Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: NW_019167938.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_20, whole genome shotgun sequence

Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000

Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000

Length: 19866354
ACGTcount: A:0.33, C:0.17, G:0.17, T:0.33

Warning! 74000 characters in sequence are not A, C, G, or T


File 1 of 100

Found at i:313 original size:181 final size:179

Alignment explanation

Indices: 1--2393 Score: 1818 Period size: 180 Copynumber: 13.4 Consensus size: 179 * * * ** * 1 TTTATGATAAAATAAAAGGTTATGGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * 66 TAAACTTGTTC-GATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAGAATATTAA 66 TGAAC-TGGTCAGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA * 130 TAAATTAGAATTATGTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT 129 TAAATTA-AATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * * 182 TTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCGTAACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * ** * * 247 TGCACTGGTCAGGCCAACAGATTCATTATTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT 66 TGAACTGGTCAGGTAAACAGATTTATT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT * * ** * * 312 AAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAATTGT 130 AAATTA-AATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * * * * 363 TTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATATGAAATAAATAATTGTTTAAATTGTTATAACTAAT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * ** * * * 428 TGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAAT 66 TGAACTGGTCAGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT * * * * * * 489 AAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGT 130 AAATTAA-ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * ** * * * * 540 TTTACGACAAAACAAAA-GTACATAATTATTTGAAATGGATAATTATTCATATAG-CTTTAACTA 1 TTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTA ** * * * ** * * * 603 TTTGAACTGGTTCA-ACAAATAAATTTATTTTCAAATCTGATAATTATTAATTTTCATAATATTA 64 TTTGAACTGG-TCAGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA * * * * * * 667 TTAGATTAATATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTAT 128 ATAAATTAA-ATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * 720 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGACTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * 785 TGAACTGGTTCA-GTAAACA-A---A----T-AATCTCTTGCTTATTAATTTTTTA-AATATTAA 66 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TAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAG-TATGTATGAATTGGAACAATTAT 126 TAATAAATTAA-ATTATTTTATTCTGAATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * * * ** * 1254 TTTATAACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAAATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * ** * * * * * * 1319 TGAACTGATTC-GACAAATATATTTATTTTTAAATCTCTTGCTTATAAATTTTTAAAATATTATT 66 TGAACTG-GTCAGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT ** * * * * * * * * * 1383 AGTTTAACAATATTTTACTCCGAATTAGTTTGTATAAACAAAAATAATTGT 130 AAATTAA-ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * * * 1434 TTAATGACAAAACAAAA--TCATACCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * 1497 TGAA-TTGTCTA-GTAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAA 66 TGAACTGGTC-AGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA * ** * 1556 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTAT 129 TAAATTA-AATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * * * * * 1608 TTTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATATTCATAACTAT 1 TTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT ** * * * * * * * 1673 TTGAACT-CACTAGTTAAACAAAATTATTTTTTAATCTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATTTTAA 65 TTGAACTGGTC-AGGTAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA * * * 1736 TAAATT--ATTATTTTATTCTG-TTAAGCTTTTATGAATAAAAACAATTGT 129 TAAATTAAATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * 1784 TTTATGGCAAAA-AAAAAGTCATCAC-AGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTAT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT * ** * * * * * * 1847 TTGAACGTGTTCA-AAAAATATATTTATTTTTTATAT-TTTTACTTATTAATCTTTGGAATATTA 65 TTGAAC-TGGTCAGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA * * * * * * 1910 GTAAATTCATATTATTTTGTTC-GAAATAAGCTTGAATGAACAGAAACAATTAT 128 ATAAATT-AAATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * 1963 TTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-T 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * * 2027 TAAACTTGTTTA-GTAAACAGATTCATTTTCTAAATCTCTTACTCATTAATTTTT-GAAATAGTA 66 TGAAC-TGGTCAGGTAAACAGATTTATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTA * * * * * * * * 2090 ATAAGTTAGTATTATCTTATT-TCGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTAT 128 ATAAATTA-AATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * 2143 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTTATTACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * * 2208 TGAACTTGTTC-GGTAAACATATTTAGTTTTTTATATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA 66 TGAAC-TGGTCAGGTAAACAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA * * * * * 2272 ACAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGT 128 ATAAATTAA-ATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT * * * * 2325 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATTATAACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT 2390 TGAA 66 TGAA 2394 ATTATTCAGT Statistics Matches: 1745, Mismatches: 377, Indels: 179 0.76 0.16 0.08 Matches are distributed among these 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Indices: 1--2393 Score: 1772 Period size: 181 Copynumber: 13.4 Consensus size: 179 * * * ** * 1 TTTATGATAAAATAAAAGGTTATGGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * 66 TAAACTTGTTC-GATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAGAATATTAA 66 TGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA * 130 TAAATTAGA-ATTATGTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAATTGT 129 TAAATTA-ATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAATA-AAA-AATTGT * * * * * 182 TTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCGTAACTATT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * ** * * * * * 247 TGCACTGG-TCAGGCCAACAGATTCATTATTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA 66 TGAACTGGTTCA-GTAAACAAATTTATT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA ** * * * * 311 TAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTAT-CAATAGAAATAATTGT 129 TAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAAATA-AAA-AATTGT * * * * * * * 363 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TAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATG-AATAGAAACAATTAT 129 TAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAATA-AAA-AATTGT * * * * * * * * 1608 TTTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATATTCATAACTAT 1 TTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT *** * * * ** * 1673 TTGAACTCACT-AGTTAAACAAAATTATTTTTTAATCTTTTACTTATTAATTTT-GGAATTTTAA 65 TTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA * * 1736 TAAA-T--TATTATTTTA-TTCTG-TTAAGCTTTTATG-AATAAAAACAATTGT 129 TAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAAT-AAAA-AATTGT * * * * 1784 TTTATGGCAAAA-AAAAAGTCATCAC-AGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTAT 1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT ** * * * * ** 1847 TTGAAC-GTGTTCAAAAAATATATTTATTTTTTATAT-TTTTACTTATTAATCTTT-GGAATATT 65 TTGAACTG-GTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTCAAAATATT * * * * * * * 1909 AGTAAATTCATATTATTTT-GTTCGAAATAAGCTTGAATGAACAGAAACAATTAT 127 AATAAATTAATATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAA-ATAAAAAATTGT * * 1963 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66 TGAA 2394 ATTATTCAGT Statistics Matches: 1748, Mismatches: 366, Indels: 195 0.76 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 170 3 0.00 171 129 0.07 172 2 0.00 173 5 0.00 174 130 0.07 175 38 0.02 176 49 0.03 177 199 0.11 178 77 0.04 179 64 0.04 180 370 0.21 181 397 0.23 182 274 0.16 183 11 0.01 ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (179 bp): TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT TGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATA AATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAATAAAAAATTGT Found at i:1298 original size:182 final size:181 Alignment explanation

Indices: 807--2413 Score: 1282 Period size: 182 Copynumber: 9.0 Consensus size: 181 797 GTAAACAAAT * * * * * * * 807 AATCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCTAAATAGGCTTG 1 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG * * * * * ** 872 TACG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTG 65 TATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG * * * * ** 936 TTCAAATGGCCATAACTATTTGAA-TTGATTGAATAAATTGATTTATG-TTTTA 129 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAACAGATTTATGTTTTTA * ** * * * 988 AATTTCCAAATT-TTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTT 1 AATCTCTTACTTATT-AATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTT * * * * * 1052 TTATGAA-ATGAAACAATTATTTAATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA-ATGATAAT 64 GTATGAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-GATAAT * * * * 1115 TGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTTAACAGATTTATGTTTTTA 127 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATGTTTTTA * * * * 1170 AAT-TGCTTGCTTATCAATTTTCTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAG-TA 1 AATCT-CTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCT- * * * * * * * 1233 TGTATGAATTGGAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAAATAATT 63 TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT ** * * * * * * 1298 GTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGATTCGACAAATATATTTA--TTTTTA 128 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATGTTTTTA * * * * ** * * * ** * * 1350 AATCTCTTGCTTATAAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAACAATATTTTACTCCGAATTAGTTTG 1 AATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG * * * * * * * * * 1415 TATAAACAAAAATAATTGTTTAATGACAAAACAAAA--TCATACCAATTTGAGATAGATAATTAT 65 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT * * * 1478 TCAAATACTCATAACTATTTGAA-TTGTCTAGTAAATAGATTTA-GTTTTTA 130 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATGTTTTTA ** * * ** 1528 AA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTG 1 AATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG * * * * * * * 1589 TATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTAAAATAAATAATTA 65 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG * * *** * * 1654 TTTAAATATTCATAACTATTTGAAC-TCACTAGTTAAACAAAATTAT-TTTTT- 129 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATGTTTTTA * * * * * * 1705 AATCTTTTACTTATTAATTTTGGAATTTTAATAAA-T--TATTATTTTATTCTG-TTAAGCTTTT 1 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT * * * * * * 1766 ATGAATAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAA-AAAAAGTCATCACAGTTTGAAATAGATAATTGTT 66 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT * * * ** * * 1830 CAAATAGCCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAAATATATTTAT-TTTTTA 131 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATGTTTTTA * * * * * * * 1880 TAT-TTTTACTTATTAATCTTTGGAATATTAGTAAATTCATATTATTTT-GTTCGAAATAAGCTT 1 AATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTT * * * ** 1943 GAATGAACAGAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG 64 GTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG * * * 2008 TTCAAATAGTCATAACTA-TTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCAT-TTTCTA 129 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATGTTTTTA * * * * * * * * 2059 AATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATAGTAATAAGTTAGTATTATCTTATTTCGAATAAGCCTA 1 AATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG * * ** * 2124 TATGAATTGATACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTTT 65 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT * * ** * 2189 TCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTA-GTTTTTTA 130 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATG-TTTTTA * * ** * * * 2241 TATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTAG 1 AATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG * * * * * 2306 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGT 65 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * 2371 TCAAATAATTATAACTATTTGAAATTATTCAGTAAATAGATTT 130 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT 2414 GAGATAAGCT Statistics Matches: 1129, Mismatches: 251, Indels: 91 0.77 0.17 0.06 Matches are distributed among these distances: 174 137 0.12 175 32 0.03 176 31 0.03 177 77 0.07 178 75 0.07 179 67 0.06 180 256 0.23 181 170 0.15 182 280 0.25 183 4 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42 Consensus pattern (181 bp): AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATGTTTTTA Found at i:2063 original size:709 final size:704 Alignment explanation

Indices: 26--2393 Score: 2141 Period size: 709 Copynumber: 3.3 Consensus size: 704 16 AAGGTTATGG * * 26 CGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTC-GATAAACAAATTT 1 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAAC-AATTT * * * * 90 AGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCTGAA 64 AGTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA * * * * * 155 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG 125 TAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAA * * * *** * * 220 ATAATTATTCAAATAGTCGTAACTATTTGCACTGGTCAGGCCAACAGATTCATTATTTAAATCTG 190 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AT-AGATAAACAAATT-ATT-TTTAAATCTT * * ** * * 285 TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCA 251 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT---ATTATTTTATT-CTGATAAG-CTTTTATGA * * * * * 349 ATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAC-GATATGAAATAAATAATTGTTTAA 311 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAG-TTTGAAATAGATAATTGTTCAA * * * * * 413 ATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTATTAATTTT 375 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAATTTTTCTTATTAATTTT * * * * * * * 477 CAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAACTT-ATATGAATAAAAACATTTGTT 439 CAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGA-ATGAATAGAAACAATTATT * * * * * 541 TTACGACAAAACAAAA-GTACATAATTATTTGAAATGGATAATTATTCATATAG-CTTTAACTAT 503 TTATGACAAAACAAAAGGT-CATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-TTAACTAT * * * ** * * * 604 TTGAACTGGTTCAACAAATAAATTTATTTTC-AAATCTGATAATTATTAATTTTCATAATATTAT 566 TTGAACTTGTTTAGCAAATAAATTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAT 668 TAGATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAAC 631 TAG-TTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAAAAC * 733 AAAAGGTTATAA 694 AAAA-GTCATAA * * * * * * 745 CGACTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAA-ATAA 1 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAATTTAG * * * ** * * * 809 TCTCT---T-GCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCTAAATAGGCT 66 TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCT * * * * * 870 TGTACG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTGAAATAGATAAT 131 TGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAAT * * * * * ** * ** * 934 TGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAATTGATTGAATAAATTGATTTATGTTTTAAAT-TTCCAAA 195 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATAG-ATAAA-CAAATTAT-TTTTAAATCTT-TTAC * * 998 TT-TTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA-AT 255 TTATT-AATTTTTGGAATATTAATAAA-T--TATTATTTTATTCT-GATAAGCTTTTATGAATA- * * * * * 1061 GAAACAATTATTTAATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAAT-GATAATTGTTCAAATA 314 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA * * * * * * 1125 GTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTTAACAGATTTATGTTTTTAAATTGCTTGCTTATCAATTT 378 GTCATAACTATTTGAAC-TGTTTGGTAAACAAATTTAT-TTTTT-AATT--TTTCTTATTAATTT * * * * * * * 1190 TCTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTTG-AATAAG-TATGTATGAATTGGAACAATTA 438 TCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCGAAATAAGCT-TGAATGAATAGAAACAATTA * * * * * * ** 1253 TTTTATAACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAAATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTAT 501 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTAT * * * * * 1318 TTGAAC-TGATTCGACAAATATATTTATTTT-TAAATCTCTTGCTTATAAATTTTTAAAATATTA 566 TTGAACTTGTTTAG-CAAATAAATTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA * * * * * * * * * 1381 TTAGTTTAACAATATTTTACTCCGAATTAGTTTGTATAAACAAAAATAATTGTTTAATGACAAAA 630 TTAG-TTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-AATTATTTTATGACAAAA * 1446 CAAAA-TCATAC 693 CAAAAGTCATAA * * * * * 1457 CAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTGAA-TTG-TCTAGTAAATAGATTT 1 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACA-ATTT * 1520 AGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAT 64 AGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG * * * * * * * 1585 TTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAAAAAAAAGATCATAACGATTTAAAATAAATA 129 CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATA * * * * 1650 ATTATTTAAATATTCATAACTATTTGAACTCACTAGTTAAACAAAATTATTTTTTAATCTTTTAC 193 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-A-TAGATAAAC-AAATTATTTTTAAATCTTTTAC * * * 1715 TTATTAA-TTTTGGAATTTTAATAAATTATTATTTTATTCTGTTAAGCTTTTATGAATAAAAACA 255 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTTTATTCTGATAAGCTTTTATGAATAGAAACA * * * * 1779 ATTGTTTTATGGCAAAA-AAAAAGTCATCACAGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA 320 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA **** * * * 1843 CTATTTGAACGTGTTCAAAAAATATATTTATTTTTTATATTTTTACTTATTAATCTTT-GGAATA 385 CTATTTGAAC-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA-ATTTTT-CTTATTAAT-TTTCAGAATA * * * * * 1907 TTAGTAAATTCATATTATTTTGTTCGAAATAAGCTTGAATGAACAGAAACAATTATTTTATGGCA 446 TTAATAAATTAATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGAATGAATAGAAACAATTATTTTATGACA * * * 1972 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTAAACTTGT 511 AAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGT * * * * * * * * * 2036 TTAGTAAACAGATTCATTTTCTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATAGTAATAAGTTAGTA 576 TTAGCAAATAAATTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATA-TTATTAGTTAATA * * * ** * * 2101 TTATCTTATTTCGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT 640 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT 2166 AA 703 AA * * * * * 2168 TGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTA 1 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACA-ATTTA * * * 2233 GTTTTTTATATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATT-TGA 65 G-TTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGA * * * * 2297 ATAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA 124 ATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA * * * 2362 AATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGAA 189 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA 2394 ATTATTCAGT Statistics Matches: 1307, Mismatches: 279, Indels: 129 0.76 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 708 30 0.02 709 436 0.33 710 45 0.03 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Indices: 2291--2513 Score: 322 Period size: 120 Copynumber: 1.9 Consensus size: 119 2281 TATTATTTTA * 2291 ATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT 1 ATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATT ** 2356 GAAATAAATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTTGAAATTATTCAGTAAATAG 66 GAAATAAATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTTGAAATTATTCAGTAAATAG * * * * * * 2410 ATTTGAGATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGGCAATACAAAAGGTTATAGCAAA 1 ATTTGA-ATAAGCTAGTATGAACA-AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAA * * 2474 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA 64 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTTGAA 2514 CTTGTTCAAT Statistics Matches: 91, Mismatches: 11, Indels: 3 0.87 0.10 0.03 Matches are distributed among these distances: 119 6 0.07 120 81 0.89 121 4 0.04 ACGTcount: A:0.46, C:0.08, G:0.13, T:0.33 Consensus pattern (119 bp): ATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAATT GAAATAAATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTTGAAATTATTCAGTAAATAG Found at i:3625 original size:180 final size:181 Alignment explanation

Indices: 3313--3641 Score: 423 Period size: 180 Copynumber: 1.8 Consensus size: 181 3303 AAAGTTCAAT * ** * * * 3313 TAGTTATGACTATCAAAATAATTATCTATTTCAAAACAATATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAT 1 TAGTTATGACTATCAAAACAATTATCTATTTCAAAACAATAAAACAATTTATTTTGTCATAAAAC * * * 3378 AATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAAAATTCTAAAAA 66 AATTGGTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAAAATTCTAAAAA * 3443 TTAATAAGTAAAA-ATTTAAAACATAAATACATTTTCTAAACACATTTAAA 131 TTAATAAATAAAATATTTAAAACATAAATACATTTTCTAAACACATTTAAA *** * * * * 3493 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACAATTTATTTTGTTATAAACC 1 TAGTTATGACTATCAAAACAATTATCTATTTCAAAACAATAAAACAATTTATTTTGTCATAAAAC * * * 3558 AATT-GTTTCTATTCTTACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATGCT-AATTTATTAATATTTCT-A 66 AATTGGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAA-AATTCTAA 3620 AAATTAATAAATAAAATATTTA 128 AAATTAATAAATAAAATATTTA 3642 GATAATAAAT Statistics Matches: 125, Mismatches: 20, Indels: 7 0.82 0.13 0.05 Matches are distributed among these distances: 179 4 0.03 180 110 0.88 181 11 0.09 ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.06, T:0.41 Consensus pattern (181 bp): TAGTTATGACTATCAAAACAATTATCTATTTCAAAACAATAAAACAATTTATTTTGTCATAAAAC AATTGGTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAAAATTCTAAAAA TTAATAAATAAAATATTTAAAACATAAATACATTTTCTAAACACATTTAAA Found at i:5728 original size:169 final size:169 Alignment explanation

Indices: 5467--5776 Score: 382 Period size: 168 Copynumber: 1.8 Consensus size: 169 5457 ATAATTACAA * * 5467 CTATTTAAGCAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTT 1 CTATTTAAGCAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTAGTTTGTTATAAAACAATTGTTTT * * 5532 TCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAAATATTACTCA-TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA 66 TCATCATACAAGCCTATTCAAAAT-AAAATAATACT-ATTTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATA * 5595 AGTAAGAAATTTAACAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTT 128 ACTAAGAAATTTAACAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTT * * 5637 CTATTTGAA-CAATTATTTATTTCAAATTATTAT-AACCTTTT-GTTTGTTATAAAATAATT-TT 1 CTATTT-AAGCAATTATCTATTTCAAATTATTATGAA-CTTTTAGTTTGTTATAAAACAATTGTT * * *** * 5698 TTT-AGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTATTTTAATAATATTCAAAAAATTGAT 64 TTTCA--TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTAATAATATTCAAAAAATTAAT * 5762 AACTAAGAGATTTAA 127 AACTAAGAAATTTAA 5777 AAAACAGATC Statistics Matches: 120, Mismatches: 14, Indels: 14 0.81 0.09 0.09 Matches are distributed among these distances: 167 5 0.04 168 46 0.38 169 34 0.28 170 33 0.28 171 2 0.02 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.06, T:0.43 Consensus pattern (169 bp): CTATTTAAGCAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTAGTTTGTTATAAAACAATTGTTTT TCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTAATAATATTCAAAAAATTAATAACT AAGAAATTTAACAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTT Found at i:6383 original size:184 final size:178 Alignment explanation

Indices: 5637--6535 Score: 572 Period size: 178 Copynumber: 5.0 Consensus size: 178 5627 AAACTAGTTT * * * * 5637 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTA-TTATAACCTTTTG-TTT-GTTATAAAATAA-TTTT 1 CTATTTGAACAATTATATATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTAG-CATAAAACAATTTTT * * * * 5698 TTTAG-TTCATATA-AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTATTTTAATAATA-TTCAAAAAATTG 64 TTTTGATT--TATACAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T- * * * * * * * 5760 ATAACTAAGAGATTTAAAAAACAGA-TCTGTTTGCTGAAGC-AATTCAAATAATTAAGA 124 -TAAC-AAGAGATTTAAAAAATA-ATTCTATTTAC-CAAACTAGTTCAAATAATTATGA * * * * * * * * * * 5817 CTATATGAATAATTATCTGTTTATCAAA-AGTTACGGCTTTTTG-TTTGGTCATATAACAA-ATT 1 CTATTTGAACAATTATAT-ATT-TCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTAG-CATAAAACAATTTT * * * *** * * 5879 TTTTT-A-TCATTCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAA 63 TTTTTGATTTATAC-AGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-- * * * 5942 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCAAACTAG-TCAAAT-A-TATAA 124 TAA-CAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGA * * * * * * * 5995 CTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAA-TTATT 1 CTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTAGCATAAAACAATTTTTT * * *** * * * * * 6058 TTTG-TTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTGAAAATTAATA 65 TTTGATTTATAC-AGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTA * * * * * * * 6122 ACTAAGAGAATTAAACAATAAATT-TGTTTGCCAAACTAGTTGAAATATTTAAGA 126 AC-AAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGA * * * 6176 CTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAGCATAAAACAAGTTTTTT 1 CTATTTGAACAATTATATATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTAGCATAAAACAA---TTTT 6241 TTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT 63 TTTTTG-ATTTATAC-AGCTTATTTGGAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT * * 6305 AACAAGAGATTTAAAAAAATAATTCTATTTACCTAACTAGTTCACATAATTATGA 125 AACAAGAGATTT-AAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGA * * * * 6360 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCACAAAACAA-ATGTT 1 CTATTTGAACAATTATATATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTAG-CATAAAACAATTTTTT * * * * * * 6423 TTTG-TTCATATA-AGTTTGTTTGGAATAAAGTAATATTAATATGTTAATATTTCAAAAATTAAC 65 TTTGATT--TATACAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAC * * * * * 6486 ATGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTTATG 128 AAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATG 6536 CCTTATTGTT Statistics Matches: 568, Mismatches: 113, Indels: 79 0.75 0.15 0.10 Matches are distributed among these distances: 176 5 0.01 177 60 0.11 178 142 0.25 179 19 0.03 180 37 0.07 181 133 0.23 182 23 0.04 183 13 0.02 184 86 0.15 185 8 0.01 186 7 0.01 187 35 0.06 ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (178 bp): CTATTTGAACAATTATATATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTAGCATAAAACAATTTTTTT TTGATTTATACAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG AGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGA Found at i:6880 original size:159 final size:159 Alignment explanation

Indices: 6592--6893 Score: 350 Period size: 159 Copynumber: 1.9 Consensus size: 159 6582 ATTTAGATTA * * 6592 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAAATAATAAGTAAAAAATTTTAAAATAAATATGTTT 1 AAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAACAAATAATAAGTAAAAAATTTAAAAATAAATATGTTT * * * 6657 ATTGAGCTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TT 66 ATCGAGCTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTATGACCTTT * 6721 TTGTTTTGTCATATAAGCTTATTCGAAAT 131 TTCTTTTGTCATATAAGCTTATTCGAAAT * * 6750 AAATAATACTAAGTTATTAATATTT-AGA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG 1 AAATAATACTAAGTTATTAATATTTCA-ACAAA-TAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATATG * * * * * * 6813 TTTGTCGAGC-AGCTTTAAATAATTATGACTATTTTG-ATAATTTGAT-T-TTTGAAATTGCTAT 63 TTTATCGAGCTAG-ATCAAATAATCATGACTA-TTTGAATAA-TT-ATCTATTTCAAATCGCTAT 6874 -AGCCTTTTTCTTTTGTCATA 124 GA-CCTTTTTCTTTTGTCATA 6894 AAATGATTTT Statistics Matches: 121, Mismatches: 14, Indels: 16 0.80 0.09 0.11 Matches are distributed among these distances: 157 4 0.03 158 43 0.36 159 51 0.42 160 21 0.17 161 2 0.02 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (159 bp): AAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAACAAATAATAAGTAAAAAATTTAAAAATAAATATGTTT ATCGAGCTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTATGACCTTT TTCTTTTGTCATATAAGCTTATTCGAAAT Found at i:7295 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 6721--11783 Score: 3212 Period size: 181 Copynumber: 28.3 Consensus size: 181 6711 TTATGACCTT * * * 6721 TTGTTTT-G-TCATATAAGCTTATTCGAAAT-AAATAATACTAAGTTATTAATA-TTTAGAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAAT * * * * 6782 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAGC-AGCTTTAAATAATTATGACTATT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTA-T * * * * * ** 6846 TTGATA-ATTTGAT-T-TTTGAAATTGCTAT-AGCCTTTTTCTTTTGTCATAAAATGA 128 TTGA-ACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGA-CC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * ** 6900 TTTTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTTG-AATAAAATAATAAAAATTTATTAATA---TAAAGAC 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA-A- * * * * * 6961 ACTTAATAAGTAAAACATTT-AAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACC 63 A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACT * * 7023 GTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTGTTTTGTC----AACAA 126 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * 7075 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * ** * 7139 TAATAAGTAAAAGATTTAAGCAATAAATATGCTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACAAT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTAT * * * * * 7202 TTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA 128 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * ** * 7256 TTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT * * * * * * * * * 7321 AATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACATGTTTAAATAGTTATGATTATCTG 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG * * * * * * 7386 AATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTTTTTTGTCATAAAATAA 131 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * *** 7437 TTGGTTTT-GTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAA-AATA--AATTTAATAATATTTGGGAAAT 1 TT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * * 7498 CAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT * * * * 7561 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAACCAA 129 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * 7614 TTGTTTCTA-TTTATAAAAGCTTATTTGGAATAAAAT-ATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * * * * * 7677 TAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAGAGAGTTTAAATAGTCATGATTATT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATT * * * * * * * 7741 TGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTGTGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAA 129 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * 7794 TTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCTT-AAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAAA ** * * * * * 7857 TTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTTAGCAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCA 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTA * * ** ** * 7920 TTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTTGTAAAATAA 127 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * ** ** * * 7975 TTGTTTCTA-TTTATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATA-TCAATTTATCAATATTTT-GAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAA * * * * ** * * 8037 -T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAGTTTTAACAGTTATGATTATT 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT ** * 8098 TGAACAATTATCTATCCCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAA 129 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * * * * * * ** 8150 TTGTTTATA-TTCAGACAAGCTTAGTCGGAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTATCCTAAAAAT 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * * * * 8214 TAATAA--CA-A-ATTTAACAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAA-TTCAAAT-GATTATGATTAT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTAT * * * * * 8273 TAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTAGTCATAAAATAA 128 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * 8327 GTT-TTTCAGTTCATACATGCTTATTTAAAATAAAATGATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAT 1 -TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * 8390 TAATAA--AA-A-A--T---AAAT---T-TGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * *** * 8442 GAACAATTATGTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAACAA 130 GAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAA * * * * * * * 8495 TTATTTTAGTTCATA-AATGCTTA-TCGAAATAAAATAATATTACTTTATCAATATTTCAAAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * *** * * * * 8558 TGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCA-GTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT * * ** * * * 8622 TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTTGTTTTATCATAAAATAA 129 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA *** * * ** * * * * 8676 TTGTTTTTCATCATACAAGCCTGTTCAAAATAAAGTAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAA-T 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT * * * * * 8740 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-TA-AA---C---TAG-T-T-CCTACTTG 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG * * * * * * * 8790 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAA 131 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * ** 8841 TTGTTATAGTTTATATAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT * * * * * * * * * 8906 AACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTGTCGAA-ACAGTTCAAACAATTAAGACTATAT 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * * * * 8970 GAACAACTA-CATATTTCAAATCATTAAGATCTTTTGTTTTATCATAAAAAAA 130 GAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * 9022 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTGTTCAAAATAAAATAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTG 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-----TGAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTTA * * * * * * * * * 9087 AAAGTTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAACT-TGTCTATAGATTC-AGGTCTAAA-AATGAT 60 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTATCGA-ACAAGTTC-AAATAGTTAT * * * * * * * * * * * 9149 GGCCATGTCAATAATTATTTA-TTGAAATTGTTTTTACCTTTTG-TTTGCTCATATAACAA 122 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAA * ** * * * * * 9208 TTATATTT-GAACATTCAAGCTTA-CTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA 1 TTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA * ** * * * 9271 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAACTA-TCTCAAATAGTTATGACTAT 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTAT * * * * * * 9335 TTGAGCAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTA 128 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-A--A * * * * * * ** * 9391 TTTATATTTATATTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAA 1 -TTGT-TTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA * * * * 9456 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTGAATCAA-TTCAAATAGTTAAGATT 63 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT * * * * ** * * 9519 ATTAT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAATAATAAAATAA 126 ATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * ** *** * * * * 9575 TTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATACCGCT-CTTCTATTAACA-CTCAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTTAAAAA- * * * 9638 TTAATAAG-AAG-GAAGTTTAAAAGAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACT 64 TTAATAAGTAAGAG-A-TTTAAAA-AATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT * * * 9701 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT-AGCCTTTTGTTTTATCATAAAACAA 126 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * ** * * * * 9757 TTGTTTCAATTCATA-AACGCTTA-TCCAAAAAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * ** * * * * 9820 TGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACCAT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT * * * 9883 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTAAGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA 128 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA *** * * * 9937 TTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCT-AAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * * * 10001 TAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATTT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * * * 10066 GAA-AATTTGTATATTTCAAATCGTT-TAACCTTTTGTTTTTTCATAAAATAA 130 GAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * * * * * 10117 TT-ATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAATACAGTAATGCTAATCTAATAATATTATGAAATT 1 TTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * * * * * ** 10181 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAACTAA-TTGAAATAGTTAAGGCTACA 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATT * * * * 10245 TGAAAAATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAGCAAA 129 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA * * * * * 10299 TTGTTTT-GCTCATATAAGTTTGTTT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA- 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * ** * * * * 10361 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * * * 10423 GAACAATTA-CTTATTTTAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAA 130 GAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * ** * ** 10475 TTGTTTCTA-TTGATAC-AGTCTTATTCGAGATAGAGTAATGGTAATCTATTAATATCCTAAAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA * * * * * * ** * * 10538 TTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGAACTG-ACTAA-TACAAATAGTTAAAATTG 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTA * * * *** 10601 TTGGAACAATTATCTATTTCAAAGCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAA 127 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * * * ** 10656 TTGTTTTTGTTCGTTCAAGATGACTCGAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * * * * 10720 TAATAAGTATGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGATCAAGTTCAAATAGTTACT-ACTCTT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATT * * * * * 10784 TGAACATTTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAT---ATAA 129 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * 10834 TTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTTGACAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAA ** * * * * * * * * * 10896 CCAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCGAATAAGTTCAAACAATTATGACTATT 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT * * * * * 10961 T-AACAATTATTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAA 129 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * * 11013 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT * * * * * * * * * 11078 AATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTG 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG * * * ** 11143 AATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA 131 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * ** * ** 11194 TTGTATCAATTTATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT * * * * * * * * 11259 AATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTA-CTGAACGAGCTCAAATAGTTATGACTGTTT 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * * * * 11323 GAA-AATTTATTTATTTTAAATAGTTATGATC-TTTATTTTGTCGTAAAACAA 130 GAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * ** 11374 TTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT * * * * * * * * * 11438 TAATAGGTAGGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATTGTCATGTCCATTT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT * * * ** * 11502 GAAAAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGCATTATCATAAAACAA 130 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * * 11554 TTGTTTCTA-TTTATACATA-ATTATTT-AGAATAAACTAATACTGATTCATTAAGATTTTGAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACA-AGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA * ** * * * * 11616 ATTAATAAG--AG-CA-TTAAAAACCAAATCTGTTTA-CTGAACTAGTTCAAATAGTTATGATTT 63 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA * * * * * * * * 11676 TTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCACAGAACAA 127 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * 11730 TTGTTTCT-TTTCATATAAGCTTA-TTCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA 11784 AAAATTAAAT Statistics Matches: 3776, Mismatches: 898, Indels: 423 0.74 0.18 0.08 Matches are distributed among these distances: 165 69 0.02 166 31 0.01 167 85 0.02 168 40 0.01 169 26 0.01 170 2 0.00 171 7 0.00 172 3 0.00 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Indices: 6721--24309 Score: 5597 Period size: 538 Copynumber: 32.5 Consensus size: 535 6711 TTATGACCTT * * * * 6721 TTGTTTT-G-TCATATAAGCTTATTCGAAAT-AAATAATACTAAGTTATTAATATT-TAGAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAAT * ** * * * * 6782 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAGCAGCTTTAAATAATTATGACTATTT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAG-TTCAAATAGTTATGATTA-TT * * * * * * * * 6847 TGATA-ATTTGAT-T-TTTGAAATTGCTAT-AGCCTTTTTCTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTT 128 TGA-ACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGA-CC-TTTTGTTTTATCATAAAAT-AATTGTTTT * ** ** * 6908 GTTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATAAAGACACTTAATAAGTA 188 GTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT-AAAATTTATTAATATTTAGA-AATTAATAAGTA * * * * * ** 6973 AAACATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACCGTTTGAACAATTA 250 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * 7036 TTTATTTCAAATTCTTATGA-CTTTCTGTTTTGTC----AACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGC 314 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CTATTTCAAATTGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCT * * * * 8697 TGTTCAAAATAAAGTAATATTAATTTGTTAATATTTC-AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAA 378 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAA * * * ** 8758 ATAAATCTATTTA-CTAAA---C---TAG-T-T-CCTACTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT 443 ATAAATCTATTTATCAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT * * * * * * 8813 TATAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAA 508 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * 8841 TTGTTATAGTTTATATAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT * * * ** * * * * * 8906 AACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTGTCGAAACAGTTCAAACAATTAAGACTATATG 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG-AACAGTTCAAATAGTTATGATTATTTG * * * * * * 8971 AACAACTA-CATATTTCAAATCATTAAGATCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAGTTCA 130 AACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TGTTCA * * 9035 TACAAGCTTGTTCAAAATAAAATAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTGAAAGTTAATAAGT 193 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TCGTTCAAGATGACTCGAAATAACATAAATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTATG 190 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAT-AATAAAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTAAG * * * * * 10731 AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGATCAAGTTCAAATAGTTACT-ACTCTTTGAACATTTAT 252 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTAT * * * * 10795 CTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAT---ATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA 315 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * * * ** * * 10857 TTTC-AATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT-GACAACCAATTAGTAAAAGATTTAAAAA 380 -TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAA * * * * * * 10919 ATAATTCTATTTACCGAATAAGTTCAAACAATTATGACTATTT-AACAATTATTTTTTTCAAATC 443 ATAAATCTATTTATC-AA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * * 10983 ATTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAA 506 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * *** * 11013 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT * * * * * * * * * * 11078 AATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTG 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTG * * * * * *** * 11143 AATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTTAT 130 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGT-TTTGTTCAT * ** * * * 11208 ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAT 194 ACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA-TAAAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTAAGAGAT * * * * * * * * 11273 TTAAAATATGAATCTATTTACTGAACGAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAA-AATTTATTTAT 256 TTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTAT * * * * * * 11337 TTTAAATAGTTATGATC-TTTATTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCA 319 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA * * * * 11401 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAATAAAT 384 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT * * * * * * * * * 11465 ATGTTTACCAAATAAGTTCAAATTGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATCATTATG 449 CTATTTATC-AA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG ** * 11530 ACCTTTTGCATTATCATAAAACAA 512 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * *** 11554 TTGTTTCTA-TTTATACATA-ATTATTT-AGAATAAACTAATACTGATTCATTAAGATTTTGAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACA-AGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA * ** * * * 11616 ATTAATAAG--AG-CA-TTAAAAACCAAATCTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGATTTT 63 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTAT * * * * * * * * * * * 11677 TTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCACAGAACAATTGTTTCTTTT 127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TGTT * * * * * 11741 CATATAAGCTTATTCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA---A-AAATT-A-AA-T--GAG 191 CATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTTAGAAATTAATAAGTAAGAG * * ** * 11797 -TTT------T--A-C------CGAACTAGTTCGAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTAT 254 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT ** * * * * 11846 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCAAAAAACAATTATTTC-AGTTCATACATGCTTACTT 319 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TT * * * * 11910 -AGAATAAAATTATACTAATTTATTAA-AATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAT 382 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAA-TAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT * * * * * * * 11973 AAATATGTTTATCGAACAAGCTCAAATAGATATGGCCATCTT-AACAATTATCTATTTCAAATCT 445 AAATCTATTTATC-AA-AAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * * * 12037 TTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAA 507 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * 12066 TTGTTTGGTCATATAAAATAATACTAA--TTGTTTAGTCATATAAAATAATACTAATTT-TTGAA 1 TTGTTT--T-A-GT----TCATAC-AAGCTTATTT-G--AAATAAAATAATACTAATTTATT--A * * * * ** * * * * * 12128 AGATT--AATCAATTAGT-A-TTA-ATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGATTA---ATCA-TACA 52 ATATTCCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAA-A--AATAAATTTGTTTACCGAACAGTTCA * * ** * ** * ** * ** * 12184 AGTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTGAT-TAATCTTTCAAA-AATTAAT-A-ATTAAGAGAT 112 AATAGTT-ATGATTATTTGA-AC-AATT-ATCT-A--TTTCAAATCGTT-ATGACCTT--TTGTT * * * ** * 12245 TTA--A-AAAATAAATT-TATTTG-TCGA-ACCAG----TTCAAAT--AGTTATGACTATTTGAA 167 TTATCATAAAAT-AATTGT-TTTGTTC-ATACAAGCTTATTCAAATAAAATAAT-AAAATTT-AT * * * * * ** * * * * 12298 CAAT-TGTA-TACTTCA-AA-TCAA-TTATTTAAAAAAATAAAACCTTTTATTCTG-TC-A--TA 227 TAATATTTAGAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAAT-AAATCTGTT-TTC-GAACAAGTTC * * * * * * * * * * 12354 AAATAATTAT--TTATGTTCATACAAGT-T-TATTTCAAATAAAATAATAATAATCTAATAGTAT 287 AAATAGTTATGACTAT-TTGA-ACAATTATCTATTTCAAAT----T-GTTATGACCT-TTTGT-T *** * ** * *** ** * 12415 TCTAAAAATTAATAACTCAGAGATT-TAAAAATA-AAATTTGTTTGCCGAACCAATTTAAATAGC 343 T-T-GTCA-TAA-AAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATT--C-AA--AA--TAAA-A-- * ** * ** * ** ** ** *** * 12478 TAAGACTATATGAGCAATCGT-CTATTTCAAATCAT--TATG-ACCATTTCTTTCATCGTAAAAC 392 TAATACTA-AT---TTAT--TAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATC * * * * ** * * * 12539 AATTTTTTC--AA-TTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAGTGAATTTATTAATATTTCAA 450 TA-TTTATCAAAAGTTCA-AATAG-TTA-T--GACT-ATTTGAA--CAA-TTA-T-CTATTTCAA * * ** *** * * * 12601 A-AATTAAGAAGTAAAAG-ATT-T-AAAAAATAA 503 ATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAA ** * * * 12631 TT-TCATTTACCT-A-ACCAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-CT-ATTTCAAAT 1 TTGT--TTTAGTTCATACAAG--CT--T-ATT-TGA--A-AT-AA-AATAATACTAATTT---AT * ** ***** * * * * **** * 12691 CATTATGACCCTCGGTTTTGTCATAA-AAAAATGTTTTTATTCTTATAAGTTTGTTT---GAA-A 50 --TAAT-ATTC-CAAAAAT-TAATAAGTAAGA-G-ATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACCGAACA * * * * ** *** * * 12751 --TAAAATAATGTTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAA-AAATA-AATCT 107 GTTCAAAT-A-GTT-AT-GATT-AT-TT-GAACAATT-AT---CTATTTCAAATCGTTATGACCT ** * * * * 12811 TTT-TATCAAATCAGTTCAAGTAATTATGACTATTTG--AATA-ATTATC-TATTTCAAACT--- 161 TTTGT-T-TTATCA--TAAAATAA-T-TG--T-TTTGTTCATACA--AGCTTA-TTCAAA-TAAA * * ** ** * * * * * * * ** 12868 ATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA 213 ATAATAAAATTTAT-TAATAT-TTAGA-AATTA-ATAAG----TAAGAGATT-TAAAAAAT-AAA * * * * 12932 TGATGTTGTATC-AACAA-TTCAAA-AGTTAATAAGTAATAGATTTAAAAAAATAAATTAGTTTA 268 T-CTGTT-T-TCGAACAAGTTCAAATAGTT-AT--G-ACT--ATTT----GAA-CAATTA---T- ** * ** 12994 CTAAATCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTAAACAACTATCTATT-TCA-AATTGTTATTACCT 315 CT--AT---TTCAAATTGTTATGA-CC-TTT-------TGT-T-TTGTCATAA-----A--ACAA * * * * ** * * * ** * * 13056 TTAGTTTTCTCA-TAAAACAATTGCTT-TTCTATATAGAGGCTTATTCAAAATAAAACAATACTA 357 TT-G-TTTCT-ATTCATACAA--GCTTATTCAAAATA-A-AATAATAC-TAAT---TTATTAAT- * * 13119 ATTTACTAATATTTCAAGAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACTAGTT 410 ATTT-C-AA-A---AAATAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAA--AGTT * * * ** * * * * 13182 CAAATAGTTATCACTATTTAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTGTAACCTTTTGTTCTATCATA 465 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA 13247 AAACAA 530 AAACAA * * * * * * * 13253 TTGTTTTTGTTTATATAAGCTTA-TTCAGAATAAAGTAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT * * *** * * * * 13317 TAAT-AGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATATATTTGTTGAACTACTTCAAATAGTTAAGACTATA 65 TAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATT * * * * 13380 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTT 128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG--TTTTGTT * * * * * * * 13445 AATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAA-TAA 191 CATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATA-TTTAG-AAATTAAT-AAGTAA * * * * * * * * * 13509 TAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAACCATTTCAAATGGTTTTGACTATTTGAATAATTAT 251 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * ** * * * * * * * * * 13574 CTAAGTT-AAATCATTATAACTTTTTGTTTTGACATCAAACAATTGGTCCTGTTCATACTA-TTG 315 CT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT- * * * * ** ** * * 13637 TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAA 378 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAG-AGATTTAAAA * ** * * * * ** ** * * 13702 AATAAATCTAACTGCTGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACCACATGAATGATTATTTATTCCAAAT 442 AATAAATCT-ATTTATCAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT ** * * * 13767 TGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAAATAA 505 CATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * 13799 TTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCTG-ATTAAAATAACACTAATTTAATAATTTTTCAAAACT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT * * * * * * * 13862 TAATAAG--A-A-ATTTTAAAAATAAATTTATTTATCGCATCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTA 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG-AACAGTTCAAATAGTTATGATTATTT * * * * * * * 13923 GAACAATTATCTATTTGAAATCGTTTTGACATTTT-ATTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTT 129 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTT-TGTTC * * * * * * * * 13987 ATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAATAT 192 ATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-AAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTAAGAG * * * * 14052 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCAA 254 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA * * * * * * * 14117 TTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACATTTGTTT-TAGTTAATTCAAGCTTAGA 318 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT--A * * * * * * 14181 TT--GATTAAAATAATACTAATTTATTAACACTTACTAAAAAATAAATTAGTTTATCGA-ATTAG 380 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC-AAAAAAT-AATAAG--TA-AGAGA-T-- * * * * * * * * * ** 14243 TTAATATAATTATAGCCATTTGAATGATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCT-TTTG---TTTT 436 TTAA-A-AAATAAATCTATTT--ATCA--A--AAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATT * * * * * 14304 GTC-A--T-AAA--ATAATTA---TTT-TTTTATCATACAATC-- 492 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAA * * ** * * * ** * * * * * * ** 14337 TTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAT-TTAATAA-GTA-AAAGATTTT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-A-TT-TGAA-A--T-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCC * * * ** ** ** * * ** * 14399 AAAAATAAATATGTTTACCGA---ACCAGTTCAAA-TAG-TTA-TG-ACTA-TTTGAATAATTAT 59 AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTA- * * ** * * * * * ** * 14456 TAATCTCAAATTG-TTAA-GATCTATGTT----TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAA 120 TGAT-T--ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTT-T-ATCATAAAA * * * * * * * * * * * * * * * 14515 -ACTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATT-TAATAATAT-TTAAAA--AATTAATAAGTAAGAGA 178 TAATTGTTTTGTT-CATACAA-GCTTATTCAAATAAAATAATAAAATTTATTAAT-ATTTAGAAA * * ** * * ** 14575 TT--TAA--AA-A-A--T---AAAT--GTGT-TTACCAAGTCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATT 240 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT * * * * * * * * * * 14625 AGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTATGTATAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATAC 304 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-T * * * * * * * * 14689 CTTACAAGCTTATTCGAAATAAAAGAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCAGAGAATTAAAAAGGAA 368 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAAATAATAAGTAA * * * * * 14752 -ATTATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTCAAATAGTGATGACTATTTGAAAAATT 431 GA-GATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-TCAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * * 14816 ATTTATTTAAAATCATTATTACCATTTGTTTTGACATAAAACAT 492 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * *** * * * 14860 TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAA-AATA-TATATTAATT--TCTTACAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTCCAAAAAT ** * * ** * 14920 TAATAAACAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCCAACAAATTCAAATAGTTATGCCTACTT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATTT * * * * * * 14982 GAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGAATTC 129 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTG--TTC * * * * * * 15046 ATGCAAGCTTAGTTAAAATAAAAT-ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAGTG 192 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTT-AGAAATTAATAAGTAAGAG * * * * * * * 15110 ATTTAAAAAGTGAATCTATTTATTGAATC-AGTTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATTATCT 254 ATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT * ** * * * * * * * * * 15174 ATTTTAAATCATTATTACATTTTATTTGGTCACAAAACAATTTTTTTTA-TCATACATGTTTATT 317 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT * * * * * 15238 CAAAATAAAATAA-AGTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAATAATA 382 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATA * * * * * * * * * 15302 AATATATTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATCGTT 446 AATCTATTTATC-AA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT * * * 15367 ATAACCTTTTGTTCTATCATAAAA-AA 509 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * ** * ** * 15393 TTTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCAAAAAA 1 -TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA ** ** * * ** * 15457 TTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATA 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATT * * *** 15522 TGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAATAAAAT-TTCACTTC 128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAT-AATTGTTTTGTTC * ** * * * 15579 ATACTAA-CCTATTTGGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGA 192 ATAC-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTT-AGAAATTAATAAGTAAGA * * * * * 15643 GATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAATCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC 253 GATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * * * * * * * 15707 TATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGT 316 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT * * * * * 15772 TCATAATAAAATAATGCCAATCTATTAATATTTC-AAAAAT--TAA-TAATAGATTTAAAAAATA 381 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA * * * ** * ** 15833 AATCTTTTTATCAAACTTGTTCAAAGAGTTATGACTA-TCCAAGCAATTATTTATTTCAAATTGT 446 AATCTATTTATCAAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCAT * * * * * * 15897 TAT---TTTTTATTCTATTACAAAACAA 508 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA ** * * * * 15922 TAATTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATAT-CAACA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCCAAAA * * * * * 15984 ACTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTA 63 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTA * * * * * * * * 16046 TTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCTTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAA-AATTATTTTAGT 126 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTT-GT * * * * * * 16110 TCATATC-AGCATATTTGAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAA 190 TCATA-CAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTAA * * * 16174 GAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT 251 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT * * * * * ** ** * * * 16239 CTATTTGAAATTGCTATAACTTTTTCTTTTGTCACCAAATTATTTTTTCTATTTATACAAGCTTG 315 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * * * * * * 16304 TT-ACAAATAAAATAATAC-AACTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATCTCAAA 380 TTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AAATAATAAGTAAGAGATTTAAAA * * * * * * * * 16365 AATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATACTTATGACTAATTAAACAATTATTTATTTTAAAT 442 AATAAATCTATTTA-TCAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT ** * * 16430 TGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA 505 CATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * 16462 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT-GTTCATATTAAAATAATAGTAATTTATAAATATTTCAACAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA-AA * * * * * 16525 A-TAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTAT 63 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTAT * * * * * ** * ** 16589 TTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTAACCTTTTGTTTCGTAATAAAATAATTGTTTCAATT 127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TGTT * * * * * * ** 16654 CATATAAGCTTATTTGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATATTGTA-AAATTAATGTGTAAGA 191 CATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTAAGA ** * * * * * * 16718 GAACTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTGGACAATTATC 253 GATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC *** * * * 16782 TATTTCAAAACATTATGACCTTTAGTTTTGTCATCAAACAATTAG-TTCTATTCATGCAAGCTTA 316 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA * * * * * * 16846 TTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATTCCAATAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAA 380 -TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAA * * * * * * * 16908 ATAAATATATTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATT 443 ATAAATCTA-TTTATCAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC * ** ** 16973 GTTAAAACCTTTCATTTTGTCAT-AAACTAA 506 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA * ** 17003 TTGTTTCTA-TTCAT-CAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTTTAAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAA * * * * * * 17065 ATTAATAAATAAAAGATTTAAAAATAATAAATCTGTTTA-CTAAGCGAGTTTAAATAGTTATGAC 63 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAA-AATAAATTTGTTTACCGAA-C-AGTTCAAATAGTTATGAT * * * * 17129 TCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCT 124 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-T * ** * ** * * * 17193 ATTCATACAATTTTATTTGAACGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTT 188 GTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTA * * ** * * * * * 17258 GGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCTATTA 250 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * ** * ** ** * ** 17323 TCTATTTCAAATAGTTATGATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTAATTCTATTTATACAAAATT 314 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT * * 17388 ATTC-ATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAC 379 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA * * * * 17447 TAAATCTATTTATCAAATCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATCTCAAATCG 444 TAAATCTATTTATCAAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * 17512 TTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAATAA 507 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * ** ** * * * 17540 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAGCAAAAT-ATTGTGAAATTAATAATATTCTAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAAT * * ** * * * * * 17604 TAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAATCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTA 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATTT * * * * ** * 17669 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTT-ATTTATTTGTTAAATAATT-TTTTCAGTT 129 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTT--GTT * * * * * * ** 17732 CATGCATGCTTATTTGAAATAAAATAATTACCTAA-TAATT-ATCATGTAGAAAATTAATAAACA 191 CATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAA-TA--AAATTTATTAAT-ATTTAG-AAATTAATAAGTA * * * * * 17795 AGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA 250 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA ** * * * ** * 17860 TCTATTT-ATAAGAAG-TATGACCTCTTGCTTTATCATAAAATGATTGTTTC-AGTTCATAAAAG 314 TCTATTTCA-AA-TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG * * * * * * 17922 CATTTTTGAAAA-AAAATAACATTACTTTATTAATATTTC-AAAAATAAAAAGTTAA-AGATTTA 376 C-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAG-TAAGAGATTTA * * * * * * * * 17984 AAAAATAAGTC-AGTTTATCGAATCACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATTTATTTC 439 AAAAATAAATCTA-TTTATC-AA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC * 18048 AAAT-ATTTATGAACTTTTG--TTGTCATAAAACAA 501 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * *** * * * * * 18081 TTTTTTTTCATCATAAAAGCCTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT * ** * 18145 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAAC----C----AGTT-T--CTATTTG 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAGTTCAAATAGTTATGATTATTTG * * * * * * * * 18199 AAC-GTTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTATGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCCT 130 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TGTTCAT * * ** * ** * * * 18263 ATAACCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATTACAT-TCCAAAAATTGATAACTAAGAGA 194 ACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTT-ATTA-ATATTTAGAAATTAATAAGTAAGAGA * ** ** * * * * * * 18327 TGTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAAGTAGTTTAAACAATTAAGACTATATGAATAATTATCTAT 255 TTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT * *** * * * * * * * 18392 TTATAAAAAATTATGACTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTAATCATTCAAGCCTATTC 319 TT-CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC * * * 18457 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA 383 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA * * * * ** * 18522 TCTGTTTATTGAATTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTA 448 TCTATTTA-TCAA--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA * * * ** * 18584 TAACCTTTTGCTCTACCATAAAAAAA 510 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * ** ** * 18610 TTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAACTAATAATATTCCAAAAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT * * * * * * * * * 18675 AATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATAT- 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATTTG * * * * * 18739 AAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAGTTTTTTTCAATT 130 AA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA-TTGTTTT--GTT * * ** * * 18804 CATTCTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATAATTCA-AAA--ATTAA-TAAG 191 CATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAA--AATTTATTAAT-ATTTAGAAATTAATAAGTAAG * * * * * * * * 18864 AGATTT-AAAAGTAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATC 252 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC ** * * * * * * * ** * 18928 TATTTCAAATCATTATGACCATTTGTCTTGTCATGAAACAAATGTTTTTGTTCATATAATTTTGT 316 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-A * * 18993 TTC-AAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT 380 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT * * * * 19053 AAAATCTATTTATCTAACGAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCA 445 -AAATCTATTTATC-AA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * 19118 TTATGA-CTTTCTGTTTTGAT-ATAAAATAA 507 TTATGACCTTT-TGTTTTG-TCATAAAACAA * * * * * * ** 19147 TTGTTTCCA-TTCATACAAGCCTATTCG-GAT-TAA-AATACTAATTTATTAATATTTCACCAAT 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT * * ** * * * * 19208 TAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAATTAGAT-AAATAGTCATGACTATT 65 TAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATT * * * * * * 19271 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTA-AAAAAAATTATTTCAT-TT 128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT--TGTT ** * * * * 19334 TGTATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTAGAAAATTAATAATTAAGA 191 CATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTTAG-AAATTAATAAGTAAGA * * * * 19398 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCT 253 GATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT * * * * * * * * 19463 TTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTCTCATAAAATGAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTAT 317 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT *** ** * * * 19528 TTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA--T-AAAGACAATAATAAGCAAAACATTTAAAAAA 381 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-A-AATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA * * * * * * 19590 TAAATTTGTTTATCAAACAAGTTTC-AAT-CTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATT 444 TAAATCTATTTATC-AA-AAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T * * * 19653 C-TTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAA 505 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * *** 19683 TTATTTCTA-TTTATGCAAGCTTA-TTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA * ** * * * * * * 19746 TTAATAAGTAAAACTTTTAAGAAATAAATATGTTT--TGAACAAGTTCAAATAGTTCTAACTATT 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATT * * * * * * * * * 19809 TGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTT 128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TGTTC * * * * * * * * * 19874 ATATAACCTCATTTGAAATTAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAAAG 192 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTAAGAG * * * * * * * * 19939 AATTAAAAAATGAATTTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTA 254 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA *** * * * * * 20004 TTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTT 318 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC ** * * * * 20069 TGAATAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAA 383 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA * * * 20132 ATATGTTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT 447 ATCTATTTATC--AA-A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT * * * 20195 TATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAA 508 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * 20223 TTTTTTCTA-TTTATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAAT 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT * *** * * * 20287 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCATTTA-CTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTACT 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-C-AGTTCAAATAGTTATGATTATT ** * * ** 20351 TGAACAATTATCT-TTTCCAAATCACTATGATCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCATTC 128 TGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTGTTC * * * * * * ** ** 20415 ATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTTACCAGTTGGAG 192 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATA-TTTAGAAATTAATAAGTAAGAG * * * 20480 ATTTAAAAAATAAAT-T-TTTTCATGAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATTCATTT-AAGCTATTAT 254 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTTC--GAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAA-CAATTAT ** * * * ** * * *** 20541 CTATTTCAAATCATTATGACATTATATTTTGTTGTAAGATAATTGTTTCTATTCATACAAAAATA 315 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * * ** * * * 20606 TTCAAAATAAAATAATACCAATTTGTTAATATTT-TGAAAAT--TAA-TAAGAGATGTAAAGACT 380 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT * ** * * * 20667 AAATCTATTTATTGAACCAA-TTGTAATAGTTATGATTATTTGAATAATCATCTATGTT-AAATC 445 AAATCTATTTA-TCAA--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATC * * * * * 20730 GTTATAATC-TGTGTTTTGTCATAAAAAAA 506 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * * * * * 20759 TTGTTTATA-TTCATGCAAACTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTGA-TAGTATTCTAAAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAA * * * * * 20822 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATTG----CTGAATTAGTTCAAATAATTAAGACTA- 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTAT * * * * * * 20882 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTAACCTTTTG-TTTAGTCATAGAATAATT-TTTTCAA 127 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTT--G * * * * * 20945 TTCATACATGCTTATTCAAAATAAAA-ATTAGACTAATTTATTAACAATTAAAAAATTAATAAAG 189 TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-A--AATTTATTAA-TATTTAGAAATTAAT-AAG * * ** * * * * * * 21009 -AACAAATTTTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACAAATTCAAATAATTATGATTGTTTGAACTA 248 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA * *** * * * * 21073 TTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTTTTTTTATCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATAAA 311 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA * * * ** * * 21137 AGCTTA-TCTAAAATAAAATAATATTACTTCATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTT 374 AGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTT * * ** * * * * * 21201 AAAAAATAAGT-TAGTTAATCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATTATCTATTT 438 AAAAAATAAATCTA-TTTATC-AA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT ** * * * 21265 CAAATCATTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAAGAA 500 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * ** * * 21301 TTGTTTTTGATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAATAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT * * * ** * * * * * 21366 AATAACTAAAAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATGGAAGTAGTTGAAATAGTTAAGACTATATG 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATTTG * * * * * ** * 21431 AACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACCATTGTTTCAGTTCAT 130 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TGTTCAT * * * * * 21496 ACAAACTTATTTAAAATAAAATAATAATAATAATAATTTATTGATATTCCAAAAATTAATAAGT- 194 ACAAGCTTA--T----TCAAATAA-AATAATAA-AATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTA * * * * * * * * *** 21560 ---GATTTAAAAAGTGAATATGTTTACTAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATGCCAACAATT 250 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT * * * * * * * * 21621 AACTATTTGAAATTTTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATT-TGA-ACATTCAAG 313 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAG * * * * 21684 CTTATTCAAAATAAAATAATACT-A---CTTAATCTTT-AAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAA 376 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAA * * ** * 21744 AAAATAAATCTATTTA-CTAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCA 440 AAAATAAATCTATTTATC-AAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA *** * 21808 AATCATTAT-AGCCTTTTGCGCTATCATAAAACAA 502 AATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * ** * 21842 TTATTTTTGTTCATATAAGCTTGTTCAAAATAAAAT-A-A-T-A---A-TAATATTCCAAAAGTT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT * * * ** * * * * * * 21899 AATAACTATGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAGATATTTAAGACTATATG 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTG * * * * * 21964 AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTATTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTT 130 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA-TTGTTTTG--TTC * ** * * 22028 ATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGATAAGA 192 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTT-AGAAATTAATAAG-TAAGA * * * * * * * * 22092 GATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAG-TCTAAATAATTATGAGTATTTGAATAATTATC 253 GATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCGAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC * ** ** * ** * *** 22156 TATTTTAAATCATTATGGTCATTTGTTTAATCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATGCGCTTA 316 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA *** * * * 22220 TTGGGAATAAAATAATAC-AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAA 380 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAA * * * * * * * * 22283 TGAATCT-TTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTAAACAATTATCTATTTGAAATCG 444 TAAATCTATTTA-TCAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA * * * * 22347 CTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAA 507 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * ** * * 22376 TTTTTTCTA-TTTGTACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT--AAGACA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA-A-A * * * * * *** * * *** * 22438 ATT-GTATTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAATTAA-A-AT-AATAC 63 ATTAATA-AG---TAAGA-GA---TTT-AAAAAATA-AA-TTTGTT-TACCGAACAGTTCAA-A- * * * * * * *** 22499 TAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC 114 T-AGTTATGATTATTTGAACAA-T--T-A-T---CTA-TTT--CAAATCGTTATG---A-C---C * * ** * * *** 22564 AAGTTTAGATAGTCTTGATGATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCACAATGACCTT-TTCTTT 160 ---TTT---T-GT-TTTATCA-TAAAATAATTGT-TTTGTTC--AT-ACAA-G--CTTATTCAAA ** * * * * * * ** * 22627 TGTAACAA-AACAATTGTTTTAGTTTTTATAAGTT--T--GTTTGA-A-CTAAAATAATACTAAT 209 TAAAATAATAA-AATT-TATTAATATTTAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATA--AAT * * * * * ** * ** *** * * * 22685 TTATTAATATTCTAA-AAATTAATGAATAAGAGAATTAAAAACAGAATCTATTTACCGAATAAGT 269 CT-GT--T-TTCGAACAAGTTCA--AAT-AG-TTATGACTATTTGAA-CAAT-TATC---T-ATT * * ** * ** * * 22749 TAAAATAGTTATGA-CTAGCTGAACAATTATCTATTTTAAAA-AATTATGACCTTTTGTTTTGAC 320 TCAAATTGTTATGACCT-TTTG-----TT-T-TGTCATAAAACAA-T-TG----TTTCTATT--C * * * * * * 22812 ATAAAATAATTGGTTCTGTTTATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATTTAAATTTATTAATATT 369 AT---ACAA---G--C---TTATTCAA----AATA--AA-ATAAT-A-CT-AATTTATTAATATT * * * * * 22877 TCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGTT 413 TCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC--AA-A-AGTTCAAATAGTT * * ** * 22939 ATGA-TATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTCATCAT-AAACTCA 474 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA * * * * * 23000 TTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATT 1 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT * * * * * * * * * 23065 GATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAGCGAATTCAAATAGTTATAACTATTTA 66 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTG * ** * * * * 23130 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTACAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT 130 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TGTTCAT * * * * * * 23195 ACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAGGAGAT 194 ACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATT-TAGAAATTAATAAGTAAGAGAT * * * * * * * * * * * * 23260 TGAAAAAATAAATTTATTTACTAAATAAGTTTAAACAGTCATGTCTATTTAAACTATTATCTATT 256 TTAAAAAATAAATCTGTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT ** ** * * ** ** 23325 TCAAATCATTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGTAAAATTATTCAA 320 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA * * ** * 23390 AATAGAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAATCTAAATT 385 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC * * * * * * ** 23451 TGTTTA-CAAAATCATTTCAATTAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCATATCACAATG 450 TATTTATC-AAA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG ** ** * * 23515 GTC-TTCATTCTATCATAAAACAA 512 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * ** * ** 23538 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTTCTAAACTAATAATATTTTAAAAA 1 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA * * * ** * * 23601 TTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATT 64 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATT ** * * 23666 AAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTC 128 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTT-GTTC * * * * * ** ** 23731 ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGTTAAGTTGGAG 192 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTT-AGAAATTAATAAGTAAGAG * 23796 ATTTAAAAAATAAAT-TAG-TTT------A--TC-GA-A-TTA-G-----TTGAACTAA-T-T-T 254 ATTTAAAAAATAAATCT-GTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCT * * 23839 ATTTCAAATAT-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTCTT-TCA-TCATACAAGCTT 317 ATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTT * * * * 23901 GTTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAA 379 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA * * * * * ** * 23966 TAAATATGCTTCT-TGAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAGTTGAATGATTATATATTTCAAAT 444 TAAATCT-ATT-TATCAA--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT * * * 24029 CATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA 505 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA * * * * * ** 24060 TT-ATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATAAAAAT 1 TTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT *** * * * ** * 24124 TAATAACCGAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTA-TA 65 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATTT * * * * * * * 24188 GAATAATTATTTATTTCAAA-CTATTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTGTTGTTC 129 GAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTT-TTGTTC * * * 24252 ATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTA-AAATTAATAAG 192 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-AAATTTATTAATA-TTTAGAAATTAATAAG 24310 AGATTTACAA Statistics Matches: 12705, Mismatches: 3189, Indels: 2335 0.70 0.17 0.13 Matches are distributed among these distances: 508 2 0.00 509 71 0.01 510 76 0.01 511 3 0.00 512 91 0.01 513 19 0.00 514 106 0.01 515 31 0.00 516 27 0.00 517 102 0.01 518 51 0.00 519 138 0.01 520 57 0.00 521 187 0.01 522 266 0.02 523 47 0.00 524 73 0.01 525 27 0.00 526 157 0.01 527 181 0.01 528 322 0.03 529 171 0.01 530 51 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Indices: 6721--11783 Score: 2203 Period size: 357 Copynumber: 14.1 Consensus size: 357 6711 TTATGACCTT * * * * 6721 TTGTTTT-GTCATATAAGCTTA-TTCGAAAT-AAATAATACTAAGTTATTAATATTTAGAAAATT 1 TTGTTTTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTTTG-AAATT * * * * * 6783 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTC-GAGC-AGCTTTAAATAATTATGACTATT 63 AATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACAAG-TTCAAATAGTTATGAC-AAT * * * * * ** * * 6846 TTG-ATAATTTGAT-T-TTTGAAATTGCTAT-AGCCTTTTTCTTTTGTCATAAAATGATTTTTTT 124 TTGAATAA-TT-ATCTATTTCAAATCGTTATGA-CC-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC * * * * ** * 6907 TGTTCATACAAGTTTATTTTG-AATAAAATAATAAAAATTTATTAATA--T-AAAGACACTTAAT 185 TATTTATAAAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-ATAAT * * * * * * *** 6968 AAGTAAAACATTT-AAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACCGTTTGAA 246 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA-AAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAA * * * * 7030 CAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTGTTTTGTC----AACAA 309 TAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGATCTTT-TATTTTGTCATAAAATAA * * 7075 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9464 GTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTGAATCAA-TTCAAATAGTTAAGATTATTAT-AA 248 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA--AAGTTTAAATAGTTATGATTATT-TGAA * * * * * * * ** * 9526 CAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAATAATAAAATAA 309 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAA * * *** ** * * *** 9575 TTGTTTCAGTTCATACATGCTTA-TTCAAAATAAAATACCGCTCTTCTATTAACACTCAAAAATT 1 TTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAATT-TATTAATATTTTGAAA-T * * * * * 9639 TAATAAG-AAGGAAGTTTAAAAGAATAAATCTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA 62 TAATAAGTAA--AAATTTAAAA-AATAAATATGTTT-TCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAA * * * * * * 9702 TTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT-AGCCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAA 123 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTA * * ** * * * * * * ** 9766 TTCATAAACGCTTA-TCCAAAAAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTG 187 TTTATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAA * * * * ** * 9830 GAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATCACCATTTGAACAATT 252 GAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAA--AAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATT * * * * 9893 ATCTATTTCAAATCTTTAAGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA 314 ATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAA * * ** 9937 TTGTTTT-TCATCATACAAGCCTA-TTCTAAATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA 1 TTGTTTTAT--TCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTT-TGAAA * * * * * * ** 10000 TTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGATTATT 61 TTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATT * * * * * * * * * 10065 TGAA-AATTTGTATATTTCAAATCGTT-TAACCTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTATTTATGTT 125 TGAATAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATT * * * * * * * * * ** * 10128 CATACAAGCTTATTTGGAATACAGTAATGCTAATCTAATAATATTAT-GAAATTTAATAACTAAG 189 TATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAAATAATAAGTAAG * * * * * ** ** * 10192 AGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAACTAA-TTGAAATAGTTAAGGCTACATGAAAAATTAT 253 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA--AAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTAT * * * * 10256 CTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAGCA-AA 316 CTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAA--ATAA ** * * * * * 10299 TTGTTTTGCTCATATAAGTTTGTTT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT 1 TTGTTTTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-CAATTTATTAATATTTT-GAAATT * * * * * ** * * 10363 AATAAG---AGATTTAAAAAGTAAATCTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGA 63 AATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGA * * * * * * * 10425 ACAATTA-CTTATTTTAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTGAT 128 ATAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTTAT * * * * * ** * * * * 10489 -ACAGTCTTATTCGAGATAGAGTAATGGTAATCTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAACAG 192 AAAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAATAATAAGTAAGAG * * * * * * ** ** * * * 10552 ATTTAAAAAATGAATTTGTTGAACTGACTAA-TACAAATAGTTAAAATTGTTGGAACAATTATCT 255 ATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GA-AAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCT * * * * *** * 10616 ATTTCAAAGCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAA 318 ATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAA * * * * * * * *** 10656 TTGTTTTTGTTCGTTCAAGATGA-CTCGAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAAAAA 1 TTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-C-AATTTATTAATATT-TTGAAA * * * * * * ** 10719 TTAATAAGTATGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATC-GATCAAGTTCAAATAGTTACT-ACTC 61 TTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACAA * * * * * * * * 10782 TTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAT---ATAATTTTTTCTAT 123 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTAT * * * * * * ** * 10844 TCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT-GACAACCAATTAGTAA 188 TTATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAA * * * * * * * * 10907 AAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCGAATAAGTTCAAACAATTATGACTATTT-AACAATTAT 252 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-AAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTAT * * * * 10971 TTTTTTCAAATCATTATGA-CTTTTTATTTTGTCATAAAACAA 316 CTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTTATTTTGTCATAAAATAA * * * * 11013 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAAT 1 TTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-CAATTTATTAATATTTTGA-AAT * * ** * * * * * 11077 TAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTT 62 TAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTT * * ** * * * 11142 GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTTA 126 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTTA * ** * * * * 11207 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGA 191 TAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAGAGA * * * * * * * * 11272 TTTAAAATATGAATCTATTTA-CTGAACGAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAA-AATTTATTT 256 TTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA-AAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAA-TTATCT * * * * 11335 ATTTTAAATAGTTATGATC-TTTATTTTGTCGTAAAACAA 318 ATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAA * * 11374 TTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT 1 TTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTTT-GAAAT * * * * ** * * * * * 11438 TAATAGGTAGGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATTGTCATGTCCATTT 62 TAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTT * * * ** * * 11502 GAAAAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGCATTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTA 126 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTTA * * * * ** 11567 TACATAA--TTATTT-AGAATAAACTAATACTGATTCATTAAGATTT-TGAAAAT--TAA-TAAG 191 TA-A-AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAG ** * * * * 11625 AGCA-TTAAAAACCAAATCTGTTTA-CTGAACTAGTTCAAATAGTTATGATTTTTTGAATAATTA 253 AG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA-AAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTA * * * * * * 11688 TATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCACAGAACAA 315 TCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAA * * * * * 11730 TTGTTTCTTTTCATATAAGCTTA-TTCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA 1 TTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATAC-AATTTATTAATA 11784 AAAATTAAAT Statistics Matches: 3656, Mismatches: 808, Indels: 488 0.74 0.16 0.10 Matches are distributed among these distances: 342 1 0.00 343 59 0.02 344 36 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Indices: 8624--8928 Score: 379 Period size: 165 Copynumber: 1.8 Consensus size: 168 8614 TGGCCATTTA * 8624 AACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTCATCA 1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTCATCA * * * ** * 8689 TACAAGCCTGTTCAAAATAAAGTAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAATT-AA-TAAGAGATT 66 TACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAACTAAGAGATT 8752 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCCTACTTG 131 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCCTACTTG ** * * * 8790 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTATAGTTTA 1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTT-T--TTCA * *** 8854 T-ATA-AA-CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAG 63 TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT-A-AACTAAG 8916 AGATTTAAAAAAT 126 AGATTTAAAAAAT 8929 TAATTTGTTT Statistics Matches: 116, Mismatches: 16, Indels: 11 0.81 0.11 0.08 Matches are distributed among these distances: 165 64 0.55 166 26 0.22 167 3 0.03 168 6 0.05 169 17 0.15 ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.06, T:0.41 Consensus pattern (168 bp): AACAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTCATCA TACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAACTAAGAGATT TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCCTACTTG Found at i:10727 original size:719 final size:715 Alignment explanation

