Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
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Warning! 69000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 4 of 129
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573895 TTTTAATTGA
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* * *
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* * ** *
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* * *
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* *
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*
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Statistics
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574675 ATTGTTTTAT
* * * * *
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* * * *
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*** * ** * * **
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* * * * * *
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* ** * *
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* * * ** * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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*** * * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * * * *
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66 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * *** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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*** * * * * ** *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* ** * * * *
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* * *
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** * * * * *
575761 ATTAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATTGATATTTG-T--
1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCA
* * * * * * *
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* * * *
575881 AATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAA-CTTTTTATA
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** * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * * ** **
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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* ** * *
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* * * * * * ** **
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
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* * *
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* *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
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* **
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* * * * * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCA
* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
577195 AACTAATAA-AATTGTTTTATGATGAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAAATAAATATTGA
1 AAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * ** * * *
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* * * * *
577323 ATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATG
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* * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
** * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * * *
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66 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTA-AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * ** * *
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* * * * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCA
* * * ** * *
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* * * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
** * * * *
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* * * *
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** * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * ** * ** * *
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* * * ** *
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*** * * * * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * *
578698 ATAGTAATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTTAATTTCTTGCTTACTAA
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* * * *
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* * * * * ** * * *
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1 AAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * ** * *
578879 AATAG-CATTAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATACTTTTATTTTTGAAATCTCTTACTTGTTA
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* ** * * * *
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* * * * * * * *
578995 AATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAAATAATTGTTTAA
1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * *
579059 ATAGTCATAACTATTTGAATTAGTCCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAAT
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** **
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* * * * * ** *
579171 AATAAAAATAACTATTTTATGACAAAACAATATATCATAACGATTT---A-AGATAATAT-TTCA
1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCA
* * * * * * * * * ** *
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* * * * * ** ** *
579296 -TTTTATAATACTAATAAATTAATATTATTTAATCTCAAATAAAATAATA-C
130 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * ** * * *
579346 AA-AGAAAACTAAATGTTTGATGACAAAATGAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
1 AACA-AAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
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64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTAT
* * *
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* * *
579527 AGCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGAT-A-----C--
1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * *
579584 -T--T-AT-TC-ATTTGAACAGGTTCAGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAA
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* * * *
579643 TTTGA-AATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATG
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* * * * ** *
579693 AGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAATTGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * *
579758 ATAGTCTTAACTATTTAAAGTGGTTC-GACAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAA
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* * * *
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* * * ** * * * * * * *
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1 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * *
579939 ATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTAATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC----TAAT
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* * * * *
580000 TATT-GAA-A-TACT-AA-TATTATTCTTTTATTTCAAATAAGTTTGTATG
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*** * * *
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580092 TATTTCAAAC
Statistics
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0.76 0.17 0.07
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * * ** *
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* ** * * ** *
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195 CAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* * * * * * ** *
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**
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* * * ** * * *
575055 AATTGTTTTATCATAGAAA-AAAAGGTTATAACAAATTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
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* * ** * **
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130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-AAAAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * * *
575244 ACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTATTGAAATGGCCATAATTATTTAAATT
194 ACAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *** * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * *
575477 ACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTACTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-
66 ACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGA
* * ** * *
575540 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTATTATAT
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * **
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193 GACAAAAAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATT-ATTTAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
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256 CT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAA
* ** * *
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* * * *
575770 AATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATTGATATTTG-T----T--TCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
575826 AACTATTTTAACTGGTT-TGAAAAAAAGGTTTTACTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA
65 AACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACA-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * *
575890 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAA-CTTTTTAT-AAACTGAAACGATTTTTTT
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC-TTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTT
* * *
575953 ATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATGGTCA-AATCTATT
191 ATGACAAAA-AAAAGA-TCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAA-CTATT
* * * * * *
576015 TAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAA
252 TGAAC-TGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAA
* * * *
576080 TAAATTAGTATTA-TGTATTCTGAA-AAGGTTATATGAACTGAAAT
315 TAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC
* * * * ** ** *
576124 AATTGTTTTATGCCTAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGTAATAGTCTTA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
576189 ACTATTT-AATCTAGTTCAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAA
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* * * * *
576253 ATATTATTAAATTAGTAATATTTTAATCCAAATAAGCTTGTGTGAAAAGAAACAATTGTTTTATG
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* * * *
576318 ACAAAATAAAGACCATAATGATTTGAGATAGATAATTATTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTA
194 ACAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* * * *** * * *
576383 TTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATAATAATAGATCAG
258 GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAG
* * ** **
576444 TACTATTTTATTGTAAATAATTTTACATGAACATG-AAC
323 TATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAAC
* * * * * *
576482 AATTATTTTATGAGAAAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATG
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
576547 ACTATTTGAACTTGTT-TGATAAA-TGATTTATTTTTTAAATC-CACTACCTATTAATTTTT-AG
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* * * * * *
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128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * *
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192 TGACAAAA-AAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGA
* *
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255 AC-TGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATA
* * **
576798 AACTAGTATTATTTTATTTCGAATACA-CTTGTTTGAACAAAAAC
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* *
576842 AATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *
576906 AACTATTTGAACCT-GTTCAAG-AAACAAATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGG
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** * *
576968 AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTA
128 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTA
* * * * *
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192 TGACAAAA-AAAA-GATCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
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254 AAC-TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAA
* * * * * *
577161 ATTAGTATTGTTTTATTTCAAATAAGCCTATGTGAACT-AATAA
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** * * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* ** * * * * **
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* *
577333 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAA-AAACAATTGTTTTATG
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
577397 ACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
194 ACAAAA-AAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *** *
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* * * *
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* * * * * *
577565 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGTTAATTGTTTAAACAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
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* * * * * * ** *
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130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATG
* ** ** * * * *
577758 ACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG--AATTGCTCAAACAGTCATAACTATTCGTACT
194 ACAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * *
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258 -GTTCAGTA-AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATT
* ** * * *
577885 AGCATTACATTATTTCAAATAAGAC-TATATCAA-TAGAAAC
321 AGTATTATTTTATTT-GAATAAG-CTTGTATGAACT-GAAAC
* * * ** * * *
577925 GATTCTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * ** * **
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* * * * *
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* * *
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192 TGACAAAA-AAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTC-ATAACTATTTG
* ** * * * *
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254 AACT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TTGAATATTAAT
* *
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* * * *
578283 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
578348 ACTATTTGAACTAATTC-GATAAA-AAATTTA-TTTTTATATCTCATACTCATTAATTTTTGAAA
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* * * * *
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130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-AAAGAAACAATTGTTTT-AT
* * * * * *
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* ** * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* ** *
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* * ** * * * * **
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* * *
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* * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
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** ** * * *
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* * * * * *
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195 CAAAA-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTT-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-
* * * * * ** * * *
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257 TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTA
* * ** ** ** * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * **
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
580313 ATGACAAAAAAAAAGTTCATAACAAATTTAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
128 ATGACAAAAAAAAAGGTCATAACAAATTTAAACAGATAATTATTCAAATAAT
* * *
580365 CATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAATATTT
1 CATAACTATTTGAACTTATTCAGAAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTAT-CTTATTAAT-TTT
* *
580430 TG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATCTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACTATTATTT
63 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTT
* * ** * *
580494 GATGAC-TAACTAAAGGTCA-AA-ATGATTTGAAACAGATAATTATTCTAATAAT
127 CATGACAAAAAAAAAGGTCATAACA-AATTT-AAACAGATAATTATTCAAATAAT
* * * * * * * *
580546 CTTAACTTTTTGAACTAATTTAGCATACACATTTATTTTCTAAATC--A-CTTATTAATTTTTGA
1 CATAACTATTTGAACTTATTCAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTATCTTATTAATTTTTGA
* * * *
580608 AATACTATTAAATTAGTACTATTTTTATTTGAATAAGCTTGTATG-ATCGAAAACAATGT-TTT-
66 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATTG-AAACAAT-TATTTC
580670 ATGACAAAA
128 ATGACAAAA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (179 bp):
CATAACTATTTGAACTTATTCAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTATCTTATTAATTTTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTCATG
ACAAAAAAAAAGGTCATAACAAATTTAAACAGATAATTATTCAAATAAT
Found at i:581206 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 580887--583851 Score: 2108
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580877 GTTTGGTTTC
* * * *
580887 AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTT
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* * * * * * * * *
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64 TGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * *
581015 TGTTC-AATAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTT
128 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * *
581067 AAATTTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTCTTTTAATTTGAATAAGCTT
1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTT
* * * * * * * * *
581132 CTATGAAGACAAATAATTGTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTG
65 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
*
581196 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATTTA-TTTTT
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** *
581246 AAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAATTC
1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT-TGAATAA-GC
* * * * * **
581307 TT-TATGAACA-AAAAAATTGTTTAACGA-TAAA-AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAAT
63 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * *
581368 TGTTCGAATGGGT-ATGACTATTTGAATTTGTTCGGTAAATAGAATTATCTTTT
128 TGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * * *** *
581421 AAATCTCCTACCTATTAATTTCCAAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTCGAATAAACTT
1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTT
* * *
581485 GTATGAATAGAAATAATTGTTTTATG----AA-AAAA---C-T----ATTAGAAATAAATAATTG
65 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
581537 TTTAAATAGTCATAACTATTT-ACGTTTGCTT-AATAAACAGATTTATTTTTT
130 TTCAAATAGTCATAACTATTTGA--ATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * *
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1 AAAT-TTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGC
* * * * * * **
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63 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
581717 TATTCAACTAGTCAAAACTATTTGAACAT-GTTCAGA-AAATATATTTATTTTTT
128 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTC-GATAAACAGATTTATTTTTT
* * **
581770 TAATTT-TTACTTATTAATTTTTG---GA-T--T--A-T--T-TTATTTTATTCAAAATAAGCTT
1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTT
* * *
581822 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAGTAGATAATTG
65 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* *
581887 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTC-AGTAAATAGATTCATTTTTT
130 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTT
* * * * *
581938 AAATCTT-TGACTGAATAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAACC
1 AAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGC
* * * * * *
582001 CTATATGAACTA-ATACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATCA
63 TTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * *
582065 TTATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACTT-GTTCGATAATCATATTTACTTTTA
127 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* **** * * * *
582119 AAATCTT-TTACTTATTAGTTGCCAAAATATGAAGAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCT
1 AAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCT
* * * * * * *
582183 TGTATGAACA-AAACAACTATTTCATGACAAAACTAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAAC
64 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
** ** * * *
582246 TGTTCAAATAGTCATAAGAATTTGAATTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
128 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * **
582299 AAATCTT-TTACTTATTAATTGTTTG-AATATTAATAAATTTGCATCGTTTTATTTGAAATAAGC
1 AAAT-TTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGC
* * * * * **
582362 TTCTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAAT-GCATAA
63 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG-ATAA
* ** * * * * * *
582426 TTGTTTAAATAGTTGTAACAATTTAAACTT-GTTTGGTAAAGA-ATTCATTTTTT
127 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * * * * *
582479 AAA--TC-T-CTTATTACTTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTTGAATGAGTTT
1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTT
** * * * * *
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65 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * ** * *
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130 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGA-TAAACAGATTT-ATTTTTT
* * * * *
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1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCT
* * * * * *
582720 AGTATGAATAGAAACAATTGTTCTATGAAAAAACAAATGATCATAACGATTTGAAATAAATAATT
64 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
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129 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG-GTT-CGATAAACAGATTTATTTTTT
* * * * * * *
582837 AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAATCAT
1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTT
* * * *
582902 ATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTG
65 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * ** * *
582967 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTTGGCAAATAGAATTA-TTTTT
130 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * *
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1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATT-TGAATAAGCT
* * * * *
583080 TAGTAAGAACT-GAAA-ACTTTGTTTT-TCGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAG
64 T-GTATGAA-TAGAAACA-ATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * ** * * *
583142 AATTGTTCATATAGCCTTAACTGTTTGAACTAATT-TAGCAAACA-A--GATTTTTT
125 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTT
* * * *
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1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCT
* * * * * *
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64 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
583324 GTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAACAAATTTATTTTTT
129 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
* * ** *
583376 AAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCCAAATAGGCTT
1 AAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTT
* * * *
583440 GTATG-AT-GAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATATTT
65 GTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * ** * *
583503 GTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTTGATAAATTA-ATTTA-TTTTT
129 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAA-CAGATTTATTTTTT
* * * *
583554 AAATCTT-TAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT-AAGTAATATTATTTTATTTTTG-ATAAGC
1 AAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTTGAATAAGC
* * ** * * * * * *
583616 TTTTATGAATTGAAATGATTG-TTTATGATAAAATAAAAAGTTATAATGATTTTAAATAGATAAT
63 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* *
583680 TGTTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGGAT-AA-TGATTT-TTTTTT
128 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTC--GATAAACAGATTTATTTTTT
** * * ** * **
583732 -AATTTCTTGGTTATTAATTTTTTG-AATATAAACAAATTCTTATTATTTTATTTCAAATAAGAA
1 AAATTTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCT
* * * * * * *
583795 TGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAATGAGTTGAAAT
64 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
583852 TTGTTCAATA
Statistics
Matches: 2217, Mismatches: 438, Indels: 261
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
166 4 0.00
167 60 0.03
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170 3 0.00
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185 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
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TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT
Found at i:581258 original size:480 final size:479
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580393 AGATTTATTT
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1 TTTCAAATCTTATGCTTATTAATATTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATCTTGAATAA
* * * *
580468 GCTTGTATGAATTGAAACTATTATTTGATGACTAACTAAAGGTCAAAATGATTTGAAACAGATAA
66 GCTTGTATGAACTGAAAATATTATTTGATGACTAAATAAAGGTCAAAATGATTTGAAACAAATAA
* * * * *
580533 TTATTCTAATAATCTTAACTTTTTGAACTAATTTAGCATACACATTTATTTTCTAAATCACTTAT
131 TTATTCTAATAATCTTAACTATTTAAACTAATTGAGCAAACACATTTATTTTCTAAATCACATAT
* * *
580598 TAATTTTTGAAATACTATTAAATTAGTACTATTTTTATTTGAATAAGCTTGTATGATCGAAAACA
196 TAATTTTTGAAATACTATTAAATTAGTACTATTTTAATTTGAATAAGCTTCTATGATAGAAAACA
* ** * *
580663 ATGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATTGACATTTGTGCAAATAGTCATAACT
261 ATGTTCTATGACAAAACAAAGATCATAACAATTTGAGATAGACAATTGTGCAAATAGTCATAACT
* * **
580728 AGTTAAATTGATTTGGAAAACAACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATATT
326 AGTTAAATTGAGTTCGAAAACAACTTTAGTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATT
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580858 TTCATATGTGTTTGAACTTGTTTGG
455 TTCATATGTGTTTGAACTTGTTTGG
* *
580883 TTTCAAATCTCT-TGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
1 TTTCAAATCT-TATGCTTATTAATATTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATCTTGAATA
* *
580947 AGTTTGTATGAACT-AAAATAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGT-AAGAATGATTTGAAACAA
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* * * ** *
581010 ATAATTGTTC-AATAGTCTTAACTATTTAAATTGGTTCGA-CAAACACATTTATTTTTTAAATTT
127 ATAATTATTCTAATAATCTTAACTATTTAAACTAATT-GAGCAAACACATTTATTTTCTAAA--T
* * *
581073 CTTACATATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTCTTTTAATTTGAATAAGCTTCTATGA
189 C--ACATATTAATTTTTGAAATACTATTAAATTAGTACTATTTTAATTTGAATAAGCTTCTATGA
* * * *
581138 -AGACAAATAATTGTTCTATGACAAAATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAA
252 TAGA-AAACAA-TGTTCTATGACAAAACAAAGATCATAACAATTTGAGATAGACAATTGTGCAAA
* * *
581202 TAGTCATAACTATTTGAATTG-GTTCGATAAATAGA-TTTA-TTTTTAAA-TC-T-CTTATTAAT
315 TAGTCATAACTAGTTAAATTGAGTTCGA-AAACA-ACTTTAGTTTTTAAACTCTTGCTTATTAAT
581261 TTTCAAAATATTAATAA
378 TTTCAAAATATTAATAA
581278 ATTAGTATTA
Statistics
Matches: 341, Mismatches: 41, Indels: 26
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
479 4 0.01
480 153 0.45
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482 4 0.01
483 2 0.01
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485 72 0.21
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ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (479 bp):
TTTCAAATCTTATGCTTATTAATATTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATCTTGAATAA
GCTTGTATGAACTGAAAATATTATTTGATGACTAAATAAAGGTCAAAATGATTTGAAACAAATAA
TTATTCTAATAATCTTAACTATTTAAACTAATTGAGCAAACACATTTATTTTCTAAATCACATAT
TAATTTTTGAAATACTATTAAATTAGTACTATTTTAATTTGAATAAGCTTCTATGATAGAAAACA
ATGTTCTATGACAAAACAAAGATCATAACAATTTGAGATAGACAATTGTGCAAATAGTCATAACT
AGTTAAATTGAGTTCGAAAACAACTTTAGTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTA
ATAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACTATTTTAAATGGATAATTGTTCAAATAT
TCATATGTGTTTGAACTTGTTTGG
Found at i:581838 original size:168 final size:169
Alignment explanation
Indices: 581645--581960 Score: 429
Period size: 168 Copynumber: 1.9 Consensus size: 169
581635 TTTTGTTTTG
* * * * * *
581645 AATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTGGTTTGTGATAAAATAAAACGTCATAACT-TTTTGAAA
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAACGTCATAA-TGATTTGAAA
* * * *
581709 TAGATAATTATTCAACTAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTTAAT
65 TAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCAGAAAATAGATTCATTTTTTAAAT
* * *
581774 -TTTTACTTATTAATTTTTGGATTATTTTATTTTATTCAA
130 CTTTGACTGAATAATTTTTGGATTATTTTATTTTATTCAA
* * *
581813 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAGT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAACGTCATAATGATTTGAAAT
* * * *
581878 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATC
66 AGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCAGAAAATAGATTCATTTTTTAAATC
581943 TTTGACTGAATAATTTTT
131 TTTGACTGAATAATTTTT
581961 AGAATATTAA
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 20, Indels: 3
0.85 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
167 1 0.01
168 110 0.87
169 15 0.12
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (169 bp):
AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAACGTCATAATGATTTGAAAT
AGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCAGAAAATAGATTCATTTTTTAAATC
TTTGACTGAATAATTTTTGGATTATTTTATTTTATTCAA
Found at i:582677 original size:718 final size:713
Alignment explanation
Indices: 581830--583510 Score: 1835
Period size: 718 Copynumber: 2.3 Consensus size: 713
581820 TTGTATGAAC
** *
581830 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAGTAGATAATTGTTCAAATA
1 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
581895 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTTGACTGAATAATTTT
66 GTAATAACTATTTGAACTAGTTAAGTAAACAGTTTCATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTT
* *
581960 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAACCCTATATGAACTAATACAATTGTTT
130 TAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTTCAAATAA-CATATATGAA-TAAAACAATTGTTT
* * * * * *
582025 TACGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATCATTATTCAAATAGTTATGACTATTTA
192 TATGAAAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTAATTA
* * * * *
582090 AACTTG-TTCGATAATCATATTTACTTTTAAAATCTTTTACTTATTAGTTGCCAAAATATGAAGA
257 AACTAGTTTCG-CAATCAGATTTACTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGCCAAAATATGAAGA
* * *
582154 AATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAACTATTTCATGACAAAACTA
321 AATTAATATTATTTTAATTCGAACAAGCATATATGAACAAAAACAACTATTTCATGACAAAAC-A
* * * *
582218 AAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAAGAATTTGAATTTATTTGGT
385 AAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAAGAATTTGAATTGATTTGGC
* **
582282 AAACA-AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTG-AATATTAATAAATTTGCATCG
450 AAACAGAA-TTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTTGCATAA
* * *
582345 TTTTATT-TGAAATAAGCTT-CTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTAT-GGCAAAACAAAAGGTTA
512 TTTTATTATG-AATAA-CTTACTAAGAACT-GAAAAAATTATTTT-TCGACAAAACAAAAGGTCA
* ** * * * ** * * *
582406 TAGTGATTTGAAATGCATAATTGTTTAAATAG-TTGTAACAATTTAAACTTGTTTGGTAAAGAAT
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* * *
582470 TCATTTTTTAAATCTC-TTATTACTTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTTGAAT
636 -CATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTATGAAT
* * *
582534 GAGTTTGTACAAAT
700 AAGCTTATACAAAT
* * * * *
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* * ** * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *** * *
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* * * * *
582873 ATTAATATTATTTTATTTCGAACAATCATATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
322 ATTAATATTATTTTAATTCGAACAAGCATATATGAACAAAAACAACTATTTCATGACAAAACAAA
* * ** *
582938 AGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTTGGCAA
387 AGGTCATAACGATTTAAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAAGAATTTGAATTGATTTGGCAA
* * **
583003 ATAGAATTATTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTAATTTTA
452 ACAGAATTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGCATAATTTTA
* ** *
583068 TTATGAATAACTTAGTAAGAACTGAAAACTTTGTTTTTCGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
517 TTATGAATAACTTACTAAGAACTGAAAAAATTATTTTTCGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* ** * *
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582 GAAATAAAGAATTGTTCAAATAGCCTTAACAATTTAAACTAATTTAGCAAACAACATTTTTTAAA
* * * *
583198 TCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTATA
647 TCTC-T--TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTATGAATAAGCTTATA
***
583263 TGGAT
709 CAAAT
* * *
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1 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* **
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66 GTAATAACTATTTGAACTAGTT-AAGTAAAC-AGTTTCATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT
* * * * * *
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* * * *
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Statistics
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * * * ** *
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* * * * ***
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*
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* * * *
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* * * * **
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* * * * * **
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762 ATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACGATTTGAAAT
* * * *
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581772 ATTTTTA
886 ATTTTTA
* * *
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* *
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* * ** * * *
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128 TTATAACTATTTGAA-TTGTTTAG-CGATCAGATTTATTTTTTAAATCTCTTG-CTTATTAATTT
* * * * * *
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* * * * * * *
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254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *** *
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* * * *
582151 AGAAATTAATATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAAC--AAAACAACTATTTCATGACAA
378 ATAAATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAAC-ATTGTTT-ATGACAA
* * * * ** * *
582213 AACTAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAAGAATTTGAATTTAT
441 AAC-AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAAT
* * *
582277 TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTTGCA
505 TTGGTAAACAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTA
** * * * * *
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*** ** * * * ** *
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632 AACAATTTGAAATAG-ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACAGAT
* * * * * **
582470 TCATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTACTTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTTG
696 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * ** * * * *
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* * * * ** ** *
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825 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAA-ATTAATTTATTTTT-AAA
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887 TTT-TTA
* *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
582861 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAATCATATATGAACAAAAACAATTGTTTTA
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* * *
582926 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
258 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
*
582991 TTGGTTTGGCAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
323 TTGGTTT--CAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
* * * * *
583056 TGT-TTAATTTT-ATTATGAATAA-CTTAGTAAGAACTGAAAACTTTGTTTTTCGACAAAACAAA
385 AGTATT-ATTTTAATTCTGAATAAGCTT-GTATGAACTGAAAACATTGTTTAT-GACAAAACAAA
* * * * * * * *
583118 AGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTGTTTGAACTAATTTAGCAA
447 AGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTGGTAA
* * * *
583183 AC-AA-GATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTA
512 ACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * *
583246 TTATGAATAAGCTTATATGGATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTT
576 TT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * *
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* * *
583376 AAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCCAAATAGGCTT
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* * * *
583440 GTATGAT-GAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATATTTG
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* * * * *
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834 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTAATTTATTTTTAAAT-TTTTA
* * ** *** * *
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1 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TATATGAATA
** * * *
583627 GAAATGATTG-TTTATGATAAAATA-AAAAGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCGAATA
64 GAAACAATTGTTTTATGA-AAAA-ACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
583690 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-GATAATGATTT-TTTTTT-AATTTCTTGGTTATTAATTT
127 GTTATAACTATTTGAA-TTGTTTAGCGATCA-GATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TT
* * ** * ** *** *
583752 TTTG-AATATAAACAAATTCTTATTATTTTATTTCAAATAAGAATGTATGAATTGAAACAATTAT
189 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGT
* * * ** * * *
583816 TTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAATGAGTTG--A-A-AT--TTGTTC-AATA--AAT-A-GATT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * **
583870 T--ATT--TTT----TA-AA--ATCTTT---T-TC---TTATTAATTTTTCAAATGCTAATAAAT
319 TGAATTGGTTTCAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
* * * ** *
583917 TAGTAGTAATTT-ATTCTGAATAAGCTTGGATGAACTGAAATA-ATTGTTTTATGATTAAACATA
384 TAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-ACATTG-TTTATGACAAAACAAA
* * * * * * *
583980 AGGTCAAAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAGCCAATTGAACTAA-TTGAATA
447 AGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTG-GTA
*
584044 AACAAACTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTT
511 AACAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** * * * *
584109 TAATCAAATAAGCTTGTACGAA-A-AAA-AATTTATTTTACGACAAAAGAAAAGGTCATAACAAT
574 TATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * ** * **
584171 TTGAAACAGATAATCGTTCATATAATCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAATTAGATTTATTTT
638 TTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACAGATTTATTTT
* * ** ** * * * *
584236 TTAATTTTCTTGGTTATT-ATGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAATAAA
703 TTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG
* * * * * * *
584300 ATAGTACGA-ACATAACCAATTGTTTGATGACAAAAGAAAATGTT-ATAACGATTTGAAACAGAT
767 CTTGTATGATAGA-AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * * *
584363 AATTATTAAAATAGTCAAAAGTATTTGAAATAGTTTGGTAAA-TAGTTTTACTTTTTAAATCTCT
829 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTA-ATTTA-TTTTTAAAT-TTT
584427 TA
891 TA
* * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
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317 TTTGAATTGGTT--TCAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATATTAA
** * ** * *
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* *
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*
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440 AAACAAAAGGTCATAAT-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAA-CTATTTGAACTA
* * * * * * * *
585820 GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCACTAATTTTTCAAATGTTAATAAAGTA
503 ATTTGGTAAACA-AATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTA
** * * * *
585885 GTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAATTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGT
565 GTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
** * ** * *
585950 CAT-ATGATTTGAACTAGATAATTG-TTATAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACA
629 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACA
* * * *
586013 CATTTATTTTTTAAATATCTTACTAATTAACTTTTTG-AATATT-ATGAAATTAGTATTATTATA
693 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
586076 ATTCAAATAAGCTTATATGGAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCTTAACAATTT
756 TTTCAAATAAGCTTGTAT-GATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTT
*** * * * *
586140 TTGATAGATAATTATTCAAACTAGTCATAACCATTTGAACTAATTT-AGCAAA-CAGATTTAGTT
820 GAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAATTA-ATTTA-TT
*
586203 TTTAAA-TCTT-
881 TTTAAATTTTTA
* * * * ** * * *
586213 -TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAATATTATTTTA-TTCTAAATAA-TTTTGCATGAAC
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTC-AAATAAGCTAT--ATGAAT
* * * * * *
586275 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA-CAATTCAAATTAGATAATTGTTTAAAT
63 AGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAA-AGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAAT
* ** *** * * * * *
586339 GGACATAA-TAATTTGAACTTGTTTGATAAAT-AGATTAATTCTTTAAATCTCATACTTATTAGT
126 AGTTATAACT-ATTTGAA-TTGTTT-AGCGATCAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAT
** * * * *
586402 TTTCAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTATGCAA-AGAAACAAC
188 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-AACAAAAACAAT
** ** *** * ** *
586465 TGTTTTATGA-ATTGTTTTATTAATTTTTATTTATTAATTTTTGGAATATTA-ATAAAT-TT---
251 TGTTTTATGACA-----AAACAAAAGGTCA--TAACAA--TTT-GAA-A-TAGATAATTGTTCAA
* * * * ***
586524 ATA-T--T-ACTTTATTTGGAATAAGCTTGT-ATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAT
304 ATAGTCATAAC--TATTT-GAAT-TGGTT-TCA--AATAG-AATTA-T-TTTTA--A-ATCTC-T
* ** * * ** *
586584 AATGTCA-TAACGATTTAAAATA--GA-AAATT-GTTCAAATAGTCATAA--CT-ATTTGAA-CT
355 TAT-T-ATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAG-T--ATTA-TTTTAATTCTGA-AT-AAGCT
* * ** * * *** * ** *
586640 TGTTTGGTAAAT-AGATTCATT-TTT-T--TAAATCTCTTA-CTC--AATAATTT-TCAGA-AT-
411 TGTAT-G-AACTGA-AAACATTGTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATA
** * ** * * *
586694 ATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTTATACGAGTTGATAC-AATTGTTTTAT
472 ATTGTTCAAA-TAGTCTTA-ACTATTT-GAACTAA--TT-T--G-G-T-AAACAAATTATTTTTT
*** * * * * ***
586756 ACAA-CATAAAAAGTCA-TAATGATTTGAA-A-TAGATAATTATTCAAATAGTTACGACTATTTG
526 A-AATC-T-CTTACTTATTAAT-TTTTGAATATTA-ATAA--ATT--AGTA-TTA-TTTTATTTG
* * * * * ** * * * *
586817 ---AA-CTTGT-TCAGTA-AACATATTTATTTT-T-A-AAATCTATTA-CTTATTA-ATTGTTGA
580 AATAAGCTTGTATGAATAGAA-ATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAAT-TTGA
* *** * ** * ***
586871 AATA-TTAATAAATT-AATA-TTAT-TTTAATTTGAA-TAAGCTTGT-ATGAACAGAAACAATTG
642 AATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACT-ATTTGAACT-AG-TT-TAATAAACAG-ATTTATT-
** ** * * ** * * * *
586930 TTTT--ATGGCAAAAC--A-AAAGTCAT-AACAGT-TTAAAATAAATAAGTGTTCAAATAGTCAT
701 TTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAA-A-TATT--AATAAATTAGTATT---AT-TTTAT
** * *** * *** * *
586988 AACAATTTGAA-CTTGT-TCGAT--AAACATATT-TATTT-TTTTAAATCTTTTACTT-ATTAAT
757 TTCAA-AT-AAGCTTGTAT-GATAGAAACA-ATTGT-TTTATGACAAAAC-AAAAGTTCA-TAAC
* * * * * * * * * **
587046 TATCTT-AATATTA-ACAATT-TTC-ATTATTTTATTCAAC-A-TAG-GCTTGTATGA-ACAAAA
815 GAT-TTGAA-A-TAGATAATTATTCAAATA-GTCA-T-AACTATTTGAACTAGTTTGATA-AATT
*
587103 ACATTTATTTTATGAAA----AA
873 A-ATTTATTTT-T-AAATTTTTA
** * * * * * ** *
587122 GC--AAAAAGTTATAGCAAT-TT--CAAA-TAG-ATAATTGTTCAAATTATCATAATTATTTAAA
1 -CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTATT-TT---ATT-TCA-AATAAGCTATA
** * * * **** ** * *
587180 CTTGTCTAGTAAACAAATTCCTTTTTTTAAGTCTCTTAA-TTATTAAT--TTGTAGAATAATAAA
58 --TGAATAG-AAAC-AATT-GTTTTATGAAAAAACAAAAGTCA-TAATGATT-T-G-A-AATAGA
* * * * * * * * * * * * *
587242 AAATTG-GC-ATTA-TTTTATTCAATAT-ACTTATATGAACTGAAACA-ATTCT-TTTATGATAA
113 TAATTGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATTGT-TTAGC-G-ATCAGATT-TATTT-T-TTAA
* **** * * ** * * ** *
587301 AACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATCGA-TAATTATTTA-TATAGTCATCACTAATT-G-ATC
171 ATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAAAT--ATTAATAAATTAGTAT--T-AT-TTTATTTCGAAT-
* * * * * *
587361 CAGTTTGGTA--AACATATTTATTTTTAA-ATTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAAT
228 AAGCTT-GTATGAACA-A---A-----AACA--ATT-GTT-TT-A-TGAC-AAA-A--CA-AAA-
* * * *
587423 GAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAATAGAACA-AA-
271 G-G--TCA---TAA--C-AAT----TTG-A--AATAG--ATAATTG-TTCA-AATAG-TCATAAC
* * * * * * * *
587486 AAGTCAT-AA--GGATTTGAAATA-AATAATTTGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTG
315 TA-T-TTGAATTGG-TTTCAAATAGAATTATTT-TTAAAT-CTC-TTATTA-TT-AA-T--TTT-
* ** * * * * * ** * * *
587547 ATAAGTAA-ATTTACT-TTTTA-AATCTCTTATTAGTTTTCAA-AATATT-AAT-AGATTAGTAT
368 -TAA--AATA-TTAATAAATTAGTAT-TATT-TTAATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ACT-G-AA
* * * *
587606 TACTTTATTCCAAACAAATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATA
424 AACATTGTT---TA----------TG-AC----A-A--------A--AC-----AAAAGGTCATA
* * * * * ** * *
587671 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTGGGAAAACAAAATT
455 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTGGTAAAC-AAATT
* * * * **
587736 ATTTTTTTAATTCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTGTTCCA
519 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TG
* * ** * * * * *
587800 AATAAG-TTAGCAAGAATTCAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAAGTC--AACATTTTAAA
580 AATAAGCTT-GTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * ** * *
587862 ATAGATAATTG-TTATTAGAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTCGACAAACAAATTTA-TTTTTAA
643 ATAGATAATTGTTTA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * * * * *
587925 TTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGT
707 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* * * * * * * * *
587990 ATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTT-ATAACAATTTGAAGTATACAATTGT
772 ATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * * * * * * *
588054 TTAAATAATTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAA-CAGATTTATTTTTTAA--TCT-
835 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTA-ATTTATTTTTAAATTTTTA
* * *
588109 CTTATTAATTTTT-GAAAGATTAATAAATTAGTATCATTTTA-TTCTAAATAAGCT-TCAATG-A
1 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTC-AAATAAGCTAT--ATGAA
* * * * ** * * * *
588170 TAAAAACCATTTGCTATATGACTAAACAAAAGGTAAAAATGATTTGACATAGATAATTGTTGAAA
62 TAGAAA-CAATTGTTTTATGAAAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* ** * * * * * * **
588235 TGGCCATAATTATTTGAAATGATT--CGATAAATAGATTCACTTTTTAAA----TAACTTATTAA
125 TAGTTATAACTATTTGAATTGTTTAGCGAT---CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA
* * * * ** *
588294 TTTTTGGAAA-ATTAATAAATCT-TTATCATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGAACTGAAATAA
187 TTTTT-GAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
* * *** *
588357 TTATTTT-TGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCGTGTAGTCTTAAC
250 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* ** * * * * *
588421 TATTTGAACTACTTCAACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATCTTTGAAATAT
315 TATTTGAATTGGTT--TCAAATAGAATTA-TTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATAT
* * * * * * * *
588486 TATTAAATTAGTCTTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATAAACT-AAAATAATTATTTTATAAT
376 TAATAAATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-CATT-GTTTATGAC
* * ** * * *
588549 AGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGGTAATTACTT-AAATAG----GA--A-TTG-----
439 AAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTA
* * * * * * * * *
588601 GTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTGTTAATTTTTTACATATTAATAAATTCG
503 ATTTGGTAAACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTAG
* * * * *
588666 TATTATTTTATTTCGAGTAAGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTT
566 TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
** * ** * * * * * *** *
588730 CATAATGATTTGAAATAAATAATTACTGAAATGGCCAT-ACTTATTT-AAATTGATTCGGTAAAT
629 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTAG-TTTAATAAAC
* * * * * *
588793 AGATTCACTTTTTAAATCGCTTACTTATTAA-TTTTAAAATACTAATAAATTATTATTATTATTT
692 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-T-TTT
* * * *
588857 ATTTCAAATAAACTTGTATGAACTA-AAGCAATTATTTTATGACAAAACAACAAGTT-ATAACAA
755 ATTTCAAATAAGCTTGTATG-A-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGTTCATAACGA
* * * * * * * * * *
588920 TTTTAAATATACAATAATTCAAATAGTCATAACTATTTCAATTTG-TTCAAAAAATAGATTTATT
817 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTA-ATTTA--
*
588984 TTTTTAAATCTTTTG
879 TTTTTAAAT-TTTTA
* * *** *
588999 CTTAATAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGCTTTTATGAATC
1 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TATATGAAT-
* * * ** * * *
589063 A-AAACGATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGATCAAATAG
63 AGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * *
589127 ATATAACTATTTGAGCTTATTT-GATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTT
128 TTATAACTATTTGA-ATTGTTTAG-CGATCAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAA-TT
* * * * * * * * * ** * *
589191 TTTG-AATGTTAATATATTAGGAATATTTTATTCCAAATAAGTTTCTATTATA-TGAAACAAATA
189 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTG
* * * * ** * * * ** **
589254 TTTTA-AACTAAA-AGAAGGTTATAATGATTCGAAATAGATAACTATTCTTATAGTTTTAACTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * ** *
589317 TTGAACTAGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC---TTATTAATTTTTGGAATATTATT
318 TTGAATTGGTTT--CAAATAGAATTA-TTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAAAATATTAAT
** * * *
589379 AAATTAGTATTATTTTTAA--CCAAATAAGCTTCTATGATCAG-AAACAATTGTTTTATGACAAA
380 AAATTAGTATTA-TTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAAC-ATTG-TTTATGACAAA
* ** * * * * * ** *
589441 ACAAAA-ATCATAACGATTTGAGATTGATAATTATTCAAATAGTCATACCTATTCAAACTAGTTT
442 ACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTT
* * *
589505 -G---ATAAATTGATTTTTTTAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATTAATATT
507 GGTAAACAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
589561 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGGTCATA
570 ATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * ** *
589624 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT-GATTCGATAAACAAATT
633 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTAATAAACAGATT
* *
589688 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTG
697 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
* * * * *
589752 TATAAGCTTGTACTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAA
761 AATAAGCTTGTA-TGA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * *
589816 TAGACAATTGTTTAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAA-TAGATTTATTTTTAAAA
824 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTA-ATTTATTTTT--AA
589880 ATCTCTTT-
886 AT-T-TTTA
* ** * * * *
589888 CTTATTAAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAATATTAATTTA-TTCTGAATTAGCTTGTATGAAC
1 CTTATT-AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTC-AAATAAGC-TATATGAA-
* * * ** * *
589951 T-TAAACAATTATTTAATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGAT-ATTGTT-ATAA
62 TAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AA
* ** * ** * * * * *
590013 TAGTCT-TAACCATAAGAATTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTCAAATATCTTACTTATTAAT
125 TAGT-TATAACTATTTGAATT-GTTTAGCGATCAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAT
* * *
590077 TTTTGAAATATTATTAAA-TATGTATTATTTTAATAT-GATTAAGCTTGTATGAACAAAAA-AAT
188 TTTTGAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA-
* * * * ** * * *
590139 TTGTTTTATGAC--AACAATAGGTCATAACGATTTAAAATTGATAATCATTGATATAGTCTTAAC
250 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * * * * * * *
590202 TATTTGGACTGG-TTCGGTAATTAGATTTATTTTTTATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCATAATAT
315 TATTTGAATTGGTTTC---AAATAGAATTATTTTTAAATCTCTT-ATTATTAATTTTTAAAATAT
* ** ** * * * *
590266 TATTAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAAATAAAATAGTATGGAC--AAAACCAACTATTTGACT-
376 TAATAAATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-C-ATTGTTT-A-TG
* * * * * ** *
590327 ACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAAAACTATTTGAAAT
437 ACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACT
** * * * ** * *
590392 GGTTTAGTAAAGAGATTAACTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAG
502 AATTTGGTAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAG
** ** * * * *
590457 TATTATTTTATTTCTACCAGACTTATATGAACA-AAATTATTGTTTGATGACAAAACAAATA-GT
566 TATTATTTTATTTGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGT
* ** * * * * * * *** *
590520 AATAATGATTTGACATAGATAATTATTCAAATAGTTAT-GCTTATTTAAACTAGTTCGGTAAATA
629 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTAGTTTAATAAACA
* * * * * * *
590584 GAATTATTTTTTAAATCTCTTAATTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTGTT
693 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
590649 CCAAATAAACTTGTATAAGCTA-AAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA-TGTCATAACGATTT
758 TCAAATAAGCTTGTAT--GATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATAACGATTT
* * * * *
590712 GAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAA-TAGATTTTATTTC
820 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTA-A-TTTATTT-
**
590776 TTAAATCTCGTA
882 TTAAAT-TTTTA
* * * * * * * * * * *
590788 GTTATGAATTTTTGGAACATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAACTTGTATGAACAG
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TATATGAATAG
* * * * ** * **
590853 AAATAATTG-TTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAGT
65 AAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * *
590917 CATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTACTAATTCTTT
129 TATAACTATTTGAA-TTGTTTAGCGATCAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT-TTT
* * * ***
590978 -AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTACGTTGAAAAACAATTGTTTT
192 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTT
** * * * * * * * *
591042 ATGACAAAGTGAAAA-GTAATAACAATTTAAAATAGATATTTATTCAAATGGCCAGAAGTATTTG
257 ATGACAAA-ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * ** *
591106 AACT-AATTCGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCACACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
321 AATTGGTTTC---AAA-TAGAATTA-TTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * *
591170 AAAGTAGTACTATTTT-ATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTG-AAACAATTGTTTTATGAC-AAA
380 AAATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAAC-ATTG-TTTATGACAAAA
* ** * * * * * **
591232 CCAAAGGTTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTGAAATAATCATAACTATTTGAA-TTGTTT
443 CAAAAGG-TCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTT
* * * * * * * * * *
591296 GATAAACAGATTTATTTTTTCAAGTATATTGCTTATTAATTTTTTTATTGTTAATAAATTAATAT
507 GGTAAACA-AATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * * *
591361 TATTTTATTCCT-AATAAACTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTTAG
569 TATTTTATT--TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * ** * * * * * * * *
591425 AACGATTTAAAATAGATAATTATTCCAATAGACTTAACCATTTAAACTAATTTGACAAACACATT
632 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACAGATT
* * *
591490 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATATTTATCT-A
697 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCA
* * * * *
591554 AATAAACTTGTATGATCTA-AAATAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGA
761 AATAAGCTTGTATGA--TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAA
* * * ** * * * * *
591617 TTGATATTTATTCAAATATTTGTAACTATTTGAACT-GGTTCAAAAAATAGCTTTATTTTTTAAA
824 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTA-ATTTA-TTTTT-AA
* *
591681 ACTCTTGA
886 A-TTTTTA
* * * * * * *
591689 -TTAATAATTTTTTA-AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACT
1 CTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAG-CTATATGAA-T
* * * *
591752 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTTAAATAGTTAATTATTCAAAT
63 AGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAA-GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *** *
591815 AGTCATATCTATTTGAGCTTATTTGATAAAT-AGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
126 AGTTATAACTATTTGA-ATTGTTT-AGCGATCAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAT
** * * * * * **** *
591879 TTTTTTAATGTTAATAAATAAGTATTATTTTATTCCGTATAAGCTTGTATAAATTGGAATAATTG
188 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG
* ** * * *
591944 TTTTATGACAAAACAAAAAGGTTAGGACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTA
253 TTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
592009 TTTGAATTGG-TT----TAG---CA-----AAA-CAC--A-T-TT-ATTTTT----CATTATTAA
317 TTTGAATTGGTTTCAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * ** *** * * *
592051 ATTAATATTATCTTAA-TCCGATTAAGCTTACATGAAAAAAAAAAATTATTCTATGACAAAA-TA
382 ATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAACATTGTT-TATGACAAAACAA
* * * * * * * * * ***
592114 GAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTTTTCAAATAATCATAACTATTTGAATTAGTTCAATA
446 AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTGGTA
* * * * * *
592179 AATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAAAACTTAATAAATCAGTATTATTT
511 AACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTT
** * * ** * *
592239 TATTTTGAATAATTTTATATGAACAGAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCTTAACGAT
574 TA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * ** *
592304 TTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGACATGACT-TTTAAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTT
638 TTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACAGATTTATTTT
* * * * * *
592368 TTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAAC
703 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* * * * * * * *
592433 TTTTATGAATAAAAACAATTGTTTTATTACAAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATATT
768 TTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* ** * * * * * *
592498 TCTTCAAGCAATTATAACAATTTG----AGCTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
832 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTAATTTA-TTTTTAAAT-TTTTA
* * * ** * ** *
592557 CTTATTAATTTTTGGAATATTAATGAAGTAATATTATTTTATTTCGAATAAATTTATATGAACAG
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTATATGAATAG
* * * *
592622 AAACAATTGGTTTATGACAAAAC-AAAGTTCATAGCT-ATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG
65 AAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAG-TCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
592685 TCATAGC-ATTTGAATGTGTTCA--AATTACA-AATT-TTTTTAAAAT-TTTTACTTACTAATTT
128 TTATAACTATTTGAAT-TGTTTAGCGA-T-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
* * * **
592744 TTGGAATATTAATAAATTTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAA-GGAAACAATTG
190 TTGAAATATTAATAAA--TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG
* *
592807 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATTCATAACTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * * *
592872 TTGAACTT--TTTTAGTGAATA-TTTTCTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAGTTTTCAAAATATT
318 TTGAA-TTGGTTTCA---AATAGAATT-ATTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATATT
* * * * * * * * *
592934 AATATATTTA-TATTATTTT-ATTCTGAATAAGCCTATGTGAATTGGTATA-ATTGTTTTATAAT
377 AATA-AATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAACATTG-TTTATGAC
* * * * * * *
592996 GAAACAAAAGTTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTT
439 AAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTA
* * * * * * *
593060 GTTTAGTGAAGAGATTCATTTTTTAAATGTCTTACTTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAG
503 ATTTGGTAAACAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAG
* * ** * ** * * * *
593125 AATCATGGTATTTTGAATAAGCATGTACAAATAGAAATAATTATTTTGTGATAAAACAAAAGGTT
566 TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *** *
593190 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTAATTGCA-TTGGTCAGGCCAACAT
630 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTA-ATAAACAG
** * * *
593254 ATACATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTT-AGAATATGAATAAATTAATATTACTTTA-
694 ATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * **
593316 TTCTAAATAAGATGGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATTATTT
757 TTC-AAATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTT
* * * * * * ***
593381 GAAATAAATAATTGTTCAAATAATTATAACTAATTGAACTGGTTT-AGTAAGCAAATTTATTTTT
820 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAATTAATTTATTTTT
*
593445 TAATTCTCTTA
884 AAATT-T-TTA
* * ** * * * * * *
593456 ATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTGTTTGAATAA
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TATATGAATAG
* *
593521 AAACATTTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAATG-TCTTGAAATAGTTAATTGTTCAAATAG
65 AAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAA-GTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * * * * * *
593585 TCATAATTATATGAACCGGTTTGGCAAAT-AGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTATTTTT
128 TTATAACTATTTGAA-TTGTTTAGC-GATCAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* * * * * * *
593649 TGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTA-TTCTAAACAAG-TTAGTAAGAACTGAATA-AATTG
191 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTT-GTATGAAC-AAAAACAATTG
* * ** * * * * * * *
593711 TTTTATAATAAAACAAAATATCATGACAATTTAAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTAT
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
593776 TTGAACTAG-TTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATTAATTTTCATAATATTA
318 TTGAATTGGTTTCAA-ATA-GAA-TTA-TTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * * * * *
593840 TTACATTAGTATTATTTT-ATTTTGAGTAAACTTGTATGAA-TAAAAATAATTATTTTATGACAG
378 ATAAATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-CATT-GTTTATGACAA
* ** * * * * * **
593903 AATAAAAGGTTTTAAGAAATTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTAAATTGGT
441 AACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTAAT
* * * * *
593967 TCGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTG
505 TTGGTAAACAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
594032 TTGTTTTATTTCAAGTAGGCTAGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
568 TTATTTTATTTGAA-TAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * *
594096 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATTAGTATTTGAACTAATTTGATAAATTA-A
631 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAA-CAGA
* * * * * * *
594160 TTTATGTTTTAAATCTCTAACTTATCAGTTTTTAAAATGA-TAATAAAGTAATATTATTTTATTT
695 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * **
594224 CGAATAAGTTTTTATGAGCT-GAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAAGGTCATATTGATTT
759 CAAATAAGCTTGTATGA--TAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTTCATAACGATTT
* * * * * * * * *
594288 TAATTAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGATTGACAAA-CACATTTATTTTT
820 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTA-ATTTA-TTTT
**
594352 TAAATCCTTA
883 TAAATTTTTA
* * * * * * * * *
594362 CTTACTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAAAAA
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TATATGAATAG
* * * ** *
594427 AAACAGA-TGTTTTAGGACAAAACAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT
65 AAACA-ATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** ** *
594491 CATATCTATTTCAATTGGTTT-GATAAAGAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT
129 TATAACTATTTGAATT-GTTTAG-CGATCAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
* * * ** * * *
594551 AAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTCT
192 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
594615 TACGACAAAACAAAATGTCATACCAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
594680 AACTT-GTTCCGTAAACAGAATAATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTTTAGAATATT-AT
321 AA-TTGGTTTC--AAATAGAATTA-TTTTTAAATCTCT-TA-TTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * **
594742 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTCATATGAA-T-AGAAACAATTGTTTTATGACAAA
380 AAATTAGTATTATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGA-AAAC-ATTG-TTTATGACAAA
* * * * * *
594804 ACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTT
442 ACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTT
* * * **
594869 GGTAAACAAATTTATTCTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTACCATTA
507 GGTAAACAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
594934 TTTTATTCTAAATATGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAT
571 TTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
594999 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGT-GTTCAAAAAAAAGCTTTA
635 AATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTAATAAACAGATTTA
* * *
595063 TTTTCTAAAAT-T-TAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGA
699 TTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * *
595124 AATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTATTTTATGACGAAACAAAAGGTT-ATAATGCTTTGAAA
761 AATAAGCTTGTATG-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACGATTTGAAA
* * * * *** *
595188 TAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATACACGGAGTTT-TTTTTAAAA
824 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATA-AATTAATTTATTTTT-AAA
595252 TTATTTTA
887 -T-TTTTA
* **
595260 CTCT-TTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAGC
1 CT-TATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TATATGAAT
* * * * * * *
595323 AAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTGAAATACAAAATTTTTCAAATA
63 AGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
595388 GTCATTACTATTTGAACTT-ATT--CGATAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATAAATT
127 GTTATAACTATTTGAA-TTGTTTAGCGAT--CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT
* ** * * * * * *
595450 GTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
189 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGT
* * * * * *
595515 TTTATGACAAAACAAAAAGTGATAACAATTTGAAATAAACAATTGTTTAAATAGTCATAACAATT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
595580 TGAA
319 TGAA
595584 CTTATTCGAT
Statistics
Matches: 10279, Mismatches: 2539, Indels: 1954
0.70 0.17 0.13
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861 6 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (892 bp):
CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGCTATATGAATAGA
AACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
TAACTATTTGAATTGTTTAGCGATCAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG
GTTTCAAATAGAATTATTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTAATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAACATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTAT
TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAG
CTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAA
TTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATAGAA
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATTAATTTATTTTTAAATTTTTA
Found at i:584996 original size:177 final size:176
Alignment explanation
Indices: 583859--586474 Score: 1659
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* * ** *
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* ** * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * *
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1 -ATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
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* * * * *
584166 ACAATTTGAAACAGATAATCGTTCATATAATCTTAACTATTTGAACTAGTTCG
125 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-G
* ** * * * ** * *
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1 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ATTA--AT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * * * * *
584284 TTTTATTCCAAATAAAATAGTACGAACATAACCAATTGTTTGATGACAAAAGAAAATGTTATAAC
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* * * * * * *
584349 GATTTGAAACAGATAATTATTAAAATAGTCAAAAGTATTTGAAATAGTTTG
127 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTG
* * * *
584400 GTAAATAGTTTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATT
1 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
584464 ATTTTATTTCAAACATA-CTTATATTAACA-AAAGCAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTAAT
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** * * * * *
584526 AATGATTTGAAACAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTTCG
124 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-G
* * * * * * *
584580 ATAAATAGAATTAGTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTTATAAATTAATTTTA
1 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-T-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* *** * * * * *
584645 TTCTATTTTGAACAACCTTGTATGAGCTA-AAATAATTGTTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAA
62 TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
584709 AAATTTGAAATA-ACTAACTG-TCATATACTCTTAACTGTTTGAGCTGGTTCA
126 CAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-G
* ** *
584760 ACAAATGGATTTA-TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATT
1 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * *
584823 ATTTTATTCCAAATAAGTTTGTACAAACAGAAATAATTGTCTTATGATAAAACCAAAGATTATAA
61 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* *
584888 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTGTTTAAACTAGTATG
126 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TG
* * * *
584940 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTT
1 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*** * *** * * * * *
585005 ATTTTGAATAATCTTGTATGTTGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAACTATT
66 ATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
* * * * * * *
585070 TGAAATATATAGTTGTTTAAATGGTCATAATTATTTGAACTAATTT
131 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTG
* * *
585116 AGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAACTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTAT
1 A-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATT---TTT-GAAATATTAATAAATTAGTAT
**** * ** * *
585180 TATTTTATTTTGGATAAG-TTTTCAAAAACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAACGAAAGGTCA
60 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGT-ATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * *
585243 TAACGATTTTAAATCGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCG
123 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTG
* * * * * * *
585298 ATAAATAAATTTATTTAGTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTCTT
1 ATAAACAGATTTATTT-TTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * * * *
585363 ATTTTATTCCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTATATGACTAACCAAAAGGTTAAAA
61 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
585428 CGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAAC-CGATTCG
126 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TT-G
* ** * * * * *
585480 ACAAACACTTTTCTTTTTTAAATCTCTTATTGATTTTTGGAATATTATTAAATTAGCATTAATTT
1 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTT
* * * * *
585545 T-GTCCGAATAAGCTTGTAT-AATAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAATA--TCATAACA
65 TATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACA
* * * *
585606 ATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-G
* * *
585656 AAAAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTA-T
1 ATAAACAGA-TTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
585719 -TTTGA----AAA-AA-ATTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
61 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
585777 TGACTTT-AAATAGATAATTGTTGAAATAGTTA-AATCTATTTG-AGT--TTG
126 -CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTG
* * * * *
585825 GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCACTAATTTTTCAAATGTTAATAAAGTAGTATT
1 ATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA-T---TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * *
585890 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAATTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCAT-A
61 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * **
585954 TGATTTGAACTAGATAATTGTT-ATAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTG
126 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTG
* * *
586006 ACAAACACATTTATTTTTTAAATATCTTACTAATTAACTTTTTG-AATATT-ATGAAATTAGTAT
1 ATAAACAGATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTAT
* * * * *
586069 TATTATAATT-CAAATAAGCTTATATGGAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCT
60 TATT-TTATTCCAAATAAGCTTGTAT-GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
*** * * * *
586131 TAACAATTTTTGATAGATAATTATTCAAACTAGTCATAACCATTTGAACTAATTT
123 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTG
* * * ** * * *
586186 AGCAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAATATTATTT
1 A-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** * *
586251 TATTCTAAATAATTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAA-
65 TATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * *
586315 TTCAAATTAGATAATTGTTTAAATGGACATAA-TAATTTGAACTTGTTTG
130 TTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAG-TTG
* * * * ** *
586364 ATAAATAGATTAATTCTTTAAATCTCATACTTATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTAGTATTA
1 ATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * *
586429 TTTTATTCTGAATAAACTTGTATGCAA-AGAAACAACTGTTTTATGA
62 TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG-AACAGAAACAATTGTTTTATGA
586475 ATTGTTTTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
166 4 0.00
167 2 0.00
168 2 0.00
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171 2 0.00
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185 3 0.00
186 7 0.00
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Consensus pattern (176 bp):
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ATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTG
Found at i:585272 original size:358 final size:355
Alignment explanation
Indices: 583867--586452 Score: 1701
Period size: 358 Copynumber: 7.2 Consensus size: 355
583857 CAATAAATAG
* * * ** * *
583867 ATTTATTTTTTAAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTCAAATGCTAATAAATTAGTAGTAATTTATT
1 ATTTATTTTTT-AAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * * *
583932 CTGAATAAGCTTGGATGAACTG-AAATAATTGTTTTATGATTAAACATAAGGTCAAAATAATTTA
64 TTGAATAAGCTTGTATG---TGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * *** * * * * * *
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126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTA
** * * *
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191 AATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-TTT
* * * * * * * *
584125 TACGAAA-AAAA-ATTTATTTTACGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTGAAACAGATAATCGT
255 TA-TAAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * ** *
584188 TCATATAATCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAATTAG
318 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-GATAAACAA
** ** ** * *
584227 ATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATT-ATGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTAGTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAA-ACTCTTACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
*** ** * * * * * * * *
584291 CCAAATAAAATAGTACG-AACATAACCAATTGTTTGATGACAAAAGAAAATGTTATAACGATTTG
64 TTGAATAAGCTTGTATGTGA-A-AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * * * * *
584355 AAACAGATAATTATTAAAATAGTCAAAAGTATTTGAAATAGTTTGGTAAATAGTTTTACTTTTTA
126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTA
* * * * * *
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191 AATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA-AGTTT
* * * * * *
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255 TATAAACAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *
584550 CAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGA
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-GATAAACA-A
* * * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
584653 TGAACAACCTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTGAA
65 TGAATAAGCTTGTATGTG--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * * * ** * ** *
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128 ATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAA
* * * *
584780 ATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTTGT
192 ATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTT-T
* * * * * * *
584845 ACAAACAGAAATAATTGTCTTATGATAAAACCAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
256 ATAAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * *
584910 CAAATAGTCATAACTGTTTAAACTAGTATGGTAAACAA
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TGATAAACAA
* *
584948 ATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTT
1 ATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * *
585010 GAATAATCTTGTATGTTGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAACTATTTGAAA
66 GAATAAGCTTGTATG-TG-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * *
585075 TATATAGTTGTTTAAATGGTCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAA
129 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAA
* * ****
585139 TCTCTTACTTATTAACTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTCA
193 TCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTTT-A
* * * *
585204 AAAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACGAAAGGTCATAACGATTTTAAATCGATAATTGTTC
257 TAAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
585269 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCGATAAATAA
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTGATAAACAA
* * * * *
585306 ATTTATTTAGTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTCTTATTTTATT
1 ATTTATTT-TTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * * * * * *
585371 CCGAATAAGCTTATATGAATTG-AAACAATTATTATATGACTAACCAAAAGGTTAAAACGATTTG
64 TTGAATAAGCTTGTATG---TGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * ** * * * ** *
585435 AAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAACCGA-TTCGACAAACACTTTTCTTTTTT
126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAATTTAG-TAAATAGATTTATTTTTT
** * * * *
585499 AAATCTCTTA-TTGA-T--TTTT-GGAATATTATTAAATTAGCATTAATTTT-GTCCGAATAAGC
190 AAATCTCTTACTT-ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTCCAAATAAG-
* * * ** * * * *
585558 TTGTATAATAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAATATCATAACAATTTGAGATTGATATTT
252 TTTTATAA-ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* *
585623 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAAAAAACAA
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-GATAAACAA
* * * *
585664 CTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA--AG---TA--GTATTT
1 ATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * *
585721 TGAAAAAAATTTTATGAACTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-
65 TGAATAAGCTTGTATG---TGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTG
* * * * *
585784 AAATAGATAATTGTTGAAATAGTTA-AATCTATTTG----AGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT
126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAT-TATTTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTA-TTTTT
* * * *
585844 TAAATCTCTTACTCACTAATTTTTC-AAATGTTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
189 TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-
* ** * * * * *
585908 TTGTATAAATTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCAT-ATGATTTGAACTAGATAAT
252 TTTTATAAA-CAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
** * *
585972 TGTT-ATAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAC
315 TGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTGATAAACAA
* * * *
586014 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTAATTAACTTTTTG-AATATT-ATGAAATTAGTATTATTATAA
1 ATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAT
** * * * *
586077 TTCAAATAAGCTTATATG-GAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCTTAACAATTT
63 TTTGAATAAGCTTGTATGTG--A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
*** ** * * *
586140 TTGATAGATAATTATTCAAACTAGTCATAACCATTTGAACTAATTTAGCAAACAGATTTAGTTTT
125 GAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTTT
* * * *
586205 TAAA--TCTT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAATATTATTTTATTCTAAATAA-TT
189 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTT
* * *
586265 TTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAC-AATTCAAATTAGATAA
254 TT--ATAAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAA
* * * * * *
586329 TTGTTTAAATGGACATAA-TAATTTGAACTTGTTTGATAAATAG
314 TTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAG-TTGATAAACAA
* * * * ** * *
586372 ATTAATTCTTTAAATCTCATACTTATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
*
586437 TGAATAAACTTGTATG
65 TGAATAAGCTTGTATG
586453 CAAAGAAACA
Statistics
Matches: 1715, Mismatches: 418, Indels: 188
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
345 7 0.00
346 20 0.01
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348 3 0.00
349 83 0.05
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353 2 0.00
354 3 0.00
355 3 0.00
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364 1 0.00
365 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
ATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
GAATAAGCTTGTATGTGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
GATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
CTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTTTATAAA
CAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTAGTTGATAAACAA
Found at i:585324 original size:540 final size:531
Alignment explanation
Indices: 583888--586450 Score: 1980
Period size: 540 Copynumber: 4.8 Consensus size: 531
583878 AAAATCTTTT
* * * * * *
583888 TCTTATTAATTTTTCAAATGCTAATAAATTAGTAGTAATTTATTCTGAATAAGCTTGGATGA--A
1 TCTTATTAATTTTTGAAAT-ATTATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTAT-ATTA
** * * * * * * *
583951 CTGAAATAATTGTTTTATGATTAAACATAAGGTCAA-AATAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAA
63 -AAAAACAATTGTTTTATGA-CAAA-AAAAGAT-AATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * * *
584015 TAGTCTTAGCCAATTGAACTAATTGAATAAACAAACTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
124 TAGTCATAACTATTTGAACTAATTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * *
584080 TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATCAAATAAGCTTGTACGAA--AAAA-AATTTA
189 TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAAATAAG-TTTTATGAACTAAAACAA-TTG
* * * * * * *
584141 TTTTACGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTGAAACAGATAATCGTTCATATAATCTTAACTAT
252 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * ** *
584206 TTGAACTAGTTCGACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATT-ATGTTTCAAAATATTA
317 TTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTT-TAAATATTA
* * ** * * * * *
584270 TTAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAATAAAATAGTACGAACATAACCAATTGTTTGATGACAAAA
379 ATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAACAGAAACAATTGTTT-ATGACTAAA
* * * * * * *
584335 GAAAATGTTATAACGATTTGAAACAGATAATTATTAAAATAGTCAAAAGTATTTGAAA-TAGTTT
443 CAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTAGTAT
** * ** *
584399 GGTAAATAGTTTTACTTTTTAAATC
507 GACAAACACATTTATTTTTTAAATC
* *
584424 TCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACATA-C-T-TA
1 TC-T--T-ATTAATTTT-TGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATA-AGCTTGTA
* ** *
584485 TATTAACAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGTAATAATGATTTGAAACAGATAATTGTT
58 TATTAA-AAAA-CAATTGTTTTATGACAAAAAAAGA-TAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * *** * * * *
584550 CAAATAGTTATAATTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGAATTAGTTTCTAAATCTCTTACTTAT
120 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTAG-TAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * * * * * *
584614 AAATTTTTGAAATATTTATAAATTAATTTTATTCTATTTTGAACAACCTTGTATGAGCTAAAATA
184 TAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAAATAA-GTTTTATGAACTAAAACA
* * * * * *
584679 ATTGTTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTGAAATA-ACTAACTG-TCATATACTCTTA
248 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
584742 ACTGTTTGAGCTGGTTCAACAAATGGATTTATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATA
312 ACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATA
* * *
584807 TTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTTGTACAAACAGAAATAATTGTCTTATGA-T
376 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAACAGAAACAATTGT-TTATGACT
* * * * *
584871 AAAACCAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTGTTTAAACTAG
440 -AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG
** *
584936 TATGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
504 TATGACAAACACATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
584964 TCTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATCTTGTATGTTGA
1 TCTTATTAATTTTTGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATATTAA
* * * * * * *
585029 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAACTATTTGAAATATATAGTTGTTTAAATGG
64 AAAACAATTGTTTTATGACAAAA--AAAGATAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
585094 TCATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTC
127 TCATAACTATTTGAACTAATTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* ** **
585159 AAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTCAAAAACTAAAACAATTGTTTT
192 GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTT-ATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * *
585224 ATAACAAAACGAAAGGTCATAACGATTTTAAATCGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
256 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
585289 ACTTGCTCGATAAATAAATTTATTTAGTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAA
321 ACTTGTTCGATAAATAGATTTATTT--TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAA
* * * ** ** * *
585354 ATTAGTCTTATTTTATTCCGAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTATATGACTAACCAAA
383 ATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAACAGAAACAATTGTT-TATGACTAAACAAA
* * * * * *
585419 AGGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAAC-CG-ATTCGAC
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* *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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128 CATAACTATTTGAACTAATTTAGTAAACAGA-TTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
585698 GAAATATTAATAAAGTAGTA-T-TTTGA----AAA-AAATTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTA
192 GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * *
585756 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTGAAATAGTTA-AATCTATTTG
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* * * * *
585819 -A---GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCACTAATTTTTCAAATGTTAATA
320 AACTTGTTCGATAAATAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATA
* * ** * *
585880 AAGTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAATTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAA
382 AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAACAGAAACAATTG-TTTATGACTAAACAA
* * * * ** * *
585945 AAGGTCAT-ATGATTTGAACTAGATAATTGTT-ATAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGAC
446 AAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTAAACTAGTATGAC
586008 AAACACATTTATTTTTTAAATATC
510 AAACACATTTATTTTTT-AA-ATC
* * *
586032 TTACTAATTAACTTTTTG-AATATTATGAAATTAGTATTATTATAATTCAAATAAGC-T-TATAT
1 -T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAT-AAATTAGTATTATT-TTATTCGAATAAGCTTGTATAT
* ** *** *
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61 -TAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAGATAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* *
586159 ACTAGTCATAACCATTTGAACTAATTTAGCAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TCTT--TTATTAA
123 A-TAGTCATAACTATTTGAACTAATTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
** * * *
586220 TTTTCAAAATATTAATAGA-TCAATATTATTTTATTCTAAATAA-TTTTGCATGAAC-AGAAACA
187 TTTTTGAAATATTAATAAAGT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTT--ATGAACTA-AAACA
* * * * *
586282 ATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAA-TTCAAATTAGATAATTGTTTAAATGGACATA
248 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
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312 ACT-ATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAA
* ** *
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TTTTTTAAATC
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TTTATTAATTTTTA
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * ** *
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* * * *
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* * ** * *
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* ** * * ** * ** * *
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* * * *
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* ** * * * * *
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* * ** * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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**
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* * * **
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* * * * * * * * * * *
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64 AAA-CAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
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* * * * *
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1 TTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * ***
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* ** ** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-T-TTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAC-
* * * * * * * * *
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62 AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * ** * * *
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* * *
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1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAG
* * * * *
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64 AAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAG
* * * * *
589127 AT-ATAACTATTTGAGCTTATT-TGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGC
127 -TCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC
* * * * ** * * * *
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* * * * * * * * * **
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** * ** *
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* * **** * *
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* *
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* ** * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * ** * * *
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* * *
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* * *
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* * *** *
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** * * * * * *
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* * ** * **
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128 CATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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129 ATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC
** * * * * **
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1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT--TGAATAAGCTTGTATGAACAG
* * * * * * *
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* * * * * * *
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128 CATAACTATTTGAACT--TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * *
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1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AG
* * * * * * *
591573 AAATAATTTTTTTATGACAAA-ACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATATT
64 AAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
** * ** * * *
591637 TGTAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGCTTTATTTTTTAAAACTCTTGA-
128 CATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-AC
* * * * * *
591689 TTAATAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACTA-
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGAAC-AG
* * * *
591753 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTTAAATAGTTAATTATTCAAATAGT
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* * * * *
591818 CATATCTATTTGAGCTTATT-TGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAC
128 CATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAC
** * * * * * ** *
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1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * ** * * * *
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* * * *
592001 CTTAACTATTTGAA-TTGGTTTAGCAAAACACATTTATTTTT
128 CATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACAGATTTATTTTT
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Statistics
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* **
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * *** * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** *** * * * * * ** *
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* * * * * *
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*** * ** ** * * * *
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** * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTT
* * * * * * * **** *
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* * * * * ** * *
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** * * * * * * **
588691 TATGATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAAATAATTAC
1 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTG
* * * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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127 TTAATTGTCAAAATATTAATAAATGAGTATTA--CTTTAATCCAAACAAACTTA
* * * * * * * *
588873 TATGAACTA-AAGCAATTATTTTATGACAAAACAACAA-GTTATAACAATTTTAAATATACAATA
1 TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT-
* * * * * ** * * * * *
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* * ** * * * **** * * *
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* * * * *
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1 TATGAA-CAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTT
* * ** *
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* *** * * * * * * * * ** *
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124 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATGAGTATTACTTTAATCCAAACAAACTTA
* * * * * * * * *
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1 TATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA-T
* ** * * *
589297 ATTCTT--ATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAA-TCT-CTT
63 -TTGTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCTACTT
* *** * * * * * *
589358 ATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAA-CCAAATAAGCTTC
126 ATTAATTGTCAAAATATTAATAAATGAGTATTA-CTTTAATCCAAACAAACTTA
* * * * *
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1 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-T
* * ** * ***
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* ** * * * * * * * *
589534 ATTTTTGAAATATTAAT-AATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
130 ATTGTCAAAATATTAATAAATGAGTATTACTTTAATCCAAACAAACTTA
* * *
589582 TATGATA-AAAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA-TT
1 TATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTT
* * * * * *
589644 GTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
65 GTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTA-TTTTTAAAT-TC-TACTT
* * * * *** * * *
589709 ATTAATT-TTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGTATAAGCTTG
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* * * * * * *
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*** * * * * * ** ** * *
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** * * * * *
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* * ** * *
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* ** * * *** ** * *
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* * * * *
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* * * * * ** * ** **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* *** * * * * * * * * *
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** * * * * * *
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** * * * * ** * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** ** * * ** *
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* * ** * * ** * * ** *
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* * * *
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* * * ** * *
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* *** * * * * ** * * *
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* ** * * * * ** * *
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1 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTT
* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * *
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*
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* ** * * ** *
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* * * * * * ** * * *
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* * * * ** * * *
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* * * ** * * ** * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * ** * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * ** *
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* * * * *
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** * * * * ** *
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* * * * * * *
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*
588280 AAATA---AC
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* * * *
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* * * * * ** * * * *
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* *** * * *
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* * * * ** ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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495 TCGGTAAATAGAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTT
* *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * * *** * * *
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* * * * * * *
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* * * **
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* ** * * * *
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* * * * *
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257 AAAACAAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAAAACTATTCAAACTAGT
** * * *
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* ** * * *
589564 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGGTCATAACGAT
387 TTATTTCAAATAAGCTTATATGA-AAAAAATTATTG-TTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGAT
* * * * *
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450 TTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATACTTATTTAAACTGATTCGGTAAATAGAA-TTATTT
* *** *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * **
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* * ** *
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* * * *
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* * * *
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* * ** * ** * *
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* *
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* * *
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* *
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* ** *
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* * *
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* *
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* * * * * * *
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* ** * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * ** * * *
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** * * * *
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* * ** * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
591413 ACAAAAAGTTAGAACGATTTAAAATAGATAATTATTCCAATAGACTTAAC-CATTTAAACTAATT
433 AC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCAT-ACTTATTTAAACTGATT
* ** * * * * * *
591477 TGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTAT
496 CGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTTT
* * * *
591542 TATATTTA-TCTAAATAAACTTGTATGATCTAAAATAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCAT
560 TAT-TTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCAT
* * * * * * ** * * * *
591605 AACGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATATTTGTAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGCTT
622 AACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGAAAAATAGATT
* ** * * *
591670 TATTTTTTAAAACTCTTGATTAATAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-TTA
687 TA-TTTTTAAATCTCTTTCTT-ATAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA
* * * * * *
591734 GATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTTAAAT
749 -ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACTAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * * *
591799 AGTTAATTATTCA-AATAGTCATATCTATTTGAGCTTATTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTTAA
812 AGATAATTGTT-ATAATAGTCATAACTATTTGA-ATTAGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTCAA
*
591862 ATCTCTTAC
874 ATATCTT-C
** * * ** * *
591871 TTATTAATTTTTTTAATGTTAATAAATAAGTATTATTTTATTCCGTATAAGCTTGTATAAATTG-
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAA--GA
* * * * ** * ** * * *
591935 GAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTTAGGACAATTTGAAATAAATAATTGTTC-TAATA
64 AAAAAATTGTTTTATGAC--AA-AAGAAGGTCATAACGATTCAAAATAGATAACTATTCAT-ATA
* * * ** * *
591999 GTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGCAAAACACATTTA--TTTT---TC-ATTATTAA-ATT---
125 GTCTTAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAGTTTCAG
* ** *** * *
592054 AATATTATCTTAATCCG-ATTAAGCTT-AC---AT-GAA-A--A--A--A-AAA-AATTATTCT-
189 AATATTAT-TAAATTAGTATTATTTTTAACAAAATAAAATACTATGATCAGAAACAACTATT-TG
* * * * * * ** * **
592103 ATGACAAAATAGAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTTTTCAAATAATCATAACTATTTGAA
252 ATGACAAAACAAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAAAACTATTCAAA
* ** * *
592168 TTAGTTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCT--T-ATTAA-TTTTCAAA-ACTTAATAAAT
317 CTAGTTTGATAAAGAGA--T--TTTTTAAATCTCTACTGATTAATTTTTTAAATA-TTAATAAAT
* ** ** * * **
592228 CAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTATATGAACAGAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAAG
377 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-AAAAATTATTG-TTTATGACAAAACAAAA-
* * * * * *
592293 GTCTTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGACATGAC-T-TTTAAACTTG-TTTGGTAA
439 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCAT-ACTTATTTAAAC-TGATTCGGTAA
* * * * * *
592355 ACA-AATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTT
502 ATAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTT
* * * * * * *
592419 TATTTCGAATAAACTTTTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATTACAAAATAAAAGATCATAACTA
565 TATTCCAAATAAACTTGTAT-AACT-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGA
* * * * * ** * * * * * * *
592483 TTTGAAATAAATATTTCTTCAAGCAATTATAACAATTTGAGCTTG---G-TAAATAAATTTATTT
627 TTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGAAAAATAGATTTA-TT
* * *
592544 TTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATGAAGTAATATTATTTTATT-TCGAATA
691 TTTAAATCTCTTT-CTTA-TAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATA
** * * * * *
592607 AATTTATATGAAC-AGAAACAATTGGTTTATGACAAAAC-AAA-GTTCATAGCTATTTAAAATAG
752 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-GTTTATGACTAAACAAAAGGTT-ATAACAATTTGAAATAG
* *
592669 ATAATTGTTCA-AATAGTCATAGC-ATTTGAATGT-GTTCA--AATTACAAA-TT-TTTTTAAAA
814 ATAATTGTT-ATAATAGTCATAACTATTTGAAT-TAGTTCAGTAA--ACAAATTTATTTTTCAAA
*
592727 T-TTTTAC
875 TATCTT-C
* * *
592734 TTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTTA-TATTATTTTATT-TGGAATAAGCTTATATGAAG
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA--TTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAAG
* * * * ** * * *
592797 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAT
63 AAAAAAATTGTTTTATGAC-AAA-AGAAGGTCATAACGATTCAAAATAGATAACTATTCATATAG
* ** ** * * * * *
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126 TCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA-T--TAAG-TTTC
* * * * ** ** * * ** * * *
592926 AAAATATTAATATATTTA-TATTA-TTTTATTCTGAATAAGCCTA-TGTGAAT-TGGTATAATTG
187 AGAATATTATTA-AATTAGTATTATTTTTA-ACAAAATAA-AATACTATG-ATCAGAAACAACTA
* * ** * * ** *
592987 TTTTATAATGAAACAAAAGTTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTAT
248 TTTGATGACAAAACAAAA-ATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAAAACTAT
* * * * * ** *
593052 TTAAACTTGTTT-AGTGAAGAGATTCATTTTTTAAATGTCTTACTTATTAATTTTTGGATTATTA
312 TCAAACTAGTTTGA-T-AA-AGA--GATTTTTTAAATCTC-TACTGATTAATTTTTTAAATATTA
* * ** ** * * * * * * *
593116 ATAAATTAGAATCATGGTATTTTGAATAAGCATGTA-CAAATAGAAATAATTATTTTGTGATAAA
371 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAA-A-AAATTATT-GTTTATGACAAA
* ** * * * * * * ** * *
593180 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAC-TAATTGCATTG-GT
433 ACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCAT-ACTTATTTAAACTGATT
* * * * *
593243 CAGGCCAACATA-TA-CATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTAGAATATGAATAAATTA
496 C-GG-TAA-ATAGAATTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTA
* * * * * * * *
593305 ATATTACTTTATTCTAAATAAGA-TGGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGG
556 GTTTTATTTTATTCCAAATAA-ACTTGTAT-AACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AG
** * * * * * * * * * * **
593369 TCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAGCA
618 TCATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCG-AAAAA
* ** * *
593434 -A-ATTTATTTTTTAATTCTCTTAATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
681 TAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTTCTTA-TAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * ** * **
593497 TT-TCGAACAAACTTGTTTGAA-TAAAAACATTTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAA-TGT
743 TTCT-GAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTG-TTTATGACTAAACAAAAGGTTATAACAAT
* * * *** ** * *
593559 CTTGAAATAGTTAATTGTTCA-AATAGTCATAATTATATGAACCGGTTTGGCAAATAGAA-TTAT
805 -TTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAGTAAACA-AATTTAT
* *
593622 TTTTTAAATCTCTTAC
867 TTTTCAAATATCTT-C
* * * * * * * *
593638 TAATTATTTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCTAAACAAG-TTAGTAAGAACTG
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTT-GTATGAA--G
* * * * ** * * * * * * *
593702 -AATAAATTGTTTTATAATAAAACAAAATATCATGACAATTTAAAATAAAGAATTGTTCATATAG
63 AAAAAAATTGTTTTATGA-CAAA-AGAAGGTCATAACGATTCAAAATAGATAACTATTCATATAG
* *** * *
593766 CCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATTAATTTTC
126 TCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCT-C---TTATTAAGTTTC
* * **** * * ** * * *
593831 ATAATATTATTACATTAGTATTA-TTTTATTTTGAGTAAACTTGTATGAAT-AAAAATAATTATT
187 AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTA-ACAAAATAAAATACTATG-ATCAGAAACAACTATT
* * * * ** * * * ** *
593894 TTATGACAGAATAAAAGGTTTTAA-GAAATTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
250 TGATGACAAAACAAAA-ATCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAAAACTATT
* * * * * * * * **
593958 TAAATTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAT
313 CAAACTAGTTTGATAAAGAGA--T-TTTTT-AAATCT-CTACTGATTAATTTTTTAAATATTAAT
* * * * *
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373 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT--TAT-ATGAAAAAAATTATTG-TTTATGACAAAA
* * * * * *
594086 CAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATTA-GTATTTGAACTAATTT
434 CAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCA-TACTTATTTAAACTGATTC
* * * * * * * * * *
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497 GGTAAA-TAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATAT--TAATAAATTAGTT
* * ** * * * * *
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559 TTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACT-AAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAA-GTC
** * * * * * * * * * *
594278 ATATTGATTTTAATTAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGATT-GACAAACAC
620 ATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCGAAAAATAG
* * * * * *
594342 ATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTACTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTC
684 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTTCTTA-TAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** ** * * * *
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746 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA-ATTG-TTTATGACTAAACAAAAGGTTATAACAATTTGA
* * * * * *
594469 AATAGATAATTGTT-TAAATAGTCATATCTATTTCAATTGGTT-TGATAAAGAGATTTAGTTTTT
809 AATAGATAATTGTTAT-AATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTT
594532 --AA-ATC-TC
871 CAAATATCTTC
* * * * ** *
594539 TTATTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATAGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAAGA-A
* * * * * * * ** * * *
594604 AACAATTGTCTTACGACAAAACAAAATGTCATACCAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGA
65 AAAAATTGTTTTATGAC-AAA-AGAAGGTCATAACGATTCAAAATAGATAACTA-TTCATATAGT
* * * * * * * * *
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127 CTTAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATC-T---CTTATTAAGTTTCA
** * * *
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188 GAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACAAAATAAAATAC-TATG-ATCAGAAACAACTATT
* * * * * * *
594794 TTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
250 TGATGACAAAACAAAA-ATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAAAACTATTC
* * * * * * * **
594859 GAACTCA-CTTGGTAAACAAATTTATTCTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAAT
314 AAACT-AGTTTGATAAAGAGA--T-TT-TTTAAATC-TCTACTGATTAATTTTTTAAATATTAAT
** * * * * **
594922 AAATTACCATTATTTTA-TTCTAAATATGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAC
373 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAA-AAAAATTATT-GTTTATGACAAAAC
* * * * *
594986 AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACGTG-TTC
435 AAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCAT-ACTTATTTAAAC-TGATTC
*** * ** * * * *
595049 AAAAAAAAGCTTTATTTTCTAAAAT-T-TAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TA
497 GGTAAATAGAATTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAA-TTAGTT
** * * * * *
595111 TTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAA-TAGAACCAATTATTTTATGACGAAACAAAAGGTTA
559 TTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCA
* * * * * * * * * **
595175 TAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATACACGGAG
621 TAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGAAAAATAGA-
* *
595240 TTT-TTTTTAAAAT-TATTTTACTCTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
685 TTTATTTTT-AAATCT-CTTT-CT-TATAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * **
595303 -TCAAATAAGCTTATATGAGCAAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTG
745 CT-GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACTAAACAAAAGGTTATAACAATTTG
* * * * *
595367 AAATACAAAATTTTTCA-AATAGTCATTACTATTTGAACTTA-TTC-G-ATAACATATTTATTTT
808 AAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAGTA-AACAAATTTATTTT
* * *
595428 TTAAATCTTTTAC
870 TCAAATATCTT-C
* * * ** * * *** *
595441 TGATAAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAAGA-A
*
595506 AACAATTGTTTTATGACAAAA
65 AAAAATTGTTTTATGACAAAA
595527 CAAAAAGTGA
Statistics
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0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (881 bp):
TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAAGAAA
AAAATTGTTTTATGACAAAAGAAGGTCATAACGATTCAAAATAGATAACTATTCATATAGTCTTA
ACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAGTTTCAGAATATTA
TTAAATTAGTATTATTTTTAACAAAATAAAATACTATGATCAGAAACAACTATTTGATGACAAAA
CAAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCAAAACTATTCAAACTAGTTTGA
TAAAGAGATTTTTTAAATCTCTACTGATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
TTCAAATAAGCTTATATGAAAAAAATTATTGTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAA
TAGATAATTATTCAAATGGCCATACTTATTTAAACTGATTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAAT
CTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATA
ACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAAT
AGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGAAAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTTCTTATAATTTTT
GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTAT
GACTAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTATAATAGTCATAACTATTTGAAT
TAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTCAAATATCTTC
Found at i:591369 original size:25 final size:23
Alignment explanation
Indices: 591330--591378 Score: 62
Period size: 25 Copynumber: 2.0 Consensus size: 23
591320 TATATTGCTT
**
591330 ATTAATTTTTTTATTGTTAATAA
1 ATTAATTTTTTTATTCCTAATAA
591353 ATTAATATTATTTTATTCCTAATAA
1 ATTAAT-TT-TTTTATTCCTAATAA
591378 A
1 A
591379 CTTGTATGAA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
23 6 0.27
24 2 0.09
25 14 0.64
ACGTcount: A:0.39, C:0.04, G:0.02, T:0.55
Consensus pattern (23 bp):
ATTAATTTTTTTATTCCTAATAA
Found at i:592423 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 592118--595666 Score: 2779
Period size: 181 Copynumber: 19.7 Consensus size: 181
592108 AAAATAGAGA
* * * * *** *
592118 TCATAATGATTTGAGATAGATAATTTTTCAAATAATCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAATAAAT
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAAC
* * * * * *
592182 AGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAA-CTTAATAAATCAGTATTATTTTAT
65 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
** * * * **
592242 TTTGAATAATTTTATATGAACAGAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGG
130 TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * *
592294 TCTTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGACATGACT-TTTAAACTTGTTTGGTAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* *
592358 AATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * * *
592423 TCGAATAAACTTTTATGAATAAAAACAATTGTTTTATTACAAAATAAAAGA
131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * ** * * * * *
592474 TCATAACTATTTGAAATAAATATTTCTTCAAGCAATTATAACAATTTG-A---GCTTGGTAAATA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* ** * *
592535 AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATGAAGTAATATTATTTTATT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* ** * * * *
592600 TCGAATAAATTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAC-AAAGT
131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * **
592650 TCATAGCTATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGC-ATTTGAA--TGTGTT-CAAATT
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TTGGTAA--
* * * ** *
592711 ACAAA-TT-TTTTTAAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTTATATTATTT
63 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAATATTATTT
* * *
592773 TATTTGGAATAAGCTTATATGAA-GGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
127 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * *
592827 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATTCATAACTATTTGAACTTTTTTAGTGAA-T
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * * * * *
592891 ATTTTCTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAGTTTTCAAAATATTAATATATTTATATTATTTTATT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * ** * * ** *
592956 CTGAATAAGCCTATGTGAATTGGTATAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGT
131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * *
593007 TCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTGAAGA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * ** * * **
593072 GATTCATTTTTTAAATGTCTTACTTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGA-ATCATGGTAT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTAT
* ** * * * *
593136 TTTGAATAAGCATGTACAAATAGAAATAATTATTTTGTGATAAAACAAAAGG
130 TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * ** **
593188 TTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTAATTGCA-TTGGTCAGGCCAAC
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAAC
* ** * * *
593252 ATATACATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTAGAATATGAATAAATTAATATTACTTTA
65 AAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * * * * * *
593316 TTCTAAATAAGATGGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGG
129 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
** * * * * * * *
593369 TCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAGCA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* *
593434 AATTTATTTTTTAATTCTCTTAATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * * *
593499 TCGAACAAACTTGTTTGAATAAAAACATTTGTTTTATGAAAAAACAAAAGG
131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * ** * *
593550 TCATAATG-TCTTGAAATAGTTAATTGTTCAAATAGTCATAATTATATGAACCGGTTTGGCAAAT
1 TCATAACGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC
* * * ** *
593614 AGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTATTTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTA
65 A-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * * * * * **
593678 TTCTAAACAAG-TTAGTAAGAACT-GAATA-AATTGTTTTATAATAAAACAAAATA
129 TTTTGAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * * * ****
593731 TCATGACAATTTAAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * * * * *
593796 AATTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTACATTAGTATTATTTTATT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * * *
593861 TTGAGTAAACTTGTATGAATAAAAATAATTATTTTATGACAGAATAAAAGG
131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
** * * * * *
593912 TTTTAA-GAAATTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AAATTGGTTCGGTAAA
1 TCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAA
* * * * *
593975 CAAATTTATTTTTAAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTGTTGTTTT
64 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * * *
594039 A-TTTCAAGTAGGCTAGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT
128 ATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * ** * **
594093 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATTAGTATTTGAACTAATTTGATAAATT
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * * *
594158 AATTTATGTTTTAAATCTCTAACTTATCAGTTTTTAAAATGA-TAATAAAGTAATATTATTTTAT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT-ATTAATAAATTAATATTATTTTAT
* * * * * *
594222 TTCGAATAAGTTTTTATGAGCT-GAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAAGG
130 TTTGAATAAGCTTGTATGA-ATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGG
** * * * * * * **
594276 TCATATTGATTTTAATTAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGATTGACAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * * * ** * *
594341 CATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTACTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
*** * * * *
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131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * *
594455 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATATCTATTTCAA-TTGGTTTGATAAAG
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAAC
* * * *
594519 AGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTAT
65 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
* * ** * * *
594580 TCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTCTTACGACAAAACAAAATG
130 TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * **
594632 TCATACCAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCCGTAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * *
594697 GAA-TAATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTTTAGAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTA
66 -AATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
** * ** *
594759 TTTCAAATAAACTCATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA
129 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * ***
594812 TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTTGGTAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * ** **
594877 AATTTATTCTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTACCATTATTTTATT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * *
594941 CTAAATATGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGG
131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * ** *
594992 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTG-TT-CAAAAAA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * *
595055 AAGCTTTATTTTCTAAAAT-T-TAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTT
66 AA--TTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * *
595118 A-TTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTATTTTATGACGAAACAAAAGG
128 ATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * *
595172 TTATAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATACACG
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-
* * * * * * *
595237 GAGTTT-TTTTTAAAATTATTTTACTCT-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
65 AAATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACT-TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
** * ** * * *
595300 ATTTCAAATAAGCTTATATGAGCAAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAG
128 ATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * * *
595354 TCACAATGATTTGAAATACAAAATTTTTCAAATAGTCATTACTATTTGAACTTATTCGAT-AACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * * * * *
595418 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATAAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
*** *
595483 CCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG
131 TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * * *
595534 TGATAACAATTTGAAATAAACAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCGATAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * * *
595599 GATTTATTTTTTAAACCTTTTACCTATTAACTTTCTT--AATATTAATAAATTTATAACTTA-TT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT-TTAAAATATTAATAAATTAAT-A-TTATTT
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127 TATTTT
595667 CTTAATATTA
Statistics
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AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
Found at i:597031 original size:177 final size:177
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* * * * ***
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAG--AGAGA-TTTAAA-AAATAAATC
* * *
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* * * * *
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1 AAA-TCA-TTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-A
* * * * *
596663 AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGGGATTTAAAAACTAAAG
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* * * * * * * * * * * **
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123 TCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * *
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1 AAATCATTATGACCT-TTTGTTTGTC--ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TT-C
* * *
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* *
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* * * * *
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1 AAATCATTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* ** * *
597024 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAAATA
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA-TTATAAG--AGAGATTT--AAAAAATAAATC
* * * *
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125 TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * * *
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1 AAATCATTATG-ACCTTT-TGTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC-ATACAAGCTTATTCAA
* * * *
597205 AATAAAAAAATTCT-A-CT-TT-AT-TT-CAAAAATTAATATGTAAGAGA-TTAAAAAATAAAT-
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**** ** * * * * * * * *
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* * * *
597316 AAATCATTTTTACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA--ACATACAAGCTTATTCAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
597379 ATAACATAATCCTAATTTATTAACATTTCAAGAATTA-ATA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATA-AGAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * *
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128 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * * * * **
597492 AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTGTT-TGGTCATATAAACTTATTTGAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* ** * * * *
597556 ATAAAACAATACTAATTTAGCAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGATATTTAAAAAATAAATCC
64 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAA--GAGAGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * * * * * *
597621 GTTTAGTGAATCAACTT-AAACAATTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTT
126 GTTTA-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * ** * ***
597673 AAATTTTTATGACCTTTTGCTTTGTCATATAATAATTATTTCAACTCATAAAAGCTTATTTGGAA
1 AAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * ** *
597738 TAGAAA-AA-AGCTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-TATA-AGATATTTAGAAAATAGTTCTC
65 TA-AAATAATA-CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATA-AGAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * *
597799 TTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTC
127 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * ** * * * * **
597850 AAATCGTTATTACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTGAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
597915 TAAAATAATACTCATTTATTAATATAT-AAAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCT
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCCAAAAATT-AT-AA-GAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
597979 GCTTGCCAAAACATTTCAAATAGTTTTA-ACTATTTGAATATTTATCTATTTC
126 GTTTACCAAACCAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * * * * **
598031 AAATCATTAT-AACTTTT-TAT-T--T-GAATAGTT-TTGACTGTTCATACTATTTTATTCAAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * * *
598089 TAAAATAACACTAATTTAATAACATTCCAAAACTTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAA--GAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * *
598154 ATTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTC
127 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * *** *
598205 AAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAGAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGCTTATTTGGAT
1 AAATCATTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * *
598269 TAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
65 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAG
598310 TATGTATTGT
Statistics
Matches: 1471, Mismatches: 327, Indels: 187
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
172 1 0.00
173 52 0.04
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175 20 0.01
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (177 bp):
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AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
Found at i:597250 original size:358 final size:353
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Period size: 358 Copynumber: 12.3 Consensus size: 353
596228 TGTTTGTTTA
* * * * * ***
596238 AAATCGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TTTCCATACAAGCTTGTTTGGA
1 AAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTT-CATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * * *
596302 TTAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCCAAAATTTAGTAAGCAAGAGAGTTAAAAAAAAATAAA
64 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAA-ATAATAAGCAAGAGA-TT--TAAAAAATAAA
* ** * * * * * *
596367 TGTGTTTACTGAACCAGTTTACATAGTTA-AGACTA-TTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTC
125 TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * **
596430 TGACCTATTATTTAGTCATAAAGCAATAT-TTCATT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
189 TGAAC-ATTTTTTTGTCATAAAACAAT-TGTT--TTGTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * *
596493 TACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGA-GCAAAAGATTTTAAACAAA-AAATATGTTTAC
250 TACTAA--T-TTAATATTC-AAAAATTAAT-ATGTAAGAGA-TTTAAA-AAATAAATGTGTTTAC
* * *
596556 CAAACAAGTTTAAATAGATT-TGACTATT-GAATAATTATCTATTT-
308 CAAACCAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTC
* * * *
596600 AAAGT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTA-TCTG
1 AAA-TCA-TTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-A
* * * * *
596663 AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGGGATTTAAAAACTAAAG
62 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAA-TAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-
* * * * * * **
596728 TTAT-TTT-CTAGACAAGTTTAAATAGTTATGAA-TATTTGAACAAATATCAACCTCAAATCGTT
125 -TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * *
596790 ATG-ATATTTGTTTTCTAATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCCTATTTGGATAA-AAAAT
188 ATGAACATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TG-TCATAAAAGCTTATTT-GA-AATAAAAT
596853 AATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA-A-G--AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACC
248 AATACTAA-TT--TAATATT-CAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACC
*
596914 AAACCAGTTCTAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTC
309 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTC
* * * *
596959 AAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCCTGTTCAAAA
1 AAATCATTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
*
597024 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAAATA
65 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAA-TAATAAGCAAGAGATTT--AAAAAATAAATA
* * * *
597089 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATGACTATCTATTTGAAATCATTATGA
127 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * *** * *
597154 ACATTTATTTTCTCATAAAACAATTCTTTTAGTCAATAAAAGTTTATCCAAAATAAAAAAATTCT
192 ACATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTC-ATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* **** ** *
597219 ACTTT-AT-TTCAAAAATTAATATGTAAGAGA-TTAAAAAATAAAT-TAGTTTGTTGAATTAATT
254 AATTTAATATTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTACCAAACCAGTT
* * * * * * * *
597280 TAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTC
318 CAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTC
* * * * *
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1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAATAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* ** ** *
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* * * * * * *
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** * * ** * ***
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * **
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1 AAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAATAATTGTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
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65 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAA-ATAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATAT
** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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*
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * ***
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* * * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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65 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
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AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAACCA
GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAG
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* * * **
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* * ** * ** ** *
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*** * ** **
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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249 TATATTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * **
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314 TA-CTTTTTTTTCGTCATAAAACAATTATTTTGGTTT-ATACA
* * * * *
598781 AGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTGATTAACATTCAAAAAAGTAATGAGGCAAAGATTT-
1 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTA-TAATATTCAAAAAATTAAT-A---AGAGATTTA
* * * *
598845 AAAAA-AAAT-ATGTTTACCGAA-CAAGTTTAAATAGATT-TGACTATTA-AACAATTATCTATC
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* ** * * * **
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123 TAAA-TCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAA
* * * **
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186 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * ** * *
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* * * * *
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315 ACT-TTTTTTTCGTCATAAAACAATTATTTTGGTTTATACA
* * * *
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1 AGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAACTT-ATAATATT-CAAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
** * * * ** ** * *
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* * * * *
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* * * * *
599331 AATAATACAAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATATGTT
191 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATATATT
* * *
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255 TGCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CTT
* * *
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319 TTT-TTTCGTCATAAAACAATTATTTTGGTTTATACA
* *
599498 AGCTTATCCAAAATAAAACAATACT-ACTT-T-AT-TTC-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA
1 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAA
** * * *
599558 ATAAATCAGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTAAGGCCATTAGAACAACTATCTATTTCAAATT
65 ATAAATCAGTTTACCGAATCAATTCAAATAATTAAGACCATTAGAACAATTATCTATTT-AAATC
* * * * ** *
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129 ATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAA
* * * * *
599686 ATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTT
192 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTG
** * * * * * **
599747 TTGAACTAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTA-TAAATTTT
257 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTT
* * ** **
599811 GTTCATCATAAAACAATTATGTCCGGTCAAT-CA
322 TTTCGTCATAAAACAATTAT-TTTGGTTTATACA
** * * * *
599844 AGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGACATTTA
1 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTA-TAATATTC-AAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTA
* * *
599909 AAAAATAAATCTA-TTTACCGAATCAATTCAAACAATTAAGACCA-TACAAACAATTATTTATTT
61 AAAAATAAATC-AGTTTACCGAATCAATTCAAATAATTAAGACCATTA-GAACAATTATCTA-TT
** * * * ** * *
599972 TAAATTTTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATAAAAGCTTATTTAGA
123 TAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAA
* * * * * * *
600037 ATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTTAA-AAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTC
187 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * *
600101 TATTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTATAAATATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTA
251 TATTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA
* * * * *
600166 CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTAATATA
316 CTTTTT-TTTCGTCATAAAACAATTATTTTGGTTTATACA
* * ** * * * * *
600206 AGTTTGTTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAATAAGAGATTTT
1 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTA-TAATA-TT-CAAAA--AATTAATAAGAGATTTA
** * * * * * * ** * * *
600271 AAATGTAAAT-ATGCTTGCCAAAACATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
61 AAAAATAAATCA-GTTTACCGAATCAATTCAAATAATTAAGACCATTAGAACAATTATCTATTT-
* * * * * * ** *
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124 AAATCATTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * * *
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188 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * *** *
600456 TAATTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAATGGTTATCTATTTCAAATCGTTATGA
251 TATTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA
* * * * *
600521 CCTTTTCTTTT-GTCATAGAATAATTGTTTT-GTTCATATA
316 -CTTTT-TTTTCGTCATAAAACAATTATTTTGGTTTATACA
* ** * * **
600560 TGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG
1 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTT-ATAATATTCAAAAAATTAATAAG
600614 TACGAGATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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368 1 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (354 bp):
AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA
TAAATCAGTTTACCGAATCAATTCAAATAATTAAGACCATTAGAACAATTATCTATTTAAATCAT
TATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAA
TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTGCCGA
ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTTTTTC
GTCATAAAACAATTATTTTGGTTTATACA
Found at i:599783 original size:531 final size:527
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Period size: 531 Copynumber: 3.4 Consensus size: 527
598520 ACTATTATTT
* * * * *
598530 GAACAATTATCTATTTAAAATTGCTA-TAGCCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTC
1 GAACAAATATCTATTTCAAATTGTTATTA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATC
* * *
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* * *
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124 A-TTT-AAAAAATAAATGTGTTTGCAGAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
* * * *
598723 TATTTCAAATTGTTCTGACCTCTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATTTCATACAAGTTTAT
187 TATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAT
** * * * * * *
598788 TCAAAATAAAATAATACTAACTGATTAACATTCAAAAAAGTAATGAGGCAAAGATTT-AAAAA-A
252 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAAT-AAGCAGAGATTTAAAAAATA
* * *
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315 AATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGATTTGACTATTAAACAATTATCTATCTAAAATCCTCA
* * * *
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380 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTACCAAAATAAAACAATA
*
598981 CTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGGGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTGAAC
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* * * * *
599046 CAATTTAAATAGTTATGAATATTT
504 CAATTCAAATAATTAAGAACATTA
* ** ** * ** **
599070 GAACAAATATCAACCTCAAATCATTATGATATTTT-TTTCCTCATAAAACAATTGTTTTTGATCA
1 GAACAAATATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATCA
* * *
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65 TACAAGCTTATTCGAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* ** *
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129 AAAAATAAATGTGTTTGCAGAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
** * * * *
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194 AATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
*
599329 AAAATAATACAAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATATG
259 AAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAGCA-GAGATTT-AAAAAATAAATATG
* * * *
599394 TTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTCATTAC
321 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTA-TTAAACAATTATCTATCTAAAATCCTCATGAC
** * *
599458 CTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAACAATACT
384 C-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTA-CCAAAATAAAACAATACT
* * *
599523 A-CTT-TATTTCAAAAATTAATAAG-A-GATTTAAAAAAATAAATC-AGTTTAT-TGAATCAATT
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**
599582 CAAATAATTAAGGCCATTA
509 CAAATAATTAAGAACATTA
* * **
599601 GAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTCAAAA
1 GAACAAATATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATCA
* * * ** *
599665 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAGATTTA
65 TACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * *** * * *
599730 AAAAATAAATTTATTTTTTGAACTAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCA
129 AAAAATAAATGTGTTTGCAGAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * *
599795 AATTGTTATAA-ATTTTGTTCA-TCATAAAACAATTATGTCCGGTCA-ATCAAGCTTATTTGAAA
194 AATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
599857 TAAAATAATAGTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAA-CTAAGACATTTAAAAAATAAATCT
258 TAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAATTAATAAGC--AGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * * * ** *
599921 ATTTACCGAATCAA-TTCAAACA-ATTAAGACCATACAAACAATTATTTATTTTAAATTTTTATG
320 GTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGATT-TGACTAT-TAAACAATTATCTATCTAAAATCCTCATG
** * * ** * ** * *
599984 ACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATAAAAGCTTATTTAGAATAGAATAAAAC
382 ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTA-CCAAAATA-AA-ACAA-
* * * * ** * **
600049 TAATTTATTAATATTTCAAAATTTTAA-AAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGCCAAAC
443 TACTATATT-ATATTTCAAAA-ATTAATAAG-AAG-GATTTAAAAAATAAAGCTATTTTCTGAAC
* * *
600113 CAGTTCAAATAATTATA-AATATTT
504 CAATTCAAATAATTA-AGAACATTA
* * ** * * * * *
600137 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTAA
1 GAACAAATATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATCA
* * * * * * *
600202 TATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATCAATAAGAG
65 TACAAGCTTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA-AAAA-T--T-AATAAGAG
* ** * * * * * **
600266 ATTTTAAATGTAAATATGCTTGCCA-AAACATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCT
124 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTG-CAGAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATTTGAATAATTATCT
** *
600330 ATTTCAAATCATTATAACCTTTT
188 ATTTCAAATTGTTCTAACCTTTT
600353 ATTTGAATAG
Statistics
Matches: 1034, Mismatches: 201, Indels: 94
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (527 bp):
GAACAAATATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATCAT
ACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
AAATAAATGTGTTTGCAGAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
TTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
AATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAATTAATAAGCAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
CGAACAAGTTCAAATAGATTTGACTATTAAACAATTATCTATCTAAAATCCTCATGACCTTTTAT
TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTACCAAAATAAAACAATACTATATTATAT
TTCAAAAATTAATAAGAAGGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTCTGAACCAATTCAAATAATTAAG
AACATTA
Found at i:600477 original size:174 final size:173
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* * * * * * * * *
600036 AATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTTAA-AAGTAAGAGATTTAGAAAATAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAA-ATTAATAA-TAAGAAAATAAAAAAATAAAT
* * * * *
600100 CTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTATAAATATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATT
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* * * * * * *
600165 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATT-TTTGTTAATATAAGTTTGTTTGA
128 ACCTTTTCTTTTG-----AAATAGTT-TTGTTTGTTCATAT-ATTTTATTCGA
* * * * ** ** *
600217 AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAATAAGAGATTTTAAATGTAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAAT-AATAAGAAAATAAAAAAATAAATC
** * * *
600282 TGCTTGCCAAAACATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
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* ** *
600347 CCTTTT-ATTTG-AATAGTTTTGACTGTTCATACTATTTTATTCAA
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*
600391 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACTAAGAAAATAAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-TAAGAAAATAAAAAAATAAATC
* * * ** * *
600456 TAATTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAATGGTTATCTATTTCAAATCGTTATGA
64 TAATTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
** * * *
600521 CCTTTTCTTTTGTCATAGAATAATTGTTTTGTTCATATATGCTTATTCGG
129 CCTTTTCTTTTGAAATAG--T-TTTG-TTTGTTCATATAT-TTTATTCGA
*
600571 ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTAAAAATTAATAA
600613 GTACGAGATT
Statistics
Matches: 320, Mismatches: 61, Indels: 31
0.78 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 4 0.01
174 128 0.40
175 7 0.02
176 4 0.01
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179 6 0.02
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (173 bp):
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAATTAATAATAAGAAAATAAAAAAATAAATCTA
ATTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
TTTTCTTTTGAAATAGTTTTGTTTGTTCATATATTTTATTCGA
Found at i:600883 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 600656--600995 Score: 452
Period size: 182 Copynumber: 1.9 Consensus size: 180
600646 TAATTTCCAA
* ** **
600656 AATATTTATAAATCAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGGATTAT
* *
600721 GAC-AA-AAAAGGATAATAAATATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTGATAACTATTTGAAC
66 GACAAACAAAAGG-TAATAAATATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAA-
* *
600784 T-TGCTCAGTAAATAGACTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGG
129 TGTACTCAGAAAATAGACTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGG
* * **
600836 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATATGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGATTAT
1 AATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGGATTAT
* * * *
600901 GACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
66 GAC-AAACAAAAGGTAATAAATATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAAT
* *
600966 GTATTCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT
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AATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGGATTAT
GACAAACAAAAGGTAATAAATATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAATG
TACTCAGAAAATAGACTTATTTTTAAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGG
Found at i:600942 original size:17 final size:18
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* *
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1 ATAACTATTTGAA
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Statistics
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ATAACTATTTGAAATAGC
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * **
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** * * * * * *
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1 AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
*
601339 AATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAA
66 AATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
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* * * * * *
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1 AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAGAATAT
** * * ** *
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* * *** * *
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** * * * * * *
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1 AATTG-AACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
* * * * ** * *
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65 TAATAAATTAATATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * *
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** * * *
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* * * * *
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1 AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
* * * * * * * * **
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* * * *
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131 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG-TTATAACT
* * * * * * *
602173 AATTTAAACTGGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAAATTTCATAATAT
1 AA-TTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
* * ** * ** * *
602238 TATTACATTAGCATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATGAATAATTGTTTAATGACA
65 TAATAAATTAATATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * *
602302 AAACAAAGGGTTATAATGATTTAAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACT
129 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACT
* * * * * **
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1 AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATAT
* * * * * * * * *
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65 TAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTAT-AAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * **
602473 AAACAAAAGTTCATAATGATTTGAATTAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACT
129 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACT
* * * ** *** * *
602526 -ATTTAAGTTGATTCGATAAATTGATTT-TTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTT-GAAATA
1 AATTGAACTTG-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATA
* * * * * ** * **
602588 TTAATAAAATAATATTA-TTTAATTTTGGATAAGCTTTTTATGAACTGAAGCAATCATTTTATGA
64 TTAATAAATTAATATTATTTTAA-TTCGAATAAGC-TTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
602652 -TAAGCAAAAGGCCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
127 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACT
* * ** * * * * * * *
602706 ATTTGAACTTGTTCAGT-AGTAGATTT-GTTTTTAATTC-CTTGCTTATTAATTTTTTGGATGTT
1 AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
* * * * * *** * * * *
602768 AATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAATTGAAACGATTATTTTATAACTAA
66 AATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * ** * * *
602833 ACAAAAAGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCTAGTAGTCT-TTACT
131 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT-TATAACT
* *** * *
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1 AATTGAACTT-G-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* ** ** * * * * * * * * * * *
602947 TTATTAGTTTAGCAATA-TTTACTCCAAATAAGTTTTTATGAATAGAAACAATTGTTATATGATA
64 TTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * ** *
603011 AAAC-AAAGATCATATCGATTTGAGATAGTTAATTATTCAAATAATTATAACT
129 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACT
* * * * * *
603063 ATTTGAACTGGTCCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTCTT-GAAATAT
1 AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATAT
* * ** * * * *
603123 TAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAATTTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-
65 TAATAAATTAATATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * ** * *** *
603186 AAA-AAAATGTCATAATGATTTGAAACT-GGTAA-TAGTTCAAATGGACGTGACT
129 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAAATAATTA-TTCAAATAGTTATAACT
* * * * * *
603238 ATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTCAAC-TA--ATTTTTTA-AATAT
1 AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT-TACTTATTAATTTTTAGAATAT
* * * * * * * *
603298 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAAA-AGAAATAATTATTTTGTGAGA
65 TAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTAT-AAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
603362 AAGCAAAAGATCATAACAATTTGAAATGAATAATTGTT-TAATA-TTCATAACT
129 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTT-ATAACT
* ** ** * *
603414 ATTTGAACTCACTT-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATT
1 AATTGAACT-TGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATA
* * * * * *
603477 TTCATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTTTATCAACAGAAACAATTGGTTTATGAC
64 TTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
603541 AAAACAAA
128 AAAACAAA
603549 TGGCTACAAA
Statistics
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0.74 0.19 0.08
Matches are distributed among these distances:
170 6 0.00
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179 119 0.07
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AATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
AATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACT
Found at i:603566 original size:180 final size:177
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 6.5 Consensus size: 177
602379 TAATCTCCTA
* ** **
602389 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATAGGCTTGTT-TGATAA
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* * * * *
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* ** ** ***
602516 GGCCATAACTATTTAAGTTGA-TTC-GATAAATTGATTT-TTTTTTAAATCTCCAA
126 -GACATAACTATTTAAACT-ACTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTT
* * * * * * * * **
602569 CTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTAATTTTGGATAAGCTTTTTATGAACT
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAC-TTTTATGAAAA
* ** * * * * * * * *
602634 GAAGCAATCATTTTATGA-TAAGCAAAAGGCCATAACGATTTTAAA-TAAATAATTGTTCAAATA
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGTCATAA-TATTTGAAACT-GATAATAGTTCAAAT-
* * ** ** * * * *
602697 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGT-AGTAGATTT-GTTTTTAATTCCTTG
126 GACATAACTATTTAAACTACTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * * * * * * *
602747 CTTATTAATTTTTTG-GATGTTAATAAAATAATATTATTTTATT-TCAAATAAGCATGTATGAAT
1 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAACTTTTATGAAA
* * * * * * * * * * * *
602810 TGAAACGATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTTAGAACAATTTGAAA-TAGATAATCGTTCTAGT
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGTCATAA-TATTTGAAACT-GATAATAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
602874 AGTCTTTACTATTTGAATTGGCTT-GGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA
126 -GACATAACTATTTAAACT-ACTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTT
* ** * * * ** ** *
602928 CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCAATA-TTTACTCCAAATAAGTTTTTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTTTATGAAAA
* * * *
602991 GAAACAATTGTTATATGATAAAACAAA-GATCAT-ATCGATTTGAGA-TAGTTAATTA-TTCAAA
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* * * ** * *
603052 TAATTATAACTATTTGAACTGGTCCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T
125 TGA-CATAACTATTTAAACTACTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * ** *
603103 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTTTATGAATAG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTTTATGAAAAG
*
603168 AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAATGTCATAATGATTTGAAACTGGTAATAGTTCAAATGGAC
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTCATAAT-ATTTGAAACTGATAATAGTTCAAAT-GAC
* * ** *
603232 GTGACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TTTT
129 ATAACTATTTAAACTACTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * *
603279 C-AACTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAACTTGTATGAAAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAACTTTTATGAAAA
* * * * * * * * *
603342 GAAATAATTATTTTGTGAGAAAGCAAAAGATCATAACAATTTGAAA-TGAATAATTGTTTAATAT
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATG-TCATAA-TATTTGAAACTG-ATAATAGTTCAA-AT
* * * *
603406 -TCATAACTATTTGAACTCACTT-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
126 GACATAACTATTTAAACT-ACTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * * *
603457 ACTTATTAATTTTTGAAATTTTCATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATCAACA
1 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTTTATGAAAA
*
603522 GAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATG
603551 GCTACAAATA
Statistics
Matches: 752, Mismatches: 184, Indels: 92
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.00
175 159 0.21
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTTTATGAAAAG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTCATAATATTTGAAACTGATAATAGTTCAAATGACAT
AACTATTTAAACTACTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
Found at i:603640 original size:145 final size:146
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603421 CTCACTTGGT
*
603431 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTCATAAATTAGTATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTCATAAATTAGTATTATT
* * *
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603561 TTTGAACGTGTTCAAA
131 TTTGAACGTGTTCAAA
* * * *
603577 AAATAGATTTATTTTTTTAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTGGAATATT-AGTCAATTTA-TATTA
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTCA-T-AAATTAGTATTA
* * * *
603639 TTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGAATAGGAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
64 TTTTATTCAGAATAAGCTTGTATCAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAA
603694 AGGTCATAAC
Statistics
Matches: 103, Mismatches: 12, Indels: 5
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
144 1 0.01
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TTATTCAGAATAAGCTTGTATCAACAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAATGGCTACAAATA
TTTGAACGTGTTCAAA
Found at i:603858 original size:174 final size:178
Alignment explanation
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Period size: 174 Copynumber: 3.1 Consensus size: 178
603549 TGGCTACAAA
* ** * * * * * * * *
603559 TATTTGAACGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTTAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTGGAATAT
1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTATCGAAATAT
* * * * * * * ** *
603623 TAGTCAATTTATATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGAATAGGAACAATTATTTTATGACAA
66 TAAT-AA-CTATATTATTTTATCCA-AATAAACCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
603688 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
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* *
603739 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATAT
1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTATCGAAATAT
* * * * *
603804 TAAT-AGT-TATT-TTATT-T-CAAATAAGCCTATATGAACTAATATAATTGTTTTATGACAAAA
66 TAATAACTATATTATT-TTATCCAAATAAACCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
** * * * *
603864 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATTAC
130 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * *
603913 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATAT
1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTATCGAAATAT
* * *
603978 TAATAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
66 TAAT-AACT-ATATTATTTT-ATCCAAATAAACCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
*
604043 AACAAAAGGTCATAACTATTTGAACA-A-ATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
128 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
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1 TATTTGAACTT
604104 ATTCGATAAA
Statistics
Matches: 308, Mismatches: 46, Indels: 22
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 138 0.45
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Consensus pattern (178 bp):
TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTATCGAAATAT
TAATAACTATATTATTTTATCCAAATAAACCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
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603863 ACAAAAGGTC
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*
603890 ATAATTATTT-AAATAG
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Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
ACGTcount: A:0.48, C:0.00, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (17 bp):
ATAATGATTTGAAATAG
Found at i:604044 original size:500 final size:498
Alignment explanation
Indices: 603103--604048 Score: 1151
Period size: 500 Copynumber: 1.9 Consensus size: 498
603093 TTTTAAATCT
** *
603103 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTTTATGAATAG
1 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * ** * * *
603168 AAACAATTGTTTTATGACAAAAAAATGTCATAATGATTTGAAACTGGTAATAGTTCAAATGGACG
66 AAACAATTATTTTATGACAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAACTGATAATAGTTCAAATAGACA
* * *
603233 TGACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTCAACTAATTTTTTAAATAT
131 TAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATCTATTTTTTAAATTTTCAACTAATTTTTGAAATAT
* * * * *
603298 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAAAAGAAATAATTATTTTGTGAGAA
196 T-ATAAATTAG-ATTATTTTATTTCAAATAAACCTATATGAAAAGAAATAATTATTTTATGACAA
* *
603363 AGCAAAAGATCATAACAATTTGAAATGAATAATTGTTTAATATTCATAACTATTTGAACTCACTT
259 AACAAAAGATCATAACAATTTGAAATGAATAATTATTTAATATTCATAACTATTTGAACTCACTT
* * * * * * *
603428 GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTCATAAATTAGTATT
324 AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAATAAACTAATATT
* * * * *
603493 ATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATCAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGCTACAA
389 ATTTTAATCCGAATAAACTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGCTACAA
603558 ATATTTGAACGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTTAATTTTTG
454 ATATTTGAACGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTTAATTTTTG
* * * *
603603 CTTATTAATTTTTGGAATATTAGTCAATTTA-TATTATTTTATTC-AGAATAAGCTTGTATGAAT
1 CTTATTAATTCTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAAT
* *
603666 AGGAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAAT
64 AGAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAAGGTCATAACAATTTGAAACT-GATAATAGTTCAAAT
* * * * * *
603730 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTT
126 AGACATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATCTATTTTTTAAAT-T-TT-C-AACTAATTT
* * * *
603795 TTGAAATA-T-T-AA-TAG-TTATTTTATTTCAAATAAGCCTATATGAACTA-ATATAATTGTTT
187 TTGAAATATTATAAATTAGATTATTTTATTTCAAATAAACCTATATGAA-AAGAAATAATTATTT
* ** *
603854 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTATTTAAATAGTT-ATTACTATT
251 TATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATGA-ATAATTATTT-AATA-TTCATAACTATT
** *
603917 TGAACT-TGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAA
313 TGAACTCACTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAA
* *
603981 TAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
377 TAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAAC
604046 AAA
442 AAA
604049 AGGTCATAAC
Statistics
Matches: 375, Mismatches: 57, Indels: 28
