Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 23775123
ACGTcount: A:0.35, C:0.15, G:0.15, T:0.35
Warning! 69000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 6 of 129
Found at i:764166 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 764109--764166 Score: 59
Period size: 18 Copynumber: 3.3 Consensus size: 18
764099 GAAATATATA
764109 ATTATTCAAATAGTTATG
1 ATTATTCAAATAGTTATG
* * *
764127 A-GATTTGAAATAG--ATA
1 ATTA-TTCAAATAGTTATG
764143 ATTATTCAAATAGTTATG
1 ATTATTCAAATAGTTATG
764161 ATTATT
1 ATTATT
764167 TGAACTTATT
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 6, Indels: 8
0.68 0.14 0.18
Matches are distributed among these distances:
16 11 0.37
17 2 0.07
18 17 0.57
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Consensus pattern (18 bp):
ATTATTCAAATAGTTATG
Found at i:764327 original size:215 final size:214
Alignment explanation
Indices: 763913--764337 Score: 473
Period size: 215 Copynumber: 2.0 Consensus size: 214
763903 AGGTCATAAC
* * *
763913 GATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTTATAACCATTTGAACTTGTCCAGTAAATAGATTCAT
1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACCATTTGAACTTGTCCAGTAAACAGATT-AT
* * * *
763978 ATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
65 ATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTGTCAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATCTCGAATA
* * * * ** * * * *
764043 AGCCTATATGAACTAATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCACAGCAATTTGAAATATAT
130 AACCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCACAACAATTAGAAATAAAT
764108 AATTATTCAAATAGTTATGA
195 AATTATTCAAATAGTTATGA
* ** * * *
764128 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACTTATTC-GATAAACATATT-T
1 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACCATTTGAACTTGTCCAG-TAAACAGATTAT
764191 ATTTTAAAAATCTTTTACCTT-TTAA-TTGTCAATATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCT-
65 ATTTT--AAATCTTTTA-CTTATTAATTTGTCAA-ATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATCTC
* * * * * ** *
764253 GAATAAACTTGTTTGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAAGTCATAATGATTAGGAA
125 GAATAAACCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCACAACAATTAGAAA
764318 TAAATAATTATTCAAATAGT
190 TAAATAATTATTCAAATAGT
764338 CATAACTGAT
Statistics
Matches: 173, Mismatches: 31, Indels: 12
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
213 6 0.03
214 6 0.03
215 155 0.90
216 6 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (214 bp):
GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACCATTTGAACTTGTCCAGTAAACAGATTATA
TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTGTCAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATCTCGAATAA
ACCTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCACAACAATTAGAAATAAATA
ATTATTCAAATAGTTATGA
Found at i:764564 original size:64 final size:64
Alignment explanation
Indices: 764441--764564 Score: 187
Period size: 64 Copynumber: 1.9 Consensus size: 64
764431 AGATTTTATG
* * *
764441 AATTAAAACAATTATTTTATGTTAAAACCAAATGGTCAAAATGATTTTAAATAGATAATTCTATA
1 AATTAAAACAATTATTTTATGCTAAAA-CAAAGGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTCTATA
*
764506 AATTAAAACAATTATTTTATGACTAAAA-AAAGGGTCAAAATGATTTGAAATAGCTAATT
1 AATTAAAACAATTATTTTATG-CTAAAACAAAGGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATT
764565 TTTCTCATAG
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 4, Indels: 3
0.89 0.07 0.05
Matches are distributed among these distances:
64 28 0.52
65 21 0.39
66 5 0.09
ACGTcount: A:0.48, C:0.07, G:0.10, T:0.35
Consensus pattern (64 bp):
AATTAAAACAATTATTTTATGCTAAAACAAAGGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTCTATA
Found at i:765391 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 765347--765391 Score: 56
Period size: 19 Copynumber: 2.4 Consensus size: 19
765337 AAATTTTTAC
765347 TTATT-AATTTTTGTAATA
1 TTATTCAATTTTTGTAATA
* * *
765365 TTAATCAATTTTTGTTATT
1 TTATTCAATTTTTGTAATA
765384 TTATTCAA
1 TTATTCAA
765392 AAAAAGCTTG
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 4, Indels: 1
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
18 4 0.18
19 18 0.82
ACGTcount: A:0.31, C:0.04, G:0.04, T:0.60
Consensus pattern (19 bp):
TTATTCAATTTTTGTAATA
Found at i:765546 original size:544 final size:531
Alignment explanation
Indices: 764600--766116 Score: 1294
Period size: 540 Copynumber: 2.8 Consensus size: 531
764590 TTGGTTCCAC
* * * * * *
764600 AAACACATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAGTTAGA-AGT
1 AAACATATTTACTTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCAAAATATTAATAA-TTA-ATATT
* ** * * * * * * *
764662 ATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTACTTTATGAGAGAAAAAAAGA-TCACA
63 ATTTTAATCCAAATAACCTTGTATGAACAAAAACAATTAGTTTATGACA-AAACAAAGAGTTATA
** * * * * ** * *
764726 ATGATTTTAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTCCGATAAATAGATT
127 ACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAC-ATTTGAACGT-ATTAGATAAACAAATT
** * ** **
764790 TA-TTTTTAAATCT-TTA--T--TTGTTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA
190 TATTTTTTAAATCTCTTACCTACTAATTGTCTTAATATTAAT-AATTTTTATTATTTTATTCTAA
** *
764849 ATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATATCATAATAATTTAAAATA
254 A-AAAGTTG-ATGAATAGAAACAATTGTTTTA-GACAAAACAAAATGTCAT-AT-ATTTAAAATA
* * * * * * *
764914 GCTAATAGTTCGAATAGACTTGACTATTTG-GACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
314 GATAATTGTTCGAATAGTCATAATTATTTGAG-CTTGTTTGGTAAACAAA-TTATTTTTTAAATC
** *
764978 TCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTCAAATAAACTTGTAT
377 TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCAAATAAACTTATAT
765043 -AAGTAGAAACAATTG-CTTTATGA-GAAGACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA-AATAATTG
441 GAA-TAGAAACAATTGTCTTTATGACG-A-AC--AAGATCATAACGATTTGAAA-AGAATAATT-
* *
765104 A-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTC-
499 ATTCAAATAATCATAACTATTTCAACTCACTCG
** * *
765135 AAACAATAAATTTTA-TTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAAATTTTGAAATTTTAATAAATTAGT
1 AAAC-AT--A-TTTACTTTTTTAAAATCTTTTACTTATT-AATTTCAAAATATTAAT-AATTAAT
* * *
765199 ATTATTTT-ATACCAAATAAGCTTTTATGAA-AAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAA-AGAT
60 ATTATTTTAAT-CCAAATAACCTTGTATGAACAAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAGAG-T
* ** *
765261 TGTAACAATTTGAAATGGATAATTATTCAAATTGAT-ATAACTATTTGAACGTATTAAGA-AAAC
123 TATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG-TCATAAC-ATTTGAACGTATT-AGATAAAC
* * * * *
765324 AAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-TTTGTAATATTAATCAATTTTTGTTATTTTA
185 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTACTAATTGTCT-TAATATTAAT-AATTTTTATTATTTTA
* * *
765387 TTCAAAAAAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGATATTTT
248 TTCTAAAAAAG-TTG-ATGAATAGAAACAATTGTTTTA-GACAAAACAAAATGTCAT-ATA-TTT
* * * * *
765452 GAAATAGATAATTGTTCGGATAGTCGTAATTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAGATTAATTTTCT
308 AAAATAGATAATTGTTCGAATAGTCATAATTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAAATT-ATTTTTT
* * * * *
765517 AAGTCTCTTACTCT-TTAATATTCAGAATATCAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACT
372 AAATCTCTTACT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACT
* * * * * * * * **
765581 TATTTGAATTGAAATAGTTGTTTTTATTACGAACAAGGTCATAATGATTTGAAAAGGCTAATTAT
436 TATATGAATAGAAACAATTGTCTTTATGACGAACAAGATCATAACGATTTGAAAAGAATAATTAT
* ***
765646 TCAAATAATCATGACTATTTCAACTTGTTCGG
501 TCAAATAATCATAACTATTTCAACTCACTC-G
*
765678 TAAACATATTTACTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCAAAATATTAATAATTAATATTAT
1 -AAACATATTTACTTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTCAAAATATTAATAATTAATATTAT
*** * * * *
765743 TTTAATTTGAATAACCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAGAGTTATAATA
65 TTTAATCCAAATAACCTTGTATGAACAAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAGAGTTATAACA
* * * *
765808 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTT
130 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACATTTGAACGTATTAGATAAACAAATTTATTT
* *
765873 TTTAAATCTCTTACCTACTAATTGTCTTAATATTAATAATTTTGTATTATTTTATT-TGAAATAG
195 TTTAAATCTCTTACCTACTAATTGTCTTAATATTAATAATTTT-TATTATTTTATTCTAAAAAAG
* * * * *
765937 -T-ATGAATAGAAAAAATTATTTTACATCAAAACAAAATGTTATATCGATTTCAAATAGATAATT
259 TTGATGAATAGAAACAATTGTTTTAGA-CAAAACAAAATGTCATAT--ATTTAAAATAGATAATT
** * * * * * * *
766000 GTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGATCGGTAAACATATTTTTTTTTAAATCTCTTAATTA
321 GTTCGAATAGTCATAATTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *
766065 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTCGAATAAACTTA
386 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTA
766117 GAGATTTAAA
Statistics
Matches: 793, Mismatches: 142, Indels: 95
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
533 1 0.00
534 63 0.08
535 87 0.11
536 2 0.00
537 2 0.00
538 9 0.01
539 150 0.19
540 182 0.23
541 78 0.10
542 1 0.00
543 35 0.04
544 180 0.23
545 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (531 bp):
AAACATATTTACTTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTCAAAATATTAATAATTAATATTATT
TTAATCCAAATAACCTTGTATGAACAAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAGAGTTATAACAA
TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACATTTGAACGTATTAGATAAACAAATTTATTTT
TTAAATCTCTTACCTACTAATTGTCTTAATATTAATAATTTTTATTATTTTATTCTAAAAAAGTT
GATGAATAGAAACAATTGTTTTAGACAAAACAAAATGTCATATATTTAAAATAGATAATTGTTCG
AATAGTCATAATTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
TTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTG
TCTTTATGACGAACAAGATCATAACGATTTGAAAAGAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT
CAACTCACTCG
Found at i:765746 original size:179 final size:177
Alignment explanation
Indices: 764515--766116 Score: 670
Period size: 175 Copynumber: 8.9 Consensus size: 177
764505 AAATTAAAAC
* * * ** * ** * *
764515 AATTATTTTATGACTAAAA-AAAGGGTCAAAATGATTTGAAATAGCTAATTTTTCTCATAGTCTT
1 AATTATTTTATGAC-AAAACAAAGAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCAT
* * * * * * *
764579 AACTATTTGAA-TTGGTTCCACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGA
65 AAC-ATTTCAACTT-GTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAA-TTTCAAA
* * * * * * * * *
764643 ATATTATTAAGTTAGAAGTATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAC
127 ATATTAATAA-TTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAACTTATATGAACATAAAT
* * * * * * * * *
764696 AATTACTTTATGAGAGAAAAAAAGA-TCACAATGATTTTAGATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
1 AATTATTTTATGACA-AAACAAAGAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCAT
* * * * * **
764760 AACTATTTGAACTGGTCCGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCT-TTA--T-TTGTTTTCAAAAT
65 AAC-ATTTCAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTCAAAAT
** * * * *
764820 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAAC
129 ATTAAT-AATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAACTTATATGAACATAAAT
* * * * ** *
764871 AATTGTTTTACGACAAAACAAA-ATATCATAATAATTTAAAATAGCTAA-TAGTTCGAATAGA-C
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAGA-GTCATAATAATTTGAAATAAATAATTA-TTCAAATA-ATC
* * ** * ** * *
764933 TTGACTATTTGGACTTGTT-TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTA
63 ATAAC-ATTTCAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAA-TTTCA
* * * * * *
764997 GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTCAAATAAACTTGTAT-AAGTAGAAAC
125 AAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTA-TTT-AAATAAACTTATATGAA-CATAAAT
** * * ** *
765053 AATTGCTTTATGAGAAGACAAA-AGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGA-TCAAATAGTCA
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAGAG-TCATAATAATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAATCA
* *** * * * * *
765116 TAACTATTTGAACTCACTC-AAACAATAAATTTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAAATTTT
64 TAAC-ATTTCAACTTGTTCGATA-AACAAA-TTTATTTTTT-AAATCTCTTACCTATT-AATTTC
* * ** * * * *
765180 GAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATACCAAATAAGCTTTTATGAA-AAAAAC
124 AAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAT-TTAAATAAACTTATATGAACATAAAT
** ** * ** *
765235 AATTGGTTTATGACAAAACAAA-AGATTGTAACAATTTGAAATGGATAATTATTCAAATTGAT-A
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAGAG-TCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-TAATCA
* * * * * * ***
765298 TAACTATTTGAACGTATTAAGA-AAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGT
64 TAAC-ATTTCAACTTGTT-CGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAA-TTTCAA
** * * * ** * * **
765361 AATATTAATCAATTTTTGTTATTTTATTCAAAAAAAGCTTGCATGAATAGAACC
126 AATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTAAATAAA-CTTATATGAACATAAAT
* * * * * ** * *
765415 AATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATGATATTTTGAAATAGATAATTGTTCGGATAGTCGT
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAGA-GTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCAT
* * * * * * * * * *
765479 AATTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAGATTAATTTTCTAAGTCTCTTACTCT-TTAATATTCAGA
65 AA-CATTTCAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-CTATTAAT-TTCAAA
* * *
765543 ATATCAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATTTGAA-TTGAAAT
127 ATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAACTTATATGAACAT-AAAT
* * * * * **
765596 AGTTGTTTTTATTAC-GAAC-AAG-GTCATAATGATTTGAAA-AGGCTAATTATTCAAATAATCA
1 AATT-ATTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAATAATTTGAAATA-AATAATTATTCAAATAATCA
* * * * *
765657 TGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACATATTTACTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCAA
64 TAAC-ATTTCAACTTGTTCGATAAACAAATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTCAA
* * * *
765722 AATATTAATAATTAATATTATTTTAATTTGAATAACCTTGTATGAACATAAAT
126 AATATTAATAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAACTTATATGAACATAAAT
* *
765775 AATTATTTTATGACAAAACAAAGAGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATA
* * * * **
765840 ACATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTACTAATTGTCTTAATA
66 ACATTTCAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATT-TCAAAATA
* * * * *
765905 TTAATAATTTTGTATTATTTTATTTGAAAT--A---GTATGAATAGAAAA
130 TTAATAA-TTAGTATTATTTTATTT-AAATAAACTTATATGAACATAAAT
* * * * * * * *
765950 AATTATTTTA-CATCAAAACAAA-ATGTTAT-ATCGATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
1 AATTATTTTATGA-CAAAACAAAGA-GTCATAAT-AATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATC
* * * * * ** ***
766012 ATAATTATTTAAACTTGATCGGTAAACATATTT-TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGG
63 ATAA-CATTTCAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAA-TTTCAA
*
766076 AATATTAATAAATT-GATATTATTTTATTTCGAATAAACTTA
126 AATATTAAT-AATTAG-TATTATTTTATTT-AAATAAACTTA
766117 GAGATTTAAA
Statistics
Matches: 1106, Mismatches: 241, Indels: 149
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
174 15 0.01
175 219 0.20
176 40 0.04
177 3 0.00
178 40 0.04
179 160 0.14
180 158 0.14
181 218 0.20
182 178 0.16
183 27 0.02
184 45 0.04
185 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
AATTATTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATA
ACATTTCAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTCAAAATAT
TAATAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAACTTATATGAACATAAAT
Found at i:766724 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 766692--766724 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
766682 AACAAATTCA
766692 AACAATTATGACTATTTG
1 AACAATTAT-ACTATTTG
766710 AACAATTAT-CTATTT
1 AACAATTATACTATTT
766725 AAAATCATTA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.06, T:0.42
Consensus pattern (17 bp):
AACAATTATACTATTTG
Found at i:767104 original size:540 final size:535
Alignment explanation
Indices: 766111--767246 Score: 1281
Period size: 540 Copynumber: 2.1 Consensus size: 535
766101 ATTTCGAATA
* * * * *
766111 AACTTAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TTACTATTTGA
1 AACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAACA-ATTATGACTATTTGA
* * * *
766175 ATAATTTATCACTTTCAAGTTATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTTTAGTTCATAAA
64 ACAATTTATCACTTTAAAATCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTTTAGTTCATAAA
* ** *
766240 AACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTA
129 AACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGACTTA
* * * * * * * *
766305 AAAACTAAAGCTATTTTTCGAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATATCAATCTTA
194 AAAAATAAAGCAATTTCTCGAACCAGTTAAAACAATTATAACCATTTAAACAAATATCAATCTTA
* * * * * *
766370 AATCGTTATAATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGGATAA
259 AATCATTATAATCTTTATTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTAGAATAA
* * * *
766435 AAATAATACTGATTTAATAATATTTCAAAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTA
324 AAATAACACTAATTTAATAATATTTCAAAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTA
* * *
766500 AAGCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAACTATCCATTTAAAATTGTTCTGACATTTTATT
389 AAGCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAACTATCCACTTAAAATTGTTCTAACATTTTATT
* * * * * * *
766565 -TGGTCATATAATAATTGTTTTAGTTCATACAATCTTATTCA-AAATAAAATAATATTAATTTAT
454 CT-ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAAA-AAAATAATAATAATTTAG
*
766628 TAACATTCA-AAAAATTAAC
517 TAAAATT-ATAAAAATTAAC
* *
766647 AAGC-AAGAGATTTGAAAAAATAAATATTTTTACTAAACAAATTCAAACAATTATGACTATTTGA
1 AA-CTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAACAATTATGACTATTTGA
**
766711 ACAA-TTATCTA-TTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTC
64 ACAATTTATC-ACTTTAAAATCATTATGACC-TTTCATTTTGTCATAAAACAA---TTTTAGTTC
** * **
766774 ATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTCATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAG
124 ATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG
* ** ** * *
766839 ACTTAAAAAATAAATCAATTTGCT-GAATTAGTTAAAACAATTATGGCCATTTAAACAACTATCT
189 ACTTAAAAAATAAAGCAATTT-CTCGAACCAGTTAAAACAATTATAACCATTTAAACAAATATCA
* ** * *
766903 AT-TTCAAGTCATTATTTTCTTGTATTTTAC-CATAAAACATTTGTTTTTCAACATACAAGTTTA
253 ATCTT-AAATCATTATAATCTT-TATTTT-CTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTA
* ** *
766966 TTAGAA-ATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAGAGTTAATATGAGATTTAAAAAATAAA
315 TTAGAATA-AAAATAACACTAATTTAATAATATTTCAA-AAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
767030 TCTATTTAC-AAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATTGTTT
378 TCTATTTACTAAAGC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAACTATCCACTTAAAATTGTTC
* *
767093 TAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAAAAAAATAAT
442 TAACATTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAAAAAAATAAT
* *
767158 AATAATTTAGTAAAATTATGAAAATTAAT
507 AATAATTTAGTAAAATTATAAAAATTAAC
* * * *
767187 AACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACCAATTTAAACAATTATGACTATT
1 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAACAATTATGACTATT
767247 ACAATGATTA
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AATTTATCACTTTAAAATCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTTTAGTTCATAAAAA
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AAATAAAGCAATTTCTCGAACCAGTTAAAACAATTATAACCATTTAAACAAATATCAATCTTAAA
TCATTATAATCTTTATTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTAGAATAAAA
ATAACACTAATTTAATAATATTTCAAAAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA
GCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAACTATCCACTTAAAATTGTTCTAACATTTTATTCT
ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAAAAAAATAATAATAATTTAGTAAA
ATTATAAAAATTAAC
Found at i:767293 original size:181 final size:178
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766106 GAATAAACTT
* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * *
766241 ACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGCA
127 GCTTATTTAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTGAAAATTAATAA-TA
* * * * * * * * * * * *
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1 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAATTCAAACAATTATGACTATTAGAACAATT
* * * * * ** *
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65 ATCTAT-TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGC
* * * * *
766423 TTATTTGGATAAAAATAATACTGATTTAATAATATTT-CAAA--AATAATA
129 TTATTT-AAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAATTAATAATA
* * * * * * *
766471 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTAAAGC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAACT
1 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAATTCAAACAATTATGACTATTAGAACAATT
* * * * ** * * * *
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* * * ** * *
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* * *
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1 AGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAACAATTATGACTATTAGAACAATT
** * * * *
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** * * *
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129 TTATTTAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-GAAAATTAATAA-TA
* ** * * ** * * * * *
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1 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAACAATTATGACTA-TTAGAACAATT
* * ** *** * * * * *
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* * * *
766962 TTTA-TTAGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAGAGTTAAT-AT-
128 CTTATTTA-AAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAA-AATTAATAATA
* * * * * *
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1 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAACAATTATGACTATTAGAACAATTA
* * * * * *
767076 TCTACTTCAAATTGTTTTAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTT
66 TCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTT
* * *
767141 ATTTAGAAAAAAATAATAATAATTTAGTAAAATTATGAAAATTAATAACTA
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* * * * * **
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1 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAACAATTATGACTATTAGAACAATTA
* * ** * * *
767257 TCTATTTGAAATTGCTAT-AGCCTTTTGTTTTATCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATAGAAGCT
66 TCTATTTAAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT
* * * * * *
767321 TGTTTCAAATAAAATAATACGAATTTTTTTATATTATGACAATTAATAAGTA
130 TATTT-AAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TGAAAATTAATAA-TA
* * * * * *
767373 AAAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-TCAAACAAATTCAAATC-TTTATGA-TATTTGAATAAT
1 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAATTCAAA-CAATTATGACTATTAGAACAAT
* * * * *
767435 TATTTATTGT-GAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAAACAA
64 TATCTATT-TAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAA
* ** *
767498 GTTTATTCTAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAGTA
127 GCTTATT-TAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTGA-AAATTAATAA-TA
* * * * *
767553 AAAGATTTAATAAATAAATATGTTTACTAAATAAGTTCAAA
1 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAA
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TCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTT
ATTTAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAATTAATAATA
Found at i:767296 original size:357 final size:347
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766108 ATAAACTTAG
* * * * * * *
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* * * * * * * * **
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTATTA-AATAACTATC
* * * ** * * * *
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65 TATTTAAAATTGTTATG-CCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGT-TTA
* * * *
766602 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAACAAGCAAGAGATTTGAAAAA
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* * * * *
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* * * * * **
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* * * *
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* ** * * ** * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACTATC
* * ** ** * * ***
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*
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * * *
767194 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACCAATTTAAACAATTATGACTATTACAATGATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTATTA-AATAACTATC
* * * * * *
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* * * * * * *
767323 T-TTCAAATAAAATAATACGAATTTTTTTATATTATGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAC
126 TATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCA-AATTAAT-A-T--GAGATTTAAAAAA
* * ** * * * * *
767387 TAAATTTGTTTATCAAACAAATTCAAATCTTTATGA-TATTTGAATAATTATTTATTGTGAATTG
185 TAAATCTATTTA-CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACT-TAAATCG
* * * * **
767451 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAAACAAGTTTATTCTAATTAAAA
248 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATT-TAAAAAAAA
*
767515 TAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAATAATAAGTAAA
311 TAATACTAATTTATTAATA-TTTGA-AAATAATAA-TAAA
* * ** * * *
767555 AGATTTAATAAATAAATATGTTTACTAAATAAGTTCAAATC-ATTGTGACATTTTGTTTTGTAAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTT-AAAACAATTATGAC-------TAT-TAA-
* * * * * ** * * ** ** * * *
767619 AAAACAAT-TGTTT-TAGTTCATACGAGCTTAATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
56 ATAACTATCTATTTAAAATTGTTATG-CCTT--TT-ATTTTATCATAAAAC--ATTTGTT--TTT
* * * * *
767681 G-CCA-A-AAATTAATGAATAAGAGAATTAAAA-AATGAATATATTTATTGAACATGTTCAAA-T
113 GTTCATACAAGTT--T--ATTA-A-AA-TAAAATAAT-ACTA-ATTTATT-AATAT-TTCAAATT
* * * * * * * * * * * *
767741 AGTTATAACTATCTGAATAAT-TATCTATTT-CAAA-ATATT---ATGACCTTTTG-TTTTGTCA
167 A-ATATGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACAAACAAATTCAAAT-A-GTTATGACTAT-T--
* * * * * * * * * * *
767799 TAAACAATTGGTTCTA-TT-CAT-G---CAAGC--TTATTTTG-AATAAAATAA---TATAAATT
225 TGAACAATT--ATCTACTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT
* * * * *
767852 TAT-TAA---TATTCT---AAAAAT--TAATAA-GTA--AAAATTT-AAAA-AAT-A-AAA
288 CATACAAGCTTATT-TAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAATAATAATAAA
* *** * ** * * * ** * *
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1 AGATTTAAAAAATA-AATCTG-T--TTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTAT-T-AAATAA
* **** ** ** * *
767957 TTATGACT-TTTTGTTTTGTCCTAAACCAATTGTTTCTATTCAT-AAA-A---G-----CTT-AT
60 CTAT--CTATTTAAAATTGT--TATGCCTTTTATTT-TA-TCATAAAACATTTGTTTTTGTTCAT
* * * * *
768010 TC-AG--------AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGCAAAATATT
119 ACAAGTTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAATTAATATG--AGAT-TT
* * * * * * *
768066 TAAAAATAAATCTAATTACTAAGCGAGTTCAAATAAG-TATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
179 AAAAAATAAATCTATTTAC-AAACAAATTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-CT
* * * * **
768130 TAAATCATTATGATCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAATTTTATTTGA
241 TAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-A
* ***
768194 AAAAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTTTG
304 AAAAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TGAAAA-TAATAA-TAAA
* * *
768240 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACAAGTTCAAAACTAAATCTATTTACTGAAGTAGTT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACCAGTT-AAAAC---A---A-TTA-TG-ACTA-TT
** * * * * ****
768304 CAAATAGTTAT-GACTTAAAGAATTATCTAT-CTCAAATCGTTATAATCTT-T-ATTTTGTCATA
54 -AAATAACTATCTA-TTTAA-AATTGT-TATGC-C---T--TT-T-ATTTTATCA-TAAAACAT-
** ** * ** * *
768365 AAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAACTTATTCGGATTGTAATAATACTAATTTAATAATATTCC
105 ------TTGTTT-TTGTTCATACAAGTTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * * *
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162 AAATTAA-TA-TGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAAACAAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * *
768492 TAGAATAATTGTCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAATT
224 TTGAACAATTATCTACTT-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT
* * * *
768557 CATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATGAGTAA
288 CATACAAGCTTATTTAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAATAA-TAAT-A--AA
* * * ** * * * *
768621 GAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATGAATT-TGATTATTTGAACAATT
1 -AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAG-TTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACT
* ** * * * * *** * * **
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62 AT-CTATTTAAAATTGTTATG-CCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGT
* * * * *
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125 TTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAATTAAT----ATGAGATTTAAAA
** * * * * * * * * *
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183 AATAAATCT-ATTTACAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-CTTAAAT
* * * * * * *
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246 CGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-AAAAAA
* * * * * *
768941 AATAACACCAATTTAATAATATTTCAAAACTTA-AATAAG
309 AATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAA-TAATAATAAA
* * * * * * * **
768980 AGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCAAACCTA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAGTTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACC-AGTTAAAACAATTATGACTATTA-AATAACTAT
* * * ** * * * *
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64 CTATTTAAAATTGTTATGCCTTTTAT-TTTA-TCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGTTT
** *
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127 A-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC----AAATTAAT----ATGAGATTT-AAA
* * * * *
769171 AAAGTAAAT-TAGTTTACTGAACAAGTTCAAAGAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTAA
182 AAA-TAAATCTA-TTTAC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-A
* * * * ** * * * **
769235 AACCATTATGACCATTTGCATTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTGCATAAAAGCTTATCCAAAAT
243 AATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAA-
* * *
769300 AAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAATGTTAATAAGTAAA
307 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAA--ATAATAA-TAAA
* * * * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACTAT
* * ** * * * ** * * *
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64 CTATTTAAAATTGTTA-TGCCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTG-TTCATACAAGTTT
* * * * * * *
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127 ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-A-AATTAATATGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * **
769535 CTATTTATTAAACCAGTTTAAATA-TCATAACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTATTATA
190 CTATTTA-CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAATCGTTATA
* * * * *
769599 ACCTTTT-TTTCTAAT-ATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATACGT-AATAAAATAA
253 ACCTTTTGTTT-T-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT--TTAAAAAAAATAA
* * *
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314 TACTAATTTATTAATATT-TGAAAA-TAATAA-TAAA
* * * *** * * * *
769698 AGATTTAAAAAATAATTTCAT-TTGT-C-GAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTACATGAATAATT
1 AGATTTAAAAAATAA-ATC-TGTT-TACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACT
* *** * * * * * ** * *
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62 ATCTATTTAAAATTGTTATG-CCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTG-TTCATACAAGT
** * * * * *
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125 TTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--CAAA--T-TAA-TATGAGATTTAAAA
* *** * * * *
769888 AATAAAATCTATGTATCAAACTGGTTCAAATAATTATAACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAA
183 AAT-AAATCTATTTA-CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAA
* * * ** * * * * * *
769953 TCATTGTTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCGAAAT
245 TCGTTATAACCTTT-TGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TAAAA
* * * *
770016 AAAATAACAATAATTTATTAATATTT-ACAAACTTAATCAGTAAG
307 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTGA-AAA--TAAT-AATAAA
* * * * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACT-AT
* ** * * * * * * *
770124 C-ATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTA
64 CTATTTAAAATTGTTAT-GCCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGTTTA
* * * * *
770188 TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAT
128 TT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAA-TTAAT-A-T--GAGATTTAAAAAAT
** * * * ** * *
770253 AAATCTAATTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGT
186 AAATCT-ATTTACAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAATCGT
* * * * * ** * ** *
770318 TATGACATTTT-TTTTATCGT-AAACAATTGTTTTA-TTTGTACAAGCTT-TTTCGGATTAGAAT
249 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT--AAAAAAAAT