Indices: 9236--11487 Score: 1770 Period size: 719 Copynumber: 3.1 Consensus size: 715 9226 GCTTACTCAG * * * ** 9236 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACC 1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATA * * * * * ** 9301 TATTTACCGAACTA-TCTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAGCAA-TTATCTATCTCAAATCATTA 66 TGTTTACCGAACAAGT-TCAAATAGTTACT-ACTATTTGA-AAATTTATATATTTCAAATCGCTA ** * * * * 9363 GGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTTATATTCATACAAGCTTA-TTCGAAGTA 128 TAACCTTTTGTTTTGTCAT------A-TA-AT-TATTTATATTCATACAAGCTTATTTC-AATTA * * * * ** * * * * 9426 AAATATTGCTAAA-CTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAA-TGTG 183 AAATAAT-ATAAATCTAATAATA-TTTGACAACCAATAACTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTCTA * * * * * * * * * 9489 TTTACTGAATCAA-TTCAAATAGTTAAGATTATTAT-AACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAA 245 TTTACCGAAT-AAGTTCAAACAATTAAGACTA--ATGAAAAATTATCTATTTCAAACCATTATGA * ** * * ** * * * **** 9552 CCTTTTGTTTAATAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATACCGCT 307 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATT * * * * * * * * 9617 -CTTCTATTAACA-CTCAAAAATTTAATAAGAAGGAAGTTTAAAAGAATAAATCTGTTTATCAAA 372 AATT-TATTAATATTTTAAAAA-TTAATAAGAA--AA-TTTTAAA-AATAAATATATTTACCAAA * * * * * * ** * * * * 9680 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAGCCTTTTGTTTT 431 CAAGTTCAAATAGTCATAACAACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCATTTGTTTC * * * ** * * 9745 ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AACGCTTATCCAAAA-AAAATAATATTAGTTTATTAA 496 ATCATAAAACAATTGTATCAATTGATATAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATCTATTAA * * * *** * * * 9808 TATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATC-A-ATTCAAA 560 TATTCCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTA-TTAACTGAA-CGAGA-TCAAA * ** ** * * * 9870 TAATTATCACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTA-AGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA 622 TAGTTAAAACTGTTGGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATA-ATCTTTTGTTTTGTCGTAAAA * * 9934 CAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCTA 686 CAATTGTTTTT-ATTCATACAAG-ATATTCAA * * 9965 AATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAAA 1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATA * * * * 10030 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-TGATTATTTGAAAATTTGTATATTTCAAATCG-TTTA 66 TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTACT-ACTATTTGAAAATTTATATATTTCAAATCGCTATA * * * * * 10093 ACCTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAA-TACAGTAATG 130 ACCTTTTGTTTTGTCAT---ATAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTT-CAATTAAAATAAT- * ** * * 10157 CT-AATCTAATAATATTATGA-AATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TTTTTACCG 190 ATAAATCTAATAATATT-TGACAA-CCAATAACTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCG * * * * * * 10219 AACTAA-TTGAAATAGTTAAGGCTACATGAAAAATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGT 252 AA-TAAGTTCAAACAATTAAGACTA-ATGAAAAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTAT * * * * * * 10283 TTTGTCTTAAAGCAAATTG-TTTTGCTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATATTAATTTAT 315 TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTAT * * * * 10347 TAATATTTTAAAAATTAATAAG-AGA-TTTAAAAAGTAAATCTATTTGCCAAACCAGTTCAAATA 379 TAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAATTTTAAAAA-TAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATA * * * * ** * 10410 GTTATAACAATTTGAACAATTA-CTTATTTTAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACA 443 GTCATAACAACTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTACAACCATTTGTTTCATCATAAAACA * * * * * * * * 10474 ATTGTTTCTATTGATA-CAGTCTTATTCGAGATAGAGTAATGGTAATCTATTAATA-TCCTAAAA 507 ATTGTATCAATTGATATAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCC-AAAA * * * * 10537 ATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGAACTG-ACTA-ATACAAATAGTTAAAATT 570 ATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTATT-AACTGAACGAGAT-CAAATAGTTAAAACT * * * * * 10600 GTTGGAACAATTATCTATTTCAAAGCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTTTG 633 GTTGGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTA * * * * 10665 TTCGTTCAAGATGACTCGA 698 TTCATACAAGAT-ATTCAA * * * * 10684 AATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAACTAAAT 1 AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT * * * * * * * * 10748 CTATTTATCGATCAAGTTCAAATAGTTACTACTCTTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGCTATA 65 ATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTACTACTATTTGAAAATTTATATATTTCAAATCGCTATA * * 10813 ACCTTTTGTTTTGTCATATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAA 130 ACCTTTTGTTTTGTCATATAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAA * * * * 10878 TTTATTAATATTTGACAACCAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCGAATAAGTT 195 TCTAATAATATTTGACAACCAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCGAATAAGTT * * * * * * * * 10943 CAAACAATTATGACTATTTAACAATTATTTTTTTCAAATCATTATGACTTTTTATTTTGTCATAA 260 CAAACAATTAAGACTAATGAAAAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAA * * * * 11008 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGA 325 AACAATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAA * * * * 11073 TAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCTAATAGTCATAACT 390 AAATTAATAAG---AAAATTTTAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACA * ** * * 11138 ACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAA 452 ACTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCATTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAA * * * * 11203 TTTATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAA 517 TTGATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA * * * * ** * 11268 GAGATTTAAAATATGAATCTATTTACTGAACGAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAA-AATTTA 582 CAGATTTAAAAAATGAATCTATTAACTGAACGAGATCAAATAGTTAAAACTGTTGGAACAA-TTA * * * * * * * 11332 TTTATTTTAAATAGTTATGATC-TTTATTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTT 646 TCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-AT 11396 ATTCAA 710 ATTCAA * * 11402 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAATAAATA 1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATA * * 11466 TGTTTACCAAATAAGTTCAAAT 66 TGTTTACCGAACAAGTTCAAAT 11488 TGTCATGTCC Statistics Matches: 1223, Mismatches: 252, Indels: 108 0.77 0.16 0.07 Matches are distributed among these distances: 714 5 0.00 715 106 0.09 716 49 0.04 717 78 0.06 718 199 0.16 719 420 0.34 720 40 0.03 722 9 0.01 723 170 0.14 724 20 0.02 725 2 0.00 726 3 0.00 728 5 0.00 729 116 0.09 730 1 0.00 ACGTcount: 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Indices: 11645--11931 Score: 346 Period size: 153 Copynumber: 1.9 Consensus size: 154 11635 ACCAAATCTG * ** * * * * * 11645 TTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGATTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGATC 1 TTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGACC * * * ** * * * 11710 TTTAT-TTT-GTCACAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTA-TTCAGATTAAGATAATACT 66 TTT-TGTTTAGTCAAAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTACTT-AGAATAAAATAATACT 11772 AATTTAATAATAAAAATTAAATGAGT 129 AATTTAATAATAAAAATTAAATGAGT * * * 11798 TTTACCGAACTAGTTCGAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC 1 TTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGACC * * 11863 TTTTGTTTAGTCAAAAAACAATTATTTCAGTTCATACATGCTTACTTAGAATAAAATTATACTAA 66 TTTTGTTTAGTCAAAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTACTTAGAATAAAATAATACTAA 11928 TTTA 131 TTTA 11932 TTAAAATTCA Statistics Matches: 110, Mismatches: 21, Indels: 5 0.81 0.15 0.04 Matches are distributed among these distances: 152 1 0.01 153 60 0.55 154 47 0.43 155 2 0.02 ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (154 bp): TTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGACC TTTTGTTTAGTCAAAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTACTTAGAATAAAATAATACTAA TTTAATAATAAAAATTAAATGAGT Found at i:12094 original size:27 final size:27 Alignment explanation

Indices: 12064--12125 Score: 108 Period size: 27 Copynumber: 2.3 Consensus size: 27 12054 GTCATATAAC 12064 AATTGTTTGGTCATATAAAATAATACT 1 AATTGTTTGGTCATATAAAATAATACT * 12091 AATTGTTTAGTCATATAAAATAATACT 1 AATTGTTTGGTCATATAAAATAATACT 12118 AATT-TTTG 1 AATTGTTTG 12126 AAAGATTAAT Statistics Matches: 33, Mismatches: 2, Indels: 1 0.92 0.06 0.03 Matches are distributed among these distances: 26 3 0.09 27 30 0.91 ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.10, T:0.44 Consensus pattern (27 bp): AATTGTTTGGTCATATAAAATAATACT Found at i:12176 original size:28 final size:29 Alignment explanation

Indices: 12117--12177 Score: 115 Period size: 29 Copynumber: 2.1 Consensus size: 29 12107 AAAATAATAC 12117 TAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGTAT 1 TAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGTAT 12146 TAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAG-AT 1 TAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGTAT 12174 TAAT 1 TAAT 12178 CATACAAGTT Statistics Matches: 32, Mismatches: 0, Indels: 1 0.97 0.00 0.03 Matches are distributed among these distances: 28 6 0.19 29 26 0.81 ACGTcount: A:0.43, C:0.03, G:0.10, T:0.44 Consensus pattern (29 bp): TAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGTAT Found at i:12685 original size:181 final size:179 Alignment explanation

Indices: 12336--22431 Score: 5750 Period size: 180 Copynumber: 56.4 Consensus size: 179 12326 AAAAAATAAA * * * * * * 12336 ACCTTTTATTCTGTCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGTTTATTTCA-AATAAAATAAT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCA-ATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAT * * * * * * * * * * * 12399 AATAATCTAATAGTA-TTCTAAAAATTAATAACTCAGAGATTTAAAAATAAAATTTGTTTGCCGA 64 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAATTTATTT-ACTA * * * * * * ** 12463 ACCAATTTAAATAGCTAAGACTATATGAGCAATCGTCTATTTCAAATCATTATG 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * ** * * * 12517 ACCATTTCTTTCATCGTAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AG 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * 12581 TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTCATTTACCTAAC 66 T-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTT-ATTTA-CTAAC * * 12646 CAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG 128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * ** * * * * * * 12698 ACCCTCGGTTTTGTCATAAAAAAATGTTTTT--ATTCTTATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAAT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT ** * * * 12760 GTTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTATCAA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAT-TTATTTA-CTA * * * * 12820 ATCAGTTCAAGTAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-CTATTATG 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATG * * * * * 12874 ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTATTTT-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATGAT- 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * * * * * * * 12936 GT--TGTATCAACAATTCAAAAGTTAATAAGTAATAGATTTAAAAAAATAAATTAGTTTACTAAA 65 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAATTTA-TTTACT-AA * * * * * ** * 12999 TCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATT 127 CCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * 13052 ACCTTTAGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCTA-T-ATAGAGGCTTATTCAAAATAAAACAAT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * * 13115 ACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AA * * * * ** * * 13176 CTAGTTCAAATAGTTATCACTATTTAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTGTA 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * ** * * * 13229 ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTTATATAAGCTTATTCAGAATAAAGTAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * * ** 13293 CTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAAT-AGTTAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTGTTGAA 65 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AA * * * * * ** 13356 CTACTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG ** * * * * * 13409 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTT-TGTTAATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA * * * * * * 13472 TACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAA-TAATAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACT 63 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT * * * * * * 13536 AAACCATTTCAAATGGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTAAGTT-AAATCATTATA 125 -AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATG * * * ** * ** * * * 13592 ACTTTTTGTTTTGACATCAAACAATTGGTCCTGTTCATACTA-TTGTATTTAGAATAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCT-TATTCAGAATAAAATAATA * * * ** * * * ** * 13656 CTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAACTGCTGAA 65 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AA * * * ** ** * * ** 13721 TCAGTTCAAATAGTTAAGACCACATGAATGATTATTTATTCCAAATTGTTATG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * 13774 ACCTTTTTCTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTT--ATTCATACAAGCTTATTCTGATTAAAATAAC 1 ACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * * * ** 13837 ACTAATTTAATAATTTTTCAAAACTTAATAAG---AA-ATTTTAAAAATAAATTTATTTATCGCA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTA-CTAA * * * * * * * * 13898 TCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTTTG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * 13951 ACATTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATAC 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * ** * * 14016 TAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAG-AAATATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAC 66 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AAC * * * * * * 14080 AAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCGTTATA 128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * 14132 ACCTTTTGATTTGTCATAAAAC-ATTTGTTTTAGTTAATTCAAGCTTAGATT--GATTAAAATAA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCAATTCATACAAGCTT--ATTCAGAATAAAATAA * * * ** *** * * * 14194 TACTAATTTATTAACACTTACTAAAA--AATAA--ATTAG-TTTATCGAATTAGTTA-ATA-TAA 63 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTATTTACTAA ** *** * * * * ** 14252 TTA--T-AGCCA-TT-TGAATGA-TT-ATCTATTT------T-AAATTGTTATG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * ** * * 14292 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTT-TTTATCATACAATCTTATT-TGAAATAAAATAA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAAT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA * * * * * * 14355 TATTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGA 63 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTA-CTA * * ** * 14420 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT-TAATCTCAAATTGTTAAG 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATG * * * * * * * ** 14474 ATC-TATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAACTTATT-TGGTTAAAAATAAT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AATTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAAT * * * * * * 14536 ACTAATTTAATAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAG 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACTAA- * * ** * * * * 14601 TCAATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * 14654 ACCTTATGTATAGTCATAAAA-TATTTGTTTC-ATACCTTACAAGCTTATTC-GAAATAAAAGAA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCAAT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA * * * * ** * 14716 T-CTAAATTTATTAACA-TTCAGAGAATTAAAAAGGAAATTATTTGAAAAAATAAATCTATTTAC 63 TACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAAT-AATTTATTTAC * * * * * * * 14779 TGAACAAATTCAAATAGTGATGACTATTTGAAAAATTATTTATTTAAAATCATTATT 124 T-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * 14836 ACCATTTGTTTTGACATAAAAC-ATTTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAA-AATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * * * * 14898 -T-A--TATTAATTTCTTACAAAAATTAATAA--ACAAGAGTTTAAAATA-AATTTGTTTACCCA 65 CTAATTTATTAATAT-TT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAATTTATTTA-CTA * * * * * * 14956 ACAAATTCAAATAGTTATGCCTACTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATG 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * 15010 ACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATGCAAGCTTAGTT-AAAATAAAAT-ATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATA * ** * * * * 15073 CTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTATTGAAT 65 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AAC * * * * * 15138 CAGTTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATT 128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * ** * * * * 15190 ACATTTTATTTGGTCACAAAACAATTTTTTTTA-TCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAA-AG 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * * * * * * 15253 TAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAATAATAAATATATTTACCGAAC 66 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AAT-AATTTATTTA-CTAAC * * * * * * * * 15318 TAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATA 128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * 15370 ACCTTTTGTTCTATCATAAAA-AATTTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * ** * * * * 15434 CTAATATAAAAATA-TTCAAAAAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAA 65 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAAT-AATTTATTT-ACTA * * * * 15497 ACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT- 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * ** * * ** 15547 ---TTTTGTTTTGTCATAAAATAA-AATTTCACTTCATACTAA-CCTATTTGGAATAAAATAA-A 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * * * 15606 ATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAA 65 CT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATT-TATTTA-CTAA * * * * *** 15671 TCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * 15724 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTTTT--ATTCATATAAGTTTGTTCATAATAAAATAAT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * * * 15787 GCCAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTATCAA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAT-TTATTTA-CTA ** * ** * ** 15847 ACTTGTTCAAAGAGTTATGACTA-TCCAAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT- 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * ** * * * * 15900 --TTTTTATTCTATTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCATATTAAAATAATAC 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * * * * * * * * 15963 TAATTTATTAATATATCAACAACTAATAAGTAAAA-TTTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACTA 66 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTATTTA-CTAACCA * * * * * * 16027 GATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCTTTATG 130 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * 16077 ACTTTTTGTTTTGTTATAAAA-AATTATTTT-AGTTCATATC-AGCATATT-TGAAATAAAATAA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATA-CAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA * * * * * * * 16138 TATTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCG 63 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTA-CT * * * * *** * 16202 AACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATA 125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * ** ** * * * 16257 ACTTTTTCTTTTGTCACCAAATTATTTTTTCTATTTATACAAGCTTGTTACA-AATAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATA * * * * * 16321 C-AACTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATCTCAAAAATAAATTTGTTTACTGA 65 CTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-A ** * * * * * ** 16383 ATAAGTTCAAATACTTATGACTAATTAAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATG 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * 16437 ACTTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTGTTCATATTAAAATAATA 1 AC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA * * * * * * 16502 GTAATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAA 65 CTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTA-CTAA * * * * * * 16566 CAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTA 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * 16619 ACCTTTTGTTTCGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATT-TGAAACAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA * * ** * ** * 16683 CTAATTCATGAATATTGT--AAAATTAATGTGTAAGAGAACTAAAAAATTAATTTGTTTA-TCAA 65 CTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAATTTATTTACT-AA * * * * * 16745 ACATTTCCAAATAGTTATGACTATCTGGACAATTATCTATTTCAAAACATTATG 127 CCAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * ** * * 16799 ACCTTTAGTTTTGTCATCAAACAATTAGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATA * * * * * ** 16863 -TAAATTTATTTATATTCCAATAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATATTTTTTGAA 65 CT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AA * * ** ** 16926 -CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTAAA 127 CCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG ** * * 16979 ACCTTTCATTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCAT-CAAAGCTTATTC-GAAATAAAATAA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTCAATTCATAC-AAGCTTATTCAG-AATAAAATAA * * * * 17041 TACTAATTTATTAA-ATTTTTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAATAATAAATCTGTTTAC 63 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAA-AAT-AATTTATTTAC * * * * * 17105 TAAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG 124 TAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * ** * * 17162 ATCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATT-TGAACGAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATA *** * * 17225 CTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCACTGAA 65 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AA * * * * * * 17289 CAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATG ** * ** ** * * ** * 17342 ATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTAATTCTATTTATACAAAATTATTCA-TA-AAAATAATAC 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * * * * 17405 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATC 66 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTA-CTAACC * * * * 17466 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATG 129 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * ** * * 17517 ACC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATT-TGAAGCAAAAT-AT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAAT ** * * * * * * * * 17578 TGTGAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCA 64 ACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTT-ACT * * * * * * 17642 AATCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTG 125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * ** * * * * * * 17697 ACCTTTTATTTAT-TTGTTAAATAATTTTTTCAGTTCATGCATGCTTATT-TGAAATAAAATAAT 1 ACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA- * * ** * 17760 TACCTAA-TAATT-ATCATGT-AGAAAATTAATAAACAAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTA 63 TA-CTAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTA * * * ** * 17821 CCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATG 123 -CTAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATG * * * ** * * * * * * * 17879 ACCTCTTGCTTTATCATAAAATGATTGTTTCAGTTCATAAAAGCATTTTTGA-AAAAAAATAACA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGC-TTATTCAGAATAAAATAATA * * * * * * * * 17943 TTACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAAAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAAT 65 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTA-TTTA-CTAAC * * * * * * 18007 CACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTTATG 128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATG * * * 18059 AACTTTTG--TTGTCATAAAACAATTTTTTTTC-A-TCATAAAAGCCTATTCAGAATAAAATAAT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * * 18120 ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AA * * 18185 -C----C----AGTT-T--CTATTTGAAC-GTTATCTATTTCAAATCATTATA 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * * * ** 18225 ACCTTTTGTTATGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCCTATAACCTTATTTGGAATAAAATAATAC 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC * * * * * * * * * * 18290 TAATTTAATT-ACATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAAG 66 TAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AAC * * * * * * * * ** 18354 TAGTTTAAACAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTATAAAAAATTATG 128 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATG * * * * * * 18407 ACTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTAA-TCATTCAAGCCTATTC-GAAATAAAATAAT 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT * * * * * 18470 ACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-AA ** * * * ** * * 18535 TTAATTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATA 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * ** * ** * 18586 ACCTTTTGCTCTACCATAAAAAAATTATTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA 1 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TACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAATCTATTTATCT 63 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT--AATTTATTTA-CT * * * * 19068 AACGAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATG 125 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * * 19123 A-CTTTCTGTTTTGAT-ATAAAATAATTGTTTCCATTCATACAAGCCTATTC-GGAT-TAA-AAT 1 ACCTTT-TGTTTTG-TCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT ** * * 19183 ACTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTAA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-A ** * * * 19247 ATTAGAT-AAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG 126 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * ** * 19300 ACCTTTTGTTTTGTTA-AAAAAAATTATTTCATTTTGTATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA * * * * * * 19363 CTAAGTTATTAATA-TT-AGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAA 65 CTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTT-ACTAA * * * * * * *** * 19426 CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTGCTATA 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * ** ** 19479 ACCTTTTGTTTTCTCATAAAATGAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA ** * * * * * 19544 AAAATTTATTAATA--T-AAAGACAATAATAAGCAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAA 65 CTAATTTATTAATATTTCAAA-A-ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTA-CTA * * * * * 19606 ACAAGTTTC-AAT-CTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTC-TTATG 126 ACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATG * * * * * * * * 19659 ACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTATTTATGCAAGCTTATTCA-AATTACAATAATA 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATA * ** ** * * * 19723 TTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAACTTTTAAGAAATAA-ATATGTT-TTGAAC 65 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTAT-TTACT-AAC * * * * * 19786 AAGTTCAAATAGTTCTAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATG 128 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*** * ** * * * 21817 AGCCTTTTGCGCTATCATAAAACAATTATTTT-TGTTCATATAAGCTTGTTCAAAATAAAAT-A- 1 A-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * * ** * * * * 21879 A-T-A---A-TAATATTCCAAAAGTTAATAACTATGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAA 64 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTATTT-ACTAA * * * * * * * 21938 CTAGTTCAGATATTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG 127 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG * * * * * ** 21991 ACC-TTTATTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA- 1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT * * 22054 AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT 64 ACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAATT-TATTTA-CT * * * * 22118 AACCAG-TCTAAATAATTATGAGTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATG 125 AACCAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG ** * ** * * * *** ** 22173 GTCATTTGTTTAATCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATGCGCTTATTGGGAATAAAATAATAC 1 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** * * * * * 19752 AGTAAAACTTTTAAGAAATAAATATGTTT-T-GAACAAGTTCAAATAGTTCTAA 126 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATGA * * * * * 19804 CTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC 1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTTC * * * * * * * 19869 AGTTTATATAACCTCATTTGAAATTAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGT 66 ATTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGT * * * * * * 19934 AAAAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTA-CTAAACATGTTCAAATAGTTATGA 129 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAATTATGA * * * * * * * 19985 CTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTC 1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTTC * * * 20050 -TATTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATA 66 AT-TTTATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATA * * * * 20112 AGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGA 126 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACA-AGTTCAAATAATTATGA * * ** * 20165 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTTTTTC 1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTTC * * * * 20230 -TATTTATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAG 66 AT-TTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAG * *** * * * 20294 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCCATTTA-CTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGA 128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAATTATGA * * * ** * * 20346 CTACTTGAACAATTATCT-TTTCCAAATCACTATGATCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT 1 CTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTT * * * * * ** 20410 CA-TTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTTACCAG 65 CATTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAG ** * * 20474 TTGGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTCAT-GAACAAGTTCAAATAGTCAT-A 128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATCGAACAAGTTCAAATAATTATGA * * * * * * * * 20524 TTCATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTATATTTTGTTGTAAGATAATTGTT 1 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TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAAACTAATAATA * * * * * * ** * * * 23235 TTCTAAAAATTAATAATTAGGAGATTGAAAAAATAAATTTATTTACTAAATAAGTTTAAACAGTC 66 TTTTAAAAATTAATAAGTA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTT * * ** * 23300 ATGTCTATTTAAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTG 130 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTG * * 23365 TTTTTATTCATGTAAAA-TTATTCAAAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA 195 TTTTTATTCA--TAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA * ** * * * * * * 23429 -TAAGAGATTTAAAATCTAAATTTGTTTACAAAATC-ATTTCAATTAGTTATGACTATTTGAATA 258 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-AAAGCGAATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACA * 23492 ATTATCTATCTC-A-TATCACAATGGTCTTCATTCTA 322 ATTATCTATCTCAATTATCACAAT-CT-TTCATTCTA * * 23527 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTTCTAAACTAATAAT 1 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA-TAAAATAATACTAAACTAATAAT * * 23591 ATTTTAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGT 65 ATTTTAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGT * * * * * 23656 TAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT 129 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATT * * * 23721 G-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTG 194 GTTTTTA-TTCATAAAA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA--- *** * * * 23785 TTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTT----ATCGAA-T----TAGTT-GAACTAATTT- 254 TTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACAAAGCGAATTCAAATAGTTATAACT-ATTTA ** ** ** * * 23839 ----ATT-TC-AAAT--ATT-T-ATGATCTTTTGTTTTG 318 AACAATTATCTATCTCAATTATCACAATCTTTCATTCTA * * * ** * 23868 TCATAAAACAAATGTCTT-TCA-TCATACAAGCTTGTTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAA 1 TCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAAACTAATAA * * * * * * 23931 TATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTCTTGAACCAATTCAAATAA 64 TATTTTAAAAATTAATAAGTA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAG * * ** * * * * 23996 TTATGACTAGTTGAATGATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAT 128 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAAT * * * * * * * * 24061 TATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-AAAAATT 193 TGTTTTTATTCATA-AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT * * * 24125 AA-TAACCGAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAA-CCAATTCAAATAGTTA 256 AAGTAA---A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CAAAGCGAATTCAAATAGTTA 24180 AGGCTATAGA Statistics Matches: 1086, Mismatches: 219, Indels: 141 0.75 0.15 0.10 Matches are distributed among these distances: 337 1 0.00 338 4 0.00 340 1 0.00 341 222 0.20 342 15 0.01 343 3 0.00 344 2 0.00 345 6 0.01 346 4 0.00 347 3 0.00 350 5 0.00 351 3 0.00 352 9 0.01 355 12 0.01 356 16 0.01 357 205 0.19 358 60 0.06 359 17 0.02 360 218 0.20 361 106 0.10 362 97 0.09 363 68 0.06 364 9 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (356 bp): TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAAACTAATAATA 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Indices: 23889--24309 Score: 501 Period size: 181 Copynumber: 2.3 Consensus size: 179 23879 ATGTCTTTCA * * 23889 TCATACAAGCTTGTTCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGG 1 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAGG * * * * 23954 AGATTTAAAAAATAAATATGCTT-CTTGAACCAATTCAAATAATTATGACTAGTTGAATGATTAT 65 AGATTTAAAAAATAAATATGCTTAC-CGAACCAATTCAAATAATTAAGACTA-TAGAATAATTAT * * * 24018 ATATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATT-TATGT 128 ATATTTCAAACT-ATTATAACCTCTTGTTTTATCATAAAAGAAATATTGT-TGT * * * * 24070 TCATACAAGCTTATTCGAAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATAAAAATTAATAACCG-A 1 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAA--GTA * ** * * 24134 -GAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATAGAATAATTAT 63 GGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATAGAATAATTAT * * * * 24198 TTATTTCAAACTATTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTGTTGT 128 ATATTTCAAACTATTATAACCTCTTGTTTTATCATAAAAGAAATATTGTTGT * * * * 24250 TCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAG 1 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAG 24310 AGATTTACAA Statistics Matches: 205, Mismatches: 29, Indels: 16 0.82 0.12 0.06 Matches are distributed among these distances: 177 1 0.00 179 12 0.06 180 90 0.44 181 98 0.48 182 3 0.01 183 1 0.00 ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (179 bp): TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAGGA GATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATAGAATAATTATATA TTTCAAACTATTATAACCTCTTGTTTTATCATAAAAGAAATATTGTTGT Found at i:25056 original size:361 final size:361 Alignment explanation

Indices: 24439--25094 Score: 797 Period size: 361 Copynumber: 1.8 Consensus size: 361 24429 TCCTAAAAAT * * * * * 24439 TAATTAGTAATAGATTTAAAACATAAATCTGTTAAACTGAGCAATACAAATAGTTATAATTGTTT 1 TAATTAGTAATAGATTTAAAAAATAAATCTATTAAACTGAGAAATACAAATAGTTATAACTATTT * ** * 24504 GAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTGTTCA 66 GAACAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCA * * * 24569 TACAAGCTGACTTGGAATAACATAAATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA 131 TACAAGCTGACTTGGAATAAAATAAATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAA * * * * 24634 TTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGATCAAGTTCAAATAGTTACTACTCTTTGAACAATTATCTAT 196 TTTAAAAACTAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCACTACTCTTTGAACAATTATCTAT ** 24699 TTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAACTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA 261 TTCAAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAACTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA 24764 ATTAAAATAATACAAATTTGTTAATATTTAGACAAC 326 ATTAAAATAATACAAATTTGTTAATATTTAGACAAC * * * * 24800 TAATTAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAAC-GAATAAATTCAAATAGTTATGACTAT 1 TAATTAGTA-ATAGATTTAAAAAATAAATCTATTAAACTG-AGAAATACAAATAGTTATAACTAT * * * * * * * 24863 TTGAACAATTATTTTTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT 64 TTGAACAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATT ** * ** * 24928 CATACAAGCT-TTTTCGGATTAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAA 129 CATACAAGCTGACTT-GGAATAAAATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-A * * * ** 24991 AAAAATTTAAATA-TAAATATATTTA-CGGAACAAGTTCTAATTGTCA-TAACTAC-TTGAGTAA 191 AAAAATTTAAAAACTAAATATATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTCACT-ACT-CTTTGAACAA * * * 25052 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA 253 TTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA 25095 CAATTGTATA Statistics Matches: 244, Mismatches: 43, Indels: 16 0.81 0.14 0.05 Matches are distributed among these distances: 360 5 0.02 361 224 0.92 362 15 0.06 ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (361 bp): TAATTAGTAATAGATTTAAAAAATAAATCTATTAAACTGAGAAATACAAATAGTTATAACTATTT GAACAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCA TACAAGCTGACTTGGAATAAAATAAATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAA TTTAAAAACTAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCACTACTCTTTGAACAATTATCTAT TTCAAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAACTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA ATTAAAATAATACAAATTTGTTAATATTTAGACAAC Found at i:25112 original size:181 final size:178 Alignment explanation

Indices: 24324--25101 Score: 672 Period size: 181 Copynumber: 4.3 Consensus size: 178 24314 TTACAAAGTA * * * * 24324 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATAA-TTATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTATTGA 1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA * * * * * * * ** * * ** * * * 24388 TACGATCTTATGCGAAATAAAGTAATGCTAATCTATTAAAATCCTAAAAATTAATTAGTAATAGA 65 TACAAGCTTTTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAGA * * * * * ** 24453 TTTAAAACATAAATCTGTTAAACTGAGCAA-TACAAATAGTTATAATTGTTTG 130 TTTAAAA-ATAAATCTATT-TAC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTACTTG * * *** * 24505 AATAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTGTTCAT 1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT ** * * ** * * 24570 ACAAGCTGACTT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAG 66 ACAAGCT-TTTTCGGATTAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAG * * 24633 ATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGATCAAGTTCAAATAGTTACTACT-CTTTG 129 ATTTAAAAA-TAAATCTATTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTA-TACTAC-TTG *** * * * 24686 AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAACT-TTTCTATTCAT 1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT * ** * * * * 24750 ACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTGTTAATA-TTTAGACAACTAATTAGTAGAAG 66 ACAAGCTT-TTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTA-ACAATTAATAAGTAAAAG * * * 24813 ATTTAAAAAATAAATCTATTTAACGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTG 129 ATTT-AAAAATAAATCTATTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTACTTG * * * * * 24866 AACAATTATTTTTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT 1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT * 24931 ACAAGCTTTTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAAAA 66 ACAAGCTTTTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGT-AAAAGA * * * * * 24996 TTTAAATATAAATATATTTACGGAACAAGTTCTAATTGTCATAACTACTTG 130 TTTAAAAATAAATCTATTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTACTTG ** * 25047 AGTAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT 1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT 25102 ATAAATTCAT Statistics Matches: 479, Mismatches: 97, Indels: 42 0.78 0.16 0.07 Matches are distributed among these distances: 179 3 0.01 180 144 0.30 181 318 0.66 182 14 0.03 ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (178 bp): AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT ACAAGCTTTTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAGAT TTAAAAATAAATCTATTTACGAACAAGTTCAAATAGTTATACTACTTG Found at i:25366 original size:286 final size:286 Alignment explanation

Indices: 24847--25387 Score: 684 Period size: 286 Copynumber: 1.9 Consensus size: 286 24837 GAATAAATTC * * 24847 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAA 1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTATTTTGTCATAA * * * * * * 24912 AACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTTTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAA 66 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAA * * * ** 24977 CAATTAATAAGTAAAAAAATTTAAATATAAATATATTTACGGAACAAGTTCTAATTGTCATAACT 131 CAATTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAAATATATTTACGAAACAAGTTCAAATAATCAT-ACT * * * 25042 ACTTGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTATAA 195 ACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTATAA 25106 ATTCATATAGGCTTGCTAAACAAGCTT 260 ATTCATATAGGCTTGCTAAACAAGCTT * * 25133 AAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTT-TTGA-TCTTTTATTTTGTCA 1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATT-ACT-TTTTATTTTGTCA * * 25195 TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG-TTTATTTAGAATAAAACAATACTAATTTATTAATATT 63 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTT-TTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAATATT ** * * * * * 25259 CTCAA-AATTAATAAGT-AGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAATC 127 -TCAACAATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAAATATATTTACGAAACAAGTTCAAATAATC * * 25322 AT-GTCCGTTCGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAAT 190 ATACTAC-TT-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAAT 25386 TG 253 TG 25388 CTTCTATTCA Statistics Matches: 217, Mismatches: 29, Indels: 17 0.83 0.11 0.06 Matches are distributed among these distances: 284 2 0.01 285 15 0.07 286 174 0.80 287 26 0.12 ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.08, T:0.43 Consensus pattern (286 bp): AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTATTTTGTCATAA AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAA CAATTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAAATATATTTACGAAACAAGTTCAAATAATCATACTA CTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTATAAA TTCATATAGGCTTGCTAAACAAGCTT Found at i:25912 original size:21 final size:18 Alignment explanation

Indices: 25878--25922 Score: 54 Period size: 20 Copynumber: 2.3 Consensus size: 18 25868 TTACGACCTT 25878 TTGTTTTGTCATAAAACAA 1 TTGTTTTGTCATAAAA-AA * 25897 TTGTTTTAGTTCATAAAAAC 1 TTGTTTT-G-TCATAAAAAA 25917 TTGTTT 1 TTGTTT 25923 GAAGTAAAAT Statistics Matches: 23, Mismatches: 1, Indels: 3 0.85 0.04 0.11 Matches are distributed among these distances: 19 7 0.30 20 8 0.35 21 8 0.35 ACGTcount: A:0.31, C:0.09, G:0.11, T:0.49 Consensus pattern (18 bp): TTGTTTTGTCATAAAAAA Found at i:26419 original size:179 final size:178 Alignment explanation

Indices: 25982--27849 Score: 433 Period size: 180 Copynumber: 10.5 Consensus size: 178 25972 AAACTATTTT * * * * * * * 25982 CTAAACCAGTTCAATTAGTTACAATCATTTGAACAAATATCAATCTTAAATTGTTATGATC-TTT 1 CTAAACAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAATTGTTATGAACTTTT * * * * * * * 26046 CTTTTGTCAAAAAAAAAAATTGTTTCT-GATCATATAAGTTTATTCGGATAAAAATATACTAATC 65 GTTTTATC-ATAAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCGGATAAAAATATACT-ATC * * * * 26110 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTTAAAATAAATGTGTTTG 127 TAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAATAAATGTGTTTA * * * * * * * 26162 CTAAATCAA-TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAGTTGTT-TTAACATT 1 CTAAA-CAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTGTTATGAAC-TT * * * * 26225 TTG-TTTAGGCATAAAAACTATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGGA-ATAAATACTACT-T 63 TTGTTTTA-TCATAAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGATAAAAATA-TACTAT * * 26287 -TATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTA 126 CTAATAACATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTT--AAAATAAATGTGTTTA * * 26341 TTAAACAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGAACTTTT 1 CTAAACAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTGTTATGAACTTTT * * * * ** 26406 GTTTTATCAT-AAAACAATTGATTCAGTTCACAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACT-T 65 GTTTTATCATAAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC-GGAT-AAA-AATA-TACTAT * ** * * * 26469 TTTTTAATATTTCAAAAATTAGTAAG----AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA 126 CTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-TAAAATAAATGT-GTTTA * * * ** * 26519 -TCAAATC-CGTTCAAATAATTA-TAGCCATTTGAACAA-AATC-A-TT--A-----AT--ACTT 1 CT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTACGA-TTATTTGAACAATTATCTATTTAAATTGTTATGAACTT * * ***** * ** * 26569 TTCATTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTCAAAATACAAA-TTTATT-TAAAATAAAATAGTACT 63 TT-GTTTTATCATAAAAACAATTGTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATTCGGATA-AAAATA-TACT * * * * * ** * * 26631 AATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAATTGATTTAAAAATTAAATATGTTTA 124 -ATCTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAA-TAAATGTGTTTA * * * * * * * * 26684 CCATACTAG-TCTAAATAATTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTGT-AACATT 1 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TGTTTGGTCAT-AAAACAATTGTTTTTG-TCATATAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAAT 64 TGTTTTATCATAAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGATA-AAAAT-ATACT-AT * * * * * * 27167 CTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA 126 CTAATAACATTTCA-AAAATTAAT-AAGCAAAAGATTT-TAAAATAAATGTGTTTA * ** * * * ** 27221 C-AAACAATTTCAAATAGTTTTGACTATTTTTAATAATTATCTATTTTAAATCATTAT-AACCTT 1 CTAAACAAGTTCAAATAGTTACGATTA-TTTGAACAATTATCTA-TTTAAATTGTTATGAA-CTT * * * ** ** ** * 27284 TTGTTTTGTCAT-CAAACAATATGTTCTA-TTCATATTATTTTATTTAGA-ATGAAATAATACTA 63 TTGTTTTATCATAAAAACAAT-TGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGATA-AAAAT-ATACT- * * * * * ** * ** * 27346 ATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTG 124 ATCTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCAA-AAGATTTTAAAATAAATGTGTTTA * * * * * * * * 27402 CTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATATAAACAATTATCAATTTCAAAACT-TTATGACCTT 1 CT-AAACAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAACAATTATCTATTT--AAATTGTTATGAACTT ** * * * * ** 27465 TTGTTTTATCAT-AAAACAAATT-TTTT-GTTTGTACAAGCTTATTTGGTTTAAAATAATAAAAT 63 TTGTTTTATCATAAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGATAAAAAT-ATACTAT * * * * * * * * 27527 TTAATAATATTTCAAAAATCAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA 126 CTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-TAAAATAAATGTGTTTA * * * * * * * 27581 CCGAACCAA-TTC--ATAGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAATTATTAT-AACCT 1 -CTAAACAAGTTCAAATA-GTTACGATTATTTGAACAATTATCTA-TTTAAATTGTTATGAA-CT ** * * * * * 27642 TTTG-TTTATTCAT-AAAACAATTGTTTCGGTTCATATAAGTTTATTCAGA-ATAAATTAAACTA 62 TTTGTTTTA-TCATAAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGGATA-AAAATATACT- * * * * * 27704 ATTTATTAAAATTTGAAAAATTAATAAG-AAAGAGA-TTTAAAAAAAAT-TGTTTA 124 ATCTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAA-AGATTTTAAAATAAATGTGTTTA * * * * ** * * * * 27757 CTGAATAGGTTCAAATAGTCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTT 1 CTAAACAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTGTTATGAACTTTT * 27822 CTTTTATCATAAAAA-AATTGTTTTAGTT 65 GTTTTATCATAAAAACAATTGTTTTAGTT 27850 AACACAGTCT Statistics Matches: 1299, Mismatches: 272, Indels: 237 0.72 0.15 0.13 Matches are distributed among these 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Indices: 26696--28642 Score: 1300 Period size: 357 Copynumber: 5.5 Consensus size: 356 26686 ATACTAGTCT * * * * * * * 26696 AAATAATTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTGTAACATTTTGTTTT-GCATAA 1 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA * * * * 26760 AACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGA 66 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAGA * * * * * 26825 AAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGCTTAGCAAACCAATTCAAACAGTTAAGACT 131 AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTAAGACT * * * * * * 26890 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCTTAAGACAATTATTTCAG 195 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCTTAA-ACAATTATTTCAG * * * * * 26955 CTCATATAAGTTTACTTGGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATT-TTA-TAAGA 259 TTCATATAAGTTTA-TTAGAAT-AAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTATAACAAAGA * * 27018 TATTTAAAAAATAATTCAATTTACCGAACCAGTTC 322 AATTTAAAAAATAATTCAATTTACTGAACCAGTTC * * * * * * ** 27053 AAATAATTGTAACTATTTGAATAATTACCAATTTGAAATTGTTATTACTTTTTGTTTGGTCATAA 1 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA * * * 27118 AACAATTGTTTTTG-TCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTAGA 66 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAGA ** 27182 AAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAATTTCAAATAGTTTTGAC 131 AAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTAAGAC * * * 27245 TATTTTTAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAA-TATGTT 194 TA-TTTGAATAATTATCTATTTTAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTC-TTAAACAATTAT-TT * * * * 27309 CTA-TTCATATTATTTTATTTAGAATGAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAA 256 C-AGTTCATATAAGTTTA-TTAGAAT-AAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TT-ATAA * * * * * 27373 CCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAA-TTGCTGAACCAATTC 316 CAAAGAAATTTAAAAAATAATTC-AATTTACTGAACCAGTTC * * * * * 27414 AAATAGTTATGACTATATAAACAATTATCAATTTCAAAACT-TTATGACCTTTTGTTTTATCATA 1 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCAATTT-AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA * ** * *** * 27478 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* * * * * 27897 TAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGTTAAAATAATTATGG 129 GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAATTCAAATAGTTAAGA * * * * * * * * 27958 CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTCTAACCTTTTATTTCAT-TATAAAACAATTGTT 193 CTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTA-TTATAACCTTTTGTTT--TGTCTTAAACAATTATT *** * * * * * * 28021 TTTTTATCAGACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAA- 255 TCAGT-TCATATAAGTTTA-TTAGAAT-AAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTATAAC * * *** 28084 TAAGAGATTT--AAAA-AA-T-AA---A-TG--CGTTTTC 317 AAAGAAATTTAAAAAATAATTCAATTTACTGAACCAGTTC * ** * * * * 28113 AAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCT-TTTTGACC--TTGTTTTAGTCAT 1 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCAT * * * * * * * * * * * * 28175 AAAATATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAGTAATCCTAATATATTAACATTC 64 AAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT * * * * * * 28239 A-AAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGCTT-ACATAATT 128 AGAAAA-TTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA--TTCAAATAGTT * * * * * * * * * ** 28302 ATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCATTGTGACATTTTG-TTTATCATAAAACAACC 189 AAGACTATTTGAATAATTATC-TATTTTAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTC-TTAAACAATT * ** * * * * 28365 GTTTCAGTAAATACAAGCTTATATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAA-T-T 252 ATTTCAGTTCATATAAGTTTAT-TAGAAT-AAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAT * ** * * 28428 AA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAATCAGTTA 314 AACAAAGAAATTTAAAAAAT-AATTCAATTTACTGAACCAGTTC * * * * * * * * * 28470 AAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATATCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAA 1 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA ** * * * * * 28535 AACAATTGTTTCAGTGCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTC 66 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAAT--AA-AATAATACTAATTTAATAATATTT ** * * * * 28600 CTAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTAC 128 AGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC 28643 TGAATTAGTT Statistics Matches: 1272, Mismatches: 238, Indels: 157 0.76 0.14 0.09 Matches are distributed among these distances: 342 11 0.01 343 46 0.04 344 48 0.04 345 5 0.00 346 60 0.05 347 34 0.03 348 63 0.05 349 4 0.00 350 8 0.01 351 1 0.00 352 9 0.01 353 39 0.03 354 67 0.05 355 98 0.08 356 70 0.06 357 276 0.22 358 103 0.08 359 84 0.07 360 84 0.07 361 147 0.12 362 15 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (356 bp): AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAGA AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAATTCAAATAGTTAAGACTA TTTGAATAATTATCTATTTTAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCTTAAACAATTATTTCAGTT CATATAAGTTTATTAGAATAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTATAACAAAGAAATT TAAAAAATAATTCAATTTACTGAACCAGTTC Found at i:27266 original size:17 final size:17 Alignment explanation

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Indices: 26573--28766 Score: 1420 Period size: 177 Copynumber: 12.3 Consensus size: 177 26563 ATACTTTTCA * ** * * * 26573 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-AAATACAAAT-TTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTT 1 TTTTATCATAAAACAATTG-TTTT-AGTTATACAAGTCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT * * ** * * * 26636 ATTAATATTTCAAGAATTAGTAATTGATTTAAAAATTAAATATGTTTAC-CATACTAG-TCTAAA 64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA-ACTAGTTC-AAA * * * * * * 26699 TAATTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTGTAACATTTTG 127 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTG * * * * * 26750 TTTT-GCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTA 1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTT-ATACAAGTCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA * * * ** * * * * 26813 ATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGCTTAGC-AAACCAATTCA 65 TTAATA-TTTCAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACTAGTTCA * * * * * * * 26877 AACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG 125 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTG * * * * * * * * * * * 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TATTAAAATTTGAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT-AAAAA-AAA-TTGTTTACTGAA-TAGGTT 63 TATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTA-GTT * * * * * 27768 CAAATAGTCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTC 123 CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTG * * 27823 TTTTATCATAAAAAAATTGTTTTAGTTA-ACACAGTCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTA 1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTATACA-AGTCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA * * * * 27887 TTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATTAGTTAAAATAA 65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAA * * * * * * 27952 TTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTCTAACCTTTTA 130 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTG * * * * 28000 TTTCATTATAAAACAATTGTTTT-TTTATCAGACAAG-CTTATTTAAAATAAAATAATACTAATT 1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTAT---ACAAGTCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT * 28063 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA--TG----C-G---T-TTTCAAAT 63 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAAT * ** * * * ** * 28117 AGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTTTGACC--TTG 128 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTG * * * * * * * 28165 TTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATA-TCATACAAG-CTTATTTGGAATAAAGTAATCCTAATA 1 TTTTA-TCATAAAACAATTGTTT--TAGTTATACAAGTCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT * * 28228 TATTAACA-TTCAAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TAAG 63 TATTAATATTTCAAAAA--T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AG * * * 28291 CTT-ACATAATTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATCA-TTGTGACATTTTG 121 -TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTAAAAT-AGTTATGACCTTTTG ** * * * * 28348 -TTTATCATAAAACAACCGTTTCAGTAAATACAAG-CTTATATGGAATAAAATAATACTAATTTA 1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGT-TATACAAGTCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA * * * 28411 TTAATATTTCTAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TCAGTTAAAATA 65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATA * * * * * 28475 ATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATATCAAATTA-TTATGACCTTTTC 129 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAAATAGTTATGACCTTTTG * * * * 28524 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTGCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAAT 1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGT-TATACAAGTCTTATTTGAAAT--AA-AATAATACTAAT * * * * * * 28588 TTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACTGAATTAGTT 62 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A--GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTT * * * * * * * 28653 CAAATAA-TATGGCCATTTTAACAATTAGCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTG 123 CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTG * * * * * 28707 TTTTCTTATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAG-CTTATTTGGAATAAAGTAATACTAA 1 TTTTATCATAAAACAATTG-TTTT-AGTTATACAAGTCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA 28767 CATCAAATGA Statistics Matches: 1613, Mismatches: 288, Indels: 229 0.76 0.14 0.11 Matches are distributed among these distances: 164 8 0.00 165 40 0.02 166 15 0.01 167 40 0.02 168 8 0.00 169 10 0.01 170 10 0.01 171 1 0.00 172 3 0.00 174 9 0.01 175 16 0.01 176 196 0.12 177 316 0.20 178 165 0.10 179 129 0.08 180 228 0.14 181 254 0.16 182 50 0.03 183 75 0.05 184 38 0.02 185 2 0.00 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40 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Indices: 28173--28762 Score: 603 Period size: 183 Copynumber: 3.3 Consensus size: 178 28163 TGTTTTAGTC * * * * ** * 28173 ATAAAATATTTGTTTCATATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAGTAATCCTAAT-A--TATTAAC 1 ATAAAACAATTGTTTCA-GTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATAATTTATTAAT * * * 28235 ATTCAAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGCTTACATAA 65 ATTCTAAAA-TTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAG-TTAAATAA * * * * * 28300 TTATGACTATTTGAACAATTACTTATTTAAAATCATTGTG-ACATTTTGTTTATC- 126 TTATGGCCATTTGAACAATTAC-TATTTCAAATTATTATGAAC-TTTTGTTT-TCT ** * * * 28354 ATAAAACAACCGTTTCAGTAAATACAAGCTTATATGGAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAAT 1 ATAAAACAATTGTTTCAGT-CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATAATTTATTAAT * 28416 ATTTCTAAAATTAATAAG-AA--ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAGTTAAAATAATT 65 A-TTCTAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTT-AAATAATT * * * * 28478 ATGGCCATTTGAACAATTATCTATATCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGT 128 ATGGCCATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTCT * 28530 CATAAAACAATTGTTTCAGTGCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAA 1 -ATAAAACAATTGTTTCAGT-CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATAATTTATTAA * * * * 28595 TATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACTGAATTAGTTCAAATAA 64 TATT-CTAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTT-AAATAA * * 28660 -TATGGCCATTTTAACAATTAGCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTCTT 126 TTATGGCCATTTGAACAATTA-CTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTC-T * 28714 ATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAGTAATA 1 ATAAAACAATTG--TTTCAGTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA 28763 CTAACATCAA Statistics Matches: 342, Mismatches: 46, Indels: 40 0.80 0.11 0.09 Matches are distributed among these distances: 175 3 0.01 176 69 0.20 177 40 0.12 178 6 0.02 179 6 0.02 180 37 0.11 181 48 0.14 182 7 0.02 183 84 0.25 184 37 0.11 185 5 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39 Consensus pattern (178 bp): ATAAAACAATTGTTTCAGTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATA TTCTAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTAAATAATTATG GCCATTTGAACAATTACTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTCT Found at i:29021 original size:15 final size:15 Alignment explanation