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
498 1 0.00
499 75 0.20
500 191 0.51
501 14 0.04
502 74 0.20
503 2 0.01
504 2 0.01
505 2 0.01
506 14 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (498 bp):
CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG
AAACAATTATTTTATGACAAAAAAAGGTCATAACAATTTGAAACTGATAATAGTTCAAATAGACA
TAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATCTATTTTTTAAATTTTCAACTAATTTTTGAAATAT
TATAAATTAGATTATTTTATTTCAAATAAACCTATATGAAAAGAAATAATTATTTTATGACAAAA
CAAAAGATCATAACAATTTGAAATGAATAATTATTTAATATTCATAACTATTTGAACTCACTTAG
TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAATAAACTAATATTAT
TTTAATCCGAATAAACTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGCTACAAAT
ATTTGAACGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTTAATTTTTG
Found at i:604575 original size:481 final size:474
Alignment explanation
Indices: 603657--604581 Score: 1087
Period size: 481 Copynumber: 1.9 Consensus size: 474
603647 AGAATAAGCT
*
603657 TGTATGAATAGGAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAATAGGAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
* * * *
603722 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTTAAATCTCTTACTC
66 ATTCAAATAGTCACAACTATTTCAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTAAAATCTCTTACTC
* * * * * * *
603787 ATTAATTTTTGAAATATTAATAGTTATTTTATTTCAAATAAGCCTATATGAACTAATATAATTGT
131 ATTAATTTTTGAAATATAAATAGTTATGTTATTTCAAATAAGCCTATATCAAATAAAAAAATTAT
* * * * * *
603852 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATTACTATT
196 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAACTATTCAAACAGTCATAACTATT
* ** * *
603917 TGAACTTGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCGAAATATTAAT
261 TGAACTAGTTCAGTAAATATATACATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAAT
* *
603982 AAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
326 AAACTAACATTACTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * *
604047 AAAGGTCATAACTATTTGAACAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATA
391 AAAGGTCATAACTATTTAAACAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTATTCGATA
604112 AACAGATTTGAATTAAACA
456 AACAGATTTGAATTAAACA
* * *
604131 TGTATGAATAGGAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAATAGGAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
* * *
604196 AATT-AAATAGTGACAACTATTTCAACTTGTTCAGTAAATAGAT-TCATTTTTAAAATTTTTTAC
66 -ATTCAAATAGTCACAACTATTTCAACTTGTTCAGTAAATAGATCT-ATTTTTAAAATCTCTTAC
* * * * *
604259 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTA-TTCTGATTAAGCTTGTA-CAAATA
129 TCATTAATTTTT-GAA-A-T-ATAAA-TAG--TTATGTTATTTC-AAATAAGCCTATATCAAATA
* * * *
604322 GAAAAAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGGAATAGATAACTGTTCAAGCAG
186 -AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAACTATTCAAACAG
* * *
604387 TCATAATTGTTTGCACTAGTT-AGGCTAACA-A-ATACATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATT
250 TCATAACTATTTGAACTAGTTCA-G-TAA-ATATATACATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * * * ** * * *
604449 TTCAAAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATTTTGAATACGAC-TGTATGAATAGAAACAATTG
312 ATCAAAATATTAATAAACTAACATTACTTTAATCCGAATA-AACTTGTATGAACAAAAACAATTG
* * * *
604513 TTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA-TGATTTAAAATAAATACTTGCTC-AATAGTTATAACTA
376 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTT-AAACAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTA
604576 ATTGAA
439 ATTGAA
604582 TTGGTTTGGT
Statistics
Matches: 374, Mismatches: 60, Indels: 27
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
473 1 0.00
474 123 0.33
475 5 0.01
476 1 0.00
477 1 0.00
478 4 0.01
479 3 0.01
480 9 0.02
481 208 0.56
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483 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (474 bp):
TGTATGAATAGGAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
ATTCAAATAGTCACAACTATTTCAACTTGTTCAGTAAATAGATCTATTTTTAAAATCTCTTACTC
ATTAATTTTTGAAATATAAATAGTTATGTTATTTCAAATAAGCCTATATCAAATAAAAAAATTAT
TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAACTATTCAAACAGTCATAACTATT
TGAACTAGTTCAGTAAATATATACATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAAT
AAACTAACATTACTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
AAAGGTCATAACTATTTAAACAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTATTCGATA
AACAGATTTGAATTAAACA
Found at i:604839 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 604125--605618 Score: 961
Period size: 180 Copynumber: 8.3 Consensus size: 180
604115 AGATTTGAAT
* * * *
604125 TAAACATGTATGAATAGGAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAG
1 TAAACTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG
* * * * * * * *
604190 ATAATTAATT-AAATAGTGACAACTATTTCAACTTGTTCAG-TAA-ATAGATTCATTTTTAAAAT
65 ATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACATA-ATT-ATTTTTTAAAT
* * * * * * * *
604252 TTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTA-TTCTGAT
127 CTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAA
* ** * * * * *
604306 TAAGCTTGTACAAATAGAAAAAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGGAATAG
1 TAAACTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG
* ** * * * * * * *
604371 ATAACTGTTCAAGCAGTCATAATTGTTTGCACTAGTTAGGCTAACA-AATACATTTTCTAAATCT
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACATAAT-TATTTTTTAAATCT
* * ** * * * **
604435 TTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATTTTGAA
129 CTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * ** *
604487 TACGAC-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTAAAATA
1 TA-AACTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA
* * * * * * * * * *
604551 AATACTTGCTC-AATAGTTATAACTAATTGAATTGGTTTGGTAAACGAT-TTTATTTTTTAAATC
64 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAAC-ATAATTATTTTTTAAATC
** * *
604614 TCTTA--T--TAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAA
128 TCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * *
604663 CAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG
1 TAAACTTGTATGAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG
* * *
604728 ATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTC
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACATAATTATTTTTTAAATCTC
* * * *
604793 TTACTTAATAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAA
130 TTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
** * * * * * **
604844 TATGCTAGTAAGAGCT-GAAAAATTGTTTTA-CAGC-AAACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAAT
1 TAAACTTGTATGA-ATAAAAAAATTGTTTTATGA-CAAAAC-AAAAGGTAATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * *
604906 AGATAATTGTTCATACA-TCCTTAACTATTTAAAATGGTTTGGCAAACA-AATTTATTTTTCAAA
63 AGATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACATAA-TTATTTTTTAAA
* * * * * * **
604969 TCTCTTACTTATTAA-TTGTCAGAATCTTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA
126 TCTCTTACTTAATAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * ** *
605024 TAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATAT
1 TAAACTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG
* * * * *
605088 ATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT-GTTTCGGTAAATAGAATT-TTTTTTAAATCT
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGGCAAACATAATTATTTTTTAAATCT
* * * * *
605151 CTAACTTTTAA-AA-TTTTGAAATATTAAAAAATTAGTTTTATTTTATTACGAA
129 CTTAC--TTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * *
605203 TAAACTTGGATGAGTTGAAATAATT-TCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTTAAATA
1 TAAACTTGTATGA-ATAAAAAAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA
* ** * * *
605267 GATAA-TGCTTCATATAGTTTTAACTATTTGAATTGGTTCAGC-AA-ATGAATTTATTTTTTAAA
64 GATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACAT-AA-TTATTTTTTAAA
* * * * * *
605329 TCTCTTAGTT-ATGATTTTT-AGAATATT-TTGAATTTTGTATTATTTTATTTCGAA
126 TCTCTTACTTAATAATTTTTGA-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * * *
605383 TAAACTTATATGAATGAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAA
1 TAAACTTGTATGAAT-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAG
* * ** * * * * * *
605448 ATAATTATTCAAATAGTCATAACCATGCGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTGAATCTC
65 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACATAATTATTTTTTAAATCTC
* * *
605513 --A--TACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAAA
130 TTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * ** * *
605560 TAAGCTTGTATG-TTCAAAAACAATTGTTTTTATGACAAAATGAAAGGTAGTAACTATTT
1 TAAACTTGTATGAAT-AAAAA-AATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTT
605619 TATTTCAAAT
Statistics
Matches: 1013, Mismatches: 247, Indels: 109
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 5 0.00
176 97 0.10
177 91 0.09
178 31 0.03
179 98 0.10
180 402 0.40
181 276 0.27
182 12 0.01
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TAAACTTGTATGAATAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGA
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACATAATTATTTTTTAAATCTCT
TACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
Found at i:605410 original size:540 final size:538
Alignment explanation
Indices: 604152--605413 Score: 1173
Period size: 537 Copynumber: 2.3 Consensus size: 538
604142 GAAAAATTGT
* * * * * *
604152 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTAATT-AAATAGTGACAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAATCATAACTAT
* * ** * * * * *
604216 TTCAACTTGTTC-AGTAA-ATAGATTCATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATT
65 TTGAACTAGTTCGACAAACATA-ATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATT
* * * * ** * * * *
604279 AATAAATTAGAATTATGTTATTCTGATTAAGCTTGTACA-A-ATAGAAAAAATTATTTTGTGACA
128 AGTAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTAGTA-AGAGAT-G-AAAAATT-GTTT-T-ACA
* * * * * * * **
604342 --AAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGGAATAGATAACTGTTCA-AGCAGT-CATAATTGTTTGCA
187 GCAAACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATA-CA-TCCTTAACTATTTAAA
* * * * ** * *
604402 CTAGTTAGGCTAACAAATACA-TTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATTAA
250 ATGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATTAA
* * *
604466 TTAGCATTACTTTATTTTGAATACGACTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAT
315 TTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGACTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
* * *
604531 GGTCATAATGATTTAAAATAAATACTTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAATTGGTTTGGTAAAC
380 GGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAAA
* * *
604596 GATTTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCA
445 GATATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAAATTATTATTATTTTATTACA
* *
604661 AACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGT
510 AACAAACTTAGATGAACAAAAACATTTGC
* *
604690 TTTATGAGAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATT
604755 TGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAGT
66 TGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAGT
* ** *
604820 AAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATATGCTAGTAAGAGCTGAAAAATTGTTTTACAGCAAACTAA
131 AAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTAGTAAGAGATGAAAAATTGTTTTACAGCAAACTAA
604885 AAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATACATCCTTAACTATTTAAAATGGTTTGGCA
196 AAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATACATCCTTAACTATTTAAAATGGTTTGGCA
* * * *
604950 AACAAATTTATTTTTC-AAATCTCTTACTTATTAATTGTCAGAATCTT-ATTAGATTAGTATTAT
261 AACAAATTTATTTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATTA-ATTAGCATTAC
* *
605013 TTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGTTATAAT
325 TTTATTTTGAATAAGAC-TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * *
605076 GATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT-GTTTCGGTAAATAGA-ATT
389 GATTTAAAATAAATAATTGCTC-AATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTT-GGTAAA-AGATATT
* * *
605139 -TTTTTTAAATCTCTAACTTTTAAAATTTT-GAAATATTAAAAAATTAGTT-TTATTTTATTACG
451 ATTTTTTAAATCTCT---TATT--AATTTTCAAAATATTAAAAAATTA-TTATTATTTTATTACA
* * ** *
605201 AATAAACTTGGATGAGTTGAAATA-ATTT-C
510 AACAAACTTAGATGA--ACAAAAACATTTGC
* * * * **
605230 TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTTAAATAGATAA-TGCTTCATATAGTTTTAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAATCATAACTAT
* * * *
605294 TTGAATTGGTTC-AGC-AA-ATGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT-ATGATTTTT-AGAATA
65 TTGAACTAGTTCGA-CAAACAT-AA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGA-AATA
* * * * *
605354 TT-TTGAATTTTGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTA-TATGA-ATGAAAATAATTGTTTTA
126 TTAGT-AAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAAC-TAGTAAGAGATG-AAA-AATTGTTTTA
605414 TGATAGAACA
Statistics
Matches: 594, Mismatches: 97, Indels: 64
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
534 3 0.01
535 1 0.00
536 60 0.10
537 176 0.30
538 139 0.23
539 61 0.10
540 138 0.23
541 12 0.02
542 4 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (538 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATT
TGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAGT
AAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTAGTAAGAGATGAAAAATTGTTTTACAGCAAACTAA
AAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATACATCCTTAACTATTTAAAATGGTTTGGCA
AACAAATTTATTTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATTAATTAGCATTACT
TTATTTTGAATAAGACTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
TTTAAAATAAATAATTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAAAGATATTATTTT
TTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAAATTATTATTATTTTATTACAAACAAACTTAG
ATGAACAAAAACATTTGC
Found at i:605442 original size:540 final size:538
Alignment explanation
Indices: 604423--605458 Score: 1162
Period size: 540 Copynumber: 1.9 Consensus size: 538
604413 AACAAATACA
* *
604423 TTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATTTTGAAT
1 TTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATTTTGAAT
* * *
604488 ACGACTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTAAAATAAA
66 AAGACTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAA
* * * *
604553 TACTTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAATTGGTTTGGTAAACGATTTTATTTTTTAAATCTCTT
131 TAATTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAAAGATATTATTTTTTAAATCTCTT
* * *
604618 ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAA
196 ATTAATTTTCAAAATATTAAAAAATTATTATTATTTTATTACAAACAAACTTAGATGAACAAAAA
* *
604683 CATTTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCAT
261 CATTTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCAT
*
604748 AATTATTTGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAA
326 AACTATTTGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAA
* ** *
604813 TATTAGTAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATATGCTAGTAAGAGCTGAAAAATTGTTTTACAGC
391 TATTAGTAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTAGTAAGAGATGAAAAATTGTTTTACAGC
* *
604878 AAACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATACATCCTTAACTATTTAAAATGG
456 AAACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATACATCCTTAACTATTTAAAATGG
604943 TTTGGCAAACAAATTTAT
521 TTTGGCAAACAAATTTAT
* * * *
604961 TTTTC-AAATCTCTTACTTATTAATTGTCAGAATCTT-ATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA
1 TTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATTA-ATTAGCATTACTTTATTTTGAA
* * *
605024 TAAG-CTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
65 TAAGAC-TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATA
* * * *
605087 TATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT-GTTTCGGTAAATAGA-ATT-TTTTTTAAAT
129 AATAATTGCTC-AATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTT-GGTAAA-AGATATTATTTTTTAAAT
* * * * *
605149 CTCTAACTTTTAAAATTTT-GAAATATTAAAAAATTAGTT-TTATTTTATTACGAATAAACTTGG
191 CTCT---TATT--AATTTTCAAAATATTAAAAAATTA-TTATTATTTTATTACAAACAAACTTAG
** * * *
605212 ATGAGTTGAAATA-ATTT-CTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTTAAATAGATAA-TG
250 ATGA--ACAAAAACATTTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTG
* * ** * *
605274 CTTCATATAGTTTTAACTATTTGAATTGGTTC-AGC-AA-ATGAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
313 -TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-CAAACAT-AA-TTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
605336 GTT-ATGATTTTT-AGAATATT-TTGAATTTTGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTA-TATGA-
374 CTTAATAATTTTTGA-AATATTAGT-AAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAAC-TAGTAAGAG
* * ** *
605396 ATGAAAATAATTGTTTTA-TGATAGAAC-AAAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCA
436 ATG-AAA-AATTGTTTTACAG-CA-AACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCA
605459 AATAGTCATA
Statistics
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0.80 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
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AAGACTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAA
TAATTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAAAGATATTATTTTTTAAATCTCTT
ATTAATTTTCAAAATATTAAAAAATTATTATTATTTTATTACAAACAAACTTAGATGAACAAAAA
CATTTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCAT
AACTATTTGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAA
TATTAGTAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTAGTAAGAGATGAAAAATTGTTTTACAGC
AAACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATACATCCTTAACTATTTAAAATGG
TTTGGCAAACAAATTTAT
Found at i:605501 original size:540 final size:535
Alignment explanation
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604413 AACAAATACA
* * * *
604423 TTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATTTTGAAT
1 TTTTC-AAATCTCTTACTTATTAATTGTC-AAATATT-ATTAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * *
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* * * *
604552 ATACTTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAATTGGTTTGGTAAACGATTTTATTTTTTAAATCTCT
127 ATAATTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAAAGATATTATTTTTTAAATCTCT
* * *
604617 TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAA
192 TATTAATTTTCAAAATATTAAAAAATTATTATTATTTTATTACAAACAAACTTAGATGAACAAAA
* *
604682 ACATTTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA
257 ACATTTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA
*
604747 TAATTATTTGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAA
322 TAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAA
* ** *
604812 ATATTAGTAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATATGCTAGTAAGAGCTGAAAAATTGTTTTACAG
387 ATATTAGTAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTAGTAAGAGATGAAAAATTGTTTTACAG
* * * * * ** *
604877 CAAACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATACATCCTTAACTATTTAAAATG
452 CAAACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACATCCATAACCATGCAAAATA
604942 GTTTGGCAAACAAATTTAT
517 GTTTGGCAAACAAATTTAT
*
604961 TTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAGAATCTTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
1 TTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTGTCA-AATATTATTA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * *
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64 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAAT
* * *
605090 AATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT-GTTTCGGTAAATAGA-ATT-TTTTTTAAATCTC
129 AATTGCTC-AATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTT-GGTAAA-AGATATTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
605152 TAACTTTTAAAATTTT-GAAATATTAAAAAATTAGTT-TTATTTTATTACGAATAAACTTGGATG
191 T---TATT--AATTTTCAAAATATTAAAAAATTA-TTATTATTTTATTACAAACAAACTTAGATG
** * * *
605215 AGTTGAAATA-ATTT-CTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTTAAATAGATAA-TGCTT
250 A--ACAAAAACATTTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TT
* * ** * * *
605277 CATATAGTTTTAACTATTTGAATTGGTTC-AGC-AA-ATGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
312 CAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-CAAACAT-AA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * * *
605339 -ATGATTTTT-AGAATATT-TTGAATTTTGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTA-TATGA-ATG
374 AATAATTTTTGA-AATATTAGT-AAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAAC-TAGTAAGAGATG
* * ** * *
605399 AAAATAATTGTTTTA-TGATAGAAC-AAAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
436 -AAA-AATTGTTTTACAG-CA-AACTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAC
* * * * *
605462 AGT-CATAACCATGCGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTAT
497 A-TCCATAACCATGCAAAATAGTTTGGCAAACAAATTTAT
** * * * * **
605501 TTTTTGAATCTCATACTAATT-CTTG--AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAAATAA
1 TTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAATATT-ATTAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * *
605563 GCTTGTATG-TTCAAAAACAATTGTTTTTATGACAAAA
65 GCTTGTATGAAT-AGAAACAATT-ATTTTATGACAAAA
605600 TGAAAGGTAG
Statistics
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Consensus pattern (535 bp):
TTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAATATTATTAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
CTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAA
TTGCTCAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAAAGATATTATTTTTTAAATCTCTTATT
AATTTTCAAAATATTAAAAAATTATTATTATTTTATTACAAACAAACTTAGATGAACAAAAACAT
TTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAC
TATTTGAACTAGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATAT
TAGTAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTAGTAAGAGATGAAAAATTGTTTTACAGCAAA
CTAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACATCCATAACCATGCAAAATAGTTT
GGCAAACAAATTTAT
Found at i:605675 original size:67 final size:68
Alignment explanation
Indices: 605546--605675 Score: 217
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605536 AAATTAGTAT
*
605546 TATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATTGTTTTTATGACAAAATGAAAGGTAGT
1 TATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATTGTTTTCATGACAAAATGAAAGGTAGT
605611 AAC
66 AAC
* * *
605614 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAATAATTG-TTTCATGACAAAATGAAAGGTA
1 TATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATTGTTTTCATGACAAAATGAAAGGTA
605676 ATAATGATTT
Statistics
Matches: 58, Mismatches: 4, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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TATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAACAATTGTTTTCATGACAAAATGAAAGGTAGT
AAC
Found at i:605849 original size:19 final size:21
Alignment explanation
Indices: 605814--605855 Score: 61
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605804 TTGGATAAAC
*
605814 TTTTATGAACTAAAACAATAG
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1 TTTTATGAACTAAAACAAAAG
605854 TT
1 TT
605856 CATAATGATT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 2
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TTTTATGAACTAAAACAAAAG
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Indices: 605741--607928 Score: 1473
Period size: 181 Copynumber: 12.2 Consensus size: 180
605731 GATAAACTAT
* * * * *
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1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TC
** * * * *
605805 TGGATAAACTTTTATGAACTAAAACAA-TAGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTTA
65 TAAAT-AACTTGTATGAACTGAAACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * * *
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* *
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1 TTTA--TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA-ATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTT
* * * * * ** * * *
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62 ATCTAAATAA-CTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* ** * *
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126 GAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
* * *
606106 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATAATATTAAATTGGTATTATTTTTATCT
1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCT
* * * ** * * *
606171 GAATCAACTTGTATCATCAAAAACAATTATTTTATGAAAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGA
66 AAAT-AACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
606235 TTGATATTTGTT-TAAATAGTCGTAACTATTTGAAATGGTTC-G-AAAAATA
130 TAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
** * * ** * *
606284 GCTTTAGCTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTATTATTA-TTTTAT
1 --TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * * * * * * *
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64 CT-AAATAA-CTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* ** * * *
606413 AAATAGATAATTGTT-TAAATAGT-TATATTTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGA
127 AAATAGATAATTATTCT-AATAGTCT-TAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
* * * ** *
606467 TTT-TTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT
1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-T
* * * * * * * *
606529 TTCAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACGAAAGATCATAATGATCT-A
64 CTAAATAA-CTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * * *
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128 AATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
*** * * * *
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1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCT
* ** * * * * *
606710 AAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTACGACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGA
66 AAATA-ACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * *
606774 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACCT-GTTCAGTAAATAGA
130 TAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-CTGGTTCAGTAAACACA
* * * *
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1 TTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TA
* * * * * *
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63 TCTAAATA-ACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* ** * * *
606953 AAATAGATAATTATTCTAATAGCCTTAACTATTCAAACTGATTCAATGAACACA
127 AAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
* * *
607007 TTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCC
1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCT
* * * *
607072 AAATCAACTTG-AT-AA---AAAAAATTACTTTATGACAAAACAATTA--TCATAATGATTTTAA
66 AAAT-AACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * ** *
607130 GATTGATATTTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGC-
129 -ATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACA-CA
* * * ** * * *
607183 TTTAGTTTTTAAATCTATTACTTAATAATTTTTGAAATATTCATAAAGTAGTATTA-TTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCT
* * * * * ** * * ** *
607247 CAGAGAAGTTTTTATGAACTGAAATAATTGGTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAA
66 -AAATAA-CTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * ** * *
607312 ATAGATAATTATT-TAAATAGTCATATCTATTTGAACTTATTCAATAAACAGA
129 ATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
* * * ** * ** *
607364 TTTTTTTTTTTGAATTTCTTGGTTACTAACTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATTA-TTTTAT
1 -TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT
* * * * * ** * **
607427 TTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAATAAAACATCAGAACAATTTG
64 CT-AAATAA-CTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * ** ** * *
607492 AAATAAATCATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTGATTTGGTTCAACAAATATA
127 AAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
*** * *
607546 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATT-ATTAATTAGTATTATTTTAATGC
1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAT-C
* * * * * * * * *
607610 T-AATATGCTTGTATGAA-AGAAATAATTGTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAG
65 TAAATA-ACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
607672 ATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-AGATAAACAAA
129 ATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACACA
* *
607724 TTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TC
* * **
607784 TCAATAATTTTGTATGAA-TAGAAACAATT-TTTT-TCGAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
65 TAAATAA-CTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTAT-G-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * * *
607846 GAAATAGATAATTGTTC-AAGTGGACATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACAAA
126 GAAATAGATAATTATTCTAA-TAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
* * *
607901 TTTATTTTTTAGATCTCCTACCTATTAA
1 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
607929 ATTGCAGAAT
Statistics
Matches: 1594, Mismatches: 339, Indels: 148
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Matches are distributed among these distances:
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177 73 0.05
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179 198 0.12
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCT
AAATAACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
AGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACA
Found at i:606793 original size:539 final size:540
Alignment explanation
Indices: 605614--607864 Score: 1942
Period size: 539 Copynumber: 4.2 Consensus size: 540
605604 AGGTAGTAAC
** * * * *
605614 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAA-AAATAATTGTTTCATGACAAAATGAAAGGTAAT
1 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-AAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCAT
* * * * * * *
605678 AATGATTTGAAATATATAATTGTTCAGATGGCCATAATTATTTCAAATGATT-TGATAAACTA-T
64 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCAGA-AAA-TAGT
* * * * ** * *
605741 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTGATCTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
127 TTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
** * * * * * *
605806 GGATAAACTTTTATGAACTAAAACAATAGTTTTATGAC-AAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTTA
191 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAAACAAAAAG-TCAGAATGATTTGA
* * * * * *
605869 AATAGGTAATCATTCAAATAGTCATAACTATTCGAACATGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTT
255 AATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTCGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA--TTTTTT
* * *
605934 CAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTTGTCCAACTAAGCT
318 -AAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATAAGCT
* * * * * * *
605999 TGTATGAATTGAAACAATTATTTTATAATTAAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATT
382 TGTATGAA-TGAAATAATTATTTTATGACTAAA-CAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * *
606064 ATGCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
445 GTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACATATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTT
* *
606129 ATTAATTTTCAAAATAATATTAAATTGGTAT
510 ATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTAT
* * * * * *
606160 TATTTT-TATCTGAATCAA-CTTGTATCATCAA-AAACAATTATTTTATGA-AAAAACAAAGATC
1 TATTTTATTTC-AAAT-AAGCTTGTATGA-AAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAA-AAAGGTC
* * * * * *
606221 ATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCGTAACTATTTGAAATGGTTC-GAAAAATAG
62 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCAG-AAAATAG
* ** * * *
606285 CTTTAGCTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTATTATTATTTTATTT
126 TTTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
606350 CAAATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAAGTAATAATGATTTAA
190 CAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGA
* * ** * * * *
606414 AATAGATAATTGTT-TAAATAGTTATATTTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT-TTTTTTT
255 AATAGATAATTATTCT-AATAGTCATAACTATTCGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTA
* * ** * *
606477 AATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-AATAAGCTT
319 AATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCTT
* *
606541 GTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACGAAAGATCATAATGATCT-AAATAGATAATTG
383 GTATGAA-TGAAATAATTATTTTATGACTAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * ** *
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446 TTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACATATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTA
*** *
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511 TTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTAT
* * * * * *
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1 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAA
* * * * *
606764 TGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACCTG-TTCAGTAAATAGATTT
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-ATGATTCAGAAAATAGTTTT
* * * * *
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130 ATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAAA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * *
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193 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAAT
* * * * * *
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258 AGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTCGAACTTG-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* *
607021 CTCTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATCAA-CTTG-
322 CTCTTACTTATTAATTTTTCAAAA-GTTAATAAATTAGTATTATTTTTATCCAAAT-AAGCTTGT
* * * ** * * *
607083 AT-AA--AAAAAATTACTTTATGACAAAACAATTATCATAATGATTTTAAGATTGATATTTGTT-
385 ATGAATGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAGATCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTC
* * *
607144 TAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA--AAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTATTACTTA
449 T-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACATA--TTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTA
* ** *
607207 ATAATTTTTGAAATATTCA-TAAAGTAGTAT
511 TTAATTTTCAAAATATT-ATTAAATTAGTAT
* * * * ** * * * *
607237 TATTTTATTTCAGAGAAGTTTTTATGAACTGAAATAATTGGTTTATTACAAAACAAAAGGTTATA
1 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATA
** * * * * * * *
607302 ACAATTTTAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATATCTATTTGAACTTATTCA-ATAAACAGATT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCAGA-AAATAG-TT
* * * * * *
607366 TTTTTTTTTGAATTTCTTGGTTACTAACTTTTTGAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
128 TTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * **
607431 AATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAATA-AAACA-TCAGAACAATTTGAA
192 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAA-ACAAAAAGTCAGAATGATTTGAA
* * * * * * * *
607494 ATAAATCATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTG-ATTTGGTTCAACAAATATATTTATTTTTTAA
256 ATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTCGAACTT-GTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * * * * *
607558 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA-TT-ATTAATTAGTATTATTTTAATGCTAATATGCTTG
320 ATCTCTTACTTATTAATTTTT-CAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATAAGCTTG
* * * * * * * *
607621 TATGAAAGAAATAATTGTTCTATGACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGATATATAATTGTTC
384 TATGAATGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
607686 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-AGATAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATT
449 TAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-CAAACATATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATT
*
607746 AATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTAT
513 AATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTAT
** *
607774 TATTTTATTTTC-AATAATTTTGTATGAATAGAAACAATT-TTTT-TCGAACAAAACAAAAGGTC
1 TATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTAT-G-ACAAAA-AAAAGGTC
**
607836 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
62 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
607865 GTGGACATGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCAGAAAATAGTTTTA
TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGA
TAATTATTCTAATAGTCATAACTATTCGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
TACTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATAAGCTTGTATGAAT
GAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
CATAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACATATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA
AAATATTATTAAATTAGTAT
Found at i:606844 original size:360 final size:361
Alignment explanation
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* ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * *
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* * * * * *
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*
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* ** * * ** * * *
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* * * * ** * * *
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* * *
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* * * * * * *
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191 TTCAAT-AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTG
* * * * * * * **
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255 AAATAGATAATTATTCT-AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATA--TTTATTTT
* * * *
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317 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTAT
* * * ** * * * *
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1 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGA-TCATA
* * * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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195 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
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* * *
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325 CTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTAT
* * *
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1 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAA
* * *
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* * * * * *
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131 ATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAAAA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC
* * * * * *
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* * ** * * * * *
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258 TAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* *
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** * **
607061 TATTTT-TATCCAAATCAA-CTTG-AT--AAA-AAA-AATTACTTTATGACAAAACAATTATCAT
1 TATTTTAT-TCCAAAT-AAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCAT
* * * * ** * *
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* * * * *
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128 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * * ** *
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192 TCA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGA
* ** * * *
607311 AATAGATAATTATT-TAAATAGTCATATCTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTTTTTTTTT
256 AATAGATAATTATTCT-AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATA-TTTATTTTTT
* * ** * *
607375 GAATTTCTTGGTTACTAACTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTAT
319 AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTT-AAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * * *
607419 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAATAAAACATCAGA
1 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAT-AAAGATCATA
** * * * * * ** ** * *
607484 ACAATTTGAAATAAATCATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTG-ATTTGGTTCAACAAATATATT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCTGGTTCAGTAAACAGATT
* * * * *
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130 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTC-
* * * * * *
607611 AATATGCTTGTATGAA-AGAAATAATTGTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGAT
194 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAAT
* * * * * *
607674 ATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-AGATAAACAAATTTAGTTTTTAAA-
259 AGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAAT
*
607737 -TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTAT
323 CTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * *
607774 TATTTTATTTTC-AATAATTTTGTATGAATAGAAACAATT-TTTT-TCGAACAAAACAAAAGGTC
1 TATTTTA-TTCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTAT-G-ACAAAA-TAAAGATC
** * * * * * * * *
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62 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCTGGTTCAGTAAACAG
* * *
607900 ATTTATTTTTTAGATCTCCTACCTATTAA
127 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
607929 ATTGCAGAAT
Statistics
Matches: 1554, Mismatches: 333, Indels: 136
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Matches are distributed among these distances:
353 1 0.00
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (361 bp):
TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAA
TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCTGGTTCAGTAAACAGATTT
ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTCAA
TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAG
ATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC
TTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTAT
Found at i:607971 original size:146 final size:146
Alignment explanation
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607784 TCAATAATTT
* *
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* * *
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66 ATTCAAGTGGACATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTGTTAAATCTCCTACCT
607924 ATTAAATTGCAGAATA
131 ATTAAATTGCAGAATA
* *
607940 TGTATGAACAAAAATAATTTTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
1 TGTATGAACAAAAACAATTTTTTT-CGAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * * *
608004 TATTCAAGTGGACATGATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTCTTTGTTAAATCTCCTACC
65 TATTCAAGTGGACATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTGTTAAATCTCCTACC
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130 TATTAAATTGCAGAATA
608086 T
1 T
608087 CAATAAATTA
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 12, Indels: 2
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (146 bp):
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ATTCAAGTGGACATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTGTTAAATCTCCTACCT
ATTAAATTGCAGAATA
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Alignment explanation
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*
608410 AAATATTTACTTTTT
1 AAATATTTACTTATT
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1 AA
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Statistics
Matches: 16, Mismatches: 1, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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AAATATTTACTTATT
Found at i:609397 original size:180 final size:178
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* * * ** *
609079 ATATTTGAACTGGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTGAAATCTTTTAGTTATTAATTTTAAGAATG
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* * * * * *
609144 TTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAGTAAACTTGTGTGA-ACAAAAATAATTGTTTTATGA-
65 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTGTATGATA-AAAAA-ATTTG-TTTATGAT
* * *
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127 CA-AACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * * *
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1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATT-AATTTTAAAATA
* * * *
609324 TTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACGTGAATGATAAAAAACATTTGTTATATCATC
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* * * * *
609389 AAACAAAAGGTAATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTAAAATGGCCCCTAA
128 AAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CCATAA
* * ** * * * * * **
609441 TTATTTGAAA-TGATACAGTAAGCAGATTCACTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTTGTAAT
1 ATATTT-AAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAA-TTTTAAAAT
* * * * **
609501 ATTAATAAATTTGTATTACTTTATTTCTAA-AAAGCCTGTATGACT-AAGCAATGTT-TTTATGA
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* * * * *
609563 TAAAACAAAAGGTCCAA-AACAAATTTGAAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAA
126 TCAAACAAAAGGT--AATAA-TAATTT-AAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * * *
609619 ATGTTTGAACT-GTTTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-ATTATTAATTTTCAAAA
1 ATATTTAAACTGGTTT-AGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACA-TATTAATTTT-AAAA
* * * * * *
609682 TATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGGATAAGCTTGTGTGAACTGAAACAATTAT-TTTAT
63 TATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACCTGTATG-A-TAAAAAAATT-TGTTTAT
* * ** * * *
609745 -AGCAGAACAAAAGGTTATAACGATTT-GAATAGGTAATTATTCAAATAG------
124 GATCA-AACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * * ** * *
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1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAA-TTTTAAAATA
* * * * ** *
609852 TTAATAAATTA-AATTTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAA-TTGTTTTATGA
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* * ** * * * *
609915 -CAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATTATTGTTGAAATGGCCA-AA
126 TCAAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * ** * * * * *
609966 ATTATTTGAATTGATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTAGGAAT
1 A-TATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTA-AAAT
* * * * * * * *
610027 ATTAATAAATTATTAATATTATTATTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAATAA-TTGTTT
64 ATT-ATTAA--ATTAGTATTA-T-TTTATTTCGAATAAACCTGTATG-A-TAAAAAAATTTG-TT
* ** ** * ** * *
610091 TATGA-CAAAATAAAAGGTCCTAACGATTTTAAATAGATAATTACTCAAA-CGACATTAA
121 TATGATC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCA-TAA
* * * * * *
610149 TTATTTTAACTGATTCAGCAAA-TGAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTAGAAAT
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTA-AAAT
* * * * * * *
610209 ATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTC-ATATAAGCTTGTATTAATTGAAACAA-TTGTTTTATG
64 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAACCTGTA-TGA-TAAAAAAATTTG-TTTATG
* * * * ** * * **
610272 CTAAAACATAAGGTCATAGCAATTTTAAATA-AGTAATTGTTGAAATAATCATAA
125 ATCAAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * ** * ** * * * * * **
610326 CTATTTGAGCTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTCCAATCTCTTGCTTATTATTTTTTTGAAT
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACATATTA-ATTTTAAAAT
* * * * * * *
610391 GTTAATATATTAAG-ATTATTGTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGATATGAAACAAATAT-TTTAT
64 ATTATTAAATT-AGTATTATTTTATTTC-GAATAAACCTGTATGATA--AAA-AAATTTGTTTAT
* * * * * *
610453 CA-CTAAA-ACAAGGTCA-AATGATTTCAAATAGATAATTTTTC---TA--C-T-A
124 GATC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * * * * *
610499 GT-TTT-AACT-ATTCA-AAAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATA
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAA-TTTTAAAATA
* * * * ** * *
610556 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT-CCACTAAAAAACAGTTGGTTTAT-AA
65 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTGTATGA-TAAAAAA-A-TTTGTTTATGAT
* * * * * * * * *
610619 CAAAATAAAAGTTTACAATGATTTGAGATAGATAATTGCTCAAATGGCCATAA
127 C-AAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* ** * * * * * *
610672 TTATTTTTACTGATTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTAGAAATA
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTA-AAATA
* * * *** * * *
610733 TTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCCATATAAGTTTGTATTAACTGAAACAA-TTGTTTTATGA
65 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAACCTGTA-TGA-TAAAAAAATTTG-TTTATGA
* ** * * ** *
610796 -CAAAGC-AAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTAATGA
126 TCAAA-CAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * ** * * * * *
610848 CTATTTGAACCT-AATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTCAA
1 ATATTT-AAACTGGTTTAGCAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TTTACATATTAA-TTTTAAA
* * * * * * * *
610911 ATTTTAATAAATTTGTATTAATTTATTTCTAATAAACTTGTATGAACTGAAACAA-TTGTTTTAT
62 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTGTATG-A-TAAAAAAATTTG-TTTAT
* ** * * * * * *
610975 GA-CTAAACAGGAA-GTCAA-AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAACAGTCTTAGC
124 GATC-AAACA-AAAGGT-AATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATA-A
* * * * * * * ** * *
611031 CTA--TGAAGTGGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCGTACTTATTAATTTTTGAAATA
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAA-TTTTAAAATA
* *** * * * * *
611094 TTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAGCTTGTA-CA-AAAAAAA-TTGTTTTATGATAA
65 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTGTATGATAAAAAAATTTG-TTTATGATCA
* * * ** * * * *
611156 AACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATTGATAATCATTTATATAGTCTTAA
129 AACAAAAGGTAATAATA-ATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * * ** * *** **
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1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACATATT-AATTTTAAAAT
* * ** **
611270 ATTATTAAATTAGTATTATATTA-TTCTAA-ACAAAATAGTATGAATAGAACCAA-TTGTTTGAT
64 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-AACCT-GTATG-ATA-AAAAAATTTGTTT-AT
* * * * * *
611332 GA-CAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGAAAATTATTACAAATAGTCA-AA
124 GATC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTT-CAAATAGCCATAA
* * * * * *
611387 ACTATTTGAAA-TGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTAC-TGATTAATTTTCTAA
1 A-TATTT-AAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACAT-ATTAATTTT-AAA
* * * * * * * *
611450 ATATTAATAAACTAGTATTATTTAATTTTGAACAAACTTATATGA-ACAAAAACAATTGTTTTAT
62 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTGTATGATA-AAAAA-ATTTG-TTTAT
** * * * **
611514 GA-CAAACAAAA-GTAATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAACTAGTTATAA
124 GATCAAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * ** * * * * * * *
611567 TTATTTGAACTAGTCCAGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATCAAATTTTGAAATA
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATAT-TAATTTTAAAATA
** * * * * * * * * *
611632 TTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCCAAGTAAACTTATATGAGCTGAAATAGTTAT-CTTAAGA
65 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAACCTGTATGA--TAAAAAAATT-TGTTTATGA
* ** *
611695 -CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC--AT----AT-A
126 TC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * ** * *
611741 GT-TTT-AA-TTGTTT-G-----A-ATTTATTTTTTAAATCCCTTA-GTTTTGAATTTTCAAAAT
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATT-AATTTT-AAAAT
* *
611795 ATTATTACATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGA-ACAGAAATAA-TTGCTTTATG
64 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTGTATGATA-A-AAA-AATTTG-TTTATG
* * * * * **
611858 --CAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTGATAA
125 ATC-AAACAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
* * * * * *
611911 TTATTTAAACTGGTTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAAATC----A-ATTATTAATTCTTGAAAT
1 ATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACA-TATTAATT-TTAAAAT
*
611971 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
64 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT
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TATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACCTGTATGATAAAAAAATTTGTTTATGATCAAA
CAAAAGGTAATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
Found at i:610357 original size:177 final size:175
Alignment explanation
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* *
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* * * *
609869 TTTTATTCCAAATAGGCTTGTA-TGA-TGAAAAACAATTGTTTTATG-ACAAACAAAAGTTCATA
61 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTG--AAACAATTGTTTTATGCA-AAAC-AAAGGTCATA
* * * * * * **
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* * * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA--ATTAGTATTA-T
* * * * *
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** * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* ** *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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*
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* * * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * *
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* * * * * * *
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130 AAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA
* * * *
610866 TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATTTTAATAAATTTGTATTA
1 TAAACAGATTTA-TTTTTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
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61 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATG-CAAAACA--AAGGTCATAA
* * ** * * * ** *
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123 CGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATA-ACTATTTGAACTTATTCAA
* * * *
611047 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCGTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * *
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62 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATG-CAAAAC-AAAGGTCATAACG
* * ** * * * * ** *
611173 ATTTGAAATTGATAATCATTTATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAG
125 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA
** * * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAA--ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * * * * * *
611289 ATTA-TTCTAAACAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAAT
62 TTTATTTC-AAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATG-CAAAA-CAAAGGTCATAAC
* * * * * * ** ***
611353 GATTTAAAATAGAAAATTATTACAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGG
124 GATTTTAAATAGATAATTGTT-CAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA
* * *
611406 TAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAACTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * *** * * * *
611470 TTTAATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATG-ACAAACAAAAGTAATAGCA
61 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGCA-AAACAAAGGTCATAACG
* * * * * * * *
611534 ATTTGAAATAGGTAATTGTTCAACTAGTTATAATTATTTGAAC-TAGTCCAG
125 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAA
* * * * *
611585 TAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATCAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-T-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * ** * * * * *
611650 TTTATTCCAAGTAAACTTATATGAGCTGAAATAGTTATCTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAACG
62 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATG-CAAAAC-AAAGGTCATAACG
* * *
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125 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA
* * ** * *
611753 T---GA-ATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTTTGAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA---TT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * * *
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62 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGCAAAAC-AAAGGTCATAACGA
* * * * * * * ** *
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126 TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA
* * ** *
611929 TAAATAGATTTAATTTTTAAATCAATTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * *
611994 TTTTAAATAAG-TT-TA-TATGTTGAAAAATAATTATTTTATGACAAAACGAAAAGT-ATTAACA
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* ** * * ** * * *
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125 ATTTTAAATAGATAATTGTTCA-AATGGTCAT-AACTATTT-G--AACTTATTCAA
*** * * * * *
612106 TTTTCTA-A---ATCTCTT--A---CTTATTAATTTTTGAAATATTA-AAAAAAAGTAGTATTAT
1 TAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG-AA-A-TATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * * *
612161 TTTATTTTGGATAAGCTT-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAACA
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** ** * *
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* * * *
612276 TAAATAAATTT-TTTTTTCAAATATTTTCCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAG---T
1 TAAACAGATTTATTTTTT--AA-A-TCT-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * * ** * *
612336 -GTTTATTTCGAATAGGCTTTTATGAACTAAAACAATAGTTTTATGACCAAACAAAAAATTAAAA
60 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATG-CAAAAC-AAAGGTCATAA
** * ** * * * ** * **
612400 TAACTCAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAA-TCATTTGAA-TTGTTCGG
123 CGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACT-ATTTGAACTTATTCAA
* * * * *
612452 CAAACACATTTACTTTTTAAATCTCTCACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTACTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * ** * * *
612517 TTTCA-TCCAAATAGGCTTATA-TGATCAAAAATAATT-TTTT-TGACAAAACAAAGATCATAAT
62 TTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATTAAT-TGAAACAATTGTTTTATG-CAAAACAAAGGTCATAAC
* * * * * ** * *
612578 GATTTGAGATTGATATTTATTCAAATGGTTGTAACTAATTGAAC-TAGTTTGAA
124 GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTA--TTCAA
* * * *
612631 -AAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGCT-TTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T--TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TATTA
* * * * * *
612694 TTTTAGTTT-AGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
61 TTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATG-CAAAAC-AAAGGTCATAA
* * * * * * * *
612758 TGATTTTAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTCGA
123 CGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA
* ** * *
612811 TAAACATATTTATTTTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTTCAGTTTTAATAAATTAGTATTATTT
1 TAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * * *
612876 TATTCCAAATAAGCATGTATGAACT-AAGATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGA
64 TATTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAA-ACAATTGTTTTATG-CAAAAC-AAAGGTCATAACGA
* * * ** **
612940 TTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTCGACA
126 TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTC-A-A
*
612992 -AAACACATTTATTTTTT
1 TAAACAGATTTATTTTTT
613009 GTTATTAAAT
Statistics
Matches: 2312, Mismatches: 524, Indels: 378
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
163 49 0.02
164 128 0.06
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Consensus pattern (175 bp):
TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
TTTCAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGCAAAACAAAGGTCATAACGATTTTA
AATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTCAA
Found at i:610686 original size:523 final size:526
Alignment explanation
Indices: 609998--611019 Score: 1282
Period size: 523 Copynumber: 1.9 Consensus size: 526
609988 ACAGATTCAC
*
609998 TTTTTAAATCACTTATTAATTTTAGGAATATTAATAAATTATTAATATTATTATTTATTTCAAAT
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* * * * * * *
610063 AAGCTTTTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCCTAACGATTTTAAATAGA
65 AAGCTTTCATGAA-TAAAACAATTGGTTTATAACAAAATAAAAGGTACTAACGATTTGAAATAGA
* ** *
610128 TAATTACTCAAACGACATTAATTATTTTAACTGATTCAGCAAATGAATTTATTTTTTAAATCTCT
129 TAATTACTCAAACGACATTAATTATTTTAACTGATTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCT
* * * *
610193 TATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCATATAAGCTTGTATTAATTGAA
194 TATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCATATAAGCTTGTATTAACTGAA
* * * *
610258 ACAATTGTTTTATG-CTAAAACATAAGGTCATAGCAATTTTAAATAAGTAATTGTTGAAATAATC
259 ACAATTGTTTTATGAC-AAAACA-AAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATA
* * * * * *
610322 ATAACTATTTGAGCTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTCCAATCTCTTGCTTATTATTTTTTT
322 ATAACTATTTGAACCTAATCAATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTC
* * *
610387 GAATGTTAATATATTAAG-ATT-ATTGTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATAT
387 AAATGTTAATAAATT-AGTATTAATT-TATTTCT-AATAAACTTGTATGA-ACTGAAACAAATAT
* * *
610448 TTTATCACTAAAACA-AGGTC-AAATGATTTCAAATAGATAATTTTTCTACTAGTTTTAACTATT
448 TTTATCACT-AAACAGAAGTCAAAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCTACTAGTTTTAACTATT
610511 CAAAAACACATTTAT
512 CAAAAACACATTTAT
* * *
610526 TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA-ATTAGTATTA-T-TTTATTTCAAATA
1 TTTTTAAATCACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATATTAATATTATTATTTATTTCAAATA
* * * *
610587 AGCTTGTCCACT-AA-AAAACAGTTGGTTTATAACAAAATAAAAGTTTAC-AATGATTTGAGATA
66 AGCTT-T-CA-TGAATAAAACAATTGGTTTATAACAAAATAAAAG-GTACTAACGATTTGAAATA
* * * *
610649 GATAATTGCTCAAATGGCCA-TAATTATTTTTACTGATTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATC
127 GATAATTACTCAAA-CGACATTAATTATTTTAACTGATTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATC
*
610713 TCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCATATAAGTTTGTATTAACT
191 TCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCATATAAGCTTGTATTAACT
* * *
610778 GAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
256 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAAT
* * * * *
610843 AATGACTATTTGAACCTAATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT
321 AATAACTATTTGAACCTAATCAATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
* * * *
610908 CAAATTTTAATAAATTTGTATTAATTTATTTCTAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT
386 CAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCTAATAAACTTGTATGAACTGAAACAAATATTTT
* *
610973 ATGACTAAACAGGAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTA
451 ATCACTAAACA-GAAGTCAAAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCTA
611020 ACAGTCTTAG
Statistics
Matches: 423, Mismatches: 58, Indels: 30
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
521 7 0.02
522 138 0.33
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524 33 0.08
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526 1 0.00
527 2 0.00
528 32 0.08
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (526 bp):
TTTTTAAATCACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATATTAATATTATTATTTATTTCAAATA
AGCTTTCATGAATAAAACAATTGGTTTATAACAAAATAAAAGGTACTAACGATTTGAAATAGATA
ATTACTCAAACGACATTAATTATTTTAACTGATTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTA
TTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCATATAAGCTTGTATTAACTGAAAC
AATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATAATAA
CTATTTGAACCTAATCAATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAAT
GTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCTAATAAACTTGTATGAACTGAAACAAATATTTTATCAC
TAAACAGAAGTCAAAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCTACTAGTTTTAACTATTCAAAAACAC
ATTTAT
Found at i:611204 original size:176 final size:178
Alignment explanation
Indices: 610714--611993 Score: 567
Period size: 181 Copynumber: 7.2 Consensus size: 178
610704 TTTTAAATCT
* * ** ** * ** *
610714 CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCATATAAGTTTGTATTAACTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAACTTGTATCAAC--
* * * * * ** * *
610779 AAACAATTGTTTTATGAC-AAAGCA-AAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAG
64 AAAAAATTGTTTTATGACTAAA-CAGAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATCATTCTAACAG
** * ** *
610842 TAATGACTATTTGAACCT-AATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTT
128 TCTTAACTA-TTGAA-CTGGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *** * *
610895 CTTATTAATTTTTCAAATTTTAATAAATTTGTATTAATTTATTTCTAATAAACTTGTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAACTTGTATCAAC--
* * **
610960 AAACAATTGTTTTATGACTAAACAGGAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAACAGT
64 AAAAAATTGTTTTATGACTAAACAGAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATCATTCTAACAGT
* * * *
611025 CTTAGCCTA-TGAAGTGGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCGTA
129 CTTA-ACTATTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
*
611075 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAGCTTGTA-CAA-AA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAACTTGTATCAACAA
* *
611138 AAAATTGTTTTATGA-TAAAACA-AAAGGTCATAAA-GATTTGAAATTGATAATCATT-TATATA
66 AAAATTGTTTTATGACT-AAACAGAAA-GTCA-AAACGATTTGAAATAGATAATCATTCTA-ACA
* * * *
611199 GTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTG
127 GTCTTAACTA-TTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * ** * * * * * *
611252 GTTATTAAATTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATATTATTCTAAACAAAATAGTATGAATAG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAACTTGTATCAACA-
* * * * * * * * * * * *
611317 AACCAATTGTTTGATGACAAAATA-AAAGGTTATAATGATTTAAAATAGAAAATTATTACAAATA
65 AA-AAATTGTTTTATGACTAAACAGAAA-GTCAAAACGATTTGAAATAGATAATCATT-CTAACA
** * ** *
611381 GTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA
127 GTCTTAACTA-TTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * **** * * *
611434 CTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAACTAGTATTA-TTTAATTTTGAACAAACTTATATGAAC
1 CTTATTAATTTT-TGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAA-ACCAAATAAACTTGTATCAAC
* * * **
611497 AAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACA-AAAGT-AATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTC-AAC
64 -AAAA-AATTGTTTTATGACTAAACAGAAAGTCAA-AACGATTTGAAATAGATAATCATTCTAAC
* * * *
611558 TAGT-TATAATTATTTGAACTAGTCCAGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA
126 -AGTCT-TAACTA-TTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * * ** * * * *
611613 CTTATCAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCCAAGTAAACTTATATGAGCTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAACTTGTATCAAC--
* * * * * * * ** *
611678 AAATAGTTATCTTAAGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-ATATA
64 AAAAAATTGTTTTATGACTAAACAGAAA-GTCAAAACGATTTGAAATAGATAATCATTCTA-ACA
* *
611741 GT-TTTA--ATTG---T--TT--G-----A-ATTTATTTTTTAAATCCCTTA
127 GTCTTAACTATTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * *** * *
611777 GTT-TTGAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACA
1 CTTATT-AATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAACTTGTATCAACA
* * * * * * * * *
611841 GAAATAATTGCTTTATG-CAAAACA-AAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
65 -AAA-AATTGTTTTATGACTAAACAGAAA-GTCAAAACGATTTGAAATAGATAATCATTCTAACA
** * * *
611904 GTGATAATTATTTAAACTGGTTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAAA--TC--A
127 GTCTTAACTA-TTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
611953 ATTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTA
611994 TTTTAAATAA
Statistics
Matches: 859, Mismatches: 186, Indels: 113
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
162 1 0.00
163 45 0.05
164 76 0.09
165 1 0.00
166 1 0.00
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170 2 0.00
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174 2 0.00
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183 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACCAAATAAACTTGTATCAACAA
AAAATTGTTTTATGACTAAACAGAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATCATTCTAACAGTCT
TAACTATTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
Found at i:611365 original size:357 final size:359
Alignment explanation
Indices: 610695--611655 Score: 826
Period size: 361 Copynumber: 2.7 Consensus size: 359
610685 TTCAACAAAC
* * * **
610695 AAATTAATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
1 AAATTTATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAA
* * * * * * *
610757 CCATATAAGTTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAGGTCATAACGATTTTAA
66 CCAAATAAGCTTGTATCAAC--AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAAAGATTTGAA
** *
610822 ATAAATAATTGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACCTAATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAA
129 ATAAATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACCTAATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAA
* * * * * * *
610887 ATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATTTTAATAAATTTGTATTAATTTATTTCTAATAAACTTGT
194 ATCTCTTGCTTATTAAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCTAACAAAATAGT
* * * * * *
610952 ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAGGAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
259 ATGAACTGAAACAATTGTTTGATGACAAAACAGAAAGTCAAAACGATTTAAAATAGAAAATTATT
* * ** *
611017 -CTAACAGTCTTAGCCTA-TGAAGTGGTTCAGTAAAT
324 ACAAACAGTC-AAAACTATTGAAATGGTTCAGTAAAT
* *
611052 AAATTTATTTTTTAAATCTCGTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAA
1 AAATTTATTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA
*
611117 ACCAAATAAGCTTGTA-CAA-AAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAA
65 ACCAAATAAGCTTGTATCAACAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAAAGATTTGAA
** * * ** ** *
611180 ATTGATAATCATTTATATAGTCTTAACTATTTGAA-CTGGTTCAGTAATTAGATTTA-TTTTTTA
129 ATAAATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACCT-AATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTA
* * * ** *
611243 ATTTTCTTGGTTATTAAATTTTGGAATATTATTAAATTAGTATT-ATATTA-TTCTAAACAAAAT
193 AATCTCTTGCTTATTAAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAAT-TTATTTCT-AACAAAAT
* * * * *
611306 AGTATGAA-TAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATA-AAAGGTTATAATGATTTAAAATAGAAAA
256 AGTATGAACT-GAAACAATTGTTTGATGACAAAACAGAAA-GTCAAAACGATTTAAAATAGAAAA
* **
611369 TTATTACAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAAT
319 TTATTACAAACAGTCAAAACTA-TTGAAATGGTTCAGTAAAT
* * * *
611411 AGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAACTAGTATTA-TTTA
1 AAATTTATTTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
**** * * * * * * *
611474 ATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGTAATAGCA-ATT
64 A-ACCAAATAAGCTTGTATCAAC-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATA-AAGATT
** ** * * * * *
611537 TGAAATAGGTAATTGTTCAACTAGTTATAATTATTTGAA-CTAGTCCAGTAAATAGAATTA-TTT
125 TGAAATAAATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACCTAAT-CAGTAAATAGATTTATTTT
* * * * * *
611600 TTTAAATCTCTTACTTATCAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATT
189 TTTAAATCTCTTGCTTATTAAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATT
611656 CCAAGTAAAC
Statistics
Matches: 479, Mismatches: 102, Indels: 41
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
356 9 0.02
357 142 0.30
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359 76 0.16
360 7 0.01
361 150 0.31
362 11 0.02
363 13 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (359 bp):
AAATTTATTTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAA
CCAAATAAGCTTGTATCAACAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAAAGATTTGAAAT
AAATAATCATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACCTAATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAT
CTCTTGCTTATTAAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCTAACAAAATAGTAT
GAACTGAAACAATTGTTTGATGACAAAACAGAAAGTCAAAACGATTTAAAATAGAAAATTATTAC
AAACAGTCAAAACTATTGAAATGGTTCAGTAAAT
Found at i:611726 original size:361 final size:350
Alignment explanation
Indices: 610779--612987 Score: 1154
Period size: 358 Copynumber: 6.2 Consensus size: 350
610769 GTATTAACTG
* * *
610779 AAACAATTGTTTTATGACAAAGC-AAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * *
610843 AATGACTATTTGAACCTA-ATCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTT
65 TATAACTATTTGAA-CTAGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTT
* * * * *
610907 TCAAATTTTAATAAATTTGTATTAATTTATTTCTAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAATAAACTTATATG-ACTGAAACAATTG-TT
* * * * *
610972 TATGACTAAACAGGAA-GTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAACAGTCTTAGCCTA--
190 TATGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTC--A-ACTATT
* * *
611034 TGAAGTGGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCGTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAT
250 TGAAATGGTT-TGTAAAT-AATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTCT-AAATATTAT
* * *
611098 TAAAT--T-TGTA-TTATTTTAAACCAAA-TAAGCT-TGTACAA
311 TAAATAGTAT-TATTTATTTTGAA-CAAACTTA--TATGAACAA
* * ** * * *
611136 AAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAATTGATAATCATTTATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
* * * * **
611200 TCT-TAACTATTTGAACTGGTTCAGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAATTT
64 T-TATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTT
* * * ** * *
611264 TGGAATATTATTAAATTAGTATTATATTATTCTAA-ACAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTT
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAATA-AACTTA-TATGACT-GAAACAATTGTT
* * * * * *
611328 TGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGAAAATTATTACAAATAGTCAAAACTATT
190 T-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-C-AATAGTC--AACTATT
* *
611393 TGAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAAT
250 TGAAATGGTTT-GTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTTCTAAATATTATT
611458 AAACTAGTATTATTTAATTTTGAACAAACTTATATGAACAA
312 AAA-TAGTATTATTT-ATTTTGAACAAACTTATATGAACAA
* * ** * *
611499 AAACAATTGTTTTATGACAAACAAAA-GTAATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAACTAGTT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTT
* * * *
611563 ATAATTATTTGAACTAGTCCAGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATCAAATTTTGA
66 ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGA
* * * * * * *
611628 AATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTCCAAGTAAACTTATATGAGCTGAAATAGTTATCTTAA
131 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA-TAAACTTATATGA-CTGAAACAATTGT-TTAT
* *
611693 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-ATA-T--AGT-TTT--AATTG
193 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGTCAACTATTTGAAATGG
* * * * *
611751 TTTG-----AATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTTTGAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTAT
258 TTTGTAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATT-AATTTTCTAAATATTATTA-AATAGTAT
* * * *
611811 TATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACAG
321 TA-TTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAA
* * *
611842 AAATAATTGCTTTATG-CAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
611906 GATAATTATTTAAACTGGTTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAAA--TC--AATTATT-AATTCTT
65 TATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATT-TT
* ** * * *
611966 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTATATG-TTGAAAAATAATTATTT
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AATAAACTTATATGACTG--AAACAATT-GTT
* * * * *
612030 TATGACAAAACGAAAA-GT-ATTAACAATTT----T-GTTCAAATG-GC--TA-T-AATTATTTG
190 TATGACAAAAC-AAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAATAGTCAACTATTTG
* * *
612083 AACT-ATTTGGTAAACTTATTTATTTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAAA
252 AAATGGTTT-GTAAA-TAATTTATTTTT-TAAATCTCTTAC-TATTAATTTTCT-AAATATT--A
** * * * **
612146 AAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TATGAACTG
310 TTAAA-TAGTATTA-TTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAA
* * * * * * * *
612188 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTATAGAACTAATCATTCAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * *
612253 GATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAAATTT-TTTTTTCAAATATTTTCCTTATTAATTTTT
65 TATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-ATTT
* * * * ** * * *
612317 TG-AATGTTAATAAATTAGT-GT-TTAT-TTCGAATAGGCTTTTATGAACTAAAACAATAGTTTT
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAATAAACTTATATG-ACTGAAACAATTG-TTT
* ** * * ** * ** * *
612378 ATGACCAAACAAAAAATTAAAATAACTCAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAA-TCATTTG
191 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAG--TCAACT-ATTTG
* * * * * *
612442 -AATTGTTCGGCAAACACATTTACTTTTTAAATCTCTCACTTATTAATTTT-TGAAATATTATTA
252 AAATGGTT-TGTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTCT-AAATATTATTA
* * ** * *
612505 AATTAGTACTATTT-TCATCCAA-ATAGGCTTATATGATCAA
313 AA-TAGTATTATTTAT-TTTGAACA-A-ACTTATATGAACAA
* * ** * ** * *
612545 AAATAATT-TTTT-TGACAAA-ACAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATGGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * *
612607 TGTAACTAATTGAACTAGTT-TGAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTT
65 TATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTT
* ** * *
612671 GAAATATTAATAAAGTAGCT-TTATTTTAGTT-TAGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTATT
129 GAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTA-TTCTA-ATAAACTTATATG-ACTGAAACAATT-GT
* * * *
612734 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATATCTATTT
189 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCA-A-CTATTT
** * * * * * * * *
612799 GAGCTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTTTCAGTTTTAAT
251 GAAATGGTTTG-TAAATA-ATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTCTAAATATTATT
*** * * * * *
612861 AAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTATGAACTA
312 AAA-TAGTATTA-TTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAA
* * * * * ** * * * *
612902 AGATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* *
612967 TTTAACTATTTGAACTGGTTC
65 TATAACTATTTGAACTAGTTC
612988 GACAAAACAC
Statistics
Matches: 1430, Mismatches: 300, Indels: 240
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
334 3 0.00
335 5 0.00
336 8 0.01
337 3 0.00
338 5 0.00
339 5 0.00
340 73 0.05
341 7 0.00
342 5 0.00
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350 8 0.01
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364 9 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (350 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTT
ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAATAAACTTATATGACTGAAACAATTGTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGTCAACTATTTGAAATGGTTT
GTAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTCTAAATATTATTAAATAGTATTATTT
ATTTTGAACAAACTTATATGAACAA
Found at i:612978 original size:179 final size:178
Alignment explanation
Indices: 612122--613008 Score: 590
Period size: 179 Copynumber: 5.0 Consensus size: 178
612112 AAATCTCTTA
* * * ****
612122 CTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TATGAAC
1 CTTATTAATTTTTTAAATATT--AATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAC
* * * * ** * *
612186 TGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTCATAACAATTT--TATAGAACTAATCATTCAAA
64 TAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAG-A-TAATTATTCAAA
* ** * * * ** *
612249 TAATGATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAAATTT-TTTTTTCAAATATTTT
127 TAGTTTTAACTATTTGAACTTGTTCGA-AAACACATTTATTTTTTTTAA-A-TCT
* * * * * * *
612303 CCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAG---T-GTTTATTTCGAATAGGCTTTTATGAACT
1 -CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACT
** * * * * * * * *
612364 AAAACAATAGTTTTATGACCAAACAAAAAATTAAAATAACTCAAAATAGATAATTATTCTAATAG
65 AAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG
* *
612429 TTTTAA-TCATTTGAA-TTGTTCGGCAAACACATTTA--CTTTTTAAATCTCT
130 TTTTAACT-ATTTGAACTTGTTC-GAAAACACATTTATTTTTTTTAAA--TCT
* * * * *
612478 CACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTACTATTTTCA-TCCAAATAGGCTTATATGAT
1 --CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTATATGAA
* * * * * *
612542 CAAAAATAA-TTTTTT-TGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTCAAAT
63 CTAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * **
612604 GGTTGTAACTAATTGAACTAGTTTGAAAA-ATAGTTT-TAGTTTTTAAATCT
128 AGTTTTAACTATTTGAACTTGTTCGAAAACACA-TTTATTTTTTTTAAATCT
* * * * *
612654 CTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGCT-TTATTTTAGTT-TAGATAAGTTTTTAT
1 CTTA-TTAAT--TTTTT-AAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTATAT
* * * * *
612717 GAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAGATAGATAATTATTCA
60 GAACTAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCA
** * * *
612782 AATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTTTAAATCT
125 AATAGTTTTAACTATTTGAACTTGTTCGA-AAACACATTTATTTTTTTTAAATCT
* * * * *
612837 CTTATTAATTTTTTCAGTTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTATGAACTA
1 CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACTA
* * * * * * * *
612902 AGATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
66 AAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGT
*
612967 TTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAAACACATTTATTTTTT
131 TTTAACTATTTGAACTTGTTCG--AAAACACATTTATTTTTT
613009 GTTATTAAAT
Statistics
Matches: 547, Mismatches: 123, Indels: 72
0.74 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
174 5 0.01
175 12 0.02
176 62 0.11
177 114 0.21
178 64 0.12
179 124 0.23
180 64 0.12
181 54 0.10
182 29 0.05
183 19 0.03
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (178 bp):
CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACTA
AAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGT
TTTAACTATTTGAACTTGTTCGAAAACACATTTATTTTTTTTAAATCT
Found at i:613466 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 613020--613489 Score: 470
Period size: 180 Copynumber: 2.6 Consensus size: 177
613010 TTATTAAATT
* * * * * * * *
613020 AGTATTATCTTAATCCAAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTCTATGATAAAAT-AAATA
1 AGTATTATTTTATTCTAAATAATCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGA
* * * * * * *
613084 TCATAACAATTTGAGATATATAATTGTTCAAAAAGTA-ATAACTATTTGAGCTAGTTTAATAAAC
66 TCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTC-AAATGGACATAACTATTTGAACTAATTTAATAAAC
* *
613148 AGATTTAGTTTTTAATAGTCTTATAAATTTTTAAAATCTTAATGAATC
130 AGATTTAGTTTTTAATAGTCTTATAAATTTCTAAAATATTAATGAATC
* * *
613196 AGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTTTAT-AAACAGAAACAATTTTTTTATGACAAAATAAAAG
1 AGTATTATTTTATTCTAAATAATCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAG
* * * ** *
613260 GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTAATTTGGTACA
65 ATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGACATAACTATTTGAACTAATTTAATAAA
* * * * *
613324 TAGATTTATTTTTTAA-ACGTTTTACCTATTAATTTCTAGAATATTAAT-AGATT
129 CAGATTTAGTTTTTAATA-GTCTTA--TA--AATTTCTAAAATATTAATGA-ATC
* * *
613377 AGTATTATTTTATTCTGACA-AA-CTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAG
1 AGTATTATTTTATTCT-AAATAATCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAG
* *
613440 ATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
65 ATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGACATAACTATTTGA
613490 GCTTGTTCAG
Statistics
Matches: 241, Mismatches: 40, Indels: 22
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.01
176 52 0.22
177 67 0.28
179 2 0.01
180 77 0.32
181 38 0.16
182 2 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
AGTATTATTTTATTCTAAATAATCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGA
TCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGACATAACTATTTGAACTAATTTAATAAACA
GATTTAGTTTTTAATAGTCTTATAAATTTCTAAAATATTAATGAATC
Found at i:613775 original size:287 final size:285
Alignment explanation
Indices: 613234--613776 Score: 680
Period size: 286 Copynumber: 1.9 Consensus size: 285
613224 ATAAACAGAA
* * ** *
613234 ACAATTTTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGACA
* * * * * * * * *
613299 TGACTATTTGAACTAATTTGGTACATAGATTTATTTTTTAAACGTTTTACCTATTAATTTCTAGA
66 TGACAATTAGAACTAATTCGATAAAGAGATTTATATTTAAAACGTTTTACCTATTAATTTCTAAA
* * * * * * * * * *
613364 ATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGACAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA
131 ATATTAACAAATTAATATTATTTTAATATGAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * *
613429 CAAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTT
196 CAAAAAAAAAGATCATAACTATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAGCTT
613494 GTTCAGTAAGCCTATATGAATTGAT
261 GTTCAGTAAGCCTATATGAATTGAT
* * **
613519 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGGTAATTACTCAAGTAGTT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGAC
** * *
613584 ATGACAATTAGAACTTGTTCGATAAAGATATTTATATTTAAAATC-TTTTACTTATTAATTATC-
65 ATGACAATTAGAACTAATTCGATAAAGAGATTTATATTTAAAA-CGTTTTACCTATTAATT-TCT
613647 AAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATATGAAAAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTT
128 AAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATATGAAAAA-CTTATATGAACAAAAACAATTGTTTT
*
613712 ATGAGAAAACAAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTT
192 ATGACAAAA-AAAAAGATCATAACT-ATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTT
613775 GA
255 GA
613777 ACTTATTTGG
Statistics
Matches: 216, Mismatches: 36, Indels: 10
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
285 19 0.09
286 114 0.53
287 78 0.36
288 5 0.02
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (285 bp):
ACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGACA
TGACAATTAGAACTAATTCGATAAAGAGATTTATATTTAAAACGTTTTACCTATTAATTTCTAAA
ATATTAACAAATTAATATTATTTTAATATGAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA
CAAAAAAAAAGATCATAACTATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAGCTT
GTTCAGTAAGCCTATATGAATTGAT
Found at i:613835 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 613519--615419 Score: 1500
Period size: 181 Copynumber: 10.4 Consensus size: 180
613509 ATGAATTGAT
* ** * *
613519 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGGTAATTACTCAAGTAGTT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * * **
613584 ATGACAATTAGAACTTGTTCGATAAAGATATTTATATTTAAAATCTTTTACTTATTAATTATCAA
65 ATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTA
* * * *
613649 AATATTAACAAATTAATATTATTTTAATATGAAA-AAGCTTATATGAACAAAA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * * * *
613701 ACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGACA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* *** * * *
613766 TAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAGTTTTCTAA
66 TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAA
* * *
613831 ATATTAATAAATTCGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAA
* * * * * *
613883 A-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGACTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGAGTAA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
613947 TAACTATTTGAACTTGATCGAGAAACA-CTTTCAGTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGG
66 TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-A
* * * *
614011 AATATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTT-AGAGTTAGCTTGTA-GAAATAGAAA
129 AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTGA-AATAAGCTTGTATG-AACA-AAA
* * * * * * *
614064 ACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTTATAATGCTTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTTA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
614129 TAACTATTTGTAC-TGGTCAATCCAACAAATTTATTTTTTAAATTTGTTACTTATTAATTTTGAG
66 TAACTATTTGAACTTGTTCAAT-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-
* * * * * * * * *
614193 GATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTAAATAAGAC-TGTGTCAATAGAA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTGTATGAACAAAA
* * * * * *
614245 ACAACTGTTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* *** *
614310 TAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAA
66 TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AA
* * *
614371 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATCCTGAACA-AA-CTTATATGAACAAAA
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTGAA-ATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * * *
614422 ACATTTGTTTTATGATAAAAGAAAAACATTTGTTTTAGGTCATAAT-AGTTTGTAATAGATAATT
1 ACAATTGTTTTATG--ACAA-AACAA-A--------AGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATT
* * ** * * * * *
614486 GTTCATATAG-CTTTAACTATTTGAA-TTGGTTTGATAAAAAAAATTATTTCTTAAATCTCTTAG
53 GTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-GTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * *
614549 TTATTAATTTTTATAATATTATTACATTAGTATTATTGTGTTCTG-AATAAGCTTGTATGAACAT
116 TTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAACAA
614613 AA
179 AA
* ** * * *
614615 ATAATCATTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATT-TTACAAATAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGTC
* * * *
614679 TTAACTATTTGAA-TTGCTTCAGTAAGTATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
65 ATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-
* ** * **
614743 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTCAAAACAAGCTTGTATGATGAAAA
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * * * * *
614796 ACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCACAAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGTG
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * *
614860 ATAATTATTTGAAC-TGATTCAATAAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAAATTTT
65 ATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-TAATTTT
* * * * ** **
614923 GAAATATTAATAAAGTAATATTTTTTTATTTGGGATAAGCCTT-TATGAAGTAAA
127 TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTGTATGAACAAAA
* *
614977 ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATAT-TTCAAATAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTC
*
615041 ATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTTAAACTTCTTGCTTA-TTAATTAAT
65 ATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTA-TTTTTTAAA--TC-T-CTTACTT-ATTAAT
* * * ** * * **
615105 TTTTCGAATGTTAACAAAAGAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTGAA
124 TTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * * * *
615163 ACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
615228 TACCTATTTGAACTGGTTCAATAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
66 TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AA
* ** * * * * * *
615293 ATATTATTACTTTAGCAATATTTTACTCT-AAATAAGCTTGTATAAATAGAA
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* ** * * *
615344 ACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATATATAATTGATCAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
*
615408 TAACTAATTGAA
66 TAACTATTTGAA
615420 ATGATTTTGT
Statistics
Matches: 1365, Mismatches: 283, Indels: 144
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 1 0.00
177 54 0.04
178 7 0.01
179 5 0.00
180 69 0.05
181 744 0.55
182 191 0.14
183 8 0.01
184 2 0.00
185 21 0.02
186 123 0.09
188 2 0.00
189 64 0.05
190 4 0.00
191 6 0.00
192 5 0.00
193 59 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
Found at i:614628 original size:193 final size:189
Alignment explanation
Indices: 614281--614639 Score: 416
Period size: 193 Copynumber: 1.9 Consensus size: 189
614271 GTTATAATGA
* * * * *
614281 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGATTTACTT
1 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAAAATTACTT
*
614346 TTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATCCTGAACAAACTTA
66 TTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTGTATCCTGAACAAACTTA
* ** *
614411 TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGATAAAAGAAAAACATTTGTTTTAGGTCATAATAG
131 TATGAACAAAAACAATCATTTTATGACAAAAGAAAAACATTTGTTTTAGGTCATAATAG
* * * *
614470 TTTGTAATAGATAATTGTTCATATAGCTT-TAACTATTTGAATTGGTTTGATAAAAAAAATTA-T
1 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAAAATTACT
* * * * * * *
614533 TTCTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTATAATATTATTACATTAGTATTATTGTGTTCTGAATA
65 TT-TTAAATCTC----TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTGTATCCTGAACA
* * * * *
614598 AGCTTGTATGAACATAAATAATCATTTTATGACAAAATAAAA
125 AACTTATATGAACAAAAACAATCATTTTATGACAAAAGAAAA
614640 GGTTATAATG
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 26, Indels: 8
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
188 3 0.02
189 59 0.43
190 2 0.01
193 74 0.54
ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.10, T:0.44
Consensus pattern (189 bp):
TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAAAATTACTT
TTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTGTATCCTGAACAAACTTA
TATGAACAAAAACAATCATTTTATGACAAAAGAAAAACATTTGTTTTAGGTCATAATAG
Found at i:614837 original size:551 final size:539
Alignment explanation
Indices: 613508--615425 Score: 1395
Period size: 551 Copynumber: 3.5 Consensus size: 539
613498 AGTAAGCCTA
* * ** * *
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1 TATGAACTGAAACAATCATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * * * *
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* ** * ** * * * * *
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* * * *
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* *** * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * ** * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *** * *
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* *
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*
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* *
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* ** * ** * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * **
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*
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* * * * * *
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*
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* * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * *
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* *
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* *
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** * *
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* * * * * * * *
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* * * *** * * * ** *
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*** * * **
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* ** * ** *
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* * *
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* ** * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** ** * *
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** * * * * * ** ** * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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** * * * ** ** * * * * * * *
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* *** ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * **** * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * ** * * * ** * * * *
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* * * * *
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** * ** ** * * **
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-CAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AT
* * * * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *** * ** *
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190 TTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTAT
** * * * * * *
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254 TCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAG
* * * * * ** * *
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318 AAATTTTAAA-AAGTAAATTTGTTGACCCAACAAGTCCACATAG
* * * * * * * ** **
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *** * * * *
620421 GATCAATCGT-TAATCTT-AAATCATTA--TCATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
192 GAACTATTATCT-AT-TTCAAATCGTTAGGACAT-TTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTAT
* * ** * * * * * *
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254 TCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA
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620544 G--A-TTTAAAAAATAAATGTGTTTG-TCGACCCAGTTCAAATAG
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* ** ** *** * * *
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* ** * * * * ***
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127 AGT-AT-AAGTAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAGTTCAAATAGTCACGTCTA
* *** * * * ** * *
620775 TTTG-A-TAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTCTTTGATCATAAAATAATTGTTTC-A
189 TTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTA
* * * * * * * * * *
620837 GTTAATA-AAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGT
253 -TTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * * * * * * *
620901 TTAAGATTTCAAAAATAAGTCAATTTATTGA---ATC-AGTTCAAATAA
316 AGAA-ATTT--TAAA-AAGTAAATTTGTTGACCCAACAAGTCCACATAG
* ** * * * * *
620946 TTATGGCCGTTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACA-
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-CAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AT
* * * * * * *
621009 ATTGCTTTCCA-TCATGCAAG-TCTATTCAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
64 AATG-TTTCTATTCATACAAGAT-TATTCAAAATAAAATAAAACTAATTCATTAATATTTTAAAA
* * * * * * *
621072 ATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCT-GTT--T-AAC--GATCCAAT--T----TCAAT
127 AGTA-TAAGTA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAGTTCAAATAGTCACGTCTAT
* * * * ** * *** * * *
621125 TTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGT
190 TTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTA-T
* ** * * * *
621189 TCATATAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTA
254 TCATACAAAATTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGT-
* * ** * *
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* * * * ** * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAATAA
* * * ** * * * ** *
621360 T-TCTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTACAAAAAT
66 TGT-TTCTA-TTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTCATTAATATTTTAAAAAG
* * * * * * ** * * * * *
621424 TAAAAAGTA-AGTTATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTGAATTAGTTCAAAAAATTATGACCT-T
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* * * * * ** * *** * * **
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190 TTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTATT
* ** * *
621546 CATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAAG-AG--
255 CATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAA
* * * * * * * * *
621608 A-TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAGCTAGTTCAAAGAG
320 ATTTTAAAAAGTAAATTTGTTGACCCAA-CAAGTCCACATAG
* * * *
621648 TTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTACAACC-TTTTGTTTTGTCAT-AAA-A
* * * * * * ** * ** *
621712 ATTAT-TTT-TGTTGATACAAGCTTATTCGAAAA-AAAGTCATTCTAA-TCTAATAATATTCCAG
62 ATAATGTTTCTATTCATACAAGATTATTC-AAAATAAAATAAAACTAATTC-ATTAATATTTTAA
* * * * * * * * * * *
621773 AAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTT-CCCGAACCAA-TTCAAATATTTAGGA
125 AAAGT-ATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AA-CAAGTTCAAATAGTCACGT
* * * * * *** * *
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186 CTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTC
621901 TATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-
251 TATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * *
621965 AG--A-CTTAAAAAATAAATCTGTTTG--TGAAGCCAA-TTCAAATAG
316 AGAAATTTTAAAAAGTAAATTTG-TTGACCCAA--CAAGTCCACATAG
* * * *
622007 TTATGACTATTTGATCAATCATCGATCTT-AAATCATTATC-ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTA-CAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
* * * * * ** * * *** * * *
622069 -ATTGTTT-TTTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAACATATTCCAAAATT-AATAATATTCTAAAA
63 TAATGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAAC-TAATTCATTAATATTTTAAAA
* * * * * * ** * * *
622131 ATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGACCCTGTTCAAATAGTTAAGACTA
127 AGT-ATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAGTTCAAATAGTCACGTCTA
** * * * ** * * * * ** * *
622195 TTAAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTTGACCTTTTATTTAGTCATTAAATAATTGTTTCAAC
189 TTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTA-
** * * * *
622260 TT-ATAC-ATGTATATTAAAAATAAAATAACT-CTAAGTTATTAACATTT-AGAAAACTAATAAA
253 TTCATACAAAAT-TATTCAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AA
** * * * * * * * *
622321 CAAGAAATTTAAAAAAACT-AATTCTATTTA-CAAATAAGTTCAAATAG
314 GTAGAAATTT-TAAAAAGTAAATT-TGTTGACCCAACAAGTCCACATAG
* * * * * **
622368 TTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTG-TTTGATCAT-AAAATA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTGTTTTG-TCATAAAAATA
* * * * * * * * * *
622430 ATTGTTTC-AGTTAATAAAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTAATTAATATTTTAAAAA
65 A-TGTTTCTA-TTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTCATTAATATTTTAAAAA
* * * * * * * * * **
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128 GT-ATAAG-TAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAA-CAAGTTCAAATAGTCACGT-CTA
* * * * * ** * * *
622557 TTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGA-ATTTTTGCTT-TGTCATAAAACAATTTCTTTC
189 TTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACA-TTTTG-TTCAATCA-AAAAAAAATTGTTTC
* * * * * * * *
622620 CA-TCATGC-AAGTCTACTCGAAGTAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACT-AG
251 TATTCATACAAAAT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * **
622682 ATATGAGA-TTTAAAAAGTAAATCTGTT----TAATGA-T-C-CA-A-
315 -TA-GAAATTTTAAAAAGTAAATTTGTTGACCCAACAAGTCCACATAG
* * * * * *
622720 TTCT---TA-TTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTCTGTTAT-AAAATA
1 TTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAATA
* * * * * * * *
622780 ATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTTATTTGA-TAATATTATAAA
65 A-TGTTTCTA-TTCATACAAGATTATTC-AAAATAAAATAAAAC-TAATTCATTAATATTTTAAA
* * * * * * * *** *
622842 AATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGCAA-TTCAAATAGTTAAAACC
126 AAGT-ATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAA-CAAGTTCAAATAGTCACGTCT
* * * * * * *** ** * *
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188 ATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTA
* * * *
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253 -TTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * * * ** * * *
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316 -AGAAATTTTAAAAAGTAAATTTGTTGACCCAA-CAAGTCCACATAG
* * * ** ** *
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1 TTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTGTTTTGTCATA-AA-AA
* ** ** * * * *
623143 T--TGTTT-T-TTAACATTCAATCTTATTCGGAATAAAATAACACTAATTTATTAATCTTTCAAA
63 TAATGTTTCTATT--CATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTCATTAATATTTTAAA
* ** * * * * *
623204 AA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGTTAGGTCAAAGAGTTATGGCTA
126 AAGTATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAA-CAAGTTCAAATAGTCACGTCTA
* * **** * ** * *** * * * *
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189 TTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGA-CATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTA
** * * * * * * *
623330 TTGGTA-AAAGATTATTCGAAA-AAAA-AATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTA
253 TTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-
* * * * * ** * *
623392 AGAGAA--TAAAAAAATAAATTTATT-TCCCGAACTAGTTGAAATAT
316 AGA-AATTTTAAAAAGTAAATTTGTTGACCC-AACAAGTCCACATAG
* * * ** * ** *
623436 TTACGACTGTATGAACAATTATCTATTTGGAATCTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA-A
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-ATA
* ** * * ** *
623500 TTGTTTCTATTTGTACATG-TATATTAAAAATAAAATAACTCTAAGTT-ATTAACA-TTTAGAAA
65 ATGTTTCTATTCATACAAGAT-TATTCAAAATAAAATAAAACTAA-TTCATTAATATTTTA-AAA
* ** * * * * * *** *
623562 ATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAATTCTACTTAC-AAACAAGTTCAAATTGTTTTGACTA
127 AGT-AT-AAGTAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAGTTCAAATAGTCACGTCTA
* *** * ** * *
623626 TTTG-A-TAATTATCTATTTAAAATAAATATGACATTTTGTTTGATCATAAAATAATTGTTTC-A
189 TTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTA
* * * * * * * * * *
623688 GTTAATA-AAAGTTTATCCAAAATAAAATGACATTACTTAATTAATATTTTAAAAATTCATAAGT
253 -TTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-
* * * * * * * *
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315 TAGAAATTT--TAAA-AAGTAAATTTGTTGACCCAACAAGTCCACATAG
* ** * * * * * *
623797 TTATGGCCGTTTGAGCTATTATGTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACA-
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-CAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AT
* * * * * * * *
623860 ATTGCTTTGC-A-TCATGCAAG-TCTATTCGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAA
64 AATG-TTT-CTATTCATACAAGAT-TATTCAAAATAAAATAAAACTAATTCATTAATATTTTAAA
* * * * * *
623922 AATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCT-GTT--T-AAC--GATCCAAT--T--C-T-TA
126 AAGTA-TAAGTA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAGTTCAAATAGTCACGTCTA
* * * ** * *** ** * *
623975 TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCCTAAAATAATTGCTT-TAG
189 TTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTA-
** * * * *
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253 TTCATACAAAATTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT-AAG
* * * * ** * *
624102 AAGAGATTTGAAAAA-TAAATATGTTTG-CTGAAGCAA-TTCAAATAG
315 TAGAAATTTTAAAAAGTAAATTTG-TTGACCCAA-CAAGTCCACATAG
* * * * * ** * *
624147 TGAAGACCATATGAACAATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCCT-AAAATAA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAATAA
* * * * * * * ** *
624211 TTTTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGCAAAAATT
66 -TGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTCATTAATATTTTAAAAAGT
* * * * * * * * ** * * * * * * *
624276 AGAAAGTAAGTGATTCAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATTAGTTCGAACAATTATGACCT-TGT
130 A-TAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAGTTCAAATAGTCACG-TCTATTT
* * * ** * *** * * * * *
624340 CAACAATTATCTATTTCTAA-CGGTTATTACATTTTCTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-A
192 GAACTATTATCTATTTCAAATC-GTTAGGACATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCT-ATT
* * ** * * * *
624403 AATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAGTTAATAAG-AG--
255 CATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAA
* * * * * * *
624465 A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAGCTAGTTCA-AGGAG
320 ATTTTAAAAAGTAAATTTGTTGACCCAA-CAAGTCCACA-TAG
* **** * *
624505 TTATGGCTATTTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTATGTCATAAAACAA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACC-TTTTGTTTTGTCAT-AAA-AA
* * * * * ** * **
624570 TTATTTTTC-CTT-ATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATTCTAA-TCTAATAATATTCCAAAA
63 TAATGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTC-ATTAATATTTTAAAA
* * * * * * * * * * *
624631 ATTAGTAACTAAGAGAATAAAAAAATAAAT-T-TTT-CCCGAACCAGGTCAAATAATTAAGACTA
127 AGTA-TAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAGTTCAAATAGTCACGTCTA
* * * ** * * *** * *
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*
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254 TCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA
* * ** * *
624821 -A-CTTAAAAAATAAATTTGTTTG--TGAAGCCAA-TTCAAATAG
319 AATTTTAAAAAGTAAATTTG-TTGACCCAA--CAAGTCCACATAG
* * * *
624861 TTATGACTATTTGATCAATCATCGATCTT-AAATCATTATC-ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTA-CAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
* * * * * * ** * *** * *
624923 -ATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAAATATTCCTAAATT-AATAATATTCTAAAA
63 TAATGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAACT-AATTCATTAATATTTTAAAA
* * * * * * * * *
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** * * ** ** * * ** * *
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* *** * * *
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* * ** * * ** * * *
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* * * * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAC-AACCTTTTGTTTTG-TCATAAAAAT
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * **
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* * * ** * * * *
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251 TATTCATACAAAAT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * **
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * *** ** * *
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** * *
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* * * * ** * * *
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* * * ** ** *
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* * * * ** * ** * * *
625997 T--TGTTTTTGA-ACATTCAAGCTTATTCGGAACAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAA
63 TAATGTTTCT-ATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTCATTAATATTTTAAAA
* * * * * * *
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127 AGTATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAA-CAAGTTCAAATAGTCACGTCTAT
* **** * ** * * * * * * *
626120 TTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTT--GTCATAAAACAATTATTTTTGT
190 TTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGA-CATTTTGTTCAATCAAAAAAAAATTGTTTCTAT
* ** * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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*
626416 -TAA-TATGAGACTTAAAAAATAAAT
130 ATAAGTA-GAGATTTAAAAAATAAAT
626440 ATGTTTGTGA
Statistics
Matches: 6590, Mismatches: 1605, Indels: 1075
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
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** * * *
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* * ** * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * * ** * *
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* * ** *
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* * * * * * *
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** * * * *
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*** * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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** ** * *
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* * * * * * **
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* * * * * ** * *
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128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* ** * * * **
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* *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * *** *
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* * * * *
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* * * * * *
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** * * * * ** *
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
623054 TTGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-TGT-CAACAATTATCTAT
130 CTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT-TAGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTT--CATACAAGCTTATT
* * *
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** * * * * * ****
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128 ATCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * ** * *
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1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
** * * * ** *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCT-TATT
** * * * ** *
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64 CGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT
* ** * * * * * *
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126 AAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * * * * *
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * ** * * * *
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129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* ** * * * *
623823 TTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-GCATCATGCAAG-TCTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAG-TTCATACAAGCT-TATT
* * * * * *
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64 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* *
623951 ATCTG-TT--T-AA-C-GATCCAAT--TCT-T-A-T-TTA-AACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGT-TATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * *
623992 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCCTAAAATAATTGCTTTAGTTCATACAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-
* * * * *
624057 GAAA-AAGATAATACTAATTTAATAGTATTATAAAAATTAATAAAG-AAGAGATTTGAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
624120 ATATGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTGAAGACCA-TATGAACAATTACCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
* * * *
624173 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATT-TTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTC
* * * *
624237 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAGA-AAGTAAGTGATTCAAAAAGTGA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * ** * * * *
624301 ATTTGTTTACTAAATTAGTTCGAACAATTATGACCT-TGT-CAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT-TAGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * *** *
624354 TTCTAA-CGGTTATTACATTTTCTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAAAATTCAAGCTTATTC
1 TTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * *
624418 GAAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * ****
624479 TCTGTTTACT-AAGCTAGTTCAAGGAGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAAT
129 TCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * **
624531 TTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTTTCCTT-ATACAAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT
* * * * * * *
624595 CGAAA-AAAATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAGTAACTAAGAGAATAAAAAAATAA
64 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
624659 AT-T-TTTCCCGAACCAGGTCAAATAATTAAGACTA-TATGAACAATTATCTAG
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
** * * * **
624710 TTGGAATCTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* *
624774 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
624835 TTTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCGAT
129 TCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * *
624887 CTT-AAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTGTTC
1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * *
624950 GGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACTAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAA
* * * * *
625015 ATGTGTTT-GTCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * * * * * * ** *
625068 TTCAAATTGTTTTGACCCTTTGTTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAATTTATACGTG-TATATTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTC
* * * ** *
625132 AAAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAACAA-AAATTTAAAAAAAAT
65 GAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAAT
* * * * * * *
625195 AATTCTATTTA-TAAACAAGTTCATATTGTTATGACTATCT-G-ATAATTATCTAT
126 AAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * *
625248 TTAAAATAAATCTAACCTTTTG-TTTGATCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * * *
625312 GAAATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAG
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * * *
625377 TCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCGT-TTA-AGCAATTATGTAT
129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAT-GAC-TATTAGAACAATTATCTAT
* ** * * * *** * * *
625429 TTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTCCATCATGCAA-TTCTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTC
* * * * * *
625493 GAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAGAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * **
625558 TCTGTTTAATG----A--TCCAAT--TCCT-A-T-TTA-AACAATTATCTAT
129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * *
625598 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAAATGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-
* * * * *
625663 GAAA-AAGATAAAACTAATTTAATAATATT-ATAAAATTTAATAAATAAGAGATTTGAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
625726 ATTTGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCA-TATGAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
* * * * * *
625779 TTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTCTCGTAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCCTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
** * *
625844 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAA-AAGTAACTGATTTAAAAAGTGAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * *
625908 TTGTTTACT-AGATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGT-CAACAATTATCTAT
130 CTGTTTACTGA-ACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT-TAGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * ** *
625959 TTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
626024 GAACAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ****
626085 CTGTTTACT-AAGCTAGTCCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAAT
130 CTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * *
626136 TTCAAATCATTATAACCTTTT-TGTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * *
626200 AAA-AAAATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * *
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130 CTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
* * * * **
626315 TTCGAATCGTTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* * *
626378 AAAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-T--GAGACTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
626439 TATGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCGAT
129 TCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * *
626491 CTT-AAATCATTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTGTTC
1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * *
626554 GGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
626619 TGTGTTT-GTCGACCCTGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTAT
129 TCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * * * * * * *
626671 TTCAAATTGTTTTGACCATTTATTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTAT-TAA---TATTTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTC
* * * * * ** * ***
626732 AGAAAT-TACTAGGTA-TGAGATTTA--AAAAGT-AAATCTGT-TTAACGATCCAATTCCTATTT
65 -GAAATAAAATA-ATACT-A-ATTTATTAATATTCAAAAAT-TAATAA-G-T--AA--GAGATTT
* * * * * ** ** * * * * * *
626791 AAACAAT-TATCTATTT-C-AAATCA-TTGTAA-CCTTTTGTTCTGTTATAA-AATAAT-TGT
119 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * * * * * * * **
626847 TTCAGTTCA-TATAAGC--TTATTCTG--AAAAAGATAATACTAATTTAATAATATTATA-AAAA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAAT--T-GTTT--TAGT-TCATACAAGC
* * * * * ** * *
626906 TTAAT--AAATAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTT--TGCTGAAGCAATTCAA-ATAGTTAAGA
59 TTATTCGAAATAA-A-A--T-AATACT-AATTTATTAATATTCAA-AAATT-AATA-AG-TAAGA
* * * * * * * * * * ** * *
626966 CCATATGAACAAT-TATCTATTT-C-AAATCA-TT---ATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAATAA
114 -GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAAT-A-GTTATG-ACTAT--TAGAACAA
627024 TT-T-T-T
173 TTATCTAT
** ** ***** *** * * * **
627029 TT-AGTTCA-TAAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTA-AT-ATTACAA--AAA
1 TTCAAATCATTATGA-CCT-TTTGTTTTGTCATAA-AATAATTGTTTTAGTTCA-TACAAGCTTA
*** * * * * * * * * * **
627087 TAAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTT--TACT-AGATTAGTTCAAATAATTATGACC
62 TTCGAAA-TAA---A-AT-AATACT-AATTTATTAATATTCA-A-AAATT--AATAAGTAAGAGA
* * * * ** * * * ** * * *
627149 TTGTCAACAAT-TATCTATTT-CT-AA-TTGTT--ATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTG
116 TT-TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATA-GTTATGACT-AT--TAGAACAATTA
627208 T-T-T
176 TCTAT
* * * * ** * * * *
627211 TT-GAA-CATTCAAG-CCTATTCG----G-AATAAAAT-A--GTACTAATTTAT-TAATC-T-TT
1 TTCAAATCATT-ATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT
* ** ** * * *
627262 C--AA-AAATTAATAAGAGATTTA--AA-A---AATAAATCTGTTTACTAAGCTAG-TTTAAAGA
64 CGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTCAA-AAAT-TAATAAGTAAG--AGATTTAAAAA
* * * * * * ** * * *
627317 GT-TAT-TGCTATT--TGAA-CAATTGCAAAT--TT-TAAATCATTATAACCTTTTTGTTT
124 ATAAATCTG-T-TTACTGAACCAGTT-CAAATAGTTATGACT-ATTAGAACAATTATCTAT
* * * ** * *
627370 TGTCATAAAACAATTAT----TTTTGTTGATATGAGCTTATTCGAAAAAAAATAATTCTA-ATC-
1 T-TC--AAATC-ATTATGACCTTTTGTT--T-T--G-TCA-T---AAAATAATTGTTTTAGTTCA
* * * * * * * **
627429 TA-ATA--ATATTC-CAA-AAATTAATAACTAA--GA-GAATA--AAAAAATAAATTCGTTTCCC
52 TACA-AGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAG--T---
* * ** * * * * * *
627484 GAACTAG-TTCAAATATTTAAGA-CTGTATGAACAATTATCCATTTCGAATCGTTATGAC-ATTT
110 -AA-GAGATTTAAA-AAATAA-ATCTGT-T-TAC--TGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT
* ** *
627546 TG---TTTTGTC-A-
166 AGAACAATTATCTAT
* ** * ** *
627556 -TCAAA-CAAT-TGTTTCTATTCGTACAAAATTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAA
1 TTCAAATCATTATG-ACCT-TTTGT------TT-TGTC---ATAAAATAAT--TGTTTTAGTTCA
** ** * * * * * * *
627616 TATTTCAAAAATTAATAAGAGACTTAAAA-AATAAATATGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTA
52 TA---C-AAGCTT-ATTCGA-A-ATAAAATAAT-ACTA-ATTTATTAA---TATTCAAA-AATTA
* * * * * * ***
627680 TGACTATTTGATGAATCATCGATCTTAAATCATTATCATCTTTGTTT--TG-TCCTAAAAC-AAT
104 --A-TA--AG-T-AA-GA--GAT-TTAAA-AAATA-AATC--TGTTTACTGAACC-AGTTCAAAT
* * * * * *
627741 TGTTTTTG-TTCA-TA-AA-AGCTTGTTCGGA-
153 AG-TTATGACT-ATTAGAACA-ATT-ATC-TAT
* * * ** * * * ***
627769 GTAAAAT-ATT-TCTA-AATTAGTAATAT-TC-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATA
1 TTCAAATCATTAT-GACCTTTTGT--TTTGTCAT-AAAA-TAAT-TGTTTTAG-TTC-----ATA
* * * *
627829 -AATGTGCTTA-TCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTAAAACAATTATCTATTTCAAATT
54 CAA---GCTTATTCGA---A-AT-AAA-A--TAATACTAATT-----TATTA-ATA-TTCAAA--
** * * * * ** * * *** * * * *
627891 GTTTTGACCCTTTATTTAGTCA-TGAAATAATTGTTTCAGTTTATACATGTA-TA-TTAAAAATA
99 -AATT-A---ATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTG-TT-TAC-TGAACCAGTT-CAAATA
** * * *** *
627953 -AAATAACT-CTA-AGTTATTAAC-AT
154 GTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * ** ** * * * *
627976 TT-AGAA-AATTAATAAAC--AAGAAATT-TAAAAAAATAATTCTATTTA---CAAACAAG----
1 TTCA-AATCATT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAATAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTA
** * * * * * * * ** *
628029 TTC-AAATAGTTATGACTATCTGA-TAATTATCTATT-TAAAATAAATATGACCTTTTGTTTGAT
62 TTCGAAATA-AAAT-AATA-CTAATTTATTA-ATATTCAAAAATTAATA--A--GTAAG--AGAT
* * ** * * * ** * ***
628091 CATAAAATACTCATTTCAG-TTAAT-AA-AAGTTTATCTGAAATA-AAATCAC-ATTA-CTTAAT
117 -TTAAAA-AAT-AAATCTGTTTACTGAACCAG--T-TC--AAATAGTTATGACTATTAGAACAAT
*
628150 TA-ATAT
174 TATCTAT
* * ** ** ** *** * * * *
628156 TTTAAA-AATTGAT-AAGTTAGAGAATTAAAAAATAAATCAATT-TATTGAATGGGTTCAAATAA
1 TTCAAATCATT-ATGACCTT-TTGTTTTGTCATA-AAAT-AATTGT-TT---T-AGTTCATACAA
** *** * ** * ** **
628218 --TTA-T-G-GCT-GTTTAA-GC-AA-TTATGT-AT-TTCAAATCGTT-ATGAATTTTTG-TTTT
57 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCAAA-AATTAAT-AA-GTAAGAGATT
* * * * ** * * ***
628270 GTCATAAAA-CAAT-TGCTTTCCATCATGCAAGTCTA-TTCGAACTA-AAAT-AATACTA-ATTT
118 -T-AAAAAATAAATCTG-TTT--A-C-TG-AA--CCAGTTC-AAATAGTTATGACTATTAGAACA
*
628329 ATTA-ATAT
172 ATTATCTAT
* ** * * * * *
628337 TTCAAAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGT-TTAACGATCCAA-T-TCTTA-TT
1 TTC--AAA-T-C-A-TTATGACCTTT----TGT---TTTGTCATAA-AAT--AATTGTTTTAGTT
* * * ** * * ** * * ** *
628398 TAAACAA--TTA-TCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTT-TGTTCTGTTATAAAATAGTTGTTTT
50 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT-AATACTAA--TTTAT-TAATATT-CAAAA-A-TT-AATA
* * * * * * * *
628458 AGTTCATATAAGCTTATTCTGAAAAAGAT-AATACTAATTAAAT-AA-TATTATAAAAATTAATA
107 AG-T-A-A-GAG---ATT-T-AAAAA-ATAAAT-CT-GTTTACTGAACCAGT-T-CAAA-TAGT-
* * * * * *
628520 AATAGGA-GATTTGAAAAATAAATCTGT
156 --TATGACTATTAGAACAAT-TATCTAT
* * * *** * ** * * * ** **
628547 TTGCCGAAGCA--AT-TCAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATGA
1 TT--CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATA-AAATAATTG--T-TTT-AGTTCA-TACAA
*** *** * * ** *
628609 GCTT-TT-GTTTTATCCTAAAAC-AATTT-TT--TAGTTCAAAAAAGTTTATTTG-AA-ACA---
57 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-AAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * ** * * * *
628663 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTACAAAAATT-AAAAAGTAAGTGA-T-TTA-AA-AAGTGAA
119 AAAAAATA--AATCTGTT--TACTGA-ACCAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTAGAACAA-T-TA
* *
628722 TTTGT
176 TCTAT
* * * ** * * * * * ** **
628727 TTACTAAATTAGTTCAAT-A-ATTATGACCTTATCA-ATAATTATCTATTTCTAATTGTTATTAG
1 TT-C-AAATCA-TT--ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAATAAT-TGTTT-TAGTTCATACAAG
* * * ** ** * *
628789 CTTTTGTTTGGTCACATAACAATTGTTTTTGAA--CATTCAAGCTTATTCTGAATAAAATAAT-A
58 C--TT-ATTCG--AAATAA-AA-TAATACT-AATTTATT-AA---TATTC--AA-AAATTAATAA
* * * * *
628851 CTAATTTATTAATCTTTAAAAAATTAATAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAGCTAGTT
108 GTAA--GA--GA--TTTAAAAAAT------------------AAATCTGTTTACTGAA-CCAGTT
* * ****
628915 CAAA-AGGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAAT
148 CAAATA-GTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * *
628948 TTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * *
629013 -AAAAAAAATAATTA-TAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
629076 ATTTGTTTCCTGAACCAATTCAAATATTTAAGACT-GTATGAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
** * * * * * **
629129 TTGGAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* *
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * **
629254 TATGTTT-GTGAAGCCATTTTAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGAT
129 TCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
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1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * **
629369 GGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTGGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
629434 TGTGTTT-GTCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATATAT
129 TCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * * * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTC
* * * ** * *
629550 AAAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAAAT
65 GAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-
* ** * * * * *
629614 AAT-TCGATTTAC-AAATAAGTTCAAATTGTTATGACTATTTG-ATAATTTTTTAT
127 AATCT-G-TTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
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1 TTCAAAT-CAT--TATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA
* * *** * * ** * *
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* *** * * * * ** * * *
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126 AAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* ** ** * * *** *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTC
* * * * ** *
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAA
* * **
629979 ATCTG-TT--T-AA-C-GATCCAAT--TCCT-A-T-TTA-AACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
630020 TTCAAATCATTATAACCTTTGGTTCTATTATCAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-
* * * * *
630085 GAAA-AGAATAATACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
630149 TCTGTTTGCTGAAGCAATTTAAATAGTTAAGACCA-TATGAACAATTATCAAT
129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
* * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
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66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * *
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130 CTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT-TAGAACAATTATCTAT
** ** * * * * * ** *
630381 TTTTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTC-
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* *
630445 AGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
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* * * * * * *
630506 TCTATTTACT-AAGCTAGTTCAAAAAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAAT
129 TCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC-TAT
* * * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * *
630623 GAAA-AAATATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGAATAAAAAAATAA
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* * * * * *
630687 ATTTGTTTCCCGAACCAGTTAAAATATTTAAGA-T-TGTATGAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TA-GAACAATTATCTAT
** * * * * **
630740 TTGGAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* *
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * **
630865 TATGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGAT
129 TCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * *
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1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAA-GCTTATT
* * * * * * * *
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* * * ** *
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128 ATCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * * * * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTC
* * * * * ** *
631161 AAAATAAACTAACT-CTAATTTGTTAACATTTAGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATA
65 GAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATA
* * * * *
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127 AATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * * *
631340 GAAATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAG
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * *
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** * * *** *
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* * * * **
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * **
631586 TCTG-TT--T-AA-CA-ATCCAAT--TCCT-A-T-TTA-AACAATTATCTAT
129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * *
631626 TTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTGTTATAACATAATTGTTTTAGTTCA-ATAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * *
631689 TGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAA
65 -GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
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128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
* * * * * * *
631806 TTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTGGTTCATAAAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
631871 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * *
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130 CTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT-TAGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * ** * *
631987 TTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAGGCTTATTC-
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
*
632051 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
66 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * *
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65 GAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * *
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* * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGT-TTT-AGTTCATACAAGCTTAT
* * * *
632410 T-TAGGATAAAATAA-A-TAAATTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
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* * * * * * * * *
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* ** * * * * * * *
632529 TTCAAATCATTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAACAAGTGTTTTTGTTGATATAAGTTTGTTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
** * * * * *
632594 -AGAATAAGGTAAAACTAA-TCATTTATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGTTTTAAAAAATAA
65 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * *
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128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * ** * *
632706 TTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTCTAT-TTTTAAAA-AGTTGTTTTTG-TCTATACAAGCTTAT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTC-ATACAAGCTTAT
* * * *
632768 TTG-GATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAAA
63 TCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAA
* ** *** * * *
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125 TAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTAT
* * ** * *
632887 TTTAAATCGTTATGATATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * ** *
632950 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAGAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
633015 TCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATATAT
129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * ** *
633067 TTCAATTCATTATGA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAAACAAAATTATTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* * *
633130 AAAATCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAATTAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
633191 TCTGTTTA-TGAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTAT
129 TCTGTTTACTG-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * *
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1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATT
* * * * * *
633305 C-AGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
64 CGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
633369 AATGTGTTTGCCGAGCTAG-TCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTAT
127 AATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * *
633476 AAATAAAATAACT-CTAATTTCTTAACATTTAGAAAATTAATGAA-AAAGA-AATTAAAAAACAT
66 AAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATA-
* ** * * *
633538 AATGCTATTTACCAAACAAGTTCATATAGTTATGACTATCT-GAATAATTATCTAT
127 AAT-CTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
633593 TTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * * * *
633658 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * *
633723 CAATTTA-TCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTAT
130 CTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * **** * *
633774 TTCAAATCATTATGAACTTTTG-TTTGTCATAAAGTAATTGCTTTCCAACATACTAG-TCTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTC
* * *
633837 GAAATAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
* * *
633902 ATTTG-TT--T--ACC-GATC---TAG-T-T-ACTATTTGAACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
633943 TTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCATATTTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * *
634008 AAATAAAAATAA-AGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAA
66 AAAT-AAAATAATA-CTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * *
634072 ATTTGTTT-GTCGAAGCAGTTCAAATCGTTATGACCATATA-AACAATTATCTAT
128 ATCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAACAATTATCTAT
** * * * * *
634125 TTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCAGCTCATAAAAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTC
* * * ** *
634189 GAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTGGAAAATGAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * *
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129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT-TAGAACAATTATCTAT
** * * * * * ** *
634306 TTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-TTTTTGAACATTCAAGCTTATTC-
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
*
634369 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
66 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
634434 TCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTA-AACAATT-GCAAAC
129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATC-TAT
* * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * *
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
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129 TCTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTAT
* * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TGTTTT-AGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
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* * * ** * * * ** *
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* * * * * * * * * * *
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128 ATCTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * ** * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * *
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* * * * * * * * *
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128 ATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * *
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* * * * **
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65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
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129 TCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGT-TATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* ** * * **
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* **
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* ** * * *
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129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-G----A--TC---AAATT-T-A
* * * ** * * *
621483 C-CTTGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTC------CAATTGTTT
182 CAATT-TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TT
** * * * * *
621541 TTA-AACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATGTTTCAAAAA-T--TAA
245 TTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAA
621602 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAGCTAGTTC
308 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * *
621642 AAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTGTTTTGTCA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGAA-C-TTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
621705 TAAAACAATTATTTTTGT-TGATACAAGCTTATTCGAAA-AAAAGTCATTCTAATCTAATAATAT
63 TAAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
621768 TCCAGAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCCGAACCAATTCAAATATTTA
125 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT----AA-CGA-TC-AA-ATTT-
* * ** * * * * *
621833 GGACTATATGTACAATTATCTATTTCGAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
181 --ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
** * *
621898 TTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T
244 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAAT
* * * *
621959 AATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTC
306 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAG-CAGTTC
* * * * *
622001 AAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCGATCTT-AAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * * *
622064 AAACAATTGTTTTTT-TCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAACATATTCCAAAATTAATAATA-TTCT
65 AAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * *
622127 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATGTGTTTGTCGACCCTGTTCAAATAGTTA-AG
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T--A-AC-GATCAAAT--TTACA-
* ** * * * * *
622191 ACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTTGACCTTTTATTTAGTCATTAAATAATTGTTT
184 A-T-TT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * ** * * * *
622256 CAACTT-ATACATG-TATATTAAAAATAAAATAACT-CTAAGTTATTAACATTTAGAAAACTAAT
246 -TAGTTCATACAAGCT-TATTCGAAA-AAAATAA-TACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAAT
* * * * **
622318 AAACAAGAAATTTAAAAAAACTAATTCTATTTAC-AAATAAGTTC
306 -AATAAGAGATTT-AAAAAA-TAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * * *
622362 AAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTG-TTTGATCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTG-TCATA
* * * * * * * * * *
622425 AAATAATTGTTTCAGTTA--ATAAAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTAATTAATATTT
65 AAACAATTGTTT--TTTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
622488 TAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATCAGTTTAAATAATTATT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC--TGT-TT-AA-C-GATCAAAT--TTA--
** * * * ** * * *
622553 GCCGTTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGAA-TTTTTGCTTTGTCATAAAACAATT-TC
182 -CAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-
*** * * * *
622616 TTTCCATCATGCAAG-TCTACTCGAAGTAAAAA-AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAC
244 TTTAGTTCATACAAGCT-TATTCGAA--AAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAA
* * * *
622679 TAGATATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTA---ATG-A--TC
305 TA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * *
622717 -CA-A-TTCT---TA-TTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTCTGTTAT
1 AAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
622774 AAAATAATTGTTTTAGT-TCATATAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTTATTTGA-TAATAT
64 AAAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTC--AAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATAT
* * *
622836 TAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTT
125 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T-AA-CGA-TCAAAT--TT
* * * * * * * *
622900 AAAACCATATGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTTCCTAAAATAATTT
181 ---ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * *
622965 TTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAA
243 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAAT
* * * * * * * *
623030 AAGTAAGCGATTTGAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATCAGTTC
306 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * ** * * *
623073 AAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATA
1 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
623137 TAACAATTGTTTTTTAACATTCAATCTTATTCGGAATAAAATAACACTAATTTATTAATCTTTCA
65 AAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
623202 AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAGTTAGGTCAAAGAGTTATGGC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA--ACG--A--TC-AA-A-TT-T-AC
* * * **** *
623263 TATTTGAACAAATGGAAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
183 AATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
* ** * * * * * *
623328 TGTTGGTAAAAGATTATTCGAAAAAAA-AATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTA
247 AGTTCATACAAGCTTATTCGAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-TA
* * * * * *
623392 AGAGAATAAAAAAATAAATTTATTTCCCGAA-CTAGTTG
310 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * * ** *
623430 AAATATTTACGACTGTATGAACAATTATCTATTTGGAATCTTTATG-ACATTTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
623494 AAACAATTGTTTCTATT-T-GTACATG-TATATTAAAAATAAAATAACT-CTAAGTTATTAACAT
65 AAACAATTGTTT-T-TTATCATACAAGCT-TATT-CAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
623555 TT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAATTCTACTTACAAACAAGTTCAAATTGTT
125 TTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCT-GTT--TAAC--GATCAAA----T
* * * * * * * *
623619 TTGACTATTT-GATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACATTTTG-TTTGATCATAAAATAATT
179 TT-ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATT
* * * * * *
623682 GTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATGACATTACTTAA-TTAAT-AT-TTTAAAAAT
242 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAAT-A-A-TAC-TAATTTAATAATATTTAAAAAT
* * * * * *
623744 TCATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATCAGTTC
302 TAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * ** * * * * *
623791 AAATAATTATGGCCGTTTGAGCTATTATGTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* ** * * *
623856 AACAATTGCTTTGCATCATGCAAG-TCTATTCGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCA
66 AACAATTGTTTTTTATCATACAAGCT-TATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * *
623920 AAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAACGATCCAA-TT-CTTATTTAAACA
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACGATCAAATTTAC-AATTTAAACA
* *
623983 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCCTAAAATAATTGCTTTAGTTCATACAA
193 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAA
* * * *
624048 GCTTATTCTGAAAAAGATAATACTAATTTAATAGTATTATAAAAATTAATAAAGAAGAGATTTGA
258 GCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAA
* * * *
624113 AAAATAAATATGTTTGCTGAAGCAATTC
320 AAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * * * * *
624141 AAATAGTGAAGACCATATGAACAATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCCTAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
624206 AATAATT-TTTTCTGT-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGC
66 AACAATTGTTTT-T-TATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * *
624269 AAAAATTAGA-AAGTAAGTGATTCAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATTAGTTCGAACAATTATG
128 AAAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T-AA--CGATC--A-AATT-T-
* * * * * * * * * *
624333 AC-CTTGTCAACAATTATCTATTTCTAA-CGGTTATTACATTTTCTTTGGTCATATAACAATTGT
181 ACAATT-TAAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* *** * * * * * *
624396 TTTTGAAAATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAGT--TAA
244 TTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAATTAATAA
*
624459 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGCTAGTTC
308 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
** * **** *
624499 AAGGAGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTGTTATGTCAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-C-TTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * * *
624563 AAAACAATTATTTTTCCTTATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATTCTAATCTAATAATATTCC
64 AAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
624627 AAAAATTAGTAACTAAGAGAATAAAAAAATAAAT-T-TTTCCCGAACCAGGTCAAATAATTA-AG
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT----AA-C-GATCAAAT--TTACA-
* * ** * * *
624689 ACTATATGAACAATTATCTAGTTGGAATCTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
184 A-T-T-TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* ** * *
624754 CTA-TTCGTACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA
246 -TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAA
* * * * *
624815 TAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTT-GTGAAGCCAATTC
308 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAG-CAGTTC
* * * * *
624855 AAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCGATCTT-AAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
624918 AAACAATTGTTTTTGT-TCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATA-TTC
65 AAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
624981 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACTAAATGTGTTTGTCGACCCAGTTCAAATAGTTA-
128 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTG-TT-T--A-AC-GATCAAAT--TTAC
** * * * * *
625045 AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCCTTTGTTTAGTCATGAAATAATTGT
183 A-A-T-TT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * ** ** * *
625110 TTCAATTTATACGTG-TATATTAAAAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAA
244 TTTAGTTCATACAAGCT-TATTCGAAA-AAAATAA-TACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAA
* * * *
625173 TAA-ACAAAAATTTAAAAAAAATAATTCTATTTA-T-AAACAAGTTC
305 TAATA-AGAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * * * * * *
625217 ATATTGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTAAAATAAATCT-AACCTTTTG-TTTGATCAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTG-TCAT
* * * * * * * * *
625279 AAAATAATTGTTTCAGTTA--ATAAAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTTATTAATATT
64 AAAACAATTGTTT--TTTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
625342 TTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTAT
126 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC--TGT-TT-AA-C-GATCAAAT--TTA-
** * * * * * * *
625407 GGCCGTTTAAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGC
182 --CAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
*** * * * * * * *
625471 TTTCCATCATGCAA-TTCTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAGAAATTACT
244 TTTAGTTCATACAAGCT-TATTCGAA-AAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * *
625535 AGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTA---ATG-A--TC
306 A-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * *
625572 -CA-A--T-T-CCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTCTGTTATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
625630 AAATAAATGTTTTAGT-TCATATAAGCTTATTCTGAAA-AAGATAAAACTAATTTAATAATATTA
65 AAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTC--AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * *
625693 T-AAAATTTAATAAATAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAA
126 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T-AA-CGA-TCAAAT--TT--
* * * * * * * *
625757 GACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTCTCGTAAAATAATTTTT
181 -ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * *
625822 TTAGTTCATAAAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAA-AA
245 TTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA
** * * * * **
625886 GTAACTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACT-AGATTAGTTC
308 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA-AGCAGTTC
* * * * ** * * *
625927 AAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATA
1 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
625991 TAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCGGAACAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCA
65 AAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
626056 AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAGCTAGTCCAAAGAGTTATGGC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--TAA-CGA-T-C-AA-A-TT-T-AC
* * **** * * * *
626117 TATTTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTATAACCTTTT-TGTTGTCATAAAACAATTATTTTT
183 AATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA
* * * *
626181 GTTGATACAAGCTTATTCGAAAAAAATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
248 GTTCATACAAGCTTATTCGAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-TAA
* * * * * ** * *
626246 GAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCCAAACCAGTTT
311 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * * *
626283 AAATATTTAAGACTGTATGAACAATTATCTATTTCGAATCGTTATG-ACATTTT-TTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATA
* ** *
626346 AAACAATTG-TTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTTC
65 AAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
626410 AAAAATTAAT-A-T--GAGACTTAAAAAATAAATATGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T-AA--CGA-TC-AA-A-TT-T-A
* * * * * ** * *
626471 CTATTTGATCAATCATCGATCTT-AAATCATTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT
182 CAATTTAAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * ** * * *
626534 TTGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG
246 TAGTTCATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-
* * * * ** *
626599 TAAGAGATTCAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGACCCTGTTC
308 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAGCAGTTC
* ** ** * * * * * *
626639 AAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCATTTATTTAGTCATGA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * *
626704 AATAATTGTTTCAGTTTAT--T--AA---TATTTC--A-GAAAT--TACT-AGGTA-TGAGATTT
66 AACAATTGTTT---TTTATCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** ** * * *
626755 -AAAAAGT-A-AA-T--CTG-TTT-AACGATCCAATTCCTATTTAA--A-C-AA-TTATCTATTT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT--AAAT-CTGTTTAACGATCAAATTTA-CAATTT
* * ** * ** * * * *
626807 CAAATCATTGTAACCT-TTT--GTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC
188 -AAA-CAAT-T-ATCTATTTCAAATC-ATTATAACCT-TTTGTTT-TG-TCATA-AA--ATAAT-
**** * * * * * ** * * * *
626869 TGAAAAAGATAATACTAA-TTTAAT--AATATTATAAAAATTAA-TAAATAAGAGATTTGAAAAA
241 TGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCGAAAAAAAT-AATACTAATTTAAT-A-ATATTT-AAAAA
* ** * ** * ** * * *
626930 TAAATCTGTTTGCTGAAGCA-ATTCAAATAGTTAAGACCATATGAACAAT-TATCTATTTC
301 TTAA------TAAT-AAG-AGATTTAAA-AAATAA-ATC-TATTTAC--TGAAGC-AGTTC
* * *
626989 AAATCA-TTATGACCT-TTTG-----TT-T-TA-TCCTAA--A--AT-AA-TTTT-TTTAGTTCA
1 AAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTG-TCA
** * * * * * *
627037 T--AA-AA--G-CCTAT-TCA-A-AA--TAAAAT--AATACTAAT-TTATTAA--TA-T--TA--
63 TAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCT-TATTCAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
627081 -CAAAAATAAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTT-ACTAGATTAGTTCAAATAATTA
126 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC--G---A--TCAAAT--TTA
* * * * ** * * * *
627144 TGACCTTGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGT
182 -CA-ATT-TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* ** * * * * * *
627209 TTTTGAACATTCAAGCCTATTCGGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TA
244 TTTAGTTCATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATA
* *
627271 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGCTAGTTT
307 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * *
627312 AAAGAGTTATTG-CTATTTGAACAATT-GCAAATTTTAAATCATTAT-AACCTTTTTGTTTTGTC
1 AAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGAA-C-TTTTGTTTTGTC
* * ** * * * *
627374 ATAAAACAATTATTTTTGT-TGATATGAGCTTATTCGAAAAAAAATAATTCTAATCTAATAATAT
62 ATAAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
627438 TCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAAT-TCGTTTCCCGAACTAGTTCAAATATTT
125 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTT----AAC--GATC-AA-ATTT
* * * * * * * *
627502 A-AGACTGTATGAACAATTATCCATTTCGAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATCAAACAATT
181 ACA-A-T-T-TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* ** * *
627566 GTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-
242 GTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTA
* * * * *
627628 -TAATAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTT-GTGAAGCCAATTC
304 ATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAG-CAGTTC
** * * * * *
627671 AAATAGTTATGACTATTTGATGAATCATCGATCTT-AAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCCTA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
627734 AAACAATTGTTTTTGT-TCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAAATATTTCTAAATTAGTAATA-TTC
65 AAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
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128 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T--A-AC-GATCAAAT--TTACA
** * * * * * *
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184 -A-T-TT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * ** * * *
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245 TTAGTTCATACAAGCT-TATTCGAAA-AAAATAA-TACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAAT
* * * *
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306 -AATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTG-TCATA
* * ** * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC--TGT-TT-AA--CGATCAAAT--TTA--
** * * * * * *
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182 -CAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
*** * * * *
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245 TTAGTTCATACAAGCT-TATTCGAA-AAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATA
* * * * *
628351 GGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCT-GTT--T-AA-C-GATC
307 -ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * *
628387 -CA-A-TTCT---TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTCTGTTATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
628445 AAATAGTTGTTTTAGT-TCATATAAGCTTATTCTGAAA-AAGATAATACTAATTAAATAATATTA
65 AAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTC--AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * *
628508 T-AAAAATTAATAAATAGGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAGCAATTCAAATAGTTAA
126 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT----AA-CGA-TCAAAT--TT--
* * * * * * * * *
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181 -ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * * *
628636 TTAGTTCAAAAAAGTTTATTTGAAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAA
245 TTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA
* * * * * * **
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308 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * * ** * * * *
628742 -AATAATTATGACCT-TATCAATAATTATCTATTTCTAATTGTTATTAGCTTTTGTTTGGTCACA
1 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
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65 AAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * *
628869 AAAA--ATTAA-T-A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAGCTAGTTCAAAAGGTTATGGC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--TAA-C--GATC-AAA--TT-T-AC
* * **** * *
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183 AATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
* * * * *
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247 AGTTCATACAAGCTTATTCGAAAAAAATAA-TACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-T
* * * * * * *
629058 AAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCTGAACCAATTC
309 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * ** * *
629097 AAATATTTAAGACTGTATGAACAATTATCTATTTGGAATCGTTATG-ACATTTTATTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATA
* * **
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65 AAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
629225 AAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTGTGAAGCCATTTTAAATAGTTATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T-AA-CGA---TCAA-A-TT-T-A
* * * * ** * * * *
629286 CTATTTGATCAATCATAGATGTT-AAATCATTTTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT
182 CAATTTAAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * ** * * * **
629349 TTGTTCATAAAAACTTGTTCGGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTGGTAAG
246 TAGTTCATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-
* * * **
629414 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGACCCAGTTC
308 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAGCAGTTC
* ** * ** * * * * *
629454 AAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATATATTTCAAATTGTTTTGACCCTTTGTTTAGTCATGA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
629519 AATAATTGTTTCAGTT-T-ATACATG-TACATTTAAAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACATT
66 AACAATTGTTT--TTTATCATACAAGCT-TA-TTCAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATT
** * * * *
629580 T-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAAATAAT-TCGATTTACAAATAAGTTCAAATTGT
126 TCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCT-G-TTT----A-ACGATCAAA---T
* * * * * * *
629643 TATGACTATTT-GATAATTTTTTATTTAAAATAAATAATATAACCTTTTG-TTTGATCATAAAAT
179 T-T-ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-CAT--TATAACCTTTTGTTTTG-TCATAAAAT
* * * * * * *** * * * *
629706 AATTGTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCCTAAATAAAATGGCATTACTTTATTAATATTTTGAAAA
238 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTAAAAA
* * * ** * *
629771 TTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTAAATTTATTGAATCAGTTC
301 TTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * ** * * * ** *
629819 AAATAATTATGGCCGTTTGAGCAATTATATATATCAAATTGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* *** * * *
629884 AACAATTGCTTTCCCTCATGCAAG-TCTATTCGAAGTCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
66 AACAATTGTTTTTTATCATACAAGCT-TATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * ** * * * *
629948 AAATTTACTGGGTATA-AGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAACGATCCAA-TTCCTATTTAAACA
129 AAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACGATCAAATTTACAATTTAAACA
* * * * * *
630011 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTGGTTCTATTATCAAATAATTGTTTTAGTTCATATAA
193 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAA
* *
630076 GCTTATTCTGAAAAGAATAATACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGA
258 GCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAA
* * * *
630141 AAAATAAATCTGTTTGCTGAAGCAATTT
320 AAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * * *
630169 AAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATG-ACTTTTGTTTTATCCTAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
630233 AATAA-T-TTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGC
66 AACAATTGTTTTTTA--TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * *
630296 AAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTGCTAAATTAGTTCAAATAATTATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T-AA--CGATCAAAT--TTA-CA
* * ** ** * * * *
630361 CCTTGTCAACAATTATCTATTTTTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT
184 -ATT-TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
* ** * * * * *
630426 TGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAATA
247 AGTTCATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAATA
630488 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAGCTAGTTC
310 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * * *
630526 AAAAAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTATTTTGTCA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGAA-C-TTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
630589 TAAAACAATTATTTTTGT-TGAAACAAGCTTATTTGAAA-AAATATAATTCTAATCTAATAATAT
63 TAAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTA-TTCAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
630652 TCCAAAAATTAATAACTATGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCCGAACCAGTTAAAATATTTA
125 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT----AA-C-GAT-CAA-ATTTA
** * * * *
630717 -AGATTGTATGAACAATTATCTATTTGGAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
182 CA-ATT-TA--AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* ** * *
630781 TTTCTA-TTCGTACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--
243 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAA
* * * * *
630842 TAATAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTT-GTGAAGCCAATTC
305 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAG-CAGTTC
* * ** * *
630885 AAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGATCTT-AAATCATTACGATC-TTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
630948 AAACAATTGTTTTTGT-TCATA-AAGGCTTGTTCGGAGTAAAGTATTGCTAAATTAATAATA-TT
65 AAACAATTGTTTTT-TATCATACAA-GCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
631010 CTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGACCCAGTTCAAATAGTTAA
127 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T--A-AC-GATCAAAT--TTAC
** * * * * * *
631075 AACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACCCTTTATTTAGTCATGAAATAATTGTT
183 AA-T-TT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * ** *
631140 TCAGTTTATACATG-TATATT-AAAAATAAACTAACT-CTAATTTGTTAACATTTAGAAAATTAA
245 TTAGTTCATACAAGCT-TATTCGAAAA-AAA-TAA-TACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAA
* * * *
631202 TAAACAAGAAATTTTAAAAAATAATTCTATTTAC--AAACAAGTTC
305 T-AATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * ** * *
631246 AAATAGTTATGACTATCT-AATAATTATCTATTTAAAAAAAATATGACCTTTTG-TTTGATCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTG-TCATA
* ** * * * * * * * * *
631309 AAA-TATTG-TTTCAATTGATAAAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTT
65 AAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * *
631372 AAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTTAATTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGG
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A---AATCTGTTTAA--CGATCAAAT--TTA---
* * * * * * *
631437 CCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCATTATGAA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTT
182 CAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
*** * * * *
631501 TCCATCATGCAAG-TCTATTCGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAG
246 TAGTTCATACAAGCT-TATTCGAA-AAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATA-
* * ** * *
631565 GTATGAGATTTAAAAGGTAAATCT-GTT--T-AA-CA-ATC
307 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * * *
631600 -CA-A--T-T-CCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTGTTATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
631658 ACATAATTGTTTTAGT-TCA-ATAAGCTTATTCTGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTA
65 AAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTC--AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * *
631720 T-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAA
126 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT--T-AA-CGA-TCAAAT--TT--
* * * * * * * * *
631784 GACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTTTT
181 -ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * *
631849 TTGGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAA
245 TTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA
* * * * * * **
631914 GTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATTGAATTAGTTC
308 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * * ** * * *
631955 AAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATA
1 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
632019 TAACAATTGTTTTTGAACATTCAGGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCA
65 AAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * *
632084 AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAAGAGTTATGGC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T-AAC--GATC-AA-A-TT-T-AC
* * * * * * *
632145 TATTTGAACAATT-GCAAAATTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
183 AATTTAAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * *
632209 TTGTTGATACAAGCTTATTTGAAAAAATATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAAC
246 TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAAAAA-ATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-
* * * * * * *
632274 TAAGAGAATAAAAAAATAATTTTGTTT-CTCTAACCAGTTC
308 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAGCAGTTC
* * * *
632314 AAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
632379 AATAA--GTTTATTTGAATTCATACTAGTTTATTTAGGATAAAATAA-A-TAAATTTATTAATAT
66 AACAATTGTTT-TTT--A-TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * * *
632440 TTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAATTCTATTTATATAACCAATTTAAATAAATT
125 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC--TGT-T-TAA-CGA--T---CAAATT
* * ** * *
632505 ATGACTACTTT-AACAAATATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAACAAG
180 -T-AC-AATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAAT
* * * * * * ** * * * * * *
632569 TGTTTTTGTTGATATAAGTTTGTTCAGAATAAGGTAAAACTAA-TCATTTATATTTCAAAAGT--
241 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAATTAA
* * *
632631 TAATAAGAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-ATCTAGTTC
305 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * * ** * **
632674 AAATAATTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTT-TCTTCTATTTT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGT-TT-T-GTCA
* * ***
632737 TAAAA-AGTTG-TTTTTGTCTATACAAGCTTATTTGGATGAAAATAATACTAATTTATTAATATT
63 TAAAACAATTGTTTTTTATC-ATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
632800 TCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAGTAAGCTCACATAGTTA
126 TCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-AC-G--A--TCA-A-A-TT-
* * * * * ** *
632864 TGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGATATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGT
180 T-ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
** * *
632928 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTTAAAAATTAAT
244 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAA-TATTTAAAAATTAAT
** * *
632992 AAGTTGGAGATTTAAGAAATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTC
306 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * * * *
633035 AAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATATATTTCAATTCATTATGAA-TTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * *
633099 AACAATTG-TTTCTATTCAAACAAAATTATTAAAAATCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
66 AACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
633163 AAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAATTAAATCTGTTTATGAAACCAATTCAAATAGTTATGAC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T--AA-CGA-TC-AA-A-TT-T-AC
* * * * * * * *
633224 TATTTGAATAATTTTCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTT
183 AATTTAAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTT
** * * * *
633287 T-GTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAG
246 TAGTTCATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-
* * * *
633351 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCG-AGCTAG-TC
308 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * ** * * *
633390 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTCTG-ACATTTTGTTTAGTCATG
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATA
* * * *
633454 AAATAATTG-----T-T-AT----GCTTATTTGAAATAAAATAACT-CTAATTTCTTAACATTT-
65 AAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
633506 AGAAAATTAATGAA-AAAGA-AATTAAAAAACATAATGCTATTTACCAAACAAGTTCATATAGTT
128 A-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AAT-CTGTTT----AAC--GATCA-A-A-TT
* * * * * * * * *
633569 ATGACTATCTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG
180 -T-ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * * * * * * *
633634 TTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGAT
243 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTAAAAATTAAT
* * * *
633699 AAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTA-TCGAATCAGTTC
306 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAGCAGTTC
* * * * *
633742 AAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCATTATGAACTTTTG-TTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
** * ** * * * * *
633806 AGTAATTGCTTTCCAACATACTAG-TCTATTTGAAATAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCA
66 AACAATTGTTTTTTATCATACAAGCT-TA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * *
633870 AAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGATC-TAGTTACTATTTGAACA
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAACGATCAAATTTACAATTTAAACA
* * * * * *
633934 ATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAA
193 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAA
* * *
633999 GCATATTTGAAATAAAAATAA-AGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT
258 GCTTATTCG-AA-AAAAATAATA-CTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT
* * * *
634063 GAAAAATAAATTTGTTT-GTCGAAGCAGTTC
318 AAAAAATAAATCTATTTACT-GAAGCAGTTC
* * * * ** * * *
634093 AAATCGTTATGACCATATAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
634158 AATAA-T-TTTTTCAGCTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTC
66 AACAATTGTTTTTTA--TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * ** * * * *
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128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACG----A--TCAAAT--TTA-CA
* * * ** * * * *
634286 CCTTGTCAACAGTTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-TTTT
184 -ATT-TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
* ** * * * *
634350 TGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT
247 AGTTCATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAA-T
*
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309 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGC-AGTTC
* * * * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
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64 AAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * * * *
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128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACGATCAAATTTACA-ATTTAA-A
**
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191 C-A-AT---TA----TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TGTT
* * * * * * ** *
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245 TT-AGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAAAAAATAATACT-AATTTAATAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * * * * *
634772 AACTAAGCGATTTAAAAAATAATTTTGTTTA-TATAAGTAATTT
306 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAGCAGTTC
* * * *
634815 AAATAATTATGACTATTTTAACAGTTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTCTTTTGTCAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-C-TTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * ** * *
634879 AGAACAAATGTTTTTGT-TGATATAAGTTTGTTCAAAGTAAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTT
64 AAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
634942 C-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAATCTAATTTAAATAGCTATG
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT---AA-C-GA-TCAAAT---T-T-
* * * * * * * **
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181 ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TT
* * * *
635068 CT-GTTTATACAAGCTTATTC-AAATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATA
245 TTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA--AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATA
* * * * *
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* * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
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66 AACAATTGTTT-T-TTATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
** * * *
635300 AAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAGATAGTCTTGT
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T-AAC--GATCA-A-A-T-TT-A
* * * * * ** *
635365 CCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
182 CAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-
* ** * * *
635430 TA-TTCATAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAT
246 TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAT
* * *
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* * *
635530 AAATAGTTACGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATG-ATTTTTATTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
635593 AAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTAGAGTAAAATATTTCTAAATTAATAATA-TTC
65 AAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
635656 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCATGCCAGTTCAAATAGTTAAG
128 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT---A--AC-GATCAAAT--TT---
* * * * * * ** *
635721 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGCTTAATCAT-GAATAATTGTTT
181 ACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * ** * * * *
635785 CAATTCATACATTCTTATTCAAAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAA
246 TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAA-TACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAAT-A
* * * * * * *
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* * * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
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65 AAACAATTGTTTTTTA--TCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * ** * * *
636017 TAAAAATTGATATGTTAA-AGATTTAAAAATAAGTAAATTTATCGAATTAGTTTAAATAATTATG
127 CAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTT-AAAA-AA-TAAATCTGTTTAA--CGATCAAAT--TTA--
* * * * ** * * * *
636081 GCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGAA-CATTTGTTTTATCATAAAACAATTGCT
182 -CAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
*** * * * *
636145 TTCCATCATACAAG-TCTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAATTCATA
245 TTAGTTCATACAAGCT-TATTC-GAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATA
* * * * * *
636209 AGTAAGTGATTTTAAAAATTAATTTGTTTAC-----CA-ATC
307 A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAGCAGTTC
* * * *** *
636245 -CA-A--T-T-CCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTCCATTATA
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* * * * * * *
636303 AAATAATTGTTTTAGT-TGATATAAGCTTATTGGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTT
65 AAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
636367 AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAGCAGTTCAAATAATT-CAA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT----AA-C-GATCAAAT--TTAC-A
** * *
636431 ACTATATGGACAATTATCTATTTCAAAAT-TTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATCAA-TGT
184 A-T-T-TAAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGT
* * * * * *
636494 TTCAATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAAAA
244 TTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATA
** * * * * * *
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307 A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAGCAGTTC
* * * * * * ** * * * *
636600 AAATAATTGTGACCT-TATCAACAATTTTCAATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTGGTCATA
1 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
*
636664 TAACAATTGTTTTT
65 AAACAATTGTTTTT
636678 GAGGATTCTA
Statistics
Matches: 14535, Mismatches: 3478, Indels: 2644
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
322 3 0.00
323 17 0.00
324 2 0.00
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326 3 0.00
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* * * * * * * * *
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** * * ** * * *
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** * * * * * **
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* * * * * * ****
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*** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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314 TTACA-AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACC
* * * * * ** * *
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376 TTTTG-TTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTAATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAACATT
* * * ** *
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* * * * * * *
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501 GGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTT---TT
* * * * * *
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563 GTCATAAAACAATTTCTTTCCA-TCATACAAG-TTATTCGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ** * *
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* * *
617705 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTAT
683 TAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
* *
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1 TTCAAATCATTATC-ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTT-TATTTCATAAAAGCTTAT
** * * * * * * **
617796 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTTAAAAAGTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATA
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* * * * ** * *
617861 AATCTGTTT-ACTGAACAAGTTCAAATAGTCACGTCTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGT
127 AATCTGTTTGAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGT
** * * * *
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* * *
617988 TAATTCTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT--A-AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATCAT
253 TAACTCTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT--T
* * * *
618048 GAAGCCAATAAATTTGTCATGAAGCCAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATTT
315 -TA--C----AA------AT-AAG----TTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTT
* * * * * * ** * * * *
618113 TAAATCATTATGATC-TTTGTTTCATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGA
361 CAAATAATTATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAA
* * * ** * *
618177 GTAAAATATTC-CTAAATTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
425 ATAAAATA-ACATTACTTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT
** ** ** ** * * * * * * *
618240 GTGTTTGCTGAGCCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCT-
487 -CATTTATTGAATCAGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * ** * *** * *
618304 AACCTTTTGTTTAGTCACGAAATAATTGT-TTTAGTTCATACATGCTTATTAGAAATAAAATAAC
551 AA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TCTTTCCATCATACAAG-TTATTCG-AATAAAATAA-
* * * * *
618368 T-CTAATTTATTAACA-ATCGAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAAATAATTCTATTT-T
611 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTGT
* * * * * *
618430 CTAA-ACAAGTTCAAATAGTTATGAGTATCTAAATAATTATCTAT
669 -GAAGCCAA-TTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
618474 TTAAAATAAATATGACAT-TTTATTTTATCGTAAAATAATTGTTTCAGTTT-ATAAAAGCTTA-T
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTTCATAAAAGCTTATT
* * ** * * * * *
618536 CTGAAATAAAATAA-CATTACTTTATTAATTTTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT
63 C-GGAATAAAATAATC-CTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * * * * * * * **
618600 AAGTCAATTT-ATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTAAGCAATTATGTATTTCAAATCA
126 AAATCTGTTTGA-CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTG
** * * * * * * *
618664 TTACGAACTTTTATTTCGTCATAAAACAATTGCTTTCCA-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
190 TTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG-TTTCAAGTTATACAAG-TTATTCAAAATAAAA
* * * * * * *
618728 TAATTTTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAA-AAAGTAAAATATTTTAAAAATAAATT-TGTT
253 TAACTCTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATT
*** * * * * **
618790 TACCGGTCCAGTTC--CTA-TT-TGA--A-C----AATTATTTATTTCAAATCATTCCAACCTTT
315 TACAAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTT
* * * * ** * * *
618844 TGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAACACTAATTT
379 TG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATTACTTT
* * * * * * * *
618909 AATAATATTGCAAAAATTAATAACTAAGAG-TTTGAAAAATAAAT-ATAT-TTGCCAAAGCAGTT
443 ATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCATTTATTG---AATCAGGT
* * * * * ** * * *
618971 CAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTATATCATA
504 CAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATA
* * ** **
619036 AAATAA-TTCTTT-TAGTTCATAGGAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
569 AAACAATTTCTTTCCA--TCATACAAG-TTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * ** * * *
619099 CAAAAATTAAAAAGTATGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCGAA-TTAGTTTAAATAATTAT
630 CAAAAATTAATAAG-A---GATTTAAAAAATAAATCTGTTTGT-GAAGCCAATTCAAATAGTTAT
* * *
619163 GACGT-TGTCAGCAATTATCTAT
690 GAC-TATATGAACAATTATCTAT
** * * * * *** **
619185 TTCAAATTGTTATTAGTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT-TGAAAATTCAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATCA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATTC
** ** * * * * *
619249 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCTT-TCAAAACTTAATAAGT----GACTTAAAAAATAA
64 GGAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * **
619309 ATTTGTTT-ACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAAA-AATT-GCAAACTTCAAATCA
128 ATCTGTTTGAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAAACAATTATC-TATTTCAAATTG
* * * * * * * * **
619371 ATATAACCTTTT-CTTATGTCATAAAACAATTATTT--ATTTGATACAGGCTTATTCTGAA-AAA
190 TTTTGACCTTTTGTTTA-GTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * *
619432 ATTA--CTAATCTAATAATATTTCA-AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATT-TATT
252 ATAACTCTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATT
* ** * * * * * *
619493 TGCCAAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
315 T-ACAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTT
* * * * * * * * **
619558 TTGTATTGTCATAAAATAATTTTTTTTTAATTCATACTAGCTTATTTGGGATAAAATAAACA--A
378 TTGT-TTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAAT-AACATTA
* * * * *
619621 ATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTAT-GTTTATAT-AACC
439 CTTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAA--ATCATTTAT-TGAATC
** * * * * * * *
619684 AATTTAAA-AATTTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAAACATTAT-AACATTTTGTTTT
500 AGGTCAAATAA-TTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTT
* * * * * * * ** * * *
619747 GCCATAAAAAAAACATT-TTT--ATTGATATAAGTTTGTTTAGAATAAGGTAAAACTAA-TCACT
563 GTCAT-AAAACAA-TTTCTTTCCA-TCATACAAG-TT-ATTCGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * ** * * *
619808 AATATTTCAAAAGTTAATAAGACATTTAAAAAATAAATATATTTGCCAATCTAGTTCAAATAGTT
623 AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTT
* ** *
619873 ATGACTATTTGAGTAATTATTTAT
688 ATGACTATATGAACAATTATCTAT
** * * * ** * *
619897 TTCAAATTGTTATCATTTTTTGTTCTATTTTAAAACAATTGTTTT-TGTTTATACAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATCA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATTC
* * * * *
619961 GG-ATGAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGT-AGAAATTTTAAAAAAT
64 GGAAT-AAAATAATCCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT
* * * * ** * *
620023 AAATCTATTT-ACCGAACAAGTTCACATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTG
126 AAATCTGTTTGA-CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTG
* ** * * * * * *
620087 TTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTACTCATACAAGCTTATTGAAAATAAAAT
190 TTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTTATACAAG-TTATTCAAAATAAAAT
* * * * * ** *
620151 AA-TACTACTTTAAT-ACTATTTTA-AAAACTAATAAGTTAGAGATTTAAAGCATAAATCTATTT
254 AACT-CTAATTTATTAAC-A-TTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
* * * * * * * * * * * **
620213 ACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTCA-ACTATTATTTATTTCGAATCATTATGATATT
316 AC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATA--ATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTT
* * ** * * * *
620277 TTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTA-TTAATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
378 TTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATTACT
* * * * * **
620341 TTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTCAAAAAATAAATCTATTT-GTAAAGCCAATT
441 TTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTGAA-TCAGGT
* * * * ** * * *
620402 CAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCGT-TAATCTT-AAATCATTAT-CATCTTTGTTTTGTCA
504 CAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCA
*** * * * * * * *
620464 TAAAACAATTGT-TTTTGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATT
567 TAAAACAATT-TCTTTCCATCATACAAG-TTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
620528 CTTAAAAA-TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCG-ACCCAGTTCAAATAGTTAAGA
629 -TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGT-GAAGCCAATTCAAATAGTTATGA
*
620591 CTAT-TAAAACAATTATCTAT
692 CTATAT-GAACAATTATCTAT
** * * * * * * * * *
620611 TTCAAATTGTTTTGACCCTTTGTTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTT-ATACATG-TATATT
1 TTCAAATCATTATCA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTTCATAAAAGCT-TATT
*** * * * ** *
620674 AAAAATAAAATAA-CTCTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAA
63 CGGAATAAAATAATC-CTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAA
* * * * ** * * *
620737 TAATTCTATTT-ACAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATT-TGATAATTATCTATTTAAAATA
125 TAAATCTGTTTGACGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATT
** * * * * *
620799 AATATGACCTTTTCTTT-GATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTAATAAAAGTTTATCCGAAATAA
189 GTTTTGACCTTTTGTTTAG-TCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAA
* * * * * * * * *
620862 AATGACAT-TACTTTATTAATATTTTA-AAAATTGATAAGTTTA-AGATTTCAAAAATAAGTCAA
251 AATAAC-TCTAATTTATTAACA-TTTAGAAAATTAATAA-ATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA
** * * * ** * * * **
620924 TTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCGTTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAA-
313 TTTA-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGA-TAATTATCTATTTCAAATAATTAT-AAC
* * * * *
620988 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCA--TCATGCAAGTCTATTC-AAAGTAAAATAATA
375 CTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTG-TTT-CAGTTAATACAAGTTTATTCGAAA-TAAAATAACA
* * * * *
621050 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACT-AGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATC-TGT-TT-AA-
436 TTACTTTATTAATATTTCAAAAATTA-TAAGTTA-GAGATTTAAAAAATAAATCATTTATTGAAT
* * * * * * *
621110 C-GATC---CAATT-T--CAATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTT
499 CAGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTT
* * *** * *
621167 GTTATAAAATAATTGT-TTTAGTTCATATAAGCTTATTCTGAA-AAGAATAATACTAATTTAATA
563 GTCATAAAACAATT-TCTTTCCATCATACAAG-TTATTC-GAATAA-AATAATACTAATTTATTA
* *
621230 ATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGCTGAAG-CAATTCAAA
624 ATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTG-TGAAGCCAATTCAAA
* * *
621293 TAGTTAAGACCATATGAACAATTATCAAT
683 TAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
621322 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTCTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTCG
* * ** * * ** * *
621387 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTAC-AAAAATTAAAAAGTAAGTTATTTAAAAAGTGAA
65 GAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * * *
621451 TTTGTTT-ACTGAATTAGTTCAAAAAATTATGACCT-TGT-CAACAATTATCTATTTCTAATTGT
129 TCTGTTTGAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGA-CTAT-TAAAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * ** ** *
621513 TATT-ACCTTTTGTTTGGTC---CAATTGTT-TTT-AA-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAAT
191 T-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTTATACAAG-TTATTCAAAATAAAAT
* ** *
621571 AA-TATTAATTTATTAATGTTTCA-AAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
254 AACT-CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA
* * * * * * * *
621630 CTAAGCT-AGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAATTTCAAATCATTATAACCTT
317 C-AA-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATC-TATTTCAAATAATTATAACC-T
* ** * *
621693 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTCGAAA-AAAAGT--CATT-C
377 TTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAA-TAACATTAC
* * * * * * * ** *** *
621754 TAATCTAATAATATTCCAGAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCCGAACC
440 T--T-TATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTATTGAATC
** * * * * *
621819 AATTCAAATATTTA-GGACTATATGTACAATTATCTATTTCGAATCGTTATGACA-TTTTGTTTT
500 AGGTCAAATAATTATGG-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-ATTTTTGTTTT
* * * *
621882 GTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
563 GTCATAAAACAATTTCTTTCCA-TCATAC-AAGTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAA
*
621946 TATTTCAAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTAT
625 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTAT
* * * *
622011 GACTATTTGATCAATCATCGAT
690 GACTATATGAACAATTATCTAT
*
622033 CTT-AAATCATTATCATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTTCATAAAAGCTTGTTCG
1 -TTCAAATCATTATCATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * *
622096 GAGTAACATATTCCAAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAAT
65 GAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
622161 GTGTTTGTCGACCCTGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTTG
130 CTGTTTGACGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTG
* * * * *
622226 ACCTTTTATTTAGTCATTAAATAATTGTTTCAACTTATACATGTATATTAAAAATAAAATAACTC
195 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTTATACAAGT-TATTCAAAATAAAATAACTC
* * * *
622291 TAAGTTATTAACATTTAGAAAACTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAACTAATTCTATTTACAAAT
259 TAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AAAAAA-TAATTCTATTTACAAAT
* * *
622356 AAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTGAT
322 AAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTTTGTTTG-T
* * * * *
622421 CATAAAATAATTGTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTAATTAATAT
386 CATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATTACTTTATTAATAT
* * * *
622486 TTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATCAGTTTAAATAATTA
451 TTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTGAATCAGGTCAAATAATTA
* * * * * *
622551 TTGCCGTTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGAATTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTTC
514 TGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTC
* * *
622616 TTTCCATCATGCAAGTCTACTCGAAGTAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTA
579 TTTCCATCATACAAGT-TATTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TA
* * * * *
622681 GATATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAATG-ATCCAATTC------TTAT---T-GA--AAC
639 -ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATATGAAC
*
622733 AATTAGCTAT
702 AATTATCTAT
* * * * *
622743 TTCAAATCATTATAACAT-TTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTC
* * * * * * * *
622807 TGAA-AAGAATAATACTTATTTGATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAA
64 GGAATAA-AATAATCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * **
622871 ATCTGTTTG-CTGAAGCAATTCAAATAGTTAAAACCA-TATGAACAATTATCAATTTCAAATCAT
128 ATCTGTTTGAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-AAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* ** * ** * *
622934 TATGACCTTTTGTTTTTTCCTAAAATAATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAAT
191 TTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAAAAT
* * * * * *
622998 AA-TACTAATTTATTAATA-TTACAAAAATTAA-AAAGTAAGCGATTTGAAAAGTGAATT-TGTT
254 AACT-CTAATTTATTAACATTTA-GAAAATTAATAAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATT
* * * * * * ** *
623059 TACTAAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCT
315 TAC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATCT-GATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCT
* * * * *
623123 TTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTT--TTTAACATTCAA-TCTTATTCGGAATAAAATAACACT
377 TTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTT-A-ATACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAACATT
* * * * * *
623185 AATTTATTAATCTTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGTTA
438 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTGAA-TCA
* * * * **** *
623246 GGTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAAATGGAAATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTGTTTTG
501 GGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA--TTTTTGTTTTG
*** ** * * * * *
623310 TCATAAAACAATTGT-TTTTGTTGGTAAAAGATTATTCGAA-AAAAAAATTCTAATCTAATAATA
564 TCATAAAACAATT-TCTTTCCATCATACAAG-TTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** * * * *
623373 TTCCAAAAATTAACAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTATTTCCCGAA-CTAGTTGAAATATT
627 TTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGT
* *
623437 TACGACTGTATGAACAATTATCTAT
687 TATGACTATATGAACAATTATCTAT
** * * * *
623462 TTGGAATCTTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTT-GTACATG-TATAT
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATAAAAGCT-TAT
*** * * * ** *
623524 TAAAAATAAAATAA-CTCTAAGTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAA
62 TCGGAATAAAATAATC-CTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAA
* ** * * * ** ** * * *
623587 ATAATTCTACTT-ACAAACAAGTTCAAATTGTTTTGACTATT-TGATAATTATCTATTTAAAATA
124 ATAAATCTGTTTGACGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATT
** * * * *
623650 AATATGACATTTTGTTT-GATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTAATAAAAGTTTATCCAAAATAA
189 GTTTTGACCTTTTGTTTAG-TCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAA
* * * * * * * * *
623713 AATGACAT-TACTTAATTAATATTTTA-AAAATTCATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAAT
251 AATAAC-TCTAATTTATTAACA-TTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT
** * * * ** * * **
623776 TTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCGTTTGAGCT-ATTATGTATTTCAAATCGTTATGAA-
314 TTA-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGA--TAATTATCTATTTCAAATAATTAT-AAC
* * * * * * *
623839 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTGCA--TCATGCAAGTCTATTCGAAGTAAAATAATAC
375 CTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTG-TTT-CAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACAT
* * * * *
623902 TAATTTATTAGTATTTCAAAAATTACT-AGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATC-TGT-TT-AA-C
437 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTA-TAAGTTA-GAGATTTAAAAAATAAATCATTTATTGAATC
* * * * *
623962 -GATCCAAT--TCT-T----ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTT
500 AGGTCAAATAAT-TATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTT
* * * *** * *
624018 GTCCTAAAATAATTGCTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAA-AAAGATAATACTAATTTAATAG
563 GTCATAAAACAATTTCTTTCCATCATACAAG-TTATTC-GAATAAA-ATAATACTAATTTATTAA
* *
624082 TATTAT-AAAAATTAATAAAGAAGAGATTTGAAAAATAAATATGTTTGCTGAAG-CAATTCAAAT
625 TATT-TCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTG-TGAAGCCAATTCAAAT
* * * *
624145 AGTGAAGACCATATGAACAATTACCTAT
684 AGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
* * * * * *
624173 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATT-TTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATTC
* * * * * * * *
624237 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGC-AAAAATTAGA-AAGTAAGTGATTCAAAAAGTG
64 GGAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATT-CTAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * ** * * * * * * **
624300 AATTTGTTT-ACTAAATTAGTTCGAACAATTATGACCT-TGT-CAACAATTATCTATTTCTAACG
127 AATCTGTTTGAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGA-CTAT-TAAAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * * *
624362 GTTATT-ACATTTTCTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAA--AATTCAAGCTTATTCGAAATA
189 GTT-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG--TTTCAAGTTATACAAG-TTATTCAAAATA
* * * * *
624424 AAAT-AGTACTAATTTATTAATC-TTT-CAAAAGT--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
250 AAATAACT-CTAATTTATTAA-CATTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA
* ** * * * **** *
624483 TTTACTAAGCT-AGTTCAAGGAGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTATAAC
313 TTTAC-AA-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTCAAATAATTATAAC
* * * *
624547 CTTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTTTC-CTT-ATACAAGCTTATTCGAAA-AAAATAA-T
375 C-TTTTGTT-TGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACA
* * * * * * * * * *** *
624608 TCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAGTAACTAAGAGAATAAAAAAATAAAT-TTTTCCCGAAC
436 T-TACTTTATTAATATTTCAAAAATTA-TAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCATTTATTGAAT
* * * * * ** *
624672 CAGGTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTAGTTGGAATCTTTATGACA-TTTTGTTTT
499 CAGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-ATTTTTGTTTT
* * * * * *
624736 GTCATAAAATAA-TTGTTTCTATTCGTACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
563 GTCATAAAACAATTTCTTTCCA-TCATAC-AAGTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *
624800 TATTTCAAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTAT
625 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTAT
* * * *
624865 GACTATTTGATCAATCATCGAT
690 GACTATATGAACAATTATCTAT
*
624887 CTT-AAATCATTATCATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGCTTGTTC
1 -TTCAAATCATTATCATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATTC
* *
624950 GGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACTAA
64 GGAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAA
* * *
625015 ATGTGTTTGTCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTT
128 ATCTGTTTGACGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTT
* * * ** *
625080 TGACCCTTTGTTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAATTTATACGTGTATATTAAAAATAAAATAAC
193 TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTTATACAAGT-TATTCAAAATAAAATAAC
* * *
625145 TCTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAACAA-AAATTTAAAAAAAATAATTCTATTTATAA
257 TCTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTT--AAAAAATAATTCTATTTACAA
* * * * * *
625209 ACAAGTTCATATTGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTAAAATAAATCTAACCTTTTGTTTG
320 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTTTGTTTG
* * * *
625274 ATCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTTATTAAT
385 -TCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATTACTTTATTAAT
* * *
625339 ATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAAT
449 ATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTGAATCAGGTCAAATAAT
* * *
625404 TATGGCCGTTT-AAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
512 TATGGCCATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
625468 TGCTTTCCATCATGCAATTCTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAGAAATTA
576 TTCTTTCCATCATACAAGT-TATTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * *
625533 CTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAATG-ATCCAATTC------CTAT---T-TA--
639 --A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATATG
625585 AACAATTATCTAT
699 AACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
625598 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAAATGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTCG
** * * * * *
625663 GAA-AAAGATAAAACTAATTTAATAATATTATAAAATTTAATAAATAAGAGATTTGAAAAATAAA
65 GAATAAA-ATAATCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * **
625727 TTTGTTTG-CTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
129 TCTGTTTGAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-AAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * ** * ** * * *
625790 ATGACCTTTTTTTTTCTCGTAAAATAATT-TTTTTAGTTCATAAAAGCCTATTCGAAATAAAATA
192 TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAAAATA
* * * ** * *
625854 A-TACTAATTTATTAATA-TTACAAAAATTAA-AAGTAACTGATTTAAAAAGTGAATT-TGTTTA
255 ACT-CTAATTTATTAACATTTA-GAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTA
* * * * * * * ** *
625915 CTAGATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTT
317 C-AAATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATCT-GATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTT
* ** * * * * * ** * *
625979 TGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTG-AACATTCAAGCTTATTCGGAACAAAATAGTACTAATT
379 TGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTA-ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATTACTT
* * * * *
626043 TATTAATCTTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGCTA-GTC
442 TATTAATATTTCAAAAATTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTGAATC-AGGT-
* * * **** *
626103 CAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTG--TTGTCA
504 CAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA--TTTTTGTTTTGTCA
*** * * * * * *
626165 TAAAACAATTAT-TTTTGTTGATACAAGCTTATTCGAAAAAAATAATTCTAATCTAATAATATTC
567 TAAAACAATT-TCTTTCCATCATACAAG-TTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *** * * * * *
626229 CAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCCAAACCAGTTTAAATATTTAAG
630 CAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTATG
*
626294 ACTGTATGAACAATTATCTAT
691 ACTATATGAACAATTATCTAT
* * *
626315 TTCGAATCGTTATGACAT-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-ATTAT
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATA-AAAGCTTAT
** * * * * *
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62 TCGGAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * ** * * * *
626436 AAATATGTTTG-TGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCGATCTT-AAATC
126 AAATCTGTTTGACGAA-CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTAT-TTCAAATT
* ** * * * ** * * ** *
626499 ATTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT-TTGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAA
189 GTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * * * * * * * *
626562 AT-ATTCCTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATGTGTT
252 ATAACT-CTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATT
* * **** * * * ** * * *
626625 TGTCGACCCTGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCA
315 T-ACAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCT--GATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCT
* * * * * *
626689 TTTATTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTAT-TAA-TAT-TTCAGAAAT----T-AC--TA-
377 TTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAACATTAC
** * * * ** * ** *
626743 GGTA-TGAGATTT-AAAAAGTA-AA-TCT---G-TTT-AACGAT---CCA---ATT-CCT-A-TT
440 TTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGT-TAGAGATTTAAAAAATAAATCATTTATTGAATCAGGT
* * * * * * ** * **
626790 TAAACAATTAT--CTATTTCAAATCATTGTAACCT-TTT--GTTCTGTTATAAAATAATTGTTTC
504 CAAATAATTATGGCCATTT-GAA-CAAT-T-ATCTATTTCAAATC-GTTAT-GAATTTTTGTTT-
* * * * * * * * ** *
626850 AGTTCATATAAGC---TT-ATT-C-TGA-AAAAGATAAT--ACTAATTTAATAAT-A-TTA-TAA
562 TG-TCATA-AAACAATTTCTTTCCATCATACAAGTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
626903 AAATT----AATAAATAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAG-CAATTCAAATAGTTA
625 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTG-TGAAGCCAATTCAAATAGTTA
* *
626963 AGACCATATGAACAATTATCTAT
689 TGACTATATGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
626986 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCCTATTCA
1 TTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * * * * * *
627051 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAC-AAAAATAAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAA
65 GAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * *
627115 TTTGTTT-ACTAGATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGT-CAACAATTATCTATTTCTAATTGT
129 TCTGTTTGACGA-ACCAGTTCAAATAGTTAAGA-CTAT-TAAAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * * **
627177 TATT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAA--CATTCAAGCCTATTCGGAATAAA
191 T-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG--TTTCAAGTTATACAAG-TTATTCAAAATAAA
* * *
627239 AT-AGTACTAATTTATTAATC-TTTCA-AAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
252 ATAACT-CTAATTTATTAA-CATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT
* * * * * * * * *
627297 TTACTAAGCT-AGTTTAAAGAGTTATTG-CTATTTGAACAATT-GCAAATTTTAAATCATTATAA
314 TTAC-AA-ATAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATCTG-ATAATTATC-TATTTCAAATAATTATAA
* ** * ** * * *
627359 CCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATATGAGCTTATTCGAAAAAAAATAA-TT
374 CC-TTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACAT
* * * * * * * * * ***
627423 CTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTCGTTTCCCGAA-
437 -TACTTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTATTGAAT
* * * * ** * * *
627487 CTAGTTCAAATATTTAAGACTGTATGAACAATTATCCATTTCGAATCGTTATGACA-TTTTGTTT
499 C-AGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-ATTTTTGTTT
* * * * * *
627551 TGTCATCAAACAA-TTGTTTCTATTCGTACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
562 TGTCATAAAACAATTTCTTTCCA-TCATAC-AAGTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *
627615 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTA
624 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTA
* ** * *
627680 TGACTATTTGATGAATCATCGAT
689 TGACTATATGAACAATTATCTAT
* *
627703 CTT-AAATCATTATCATCTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGCTTGTTC
1 -TTCAAATCATTATCATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATTC
* * * * *
627766 GGAGTAAAATATTTCTAAATTAGTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAA
64 GGAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
627831 TGTGCTT-ATCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTT
129 TCTGTTTGA-CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTT
* * * * *
627895 TGACCCTTTATTTAGTCATGAAATAATTGTTTC-AGTTTATACATGTATATTAAAAATAAAATAA
193 TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAG-TTATACAAGT-TATTCAAAATAAAATAA
* * *
627959 CTCTAAGTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAATTCTATTTACAA
256 CTCTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AAAAAATAATTCTATTTACAA
* * * *
628024 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTG
320 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTTTGTTTG
* * ** * * *
628089 ATCATAAAATACTCATTTCAGTTAATAAAAGTTTA-TCTGAAATAAAATCACATTACTTAATTAA
385 -TCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAACATTACTTTATTAA
* * *
628153 TATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGAATTAAAAAATAAATCAATTTATTGAAT-GGGTTCAAATA
448 TATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTGAATCAGG-TCAAATA
** *
628217 ATTATGGCTGTTT-AAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACA
510 ATTATGGCCATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *
628281 ATTGCTTTCCATCATGCAAGTCTATTCGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
574 ATTTCTTTCCATCATACAAGT-TATTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * **
628346 TACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTG-TT-T-AA--CGA-TCCAATTCTTAT---T-TA-
637 TA--A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATAT
628400 -AACAATTATCTAT
698 GAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
628413 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAGTTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * *
628478 GAA-AAAGATAATACT-AATTAAATAATATTATAAAAATTAATAAATAGGAGATTTGAAAAATAA
65 GAATAAA-ATAATCCTAAATT-AATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * **
628541 ATCTGTTTGCCGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCA-TATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATT
128 ATCTGTTTGACGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-AAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * * * ** *
628605 ATGAGCTTTTGTTTTA-TCCTAAAACAATT-TTT-TAGTTCAAAAAAGTTTATTTGAAACAAAAT
192 TTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAAAAT
* * * * *
628667 AA-TACTAATTTATTAATA-TTACAAAAATTAA-AAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATT-TGTT
254 AACT-CTAATTTATTAACATTTA-GAAAATTAATAAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATT
* * * * ** * *
628728 TACTAAATTAGTTC-AATAATTATGACCTTATC-AATAATTATCTATTTCTAATTGTTATTAGCT
315 TAC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGA-C-TATCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCT
* * ** * * * * *
628791 TTTGTTTGGTCACATAACAATTGTTTTTG-AACATTCAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATACTA
377 TTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTA-ATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAACATTA
* * * ** * *
628854 ATTTATTAATCTTT-AAAAAAT-TAA--TA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAGCTAG
439 CTTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTATTGAATC-AG
* * * **** *
628913 TTCAAA-AGGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTGTTTTG
502 GTCAAATA-ATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA--TTTTTGTTTTG
*** * * * * *
628976 TCATAAAACAATTAT-TTTTGTTGATACAAGCTTATTCAAAAAAAATAATTA-TAATCTAATAAT
564 TCATAAAACAATT-TCTTTCCATCATACAAG-TTATTCGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAAT
* * * * * *
629039 ATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCTGAA-CCAATTCAAATAT
626 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAG
* *
629103 TTAAGACTGTATGAACAATTATCTAT
686 TTATGACTATATGAACAATTATCTAT
** * * * *
629129 TTGGAATCGTTATGACAT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAA-ATTAT
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATA-AAAGCTTAT
** * * * *
629191 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAAT
62 TCGGAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * ** * * ** *
629251 AAATATGTTTG-TGAAGCCATTTTAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGATGTT-AAATC
126 AAATCTGTTTGACGAA-CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTAT-TTCAAATT
* * * * ** * * * ** *
629314 ATTTTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT-TTGTTCATAAAAACTTGTTCGGAGTAAA
189 GTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-AT-ACAAGTTATTCAAAATAAA
* * * * ** * * * *
629377 AT-ATTCCTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTGGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTT
252 ATAACT-CTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATT
* * *** * * * * ** * * *
629440 TGTCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAAAACAATTATATATTTCAAATTGTTTTGACCC
315 T-ACAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCT--GATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCT
* * * * ** ** *
629504 TTTGTTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTATACATGTACATTTAAAATAAAATAAC-TCTAA
377 TTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACAT-TAC
* *** * * ** *
629568 TTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAAATAATTCGATTTA-CAAATA
440 TTTATTAATATTTCA-AAAATT-ATAAGTTAGAGATTT--AAAAAATAAATC-ATTTATTGAATC
* ** * * * * * * ** *
629631 AGTTCAAATTGTTATGACTATTTG-ATAATTTTTTATTTAAAATAAATAATAT-AACCTTTTG-T
500 AGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CGT--TATGAA-TTTTTGTT
* * * * * * *** * *
629693 TTGATCATAAAATAA-TTGTTT-CAGTTAATAAAAGTTTATCCTAAATAAAATGGCATTACTTTA
561 TTG-TCATAAAACAATTTCTTTCCA--TCATACAAG-TTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *** * * *
629756 TTAATATTTTGAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTAAATTTATTGAA-TCAGTTCA
621 TTAATA-TTTCAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCA
* * ** * * *
629820 AATAATTATGGCCGTTTGAGCAATTATATAT
681 AATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
* ** * * * *** **
629851 ATCAAATTGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCCTCATGCAAG-TCTATTC
1 TTCAAATCATTAT-CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCT-TATTC
* * * * * * ** *
629915 -GAAGTCAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTTACTGGGTATA-AGATTTAAAAAGT
64 GGAA-TAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAAT
* * * * **
629977 AAATCTGTTT----AA-C-GATC-CA-A-TT---CCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCAT
126 AAATCTGTTTGACGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * * * *
630030 TATAACCTTTGGTTCTA-TTATCAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCTGAAA-AGA
191 TTTGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTC-AAAATAAA
* * * * * *
630092 ATAA-TACTAATTTAATAATATTATA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTT
252 ATAACT-CTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATT
* ** * * * * * * * *
630155 TGCTGAAGCAA-TTTAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGA-CT
315 TAC--AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCT
* * * * * * * * * * * *
630218 TTTGTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
377 TTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATTACT
* * * * * * ** ** * * *
630283 TTATTAATATTGCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTGCTAAATTAGTT
441 TTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAATCATTTATTGAATCAGGT
* * ** * * ** *
630348 CAAATAATTATGACC-TTGTCAACAATTATCTATTTTTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCAT
504 CAAATAATTATGGCCATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * *
630412 ATAACAATTGT-TTTTGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTT
568 AAAACAATT-TCTTTCCATCATACAAG-TTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
630476 CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAGCTAGTTCAAAAAGTTATGGCT
630 CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACT
* * *
630540 ATTTGAACAATT-GCAAAT
694 ATATGAACAATTATC-TAT
* * * * *
630558 TTCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TGTTGA-AACAAGCTTAT
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAA-AAGCTTAT
* * * * * * * *
630621 T-TGAAAAAATATAATTCT-AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGAATAAAAAAA
62 TCGGAATAAA-ATAATCCTAAAT-TAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* ** * * * **
630684 TAAATTTGTTTCCCGAACCAGTTAAAATATTTAAGA-T-TGTATGAACAATTATCTATTTGGAAT
125 TAAATCTGTTTGACGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TA-AAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
630747 CGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTCAAAATAA
188 TGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATAC-AAGTTATTCAAAATAA
* * * * *
630811 AATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAA-T--T-AATAAGAGACTTAAAAAATAAATATGT
251 AATAACT-CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT
** ** * * ** * ** *
630870 TTGTGAAGCCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGATCTT-AAATCATTACGAT
314 TT-ACAA-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAT-AATTATCTAT-TTCAAATAATTATAAC
** * * * * * *
630933 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-AAGGCTTGTTCGGAGTAAAGT---ATT
375 CTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAA-GTTTATTCGAAATAAAATAACATT
* **
630993 GCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAGGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTT-TGTC
438 ACTTTATTAAT-AT-TTC-AAAAATT-ATAAGTTA-GAGATTTAAAAAATAAATCAT-TTAT-T-
** * * *** * ** * * * *** *
631055 GACCCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACCCTTTAT
495 GAATCAGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGT
* * * * * * ** *
631120 TTAGTCATGAAATAA-TTGTTT-CAGTTTATACATGTATATTAAAAATAAACTAACT-CTAATTT
560 TTTGTCATAAAACAATTTCTTTCCA--TCATACAAGT-TATT-CGAATAAAATAA-TACTAATTT
* * * * * ** *
631182 GTTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAATTCTATTT-ACAA-ACAAGT
620 ATTAATATTTCA-AAAATTAAT----AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTGTGAAGCCAA-T
* *
631244 TCAAATAGTTATGACTATCT-AATAATTATCTAT
678 TCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * * * * *
631277 TTAAAAAAAATATGACCTTT-TGTTTGATCATAAAA-TATTGTTTCAATTGATAAAAGTTTATCC
1 TTCAAATCATTATCATCTTTGT-TTTG-TCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTC
* ** * * * *
631340 GAAATAAAATGACAT--TACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATA
64 GGAATAAAAT-A-ATCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * ** * * * * ** * * **
631403 AGT-TAATTT-ATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCA
127 AATCT-GTTTGA-CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTG
* ** * * * * * * *
631466 TTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCA-TCATGCAAGTCTATTCGAAGTAAAA
190 TTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG-TTTCAAGTTATACAAGT-TATTCAAAATAAAA
* * ** * ** * *
631530 TAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAGGTAAATCTGTTT
253 TAACT-CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
* * * *
631593 A-ACAATCCAA-TTC--CTA-TT-T-A--A----ACAATTATCTATTTCAAATCATTATATCCTT
316 ACA-AAT--AAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTT
* * * * * * * *
631645 TTGTTCTGTTATAACATAATTGTTTTAGTTCAAT--AAGCTTATTCTGAAA-AAAATAATACTAA
378 TTGTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT-AATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAACATTAC
* * * ** * *
631707 TTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAA
440 TTTATTAATATT-TCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTGAATCAG
* * * * * *
631771 TTCAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ATCTTTTGTTTTATC
502 GTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAT-TTTTGTTTTGTC
* * * *** *
631835 CTAAAATAATTTTTTTGGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
566 ATAAAACAATTTCTTTCCATCATACAAG-TTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * ** * *
631900 ACAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATTGAA-TTAGTTCAAATAATTA
629 TCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTA
* *
631964 TGACCT-TGTCAACAATTATCTAT
689 TGA-CTATATGAACAATTATCTAT
* ** * * * * ** ** *
631987 TTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT-TGAACATTCAGGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATTC
* * * * *
632051 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
64 GGAATAAAATAATCCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * ** * * * **
632111 ATTTGTTT-ACTAAACTAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAAATTCAAATCAT
128 ATCTGTTTGAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATC-TATTTCAAATTGT
* * * * * ** * *
632174 TATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTGTTGATACAAGCTTATTTGAAAA-AAT
191 TTTGACC-TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTA-TTCAAAATAAA
* * * * * * * * * *
632237 ATAATTCTAATCTAATAATATTCCA-AAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAATTTTGTTT
252 ATAACTCTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
* * ** * * * * * *
632301 CTCTAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
316 -ACAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCTTT
* * * * * * * * * *
632366 TGTTTTGTCATAAAATAAGTTTATTTGAATTCATACTAGTTTATT-TAGGATAAAATAA-ATAAA
379 TG-TTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAACATTAC
* * * * * * *
632429 TTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAATTCTATTTATAT-AACCAA
440 TTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTAT-TGAATCAG
* * * * * * * **
632493 TTTAAATAAATTATGACTACTTT-AACAAATATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTCATTTTG
502 GTCAAAT-AATTATGGCCA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGTTTTG
** * * * ** * * *
632556 TCATAAAAACAAGTGTT-TTT-GTTGATATAAGTTTGTTCAGAATAAGGTAAAACTAA-TCATTT
564 TCAT-AAAACAA-T-TTCTTTCCATCATACAAG-TTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * ** * * * *
632618 ATATTTCAAAAGTTAATAAGAGTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-ATCTAGTTCAAATAATT
624 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTT
* * * *
632682 ATAACTATTTGAGCAATTATTTAT
688 ATGACTATATGAACAATTATCTAT
** * * * ** * * *
632706 TTCAAATTGTTATGA-CTTTTTCTTCTATTTTTAAAA-AGTTGTTTT-TGTCTATACAAGCTTAT
1 TTCAAATCATTATCATCTTTGT-TT-T-GTCATAAAACAATTGTTTTATTTC-ATAAAAGCTTAT
* * * * * *
632768 TTGG-ATGAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAA
62 TCGGAAT-AAAATAATCCTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAA
* * *** * * * * * *
632830 ATAAATTTGTTT-ACCCAGTAAGCTCACATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAAT
124 ATAAATCTGTTTGA-CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAAT
* * ** * * * *
632894 CGTTATGATATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTAAAAATAA
188 TGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAATAA
** * ** * *
632957 AATAA-TACTAATTTATTAATTTTTTA-AAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAGAAATAAATCTAT
251 AATAACT-CTAATTTATTAA-CATTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT
* * * * * * * *
633020 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGA-ACTATTATATATTTCAATTCATTATGAA-
314 TTAC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATA--ATTATCTATTTCAAATAATTAT-AAC
** ** * * *
633083 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAA-ACAAAATTATTAAAAATCAAATAATAC
375 CTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTT-AATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACAT
* * * *
633145 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--T--AGATTTAAAAATTAAATCTGTTTA-TGAAAC
437 TACTTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC-ATTTATTG-AAT
** * * * * * * * *
633205 CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATCTT-AAATCATTATG-ATCTTTATTTT
499 CAGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTT
* *** * * * * *
633268 GTCATAAAACAATTGCTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAAT
563 GTCATAAAACAATTTCTTTCCATCATACAAG-TTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
633333 ATTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCG-AG-CTAGTCAAATAG
626 ATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTG-TGAAGCCAATTCAAATAG
* *
633396 TTAAGACTAT-TAGAACAATTATTTAT
686 TTATGACTATAT-GAACAATTATCTAT
** * * * * *
633422 TTCAAATTGTTCTGACAT-TTTGTTTAGTCATGAAATAATTG------TT-AT----GCTTATTT
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATAAAAGCTTATTC
* * ** * * * *
633475 GAAATAAAATAA-CTCTAATTTCTTAACATT-TAGAAAATTAATGAA-AAAGA-AATTAAAAAAC
64 GGAATAAAATAATC-CTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
633536 ATAATGCTATTT-ACCAAACAAGTTCATATAGTTATGACTATCT-GAATAATTATCTATTTAAAA
126 A-AAT-CTGTTTGA-CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAAAACAATTATCTATTTCAAA
*** * * *
633599 TAAATATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTCAA-TTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
187 TTGTTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACAAG-TTATTCAAAAT
* * * * * * * *
633662 AAAATAA-TATTACTTTATTAATATTTTA-AAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCA
249 AAAATAACT-CTAATTTATTAACA-TTTAGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCT
* * * * * * * * *
633725 ATTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCATTATGAA
312 ATTTA-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGA-TAATTATCTATTTCAAATAATTAT-AA
** * * * *
633790 -CTTTTGTTTGTCATAAAGTAATTGCTTTCCA---ACATACTAGTCTATTTGAAATAAAATAATA
374 CCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-CAGTTA-ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACA
633851 TTAAC-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TATGAGATTTAAAAAAATAAAT--TTGT-TT-
436 TT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTA-GAGATTT-AAAAAATAAATCATT-TATTG
* * * * ** *
633910 -A-CCGATC---TAGTTA---CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTAT-AACCTTTTGT
496 AATCAGGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-TTTTTGT
* * * * * * * *
633966 TCTGTTATAAAATAA-TTGTTTCAATTCATATAAGCATATTTGAAATAAAAATAA-AGCTAATTT
560 TTTGTCATAAAACAATTTCTTTCCA-TCATACAAG-TTATTCG-AAT-AAAATAATA-CTAATTT
* * * * *
634029 AATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAG-CAGTTC
620 ATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGT-GAAGCCAATTC
* * *
634093 AAATCGTTATGACCATATAAACAATTATCTAT
680 AAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
** * * * * * ** *
634125 TTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCAGCTCATAAAAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-ATTTCATAAAAGCTTATTC
* * * * * ** *
634189 GAAATAAAATAATACT-AATTGATTAATATT-TCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTGGAAAATG
64 GGAATAAAATAATCCTAAATT-AATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* ** * * * *
634252 AATTTGTTT-ACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGT-CAACAGTTATCTATTTCAAATT
127 AATCTGTTTGA-CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGA-CTAT-TAAAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * *
634314 GTTATT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTGAA--CATTCAAGCTTATTCAGAATAA
189 GTT-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-TTGTTTCAAGTTATACAAG-TTATTCAAAATAA
* *
634376 AATAA-TACTAATTTATTAATC-TTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
251 AATAACT-CTAATTTATTAA-CATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA
* * * * * * * * *
634438 TTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGGCTATTTAAACAATT-GCAAACTTCAAATCATTATAG
313 TTTAC-AAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATCT-GATAATTATC-TATTTCAAATAATTATAA
* * * ** * * * * * *
634501 CCTTATGTTCTGTCATAAAAAAATTATTTTTGTTGATGCAAGCTTATTC-AAA-AAAAAAATACT
374 CCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATT
* * * * * * * * * * *
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438 ACTTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTATTGAATCA
** * * * * * * * * * * **
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501 GGTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTC
* ** * * * * *
634694 ATAAAATAAGTATT-TTTGAATTCATGCTAGCTTATTTAGGATAAAATAA-A-TAAATTTCTTAA
566 ATAAAACAA-T-TTCTTTCCA-TCATACAAG-TTA-TTCGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * * * *
634756 TATTTCAAAACTTAATAACTAAGCGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATATAAG-TAATTTAAATA
625 TATTTCAAAA---ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGT-GAAGCCAATTCAAATA
* * * *
634820 ATTATGACTATTTTAACAGTTATCTAT
685 GTTATGACTATATGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
634847 TTCAAATCATTATAACCTTTTTCTTTTGTCATAGAACAAATGTTTT-TGTTGATATAAGTTTGTT
1 TTCAAATCATTAT--CATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATT
* ** ** * * * *
634911 C-AAAGTAAGGTAAAACT-AATCATTAATATT-TCAAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
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* * * * * * * * ** * * * **
634970 AATCTATTT-ACCAATCTAATTTAAATAGCTATGACAATTTGAGCAATTATTTGTTTCAAATCAT
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* ** * *
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* * * * * *
635096 ATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATT-TGT
252 ATAACT-CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTAT
* ** * * * * * * *
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314 TTA-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATCTATTTCAAATAATTATAACCT
* * * * * * * *
635223 TTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTTATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAC
377 TTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACA-TTAC
* * * ** *
635287 -TTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAG
440 TTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTATTGAATC-AG
* * * * *
635350 TTCAGATAGTCT-TGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ATATTTTGTTTTGT
502 GTCAAATAAT-TATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAT-TTTTGTTTTGT
* * * * * *
635413 CATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
565 CATAAAACAATTTCTTTCCA-TCAT-ACAAGTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
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*
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692 CTATATGAACAATTATCTAT
* * * * *
635562 CTT-AAATCATTATGATTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTT
1 -TTCAAATCATTATCATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATAAAAGCTTATTC
* * * *
635625 AGAGTAAAATATTTCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
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* * * ** * *
635690 TGTGTTTG-CCATGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTC
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* * * **
635754 TGACCTTTTGCTTAATCAT-GAATAATTGTTTCAA-TTCATACATTCTTATTCAAAATAAAATAA
193 TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAAGTT-ATACA-AGTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
635947 TATCATAAAATAATTTTTTTAGTTTATAAAAGCTTATTGGAAATAAAATAATATTACTTTATTAA
383 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACATTACTTTATTAA
* * * * * * * * *
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448 TATTTCAAAAATT-ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT-CATTTATTGAATCAGGTCAAATAA
* * * ** *
636076 TTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAAT
511 TTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* *
636141 TGCTTTCCATCATACAAGTCTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAATTC
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* * * * * * *
636206 ATAAGTAAGTGATTTTAAAAATTAATTTG-TT-T--A-CCAA-TC-CA-A--T-T-CCTATTTGA
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*
636259 ATAATTATCTAT
700 ACAATTATCTAT
* * *** * * * * *
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* * * * *
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* * * **
636400 TCTGTTTGCCGAAGCAGTTCAAATAATTCAA-ACTA-TATGGACAATTATCTATTTCAAAATT-T
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* * *
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** ** * *
636525 -AA-TACTAATTTATTAATGTTTCA-AAAATTAA-AAAGTAAGTTATTTAAAAAGTGAATT-TGT
253 TAACT-CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTAT
* * * * * * * ** *
636585 TTATCGAATCAA-TTCAAATAATTGTGACCTTATC-AACAATTTTCAATTTCAAATTGTTATTAC
314 TTA-CAAAT-AAGTTCAAATAGTTATGA-C-TATCTGATAATTATCTATTTCAAATAATTATAAC
* *
636648 CTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTT
375 CTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTT
636676 TTGAGGATTC
Statistics
Matches: 14360, Mismatches: 3380, Indels: 2416
0.71 0.17 0.12
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Consensus pattern (711 bp):
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AAATTATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCATTTATTGAATCAGGTCAAATAATTATGGCCAT
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTCTTTCCAT
CATACAAGTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
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** * * * * * * **
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* * * * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
617397 TTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTGATATAAGTTTGTTCTGAATAAG-GTAAAACTAA
365 TTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAA-AAGAATAATACTAA
* * * * * **
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* * * * *
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* * ** * * * * *
617552 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCAATTTAAAAAAAAATTGTTTCTA-TTTATACAAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * * *
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64 CGAAAT-AAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT
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* * * * * ** *
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189 TTATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACA-ATTGTTTTTCA-TCATGCAATCTTATTC-GAATAAA
* * * **
617806 ATAATACTAATTTATTACTATTTTAAAAAGTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
251 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * ** *
617871 CTGAACAAGTTCAAATAGTCACGTCTATTTG-AACTATTATCTATTTCAAATCGTTAGGACATTT
314 ATG----A--TCAAAT--T----TATA-TTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
* * ** * * *
617935 TGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTC-AAAATAAAATAATTCTAAT
366 TGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAAT
*
617998 TTATTAATATT-TCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATCATGAAGCCAATA
429 TTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT--A---A--AT-----C--T-
** *
618058 AATTTGTCATGAAGCCAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATCTAT
478 -ATTTG-C-TGAAG-CAATTCAAATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * * * *
618111 TTTAAATCATTATGATC-TTTGTTTCATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * ** * *
618175 GAGTAAAATATTCCTAAATTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* * ** * * * *
618239 TGTGTTTGCTGAGCCAATTCAAATAGTTAAGA-CTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTC
129 TCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-TT-GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* ** * *** * *
618303 T-AACCTTTTGTTTAGTCACGAAATAATTGTTTTAGTTCATAC-ATGCTTATTAGAAATAAAATA
192 TGAA-CTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAAT-CTTATTCG-AATAAAATA
* * * * * *
618366 ACT-CTAATTTATTAACA-ATCGAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAAATAATTCTATTT
254 A-TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-AT-AATAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATC--TGT
* * * * * * * * * *
618429 TCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAGTATCTAAATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACATTT
311 T-T--A-ATGATCAAAT--TTAT-A-T-T-GAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
* * * * * * * * * *
618494 TATTTTATCGTAAAATAATTGTTTCAGTTTATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAACATTACTT
366 TGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATT
* * * * * * * * ** * *
618558 TATTAATTTTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAATTTATTGAATCAGTTC
430 TAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTC
* * * * * *
618623 AAATAATTATGGCTATTTAAGCAATTATGTAT
495 AAATAGTTAAGACTATATGA-CAATTATCTAT
* * * ** * * *** *
618655 TTCAAATCATTACGAACTTTTATTTCGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCATACAAGCTTATTC-
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
** * * * *
618719 AGAATAAAATAATTTTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAATATTTTAAAAATAAA
66 A-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* * * * * ** *
618784 TTTGTTTACCG-GTCCAGTTC--------CT-A--TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATT-C
129 TCTGTTTACTGAAT-CAGTTCAAATAATTATGACCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * *
618836 CAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCAT-AT--AAACTTATTTGAAATAAAAT
193 GAA-CTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTT---TTCATCATGCAATCTTATTCG-AATAAAAT
* * * * * *
618898 AACACTAATTTAATAATATTGCAAAAATTAATAACTAAGAG-TTTGAAAAATAAATATATTTGCC
253 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT---
* * * * *
618962 AAAGCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTA
313 AATG-A--TCAAAT--TT---A-TAT-TGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * ** * *
619026 TTATATCATAAAATAATTCTTTTAGTTCATAGGAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTA
368 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * ** * *
619090 TTAATATT-TCAAAAATTAAAAAGTATGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTT-ATCGAATTAGTTT
432 ATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCT-GAAGCAATTC
* * * *
619153 AAATAATTATGACGT-TGTCAGCAATTATCTAT
495 AAATAGTTAAGAC-TATATGA-CAATTATCTAT
** * ** ** * * * *** ** *
619185 TTCAAATTGTTATTAGTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAAAATTCAAGCTTATTCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * * *
619250 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATCTTTCAAAACTT---AA-TAAGTGACTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * * * * * * * ***
619311 TTGTTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAAAAATT-GCAAACTTCAAATCAATA
130 CTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTA
* * * * **
619374 T-AACCTTTTCTTAT-GTCATAAAACAATTATTTATT--TGATACAGGCTTATTCTGAA-AAAAT
192 TGAA-CTTTTGTT-TGGTCATAAAACAATTGTTT-TTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAAAT
* * * * *
619434 --TACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTGCC
253 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT---
* * * *
619497 AAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
313 -AA--TGATC-AA-ATTT---A-TAT-TGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * * * *
619561 TATTGTCATAAAATAATTTTTTTTTAATTCATACTAGCTTATT-TGGGATAA-AATAA-ACAAAT
368 TTTTGTCATAAAATAA--TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCT--GAAAAGAATAATACTAAT
* * * ** * *
619623 TTATTAATATT-TCAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TATGTTTATATAACCA
429 TTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTGCT-GAAGCA
* * * * * *
619685 ATTTAAAAATTTATGACTATTTTAACAATTATCTAT
491 ATTCAAATAGTTAAGACTA-TATGACAATTATCTAT
* * * ** * * * * * *
619721 TTCAAAACATTATAACATTTTGTTTTGCCATAAAAAAAACAT-TTTTA-TTGATATAAGTTTGTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAAATAA-TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* ** * * * * * *
619784 -TAGAATAAGGTAAAACTA-ATCACTAATATTTCAAAAGTT---AA-TAAGACATTTAAAAAATA
64 CGA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-
* * * * * * ** *
619843 AATATATTTGC-CAATCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGT
127 AATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* ** * ** ** * * * *
619907 TATCATTTTTTGTTCT-ATTTTAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCGGATGAAAAT
190 TATGAACTTTTGTT-TGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTCGAAT-AAAAT
* * *
619971 AATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTAC
253 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTT--
* * * ** ** * **
620035 CGAACAAGTTCACATAGTTATGACTATTTG-AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATGTTTT
313 ---A-ATGATCA-A-A-TT-T-A-TA-TTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
* * * *
620099 GTTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTA-CTCATACAAGCTTA-T-TGAAAATAAAATAATACTACT
367 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCTG-AAA-AGAATAATACTAAT
* * * * * ** *
620160 TTAATACTATTTTAAAAACTAATAAGTTAGAGATTTAAAGCATAAATCTATTTACTGAA-CAAGT
429 TTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAA-T
* * * * * * * *
620224 TCAAATAGTCATGTCCATTTCAACTATTATTTAT
493 TCAAATAGTTAAGACTATAT-GACAATTATCTAT
* ** * * * * *
620258 TTCGAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCTA-TTAATACAAA-ATTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTATT
* * *
620321 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTCAAAAAATAA
64 CGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * * * * ** **
620382 ATCTATTT-GTAAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCGT-TAATCTT-AAATCA
128 ATCTGTTTACTGAA-TCAGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATTG
* * * ** ** * * *
620444 TTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAAAT
189 TTATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAAAT
* * * * * *
620508 ATTCCTAAATTAATAATA-TTCTTAAAA--ATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCG
253 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T--
* * * ** * * *
620570 ACCCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCCTTTGT
313 A---ATGATCAAAT--TT---A-TATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * * * * ** *
620634 TTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTATACATG-TATATT-AAAAATAAAATAACT-CTAATTT
369 TTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTCTGAAA-AGAATAA-TACTAATTT
* * * * * *
620696 ATTAACATT-TAGAAAATTAATAAAC-AAGAAATTTAAAAAAATAATTCTATTTAC--AAACAAG
431 AATAATATTATA-AAAATTAAT-AACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAA-
* *
620757 TTCAAATAGTTATA-ACTATTTGATAATTATCTAT
492 TTCAAATAGTTA-AGACTATATGACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
620791 TTAAAATAAATATGACCTTTTCTTTGATCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * * * * *
620856 AAATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTTA-AGATTTCAAAAATAAG
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAA-
** * * * * *
620920 TCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCGTTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTAT
129 TCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * *
620985 GAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCATGCAAGTC-TATTCAAAGTAAAATAAT
193 GAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAA-TCTTATTCGAA-TAAAATAAT
* * * *
621049 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAACGAT
256 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-TA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAATGAT
* * * * *
621114 CCAATTTCA-ATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATA
319 CAAATTT-ATATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
*
621178 ATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCTGAAAAGAATAATACTAATTTAATAATATTATAAAAAT
383 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAAAGAATAATACTAATTTAATAATATTATAAAAAT
* *
621243 TAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCATAT
448 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACTATAT
*
621308 GAACAATTATCAAT
513 G-ACAATTATCTAT
* * *
621322 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTCTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* ** *
621387 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTTATTTAAAAAGTGAAT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * * * * *
621452 TTGTTTACTGAATTAGTTCAAAAAATTATGACCTTGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATT
130 CTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCTT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * * *
621517 ACCTTTTGTTTGGTC------CAATTGTTTTTAAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
194 AACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAAATAATAC
* *
621576 TAATTTATTAATGTTTCAAAAA-T-TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAGCTAG
258 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT--TAA--T-G
* * *