* * *
770379 AATACTAATTTAATAATAGTTTAAAAATTAATAAGTAAG
312 AATACTAATTTATTAATA-TTTGAAAA-TAATAA-TAAA
* * * * * * ** * *** * * *
770418 GGATTTAGAAAATAAATTTATTTATTGAATAAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAAAAAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTATT--AAATAACTAT
* * * * * * * * * *** **
770483 CTACTTCAAATCGTTCTCACCTTTT-GTTTAGTTATAAAATAATTGTTTCAATTTGTACAAGTTT
64 CTATTTAAAATTGTTAT-GCCTTTTATTTTA-TCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGTTT
* * * *
770547 ATTCAGAATAAATTAATACTAATATT-TTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGACAGAGATTTACAA
127 ATT-AAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTC---AAATTAAT---A-TGAGATTTA-AA
* * *
770610 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTG-CTATTTGAACAATTGTCTATTTAAA
182 AAATAAATCTATTTA-CAAACAAATTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AA
* * * * * * * ** **
770674 ATTGTTATAACCTTTTGATTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTAATAGAAGCTTAAAT-GGAAA
244 ATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAAAA
* * *
770738 AATAATACTAATTCATTTATATTTTTGAAATTAATAAGTAAGA
309 AATAATACTAATTTA-TTA-ATATTTGAAAATAATAA-TAA-A
* ** * * * ** * *
770781 A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAATTAGTTAAAACAATTATGGCCATTTGAACGATTAC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACTAT
* * * * * * * *
770844 CTCTTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACA-AT-TTTTT-ATCATACAAGCTTA
64 CTATTTAAAATTGTTATG-CCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGTTTA
* * * *
770906 TTGAAATAAAATAATGCTGATTTATTAATATTTCAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAT
128 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA--T-TAA-TATGAGATTTAAAAAATA-
* * * * * * **
770971 ATATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATTAT
187 A-ATCTATTTA-CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-CTTAAATCGT
* * * * * **
771036 TA-AGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAGGTTATTTGATTAAAAAT
249 TATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-AAAAAAAAT
* ** * * *
771099 AATACTAATTTAATAATATTCCAAAA-ATTAACAAG
312 AATACTAATTTATTAATATTTGAAAATAATAATAAA
* * * * * * * ** * *
771134 AGATTTAAAAAATAAATGTGCTT-GTGGAACCAATTCAAATAATTAAAACCATTAGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACCAGTTAAAACAATTATGACTATTA-AATAACTAT
* * * *** * * * * *
771198 CTATTTTAGATCGTTATGAAATTTATTTTAGTCATAAAATATTTGTTTAAT-ATCTTACAAGCTT
64 CTATTTAAAATTGTTATGCCTTTTATTTTA-TCATAAAACATTTGTTT-TTGTTCATACAAGTTT
** * * * * * *
771262 ATTTGGAATAAGATAATCCAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTCGAAAA
127 A-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC---AAATTAATATG----AGATT-TAAAA
* * * *
771326 AAT--A--TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTAT-TGATTTAAAA
183 AATAAATCTATTTAC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ACTT-AAA
* * * * * * **
771386 TTGTTATGACCTTTTGTTTTGACATGAAACATTTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAA
245 TCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAA-AA
* * *
771451 AATAATACTAATTTCTTAATATTTAAAAAATTAATAAGAAAA
309 AATAATACTAATTTATTAATATTT-GAAAA-TAATAA-TAAA
* * * * * * * * * * *
771493 AGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTGT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACTAT
* ** * * * ** * * *
771557 TTATTTAAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTG
64 CTATTTAAAATTGTTAT-GCCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGTTTA
* * * * * *
771622 TTCGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAAT
128 TT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAATTAATATGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * * * *
771687 ATGTTTATTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATTGATAT
190 CTATTTA--CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAATCGTTAT
* * * * * * * *
771751 TACTTTTTG-CTTGATCATATAACAATTATTTTC-TTATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
252 AACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-GTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTA-AAAAAAATA
* * *
771814 ATACTAATTTATTAATCTTTCAACAATTAATAAGTAAG
313 ATACTAATTTATTAATATTTGAA-AA-TAATAA-TAAA
* * * * * * * * *
771852 AGATTTAAAATATAAATCTATTAACCAAACCATTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTGTA
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TT--A-AA---TA
** ** * * * * * *
771917 TACCTTAAATCAATTATTTAAAA--AATAAACCTTTTATTATGTCATAAAATAGTTATTTATGTT
59 -A-C-T--ATC---TATTTAAAATTGTTATGCCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTT
* * *
771980 CATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGA
116 CATACAAGTTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAATTAAT-A-T--GA
* * * ** * * ** * *
772045 GATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTTGAATC-AGTTCAAATAGTTAAAACTGTATGAACAATTATC
174 GATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * *** * * *
772109 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCAT-AAATTTTTTTTTCAATTCATACTAGCTTAT
237 TACTT-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT
** * * * * *
772173 TCGGAATAAAATAA-AATGAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
301 T-TAAAAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-GAAAA-TAATAA-TAAA
* ** * * ** * *
772224 AGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCT-AACCAGTTCTAATAATTGTGACTATTTGCACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACTAT
* ** * * * * * * *
772288 CTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTTTTGTTTATATAAGTTTG
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* * **
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128 TT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAATTAATATGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * *
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192 ATTTA-CAAA-CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAATCGTTATAA
* * * * * * * **
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254 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTT-CATACAAGCTTATTTA-AAAAAAATAATA
* *
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316 CTAATTTATTAATA-TTT-GAAAATAATAA-TAAA
* * * * * * * * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACTATC
* * * * * * * * * *
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65 TATTTAAAATTGTTATGCCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATT
* * * *
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130 -AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAATTAAT-A-T--GAGA-TTTAAAAAATA
* * * * * * * * **
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* *
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** * *
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* * * * * * *
772930 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAGCAAGTTCAAATC-GTTATGAGTATT---TGAAC-A-
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTT-AAAACAATTATGACTATTAAAT-AACTAT
* * * * * * * * * * *
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64 CTATTTAAAATTGTTATGCCTTTTA-TTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGTTTA
** * * * *
773049 TTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
128 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCA-AATTAAT-A-T--GAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
773114 AATAC-ATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTCATGAATATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
187 AAT-CTATTTA-CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAATCGT
* * * * * * * * * *
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249 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTTAAAAAAAATA
* * *
773241 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATAGAATAAG
313 ATACTAATTTATTAATATT-TGAAAA-TA-ATAATAAA
* * * * ** * * * * *
773279 AGAATTAAAAAAATGAATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATCTGAACAATTAT
1 AG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTAT-TAAATAACTAT
* ** * * * * * *
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** * * * * *
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126 TA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC--AAA-TTAATATG---AGATTTAAAA
* * ** * * * * *
773471 AATAAATTTATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTGATAACTATTTGAACAAATATCTATTTCGAAT
183 AATAAATCTATTTAC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAAT
* * * * * * *
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246 CGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAAAAAA
*
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* * * * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGA--CTATTAAATAACTA
* * ** * * * * * * * * * *
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* *
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127 ATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAATTAAT---AT-GAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
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* * * ** **
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* *
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* * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TT-AAATAACTA
* * ** * * * * *
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* * * * * * * *
774123 TATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAA
126 TA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAATTAAT----ATGAGATTTAAAAA
* * ** * * * *
774188 ATAAAT-GAGTTTGCTAAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT
184 ATAAATCTA-TTTAC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTT-AAAT
* * * * * * * *
774252 CGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-T-TTTCAATTCATGCATGCTTATTCAAAATAAA
246 CGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAA-AAA
* * *
774315 ATAATCCTAATTTATTAACATTCAT-AAAATTAACAA-ACAA
310 ATAATACTAATTTATTAATATT--TGAAAA-TAATAATA-AA
* * * * *** * * * * * * *
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1 -AGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTAAAACAATTATGACTA-TTAAATAACTA
* *** * * **** * *
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63 TCTATTTAAAATTGTTATG-CCTTTTATTTTATCATAAAACATTTGTTTTTGTTCAT-ACAAGTT
* * *
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AATATTTGAAAATAATAATAAA
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* *
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* * *
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64 ATACTAATTTATTAATATTGCCAAAAA-TAAT-AAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATATTTAC
* *
767726 TGAACATGTTCAAAT
127 TAAACAAGTTCAAAT
767741 AGTTATAACT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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146 102 0.88
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Consensus pattern (146 bp):
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* * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATT
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1 TTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATT
* * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * * **
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* * * *
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** * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
* *
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* * * **
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131 C-ATTT-TCGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *** *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
* * *** * *
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772585 T-ATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATGTAT
130 TCAT-TTT-CGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * *
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* * * * *
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* *
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** * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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65 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAA
* * *
774013 -TCTGTTTATC-AAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTAT
129 TTC-ATTT-TCGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
774065 CTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
* * * * * *
774129 GAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAA-
66 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
774193 TGAGTTTGCTAAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT
130 TCA-TTTTCGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
774245 TTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-T-TTTCAATTCATGCATGCTTATTCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
* * * * ** *
774308 AAATAAAATAATCCTAATTTATTAACATTC-ATAAAATTAACAAACAACAAATTTTAAAAAATAA
66 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAA-AGA-TTTAAAAAATAA
** * * * *
774372 ATTTGTTTATTGATTA-AGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTAT
128 ATTCATTT-TCGA-AACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
774425 TT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAACTCATAAAAAGCTTATT
1 TTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACAAGCTTATT
* * *
774489 T-GAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGATAAGGTAAAGATTTAAAAAAT
64 TAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA-GTAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * * *
774552 AAA-ACAGTTTATCGAATC-GATTTAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATC--T
126 AAATTCA-TTT-TCGAAACAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * ** *
774605 GTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCTTAAAATAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCGATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* * *
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65 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
774695 CAGTCATAAT
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATT
CATTTTCGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:768115 original size:686 final size:682
Alignment explanation
Indices: 766969--768278 Score: 1482
Period size: 686 Copynumber: 1.9 Consensus size: 682
766959 AAGTTTATTA
** * * * *
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1 GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATGCCAAAAATTAATATGAGAATTAAAAAATAAATATA
* * * * *
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66 TTTACAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATCTGAACAATTATCTACTTCAAAATATTATAACCT
*
767099 TTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAAAAAAATAATAATAAT
131 TTTATTCTATCATAAAACAATTGGTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAAAAAAATAATAATAAT
* * *
767164 TTAGTAAAATTATGAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAACCAATT
196 TTAGTAAAATTATAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAAACTGTTTGCGAAACCAATT
* * * * *
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261 CAAACAATTATGACTATTACAATAATTATCTATCTCAAATTACTATAGCCTTTTGTTTTATCATA
** * * * * * * * **
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326 AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTGATTCAAATAAAATAATACGAATTTATTAAAATTACA
* * * ** ***
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* * **
767424 ATTTGAATAATTATTTATTGTGAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
456 ATTTGAACAATTATTTATTGTAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
767488 ATTCAAACAAGTTTATTCT-AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAG
520 ATTCAAACAAGTTTATT-TGAA-AAAAAAAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAC
* *
767551 TAAAAGATTTAATAAATAAATATGTTTA-CTAAATAAGTTCAAATCATTGTGACATTTTGTTTTG
582 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCT-AACAAGTTCAAATCATTGTGACATTTTGTTTTG
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646 TAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACGAGCTTAATT
* *
767652 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGCCAAAAATTAATGAATAAGAGAATTAAAAAATGAA
1 GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATGCCAAAAATTAAT--AT--GAGAATTAAAAAATAAA
** * *
767717 TATATTTATTGAAC-ATGTTCAAATAGTTATAACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAATATTA
62 TATATTTA-CAAACTA-GTTCAAATAGTTATAACTATCTGAACAATTATCTACTTCAAAATATTA
* * * * * * *
767781 TGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAA
125 TAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGGTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAAAAAAATAA
* * * *
767844 T-ATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAAAACAT-TTT-C
189 TAAT-AATTTAGTAAAATTATAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAAT-AAAAC-TGTTTGC
* ** * * ** * *
767905 GAAA-CACGTTCGGATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTATTAT-GACTTTT
251 GAAACCA-ATTCAAACAATTATGACTATTACAATAATTATCTATCTCAAATTACTATAG-CCTTT
* * * *
767968 TGTTTTGTCCTAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTCAGAATAAAATAATACTAATT
314 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTGATTCA-AATAAAATAATACGAATT
* * * * *
768032 TATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGCAAAATATTTAAAAA-TAAATCTAATTA-CTAAGCGAGTT
378 TATTAAAATTACAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAACTAAATCTAATTATC-AAACAAATT
* *
768095 CAAATAAGTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTTTCATA
442 CAAATAAGTATGA-TATTTGAACAATTATTTATTGTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATA
* *
768160 AAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGAAAAAAAAAATACTAATTTATTAATATTCTAA
506 AAACAATTGTTTCTATTCAAACAAGTTTATTTGAAAAAAAAAATACTAATTTATTAATATTCTAA
*** *
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571 AAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCTAACAAGTTCAAA
768279 ACTAAATCTA
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Consensus pattern (682 bp):
GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATGCCAAAAATTAATATGAGAATTAAAAAATAAATATA
TTTACAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATCTGAACAATTATCTACTTCAAAATATTATAACCT
TTTATTCTATCATAAAACAATTGGTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAAAAAAATAATAATAAT
TTAGTAAAATTATAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAAACTGTTTGCGAAACCAATT
CAAACAATTATGACTATTACAATAATTATCTATCTCAAATTACTATAGCCTTTTGTTTTATCATA
AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTGATTCAAATAAAATAATACGAATTTATTAAAATTACA
AAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAACTAAATCTAATTATCAAACAAATTCAAATAAGTATGAT
ATTTGAACAATTATTTATTGTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
TTCAAACAAGTTTATTTGAAAAAAAAAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAA
AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCTAACAAGTTCAAATCATTGTGACATTTTGTTTTGTAATA
AAACAATTGTTTTAGTTCATACGAGCTTAATT
Found at i:774940 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 774699--775155 Score: 480
Period size: 181 Copynumber: 2.5 Consensus size: 182
774689 TATTAACAGT
* * *
774699 CATAATTATTTGAACTAGTTTGACAAATAGAA-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
1 CATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACA-AATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * *
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65 TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTACGAATAAACTTGAGTAAAAA-GAAAAAATTAT-
* *
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* * **
774879 CTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTCA
1 CATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
774944 G-AATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAACTTGGGTGAATAGAAATAATTATTTT
66 GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTACGAATAAACTTGAGTAAAAAGAAAAAATTATTTT
* * * * * ** * *
775008 ATGACATAACAAAAGGTTATAATAATTTGATATGTATAATTGTTCAAATAGT
131 ACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGC
* ** * *
775060 CATAACTATTTGAACT-GATTTGGTAAACGGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTT
1 CATAACTATTTGAACTAG-TTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
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65 TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTA
775156 ACAAAAGGTA
Statistics
Matches: 226, Mismatches: 43, Indels: 14
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
179 2 0.01
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (182 bp):
CATAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTACGAATAAACTTGAGTAAAAAGAAAAAATTATTTT
ACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGC
Found at i:775480 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 775155--777777 Score: 1683
Period size: 181 Copynumber: 14.8 Consensus size: 181
775145 TTATTTTATT
* * * * * * *
775155 AACAAAAGGTAATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCCTAAGTATTTGAAAT-GA
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAG-
* * *
775218 TTCGGTAAGCAA-ATTCACTTTTT-AA-ATC--ACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTT
65 TTCGGTAA--AAGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA
*** * * *
775277 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACGATTGTTTTATGATAC
127 GTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
** * * * *
775332 AACAAATA-GTCA-AACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCGTATAGCCTTAAATGTTTGAACTAC
1 AACAAA-AGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAG
* * * * **
775395 TTTGGCAAAAGGATTTATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTTAAATATTTTTAAATTAGT
65 TTCGGTAAAA-GATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * *
775460 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTGTGAATTGAAACAATTATTTTAT-AGTAG
129 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-TAA
* * * *
775513 AACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGGTAA---TT---AT--TC--AAATA--GGAACTGGT
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGT
* * * *
775565 TCGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
66 TCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * *
775630 TTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG-A-TGAAAAACAACTGTTTTATAACAA
130 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGATAA
* * * * * *
775682 AACAAAAGTTCATAAC-GATTTGAAATAGCTAATTGTTAAAATGGCCATAATTATTTGAACT-GA
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAG-
* * * *
775745 TTCGATAAACAGATTCACTTTTTAAATCA-CTTACTTATTAATTTTACG-AATATTAATAAATTA
65 TTCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAAT-ATCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAAT-AA--A
* * * *
775808 TTATTATTATCATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGCACTGAAACAATTGTTTTATGACAA
124 TTAGTA-T-T-ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
* * * * * * *
775869 AAGAAAAGGTCATAAC-GATTTGATATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT-GA
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAG-
* *
775932 TTCAGTCAACAA-ATTTA-TTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAG
65 TTCGGT-AA-AAGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* ** ** * * *
775992 TA-TATTTTATTTCTTATAAGCTTGTATTTACTGAAGCAGTTGTTTTACGATAA
128 TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
* *
776045 AACAAAAGGTCATAA-TGATTTTAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTT
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAA-C-T
* * * * * * *
776107 A-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAAATTTTTG-AATGTTATTATAT
63 AGTTCGGTAAA-AGATTTATTTTTT-AAATATCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * *
776170 TAGGATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAA
125 TAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGA-TAA
* *
776228 AAC--AAGGTCA-AAC-GATTTGAAATAGATAATTATTC---TA---AT-AGT-TTT-AACTA-T
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGT
* * *
776279 T-TGAAAACACATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
66 TCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
*** * * ** * *
776339 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTCTGATCAAAAACAATTGTTTTATAATGA
130 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
* * * * * * *
776391 AATAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAAT
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGT
* * *
776455 TCAGTAAAAAAATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTA
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* ** * *
776516 TTATTTTATTTCGTATAAGATTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
130 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
* * * ***
776568 AAGAAAAGGTCATAACT-ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATGGCTATTTGAACATA-
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAAC-TAG
* * * * *
776631 TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTACTAATTTTTCAAATTTTAATAAA-T--
65 TTCGGTAAA-AGATTTA-TTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* ** * * *
776693 T-TTAATTTATTCTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACT-A
128 TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-TAA
* * * * * * * * *
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1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-ATATTTGAACTAG
* * * *
776808 TTCGGTAAATAAATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTGATTTTTGAAATATTATTAAATTTGT
65 TTCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
** ** *
776869 ATTATTTTAAACCAAATAAGCTTGTACAAAC--AAAAAATTTGTTTTATGATAA
129 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAA-TTGTTTTATGATAA
* * * * * * * *
776921 AACAAAGGGTCATAA-AGATTTGAAATTGATAATTGTTTATATAGTCATAACTATTTGAATTGGT
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGT
* * * * * ** * * *
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66 TCGGTAA--AAGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* ** ** ** * * *
777049 ATTATTTCATTCTGAATAAAATAATGTGAA-T-AGAACATATTGTTTGATGACAA
129 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGA-AACA-ATTGTTTTATGATAA
* * * * * * * *
777102 AACAAAAGGTTATAA-TGATTTAAAAAAGATAATTATTACAAATAGTTA-AAATTACTTGAAATT
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGTCATAAA-TATTTGAACTA
* * * *
777165 GTT-TGTAAACAGATTTACTTTTTAAGTCTCTTA-TTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATT
64 GTTCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATT
* * * * ** *
777227 AGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATG-ACAAAAACAATTGTTTTATGAAAA
126 AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
* * * * * * * * * *
777282 AACAAAAAGTAATAAC-AATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTTACAATTATTTGAATTGGT
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGT
* * * * * * * *
777346 TTGGTAAATTGAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGT-
66 TCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * * * *
777410 TTGATTTTATTCTAAGTAAACTTATATGAGCTGAAATAAATGTCTTAAGATAA
130 TT-ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
* * * * * *
777463 AACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTGAACTGGT
1 AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGT
* * * * * * ** * * *
777527 TTGGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTCAAAATATTATTATATTAGAA
66 TCGGTAAA-AGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * ** * *
777592 TTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG-CAA
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* * * * * *
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* * * *
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*
777767 ACTATTTTATT
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777778 TTAAATAAAT
Statistics
Matches: 1952, Mismatches: 367, Indels: 255
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
163 12 0.01
164 57 0.03
165 10 0.01
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167 4 0.00
168 1 0.00
169 145 0.07
170 6 0.00
171 5 0.00
172 31 0.02
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185 1 0.00
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189 3 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
AACAAAAGGTCATAACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGT
TCGGTAAAAGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAA
Found at i:775741 original size:350 final size:343
Alignment explanation
Indices: 775215--777686 Score: 1314
Period size: 361 Copynumber: 7.0 Consensus size: 343
775205 GTATTTGAAA
* * * * * *
775215 TGATTCGGTAAGCAAATTCACTTTTTAAA-TCACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTGT
1 TGATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
775279 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACGATTGTTTTATGATACAACAAATA-GTC
65 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ACTGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAA-AGGTC
** * * * * *
775343 A-AACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCGTATAGCCTTAAATGTTTGAACTACTTTGGCAAA-AG
128 ATAAC-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTA-TTCGGTAAACA-
* * * *
775406 GATTTATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTTAAATATTTTTAAATTAGTATTATTTTATT
190 AATTTATTTTTTAAATATCTT-CTTATTAATTTTATAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
775471 CCAAATAAGCTTGTGTGAATTGAAACAATTATTTTAT-AGTAGAACAAAAGGTTATAATGATTTG
254 CCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGA-TAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTG
*
775535 AAATAGGTAATTATTCAAATAGGAAC
318 AAATAGATAATTATTCAAATAGGAAC
* * * *
775561 TGGTTCGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
1 TGATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAAT-T-CT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
* * * * *
775626 AGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-TGAAAAACAACTGTTTTATAACAAAACAAAAG
62 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGACTG--AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAG
* * * * *
775690 TTCATAACGATTTGAAATAGCTAATTGTTAAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAAC
125 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-ATTCGGTAAAC
* * * ** * *
775755 AGATTCACTTTTTAAATCA-CTTACTTATTAATTTTACGAATATTAATAAATTATTATTATTATC
189 AAATTTATTTTTTAAAT-ATCTT-CTTATTAATTTTATAAATATT-ATTAA--ATTAGTA-T-T-
* * * *
775819 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGCACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAA
246 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAA
*
775884 CGATTTGATATAGATAATTATTCAAAT-GGCCATAATTATTTTAAC
311 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGG-------------AAC
*
775929 TGATTCAGTCAACAAATTTATTTTTAAAATT-TCTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAG
1 TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTT-AAATTCTCTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAG
** * * * **
775992 TA-TATTTTATTTCTTATAAGCTTGTATTTACTGAAGCAGTTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTC
64 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-TGACTGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTC
* * * * *
776056 ATAATGATTTTAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTATTTGGTAAACA
128 ATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAA-C-TATTCGGTAAACA
* * * * * *
776119 AATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAAATTTT-TGAATGTTATTATATTAGGATTACTTTA
190 AATTTATTTTTT-AAATATCTT-CTTATT-AATTTTATAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
* *
776183 TTCCAAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATATTTTATGACT-AAA-ACAAGGTCA-AACGAT
252 TTCCAAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTATTTTATGA-TAAAAGAAAAGGTCATAACGAT
* *
776244 TTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAAC
315 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAG---GAAC
* * * *
776276 T-ATT-TGAAAACACATTTATTTTTTAAA-TCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
1 TGATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * ** * *
776338 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTCTGATCAAAAACAATTGTTTTATAATGAAATAAAAGGTCA
65 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-CTGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
776403 AAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTCAGTAAAAAAAT
129 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-ATTCGGTAAACAAAT
* * * **
776468 TTATTTTTT-AA-ATC-TCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGT
193 TTATTTTTTAAATATCTTCTTATTAATTTTATAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * *
776530 ATAAGATTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACTATTTTAAATA
258 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* *
776595 GATAATTGTTCAAATAGTAATGGC
323 GATAATTATTCAAATAGGAA---C
* * * * * *
776619 TATTTGAACATATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTACTAATTTTTCAAATT
1 ----TG-----ATTCAGTAAACAAATTTA--TTTTTAAAT-TC--TCTTATTAATTTTTAAAATA
* * * * *
776684 TTAATAAA-T--T-TTAATTTA-TTCTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAC
52 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-ACTGAAACAATTGTTTTAT-AA
* * * * * * * * * *
776744 T-AAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCTA--TGGATT
114 TAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA-TTATTTGAACT
* * * *