Indices: 28997--29041 Score: 58 Period size: 14 Copynumber: 3.1 Consensus size: 15 28987 ACAATGGATG 28997 AAAA-ATGAAAAAAA 1 AAAAGATGAAAAAAA 29011 AAAAGATG-AAAAAA 1 AAAAGATGAAAAAAA * 29025 AAAAGAAAGAAAAAAA 1 AAAAG-ATGAAAAAAA 29041 A 1 A 29042 TGAGAAAACG Statistics Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 4 0.84 0.03 0.12 Matches are distributed among these distances: 14 15 0.56 15 5 0.19 16 7 0.26 ACGTcount: A:0.84, C:0.00, G:0.11, T:0.04 Consensus pattern (15 bp): AAAAGATGAAAAAAA Found at i:30182 original size:22 final size:22 Alignment explanation

Indices: 30157--30204 Score: 53 Period size: 22 Copynumber: 2.2 Consensus size: 22 30147 TGGGAATTTT 30157 TGAGAACTC-AAATGAGAATCTC 1 TGAG-ACTCAAAATGAGAATCTC ** * 30179 TGAGTTTCAAAATGAGAATCTT 1 TGAGACTCAAAATGAGAATCTC 30201 TGAG 1 TGAG 30205 GAGTGAAACC Statistics Matches: 22, Mismatches: 3, Indels: 2 0.81 0.11 0.07 Matches are distributed among these distances: 21 2 0.09 22 20 0.91 ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.21, T:0.29 Consensus pattern (22 bp): TGAGACTCAAAATGAGAATCTC Found at i:30780 original size:41 final size:41 Alignment explanation

Indices: 30718--31051 Score: 472 Period size: 41 Copynumber: 8.1 Consensus size: 41 30708 GATTGTCAAA * * * 30718 GAGCCATTTACTTTTCAAAGTCATGGTGTCTCTGTTTAGAG 1 GAGCAATTTACTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG * * 30759 GAGCAATTTACTTTTCAAAGTCATGGTGCCTCTATTTAGAG 1 GAGCAATTTACTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG * * 30800 GAGCATTTTACTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG 1 GAGCAATTTACTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG * * 30841 GAGCAATTTAATTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTATTTAGAG 1 GAGCAATTTACTTTT-CAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG * * 30883 GAACAATTTATTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG 1 GAGCAATTTACTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG * 30924 GAGCAATTTA-TATTTCAAAGTCCTGGTGCCTCTGTTTAGAG 1 GAGCAATTTACT-TTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG * * 30965 GAGCAATTTACTTTCCAAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAA 1 GAGCAATTTACTTTTC-AAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG * *** 31007 GAGCAATTTACTTTCCAAAGTCGTTAAGCCTCTGTTTAGAG 1 GAGCAATTTACTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG 31048 GAGC 1 GAGC 31052 TTTGATAAAA Statistics Matches: 266, Mismatches: 23, Indels: 8 0.90 0.08 0.03 Matches are distributed among these distances: 40 1 0.00 41 187 0.70 42 78 0.29 ACGTcount: A:0.25, C:0.18, G:0.22, T:0.36 Consensus pattern (41 bp): GAGCAATTTACTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG Found at i:30903 original size:83 final size:81 Alignment explanation

Indices: 30718--31051 Score: 461 Period size: 83 Copynumber: 4.0 Consensus size: 81 30708 GATTGTCAAA * * * * * 30718 GAGCCATTTACTTTTCAAAGTCATGGTGTCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTACTTTTCAAAGTCAT 1 GAGCAATTTACTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTA-TTTTCAAAGTCGT 30783 GGTGCCTCTATTTAGAG 65 GGTGCCTCTATTTAGAG * 30800 GAGCATTTTACTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTAATTTTCCAAAGTCG 1 GAGCAATTTACTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTT-ATTTT-CAAAGTCG 30865 TGGTGCCTCTATTTAGAG 64 TGGTGCCTCTATTTAGAG * * * * 30883 GAACAATTTATTTTTCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTATATTTCAAAGTCCT 1 GAGCAATTTACTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTAT-TTTCAAAGTCGT * 30948 GGTGCCTCTGTTTAGAG 65 GGTGCCTCTATTTAGAG * * 30965 GAGCAATTTACTTTCCAAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAAGAGCAATTTACTTTCCAAAGTCG 1 GAGCAATTTACTTTCC-AAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTA-TTTTCAAAGTCG *** * 31030 TTAAGCCTCTGTTTAGAG 64 TGGTGCCTCTATTTAGAG 31048 GAGC 1 GAGC 31052 TTTGATAAAA Statistics Matches: 226, Mismatches: 21, Indels: 9 0.88 0.08 0.04 Matches are distributed among these distances: 82 88 0.39 83 137 0.61 84 1 0.00 ACGTcount: A:0.25, C:0.18, G:0.22, T:0.36 Consensus pattern (81 bp): GAGCAATTTACTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTATTTTCAAAGTCGTG GTGCCTCTATTTAGAG Found at i:30953 original size:124 final size:124 Alignment explanation

Indices: 30718--31051 Score: 469 Period size: 124 Copynumber: 2.7 Consensus size: 124 30708 GATTGTCAAA * * * * * 30718 GAGCCATTTACTTTT-CAAAGTCATGGTGTCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTACTTTTCAAAGTCA 1 GAGCAATTTAATTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTACTTTTCAAAGTCG * * 30782 TGGTGCCTCTATTTAGAGGAGCATTTTACTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAG 66 TGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCATTTTACTTTCCAAAGTCCTGGTGCCTCTGTTTAGAG * * * 30841 GAGCAATTTAATTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTATTTAGAGGAACAATTTATTTTTCAAAGTCG 1 GAGCAATTTAATTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTACTTTTCAAAGTCG 30906 TGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTATA-TTT-CAAAGTCCTGGTGCCTCTGTTTAGAG 66 TGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGC-ATTT-TACTTTCCAAAGTCCTGGTGCCTCTGTTTAGAG * * * 30965 GAGCAATTT-ACTTTCCAAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAAGAGCAATTTACTTTCCAAAGTC 1 GAGCAATTTAATTTTCC-AAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTACTTTTCAAAGTC *** 31029 GTTAAGCCTCTGTTTAGAGGAGC 65 GTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGC 31052 TTTGATAAAA Statistics Matches: 188, Mismatches: 19, Indels: 7 0.88 0.09 0.03 Matches are distributed among these distances: 123 19 0.10 124 160 0.85 125 7 0.04 126 2 0.01 ACGTcount: A:0.25, C:0.18, G:0.22, T:0.36 Consensus pattern (124 bp): GAGCAATTTAATTTTCCAAAGTCGTGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCAATTTACTTTTCAAAGTCG TGGTGCCTCTGTTTAGAGGAGCATTTTACTTTCCAAAGTCCTGGTGCCTCTGTTTAGAG Found at i:31071 original size:8 final size:8 Alignment explanation

Indices: 31058--31087 Score: 60 Period size: 8 Copynumber: 3.8 Consensus size: 8 31048 GAGCTTTGAT 31058 AAAAAACA 1 AAAAAACA 31066 AAAAAACA 1 AAAAAACA 31074 AAAAAACA 1 AAAAAACA 31082 AAAAAA 1 AAAAAA 31088 AAAGGGTTGC Statistics Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0 1.00 0.00 0.00 Matches are distributed among these distances: 8 22 1.00 ACGTcount: A:0.90, C:0.10, G:0.00, T:0.00 Consensus pattern (8 bp): AAAAAACA Found at i:31238 original size:127 final size:129 Alignment explanation

Indices: 31099--31339 Score: 398 Period size: 127 Copynumber: 1.9 Consensus size: 129 31089 AAGGGTTGCC * * 31099 TCTATTTGGAGGAGCTTTGTTTATGTTTCTCAAAGTCATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCTTTGA 1 TCTATTTAGAGGAGCTTTGTTTATGTTTCTCAAAATCATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCTTTGA * * * 31164 TC-AAATTTAAAAAAAAAAAA-AAGCAAAAAAAAA-GGGAGAAAAAAAAACAAAAAAAAATTACT 66 CCAAAATTAAAAAAAAAAAAAGAAGCAAAAAAAAATGGG-CAAAAAAAAACAAAAAAAAATTACT * 31226 TCTATTTAGAGGAGCTTTGTTTATGTTTCTCAAAATCATTGAGCCTCTGCTTAGAGGAGCTTTGA 1 TCTATTTAGAGGAGCTTTGTTTATGTTTCTCAAAATCATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCTTTGA 31291 CCAAAATTAAAAAAAAAAAAAGAAGCAAAAAAAAATGGGCAAAAAAAAA 66 CCAAAATTAAAAAAAAAAAAAGAAGCAAAAAAAAATGGGCAAAAAAAAA 31340 TCAGTTTAGT Statistics Matches: 105, Mismatches: 6, Indels: 4 0.91 0.05 0.03 Matches are distributed among these distances: 127 63 0.60 128 17 0.16 129 22 0.21 130 3 0.03 ACGTcount: A:0.46, C:0.12, G:0.16, T:0.26 Consensus pattern (129 bp): TCTATTTAGAGGAGCTTTGTTTATGTTTCTCAAAATCATTGAGCCTCTACTTAGAGGAGCTTTGA CCAAAATTAAAAAAAAAAAAAGAAGCAAAAAAAAATGGGCAAAAAAAAACAAAAAAAAATTACT Found at i:31320 original size:14 final size:14 Alignment explanation

Indices: 31302--31340 Score: 51 Period size: 14 Copynumber: 2.7 Consensus size: 14 31292 CAAAATTAAA * 31302 AAAAAAAAAAGAAGC 1 AAAAAAAAATG-AGC * 31317 AAAAAAAAATGGGC 1 AAAAAAAAATGAGC 31331 AAAAAAAAAT 1 AAAAAAAAAT 31341 CAGTTTAGTC Statistics Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 1 0.88 0.08 0.04 Matches are distributed among these distances: 14 12 0.55 15 10 0.45 ACGTcount: A:0.77, C:0.05, G:0.13, T:0.05 Consensus pattern (14 bp): AAAAAAAAATGAGC Found at i:31554 original size:23 final size:22 Alignment explanation

Indices: 31503--31559 Score: 71 Period size: 22 Copynumber: 2.6 Consensus size: 22 31493 TTTATTTTAG 31503 ATTTTTTTATTTCATATTTATC 1 ATTTTTTTATTTCATATTTATC * 31525 ATTTTTTTATTTTATGATTTAT- 1 ATTTTTTTATTTCAT-ATTTATC * * 31547 TTTTTTTTCTTTC 1 ATTTTTTTATTTC 31560 TTTTGATTAT Statistics Matches: 30, Mismatches: 4, Indels: 2 0.83 0.11 0.06 Matches are distributed among these distances: 22 24 0.80 23 6 0.20 ACGTcount: A:0.18, C:0.07, G:0.02, T:0.74 Consensus pattern (22 bp): ATTTTTTTATTTCATATTTATC Found at i:33525 original size:5 final size:5 Alignment explanation

Indices: 33515--33558 Score: 56 Period size: 5 Copynumber: 8.8 Consensus size: 5 33505 TTAGTACTTT 33515 TTTTA TTTTA TTTTTA TTTT- TATTTA TTTTA TTTTA -TTTA TTTT 1 TTTTA TTTTA -TTTTA TTTTA T-TTTA TTTTA TTTTA TTTTA TTTT 33559 TTCTTCTTAA Statistics Matches: 35, Mismatches: 0, Indels: 8 0.81 0.00 0.19 Matches are distributed among these distances: 4 5 0.14 5 24 0.69 6 6 0.17 ACGTcount: A:0.18, C:0.00, G:0.00, T:0.82 Consensus pattern (5 bp): TTTTA Found at i:33526 original size:21 final size:21 Alignment explanation

Indices: 33501--33548 Score: 62 Period size: 21 Copynumber: 2.3 Consensus size: 21 33491 ATATCTAGAA 33501 TTATTTAGTACTTTT-TTTATT 1 TTATTT-GTACTTTTATTTATT * * 33522 TTATTTTTATTTTTATTTATT 1 TTATTTGTACTTTTATTTATT 33543 TTATTT 1 TTATTT 33549 TATTTATTTT Statistics Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 2 0.86 0.07 0.07 Matches are distributed among these distances: 20 6 0.25 21 18 0.75 ACGTcount: A:0.19, C:0.02, G:0.02, T:0.77 Consensus pattern (21 bp): TTATTTGTACTTTTATTTATT Found at i:33540 original size:10 final size:9 Alignment explanation

Indices: 33512--33560 Score: 55 Period size: 9 Copynumber: 5.6 Consensus size: 9 33502 TATTTAGTAC 33512 TTTTTTTAT 1 TTTTTTTAT * 33521 TTTATTT-T 1 TTTTTTTAT * 33529 TATTTTTAT 1 TTTTTTTAT * 33538 TTATTTTAT 1 TTTTTTTAT * 33547 TTTATTTAT 1 TTTTTTTAT 33556 TTTTT 1 TTTTT 33561 CTTCTTAAAT Statistics Matches: 31, Mismatches: 8, Indels: 2 0.76 0.20 0.05 Matches are distributed among these distances: 8 6 0.19 9 25 0.81 ACGTcount: A:0.16, C:0.00, G:0.00, T:0.84 Consensus pattern (9 bp): TTTTTTTAT Found at i:33549 original size:21 final size:19 Alignment explanation

Indices: 33512--33559 Score: 69 Period size: 20 Copynumber: 2.4 Consensus size: 19 33502 TATTTAGTAC 33512 TTTTTTTATTTTATTTTTAT 1 TTTTTTTATTTTA-TTTTAT 33532 TTTTATTTATTTTATTTTAT 1 TTTT-TTTATTTTATTTTAT 33552 TTATTTTT 1 TT-TTTTT 33560 TCTTCTTAAA Statistics Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 4 0.87 0.00 0.13 Matches are distributed among these distances: 20 15 0.58 21 11 0.42 ACGTcount: A:0.17, C:0.00, G:0.00, T:0.83 Consensus pattern (19 bp): TTTTTTTATTTTATTTTAT Found at i:33626 original size:58 final size:56 Alignment explanation

Indices: 33567--33795 Score: 253 Period size: 59 Copynumber: 3.9 Consensus size: 56 33557 TTTTCTTCTT * * * 33567 AAATAAATTTTCAAAAAAGGTTTTTTTTGAGGAAAAGTTGAAAGCATCAATTTTCCTTA 1 AAATAAATTTTCAAAAAA---TATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTA *** * 33626 AAGATAAATTTTC-AAAGGGATTTTTGAGAAAAAGTTAAAAGTATCAATTTTCCTTAA 1 AA-ATAAATTTTCAAAAAATATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTT-A * * * 33683 AAATAAGTTTTCAAAAAATAAATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTTCTCA 1 AAATAAATTTTCAAAAAAT--ATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTA * * * 33741 AAATTAAAGTTTCAAAAGAATATTTTTGGGGAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCC 1 AAA-TAAATTTTCAAAA-AATATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCC 33796 CTCCACATAA Statistics Matches: 144, Mismatches: 19, Indels: 15 0.81 0.11 0.08 Matches are distributed among these distances: 56 41 0.28 57 6 0.04 58 35 0.24 59 49 0.34 60 13 0.09 ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.14, T:0.36 Consensus pattern (56 bp): AAATAAATTTTCAAAAAATATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCAATTTTCCTTA Found at i:33676 original size:27 final size:27 Alignment explanation

Indices: 33645--33736 Score: 78 Period size: 27 Copynumber: 3.2 Consensus size: 27 33635 TTTCAAAGGG 33645 ATTTTTGAGAAAAAGTTAAAAGTATCA 1 ATTTTTGAGAAAAAGTTAAAAGTATCA * * * * 33672 ATTTTCCTTAAAAATAAGTTTTCAAAA-AATAA 1 ATTTT--TGAGAAA-AAG--TT-AAAAGTATCA * 33704 ATTTTTGAGAAAAAGTTGAAAGTATCA 1 ATTTTTGAGAAAAAGTTAAAAGTATCA 33731 ATTTTT 1 ATTTTT 33737 CTCAAAATTA Statistics Matches: 49, Mismatches: 9, Indels: 14 0.68 0.12 0.19 Matches are distributed among these distances: 26 3 0.06 27 16 0.33 29 8 0.16 30 8 0.16 32 10 0.20 33 4 0.08 ACGTcount: A:0.46, C:0.05, G:0.11, T:0.38 Consensus pattern (27 bp): ATTTTTGAGAAAAAGTTAAAAGTATCA Found at i:34761 original size:181 final size:179 Alignment explanation

