Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167937.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
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Warning! 165000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 194 of 195
Found at i:35734436 original size:58 final size:58
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35734363 TAAAATTCAA
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*
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* *
35734489 AAAAAAATATTTTTG-GGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTTCTTGAAAATAAATTCTC-
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** *
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* *
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AAAAAATATTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTTCTTGAAAATAAGTTTTCT
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35744849 AAAAAAAATG
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*
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AAAATGAAAAAAGAAAA
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35744839 GCTTGAAATA
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AAAAAAAATGAAAATGAAAAAAG
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1 AA
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AAAAGAAAAAAAAAGTG
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35745893 ATGATTGTCA
*
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1 AGGAGCCATTTATT-TTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
*
35745985 AGGAGCCATTTATTTTTCAAAAGTCATTGAGCCTCTGATTAG
1 AGGAGCCATTTATTTTTC-AAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
* *
35746027 AGGAGCCATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCTTCTAATTAG
1 AGGAGCCATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
* *
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* * *
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1 AGGAGCCATTTATTTTTC-AAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
* * * * *
35746152 AGGAGCCATTTATTTTCCAAATTCATTGTGCCTCTGTTTAG
1 AGGAGCCATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
* *
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*
35746235 AGGAGCTTTATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
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35746278 AGGAG-C-TTTATTCATTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
1 AGGAGCCATTTA-T--TTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
*
35746320 AGGAG-CATTGTTTATGTTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGCTTAG
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1 AGGAG
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AGGAGCCATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
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35745893 ATGATTGTCA
* *
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* *
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64 CGTTGAGCCTCTGATTAG
* * *
35746068 TA-GAGCCTTTTATTTTTCAAAAGTCGTTGAGCCACTGATTAGAGGAGCCTTTTATTTTTCAAAA
1 -AGGAGCCATTTATTTTTC-AAAGTCATTGAGCCTCTGATTAGAGGAGCC-TTTATTTTTC-AAA
* *
35746132 GTCGTTAAGCCTTTGATTAG
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* * * *
35746152 AGGAGCCATTTATTTTCCAAATTCATTGTGCCTCTGTTTAGAGGAG-CTTTATTCGTTTTCAAAG
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* *
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63 TCGTTGAGCCTCTGATTAG
* *
35746235 AGGAGCTTTATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAGAGGAG-CTTTATTCATTTTCAA
1 AGGAGC--CATTTATTTTTCAAAGTCATTGAGCCTCTGATTAGAGGAGCCTTTA-T--TTTTCAA
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* *
35746320 AGGAG-CATTGTTTATGTTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGCTTAGAGGAG
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35746370 TTTTGATCAA
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TTGAGCCTCTGATTAG
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35745893 ATGATTGTCA
* *
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* *
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* *
35746027 AGGAGCCATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCTTCTAATTAGTA-GAGCCTTTTATTTTTCAAAAG
1 AGGAGCCATTTATTTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG-AGGAGCCTTTTATTTTTC-AAAG
* * *
35746091 TCGTTGAGCCACTGATTAGAGGAGCCTTTTATTTTTCAAAAGTCGTTAAGCCTTTGATTAG
64 TCGTTGAGCCTCTGATTAGAGGAGCCTTTTATTTTTCAAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
* * * * * * **
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* * *
35746217 CGTTGAGCCTCTAAGTAGAGGAGCTTTATTTATTTTTC-AAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
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*
35746278 AGGAG-C-TTTATTCATTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAGAGGAGCATTGTTTATGTTTTT
1 AGGAGCCATTTA-T--TTTTCAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAGAGGAGC-CT-TTTA--TTTTT
*
35746341 CAAAGTCGTTGAGCCTCTGCTTAGAGGAG
59 CAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAGAGGAG
35746370 TTTTGATCAA
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GTTGAGCCTCTGATTAGAGGAGCCTTTTATTTTTCAAAAGTCGTTGAGCCTCTGATTAG
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*
35746556 TTTTGTA
1 TTTTATA
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1 TTTTATA
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1 TTTTA-TA
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1 TTTTATA
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1 TTTTATA
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1 TTTTATA
35746598 TTTT
1 TTTT
35746602 TTTCCTTTCT
Statistics
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TTTTATA
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35746536 TGGGTAGGCC
* *
35746546 TATTTTGTTTTTTTGTATTTTA
1 TATTTTATTATTTT-TATTTTA
35746568 TATTTTATTATTTTTATTTTA
1 TATTTTATTATTTTTATTTTA
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1 TATTTTATTATTTTT
35746603 TTCCTTTCTT
Statistics
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TATTTTATTATTTTTATTTTA
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35746609 TCTTTATTTC
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*
35746634 TTATTTATTTATTAT
1 TTATGTATTTATTAT
35746649 T
1 T
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TTATGTATTTATTAT
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35746614 ATTTCTTATG
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*
35746652 TATTTATTAATATATATTTAGTTATTATTATTTC
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* *
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1 TAT-TTATTATTTATTTATTTATTA-TT-AC
** *
35746716 TATTTA-TATATTATTATACATACATATT--
1 TATTTATTAT-TTATT-TATTTA-TTATTAC
*
35746744 TA-TTATTATTTATCTATTTATATATTA-
1 TATTTATTATTTATTTATTTAT-TATTAC
35746771 TAATTTATCTA-TTATTTATTT-TTATT
1 T-ATTTAT-TATTTATTTATTTATTATT
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Statistics
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TATTTATTATTTATTTATTTATTATTAC
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35746621 ATGTATTTAT
* *
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* *
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35746698 TATTTA-TTATT
1 TATTTAGTTATT
35746709 ACTTAACTAT
Statistics
Matches: 39, Mismatches: 3, Indels: 5
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* * *
35746740 TATTTATTATTATTTATCTATTTATATATTATAATTTATCTAT
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* *
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35746855 TTTATTTGAT
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Matches: 66, Mismatches: 4, Indels: 5
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TATTTATTTTTAATTATCTATTAATATTTTAATTTATCTAT
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35746734 CATACATATT
35746744 TATTATTATTTATCTATTTATA
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* *
35746766 TATTATAATTTATCTATTATT
1 TATT-TTATTTATCTATTA-A
35746787 TATTTTTATTTATCTATTAA
1 TA-TTTTATTTATCTATTAA
*
35746807 TATTTTCATTTATCTGATTATTT
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* *
35746830 TCTTTTAATTATCTATTAA
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1 TATTTTATTTAT
35746860 TTGATTTTTA
Statistics
Matches: 79, Mismatches: 10, Indels: 14
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Matches are distributed among these distances:
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TATTTTATTTATCTATTAA
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35747210 TCCAGATTTC
*
35747220 GATTGAATTTTTCCTCGAA
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*
35747239 GATTGAATTTTTCGACGAA
1 GATTGAATTTTTCCACGAA
* *
35747258 GATTAAATTTTTCAACGA
1 GATTGAATTTTTCCACGA
35747276 CTATTTTGAT
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 4, Indels: 0
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35747727 TTTTCATTTT
*
35747737 TTA TTA TT- TTA TTA TT- TTA TAA TTA TT- TTAA TTA TTA TTA TTA
1 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TT-A TTA TTA TTA TTA
35747780 TT
1 TT
35747782 TATTGATTAG
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Matches: 36, Mismatches: 2, Indels: 8
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TTA
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*
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* * *
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*
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*
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*
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* *
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* *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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*
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*
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1 GAAGTCATTTACCTTTTCTCGATGATGATATC
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* * * *
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* * *
35754884 CTGAAGTCATTTACCTTTTCTCGATGGTGATATCAGAAGTCAT
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* * * *
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* *
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35755025 TCAAGTGTCA
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CCGAAGTCATTTACATATTCTCGATGGTGATATCAGAAGTCAT
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* *
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* ** *
35755054 TCAGTGGTGATATTTGAAGTCATTTGCATATTC
1 TCGGTGGTGATATCCGAAGTCATTTACATATTC
* *
35755087 TCGATGGTGATATCCGAAGTCATTTGCATATTC
1 TCGGTGGTGATATCCGAAGTCATTTACATATTC
35755120 TCGGTGGTGATATC
1 TCGGTGGTGATATC
35755134 TGAGTGTTAA
Statistics
Matches: 98, Mismatches: 11, Indels: 26
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Matches are distributed among these distances:
32 2 0.02
33 60 0.61
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Indices: 35754899--35755106 Score: 245
Period size: 75 Copynumber: 2.8 Consensus size: 74
35754889 GTCATTTACC
* * * * * * * *
35754899 TTTTCTCGATGGTGATATCAGAAGTCATTTACCTTTTTTCGATGATGATATCCGAGTGTCAAGGT
1 TTTTTTCGGTGGTGATATCAGAAGTCATTTACATATTCTCGATGGTGATATCCAAGTGTCAAAGT
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66 TTGAATTAT
* * *
35754973 ATTTTTTCGGTGGTGATATCCGAAGTCATTTACATATTCTCGGTGGTGATATTCAAGTGTCAAAG
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*
35755038 TTTGAATTGT
65 TTTGAATTAT
* ** *
35755048 TTTTTCTCAGTGGTGATATTTGAAGTCATTTGCATATTCTCGATGGTGATATCCGAAGT
1 TTTTT-TCGGTGGTGATATCAGAAGTCATTTACATATTCTCGATGGTGATATCC-AAGT
35755107 CATTTGCATA
Statistics
Matches: 113, Mismatches: 18, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
74 5 0.04
75 104 0.92
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TTGAATTAT
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Indices: 35754819--35755178 Score: 450
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35754809 AAGATTTGAA
* * * **
35754819 TTACATTTTTTCGGTGGTGATATCCAAGTGTCAATGTTTGAATTGCATTTTCTTGGTGGTAATAA
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* * * * *
35754884 CTGAAGTCATTTACCTTTTCTCGATGGTGATATCAGAAGTCATTTACCTTTTTTCGATGATGATA
66 CTGAAGTCATTTACATATTCTCGATGGTGATATCAGAAGTCATTTACATATTCTCGATGATGATA
* * * * ** *
35754949 TCCGAGTGTCAAGGTTTGAATTATATTTTTTCGGTGGTGATATCCGAAGTCAT
131 TCCGAGTGTCAAAGCTTGAATTACATTTTCTCAATGATGATATCCGAAGTCAT
* ** * *
35755002 TTACATATTCTCGGTGGTGATATTCAAGTGTCAAAGTTTGAATTGTTTTTTCTCAGTGGTGATAT
1 TTACATATTCTCGGTGGTGATATCCAAGTGTCAAAGTTTGAATTGCATTTTCTCAGTGGTAATAA
* * * * * *
35755067 TTGAAGTCATTTGCATATTCTCGATGGTGATATCCGAAGTCATTTGCATATTCTCGGTGGTGATA
66 CTGAAGTCATTTACATATTCTCGATGGTGATATCAGAAGTCATTTACATATTCTCGATGATGATA
* *
35755132 TCTGAGTGTTAAAGCTTGAATTACATTTTCTCAATGATGATATCCGA
131 TCCGAGTGTCAAAGCTTGAATTACATTTTCTCAATGATGATATCCGA
35755179 GTATATTTCG
Statistics
Matches: 147, Mismatches: 30, Indels: 0
0.83 0.17 0.00
Matches are distributed among these distances:
183 147 1.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.14, G:0.21, T:0.41
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CTGAAGTCATTTACATATTCTCGATGGTGATATCAGAAGTCATTTACATATTCTCGATGATGATA
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Found at i:35755459 original size:48 final size:49
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Indices: 35755352--35755856 Score: 494
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35755342 TTAATAGTTT
* * *
35755352 AATTTTAAAGTTGTTGAGCCTCTACTTTGAGGAGCTTTTTT-AAGATGAA
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATG-A
* *
35755401 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAG-TTTTTTCAAAATAA
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
* *
35755449 AAATTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAG-TTTTTTCAAAAT-A
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
** * *
35755496 AAAATTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGATGAGC-TTTTTCAATATG-
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
* * *
35755543 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGAAAC-ATTTTCAA-A--A
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
* * * * *
35755588 ATTTTTAAAATTGTTGAA-CCTCTACTTAAATGAGC-TTTTTCAAGATGA
1 AATTTTAAAGTTGTT-AAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
* * * * *
35755636 ATTTTTAAAAGTTGTTAAACCTCTACTGAGAGGAGCTTTTTTCAAAATGA
1 AATTTT-AAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
* * * * *
35755686 GATTTTAAAGTTATTGAGCCTCTGCTTAGATGAGCTTTTTTTAAGATGA
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
* * * * * * * *
35755735 ATTTTTAAAGTTATTGAGCTTCTACTTAGAAGAGATTTTTCCAAGATGA
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
* * * * * *
35755784 ATTTTTAAAATTATTGAGCTTCTGCTTAGAGTAGCTTTTTTTCAAGATGA
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGC-TTTTTTCAAGATGA
*
35755834 ACTTTTAAAGTTGTTAAGCCTCT
1 AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCT
35755857 AATTATAGGG
Statistics
Matches: 387, Mismatches: 57, Indels: 23
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.32, C:0.11, G:0.16, T:0.40
Consensus pattern (49 bp):
AATTTTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTTTTCAAGATGA
Found at i:35755610 original size:45 final size:46
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Period size: 47 Copynumber: 3.5 Consensus size: 46
35755490 AAAATAAAAA
* * * * * *
35755500 TTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGATGAGCTTTTTCAATATGAA-TT
1 TTAAAATTGTTAA-CCTCTACTTAAATGAACATTTTCAAGA-GAATTT
* * *
35755547 TTAAAGTTGTTAAGCCTCTGCTTAGA-GAAACATTTTCAA-A-AATTT
1 TTAAAATTGTTAA-CCTCTACTTAAATG-AACATTTTCAAGAGAATTT
* *
35755592 TTAAAATTGTTGAACCTCTACTTAAATGAGCTTTTTCAAGATGAATTT
1 TTAAAATTGTT-AACCTCTACTTAAATGAACATTTTCAAGA-GAATTT
35755640 TTAAAAGTTGTTAAACCTCTACT
1 TTAAAA-TTGTT-AACCTCTACT
35755663 GAGAGGAGCT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
44 2 0.02
45 31 0.31
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48 11 0.11
49 15 0.15
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (46 bp):
TTAAAATTGTTAACCTCTACTTAAATGAACATTTTCAAGAGAATTT
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Period size: 333 Copynumber: 2.9 Consensus size: 332
35765216 GCAGAAATCT
* * * *
35765226 GATCTTATGAATTATAAATCTTGAACTTTGCTTCTTTATCATATTTAAAGGTATTATAGCATATT
1 GATCTTATGAATTATAAATCTTGAACCTTAC-TATTTATCATCTTTAAAGGTATTATAGCATATT
* * * ** * *
35765291 AAACATTGGATATCATTAATTTTAATTCAGAATTCTAGATT-TTTTTTGGCTAATATTTATGTTT
65 AAACATTGAATATCATCAGTTCCAATTCAGAATTCTAGATTATTTTTTAGTTAATATTTATGTTT
* ** ** * * *
35765355 GGTAAGTAATGTTGGGAATGAATTTTCTACAAGTTCTACTGAGTGATGCAAATGATGTTCTAGTT
130 GATATTTAATGTT-GGAAACAAATTTCCACAAGTTCTACTGAGTGATGTAAATGATGTTCTAGTT
* * * *
35765420 AAATATACATTCAAGAATGTTAATGAAAAGCTTAAAGTGTATCTTGTGCTTCATGGAATTTTAAA
194 AAATATGCATTCAAGAATGTTAATGAAAAGCTTAAAGTGTATCTTATGCTTCATGAAATTCTAAA
* * * * *
35765485 TGCAAAAACAGAACGAGAAAAGATCAAGAATAAAAGTGCATTATCTCAAAATGATAAAGCACAAA
259 TGCAAAAATAGAGCGTGAAAAGATCAAGAATAAAAATGCATTCTCTCAAAATGATAAAGCACAAA
35765550 AAATCATCA
324 AAATCATCA
* * ** * *
35765559 TATCTTATGAATTATAGATCTTGAACCTTGTTTTTTTATCATCTTTAAAGGTATTGTAGCATATT
1 GATCTTATGAATTATAAATCTTGAACCTT-ACTATTTATCATCTTTAAAGGTATTATAGCATATT
*
35765624 AAACATT-AGATATCATCAGTTCCAATTTAGAATT-TAAGATTATTTTTTAGTTAATATTTATGT
65 AAACATTGA-ATATCATCAGTTCCAATTCAGAATTCT-AGATTATTTTTTAGTTAATATTTATGT
* * * * *
35765687 TTGATATTTAATGTTGGAAACAAATTTTTCATAGGTTCTACTGAGTGATGTAAATGATGTTATAA
128 TTGATATTTAATGTTGGAAACAAA-TTTCCACAAGTTCTACTGAGTGATGTAAATGATGTTCTAG
* * * * * *
35765752 TTGAGTATGTATTCAAGAATG-TAATGAAAAGCTTAAATTTTATCTTATGCTTCAT-AGGATTCT
192 TTAAATATGCATTCAAGAATGTTAATGAAAAGCTTAAAGTGTATCTTATGCTTCATGA-AATTCT
* * * * *
35765815 AAATGCAAAAATAGAGTGTGAAAATATCAAGAATAAAAATACATTCTTTCAAAATGATTAAGCAA
256 AAATGCAAAAATAGAGCGTGAAAAGATCAAGAATAAAAATGCATTCTCTCAAAATGATAAAGC-A
* * *
35765880 CTAAAACT-ATTA
320 CAAAAAATCATCA
* * * * *
35765892 GATCTTGTGAATTATAAATTTTGAACCTTACTATTTATCTTCTTTAAAGATATTCTAGCATATTA
1 GATCTTATGAATTATAAATCTTGAACCTTACTATTTATCATCTTTAAAGGTATTATAGCATATTA
* **
35765957 AACATTGAATATCATCAGTTCCAATTCAGAATTCTAGATTATTATTT-GTTAATAACTATGTTTG
66 AACATTGAATATCATCAGTTCCAATTCAGAATTCTAGATTATTTTTTAGTTAATATTTATGTTTG
* * * * * *
35766021 ATATTTAATGTTTGAAACAAAGTTCCACAAGTTCTACTGAATGATGTAGATGATGGTCTAGTTCA
131 ATATTTAATGTTGGAAACAAATTTCCACAAGTTCTACTGAGTGATGTAAATGATGTTCTAGTTAA
* * *
35766086 ATATGCATTCGAA-AATGTTAATGAAAAGCTTAAAGTGTATTTTATGCTTAATGAAACTCTAAAT
196 ATATGCATTC-AAGAATGTTAATGAAAAGCTTAAAGTGTATCTTATGCTTCATGAAATTCTAAAT
* * * **
35766150 GCAAAAGTAGAGGGTGAAAAGCTGGAGAATAAAAATGCATTCT
260 GCAAAAATAGAGCGTGAAAAGATCAAGAATAAAAATGCATTCT
35766193 ATGAACATGA
Statistics
Matches: 530, Mismatches: 92, Indels: 26
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.37, C:0.10, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (332 bp):
GATCTTATGAATTATAAATCTTGAACCTTACTATTTATCATCTTTAAAGGTATTATAGCATATTA
AACATTGAATATCATCAGTTCCAATTCAGAATTCTAGATTATTTTTTAGTTAATATTTATGTTTG
ATATTTAATGTTGGAAACAAATTTCCACAAGTTCTACTGAGTGATGTAAATGATGTTCTAGTTAA
ATATGCATTCAAGAATGTTAATGAAAAGCTTAAAGTGTATCTTATGCTTCATGAAATTCTAAATG
CAAAAATAGAGCGTGAAAAGATCAAGAATAAAAATGCATTCTCTCAAAATGATAAAGCACAAAAA
ATCATCA
Found at i:35768421 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 35768416--35768458 Score: 50
Period size: 2 Copynumber: 21.5 Consensus size: 2
35768406 TATATATATA
* * **
35768416 TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG CG CG TG CA TG TG TG TG TG TG TG
1 TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG TG
35768458 T
1 T
35768459 ATAAATTAAA
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 6, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 35 1.00
ACGTcount: A:0.02, C:0.07, G:0.47, T:0.44
Consensus pattern (2 bp):
TG
Found at i:35785965 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 35785957--35785981 Score: 50
Period size: 3 Copynumber: 8.3 Consensus size: 3
35785947 TCACTCACAA
35785957 AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG A
1 AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG A
35785982 TGGTGCATAG
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.68, C:0.00, G:0.32, T:0.00
Consensus pattern (3 bp):
AAG
Found at i:35787016 original size:2 final size:2
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Indices: 35787009--35787034 Score: 52
Period size: 2 Copynumber: 13.0 Consensus size: 2
35786999 ATTGCTAATC
35787009 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
35787035 TACGTTATAC
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:35787172 original size:20 final size:21
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Indices: 35787135--35787176 Score: 59
Period size: 20 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
35787125 GTAAGAGATT
*
35787135 TTTTTAATTATTAATTAAATA
1 TTTTTAAATATTAATTAAATA
*
35787156 TTTTTAAAT-TTATTTAAATA
1 TTTTTAAATATTAATTAAATA
35787176 T
1 T
35787177 CAAAATTATT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
20 11 0.58
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Consensus pattern (21 bp):
TTTTTAAATATTAATTAAATA
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Indices: 35795162--35795214 Score: 65
Period size: 23 Copynumber: 2.3 Consensus size: 23
35795152 TTTTTGATTG
*
35795162 AATTATTTTTTATTTAT-AATAAT
1 AATTATTTTATATTTATCAAT-AT
*
35795185 AATTATTTTATA-TTATCAATTT
1 AATTATTTTATATTTATCAATAT
35795207 AATTATTT
1 AATTATTT
35795215 ACATTAAATG
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 2, Indels: 3
0.84 0.06 0.09
Matches are distributed among these distances:
22 13 0.48
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ACGTcount: A:0.38, C:0.02, G:0.00, T:0.60
Consensus pattern (23 bp):
AATTATTTTATATTTATCAATAT
Found at i:35796039 original size:218 final size:219
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Indices: 35795815--35796229 Score: 475
Period size: 219 Copynumber: 1.9 Consensus size: 219
35795805 ATTTCAAACA
* * *
35795815 ATTTTACGTAAAATAATATCAATTTTATGATTA-TTCTCACCGTCTTATGTTAACTCTT-TTTTT
1 ATTTTACGTAAAATAATATCAATTTTACGATTACTT-TCACCGTCTTATATTAACACTTATTTTT
* * * * * * ** *
35795878 TTGTTTA-AATTATTTTTTATCTGTAATAATATTTTTTTTACACT-ATAAACTTAATTATTTATG
65 TGGTTTATAATTATTATTTATCTATAATAATAATTCTTTTACACTGACAAAAAT-ATTATTTAAG
35795941 TTATAATGA-TATTTTTT-TGCACTTATTATTATCTTTCATTACGTTTAAGAA-TATCATAACTT
129 TTATAAT-ATTATTTTTTAT--ACTTATTATTATCTTTCATTACGTTTAA-AATTATCATAACTT
*
35796003 TTTCTTAAAGGTATTACGATATTTATAATC
190 TTTATTAAAGGTATTACGATATTTATAATC
* * * *** *
35796033 ATTTTACTTCAAATGATATCAATTTTACGATTACTTTCATTTTTTTATATTAACACTTATTTTTT
1 ATTTTACGTAAAATAATATCAATTTTACGATTACTTTCACCGTCTTATATTAACACTTATTTTTT
* * *
35796098 GGTTTATAATTATTATTTATGTATAATAATAATTCTTTTACATTGCCAAAAATATTATTTAAGTT
66 GGTTTATAATTATTATTTATCTATAATAATAATTCTTTTACACTGACAAAAATATTATTTAAGTT
* * * * *
35796163 ATAATATTATTTTTTATACTTGTTCTTATTTTTTATTATGTTTAAAATTATCATAACTTTTTATT
131 ATAATATTATTTTTTATACTTATTATTATCTTTCATTACGTTTAAAATTATCATAACTTTTTATT
35796228 AA
196 AA
35796230 GCTGTTAGGA
Statistics
Matches: 162, Mismatches: 28, Indels: 13
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
218 47 0.29
219 55 0.34
220 55 0.34
221 5 0.03
ACGTcount: A:0.32, C:0.09, G:0.06, T:0.53
Consensus pattern (219 bp):
ATTTTACGTAAAATAATATCAATTTTACGATTACTTTCACCGTCTTATATTAACACTTATTTTTT
GGTTTATAATTATTATTTATCTATAATAATAATTCTTTTACACTGACAAAAATATTATTTAAGTT
ATAATATTATTTTTTATACTTATTATTATCTTTCATTACGTTTAAAATTATCATAACTTTTTATT