621639 TTCAAAGAGTTATGGCTATTTG-AACAATT-GCAAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTG
317 ATC-AA-A-TT-T--ATA-TTGAAACAATTAGC-TATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTTTG
* * * * * * * *
621702 TCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTC-GAAAAAAAGTCATTCTAATCTAATAAT
373 TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAAAGAA-TAATACTAATTTAATAAT
** * * * * * * * * *
621766 ATTCCAGAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCCGAACCAATTCAAATATT
437 ATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGT
*
621831 TAGGACTATATGTACAATTATCTAT
502 TAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * * * *
621856 TTCGAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-ATTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTATT
* * *
621919 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGACTTAAAAAATAA
64 CGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * * * * **
621980 ATCTGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATCGATCTT-AAATCAT
128 ATCTGTTTACTGAA-TCAGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTGT
* * * * ** * * * *
622043 TATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAACATA
190 TATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAAATA
* * * * * * *
622106 TTCCAAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATGTGTTTGTC
254 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T-
* * * * * ** * * *
622170 GACCCTGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTTGACCTTTTAT
313 -A--ATGATCAAAT--TT---A-TATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * * * * ** * *
622235 TTAGTCATTAAATAATTGTTTCAACTT-ATACATG-TATATT-AAAAATAAAATAACT-CTAAGT
369 TTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCT-TATTCTGAAA-AGAATAA-TACTAATT
* * * * * * **
622296 TATTAACATT-TAGAAAACTAATAAAC-AAGAAATTTAAAAAAACTAATTCTATTTAC--AAATA
430 TAATAATATTATA-AAAATTAAT-AACTAAGAGATTT-AAAAAA-TAAATCTATTTGCTGAAGCA
* * *
622357 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTAT
491 A-TTCAAATAGTTAAGACTATATGACAATTATCTAT
* * * * * * * *
622393 TTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTGATCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * * * * *
622458 AAATAAAATGACATTACTTAATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-T
** * * * *
622523 CAATTTATTGAATCAGTTTAAATAATTATTG-CCGTTTGAGCAATTATGTATTTCAAATTGTTAT
130 CTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTA-TGACC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * *
622587 GAATTTTTGCTTT-GTCATAAAACAATT-TCTTTCCATCATGCAAGTC-TACTCGAAGTAAAAAA
193 GAACTTTTG-TTTGGTCATAAAACAATTGT-TTTTCATCATGCAA-TCTTATTCGAA-TAAAATA
* *
622649 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAGATATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAATG
254 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-TA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAATG
* * * *
622714 ATCCAATTCT-TATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTCTGTTATAAAA
317 ATCAAATT-TATATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *
622778 TAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCTGAAAAGAATAATACTTATTTGATAATATTATAAAA
381 TAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAAAGAATAATACTAATTTAATAATATTATAAAA
* * * *
622843 ATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAAACCAT
446 ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACTAT
*
622908 ATGAACAATTATCAAT
511 ATG-ACAATTATCTAT
* * *
622924 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTTCCTAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * *
622989 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGCGATTTGAAAAGTGAAT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * * * *
623054 TTGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTATGACCTTGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATT
130 CTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCTT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * *
623119 ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTAACATTCAATCTTATTCGGAATAAAATAACAC
194 AACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAAATAATAC
*
623184 TAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T-TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAGTTAG
258 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--TAA--T-G
* * * * **
623247 GTCAAAGAGTTATGGCTATTTG-AACAAATGGAAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGT
317 ATC-AA-A-TT-T--ATA-TTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTTTGT
* * ** * * * * *
623311 CATAAAACAATTGTTTTTGTTGGTAAAAGATTATTC-GAAAA-AAAAATTCTAATCTAATAATAT
374 CATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAAAGAATAATACTAATTTAATAATAT
** * * * * * * * * *
623374 TCCAAAAATTAACAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTATTTCCCGAA-CTAGTTGAAATATTT
439 TATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGC-AATTCAAATAGTT
* *
623438 ACGACTGTATGAACAATTATCTAT
503 AAGACTATATG-ACAATTATCTAT
** * * * * ** * *
623462 TTGGAATCTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTGTACATG-TATATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCT-TATT
** ** * * *
623525 AAAAATAAAATAACT-CTAAGTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAA-CAAGAAATTTTAAAAA
64 CGAAATAAAATAA-TACTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTAA-AAAGTAAGAGA-TTTAAAAA
** * ** * * * *
623587 ATAATTCTACTTAC--AAACAAGTTCAAATTGTTTTGACTATTTG-ATAATTATCTATTTAAAAT
125 ATAA-TCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
*** * * * ** * *
623649 AAATATG-ACATTTTGTTTGATCATAAAATAATTG--TTTCAGTTAATAAAAGT-TTATCCAAAA
187 TGTTATGAAC-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATGCAA-TCTTATTC-GAA
* * * * * * * *
623710 TAAAATGACATTACTTAATTAATATTTTAAAAATTCATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAA
247 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC--
* * * * * *
623775 TTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCGTTTG-AGCTATTATG-TATTTCAAATCGTTATGA
308 TGT-TT-AAT--GATCAAAT--TTAT-----ATTGAAACAATTA-GCTATTTCAAATCATTAT-A
* * * * *
623838 A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-GCATCATGCAAG-TCTATTC-GAAGTAA-AATA
360 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAG-TTCATACAAGCT-TATTCTGAA--AAGAATA
* * * ** * * * *
623898 ATACTAATTTATTAGTATT-TCAAAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAAC
421 ATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-GC
** *
623962 -GATCCAATTC--TTA-TT-----TA-A--ACAATTATCTAT
484 TGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGACAATTATCTAT
* * * * *
623992 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCCTAAAATAATTGCTTTAGTTCATACAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC-
* * * * *
624057 GAAA-AAGATAATACTAATTTAATAGTATTAT-AAAAATTAATAAAG-AAGAGATTTGAAAAATA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAA-AAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-
* * * * * * * * * **
624119 AATATGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTGAAGACCATATGAACAATTACCTATTTCAAATCATT
127 AATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* ** * * ** ** *
624184 ATGACCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATT-TTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
191 ATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTT-TCATCATGCAATCTTATTCG-AATAAAATA
* * * * * * *
624248 ATACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAGAAAGTAAGTGATTCAAAAAGTGAATTTGTTTACTA
254 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T-
* * * * * * * * *
624313 AATTAGTTCGAACAATTATGACCTTGTCAACAATTATCTATTTCTAA-CGGTTATTACATTTTCT
313 AA-T-GATC-AA-ATTTAT-A--TTG-AAACAATTAGCTATTTCAAATC-ATTATAACCTTTTGT
* * * * *** * * * *
624377 TTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAAAATTCAAGCTTATTC-GAAATAAAATAGTACTAATTTAT
369 TTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTTAA
* * * * * *
624441 TAATCTT-TCAAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGCTAGTTCAA
433 TAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGC-AATTCAA
** * * * ****
624501 GGAGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAAT
497 ATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * * * ** *
624531 TTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTTTCCTT-ATACAAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAATAATT-GTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * * ** * * *
624595 CGAAA-AAAATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAGTAACTAAGAGAATAAAAAAATAA
64 CGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * * **
624659 AT-T-TTTCCCGAACCAGGTCAAATAATTAAGA-CTATATGAACAATTATCTAGTTGGAATCT-T
128 ATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-T-TGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGT
* * * * * ** *
624720 TATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCGTACAAAATTATTCAAAATAAAA
190 TATGAAC-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATGCAATCTTATTC-GAATAAAA
* *
624783 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAATAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTGTGA
252 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T-A
* * * * * *
624846 A-GCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAATCATCGATCTT-AAATCATTATCATC-TTT
314 ATG---A-TC-AA-A-TT-T-A-TA-TTGAAACAATTAGCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTT
* * * * * * * * *
624907 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAA-AATATTCCTAAATT
367 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGA-AAAGAATAATACTAATTT
* * * * ** *
624971 AATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACTAAATGTGTTTG-TCGACCCAGTT
431 AATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTATTTGCT-GAAGCAATT
**
625035 CAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTAT
494 CAAATAGTTAAGACTA-TATGACAATTATCTAT
** * * * * * * ***
625068 TTCAAATTGTTTTGACCCTTTG-TTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAATTTATACGTG-TATATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT-TATT
** * * * *
625131 AAAAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAA-CAA-AAATTTAAAAAA
64 CGAAATAAAATAA-TACTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTAA-AAAGTAAGAGATTT--AAAA
* * * ** * *
625192 AATAATTCTATTTA-T-AAACAAGTTCATATTGTTATGA-CTATCTG-ATAATTATCTATTTAAA
124 AATAA-TCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGACCT-T-TGAACAATTATCTATTTCAA
*** * * * * ** *
625253 ATAAATCT-AACCTTTTGTTTGATCATAAAATAATTG--TTTCAGTTAATAAAAGT-TTATCCGA
185 ATTGTTATGAA-CTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATGCAA-TCTTATTCG-
* * * * * * *
625314 AATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTC
245 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
625379 AATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCGTTTAAGCAATTATG-TATTTCAAATCGTTATG
308 --TGT-TT-AAT--GATCAAAT--TTAT----ATTGAAACAATTA-GCTATTTCAAATCATTAT-
* * * * *** * *
625443 AA-TTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTCCATCATGCAA-TTCTATT-TGAAGTAA-AATA
359 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTCTGAA--AAGAATA
* * * ** * * * **
625504 ATACTAATTTATTAATATT-TCAGAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAAT
421 ATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCT
** *
625568 GATCCAATTC--CTA-TT-----TA-A--ACAATTATCTAT
485 GAAGCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGACAATTATCTAT
* * * * * *
625598 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAAATGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC-
* * * * * *
625663 GAAA-AAGATAAAACTAATTTAATAATATTAT-AAAATTTAATAAA-TAAGAGATTTGAAAAATA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAA-AAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-
* * * * * * * **
625725 AATTTGTTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
127 AATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * ** * * ** * *
625790 ATGACCTTTTTTTTTCTCGTAAAATAATT-TTTTT-AGTTCATAAAAGCCTATTCGAAATAAAAT
191 ATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATGCAATCTTATTCG-AATAAAAT
* * ** * * *
625853 AATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAGTAACTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTA
253 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--TA
* * * * ** *
625918 GATTAGTTCAAATAATTATGACCTTGTCAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTT
314 -A-T-GATCAAAT--TTAT-A--TTG-AAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTT
* * * * ** * * * *
625983 TGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCGGAACAA-AATAGTACTAATTTATT
370 TTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAA-AAGAATAATACTAATTTAAT
* * * * *
626047 AATCTT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGCTAGTCCAA
434 AATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGC-AATTCAA
* * * * ****
626106 AGAGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAAT
497 ATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * * * * * *
626136 TTCAAATCATTATAACCTTTT-TGTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * * * * * *
626200 AAA-AAAATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * ** * * * * * *
626264 TTGTTTCCCAAACCAGTTTAAATATTTAAGA-CTGTATGAACAATTATCTATTTCGAATCGTTAT
130 CTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-T-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * ** * *
626328 G-ACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATCA
193 GAAC-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATGCAATCTTATTC-GAATAAAATAA
* * *
626390 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAATATGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTGTGAA-G
255 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T-AATG
* * * * ** *
626452 CCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAATCATCGATCTT-AAATCATTACGATC-TTTGTT
317 ---A-TC-AA-A-TT-T-A-TA-TTGAAACAATTAGCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
626514 TTGTCATAAAAGAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAA-AATATTCCTAAATTAAT
370 TTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGA-AAAGAATAATACTAATTTAAT
* * * * * ** **
626578 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATGTGTTTG-TCGACCCTGTTCAAA
434 AATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCT-GAAGCAATTCAAA
**
626642 TAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTAT
498 TAGTTAAGACTA-TATGACAATTATCTAT
** * * * * * * *
626671 TTCAAATTGTTTTGACCATTT-ATTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTAT-TAA---TATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TT
* ** * * * ** *
626731 C---A-GAAAT--TACTA-GGTA-TGAGATTT-AAAAAGTAAATCTGTTTAACGATCCAATTCCT
64 CGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAA-AAG--TAA-GA---GATT--T
* * * ** ** * ** * * *
626787 ATTTAAACAATTATCTATTT-C-AAATCA-TTGTAA-CCTTTTGTTCTGTT-ATAAAATAAT-TG
120 A---AAA-AATAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-TTGA-ACAATTATCTA
* ** * * * * ** * *
626846 TTTC-AGTTCATAT-AAGCTTAT-TCT-G--AAAAAGATAATACTAATTT-A--AT--AATATTA
179 TTTCAAATTGTTATGAA-CTTTTGTTTGGTCATAAA-ACAATTGT-TTTTCATCATGCAATCTTA
* * * ** * *
626900 -T--AA-AAATTAATA--AA--TA--AGAGATTTGAAAAA-TA-AAT--CTGTTTGCTGAAGCAA
241 TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATT--T-AA-AAA
* * * * *
626951 TTCAAAT-AG-TTAA-GA-C-----CATA-TG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
301 AT-AAATCTGTTTAATGATCAAATTTATATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * * * * *
627005 TTGTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCCTATTC-AAAATAAAATAATACTAAT
365 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAAT
* * * * * * * * * * * ** *
627069 TTATTAATATTACAAAAATAAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACT-AGATTAGT
429 TTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGA-AGCAAT
* * * *
627133 TCAAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTAT
493 TCAAATAGTTAAGA-CTATAT-GACAATTATCTAT
* ** * ** * * * ** ** *
627167 TTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCCTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * *
627232 GAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * * * * * * * **
627293 CTGTTTACT-AAGCTAGTTTAAAGAGTTATTG-CTATTTGAACAATT-GCAAATTTTAAATCATT
130 CTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTA-TGAC-CTTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTT
* * ** * *** * *
627355 AT-AACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATATGAGCTTATTCGAAAAAAAAT
191 ATGAA-C-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTCG-AATAAAAT
* * * * * *
627419 AATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAAT-TCGTTTCC
253 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTT--
* * * * * * * * *
627483 CGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTGTATGAACAATTATCCATTTCGAATCGTTATGACATTTTG
313 --AA-T-GATC-AA-ATTT-ATATTG-A--AACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * ** * *
627548 TTTTGTCATCAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTT
368 TTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTT
* * * *
627611 ATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTG-TGAAGCCAATT
431 AATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAG-CAATT
* * * * *
627670 CAAATAGTTATGACTATTTGATGAATCATCGAT
494 CAAATAGTTAAGACTATATGA-CAATTATCTAT
* * * * * * *
627703 CTT-AAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTGTTC
1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * * ** * * *
627766 GGAGTAAAATATTTCTAAATTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * ** * * *
627830 ATGTGCTTA-TCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGA-CTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGT
128 ATCTGTTTACT-GAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-TT-GAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * * * * * **
627893 TTTGACCCTTTATTTAGTCATGAAATAATTG--TTTCAGTTTATAC-ATGTATATTAAAAATAAA
190 TATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATGCAATCT-TATT-CGAATAAA
* * * * * *
627955 ATAACT-CTAAGTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAATAATTCTAT
251 ATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-AT-AATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGT
* * *** * * * * * *
628018 TTACAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTT
311 TT----A-ATGATCAAAT--TTAT-A-T-TGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
* ** * * * * * *
628083 TG-TTTGATCATAAAATACTCATTTCAGTTAATAAAAGTTTA-TCTG-AAATAA-AATCACATTA
366 TGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAAAGAATAAT-AC-TAA
* * * * * * * ** *
628144 CTTAATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGAATTAAAAAATAAATCAATTTATTGAATG-G
428 TTTAA-TAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAA-GCA
* * * * * * * *
628208 GTTCAAATAATTATGGCTGTTTAAGCAATTATGTAT
491 ATTCAAATAGTTAAGACTATATGA-CAATTATCTAT
* ** * * * *** **
628244 TTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCATGCAAG-TCTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT-TATTC
* * ** * * *
628308 GAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAAGTAAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* **
628373 TCTGTTTAAC-G-ATC----C-AAT--TCT-T-A--TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
129 TCTGTTT-ACTGAATCAGTTCAAATAAT-TATGACCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * *** ** *
628425 T-AACCTTTTGTTCT-GTTATAAAATAGTTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCTGAA-AAAGAT
192 TGAA-CTTTTGTT-TGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAA-AT
* * * *
628487 AATACTAATTAAATAATATTAT-AAAAATTAATAAATAGGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGC
253 AATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT-AT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT--
* * *
628551 CGAA-GCAATTCAAATAGTTAAGACCATATG-AACAATT-GTCTATTTCAAATCATTATGAGCTT
313 --AATG--A-TCAAAT--TT---A-TAT-TGAAACAATTAG-CTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * * * * *
628613 TTGTTTTATCCTAAAACAATT-TTTTAGTTCAAAAAAGTTTATT-TGAAACAAAATAATACTAAT
365 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAAT
* * * * * * * * * * * ** *
628676 TTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATTAGTT
429 TTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATT
* * * *
628741 C-AATAATTATGACCT-TATCAATAATTATCTAT
494 CAAATAGTTAAGA-CTATAT-GACAATTATCTAT
* ** * * ** * * * * ** **
628773 TTCTAATTGTTATTAGCTTTTGTTTGGTCACATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC-
* * *
628838 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTAAAAAATT---AA-T-A-AGATTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* * * * * **** **
628896 TTTGTTTACT-AAGCTAGTTCAAA-AGGTTATGGCTATTTGAACAATTGGAAATTTCAAATCATT
129 TCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATA-ATTATGAC-CTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * ** * * * * *
628959 AT-AACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTCAAAAAAAATA
191 ATGAA-C-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTCGAATAAAATA
* * * * * *
629023 ATTA-TAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCCT
254 A-TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T
** * * * ** * * * *
629087 GAACCAATTCAAATATTTAAGACTGTATGAACAATTATCTATTTGGAATCGTTATGACATTTTAT
313 -AA-TGA-TC-AA-ATTT-ATATTG-A--AACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * ** * *
629152 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTA
369 TTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTTA
* * * * * *
629215 TTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTG-TGAAGCCATTTT
432 ATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAG-CAATTC
* * * **
629274 AAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGAT
495 AAATAGTTAAGACTATATGA-CAATTATCTAT
* * * * * * *
629306 GTT-AAATCATTTTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTTGTTCATAAAAACTTGTTC
1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * * ** * ***
629369 GGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTGGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * ** * * * *
629433 ATGTGTTT-GTCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGA-CTATTAAAACAATTATATATTTCAAATTGT
128 ATCTGTTTACT-GAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-TT-GAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * * * *
629496 TTTGACCCTTTGTTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTATACATGTACAT-TTA---AAATAA
190 TATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTT---TTCAT-CATGCA-ATCTTATTCGAATAA
* * * *
629557 AATAACT-CTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTAAAAAAAATAAT-TC
250 AATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-AT-AATAAGAGATTTAAAAAATA-AATCT-
* *** * *** * *
629619 GATTTACAAATAAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGATAATTTTTTATTTAAAATAAATAATATA
309 G-TTT---AAT--GATCAAA-T-TTAT-A-T-TGAAACAATTAGCTATTTCAAAT-CAT--TATA
* * * * * * ***
629684 ACCTTTTG-TTTGATCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATAAAAGTTTATCCT-AAATAAAATGGC
360 ACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAAT
* * * * * * * * * ** **
629747 ATTACTTTATTAATATTTTGAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTAAATTTATTGAA
423 ACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAA
* * * * * ** * *
629812 TCAGTTCAAATAATTATGGCCGTTTGAGCAATTATATAT
488 GCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGA-CAATTATCTAT
* ** ** * * * *** **
629851 ATCAAATTGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCCTCATGCAAG-TCTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT-TATTC
* * * * **** *
629915 GAAGTCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTACTGGGTATA-AGATTTAAAAAGTAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTA-AGAGATTTAAAAAAT-A
** * **
629979 ATCTGTTTAAC-G-ATC----C-AAT--TCCT-A--TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
128 ATCTGTTT-ACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * *** ** *
630032 T-AACCTTTGGTTCT-ATTATCAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCTGAA-AAGAAT
192 TGAA-CTTTTGTT-TGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAA-AAT
* * **
630094 AATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTGC
253 AATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAA
* * * *
630158 TGAAGC-AATTTAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGA-CTTTT
315 TG-ATCAAATTT--ATA-TT--G-----A--AACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
* * * * *
630221 GTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTT
367 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTT
* ** * * * * * * * * ** *
630285 ATTAATATTGCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTGCTAAATTAGTTCA
431 AATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCA
* * * *
630350 AATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTAT
496 AATAGTTAAGA-CTATAT-GACAATTATCTAT
** ** * ** * * * ** **
630381 TTTTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTC-
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * *
630445 AGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
66 A-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* * * * * * **
630506 TCTATTTACT-AAGCTAGTTCAAA-AAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAATTTCAAATCAT
129 TCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAA-TTATGAC-CTTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGT
* * * ** * ** * * *
630568 TAT-AACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGAAACAAGCTTATTTGAAAAAATA
190 TATGAA-C-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTCGAATAAA-A
* * * * * * * *
630632 TAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGAATAAAAAAATAAATTTGTTTCC
252 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT--
* * * * * ** * * *
630697 CGAACCAGTTAAAATATTTAAGATTGTATGAACAATTATCTATTTGGAATCGTTATGACATTTTG
313 --AA--TGAT-CAA-ATTT-ATATTG-A--AACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * ** * *
630762 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAAATTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTT
368 TTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTT
* * * *
630825 ATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTG-TGAAGCCAATT
431 AATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAG-CAATT
* * * **
630884 CAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGAT
494 CAAATAGTTAAGACTATATGA-CAATTATCTAT
* * * * * * *
630917 CTT-AAATCATTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAGGCTTGTTC
1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * * * ** * * *
630980 GGAGTAAAGTATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * ** * * * *
631044 ATATGTTT-GTCGACCCAGTTCAAATAGTTA-AAACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATTGT
128 ATCTGTTTACT-GAATCAGTTCAAATAATTATGACCT-TT-GAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * * * * * * **
631107 TTTTACCCTTTATTTAGTCATGAAATAATTG--TTTCAGTTTATAC-ATGTATATTAAAAATAAA
190 TATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATGCAATCT-TATT-CGAATAAA
* * * * * * *
631169 CTAACT-CTAATTTGTTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAATTCTAT
251 ATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-AT-AATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGT
* * ** * * * ** * *
631232 TTACAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAATAATTATCTATTTAAAAAAAATATGACCTTT
311 TT----A-ATGATCAAAT--TTAT-A-T-TGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
* * * * * * * * * * *
631297 TG-TTTGATCATAAAAT-ATTGTTTCAATTGATAAAAGTTTA-TCCGAAATAAAATGACATTACT
366 TGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAAT
* * * * * * ** ** *
631359 TTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGT-TAATTTATTGAATTAGT
429 TTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTGCTGAAGCAAT
* * * * * *
631423 TCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTAT
493 TCAAATAGTTAAGACTATATGA-CAATTATCTAT
** * * * *** **
631457 TTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCATGCAAG-TCTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT-TATTC
* * ** * * **
631521 GAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAGGTATGAGATTTAAAAGGTAAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
** * **
631586 TCTGTTTAAC--AATC----C-AAT--TCCT-A--TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
129 TCTGTTT-ACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * *** * *
631639 -ATCCTTTTGTTCT-GTTATAACATAATTGTTTTAGTTCAAT--AAGCTTATTCTGAAAAAAATA
193 GA-ACTTTTGTT-TGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATC-ATGCAATCTTATTC-GAATAAAATA
* *
631700 ATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGCT
254 ATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT--T
* * * * *
631764 GAA-GCAATTCAAATAGTTAAGACCATATG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTT
313 -AATG--A-TCAAAT--TT---A-TAT-TGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
* * * * * *
631827 GTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTGGTTCATAAAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTT
367 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATTT
* * * * * * * * * ** ** *
631891 ATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATTGAATTAGTTCA
431 AATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCA
* * * *
631956 AATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCTAT
496 AATAGTTAAGA-CTATAT-GACAATTATCTAT
* ** * ** * * * ** ** *
631987 TTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAGGCTTATTC-
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* *
632051 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
66 A-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* * * * * * * * * **
632112 TTTGTTTACT-AAACTAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAAATTCAAATCATT
129 TCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTT
* * ** * * * * *
632175 AT-AACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTTGAAAAAATAT
191 ATGAA-C-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTCGAATAAA-AT
* * * * * * * *
632239 AATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATAAAAAAATAATTTTGTTTCTC
253 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG--T-T-
* * * *
632304 TAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
312 TAA--TGATC-AA-ATTT---A-TAT-TGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * *
632368 TTTTGTCATAAAATAAGTT-TATTTGAATTCATACTAGTTTATT-TAGGATAA-AATAA-A-TAA
368 TTTTGTCATAAAATAA-TTGT-TTT-AGTTCATACAAGCTTATTCT--GAAAAGAATAATACT-A
* * * * * * * * *
632428 ATTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAATTCTATTT-ATATAACCA
427 ATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCT-GAAGCA
* * * * * *
632492 ATTTAAATAAATTATGACTACTTTAACAAATATCTAT
491 ATTCAAAT-AGTTAAGACTA-TATGACAATTATCTAT
* ** * * * * * * * *
632529 TTCAAATCATTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAACAAGTGTTTTTGTTGATATAAGTTTGTTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTC
** * * * * * *
632594 -AGAATAAGGTAAAACTA-ATCATTTATATTTCAAAAGTT---AA-TAAGAGTTTTAAAAAATAA
65 GA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * *
632653 ATCTATTTACCG-ATCTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTT
128 ATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* ** ** * * * * * *
632717 ATG-ACTTTTTCTTCTATTTTTAAAA-AGTTGTTTTT-GTCTATACAAGCTTATTTGGATGAAAA
191 ATGAAC-TTTTGTT-TGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATC-ATGCAATCTTATTCGAAT-AAAA
* * *
632779 TAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
252 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * ** * * * **
632843 CCCAGTAAGCTCACATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGATATTTT
314 ---A-T--GATCA-A-A-TT-T-A-TATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
* ** *
632908 -TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAAATAAAATAATACTAATT
367 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAATACTAATT
* * * * ** * * *
632970 TATTAATTTTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAGAAATAAATCTATTTACT-AAACAAGTT
430 TAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAA-TT
* * * * * * *
633034 CAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATATAT
494 CAAATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * * **
633067 TTCAATTCATTATGA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA-AACAAAATTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAA-AAGCTTATT
** * * * *
633129 AAAAATCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAATAGATTTAAAAATTAA
64 CGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * * **
633190 ATCTGTTTA-TGAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATCTT-AAATCAT
128 ATCTGTTTACTG-AATCAGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTGT
* * ** * * *
633253 TATGATCTTTAT-TTT-GTCATAAAACAATTGCTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAAT
190 TATGAACTTT-TGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAAAT
* * * * *
633316 ATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGC
253 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT--
* ** ** * * *
633380 CGA-GCTAGTCAAATAGTTAAGACTATT-AGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTCTGACATTTT
313 -AATG--A-TCAAAT--TT---A-TATTGA-AACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
* * *
633443 GTTTAGTCATGAAATAA-----TT-GTT-AT----GCTTATT-TGAAATAAAATAACT-CTAATT
367 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA-AGAATAA-TACTAATT
** * * * * * * *
633495 TCTTAACATT-TAGAAAATTAATGAA-AAAGA-AATTAAAAAACATAATGCTATTTAC-CAAACA
430 TAATAATATTATA-AAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATA-AAT-CTATTTGCTGAAGCA
* * * *
633556 AGTTCATATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTAT
491 A-TTCAAATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * * * * *
633593 TTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * *
633658 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-T
** * * * **
633723 CAATTTA-TCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTATTTCAAATCATTAT
130 CTGTTTACT-GAATCAGTTCAAATAATTATGACC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
** * * * * * *
633787 GAACTTTTGTTT-GTCATAAAGTAATTGCTTTCCAACATACTAGTC-TATTTGAAATAAAATAAT
193 GAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGC-AATCTTATTCG-AATAAAATAAT
* * * * **
633850 ATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGA
256 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAATGA
* * * * * *
633915 TC-TAGTTACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAA
318 TCAAATTTA-TA-TTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * **
633978 TAATTGTTTCAATTCATATAAGCATATT-TGAAATAAAAATAA-AGCTAATTTAATAATATTCCA
381 TAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTG-AA-AAGAATAATA-CTAATTTAATAATATTATA
* * * * * *
634041 AAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTG-TCGAAGCAGTTCAAATCGTTATGA
443 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCT-GAAGCAATTCAAATAGTTAAGA
* *
634105 CCATATAAACAATTATCTAT
507 CTATAT-GACAATTATCTAT
** * * *
634125 TTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCAGCTCATAAAAGCTTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTT-AGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * **
634189 GAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTGGAAAATGAA
65 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* * * * *
634254 TTTGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCTTGTCAACAGTTATCTATTTCAAATTGTTAT
129 TCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCTT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * *
634319 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-TTTTTGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
193 GAACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTC-GAATAAAATAATA
* *
634383 CTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC
257 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT--T-AA-
* * * * * * *
634448 TAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTAAACAATT-GCAAACTTCAAATCATTATAGCCTTATGTTCT
315 T-GATCAAAT--TTA----TATTGAAACAATTAGC-TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
634512 GTCATAAAAAAATTATTTTTGTTGATGCAAGCTTATTC--AAAAAAAAAATACTAATCTAATAAT
372 GTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAAAGAATAATACTAATTTAATAAT
** * * * * * *
634575 ATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAATTAAATTTATTT-ATCGAACCAATTCAAATAT
437 ATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCT-GAAGCAATTCAAATAG
*
634639 TTAAGACTATATGA-ATAGTTGTCTAT
501 TTAAGACTATATGACA-A-TTATCTAT
* * * ***
634665 TTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTAT-TTTTGAATTCATGCTAGCTTAT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA-T-TGTTTT-AGTTCATAAAAGCTTAT
* * * * * * * *
634729 T-TAGGATAAAATAA-A-TAAATTTCTTAATATTTCAAAACTTAATAACTAAGCGATTTAAAAAA
63 TCGA-AATAAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
634791 TAATTTTGTTTA-TATAAGT-AATTTAAATAATTATGACTATTTTAACAGTTATCTATTTCAAAT
126 TAA-TCTGTTTACT-GAA-TCAGTTCAAATAATTATGAC-CTTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * ** * ** * *
634854 CATTAT-AACCTTTTTCTTTTGTCATAGAACAAATGTTTTTGTTGATATAAGT-TTGTTCAAAGT
187 TGTTATGAA-C-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAA-TCTTATTCGAA-T
** * * * *
634917 AAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTTC-AAAAGT-TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
248 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
*** * ** * *
634979 ACCAATCTAATTTAAATAGCTATGACAATTTGAGCAATTATTTGTTTCAAATCATTATGACCTTT
313 AATGATCAAATTT--ATA--T-TG--AA----A-CAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
* * ** * * *
635044 TGTTCTATTTTAAAATAATTGATTCT-GTTTATACAAGCTTATTC--AAATGAAAATAATACTAA
366 TGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAA--AGAATAATACTAA
* * * * * * * * *
635106 TTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCG-AGCAA
428 TTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAA
* * * * * *
635169 GTTCACATAGTTATGAGTATTTGAATAATTATTTAT
492 -TTCAAATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * *
635205 TTCAAATCATTATGATCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTTATATAAGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * * **
635268 AAAATAAAATAATACTAAC-TTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * *
635332 ATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAGATAGTCT-TGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGT
128 ATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAAT-TATGACC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * ** ** *
635395 TATGATA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAAATTATTCAAAATAAAA
190 TATGA-ACTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATGCAATCTTATTC-GAATAAAA
* * * *
635458 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAATAATAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTGA
252 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT-T-A
* * *
635521 A-GCCAATTCAAATAGTTACGACTATTTG-AACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGA-TTTTT
314 ATG---A-TCAAAT--TT---A-TA-TTGAAACAATTAGCTAT-TTCAAATCATTATAACCTTTT
* * * * * * *
635582 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TAGAGTAA-AATATTTCTAAAT
367 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCT-GA-AAAGAATAATACTAATT
* * * * * * *
635645 TAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGC-CATGCCAGTT
430 TAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAG-CAATT
*
635709 CAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
494 CAAATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* * * * * * * * ** *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * *
635806 AAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAA-CAAGAAATTAAAAAAATA
66 AAATAAAATAA-TACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-AAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * **
635868 ATTCTCTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATCTAAATAATTATCTATTTAAAATAA
128 A-TCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGACCT-T-TGAACAATTATCTATTTCAAATTG
* ** * * ** * *
635931 ATATG-ACATTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTT-AGTTTATAAAAGCTTATTGGAAATAA
189 TTATGAAC-TTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATGCAATCTTATTCG-AATAA
* * * * *
635993 AATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTTAAAAATAAGTAAATTT
250 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATA--ATAAGAGATTT-AAAA-AA-TAAATCT
* ** * * * **
636057 ATCGAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATTTG-AGCAATTATG-TATTTCAAATTGTTATGAA-C
309 GTTTAA-T-GATCAAAT--TTAT----A-TTGAAACAATTA-GCTATTTCAAATCATTAT-AACC
* * * * *** *
636119 ATTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTCCATCATACAAG-TCTATTCGGAATAA-AATAATACT
363 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTCTGAA-AAGAATAATACT
* * * * * * * *
636182 AATTTATTAGTATT-TCAAAAATTCATAAGTAAGTGATTTTAAAAATTAAT-T-TGTT--T--AC
426 AATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTGCTGAAG
* * * *
636240 CAA-TC-CA-A-TT---CCTATTTGAATAATTATCTAT
489 CAATTCAAATAGTTAAGACTATATG-ACAATTATCTAT
* ** * * * *
636271 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCCATTATAAAATAATTGTTTTAGTTGATATAAGCTTATTGG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* * * * * *
636336 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * * * *
636401 CTGTTTGCCGAAGCAGTTCAAATAATTCA--AACTATATGGACAATTATCTATTTCAAAATT-TT
130 CTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATT-ATGACCT-T-TGAACAATTATCTATTTC-AAATTGTT
* * *
636463 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATCAA-TG--TTTCAATTCATACAAGT-TTATTCGAAATAAA
191 ATGAACTTTTGTTTGGTCATAAAA-CAATTGTTTTTC-A-TCATGCAA-TCTTATTCG-AATAAA
*
636524 A-AATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTA
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636555 AAAAGTAAGT
Statistics
Matches: 14373, Mismatches: 3324, Indels: 2624
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
491 3 0.00
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Consensus pattern (525 bp):
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATC
TGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA
CTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAATCTTATTCGAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTTCAAAAATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAATGATCAAATTT
ATATTGAAACAATTAGCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
AGTTCATACAAGCTTATTCTGAAAAGAATAATACTAATTTAATAATATTATAAAAATTAATAACT
AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGACAATTA
TCTAT
Found at i:626592 original size:176 final size:177
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 6.1 Consensus size: 177
625568 GATCCAATTC
* * * * * * *
625578 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAAATGTTTT
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* * * * * *
625643 AGTTCATATAAGCTTATTCTGAA-AAAGATAA-AACTAATTTAATAATATTAT-AAAATTTAATA
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* * * *
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126 ACT-AGAGA-TTAAAAAATAAATATGTTT-CTGAAGCCAGTTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAA-TATCGATTTCAAATCATTATGA-C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * *
625823 TAGTTCATAAAAGCCTATTCGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAG
63 T-GTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATTACTAAATTAATAATATTTCAAAAATT--AA-
* * * * ** * *
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124 TAACTAGAGATTAAAAAATAAATATGTTT-CTGAAG-CCAGTTCAAATAGTTAAGA
* * * * ** * * *
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1 -CTATTTGAACAA-TATCGATTTCAAATCATTATGA-C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** ** * * * * *
626003 TTGAACATTCAAGCTTATTCGGAACAAAAT-AGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAAT-A
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* * * * * *
626066 --AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAGCTAGTCCAAAGAGTTATGG
127 CTAGAGA-TTAAAAAATAAATATGTTT-CTGAAGCCAGTTCAAATAGTTAAGA
* * *
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1 CTATTTGAACAATATCG--ATTTCAAATCATTATGA-CTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
626179 TTGTTGATACAAGCTTATTC-GAAAAAAATAATT-CT-AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATA
62 TTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATTACTAAAT-TAATAATATTTCAAAAATTAATA
* * ** * * *
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126 ACT-AGAG-ATTAAAAAATAAATATGTTTCTGAAGCCAGTTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * *
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1 CTATTTGAACAA-TATCGATTTCAAATCATTATGAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * ** * * *
626360 ATTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATCA-TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-
64 GTTCATA-AAAGCTTATTCGGAATAAAATAATTACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAATAAC
* * *
626421 T-GAGACTTAAAAAATAAATATGTTTGTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGA
128 TAGAGA-TTAAAAAATAAATATGTTTCTGAAGCCAGTTCAAATAGTTAAGA
* * *
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1 CTATTTGAACAAT-ATCGAT-TTCAAATCATTATGA-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * *
626535 TGTTCATAAAAGCTTGTTCGGAGTAAAAT-ATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAA
63 TGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATTACTAAATTAATAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * * *
626598 GTAAGAGATTCAAAAAATAAATGTGTTTGTCG-ACCCTGTTCAAATAGTTAAGA
127 CT-AGAGATT-AAAAAATAAATATGTTTCT-GAAGCCAGTTCAAATAGTTAAGA
** *
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1 CTATTTGAACAA-TATCGATTTCAAAT
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Statistics
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Consensus pattern (177 bp):
CTATTTGAACAATATCGATTTCAAATCATTATGACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
TCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATTACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAG
AGATTAAAAAATAAATATGTTTCTGAAGCCAGTTCAAATAGTTAAGA
Found at i:630374 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 630007--636707 Score: 4031
Period size: 180 Copynumber: 37.5 Consensus size: 179
629997 TTCCTATTTA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * * *
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66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * ** * *
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** ** * * * * **
630368 AACAATTATCTATTTTTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTT-GAACA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCA
* * * *
630432 TTCAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAG
65 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
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129 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGAC--TTTG
* * * * *
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1 AACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTT
* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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127 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-T-TG
** * * * * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCA
** **
630791 TACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * *
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130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGAC--TTTG
* * ** * * *
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1 AACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTC
* * * * * * * * * *
630966 ATA-AAGGCTTGTTCGGAGTAAAGTATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAGG
64 ATACAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * ** *
631029 AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GTCGACCCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAA
127 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-TT-G
** * * * * * * * * *
631084 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACCCTTTATTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* ** * * * **
631149 ACATG-TATATTAAAAATAAACTAACT-CTAATTTGTTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGA
66 ACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA
* * * *
631211 AATTTTAAAAAAT-AATTCTATTTAC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCT-
128 GA-TTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-T-TG
* * ** * * * * *
631264 AATAATTATCTATTTAAAAAAAATATGACCTTTTG-TTTGATCATAAAAT-ATTGTTTCAATTGA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTTTTTTAGTTCA
* * ** * * * * * * *
631327 TAAAAGTTTATCCGAAATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * ** * *
631392 TTTAAAAAATAAGTTAATTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTG
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAT-GAC-TTTG
* * ** * ** ***
631444 AGCAATTATGTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * * * * *
631509 GCAAG-TCTATTCGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAGGTATGAGA
66 ACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
** * * * ** *
631573 TTTAAAAGGTAAATCTG-TT--T-AA-CA-ATCCAAT--TCCT-A-TTTA
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTTTG
* * * *
631613 AACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTGTTATAACATAATTGTTTTAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCA
* *
631677 -ATAAGCTTATTCTGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGA
65 TACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * *
631739 GATTTGAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCATATG
128 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-C-TTTG
* * * * *
631793 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTGGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * * * *
631858 AAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTGAT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * ** * *
631923 TTAAAAAGTGAATTTGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGACCTTGTC
131 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTT-TG
* ** * * * * **
631974 AACAATTATCTATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTT-GAACA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCA
* * * *
632038 TTCAGGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAG
65 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
632098 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC--TTTG
* * * * *
632151 AACAATT-GCAAAATTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTT-GTT
1 AACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTT
* * * * * *
632214 GATACAAGCTTATTTGAAA-AAATATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAG
63 CATACAAGCTTATTTGAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
632278 AGAATAAAAAAATAATTTTGTTT-CTCTAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATG
127 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-T-TG
* *
632333 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTATTTGAATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTT-TTTTAGTTC
* * * * *
632398 ATACTAGTTTATTT-AGGATAAAATAA-A-TAAATTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAG
64 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
632460 AGATTTAAAAAA-CAATTCTATTTA-TATAACCAATTTAAATAAATTATGACTACTTT
127 AGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACT-GAACCAGTTCAAAT-AGTTATGACT--TTG
* * ** * * *
632516 AACAAATATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAACAAGTGTTTTT-GTTG
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAA-TTTTTTTAGTTC
* * ** * * * *
632580 ATATAAG-TT-TGTTCAGAATAAGGTAAAACTAA-TCATTTATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAG
64 ATACAAGCTTAT-TTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * *
632638 AGTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGATCTAGTTCAAATAATTATAACTATTTG
127 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC--TTTG
* * ** * * ** *
632693 AGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTCTAT-TTTTAAAA-AGTTGTTTTT-G-T
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTT
* *
632754 CTATACAAGCTTATTTG-GATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-A
63 C-ATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* ** *** * * *
632817 GAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAGTAAGCTCACATAGTTATGACTATTTA
126 G-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC--TTTG
* * * ** * *
632874 AACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGATATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCA
** * * **
632937 TACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
633002 TTTAAGAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTG
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATG-AC-TTTG
* * * * * *
633054 AACTATTATATATTTCAATTCATTATGA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCA
* ** ** *
633117 AACAAAATTATTAAAAATCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGA
65 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *
633178 TTTAAAAATTAAATCTGTTTA-TGAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTG-AACCAGTTCAAATAGTTATGAC--TTTG
* * * * * *
633230 AATAATTTTCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTTT-GTTC
1 AACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTC
* * * * * * *
633292 ATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTATTAAGTAAG
64 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
633355 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAGCTAG-TCAAATAGTTAAGACTATTAG
127 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-TT-G
* ** * * * *
633409 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATGAAATAA-----TT-GTT-AT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * *
633467 ----GCTTATTTGAAATAAAATAACT-CTAATTTCTTAACATTT-AGAAAATTAATGAA-AAAGA
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGA
* * * * ** * *
633525 -AATTAAAAAACATAATGCTATTTACCAAACAAGTTCATATAGTTATGACTATCTG
128 GATTTAAAAAATA-AAT-TTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-T-TG
* * * * * * * *
633580 AATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* *** * * * * *
633645 AAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGAT
66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* *** * * *
633710 TTAAAAAATAAGTCAATTTA-TCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTG
131 TTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTAT-GAC-TTTG
* * * * ** ****
633761 AGCAATTATGTATTTCAAATCATTATGAACTTTTG-TTTGTCATAAAGTAATTGCTTTCCAACAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * * *
633825 ACTAG-TCTATTTGAAATAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATGAGA
66 ACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
*
633889 TTTAAAAAAATAAATTTG-TT--T--ACC-GATC---TAGTTACT-A-TTTG
130 TTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTA-TGACTTTG
* * * * * * *
633930 AACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * * * *
633995 ATAAGCATATTTGAAATAAAAATAA-AGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAG
66 ACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
634059 ATTTGAAAAATAAATTTGTTT-GTCGAAGCAGTTCAAATCGTTATGACCATATA
129 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGA-C-TTTG
** * * * *
634112 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCAGCTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * * *
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66 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
** * * ** * *
634242 TTGGAAAATGAATTTGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCTTGTC
131 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTT-TG
* ** * * * * **
634293 AACAGTTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTT-GAACAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCAT
* * *
634357 TCAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
66 ACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
634421 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTA
130 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC--TTTG
* * * * * *
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1 AACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTT
* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TTTTTTAGTTC
* * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATA-AA-ATAATTTTTTTAGTT
* * * ** * * *
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63 CATACAAGCTTAT-TTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * **
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* * *
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* * ** * *
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* ** ** *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * ** * * * *
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** ** * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * * ** ***
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* * * * *
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* * * * **
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* * *** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTT-AGTTC
* * *
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* * * *
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* * * * *
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*
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*
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*
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* ** * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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** *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * *
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194 T-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * * * * *
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258 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
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** * * * * * * ** * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCAT
* * * * * **
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* * * * * *
627997 AATTTAAAAAAATAATTCTATTTAC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ATAATTATC
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * * * *
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*** ** *** * * *
628189 AAATCAATTTATTGAATGGGTTCAAATAATTATG-GCTGTTT
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* * ** * **
628230 AAGCAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCA
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* * * *
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* * * * *
628358 GATTTAAAAAGTAAATCTG-TT--T-AAC--GATC-CA-A-TTCT---TATTTAAACAATTATCT
128 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
628411 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAGTTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATT
193 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * * *
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258 -TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
628539 AAATCTGTTTGCCGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCATATG
321 AAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACC-TTTG
* * * * * * *
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* * * * * * *
628645 AAAAGTTTATT-TGAAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTGA
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* * * * * * * *
628709 TTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATTAGTTC-AATAATTATGACCT-TATCAATAATTATCTA
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTA
* ** * * * * * * * ** **
628772 TTTCTAATTGTTATTAGCTTTTGTTTGGTCACATAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTC
194 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT-
* *
628837 TG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTT-AAAAA--ATTAA-T-A-AGATTTAAAAAATAA
258 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *
628895 ATTTGTTTA-CTAAGCTAGTTCAAA-AGGTTATGGCTATTTG
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**** * * * *
628935 AACAATTGGAAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCA
* * * * *
629000 TACAAGCTTATTCA-AAAAAAATAATTA-TAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAG
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * * *
629063 AATAAAAAAATAAATTTGTTTCCTGAACCAATTCAAATATTTAAGACTGTATGAACAATTATCTA
129 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * * *
629128 TTTGGAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAA-ATTAT
194 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTAT
** *
629191 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATA
257 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* ** * * *
629252 AATATGTTT-GTGAAGCCATTTTAAATAGTTATGACTATTTG
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* * ** * * * *
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* * * * * * * * * **
629356 TAAAAACTTGTTCGGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTGGTAAGTAAGAG
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* * * * * * ** *
629420 ATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGACCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATAT
129 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
** * * * * * * * * *
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320 TA-AATTTG-TTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC-CTTTG
* * * * * * * ** *
629655 -ATAATTTTTTATTTAAAATAAATAATATAACCTTTTG-TTTGATCATAAAATAATTGTTTCAGT
1 AACAATTATCTATTTCAAAT-CAT--TATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTGA
* * * * *** * * ** * *
629718 TAATAAAAGTTTATCCTA-AATAAAATGGCATTACTTTATTAATATTTTGAAAATTGATAAGTTA
62 TCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* *** * * * * ** *
629782 GAGATTTAAAAAATAAGTAAATTTATTGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCCGTTTGAGCAATTA
126 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** ** * * *** **
629846 TATATATCAAATTGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCCTCATGCAAG-TC
190 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT-
* * * * * **
629910 TATTCGAAGTCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTACTGGGTATA-AGATTTAAAA
254 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAA
* * * * * *
629974 AGTAAATCTGTTTAACGATCCAATTC--CTA-TT-T-A------
318 AATAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCTTTG
* * * * * * * * *
630007 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTGGTTCTATTATCAAATAATTGTTTTAGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCAT
* * * *
630072 ATAAGCTTATTCTGAA-AAGAATAATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAG
66 ACAAGCTTATTCAGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * *
630135 ATTTGAAAAATAAATCTGTTTGCTGAAGC-AATTTAAATAGTTAAGACCATATGAACAATTATCA
129 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *
630199 ATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
193 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * *
630263 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGA
258 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** ** * *
630328 ATTTGTTTGCTAAATTAGTTCAAATAATTATGACCTTGTC
323 ATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCTT-TG
** ** * * * *
630368 AACAATTATCTATTTTTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCAT
* * *
630433 TCAAGCTTATTCAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
630494 TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAGCTAGTTCAAAAAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAAT
131 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TAT
* * * * * *
630558 TTCAAATCATTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGA-AACAAGCTTATT
195 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAA-AAGCTTATT
* * * * * * * *
630622 TGAAA-AAATATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGAATAAAAAAATA
258 TGAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * *
630686 AATTTGTTTCCCGAACCAGTTAAAATATTTAAGA-TTGTATG
322 AATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCT-T-TG
** * * * *
630727 AACAATTATCTATTTGGAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCG
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCA
** *
630791 TACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * * * **
630852 CTTAAAAAATAAATATGTTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCATAGA
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
630916 TCTT-AAATCATTACGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAGGCTTGTT
194 T-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * * * * * *
630979 CGGAGTAAAGTATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATA
258 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* ** * * * *
631043 AATATGTTTGTCGACCCAGTTCAAATAGTTA-AAACTATTAA
322 AATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCT-TT-G
** * * * * * * * ** * *
631084 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACCCTTTATTTAGTCATGAAATAATTGTTTCAGTTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCAT
* * * * * * **
631149 ACATG-TATATTAAAAATAAACTAACT-CTAATTTGTTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGA
66 ACAAGCT-TATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * *
631211 AATTTTAAAAAATAATTCTATTTAC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCT-AATAATTATC
128 GA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** * * * * *
631274 TATTTAAAAAAAATATGACCTTTTG-TTTGATCATAAAAT-ATTGTTTCAATTGATAAAAGTTTA
192 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA
** * * * * * * *
631337 TCCGAAATAAAATGACATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT
256 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** ** ** * *
631402 AAGTTAATTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTG
321 AAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACC-TTTG
* * ** * **
631444 AGCAATTATGTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTCCATCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCAT
* * * *
631509 GCAAG-TCTATTC-GAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACTAGGTATGAG
66 ACAAGCT-TATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
** * * * *
631572 ATTTAAAAGGTAAATCTG-TT--T-AAC-A-ATC-CA-A--T-T-CCTATTTAAACAATTATCTA
129 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * *
631625 TTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTGTTATAACATAATTGTTTTAGTTCA-ATAAGCTTATT
194 TTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* *
631688 CTGAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAAT
258 -TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
631751 AAATCTATTTGCTGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCATATG
321 AAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACC-TTTG
* * * * * *
631793 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATT-TTTTTGGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-GATCA
* * * *
631857 TAAAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTG
65 TACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * *
631921 ATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTATCT
129 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT
* ** * * * * * ** ** *
631985 ATTTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAGGCTTA-T
193 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* *
632049 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
258 TGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
** * * * *
632110 AATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTG
322 AATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC-CTTTG
* * * * * * *
632151 AACAATT-GCAAAATTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTG
1 AACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATC
* * * * * * *
632215 ATACAAGCTTATT-TGAAAAAATATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGA
64 ATACAAGCTTATTCAGAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * *
632279 GAATAAAAAAATAATTTTGTTT-CTCTAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATC
128 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** *
632343 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TATTTGAATTCATACTAGTT
192 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGT-TTT-AGTTCATAAAAGCT
* * *
632407 TATTT-AGGATAAAATAA-A-TAAATTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAA
254 TATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * *** * * *
632469 AAA-CAATTCTATTTATATAACCAATTTAAATAAATTATGACTACTTT-
317 AAATAAATT-TGTTTACCGAACCAGTTCAAAT-AGTTATGAC--CTTTG
* * ** * * *
632516 AACAAATATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAACAAGTGTTTTTGTTGA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTGATCA
* * * ** * * * * *
632581 TATAAGTTTGTTCAGAATAAGGTAAAACTAA-TCATTTATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGT
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * * * *
632641 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGATCTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAGCAATTATTTAT
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * ** * * *
632706 TTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTCTAT-TTTTAAAA-AGTTGTTTTTG-TCTATACAAGCTTAT
195 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTC-ATAAAAGCTTAT
* * *
632768 TTG-GATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAAAA
257 TTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAA
* *** * * * *
632831 TAAATTTGTTTACCCAGTAAGCTCACATAGTTATGACTATTTA
320 TAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC-CTTTG
* * * ** *
632874 AACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGATATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCA
* * * * **
632937 TACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGA
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * * *
633002 TTTAAGAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATATAT
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * **
633067 TTCAATTCATTATGA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA-AACAAAATTATT
195 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAA-AAGCTTATT
** * *
633129 AAAAATCAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAATTAA
258 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *
633190 ATCTGTTTA-TGAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG
323 ATTTGTTTACCG-AACCAGTTCAAATAGTTATGAC-CTTTG
* * * * * *
633230 AATAATTTTCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTGTTCA
1 AACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCA
* * * * * *
633293 TACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTATTAAGTAAGAG
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * * *
633357 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAGCTAG-TCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTA
129 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * *
633421 TTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAGTCATGAAATAA-----TT-GTT-AT----GCTTATTT
194 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTT
* * * * *
633475 GAAATAAAATAACT-CTAATTTCTTAACATTT-AGAAAATTAATGAA-AAAGA-AATTAAAAAAC
259 GAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
633536 ATAATGCTATTTACCAAACAAGTTCATATAGTTATGA-CTATCTG
321 A-AAT-TTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCT-T-TG
* * * * * * **
633580 AATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG-TTTCAATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCA
* * * * * * * *
633644 TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGA
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * * * * * *
633709 TTTAAAAAATAAGTCAATTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATGTA
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * **** **
633773 TTTCAAATCATTATGAACTTTTG-TTTGTCATAAAGTAATTGCTTTCCAACATACTAG-TCTATT
194 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT-TATT
* * *
633836 TGAAATAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAAATA
258 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATA
633901 AATTTGTTTACCG----A--TC---TAGTTACT-A--TTTG
322 AATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-TGACCTTTG
* * * * * **
633930 AACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTG-TTTCAATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCA
* * * * * *
633994 TATAAGCATATT-TGAAATAAAAATAA-AGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAG
65 TACAAGCTTATTCAG-AAT-AAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * *
634057 AGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAGC-AGTTCAAATCGTTATGACCATATAAACAATTAT
127 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
** * * *
634121 CTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCAGCTCATAAAAGCTT
191 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-AGTTCATAAAAGCTT
* * * **
634185 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTGGAAAA
255 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* ** * *
634250 TGAATTTGTTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCTTGTC
320 TAAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCTT-TG
* ** * * * *
634293 AACAGTTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-TTTTTGAACAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCAT
* *
634357 TCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
634422 TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTAAACAATT-GCAAAC
131 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TAT
* * * * * * **
634486 TTCAAATCATTAT-AGCCTTATGTTCTGTCATAAAAAAATTATTTTTGTTGATGCAAGCTTA-TT
195 TTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTT
* * * * * * * *
634549 CAAA-AAAAAAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAATTAAA
259 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
634613 TTTATTTATCGAACCAATTCAAATATTTAAGA-CTATATG
324 TTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACCT-T-TG
* * * * * * *
634652 AATAGTTGTCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTATTTTTGAATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG-A-TC
* * * * * * * *
634717 ATGCTAGCTTATTTAGGATAAAATAA-A-TAAATTTCTTAATATTTCAAAACTTAATAACTAAGC
64 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * *
634780 GATTTAAAAAATAATTTTGTTTA-TATAAGTAATTTAAATAATTATGACTATTTTAACAGTTATC
128 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
634844 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTTCTTTTGTCATAGAACAAATGTTTTTGTTGATATAAG-TT-
192 TATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA
* ** * * *
634907 TGTTCAAAGTAAGGTAAAACTAA-TCATTAATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAA
256 T-TTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * *
634967 ATAAATCTATTTACC-AATCTAATTTAAATAGCTATGACAATTTG
319 ATAAATTTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGAC-CTTTG
* * * * * ** * * * * *
635011 AGCAATTATTTGTTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATTTTAAAATAATTGATTCTGTTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCAT
* * *
635076 ACAAGCTTATTCA-AATGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAA
66 ACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * * * * *
635140 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAGCAAGTTCACATAGTTATGAGTATTTGAATAATTATTTAT
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
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195 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTT
* * * * **
635268 AAAATAAAATAATACTAACTTATTACTATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAA
259 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
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324 TTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGT-TATGACC-TTTG
* * ** *
635372 AACTATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCA
* ** * *
635436 TAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGA
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
635497 TTTAAAAAATAAATGTATTT-GTGAAGCCAATTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTATCTA
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * *
635561 TCTT-AAATCATTATGA-TTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
194 T-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * *
635624 T-AGAGTAAAATATTTCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
258 TGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
635687 AAATGTGTTTGCC-ATGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG
321 AAATTTGTTTACCGA-ACCAGTTCAAATAGTTATGAC-CTTTG
* * * ** * * **
635729 AACAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGCTTAATCAT-GAATAATTG-TTTCAATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCA
** * * **
635792 TACATTCTTATTCAAAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGA
65 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * *
635855 AATTAAAAAAATAATTCTCTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCT
128 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * *
635920 ATTTAAAATAAATATGACATTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTTAGTTTATAAAAGCTTATT
193 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * * *
635985 GGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTT-AAAAATA
258 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATA
* *** * ** * * *
636048 AGTAAATTTATCGAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATTTG
322 AATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACC-TTTG
* * ** * * * * **
636089 AGCAATTATGTATTTCAAATTGTTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTCCATCAT
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* * * *
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* * * * * * *
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* *** * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * **
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* * *
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** * * * * * * * * * * *
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* ** * * * * * * *** ***
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* * * * * ** *
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255 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTTCAAA-AATTA--A-TAAGT-AAGAGATT
** * * ** *
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* * * * * ** *** ** ** *
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1 -AA-CAA-TTAT-CT-ATTTCA-AATCATT--ATGACCTT--TTGTTTTG-TCA-T-AAAA-CAA
* * * * ** ** * ** * *** **
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* * * * *** ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * *
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*
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* * * *
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* * * *
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** * * * * *
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* ** *
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* * * *
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** *** * * * *
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* * ** * * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCA
* * * * * **
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* * * * * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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Statistics
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* * * *
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* * * ** * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * ** * * * * * * *
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* * * * * * ** *
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**
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* * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * ** *
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* * ** * *
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* * ** * * ** *** *
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* * * * * *
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* * * * * *** *
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* * * *
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**** * * * * * ***
628933 TGAACAATTGGAAATTTCAAATCATTATAACCT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGT
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *** * **
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* * * * *
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* ** * * * * * * * **
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312 AAATAAATCTGTTTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTAT-TTCAA
* * * * ** * *** * ** * ** *
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376 ATTATTATGACCTTTTGCTTAATCAT-AAATAATTGTTTCAATTCATACAGTCTTATTCAAAATA
* * * * * ** ** * * * * *
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** * * * * * * * *** * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * *** * *
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* * * ** * *
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* * * * ** * * *
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* ** * * *** * * ** *
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* * * * * * ***
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* * * * **
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * *
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* ** * * *** ** * **
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* ** ** * * * *
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* * * * * ** * *
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*** * * * *