Indices: 34551--48282 Score: 3380 Period size: 181 Copynumber: 75.6 Consensus size: 179 34541 TTAATTATTG * * * * 34551 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTTTTTTATTACAAACCAAAAGGTCAT 1 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAA-CAAAAGGTCAT * * * * ** 34616 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAACATGTT 65 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAATT * * * * * 34681 TATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAGTA 129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * * * 34732 TTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACTATTATTTTATAACATAACAAAAAGTCGT 1 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACA-AACAAAAGGTCAT ** * * * * * * * * * 34797 AATAATTTGCAAGAAATAATTGCTCAAGTAGTCATAACTATTTGAAATGGTTTGTTAAGC-AATT 65 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAAATT * * 34861 TACTTTTTATATCTCTTA-TTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA 129 TATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * * * * * * 34912 TTATTTT-ATTTCGAACAAACTTATATTACCAAAAAAAATTGTTTTATGA-AAA-AAAAAGTAAT 1 TTATTTTAATTT-GAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAACAAAAGGTCAT * * * * * * 34974 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATTCTTTGAACTGGTTCGGTAAATAGAA- 65 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACA-AAT * * * ** * 35038 TTATTTTCTAAATCTTTTACTTATAAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTT 128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * *** * * * * * 35090 TTATTGTACTCCAAATAAGCTTCTAT-AAGTTGAAAAA-ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGC 1 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAA---CAAAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGT * * *** * 35153 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC--ATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAATAA 62 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACAA * * * * * 35216 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTTTTTAATTTTATTATATTAGTA 126 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA--TTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * * * * * * * 35272 CTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTGTTTCAAGACATAATAAAAGGTTAT 1 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* * * 46558 GTTATTTT-ATTTCGAATAAG-TATGTATGAACTGAAACAGTTATCTCATGACTAAACAAAAGTT 1 -TTATTTTAATTT-GAATAAGCT-TATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGT * * * * * * * * * 46621 CAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAAT-TTGAACTATTTGAACTGGCTCAGCAAACA 62 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACT-GTTCGGTAAACA * * * ** * * * 46685 CATTTTTTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTGGAATATTATTAATTTAGAA 125 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * *** * * * * * 46740 ATACTTTACTCCAAATAAGTTTCTATGAACAAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAGATTA 1 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAAC-AAAAACAATTATTTTATGACAAACA-AAAGGTCA * * * * * 46804 TAATGATTT-AAGATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGCTTC-ATAAACAG 64 TAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTCGGTAAACAA * * * * 46867 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-GTTATTCATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTA 126 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA ** ** * * * * * 46917 TTATTTTGTTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAT 1 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCAT * * * * * ** 46982 AATGATTTGAAATAGATAATAGTTCTAATGGACATGAA-TATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAAT 65 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAAT ** * * 47046 TTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAAAATAATAAT-AATTAGTA 128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * * * ** 47097 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCAT 1 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCAT * * * * * * * * 47162 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATAGTTATAAACTATGTGAACTTGCTGGGTAAACATAT 65 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAAT * * ** * 47227 TTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAG-A 128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * ** * * 47278 ATATTTT-ATTCTGAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAAGATCA 1 TTATTTTAATT-TGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATG-ACAAACAAAAGGTCA * * * * ** * 47342 TAATGACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAGTTGAATGTGTTTAG-AAACCATA 64 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCGGTAAA-CAAA * * * * * * 47406 TTTATTCTTTGAAT-TTTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTCA-TA 127 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATT-AGTA ** ** * * 47458 TTATTTT-ATTCAAAATAAGCTTCCATGAACAAAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTA 1 TTATTTTAATT-TGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCA * * * * * * ** * * 47522 TAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAATCATAGCTATTTGAATATGTTCTATTAACAGAT 64 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCGGTAAACAAAT * * * 47587 TCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA 128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTA * * ** * * * * 47639 TTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTATATGACCTGAAACAATTATTTTGTTACAAAACAGAAGGCCA 1 TTATTTTAATTT-GAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCA * * * * * * * * * 47703 CAATGTTTTGAAATAAATAATTAGCT-AAACAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATA 64 TAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAA * * ** * * 47767 TTTATTTTTTAAATCT-TATACTTATTAACTATCAAAATATTAATAAATCAATA 127 TTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * 47820 TTATTTTAATTTTAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATA-GTCA 1 TTATTTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAA-AGGTCA * * * *** * * * 47884 TAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAAGGTTTGAACTTGTTTGGTAAGCAGAT 64 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACAAAT * * * * * 47949 TTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCTT-AATATTACTAAATTTGTA 128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTTAAATATTAATAAATTAGTA * * * * 48001 TTATTTTAA-TCGAATTAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AGATCATTTTATGACAAAACAAAAGCT 1 TTATTTTAATTTGAA-TAAGCTTATATGAACA-AAAACA-ATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGT * * * * * * * * 48064 AATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTTAAATAAG-CATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACA 62 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGGTAAACA * * * * * * * 48128 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Indices: 37140--41470 Score: 1874 Period size: 360 Copynumber: 12.1 Consensus size: 357 37130 ACCTCTTATG * * * ** * 37140 ATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAAATTATATTAACAAAA 1 ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGCATAAACAAAA * * * * * * ** 37204 ACAATTGTTTAATGACAAAACAAAAAGTAATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AGTT 65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGA-AC * * * * *** * * * * * * 37268 ATAATTATTTGAACTAGTTTAGTGAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGA 129 ATAATTATCTAAACTACTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG * * * * * * * * 37333 AATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCGAATAAGCTTTTATGAGCTAAAATATTTATTTTAT 194 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGC-TTTATGA-ATAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * * * 37398 AACAAAGCAAAAGGTTATAA-AATTTTAAACTAAATA-ATTGT-TCATATAGTCTTAA-TTTTTG 257 GACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAA-TAGATATA-TGTCT-AAATAGTCATAACTATTTG ** * 37459 AA-TTGATTCAGTAAACGGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTAGTT 318 AACTT-ATTCAGTAAATAGATTTTATTTTTTAAA---TTTACTT 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* * ** * * * * * 42284 TGTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATGATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC 505 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT * * * * * * * ** * 42348 AAATAACCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTT 570 GAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAA--TA--TCATAA----C-G * * * * * * 42413 AGTTATTAATTTTTGA-AATACTATT-AGATTTAGT-ATTACTTTATTCTAAAGAAGCTTGTATC 625 A-TT-TGAA--ATAGATAAT--TGTTCA-A-ATAGTCATAAC--TATT-T---GAA--TTGT-TC ** * * * * * *** ** 42475 AACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAGTT 673 AGTAAACAGATTTATTTTTTAA-ATCTC-TTA--TTAT--TAATTT----TT * * ** ** * * * * 42527 TACA-ATTGTTCAAA-TAGTCA-TA-ACTATTT-G---AA-CTAGT-TCAAT--AAACATTTATT 1 AAAATATTAAT-AAATTAGT-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTT * *** * * * * * * ** * 42580 TT-T--AAATCTTTA-CTTATTAAT-TTTTGGAAAGATATAAATTAGTATTATTTTATTGCA-AA 64 TTATGAAAAACAAAAGGTCA-TAATGATTT-GAAATAGAT-AATTA-T-TCA-AATAGT-CATAA * * *** ** ** * * 42639 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* * * * * 44595 TTCAAAATAAGCTTTTATGAATAGAAAATATTATTTTGTGAGAAAACAAA-AGGTTATAGCGATT 566 TTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAACGATT * * * * * * * * * * * 44659 TCAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAATTATTTAAACTTATTCAATAAATAGAATCATTTTT 628 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTT 44724 TAAATCTCTTTATTATTAATTTTT 692 TAAATCTC-TTATTATTAATTTTT * * * * * * * * 44748 AGATTATTTATAAATTAGTATTAGTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTCTTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT * * ** * * * 44813 ATAACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGA 66 ATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * * 44878 TCTAGTTC-AGTAAACATATTTATGTTTT-AAATTTTTTACTTATTAATGGTT-GAAATATTAAT 130 ACTTGTTCGA-TAAAAAGATTTAT-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAAT-TTTAGAAATATTAAT ** * ** * ** * * 44940 AAATTAGTATTATTTTTATTT-GGATAAGCTTGCATAAACAGAAACAATTGTTTTAAAATAGAAC 192 AAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACA-AAA-AATTGTTTTATGACAAAAC * 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TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTG * * * ** * * 48196 AATAAGCTTAG-ATGAAC-TGAAATAACTT-TTTTATGTCAAACCTAAAGGTTATAACAATTTGA 571 AATAAGCTT-GTATGAACAT-AAA-AAATTATTTTATGACAAA--AAAATATCATAACGATTTGA * * * ** 48258 AATAGATAATTATTCAAATA--C-T--C-A--TG-ACTGTT---T---C--ATCTAGTTTGGTAA 631 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAA * * * * 48306 ATAT-AT-TTATTAATTGTC 695 ATCTCTTATTATTAATTTTT * * * ** * * * * * 48324 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATATGCTCATATGAACAAAAACTATTATTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * * * * ** * 48388 TATAACAAAATAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAGTAGTCATAACTATTTG 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * 48453 AACTAGTTTGATAAACAAG-TTTATTTTTTATATC---T-CTTATTAACTTTTA-AAATATTAAT 129 AACTTGTTCGATAAA-AAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAAT * ** * * * * 48512 AGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTGATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATA 192 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAC-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACA **** ** *** * * * * ** * * * * * 48577 AAACCAAATAACAATCCAAAATCGATAATTGCTCAAAGAGTTGTAATTATTT-AAATTGGTTAGG 255 AAAAGTCATAATGATTTGAAAT-AAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGA * * * ** * * * 48641 TAAGCACAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTG 318 TAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * * 48705 TTTTATTCTG-ATTAAGCTAT-TGTGAATTGAAA-AATTTATTTTATAACAAAACAAAA----A- 381 TTTTAAT-TGAAATAAGCT-TGTATGAATAGAAATAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT * * * ** * * * ** 48762 CT-ACTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTTGAATTGGTT-AGGCCAAACAAAT 443 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA--ATAAACAAAT * * * * 48825 TTATTTTTTAATTCTCTT-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCCG 506 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG * * * * * * * 48889 AATAAGCTTGTATGATCA-AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGTTTTGAAG 571 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TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTT * 49734 TTAAATCTCTTACTTGTTAATTTTT 691 TTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * 49759 GAAATATT-ATAAAATTACTATTATTTTTAATT-GAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTT 1 AAAATATTAAT-AAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTT * * * * * * 49822 TTATGACAAAAC-ATAGATCTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT 64 TTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * ** * 49886 GAACTAGTTTGGTAAATAA-ATTTATTTTTTAAATCTGCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT 128 GAACTTGTTCGATAAA-AAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAT * * * * * 49950 AAACTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA 192 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAC-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACA * * * ** * * * * * * 50015 AAAGGCCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAA-CGGCTATAATTATTTTAACTAATTTGA 255 AAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTATTCGA * ** 50079 TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAC-TAGTT-AATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTAT 318 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* 51698 TTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTACTAATTTTTTGAATGTTAACAAATTAGTATTTTTTTTATTC 506 TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTC ** * * * ** * * 51763 CAAATAAGCAAT-TATGAGC-TAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTG 569 TGAATAAGC-TTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTATGAC-AAA-AAAATATCATAACGATTTG * * * * * * * * * 51826 AAATAGATAACTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTA 630 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTA 51891 AATCTC---TTATTAATTTTT 694 AATCTCTTATTATTAATTTTT * ** * * * * 51909 AGAATATTGTTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTA-CAATCA-AAACCAATAG- 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAA-CAATTGT * * * * * 51970 TTTATGATAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAAT-GTCATAACTA-T 63 TTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * * * * 52032 TGAA-TTGGTT-TAGAAACAGTTTTAATTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTA 127 TGAACTT-GTTCGATAAAAAGATTT-ATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTA * * * *** ** * * 52094 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53315 AATCTCTTACTCATTAATTTTT 694 AATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * ** * 53337 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTATATGAACT-G-ATTAATTGCTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTT * * ** * * * * 53400 TATGATGAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTACTAAAATAGTTATGACTATTTG 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * 53465 AACTTATTTC-ATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCGACATATTAATA 129 AACTT-GTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATA * * * * * ** * * 53529 AACTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGCATAAATGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA 193 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAA-CAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAA * ** ** * * * 53594 AAAATTGTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGGTA 256 AAAGTCATAATGATTTGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATA * * 53659 AACAAATTTATTTTTGAAATCTTTTACTTATT-AATTGTTTGAATATTAATAAATTTA-TTTTAT 320 AACATATTTATTTTT-AAATCTTTTACTTATTAAATT-TTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTAT * * * * ** * 53722 TTTAATTAAAAGAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAATATTATAGC 382 TTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA-T * * * * * * * 53787 GATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAAT-AACAGATTCAG 445 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAATTTAT * ** * ** 53851 TTTTTAAA--T-AT-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAAAATTATGTTATTCCAAATA 510 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA * * * ** * * ** ** * * * 53912 AGCTTGTACGAATATAAACAATTATTCAAATAGTCATAACTAT-TTGT-ACTAGTTAGGCTAATA 575 AGCTTGTATGAACATAAAAAATTATT-TTAT-GACAAAAAAATATCATAACGA-TT-TG-AAATA * * * * * * * * 53975 GATTCATTTTTTAAAT--CCATTACT-TATT-AATT-TTCATAATATTAAAAAATTAGCATTACT 635 GA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAATTGTTC--AGTA--AACAGA-T----TTA-T * * * ** 54035 TTATTCTGAATAAGACTGTATCAATAGAAACAATTGTTT 688 TT-TT-T--A-AA-TCTCT-T--AT--TATTAATT-TTT * * * *** ** * * 54074 --AATGA-TAAAAAAATGGTCA-TA-ACGATTT-GAAATAAATAATTGTTTAAATTGTTATAACT 1 AAAAT-ATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCG-AAT-AA-GCTTGTATAAATAG--A-AAC- * * ** ** ** ** * * * * ** * 54133 AGTTGAATTGGTTTAGTA-AGTAGAT--TTAT-TTTTTAAATCTCTTATTAATT-TTCAAAATAT 57 AATTG-TTTTATGAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA--T-AGA-TAATTATTC-AAATAG * * ** * * **** * * * 54193 TAATAAATTAATATT-ATTTTGTTCCA-AACAAA-CTTATATGAACAAAAACATTTT-TTTATGA 116 TCAT-AACT-AT-TTGAACTTGTTCGATAA-AAAGATT-TATTTTTAAAATC-TTTTACTTATTA **** * * * * 54254 CAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATATTATTCATATAGCCTT-AATTATTTGAAC- 175 -ATTTTAGAAA--T-AT--T-A-ATAAATTAG-TATTATT--T-TA--TTTCAA--A--TAAACT * * ** * **** * *** * 54316 TAGTTTG-GCAAACAAATT-TATTT-T-TTAAATCTCTTAGT--T-ATTATTTTTCAT-AATATT 222 TA-TATGAACAAA-AAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAAATT * * * * ** ** 54373 ATT-ATATTAGT-ATTATATTATTCTGAA-TAAGCTT-GTATAAACATAAATAGTTTTTTTATGA 284 GTTCA-AATAGTCA-TA-ACTATT-TGAACTTA--TTCG-ATAAACATATTTA-TTTTTAAAT-- *** ** * *** ** *** * 54434 C-AAAACAAAGGTTATAATAATTTGAAATATATAATTTTTTAAAAAGTTATAACCATTTG-AAT- 339 CTTTTACTTA--TTA-AAT-TTTTG-AATAT-TAATAAATT-AGTA-TTAT-TTTAATTGAAATA * * * * ** * ** *** * ** 54496 TGGTT-T-TGTAA-ACAAATTTATT-TTTTAAATTTCCTACTCATTAATTTTTGAAAT-ATTAAA 395 AGCTTGTATG-AATAGAAA-TAATTGTTTT--A-TGACAAAACA--AAAGGTT-ATATGATTTGA * * * * * * * * 54556 AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTATACGA--TGAACAAAAATTGTTTTATGACAAAAC 452 AA-TAG-A-TA-ATTGTT-CAAATAGTCATA-ACTATTTGAAC-----TAG-TTCA--A-TAAAC * * * * * * 54619 AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATGGCCATAATTATTT-AAACTAATTT 502 -AAA-TT--T-AT-TTTTTAAAT--CT-CTTACTT---AT-----TAATT-TTTGGAA-T-A-TT * * * * ** * * * 54682 GATAAACTGATTTATT-TTTTAAATCT--CCAA-CTT-T-TCAACTTTTAAAATATTAATAGCCT 546 AATAAA-TTA-GTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAAC--ATAAAAAATT-AT----T * * ** ** * * ** * 54741 TTAGTTAGGTA-AAAATAAGAGTGTC-TACCTCTATT-CTATGAGGTAA-AG--CCGAGAG-CAT 601 TTA--T--G-ACAAAA-AA-A-TATCATAACGAT-TTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * ** *** * * * 54799 GAGAGCCT-TTT-CA--GCT-AGCCTATATAGCTGTGCCTTGTTTGGCACCT-TTCCTTCACTTG 656 -A-A--CTATTTGAATTGTTCAG--TAAACAGAT-T-TATT-TTTTAAATCTCTT-ATT-A-TTA * 54858 CTTCCTTGCAT 709 ATT--TT---T ** ** * *** * * 54869 GGACAGCTACCAAGCCCAAAATCT-GTTCATGCTAAGATCAAAAAGGATGCAAAAGTAATATTAT 1 --A-AAATATTAA----TAAAT-TAG-T-AT--T---AT--TTTA--TTTC----G-AATA--A- ** * * * * * * 54933 TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATTATAAA-ACATAAG--GTCATA 39 GCT-T---GTATAA------AT---A-GAAACAATTGTTTTATGAAAAACA-AAAGGTCAT-A-A * * * * * * * * 54995 ATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTGACTATTTGAATTTATTCGGTAAACA-ATTT 87 -TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAAAAGATTT * * * * 55059 -GTTTT--AAT-TTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTT 151 ATTTTTAAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTC * * * * * * * * * 55118 GAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAA 213 AAATAAACTTATATGAAC--AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA * * * * * * ** * 55183 TAGAAAATTGCTCTAATAGTCTTAACTGTTTGAA-TTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTAAAT 276 TA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACATATTTATTTTTAAAT * * * ** * * * ** * 55247 CTATTACTTATT-AATTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTAC 339 CTTTTACTTATTAAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTAT * * * * * * * * 55311 AAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGAAAATTATTCA 404 GAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA * * * * * * * * 55375 AATAATCATAACTATTTGAATTGGTCCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA 468 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA ** * * ** 55436 TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTTCTAAATAATTTTGTAT-AA-ATAAAAAAAT 533 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAAAAAT * * * * * 55499 TGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAGGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT 597 TATTTTATGAC-AAA-AAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT *** * ** 55564 ATTTGAACTCACTCGGTAAATGGATTTATTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTTGGTAA 660 ATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTT----T--T--TAA--A--T---CT--C-T--T-- * * 55629 ATGGATTTATTTTT 702 AT-TATTAATTTTT ** * * * * * 55643 CAAGTCTTTTACTTATTAATTTTTAGAAAATTAATAAATTTATATTATTTTTTTGAAAGAAGCTT 1 -AA----AATA-TTAATAA--ATTAG-----T-AT-TAT---T-TTA---TTTCG-AATAAGCTT * * * * * * 55708 GCATGAATA-AAGATAATTGTTTCATGATAAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATT 43 GTATAAATAGAA-ACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT * * * * * * * * * * * 55772 GTTTAGAGAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACATATTCTTTTTTTAATTATC--TTAC 106 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAAAAGATT-TATTTTTAA-AATCTTTTAC * * ** * 55835 TCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGAACGGA 169 TTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAC--A * * * * ** * 55900 AACAATTGTTTTACT-ACAAAA-AAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTACTCGAATAG 232 AAAAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAG * * * 55963 TCATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTGT 294 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATT-T *** ** * * * 56027 CAAAATATTAATAAATT-GATATTATTTTAATCCAATTATA-CTTGTATAAACA-AAACT-ATTG 357 TTGAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTAATTGAAATA-AGCTTGTATGAATAGAAA-TAATTG * * * * * * * * 56088 TTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATTACTAT 419 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT * * ** * * * 56153 TAGAACTTGTTTGATACAA-AGATTTATCTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTA 483 TTGAACTAGTTCAATA-AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA * * * * * * * * * 56213 GTAGATTAGTATTTTTTTTATT-TCAAACAAACTTATATGAACA-AAAACATTTGTTTTATGACA 547 ATAAATTAGTA-TTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTATGACA * * * * * * * 56276 AAAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGCCAAAATTATTTGAACTGATT- 609 AAAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTC * 56340 AGGTAAACAGA-ATAGTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT 673 A-GTAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * ** * * * ** * * * 56385 GAATTATTAATAGTTTTCA-TTTTATTTTATTCCTAATAAGCGAGTATGAATTGAAAAAATTGTT 1 AAAATATTAATA-AATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTT * * 56449 TTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT 64 TTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * 56514 GAAC-TGATCCAATAAATAGATTTAGTTTTT-AAATC---T-CTTGTTAATTTTTA-AAATATTA 128 GAACTTG-TTCGATAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTA ** ** ** * * * 56572 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATAAATAAAAAGAATTGTTTAATGACAAAA 190 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAA-CAAAA-AATTGTTTTATGACAAAA * * * * 56637 CAAAATGTCAT-ATCGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTCACTC 253 CAAAAAGTCATAAT-GATTTGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC * * * * * 56701 AATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTATAAAATTAATAAATTTA-TA 316 GATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTT-GAATATTAATAAA-TTAGTA * * * * * * * * 56764 TTATTTT-ATTCG-AATAAGCTTGCATGAAGAGAAACACTTATTTTATGACAAAATAGAAGGTCA 378 TTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA * * * * * * *** * 56827 TTATGTTTTGAAATAAATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTAAAGT-GATTTGGTAAACAGA 442 -TATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACAAA * * * 56891 TTCT-TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACAT 505 TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT * * * * * 56955 C-AAATAAGCTTATATGAAC-TAAAACAATTGTTTTACT-ACAAAAAAA-AGGTCAGAATGATTT 568 CTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTA-TGACAAAAAAATA--TCATAACGATTT ** * * * * 57016 GAAATAGATAATTACTCGAGTAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTT 629 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT * * * 57081 AAATCTTTTACTTATTAATTGTC 693 AAATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * * * * 57104 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCCAATTATGGTTGTGTGAACA-AAACTATTGTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * * * 57167 TAT-AATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATTACTATT 65 TATGAA-A-AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * 57230 AGAACTTGTTTGATAAATAG----A--TTT-AAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAGT 127 TGAACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAT * * * * 57284 AGATTAGTATTTTTTTTATTTCAAA-AAACTTATATGAGCAAAAACATTTATTTTATGACAAAAC 192 AAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAAC * ** * * * 57348 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-TAATTTGAAC-TAGTTA 254 AAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTA-TTC * * * * * * 57411 GGTAAATAGAATTATTTTTTAAATC---T-CTTATT-AATTTTTGTAATATTAATAGATTCA-TT 316 GATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTA ** ** * * * 57470 TTATTTT-ATTCCTAATAAGCAAGTATGAATTG-AA-AA--GTTTTATGACAAAATAAAAGGTCA 378 TTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA * * * * *** 57530 TAATGATTTGAAATCGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCTGCAAACAAAT 442 T-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAAT * * * * ** 57595 TTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAAAATTATTTTATT-TC 506 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ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAC--AAAAAATTGTTTTATGACAAAA ** * * * * * * * 58058 CAAAAAGTCATAACAATTTTAAATAGACAACTTTTTC-AATAGTCGTAACTATTTGAATTTGTTT 253 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-A-AAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC * * * * * * ** * * 58122 GGTAAATAAATTTATTTTTTTAGA-CTCTTGCTTATT-AATTTTCAAAATGTTAAGAAATTAGTA 316 GATAAACATATTTA--TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTA * * * ** * * * * * ** * 58185 TTCTTTTATTTTG-GATAAAATTTTATCAATTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAATGAAAGGTCA 378 TTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA ** * * * * * 58249 TAACAATTTTAAA-ATGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAATAAA 442 T-ATGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAA * * * * * * * * * 58313 TTTATTTTTTCGAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAACATTAATAACTTTGGATTATTTTATTT 505 TTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC * * * 58378 TGAATAAGCTTG--T-AACATTTGAAACAAA-TATTTTATAACTAAACAAAAGTGTCATAATGAT 569 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AATA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTCAG * * * * 59227 ACAAACACATTTATTTTTT--AT-TATTAAATTAGTATCATCTTAATCT 675 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT--ATTA-T-TAAT-TT--T-T ** * * * * * 59273 GAATAAGCTTATATGAA--AGAAATT-GTTTA-TT-GACA-AA----ATA-AAGATCA-TAACGA 1 -AA-AATATTA-ATAAATTAG-TATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATAA-AT-AGAAAC-A * *** * *** * ** * * 59326 TTTGAGATAGGTAATTGTTCAAATA-GTCATAACT-ATTT-AAACTAGTTTGGTTA-ACAGATTT 58 ATTGTTTTATG-AA--AAACAAA-AGGTCATAA-TGATTTGAAA-TAG-ATAATTATTCA-A-AT ** * * *** * * 59387 AGTTTTTAAATCTCATATT-AA-TT-TTC----AAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTA-TTA 114 AG-TCAT-AA-CT-AT-TTGAACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAA--AATCTTTTACTTA * * * ** ** * * * 59444 TGGATAATTCT-G---TATGAACAGAA--ACAATTATTTTATGACAAAAAAAGGTCATAACGATT 172 T---TAATTTTAGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA---C-T---TATA * ** ** * ** * * * ** 59503 TGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGACATGAC--TATTTGA-ACTTATTTCGTAAATAGATTTAT 226 TGAACA-A-AAAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAAGTCATAATGATTT-G-AAATA-A-AAAT * * * * * * * * * * * 59564 TTTTTAGAT-TTCCTACCTA-TTG-A-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TAT-TT 283 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCG-ATA--AACATATT--TATT-TTTAAATCTT * * ** * *** *** * 59623 TGA---A-TAAACTTGTATGAATAGAAAT-AATT-GTTTTATGAAAAACAAAAATCATAACTAT- 342 TTACTTATTAAA-TT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTAATTGAAAT-A-AGCT-TG * * * * * * * * * * * * * 59681 T-TGAA-ATAAATAACTATTTAAACAGTCATAACTATTTAAGCTTGTTTG--GT-AAATAGATTT 401 TATGAATAGAAATAATTGTTT-TA-TGACAAAAC-A--AAAGGTTATATGATTTGAAATAGA-TA * * * ** * * * * * * ** 59741 ATTTTTTATATCTTTACTTATTGATTTTTGGATTA-TT-AATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGA 460 ATTGTTCAAATAGTCA-TAACT-A--TTTGAACTAGTTCAATAAA-CAAATTTA-TTT-TTT--- * * ** * * * * * * * * * 59804 ATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGACAAAATAA-AAGGTCA-TAACTATTTGA-A 515 A-AATC-TCT-T--AC-TTATTAATT--TTT-GGA-ATATTAATAA-ATTAGT-ATTATTTTATT * * * * * * * ** 59866 ATAAATAA--TTGT-TCAAACAGT-TATAATTATTTAAATATGTTTAGAAAACATATTTATTTTT 568 CTGAATAAGCTTGTAT-GAACA-TAAAAAATTATTT---TATG---ACAAAA-A-A---ATATCA * ** * ** * * * * * 59927 TAA-AATTAT-ACTTAG-TAATTTTTGGAATATTAATAA--ATTT-ATATTATTTTATTCAAAAT 620 TAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATT-GTTCAGT--AAA- * * *** * ** * *** 59986 AAGCTTGTA-TGAGTAGAAACAATTGTT-TT-A-TGAC 679 CAGATT-TATTTTTTA-AATCTCTTATTATTAATTTTT * * * ** * * ** * * * 60020 AAAACA--AA-AGATCAAAATGATTTGAAATAG-ATAA--TT-AATCAAATAGTCATAACTATTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAG--A-AAC-AATT * ** * ** ** * * * * * * * 60078 GAACTTTTAGGGTAAACTGATACATTTTTTAATTATGTT--ACT-CATAAATTTTTGAAATATTA 61 G---TTTTATGAAAAAC--A-AAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTC * ** * * * * * * 60140 ATAAATTTATATT-ATTTTATTTCG--AATAAGACTCTATGAACTTATACAAT-TGTTTCATGTT 118 AT-AA-CTAT-TTGAACTT-GTTCGATAAAAAGA-T-T-T--ATTTTTAAAATCT-TTT-A-CTT ** * 60201 GAAACAAAAGGTCATAATGGTTT-GAAATAGGTATTTCTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACT 171 --------A--T--TAAT--TTTAG-AA-A--TA-TTAAT-AAATTAG-TAT---TATTT-TA-- * * * * **** * * 60264 TGTTCAGTAAATATATTTATTTTTAA-AATCTTTTACTTATTAATTAGCAAAAATTAATACATTA 209 T-TTC---AAATAAACTTA-TATGAACAAAAAATT-GTT-TT-A-T-G---ACA--AA-ACA--A * * * * 60328 ATATTATTTCAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGT 256 A-A--A-GTC-AT---AAT--G-AT-T-TGAA-ATAAA-AATTG---T-T-------CAAATAGT * * * * * * *** * *** * * 60393 CATAA-TCATTTAAAATAAATAATT-GTTCAA-ATAGTCATAACTAATTGAACTTATTTTTTAAA 295 CATAACT-ATTTGAACT---T-ATTCGATAAACATATTTATTTTTAAAT-CTTTTACTTATTAAA ** ** * 60455 TCTTTTGCTTATTAATTATTTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTA 354 T-TTTTGAATATTAA-TAAATTAGTA-T--T--ATTT-TA-------A-TTGAAATAAGCTTGTA * * * * 60520 TGAATAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATATTTGTTT 403 TGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA-TGATTTGAAATAGATAATTG-TT * * * * * * 60585 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTCT-TTTTTTAAATCTATTATTTA- 466 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTAT * * *** * * * * * 60648 CAACTTTCAAAATTTTAATAAATTAGAATTATATTA-TCTTGAATAAGCTTATATGAACATAAAC 530 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-TGAATAAGCTTGTATGAACATAAAA * * * * * * 60712 AATTATTTTGTGATATAACAAAAGGT-TC-TAATGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAACAGTCA 594 AATTATTTTATGACA-AA-AAAA--TATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * ** * * * * * 60775 TAACTATTT-ATATTGGTCAAGCCAACA-AGTTCATTTTTTAAGTCTATTACTTATTAGTTTTC 655 TAACTATTTGA-ATTGTTC-AGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * 60837 ATAATATCAATAAATTAGCATTACTTTA-TTC---TAA------ATAAA-A-ATA-AA-GGTTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT * * * * * ** 60888 ATGACAAAACAAATA-GTCATAGTGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATATCTAAATG 66 ATGA-AAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * 60952 AA-TTGGTT-TAGTGAATAGATTTATTTTTTAATTCTTTTACTTATTAATTTTCA-AAATATTAA 129 AACTT-GTTCGA-TAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTT-AGAAATATTAA * * * * * * 61014 TAAATTAATATGATTTTATTCCAAACAAACTTATTTGAAGAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC 191 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAAC * * * * * 61079 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTCGAAC-TAGTTC- 254 AAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCG * * * ** ** * * * * 61142 AGCAAGCAAAACTATTTTTTAAATCTCCTACTGATT-AATTTTTTAA-A-T-ATTAATTA-TTTT 317 A-TAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT * * * * ** * * * * * 61202 ATTTTATTTTAAATAA-ATTAGTAAGAACGGAAAAAATT-ATTT-TGATAAAAGAAAAGGTCATA 380 ATTTTAATTGAAATAAGCTT-GTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT- * * * * * * * * 61264 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTGAACAAATTT 443 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAATTT * * *** * * * 61329 ATTTTTTAAGTCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAA 508 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA * * * * 61394 TAAGCTTGTATGAACA-GAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTTATAA--ATTTGAAATA 573 TAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAACGATTTGAAATA * * * ** ** * * 61455 TATAACTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTTAAGTC 635 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TCGATAAACATATTTA--T-TTTTAAATCTT-TTACTTATTAAATTTTTGAATATTAATAAATTA * * * * * * * * * 61918 GTATTATTTTATTTTTG-AATAAGCCTATATAAATTGAAACAATTATTTTATGACTATACAAAAG 375 GTATTATTTTA--ATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG * * ** * * * * * * * 61982 GCTAGAACAATTCGGAATGGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAATATTTGAACTATTTTGGCAA-A 438 GTTA-TATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTT--CAATA * * * * * * * 62046 AAC--A-TT-TTTTTTAAA-C-CATACTTATTAGTTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTT 499 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * * * * * * * 62105 TACTCTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAAA-T-GTTTAGGAAAAAACAAAGAT-ATAATGAT 564 TATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAA-AAATTATTTTATGACAAAA-AAATATCATAACGAT * * *** * 62167 TTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTAAAT-AGGTAAA-ACGATTTAGT 627 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCA-GTAAACA-GATTTATT * 62230 TTTTAAATGTC---TTATTAATTTTT 689 TTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTT * * * * ** * * * 62253 AAAATAGTAGTTAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATGATTTTATATGAATAG-AACAATTCTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * * * * * 62316 TACGACAAAACAAAATGTCATAATGGTTTAAAATAGA-AAATAGTTCAAAT-GTACATGACTATT 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGT-CATAACTATT * * * * ** * * 62379 TGAACTTGTTCAATAAACA-ATTAATTTTTTAAATCTTCAACTTATTGATTTTTAG-AATATGAA 127 TGAACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-AATTTTAGAAATATTAA * * * * * * * 62442 TAAATTGGTACTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAACAATTGTTTGATAACAAAAC- 191 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACA-AAAAATTGTTTTATGACAAAACA ** * * * * * 62506 AAAAGATCATAACAACTTGAAAAAAACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAATCGG 255 AAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGA * * * * * * 62571 TAAATACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTGGAATATTAATAAATTAATATTAT 318 TAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTAT * ** * *** * * ** 62635 TTT-ATTCTAAATAAAATTGT-TCAAATACTTATAA-CG-ATT-T----AAAC---TTGTT-T-T 382 TTTAATT-GAAATAAGCTTGTAT-GAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAT ** * * * * * * * * * 62686 G---T-AAATAGATTTTTTTTTAAAT-CT-TTTACT-TCTT-AA-TTGTCTTAATGTTAATAAAT 445 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTAGT-TCAA--TAAACAAA- * * * * * * * * * * * ** 62742 TTTTATTATTTT--AT-TCTAAATAAGT-ATGTAT-GAACA-GAAAAAATTA-TTTTATGTTAAA 505 -TTTATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * ** * * * * * * ** * 62800 AT-AA-AAATTTATAGTGATTTCA-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT-TTA-AACT 568 CTGAATAAGCTTGTA-TGA--ACATAAAAAATTATT-TT---AT-GACAAAAAAATATCATAAC- * * * * * * * * * 62860 TG-TTCAGCAATCAGATTCATTTTTTATATTA-T-TTAATTA-TT-AATT-TT---TAAA-ATAT 624 -GATT-TGAAAT-AGA-TAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAATTGTTCAGTAAACAGAT * *** * * ** 62915 TAATAACTT--A-GTATTATT-TT-ATTTCG 684 TTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTT *** * * * * * * * ** * 62941 AATAGGCTTATATCAATT-GAATTTTTCTTTTTTTG-ATAA-----AACAAA-AG-GTCATAATG 1 AA-AATATTA-ATAAATTAGTATTATT-TTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACA-ATTG * * ** ** * 62997 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A--TTGTTCAAAAATA-AATTAGTATT-TTATTCTGA-ATAATTTTGTATGAATAGAAAATTTGT 395 AGCTTG-T-ATGAATAGAAATA--ATTGTT-TTATGACA-AA------A-CAAAAGGTTATATGA * * 63424 TTTCAGACAA-A-ATAAAATGTCATAACAATTTGAAAAATATAATAATTCAAATGGACATGACTA 447 TTT--GA-AATAGAT-AATTGT--T--C-A------------AAT-AGTC--AT----A--ACTA * ** * * * * 63487 TTTGAACTTGTTTGATGAACATATTTATTTTTAAAAT-T-TTCAACTTATTAA-TTTTAGAATAT 482 TTTGAACTAGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT--ACTTATTAATTTTTGGAATAT * * ** * * * 63549 TAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGATG 545 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTATGA-C * * * * * * 63613 AAACAAAATATCATAACGATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATA-TCTTTACTATTTGAGCTCGC 608 AAA-AAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTG- * * * 63676 TT-AGTAAAC-GATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTT 670 TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * * * 63719 AGAATTTTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTAAATAAGTTTTTATGAATAGAAACAATTGGTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * 63783 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * 63848 AAAACTAT-TT-GAAAGTGTACAACAAGCAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT 129 --AACT-TGTTCG--A---TA-AA-AAG---ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTA * * * ** 63910 GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTACATGCATAGAACCAATTGTT 181 GAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTATATG-A-ACAAAAAATTGTT * * * * * 63973 TTATGACAAAACAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTT 242 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * * * * ** * 64038 GAGCATGTTTGGTAAATAGATTCATTTCTTAATTCCCTTACTCT-TT-AGTTTTTGGAATATTAA 306 GAACTTATTCGATAAACATATTTATTT-TTAAATCTTTTACT-TATTAAATTTTT-GAATATTAA * * * * * 64101 TAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTG---T-T------- 368 TAAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA * * * * * * 64154 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* * * * * ** 64528 TAAACTTGTTTGGCAAATAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTTATTTTTGTTATATTAA 127 TGAACTTGTTCGATAAA-AAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAA * * * * * * * ** 64592 TAACTTAGTATTATGTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTTTTTTATGGTAAAAC 191 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAA--CAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC * * * * * * 64657 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATC-TAGTTC- 254 AAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCG * ** * * * 64720 AGTAAACATATTTATTTTAAAAAAATTTTTCTTATT-AATTATTGAAATATTAAAAAATTAGTAT 317 A-TAAACATATTTATTTT-TAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTAT * * * * * * 64784 TATTTTAATATG-AATAAGCTTGTATGGATAGAAA-ATTTATTTTAT-A-ATAGACAAAAAGTCA 379 TATTTTAAT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTTA ** * * ** * * 64845 TAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCA-TTTTATAAATAGA 442 T-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCAATAAACAAA * * * * 64909 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TTATT-TCAAATAAACTTATATGAA-TTGAAACAATTATTTTATAATAGAACCAAAGGTTATAAG 563 TTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACAT-AAAAAATTATTTTATGACA-AA-AAAATATCATAAC * * * * * 65735 GATTGGAAATAGA-AATTTGTTTAAATAG---GAAC----TG-A---TTCAATAAATAGATTTAT 624 GATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTCAGTAAACAGATTTAT * 65788 TTTTTAAATCTCCTTCTTATTAATTTTT 688 TTTTTAAATCT-CTTATTATTAATTTTT * * * * * * 65816 GAAATATTAATAAATTAATATTCTTTTATTTCGAA-AAGGCTTGTAT-GATGGAAAACAATTATT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-GCTTGTATAAATAG-AAACAATTGTT * * * * * * 65879 TTAAT-ACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGACATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATT 64 TT-ATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * * * * 65943 T-AAATCGATTTGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATC-TTTACCTTATCAATTTTTGAAATATT 127 TGAACTTG-TTCGATAAA-AAGATTTATTTTTAAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTAGAAATATT * * * ** * * 66005 AATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-TATGAGTTGAAACAATTGTTTTATGATAAA 189 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGA--ACAAAAAATTGTTTTATGACAAA * * * * ** * * 66069 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AAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT 66515 AAATCTC---TTATTAATTTTT 693 AAATCTCTTATTATTAATTTTT * * * ** * * * 66534 TAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTAATTCTAAATAATTTTGTATGAATGGGAACAATTGTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * * * * * * 66598 GATGACAAAAAAAAAATGTCATAAGGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATT 65 TATG--AAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATT * * * ** * ** 66662 TGAACTTATTTGGTAAATGGATTTATTTTTTAAATC-TCCATCTTATTAATTTTAG-AATATTAA 127 TGAACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTAGAAATATTAA * * * * * * * 66725 TAAATTAGGATTATTTTATTTCGAATAACCTTTTATGAATAGAAACAATTATTTTATAAACAAAA 191 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACA-AAA-AATTGTTTTAT-GACAAAA * * * * * * * * 66790 C-AAAAGATCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAGATTCATAATTATTTGAACTCACTC 253 CAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC * ** * * 66854 -AGTAAATAGGTTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTAGGAATTTTAATAAATTAGT 316 GA-TAAACATATTTA--TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGT * * * * * 66917 ATT-TTTT-ATTCCG-AATAAACTTTTATGAACAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAATGG 377 ATTATTTTAATT--GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGG * ** * * * * 66978 TCATAACAATTTGAAATAGATATTTGTTTAAATAGTGATAACTATTTGAACGT-GTTTAGA-AAA 439 TTAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCA-ATAAA * * * * * 67041 CAATTTTATTTTTAAAAT-T-TTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTC 501 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTT ** * * * * ** * * 67103 TATTCAAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACTAATTGTTTTTTGACAAAACCAAAGGTCGTAA-TA 564 TATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAA-AAATTATTTTATGACAAAA--AAATATCATAACGA * * * * * * 67166 TTTTGAAATAGATAATTATTGAGATAGTCATAA-TAATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTCAT 626 -TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTA- * 67230 TTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTT 687 TTTTTTAAATCTCTTA-T-TATTAATTTTT * * ** * * * * * 67259 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TATGAA-A-AACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTAT * 68089 TTGAAC-TGATTTGATAAAAAGATTTACTTTTT-AAATC---T-CTTATTAATTTTTA-AAATAT 126 TTGAACTTG-TTCGATAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATAT * * * 68147 TAATAGATTAGTATTATTTTGTTT-AGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACA 188 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAACTTATATGAACAAAAA-A-TTGTTTTATGACA * ** * * * * * ** ** 68211 AAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTGCAAATAGTCACAATTATTAAAACTGGT 250 AAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAT * * * * * * * 68276 TTGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTGTGAAAAATTAATAAATTCA- 314 TCGATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AG * * * * **** * 68339 TTTTATTTTATTTCG-AATAAGCTAGTATGAATTGAAA-AA-AAAATTATGATAAAACAAAAGGT 376 TATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT * ** * ** * 68401 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAACAA 440 TAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAA * * * * 68466 ATTTAATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATT-ATCAGATTAGTATTATTTTATT 504 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATT * ** * * * * 68530 -TCAAATAAAATCGTATGAACATAAATAACTATTTTATGACATAATAAAAGGTTTACTTTTTAAA 568 CT-GAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACA-AA-AAAA----TA-----T-CA * ** * * * * ** * * 68594 TAATTGATTTGAGGT-GTACAATTGTTCAAATAGTTATAAGTATTTGAAATGGTTTGGTTAATAG 620 TAA-CGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTGTTCAGTAAACAG * ** 68658 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTGAT 682 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * 68692 GAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGATAA-A-AAATAATTGT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAT-A-AATAGAAACAATTGT * * * * * * * * * * * * 68754 TATGTGACCAAACAAAAAGTAAT-ATCAATTCGAAATAGATAATTGTTAAAATGGCCATAATTAT 63 TTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT * * * * * 68818 TTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTCACTTTTT-AAATC----ACTTATTAATTTTTGGAATATT 126 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69262 TCCAAATAAGCTTGTAT--ATATGAAACAAA-TATTTTATGACTAAACAAAATATCATAACGATT 567 TCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAA-AAATTATTTTATGAC-AAA-AAAATATCATAACGATT * * * ** * * * * 69324 TGAAACAGATAATTATTCTAAT-GATTTTAATTATTTGAATTGGTTCCA-CAAGCACATTTATTT 628 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAATT-GTT-CAGTAAACAGATTTATTT * 69387 TTTAAATCTC---TTGTTAATTTTT 690 TTTAAATCTCTTATTATTAATTTTT ** * * * * * * * * 69409 GGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAATCAAATAACCTTCTAT-GATCAGAAAAAATTATT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTT * * * * * * 69472 TTATGACAAAACAAAA-ATCTTAACGATTTGAGATTA-ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATT 64 TTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * * * 69535 TGAA-TTAGTTTGGTAAACATATATATATTTTT-AAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATT 127 TGAACTT-GTTCGATAAA-A-AGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATT * * * * ** 69598 AATAAATCAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGATAAAAAAAATTGTTTTATGATGAAA 189 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGA-ACAAAAAATTGTTTTATGACAAAA * * * * ** * * * * 69662 CAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAGATAATCATTCAAAT-GACCATAATTATTTTAACTGATTC 253 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTC * * * *** * 69726 GATAAACAAATTTATTTTTTAAT-TTCTACTTATT-AATTTAAAAAATATAAATAAATTAGTATT 316 GATAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTT-TTGAATATTAATAAATTAGTATT * ** * * * * * * 69789 -TTTT--TTCCATTTAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTATTTTATGATAAATCAAAAGGTTATA 380 ATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT- ** * * * *** 69851 ACAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAG-CAATAACTATTTGAACTTGTTTTGGTAAACAAAT 443 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACAAAT * * * * * * 69915 TTATTTTTGTAATAT-T-TGT-CTTACTAATTTTTTGAATGTTAA-AATATTAATTTTAATTTAT 506 TTATTTTT-TAA-ATCTCT-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTAT * * * * ** * * * 69976 TTTGAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTGAGAATGATTT 567 TCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAAAAATTATTTTATGAC-AAA-AAAATATCATAACGATTT * * * * * * * * 70040 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* 70818 AGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTACGTATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT * * * * * * * * 70883 ATGTTAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATGACTACTTAA 66 ATG-AAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA * ** * * 70948 ACTGGTTTAATAAATAGATTTACTTTTT-AAAGC---T-CTTATTAATTCTT-GAAATATTAATA 130 ACTTGTTCGATAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATT-TTAGAAATATTAATA * ** * * 71007 AA-TAGCATTATTTT-TTTTGAATAAGCTTATATGTCATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAATA 193 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATG--A-ACAAAAAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * * 71069 AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAGCTATTTGAA-TTGATT-TA 255 AAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGA * * * 71132 GTAAATCA-ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAACA--TTTGAAATATTAATACAGTAGTAT 318 -TAAA-CATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-ATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTAT * * * * * * * * 71194 TATTTTTATTTTG-GATAAGCTTTTATGCACTA-AAA-AATTGTCTTATGACAAAGCAAATGGTC 379 TA-TTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATG-AATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT * * * * * * * * 71256 ATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCTAACAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTACACTAA 441 AT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAA * * * * 71321 TTTACTTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTAT 505 TTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT ** * * * * * 71386 TCCAAATAAGCTTGTATGAA-TTAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAA-AGTTAGAACAATT 567 TCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTATGAC-AAA-AAAATA-TCATAACGATT * * * * * ** * * 71449 TGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTTGGCAAACATATTTA-TTTT 628 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTT * 71513 TAAATCTCTTA-T-TTAAGTTTT 692 TAAATCTCTTATTATTAATTTTT * * * * * * * * * * * 71534 GAAATATTATTAAATTGGTGTTATTTT-TATCCAAATAGGCTTGTATGATTAGAAACAACTATTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * * ** * * * * 71598 TATGAGAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGGTTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * * * 71662 AACTGGTTTGGA-AAATAGCTTTAGGTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT 129 AACTTG-TTCGATAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAT * * *** ** * * * * * * 71725 AAAATCA-TATTGTTTTATTTTTGATAAGTTTTTATAAATTGAAACAATTGTTTTAGGATAAAAC 192 -AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAA--CAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC * * ** * * * * * * 71789 AAAAGGTCATAATGACTTTAAAAGGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCCATTTAAACTTGTTTG 254 AAAAAGTCATAATGA-TTTGAAATAAAAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTATTCG * * * * * ** * 71853 GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTCATTTTTTTTTGAATGTTAATAAATTAGT 317 ATAAACATATTTA--TTTTTAAATCTTTTACTTATT-A--AATTTTTGAATATTAATAAATTAGT * * * * 71918 ATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTT 377 ATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT * ** * ** * * *** * 71982 AGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCCACCAGTCTTAACTATTTGAACTGGCTT-GGCAAACAT 441 A-TATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACAA * * * 72046 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTATAATC 504 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC * * * * * * * * * * 72107 CGAATAAGTTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATTATAATGATTTGAGA 569 TGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAATATCATAACGATTTGAAA * * * * 72172 TAGATAATTCTT--TA-AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA- 633 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT * * 72233 -TC-TGTTATTAATTTTC 697 CTCTTATTATTAATTTTT * ** ** * * * 72249 AAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAATTTTACATGACTAGAAAGAATTGTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT ** * * * 72313 TATGACAAAACAGAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGACATGACTATTT 65 TATGA-AAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * 72377 GAACTTGTTCCATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACCTATTTATTTTCAG-AATATTAAT 128 GAACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTT-AGAAATATTAAT * * * 72441 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGACAAAA-T 192 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACA-AAA-AATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * * ** 72505 AAAAGAACATAACT-ATCTGAAAGAAATCACTATTCAAACAGTCATAACAATTTGAA-TCTGCTC 255 AAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTC * * * * * * 72568 AATAAAAAAATTTATTTCCTAAATTTTTTACTTATT-AATTTTTGCAATATTAATAAATTATTAT 316 GATAAACATATTTATTT-TTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTAT * * * * * * * ** * 72632 TATTATT-TTTTAAATATGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTAAGACAAAATGAAAGGTCAT 379 TATT-TTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT * * * * 72696 AACT-ATTTGAAATAGATTATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAA-T-GTGT---TCAACATA 443 -A-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TCAATAAACAAA * * * * 72755 TTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TA 505 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC * * * 72817 TGAAATAAGCTTGTACGAACA-AAAACAATTACTTTATGACAAAAAGAA-AGGTCAAAACGATTT 569 TG-AATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTATGACAAAAA-AATA--TCATAACGATTT * * * * * * * 72880 GAAATAGATAATTGTTCAAGTAATCATAACCATTTGGACTTGTT-AGGTAAACAAATTCATATTT 629 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAATTGTTCA-GTAAACAGATTTATTTTT 72944 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTT 692 TAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT ** ** * * ** * * 72968 GGAGCATTAAT--A-T--T-TTA---T-TTT-GAATAAGCCTATATGAACCA-ATACAATTATTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTT * * ** * * * 73021 TATGATGAAACAGAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTTTTCAAATAGTTATAACTATTTG 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * * * * 73086 AACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTGAAAATATTTTACTTATTAATTGTCA-AACTATTAAAA 129 AACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATT-TTAGAAATATTAATA * * * * * * * * 73150 AAATAATATTATTTCAATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAAAAAAAACAATTGTTTTATGATAAAA 193 AATTAGTATTATTT-TATTTCAAATAAACTTATATG---AACAAAA-AATTGTTTTATGACAAAA * * * * 73214 CAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCA 253 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCG * * * * * 73279 ATAACCAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AGTTTTCTAAATATTAATAAATTTGTATT 317 ATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATT ** * 73343 ATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATAATTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAA 380 ATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-A * * * * * * ** * * 73407 CGAATTGAAATAGGTAATTCTTCAAATAGTGATAACTATTTGAATTTA-TTTGATAAATAGATTT 444 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCAATAAACAAATTT * * * * 73471 AGTTTTTAAATCTCTTACTTATTACTTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCTGAA 508 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA * * * * * * * * * * * 73536 TCAGTTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAATCATAATGACTTGAAATAG 573 TAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACA-AA-AAAATATCATAACGATTTGAAATAG * * * * * * * * ** * * 73601 ATAATTATTCACACACTTATAACTATATGTACTAG-TCAGGCCAACATATTCATTTTTTAAATCT 636 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTGTTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT * * 73665 GTTACTTATTACTTTTT 699 CTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * * 73682 AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTA-TTCTGAATAAGATTGTATTAATAGAAATAATTATTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * * * * * 73746 TATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTAATTG 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * ** * * 73811 AA-TTGGTTTGGTAATCAGATTTAGTTATT-AAATCTCTTA-TTAAAGGTCATAATGATTTA-AA 129 AACTT-GTTCGATAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTT--A--T--TAAT--TTTAGAA * * ** ** *** *** * ** 73872 ATAGATAATTATTCATATAGCCTTA-ACTATTT-AAAT-TGGTTCGGTAAACAAATTTATT-TTT 184 ATA-TTAA-TA--AAT-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAA-AAATTGTTT ** ** ** ** * ** * * 73933 TAAATCTCTCAGTTATTAAATTTCATAAT-ATTACT-ACATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG 243 T--A--TGACA-AAACAAAAAGTCATAATGATT--TGA-A--A-TA-AAAATTGTTC-AAAT-AG * ** * * * * 73996 CTTATATGAACATAAAT-AA-TTATTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAAT-ATA 294 --T-CAT-AAC-TATTTGAACTTA--TT-CGATA-AAC-ATAT-TTAT--T--TTT-AAATCTTT * * ** * * 74058 TAATTATTCAAAGAGTCAT-AATTATT--TAAATTGGTTCAATATGCATGTTTAAATCTCCTACT 343 TACTTATT--AA-ATTTTTGAA-TATTAATAAATTAG-T--AT-T--AT-TTT-AAT-T--GA-- * * ** * *** **** * * * 74120 TATTAA--TT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATCA--T 391 -AATAAGCTTGTATG-AATAGAAAT-AATT-GTTTTATGACA-AAACAAAAGG-TTATATGATTT * * * * * 74180 GAAA-A-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGAT-AATTGTTCA 450 GAAATAGATAATTG---T-T--C---A-AATAG-TCATAACTATTTGAACTAGTTCAA----T-A * * * *** * * ** * * * 74242 AATGGCCATAA-TTATTTGAATTGATTAAATAAACTGAATT-ATTTTTTAAATCTCCAACTTCTC 499 AA----CA-AATTTATTT--TTTAAATCTCT-TACT-TATTAATTTTTGGAATAT-TAA----TA ** * * *** ** * * * 74305 AATTTTTGA-AATATTAATAAAGCAATATTATTTTATTTAGGATAAGTTTTTATGAACTGAAACA 550 AATTAGT-ATTAT-TTTATTCTG-AATA--AGCTT-G-TATG--AA-----CAT--A---AAA-A * * * ** * * * 74369 ATTATTTTATGATAAAATAA-A-AAGTCATAACAATTTTACATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT 595 ATTATTTTATGACAAAAAAATATCA-T-AAC--GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * 74432 AACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTTCT 656 AACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT-ATTATTAATTTT-T * * * * * * 74495 -AAATGTTAATAAAATAGTATTA-TTTATTTTCAAATAAG-TATGTATAAATTGAAAAAATTATT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCT-TGTATAAATAGAAACAATTGTT * * * * * * * * * 74557 TTATGACTAAACAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATAGATTATTTTTCTAATAGTCTTAACTACTT 64 TTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * * * 74622 AAAC-TGATTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAG-AATATTAT 128 GAACTTG-TTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAA ** * * * * 74685 TAGTTTAGCTA-TATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA 191 TAAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAC-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAA * * * * * ** 74749 CAAAGA-TTATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTT-G 253 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* 75193 CTTTTATTTATTAATTTTT 697 CTCTTA-TTATTAATTTTT ** * * * * * * * * * 75212 TGAATTTTCATAAATTAGTATTA-TTTATTCCTAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGGTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT * * 75276 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAGATAATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTG 66 ATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * 75341 AACGTGTTCAGAAAAAAAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTCTTAATTTTTGGACTATTAATA 129 AACTTGTTC-GATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATA * * * ** * 75405 AATTTA-AATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACAAAACCAATTGGTTTATGACAAAACA 193 AA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAA--AATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * 75469 AAAGGTCAAAAGGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGT 255 AAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGAT * * * ** * * 75534 AAACAGATTCT-TTTTTAATTCTGTTACTCGTT-AATTTTCTAAATATTAATAAATTGGTATTAT 319 AAACATATT-TATTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * * * * * 75597 ATTACTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACGAAAGAAAAGGTCATATTA 382 TTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA-TG * * * * * * * 75662 ATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAGTCATTATTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATT 446 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAATTTATT * * ** * * * * 75727 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATAGTATTTTAATCCG-A-AA 511 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA * * * * * * * * * 75790 -CTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGAAAAAAGCAAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAAAT 576 GCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATG-ACAAA--AAAATATCATAACGATTTGAAATAGAT * * * * 75854 AATTGCTT-ATATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTCATTTTTCAAATCAT 638 AATTG-TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-T * 75917 -TTACTTAGTAATTGTCTT 699 CTTA-TTATTAATT-T-TT * * * * * * * * 75935 --AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGGTTGTATGAACAAAAAGAATTATTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * ** * * * * 75997 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GTAAACTGGTTTGGTTAATAA-ATTTATTTTTTAATTCCCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTA 126 TTGAACTTG-TTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTA * * * * * * * * * * 76841 TTAGATTAGTTTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAATAATTATTTTATGATAGAA 190 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAC-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAA * * * * ** * * * 76906 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAGTTTACAATAATTCAAATTGTCATAACTATTTG-ACCTAGTTA 253 CAAAAAGTCATAATGATTTGAA-ATAAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTC * * * * * 76970 GGTAAACAGATCTATTTTTTAAATC---T-CTTATT-AATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTTT 316 GATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTAT * * ** * * * * * * 77030 TATTTTATTTTG-AATAAACTTAAATG-CTCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAA 379 TATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA * * * * * * * * * * * * 77093 TAACGATTTAAAATAGATAATTG-TGACATGGCCATAATTATTTGAA-TCGATTCAGTGAATATA 442 T-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACAAA * * * * 77156 TTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT 505 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT * * * * 77217 GAATAAGCTTGCATGAAC-TGTAACAATTGTTTTATGACAAAATAAA-AGGTCATAACGATTTGA 570 GAATAAGCTTGTATGAACAT-AAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAACGATTTGA * * * * * * * 77280 AGTAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGCTT-TGACAAACTGATATATTTTTTA 631 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTA 77344 AATCTCTTAGTTATTAATTTTT 694 AATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * * * * 77366 GAAAGATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTATTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT * * * 77431 AT-AATATAACAAAAGG-CTATAATGATTTGAAATGGACAATTGTTCAAATAG--A-AAC----T 66 ATGAA-A-AACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * 77487 G-----GTTCAATATATAA-ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT 128 GAACTTGTTCGATA-AAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAT *** ** * 77546 AAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAGGCTTGTATGATGAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC 192 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC-T-TAT-ATGAACAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC * * * * * * * 77610 -AAAGGTTCGTAACT-ATTTGAAGTAGATAATTGTTCAAATTA-CCATAACTATGTGAA-TCGAT 254 AAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACT-TAT * * *** * * * 77671 TTGATAAAC-TGACTTATTTTTTAAATC-CCAACTTA-TCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAA 314 TCGATAAACAT-ATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAG * * * * * ** 77733 TATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTTTATGAATTGAAATAATTGTTCTATGATAAAATGAAAGGT 376 TATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT * * * * * * * * *** 77797 CATTTTTATTTTAAACTA-ATAATTGTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAATTTGTTTGGTAAACA 440 TA-TATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACA * * * ** * ** * 77861 GATTTATTTTTTTTAATTTCTTGTTTATT-ATTTTTTGAATATCGATAAATTAATATTATTTTAT 503 AATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT * * * ** * * * * * 77925 T-TCAAATCAGCATGTATGAAC-TAAAACGAATTATTTTATGGTTGAATAAAATGTTAGAACAAT 567 TCT-GAATAAGCTTGTATGAACATAAAA--AATTATTTTAT-G-ACAAAAAAATATCATAACGAT * * * * * * ** ** 77988 TTGAAATAGAAAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATATAAACTGGTTCAACAAACTCATTTATTTT 627 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTT * 78053 TTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT 691 TTAAATCTCTT-ATTATTAATTTTT * * * * * * 78078 AGAATATTATTAATTTAGTAAT-TTTTACTTCGAATAAGTTTGTATGCATAGAAACAATTTCAGA 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG--T--AT-------A----A-A * * * * * * * 78142 TAGATAATTGTTCAAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTTAGATAGATAACTG 50 TAGA-AA-----C-AATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * ** * * 78206 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTTATAAATAG----A--TTT--AGT-TTTTA--TA 107 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA * ** * ** ** * * * 78260 -T--TTGTCCAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAGC 172 TTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACA-AA-A * * * * ** * * * * * * 78322 AACTGTTTTATAAAAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCGAATGGACATG 235 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * *** 78387 GCTATTTCAACTTCTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATT-AATTGTCAAAA 299 ACTATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTT-AAATCTTTTACTTATTAAATT-TTTGAA * * * * * * * 78450 AATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTG-AATAACCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATG 362 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATG * * * * * * 78514 ACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTCGAACT 426 ACAAAACAAAAGGTTAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT * * * * * *** 78579 TGTTTC-ATAAACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTGTCATAATATTAATAAATT 490 AG-TTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT * ** * * * ** * 78643 TGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAACTATTTTATGA-AAAAAAAGGTT 554 AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAAAAATATC * * * * * * * * * * * * 78707 ATAGCAATTTCAAATAAAGAGTCGTTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTT-TGATAAATAG 619 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAG-TAAACAG * * 78771 ATTCT-TTTCTTAAATCTCTTAATTGTTAATTTTT 682 ATT-TATTTTTTAAATCTCTT-ATTATTAATTTTT ** * * * * * 78805 GGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT-AGACTTTTATGAACT-GAAACAATTCTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTT * * * * 78868 TTATGAAAAAACAAGAGGTCATAACGATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTTA-AACTATTT 64 TTATG-AAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * ** 78932 G-ATTTAGTTCAGCA-AACAA-ATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTGTTAATTTCCGAAATATTA 128 GAACTT-GTTC-G-ATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTA * * * * * *** 78994 ATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAGACAATTGTTTTATGACCGGA 190 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACA-A-AAAATTGTTTTATGACAAAA * 79059 CAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTTGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTT 253 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAA-AA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TT * * * * * * 79122 TGATAAATAGATTTATATTTCTAAA---TATA-TTATT-AATTTTTGAAATATTAATAGATGAGT 315 CGATAAACATATTTAT-TTT-TAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGT ** * * * ** * * * * * 79182 ATTATTTT-ATTCCCAACAAACTTATATGAGCAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC 377 ATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT ** * * * * * 79246 ATAACAATTTGATAACA-ATAATTGTTCAAGTAGTCATAATTATTTGAACAAGTT-AGGTAAACA 441 AT-ATGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-ATAAACA ** * * 79309 AAAATATTGTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA 503 AATTTATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTA * * ** * * * * 79373 TTTTGAATAAGCTAGTAACAA-TTGAAAATTTATTTTATGATAAAACAAA-AGGTCATAAC-ATT 566 TTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAACGA-T * * * * ** * * * 79435 TTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAATA-ATTTTTTTT 627 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTT * 79499 TTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTT 691 TTAAATCTCTTA-TTATTAA-TTTTT ** * * * * * ** * * * * 79525 GGAATATTATTAGATTTGTATTATTTTATTCCGAGTAAGCTTGTATGGACAAAAATAA-T-TATT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT * * * * ** * * * * * 79588 GTGATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGACATATACAATTGTTCAAATAAT--TAACTATTTGA 66 ATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA ** * * * * 79651 ACTAATTCGATAAATAGATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAA 130 ACTTGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAA * * * * * 79716 TTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGAATAAT-AA-AAAAACATTTGTTATATGACCAAACA 195 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTT--AT-ATGAACAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * * * * * 79779 AAAGGTAAAAAATGATATGAAATAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAATTATTTGAT 255 AAAAGT-CATAATGATTTGAAATAAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGAT * ** ** * * * 79844 AAACAAATCAATTTTTAAATCACTTATTTATT-AATTTTTGAAAAATTAATAAATTTGTATTATT 319 AAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * * * * 79908 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ACTTG-TTCGATA-AAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATA * * * * * * * ** * * * 81104 AATTACTATTATTTTATTCCATATAAGCTTGTATTAATTGAAGCAATTGTTTTATGATAAAATAC 193 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAA--CAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAA * ** * * * * * 81169 AAAGTTATAACAATTTTAAACAGACAATTGTTGTATGACTAAACAAAAAGTCAGAA-TAATTTGA 256 AAAGTCATAATGATTTGAAATA-A-AA--ATTG--T---T---CAAATAGTCATAACT-ATTTGA * * ** * * ** 81233 AATAGATAATT-GTTCTA-ATAGTCTTAACTATTTGAAT-TTATTCGACAGAACGCATT-AATTT 308 ACT---T-ATTCGATAAACATA-T-TT-A-TTTTTAAATCTT-TT-------ACTTATTAAATTT * * * 81294 TT---TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTCG-AATAAGC-TGATATGAA-A-AAAAAATTTG 357 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG-TATGAATAGAAATAA-TTG * * * * ** * * * 81352 TTTTATGATAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCAT 419 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT * *** * * * *** 81416 TTGAACTGGTTTGGTAAAGAGATTTAGTTTTTAAATCTC-TA---ATTAATTTTCAAAATATTAA 483 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82620 CAAAAGGTTATAACAATTTGAACA-GGTAATTGTTTAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTC- 253 CAAAAAGTCATAATGATTTGAA-ATAAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCG * * * * * * * * 82683 AGTAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTATTTATT-AATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGAAT 317 A-TAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTAT * * * ** * * * * 82747 TATGTTATTTCG-AATAAACTTGTACAAATAGAAACAATT-TATTTGTGATAAAACAAAAGATTA 379 TATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTTA * * * * * *** * 82810 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTATAACTATTAGTACTA-ATCAGGCCAATAGA 442 T-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-ATAAACA-A * *** * * 82874 A-TCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATT 504 ATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** * * * * * * 82937 CCAAATAAGAC-TGTGTGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATTATCATAACAATTTA 568 CTGAATAAG-CTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAAAA-AAA-TATCATAACGATTTG * * * ** * * 83001 AAATAAATAATTGTTCAAATAAT--TAA--AATTGAACTACTTTAGTAGACAGATTTATTTTTT- 630 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTA * * 83061 AAT-TC-TCTTATTAATTTTC 694 AATCTCTTATTATTAATTTTT * * * * * * * * * 83080 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAGAA-AAACTTATTTGAACAAAAACATTTGTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT * * * 83144 TGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATGCAAATAGTCATAATTATTT- 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * ** * 83208 AAATTGATTC-AGTAAACAA-AATTATGTTTT-AAATTTTTTACAGATTAATTTTTGAAATATTA 129 AACTTG-TTCGA-TAAA-AAGATTTAT-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTA * * * * * 83270 ATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAA-TTAGTAAGAATTGAAAAAATTGTTTTACT-ACAA 190 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTA-TATGAA--CAAAAAATTGTTTTA-TGACAA * * * * * * * * ** 83333 AATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAAAATTATTCATATAGGCTTAACTATTTG-AGTCGGT 251 AACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAT-AAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TAT * * * * * * * * 83397 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AAATTATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTC-AGATAAGCTTTTACAAACTA-AAAAAATTGTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATAAA-TAGAAACAATTGTT * * * ** * * * 83867 TTAGGATAAAATAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT 64 TTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * 83932 GAACTTGTTTTG-TAAATAGATTT-TTTTT-TAAT-TTCTTACTTGTTAATTTTTTG-AATGTTA 128 GAACTTG-TTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTA * ** * * * * * 83992 ATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAA 190 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAC-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAA * * * ** * 84057 C-AAAAGTTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGATT 253 CAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATT * * * * * * * * 84121 -AACAAACACA-TT-TTCTTAAATC-----CTTATT-AATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAA 315 CGATAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTAT * * * * * * * * * * 84177 TATTTTACTTCG-AAGAAGCTTATATGAACAGAAATAAATGTTTTAGGATAAAA-TAAAGATCAT 379 TATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT * * * * * * * * 84240 AACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAATTGGTTCAGTAAAGAGATT 443 -ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAATT * * * * 84305 TAGTTTTTAAA---C-T-CTTATTAATTTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTAGTTTATTCTGA 507 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA ** * * * * * * * 84365 ATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATA 572 ATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGAC-AAA-AAAATATCATAACGATTTGAAATA * * * * * 84430 GATAATAGTTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAAATTATTTTTTAAATC 635 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATC * 84494 TTTTACTTATTAA-TTTT 698 TCTTA-TTATTAATTTTT ** ** * * * * * * * 84511 GGAATATTAATATGTTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAACAGAAATAATTGGTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT * * * * 84576 ATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA 66 ATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * * * 84641 ACGTG-TAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAAA--TTTTAATTATT-ATTTTTGGAATATTCATAA 130 ACTTGTTCGATAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAA * * ** * 84701 ATTTA-TAGTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACAAATTGTTTTATG----AACA 194 A-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTATATGAACA-AA-AAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * ** * * 84760 AAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGCTT-AGACAATCATAACTATTTGAACTCGTTTGG 255 AAAAGTCATAATGATTTGAAATA-AAAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGA * * ** * * * * * * 84824 TAAACAAATTCATTTTT-TTTC-ATT-C-TCTT-ACTCTTT--A-ATT--T---TCAG-AATATT 318 TAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATT ** * ** * * ** 84875 TT-ATTCCTAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGGTAGAATAAAAGGTTATAACA 383 TTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-ATG * * * 84939 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-GTTTGAACAAA-AAGATTTA 446 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAATAAACAA-ATTTA * * ** * ** * 85002 TTTTTTAAATCTCTTA---A-TAATTCTTGAAACGTCAATAAATTAACATTATTTTATT-TCAAA 509 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAA * * * * * * * * 85062 AAAGCTTGTATG--CTTAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGATAATAATGATTTAAAAT 573 TAAGCTTGTATGAACAT-AAAA-AATTATTTTATGAC-AAA-AAAATATCATAACGATTTGAAAT * * * * * * * * * 85125 TGATAGTTGTTTAAATGGCCGTGATTATTTGAACTGATTC-GATAAACTAG-TTTATTTTTTAAA 634 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTCAG-TAAAC-AGATTTATTTTTTAAA 85188 TCTCTTACTTATTAATTTTT 696 TCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * 85208 GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTT * * * * * 85272 TATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTAT-AAATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAACTATAT 65 TATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * ** * * * 85336 AAACATGTTC-AGTAAATAGGTATATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTG-AATATCA 128 GAACTTGTTCGA-TAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTA * * * * * * * 85399 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAATTAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTGTTATATGACTAA 190 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTATATGAAC--AAAAAATTGTTTTATGACAAA * * * ** 85463 AC-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTGTTAACTATTTGAA-TTGAT 252 ACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-AT * * * ** * * * 85526 TTGACAAACACAACTATTTTTTAAA---TAT-CTTATT-AATTTTTAGAATATT-ATTAATT-TT 314 TCGATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGT * * * * * * 85584 TTTATTTTTATTTG-AATAAGCTTGTATG-ATCAGAAACAAATGTTTTATG---AAA-AAGA-GA 377 ATTA-TTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT * * * * * * * * * * * ** 85642 TA-ACGATTTGAGATTGATATTTATTTAAATAGTCATATCTATTTAAACTGGTTCAAAAAATAGC 440 TATATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAA ** * * * * * * 85706 TTTGGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAGCATT-TTTTATTTT 505 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT * * * * * * ** * 85770 GGATAAGTTTTTATAAAC-TAAAACAATTGTTTTATGATAAATTAAAAGGTCATAACAACTTT-A 570 GAATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTATGACAAA--AAAATATCATAACGA-TTTGA * * * * 85833 AATAGATAATTGTTCAAGTAGTCA-AATCTATTTTAACTTGTTCGGTAAAGAGATTTATTTTTTA 631 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT- * * * 85897 AAATCTTTTGCTAATTAATTTTT 693 AAATCTCTT-ATTATTAATTTTT ** * * * * * * * 85920 TGAATGTTAATAAATTAGTATT-CTTTAATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GACATAATTGTT 1 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTT * * * * * * * * 85983 TTATGACTAATCAAAAGGTCAGAATGATTAGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAATATTT 64 TTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT * * ** * * * * * * 86048 -AAATCGGTTCGGCAAACATATTT-TTTTT-AAATCTTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATT 128 GAACT-TGTTCGATAAAAAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAT * * * * * * 86110 CAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTATTTTATGACAAAA- 192 AAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAACTTATATGAACA-AAA-AATTGTTTTATGACAAAAC * * ** * * * * 86173 TAAAAGATCACAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TATTTC 254 AAAAAG-TCATAATGATTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTC * * *** * ** 86237 -AGTAAATAGATTTCATTTTTAAATC---T-CTTATT-AATTATCAAAATATTAATAAATCAACA 316 GA-TAAACATATTT-ATTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTA * * * * * * * * * ** * 86296 TTATTTTATTTTG-AAT-AGTTTTGCATAAATAGATACAATTATTTTGTGGCAAAACAAAATATC 378 TTATTTTA-ATTGAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT * ** * * * * * * * * 86359 ATAACGAAATAAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTGTTCGATAAA-ATA 441 AT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAA * * * * * 86423 TTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCT 505 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT * * * * * * * 86488 AAATAAACTTATATG-A-ATAAAAATTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAA 570 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* * * ** 87692 ATTA-CTTAATTCTTAATAAGGCCATGT-T-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAATTG 377 ATTATTTTAATT-GAAATAA-G-CTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG * * * * * * * *** * * 87754 TCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATTGAT-ATAACTATTTGCATTGGTTTGGTGAAT 439 TTAT-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAAC ** *** * 87818 AGGTTTATTTTTTAAA--TCTTA--TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT 502 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT * * * * ** * 87879 TTTGAATAAGCTTATATGAACA-AAAATATTTGTTTTACAACAAAACAAA-AGGTCATAATGATT 567 TCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATTATTTTATGACAAAA-AAATA--TCATAACGATT * * * * * 87942 TGAAATAGATAATTATTAAAATAGCCTTAACTATTTGAATTGGTTC-GACAAACA-ATTTTATTT 628 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTCAG-TAAACAGA-TTTATTT * 88005 TTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTC 690 TTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT * * * * * * * * * * * * * 88031 ATAATATTATTAGATTAGCATTTTTTTATTCCAAATTAGCTTGTATGAAGATAAATAATTGTTCT 1 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TTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA * ** * * ** ** * * 88480 TAAAGATTT-AAAGTTTATAATTGTTCAAATAATCAAAACGGTTTGAACTAGTTTGATAAATAGA 442 T-ATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAA * * * * * * * 88544 TTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATGATTATTATTTCATCCT 505 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT * 88609 AAATAAGCTTG 570 GAATAAGCTTG 88620 AATGTTCAAA Statistics Matches: 38117, Mismatches: 9161, Indels: 7649 0.69 0.17 0.14 Matches are distributed among these distances: 666 2 0.00 667 12 0.00 668 26 0.00 669 20 0.00 670 13 0.00 671 83 0.00 672 316 0.01 673 23 0.00 674 4 0.00 675 74 0.00 676 30 0.00 677 6 0.00 678 28 0.00 679 244 0.01 680 126 0.00 681 33 0.00 682 94 0.00 683 66 0.00 684 103 0.00 685 35 0.00 686 64 0.00 687 81 0.00 688 134 0.00 689 182 0.00 690 173 0.00 691 193 0.01 692 134 0.00 693 163 0.00 694 129 0.00 695 284 0.01 696 195 0.01 697 243 0.01 698 92 0.00 699 164 0.00 700 236 0.01 701 453 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Indices: 36798--48282 Score: 5987 Period size: 181 Copynumber: 63.7 Consensus size: 181 36788 AACCATTTCA * * * ** * 36798 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTATATGAA-CAAAACAATTGTTCTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA * * * * * ** * * * 36862 CGATAAAAGAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTACCTATTTGAA 66 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * ** * * * *** * 36927 TTGGTTTAGCAATTAGGTTTATTTTTTAATTTTCTGGGTTATTAAGTTTTG 131 CTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * ** * * * *** 36978 GAATATTATTAAATTAGTATTTTTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAA--CAATCAA---AACTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA * * * * * * 37038 T-TC-AAATAAAAGGTTATAATGAATTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCGA-AGCTATTTGA 66 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGA * ** * ** * * * 37100 AAT-GTTTTGGCAAGTAGATTTACTTTTTAAACCTCTTA-TGATTAATTTTCT- 130 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* ** * 44152 AAACTTA-TTCAGTGAACAGATTCT-TTTTTTAGTTCTCTTACTCATTAATTTTT- 128 GAAC-TAGTTCAGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * * * * * 44205 AGAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAATACTTATTTT 1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT * * * * * * 44270 AATTACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTTATAACTATTTG 65 -ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * * ** 44335 AACTTGTTC-GATAAAC--ATATATATTTTAAATATTTTACTTTTTAATTATCA 129 AACTAGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * * * 44386 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATACGAATAACCTTGTATGAATAGAAACAACTGTTTTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA * * ** * * 44451 TGTCAAAACATAAA-GTCATCACAAGTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAA-TAATTT 66 TGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACT-ATTT * * ** * 44513 GAATTTGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTG 128 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131 CTAGTTCAGTAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TG * * * * 46540 AAATGA-TAATAAATTAG-AGTTATTTTATTTCGAATAAG-TATGTATGAACTGAAACAGTTATC 1 AAAT-ATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCGAATAAGCT-TGTATGAATTGAAACAATTGTT * * * * ** * * * * 46602 TCATGACTAAACAAAAGTTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAAT-TTGAACTATT 63 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATT * * * * * * 46666 TGAACTGGCTCAGCAAACACATTTTTTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTG 127 TGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * * * * * * * * *** 46721 GAATATTATTAATTTAGAAATACTTTACTCCAAATAAGTTTCTATGAACAAAAAACAATTGTTTT 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAACAATTGTTTT * * * 46786 ATGACAAAAC-AAAGATTATAATGATTT-AAGATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTG 65 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * 46849 AATTGGCTTCA-TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-GTTATTCATTTTTG 129 AACTAG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * ** * 46898 AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA * * * * * 46963 TGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCTAATGGACATGAA-TATTTGA 66 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGA * * * ** * 47027 ACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTA 130 ACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * 47079 AAATAATAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA ** * * * * 47143 TGACAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATAGTTATAAACTATGTGA 66 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGA * * ** * * * 47208 ACTTGCTGGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTG 130 ACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * ** * 47260 GAATTTTAATAAATTAG-AATATTTTA-TTCTGAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTT 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT * * * * 47323 ATGAAAAAACAAAAGATCATAATGACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAGTTGA 65 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * * * 47388 A-TGTGTTTAG-AAACCATATTTATTCTTTGAAT-TTTTATTTATTAATTTTTG 130 ACT-AGTTCAGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * ** ** * 47439 AAATATTAGTAAATTCA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTCCATGAA-CAAAACCAATTATT 1 AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTGTT * * * * * 47501 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAATCATAGCTATTT 63 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * 47566 GAA-TATGTTCTA-TTAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTT- 128 GAACTA-GTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * ** * 47619 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGACCTGAAACAATTATTTT 1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT * * * * * * * * * * 47684 GTTACAAAACAGAAGGCCACAATGTTTTGAAATAAATAATTAGCT-AAACAGTCATGACTATTTG 65 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTG * ** * * * ** 47748 AACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TATACTTATTAACTATCA 129 AACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTG * * * ** * 47801 AAATATTAATAAATCAATATTATTTTAATTT-TAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTT 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT ** * * *** 47865 ATGACAAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAAGGTTTG 65 ATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * ** * * * 47929 AACTTGTTTGGTAAGCAGATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCTT- 129 AACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTG * * * ** * ** 47983 -AATATTACTAAATTTGTATTATTTTA-ATCGAATTAAGCTTGTATGAACAGAAAAAGATCATTT 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATGAATTGAAACA-ATTGTTT * * ** * * * * 48046 TATGACAAAACAAAAGCTAATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTTAAATAAG-CATAATTATTT 64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTT * * ** * * * * 48110 AAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTATATCTCTTAATTATTAAATTTTG 128 GAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * 48164 AAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATATCGAATAAGCTTAG-ATGAACTGAAATAACTT-TTT 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAATTGAAACAA-TTGTTT * * * * ** * * 48227 TATGTCAAACCTAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCAT 64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT 48283 GACTGTTTCA Statistics Matches: 8751, Mismatches: 1962, Indels: 1183 0.74 0.16 0.10 Matches are distributed among these distances: 161 6 0.00 162 95 0.01 163 10 0.00 164 3 0.00 165 1 0.00 166 19 0.00 167 2 0.00 168 4 0.00 169 115 0.01 170 34 0.00 171 9 0.00 172 74 0.01 173 112 0.01 174 196 0.02 175 65 0.01 176 284 0.03 177 508 0.06 178 402 0.05 179 614 0.07 180 1565 0.18 181 2963 0.34 182 1083 0.12 183 240 0.03 184 32 0.00 185 39 0.00 186 8 0.00 187 14 0.00 188 3 0.00 189 3 0.00 190 4 0.00 191 3 0.00 192 1 0.00 193 2 0.00 194 5 0.00 196 7 0.00 197 2 0.00 198 11 0.00 199 16 0.00 200 3 0.00 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Indices: 41516--42343 Score: 858 Period size: 358 Copynumber: 2.3 Consensus size: 358 41506 ATGAACAAAG * * * * ** * * 41516 ATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTTATTAGATTTAGTTTCTAAA 1 ATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA * * * 41581 TC---T-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTA 66 TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTTGAATAATTTTGAA * * * 41642 TGAAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATATATAATAGTT 131 TGAAAAAAAAACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAA-GACACAATGATTTGAAATATATAATAGTT ** * * * * 41707 TGAATGGATATGATTATTTAAACTTATTCGGTAAATAAATTTTTTTTTGTAATCTCCAACTTTTA 195 CAAATGAATATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAAA--TTTTTTTGTAATCTCCAACTATTA * * * * 41772 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAAAAAAT 258 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAAAAAT * * * 41837 TATTTTATGATAAAACAAAAGATCATGAAATTTAAA 323 TATTTTATGACAAAAAAAAAGATCATAAAATTTAAA * * * * ** * * 41873 ATAAAGAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTAAACTCACTCTGTAAACAAATTTATTTTTTAAA 1 ATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA * * 41938 TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTTTTATTTTACTTTGAAT-ATGCTTT- 66 TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTTGAATAAT--TTTG * * * * * 42001 AATG-CATAGAAACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAA-ACTCAATGTTTTGAAAT-TGATAATTA 129 AATGAAAAAAAAACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAAGACACAATGATTTGAAATAT-ATAA-TA * ** * 42063 -TTCAAAT-AATCATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAGA-TTTTTT-TAATTCTCTTAGTC 192 GTTCAAATGAAT-ATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAAATTTTTTTGTAA-TCTCCAACT- * * 42124 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAA 254 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAA-TAGAA * * * * * * 42188 ACAATTGTTTTAATTACAAAATAAAAAGGTCGTAATAATTTGAA 318 AAAATTATTTT-ATGACAAAA-AAAAAGATCATAA-AATTTAAA * * * * * 42232 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATGTA-TTTTTAAA 1 ATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA ** * * 42296 TCTTTTACTTATTAATGATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTA 66 TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA 42344 ATCCAAATAA Statistics Matches: 384, Mismatches: 72, Indels: 29 0.79 0.15 0.06 Matches are distributed among these distances: 354 3 0.01 355 12 0.03 356 64 0.17 357 62 0.16 358 109 0.28 359 53 0.14 360 30 0.08 361 48 0.12 362 3 0.01 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (358 bp): ATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTTGAATAATTTTGAA TGAAAAAAAAACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAAGACACAATGATTTGAAATATATAATAGTTC AAATGAATATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAAATTTTTTTGTAATCTCCAACTATTAATT TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAAAAATTAT TTTATGACAAAAAAAAAGATCATAAAATTTAAA Found at i:45204 original size:178 final size:178 Alignment explanation

Indices: 43721--53891 Score: 784 Period size: 181 Copynumber: 56.8 Consensus size: 178 43711 ATAGAAACAA * 43721 TTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-A-AATTTTGTTCAAATAGTCATA 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA--TTGTTCAAATAGTCATA * * * ** * * * * * * * 43784 ACTATCTAAACTCAGTCT-ATAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA 64 AATATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTGTTAACTTTCGAAA * ** ** * * * ** * * 43848 TTTTAATAAATTAAAATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAAT-AGAAACAA- 125 TATTAATAAATT-AGTTTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAATCA-AAAAAAC ** * * * * * 43902 TTGGTTTATGACAAAACAGAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGTCATAAC 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA ** * * * * * ** 43967 TATTTGAA--TGTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATA 66 TATTTGAACTTG-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAA-TCT-CTTGTTAACTTTCGAAATA ** ** * * * * * * 44030 TTAATAAATTTAAATTATTTTATTCAAAATAAACTTGCATCAAT-AAAACCAA- 127 TTAATAAA-TTAGTTTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAATCAAAA-AAAC * * * * * ** * * 44082 TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATATATAATTATTCAGGTAGTAATAAC 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA * * ** * ** * ** 44147 TATTTAAACTT-ATTCAGTGAACAGATTCT-TTTTTTAGTTCTCTTACTCATTAA-TTTTTAGAA 66 TATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTC-T--T-GTTAACTTTCGA-AA * ** * * * * ** * 44209 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-CTTCAAATAAGCTTA-TATGAA-CTGAAATAC 125 TATTAATAAATTAGT-TTACCTTATC-CCAAACAAAC-TAGTATCAATCAAAAAAAC * * * * * * 44263 TTATTTTAATTACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTTATAA 1 TTATTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * * * * * * * 44328 CTATTTGAACTT-GTTCGATAAACATATATA-TTTTAAATATTTTACTTTTTAA-TTATCAAAAT 65 ATATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAA-A-TCT-CTTGTTAACTT-TCGAAAT * ** * * * * * * * 44390 ATTAATAAATTAATATTATTTTAAT-ACGAATAACCTTGTATGAAT-AGAAACAAC 126 ATTAATAAATTAGT-TTACCTT-ATCCCAAACAAACTAGTATCAATCA-AAAAAAC * * * ** * * 44444 -TGTTTTATGTCAAAACATAAA-GTCATCACAAGTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCAT- 1 TTATTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATA * * * 44505 AATAATTTGAA-TTTGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTCT 64 AAT-ATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATC---T-CTTGTTAACTT-TCG ** * * ** * * * * ** * * 44568 TGATCTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTTTATGAAT-AGAAAATA- 122 AAATATTAATAAATTAGT-TTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAATCA-AAAAAAC * * * ** * * * * * 44625 TTATTTTGTGAGAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAAT 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA * * *** * * * * * ** * 44690 TATTTAAACTT-ATTCAATAAATAGAATCATTTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTTTTAGATTA 66 TATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTGTTA--ACTTTCGA-AATA * ** ** * * * * ** * 44754 TTTATAAATTAGTATTAGTTTATTTCGAATAAGCTTA-TATGAATTGAAACAA- 127 TTAATAAATTAGT-TTACCTTATCCCAAACAAAC-TAGTATCAATCAAAAAAAC * * * ** * * * * 44806 TTCTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGAT 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA * * ** * * * * 44871 TATTTGATC-TAGTTCAGTAAACATATTTATGTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TGGTT-GAAA 66 TATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTGTTAACT--TTCGAAA ** **** * * * * * * 44933 TATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT-TTGGATAAGCTTGCAT-AAACAGAAACAA- 125 TATTAATAAATTAGT-TTA-CCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAATCA-AAAAAAC * ** * * * * * * * 44987 TTGTTTTAAAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAATCATAAC 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA * * * 45052 TATTTTGAACTTAGATTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGTTAACTTTCGAAATATTA 66 TA-TTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGTTAACTTTCGAAATATTA * * * * * 45117 AT-GATTAGTTTTACCTTATTCCGAACAAACTTA-TATCAA-CAAAAACAT 130 ATAAATTAG-TTTACCTTATCCCAAACAAAC-TAGTATCAATCAAAAAAAC * * * * 45165 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATAGCCATAAT 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA * * * * * * 45230 TATTT-AAATTGGTTATAG-AAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAAT 66 TATTTGAACTTGGTT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTGTTAACTTTCGAAAT * ** * * * 45293 ATTAATAAATTTGTTTATTTTATCCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAAC 126 ATTAATAAATTAGTTTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAA-TCAAAAAAAC * * 45347 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAA 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA * * * * * 45412 TATTTGAAC-TGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAAT 66 TATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTT-G---TTAACTTTCGAAAT * * **** * * * * 45476 ATTACTAAATTAGTATTA-ATT-TTTTTAATAAGCTTGTGTCAA-CAAAAATAA- 126 ATTAATAAATTAGT-TTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAATCAAAAA-AAC * * * * * * * * 45527 TTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGATTT-AAAGTTTG-CAATTGTTCAAATAGCCATA 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA--TAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * *** * * * * 45590 AACTATTT-AAATTAGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA 64 AA-TATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTGTTAACTTTCGAA * ** ** * * * * * ** 45654 AGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGAAT-GTTCAAAAACAA- 124 ATATTAATAAATTAGT-TTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAATCAAAAA-AAC * * * * ** * * 45709 TTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGACAA-GGTCATAA 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAA * ** * * * * * * 45773 TTATTTGAAC-TAATTTGGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTCTTTTAATTTTTGAAA 65 ATATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT--C-T-CT-TGTTAACTTTCGAAA * * ** ** * * * ** * * 45837 TATTAACAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAA-CTGAAAAAA- 125 TATTAATAAATTAGT-TTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAATC-AAAAAAAC * * * * * * 45891 TTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATGGTCTTAAT 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAA * * * * * * * * * 45956 TGTTTGAAC-TGCTTTGGCAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTATTATTAATTTTTTGGAATA 66 TATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC---TTGTTAA-CTTTCGAAATA * ** ** * * * * * 46020 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA-TATGAA-CTAAAACAA- 127 TTAATAAATTAGT-TTACCTTATCCCAAACAAAC-TAGTATCAATC-AAAAAAAC * * * * 46072 TTATTTTATAACATAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGTACATT 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GT-CA-- * * * * * 46137 GGTAAATAGATTT--A-TT--TTT--T--A-A-ATCT-CTTATT-AAT-T-TT-TGAAATATT-- 62 --TAAAT--ATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGTTAACT-TTCG * * * ** * * * * * ** 46184 AATAAATTAGT--ATTATTTTA--TT-T--TGAATAGACTTGTAT-GATGGAAAGCAA- 122 AA-ATATTAATAAATTAGTTTACCTTATCCCAAACAAACTAGTATCAAT-CAAAAAAAC * * * * * 46234 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATACATAATTGCTT-AAATGGCCATAA 1 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAA * * * * ** * * ** 46298 TTATTTGAAC-TGATTCGATAAATTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACT-TATCAATTTTTAAAA 65 ATATTTGAACTTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT---TGT-T-AACTTTCGAAA * * * ** ***** * * ** * * 46361 TATAAATAAAGTACTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA-CTAAAACAA- 125 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Indices: 44525--52380 Score: 1344 Period size: 181 Copynumber: 43.9 Consensus size: 167 44515 ATTTGTTTGG * * * 44525 TAAACAGATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTG--ATCTTAATAAATTTGTAT 1 TAAATAGA-TTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTAT *** * * * 44588 TATTTTATTCAAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAA-ATATTATTTTGTGAGAAAACAAAAGGTTA 59 TATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTA-AAACA-ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTA ** * ** * * 44651 TAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAATTATTTAAACTTATTCAA 122 TAATGATTTGAAATAGATAATTA-T-------TCATAATTA-TGGAAC-GATTCGA * * * * 44707 TAAATAGAATCATTTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTTTT-AGATTATTTATAAATTAGTATTA 1 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * * * * * 44771 GTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAAC 61 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT * * * * 44836 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCAT-GATTATTTGATCTAGTTCA 126 GATTTGAAATAGATAATTATTC--ATAATTATGGA--A--CGAT-TCG---A * * * * ** 44887 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Indices: 48326--53919 Score: 3610 Period size: 181 Copynumber: 31.2 Consensus size: 180 48316 TAATTGTCAA * * * * ** * * * 48326 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATATGCTCATATGAACAAAAACTATTATTTTAT 1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * 48391 AACAAAATAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAGTAGTCATAACTATTTGAAC 66 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC * * * * ** 48456 TAGTTTGATAAACAAGTTTATTTTTT--ATATC-T-CTTATTAACTTTTAA 131 TAGTTTGGTAAACAA-ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG * * * * * 48503 AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAAC-TGATATGAACAAAAACAATTATTTTA 1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG-TATGATCAAAAACAATTGTTTTA * **** ** *** * * * ** * * 48567 TGACAAAATAAAACCAAATAACAATCCAAAATCGATAATTGCTCAAAGAGTTGTAATTATTTAAA 65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * * * 48632 TTGGTTAGGTAAGCACAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTTTTGA 130 CTAGTTTGGTAAACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG * * * * * 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129 ACTAGTTTGGTAAACAAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG * * * * * 50302 AATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTAT 1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * * * 50367 GACTAACCAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCAATTGAAC 66 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC * * * * 50432 TAATTTAGTAAACAAATTTATTTTCTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGA 131 TAGTTTGGTAAACAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG * * ** * * ** * 50479 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAGTTGCCTTAC 1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * * * * 50543 AATAAAAGAAAAAGTCAAAATAATTTAAAATAGATAATCGTTCATATAGTC-TAGCTATTTGAAC 66 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC * * * ** * ** * * * 50607 TGGTTAGGCAATTAGATTTATTTTTTATTTTTTTTA-TTATTAAGTTTTGG 131 TAGTTTGGTAAACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG * * * ** * * * * ** 50657 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GACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGATATAAATAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC 66 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC ** * *** 51503 T-GATTCAGTAAACAAATTTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAACTTTCAA 131 TAG-TTTGGTAAACAAA--TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG ** * * * 51551 AATATTAATAAAGGAGTATTATTTTTTTTTTGGAA-AAGCTTTTATGAACTAAAAA-AATTGTTT 1 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGATC-AAAAACAATTGTTT ** * * * * 51614 TATGACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTTAAAAATATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG 63 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * 51678 AACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTACTAATTTTTTG 128 AACTAGTTTGGTAAACAAA-TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG * * * *** * * * * * 51733 AATGTTAACAAATTAGTATTTTTTTTATTCCAAATAAGCAAT-TATGAGCTAAAACAATTATTAT 1 AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGC-TTGTATGATCAAAAACAATTGTTTT * * ** * * * * * 51797 ATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAACTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAA 64 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Indices: 48325--53919 Score: 3677 Period size: 361 Copynumber: 15.6 Consensus size: 359 48315 TTAATTGTCA * * ** *** * * 48325 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTA-AATATGCTCATATGAACAAAAACTATTATTTT 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT * * * * * * 48389 ATAACAAAATAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAGTAGTCATAACTATTTGA 65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * ** * 48454 ACTAGTTTGATAAACA-AGTTTATTTTTTATATC---T-CTTATTAACTTTTAAAATATTAATAG 130 ACTTGTTTGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAA * * ** * * 48514 ATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAAC-TGATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAA 193 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG-TATGAAC-TGAACAATTGTTTTATGACAAAACAA **** *** * * * * * * * 48578 AACCAAATAACA-ATCCAAAATCGATAATTGCTCAAAGAGTTGTAATTATTT-AAATTGGTTAGG 256 AAGGTCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTA-G * * * 48641 TAAGCACAA-TTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTTTTG 319 TAAACA-AATTTATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * * 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AATTTGTCCAGTAAATAGATTT-TTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTGTAATGTTAATAA 129 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAA * * * * * 50313 ATTAATATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAACCAAA 193 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA * * * * * ** 50378 AAGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACCAATTGAACTAATTTAGT 257 AGGTCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTTAGT * * 50441 AAACAAATTTATTTTCTAA-ATC-T-CTTATTAATTTTTG 320 AAACAAATTTATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * ** * ** 50478 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAGTTGCCTTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA ** * * * * * * * * 50542 CAATAAAAGAAAAAGTCAAAATAATTTAAAATAGATAATCGTTCATATAGTC-TAGCTATTTGAA 66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * ** ** * * * * 50606 CTGGTTAGGCAATTAGATTTATTTTTTATTTTTTTTA-TTATTAAGTTTTGGAAAATTATTAAAT 131 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAAT * ** * ** * 50670 AAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAAATAGTATGAACAT-AACCAATTGTTCGATGACAAAATAAA 195 TAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAAC-TGAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAA * * * * * * * * * 50733 AGGTAATAACA-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAATTATTTGAAATGGTTTGGTA 257 AGGTCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTA * * 50797 AACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCT- 321 AACAAATTTA-TTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTT-TG * * * * * * *** 50837 AAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA * * * * * * 50902 TGA-AAAACAAAAAGTAATAAAGATTTGGAATAGACAAATT-TTTAAATAGTTAT-ACTTATTTG 66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTG * * * * * * 50964 AA-TTGGTTCGCTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAATA 129 AACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATA * * * 51027 AATTAGT-TGT-TTTCTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAGAATTGTTTTATGACAAAGC 192 AATTAGTAT-TATTT-TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG-AACAATTGTTTTATGACAAAAC * * * 51090 AAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCT-TAACTATTTGAACTAGTTT 254 AAAAGGTCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTT * * * 51153 GGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT- 317 AGTAAACAAATTTATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * * * * 51196 AGAATATTACTATATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATGTGAATAGAAACAATTGTTTT 1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT * * * * ** 51261 ATGATAGAAC-AACACT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA 65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * * 51324 ACTAT-TTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATC---T-CTTATTAATTCTTGAAATGTTATTAA 130 ACT-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAA * 51384 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGT-TGAA--AAACAATTGTTTTATGACAAAAC 193 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC---T-TGTATGAACTGAACAATTGTTTTATGACAAAAC * * * ** * ** * * 51446 AAAAGGTAAT-AATGATTTGATATAAATAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTC 254 AAAAGGTCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTT * * ** 51509 AGTAAACAAATTTTATTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAACTTTCA 317 AGTAAACAAA-TTTATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG ** * * * * * * 51550 AAATATTAATAAAGGAGTATTATTTTTTTTTTGGAA-AAGCTTTTATGAACTAAAAAAATTGTTT 1 AAATATTAATAAATTAGTATTA--TTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTT * ** * * * * 51614 TATGACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTTAAAAATATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG 64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * 51678 AACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTACTAATTTTTTGAATGTTAACA 129 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATA * *** * * * * * * 51743 AATTAGTATTTTTTTTATTCCAAATAAGCAAT-TATGAGCTAAAACAATTATTATATGACTAAAC 192 AATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGC-TTGTATGAACT-GAACAATTGTTTTATGACAAAAC * * * * * * 51807 AAAAGGTCAGAACA-ATTTGAAATAGATAACTATTCTAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGGTTT 254 AAAAGGTCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTT * * * 51870 AGCAAACACATTTATTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAATTTTT- 317 AGTAAACAAATTTATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG ** ** * ** * 51909 AGAATATTGTTAAATTAGTATTATTTTTATCCA-AATAAGCTTGTA-CAATCAAAACCAATAG-T 1 A-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTGTT * * * * 51971 TTATGATAAAACAAAAA-TCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAAT-GTCATAACTA-TT 63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * 52033 GAA-TTGGTTTAG-AAACAGTTTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAGT 128 GAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAAT * * * * * * 52096 AAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACA 191 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG-AACAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * 52161 AAAGGTCAT-AATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAATTTATTCT 255 AAAGGTCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAA-CTATTTGAACTTGTT-T * * * * * 52224 A-TAAATAGATTTTTTTTTTAAATCTCTTTGCTCATTAATTTTTTG 317 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AAATATTAATAGATCAGTATT-TTTT-TTT-GAATAATTTTGCATGAGTAGGAACAATTATTTTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA ** * * * * * * * 52684 CAACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGATTATATGAA 66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * *** * 52749 CTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTTAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT 131 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAAT * * * * ** * * 52814 TAGTATTATCTTGTTCTAAATAAAATTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG 195 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG * * * * * * * * * 52879 ATCA-AAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAGCTATTTGAACTTGCTTGGTAAA 259 GTCATAAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAA * 52943 CAAATTTATTTTTTAAGTCT-TCTACTTTTTAATTTTTTG 323 CAAATTTATTTTTTAA-TCTCT-TACTTATTAA-TTTTTG * * 52982 -AATATTAATAAGA-TAGTATTATTTTATTTCA-AAT-A-CTTGTATGAA-CGAAACAATTGTTC 1 AAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT-AGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTT * * 53041 TATGACAAAAC-AAAAGATCATAACT-CTTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-T 64 TATGACAAAACAAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * * * * * 53103 TGAAACATGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TATTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA 127 TG-AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAA * * * * 53167 TAAATTTA-TATTGTTTTATTTTGAATAAACTTGCATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAA 190 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-G-AACAATTGTTTTATGACAAA * * * * * * * * * 53230 ATAAAATGTCAT-AATGATTTAAAATATAAAATTGCTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTTGTT 252 ACAAAAGGTCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTT * * * * * 53294 T-GATAAATAGATTCATTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTG 316 TAG-TAAACAAATTTATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG * * * * * ** * 53338 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTATATGAACTG-ATTAATTGCTTTA 1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA ** ** ** * * * 53402 TGATGAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTACTAAAATAGTTATGACTATTTGAA 66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * ** * * * * * 53467 CTTATTTCATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCGACATATTAATAAAC 131 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAAT * * *** * * 53532 TAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGCAT-AAATGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA 195 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG--AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA ** ** * * * * * 53596 AATTGTAACA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGGTAA 258 GGTCATAA-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAA * * 53660 ACAAATTTATTTTTGAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTG 322 ACAAATTTATTTTT-TAATCTCTTACTTATTAATT-TTTG * * * * * * * 53700 -AATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTAATTAAAAGAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTATTT 1 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTG-AAACAATTGTTT * ** * * 53763 TATGACAAAACAAAATA-TTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT 64 TATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT * *** * * * 53827 AAACTTGTTCAAT-AACAGATTCAGTTTTTAAA---TAT-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATA 128 GAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATA ** * *** 53887 AATTAAAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTA 192 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA 53920 CGAATATAAA Statistics Matches: 4098, Mismatches: 903, Indels: 472 0.75 0.16 0.09 Matches are distributed among these distances: 350 1 0.00 351 189 0.05 352 27 0.01 353 137 0.03 354 137 0.03 355 486 0.12 356 229 0.06 357 132 0.03 358 359 0.09 359 487 0.12 360 732 0.18 361 735 0.18 362 295 0.07 363 151 0.04 364 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (359 bp): AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATT AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT CATAAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA ATTTATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTG Found at i:53164 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Indices: 53801--54069 Score: 294 Period size: 135 Copynumber: 2.0 Consensus size: 130 53791 TGAAATAGGT * 53801 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAACAGATTCAGTTTTTAAATATCTTA 1 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAATAACAGATTCAGTTTTTAAATATCTTA ** * * 53866 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAAAATTATGTTATTCCAAATAAG-CTTGTA-CGAATATAA 66 TTAATTTTCAGAATATTAAAAAATTAAAATTATGTTATTCCAAATAAGAC-TGTATC-AATAGAA 53929 AC 129 AC ** * * * 53931 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGTACTAGTT-AGGCTAATAGATTCATTTTTTAAATCCAT 1 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCA--ATAACAGATTCAGTTTTTAAAT--A- * ** ** 53995 TACTTATTAATTTTCATAATATTAAAAAATTAGCATTACT-TTATTCTGAATAAGACTGTATCAA 61 T-CTTATTAATTTTCAGAATATTAAAAAATTAAAATTA-TGTTATTCCAAATAAGACTGTATCAA 54059 TAGAAAC 124 TAGAAAC 54066 AATT 1 AATT 54070 GTTTAATGAT Statistics Matches: 115, Mismatches: 15, Indels: 13 0.80 0.10 0.09 Matches are distributed among these distances: 129 1 0.01 130 32 0.28 131 19 0.17 133 1 0.01 134 1 0.01 135 58 0.50 136 3 0.03 ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (130 bp): AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAATAACAGATTCAGTTTTTAAATATCTTA TTAATTTTCAGAATATTAAAAAATTAAAATTATGTTATTCCAAATAAGACTGTATCAATAGAAAC Found at i:54494 original size:180 final size:178 Alignment explanation