AAAGGTATTACGATATTTATAATC
Found at i:35796299 original size:219 final size:216
Alignment explanation
Indices: 35795404--35796299 Score: 648
Period size: 218 Copynumber: 4.1 Consensus size: 216
35795394 AAATTATACT
* * *
35795404 AATTTTACGATTATTCTTACATTTTTATGTTAACACTTATTTTTAGATTTAGAATTATTTTTTAT
1 AATTTTACGATTATTCTCAC-TTTTTATATTAACACTTATTTTTTGATTTAGAATTATTTTTTAT
** ** * * *** *
35795469 TTATAATAATAA-TTTTTTATGTTGTC-AATTTAATTATTTACGTTACAATAATATCAGTTACAT
65 TTATAATAATAATTTTTTTA-CAT-TCAAAAATAATTATTTAAGTTATAATAATATTTTTTACAC
* * *
35795532 TTGTTCTTACATTTT-ATTATATTAAAAATTATCATAATTTTTTCA-TAA-GTATTACGACACTT
128 TTGTTCTTAC-TTTTCATTACATTTAAAATTATCATAACTTTTT-ATTAAGGTATTACGACA-TT
** * * * *
35795594 CAAATATGTTTTATGTCAAATTATATC
190 TTAATCTATTTTACGTCAAATGATATC
* * * * *
35795621 AAATTTATGATTATTCTCACTTTTT-TACTTGAATACTTATTTTTTTATTTAGAATTA-TTTTTG
1 AATTTTACGATTATTCTCACTTTTTATA-TT-AACACTTATTTTTTGATTTAGAATTATTTTTTA
* * * *
35795684 TTTGTAATATTAATTTTTTTACCTT-ACAAAT--TTA-TTACA-TT-TCAATAATATCTTTTTAC
64 TTTATAATAATAATTTTTTTACATTCAAAAATAATTATTTA-AGTTAT-AATAATAT-TTTTTAC
* * * * * * *** *
35795743 ATTTGTTGTTACTTTTCATTACATTTAAAATTATTACAATTTTTTTGTTAAGGTGCAACGATATT
126 ACTTGTTCTTACTTTTCATTACATTTAAAATTATCATAA-CTTTTTATTAAGGTATTACGACATT
* * * * *
35795808 TCAAACAATTTTACGTAAAATAATATC
190 TTAATCTATTTTACGTCAAATGATATC
* * * * * *
35795835 AATTTTATGATTATTCTCACCGTCTTATGTTAACTCTTTTTTTTTG-TTTA-AATTATTTTTTAT
1 AATTTTACGATTATTCTCA-CTTTTTATATTAACACTTATTTTTTGATTTAGAATTATTTTTTAT
* * * ** * * *
35795898 CTGTAATAATATTTTTTTTACACTAT-AAACTTAATTATTTATGTTATAATGATATTTTTTTGCA
65 TTATAATAATAATTTTTTTACA-T-TCAAAAATAATTATTTAAGTTATAATAATA-TTTTTTACA
* * * * *
35795962 CTTATTATTA-TCTTTCATTACGTTTAAGAA-TATCATAACTTTTTCTTAAAGGTATTACGATAT
127 CTTGTTCTTACT-TTTCATTACATTTAA-AATTATCATAACTTTTTATT-AAGGTATTACGACAT
*
35796025 TTATAATC-ATTTTACTTCAAATGATATC
189 TT-TAATCTATTTTACGTCAAATGATATC
* * * *
35796053 AATTTTACGATTACTT-TCATTTTTTTATATTAACACTTATTTTTTGGTTTATAATTATTATTTA
1 AATTTTACGATTA-TTCTCA-CTTTTTATATTAACACTTATTTTTTGATTTAGAATTATTTTTTA
* * * *
35796117 TGTATAATAATAATTCTTTTACATTGCCAAAAAT-ATTATTTAAGTTATAATATTATTTTTTATA
64 TTTATAATAATAATTTTTTTACATT--CAAAAATAATTATTTAAGTTATAATAATATTTTTTACA
* * ** * * *
35796181 CTTGTTCTTATTTTTTATTATGTTTAAAATTATCATAACTTTTTATTAAGCTGTTAGGACACTTT
127 CTTGTTCTTACTTTTCATTACATTTAAAATTATCATAACTTTTTATTAAGGTATTACGACA-TTT
*
35796246 TAATCTATTTTACGTCAAATGACA-C
191 TAATCTATTTTACGTCAAATGATATC
*
35796271 TAATTTTACGATTATTCTTATCTTTTTAT
1 -AATTTTACGATTATTCTCA-CTTTTTAT
35796300 GCCATAACAT
Statistics
Matches: 534, Mismatches: 107, Indels: 74
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
212 22 0.04
213 64 0.12
214 59 0.11
215 21 0.04
216 25 0.05
217 58 0.11
218 132 0.25
219 100 0.19
220 49 0.09
221 4 0.01
ACGTcount: A:0.31, C:0.10, G:0.06, T:0.52
Consensus pattern (216 bp):
AATTTTACGATTATTCTCACTTTTTATATTAACACTTATTTTTTGATTTAGAATTATTTTTTATT
TATAATAATAATTTTTTTACATTCAAAAATAATTATTTAAGTTATAATAATATTTTTTACACTTG
TTCTTACTTTTCATTACATTTAAAATTATCATAACTTTTTATTAAGGTATTACGACATTTTAATC
TATTTTACGTCAAATGATATC
Found at i:35797307 original size:19 final size:19
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Indices: 35797280--35797327 Score: 55
Period size: 18 Copynumber: 2.5 Consensus size: 19
35797270 ATGATTATTC
35797280 TTATCTTTTTAAGT-TAACA
1 TTAT-TTTTTAAGTGTAACA
*
35797299 TTTATTTTTT-AGTGTAAGA
1 -TTATTTTTTAAGTGTAACA
35797318 TTATTTTTTA
1 TTATTTTTTA
35797328 TTTATAATAC
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 5
0.81 0.03 0.16
Matches are distributed among these distances:
18 12 0.48
19 9 0.36
20 4 0.16
ACGTcount: A:0.27, C:0.04, G:0.08, T:0.60
Consensus pattern (19 bp):
TTATTTTTTAAGTGTAACA
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Indices: 35797067--35797643 Score: 577
Period size: 218 Copynumber: 2.6 Consensus size: 217
35797057 TTACTCTCAC
* * *
35797067 TTTTTTACATTAACATTT-TTTTTTTGCTTAGAGTTATTTTTTATTTATAATTAAT-TTTTTTTA
1 TTTTTTACATTAACATTTATTTTTTTGTTTAAAATTATTTTTTATTTATAA-TAATATTTTTTTA
* ** * * * *
35797130 TATTGTCAACTTAATTATTATT-TTATAATAATA-TCTTTTACGCTTCTTTTTATCTTTTAATT-
65 CATTACCAACTTAATTATTTTTATTATAATAATATTTTTTTACG-TTGTTATTAT-TTTTAATTA
* * * *
35797192 CGTTTAAAATTATTAAAACTTTTTTCTTAAAGTGTTATGACATTTTTAACATATTTTACGCTAAA
128 CGTTTAAAATTATTAAAACTATTTTATTAAAGTGTAATGACA-TTATAACATATTTTACGCTAAA
*
35797257 ATATATCAATTTTATGATTATTCTTA
192 ATATATCAATTTTATGACTATTCTTA
* * * *
35797283 TCTTTTTA-AGTTAACATTTATTTTTTAGTGTAAGATTATTTTTTATTTATAATACTAATTTTTT
1 T-TTTTTACA-TTAACATTTATTTTTTTGTTTAAAATTATTTTTTATTTATAATAAT-ATTTTTT
* ** * * * *
35797347 T-CATTACCAATTTAATTATTTACATTTTAATAATCCTTTTTTTACATTTGTTATTATTTTTTAT
63 TACATTACCAACTTAATTATTTTTATTATAATAAT-ATTTTTTTAC-GTTGTTATTATTTTTAAT
* * * *
35797411 TACGTTTAGAATTATTACAA-TATTTTATTAAGGTGTAATGTAC-TTATAAC-TATTTTACG-TC
126 TACGTTTAAAATTATTAAAACTATTTTATTAAAGTGTAATG-ACATTATAACATATTTTACGCTA
35797472 AAATA-ATACTAATTTTATGACTATT-TTCAA
190 AAATATAT-C-AATTTTATGACTATTCTT--A
* *
35797502 TTTTTTACATTAACTTTTATTTTTTTGTTTAAAATTATTTTTTATTTGTAATAATATTTCTTTTA
1 TTTTTTACATTAACATTTATTTTTTTGTTTAAAATTATTTTTTATTTATAATAATATTT-TTTTA
* * * * *
35797567 CATTACCAACTTAATTATTTTTATTACAATAATATTTTTTTATGTATGTTGTTATTTTTCACTAC
65 CATTACCAACTTAATTATTTTTATTATAATAATATTTTTTTACGT-TGTTATTATTTTTAATTAC
*
35797632 GTTTATAATTAT
129 GTTTAAAATTAT
35797644 CATAACTCTT
Statistics
Matches: 294, Mismatches: 48, Indels: 36
0.78 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
216 4 0.01
217 32 0.11
218 149 0.51
219 53 0.18
220 23 0.08
221 33 0.11
ACGTcount: A:0.30, C:0.08, G:0.05, T:0.56
Consensus pattern (217 bp):
TTTTTTACATTAACATTTATTTTTTTGTTTAAAATTATTTTTTATTTATAATAATATTTTTTTAC
ATTACCAACTTAATTATTTTTATTATAATAATATTTTTTTACGTTGTTATTATTTTTAATTACGT
TTAAAATTATTAAAACTATTTTATTAAAGTGTAATGACATTATAACATATTTTACGCTAAAATAT
ATCAATTTTATGACTATTCTTA
Found at i:35798951 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 35798912--35798950 Score: 55
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
35798902 TAAATATAAA
35798912 TTCTTTTAGATTAATTATT
1 TTCTTTTAGATTAATTATT
35798931 TTCTTTTATG-TTAA-TATT
1 TTCTTTTA-GATTAATTATT
35798949 TT
1 TT
35798951 TTAATTTCTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 3
0.86 0.00 0.14
Matches are distributed among these distances:
18 6 0.32
19 12 0.63
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ACGTcount: A:0.23, C:0.05, G:0.05, T:0.67
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TTCTTTTAGATTAATTATT
Found at i:35799004 original size:41 final size:40
Alignment explanation
Indices: 35798924--35799006 Score: 98
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35798914 CTTTTAGATT
* *
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1 AATTATTTTCTTTTATGTTAATACTTTTTAATATCTTTAG
*
35798964 AATTATTTT-TTTTATTTTATAATACTTTTTAACTAT-TTTAG
1 AATTATTTTCTTTTA-TGT-TAATACTTTTTAA-TATCTTTAG
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1 AA
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AATTATTTTCTTTTATGTTAATACTTTTTAATATCTTTAG
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* * *
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Statistics
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ATTTTCTTTAACTGCTTTAAG
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* * * ** *
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* * *
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** * * *
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1 ATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAA
** * * ** *
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66 TAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTAAAAT-ATTTA-AACAATTA-TCTATTTCAAAT
* * ** * * ** * **
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* * *
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1 ATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAA
* * *
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* *
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ATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAA
TAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTAAAATATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGT
TATAATTTGTTTAATAATAAAATAATTTTCCATTCACAAATAA
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35815799 AAGCTTACTC
* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
35815988 AAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AT
1 AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
35816048 TCTAATTTATCGAA-ATAATTCAAATAATTATGACAATTTGAAA-AATTAACTACTTCTAATC-A
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* * * *
35816110 TATTGACATTTTGTTTTGTCATAAAAACAATTATTTTTATTCATAAAAACTTATTT
128 TA-T-A-ACTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTATTCATACAAATTTATTT
* * * * * *
35816166 GGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTAAAAAAATAAA
1 AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
35816231 TCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA-AGAATATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
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** * * * * * *
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130 T-A-ACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAATTTATTT
* * * *
35816344 ----TAAAA-AATATTAATCTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGATATTTACAAAATAAA
1 AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * *
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* * * * ** *
35816466 TCTAACTTT-TTTTGCTCATAAAACAAGTGTTTCTGTTCGCACAATTTTATTT
128 TATAACTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAATTTATTT
* * *
35816518 AGAATAAAATAATATTTATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAGA
1 AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* *
35816583 TCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAA-AATATATCTATTTCAAATTGTTA
66 TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAAT-TATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * *
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AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
TCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
AACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAATTTATTT
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35816553 AATTAATAAG
* * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCT-AATAGCTATAACTATTTAAAAAT
* * * * * * *
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* * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCTAATAGCTATAACTATTTAAAAATT
* * * * *
35816779 AACTATTTTAAATCGTTATGATCTTTGCTTGGTCATAAAACAATGTTTCTACTCAAATAAGTTTA
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131 TTC
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TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCTAATAGCTATAACTATTTAAAAATT
AACTATTTCAAATCGTTATAACCTTTGCTTAGTCATAAAACAATGTTTCTACTCAAACAAGTTTA
TTCGGGTTCCAAAAATTGA
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35818304 AACTTAATGG
*
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*
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*
35818407 AAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAACAATTCAAATAC
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*
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Statistics
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TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAACAATTCAAATAC
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35818303 TAACTTAATG
*
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* *
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*
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1 -GTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAACAATTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATT
*
35818476 ATCTATTTCAAATATTTACCTAAACAGTTCAAAT
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* *
35818510 GCTTATGACTATTGGAACAATTA
1 G-TTATGACTATTTGAATAATTA
35818533 CCTATTTCAA
Statistics
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TCTATTTCAAATATTTACCAAAACAGTTCAAAT
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35818490 TTTACCTAAA
** * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * **
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* * * * * *
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* * *
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64 TATCATAAAATAATTGTTTTT-TTCATACAAGCTTAT
35818964 CCAGGTTTTA
Statistics
Matches: 236, Mismatches: 36, Indels: 20
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Matches are distributed among these distances:
180 5 0.02
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CAGTTCAAATAATTATGAATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTA
TCATAAAATAATTGTTTTTTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTTCTTTATTAAATT
TCTAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCAAAC
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35819228 ATTATAATCT
* * * * * *
35819238 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGCTTT-TGTTCT-AATAAGCTTATTTGGAA-AAAA-AA-ACTA
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* *
35819298 ATGT-ATTAATA-TTCATAAAATTAATAAGTAA-ATAATTTAAAAAATG-AATCTATTTACCGAA
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125 CAAATTTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCC
*
35819415 TTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTGTATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTGAATAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * *
35819480 TCATTAATATTTCAAAAATAAATAAGTAAGATATTCAAAAAAGAAATTTGTTTACCGAACAACTT
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* * * * * *
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35819580 AAACAATTCA
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 18, Indels: 15
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Matches are distributed among these distances:
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35819549 TGGTTATAAT
35819559 TATTTGAATAATTATTTATTTAAACAATTCAAATAATTATGAC
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* *
35819602 TATTTGAATAATTATTTATTTGAATAATTCAAATAATTATGAC
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* *
35819645 TATTTGAACAATTATCTATTT
1 TATTTGAATAATTATTTATTT
35819666 CAAATACTTA
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Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * * *
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* * * * * ** * **
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* * * * * * *
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* * * *
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** ** * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * ** * *
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* *
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* * ** *
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* ** * * * * * * * *
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* ** ** * *
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* * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
* ** * ** * * *
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65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
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130 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * * *
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* ** ** * * * * * * *
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257 TGTTATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATA-CAAGTTATTCGAAATAAA
* * *
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* * * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTA-
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64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAG-CT
* ** * *
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128 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * ** ** * * *
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192 AATAAATTTGTTTA-C-CGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTAT-TTCA
* * * * * * * *
35825204 AATTATTGTGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATAGAAGCTGATTTGAAAT
254 AATTGTTATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAAT
* * * *
35825269 AAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAAAAGTAAA
317 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
** * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
** * * * *
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* * * * * * *
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* *** * * *
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* * * * * *
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255 ATTGTTATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT-ACAAGTTATTCGA-AAT
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317 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
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35825670 AGATTTAAAAACTAAATTTGTTCATTGAA-TTGATTTAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
* * * **
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** * * * *
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130 TTCAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
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194 TAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
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257 TGTTA-TGCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAG-TTATTCGAAAT-A
* *** *
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318 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-ACTAAG
* * * * * *
35826032 AGATTTAAAGAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGGATAATTAT
1 AGATTTAAA-AAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * * *
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65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
* * * * * *
35826162 TTCAAAATAAAACAATACTACTTTATTAGTATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAACT
130 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
** **** * *
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195 AAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAG---T---TA--TA-A-CTATTTAAACAATTATCTA-
* * * * *
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* * ** *
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* * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
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* * * * *
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130 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTT-AAA
* * * * * * *
35826596 AAATAAATCTATTTACCGAATAAGTACAAATAGTTATGACTATTTAAACAAGTATTTATTTAAAA
191 AAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * * *
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256 TTGTTATGCT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCAT-ACAAGTTATTCGAAATA
** * * *
35826725 AAATAATACTACCTTATTAATATTTTAAATATTAAAAAGC-AAC
318 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-CTAAG
* * * * * * * * ** *
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* * * * ** ** *
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64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCT
* * * * *
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128 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * *
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192 AATAAATTTGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
* *
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256 TTGTTATGCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-TCATACAAGTTAT-TCGA-AATA
* * *
35827087 AAATAATGCTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAG
318 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATT-TGAATAATT
* * * * * *
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** * * *
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* * * ** ** * * *
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**
35827508 ATTTATTAATATTTCTAAAATTAA-TAAG
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* * * * * * * * **
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64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTT
* * * *
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129 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** * *
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194 TAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * * *
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258 GTTAT-GCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAA
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* * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACTAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAATAATTA
* * * ** * * *
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64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTT
** * ** * *
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129 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
35828086 T-AATTTG-TTATCTAA-ACCAGTTTAAATAAG-TATGACTATTTGAGCAATTATCTAGTTCAAA
194 TAAATTTGTTTACCGAATA--AGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
* * *
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256 TTGTTATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAAC--A-A---TTGTTT-T-T-A------TT-C-----
* ** * * * * *
35828209 TTTATATAAGTT-TGTTTAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTC
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* * * *
35828275 AGATTTAAGAAATAAATATATTTACCGAA-TCAGTT-AAATTAGTTATA-ACTATTTGAACAATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAA-TAGTTA-AGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
35828337 ATTTATTTTAAATTATTACGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAATC
63 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGC
* *
35828401 TTATTC-GAAATAAAGTAA-AGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTA
127 TTATTCAG-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * *
35828463 AAAAGATGAGTTTG-TTAGTCC-AACAAGTGT-AAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTTT
189 AAAA-ATAAATTTGTTTA--CCGAATAAGT-TCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * * * *
35828525 TTCAAATTATTATAACATTTTATTTTATCAAAAAAACATTTGTTTCTATTCGTGCAACCTTATTT
250 TTCAAATTGTTAT-GCTTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA-GTTATTC
* * * * *
35828590 GGAATAATATAATA-TAAATTTATTATTATTTTAAAAAATTAATAAGTAAA
312 GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTT-AAAAATTAATAACTAAG
* * * * * * *
35828640 AGATTTAAAAACTGAATCTGTTTACCGAA-TATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
*** * * * * * * ** * * * *
35828704 CTATTTCAAATTGCTCTAACCTTTTGTTTTATTATAAAATAATTTTTTTTGTTAAAACATGTTTA
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
* * * * *
35828769 TTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAGACAATT--TGAGCAATTATTTATTTC
130 -TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-GA--GATTT-
* * * *** * ** * * * * * *
35828829 AAATTATTATCACTTT-TTTTTTGTCATAA-AAC-ATTTGTT-T--TTATTCATACAAGCTTATT
188 AAA--A-AATAAATTTGTTTACCG-AATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAA--TTATC
* * * * * ** * ***
35828888 TGGA-TTAAAATAATATTAAT--TTATTAATATTTTGATGATTAATAAATAAAAGATTTTAAAAA
247 T--ATTTCAAAT--TGTT-ATGCTT-TT--TGTTTTG-TCA-T-A-AAACAATTGTTTTTATTCA
* *