776806 GGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTT-AA-ATC-TCTTATTGATTTT-TGAAATATTATTAAATTT
178 -ATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTCTTATTAATTTTAT-AAATATTATTAAATTA
** ** * * * *
776867 GTATTATTTTAAACCAAATAAGCTTGTACAAAC--AAAAAATTTGTTTTATGATAAAACAAAGGG
241 GTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAA-TTATTTTATGATAAAAGAAAAGG
* * * *
776930 TCATAAAGATTTGAAATTGATAATTGTTTATATAGTCATAACTATTTGAAT
305 TCATAACGATTTGAAATAGATAA-----T-TAT--TCA-AA-TA--GGAAC
* * ** * * * * ** *
776981 TGGTTCAGCAATTAAATTTTTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCGAAATATTATTAAATT
1 TGATTCAGTAAACAAA-TTTATTTTTAA-ATTC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
* ** ** * * * * *
777046 AGTATTATTTCA-TTCTGAATAAAATAATGTGAAT-AGAACATATTGTTTGATGACAAAACAAAA
62 AGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGACTGA-AACA-ATTGTTTTATAATAAAACAAAA
* * * * * ** * * * **
777109 GGTTATAATGATTTAAAAAAGATAATTATTACAAATAGTTAAAATTACTTGAAAT-TGTTTGTAA
124 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGCCATAATTATTTGAACTAT-TCGGTAA
* * * * * * *
777173 ACAGATTTACTTTTTAAGTCTCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
187 ACAAATTTATTTTTTAAATATCTTCTT-ATTAATTTTATAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT
* * * * ** * * * * * *
777238 ATTTCAAACAAACTTATATG-ACAAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAAGTAATAACAATT
251 ATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACGATT
* *
777302 TGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTTACAATTATTTGAAT
316 TGAAATAGATAATTATTCAAATAG------------GAAC
* ** ** * * * * *
777342 TGGTTTGGTAAATTGAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAAT
1 TGATTCAGTAAA-CAAATTTA-TTTTTAAA--TTCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
* * * * * *
777406 TAGT-TTGATTTTA-TTCTAAGTAAACTTATATGAGCTGAAATAAATGTCTTA-AGATAAAACAA
61 TAGTATT-ATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATGA-CTGAAACAATTGTTTTATA-ATAAAACAA
* * * * * * * * *
777468 AAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTGAACTGGTTTGGCA
122 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-ATTCGGTA
*** * * * * *
777533 AATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTCA-AAATATTATTATATTAGAATTATT
186 AACAAATTTATTTTTTAAATATCTT-CTTATTAATTTT-ATAAATATTATTAAATTAGTATTATT
* * * ** * * * * * * *
777597 TTATTTCGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG-CAAAACAAAAAGTTATAACAA
249 TTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACGA
*
777661 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
314 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
777687 TCATAATTAT
Statistics
Matches: 1663, Mismatches: 319, Indels: 273
0.74 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
340 11 0.01
341 62 0.04
342 9 0.01
343 30 0.02
344 3 0.00
345 44 0.03
346 142 0.09
347 8 0.00
348 3 0.00
349 3 0.00
350 156 0.09
351 13 0.01
352 36 0.02
353 63 0.04
354 97 0.06
355 100 0.06
356 183 0.11
357 38 0.02
358 52 0.03
359 31 0.02
360 28 0.02
361 310 0.19
362 41 0.02
363 112 0.07
364 49 0.03
365 11 0.01
367 6 0.00
368 22 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (343 bp):
TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATTCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGACTGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATA
ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTATTCGGTAAACAAATTTA
TTTTTTAAATATCTTCTTATTAATTTTATAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
AGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
AATTATTCAAATAGGAAC
Found at i:776421 original size:522 final size:518
Alignment explanation
Indices: 775227--777327 Score: 1592
Period size: 522 Copynumber: 4.0 Consensus size: 518
775217 ATTCGGTAAG
* * * *
775227 CAAATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT
1 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* *
775291 TGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACGATTGTTTTATGATACAACAAATA-GTCAAACTGATTTG
65 TGAATAAGCTTGTATGAATCTGAAACAATTGTTTTATGATA-AACAAA-AGGTCAAAATGATTTG
** * * * * * * *
775354 AAATAGATAATTGTTCGTATAGCCTTAAATGTTTGAACTACTT-TGGCAAAAGGATTTATTTTTT
128 AAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTA-TTCAGTCAAAA--ATTTA-TTTTT
* ** ** * *
775418 AAATATCTTAGTTATTAATTTTTTAAATATTTTTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
189 AAA-AT-TT-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTT
* * * * * * * * * *
775483 GTGTGAATTGAAACAATTATTTTATAGTAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTA
251 GTATTAACTGAAACAATTGTTTTAGA-TAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAGTAATTG
* * * *
775548 TTCAAATAG--GAAC----T--G--GTTCGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATT
315 TTCAAATAGTATAACTATTTAAGCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
775603 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATGA-AAAACA
380 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-ATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAT-ATAAAACA
* * * * *
775667 ACTGTTTTATAAC-AAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGCTAATTGTTAAAATGGCCATA
443 AATGTTTTATGACTAAAAC--AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA---TT---AT--TC-TA
* *
775731 ATTA-TTTGAACTGATTCGATAAA
497 A-TAGTTTTAACTGATTTGA-AAA
* * * * *
775754 CAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTACG-AATATTAATAAATTATTATTATTAT
1 CAAATTTATTTTTTAAAT--C-T-CTTATTAATTTT-TGAAATATTAAT-AA--ATTAGTA-T-T
** * * * *
775818 CATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGCA-CTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAT
56 -ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATCTGAAACAATTGTTTTATGA-TAAACAAAAGGTCAA
* * *
775882 AACGATTTGATATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTCAGTCAACAAATT
119 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT-ATTCAGTCAA-AAATT
*
775947 TATTTTTAAAATTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTTCTTATAA
182 TATTTTTAAAATTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCATATAA
* * *
776011 GCTTGTATTTACTGAAGCAGTTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAGTA
247 GCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAGTA
* * *
776076 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAGCTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTT
311 ATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTAAGC-TATTCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
* * * * *
776141 GCTTATTAAATTTTT-GAATGTTATTATATTAGGATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATA
373 ACTTATT-AATTTTTAAAATATTAATAAATTA-GATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATA
* *
776205 TGAAACAAATATTTTATGACTAAAACAAGGTCA-AACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
436 TAAAACAAATGTTTTATGACTAAAACAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
776269 TTTTAACT-ATTTGAAAA
501 TTTTAACTGATTTGAAAA
*
776286 CACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
1 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* ** * *
776351 GAATAAGCTTGTCTG-ATCAAAAACAATTGTTTTATAATGAAATAAAAGGTCAAAATGATTTGAA
66 GAATAAGCTTGTATGAATCTGAAACAATTGTTTTATGAT-AAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAA
* *
776415 ATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTCAGTAAAAAAATTTATTTTTTAAA
130 ATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT-ATTCAGT-CAAAAATTTATTTTTAAAA
* * *
776480 TCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTATAAGATTGTATTAA
193 TTTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTTGTATTAA
*
776545 CTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACT-ATTTTAAAT-AGATAATTGTTCAA
258 CTGAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTTAAATAAG-TAATTGTTCAA
** * *
776608 ATAGTAATGGCTATTTGAA-CATATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTACTA
320 ATAGT-ATAACTATTT-AAGC-TATTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * ** * * *
776672 ATTTTTCAAATTTTAATAAATT---TTAATTTATTCTGAATAAACTTATATGA-ACTAAAACAAT
381 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATA-TAAAACAAA
* * * * *
776733 TGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACC
445 TGTTTTATGACTAAA-ACAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAA-C
*
776798 TATGGATTGGTTCGGTAAA
508 --T-GA-T--TT--GAAAA
* * * * ****
776817 TAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTGATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAACC
1 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * *
776882 AAATAAGCTTGTA-CAAAC--AAAAAATTTGTTTTATGATAAAACAAAGGGTCATAAA-GATTTG
66 GAATAAGCTTGTATGAATCTGAAACAA-TTGTTTTATGAT-AAACAAAAGGTCA-AAATGATTTG
* * * * * * * * * * *
776943 AAATTGATAATTGTTTATATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCAG-CAATTAAATTTTTTTTTT
128 AAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT-ATTCAGTCAA--AAATTTATTTTTA
* * * * * * **
777007 AATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTCATTCTGA-ATAAAAT
190 AAATTTC----TTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCATATAAGCT
** * * * * * *
777071 AATGTGAA-T-AGAACATATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTAAAAAAGATA
250 TGTATTAACTGA-AACA-ATTGTTTTA-GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAG-TA
* * * * ** * * * * *
777133 ATTATTACAAATAGTTAAAATTACTTGAAATTGTT-TGTAAACAGATTTACTTTTTAAGTCTCTT
311 ATTGTT-CAAATAG-TATAACTA-TTTAAGCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
777197 A-TTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAC
373 ACTT-ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAG-ATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAT
* * * * * * *
777260 A-AAAACAATTGTTTTATGA-AAAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAA
435 ATAAAACAAATGTTTTATGACTAAAAC--AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAA
777323 TAGTT
498 TAGTT
777328 ACAATTATTT
Statistics
Matches: 1287, Mismatches: 200, Indels: 165
0.78 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
518 1 0.00
519 44 0.03
520 7 0.01
521 35 0.03
522 163 0.13
523 137 0.11
524 11 0.01
525 6 0.00
526 1 0.00
527 21 0.02
528 23 0.02
529 9 0.01
530 82 0.06
531 97 0.08
532 100 0.08
533 83 0.06
534 116 0.09
535 26 0.02
536 64 0.05
537 120 0.09
538 7 0.01
539 3 0.00
540 2 0.00
541 1 0.00
543 18 0.01
544 26 0.02
545 71 0.06
546 13 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (518 bp):
CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
GAATAAGCTTGTATGAATCTGAAACAATTGTTTTATGATAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAA
TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTATTCAGTCAAAAATTTATTTTTAAAATTT
CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTTGTATTAACTG
AAACAATTGTTTTAGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAGTAATTGTTCAAATAGTA
TAACTATTTAAGCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAA
TATTAATAAATTAGATTACTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATATAAAACAAATGTTTTATGAC
TAAAACAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTGATTTGAAAA
Found at i:777055 original size:180 final size:175
Alignment explanation
Indices: 776289--777055 Score: 443
Period size: 177 Copynumber: 4.3 Consensus size: 175
776279 TTGAAAACAC
* * *****
776289 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTGATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAACCAAA
* * * * * *
776354 TAAGCTTGT-CTGATCAAAAACAATTGTTTTAT-AATGAAATAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAA
66 TAAGCTTGTAC-AAACAAAAA-ATTTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCATAAA-GATTTAAAA
* * * * * * * ** * *
776416 TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAA-TTATTTTAACTAATTCAGTAAAAAA
127 TAGATAATTATTCTAATAGTCATAACCTA--TGAATTGGTTCAGCAAATAA
* * * *** **
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTGATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAACCAAA
* ** * * ** *
776531 TAAGATTGTATTAACTGAAACAA-TTGTTTTATGA-TAAAAGAAAAGGTCATAACTATTTTAAAT
66 TAAGCTTGTACAAAC--AAAAAATTTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCATAAAGATTTAAAAT
* * * ** * * * * *
776594 AGATAATTGTTCAAATAGTAAT-GGCTATTTGAACAT-ATTCGGTAAATAG
128 AGATAATTATTCTAATAGTCATAACCTA--TGAA-TTGGTTCAGCAAATAA
* * * * * * **
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1 ATTTA-TTTTTTAAA--TC--TCTTATTGATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAA
** * * ** * *
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* * * *
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*
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* * *
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* *
776949 ATAATTGTT-TATATAGTCATAA-CTATTTGAATTGGTTCAGCAATTAA
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* * * *
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TAAGCTTGTACAAACAAAAAATTTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAAAGATTTAAAATAGA
TAATTATTCTAATAGTCATAACCTATGAATTGGTTCAGCAAATAA
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* * *
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* * * * *
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**
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*
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * * * **
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* * * * * *
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* *
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* *
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* * **
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TAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAA
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * **
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* * ** *
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* * *
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* * *
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TATTAACAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
CAAAACAAAATATCAGAACTATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAGCTT
GTTCAGTAAGCATATATGAATTGATA
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* * * * * * * * * * * *
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** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ***
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1 TATGAATAGAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
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* * * * *
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* * * * *** * * * *
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1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
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65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CTTTACTT
* * * *
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* * * * * *
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1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *** * * * * *
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66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATT
* * * * * * * *
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* ** * * * ** *
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1 TATGAATAGA-AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
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64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTAC--
* * *
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* * * * *
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1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
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66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTA
* *
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* * * * **
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* * * * * * * ** **
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64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACT
** * * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * ** * * **
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127 TATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG
* * * * * * *
780855 TATGAACT-GAAACAATTATTTAATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGAGAATTA
1 TATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
** * ** * * *
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* ** * * *
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* ** *
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* * * * ** *
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* **
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* * * ** * *
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1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * ** ** *
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66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTAT
* * *
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* * ** ** *
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* * * * * *
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65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTTTACTTA
* * * * * *
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* ***
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* * * * * * * *
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** * *
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131 AA-TTTTTAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG
* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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** *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
782232 TAGATAAT-TGTTCAAACAGTCA-CAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAA-CAG-ATTCATTTTTT
114 T-TA-AATCT-TT---AC--TTATTAATT-TTTAAA--TATT-AATAAATTAGTATT-A--TTTT
* * **
782293 AAATCTCTTTATTATTAATTTTTG
164 -AA----TTGA--AATAA-GCTTG
* ** ** * ** * ** ***
782317 AATTATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTCTTTT
1 ---TATGAATAGAA--ACAATTATTTTA-TGACAA-AA-CA-A-AAGGTC-ATAATGATT-TGAA
** ** * * *
782381 AT-GATAA---AACAAA-AGGTCATAAAAGATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAATCATGAT
54 ATAGATAATTGTTCAAATA-GTCAT-AACTATTTGAACT---T-ATTCAGT-AAACAA--AT--T
* * * * * *
782440 TATTTGATCT-AGT-TTGGTAAACATATTTA-TTTTAAA-A--AA-AATTTACTTATTAATTGTT
108 TATTT--TTTAAATCTT--T--ACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTA-GTATT-ATT-TT
*
782498 GAAATAT-TAATAA-CTTAG
164 --AAT-TGAAATAAGCTT-G
* * * ** * * * * * * * *
782516 CATTATTTTAATCTAGATAAGCTTGTATG--AATA-GAAA---CA-ATTGGTTT-ATAACA-A-A
1 TATGAATAGAAAC-A-ATTA--TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAGATA
* * * * * * *** * *
782571 A-----CAAA-ATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
61 ATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAAT--T--T-ATTTTTTAAA-
* * * * * * * * * *
782630 TAGTTTGA-TAAATAGATTTTTTTTAAATCTCTTATTAATATTTGAAATATTAATAGATT-AGTA
119 T-CTTT-ACTTATTA-A---TTTTTAAA--TATTAATAA-ATTAGTATTATT-TTA-ATTGA-AA
* *
782693 TTA-CTTT
172 TAAGCTTG
* ** * ** ** * * **** *
782700 TTTTTAT-CAAAC--TTA---TATGAACAAAAACATTTATTTTATGAT-AAAACAAATGGTCATA
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATG-AC-AAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAG--ATA
* * * * *** **
782758 A-TGATTTAAAATAG--ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTCAGACTGGTTAGGTAAATAGA
61 ATTG--TTCAAATAGTCATAACTATT----T-G--A-ACTTATTC--A---G-TAAACAAAT-TT
** ** * * * ** *
782820 ATTATTTTTTAAATCT-CTTATCTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTCCTTTTATTTT-ATT
109 ATT-TTTTAAATCTTTACTTAT-TAAT----TTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
* *
782883 CCAAATAAGCTAG
168 -GAAATAAGCTTG
* * * * *
782896 TATAAATTCA-AAAAAACATATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
1 TATGAA-T-AGAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * ** * * *
782960 TGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAAC-TAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAG
63 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTAC
* * * * *
783024 TTATTAATTTTTTAATATTATTAGATTATTATTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTA
126 TTATTAATTTTTAAATATTAATA-A--ATTAGTATTATTTTAAT-TGAAATAAGCTTG
* * * * *** * *** ** *
783081 TATGAATAAAAATAATTGTTTTATGATAGCGCAAAAGGTTATAATGATTTGTTGTTTACAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
** * * * *
783146 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACATAT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTAT
* *
783211 TAATTTTTGAAAGA-T--T-AATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTG
130 TAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTG
* * * * * * * *
783258 AATG-TTCA-AATACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTCAAATAGTTAATT
1 TATGAAT-AGAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
*** * * * * * *
783321 GTTGGCATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTTAGTAAACAAATTCACTTTTTAAATC---ACTT
64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTT
* * *
783382 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTATTTTATTTTG-AATAAGTTTG
128 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTA----A--TTGAAATAAGCTTG
** ** *
783441 TATGAACT-GAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
1 TATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * ** * *
783505 TTCATATAGTCTTAACTATTTCAAC-TACTTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTT
** * * * *
783569 ATTAATTATTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTG
128 ATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
* * * * * * *
783622 TATG-ATGGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGTTCGTAA-GATTTGAAATTGATAATTG
1 TATGAATAG-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * * * *
783685 TTCAAATGGCCAAAATTATTTGAAC-CAGTT-TGATAAACTAACTTACTTTTTAAATCTCTAACT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACT
* * * * * * * *
783748 TATCAATTTTCTAAATATTAATAAAGTAATGTTATTTTATTTCAGATAAGCTTT
127 TATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
* * * * * * *
783802 TATGAACT-GAATCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATAG
1 TATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* ** * * * * * * **
783866 TTCAAACAACCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTGTTGTTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCT-TTACTT
* * * * * * *
783931 ATTAATTTTTTAATTGTTAATAAATTAGTCTGATTTTATTTCG-AATAAGCATA
128 ATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG
* * * *
783984 TATGAACT-GAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
784048 TT-TAATAGTCTTAATTATTTGAACTAATTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTA
* * * * * ** *
784112 TTAATTTTTAGAATACT-ATCAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGTTTG
129 TTAATTTTTA-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
* * * * * * * * * *
784164 CACGAATATAAACAATTGTTTTATGACAATAC-AAAGATTATAACGATTT-AAGATAGATGATTA
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTG
* ** * * * * *
784227 TTCAAATAATCATAACTATTACAA-TTGGTTCAATAAACAGATTTAGTCTTTAAATC--T-CTTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTA
* * **
784288 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTG-AATAATTTTG
129 TTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTG
* * * * * * * *
784340 TATGAATAGAAACAATTATTTTA-CAGCAAAATATAATGTTATAACGATTTAAAATAGATAATAG
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * **
784404 CTT-AAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTCA-TGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACT
65 -TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACT
** * * * *
784466 GGTAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAACTTA
127 TATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG
* * * * *
784520 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAGTGATTTGGAATAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *** * *
784585 TCAAGTTGTCATAACTATTTGAAC-TCGCCTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
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* * *
784649 TTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTTTT
129 TTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGC--TTG
* * ** * * **
784703 TATAAATAGAAAAAATT-GGTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * *
784767 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTACTTATT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATT
* * * *
784831 AATCTTTCAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTCAAAATAAGCCTA
131 AAT-TTTTAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG
* * *
784881 CATGAATAGAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * *
784945 TTTAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAATTTTCTTACTCA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTA
* * * *
785010 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATGAGCTTA
129 TTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
* * * * * * *
785062 TATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACGAAACAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * * * **
785127 TCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTGTTTCTTAAAAGTTTACTTATT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATT
** * * *
785192 AATTGTCAAAATATTAATGAATTAATATTATTGTAATTTG-AATAAGCTTG
131 AATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-TTGAAATAAGCTTG
* * * * *
785242 TATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-GAATTTAAAATAAATAATTA
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTG
* * * * *
785306 TTCAAATAGTCATAA-GATTTGAACTTGTT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATGTTTTACCT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CTTTACTT
* * * *
785369 ATTAATTGTCTT-TATATTAATAGATTTA-TATTATTTT-ATTCAAAATAAACTTG
128 ATTAATT-T-TTAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG
* * * ** * * ** * *
785422 TACGAATAGAAAAAAATCATTTTACAAGAAAAC-AAAGGTTATAACAATTTCAAAAAGATAATTG
1 TATGAATAG-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * ** * ** * * *
785486 TTGAAATAGTCATAATTAATAAAACTTGTTCAACAAACAAATTCATTTTTTAAAACTCTTAATTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTA
* * *
785551 TTAATTTTCT-AATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTA
129 TTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTG
** * * * * *
785602 TACAAATTGAAATAATT-TTTTTTCACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
785666 TCAAATAGTCATGACTATTTGATC-TAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTACTTA
* * * ** *
785730 CTAATTGGTGAAATATTAATAAATTAG---TATTTTAATCCAAATAGGCTTG
129 TTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
* * *
785779 TATGAATGGAAACAATTATTTTAT-ATCAACACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* ** * *
785843 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAATAGAA-TTA-TTTTTAAATC---CCTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTTTACTT
* *
785902 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTT-ATTCCAAATAAGCT
128 ATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCT
785953 AGAATGATTT
Statistics
Matches: 4916, Mismatches: 1221, Indels: 812
0.71 0.18 0.12
Matches are distributed among these distances:
172 1 0.00
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191 12 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATT
AATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTG
Found at i:780641 original size:362 final size:359
Alignment explanation
Indices: 779232--785952 Score: 3467
Period size: 360 Copynumber: 18.5 Consensus size: 359
779222 AGTAAGCATA
* * * * **
779232 TATGAATTGATACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTAC
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * * * *
779297 TCAAGTGGTTATGAC-AATTAGAACTTGTTC-GATAAATATATTTA-TATTTAATTTTTTTACTT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTA-AA-TTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* ** * *
779359 ATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
128 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
* * * *
779424 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
192 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * ** * *
779489 AAGTATTTGAACTTATTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTTGTACTAATTAGTTGTCT-A
257 AACTATTTGAACTGATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATT-T-TGA
* * **
779552 AATATTAATAATTTTGTATTATTTTA-ACTGAAATAAGCTTG
319 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTG
* * * ***
779593 TATGAATAGAAA-AAGTTACTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAATAGAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *
779657 TTCAAAGAGT-AGTAACTATTTGAACTTGATC-GATAAAGAGATTT-TGTTTTTAAATTTCTTAC
65 TTCAAATAGTCA-TAACTATTT-AAATTGTTCAG-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTAC
* * * * * *
779719 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTCCAAGTTAGCTTGTACGAACAT
126 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAACAA
*** * * * * * *
779783 AAACAATTGTTTTGCAACAAAACAAAAGGTTATAA-AACTTTCAAAAAGATAATTGTTCAAACAG
189 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * *
779847 TTATAACTATTTGTA-TTAGTCAGTTCAAC-AGATTCATTTTTTAAATC-CTTTACTTATTAATT
253 TCATAACTATTTGAACTGATTC-GATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTC-CTACTTATTAATT
* * * *
779909 TTGTAGGATATTAATAGAA-TAGCATTACTTTATTTCGAATAAGAC-TG
315 TTG-A-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTG
* * * * * *
779956 TATCAATAGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAATGATTATAATGATTTGAAATAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *** * * * * *
780021 TCAAATTGTTATAACTATTTGAACCGGTTTAGTAAATAGATTTACTTTGTAAA--TC-T-CTTAT
66 TCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* ** * * * * * *
780082 TCATTTTCAAAATATTAATCAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAACAACG
130 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
* * * * ** * * * *
780147 TTTCTTTCACGACAAAACAAGTGGTCATAAT-AGTTTGAAATAAATAATTATTCATATAGCCTTA
194 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * ** *
780211 ACTATTTGAATTGGTTCAATAAAAAAATTTATTTTTTAAATCT-CT-CGGTTATTAATTTTTATA
258 ACTATTTGAACTGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCTAC--TTATTAATTTTGA-A
* * **
780274 ATATTATTAGATTAGTATTATTGAATTTTGAATAAGCTTG
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* * * * *
780314 TATGAACATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *
780379 TCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTAT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* **
780444 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAACAAGCTTGTATGATGAAAAACA
130 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
* * ** * *
780509 TTTGTTTAATGACAAAACAAAATATCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGTGATA
194 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * **
780573 ATTATTTCAACTGATTTGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAAT
258 ACTATTTGAACTGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTGAAAT
* * * * *
780638 ATTATTAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT
322 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* *
780676 TATGAACTA-AAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTG
1 TATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * *
780738 TTCAAATAGTTATAACTATTGAACTTGTTCAGGAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTTCTTGCTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC-TCTTACTT
* ** * * ** **
780802 ATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAAGAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGAATGTATGAACTGAA
128 ATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * * * * * * **
780866 ACAATTATTTAATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGAGAATTATTTTAAT-GATC
191 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TC
* * * * * *
780930 TTAACTATTTGAACTGGTTCAATAAAC-ATATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
255 ATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTG
* ** * * *
780994 AAACATTAATAGTTTAGAAATATTTTACTTTGAATAAGCTTG
318 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* ** *
781036 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAGAATGAAAA--TCAT--TGGATTTGAGATAGATAATT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATT
* * ** *
781097 ATTCAAATAGTCATAACTAATTGAAA-TGATTTTGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CT
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* ** ** * *
781157 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAA
127 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * ** * * *
781222 ACAATTATTTTATGACAAAATAAAATATCATAATGATTTGAAGTAGATAA-TAGTTTAAATAGAC
191 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTC
* * * * * * * * * *
781286 ATGACTGTTTAAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG
255 ATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTGA-
** *
781351 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTG
319 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * ** ** *
781392 TATGAATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAA-AAGAAGATTGTAACAATTTGAAATAAATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** * * *
781456 TTTAAATAATCATAACTATCTGAACTTACTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTA
65 TTCAAATAGTCATAACTAT-TTAAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * * *
781521 TCAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAATTAAGCTTTTGTGAATAGAAAC
129 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC
* * * *
781586 AATGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATA
193 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** *
781651 AATATTTGAACGTG-TTCAGA-AAA-TAAATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAAGTTTTGG
258 ACTATTTGAAC-TGATTC-GATAAACT-AATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTGA
* ***
781712 AATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTCAAAATAAGCTTG
319 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * * *
781753 CATGAATAGAACCAATTGTTTGATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
** * * * * * * *
781818 TCAGCTAGTCATAACTATTTTAACTTATTCAGTAAATAGA-TTCTTTTTTAATTCTCTTACTCAT
66 TCAAATAGTCATAACTA-TTTAAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
781882 TAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTTCAAACAAACTTATAAGAACTAAAAC
130 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC
* * * ** *
781946 AATTGTTTTGTTACAAAAGAAAAGGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCA-A
193 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
** *
782010 GACTATTTGAACTTG-TTC-AGTAAAC-ATATTTATTTTTTAAACTCTTTTACTTATTAATTGTC
258 -ACTATTTGAAC-TGATTCGA-TAAACTA-ATTTATTTTTTAAA-TCTCCTACTTATTAATT-TT
* * * *
782072 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAACTTG
317 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * * * *
782115 TTTGAATAGAAACAATTGTCTTAATATTA-ATAAATCTATA--TTAT-TTTATTTGAAATAAGCT
1 TATGAATAGAAACAATTAT-TT--TATGACA-AAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-A---
* *** ** * *** ** * ** *
782176 TGTATGAATAGAAAAAATTCTTTTATAA-TAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAAT
57 -G-AT-AATTGTTCAAA-T-AGTCATAACT-ATTTAAATTGTT-CAGT-A-AACAAAT---TTAT
* * ** * * * * *** * *
782240 TGTTCAAA-CAGTCACAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTA-AATCT-CTT
110 TTTTTAAATC--TCTTACTTA-TT-AA-TT-TT---TGAA-ATATTAATAAATTAGTAT-TATTT
* ** * * * ** * ** * **
782302 TATT--ATTAATTTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAGCATATATGAA
164 TATTCAAATAA-GCTTG---TATGAACAAA-AACAATTGTTTTA-TGACAA-AA-CA-A-AAGGT
* ** *** * ** * *
782365 CTAAAACAATTCTTTTAT-GATAA--A-ACAAA-AGGTCATAAAAGATTTGAAATAAATAATTAT
219 C-ATAATGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATA-GTCAT-AACTATTTG------A-ACTGAT
* * * * *
782425 TCAAATAATCATGATTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTAAAAAAAATTTACTTAT
273 TC-GATAAAC-T-A--ATTT-AT-T--TTT--T----A-A---ATCTC---------CTACTTAT
* * * *
782490 TAATTGTTGAAATATTAATAACTTAGCATTATTTTAATCT-AGATAAGCTTG
310 TAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTG
** * * ** * *
782541 TATGAATAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGC
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
782606 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTT-TGATAAATAGA-TT-TTTTTTAAA--TC-T-CTTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * ** * *
782664 TTAATATTTGAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTT-TT-TTATCAAACTTATATGAACAAAAA
129 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCAAAT-AAGCTTGTATGAACAAAAA
* * * * * *
782727 CATTTATTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
192 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
782792 AATTA-TTCAGACTGGTTAGGTAAA-TAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TCTATTAATTTTTT
257 AACTATTTGA-ACTGATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACT-TATTAA--TTTT
** * *** *
782854 G-AATATTAATAAATTCCTTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAG
317 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * *
782896 TATAAATTCA-AAAAAACATATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
1 TATGAA-T-AGAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * ** * * *
782960 TGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGT
63 TGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * *
783025 TATTAATTTTTTAATATTATTAGAT-TATTATTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATA
127 TATTAATTTTTGAA-A-TATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACA
* * *** * *** ** * *
783089 AAAATAATTGTTTTATGATAGCGCAAAAGGTTATAATGATTTGTTGTTTACAATTGTTCAAATAG
188 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * ** *
783154 TCATAACTATTTGAACTGGTTC-AGTAAA-TAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACATATTAATTT
253 TCATAACTATTTGAACTGATTCGA-TAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TT
*
783217 TTGAAAGA-T--T-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
315 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * * * *
783258 AATG-TTCA-AATACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTCAAATAGTTAATT
1 TATGAAT-AGAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
*** * * * * * * *
783321 GTTGGCATGGCCATAATTATTTGAATTGATTTAGTAAACAAATTCACTTTTTAAA--TC--ACTT
64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * *
783382 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAA
128 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTA-TTCA-----AATAAGCTTGTATGAA
** * ** * * *
783447 CTGAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATAT
186 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * *
783512 AGTCTTAACTATTTCAACT-ACTTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATT
251 AGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATT
* * ** *
783576 ATTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTG
315 -TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * * *
783622 TATG-ATGGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGTTCGTAA-GATTTGAAATTGATAATTG
1 TATGAATAG-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * * * *
783685 TTCAAATGGCCAAAATTATTTGAACCAGT-TTGA-TAAACTAACTTACTTTTTAAATCTCTAACT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTT-AA--ATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * **
783748 TATCAATTTTCT-AAATATTAATAAAGTAATGTTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTGA
127 TATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * * * * **
783812 ATCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAA-TAGTTCAAACAAC
190 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGT
* * * ** **
783876 CATAACTATTTGAATTTG-TTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTTTAAATTTGTTGTTTATTAATTT
254 CATAACTATTTGAA-CTGATTCGATAAACTA-ATTTA-TTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TT
* * * * * * * *
783939 TTTAATTGTTAATAAATTAGTCTGATTTTATTTCGAATAAGCATA
315 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * *
783984 TATGAACT-GAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** * * *
784048 TT-TAATAGTCTTAATTATTTGAACTAATTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * * * * *
784112 TTAATTTTT-AGAATACT-ATCAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGTTTGCACGAATATAA
129 TTAATTTTTGA-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * * * * *
784175 ACAATTGTTTTATGACAATAC-AAAGATTATAACGATTT-AAGATAGATGATTATTCAAATAATC
191 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTC
** * * * * * *
784238 ATAACTATTACAATTGGTTCAATAAAC-AGATTTAGTCTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTA
255 ATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTG
* **
784298 AAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTG
318 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * * * *
784340 TATGAATAGAAACAATTATTTTA-CAGCAAAATATAATGTTATAACGATTTAAAATAGATAATAG
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * **
784404 CTT-AAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTCA-TGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACT
65 -TTCAAATAG-TCATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
** * * * * * * *
784466 GGTAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATAGAA
127 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
* * * * * * * * *
784531 ACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAGTGATTTGGAATAAATAATTGTTCAAGTTGTCA
191 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
** * **
784596 TAACTATTTGAACTCGCCTAG-TAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
256 TAACTATTTGAACT-GATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTG
* *** *
784659 AAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTT
318 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC--TTG
* * ** * * **
784703 TATAAATAGAAAAAATT-GGTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
** * *
784767 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACA-TGTTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-T-TTACTTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTT-AA-ATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * ** * * *
784829 TTAATCTTTCAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCCTACATGAATAGAAC
129 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
* * * * *
784893 CAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCA
192 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * *
784957 TAACTATTTGAACATG-TTC-AGTAAACAAATTCATTTTTTAATTTTCTTACTCATTAATTTTTA
256 TAACTATTTGAAC-TGATTCGA-TAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTGA
** * *
785020 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATGAGCTTA
319 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * * *
785062 TATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACGAAACAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * * * **
785127 TCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTGTTTCTTAAAAGT-TTACTTAT
66 TCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* ** * * * ** * * *
785191 TAATTGTCAAAATATTAATGAATTAATATTATTGTAATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATA
130 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
* * * *
785256 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-GAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
194 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * ** * **
785320 A-GATTTGAACTTG-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATGTTTTACCTATTAATTGTCT-TT
258 ACTATTTGAAC-TGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATT-T-TGAA
* *** *
785382 ATATTAATAGATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAACTTG
320 ATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * ** * * ** * *
785422 TACGAATAGAAAAAAATCATTTTACAAGAAAAC-AAAGGTTATAACAATTTCAAAAAGATAATTG
1 TATGAATAG-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** * * *
785486 TTGAAATAGTCATAATTAATAAAACTTGTTCAACAAACAAATTCATTTTTTAAAACTCTTAATTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * ** ***
785551 TTAATTTTCT--AATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACAAATTGAAA
129 TTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
* * *
785614 TAATT-TTTTTTCACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
192 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * ** * *
785678 GACTATTTGATCTAGTTTAG-TAAAC-ATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTACTAATTGGTG
257 AACTATTTGAACT-GATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTT-AAATCTCCTACTTATTAATT-TTG
* *** *
785740 AAATATTAATAAATTAG---TATTTTAATCCAAATAGGCTTG
318 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * *
785779 TATGAATGGAAACAATTATTTTAT-ATCAACACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
785843 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAATAGAA-TTA-TTTTTAAATC-C---CT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTCA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
*
785901 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCT
127 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CAAATAAGCT
785953 AGAATGATTT
Statistics
Matches: 4876, Mismatches: 1155, Indels: 666
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
351 1 0.00
352 13 0.00
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377 3 0.00
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380 3 0.00
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394 18 0.00
395 11 0.00
396 10 0.00
397 7 0.00
398 8 0.00
399 6 0.00
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401 2 0.00
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426 69 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (359 bp):
TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
ATTTGAACTGATTCGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTGAAATATTA
ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
Found at i:780906 original size:541 final size:536
Alignment explanation
Indices: 779243--795519 Score: 4136
Period size: 541 Copynumber: 30.0 Consensus size: 536
779233 ATGAATTGAT
* * * * ** * * *
779243 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTACTCAAGTGGTTA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * * *
779308 TGAC-AATTAGAACTTGTTC-GATAAATATATTTA-TATTTAATTTTTTTACTTATTAATTGTCA
66 TAACTATTTA-AA-TTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * *
779370 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTA-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTT
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTTG-TTT
* * *
779434 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGA
190 ATGACAAAACAAAAA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
779499 ACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TGTAC-TAATTAGTTGTCT-AAATATTAAT
254 ACTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTAATAAGTT-T-TAAAATATTAAT
* ** ** *
779561 AATTTTGTATTATTTTA-ACTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AAGTTACTTTATGACAAAA
316 AAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATA-AAACAA-TTATTTTATGA-AAAA
* * *** * *
779624 CAAAAGTTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGAG-TAGTAACTATTTGAACTTGATC
377 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA-TAACTATTTGAACTTGTTC
* * * *
779688 -GATAAAGAGATTT-TGTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-A
441 AG-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *
779750 TTTATGTTATTCCAAGTTAGCTTGTACGAACATAA
504 -TTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAAC-TAA
* *** * * * * *
779785 ACAATTGTTTTGCAACAAAACAAAAGGTTATAA-AACTTTCAAAAAGATAATTGTTCAAACAGTT
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** * * *
779849 ATAACTATTTGTATTAG-TCAGTTCAACAGATTCATTTTTTAAATC-CTTTACTTATTAATTTTG
65 ATAACTATTTAAATT-GTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTT-
** * * * * *
779912 TAGGATATTAATAGAA-TAGCATTACTTTATTTC-GAATAAGAC-TGTATCAATAGAAACAACTA
126 TAAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAG-CTTGTAT-GATAAAAAC-A-TT
* * * * *
779974 T-TTTATGACAAAACAAATGATTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTA
185 TGTTTATGACAAAACAAA-AATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
780038 TTTGAACCGGTTT-AGTAAATAGATTTACTTTGTAAATCTCTTA-TTCAT---TTTCAAAATATT
249 TTTGAACTGATTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATT
* ** * * * ** * * *
780098 AATCAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAACAACGTTTCTTTCACGACAAA
313 AATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAA-AACAATTATTTTATGA-AAA
** * * * *
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376 ACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACTT-G
* * *** * * *
780225 TTCAATAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTCGGTTATTAATTTTTATAATATTATTAGATTAGT
438 TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
** ** *
780290 ATTATTGAATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAA
503 ATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAAC-TAA
* * *
780325 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *
780390 TAACTATTTAAATTGGTTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAA
66 TAACTATTTAAATT-GTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
*
780455 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAACAAGCTTGTATGATGAAAAACATTTGTTTAATG
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGAT-AAAAACATTTGTTT-ATG
* * * * *
780520 ACAAAACAAAATATCATAAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGTGATAATTATTTCAAC
193 ACAAAACAAAA-ATCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** * * * * *
780584 TGATTTGATAAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTATTAAAG
256 TGATTTGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAATAAAT
* * *
780648 TAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGATAAA-AAAAGG
320 TAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGAAAAACAAAAGG
* *
780712 TCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAACTTGTTCAGGAAACA
384 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACA
* * * ** *
780776 AATTTATTTTTTTAAA-CTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAAGAGTTTTATTTTA
449 AATTTA-TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* *
780840 TTTCGAATAAGAATGTATGAACTGAA
512 TTTCAAATAAGATTGTATGAACT-AA
* * * * * **
780866 ACAATTATTTAATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGAGAATTATTTTAAT-GATC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TC
* * * * *
780930 TTAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACATATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
65 ATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* ** * * * * *
780995 AACATTAATAGTTTAGAAATATTTTACTT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTTG-TTTA
* ** * * *
781059 TGACAGAATGAAAATCAT--TGGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAA
191 TGACAAAACAAAAATCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * *
781122 ATGATTTTG-TAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTA-TTAAT---TTTTAAAATATTAATAAA
255 CTGA-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAATAAA
* ** * *
781182 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA
319 TTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAA
** * * * ** * * * * **
781247 TATCATAATGATTTGAAGTAGATAATAGTTTAAATAGACATGACTGTTTAAACTTATTTGGTAAA
382 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA
** *
781312 CAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
447 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
781377 TTTCAAATAA-ACTTGTATGAA-TAGAA
512 TTTCAAATAAGA-TTGTATGAACT--AA
* * * * * * *
781403 ACAATTTTTTTATGACAAAA-AAGAAGATTGTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAATC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * ** * * * * * **
781467 ATAACTATCTGAACTTACTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATCAATTTTTGG
65 ATAACTAT-TTAAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * **
781532 AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-ATTAAGCTTTTGTGAATAGAAACAATGGGTTTA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAC-ATTTGTTTA
* * *
781596 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAA
191 TGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * **
781661 CGTG-TTCAGA-AAATAAATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAA
255 C-TGATT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAATAA
*** * * * * *
781723 ATTTAA-ATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTGATGTCAAAACAA
318 A-TTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTATTTTATG-AAAAACAA
* * ** * * *
781787 AAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGCTAGTCATAACTATTTTAACTTATTCAGTA
380 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
* * * * *
781852 AATAGA-TTCTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
445 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * *
781916 TAGTTCAAACAA-ACTTATAAGAACTAAA
510 TATTTCAAATAAGA-TTGTATGAACT-AA
* * * * * *** * *
781944 ACAATTGTTTTGTTACAAAAGAAAAGGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * *
782009 -AGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAACTCTTTTACTTATTAATTGTCA
66 TA-ACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * *
782073 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTTTGAATAGAAACAATTGTCTTA
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTTGT-TTA
* ** * * ** * ** *
782138 --ATATTA-ATAAATCTATATTATTTTATTTGAAATA-A-GCTTGTAT-GAATAGAAAAAATTCT
191 TGACAAAACAAAAATC-ATA--A--TGATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAA--C-
** * * * ** * *
782197 TTTATAATAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGA-TAATTGTTCAAACAGTCACAATTAT
247 --TAT--TTGAAC------TGAT-TTGA--T-AAATAGATTTATT-TTTTAA-A-TCTC--TTAC
* * * * *** *
782261 TTAA-ACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTTTTGAATTATTA
293 TTAATA--AGTT--TTAAA-ATATTAATAAATT-AA--T-ATTATT-TT-A-TTTTGAA----T-
** * * *** * * * * * * * **
782325 ATAAATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAGCATATATGAACTAAA-ACAA-TTCTTTTATGATAA
341 A-AGCTT-GTATGA--ATA-AAACAATTA--TTTTATGAA--AAACAAAAGGTC-ATAATGATTT
* * * * * * * *
782388 AACAAAAGGTCATAAAAGATTTGAAAT-AAATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGATCTAG
396 GA-AATA-G--AT---A-A-TTG--TTCAAATAGTTA-T-AACT-AT-TTGA--ACTTGTTC-A-
* ** ** * *
782452 TTTGGTAAACATATTTATTTTAAAAAAAAT-TTACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAACTTA
442 ----GTAAACAAATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTA
* * * *
782515 GCATTATTTTA-ATCTAGATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
501 GTATTATTTTATTTC-AAATAAGATTGTATGAACT--AA
** * * * * * *
782552 ACAATTGGTTTATAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
782617 TAACTATTTAAACTAGTT-TGATAAATAGA-TT-TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATATTTGA
66 TAACTATTTAAA-TTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * ** * * *
782675 AATATTAATAGATTAGTATTACTTTTTTTTATCA-AA-CTTATATGAACAAAAACATTTATTTTA
129 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTT-GTTTA
* ** * * *
782738 TGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA-TTCAG
191 TGACAAAACAAA-AATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-
* * * * * * **
782802 ACTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TCTATTAATTTTTTGAATATTAATAA
254 ACTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TAATAAGTTTTAAAATATTAATAA
** * *** * * * *
782866 ATTCCTTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTCAAAAAAACATATTTTATGAAAAAACA
318 ATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAACAA-TTATTTTATG-AAAAACA
* * * * **
782931 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT-TAAATATTTGAACTAGTTTGG
379 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* * * * * *
782995 CAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTT-TAATATTATTAGATTATTATTAT
443 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-A--ATTAGTAT
* * *
783059 TATTTTA-TTCTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAA
505 TATTTTATTTC-AAATAAGATTGTATGAACT--AA
* * * *** * *** ** *
783092 ATAATTGTTTTATGATAGCGCAAAAGGTTATAATGATTTGTTGTTTACAATTGTTCAAATAGTCA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
783157 TAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAA
66 TAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* ** * * * *
783222 AGA-T--T-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGAATGTTCAAATACAATTGTTATATG
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGAT-AAAAACATTTGTT-TATG
* * * * * *** * * * *
783283 ACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTCAAATAGTTAATTGTTGGCATGGCCATAATTATTTGAATT
193 ACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * **
783348 GATTT-AGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTA-TTAAT---TTTTGGAATATTAATAAATT
257 GATTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAAT-AA--
* * **
783408 ATTATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAACAATGGTTTTATGACAAAAC
318 ATTA--A-TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGA-AAAAC
** * * * **
783473 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCT-TAACTATTTCAACTACTTCA
378 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTCA
** * * * * *
783537 ACAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTATTGGAATATTATTAAATTAGTATTA
442 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ***
783602 TTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGATGGAAA
507 TTTTATTTCAAATAAGATTGTATGA-ACTAA
* * * * * * *
783633 AAAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-GTTCGTAA-GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATGGCC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * *
783696 AAAATTATTTGAACCAGT-TTGA-TAAAC-TAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTT
65 ATAACTATTT-AA--ATTGTTCAGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
783758 CT-AAATATTAATAAAGTAATGTTATTTTATTTCAG-ATAAGCTTTTATGA-ACTGAATCAATTG
126 -TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATGATA--AAAACATTTG
* * * * * * * **
783820 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATAGTTCAAACAACCATAACTAT
187 -TTTATGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * ** * * * * *
783885 TTGAATTTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTGTTGTTTATTAATTTTTTAATTGTT
250 TTGAA-CTGATTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATT
* * * * * * *
783949 AATAAATTAGTCTGATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACTGAAAA-AATTATTTTATGACTA
313 AATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAACAATTATTTTATGA-AA
* * * * **
784013 AACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTCT-TAATTATTTGAACTAAT
375 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * *
784076 TCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTAGAATACT-ATCAATTTAGC
439 TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AAATTAGT
* * * * * * *
784140 AATATTTTACTCCAAATAAGTTTGCACGAATATAA
503 ATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAA-CTAA
* * * * * *
784175 ACAATTGTTTTATGACAATAC-AAAGATTATAACGATTT-AAGATAGATGATTATTCAAATAATC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
784238 ATAACTA-TTACAATTGGTTCAATAAACAGATTTAGTCTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTA
65 ATAACTATTTA-AATT-GTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* ** ** *
784298 AAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTAT-TTT
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAC-ATT-TGTTT
* * ** * * * * * *
784362 A-CAGCAAAATATAATGTTATAACGATTTAAAATAGATAATAGCTT-AAATGGAT-ATGACTATT
190 ATGA-CAAAACA-AAAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAG-TCATAACTATT
* * * * ** *
784424 TGAACT--TGTTCATGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTGGT-A-AATTTTTAAAATATT
251 TGAACTGAT-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT--TAATAAGTTTTAAAATATT
* * * *
784485 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAA
313 AATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTATTTTATGA-AAA
* * * * * * * * *
784550 ACAAAAGATCATAGTGATTTGGAATAAATAATTGTTCAAGTTGTCATAACTATTTGAACTCG-CC
376 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * *
784614 TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAATTTTAATAAATTAGTA
441 -AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * *
784678 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTTTAT-AAATAGA
504 TTATTTTATTTCAAATAAG--ATTGTATGAACTA-A
* * *
784713 A-AA-AATTGGTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
1 ACAATTATT--TTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * *
784776 CATAACTATTTGAACA-TGTTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATCTTT
64 CATAACTATTT-AA-ATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * *
784838 CAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCCTACATGAATAGAACCAATTAT-T
127 AAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAC-ATT-TGT
* * *
784901 TTATGACAAAACAAAATGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATT
188 TTATGACAAAACAAAA-ATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * * * *
784965 TGAAC--ATGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAATTTTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTA
251 TGAACTGAT-TTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTA
* ** * * * * * *
785028 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATGAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACGAAA
314 ATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGA-AAAA
* * * * *
785093 CAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTCA
377 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCA
** * * * ** * * * * *
785158 AAAAACATATTTGTTTCTTAAAAGT-TTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATGAATTAATATTA
442 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
785222 TTGTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
507 TT-TTATTTCAAATAAGATTGTATGAACT--AA
* * * * * *
785253 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-GAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
785317 ATAA-GATTTGAACTTGTT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATGTTTTACCTATTAATTGTCT
65 ATAACTATTT-AAATTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-T
* * * * * * *
785380 T--TATATTAATAGATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAACTTGTACGAATAGAAAAAAATCAT
126 TAAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATG-AT--AAAAACAT-TT
** * ** * ** * * * * *
785442 -TTTACAAGAAAACAAAGGTTATAACAATTTCAAAAAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTAAT
186 GTTTATGACAAAACAAAAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** ** * * * * * * * **
785506 AAAACTTG-TTCAACAAACAAATTCATTTTTTAAAACTCTTAATTATTAA-TTTTCTAATATTAA
251 TGAAC-TGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAA
* * * * ** * * * *
785569 TAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATACAAATTGAAATAATT-TTTTTTCACAAAAC
315 TAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGA-AAAAC
* * * * * *
785633 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTAG
378 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* * * **
785698 TAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTACTAATTGGT-GAAATATTAATAAATTAG---T
443 TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
785758 ATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAA-TGGAA
506 ATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACT--AA
* * * *
785790 ACAATTATTTTAT-ATCAACACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
1 ACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
785854 ATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAATAGAATTA-TTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTG
65 ATAACTATTT-AAATTGTTCA-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * *
785913 AAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCA-AATAAGCTAGAATGATTTGAAATAGATAATT
128 AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CAGAATAAGCTTGTATGA--T-AAA-A-ACATTT
* * * ** * * * * * * ** ** *
785976 GCTCAT-A-TAGTCTTAAATAT-TTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTTATT-TTTTAATTTTCTT
186 GTTTATGACAAAAC--AAAAATCAT-AA-TGATTT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * ** *
786037 AGCTA-TT-AA-T-TTTTG--GAATATTATTATATTAGTATT-ATTTTATT-CTGGATAAG-CTT
244 AACTATTTGAACTGATTTGATAAATA-GATT-TATT--TTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTT
* * * *** * * * * ** **
786093 ---GTATGAACAAA--AATAATTATTTTATGGCAGAGCAAAAGGTTATAATGATTTGAA-GTTTA
305 AAAATATTAATAAATTAAT-ATTATTTTAT-TTTGA--ATAAGCTTGT-ATGAATAAAACAATTA
*** ** * ***
786152 CAAT-TG---TTCAAATA-GTTAT-AT-ATTTG-AAT---TAATTCAACAAACATA-TT-T-A-T
365 TTTTATGAAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AA-ATAGTTATAACT
* * * * * * ** * * ** ** *
786202 TTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAT-TAGTA-TTATT--TTATTTT
427 ATTTGAACT-TGTTCAGTAAACAA-ATTT---A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTA
** ** * * ** * * **
786262 GAATAGGCTTGAATGATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGCCATAAT-TTTTTA-T
485 GAATA---TT-AAT-A--AATTAGTATTATTTTAT-TTC-AA-ATAA-G--AT--TGTATGAACT
786325 AA
535 AA
* * * ** * * * * *
786327 ACAGATAATTGTTCAT-A-TAATCTTAA--TTATTTAAACTGCTTCAGTAAACAGATTTATTTTT
1 ACA-ATTATT-TT-ATGACAAAACAAAAGGTTA--T-AAC-GATT-TG-AAATAGA-TAATTGTT
* * * * * * *
786388 TACAT-CTCTTAATTA-TCAAATT-TTGGAATGTTATTAA-ATTAATATTATTTTATTCCAAATA
56 CAAATAGTCATAACTATTTAAATTGTT--CA-G-TA--AACA-T-AT-TTATTTT-TT--AAAT-
* * * * * *
786449 AGCTTATATGAACTGAAATAATTATTTTATAACATAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGA
108 --C-TCT-T--ACT----T-ATTAATTT-T----TAA-AATA--TTAATAA--ATTAG-TAT-TA
* * * * * * * *** * *
786513 TAATTGTTCA-AATAAAAACTGGT-TCAATAAATAA-ATTT-TTT-T--TAAATCTCTTACTTAT
150 T-TTTATTCAGAAT--AAGCTTGTAT-GATAAA-AACATTTGTTTATGACAAAAC-AAAAATCA-
* * ** * ** *
786571 TAAT-TTTTGAAATA-TTAATAAATT--AATA-TTAT-TTTATTTCGAA-TAGCTTTTATGATGA
208 TAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAACT-G--ATT-TGAT-A
** ** * * * *
786629 AA-A-A-CAATTGTTTT--ATGGC-AAC--AA-AAG-TTCATAACTATT--TGAAATAAATAATT
266 AATAGATTTATT-TTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTA-AAATATTAAT-AAATTAAT-ATT
* ** * * * * ** * * **
786682 -GTTTAAATGGACATAATCATTTGAAGTGATTTCGATAAACTGGCTTATTTT-T-TAAATCTTTA
327 ATTTTATTTTGA-ATAAGC--TTGTA-TGA-AT--A-AAAC--AATTATTTTATGAAAAAC-AAA
* ** * * *** * * *
786744 A-TTTTTTAT-TTTTGAAGTATTA-ATAAAGTAATGTT-TTTTATTTTGAAAATGCTTTTGTGAA
381 AGGTCATAATGATTTGAA--A-TAGAT-AA-T--TGTTCAAATA-GTT-ATAA--CTATT-TGAA
* * * * ***
786805 C-TG---A--AAAC-AA-TCATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATACTTCTT-ATAAATAG-ATA
