Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 69000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 129 of 129
Found at i:23638373 original size:11 final size:11
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23638331 TATAATTATG
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*
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1 T-AATATTAAAT
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1 TAATATTAAA
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TAATATTAAAT
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23638314 TTGATATTAA
* *
23638324 AAATTAATA-TAATTATGTAATAT
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*
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1 AAATTAATATTAAATAT-ATATT
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1 AAA
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AAATTAATATTAAATATATATT
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23638475 TTATTTTAGT
*
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*
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1 TATATTA
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TATATTAATCATATCTATTCATATATATC
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23640533 TACATATAAA
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1 AATATATTATTTAATT-TATTAATTT
23640567 -ATATA-TATTT--TTTATTAA---
1 AATATATTATTTAATTTATTAATTT
*
23640585 AAAATATTATTTAATTTATTAATTT
1 AATATATTATTTAATTTATTAATTT
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1 AATATATT
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AATATATTATTTAATTTATTAATTT
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23640873 TATATAAAAA
* *
23640883 TATATTTAATTATTTATTTTATT
1 TATATTTAATTATGTATTATATT
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1 TATATTTAAT-TATGTATTATATT
23640929 AATAAAGATA
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TATATTTAATTATGTATTATATT
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23647766 GCTTTTATAC
* * *
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* * * *
23647837 AAG-AAAATTGGTACTTCCAACTTTTCTTC-AAAATTTTTTTTTGAAAATTTTATTTTC
1 AAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATTTTTTTTTGAAAATTTTATTTTT
*
23647894 AAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCACAAATTTTTTTTTTGAAAATTTTTATTTTTATAT
1 AAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCA-AAAATTTTTTTTTG-AAA-----A-TTTTAT-T
23647959 TTT
57 TTT
* *
23647962 CAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTTCTCAAAAATATTTTTTTTGAAAATTTTATTTTA
1 -AAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAT-TTTTTTTTGAAAATTTTATTTTT
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1 AAGA
23648027 GATCATTGAA
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AAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATTTTTTTTTGAAAATTTTATTTTT
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* *
23647887 TATTTTCAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCACAAATTTTTTTTTTGAAAATTTTTATT
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65 TTTA
*
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1 TATTTTCAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTTTGAAAATTTTATTT
23648021 T
66 T
23648022 AAAGAGATCA
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TATTTTCAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTTTGAAAATTTTATTT
TTA
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23648951 ATCTAGAAGA
*
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1 AAAT AAAT AAAT AAAT A-AAT AAAT AAAT AAAT AAAT AA
23648999 TTAATTAAGC
Statistics
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AAAT
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23649272 AAAGTTTAAT
* * * * * * *
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* * *
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1 GACTTT-GAAAAATAAACAAAGCTCCTCTAATCAGAGACTCAAC
* * *
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* *
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1 GAC
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GACTTTGAAAAATAAACAAAGCTCCTCTAATCAGAGACTCAAC
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* *
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* *
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23649458 AATGCTCCTC
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*
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* *
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1 ACAAAGCTCCTCTAATCAGAAGCTCAAC
23649484 AACTTTGAAA
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ACAAAGCTCCTCTAATCAGAAGCTCAACG
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* * *
23649298 ACAAGGCTCATCTAATAAGTGGCCCAACAATTTTGGAAAAATAAATAAAGCTCCTCTAATCAG-A
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* * *
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*
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* * * * * * *
23649456 ACAATGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATACATAAGGCTCCTCTAATGAGAA
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* * * *
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66 GCTCAACGACTTTGAAAAATAAACAAAACTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATA
* *
23649586 AACAAGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAAC
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23649615 AACTTTGGAA
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AACAAAGCTCCTCTAATCAGAAGCTCAACG
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* *
23649456 ACAATGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAC
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* * * * ** *
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1 ACAAAGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAA
* *
23649543 ACAAACCTCCTCTAATTAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAA
1 ACAAAGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAA
* *
23649587 ACAAGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGGAAAAATAA
1 ACAAAGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAA
*
23649631 ACAAAGCTCCTCTAATCAAAGGCTCAACAACTTTGAAAAAAATAA
1 ACAAAGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTG-AAAAAATAA
*
23649676 ACAAAGCTCCTCTAATTAGAG
1 ACAAAGCTCCTCTAATCAGAG
23649697 CTAATTAGAG
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ACAAAGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAA
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23649337 AATAAATAAA
* * *
23649347 GCTCCTCTAATCAGAGACTCAACGACTTTGAAAAATAAACAAAACTCTCTAATCAGAGGCTTAAC
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*
23649412 GACTTTGGAAAATAAACAAAGCTCCTCTAATTAGAAGCTCAACGACAAT
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* * * *
23649461 GCTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAA-ATACATAAGGCTCCTCTAATGAGAAGCTC
1 GCTCCTCTAATCAGAGACTCAACAACTTTGAAAAATAAACA-AA-ACT-CTCTAATCAGAAGCTC
* *
23649525 AATGACTTTGGAAAATAAACAAACCTCCTCTAATTAGAGGCTCAAC
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23649571 AACTTTGAAA
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Matches: 97, Mismatches: 10, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
113 4 0.04
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GACTTTGGAAAATAAACAAACCTCCTCTAATTAGAAGCTCAACGACAAT
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Indices: 23649462--23649696 Score: 355
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23649452 AACGACAATG
* * * *
23649462 CTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATACATAAGGCTCCTCTAATGAGAAGCTCAA
1 CTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAAACAAGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAA
**
23649527 TGACTTTGG-AAAATAAACAAAC
66 CAACTTTGGAAAAATAAACAAAC
*
23649549 CTCCTCTAATTAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAAACAAGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAA
1 CTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTGAAAAAATAAACAAGGCTCCTCTAATCAGAGGCTCAA
*
23649614 CAACTTTGGAAAAATAAACAAAG
66 CAACTTTGGAAAAATAAACAAAC
* * *
23649637 CTCCTCTAATCAAAGGCTCAACAACTTTGAAAAAAATAAACAAAGCTCCTCTAATTAGAG
1 CTCCTCTAATCAGAGGCTCAACAACTTTG-AAAAAATAAACAAGGCTCCTCTAATCAGAG
23649697 CTAATTAGAG
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 12, Indels: 2
0.91 0.08 0.01
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CAACTTTGGAAAAATAAACAAAC
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23650743 TCCTTTTTCC
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1 TTTTTCATTTTCTTTTG-TTTTTGT
23650778 TTTTTCTATTTT-TTTTGTTTTTGT
1 TTTTTC-ATTTTCTTTTGTTTTTGT
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1 TTTTTCATTTTCTTTT
23650816 CAAGCATAGT
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 0, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
21 4 0.11
22 4 0.11
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23661126 TGCCTTTATA
* *
23661136 CAAGAAAAATTGATACTTTTAACTTTTCCTTAAAAATATTTTTTTTAG-AATTTTATTTT
