTTATCATAAAAAAATTATTTTTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *
145723 TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATTCTAATCTAATAATATTTCAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA---T-A-CTAAT-TTATTTCAAA
* * * * * *
145775 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCAGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
145840 TATGAACAATTATCTATTTCAAGTCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATGAAAC-ATT-TTTTCAA
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TA
*** * * *
145903 TTCATACCTGCTTAT-TAGGAATAAAATAAAATGAATCT-ATTAATATCTCAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCA-AAATAAAAT--AAT--A-CTAATT--TATTTCAAA
* * * * * **
145955 AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTAACT-AACTAGTTCAAATAATTACAACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * *
146015 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * *** * *
146080 CTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAAAAAATACTAATCTACTAATATTTTAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAAATAATACTAA--T--T--TATTTCAAA
* * *
146133 AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTATCT-AA-CAAGTTCTAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
146192 TATTTGAGCAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAG-TTT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * ** * * *
146255 TGTTCATACAAGCATAAT-CGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTTTGAC
128 TATTCATAAAAGC-TTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATT--TCA-----AA
* * * * * *
146309 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTGAAATTGTCATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
146373 A-TTCAAGTAATTATCTCTTTCAAATCATTCTGACC--CT-TTTT-TAATAAAATAATT-ATTTC
65 ATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* *** ** *
146432 AGTTCATACAAGCTTATTTGATGTAAAATAATTCTAATTTACTAATATTTCAAA
129 A-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA--T--T--TATTTCAAA
* * * * **
146486 AATTAATGAGTAAGATAGTTAAAAAA-AGAA------TAC-CAAATAACTTCAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
146543 -A-ATCAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATAAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
64 TATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* **
146605 TCTTCATGCAAGCTTATTCC--AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATTTTCTAAA
128 TATTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACT-AA--T-TT-A-TTTC-AAA
* * ** *
146658 AATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAAT-TGATTTA-TCGAATGAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
146721 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGGCATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * *
146786 ATTTATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-TT-AAT
129 ATTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTCAAA
* * * * * * *
146831 ATTTCAAAAATTAATAAGATATTGAAAAACTAAATCTGTTTACT-AGACTAGTTCAAATAGTTAT
1 AATT-AATAAGTAA-GAGAT-TT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGA-ACCAATTCAAATAGTTAT
* *
146895 AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAACAATT-T
61 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
** * ** *
146958 TTTTCAATTCATACTCA-TTTAGTAGGAATAAAAGAAAATGAAT-CT-ATTAATATTTCAAA
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* * * * * * *
147017 CATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAACAATTATATTTACAT-AACC-ATGTCAAATAATTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TGAACCAAT-TCAAATAGTTATGAC
* * ** * *
147080 AATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTT
* * * * *** *
147144 TGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAAAAAATACTAATCTACTAATATTTCAAA
128 TATTCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAAATAATACTAA--T--T--TATTTCAAA
* * * * * * *
147199 AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATGTA-TCAAACAAGTTCTAATAGTGAAGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
147259 ATTT-AAGTAATTATTTATATCAAATCATTATGA-CTTCTTGTTTTGTTATAAAATAATAG-TTT
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* * * ** * * ** *
147321 TGTTCATACAAGCATAAT-CGGATTAAAATAATATCAATTTATTAATATTTTGAT
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* * * *
147375 AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
147439 A-TTCAAGTAATTATCGATTTCAAATCATTCTAACCATTTT-TTTTAGT-A-AAAA-AATTG-TT
65 ATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTATTTT-GTCATAAAACAATTGTTT
* * *** ** *
147498 TCAGTTCATATAAGCTTATTTGATGTTAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
127 TTA-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* * * * * * ** * *
147554 AATTAATGAGTAAGATAATTAAAAAA-AGCATCTATTTAC-CAAATAAGTTCATATAATTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
147617 TATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAATAATTGTTTC
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTT
* *
147682 TATTCATACAAGCTTATTTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATTTTCTAAA
128 TATTCATAAAAGCTTA--TCCAAAATAAAATAATACT-AA--T-TT-A-TTTC-AAA
* * *** *
147737 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCT-ATTGAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
147801 ATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ** * *
147866 TTGATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTA-TT-AAT
130 TTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTCAAA
* * * * * * ***
147910 ATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAACTTATTTTGTTTACT-AGACTTGTTCAAATAGTTAT
1 AATT----AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA-ACCAATTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
147974 GATTATCTAAACAATTATCTCTCTT-AAA-CTATTATGA--TCTTGTTTTGTCATAAAATAATTA
61 GACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATC-ATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
* ** * * ** * * *
148035 TTTTTGTTTGTACAAGCTTAT-----TTGGAGT-A-A--AA--TATTGC-TA
124 TTTTTATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTCAAA
** * * *
148075 AATTAATAAGTTGGTA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGTC
1 AATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
148138 CATCTCAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGGCATTTTGTTTT-TCATAAAACAATTGTTTCT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * *
148202 ATTTATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAAATTTCAAA
129 ATTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA----ATT-TATTTCAAA
* *
148254 AA-T--TAA-TAACAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TGAAACCAATTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * *
148314 ATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTT
65 ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * * *
148377 GTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCCAAA
129 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-AATT--T-AT-TT-CAAA
* * * * * * * *
148430 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCTAGTTTAAATAATTAAGACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * * * *
148495 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCAGAAAATAATTG-TTTCAG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* * * * * * *
148559 TTCACACATGCTTCTTCGAAATAAAATAGCT-CTAATTTATTAACATCCAAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATA-ATACTAATTTATT----T-C-AAA
** * ** * *
148611 AATTAATAAACAAGAAATGAAAAAAAT-AA----TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTGTGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * * *
148670 ATCTGAATAATTATTTATTTAAAATAAATATGGCCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG-TTTCA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
** * * *
148734 TTTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATTTTTTAAA
130 -TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT-A-A-TAC-TAATT--TATTTCAAA
* * * ** * * ** * *
148787 ATTTGATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTA-TCGAATCATTTCAAATAACTATGGCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * *
148851 ATTTGAGCAATTATATATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG--TTTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * * *
148914 CTGTGAT-ATAGGTCTATTCAGAATAAAATAATATTAGTATTTTAATATTTTAAA
130 -T-TCATAAAAGCT-TATCCAAAATAAAATAATACTA--A--TT--TATTTCAAA
* * * * *
148968 AATTAATAAGTAAAATATTTAAAAACA-AAATCTATTTA-T----CAATGC----AG-T-T-CCT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
149020 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATAATCTTTT-TTCTGTTATAAAATAATTG-TTTCA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* *
149083 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAA
130 -TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA-TT--T-AT-TT-CAAA
* * * * * ** * * * * * * *
149136 AATTCATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAGCAGTTTAAACAGTTAAGGCCA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
149201 TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTTAG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* ** *
149265 TTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTAGTAATATTTCAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA--T--T--TATTTCAAA
* * * ** * * ** * *
149317 AATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGCATATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * * * * *
149382 -TGTCAATAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTT-
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* ** * * * *
149445 TAACATTCAAGCTTATTCAGAAT-AAGTAATACTAATTTACTAATCTTTAAAA
130 T-TCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA-TT--T-A--TTTCAAA
* * * * * *
149497 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACTACTCCAAATAGTTATGGCTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * * * * *
149562 TTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCAATATAACCTTTTGTTCTATCACAAAATAATTATTTTTG
66 TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * *
149626 TTGATACAAGCTTATTCAAAAAAAAATAATACTAATCTACCAATATTTCAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAAT-T-----TATTTCAAA
* * * * * * * * * *
149678 AATTAATAACTAATAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATATTTA-AAGCT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGA-CT
* ** * * *
149742 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCCCTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-----TTGT
** ***** * *
149807 TTTTACTTCATACTAGCTTATTTGGGATAAAATAA-ACAAATTTATTAATATTTCAAT
125 TTTTA-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAC----TAATT--TATTTCAAA
* * * * * *
149864 ACTTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTAATTTGTA-T-AACCAATTTAAATAATTATGA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT--GTT-TACTGAACCAATTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
149926 CTATTTTAACAATTATCTATTTCAATTCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTT
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
149991 TATTGATATAAGTTTGTTCTGAATAAGGTAAAACTAATCATTAA--TATTTCAAA
128 TATTCATAAAAGCTT-ATC-CAA-AA--TAAAA-TAAT-ACTAATTTATTTCAAA
* * * ** * *
150044 AGTTAAT-AG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAATTTAGTTCAAATAGTTATGTCT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * ** *
150103 ATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAACAATTGTTTCT
65 ATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * ** * * *
150167 ATTTATACAAGCTTATTTGTTGAAAATAATACTAAT--TTATTAATATTTCAAT
129 ATTCATAAAAGCTTA----TCCAAAATAA-AATAATACTAATT--TATTTCAAA
* ** * *
150219 AATTAATAAGT-AGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCCAA-CAAGTTTACATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
150282 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
150347 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-ATTTATTACTATTTTAAA
129 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATT--TATTTCAAA
** * * * * * *
150395 AATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAA-CAAGTTTAAATAG-TCTGTCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
150458 ATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* *
150523 TTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
130 TTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* * * ** *
150575 ACTTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTCATAAAGCT-AATAAATCTATCATGAAGCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT--T-TA-CTGAACCAA--T-TCA--AA--T
* * * * **
150635 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTCA
55 AGTT---AT-G-----ACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTG
* * **** * * *
150698 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATA
110 TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-AATT--T-AT-
150763 TTCTAAA
170 TTC-AAA
* ** * * *
150770 AATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGGTGTTTGCTGAGCCAATTCAAATAGTTA-AACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * * ** * *
150834 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCACGAAATAATTG-TTTCAG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* * *
150898 TTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACT-CTAATTTATTATAATTCAAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA-TACTAA--T-TTAT--TTC-AAA
** * * * * *
150950 AATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAAATAATTCTATTTTCT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA
1 AATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGA
* ** * * ** * * * * * * *
151014 GTACATAAATAATTATCTATTGAAAATAAATACGTCCTTTTATTTTATCGTAAAATAATTG-TTT
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* *** * *
151078 CAGTTCATAAAAGCTTATATGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTTAAA
128 TA-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA----ATT--TATTTCAAA
* * * ** * ** * * *
151133 AATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATGAATTTAAATAATT-T-AGCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * *
151196 ATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTACGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTT
* * * * * *
151261 -GTCATAGAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
129 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* * * *
151313 AATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-ACC----C--A-A--T-T-CCTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
*** * * **
151366 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCCAACCTTTTGTTTTGTTATAAAGTAATTG-TTTTAG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
**
151430 TTCATATAAA-CTTATTTGAAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAA
130 TTCATA-AAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTAA-TT--T-AT-TT-CAAA
* * ** * ** ** * * *
151482 AATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCAATTTGCCAAAGTAGTTCAAATAGTTAAGACCA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
151547 TATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TGTTTATCATAAAATAATT-TTTTTA
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTAT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* *
151610 GTTCATAGAAA-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
130 -TTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* * * * * *
151663 AATTAATAAGT----GATTTAGAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * *
151724 TTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCAATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTT-
66 TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ** * * *
151787 TTGATACAAGCTTATTTGGAAAA-AAAATTACTAATCTAATAATATTCCAAA
130 TTCATAAAAGCTTA--TCCAAAATAAAA-TAAT-A-CTAAT-TTATTTCAAA
* ** * * * * *
151838 AATTAATAACTAAGAGAACTAAAAAATAAATTTATTT-GTCGAACCAGTTCAAATA-TGTAAGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGT-TATGAC
* * * * *
151901 TATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAATT-TTTT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTT
* ** ** * * *
151965 AATTCATACTAGCTTATTTGGGATAAA-ACAAACAA-ATTTATTAATATTTCAAA
128 TATTCATAAAAGCTTA--T-CCA-AAATA-AAATAATACTAATT--TATTTCAAA
* * * * * *
152018 ACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA-TATAACCAATTTAAATAATTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* *
152082 ACTTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCGTTTTGTCATAAAACCAA-TGTTT
65 A-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAA-CAATTGTTT
* * * * * * ** * ** * ***
152145 GTGTTGATATAAGTTTGTTTAGAATAAGGTAAAACTAATCATTAATATTTTGA
127 TTATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAAT--TT-AT-TTCAAA
* * * * * *
152198 AAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAATCTAGTTCAAATAGTTATAACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CCAATTCAAATAGTTATGACT
* * *** * * * * **
152259 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAAC-ATT-TTTTT-
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * **** *
152321 GTCTATACAAGCTTAT-TTGGATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAC
130 TTC-ATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* * * * ** * *
152374 AATTAATAAGT-AGAAAAATTAAAAATTAAATCTATTTAC-CCAGCAAGTTCATATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* * *
152437 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
152502 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-ATTTATTACTATTTTAAA
129 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATT--TATTTCAAA
** * * * * * *
152550 AATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAA-CAAGTTTAAATAG-TCTGTCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
152613 ATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* *
152678 TTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
130 TTCATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* *
152730 AATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAACCAATACAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
152790 ATTTGATCAATCATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
65 ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* ** * * *
152853 ATTCATAAAAGCTTATTCGGAGTAAAAT-ATTCTTAAATTAATAATATTTTAAA
129 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAC-T-AA-T--T--TATTTCAAA
* * * * * * * * *
152906 AATTAATAAGTAAGAGATTGAAAAAATAAATGTGGTTGCCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTG
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
** ** * * * * * *
152971 TTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATGAAATAATTG-TTTCAG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* ** *
153035 TTCATAAATG-TATATTAAAAATAAAATAACT-CTAATTTACTAACATTTAGAA
130 TTCATAAAAGCT-TATCCAAAATAAAATAA-TACTAATTTA-T----TTCA-AA
** * * * * * *
153087 AATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAATTCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAATTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * **
153151 TATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTGTCA
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * ** * * *
153216 ATTAATAAAAGTTTATCTGAAATAAAATGGCATTACTTTATTAATATTTTAAA
129 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT---AATAC-TAATT--TATTTCAAA
* * * ** ** * * * *
153269 AATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTA-TCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * *
153333 GTTT-AAGTAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTC
65 ATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT
* ** * *** * *
153397 CA-TCATGCAAG-TCCATTTGAAGTAAAATAATACTGATTTATTAATATTTTAAA
128 TATTCATAAAAGCT-TATCCAAAATAAAATAATACT-A---ATT--TATTTCAAA
* * * * * *
153450 AATTACTAAGTATGAGATTTAAAAAGTAAATATG-TT--T-AA-CAA-TC---CAG-T-T-CCTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
153503 TTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTAT-AAATAATTG-TTTTAG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* **
153566 TTCATATAAGCTTATTTTGAAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAA
130 TTCATAAAAGCTTA--TCCAAAATAAAATAATACTAA-TT--T-AT-TTC-AAA
* * * * *
153619 AATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTATGACCA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
153684 TATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTATCCTAAAACAATTTTTTTTAG
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* *
153748 TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAA
130 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA--T-TT-AT-TT-CAAA
* * * * ** * * *
153800 AATTAAAAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACTGAATTAGTTTAAATAATTATGACT-
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * *
153864 TTGTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTG
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* ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * ** ** * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * ** * ** * ***
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* * * * * *
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* * *** * * * * **
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* * **** *
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* * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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** *
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*
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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*
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* * * * * ** *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * **
148405 ATTCCTAAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACC
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* * * * * * ** * *
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* * * * * * * * * * *
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* *** * ** * * * *
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** * * * *** *
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* * * * * * * *
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* *
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* ** * * * ** * * * **
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*** * * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * * * * * * * *
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376 T-ATATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
* * * * * *
149236 TTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATATTAAT
440 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAA-
* * * * * ** * * * * **
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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*
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* *** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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128 GAAAAAAAAT--TA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
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** * * * ** *
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* * * *
149837 AATAA-ACAAATTTATTAATATTTCAATACTTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATT-TAATT
312 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT-ATT
* * *
149900 TGTATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAATTCATTATAACCTT
376 TATATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * * * * ** * *
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441 TTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATT
* * * * * ***
150030 ATTAATATTTCAAAAGTTAA-T-AGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAATTTAGTTCAAAT
504 AATAATATTTTAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAAAT
* * * * ** *
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* * * * *
150157 AATTGTTTCTA-TTTATACAAGCTTATTTG--TTGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAT
632 AATT-TTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
150219 AATTAATAAGTAG
695 AATTAATAAGTAG
* * * * * *
150232 AAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCCAACAAGTTTACATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 --A-TTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-G
* ** * *
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* * *
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126 TTGAAAA-AAAATTATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * *
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* * * ** *
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*
150554 CTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTCATAAAGCT
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* * *
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* * ** * *
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** * * * *
150870 TTGTTTAGTCACGAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACT-CTAAT
616 TTGTTTA-TCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-TACTAAT
* **
150934 TTATT-ATAATTCAAAAAATTAATAAACAAG
679 TTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAG
* * * * ** * *
150964 AAATTTTAAAAAAATAATTCTATTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAGTACATAAATAATTA
1 --A-TTTAAAAATA-AATT-TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-
* ** * * * * * * *
151029 TCTATTGAAAATAAATACGTCCTTTTATTTTATCGTAAAATAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCT
60 GCTATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT
* * *
151093 TATATGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAA
124 TAT-TGAAA-AAAA-ATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * *
151158 ATAAGTCAATTTATTGAATGAA-TTTAAATAAT-TTAG-CCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAA
185 ATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAAT-ATGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
151220 TCGTTACGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTTT-TGTCATAGAAGCCTATTCAGAATA
248 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAT-TCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * *
151284 AAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA--
311 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATT
* *** * **
151347 T-T-T-ACC----GACCCAA-T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCCAACCTT
376 TATATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* ** * *
151402 TTGTTTTGTTATAAAGTAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTTGAAAAAAAATAATACTAATT
441 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATATAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAA-T
** * * *
151467 TAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCAATTTGCCAAAGTAGTTC
503 TAATAATATTTTAAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTC
*
151532 AAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTTATCATAA
565 AAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTTATCATAA
* *
151597 AATAATTTTTTTAGTTCATAGAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
629 AATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
151662 AAATTAATAAGT-G
694 AAATTAATAAGTAG
* *** * * *
151675 ATTTAGAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTGCAAA
1 ATTTA-AAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGC-TA
* * * * * *
151740 CTTCAAATCAATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTT-TTTTGATACAAGCTTATTT
64 TTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT
* * ** * * **
151804 GGAAAAAAAATTACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAACTAAAAAATAAAT
128 -GAAAAAAAATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
151869 TTATTT-GTCGAACCAGTTCAAATATGTAAGACTATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTAT
191 CTATTTACT-GAACAAGTTCAAATATGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * *
151933 GACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAATT-TTTTAATTCATACTAGCTTATTTGGGATAAAACAA-
255 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* *
151996 ACAAATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATATAA
318 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATATAA
152061 CCAATTTAAATAATTATGACTACTTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCGTT
383 CCAATTTAAATAATTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-GTT
* * * ** * * *
152125 TTGTCATAAAACCAA-TGTTTGTGTTGATATAAGTTTGTTTAGAATAAGGTAAAACTAATCATTA
446 TTGTCATAAAA-CAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTAATA
* * * *
152189 ATATTTTGAAAGTTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AATCTAGTTCAAATAGT
508 ATATTTTAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAATAGT
* * * * ** *
152252 TATA-ACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGCTATGA-CTTTTTGTTCTATTTTAAAA-CA
572 TA-AGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTT-TATCATAAAATAA
* * *
152314 TTTTTTT-G-TCTATACAAGCTTATTTG-GATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAA
634 TTTTTTTAGTTC-ATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
152376 TTAATAAGTAG
697 TTAATAAGTAG
* * * * * *
152387 AAAAATTAAAAATTAAATCTATTTACCCAGCAAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 ---ATTTAAAAA-TAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-G
* * * * *
152452 TTATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
61 CTATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * *
152517 TTCAAAATAAAA-TA-AATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAA
126 TTGAAAA-AAAATTATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * *
152580 TCTATTTACTTAACAAGTTTAAATA-GTCTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAG
190 TCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** *
152644 GACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATA
255 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
* * *
152709 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGA-AA
319 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTAT-ATAA
** * * * * *
152769 CCAATACAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTT
383 CCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * * * *
152832 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAGTAAAAT-ATTCTTAAATTAATA
447 TGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATAC-T-AATTAATA
* * * ** * **
152896 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTGAAAAAATAAATGTGGTTGCCGACCCAGTTCAAATA
508 ATATTTTAAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAAATA
* * * * *
152961 GTTAAGACTGTTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACC-TTTTGTTTAGTCATGAAATA
570 GTTAAGACTATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTTA-TCATAAAATA
* * ** * *
153025 ATTGTTTCAGTTCATA-AATG-TATATTAAAAATAAAATAACT-CTAATTTACTAACATTT-AGA
633 ATTTTTTTAGTTCATACAA-GCT-TATTCGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-A
**
153086 AAATTAATAAACAAG
694 AAATTAAT-AAGTAG
* * *
153101 AAATTTAAAAAAATAATTCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGT
1 --ATTTAAAAATA-AATT-TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTG-
* * * * * * *
153166 CTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTGTCAATTAATAAAAGTTTA
61 CTATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * *
153231 TCTGAAATAAAATGGCATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT
126 T-TGAAAAAAAAT--TA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * * * *
153296 AAGTCAATTTA-TCGAATTAGTTCAAATAAT-TATGGCCGTTT-AAGTAATTATGTATTTCAAAT
187 AAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAAT-ATGTAAGACCATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT
** * * * *
153358 CGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCA-TCATGCAAG-TCCATT-TGAAGT
249 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-TATTCATACAAGCT-TATTCAGAA-T
* * * * * *
153420 AAAATAATACTGATTTATTAATATTTTAAAAATTACTAAGTATGAGATTTAAAAAGTAA--ATAT
310 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT
* ** * * * *
153483 GT-T-TAA-CAA--T---CCAGT-T-CCTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
375 TTATATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
* * * *
153538 TTTGTTCTGTTAT-AAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTTGAAAAAAAATAATACTAA
440 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATATAAGCTTA-TTTG-AATAAAATAATACTAA
* * * ** *
153602 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGCAAT
502 -TTAATAATATTTTAAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGT
* * * * *
153667 TCAAATAGTTATGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGT-TTTATCCT
563 TCAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTTATCAT
* * *
153731 AAAACAATTTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTA
627 AAAATAA-TTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
*
153796 CAAAAATTAAAAAGTAAGCG
691 CAAAAATTAATAAGT-A--G
* * * ** ** * * * *
153816 ATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACTGAATTAGTTTAAATAATTATGACT-TTGTCAACAATTATCT
1 ATTTAAAAA-TAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATT-GCT
*** * * * * * * *
153880 ATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-ACATTCAAGCTTAT
63 ATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTAT
* * *
153944 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATA
127 TGAAAA-AAAAT--TA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
154005 AATTTGTTTACT-AAGCTAGTTCAAAGA-GTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAATTTCAAATC
188 AATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATC
* * * * * * * * *
154067 ATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTTTTGATACAAGCTTATTCA-AA-AAAA
250 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
* * * * * * * * *
154130 -AATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATCAAAAAATAAATT-TGTTTC
314 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTT-
* * * * * * * **
154193 CTA-AACCAGTTCAAATATTTAAT-ACTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACCTT
377 ATATAACCAATTTAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * *
154256 TTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TATTTGAATTCATACT-AGTTTTATTTAGGATAAAATAA-A-
441 TTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGT-TTTG--TTCATA-TAAG-CTTATTT-GAATAAAATAATAC
* * * * **
154317 TGAAGTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT-ATATAA
499 T-AA-TTAATAATATTTTAAAA---ATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCA-AA
* * * * * * * * *
154381 CCAATTTAAATAATTATGACTACTTTAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCGTTT
558 GCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-TT
* * * * * * * * * ** * *
154446 TGTCATAAAACCAATGTTTGT-GTTGATATAAGTTTGTT-TAGAATAAGGTAAAACTAA-TCATT
621 TATCATAAAA-TAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATT
** *
154508 AATATTTTGAAAGTTAATAAG-AG
684 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAG
* * * * * **
154531 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAATCTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTA
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-GCTA
*** * * * ** *
154596 TTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAA-CATT-TTT-T-TGTCTATACAAGCTTAT
64 TTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TC-ATACAAGCTTA-
* * * * * *
154657 TTGGATGAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAG-TAGAAAAATTAAAAAT
126 TT-GA--AAAAAAATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAG-AGATTTAAAAAA
** * * * * *
154720 TAAATCTATTTACCCAGCAAGTTCACATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC
186 TAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
154784 ATTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
250 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
* * * ** * * * *
154849 TAATATTAATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGACATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
314 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA-
* * * * * * * * *
154914 T-GAA-TAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATCATCTATTTCAAATCATTATGAA--TT
378 TATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTT
* * * * ** **
154975 TTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
441 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAA-T
* * * ** *** * *
155040 TATTAATATTTCAAAAATTAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTATGAAACCAATTCAAA
503 TAATAATATTTTAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAAA
* * * * *
155104 TAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATCTT-AAAT-ATTATGATCTTTTT-TTT-TCATAAAA
568 TAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTTATCATAAAA
* * * * * *
155165 CAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATATTCCTAAATTATTAATATTCCAA
631 TAATT-TTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
*
155228 AAATTATTAAGTAAGAG
694 AAATTAATAAGT---AG
* * * * * * * * * *
155245 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTC
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-GCTA
*** * * *
155310 TTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATGAAATAATTG------TT-AT----GCTTATTT
64 TTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT
* * * * * *** *** *
155364 GAGATAAAATAACTCTAGTTTCTTAACATGCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAA
128 GA-A-AAAA-AATTATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTT-AAAAAATAA
* * ** * * * * * * ***
155429 TTGTATTTACCAAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATCTGAATAATGATCTATTTAAAATAAAT
189 ATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * *
155493 ATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTTA-TCCGAAATAAAATA
253 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATA
* * * * * * * *
155557 ATATTACTTTATTAATATTTTAAAATTTTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTAT-T
316 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATAT
* * * * * *
155621 GAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTT-AAGCAATTATATATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTT
381 -AACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTT
* * * ** *
155684 GTTTTGTCATAAAATAATTGCTTTCTATCATACGAG-TCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTT
443 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATATAAGCT-TATTT-GAATAAAATAATACTAA-TT
* * * * *
155748 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-T-TGTT--C--A-CTGAT
504 AATAATATTTTAAAAA-T--TAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAT-TTGCCAAAGCAGTT
* * *
155806 C---TAGTT---ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTCTATTAT
564 CAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTT-TATCAT
* * * * * * * *
155864 AAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCATATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTT
627 AAAATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
*
155929 AAAAATTAATAACTAAGAG
692 AAAAATTAATAAGT---AG
* * * ** * ** * *
155948 ATTTGAAAAATAAATTTGTTTGCCGAAGC-AGTTCAAATAGTTAAAACCATATAAAAAAATTATC
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATT-GC
** * * * * *
156012 TATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATAAAAGTTTA
62 TATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* * * * * * *
156076 TTCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATAAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAAT
126 TT-GAAA-AAAA-ATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * *
156141 GAATC-ACTTTACCGAATTAGTTCAAATAAT-TATGACC-TTCTCAACAACTATCTATTTCAAAT
187 AAATCTA-TTTACTGAACAAGTTCAAAT-ATGTAAGACCATT-TGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
156203 TGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT-TGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAA
249 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* * * *
156267 AATAATACTAATTTCTTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTT
312 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
* * * * * * * * *
156328 ACTA-AACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTA-CAAACTTCAAATCATTATAGCCT
377 A-TATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATAACCT
* * * * * * * * ** * *
156391 TTTATTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTGATGTATGCTTGTTCAAAAAAAATAACACTAATC
440 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAAT-
** * * * * ** * *
156456 TAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAATTC
503 TAATAATATTTTAAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTC
* * * ** *
156521 AAATATTTAAGACTATATGAATAGTTATCTATTTCAAATAATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATA
565 AAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-TTTATCATA
* * * * * ** * *
156585 AAATAAGTACTTTTTAATTCGTACTAGCTTATTTGGGATAAAATAA-ACAAATTTCTTAATATTT
628 AAATAA-T-TTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* *
156649 CAAAACTTAATAAGCAAGAG
691 CAAAAATTAATAAG---TAG
* * * * * * *
156669 ATTTAAAAA-ATAATTCTGTTTA-TATAACTAA-TTTAAATAATTTTGACTATTTTAACAATTAT
1 ATTTAAAAATA-AATT-TATTTACCA-AAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-G
* * * * ** * * * * * * * * * *
156731 CTATTTTAGATCATTATAACCTTTTCATTTATCATAGAACAAATGTTTTTGTTGATATAAGTTTG
61 CTATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * *
156796 TTCGAAATAAGGTAAA--ACTAA-TCATTAATATTTCAAAAGTTAAT-A---AGAGATTTAGAAA
126 TT-GAAA-AA---AAATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAA
* * * * * *
156854 ATAAATCTATTTAC-CAATCTAA-TTTAAATA-GTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAA
185 ATAAATCTATTTACTGAA-C-AAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * ** * * *
156916 ATCATTATGACC-TTTGTTCTATTTTAAAATAATTGATTCTA-TCTATACAAGCTTATT-TGAAT
247 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATTC-ATACAAGCTTATTCAGAAT
* * *
156978 GAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAAATAAATT-
310 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAAT-AATTC
* ** ** * * * * * * *
157041 TGTTTA-CCAAGTAAGTTCACATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG
372 TATTTATATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * **
157105 ATCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTGTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
436 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATAC
* * * * *
157170 TAATTTATTACTATTTTAAAAATTAA-TAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-
499 TAA-TTAATAATATTTTAAAAATTAACT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAG
* * * * *
157233 CAAGTTCAGATAGCCTT-A-TCTATTTGAACTATTATC-ATTTCAAATCATTATGACATTTTAT-
559 C-AGTTCAAATAG--TTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TG
* * * ** *
157294 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
619 TTTATCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
*
157358 TAATATTTCAAAAATTAATAA-TAA
683 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAG
* * *** * *
157382 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-GCTA
* * * * * * *
157447 TCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
64 T-TTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * * * * ** ***
157510 CAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-TATCTA-A--TAATATTCC
128 --GA-AAAAAAATT-ATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-TAGAGATTTAA-A-AAA
* * * * * * *
157571 TAAATGTGTTTGCCATG--CCAGTTCAAATA-GTTAAGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAA
186 TAAATCTATTT-AC-TGAACAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * *
157633 TTATTCTGACCTTTTGTTTAGTCAT-GAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAA
248 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* * * ** * * *
157697 AATAACT-TTAATTTGTTAA-AATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAAAAAT-TAT
312 AATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT
* ** * * * * * * * *
157759 GTT-TACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATATGA
375 -TTATA-TAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * * * *
157823 CCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCAATTCATAAAAGCTTATTGGAAATAAAATAATAT
437 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--GTTCATATAAGCTTATTTG-AATAAAATAATAC
* * * * * ** * *
157887 TACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATCGAAT
499 TA-ATTAATAATATTTTAAAAATT-A-A--CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAG
* * * * * * * * * *
157951 CAGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGAAC-ATTTGTTTT
559 CAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-TTT
* *
158015 ATCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAG-TCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
622 ATCATAAAATAATT-TTTTT-AGTTCATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* *
158077 AGTATTTCAAAAATTCATAAG-AG
684 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAG
* * * * * **
158100 ATTTAAAAAATTAATCTATTTACCAATCCAGTTC--CTA-TT-TGA--A--T-AATTA-T-CTAT
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCTAT
* * * * * *
158154 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGTTTATTG
65 TTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-
* * * * * *
158218 GGGATAAAATAA-TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAA
128 --GA-AAAAAAATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * ** * * * * *
158282 ATTTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAAT-TAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAGTCTTT
189 ATCTATTTACTGAACAAGTTCAAAT-ATGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* *
158346 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCAA-TGTTTCAGTTCATACAAGTTTATTC-GAAATAAAAT
253 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAAT
* * ** * *
158409 AATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTTATTTAAAAAGTGAATT-TGTTTAT
315 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTAT
** * * * * * * *
158473 -TGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TATCAACAATTATCAATTTTAAATCATTATTACCTTT
379 AT-AACCAATTTAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
* * ** * **
158536 TGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-A-TGTTT
442 TGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCA-TATAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATT
* * * * * ** * * * * ** *
158598 ACTGAGCTAGTTCAAATAGTT-A-TAA-CTATTTAAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACC
504 AAT-A-ATATTTTAAA-AATTAACTAAGAGATTTAAA-AA--ATAAA--TCTATTTGCCA-AAGC
* * **** * * * *
158660 TTTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTCGAATT-AAA--GTAAT-A
560 ---AG---T-TC---AAATAGTTAAGACTATTGA-ACAA--TTA-TCTATTTCAAATCGTTATGA
* ** * ** *** * * * ** * * *
158721 -CTAATCTAATAATATTCCA-AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTTGACA
611 CCT--TTTTGT-TTA-T-CATAAAA-TAAT-TTTTTTAG--TT--CATACAAGCTT-ATTCGAAA
* * * * * * *
158784 TGAAACAAT-CGTTTCTATTCATACAAGGTTATTTGGATTAAAA-TAAT-ATTA-
664 TAAAATAATAC---T-AATTTAT-TAA---TATTT-CA--AAAATTAATAAGTAG
** * * * ** * * *
158835 ATTTATTAATGTTTTAACAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAATACATATGTTTACTGAACTAG
1 ATTTA--AA---AATAA-ATTTATTTACCAAACA-AGTT---CA-A-ATA-G-TTA-TG-ACTAT
* * * *
158899 TTCAA-ATAGTCATGACTATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTA
50 TTGAACA-A-T--TG-CTA--T--------------TTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTC
*
158963 ATTAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAA-TATTAATTTATTAAT
94 A-TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTGAA--AAAA-AATTA-TAATTTATTAAT
* * * * ** * ** * * *
159026 ATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAACAAAA-AAAAATGTTTACCAAATAAATTTAAATA-
152 ATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAA-AAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAT
* * * * * * *
159089 GTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
216 G-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** * * *
159154 TTG--CT-TCCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAACAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATT
280 TTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * *
159215 AATACA--AAAAAATTTTAAAAATGAA-TATATTT-TCTGAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTA
344 AATA-AGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTATAT-AACCA-ATTTAAATAATTATGACTA
* * *
159275 TTTGCACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTAT
405 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGT
* * * * * * *
159340 GT-ATAAAAGCATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAACTAATAATTAA
469 -TCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAA-TTAATAATATTTTAAAAA-T--TAACTAA
* * * * ** * * * *
159404 AAGGTTTAAAAAATAAATTTATTTATG-GAGTG-AGTTTAAATAGTTATA-ATTATCTAAATAAT
528 GAGATTTAAAAAATAAATCTA-TT-TGCCAAAGCAGTTCAAATAGTTA-AGACTAT-TGAACAAT
* * * * * * ** *
159466 TATTTATTTCAAAT-TTTCATGATC-TTTTGCTTTGTCTTAGAGCAATTGTTTCTA-TTCATACA
589 TATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTTG-TTTATCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCATACA
* ** * *
159528 AGTTTATTTAAAATAAAACAATACTAATTTGTTAATA-TTCTAAAAATTAA-AAGTTGGAG
651 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-T--AG
* * ** * * * * *
159587 ATTTCAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTCGAACTATAAT-C
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAAC-A-ATTGC
* * * * * **
159650 TATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGCTTT-TATTCATACAAAATTA
62 TATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * *
159714 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAGAAACT
126 TTGAAAA-AAAAT--TA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * * ***
159775 AAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-TGTTC
187 AAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATC
* * * * * * * ** * * * *
159838 -ATATAAGC--TTATTTAG--AGTAAAA-TATTGCTAAAGT-A-ATAA---TATTC-TAA-AAAT
250 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
** * * * * *
159890 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAGTTCGAATAATTAAGA-TTATTAGAA
314 TAATACTA-ATTT-----ATTAA--TATTT-C-AAA--AATT--AATAAGTAAGAGAT-TTA-AA
* * * * * * ** ** ** * * *
159954 TAATTA-TCTATGT-CA-AATC-GTTTTGA-CCTT-TGTTTAGTCAT-AA-AATAAT-TATTTTA
363 AAATAATTCTATTTATATAACCAATTTAAATAATTATGACTA-T-TTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * **** * ** * *
160010 GTTCA-TACAAGC--TT-ATTCAAAATAAAATAATACTATT-TT-AT-TAA-C--A-TTCAA-AA
426 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAATAA
** * * *
160063 AAT--TACTAAGCAAT-A-A-T-T-----TTAA--AA-A-A-TT----AAT---T-TGTTTACCG
491 AATAATACTAATTAATAATATTTTAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCA
* * * *
160104 AA-CAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACC-TTTTG
556 AAGCA-GTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG
* * * * ** * * * *
160167 TTTTATCATAAAACAA-TTGTTCA-TATCATAAAAAATTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTA
619 -TTTATCATAAAATAATTTTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* *
160230 TTAATATTTC-AAAATTGAGAAGTTGGAG
682 TTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T--AG
** * * * * * *
160258 ATTTAAAAAGTAAATCAACTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATG-GTCATTTGAACAATTATC
1 ATTTAAAAA-TAAATTTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATT-GC
* * ** * *
160321 TATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTTGTAAAAAAATTGTTTCT-TATCATATAAGCCTC
62 TATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATACAAG-CT-
*
160385 T-TTGAAATAAAATAATAGTAATTT-TTAA-ATTTTATAAAAATTAATAAG-TAGGAGATTTAAA
124 TATTGAAA-AAAA-ATTA-TAATTTATTAATA-TTT-TAAAAATTAATAAGTTA-GAGATTTAAA
* ** ** * * * * *
160446 AAATAAATATGCTTACCAAACTAGCTT-AAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATATCTTTCA
183 AAATAAATCTATTTACTGAACAAG-TTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *
160509 AATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-T-TTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
246 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* ** * * * *
160572 AAATAATACTAATCTAACAATATTAT-GAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAGATT-TG
311 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-ATTCTA
* * * * * * * * * *
160635 TTTGCT-GAAGCAATTCAAATAGTTAAG-CATATATGGATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
374 TTT-ATATAACCAATTTAAATAATTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
** * * ** ** *
160698 --TATAAGTTTAAATAG-AATAAAATAATAT-TAAT-TT-AT-TAATATT-TTTAAAATTAATAA
437 CCT-TTTGTTT---T-GTCATAAAACAAT-TGTTTTGTTCATATAAGCTTATTT-GAA-TAA-AA
* * * * * ** ** *
160755 GAA-ATTTAA-AAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAG-TTATAACAATTTGAAT-AAT
493 TAATA-CTAATTAAT-AATAT-TTTA-AAAATTAACT-AA-GAGATT-TAA-AA----AATAAAT
* * * ** * ** * * *
160816 -TATTTGTTTCAAATC-GTT-ATGACCATTTGTTTTGTC-A-T-AA-AACAAT-TGTTTC-CATT
546 CTATTTG--CCAAAGCAGTTCA--A--A-TAGTTAAGACTATTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * ** ** * ** *
160872 GGTA-CATTCTTATTCGAAATAT-AGTAATGCTAATTTATTAATA-TTC-TA-AAAATTAAT--A
604 GTTATGA-CCTT-TTTG-TTTATCA-TAA-AATAATTT-TT-TTAGTTCATACAAGCTTATTCGA
* * * ** ** * * *
160930 AATAATGGATTTAAAAAATGAATTTATTGGCT-TGACCAGTAAAAATAAATATAATTG
662 AATAA---A-AT-AATACT-AATTTATT-AATAT-TTC---AAAAATTAATA-AGTAG
* * * * * * * * * ***
160987 -TTTGAATAAT-TATATATTTTA--AATCATTATGATC--TTTGTTTTGTC-A-CAAAACAATTG
1 ATTT-AAAAATAAATTTA-TTTACCAAACA--A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTG
* ** * * ** * * *
161044 ---TTTC-TATTTATA-GCAGC--TT-ATTTGGAATAACATAATTCTAATT-TATTAATATTCCA
61 CTATTTCAAATCAATATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT--TTCTATTCATA---C-
** * * * ** * * *** * *
161100 AAAATTAAT-AAGTAAGAGATT-TAA-AAACTAA-A-TCTATTTATCGAACAAGTTCA-A-A--T
119 AAGCTTATTGAA--AAAAAATTATAATTTATTAATATTTTAAAAAT-TAATAAGTT-AGAGATTT
*** * ** * *** * * * *
161156 -AGTTAT-CA-CTA-TT--TGAACAA-TT-ACCTATTTCAA-ATTGTTAT-AAC-CTTTTGTTTT
180 AAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATGT-AAGACCATT-TGAACAATTATCTATT
* * * * * *
161210 GTCATAA----AAT-A-ATTTT-TTCTAT-TCATACAAGC--TTATTTCAATT-A-A-AA--TAA
243 -TCA-AATCGTTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATA-AAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA
** * * ** ** * *
161260 TTCA-AATTTATTAATATTCAGA-CAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAA-ATCTG-TTT
302 TTCAGAATAAAATAATACT-A-ATTTATTAATATTTCAAAA-A-TTAATAAGTAAGA---GATTT
** ** * ** * * *
161320 ATTAAATAAATTC-AAATAGTA-AAGACTGTTTGAACA-AATT-T--TTATTT-CA-AATTGT-T
360 AAAAAAT-AATTCTATTTA-TATAA-CCAATTT-AA-ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
*** ** * ** * * * *
161376 GAGTTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC--TT-ATTTGAATTAAAAT
420 -A-TTTCAAATCAT-T-AT-AACCTTTTG-TTTTG-TCATA-AAACAATTGTTTTG--TTCATAT
* * * * * * * ***
161437 AA---TATAT--ATATAAT--TAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAA-TAAAT-A-TG-TTTATCGA
475 AAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTAATAATATTTTAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * *** * * * *
161490 ACAAGTTCAAATAATCATAA-CTA-TTTAAATAATT-A-TCTATTTCAA-ATCATTATGACCTTT
540 ATAA-ATCTATTTGCCA-AAGC-AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACA--ATTAT---C---
* ** ** * *** * * * *
161550 TATTTC--ATC-ATAAAACAACTGTGTCAGTTCAT-ATAGGCTTATTAATTTATTAATTTAT-TA
593 TATTTCAAATCGTTATGAC--CT-T-TTTGTTTATCATAAAATAATT--TTT-TTAGTTCATACA
* * * *** * * * *** * **
161610 A---TATTC-CAA-AAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATTTGTTTACTGAACAAG
651 AGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTA-TTAATATTTCAA--AAATTAAT-AAGTAG
* * ** * * *
161667 -TTT--AAAT--AGTTA-TGA--TTA---TTTGAACA-A-TTAT--CCATTT---CAA-----A-
1 ATTTAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCTAT
* * * * *
161708 -TC--GT---TACGACCTTTAGTTTTTTC-TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTTTTTT
65 TTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGC--TTATT
* * * * * *
161766 GAATAAAGAAA-TATAAATATGTTAATATTCTAAAAAATAATAATTTA-AAATTTAAAAAATAAA
128 GAA-AAA-AAATTAT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * **
161829 TTTGTTTTCTGAACACA-TTTAAATA-GTTATATGACTATTTGAATAATTATCAATGTCAAATAA
190 TCTATTTACTGAACA-AGTTCAAATATG-TA-A-GACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * *
161892 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTTTTTTCATATAAGCATATTCAAAATAAA
251 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG---TTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAA
* * * * * * * * *
161957 ATAAAACTAATTTGTTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTA
313 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA
* * * * * * *
162022 TCA-AA-CAAGTTTAAATATTTAGGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCT
378 T-ATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCT
* * * * *
162084 TTGGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGTTTATTTTGGAATAAAATAATACTAA
440 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATATAAGCTTA-TTT-GAATAAAATAATACTAA
* * * *
162149 TTTATTAATATTCTAAAAATTAA-TAGGTGGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAA
502 -TTAATAATATTTTAAAAATTAACTA----AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-A
* * * * * * *
162212 GTTCAAATAATCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTTC
561 GTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTTATC
* * ** ** *
162276 ACAAAACAATTGTTTTT-GTTCATGA-AAAATTATTTAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA
625 ATAAAATAATT-TTTTTAGTTCAT-ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * *
162339 TTTTTAAAACTAATAAG-AA
688 TTTCAAAAATTAATAAGTAG
* ** *
162358 ATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAAA-ATAGTTCAAATTAGTTATGACTATTTGGACAAATA
1 A-TTT-AAAAATAAATTTATTTA-CCAAACA-AGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAAC-AAT-
* * * ** *
162422 T-CTATCTCAAATCATTATGA--TATTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTTTTCATA-AAGC
59 TGCTATTTCAAATCAATATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * ** ** *
162483 TGATTTAGATTAAAATAA-TACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGCTAAGTAAGAGATTTAAA
123 TTA-TT-GA--AAAAAAATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAA
* * * ** ** * * * * *
162547 AAATAAATGTGTTTGCCAAACTCGTTTAAATAAT-TAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAA
183 AAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAAT-ATGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
162611 ATCATTCTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATACAAG-TCTATTTAGAAC
247 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCT-TATTCAGAAT
** * * *
162675 AAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAAATAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AATATCT
310 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAT-TCT
** * * *
162738 ATTTATCGAA-TAAGTTCAAATATATT-TGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAGTCATTAT
373 ATTTATATAACCAA-TTTAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTAT
* * * * ***
162800 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCACAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATA
435 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATATAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATA
* * * * * *
162865 CTACTTTATTAATATTTCAAAAAATTAAAAAGC-AAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCCAA
498 CTA-ATTAATAATATTT-TAAAAATT---AA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAA
* * * * * * * * * * *
162929 ACCAATTCCAATAATTATA-ACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGT-T
557 AGCAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGT
* * * *
162992 TTCTCATAAAATAACTGTTTTTGAG--CATA-ATAGCTTATT-TAGATAAAAATAATACTAATTT
620 TTATCATAAAATAA-T-TTTTTTAGTTCATACA-AGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTT
*
163053 AATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AG
681 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAG
* ** * * * * * *
163079 ATTTAAAAAATAAATGTATTTACTGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATTAGAATAATTATCTA
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-GCTA
* * * * *
163144 TTTCAAATTATTTTGACCTTTT-TATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAT
64 TTTCAAATCAATATGACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* ** *
163208 TCAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-CATGAGATTTGAAAAA
127 T--GAA-AAAA-AATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTA-GAGATTT-AAAAA
* * * * * * * *
163271 ATAAATCTATCTACTGAATAAGTTTAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAAA
185 ATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
163335 CATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAA
249 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAA
* * * * *
163400 ATAATACTACTTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAATAATAAATC-AGTTT
313 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTT
** ** * * * * *
163464 ATCGAATTAATTCAAATAATTATGGCCATTTG-ACTAATTAACTATTTCAAATCATTATTACCTT
377 ATATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * * **
163528 TT-TTTTGGTCATAAAACAATTATTTT-TCAACACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
441 TTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTGT--TCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** *
163591 TTTATTAGT-TTTTCAAACATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTTCTGAACCAGTTC
502 -TTAATAATATTTT-AAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTC
* * * * * *
163654 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACC-TTTTGTTTTATCACA
565 AAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-TTTATCATA
* * * * * * * * *
163718 AAACAATTGTGTCT-GGTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTGATTCAGTAATA-TTC
628 AAATAATT-TTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
*
163781 TAACAATTAATAACAAAG-AG
692 -AAAAATTAAT----AAGTAG
** * * * * * * * * * **
163801 ATTTAAAAAATAAATCCATCTATCGAATCAA-TTCAAACAATTAAGACTGTATGAATAATTATTT
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-GCT
* *** * * * *
163865 ATTTTAAATTTTTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAATAATTGTTTC-AGCTCATAAAAGCTTAT
63 ATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT
* * * *
163929 TCGGAATAGAATAAA-TCTAATTCATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAAA
127 T--GAA-A-AA-AAATTATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTA-AAAAA
* * ** * ** *
163989 -AATTCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAAT-TATA-ACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
186 TAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAAT-ATGTA-AGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * ** * *
164051 TGTTATTACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTCAATATAATTTTGTT-TGAAATA
249 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TC-ATACAAGCTTATTCAG-AATA
* *
164114 AAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATT-TG
311 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCT-
* *** * * *
164177 CTTGCCA-AA--ATATTTCAAATAGTTTTGAC--TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATA
373 ATTTATATAACCA-ATTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * *** ** ** **
164237 ACCTTTT-ATTTG----AATAGTTTTG-ACTGTTCATACT-ATTTTATTCAAAATAAAATAATAC
436 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATA-TAAGCTTATT-TGAATAAAATAATAC
** * * *
164295 TAATTTAATAATATTCCAAAACTTAA-TAACCAAGATAATTAAAAAATAAATCTAATTG-CAAA-
499 TAA-TTAATAATATTTTAAAAATTAACTAA--GAGAT--TTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAG
** *
164357 CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCT-TT
559 C-AGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TGTT
* * * * * * * *
164421 TGTCATAGAACAATTGTTTT-GTTCATATACA-CTTATTTGGATTAAAATAATACT-A---A-TA
621 TATCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACA-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *
164479 ATATTTTAAAAATTAATAAATAAAAG
685 ATATTTCAAAAATTAATAAGT---AG
* * * * ** * * *
164505 ATTTAAAAAATAATTTTATTTACTAAATC-AGTTCGAATGGTTAAAACTATTGGAATAATT-ATA
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCTA
* ** * * * * * * *
164568 TATTGTAAATCGTTCTAACCTTTAGCTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAT
64 T-TT-CAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-
* * * * **
164633 TTAGAATAAATTAA-TACTAATTTATTAACA-TTCAAATATTAATAAGAAAGAGATTTAAAATAA
126 TT-GAA-AAA-AAATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAA-AA
* ** * ** ** * * * *
164696 TAAATCTGTTTACCAAACAA-TTTAAATA-GTTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATT
186 TAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
164759 GTTATAACCTTTTGATTTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGA-AATAAA
250 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAA
* ** * *
164823 ATAATACTAAGTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTA
313 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA
** * * * * * * * * * *
164888 CTA-AATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATCTAAACGATTATCTACTACAAATCATTATGACGTT
378 -TATAACCAATTTAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * *
164951 TTGTTTTGTCAT-AAACTAATTATTTTTTATCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
441 TTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTGT-TCATATAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAA-
* * ** * * *
165015 TTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAATCAAT
502 TTAATAATATTTTAAAAATTAACTAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGT
* * * * * * ** * *
165079 TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAATTTGTTA--AAATATTTGTTTTGTCA
563 TCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-TTTATCA
* ** * * * *
165142 TAAAA-AATTGTTTTT-TTATCGCAGAAGCTTATTCG-ATTAAAAATAATACTCATTTAATAATA
626 TAAAATAATT-TTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA
165204 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG
688 TTTCAAAAATTAATAAGT---AG
* * * * * * *
165227 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGACCTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATATTTAGAAT
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-T-----TA-T-GACTATTT-GAAC
* * * * ** * *
165292 AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTCTTGTTTAATCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTAC
56 AATT-GCTATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATAC
* * ** *
165356 AAGCTTATTTGAAATAAAATTATCCAAATTTATTAACA-TTTAGAAAATTAATAAGCAAAAGATT
119 AAGCTTA-TTGAAAAAAAATTAT---AATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTTAGAGATT
* * ** * *
165420 TGAAAAAATAAATCTGTTTACTG-ACTAAGTTAAAATA-GTTATTACTATTTGAATAATTAT-TC
179 T-AAAAAATAAATCTATTTACTGAAC-AAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCT-
* * * * * * *
165482 ATTTAAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGAT-ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTAT
240 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTAT
* * *
165546 TCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCCAAAATT-A-AA--AA-A-A--T-----A-A
303 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
165597 ATT-TGTTTACTA-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCAC
368 ATTCTATTTA-TATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * *
165660 TATGACCTTTTGTTCTG-CTACAAAATAATTGTTTAAGTTCATACAAACTTACTTGAAATAAAAT
432 TATAACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATTTG-AATAAAAT
* * * * * **** *
165724 AATACTAATTATTAATATTTCAAAATTTAA-TAAGTGATTTAAAAAATGAATCT-TTTATTGAAT
494 AATACTAATTAATAATATTTTAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAG
* * * * * * * * * * *
165787 CACTTCAAATAATTATGTCCATTTCAATAGTTATTTATTTTAAATCGTTATTACC-TTTTGTTTG
559 CAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTGTTT-
* * * * * * * *
165851 GTCATATAACAATTTTTTT--TTCATACAAGTTTATTC-AGGATAAAATAGTATTAATTCATTAA
622 ATCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
165913 TCTCTCAAATATTAATAAG-AG
686 TATTTCAAAAATTAATAAGTAG
* * * * * *
165934 ATTTAAAAAATAAA-CTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAGTTG-TAT
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCTAT
*** * * * ** *
165997 ACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTTCTATTCATACAAG-TTAAT
65 --TTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-AT
* * * * * *
166061 TCGAAATAAAATAGTACTAATCTAATAA-A-ATTAAAAA--AGTAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
127 T-GAAA-AAAA-ATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-
* * * * *
166121 AAATTTGTTTGCTGAACCAA-TTCAAATA-GCTAAGA-C-TATGAGCAATTATCTATTTCAAATC
187 AAATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
166182 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTAAACTT-ATAGAAGCTTATTCAGAATAG
250 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--A-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* * * *
166245 AATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATCT-ATAAGTAAGTGATTTAGAAAATAATT-TTTT
312 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATT
** * * * * *
166308 TATCGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATTACTT
376 TATATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAAC-C
* * * * * *
166372 TTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTTTGGTAATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATATTACTAA
439 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATATAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAA
* * * * * ** ** * *
166437 TTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAAATATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTAACAAACCATT
502 -TTAATAATATTTTAAAAATTAA-C--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGT
* * * * ** * *
166501 TCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGA-CTTTTTGTTTTGTTA
563 TCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-TTTATCA
* * * * * *
166565 TAAAACAATAGTTCTT-GTTCATATAAGCTTATTC-AGATTGAAATAATACTAATTTATTAATAT
626 TAAAATAAT-TTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * *
166628 TTTGACAATTAATAAGTAAAAA
689 TTCAAAAATTAATAAGT---AG
* * * * ** * * * *
166650 ATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGACCAAATAGTCATGATTA-TTGAAATAATTATCT
1 A-TTTAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATT-GCT
* * * * * * * * *
166714 ATTTTAATTCATTATGATCTTTT-TTTATAT-ACTAAAAAAATTATTTC-AGTTCATATAAACTT
63 ATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTT-TGTCA-TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT
* * * * * * *
166776 ATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTGTTAATATTCTGAAAATTAATAA-TTAAAAGATTTTAAAA
125 A-TTGAAA-AAAA-ATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTT-AGAGATTTAAAAA
** * * * * * *
166840 ACGATTATATTTA-TTAGACAAGTTTC-AATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAA
185 ATAAATCTATTTACTGA-ACAAG-TTCAAAT-ATGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * ** * *
166902 A-CACTATAATCTTTTGCTTTGTCATTAAATGAATT-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTA-AA
247 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAGAA
* * * *
166964 TAAAATAATACAAATCTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATC
309 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTC
* * * * ** * ** *
167026 TAGTTACCA-AA-TAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTT
372 TATTTA-TATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
167089 TGA-CTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAT-ATTAAAATA
434 TAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATT--TGAATAAAATA
* * * * * * * * * *
167152 ATATTTATTTATTAATATTTCAATAATTAA-TAAGTAAAATTTTTTTAAAAATAAATATGTTTAC
495 ATA-CTAATTAATAATATTTTAAAAATTAACTAAG--AGA---TTTAAAAAATAAATCTATTTGC
* * * * * * * * *
167216 CGAA-CAAGTTTAAACAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACC-TTT
554 CAAAGC-AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * * * *
167279 TGTTT-TGTATTAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCAATT
617 TGTTTAT-CA-TAAAATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT
167343 TATTAATATTTCAAAAATTAA-AGAGTAAGAG
680 TATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGT---AG
* * * * * * *
167374 AATTATAAAAAT-GATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG-T-T-A-TATGTAAAAAAAT-CTA
1 -ATT-TAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCTA
* * * ** * * *
167433 TTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATT
64 TTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-T
* * * * * *
167497 TCCAATAAAATAA-TATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTTAAAAATA
127 T-GAA-AAAA-AATTAT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
167560 AATCTGTTTTCTAAATTC-A-TTTAAATA-GTTATGACTATTTGAACAAATT-TCTATTTTAAAT
188 AATCTATTTACTGAA--CAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
167621 CATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTGAAACAAGTTTATTC-GAAATAA
249 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAA
* * * * * *
167685 AATAATACTAATTTATTAATA-CTAAAAAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
312 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
* ** * * * * * * * * * * * * *
167749 ACCA-GGCGAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATCATTTATTTCAAGTCGTTATGATCTT
377 A-TATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * ** * * *
167813 TTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTTGGAATAAAATAATAATAATT
441 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAA-T
** ** * * * * * * *
167878 TTTTTTTACTCTAAAAATTAA-TAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTACTAAA-CAAGT
503 TAATAATATTTTAAAAATTAACTAA---G-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AGT
* * * * * * * * * * *
167941 TCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATTGTTAAGA-CATTTTGTTTTGTCT
563 TCAAATAGTTAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTG-TTTATCA
* * ** ** *
168005 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTGCTC-ATAATAAAATAATACTAATTTATTACTAT
626 TAAAATAATT-TTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
168068 TTCAAAAATTAATAAG-AC
689 TTCAAAAATTAATAAGTAG
* * *** * * *
168086 ATTTAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATG-T
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T-TGCT
** ** * * * * *
168150 ATCACAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTTTAGTCATACAAG-TTCAT
63 ATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-AT
* * * * * * *
168213 TCTAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG-TA-AGAATTAAAAAATG
127 T-GAA--AAAAAATTA-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATA
** * * * *
168276 AATGC-ATTTACCAAACCAA-TACAAATA-GTTAAGACTATTAGAACAAGTATCTATTTCAAATC
188 AAT-CTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATATG-TAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
168338 GTTCT-AGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACATGCTTAATCAAAATAAA
250 GTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAA
** * * * *
168402 ATAATACTAAACTATGAAAATTT-AGAAAATTAATAAG--A-A-ATTAAAAAAAATAAATT-TGT
313 ATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAAT-AATTCTAT
* * * * *
168461 TTACTA-AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAAC
375 TTA-TATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * **** * * *
168524 CTTTTATTTTTTTCATAAAACATTTGTACCAATTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATT
438 CTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGTTCATATAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACT
* * * * * ** * *
168589 ACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAACATAAATCAATTTATCGAATC
500 A-ATTAATAATATTTTAAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTGCCAAAGC
* * * * * * * * * * ** *
168654 AATTCAAATAATTATGGCCATTTAAGCAATTGTTTATTTTAAATCATTATGAAATTTTCT-TTTT
560 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TGTTTA
* * * * * *
168718 TCATAAAACAATTATTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATGCTAGTTTATTAA
623 TCATAAAATAATT-TTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *
168781 TATTTTAAAAATAAATAAGTAGGAG
686 TATTTCAAAAATTAATAAGT---AG
* * * * **
168806 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTA
1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-GCTA
* * * * * *
168871 TTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC
64 TTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-
* ** * * * * * * *
168936 AAAATATAAGAATGCTAATGTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGTGATTTAAAAAATAAA
128 GAAA-A-AA-AATTATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
169001 TTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATA-GTTAA-AGCTATATGAACAATTCT-TAATTTCAAATCGT
190 TCTATTTACTGAACAAGTTCAAATATG-TAAGA-CCATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGT
* * * * *
169063 TATGACATTTTGTTCTGTCATAAAATAAATT-TTTTAGTTCTTACTAA-CTTATTCAAAATAAAA
252 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTA-TTCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAA
* * * * * * *
169126 TAAAACAAATTTATTAGTA-CTCAAAAAATTAATCAA-TAAGAAATTTGAAAAA-AATACTGA-T
314 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT-ATT
** * * * *
169187 TATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
376 TATATAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * ** *
169252 TTGTTTTGTCATAAAACAACTAT-TTTTGTTCAAATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAAT
441 TTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTTGTTCATATAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAA-
* * * * * * * *
169316 TTATTAACATTTTGAAAATTAA-TAAGAGAATTAAAAAATAAA--TATTTACTAAAACAGTT-TA
502 TTAATAATATTTTAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAA
* * ** * *
169377 ATAAGTTATA-ACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGACCATTTATATTGT-T-AT
567 AT-AGTTA-AGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTTGTT-TATCAT
* * * * * *
169439 TAAATAATTGTTTCTA-TTTATAC-AGTCTTATTC-AGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAA-AA
627 AAAATAATT-TTTTTAGTTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
169500 TTCTAAAAATTATTAAGTAATG
689 TTC-AAAAATTAATAAGT-A-G
* * * ** *** * *
169522 AATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACTAA-TGCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-AT
1 -ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCT
* * * ** * * * * ** *
169585 TTGATTCAAATCATTATAACC-TTTGTTTCATCACAAAACAATTGTTTTTGTTTGTGCAAGCTTA
63 AT--TTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* *
169649 TTCGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAGTTAATAGGTAATAGATAATAGATTT
126 TT-GAAA-AA-A-AATTATAATTTATTAATA-T-T-----TTAA-A---AAT---TAATA-AGTT
* * * * * * *
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** * * * * *
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232 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT-TATTCATAC
* * * *
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295 AAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * * * * *
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358 TTAAAAAATAATTCTATTTATATAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * *
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422 TTCAAATCATTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATATAAGCTTATT-
* * * * **
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* * *** * * * *
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543 AATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * * ** *
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605 TTATGACCTTTTTGTTT-ATCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * *
170221 TAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAG
669 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---AG
* * *** * * * * *
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1 ATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-GCTA
* * * * *
170328 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTTCACACAAGCTTATT
64 TTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTA--
* * ** * *
170393 TTGAATAAAATAA-TATAAATTTATTAATATTTCAAGAATTACCAAG-TAGAAATTTTTAAAAA-
126 TTGAA-AAAA-AATTAT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGA-TTTAAAAAAT
* ** * * * *
170455 AAATCTGTTTTTTGAAC-A-TTCAAATAGTTGT-A-ACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATA
187 AAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATA--TGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
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* ** * * *
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378 T
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TACTGAACAAGTTCAAATATGTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
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AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAG
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*
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CTATTTCAAATAATTAT
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* * * * * *
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* * * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * *** *
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254 AT-TATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * ** *
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318 ATTGT-TTCTGATCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * ** * **
141643 AATTTTGAGTAAGAGATTT-AAAATTTGATCTATTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTA
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* * * * * * * *
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* *
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* * * * * * **
141802 AAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGC-AA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTTTGAA-
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* * * * * * *
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* ** ** *
141928 TGTCATAAACCAATTGT-TTT-TGTTCATACAAGAATATTT-GAAATAAAGTAATACTAATTTAT
127 TGTCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTAT
* * * * * ** *
141990 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAAATTTTAAAAATAAATC-ATTTA-TCGAGCAAGTTCA
189 TAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACT-GAATAA-TTTA