434 CTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTT-T--TAAATC------TCTTACTTATTAATTTTTAGAAT-
** ** * * * *
786860 ATTGTTCAAA-TAGTCA-TA-ACTATTT-AAACT-TGTTTG-GT-AACCAA
489 ATTAAT-AAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAA-TAAGATTGTATGAACTAA
** ** * *** * ** * * * *
786904 ATTTATT-TTTTAAATTTCTTATTTATTAATTTTTTACATGATAAT-AAATTAGTATTATT-TT-
1 A-CAATTATTTT--ATGAC-AAAACA-AAAGGTTATA-ACGAT-TTGAAA-TAG-ATAATTGTTC
** * * * * * * ** *** *
786965 ATTTCG-AATAAGC-ATGTATGAACTG---A-AAAACTTATTT-TATAATTAAA--TAAAAGGTT
57 AAATAGTCATAA-CTAT-T-TAAATTGTTCAGTAAACATATTTAT-TTTTTAAATCTCTTA-CTT
* * * * ** * * * * ** ** *
787021 A-GAATGATTTGAAATA--AATAATTGTTTTAATAGTCTTA-ACTGTTTGAA-CTAAT-TCGACA
117 ATTAAT-TTTTAAAATATTAATAAAT-TAGTATTA-TTTTATTCAGAAT-AAGCTTGTAT-GATA
* * ** * *** * * * *
787080 AACACATTTATTT-T-TTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTAGAATATTA-TTAA-T-TTCACA
177 AAAACATTTGTTTATGACAAAAC-AAAAATCA-TAATGATTT-GAA-A-TAGATAATTGTTCA-A
* * * * * * * * ****
787139 ATA-T-TTTAC--TTTGAA-TAAGCTTGTATCAACAAAAGCAATTATTTTATGACAAAACAAAGA
236 ATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTTG-AT--A-AATAG-ATTTATTTT-T--TAAATCTCTTA
* * * ** * * * *
787199 TCATAACAA-TTTGAGATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAT
292 -CTTAATAAGTTTTA-A-A-AT-ATTAAT-AAAT--TAAT-ATTATTT-TA-T--TTTGA-ATA-
* *** * * * * *
787263 AGATT-TAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATG
342 AGCTTGTA-TGAATAAA--AC-AATT-ATTTTATG-AA-A--AACAAA--AG-------GTCAT-
* *
787326 AATAATTTTGTATAAATAGAAATAATTGTTTTACAACAAAATAAAATATCATAACTATTTGAAAT
388 AATGA-TTTG---AAATAG--ATAATTG--TT----C-AAAT--AGT-T-ATAACTATTTG--A-
*
787391 AGATAATAGCTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTTTTGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCT
433 A-CT--T-G-T----T---CA-G--TA----AAC----------A-A-ATTTATTTTTTAAATCT
** * *
787456 CCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAAAAAATTAGTATTATTTT-TATTCAAATAAAATTGTATG
467 CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGATTGTATG
787520 AA-TAGA
531 AACTA-A
** * * *
787526 AGCAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTC
1 A-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
*** * * * * *
787591 ATAACTATTTAAACTCACTCGGTAAAAAGATTTATTATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTT
65 ATAACTATTTAAA-TTGTTCAGTAAACATATTTA-T-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
787656 AAAA-ATTTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTTTATGAAAAGAAACAATTAGT
127 AAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATGATAA-AAAC-ATTTGT
* ** * * *
787719 TTATGACAAAATGAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAATTATTT
188 TTATGACAAAA-CAAAAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * * * * **
787784 GAACGTG-TTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTAA
252 GAAC-TGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAA-GTTTTAAAATATTAA
* * * *
787847 TAAATTTATATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAATAAAACTAATTGTTTTATTACAAAA
315 TAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAAAAC-AATTATTTTATGA-AAAA
* * * *
787911 CTAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAA-ATGTTT
377 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT-GAACTTG-TT
* * ** ** * * * *
787975 GAG-AAACAAATTAATTTTTTAGTTCTCTTACACATT-ACTTTTCGAATATTCATGAATTAGTAT
440 CAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
* *
788038 TATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAA
505 TATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACT-AA
* * * * * *
788071 ACTATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAA-TATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
788135 AAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACATATTTATTTTTTAAATGT-TTTCTTATT-ATTTGTTG
66 TAACTATTT-AAATTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTA
* * * * * *
788197 AAATATTTATAAATTAATATTATTTTAAT-ATGAAGAAGCTTGTATGAATAGAAACA---ATTTA
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA-GAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTTGTTTA
* * *** * * ** * * * * *
788258 --AAATAAATAATTGCTCAATTAGTCATAAGGATTTGA-ACTTGTT----TAGT-A-AACAAATT
191 TGACA-AAACAA-AAATC-A-TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATT
* * * ** * * * * * ** *
788314 T--A-T--TTT-TTAGATA-TTTTACCTATTAATTGTCTTAATATTAATAAGTTGTATTATTTTA
251 TGAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-A-CTTAATAAGTTTTAAAATATTA
* * * ** * * * * * * * * * * * **
788372 TTTGTAA-CAAGCTTGTATGA-ATAGAAAAAATCATT-TGGTG-ACAAAAGAA-AAAGTTATAGC
314 -AT-AAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGC-TTGT-ATGAATAAAACAATTATTTTAT-G-
*** * * * *
788432 AATTTCAAATA-G--ATAATTG--TTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAA--A--
372 AAAAACAAA-AGGTCATAA-TGATTTGAAATAG--ATAATTGTTCAAA-TAGTT--ATAACTATT
* * *
788488 ----------CAG-------ATTCATTTTTTAAATCTCGTAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT
430 TGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * *
788536 AACTTAGTATTATTTTATTTCGAATATG-CTGATATGAACTAAA
495 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGATTG-TATGAACT-AA
* * * * * * * *
788579 ATAATT-TTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAAAAGATTTGAAATAAATACTTATTTAAATAGTC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * ** * * *
788643 ATGACGATTT-GATCTAGTTTGGTAAAC-CATTTATTTTTTAAAAT-T-TTGCTTATTAATTATT
65 ATAACTATTTAAAT-T-GTTCAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* ** * * *
788704 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTTG-ATAAGCTTTTATGAATAGAAA-TTATTGTT
127 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAT-TTGTT
* ** * * * *
788767 T-TGTA-ATAGAACAAAAA-AATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTAATAACTTTT
189 TATG-ACA-A-AACAAAAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
788829 TGAA-TGAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTATTA-TTAAT---TTTTGAAATATTAA
251 TGAACTGA-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAA
* *** * * * * * * *
788889 TAGATTGGCATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC
315 TAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTATTTTATGA-AAAAC
*** * * *
788954 AAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-TGATT-A
378 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTCA
* * * *
789017 GGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCATACATATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTCA-TT
442 -GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTA
* * *
789080 TTATTTTATTCCGAATAAG-TTAGTATGAAGTGAA
504 TTATTTTATTTCAAATAAGATT-GTATGAACT-AA
*** * * * * *
789114 ATTTTTGTTTTATGACAAAACAAAA----AT---GATTTGAAATAGATAAATGTTCATATAGCCT
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * **
789172 TAACTATTTGAACTAGTT-TGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTATTAATTTTTGG
66 TAACTATTT-AAATTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
** * ** * *
789236 AATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAATAATTGTTTTA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGATA-A-AAACATTTG-TTTA
* * * * * * * * * * * * *
789300 TGATAGAATAAAAGGTTATGACGGTTTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAA
191 TGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
789365 CT-AGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTAATAA
255 CTGA-TTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAATAA
* * * * * * * * * * *
789429 ATTACTTTTCTTTCATTTTGAATAAACATGTATGATAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAA
318 ATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAA
* * * ** * ** *
789494 AGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTG-TCGAAATGGACATAATTATTTGAACTAATTTAGTA
381 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
* * * * * *
789558 AATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATT
445 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
789622 TTATTTTAACTAAGCTTGCATGAATTCAA
509 TTATTTCAAATAAGATTGTATGAACT-AA
* * * * * *
789651 ACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * **
789716 TAACTATTTGAATTTGTT--G-GGACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGTTTATTAA-TTTT---
66 TAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* * * ** * * * **
789771 -T-GTAAGAAATTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTGTGA-ACTAAAACAAATGTTTTAT
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGATA--AAAACATTTG-TTTAT
* ** * * *
789833 GTCAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAAT
192 GACAAAACAAA-AATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-
* * * * * ** ** *
789898 TTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTCAAATCAT-TTCCTTTTTAA-TTCTTTGAATGTTAATAA
255 CTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTAATAAGTT-TTAAAATATTAATAA
* * * ** * * *
789960 ATTTAGATTCTTTTATTCCGAATAAGCTTGTAAGATATGAAAA-AAATATTTTATTACTAAAA-A
318 ATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-AT-AAAACAATTATTTTATGA--AAAACA
* * * * * *
790023 AAAGGTTAGAATGATTTAAAATAGATAATTATT-ATAATAGTTTTAACTATTTGAA-TTGACTCA
379 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTCA
* *
790086 GTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATT
442 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
** * * *
790150 ATTTGTA-ACCAAATAAGTTTCTATGATTA-GAA
506 ATTT-TATTTCAAATAAGATTGTATGA--ACTAA
* * * * *
790182 ACAATTGTTTTATGACAAAAC-ATAGATCT-TAACAATTTGAGATTA-ATAATTGTTCAAATAGT
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT-TATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
790244 CACAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTTG
64 CATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * *
790309 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCA-AATAAGATTGTATCATAAAAAAATAATTGTTT
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATGATAAAAACAT--TTG-TT
* * ** * *
790373 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAAAT-GGCTATAATTATAT
189 TATGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTAT-T
* ** *
790437 T-AACTAATTCAATAAACT--A---A---TTT--A--T-TT--TT--T-AG---T-AAGTATTAA
251 TGAACTGATTTGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAA
* * * * * *
790479 TAAATTAGTATTATTTTA--ATCAATCTAAGCTTGTATTAACTAAAACAAATGTTTTATGACAAA
315 TAAATTAATATTATTTTATTTTGAA--TAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGA-AAA
* * * * * * * * *
790542 TC-AAAGTGTTATAACGATTTTAAATTGACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTATT
376 ACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * *
790606 CAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTATTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTAT
440 CAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
790671 TAATTTA-TTCTGACTAAGCTTGTATAAACTGAA
505 TATTTTATTTC-AAATAAGATTGTATGAACT-AA
* * * * * * * * * * *
790704 ACAATTGTTTTATGACTAAATAAAATGTCAAAACGATTTCAAATAGATAATTATTCTAATAATCT
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
790769 TAACCATTTGAACTGATTC-GATAAATAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTATTTTTTGA
66 TAACTATTTAAATTG-TTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-A
* * * * *
790833 ACA-ATTATTAAATTAGTGTTATTTTAATAAGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAACAATTAT-TTT
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGATA-AAAAC-ATT-TGTTT
* * * * ** ** *
790895 ACGACAAAAGAAAAAGGTCATAACGATTTGGAATAGATAATCATTCATGTAGTCTTAACTATTTG
190 ATGACAAAACAAAAA--TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * * * * ** * ** *
790960 AATTGGTTCAACAATTAGATTTATTATTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTATT
253 AACTGATTTGATAAATAGATTTA-T-TTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAAT
* * * ** * * * * * * *
791025 AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAACAGGACCAATTGTTTAATGTAAAAAAA
316 AAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTATTTTATG-AAAAACA
* * * * * * * * *
791090 AAAGCT-ATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGT
379 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGT
* * * * *
791154 AAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCTAAAATATTAATAACTTAGTATTA
444 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
791218 TTTTATTTCGAACAA-ACTTATATTAACAAAA
507 TTTTATTTCAAATAAGA-TTGTATGAAC-TAA
* * * * * *
791249 AGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTC
1 A-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * ** * **
791314 TTAACGATTTGAACTAATTCAGCAAATGTATTTATTTTTTAAATCTCTTAGC-TATTAATTTTTA
65 ATAACTATTT-AAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
791378 GAATATTACCT-AATTAGTATTACTTTATTCTGAATAAGCTTATAT-AAACAGAAACAATTGTTT
128 AAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGATA-A-AAACATTTGTTT
* * * * ** * *
791441 CATGATAGAACAAAAGTTTATAACAATTTGAAATAGAGAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTG
190 -ATGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
791506 AACT-AGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA---AA-AA-TTCTTGAAATATTAGT
253 AACTGA-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTT-TTAAAATATTAAT
* * * * * *
791565 AAATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCCTCTAT-ATTGAAAAGCAATTATTTTATAAGAAAAC
316 AAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAA-CAATTATTTTATGA-AAAAC
* * ** * * * * * *
791629 AAAATGTAATAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGTCATAATTATTTGAA-TTGATTTA
378 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTCA
* * * * *
791693 GTAAACTAATTTATTTTTTTAAATCTATTACTTATTAACTTTT-GAATTATTAATACA--A-CAT
442 GTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTAT
* *** * * *
791754 CATTTTATTTTGGATCAGTTTTTATGAAC-AA
505 TATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAACTAA
* * * *
791785 A-AATAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 ACAATTA-T-TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
791849 TATAACTACTTAAATTGGTT-TGATAAAAAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT
64 CATAACTATTTAAATT-GTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
** * * * * * *
791909 GGAATATTAATAGATTAGCATTATTTTCATTTCA-AACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTT
127 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-A-TTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTTG-T
** * * *
791973 TTATGACAAAACCAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAG--ATAATTATTA
188 TTATGACAAAA-CAAAAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * *
792036 GAACTGGTTAGGTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
252 GAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAATA
* * * * *
792101 AATTTATTTTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAAGA
317 AATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAACAATTATTTTATGA-AAAACA
* * * * * * * * *
792165 AATGGTCGTAATGATTTGAAATAGATAATTGCTT-ATATAGTTGTAGCTATTTAAACTGGTCCGG
379 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* * ** *
792229 CAAACAAATTT-TATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTATT-TTAT-TTCAAATGAACTT-GT
443 TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTAGAATATT--AAT-AAATTAGT
* ** *
792290 ATGA----ACAT-AAATAATTG-TTTTATG-A-TAGA
503 ATTATTTTATTTCAAATAA--GATTGTATGAACTA-A
* * **** * * * *
792319 ACAA-AAGGTTTATTTTTTAAA-ATAA---T-T---GATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGT
1 ACAATTA-TTTTA-TGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* ** * * * * * * ** *
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* * * ** * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * **
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* * * * * * * * *
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1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * ** * * *
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66 TAACTATTT-AAAT-TGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * ** * *
792952 AATCTTAATGAATCAGTATTATTTTATTCTA-AATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTTG-TTTA
* ** * * * * * *
793016 TGATAATGCAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTTTTCAAATGGACATGACTATTTGAA
191 TGACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * * *
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255 CTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAATAAAT
* * *
793145 TAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAG
320 TAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAG
* * * * * * *
793209 ATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTCGTTTAGTAAA
383 GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA
* * * * * * *
793273 TAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTA
447 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** ** * * *
793338 TTTTGAATAAGCCTATATGAATTGAT
512 TTTCAAATAAGATTGTATGAACT-AA
* ** * * * * *
793364 ACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAGTAGTTA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * * ***
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66 TAACTATTTA-AA-TTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * *
793492 AAATATTAATAAATTAATATTATTTCAATCCA-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTT
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTCAGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACATTTG-TTT
* * *
793556 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA-A-AAAATTTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTA
190 ATGACAAAACAAAAA-TCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
793619 AATTTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC-TAATTAGTTGTCT-AAATATTAAT
253 AACTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTT-T-TAAAATATTAAT
** * *
793682 AAATTTGTATTATTTTA--ATGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAC
316 AAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTATTTTATGA-AAAAC
* *** * * * *
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*
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442 G-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTA
* ** * * ** *
793871 TTTATGTTATTTTGAGTCAA-CTTGTGCGAAATAGAA
504 -TTATTTTATTTCAAAT-AAGATTGTATGAACT--AA
* ** * * * * **
793907 ACAATTGTTTTACAACAAAACAAATGGTTATAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTTT
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
*** * * * ** * *
793972 TAATTCT-TTTGTGTTGGTCAATTCAACGGATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATAAATTTTT
66 TAA--CTATTTAAATTGTTC-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTT
** * * * * * * *
794035 AGGATATTAATAGATTAGCATTACTCTATCTC-GAATAAGAC-TGTATCAATAGAAACAATTGTT
127 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCAGAATAAG-CTTGTAT-GATAAAAACATTTG-T
* ** * * * *
794098 TTATAACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTT
188 TTATGACAAAACAAA-AATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
794163 GAACTGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTAAT---TTTTAAAATATTAATA
252 GAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAAGTTTTAAAATATTAATA
* * * * * * *
794224 AATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAGCA-AAAACATTTGTTTTAAGACAAAACA
317 AATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA--ATAAAACAATTATTTTATGA-AAAACA
* * * * *
794288 AAAGGTCATAA-CAGTTTGAAATAGATAATTTTTCATATAGCCT-TAACTATTTCAA-TTGGTTC
379 AAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACTT-GTTC
* * * * *
794350 -GATAAA-AAATTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTA
441 AG-TAAACAAA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA
* * *
794413 TTATTGTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAA
504 TTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGAAC-TAA
* * * * * *
794447 ATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGCTATAATGATTTGAAATATACAAATT-TTCAAATAGTC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
794511 ATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACATTTTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGA
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* *
794576 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTAT
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGAT-AAAAACATTTG-TTTAT
* * * * * *
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192 GACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** ** * * *
794706 TGATTCAATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-CTCAATTTTTGAAATATTAATAAA
256 TGATTTGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAAT-AAGTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * *
794769 CTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA
319 TTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAA
* ** * * * *
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382 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAA
* * * * * * * *
794898 ACAGATTTATTTTTTTAAA-CTTCCTGCTTATTAATTTTTTGAGTGTTAATAGAA-GAGTGTTAT
446 ACAAATTTA-TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-AATTAGTATTAT
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508 TTTATTTCAAATAAG-ATTGTATGAACT-AA
* ** * * * * * *
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1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *
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66 TAACTATTTAAATTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* ** * * * * *
795119 ATATTATTAGTTTAGCAATA-TTTACTTC-GAATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTAT
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * * *
795305 GTATTATTTTATTTTGAATAA-TTTACATGAATAAAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGT
322 ATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTATTTTATGA-AAAACAAAAGGT
* * * * * ** * * * * ** *
795369 CATAATGATTTCAAACAAATAATAGTTTAAAT-GGAACGTGACTGTTTAAACTTATTTGGCAAA-
385 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA--TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC
** *
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448 A-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*
795497 ATTTCAAATAAAACTTGTATGAA
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795520 TAGAAACAAT
Statistics
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Alignment explanation
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *** * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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379 AGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCA-TAACTATCTCAAC-TGACTC
* * * * ** ** * * *
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* * * * * *
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504 ATTATTTTATTCCAA-TTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTTATG--ACAAAACAAAAGG
* * * * * * * * **
779812 TTATAA-AACTTTCAAAAAGATAATTGTTCAAACAGTTATAACTATTTGTA-TTAG-TCAGTTCA
566 TCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTCAG-AAA
* * * * * * *
779874 ACAGATTCATTTTTTAAATCCTTTACTTATTAA-TTTTGTAGGATATTAATAGAATAG-CATTAC
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * * *
780001 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAACCGGTTTAGTAAATAGATTTAC
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* * * * * * * *
780066 TTTGTAAATCTC-T--T-ATTCATTTTCAAAATATTAATCAATTA-ATATTATTTTATTTCAAAT
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*
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** * * * * ** ** * * *
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* * * *
780208 TTAACTATTTGAATTGGTTCAATAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTCGGTTATTAATTTTTAT
64 ATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTC--TTATTAATTTTTAA
* * ** * * *
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125 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTAT
* * * * *
780338 GACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT
190 GACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAAT
* * * * *
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255 TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAAT
*
780467 TAGTATTATTTTA-TTCAGAACAAGCTTGTATG-ATGAAAAAC-ATTTGTTTAATGACAAAACAA
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* * ** * * * **
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** * *
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*** * * *
780656 TTTTATTTTGGA-TAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAAGGTCATA
508 TTTTA-TTCCAATTAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
780717 ATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAACTTGTTCAGGAAACAAATTT
571 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAACAAATTT
* * * * **
780781 ATTTTTTTAAACTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA-AGAGTTTTATTTTATTTC-
636 ATTTTTTT-AA-TTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATAGA-AATTATTTTA-TTCA
* * * *
780844 GAATAAGAATGTATGAACT-GAAACAATTATTTAATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAA
697 AAATAAGAATGCATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAA
* * * *
780908 ATAGAGAATTATTTTA-AT-GATCTTAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACATATTGATTTTTTA
761 ATAGAGAATTA-TTCAGATAG-TCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGATT-ATTTTTTA
* ** ** * * *
780971 AATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAACATTAATAGTTTAGAAATATTTTACTTTGAATAAGCTTG
823 AATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAACAAACTTA
*
781036 TATGAA-TAGAA
888 TAAGAACTA-AA
* *
781047 ACAATTGTTTTATGACAGAATGAAAA-TCATTG-GATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACA-AAAGAAAAGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * ** *
781110 TAACTAATTGAAATGATTTTGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA-TCTCTTATTAATTTTTAAAATA
65 TAACTATTTGAATTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTCTTATTAATTTTTAAAATA
** *
781174 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTATTTTATGACA
129 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATGACA
* * * * * *
781239 AAATAAAATATCATAATGATTTGAAGTAGATAATAGTTTAAATAGACATGACTGTTTAAACTT-A
194 AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAA-TTGA
**
781303 TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
258 TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
* * * **
781368 ATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAAAGAAGATTG
323 ATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATTTTTTAATGACAAAAAAGAAGATCA
* * * *
781433 TAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTATCTGAACTTACTCAGTAAACAAAT
388 TAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGACTCAGTAAACAAAT
* *** * * * * * *
781498 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATCAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
453 TTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTCCA
* *
781563 ATTAAGCTTTTGTGAATAGAAACAATGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
518 ATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
*
781628 AGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAATAAATTTATTTTTTTAATT
583 AGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTTAATT
* ** **
781693 TTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATTTAAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGA
648 CTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATAGAAATTATTTTATTCAAAATAAGAATGCATGA
* * * * * * * * *
781758 ATAGAACCAATTGTTTGATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAGC
713 ATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGAGAATTATTCAGA
* * * * * *
781823 TAGTCATAACTATTTTAACTTATTCAGTAAATAGATTCTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTT
778 TAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGATTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTT
* * * * *
781888 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTTCAAACAAACTTATAAGAACTAAA
843 TTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAACAAACTTATAAGAACTAAA
* * *
781944 ACAATTGTTTTGTTACAAAAGAAAAGGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * *
782009 -AGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAACTCTTTTACTTATTAATTGTCA
65 TA-ACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAACTC---T-CTTATTAATTTTTA
* * * ** * * *
782073 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTTTGAATAGAAACAATTGTCTTA
124 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTAT-TT-
* * * * * * * * * *
782138 ATATTA-ATAAATC--TATATTAT-TTTATTTGAAATAAGCT--T-GTAT-GAATAGAAAAAATT
187 -TATGACA-AAA-CAAAAGATCATAATGATTTGAAAT-AGATAATAGT-TCAAATAGACATAA--
* ** * * *
782195 CT-TTTATAA-TAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAA-CAGT-CACA
245 CTATTTA-AATTGATTC---A-G-TA-A---A---CAAAT---TTATTTTTTAAATC--TCCA-A
* ** *
782256 ATTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTTTTGAATT
291 ATTA-TT-AA-TT-TT---T----AGAAT-A-TTAATAAA-----TTAGTATT-A-TTTT--ATT
* *
782321 AT-TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCCAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTCTTTT-AT
334 -TCAAACAAACTT-G-----------T----AT--G---A-AT--A--AAAACAATT-TTTTAAT
* * * * * * *
782383 GATAAAACAA-AAGGTCATAAAAGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGA
371 GACAAAA-AAGAAGATCATAACA-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCA
* * ** * * ** ** **
782447 TCT-AGTTTGGTAAACATATTTATTTTAAAAAAAAT-TTACTTATTAA-TTGTTGAAATATTAAT
434 ACTGA-CTCAGTAAACAAATTTATTTT-TAAAATCTCCAACTTAACAACTT-TTGAAATATTAAT
** ** * * * *
782509 AACTTAGCATTATTTTAATCTAGA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-GTTTATAACAAAA
496 AAAGTAATATTATTTTATTCCA-ATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAA
* ** * * * * *
782572 CAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TAGTT-
559 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTC
* * * * * * *
782635 TGATAAATAGA--T-TTTTTTTAAATC-T-CTTATTAA-TATTTGAAATATTAATAGATTAG-TA
623 AGA-AAACAAATTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGT-TTTGGAATATTAATA-AATAGAAA
* * * *** * * * * * *
782693 TTACTTTTTTTTATCAA-ACTTAT--ATGAACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAAATGGTC
685 TTA-TTTTATTCA-AAATAAGAATGCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * * * *
782755 ATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA-TTCAGACTGGTT-AGGTAAATA
748 AGAACGATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGA-ACTGATTCA-ATAAACA
** * *****
782818 GAATTATTTTTTAAATCTCTTA-TCTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTCCTTTTATTTTA-
811 G-ATTATTTTTTAAATCTCTTACTC-ATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTAC
* * *
782881 TTCCAAATAAGC-TAGTATA-AATTCAAA
874 TT-CAAACAAACTTA-TA-AGAACT-AAA
* * * * * *** * *
782908 AAAACATATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTC
1 ACAA-TTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * ** * * *
782973 TTAAATATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTTA
64 ATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ACTC-T-CTTATTAA-TTTTTA
* * * * ** * * *
783038 ATATTATTAGAT-TATTATTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATAAAAATAATTGTTT
124 A-AATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTT
* *** * * *** ** * * * *
783102 TATGATAGCGCAAAAGGTTATAATGATTTGTTGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
187 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTA
* * * * * ** * * *
783167 AACTGGTTCAGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACA-TATTAATTTTT-GAA-A--GATT
252 AATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATA
** * * * * * * *
783227 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGAATG-TTCAAATACAA-TTGTTATATGACCAAAC
316 AATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAAT-AAAAACAATTTTTTA-ATGA-CAAAA
* * ** * ** * *** *** * * * * * *
783290 AA-AAGGTAATAATGATTTCAAATAGTTAATTGTTGGCATGGCCATAATTATTTGAATTGATTTA
378 AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGACTCA
* ** * * *
783354 GTAAACAAATTCACTTTTT-AAA--T-C-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATT
443 GTAAACAAATTTA-TTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAAT-AA--AGTA--
**
783414 ATTATTATTTTATTTTGAA-TAAG-TTTGTATGAACT-GAAACAATG-GTTTTATGACAAAACAA
502 A-TATTATTTTA-TTCCAATTAAGCTTT-TATGAA-TAGAAACAATGAG-TTTATGACAAAACAA
** * * * * * * *
783475 AAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTCAAC-TACTTCA-A
562 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTCAGA
* * * * *
783538 CAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTATTGGAATATTATTAAATTAG-TATT
626 -AAACAAATTTATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTT-TTGGAATATTAATAAA-TAGAAATT
* ** * * * * * * *
783601 ATTTTATTTC-AAATAGGCTTGTATG-ATGGAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGTTC-G
687 ATTTTA-TTCAAAATAAGAATGCATGAATAG-AAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAG
* * * * * * * * * **
783663 TAA-GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATGGCCAAAATTATTTGAAC-CAGTTTGATAAACTA-
750 -AACGATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCAATAAAC-AG
* * * * * * ** *
783725 ACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTCT-AAATATTAATAAAGTA-ATGTTATTTTAT
812 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTT-TAAAACATTAATAAATTAGA-AATATTTTAC
* * * * * *
783788 TTCAGATAAGCTTTTATGAACTGAA
874 TTCAAACAAACTTATAAGAACTAAA
* * * * * * **