1 CAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTTTAGAAATTTTATTTT
* *
23661195 TAAGAAAAATTGATAC-TTCTAACTTTTCCTCAAAAA-AATTTTTTTAGAAATTTTATTTT
1 CAAGAAAAATTGATACTTTC-AACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTTTAGAAATTTTATTTT
* * * *
23661254 CAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCACAAAAATATTTTTTTTGGAAATTTTAATTT
1 CAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTTTAGAAATTTTATTTT
* **
23661314 CAAGGAAAATTGATA-TCGCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTTTTAGAAATTTTATTTT
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* * * *
23661374 CAAGGAAAGTTGATACTTTCAACTTTTCCTC-ACAATATTTTTTTGA-AAATTTTTTTTATATTT
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23661437 T
60 T
* *
23661438 TAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAATATTTTTTTTTGAAAATTTTATTTT
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*
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* * *
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66 TA
*
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TA
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*
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1 AGCCAAATCTACATG
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* * *
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1 TT
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TA
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*
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* ** *
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* *
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* * *
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** * *
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194 CCA
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*
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1 TTT
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* *
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** * *
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* * * * * * * * *
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AATTTTCTCTTACTTATACTAATGCTTAAAACTTATCAGTATAGATTTATATGTTTTAATCTTCT
TACCTATATCGATGACTAGCAACTATCAGC
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*
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1 AAAGACTTTTTTGTTTTTTGCA
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* ** *
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*
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* *
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TAGGGTTTTGATTT
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*
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*
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1 TAGGGTTTTGA-TTTTAGGGTTTCACTT
* *
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1 TAGGGTTTTGATTTTAGGGTTTCACTT
* *
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TAGGGTTTTGATTTTAGGGTTTCACTT
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*
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*
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*
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TAGGGTTTTGATTTTAAGGTTGCATT
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TTTATTATTATTAT
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*
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**
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AATTTTAAATGAAATTTCAAACTTAAACAATATGAAAGA
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*
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AAACTTAAACATCATGAAAGAAATTTGCATGAAATTTC
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* * *
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*
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** * * *
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* * ** *
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** *
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1 GGCTTAAATTTTCATTAGGTGCTAAATAAACTA
* * *
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* * *
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1 GGCTTAAAT-TTT-CATTAGGTGCTAAATAAACTA
* *
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* * * * *
23711282 GGCTTGAATCTTTCATTAGGTACCAATTAAGCT-
1 GGCTTAAAT-TTTCATTAGGTGCTAAATAAACTA
* *
23711315 GAGCTTAAATTTTCATTA-ATGCCAAATAAACTA
1 G-GCTTAAATTTTCATTAGGTGCTAAATAAACTA
* * * * *
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**
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* ** * * *
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*
23711448 GGCTTAAATCTTCATT
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23711464 GGGTTCAGCT
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GGCTTAAATTTTCATTAGGTGCTAAATAAACTA
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* * * * *
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63 TGGA
* * *
23711185 CTTAAATTTTCTTTGGATGTCA-ACTAAGCTAGGCTTAAATCTTTCCATGAGTGCTAGATAAATT
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64 GGA
* * * * **
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23711315 -GA
64 GGA
* * * *
23711317 GCTTAAATTTTCATT-AATGCCAAATAAACTAGGCTTAAATCTTT-CATTAGATGCCA-ACTAAA
1 -CTTAAA-TTTCATTGGATGCCAGATAAACTAGGCTTAAATCTTTCCATGAG-TGCTAGA-TAAA
* *
23711379 GTGGG
62 TTGGA
* * * *
23711384 CTTAAATTTTCATTGG-TGCTAGCTAAACTAGGTTTAAAAAC-TT-CAGTGAGTGCTA-ACTAAA
1 CTTAAA-TTTCATTGGATGCCAGATAAACTAGGCTT-AAATCTTTCCA-TGAGTGCTAGA-TAAA
* *
23711445 CTGGG
62 TTGGA
* * * * * * *
23711450 CTTAAATCTTCATTGGGT-TCAGCTAAA-TTGAGCTTAAATC-TT-CATTGAATGCTAGTTAAAC
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63 TGGA
* *
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1 -CTTAAATTTCATTGGATGCCAGATAAACTAGGCTTAA
23711552 GAACTTTATT
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CTTAAATTTCATTGGATGCCAGATAAACTAGGCTTAAATCTTTCCATGAGTGCTAGATAAATTGG
A
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23711248 TGGACTTAAA
* * *
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* *
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1 TTTCATTAGATGCCAATTAAGCTGAGCTTAAATC
* *
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1 TTTCATTAGATGCCAATTAAGCTGA-GCTTAAATC
* *
23711358 TTTCATTAGATGCCAACTAAAG-TGGGCTTAAAT-
1 TTTCATTAGATGCCAA-TTAAGCTGAGCTTAAATC
23711391 TTTCATT
1 TTTCATT
23711398 GGTGCTAGCT
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TTTCATTAGATGCCAATTAAGCTGAGCTTAAATC
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23711011 AGCTAATTTG
* * * *
23711021 GGCTTAAATTTTCATTGAAGTCAACTAAATTAGGCTTAAA-TTTCATTAGGTGCTAAATAAATTG
1 GGCTTAAATTTTCATTGATGTCAACT-AAGTAGGCTTAAATTTTCATGA-GTGCTAGATAAATTG
* * *
23711085 AGCTTAAAACTTCATCAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAATTTCATTTGATGCCTCAGTTAAACT
64 AGCTTAAAACTTCATCAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAATTTCATTAGATGACTCAATTAAACT
* * *** *
23711150 GGGCTTAAATTTTCATTAGTGCTTGATAATCT
129 GAGCTTAAATTTTCATTAATGCCAAATAAACT
*
23711182 GGACTTAAATTTTCTTTGGATGTCAACTAAGCTAGGCTTAAATCTTTCCATGAGTGCTAGATAAA
1 GG-CTTAAATTTTCATT-GATGTCAACTAAG-TAGGCTTAAAT-TTT-CATGAGTGCTAGATAAA
* ** * *
23711247 TTG-GACTT-AAATTTCATTGGATGCCAGA-TAAACTAGGCTTGAATCTTTCATTAGGT-AC-CA
61 TTGAG-CTTAAAACTTCATCAG-TGCCA-ACTAAACTAGGCTT-AA-ATTTCATTAGATGACTCA
*
23711307 ATTAAGCTGAGCTTAAATTTTCATTAATGCCAAATAAACT
121 ATTAAACTGAGCTTAAATTTTCATTAATGCCAAATAAACT
* * *
23711347 AGGCTTAAATCTTTCATTAGATGCCAACTAAAGTGGGCTTAAATTTTCATTG-GTGCTAGCTAAA
1 -GGCTTAAAT-TTTCATT-GATGTCAACT-AAGTAGGCTTAAATTTTCA-TGAGTGCTAGATAAA
* * * * * ** *
23711411 CT-AGGTTTAAAAACTTCAGTGAGTGCTAACTAAACTGGGCTTAAATCTTCATT-G--GGTTCAG
61 TTGA-GCTT-AAAACTTCA-TCAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAAT-TTCATTAGATGACTCAA
* * * * **
23711472 CTAAATTGAGCTTAAATCTTCATTGAATGCTAGTTAAACT
122 TTAAACTGAGCTTAAATTTTCATT-AATGCCAAATAAACT
* * *
23711512 GAGCTTAAA-TTTCATTGGATGCCAGCTAATCTAGGCTTAA
1 G-GCTTAAATTTTCATT-GATGTCAACTAA-GTAGGCTTAA
23711552 GAACTTTATT
Statistics
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Consensus pattern (160 bp):
GGCTTAAATTTTCATTGATGTCAACTAAGTAGGCTTAAATTTTCATGAGTGCTAGATAAATTGAG
CTTAAAACTTCATCAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAATTTCATTAGATGACTCAATTAAACTGA
GCTTAAATTTTCATTAATGCCAAATAAACT
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** *
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1 GCTTAAATCTTCATT-GGATGCTAGCTAAACTGA
* ** * *
23711086 GCTTAAAACTTCATCAG-TGCCAACTAAACT-A
1 GCTTAAATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
* * *
23711117 GGCTTAAAT-TTCATTTGATGCCTCAGTTAAACTGG
1 -GCTTAAATCTTCATTGGATG-CT-AGCTAAACTGA
* * * * *
23711152 GCTTAAATTTTCATTAG-TGCTTGATAATCTG-
1 GCTTAAATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
* * * *
23711183 GACTTAAATTTTCTTTGGATG-TCAACTAAGCT-A
1 G-CTTAAATCTTCATTGGATGCT-AGCTAAACTGA
* *
23711216 GGCTTAAATCTTTCCA-T-GAGTGCTAGATAAATTG-
1 -GCTTAAATC-TT-CATTGGA-TGCTAGCTAAACTGA
* *
23711250 GACTTAAAT-TTCATTGGATGCCAGATAAACT-A