Indices: 53931--54708 Score: 608 Period size: 180 Copynumber: 4.4 Consensus size: 178 53921 GAATATAAAC * * * * * * * * 53931 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGTACTAGTTAGGCTAATAGATTCATTTTTTAAATC-CAT 1 AATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-T * * * ** * * 53995 TACTTATTAATTTTCATAATATTAAAAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAGAC-TGTATCAA 65 TACTTATTATTTTTCATAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-CTTATATGAA * * * * * 54059 TAGAAACAATTGTTTAATGATAAAA-AAATGGTCATAACGATTTGAAATAAAT 129 CA-AAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATAGAT * * * * * * * ** * 54111 AATTGTTTAAATTGTTATAACTAGTTGAATTGGTTTAGTAAGTAGATTTATTTTTTAAATCTCTT 1 AATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT * * * * * * 54176 A-TTA--A-TTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGTTCCAAACAAACTTATATGAACA 66 ACTTATTATTTTTCATAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAC- * * 54237 AAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGAT 130 AAAACATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT * * * * 54287 -ATTATTCATATAGCCT-TAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT 1 AATTATTTAAATAG-TTATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT * ** * * ** * * 54350 TAGTTATTATTTTTCATAATATTATTATATTAGTATTATATTATTCTGAATAAGCTTGTATAAAC 65 TACTTATTATTTTTCATAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAC * * * * * 54415 ATAAATAGTTTTTTTATGACAAAACAAAGGTTATAATAATTTGAAATATAT 130 A-AAACA-TTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT * * * * * * * * * 54466 AATTTTTTAAAAAGTTATAACCATTTGAATTGGTTTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCCT 1 AATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT * * * 54531 ACTCATTAATTTTTGA-AATATT-AAAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTATACGATG 66 ACTTATT-ATTTTTCATAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTAT---ATG * 54594 AACAAAA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGAT 127 AACAAAACATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT * * * ** * * * ** ** 54646 AATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAACTAATTTGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTC 1 AATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC 54709 CAACTTTTCA Statistics Matches: 468, Mismatches: 111, Indels: 38 0.76 0.18 0.06 Matches are distributed among these distances: 175 64 0.14 176 68 0.15 177 5 0.01 178 2 0.00 179 116 0.25 180 196 0.42 181 11 0.02 182 6 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42 Consensus pattern (178 bp): AATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT ACTTATTATTTTTCATAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA AAACATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT Found at i:55601 original size:46 final size:46 Alignment explanation

Indices: 55547--55640 Score: 179 Period size: 46 Copynumber: 2.0 Consensus size: 46 55537 TAAATAATTG 55547 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGGTAAATGGATTTAT 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGGTAAATGGATTTAT * 55593 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTTGGTAAATGGATTTAT 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGGTAAATGGATTTAT 55639 TT 1 TT 55641 TTCAAGTCTT Statistics Matches: 47, Mismatches: 1, Indels: 0 0.98 0.02 0.00 Matches are distributed among these distances: 46 47 1.00 ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.13, T:0.39 Consensus pattern (46 bp): TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGGTAAATGGATTTAT Found at i:55843 original size:180 final size:181 Alignment explanation

Indices: 55593--59218 Score: 2475 Period size: 181 Copynumber: 20.1 Consensus size: 181 55583 ATGGATTTAT * ** * * * 55593 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTT-GGTAAATGGATTTATTTTTCAAGTCTTTTACTT 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT * * * 55657 ATTAATTTTTAGAAA-ATTAATAAATTTATATTATTTT-TTTGAAAGAAGCTTGCATGAATAAAG 65 ATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAA- * * * * * 55720 ATAATTGTTTCATGATAAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTG 129 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * 55773 TTTAGAGAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACATATTCT-TTTTTTAATTATCTTACTC 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTT ** * ** 55837 ATTAATTTTT-GAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGAACGGA 65 ATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAA * * * * 55900 AACAATTGTTTTACT-ACAAAAAAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTA 128 AACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG * * * * ** * * 55954 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ATTAATTTTT-ATAAAATTAATAAATTTATATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGCATGAAGAGAA 63 ATTAATTTTTGA-AAAATTAATAAA-TTATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAA * * * * * * * 56797 ACACTTATTTTATGACAAAATAGAAGGTCATTATGTTTTGAAATAAATAATTGTTTAGATAGTCA 126 ACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA * * * * * * * * * 56862 TAACTATTTAAAGTGATTTGGTAAACAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGA 191 TAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTGAA ** * 56927 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTACT 255 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA-AATTGTTTTA-T * * 56992 -ACAAAA-AAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTA 317 GACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * * * * * * * 57030 CTCGAGTAGTCATGACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAA--TTTTACTT * * * * * * * 57094 ATTAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAATTATGGTTGTGTGAAC-AAA 63 ATTAATTTTTGAAAA-ATTAATAAATT-ATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAA * * * * * * 57157 ACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTC 126 ACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATAGTC * * * 57221 ATTACTATTAGAACTTG-TTTGATAAATAG----A---TTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTTGA 190 ATAACTATTTGAAC-TGATTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTGA * * * * * ** * 57275 AATATTAGTAGATTAGTATTTTTTTTATTTCAAA-AAACTTATATGAGCAAAAACATTTATTTTA 254 AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-A-TTGTTTTA * ** 57339 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA 316 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * * * 57380 TTCAAATAGTCATAA-TAATTTGAACTAGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAA-TCT-CTTAT 1 TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTAT * * * * * ** *** 57442 TAATTTTTGTAATATTAATAGATTCATTTTATTTTATTCCTAATAAGCAAGTATGAA-TTGAA-A 65 TAATTTTTGAAAAATTAATAAATT-ATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA ** * * 57505 A--GTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATCGATAATTGTTCATATAGTCTTAA 129 ATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * * * * 57568 CTATTTGAACTGGTTCTG-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAAT 194 CTATTTGAACTGATTC-GATAAATAGATTCATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTGAAAT * * ** * 57632 ATTATTAGATTAAAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTTATGA 257 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAA-AA-TTGTTTTATGA * * ** * * * * 57697 TAGAACAAAAAGTTGTAATGATTT-AAGTATACAATTG 319 CAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA ** * * 57734 TTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTGGTTTGATAAATAGATTT-TTTTTTAAA-TAT-CTTATT 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATT * * * 57796 AATTTTTGAAAAAATAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAA 66 AATTTTTGAAAAATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA * * * * * * 57861 TTGTTATATGACCAAACAAAAGGT-ACTAATGATTTGAAATAAATAATTGCTAAAATAGCCATAA 130 TTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCA-TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * * 57925 TTATTTGAATTGATTCGCTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATA 194 CTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTGAAATA * ** * * 57990 TTAATAAATTAGTCTTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACA 258 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAAAATTGTTTTATGACA ** * * * 58055 AAACAAAAAGTCATAACAATTTTAAATAGACAACTTT 321 AAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTA * * * * * * * * 58092 TTC-AATAGTCGTAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTTAGACTCTTGCTTA 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTA-AATTTTACTTA * * * * **** ** * * *** 58156 TTAA-TTTTCAAAATGTTAAGAAATTAGTATTCTTTTATTTTGGATAAAATTTTATCAATTGAAA 64 TTAATTTTTGAAAA-ATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA * * ** * * 58220 CAATTGTTTTATGTCAAAATGAAAGGTCATAACAATTTTAAA-ATGATAATTGTTCAAATAGTCA 127 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCA * * * * * * 58284 TAACTATTTAAACTTG-TTCGATAAATAAATTTATTTTTTCGAATCTTTTGCTTATTAATTTTTT 191 TAACTATTTGAAC-TGATTCGATAAATAGATTCATTTTTT-AAATC-CTTACTTATTAA-TTTTT * * * * ** ** * * 58348 G-AACATTAATAACTTTGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAACATTTGAAACAAA-TATTT 252 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-AT-AAA-AAATTGTTT * * * 58411 TATAACTAAACAAAAGTGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA 314 TATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * * * ** * * 58455 TTCAAATGGTCATAATTATTTTAATTGAG-TAAATAAATATATTTATTTTTTAAATTTTTATTTA 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA-TTTTACTTA * ** * * ** * * * 58519 ATAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTCCATCTAAACTTGTATTAACTAAAAC 64 TTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC * * * ** * * * 58584 AATCGTTTTATGACAAATTAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT-GATAAT 128 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCAT * * * * * * 58648 AACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGTTTTATTTTTTAAATTTCTTTCTTATTAATTTTTTG- 192 AACTATTTGAAC-TGATTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAA-TCCTTACTTATTAA-TTTTTGA * * * * * * 58711 AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCTAAATAAACTTGTATAAACTAAAACGATTATTTTA 254 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA-AATTGTTTTA * * * * * 58775 TAACTAAA-TAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTT 316 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * * * 58815 TTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACT-GATTCGATAAAT-GAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT 1 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGATAAATAG-ATTTATTTTTTAAAT-T-TTACT * ** * 58878 TATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTGCTTTATTTTAGATA 62 TATTAATTTTTGAAA-A--ATTAA---T--AA-ATT-AT--A-T--TA-T--TTTATTCCAAATA * * *** * * * * 58943 AGGTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAGAT 109 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAT * * * * 59008 AATTGTTCAAATAGTCATATCTATTT-AAGCTTACTT-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCT 174 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGA-TTCGATAAATAGATTCATTTTTT-AAATC- * * ** 59071 CTTGCTTATTAATCTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG 235 CTTACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG * * * * * * 59135 AACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATCATTG 299 AA-T-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA * * * * * * * * 59195 TT-ATAGTAGTCTTAACTAATTGAATTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTTA 1 TTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTA 59247 TTATTAAATT Statistics Matches: 2588, Mismatches: 552, Indels: 287 0.76 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 342 4 0.00 343 64 0.02 344 1 0.00 345 1 0.00 346 43 0.02 347 9 0.00 348 6 0.00 349 54 0.02 350 88 0.03 351 2 0.00 352 2 0.00 353 82 0.03 354 87 0.03 355 39 0.02 356 90 0.03 357 350 0.14 358 122 0.05 359 183 0.07 360 312 0.12 361 279 0.11 362 204 0.08 363 226 0.09 364 68 0.03 365 1 0.00 367 1 0.00 369 2 0.00 370 4 0.00 371 1 0.00 372 1 0.00 373 1 0.00 375 2 0.00 376 1 0.00 377 3 0.00 378 104 0.04 379 79 0.03 380 71 0.03 381 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (356 bp): TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTACTTATT 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Indices: 58903--59246 Score: 408 Period size: 182 Copynumber: 1.9 Consensus size: 182 58893 TATTAATAAC * * * * * 58903 TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTGCTTTATTTTAGATAAGGTTTTATGAATTGAAACAATTGT 1 TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTAT * * * 58968 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATT 66 TTTATGACAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT * ** * * 59033 TAAGCTTACTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATCT 131 GAA-CTTACTTGACAAACACATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATCT * * * * 59086 TTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTA 1 TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTA * * * * 59149 TTTTATGACTAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATCATTGTT-ATAGTAGTCTTAACTA 65 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACT- ** 59213 ATTGAA-TTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTTA 128 ATTGAACTT-ACTTGACAAACACATTTATTTTTTA 59247 TTATTAAATT Statistics Matches: 134, Mismatches: 23, Indels: 9 0.81 0.14 0.05 Matches are distributed among these distances: 181 4 0.03 182 121 0.90 183 9 0.07 ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.12, T:0.43 Consensus pattern (182 bp): TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTAT TTTATGACAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT GAACTTACTTGACAAACACATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATCT Found at i:59950 original size:180 final size:179 Alignment explanation

Indices: 59245--60789 Score: 1051 Period size: 180 Copynumber: 8.7 Consensus size: 179 59235 ATTTATTTTT * * * * * 59245 TATTATTAAATTAGTATCATCTTA-ATCTGAATAAGCTTATATGAA-AG--A-AATTG-TTTATT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA-T * * * * * 59304 GACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA- * * * * * ** 59368 TAGTTTGGTTAACAGATTTAGTTTTT-AAA-TCT-CATATTAATTTTCAAAA 128 TTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTGAAA * * * * 59417 TATTAATAAATAAGTATTATTTTATTAT-GGATAA-TTCTGTATGAACAGAAACAATTATTTTAT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCT-TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT * * * * 59480 GAC-AAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTGAAC 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAA * * * * * * * 59543 TTATTTCGTAAATAGATTTATTTTTTAGATTTCCTACCTATTGATTTTT-AGAA 128 TTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATT-CTACTTATTAATTTTTGA-AA * * * * 59596 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * * * * * * 59661 -AAAACAAAA-ATCATAACTATTTGAAATAAATAACTATTTAAACAGTCATAACTATTTAAGCTT 66 CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA-ATT * * * * * * * 59724 GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-ATATCTTTACTTATTGATTTTTGGAT 130 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TCTACTTATTAATTTTTGAAA * * * * 59774 TATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * * * * 59839 CAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTTATAATTATTTAAATAT 66 CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT-T * * * * * 59904 GTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAATTATACTTAGTAATTTTTGGAA 130 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTGAAA * ** 59954 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAGTAGAAACAATTGTTTTAT 1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT * * ** * 60017 GACAAAACAAAAGATCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTAATCAAATAGTCATAACTATTTGAA 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA * * ** * * * 60081 CT-TTTAGGGTAAACTGATACATTTTTTAATTATGT-TACTCATAAATTTTTGAAA 128 TTGTTTA--GTAAACAGATTTATTTTTTAA-AAT-TCTACTTATTAATTTTTGAAA * ** * * 60135 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGAC-TCTATGAACTTATACAATTGTTTCAT 1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT *** * * * * * * 60198 GTTGAAACAAAAGGTCATAA-TGGTTTGAAATAGGTATTTCTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA * * * * * * 60262 CTTGTTCAGTAAATATATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA--TTAGCAAA 127 ATTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAA--TTCTACTTATTAATTTTTG-AAA * * * * * * * * * 60315 AATTAATACATTAATATTATTTCAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * * 60380 CAAAACAAAAAGTCATAA-TCATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC----T-AA-- 66 CAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT * * * * 60437 --TT-G--AAC----TTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTATTT-TAA 130 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-ATTCTACTTATTAATT-TTTGAAA * * * * * 60479 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAATTGTTTTATA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG * * * * 60543 ACAAAACAAAAGGTTAT-AGTGATTTGAAATAGATATTTGTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTT-AA * * * * * ** 60607 CTTGTTCAATAAATAGATTCT-TTTTTT-AAA-TCTA-TTATTTACAACTTTCAAAA 127 ATTGTTTAGTAAACAGATT-TATTTTTTAAAATTCTACTTA-TT--AATTTTTGAAA * * * * * * * 60660 TTTTAATAAATTAGAATTATATTATCTT-GAATAAGCTTATATGAACATAAACAATTATTTTGTG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG * * * * * * 60724 ATATAACAAAAGGTTC-TAA-TGATTTAAAATAGATAATTGTTGAAACAGTCATAACTATTTATA 65 ACAAAACAAAAGG-TCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA 60787 TTG 128 TTG 60790 GTCAAGCCAA Statistics Matches: 1083, Mismatches: 214, Indels: 145 0.75 0.15 0.10 Matches are distributed among these distances: 163 16 0.01 164 93 0.09 165 15 0.01 166 2 0.00 167 2 0.00 169 2 0.00 170 1 0.00 171 2 0.00 172 32 0.03 173 2 0.00 174 2 0.00 175 72 0.07 176 12 0.01 177 5 0.00 178 90 0.08 179 167 0.15 180 321 0.30 181 222 0.20 182 21 0.02 183 4 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (179 bp): TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTG TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTGAAA Found at i:60216 original size:361 final size:358 Alignment explanation

Indices: 59274--62640 Score: 1337 Period size: 361 Copynumber: 9.5 Consensus size: 358 59264 TCTTAATCTG * * * ** * 59274 AATAAGCTTATATGAA-AG--A-AATTG-TTTATTGACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGAT 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAATCA-AAATATTTGAAAT ** * * * * * * ** * * 59334 AGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTTAACAGATTTAGTTTTTAAATC 64 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGGTAAATAGATACATTTTTTATATC * * ** * * 59399 -TCA-T-ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTAT-GGATAA--TTCTGTA 129 GTTACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTC--TA * ** * 59458 TGAACAGAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC 191 TGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTC ** * * * * * * * * 59521 AAATAGACATGACTATTTGAACTTATTTCGTAAATAGATTTATTTTTTAGATTTCCTACCTATTG 256 AAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAAATT-ATACTTATTA * *** 59586 ATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG 320 ATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAA * * 59625 AATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAATCATAACTATTTGAAATA 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCA-AAATATTTGAAATA * * * * ** 59689 AATAACTATTTAAACAGTCATAACTATTT-AAGCTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTATATC 65 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTGGGTAAATAGATACATTTTTTATATC * * ** * * * * 59753 TTTACTTATTGATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA 129 GTTACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGA * * * 59818 ACAAAAATAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA 194 ACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA * * * * * * * 59883 CAGTTATAATTATTT-AAATATGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAATTATACTTAGTAATT 259 TAGTTATGACTATTTGAACT-TGTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAAATTATACTTATTAATT 59947 TTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA 323 TTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA * * 59983 AATAAGCTTGTATGAGTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAAT 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCAAAAT-ATTTGAAAT * * 60048 AGATAATTAATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTAGGGTAAACT-GATACATTTTTTAAT 64 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-GGGTAAA-TAGATACATTTTTT-A- 60111 TAT-GTTACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCGAATAAGAC-T 125 TATCGTTACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTT ** * *** * * * 60173 CTATGAACTTATACAATT-GTTTCATGTTGAAACAAAAGGTCATAA-TGGTTTGAAATAGGTATT 188 CTATGAACAAAAACAATTGGTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAAT * * * 60236 TCTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATATATTTA-TTTTTAAAATCTTTTAC 251 TGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAAA--TTATAC * * * * * * * * 60300 TTATTAA--TTAGCAAAAATTAATACATTAATATTATTTCAATCCA 314 TTATTAATTTTTG-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA * * * * 60344 AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATCATTTAAAAT 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TCAAAAT-ATTTGAAAT * * * * * * * 60409 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTATT---T---T--TTA-AATCTTT-T-GC 64 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGGTAAATAGATACATTTTTTATATC * * * 60463 -TTA-T--T-AATTATTT-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTAT 129 GTTACTCATAAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTCTAT * * * * * * * 60521 GAATAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTAT-AGTGATTTGAAATAGATATTTGTTT 192 GAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTG-TT * * * * * * * 60585 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTCT-TTTTTT-AAATCTATTATTTA 255 CAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATATATT-TATTTTTTAAAAT-TA-TACTTA * * *** * * * ** 60648 -CAACTTTCAAAATTTTAATAAA-TTAGAATTATATTA-TCTTG 317 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC-AA * * * * * * * * * * * 60689 AATAAGCTTATATGAACATAAACAATTATTTTGTGATATAACAAAAGGTTC-TAATGATTTAAAA 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA--ATCAAAAT-ATTTGAAA * * * * ** ** * 60753 TAGATAATTGTTGAAACAGTCATAACTATTT-ATA-TTGGTCAAGCCAACA-AG-TTCATTTTTT 63 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTT-GT-TGGGTAA-ATAGATACATTTTTT * * * * * * * * 60814 A-AGTCTATTACTTAT-TAGTTTTCATAATATCAATAAATTAGCATTACTTTA-TTC---TAA-- 124 ATA-TC-GTTACTCATAAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC * * * 60871 ----AT-AA-AAATA-AA--GGTTTTATGACAAAACAAATA-GTCAT-AGTGATTTGAAATAAAT 186 TTCTATGAACAAAAACAATTGG-TTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACT-ATTTGAAATAGAT ** * * ** 60925 AATTGTTCAAATAGTTAT-ATCTAAATGAA-TTGGTTTAGTGAATAGATTTATTTTTTAATTCTT 248 AATTGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACTT-GTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAA-AATT * *** * * * 60988 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATGATTTTATTCCA 310 ATACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA * * * * * * * * * * 61037 AACAAACTTATTTGAAGAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCAAAAT-ATTTGAAAT * * * * ** * ** * * 61102 ATATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTCGAACTAGTTCAGCAAGCA-AAACTATTTTTTAAAT 64 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGGTAAATAGATAC-ATTTTTTATAT * * * * ** * * 61166 C-TCCTACTGATTAATTTTTTAAATA-T--T-AATTA-TTTTATTTTATTTTAAATAA-ATTAGT 128 CGT--TACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-CT * * * * * * 61224 AAGAACGGAAAA-AATT-ATTT-TGATAAAAGAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTG 190 ATGAAC-AAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * 61285 TTCATATAGCCTTA--ACTATTTGAACTGGTTTAGTGAACAAATTTATTTTTT-AAGTCTCTTAG 253 TTCAAATAG--TTATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-T-ATAC *** * * *** 61347 TTATTAATTTTCATAATATTATTACA-TTAGTATTATTTTATTTTG 314 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAA * * * * 61392 AATAAGCTTGTATGAACAG-AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-ATTTGAAATA 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCAAAATATTTGAAATA * * * * ** * * * ** 61455 TATAACTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAATTTGGCAAACAGATTTATTTTTT-TAAGT 65 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGGTAAATAGATACATTTTTTAT-A-T * * * * * * * 61519 C-TCCTACTTATTAATTATTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAGGCTTGT 128 CGT--TACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTCT ** * * * * 61582 ATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTTATAACGATTGGAAATAGATAATTGT 190 ATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACTATTTGAAATAGATAATTGT * ** * * * * * 61646 TCAAATGGCCATAATTATTAGAAC-TGATTT-GATAAACTA-ATTTATATTTT-AAATCTCTAAC 254 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTG-TTTAG-TAAA-TATATTTATTTTTTAAAAT-TAT-AC * * ** * * * 61707 ATATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTTTTC-A 314 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA * ** * * * * * * * 61751 ACTAAAATTTTATGAACTA-AAACAATTGGTTTATGATAAAATAAAAGATCATAATGATTTTAAA 1 AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCAAAAT-ATTTGAAA * * * * ** * ** 61815 TAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGCAAACATATTTATTTATTTTTA 63 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTGGGTAA-ATA--GATACATTTTT- * * * * 61880 ATTTATCGCTTA-T--TAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTGAATAAG 123 -TATATCG-TTACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAG * * * *** ** * * * * * * * 61941 CCTATATAAATTGAAACAATTATTTTATGACTATACAAAAGG-CTAGAACAATTCGGAATGGATA 185 CTTCTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACTATTTGAAATAGATA * * * * * * * ** 62005 ATTGTTCTAATAGTCT-TAAATATTTGAACTAT-TTTGGCAAAAACA-TT-TTTTTT-AAACCAT 249 ATTGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACT-TGTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAAATTAT * * * * * * ** 62065 ACTTATTAGTTTTTAGAATATT-ATTAATTTAGCAATATTTTACTCTG 312 ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAA * * * * * * * * 62112 AATAAGTTTGTATGAATAGAAACAAATG-TTTAGGAAAAAACAAAGAT-ATAATGATTTGAGATA 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCAAAAT-ATTTGAAATA * * * *** * ** * * 62175 GATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTAAATAGGTAAA-ACGATTTAGTTTTTAAAT- 65 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGGTAAATA-GATACATTTTTTATATC * * * * * * * ** * 62238 G-T-CTTATTAATTTTTAAAATAGTAGTTAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATGATTTTATATG 129 GTTACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTCTATG * * ** * * * * * * 62300 AA-TAGAACAATTCTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAA-TGGTTTAAAATAGAAAATAGTTCA 193 AACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCA * * * * * * 62363 AAT-GTACATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACA-ATTAATTTTTTAAATCTTCA-ACTTATT 257 AATAGT-TATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAA-ATT-ATACTTATT * * * ** * 62425 GATTTTTAGAATATGAATAAATTGGTACTATTTTATTTC-A 319 AATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-TTCAA * * * * * 62465 AATAAACTTGTATGAATAG-AACAATTGTTTGATAACAAAACAAAAGATCATAACA-ACTTGAAA 1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCA-AA-ATATTTGAAA * * * * ** * * ** * 62528 AAAACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAATCGGTAAATACATTGATTTTTTAAAT 63 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGGTAAATAGATACATTTTTTATAT * * * * * 62593 CTCTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT 128 C-GTTACTCATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT 62641 CTAAATAAAA Statistics Matches: 2318, Mismatches: 505, Indels: 378 0.72 0.16 0.12 Matches are distributed among these distances: 343 13 0.01 344 97 0.04 345 151 0.07 346 15 0.01 347 55 0.02 348 166 0.07 349 24 0.01 350 69 0.03 351 43 0.02 352 99 0.04 353 87 0.04 354 140 0.06 355 193 0.08 356 22 0.01 357 80 0.03 358 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Indices: 60280--60609 Score: 419 Period size: 164 Copynumber: 2.0 Consensus size: 164 60270 GTAAATATAT * 60280 TTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTAGCAAAAATTAATACATTAATATTATTTCAATCCAA 1 TTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTAGCAAAAATTAATAAATTAATATTATTTCAATCCAA * * 60345 ATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATCATTTAAAATA 66 ATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATCATTTAAAATA 60410 AATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTAATTGAAC 131 AATAATTGTTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAC * * *** * ** * * ** 60443 TTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTATTTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGA 1 TTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTA-GCAAAAATTAATAAATTAATATTATTTCAATCCA * * * * * * 60508 AATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAAT 65 AATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATCATTTAAAAT * * * * 60573 AGATATTTGTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC 130 AAATAATTGTTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAC 60608 TT 1 TT 60610 GTTCAATAAA Statistics Matches: 140, Mismatches: 25, Indels: 2 0.84 0.15 0.01 Matches are distributed among these distances: 163 28 0.20 164 87 0.62 165 25 0.18 ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.08, T:0.42 Consensus pattern (164 bp): TTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTAGCAAAAATTAATAAATTAATATTATTTCAATCCAA ATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATCATTTAAAATA AATAATTGTTTCAAATAGTCATAACTAATTGAAC Found at i:60851 original size:181 final size:182 Alignment explanation

Indices: 60445--60859 Score: 423 Period size: 181 Copynumber: 2.3 Consensus size: 182 60435 AATTGAACTT * * * * * * 60445 ATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTATT-TTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAA 1 ATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATT-TTCATAATATTAATAAATTAGAATTATATTATTTGAA * * * * * 60509 ATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATA 65 ATAAGCTTATATGAACAAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATA * * * * * 60574 GATATTTGTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTC 130 GATAATTGTTTGAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGGTCAACAAATAGATTC * * * * * * 60627 TTTTTTTAAATCTATTATTTA-CAACTTTCAAAATTTTAATAAATTAGAATTATATTATCTTG-A 1 ATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGAATTATATTAT-TTGAA * * * * * * * 60690 ATAAGCTTATATGAACATAAACAATTATTTTGTGATATAACAAAAGGTTCTAATGATTTAAAATA 65 ATAAGCTTATATGAACAAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATA 60755 GATAATTG-TTGAAACAGTCATAACTATTT-ATA-TTGGTCAAGCCAACA-AG-TTC 130 GATAATTGTTTGAAACAGTCATAACTATTTGA-ACTTGGTCAA--CAA-ATAGATTC * * * * 60807 ATTTTTTAAGTCTATTACTTATTAGTTTTCATAATATCAATAAATTAGCATTA 1 ATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGAATTA 60860 CTTTATTCTA Statistics Matches: 187, Mismatches: 39, Indels: 15 0.78 0.16 0.06 Matches are distributed among these distances: 179 8 0.04 180 43 0.23 181 115 0.61 182 21 0.11 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (182 bp): ATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGAATTATATTATTTGAAA TAAGCTTATATGAACAAAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAG ATAATTGTTTGAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGGTCAACAAATAGATTC Found at i:61334 original size:174 final size:175 Alignment explanation

Indices: 60883--61850 Score: 685 Period size: 181 Copynumber: 5.4 Consensus size: 175 60873 AAAAATAAAG * ** * 60883 GTTTTATGACAAAACAAATA-GTCATAGTGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATATCT 1 GTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACT ** * * * * * ** ** 60947 AAATGAATTGGTTTAGTGAATAGATTTATTTTTTAATTCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATT 65 ATTTGAACTAGTTTAGTGAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAATTTTTTAAATATT * ** * * 61012 AATAAATTAATATGATTTTATTCCAAACAAACTTA-TTTGAA-GAAAAACATTT 130 AAT-TATT--T-T-ATTTTATTTTAAATAAA-TTAGTATGAACGAAAAA-A-TT * * * * 61064 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAATTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA * * * ** * * 61129 TTCGAACTAGTTCAG-CAAGCAAAACTATTTTTTAAATCTCCTACTGATTAATTTTTTAAATATT 66 TTTGAACTAGTTTAGTGAA-CAAATTTATTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAATTTTTTAAATATT * 61193 AATTATTTTATTTTATTTTAAATAAATTAGTAAGAACGGAAAAAATT 130 AATTATTTTATTTTATTTTAAATAAATTAGTATGAAC-GAAAAAATT * * * * * 61240 -ATTT-TGATAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGCCTTAACTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA * * * * 61303 TTTGAACTGGTTTAGTGAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTA 66 TTTGAACTAGTTTAGTGAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAATTTT-TTAA-A-TA * * * * 61368 TTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAAC-AGAATAATT 128 TTA-ATTA-TTTTATTTTATTTTAAATAA-ATTAGTATGAACGA-AAAAATT * * * 61418 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA--ATTTGAAATATATAACTGTTCAAATAGCCATAACTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA * * ** * * * 61481 TTTGAACTAATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAATTATTCAAATATT 66 TTTGAACTAGTTTAGTGAACAAATTTA-TTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAATTTTTTAAATA-T * * ** * 61546 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAGGCTT-GTATG-ATGAAAAACAATT 129 --T-AATTA-TTTTATTTTATTTTAAATA-AATTAGTATGAACG-AAAA-AATT * * * * * * 61598 GTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTTATAACGATTGGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATT 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACT * * * * * * * * 61662 ATTAGAACT-GATTT-GATAAACTAATTTATATTTTAAATCT-CTAACATATCAATTTTTAAAAT 65 ATTTGAACTAG-TTTAG-TGAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCCT-ACTTATTAATTTTTTAAAT * * * * * 61724 ATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTCAACTAAAATT-TTATGAACTAAAACAATT 127 ATTAAT----T-ATTTTATTTTATTTTAAAT-AAATTAGTATGAACGAAAA-AATT * * * * * * * * 61778 GGTTTATGATAAAATAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA 61843 TTTGAACT 66 TTTGAACT 61851 TATTTGGCAA Statistics Matches: 636, Mismatches: 113, Indels: 77 0.77 0.14 0.09 Matches are distributed among these distances: 174 93 0.15 175 11 0.02 176 23 0.04 177 13 0.02 178 74 0.12 179 91 0.14 180 133 0.21 181 147 0.23 182 51 0.08 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (175 bp): GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA TTTGAACTAGTTTAGTGAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAATTTTTTAAATATTA ATTATTTTATTTTATTTTAAATAAATTAGTATGAACGAAAAAATT Found at i:62649 original size:179 final size:179 Alignment explanation

Indices: 60883--62654 Score: 1191 Period size: 179 Copynumber: 9.9 Consensus size: 179 60873 AAAAATAAAG * * * * 60883 GTTTTATGACAAAACAAATAG-TCATAGTGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATATCT 1 GTTTTATGACAAAACAAA-AGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT ** * * * * * * * 60947 AAATGAA-TTGGTTTAGTGAATAGATTTATTTTTTAATTCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATAT 65 ATTTGAACTT-ATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATAT * * * * * * * * * 61011 TAATAAATTAATATGATTTTATTCCAAACAAACTTATTTGAAGAAAAACATTT 128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAACAATT * * * * 61064 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAATTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * ** * * * ** * * * 61129 TTCGAAC-TAGTTCAGCAAGCAAAACTATTTTTTAAATCTCCTACTGATTAATTTTTTAAATA-T 66 TTTGAACTTA-TTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATT * * * ** * 61192 --T-AATTA-TTTTATTTTATTTTAAATAAA-TTAGTAAGAACGGAAAAAATT 129 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTT-GTATGAATAG-AACAATT * * * * * * * * 61240 -ATTT-TGATAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGCCTTAACTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA ** * * * * * * 61303 TTTGAACTGGTTTAGTGAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTA 66 TTTGAACTTATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTA * * * * * * * 61368 TTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAATAATT 130 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAACAATT * * * * * 61418 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA--ATTTGAAATATATAACTGTTCAAATAGCCATAACTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * * * * * * 61481 TTTGAACTAATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTTAAGTCTCCTACTTATTAATTATTCAAATATT 66 TTTGAACTTATTTGGTAAACACATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAAAATATT ** * 61546 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATT 129 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAAT--AGAACAATT * * * * * * * * 61598 GTTTTATGACAAAACAAAGGTTTATAACGATTGGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * * * * * * * 61663 TTAGAACTGATTTGATAAACTA-ATTTATATTTTAAATCTCTAACATATCAATTTTTAAAATATT 66 TTTGAACTTATTTGGTAAAC-ACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATT * * * * * * * 61727 AATAAAGTAATATTATTTTTTTC-AACTAAAATTTTATGAACTAAAACAATT 129 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAACAATT * * * * * 61778 GGTTTATGATAAAATAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * * * * * ** ** * 61843 TTTGAACTTATTTGGCAAACATATTTATTTATTTTTAATTTATCGCTTATTAATTTTTTGAATGT 66 TTTGAACTTATTTGGTAAACACATTTA-TT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATAT * * * * * * * 61908 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTGAATAAGCCTATATAAATTGAAACAATT 128 TAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATGAATAG-AACAATT * * * * * ** * * * * * * 61962 ATTTTATGACTATACAAAAG-GCTAGAACAATTCGGAATGGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAAT 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT * * * * * 62026 ATTTGAAC-TATTTTGGCAAAAACA-TT-TTTTTTAAA-C-CATACTTATTAGTTTTTAGAATAT 65 ATTTGAACTTA-TTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTAAAATAT * * * * * * ** * 62086 TATTAATTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAAAT 128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAG-AACAATT * * * * 62139 G-TTTAGGAAAAAAC-AAAGAT-ATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * * * * * * * 62201 TTTGAACTAAATAGGTAAA-ACGATTTAGTTTTTAAATGTCTTA-TTA--ATTTTTAAAATAGTA 66 TTTGAACTTATTTGGTAAACAC-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTA * * * * ** * 62262 GTTAATTAGTATTATTTTATTCTGAATGATTTTATATGAATAGAACAATT 130 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAACAATT * * * * * * * 62312 CTTTTACGACAAAACAAAATG-TCATAATGGTTTAAAATAGAAAATAGTTCAAAT-GTACATGAC 1 GTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-CATAAC * *** * * * * 62375 TATTTGAACTTGTTCAATAAACA-ATTAATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTGATTTTTAGAATA 64 TATTTGAACTTATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATT-AATTTTAAAATA * * * 62438 TGAATAAATTGGTACTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATGAATAGAACAATT 127 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAATAGAACAATT * * ** * * * * * 62491 GTTTGATAACAAAACAAAAGATCATAACAACTTGAAAAAAACAATTGTTTAAATAGTCATAACTA 1 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * * * * ** 62556 TTTGAACTTAATCGGTAAATACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGGAATATTAA 66 TTTGAACTTATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAA * * 62621 TAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAAATTGT 131 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGT 62655 TCAAATACTT Statistics Matches: 1236, Mismatches: 296, Indels: 120 0.75 0.18 0.07 Matches are distributed among these distances: 173 12 0.01 174 195 0.16 175 35 0.03 176 91 0.07 177 34 0.03 178 103 0.08 179 247 0.20 180 183 0.15 181 146 0.12 182 101 0.08 183 9 0.01 184 80 0.06 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (179 bp): GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA TTTGAACTTATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAA TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAACAATT Found at i:63008 original size:181 final size:177 Alignment explanation

Indices: 62796--63298 Score: 466 Period size: 180 Copynumber: 2.8 Consensus size: 177 62786 TATTTTATGT * * * * * * * * 62796 TAAAATAAAAATTTATAGTGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT 1 TAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTA * * 62861 GTTCAGCAATCAGATTCATTTTTTATATTATTTAATTATTAATTTTTAAAATATTAATA-ACTTA 65 GTTCAGAAATCAGATTTATTTTTTA-ATT-TTT-ATTATTAATTTTTAAAATATTAATAGA-TTA * * * * ** * * * 62925 GTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTATATCAATTG-AATTTTTCTTTTTTTGA 126 GTATTATTTTATTTCGAATAAGCATATATCAATAGAAACTAAT-GTTTTGTAA * * 62977 TAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGAATATTTGATCTA 1 TAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTA ** * * * * * * * 63042 GTTTGGTAAA-CATATTTATTTTTAAATTTTTTATGCATTAATTGTCAAAATATTAATATATCAG 65 GTTCAG-AAATCAGATTTATTTTTTAA-TTTTTAT-TATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAG * 63106 TATTATTTTAATTT-GAATAAGCATATATGAATAGAAACTAATGTTTTGTAA 127 TATTATTTT-ATTTCGAATAAGCATATATCAATAGAAACTAATGTTTTGTAA ** 63157 TGGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACT 1 TAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTA-TTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACT * * * * 63221 GGTTTGATAAAT--GATTTATTTTTTCAA-TCTT-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAG 64 AG-TTCAGAAATCAGATTTATTTTTT-AATTTTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAG * 63282 TATTACTTTATTTCGAA 127 TATTATTTTATTTCGAA 63299 CAAATTTATA Statistics Matches: 262, Mismatches: 47, Indels: 31 0.77 0.14 0.09 Matches are distributed among these distances: 175 4 0.02 176 35 0.13 177 1 0.00 178 3 0.01 179 14 0.05 180 118 0.45 181 83 0.32 182 4 0.02 ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.09, T:0.45 Consensus pattern (177 bp): TAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATATTTGAACTAG TTCAGAAATCAGATTTATTTTTTAATTTTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTATT ATTTTATTTCGAATAAGCATATATCAATAGAAACTAATGTTTTGTAA Found at i:63738 original size:177 final size:178 Alignment explanation