35828950 TA-AA-TATATTTACCGAACAAATTCAAAAAGTCATAACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
300 TACAAGT-TA-TT--CG---AAA-T--AAAA-TAAT-ACTAATTT-ATTAA-TA--T-TTT-AAA
* ***
35829012 TCATT-ATAACCTTTT
347 -AATTAATAA-CTAAG
** * * ** * *
35829027 ATG-TTGTCATAAGAAATTGTATC-AGTTCATATAG-CCATA-TTCGAAATAACATAATACTAAT
1 A-GATT-T-A-AA-AAA-TAAATCTA-TT--TATCGAAC-TAGTTC-AAAT-AGTTAAGACTATT
* * * *** ** * *
35829088 T---T-ATTA-ATATTTCAAA-AATTAATTA--TAAGGGATT-T-AAAAAATGAATCTATTTAAC
54 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TATTT--C
* * * * * * * * *
35829143 AAATAAGTTTAAATAGTTATGATTATT-TGAA-AAAATATCTATTTCAATTTGCTCTAACATTT-
114 -----AG-TT-CATA--CAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATA-CT-AATTT-AT-TAATATTTC
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35829205 -TGTTTTATCATAAAATAA-TTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTT--CAAATAAAATAATACAA
165 AAAAATTA--AT-AAGTAAGAGATTT-AAAAAATA-AA-TTTGTTTACCGAAT-AAGT--T-CAA
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35829266 A-AATTAATAA-TATTCAGACAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATGAATCTACTTACCGAAT
220 ATAGTT-ATAACTATTTAAACAATT-AT--CT-----ATTT-CAAATTG-TTATGCTTTTTG-TT
** * * * *** * * ** *** * ** **
35829329 AAGT--TCAAATAATTATGACTATTTGAGTA-ATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTGTTT
273 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA-TACA--AGTTATTCGAAAT-AAAAT-AATACT-AAT
* * *** *
35829391 TGTCATAAAACAATTGTT-TTTATTCAT-A-TAAG
331 T-T-AT-TAA-TATT-TTAAAAATTAATAACTAAG
** * * * *
35829423 CTTATTTAGGTTACAATAATAT-TAATTTAT-TAA-T-GTTTTGACAATTAATAAGTAAAAGA-T
1 -AGATTTA---AAAAATAA-ATCT-ATTTATCGAACTAG--TT--C-A--AAT-AGT-TAAGACT
* * ** **
35829483 -TTTAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTACAACGATTTGAAATAAATAGTT
51 ATTT--GAAT-AAT-TATCTAT--------TTCAAATCA-TTATGACCTTTTG---T---T--TT
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** ** * ** ** *
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148 TAATTTATT-A-AT-A-TTT-C-AAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTA--AA-A-AAT-AAATTT
** * * * * * * * * * * *
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201 GTTTACCG-AATAAG-TTCAAATAGTTATAACTAT-TTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* *** * **
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* ** * * *
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* * * * * ** **
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1 AGATTTA--AAAAAT--AAATCTATTTATCGAACT--AGTTC-AAATAGTTAAGA-CTATTTGAA
* * * * * * *
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58 TAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG--T--TT-TGTCA--T-AAA--A-CA-A--
* ** * * * * *
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107 -TTAT-TTCAGTTCAT--A-CAA--GCTTAT-TCAGA-ATAA----A---ATAAT--ACTAATT-
* * *** * * * * * *
35830010 TAATTATTAATATTCCAAAAATTAA-AATGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGTA
153 T-ATTAAT-ATTTCAAAAAT--TAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATA
* * * * * * * * *
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213 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGCT-TTTTGTTTTGT
* * * * *
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277 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC-AAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * **
35830204 TCTAAAATTTAATAGGT-AG
341 TTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * *
35830223 AAGATTTTAAAAAATATATCTATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATGA-TCATTTGAATAAT
1 -AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTTGAATAAT
* * * *
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62 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAG
* * ** * ** *
35830350 ATTATTTAGAAGGAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAGA
126 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* ** * ** * * *
35830411 AACTAAATCCGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATATCAAA
191 AAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * *
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256 TTGTTATGCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAG-TTATTCGAAATAA
* * ** * *
35830540 AATAAAACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGG
319 AATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * ** * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
* * * * * * * *
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66 TATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
* * * ** * * *
35830712 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTGTAAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAT
130 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * **
35830777 ATATCTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTGTGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
195 AAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * *
35830842 TATGACATTTTGTTTTATCATAAAACCATTGTTTTTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATA
260 TATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC-AAGTTATTCGAAATAAAATA
* * * *
35830907 GTATTGATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAG
323 ATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * ** * * *
35830941 AGATTTAGAAACTAAATTTGCTTA-CCAAATAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATTATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * ** *
35831004 CTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTTTTTATACAAGCTTA
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
** * * * *
35831068 TTTGGATTAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAAT
130 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * * *
35831133 AAATATGTTTGCCAAACCAGCTT-AAATAATTA-AGACTATTAAAATAATTATTTATTTCAAATT
195 AAATTTGTTTACCGAATAAG-TTCAAATAGTTATA-ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * *
35831196 GTTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-ATTTTACTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
258 GTTAT-GCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAG-TTATTCGAAATAAA
* * * *
35831260 ATAATATTAATTTATTAA-CTTTCAAAAAATAATAAGC-AAG
320 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-CTAAG
* * * * * * *
35831300 AGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAATAAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTA
1 AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
35831364 TTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAGAACAATTGTTTCAATTCATA-AAGACT
64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAG-CT
* * * ** * * * *
35831428 TATTGAAAATAAAAACAATACTACCTTATTAACATTTCAAAAAGTAATAAGCAAGAAATTTAAAA
128 TATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* ** * * *
35831493 ACTAAAGCTATTT------T---TT-GAATCAGTT-TAACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAA
192 AATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * *
35831547 -TCTTATGATCTTTGTTTTGGCATAAAAGCAATTATTTTTTATT-ATACAAGCTTATTCG-GATA
256 TTGTTATGCTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATT-GTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAAT-
* * * * *
35831609 AAAATAGTACTAATTGAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
317 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * * * * * *
35831653 AGATTTGAAAATTAAATGC-GTTTGTTGAACTAATTTAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
* ** * * * ** * *
35831717 ATATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTCTAGTTGTAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGTTTA
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
** * * * *
35831782 TTTGGAATAAAATGATACTAATTTATTAACA-TT-AAGAGAATTAATAAGCAAGATATTTGAAAA
130 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAA
* ** * * *
35831845 AATAAATATGTTTACAAAATAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCT-TCTTAAAA
192 AATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTAT-TTCAAA
* * * * ** * * ** *
35831909 TCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTGTTTCAATTCATAAAAACTTAGCCAAAATAA
256 TTGTTATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT-ACAAGTTATTCGAAATAA
* **
35831974 AATAATACTACA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAGGTAAG
319 AATAATACTA-ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * * * * *
35832016 AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
* ** * *
35832080 CTATTTCAAATCGTTATTTCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA--ACATAAAAGCT
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA--TTTCAGTTCATACAAGCT
* * * *
35832143 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAATAATTAATAAATAAGATATTTAAAAA
128 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
** ** * * * * *
35832207 ATAAATTTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTCTTTATTTGAAATT
193 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * * * * *
35832272 GTTATAACCTTTTT-TTCTATCATGAAATAGTTATATCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAA
258 GTTAT--GCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAATAAA
* * *
35832336 ATAATACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAATTTAA-
320 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-CTAAG
* * * * * * * * *
35832377 TGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAG---ACA-A-TTAAGACTATATGAATATTTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
* * * * *
35832437 TATTTCAAATCATTATGGCCTTTT-TTTTGTGATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAACTTAT
66 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAT
** * * * * *
35832501 TTGGAAT-AAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTTATAAGTTAGTGATTTAAAAAA-A
131 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * * **
35832564 TATTATATTTACTGAACCAA-TTTAAGTAATTATAATTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCA
196 AATT-TGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTG
* * * * * * *
35832628 TTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCGTATAAGATTTTTTGGAAA-AAAA
259 TTA-TGCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG--TTATTCGAAATAAAA
* * * * *
35832692 TAACATTAATTTGTTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG
321 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * * * * * * ** *
35832732 AGA-TCAAAAAAGTAAATATGTTTACCAAATTATTTCAAATAATTTTGACAATTTGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAA-TAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * * **
35832796 TTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACTATTTT
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTT
* * * * ** ** * *
35832860 ATTCAAAATAAAATAGTACTAATTTAATAATAATTT-GAAGCTTAATAACCAAAAAATTTAAAAA
129 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * ** * ** *
35832924 ATAAATTTGATTGCCAAACCAGTTCAAAAAGTTA-AGACTATACAAACAATTATCTATTTTAAAT
193 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * * * * * * *
35832988 CATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG-TTGTGTTCGTACAAGTTTATTTGGATTGAA
257 TGTTATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAATAAA
* * *
35833052 ATAA-AGCTAATTTAATAATATTTTATAAATTAATAAGTAAG
320 ATAATA-CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * ** * * * * *
35833093 ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCTAACCAATTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
** ** * * ** *
35833158 TATTTCAAATTGTCCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATAAAAGC----
66 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
35833219 T-----TAAAA-GAT--TAATTTGTT--TA-TTGAAAAAGTTAAAATAGTTATGACTG-TTTAAT
131 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATA-AG-TAAGA--GATTTAAA
* * * * * ** * * * *
35833272 CAAT-TATCTATTTA--AAATAA-TT-ATAATA-TT-T-TGTTTTGTCATA-AATCAGCTATTTC
191 AAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCA-AATAGTTATAACTATT-T-AAACAATTATCTATTTC
* * * ** * ** * * * * * *
35833328 TAA---TCATACAAGTTT-ATTTGGAATAAAATAATATTATTTCATTAATATTATAAAAATTAAT
253 AAATTGTTATGC-TTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTGTTT--TT-AT-TCATACAAGTTATT
* ** ** ** * *
35833389 --AAGTAAAAGATGAA-A-GGATAAATCTAAT-TATCGAACAAGTTCA-AA-T---
311 CGAAAT-AAA-AT-AATACTAATTTAT-TAATAT-TTTAA-AAATTAATAACTAAG
* ** * * * * * * * *
35833435 AGCTTTAACTATTAGA-CTAATTAT----CTATTTCAAATAATTATGAC-ATTTG-GT-TTTAT-
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
35833491 TA--T-AAA--A-TA-G--C---TGCTTTTGT--T----C---------A--TC---CAAGCTTA
66 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
* * * * * * * *
35833524 TT-TGAAATAAAATATTATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAAATTAAAATA
130 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* *** * * * * * ** *
35833588 TAAATTTATTTATTAAACAAGTTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAAATT-TATATTTTGAATA
194 TAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC-AATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * * * *
35833652 ATTATGACCTTTT-ATTTGTCATAGAATAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTTTTTGAAACAAAA
258 GTTATG-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAA
* * * *
35833716 TAATATTAATTTAATAGTATTCTAAAAATTAATAACTAA-
321 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
** * * * * ** *
35833755 ATGATTTAAATGATGAATTTATTTATTGAACTTGTTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTAT
1 A-GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * ** *
35833820 CTATTTAAAATAATAATGATCTTTTGTTTTCTTTTAGAAA-AATTATTTTC-GTTCATACAAACT
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTA-TTTCAGTTCATACAAGCT
* * * *
35833883 TATTC-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGTAA-AAAGTTTAAA
128 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA
* * * * * ** *
35833946 AGATAAATCTGTTTATC-AATCAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGGACAATTATCAATTTCAA
191 AAATAAATTTGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * **
35834010 ATAGTTATGATATTTTGTTTTGTTATAAAATAACTGTTTCTACAT-ATAAAAGCTT-TTTTAGAA
255 ATTGTTATGCT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAG-TTATTCGA-AA
* * * * * * ** *
35834073 TAAAATAATATTCATATGTTATTGTTCCAAAAATTAATAAGC-AAA
316 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-CTAAG
* * * * ** * * ** *
35834118 AGATTTAGAAGATAAATCTATTTACCAAAAAAGGTCAAATATTTATTACTA-TTGAAAAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
* * * * * * * ** * *
35834182 TATTTCAAATAATTAT-AGCATGTTGTTTTATCATAAAATATTTGTTTTTGTTCATACAAACTTT
66 TATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
* * * * *
35834246 TTCAGAATGAGAA-AATATTAGTTTATTAATATTACAAAAATTAATTAA-T-AGCAAATTTAAAA
130 TTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGTAAG-AGATTTAAAA
* * * ** * * * *
35834308 GATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATTGTTACGATTATTTGAATAATTATCAATTTCAAAT
192 AATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
*** * * * * * * * * * * * *
35834373 AACTATAACATTTT-TTTTGTTATAGATCAAATATTTCTATTTATACAAGCTTGTTCAAAATATA
257 TGTTAT-GCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAATAAA
* ** *
35834437 ATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAACTAAG
320 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * * * * * * *
35834478 AGATTTAAAAAATAAATTTATTAATCG-ATTAAG-TCAGATAATTATGATTATTGGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTAT
** * * * * * **
35834541 CTATTTCAAAAAATTGTAACATTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTA
* * * * * ** * * * *
35834606 TTC-GGATAAAA-AAAATTAAATCATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAAAAAATTTAAAAGAT
130 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * * ** * **
35834669 AAATCTGTTTAGTGAACAAGTTCAAATAGTTTTAAGTATTT-GTCTAATTATCTATTTTAAATAA
195 AAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC-AATTATCTATTTCAAATTG
* * * * * * * *
35834733 TTATGATGTTTGGTTTTATCTTAGAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG-GATAAAA-
259 TTATGCT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAAT
* * * * * *
35834796 AA-ATTAAATCATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAA
322 AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * * **
35834834 AAATTTAAAAGATAAATCTGTTTAGT-GAACAAGTTCAAATAGTTTTAA-A-TATTTGTCTAATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAACTAGTTCAAATAG--TTAAGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
35834896 ATCTAGTTT-AAATAATTATGA-CATTTGATTTTATCTTAGAACAATTGTTTCTA-TTCATTCAA
63 ATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAA
* * * * * * *
35834958 GCTTATTCAAAATAAAATAACATTAATTTATTAATATTTCACATATTATTAATTAA-AGATTTAA
125 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
** * * * * * * * * * *
35835022 ACGATAAATCTGTTTATCAAACAAGCTCAAATAGTTGTGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
190 AAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA
*** * * * * * * *
35835087 AAAATTATGAGC-TTTTGTTTTATCATATAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTATTGGGAAT
255 ATTGTTAT--GCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATTCGAAAT
** * * * * * * *
35835151 AAGGTATTATTAATTTAATAATATTTCAATAATTAATAAGTAAA
317 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * ** * *
35835195 AGATTTAAAATATAAATCTATTTA-CTGGA-TAAGTTCAAATAGTTATCAATATTTAAATAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * * **
35835258 TTTATTTCAAATAATTTTGACATTTTGTTTTGTCATAGAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAATT
64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCT
* * * ** * * *
35835322 TATTCAAAATAAAGTAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TAATAAGTAAAAAATTTAAACA
128 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * *
35835386 ATAAATCTATTTACCAAATAAGATCAAATAGTTATAACTATTTGAATAGAACAATTATCTATTTC
193 ATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TT---TA-AACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
35835451 AAATTATTAT-CATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTATG-
253 AAATTGTTATGC-T-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-TTATT-CGA
* * ** * *
35835514 AA-AAAA-AATATTTATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAA
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** * * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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** * * * * * * * ** *
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* * * * * *
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*** * * *
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* *** * * * *
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* * * * * ** *
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* * * ****
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** * * ** ** * * * * *
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* * ** * ** *
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* * * * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * ** ** * * *
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*** * * * * * *** * *
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* ** * * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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** ** ** * * * * *
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* ** * **
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* * * * * ** * *
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* * * * * * *
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*** * *** * * * *
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* * * * * * *** * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * ** * **
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* * ** * * ** ** *
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* * * ** * * **
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503 A-ATTTAAAAACTAAAA-CTGTTCATTAAAATCA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * ** ** * *
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** * ** * * * * * * *
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** * * * * * *
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317 AAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * * * * *
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* ** * * ** * * * *
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* * * * * *
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*** * * * * * * *
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* * * * *
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** * * ** *
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* * * * ** ** *
35825358 AGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGT
191 AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTACAACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGT
* * * * *
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* *** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * *
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* *
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* * **
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* *
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* * * *
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* * *
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*
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* **
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * ** * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** ** * * **
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** *
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* **
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* * * * * * * *
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* **
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* * * * * *
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** * * * * *
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**
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** * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* ** * * * *
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** * * ** ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** *
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128 TGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * * * * **
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1 TTAAAAGATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGACTAATTATCTATT
* * * * * * *
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* * ** *
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* * * ** * * *
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1 TTAAAAGATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGACTAATTATCTATT
* * * * * * * * **
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* ** * * *
35834430 AAATATAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAACTAAGAGAT
130 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * ** * * * * *
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1 TTAAAAGATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTG-ACTAATTATCTAT
* * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* ** * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* **
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* ** * * * **
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * ** *