1 G-CTTAAATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
* * * ** *
23711282 GGCTTGAATCTTTCATTAGG-TACCAATTAAGCTGA
1 -GCTTAAATC-TTCATT-GGATGCTAGCTAAACTGA
* * * **
23711317 GCTTAAATTTTCATT-AATGCCAAATAAACT-A
1 GCTTAAATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
* * * * *
23711348 GGCTTAAATCTTTCATTAGATGCCAACTAAAGTGG
1 -GCTTAAATC-TTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
*
23711383 GCTTAAATTTTCATTGG-TGCTAGCTAAACT-A
1 GCTTAAATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
* * * * *
23711414 GGTTTAAAAACTTCAGT-GAGTGCTAACTAAACTGG
1 -GCTT-AAATCTTCATTGGA-TGCTAGCTAAACTGA
* * *
23711449 GCTTAAATCTTCATTGGGTTC-AGCTAAATTGA
1 GCTTAAATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
* *
23711481 GCTTAAATCTTCATTGAATGCTAGTTAAACTGA
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* *
23711514 GCTTAAAT-TTCATTGGATGCCAGCTAATCT-A
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* * * * * *
23711545 GGCTTAAGAACTTTATTGG-TGCAAGATAATCTGG
1 -GCTTAA-ATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
* * *
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* * * ** *
23711608 GCTTACATCTTTATTGG-TGCCAATTAAAATTG-
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* * *
23711640 GCTTAAATCTTCATTGGGTGCTAACTAAATTGA
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Statistics
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GCTTAAATCTTCATTGGATGCTAGCTAAACTGA
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1 TTTTTTTATG
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1 TTTTTTT
23713314 TACAAGCCCT
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TTTTTTTATG
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23713483 ATTCATGTCA
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1 TTCCATAAAAAAGAATG
23713527 AATGGGTTGA
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*
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*
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1 ATGAATGAATAAACAA
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23719147 AAGTTTTACC
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AT
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* **
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**
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* **
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** ** * **
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*
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* *
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* * * * **
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* * * ** * *
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* *
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* * * * * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * *
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** * **
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 AAAAATAATTATTTTATGACAAAAAA-AAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * *
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* ** ** * * * * *
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125 TTTTTAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* ** * * *
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1 AAAAATAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGT-CATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * * * * * *
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* * *
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* * ** * * *
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1 AAAAATAATTATTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * * *
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* * * * * * * *
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127 TTT-AAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * *
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* * *
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* * * * *
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125 TTTTTAAAA-ATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * * *
23753001 AAAAATAATTATTTT-TAGTAC-AAAACAATGTTACAATGATTTTAAATAGATAATTATT-TAAT
1 AAAAATAATTATTTTAT-G-ACAAAAAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** *
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* * *
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* * * * * * * * *
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1 AAAAATAATTATTTTATGACAAAAAAAAAG-TCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAT-
* * * * * *
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64 GATCATAACTATTTGAACTATG-TTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTAT-TTATTAAT
** * * * ** *
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* * * * * ** * * * *
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1 AAAAATAATTATTTTATGACAAAA-AAAA-AGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTC-AAA
* * * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** **
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* * * * * * * * * *
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* * *** * * *
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* * ** * *
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125 -TTTTTAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * * * * * * *
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1 AAAAATAATTATTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * * * * *
23753966 ATCATAACT-TATTGAAGT-TGTTTG-ACGAATAGATAATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
65 ATCATAACTAT-TTGAACTATGTTAGTA--AACAGAT--TTATTTTTTAAATTTC-TATTTATTA
* * * * *
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* * * * ** * *
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1 AAAAATAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGTCATAATGATTT-AAAATAGATAATTGTTCAAATG
* * *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * *
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* *
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* **
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* * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * * * ** * *
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** * * * *
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* * * * * * * *** * * ** * *
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* * * * * * * *
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193 GATAATTATTCAAATGATCATAA-TTATTTGAACTTATTCG--GAA-A-ACAATTTTTTTTTTAT
* * * * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * *
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* * *
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126 ATA-TTAAAAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATGAACAGAAATAATTTTTTTA-
* * * * * * * * * *
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189 GTACAAAACAATGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTT-TAATAATCATAACTATTTGAACT
* * ** * *
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253 TAGTT-GGTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * *
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316 ATATTATTTT-ATCGAAATATGCATGTATGAACAGAAACAATTATTTAAACACAAAACAAAAGGT
* * * *
23752314 CAT-CTCAATTT-AAACTATATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TTATTTGAACTTATTTAATAAA
380 CATAAT-AATTTGAAA-TAGATAATTGTTAAAATAGACATAACTT-TTTGAACTTATTTAATAAA
* * * * *
23752376 TTGATTTATTTTTAAAAT-TTCTTGTATATTAGTTTTTGATTATTAATAAATTAGCACTATTTTA
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* * ** * * * * **
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* * * * *
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* **
23752565 TTTGTAATTTCA-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-AATTATT-TAGTTTTGA-A
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* * * *
23752626 TAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATAACAAAACCAAAA-GTCATAACAATTTGAAATA
692 TAAAATTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAA-CAAAATATCATAACAATTAGAAATA
* *
23752690 AATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATA-TT-TATTTTTTAAAT
756 AATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAAT-AA-ATAGTTATATATTCTAAAT
* * * * *
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883 AAACAAAAAC
* * * * *
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1 AATTATTTTATAATAAAATAAAA-ATCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATGATCATA
*
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65 ACTATTTGAA-TTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAT-ATTTACTATATTAATTTTTAAAAT
* * * *
23752957 ATAAAAAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAA-TTTTTATGAACAAAAATAATTATTTTTAGTA
128 ATTAAAAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATGAACAGAAATAATT-TTTTTAGTA
* * * * *
23753021 CAAAACAATGTTACAATGATTTTAAATAGATAATTATTTAATAGTCATAA-TAATTTGTACTTAG
192 CAAAACAATGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTTAATAATCATAACT-ATTTGAACTTAG