Indices: 63384--64157 Score: 708 Period size: 191 Copynumber: 4.3 Consensus size: 178 63374 AATAAATTAG * ** * * * 63384 TATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAA-ATTTGTTTTCA-GACAAAATAAAATGTCAT 1 TATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAATGTCAT ** * * * * * * * * * 63447 AACAATTTGAAAAATATAATAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTT-GATGAACATAT 65 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGC-TGTTTAG-TAAAC-GAT ** * 63511 TTATTTTTAAAATTTTCAACTTATTA-ATTTTAGAATATTAATAAATTAATAT 127 TTATTTTT-AAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAATAT * * ** * * ** * 63563 TATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATA 1 TATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA * * * * * 63628 ACGATTTGAAATA-AAAATTATTCAAATA-TCTTTACTATTTGAGCTCGCTTAGTAAACGATTTA 66 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCT-GTTTAGTAAACGATTTA * 63691 TTTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAGAATTTTAATAAATTAATAT 130 TTTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAATAT * * * * 63740 TATTTTATTCTAAATAAGTTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA 1 TATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA * * * 63805 ATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAACTATTTGAAAGTGTACAA 66 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG--AGCTGTTT---A--GTA-AA * * 63870 CAAGCAAATTTATTTTTTAAA-TTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTTATAT 123 C--G---ATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAG-AATATTAATAAATTAATAT * * * * 63931 TATTTTATTCAAAATAAGCTTACATGCATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA 1 TATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA * * * * * 63996 ATGTTTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAGCATGTTTGGTAAATAGATTC 66 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGC-TGTTTAGTAAA-CGATTT ** * 64061 ATTTCTT-AATTCCCTTACTCT-TTAGTTTTTGGAATATTAATAAATTAATAT 129 ATTT-TTAAATT-TTTTACT-TATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAATAT 64112 TATTTTATT-TCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTAT 1 TATTTTATTCT-AAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT 64158 TAAAAAATAA Statistics Matches: 495, Mismatches: 69, Indels: 60 0.79 0.11 0.10 Matches are distributed among these distances: 176 15 0.03 177 101 0.20 178 33 0.07 179 61 0.12 180 43 0.09 181 73 0.15 182 3 0.01 183 2 0.00 184 2 0.00 185 6 0.01 186 3 0.01 188 1 0.00 189 2 0.00 190 5 0.01 191 137 0.28 192 8 0.02 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43 Consensus pattern (178 bp): TATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATA ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTGTTTAGTAAACGATTTAT TTTTAAATTTTTTACTTATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAATAT Found at i:64699 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 64360--80959 Score: 3727 Period size: 181 Copynumber: 91.3 Consensus size: 180 64350 GTTATTCAAA * * * * * * 64360 TAAACGAATTTAATTTTTAAATATTTTACGTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATT * * * *** * * 64423 ATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTATGATGCAACAAAATGTTAT 64 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATTG-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * ** * * 64487 AATGATTTCTAATAGATAATTGTT-GAATAGTCATAATAATTTAAACTTGTTTGG 127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTTGTTTGG * * * * ** * 64541 CAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTTATTTTTGTTATATTAATAACTTAGTATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * ** 64606 GTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTTTTTTATGGTAAAACAAAAGGTCATAACG 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG * * * * ** 64671 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAG 131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGG * ** ** * * * * 64722 TAAACATATTTATTTTAAAAAAATTTTTCTTATTAATTATTGAAATATTAAAAAATTAGTATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * 64787 TTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGGATAGAAA-ATTTATTTTAT-A-ATAGACAAAAAGTCATAA 66 TTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAA * * * ** ** 64848 CAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCATTTTA 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * * 64901 TAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATAATAATATATTAGTATTAC 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * *** * * * 64962 TTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG * *** * 65027 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTCAACCAATTAGG 131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * 65078 TAAACAAAATTA-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTA * * * * * ** 65141 TTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAGTTTAAAAAAACTTATTTTTATGACAAAACAAAATATCA 65 TTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGA-ATTGAAACAA-TTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCA * * * * * * ** 65205 TAATGATTTGAAATAGATAAGTGTTCATATAGTCTTAAATATTCGAACTAGTTCAG 126 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGG * * * * * * * * 65261 TAAACAAATTTATTTTTTAATTATCTTAGTTATTGATTTTTGAAATATTATTAGACTAATATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * *** * * * * * * 65326 TTTGTTGCAAATAAGCTTATATGAACAAAAAAAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACA 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG * ** * * * 65391 ATTT-AGAGTTTACAATTGTTCACATAGTCAT-ATATTTGAACTAGTTTGG 131 ATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTTGTTTGG * * * 65440 TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGATCAATAAATTAGTATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * ** * * * * 65501 TTTATTTCGAATAAGCATGAATG-ATCAAAATCAATTGTTATATGACCAAAC-AAAGGACCATAA 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAA ** * * * * * 65564 -TTTTTAGTAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAATTGTTTGAAC-TGCTTTAG 129 CGATTT-G-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGG ** * 65618 TAAACTGATTTATTTTTTAAATCTC---C----T-A---TTGAAATATTATTAAATTAGTATT-T 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * * * * 65671 TTTATTTCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAATAGAACCAAAGGTTATAAGG 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG * * *** 65736 ATTGGAAATAGA-AATT-TGT----T--T-A-AATA--GGAAC-TGATTCAA 131 ATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAATATTTGAACTTG-TTTGG * * * * 65775 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTC 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * 65839 TTTTATTTCGAA-AAGGCTTGTATG-ATGGAAAACAATTATTTTAAT-ACAAAACAAAAGTTCAT 65 TTTTATTTCGAATAA-GCTTGTATGAATTG-AAACAATTATTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * * * * * 65901 AATGATTTGACATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-AAATCGATTTGA 127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGG * * * * * 65956 TAAACTAACTTATTTTTTAAATCT-TTACCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * 66020 TTTTATTTCAAATAAGCTT-TATGAGTTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGGTCATAT 65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAA ** * ** * ** *** 66084 TTATTCT-AAATAGATAATTGTACAAATAGTCATGGCTATTTAAACTTAATCAA 129 CGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGG * * ** * * * 66137 TAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTGTTAATTTTATG-AATGTTAATAAATTAGGATT 1 TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * 66201 ATTTTATTTTGAATAAGCATGCATGAATTG-AA-AATTATTTTTTGACTAAACAAAAGTTCAAAA 64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * ** ** 66264 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTAA 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * ** * * * * * * * 66317 CAAACTCATTTATTTTTTAAAACTCTTTCTTATTAATTTTT-AGAACATTATTAATTTAGCAATA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA * * ** * * 66381 TTTGA-CTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGAAAAAAC-AAAGATCATAA 65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * *** 66444 TGATTTGAGATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCAA 129 CGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTT-GTTTGG * * * 66497 TAAACAGATTTAATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTA- 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * ** * * * * * * 66557 TTTAATTCTAAATAATTTTGTATGAATGGGAACAATTGTTTGATGACAAAAAAAAAATGTCATAA 66 TTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAA * * * * * * 66622 GGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTATTTGG 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGG *** * * * 66675 TAAATGGATTTATTTTTTAAATCTC-CATCTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGGATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * 66738 TTTTATTTCGAATAACCTTTTATGAATAGAAACAATTATTTTATAAACAAAACAAAAGATCATAA 65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAA ** * * * * * *** ** 66803 TAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAGATTCATAATTATTTGAACTCACTCAG 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * ** * * * * 66856 TAAATAGGTTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGGAATTTTAATAAATTAGTATT- 1 TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * ** * * 66920 TTTTATTCCGAATAAACTTTTATGAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAC 65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * * * 66985 AATTTGAAATAGATATTTGTTTAAATAGTGATAACTATTTGAACGTGTTTAG 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * * * 67037 AAAACAATTTTATTTTTAAAAT-T-TTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATC 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT * * * ** * * * * 67099 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TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGC-TGACTATTTGATCTAGTTTAG 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-CAT-AATATTTGAACTTGTTTGG * * * * * ** * 67927 TAAATATATTTATTTTTAAAAT-TTTGTACTTATTAATTGTCAAAACATTAATAAATTAGTATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * ** * * * * * * 67991 TTTTA-ATCTGAATAAGCATGTACAAATAGAAACTATTGTTTTATAATAGAACACAAA-GTC--- 65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATA * * * * 68051 A--ATTTGGAATAAATAATTGCTT-AAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGATTTGA 128 ACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGG * * * 68103 TAAA-AAGATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTATTA 1 TAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * *** * * 68163 TTTTGTTTAGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC 65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * ** * 68228 AATTTAAAATAGATAATTGTGCAAATAGTCACAATTATTAAAACTGGTTTGG 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * 68280 TAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTGTGAAAAATTAATAAATTCA-TTTT 1 TAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATT * * ** * 68343 ATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAATTGAAA-AA-AAAATTATGATAAAACAAAAGGTCATAA 64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * ** * *** 68406 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTCAA 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * 68459 CAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATT-ATCAGATTAGTATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTA * ** * * * * * * 68523 TTTTATTTCAAATAAAATCGTATGAACAT-AAATAACTATTTTATGACATAATAAAAGGTTTACT 65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG--T-C- * ** * * * * 68587 TTTTAAATAATTGATTTGAGGT-GTACAATTGTTCAAATAGTTATAAGTATTTGAAATGGTTTGG 125 ------ATAA-CGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * ** * 68651 TTAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTGATGAAAGATTAATAAATTAGTATTAT 1 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-AT-ATTAA 172 CTTGTTTGG * * * * ** * * * * * * 71005 TAAATAGCATTATTTTTTTTGAATAAGCTTATATGTCATAAAAAAATTGTTTTATGACA-AAATA 1 TAAACA-AATT-TATTTTTTAAAT-CTCTTA-CT-T-AT----TAATT-TTTGA-AATATTAATA * * * * * ** * * 71069 AA--AGGTAATA-ATGATTT-GAAATAGATAG-TTGT-TCAAATG-GCCATAGCTATTTGAATTG 54 AATTA-GTATTATTTTATTTCG-AAT--A-AGCTTGTATGAATTGAAACA-A-TTATTT-TA-TG * * * ** * ** * * * * * 71127 ATTTAGTAAATCAATTTA-TTTTTAA--ATCTCTTACTTA-TTAACAT-TTGAAATATTAATACA 110 A--CA--AAA-CAA--AAGGTCATAACGAT-T-TGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATA-A ** * 71187 GTAGTATT-ATTTTTATTTTGG 164 -TA-T-TTGA-ACTT-GTTTGG * * * *** * ** ** * ** * * 71208 ATAAGC--TTTTATGCACTAAAAAATTGTCTTATGACAAAGCAAATGGTCATAATGATT-TTAAA 1 -TAAACAAATTTAT---TTTTTAAA-TCTCTT---ACTTATTAATTTTTGA-AAT-ATTAATAAA * * ** * 71270 -TAG-ATAATTGTTCTAACAGTCATAA-CTAT-T-TGAACTTGTTTAGTACACTAATTTACTTTT 56 TTAGTATTATT-TTATTTC-G-AATAAGCT-TGTATGAA-TTG---A--A-AC-AA-TTA-TTTT * * ** * * * *** * * ** * 71330 -T-TCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTTGAATGTTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-A 107 ATGACAAAACAAAAGGTCA-TAA-CGATTTGAA--ATAGAT-AATT-GT-TCA-AATAGT-CATA * * * 71391 ATA----AGCTTGTATGAAT 163 ATATTTGAACTTGTTTG--G * *** **** * * ** * * 71407 TAAAACAATTATTATATGACTAAA-CAAAAAGTTA-GAACAATTTGAAATA--AAT-AATTATTC 1 T-AAACAAAT-TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA * ** * * * * * * * *** 71467 TAATAGTCTTAACTATTTAA-ATTGGT-T---TGGCAAACATATTTATTTT-T---AAATCTCTT 62 TTATTTTATT-TCGA-ATAAGCTT-GTATGAATTG-AAACA-A-TTATTTTATGACAAAAC-AAA * * * * ** * * 71523 A--T-TTAA-GTTTTGAAATATTATTAAATTGGTGTTATTTTTA-TCCA-AATAGGCTTGTA--T 120 AGGTCATAACGATTTGAAATA-GA-T-AATT-GT-TCA--AATAGT-CATAATA--TTTGAACTT * * 71580 GATTAG 175 GTTTGG **** ** * * * 71586 -AAACAACTATTTTATGAGAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGGTTGATATTTGTTCAAATAGT 1 TAAACAA--A-TTTAT---TTTTTAAATCTC-TTAC---TT-A--TT-A-ATTT-TTGAAATATT * * ** ** * * * * **** * 71650 CAT-AACTA-T-TTAAACTGGTTTGGAAAATAGCTTTAGGTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT 50 AATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCGAATA-AGC-TT--G-TATGAAT-TGAAAC-AATT-ATTT * * ** * ** * * * * * 71712 T-TGAAATATTAATAAAA--TCATATTG-TTTTATTTTTGATAAGTT-TTTATAA-ATTGA-AAC 106 TATGACA-A--AACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAA-TTGTTCA-AATAGTCATAAT * * 71770 AATTG---TT-TTAGG 165 ATTTGAACTTGTTTGG * ** **** * * * ** * 71782 ATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTAAA-AGGATAATTGTTCAAATAATCAAATCCATTTAAAC 1 -T-AAAC-AAA--T--TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAAT--A-TT-AA- *** * * * *** * * * * 71846 TTGTTTGGTAAATAGATTTATTT-TTTTAAATCTCT-TACT-CATT----C-ATTTTTTTTTGA- 52 TAAATTAGT-ATTA-TTTTATTTCGAAT-AAGCT-TGTA-TGAATTGAAACAATTATTTTATGAC **** * * ** * ** * * * ** * 71902 ATGTTAATAA-ATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GAATTGAAATAATTATTTT 112 AAAACAA-AAGGTCA-TAACGATTTGAAATAG-ATAA--TTGT-TCAAATAGTCATAA-TATTTG ***** 71964 ATGACTAAACAAAAGG 170 A--ACT---TGTTTGG ** ** * * * * * * *** 71980 TTAGAAC-AATTTGA-AATAGATAAT-TGTTCCACCAGTCTTAACTATTTGAACTGGCTTGGCAA 1 -TA-AACAAATTT-ATTTTTTA-AATCTCTT--A-C-TTATTAA-TTTTTGAAAT--ATTAATAA * * * * * * * * * * 72042 ACATATTTATT-TTTTAAATCTCTTACTAA--TT-TTTGGAATATTATTA-AATTAGTATTATTA 55 A-TTA-GTATTATTTT--ATTTC-GAATAAGCTTGTAT-GAAT-TGA-AACAATTA-TTTTATGA * ** * ** * *** * ** * * 72102 TAATCCGAATAAGTTTGT-ATGAAAAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAATAAAGATTATAATGA 111 CAAAAC-AA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C-AAAT--AG-TCATAAT-A * ** 72165 TTTGAGA-TAGATAATTCTT 166 TTTGA-ACTTG-T--TT-GG * * * * * * * 72184 TAAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGAT-TTAGTTTTTAAATCTGTTAT-TAATT 1 TAA-ACA-AATTTATTT----T--TT-A--AATC---TCTTACTTATT-AAT-T-TT-TGAAATA * * ** ** * * * * 72246 TTCAA-AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTACATGACTAGAAAGAATTG 48 TT-AATAA-A-T--TAG--TATTATT-TTAT-TTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTA * * * * * 72310 TTTTATGACAAAACAGAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGACATGACTA 103 TTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATA *** 72374 TTTGAACTTGTTCCA 166 TTTGAACTTGTTTGG * * * * * 72389 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TCTACCTATTTA-TTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT * * * * * ** 72452 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAT-AAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGAACATA 64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA * * * * * * * * * * *** 72516 ACTATCTGAAAGAAATCACTATTCAAACAGTCATAACAATTTGAA-TCTGCTCAA 128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACT-TGTTTGG * ** * * * * 72570 TAAAAAAATTTATTTCCTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAATTATTATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT ** * * * ** * ** 72635 TATT-TTTTAAATATGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTAAGACAAAATGAAAGGTCATAAC 66 T-TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * 72699 TATTTGAAATAGATTATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAA--TG--TGT 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * 72747 TCAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA * * *** * * 72810 TTTTATAT-GAAATAAGCTTGTACGAACAAAAACAATTACTTTATGACAAAA-AGAAAGGTCAAA 65 TTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATA * * * * * 72873 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAATCATAACCATTTGGACTTGTTAGG 128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * ** 72927 TAAACAAATTCATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAGCATTAAT--A-T--T-TTA- 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * ** ** * 72985 --T-TTT-GAATAAGCCTATATGAA-CCAATACAATTATTTTATGATGAAACAGAAGGTCATAAC 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * 73045 AATTTAAAATAGATAATTTTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTGG 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * ** * * * * * * * 73097 TAAACATATTTATTTTGAAAATATTTTACTTATTAA-TTGTCAAACTATTAAAAAAATAATATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTA * *** * * * 73161 TTTCAATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAAAAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCAT 65 TTT-TATTTCGAATAAGCTTGTATG--AATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * * *** 73225 AACGATTTGAAATAAATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA 127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * 73280 TAACCAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTTTCT-AAATATTAATAAATTTGTATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * 73344 TTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATAATTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAA 65 TTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * * * 73407 CGAATTGAAATAGGTAATTCTTCAAATAGTGATAACTATTTGAATTTATTTGA 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * * * 73460 TAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTACTTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * * * ** * 73525 GTTA-TTCTGAATCAGTTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAATCATAAT 66 TTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * * * * * * ** 73589 GACTTGAAATAGATAATTATTCACACACTTATAACTATATGTACTAGTCAGG 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG ** * * * * * 73641 CCAACATATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTATTACTTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * * 73705 CTTTA-TTCTGAATAAGATTGTATTAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA 65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * * 73769 CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTAATTGAA-TTGGTTTGG 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTT-GTTTGG * * * * ** * * 73822 TAATCAGATTTAGTTATTAAATCTCTTA-TTA--AA--GGTCATAATGATT--TAAAATAGATAA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AAT-ATTAATAAATTAG-T-A * * * ** * * * * 73880 TTA-TTCATATAGCCTTAA-CTATTTAAATTG-GTTCGGTAAACAAATTTATTTT-T--TAAATC 62 TTATTTTATTTCG-AATAAGCT-TGT--A-TGAATT--G-AAAC-AA-TTATTTTATGACAAAAC *** * * ** * * 73939 TCTCA-GTTATTAA--ATTT--CATA-AT-ATTACT-ACATTAGT-ATTATTTTATTCTGAA-TA 117 -AAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCA-TA--ATATT-TGAACT- * * 73994 AGCTTAT-A 174 TG-TT-TGG * *** * * 74002 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74387 AAAAAGTCATAACAATTT-TACATAGATAATTGT 156 ----AGTCATAA-TATTTGAAC-TTG-T--TTGG * * * ** * ** * * ** *** 74420 TCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-ATTTCTTGC 1 T--AA-A--CA-AATTTATTT---TTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA * * ** * * * * 74482 TTATTAATT-TTCTAAATGTT--AATAAAATAGTATTATTTATTTTCAAATAAGTATGTATAAAT 56 TTAGT-ATTATT-T-TAT-TTCGAATAAGCTTGTATGA---A--TTGAAA-CA--AT-TAT---T * * * * * * * * 74544 TGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATAGATTATTTTTCTAATA 105 T-------------TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA * * * * 74609 GTCTTAACTACTTAAAC-TGATTCGG 157 GTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGG * * * * ** 74634 TAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCTA-T 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG-TATT * * * *** * * * 74697 ATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATTATAA 64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA * * * * 74761 TGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAC-TGGTTGAG 129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTG-G * * * 74814 TAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * ** * * * ** * ** 74875 TTTA-TTCTAAATAATTTTGTATCAA-TAAAACAATTGTTTTGCGACTAAACAAAATATCATAAC 66 TTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * ** * * * * * ** 74938 AATTTGAAATAGATAATAATTCAAGTGGACATGACTATTTGAACTTATTCAG 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTTGTTTGG * ** * 74990 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTTGTATTA 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA * * * ** * * * ** * * 75054 TTTTATTTTGAATAAACTTGTAAGAACAGAAGCAATTGTTTTATAACAAAATGAAAGATCATAAT 65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC * * * * * * * 75119 GATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATACT-AAAACTATTTGAACTCGTTTAG 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * * * 75170 TAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTTTTTG-AATTTTCATAAATTAGTATT 1 TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT * * * *** ** 75234 A-TTTATTCCTAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA 64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA ** * * * ** 75298 TAATTTAAAATAGATAATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAG 129 CGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * * * * * 75352 AAAAAAAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTCTTAATTTTTGGACTATTAATAAATTTA-AATT 1 TAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT * ** ** * 75415 ATTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATGAA-CAAAACCAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAA 64 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * 75478 AAGGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGG 127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTTGG * * * * ** * 75533 TAAACAGA-TTCTTTTTTAATTCTGTTACTCGTTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTGGTATTA 1 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GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGG * * * * * 77148 TGAATATATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * 77209 TTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACTGTAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACG 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG * * * * 77274 ATTTGAAGTAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGCTTTGA 131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTTGG * ** * * * * 77325 CAAACTGATATATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAAGATTATTAAATTAGTATTAT 1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * * * 77390 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTATTTTATAATATAACAAAAGG-CTATAAT 66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAAC * * * *** 77454 GATTTGAAATGGACAATTGTTCAAATAG-------A----AACTGGTTCAA 130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTTGTTTGG * * * 77494 TATATAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT 1 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Indices: 64474--70405 Score: 1941 Period size: 539 Copynumber: 11.0 Consensus size: 537 64464 TTTATGATGC * * ** * * *** 64474 AACAAAATGTTATAATGATTTCTAATAGATAATTGTT-GAATAGTCATAATAATTTAAACTTGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACCAATT * * * ** * ** * 64538 TGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTTATTTTTGTTATATTAATAACTTAGTAT 66 AGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT * * * * ** * 64603 TATGTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTTTTTTATGGTAAAACAAAAGGTCATA 131 TATGTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTAAAAAAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA * * * * * * 64668 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAGTAAACATATTT 196 ACGATTTGAAATAGATAAGTATTCAAATAGTCATAAATATTCGAACTAGTTCAGTAAACAAATTT * * * * 64733 ATTTTAAAAAAATTTTTCTTATTAATTATTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAATATGAA 261 ATTTTAAAAAAATCTTACTTATTAATTATTGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAATATGAA * * * * * * 64798 TAAGCTTGTATGGATAGAAAATTTATTTTATAATAGACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAT 326 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* * * * * * * 65664 AGTATT-TTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAATAGAACCAAAGG 126 AGTATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTAAAAAAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGA * * * * * * * 65728 TTATAAGGATTGGAAATAG--AA--ATT----T-GT-TTAAATA--GGAACT-GATTCAATAAAT 191 TCATAACGATTTGAAATAGATAAGTATTCAAATAGTCATAAATATTCGAACTAG-TTCAGTAAAC * ** ** * * * * 65780 AGATTTATTTTTTAAATCTCCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTCTTTT- 255 AAATTTATTTTAAAAAAAT-CTTACTTATTAATTATTGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTA * * ** * * ** 65843 ATTTCGAA-AAGGCTTGTATGATGGAAAACAATTATTTTAATACA-AAAC-AAAAGTTCATAATG 319 ATAT-GAATAA-GCTTATATGA-AAAAAAAAATTATTTT-ATA-ATAGACAAAAAG-TCATAACA * * * * * * * * * * 65905 ATTTGACATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-AAATCGATTTGATAAACTA-ACTTA 378 ATTTGAAATAAACAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGATAAAC-AGATTTA * * * * * * 65968 TTTTTTAAATCTTTACCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAAT 441 TTTTTTAAATC--T--CTTATTAATTTTTGAAAAATCAATAAATTAGTATTACTTTATTTCAAAT * ** **** * * 66033 AAGC-TTTATGAGTTGAAACAATTGTTTTATGATAA 502 AAACATGAATGAACAAAAACAATTGTTATATGACAA * * * *** * 66068 AACAAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGATAATTGTACAAATAGTCATGGCTATTTAAACTTA 1 AAC-AAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-CA * ** * * * *** * * 66132 ATCA-ATAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTGTTAATTTTATG-AATGTTAATAAATT 63 ATTAGGCAAACAAAATTATTTTTT-AAATCTCTTACATATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATT * * *** * ** * * 66195 AGGATTATTTTATTTTGAATAAGCATGCATGAATT--GAAAATTATTTTT-TGACTAAACAAAAG 126 AGTATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTAAAAAAATT-TTTTTATGACAAAACAAAAG * * * * * * * * * * ** 66257 TTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTAACAAAC 190 ATCATAACGATTTGAAATAGATAAGTATTCAAATAGTCATAAATATTCGAACTAGTTCAGTAAAC ** ** * * * * ** ** ** * * 66322 TCATTTATTTTTTAAAACTCTTTCTTATTAATT-TTTAGAACATTATTAATTTAGCAATATTTGA 255 AAATTTATTTTAAAAAAATCTTACTTATTAATTATTGA-AATATTAAAAAACTAATATTATTTTA * * * * * * * ** 66386 CTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAGA-TCATAATGATTT 319 ATATGAATAAGCTTATATGAA-AAAAAAAATTATTTTAT-AATAGACAAAAAGTCATAACAATTT * * * * ** * 66450 GAGATAGATA-AATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCAATAAACAGATTTAATTT 382 GAAATA-A-ACAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTT * * * * *** 66513 TTAAATCTCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTAATTCTAAATAATTTTG 445 TTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAAAATCAATAAATTAGTATTACTTTATTTC-AAATAAACATG * **** 66577 TATGAATGGGAACAATTGTT-TGATGACAAA 509 AATGAACAAAAACAATTGTTAT-ATGAC-AA * * * * * * * * * ** 66607 AAAAAAATGTCATAAGGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTATT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACCAATT * * *** * * * * * 66672 TGGTAAATGGATTTATTTTTTAAATCTC-CATCTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGGA 66 AGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA-CATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA * * * * * * * * 66735 TTATTTTATTTCGAATAACCTTTTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATAAACAAAACAAAAGATC 130 TTATGTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTA-AAAAAATTTTTTTAT-GACAAAACAAAAGATC ** * * * * * * * * * * 66799 ATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAGATTCATAATTATTTGAACTCA-CTCAGTAAATAG 193 ATAACGATTTGAAATAGATAAGTATTCAAATAGTCATAAATATTCGAACT-AGTTCAGTAAACAA * ** ** * * * * * * * 66863 GTTTACTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTAGGAATTTTAATAAATTAGTATT-TTTTAT 257 ATTTA-TTTTAAAAAAATCTTACTTATTAATTATT-GAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAA ** * * * * * * ** 66926 TCCGAATAAACTTTTATGAACAGAAACAATTAGTTTATGACA-AAACAAATGGTCATAACAATTT 320 TATGAATAAGCTTATATGAA-AAAAAAAATTATTTTAT-A-ATAGACAAAAAGTCATAACAATTT * * * * * * 66990 GAAATAGATATTTGTTTAAATAGTGATAACTATTTGAACGT-GTTTAGA-AAACA-ATTTTATTT 382 GAAATAAACAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTT-GATAAACAGA-TTTATTT * * * * * * 67052 TTAAAATTTTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATCA-TTCTA-TTCAAAATA 444 TTTAAA--TCTCTTATTAA-TTTTTGAAAAATCAATAAA-TTAGTATTACTT-TATTTC-AAATA * * * * * 67114 AGCTTGCATGAAC-AAAACTAATTGTTTTTTGACAA 503 AACATGAATGAACAAAAAC-AATTGTTATATGACAA * * * * * * * *** 67149 AACCAAAGGTCGTAAT-ATTTTGAAATAGATAATTATTGAGATAGTCATAATAATTTGAACTTGT 1 AACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-CAA * * * * 67213 TTA-GTAAAC-ATATTCATTTTTTTAATTCTCTTAC-TCTTTAATTTTT-AGAATATTAATAAAT 64 TTAGGCAAACAAAATT-A-TTTTTTAAATCTCTTACAT-ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAT * * * * * * 67274 TAGTATTATTTTATAT-AAAATAAGCTTATATTAATTGAAATAAATGTTTTTATTAC-AAA-AAA 125 TAGTATTATGTTAT-TCCAAATAAGCTTATATGAATT-AAAAAAATTTTTTTATGACAAAACAAA * * * * * * * * ** * * 67336 AGGTAACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATTCATGACTATTTAAACTTGTT-TGATA 188 AGATCATAACGATTTGAAATAGATAAGTATTCAAATAGTCATAAATATTCGAACTAGTTCAG-TA *** ** ** * * ** * * 67400 AATGTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTT 252 AACAAATTTATTTTAAAAAAATCTTACTTATTAATTATTGAAATATTAAAAAACTAATATTATTT ** * * * * 67465 TAAT-CCAATAAGCTTGA-ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAAATCATAACA 317 TAATATGAATAAGCTT-ATATGAA-AAAAAAAATTATTTTAT-A-ATAGACAAAAAGTCATAACA * * * * * * 67527 ATTTG---T-----A--GTTCAAATACTCATAACGATTTGAACTTA-CTCGATAAACAAATTTAT 378 ATTTGAAATAAACAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGATAAACAGATTTAT * * * * * * ** 67581 TTTTTAAATCTTTGACTTATTAATTGTTTG-AATATTAAGAAAGTT-TTACTATTTTATTGGAAA 442 TTTTTAAATC--T--CTTATTAATT-TTTGAAAAATCAATAAA-TTAGTATTACTTTATTTCAAA * * * ** * 67644 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-TTTTATGACAA 501 TAAACATGAATGAACAAAAACAATTGTTATATGACAA * * * * * *** 67680 AACAAAAAGT--TATTGCAATTTCAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG 1 AACAAAAGGTCATAATG--ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACCAA * * ** * * * * 67743 TT-CGAAAAGTAGATTCATTTTTTTAATTCTTTTA-ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTT 64 TTAGGCAAACAAAATT-A-TTTTTTAAATCTCTTACA-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT * *** * * 67806 AGTATTAAT-TAATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATAA-TTTTTT-TGACAAAACAAAAG 126 AGTATT-ATGTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTAAAAAAATTTTTTTATGACAAAACAAAAG * ** * * * * * * 67868 -CCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGC-TGACTATTTGATCTAGTTTAGTAAA 190 ATCATAACGATTTGAAATAGATAAGTATTCAAATAGT-CATAAATATTCGAACTAGTTCAGTAAA * * * * * * ** * * * * 67931 TATATTTATTTT-TAAAATTTTGTACTTATTAATTGTCAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTT 254 CAAATTTATTTTAAAAAAATCT-TACTTATTAATTATTGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTT * * * * ** * * 67995 AATCTGAATAAGCATGTA-CAAATAGAAACTATTGTTTTATAATAGAACACAAAG---T--CAAT 318 AATATGAATAAGCTTATATGAAA-A-AAAAAATTATTTTATAATAG-ACAAAAAGTCATAACAAT * * * * * * * 68054 TTGGAATAAATAATTGCTTAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GATTTGATAAAAAGATTTACTT 380 TTGAAATAAACAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGATAAACAGATTTATTT * * * * * 68118 TTTAAATCTCTTATTAATTTTT-AAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTGTTT-AGAACAAAC- 444 TTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAAA-ATCAATAAATTAGTATTACTTTATTTCA-AATAAACA * * * 68180 TTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAA 507 TGA-ATGAACAAAAACAATTGTTATATGACAA ** * * * * *** 68212 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTGCAAATAGTCACAATTATTAAAACTGGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACCAATT * * * * * * * 68277 TGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTGTGAAAAATTAATAAATTCA-TT 66 AGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTA * * * ** * * 68341 TTATTTTATTTCGAATAAGC-TAGTATGAATTGAAAAAAA---AATTATGATAAAACAAAAGGTC 130 TTATGTTATTCCAAATAAGCTTA-TATGAATT-AAAAAAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATC * * * * ** * * ** 68402 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAACAAA 193 ATAACGATTTGAAATAGATAAGTATTCAAATAGTCATAAATATTCGAACTAGTTCAGTAAACAAA * ** * * ** * * * * 68467 TTTAATTTT-TAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTATCAGATTAGTATTATTTT-ATT 258 TTT-ATTTTAAAAAAATCTTACTTATTAATTATTGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAATA * ** ** * * * * * 68530 TCAAATAAAATCGTATGAACATAAATAACTATTTTATGACATA-ATAAAAGGTTTACTTTTTAAA 322 T-GAATAAGCTTATATGAA-AAAAAAAATTATTTTAT-A-ATAGACAAAAAG--T-C-------A ** ** ** * * * * * * * * 68594 TAATTGATTTGAGGTGTACAATTGTTCAAATAGTTATAAGTATTTGAAATGGTTTGGTTAATAGA 373 TAA-CAATTTGAAATAAACAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGA ** * * * 68659 TTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTGATGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTC 437 TTTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTGAAAAATCAATAAATTAGTATTACTTTATTTC * * * * * * * 68723 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AATTTGAAATAAACAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTAT * * * * * * * 70279 TTTTTAATTTTCTTAGTT-ATTAAGTTTCAAAATATGATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT 442 TTTTTAAATCTCTTA-TTAATT---TTTGAAAA-ATCAATAAATTAGTATTACTTTATTTCAAAT * * * 70343 AGA-ATAGTATGAACAAAACCAATTGTT-TGATGACAA 502 AAACAT-GAATGAACAAAAACAATTGTTAT-ATGACAA * * * 70379 AATAAAAAGGTTATAACGATTTGAAAT 1 AA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT 70406 GGTTTGATAA Statistics Matches: 4165, Mismatches: 919, Indels: 617 0.73 0.16 0.11 Matches are distributed among these distances: 513 7 0.00 514 115 0.03 515 13 0.00 516 38 0.01 517 3 0.00 518 2 0.00 519 71 0.02 520 57 0.01 521 7 0.00 522 3 0.00 524 2 0.00 525 7 0.00 526 30 0.01 527 4 0.00 528 21 0.01 529 140 0.03 530 117 0.03 531 311 0.07 532 277 0.07 533 108 0.03 534 51 0.01 535 51 0.01 536 152 0.04 537 137 0.03 538 235 0.06 539 532 0.13 540 506 0.12 541 304 0.07 542 280 0.07 543 110 0.03 544 48 0.01 545 14 0.00 546 1 0.00 547 8 0.00 548 104 0.02 549 4 0.00 550 143 0.03 551 19 0.00 552 128 0.03 553 5 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Indices: 65782--70405 Score: 2726 Period size: 361 Copynumber: 12.9 Consensus size: 357 65772 CAATAAATAG * * 65782 ATTTATTTTTTAAATCTCCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTCTTTTATT 1 ATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * ** 65846 TCGAA-AAGGCTTGTATG-ATGGAAAACAATTATTTTAAT-ACAAAACAAAAGTTCATAATGATT 65 TTGAATAA-GCTTGTATGAATTG-AAACAAATATTTT-ATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATT * * * * * * * * 65908 TGACATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-AAATCGATTTGATAAACTA-ACTTATTT 127 TGAAATA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GATTCGGTAAAC-AGATTTATTT * * * 65971 TTTAAATCTTTACCTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAG 189 TTTAAATC--TA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAG ** * * * *** 66036 CTT-TATGAGTTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGAT 250 CTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATT-TGAAATAGAT * * ** * ** * 66099 AATTGTACAAATAGTCATGGCTATTTAAACTTAATCAATAAACAA 313 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAA * * ** * * * 66144 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CCGAATAAACTTTTATGAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGA 65 TTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAATATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA * * * ** * * 66992 AATAGATATTTGTTTAAATAGTGATAACTATTTGAACGTG-TTTAGAAAACA-ATTTTATTTTTA 130 AATA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTT * * * * * * 67055 AAATTTTTCTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATCATTCTATTCAAAATAAGCTT 192 AAA-TCTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTT * * * * * * * 67119 GCATGAAC-AAAACTAATTGTTTTTTGACAAAACCAAAGGTCGTAATATTTTGAAATAGATAATT 253 GTATGAACTAAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT * * * * 67183 ATTGAGATAGTCATAA-TAATTTGAACTTGTT-TAGTAAACAT 317 ATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAA * * 67224 ATTCATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA 1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA * ** * * * * * * ** 67287 TATAAAATAAGCTTATATTAATTGAAATAAATGTTTTTAT-T-ACAAA-AAAAGGTAACAATGAT 63 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAAT-ATTTTATGTCA-AAACAAAAGGTCATAACAAT * * * * * * * 67349 TTGAAATAGATAATTATTCAAATATTCATGACTATTTAAACTTG-TTTGATAAA-TGTATTTATT 126 TTGAAATA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAG-ATTTATT * ** * * ** 67412 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAATAAG 188 TTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAG * ** 67477 CTTGAATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAATCATAACAATTTG---TAG--- 250 CTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA * * ** 67535 ----TTCAAATACTCATAACGATTTGAACTTACTCGATAAACAA 314 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAA * * * 67575 ATTTATTTTTTAAATCT-TTGACTTATTAATTGTTTG-AATATTAAGAAAGTT-TTACTATTTTA 1 ATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA * * * * * * ** 67637 -TTGGAAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC-AATTTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATTGCAATT 63 TTTTG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAATATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATT * * * * * * * * 67700 TCAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTC-GAAAAGTAGATTCATTT 127 TGAAAT-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAA-CAGATTTA-TT * * * * * * 67763 TTTTAATTCTTTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTAATTAATTTTGAATAA 188 TTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAA * * * * 67828 GCTTATATGAACTAAAATAATT-TTTT-TGACAAAACAAAA-GCCATAATAATTTGAAATAGATA 249 GCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA * * * * * * 67890 ATTATTCAAATAGTGC-TGACTATTTGATCTAGTT-TAGTAAATAT 314 ATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAA * * * ** * * 67934 ATTTATTTTTAAAAT-TTTGTACTTATTAATTGTCAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT 1 ATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * ** * * * * * * 67998 CTGAATAAGCATGTACAAATAGAAACTATTGTTTTATAAT-AGAACACAAA-G---T--CAATTT 65 TTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAATATTTTAT-GTCAAAACA-AAAGGTCATAACAATTT * * * * * * * 68056 GGAATAAATAATTGCTT-AAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAAAAGATTTACTTTT 128 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Indices: 70272--70556 Score: 317 Period size: 147 Copynumber: 1.9 Consensus size: 147 70262 GTTGGCAATT * * * * * 70272 AGATTTATTTTTAATTTTCTTAGTTATTAAGTTTCAAAATATGATTAAATTAGTATTATTTTATT 1 AGATTTATTTTTAAATCTCTTACTGATTAAGTTTCAAAATATGAATAAATTAGTATTATTTTATT * ** * * * 70337 TCGAATAGAATAGTATGAAC-AAAACCAATTGTTTGATGACAAAATA-AAAAGGTTATAACGATT 66 TCGAACAGAATAGTATGAACAAAAAAAAATTGTTTGATGACAAAACATAAAA-GTAACAACGATT 70400 TGAAATGGTTTGATAAGC 130 TGAAATGGTTTGATAAGC * ** * * * 70418 AGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTGTAAATATTAATAAATTATTGTTATTTTAT 1 AGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTGATTAAGTTTCAAAATATGAATAAATTAGTATTATTTTAT * * * 70483 TTCGAACA-AACTTA-TATTAACAAAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACATAAAAGTAACAATG 65 TTCGAACAGAA--TAGTATGAAC-AAAAAAAAATTGTTTGATGACAAAACATAAAAGTAACAACG 70546 ATTTGAAATGG 127 ATTTGAAATGG 70557 ATAATTACTC Statistics Matches: 113, Mismatches: 20, Indels: 9 0.80 0.14 0.06 Matches are distributed among these distances: 146 9 0.08 147 59 0.52 148 2 0.02 149 39 0.35 150 4 0.04 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.11, T:0.40 Consensus pattern (147 bp): AGATTTATTTTTAAATCTCTTACTGATTAAGTTTCAAAATATGAATAAATTAGTATTATTTTATT TCGAACAGAATAGTATGAACAAAAAAAAATTGTTTGATGACAAAACATAAAAGTAACAACGATTT GAAATGGTTTGATAAGC Found at i:72041 original size:542 final size:540 Alignment explanation