* * * * * * * ** *
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250 AATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * ** *
142117 AATTATTGTTTAT-ATTCATACAAGTTTATTCGGAAT-AAATAATATTAATTTATTAATA-TTCT
314 AACAATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * *
142179 AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATCGTCATG
377 AAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * *** * * * * * *
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* * * * * * *
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66 GTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * * * * *
142469 ATAAAGCAA-TTGTTTCTTTTAATACAAGCTTATTTGGATTAAAAAAAATACTAATTTAATAAAA
131 ATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATA
** * * * * * * *
142533 TTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAATTCAAATAGT
194 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAAT
* * * * * * *
142598 TAAGACTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTATTATTTAGTCATAAAACAATT
256 TATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * *
142662 ATTT-T-ATTTCATACAAGCTTATTCAAAATACAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAT
321 GTTTCTGA--TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* ** * ** * *
142724 TAATGAGCAAAAGATTTTTTAAAA-AAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAGATT-TGACTA-
383 TAAT----AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTAT
* * * * * * * **
142786 TTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGT
442 TTGAACAATTA-CTATTTCAAA-TCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGT
* * * *
142850 TCATAAAAACTTA--TCCAAAATAAAATAATACT
505 TCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
** * ** * * * *
142882 AACCT-ATGAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGGGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTCTGAAC
1 AATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAA-CTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAAC
* * * * * * * * **
142945 CAGTTTAAATAATTATGAATATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA--TATTAATTTT
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCT-TTTGTTTT
* * * * *** *
143008 CTAATAAAACAACTGTT-TTT-TA-TCAAACAAGCTTACCCAG-ATAAAAATAATACTAATTTAA
128 GTCATAAAACAA-T-TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATA-TAATTTAT
** * * * * *
143069 TAATATTCCAAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAGATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCT-A
189 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATT-TAA
* * * ** ** * ** *
143129 ATAGTTAAGATTATTAGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAATCATATAA
251 ATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * *
143194 TAATTGTTTCAGTTCATACAAGGTTATTTGAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAA
316 CAATTGTTTCTGATCATTCAAGATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
143258 AATTAGTAAGCATGAGATTTGAAAAAAATAAATATATTT-GTCCAA-TAAGTACAAATAGTTATG
380 AATTAAT-A--A-GAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACT-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
143321 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAACCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
437 ACTATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT
* * *
143386 TTAGTTCATAAAAGCTTA--TCCA-AAATAAAATA-T
501 TT-GTTCATACAAGCTTATTTGCAGAAAAAAAATACT
* * * * * * * * * ** *
143419 TA-GTACT-TTATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * * * ** ** *
143482 ATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTAACTTTTGTTTTGTC
66 GTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
143547 ATAAAACAATTATTTTTCAA--CATATAAGCTTA-TTCGAAATAAACTAATCTCAATTTATTAAC
131 ATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATAT-AATTTATTAAT
* *
143609 ATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATATATCTATTTACCT-AACT-ATTTCAAATA
193 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-ATCTGTTTA-CTGAA-TAATTT-AAATA
* * * * * * *
143668 GTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCACAAAA-AA
254 ATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * ** * *
143732 TTATTTCT-ATTTATACAAGCTTATCCGTAATAAAATAATACTAATTTAGTAA-AATTCTAAAAA
319 TTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * ** * * * * ** *
143795 TTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAATCTATTTGCCGAACCAGTTCAAATAGCTAAGATTATAAGTA
382 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** * ** * * * * * * * * *
143860 TGATTATTTATTAAAAAAT-TTTATGACCTTTTATTTTGA-CATGAAACAATTATTTTAGCTT-A
447 CAATTA-CTATT-TCAAATCATTATAACTTTTTGTTCT-ATCATAAAATAATTGTTTTTG-TTCA
*
143922 TACAATCTTA-TT-CAGAATAGAATAAA-ACT
508 TACAAGCTTATTTGCAGAA-A-AA-AAATACT
* * * * * * ** * * ** *
143951 AATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTGGAAAATAATTCTATTTATTGAACTA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * *** ** * *
144016 GTTCAAATAATTATAACTAT-TCGAATAATTATCTATTTAAAATCATTGTTATGTTTTGTTCTAT
66 GTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
** * * * *
144080 CATAAAACAATTGT-TTT-TGTTGATATAA-ATT-TGTTAGAAATAAAATGATACTAATTTATTA
130 CATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTAT-TTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTA
** * * * * ** *
144141 ATATTTGGAAAATTAATCAGTAA-AGGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTACTAAACCATTTCAACT
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATAATTT-AAAT
* * * * * * * * * *
144205 AGTTTTGACTATTTGAATAATTAACTGTTTCAAATCACTATAACCTTTTATTTTATCATTAAACA
253 AATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
144270 ATTGATTT-T-ATTCATACTA-TTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAA
318 ATTG-TTTCTGA-TCATTCAAGATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * ** * * * * *
144331 ACTTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTG
380 A---ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* ** * ** * * *
144396 TATGAATGATAATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTCT-TT-TA-CATCAAACAATTGTTTTT
441 TTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTAT-AACTTTT-TGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT
* ** * * *** *
144458 TTTTGTACAAGCTTATTCGAATTCAAATAATACT
503 GTTCATACAAGCTTATTTGCAGAAAAAAAATACT
* * * * * *
144492 AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACC
* * * * * *
144556 AGTTCAAATGGTTAAGACTAT-TAAAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTAG
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* * ** * *
144619 TTATAAAATAATTGT-TTT-GGTTCATACAAACTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAA
129 TCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
** * * ** * *
144682 TATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATA
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATAA-TTTAAATA
* * * * * ** ** *
144747 GTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAATAA
254 ATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * ** *
144812 TTGTTTCAGTTAATACAAGTTTAGAT-GGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTAAAT
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-C-AAA-
* * * * * * * * *
144876 TATTAAATAAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACT-GACTTAATTAAAATAATTATGACTATT
380 AATT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
144940 TGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTT-TAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-A
443 TGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTA-TCATAAAATAATTGTTT-TTGT
* * * *
145003 TCTTACAAGCTTA-TT-CAAAATAAAATAATCCA
505 TCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * *
145035 AATTTATTAACATT-CAACAAATTAACAAGC-AA-AATATTTTAAAAAATAAATCTATTT-ATCG
1 AATTTAATAATATTCCAA-AAATTAATAA-CTAAGAA-A-ATTAAAAAATAAATCTGTTTCCT-G
* * * * * * * * *
145096 AACAAGTTTAAATAGCTATAATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
61 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTT
* * * ** * *
145161 TTGACATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATA-AAACTTTATCAAAAATAAAATAATACTAATTTCT
126 TTGTCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGC-TTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTAT
* * * * ** * *
145224 TAATATTTTGAAACTTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAA
189 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAA
* * ** * * * ** * * * *
145288 ATAGTTACGACTATTGGAACGATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTGTT-TTTTATTATAAAA
251 ATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * ** *
145352 TAATTGTTTC-AATTCATACAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTCAAA
316 CAATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * * *
145416 AATTAATAGGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAGTGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCT
380 AATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * **
145480 ATTTCAGCAAATATTTATTTCAAATCATTATTA-TCTTTTGTT-TGGTTATATAGCAATT-TTTT
440 ATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACT-TTTTGTTCT-ATCATAAAATAATTGTTTT
* * *
145542 T-ATCATACAATCTTATTCG-A-AATAAAATAATACT
502 TGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * * * * * *
145576 AATTTATTATTTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTT-ATCGAATC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCT-GAACC
** * * * * ** * ** *
145640 AGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAATC-TTTCATTTAT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * *
145704 CATAAAA-AAATTATTTTTATTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATTCTAATCTAATAAT
130 CATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAA-TATAATTTATTAAT
* * * * * * * * *
145767 ATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCAGAACCAGTTCAAATAGT
193 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAAT
* * * * * * * *
145832 TAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAGTCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATGAAAC-ATT
256 TATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** * * * * *
145896 TTTTC-AATTCATACCTGCTTATT-AGGAATAAAATAA-AATGAATCTATTAATATCTCAAAAAT
321 GTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCA-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * **
145958 TAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTAACT-AACTAGTTCAAATAATTACAACTATTTGAA
383 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * ** * * * * * *
146022 TAATTATCTATTTTAAATTGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATA
447 CAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACT-TTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATA
* * * * *
146086 TAAGTTTGTTTGAAATAAAAAAAATACT
510 CAAGCTTATTTG-CAGAAAAAAAATACT
* * ** * * * * * *
146114 AATCTACTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTATCT-AACA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAACC
* * * * * * * *
146174 AGTTCTAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTCTA
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTACGACCTTTTGTTTTG
* ** * * ** *
146238 TTATAAAACAA--TAGTTT-TGTTCATACAAGCATAATCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
129 TCATAAAACAATTTA-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * * * * * **
146300 TATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTGAAATTG
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATAA-TTTAAATAA
* * * * * * * *
146365 TCATGACTA-TTCAAGTAATTATCTCTTTCAAATCATTCTGACC--CT-TTTT-TAATAAAATAA
255 TTATGACTATTTCAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * ** ** * *
146425 TTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGATGTAAAATAATTCTAATTTACTAATATTTCAAAAATT
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
146490 AATGAGTAAGATAGTTAAAAAA-AGAA------TACCAAA-TAACTTCAAATAGTTATGAC-A-A
384 AATAAG--AGAT--TTAAAAAATA-AATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
146545 TCAACAATTATCTATTTCAAA--ATATAAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCT
443 TGAACAATTA-CTATTTCAAATCAT-TATA-ACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGT
* * *
146608 TCATGCAAGCTTA-TTCCA-ATAAAATAATA-T
505 TCATACAAGCTTATTTGCAGA-AAAAAAATACT
* * * * * *
146638 AAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAAGTAA-AACATTTAAAAAATAAAT-TGATTT-ATCGA
1 -AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTG-TTTCCT-GA
** * * * * *
146700 ATGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGGCATTTTGTTT
62 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTT
* * * ** * *
146765 TATCATAAAACAATTGT-TTT-TATTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
127 TGTCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * * * * *
146828 AATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTGAAAAACTAAATCTGTTTACTAGACTAGTTCAAAT
190 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACT-GAATAATTTAAAT
* * * * * *
146889 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAAC
253 AATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
146953 AATT-TTT-T--TCAATTCATACTCATTTAGT-AGGAATAAAAGAA-AATGAATCTATTAATATT
317 AATTGTTTCTGATC-ATTCA-A--GA-TTATTCA-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * * * *
147012 TCAAACATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAACAATTATATTTAC-ATAACCA-TGTCAAATAATT
375 TCAAA-A--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA-AACTAGT-TCAAATAGTT
* * ** * * * *
147075 ATGACAATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATT
434 ATGACTATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAAT-AATT
* * * * *
147140 -TTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAAAAAATACT
497 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-CAGAAAAAAAATACT
* * * * * * *
147180 AATCTACTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATGTAT-C-AAAC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATC--TGTTTCCTGAAC
* * * * * * * * *
147239 AAGTTCTAATAGTGAAGACTAT-TTAAGTAATTATTTATATCAAATCATTATGA-CTTCTTGTTT
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTT-TTGTTT
* * ** * * ** *
147302 TGTTATAAAATAA--TAGTTT-TGTTCATACAAGCATAATCGGATTAAAATAATATCAATTTATT
127 TGTCATAAAACAATTTA-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATT
* * * * * * * *
147364 AATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
190 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATAA-TTTAAAT
* * * *
147429 AGTTATGACTA-TTCAAGTAATTATCGATTTCAAATCATTCTAACCATTTT-TTTTAGT-A-AAA
253 AATTATGACTATTTCAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTTT-GTCATAAA
* * * ** ** *
147490 A-AATTGTTTCAGTTCATAT-AAGCTTATTTGATGTTAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
315 ACAATTGTTTCTGATCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
147553 AAATTAATGAGTAAGATAATTAAAAAA-AGCATCTATTTACCAAA-TAAGTTCATATAATTATGA
379 AAATTAATAAG--AGAT--TTAAAAAATA-AATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
147616 CTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAATAATTGTTT
438 CTATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCAT-AAAATAATTGTTT
* * *
147681 CTATTCATACAAGCTTATTTTCA-AATAAAATAATA-T
501 TTGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * * *
147717 AAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCT-AT
1 -AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAA
** * * * * * *
147780 TGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTT
63 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTT
* * **
147845 GTCATAAAACAATTGT-TTT-TATTGATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
128 GTCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * * ** *
147908 ATATTTCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAACTTATTTTGTTTACTAGACTTGTTCAAATA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAATCTGTTTACT-GAATAATTTAAATA
* * * * * * * *
147969 GTTATGATTATCTAAACAATTATCTCTCTT-AAA-CTATTATGA--TCTTGTTTTGTCATAAAAT
254 ATTATGACTATTTCAACAATTATCTAT-TTCAAATC-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** * * *** * * * *
148030 AATTATTTTTGTTTGTACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAA---ATT-A-A--T---AAG
317 AATTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
** * * * * * * * *
148085 TTGGT---A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATCTCAA
382 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* ** * * * * * *
148146 CTATTATCTATTTCAAATCATTATGGCATTTTGTT-TTTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATAC
447 CAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATAC
** *
148210 AAAATTA-TT-CAAAATAAAATAATACT
511 AAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * *
148236 AGTTTATTAA-ATTTCAAAAATTAATAAC--AG--ATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATGAAACC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTG-AACC
* * * *
148295 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTG
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * * * *
148358 ACATAAAACAATTGT-TTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAA
129 TCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAA
** * * * *
148421 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCTAGTTTAAATAA
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGA-ATAATTTAAATAA
* ** ** * * * * *
148486 TTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCAGAAAATAAT
255 TTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * ** * * * * * * *
148551 TGTTTCAGTTCACACATGCTTCTTCGAAATAAAATAGCT-CTAATTTATTAACA-TCCAAAAAAT
320 TGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* ** * ** * * *
148614 TAATAA-ACA-AGAAATGAAAAAAAT-AATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTGTGACTATCTGA
383 TAATAAGAGATTTAAA--AAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * ** * * *
148676 ATAATTATTTATTTAAAATAAATATGGCCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAT-TTCAT
446 ACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT-TTGTTCAT
* * *
148740 AAAAGCTTATCTG-A-AATAAAATAATATT
509 ACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * ** * * * * * * ** * *
148768 ACTTTATTAATTTTTTAAAATTTGATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTT-ATCGAATC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCT-GAACC
* ** * * * * * ** * * *
148832 ATTTCAAATAACTATGGCCATTTGAGCAATTATATATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTAT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
148897 CATAAAACAA-TTGTTT-ACTGTGATA-TAGGTCTATTCAGAATAAAATAATATTAGTATT-TTA
130 CATAAAACAATTTATTTCAAT-TCATACAAGCT-TATTTAGAATAAAATAATA-TAAT-TTATTA
* * * * * **
148958 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAACAAAATCTATTTA-T---CAA--T---GCA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAATCTGTTTACTGAATAATTTAAATAA
* * * * * * * * *
149014 GT-T-CCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATAATCTTTT-TTCTGTTATAAAATAAT
255 TTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
149076 TGTTTCAGTTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
320 TGTTTCTGATCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T
* * * * * * * * * *
149140 CATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAGC-AGTTTAAACAGTTAAGGCCATAT
383 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * ** *
149204 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTTAGTTC
444 GAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT-GTTC
* * *
149268 ATAAAAGCTTA-TT-CGGAATAAAATAATATT
507 ATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * ** * * ** * **
149298 AATTTAGTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGCATATGTTTACC-GAATT
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAACC
* * * * * ** *
149362 AGTTCAAATAATTATGACCT-TGTCAATAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTGG
65 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
149426 TCATATAACAATTGTTTTTTAA--CATTCAAGCTTATTCAGAAT-AAGTAATACTAATTTACTAA
129 TCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * * * ** *
149488 TCTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACTACTCCAAATAG
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAA
* * * * * * * * * *
149553 TTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCAATATAACCTTTTGTTCTATCACAAAATAA
255 TTATGACTATTTCAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * * **
149617 TTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTCAAAAAAAAATAATACTAATCTACCAATATTTCAAAAATT
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T
* * * * * * *
149682 AATAACTAATAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATATTTA-AAGCTATAT
383 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTT
* *** * * *
149746 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCCCTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTTTTT
444 GAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAA-----TTGTTTTT
* * * * *
149811 ACTTCATACTAGCTTATTTG-GGATAAAATAA-ACA
503 -GTTCATACAAGCTTATTTGCAGA-AAAAAAATACT
* * * * * * * * * * * *
149845 AATTTATTAATATTTCAATACTTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTAATTT-GTATAAC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCT-GTTTCCT-GAAC
* * * * * * ** *
149908 CAATTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAATTCATTATAACCTTTTGTTTTA
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * *
149973 TCATAAAACAAATGTT-TTT--ATTGATATAAGTTTGTTCT-GAATAAGGTAAAACTAA-TCATT
129 TCATAAAAC-AAT-TTATTTCAATTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * * * *
150033 AATATTTCAAAAGTTAAT-AG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAATTTAGTTCAAA
190 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA--TAATTTAAA
* * * * * * * * **
150092 TAGTTATGTCTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAA
252 TAATTATGACTATTTCAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * ***
150156 CAATTGTTTCT-ATTTATACAAGCTTATT--TGTTGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
316 CAATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* ** * * *
150218 TAATTAATAAGTAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCCAACAAGTTTACATAGTTATGACT
379 AAATTAATAAG-AG--A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
150283 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
440 ATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACT-TTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT
* *
150347 ATTCATACAAGCTTA-TT-CA-AAATAAAATA--
503 GTTCATACAAGCTTATTTGCAGAAAAAAAATACT
* * ** * ** * * * * * *
150376 AATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAACAA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * * * * * * * *
150441 GTTTAAATAG-TCTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTTTATT
66 GTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * *
150505 ATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
131 ATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* *
150569 TTCAAAACTTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTCATAAAGCTAATAAATCTATCATG
195 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA----TC-T---G----T---T-TA-C-TG
* * * * * * *
150630 AAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTG
241 AA--TAATTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTG
** * * * * *** * * * * *
150693 TTTCATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTCCTAAATTAA
303 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * * *
150758 TAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGGTGTTTGCTGAGCCAATTCAA
368 TAATATTTC-AAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAA
* * ** * * **
150822 ATAGTTA-AACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTT-TAGTCACGAA
428 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTA-TCATAAA
** * *
150885 ATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTA-TT-CA-AAATAAAATAACTCT
491 ATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAAAAAAAAT-A--CT
* * * * * * *
150931 AATTT-ATTATAATTCAAAAAATTAATAAAC-AAGAAATTTTAAAAAAATAATTCTATTTTCTAA
1 AATTTAATAAT-ATTCCAAAAATTAAT-AACTAAGAAA-ATT-AAAAAATAAATCTGTTTCCTGA
* * * * * ** * * * *
150994 ACAAGTTCAAATAGTTATGAGTACATAAATAATTATCTATTGAAAATAAATACGTCCTTTTATTT
62 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTT
* * * * * * * *
151059 TATCGTAAAATAA-TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATAT-GAAATAAAATAATATTATTTTATT
127 TGTCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATT
* * ** *
151122 AATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATGAATTTAAAT
190 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TCTGTTTACTGAAT-AATTTAAAT
* * * * * * *
151187 AATT-T-AGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTACGAA-CTTTTATTTTGTCATAAAA
253 AATTATGA-CTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** ** * *
151249 CAATTGCTTTTTG-TCATAGAAGCCTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
316 CAATTG-TTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * ** *
151313 AATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC----C--G-ACCCA-A--T-T-CCTA
380 AATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
** * * * * * *
151366 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCCAACCTTTTGTTTTGTTATAAAGTAATTGTTTTAGT
441 TTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGT
* * *
151431 TCATATAAACTTATTTG-AAAAAAAATAATACT
505 TCATACAAGCTTATTTGCAGAAAAAA-AATACT
* * * ** * **
151463 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCAATTTGCC-AAAGT
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAACC
* * * * *
151527 AGTTCAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TGTTTA
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGT-TTTG
* * * * * *
151591 TCATAAAATAATTT-TTTTAGTTCATAGAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * * * * *
151654 TATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAGAAAATAAATTTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAG
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAA
* * * * * * *
151715 TTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCAATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
255 TTATGACTATTTCAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * * * * *
151779 TTATTT-TTTTGATACAAGCTTATTTGGAAAA-AAAAT--TACTAATCTAATAATATTCCAAAAA
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTA-TT-CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
** * * * * * *
151840 TTAATAACTAAGAGAACTAAAAAATAAATTTATTT-GTCGAACCAGTTCAAATA-TGTAAGACTA
382 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGT-TATGACTA
* * * * * * * **
151903 TATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAATT-TTTTAA
441 TTTGAACAATT-ACTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAAT-AATTGTTTTTG
* * * *
151967 TTCATACTAGCTTATTTG-GGATAAAACAA-ACA
504 TTCATACAAGCTTATTTGCAGA-AAAAAAATACT
* * * * * * * * * *
151999 AATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT-ATATAACC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCT-GAACC
* * * * **
152063 AATTTAAATAATTATGACTACT-TTAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCGTTTT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTT-GTTTT
* * * * * * ** * *
152127 GTCATAAAACCAATGTT-TGT--GTTGATATAAGTTTGTTTAGAATAAGGTAAAACTAA-TCATT
128 GTCATAAAA-CAAT-TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * * * *
152188 AATATTTT-GAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAATCTAGTTCAAA
190 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA--TAATTTAAA
* * * * * *** * * * * **
152248 TAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAAC
252 TAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *** *
152313 -ATT-TTTTTG-TCTATACAAGCTTATT-TGGATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAC
317 AATTGTTTCTGATC-ATTCAAGATTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * ** * * *
152374 AATTAATAAGTAGAAAAATTAAAAATTAAATCTATTTACCCAGCAAGTTCATATAGTTATGACTA
380 AATTAATAAG-AG---ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
152439 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTAT-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTCT
441 TTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTAT-AACTTTT-TGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT
* *
152502 ATTCATACAAGCTTA-TT-CA-AAATAAAATA--
503 GTTCATACAAGCTTATTTGCAGAAAAAAAATACT
* * ** * ** * * * * * *
152531 AATTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAACAA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * * * * * * * *
152596 GTTTAAATAG-TCTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCTATC
66 GTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * *
152660 ATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
131 ATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * ** *
152724 TTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAACCAATACAAATAGTT
195 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTG-AA-TAATTTAAATAATT
* * * * *
152784 ATGACTATTTGATCAATCATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT
257 ATGACTATTTCAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * ** * * * * *
152847 GTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCGGAGTAAAAT-ATTCTTAAATTAATAATATTTTAAAAATT
321 GTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAAA-T
* * * * ** * * * * **
152910 AATAAGTAAGAGATTGAAAAAATAAATGTGGTTGCCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTGTTAA
383 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * **
152975 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTT-TAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTCA
445 AACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTA-TCATAAAATAATTGTTTTTGTTCA
153039 TA-AA--TGTATATT--A-AAAATAAAATAACTCT
508 TACAAGCT-TAT-TTGCAGAAAA-AAAAT-A--CT
* * * * * * *
153068 AATTTACTAACATT-TAGAAAATTAATAAAC-AAGAAATTTAAAAAAATAATTCTATTTACC-AA
1 AATTTAATAATATTCCA-AAAATTAAT-AACTAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTGTTT-CCTGA
* * * * * * * * *
153130 ACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTT
62 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTT
* * * * * * * * *
153195 TGTCATAAAATAA-TTGTGTCAATTAATAAAAGTTTATCT-GAAATAAAATGGCAT-TACTTTAT
127 TGTCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAAT--AATATAATTTAT
* * ** * *
153257 TAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTA-TCGAATTAGTTCAA
189 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TCTGTTTACT-GAA-TAATTTAA
* ** * * * *
153321 ATAATTATGGCCGTTT-AAGTAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTTGTCATAA
251 ATAATTATGACTATTTCAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * *
153384 AACAATTGCTTTC-CATCATGCAAG-TCCATTTGAAGTAAAATAATACTGATTTATTAATATTTT
314 AACAATTG-TTTCTGATCATTCAAGAT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * *
153447 AAAAATTACTAAGTATGAGATTTAAAAAGTAAATATG-TT--T-AAC-A-ATC---CAG-T-T-C
377 AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
153500 CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTAT-AAATAATTGTTTT
438 CTATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTT
* * *
153564 AGTTCATATAAGCTTATTTTG-AAAAAAAATAATACT
502 TGTTCATACAAGCTTA-TTTGCAGAAAAAA-AATACT
* * * * * *
153600 AATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGCA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * *
153665 ATTCAAATAGTTATGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTATC
66 GTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
153729 CTAAAACAATTTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
131 ATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
** * * * *
153793 TTACAAAAATTAAAAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACTGAATTAGTTTAAATAATT
194 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAATT
** * * *
153858 ATGACT-TTGTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT
257 ATGACTATT-TCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
153922 GTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAA
321 GTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * *
153987 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAGCTAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAAT
386 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
154052 TGCAAATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTTTTGATACAAGC
451 TAC-TATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
*
154117 TTA-TT-CA-AAAAAAAATTCT
515 TTATTTGCAGAAAAAAAATACT
* * * *
154136 AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATCAAAAAATAAATTTGTTTCCTAAACCA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * *
154201 GTTCAAATATTTAAT-ACTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACCTTTTGTTTTGT
66 GTTCAAATAGTT-ATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
154265 CATAAAATAAGTTTATTTGAATTCATACTAGTTTTATTTAGGATAAAATAA-ATGAAGTTATTAA
130 CATAAAACAA-TTTATTTCAATTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATTAA
* * * *
154329 TATTTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA-TATAACCAATTTAAATA
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TCTGTTTACT-GAA-TAATTTAAATA
154393 ATTATGACTACTTT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCGTTTTGTCATAAAAC
254 ATTATGACTA-TTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAA-
* * * * * * * ** * * **
154457 CAA-TGTTTGTGTTGATAT-AAGTTTGTTTAGAATAAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTTTGAA
316 CAATTGTTTCTGATCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * *
154519 AGTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAATCTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
380 AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *** * ** *
154584 AGCAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAA-CATT-TTTTTG-TCTA
445 AACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTC-A
* *
154646 TACAAGCTTATTTGGATG-AAAATAATACT
508 TACAAGCTTATTTGCA-GAAAAAAAATACT
* * * * * * * *
154675 AATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAAATTAAAAATTAAATCTATTTACC-CAGC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAG-AAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAAC
* * * * * * *
154738 AAGTTCACATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTG
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
154803 TCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTACT
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAAT
** * * * *
154867 ATTTTAAAAATTAATAAGTTGGACATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGT
193 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATAA-TTTAAATAAT
* * * * * * *
154932 CATGTCCATTTGAACTATCATCTATTTCAAATCATTATGAA--TTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
256 TATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** *
154995 TGTTTCT-ATTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
320 TGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
155059 AATAATAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTA-TGAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
384 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
155123 AATTTTCTATCTT-AAAT-ATTATGATCTTTTT-TT-T-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
448 AA-TTACTAT-TTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATA
* * *
155183 CAAGCTTA-TT-CAGAGTAAAATATTCCT
510 CAAGCTTATTTGCAGA--AAAAAAATACT
* * * * * * * * * *
155210 AAATTATTAATATTCCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-ATCGAGCT
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCT-GAACC
* * ** *
155274 AGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTCTTTCAAATTGTT-CTGACCTTTTGTTTA
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTAC-GACCTTTTGTTTT
* * * * * *
155337 GTCAT--GA-AA--TAATT--GTT-AT----GCTTATTT-GAGATAAAATAACTCTAGTTTCTTA
128 GTCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGA-ATAAAATAA-TATAATTTATTA
* *** ** * ** * *
155389 ACATGCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAAT-TGTATTTACCAAACAAGTTCAAA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAATCTG--TTTACTGAATAA-TTTAAA
* * * * * * * * * * *
155453 TAGTTATGACTATCTGAATAATGATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAT
252 TAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * * * *
155518 AATTGTTTC-AATTCATAGAAGCTTATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAA
317 AATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * ** * * * *
155582 TTTTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCTA
381 --AT-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
155646 TTT-AAGCAATTATATATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTTC
441 TTTGAA-CAATTA-CTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTG-TTTT
* * *
155709 T-ATCATACGAG-TCTATTTG--GAATAAAATAATATT
502 TGTTCATACAAGCT-TATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * *
155743 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTG-TTCACTG---
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTGTTTC-CTGAAC
* ** * *
155804 -A--TC---TAG-T-T-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTA
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
155860 TTATAAAATAA-TTGTTTCAGTTCATATAAGCATATTT-GAAATAAAATAATGCTAATTTAATAA
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAAT-ATAATTTATTAA
* * * * * * * * *
155923 TATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGCCGAAGCAGTTCAAATAG
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAA
** * ** * * * * * *
155988 TTAAAACCATATAAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA
255 TTATGACTAT-TTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * *
156053 TTTTTTCAGTTCATAAAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATA
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-
* * * ** ** * * *
156118 AAAAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCACTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TCT
383 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTT
* * ** * * * * * **
156182 CAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTT-TGGTCATATAACAATTGTTTTTGAAC
444 GAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCT-ATCATAAAATAATTGTTTTTGTTC
*
156246 ATTCAAGCTTA-TT-CAGAATAAAATAATACT
507 ATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
** * * * * * * * * *
156276 AATTTCTTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACTA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * * * * * *
156337 GTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTA-CAAACTTCAAATCATTA-TAGCCTTTTATTCTA
66 GTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTACGA-CCTTTTGTTTTG
*** * ** * * * * * * *
156400 TCATAAAACAA-TTATTTTTGTTGATGTATGCTTGTTCA-AAAAAAATAACACTAATCTAATAAT
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAAT
** * * * * * *
156463 ATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAATTCAAATATT
193 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAAT
* * * * * * * *
156528 TAAGACTATATGAATAGTTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGT
256 TATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T
** * * * * * * **** * * *
156593 ACTTTTTAATTCGTACTAGCTTATTTGGGATAAAATAA-ACAAATTTCTTAATATTTCAAAACTT
320 TGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
156657 AATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTA-TATAACTAATTTAAATAATTTTGACTATTT
384 AAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * ** * * * *
156721 TAACAATTATCTATTTTAGATCATTATAACCTTTTCATT-TATCATAGAACAAATGTTTTTGTTG
444 GAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAA-CTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTC
*
156785 ATATAAG-TT-TGTT-C-GAAATAAGGTAAA-ACT
507 ATACAAGCTTAT-TTGCAGAAA-AA---AAATACT
* * * * * * * *
156815 AA-TCATTAATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAGAAAATAAATCTATTTACC--AATC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAA-C
* * * * * * * * *
156873 TAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTCTA
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
** * * *
156937 TTTTAAAATAATTGA-TTCTA-TCTATACAAGCTTATTT-GAATGAAAATAATAATAATTTATTA
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTC-ATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAAT-ATAATTTATTA
* * * * * * *
156999 ATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAGTAAGTTCACA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAA-TTTAAA
* * * * * * *
157062 TAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTTTCATAAAAC
252 TAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
157127 AATTGTTTGT-ATTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTTAAA
317 AATTGTTTCTGA-TCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* *
157190 AATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAGATAGCCTTAT--C
380 AATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAG--TTATGAC
* * * * * * * *
157253 TATTTGAACTATTA-TCATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
439 TATTTGAACAATTACT-ATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT
* ** *
157317 ATTCATACAAAATTA-TT-CAAAATAAAATAATACT
503 GTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * *
157351 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAACA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTG-AACC
* * * * *