* *
23753085 TTGGTAAACTAATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA
256 TTGGTAAA-TAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TA
* * * ** * * *
23753150 TTATTTTATTGTAACATAT-TA-GTATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAATGTTCA
319 TTATTTTATCG-AA-ATATGCATGTATGAACAGAAACAATTATTTAAACACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * ** *
23753213 TAATTATTTGAAATAGGTAATTGTTAAAATGGACATAACTTTTTTAATTTGTTTGGTTAATAGAT
382 TAATAATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATAGACATAACTTTTTGAACTTATTTAATAAATAGAT
* * * * *
23753278 TTATTTTTTAAATCTTCTTCTTATTAATTTTCGAATATTAATAGATTATATTATTTTATTTCATA
447 TTATTTTTAAAATCTTCTTCTTATTAATTTTCGAATATTAATAAATTACACTATTTTATTTCAAA
* * *** * *
23753343 TTAACTTGTACAAATAGATACAATTGTTTTATAACAAAAGAAAATAGCATAACAATTTGAAGTAA
512 TAAACTTGTACAAATAGAAACAATTAAATTATAACAAAAGAAAATAGCATAACAATTTAAAATAA
* * *
23753408 ATAATTGTTCTAATTGTCAAAACTATTTAAATTTGTTCAATAGATAGATTTATTTTTTAAATCAT
577 ATAATTATTCTAAATGTCAAAACTATTTAAATTTGTTCAATAGACAGATTTATTTTTTAAATCA-
* ** * *
23753473 TTACTTATTGATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTGTTCTATTCCATATAAAATTGTATGAA
641 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTATTCTATTCCATATAAAATTGTATGAA
* * * **
23753538 TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATATCATAATGATTAGAAATAAATAATTGTTTAAAT
706 CAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAATATCATAACAATTAGAAATAAATAATTGTTTAAAT
* * * *** * *
23753603 TGTCATAATTATTTGAATTTTTTGGTAAATAGTTATATATTCTAATTCTCATATTTATTAATTTT
771 AGTCATAACTATTTGAATTGTTCAATAAATAGTTATATATTCTAAATCTCATACTTATTAATTTT
* * * * ** *
23753668 AGAATTATTAATAAATTAGAATTATTTTATTCCAAATAAGCTTAAATGAGTAGAAAC
836 AGAAATATTAATAAACTAGAATTATTTTATTCCAAATAAGCATAAATAAACAAAAAC
* * * * * * * *
23753725 AAGTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAACTTA-TTGAAATAGATAATTGTTTAAAT-AGTGA
1 AATTATTTTATAATAAAATAAAA-ATCATAA-TGATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATGA-TCA
** * *
23753788 TAACTATTTGAATTTATCCGGTAAAAAGATTTATTTTTTTAAATATCTTACT-TATTAATTTTTT
63 TAACTATTTGAA-TTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTT--ATAT-TTACTATATTAATTTTTA
* * ** ** *
23753852 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCATGTATGAATAGAAAT-ATTTGTTTT
124 AAATATTAAAAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATGAACAGAAATAATTT-TTTT
* * *
23753916 A-TAACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGACATACATAATTGTTTAAATAATCATAACT-TATT
188 AGT-ACAAAAC--AATGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTT-AATAATCATAACTAT-TT
* *
23753979 GAAGTT-GTTTGACGAATAGATAATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
248 GAACTTAG-TTG--G--TAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
** * * * **
23754042 -ATAAATTAATATTATTTTAGTCTG-AATAAAC-TCGTATGAACAAAAAGAATTATTTTATGAC-
308 AATAAATT-ATATTATTTTA-TC-GAAATATGCAT-GTATGAACAGAAACAATTATTTAAACACA
* * * * * * * * * *
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ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTATTCTATTCCATATAAAATTGTATGAACAAAAACAAT
TATTTTATAACAAAACAAAATATCATAACAATTAGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACT
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ATAAACTAGAATTATTTTATTCCAAATAAGCATAAATAAACAAAAAC
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*
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*
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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64 CAAAAACAATTATTTTATAAC-AAA-AAAA-AGCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAA
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * *
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* * *
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*
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* * * * *
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* * *
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709 TTTTTAAATCTCT
* * **
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* * *
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* * * ** * * * * * *
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** ** * * * * * * *
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* *
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ATTTGGTAAACAGTTATATATTCTAATTATCATATTTATTAATTTTAGAAATATAAAAAAATTAG
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TTTATTTTTTTAAATACCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATC
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ATCTCT
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* * * **
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** ** * * * * *
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*
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129 TTAATTTTTAAAATATTAAAAAATAGTATTATTTTATTC-AAATAA-TTATGCACGAACAGAAAA
* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * **
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* * * *
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* * * * * ** * *
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1 AATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCA
* * * ** * * * * *
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* * ** * *
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** * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * ** * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
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66 ACTATTTGAACTTAT-TTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
23768662 AATTATTTTATGACAAAACACAAA-GTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCAT
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* * ** * * * * *
23768726 AATTATTT-AAATT-TTTTTAAAAAATATTTATTTGTTAAATCTGTT-CTTAATAATTTTTGCAA
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* * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * *
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Statistics
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23764336 ATGAACTAAAACAATTCTTTTATGATAAAA-AAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATT
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* * * *
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23764881 AATAAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
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** * *
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* * *
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* * * * * *
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23765116 AAATAACT-ATAATTATTTTG-GTTAGTTCAATAAACATAATTATTTTTAAAAAT-TTTTACTTA
65 AAATAAGTCATAACTA-TTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTATTTTT--AAATCTTTTACTTA
** * ** *
23765178 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAATCTTGCCTGAATAGAAA-
127 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAGAAAT
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23765305 TAGAACTATTTAAACTTGTTCGACAAACA-ATTTTATTTTCTAATTCTCCGATTTATTAATGTTT
254 CATAACTATTTGAACTTATTTGA-AAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * *
23765369 GTAATATTAATAAATTAATATTATTTTATCCTGAATAAG-TTGGA
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* ** * * ** *
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63 TCAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTT--AAATCTTTTACT
* * * * * * * * *
23765541 TATTAGTTTTT-GAAATATTAAAAAAGTAATACTATTTTAATTCG-AATGAGCATGTATGAACA-
125 TATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAACTTGTATGAACAG
* * ** *
23765603 AAAACAATTGTTTTATGATAAAATTAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTATTCAAATAG
188 AAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
23765668 TCATAACT-TATTGAAGTTGTTCGACGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
253 TCATAACTAT-TTGAACTTATTTGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * * **
23765732 TGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTCAT
316 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGT
* * * * * *
23765777 ATAAATAAAAAAAAATTGTTTTATGTC-AAA-AAAATGACATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
1 ATGAAT--AAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * ** * *
23765840 TCAAAT-AGTCATAATTATTTAAACTAGTGCGGTAAACATATTTGATTTTTAAATCTCTTACTTT
63 TCAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTT-ATTTTTAAATCTTTTACTTA
** * * ** * *
23765904 TTTTTTTTTGGGAATATTTATAAATTTA-TATTATTTTATTCT-AAATAAGTTTATACT-AATAG
127 TTAATTTTT-AGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAACTTGTA-TGAACAG
* * * ** * * *
23765966 AAA-CAATTGTTTTATAATAAAGCAAAAAATCATAACGATATGAAATAGCTAATTATTCAAAT-G
188 AAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
23766029 ATCAAAATTATTTGAACTTCTTTAATAAACAAATTTATTTTTTAAA---TAT-CTTATTAATTTT
253 -TCATAACTATTTGAACTTATTTGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* ** ** *
23766090 TGAAATATTAATAAATAAGTATTATTTCGTTCCAAATATA-TTTGT