Indices: 70512--86703 Score: 4235 Period size: 540 Copynumber: 30.0 Consensus size: 540 70502 ACAAAAAAAA * * * ** * 70512 AATTGTTTTATGACAAAACATAAA-AGTAACAATGATTTGAAATGGATAATTACTCAAATAGTTA 1 AATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAAGA-TAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * * * * 70576 TAATTATTTGAA-TCGG-TTCGATAAATCGATTTA-TTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTT 63 TAACTATTTGAACT-GGTTTAG-TAAATAGATTTAGTTTT-TAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT * * * * * * * * * 70638 GAAATATTAATAAATTAAT-TTATTCTA-TTTCGAATAAGCTTGTGT-AAGCT-AAAATAATTAT 125 GAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAA-TTGAAAA-AATTGT * * * * * ** * * ** 70699 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAAGGTGAAATAAATAATTATTCATGTAGTCTTAAGAAT 187 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAA-TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTAT * * * * * ** 70763 TTGAAC-TGGTTCG-ACAA-ACGAAATTA-TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTA--ACTTTTAGAA 251 TTGAACTTGTTTAGTA-AATA-G-ATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAA * * ** ** 70822 TATTACTAAATTAGTATTATTTTATTACGTATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATG- 313 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ACAAAGCAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCTAACAGTCATAACTATTTGAACT 193 ACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT * * * * * * * 71306 TGTTTAGTACACTA-ATTTACTTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTT-GAATGTTAATA 258 TGTTTAGTA-AATAGATTTA-TTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAATA * * * 71369 AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTAAAACAATTATTATATGACTAAACAA 321 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAA * * * * * 71434 AAAGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTTGGCA 386 AAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCA * * 71499 AACATATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTGGTGTTATTTTTA 451 AACATATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTA * * 71563 TCCAAATAGGCTTGTATGATTAGAAAC 514 TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * * * * * 71590 AACTATTTTATGAGAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGGTTGATATTTGTTCAAATAGTCATAA 1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * * * 71655 CTATTTAAACTGGTTTGGAAAATAGCTTTAGGTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATA 66 CTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATA * * * * * 71720 TTAATAAAATCA-TATTGTTTTATTTTTGATAAGTTTTTATAAATTGAAACAATTGTTTTAGGAT 131 TTAATAAAAT-AGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGAC * * * 71784 AAAACAAAAGGTCATAATGACTTTAAA-AGGATAATTGTTCAAATAATCA-AATCCATTTAAACT 195 AAAACAAAAGGTCATAATGAATTTAAATA-GATAATTGTTCAAATAATCATAA-CTATTTGAACT * * * 71847 TGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTCATTTTTTTTTGAATGTTAATAA 258 TGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATT-ATTTTTTTTAGAATATTAATAA ** * 71912 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAA 322 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAA * ** * * 71977 AGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCCACCAGTCTTAACTATTTGAACTGGCTTGGCAA 387 AGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAA * * * * * 72042 ACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTATAATC 452 ACATATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATC * ** 72107 CGAATAAGTTTGTATGAAAAGAAAC 516 CGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * 72132 AATTGTTTTATGACAAAATAAAGATTATAATGATTTGAGATAGATAATTCTT--TA-AGTCATAA 1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * ** 72194 CTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-TG-TTATTAATTTTCAAAATA 66 CTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATA * * * * * * * 72255 TTAATAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAA-TTTTACATGACTAGAAAGAATTGTTTTATGA 131 TTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTT-TATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGA * * * * 72318 CAAAACAGAAA-GTCATAA-CAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGA-CATGACTATTTGAA 194 CAAAACA-AAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATA-ATCATAACTATTTGAA * * 72380 CTTGTTCCA-TAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TCTAC-C--TATTTATTTTCAGAATATTA 256 CTTGTT-TAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCT-TACTCATTATTT-TTTTTAGAATATTA * * * * 72439 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAT-AAATAATTGTTTTATGACAAA 318 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTATTTTATGACTAA * *** * * * * * * * * * * * * * 72503 ATAAAAGAACATAACTATCTGAAAGAAATCACTATTCAAACAGTCATAACAATTTGAATCT-GCT 382 ACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT-AAACTGGTT **** * * * * * * * 72567 CAATAAAAAAATTTA-TTTCCTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGCAATATTAATAAATTATTA 446 TGGCAAACATATTTACTTT-TTAAA---TCT-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTA *** * * * 72631 TTATTATTT-TTTAAATATGCTTTTATGAATAGAAAC 505 TTATT-TTTATCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * * * * 72667 AATTGGTTTAAGACAAAATGAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATTATTGTTCAGATAGTCAT 1 AATTGTTTTATGACAAAAT-AAAGATAATAA-TGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * 72731 AACTATTTGAA-TGTGTTCA--ACAT--ATTTA-TTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA 64 AACTATTTGAACTG-GTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA * * *** * * * ** ** 72789 AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATATGAAATAAGCTTGTACGAA-CAAAAACAATTACTTT 127 AATATTAATAAA-ATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAA-AATTGTTTT * * * * 72852 ATGACAAAA-AGAAAGGTCAAAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAATCATAACCATTT 190 ATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTT * * * * * * * * ** 72915 GGACTTG-TTAGGTAAACAAATTCA-TATTTTAAATCTCTTACTTATTA--ATTTTTGGAGCATT 253 GAACTTGTTTA-GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATT * * * ** 72976 AAT--A-T--T-TTA---T-TTT-GAATAAGCCTATATGAA-CCAATACAATTATTTTATGA-TG 317 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAA-ACAATTATTTTATGACT- * * * * * * * 73028 AAACAGAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTTTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTG 380 AAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGG * * * * * ** * * 73092 TTTGGTAAACATATTTA-TTTTGAAAATATTTTACTTATTAATTGTCAAACTATTAAAAAAATAA 444 TTTGGCAAACATATTTACTTTT--TAA-A-TCT-CTTATTAATTTTGAAA-TATTATTAAATTAG ** ** ** * 73156 TATTATTTCAATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAAAAAAAC 503 TATTATTTTTATCCGAATAAGCTTGTATG--ATTAGAAAC * * * * * * * * * 73196 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTTTTTAAATAGTCATA 1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAGA-TAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA ** * * ** * * * * * 73261 ACTATTTGAACTTATTCAATAACCAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTTTCT-AAA 65 ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT-TGAAA * * * *** * * * ** 73325 TATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAAAATAATTTTATGA 129 TATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGA * * * * * * * * * 73389 CAAAATAAAAGGTTATAACGAATTGAAATAGGTAATTCTTCAAATAGTGATAACTATTTGAATTT 194 CAAAACAAAAGGTCATAATGAATTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTT * * * * * 73454 ATTT-GATAAATAGATTTA-GTTTTTAAATCTCTTACTTATTA--CTTTTTGGAATATTAATAAA 259 GTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAATAAA * * * * * * * * 73515 TTAGAATTATGTTA-TTCTGAATCAGTTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-TAGAACAA 323 TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTA-AACAA ** * * ** * * * * * * ** * ** 73578 AAAATCATAATGACTTGAAATAGATAATTATTCACACACT-TATAACTATATGTACTAGTCAGGC 386 AAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGGTTTGGC * * * * * * * * 73642 CAACATATTCATTTTTTAAATCTGTTACTTATTACTTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTA-C 450 AAACATATTTACTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATT * * * * * 73706 TTTATTCTGAATAAGATTGTATTAATAGAAAT 510 TTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * * * * * * * 73738 AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATA 1 AATTGTTTTATGACAAAATAAA-GATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * *** * 73803 ACTAATTGAATTGGTTTGGT-AATCAGATTTAGTTATTAAA--TC-T-CTTATTAA-AGGTCATA 65 ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAAT-AGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA-A *** * ** * 73862 ATGATT--TAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACT-A-TTTAAATTG-GTTCGGTAAACA 128 AT-ATTAATAAAATAG-T-ATTATT--T-TATTTTTGA-TAAGTTTTTA-TGAATT--G-AAA-A ** * *** * * * ** * * 73922 AATT-TATTT-T-TTAAATCTCTCA-GT--TATTAAATTT-CATA-AT-ATTACT-ACATTAGT- 181 AATTGT-TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGAATTTAAATAGATAATTGTTCA-AATAATC ** * * * * 73976 ATTATTTTATTCTGAA-TAAGCTTATA-TGAACATAAATAATTATTTTATGATAGAA-CAAAATG 243 A-TA-ACTATT-TGAACT-TG-TT-TAGT-AA-ATAGAT--TTATTTT-T-TTA-AATC----TC * * ** * * * * * 74038 TTA-TAATGATTTGAAATATATAATTATTCAA-AGAGTCA-TAATTATTTAAATTGGTTC-AATA 291 TTACTCATTATTT--TTTTTAGAA-TATT-AATA-AATTAGT-ATTATTT-TA-T--TTCAAATA * * * * *** * * * * 74099 TGCATGTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT 346 AGCTTGTATGAAT-TGAAAC-AATT-ATTTTATG-ACTA--AACAAA--AG------GTTA---- * ** * * * * * * 74163 GAATAGGCTTGTATCATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAA 393 GAACA-ATTTG-A--A--ATAGATAATTG---T-T--C---A-AATAG-TCTTAACTATTT-AAA * * ****** * * * * ** * * 74228 -TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAT-TGATTAAATAA-ACTGAATTATTTTTTA 440 CT-GGT--TTG-GCAAACATATTTACTT-TTTAAATCT-CTT-ATTAATTTTGAAATA-TTATTA * *** * * * 74290 AATCTCCAACT-TCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGCAATAT-TATTTTATTTAG-GAT 497 AAT-T---AGTAT-T--ATTTTT---ATCCGAAT-AAGC--T-TGTA--TGA-TTAGAAAC * * * *** ** * 74348 AAGT-TTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAA-AATAAAAAGTCATA-ACAATT-TTACA 1 AATTGTTTTATG-AC---AA-AA-TA----AAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTT-CA ** ** * * * 74409 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAA 55 -A-AT-A--G------T---CATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTT-AAA * * ** * * 74474 TTTCTTGCTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAAATAGTATTA-TTTATTTTCAAATAAGTATG 105 TCTCTTGCTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTT-TGATAAGTTTT * * * * * * * * 74537 TATAAATTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAATG-ATTTGAAATAGATTATTT 168 TATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTG * * * * * ** * 74601 TTCTAATAGTCTTAACTACTTAAAC-TGATTCGGTAAATACATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA-T 232 TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACT * * ** * * * 74663 --TTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCTA-TATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATAAAC 296 CATTATT-TTTTTTAGAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT ** * * * * ** * 74725 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATTATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATA 359 TGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA * * * * * * * 74789 ATCATAACTATTTGAACTGG-TTGAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA 424 GTCTTAACTATTTAAACTGGTTTG-GCAAACATATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTGA * ** ** * * 74853 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAATTTTGTATCAATA-AAAC 487 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC ** * * ** * ** * * * 74906 AATTGTTTTGCGACTAAACA-AAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATAATTCAAGTGGACAT 1 AATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * ** * * * *** 74970 GACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTT-AGA 64 AACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA-A * * ** * * ** ** 75034 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTTTGAATAAACTTGTAAGAACAGAAGCAATTGTTTTAT 128 ATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTAT * ** * * * * * * 75098 AACAAAATGAAAGATCATAATG-ATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATACT-AAAACTATTTGAA 192 GACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA * * * * * * * * 75161 CTCGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTATTTATTA-ATTTTTT-GAATTTTCATA 256 CTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAATA * * * *** ** * 75224 AATTAGTATTA-TTTATTCCTAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAA 321 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAA * * * * * * * * 75288 AAGGTCATAATAATTTAAAATAGATAATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-GTGTTCAG 386 AAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTG-GTT-TG ** * * * * * * * * 75352 AAAAAAAGATTTA-TTTTTAAAATTTTTACTTCTTAATTTTTGGACTATTAATAAATTTA-AATT 448 GCAAACATATTTACTTTTT-AAA--TCT-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAA-TTAGTATT ** * ** 75415 A-TTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACC 507 ATTTTTATCCG-AATAAGCTTGTATGATTAGAAA-C * * * * * * 75449 AATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAA-AAGGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT 1 AATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGAT-AATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT ** * * * * * ** 75513 AACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTCT--TTTTTAATTCTGTTACTCGTTAATTTTCT-A 64 AACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATT-TAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT-TGA * * * * *** * * * 75575 AATATTAATAAATTGGTATTATATTACTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTAT 127 AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTAT * * * * * * * * * 75640 TACGAAAGAAAAGGTCAT-ATTAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAGTCATTATTATTTGAA 192 GACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA * * * * * * * * 75704 CTTG-TTCGATAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTA--ATTGTTAAAATATTAAT 256 CTTGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAAT * * * ** ** * * ** 75765 AAATTAATAGTATTTTA-ATCCGA-AA-CTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGAAAAAAGC 320 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAA-C ** * * * * * * * * * 75827 AAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTT-ATATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTC 384 AAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCTTAACT-ATTTAAACTGGTTT * * * * * * * 75890 GGTAAACAGATTCA-TTTTTCAAATCATTTACTTAGTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGTA 447 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382 ACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTT * * * 77497 ---ATA-A-ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT 447 GGCAAACATATTTACTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT ** * * * * 77557 A-TTTTATTTTGGATAGGCTTGTATGATGAAAAAC 507 ATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * ** * 77591 AATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTTCGTAACT-ATTTGA-AGTAGATAATTGTTCAAATTA-CC 1 AATTGTTTTATGACAAAATAAA-GATAATAA-TGATTTGAGA-TAGATAATTGTTCAAA-TAGTC * * * * *** * 77653 ATAACTATGTGAA-TCGATTT-GATAAACT-GACTTATTTTTTAAATC-CCAACTTATCAATTTT 62 ATAACTATTTGAACT-GGTTTAG-TAAA-TAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT * * * * * 77714 TGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTTTATGAATTGAAATAATTGTT 124 TGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTT * * ** ** * * * * * 77778 CTATGATAAAATGAAAGGTCATTTTTATTTTAAACTA-ATAATTGTTCAAATAGTTATAGCTATT 188 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTTAAA-TAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATT * * * * * * 77842 TGAATTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTTAATTTCTT-GT--TTATTATTTTTT-GAATAT 252 TGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATT-TTTTTTAGAATAT ** * * * * * ** 77903 CGATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATCAGCATGTATGAACTAAAACGAATTATTTTATGGTT 316 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAC-AATTATTTTATGACT * * * * * * 77968 GAATAAAATGTTAGAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATATAAACTGGT 380 AAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGT *** * * * 78033 TCAACAAAC-TCATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGT 445 TTGGCAAACAT-ATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTGA-AATATTATTAAATTAGT * * 78097 A--ATTTTTACTTCGAATAAGTTTGTATGCA-TAGAAAC 504 ATTATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAAC *** * ** * * * **** * * ** * * 78133 AATT-TCAGATAGATAATTGTTCAAA-TTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTTAGA 1 AATTGTTTTAT-GACAA--AAT-AAAGATA-ATAATGATTTGAGATAGAT-A-ATTG--TTCAAA * * * * * ** * * 78196 TAG--ATAACT-GTTCAAATAG-TTA-TAACTATTTGAACTGGTTTTATAAATAGAT-TTAG-TT 57 TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGTAA--A-TAGATTTAGTTTT-TAAAT--CTCTT-GCTT * ** 78254 TTTATATTTGTCCAAATATTAA-AAAATTAGTATTATTTTA-TTTTGAATAA-TTTTGTATGAAT 115 ATTA-ATTT-TTGAAATATTAATAAAA-TAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTT-TATGAAT * ** * * * * * * * 78316 AGAAGCAACTGTTTTATAAAAAAACAAAATGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATAGTTCGAAT 175 TGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAAT * ** * * * * * * * * 78380 GGA-CATGGCTATTTCAACTTCTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAAAAT-TTTTACTTATTA-- 239 -AATCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATT * * * * * * * * *** 78440 ATTGTCAAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAACCTTGTATGAACAAAAACAA 303 TTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAA * * * * * * * 78504 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC 367 TTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAAC * ** * *** * * * 78569 GATTCGAACTTGTTTCATAAACAGATTTA-TTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTGTCATAATA 432 TATTTAAACTGGTTTGGCAAACATATTTACTTTTT-AAATC---T-CTTATTAATTTTGA-AATA * * ** * * 78633 TTAATAAATTTGTATTA-TTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA 491 TTATTAAATTAGTATTATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * *** * * * * * * * 78683 AACTATTTTATGA-AAAA-AAAGGTTATAGCAATTTCAAATAAAGAGTCGTTCAGATAGTCATAA 1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA * * * ** * * 78746 TTATTTAAACTTGTTT-GATAAATAGATTCT--TTTCTTAAATCTCTTAATTGTTAATTTTTGGA 66 CTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAGATT-TAGTTT-TTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAA * * *** * * * * 78808 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT-AGACTTTTATGAACTGAAACAATTCTTTTAT 128 ATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTGATAAG-TTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTAT * * * * * * * 78872 GAAAAAACAAGAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTTA-AACTATTTG-A 192 GACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA * * * * * * * ** * *** 78934 TTTAGTTCAGCAAACAAATTTA-TTTTTTAAATTTTTTACTTGTTA-ATTTCCGA-AATATTAAT 256 CTT-GTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAAT * * * * * * *** 78996 AAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAGACAATTGTTTTATGACCGGACA 320 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACA * * * * * * * * * 79061 AAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTTGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA 385 AAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGG * * * * * * * * 79125 TAAATAGATTTA-TATTTCTAAATATATTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATGAGTATTA-TT 449 CAAACATATTTACT-TTT-TAAATCTCTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTT * * * * ** * 79188 TTATTCCCAACAAACTTATATGAGCAAAAAC 511 TTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * * ** * * * 79219 ATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGATA-ACAATAATTGTTCAAGTAGTCAT 1 AATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATAATAATGATTTGAGATA-GATAATTGTTCAAATAGTCAT * ** * * ** * * 79283 AATTATTTGAACAAG-TTAGGTAAACAAAAATATTGTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA 64 AACTATTTGAACTGGTTTA-GTAAATAGATTTAGT-TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA * * * ** ** * * 79347 AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTTTGAATAAGCTAGTAACAATTG-AAAATTTATTTT 127 AATATTAATAAAAT-AGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTT * * * * * * * 79409 ATGATAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTG 190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG * * * * * * * * * 79473 AACTGGTTTGGCAAATA-ATTT-TTTTTTTAATTCTCTTAGTTATTA-ATTTTTTGGAATATTAT 254 AACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAA * * * * * * * * * 79535 TAGATTTGTATTATTTTATTCCGAGTAAGCTTGTATGGA--CAAA-AATAATTATTGTGA-TAGA 319 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATT-TTATGACTA-A * * * * * * * ** * 79596 ACAAAAAGTTATAACAATTTGACATATACAATTGTTCAAATA--ATTAACTATTTGAACTAATTC 382 ACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTT ** * * * * 79659 GATAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTAT 447 GGCAAACATATTTACTTTTT-AAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTAT * * * * 79723 TA-TTTTATTCCGAATAAGCTTGAATAATAAAAAAAC 506 TATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGAT-TAGAAAC * * * * * * * * * 79759 ATTTGTTATATGACCAAACA-AAAGGTAAAAAATGATATGAAATA-ATAATTGTTGAAATGGCCA 1 AATTGTTTTATGA-CAAA-ATAAAGAT-AATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * ** * * * * * ** 79822 TAATTATTTGAAATTATTT-GATAAACA-AATCAATTTTTAAATCACTTATTTATTAATTTTTGA 63 TAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA * * * ** * * ** * * 79885 AAAATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAGATAAGCTTGTATGAATTGAAATGACTATTTTAT 127 AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTAT ** * * ** * * * 79950 GACAAAACAAAATTTCATCATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTTATGTAGTCTTAACTATTTAAA 192 GACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA ** * ** * * * * * * * 80014 CTACTTCACCAAACAGATTTA-TTTTTCAAATCTCTTAGT--TT-TTAATTTTCAAAATATTATT 256 CTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATT-TTTTTTAGAATATTAAT * ** * * 80075 AAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAGCCT-AAATAATTATTTTAT-AATAGA 320 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA-ATTGAAACAATTATTTTATGACTA-A * * * * * * 80137 ATAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGGTAATTATTC-AA-A--C--AA-GA-TT----TGGTTT 382 ACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTT * * * * * 80190 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT 447 GGCAAACATATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT * * * * 80255 A-TTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGATGAAAAAC 507 ATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * ** ** * * * * 80289 AATTGTTTTATGAGGAAACA-AAAGTTCATAGCGATTCAAAATAGATAATTGTTAAAATGGCCAT 1 AATTGTTTTATGA-CAAA-ATAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * ** * * * * * * 80353 AATTGTTTGATTTGATTT-GATAAATAGATTCACTTTTT-AA-GTC--AC--ATTAATTTTTGGA 64 AACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAA * * * * * * * 80411 ATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTTTATGAATTGAAACATTTGTTTTATG 128 ATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATG * * * * 80476 ACAAAACAAAAGGTCATAAT-AATTTAAAATATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT 193 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ACTATTTGAACTAGCTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT 65 ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAAT * * * 80952 ATTAAT---A-AG------------CTTGCATAA-----TA--AA---AAACAATTGTTTTATAA 130 ATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGA * * * *** * 80991 CAAAACAAAAGATCATAA-GGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-AAC- 194 CAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT * * * * * 81053 TGATTTGGTAGATA-A---A----TTT--AT-TCTTACTAATTA-ATTTTTGA-AATATTAATAA 258 TG-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAATAA * * * * * * 81105 ATTACTATTATTTTATTCCATATAAGCTTGTATTAATTGAAGCAATTGTTTTATGA-TAAA-ATA 322 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACA-A * * * * * * ** 81168 CAAAGTTATAACAATTTTAAACAGACAATTGTTGTATGACTAAACAAAAAGTCAGAA-TAATTTG 386 -AAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAA---TTG--T---T---CAAATAGTCTTAACT-ATTT- * * * * * 81232 AAA-TAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTTATTCGACAGAACGC--ATTAATTT 437 AAACT-GGT--TTG-GC-AA-A--C---A-TATTT-ACTTT-TT--A-A-ATCTCTTATTAATTT * * * * * * 81294 T---TTATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTCGAATAAGC-TGATATGA--AAAAAA 484 TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCCGAATAAGCTTG-TATGATTAGAAAC * * ** * 81346 AATTTGTTTTATGATAAAATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATA 1 AA-TTGTTTTATGACAAAATAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * ** 81411 ACCATTTGAACTGGTTTGGTAAAGAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTAATTAATTTTCAAAAT 65 ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAAT * * * ** * * * * *** * 81472 ATTAAT-AAATCATTATTAATTTATTCTAAATAACTCTATAAGAGCAGAAATAATTGTTTTATGA 130 ATTAATAAAAT-AGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGA * * * * * * * * 81536 CAAAGCAAAAGATCCTAATG-ATTTGAAATGGATAATTATTCAAATCCA-CATGACTATTTGAAT 194 CAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAAT-AATCATAACTATTTGAAC * * * * * * 81599 TTG-TTAGGTAAATAGGTTTA-TTTTTTAAATCTCCTACTTATTA--ATTTTCAAAATATTAATA 257 TTGTTTA-GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAATA * * * ** * * 81660 AATTAGTATT-TTTT-TTT--AATAAACTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTATGAAAAAAGAG 321 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAA * * * * * * * * * * * * * * 81721 AAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTCAATTTGCTCGGTA 386 AAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCA * * * 81786 AACAAATTTA-TTTCTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA-T 451 AACATATTTACTTT-TT-AA-ATC-T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATT * * * ** * 81849 TTTATTTCAAATAAGGTTGTATGAACAAAAAC 510 TTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * * * * 81881 AATTGGTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAACT-ATTTGAAAGAGATAATTGTTCAAATAGTTAT 1 AATTGTTTTATGACAAAATAAA-GATAATAA-TGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * * * * 81945 AACTATTTAAACAT-GTTCA--AAA-A-ATATATTTTTTAAAACATTTCTACTTATTAATTTTAG 64 AACTATTTGAAC-TGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATC-TCT-TGCTTATTAATTTTTG ** * * **** * * * * * * * 82005 GCATATTAATAAATTTA-TATTATTTCATTCAAAATAAGCTTGTCTAAATAGAAATATTTGTTTT 126 AAATATTAATAAA-ATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTT * * * * * 82069 GTGACAAAACAAAAGGTCAAAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTA 190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG ** * * * 82133 AACTTGTTCGGTAAATAGATTCA-TTTTTTAAATCTCTTACTCATTA--ATTTTTGGAATATTAA 254 AACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAA * * * * * * * * * 82195 TCAATTAGTATTATTTTATTTCAAATCAGCCTATA-GAACTGATACAATTGTTTTAT-AATGAAT 319 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACT-AAA * * * * * * * ** * * 82258 CAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTGAAATAGT-TATGATTATTTGTACTTGTTC 383 CAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGGTTT ** * * * 82322 GATAAACATATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTATTTGTCAAACTATTAATT-AATTATTA 447 GGCAAACATATTTACTTTTT-AAATCTCTTA-TTA--ATTT-TGAAA-TATT-ATTAAATTAGTA * * * * * 82385 TTATTTTAATTCG-ATAAGCTTGTATGAATAAAAAA 505 TTATTTTTATCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * * * ** * * * * 82420 AAGTTATTTTTTGATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAT 1 AA-TTGTTTTATGACAAAATAAAGA-TAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT ** * * * 82485 AACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTT-TTCAATTGTTTG 64 AACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCT-TGCTTATT-AATT-TTTG * * *** * * * * ** 82548 -AATATTAATAAATTTA-TGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAATTTTGTTTT 126 AAATATTAATAAA-ATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAAAATTGTTTT * * * * * * * 82611 ATGACAAAACAAAAGGTTATAA-CAATTTGAACAGGTAATTGTTTAAATAGA-CATGACTATTTG 190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTTAAATAGATAATTGTTCAAATA-ATCATAACTATTTG * * * * * 82674 AACTTGTTCAGTAAATAGATTCA-TTTTTTAATTCTCTTA-T--TTATTAATTTTTGGAATATTA 254 AACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATT-TTTTTTAGAATATTA * * * * * ** * * 82735 ATAAGTTAGAATTATGTTATTTCGAATAAACTTGTACAAATAGAAACAATT-TATTTGTGA-TAA 318 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTAT-TTTATGACT-A * * ** * * ** 82798 AACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAT-TATAACTA-TTAGTACTAA 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ATTGATTCAGTAAACAAAATTA-TGTTTTAAATTTTTTACAGATTA-ATTTTTGA-AATATTAAT 256 CTTG-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAAT * * * * * * * * 83272 AAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAA-ATTAGTAAGAATTGAAAAAATTGTTTTACT-ACAAAA 320 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAATTGAAACAATTATTTTA-TGACTAAA * * * * * * * * * * * * 83335 TAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAAAATTATTCATATAGGCTTAACTATTT-GAGTCGGTTC 383 CAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACT-GGTTT ** * * * * 83399 AACAAA-TTAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTATTACATTAGTAT 447 GGCAAACAT-ATTTACTTTTTAAATCTC----TTATTAA-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTAT * * * 83463 TA-TTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAAT 506 TATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC * * * * ** * * * 83498 AGTTGTTTTATGAAAAAACAACAAGTTAA-AACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCAT 1 AATTGTTTTATGACAAAA-TA-AAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * * * * 83562 AACTATTTAAACTGATTTGGTAAACATATTTA-TTTGTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTTAA 64 AACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTT-TTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAA * **** * * 83626 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT-AGACTTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTTT 128 ATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTGATAAG-TTTTTATGAATTG-AAAA-AATTGTTTT * * * *** * * 83688 ATGACAAAACAAAAGTTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCGTAATTATTTG 190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG ** * * * * * * 83752 AAC-TAATTCGATAAACT-GATTTA-TATTTTAAATTTCTAACTTATTA--ATTTTTA-AATTAT 254 AACTTGTTTAG-TAAA-TAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAA-TAT * * * * ** * * * * * 83811 TAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTACAAACTAAAAAAATTGTTTTAGGA-TA 316 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACT- * * * * * * * * * 83875 AAATAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT 380 AAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGT * * * * * * * * * * 83940 TTTGTAAATAGATTT-TTTTTTAATTTCTTACTTGTTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATA 445 TTGGCAAACATATTTACTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAA--TTTTGAAATATTATTAAATTAGTA ** * * 84003 TTA-TTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTA-AAAC 505 TTATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAAC * * * * ** 84039 AATTATTTTATGACTAAACA-AAAGTTCAA-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTT 1 AATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAAGAT-AATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * ** * * * 84102 TAACTATTTGAACTGGATTAACAAACACA-TT--TTCTTAAA--TC---CTTATTAATTTTT-AG 63 TAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA- * ** * * * * * * * ** 84158 AATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-CTTCGAAGAAGCTTATATGAACAGAAATAAA-TGTTTT 127 AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAATTGAAA-AAATTGTTTT * * * * * * * * 84221 AGGATAAAA-TAAAGATCATAACG-ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTG 190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG * * * * * * 84284 AA-TTGGTTCAGTAAAGAGATTTA-GTTTTTAAA-CTC-T--T-ATTA-ATTTTTGA-AATAATA 254 AACTT-GTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTA * * ** * * * * 84340 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AATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGATAATAATGATTTAAAATTGATAGTTGTTTAAATGGCCGTG 1 AATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * 85148 ATTATTTGAACT-GATTCGATAAACTAG-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA 65 ACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAA-TAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAA * * * * 85211 ATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-AAAACAATTGTTTTAT 128 ATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTTGATAAGTTTTTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTAT * * * * * * 85275 GACAAAACAAATGGTCATAATG-ATTATAAATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAACTATATAAA 192 GACAAAACAAAAGGTCATAATGAATT-TAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA * * * * * * * * * * 85339 CATGTTCAGTAAATAGGTATATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTA-ATTTTTT-GAATATCAATA 256 CTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTTAGAATATTAATA * * * * * 85402 AATTAGTATTATTTTA-TTCTAATTAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTGTTATATGACTAAACA 321 AATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACA * * * ** * * * * * * * 85466 AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTGTTAACTATTTGAATTGATTTGAC 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Indices: 73865--80959 Score: 3976 Period size: 181 Copynumber: 39.6 Consensus size: 181 73855 GGTCATAATG * * * * * * * * 73865 ATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTT-AAATTGGTTCGGTAAACAAATTTAT 1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTAT * * * * * * * * 73929 TTTTTAAATCTCTCAGTTATTAAATTTCATAATATTACTACATTAGTATTATTTTATTCTGAATA 65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATA * * * * * * ** 73994 AGCTTATATGAAC-ATAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAATG-TTATAATG 130 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACA * * * * * * ** 74046 ATTTGAAATATATAATTATTCAAAGAGTCATAATTATTT-AAATTGGTTC-----A-ATATGCA- 1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTAT * * * * 74103 TGTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT 65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT * * *** * 74167 AGGCTTGTATCATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACA 129 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACA * * * * * * * 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ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATT 80920 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAA 66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAA 80960 GCTTGCATAA Statistics Matches: 5343, Mismatches: 1261, Indels: 621 0.74 0.17 0.09 Matches are distributed among these distances: 167 7 0.00 168 7 0.00 169 244 0.05 170 8 0.00 171 10 0.00 172 7 0.00 173 5 0.00 174 146 0.03 175 179 0.03 176 354 0.07 177 403 0.08 178 424 0.08 179 311 0.06 180 934 0.17 181 1443 0.27 182 555 0.10 183 169 0.03 184 14 0.00 185 11 0.00 186 5 0.00 187 5 0.00 188 20 0.00 189 32 0.01 190 7 0.00 191 1 0.00 192 4 0.00 193 1 0.00 194 7 0.00 195 10 0.00 197 2 0.00 198 5 0.00 199 1 0.00 200 1 0.00 201 6 0.00 202 5 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (181 bp): ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATT TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA GCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACA Found at i:75686 original size:899 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Indices: 74105--88602 Score: 3725 Period size: 899 Copynumber: 16.3 Consensus size: 878 74095 AATATGCATG * * * 74105 TTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGG 1 TTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAAG * * 74170 CTTGTATCATGAA-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGAT 65 CTTGTA--A-GAACAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-GATTTG-AATAGAT * * * * * 74233 AATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTAAATAAACT-GAATTATTTTTTAAATCTC 125 AATTGTTCAAAT-ACTATAATTATTTGAACTTG-TTAAGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTA ** * * * ** * * 74296 CAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGCAATATTATTTTATTTAGGATAAGTTTTTATGAA 187 TTA-TTATTAATTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTA--ATAAGCTTTTATGAA * * * * * * 74361 CTGAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAACAATTTTACATAGATAATTGTTCAAAT 247 CTAAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAACATAGATAATTATTCAAAT * * * * * 74426 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATT 312 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A--A-TAATTCTTGAAACGTCAATAAATTAACATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTATG--CTT 189 ATTATTAATTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTA-TTTATTT--AATAAGCTTTTATGAAC-T ** * * ** * * * * * 85077 AAAAACAATTGTTTTAAGACAAAAC-AAAAGATAATAATGATTTAAAATTGATAGTTGTTTAAAT 249 -AAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTAACATAGATAATTATTCAAAT * * * * * ** * * * 85141 GGCCGTGATTATTTGAACTGATTC-GATAAACTAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT 312 AGTCATAACTATTTGAACTG-TTCAGA-AAAAAAATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATT * * * 85205 TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTG-GATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTG 374 TTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTG * ** * * * 85269 TTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTAT-AAATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAACTA 437 CTTTATGACAAAACAAAAAGTCAAAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * * * * ** * * * * * * 85333 TATAAACATGTTCAGTAAATAGGTATATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTGAATATC 501 TTTGAACTTATTTGGTAAATAGAT-TCTTTTTT-AAATCT-TTAC-TATTAA-TTTTTAAATATT * * * * 85398 AATAAATT-AGTATTATTTTA-TTCTAATTAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTGTTATATGACT 561 AATAGATTGA-TATTA-TTTACTTC-AAATAAGCTTGTATGAA---AAACAATTGTTTTATGAC- * * * ** * * * 85461 AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTGTTAACTATTTGAATTGAT 619 AAA-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTG-G * * ** * * * * * * 85526 TTGA-CAAACACAACTATTTTTTAAAT-AT-CTTATTAATTTTTAGAATATT-ATTAATTTTTTT 682 TTGAGTAAACATATTTAGTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTATATT ** * * * * * 85587 ATTTTTATTTGAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAAATGTTTTATG-AAAAAG----AGAT---A 747 A-TTTTATTCAAATAA-CTTGTATCAACAGAAACAATTGTTTTACGAAAAAAGCAAAAAATCAAA * * * ** * * * * * * ** ** * * 85644 ACGATTTGAGATTGATATTTATTTAAATAGTCAT-ATCTATTTAAACTGGTTCAAAAAATAGCTT 810 ACAAGTTGAAATAAATAATTAATTATATAGACATAAT-GATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATT *** 85708 TGGTT 874 CATTT * * * * * * * 85713 TTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAGCATT-TTTTATTTTGGATAAG 1 TTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAAG * * * * ** * * * 85777 TTTTTATA-AACTAAAACAATTGTTTTATGATAAATTAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATA 65 CTTGTA-AGAAC-AAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-GA-TTTGAATAGATA * * * ** * * 85841 ATTGTTCAAGTAGTCA-AATCTATTTTAACTTGTTCGGTAAAGAGATTTATTTTTTAAAATCTTT 126 ATTGTTCAAATACT-ATAAT-TATTTGAACTTGTTAAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTAT * * * * * 85905 TGCTAATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTCTTTAATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC 188 T-ATTATTAA-TTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTATTT-ATT-T-AATAAGCTTTTATGAAC * * * ** * * * * ** * * * 85970 TGACATAATTGTTTTATGACTAATCAAAAGGTCAGAATGA-TTAGAAATAGATAATTGTTCTAAT 248 TAAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTA-ACATAGATAATTATTCAAAT * * * * * * * * * 86034 AGTCTTAAATATTTAAATCGGTTCGGCAAACATATTT-TTTTT-AAATCTTTTACTTACTAATTT 312 AGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCAGAAAAAAAATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTT * * * * * * ** 86097 TTGGAATATTATTCAATTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTAT 375 TT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGC * * ** * * * 86161 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AACTATTTGAAATAAGTAATTGCTCAAATAGTCATAGCT-ATTTGAACTTGCTCGGTAAACAAAT 809 AACAAGTTGAAATAAATAATTAATTATATAGACATA-ATGATTTGAACTTATTCAGTAAACAGAT * 86604 TTATTT 873 TCATTT * ** * ** * 86610 TTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATATG 1 TTTAAATCTCATACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAAG ** * * ** * * * 86675 CTTGTCTGAATAGACA-CAATTGATTTATGGGAAAACAGAAGGTC-----A--T--A-A-CT-A- 65 CTTGTAAGAACA-A-AGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAGATTTGAATAGATAAT * 86726 T-TT--AA-AC-------A--TG----T-TTAA-AAAATAGATTTATTTTTT-AAT-TATTA--A 128 TGTTCAAATACTATAATTATTTGAACTTGTTAAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTATTATTA * * * * * *** 86768 -T--TTTTAGAATATTAATAAATTCATATATTATTTTATTCAAAATAAACAGGTATGAA-TAGAA 193 TTAATTTTTGAATTTTAATAAATT-A-GTATTA-TTTATT--TAATAAGCTTTTATGAACTA-AA * * 86829 ACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTC 252 ACAATTACTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTT-AACATAGATAATTATTCAAATAGTC * * * * * *** 86892 ATAACTATTTAAACTTGTTCA-ATAAACAGATTCATATTTT-AAATCTCTTAAACATTAAATTTT 316 ATAACTATTTGAAC-TGTTCAGA-AAAAAAATTTAT-TTTTAAAAT-TTTTACTTATT-AATTTT * * * * 86955 GAAATATTAATAAATTA-TCATTATTTTATTTTG-AATAAGAC-TATATGAACTAATACAATTGT 376 TAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAAATAAG-CTTGTATGAAC-AAAACAATTGC ** * * * * * * * 87017 TTTATGATGAAACAAAACGTCATAACT-ATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTCT 438 TTTATGACAAAACAAAAAGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT * ** * * * 87081 TTGAACTTGTTTAATAAACATATT-TATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTA 502 TTGAACTTATTTGGTAAATAGATTCT-TTTTT-AAATC-TTTAC-TATTAATT-TTTAAATATTA * * * ** * * * 87145 ATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATATA-CTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATAACAAA 562 ATAGATTGATATTA-TTTACTTCAAATA-AGCTTGTAT---GAAAAACAATTGTTTTATGAC-AA * * ** * * * * * * ** 87209 AAAAAAGTCA-AACAATTTGAAACAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCG 621 AAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-G * * * * 87273 A-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAGTTGTTT-CAATATTAATAAATTTATAT 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Indices: 74105--86703 Score: 1973 Period size: 181 Copynumber: 70.5 Consensus size: 179 74095 AATATGCATG * * * ** ** * 74105 TTTAAATCTCCTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAG 1 TTTAAATCT-TTACTTAGTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAA * ** * * * ** * * 74169 GCTTGTATCATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATA 64 GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAGAAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAGATA * * *** * 74234 ATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTAAATAAACTGAATT-ATTT 129 ATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAG-ATTCATTT ** * * ** * * * * 74286 TTTAAATCTCCAACTT-CTCAATT-TTTGAAATATTAATAAAGCAATATTATTTTA-TTTAGGAT 1 TTTAAATCT-TTACTTAGT-AATTGTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCA-AAT * * * * * * * * * * * 74348 AAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAACAATTTTACATAGA 62 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAGAAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAGA * * * 74413 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTT 127 TAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTCATTT * * * 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GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAGAAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAGATA * * * * * * 75676 ACTATTCAAATAGTCATTATTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTT 129 ATTGTTCAAATAGTCA-TAATATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTCATTT * * * ** 75728 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTGT-TAAAATATTAATAAATTAATAGTATTTTA-ATCCGA-AA 1 TTTAAATC-TTTACTTAGTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATCAAATAA * * 75790 -CTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGAAAAAAGCAAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAAAT 64 GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAG-AAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAGAT * 75854 AATTGCTT-ATATAGTCATAATGATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTCATTT 128 AATTG-TTCAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTCATTT * * * * 75907 TTCAAATCATTTACTTAGTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAA 1 TTTAAATC-TTTACTTAGTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATC-AAATAA * * * * * ** * * * ** ** 75971 GGTTGTATGAACAAAAAGAATTATTTTATG-ACAAAGCAAAAGGTTATAGCATTTTCTAATAGAT 64 GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAG-AAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAGAT * * * * * 76035 AGTTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTT 128 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Indices: 73852--88684 Score: 5605 Period size: 718 Copynumber: 20.8 Consensus size: 711 73842 ATCTCTTATT * * * * 73852 AAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTAAATTGGTTCGGT 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGT * * * * *** * * 73917 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTATTAAATTTCATAATATTACTACATTAGTATTATT 66 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * * * * 73982 TTATTCTGAATAAGCTTATATGAACATAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAATGT-TATAATG 131 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCT-TAATG * * * * 74046 ATTTGAAATATATAATTATTCAAAGAGTCATAATTATTT-AA--A--TTGGT--TCA-ATATGCA 194 ATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGAT-TTC- * * 74103 TGTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA 254 TTTTTAAATCTCTTA--T-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA * * ** * 74168 GGCTTGTATCATGAAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGA 316 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA ** 74232 TAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTAAATAAACT-GAATT-ATTTTTTAAATC 378 TAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTG-TTTCATAAA-TAG-ATTCATTTTTTAAATC * * ** * ** * 74294 TCCAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGCAATATTATTTTATT-TAGGATAAGTTTTTAT 440 T-C--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTA-AATAAACTTGTAT * * * * * * 74358 GAACTGAAACAA-TTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAACAATTTTACATAGATAATTGTTC 501 GAAC--AAACAATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC * * * 74422 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTAT 564 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAGTAAACAAA-TTATTTTTTAAAATCTCTTACTTAT * * * * * 74486 TAA-TTTTCTAAATGTTAATAAAATAGTATTA-TTTATTTTCAAATAAG-TATGTATAAATT-GA 627 TAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTA-GTATGAATTCAA * 74547 AAAAATTATTTTATGACTAAACA 689 AAAAATTATTTTATGACAAAACA * * * * * * * * 74570 AAAAGTTAGAATGATTTGAAATAGATTATTTTTCTAATAGTCTTAACTACTTAAACTGATTCGGT 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGT * * * * ** 74635 AAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCTA-TAT 66 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-TATTAT * ** * * 74699 TTTACTTCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAT-TATAAT 130 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCT-TAAT * * * * 74762 GATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-GGTTGAGTAAATAGATTTA 193 GATTTGA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTTG-GTAAACAGATTT- * * * * 74826 GTTTTTAAATCTCTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAT 253 CTTTTTAAATCTCTTATTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG * * * * ** 74890 TTTGTATCAA-TAAAACAATTGTTT-TGCGACTAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATA 318 CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTAT---AATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA ** * * * * * * * 74953 ATAATTCAAGTGGACATGACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCAA 380 ATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCA-TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTC-- ** * * * 75017 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TATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAACAAAACCAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAA 127 TATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTT * * * 75478 AAGGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAACAGA- 190 AATGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACAGAT * * * * * * 75541 TTCTTTTTTAATTCTGTTACTCGTTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTGGTATTATATTACTTC 251 TTC-TTTTTAAATCTCTTA-T--TTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT * *** ** * ** 75605 AAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACGAAAGAAAAGGTCATATTAATTTGAAA 311 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTA-TAATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA * * * * * * * * 75670 TAGATAACTATTCAAATAGTCATTATTATTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAA 374 TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTC-ATAAATAGATTCATTTTTTAAA * * * * * ** 75734 TCTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATAGTATTTTAATC---CGAAACTTGTA 438 TC---TCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTA * * * ** * * * * 75796 TGAACAGAA-ATAATTGTTTTATGAAAAAAGCAAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAAATAATTGC 500 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TAAATGCTCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATT 320 TGTATGAACAAAAACAATTGTT-TAT-AATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT * * * * * * * * 77115 G-TGACATGGCCATAATTATTTGAA-TCGATTCAGTGAATATATTCACTTTTTAAATC-ACTTAT 383 GTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCA-TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTTAT * * * * * * 77177 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACTGTAACA 447 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAAC--AAACA * * * 77242 A-TTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAGTAGATAATTGTTCATATAGTCTTA 510 ATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * ** * * 77306 ACTATTTGAA-TTGCTT-TGACAAACTGATATATTTTTT-AAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGA 575 ACTATTTGAACTAG-TTCAG-TAAACAAAT-TATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCA * * * * * 77368 AAGATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAATT-GAAATAATTATTTT 637 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATTCAAAAAAATTATTTT * * * 77431 ATAATATAACA 701 ATGACAAAACA * * * ** 77442 AAAGG-CTATAATGATTTGAAATGGACAATTGTTCAAATAG------------AAACTGGTTCAA 1 AAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGG * * * 77494 TATATAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT 65 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * 77559 TTTATTTTGGATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTCGTAAC 130 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCTTAA- * * * * * * 77623 T-ATTTGAAGTAGATAATTGTTCAAATTA-CCATAACTATGTGAA-TCGATTTGATAAACTGACT 192 TGATTTGAA-TAGATAATTATTCAAA-TAGTCAT-A-TATTTGAACTAG-TTTGGTAAACAGA-T * * * * * 77685 TAT-TTTTTAAATCCCAACTTA-TCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCG 251 T-TCTTTTTAAAT--C-TCTTATTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG * *** * * **** * 77748 AATAAGCTTTTATGAATTGAAATAATTGTTCTATGATAAA-ATGAAAGGTCATTTTTATTTTAAA 312 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTT-TATAATAAACA--AAAGGTCATAACAATTTGAAA * ** ** * ** * * 77812 CTA-ATAATTGTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAATTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTTA 374 -TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCATAAATAGATTCA--TTTTTTA * ** * ** * * * 77876 ATTTCTTGTTTATTATTTTTTG-AATATCGATAAATTAATATTATTTTATT-TCAAATCAGCATG 436 A-ATC-TCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAACTTG * **** * * * * * 77939 TATGAACTAAAACGAA-TTATTTTATGGTTGAATAAAATGTTAGAACAATTTGAAATAGAAAATT 498 TATGAAC--AAAC-AATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT * * * * * ** * * * 78003 GTTCTAATAGTCTTAACTATATAAACTGGTTCAACAAACTCATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCT 560 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAC-AAATTATTTTTTAAAATCTCTTACT * * * * * * 78067 TATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGTAAT-TTTTACTT-CGAATAAGTTTGTATGCATAG 624 TATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAG---CTA-GTAT-G 78129 AAACAATTTCAGATAGATAATTGTTCAAATTATTTTATGACAAAAC- 682 ----AA-TTC----A-A-AA------AAATTATTTTATGACAAAACA * * * * * * * 78175 AAAGATCATAACGATTTTAGATAGATAACTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTGGTT--- 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGGTTCGG * ** * *** * 78236 T-TATAAA--TA-GATTT--A-GT-TT--TTA-T-ATTTGTCCAAATATTAAAAAATTAGTATTA 65 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTA ** * * * * * * * * 78289 TTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAGCAACTGTTTTATAAAAAAACAAAATGTCATAAC 129 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAAT * * * * * * ** * * 78354 AATTTGAAATAGATAA-TAGTTCGAATGGACATGGCTATTTCAACTTCTTTGGTAAACATATTTA 193 GATTTG-AATAGATAATTA-TTCAAATAGTCAT--ATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTC * * ** * * * 78418 TTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCAAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAAT 254 TTTTT-AAATCTCTTA--T-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT * * * * * 78482 AACCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAA 315 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG * * ** * * * * 78546 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTCGAACTTGTTTCATAAACAGATTTATTTTTCAAATCTT 377 ATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCATAAATAGATTCATTTTTTAAATC-- * * * ** * * 78611 TTACTTATTAA-TTGTCATAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGA 440 -TCCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGA * * ** * * * * * * * * * * 78675 ATAGAAAAAACTATTTTATG--AAAA-AAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAAAGAGTCGTTCAGA 503 ACA-AACAATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA * * * * * * * * * 78737 TAGTCATAATTATTTAAACTTGTT-TGATAAATAGATTCTTTTCTT-AAATCTCTTAATTGTTAA 567 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTATTTT-TTAAAATCTCTTACTTATTAA ** * * ** * * * 78800 TTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT-AGACTTTTATGAACT-GAAACAA 630 TTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-CTAGTATGAATTCAAAAAAA * * 78863 TTCTTTTATGAAAAAACA 694 TTATTTTATGACAAAACA * * * * * ** * * * 78881 AGAGGTCATAACGATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGT-TAAACTATTTGATTTAGTTCAGC 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGT * * * * ** * 78945 AAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTGTTAATTTCCGAAATATTAATAAATTAGTATTATT 66 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT * *** * * * *** * * * 79010 TTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAGACAATTGTTTTATGACCGGACAAAAAGTCATAACGA 131 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATGA * * * * * 79075 TTTGAAATAAATAATT-TGTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATA 195 TTTG-AATAGATAATTAT-TCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTCT- * * * * *** * * 79139 TTTCTAAATATATTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAGATGAGTATTATTTTATTCCCAACAAAC 255 TTT-TAAATCTCTTATTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC * * * * * 79203 TTATATGAGCAAAAACATTTATTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGATAACA-ATA 319 TTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA-AATAGATA * * * ** *** * * * 79266 ATTGTTCAAGTAGTCATAATTATTTGAACAAGTTAGGTAAACAAAAAT-ATTGTTTTAAATCTCT 380 ATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCATAAA-TAGATTCATT-TTTTAAATCTC- * * * * * * ** 79330 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTAACAAT 442 --CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA- ** * * * * 79395 TGAA-AATTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTGTTCATAT 504 CAAACAATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT * * * ** * * * * * * 79458 AGTCTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAA-TAATTTTTTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTT 568 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAA-TT ** * * * * * * * 79522 TTTGGAATATTATTAGATTTGTATTATTTTATTCCGAGTAAGCTTGTATGGA--CAAAAATAATT 632 TTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAA-AATT * * * 79585 A--TTGTGATAGAACA 696 ATTTTATGACAAAACA * * ** * * * * * * ** * 79599 AAAAGTTATAACAATTTGACATATACAATTGTTCAAATA--ATTAACTATTTGAACTAATTCGAT 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGT * * * * 79662 AAATAGATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATT 66 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT ** * * * *** 79727 TTATTCCGAATAAGCTTGAATAAT-AAAAAAACATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAAAAAA 131 TTATTTTGAATAAGCTTG--T-ATGAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CTTAA * * * * * * * * ** 79791 TGATATGAAATA-ATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAATTA-TTTGATAAACAAATCA 192 TGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTG-AACTAGTTTGGTAAACAGATTT * * * * * 79854 ATTTTTAAATCACTTATTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTTCAGA 253 CTTTTTAAATCTCTTA--T-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-A * * * ** * ** 79918 TAAGCTTGTATGAATTGAAATGACTA-T-TTTATGACA-AAACAAAATTTCATCATGATTTGAAA 314 TAAGCTTGTATGAA--CAAA-AACAATTGTTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA * ** * * * * * ** * * * * 79980 TAGATAATTGTTTATGTAGTCTTAACTATTTAAAC-TACTTCACCAAACAGATTTATTTTTCAAA 374 TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCA-TAAATAGATTCATTTTTTAAA ** * * * * 80044 TCT-CTTAGTTTTTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT 438 TCTCCTTA----TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGT * * * * * * * ** * * 80108 ATGAGCCTAAATAA-TTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGGTAATTAT 499 ATGA-AC-AAACAATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT * ** 80172 TC-AA-A--C--AA-GATTTG-----GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTA 562 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAA-TTATTTTTTAAAATCTCTTACTTA * * * * * * 80224 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATG-A-TGAAAA 626 TTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAA * ** 80287 ACAATTGTTTTATGAGGAAACA 691 A-AATTATTTTATGACAAAACA * ** ** * * * * * * * * ** * * * 80309 AAAGTTCATAGCGATTCAAAATAGATAATTGTTAAAATGGCCATAATTGTTTGATTTGATTTGAT 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGT * * * * * 80374 AAATAGATTCACTTTTT-AA-GTC--AC--ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATT 66 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT * ** * * * 80433 TTATTTCT-AATAAGCTTTTATGAATTGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA 131 TTATTT-TGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATG * * * * * * **** 80497 ATTTAAAATATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAAAAAACA-A-TT-TT 194 ATTT-GAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTCTT * * * 80559 TTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAG 256 TTTAAATCTCTT--AT-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG * * *** * * ** * 80624 CTTTTATTAATTGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATA-AGT 318 CTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-T * * * * * * * * * 80687 TATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTT-ATTCAATAAATATATTTATTTTTTCAAATCTC 379 AATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTC-ATAAATAGATTCATTTTTT-AAATCTC * * * *** * * * * * 80751 TTGTTTATTAATTTTTCG-AATGTTAATATATTAGGGTAATTTTTTTCCAAGTAAGCTTGTATGA 442 ---CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGA * * * * ** * * * * * 80815 TATGAAAGAA-ATATTTTATGACTAAAAT--ATTGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCT 503 -A-CAAACAATTTGTTTTATGAC-AAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA ** * ** * 80877 AATAGTTTTAACTATTTGAACTAGCTCAACAAACACATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA 565 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA-AATTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTA * * * * 80941 ATTTTTGAAATATTAAT--A--AG---------CTTGC-----A--TA--AT-AA---AAAACAA 629 ATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAA * * 80980 TTGTTTTATAACAAAACA 694 TTATTTTATGACAAAACA * * * * * * * * * * 80998 AAAGATCATAAGGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-AACTGATTTGGT 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGT * * * * 81062 AGAT-AA---A---TTT--AT-TCTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATT 66 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT ** * ** * * * 81117 TTA-TTCCATATAAGCTTGTATTAATTGAAGCAATTGTTTTATGATAAAATACAAA-GT-TATAA 131 TTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCT-TAA ** * * * * * * 81179 CAATTTTAAACAGACAATTGTTGTATGACTAAACAAAAAGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATT 192 TGA-TTTGAATAGATAA----T-TAT---T---CAAATAGTCA-TAT-ATTTGAACTAG-T--TT * * * * * ** * * 81244 GTTCTAATAG-TCTTAACTATTTGAATTTATTCGACAGAACGCATTAATTTTT----TATTATTA 240 GGT-AAACAGAT-TT--CT-TTTTAA---A-TC-TC-TTA---TTTAATTTTTGAAATATTAATA * * * * 81304 AATTAGTATTATCTTAATTCGAATAAGC-TGATATGAA-AAAAA-AATTTGTTTTATGATAAA-A 291 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG-TATGAACAAAAACAA-TTG-TTTATAATAAACA * * * * * ** * ** 81365 TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTGGTTTGG 353 -AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCA * * * * ** * * * 81430 TAAAGAGATTTAGTTTTTAAATCT-CTAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCATTATTAATTT 417 TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT * * * * ** * * * 81494 ATTCTAAAT-AACTCTATAAGAGCAGAA-ATAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGATCCTAATGA 482 ATTCTAAATAAACT-TGTATGAACA-AACA-ATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGA * * *** * * * * ** 81557 TTTGAAATGGATAATTATTCAAATCCACATGACTATTTGAATTTGTT-AGGTAAATAGGTTTATT 544 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-GTAAACA-AATTATT * * 81621 TTTT-AAATCTCCTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATT-TTTT-TT--TAAT 607 TTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT * * * * * * 81680 AAACTTGTATGGA-T-AGAAACAATTATTTTATGAAAAAAGA 671 AAGCTAGTATGAATTCA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACA * * * * * * * * * 81720 GAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTCAATTTGCTCGG 1 AAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGG * * * 81784 TAAACAAATTTATTTCTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT 65 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT ** * * * * 81849 TTTATTTCAAATAAGGTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAACT 130 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAA-T * * * * **** * * 81914 -ATTTGAAAGAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC-ATGTTCAAAAAATATATTT- 193 GATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTA-GTTTGGTAAACAGATTTC ** * ** * *** 81976 TTTAAAACATTTCTACTTA-TTAATTTTAGGCATATTAATAAATTTA-TATTATTTCATTCAAAA 254 TTTTTAA-A--TCT-CTTATTTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAA * * * * * * * * ** 82039 TAAGCTTGTCTAAATAGAAATATTTGTTTTGTGACA-AAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATA 314 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA * *** * * * * 82103 GATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTAAACTTG-TTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATC 376 GATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTC-ATAAATAGATTCATTTTTTAAATC * * * * * * * * 82167 TCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATCAGCCTATA- 440 TC---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTAT * * * * * 82230 GAACTGATACAA-TTGTTTTAT-A-ATGAATCAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTAT 501 GAAC--AAACAATTTGTTTTATGACA-AAAT-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * * * 82292 TGAAATAGTTATGATTATTTGTACTTGTTC-GATAAACATATT-TATTTTTAAAATCTTTTACTT 562 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTAT-TTTTTAAAATCTCTTACTT * * * * * * 82355 ATT-ATTTGTCAAACTATTAATTAATTATTATTATTTTAATT-C-GATAAGCTTGTATGAA-TAA 625 ATTAATTTTTCAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCA * * 82416 AAAAAAGTTATTTTTTGATAAAACA 688 AAAAAA-TTATTTTATGACAAAACA * ** * * * * ** ** 82441 AAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTATTTAG 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGGTTCGG * * * 82505 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AAATCCATTACTTATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC 435 AAAT-C--TCCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAA-AC * * * * * *** * * * 82948 -TGTGTGAATAGAA-ATAATTATTTTATGACAAAACAAATTATCATAACAATTTAAAATAAATAA 495 TTGTATGAACA-AACA-ATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA * * * * * * 83011 TTGTTCAAATAAT--TAA--AATTGAACTACTTTAGTAGACAGATTTATTTTTT--AAT-TC-T- 558 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA-AATTATTTTTTAAAATCTCTTA * * * * 83067 CTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAGAA-AAACTTA-TTTGAA 622 CTTATTAATTTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-AATAAGC-TAGTATGAA * * * 83129 --CAAAAACATTTGTTTTGTGACAAAACA 684 TTCAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACA * * * * * * 83156 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATGCAAATAGTCATAATTATTTAAATTGATTCAGT 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGT * * * * * ** * * * 83221 AAACAAAATTATGTTTTAAATTTTTTACAGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATT 66 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT *** * * * * * 83286 TTATTCCAAATAA-ATTAGTAAGAATTGAAAA-AATTGTTTTACT-ACAAAATAAAAGGTCATAA 131 TTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAA--AAAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCTTAA * * * * * * * * **** * 83348 CGATTTGAAATAAAAAATTATTCATATAGGCTTAACTATTTG-AGTCGGTTCAACAAATTA-ATT 192 TGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACT-AGTTTGGTAAA-CAGATT * * * * ** 83411 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCCGA 252 T-CTTTTTAAATCTCTTA--T-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA * * * * * * 83476 ATAAGCTTGTATGAATAAAAATAGTTGTTTTATGAAAAAACAACAA-GTTAAAACAATTTGAAAT 313 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTAT-AATAAACAA-AAGGTCATAACAATTTGAAAT * * * * * * ** * * * * 83540 ATATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TGATTTGGTAAACATATTTATTTGTTAAAT 375 AGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTG-TTTCATAAATAGATTCATTTTTTAAAT * * * * 83604 CTCCTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGACTTGTAT 439 CT-C--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTAT * * * * * 83669 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* * 84073 TTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGATTAACAAACACA-TT-TTC 195 TTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTCTTT * * * * * * * 84136 TTAAATC-CTTA-TTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTCGAAGAAGCTT 257 TTAAATCTCTTATTTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT * * * * * * * 84198 ATATGAACAGAAATAAATGTTT-TAGGATAAA-ATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATT 321 GTATGAACAAAAACAATTGTTTATA--ATAAACA-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT * * * * * * * 84261 GTTCAAATAGTCATAAATATTTGAA-TTGGTTCAGTAAAGAGATTTAGTTTTTAAA-CT-CTTAT 383 GTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCA-TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCTTAT * * * * ** * 84323 TAATTTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTAGTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACA 447 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATG-A-ACAAACA * * * * * * * 84388 A-TTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATG 510 ATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * ** 84452 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TAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-AAAAC 627 TAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAA * 85264 AATTGTTTTATGACAAAACA 692 AATTATTTTATGACAAAACA * * * * 85284 AATGGTCATAATGATTAT-AAATAGATAATTGTTGAAATAGT-TATAACTATATAAACAT-GTTC 1 AAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAAC-TGGTTC * ** * * * * * 85346 AGTAAATAGGTATATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTGAATATCAATAAATTAGTAT 63 GGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAT * * * * * * 85411 TATTTTATTCT-AATTAAGCTTGTAT-AAACTGAAACAATTGTTATATGACTAAACAAAAGATCA 127 TATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAAA--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCT * ** * ** * 85474 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTGTTAACTATTTGAA-TTGATTTGACAAACACA 189 TAATGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAG-TTTGGTAAACA-G * * * * * 85538 ACTAT-TTTTTAAATATCTTA-TTAATTTTT-AGAATATT-ATTAATT-TTTTTATTTT-TATTT 249 A-TTTCTTTTTAAATCTCTTATTTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTT * * * * * * 85597 GAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAAATGTTT-T-AT-GA-AAAAGAG--ATAACGATTTGAGAT 311 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTATAATAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAAT * * * * * * * * * * *** 85656 TGATATTTATTTAAATAGTCAT-ATCTATTTAAAC-TGGTTCAAAAAATAGCTTTGGTTTTTAAA 375 AGATAATTGTTCAAATGGCCATAAT-TATTTGAACTTGTTTC-ATAAATAGATTCATTTTTTAAA * * ** * ** ** * 85719 TCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAGCATT-TTTTATTTTGGATAAGTTTTTA 438 TCTC---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTA * * * * 85783 TAAACTAAAACAA-TTGTTTTATGATAAATTAAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTGT 500 TGAAC--AAACAATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGT * * * * * * * * * 85846 TCAAGTAGTCA-AATCTATTTTAACTTGTTCGGTAAAGAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTA 562 TCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTCAGTAAACA-AATTATTTTTTAAAATCTCTTACTT ** * * * * * * * * 85910 ATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTCTTTAATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAC 625 ATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAA * * * * 85974 ATAATTGTTTTATGACTAATCA 690 AAAATTATTTTATGACAAAACA * * * * * 85996 AAAGGTCAGAATGATTAGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAATATTTAAA-TCGGTTCGG 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACT-GGTTCGG * * * * * * * 86060 CAAACATA-TT-TTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTCAATTAGTATTAT 65 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * * * ** ** 86123 TTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAGATCACAACA 130 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATG * * 86188 ATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTA-TTTCAGTAAATAGATTTCA 194 ATTTGA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTT-GGTAAACAGATTTC- * ** * ** 86252 TTTTTAAATCTCTTA-TTAATTATCAAAATATTAATAAATCAACATTATTTTATTTTGAAT-AGT 254 TTTTTAAATCTCTTATTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG- * * * * * * * * * ** * * 86315 TTTGCATAAATAGATACAATTATTTTGTGGCA-AAACAAAATATCATAACGAA-ATAAAATAGAT 318 CTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTAT--AATAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGAT * * * * * * 86378 AATTGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTG-TTCGATAAA-ATATTTATTTTTTAAATCTCC 379 AATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTC-ATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCC * * 86441 TACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAACTTATATGAA 443 T---TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA * * * * * 86505 TAAA-AATTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATA-AGTAATTGCTCAAA 504 CAAACAA-TTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAA * * * * * * 86568 TAGTCATAGCTATTTGAACTTGCTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATTTTTTACTTATTAAT 567 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAA-TTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAAT ** * * * * * * 86632 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATATGCTTGTCTGAA-T-AGACACAAT 631 TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCA-AAAAAAT ** 86695 TGA-TTTATGGGAAAACA 695 T-ATTTTATGACAAAACA * * ** * * ** 86712 GAAGGTCATAACT-ATTT-AAACATG-T--TTA-AAAAATAGAT-TT-A-TTTTTTAA-TTATT- 1 AAAGGTCATAA-TGATTTGAAATA-GATAATTATTCAAATAG-TCTTAACTATTTAAACTGGTTC ** *** ** * * * * 86766 AATTTTTAGAA--TA-TTAATAAAT-TCATA--TATT-A-TTTT--ATTCA-AAATAAA-CAGGT 63 GGTAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAAT-ATTAATAAATTA-GT * * ***** * * * ** * * *** 86819 ATGA--ATAGAAACAATTA--TTTTATG-ACAAAACAAAAG--TCATAACAATTTGAAATA-G-- 125 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAAAAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAA-AGGTC * ** * * * * ** *** 86874 ATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCA-ATA----AAC-AGATTCATATTTT 188 TTAA-TGATTTGAATAG--ATAATTATTCAAA-TAG-TCATATATTTGAACTAGTTTGGTA-AAC * * * ** * * * * * 86932 A-A-ATC-TCTTAAA---C--ATTAAATTTTGAAATATTAATAA-ATTATCATTATT-TTAT-TT 247 AGATTTCTTTTTAAATCTCTTATTTAATTTTTGAA-A-TATTAATA-AATTAGTATTATTTTATT * * * * * * * * 86986 TG-AATAAGAC-TATATGAACTAATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAACGTCATAACTATTTC 309 TTGAATAAG-CTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTATAAT-AAACAAAAGGTCATAACAATTTG * * ** * * * * * * * * 87049 AAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTCTTTGAACTTGTTTAATAAACATATTTATTTTTAA 371 AAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCATAAATAGATTCATTTTTTA * * * * * 87114 AATCTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATATACTT 436 AATC---TCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCTAAATAAACTT * * * * * * * 87178 GTATAAACAAAAACAA-TTATTTTATAACAAAA-AAAAAGTCA-AACAATTTGAAACAAATAATT 497 GTATGAAC--AAACAATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT * * * 87240 GTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTC-GATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCT-TCT 560 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAG-TAAACA-AATTATTTTTTAAAATCTCT-T * * * * 87301 ACTTATTAGTTGTTTC-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTAT-T 621 ACTTATTAATT-TTTCAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTAGTATGA * ** * * 87362 AGTGGAGAAAATTATTTTATGA-TAAACA 683 ATTCAAAAAAATTATTTTATGACAAAACA * ** * * * * * ** * 87390 AAAGGTTATAGCGATTTG-AA-AGGTAATTGTTTAAATAAT-TATAACTATTTGAACTTATTCGA 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGGTTCGG * * * * * * 87452 TAAATAGATTCAATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTAT 65 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT *** * * * * * * * * * * 87517 GTTT-TTCCAAATTAGCTTGTAAGAATAGAAACAATTGTTTTGTAAAAAAATAAAAGATCATAAC 130 -TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAAT * * * * *** ** 87581 GCTTTGAAATAGATAATTATACAAACAGTTATAACTATTT-ATACTAGTCAAGCCAACAGATTTA 193 GATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A-TATTTGA-ACTAGTTTGGTAAACAGATTT- * * * * * * 87645 TTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTT-AGAATAATAAT-AAGTAGCATTACTTAATTCTT- 253 CTTTTTAAATCTC-TTA--T-TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTG * * * * * ** ** 87706 AATAAGGCCATGT-T-AATAGAAACAATTATTTTATGACA-AAATAAATTGTCATAATGATTTGA 312 AATAA-G-CTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTAT-A-ATAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA * * * ** * * ** * * * 87768 AATAAATAATTTTTCAAATTGATATAACTATTTGCA-TTGGTTTGGTGAATAGGTTTATTTTTTA 372 AATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTT-GTTTCATAAATAGATTCATTTTTTA ** * * * * 87832 AATCT--TATATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATA 436 AATCTCCT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTA * ** * * * * 87895 TGAACAAAAATATTTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTA 500 TGAACAAACA-ATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC * * * * * * * 87960 AAATAGCCTTAACTATTTGAATTGGTTC-GACAAACAATTTTATTTTTT-AAATCTCTTAGTTAT 564 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAA-ATTATTTTTTAAAATCTCTTACTTAT * * * * * * * 88023 TAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGCATTTTTTTATTCCAAATTAGCTTGTATGAA--GATAA 627 TAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCA-AA * * * 88085 ATAATTGTTCTATGACAAAACA 690 AAAATTATTTTATGACAAAACA * * * * * * * * * 88107 AAAGATCATAACGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAATTACATAACTATTTGAACTGGTTCA 1 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AGT-CTTAACTATTTAAACTGGTTCG * * * * * 88172 ATAAGCAT-AA-TTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTCA-TT 64 GTAA--ATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTA * * * * * * * * * * 88234 TTATTTGATTCTGAATAAGCTAGTATTAAAAAAAAAAACTTATTTTATGATAAAATAGAAGGTCA 126 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-TGAAAAAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCT ** * * * * * * * 88299 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTATAAATATTTGAATTGGTTTGGCAAACAAAT 189 TAATGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCAT--ATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGAT * * * * * * 88364 TTATTTATTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTG 251 TTCTTT-TTAAATCTCTTA--T-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG * * * * * 88429 AATATGCTTGTATAAACAAAAATAATTGCTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAA-AGATTT-AAA 312 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTATAATA-AACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAA ** *** * *** * * * * 88492 GTTTATAATTGTTCAAATAATCAAAACGGTTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTCTTAAA 374 -TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTGTTTCATAAATAGATTCATTTTTTAAA * * * * * * * 88557 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATGATTATTATTTCATCCTAAATAAGCTTGAA 438 TCTC---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTA ** * * * * * * 88622 TGTTCAAATACAA-TAGTTATT-TGACCAAACAAAA-GTAATAATGATTTGAAATATATAATTGT 500 TGAAC-AA-ACAATTTGTT-TTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT 88684 T 562 T 88685 GACATGGCCA Statistics Matches: 10785, Mismatches: 2456, 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Indices: 73928--86665 Score: 6784 Period size: 540 Copynumber: 23.8 Consensus size: 538 73918 AACAAATTTA * * * * * * 73928 TTTTTTAAATCTCTCAGTTATTAA-ATTTCATAATATTACTACATTAGTATTATTTTA-TTCTGA 1 TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GA * * * * * * * * 73991 ATAAGCTTATATGAACAT-AAATAATTATTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAAT 64 ATAAGCTTGTATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT * * * * * * * ** * 74055 ATATAATTATTCAAAGAGTCATAATTATTT-AA---ATTGGT--TCAATATGCA-TGTTTAAATC 128 AGATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAACTGTTTGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATC * * * * 74113 TCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATC 191 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATG ** * * * 74178 ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA 256 AACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCA * * * ** * * ** * * 74242 AATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTAAATAAACTGAATTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCA 320 AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTCATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA ** * * * * * * 74306 ATTTTTGAAATATTAATAAAGCAATATTATTTTATT-TAGGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAA 384 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAA * * * * * * * 74370 TTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAACAATTTTACATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC 447 TTATTTTATGA-CAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT * * * * * * 74435 TATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTA 511 TATTTGAACTTGTTTGATAAATAGA-TTC * ** * * * 74464 TTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAAATAGTATTA-TTTATTTTCA 1 TTTTTT-AAATCTCTTAATTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCG * * * * * * * 74527 AATAAG-TATGTATAAATTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAATGATTTGAAA 63 AATAAGCT-TGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA * * * * * * * * * 74591 TAGATTATTTTTCTAATAGTCTTAACTACTTAAACTGATTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAAT 127 TAGATAATTGTTCAAATAGT-TAAACTATTTGAACTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT * * ** * ** 74656 CTCTTATTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCTA-TATTTTACTTCAAATAAGCTTGT 190 CTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG-TATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGT * * * * * * * 74719 ATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TTATAATGATTTGAGATAGATAATTGTT 253 ATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTT * * * * * 74783 CAAATAATCATAACTATTTGAAC-TGGTTGAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTAT 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT * ** * * 74843 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATCAATAAAACAA 382 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAA * ** ** * ** * * * * * 74908 TTGTTTTGCGACTAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATAATTCAAGTGGACATGAC 447 TTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT * * * * 74973 TATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAGATTTA 511 TATTTGAACTTGTTTGA-TAAATAGA-TTC * * * 75002 TTTTTTAAATCTC-AAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGA 1 TTTTTTAAATCTCTTAA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA * * ** * * ** * * 75065 ATAAACTTGTAAGAACAGAAGCAATTGTTTTATAACAAAATGAAAGATCATAATGATTTGAGATA 64 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA * * * * * * * 75130 AATAATTGTTTAAATACTAAAACTATTTGAACTCGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCT 129 GATAATTGTTCAAATAGTTAAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT * * * * * 75195 TTTATTTATTAATTTTTTG-AATTTTCATAAATTAGTATTA-TTT-ATTCCT-AATAAGCTTTTA 192 CTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT--TGAATAAGCTTGTA ** * * * * 75256 TGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAGATAATTTATT 254 TGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAA-TTGTT * * * * * * 75321 CAAATAGTCATAACTATTTGAACGTG-TTCAGAAAAAAAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTC 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC--ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * * * 75384 TTAATTTTTGGACTATTAATAAATTTA-AATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATGAACAAAA 381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAAAA * ** * * *** 75447 CCAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAAGGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA 444 -AAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * * * 75512 TAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTC 507 TAATTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTC * * * ** * * * * 75544 TTTTTTAATTCTGTTACTCGTTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTGGTATTATATTACTTCAAA 1 TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * 75608 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACGAAAGAAAAGGTCATATTAATTTGAAATAG 65 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG * * * * * * * * * 75673 ATAACTATTCAAATAGTCATTATTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTT 130 ATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAAC-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC * * * * ** 75738 TTACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATAGTATTTTAATCCG-A-AA-CTTGTATGAA 193 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA * * * * * * * * * 75800 CAGAAATAATTGTTTTATGAAAAAAGCAAAAAATCAAAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTT-AT 258 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG-TTCAA * * * * 75864 ATAGTCATAA-TGATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTCATTTTTCAAATCAT-TTACTTAGT 321 ATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTC-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATT * ** * * 75926 AATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGGTTGTATGAACAAAAAG 383 AATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAA- * * ** * * 75989 AATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAGCATTTTCTAATAGATAGTTGTTCAAATAATCATA 445 AATTATTTTATGACAAA-CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA * * 76054 ATTATTTAAACTTG-TTCAGTAAATAGATTC 509 ATTATTTGAACTTGTTTGA-TAAATAGATTC * * * * 76084 ATTTTTTAAATCTCATT-ATTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTTGA 1 -TTTTTTAAATCTC-TTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA * * ** * * ** * 76148 ATAAGCTTATATGAATTAAAACAATTCCTTTATGACAAAACAAAAAGTCTTAACAATTTGACATA 64 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA * * * * * * 76213 GATAATTATTCAAATAG-T-CA-TGA-TTGATCTAGTTTGGTAAACATATTT-CTTTTTATAATG 129 GATAATTGTTCAAATAGTTAAACT-ATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA-AATC * * * * * * 76273 TTTTAGTTATCAATTATTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTTGAATAAGCTTGTTT 191 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-TTTGAATAAGCTTGTAT * ** * * * * * * 76338 GAACAGAAACAATTGCTTTATAATAGAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCA 255 GAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCA * * * * 76403 AATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTCATTTTTTTAAATCTC---CTT-TTA 320 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTA * * * * * * * 76464 ATTTTTGAAATATTAATAGATTAATATTACTTTATTCTAAACAAACTTATATG-A-AAAAAAATT 384 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAATT * * ** * 76527 TTGTTTTTGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATT 449 AT-TTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATT * ** * * 76592 ATTTGATCGAGTTAAGCA-AACATA-ATTA 512 ATTTGAACTTGTT-TG-ATAA-ATAGATTC * ** * * * * 76620 GTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCCAAA 1 TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * 76684 TAAACTAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT 65 TAAGCTTGTATGAATT-GAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT * * * ** * * * * * * * 76749 TGATAACTATTCTTATAGTCTTAATTATGTAAACTGGTTTGGTTAATAAATTTATTTTTTAATTC 128 AGATAATTGTTCAAATAGT-TAAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC * * * * * ** 76814 CCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTTTTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGTAT 191 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTAT * * * * * * * ** * ** 76878 AAACAAAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAGTTTACAATAATTCA 255 GAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCA * * * *** * 76943 AATTGTCATAACTATTTGACCTAGTTAGGTAAACAGATCTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA 320 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA * * * * ** * 77004 TTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAACTTAAATG-CTCAAAAACAAT 385 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AAT * * * * * * * * * 77068 TGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTG-TGACATGGCCATAATT 448 TATTTTATGA-CAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATT * * * * * 77132 ATTTGAA-TCGATTCAGTGAATATATTC 512 ATTTGAACTTGTTTGA-TAAATAGATTC * * * 77159 ACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA 1 -TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * * 77220 TAAGCTTGCATGAACTGTAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAGTAG 65 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG * * * ** ** * 77285 ATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGCTTTGACAAACTGATATATTTTTTAAATCTC 130 ATAATTGTTCAAATAGT-TAAACTATTTGAACTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC * * * * * 77350 TTAGTTATTAATTTTTGAAAGATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTATATGA 193 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGA *** * * * * * * ** * 77414 ATTGAAATAATTATTTTATAATATAAC-AAAAGGCTATAATGATTTGAAATGGACAATTGTTCAA 257 ACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTC-ATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA ** * * * 77478 ATAG--A-AACTGGTTCAA------T-ATATA-A-ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAAT 321 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT * * * 77531 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATT 386 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AATT * * * * * * 77595 GTTTTATGACAAA-ACAAAGGTTCGTAACTATTTGAAGTAGATAATTGTTCAAATTA-CCATAAC 449 ATTTTATGACAAACA-AAAGGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAAT * * * 77658 TATGTGAA-TCGATTTGATAAACT-GACTTA 511 TATTTGAACTTG-TTTGATAAA-TAGA-TTC * * * * 77687 TTTTTTAAATC-C-CAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGAA 1 TTTTTTAAATCTCTTAA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * ** ** * * 77750 TAAGCTTTTATGAATTGAAATAATTGTTCTATGATAAAATGAAAGGTCATTTTTATTTTAAACTA 65 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TA * * * * * 77815 -ATAATTGTTCAAATAGTTATAGCTATTTGAATTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTTAATT 129 GATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAA-CTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC ** * ** * * * * 77879 TCTTGTTTATTATTTTTTG-AATATCGATAAATTAATATTATTTT-ATTTCAAATCAGCATGTAT 191 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTAT * **** * * * * * 77942 GAACTAAAACGAATTATTTTATGGTTGAATAAAATGTTAGAACAATTTGAAATAGAA-AATTGTT 255 GAACAAAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATA-AATAATTGTT * * * * * * ** * 78006 CTAATAGTCTTAACTATATAAAC-TGGTTCAACAAACTCATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTAT 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT * * * * 78070 TAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGTAAT-TTTTACTTC-GAATAAGTTTGTATGCATAGAAA 382 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTG--T--AT-G--- * * * * * 78132 CAATTTCAGATAGATAATTGTTCAAATTATTTTATGACAAA-ACAAAGATCATAACGATTTTAGA 437 -------A-ATA-A-AA------AAATTATTTTATGACAAACA-AAAGGTTATAACAATTTGAAA * * * * * 78196 TAGATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTTATAAATAGA--- 485 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTC * ** * * 78247 ---TTT--A-GT-TT--TTA-T-ATTTGTCCAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA 1 TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA ** * * * * * * ** 78301 TAATTTTGTATGAATAGAAGCAACTGTTTTATAAAAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAG 65 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG * * * ** ** * * * * * 78366 ATAATAGTTCGAATGGACATGGCTATTTCAACTTCTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAAT-TT 130 ATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAAC-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC * ** * * * 78430 TTACTTATTAATTGTCAAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAACCTTGTATGAA 193 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA 78495 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT 258 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT * * * * 78560 AGTCATAACGATTCGAACTTGTTTCATAAACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAA-TT 323 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT * * * ** * 78624 GTCATAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAACTAT 388 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTAT * * * * * * * 78689 TTTATGA-AAA-AAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAAAGAGTCGTTCAGATAGTCATAATTATTT 451 TTTATGACAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * 78752 AAACTTGTTTGATAAATAGATTC 516 GAACTTGTTTGATAAATAGATTC * * * * 78775 TTTTCTTAAATCTCTTAATTGTTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAA 1 TTTT-TTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * * * * * 78840 T-AGACTTTTATGAACTGAAACAATTCTTTTATGAAAAAACAAGAGGTCATAACGATTTGAAATA 65 TAAG-CTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA * * ** ** * * * 78904 GACAATTATTCAAATAGTTAAACTATTTGATTTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTT 129 GATAATTGTTCAAATAGTTAAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC * ** *** * 78969 TTACTTGTTAATTTCCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAA 193 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA * * * * *** ** 79034 TAGAGACAATTGTTTTATGACCGGACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTTGTT-AAA 258 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAA-TTGTTCAAA * * * * * 79098 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATATTTCTAAA--T-ATA-TTATTAAT 322 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT * * ** * * * ** * 79159 TTTTGAAATATTAATAGATGAGTATTATTTTATTCCCAACAAACTTATATGAGCAAAAACATTTA 386 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-AATTA * * * 79224 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGATAACA-ATAATTGTTCAAGTAGTCATAATTA 450 TTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA ** * * * * * * 79288 TTTGAACAAGTTAGGTAAACAAAAATA 513 TTTGAACTTGTTTGATAAA-TAGATTC * * * 79315 TTGTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTGA 1 TT-TTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGA * ** * * * * 79379 ATAAGCTAGTAACAATTGAAA-ATTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAAT 64 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAAT * * * * * 79442 AGATAATTGTTCATATAGTCTTAAA-TATTTGAACTGGTTTGGCAAA-TAATTTTTTTTTTAATT 128 AGATAATTGTTCAAATAG--TTAAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT * * * * * * * 79505 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79917 ATAAGCTTGTATGAATTGAAATGACTATTTTATGACAAAACAAAATTTCATCATGATTTGAAATA 64 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA * ** * * * **** * * 79982 GATAATTGTTTATGTAGTCTTAACTATTTAAACTACTTCACCAAACAGATTTATTTTTCAAATCT 129 GATAATTGTTCAAATAGT-TAAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT * * ** * 80047 CTTAGTTTTTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATG 192 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATG * ** * * * * * * * ** * 80111 AGCCTAAATAATTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGGTAATTATTC-A 256 AACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA * ** * 80175 A-A--C--AA-GATTTG-----GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT 321 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT * * 80229 TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAAT 386 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AAT * * * * ** * * * 80292 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TACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTT-ATTCCATATAAGCTTGTATTAA 194 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA-ATAAGCTTGTATGAA *** * * * * * * * * * ** 81141 TTGAAGCAATTGTTTTATGATAAAATACAAAGTTATAACAATTTTAAACAGACAATTGTTGTATG 258 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAA-TTTGAA-ATA-AATAATTG--T- * * * * ** * * 81206 ACTAAACAAAAAGTCAGAA-TAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG-TCTTAACTATTTGAA 317 --T---CAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTG-T--TTCAT-AAACAGAT-TT-A-T-TTT--- * * * ** ** * * 81269 TTTATTCGACAGAACGCATTAATTTTT----TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTC-GAATA 365 TTAAATC-TC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTCTGAATA * * * * * 81329 AGC-TGATATGAA-AAAAAAATTTGTTTTATGATAAA-ATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGA 427 AGCTTG-TATGAATAAAAAAA-TTATTTTATGACAAACA-AAAGGTTATAACAATTTGAAATAGA * ** * * * 81391 TAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTGGTTTGGTAAAGAGATT- 489 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTC ** * * * * 81440 TAGTTTTTAAATCTC-T-A--ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCATTATTAATTTA-TTCTA 1 T--TTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-G * * *** * * * * 81500 AATAA-CTCTATAAGAGCAGAAATAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGATCCTAATGATTTGAAA 63 AATAAGCT-TGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA * * ** * * * * ** 81564 TGGATAATTATTCAAATCCACAT-GACTATTTGAATTTGTTAGGTAAATAGGTTTATTTTTTAAA 127 TAGATAATTGTTCAAAT--AGTTAAACTATTTGAA-CTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA * ** * 81628 TCTCCTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATT-TTTT--TTT-AATAAACTTGTA 189 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTA * * * * * 81689 TGGATAGAAACAATTATTTTATGA-AAAA-AGAGAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTA 254 TGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAAG-TCATAA-TAATTTGAAATAAATAATTG * * * * * * * * 81751 TTCAGATAGTCATAACTATTTCAATTTG-CTCGGTAAACAAATTTATTTCTTAAATATCTTACTT 316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT * * * * 81815 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGGTTGTATGAACAAAA 380 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAAAA ** * * * * * 81879 ACAATTGGTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAACTATTTGAAAGAGATAATTGTTCAAATAGTTA 444 A-AATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * * ** * * 81944 TAACTATTTAAACATGTTCAAAAAATATATT- 507 TAATTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTC ** * * * ** * * 81975 TTTTAAAACATTTC-TACTTATTAATTTTAGGCATATTAATAAATTTA-TATTATTTCA-TTCAA 1 TTTTTTAA-ATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-G * * * * * * * 82037 AATAAGCTTGTCTAAATAGAAATATTTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAAT 63 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT * * * * * * * * * 82102 AGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATC 128 AGATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAAC-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC * * * * * * * 82167 TCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATCAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATCAGCCTATA- 191 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTAT ** * * * ** * * * * * * * 82230 GAACTGATACAATTGTTTTATAATGAATCAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTGA 255 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125 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAAC-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA * * * * * * * 82705 TTCTCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGAATTATGTT-ATTTCGAATAAACTTG 188 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTG ** * * * * * * * 82769 TACAAATAGAAACAATT-TATTTGTGATAAAAC-AAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATT 252 TATGAACAAAAACAATTAT-TTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAAATAATT * * * * ** ** * * * 82832 GTTCAAATAATTATAACTATTAGTAC-T-AATCAGGCCAATAGAATCATTTTTTAAATC-CATTA 315 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCA--TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTA * * * ** * 82894 CTTATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTGTGAAT 377 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAAT * *** * * * 82957 AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATTATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATA 440 A-AAAAAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA * * ** * * 83022 AT--TAA--AATTGAACTACTTT-AGTAGACAGATT- 503 GTCATAATTATTTGAACTTGTTTGA-TAAATAGATTC * * ** * * 83053 TATTTTTTAAT-TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAGA 1 T-TTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGA * * * *** * * 83115 A-AAACTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA 64 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA * * * * * * ** * * * 83179 GATAATTATGCAAATAGTCATAATTATTTAAATTGATTCAGTAAACAAAATTATGTTTTAAATTT 129 GATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAACTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT * ** * * ** * * 83244 TTTACAGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTT-ATTCCAAATAA-ATTAGTAA 192 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTT-GTAT ** * * * ** * * 83307 GAATTGAAAA-AATTGTTTTACT-ACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAAAATTATT 255 GAA-CAAAAACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTT * * * * * * * * * 83370 CATATAGGCTTAACTATTTG-AGTCGGTTCAACAAATTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-ATAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * * 83433 TTAATTTTTAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAAT 381 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAA- * * * * * * 83498 AGTTGTTTTATGAAAAAACAACAA-GTTAAAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCAT 445 AATTATTTTATG-ACAAACAA-AAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * 83562 AACTATTTAAAC-TGATTTGGTAAACATATT- 508 AATTATTTGAACTTG-TTTGATAAATAGATTC * * * * * 83592 TATTTGTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA 1 T-TTT-TTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA * ** 83657 AT-AGACTTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAA 64 ATAAG-CTTGTATGAATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA * * * * * * * ** * 83719 ATAGATAATTATTCAAATGGCCGT-AATTATTTGAACTAATTCGATAAACTGATTTATATTTTAA 126 ATAGATAATTGTTCAAATAG--TTAAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA * * * * * 83783 ATTTCTAACTTATTAATTTTT-AAATTATTAATAAAGTAATATTATTTT-ATTTCAGATAAGCTT 188 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA-ATAAGCTT * ** * * * * * * * 83846 TTACAAACTAAAAA-AATTGTTTTAGGATAAAATAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGAA-AAT 251 GTATGAAC-AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATA-AATAAT ** * * 83909 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTTGTAAATAGATTT-TTTTTT-AATTTCTTACT 314 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT * * * * * 83972 TGTTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTAA 379 TATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAA * * ** * 84036 AACAATTATTTTATGACTAAACAAAA-GTTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT 442 AAAAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT ** * * * * * * * 84100 TTTAACTATTTGAACTGGATTAACAAACACA-T- 505 CATAATTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTC * * * * * * 84132 TTTCTTAAATC-C----TTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTCGAA 1 TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA * * ** * * * * * * * * 84191 GAAGCTTATATGAACAGAAATAAATGTTTTAGGATAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATAG 65 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG * ** * * * 84255 ATAATTGTTCAAATAGTCATAAA-TATTTGAATTGGTTCAGTAAAGAGATTTAGTTTTTAAA--- 130 ATAATTGTTCAAATAGT--TAAACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT * * ** 84316 C-T-CTTATTAATTTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTAGTTT-ATTCTGAATAATTTTGTATG 192 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATG * * * * * * * * 84378 AATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGTTCAA 256 AACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA * * * * * 84443 ATAGACATGACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA 321 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA * ** * * * * * 84507 -TTTTGGAATATTAATATGTTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAACAGAAATAATT 385 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATT ** * * ** * * 84571 GGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA 449 ATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA * * * * 84636 TTTAAACGTG-TAGA-AAATAGATTTA 513 TTTGAACTTGTTTGATAAATAGA-TTC * * * 84661 TTTTTTAAAAT-T-TTAATTATT-ATTTTTGGAATATTCATAAATTTA-TAGTATTTTA-TTCGA 1 TTTTTT-AAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG- * * * 84721 AATAAGCTTGCATGAATAG-AACAAATTGTTTTATG----AACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAA 63 AATAAGCTTGTATGAATTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA * * * * * 84781 TAGATAATTGCTT-AGACAATCATAACTATTTGAACTCGTTTGGTAAACAAATTCATTTTTT--- 127 TAGATAATTG-TTCAAATAGTTA-AACTATTTGAACT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA * * * * * 84842 T-TCATT-C-TCTTACTCTTT---A-ATT--T---TCAG-AATATTTT-ATTCCT-AATAAGCTT 189 TCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT--TGAATAAGCTT * * * ** * * * * * * 84892 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGGTAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTG 251 GTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG * * * * 84957 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TGTTTGAACAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA--- 316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-CATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT * ** * ** * * ** 85018 A-TAATTCTTGAAACGTCAATAAATTAACATTATTTTATT-TCAAAAAAGCTTGTATGCTTAAAA 380 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAAAA * * * * ** * * * * * * * 85081 ACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGATAATAATGATTTAAAATTGATAGTTGTTTAAATGGCCG 444 A-AATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * * * 85146 TGATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACTAGTTTA 507 TAATTATTTGAACTTG-TTTGATAAA-TAGATTC * * * * 85179 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGAT 1 TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT * * * * 85244 AAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTAT-AAATAG 66 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAG * * * ** * ** * 85308 ATAATTGTTGAAATAGTTATAACTATATAAACATGTTCAGTAAATAGGTATATTTTTTCAAATCT 130 ATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTATTTGAAC-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT * * * 85373 CATGCTTATTAATTTTTTG-AATATCAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCT-AATTAAGCTTGTA 192 CTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAA-TAAGCTTGTA * ** * * * * * * 85435 TAAACTGAAACAATTGTTATATGACTAAAC-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT 254 TGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTT * ** * * * ** * 85499 CTAATAGTGTTAACTATTTGAA-TTGATTTGACAAACACAACTATTTTTTAAA--T-AT-CTTAT 318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTCATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT * * * 85559 TAATTTTT-AGAATATT-ATTAATT-TTTTTATTTTTATT-TGAATAAGCTTGTATG-ATCAGAA 382 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-A-AA * * * * * * * * 85619 ACAAA-TGTTTTATG--AAA-AAGA-G--ATAACGATTTGAGATTGATATTTATTTAAATAGTCA 443 A-AAATTATTTTATGACAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA * * ** * * 85677 T-ATCTATTTAAACTGGTTCAAAAAATAGCTT- 507 TAAT-TATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTC ** * * * * * 85708 TGGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAGTAGCATT-TTTTATTTTGG 1 T--TTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA * * * * * * ** ** 85772 ATAAGTTTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAATTAAAAGGTCATAACAACTTT-AAAT 64 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AATAGTCATAGCTATTTGAACTTG-CTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTA 320 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA * 86630 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT 384 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT 86666 TCAAATATGC Statistics Matches: 9500, Mismatches: 2073, Indels: 1258 0.74 0.16 0.10 Matches are distributed among these distances: 506 2 0.00 507 87 0.01 508 7 0.00 509 2 0.00 510 5 0.00 511 3 0.00 512 1 0.00 513 2 0.00 514 65 0.01 515 10 0.00 516 102 0.01 517 15 0.00 518 33 0.00 519 136 0.01 520 82 0.01 521 117 0.01 522 36 0.00 523 13 0.00 524 153 0.02 525 215 0.02 526 117 0.01 527 180 0.02 528 150 0.02 529 136 0.01 530 490 0.05 531 291 0.03 532 157 0.02 533 203 0.02 534 438 0.05 535 556 0.06 536 355 0.04 537 723 0.08 538 463 0.05 539 812 0.09 540 924 0.10 541 694 0.07 542 525 0.06 543 502 0.05 544 103 0.01 545 66 0.01 546 13 0.00 547 4 0.00 548 6 0.00 549 126 0.01 550 78 0.01 551 132 0.01 552 38 0.00 553 4 0.00 554 2 0.00 555 7 0.00 556 35 0.00 557 3 0.00 558 1 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Indices: 81147--81246 Score: 105 Period size: 46 Copynumber: 2.2 Consensus size: 46 81137 TTAATTGAAG * * * * 81147 CAATTGTTTTATGATAAAATACAAAGTTATAACAATTTTAAACAGA 1 CAATTGTTGTATGATAAAATACAAAGTCAGAACAATTTGAAACAGA * * 81193 CAATTGTTGTATGACTAAACA-A-AAAGTCAGAATAATTTGAAATAGA 1 CAATTGTTGTATGA-TAAA-ATACAAAGTCAGAACAATTTGAAACAGA * 81239 TAATTGTT 1 CAATTGTT 81247 CTAATAGTCT Statistics Matches: 45, Mismatches: 7, Indels: 4 0.80 0.12 0.07 Matches are distributed among these distances: 46 39 0.87 47 5 0.11 48 1 0.02 ACGTcount: A:0.46, C:0.08, G:0.12, T:0.34 Consensus pattern (46 bp): CAATTGTTGTATGATAAAATACAAAGTCAGAACAATTTGAAACAGA Found at i:81949 original size:181 final size:181 Alignment explanation

Indices: 81296--86728 Score: 3647 Period size: 181 Copynumber: 30.5 Consensus size: 181 81286 ATTAATTTTT * * * * 81296 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTCGAATAAGC-TGATATGAA-AAAAA-AATTTGTTTTAT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG-TATGAATAAAAACAA-TTGTTTTAT * * * * * * * 81358 GATAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAAC 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC * * * * *** 81422 TGGTTTGGTAAAGAGATTTAGTTTTTAAATCTC-TA---ATTAATTTTCAAAA 129 TTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * ** * * 81471 TATTAATAAATCATTATTAATTTA-TTCTAAATAA-CTCTATAAGAGCAGAAATAATTGTTTTAT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCT-TGTATGAATAAAAACAATTGTTTTAT * * * * * *** * 81534 GACAAAGCAAAAGATCCTAA-TGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATCCACATGACTATTTGAA 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * *** 81598 TTTGTTAGGTAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTCAAAA 128 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * 81652 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* * * 82071 GACAAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTAAA 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * 82135 CTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAA 128 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * * 82189 TATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCAAATCAGCCTATA-GAACT-GATACAATTGTTTTATA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATG ** * * * * * * * * * 82252 ATGAATCAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTGAAATAGTTATGATTATTTGTACT 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT * * * * * ** 82317 TGTTCGATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAA 130 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * * 82368 CTATTAATTAATTATTATTATTTTAATTC-GATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAAGTTATTTTTT 1 -TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAA-TTGTTTTAT * * * * * * 82432 GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC 64 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-TAATCAGGCCAATAGAATCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTCATAA 129 TTGTTC-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * * 82911 TATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTGTGAATAGAAATAATTATTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATG *** * * * * * 82975 ACAAAACAAATTATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAAT--TAA--AATTGAACT 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT ** ** * *** 83036 ACTTTAGTAGACAGATTTATTTTTT-AAT-TC-T-CTTATTAATTTTCAAAA 130 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * * 83084 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTAGAA-AAACTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTGT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A-AATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTAT * * * 83147 GACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATGCAAATAGTCATAATTATTT-AA 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * * * ** * 83210 ATTGATTCAGTAAACAAAATTATGTTTTAAATTTTTTACAGATTAATTTTTGAAA 128 CTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * 83265 TATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAA-ATTAGTAAGAATTGAAAA-AATTGTTTTAC 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTA- * * * * * * * * 83328 T-ACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAAAATTATTCATATAGGCTTAACTATTTG-A 63 TGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * *** * * ** 83391 GTCGGTTCAACAAATTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAA 128 CT-TGTTCGGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * 83446 TATTATTACATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAATAGTTGTTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA * * * * * * * 83511 AAAAACAACAA-GTTAAAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAAC- 66 CAAAACAA-AAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT * * * * ** 83574 TGATTTGGTAAACATATTTATTTGTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTTAAA 130 TG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * 83627 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT-AGACTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTAT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * 83690 GACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCGTAATTATTTGAAC 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC ** * * * * * * 83755 TAATTCGATAAACTGATTTATATTTTAAATTTCTAACTTATTAATTTTT-AAA 129 TTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * ** * 83807 TTATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTACAAACTAAAAA-AATTGTTTTAG 1 -TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * 83871 GATAAAATAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC ** * * * * 83936 TTGTTTTGTAAATAGATTT-TTTTTT-AATTTCTTACTTGTTAATTTTTTGAA 129 TTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * ** * * 83987 TGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACT-AAAACAATTATTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATG * * * * ** 84051 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ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT * * * * 84464 TGTTCGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTGGAA 130 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA ** * ** * * * * * 84515 TATTAATATGTTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAACAGAAATAATTGGTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA * * * * 84580 CAAAACAAATGGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACG 66 CAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT * * * * 84644 TG-T-AGAAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-T-TTAATTATT-ATTTTTGGAA 130 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * 84692 TATTCATAAATTTA-TAGTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAAT-AGAACAAATTGTTTTA 1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAAAAAC-AATTGTTTTA * * * * 84754 TG----AACAAAAGGTCATAA-TGTTTTGAAATAGATAATTGCTT-AGACAATCATAACTATTTG 63 TGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTG * * * * * * * 84813 AACTCGTTTGGTAAACAAATTCATTTTTT---T-TCATT-C-TCTTACTCTTT---A 126 AACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * 84861 -ATT--T---TCAG-AATATTTTATTCCTAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA * * * * * * 84919 TAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-T 66 CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT * ** * * * 84983 GTTTGAACAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA---A-TAATTCTTGAAA 131 GTTCG-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA ** * ** * ** * 85031 CGTCAATAAATTAACATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGTATGCTTAAAAACAATTGTTTTAAGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA * * * * * * * * * * * 85096 CAAAACAAAAGATAATAA-TGATTTAAAATTGATAGTTGTTTAAATGGCCGTGATTATTTGAAC- 66 CAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT * * 85159 TGATTCGATAAACTAG-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA 130 TG-TTCGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * *** * 85212 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TATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * * * 85632 G---AAA-AAGA-G--ATAACGATTTGAGATTGATATTTATTTAAATAGTCATATCTATTTAAAC 64 GACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC * *** * * ** * * 85690 TGGTTCAAAAAATAGCTTTGGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAA 129 TTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * *** * * * 85743 TATTAAAAAAGTAGCATT-TTTTATTTTGGATAAGTTTTTATAAACT-AAAACAATTGTTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATG * ** * * * 85806 ATAAATTAAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAGTAGTCA-AATCTATTTTAA 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA * * * * * 85869 CTTGTTCGGTAAAGAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTAATTAATTTTTTGAA 128 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA * * * * * * 85924 TGTTAATAAATTAGTATT-CTTTAATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GACATAATTGTTTTAT 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * 85987 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Indices: 84709--85007 Score: 363 Period size: 166 Copynumber: 1.8 Consensus size: 162 84699 AAATTTATAG * *** 84709 TATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACAAATTGTTTTATGAACAAAAGGTCATAATGT 1 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGCATGAATAGAACAAATTGTTTTATGAACAAAAGGTCATAACAA * * * 84774 TTTGAAATAGATAATTGCTTAGACAATCATAACTATTTGAACTCGTTTGGTAAACAAATTCATTT 66 TTTGAAATAGATAATTGCTTAAACAATCATAACTATTTGAACTCGTTTGGAAAAAAAATTCATTT 84839 TTTTTCATTCTCTTACTCTTTAATTTTCAGAA 131 TTTTTCATTCTCTTACTCTTTAATTTTCAGAA * * * * 84871 TATTTTATTCCTAATAAGCTTGTATGAATAGAA-ACAATTGTTTTATGGTAGAATAAAAGGTTAT 1 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGCATGAATAGAACA-AATTGTTTTA---T-GAACAAAAGGTCAT * * * 84935 AACAATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-GTTT-GAACAAAAAG 61 AACAATTTGAAATAGATAATTGCTT-AAACAATCATAACTATTTGAACTCGTTTGGAA-AAAAA- * 84997 ATTTATTTTTT 123 ATTCATTTTTT 85008 AAATCTCTTA Statistics Matches: 114, Mismatches: 15, Indels: 12 0.81 0.11 0.09 Matches are distributed among these distances: 161 1 0.01 162 40 0.35 164 2 0.02 165 11 0.10 166 60 0.53 ACGTcount: A:0.37, C:0.10, G:0.12, T:0.41 Consensus pattern (162 bp): TATTTTATTCCAAATAAGCTTGCATGAATAGAACAAATTGTTTTATGAACAAAAGGTCATAACAA TTTGAAATAGATAATTGCTTAAACAATCATAACTATTTGAACTCGTTTGGAAAAAAAATTCATTT TTTTTCATTCTCTTACTCTTTAATTTTCAGAA Found at i:85587 original size:20 final size:19 Alignment explanation