157411 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTTG
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * * * *
157474 TAATAAAACAATTGT-TTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAA
129 TCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAA
* ** *** * * ** * *
157537 TATTCTAAAAATTAATAA-TATCTA-A--TAATATTCCTAAATGTGTTTGCCATG-CCAGTTCAA
192 TATTTTAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAA-A-AAAT-AATCTGTTT-AC-TGAATAATTTAA
* * * * * * * * * *
157597 ATAGTTAAGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGTTTAGTCAT-GAA
251 ATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * *
157661 TAATTGTTTC-AATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACT-TTAATTTGTTAA-AATTCAA
316 CAATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-A
* * * *
157723 AAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAAAAATTATGTTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTATG
378 AAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
157787 ACTATCTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTT
437 ACTATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT
** * * *
157851 TCAATTCATAAAAGCTTA-TTGGA-AATAAAATAATATT
501 T-TGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * ** * ** * * * ** * *
157888 ACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCAATTT-ATCGAAT
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATA-ACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCT-GAAC
* * * * * * * ** * * * *
157951 CAGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGAACATTTGTTTTA
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* * *
158016 TCATAAAACAATTGTTTTTC-A-TCATACAAG-TCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
129 TCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCT-TATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * * * * **
158078 GTATTTCAAAAA-T--TCA-TAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTAC-CAATCCAGTT-CCT-
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAATCTGTTTACTGAAT-AATTTAAATA
* * *
158136 ATT-TGA--A--T----AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAA
254 ATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * **** *
158192 TTGTTT-TAGTTCATAT-AAGTTTATTGGGGATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA
319 TTGTTTCT-GATCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * ** * * ** *
158255 TTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAATTAAAACTATA
382 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * **
158320 TGAACAATTATCTATTTCAAGTCTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCAA-TGTTTCAGTT
443 TGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAA-TAATTGTTTTTGTT
* *
158384 CATACAAGTTTATTCG-A-AATAAAATAATACT
506 CATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * ** * * * * ** **
158415 AATTTATTAATGTTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTTATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATTGAATTA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * ** *
158480 GTTCAAATAATTATGACCT-TATCAACAATTATCAATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGT
66 GTTCAAATAGTTATGA-CTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
158544 CATATAACAATTGTTTTTGAA--CATTCTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AT-GTTTACTGAG
130 CATAAAACAATT-TATTTCAATTCATAC-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATATAATTTA-TTA-
* * * * * * * ** * *
158604 CTAGTTCAAATAGTT-ATAACTATTTAAACAATTGT-AAACTTCAAATC-GTTATAACCTTTAGT
191 ATATTTTAAA-AATTAATAAGTA---AGA-GATT-TAAAAAAT--AATCTGTT-T-A-C-TGAAT
** * * * * * * * *
158666 TTTGTCATAAAACAATTAT--TTTTGTTGATACAAGCTTATTCGAATT-AAAGT-AATACTAATC
244 AAT-T--T-AAATAATTATGACTAT-TTCA-ACAA--TTA-TCTATTTCAAA-TCATTA-TAACC
** ** * * * ** ** * * * ***** * *
158727 TAATAATAT-TC--CAAA-AATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTTGACATGAA
298 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCT--GATCATT-CAAGAT-TATTCAAAATAAAAT-AA
* * * ** * *
158788 -AC-AATCGT-TT-CTA-TTCATACAAGGTT-ATTTG-GATTAAAATAATATTAATTTATTAATG
357 TACTAAT-TTATTAATATTTCA-A-AA-ATTAATAAGAGATTTAAA-AA-A-TAA---A-T-CTG
* * * * ** * * *** * * *
158846 TTTTAAC-AATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAATACATATGTTTACTGAACTAGTTCAAAT-AG
410 -TTT-ACTAA--ACT-AGTTCAAATAGTTATGACT--ATTTGAACAAT-TACTATTTCAAATCA-
* * *
158908 TCATGACTATTTGAATAGTTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTATTTTGTAATTAAAATA
466 TTATAACT-TTT---T-G-T-TCTA--TCATAA--A--AT-A-----A---TTG-----------
* * * * *
158972 ATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATATT
498 -TT-TTT--GTTCATACAAGCTTATTTGCAGAAAAAAAATACT
* * * * * ** * *
159015 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAACAAAA-AAAAATGTTTACC-AAAT
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAA-AAAATAAATCTGTTT-CCTGAAC
* * * * * * * *
159078 AAATTTAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTG
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
** * * * * *
159143 TCATAAAACAA-TTGCTTC----CATGCAAGTTTATTTTGAATAAAACAATTTAAATTTATTAAT
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATTAAT
** * * * * * * * * *
159203 ATTCCAAAAATTAATACA--AAAAAATTTTAAAAATGAATATATTTTCTGAACATGTTTAAATAG
193 ATTTTAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATA-ATTTAAATAA
*
159266 TTATGACTATTTGC-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAA
255 TTATGACTATTT-CAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * *
159330 TTGTTTCT-ATGTATAAAAGCA-TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAA
319 TTGTTTCTGAT-CATTCAAG-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * ** * * * *
159393 CTAATAATTAAAAGGTTTAAAAAATAAATTTATTTA-TGGAGTGAGTTTAAATAGTTATAATTAT
382 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * ** *
159457 CTAAATAATTATTTATTTCAAAT-TTTCATGA-TCTTTTGCTT-TGTCTTAGAGCAATTGTTTCT
442 TTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATT-ATAACT-TTTTG-TTCTATCATAAAATAATTGTTTTT
* * *
159519 ATTCATACAAGTTTATTT--AAAATAAAACAATACT
503 GTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
** * * ** * * * * **
159553 AATTTGTTAATATTCTAAAAATTAA-AAGTTGGAGATTTCAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * * * *
159617 GTTCAAATAGTCAT-ATCCAT-TCGAACTATAATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTA
66 GTTCAAATAGTTATGA-CTATAT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* ** * ** * *
159680 TCGTAAAACAATTGCTTT-TATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAAT
* * * * ** * * * *
159744 ATTTGAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAGAAACTAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGT
193 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAAT
* *** * * * *
159805 TATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-TGTTCA-TATAAGC--TTATTTAG--AGTAAAA-TA
256 TATGACTATTTCAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAA
* * * * * * ** **
159863 TTG---CT-A-AAGT-AATAATATTC-TAA-AAATTAATAAGAGATTTA--AA-AAAT-AAATGT
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAA---
** ** * * * * * * * * *
159916 GTTTGCTAA-ACCAGTTCGAATAATTAAGAT-TATTAGAATAATTATCTA-TGTCAAATCGTTTT
380 AATTAATAAGA-GA-TT-TAAAAAATAA-ATCTGTT-TACTAA--A-CTAGT-TCAAATAGTTAT
* * * * * ** * * **
159978 GACCTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCA-TACAAGC---TTATTC-AAAATAAAAT
436 GA-C--TATTT-G--A-ACAATTACTATTTCAAATCATTATAA-CTTTTTGTTCTATCATAAAAT
** * * ** ** * *
160038 AATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTACTAAGCAATAATTTTAAAAAATTAATT
493 AATTGT-TTTTGTT--CA-T-ACAAGCTTA-TTTGC-AGAA----AAAAAA-T-ACT
** ** * * * *
160095 TGTTTACCGAACAGGTT-CAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
1 AATTTA-ATAATA--TTCCAAA-AATTAATAACTA--AGAA-AATT----A---AAAA--A-TA-
* ** ** * * * * * * * * * ** *
160158 AACCT-TTTGTTTTATCA--TAAAACAATTGT-TCATATCATAAAAAATTATCCAAAATAAAAT-
48 AATCTGTTTCCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC-TAT-ATGAACAATTAT-CTATTTCAAATC
* ** * * * * * * * *
160218 AATATTACTTTATTAATATT-TCA-AAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGT-AAATCAA-CTT
110 ATTACGACCTT-TT-GTTTTGTCATAAA---ACAA-TT---TATTT--CAATTCATA-CAAGCTT
* * ** ** * * * ** * *
160279 A--TCGAATCAGTTCAA-ATAA-TTA-TGGTCATTTGAACAATTATCTATTTCA-A-ATCATTAT
163 ATTTAGAATAAAAT-AATATAATTTATTAAT-ATTTTAAAAATTA-ATAAGTAAGAGAT--TTAA
* * * * * * * * * * * *
160337 GAACT--TTTGTTT--TG--T--TGTAAAAAAAT-TG--T-TTCTTATCATATAAGCCTCTTTGA
223 AAAATAATCTGTTTACTGAATAATTTAAATAATTATGACTATT-TCAACA-ATTA-TCTATTTCA
* ** ** * * * * * * * ** * * *
160390 AATAAAATAATAGTAATTTTTAAATTTTATAAAAATTAATAAGTAGGAGATT-TAAAAAATAAAT
285 AAT--CAT--TA-TAACCTTT-TGTTTTGTCATAA--AACAA-T---TGTTTCTGATCATTCAAG
** * * *
160454 ATGCTTACCAAACTAGCTTAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATATCTTTCAAATCATT-A
338 ATTATT--CAAA--A---TAAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAA-AATTAA
* ** * * * * * * *
160517 TAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATGTTCATAC-AAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAT-
386 TAA-----GAGATT-T-AAAAAATAA-ATCTGTT--TACTAAAC-TAGTTCA-AAT--AGTTATG
* * ** * ****
160579 ACTAATCT-AACAA-TATTA-TGAAAATGA--ATAACTAAGAGATT-TA--A-AAAATAGATT-T
437 ACT-ATTTGAACAATTACTATTTCAAATCATTATAACTTTTTG-TTCTATCATAAAATA-ATTGT
* * * * * * * * * *
160634 GTTTGCTGA-AGCAATTCAAATAGTTAAGCATATATGGATAATTATCT
499 TTTTGTTCATA-CAA-GC--TTA-TT-TGCAGA-A--AAAAAATA-CT
* ** * * * *** * * *
160681 -ATTTCA-AATCATTATGATATAAGTTTAAATAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTT
1 AATTTAATAAT-ATT-CCA-A-AA-ATT-AATA-ACTAAGA-AA-ATTAAAAAATAAATCTGTTT
** * ** * ** * * ** * *
160744 AAAATTAATAAGAAATTTAAAAATAAATCTG--TTTACCAAACCAGTTCAAT-TAGTT-ATAA-C
57 --CCTGAACCAG----TT-CAAATAGTTATGACTATA-TGAA-CAATT--ATCTATTTCA-AATC
** ** * * * * * * * *
160804 AATTTGAATAATTATTTGTTTCAAATCGTTAT-GACCATTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTT
110 -A-TT-ACGACCT-TTTGTTT----T-GTCATAAAACAATT-TATT-TCAATTCATACAA--GCT
* * ** * * * * * * * *
160866 TCCATTGGTACATTCTTATTCGAA-ATATAGTAATGCTAAT-TTATTAATATTCTAAAAATTAAT
162 T--ATT--TAGAAT-AAAAT--AATATA-ATTTAT--TAATATT-TTAAAAAT-TAATAAGTAAG
* * ** ** * ** * * * * * *
160929 AAATAATGGATTTAAAAAATGAATTTATTGGCTTGACCAGTAAAAATAAATATAATTGTTTGAAT
215 -----A--GATTTAAAAAAT-AATCTGTTTAC-TGAATAATTTAAATAATTATGACTATTTCAAC
* * * * * * *
160994 AATTATATATTTTAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT-ATTTATAG
271 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCAT-T
* *** * * *
161057 C-AGCTTATTTGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
334 CAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
* * * * *
161121 TAAAAACTAAATCTATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTACCTATT
395 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTATT
** * * * *
161185 TCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-
458 TCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTG
* * *
161248 CA-ATTAAAATAATTCA
522 CAGA--AAAAAAATACT
* * * * ** * *
161264 AATTTATTAATATT-CAGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAAT
1 AATTTAATAATATTCCA-AAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAAC
* * * * * * * ** **
161327 AAATTCAAATAGTAAAGACTGTTTGAACAAATT-TTTATTTCAAATTGTT--GAGTTTTTGTTTT
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTT
**
161389 GTCATAAAACAATTGT-TTT-TGTTCATACAAGCTTATTT-GAATTAAAAT-A-AT-A--TA-T-
128 GTCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATATAATTTATTA
* * * * *
161444 ATA---T---AATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAAT
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACT-GAATAA-TTTAAAT
* * * * * * **
161502 AATCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTCATCATAAAACA
253 AATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * *
161567 ACTGTGTCAGTTCATAT-AGGCTTATT---AAT----T--TATTAATTTATTAATATTCCAAAAA
318 ATTGTTTCTGATCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * *
161622 TTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATT
382 TT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * * * * *
161687 TGAACAATTATCCATTTCAAATCGTTACGACCTTTAGTTTTTTC-TAAAATAATTGTTTCTATTC
443 TGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTC
* *
161751 ATACAAGCTTTTTTTG-A-ATAAAGAAATA-T
507 ATACAAGC-TTATTTGCAGA-AAAAAAATACT
* ** * * * * * * *
161780 AAATATGTTAATATTCTAAAAAATAATAATTTA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTGAACA
1 -AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAAC-
* * * * * * **
161844 CA-TTTAAATAGTTATATGACTATTTGAATAATTATCAATGTCAAATAATTATAACCTTTTGTTT
64 CAGTTCAAATAG-T-TATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTT
* * *** * * * * * *
161908 TGTCATAAACCAATTGTTTTTTTTTTCATATAAGCATATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTGTT
127 TGTCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * * * * *
161973 AATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAAGTTTAAA
190 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACT-GAATAA-TTTAAA
* * * * * * * * * *
162037 TATTTAGGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTGGCTTTGTCATAAAA
252 TAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * ***
162101 CAATTGTTT-TTATTCATAAAAGTTTATTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTA
316 CAATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-A
* * * * * * *
162164 AAAATTAATAGGTGGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGTC
378 AAAATTAATA----AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
162229 CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTTCACAAAACAATTGTTTTT
439 TATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT
** *
162293 GTTCATGA-AAAATTATTT--AAAATAAAATAATACT
503 GTTCAT-ACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * *** * * * ** *
162327 AATCTATTAATATT-TTTAAA--ACTAA-TAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAAAA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAA-ATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTG-AAC
* * * * * * *
162388 TAGTTCAAATTAGTTATGACTATTTGGACAAATATCTATCTCAAATCATTATGA--TATTTATTT
64 CAGTTCAAA-TAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCT-TTTGTTT
* * ** * * *
162451 TGTCATAAAGCAA-TTGTTTCTTTTCATA-AAGCTGATTTAGATTAAAATAATACTAATTTAATA
127 TGTCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTA
** ** * * ** **
162514 ATATTCCAAAAATTGCTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTCGTTTAAATA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATA
* ** * * *
162579 ATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
254 ATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * * **
162644 TTATTTCAGTTTATACAAG-TCTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAA
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGAT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * *
162707 ATAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AATATCTATTTA-TCGAA-TAAGTTCAAATA-TATTTGAC
382 TTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTACT-AAACT-AGTTCAAATAGT-TATGAC
* * * * * *
162768 TATTTGAACAATTATTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
439 TATTTGAACAATTA-CTATTTCAAA-TCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTT
* * * * * *
162832 AGTTCACAAAAACTTA--TCCAAAATAAAATAATACT
502 TGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * * * * * *
162867 ACTTTATTAATATTTCAAAAAATTAAAAAGC-AAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCC-AAA
1 AATTTAATAATA-TTCCAAAAATTAATAA-CTAAGAAAATTAAAAAATAAATCT-GTTTCCTGAA
* * * * * * * * * * *
162930 CCAATTCCAATAATTATAACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTT
63 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTT
* * * *
162994 CTCATAAAATAACTGTT-TTT-GA-GCATA-ATAGCTTATTTAG-ATAAAAATAATACTAATTTA
128 GTCATAAAACAA-T-TTATTTCAATTCATACA-AGCTTATTTAGAAT-AAAATAATA-TAATTTA
* * * * * *
163054 ATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACTGAACTAGTTCAA
188 TTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAA
* * ** * * * * *
163115 ATATTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTT-TATTTAGTCATAT
251 ATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT-TTT-GTCATAA
* * * * * *
163179 AATAATTGTTTC-AATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCA
314 AACAATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * *
163242 AAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATCTATCTACTGAA-TAAGTTTAAATAGTTAT
377 AAAAATTAAT-A--A-GAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTAT
* * * * ** * * * * *
163306 GACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAAACATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTATT
436 GACTATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTT
* * * *
163371 TTAGTTCATAAAAGCTTA--TCCAAAATAAAATAATACT
500 TTTGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* ** * * * * * * *
163408 ACTTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATCTAAATAATAAATCAGTTT-ATCGAAT
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAAT-TAAAAAATAAATCTGTTTCCT-GAAC
* * * * * * * **
163471 TAATTCAAATAATTATGGCCATTTG-ACTAATTAACTATTTCAAATCATTATTACCTTTT-TTTT
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTT
* * * *
163534 GGTCATAAAACAATTATTTTTCAA--CACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
128 -GTCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * * * * * *
163597 AGT-TTTTCAAACA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTTCTGAACCAGTTCAAA
190 AATATTTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAA
* * * * ** * *
163657 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCACAAAAC
252 TAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * *
163722 AATTGTGTCTGGTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTGATTCAGTAATA-TTCTAACA
317 AATTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * * * * * * *
163786 ATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATCTATCGAATC-AATTCAAACAATTAAGACTG
381 ATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * ** * * **
163850 TATGAATAATTATTTATTTTAAATTTTTATGACCTTTTGCTT-TATCATAAAATAATTGTTTCAG
441 TTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTG-TTCTATCATAAAATAATTGTTTTTG
* * *
163914 CTCATAAAAGCTTA-TT-CGGAATAGAATAAAT-CT
504 TTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-A-AA-AAATACT
* * * * * * * *
163947 AATTCATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAAA-AATTCTATTTGCC-AAAC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTA-AAAAATAAATCTGTTT-CCTGAAC
* * * * * * ** ** * *
164006 TAGTTCAAATAATTATAACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTATTTTG
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* ** *
164071 TCATAAAACAATTGT-TTT---TGTCAATATAATTTTGTTT-GAAATAAAATAATACTAATTTAT
129 TCATAAAACAATT-TATTTCAAT-TC-ATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTAT
* * * * * * *
164131 TAATA-TTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTGC-CAAAATATTTCA
189 TAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATA-ATTT-A
* * * * *
164194 AATAGTTTTGAC--TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-ATTTG------A
250 AATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * ** * *
164250 ATAGTT-TTGACTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAA
315 ACAATTGTT-TCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * ** * *
164314 AACTTAATAACCAAGATAATTAAAAAATAAATCTAATTGC-AAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT
379 AAATTAATAA--GAGAT--TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * * *
164378 ATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAGAACAATTG-TTTTG
440 ATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTG
* * ** *
164442 TTCATATACA-CTTATTTGGATTAAAATAATACT
504 TTCATACA-AGCTTATTTGCAGAAAAAAAATACT
* * * * * * * * *
164475 AA--TAAT-AT-TT-TAAAAATTAATAAATAA-AAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACTAAATC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACC
* * ** * * * * * *
164534 AGTTCGAATGGTTAAAACTAT-TGGAATAATTATATATTGT-AAATCGTT-CTAACCTTTAGCTT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAACAATTATCTATT-TCAAATCATTAC-GACCTTTTGTTT
* * *
164596 AGTCATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTA
127 TGTCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * ** *
164660 ACA-TTCAAATATTAATAAGAAAGAGATTTAAAATAATAAATCTGTTTACCAAACAATTTAAATA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AAT-AATCTGTTTACTGAATAATTTAAATA
* * * * * * * ** * * * *
164724 GTTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTATTATAAAATAA
254 ATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * * **
164789 TTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGAT-GAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCCTAAAT
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
164853 TAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATC
383 TAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATT
* * * * * * * * * *
164917 TAAACGATTATCTACTACAAATCATTATGACGTTTTGTTTTGTCATAAACTAATTATTTTT-TAT
443 TGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGT-T
*
164981 CATACAAGTTTATTTG-A-AATAAAATAATACT
506 CATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * * * * * * *
165012 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACC-AAATC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTG-TTTCCTGAACC
* * * * * * ** **
165076 AATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAATTTGTTA--AAATATTTGTTTTG
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCT-TTTGTTTTG
* ** ** * * * * *
165139 TCATAAAA-AATTGTTTTTTTA-TCGCAGAAGCTTA-TTCGATTAAAAATAATACTCATTTAATA
129 TCATAAAACAATT-TATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATA-TAATTTATTA
* * * *
165201 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGACCTAGTTCAAATA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGA---A--T--AAT-
* * * * * * **
165266 GTTAAA-ACTATTA-GAATATTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTCTTGTTTAA
247 -TTAAATA--ATTATGACTATTT-CAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * *
165329 TCATAAAATATTTGTTTCAT-ATC-TTACAAGCTTATTTGAAATAAAATTATCCAAATTTATTAA
308 TCATAAAACAATTGTTTC-TGATCATT-CAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
165392 CATTT-AGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACT-GACTAAGTTAAAA
371 TATTTCA-AAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAA
* * * * * * *
165455 TAGTTATTACTATTTGAATAATTATTCATTTAAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGAT-ATAAAA
429 TAGTTATGACTATTTGAACAATTACT-ATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCT-ATCATAAAA
* *** * * *
165519 CAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTA-TT-CAAAATAAAATAATACT
492 TAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
** * * *
165564 AATTTTTTAATATTTCC-AAAA-T--T-A--AA-AAAA-T---AAAT---T-TGTTTACTAAACA
1 AATTTAATAATA-TTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACC
* * * * * * * *
165613 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCACTATGACCTTTTGTTCTG-
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
165677 CTACAAAATAA-TTGTTT-AAGTTCATACAAACTTACTT-GAAATAAAATAATACTAA-TTATTA
130 C-ATAAAACAATTTATTTCAA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * *
165738 ATA-TTTCAAAATT--TAA-TAAGTGATTTAAAAAATGAATCT-TTTATTGAATCACTTCAAATA
191 ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAAT-AATTTAAATA
* * * * * * * * * *
165798 ATTATGTCCATTTCAATAGTTATTTATTTTAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAA
254 ATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * * ** * * * * * *
165863 TT-TTT-TTTTCATACAAGTTTATTCAGGATAAAATAGTATTAATTCATTAATCTCTCAAATATT
319 TTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
165926 AATAAGAGATTTAAAAAATAAA-CTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATA
384 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * ** * * * * ** * * *
165990 GTTGTA-TACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTTCTATTCATACA
449 -AT-TACTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACA
*
166054 AG-TTAATT-C-GAAATAAAATAGTACT
512 AGCTTATTTGCAGAAA-AAAA-A-TACT
* * * * * * *
166079 AATCTAATAAAATT--AAAAA--AGTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTGCTGAACC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAT-AAATCTGTTTCCTGAACC
* * * * *
166139 AATTCAAATAGCTAAGAC--TATGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
166202 CATAAAACAATTT-TTTAAACTT-ATAGAAGCTTATTCAGAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT
130 CATAAAACAATTTATTTCAA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAAT
* * * * * * *
166265 ATTTCAAAAATCT-ATAAGTAAGTGATTTAGAAAATAATTTTTTTA-TCGAACCAATTCAAATAA
193 ATTTTAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATCTGTTTACT-GAA-TAATTTAAATAA
* * * * * *
166328 TTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATTACTTTTTTGTTTTGTCCTAAAACA
255 TTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * ** * *
166392 ATTGTTTTTGGTAATAT-AAGTTTGTTTGAAATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTAAAAAA
318 ATTGTTTCTGATCAT-TCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
166456 TTAATCAGTAAAATATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTAAC-AAACCATTTCAAATAGTTATGACTAT
382 TT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * * *
166519 TTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATAGTTCTTGTT
442 TTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTT
* * *
166584 CATATAAGCTTA-TT-CAGATTGAAATAATACT
506 CATACAAGCTTATTTGCAGA--AAAAAAATACT
* *** * * * *
166615 AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACC-GAAC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAA-TTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAAC
* ** * * * * * * *
166678 TAGACCAAATAGTCATGATTAT-TGAAATAATTATCTATTTTAATTCATTATGATCTTTT-TTTA
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTT-
* * * * * * *
166741 TAT-ACTAAAA-AAATTATTTCAGTTCATATAAACTTATTT-GAAATAAAATAATACTAAGTTGT
127 TGTCA-TAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTAT
* * * * ** * * * * * *
166803 TAATATTCTGAAAATTAATAATTAAAAGATTTTAAAAACGATTATATTTATTAGACA-AGTTTCA
189 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAATCTGTTTACT-GA-ATAATTTAA
* * * * *
166867 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-CACTATAATCTTTTGCTTTGTCATTAAA
251 ATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA-TAAA
** * * * ** * *
166931 TGAATT-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACAAATCTATTAATA-TT-AAG
315 ACAATTGTTTCTGATCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-
* * *
166993 ACAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACCAAA-TAAGTTCAAATCGTTATGA
379 A-AATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * * * * *
167056 CTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTT
438 CTATTTGAACAATTA--CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
167121 CTATTCATACAAGCTTA-TT-CATATTAAAATAATATT
501 TTGTTCATACAAGCTTATTTGCAGA--AAAAAAATACT
* * * * * ** * *
167157 TATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAA-AATTTTTTTAAAAATAAATATGTTTACC-GAA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA--AATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAA
* * * * * * * **
167220 CAAGTTTAAACAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTT
63 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTT
* * *
167285 GT-ATTAAAACAA-TTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACCAATTTATT
128 GTCA-TAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * * * * *
167347 AATATTTCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTATAAAAATGATTTATTTA-TCGAACAAGTTCAA
190 AATATTTTAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTA-AAAAATAATCTGTTTACT-GAATAA-TTTAA
* * ** * * * **
167410 AT-AGT-T-A-TATGT-AA-AAAAATCTATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAA
251 ATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
167469 CAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTC-CAATAAAATAATA-TCAATGTATTAATATTTCA
316 CAATT-GTTTCTGATCATTCAAGATTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA
* * * * *
167531 AAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTTCTAAATTCA-TTTAAATAGTTATGAC
378 AAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * ** *
167595 TATTTGAACAAATTTCTATTTTAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TGTTC
439 TATTTGAAC-AATTACTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGT-TTT
* * * * *
167659 TATTGAAACAAGTTTATTCG-A-AATAAAATAATACT
502 TGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * * ** * * *
167694 AATTTATTAATACT-AAAAAATTAATAGGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAG-GC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAAC
* * * * * * * * * * * *
167756 GAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATCATTTATTTCAAGTCGTTATGATCTTTTGTTTTA
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * **
167821 TCATAAAATAA-TTGTTTCTACTCATACAAGATTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTTTTTTT
129 TCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAAT
* * * * * * * *
167885 ACTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG
193 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAA-TAATCTGTTTACTGAATAA-TTTAAATAA
* * * * * * ** * *
167949 TCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATTGTTA-AGACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAA
255 TTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * *
168013 TTGTTTCT-ATTCATACAAAATTGCTCATAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAAT
319 TTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
168077 TAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAT
383 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* ** * * * * * * *
168142 AATTATGTATCACAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTTTAG-TCATAC
448 AATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT-GTTCATAC
* * * *
168205 AAG-TTCATTCT-AAGTAAAATATTACT
511 AAGCTT-ATT-TGCAGAAAAAAAATACT
* * * * * *
168231 AAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG--AATTAAAAAATGAATGCAT-TTACC-AAAC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAAT-C-TGTTTCCTGAAC
* * * * * *
168292 CAATACAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAAGTATCTATTTCAAATCGTT-CTAGCCTTTTGTTT
64 CAGTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGA-CCTTTTGTTT
* * * * * * * * ** *
168355 AGTCATAAAATAA-TTATTTTAGTTCATACATGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAAACTATGA
127 TGTCATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * *
168419 A-AATTTAGAAAATTAATAAG--A-A-ATTAAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAA
191 ATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAATAA-TTTAAA
* * * * * *
168479 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTATTTTTTTCATAAAA
252 TAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAA
* * ** ** * * * * *
168544 CATTTG-TACCAATTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAA
316 CAATTGTTTCTGA-TCATTCAAGATTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* ** * * * * *
168607 AAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAACATAAATCAATTTATCGAATC-AATTCAAATAATTATGG
379 AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * * * *
168671 CCATTT-AAGCAATTGTTTATTTTAAATCATTATGAAATTTTCT-TT-TTTCATAAAACAATTAT
438 CTATTTGAA-CAATT-ACTATTTCAAATCATTAT-AACTTTT-TGTTCTATCATAAAATAATTGT
** * *
168733 TTTTCATCATACAAGCCTATTTG--GAATAAAATAATGCT
499 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * ** * * * * * *
168771 AGTTTATTAATATTTTAAAAATAAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-GAACC
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-CCTGAACC
* * * * ** * *
168835 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTAT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
168900 CATAAAATAA-TTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATATAAGAATGCTAATGTAATAATA
130 CATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATA
* * * * * * * * *
168964 TTATGAAAATTAATAACTAAGTGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTT
194 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTACTGAA-TAATTTAAATAATT
* * * * * * * * *
169029 A-AAGCTATATGAACAATTCT-TAATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTCTGTCATAAAATAAA
257 ATGA-CTATTTCAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAA
* * * * * *
169092 TT-TTT-TAGTTC-TTACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACAAATTTATTAGTA-CTCAAAA
319 TTGTTTCT-GATCATT-C-AAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * * * * *
169152 AATTAATCAATAAGAAATTT-GAAAA-AAATACTGATTA-TCGAACCAGTTCAAATAATTATGAC
380 AA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
169214 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTTT
439 TATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTT
* * * *
169279 GTTCAAATAAG-TT-TGTT-CAAAATAAAATAATATT
503 GTTCATACAAGCTTAT-TTGCAGAA-AAAA-AATACT
* * *** * * * * *
169313 AATTTATTAACATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGAATTAAAAAATAAA--TATTTACTAAAACA
1 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTCCTGAACCA
* * * * * * * * * *
169372 GTT-TAATAAGTTATAACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGACCATTTATATTGT
66 GTTCAAAT-AGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * *
169436 TATTAAATAA-TTGTTTCTATTTATAC-AGTCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAAA
130 CATAAAACAATTTATTTCAATTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAAT
* * ** * ** *
169499 ATTCTAAAAATTATTAAGTAATGA-ATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACTAATGCAAATAG
193 ATTTTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTAC-TGAATAATTTAAATAA
* * ** *
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* * ** * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * ** * **
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* * * * * * ** * *
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** *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * * ** **
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* * * ** * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * ** * * * **
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* * * * * * *
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* * ** * * **
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** * *
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TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATCTGTTTACTGAATAATTTAAATAATTATGA
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GCAGAAAAAAAATACT
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* * * **
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* * ** *
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* * ** **
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* *
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* * ** ** * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * ** ** *** * * *
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255 CAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAACAAAA-AAAAATATTTACCAAATAAATTTAAATAGTTAT
* * ** *
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* * * * *
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* *** *
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* * * * * *
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*
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TTAATAAGTAAAAGAATTAACAAAAAAAAATATTTACCAAATAAATTTAAATAGTTATAACTATC
TAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCT
Found at i:159885 original size:16 final size:16
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* *
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* * *
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66 ATAAAACAATTGTTTCATATCATAAAAAACTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTT-TTAAATAT
* * * * * *
160237 T-TCAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCA-ACTTATCGAA-TCA
130 TATAAAAATTAAGAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT-ATACTTACCAAACT-A
* *
160288 GTTCAAATAATTATG-GTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTG
1 GTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTG
** * * * ** * *** *
160351 TTGTAAAAAAATTGTTTCTTATCATATAAGCCTCTTTGAAATAAAATAATAGTAATTTTTAAATT
64 TCATAAAACAATTGTTTCATATCATAAAAAACTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTTTAAATA
* *
160416 TTATAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAAACTA
129 TTATAAAAATTAAGAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTA
* * *
160469 GCTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATCTTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGT
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ATAAAAATTAAGAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATACTTACCAAACTA
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* * * ** * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * ** * *
160023 TATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTACTAAGCAA
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* * * *
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1 GAGA-TTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
160139 ATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTCATATCATAAAAAATT
64 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTCATATCATAAAAAACT
* * * * *
160204 ATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTGAGAAGTTG
129 ATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTAAAAATTAAGAAGTAG
* * * * *
160255 GAGATTTAAAAAGTAAATCA-ACTTATCGAA-TCAGTTCAAATAATTATG-GTCATTTGAACAAT
1 GAGATTTAAAAAATAAAT-ATGCTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAAT
** * * *
160317 TATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTTGTAAAAAAATTGTTTCTTATCATATAAG
63 TATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG-TTCATATCATAAAAA
* * *** * *
160381 CCTCTTTGAAATAAAATAATAGTAATTT-TTAAATTTTATAAAAATTAATAAGTAG
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*
160436 GAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAAACTAGCTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
160500 TATCTTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
65 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
160545 TATGTTCATA
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Matches are distributed among these distances:
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GAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTCATATCATAAAAAACTAT
CCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTAAAAATTAAGAAGTAG
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160703 GTTTAAATAG
* **
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* * * * * * * * * * *
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* * * ** **
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* * * * *
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* ** * * ** ** * * * * * *
160952 TTTATTGGCTTG-ACCAGTAAAAATAAATATAATTGTTTGAATAATTATATATTTTAAATCATTA
64 TCTATT-TATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * **
161016 TGATC-TTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTTATAGC-AGCTTATTTGG
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* * * *
161069 AATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * ** *
161134 TATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATAA
66 TATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
*
161199 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
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* * * * *
161250 ATTAAAATAATTCAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * *
161314 CTGTTTATTAAATAAATTCAAATAGTAAAGACTGTTTGAACAAATT-TTTATTTCAAAT--TGT-
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** * *
161375 TGAGTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGA
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* * * *
161429 ATTAAAAT-A-A-T-A--TA-T-ATA--T----AATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
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* ** * * * * *
161545 CCTTTTATTTCATCATAAAACAACTGTGTC-AGTTCATATAGGCTTA-TT--
131 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA
* * * * * *
161593 AAT----T--TATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
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* * * * * **
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* * * *
161767 AATAAAGA-AATA-TAAATATGTTAATA-TTCTAAAAAATAATAATTTAA-A-ATTTAAAAAATA
1 AATAAA-ATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
161827 AATTTGTTT-TCTGAACACA-TTTAAATAGTTATATGACTATTTGAATAATTATCAATGTCAAAT
62 AATCTATTTATC-GAACA-AGTTCAAATAG-T-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
161890 AATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTTTTTTCATATAAGCATA-TTCAA
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* * * * * * *
161951 AATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
162016 TGTTTATCAAACAAGTTTAAATATTTAGGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATG
66 TATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATG
* * * * * **
162080 ATCTTTGGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATAAAAGTTTATTTTGG
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTCA
* **
162133 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTGGGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
162197 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
65 CTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * ** *
162262 ACCTTTTGTTTT-TCACAAAACAATTGTTTT-TGTTCATGA-AAAATTATTTAA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCAT-ACAAGCTTATTTCA
* ** * *
162313 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTTAAAACTAATAAG-AA-A-TTTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
162375 TATTTATTGAAAATAGTTCAAATTAGTTATGACTATTTGGACAAATATCTATCTCAAATCATTAT
66 TATTTATCGAACA-AGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
162440 GA--TATTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTTTTCATA-AAGCTGATTT-A
129 GACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * * **
162490 GATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGCTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * ** * * * * * * * *
162555 GTGTTTGCCAAACTCGTTTAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTA
65 CTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* *
162620 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTTATACAAG-TCTATTT-A
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCT-TATTTCA
* ** * * *
162671 GAACAAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAAATAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-
* * *
162734 ATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAGTCAT
63 ATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCAT
* * * * *
162797 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCACAAAAACTTA-TCCAA
126 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-A
* * * * *
162853 AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAATTAAAAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
162918 CTATTT-TCCAAACCAA-TTCCAATAATTATAACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTA
65 CTATTTAT-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
162981 TGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAACTGTTTTT-GA-GCATA-ATAGCTTATTT-A
128 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTCTATTCATACA-AGCTTATTTCA
* *
163033 GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
163094 GTATTTA-CTGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTT
65 CTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
163158 GACCTTTT-TATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCA
129 GACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * *
163211 GAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
* * * * * *
163275 ATCTATCTA-CTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAAACATT
63 ATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * *
163339 ATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTATTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAA
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* * * *
163394 AATAAAATAATACTACTTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAATAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
163459 -AGTTTATCGAATTAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTG-ACTAATTAACTATTTCAAATCATTA
66 TA-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTA
* * *
163521 TTACCTTTT-TTTTGGTCATAAAACAATTATTTT-TCA-ACACACAAGCTTA-TTCAA
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* * * *
163575 AATAAAATAATACTAATTTATTAGTTTTTCAAACA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * ** *
163636 TATTT-TCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATA
66 TATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * ** *
163700 ACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTGTCTGGTCATACAAGCTTA-GTCAA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-A
* * * * **
163752 AATAAAATAATACTGATTCAGTAATA-TTCTAACAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * **
163816 CCATCTATCGAATCAA-TTCAAACAATTAAGACTGTATGAATAATTATTTATTTTAAATTTTTAT
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* * * * * * *
163880 GACCTTTTGCTTTATCATAAAATAATTGTTTC-AGCTCATAAAAGCTTA-TTCGG
129 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-A
* * *
163933 AATAGAATAA-ATCTAATTCATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAAA-AAT
1 AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAA
** * * * * * * **
163992 TCTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATAACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
64 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * ** * *
164057 TACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T-GTCAATATAATTTTGTTTGA
129 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTC-ATACAAGCTTATTTCA
* *
164110 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * *
164174 TTGCTT-GCCAAAATATTTCAAATAGTTTTGAC--TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
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* * * * ** * * **
164236 AACCTTTT-ATTTG------AATAGTTTTGACTGTTCATACTATTTTA-TTCAA
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* * * ** * *
164282 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGATAATTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * **
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* * * * * **
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* * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
164636 GAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAATATTAATAAGAAAGAGATTTAAAATAATAAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAA
* * * * * * * * * **
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* * * * * * * ** *
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* ** *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * *
164882 TATTTA-CTAA-ATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATCTAAACGATTATCTACTACAAATCATTA
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* * * *
164944 TGACGTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTATTTTTTA-TCATACAAGTTTATTTGA
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*
164998 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * * **
165063 TGCTTACCAAATCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAATTTGTTA--
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** * ** * *
165125 AAATATTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTT-TTTATCGCAGAAGCTTA-TTCG
130 ACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTCA
* * * *
165177 ATTAAAAATAATACTCATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
165242 GTGTTTACCGACCTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATATTTAGAATAATTATCTATTTCAA
65 CTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG-T-----TA-T-GACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAA
* * ** * * *
165307 ATCATTTTGACCTCTTGTTTAATCATAAAA-TATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTTGA
121 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTCA
* * * * * *
165368 AATAAAATTATCCAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * *
165432 TCTGTTTA-CTG-ACTAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTAT-TCATTTAAAATCAT
64 TCTATTTATC-GAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCAT
* * * * * *
165494 TATAACCTTTTCTTTTGAT-ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTA-TTCAA
126 TATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-A
* *
165550 AATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCCAAAATT-A-AA--AA-A-A--T---AAAT---T-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
165600 TGTTTA-CTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCACTATG
66 TATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * * *
165664 ACCTTTTGTTCTG-CTACAAAATAATTGTTT-AAGTTCATACAAACTTACTTGA
130 ACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA
* *
165716 AATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGTGATTTAAAAAATGAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * * * *
165776 T-TTTATTGAATC-ACTTCAAATAATTATGTCCATTTCAATAGTTATTTATTTTAAATCGTTATT
66 TATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
165839 ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTT-T-TTCATACAAGTTTA-TTCA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * * * * * *
165888 GGATAAAATAGTATTAATTCATTAATCTCTC--AAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * ** *
165948 CTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAGTTGTATACTTCAAATTGTTATA
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* * * * *
166013 ACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTTCTATTCATACAAG-TTAATTCGA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-A
* * * * *
166065 AATAAAATAGTACTAATCTAATAA-AATT-AAAAA--AGTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAAT
* * * * * *
166125 TTGTTT-GCTGAACCAA-TTCAAATAGCTAAGACTA--TGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTA
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** *
166186 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTAAACTT-ATAGAAGCTTA-TTCA
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* * * *
166239 GAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATCT-ATAAGTAAGTGATTTAGAAAAT-AA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
166302 TTTTTTTATCGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTT
64 TCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TT
* * * ** * * * * *
166365 ATTACTTTTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTT-TGGTAATATAAGTTTGTTTGA
127 ATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * * * * *
166421 AATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAAATATTTAAAAAGTAAAT-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * * * *
166485 TGCTTAACAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGA
66 TATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * ** * *
166550 CTTTTTGTTTTGTTATAAAACAA-TAGTTCTTGTTCATATAAGCTTA-TTCA
131 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-TATTCATACAAGCTTATTTCA
* * ** * * * *
166600 GATTGAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** * * * * *
166665 ATGTTTACCGAACTAGACCAAATAGTCATGATTA-TTGAAATAATTATCTATTTTAATTCATTAT
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* * * * * * *
166729 GATCTTTT-TTTATAT-ACTAAAAAAATTATTTC-AGTTCATATAAACTTATTTGA
129 GACCTTTTGTTT-TGTCA-TAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA
* * * * * * ** *
166782 AATAAAATAATACTAAGTTGTTAATA-TTCTGAAAATTAATAATTAAAAGATTTTAAAAACGATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
166846 ATATTTAT-TAGACAAGTTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-CACTA
65 CTATTTATCGA-ACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * *
166908 TAATCTTTTGCTTTGTCATTAAATGAA-TTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTA
128 TGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * *
166962 AATAAAATAATACAAATCTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** *
167024 TCTAGTTACCAAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTT
64 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTA
* * *
167089 TGA-CTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA
128 TGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * * * * ** *
167142 TATTAAAATAATATTTATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAATTTTTTTAAAAATAAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
167207 TATGTTTACCGAACAAGTTTAAACAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGT
64 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
167272 GACCTTTTGTTTTGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGA
129 GACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * *
167325 AATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTATAAAAAT-GA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTA-AAAAATAAA
* * ** *
167388 TTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG-T-T-A-TATGT-AA-AAAAATCTATTTCAAAACATTAT
64 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* ** * * * *
167447 GATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTCC
129 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * *
167500 AATAAAATAATA-TCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
167563 CTGTTT-TCTAA-ATTCA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATT-TCTATTTTAAATCAT
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* * * * * * *
167624 TATAACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTGAAACAAGTTTA-TTCGA
126 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-A
* * * *
167680 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTAAAAAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * * *
167744 TGTTTA-CCAGGCGAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATCATTTATTTCAAGTCGTTATG
66 TATTTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * **
167808 ATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTTGG
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * ** * * *
167860 AATAAAATAATAATAATTTTTTTTTA-CTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * **
167923 TTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATTGTTA
64 TCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * ** **
167987 AGACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATT-GCTCA
128 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* *
168040 TAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * ** *
168101 CTCTTTATTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATGTATCACAAATCGTTATG
65 CTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
168166 A-CTTTTGTTTTGTCCTAAAAC-ATTTGTTTTTAGTCATACAAG-TTCA-TTCTA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTC-A
* * * * *
168217 AGTAAAATATTACTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-A-TTAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
168279 GC-ATTTACCAAACCAA-TACAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAGTATCTATTTCAAATCGTTC
65 -CTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
168342 T-AGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACATGCTTA-ATCAA
128 TGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-A
** * * *
168396 AATAAAATAATACTAAACTATGAAAATTT-AGAAAATTAATAAG--A-A-ATTAAAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAA
* * * * * *
168456 TTTGTTTA-CTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTA
64 TCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * * * *
168520 TAACCTTTTATTTTTTTCATAAAAC-ATTTGTACCAATTCATAAAAGCTTATCTGA
128 TGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * * * *
168575 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAACATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAAT
* * * * * * *
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** * * * **
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* * * * *
168757 AATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTTTAAAAATAAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
169119 AATAAAATAAAACAAATTTATTAGTA-CTCAAAAAATTAATCAA-TAAGAAATTT-GAAAA-AAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
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* * * *
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* * **
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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129 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTCA
* * * * *
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1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAA
* ** * * *
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* ** * * ** *
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* * * *
169654 AATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAGTTAATAGGTAATAGATAATAGATTTAAAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAA---AA-A--T--TA-AT-A-AG---T--AAG
* * * *
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* * * * *
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* * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * **
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* * ***
169982 A-CTTTTAGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTAGG
130 ACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * * ** * *
170034 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTATCAATTAATAAGAAAAAGAATTT-AAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * * * *
170098 ATGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTCA-CAATATTTGAATAATTATTTATTTCAAACCGTTATG
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* ** * * * * ** *
170162 GCCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTAT-TAGTTTATATAAATTTATTTGA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA
* * * *
170214 AATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
170279 TATTTA-CTGTACAAATTCAAATATTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
66 TATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * **
170343 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTTCACACAAGCTTATTTTG
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* ** * *
170396 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAGAATTACCAAGT-AGAAATTTTTAAAAA-AAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
170458 TCTGTTTTTTGAAC-A-TTCAAATAGTTGTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAT-AGCTA
64 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA
* * * * *
170520 TGACCTTTTGTTTTGCCATAAACCAATTGTTTT-TGTTCATACAAACTTATTTGA
128 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * ** * *
170574 AATAGAATAATATTAATTTGCTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
*
170639 TATTTATCGAGCAAGCTT-AAATAGTTATGA
66 TATTTATCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGA
170669 TTGTTTAACA
Statistics
Matches: 7632, Mismatches: 1633, Indels: 1025
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
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161 1 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
TATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
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Alignment explanation
Indices: 160713--170668 Score: 5743
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160703 GTTTAAATAG
***
160713 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAG--A-A-ATTT-AAAAATAAATC
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
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* * * * *
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* * *
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* * * * **
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130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT
* *
161264 AATTTATTAATATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAATAA
194 AATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAA
* * * * * * **
161329 ATTCAAATAGTAAAGACTGTTTGAACAAATT-TTTATTTCAAATTGT-TGAGTTTTTGTTTTGTC
258 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTATGACCTTTTGTTTTGTC
161392 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
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* * * *
161429 ATTAAAAT-A-AT-A--TA-T-ATA-T-----AATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATAT
1 AATAAAATAATATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * *
161481 GTTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
66 GTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* ** * * * * * *
161546 CTTTTATTTCATCATAAAACAACTGTGTC-AGTTCATATAGGCTTATT--AAT----T--TATTA
131 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTA
* * * * * * *
161602 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATTTGTTTA-CTGAACAA
195 ATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATAA
* * * * * * * *
161666 GTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCGTTACGACCTTTAGTTTTTTC
258 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
161731 -TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTTTTTTG-
322 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC-TTATTTGA
* * * * *
161767 AATAAAGA-AATATAAATATGTTAATATTCTAAAAAATAATAATTTAA-A-ATTTAAAAAATAAA
1 AATAAA-ATAATAT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
161829 TTTGTTT-TCTGAACACA-TTTAAATAGTTATATGACTATTTGAATAATTATCAATGTCAAATAA
63 TCTGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAG-T-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
161892 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTTTTTTCATATAAGCATATTCAAAATAAA
124 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAA
* * * * * *
161957 ATAAAACTAATTTGTTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTA
186 ATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * * * *
162022 TCAAACAAGTTTAAATATTTAGGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTG
250 TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TATGACCTTTT
* * * * *
162087 GCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGTTTATTTTGG
314 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTTGA
* * **
162133 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTGGGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
162198 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
65 TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * ** *
162263 CCTTTTGTTTT-TCACAAAACAATTGTTTT-TGTTCATGA-AAAATTATTTAAAATAAAATAATA
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCAT-ACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA
* ** * * * *
162325 CTAATCTATTAATATTTTTAAAACTAATAAG--AAA-TTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAAA
192 CTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAA
* * * * *
162387 -ATAGTTCAAATTAGTTATGACTATTTGGACAAATATCTATCTCAAATCAT-TATGA--TATTTA
255 TA-AGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--TGTATGACCT-TTTG
* *
162448 TTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTT-TTCATA-AAGCTGATTT-A
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * **
162490 GATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGCTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** ** * * * * * * *
162555 GTGTTTGCCAAACTCGTTTAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTA
64 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * *
162620 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTTATACAAG-TCTATTTAGAACAAAATAAT
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCT-TATTCA-AATAAAATAAT
** * * * * * *
162683 ACTAATTTATTAGCATTCAAAAAAATAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AATATCTATTTATCGA
191 ACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTATCAA
* * *
162747 ATAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAGTCAT-TATGACCTTTTG
254 ATAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-T--TGTATGACCTTTTG
* * * * ***
162809 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCACAAAAACTTATCCAA
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * * *
162853 AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAATTAAAAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAG
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
162918 CTATTT-TCCAAACCAA-TTCCAATAATTATAACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTA
64 CTGTTTAT-CAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * *
162981 TGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAACTGTTTTT-GA-GCATA-ATAGCTTATTTAGATAAAAAT
127 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTCTATTCATACA-AGCTTATTCAAAT-AAAAT
* * *
163042 AATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTATTTACT
188 AATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-T
* * * * * * *
163103 GAACT-AGTTCAAATATTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTT-
251 CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATT-GTATGACCTTTTG
* * *** *
163166 TATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCA
315 T-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * *
163211 GAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAA
1 -AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * * *
163276 TCTATCTA-CTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAAAAACATTA
63 TCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
163340 TGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTATTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA
127 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA
* * * * * *
163404 TACTACTTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAATAATAAATCAGTTTATCGA
190 TACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * * * * *
163469 ATTAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGACTAATTAACTATTTCAAATCAT-TATTACCTTTT-T
253 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--TGTATGACCTTTTGT
* *** * **
163531 TTTGGTCATAAAACAATTATTTTTCAACACACAAGCTTATTCAA
316 TTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
163575 AATAAAATAATACTAATTTATTAGTTTTTCAAACA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * **
163636 TATTT-TCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATA
65 TGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * * ** *
163700 ACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTGTCTGGTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATAC
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAC
* * * * * ** * *
163765 TGATTCAGTAATATTCTAACAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATCTATCGAAT
193 TAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAT
* * * * * * * * *
163829 CAA-TTCAAACAATTAAGACTGTATGAATAATTATTTATTTTAAATTTTTATGACCTTTTGCTTT
256 -AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TTGTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * * * *
163893 ATCATAAAATAATTGTTTCAGCTCATAAAAGCTTATTCGG
319 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
163933 AATAGAATAAATCTAATTCATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAAA-AATT
1 AATAAAAT-AATATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAAT
* ** * * * * * ** *
163993 CTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATAACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATT
64 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * * ** * *
164058 ACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T-GTCAATATAATTTTGTTTGAAATAAAATAAT
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTC-ATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAAT
* * * * * * **
164121 ACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTGCCAAA
191 ACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA
* * * *
164186 -ATATTTCAAATAGTTTTGAC--TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATAACCTTTT-AT
255 TA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--TGTATGACCTTTTGTT
* * ** * ** **
164246 TTG------AATAGTT-TTGACTGTTCATACTATTTTATTCAA
317 TTGTCATAAAACAATTGTT-TTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * ** * *
164282 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGATAATTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * ** *
164347 TAATT-GCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGA
65 TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * * * ** *
164411 CCTTTTCTTTTGTCATAGAACAATTGTTT-TGTTCATATACA-CTTATTTGGATTAAAATAATAC
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACA-AGCTTA-TTCAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
164474 TAA--TAAT-AT-TTTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAATTTTATTTA-CTAAATC
193 TAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATA
* * ** * * * * * * * *
164534 AGTTCGAATGGTTAAAACTATTGGAATAATTATATATTGT-AAATCGTTCTAACCTTTAGCTTAG
257 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT-TCAAATTG-TATGACCTTTTGTTTTG
***
164598 TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTT-A
320 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * *
164636 GAATAAATTAATACTAATTTATTAACATT-CAAATATTAATAAGAAAGAGATTTAAAATAATAAA
1 -AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAA
* * * * * * * **
164700 TCTGTTTACCAAACAA-TTTAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATTGTTAT
63 TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * * *
164764 AACCTTTTGATTTATTATAAAATAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATGAAATAAAATAAT
128 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT
* ** *
164828 ACTAAGTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTA
191 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * * * * ** * * *
164891 AATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATCTAAACGATTATCTACTACAAATCAT-TATGACGTTTTG
253 AATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--TGTATGACCTTTTG
* *
164954 TTTTGTCAT-AAACTAATTATTTTT-TATCATACAAGTTTATTTGA
315 TTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGA
* *
164998 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * **
165063 TGCTTACCAAATCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAATTTGTTA-A
65 TGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * ** * * *
165126 A-ATATTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTT-TTTATCGCAGAAGCTTATTCGATTAAAAATAA
129 ACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAA
* * * *
165188 TACTCATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGA
190 TACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
** * *
165253 CCT-AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATATTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-TTTG
253 AATAAGTTCAAATAG-T-----TA-T-GACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAAT--TGTATG
* ** * * * * *
165316 ACCTCTTGTTTAATCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCTTACAAGCTTATTTGA
307 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
165368 AATAAAATTATCCA-AATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAA
1 AATAAAATAAT--ATAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
** * * * *
165431 ATCTGTTTA-CTGACTAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTAT-TCATTTAAAATCAT
62 ATCTGTTTATCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCAT
* * * * *
165494 TATAACCTTTTCTTTTGAT-ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTATTCAAAATAAAAT
125 TATAACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAT
* *
165558 AATACTAATTTTTTAATATTTCCAAAA-T--TAA--AAAA-A--T---AAAT---T-TGTTTA-C
188 AATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * * **
165607 TAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCACTATGACCTTTTG
252 -AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGTATGACCTTTTG
* * * ** * *
165672 TTCTG-CTACAAAATAATTGTTTAAGTTCATACAAACTTACTTGA
315 TTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * *
165716 AATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGTGATTTAAAAAATGAATC
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * * * * *
165776 T-TTTATTGAATC-ACTTCAAATAATTATGTCCATTTCAATAGTTATTTATTTTAAATCGTTATT
65 TGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * * * *
165839 ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTT-T-TTCATACAAGTTTATTCAGGATAAAATAGTAT
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAC
* * * * **
165902 TAATTCATTAATCTCTCAAATATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAA-CTGTTTACCAAACC
193 TAATTTATTAATAT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATA
* * * * * * *
165962 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAGTTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGT
257 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
166027 CATGAAGCAATTATTTCTATTCATACAAG-TTAATTCGA
321 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTTGA
* * * * *
166065 AATAAAATAGTACTAATCTAATAAAATT--AAAAA--AGTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAAT
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAAT
* * * * * * *
166125 TTGTTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGCTAAGACTA--TGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTAT
64 CTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* ** * * *
166187 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTAAACTT-ATAGAAGCTTATTCAGAATAGAATAAA
128 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAAT
** * * *
166251 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATCT-ATAAGTAAGTGATTTAGAAAAT-AATTTTTTTATCGA
191 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
** * * * * *
166314 ACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATTACTTTTTTGT
253 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TATGAC-CTTTTGT
* * * * * *
166378 TTTGTCCTAAAACAATTGTTTTTGGTAATATAAGTTTGTTTGA
316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* ** * * * *
166421 AATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAAATATTTAAAAAGTAAAT-
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * *
166485 TGCTTAACAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGA
65 TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * ** * * * *
166550 CTTTTTGTTTTGTTATAAAACAA-TAGTTCTTGTTCATATAAGCTTATTCAGATTGAAATAATAC
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAC
** * * * * * *
166614 TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACT
193 TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAAT
** * * * * *
166679 -AGACCAAATAGTCATGATTA-TTGAAATAATTATCTATTT-TAATTCATTATGATCTTTT-TTT
256 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATT--GTATGACCTTTTGTTT
* * * ** * *
166740 ATAT-ACTAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAACTTATTTGA
318 -TGTCA-TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * ** * * * ** * *
166782 AATAAAATAATACTAAGTTGTTAATATTCTGAAAATTAATAATTAAAAGATTTTAAAAACGATTA
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
166847 TATTTATTAGACAAGTTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-CACTATA
65 TGTTTATCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * ** * *
166910 ATCTTTTGCTTTGTCATTAAATGAA-TTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA
129 ACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA
* * * *
166974 CAAATCTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGT-AAACATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACCAA
192 CTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCAA
* * * *
167036 ATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTTTGA-CTTTTGGT
254 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATTG-TATGACCTTTT-GT
* * * * *
167100 TTTATCAGAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCA
316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * * ** *
167142 TATTAAAATAATATTTATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAATTTTTTTAAAAATAAA
1 -AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
167207 TATGTTTACCGAACAAGTTTAAACAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGT
63 TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
167272 GACCTTTTGTTTTGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
128 AACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT
* * * * * * *
167336 ACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTATAAAAAT-GATTTATTTATCG
191 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTATCA
* * ** * * **
167399 AACAAGTTCAAATAG-T-T-A-TATGT-AA-AAAAATCTATTTCAAAACAT-TATGATCTTTCAT
253 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAA-TTGTATGACCTTTTGT
* * **
167457 TTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCC
316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * *
167500 AATAAAATAATATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* *
167564 TGTTT-TCTAAATTC-A-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATT-TCTATTTTAAATCATT
65 TGTTTATC-AAA--CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * *
167625 ATAACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTGAAACAAGTTTATTCGAAATAAAATAA
126 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA
* * * * **
167690 TACTAATTTATTAATACTAAAAAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAGG
190 TACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA
** * * ** * * * * *
167755 CGAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATCATTTATTTCAAGTCGTTATGATCTTTTGTTTT
255 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TATGACCTTTTGTTTT
* * * ** * *
167820 ATCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTTGG
319 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
* ** * * * *
167860 AATAAAATAATAATAATTTTTTTTTACTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAAT
1 AATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * **
167924 TTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATTGTTA-
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* * * ** **
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128 A-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAAT
* * * *
168052 ACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG----ACATTTAAAAAATAAATCTCTTTATTGAA
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* * * ** *
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* *
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* * * * * *
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1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-
* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * *
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191 ACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * * *
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253 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TATGACCTTTT-GT
* * ***** * *
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* ** * *
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1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAAT
** * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * ** * *
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* ** * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *** * * *
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1 AATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* * * * * * **
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* ***
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1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * ** **
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* * * * *
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** * ** * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* ** ** * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * * * ** * *
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129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA
* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * ** * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * *
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*
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CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAA
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AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA
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*
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*
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* * *
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* * * *
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*
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
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** ** * *
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* * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * **
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* * * * *
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*
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* * * * * * * *
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1 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCA-TTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCTT
* ** * ** * * *
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64 ATTTCCAATAAA-ATAATATAAATGTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAA
* * * ** ** * * * *
161824 ATAAATTTGTTTTCTGAA-CACATTTAAATAGTTATATGACTATTTGAATAATTATCAATGTCAA
127 ATAAATCTATTTACCAAATC-CATACAAATAG-T-TATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAA
* * * * * * *
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189 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAA---TTTTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAA
* * * * * * * *
161953 TAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTAA-AAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATCT
251 TAAAATAATACAAATCTATTAATA-CTAAGAAAATTAATAAG-TAAACATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
162017 -GTTTATCAAACAAGTTTAAATATTTAGGACTGTTTGAATAATTA-TTTATTTCAAATAGTTATG
314 AG-TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * * **
162080 A-TCTTTGGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGTTTATTTTGGAATAAAATAAT
378 ACT-TTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAGATTA-TTCAGAATAAAATAAT
* * *** * *
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441 AATAATTTATTAATATCTC-AAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA
* * * * *
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505 AACAAGTTCAAACAGTCATGAT-CATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGT
* *** ** * * *
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569 TTTGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCAT-ACAAAATTAGCTCAAATAAAATAATACCAATTTA
** * * * *
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632 TTAATATTTCAAAAATTAAGAGTAAGACAATTAT-AAAAAT-AATCTATTTATCGAACA-AGTTC
* * *
162394 AAATTAGTTATGACTATTTGGACAAATATC
694 AAA-TAG-T-T-A-TA--TGTAAAAAAATC
* * * * * *
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1 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCTTA
** * * * ** *
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65 TTTCCAATAAAATAATA-TAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAA
* * * * ** * * * * * *
162550 TAAATGTGTTTGCCAAA-CTCGTTTAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATC
128 TAAATCTATTTACCAAATC-CATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATC
* * * * * *
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192 ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTCTA-TTCAAACAAGCT-TATTCGA-AATA
* * * * * * *
162676 AAATAATACTAATTTATTAGCATTC-AA-AAAAATAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AATATCT
253 AAATAATACAAATCTATTA--ATACTAAGAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAA-ATCT
* * * * * * *
162738 ATTTATCGAATAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTA-TTTATTT-AAAGTCATTAT
314 AGTTACCAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAA-TCGTTAT
* * * * * * *
162800 GACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCACA-AAAACTTATCCAAAATAAAATA
377 GA-CTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTA-CTCATACAAGA-TTATTCAGAATAAAATA
* * * * * * *
162862 ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAATTAAAAAGCAAGA-GATTTAAAAACTAAAGCTAT-TTT
439 ATAATAATTTATTAATATCTC-AAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAA--TATGTTT
* * * * * * * * * * *
162925 -CCAAACCAA-TTCCAATAATTAT-AACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATG--AT
501 ACCAAA-CAAGTTCAAACAGTCATGATC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACAT
* * * * * * *
162985 CTTTGTTTTCTCA-TAAAATAACTGTTT---TTGA-GCATAA-TAGCTTATTTAGATAAAAATAA
564 -TTTGTTTTGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTCA---A-AT-AAAATAA
* * * * *
163044 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT-A-A-TAAGAGATTTA-AAAAATAAATGTATTTA-CTG
622 TACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAGTAAGACAATTATAAAAAT-AATCTATTTATC-G
* * *
163104 AACTAGTTCAAATATTTAAGACTAT-TAGAATAATTATC
685 AACAAGTTCAAATAGTT---A-TATGTA-AA-AA-AATC
** * * * * * * **
163142 TATTTCAAATTATTTTGACCTTTTTATTTAGTCATATAATAATT-GTTTCAATTCATACAAGCTT
1 TATTTCAAAACATTATGATC-TTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCTT
* * * * * * *
163206 A-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAA
64 ATTTC-CAATAAAATAATA-TAAATGTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAAATTT-AA
* ** * ** * * *
163268 AAAATAAATCTATCTACTGAAT-AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTAA
124 AAAATAAATCTATTTACCAAATCCA-TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCA
* * * * * * *
163332 AAACATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTATTT-TAGTTCATAA-AAGCTTATCCAAA
188 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTCTA-TTCA-AACAAGCTTATTCGAA
* * * * * * * * *
163395 ATAAAATAATACTACTTTGTTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAATAATAAATC
250 ATAAAATAATACAAATCTATTAATA-CTAAGAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * ** *
163459 -AGTTTATCGAATTAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTG-ACTAATTA-ACTATTTCAAATCATT
313 TAG-TTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATCATTTTATTTCAAATCGTT
* * * * * * * * *
163520 ATTACCTTTT--TTTTGGTCATAAAACAATTATTT-TTCAACACACAAGCTTATTCAAAATAAAA
375 ATGA-CTTTTGGTTTT-ATCAGAAAACAATTGTTTCTAC-TCATACAAGATTATTCAGAATAAAA
* * * * * * * *
163582 TAATACTAATTTATTAGTTTTTCAAACATTAATAAG----A-GATTTAAAAAATAAATTTATTTT
437 TAATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
** * * * * ** *
163642 CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATA-ACCTT
502 CCAAACAAGTTCAAACAGTCATGATC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-AGACATT
* * * *** ** **
163705 TTGTTTTATCA-CAAAACAATTGTGTCTGGTCATACAAGCTTAG-TCAAAATAAAATAATACTGA
565 TTGTTTTGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTC-AAATAAAATAATACCAA
* * * * ** * * * *
163768 TTCAGTAATA-TTCTAACAATTAATAACAAAGAGATTTA-AAAAATAAATCCATCTATCGAATCA
628 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-GAGTAAGACAATTATAAAAAT-AATCTATTTATCGAA-CA
* * * * *
163831 A-TTCAAACAATTAAGACTGTATGAATAATTATT
689 AGTTCAAATAGTT-ATA-TGTA--AA-AA-AATC
* *** * *** * * * * *
163864 TATTTTAAATTTTTATGACCTTTTGCTTTATCATAAAATAATT-GTTTCAGCTCATAAAAGCTTA
1 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCTTA
* * * * * *
163928 -TTCGGAATAGAATAA-ATCTAAT-TCATTAATATTTCAAAAATTTATAAG---AGATTTAGAAA
65 TTTC-CAATAAAATAATAT-AAATGT-AATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA-AAA
* * * * * * * * *
163987 AA-AATTCTATTTGCCAAA-CTAGTTCAAATAATTATAACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAA
126 AATAAATCTATTTACCAAATCCA-TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAA
** * * * * * ** * *
164050 TTGTTATTACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TGTCAATATAATTTTGTTTGAAAT
190 TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTCTAT-TCAA-ACAAGCTTATTCGAAAT
* * * * * * * *
164113 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TTG
252 AAAATAATACAAATCTATTAATACTAAGAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATCTAG
* * * * * * * *
164177 CTTGCCAAA-ATATTTCAAATAGTTTTGAC--TTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCATTATAA
316 -TTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * ** * ** * *
164238 CCTTT--TATT-T--G--AATAGTT-TTGACTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATAC
379 CTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTT-TCTACTCATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATAA
* * ** * * * ** *
164295 TAATTTAATAATAT-TCCAAAACTTAATAACCAAGAT-AATTAAAAAATAAATCTAATT-GCAAA
443 TAATTTATTAATATCT-CAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA
* * * * * * * * *
164357 CTAGTTCAAATAGTTAAGA-CTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTT
507 CAAGTTCAAACAGTCATGATC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTT
* ** * * * ** ** * *
164421 TGTCA-TAGAACAATTGTTT-TGTTCATATACACTTATTTGGATTAAAATAATA-C----TAATA
571 TGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTCAAATAAAATAATACCAATTTATTA
* * * * * * * * *
164479 ATATTTTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTA-AAAAATAATTTTATTTA-CTAA-ATCAGTTCGA
635 ATATTTCAAAAATTAA-GAGTAAGACAATTATAAAAATAA-TCTATTTATCGAACA--AGTTCAA
* * ** *
164541 ATGGTTAAAACTATTGGAATAATTATA
696 ATAGTT---A-TA-TGTAA-AAAAATC
* * * * * * * **
164568 TATTGT-AAATCGTTCTAACCTTT-AGCTTAGTCATAAAACAATT-GTTTCAATTCATACAAGCT
1 TATT-TCAAAACATTATGATCTTTCA-TTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCT
** * * * * *
164630 TATTTAGAATAAATTAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAATATTAATAAG-AAAGAGATTTAAA
63 TATTTCCAATAAAATAATA-TAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAAA
* * ** * * * * * *
164692 ATAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTTAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAA
125 A-AATAAATCTATTTACCAAATCCATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAA
** * * * ** *
164756 ATTGTTATAACCTTTTGATTTATTATAAAATAATTGTTTC-AGTT-AATACAAGCTTAGAT-GAA
189 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTCTA-TTCAA-ACAAGCTTA-TTCGAA
* * **** *
164818 ATAAAATAATACTAAGT-TATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATC
250 ATAAAATAATAC-AAATCTATTAATACTAAGAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATC
* * ** * * * * * * * * * * *
164882 TATTTACTAAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATCTAAACGATTA-TCTACTACAAATCATTAT
313 TAGTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * *
164945 GACGTTTT-GTTTTGTCA-TAAACTAATTATTTTTTA-TCATACAAGTTTATT-TGAAATAAAAT
377 GAC-TTTTGGTTTTATCAGAAAAC-AATT-GTTTCTACTCATACAAGATTATTCAG-AATAAAAT
* * * * *
165006 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACA-GATTTAAAAAATAAATCTGCTTAC
438 AATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * * * * * **
165070 CAAATCAA-TTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCAATCTCAATTTGTTAA-A-ATAT
503 CAAA-CAAGTTCAAACAGTCATGATC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACAT-T
* * * * * * *
165131 TTGTTTTGTCA-TAAAA-AATTGTTT--TTTTATCGCAGAAGCTTA-TTCGATTAAAAATAATAC
565 TTGTTTTGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCAT-ACA-AA-ATTAGCTCAAAT-AAAATAATAC
* * * * * * * * *
165191 TC-ATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATGTGTTTACCGAC
625 -CAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAGTAAGACAATTATAAAAAT-AATCTATTTATCGAA
*
165254 CTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATATTTAGAATAATTATC
687 CAAGTTCAAATAGTT---A-TA-T-G--TA---A-AA-AA--ATC
* * * * ** * * ** *
165299 TATTTCAAATCATTTTGACCTCTT-GTTTAATCATAAAA-TATTTGTTTCATATCTTACAAGCTT
1 TATTTCAAAACATTATGATCT-TTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGT-TCATACAAGCTT
** * ** * * * *
165362 ATTTGAAATAAAATTATCCAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAA
64 ATTTCCAATAAAATAATATAAATGTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAA
* ** * * * * * *
165426 AATAAATCTGTTTACTGACT-AAGTTA-AAATAGTTATTACTATTTGAATAATTAT-TCATTTAA
126 AATAAATCTATTTACCAAATCCA--TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCT-ATTTCA
* * * * *
165488 AATCATTATAACCTTTTCTTTTGAT-ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAA-AAGGTTATTCAAA
188 AATCATTATAACCTTTTGTTTTG-TCATAAACCAATT-TTTCTATTCA-AACAAGCTTATTCGAA
* * ** * *
165551 ATAAAATAATACTAAT-T-TT--T--T---AATATT--T--CCAAA-ATTAAAAAAATAAAT-TT
250 ATAAAATAATACAAATCTATTAATACTAAGAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * **
165601 GTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT--TGTCTATTTAAAATCACTATG
315 G-TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCAT-TTTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * *
165664 ACCTTTT-GTTCT-GCTACAAAATAATTGTTT-AAGTTCATACAA-ACTTACTTGA-AATAAAAT
378 A-CTTTTGGTTTTATC-AGAAAACAATTGTTTCTA-CTCATACAAGA-TTA-TTCAGAATAAAAT
* * * * *
165724 AATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-T-AAGTGATTTAAAAAATGAATCT-TTTAT
438 AATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-
** * * * * * * * * * * ** *
165782 TGAATC-ACTTCAAATAATTATG-TCCATTTCAATAGTTATTTATTTTAAATCGTTATTACCTTT
502 CCAAACAAGTTCAAACAGTCATGAT-CATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTT
* * ** ** * * * **
165845 TGTTTGGTCA-TATAACAATT-TTT-TTTTCATACAAGTTTA-TTCAGGATAAAATAGTATTAAT
566 TGTTTTGT-ATTAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTCA-AATAAAATAATACCAAT
* * * * * * * * * * *
165906 TCATTAATCTCTCAAATATT-A-A-TAAGAGATTTA-AAAAATAAACTGTTTACCAAACCAGTTC
629 TTATTAATATTTCAAAAATTAAGAGTAAGACAATTATAAAAATAATCTATTTATCGAACAAGTTC
* ** *
165967 AAATAGTTATGAT-TATTTGAATAGTTG
694 AAATAGTTAT-ATGTA----AAAAAATC
*** * * ** * * * * *
165994 TATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATT-ATTTCTATTCATACAAG-T
1 TAT--TTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCT
* * * * * * * *
166057 TAATTCGAAATAAAATAGTACT-AATCTAATAA-AATTAAAAAAGTAATAAG---AGATTTAAAA
63 TATTTC-CAATAAAATAATA-TAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAA
* * * ** * * * * *
166117 AATAAAATTTGTTTGCTGAA-CCAATTCAAATAGCTAAGACTA--TGAGCAATTATCTATTTCAA
126 AAT-AAATCTATTTACCAAATCC-ATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAA
* * * *
166179 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT-TAAACTT-ATAGAAGCTTATTC-AGA
189 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTTTTCT--A-TTCAAACAAGCTTATTCGA-A
* * * * * * ** *
166241 ATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATCT-ATAAGTAAGTGATTTAGAAAAT-AAT
250 ATAAAATAATACAAATCTATTAATA-CTAAGAAAAT-TAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * * *
166303 TTTTTTATCGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATAGTTA
312 CTAGTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTTA
* * * ** * ** * * * * *
166366 TTACTTTTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTTTGGTAATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATA
376 TGAC-TTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTCAG-AATAAAATA
* * * * * * * *
166430 TTACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAAAT-ATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTAAC
439 ATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC
* * * * ** * * * * *
166493 AAACCATTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGACTTTTTG
504 AAACAAGTTCAAACAGTCATGATC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTG
* ** * ** * * * *
166557 TTTTGT-TATAAAACAATAG-TTCTTGTTCATATAAGCTTA-TTCAGATTGAAATAATACTAATT
568 TTTTGTAT-TAAAACAATTGTTTC-AATTCATACAAAATTAGCTCA-AATAAAATAATACCAATT
** * * * * * * * * **
166619 TATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGAC
630 TATTAATATTTCAAAAATTAA-GAGTAAGACAATTATAAAAAT-AATCTATTTATCGAACAAGTT
*
166683 CAAATAGTCATGATTAT-TGAAATAATTATC
693 CAAATAGT--T-A-TATGT-AAA-AA-AATC
* ** * * * * * * *
166713 TATTTTAATTCATTATGATCTTT--TTTTATATACTAAAAAAATT-ATTTCAGTTCATATAAACT
1 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGT-CA-TAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCT
** * * * *
166775 TATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTGT--TAATA-TTCTGAAAATTAATAATTAAAAGATTTTA
63 TATTTCCAATAAAATAATA-TAA-ATGTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
** * * ** * * * * * *
166837 AAAACGATTATATTTATTAGA-CAAGTTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTG
124 AAAATAAATCTATTTACCAAATCCA--TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTC
* * * ** * * **
166900 AAA-CACTATAATCTTTTGCTTTGTCATTAAATGAATTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTAAA
187 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA-TAAACCAATTTTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAA
* *
166964 TAAAATAATACAAATCTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATCTAG
251 TAAAATAATACAAATCTATTAATACTAAGAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATCTAG
* * * * *
167029 TTACCAAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTTTGACT
316 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTTATGACT
* * * * * *
167094 TTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTTA
381 TTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATAATAA
* * ** * *
167159 TTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAATTTTTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAG
446 TTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAG
* * ** *
167224 TTTAAACAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAT
511 TTCAAACAGTCATGATCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTTTGTAT
* ** ** *
167289 TAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTT
576 TAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTCAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTT
* * *
167354 CAAAAATTAAAGAGTAAGAGAATTATAAAAATGATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATA
641 CAAAAATT-AAGAGTAAGACAATTATAAAAATAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATA
167419 TGTAAAAAAATC
705 TGTAAAAAAATC
*
167431 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTAT
1 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATACAAGCTTAT
* * *
167496 TTCCAATAAAATAATATCAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAA
66 TTCCAATAAAATAATATAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
* * * * ** * *
167561 ATCTGTTTTCTAAATTCATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATTTCTATTTTAAATCATTA
131 ATCTATTTACCAAATCCATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATCATTA
* * *
167626 TAACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTGAAACAAGTTTATTCGAAATAAAATAAT
196 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTT-TTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
* * * * *
167691 ACTAATTTATTAATACTAA-AAAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAG
260 ACAAATCTATTAATACTAAGAAAATTAATAAGT-AAACATTTAAAAAATAAATCTAG-TTACCAA
* * * * * *
167754 GCGAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATCA-TTTATTTCAAGTCGTTATGATCTTTT-GT
323 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGGT
* * ** *
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387 TTTATCAGAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATT
** ** * * *
167882 TTTA-CTCTAAAAATTAATAAGTTGAA-GATTTAAAAAATTAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAA
452 AATATCTC-AAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAA
* * ** *
167945 ATAGTCATG-TCCATTTGAACT-ATTATCTATTTTAAATTGTTAAGACATTTTGTTTTGTCTTAA
516 ACAGTCATGAT-CATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACATTTTGTTTTGTATTAA
* * *
168008 AACAATTGTTTCTATTCATACAAAATT-GCTCATAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCA
579 AACAATTGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTCA-AATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
168072 AAAATT-A-A-TAAGACATTTA-AAAAATAAATCTCTTTATTGAACTAGTTTAAATAGTTATGAC
643 AAAATTAAGAGTAAGACAATTATAAAAAT-AATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-A-
* ** *
168133 TATTTGAATAAT-
705 T-GTAAAAAAATC
* ** * * *
168145 TATGTATCACAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTTTAG-TCATACAAG
1 TAT-T-TCA-AAA-CATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTT-GTTCATACAAG
* * *
168208 -TTCA-TTCTAAGTAAAATATTACTAAAT-TAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAA-TT
61 CTT-ATTTCCAA-TAAAATAATA-TAAATGTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTT
* * * *
168268 AAAAAATGAATGC-ATTTACCAAA-CCAATACAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAGTATCTATT
122 AAAAAATAAAT-CTATTTACCAAATCC-ATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATT
* * * * ** * * * *
168331 TCAAATCGTTCTAGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACATGCTTAATCA
185 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTCTA-TTCAAACAAGCTTATTCG
* * * * *
168395 AAATAAAATAATACTAAA-CTATGAAAATTTAGAAAATTAATAAG--AA-ATTAAAAAAAATAAA
248 AAATAAAATAATAC-AAATCTATTAATACTAAGAAAATTAATAAGTAAACATT-TAAAAAATAAA
* * * * * *
168456 T-TTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTAAAATCGTT
311 TCTAG-TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTT
* ** * * * ** * * * * *
168519 ATAACCTTTTATTTTTTTCATAAAACATTTGTACCAATTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAAT
375 ATGA-CTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTCAG-AATAAAAT
* * * * * * * *
168583 AATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGA-GATTTAAAAACATAAATCA-ATTT
438 AATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAA-ATAAAT-ATGTTT
* * * * * ** * * * * * *
168646 ATCGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTT-AAGCAATTGTTTATTTTAAATCATTATGAAAT
501 A-CCAAACAAGTTCAAACAGTCATGATCATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTAAGACAT
* * * *** ** ** * *
168709 TTTCTTTTTTCA-TAAAACAATTATTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATGCT
564 TTTGTTTTGT-ATTAAAACAA-T-TGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTCAAATAAAATAATACC
* * * * * * * * *
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626 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAGTAAGACAATTATAAAAAT-AATCTATTTATCGAACA
* ** *
168835 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT
689 AGTTCAAATAG-T-T-A-TATGT-AA-AAAAATC
** * * ** * * * * *
168869 TATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATT-ATTTCTATTCATACAAGCTTA
1 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCTTA
* * * * * * **
168933 -TTCAAAATATAAGAATGCT-AATGTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGTGATTTAAAA
65 TTTC-CAATAAAATAAT-ATAAATGTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAA
* * ** * * *
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126 AATAAATCTATTTACCAAATCCA-TACAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAATATC-T-ATTTC
* * * * ** ** *
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187 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACCAATTTTTCTA-TTCAAAC-AAGCTTATTCGA
* * * * *
169119 AATAAAATAAAACAAATTTATTAGTACTCAA-AAAATTAATCAA-TAAGAAATTT-GAAAA-AAA
249 AATAAAATAATACAAATCTATTAATACT-AAGAAAATTAAT-AAGTAA-ACATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
169180 TACT-GATTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCAT
311 T-CTAG-TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGT
* * * * * ** * * * * *
169243 TATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTCAAAATAAAAT
374 TATGA-CTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAGATTATTCAGAATAAAAT
* * * ** *
169307 AATATTAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAG----A-GAATTAAAAAATAAATA--TTTAC
438 AATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * * * * * * *
169365 TAAA-ACAGTTTAATA-AGTTAT-AACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGACCA-
503 CAAACA-AGTTCAA-ACAGTCATGATC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAGA-CAT
* * * * * *** * * * *
169426 TTTATATTGTTATT-AAATAATTGTTTCTATTTATACAGTCTTA-TTCAGAATAAAGTAATGCTA
564 TTTGTTTTG-TATTAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAAATTAGCTCA-AATAAAATAATACCA
* * * ** *
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* * ** *
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686 AC-AAGTTCAAATAGTTAT-A-T-GTAAAAAAATC
* * * * ** * * ** *
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1 TA--T--TTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * *
169646 TTA-TTCGAAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAAAGTTAATAGGTAATAGATAATA
62 TTATTTC-CAATAAAATAATAT-AAATGTAATAATATT-T-CAA---AA-A--T--TA-AT-A-A
* * * * *
169709 GATTTAAAAAACGAATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTAAA-CAAATTCAAATAG-T-TGACTAT
112 G---T---AAA--AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATC-CATACAAATAGTTATGACTAT
* * * ** *
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168 TTGAACAAATATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAA--TTTTTCTAT
* * * * *
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* * ** * * * * *
169898 ACAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAATAAGTTCAATTAGTAATGATTATTTGAACAATTA
294 A-ACATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCA
* * * * * * ** *
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358 TTTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAGAT
* * * * ** *
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423 TATTCA-GAATAAAATAATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAATG-ATTTAA
** * ** *
170089 AAAATAAATATGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTCACAAT-ATTTGAATAATTATTTATTTCAA
486 AAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAACAGTCATGATCATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** * * * * ** *
170153 ACCGTTATGGCCTTTTGTTTCATCA-TAAAACAATTGTATT-AGTTTATATAAATTTATTTGAAA
551 ATCATTAAGACATTTTGTTTTGT-ATTAAAACAATTGT-TTCAATTCATACAAAATTAGCTCAAA
* * * * *
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614 TAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAGTAAGACAATTATAAAAAT-AATCT
* * * * *
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* * ** * * *
170326 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTTCACACAAGCTTA
1 TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTG-GTTTTGTTCATACAAGCTTA
** * * * ** * *
170391 TTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAGAATTACCAAGTAGAAATTTTTAAAAA-
65 TTTCCAATAAAATAATATAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAAT
* **** * * * * * *
170455 AAATCTGTTTTTTGAA--CATTCAAATAGTTGTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAT-AG
129 AAATCTATTTACCAAATCCATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATCA-
* * * * * * * * *
170517 CTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAACTTATTTGAAATAGAAT
193 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
** * ** * * * * *
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* *
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TATTTCAAAACATTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATACAAGCTTAT
TTCCAATAAAATAATATAAATGTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA
ATCTATTTACCAAATCCATACAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTCAAATCATTA
TAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTTTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
CAAATCTATTAATACTAAGAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATCTAGTTACCAAACA
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGGTTTTA
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TCTCAAAAATTAATAAGTAAAATGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAACAGT
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C
Found at i:169234 original size:16 final size:17
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*
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
171281 TGGTTT-TATATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA
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* * * * * * *
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* * * *
171391 ACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTTATATAGCCATAACTATTTGAAT
1 ACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAT
* * * * * * *
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* *
171520 TAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATG
127 TAGTATTACTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTGTTTTATG
* * * * *
171573 ACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATATGAA
1 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA
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Found at i:171698 original size:83 final size:82
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* * *
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* *
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* *
171630 TATGAACA-AAATCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGAGAAT
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*
171693 TGTTTATATAGCCATAACTA
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*
171713 TTTGAA
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Statistics
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TTAAATAGCCATAACTA
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171353 CTAAACAAAC
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*
171493 TTATTAATTTTTATTATATTATTAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATA
131 TTATTAATTTTCATTATATTATTAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATA
171558 AATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTC
196 AATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTC
171623 ATAA
261 ATAA
171627 TTATATGAACAAAATCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAA
1 TTATATGAACAAAATCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAA
*
171692 TTGTTTATATAGCCATAACTATTTGAATTCGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
66 TTGTTTATATAGCCATAACTATTTGAATTCGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
*
171757 TTATTAATTTTCATTATATTATTAGATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATA
131 TTATTAATTTTCATTATATTATTAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATA
*
171822 AATAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTC
196 AATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTC
171887 ATAA
261 ATAA
*
171891 TTATTTGAAC
1 TTATATGAAC
171901 TGGTTCGGTA
Statistics
Matches: 269, Mismatches: 5, Indels: 0
0.98 0.02 0.00
Matches are distributed among these distances:
264 269 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (264 bp):
TTATATGAACAAAATCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAA
TTGTTTATATAGCCATAACTATTTGAATTCGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
TTATTAATTTTCATTATATTATTAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATA
AATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTC
ATAA
Found at i:171972 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 171630--172142 Score: 568
Period size: 181 Copynumber: 2.8 Consensus size: 179
171620 GTCATAATTA
* * *
171630 TATGAACAAAATCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTG
1 TATGAACAAAAT-AATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * *
171695 TTTATATAGCCATAACTATTTGAATTCGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
64 TTTAAATAGCCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCATACTTA
* * * * * *
171760 TTAATTTTCATTATATTATTAGATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTG
129 TAAATTTTGA-AATATTAATAAATCAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTG
* * *
171812 TATGAACATAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACT-ATTTGAAATATATAATTG
1 TATGAACA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTG
* * *
171876 TTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTCAATCTCATACTTA
64 TTTAAATAGCCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCATACTTA
* **
171941 TAAAATTTTGAAATATTAATAAATCAGTATTATTTTATTCCAAATTGGCTTG
129 T-AAATTTTGAAATATTAATAAATCAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTG
* * *
171993 TATGATGA-AAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAA-GTTCATAATGGTTTGAAATAGATAATT
1 TATGA--ACAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
172056 GTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAAC-TAATTTATTTTTTAAATCTCCA-AC
63 GTTTAAATAGCCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCT-CATAC
* *
172119 TTCTCAATTTTTGAAATATTAATA
126 TTAT-AAATTTTGAAATATTAATA
172143 GAGTAATATT
Statistics
Matches: 280, Mismatches: 42, Indels: 19
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
180 5 0.02
181 235 0.84
182 35 0.12
183 5 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TATGAACAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
TAAATAGCCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATA
AATTTTGAAATATTAATAAATCAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTG
Found at i:171972 original size:445 final size:438
Alignment explanation
Indices: 171205--172081 Score: 1028
Period size: 445 Copynumber: 2.0 Consensus size: 438
171195 TCAATAGAAA
* * * *
171205 ATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATTGCTATA
1 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTTAAATAGCCATA
* * ** * * * *
171270 AGTAATTGAATTGGTTTTATATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
66 ACTAATTGAATTCGTTGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * * *
171335 AAATTAATATTATTTTATCTAAACAAACTTATATGAACAAAATCATTTGTTTTATGACAAAACAA
131 AAATTAATATTACTTTATCCAAACAAACTTATATGAACAAAATCAATTATTTTATGACAAAACAA
* *
171400 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTTATATAGCCATAACTATTTGAATTCGTTCGAC
196 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTTAAATAGCCATAACTATTTGAACTCGTTCGAC
* * * * * * *
171465 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTATTATATTATTAAATTAGTATTACT
261 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATAAATTTTGATAATATTAATAAATCAGTATTACT
* *
171530 TTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAACT
326 TTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAA-T
* * *
171594 -ATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATATGAACAAAATC
389 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATATGAACAAAATC
* *
171643 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTTATATAGCCAT
1 ATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTTAAATAGCCAT
* **
171708 AACTATTTGAATTCGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATTA
65 AACTAATTGAATTCGTT--GCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTCAAAA
* * * * * *
171773 TATTATTAGATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAAT-AATTATTTTATG
124 TATTAATAAATTAATATTACTTTA-TCCAAACAAACTTATATGAACA-AAATCAATTATTTTATG
* * * * * *
171837 ATAAAAC-AAAAGGTTATAACT-ATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAA
187 ACAAAACAAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGAGAATTGTTTAAATAGCCATAACTATTTGAA
* ** * * *
171900 CTGGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTCAATCTCATACTTATAAAATTTTGA-AATATTAATAAA
251 CTCGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTAT-AAATTTTGATAATATTAATAAA
* ** ** * *
171964 TCAGTATTATTTTATTCCAAATTGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAA
315 TCAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
* * *
172029 GTTCATAATGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC
380 GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATATGAAC
172082 TGATTCGATA
Statistics
Matches: 363, Mismatches: 63, Indels: 19
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
438 19 0.05
439 53 0.15
441 21 0.06
444 4 0.01
445 220 0.61
446 42 0.12
447 4 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (438 bp):
ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTTAAATAGCCATA
ACTAATTGAATTCGTTGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
AAATTAATATTACTTTATCCAAACAAACTTATATGAACAAAATCAATTATTTTATGACAAAACAA
AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTTAAATAGCCATAACTATTTGAACTCGTTCGAC
AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATAAATTTTGATAATATTAATAAATCAGTATTACT
TTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGA
TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATATGAACAAAATC
Found at i:172207 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 171630--172207 Score: 512
Period size: 181 Copynumber: 3.2 Consensus size: 177
171620 GTCATAATTA
* * * * *
171630 TATGAACAAAATCATTTGTTTTATGA-CAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATT
1 TATGAACAAAA-CAATT-ATTTATGATAAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * ** *
171694 GTTTATATAGCCATAACTATTTGAATTCGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
63 GTTTAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GTTCGGTAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT
* * * * * *
171759 ATTAATTTTCATTATATTATTAGATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTG
126 ATAAATTTTGA-AATATTAATAGAATAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG
* *
171812 TATGAACATAAATAATTATTTTATGAT-AAAACAAAAGGTT-ATAACT-ATTTGAAATATATAAT
1 TATGAACA-AAACAATTA-TTTATGATAAAAACAAAA-GTTCATAA-TGATTTGAAATAGATAAT
* * *
171874 TGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTCAATCT-CATAC
62 TGTTTAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GTTCGGTAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCCA-AC
**
171938 TTATAAAATTTTGAAATATTAATA-AATCAGTATTATTTTATTCCAAATTGGCTTG
124 TTAT-AAATTTTGAAATATTAATAGAAT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG
* *
171993 TATGATGA-AAAACAATTGTTT-TG-TGACAAAACAAAAGTTCATAATGGTTTGAAATAGATAAT
1 TATGA--ACAAAACAATTATTTATGAT-A-AAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * *
172055 TGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACT
62 TGTTTAAATAGCCATAATTATTTGAACTG-TTCGGTAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCCAACT
* * * * ***
172120 TCTCAATTTTTGAAATATTAATAGAGTAATATTATTTTATGT-TGGATAAGCTAT-
125 TAT-AAATTTTGAAATATTAATAGAATAGTATTATTTTAT-TCCAAATAAGCT-TG
*
172174 TATGAACTAAAACAACTATTTATGATAAAAACAA
1 TATGAAC-AAAACAATTATTTATGATAAAAACAA
172208 TTGTTCAATA
Statistics
Matches: 323, Mismatches: 47, Indels: 53
0.76 0.11 0.13
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
179 3 0.01
180 11 0.03
181 259 0.80
182 44 0.14
183 5 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
TATGAACAAAACAATTATTTATGATAAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
TAAATAGCCATAATTATTTGAACTGTTCGGTAAACAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATAAA
TTTTGAAATATTAATAGAATAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG
Found at i:172936 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 172216--173409 Score: 879
Period size: 182 Copynumber: 6.7 Consensus size: 178
172206 AATTGTTCAA
* * * * * *
172216 TAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAAATAATATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
172281 TTTTATTTCAAAT-AAGTATGAATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAA
64 TTTTATTTCAAATAAACT-TGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * * * * *
172345 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATCTGATCTAGTTCA-G
126 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTT-AGG
* * * * ** * *
172398 CAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTATTATTTTAGCAATAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *
172463 TTTACTCCAAATAAACTTGTATAAATAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAATGA
65 TTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAAAACAA-TTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA
* * * * *
172527 TTTGAGATAAATAATTGTTCAAAGAGTCATAATTATTTG-ACTCGGTTTGG
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTC-GTTAGG
* **
172577 TAAGCAGATTTAGATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
172638 TTTGTGTT-GAAT-AATTTGGTATGAATAAAAACAA-TTTGTA-G---AAA-AAATG-TCATAAC
65 TTTAT-TTCAAATAAACTT-GTATGAAT-AAAACAATTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * * * * * * **
172694 AATTTGAAATAGATAATAGTTTAAATGGAT-ATGATTATTTAAACTTAATTA-G
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC-TCGTTAGG
* ** *
172746 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *
172811 TTTATTTCAAATAAACTTGTTTGAATAGAAACATATGTTTTATGACAAAACAAGAGATCATAATG
65 TTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATA-AAACA-ATTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * * *
172876 ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCGCTAGG
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTAGG
* * ** * * * *
172927 CAAATAGA-TT-TTTTAAAAACTTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTATTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * *
172990 TTTTATTCCAAATAAGGTTTTATGAACAAACACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAT
64 TTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAAA-ACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * * * * * *
173055 GATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAAGT-GATTTGA
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG-TTAGG
* * * * *** * *
173107 TAAACTGTTTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTGATCTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTA
1 TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
*** * * * * *
173172 TTTTATTTTGGATAGACTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAAT
64 TTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * * *
173237 GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAAC-CTATTCGG
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTC-GTTAGG
* * * * *
173289 TAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
173354 -TTTCTTCCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAGACAAAAG
64 TTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAG
173410 TTATGACTAC
Statistics
Matches: 791, Mismatches: 177, Indels: 89
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 57 0.07
170 8 0.01
171 3 0.00
172 3 0.00
173 54 0.07
174 15 0.02
175 49 0.06
176 10 0.01
177 2 0.00
178 2 0.00
179 75 0.09
180 166 0.21
181 156 0.20
182 180 0.23
183 11 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAAAACAATTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATT
TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTAGG
Found at i:173178 original size:362 final size:360
Alignment explanation
Indices: 172227--173409 Score: 850
Period size: 362 Copynumber: 3.3 Consensus size: 360
172217 AAACAGATTT
* ** * * * *
172227 ATTTTTTAAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCA
1 ATTTTTTAAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCCA
* * * * **
172291 AATAAG-TATGAATGAA-CTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
64 AATAAGCT-TGTATGAATC-AAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAA
* * * * * * * * * * * *
172354 ATAGATAATTA-TTCAAATAGTCTTAACTATCTGATCT-AGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTA
127 ATAGATAA-TAGTTTAAATGGACATAATTATTTAAACTGAATT-AGTAAATAGATTTATTTTTTA
*** * ** * *** ** * * * *
172417 AATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTATTATTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAACTTG
190 AATCTCCAACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTT
* * * * *
172482 TAT-AAATAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGT
255 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * * * *
172545 TCAAAGAGTCATAATTATTTG-ACTCGGTTTGGTAAGCAGATTTAG
320 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACAC---TCGCTAAACA-A-ATAG
* **
172590 A--TTTT-AAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTT-TGTGTT
1 ATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTCAAA-AGTTAATAAATTAGTATTATTTAT-T-CC
* * * * * * **
172646 GAATAA-TTTGGTATGAATAAAAACAATT--TGTA-G----AA-AAAATGTCATAACAATTTGAA