316 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AGCTTGT
* * * * * * *
23766135 ATGAACATAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCTTAA-AAGTTTGAAATAAATAATTGT
1 ATGAATA-AAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
23766199 TCAAAT--GCACATAACTTTTTAAACTTA-TTCTATAAACAGATTTATTTTTTAATCTATTT-CT
63 TCAAATAAG-TCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAATCT-TTTACT
* * * * * *
23766260 TATTAATTTTTAAAAAATTAAAAAATTA-TATTATTTTATTTCAAGTAAGCTTGTAT-AGACAGA
125 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGA-ACAGA
* * * * * * ** * *
23766323 CAT-AATTATTTTATGATAAAGCAAAAGGTTATCACAATTT-AAAGTAGATAATTATTTAAATAA
189 AATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAG
* * *
23766386 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTATTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTT
253 TCATAACTATTTGAACTTATTTGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * **
23766451 GAAAT-TTAATAAATT--TATTATTTTAGTCCGAATAAGAATGT
317 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * *
23766492 ATAAATAAATA-AATTATTTTATGACAAAATATAAA-GTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGT
1 ATGAATAAA-ACAATTA-TTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** *
23766555 TCAAA-CAGTTATAACTATTTGAATTTTTTCAAGAAA-ATATTTACTTTTTAAATC--TT--TTA
63 TCAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTA
* * ** **
23766614 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCTAATAAACTTGTACAAACAGAAAT
127 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAGAAAT
* * * * * * *
23766679 -AATTATCTTATTG-CAAAACAAAAAGGTTATGA-GAATTTAAAATAGATAATTTTTTAAATAGT
192 CAATTGTTTTA-TGACAAAAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * *
23766741 TATAACTATTTGAAC-TAATCGATAAATAGATTTATGTTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTTTT
254 CATAACTATTTGAACTTATTTGA-AAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
** * *
23766805 GAAATATTAATAAATTAACATTATTTTAATTC-GAATATGCATGT
317 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * * *
23766849 ATGAACAATAACAAGTATTTTATAATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAACTATT
1 ATGAATAA-AACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
23766914 CAAATAA-TCAGAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTCT
64 CAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTT-ATTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * * * * * *
23766978 TAATTTTCATAATATAAATAAATTAATACTATTTT-TTTGCAAAAAAACTTTTTTGAGCA-AAAT
128 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AAATAAACTTGTATGAACAGAAAT
* * * * *
23767041 CAATTGTTTTATGACCAAA-AAAAGGTCATAACGAGTTT-AAATAAATAATTATTTAAAAAGTCA
192 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
23767104 TAACTATATAAACTGGA-TCGATAAACATATTTATTTTTTAATTCTCTTACTTATTAA-TTTTCA
256 TAACTATTTGAACT-TATTTGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * * *
23767167 TAATATTAGTCATTTAATATTATTTTATT-TCAAGTAAGCCTAT
319 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA-TAAGCTTGT
* * * * * ** * * * *
23767210 ATGTACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAGAATATCACAA-CATTATGAATTATG-TAATTT
1 ATG-AATAAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATA-GATAATTG
* *** * **
23767273 TTCAAATAA-TCATAACTATTTGAAATTATTTTTGCTAAAC-TAATTTATTTTTTGAAT-TACCT
62 TTCAAATAAGTCATAACTATTTG-AATTA-GTTCAATAAACAT-ATTTA-TTTTTAAATCT-TTT
* * * *
23767335 ACTTATTAATTTTT-GAAATATTGATAAATTAGTATTATTTTATTCCG-AATAAGCTTGTACGAA
122 ACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAACTTGTATGAA
* * * * * * ** * *
23767398 CATAAAT-AATTGATTTATGATACAGA-AAAATGTCACAACAATTTGAAATAGATAATTGTCCAA
185 CAGAAATCAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * ** * *
23767461 ATTA-TTATAACT-TGTTAAATTTGTTCAGTAAATTGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACATATT
249 A-TAGTCATAACTAT-TTGAACTTATT-TGAAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * **
23767524 AGTTTTT-AGAACATTAATAAATTAGTATTATTTT-TT-T-ATTAAGCTCAT
310 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * ** *
23767572 ATGAATAAAAATAATTGTTTTATGA-AAAA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT
1 ATGAAT-AAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
23767634 TAAAT-AGTTAAAAC-ATTTGAATTGGTTTC-GTAAATATATATGT-TTTTTAAATTTTTTACTT
64 CAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAG-TTCAATAAACATAT-T-TATTTTTAAATCTTTTACTT
* * * ** * * *
23767695 ATTAATTTTCAGAATATTTATAAATTAATATTATTTTATTCCAAAATAAGCTTATATAAACAGAA
126 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAACTTGTATGAACAGAA
* * ** *
23767760 A-CAATTATTTTTTGACAAAACAAAATATCATAATGATTT-AAATAGATAATTATTCAAATGGTC
190 ATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
23767823 ATAGCTATTTGAA--TATATT-CAGATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTATAA
255 ATAACTATTTGAACTTAT-TTGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * *
23767885 AATATCAATAAATTGGTATTATTTGATT-TACAAATAAACTTGT
319 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT--GAATAAGCTTGT
* * * * * * * *
23767928 ATGAGCTGAAAGAATTGTTTTATGACAAAACAGAAGGATCATAATAATTTTAAATAAATAATTGT
1 ATGA-ATAAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *
23767993 TCAAAT-AGACATAACTTTTTGAACTT-GTTCAATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTT-CT
63 TCAAATAAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTAAATCT-TTTACT
* * * *
23768055 TATTATTTTTTAGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATCTCG-AATAAACTTGTACGAAGAGA
125 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTGAAATAAACTTGTATGAACAGA
* * * * * * * *
23768118 CAT-AATTATTTTATAACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTCAAATAAATAATTATTCAAATACT
189 AATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
23768182 CATAACTATTTGAAC-TAGTTGGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-ATTT
254 CATAACTATTTGAACTTA-TT-TGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
23768245 CACAATATTAATAAACTAGTAATGTTTTATTCTGAATAAGTTTAT
317 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * **
23768290 ATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAGAAA-AAAA-GTTATAACAATTT----T--A-AATTGT
1 ATGAA-TAAAACAATTA-TTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
23768346 TCAAACAA-TCATAATTATTTGAACTGGTTCAATAAACATATTTATTTTTTTTAATCTTTTACTT
63 TCAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTA--TTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * * *
23768410 ACTAATTTGT-GCAATATTAATAAATTGGCATTATTTTATTTTG-GA-AAAGTTTTATGAA-ATG
126 ATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAACTTGTATGAACA-G
* * * ** * * * *
23768471 AAA-CAACAGTTTTTTTTTTTTGACCAAACAAAAACTTATAACT-ATTTGAAATGGTTAATTTTT
188 AAATC-A-A----TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * * * * * *
23768534 CAAATAATCATAATTATTCGAACCTGTTTAGTAAACATATTTAATTTTTAAATCTCTTACATATT
246 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTT-GAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* *
23768599 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT
310 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * *
23768650 ATGTACA-AAAATAATTATTTTATGACAAAACACAAA-GTCATAATAATTTGAAATAAATAATTA
1 ATG-A-ATAAAACAATTA-TTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * ** * *
23768713 TTCAAATAA-TCATAATTATTTAAATTTTTTTAA-AAA-ATATTTATTTGTTAAATCTGTT-CTT
62 TTCAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTATTT-TTAAATCTTTTACTT
* * * *
23768774 AATAATTTTT-GCAACATTAATAAATTAATATTATTTTATTATG-AATAAGCTTGTATGAACAGA
126 ATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAACTTGTATGAACAGA
* * *
23768837 AA-CAATTGTTTTATTACAAAA-TAAAGGATCGTAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
189 AATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
23768899 GTCATAACTAATTCAACTAATTCAGTAAACAAAATTATTTTTTAAAGT-TTTTACTTATTAATTT
252 GTCATAACTATTTGAACTTATT-TGAAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTTTTACTTATTAATTT
*
23768963 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTGA-TTTATT-TCGAATAAGCTTAT
315 TTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTCT-GAATAAGCTTGT
* * * *
23769009 GTGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTAGAAATAGATAATTGTG
1 ATGAATA-AAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * ** * * * *
23769074 CAAAT-GGTCAAAACTAATTGAACTT-GTTCGGTAAACA-ATTTTTTTTTCTAATTCCTTTATTT
64 CAAATAAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAACATA-TTTATTTT-TAAATCTTTTACTT
* ** ** ** * * *
23769136 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAAAATTTTAAAT-ATTTGAACTTCTTTG----GTAA
126 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAG-AA
* * * * *
23769196 ATC----GTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTC
190 ATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * **
23769257 AAAACTATATGAACTT-TTCGGTAAATAGATTTACTTTTT-AA----TT-CTT-TTAACTTTCAA
255 ATAACTATTTGAACTTATT-TGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
* *
23769314 AATATCAATAAATT--TATTATTTTATTCTGAATAAGCATGT
319 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * *
23769354 ATGAATAGATA-AATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAATTATT
1 ATGAATA-AAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * **
23769418 CAAAT-AGTCATAACTAGTTAAACTT-GTTCAAAAAATATATTTATTTTTAAATCTCTTAAATAT
64 CAAATAAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * *
23769481 TCACTTTT-GAAATATTAACAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTAT-AAGCAGAA
128 TAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAACTTGTATGAA-CAGAA
* * * * *
23769543 AT-AATTATTTTAT----------TA---CA-AATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTT
190 ATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * *
23769593 ATAACTATTTGAA-TTAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTTTTAATTTTT
255 ATAACTATTTGAACTTA-TT-TGAAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* *
23769657 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATAAG-TATGT
317 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCT-TGT
* * * * * * * *
23769701 ATGAACAGAAACTATTATTT-TACATCAAAACCAAATGTCATAACGATTTGAAGTAAATAATTGT
1 ATGAATA-AAACAATTATTTAT-GA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
23769765 TTAAAT-AGTCATAATTATTTGAATTAGTTTAGTAAAAAGATTTAATTATTAAATCTCTTACTTA
63 TCAAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTT-ATTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * *
23769829 TTAATTTTT-GTAATATTAATAAATTAG-ATTTATATTATTTCG-AATAAGCTTATTTGAA-A-A
127 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTT-GAAATAAACTTGTATGAACAGA
* * * *
23769889 AATACAACTGTTTTATGAC-AAA-AAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAA-AG
189 AAT-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
23769951 TCATAACTATATGAAC-TACTTTGATAAATAGGTTTA-TTTGTAATTCTCTTACTTATTAATTTT
253 TCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * * *
23770014 TGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAGTAAGCTTGT
316 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * * * ** * *
23770059 ATGAACATAAATAATTGTTTTAT-AGCAAAATAAAAATGTTATAACGGTTAAAAATATATAATTT
1 ATGAATA-AAACAATT-ATTTATGA-CAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
** ** * **
23770123 TTCAAAT-AGTCATAACTATTCAAACTTA-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACT
62 TTCAAATAAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACT
* * * * *
23770186 TATTAAATTTT-GAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAATTTATATAAACAG
125 TATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAACTTGTATGAACAG
* * ** * *
23770249 AAAT-AATTGATTTATGATAAAACAAAAGGT-AGTAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAACT
188 AAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-T
* * * * * **
23770312 A-TTATAACT-TACTAAAGTTGTTCT-ATAAATTGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAAT
251 AGTCATAACTAT-TTGAACTTATT-TGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
*
23770370 TTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGATTAAGCTTGT
313 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * *
23770418 ATGAATAAAATAATTATTTTATG---AAA-AAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
1 ATGAATAAAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *** * * *
23770479 AAAT--GCTTAAAACTATTGGAA-CAATTTGGTAAAGAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAT
65 AAATAAG-TCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * ** *
23770541 TAATTTTGT-GAATATTTATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAA-AAAGCTTATATGAACA-AAA
128 TAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAA-CTTGTATGAACAGAAA
** * * * *
23770603 -CTAATTACTTTATGACAAAATAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATTGTC
191 TC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * ** *
23770667 AAAACTATTTCAA--TCTCTCCAAACAGATTTATTTTTTGAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AG
255 ATAACTATTTGAACTTATTTGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-
*
23770729 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTTGT
319 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * *
23770771 ATGTACTAAAACAATTTCTTTATAATAAAACAAAATGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTT
1 ATG-AATAAAACAA-TTATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * *** * * * *
23770836 TAAATGAA--CATAACTTTTTGAACTTA-TTTGTTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAAT
64 CAAAT-AAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAACATATTTA--TTTTTAAATCTTTTACT
* * * * * *
23770898 TATTAATTTTTAAAATATGAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAATTTGTA-CAGATAGA
125 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGA-ACAGA
* * ** * * * * *
23770961 CA-CAATT-TTTTATGGCAAATGAAAATGTCATAACGATTTCAAGTAGATAATTATTCAAATAAT
189 AATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *
23771024 CATAACTA-TTGAAACTT-TTTGATAAACA-AGTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTCTTAACTTT
254 CATAACTATTTG-AACTTATTTGA-AAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* ** * * * *
23771086 CGAAATATTAAT-AATTAAAATTAGTTTATTCTAAATAAGCATAT
316 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * * *
23771130 ATGGACAAAAGAATTACTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACGATTAGAAATAGATAATTATTC
1 ATGAATAAAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *** * * * *
23771195 -AATTAGTCATAACTATTTGAACTAATTGGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATGTTCTACTTATT
65 AAATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * ** * *
23771259 GATTTTCAAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATAAATAGAAA-CA
129 AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAGAAATCA
* * * * * * * * *
23771323 ATTGTTCTAAGATAAAACAAAATGTCATAACGATTTGTAATATATAACTT-TTTAAATAGTCAGA
194 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATA
* * * * * *
23771387 ACTATTTAAACTAATTTGATAAACATATTTATATTTTAAATATTTTGCTTATTAATTTTTG-AAT
258 ACTATTTGAACTTATTTGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * **
23771451 ATTAATAAATTAGTATTTTTTCTCTTCCAAATAAGCTTGT
322 ATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * *
23771491 ATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTGTT
1 ATGAA-TAAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * *
23771556 CAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAAAAAATCAGATTTGTTTTTTAAATTTTTTACTT
64 CAAATAAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAA-CATATTT-ATTTTTAAATCTTTTACTT
* * ** * * *
23771619 CTTAATTTTTTA-AATATTAATTAATTTTTGTTATTTTATTTTG-AATAATCTTGTATGAGCAGA
126 ATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAACTTGTATGAACAGA
* * *
23771682 AA-CAATTGTTTTATGA-AGAAACAAAAAGTTA-AAGTGATTTGAAATAGGT-A--A-T----T-
189 AATCAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* ** * *
23771735 G---------TTTGAACTTA-TTGAGTAAACATATTTATCATTTAAATCCTTTACTTATTAATTA
252 GTCATAACTATTTGAACTTATTTGA--AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* * * * * *
23771790 TTGAAATATTAATAAATTAATATTAGTTTATTGTAAATAAACTTAT
315 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * * *
23771836 ATG-A-ACAATAATTGTTCTATGACAAAACAAAATGTTACAATTATTTGAAATAGATAATTATTC
1 ATGAATAAAACAATTATT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * *
23771899 AAATAA-TCATAGCTA-TTGAAATTTGTTCAGCAAACAGATTTAACTTTTAAAT-TTTTACTTAT
65 AAATAAGTCATAACTATTTG-AATTAGTTCAATAAACATATTT-ATTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * ** * * * * * *
23771961 AAATTTAATA-AA-AAAAAGAAATTAATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAGCAAAAAT
128 TAATTT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAGAAAT
** * * * *
23772024 -AATAATTATATGACAAAACAAAAAGTCATAATTATTTGAAAGAGATAATTATTCAAATAGTCAT
192 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * ** * * *
23772088 AACTCTTTTAATTTATTCGATAAACAGATTTATCATTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAAAA
257 AACTATTTGAACTTATTTGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
** * * *
23772153 TATTAATAAATTAAAATTCTTTTATTTCT-TATAAGGTTGT
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* * * * * * *
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1 ATGAATAAAAC-AATTA-TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTG
* * ** * *
23772257 TTCAAAT-GGTCATAATTATTTGAACTTA-TTTGATAAACAAATTTATCTTTTAAATCTTCTACT
62 TTCAAATAAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAACATATTTAT-TTTTAAATCTTTTACT
* * * * **
23772320 TATAAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCCAAAT-AA---G-A--AA-AGAA
125 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAGAA
* * * *
23772377 A-CAAAATT-TTTT-TGACAAAACACAAA-GTCATAATTATTTGAAACATATAATTGTTCAAATA
190 ATC--AATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
*
23772438 G----------TTG-------TT--AAACAGATTTATCTTTTAAATCTTTTACTTA-TATATTTT
252 GTCATAACTATTTGAACTTATTTGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA-ATTTT
* * * *
23772483 T-AGAATATTAATAAATTAATAGTATTTTATTTTGAATAAGTTTGT
316 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
* * * * * * * * * *
23772528 ATTAACAGAAACGATTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAATTATTTGAATTAGATAACTATT
1 ATGAATA-AAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *** * * * * *
23772593 AAAAT-AGTCACAGCTATATGAATTTA-TTTGGTCAATAGATTTATCTTTTATATCTTGTACTTA
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* * * * * *
23772656 ATAA-TTTTAGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAATTTGTGTTAATAGAA
127 TTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAACTTGTATGAACAGAA
** * * *
23772719 AT-AATTAATTTATCACAAAACAAAAAGTCATAATTATTTGAAATAGAT
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23772767 TTATCTTTTA
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AATAAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAACAGAAATCAAT
TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
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ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT
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23767324 TTGAATTACC
* * **
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* * *
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* * * *
23767464 ATTATAACTTGTTAAATTTGTTCAGTAAATTGATTTATTTTTTTAAATCTCT
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* * * * * * *
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* * **
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* * *
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* *
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23767736 CAAAATAAGC
Statistics
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AAATAATTGATTTATGATACAGAAAAAAGTCACAACAATTTGAAATAAATAATTGTCCAAATTAT
TAAAACATGTTAAATTGGTTCAGTAAATTGATATATTTTTTTAAATCTCT
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23769384 AAAAGATCAT
*
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* * *
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* * * * * * ***
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* ** * * *
23769624 TTATTTTTTAAAATCTTTTACTTTTTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT
65 TTA-TTTTT-AAATCTCTTAAATATTAACTTTTAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATTT
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23769723 CATCAAAACC
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TATTTTTAAATCTCTTAAATATTAACTTTTAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATTTGAA
TAAGTATGTATGAACAGAAACTATTATTTTATTACA
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Indices: 23769563--23772369 Score: 1457
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23769553 TATTACAAAT
* * * * * * * *
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* * * **
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* * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *** *
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* ** *
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128 AGCTTGTATGAACA-AAACAATTACTTTATGA-CAAAAT-AAAATGTCATAAC
* ** * * * *
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** * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * * * **
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1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTAT-TTCAACTT-TT-GATAAACAGATTTA
** *
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63 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
* * *
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* * * ** * * *
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* * * *
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* *
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* * * **
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* **
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTG-TCATAACTATTTCAAC-T-TTTGATAAACAGATTTA
* * * * *
23770879 TTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAAAATATGAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAA
63 -TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
** * * * * *
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* * ** **
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* * * ** * *
23771059 TTTTTAAATCTTTTACTTCTTAACTTTCGAAATATTAAT-AATTAAAATTAGTTTATTCTAAATA
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* * * * * *
23771123 AGCATATATGGACAAAAGAATTACTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAAC
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* * * * * *
23771173 GATTAGAAATAGATAATTATTC-AATTAGTCATAACTATTTGAACTAATTGGGTAAATAAATTTA
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* * * ** *
23771237 TTTTTTAAATGTTCTACTTATTGATTTTCAAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAAT
63 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
* * * * * * *
23771302 AAACTTGTATAAATAGAAACAATT-GTTCTAAGATAAAACAAAATGTCATAAC
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* * * * * * *
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* * * * *
23771418 TATTTTAAATATTTTGCTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTCTCTTCCAAAT
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * ***
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* * ** * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** *
23771777 TACTTATT-AAT-TATTGAAATATTAA----T-AA-ATTAAT--ATTAGT-TTA--TT-GT--AA
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* * * * * * * *
23771826 ATAAACTTATATGAAC--AATAATT-GTTCTATGACAAAACAAAATGTTACAAT
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* ** * ** * * * *
23771877 TATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAGCTATTGAAATTTGTTCAGCAAACAGATTTAA
1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTCAACTT-TTGA-TAAACAGATTTAT
* * * * ** * * **
23771942 CTTTTAAAT-TTTTACTTATAAATTTAAT-AAAAAAAAGAAATTAATATTATTTTATTTGAAATA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
* * * * * * *
23772005 AGCTTGCATGAGCAAAA-ATAATAATTATATGACAAAACAAAAAGTCATAAT
128 AGCTTGTATGAACAAAACA-ATTACTT-TATGACAAAATAAAATGTCATAAC
* * * * * *
23772056 TATTTGAAAGAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTCTTTTAATTTATTCGATAAACAGATTTAT
1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTCAACTT-TT-GATAAACAGATTTAT
** * * * ** * * **
23772121 CATTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAAAATTCTTTTATTTCTTATA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
* * * * * * * * *
23772186 AGGTTGTATTAATACAACGAA-TATTTCTATGATAAAACAAAA-GATCACAAT
128 AGCTTGTATGAACAAAAC-AATTACTT-TATGACAAAATAAAATG-TCATAAC
* * * * * * *
23772237 TATTTGAAATATATAATTTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTA
1 GATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATTGTCATAACTATTTCAAC-T-TTTGATAAACAGATTTA
* * * * *
23772302 TCTTTTAAATCTTCTACTTATAAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCCAAAT
63 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
23772367 AAG
127 AAG
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Statistics
Matches: 2054, Mismatches: 439, Indels: 264
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Matches are distributed among these distances:
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TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
TTGTATGAACAAAACAATTACTTTATGACAAAATAAAATGTCATAAC
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * ** * * *
23772164 TAAAATTCTTTTATTTCTTATAAGGTTGTATTAATACAACGAATATTTCTATGATAAAACAAAAG
66 TAATATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATTAA-ACAA-TAATATTTCTATGACAAAACAAAAG
* * * * * *
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128 ATCACAATTATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT
* * * * ** *
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1 TTATTCGAGTAAACAGATTTATCATTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAAT
* ** ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 TTTGAACTTATTTGAGTAAACAGATTTATCATTTAAATCTTTTACTTATAAATTTTTAAAATATT
* * ** * * *
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* * * *
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* * * **
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* * ** ** *
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* * * *
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23772440 TGTTAAACAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATAAATTAATATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATTAAACAATAATATTTCTATGACAAAACA
AAAGATCACAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
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23772616 TTATTTGGTC
* * *
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* *
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*
23772755 TTTGA
130 ATTGA
*
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1 AATAGATTTATCTTTTATATCTTGTACTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATAGTATTT
* *
23772825 TATTTTGAATAAATTTGTGTGAATAGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAAGTCATAATTAA
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23772890 TTGA
131 TTGA
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1 AATAGAT