783813 TCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAT-TTATTTTAAATAGATAA-TAGTTCAAACAAC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCAT-TGTGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGT
* * * * * *
783876 CATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTGTTGTTTATTAATTTTT
63 CATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAA-CT-CT-CTTATTAATTTTT
* * * * * * * ** *
783941 TAATTGTTAATAAATTAGTCTGATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACTGAAAA-AATTATTT
123 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAAC-AAAAACAATTATTT
* * * * * * * * * *
784005 TATGACTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTCTTAATTATTTG
187 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTA
* * * * ** * * *
784069 AACTAATTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTAGAATACT-ATCA
252 AATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT-A
* * * * * * ** * * * * *
784133 ATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGTTTGCACGAATATAAACAATTGTTTT-ATGACAATACA
316 AATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATT-TTTTAATGACAAAAAA
* * * * * **
784197 -AAGATTATAACGATTT-AAGATAGATGATTATTCAAATAATCATAACTAT-TACAATTGGTTCA
380 GAAGATCATAACAATTTGAA-ATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCT-CAACTGACTCA
* * * ** * * * **
784259 ATAAACAGATTTAGTCTTT-AAATCT----CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTGGTATT
443 GTAAACAAATTTA-TTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATT
** * * * * * * * *
784319 ATTTTATTTTGAA-TAA-TTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTA-CAGCAAAATATAATGTTA
507 ATTTTA-TTCCAATTAAGCTTT-TATGAATAGAAACAATGAGTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCA
* * * ** * * *
784381 TAACGATTTAAAATAGATAATAGCTT-AAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTCATG--AACA
569 TAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAACAG-TCATAAATATTTGAACGTGTTCA-GAAAACA
* ** ** * * ** *
784442 AATTTATTTTTTAAATCTCCAACTGGTAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTAT
631 AATTTATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTTTA-
* * ** * * * * **
784506 TTC-GAATAA-ACTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGATCATAGTGATT
693 TTCAAAATAAGA-ATGCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATT
* * * * * ** * *
784569 TGGAATAAATAATTGTTCA-AGTTGTCATAACTATTTGAACTCGCCT-AGTAAATAGATTTATTT
757 TGAAATAGAGAATTATTCAGA-TAGTCATAACTATTTGAACT-GATTCAATAAACAGA-TTATTT
* * * ** * * *
784632 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAA
819 TTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTT-CAAACAA
* * * * *
784696 GCTTTTTTATAAATAGAA
883 AC-TTATAAGAACTA-AA
* * * * * **** *
784714 AAAATTG-GTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* ** * * * * * *
784778 TAACTATTTGAACATGTTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAATTTTACTTATTAATCTTTCAAAT
65 TAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCT-CTTATTAATTTTTAAAAT
*** * * * * *
784843 ATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCCTACATGAATAGAACCAATTATTTTATGA
128 ATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
* * * *
784907 CAAAACAAAATG-TCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAAC
192 CAAAACAAAA-GATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTT-AA-
* * * ** * *
784970 A-TG-TTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAATTTTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAA
253 ATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA
** * * ** * *
785033 TTAGTATTATTTTATTTCAAATGAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTT-ATTACGAAACAA-
318 TTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATT-TTTTAATGAC-AAAAAAG
* * ** * * * * * * * **
785096 AAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTG-TTCAAA
381 AAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAAC-TGACTCAGT
* * * ** ** * *
785160 AAACATATTTGTTTCTTAAAAGT-T--TACTTATTAA-TTGTCAAAATATTAATGAATTAATATT
445 AAACAAATTTATTT-TTAAAA-TCTCCAACTTAACAACTT-TTGAAATATTAATAAAGTAATATT
* ** * * * * *
785221 ATTGTAATTTGAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
507 ATT-TTATTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
785285 A-GAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT-AAGATTTGAACTTGTT-TGATAAACAAAT
571 ATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGA-AAACAAAT
* * * * ** *
785347 TTATTTTTTAAATGTTTTACCTATTAATTGTCTTT---ATATTAATAGATTTATATTATTTTATT
634 TTATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAA--GT-TTTGGAATATTAATAAATAGAAATTATTTTATT
* * * * * * ** * * * *
785409 CAAAATAA-ACTTGTACGAATAGAAAAAAATCATTTTACAAGAAAAC-AAAGGTTATAACAATTT
695 CAAAATAAGA-ATGCATGAATAG-AAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTT
* * * * * * * * ** * *
785472 CAAAAAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTAATAAAACTTG-TTCAACAAACAAATTCATTTTT
758 GAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAACAGATT-ATTTTT
* * * * * * * * * * *
785536 TAAAACTCTTAATTATTAATTTTCT--AATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
821 TAAATCTCTTACTCATTAATTTT-TAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAACAAAC
* *
785599 TTATACA-AATTGAA
885 TTATA-AGAACTAAA
* * * * **
785613 ATAATT-TTTTTTCACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * ** *
785677 TGACTATTTG-ATCTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTACTAATTGGTGA
65 TAACTATTTGAAT-T-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAA-CTCT-CTTATTAATTTTTAA
* *** * * ***
785741 AATATTAATAAATTAG---TATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAATGGAAACAATTATTTTAT
125 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTAT
* * * * * * *
785803 -ATCAACACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
190 GA-CAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAA
* * *
785867 CTGGTT-AGGTAAATAGAA-TTA-TTTTTAAATC-CC---TTATTAATTTTT-GAAATATTAATA
254 TTGATTCA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATA
* * * * * * * * ** * *
785924 AATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCATATAGTC
316 AATT-AGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGA-AT-AAA-A-ACAATTTTTTA-AT-GAC
** * * * ** * * ** ** * *
785988 -TTAAA-TA-TTTA-AACTGGTTTGGCAAACAAATTTATT-TTTTAATTTTCTTAGCTAT-T-AA
374 AAAAAAGAAGATCATAAC-AATTT-G-AAATAAA-TAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAA
* ** * ** ** ** ** * ** * * *
786046 -T--TTTTGGAATA-TTATTATATTAGTATTAT-TTTATTCTGGATAAGC--TTG---TATGAAC
435 CTGACTCAGTAA-ACAAATT-TATTTTTAAAATCTCCA-ACTTAACAA-CTTTTGAAATATTAAT
** * ** * *
786101 AAA--AATAATTATTTTATGGC-A--GAGC----A--AA-AGGTTATAATGA--TT-TGA-AGTT
496 AAAGTAAT-ATTATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAATA-GAAACAATGAGTTTATGACA--A
* ** * *
786150 TACAATTGTTCA-AAT-AGTT---AT--AT-A-T-TT------G------A-A-TT-AA----TT
557 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTT
* * * * * *
786186 CA-ACAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAG-T
622 CAGA-AAACAAATTTATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGAA
*** * ** * * * * *
786249 ATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGAATG-ATCAAAAACAATT-GTTATATGACCAAACAAAAGGC
684 ATTATTTTATTCAAAATAAGAATGCATGAAT-AGAAACAATTATTTA-ATGACAAAACAAAAGGT
* *** * * * * * * * * * * *
786312 CATAATTTTTTATAAACAGATAATTGTTCATATAATCTTAATTATTTAAACTGCTTCAGTAAACA
747 CAGAACGATTT-GAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACA
* * * * * ** ** * *
786377 GATTTATTTTTTACATCTCTTAATTATCAAATTTTGGAATGTTATTAAATTA-ATATTATTTTA-
811 GA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGA-AATATTTTAC
* * * *
786440 TTCCAAATAAGCTTATATGAACTGAA
874 TT-CAAACAAACTTATAAGAACTAAA
* * * * * * ** *
786466 ATAATTATTTTATAACATAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA---A
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * *
786528 -AA--A-CTG----GTTCAATAAATAAA-TT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
65 TAACTATTTGAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTC-T-CTTATTAATTTTTAAAA
* * ** ** * *
786583 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAT-AGCTTTTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGG
127 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * *
786647 C--AACAAAAGTTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATGGACATAA-TCATTTGAAG
192 CAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACT-ATTTAAAT
**** ** * *
786708 TGATTTC-GATAAACTGGCTTATTTTTTAAATCT-TTAATTTTTTATTTTT-GAAGTATTAATAA
255 TGA-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAA
* * * * ** * * * * *
786770 AGTAATGTT-TTTTATTTTGAAA-ATGCTTTTGTGAACTGAAAACAATCATTTT-ATGATAAAAC
317 ATTAGTATTATTTTA-TTTCAAACAAACTTGTATGAA-TAAAAACAAT-TTTTTAATGACAAAA-
* * * * * * * * *
786832 AA-AAGGTCAT-AC-TTCTTATAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-T
378 AAGAAGATCATAACAAT-TT-GAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAAC-TGAC
** * * * ** * ** * * * * *
786893 TTGGTAACCAAATTTATTTTTTAAATTTCTTATTTATTAATTTTTTACATGA-TAATAAATTAGT
440 TCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAAT-ATTAATAAAGTAAT
* * * * * * ** *
786957 ATTATTTTATTTCGAA-TAAGCATGTATGAACT-GAAA-AACTTATTTTATAATTAAATAAAAGG
504 ATTATTTTA-TTCCAATTAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * ** * * * * *
787019 TTAGAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTGTTTGAAC-TAATTC-GACAAA
566 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTCAGA-AAA
* * * * * * **
787082 CACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTCACAA-TATTTT
629 CAAATTTATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATAGA-AATTATTTT
** ** * * * * * * *
787146 ACTT-TGAATAAGCTTGTATCAACA-AAAGCAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAA
692 A-TTCAAAATAAGAATGCATGAATAGAAA-CAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGA
* * * * * * * ** * *
787208 TTTGAGATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTAGTT
755 TTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGA-TTATTT
* * * * * *
787273 TTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--TAT-GAATAA
819 TTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACT-TCAAACAA
** *
787331 TTTTGTATA-AA-TAGAA
883 ACTTATA-AGAACTA-AA
* ** * * ** * * *
787347 ATAATTGTTTTACAACAAAATAAAATATCATAACT-ATTTGAAATAGATAA-TAGCTCAAATGGA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCAT-TGTGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGT
* ** * * * *
787410 CATGACTATTTGAACTT-TTTGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTA
63 CATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CT-C-TCTTATTAATTTTTA
* * ** ** * * * *
787474 GAATATTAAAAAATTAGTATTATTTT-TATTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAGCAATTATTTT
124 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTT
* * * * * *
787538 ATGACAAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTAA
188 ATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAA
* * * * *** * *
787603 ACTCACTCGGTAAA-AAGATTTATTATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTA-AAAATTTAA
253 ATTGATTCAGTAAACAA-ATTTA-T-TTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATA-TTAA
* * * * * *
787666 TAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAA-AAGAAACAATTAGTTT-ATGAC-AA
314 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAA-AAACAATT-TTTTAATGACAAA
* ** * * * * * *
787728 AATGAA-ATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAATTATTTGAACGTG-
377 AAAGAAGA--TCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAAC-TGA
* ** * * *** ** * * * *
787791 TTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA
439 CTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAA-CTTTTGAAATATTAATAAAGTAA
** * ** * * *
787855 TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATA-AAACTAATTG-TTTTATTACAAAACTAAAGG
503 TATTATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAAC-AA-TGAGTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * *
787918 TCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAA-ATGTT-TGAGAAA
566 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTT-GAACGTGTTCAGA-AAA
* * ** * * * * *
787981 CAAA-TTAATTTTTTAGTTCTCTTACACATT-ACTTTTCGAATATTCATGAATTAG-TATTATTT
629 CAAATTTATTTTTTTA-AT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAAT-AAATAGAAATTATTT
** ** * * * * * *
788043 TATTTC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAACTATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAA-T
691 TA-TTCAAAATAAGAATGCATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACG
* * * * * * *
788105 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAAAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTTAT
754 ATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAACAGA-TTAT
* * * * * *
788169 TTTTTAAATGT-TTTCTTATT-ATTTGTTGAAATATTTATAAATT---AATATTATT--TT----
817 TTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTT-TTAAAACATTAATAAATTAGAAATATT-TTACTTCAAA
*
788223 --AA--TAT--GAA--GAA
880 CAAACTTATAAGAACTAAA
* * * * ** *
788234 GC--TTG---TATG--AATAG-AAA--CA-----ATTTAAAATAAATAATTGCTCAATTAGTCAT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * * *
788284 AAGGATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAGATATTTTACCTATTAATTGTCTT--
66 AACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTA-A-ACTCT-CTTATTAATT-T-TTAA
* * * * * *
788347 AATATTAATAAGTT-GTATTATTTTA-TTTGTAACAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATCATTTG
125 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGCATGAACA-AAAACAATTATTTT
* * * *** * * * *
788409 GTGACAAAAGAAAA-AGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTA
188 ATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTA
* * **
788473 AACTTG-TTC-GATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCGTAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT
252 AA-TTGATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * ** * *
788536 AACTTAGTATTATTTTATTTCGAATATGC-TGATATGAACT-AAAATAATTTTTT-ATAACAAAA
315 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTG-TATGAA-TAAAAACAATTTTTTAATGACAAAA
* * * * * * * * * * *
788598 CAA-AAGGTCATAAAAGATTTGAAATAAATACTTATTTAAATAGTCATGACGATTTGATCT-AGT
378 -AAGAAGATCATAACA-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGA-C
** * *** ** * *
788661 TTGGTAAAC-CATTTATTTTTTAAAAT-T-TTGCTTATTAA-TTATTGAAATATTAATAAATTAG
440 TCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTT-TTGAAATATTAATAAAGTAA
*** ** *
788722 TATTATTTTAATTTTGA-TAAGCTTTTATGAATAGAAATTAT-TGTTT-TGTA-ATAGAACAAAA
503 TATTATTTT-ATTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTTATG-ACA-A-AACAAAA
** ** * * * * * * * * *
788783 --AAATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTAATAACTTTTTGAATGAGTT-TGATAA
564 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGA-AA
* * * * * * **
788845 ACAGATTTA-TTTTTTAAATC-TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTGGCATTATTTTA
628 ACAAATTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATAGAAATTATTTTA
* * * ** * * * * * * *
788907 TTCTAAACAA-ACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATT
693 TTCAAAATAAGA-ATGCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATT
* * * * * * *
788971 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGATT-AGGTAAACAAAATTATTTT
757 TGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCA-ATAAAC-AGATTATTTT
* * * *** * *
789035 TTAAATCTCATACAT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCCGAA-T
820 TTAAATCTCTTAC-TCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATT-AGAAATATTTTACTT-CAAACA
* * * *
789096 AAGTTAGTATGAAGTGAA
882 AACTTA-TAAGAACTAAA
*** * * * * * *
789114 ATTTTTGTTTTATGACAAAACAAAA---A---TGATTTGAAATAGATAAATGTTCATATAGCCTT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * **
789173 AACTATTTGAACTAGTT-TGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTATTAATTTTTGGA
66 AACTATTTGAA-TTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTC--TTATTAATTTTTAAA
** * * * * *
789237 ATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATG
126 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATG
* * * * * * * * * * * * * * *
789302 ATAGAATAAAAGGTTATGACGGTTTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACT
191 ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAATT
* * * ** * *
789367 -AGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAACATTAATAAA
256 GA-TTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA
* * * * ** * * * *
789430 TTACTTTTCTTTCATTTTGAATAAACATGTATG-ATAAAAAACAA-TTGTTATATGACCAAATAA
318 TTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAAT-AAAAACAATTTTTTA-ATGA-CAAAAAA
* * ** * * * * * * * * * *
789493 -AAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATT-GTCGAAATGGA-CATAATTATTTGAACTAATTTA
380 GAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTC-AAAT-AATCATAACTATCTCAACTGACTCA
* * * * ** ** * *
789555 GTAAATAGATTCACTTTTT-AAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
443 GTAAACAAATTTA-TTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATT
** * ** ** * * *
789619 ATTTTATTTTAACTAAGCTTGCATGAATTCAAACAATTG-TTTTATGACAAAGCAAAAAGTCATA
507 ATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** **
789683 ATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTT--G-GGACAAATTT
571 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAACAAATTT
* * ** * * * * ****
789745 A--TTTTAAACTCTTGTTTATTAATTTTTGTAAGA--AAT---TA-ATATTATTTTATTTTGGAT
636 ATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATAGAAATTATTTTATTCAAAAT
** *** * * * * * * * * *
789802 AAGCTTTTGTGAACTA-AAACAAATGTTTTATGTCAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAA
701 AAGAATGCATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAG
* * * * * *** *
789866 ATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAATTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTCAAATCA
765 AGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAA-CTGATTCAATAAACAGA-TTATTTTTTAAATC-
* ** * ** * * * * * *
789930 T-TTCCTTTTTAATTCTTT-GAATGTTAATAAATTTAG-ATTCTTTTA-TTCCGAATAAGCTTGT
827 TCTTACTCATTAATT-TTTAAAACATTAATAAA-TTAGAAATATTTTACTT-CAAACAAACTTAT
789991 AAGATA-TGAAA
889 AAGA-ACT-AAA
* * * * *** *
790002 A-AAATATTTTATTACTAAAA-AAAAGGTTAGAATGATTTAAAATAGATAATTATT-ATAATAGT
1 ACAATTGTTTTATGAC-AAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGT
** * * *
790064 TTTAACTATTTGAATTGACTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
63 CATAACTATTTGAATTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTC-T-CTTATTAATTTTTA
* **** * ** * *
790129 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTGTA-ACCAAATAAG-TTTCTATGATTAGAAACAATTGTTT
124 AAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTTTGAATAAGCTTGC-ATGAACAAAAACAATTATTT
* * ** * * * *
790192 TATGACAAAAC-ATAGATCTTAACAATTTGAGATTA-ATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTT
187 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGA-AATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTT
* * * * * *** * *
790255 GAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAATTTT-GAAATATTAAT
251 AAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAAT
* * * * *
790319 AAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGA-TTGTATCATAAAAAAATAATTGTTTT-ATGACAAA
315 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAA-ACTTGTATGA-ATAAAAACAATT-TTTTAATGACAAA
* * * * ** * * * * *
790382 ACAA-AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAAAT-GGCTATAATTATATTAACTAAT
377 A-AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATC-ATAACTATCTCAACTGAC
* * * * *
790445 TCAATAAACTAATTTA-TTTT----T-T---A-GT---AA-----G---TATTAATAAATTAGTA
440 TCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATA
* * * * *
790489 TTATTTTAAT-CAATCTAAGCTTGTATTAACTA-AAACAAATG-TTTTATGACAAATC-AAAGTG
505 TTATTTTATTCCAAT-TAAGCTTTTATGAA-TAGAAAC-AATGAGTTTATGACAAAACAAAAG-G
* * * * * * * * * * * *
790550 TTATAACGATTTTAAATTGACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACA
566 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAACA
* * * * * * * * *
790615 GATTTATTTTTTAAATCTATTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAG-TATTAATTTAT
631 AATTTATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTTTAT
** * ** * * * * * * * *
790679 TCTGACTAAGCTTGTATAAACT-GAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAATGTCAAAACGATTT
694 TCAAAATAAGAATGCATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTT
* * * * * * * *
790743 CAAATAGATAATTATTCTA-ATAATCTTAACCATTTGAACTGATTCGATAAATAAATTTATTTTT
758 GAAATAGAGAATTATTC-AGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGA-TTATTTTT
* * ** * *** * * * *
790807 TAAATTTCTTACTTATT-ATTTTTTGAACAATTATTAAATTAGTGTTATTTTA-ATAAGAATAAG
821 TAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAAC-ATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCA-AACAAA
* *
790870 CTTGTATGAAC-AAA
884 CTTATAAGAACTAAA
* * *** * * **
790884 ACAATTATTTTACGACAAAAGAAAAAGGTCATAACGATTTGGAATAGATAATCATTCATGTAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAG-AAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* ** ** * ** * *
790949 TTAACTATTTGAATTGGTTCAACAATTAGATTTATTATTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT
64 ATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAAATTTA-T-TTTTTAA-ACTC-T-CTTATTAATTTTT
** * * * ** * * ** * * *
791014 GGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAACAGGACCAATTGTTTA
123 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTT
* * * *
791079 ATGTA-AAAAAAAAAGCT-ATAATGATTTAAAATAGATAATTA-TTCAAATA-ATCAAAACTATT
188 ATG-ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAGA-CATAACTATT
* * * * * ** *
791140 TGAAA-TGGTTTAGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCT-CTTATTGATTAATTTTCTAAAATATT
250 T-AAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATT-ATTAATTTT-TAGAATATT
* * * * *
791203 AATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATTAACAAAAAGCAATTGTTTT-ATGACA
312 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAA-CAATT-TTTTAATGACA
* * * * * * * *
791267 AAACAA-AAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACGATTTGAACTAA
375 AAA-AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGA
* * *** * * * ** * * *
791331 TTCAGCAAATGTATTTATTTTTTAAATCTCTTAGC-TATTAA-TTTTTAGAATATTACCT-AATT
439 CTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTC-CAACTTAACAACTTTTGA-AATATTA-ATAAAGT
* * * * * * * * *
791393 AGTATTACTTTATTCTGAA-TAAGCTTATATAAACAGAAACAAT-TGTTTCATGATAGAACAAAA
501 AATATTATTTTATTC-CAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTT-ATGACAAAACAAAA
* * ** * * * * ** *
791456 GTTTATAACAATTTGAAATAGAGAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTAA
564 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTCAGAAA
* * * * * * *
791520 ACAAATTTA-TTTTTTAAATC-T-CTTA-AAAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAG-TATTGTTT
628 ACAAATTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTT-TTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTT
*** ** * * * * * * *
791580 TATTTTGAATAAGCCT-C-T-ATATTGAAAAGCAATTATTTTATAAGAAAACAAAATGTAATAAC
691 TATTCAAAATAAGAATGCATGA-ATAG-AAA-CAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAAC
* * * * * * * * * * *
791642 AATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGTCATAATTATTTGAATTGATTTAGTAAACTA-ATTTA
753 GATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAAC-AGA-TTA
* * * * * * * *
791706 TTTTTTTAAATCTATTACTTATTAACTTTT--GA-ATT-ATTAA-TACAACATCATTTTATTTTG
816 -TTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAA-AT-ATTTTA-CTTC
* * ** * * *
791766 GATC-AGTTTTTATGAACAAAA
877 AAACAAACTTATAAGAACTAAA
* * **** *
791787 ATAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * **
791851 TAACTACTTAAATTGGTT-TGATAAA-AAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTTATTAATTTTTGGAA
65 TAACTATTTGAATT-GTTCAG-TAAACAA-ATTTATTTTTTAAACTCTCTTATTAATTTTTAAAA
* * ** * * ** * *
791913 TATTAATAGATTAGCATTATTTTCATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATG
127 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATG
* * * * * *
791978 ACAAAACCAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAG--ATAATTA-TTAGAAC
191 ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTA-AAT
* * * ** *
792040 TGGTT-AGGTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAA
255 TGATTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA
* ** * * * *
792103 TTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTT-ATGACAAAAGA
318 -TTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAA-TAAAAACAATT-TTTTAATGACAAAA-A
* * * ** * * * * ** * * * *
792165 A-ATGGTCGTAATGATTTGAAATAGATAATTGCTT-ATATAGTTGTAGCTATTTAAACTG-GTCC
379 AGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGACT-C
* * ** * ** *** * * *
792227 GGCAAACAAATTTTATTTTT-AAATCTCTTAGTTATTAA-TTTATTTTAT-TTCA-AATG-AA-C
442 AGTAAACAAA-TTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTT-TGAAATATTAATAAAGTAATA
* * * * * * * *****
792286 TTGTATGA-ACATAAATAATTG-TTTTATG-ATAG-AACAA-AAGGTTTAT---TTTTTAAAA--
505 TTATTTTATTC-CAATTAA--GCTTTTATGAATAGAAACAATGA-GTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * *
792341 T-A-ATTGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTTC-GATAAA
566 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTCAGA-AAA
* * * * * * * *
792402 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATCAATTAG-TATTATTTA
629 CAAATTTATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAAT-AAATAGAAATTATTTT
* ** * * * * * * *
792466 ATTTC-GAATAA-CTTGTATGACA-AAAAACAATT-GTTATATGACTAAACAAAAGGTAATAACA
692 A-TTCAAAATAAGAATGCATGA-ATAGAAACAATTATTTA-ATGACAAAACAAAAGGTCAGAACG
* * * * * * * *
792527 ATTTGAAATAGATAATTGTTAAGATGGCCATATCTATTTGAGCTTG-TTCAATAAACATATTTAT
754 ATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAACAGA-TTA-
* * * ** ** * * **
792591 TTTTTTAAATCTATTGCTTATTAATTTTTTGAATTTTAATAAATTAG-TATAATTTTATTTTGAA
816 TTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAAT-ATTTTACTTCAAA
* * * * * **
792655 TAAGCATGTATGAACCGAA
880 CAAACTTATAAGAACTAAA
* * * * *** * * * **
792674 ATAATTGTTTTTTGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * *** *
792739 TAACTATTT-AA--GCT-AGT--TC---GGCA------AAA-T-TCAT-TTAA-TTTT----TAT
65 TAACTATTTGAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTCTTATTAATTTTTAAAATAT
* * * ** ** *
792781 TATTAAATTAGTATTATCTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACA
130 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAA-AAACAATTATTTTATGACA
* * * * * * *
792845 AAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATATATAATTA-TTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACT-A
194 AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAATTGA
* * ** * * * * * *
792907 TTTCGGTAAACAGATTTGGTATTT-AATGCT-C---TTATTAATTTTCAAAATCTTAATGAATCA
258 -TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
* ** * * **
792967 GTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT-ATGATAATGCAA-AA
321 GTATTATTTTATTTC-AAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATT-TTTTAATGACAA-AAAAGAA
* ** * * * * * * * * * **
793029 GGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTTTTCAAATGGA-CATGACTATTTGAACTTATTTGGTAA
383 GATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT-AATCATAACTATCTCAACTGACTCAGTAA
* * * ** * *
793093 ACATATTTATTTTT-AAATCTCCTACCTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTT
447 ACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATTT
** * * * * *
793156 TATTTTGAA-TAAACTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACT
511 TA-TTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-T
* * * * * * * *
793218 -ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAGC-TCGTTTAGTAAATAGATTCA
573 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTCAGAAAACAAATTTA
* * * * ***
793281 TATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-AATTATTTTATTTTGAA
637 TTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTTTATTCAAAA
** ** * * * * ** * *
793345 TAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
700 TAAGAATGCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAG
* * * * *** *
793410 ATAATTATTCA-AGTAGTTATGACTATTAGAACTTG-TTTGGTAAACATATT-TATTTTTAAATT
765 AGAATTATTCAGA-TAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAACAGATTAT-TTTTTAAA-T
* * * *** * * * * * * * *
793472 TTTTTACTTATTAATTGCCAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTCAATCCAAATAAGCTTGTA
826 CTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGA-AATATTTTACTTCAAACAAACTTATA
* *
793536 TGAACAAAA
890 AGAACTAAA
* * ** * * *
793545 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA-A-AAAATTTGTTCAAAAAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAA-GAAAAGTCATTGTGATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTC
* * ** * * * *
793608 ATAACTATTTAAATTTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTTTTACTAATTAGTTGTCT
64 ATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTCTTATTAATT--TT-T-A
* * * *
793672 AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTA--ATGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTT
124 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGCATGAACA-AAAACAATTATTT
* * *** *
793734 TATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAA-ATGTTCAAAGAGTAGC--AACTAT
187 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATA-GTTCAAATAG-A-CATAACTAT
* * ** *
793796 TTGAACTTGA-TC-GATAAACAGATTTAGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATA
249 TT-AAATTGATTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATA
* * ** ** *
793858 TTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTTTGAGTC-AACTTGTGCGAAATAGAAACAATTGTTTTACA
310 TTAATAAATTAGTA-TTATTTTA-TTTCAAACAAACTTGTATG-AATAAAAACAATT-TTTTA-A
* * * *** * * * * ** **
793921 --ACAAAACAA-ATGGTTATAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTTTTAA-T-TCTTT
370 TGACAAAA-AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCA
** ** * * ** * * ** * *
793981 TGTGTTGGTCAATTCAACGGATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATA-AA-TTTTTAGGATATT
434 ACTG--ACTC-AGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTC-CAACTTA-ACAACTTTTGA-AATATT
* * ** * * * * * * *
794043 AATAGATTAGCATTACTCTATCTCGAA-TAAGAC-TGTATCAATAGAAACAATTG-TTTTATAAC
493 AATAAAGTAATATTATTTTAT-TCCAATTAAG-CTTTTATGAATAGAAACAA-TGAGTTTATGAC
* * * ** * *
794105 AAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAAC-TG
555 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-
** * * * * * * **
794169 GTTTGGTAAATAGATTTA-CTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-A
619 GTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGA
* *** * * * ** * * *
794230 TATTATTTTATTTTGAACAA-ACT-TATTTGAGCAAAAACATTTGTTTTAA-GACAAAACAAAAG
683 AATTATTTTATTCAAAATAAGAATGCA--TGAATAGAAACAATT-ATTTAATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * * * *
794292 GTCATAAC-AGTTTGAAATAGATAATTTTTCATATAGCCTTAACTATTTCAATTGGTTCGATAAA
745 GTCAGAACGA-TTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAA
* * * * * * * * * * *
794356 -AAATTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTGT
809 CAGA--TTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTT
* * * *
794420 A-TTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-ATAA
872 ACTT-CAAACAAACTTATAAGAACTA-AA
* * * * * ** * *
794447 ATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGCTATAATGATTTGAAATATACAAATT-TTCAAATAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTC-ATTGTGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTC
* ** *
794511 ATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACATTTTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGA
64 ATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CT-CT-CTTATTAATTTTTAA
** * * ** *
794576 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTAT
125 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTAT
* * * * ** * *
794641 GACAAAACAAAAGATCTTAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTGATAATTATTTGAAT
190 GACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAAT
* * * * * *
794706 TGATTCAATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTT-GAAATATTAATAAAC
255 TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAAT
* *** * * * * ** *
794770 TAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAATTGAAACAATTGTTTT-ATGATAAAACAA-A
319 TAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATT-TTTTAATGACAAAA-AAGA
* * * * * * * * * **
794833 AGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGATA
382 AGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGACTCAG-TA
* * ** ** * * * * *
794897 AACAGATTTATTTTTTTAAA-CTTCCTGCTTATTAATTTTTTG-AGTGTTAATAGAAG-AGTGTT
446 AACAAATTTA-TTTTTAAAATC-TCCAACTTAACAA-CTTTTGAAATATTAATA-AAGTAATATT
* * * * * * * ** * *
794959 ATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATTATTAAACAAAAGGTTAGA
507 ATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * *
795023 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAATCTTAACTATTTGAA-TTGATTCAGTAAACACATT
571 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTG-TTCAGAAAACAAATT
* * * * ** *
795087 GATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-AAATATTATTAGTTTAGCAA-TA-TTTACTTC-
635 TATTTTTTTAAT-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATA-AATAGAAATTATTTTA-TTCA
* ** * * * * * * * ** * *
795147 GAATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGAC-AAA-TAAAGATCCTAATGATTTGAGA
697 AAATAAGAATGCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAA
* * * ** * * *
795210 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATT-TGTAAACAAATTTAGTTTTAAAAT
762 TAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGA-TTATTTTTTAAAT
* * * * * ** * * * *
795274 CTC-T--T-ATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAATTTACAT
826 CTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAACAAACTTATAA
795333 GAA-TAAAA
891 GAACT-AAA
* * ** * * * * * *
795341 ATAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCATAATGATTTCAAACAAATAA-TAGTTTAAATGGAA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-T
* * * * * ** *
795405 CGTGACTGTTTAAACTTATTTGGCAAA-ATAGATTTATTTTTTAAA-TCTCCAAATTATTAATTT
63 CATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACA-A-ATTTATTTTTTAAACTCT-C---TTATTAATTT
* ** * * * *
795468 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTA-
121 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGCTTGCATGAACAAAAACAATTAT
* * ** * * * * * * * * *
795532 ---AT--------AAGAGAT--TTATTTTTTGAACT--CT-CTCGGT-AAATAGA-TTTATTTTT
185 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATT
** * ** * * *
795579 TAAATCT--TT---T--ACTTATTGATTTTTGGAAT-T-----TTAATAA--ATTAG--TATTAT
250 TAAAT-TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAA
** * * * *** * *** ** * ** *
795627 TTTATTCGAAATAAGCTATTAT-GAACAAAACCAATA-GGTTTATGACAA------AA-CA-AAA
314 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAAC-AAACTTGTATGAATAAAAACAATTTTTTAATGACAAA
* * * * * * * **
795682 ---G--G-TCATAACGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTT
377 AAAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTG-ACT
* * * *** ** * * *
795740 CAGAAAATAAATTTATTTTTAAGAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTAA-A
441 CAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAA-GTAATA
** ** * * * *
795803 TTATTTTATTTGGAA-TAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTATTTTATGATAAAACAAAA-GTCA
505 TTATTTTA-TTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * *
795866 TAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCA-AAACTATTTGAA-ATATTTTAGTAAATAG
569 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAA-TATTTGAACGT-GTTCAGAAAACAA
* * * * * *
795929 A--T-TCTTTTTAATTGTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAG-TATTATTTTAT
632 ATTTATTTTTTTAA-T-TCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTTTAT
** * ** * * * * * * *
795990 T-AAAGCAA-ACTTATATAAACT-GAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAAAAGTCATTAATGAA
694 TCAAAATAAGA-ATGCATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCA-GAACG-A
* * * * * *** *
796052 TTTGAAATAGATAACTATTCAAATAGTTATGACTATTTTGAACTTG-TTTGGTAAAACATATTTA
755 TTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTA-TTTGAAC-TGATTCAAT-AAACAGA-TTA
* * * * * * * * *
796116 TTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAA
816 TTTTTT-AAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACT-TCAA
* * *
796181 ATAAACTTGA-ATGGA-TAGAA
879 ACAAACTT-ATAAGAACTA-AA
*** * ** * * *** ** *
796201 AGTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCA-T-AAAGTTGAAATAAATAATTGCACTTATAATCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAA-GAAAAGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* ** * *
796264 TAA-TGATTTGAACTTATTTTGATAAA-AAAATTATTTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTATCT
65 TAACT-ATTTGAA-TTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTT-AAA-CTCT-CTTATTAATT-T-T
* * * * * *
796327 T--AATATTAATAAATTTGTAATATTTTA-TTTGAAATAAGGTTGTATGAATAGAAAA-AATTCT
122 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGCATGAACA-AAAACAATTAT
* * * * **** * * * *
796388 TTTATAACAAAACAGAAGGTTATGGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
185 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATT
* * * *
796453 TAAACTTG-TTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATC-CCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTA
250 TAAA-TTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCC-AAATTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * * *
796516 ATAACTTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TGATATG-ATCTAAAACAATTTTTTTATGGCAA
313 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTG-TATGAAT-AAAAACAATTTTTTAATGACAA
* * * * * * * *
796579 AACAA-AAGTTCATAACAATTTGAAATAAATACTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCT-AG
376 AA-AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGAC
** * *** ** * * *
796642 TTTGATAAACATAA-TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAG
440 TCAG-TAAACA-AATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAA
* * * ** * *
796705 TATTATTTTAATCCAAATAAGTTTTTATGAACT-GAAATTAT-TGTTT-TGTA-ATAGAAGAAAA
503 TATTATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATGAGTTTATG-ACA-A-AACAAAA
** * ** * ** * * * *
796766 AATCGTAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTTAT-AATTTTTGAAC-TGATT-TGATA
564 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTG-TTCAGA-A
* * * * * **
796828 AACAGATTTA-TTTTTTAAATC-TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTA-ATTTTATTT
627 AACAAATTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATA-AATAGAAATTATTT
*** * * ** * * * * * * * **
796889 TATTTTGAACAA-ACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAGTGA
691 TATTCAAAATAAGA-ATGCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGA
* * * * * * * ** *
796953 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAATTGGTT-AGCCAAACAAAATTATT
755 TTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCA-ATAAAC-AGATTATT
* * ***
797017 TTTTAAATCTCTTACAT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCTAAA
818 TTTTAAATCTCTTAC-TCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATT-AGAAATATTTTACTTC-AAA
* * * *
797079 TAAGC-TAGTATGAATTGAAA
880 CAAACTTA-TAAGAACT-AAA
* * * * **
797099 A-AATTGCTTTATGACAAAATAAAA---A---TGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* ** * * * **
797157 AACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTGTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAA
66 AACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTC-T-CTTATTAATTTTTAAAA
** * * ** ** * *
797222 TATTTTTATATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
127 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * * *
797287 TC-GAACCAAAGGTTATAATGATTTGAAATATGCA-ATTA-TTCAAATTGTCATAATTATTTAAA
192 -CAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATA-G-ATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAA
* * ** * * *
797349 CTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAAGACTAATAA
254 TTGATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAATAA
* * ** * * ** * *
797413 ATTACTATTATTTTCTTTTGAATAAACATAAATG-ATAAAAAACAA-TTGTTATATGACCAAACA
317 ATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAAT-AAAAACAATTTTTTA-ATGA-CAAAAA
* * ** *** * * * * * *
797476 A-AAGGTAATAATGATTTGAAATTGGTAATTGTTGAAAT--TGCAATAATTATTTGAACTGATTT
379 AGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAAT-C-ATAACTATCTCAACTGA-CT
* ** ** * * * *
797538 C-GTAAACAAATTCACTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA
441 CAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATA
* ** * * ** * * * * *
797601 TAATTTTATTTTAACTAAGCTTGTATGAATTCAGACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCAC
505 TTATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ** * *
797666 AATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAACA-ATTTGAATTTGCTT-GGTAAACAAA
570 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAA-ATATTTGAACGTG-TTCAGAAAACAAA
* * * * * * * *
797729 TTCA--TTTTAAACTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAATTATTAAGAAATTAG-TATTATTTTATTT
633 TTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTTTTGGAA-TATTAATAAA-TAGAAATTATTTTATTC
* * ** ** * * * * *
797790 TAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTTTTTTATGTCAAAACAAAAGGGTCATAATGATTTG
696 AAAATAAGAATGCATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAA-GGTCAGAACGATTTG
* * * * * * ***
797854 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTC
759 AAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAACAGA-TTATTTTT-
* * * ** ** * * * * * *
797918 CAAATCAT-TTCCTTATTAATTTTTTGAATGTAAATAAATTTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAG
821 TAAATC-TCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAA-TTAGAAATATTTTACTTCAAACAAA
* *
797981 CTTGTAAGATA-TGAA
884 CTTATAAGA-ACTAAA
* * * * *** **
797996 ACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTA-ATAATTATTTTAATAG-C
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTC
* * *
798059 TTTAGCTATTTGAATTGGCTC-GATAAA-AATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
64 -ATAACTATTTGAATT-GTTCAG-TAAACAA-ATTTATTTTTTAAA-CTC-T-CTTATTAATTTT
* * ** * * ** * *
798122 TGAAAGATTAATAAATTACCATTATTTTATTTTGAATAAACATATAT-AATAAAAAACAATTGTT
122 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAA-CAAAAACAATTATT
* * * * * * * * * * *
798186 ATATGACCAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAAATTGATAACT-TTTGAAATGGCCATAATTATT
186 TTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAGACATAACTATT
* * ** * * * * * *
798250 TGAACTGATTTGGTAAACAGACTCACTTTTTAAA--T-C-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT
250 TAAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT
** * ** * **
798311 AAATTAG-ATTATTTTATTTTC-ATTAAGCTTGTATGAATTCAGACAACTGCTTT-ATGACAAAA
315 AAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAA-TTTTTTAATGACAAAA
* * ** ** * * * * * * * * * ***
798373 TAA-AAGGTCACAATGATTTTTAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTGAATTTTTTC
378 -AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGACTC
* * * * * ** * * * * *
798437 GGAAAATAAATTTA-TTTTAAACTCTTC--CTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATT
442 AGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATT
*** * *
798499 ATTTTATTTTGGA-TAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTG-TTTTATGTCAAAACAAAAGGTCA
507 ATTTTA-TTCCAATTAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * *
798561 TAATGATTTTG-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTGTTCGGTAAGCAGA
569 TAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAACAAA
** * * * * * * ** * *
798625 TTTATTTTTCCAAATCATTTCCTTATTAATTTTTTGAATGTAAATAAATCTAGATTATTTTATTT
633 TTTATTTTTTTAATTC--TTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATAGAAATTATTTTATTC
* ** * * * * * * * *
798690 TAAATAAGCTTGTAAG-ATATAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
696 AAAATAAGAATGCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAA
* * * * * * ** ** * *
798754 ATTGAAAAATTATTTTA-ATAG-CTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAAAATATTTATTTTTT
761 ATAG-AGAATTA-TTCAGATAGTC-ATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGA-TTATTTTTT
* * * ** * * * *
798817 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACAT
822 AAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAACAAACTT
* * *
798882 ATATGATCAAAA
887 ATAAGAACTAAA
* * * * *** * * *
798894 ACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGA-TT----T-GATAATTGTTGAAATAGCCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * * * **
798953 TAATTATTTGAACTGATTCGGT-AATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACCTATTAA-TTTTGGA
65 TAACTATTTGAATTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTC-T-CTTATTAATTTTTAAA
* * *** *
799016 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATG
126 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATG
* * * * * * * * ** * *
799081 ATAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAACAATTTGAATT
191 ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTT-AAAT
* **** *
799146 TG-TTCCGTAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTT-GAATTATTAAGAAAT
255 TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAAT
*** * * * *
799206 TAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCATT-TATGAACT-GAAACAATTGTTTT-ATGTCAAAACAA
319 TAGTATTATTTTATTTCAAACAAAC-TTGTATGAA-TAAAAACAATT-TTTTAATGACAAAA-AA
* * * * * * * * * * *
799268 -AAGGTCATAATGATTTTG-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTG-TTCG
380 GAAGATCATAA-CAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAAC-TGACTCA
** * * * ** * * * * **
799330 GTAAGTAGATTTATTTTTCCAAATCATTTC--CTTATTAATTTTTTG-AATGTAAACAACTTTAA
443 GTAAACAAATTTATTTTT-AAAATC--TCCAACTTAACAA-CTTTTGAAATATTAATAA-AGTAA
* * * * * * *
799392 -ATTATTTTATTTCGAA-GAAGCTTGTAAG-ATATGAAGCAAAT-ATTTTATGACTAAACAAAAG
503 TATTATTTTA-TTCCAATTAAGCTTTTATGAATA-GAAAC-AATGAGTTTATGACAAAACAAAAG
* * * ** * * ** * * * *
799453 GTCAGAATGATTTGAAATTGATAATTATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTTAA-TTAGCTT-GGTA
565 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTC-ATAAATATTTGAACGT-G-TTCAGAA
* * * * * **
799515 AACACATTTA-TTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTA-CTATTATTT
627 AACAAATTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTT
** * * * ** *
799576 TATTTC-AAATAA-ACATATATG-ATCAAAAACAATT-GTTATATGACCAAACAAAAGGGAATAA
691 TA-TTCAAAATAAGA-ATGCATGAAT-AGAAACAATTATTTA-ATGACAAAACAAAAGGTCAGAA
* * * * * * * * * * * ** *
799637 TGATTTGAAATTGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTAGAATTGATTTGATAAACTGATTCA
752 CGATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGATT-A
* * * * ** * * * ***
799702 CTTTTTAAATCACTTACTTAATAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTTGAC
816 TTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAAC
* * * * *
799765 TAAGCTTGTATGAATTCAA
881 -AAACTTATAAGAACTAAA
* * *** * ** * *
799784 ACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATATCACAATGATTTTAAATAGACCATTGTTTAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * *
799849 TAACAATTTGAATTTGTTC-GATAAACAAATTTA--TTTTAAACTCTTGCCTATTACTTTTTGAA
65 TAACTATTTGAA-TTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAACTC-T-CTTATTAATTTTTAAA
* * * * ** ** *
799911 TTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATCTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATT-GTTTATG
126 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATG
* * * * * * * *
799975 TCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTG-AATAAATAATTGTTCAATTAGTCATTACTATTTGAAC
191 ACAAAACAAAAGATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTT-AAA
* * *
800039 TTG-TTC-GATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCATTTCC---TTATTAAATTTTT-GAATGTAA
254 TTGATTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC---TCCAAATTATT-AATTTTTAGAATATTA
* * * * * * * * *
800098 ACAAATTTA-CATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAGCAAATATTTT-ATGACT
313 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATA-AAAAC-AATTTTTTAATGAC-
* * * ** * * ** * * * * *
800160 AAACAA-AAGGTCAGAATGATTTAAAATTAATAATTATTTTAATAA-CTTTAGCTATTTGAATTG
374 AAAAAAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATC-ATAACTATCTCAACTG
* * * * ** ** * * * *
800223 GCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAC
438 ACTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAA
* * * * * * * *
800288 TATTATTTTATTTCGAA-TAAACATATATG-ATCAAAAACAAT-TGTTATATGACCAAACAATAG
503 TATTATTTTA-TTCCAATTAAGCTTTTATGAAT-AGAAACAATGAGTT-TATGACAAAACAAAAG
* * ** * * * ** * * * *
800350 GTAATGACAATTTGAAATTGATAATTTTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGGTAAA
565 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTG-TTCAGAAAA
* * * * * * * *
800414 CAGATTCACTTTTTAAATTACTTATTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAG-TATTATTTT
629 CAAATTTATTTTTTTAATT-CTTACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTTT
*** * * * ** * * * * * *
800478 ATTTTGACTAAG-CTCGTATGAATTCAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGAT
692 ATTCAAAATAAGAAT-GCATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGAT
* * * * * * * * * * *
800542 TTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAACAATTTGAATTTG-TTC-GTAAACAAATT-TATT
756 TTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAA-CTGATTCAATAAACAGATTATTTT
* * * ** * * * *** * *
800604 TTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGC
820 TTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAACAAAC
* * * *
800668 TTTTATGAATTGAA
885 TTATAAGAACTAAA
* * * ** * * * *
800682 AGAATTG-TTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATACTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * *
800746 TCACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAACCATTTCTTATTAATTTTT-GA
65 TAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAA-C-TCTCTTATTAATTTTTAAA
* * ** * * ** *
800810 ATGTAAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTA
126 ATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGA-ACAAAAACAATTATTTTA
* * * * * * ** * *
800873 TCACTAAATAAAAGTTTAGAATGATTTGAAATTA-ATAATTA-TTTTAATAG-CTTTAGCTATTT
189 TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAA-TAGATAA-TAGTTCAAATAGAC-ATAACTATTT
* * ** * ** * * *
800935 GAATAGGCTC-GATAAACACATTTATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAGTTTTT-GAAAGATTAA
251 AAATTGATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAA
* * * * * *
800997 TAAATTAATTTTATTTTATTTCAAATAAACATATATG-ATAAAAA-AATTTGTTATATGACCAAA
314 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATTTTTTA-ATGA-CAAA
* * * * ** * * *** * * ** * *
801060 CAA-AAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGTACTAATTC
377 AAAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGACTC
* * * * ** ** ** * * * *
801124 GGTAAACAGATTCACTTTTT-AAATCACTTACTTATTAGTTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTAT
442 AGTAAACAAATTTA-TTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATAT
*** * ** ** * *
801188 TATTTTATTTTGACTAAGCTCGTATGAATTCAAACAATTG-TTTTATGACAAAATAAAAAGGTCA
506 TATTTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCA
* * * * * * ** * *
801252 CAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAACA-ATTTGAATTTGTTCCGTAAACAAA
569 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAA-ATATTTGAACGTGTTCAGAAAACAAA
* * * * **
801316 TTTA--TTTTAAACTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAATTATTAA-AAGATTAG-TTTTATTTTATT
633 TTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTTTTGGAA-TATTAATAA-A-TAGAAATTATTTTATT
**** ** ** * * * * * * *
801376 TTGGATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTT
695 CAAAATAAGAATGCATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTG
* * * * * * * *
801440 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGCTT-AGTAAATAGATTTATTTTTT
759 AAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAACAGA-TTATTTTTT
* * * ** * * * * *
801504 CAAATCAT-TTCCTTATTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAG
822 -AAATC-TCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAA-TTAGAAATATTTTACTTCAAACAAA
* *
801566 CCTATAAGATA-TGAA
884 CTTATAAGA-ACTAAA
* * * * * * *** **
801581 ACAAATATTTTATAATTAAACGAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTA-ATAATTATTTTAATAG-C
1 ACAATTGTTTTATGA-CAAAAGAAAAGTCATTGTGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * *
801644 TTTAGCTATTTGTATTGGCTCAGTAAACACATTTATTATTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTG
64 -ATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTC-T-CTTATTAATTTTTA
* * * **** ** * ** **
801709 AAGTATTATTAAATGAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTTTACGATTAGAAAA-AATTGGTT
124 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGCATGAACA-AAAACAATTATTT
* * * * * * * *
801772 TCTGACAAAAC-AAATATCTTAATGACTTCAGATTAG-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
187 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGA-AATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTT
* * * * *** *
801835 GAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTT-GAAATATTAAT
251 AAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAG-AATATTAAT
* * *
801899 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAAC-ATTTGTTTTATGACAAAA
315 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAAT-AAAAACAATTT-TTTAATGACAAAA
* * ** * * * *** * * * * *
801962 CAA-AAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATCATTCGAA-CGGCTATAATTATTTTAACTAATT
378 -AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATC-ATAACTATCTCAACTGACT
* * * ** * * * * *
802025 CAGTAAACAGATTTATTTTT-TAAGCTCTC-ACTTATTAA-TTTAGTAAGTACTAATAAATTAGT
441 CAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTC-CAACTTAACAACTTTTG-AAATATTAATAAAGTAAT
* * * * * *
802087 ATTATTTTATTCC-ATCTAAGCTTGTATTAACTA-AAACAATTG-TTTTATGTCTAACCAAAAGG
504 ATTATTTTATTCCAAT-TAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * * * * *
802149 TTATAATGATTTTAAATAGACATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTGTTC-GTTAAAT
566 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAG-AAAAC
* * * * * *
802213 AGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTACTAA-TTTAT-GAATGTTAATAAATTA-ATATTAATT
630 AAATTTATTTTTTT-AAT-TCTTACTTATTAAGTTT-TGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTT
* * ** * * * * * * * *
802275 TATTCTAAATAGGCTTGTATGCACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCAAAACAA
691 TATTCAAAATAAGAATGCATG-AATAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGA
* * * * * * * * * * * *
802339 CTTCAAATAGATAATTGTTCTA-ATAATCTTAACCAGTTGAACTAATTCAACAAAAAAATTTATT
755 TTTGAAATAGAGAATTATTC-AGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGA-TTATT
* * * * * * * * *
802403 TTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTAAATT-AGAA-A
818 TTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCA-AACA
*
802466 AAGCTTGTACA-AA-TAAA
882 AA-CTTATA-AGAACTAAA
** * **** * * ** *
802483 ACAATTGTTTTACAACAATAGAAAAAGGTCATAACAATTTGGAACAGATAATCGTTCATATAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAG-AAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * ** * * * *
802548 TTAACTATTTGAACTGGTTCA--ACACTTAGATTTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTAAGTTTC
64 ATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAAC--AAATTTATTTTTTAA--ACTCT-CTTATTAATTTTT
* ** * * ** * * *
802611 AAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAACATGACCAATTGTTTG
123 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTT
* * * * ** *
802676 ATGACAAAATAAGAAG-TTATAACGATTTGAAATAGATAGTTA-TTCAAATATTCAAAACTATTT
188 ATGACAAAACAA-AAGATCATAATGATTTGAAATAGATA-ATAGTTCAAATAGACATAACTATTT
* * * * ** * * * *
802739 GAAA-TGGTTTAGTAAACATATTTACTTTTTAAATCTCTTAATGATTATTTTTCTAAAATATTAG
251 -AAATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTT-TAGAATATTAA
** * * * * *
802803 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAGACAATTGTTTT-ATGAGAAAA
314 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATT-TTTTAATGACAAAA
* * ** * * * * * * *
802867 CAA-AAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATGTAGTC-TTATTATTTGAGCT-AGTT
378 -AAGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGA-CT
* * *** * * ** * ** * * * *
802929 TAGCAAATGGATTT-TTTTAAAAATTTCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTACTAAATTAGTA
441 CAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGA-AATATTAATAAAGTAATA
* * * * * * * * * *
802992 TTATTTTATTCTGAA-TAAGATTATATGAACAAAAACAATTG-TTTTATGATAGAACAAAGGGTT
505 TTATTTTATTC-CAATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAA-TGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* ** * * *
803055 GTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCA-ATAAACA
568 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGT-GTTCAGA-AAACA
** * *
803118 AATTTA-TTTTTTAAAAC-T-CTTATTAA-TTCTTGAAATATTAGTAAATTAG-AATTATTTTAT
631 AATTTATTTTTTTAATTCTTACTTATTAAGTT-TTGGAATATTAATAAA-TAGAAATTATTTTA-
** * * * * * * * * *
803178 TTC-AAAT-AGGCTTC-T-ATATTGAAAGGCAATTGTTTTATGA-GAAACAAAAAAGTAATAACA
693 TTCAAAATAAGAATGCATGA-ATAGAAA--CAATTATTTAATGACAAAAC-AAAAGGTCAGAACG
* * * * * * * *
803238 ATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGACATAATTATTTGAACTG-----AT-------TTATTT
754 ATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGATTATTT
* * * * * * * *** *
803291 TTTAAATCTC-T--T-ATTAACTTTTGAAATATTAATATAA-TAGTATTACTTTATTTTGGATAA
819 TTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAAAACATTAATA-AATTAGAAATATTTTACTTCAAACAA
* * *
803351 ACTTTTATGAACTCAA
883 ACTTATAAGAACTAAA
* ** * * * *
803367 ACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTTAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * *
803431 TTACTATTTAAATTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCTAATCTCTTGGTTATTAATTTTTCA
65 TAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTT-TAAACTC-T-CTTATTAATTTTTAA
* * * * * ** *
803496 AATGTTAATACATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACCGAAACAATTATTCTAT
125 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTAT
* * * * * * * * *
803561 GACTAAACAAAATG-TTAAAATGATCTAAAATTA-AAAATTA-TTCTAAT-GTCTTAACTATTTA
190 GACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAA-TAGATAA-TAGTTCAAATAGACATAACTATTTA
* * ** * *
803622 AACTGGTTC----AACAAATACATTTTTTAAATCT-C---TTACTAATTTTTAGAATATTATTAA
252 AATTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
* * ** * * *
803679 ATTAGTATTATTTT-TATCCAAATATGCTTGTATG-ATCAAAAATAATTATTTT-ATGAGAAAAG
317 ATTAGTATTATTTTAT-TTCAAACAAACTTGTATGAAT-AAAAACAATT-TTTTAATGACAAAAA
** * ** * * *
803741 A-AAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACT
379 AGAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACT
803789 TGCTTTTTAA
Statistics
Matches: 17957, Mismatches: 4185, Indels: 3034
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
839 11 0.00
840 108 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (898 bp):
ACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAATTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAACTCTCTTATTAATTTTTAAAATATT
AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAA
ACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTAAATTGATTC
AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAATAAAAACAATTTTTTAATGACAAAAAAGAAGATCATAA
CAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATCTCAACTGACTCAGTAAACAAATTTA
TTTTTAAAATCTCCAACTTAACAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTCCAATT
AAGCTTTTATGAATAGAAACAATGAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
TAATTGTTCAAACAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTTAATTCTT
ACTTATTAAGTTTTGGAATATTAATAAATAGAAATTATTTTATTCAAAATAAGAATGCATGAATA
GAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGAGAATTATTCAGATAG
TCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAGATTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTA
AAACATTAATAAATTAGAAATATTTTACTTCAAACAAACTTATAAGAACTAAA
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782055 TTTACTTATT
* *
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** * *
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1 AATT
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AATTGTCAAAATATTAATAAATCTATATTATTTTATCTGAAATAAACTTGTATGAATAGAAAA
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* ** *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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*** * ** *
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* **** *
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*
782102 CT-GAATAAACTTGTTTGAATAGAAACAATTGTCTT
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* ** * *
782137 AATATTAATAAATCTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTCTTTTAT
1 AATATTAATAAATCTAAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAAAATTCTTTGAT
* * * *
782202 AAT-AAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAAC-AGTCACAATTATTTAA
66 -ATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTC-AACTAGTCACAACTATTTAA
* *
782265 ACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTT-GAATTATTAATA
129 ACTTATTCAGTAAACAGATTC-TTTTTTAAATCTC-TTACTCATTAATTTTTAGAA-TATTAATA
* * * * *
782328 AATTAGTATTATTTTA-TTCCCAATAAGCATATATGAACTAAAACAATTCTTTTATGATAAAACA
191 AATTAGTATTATTTTAGTT-CAAACAAACATATAAGAACTAAAACAATTCTTTTATGACAAAACA
* * * **
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** *
782457 TAAACATATTTA-TTTTAAAAAAAATTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAACTTAGCATTA
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*
782521 TTTTAATCTAGATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
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782559 GTTTATAACA
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AATATTAATAAATCTAAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAAAATTCTTTGAT
ATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAACTAGTCACAACTATTTAAAC
TTATTCAGTAAACAGATTCTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
GTATTATTTTAGTTCAAACAAACATATAAGAACTAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGT
CATAAAGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCAAGACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAT
ATTTATTTTTAAAAAAAATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTAAT
CTAGATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTCTT
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782996 AAACAAATTT
*
783006 ATTTTTTAATTCTCTTAG-TTATTA
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783055 TTATTATTTT
Statistics
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782127 CAATTGTCTT
* * *
782137 AATATTAATAAATCTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTCTTTTA
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* ** * * * * *
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** * * * *
782265 ACTTG-TTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGAATTATTAATA
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* * * * * * *
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* * ** ** * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
782628 ACTAGTTTGATAAATAGA-TT-TTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATATTTGAAATATTAATAGA
129 ACCAGTTTCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAAT-TTTTAAATATTAATAAA
* * * * * * * * * *
782687 TTAGTATTACTTTT-TTT--TATCAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAA
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* * * * * *
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* **
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** * * * * *
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* * * *
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* *** * * * * * *
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* * * * * * * **
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191 -A--AGTAATATTATTTTATTTCAG-ATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * ** ** * *
783111 GCAAAAGGTTATAATGATTTGT-TGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
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* * * * *
783175 CAGTAAATAGATTTAA-TTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGA
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* ** * * *
783221 AAGA-T--T-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGA-ATG-TTCA-AATACAATTGTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-ATATGAAT-AGAA-AAAATTGTTT
* * * * * * * *** * * *
783279 TATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTCAAATAGTTAATTGTTGGCATGGCCATAATTATTTG
63 TATAACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * *
783344 AA-TTGATTT-AGTAAACAAATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT
128 AACCAG-TTTCA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AAATATTAAT
* * * *
783403 AAATTATTATTATTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTTGTATGAACT-GAAACAATGGTTTTATG
190 AAAGTAATATTATT-TTATTTCA----G-ATAAGCTTT-TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
783466 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTCAACT
247 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* ** * * **
783531 ACTTCAACAAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTATTGG
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* * * *
783581 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATG-ATGGAAAAAAATTGTTTTA
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* * * * * *
783645 TAACAAAACAAAAGTTCGTAA-GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATGGCCAAAATTATTTGAA
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* * * *
783709 CCAGTTTGATAAAC-TAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTCTAAATATTAATAAA
130 CCAGTTTCATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAA
* * *
783773 GTAATGTTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACT-GAATCAATTGTTTTATGATAAAACAAA
193 GTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
*** * * ** * * *
783837 AGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATAGTTCAAACAACCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAA
257 AGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAA
* * * * * ** *
783902 ATAGATTTATTTTTTTAAATTTGTTGTTTATTAATTTTTTA
322 ACA-AATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * *
783943 ATTGTTAATAAATTAGTCTGATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACT-GAAAAAATTATTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTA
* * * * * * *
784007 TGACTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTCTTAATTATTTGAA
65 TAACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
784071 CTA-ATTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTAGAATACT-ATCAA