Indices: 85541--85585 Score: 58 Period size: 19 Copynumber: 2.4 Consensus size: 19 85531 AAACACAACT 85541 ATTTTTTAAATATCTTATTA 1 ATTTTTTAAATA-CTTATTA 85561 A-TTTTTAGAATA-TTATTA 1 ATTTTTTA-AATACTTATTA 85579 ATTTTTT 1 ATTTTTT 85586 TATTTTTATT Statistics Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 5 0.82 0.00 0.18 Matches are distributed among these distances: 18 7 0.30 19 11 0.48 20 5 0.22 ACGTcount: A:0.33, C:0.02, G:0.02, T:0.62 Consensus pattern (19 bp): ATTTTTTAAATACTTATTA Found at i:85916 original size:530 final size:530 Alignment explanation

Indices: 81296--86663 Score: 2038 Period size: 535 Copynumber: 10.0 Consensus size: 530 81286 ATTAATTTTT * * * * * 81296 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTCGAATAAGC-TGATATGAAAA-AAA-AATTTGTTTTAT 1 TATTATTCAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTG-TATGAAAAGAAACAA-ATATTTTAT ** * 81358 GATAAA-ATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAAC 64 GA-AAATA-AAAGATC--AACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC * **** * * ** 81422 TGGTTTGGTAAAGAGATTT-AGTTTTTAAA--TC-TCTAATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-T 125 TAGTTCAAAAAATAGATTTCA-TTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGT ** * * ** * * * * 81482 CATTATTAATTTATTCTAAATAA--CTCTATAAGAGC-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAGCAA 189 -AGCATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATAA-A-CTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAA * * ** * * *** * * * * 81544 AAGATCCTAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATCCACATGACTATTTGAATTTGTTAGGTA 250 AAGGTCATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTA * * * *** 81609 AATAGGTTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATT-TTT 314 AA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGC-TATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * ** * * 81673 T-TT-T-AATAAACTTGTATGGA-TAGAAACAATTATTTTATGAAAAAAGAGAAGATCATAACT- 377 TATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAA-AATTGTTTTATGACTAAACAAAAGATCATAA-TG * * * * * * ** 81733 ATTTGAAATAAATAATTATTC-AGATAGTCATAACTATTTCAATTTG-CTCGGTAAACAAATTTA 439 ATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAAATATTT-AAATCGATTCGACAAACAAA--TA * * * * 81796 TTTCTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAA 500 TTTTTTAAAT-T-ATACTTACTAATTTTTAGAA * * * * * ** 81829 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGGTTGTATGAACAA-AAACAATTGGTTTAT 1 TATTATTCAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAAATATTTTAT * * * * * * * 81892 GACAAA-ACAAAGGGTCATAACTATTTGAAAGAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAA 64 GA-AAATA-AAA-GATC--AACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAA * ** * * * ** 81956 C-ATGTTCAAAAAATATATTT--TTTAAAACATTTCTACTTATTAATTTTAGGCATATTAATAAA 124 CTA-GTTCAAAAAATAGATTTCATTTTTAA-ATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA * * * **** * * * * * * 82018 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* * * 82429 TTTGATAAA-ACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT 61 TATGA-AAATA-AAAGA-TC--AACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT * * ** * * 82493 GAACTTA-TTTAGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTTCTACTT-TTCAATTGTTTG-AATATT 121 AAAC-TAGTTCAAAAAATAGATTTCA-TTTTTAAATC-TCTTCTTATT-AATT-TTTGAAATATT * * * * * 82554 AATAAATTTATG--TTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATAAA-TAGAAA-ATTTTGTTTTATG 181 AATAAA-GTA-GCATTATTTTATTTTG-GATAAGTTTTTATAAACTA-AAACA-ATTGTTTTATG * * * * * * * * 82614 ACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAACAGGTAATTGTTTAAATAGACATGACTATTTGAACTT 241 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT * * * ** * * 82679 GTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAG 306 GTTCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAG * * * * * * * 82744 AATTATGTTATT-TCGAATAAACTTGTA-CAAATAGAAACAATT-TATTTGTGA-TAAAACAAAA 369 TATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAA-AATTGT-TTTATGACT-AAACAAAA * * * * * * * * * 82805 GATTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAT-TATAACTA-TT-AGTACTAATCAGGC 429 GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAAATATTTAAAT-CGATTC-GAC * * * * * * 82867 CAATAGAATCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTCATAA 491 AAACA-AAT-ATTTTTTAAAT-TA-TACTTACTAATTTTTAGAA * * * * ** * * * * 82911 TATTAATAAATTAGCATTACTTT-ATTCCAAATAAGAC-TGTGTGAATAGAAATAATTATTTTAT 1 TATTATTCAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAG-CTTGTATGAAAAGAAACAAATATTTTAT * * * * * * * * 82974 GACAAA-ACAAATTATCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAAT--TAA--AATTGAA 64 GA-AAATA-AAA-GATC--AACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAA * * ** * * * ** * 83034 CTACTTTAGTAGACAGATTT-ATTTTTTAAT-TC-TCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT 124 CTAGTTCAAAAAATAGATTTCATTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGT ** * * * * * * * * * 83096 AATATTATTTTATTCTAGAAAAACTTATT-TGAACAAAAACATTTGTTTTGTGACAAAACAAAAG 189 AGCATTATTTTATT-TTGGATAAGTTTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG ** * * * * 83160 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATGCAAATAGTCATAATTATTTAAA-TTGATTCAGTAAA 253 GTCATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCGGTAAA * * * * * * * * * 83224 CAAAATTATGTTTTAAATTTTTTACAGATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTT 316 -AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGC-TATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT * * * * * * * * 83288 ATTCCAAATAA-ATTAGTAAGAATTGAAAAAATTGTTTTACT-ACAAAATAAAAGGTCATAACGA 378 ATTCTAAATAAGCTT-GTATGAACTG-AAAAATTGTTTTA-TGACTAAACAAAAGATCATAATGA * * * * * * * * * * 83351 TTTGAAATAAAAAATTATTC-ATATAGGCTTAACTATTTGAGTCGGTTCAACAAATTAATTTATT 440 TTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAAATATTTAAATCGATTCGACAAA-CAA-ATATT * * * * 83415 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAA 502 TTTTAAAT-T-ATACTTACTAATTTTTAGAA * * ** * 83446 TATTATT-ACATTAGTATTATTTT-ATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAA-AAATAGTTGTTTTA 1 TATTATTCA-ATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAAATATTTTA * * * * * * * * 83508 TGAAAAAACAACAAGTTAAAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAA 63 TG--AAAATAA-AAGAT-CAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAA * ** * * * 83573 CTGATTTGGTAAACAT--ATTT-ATTTGTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATA 124 CT-AGTT-CAAAAAATAGATTTCATTT-TTAAATCT-CTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATA * * **** * * * *** 83635 AATTAGTATTATTTTATTCCAAAT-AGACTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA 185 AAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAAG-TTTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * ** * 83699 AAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCGTAATTATTTGAACTAATTCGAT 249 AAAGGTCATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGT * * * ** * * * 83764 AAACTGATTTATATTTTAAATTTCTAACTTATTAA-TTTTTAAATTATTAATAAAGTAATATTAT 313 AAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGC-TATTAATTTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTAT * * ** * * * 83828 TTTATT-TCAGATAAGCTTTTACAAACTAAAAAAATTGTTTTAGGA-TAAAATAAAATG-TCATA 375 TTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAAATTGTTTTATGACT-AAACAAAA-GATCATA ** * * * * * * * * * * * * * 83890 ACAATTTTAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTTG-TAAATAGATT 436 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAAATATTT-AAATCGATTCGACAAACA-AAT * * * ** * 83954 TTTTTTTAATTTCTTACTTGTTAATTTTTTGAA 499 ATTTTTTAAATT-ATACTTACTAATTTTTAGAA * * * * * * * * 83987 TGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATG 1 TATTATTCAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAAATATTTTATG * * * * * * ** * * 84051 ACTAAACAAAAGTTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACT 65 A--AAATAAAAGATCAACA--ATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT * * * * * * ** 84116 GGATT-AACAAACACA-TT--TTCTTAAA--TC--CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTT 126 AG-TTCAAAAAATAGATTTCATTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAAGT * * * * * * * * * * * * * 84172 AGCAATATTTTACTTCGAAGAAGCTTATATGAAC-AGAAATAAATGTTTTAGGATAAAA-TAAAG 189 AGCATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATAAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG * * * * * * 84235 ATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAA-TTGGTTCAGTAAA 253 GTCATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCGGTAAA * * * 84299 GAGATTTAGTTTTTAAA-CTC-T--TATTAA-TTTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTAGTTTA 316 -AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA * ** * * ** 84359 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* * * * * 84758 CAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGCTT-AGACAATCATAACTATTTGAACTCGTTT 247 CAAAAGGTCATAACAATTT-AAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTC * * * * * * * 84822 GGTAAACAAATTCATTTTTT---T-TCATT-CTCTT-ACTCTTT--A-ATT--T---TCAG-AAT 310 GGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTC-TTGCTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT * * * * 84872 ATTTTATTCCT-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG-GTAGAATAAAAGGTTA 373 ATTTTATT-CTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAA-AATTGTTTTATGACTA-AACAAAAGATCA ** * * * * * 84934 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAA-CTG-TTTGAACAAA-A 434 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAAATATTTAAATC-GATTCG-ACAAACA * * * 84995 AGATTTATTTTTTAAA-TCT-CTTAATAATTCTT-GAA 496 A-A--TATTTTTTAAATTATACTTACTAATTTTTAGAA * * * ** * * ** * * 85030 -ACGTCAATAAATTAACATTATTTT-ATTTCAAAAAAGCTTGTATGCTTAA-AAACAATTGTTTT 1 TA--TTATTCAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATG-AAAAGAAACAAATATTTT * * * * * * * * * * * * * * 85092 AAGACAAAACAAAAGAT-AATAATGATTTAAAATTGATAGTTGTTTAAATGGCCGTGATTATTTG 62 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Indices: 86827--88602 Score: 742 Period size: 181 Copynumber: 9.9 Consensus size: 179 86817 GTATGAATAG * 86827 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC 1 AAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC * * 86892 ATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTAAACATTAAATT-TTG 66 ATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTTAT-TTTTAAATCTCTTAAACATT-AATTGTTA * * * 86956 AAATATTAATAAATT-ATCATTATTTTATTTTGAATAAGAC-TATATGAACTA 129 AAATATTAATAAATTAAT-ATTATTTTAATTTGAAT-AGACTTATATAAACAA * * ** * * * 87007 ATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAACGTCATAACTATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGT 1 AAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * * * * * *** 87072 TATTACTCTTTGAACTTGTTTAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTA 65 CATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTT-AAATCTCTTAAACATTAATTGTTA * * 87137 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATATACTTGTATAAACAA 129 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAGACTTATATAAACAA * * * * 87188 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TCATAACTATTTAAACTT-GTTCAATAAACAGATTTATTT-TTAAATCTCTTAAACATTAATTGT ** * * * * * 88395 TGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATATG-CTTGTATAAACAA 127 TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATA-GACTTATATAAACAA * ** * * * ** 88448 AAATAATTGCTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAA-AGATTT-AAAGTTTATAATTGTTCAAATA 1 AAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAA-GTCATAACA-ATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATA * * ** * * ** * *** * 88511 ATCAAAACGGTTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT 63 GTCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTT-TTAAATCTCTTAAACATTAATTGT * * * * 88576 TGAAAGATTAATAAATGATTATTATTT 127 TAAAATATTAATAAATTAATATTATTT 88603 CATCCTAAAT Statistics Matches: 1229, Mismatches: 284, Indels: 165 0.73 0.17 0.10 Matches are distributed among these distances: 175 2 0.00 176 21 0.02 177 104 0.08 178 128 0.10 179 159 0.13 180 175 0.14 181 413 0.34 182 86 0.07 183 88 0.07 184 50 0.04 185 3 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42 Consensus pattern (179 bp): AAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC 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Indices: 86833--88618 Score: 883 Period size: 357 Copynumber: 5.0 Consensus size: 360 86823 ATAGAAACAA ** * * * * * 86833 TTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC 1 TTATTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGCCTTAAA * * * * * *** * 86897 TATTTAAACTT-GTTCAATAAACAGATTCATATT-TTAAATCTCTTAAACATTAAATTTTGA-AA 66 TATTTGAA-TTGGTTCGACAAACAAATTTAT-TTATTAAATCTCTTAGTTATT-AATTTTCAGAA * * * *** * * * * * * * 86959 TATTAATAAATTATCATTATTTTATTTTGAATAAGAC-TATATGAACTAATACAATTGTTTTATG 128 TATTATTAGATTAGCATTATTTTATTCCAAATATG-CTTGTATAAACAAAAATAATTGCTTTATG ** ** * * * * * ** ** 87023 ATGAAACAAAACG-TCATAACTATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTCTTTGAAC 192 ACAAAACAAAA-GATCATAAAGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAATCAAAACGATTTGAAC * * * * * * * * 87087 TTGTTTAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATT 256 TAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-T * * * * 87152 AATATTATTTTAATT-TGAATATA-CTTGTATAAACAAAAACAA- 319 AATTTTA-TTTCATTCTGAATA-AGCTTATATAAA-AAAAAAAAC * * * * * * * * * 87194 TTATTTTATAACAAAA-AAAAAGTCA-AACAATTTGAAACAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAC 1 TTATTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGCCTTAAA * * * * * * * 87257 TATTTAAACTT-ATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAGTTGTTTC--A 66 TATTTGAA-TTGGTTCGACAAACAAATTTATTTATTAAATCTCT-TAGTTATTA-AT-TTTCAGA * * * * * **** * ** 87318 ATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATTAGTGGAGAA-AATTATTTT 127 ATATTATTAGA-TTAGCATTATTTT-ATTCCAAATATGCTTGTA-TAAACAAAAATAATTGCTTT * * * ** * ** * * * * 87380 ATGA-TAAACAAAAGGTTATAGCGATTT-GAA-AGGTAATTGTTTAAATAATTATAACTATTTGA 189 ATGACAAAACAAAAGATCATAAAGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAATCAAAACGATTTGA * * * * * * 87442 ACTTA-TTCGATAAATAGATTCAATTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA 254 AC-TAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA * * ** * * * * 87506 ATTAGA-ATTATGTT-TTTCCAAATTAGCTTGTA-AGAATAGAAACAA- 317 A-TA-ATTTTAT-TTCATTCTGAATAAGCTTATATA-AA-AAAAAAAAC * ** * * * ** * 87551 TTGTTTTGTAAAAAAATAAAAGATCATAACGCTTTGAAATAGATAATTA-TACAAACAG--TTAT 1 TTATTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTA-AAATAGCCTTA- * * * * * * * * 87613 AACTATTT-ATACTAG-TCAAGCCAACAGATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTA 64 AA-TATTTGA-ATTGGTTCGA-CAAACAAATTTATTTATTAAATCTC-TTAGTTATTAATTTTCA * * * * * ** * * * * * ** 87675 GAATAATAATA-AGTAGCATTACTTAATTCTTAATAAGGCCATGT-T-AATAGAAACAATTATTT 125 GAATATTATTAGATTAGCATTATTTTATTCCAAAT-ATG-CTTGTATAAACAAAAATAATTGCTT * * * * * * * * * 87737 TATGACAAAATAAATTG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATTGAT-ATAACTATT 188 TATGACAAAACAAA-AGATCATAAAGATTTAAAATATATAATTGTTCAAA-TAATCAAAACGATT * * * *** * * ** 87800 TGCATTGGTTTGGTGAATAGGTTTATTTTTTAAATCT-TA--TATTAATTTTCAAAATATTAATA 251 TGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA * * * * * * * 87862 AATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAATAT 316 AA-TAATTTTATTTCATTCTGAATAAGCTTATATAAAAAAAAAAAC * ** * 87908 TTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGCCTTAAC 1 TTATTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGCCTTAAA * * * 87973 TATTTGAATTGGTTCGACAAACAATTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATAT 66 TATTTGAATTGGTTCGACAAACAAATTTATTTATTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATAT * * * * 88038 TATTAGATTAGCATTTTTTTATTCCAAAT-TAGCTTGTATGAAGATAAATAATTG-TTCTATGAC 131 TATTAGATTAGCATTATTTTATTCCAAATAT-GCTTGTATAAACAAAAATAATTGCTT-TATGAC * * * 88101 AAAACAAAAGATCATAACGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAATTACATAACTATTTGAACT 194 AAAACAAAAGATCATAAAGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAA-T-CAAAACGATTTGAACT * 88166 GGTTCAATAAGCATA-A-TTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAC 257 AGTTCAATAA--ATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA- * * 88229 TCATTTTATTTGATTCTGAATAAGC-TAGTATTAAAAAAAAAAAC 318 TAATTTTATTTCATTCTGAATAAGCTTA-TA-TAAAAAAAAAAAC ** * * * * * * * 88273 TTATTTTATGATAAAATAGAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAG-TTATAA 1 TTATTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGCCT-TAA * * * * ** 88337 ATATTTGAATTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTATTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATA 65 ATATTTGAATTGGTTCGACAAACAAATTTATTTATTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATA * *** * 88402 TTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTATAAACAAAAATAATTGCTTTATGATA 130 TTATTAGATTAGCATTATTTTATTCCAAATATGCTTGTATAAACAAAAATAATTGCTTTATGACA * * * * * * 88467 GAACAAAAGGTTATAAAGATTTAAAGTTTATAATTGTTCAAATAATCAAAACGGTTTGAACTAGT 195 AAACAAAAGATCATAAAGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAATCAAAACGATTTGAACTAGT ** * * * 88532 TTGATAAATAGATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATGATTA 260 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAATT- * * 88597 TTATTTCATCCTAAATAAGCTT 323 TTATTTCATTCTGAATAAGCTT 88619 GAATGTTCAA Statistics Matches: 1119, Mismatches: 231, Indels: 147 0.75 0.15 0.10 Matches are distributed among these distances: 356 16 0.01 357 276 0.25 358 122 0.11 359 111 0.10 360 166 0.15 361 77 0.07 362 14 0.01 363 81 0.07 364 49 0.04 365 204 0.18 366 3 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42 Consensus pattern (360 bp): TTATTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGCCTTAAA 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Indices: 88745--89683 Score: 813 Period size: 181 Copynumber: 5.2 Consensus size: 180 88735 TGATGTTCTA * * * * * * * 88745 AAATAAATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTAAACATGTTCAGTAAGCAAATTATTTTTTTA 1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATT-TTTTTTTA * * * * * * 88810 ATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAG-AAATTAGTATTATTTTATATC-AAATAGGCT 65 AATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATT-AGTAAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCT * ** * * * 88873 TATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCACAATC-ATTTG 128 TGTATGAAC-AGAAACAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTG * * * * * 88926 AAATAGATAATTATTCAAACAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTCTTTCTTA 1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTT-TTTTTTA * * * 88991 AATCTTTTACTTATT-ATGTGTTGAAATAATAGTAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAACTT 65 AATCTTTTACTTATTAAT-TGTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTT * 89055 GTATGAACAGAAACAATCATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG 129 GTATGAACAGAAACAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG * * * ** * * * 89107 AAATAAATAATTGTTCAAATGGTAATAAAGATTTGAATTTGTTC-GATAAATAGATTTATTTTGT 1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTT-TTTTTT ** * * * 89171 AAATCTTTTACTTATTAATTGTTTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCT 64 AAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCT ** * * * * * * 89235 TGTATGAATTGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTC 128 TGTATGAACAGAAACAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG * * * * 89288 AAATAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTC-GATAAACAGATTCATTTTTT 1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATT-TTTTTTT * * * * * * * * 89352 AAATCTTTTAATTATTAATT-TTCAGAATATCAGTAACTTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCT 64 AAATCTTTTACTTATTAATTGTTGA-AATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCT * * * * 89416 TATATGAACTA-AAATAAT-TTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG 128 TGTATGAAC-AGAAACAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG * * * * * * ** * * * 89468 AAATAGATATTTATTCAATTAGTCATGACTACTAGATGTAGTTTAGTAAACATATTATTTTTTTA 1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATT-TTTTTTTA * * ** * * * 89533 AATTTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTTAATCCAAATAAGGTT 65 AATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAGTAAATTAGTATT-ATTTTAATCTAAATAAGCTT ** ** ** 89598 GTATGAATTGAAACTGTTGTTTTATAACAAAACACAAA-GTCATAACAATTTG 129 GTATGAACAGAAACAATCATTTTATAACAAAACA-AAAGGTCATAACAATTTG * * * 89650 AAAAAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTT 1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT 89684 AAAATAGTTT Statistics Matches: 605, Mismatches: 134, Indels: 37 0.78 0.17 0.05 Matches are distributed among these distances: 180 125 0.21 181 419 0.69 182 58 0.10 183 3 0.00 ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (180 bp): AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTTTTTTTAA ATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGT ATGAACAGAAACAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG Found at i:89746 original size:19 final size:20 Alignment explanation

Indices: 89707--89746 Score: 55 Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 20 89697 AAATAGATTT 89707 ATTTTTAAAAATATCTTAATA 1 ATTTTTAAAAATA-CTTAATA * 89728 ATTTTTTAAAATA-TTAATA 1 ATTTTTAAAAATACTTAATA 89747 GATTAGAATT Statistics Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 2 0.86 0.05 0.10 Matches are distributed among these distances: 19 6 0.33 21 12 0.67 ACGTcount: A:0.47, C:0.03, G:0.00, T:0.50 Consensus pattern (20 bp): ATTTTTAAAAATACTTAATA Found at i:89817 original size:362 final size:360 Alignment explanation

Indices: 89165--89834 Score: 763 Period size: 362 Copynumber: 1.9 Consensus size: 360 89155 AATAGATTTA * *** * * ** 89165 TTTTGTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAAT 1 TTTTGTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAAT * * * * * * 89230 AAGCTTGTATGAATTGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGA 66 AAGCTTGTATGAATTGAAAAAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAAAAAA * * * * * * * * 89295 TAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTT 131 TAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAAATAGTTCGATAAACAGATTCATTTTTAAAATATCT * * * * * * * * 89360 TAATTATTAATTTTCAGAATATCAGTAACTTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC 196 TAATAATT-ATTTTCAAAATATCAATAACTTAGAATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATAAAC * * * * 89425 TAAAATAATTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATATTTATTCAATTAG 260 AAAAACAATTTTTTATGAAAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATATTTATTCAATTAG 89490 TCATGACTACTAGATGTAGTTTAGTAAACATATTAT 325 TCATGACTACTAGATGTAGTTTAGTAAACATATTAT * * 89526 TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTTAATCCAAA 1 TTTTGTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTAATCCAAA * *** ** * 89591 TAAGGTTGTATGAATTGAAACTGTTGTTTTATAACAAAACACAAA-GTCATAACAATTTGAAAAA 65 TAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATCATTTTATAACAAAACA-AAAGGTCATAACAATTTCAAAAA * * * 89655 AATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAAATAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTAAAAATA 129 AATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAAATAGTTCGATAAACAGATTCATTTTT-AAAATA * * * * 89720 TCTTAATAATT-TTTT-AAAATATTAATAGA-TTAGAATTTTTTTTATTCTGAACAAATTTGTAT 193 TCTTAATAATTATTTTCAAAATATCAATA-ACTTAGAA-TTATTTTATTCTGAACAAACTTATAT * * ** 89782 AAACAAAAACATTTGTTTTATGAAAAAAGAAAAGGTAATAATGATTTGAAATA 256 AAACAAAAACAATT-TTTTATGAAAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA 89835 ATCATAATTG Statistics Matches: 249, Mismatches: 54, Indels: 11 0.79 0.17 0.04 Matches are distributed among these distances: 360 14 0.06 361 79 0.32 362 140 0.56 363 16 0.06 ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42 Consensus pattern (360 bp): TTTTGTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAAT AAGCTTGTATGAATTGAAAAAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAAAAAA TAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAAATAGTTCGATAAACAGATTCATTTTTAAAATATCT TAATAATTATTTTCAAAATATCAATAACTTAGAATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATAAACA AAAACAATTTTTTATGAAAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATATTTATTCAATTAGT CATGACTACTAGATGTAGTTTAGTAAACATATTAT Found at i:90965 original size:161 final size:164 Alignment explanation

Indices: 90743--91531 Score: 469 Period size: 169 Copynumber: 4.7 Consensus size: 164 90733 TTGATTTGGT * * * * * * 90743 AAACAGATTTACTTTTTAAATCACTTACTTTTTAACTTTTGGAATATGAATAAATTAGTATTATT 1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT * 90808 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAG-ATAATTA-T 66 TATTT-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTATAATAATT * * ** 90871 T-CAT-ATAGTC-TT-AACTATTGGAACT-GTTTCAAC 130 TAAATAATAATCGTTCAA--ATAAGAACTAG-TTCAAC * * * * 90904 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTAGTATTATT 1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-T * * * * * * 90969 TTATTTTAAATAAGCTTATATTAACTGAAACAATTATTTCATAATAAAACAAAAAGTTATAATAA 65 TTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAG-TATAATAA ** 91034 TTTGAAATAGATAATCGTTCAAATAAGAACTAGTTCAGT 128 TTT-AAATA-ATAATCGTTCAAATAAGAACTAGTTCAAC * * * 91073 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTA-T-TT 1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * 91136 TATTTGAATAGGCTTGTATG-A-TGAAAAACAACTATTTTATGACAAAAT-AAAAGTTCCTAATG 66 TATTTAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAG-T-ATAATA * * * * ** * ** 91198 ATTTGACACAGATAATTGTTTAAATAACTA-TAATT-ATTT 127 ATTT-AAATA-ATAATCGTTCAAATAAGAACTAGTTCA-AC * * * * * ** 91237 GAACTGATGGCTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAACATT 1 AAACAGAT---TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT * * * * * * * 91302 ATTTTATTTCAAATAACCTTTTTAT-AAATCGAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAAAGGTCAT 63 A-TTTATTT-AAATAAGC-TTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGT-AT * * ** * 91366 ATTTATTTTAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTA-TTCAAT 123 A-ATAATTTAAATA-ATAATCGTTC--A-A---AT-A--A---GAAC-TAGTTCAAC * * * * * 91422 AAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTAATTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAT 1 AAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA- * * * * 91486 TTTATTTCAAAAAAGCATGTAAGAATTGAAACAATTATTTTATGAC 64 TTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGAC 91532 TAACAAAAGG Statistics Matches: 485, Mismatches: 97, Indels: 72 0.74 0.15 0.11 Matches are distributed among these distances: 161 53 0.11 162 47 0.10 163 6 0.01 164 25 0.05 165 62 0.13 166 4 0.01 167 47 0.10 168 2 0.00 169 69 0.14 170 10 0.02 171 7 0.01 172 40 0.08 173 9 0.02 174 2 0.00 175 1 0.00 178 2 0.00 179 1 0.00 181 21 0.04 182 44 0.09 183 21 0.04 184 1 0.00 185 8 0.02 186 3 0.01 ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.08, T:0.43 Consensus pattern (164 bp): AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT TATTTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTATAATAATTT AAATAATAATCGTTCAAATAAGAACTAGTTCAAC Found at i:92027 original size:181 final size:180 Alignment explanation

Indices: 91713--92595 Score: 867 Period size: 180 Copynumber: 4.9 Consensus size: 180 91703 TGACAAAACT * ** * * 91713 AATAGTCA-AACTATTTGAACTGGTTCAATAAATAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA 1 AATAGTCATAATTATTTGAACTTATT-AGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA * ** ** * 91773 TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAATAATT 65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT * * * * 91838 GCTTTATGACAAAACAAAATGTGATAACGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCA 130 GTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAACTA-TTCA * * * * * ** * 91889 AATGGACATGATTGTTTGAACTTATTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCAAAGTTATTAA 1 AATAGTCATAATTATTTGAACTTATTA-GTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA ** 91954 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATT 65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT * * 92019 GTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCA 130 GTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCA * * * * * * * * 92070 AATAGTTATACTTATTTGAACTCACTTAGTAATTAGATTTA-TTTTTAAATATTTTGCTTATTAA 1 AATAGTCATAATTATTTGAACTTA-TTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA * * ** * 92134 TTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATT 65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT * * * * 92199 GGTTTAGGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGATATAAATAACTATTCA 130 GTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCA * * * ** * 92250 AATAGTCATAATTATCTGAA-TGTGTTTAGAAAATGTATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTA 1 AATAGTCATAATTATTTGAACT-T-ATTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA * * * * 92313 ATTTTTGGAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCA 64 ATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA * * * * * * 92376 ATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTA 127 ATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCA * * * * * * * * * * * 92429 GATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAAATATATATATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCAAT- 1 AATAGTCATAATTATTTGAACTTATT--AGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA * * * 92493 ATTTTTTGACATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAATTGAAACAA 64 ATTTTTAGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA * * * 92558 TTATTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAA 128 TTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAA 92596 CTTATTTTGT Statistics Matches: 585, Mismatches: 99, Indels: 40 0.81 0.14 0.06 Matches are distributed among these distances: 176 7 0.01 177 31 0.05 178 2 0.00 179 64 0.11 180 242 0.41 181 201 0.34 182 38 0.06 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (180 bp): AATAGTCATAATTATTTGAACTTATTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCA Found at i:92478 original size:361 final size:359 Alignment explanation

Indices: 91765--92595 Score: 912 Period size: 361 Copynumber: 2.3 Consensus size: 359 91755 TTTTAAATCT * * 91765 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-TTTTGTATGAATA 1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTT-TATGAATA * * * * * 91829 GAAATAATTGCTTTATGACAAAACAAAATGTGATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGG 65 GAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATAGTTCAAATAG * * * * * 91894 ACATGATTGTTTGAACTTATTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCAAAGTTATTAATTTTT 130 ACATAATTATCTGAACTTATTAGGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTT * * 91959 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT 195 AGAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGCATGAATAGAAACAATTGTTTT * 92024 ATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATACTTATTTGA 260 ATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATACTTATTTGA * * 92089 ACTCACTTAGTAATTAGATTTATTTTTAAATATTTTG 325 ACT-ACTTAG-AATTAGATTTATTTTTAAATATCTTA * * 92126 CTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAG 1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAG * * * * 92191 AAACAATTGGTTTAGGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGATATAAATAACTA-TTCAAATAG 66 AAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAA-TAGTTCAAATAG * * *** *** 92255 TCATAATTATCTGAA-TGTGTTTA-GAAAATGTATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTT 130 ACATAATTATCTGAACT-T-ATTAGGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTT * ** * 92317 TTGGAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTG 193 TTAGAATATTAACAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAAATTGCATGAATAGAAACAATTG * * * * * * * 92380 -TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAAC-TA 256 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTTA * * * * 92443 TTTGAAC-ATGTTCA-AATATATATATTCATTTTTTAATTCTCTTA 320 TTTGAACTA-CTT-AGAAT-TAGAT-TT-A-TTTTTAAATATCTTA * * * ** ** * 92487 CTCAAT-ATTTTTTGACATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAATT 1 CTTATTAATTTTTAGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATA ** * * 92551 GAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAA 65 GAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAA 92596 CTTATTTTGT Statistics Matches: 394, Mismatches: 62, Indels: 28 0.81 0.13 0.06 Matches are distributed among these distances: 357 4 0.01 358 6 0.02 359 65 0.16 360 73 0.19 361 238 0.60 362 8 0.02 ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (359 bp): CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAG AAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATAGTTCAAATAGA CATAATTATCTGAACTTATTAGGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTTA GAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTA TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATACTTATTTGAA CTACTTAGAATTAGATTTATTTTTAAATATCTTA Found at i:93124 original size:181 final size:178 Alignment explanation

Indices: 92612--94130 Score: 575 Period size: 181 Copynumber: 8.4 Consensus size: 178 92602 TTGTAAACAT * * * * 92612 ATTTATTTATTCAATCTTTTACTTATTATTTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT 1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-ATT * * * * * * 92677 GGAATAAACTTGTTTGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACACAAAA-TCATAACAATTCAA 65 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGATAAAA-A-AAAAGTTATAACAATTC-A * * * * * * * * 92741 AATAAATAATTATTCAAATA-TCATAA-AGATTTGAATTTGTTTGGTAAACTA 127 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTG-TTTAAACTGGTTTAGCAAACGA * * * * 92792 ATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTGTC-TAATATAAATAAATT-TGTATTATTTTATT 1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTTATT * * * * * * 92855 TGAAACAAGCTTCTATGAACAGAAAAAATCATTTTATGATAAAACAAAAAAGCTATAGCAATTTC 65 TG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGAT-AAA-AAAAAAGTTATAACAA-TTC * * ** 92920 AAATAGATCATCATTGTAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTTAGCAAACGA 126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTTAGCAAACGA * * * * * 92973 ATTTATTTTTTAAATATTTTAGTTATTAATTCTCAAAATTTTACTAAATTATTATTATTTTATTC 1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATT- * * * * * 93038 TGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGATAGAATAAAAGGTTAAAACAATTCGAA 65 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGATA-AAAAAAAAGTTATAACAATTC-AA ** * * 93103 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTGTTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTATAAA 128 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTG-T----T--T-A-AACTGGTT----TAG--CA-AAC * 93168 TA 177 GA * * * ** * 93170 GATTTATTTTTTAAATC---T-CCTATTAACTCTTGAAATATT-ATAAATTAATATTATTTTATC 1 -ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTAT- * * * * * * * ** * * 93230 TCT-AATAAACTTGTATG--TTGAAAAGCAAATGTTTTATGATCAAATATAAGGAAATAATGACT 64 T-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA--AATTATTTTATGAT-AAAAAAAAAGTTATAA-CAAT * * * * * * * ** * 93292 TGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTTAGCAAATTG- 124 TCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTTAGCAAA-CGA * * * 93347 ATTTATTTTTTAAGTCTCTTAATTATTAA-T-T-----T-TT--TAAA-TATGTATTA-TTTATT 1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTTA-T * * * * * * * * * * * 93400 TTGGATAAACTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTT 64 TTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGATAAAA-AAAAAGTTATAA-CAATTC * * * * * * 93464 AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTGTTTGAACTTGTTCAGTAAAC-A 126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTTAGCAAACGA * * * * * *** * * 93516 TATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTGTTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATT 1 -ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-T * * * * * * * * * 93581 TTGAATAAGATTGTATGAATTGAAACAATTATTATATGACCAAATAAAACGTTAGAACAATTTTA 64 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGA-TAAAAAAAAAGTTATAACAA-TTCA * * * * * * 93646 AATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAAC-A 127 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTTAGCAAACGA * * * * 93697 CATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATT--TT-T-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAT 1 -ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTA-TTTTAT *** * * * * * ** * 93757 CCAAATAGGCTTGTATG-ATCA-AAAACAATTGTTTTATGA-GAAAACAAAGATCATAATGATTT 64 TTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAAA-AATTATTTTATGATAAAAAAAAAG-TTATAACAATTC * * * * * * * * * ** 93819 AAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTGGTTCA-AAAAATA 126 AA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTTAGCAAACGA * * * * * * * * 93872 GCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAATTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT 1 -ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-T * * * * * * * * * 93937 TTGGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG 64 TTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGATAAAA-AAAAAGTTATAA-CAATTC * * * * * * 94001 AAAGT-GATAAATTATTCAAATAGT-AAAATCTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-A 126 AAA-TAGAT-AATTATTCAAATAGTCATAAT-TGTTTAAACTGGTTTAGCAAACGA * * * *** * ** * 94054 TATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAGAAGTATTTTAT 1 -ATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA- 94119 TTTGAATAAGCT 63 TTTGAATAAGCT 94131 ATTTCAAATC Statistics Matches: 1033, Mismatches: 220, Indels: 169 0.73 0.15 0.12 Matches are distributed among these distances: 169 4 0.00 170 110 0.11 171 11 0.01 172 6 0.01 173 2 0.00 174 14 0.01 175 65 0.06 176 62 0.06 177 9 0.01 178 12 0.01 179 63 0.06 180 127 0.12 181 229 0.22 182 103 0.10 183 66 0.06 184 7 0.01 186 2 0.00 188 2 0.00 189 1 0.00 190 6 0.01 191 6 0.01 192 1 0.00 193 80 0.08 194 25 0.02 195 1 0.00 196 1 0.00 197 3 0.00 198 15 0.01 ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43 Consensus pattern (178 bp): ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTT GAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGATAAAAAAAAAGTTATAACAATTCAAATA GATAATTATTCAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTTAGCAAACGA Found at i:93130 original size:18 final size:18 Alignment explanation

Indices: 93107--93151 Score: 63 Period size: 18 Copynumber: 2.5 Consensus size: 18 93097 TTCGAAATAG 93107 ATAATTATTCAAATAGTC 1 ATAATTATTCAAATAGTC * * 93125 ATAATTGTTCGAATAGTC 1 ATAATTATTCAAATAGTC * 93143 ATAACTATT 1 ATAATTATT 93152 TGAACTAGTT Statistics Matches: 23, Mismatches: 4, Indels: 0 0.85 0.15 0.00 Matches are distributed among these distances: 18 23 1.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.09, T:0.40 Consensus pattern (18 bp): ATAATTATTCAAATAGTC Found at i:93523 original size:170 final size:176 Alignment explanation

Indices: 93125--94094 Score: 681 Period size: 181 Copynumber: 5.5 Consensus size: 176 93115 TCAAATAGTC * * * * * 93125 ATAATTGTTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC 1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC ** * * * * * 93189 ---C-TATTAACTCTTGAAATATTATAAATTAATATTATTTTATCTCT-AATAA-ACTTGTATG- 66 TTGCTTATTAA-T-TT--TTTATAAT-AAGTAGTATTATTTTAT-TTTGGATAAGACTTGTATGA * * * ** * * 93247 -TTGAAAAGCAAATGTTTTATGATC-AAATATAAGGAAATAATGACTTGAAATAG 125 ACT-AAAA-CAATTGTTTTATGA-CAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG * * * ** * * * 93300 ATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTTAGCAAA-TTGATTTATTTTTTAAGTCT 1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCT ** * 93364 CTTAATTATTAATTTTTTA-AAT-A-T-GTATTA-TTTATTTTGGATAA-ACTTTTATGAACTAA 65 CTTGCTTATTAATTTTTTATAATAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGACTTGTATGAACTAA 93423 AACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG 130 AACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG * * * * * 93470 ATAATTGTTCAAATAATCATAATTGTTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTCAAATCTC 1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC * * * * 93535 TTGCTTGTTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGA-TTGTATGA 66 TTGCTTATTAA-TTTTTT-A---TAAT-AAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGACTTGTATGA * * * * * * * * ** 93599 ATTGAAACAATTATTATATGACCAAATAAAACGTTAGAACAATTTTAAATAG 125 ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG * * * * * 93651 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC 1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC * * * * ** * * 93716 TT-ATTATT--TTTGAAATATTATTA-AATTAGTATTA-TTT-TTATCCAAATAGGCTTGTATGA 66 TTGCTTATTAATTT----T-TTATAATAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATA-AGACTTGTATGA * * * * * * 93775 TCAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAA-CAAAGATCATAATGA-TTTAAGATTG 125 ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAA-ATAG * * * * * * 93826 ATATTTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTGGTTCA--AAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATC 1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATA--TTTATTTTTTAAATC 93889 TCTTGCTTATTAATTTTCAAATTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAG-CTTGTAT 64 TCTTGCTTATTAATTTT----TTA-TAAT-AAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGACTTGTAT * * 93953 GAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGT-G 123 GAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAA-TAG * * * * 94007 ATAAATTATTCAAATAGT-AAAATCTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTTAAAT 1 AT-AATTGTTCAAATAGTCATAAT-TATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAAT 94071 CTCTTGCTTATTAATTTTTT-TAAT 63 CTCTTGCTTATTAATTTTTTATAAT 94095 GTTAATAAAT Statistics Matches: 625, Mismatches: 118, Indels: 102 0.74 0.14 0.12 Matches are distributed among these distances: 169 3 0.00 170 113 0.18 171 16 0.03 172 3 0.00 173 6 0.01 174 11 0.02 175 102 0.16 176 66 0.11 177 11 0.02 178 10 0.02 179 4 0.01 180 57 0.09 181 147 0.24 182 43 0.07 183 27 0.04 184 6 0.01 ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.10, T:0.44 Consensus pattern (176 bp): ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC TTGCTTATTAATTTTTTATAATAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGACTTGTATGAACTAAA ACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG Found at i:93576 original size:544 final size:534 Alignment explanation

Indices: 93125--94130 Score: 1279 Period size: 526 Copynumber: 1.9 Consensus size: 534 93115 TCAAATAGTC * * * * * 93125 ATAATTGTTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC 1 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC * * * 93189 CTATTAACTCTTGAAATATTA-TAAATTAATATTA-TTTTATCTCTAATAAACTTGTATGTTGAA 66 CTATT-ACTCTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTTTATC-CAAATAAACTTGTATGATCAA * * * * 93252 AAGCAAATGTTTTATGATCAAATATAAGGA-AATAATGACTTGAA-ATAGATAGTTGTTCAAATG 129 AAACAAATGTTTTATGA-CAAA-ACAAAGATAATAATGA-TTGAAGATAGATAGTTGTTCAAATA * * * ** * * * 93315 GCCATAATTATTTGAACTAATTTAGCAAATTGATTTATTTTTTAAGTCTCTTAATTATTAATTTT 191 GCCAAAACTATTTGAACTAATTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT * 93380 -TTA-AAT-A-T-GTATTA-TTTATTTTGGATAAACTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA 256 ATTATAATAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA * * * * * 93439 CAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAA-TAGAT-AATTGTTCAAATAATCATAAT-TGTTTGAA 321 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGT-GATAAATTATTCAAATAAT-AAAATCTATTTGAA * 93501 CTTGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTCAAATCTCTTGCTTGTTAATTTTTTTAATGTTAATAAA 384 CTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAA * 93565 TTAATATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAATTGAAACAATTATTATATGACCAAATAAAA 449 TTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTATATGACCAAATAAAA * ** 93630 CGTTAGAACAATTTTAAATAG 514 CGTTAAAACAATTCGAAATAG * 93651 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC 1 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC * * * * ** 93716 TTATTATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATAGGCTTGTATGATCAAAA 66 CTATTACTCTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTTTATCCAAATAAACTTGTATGATCAAAA * * * * * * * 93781 ACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTAAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCAA 131 ACAAATGTTTTATGACAAAACAAAGATAATAATGATTGAAGATAGATAGTTGTTCAAATAGCCAA ** * ** 93846 AACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAT 196 AACTATTTGAACTAATTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT---AT * 93911 TATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA 258 TA-TAAT-AAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA * 93976 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGTGATAAATTATTCAAATAGTAAAATCTATTTGAACT 321 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGTGATAAATTATTCAAATAATAAAATCTATTTGAACT ** * 94041 TGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAATT 386 TGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAATT * 94106 AGA-AGTATTTTATTTTGAATAAGCT 451 A-ATATTATTTTATTTTGAATAAGCT 94131 ATTTCAAATC Statistics Matches: 406, Mismatches: 53, Indels: 29 0.83 0.11 0.06 Matches are distributed among these distances: 525 9 0.02 526 125 0.31 527 70 0.17 528 7 0.02 530 3 0.01 532 3 0.01 534 1 0.00 535 1 0.00 536 6 0.01 537 76 0.19 538 40 0.10 539 64 0.16 540 1 0.00 ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.10, T:0.44 Consensus pattern (534 bp): ATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC CTATTACTCTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTTTATCCAAATAAACTTGTATGATCAAAA ACAAATGTTTTATGACAAAACAAAGATAATAATGATTGAAGATAGATAGTTGTTCAAATAGCCAA AACTATTTGAACTAATTCAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTATTAT AATAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAA CAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGTGATAAATTATTCAAATAATAAAATCTATTTGAACTTGTTC AGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAATTAATAT TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTATATGACCAAATAAAACGTTAAA ACAATTCGAAATAG Found at i:93904 original size:356 final size:358 Alignment explanation

Indices: 93421--94075 Score: 842 Period size: 356 Copynumber: 1.8 Consensus size: 358 93411 TTTATGAACT * 93421 AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAA 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAA * * * * * * 93486 TCATAATTGTTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTGTTAATTTTT 66 TCAAAACTATTTGAACTGGTTCAG-AAAAATATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTT ** * * * * 93551 TTAA-TGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAATTGAAACAATTATTA 129 CAAATTATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAACTAAAACAATTATTA * * * * * ** 93615 TATGACCAAATAAAACGTTAGAACAATTTTAAA-TAGAT-AATTATTCTAATAGTCTTAA-CTAT 194 TATGACAAAACAAAACGTCAGAACAATTTGAAAGT-GATAAATTATTCAAATAGT-AAAATCTAT 93677 TTGAACTGGTTTAGTAAACACATTTA-TTTTTTAAATCTCTTATTATTTTTGAAATATTATTAAA 257 TTGAACTGGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTATTATTTTTGAAATATTATTAAA 93741 TTAGTATTATTTTTATCCAAATAGGCTTGTATGATCA 322 TTAGTATTATTTTTATCCAAATAGGCTTGTATGATCA * * * * 93778 AAAACAATTGTTTTATGAGAAAA-CAAAGATCATAATGA-TTTAAGATTGATATTTGTTCAAATA 1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTTAA-ATAGATAATTGTTCAAATA * 93841 GTCAAAACTATTTGAACTGGTTCA-AAAAATAGCTTTAGTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATT 65 ATCAAAACTATTTGAACTGGTTCAGAAAAATA--TTTA-TTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATT * * * * 93904 TTCAAATTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGT 127 TTCAAATTATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAACTAAAACAATTAT * * * ** 93969 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAGTGATAAATTATTCAAATAGTAAAATCTAT 192 TATATGACAAAACAAAACGTCAGAACAATTTGAAAGTGATAAATTATTCAAATAGTAAAATCTAT * * * 94034 TTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTT 257 TTGAACTGGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTT 94076 GCTTATTAAT Statistics Matches: 252, Mismatches: 37, Indels: 17 0.82 0.12 0.06 Matches are distributed among these distances: 354 6 0.02 355 11 0.04 356 151 0.60 357 69 0.27 358 15 0.06 ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42 Consensus pattern (358 bp): AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAA TCAAAACTATTTGAACTGGTTCAGAAAAATATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCA AATTATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAACTAAAACAATTATTATA TGACAAAACAAAACGTCAGAACAATTTGAAAGTGATAAATTATTCAAATAGTAAAATCTATTTGA ACTGGTTTAGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTATTATTTTTGAAATATTATTAAATTAG TATTATTTTTATCCAAATAGGCTTGTATGATCA Found at i:95547 original size:180 final size:180 Alignment explanation

Indices: 94129--95519 Score: 878 Period size: 181 Copynumber: 7.7 Consensus size: 180 94119 TTTGAATAAG * ** * 94129 CTATTTCAAATCATTATTAACTTTTT-TTTTGACATAAAACAATTGCTTT-TCA-TCATATAAGC 1 CTATTTCAAATCATTA-TGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGC * ** * ** 94191 CTATTTTGAATAAAATAATACT-AA-TT-TTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAA 63 TTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA * * * * 94253 AAATAAATCTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT 126 AAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTTT * * * * * * * * * 94308 ATATTTCAAATTATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAATCTT 1 CTATTTCAAATCATTAT-GACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT ** * * * * * 94372 A-TTCAAAATAAAATAATACCAATCTAATAATATTACGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA 65 ATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA * * *** * * * 94436 ATAAATTTGTTTGAAAAAAATCAA-TTTAAATAGTTA-AGGA-TATATGAATAATTAT 128 ATAAATCTATTT--ACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATA--ACTATTTGAATAATTTT ** * * * * * * * * * 94491 CTATTTCAAATCAACATGACCTTATG-TTTATCAGAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTG 1 CTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * ** * 94555 TTTGC-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG----AGATTTAAAAAA 66 TTT-CAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA * * * 94615 TAAATCT-TCTTA-CTAAAATAGTTCAATTAGTTATAA-TAATTTGAATAATTATT 129 TAAATCTAT-TTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAATAATT-TT * ** * * * * * * * * ** * * 94668 -TATTTCAACTTGTTATGACATTCTG-TTTCATTAGAAAATAATTGTATATGTTTGTAGAAGTTT 1 CTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTC-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT * * * * * 94731 A-TTCAAAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAA--AGTAA-TAAGAGATTTGAAA 65 ATTTC-AAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA * * * * ** * * * * ** 94791 ATTGAATCTGTCTACCCTACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAATACTTAC 127 AATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTTT * * * * * 94845 CTATTTCAAATCACTATAACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA 1 CTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA * * * * * ** * 94910 TTTCAATTAAAATAAAAGAACTTTATTAATATTCAAACAATTAATAAGCAAAAGGCTTAAAGAAT 66 TTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT * * * * 94975 AAATCTATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATT 130 AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATT-TT * * * * 95027 -TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTACATACAAGCTTA 1 CTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA ** * * * ** * * 95091 TTTGGATTAAAATAATATCAATCTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAT 66 TTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT * * * * * * * * 95156 AAATATGTTTTCGGAACAAGTTCAAATAATCAAAACTATTTGAATAATTAT 130 AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTTT * * * *** * * * 95207 CTATTTCAAATCGTTATGACATTTTG-TTTCATCATAAAGCAATTGCGACAATTCATATAGGCTT 1 CTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTC-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT * * * 95271 A-TT--GA-AAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAA 65 ATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT---AA * * * * 95331 AAAATGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATAACCATTTGAACAATTTT 125 AAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTTT * * 95387 CTATTTCAAATCATTATGA-TATTTTGTTTTGCT-ATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT 1 CTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTT-CTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT * * 95450 TATTCCAAATAAAATAATATAAATTTATAAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAA 64 TATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA 95514 ATAAAT 128 ATAAAT 95520 TCATTTTTTT Statistics Matches: 927, Mismatches: 224, Indels: 121 0.73 0.18 0.10 Matches are distributed among these distances: 174 1 0.00 175 10 0.01 176 50 0.05 177 96 0.10 178 140 0.15 179 69 0.07 180 114 0.12 181 281 0.30 182 66 0.07 183 59 0.06 184 38 0.04 185 3 0.00 ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.40 Consensus pattern (180 bp): CTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA TTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA AATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTTT Found at i:95729 original size:146 final size:145 Alignment explanation

Indices: 95391--95831 Score: 491 Period size: 146 Copynumber: 3.0 Consensus size: 145 95381 AATTTTCTAT * * * 95391 TTCAAATCA-TTATGATATTTTGTTTTG-CTATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT 1 TTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTC-AT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT * * * 95454 CCAAATAAAATAATA-TAAATTTATAAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATA 63 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA ** *** * 95517 AATTCATTTTTTTAACACG 127 AATTTGTTTACCTAACAAG * * * * * 95536 TTTAAATAGTTAAG-TCTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATGCAAGCATATTC 1 TTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC * * * * * 95600 AAAACAAAATAATACTAGTTTATTAACATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAA 64 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA * 95665 TTTGTTTACCTAGCAAG 129 TTTGTTTACCTAACAAG * * 95682 TTCAAATAGTTATGATCTTCTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCA 1 TTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA * * * 95747 TAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTC-AAAATTAAT-AGGAAGGAGATTTAAAAAATAA 65 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-CAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAA * 95810 AGTTGTTTACCTAACAAG 128 ATTTGTTTACCTAACAAG 95828 TTCA 1 TTCA 95832 TATAATCATG Statistics Matches: 246, Mismatches: 40, Indels: 19 0.81 0.13 0.06 Matches are distributed among these distances: 144 5 0.02 145 91 0.37 146 144 0.59 147 6 0.02 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39 Consensus pattern (145 bp): TTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT TGTTTACCTAACAAG Found at i:97192 original size:135 final size:132 Alignment explanation

Indices: 96937--97182 Score: 296 Period size: 139 Copynumber: 1.8 Consensus size: 132 96927 TTTCAACATA * * 96937 CAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAA 1 CAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTAATTTAGTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA * * ** * * * * 97002 ATTAAATCTGTTTACTGAATAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATACAATTGTTTCTATT 66 AATAAATATGTTTACCAAATAGTTCAAACAATTAAGACTA-TT-AATAATACAATTGTTTCTATT 97067 CATT 129 CATT 97071 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGAT 1 CAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATTTAGTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT * * 97135 TTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAGCAATTAAGACTAT 60 TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-TAGTTCAAACAATTAAGACTAT 97183 ATGAACAATT Statistics Matches: 93, Mismatches: 12, Indels: 9 0.82 0.11 0.08 Matches are distributed among these distances: 134 16 0.17 135 27 0.29 136 2 0.02 138 3 0.03 139 29 0.31 140 16 0.17 ACGTcount: A:0.46, C:0.09, G:0.08, T:0.37 Consensus pattern (132 bp): CAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTAATTTAGTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA AATAAATATGTTTACCAAATAGTTCAAACAATTAAGACTATTAATAATACAATTGTTTCTATTCA TT Found at i:97512 original size:175 final size:174 Alignment explanation

Indices: 97076--102154 Score: 1558 Period size: 181 Copynumber: 28.5 Consensus size: 174 97066 TCATTCAAGC * * * 97076 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTATA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAA 1 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAGAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAA * * ** * * * 97140 AAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAGCAATTA-AGACTATATGAACAATTATTTATTTCAA 65 AAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAA * * * * * ** * 97204 TTTTTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGCTCATGCAAGC 128 -ATCTT-T-A-TTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTT-GTTTATATAAGT * * ** * * * * * 97257 TTATTTGGAATTGAATAA-AATAATTTATTAATATTTCA-AAAATTTATAAGTAA-AAGATTTAG 1 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AGAAAATTAATAACTAAGAA-ATTTAA * * * * * 97319 AAAAT-AATTCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAACAGTTGTCTATTCCA 64 AAAATAAATT-TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT-CA * 97383 AATCTTTATTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGTTAATATAAGT 127 AATCTTTATTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGTTTATATAAGT * * * 97431 TTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTT-CTCAATATTTAGAAAATTAATCAA-TGAGAAATTTAA 1 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTAGAAAATTAAT-AACTAAGAAATTTAA * * * * * * 97494 AAAGTAAATTTGTTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTCAAA 64 AAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTCAAA * * * * * 97559 TCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTTATACT-ATT 129 TC-TT-T-A--TTTTTTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTGTTTATA-TAAGT * * * * * * 97611 TTATTCAAAATAAAATATTACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAA 1 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAGAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAA * ** ** * * * * * 97676 AATAAATCTAATTGTCGAGCTAGTTTAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTAAAA 66 AATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAA * * * 97740 T-TGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTATTTTGTTTATACAAGC 129 TCT-TTAT----TTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTTGTTTATATAAGT * * * * 97791 TTATTCTG-ATTAAAGTAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA 1 TTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AGAAAATTAATAACTAAGAAATTTAA * * 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Indices: 97047--99366 Score: 1899 Period size: 181 Copynumber: 12.9 Consensus size: 181 97037 GACTATTTGA * * ** * 97047 ATAATACAATTGTTTCTA-TTCATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAT 1 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT * * * * * ** * 97111 TAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAGCAATT 65 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT * * * * ** * 97175 AAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAATTTTTTATGACTTTTTGTTTTGTC 129 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC * * * * * * ** * 97228 ATAAAATAATTATTTTAGCTCATGCAAGCTTATTTGGAATTGAATAA-AATAATTTATTAATATT 1 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT * * * * * * * * 97292 TCAAAAATTTATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAT 66 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT * * * * * * 97357 AACCATTTGAACAGTTGTCTATTCCAAATC-TT-T-A--TTTTTTTTTGTC 131 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC * * * * * * * * * 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* * * * * * 98189 TCCTAAATTAATAAGTAAGAA-AGTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAATCAA-TTAAAATAAT 64 T-AAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTACT-GAA-CAACTTCAAATAGT * * * * * ** * * * 98251 TATGGCTATTCGAACGATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT 124 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGATTTGTCATAAAACAATT * * * * * 98316 GTTGCTTA-TCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATT 188 ATT-TTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT * * * * * 98379 AATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATATGGTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT 251 AATAAGTAAAAGATTTAAAAATATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTT * * * * * * * ** * * 98443 GAACAAT-TATCAATCTCAAATCATTAAGA-T-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATCATTCT-GAT 316 G-ACTATATATCTATTTCAAATCATTATGACTATTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTTAGTT * * ** 98504 CATAGAAGCTTATTAG-GTTAAAAATAATACTAATTT-TATAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TA 380 CATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA * ** * * * * ** * * * * 98562 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