23772901 AATTGTTTTA
Statistics
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AATAGATTTATCTTTTATATCTTGTACTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATAGTATTT
TATTTTGAATAAATTTGTGTGAATAGAAACAATTAATTTATCACAAAACAAAAAGTCATAATTAA
TTGA
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23772438 GTTGTTAAAC
* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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*
23772763 AGATTTATCTTTTATATCTTGTACTTAT-TAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATAGTATTTTA
1 AGATTTATCTTTTAAATCTTGTACTTATAT-ATTGTCAAAATATTAATAAATTAATAGTATTTTA
* * *
23772827 TTTTGAATAAATTTGTGTGAATAGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAAGTCATAATTAATT
65 TTTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATTAATT
* * * * *
23772892 GAAATAGATAATTGTTTTAAAAT-TCAAAACTATTTGAATTTGTCTGATAAACGGATTTATCGTT
130 GAAATAGATAA--CTATTAAAATATCAAAACTATATGAATTTATCTGATAAACAGATTTATCGTT
* * * * **
23772956 TAAATCTTGAACTTATTGATTTTGGGAATATTAATAGATTAATATCATTTTATTTTGAATATGCT
193 TAAATCTTGAACTTAATAATTTTAGGAATATTAATAAATTAATATCATTTTATTTTGAATAAACT
*
23773021 TGTATGAACATAAATAATT
258 TGTATGAACAGAAATAATT
23773040 GTTTTAAAAT
Statistics
Matches: 233, Mismatches: 41, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
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AGATTTATCTTTTAAATCTTGTACTTATATATTGTCAAAATATTAATAAATTAATAGTATTTTAT
TTTGAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATTAATTG
AAATAGATAACTATTAAAATATCAAAACTATATGAATTTATCTGATAAACAGATTTATCGTTTAA
ATCTTGAACTTAATAATTTTAGGAATATTAATAAATTAATATCATTTTATTTTGAATAAACTTGT
ATGAACAGAAATAATTAATTTATCACAAAACAAAAAGTCATAATTATTTGAAAT
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23772881 CATAATTAAT
*
23772891 TGAA-ATAGATAATTGTTTTAAAATTCAAAACTATTTGAATTTGTCTGATAAACGGATTTATCGT
1 TGAACATAAATAATTGTTTTAAAATTCAAAACTATTTGAATTTGTCTGATAAACGGATTTATCGT
*
23772955 TTAAATCTTGAACTTATTGATTTTGGGAATATTAATAGATTAATATCATTTTATTTTGAATATGC
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23773020 TTGTA
131 TTGTA
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1 TGAACATAAATAATTGTTTTAAAATTCAAAACTATTTGAATTTGTCTGATAAACGGATTTATCGT
23773090 TTAAATCTTGAACTTATTGATTTTGGGAATATTAATAGATTAATATCATTTTATTCTGAATATGC
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23773155 TTGTA
131 TTGTA
23773160 TGAACATAAATAATTGTT
1 TGAACATAAATAATTGTT
23773178 CCATGACAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TGAACATAAATAATTGTTTTAAAATTCAAAACTATTTGAATTTGTCTGATAAACGGATTTATCGT
TTAAATCTTGAACTTATTGATTTTGGGAATATTAATAGATTAATATCATTTTATTCTGAATATGC
TTGTA
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23773715 ACAAACTATC
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1 ATAAATATTTGAAATAGT
*
23773742 ATAATTATTT-AAATAGTT
1 ATAAATATTTGAAATAG-T
*
23773760 ATAACTATTTGAA
1 ATAAATATTTGAA
23773773 TTTAATAGGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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23773520 AAGCTTGTAT
* * * * * * *
23773530 CAAAACAAAAAGTCATAATTATTTCAAATAGATGATTGTTCAAGTAGTTATAACCATTTGAATTT
1 CAAAAC-AAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT
** ** ** * *
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* * * * * *
23773660 TATTATTTTATTTCGAATAGGTTTTTATGAAAAGAGATAATTGTTCTATTA
130 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGA-AAAATTGTTCTATAA
* * * *
23773711 CAAAACAAACTATCATAAATATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAATTT
1 CAAAACAAA-TGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT
** * * *
23773776 AATAGGTAAACAAATTTATTTTTTGAATATTTTACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTAA
65 GTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTAA
* * * * *
23773841 TATCATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAATAGAAAAACTTATTCTATAA
130 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAAAA-TTGTTCTATAA
* * *
23773892 TAAAACAAAATGTTATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTACTTGAACTT
1 CAAAAC-AAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT
* * * * *
23773957 GTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATGAAATTTTGGAATATTAATAAATTAA
65 GTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTAA
* * *
23774022 TATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTATATGAATATAAACAATTGTTTTATGA
130 TATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTATATGAATAGAAA-AATTGTTCTATAA
* * * * * *
23774073 CAACAA-AAA-GTCATAATTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCACAACTATTTAAACTT
1 CAA-AACAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT
* * ** * * *
23774136 GTTCA-GTAACCATATCAATCTTTTAAATCTTTCACTTATTAATTTTTGGAATATTC-ATAAATT
65 GTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA-TCAATAAATT
* * * * * *
23774199 AATATTATTTTATTACGAATAAGTTTGTCTAAATAGAAGCAAA-T-AT-TAT-A
128 AATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAA--AAATTGTTCTATAA
* ** * * * * * * *
23774249 -TAAA-AAAT-T-A-AAAGAATT---ATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AAGTTATTTAAATTT
1 CAAAACAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAA-CTATTTGAACTT
* ** * * *
23774305 GTTCA-ATAAACAGATTTATCGTTTAAA-CATTTACTTATTATTTTTTGAAATATTAATAAATTA
65 GTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTA
* * * * *
23774368 ATATTATTTTATTCCCAAT-A----A-ATGAATACAAACAATTGTTGTATGA
129 ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAA-AATTGTTCTATAA
* * * * * * *
23774414 CAAAATGATAGGTCATAA-TATATGAAATAGATAATCT-TTC-AATAGTCATAACCATTTGAATT
1 CAAAA-CAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT
* * * * * * * *
23774476 TATTCGGTAAATAAATTTATCTTTTATATCTTTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
64 TGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTA
* * * *
23774541 ATATTAATTTATTTCGAATAAACTTGTATGAGTAGATAATAATTGTTCTAT
129 ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGA-AA-AATTGTTCTAT
23774592 GAAAAAATAC
Statistics
Matches: 707, Mismatches: 135, Indels: 79
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Matches are distributed among these distances:
160 1 0.00
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179 134 0.19
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CAAAACAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG
TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTAAT
ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAAAATTGTTCTATAA
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*
23773906 ATAATTATTTGAAATAG
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23773923 ATAATTA-TTCAAATAG
1 ATAATTATTTCAAATAG
23773939 TTATAACTAC
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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* * ** * *
23774602 TTCAAATAATTAAGG-CATTTTGTTTCATCATAAAACAATAGTTCACATTCATGCAAGCTTATTC
1 TTCAAATAATT-AGGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTT-TTATTCATACAACCTTATTC
* * * * * ** * * * *
23774666 TAAATAAAGTAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAAATTACAAGA-TTTAAAATATAA
64 GAAATAAAATAATATTAATCTACTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAATATAA
*
23774730 ATTTATTTACAGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
129 ATTTATTTACAGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
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23774783 TTCAAATAATTTGGATCTTTTGTTTCCTCATAAAACAATTGTTTCT-TTTTTACAACCTTATTCG
1 TTCAAATAATTAGGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAACCTTATTCG
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23774847 AAATAACATAATATTAATCTACTGACATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAA-A-AAA
65 AAATAAAATAATATTAATCTACTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAATATAAA
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23774910 TTTGTTTACCGGATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
130 TTTATTTACAGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
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23774962 TTCTAGTAATTAGGGCCTTTTGTTTCATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATGCAAGCTTATTTG
1 TTCAAATAATTAGGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAACCTTATTCG
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23775027 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGAAGA-A--TTAAAAGATAA
65 AAATAAAATAATATTAATCTACTAACATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAATATTTTAAAATATAA
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23775089 ATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAG
129 ATTTATTTACAGAATAAGTTCAAATAG
23775116 ACAAGAAT
Statistics
Matches: 273, Mismatches: 52, Indels: 17
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
178 7 0.03
179 89 0.33
180 132 0.48
181 45 0.16
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TTCAAATAATTAGGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAACCTTATTCGA
AATAAAATAATATTAATCTACTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAATATAAAT
TTATTTACAGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Done.