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* * * * *
630622 TGA-AA-AAATATAATTCT-AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGAATAAAAAAA
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* * * * * * ** *
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*** * * ** * * * * *
630872 GTGAAGCCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGATCAATCAT-AGATCTT-AAATCATTACGATC
506 ACCAA-ACAAGTTCAAATAATTATGACTA-TCAAACAATTATCA-AT-TTAAAATAAATATGA-C
* * * * * *
630934 -TTTGT-TTTG-TCATAAAACAATTGTTTTT-G-TTCATAAAGGCTTGTTCGGAGTAAAGTATTG
566 ATTT-TATTTGATCATAAAACAATT-TTTTTAGATT-AT-AA-GCTTATTTGGAATAAAATAATA
* ** * * * * * * ** * *
630994 CTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAC
626 TTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTA-AAGATTT-AAAAATAAGTAAATTTATCGAA
** * * *** *
631058 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATT
689 TTAGTTTAAATAATTATGGCCATT
** * * * *** * * *
631082 AAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACCCTTT-ATTTAGTCATGAAATAATTGTTT-CAGT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATAATTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCCA-T
* * ** * * * *
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64 TCATAAAAAAT-TATTCAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AA-
* * * ** * * * *
631207 AAGAAATTTTAAAAAATAATTCTATTTACAA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCT-AATAAT
124 TAG--A-TTTAAAAAATAAATGTATTTGTAAGCCAA-TTCAAATAGTTA-CACTATTTGAACAAT
** * * * ** * * * * *
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184 TATCTATCTT-AAATCATTAT-AACTTTTATTCCATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAG
* * * * * ** * * * * *
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247 CTTAT-TGAGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
* * * ** * * * * * *
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311 AAAATAA-AT-CTGT-TTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTT
* ** * ** * * * *
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373 CAAATTATTATGACCTTTTGCTTAATCAT-AAATAATTG-TTTCAATTCATAC-AGTCTTATTCA
* * * *** * * * **
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435 AAATAAAATAACT-CTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTAAAAAAATAA
* * * ** * * * * *
631585 ATCTGTTT----AACAA--TCCAAT--TCCT-A-T-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
498 TTCTCTTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATCAAACAATTATCAATTTAAAATAAATAT
* * * * * * *
631639 -ATCCTTTTGTTCTG-TTATAACATAATTGTTTTAG-TTCAATAAGCTTATTCT-GAAAAAAATA
563 GA-CATTTTATT-TGATCATAAAACAATTTTTTTAGATT--ATAAGCTTATT-TGGAATAAAATA
* * * * ** * ** *
631700 ATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATA-ACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTT-GC
623 ATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTT-AAAAATAAGTAAATTTATC
** * * * * * *
631763 TGAAGCAATTCAAATAGTTAAGACCATA
686 -GAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATT
** * * * ***
631791 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCCTAAAATAATTTTTTTGGTTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATAATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCCATTC
** * * *
631856 ATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAAAAAGTAAGTG
66 ATAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-A--G
* * * ** * * * * *
631921 ATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATTG-AA-TTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGTCAACAATTAT
127 ATTTAAAAAAT-AA-ATGTAT-TTGTAAGCCAATTCAAATAGTTA-CA-CTATTTGAACAATTAT
* ** * * *** * * ** * *
631983 CTAT-TTCTAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAGGCTT
187 CTATCTT-AAATCATTA-TAACTTTTATTCCATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT
* * * *
632047 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAA
250 ATTGAGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * * * * *
632107 ATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATT-GCAAAATTCAAAT
314 ATAAATCTGTTTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATC-TATTTCAAAT
* * * ** * * *** * *
632171 CATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTGATACAAG-CTTATTTGAAAA-
378 TATTATGACC-TTTTGCTTAATCAT-AAATAATTGTTTCAATTCATAC-AGTCTTA-TTCAAAAT
* * * * * * *
632234 AATATAATTCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAT-AACTAAGAGAA-TAAAAAAATAATTTT
439 AAAATAACTCTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAAC-AAGA-AATTAAAAAAATAATTCT
* * * * * * * * *
632297 GTTT-CTCTAACCAGTTCAAATATTTAAGACTAT-ATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
502 CTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATCA--AACAATTATCAATTTAAAATAAATATG
* * * * *
632360 ACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAAGTTTATTT-GAATTCATACTAGTTTATTTAGG-ATAAAAT
564 ACATTTT-ATTTGATCATAAAACAA-TTTTTTTAG-ATT-ATA--AGCTTATTT-GGAATAAAAT
* * * * * * * **
632422 AA-ATAAATTTATTAATATTTTAAAACTTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAACAATTCTATTTAT
622 AATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTT-AAAAATAAGTAAATTTAT
** ** * * *
632485 ATAACCAATTTAAATAAATTATGACTACTT
685 CGAATTAGTTTAAAT-AATTATGGCCA-TT
* * * * * * ***
632515 T-AACAAATATCTATTTCAAATCATTAT-A-ACCTTTCATTTTGTCATAAAAACAAGTGTTTTTG
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATA-ATTT-GTTTTATCAT-AAAACAATTGTTTCCA
* * ** * * ** * * * * * *
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63 TTCATAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGA
* *** * * * * * * *
632641 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGATCTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAGCAATTATTTAT
128 TTTAAAAAATAAATGTATTT-GTAAGCCAATTCAAATAGTTA-CACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * ** * *
632706 -TTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTCTATTTTTAAAA-AGTTGTTTTTG-TCTATACAAGCTTAT
191 CTT-AAATCATTATAAC-TTTTATTCCA-TCATAAAACAATTGTTTTAGTTC-ATACAAGCTTA-
* * * * *
632768 TTG-G-ATGAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGT-AGAAAATTTAAAA
251 TTGAGAAT-AAAATAATACTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAG-AGATTTAAAA
* * * ** * * * * * * * *
632829 AATAAATTTGTTTACCCAGTAAGCTCACATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAAT
313 AATAAATCTGTTTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT
** ** * ** * * *
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378 TATTATGACCTTTTGCTTAATCAT-AAATAATTGTTTCAATTCATAC-AGTCTTATTCAAAATAA
** ** **** * * * * *
632957 AATAA-TACTAATTTATTAATTTTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAGAAATAAATCTATT
441 AATAACT-CTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTAAAAAAATAATTCTCTT
* * * * * ** * * * * *
633021 TACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTAT-ATATTTCAATTCATTATGA-AT
505 TACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTA-TCAAACAATTATCA-ATTTAAAATAAATATGACAT
* * * ** *** * *
633084 TTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCT--ATTCAAACAAAATTATTAAAAATCAAATAATACT
568 TTT-ATTTGATCATAAAACAATT-TTTTTAGATT---ATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATT
* * * *** *
633146 AATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A---TAATAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTAT-GAAAC
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* * * * * *
633205 CAATTCAAATAGTTATGACTATT
690 TAGTTTAAATAATTATGGCCATT
* * * * * * **
633228 TGAATAATTTTCTATCTT-AAATCATTATGAT-CTTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-TGT
1 TGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGATAATTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCCAT
* ** * * * * * * * *
633290 TCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTCCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAG
64 TCATAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAT
* ** * * * * *
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125 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTG-TAAGCCAATTCAAATAGTT-ACACTATTTGAACAATTATC
** * * * * * *
633419 TAT-TTCAAATTGTTCTGACATTTTGTT-TAGTCATGAAATAA-----TT-GTT-AT----GCTT
188 TATCTT-AAATCATTATAAC-TTTTATTCCA-TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT
* ** * * *
633471 ATTTGA-AATAAAATAACT-CTAATTTCTTAACATT-TAGAAAATTAATGAA-AAAGA-AATTAA
250 A-TTGAGAATAAAATAA-TACTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * * * *
633531 AAAACATAATGCTATTTACCAAACAAGTTCATATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTA
311 AAAATA-AAT-CTGTTTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
633596 AAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAG-CTTATCCAAA
374 AAATTATTATGACCTTTTGCTTAATCAT-AAATAATTGTTTCAATTCAT-ACAGTCTTATTCAAA
* * * ** * *** * * *
633660 ATAAAATAA-TATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTC
437 ATAAAATAACT-CTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTAAAAAAATAATTC
** * * * * ** * ** * * *
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501 TCTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTA-TCAAACAATTATCAATTTAAAATAAATATG
* ** ** ** ** *
633788 A-ACTTTTGTTTG-TCATAAAGTAATTGCTTTCCAACATACTAG-TCTATTTGAAATAAAATAAT
564 ACA-TTTTATTTGATCATAAAACAATTTTTTTAGATTATA--AGCT-TATTTGGAATAAAATAAT
* * * *
633850 ATTAAC-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TATGAGATTTAAAAA-AA-TAAA-TT-T-G-
625 ATT-ACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTA-AAGATTTAAAAATAAGTAAATTTATCGA
* *** ** * *
633907 TTTA-CCGATCTAGTTA---CTATT
688 ATTAGTTTAAATAATTATGGCCATT
** * *** * * * * *
633928 TGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATAATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCCATTC
** ** * *
633993 ATATAAGCA-TATTTGAAATAAAAATAA-AGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
66 ATA-AAAAATTATTCAAAAT-AAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--
* * * * * * * * *
634056 GAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAG-CAGTTCAAATCGTTATGACCATATAAACAATTA
125 -AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGT--AAGCCAATTCAAATAGTTA-CACTATTTGAACAATTA
** * * * ** * * *
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186 TCTATCTT-AAATCATTAT-AACTTTTATTCCATCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGC
* * * * *
634183 TTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTGATTAATATT-TCAAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTG
248 TTA-TTGAGAATAAAATAATACTAAATT-AATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
* * * * ** * * * *
634245 GAAAATGAATTTGTTTACCGAA-TTAGTTCAAATAATTATGACCT-TGTCAACAGTTATCTATTT
310 AAAAATAAATCTGTTTGCC-AAGCCAGTTCAAATAATTAAGA-CTATATGAACAATTATCTATTT
* * * ** * * * *
634308 CAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTGAA--CATTCAAG-CTTATTCA
373 CAAATTATTATGACCTTTTGCTTAATCATA-AATAA-TTGTTTCAATTCATAC-AGTCTTATTCA
* * ** * *
634370 GAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATCTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
435 AAATAAAATAACT-CTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTAAAAAAATAA
* * * * * * * * * * * *
634433 ATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTAAACAATT-GCAAACTTCAAATCATT
498 TTCTCTTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTA-TCAAACAATTATC-AATTTAAAATAAAT
* * * * * *
634497 AT-AGCCTTATGTTCTG-TCATAAAAAAATTATTTTT-G-TTGATGCAAGCTTA-TT-CAAAAAA
561 ATGA-CATTTTATT-TGATCATAAAACAATT-TTTTTAGATT-AT--AAGCTTATTTGGAATAAA
* * * * * ** * ** * * **
634556 AAAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATA-ACTAAGAGAATTAAAAATTAAATTTATTT
620 ATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGATATGTTAA-AGATTTAAAAA-TAAGTAAATTT
** * * * * * * *
634620 ATCGAACCAATTCAAATATTTAAGACTATA
683 ATCGAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATT
* * * * * *** * * * **
634650 TGAATAGTTGTCTATTTCAAATCATTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTATTTTTGAAT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATAATTTGTTTTATCATAAAACAA-T-TGTTTCCAT
*** ** * ** * *
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64 TCATAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-A
* * * * * * * *
634778 GCGATTTAAAAAATAATTTTGT-TTATATAAG-TAATTTAAATAATTATGACTATTTTAACAGTT
126 --GATTTAAAAAATAA--ATGTATT-TGTAAGCCAATTCAAATAGTTA-CACTATTTGAACAATT
* *** * * * * *
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185 ATCTATCTT-AAATCATTATAA-C-TTTTATTCCATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAG
* * * ** * * * * *
634905 TTTGTTCA-AAGTAAGGTAAAACT-AATCATTAATATT-TCAAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAA
247 CTTATTGAGAA-TAAAATAATACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
* * * * * * ** * * * * * *
634964 AAAATAAATCTATTTACCAATCTAATTTAAATAGCTATGACAATTTGAGCAATTATTTGTTTCAA
311 AAAATAAATCTGTTTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAA
* * ** * ** *
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376 ATTATTATGACCTTTTGCTT-AATCAT-AAATAATTGTTTCAATTCATAC-AGTCTTATTCAAAA
* * ** * *
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* * * * * * ** * ** * * *
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* * * ** ***
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* * * * ** * ***
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** * * * *
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* * * *
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1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATAATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCCATTC
*
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* * *** * * *
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194 AAATCATTATAACTTTTATTCCATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGAGAAT
* * * *
635630 AAAATATTTCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
259 AAAATAATACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * *
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* *
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* * * * *
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* *
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710 ATT
* * *
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1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATA-ATTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCCAT
* * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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*
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* ** *
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** * ** * *
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* * * * * * ***
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* * * * *
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Statistics
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ATAAAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTT
AAAAAATAAATGTATTTGTAAGCCAATTCAAATAGTTACACTATTTGAACAATTATCTATCTTAA
ATCATTATAACTTTTATTCCATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGAGAATAA
AATAATACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
GCCAAGCCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTT
TGCTTAATCATAAATAATTGTTTCAATTCATACAGTCTTATTCAAAATAAAATAACTCTAATTTA
TTAACATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTAAAAAAATAATTCTCTTTACCAAACAAGTTCAA
ATAATTATGACTATCAAACAATTATCAATTTAAAATAAATATGACATTTTATTTGATCATAAAAC
AATTTTTTTAGATTATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATT
GATATGTTAAAGATTTAAAAATAAGTAAATTTATCGAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATT
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* * * *
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* * *
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126 AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * *
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* * * *
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* * * * *
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* *** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* * ** * *
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***
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* *
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * * * **
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* * *
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* *
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* * * * * * * * * **
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* *
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* * * * * * *
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* ** * * **
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* *
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* * * * * * * *
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701 AAAATAATACTAATTTAT
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* * *
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* * * *** *
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* ** * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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572 AAAATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * *
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* *
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701 AAAATAATACTAATTTAT
* * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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192 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
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** * * * **
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322 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
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386 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * ** ** * * * *
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450 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT
* * * * * *
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514 TATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *** * * * * *
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* * * * * ** * **
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708 TACTAATTTAT
* * * ** * *
642243 TAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAA-ATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGTCAAA-ACATTTCA
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* * * * * *
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* * * * ** ** * *
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128 ACAATTGTT-TTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAA
* ** * * ** * *
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191 AAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* ** * * *
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255 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
* * * * * ** *
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320 GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * ** *
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385 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * * * *
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** * *
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514 TATTTGGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGATTTAAA
* * * * * * * * *
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** * * * * * **
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703 AATAATACTAATTTAT
** * * *
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1 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAATAAGTTCAA
* * * * * * *
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64 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
*
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* * * *
643151 AATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAATC-AGTTTAAATAGTTATGACT
192 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * * *
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256 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG
* * * * *
643277 TTACCACAGAAGCTTATTCT--ATTAAAAATAATACTCATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA
321 TT--CATACAAGCTTATT-TGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * ** *
643337 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGACCTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAA
382 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * ** * * * *
643401 TTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTCTTGTTTAATCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTGCAA
447 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAA
* * * * * *
643465 GCTTATTTGAAATAAAATTATCCAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAATATTTG
511 GCTTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AGATTT-
*** * * * * * *
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570 AAAAAATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
643593 AAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGACATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGGTTATTCAAA
634 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAA
*
643658 ATAAAATAATACTAATTTTT
699 ATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
643678 TAATATTTCCAAAA-TAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAATTC
1 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTATC-AAATAAGTTC
** * * * * * *
643740 AAATAGTTACAACTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTCT-TCTATA
62 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTC-ATA
* ** * *
643804 AAATAATTGTTTAAGTTCATACAAACTTATTTGAAA-GAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCA
126 AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-A
* * ** * * * *
643867 AAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATGAATCT-TTTATTGAATC-ACTTCAAATAATTATGT
190 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * * * * *
643926 CCATTTCAATAGTTATTTATTTTAAATCTTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAGTTGTTTT
254 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TT
*** * * ** * * * * *
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317 TCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* ** * *
644056 GTAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAG
382 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * * *
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447 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * * * * ** *
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512 CTTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
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577 AAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * ** * *** *
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* *
644378 AAAACTAATGTAT
706 AATACTAATTTAT
* ** * * * *
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1 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA-TAAGTTCAA
* * *
644455 ATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTTGTTTTGTCATAAA
64 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * *
644520 ATAATTGTTTTTGGTAATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAA
128 ACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAA
* * ** * * * * *
644585 AATTAATCAGTAAAATATTTAAAATGTAAAT-CGCTTAACAAACCATTTCAAATAGTTATGACTA
192 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * **
644649 TTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATAGTTTTTGT
257 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
* * * * ** *
644714 TCATATAAGCTTA-TTCAGATTGAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA
322 TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * ** * * * * *
644778 AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATCAT
386 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * *
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451 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
*** * * * * * *
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516 TTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
644973 GATTATATTTATTAGAGAAGTTTC-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-CA
577 AAATCTGTTTATTAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * ** * * ***
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641 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
*
645101 AATACAAATTTAT
706 AATACTAATTTAT
* * *
645114 TAATATT-AAGACACTTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAA
1 TAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAA
* * * ** * *
645178 ATCGTTCTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTTATCATAAAA
64 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
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129 CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAA
** * * *
645307 AATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGATT
192 AATTAATAAGTAAAA-GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
645372 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
256 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG
*
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321 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTA
* * * * * * *
645501 AGAGAATTATAAAAAT-GATTTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAGTATGT-AAAAAA
385 AGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * *
645563 AATCTATTTCAAA-AGAGTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAA
448 TATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAA
** * * *
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511 GCTTATTTGGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
* ** * *
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572 AAAATAAATCTGTTTAT-TAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTT
** * * * * * * *
645752 CAAATTGTTCTAACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCTATTCAAACAAGTTTATTCAAA
634 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAA
*
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699 ATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * **
645837 TAATACTAAAAAATTAATAGGTAAAAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCAAGTTCAAAT
1 TAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAAT
* * * * * * *
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* * * * * ** *
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130 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAA
** * * * * * *
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194 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
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** * * * *
646161 CATACAAAATTA-CTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTACTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAG
323 CATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
646221 ACATTTAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATG
387 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
** * * * * * ***
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452 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * *
646350 TCT-GAGTAAAAT-ATTAATAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAAATAAGTAAGAATTTAAAAA
517 T-TGGAATAAAATAATT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-AATAAG--AG-ATTTAAAAA
* * * * * * * * *
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575 ATAAATCTGTTTATTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* ** * * * ** *
646477 ATTTTGGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAA
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705 TAATACTAATTTAT
* * * * *
646556 GAACATTCAGAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTTAAAAAACTAAATTTGTTTA-CTAAATAAGTTC
1 TAATATTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAA-TAAATCTATTTATC-AAATAAGTTC
* * *
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* *** * * * * * * *
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125 AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT
* * * * * * *
646748 ATAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAACAT-AA-A----T------CAA-TTCAAATAATTATGG
189 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * ** * *
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254 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGT
* * * * *
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* * ** * * * **
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* * * * * * * *
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* ** * * ** * * * *
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* * * * *
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* *
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695 CAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * **
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1 TAATA-TTCAAAAATTAAT-AAGTAA-AAGATTTAAAAAATAA-ATCT-ATTTATCAAATAAGTT
* * *
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* * * * * *
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126 AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * * *
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* * * * * * * * *
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251 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
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316 TTC-AGTTCATACAAG-CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * ** * * * *
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* * * * ** ** * *
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440 TGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
** * * * * * *
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504 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATT-TCAAA---AA-T--T-A-A
* * * *
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* * * **
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* *
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* * * *
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1 TAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAA
* * *
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* * ** * *
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* * * **
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* * * * * * ** * *
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* ** * *
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321 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
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* * * *
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451 CTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * ** *
648458 ATTTAGAATAAAATAATAT-AAATTTGTTAATATTTCAAAAATTACCAAGTAGAAATTAAAAAA-
515 ATTTGGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AG-ATTTAAAAAAT
* * * * * * * * *
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* * * * * * **
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* *
648648 ATAATATTAATTTAC
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* * ** *
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648728 TAGTT
65 TAGTT
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Statistics
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ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATT
AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT
ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
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TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGG
AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
TATTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
TTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
TAT
Found at i:641125 original size:182 final size:180
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* ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * ** * *
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** * ** * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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** * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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** ** ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * ** * ***
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* * * * ** * * *
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* * ** * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * * *
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66 -TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * ** * * * ** **
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128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGATATA
* * * * * * * *
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1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCA-TTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTG
** **
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* *** * * * *
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126 ATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGAT-ATA
* * * * * *
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1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
* * **
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* * * * *
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129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATT-AAACAATTCAAATAGATATA
* * * *
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* * * * * * *
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* * * *** ** *
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* * * * * * *
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* * * ** * ** *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * *
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** * * * * * *
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** * ** * * **
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128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGATATA
** * * * ** * * * * *
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** * ** * * * * ** * ** *
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* * * * * * **** ** *
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** * * * *
641724 AAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT-TCTGAACCAGTTCAAATAGTTATG
125 AATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTAT-T-AAACAATTCAAATAGATATA
* * * ** * * * *
641777 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTGT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-T
* * * * * * * *
641842 CT-GGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTATTA-TACTAAAAATTAATA
65 TTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
* *** ** * *
641905 A-CAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCCTACCGAATCAATTCAAACA-AT-TAA
129 AGC-AAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTA-TTAAACAATTCAAATAGATAT-A
* * * * ** * ** * *
641957 GACTATATGAACAACTATTTATTTTAAATTTTTATGACCTTTTACTTTGTCATAAAATAATTATT
1 -ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
642022 TCAGCTCATAAAAGCTTATTCGGAATAGAATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAACTT--T-
65 TTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * *** *** *
642083 A-TAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTGCCAAACCAGTTCAAATA-ATTATA
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGA-TATA
* * * * * * *
642135 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * * *
642200 TTGTTAATATAATTTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATC
66 TAGTTCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATA
* * * * ** * * * * * *
642263 AGTAAGAAATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGTCAAAACATTTCAAATAGTTTTG
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTAT-TAAACAATTCAAATAGATATA
* * * * * * * * *** *
642316 ACTATTTGAATAATTATCGATTTCAAATCATTATAACCTTTT-ATTTG----AATAGTTTTG-AT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** ** * * * * *
642375 T-GTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAAC
66 TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** * *
642439 CAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-A
131 CAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGATATA
* ** * * * * *
642489 GACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAGAACAATTGTT
1 -ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * **
642554 TT-GGTCATATAAGCTTATT-TGGATTAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAA
65 TTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
** * *** * * * * *
642617 ATAATAGATTTAAAAAATAATTTTATTTATTGAATCAGTTCAAATGGTTAAA
130 GCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATT-AAACAATTCAAATAGATATA
* * * * ** * * * * * * * *
642669 ACTATTGGAATAATTATATATTGCAAATCGTTCTAACCTTTAGCTTAGTCATAAAACAACTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
642734 CAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAA
66 TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * * * * * * *
642798 GAAAGAGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTATCAAACAAGTTAAAACAGTTATT
130 GCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGATATA
* * * * ** * * * *
642850 ATTATTTGAACAATTGTCTATATAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTATCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * ** * **
642915 CAGTTAATACAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAG
66 TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
642980 TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATCAGTTAAAATA-ATTATG
131 CAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGA-TATA
* * * * * * *
643031 GCCATTTGAACGATTATCTA-CTACAAATCATTATGACGTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTA-AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
643095 TT-TTATCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
65 TTAGT-TCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * ** ** * * * *
643158 AAGTAACAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAATCAGTTTAAATAGTTATG
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGATATA
* * * * * * * *
643212 ACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTA--AAATCTTTATTTTGTCATAAAATAGTTGTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
643275 TT--TTACCACAGAAGCTTATTC-TATTAAAAATAATACTCATTTAATAATATTTCAAAAATTAA
65 TTAGTT--CATAAAAACTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * *
643337 T----AAGAGATTTAAAAAATAAATG-TGTTTACTGACCTAGTTCAAATAGTTAAA
127 TAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-GCTATTTATTAAAC-AATTCAAATAGATATA
* * * * * * * ** * *
643388 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTCTTGTTTAATCATAAAATATTTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * ** * * * * * *
643453 CA-TATCTTGCAAGCTTATT-TGAAATAAAATTATCCAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAT
66 TAGT-TCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * * * *** * * * *
643515 AAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTAAAATAG-TCTTT
128 AAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGAT-ATA
* * * * * * * * *
643570 ACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGACATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * * *
643635 CAGTTCATAAAAGGTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCCAAAA-TAATAAG
66 TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** * * * *
643699 CAAGAG-TTTAAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTACA
131 CAAGAGATTT--AAAAAATAAAGCTATTTATTAAAC-AATTCAAATAGATATA
* * * * * * *
643751 ACTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTCT-TCTATAAAATAATTGTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTT
* * *
643815 TAAGTTCATACAAACTTATT-TGAA-AGAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAAT-
65 TTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * *
643876 ---AAGTGATTTAAAAAATGAATCT-TTTATTGAATCACTTCAAATA-ATTATG
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATT-AAACAATTCAAATAGA-TATA
* * * * ** * * * * * * * *
643925 TCCATTTCAATAGTTATTTATTTTAAATCTTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAGTTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--T
** * ** * * * * * * *
643990 TTTTTTTCATACAAGTTTATTCGGGATAAAATAGTATTAATTCATTAATCTTTCAAATATTAATA
64 TTTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * ** * * *
644055 AGTAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGATATA
* ** * * * * ** * * * * * *
644108 ACTATTTGAATAGTTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * * * * *
644173 CTA-TTCATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAGTACTAATCTAATAA-AATT-AAAAA-AAATA
66 -TAGTTCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* ** * * * ** *
644233 A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAGCTCAAATAGCTA-A
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAAC-AATTCAAATAGATATA
* * * * *
644284 GACTA--TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TT
1 -ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * ** * * * *
644346 TTCAACTT-ATAGAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAATATTTCAAAAATTTAT
65 TT--AGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * *** ** * *
644410 AAGTAAGGGATTTAGAAAATAATTTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATA
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAAC-AATTCAAATAGATATA
* * * * * *
644464 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGAC-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * ** * * ** *
644529 TTTGGTAATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATC
65 TTAGTTCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * ** * ** ** * * *
644593 AGTAAAATATTTAAAATGTAAATC-GCTTAACAAACCATTTCAAATAGTTATG
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGATATA
* * * * * * * * *
644645 ACTATTTGAGCAATTATTTCTTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATAGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * ** *
644710 TTGTTCATATAAGCTTATTCAGATTGAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG
66 TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** * ** *
644775 TAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGA-TCAAATAG-TCATG
131 CAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAAC-A-ATTCAAATAGAT-ATA
* * * * * * * * *
644826 ATTATTTGAA-TAATCATCTACTTCAAATCGTTATGATC-TTTTGTTTTATAATAAAAAAATTAT
1 ACTATTTGAACAAAT-ATCTATTTAAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * *
644889 TTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTGTTAATA-TTCTGAAAATTAAT
64 TTTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
** * * *** * * *
644953 AATTAAAAGATTTAAAAAATGATTATATTTATTAGAGAAGTTTC-AATA-ATTATG
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA--TTCAAATAGA-TATA
* * * * * * **
645007 ACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-CACTATAATC-TTTTGCTTTGTCATTAAATGATT-TT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * ** ** * *
645069 TTCTGTTTATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACACTTAA
65 TT-AGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAA
* * * * ** * * * * *
645132 TAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATCGTTCTG
127 TAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGATATA
* * * ** * * *
645187 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
645252 CTA-TTCATACAAGCTTATTCATACTAAAATAATATTTATTTATTAATATTTCAATAATTAATAA
66 -TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** ** * ** *
645316 GTAAAATTTTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAATAG-TCATG
130 GCAAGA-GATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAAC-AATTCAAATAGAT-ATA
* * * * * *
645369 ATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
645434 CAATTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AG
66 TAGTTCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-
* * * ** * ** * *
645497 AGTAAGAGAATTATAAAAAT-GATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
129 AGCAAGAGATTTA-AAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGATATA
* * * * * * *
645550 AGTATGT-AAAAAAAATCTATTTCAAAA-GAGTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTT-AAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GT
** * *
645613 TTT-GTTCATGCAAGCTTATTTCCA-AA-AAAATAATA-TCAATGTATTAATATTTCAAAAATTA
64 TTTAGTTCATAAAAACTTA-TT-CAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * ** * *
645674 ATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTAAATTTATTCAAATAGTTATG
126 ATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTAT-TAAA-CAATTCAAATAGATATA
* * ** * * *
645729 ACTATTTGAATAAAT-TCCTATTTCAAATTGTTCTAACCA-TTTGTTTTGTCATAAACCAATTTG
1 ACTATTTGAACAAATAT-CTATTTAAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTG
* ** * * * *
645792 TTCTA-TTCA-AACAAGTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATA-CTAAAAAATTAA
63 TTTTAGTTCATAA-AAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * ** * * *
645854 TAGGTAAAAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATG
127 TAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGATATA
* * * * * * * *
645909 ACTATTTGAAC-AATCATTTATTTCAAGTCGTTATGATCTTTTTGTTTTATAATAAAGCAATTGT
1 ACTATTTGAACAAAT-ATCTATTTAAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** ** * ** *
645973 TTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTTTTA-CTCTAAAAATTAA
64 TT-TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
** * ** * * *
646036 TAAG-TTGAAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG-TCATG
127 TAAGCAAG-AGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGAT-ATA
* * * * * * *
646091 TCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCATTAAGACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *
646156 CTA-TTCATACAAAA-TTACTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAAT-
66 -TAGTTCATA-AAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * *
646218 ---AAGACATTTAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATG
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAAC-AATTCAAATAGATATA
* * * * * * *
646268 ACTATTTGAACAATTATGTA-TCACAAATCGTTACGAC-TTTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTA-AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T
* *** * * * * * *
646331 TTTAG-TCATACACTTTTATTCTGAGTAAAATATTAATAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAAA
64 TTTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-AA
* * * * * *
646394 TAAGTAAGA-ATTTAAAAAATGAATG-TGTTTACTAAACCAGTGCAAATAG-T-TA
127 TAAGCAAGAGATTTAAAAAAT-AAAGCTATTTATTAAA-CAATTCAAATAGATATA
* * * * * * *
646446 AGGCTATTAGAACAAATATCTATTTCAAATCATTTTGGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGT
1 A--CTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * ** * * * *
646511 TTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAACA-TTCAGAAATTAATA
64 TTTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * ** * * * * *
646575 AGTAAGAAATTTTAAAAAACTAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATG
129 AGCAAGAGA-TTTAAAAAA-TAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAGATATA
* * * * * *
646630 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTATTTTTTTCATAAAACATTTGTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * * * * *
646695 TCAATTCATAAAATCTTATATGA-AACAAAATAATATTACTTTATTTATATTTTATAAATTGATA
65 TTAGTTCATAAAAACTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
** * *
646759 AGTTAGAGATTT-----A-AAA-C-A--TA--AATCAATTCAAATA-ATTATG
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAATTCAAATAGA-TATA
* * * * * * * *
646799 GCCATTT-AAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGAAATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATT
1 ACTATTTGAA-CAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
*** * * * * * * *
646863 TTTCATCATACAAGCCTATTTC-GAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTTTAAAAATAAATA
65 TTAGTTCATAAAAACTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * *
646927 AG-TAGAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATG
129 AGCAAG-AGATTTAAAAAATAAAGCTATTTA-TTAAACAATTCAAATAGATATA
* * * * * * * * * *
646979 ACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATTATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTACTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT
* * * * * * * * * *
647044 CTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATATAA-GATGCTAATGTAATAATATTAT-GAAAATTAATA
65 TTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA
** * * * * * * *
647106 A-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAA
129 AGC-AAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTT-ATTAAACAATTCAAATAGATATA
* * * * * * * * * *
647159 ACTATATGAACAACTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTTCTATCATAAAATAAATTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTT-TGTCATAAAA-CAATTGT
* ** * * * * * *
647223 TTTAGTTCTTACTAACTTATTCAAAATAAAATAAAACAAATTTATTAGTACTTGAAAAATTAATC
64 TTTAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-
* * * * ** * * * *
647288 AA-TAAGAAATTTGAAAAATAATA-TTGATTGCTGAACCAGTTCAAATA-ATTATG
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAA-AGCT-ATTTATTAAACAATTCAAATAGA-TATA
* * * * *
647341 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
647406 TTGTTCA-AATAACTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTAAAAATTAATAA
66 TAGTTCATAAAAAC-TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
647470 --TAGA-A-TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-ATAGTTC-AATAAGTTATA
130 GCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACA-A-TTCAAAT-AGATATA
* * * * * * * * *
647518 ACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGACCA-TTTGTATTGTTATTAAATAATTGTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * ** * * *
647582 TCTA-TTTATACAGTCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTATT
65 T-TAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * * * ** * * * *
647645 AA-TAATGA-ATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAATGCAAATAG-TTTA
128 AAGCAA-GAGATTTAAAAAATAAAGCTATT-TATTAAACAATTCAAATAGATATA
* * * * * * ** **
647697 ACAATTTGAACAATTATTTGA-TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTCATCGCAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAACAAATATCT-ATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** ** * * * * *
647761 TTTGTTTGTGCAAGCTTATTC-GAAATGACATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAGTTAATT
65 TTAGTTCATAAAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA---AA-T
* * * * * * * * *
647825 GGTAATAGGTAATAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATG
124 --TAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAAC-AATTCAAATAGATATA
* * * * * *
647885 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTT
1 ACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTT
* * * * *
647950 TCTA-CTCATACAAGCTTATTTCA-TATAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AAACAATTAA
65 T-TAGTTCATAAAAACTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAA
* * * * * * *
648012 TAAGTAACAGATTGAAAAAACAAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAATAG
127 TAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTATTAAACAA-TTCAAATAG
648062 TTATGACTTT
Statistics
Matches: 7145, Mismatches: 1678, Indels: 970
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
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* *
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* **
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * ** * * **
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** * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * **
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131 AATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* ** * * * * * *
647139 AACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACAACTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTT-T
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTGT
* * * * * * * * *
647203 TCTATCATAAAATAAATT-TTTTTAGTTCTTACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACAAATTT
66 TTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * **
647266 ATTAGTACTTGAAAAATTAATCAA-TAAGAA-ATTTGAAAAATAATAT-TGATTGCTG
128 ATTAATA-TTTAAAAATTAAT-AAGTAA-AAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTACCA
* * * *
647321 AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTGT
* * * * * * *
647385 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAAATAA-CTT-TGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TT-AGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
647448 TTAACATTTTAAAAATTAATAA-T---AGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTA
129 TTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * * **
647498 AA-ATAGTTC-AATAAGTTATAACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCACTATGA-CCATTT
1 AACA-AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTT
* * * * * * * *
647560 GTATTGTTATTAAATAATTGTTTCTATTTATAC-AGTCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTT
64 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT
* * * ** **
647624 ATTAATATTCTAAAAATTATTAA-T-AATGAATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG
128 ATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CA
* * * * * * *
647679 ACCAA-TGCAAATAGTT-TAACAATTTGAACAATTATTTGA-TTCAAATCATTAT-AACCTTTTG
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGATCTTTTTG
** ** * * ** * * * * *
647740 TTTCATCGCAAAACAATTGTTTTTGTTTGTGCAAGCTTA-TTCGAAATGACATAATTCTAATTTA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
647804 TTAATATTCTGAAAGTTAATTGGTAATAGGTAATAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCA
129 TTAATATT-T-AAA---AA-T--TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * *
647865 AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTAT-AACATTTTGT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTGT
* * * * *
647929 TTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTACTCATACAAGCTTATTTCA-TATAAAATAATACAAATTTA
66 TTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * ***
647993 TTAATATTTAAACAATTAATAAGTAACAGATTGAAAAAACAAATCTATTTATTG
129 TTAATATTTAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
*
648047 AATAAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACT
648070 TTTAGTTTTC
Statistics
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Consensus pattern (181 bp):
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTGT
TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
AATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
Found at i:646915 original size:168 final size:169
Alignment explanation
Indices: 646608--646949 Score: 378
Period size: 168 Copynumber: 2.0 Consensus size: 169
646598 ATTTGTTTAC
* * *
646608 TAAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTT
1 TAAATCAAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTT
* * * *
646672 ATTTTTTTCATAAAACATTTGTTTCAATTCATAAAATCTTATATGAAACAAAATAATATTACTTT
66 AGTTTTTTCATAAAACATTTGTTTCAATTCATAAAAGCCTATATGAAACAAAATAATACTACTTT
* * **
646737 ATTTATATTTTATAAATTGATAAGTTAG-AGATTTAAAACA
131 ATTAATATTTTAAAAATAAATAAG-TAGAAGATTTAAAA-A
* * *
646777 TAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTT-AAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGAA-ATT
1 TAAATCAAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAA-CAATTATCTATTTAAAATCATTAT-AACATT
* * * * *
646839 TT-GTTTTTTCATAAAACAATTATTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTTCG-AATAAAATAATGCT
64 TTAGTTTTTTCATAAAAC-ATT-TGTTTCAATTCATAAAAGCCTATAT-GAAACAAAATAATACT
*
646900 AGTTTATTAATATTTTAAAAATAAATAAGTAGAAGATTTAAAAA
126 ACTTTATTAATATTTTAAAAATAAATAAGTAGAAGATTTAAAAA
646944 TAAATC
1 TAAATC
646950 TGTTTACTGA
Statistics
Matches: 146, Mismatches: 20, Indels: 16
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Matches are distributed among these distances:
167 10 0.07
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170 9 0.06
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.06, T:0.42
Consensus pattern (169 bp):
TAAATCAAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTT
AGTTTTTTCATAAAACATTTGTTTCAATTCATAAAAGCCTATATGAAACAAAATAATACTACTTT
ATTAATATTTTAAAAATAAATAAGTAGAAGATTTAAAAA
Found at i:647363 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 647331--647363 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
647321 AACCAGTTCA
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1 AATAATTAT-ACTATTTG
647349 AATAATTAT-CTATTT
1 AATAATTATACTATTT
647364 CAAATCATTA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.06, G:0.06, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATACTATTTG
Found at i:649076 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 648750--649880 Score: 833
Period size: 181 Copynumber: 6.3 Consensus size: 180
648740 TTTGACAAAA
* * * * * *
648750 CAAA-AGTCATAACGATTTGAACTTATTTGGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * * *
648814 AGTTATTTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT-AAAACAAGCTCGAATGAATAGAAAA-
66 AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTATTTT-ATTCAAATC-AGCTTGTATGAACA-AAAAC
* * * * * *
648877 AAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTAGAGTGATTTGAAATAGGTAATTGTT
128 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* *
648930 CAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * *
648995 AATTTTTTGAATATAAATAAATTAGAATTATGTTATTCCCAATCAGCTTGTATGAACAAAAACAA
66 AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATT-CAAATCAGCTTGTATGAACAAAAACAA
* * ** *
649060 TTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCT
130 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * ** * * **
649111 CAAAAAGTTATAACTATTTGTACTGGTCATG-CCAACAGATTCATTTTACAAATC-CATTACTTA
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTA
* * * * * * * *
649174 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATCA-ACATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAATAGAAA
64 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATT-CAAATCAGCTTGTATGAACAAAAA
* * * *
649238 -ATTTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTT
127 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * *
649291 TAAACT-GTTATAACTAATTGAAC-TGATTT--TATACAGATTTGTTTTTTAAATCTCTT-C---
1 CAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
** * ** *
649348 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCTAACA-AAATTTATATGAACAAAA
64 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATTC-AA-ATCAGCTTGTATGAACAAAA
* * * *
649411 TCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTT
126 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * * *
649466 TATATAGCCATAACTATTTCAATTTG-TTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTAGTTAT
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * *
649530 TAATTTTCATT--ATATTATTAGATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAA
65 TAATTTT--TTGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATT-CAAATCAGCTTGTATGAACAAAAA
* * *
649593 TAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACT-ATTTGAAATATATAATTGTT
127 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
649647 TAAATAGTCAT-A--ATTTGAAC-CGGTTCAGTAACCATATTTATTTTTTAAATCTCATACTTA-
1 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * ** * **
649707 TAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAACTTGGCTCGTATGATGAAAAAC
65 TAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGAATTATTTTATT-CAAATCAGCTTGTATGAACAAAAAC
* * * * *
649772 AATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGTTCATAATGGTTTGAAATAGATAACTGTT
128 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * ***
649825 GAAAT-GACCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTC
1 CAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
649881 CAACCCCTCA
Statistics
Matches: 755, Mismatches: 158, Indels: 75
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
174 52 0.07
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183 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTCAAATCAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
Found at i:649452 original size:355 final size:359
Alignment explanation
Indices: 648871--649819 Score: 900
Period size: 355 Copynumber: 2.6 Consensus size: 359
648861 TCGAATGAAT
* * * * * ** ** *
648871 AGAAAAAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTAGAGTGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATA
1 AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATA
* ** * * * * * *
648936 GTCATAACTATTTAAACTTGTT-TGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
66 GTCAT-A--ATTTGAACCGGTTCAG-TAACCAGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATAAATTT
** * * * **
649000 TTTGAATATAAATAAATTAGA-ATTATGTTATTCC--CAATCAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
127 TTAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCCAACAA--AACTCATATGAACAAAAACAATT
** **
649062 GTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGTTATAACTA
189 GTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGCCATAACTA
** * * *
649127 TTTGTA-CTGGTCATGCCAACAGATTCATTTTACAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGAATATT
254 TTTCAATCTGGTCA-GCAAACAAATTCATTTTACAAATCCATTACTTATTAATTTTCAGAATATT
*
649191 AATAAATCAACATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAAT
318 AATAAATCAACATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAAC
* *
649233 AGAAA-ATTTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAACT
1 AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAA-T
* * * * * *
649297 -GTTATAACTAATTGAACTGATT--TTATA-CAGATTTGTTTTTTAAATCTC-TTC-T-T-AATT
65 AGTCATAA-T--TTGAACCGGTTCAGTA-ACCAGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATAAATT
* * * * *
649354 TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAACAAAATTTATATGAACAAAATCATTTGT
126 TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAACAAAACTCATATGAACAAAAACAATTGT
* * * * * *
649419 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTTATATAGCCATAACTATT
191 TTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGCCATAACTATT
* * * ** * * ** *
649484 TCAATTTGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTAGTTATTAATTTTCATTATATTATT
256 TCAATCTGGTCAGCAAACAAATTCATTTTACAAATCCATTACTTATTAATTTTCAGAATATTAAT
* * ** * *
649549 AGATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC
321 AAATCAACATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAAC
* * * *
649588 ATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATA
1 AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATA
* *
649653 GTCATAATTTGAACCGGTTCAGTAACCATATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATAAATTTTTGA
66 GTCATAATTTGAACCGGTTCAGTAACCAGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATAAATTTTTAA
* **** * **
649718 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAACTTGGCTCGTATGATGAAAAACAATTGTTTTGT
131 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAACAAAACTCATATGAACAAAAACAATTGTTTTGT
* *
649783 GACAAAACAAAAGTTCATAATGGTTTGAAATAGATAA
196 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
649820 CTGTTGAAAT
Statistics
Matches: 476, Mismatches: 93, Indels: 39
0.78 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
353 9 0.02
354 2 0.00
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356 66 0.14
357 5 0.01
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360 2 0.00
361 58 0.12
362 6 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
AGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATA
GTCATAATTTGAACCGGTTCAGTAACCAGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATAAATTTTTAA
AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAACAAAACTCATATGAACAAAAACAATTGTTTTGT
GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGCCATAACTATTTCAAT
CTGGTCAGCAAACAAATTCATTTTACAAATCCATTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATC
AACATTACTTTATTCCAAATAAGATTGTATCAAC
Found at i:649874 original size:536 final size:535
Alignment explanation
Indices: 648882--649925 Score: 1169
Period size: 536 Copynumber: 1.9 Consensus size: 535
648872 GAAAAAAATA
* * *
648882 TTTTATAACAAAACAAAAGGTTAGAGTGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATAACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGCCATAACTAT
* * *
648947 TTAAACTTGTTTGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATAAA
66 TTAAACTTGTTAGACAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTT-AATATAAA
* * * *
649012 TAAATTAGAATTATGTTATTCCCAATCAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAAC
130 TAAATTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * *
649077 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGTTATAACTATTTGTACTGGTCATG
195 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGTCATAAC-ATTTGAACCGGTCATG
*
649142 CCAACAGATTCATTTTACAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATCAACATTAC
259 CCAACAGATTCATTTTACAAATCCATTACTTATAAATTTTTAGAATATTAATAAATCAACATTAC
* * * *
649207 TTTATTCCAAATAAGATTGTATCAATAGAAAATTTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGA
324 TTTATTCCAAATAAGATCGTATCAATAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * ** ** * *
649272 TTTGAAATAAATAATTGTTTAAACTGTTATAACTAATTGAACTGATTTTATACAGATTTGTTTTT
389 TTTGAAATAAATAACTGTTGAAACTGCCATAACTAATTGAACTGATTCGATAAAGATTTATTTTT
** * *
649337 TAAATCT-CTTCTTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAACAAAATTTAT
454 TAAATCTACCCCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTCTAACAAAATTTAT
649401 ATGAACAAAATCATTTG
519 ATGAACAAAATCATTTG
* * * *
649418 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAG-AATTGTTTATATAGCCATAACTA
1 TTTTATAACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAG-GTAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * * *
649482 TTTCAATTTGTTCAG-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTAGTTATTAATTTTCATT-ATAT
65 TTTAAACTTGTT-AGACAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTT--TTAATAT
* * * * * *
649545 TATTAGATTAGTATTACT-TTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGACA
127 AAATAAATTAGAATTA-TGTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACA
* * * * * *
649609 AAACAAAAGGTTATAACTATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCAT-A-ATTTGAACCGGTT
191 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGTCATAACATTTGAACCGG-T
* * * ** *
649672 CA-G-TAACCATATTTATTTTTTAAATCTCA-TACTTATAAATTTTT-GAAATATTAATAAATTA
255 CATGCCAA-CAGATTCATTTTACAAATC-CATTACTTATAAATTTTTAG-AATATTAATAAATCA
** * * ** * * * * *
649733 GTATTATTTTATTCCAACTTGGCTCGTAT-GATGAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGT
317 ACATTACTTTATTCCAAATAAGATCGTATCAAT-AAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * *
649797 TCATAATGGTTTGAAATAGATAACTGTTGAAA-TGACCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAAT
380 TCATAACGATTTGAAATAAATAACTGTTGAAACTG-CCATAACTAATTGAACTGATTCGATAAA-
*
649861 TGATTTATTTTTTAAATCTCCAACCCCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTAT
443 -GATTTATTTTTTAAATCT---ACCCCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTAT
649926 ATTGGATAAG
Statistics
Matches: 417, Mismatches: 73, Indels: 32
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
532 5 0.01
533 80 0.19
534 73 0.18
535 1 0.00
536 216 0.52
537 3 0.01
538 2 0.00
540 37 0.09
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
TTTTATAACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGCCATAACTAT
TTAAACTTGTTAGACAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTTAATATAAAT
AAATTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA
AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAGTCATAACATTTGAACCGGTCATGCC
AACAGATTCATTTTACAAATCCATTACTTATAAATTTTTAGAATATTAATAAATCAACATTACTT
TATTCCAAATAAGATCGTATCAATAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
TGAAATAAATAACTGTTGAAACTGCCATAACTAATTGAACTGATTCGATAAAGATTTATTTTTTA
AATCTACCCCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTCTAACAAAATTTATAT
GAACAAAATCATTTG
Found at i:650785 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 650541--652976 Score: 1700
Period size: 181 Copynumber: 13.6 Consensus size: 180
650531 ATCTCCAACT
* * * * * *
650541 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTGTGAATAGAAAC-ATATGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAAT-TATTTTATG
* * * * *
650605 ATAAAACAAGAGATCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * ** **
650670 CGCTAGGCAAACAGATTT-TTTTAAAAAAATTTTACTTATTAATTTTTGAAA
129 CGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * *
650721 TTTTAATAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACAAACACAATTAGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA-ACAATTATTTTATGA
* * * *
650786 CAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAAA--
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AAACT
* * * * * *
650849 CGATTTGATAAACTGTTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTGA-TCTTGAAAA
129 CG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AAA
* * **** * * * *
650902 TATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTATAAACTGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * * *
650967 CAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAAC-C
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTC
* * * * *
651031 TATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTCAAA
130 -GTTAGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * **
651084 -AGTTAATAAATT-GTATTATTTTCTTCCAAATAAGATTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATG
1 TA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTATTTTATG
* * * * * *
651147 ACTAAACAAAAGGTTAGT-ACAATTTGAAATAAATAATT-TTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA
64 ACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTT-AAATAGTCATAACTATTT-AA
* * * **
651210 A-T-GATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAA
126 ACTCG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
651264 TAATATTAAATTAGTATTATTTT-TATCGAAATGAGCTTGTATGATCAAAAACAATTATTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATG
* * * * ** * *
651328 ACAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATTGATATTTGTTTAAATAGTTGTAACTATTTGAAT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* ** * * * * * * *
651391 TGGTTCA-AAAAATAGCTCTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAA
128 TCGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * * * *
651444 TATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTCAAACAAGTTTTTATGAACCGAAACAATTGTTTTTTGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTATTTTATGA
* * ** * * * * *
651509 TAAAAAAAAAAGGTCATAACGATTTTCAATAGATAATTCTTTAAATAGTTAT-ATTTTTTGAACT
65 -CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * *
651573 TGTTCA-GTAAATAGTTTTATTTTTTAAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTTGAAA
129 CGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAA
* ** *** * * *
651627 -GTTAATAAATTACCATTATTTTATTTTGATTAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGA
* * * *
651691 CTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCT-AATAGTCCA-AACTATTTAAAC
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGT-CATAACTATTTAAAC
* * * * * *
651754 TGGTTTA-GCAAATATATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA
128 TCG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * *
651806 TATTATTAAATTAATATTA-TTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTGTGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTATTTTATGA
* * * * *
651870 CAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAC-C
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTC
* * * * *
651933 TGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTCAAA
130 -GTTAGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * *
651986 -AGTTAATAAATTAGAATTATTTTCTTCCAAATAAGCTTGTATAAATAAAACAATTATTTTATGA
1 TA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * * * *
652050 CTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGCCTTAATTATTAAAACT
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * * ** *
652114 -GATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTAAAA
129 CG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
652166 TATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATCAGCTAGTATGATCAGAAACAATTACTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTATTTTATG
* ** * *
652230 ACAAAACAATTA--TCATAATAATTT-AAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAA
64 ACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * ** ** * * * * * *
652292 TTGGTTTGAAAAATGGCTTTAGTTGTTAAATCTCTTACCTGA-CAATTTTTGAAA
127 CTCGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * * *
652346 TATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATTA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * * *
652411 CAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATATCTATTTGAATTC
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTC
* ** *
652476 ATTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TTCTTGGTTACTAACTTTTTGAAA
130 GTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAA
* * * * * **
652529 -GTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGATTGTATGAACTGAAGTAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGA
* * * *
652593 CTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCATAACTATTTGAA-
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* * * *
652656 ----TA--T------ATTTAATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAA
128 TCGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * **
652697 TATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTCCATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTATTTTATGA
* * * * *
652762 CAAAA-TAAAGATCAT-ACGATTTGAGATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTTGAACT
65 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTA-TTTAAACT
* * * * *
652825 GGTTAGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAA
129 CGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * ** * **
652873 TATTAATAAATCAATATTATTTTATTTTC-AATAATTTTGTATGAACAAAAACAATTTTTTTACA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATG
*
652937 ACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
652977 CAAGTGAACA
Statistics
Matches: 1771, Mismatches: 385, Indels: 203
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
166 31 0.02
167 10 0.01
168 15 0.01
169 65 0.04
170 11 0.01
172 2 0.00
174 1 0.00
176 74 0.04
177 29 0.02
178 58 0.03
179 67 0.04
180 551 0.31
181 563 0.32
182 235 0.13
183 58 0.03
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCG
TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
Found at i:652879 original size:902 final size:896
Alignment explanation
Indices: 650541--652973 Score: 2663
Period size: 902 Copynumber: 2.7 Consensus size: 896
650531 ATCTCCAACT
* ** * ** * * ** *
650541 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTGTGAATAGAAAC-ATATGTTTTATG
1 TATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTCAAACAAGTTTTTATGAACCGAAACAAT-TGTTTTTTG
* * * * * * * * *
650605 AT-AAAACAAGAGATCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAAC
65 ATAAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTCTTTAAATAGTTAT-ATTATTTGAAC
*** * ** * * *
650669 TCGCT-AGGCAAACAGATTT-TTTTAAAAAAATT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATTTTAATAA
129 TTATTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTACTTACTAACTTTTTGAAA-GTTAATAA
** * * * * * * * *
650730 ATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAAC-AAACACAATTAGTTTATGACAAAACAA
192 ATTACCATTATTTTATTTCGAATAAGATTGTATGAACTGAA-ATAATTATTTTATGACTAAACAA
* * * *
650794 AAGGT-AATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATGGCCATAATTATTTGAAAC-GATTTG
256 AAGGTCAA-AACGATTTAAAATAGATAATTATTCT-AATAG---T-ACTA-TT-AAACTGATTT-
* * * * * * * * *
650856 ATAAACTGT-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTGA-TCTTGAAAATATTAATAAAGTAATAT
312 AGAAA-TATATTTA-TTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTG-GAATATTATTAAATTAATAT
* **** ** * * * ** * *
650919 TATTTTATTTTGGATAAACTTTTAT-AAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCAA
374 TA-TTTAATCCAAATATGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTCCATGACAAAAC-AAAGATCAT
* * * * * * * *
650983 AATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAACCTATTCGGTAAACAAATT
436 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACCTGTTAGATAAACAAATT
*** *
651048 TATTTTTTCAAATCTT-TTGCTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTGTATTATTTTCTTCCA
501 TATTTTTTCAAAT-TTCTTAAATATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTGAATTATTTTCTTCCA
* * *
651112 AATAAGATTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGTACAATTTGAAAT
565 AATAAGATTGTATGAAATAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAAT
* * * * * *
651177 AAATAATTTTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATC
630 AAATAATTATTCTAATAGCCTTAACTATTTAAAATGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * *
651242 TCTTACTTATTAATTTTCAAAATAATATTAAATTAGTATTATTTTTATCGAAATGAGCTTGTATG
695 TCATACTTATTAATTTTCAAAATAATATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATCAGCTAGTATG
* *
651307 ATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTAAGATTGATATTTGTTTAAA
760 ATCAAAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAGATCATAATAATTTAAGATTGATATTTGTTTAAA
** * * * * *
651372 TAGTTGTAACTATTTGAATTGGTTCAAAAAATAGCTCTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATT
825 TAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAAAAAATAGCTCTAGTTGTTAAATCTCTTACCTAACAATT
651437 TTTGAAA
890 TTTGAAA
651444 TATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTCAAACAAGTTTTTATGAACCGAAACAATTGTTTTTTGA
1 TATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTCAAACAAGTTTTTATGAACCGAAACAATTGTTTTTTGA
* * * *
651509 TAAAAAAAAAAGGTCATAACGATTTTCAATAGATAATTCTTTAAATAGTTATATTTTTTGAACTT
66 TAAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTCTTTAAATAGTTATATTATTTGAACTT
* * * * *
651574 GTTCAGTAAATAGTTTTATTTTTTAAAATTTCTTACTTATTAATTTTTTGAAAGTTAATAAATTA
131 ATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTACTTACTAACTTTTTGAAAGTTAATAAATTA
* * *
651639 CCATTATTTTATTTTGATTAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGT
196 CCATTATTTTATTTCGAATAAGATTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGT
* * *
651704 CAAAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCCAAACTATTTAAACTGGTTTAGCAAATAT
261 CAAAACGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGT----ACTA-TTAAACTGATTTAG-AAATAT
*
651769 ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTAATCCA
320 ATTTATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTAATCCA
*** *
651834 AATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAGATCATAATGATTTGAAATA
385 AATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTCCATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * *
651899 GATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACCTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATT
450 GATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACCTGTTAGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATT
*** *
651964 TCTTGCTTATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTAGAATTATTTTCTTCCAAATAAGCTTGTAT-
515 TCTTAAATATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATT-GAATTATTTTCTTCCAAATAAGATTGTATG
** *
652028 AAATAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
579 AAATAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTA
*
652093 ATAGCCTTAATTA-TTAAAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAA
644 ATAGCCTTAACTATTTAAAA-TGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAA
* * *
652157 TTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATCAGCTAGTATGATCAGAAACAATT
708 TTTTCAAAATAATATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATCAGCTAGTATGATCAAAAACAATT
**
652222 ACTTTATGACAAAACAATTATCATAATAATTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTAT
773 ACTTTATGACAAAACAAAGATCATAATAATTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTAT
** * * *
652287 TTAAATTGGTTTGAAAAATGGCTTTAGTTGTTAAATCTCTTACCTGACAATTTTTGAAA
838 TTAAATTGGTTCAAAAAATAGCTCTAGTTGTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAA
* * * *
652346 TATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATT-
1 TATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTCAAACAAGTTTTTATGAACCGAAACAATTGTTTT-TTG
* * * *
652410 A-CAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATATCTATTTGAA-
65 ATAAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTCTTTAAATAGTTATAT-TATTTGAAC
**
652473 TTCATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGGTTACTAACTTTTTGAAAGTTAATAAA
129 TT-ATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTACTTACTAACTTTTTGAAAGTTAATAAA
** *
652538 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGATTGTATGAACTGAAGTAATTATTTTATGACTAAACAAAA
193 TTACCATTATTTTATTTCGAATAAGATTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAA
* *
652603 GGTCAGAACGATTTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT-C-A-T-AACT-ATTT-G-AATATAT
258 GGTCAAAACGA-TTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTACTATTAAACTGATTTAGAAATATAT
*
652661 TTAATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCA
322 TT-ATTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTA-TTTAATCCA
* *
652726 AATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTCCATGACAAAATAAAGATCAT-ACGATTTGAGATA
385 AATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTCCATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATA
*
652790 GATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTTGAA-CTGGTTAGATAAACAAATTTAGTTTTT-AAA
450 GATAATTGTTAAAATAGTCATAACTA-TTTGAACCT-GTTAGATAAACAAATTTATTTTTTCAAA
* * ** * * **
652853 TCTC-T---TATTAATTTTT-AAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTTC-AATAATTTTG
513 TTTCTTAAATATTAATTTTTCAAAA-GTTAATAAATTGA-ATTATTTT-CTTCCAAATAAGATTG
* ** * * * *
652912 TATGAACA-AAAACAATTTTTTTACAACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
575 TATGAA-ATAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATT
652974 GTTCAAGTGA
Statistics
Matches: 1327, Mismatches: 170, Indels: 82
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