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* * * * * * * * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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*
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*
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* *
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AAATAATTATGACTATTTA
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* * * * * *
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* * * * * * * * **
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* * *
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* * *
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** * ** *
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*** ** *
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* *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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*
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* *
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** ** * * * * * *
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*
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ATACGCAATAATTTTTAGAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA
TAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAATATCATAATTTTTGGAAATGA
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35836899 TTACGGCAAA
*
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*
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*
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*
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*
35837530 TTTTTGGAAATGAATAATTATTAAAATAGTCAAAATTATTTAAACCTACTTGGTAAACATATTTA
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*
35837660 AGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGATAAGATAGAAGGTTATAACAACTTGAAATAAAT
326 AGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGATAAGATAAAAGGTTATAACAACTTGAAATAAAT
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391 AATTATTCAAATAGTTATCACTATTTGAATGTGTTT
35837761 A
1 A
35837762 GAAAGCAGAT
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TTTTTTAAAATCGTTTACTTATTAATTTTTTGAATATCTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
AGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGATAAGATAAAAGGTTATAACAACTTGAAATAAAT
AATTATTCAAATAGTTATCACTATTTGAATGTGTTT
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* * ** * * * *
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* * ***
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* * *
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*** ** * * * * *
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* * * * * * * *
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35837717 AAATAAATAATTATTCAAATAGT
1 AAATAAATAATTATTCAAATAGT
35837740 TATCACTATT
Statistics
Matches: 164, Mismatches: 36, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
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AATCCCATACGCAATAATTTTTAGAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTG
TATGAATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAAACTTGG
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* * *
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Statistics
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**
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** ** * * **
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*
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* * * ** * * * ** * * * *
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*
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* * ** *** * * * *
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*
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** ** * * * *
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** ** * * * * *
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* * *
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*** * * * * * * ** *
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*
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* * *
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** ** * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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*
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* * * * * * **
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* * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
35840492 TAAAATAATTATCCTT-TGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAAT
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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* * * **
35840831 CTTATCAATTTTTGAAAT-ATTATTAAAATAGTATTGTTTTATTTCCGATAAACTTTTATGAACT
246 ---AT-AACTTTT---ATGA--ACTAAAACA--ATTGTTTTA-TGAC-A-AAAC----A--AA--
* * * ** * * *
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* * * * * * *
35840959 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATGGATTTATTTTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATT
329 T--TAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAAT-AAATTA--TTTTTTAAATCT-TTCACTTATTAATT
** * * * ** *** * *
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* * * * * * * * ** *
35841088 TTTATAACTAAAAAAAATGTTAGAACGATTTGAAATGGATAATTGTTGTAATAATCTTAACTATT
451 TTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-AT-TCA-AATAGT-ATTATT
* * * * *
35841153 TGAACTAGTTTAG-CAAAAAA
511 TAAAATAGTTCAGTC-AACAT
* * * * * *
35841173 AATTATTTTTTAAAATCTCTGGCTTATTAATTTTTTG-AATGTCAATAAATTACTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTT-AAAT-T-T--TTTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTTAT
* ** ** * * * * * *
35841237 TTTGAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTATTTTGTCACAAAACAAAAGGTTAGAAC-ATTT
60 TTCGAATAAAATTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTT
* * * * * ** *
35841300 GAAATCGATAATTGTTCGAATAGTCTTAACCATTAAAACTAG-TTCGATAAATA-AATTTATTTT
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* * * * * *
35841363 TTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTAAAAAATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-TGATTAA
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* * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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246 ATAA-CTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * *** * * *
35842030 AATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAACTGGTTCAACAAACTTATTTATTTTTTAAGTC-
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* * * * * ***
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** * * * * * *
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* * * * **
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * * *
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* *
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* * * * *
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246 ATA-ACTTTTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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496 TCAAATAG-TAT---TATTTAAAATAGTTCA-GTCAACAT
* * * * * * *
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* ** * * * * * **
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62 C-GAATAAAATTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTG
* * ** *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * ** * **
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** * * * * * *
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* * * **** * * * * *
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** ** * * **
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* * * * * * *
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* * ** * ** * *
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* * * *
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** * * * * ** ** *
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* * * * * ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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*
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* * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * **
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* * * * *
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* * *
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*
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* * * * * * *
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Statistics
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* * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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*** ** * *
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* * ** * * * * * *
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*
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* * * ** * * *
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* * * *
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* * * * *
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126 AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT-TA
* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * ** * * *
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* * ** * * *
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* * ** *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *** *
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* *
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510 AACGATTTGAAATAGATAATTA
** * * * * *
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* * * * *
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* ** ** * *
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* * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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310 TATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAG-TCATAACTATT
* * * * *
35843856 TGAACTTGTTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTTATTTTTAGAATATTAA
373 TG-ACTTG-ATCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * * * *
35843920 TATATTGGAATTATTTTATTCCAAATAAACCTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
435 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * *
35843985 AAATGGTCATAACGATTAGAAATAAATAATTG
500 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
** * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * *
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* * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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** ** * * ** * * ** * **
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* * * * * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * * * * * ** * * *
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* * * ** * * * * ** * * ** *
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* * * * * * ** * *
35845443 TT-TTTAAAT-CTC-TTATTAATTTCAAAAT-AT--G--AATAAA-TTAGTATT--AT-T-TTAC
350 TTGATCAAATAGTCATAACT-ATTT-GACTTGATCGGTAAACAAATTTAGTTTTAAATCTCTTAC
* * * * ** * * * *
35845495 TTTAAATAATTTTGTATGAATAGTAA-CAATT-GT-TT-TTTATAAAAC-AAA-AGATCAT-AAC
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* * * * *** * * * * * * *
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* *
35845614 TTATTT
526 TAATTA
* ** * * ** ** *
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* * ** * * * ** * *
35845676 -TCAA---ATAAACT-TGT-ATGTATAGAACAATTGTTTTA-TAAGAAAATAAAAGATAATAATG
63 ATTAATTTTTAAA-TAT-TAATAAAT-TAA-TATTATTTTATTTCG--AAT--AAGCTTAT-ATG
* * * ** * * **
35845734 ATTTAAAATAAATAATTATT-T-A-AATCATCATAACTATTTCA-ACTTG-TTAGGTAAATTTTA
119 A-ATAAAA-AAATTATT-TTATGACAA--AACA-AA--AGGTCATA-ATGATT-TG-AAA-TAAA
* * * * * * * * * *
35845794 TAAATATT---TTACTTATTAA-TTTTTGAA-ATATT-AATAAA-TTA-GTATTATTTT--AT-T
172 TAATTGTTCAAATAGTTA-TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATT-TTTTAAATCT
* * * ** * *** *** *
35845848 -TTGAATAAGTTTGTGTGAACAAAAAT-AATTGGT-TTATGACAAAACAAAT-GGTCATAATGAT
235 CTT-ATTAA-TTT-T-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-C-T--TG-T
* * * * * * * * * **
35845909 TTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAAC--TAT-TC--AACTTG-TTCGGTAAACATATTT
291 ATGAAAGAAACAATTATTT-TAT-GACAAAACAAAATGTCATAAC--GATT---TGAA-ATAGAT
* ** * * * ** * * * **
35845968 ATTTTTTAAAATCGT-TTTGCT-TATT-AATTG-TC---AAA-ATA-TTA---ATAAAT-TAATA
348 AATTGATCAAATAGTCATAACTAT-TTGACTTGATCGGTAAACAAATTTAGTTTTAAATCTCTTA
* * * * ** * * * * **
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* * * * * * * *
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*
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64 TTAATTTTTAAATATTAATAAATT--AATATTATTTTAT--TTCG-AATAAGCT-T-ATATGAAT
*** * * *** * * * * *
35846252 AAAACAAAAGGTTGTA-G-CTATTTAAAA--TAGATAAT--TGTTCAAAT-AGTCA----T-AAC
122 AAAA-AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAATGAT-TTGAAATAAATAATTGTTCAAA
* ** * *** ** * *
35846305 TATTTGA-ACTTGTTTG---TTAAACAG-ATTCATTTTTTAAATCTTTT--A---CTTATTAATT
184 TAGTT-ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACA-TATTT--ATTTTTTAAATCTCTTATTAATT
* * ** * * *
35846360 TTTAGAATATTAATAAATTAGTGTTATGTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACAGAAATAATT-G
245 TTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTAT
** * *
35846424 TTTAGTGACAAAACAAAAAATAATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAACAGAT-ATAACT
308 TTTA-TGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAG-TCATAACT
* * ** * * * * * *
35846487 ATTT-ACATTGGTTTGGCCAACATATTCATTTTTTTAA-CTTGTTACTTATTAATTTTTTAGAAT
370 ATTTGAC-TT-GATCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATC-TCTTACTTATTAA-TTTTTAAAAT
* * ** * * * *
35846550 ATTAATAAATTTA-TATTACTTTT-TTTTAAATAAGA-TTGAATG-ACCGAAATATTTGTTTAAT
430 ATTAATAAA-TTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAA-ACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTAT
* * * * * *
35846611 AATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTG
492 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * ** * *
35846651 TTCAAATAGTTATTTA-TAATTGAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TTT--TT
1 TTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTT-AAATCTTTACTT
* * ** * *
35846712 ATTAATTTTTGAAATATTAGTAAA-T--TATTATTTTATTTCGAACAAAATTATATAAATGAAAA
63 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAAAAA
** * * ** * * *
35846774 TTTTGTTTTATAACAAAACAAAATATCATAATAATTTGAAA-AAGATGATTGTTCAAATAGTCAT
127 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
35846838 AAATATTTAAACTAGTTTAATAAACAGAATTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAA
191 AACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTT-TAA
* * * * * * *
35846903 ATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATGAGTAGAAATAATTGTTTTATG
250 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-AAGAAACAATTATTTTATG
* * * * * * * * * *
35846968 ACAGAACAACAGGTTATAATGATTCGATATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT
314 ACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGACTT
* * * ** * * *
35847033 AGTTCGATAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTTTAAAATATTAATAAATTA
379 -GATCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA
* *
35847098 GTATTACTTTATTCCAAATAAATTCATTTTATTCTATTTCAAATAAGCTTGTTTGAACT-GAAAC
442 G-----------------T--ATT-ATTTTATTC----T-AAATAAACTTGTATGAA-TAGAAAC
* * ** *
35847162 AATTGA-TTTATGAGAAAACAAAAGGTTATAAC-ATTTTGAAATTTATAATTG
481 AATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * ** *
35847213 TTTATATAGTCTTAACTGTTTGAA-TTGGTTCAACAAACCA-ATTTATTTTTTAATTCTCTTACT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTAGTAAA-CAGATTTA-TTTTTAAATCT-TTACT
* ** * * *
35847276 TATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATTAGCTTATATGAGTAGAA
62 TATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATA-AA
* * * * ** * * * *
35847341 ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACACTCA
125 AAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
35847405 TAATTTTTTGAA-TTGGATC-GACAAACAGATTTATTTTTGAAATTTCTTACTTAATAATTTTTT
190 TAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTT
* * * * *
35847468 AAATATTAATATATTAGTATTATTTTATTCCGATTAAGCTTGTATGATAAAAAATAATTATTTTA
248 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-AAGAAACAATTATTTTA
* * * * *
35847533 TGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTCAAATAGATAATT-ATTTAAAT-GACCATAATTATTTG
312 TGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAG-TCATAACTATTTG
* * * ** * ** *
35847596 AACTAATG-T-AGTAAATAGATTAATTTTTTTAAAATCTCTTACTTATTATTTTTTTGAATGTTA
375 -ACT--TGATCGGTAAACAAATT--TAGTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * * * *
35847659 ATAAATCAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACT-GAAATAATTGTTTTATGACTAA
434 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAA
* * *
35847723 ACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAAGAGATAATTG
498 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * ** * * * *
35847757 TTCTAATAGTCTTAGCTATTTGAAATGGTTTAGGAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCATA
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCT-TTACTTA
* * * ** * * * *
35847822 TGAATTTTTGGAATATTATTAAATTTGTAATATTTTA-ATCCAAGTAAGCTTACATGAATAGAAA
64 TTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTATATGAATA-AAA
* * * * * * * * *
35847886 CAATTGTTTTATGTCAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAGTTGTTCAAATAGTCAT
126 AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT
* * *** * *
35847950 AACTATTTGAACTTGTT-AGGTAAATAGATTTAAGGTTTAAATCTTTTACTAA--TTT---TA-T
191 AACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAATATT
* *
35848008 --T---TT-G-A--A--TAATT-----T--G---GTATGAACAGAAAC-ATATGTTTTATGACAA
255 AATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAAT-TATTTTATGACAA
* * * * * * * * *
35848051 AAC-AAA-GGCTATAATGATTTAAAATCGATAAATGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGA
318 AACAAAATGTC-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGA
* * * * * *
35848114 TCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA----TTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
381 TCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * *
35848175 TTATTTTATT-TCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGATCA
445 TTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * *
35848238 TAATGATTTGAAATAAATAATTT
509 TAACGATTTGAAATAGATAATTA
** * * *
35848261 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCAGCAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTATTTTT-AAATC-TTTACTTA
* * * *
35848326 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-CTCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAA
64 TTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAATA-AAA
* * * * *
35848390 CAAA--AGGTTTATGGCAAAACAATAGGTCATAATGATTTGATAA-AGATAATT-TTTAAATAGT
126 -AAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
35848451 CATAACTATTTGAACGTATTTAGAAAATATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGA
188 TATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTAA
* * ** * *
35848516 ATATTAATAAATTTATGTTTTATGTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAACCAATTGTTTTA
250 ATATTAATAAA-TTA-GTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTA
* * * * * * *
35848581 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAATTAGATAATTGTTCAGATAGTTATAACTATTTAAA
312 TGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTT-GA
* * * * * * *
35848646 CTTGTTCGGTAAATAGATTTAGATTTTAATTATCTTACTCATTAA-TTTTGAAATATTAATAAAT
376 CTTGATCGGTAAACAAATTTAG-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
* * *
35848710 TAGAATTATTTTATT-TCAAATAAACTTTTATGAACT-GAAACAAATTGTTTTATTG-CAAAACA
440 TAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAA-TAGAAAC-AATTATTTTA-TGACAAAACA
* * * *
35848772 AAATGTTATCATGATTTGAAATAGATAATTA
501 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * *
35848803 TTCAATTAGTCATGACTATTTGAACTTA-TTCGACAAACATATCTATTTTTTAAATCTTTTACTT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATC-TTTACTT
** * * * * *
35848867 ATTAATTATCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATAT-AAATAAGTTTGTATGAACAGAA
63 ATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTATATGAATA-AA
* * * * * *
35848931 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
125 AAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
35848996 TAA-TGATTTGAATTTATTC-GATAAAAAAATTTATTTTATAAATCTTTTACTAATTAATTGTCT
190 TAACT-ATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATT-T-T
* * * *
35849059 T-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAATAAAAAAAATTATTT
247 TAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTT
* * * ** * ** * *
35849122 TATGATAAAACAAAAGGTTATTGCGATTTCAAATTTATAATT-ATTCAAATAGTTATAATTATTT
310 TATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * ** *
35849186 AAACTT-ATTCAATAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTAAC-TATTAATTTTTGGAATATTAT
374 -GACTTGA-TCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* ** ** * *
35849249 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAACTTAAATGAACTA-AAACAATTCTTTTATGATAAAA
435 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
* * *
35849313 CAAAAGGTCATAAGGATTTAAAATAGATAGTTA
499 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * ** * * *
35849346 TTCAAATAGTCATGA-TCATTTGATC-TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAAATTTTTTC
1 TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTA-TTTAGTAAACAGATTTA-TTTTT--AAATCTTTAC
* * * * * *
35849409 TTATTAATTATTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTATATGGACAGA
61 TTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATA-A
* * * * * * *
35849474 AACAATTATATTATAACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTGAAATAAATAATCGTTCAAATAGTC
124 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTT
* * * * *
35849539 ATAACTATTTGAAC-TGATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCACTAATTAATTTTT---TA
189 ATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAATA
* *** * * * * ** *
35849600 --AAT--ATT-CT-TT-TTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACTTTTGTTTTATGACA
253 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTATGACA
* * * * * *
35849658 AAACAAAAGGTCATAACAAATTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGG
317 AAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTG
* * * * * * * * ** *
35849722 GTTGGTAAACAAAATTATTTTTTAAT-AC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTGATAAATTTCTT
380 ATCGGTAAACAAATTTAGTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * * ** * * * * *
35849784 TTATTTTATTTTGAATAAGCTAATATAAATTGAAAAAATTATTTTATTACAAAATAAAAGGTCAT
445 TTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* *
35849849 AAC-ATTTGAAATATATAATTG
510 AACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * * * *
35849870 TTCATATAGTCTTAACTATATGAAC-AAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCT-TTACTT
* * * * *
35849934 ATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGGAA
63 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATA-AAA
* * * * * * * *
35849999 AAATTGTTTTATTG-TAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATATACAATTGTTTAAATAGTTA
126 AAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* *
35850063 TAATTATTTAAAC-TGATTC-GATAAACATATTTATTTTTTAAATATCTTATTAATAAATCTCTC
190 TAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACATATTTATTTTTT-AA-ATC-----------TCT-T-
* *** ** *
35850126 ATTAATTTTTGAAAGATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGATAAAAAA
238 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG--AAAGAA
* * * * * * * ** *
35850190 ACAGTTGTTTTGTGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGGGCCA
300 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCA
* ** * * * *
35850255 TAATTATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTT---
365 TAACTATTTGACTTGA-TCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* * * ** * * * * *
35850317 A-A--AAT--ATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATAAATTGAAATAAATTTTTTTTT
428 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAA-CAATTATTTTAT
* ** * * * * *
35850377 TACTAAATGAAAA-GTCATAATGATTTTAAAAAGATAACTG
492 GAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * * **
35850417 TTTAAATAGTTATAACTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGA-ATATTAATAAAGTA
1 TTCAAATAGTCATAACTA---TTTGAA---CTTATTTAGTAA---ACAGATTTATTTTTAAA-T-
* * * * * *
35850481 GTATTA-TT-TT-ATTTTGGATAAACT-TTTATCAACTAAAACAATTATTTTA--T-G-ATAA-A
55 CT-TTACTTATTAATTTT---TAAA-TATTAAT-AAAT-TAA-TATTATTTTATTTCGAATAAGC
* * * * * ** ** * *
35850537 ATAAAAG-GTCATAACGATT-TTAAATAGATAATAATTCAAATA-GTTATAACT-ATTT--AA-A
112 TTATATGAAT-AAAAAAATTATTTTAT-GACAA-AA--CAAA-AGGTCATAA-TGATTTGAAATA
** * * ** * * * * * * *
35850595 CCT-ATTCGGTAAACAATTTAGTT-T-TTTTTTTCAATTTCTT-ACCTATTA-ATTTTCCTAATG
170 AATAATT--GT--TCAA-ATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTA-AACATATT--T-AT-
** * * * * * * * **
35850655 TTAATAAATTACTATTATTTTATTCTAAAAAAGGTTTGTATAAACTAAAACAATTATTTTATTAC
224 TTTTTAAA-T-CTCTTA-TTAATTTTTAAATA---TT-AATAAA-T--TAGTATTATTTTATT-C
* * * * * * * * ** *
35850720 TAAATAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAAC--TAT-T--T--
278 CAAAT--AA-G-C---TTG-TATGAAAGAAACAATTATTTT-AT-GACAAAACAAAATGTCATAA
* ** ** * ** * * * **
35850778 -GAATTG-GTTCAGA-AATTG--CATTTATTTTTAA-AATTT---TT-TTC--T-TATTAATTT-
333 CGATTTGAAAT-AGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGACTTGATCGGTAAACAAATTTA
** * * * * * ** *
35850829 -TTGGAATAT-TCTTAAATTATTATTATTTTT-TAAT-TCGAATAAGCTT-GTATGA--ACATAC
397 GTTTTAA-ATCTCTT-ACTTATTA--ATTTTTAAAATAT-TAATAA-ATTAGTATTATTTTATTC
*** * ** ** * *** **
35850887 -ACAAT-TGTTTG-ATG-ACA-AAACAAAGA-TCAATAACAATTTAAGATA-G--ATAATTATTT
456 TA-AATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-A-AGGTCATAACGATTT
*
35850943 -AAATAGTCATAACTA
518 GAAATAG--ATAATTA
* * *
35850958 TTTAAAT--T-----------G---GT-TTGA-TAAACAGATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTAT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTACTTAT
* * * ** * *
35851002 TGATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAATA
65 TAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATA-AAAAA
* * ** ** * *
35851067 ATTGTTTTATGACAAAA-AAAATGTTGTAACAATTTGAAATAGATAACTT-TTCAAA-ACGTCA-
128 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA-TTGTTCAAATA-GTTAT
* * * *
35851128 ATACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTCTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTTAA
191 A-ACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAA-TTTTTAA
* * ** * * * *
35851193 ATATTAATAAATTAGTATTATTTGATT--AAAGGCAAATTTGTATAAATAGAAATAATTGTCTTA
250 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA--TAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTA
* * *
35851256 TGACAAAACAAAA-GATTATAATGATTTGAAATAAATAATT-ATCTAAATAGTCATAACTATTTA
312 TGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATC-AAATAGTCATAACTATTT-
* ** ** * *
35851319 AACTT-ACTTAGTAAACAAATTTCTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
374 GACTTGA-TCGGTAAACAAATTT-AGTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * ** * * *
35851383 AATTTGTACTATTTTATTCCAAATAAGTTTGTATGAACAGAAATAATTAGTTTT-TGACAAAATA
437 AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTA-TTTTATGACAAAACA
* * *
35851447 AAAGGCCATAATGATTTGAAATAAATAATTA
501 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * ** * *
35851478 TTCAAATAATAATTACTATTTGAA-TGTGTGCAGAAAACATATTTACTTTTTAAAT-TTTGACTT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTT-ACTT
* * * * * * *
35851541 ATTAGTTTTTGGAATATTATTAAATTTATATTGTTTTA-TTCGGAACAAGCTTTTATGAATAGAA
63 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAATA-AA
* * * * * * * * *
35851605 ACAATTGTTTTATGAC-AAAGAAAATGTCATAA-CATTTAAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCA
125 AAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
35851668 TAACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTCA-TTTGTAAGTTCTCTTATTAATTTTTGAAATA
190 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAA-ATCTCTTATTAATTTTT-AAATA
* * * * * *
35851732 TTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATGACA
253 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTATGACA
* * * *
35851797 AGACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTG
317 AAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTG
* * * ** * * ** * * *
35851861 TTGGGTAAACATATTTCTTTCTTAAATCTCTTAATTATTAATTATGCAAATATTAAAAAACTAAT
380 ATCGGTAAACAAATTTAGTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * ** * * * * * *
35851926 ATTATTTTAATCCAAA-ACAGTTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGGCTAAACAAAAAGTC
444 ATTATTTTATTCTAAATA-AACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * *
35851990 ATAATAATATGAAATAAATAATTG
508 ATAACGATTTGAAATAGATAATTA
** * *
35852014 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTGTAAATCTTTTACATA
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTATTTT-TAAATC-TTTACTTA
* * * ** * * * *
35852079 CTAACTATCTT-AATAATAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGTTTGTATGAACAGAA
64 TTAA-T-TTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAATA-AA
* * * *** * *
35852142 AAAATTGTTTTATGACAAAACAAGAGGTAATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
125 AAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* *
35852207 TAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
190 TAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-A
*** * * * *
35852271 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTAT
249 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTAT
* * * * * * * * *
35852336 GGCAAAACCAAA-GATCAAAATGATTTAAAATAGATAATTAATTCAAATAGTTATGATTATTTGA
313 GACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTG-
* * * * * * * *
35852400 AC-TAATTTGGTAAA-AATATTTATTTTTTAAATATTTTACTCATTAATTGTTGAAATATTAATA
375 ACTTGA-TCGGTAAACAA-ATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * ** * * *
35852463 AATTAGTATTATTTTGGTTC-AAATAAGCTTGTATGAGTAGAAGTAATTATTTTATGATATAACT
437 AATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* * * * * * *
35852527 AAATGTTATAATGATTTGATAGAAATAATTG
501 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * *
35852558 TTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTGATTGAGTAAGA-AAATTTATTTTTTAAATCTTTTACAT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAA-ACAGATTTA-TTTTTAAATC-TTTACTT
* ** * * * *
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63 ATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATA-AAA
* * * * * *
35852687 AAA-AATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-CATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
126 AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* * ** * *
35852750 GAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTAGA
190 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA----TTAATTTTTA-A
* * * * * ***
35852815 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTGCA
250 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTATG
* * * * * * * ** * *
35852880 ATAAAACAAAAGGGCAAAACAATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATATTTGTAATTATTTAAAC
314 ACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTT-GAC
* * * * *
35852944 -TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTATTAAA
377 TTGA-TCGGTAAACAAATTTA--GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * * * *
35853008 TTAGTATAATTTTAATTC-AAGT-AAGTTCATATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAGAATAA
439 TTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAACTT-GTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* *
35853071 AAGGTCATAACAATTTGACATAGATAATTA
502 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
** * * *
35853101 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTG
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATC-TTTACTTA
* * * * * * * * * *
35853166 CTAAGTTTTGAAATATCAATAAACTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGT-TCGAACAAAAA
64 TTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATAT-GAATAAAAA
* * ** * * * *
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127 -AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAAATAATTGTTCAAATA-GTT
* * * * * *
35853293 ATAATTATTTGAACTCGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAACCTTTG
189 ATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAA--AT-CT-CTTATTAA-TTTTT
*** *
35853357 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTA
248 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTA
*
35853422 TGACAAAACAAAA-GTTCATAATG-TTTAGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTT
312 TGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTT-GAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * * *
35853484 GAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATAAAATTTTGAAATATTCATA
374 G-ACTTGATCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * * * *
35853549 AATTAGTATTATTTCATTTTGAGTAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAA
437 AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* *
35853614 AAGGTTATAACGATTTGAGATAGATAATTA
502 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * *
35853644 TTCAAATAATCATAAGTATTTG-AGTTGGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATC--T-CTTA
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTACTTA
* * * * * * * * *
35853705 TTAATTTTTAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTA-TTCTAAATAGGTTTGTATAAATAGAAAC
64 TTAATTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAATA-AAAA
* * * * * *
35853769 AACTGTTTTATGACAAAACAGAATTA-TTC-TGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTT
127 AATTATTTTATGACAAAACA-AA--AGGTCAT-AATGA-TTTG-A--AAT--AAATAA-T-TGTT
* * * * *
35853832 ACAATAAAACAAAATAAAATAA-TGATTTGAAATAGCTAATAGTTCGAATAGACTTGACTATTTG
180 -C-----AA-ATAGT--TATAACT-ATTTG--A-A-CT--T-GTTC-AGTA-A----AC-A-TA-
35853896 AATTTGTTTAGTGAACATATTTATTTTATAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
219 --------T--T-----TA--T-TTTT-TAAATCT----CTTATTAATTTTTA-AATATTAATAA
* *** ** * * * * **
35853961 ATTAGTATTATTCTATTTTGAATAAATTTGTAT-AAGTAGAAATAATTGTTTTATAAGAGGACAA
260 ATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA--AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * ** * **
35854025 AA-GATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCGAACCCGCTCATT
323 AATG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGATCGGT
* * * * * *
35854089 AAACATATTTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATCA
386 AAACA-AATTTA--GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
*** * * * * ** **
35854154 TTTTATAGAAAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAATCATAAC
448 TTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * *
35854219 AATTTGAAATGGGTAATTG
513 GATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * *
35854238 TTCAAATAGAT-ATAATTATTTGAACGTGTGTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTA
1 TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTACTTA
* * * ** * *
35854302 TTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTATATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATGAACAGAAT
64 TTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTATATGAATA-AAA
* * * * * * * * * * * *
35854366 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATAATCAT
126 AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * **
35854431 AGCTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTAAGAAA
191 AACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTT-TTAAA
* * * * ** * *
35854495 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTGAATTGAAACCGTTGTTTTATTA
251 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * * *
35854560 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATT-ATTCAAATAATCATGATTATTTTAATT
315 CAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTA-TTTGACT
* * * * * *
35854624 TGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT-AATT
378 TGATCGGTAAACAAATTTA--GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
* ** * *
35854688 AGTATTATTTTAATCCGAATAACCTTGTATGAATATAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGA
441 AGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-
* * *
35854752 GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
505 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * *
35854779 TGCAAATAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTT-GTTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACAT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATC-TTTACTT
* ** * *
35854842 ATTAATTGTCTT-AATATTAATAATTTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGA
63 ATTAATT-T-TTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAATA-A
* * * ** * * * *
35854905 AAAAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAAATAATTATTTAAATAGTC
124 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTT
* * * * *
35854970 ATAA-TCATTTAAAGTTATTC-GATAAACAAATTT-TTTTTAAAATCTCTTAATTGTTAATTTTT
189 ATAACT-ATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTT-A---TTAATTTTT
* * * * * * * *
35855032 GGAATATTAATAAACTT-GTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATCGAAACAAATCTTT
248 -AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTT
* * * * * * *
35855096 TATGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATT-ATTCAAATAATCATGACCATTT
310 TATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * * * *
35855160 GATCTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAAT
374 GA-CTTGATCGGTAAACAAATTTA-GTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * * * * *
35855224 AAATTAATATTATTTTAATGTGAATAAGCATGTATGAACAGAAACAAATGTTTTATAACAAGACA
436 AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* * *
35855289 AAAAGTCAGAACGATTTGAAATAAATAATT-
501 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
** *
35855319 TGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATC--T-CTT
1 T-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTACTT
* * * * * ** *
35855380 ATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTACTTTATTAT-GAACAAATTTATATGAACAAAA
63 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTATATGAATAAAA
* * * * * * *
35855444 ACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
126 A-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* * * * **
35855509 TAATTATTTGAA-TTGGTCAAGCAAACAGAAATATTTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTG
190 TAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACATATTTA-TTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTT-
* * * * * * * *
35855573 CAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCAAATCAGCTAGTATGAATTGAAA-ATTTGTTTT
248 AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTT
* * * * * * *
35855636 ATGACAAAGCAAAAGGTCATAAC-ATTTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTG
311 ATGACAAAACAAAATGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * * * *
35855700 AACTAG-TTTGTCAAACAAATTTATTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTAT
375 -ACTTGATCGGT-AAACAAATTTAGTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * * *
35855764 ATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAA
438 ATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * * *
35855829 AGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTG
503 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * *
35855858 TTTAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TAGTTT-GATGAACAGATTTATATTTTAAATCGCTTACT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTAG-TAAACAGATTTAT-TTTTAAATC-TTTACT
* * *
35855921 TATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCTGAATAAGCTTGA-ATG-ATAA
62 TATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTT-ATATGAATAA
* * * * * * * * *
35855983 AAAACACTTGTTATATGAC-CAACAAAAGGTAATAATGGTTTGAAATAGATAAATGTTGAAATGG
124 AAAA-A-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
** * * * * * * * * *
35856047 CCATAATTATTTGAA-ATGATTCAGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTGATTAATTTTTGGA
187 TTATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-AA
* * * * ** *
35856111 ATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACTA-AAATGATTGTTTTAT
250 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA--AGAAACAATTATTTTAT
* ** * * * * *
35856175 GACAAAACAAAATTTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCGTATTGCCTTAACTATTTAAA
313 GACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAC
* ** * * * * * *
35856239 TTGCTTCGAAAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAAAT
377 TTG-ATCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
* *
35856304 TAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTA-TTTA-GA-ATAGAATA
440 TAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACA-A-AACA
* * * *
35856364 AAAAGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTA
501 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* ** *
35856395 TTCAAATA---AGAAC----T--AC-T-TCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATC-TTTACTTA
* * * * *
35856448 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAGGCTTGTATG-ATGAAAAA
64 TTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAAT-AAAAA
* * * * * * *
35856512 CAATTATTTTATGGCAAAAC-AATGTTCATAATGATTTGCAATAGATAATTGTTGAAATAGTCAT
127 -AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT
* * ** * *
35856576 AATTATTTG-ATTTGATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTT-AATCACTTACTTATTAATTTTTGA
191 AACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAAT--C-T-CTTATTAATTTTT-A
* * * * *
35856639 AATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAAT-AGCTT-TAATGAATTGAAATAATTTTTTTA
249 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGT-ATGAA-AGAAACAATTATTTTA
* * * * * * * * *
35856702 TGATAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAA
312 TGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAC
* * * * * * *
35856767 TTTATTC-ATAAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAA
377 TTGA-TCGGT-AAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * ** * * * **
35856831 TTGGTATTATTTTATTTTGGATAACCTTTTATGAACTA-AAGCAATTGCTTTATGACAAAACAAA
439 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * *
35856895 AGATCATAATGATTTTAAATA-TTAATCT-
503 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT-TA
* * * * * *
35856923 TTCAAATAGTCATAATTACTTGACCTTATTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCT
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTT-AGTAAACAGATTTA-TTTTT-AAATCT-TTACT
* * * ** * * *
35856988 TATTGATTTTTCAAATGTTAATATATTAGGATTATTTT-GTTCTAAATAAGCTTGTATGATATGA
62 TATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGA-AT-A
* * * * * ** * * * **
35857052 AACAAA-TATTTTATGACTAAA-AATAGGTTAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTTATAGT
123 AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
35857115 TTTAACTATTTGAA-TTAGTT-TGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
188 TATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTT
* * *
35857178 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGGTAAAAAAACAATTGTT
247 T-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT-G-AAAGAAACAATTATT
* * * * * * *
35857243 TTATTACAAAAC-AAATGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATTGCCATAATTAT
309 TTATGACAAAACAAAAT-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
35857306 TTAAC-TAATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC---TT-A---TT--AATA--AA
372 TTGACTTGA-TCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
** * * *
35857359 T---TT-GTATTATTTTATTCTGTATAAACTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGAAAAAA
435 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
* * * * *
35857419 CAAAAGGTCATAGCAATTTTAAATAGACAATTG
499 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* ** * *
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1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTT-TTAAATCT-TTACT
* * * * * * * * * *
35857516 TCTTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAGTAAGCTTGTATAAACTGAA
62 TATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAA-TAAA
* * * * ** * * *
35857581 ACAATTGCTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG-T
125 AAAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTT
* * * ** *
35857645 ATTAA-TCATATAAACTAGTTC-GATAAACA-ATTT-TTTTTTGATCTCTTACTTATTAATTTTG
189 A-TAACT-ATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTT-AAATC-T-CTTATTAATTTTT
* * ** * *
35857706 AAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTT
248 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTT
* * * *
35857769 ATGACAAAAC-AAATGGTGATAACTATTTGAAATAGATAATT-ATTCATATAGTCTTAACTATTT
311 ATGACAAAACAAAAT-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** ** * * * * ** * ** *
35857832 GAACTCGTTCGACAATTATATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCGAAATATTATTA
374 G-ACTTGATCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * * *
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437 AATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* * * *
35857961 AAAAGTTATAATGATTTGAAATATATAATTA
501 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * ** * * *
35857992 TTCATATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTGA
1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCT-TTACTTA
* * * ** *
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64 TTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAAAAA-
* * * **
35858122 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATA
127 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATA
* * * * *
35858187 ATTATTTTATAATTAATTTAACTGATTCGGTAAATAGTA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATA
192 ACTA---T-T--TGAA-CT---TG-TTCAGTAAACA-TATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-T-
* * * * ** *
35858251 AAATTTTGAAATATTAA-AAAGTTAGTTTTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAGCTGAAAAT
241 -AATTTTTAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-AAG-AAAC
* * * * * *
35858315 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGTCTTA
302 AATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATA
* * **** ** * * * *
35858380 ACTATTTGAATTGGTTTAACAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAAT
367 ACTATTTGACTT-GATCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * *
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* * * * * *
35841526 TAATCAGATTTAGTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATACATTAGTATGAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
35841591 TTTATTCCAAATAAGCTTGTATGTTGAAGAATAATTTTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATG
65 TTTATTCGAAATAAGCTTGTATG-GGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * *
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129 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-G-TCATAATTATTTGAACTTGA-TTCGATAAACAGATT
* * *
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191 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
* * * * * * *
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253 AGATAAGCTTTT-ATAAA-TAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
* * * **
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* * * * * * *
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1 TAAACAGATTT-ATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATT
* *
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63 ATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGGGAA---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * **
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124 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGATTCGATAAACAGA
* * * * * *
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189 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TT
* * *
35842140 C-GA-ATAGGTTTGTATGATAA-AAAAAAATTATTTTATG-TCAAAAC-AAAGATTATAACGATT
252 CAGATA-AGCTTT-TAT-A-AATAAAACAATTATTTTATGAT-AAAACAAAAGGTTATAACGATT
* * * * *
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* * * *
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1 -TAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTA
* ** * * * *
35842308 TTATTTTATTCAAAATGAA-CTTGTATGAATAAAAACAGTTATTTTATGATAAAACAAAAGATCA
61 TTATTTTATTCGAAAT-AAGCTTGTATG-GGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
35842372 TAATGATTTGAGAATA-ATTATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACGT-ATTCAGA-AAATA
124 TAACGATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGATTC-GATAAACA
* * * *
35842434 GATTTATAATTTAAAAT-T-TTACGTATTAATTTTTATAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *
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* * * * * * * * * **
35842732 AACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATGACTCTTTGAATTTG-TTAGGTAAACTTAT
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* * * * * * *
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* * * * *
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253 AGATAAGCTTTTAT-AA-ATAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * ***
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** * ** * * * * *
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** ** * *** *
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* * ** * * * * *
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* * * *
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* * ** * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * **
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* * *** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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*
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*** * * **
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*** * **
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** * * **
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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*
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *** *
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683 ATTTGAACAAGAATGTAT-AATA-AAGAA
* ** *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAA-AATTTGAAAAAGATAA-TTGTTCAAATA-GTCA
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* * * * *
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188 TATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
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252 GAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAA
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315 TAAATTAGTATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTATAAACAG-AACAATT-GTTTTATAACAAAA
* **** * * * * * * *
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441 AGGCAA-AT-TTTA-----TAAATATTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTAT
* *** * * ** * * * * * * *
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* * * * * ** * *
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563 ACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTCAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
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627 ATTTTTTAAAACTTTTCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATTT-GAA
* *
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690 CAAGAATGTATAAT-AA-AG-AA
* * * * * *
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1 -AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAA-AATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *** * * * * *
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126 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATA-AGTTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
* * * * * * *
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189 AT-GATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
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253 AACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-T-TTTTAGAATATTAAT
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* * *
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625 TTATTTTTTAAA-ACTTTT-CTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATTT
* * ** * *
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687 GAACAAGAATGTAT-AATA-AAGAA
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1 AATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAATCATAA-AATTTGA-AAAAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
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* * * * * * **
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125 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
* * *
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* * * * * *
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253 AACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
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35852825 ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTGCAATAAAACAAA
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*** * * ** * * *
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382 A-AATAATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATCA-TCATAACTATTTCAACTTG-TTAGG
* * * * * *
35852952 TAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATA
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* * * * * * * * * *
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499 ATTTTATTTTAAATAAGATTGA-ATGAACAAAAATAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** *
35853080 ACAATTTGACATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTT
563 ACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTCAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
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35853145 ATTTTTTAAATCTTTTGCTTGCTAAGTT-TTGAAATATCAATAAACTAGTATTACTTT-ATTCCA
627 ATTTTTTAAAACTTTT-CTTATTAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATT-TG
* ** *
35853208 AATAAGCTTGT-TCGAACAAA-AA
688 AACAAGAATGTAT--AATAAAGAA
* * * * *
35853230 CAATTGTTTTATAACAAAACAAAACATAATAATGATTT-AAATTAGATAAATGTTC-AATAGGTC
1 -AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAA-AATTTGAAA-AAGATAATTGTTCAAATA-GTC
* * * * * ** *
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61 ATAACTATTTAAACTAGTTCAATAAACAGAATTAT-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTT
* * * *
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124 CAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* *
35853420 TATGACAAAACAAAA-GTTCATAATG-TTTAGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
188 TATGATAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTA-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * * *
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378 CAAAAAATAATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATCATCATAACTATTTCAACTT-GTT-
* ** ** * * *
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441 AGGCAAATTTTATAAATATTTT--A---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * * * *
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501 TTTATTTTAAATAAGATTGAATGAACAAAAATAATTGGTTTATAACAAAACA-AA--AGGTCAT-
* * * * ** * *
35853800 AATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTACAATAAAACAAAATAAAATAATGATTTGAAAT
562 AACAA--TT-TA--AA-ATAAATAATTA-TTCA-AAT-AGTC---AT---A-ACT-A-TT--CA-
* * * * * *
35853865 AGCTAATAGTTCGAATAGACTTGACTATTTGAATTTGTTTAGTGAACATATTTATTTTATAAATC
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* * * * * *
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648 T--AA-TT-GTCA-----A-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATTTGAACAAGA-ATGTAT
*
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701 AA-TA-AAGAA
* * ** *
35854004 AATTGTTTTATAAGAGGACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAA-AATTTGAAA-AAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
** ** * * * * **
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* * ** * *
35854133 AATTTTAATAAATTAGTATCATTTTATAGAAAATAAGCTTT-TATGAACA-AAAACAATTGGTTT
127 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTAAATAAG-TTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTT
* ** * ** * * * *
35854196 ATGACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATGGGTAATTGTTCAAATAGAT-ATAATTATTTG
189 ATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTG
* * *
35854260 AACGTGTGTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT-GTAATATTAAT
253 AACTTGT-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT
* * * * * * *
35854322 CAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACAGAATCAATTGTTTTATGACAAAAC
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** * * * * * * * * * * * * *
35854386 AAAAGTTCATAATGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATAATCATAGCTATTTGAGCTTATTCGG
379 AAAAAATAATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATCATCATAACTATTTCAACTTGTTAGG
* * * * * **
35854451 TAAACAAATTTATTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTAAGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
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* * * *** *** * * **
35854516 TTATTTCAAATAAGCTT-ATTTGAATTGAAACCGTTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATG
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* ** * * * * * * *
35854580 ATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATGATTATTTTAATTTGTTCGGTAAACATATTTATT
566 ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTCAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA-T
* ** *
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629 TTTTTAAAACTTTT-CTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATTTGAACA
*** *
35854709 ACCTTGTATGAATATAA-AC
692 AGAATGTAT-AATA-AAGAA
* * *
35854728 AATTATTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAA-ATAATTGTGCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAA-AATCATAA-AATTTGAAA-AAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * *** * * * **
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63 AACTATTTAAACTAGTTCAATAAACAGAATTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAA
* * * * *
35854855 ATATTAATAATTTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATG
128 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATG
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192 AT-AAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA
* * * * * * * *
35854983 GTTATTCGATAAACAAATTT-TTTTTAAAATCTCTTAATTGTTAATTTTTGGAATATTAATAAAC
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35855047 TT-GTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATC-GAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAA
319 TTAGTATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTAT-AAACAG-AACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
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35855175 ACATATTTATTTTTTAAA-ATTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTT
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* * ** * * *
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630 TTTTAAAACTTTTCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATT-TGAACAA
* *
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1 A-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAA-AATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * * **
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* * * * * * *
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126 AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT-AAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
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* * * * * * *
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253 AACTTGTTCGAT-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
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35855763 TATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAA
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** * * * * * * * * * *
35855828 AAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTGTTTAAAT-AGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGAT
381 AAAATAATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATCA-TCATAACTATTTCAACTTG-TT-A-
* * *** *
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442 G-GCAAATTT-TA---TAAATATTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * * *
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** * * * * * * * * * * * * * * *
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** * * *** * * * *
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** * *
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* * * * * ** * * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * ** * **
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*** * * ** * * * * * * *
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* * *
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* * * *** ** * * **
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** * * * * * * * ** * *
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* * * ** * * *
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* * *** * *
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* * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * ** * ** **
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* * * *
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* * * *
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*** * * * * * *** * **
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* ** * * * ** *
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* * * * * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * *
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** * *
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* * * *
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Found at i:35848771 original size:181 final size:182
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* * * * *
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1 TATGAACTGAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
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* *
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* *
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1 TATGAACT-GAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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1 TATGAACTGAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * ** * *
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* *
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* * *
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1 TATGAACTGAAACAAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * ** * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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1 TATGAACTGAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * * * *
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* *
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* * * * * * *** * **
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* * * * ** * * *
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* * ***
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* * * * * * *
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1 TATGAACTGAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * **
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1 TATGAACTGAAACAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
** * *
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* ** *
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** ** ** * *
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* * * * *
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* ** * ** * *
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* * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** *
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*
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182 A
* * * * * *
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* ** * * * * * * *
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*
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* * * * *
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* ** *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* *
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* *
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* *
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* *
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AATTATTTGAAATGATTCGATAAACAAATTCATTTTTTAAATATCTTATTAATAAATCTCTC
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*
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* * **
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* * * *
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* * * * *** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * **
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** * * * **
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*
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* * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * ***
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* * * * * * **
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * **
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* * * * * * * * * * * * *
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* * * *
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* ** *
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** * * * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
35856733 TATACAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAATTTATTC-ATAAAACACATTTATTTTTTAAA
127 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGT-AAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * *** * *
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** * * * * * *
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254 TGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAAT-TAT
* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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** ** * ** *
35857094 ATAGATAATTATTCTTATAGTTTTAACTATTTGAA-TTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAA
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*
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * ** ** ** * * *
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** * * * ** *
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* ** * * * * * *
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* * ***
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* * *
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** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * **** **
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* * * *
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** * * * ** * *
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* * * * * * * ** *
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* ** * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *** *
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* * * * * * ** * ** *
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* * ** * *** ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
35854703 CGAATAACCTTGTATGAATATAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGAGTC
129 CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTC
* * * * * * *
35854755 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTGCAAATAGTCATAA-CATTTGAACTTGTTTGTTAAACAGA
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTAG-AAAACAGA
* * *
35854819 TTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTGTCTT--AATATTAATAATTTTGTATTATTTTA-T
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATT
* * * * *
35854881 TCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTT
128 TC-AAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * * *
35854935 ATAGCGATTTCAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAATCATTTAAAGTTATTCGATAAACAAA
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAGA
* * * * *
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65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATTTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
35855063 CGAATAAACTTATATGAATC-GAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAAGGTC
129 CAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * ** * * *
35855115 ATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGACCATTTGATCTAGTTCA-ATAAACAT
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTT-AGA-AAACAG
* * * *
35855179 ATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
64 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTAGTATTATTTT-AT
* * * * * * * *
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127 TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * *
35855296 AGAACGATTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAG
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAG
* *
35855360 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGA-TTAGTATTACTTTATT
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-ATTTAGTATTATTTTATT
* * * * *
35855420 ATGAACA-AA-TTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT
128 -TCAA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * * *
35855473 ATAATAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTCAAGCAAACAG
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-GT-TAGAAAACAG
** * * * *
35855537 AAATATTTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTAT
64 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATTTAGTATTATTTTAT
* * *** * *
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127 TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * *
35855654 ATAAC-ATTTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTTGTCAAACAA
1 ATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTAG-AAAACAG
* * *
35855718 ATTTA-TTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTATTATATTT-GTATTATTTTAT
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATA-ATTTAGTATTATTTTAT
* * * * * *
35855780 TCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTT
127 TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * *
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1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAGA
* * * * *
35855899 TTTATATTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTC
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * *
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130 -AAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * * *
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1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TT-AGAAAACAG
* * * * *
35856078 ATTCACTTTTTAAA--TC--ACTGATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTT-GTATTATTTTATT
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATTTAGTATTATTTTATT
* * ** **
35856138 TCAAATAAGCTTGCATGAACTAAAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAATTTC
128 TCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * * * * * *
35856191 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCGTATTGCCTTAACTATTT-AAATTGCTTCGAAAAACAA
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTAG-AAAACAG
* * * * *
35856255 ATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAATTTAGTATTATTTTATT
* * * * *
35856319 TCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATT-ATTTA-GA-ATAGAATAAAAAGTT
128 TCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA-A-AACAAAAGGTC
* * * * * * *
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1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTAGAAAACAGAT
* *
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66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTCA
* * ** * * * *
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131 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
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* * * *
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64 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATT
*** * * * **
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128 TCAAATAAGCTTGT-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
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1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTT-AGAAAACAGA
* * * * *
35856784 TTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTGGTATTATTTTATTTT
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTC
** * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 ATAACGATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-GTT-AGAAAACA
* * * * * *
35856963 AATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTGATTTTTCAAATGTTAAT-ATATTAGGATTATTTT-
63 GATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAT-TTAGTATTATTTTA
* ** * * * * *
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126 TTTC-AAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
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*
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* * *
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* * * * ** * *
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** * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * ** *
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* * * * * * * *
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1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAATTATTTGAACTTGTTAGA-AAACAG
* *
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* * * *
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127 TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * ** *
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* * * ** * * * *
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** * * * * * *
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130 AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * *
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* *
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* ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
35858214 CGGTAAATAG-TATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAAAAAGTTAGTT
58 ----AAACAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTAGTA
* * * * *
35858278 TTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATGAGCTGAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTC
118 TTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
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1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT-G-TTAGA-AAACA
* * * *
35858405 GATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-
63 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAATTTAGTATTATTTTAT
* * * *
35858468 TTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTT
127 TTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * *
35858523 ATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTCAAATAGTCAGAACTATTT
1 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
35858568 ATTTTTAGAT
Statistics
Matches: 3600, Mismatches: 756, Indels: 362
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
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TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTCA
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Found at i:35854879 original size:361 final size:358
Alignment explanation
Indices: 35853807--35858567 Score: 3433
Period size: 361 Copynumber: 13.2 Consensus size: 358
35853797 CTGAATAATT
* * ** * **** * *
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* * * * * ** * * * * **
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* * **
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* * * ** * *
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* ** * * *
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* * ***
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* *** * ** * * *
35854171 TTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATGGGTAAT
1 TTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
35854236 TGTTCAAATAGAT-ATAATTATTTGAACGTGTGT-AGAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTA
66 TATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGT-TCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
35854298 CTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATGAAC
129 CTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * *
35854361 AGAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATA
192 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
35854426 ATCATAGCTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTA
256 GTCATAAC-ATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-
**
35854490 AGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
319 -TTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * ** * * *
35854531 TTATTTGAATTGAAACCGTTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAAT
1 TTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * *
35854596 TATTCAAATAATCATGATTATTTTAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTAC
66 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAC
* ** * * * *
35854661 TTATTAATTGTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAATCCGAATAACCTTGTATGAATATA
130 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * *
35854725 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTGCAAATAGTC
195 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * *
35854790 ATAACATTTGAACTTGTTTGTTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTGTCTTA
259 ATAACATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTA
* *
35854855 ATATTAATAATTTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGC
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* * * * * * * * *
35854892 TTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATAAATAAT
1 TTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * *
35854957 TATTTAAATAGTCATAA-TCATTTAAAGTTATTCGATAAACAAATTT-TTTTTAAAATCTCTTAA
66 TATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * *
35855020 TTGTTAATTTTTGGAATATTAATAAACTT-GTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATCG
130 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
35855213 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATGT-GAATAAGC
320 -TAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGC
* ** * * * * * *
35855253 ATGTATGAACAGAAACAAATGTTTTATAACAAGACAAAAAGTCAGAACGATTTGAAATAAATAAT
1 TTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * *
35855318 T-TGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-C
66 TAT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * ** * * *
35855378 TTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTACTTTATTAT-GAACAAATTTATATGAACAA
130 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * ** * *
35855442 AAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGATATAGATAATTGTTCAAATAGT
194 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
35855507 CATAATTATTTGAA-TTGGTCAAGCAAACAGAA-ATATTTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTT
258 CATAA-CATTTGAACTTGTTCGA-TAAACA-AATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* *
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319 TT--AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
35855738 GTTATTAATTTTT-AGAATATTATTATATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATA
129 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * *
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193 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
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* * *
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321 --AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGC
* ** * * * * * *
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1 TTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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129 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
** * ** *
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193 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
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*
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* * * * * * * *
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1 TTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACA-A-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * *
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* * *
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* * * * * * * *
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193 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
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257 TCATAA-CATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
*
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* * * ** * * * *
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1 TTGT-ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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** ** * ** * *
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*
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* * * * * * *
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* * **
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** *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * * **
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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* **
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* *** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * ** * **
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* * * *
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*** * * * * * *
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* *
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* ** * * *
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* * *
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*
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* * * * * * *
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* ** **
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* * **
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* * * * *
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*
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* * *
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* ** * * ** *
35859304 CTTAATAATTTTTGAAATATTAACGAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAATTTTTATGAACTG
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* * * **
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* * * * *
35859434 TATATCTATTTAAACTTG-TTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAATCTCTTG
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**
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* * * * *
35859550 GAAATAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA
65 GAAATAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
* *
35859614 GTCTTAACTATTTGAACT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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179 3 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG
AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
CATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTG
Found at i:35859822 original size:153 final size:154
Alignment explanation
Indices: 35859509--35859803 Score: 348
Period size: 153 Copynumber: 1.9 Consensus size: 154
35859499 TGAATATTAA
* * ** ** * *
35859509 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAAC
1 TAAATTAGTATTATCTTAATTCAAATAAGCTTACATGAAAAGAAACAATTATTTTATGACTAAAC
* * * *
35859574 AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGATCGG
66 AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTAAACTAGATCAG
* *
35859639 CAAAACACATTTATTTCTTATTAT
131 CAAAACAAATTTATTTCTTATAAT
*
35859663 TAAATTAGTATTATCTTAATTGAAATAAGCTTACATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAC-AAA-
1 TAAATTAGTATTATCTTAATTCAAATAAGCTTACATGAAAAGAAACAATTATTTTATGACTAAAC
* * * *
35859726 ATAATGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTC-AAGTAGTCATAATTATTTAAACTA-ATT
66 A-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAA-TAGTCATAACTATTTAAACTAGA-T
*
35859789 CAG-TAAACAAATTTA
128 CAGCAAAACAAATTTA
35859804 GTTTTTAAAT
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 19, Indels: 8
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
152 14 0.12
153 54 0.45
154 51 0.43
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (154 bp):
TAAATTAGTATTATCTTAATTCAAATAAGCTTACATGAAAAGAAACAATTATTTTATGACTAAAC
AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTAAACTAGATCAG
CAAAACAAATTTATTTCTTATAAT
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Indices: 35859657--35860096 Score: 508
Period size: 181 Copynumber: 2.5 Consensus size: 176
35859647 ATTTATTTCT
* * * ** **
35859657 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTGAAATAAGCTTACATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTAAATAAAATTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * * *
35859722 C-AAA-ATAATGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAATTATTTAAACT
65 CAAAACAAAATG-TCATAATGACTTGAAATAGATAATTATTCAAGTAGACATAACTATTTAAACT
*
35859785 AATTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTAATTAATTTTTAAAA
129 AATTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCAAATTAATTTTTAAAA
* * * *
35859833 CATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAAATTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
* *
35859898 CAAAACAAAATGTCATAATGACTTGAAATAGATAATTATTCAAAG-GGACATAACTATTTGAACT
65 CAAAACAAAATGTCATAATGACTTGAAATAGATAATTATTC-AAGTAGACATAACTATTTAAACT
** * * * * *
35859962 TGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAA
129 AATTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCT-CAA---ATTAATTTTTAAAA
* *
35860014 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAAATTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
*
35860079 CAAAACAAAATATCATAA
65 CAAAACAAAATGTCATAA
35860097 CTATTTGAGT
Statistics
Matches: 223, Mismatches: 32, Indels: 13
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 5 0.02
176 50 0.22
177 69 0.31
178 10 0.04
180 1 0.00
181 88 0.39
ACGTcount: A:0.44, C:0.07, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAAATTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAC
AAAACAAAATGTCATAATGACTTGAAATAGATAATTATTCAAGTAGACATAACTATTTAAACTAA
TTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCAAATTAATTTTTAAAA
Found at i:35860210 original size:146 final size:146
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Indices: 35859946--35860251 Score: 409
Period size: 146 Copynumber: 2.1 Consensus size: 146
35859936 TTCAAAGGGA
* * * *
35859946 CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTA
1 CATAACTATTTGAACTTGCTTAATAAACAGATTTATGTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTA
* *
35860011 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAATAATT-ATTTT
66 GAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGATTTT
*
35860075 ATGACAAAACAAAATAT
131 -TGACAAAACAAAAGAT
** ** *
35860092 CATAACTATTTGAGTTTGCTTAATAAACAGATTTATGTTTTAAATACT-TTACTTATTAATTTTT
1 CATAACTATTTGAACTTGCTTAATAAACAGATTTATGTTTTAAAT-CTCCAACCTATTAATTTTT
* * * ** *
35860156 GGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTT
65 AGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGATTT
*
35860221 TTGACAAAACAAAAGGT
130 TTGACAAAACAAAAGAT
35860238 CATAACTATTTGAA
1 CATAACTATTTGAA
35860252 ATAAATAATT
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 20, Indels: 4
0.85 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
146 132 0.96
147 6 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (146 bp):
CATAACTATTTGAACTTGCTTAATAAACAGATTTATGTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTA
GAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGATTTT
TGACAAAACAAAAGAT
Found at i:35860470 original size:506 final size:503
Alignment explanation
Indices: 35859097--35861159 Score: 1530
Period size: 506 Copynumber: 4.0 Consensus size: 503
35859087 ATGATTTGGC
* *
35859097 AAACACATTTATTTTTTAAAT-CTTTTACTTAATAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 AAACAGATTTATATTTTAAATAC-TTTACTTAATAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAT
* * * * * *
35859161 TTTAATCCGAATAAGCTTATATG-ATAAGAAATAGTTTTTTTATGACAAAACAAAGATCATAGCG
65 TTTAATTCGAATAAGCTTATATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACT
* * * * *
35859225 ATTTGAGATTGATATTTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTAGTTT-GAAAAATAGCTTTAG
129 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAG-AAAATAGATTTA-
** * ** *
35859289 TTTTTAAATTTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAACGAAGTAGTATTATTTTATTTTGG-AT
192 TTTTTAAAAAT-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGGAAT
* * * *
35859353 AAATTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGA
254 AAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * *
35859418 TAATTGTTCAAATGGTTATATCTATTTAAACTTG-TTAGGTAAACATATTAATTTTTTTAAATCT
319 TAATTGTTCAAATGGTAATAACTATTTAAACTTGTTTA-GTAAATA-ATTAA-TTTTTTAAATCT
* * * **
35859482 CTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
381 CTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGA
* *
35859547 ACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
446 ACTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *** ** * ***
35859605 ATTCTAATAG-TCTTAACTATTTGAACTAGATCGGCAAAACACATTTATT-TCTTATTATTAAAT
1 A----AACAGAT-TT-A-TATTTTAAATA-CTTTACTTAATA-ATTT-TTGAAATATTATTAAAT
* * * * *
35859668 TAGTATTATCTTAATT-GAAATAAGCTTACATGAAAAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAATG
56 TAGTATTATTTTAATTCG-AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAG
* * * * * *
35859732 ATCATAA-TGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAATTATTTAAACTAATTCAGTAAA
120 ATCATAACT-ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGAAAA
* * * * * *
35859796 CAAATTTAGTTTTT--AAATCTCTAATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
184 TAGATTTA-TTTTTAAAAATTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
35859859 CT-AAATAAATTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGACTTG
248 -TGGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * *
35859923 AAATAGATAATTATTCAAA-GGGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTT
312 AAATAGATAATTGTTCAAATGGTA-ATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAATA-ATTAATTTTTT
**
35859987 AAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATT
375 AAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATT
** * *
35860052 GTATGAA-TAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA-TATCATAACT-ATTTGAGTTTGCTTA
440 GTATGAACT-GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATAA-TGATTTGAAATAG-ATA
35860114 A-T
501 ATT
* * * * *
35860116 AAACAGATTTATGTTTTAAATACTTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATATTTTAAATACTTTACTTAATAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATT
** * * *
35860181 TTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTT-TGACAAAACAAAAGGTCATAACT
66 TTAATTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATT-ATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACT
* * *
35860245 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAGATTT-T
129 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTAGAAAATAGATTTAT
35860307 TTTTAAAAAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAAT
193 TTTT--AAAAATTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGGAAT
*** * * * *
35860371 AACCATGTATGAACAGAAACAGTTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGA
254 AAATTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * **
35860436 TAATTGTTCAAATAGTAAGAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACTAATTAATTTTTTAAATCTCT
319 TAATTGTTCAAATGGTAATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAA-TAATTAATTTTTTAAATCTCT
* * * *
35860501 TA-CTCATTAA-TTTTAGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AACTTATATGA
383 TACCT-ATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGA
*** ** * **
35860563 ACTGATGCAATTATTTTAAAATC-AAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
446 ACTGAAATAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGAT-A--ATT
* * *
35860624 CAAATAGTTATGGCTATTTGGACTTTTTGGGTAAACATA-TTTATTTTTAAAATCTTTTACTTAT
1 --AA-A--CA--G--ATTT--A-TATTT---T-AA-ATACTTTA--CTT--AA-----TA---AT
* * * * *
35860688 TATTTGAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATAT-GAATATGCTTGTATGAACA-AAAC
37 T-TTT---GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT-TCGAATAAGCTTATATGAATAGAAAC
* * * * * *
35860751 AATT-TTTTAT-A-AAAAAAAAG-TCGTAA-TGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
97 AATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACT-ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * *
35860811 ACTATTTAAACT--TATTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATATTTTATTT-TTTTTAATTGTT
161 ACTATTTGAACTAGT-TTAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAA-A----ATTTCTTATTAATT-TT
* * * ** * *
35860873 T-AAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAA-ATTTGTT
217 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGGAATAAATTTGTATGAACAG-AAACAATTGTT
* * * ** *
35860936 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGAT-AAATAATTATAACTATTT
281 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTAATAACTATTT
* * ** * * *
35861000 TAACTTGTTCAACAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