63 AAATAAGCTT-GTATGAATCAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAA
* * *
172702 ATAGATAATAGTTTAAATGGATATGATTATTTAAACTTAATTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
127 ATAGATAATAGTTTAAATGGACATAATTATTTAAACTGAATTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * **
172767 TCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTT
192 TCTCCAACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTT-TT
* *
172832 -TGAA-TAGAAAC-ATATGTTTTATGACAAAACAAGAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
256 ATGAACT-GAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTG
* **
172894 TTTAAATAGTCATAACTATTT-AA-ACTCGCTAGGCAAATAG
319 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACACTCGCTAAACAAATAG
* * ** *
172934 ATTTTTTAAAAACTTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTATTATTATTTTATTCC
1 ATTTTTT-AAAA-TCTTTTACTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCC
* *
172999 AAATAAGGTTTTATGAA-CAAACACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAA
63 AAATAAGCTTGTATGAATCAAA-ACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAA
* * * * * *
173063 ATAGATAATTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAAGTG-ATTTGATAAACT-GTTTTATTTTTTT
127 ATAGATAATAGTTTAAATGGACATAATTATTTAAACTGAATTAG-TAAA-TAGATTTA-TTTTTT
*** * *** *
173126 AAATCTTTTACTTATTGATCTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAGACTT
189 AAATCTCCAACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTT
* * *
173191 TTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTTAAATAGATAATTG
254 TTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTG
* * * **
173256 TTCAAATATTCATAACTATTTGAACCTATTCGGTAAACAAATTT
319 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C-ACTCGCTAAACAAATAG
* * *
173300 ATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTCTTCCAAA
1 ATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTATTCCAAA
** * * *
173365 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAGACAAAAG
66 TAAGCTTGTATGAATCAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAG
173410 TTATGACTAC
Statistics
Matches: 656, Mismatches: 116, Indels: 96
0.76 0.13 0.11
Matches are distributed among these distances:
344 4 0.01
345 1 0.00
346 11 0.02
347 2 0.00
348 120 0.18
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350 45 0.07
352 4 0.01
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357 1 0.00
360 10 0.02
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363 51 0.08
364 39 0.06
365 3 0.00
366 18 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (360 bp):
ATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTATTCCAAA
TAAGCTTGTATGAATCAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAG
ATAATAGTTTAAATGGACATAATTATTTAAACTGAATTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
CAACTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTTTATGAA
CTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
AGTCATAACTATTTGAACACTCGCTAAACAAATAG
Found at i:173986 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 173452--174731 Score: 889
Period size: 181 Copynumber: 7.0 Consensus size: 181
173442 ATTTGAACAA
* * * ** * ** * * **
173452 CAAATTATCATGACTTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTATTTCTGGTCATACAA-CCTAGTTCAA
1 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA
*** * * * *
173516 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
66 A-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
173581 TGTTTACCAAACAATTTCAAATGGTCATGACTATTTGACTAATTATCCATTT
130 TTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * * * *
173633 CAAATAATTGTGACCTTGTGTTTTGTAATAAAACGATTGTTTC-AGTTAACATAAGCTTA----G
1 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGG
* * * * * * *** *
173693 AAGTAAAATAATACTAACTTATCAATATTCCAAAATTTAATGAGTAAAAGAACTAGAAAAATGAA
65 AA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTTA-AAAAATAAA
** * * * *
173758 T-TTGTTTACTAAACAAGTTCAAA-ATGTTATAACTATCTAAACAATTATCTATTT
128 TCTT-TTTACCGAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * ** **
173812 CAAAACATTATTACCTTTTGTTTTGTCAGAAAAAAATTGGTTCTATTCAGCCAAGCTTATTTCAA
1 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA
* * *
173877 ATAAAATAATATAAATTAATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGCAAAA-TTTTGAAAAAA-AAAT-
66 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTT-AAAAAATAAATC
*** * *
173939 TTGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGCATAATTATCTATTT
130 TT-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * *
173992 CATATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGA
1 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA
* * * *
174057 ATAAAA-AAAATGCTAATTTATTAA-ATTTCAAAAATAAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAAT
66 ATAAAATAATAT--TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTTAAAAAATAAAT
* * *
174120 CTTTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATATTTATTTATTT
129 CTTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
** * *
174173 CAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGA
1 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA
* * ** * *
174238 ATAAAATAATATTAATTTGTTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCT
66 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTTAAAAAATAAATCT
* * * ** *
174303 GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATTTCTATTTGAACT-ATCATCTATTT
131 TTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTT
** * * *
174354 TGAATCGTTATGACATTTTG-TTTGTCATAAAATAATACCAATTATTTAGAATAATTGGTATTCA
1 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-C-A--A-TT-G--T--TT-CTATTCA
* ** * *
174418 TACACA-ATTATTCAGAATAAAATAAT-TCCAATTTATTACTATTCCAAAAATTAATAAG-----
50 TACA-AGCTTATTTGGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA
* * * * * * * * ** * *
174476 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGCCTATGAGAACAATTTTCT
113 GTTTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
174541 ATTT
178 ATTT
* * * * * * * *
174545 TAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTAATTGAA
1 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA
* * * * * *
174610 ATAAAATAATACTAATTTATTGACATT-TAGAAAATTAATAAGCAGGAAA-TTTAAAAAAATAAT
66 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGCA--AAAGTTTTAAAAAATAAA
* * * * *
174673 TCTGTTAACCAAAAAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTT
128 TCTTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
174727 CAAAT
1 CAAAT
174732 TGTTACGACA
Statistics
Matches: 854, Mismatches: 195, Indels: 99
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 47 0.06
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196 52 0.06
197 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGA
ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTTAAAAAATAAATCT
TTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
Found at i:174221 original size:361 final size:356
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Indices: 173467--176806 Score: 2147
Period size: 361 Copynumber: 9.3 Consensus size: 356
173457 TATCATGACT
** * ** * *
173467 TTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTATTTCTGGTCATACAA-CCTAGTTCAAATTAAAATAATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAA-TAAAATAATA-TA
*** * * ** *
173531 ATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAT
63 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-AAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG
* * * * ** * *
173596 TTCAAATGGTCATGACTATTTGACTAATTATCCATTTCAAATAATTGTGACC-TTGTGTTTTGTA
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATT-TGTTTTGTC
* ** * * * * * *
173660 ATAAAACGATTGTTTCAGTTAACATAAGC----TTAGAAGTAAAATAATACTAACTTATCAATAT
190 ATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAAAAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * *
173721 TCCAAAATTTAATGAGTAAAAGAACTAGAAAAATGAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAA-ATGT
253 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATTT-TTTACTGAACAAGTTCAAATA-GT
* * * *** * *
173785 TATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATTACC
315 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* * * ** *
173827 TTTTGTTTTGTCAGAAAAAAATTGGTTCTATTCAGCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATAT-AA
* * * * ** *
173892 TTAATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGCAAAATTTTGAAAAAA-AAATTTGTTTTTTGAACACGT
64 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGT
* * *
173956 TCAAATAGTTATGACTATTTGCATAATTATCTATTTCATATCATTATGACCATTTGTTTTGTCAT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCAT
* * *
174021 AAACCAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAAAAATGCTAATTTATTAA-ATTT
192 AAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAAAAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
174085 CAAAAATAAATAAGTAAAAGTTTTAAAAAATAAATCTTTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATG
255 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * *
174150 ACTATTTGAATATTTATTTATTTCAAATTGTTATGATC
319 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* *
174188 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATA-TAA
* * *
174253 TTTGTTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACAAG
64 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAG
* ** * **
174317 TTCAAATAGTCATTTCTATTTGAACT-ATCATCTATTTTGAATCGTTATGA-CATTT-TGTTTGT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGT-TTTGT
* * * *
174379 CATAAAATAATACCAATTATTTAGAATAATTGGTATTCATACACA-ATTATTCAGAATAAAATAA
189 CAT---A-AA-A-C-A--A-TT-G--T--TT--TTTTCATACA-AGCTTATTTAGAATAAAAAAA
* * * * * *
174443 TTCCAATTTATTACTATTCCAAAAATTAATAAG-----GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGA
236 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGA
* * * ** * * ** * *
174503 ACCAGTTCAAATAGTTAAGCCTATGAGAACAATTTTCTATTTTAAATCATTTTGACC
300 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* * * *
174560 TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTAATT-GAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCG-AATAAAATAATA-TA
* * * * * * ** *
174624 ATTTATTGACATT-TAGAAAATTAATAAGCAGGAAATTTAAAAAAATAATTCTGTTAACCAAAAA
63 ATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTA--AAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * *
174688 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGA-CA------TT-T
124 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGT
* ** * * * *
174745 --T------A---TTTTTATCATA-AAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATT
189 CATAAAACAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
174797 TCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATTAAATC-AGTTCAAATAATTA
254 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
174861 TGGCCATTTGAAAAATTATCTATGTCAAATTGTTATGAAC
317 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* * * ** * *
174901 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGGTGTAAAATATTGCTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAAT-ATA
* ** * * *
174964 ATTTACTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAG
63 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG
* ** * ** * ** *
175029 TTAAAATAGTTATGACTATTTGAACGATTATATATTTCAAATTATTATAACC-TCTTGTCATGTT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCAT-TTGTTTTGTC
* * * * * * * ** *
175093 ATAAAAAAATTATTTTTGTTCAAATAAGTTTATTCA-AAAAAAAATAATACTAAAGTAATAATA-
190 ATAAAACAATTGTTTTT-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAA-AATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
175156 TTCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACTAAACCAGTTCAAATAGTT
253 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
175221 AAGACTATATGAACAATTCTTTATTTTAAACTGTTATGA-C
316 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* * * * * *
175261 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCTTAGTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAATAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTC-GAATAAAATAATAT-A
* * * * * *
175325 ATTTATTAATATTTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAACTCTGTTTGCTGGACCA
63 ATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAA
* * * * * *
175390 GTTCAAATA-TTATGATTATTTAAACAATTATCTTTTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTC
125 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTC
* * * * * * *
175454 ATAAAACAAATGCTTTTGTTCAAATAAG-TTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
190 ATAAAACAATTG-TTTTTTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * *
175518 TTGAAAATTAAAAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACCACTTCAATTAGTTAT
254 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * ** * *
175583 AACTATTTGAACCATTATTTACTTCAAATCATGATGACC
318 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* * * * * * *
175622 ATTTGTTTTGTCATAGAAGAATTGTTTCTATTCAT-CTAGTCTTATTCGGGATAAAGTAATGCTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTC-GAATAAAATAAT-ATA
* * * * * * * ** *
175686 ATTTATGAACATTCTAAAAATTAGTAATTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTG-ACCA
63 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACTGAACAA
* *
175750 GTGT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTGGTTTTA
125 GT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTT-GTTTTG
* * * * * * * * *
175813 TTACAAAA-AAGTTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAAT
188 TCATAAAACAA-TTGTTT-TTTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAAT
* * *
175877 ATTTCAAAAATTAATAAGTACGAA-ATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
251 ATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
175941 TTATTACTATTTGAACAATTATCTATATCAAGTTCTT-T-AAC
314 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* * * ** *
175982 TTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTTAAATAAAAAAATATAA
1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATAT-A
* * *
176047 ATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATAAAAAA-AAA-GT-TTTA-TGAACACA-T
63 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGT
* * * * * *
176106 TCAAATAGTTATGATTATTTG-ATCAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTATCTTGTCA
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCA
* * * * * *
176170 T-AAACCATTGTTTCTATTCATAGAAGCATATTT-GAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATT
191 TAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAAAAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
176233 CCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCTA-TCTCAAATAGTTA
254 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACTGAACAAGT-TCAAATAGTTA
* * * * *
176297 TGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATAGTTATGATA
317 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* * ** * * *
176337 ATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTTTACAAGTTTATTGGGAATAAAA-AAAACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CGAATAAAATAATA-TAA
*** * * *
176401 TTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGT
64 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA--AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGT
* * * * * * * * *
176466 TTAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGCCA
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-ATTTGTTTTGTCA
** * * * * *
176531 TAAAACAATTGTTTTTATTTGTGAAAAAC-TATTCAGAATAAAATAATACTGATTTATTAATATT
191 TAAAACAATTGTTTTT-TTCAT-ACAAGCTTATTTAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATT
* * * * **
176595 TTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGTTACTGGTAAC-AGTTCAAACAACTA
254 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTACT-G-AACAAGTTCAAATAGTTA
* * *
176655 TGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC
317 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
* *
176695 TTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATA-TAA
* * *
176759 TTTAATAATATTCCAAATATTAATAAGTAAGAGATTTAAAATATAAAT
64 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAAT
176807 ATGCTTGTAG
Statistics
Matches: 2331, Mismatches: 502, Indels: 296
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
336 24 0.01
337 18 0.01
338 7 0.00
339 68 0.03
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346 1 0.00
347 1 0.00
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365 2 0.00
366 1 0.00
367 3 0.00
368 1 0.00
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371 6 0.00
372 148 0.06
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374 1 0.00
376 19 0.01
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378 1 0.00
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Consensus pattern (356 bp):
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TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAA
CAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC
Found at i:175611 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 174753--176806 Score: 1718
Period size: 180 Copynumber: 11.5 Consensus size: 181
174743 TTTATTTTTA
* ** * * * * * *
174753 TCATA-AAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAG
1 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * *
174816 AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAAAAATTATC
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
174881 TATGTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTCA-
131 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AT
* ** * * *
174931 TCATACAAGCCTATTCGGTGTAAAATATTGCTAATTTACTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
1 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
174996 AGATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACGATTATA
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** * * ** * * * * *
175061 TATTTCAAATTATTATAACCTCTTGTCATGTTATAAAAAAATTATTTTTGT
131 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * ** * ** * * * *
175112 TCAAATAAGTTTATTCAAAAAAAAATAATACTAAAGTAATAATATTCTGAAAATTAATAACTAAG
1 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
175177 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCTT
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
175242 TATTTTAAA-CTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAAT
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * **
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * *** *
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** * * * * * *
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* **
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * *
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*
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*
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TTTTATTTTTTATATCTTATAT
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190420 TATATATACT
*
190430 TTA TTA TTA TTTA TATA TTA TTA TTA TTTA TCTA TTAA TTA ATA -TA
1 TTA TTA TTA -TTA T-TA TTA TTA TTA -TTA T-TA TT-A TTA TTA TTA
**
190476 TTA TCC TTA TTA TTA TT- TT- TTA TT- TTA TT
1 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TT
190505 GTTTATTTTA
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TTA
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*
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*
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TATTATTATTTATA
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190420 TATATATACT
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* **
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*
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*
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* *
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*
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TTTATTATTATTAATATATTATCATTA
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*
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TTATTTTATTTT
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191317 TTTTTATTTT
*
191327 TTATTTATTATTATTATTA
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1 TTATTTATT-ATTATAATTA
191365 GAATTGTTTA
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* * *
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* ** * *
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* ** *
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* * ***
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191413 ATAAAATTCA
* *
191423 AAAAAAAATATTTTTGA-AGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTTCTTAAAAATAAGCTTTTTAAAA
1 AAAAAAAATATTTTTGAGA-AAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAAAAATAAG-TTTTCAAAA
*
191487 AT-ATTTTTGGGGAAAAGTTAAAAGTATCAATTTTCCTTGAAAATAAGCTTTCT
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* *
191540 AAAAAAAATATTTTTGGGAAAAAGTTGAAATTATCAATTTTCCTTAAAAATAAGTTTTCAAAAAT
1 AAAAAAAATATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAAAAATAAGTTTTCAAAAAT
*
191605 GGATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCC
66 -GATTTTTGAGGAAAAGTTAAAAGTATCAATTTTCC
191641 CTACACAAAA
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Indices: 191423--191640 Score: 275
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191413 ATAAAATTCA
* *
191423 AAAAAAAATATTTTT-GAAGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTTCTTAAAAATAAGCTTTT
1 AAAAAAAATATTTTTGGGA-AAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAAAAATAAGCTTTT
* * * *
191482 --TAAAAATATTTTTGGGGAAAAGTTAAAAGTATCAATTTTCCTTGAAAATAAGCTTTCT
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*
191540 AAAAAAAATATTTTTGGGAAAAAGTTGAAATTATCAATTTTCCTTAAAAATAAG-TTTT
1 AAAAAAAATATTTTTGGGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTAAAAATAAGCTTTT
* ***
191598 CAAAAATGGATTTTTGAGG-AAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCC
1 AAAAAAAATATTTTTG-GGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCC
191641 CTACACAAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
57 48 0.35
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192120 TTGTCGAACC
* * * * * * * * *
192130 AATTCAAATAGTTAAGACCATTAGAACAATTATTTATTTCAATTCATTCTAACCTTTTGTTTAGT
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** * * * ** * * * *
192195 CATAAAATAATTATTTCAGTTCATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAGTACTTTATTAACAT
66 CATAAAACCATTGTTTTAGATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
192260 ATGAAAAATTAATGAGCAAGAGA-TT-AACAA-AAATTGTTTACCAAACA
131 -TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTATTTACTAAACA
** * * * * * * * *
192307 TGTTCAAATAGATT-TAAGTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTCTTG
1 AATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTG
* * * * * * * *
192371 TGATAAAA-CATT-TCTTCA-ATTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACCACTTTACTAA
65 TCATAAAACCATTGT-TTTAGA-TCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ** * *
192433 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT---AACTAAAGCTATTTTTTGAACT
128 TATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTATTTACTAAACA
* * * * * * * * * *
192484 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAAATATCAATCTAAAATAGTTATGATCC--TTATTTTC
1 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTATTTTG
* * * * * **** * *
192547 TGATAAAACAATTGTTTTTGATCTTACAAGCTT-TTTTGAAT-AAA-AATATTAATTTAATAATA
65 TCATAAAACCATTGTTTTAGATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * *
192609 TTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTTAAAAAA-ATA-TGTTTGTTGAACC
130 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTATTTACTAAACA
* * * * * * * * *
192655 AGTTCAAATAGTTAAGACT-TCTAGAATAATTATCTATTTCGAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAG
1 AATTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTG
* ** * * ** * * *
192719 TCATATAATAATTGCTTTAGTTTGTACAAGCTTAAT-CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
65 TCATAAAACCATTGTTTTAGATCATAAAAGCTT-ATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
192783 ATTAAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
129 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TATTTACTAAACA
* * * ** *
192837 AATACAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGGCATGACCTTTTATTTTGT
1 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGT
* *
192902 CATAAAACCATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA-AATACTACTTTATTAATAT
66 CATAAAACCATTGTTTTAGATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* **
192966 TTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAATTTA-TCAAAGT
131 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-ATTTACT-AAACA
* * * * * * * *
193017 AGTTCAAATAATTATTACCATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTTGT
1 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGT
* ** ***
193082 CTTAAAA-CAGTTGTTCTTCA-AT-ATACGAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
66 CATAAAACCA-TTGTT-TT-AGATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *
193144 TATTTTAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACC
128 TA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTATTTACTAAACA
* * * * *
193194 ATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGT
193259 CATAAAAC
66 CATAAAAC
193267 AATTATTTCT
Statistics
Matches: 746, Mismatches: 171, Indels: 85
0.74 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
170 3 0.00
171 51 0.07
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174 37 0.05
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182 97 0.13
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGT
CATAAAACCATTGTTTTAGATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTATTTACTAAACA
Found at i:193594 original size:510 final size:522
Alignment explanation
Indices: 192787--194116 Score: 1525
Period size: 510 Copynumber: 2.5 Consensus size: 522
192777 ATTAACATTA
* * * * * * * *
192787 AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATACAAATGGTTAT
1 AAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTGCCAAACTAATTCAAATAGTTAA
* * * ** * * *
192852 GACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGGCATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACCATTGTT
65 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTATT
*
192917 TTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG
129 TTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAAATACTACTTTATTAAAATTTCAAAAGTTAATAAG
* * *
192982 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTAATTTATCAAAGTAGTTCAAATAATTATTACCATTTGAACAAC
194 --AGAGATTTAAAAAATAAATTAATTTACCAAAGTAGTTCAAATAAGTATGACCATTTGAACAAC
* * *
193047 TACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAACAGTTGTTCTTCAATATACGAGC
257 TACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTCTTCAACATACAAGC
* *
193112 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATA
322 TTATTTGAAAT-AAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATA
* * *
193177 AATTTATTTACTAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATTGT
386 AATCTATTTACTAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTATCTATTTCAAATTGT
* *
193241 TATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTTGTATAGGC-T-T-AT-T-C-AA-AA
451 TATAACCTTTTGTTCTATCAT-AAACAATTACTTCTATTCGTATAGGCTTATAATATACTAATAA
193299 T-A-A-TC
515 TAATATTC
* * *
193304 AAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTATTTGCCAAATTAGTTCAAATAGTTAAG
1 AAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACTAATTCAAATAGTTAAG
* * * *
193368 ACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTATTGCTTTGTCATAAAACAATTATTT
66 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTT
* * *
193433 TAGTTCATATAAGCTTATCCCAAA-AAAAAATATTACTTTATTAAAATTTCAAAAGTTAATAAG-
130 TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAAATACTACTTTATTAAAATTTCAAAAGTTAATAAGA
* * * *
193496 G-GATTTAGAAAATAAATTAGTTTACCGAAA-TAGTTCAAATAAGTATGACCATTTGAATAACTG
195 GAGATTTAAAAAATAAATTAATTTACC-AAAGTAGTTCAAATAAGTATGACCATTTGAACAACTA
* * *
193559 CCTATTTCAAATCATTATTA-TTTCTTATTTTGTCTTAAAATAATTGTTTTTCAACATACAAGCT
259 CCTATTTCAAATCATTATTACCTT-TTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTCTTCAACATACAAGCT
* * *
193623 TATTTGAAATAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTACA
323 TATTTGAAATAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
** *
193688 TCTATTTACTAATTCAATTCACATAGTTATGACTATTTAAACAATTTATCTATTTCAAATTGTTA
388 TCTATTTACTAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTATCTATTTCAAATTGTTA
*
193753 TAACCTTTTGTTCTATCATAAATAATTACTTCTATTCGTATAGGCTTATTTAGAATAAAATAATA
453 TAACCTTTTGTTCTATCATAAACAATTACTTCTATTCGTATAGGC----TT---AT--AAT-ATA
193818 CTAATTTAATAATATTC
508 CTAA--TAATAATATTC
* * * *
193835 TAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAACTAATTCAAACAGTTAA
1 AAAAAATTAATAACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACTAATTCAAATAGTTAA
193900 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTGTCATAAAACAATTATTT
65 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTT
* *** * * * * *
193964 TAGCTT-ATACAAGCTTA-CTTGGAATAGAATAAA-ACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTTAT
130 TAG-TTCATAAAAGCTTATC-CAAAATA-AA-AAATACTACTTTATTAAAATTTCAAAAGTTAAT
* * * * ** * * * *
194026 AAGTAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTTATCGAACCAGTTCAAATGATTATAACTATTTGAA
191 AAG--AGAGATTTAAAAAATAAATT-AATTTACCAAAGTAGTTCAAATAAGTATGACCATTTGAA
* * *
194090 CAATTATCAATTTCAAATCATTATTAC
253 CAACTACCTATTTCAAATCATTATTAC
194117 TAATTTATTC
Statistics
Matches: 684, Mismatches: 89, Indels: 59
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
509 113 0.17
510 155 0.23
511 4 0.01
514 38 0.06
515 104 0.15
517 23 0.03
518 1 0.00
521 2 0.00
523 1 0.00
524 1 0.00
525 2 0.00
528 3 0.00
529 1 0.00
530 2 0.00
531 57 0.08
532 6 0.01
533 101 0.15
534 3 0.00
536 7 0.01
537 60 0.09
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (522 bp):
AAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACTAATTCAAATAGTTAAG
ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTTT
AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAAATACTACTTTATTAAAATTTCAAAAGTTAATAAGAG
AGATTTAAAAAATAAATTAATTTACCAAAGTAGTTCAAATAAGTATGACCATTTGAACAACTACC
TATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTCTTCAACATACAAGCTTAT
TTGAAATAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
ATTTACTAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTATCTATTTCAAATTGTTATAA
CCTTTTGTTCTATCATAAACAATTACTTCTATTCGTATAGGCTTATAATATACTAATAATAATAT
TC
Found at i:194205 original size:118 final size:118
Alignment explanation
Indices: 193997--194231 Score: 298
Period size: 118 Copynumber: 2.0 Consensus size: 118
193987 ATAGAATAAA
* * * *
193997 ACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTATCGAA
1 ACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAAATCTATTTACCAAA
*
194062 CCAGTTCAAATGATTATAACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATT
66 CCAGTTCAAATGATTATAACTATTTGAACAATTATCAATTCCAAATCATTATT
* *
194115 ACTAATTTATTCATA-TTTAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTA-AAAACTAAATCTATTTGCC
1 ACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAGAAAA-TAAATCTATTTACC
* * * * *
194177 AAACCATTTCAAAT-AGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAAATCATTAT
63 AAACCAGTTCAAATGA-TTATAACTATTTGAACAATTATCAATTCCAAATCATTAT
194232 AACCTTTTAT
Statistics
Matches: 101, Mismatches: 12, Indels: 8
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
117 9 0.09
118 90 0.89
119 2 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (118 bp):
ACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAAATCTATTTACCAAA
CCAGTTCAAATGATTATAACTATTTGAACAATTATCAATTCCAAATCATTATT
Found at i:194418 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 194114--195758 Score: 449
Period size: 181 Copynumber: 9.1 Consensus size: 181
194104 AAATCATTAT
* * * * * * ***
194114 TACTAATTTATTCATATTTAGAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTGCCAA
1 TACTAATTTAATAATATTTAGAAAATTAATCAACAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAAAGCCAA
* * ** * *
194179 ACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTTATTT
66 ACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTGATTT
*
194244 TGTCATCAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
131 TGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
* *
194295 TACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAAT-AACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAAAGCCA
1 TACTAATTTAATAATATTTAGAAAATTAATCAA-CAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAAAGCCA
* * * *
194359 AACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTGGTT
65 AACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTGATT
* * * * *** *
194424 TTGTCATAAAATAATT-GTTTTGTTCG-TACAAGCCTATTC-AGATAAAAATAA
130 TTGTCATAAAACAATTGGTTCTATT-GATACTATTTTATTCAAAAT-AAAATAA
* * * * * * * * ***
194475 TACCAATTTAATAATAGTTCA-AAAATAAAT-AAGTACGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C
1 TACTAATTTAATAATA-TTTAGAAAATTAATCAA-CAAGAAAATTAAAAAATAAATCT-AAAAGC
* * * * * * * *
194537 CAAATC-AGTTTAAATGGCTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTT
63 CAAA-CAAGTTCAAATAGTTAGGACTATAT-GAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACC-TT
* * * * * ** * * *
194600 TG-TTTAGTCATAAAACAATT-GTTTTAGATCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAA
125 TGATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * * * ***
194656 TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT-AAGAA-AGAGATTAAAATAAATAAATTTGTTTA-
1 TACTAATTTAATAATATTTAGAAAATTAATCAACAAGA-AAATT-AAA-AAATAAATCT-AAAAG
** * * * * * * * * *
194718 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACAATTTGAACAATTGTCAATT-TAGAAGCTTTAAAACCTTT
62 CCAAACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCA-AATCATTATAACC-TT
* * * * * **
194782 TGA-CTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAA
125 TGATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTA-TTCAAAATAAAATAA
* * * * * * ***
194838 TA-TAAATTTATTAATATTAAGACAATTAAT-AAGTAA-AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTA-
1 TACT-AATTTAATAATATTTAGAAAATTAATCAA-CAAGAAAA-TTAAAAAATAAATCT-AAAAG
* * * * ** * * * ** ** *
194899 CCGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTTATGGCTTT
62 CCAAACAAGTTCAAAT-AGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCAA-ATCATTATAAC-CT
* * * * * ** *** *
194963 TTG-TTTTATCATAAAACTATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTGGATTAAAATAA
124 TTGATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
** * * * * * ****
195020 TTTTAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAAT-AAGTAA-AAGATTCAAAAAATAAATATGTTTGC
1 TACTAATTTAATAATATTT-AGAAAATTAATCAA-CAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTAAAAGC
* * ** * * * * **
195082 CAAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTC
63 CAAACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTGA
* ** * ** ** *
195147 TTTTGTAATAAAACAATTATTTCAATTCG-TA-TAAGCTTATTTGAAGTAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATT-GATACT-ATTTTATTCAAAATAAAATAA
* * * ** ** *
195201 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATGAATAAGAAAATTAAAAAAGGAATCTATTTA-CT
1 TACTAATTTAATAATATTT-AGAAAATTAATCAACAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA-AAAGCC
* * * * * * * ** * *
195264 TAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATAT-AAAAAAATTATGACCTTTCA
64 AAACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTAT-TCCAAATCATTATAACCTTTGA
* * * * * * ** * *
195328 TTTTATCTTAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTAGAATAAAATAA
128 TTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
* ** * * *****
195382 TA-TAAATTTATTAATACTTTA-AAAATTAAT-AAGTTA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTC
1 TACT-AATTTAATAATA-TTTAGAAAATTAATCAA-CAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAAAGC
** ** * * * * * * * * *
195443 TTAACTTGTTCAAAAATTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAACCATTATGACCTTTTG
63 CAAACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACC-TTTG
* * * * ** ***
195508 -TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTGTAATAAAATAA
127 ATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * ***
195562 TACTAATTTATTAAAATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-
1 TACTAATTTAATAATATTT-AGAAAATTAATCAA-CAAGAA-AATTAAAAAATAAATCT-AAAAG
* *** * ** * * * * * * *
195623 CCGAGTGAGTTTAAATAGTTATAAATAT-TTAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAAACTTTT
62 CCAAACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCAAATCATTAT-AACCTTT
* * * * ***
195687 G-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAA
126 GATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
* *
195742 TATTAATTTATTAATAT
1 TACTAATTTAATAATAT
195759 AATAAAATTA
Statistics
Matches: 1159, Mismatches: 250, Indels: 111
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
179 11 0.01
180 379 0.33
181 474 0.41
182 282 0.24
183 13 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TACTAATTTAATAATATTTAGAAAATTAATCAACAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAAAGCCAA
ACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTGATTT
TGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
Found at i:194572 original size:479 final size:479
Alignment explanation
Indices: 193666--194590 Score: 1062
Period size: 479 Copynumber: 1.9 Consensus size: 479
193656 TTCAAGAATT
* * * ** *
193666 AATAAGAGATTTAAAAAGTACATCTATTTACTAATTCAATTCACATAGTTATGACTATTTAAACA
1 AATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* ** * *
193731 ATTTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAATAATTACTTCTATTCGTATAG
66 ATTTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAACAATTACTTCTATTCGTATAG
* * * **
193796 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTA
131 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACCAAGAGAAATTA
*** * * *
193861 AAAAATAAATCTATTTGTCGAACTAATTCAAACAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA
196 AAAAATAAATCTAAAAGCCAAACTAATTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCA
** * * * *
193926 AATTGTTATGACCTTTTGTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTTATACAAGCTTACTTGGAATAG
261 AATCATTATAACCTTTTGTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTTATACAAGCCTACTTAGAATAA
* * * * ** *
193991 AATAAAACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTT
326 AATAAAACCAATTTAATAATAGTTCAAAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
* * * *
194056 ATCGAACCAGTTCAAATGATTATAACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTACTAAT
391 ACCAAACCAGTTCAAATGACTATAACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTACTAAT
194121 TTATTCATATTTAGAAAATTAATC
456 TTATTCATATTTAGAAAATTAATC
* * * * *
194145 AATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATA
1 AATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* * **
194210 A-TTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATT-GATAC
66 ATTTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCAT-AAACAATTACTTCTATTCG-TA-
** * * *
194273 TA-TTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGA-AAA
128 TAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACCAAGAGAAA
* * **
194336 TTAAAAAATAAATCTAAAAGCCAAAC-AAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATGATTATTTAT
193 TTAAAAAATAAATCTAAAAGCCAAACTAA-TTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTAT
* * * *
194400 TTCAAATCATTATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-G-TTCGTACAAGCCTA-TT
257 TTCAAATCATTATAACCTTT--TGTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTT-ATACAAGCCTACTT
* *
194462 CAG-ATAAAAATAATACCAATTTAATAATAGTTCAAAAATAAATAAGTACGAGATTTAAAAAATA
319 -AGAAT-AAAATAAAACCAATTTAATAATAGTTCAAAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-
* * * * *
194526 AATT-TGTTTACCAAATCAGTTTAAATGGCTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA
381 AATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATGACTATA-ACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATCA
194589 TT
445 TT
194591 TTGACCTTTT
Statistics
Matches: 367, Mismatches: 68, Indels: 22
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
477 2 0.01
478 110 0.30
479 229 0.62
480 26 0.07
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (479 bp):
AATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
ATTTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAACAATTACTTCTATTCGTATAG
GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACCAAGAGAAATTA
AAAAATAAATCTAAAAGCCAAACTAATTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCA
AATCATTATAACCTTTTGTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTTATACAAGCCTACTTAGAATAA
AATAAAACCAATTTAATAATAGTTCAAAAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
ACCAAACCAGTTCAAATGACTATAACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTACTAAT
TTATTCATATTTAGAAAATTAATC
Found at i:194987 original size:19 final size:22
Alignment explanation
Indices: 194963--195002 Score: 59
Period size: 19 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
194953 TTATGGCTTT
194963 TTGTTT-TA-TCATA-AAACTA
1 TTGTTTCTATTCATACAAACTA
194982 TTGTTTCTATTCATACAAACT
1 TTGTTTCTATTCATACAAACT
195003 TATTTGGATT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 3
0.86 0.00 0.14
Matches are distributed among these distances:
19 6 0.33
20 2 0.11
21 5 0.28
22 5 0.28
ACGTcount: A:0.33, C:0.15, G:0.05, T:0.47
Consensus pattern (22 bp):
TTGTTTCTATTCATACAAACTA
Found at i:195710 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 194114--196396 Score: 1748
Period size: 180 Copynumber: 12.7 Consensus size: 181
194104 AAATCATTAT
* * * * *
194114 TACTAATTTATTCATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTGCC
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * *
194177 AAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATAACCTTTTAT
64 AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * * * ** **
194242 TTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTGATACTATTTTATTCAAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* ** * ** * ***
194295 TACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCT-AAAAGCC
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CC
** * ** * *
194358 AAACAAGTTCAAATAGTTAGGACTATATGAATGATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTGGT
64 AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * * * * *
194423 TTTGTCATAAAATAATTGTTT-TGTTCGTACAAGCCTA-TTCAGATAAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAA
* * * * ** *
194475 TACCAATTTAATAATAGTTCAAAAATAAATAAGTACGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
* * * * * *
194540 ATC-AGTTTAAATGGCTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGT
66 A-CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * *
194603 TTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGATCATACAAGCTTATTT-AGAATAAATTAA
129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAA
* * *
194656 TACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTAAAATAAATAAATTTGTTTAC
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * *
194719 CAAACAAGTTCAAATAGTTATTACAATTTGAACAATTGTCAATTT-AGAAGCTTTAAAACCTTTT
63 CAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATAACCTTTT
** * * *
194783 GACTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAA
127 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * *
194838 TA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTAC
1 TACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * ** ** *
194900 CGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTTATGGCTTTT
63 CAAACAAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATAACCTTT
* * * * *
194964 TGTTTTATCATAAAACTATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTGGATTAAAATAA
126 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
** * * * *
195020 TTTTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTCAAAAAATAAATATGTTTGCCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
* * * * * *
195085 ATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTCTTT
66 ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * * * * *
195150 TGTAATAAAACAATTATTTCAATTCGTATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAA
131 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* ** * *
195201 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAA-TAAGAA-AATTAAAAAAGGAATCTATTTACT
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * * ** * **
195264 TAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATATAAAAAAATTATGACCTTTCAT
64 AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * * * *
195329 TTTATCTTAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTT-AGAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAA
* * * *
195382 TA-TAAATTTATTAATACTTT-AAAAATTAATAAGTTAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCT
1 TACT-AATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* ** * * * * * *
195444 TAACTTGTTCAAAAATTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAACCATTATGACCTTTTGT
64 AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * *
195509 TTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTGTAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* *
195562 TACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
*** * * * * *
195627 GTGAGTTTAAATAGTTATAAATATTT-AACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTT
66 ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * *
195691 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAA
131 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * *** * * ***
195742 TATTAATTTATTAATA--TAATAAAATTAATGAGTTGGAGACTTAAAAAATTAATCTGTTTATTG
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * * * ** ** *
195805 AACAAATTCAAATAGTCACATCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-ATTTT-T
65 AACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGT
** * * ** **
195868 TGTTACCATAAAACAGTTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAA
129 T-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * * *
195922 TATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTATTGACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
* * * * * ***
195983 ACTAGTTCAAATTA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCTAATCATTAT-GTTTTTTGTT
66 ACAAGTTCAAA-TAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTT
* * * ** *
196046 TTGTCATAAAACAATTGCTTCCATTCATATAAGCTTATTTGGGGA-AAAATAT
130 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAA
* ** * * * * * * * *
196098 TGCTAAACTAATAATATTT-TAAAATTAATAAGCAATAGATTTAAAAAGTAAATGTGTTTGTCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCA
* * ** * * * * *
196162 ACCAA-TTCAAATAGTTA-AGAATATTACAATAATTATCTATTTTAAATCGTTTTGACCTTTTGT
65 AACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * * * **
196225 TTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAA
129 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * * * * * **
196278 TATTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAAGAAATATGTTTATT
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * *
196342 GAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
64 AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
196397 GAACTAAAAC
Statistics
Matches: 1651, Mismatches: 385, Indels: 131
0.76 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
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176 54 0.03
177 60 0.04
178 6 0.00
179 120 0.07
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184 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
Found at i:196171 original size:356 final size:357
Alignment explanation
Indices: 194145--196310 Score: 921
Period size: 361 Copynumber: 6.0 Consensus size: 357
194135 AAAATTAATC
* * * * * *
194145 AATAAG-AGATTTAAAAACTAAATCTATTTG-CCAAAC-CATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGA
1 AATAAGAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTGACC-AACTGAGTTCAAATAGTTATAAATATTT-A
* * * * * * *
194207 ATAATTATCTAT-TCCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTGAT
63 ACAATTATCTATCT-CAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCATTCAT
* ** *** ** ** * * * *
194271 ACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAA
127 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAACTAATAATATAAT-AAAATTAATAAGCAAGAGAC
*** * * * * * * * *
194336 TTAAAAAATAAATCT-AAAAGCCAAACAAGTTCAAATAGTTAGGACTA-TATGAATGATTATTTA
191 TTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACAAATTCAAATAGTTAAGAATATTA-CAATAATTATCTA
* * * * * * * * ***
194399 TTTCAAATCATTAT-AACCTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TGTTCGTACAAGCCTATT
254 TTTCAAATCGTTATGAA-ATTTTGTTTAGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAAATTATT
* ** * * * *
194462 C-AGATAAAAATAATACCAATTTAATAATAGTTCAAAAATA
318 CAAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATT
* * * * * * * * *
194502 AATAAGTACGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAGTTTAAATGGCTA-AGACTATTA
1 AATAAG-A--AGATTTAAAAAATAAATCTATTGACCAACTGAGTTCAAATAGTTATA-AATATT-
* * * * * * ** *
194566 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-TTTTAGATC
61 TAACAATTATCTATCTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCA-TTC
* * ** * * *
194630 ATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAA-AAAATTAATAAGAAAGA
125 ATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAACTAATAATA-T-AATAAAATTAATAAGCAAGA
* * * * * * *
194694 GA-TTAAAATAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACAAT-TT-GAACAATT
188 GACTT-AAA-AAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTA--AGAATATTACAATAATT
* * * * * * * *
194756 GTCAATTT-AGAAGC-TT-TAAAACCTTTTGACTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACA
249 ATCTATTTCA-AATCGTTATGAAA--TTTTG-TTTAGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
** * *
194817 AGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATT
310 AAATTA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAA-A-AATT
* * * * * * * *
194865 AATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATCA-TTATGACTATT
1 AATAAG---AAGATTTAAAAAATAAATCTATTGACC-AACTGAGTTCAAAT-AGTTATAAATATT
* * * * ** ** * * * *
194928 TGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTT-TATGGCTTTTTGTTTTATCATAAAACTATTGTTTCTAT
61 T-AACAATTATCTATCTCAAATCATTATA-AAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCAT
* * ** ** * * *
194992 TCATACAAACTTATTTGGATTAAAATAATTTTAATTTATTAATAT-TTCAACAATTAATAAGTAA
123 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAACTAATAATATAAT-AA-AATTAATAAGCAA
* * ** * * * * * **
195056 AAGA-TTCAAAAAATAAATATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATT
186 GAGACTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTA-AGAATATTACAATAATT
* * ** * * ** * * * * **
195119 ATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTATTTCAATTCGTATAAGCT
249 ATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTAGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAAAT
** * * *
195184 TATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
314 TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATT
* * ** * * * * * *
195228 AATGAATAAGAAAATTAAAAAAGGAATCTATTTACTTAAC-AAGTTTAAATAGTTATGACTATCT
1 AAT-AAGAAG--ATTTAAAAAATAAATCTATTGAC-CAACTGAGTTCAAATAGTTATAAATAT-T
* * * ** * * ** * * * **
195292 AAACAATTATCTATATAAAAAAATTATGACCTTTCATTTTATCTTAAAACAATTGGTTCTGTTCA
61 TAACAATTATCTATCTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCATTCA
* * * * * *
195357 TGCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATACT-TTAAAAATTAATAAGTTAA-
126 TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAA-CTAATAATA-TAAT-AAAATTAATAAG-CAAG
* * * *** * * * * ** *
195419 A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTT-TCTTAACTTGTTCAAAAATTTATGACTATTTGAACAATTAT
187 AGACTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAATTCAAATAGTTAAGAATATTACAATAATTAT
* * * ** * * * * **
195482 CGATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTTATACAAGCTT
251 CTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTAGCCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAAATT
*** *
195546 ATTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATT
315 ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATT
* * * * *
195589 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGTGAGTTTAAATAGTTATAAATATTTA
1 AATAAG---AAGATTTAAAAAATAAATCTATTGACCAACTGAGTTCAAATAGTTATAAATATTTA
* * * * * *
195654 ACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATA
63 ACAATTATCTATCTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCATTCATA
* * ** * * ***
195719 CAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATAATAAAATTAATGAGTTGGAGACTT
128 CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAACTAATAATATAATAAAATTAATAAGCAAGAGACTT
* * * * ** *
195784 AAAAAATTAATCTGTTTATTGAACAAATTCAAATAG-TCA-CATCCATTTGAATTATTATCTATT
193 AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTAAGAAT--ATTACAATAATTATCTATT
* * * *
195847 TCAAATTGTTATGAAATTTTTTGTTA-CCATAAAACAGTTGTTTTTA-TTCATACAAAATTATTC
256 TCAAATCGTTATGAAATTTTGT-TTAGCCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAAATTATTC
*
195910 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
319 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATT
* * * *
195949 AATAAG-AGATTTAAAAACTAAATTTATTGACCAAACT-AGTTCAAATTA-TTATGACTATTTGA
1 AATAAGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTGACC-AACTGAGTTCAAA-TAGTTATAAATATTT-A
* * ***
196011 ATAATTATCTATCTCTAATCATTAT-GTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCATTCATA
63 ACAATTATCTATCTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCATTCATA
* * * * ** * *
196075 TAAGCTTATTTGGGGA-AAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAATTAATAAGCAATAGATT
128 CAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATACTAAACTAATAATATAATAAAATTAATAAGCAAGAGACT
* * * *
196139 TAAAAAGTAAATGTGTTTGTCGAACCAATTCAAATAGTTAAGAATATTACAATAATTATCTATTT
192 TAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTAAGAATATTACAATAATTATCTATTT
* * ** * * ***
196204 TAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGTTTATTCAAA
257 CAAATCGTTATGAAATTTTGTTTAGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAAATTATTCAAA
* *
196269 ATAAAATAATATTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATT
322 ATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTC-AAAAATT
196305 AATAAG
1 AATAAG
196311 CAAAAAATTT
Statistics
Matches: 1411, Mismatches: 313, Indels: 171
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
355 10 0.01
356 242 0.17
357 36 0.03
358 4 0.00
359 14 0.01
360 225 0.16
361 335 0.24
362 153 0.11
363 284 0.20
364 99 0.07
365 9 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
AATAAGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTGACCAACTGAGTTCAAATAGTTATAAATATTTAACA
ATTATCTATCTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCATTCATACAA
GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAACTAATAATATAATAAAATTAATAAGCAAGAGACTTAAA
AAATAAATCTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTAAGAATATTACAATAATTATCTATTTCAAA
TCGTTATGAAATTTTGTTTAGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAAATTATTCAAAATAA
AATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATT
Found at i:196725 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 196470--198626 Score: 1843
Period size: 181 Copynumber: 12.0 Consensus size: 181
196460 AGAGAAGTTG
* ** * * * * *
196470 GAGATTTAAAAAAGAAATCAATTTA-TCGAATTAGTTCAAATAATTGTGGCCATTT-AAGCAATT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATT
* * * *
196533 ATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTCA-TCATATAAGC
64 ATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGC
* * * * *
196597 CTACTT-AGAACAAAAAAATACTAATTTGTTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAA
128 TTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* ** *
196651 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAAGGAACTATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
196716 AC-ATTTCAAATCGTTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTAG-TTATGTTCATACAATC
66 -CTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGC
* * * * * * *
196778 TGATT-TGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAA
128 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
196832 GAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTAAAGGCTATATGAATAATTAT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * *
196896 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTT
66 CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * *
196961 GTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--T-ACTAA
130 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
197009 GAGATTTAAAATATAAATCTATTTA-TGAAACTAGTTTAATTAGTTATAACAATTTGAATAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
197073 TTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATACAACAATTG-TTCTATTGATA-TAGTTT
65 TCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CT
** * * *
197136 TATTTGGAATAAAATAAT-GTGAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAA
129 TATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
197189 CGA-ATTTAAAAAAATGAATCTGTTGT-CAT-AACTAGTGCAAATAATTATAATTGTTTGAATAA
1 -GAGATTT-AAAAAATAAATCTGTT-TAC-TGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * **
197251 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAG
62 TTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * ** *
197316 CTTATTCGGAATAGAATAATTTTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
127 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
197371 GAGGTTTAAGAACT---T-TGTTTATTGAACAAGTTTAAACAGTTATGATTATTTGAACAATTA-
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * * *
197431 CTTATTTGAAATCACTGT-AACCTTTTGTTTTGTCATAGAATAATTTTTTCTATTCATACAAGTT
66 C-TATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * * **
197495 TATTTCA-ATTAAAATAATACAAATATATTAATA-TTTAGACAATTAATAAACAA
129 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
197548 AAGATTTAAAAAATAACTATATTTACCGAA-TAAATTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAA-AATT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAA-T
* * *
197610 TATTTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAA
63 TATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAA
* * ***
197673 GCTTATTC-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTTTCAATTAATAAGTAA
126 GCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
197729 CAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAATAATCAT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * ** * * * * * *
197793 CTATTTCAAATTGTTATGACCCTTTGTTTCATCATAAAATAATTATATCAATTCATATAGGCTTA
66 CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * *
197858 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAA
131 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * ** ** * * *
197909 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATATAAACAATTTT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
197974 CTACTTCAAATTGTTATGATA-TTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTT
66 CTATTTCAAATCGTTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
**
198038 ATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
130 A-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
198090 -A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAAC-ATGTTCAAATAGTTATAACTATTTTAACAATT
1 GAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** *
198152 ATCTATTTCAAATAATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGC
64 ATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * * *
198216 GTATTTAAAAT-AAATAGTACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
128 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
198269 AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG-AGTAAGTACAAATAGTTATGCCTATTTGAATAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
198333 TTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTT
65 TCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * **
198398 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAGTTAATGGGTAA
130 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
198450 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TATGTTCAAATAGTCATGTCTATATGAACAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* **
198514 TCTATTTCAAATCGTTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAAT
65 TCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* *
198578 TATTCAAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
129 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
198627 AGATTTAAAA
Statistics
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182 75 0.05
183 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
Found at i:197935 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 196470--198657 Score: 1946
Period size: 361 Copynumber: 6.1 Consensus size: 361
196460 AGAGAAGTTG
* * * * * * * *
196470 GAGATTTAAAAAAGAAATCAATTTATCGAATTAGTTCAAATAATTGT-GGCCATTT-AAGCAATT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAA-TAATT
* * ** *
196533 ATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTCATCATATAAGC
64 ATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC
* * * * * * * *
196597 CTACTTAGAACAAAAAAATACTAATTTGTTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAA
128 TTA-TTCGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAA
* ** * * *
196662 AATAAATTTGTTTAAGGAACTATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATAC-ATTTCAAA
192 AATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT-CTATTTCAAA
* * * * * * **
196726 TCGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTAG-TTATGTTCATACAATCTGATTTGAAATA
256 TCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * *
196790 AAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAA
320 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA
* * * ** ** ** * *
196832 GAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTAAAGGCTATATGAATAATTAT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * *
196896 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTT
66 CTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
* *
196961 GTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--T-ACTAAGAGA-TTTAAAAT
130 ATTC-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA-
* * * * * * * *
197021 ATAAATCTATTTA-TGAAACTAGTTTAATTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
193 ATAAATATGTTTATTG-AACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * ***
197085 CGTTATGACCATTTGTTTTGTCATACAACAATTG-TTCTATTGATA-TAGTTTTATTTGGAATAA
257 CGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAA
* *
197148 AATAAT-GTGAATTTATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGTAA
321 AATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * * *
197189 CGA-ATTTAAAAAAATGAATCTGTTGT-CATAACT-AGTGCAAATAATTATA-ATTGTTTGAATA
1 -GAGATTT-AAAAAATAAATCTATT-TACCGAA-TAAGTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAATA
* * * **
197250 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAA
61 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
* * * *
197315 GCTTATTCGGAATAGAATAATTTTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-GTTTA
126 GCTTATTC-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTA
* * * * * *
197379 AGAACT---T-TGTTTATTGAACAAGTTTAAACAGTTATGATTATTTGAACAATTA-CTTATTTG
190 A-AAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC-TATTTC
** * * * * *
197439 AAATCACTGTAACCTTTTGTTTTGTCATAGAATAATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTC-AA
253 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA
* * * * **
197503 TTAAAATAATACAAATATATTAATATTT-AGACAATTAATAAACAA
317 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA
* * * *
197548 AAGATTTAAAAAATAACTATATTTACCGAATAAATTCAAATAGTTTAGACTATTTGAA-AATTTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAATAA-TTA
*
197612 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATACAAGCT
65 TCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCT
* *** *
197676 TATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTTTCAATTAATAAGTAACAGATTTTAAAA
129 TATTCGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA
* * * *
197741 ATAAATATGTTTATTGAACAAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAATAATCATCTATTTCAAATT
193 ATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * ** * * * * * *
197805 GTTATGACCCTTTGTTTCATCATAAAATAATTATATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAA
258 GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
*
197870 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAA
323 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
197909 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAAAAAGTTCAAATAG-TTATGACTATATAAACAATTT
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAATAATTA
* * * *
197973 TCTACTTCAAATTGTTATGA-TATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCT
65 TCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT
* * **
198037 TATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAA
129 TA-TTCGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTT-AAA
* *
198100 AATAAATATGTTT-TCTGAACATGTTCAAATAGTTATAACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAA
192 AATAAATATGTTTAT-TGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * *
198164 TAATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTTAAAAT-A
256 TCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* *
198228 AATAGTACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
321 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
198269 AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGTAAGTACAAATAG-TTATGCCTATTTGAATAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
198333 TTTATTTCAAATAGTTATGA-TCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTT
65 TCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT
* * * * * ** *
198397 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAGTTAATGGGTAAGAGATTTAAAAA
129 TATTC-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA
* * * * * * ** *
198462 ATAAATCTATTTACTGAATATGTTCAAATAGTCATGTCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC
193 ATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * **
198527 GTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAA
258 GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
**
198592 -AATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAA
323 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* *
198626 GAGATTTAAAAATTAGATCTATTTACCGAATA
1 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATA
198658 TTTTCTAAGT
Statistics
Matches: 1483, Mismatches: 283, Indels: 125
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
355 1 0.00
356 3 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (361 bp):
GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAATAATTAT
CTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
TTCGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATA
AATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
Found at i:198855 original size:45 final size:45
Alignment explanation
Indices: 198804--198897 Score: 170
Period size: 45 Copynumber: 2.1 Consensus size: 45
198794 TAACTAATTG
198804 AATTGATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATT
1 AATTGATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATT
* *
198849 AATTGATTTGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACATATT
1 AATTGATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATT
198894 AATT
1 AATT
198898 TTCAAGATAT
Statistics
Matches: 47, Mismatches: 2, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
45 47 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.06, T:0.47
Consensus pattern (45 bp):
AATTGATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATT
Found at i:199373 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 199137--199865 Score: 625
Period size: 181 Copynumber: 4.0 Consensus size: 180
199127 ATTTTACAAT
* * * * * * * *
199137 AAAATAAAATGTCATACCTATTTGAAATAGATAATTGCTCATATAGCTTTAATTATTTGAAGTGG
1 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TTTAACTATTTGAACTGG
* * * *
199202 TTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATCATCAAAATATTATTAGATTAGT
65 TTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATCTTCAAAATATTATTAAATTAGT
* *
199267 ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC
130 ATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAC
* * * * * **
199318 AAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTAAAATAGTTATAATTATTTGATTTGG
1 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTT-TAACTATTTGAACTGG
* * * * ** * * * *
199383 TTCT-ATAAATAAATTTATTTTTGAAATATCTTACCTATAAAATTTTC-AAATGTTAATAAATTA
65 TT-TGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT-TAATCTTCAAAATATTATTAAATTA
* * * ****
199446 ATTTTATTTTATTAC-GAATAAACTTCG-ATGAGTTGAAATAATTGTTTTAT-AGC
128 GTATTATTTTATT-CTAAATAAACTT-GTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA-C
* * * *
199499 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACGATTTGAACTAG
1 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TTAACTATTTGAACTGG
* * * * * *
199564 TTTGACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAG
65 TTTGACAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATCTTCAAAATATTATTAAATTAG
* * * * * *
199629 TATTATTTTATTTTGAATAAATTTATATGAACATAAATAATTGTTTTATGAT
129 TATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAC
* * * * * **
199681 AGAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTA
1 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TTAACTATTTGAACTGG
* ** * * * * *
199746 TATGGTAAACAGATTTATTTTTTGAA--TCTT-G-TATTAATTCTT-GAAATATTAGTAAACTAG
65 TTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TCTTCAAAATATTATTAAATTAG
* **
199806 TATTATTTTGTT-TCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGAC
129 TATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAC
199858 AAAACAAA
1 AAAACAAA
199866 GGAACTAACA
Statistics
Matches: 436, Mismatches: 97, Indels: 34
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
176 1 0.00
177 67 0.15
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180 4 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTTAACTATTTGAACTGGT
TTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATCTTCAAAATATTATTAAATTAGTA
TTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGAC
Found at i:199689 original size:363 final size:362
Alignment explanation
Indices: 199063--199738 Score: 883
Period size: 363 Copynumber: 1.9 Consensus size: 362
199053 ACTTATTAAT
* * *
199063 TTTTGAAATATTAATAAATTCAATTTATTTTATTCCGAATAAGTTAGTAAGAGTTGAAAAAATTA
1 TTTTCAAATATTAATAAATTCAATTTATTTTATTACGAATAACTTAGTAAGAGTTGAAAAAATTA
* * * * * * **
199128 TTTTACAATAAAATAAAATGTCATACCTATTTGAAATAGATAATTGCTCATATAGCTTTAATTAT
66 TTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTACTCATATAGCTTTAACGAT
* * * * *
199193 TTGAAGTGGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATCATCAAAATATTAT
131 TTGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATCATCAAAATATTAT
* *
199258 TAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAAC
196 TAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * *
199323 AAAATGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTAAAATAGTTATAATTATTTGATTTGGTTCTA
261 AAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGATTTGGTTCTA
199388 TAAATAAATTTATTTTTGAAATATCTTACCTATAAAA
326 TAAATAAATTTATTTTTGAAATATCTTACCTATAAAA
* * * *
199425 TTTTCAAATGTTAATAAATT-AATTTTATTTTATTACGAATAAACTTCG-ATGAGTTGAAATAAT
1 TTTTCAAATATTAATAAATTCAA-TTTATTTTATTACGAAT-AACTTAGTAAGAGTTGAAAAAAT
* * * *
199488 TGTTTTATAGCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAG-TCTTAAC
64 TATTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTACTCATATAGCT-TTAAC
* ** * *
199552 GATTTGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTAGTTATGAATTTTTAGAATA
128 GATTTGAACTAGTTTGACAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATCATCAAAATA
* * * * * *
199617 TTATTA-ATTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTATATGAACATAAATAATTGTTTTATGAT
192 TTATTAGA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC
* *
199681 AGAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
256 AAAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTT
199739 AAACTTATAT
Statistics
Matches: 265, Mismatches: 44, Indels: 9
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
361 3 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (362 bp):
TTTTCAAATATTAATAAATTCAATTTATTTTATTACGAATAACTTAGTAAGAGTTGAAAAAATTA
TTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTACTCATATAGCTTTAACGAT
TTGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATCATCAAAATATTAT
TAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAAC
AAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGATTTGGTTCTA
TAAATAAATTTATTTTTGAAATATCTTACCTATAAAA
Found at i:200187 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 199876--201755 Score: 1330
Period size: 181 Copynumber: 10.5 Consensus size: 181
199866 GGAACTAACA
* *** * * ** *
199876 ATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAAATGTTTTATGACAAAATGAAA-TGTAATA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATA
** * * * ** * **
199940 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GGCTATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAATTGATT
65 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATT
* * *
200004 TATTTTTTGAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
200057 ATTTTATTTTAGATAAACTTTTGTGAACAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * * *
200122 CAATTTTG-AATAGATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAATAGATTT
66 CAA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT
* * * *
200186 ATTTTTTTTTCAAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATT
130 A---TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * ** * * *
200242 A-TTTCTTTT-AATAAGCTTGTATAAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAA-TATCAAA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATA
** * * * * * * *
200304 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACTATTTGAAC-TGATTCA-CAAACACA-T
65 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAACAGATT
*
200366 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATT-ATGAAATTAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATT
** * ** *
200419 ATTTT-TATCCAAATCAACTTGTATGGTCAGAAACAATTG-TTTATGACAAAAC-AAAGATCATA
1 ATTTTAT-TTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * * * * *
200481 ACGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAAC-TGCTTCGTAAAACA-ACG
65 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGT-AAACAGA-T
* * * * * * *
200544 TTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAACTTTTGAAATATTAATCAAGTAGTATT
128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
200598 ATTTTATTTCAAA-AAAGTTTTTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAA
1 ATTTTATTTTAAATAAA-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * *
200662 ACAATTTTAAATAGATAATAGTTCAAATAG---TAA-TA--T---C-----TATTAAACGGATTT
65 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT
** * * *
200713 ATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAGTAAATTATTATT
130 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * *
200766 ATTTTATTCTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTT-AAA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATA
** ** * * ** *
200830 ATTATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTAACAAACATATTT
65 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT
* * * *
200895 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCT-AAACATTATTAAATTAGCATC
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * * * *
200947 ATTTTAATCCAAATAACCTTGTATGAAAAGAAACAACTGTTGTATGACAAAATAAAA-ATGATTA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
** * * * * * * *
201011 TGATTTGAGATAGATAGTTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAATAGATTTA
66 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA
* * *
201076 ATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATT
131 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
** ** * * * * *
201123 ATTTTATTTTGGATAATTTTATATGAACAAAAACAATTGTATTATGACAAAA-GAAAG---GTAA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
* * * * * *
201184 CAAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTGGACTTGTTTAATAAACAGATTTA
66 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA
* * * * *
201249 TTTTTTAAATCT-TCGACCTATCAA-TTTGAAGAATATTAATAAAGTAGTATT
131 TTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAA-AATATTAATAAATTAGTATT
** * * *
201300 ATTTTATTTCGAATAAACTTGTATAAATA-AGAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATTATCAT
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCAT
* * * * * * * ** * *
201363 AACTATTTGAAATAAAAAATCGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAGCTTACTCAGTAAATAGATT
64 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATT
* *
201428 TATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
129 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
201481 ATTTTATTTCAAATAAGCTT-TATGGACAAAAACAATTAG-TTTATCACAAAATAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATA
* * * * * * * * *
201544 ACTATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAATAG-CAAAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAATTT
65 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT
* * * ** *
201608 ATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAAATTTTGGAATATGAATAAATT--TAATT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * * *
201658 ATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAG-TCATA
1 ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTTCATA
** *
201722 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCAT
65 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
201756 TGTTAGCTCA
Statistics
Matches: 1335, Mismatches: 293, Indels: 144
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
167 7 0.01
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172 3 0.00
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186 7 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA
TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
Found at i:201661 original size:358 final size:352
Alignment explanation
Indices: 200957--201734 Score: 767
Period size: 358 Copynumber: 2.2 Consensus size: 352
200947 ATTTTAATCC
* * * * * * *
200957 AAATAACCTTGTATGAAA-AGAAACAACTGTTGTATGACAAAATAAAAA-TGATTATGATTTGAG
1 AAATAAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
* * * * ** * * * * **
201020 ATAGATAGTTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAAC-TAGTTTGGTAAATAGATTTAATTTTTAA
65 ATAAAAAATCGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAGCTTA-CTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAA
*** **
201084 ATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTTGGATAATTTTATATGA
129 ATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA
* *
201149 ACAAAAACAATTGTATTATGACAAAAGAAAGGTAACAAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGA
194 ACAAAAACAATTGTATTATCACAAAAAAAAGGTAACAAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGA
** ** * * * * *
201214 CATGACTATTTGGACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCGACCTATCAATTTGAA
259 CAAAACTATTTAAACGTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTAAAATCTTCGACCTATAAATTTG-A
*
201279 GAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCG
323 GAATATGAATAAAGTAG-ATTATTTTATTT-G
*
201311 -AATAAACTTGTATAAATA-AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATTA-TCATAACT-ATTTG
1 AAATAAACTTGTATAAATAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AAGTCATAA-TGATTTG
*
201372 AAATAAAAAATCGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAGCTTACTCAGTAAATAGATTTATTTTTTA
63 AAATAAAAAATCGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAGCTTACTCAGTAAATAGATTTAATTTTT-
* * * *
201437 AAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-
127 AAA--TCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* * *
201501 TATGGACAAAAACAATTAGT-TTATCACAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAA-AAGATAATT
189 TATGAACAAAAACAATT-GTATTATCACAAAA-AAAAGG---TAACAAATTGAAATAA-ATAATT
* ** *
201564 GTTTAAATAG-CAAAACTATTTAAACGTGTTCAGA-AAACAAATTTATTTTTAAAAT-TTTTACT
248 GTTCAAATAGACAAAACTATTTAAACGTGTTCA-ATAAACAAATTTATTTTTAAAATCTTCGACC
*
201626 TATTAAATTTTG-GAATATGAATAAATTTA-ATTATTTTATTTG
312 TA-TAAA-TTTGAGAATATGAATAAA-GTAGATTATTTTATTTG
* * * *
201668 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
1 AAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
201733 TA
66 TA
201735 GATAATTGTT
Statistics
Matches: 346, Mismatches: 55, Indels: 42
0.78 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
352 4 0.01
353 35 0.10
354 57 0.16
355 6 0.02
357 31 0.09
358 121 0.35
359 19 0.05
360 42 0.12
361 31 0.09
ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (352 bp):
AAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
TAAAAAATCGTTCAAACAGTCATAATTATTTGAGCTTACTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAAAT
CTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
AAAAACAATTGTATTATCACAAAAAAAAGGTAACAAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACA
AAACTATTTAAACGTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTAAAATCTTCGACCTATAAATTTGAGAA
TATGAATAAAGTAGATTATTTTATTTG
Found at i:203162 original size:27 final size:26
Alignment explanation
Indices: 203125--203188 Score: 119
Period size: 27 Copynumber: 2.4 Consensus size: 26
203115 TAAAAAGAAG
203125 CTCCCCCTGAACTTATGAAAGGCAAA
1 CTCCCCCTGAACTTATGAAAGGCAAA
203151 CTCCCCCGTGAACTTATGAAAGGCAAA
1 CTCCCCC-TGAACTTATGAAAGGCAAA
203178 CTCCCCCTGAA
1 CTCCCCCTGAA
203189 TTTGGGCATA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 0, Indels: 2
0.95 0.00 0.05
Matches are distributed among these distances:
26 11 0.30
27 26 0.70
ACGTcount: A:0.31, C:0.34, G:0.16, T:0.19
Consensus pattern (26 bp):
CTCCCCCTGAACTTATGAAAGGCAAA
Found at i:203309 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 203283--203320 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 18
203273 CAATATCAAA
* *
203283 ACATGATCAGATTTTCAT
1 ACATCATCAAATTTTCAT
203301 ACATCATCAAATTTTCAT
1 ACATCATCAAATTTTCAT
203319 AC
1 AC
203321 CAATATTTCT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 18 1.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.21, G:0.05, T:0.37
Consensus pattern (18 bp):
ACATCATCAAATTTTCAT
Done.