886 5 0.00
887 65 0.05
888 25 0.02
889 1 0.00
890 10 0.01
891 93 0.07
892 85 0.06
893 3 0.00
894 4 0.00
895 1 0.00
897 1 0.00
898 1 0.00
901 55 0.04
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905 121 0.09
906 14 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (896 bp):
TATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTCAAACAAGTTTTTATGAACCGAAACAATTGTTTTTTGA
TAAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTCTTTAAATAGTTATATTATTTGAACTT
ATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTACTTACTAACTTTTTGAAAGTTAATAAATTA
CCATTATTTTATTTCGAATAAGATTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGT
CAAAACGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTACTATTAAACTGATTTAGAAATATATTTAT
TTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTAATCCAAATATG
CTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTCCATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAAT
TGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACCTGTTAGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATTTCTTAA
ATATTAATTTTTCAAAAGTTAATAAATTGAATTATTTTCTTCCAAATAAGATTGTATGAAATAAA
ACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGCCT
TAACTATTTAAAATGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTCAAA
ATAATATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAATCAGCTAGTATGATCAAAAACAATTACTTTATG
ACAAAACAAAGATCATAATAATTTAAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTG
GTTCAAAAAATAGCTCTAGTTGTTAAATCTCTTACCTAACAATTTTTGAAA
Found at i:653077 original size:144 final size:146
Alignment explanation
Indices: 652910--653194 Score: 457
Period size: 145 Copynumber: 2.0 Consensus size: 146
652900 TCAATAATTT
652910 TGTATGAACAAAAACAATTTTTTTACAACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAACAAAAACAATTTTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
*
652974 GTTCAAGTGAACATGACTATGTCAACTT-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCT
66 GTTCAAGTGAACATGACTATGTCAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCA
653038 ATTAAATTGCAAAATA
131 ATTAAATTGCAAAATA
* *
653054 TGTATGAACAGAAATAATTTTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAACAAAAACAATTTTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
653119 GTTCGAGTGGACGTGACTATTTGAGCTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCA
66 GTTCAAGTGAACATGACTATGTCAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCA
653184 ATTAAATTGCA
131 ATTAAATTGCA
653195 GAATTTTAAT
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 11, Indels: 2
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
144 32 0.25
145 52 0.41
146 44 0.34
ACGTcount: A:0.41, C:0.13, G:0.12, T:0.35
Consensus pattern (146 bp):
TGTATGAACAAAAACAATTTTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
GTTCAAGTGAACATGACTATGTCAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCA
ATTAAATTGCAAAATA
Found at i:653484 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 653054--654100 Score: 852
Period size: 180 Copynumber: 5.8 Consensus size: 179
653044 TTGCAAAATA
* * * * *
653054 TGTATGAACAGAAATAATTTTTTTA-CAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
1 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAA-AAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * * ** *
653118 TGTTCGAGTGGACGTGACTATTTGAGCTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACC
65 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * ** * * *
653183 AATTAAATTGCAGAATTTTAATAAATTAGTATGATTTTATTTAGAATAAACT
130 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCT
* * * * * *
653235 TGTTTGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGAG-CATAACTATTTGAAAAAAATAAT
1 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAG-GTCATAACTATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * *
653299 TGTTCAAATAGTCATTACTATTTTAACTTGCTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTAGT
65 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
*
653364 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAATTTT-TTTGAATAAGCT
130 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-TATT-ATTTTATTTGAATAAGCT
* *
653415 TGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAAGGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATT
* ** ** * *
653480 GTTCAAGTAGTTAAATAGTCATAACTATTCGAACGGGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTT-AA-C
66 GTTC--------AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
** * * *
653543 TTTTACTTATTAATTTTTCCAATATTAACAAATT-TAATTATTTTATTCGGAATAAGTT
123 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAT-ATTATTTTATT-TGAATAAGCT
* * * * *
653601 TGTATGAATAGAAACAATTGCTTCATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATT
* * * *
653666 GTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTCAGCAAGCAAATTAATTTTTTTAAATC---T-CT
66 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT
* * *
653727 TGTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATTATTATTTTTTATTTAGAATATGCC
130 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-TATTA--TTTTATTT-GAATAAGCT
* * *
653781 TATATGAACT-GATACAATTGTTTTAT-AATGAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATA
1 TGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAA-AAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATA
* * * * * * * *
653843 ACTATTTAAATAGTTATGACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTAAAATCTTTTA
63 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
*** * * *** *
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128 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-ATATTATTTT-ATTTGAATAAGCT
* * * *
653961 TGTATGAA-GGAAAACAATTGTTTTATGATAAAAATTAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAATAAAT
1 TGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGA-AAAAA-CAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGAT
* * * * *
654024 AATTTTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTTATT-AGATAAACATATTTATTTTTTAAGTATTT
62 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
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126 TACTTATTAATTTT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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184 6 0.01
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187 2 0.00
188 40 0.06
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATT
GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTGAATAAGCT
Found at i:653613 original size:186 final size:187
Alignment explanation
Indices: 653335--653676 Score: 494
Period size: 186 Copynumber: 1.8 Consensus size: 187
653325 CTTGCTCAGT
* ** *
653335 AAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAAT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTCCAATATTAACAAATTAG-ATTAAT
* * * *
653400 TTTTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAAGGTCAAAACTAT
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*
653465 TTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAGTTAAATAGTCATAACTATTCGAACGGGTTCAAA
130 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAAATAGTCATAACTATTCGAACGGGTTCAAA
*
653523 AAATAGATTTATTTTTT-AA-CTTTTACTTATTAATTTTTCCAATATTAACAAATTTA-ATT-AT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTCCAATATTAACAAA-TTAGATTAAT
* * * *
653584 TTTATTCGGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTCATGACAAAATAAAAGGTCATAACG
65 TTT-TT-GGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTCATGAAAAAACAAAAGGTCAAAACG
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128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
653677 CATAACTAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
184 5 0.04
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.12, T:0.40
Consensus pattern (187 bp):
AAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTCCAATATTAACAAATTAGATTAATT
TTTTGGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTCATGAAAAAACAAAAGGTCAAAACGATT
TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAAATAGTCATAACTATTCGAACGGGTTCAAA
Found at i:653800 original size:366 final size:358
Alignment explanation
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Period size: 366 Copynumber: 2.3 Consensus size: 358
653206 AATTAGTATG
* ** * * * *
653216 ATTTTATTTAGAATAAACTTGTTTGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGAG-CATA
1 ATTTTATTCAGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAG-GTCATA
* * * * * * * *
653280 ACTATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTCATTACTATTTTAACTTGCTCAGTAAATAGATTT
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* *
653345 ATTTTTTAAATATTTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAATTTTTTTGAAT
130 ATTTTTTAAATATCTTAG-T-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAATTTTTTTGAAT
* *
653410 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGAA-AAAACAAAAGGTCAAAACT-ATTTGAAATA
193 AAGCCTATATGAATAGAAACAATTGGTTTAT-AATAAAACAAAAGGTCAAAA-TAATTTGAAATA
* * *
653473 GATAATTGTTCAAGTAGTTAAATAGTCATAACTATTCGAACGGGTTCAAAAAATAGATTTATTTT
256 GATAA-----C---TAGTTAAATAGTCATAACAATTCGAACGGGTTCAAAAAACAAATTTATTTT
** ***** *
653538 TTAA-CTTTTACTTATTAATTTTTCCAATATTAACAAATTTA-ATT
313 AAAATCTTTTACTTATTAATTGGAAAAATATTAACAAATTCATATT
* * *
653582 ATTTTATTCGGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTCATGACAAAATAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTCAGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAA
* * * *
653647 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTCAGCAAGCAAATTAA
66 CGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACAAATTAA
* * *
653712 TTTTTTTAAATCTCTT-G-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATTATTATTTTTTATTTAGAA
131 -TTTTTTAAATATCTTAGTTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-ATTTT-TTT-GAA
* * * * *
653775 TATGCCTATATGAACT-GATACAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATA
192 TAAGCCTATATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATAATAAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATA
* * * * ** ***
653839 GATAACTATTTAAATAGTTATGACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTAAAATCTT
256 GATAACTAGTTAAATAGTCATAACAATTCGAACGGGTTCAAAAAACAAATTTATTTTAAAATCTT
*
653904 TTACTTATTAATTGGAAAAATATTAATAAATTCATATT
321 TTACTTATTAATTGGAAAAATATTAACAAATTCATATT
* * * * *
653942 CTTTTAATCCA-AATAAGTTTGTATGAA-GGAAAACAATTGTTTTATGATAAAAATTAAAAAGTC
1 ATTTT-ATTCAGAATAAGTTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGA-CAAAA-TAAAAGGTC
* *
654005 ATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTT
62 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
654055 ATTAGATAAA
Statistics
Matches: 392, Mismatches: 67, Indels: 33
0.80 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (358 bp):
ATTTTATTCAGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCAGCAAACAAATTAA
TTTTTTAAATATCTTAGTTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAATTTTTTTGAATAAG
CCTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATAATAAAACAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAA
CTAGTTAAATAGTCATAACAATTCGAACGGGTTCAAAAAACAAATTTATTTTAAAATCTTTTACT
TATTAATTGGAAAAATATTAACAAATTCATATT
Found at i:654170 original size:154 final size:155
Alignment explanation
Indices: 653960--654255 Score: 357
Period size: 155 Copynumber: 1.9 Consensus size: 155
653950 CCAAATAAGT
* * ** *
653960 TTGTATGAAGGAAAACAATTGTTTTATGATAAAAATTAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATA
1 TTGTATGAAAGAAAAAAATTGCGTTATGATAAAAATTAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAAATA
** * * * *
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66 ATTAGTCAAATCA-TCATAACTATTTGAACTTATTAGATAAACAGATTAATTTTTTAAATATCTT
654088 ACTTATTAATTTTATTTGAAATATGC
130 ACTTATTAATTTTATTTGAAATATGC
* * *
654114 TTGTATGAATAGAAAAAAATTGCGTTATGA-CAAAA-TAAAAAGATAATAGTGATTTGAAATAGA
1 TTGTATGAA-AGAAAAAAATTGCGTTATGATAAAAATTAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAAA
* * * * * *
654177 TAATTAGTCAAATCATTATGACTATTTGAACTTGTTAGGTAAATAGATTAATTTTTTAAATCTCT
64 TAATTAGTCAAATCATCATAACTATTTGAACTTATTAGATAAACAGATTAATTTTTTAAATATCT
654242 TACTTATTAATTTT
129 TACTTATTAATTTT
654256 TGAAATATTA
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 20, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
153 7 0.06
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Consensus pattern (155 bp):
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ATTAGTCAAATCATCATAACTATTTGAACTTATTAGATAAACAGATTAATTTTTTAAATATCTTA
CTTATTAATTTTATTTGAAATATGC
Found at i:654561 original size:180 final size:180
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Indices: 654164--654561 Score: 432
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654154 AGATAATAGT
* * *
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1 GATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAAT-ATTATAACTATTTGAACTAGTCAGGTAAATAGATTAA
* ** *
654228 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTCAAAT
64 TTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTCAGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCAAAT
* * * * *
654293 ATGCTTGTACAAACAAAAATAATTATTTTGTGATAAAACAAAAGGTTATAAC
129 AAGATTGTACAAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
654345 AATTTGGAATAGACAATTGTTCAAGCA-ATCATAACTATTTGCACTAGTCAGGCT-AATATATTC
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAA--ATATTATAACTATTTGAACTAGTCAGG-TAAATAGATTA
*
654408 A-TTTTTAAATC-CATTACCTATTAACTTTCAG-AATATTAATAAATTAGCATTACT-TTATTCC
63 ATTTTTTAAATCTC-TTACCTATTAA-TTTCAGAAATATTAATAAATTAGAATTA-TGTTATTCC
** * * *
654469 AAATAAGATTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAC
125 AAATAAGATTGTACAAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
*
654525 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-TTATAACTA
654562 ATTAAATTGG
Statistics
Matches: 178, Mismatches: 30, Indels: 19
0.78 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.01
179 2 0.01
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182 1 0.01
183 1 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.10, T:0.38
Consensus pattern (180 bp):
GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTATAACTATTTGAACTAGTCAGGTAAATAGATTAATT
TTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTCAGAAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCAAATAA
GATTGTACAAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
Found at i:655224 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 654694--655574 Score: 596
Period size: 181 Copynumber: 4.9 Consensus size: 179
654684 TATCATAATG
* * * * * ** *
654694 ATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACAGGTTTGGCAAATAGAA-TTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAA-A-AATTTAT
* * * * *
654758 TTTTTAAATATCTTACTTATTTATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTA-TTCTGAA
64 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAA
* * ** * * * * * * * *
654821 TAAG-TTACTAAGAAC-TCAA-ATTGTTCTACGGCAAAACAAAAGGTCATAACA
127 TAAGCTT-GTATGAACAAAAACATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTAAAAATA
* * * * * * ** * *
654872 TTTTGAAATAAAGAATTGTTCATATACCCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGCAAGAAAATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAA-AAAATTTA-T
* * * ** * * *
654937 TTTTTAAATCTCTTAGTTGTTTATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTACTTCGAATA
64 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * * * *
655002 AACTTGTGTGAACAGAAATA-ATTATTTTATGACATAACAAAAGGTTATAATA
129 AGCTTGTATGAACA-AAA-ACATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTAAAAATA
* * * **
655054 ATTTAAAATATATAATTTTTTAGATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACTGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAA-AAATTTATT
* * *
655119 TTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
65 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
* * * *
655184 GCTTGAATGATA-AAAAACATCTGTTATATGACCA-AACAAAAGGTAACAATA
130 GCTTGTATGA-ACAAAAACAT-TATTTTATGA-CAGAACAAAAGGTAAAAATA
* * * * * * * * * * *
655235 ATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCCTAAGTATTTGAAATGATTCGGTAAACAAATTCACT
1 ATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAA-AAATTTATT
* * * * * *
655300 TTTTAAATCACTTACTTAATAATCTTTGGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAA
65 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
*** * * *
655365 GCTTGTATGAATTGAAACGATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTCAAAACA
130 GCTTGTATGAACAAAAAC-ATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTAAAAATA
* * * * * ** *
655416 ATTTGAAATAGATAATTGTTTT-TATAGTCTTAAATGTTTGAACTACTTTGGTAAATAGATTT-T
1 ATTTGAAATAGATAATT-TTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAA-AAATTTAT
* * * * * * *
655479 TTTATAAAATTTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCCGAAT
64 TTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* ***
655544 AAGCTTGTGTGAATTGAAACAATTATTTTAT
128 AAGCTTGTATGAACAAAAAC-ATTATTTTAT
655575 AGTGGAATAA
Statistics
Matches: 558, Mismatches: 126, Indels: 35
0.78 0.18 0.05
Matches are distributed among these distances:
177 2 0.00
178 51 0.09
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Consensus pattern (179 bp):
ATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAAAAATTTATTT
TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG
CTTGTATGAACAAAAACATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTAAAAATA
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Alignment explanation
Indices: 655755--656134 Score: 426
Period size: 182 Copynumber: 2.1 Consensus size: 180
655745 TTAAGTTTCA
* * * * *
655755 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTCAATCT-AAATAAA-ATAGTATGAATAAAACCTATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTT-AATCTCAAAAAAACATA-TATGAACAAAAACAATTGTTT
* * *
655818 GATAACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATCATTACAAATGGTCAAAACTATTT
64 GATAACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATCATT-CAAATAGTCAAAACTATTT
* * * * *
655883 GAAATGGTTTGGTAAACAGATTTCCTTTTTAAAT-CTCTTA-TTGATTAAATTTTT
128 GAAATAGTTTGGTAAACAGAATT-ATTTTTAAATGC-CTTACTT-ATAAAATTTTG
* * * *
655937 AAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAAAAAACATATATGAACAAAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTAATCTCAAAAAAACATATATGAACAAAAACAATTGTTTGA
* * * ** * * *
656002 TGACAAAACAAAAAGTAATAGTGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAA
66 TAACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAA
* *
656067 CTAGTTTGGTAAATAGAATTATTTTTAAATGCCTTACTTATAAAATTTTG
131 ATAGTTTGGTAAACAGAATTATTTTTAAATGCCTTACTTATAAAATTTTG
*
656117 AAATATTAACAAATTAGT
1 AAATATTAATAAATTAGT
656135 TTTGTATTAT
Statistics
Matches: 166, Mismatches: 28, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
180 39 0.23
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183 3 0.02
ACGTcount: A:0.44, C:0.07, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (180 bp):
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTAATCTCAAAAAAACATATATGAACAAAAACAATTGTTTGA
TAACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAA
ATAGTTTGGTAAACAGAATTATTTTTAAATGCCTTACTTATAAAATTTTG
Found at i:656147 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 655635--656565 Score: 634
Period size: 180 Copynumber: 5.2 Consensus size: 179
655625 AACTAGTTTG
* * ** * * * * *
655635 TTATGATAAAACAAAAGGTCGTAAAGATTTGAAATTGATAATCATTCATATAGTCT-TAACTATT
1 TTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAATTATT
* * * * * * * * * **
655699 TAAATTGG-TTCAGCAATTAGATTTATTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTA
65 TAAACTGGTTTGA-TAAATAGATTTA-ATTTTTAAATCTCTT-ATTA-TAAATTTTGAAATATTA
* * * * * *
655763 TTAAATTAGTATTATTTCA-ATCTAAATAAA-ATAGTATGAATAAAACCT-ATTGTT
126 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTA-TATGAACAAAA-ATAATTGTT
* * * * * * * * * *
655817 TGATAACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATCATTACAAATGGTCAAAACTATT
1 TTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATT-CAAATAGTTATAATTATT
* * ** *
655882 TGAAA-TGGTTTGGTAAACAGATTTCCTTTTTAAATCTCTTATTGATTAAATTTTTAAATATTAA
65 T-AAACTGGTTTGATAAATAGATTTAATTTTTAAATCTCTTATT-A-TAAATTTTGAAATATTAA
* * * *
655946 TAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAAAAAACATATATGAACAAAAACAATTGTT
127 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTGTT
** * *
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* * * * *
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* * * * * * ** ** *
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* * * * * * *
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1 TTATGACAAAACAAAAAG-TAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAATTAT
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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* * ** * ***
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* * * ** * * *
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** *
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** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * ** * * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * ** ** * * *
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* * *
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* **
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* * * * * * * *
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** ** ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * ***
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * ** ** * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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** * * * * *
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* * * * * * * * * ** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** *
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*** ** * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * *
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65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGTAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * *
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* * * * *
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* * * * * *** ** *** * *
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* * * * *
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128 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTG
* * *
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66 CTATTTGAA-TTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * *
657441 TTAACAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATAACCTTATATGAACA-AAAAAATTGTTTTATGAC
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* *
657504 AAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-
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* * * * *
657568 ATTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTAATTAGTTGTCTAAATATTAATAAATTTG
258 ATTTAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTCTTATTAATT--TT-T-GAAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
657633 TATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTACGAATAGAAAAAATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTT
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* * * * * * *
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383 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAATTA-TTTGAA-TTGTTTG-TAAAAA
* * * *
657762 GATTCAGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG-ATT-TTGTTAT
444 AATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTAT
* * * * * ** *
657825 TTTGAGTCAGGATGTACAAACAGAAACA
508 TCTAAATAAGCATGTATGAATA-AAACA
* * * * * * * *
657853 ATTGTTTTGTAAC-AAACAAAAAGTTACAAC-ACTTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTTATA
1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * * * * * *
657916 ACTATTT-ATACTGGCCAGTCCAACAGATTCATTTTTTAAAT-TTGGTGCTTATTAATTTTT-AG
65 ACTATTTGA-ATTGTTCGGT-AAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGA-
* * * * * * * * *
657978 AATATTAACATATTGGCATTACTTTATT-TCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAACT-ATTT
126 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
** * * * *
658040 ATGACAAAACAAATTGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTTG
189 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTG
* * * **
658105 AATTGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTT-AAATCTCTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAATT
253 AATTGATTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * * * * *
658169 AATATTATTTTATTCGAAACAAACTTATATGAACAGCAACATTTTTTTACGACAAAATAAAAGGT
317 AGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * *
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382 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATT-GTTTGT-AAAAAA
** * * * * * *
658299 ATTTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTATAATATCATTAGATTAGTATTGTTGTATT
445 A-TTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * *
658364 CTGAATAAGCTTGTATGAATATAAATA
509 CTAAATAAGCATGTATGAATA-AAACA
* * * *
658391 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAAATGTTCAAATAGTTATAA
1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ** *
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66 CTATTTGAATT-GTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * *
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130 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGAC
** * * * * * * *
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194 AAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG
* * * * *
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258 ATTT-AGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCT----CTT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * *
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317 AGTATTATTTTATTTGA-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * *
658775 GTTCAAAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTT-TTTCGGTAA
379 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTT--GTAA
* * * ** * * * **
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441 AAAAATTTATTTTTTAAATC-TCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
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* * * ** * * *
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1 ATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * * *
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65 ACTATTTGAA-TTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* ** * * * * * * *
659060 ATTATTAGTTTAGCAATAGTTTACTCTGAATAAGCTTGAATGAATGGAAACAATTGTTTTATGAC
129 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
** * * * * * * *
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194 AAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGA
* * * *
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259 TTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * * *
659253 ATTTTATTTTG-AATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAATAAAATGTTATA
323 ATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * *
659317 ACGATTTGAAATAGATAA-TAGTTTAAATGGACATGATTGTTTAAACTTATTCGATAAACAAATT
386 ATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTTG-TAAAAAAATT
** * * *
659381 TATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTATAATAGTAATAAATTAGAATTATTTTATT-TCA
448 TATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
*
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* * * * *
659467 ATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGATTTTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAA
1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ** * *
659531 CTATTTAAACTTACTCGGTAAACAAATTTATCTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA-A
66 CTATTTGAA-TTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * *
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130 -TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * *
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194 AAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TG
* * * *
659725 -TTCAG-AAAGCATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA
258 ATTTAGTAAA-TAGATTTATTTTTAAAA--TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTA
* ** * * * *
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318 GTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * ** * * ** * *
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* * * *
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* * * * * *
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508 TCTAAATAAGCATGTATGAA--TAAAACA
* * * * *** *
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1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * *
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* * * *
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* * * * ** *
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* * * * ** *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * *
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** * **
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* * * * * *
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1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * *
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319 TATTA-TTTTATTTGAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-TTGTTTTATGACAAAACAAA-AG
* * * * *
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* *
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*
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* * ** * *** **
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1 A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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258 ATTTAG-TAAATAGATTTATTTTTAAAATCTC----TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * *
661403 GTATTATTTTATTTTG-AATAAGTTTATATGAACTA-AAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAG
318 GTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* ** * * * *
661466 GTTATAACAATTTGAAATTGATAATTATTCAAATAG---GAACTA---G--TTCG---GTAAATA
380 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATT-GTTTGTAAAAA
* *
661520 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
444 AATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * *
661584 TCCGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAGCA
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* * * * * * * * *
661612 ATTGTTTTATAATAAAATAAAA-GTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCAAA
1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * *** ** * * * *
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* * * * * *
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* *
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TTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGTTTGTAAAAAAATTTATTTTTT
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GTATGAATAAAACA
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*
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*
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* *
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** * * * **
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* *
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* * *
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* ** * * *
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* ** * * * * *
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*
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*
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*
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**
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* * * * *
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*** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* *
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*
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* * ** * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * ** ** ** *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * ** * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* * ** *
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** * ** * *
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* * * * * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACA
* * * *
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64 AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * *
673218 TCCA-AATAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAGACAAAATGTC
128 T-TAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTC
* * *
673272 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTT-AGGTAAACAA
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* *
673336 AATTA-TTCTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTCA-T-TTCATTTTA
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** ** * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAA
* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * ** * *
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1 ATAATGATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * * ** * *
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65 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATT
* * * * * *
673938 CCA-AATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTT
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*
673991 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--A-AAC----TG-----GTT-TGTAAA-AAA
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* * *
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* * * * *
674106 TA-AATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTC
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* * * * *
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** * * * *
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* * * ** *
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* ** * * * * *
674339 ATACTTCTTAT-AAATAGGTAATTGTTCAAATATTTATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAA
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* ** *
674403 ATTTATTTTTTTAAT-TTCTTGTTTATTAATTTTTTGAATGA-TAATAAATTAGTATTA-TTTAT
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* * * *
674465 TTTGAATAAGCATGTATGAACTA-AAAAAATTA-TTTATGACTAAACAAAAGGTC
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
674645 TCGAATAAGCTTGTAGGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGATC
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* * * * * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACA
* * *
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671474 AGTGTCTACA
* * * * *
671484 ATAACGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTAGAA-TTGGTTC-GATAAACA
1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACA
* * * *
671547 AATTTAGTTTTTAAAGT-TCTTA-TTA--ATTTTTAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATT
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*** ** * * ** * * * ** *
671608 TTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTACGACAAAATATAATGTCATAACAATTTGA
128 CCAAATAAGCTTATATG-ATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAA
* * *** *
671673 AATAGATAA-TAGCTCAAATAGAT-ATAACTATTTAAACTTGTTC-GTGAACAAATTTATTTTTT
192 AATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTT
* *** * * * * * * *
671735 AAATCTCCAATTTATAAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTT
255 AAAACTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTT
* * *
671800 ATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAGAAC-AAAGATC
320 ATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAA-AACAAAAGGTC
* * * * * * *
671841 ATAATGATTTGGAATAAATGATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTT-AGTAAATAG
1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAA
* * * * * *
671905 ATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTGTTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTA-TTTATAC
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * ** * *
671969 CAAATAAGCTTTTATGAAAAAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAA
129 CAAATAAGCTTATATGATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAA
* *
672034 TA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAACATATTTA-TTTTTAAA
194 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAA
* ** * *
672096 ATTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTCAAAATAAGCTTG
258 ACTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATT-AGAATAAGCTTA
** * * * *
672159 CGTGAACAGAACCAATTTATTTT-TGACAAAATAAAATGTC
321 TATGAACAAAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
672199 ACAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAA-TATGTTCAATAAACA
1 ATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACA
* * * * *
672262 GATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
64 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * ** *
672327 TCAAGTAAGCTTATATGAGTTGACACAATTGTTTTATTGC-AAAC-AAAGGTCACAATGATTTAA
128 CCAAATAAGCTTATATGA-TAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAA
* * ** * *
672390 AATAGATAGTAATTCAAATAGTCAGGACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATATATTTCTTAA
192 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAA
* * * *
672455 AACTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTGTAATTAGAATAAGCTTGT
257 AACTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTTAT
672520 ATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
322 ATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
672559 ATAA-GAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-GATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
1 ATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * * * * * *
672622 ATTTATTTTTTAAATGTTTTACTCATTAATTGTCATTATATTAATCAATTTGTATTATTTTATTC
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
672687 AAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGTAATTTC
129 CAAATAAGCTTATATG-ATAG--AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-
* * * * * * ** * * *
672752 AAAA-AGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATCTAAACCTGTTTGACAAGCAAATTTATTTTTT
190 AAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTT
* * * * * * *
672816 AAATCTCTTAATTATTAATTTTC-TAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
255 AAAACTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTT
** * *
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* * * * ** * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA
* * * * *
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* * * *
673050 C-AATAGGCTTGTATGA-ACCAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAA
129 CAAATAAGCTTATATGATA-GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAA
* * * ** * *
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* ** * * * *
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* * * *
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320 ATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAA
* * *
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* * *
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128 CCAAATAAGCTTA-TATG-ATAG-AAACAA--TTATTTTAT-AACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** ** * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAA
* * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * **** * * *
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192 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAA
* * * *** * * *
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*** * * *
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*
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * *
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* ** * ** *
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* ** * * * * *
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* * **
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*** * * * * * *
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* * * * * *
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190 AAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAAAAAACATATTTATTTTT
* * ** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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1 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACA
* * * *
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*
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673865 GTAAATAGAT
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*
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* * *
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* * * *
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*
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* * ** *
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* * ** * *
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* *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * ** * * * * *
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* * *
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** ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * **
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * **
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* ** *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** *
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* * * ** * *
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* * ** ** * * *
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* * * * *
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* * **
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* * *
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* * ** ** * * *
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1 AAATAGTC-ATAACTAT-TTGAACTGGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * * **
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTA-TTTTT-TAAATCTCTTACTTAT
* * * * * ** * * *
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64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAA-A-A
* * * * * * *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * * **
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65 AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TGAAA-
* * *
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126 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACA-G-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * ** * *
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* * * * * *
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126 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * * * * *
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66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATG-AAAA-AA
* * * * * * * *
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129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
679183 AAGTGGCCATAATTATTTAAACTGATTCA-GTAAACTGATTTATTTTATAAATCTCTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * *
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65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAA-A
* * * *
679308 ATTG-TTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTC
128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
679360 AAATAGTCATAACTACTTGAACTGGATTA-ATAAAAAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * ** * * *
679420 AATTTTTGGAATATTAATAGATTAGCATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAAT-AAAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAAA-A
* * * * * *
679484 TTTGTTTTATGAGAAAACCAAAGGTCACATCAATTTCAAATAGATAATTGTTC
129 -TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * *
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66 ATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAAAA
* * *
679666 TTGTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * ** * * * * *
679718 ATATAGTCTTAACTATTTAAATTGATTCGACAAACAAATTTAATTTTTAAATCTTTTATTTACTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * *
679783 ATTTTTGGAATATTATTAGATTACTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATAAACAT-AAATA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTAT-GA-ATGAAAAA
* * * * * *
679846 ATTG-TTTATGACAGAACAAAAGGTTTATTTTTTTAAATGATTGATTTGAAGTATACAATTGTTC
128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCA------T--A--A-CGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * *
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66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAA--AA
* * *
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129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTT-C
* * * * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATT
* *
680156 AATTTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAT
65 AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAA
* * * * *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * ** ** * * *** *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAG-GTAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTAT
** ** * * ** * *
680337 T-ATCTTAATTCG-AATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTCTATGACAAAATAAAG-AT-C
64 TAAT-TT--TT-GAAAT-A--TTA-AT--AAA-TTAGTATTATTTTAT-TCTGAAT-AAGCTTGT
**** * * * ** ** * * * *
680398 AT-AATGATTTGA--GATATATAATTATTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTAG-T--TTGGT-
116 ATGAATGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * ** ** * *
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1 AAATAGTCA-TAACTATTTGA-ACTGGTTAGGTAAACAGATTT---AT-TTTTTAAATC--TCTT
** ** * * ** **** * * **
680514 ATCTTATTCTGAATAATT-ATGTATGAACAGAA--ACAATTATTTTACGAAAAAGAAAAAGGTCA
58 A-CTTA-T-T-AATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTT---ATTCTGAATAAGCTTG
* * * ** * * * * * *
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115 TATGA-ATGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAAC--AAAAGGTCA--T-AAC-GATTT-G-AAATA
* * * *
680637 TATTTATTTTTT
170 GA-TAATTGTTC
* * * * * *
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* * * ** * * * * **
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53 -C-TCT-T-ACT--TATTAAT--TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTCTG-AA
** * * * ** * * * * * ** * * * *
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107 T-AA-GCTTGTATGAAT-GAAAAAATTGTTTTA---TG-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * *
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165 AAA-----TA--GA-TAATTGTTC
* * * * * ** ** * * ** *
680854 GAATATTAATAA--ATTAGAATTATTTTATTTTGAATA-AGCCTATATGAATTGATACAAT-TGT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTA-GGT-AA-ACAG---AT-TTATTTTTTA-AATCTCT
* ***** * * * * * *
680915 T--TTA-TGATGAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAGTAGTTATAA-
57 TACTTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAA--ATTAG-TAT-TAT-TTTATTC---T-G-AATAAG
*** * *** * *** * *** *
680975 CTAT-TA-GAACTTGTTCGGTAAATAT-ATTTATTTTAAAA-ATATTTTACTTATTAATTGGCAA
111 CT-TGTATGAA--TG---AAAAAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTG-AA
* **
681036 A-ATGTTAATAAATT-
167 ATA-GATAAT-TGTTC
* ** * * * * ** * *
681050 -AATA-TTATTTCAATTCGAA-TACGCTT--GTATGAACAAAAACAATAGTTTTATGACAATACA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT--GGTTAGGTA--AAC--AGA-TTTA-TTTT-TTA-AAT-CT
*** * * * ** * * *
681110 AAAAGTCA-TAATGATTTGAAATA--AAT-AATT-GT-TTA-AATAGTCAT-AACT-A-TTTGAA
55 CTTACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-TGAA-TAAGCTTGTA
* * ** * *** * * * * *
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117 -TGAAT--G-AAA-AAATTGT-TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGAT-T-TGAAATAGAT
* *
681224 AAAT-TTG
173 AATTGTTC
* * ** * ** * * * * **
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1 AAATAGTCATAACT-ATTTGAA-CTGGTTA-G-GTA-AACAGAT-TTATTTT-T--TAAATCTCT
* * * * * * * * **
681290 AAGGTTA-TAGTGATATGAAATAGATAAT-TATTCAAAG-AGTCATAACTATT-TG---AA-CTT
57 TA-CTTATTAAT-TTTTGAAATA-TTAATAAATT---AGTA-TTAT-TTTATTCTGAATAAGCTT
* * * * *** * * **
681347 -AATCG-AT-AAACAGATTCAATTTT-T---AAATCTCTTA-CTTATTAA-TTTTTGGAATATTA
114 GTAT-GAATGAAA-AAATT--GTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA-TAACGATTT-GAA-A-TA
*
681403 -ATAAATTAGATTT
170 GAT-AATT-G-TTC
* * * * * *** * * *** **
681416 ATATTGTTC-TAAGTCAACTT-ATAC---TAACAAAAACA-A-TTGTTTTGTAACAAAACAAAAG
1 AAATAG-TCATAA--CTATTTGA-ACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAA-ATCTC-TTA-
* ** * *
681474 GTTA-TAACGCTTTGAAACATATAATTGTTCAAACAGTTA-TAACTATTTGTACTGGT-TAGGCC
59 CTTATTAA-TTTTTGAAATAT-TAA----T--AA-A-TTAGT-ATTATTT-TA-T--TCT--G--
** * * * *** * * * * *
681536 AACATATTCATT-TTTAAATTTGTTACTTATTAATTTTTAGGATATTAACAAATTA-G-CATTAC
105 -A-ATAAGC-TTGTATGAA--TG-AAAAAATT--GTTTTATGACA-AAACAAA--AGGTCATAAC
* *
681598 TTTATTTCG-AATA-A-GATTGTATC
159 --GATTT-GAAATAGATAATTGT-TC
* ** ** ** * * * * * * * *
681621 AACAGAAACA-AA-TGGTT-ATACTAATT-TG-AAATA-AATAACTATTCAAAT-TGTTA--TA-
1 AA-ATAGTCATAACTATTTGA-ACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * ** * * ** *
681676 -ACTATTTGAACTAGTTTGGTAAA-TAG-ATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATA
64 TAATTTTTGAAATA--TTAATAAATTAGTA-TTA--TTTT--AT-TCTGAATAAGCTT----GTA
* * * * * ***
681738 TTAAT-AAATTAATATTATTTTATTATGA-ACAAACTTATATGAG-CAAAAC-ATTTGTTTTAAG
117 TGAATGAAA--AA-A-T-TGTT-TTATGACA-AAAC--AAAAG-GTCATAACGATTTGAAAT-AG
* **
681799 ACAA---AAC
171 ATAATTGTTC
* * * ** * * * * * *
681806 AAA-GGTCATAACTGTTTGAACT-ATATAATTATTTATATAGACTTAACTATTTGAAT-TGGTTC
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-TAGGTA---A-ACAGA-TTTATTTTTTAAATCT-CTT-
* * * * * * *
681868 AGTAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTATTAATTTCATAATATTATTAGATTAGTATTA
58 ACT-----TA-TTAATTTTTGAA----ATA-TTAATAA----AT--TAGTATT--ATT-TTATT-
* * ** * * * * *
681933 TTGTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAA-CATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAA
102 CTG-AATAAG-C-----TTGTATGAATGA-AAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * *
681997 TGATTTGAAATATACAATTGTTC
158 CGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* *
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66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAAT-GAAAA-A
* ** *
682148 ATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTC
128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
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1 AAATAGTC-ATAACTATTTGAACTG-GTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTA
* * * * * * * *
682263 TCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAAC
63 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAA
* * * * *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
682382 AAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTA-ATAAATAGATTTATTTTTTAAA-CTTTCTACTTGT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTAT
* * * * * ** * *
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64 TAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAA-GCTTGTATGAATGAA
* * * **** * * * *
682506 ACAAA-AG-GTCA-GAACGATTTGAAATA-G--ATAATTGTTTTG--ATAGTCTTAACTAT-TTG
125 A-AAATTGTTTTATG-AC-AAAACAAA-AGGTCATAA-CGATTTGAAATAG--ATAA-T-TGTTC
* * * ** * * * * *
682562 AATTGGTTCAGTAAAC-ACATTG-A-T--TT-TTTAAATC--TTTTACTTATT-AAT-TTTTAAA
1 AAATAG-TCA-T-AACTA-TTTGAACTGGTTAGGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-AC
* * * * * ** * * *
682617 ATATT-ATTAGTTTAGCAATATT--TTACTTCG-A--A---TAAGCT--TTTA---TGAAT--AT
60 TTATTAATT--TTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * **
682666 -AAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCCTAAAAATTT-AAGATAGATAATTGTTC
122 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTC
* ** * *
682723 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTTGTAAACAAATTTA-GTTTTAAA--TC-T-CTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
682783 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-TTTTTCATGAATAGGAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGT-ATGAAT-GAAAAAA
* * * * * * *
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129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * * * ** * * * *
682899 AAAT-GGAATGAGTGTTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-CACATTACT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATT
* * *
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* ** * * * *
683025 AATTGTTTTATGACAAAATAAAATATTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTT
127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *** * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * ** * *
683143 ATTATTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAA-CAAAACCAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAA--AA
* * * *
683207 TGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATATCGATTTGAAATAGATAATTATTC
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
683259 AAATAGTCATAGCTATTTGAACGTGTTTA-GAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * **
683322 AATTTTTG-AATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTCGGAATAAGCTTGCATGAATAGAACCA
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* * ** * * *
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128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * ** * * * *
683438 AGATAGTCA-AAGCTATTTGAACTTTTTCA-ATAAGTAGA-TTGTTTTTTAATTCTTTTACTCAT
1 AAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * *
683500 TAA-TTTTCAGAATATTAGTAAATTATTATTATTTTAGTTC--AAGCAAACTTATGTAAACT-AA
64 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAA-TAAGCTTGTATGAA-TGAA
* * * * * * *
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125 AA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * *
683616 AAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
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65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAAAAA
* * * * *
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129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * * *
683795 ATATATAGTCATAACGATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
1 A-A-ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* *
683860 TAATTGTCTT--AATATTATTAAATTTGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
64 TAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAAT-GAA
* * *
683922 AAAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAAC-ATTCT-AAATAGATAATTGTTC
125 AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
683977 AAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCA-ATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTAT
* * * ** * *
684040 TAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTCCCAATAAGC-TATATGAACTGAAACA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAAA
* * * * *
684104 ATTCTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTC
128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
684157 AAATAATCATGATTATTTGATCTAGTTCA-GTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * ** * * **
684221 AATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTGTTTTAAACGGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAA
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* * * *
684286 TTGTTTTAT-A-AAAA-AAAA-GTC--AATGATTTGAAATAAATGATTGCTC
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
684332 AAATAGTCATAACTATTTAAACTAGCTTA-ATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * ** * *
684392 AATATTTGAAATATTAATAGAA-TAGTATTACTTTATTCCGAATAAAATTATATGAA-CAAAAAC
65 AATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAAA-
* * * *
684455 ATTTGCTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAATGACTTGAAATAGATAATTGTTC
128 A-TTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
684510 AAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTAGATAAACATAATTATTTTTTAAAGCACTTA-TTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * ** ** *
684574 ATTTTTAAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAATATGAATTCAAAAAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-T-GAAAAA
* * * *
684638 ACTTATTTTATGAAAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
128 A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
684692 ATATAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * **
684757 ATTTTTGAAATATTATTAGATTAGCATCATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATGAAAA-AA
* * * * * * ** * *
684821 TTGTTTTACGACAATATAAAAGGTTATAAGGATTTGAAGTTTACAATTATTC
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
684873 ATATAGTCATAACTATTTGAGA-TAGTTCGGTAAATAGGTTTATTTTTTAAATCACTTAGC-TAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGA-ACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTAT
* * * * *
684936 TAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAGAAGCTTGAATG-TTCAAATAT
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAA-A-
* * * * * * *
685000 AATTGTTGTATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTCAAATAAATAATTGTTG
127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * ** * * * * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * *
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* ** * *
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126 A-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * ** * * * *
685238 ATATAGTCTTAATTATTTGAACTGCTTTGACAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTGTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * ** *
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* * * * * * * *
685367 TTATTTTATAACAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGAGAATTGTTT
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
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* * * ** * *
685536 TTATTTTATAAC-AAACAAAAGTTTGTAATGATTTAAAATAGATAATTGTTC
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *** * * * * **
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* * *
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* *** *
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127 -AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT-TTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATT
* * * *
685832 AATTTCTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCATGTATGAACTGAAAAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TGAAAAA
* * * *
685895 ATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTAGATAATTGTTC
128 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTC
* * * * ** * *
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1 AAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * *
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* * *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * * * * ** *
686186 ATTTTCAAAAAATTGATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAAAAAT
* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
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* * * * **
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* * * *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
686665 AACTAGTCATAACTATTTAAACAT-GTTCA-GAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * **
686727 TGATTTTTCAAATATTAATAAATT--TATT-TTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACC
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAAT-GAAAA
* * * * * *
686788 AATTATTTTATGAC-AAA-AAAATGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTC
127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * *** * **
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* * * **
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64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAA-
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127 AATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAA
687188 CTTGTTCGAT
Statistics
Matches: 9088, Mismatches: 2234, Indels: 1638
0.70 0.17 0.13
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158 13 0.00
159 6 0.00
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Consensus pattern (180 bp):
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ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAAAAATT
GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
Found at i:677112 original size:363 final size:359
Alignment explanation
Indices: 674867--687187 Score: 4608
Period size: 363 Copynumber: 34.0 Consensus size: 359
674857 CAACAAAACA
* * * **
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* * ** *
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * *
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*
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* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTG-ATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
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* * *
675357 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGATAGTCATAA
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * * **
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194 CTATTTG-AACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * *
675485 ATTCATGAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA-ATTGAAACAATTGTTTTATTA
258 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATA-AG-AACAATT-TTTTATGA
* * * * *
675549 CAAAAAAAAGGTTACAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
320 CAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *
675589 AAATAGTCA-AGACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
1 AAATAGTCATA-ACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * *
675652 T-ATTTTTGGAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
64 TAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAC
* * * * * * *
675716 AATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAATTACTCATA
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
** * ** * * *
675781 AGGATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAAGTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCTT--A
193 ACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAA
* * * * * * **
675844 ATACTAATAAGTT-GTAGTATTTTATTT-GTAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAAAAATCATTTGG
256 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTATATGATA-AG-AACAAT-TTTTTA
* * * * * *
675906 TGACAAAACAAAAAGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTTTTC
317 TGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
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* * *
676011 AATTTTT-AGAATATTAATAACTTAGTACTATTTTATT-TCAAATAAGC-TGATATTAACT-AAA
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* * * * * * * * *
676072 ATAATTTTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAAAGATTTGAAATAAATACTTATTCAAATTGTCA
126 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
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* * * * *
676198 AAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGTTTTTATTA-ATAGAA-ATTATTATT
254 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGATA-AGAACA--ATT-TT
* * * ** * * *
676260 TTGTAATAGAAA-AAAAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTC
314 TTATGACA-AAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
676306 AAATAATCATAACTCTTTGAACT-AGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-TA-TTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * *
676366 AATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAATAAAACCAT
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAA
* *
676431 TTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * *
676496 TATTGGAATTGGTTAGGTAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATA
195 TATTTGAACTAGTTCGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * *
676560 TTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCGAATAAGC-TAGTATGA-AGTGAA-AATTTTGTTTTAT
259 TTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA-TATGATA-AGAACAA--TT-TTTTAT
* * *
676621 GCCAAAAC-AA----A-AATGATTTGAAATAGATAATTATTC
318 GACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *** * *
676657 ATATAGCCTTAACTATTTGAACT-AGTTTGACGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * ** * * * * *
676721 AATTTTTGGAATGTTTTTATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCGTGTATGAATAAAAATAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAA
* * * * * * * * *
676786 TTATTTTATGATAGAACAAATGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAAC
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * *** *
676851 TATTTAAACTAGTTTGGTAAATTGATTTATATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGA
195 TATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
** ** * *
676916 TTAATAAATTACAATTATTTTATTTTTAATAAACATATATGATCAAGAACAATTTTTATATGACC
259 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAT-AAGAACAATTTTT-TATGA-C
* ** *
676981 AAATCAAAGGAAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTG
321 AAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *** * *
677020 AAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTCGCTTTTTAAATCACTTATTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * **
677085 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAAT
* *
677150 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTAAATAG-TCAATTGTTCAAATAGTCATAAC
131 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * *
677214 TATTTGAATTTGCTCAGTAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTAT
195 TATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * * * * * *
677276 TAAGAAATTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGACTGA-AACAAATGTTCTATGTCTA
260 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGA-TAAGAAC-AATTTTTTATGACAA
* * * *
677340 AACAAATGGTCATGATGATTTTAAATAAATAATTGTTC
323 AACAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
677378 AAATAGCCATCACTATTTGAATTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATAAT-TTCCTTT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAAT-CTCTTACTTA
* * * * *
677441 TTAATTCTGTG-AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAAG-ATATGA
63 TTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA-AA
* * * * * * * *
677503 AACAAATATTTTATGACTAAGCAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT-
125 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
677567 TTAAACTATTTGAA-TTGACTAGGCAAACACATTTATTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAAGTTTT
190 AT-AACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
677627 GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TTACCAAATAAG-TCACTATGATTAGAGACAATTGTT
253 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTA-TATGATAAGA-ACAATT-TT
* * ** * *
677690 TTATAACAAAACATATATCTTAACGATTTGAGATTA-ATAATTGTTC
314 TTATGACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTC
* * *
677736 AAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* *
677801 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAAAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACA
* * * * *
677864 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCAAAT-GGCTATA
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATA
* * *** ** * * *
677928 ATTATATT-AACTAATTCAACAAACTGATTTATTTTTTAAGTTTCTTACTTATT-ATTTTAGTAA
193 ACTAT-TTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AA
* * * * * * *
677991 GTATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCCATCTAAGCTTGTATTAACTAA-AACAAATGTTTTA
256 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTATA-TGA-TAAGAAC-AATTTTTTA
* * * * * * *
678054 TGACAAATCAAAAAGTTATAATGATTTTAAATTGACAATTGTTC
317 TGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * * * *
678098 AAATAGTAATAACTATTCAAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATTTATTTCTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * *
678162 TAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAAC
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAC
* * * * * * *
678226 AATTATTTTATGACTAAACAACAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTTA
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
678291 ACCATTTGAA-TTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTGTTACTCATTAATTTTTGAAA
193 ACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
678355 TATTATTAAATTAGCATTATTTTGA-TTAGAATAAGCTTGTATGAATAA-AACAATTATTTTACG
257 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTATATG-ATAAGAACAATT-TTTTATG
* * * * *
678418 ACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGGAATATATAATCGTTT
319 ACAAAA-CAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * **
678460 ATATAGTCTTAACTATTTGAACTGATTCGGCAATTAGATTTATTTTTTGTAATTTTCTTGGTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTT-TAAATCTCTTACTTAT
* * * * ** * * * *
678525 TAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTGTTCTAAATAAAATAGTATGAACAAGACCA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACA
* * * * * * *
678590 ATTGTTTGATGTCAAAACAAAAAGTTACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAA
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * ** * * * * *
678655 CTATTTGAAATGGTTTAGTAAACATATTTACTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTTTAAAAT
194 CTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAT
* * * * * * * *
678720 ATTAATAACTTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATTAACAAAAAGAAATTGTTTTATGA
258 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATA-TGATAAGAA-CAATT-TTTTATGA
* * *
678785 CAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
320 CAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
678826 ATATAGTCTTAACGATTTGAACT-AGTTC--AAAAAATGTATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACA-G-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * *
678888 TTAA-TTTTCATAATATTACTAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTATATAAATAGAAA
63 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA
* * ** * *
678952 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTCAT
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* **
679017 AACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCATGAAA
192 AACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * *
679078 TATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTCTATACTGA-AA-AACAATTTTTTATA
257 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CT-TATA-TGATAAGAACAATTTTTTATG
* * * * * * *
679141 AGAAAGCAAAAGGTAATGACAATTTGAAATAGATAGTTGTTT
319 ACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
679183 AAGTGGCCATAATTATTTAAACTGATTCAGTAAACTGATTTATTTTATAAATCTCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * ** * *
679248 ACTTTTGAAATATTAATACA--A-CATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACT-AAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAA
* * ** *
679309 TTG-TTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * ** *
679373 TACTTGAACTGGATT-AATAAA-AAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGGAAT
195 TATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * * * * * *
679432 ATTAATAGATTAGCATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGAG
258 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATG-ATAAGAACAATT-TTTTATGAC
* * * *
679497 AAAACCAAAGGTCACATCAATTTCAAATAGATAATTGTTC
321 AAAA-CAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
679537 AAATAGTCATAATTATTAGAACCGCTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * *
679602 ATTTTTAAAATATTAATAAAATTA-TTTTATTTTATTCTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-A
66 ATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACA
* * * *
679665 ATTGTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAA
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * ** * * * * *
679730 CTATTT-AAATTGATTCGACAAACAAATTTAATTTTTAAATCTTTTATTTACTAATTTTTGGAAT
194 CTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * * * * * *
679794 ATTATTAGATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AAACATAAATAATTGTTTATGAC
258 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATA-A-GAACAATTTTTTATGAC
* * * * * *
679858 AGAACAAAAGGTTTATTTTTTTAAATGATTGATTTGAAGTATACAATTGTTC
321 AAAAC-AAAGG-TCA------T--A--A-CGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
679910 AAATAATCATAGCTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * *
679975 ATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGCATTATTTTATTTTGAACAACCTTGTATG-ATAAAAAGTAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-CAA
* * * * *
680039 TTGTTATATGACTAAACAAAAGGTAATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTGC-GATAGCCATA
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGTCATA
* * * * * * *
680102 TCTATTTGAGCTTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-A
193 ACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAA
* * * * *
680166 ATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAATAATTGTTTTTT
256 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATA-AG-AACAATT-TTTTAT
* * * *
680230 GACAAAACAAAAGATCAGAACGATTTGAAATAAATAATTATTC
318 GACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * ** ** * * *
680273 TAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAAACTCATTTA-TTTTT--AT-TATTAAATTAG
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCG-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTAT
* * * **** ** * ** **
680334 T-ATTATCTT--AAT-TCGAATAAGCTTA-TATGAAAAGAAAC-AATTATTCTATG-ACAAAATA
64 TAATT-T-TTGAAATAT-TAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT-TGTA-TGAATA
* * * * * *
680392 AAGATCATAATGATTTGAGATAT-ATAATTATTCAAAAAGTCATAACT-ATTTGAACTAG-T--T
123 AA-AACA-ATTG-TTT----TATGACAA--A-ACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * ** ** *
680452 TGGT-AAACAG--ATTTAGT-TTTTAA-TA-CTC-TTATTA-ATTTTTAAAATCTTAATGAATCG
177 TGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTAGTTCGGTA-AACAAATTT---AT-TTTTTAAATC-
* ** ** * * ** **** *
680509 GTATTATCTTATTCTGAATAATT-ATGTATGAACAGAA--ACAATTATTTTACGAAAAAGAAAAA
235 -TCTTA-CTTA-T-T-AATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTT---ATTTCGAATAA
* * * ** * * * * * *
680571 GGTCAAATGATTTGAAATAGATAATTTT-T--C-AAACGGACATGATTATTTGAACTTATTTAGT
291 GCTTATATGATAAG-AACA-AT-TTTTTATGACAAAAC--A-AAGGTCA--T-AAC-GATTT-G-
* * * * *
680632 AAACATATTTATTTTTT
344 AAATAGA-TAATTGTTC
* * * * * * * ** * * * **
680649 AAAT-CTCCTACCTA-TT--ACT--TT--TTAGA-ATATTAATAAATTAGTAATATTTTTTTCAA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATT--T-ATTTTTTAA-ATCTCTTACTT
* * * * * *** *** * *
680705 ATAAACTTGTATG-AATA-GAA-ACAATCA-TTTTATAACAAAATAAA-AAGATCATAACTATTT
62 ATTAA-TT-TTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG--C-T---TGTAT
* * * * * * * *
680765 GAA-ATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTAA-G-C-T--TG-TTCAGTAAATAGATTC
118 GAATAAAAACAATTGTTT-TAT-GACAAAAC-A--AAAGGTCATAATGATT-TG-AAATAGA-T-
* * ** * *
680823 ACATT-TT-AAATCTCTTACTCATTAA-TTTTTGGAA-TA-TT-AATAAATTAGAATTATTTTAT
174 A-ATTGTTCAAA-----TAGTCA-TAACTATTT-GAACTAGTTCGGTAAA-CA-AATT-TATT-T
* * * * * * * *
680882 TTTGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
227 TTT--A-AA-TCTCT-T-ACTT-AT-TAA----TTT-T--TG--A-AATA-TTAATAA--ATTAG
* * * * ** **
680947 AAATATATAATTA-TTC-AAGT-AG-TTATAACT-ATTAGAAC---TTGTTCGGTA-AATATATT
271 -TAT-TAT-TTTATTTCGAA-TAAGCTTAT-A-TGATAAGAACAATTTTTTATG-ACAA-A-ACA
* ** * * ** * ** * *
681003 TATTTTAAAAATATTTTACTTA-TTAATTG-GC
327 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * **
681034 AAAATGTTAATAAATTAATATTATTTCAATTCGAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATAGTTTT
1 -AAA---TAGT-CA-T-A-ACTATTTGAACT-G-ATTCG---GTA--AAC--AGA-TTTA-TTTT
* **** * * * ** *
681099 ATGACAATACAAAAAGTCA-TAATGATTTGAAATA--AAT-AATT-GT-TTA-AATAGTCATAAC
47 -TTA-AAT-CTCTTACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-TAA-
* * * * ** * *** * * *
681157 TATTTGAA-CTTAT-TCAGTAAACA-AATT-TATTT-T-TTAAATCTTTTA-CTAATTAGTTG-T
106 -A--T-AAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGT-TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA-TA-ATGAT
* * * ** * ** * ** * * *
681214 CTGAATTA-ATAAAT-TTGTATTA-TTTTAATTGAAAT-AAGCTTGTAT-GAATAGA-AAATATT
163 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-CTAGT-TCG-GTAAACAAAT-TT
* * *** * * * * * * *
681273 ATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTA-TAGTGATATGAAATAGATAAT-TATTCAAAG-AGTCATA
223 ATTTT-T--TAAATCTCTTA-CTTATTAAT-TTTTGAAATA-TTAATAAATT---AGTA-TTAT-
** * * ** ** *
681334 ACTATTT-G---AA-CTTA-ATCGATAAACAGATTCAATTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TT
277 TTTATTTCGAATAAGCTTATAT-GAT--A-AGA-ACAATTTTT-TATGACAAAAC--A--AAGGT
** *
681391 TTTGGAA-TATTAAT-AAATTAGATTTATATTGTTC
332 CAT--AACGATT--TGAAA-TAGA--TA-ATTGTTC
* **** ** * *** **** *
681425 -TA-AGTCAACTTATACTAACAAAAACAATTG-TTTTGT-AACAAAACAAAAGGTTATAA-CGCT
1 AAATAGTC-A--TA-ACT-ATTTGAAC---TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTA-AATCTC-
* * * * * * ** ** * **
681485 TTGAAACATA-TAATTGTTCAAACAGTT-ATAACTATTTGTACT-GGTTAGGCCAACATATTCAT
56 TT---ACTTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAA--ATTAGTATTATTTTATTCTAA-ATAAGC-T
* * **** * * * * * * *
681547 T-TTTAAATTTGTTACTTATTAATTTTTAGGATATTAACAAATTA-G-CATTACTTTATTTCG-A
113 TGTATGAA-TAAAAAC-AATT--GTTTTATGACA-AAACAAA--AGGTCA-TA-ATGATTT-GAA
* * ** ** * * * * * * *
681608 ATA-A-GATTGTATCAACAGAAACA-AA-TGGTT-ATACTAATT-TG-AAATAAA-TAACTATTC
168 ATAGATAATTGT-TCAA-ATAGTCATAACTATTTGA-ACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * ** * *
681665 AAAT-TGTTA--TA--ACTATTTGAACTAGTTTGGTAAA-TAG-ATTTACTTTTTAAATCTCTTA
230 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA--TTAATAAATTAGTA-TTA--TTTT--ATTTC-GA
* ** * * * * *
681723 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGA-ACAAACTTATATGAG-CAAAA
287 ATAAGCTT----ATA-TGAT-AA-GAACA--ATTTT-TTATGACA-AAAC--A-AAG-GTCATAA
*** * **
681786 C-ATTTGTTTTAAGACAA---AAC
337 CGATTTGAAAT-AGATAATTGTTC
* * *** *
681806 AAA-GGTCATAACTGTTTGAACT-ATATAATTATTTATATAGACTTAACTATTTGAATTGGTTCA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGAT-TCGGTA---A-ACAGA-TT---TA--T---TT--TT--
** * * * * *
681869 GTAAAAAAAT-TTATTTTTTAAATCTCATAGTT-ATTAAT-TTCATAATATTATTAGATTAGTAT
48 -T--AAATCTCTTACTTATT-AAT-T--T--TTGA--AATATTAATAA-ATTAGT--ATTA-TTT
* ** * * * * * *
681931 TATTGTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAACATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATA
98 TATTCTA-AAT--A--AGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
681996 ATGATTTGAAATATACAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAGCATATTT
158 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTT
* *
682061 ATTTTCTAAATCTCATACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
223 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-A
* * * ** *
682125 ATAGGCTTGTATGATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATA
287 ATAAGCTTATATGAT-AAGAACAATT-TTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATA
682190 GATAATTGTTC
349 GATAATTGTTC
* * *** * *
682201 AAAT-GGCGATAATTATTTGAACTGATTTACTAAACTGATTTATTTTTTAAATCT-TTAACTTCT
1 AAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTAT
* * * * * ** * **
682264 CAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACA
* * * ** *
682329 ATTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * *** * * * *
682394 CTATTTAAACTTGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAA-CTTTCTACTTGTTAATTTTTTG-AA
194 CTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAA-TTTTTGAAA
* * * * * **
682457 TGTTAATAGA--AG-AGTA--TTATTT-G---AA-C-----TGA-AACAATAA--TTTTATGATT
257 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATAAGAACAATTTTTTATGACA
* *
682504 AAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTT
322 AAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * * * * * *
682543 TGATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCAGTAAACACATTGATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * ** * * * * *
682608 ATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTC-GAATAAGCTTTTATGAATATAAACAA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAA
* * * **
682672 TTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCCTAAAAATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
** *
682735 CTATTTGAACT-GATTTTGTAAACAAATTTA-GTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAAT
194 CTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * *
682794 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-TTTTTCATGAATAGGAACAATTGTTTTACGA
258 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTAT-ATG-ATAAGAACAATT-TTTTATGA
* * * * * *
682858 CAAAATAAAATGTCATAATGATTTCAAATAGATAATAGTTT
320 CAAAA-CAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
** * * * * * * * * *
682899 AAAT-GGAATGAGTGTTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-CACATTACT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATT
* *
682962 AATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC
65 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAAAAAC
* ** * ** * * * * *
683025 AATTGTTTTATGACAAAATAAAATATTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTACATAATCACA
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
683090 ACTATTTAAACTCA-CTCGGTAAATAAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTGGAA
193 ACTATTTGAACT-AGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * **
683153 TTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGA-ACAAAACCAATGGGTTTATG
257 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATA-AGAA-CAAT-TTTTTATG
* *
683217 ACAAAACAAAAGGTCATATCGATTTGAAATAGATAATTATTC
319 ACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * * * *
683259 AAATAGTCATAGCTATTTGAACGTG-TTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* ** * * *
683322 AATTTTTG-AATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTCGGAATAAGCTTGCATGAATAGAACCA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTAT
* * * ** * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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*
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* * * * ** * * **
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Statistics
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Consensus pattern (179 bp):
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TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAATTACTATTATTTTATTTCGAATAA
GCTTGTATAAACATAAATAATTGTTTATGACAAACAAAAGGTAATAAGA
Done.