346 AAACTTGTTTAGTAAATA-ATTAATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATA
** * * * * * * * *
35861065 AGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTATG-AGTGGAAATAATTGA-TTTGTGATAACAT
410 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAACT-GAAATAATT-ATTTTATGACAAAAC
35861128 AAAAGATT-ATAATGATTTGAAATAGATAATT
473 AAAAG-TTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
35861159 A
1 A
35861160 TTCAAATAAT
Statistics
Matches: 1228, Mismatches: 220, Indels: 189
0.75 0.13 0.12
Matches are distributed among these distances:
501 5 0.00
502 3 0.00
503 79 0.06
504 46 0.04
505 68 0.06
506 185 0.15
507 14 0.01
508 3 0.00
510 4 0.00
511 119 0.10
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513 6 0.00
514 9 0.01
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516 126 0.10
517 8 0.01
519 1 0.00
520 4 0.00
523 1 0.00
524 6 0.00
525 3 0.00
526 2 0.00
528 1 0.00
533 5 0.00
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539 16 0.01
540 46 0.04
541 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (503 bp):
AAACAGATTTATATTTTAAATACTTTACTTAATAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATT
TTAATTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACTAT
TTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGAAAATAGATTTATTTT
TAAAAATTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGGAATAAATTTG
TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATGGTAATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAATAATTAATTTTTTAAATCTCTTACCTATT
AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAACTGAAATAA
TTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
Found at i:35860864 original size:17 final size:17
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Indices: 35860830--35860863 Score: 61
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35860820 ACTTATTCGA
35860830 TAAATATATTTATTTTT
1 TAAATATATTTATTTTT
35860847 TAAATAT-TTTATTTTT
1 TAAATATATTTATTTTT
35860863 T
1 T
35860864 TTAATTGTTT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 1
0.94 0.00 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 10 0.59
17 7 0.41
ACGTcount: A:0.32, C:0.00, G:0.00, T:0.68
Consensus pattern (17 bp):
TAAATATATTTATTTTT
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Indices: 35860115--35861522 Score: 1233
Period size: 538 Copynumber: 2.6 Consensus size: 538
35860105 GTTTGCTTAA
** *
35860115 TAAACAGATTTATGTTTTAAATACTTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATGTTTTAAATACTTTACTTATTAATTTGAGGAATACTAATAAATTAATATTAT
* * *
35860180 TTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAACT
66 TTTATATCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT-GTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * *
35860245 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAACTATTTGAATGTGTTTAGAAAATAGATTTTTTT
130 ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAACTATTTAAATGTGATTAGAAAATAGATTTTTTT
*
35860310 TAAAAAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGGAATAACC
195 TAAAAAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAACC
*
35860375 ATGTATGAACAGAAACAGTTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAAT
260 ATGTATGAACAGAAACAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAAT
* * ***
35860440 TGTTCAAATAGTAAGAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACTAATTAATTTTTTAAATCTCTTACT
325 TGATCAAATAATAAGAACTATTTAAACTTGTTCAACAAACTAATTAATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * **
35860505 CATTAATTTTAGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACTTATATGAACTGATG
390 CATTAATTTTAGGAATACTAATAAACTAGAATTATGTTATTTCAAATAACTTATATGAACTGAAA
35860570 CAATTATTTTAAAATCAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
455 CAATTATTTTAAAATC-AACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
35860635 GGCTATTTGGACTTTTTGGG
519 GGCTATTTGGACTTTTTGGG
* *
35860655 TAAACATATTTAT-TTTTAAA-ATCTTTTACTTATT-ATTTGAGGAAATATTAATAAATTAATAT
1 TAAACAGATTTATGTTTTAAATA-C-TTTACTTATTAATTTGAGG-AATACTAATAAATTAATAT
* *
35860717 TATTTTAATAT-GAATATGCTTGTATGAACA-AAACAATT-TTTTAT-A-AAAA-AAAA-GTCGT
63 TATTTT-ATATCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT-TGACAAAACAAAAGGTCAT
* *
35860775 AA-TGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-T-ATTCGATAAATAT
126 AACT-ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-AACTATTTAAA-TGTGATTAGA-AAATAG
* * * * * * *
35860837 ATTTATTTTTTAAATATTTTATTTTTTTTAATTGTTT-AAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTA
187 ATTT-TTTTTAAAAAAATTTA--CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTA
* * * * * * * *
35860901 TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAA-ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATT
248 TTTGAAATAACCATGTATGAACAG-AAACAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATT
* * * *
35860965 TGAAATAGATAATTGAT-AAATAATTATAACTATTTTAACTTGTTCAACAAA-TAGATTCATTTT
312 TGAAATAGATAATTGATCAAATAATAAGAACTATTTAAACTTGTTCAACAAACTA-ATTAATTTT
* * * *
35861028 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAAC
376 TTAAATCTCTTACTCATTAATTTTAGGAATACTAATAAACTAGAATTATGTTATTTCAAAT-AAC
* * * * * * **
35861093 TTGTATG-AGTGGAAATAATTGATTTGTGATAA-C-ATAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGAT
440 TTATATGAACT-GAAACAATT-ATTT-T-AAAATCAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGAT
* * *** * ***** *
35861155 AATTATTCAAATAATCATAAATATTTGCACTGGGCAAGC
501 AATTATTCAAATAGTTATGGCTATTTGGACT-TTTTGGG
* * * * * * * * **
35861194 T-AACAAATTCAT-TTTTGAAATTCATCAGTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGCATT
1 TAAACAGATTTATGTTTT-AAATACTTTACTTATTAA-TTTGAGGAATACTAATAAATTAATATT
* * * * * * * *
35861256 ATTTTATTTTGAATAAGAC-AGTATG-ACTAGAAATAATTATTTTATGATAAAATAAATGGTCAT
64 ATTTTATATCGAATAAG-CTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTT-TGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
35861319 AA-TAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAAACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAAATA
126 AACT-ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAACTATTTAAA-T-G-TGATTAGA-AAATA
* * *** ** *
35861383 TATATTTTTT--AACTCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
186 GATTTTTTTTAAAAAAAT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-T
* * * * * *
35861446 TTGAACA-AACTTAT-T-TGAAAAAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
249 TTGAA-ATAAC-CATGTATG-AACAGAAACAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAAT
*
35861508 ATGAAATCA-ATAATT
311 TTGAAAT-AGATAATT
35861523 ATTTAAATGT
Statistics
Matches: 708, Mismatches: 114, Indels: 88
0.78 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
533 1 0.00
534 38 0.05
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536 20 0.03
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Consensus pattern (538 bp):
TAAACAGATTTATGTTTTAAATACTTTACTTATTAATTTGAGGAATACTAATAAATTAATATTAT
TTTATATCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAACTA
TTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAACTATTTAAATGTGATTAGAAAATAGATTTTTTTT
AAAAAAATTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAACCA
TGTATGAACAGAAACAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATT
GATCAAATAATAAGAACTATTTAAACTTGTTCAACAAACTAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTC
ATTAATTTTAGGAATACTAATAAACTAGAATTATGTTATTTCAAATAACTTATATGAACTGAAAC
AATTATTTTAAAATCAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGG
CTATTTGGACTTTTTGGG
Found at i:35861902 original size:175 final size:178
Alignment explanation
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35861212 AATTCATCAG
** * *
35861222 TTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGC-ATTATTTTATTTTGAATAAGACAGTATG-ACT
1 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-CTATTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACT
* * * * * * * **
35861284 AGAAATAATTATTTTATGATAAAATAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
64 A-AAAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATAAAGAATTCCTCAAATA
** * * ** * *
35861349 GTTA-AACTAATTAAACTG-GTTTAATAAACAAATATATATTTTTTAACTCTCTTAC
128 GCCATAACTATTTGAACTGAGTTGCA-AAA-AAAT-TATA---TTGAAATCTCTTAC
** * * * ** *
35861404 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTA-TTTGAA-AA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAA-TAAGTTACTAAGAACTA
* * * * * * * * ** *
35861467 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATATGAAATCAATAATTATTTAAAT-
65 AAAAA-A-TTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATAAAGAATTCCTCAAATA
* * * * * *
35861531 GTCATAATTTTTTGAACT-AGTTCGACAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTGC
128 GCCATAACTATTTGAACTGAGTT-G-CAAA-AAAATTA-TATTGAAATCTCTTAC
* * * ** *
35861585 TGATT-ATTTTTAAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTAA
* * ** *
35861649 AAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCC
66 AAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATAAAGAATTCCTCAAATAGCC
* * *
35861714 TTAACTATTTGAACTG-GTT-CAAATAAATT-TATTGAAATCTCTTAG
131 ATAACTATTTGAACTGAGTTGCAAAAAAATTATATTGAAATCTCTTAC
* * * *
35861759 TTATTAATTTTT-ATAATATTATTACATTACTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTACGAA-T
1 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACT
* * * * * *
35861821 AGAAATAATTATTTTATGATAGAACACAAGGTTACAACAATTTGAAATATATG-ATTCCTCAAAT
64 A-AAAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATA-AAGAATTCCTCAAAT
* * * *
35861885 AGCCATAACCT-TTTGAACTGATTTGGTAAAAAAATTATTTTTAAATCTCTTAC
127 AGCCATAA-CTATTTGAACTGAGTT-GCAAAAAAATTATATTGAAATCTCTTAC
* ** *
35861938 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAGGTTTGTATGGTAA--
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAGTTACTA-AG-AACT
* * * * * * * * * ** *
35862001 AAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCATAAC-ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATGG
64 AAAAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATAAAGAATTCCTCAAATAG
* * * * * **
35862065 CCATAATTATTTGAACTGA-TT-CGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAAC
129 CCATAACTATTTGAACTGAGTTGC-A-AAA--AAATTA-TATTGAAATCTCTTAC
* * * * *
35862118 TTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTA-TAAG--C
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAG---TTACTAAGAAC
* * * * * * * * * ** * *
35862180 TAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACAGTTTTAAATAGATAATTGTTTATATA
63 TAAAAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATAAAGAATTCCTCAAATA
*
35862245 GTCATAACTATTTGAACT
128 GCCATAACTATTTGAACT
35862263 TGTTTGATAG
Statistics
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0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTAA
AAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCACAACAATTTGAAATAAAGAATTCCTCAAATAGCC
ATAACTATTTGAACTGAGTTGCAAAAAAATTATATTGAAATCTCTTAC
Found at i:35862017 original size:21 final size:20
Alignment explanation
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Period size: 19 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
35861978 TTTTGAATAG
35861988 GTTTGTATGGTAAAAAACAATT
1 GTTTGTAT-G-AAAAAACAATT
35862010 GTTT-TATGAAAAAACAA
1 GTTTGTATGAAAAAACAA
35862027 AAGTTCATAA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
19 9 0.53
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ACGTcount: A:0.46, C:0.05, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (20 bp):
GTTTGTATGAAAAAACAATT
Found at i:35862238 original size:534 final size:536
Alignment explanation
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Period size: 534 Copynumber: 2.2 Consensus size: 536
35861194 TAACAAATTC
* *
35861204 ATTT-TTGAAATTCATCAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGC-ATTATTTTATTTTG
1 ATTTATTGAAATTC-TTAGTTATTAATTTTTATAATATTAAT-AATTA-CTATTATTTTATTTTG
* * * * *
35861267 AATAAGACAGTATGACTAGAAATAATTATTTTATGATAAAATAAATGGTCATAATAATTTGAAAT
63 AATAAG-CTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAAAACAAATGGTCACAACAATTTGAAAT
** * * *
35861332 AAATAATTGTTCAAATAGTTAAACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAAATATATATTTTTTAACT
127 AAATAATTCCTCAAATAGATAAACTAATTAAACTGATTTAATAAACAAATATATATTTTTTAAAT
*
35861397 CTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTT
192 CTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATAT
* * * *
35861462 GAAAAAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATATGAAATCAATAATTATTT
257 GAAAAAAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATATAAAATCAATAATTATTC
* * *** *
35861527 AAATGTCATAATTTTTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTGATTAT
322 AAATGCCATAATTATTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCCAACTGATAAT
* * ** *
35861592 TTTTAAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTAAAAAAATTA
387 TTTTAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAG-ACTAAAAAAATTA
*
35861657 TTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTAT
451 TTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCATAACTAT
35861722 TTGAAC-TGGTTCA-A-ATAA
516 TTGAACTTGGTTCATAGATAA
*
35861740 ATTTATTGAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTATAATATTATTACATTACTATTATTTTATTTTGA
1 ATTTATTGAAAT-TCTTAGTTATTAATTTTTATAATATTAATA-ATTACTATTATTTTATTTTGA
* * *
35861805 ATAAGCTTGTACGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACACAA-GGTTACAACAATTTGAAAT
64 ATAAGC-TGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAAAACA-AATGGTCACAACAATTTGAAAT
* * * * * **
35861869 ATATGATTCCTCAAATAGCCATAACCT-TTTGAACTGATTTGGTAAA-AAA-AT-TA-TTTTTAA
127 AAATAATTCCTCAAATAG--ATAAACTAATTAAACTGATTTAATAAACAAATATATATTTTTTAA
** * * *** *
35861929 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAGGTTTGT
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTAT
** * *
35861994 ATG-GTAAAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCATAAC-ATTTAAAAT-AGATAATTA
255 ATGAAAAAAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATATAAAATCA-ATAATTA
* *** * *
35862056 TTCAAATGGCCATAATTATTTGAACT-GATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT
319 TTCAAAT-GCCATAATTATTTGAACTAG-TTCGACAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCCAACTG
*
35862120 ATCAATTTTTAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTA-TAAG-CTAA
382 AT-AATTTTTAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAG---TTACTAAGACTAA
* * * * * * * * *
35862183 AACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAAC-AGTTTTAAATAGATAATTGTTTATATAGT
443 AAAAATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGC
* *
35862247 CATAACTATTTGAACTTGTTTGATAGATAGA
507 CATAACTATTTGAACTTGGTTCATAGATA-A
* * * * * *
35862278 TTTATTTTTTTAATTTCTT-GCTTATTAATTTTT-TGAATGTTAATAAGATAGTATTATTTTATT
1 ---ATTTATTGAAATTCTTAG-TTATTAATTTTTAT-AATATTAATAA-TTACTATTATTTTATT
* * * * *
35862341 TTGAATAAGCATATATGAATTGAAATAATTATTTTATAACT-AAACGAAA-GGTCAGAATAATTT
60 TTGAATAAGC-TGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGA-TAAAAC-AAATGGTCACAACAATTT
* *
35862404 GAAACAGATAATT
122 GAAATAAATAATT
35862417 GTTCGAGTAG
Statistics
Matches: 560, Mismatches: 89, Indels: 52
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Matches are distributed among these distances:
531 1 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (536 bp):
ATTTATTGAAATTCTTAGTTATTAATTTTTATAATATTAATAATTACTATTATTTTATTTTGAAT
AAGCTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAAAACAAATGGTCACAACAATTTGAAATAAAT
AATTCCTCAAATAGATAAACTAATTAAACTGATTTAATAAACAAATATATATTTTTTAAATCTCT
TACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAAA
AAAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATATAAAATCAATAATTATTCAAAT
GCCATAATTATTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCCAACTGATAATTTTT
AAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGACTAAAAAAATTATTTTA
CGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCATAACTATTTGAA
CTTGGTTCATAGATAA
Found at i:35862393 original size:181 final size:180
Alignment explanation
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35860076 TGACAAAACA
** * * * * *
35860086 AAATA-TCATAACTATTTGAGTTTGCTTAATAAACAGATTTATGTTTTAAATACT-TTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTATT
* * * *
35860149 AATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
65 AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * *
35860214 TTGGTTTT-TGACAAAACAAAAGGTCATAACTA-TTTGAAATAAATAATTGTTC
130 TT-ATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAAC-AGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * **
35860266 AAATAGTCA-AACTATTTGAA-TGTGTTTAGA-AAATAGATTT-TTTTTAAAAAAAT-TTACTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTT-GATAAATAAATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTA
* * * *
35860326 TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAACCATGTATGAACAGAA
63 TTAATTTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * *
35860389 ACAGTTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
126 ACAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
35860445 AAATAGTAAGAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACT-AATTAATTTTTTAAATCTCTTACTCATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAA-TAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** * * * **
35860509 AATTTTAGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATATGAACT-GATGCA
65 AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACA
** * * *
35860572 ATTATTTTAAAATCAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
129 ATTATTTTATGAT-AAACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * * * * * *
35860625 AAATAGTTATGGCTATTTGGACTT-TTTGGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
*** * * * * *
35860689 -ATTTGAGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAATATGCTTGTATGAACA-AAACA
65 AATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* * * * * *
35860752 ATT-TTTTAT-A-AAA-AAAAAGTCGTAA-TGATTTAAAATAAATAATTATTC
129 ATTATTTTATGATAAACAAAAGGTCATAACAG-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
35860800 AAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATATTTTATTTTTTT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA--CTTAT
* * * *
35860865 TAATTGTTTAAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAA
64 TAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAG-AAA
* * * * * *
35860929 -ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGC-GATTTGAAATAGATAATTGAT-
127 CAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACAG-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * *
35860982 AAATAATTATAACTATTTTAACTTGTTCAACAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* ** * * ** * * * *
35861047 ATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAGTGGAAATAAT
66 ATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * *
35861112 TGA-TTTGTGATAACATAAAAGATTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTC
131 T-ATTTTATGATAA-ACAAAAGGTCATAACAG-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *** * * * * * *
35861163 AAATAATCATAAATATTTGCACTGGGCAAGCT-AACAAATTCATTTTTGAAAT-TCATCAGTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTAT
* * * * *
35861226 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGAC-AGTATGACTAGAAAT
64 TAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAAC
* * *
35861290 AATTATTTTATGATAAA-ATAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTC
128 AATTATTTTATGATAAACA-AAA-GGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
35861344 AAATAGTTA-AACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAAATATATATTTTTTAACTCTCTTACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAAT-T-TATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
*** * * * * * * *
35861408 TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAAAC
64 TAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AATAGAAAC
* * * * * *
35861473 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-GATATGAAATCA-ATAATTATTT
128 AATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACAG-TTTGAAAT-AGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
35861527 AAAT-GTCATAATTTTTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTGATT-
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * * * * * *
35861590 ATTTTTAAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTA-AAAAA
66 ATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACA
* * *
35861653 ATTATTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAAC-GATTTGAAATAAAGAATTGTTC
129 ATTATTTTATGAT-AAACAAAAGGTCATAACAG-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
35861706 ATATAGCCTTAACTATTTGAAC-TGGTT--CAAATAAATTTA---TTGAAATCTCTTAGTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
35861765 ATTTTTAT-AATATTATTACATTACTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTACGAATAGAAATAA
66 ATTTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * * * * * **
35861829 TTATTTTATGATAGAACACAAGGTTACAACAATTTGAAATATATGATTCCTC
130 TTATTTTATGATA-AACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
35861881 AAATAGCCATAACCT-TTTGAAC-TGATTTGGTAAA-AAAATTA-TTTTTAAATCTCTTACTTAT
1 AAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTG-TTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * *
35861942 TAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAGGTTTGTATGGTAA-A-AA
64 TAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-G-AATAGAA
* * * * *
35862004 ACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTTCATAACA-TTTAAAATAGATAATTATTC
126 ACAATTATTTTATG-ATAAACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * ** ** *
35862059 AAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATC
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** * * * *
35862123 AATTTTTAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTAT-AAGCTA-AAAC
65 AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA--TAGAAAC
* * * *
35862186 AATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACAGTTTTAAATAGATAATTGTTT
128 AATTATTTTATGAT-AAACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
35862240 ATATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAGATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
35862305 ATTTTTTGAATGTTAATAAGA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAATTGAAATAA
66 ATTTTTTGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * * * * *
35862369 TTATTTTATAACTAAACGAAAGGTCAGAATAATTTGAAACAGATAATTGTTC
130 TTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * * *
35862421 GAGTAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTCGACAGACACATCTAATTTTTAAA--TC---CTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * * * * * *
35862480 ACTTTTAGAATACTATTAATTTAGTAGTATTTTACTTTGAACAAGCTTCTATGAATATAAATAAA
66 ATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * * * * *
35862545 TGTTTTAGGATAAA-ACAAAGATCATACCAATTTCAGATAAATAATTGTTT
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* ** * * * * * * * *
35862595 AAATAGTTATAACTATTTGAACTAATTCGGTAAAGAGATTTAGTTATAAAATAAT-TAGTA-TTA
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
35863022 GTTAGCTCAA
Statistics
Matches: 2147, Mismatches: 488, Indels: 242
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 65 0.03
175 259 0.12
176 14 0.01
177 63 0.03
178 72 0.03
179 289 0.13
180 502 0.23
181 513 0.24
182 199 0.09
183 162 0.08
184 8 0.00
185 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
ATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
TATTTTATGATAAACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTC
Done.