130 CCAGTTTCA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTA-AATATTAAT-AA
** ** * * * * * * * *
784134 TTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAG-TTTGCACGAATATAAACAATTGTTTTATGACAATAC-A
192 AGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTT-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * ** * * *
784197 AAGATTATAACGA-TTTAAGATAGATGATTATTCAAATAATCATAACTATTACAATTGGTTCAAT
256 AAGGTCATAACGATTTTAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGT
* * * *
784261 AAACAGATTTAGTCTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAA
320 AAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* ** ** * * * *
784299 AATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTAC
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAAAAATTGTTTTAT
* * * * * * *
784364 AGCAAAATATAATGTT-ATAACGATTTAAAATAGATAATAGCTT-AAATGGAT-ATGACTATTTG
66 AACAAAACA-AAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAG-TCATAACTATTTG
** * * * ** *
784426 AACTTG-TTCATGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTGGTAAATTTTTAAAATATTAATAA
128 AACCAGTTTCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAA
* * * * * *
784490 ATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAA
192 AGTAATATTATTTTATTTCAG-ATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* ** ** * * * * *
784554 AAGATCATAGTGATTTGGAATAAATAATTGTTCAAGTTGTCATAACTATTTGAACTCG-CCTAGT
256 AAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC-AGT
* * * * *
784618 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
320 AAACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * *
784660 AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTTTATAAATAGAAAAAATTG-GTT
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*
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* * * *
784788 AA-CA-TGTTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATCTTTCAAATATTAAT
128 AACCAGT-TTC-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAAT-TTTTAAATATTAAT
* * * * ** * *
784849 AAATTTATATTATTTTA-TTCAAAATAAGCCTACATGAATAGAACCAATTATTTTATGACAAAAC
190 AAAGTAATATTATTTTATTTC-AGATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
784913 AAAATGTCATAA-TATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAAC-ATGTTC
254 AAAAGGTCATAACGATTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTC
* * * * *
784976 AGTAAACAAATTCATTTTTTAATTTTCTTACTCATTAATTTTTAG
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* * *
785021 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATGAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAAAAATTGTTTTAT
* * * * * * * *
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66 AACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** * * * ** * ** * *
785151 TTG-TTCAAAAAACATATTTGTTTCTTAAAAGT-TTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATGAAT
131 CAGTTTC-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAAG
* * * * *
785214 TAATATTATTGTAATTTGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA
194 TAATATTATT-TTATTTCAGATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
785278 AGTCATAA-GAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-GATTTGAACTTGTT-TGATA
258 GGTCATAACG-ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TA
* * * *
785340 AACAAATTTATTTTTTAAATGTTTTACCTATTAATTGTCTT--
321 AACAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAA
* * * * * **
785381 TATATTAATAGATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAACTTGTACGAATAGAAAAAAATCATTT
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* * * * * * * * * **
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** * * * *
785508 AACTTG-TTCAACAAACAAATTCATTTTTTAAAACTCTTAA-TTATTAATTTTCT-AATATTAAT
128 AACCAGTTTC-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TAACTTATTAATTTT-TAAATATTAAT
** * * ** * * * *
785570 AACTTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATACAAATTGAAATAATT-TTTTTTCACAAAAC
190 AAAGTAATATTATTTTATTTCAG-ATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
785633 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTAG
254 AAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG
* * * * ** *
785698 TAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTACTAATTGGTGA
319 TAAACAAATTAATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * *
785741 AATATTAATAAATTAG---TATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAATGGAAACAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAAAAATTGTTTTAT
* * * * * *
785803 ATCAACACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC
66 AACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** *** * * * *
785868 TGGTTAGGTAAATAGAATTA-TTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
131 CAGTTTCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAAGT
* * * * *** * * * ** *
785928 CATTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCATATAGTCTTAAA
195 AATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGA-AT-AGA-A-ACAATTG-TTTTAT-GAC--AAA
* * * * * *** * *
785993 TATTTAAACTGGTTTGGCA-AACAAATTT-ATTTTTTAATT-TTC--TTAG-CTATTAA-TTTTT
252 -A--CAAA-AGG--T--CATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-A-TAACTATTT
* * ** * * ** * *
786051 GGAA-TA-TT-ATTATA-TTAGT-ATTATTTT--AT-TCTGGA--TA--AGCTTGTAT
307 -GAACTAGTTCAGTAAACAAATTAATT-TTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAA
* * ** * * * *
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* ***** * *** * * *
786149 TTACAATTGTTCAAATAGTT-AT-A-TATTTG-AAT---TAATTCAACAAACA-T-ATTTA-TTT
62 TTATAACAAAACAAA-AGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTAT
* * * * * * *
786204 TTTAA--A-TCTC-T-TACTTA-TTAATTTTT-GA-----AA--GATTAA----T-AA-A-T--T
125 TTGAACCAGTTTCATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAAATATTAAT
* * ** * * *
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* *** * * * * * *
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253 CAAAAGGTCATAACGATTT-TAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TT
* * * * * * **
786368 CAGTAAACAGATTTATTTTTTACATCTCTTAATTATCAAATTTTGG
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* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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*** * * * *
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* * * * * * * * **
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* * * * *
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* ** ** * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * ** *
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** * * * * * * * * ** *
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* * * ** *
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* ** * ** *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* *
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** * * * * * *
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** * * * **
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* ** *
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1 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAA-AAATTGTTTT
* * * * *
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* * * * ** * ** * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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788256 TAAAATAAAT
Statistics
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* * *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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* *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* *** * * *
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* * * * *
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* *** * *** ** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *** * * *
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* * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * ** *
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* * * * * *
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1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTATTTTA
* * * * * *
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** * * *
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* * * * * * * * ** * * *
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* * * * * * * **
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*
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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785690 TAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTACTAATTGGTGA
131 TTGTTCA-TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * *
785741 AATATTAATAAATTAG---TATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAATGGAAACAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTAT
* * *
785803 -ATCAACACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
66 GA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* *
785867 CTGGTT-AGGTAAATAGAA-TTA-TTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTGA
130 CTTGTTCA--TAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * *
785914 AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCT
1 AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
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Statistics
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Consensus pattern (180 bp):
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GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
TTGTTCATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
Found at i:787004 original size:181 final size:178
Alignment explanation
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* * * * * * * **
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
* ** * * *
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66 AATTTCTTA-CTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCT
** * * * * *
786092 TGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGGCAGAGCAAAAGGTTATAATGATTTG
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* ** * * * * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAAATTTATTTTTT
* * * * *
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* * ** * * * *
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130 GTATGAACTGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA--TTTT-T
* * * * * * *
786325 AAACAGATAATTGTTCATATAATCTTAATTATTTAAAC-TGCTTC-AGTAAACAGATTTATTTTT
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA-TAAACAAATTTATTTTT
* * * * * ** * * * * *
786388 TACATCTCTTAATTATCAAATTTTGGAATGTTATTAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCT
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* * * * *
786453 TATATGAACTGAAATAATTATTTTATAACATAACAAAAGGTTATAATGATTTG
129 TGTATGAACTGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT--TTTT
* ** * ** **** * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAA-CAAATTT--ATTTT
* * * * * * * * *
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* **** * * * *
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126 GCTTGTATGAACTGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-T-TTTT
* * * * * ****
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTG--TTCGATAAACAAATTTATTTT
* * * * * * * * * *
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63 TTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-G
* * * * *
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* * * *
786851 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAACCAAATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
* * *
786916 AATTTCTTATTTATTAATTTTTTACATGA-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCAT
66 AATTTCTTACTTATTAATTTTTTAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
* ** * * * *
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130 GTATGAACTGAAAAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT--TTTT
* ** * * ** * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * *
787097 AATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTATTAATTTCA-CAATATTTTACTTT-GAATAAGC
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* * * * *
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* * * * * * * *
787212 AGATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
* * **
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* * ** * ** *
787336 TAT-AAATAGAAATAATTGTTTTACAACAAAATAAAATATCATAACTATTTG
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* * * * * * * * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
* ** * * **
787451 AATCTCCAACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAAAAAATTAGTATTATTTT-TATTCAAATAAAAT
66 AATTTCTTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCT
* ** * *
787514 TGTATGAA-TAGAAGCAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACGATTTG
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* * * *** *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAA-ATTTA-T-TTT
* * *
787631 TTAAATCTT-TTATTTATTAA-TTTTTAAAAATTTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA
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* ** * ** * *
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126 GCTTGTATGAACTGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT--TTTT
* * * * * * *
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1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
*
787815 AATTT-TTACTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGC
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* * * * *
787877 TTGCATGAA-TAAAACTAATTGTTTTATTACAAAACTAAAGGTCATAATGTTTT
128 TTGTATGAACTGAAA--AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-TTTT
* * * *
787930 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAA-ATGTTTGAGAAACAAATTAATTTTT
1 -AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTT
* ** * ** * * *
787994 T-AGTTCTCTTACACATT-ACTTTTCGAATATTCATGAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
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* * * * *
788057 TTATATGAACTGAAACTATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAATATTTA
128 TTGTATGAACTGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-TTTT
* * * *
788110 AAATAGATAATTATTCAAATAGTTAAAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * *
788175 AATGTT-TT-CTTATT-ATTTGTTGAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATAT-GAAGAAGC
66 AAT-TTCTTACTTATTAATTT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGC
788236 TTGTATGAA
128 TTGTATGAA
788245 TAGAAACAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (178 bp):
AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
AATTTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG
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Found at i:787420 original size:175 final size:177
Alignment explanation
Indices: 787174--788177 Score: 532
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** * * * * * **
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* * **
787301 TTAATAAATTAGTATTATTTTTA-T-GAATAATTTTGTATAAATAGAAA
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* * * * *
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* * * * *
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* *
787478 ATTAAAAAATTAGTATTATTTTTATTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAG
128 ATTAAAAAATTAGTATTATTTTTATTCAAATAAAATTGTATAAATAGAAA
** * * * * * *
787528 CAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCAT
1 CAATTATTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACAT
* ** * * * * *
787593 AACTATTTAAACTCACTCGGTAAAAAGATTTATTATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTA-
66 AACTATTTGAACT-GTTTGATAAATAGATTTA--GTTTTTAAATC---TACTTATTAATTTTTAG
* * * * ** *
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* ** ** * ** * * *
787711 CAATTAGTTTATGACAAAATGAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTTAAATAGTCA
1 CAATTATTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAA-TAGCTCAAATAGACA
* ** * * * * * *
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65 TAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TCTACTTATTAA-TTTTTAGA
* * ** * *
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126 ATATTAA-AAAATTAGTATTATTTTTA-TTCAAATAAAATTGTATAAATAGAAA
* ** * ** *** * * *
787891 CTAATTGTTTTATTACAAAACTAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
1 C-AATTATTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACA
* * * * * * ** * *
787956 TAACTATTTGGAAATGTTTGAGAAACAAATTAATTTTTTAGTTCT-CTTACACATT-ACTTTTCG
65 TAACTATTT-GAACTGTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTACTT----ATTAATTTTTAG
* ** ** * *
788019 AATATTCATGAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAA
125 AATATTAAAAAATTAGTATTATTTTTA-TTCAAATAAAATTGTAT-AAATAGAAA
* ** ** * * * * **
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1 CAATTATTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAA-TAGCTCAAATAGACA
* * * * *
788135 AAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAT
65 TAACTATTTGAAC-TGTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAAT
788178 GTTTTCTTAT
Statistics
Matches: 661, Mismatches: 132, Indels: 69
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Matches are distributed among these distances:
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186 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
CAATTATTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACAT
AACTATTTGAACTGTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTAGAATATT
AAAAAATTAGTATTATTTTTATTCAAATAAAATTGTATAAATAGAAA
Found at i:787664 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 787620--787664 Score: 56
Period size: 22 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
787610 CGGTAAAAAG
**
787620 ATTTATTATTTTTAAATCTTTT
1 ATTTATTATTTTTAAATAATTT
787642 ATTTATTAATTTTTAAA-AATTT
1 ATTTATT-ATTTTTAAATAATTT
787664 A
1 A
787665 ATAAATTAAT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (22 bp):
ATTTATTATTTTTAAATAATTT
Found at i:787753 original size:18 final size:19
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787720 TATGACAAAA
*
787730 TGAAAT-GTCATAATGATT
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1 TGAAATAGTCATAATTATT
787783 TGAA
1 TGAA
787787 CGTGTTCAAA
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 1, Indels: 7
0.81 0.02 0.17
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (19 bp):
TGAAATAGTCATAATTATT
Found at i:789125 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 788249--792749 Score: 1720
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788239 TATGAATAGA
* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * ** ** * * *
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129 G-AATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
788429 AGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT-TGTTCGATAAACAGAT
1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * *
788493 TCATTTTTTAAATCTCGTAATTATTAATTTTT-AGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTC
66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTC
* * *
788557 GAATATGC-TGATATGAACTAAAATAATT-TTTTATAACAAAACAAAAGGTCAT
129 GAATAAGCTTG-TATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * * *
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* *
788672 TTTATTTTTTAAAAT-T-TTGCTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
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* * ** * * * * **
788735 TTG-ATAAGCTTTTATGAATAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAA--AAAT
127 TCGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
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* **
788851 TTATTTTTTAAA--TC-TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTGGCATTATTTTA-TTCT
66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTC-
* * * * *
788911 AAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
129 GAATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * *
788964 AGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGA-TTAGGTAAACAAAA
1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * *
789028 TTATTTTTTAAATCTCATACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCG
66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTCG
* ***
789093 AATAAG-TTAGTATGAAGTGAAATTTTTGTTTTATGACAAAACAAAA----AT
130 AATAAGCTT-GTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * **
789141 ---GATTTGAAATAGATAAATGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACT-AGTTTGACAAACAAAT
1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * ** * *
789202 TTATTTTTTAAATCTCTCAGTTATTAATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTTTG
66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCG
* * * * * *
789267 AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAATAAAAGGTTAT
130 AATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* ** * * * * * * *
789319 GACGGTTTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACT-AGTTCGGTAAATAGAT
1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * * *
789383 TTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATTACTTTTCTTTCATTTT
66 TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTC
* * * * * * *
789448 GAATAAACATGTATGATAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAAT
129 GAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * * * * *
789501 AATGATTTAAAATAGATAATTG-TCGAAATGGACATAATTATTTGAACT-AATTTAGTAAATAGA
1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAA
* * *
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* * * * *
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129 GAA-TAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * ** *
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
** * *
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66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTCG
* * * * * *
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130 AATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * ** *
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * * * * *
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* * * * * *
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128 CGAATAAGCTTGTATGA-AT-AAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCAT
** * * ** * * * ** *
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAA
* **
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* * * * * * *
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128 CGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * *
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1 AACAATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAA
* *
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* * * * *
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129 GAATAAGCTTGTAT--GAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* ** * * * *** *
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTAT-TTAAACTGAGTTTGGTAAACAA
* * * * * * * * *
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** *** * * * * * * * * ****
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121 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * *
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1 AACAA-T-TTGAAATAG--ATAA-T-TGTTCAA-ATAGTCA-T-AAC-----TA---TTTAAA-C
* * ** *** * **
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48 TGAGTTTGGTAAACAAATTTATTT---T-TTAAATCTCTTACTTATTAA-TT-TT-TGA--AATA
* * * ** * * *** * ***
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* * *
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* * * * * * * * **
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* ** ** * * *
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* * * *
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* * ** * * *
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* ** * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * ** * ***
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* *
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* * * * * * * *
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127 TC-GAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * *
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * * * * *
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* * * * * *
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130 AATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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** * * * *
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* * *
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* * * *
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** * ** * ** *
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* ** * * * ***
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** * * * ** * **** *
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* * * * * * * *
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAGTTTGGTAAACAAAT
* * * *
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66 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCG
* * * *
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130 AATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *** *
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* * * *
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* * ** * * * * *
792650 TTGAATAAGCATGTATGAACCGAAATAATTGTTTTTTGACTAAACAAAATGTCAG
127 TCGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * **
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1 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA
792750 GCTAGTTCGG
Statistics
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * * * *
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* * **
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* *
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* * *
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194 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
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* * * *
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1 CAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-TTAGGTAAACAAATTT
* * *
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* **
789093 AATAAG-TTAGTATGAAGT-GAAATTTTTG-TTT-T-AT-G-ACAAAACAAA-AATGATTTGAAA
129 -ATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAA-AAATAACAATTTGAAA
* * * * * *
789150 TAGATAAATGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAAT
190 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT
** *
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255 CTCT-A-TTATTAATTTTTGGAATATTAATA-ATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATAT
* * * * *
789280 GAACAGAAATAATTGTTTTATGATAGAATAAAAGGTTAT-G
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** * * * * * *
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* * * **
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* * * ** ** * * ** *
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* * * * * * *
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* * * *
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250 TAAATCTC-TA-TTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTGAA-TAAGCT
** * * * *
789638 TGCATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAAGTCATAA
311 TATATGAA-T-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG
** * * * * * * *
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** * * * **
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* * ** * * *** ** *
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131 AAGCTTGTATGAA-TAGAAATTATTG-TTT-TGTAATAGAACAAA--AAAATAACAATTTGAAAT
* * * * * *
789864 AAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAATTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTCAAATC
191 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * *
789929 ATTTCCTTTTTAATTCTTT-GAATGTTAATAAATTTAG-ATTCTTTTATTCCGAATAAGCTTGTA
256 -TCT-ATTATTAATT-TTTGGAATATTAAT-AA-TTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATA
* * * *
789992 AGATATGAAAAAAATATTTTATTACTAAAA-AAAAGGT--TAG
315 TGA-AT-AAAAAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAG
* * * * ** * * * * *
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1 CA--ATTTGAAATAAATAATTGTTTA-AATAGTCATAACTATTTAAACT-AGTTAGGTAAACAAA
*
790095 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTGTAA--
62 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TAATT
* * * * ** * * * * * ***
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* * * * * *
790223 ATTA-ATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAA
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * * * *
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253 ATC-TCTA-TTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAG-CT-T
* *
790352 ATCAT-AAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * *** * *
790502 TCTAAGCTTGTATTAACTA-AAACAAATGTTTTATGACA-AATCAAAGTGTTATAACGATTTTAA
130 --TAAGCTTGTATGAA-TAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAA-CAAA--AAAATAACAATTTGAA
* * * * *
790565 ATTGACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACT--TATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTA
189 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TTGA-TAAACAGATTTATTTTTTA
* * * * * * *
790628 AATCTATTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGACTAAGCTTG
252 AATC--TCTATTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTA
* * * * * * *
790693 TATAAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAATGTCAAAA
313 TATGAA-T-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG
* * * * * * * * * * *
790737 CGATTTCAAATAGATAATTATTCT-AATAATCTTAACCATTTGAACT-GATTCGATAAATAAATT
1 CAATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-TTAGGTAAACAAATT
* * * * **
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64 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCC
* * ** * * *** * *
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** ** * * * ** * **
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188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTA-T-TTTTT
* * * * * * **
790991 AATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA-AAT
251 AAATCTC-T-ATTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTT
* ** * * * *
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312 A-TATGAATA--AAAAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAG
** * * * * * * * * *
791100 TGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCAAAACTATTTGAAA-TGGTTTA-GTAAATAGATT
1 CAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AAACTAG-TTAGGTAAACAAATT
* * * *
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64 TATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * * * * ** * * * * **
791226 CGAACAAACTTATATTAACAAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
127 CG-ATAAGCTTGTATGAATAGAAA-TTATTGTTTTGTAATAGAACAAAA--AAATAACAATTTGA
* * * * * * * * *
791291 AATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACGATTTGAACTA-ATTCAGCAAA-TGTATTTATTTTTT
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAG-ATTTATTTTTT
* * * *
791354 AAATCTCTTAGCTATTAATTTTTAGAATATTACCTAATTAGTATTACTTTATTCTGAATAAGCTT
251 AAATCTC-TA-TTATTAATTTTTGGAATATTA-ATAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTT
* * * * * * * *
791419 ATATAAACAGAAACAATTGTTTCATGATAGAACAAAAGTTTATAA
312 ATATGAATA-AAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG
* * * *
791464 CAATTTGAAATAGAGAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
1 CAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTAGGTAAACAAATTTA
* * * * **
791529 TTTTTTAAATCTCTTA---A-AAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTGTTTT-ATTTTGAA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCCG-A
* * * * * * *
791589 TAAGCCTCTATATTGAAAAGCAATTA---TTTTATAAGAAAACAAAATGTAATAACAATTTGAAA
130 TAAG-CT-TGTA-TGAATAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAA--AAATAACAATTTGAAA
* * * * *
791651 TAGATAGTTGTTTAAATGGTCATAATTATTTGAA-TTGATTT-AGTAAACTA-ATTTATTTTTTT
190 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGA-TAAAC-AGATTTA-TTTTTT
* * * * * * *
791713 AAATCTATTACTTATTAACTTTT-GAATTATTAATACA--A-CATCATTTTATTTTGGATCAGTT
251 AAATCT-CTA-TTATTAATTTTTGGAA-TATTAATA-ATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCT
* * *
791774 TTTATGAACAAAAATAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AATTCCG
* * * * ** * * * * *** ** *
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129 ATAAGCTTGTATGAATAGAAATTA-TTGTTTTGTAATAGAA-CAAA-AAAATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * *
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191 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* *
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* * * *
792134 TGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAGAAATGGTCGTAA
315 TGAA-T-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG
** * * * ** * * ** *
792176 TGATTTGAAATAGATAATTGCTTATATAGTTGTAGCTATTTAAACTGGTCCGGCAAACAAATTT-
1 CAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTAGGTAAACAAATTTA
* ** * * *** *
792240 TATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTATT-TTAT-TTCAAATGAACTT-GTATGAACATAAAT
66 T-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATT--AAT-AAATTAGTATTATTTTAATT
* * * * ** *** * **
792302 --AAT-TG-TTTTATG-ATAGAACA-AAAGGTTTAT-T--T--TTTAAAATAAT--TGATTTGAA
126 CCGATAAGCTTGTATGAATAGAA-ATTATTGTTT-TGTAATAGAACAAAAAAATAACAATTTGAA
* * * * * *
792354 GTATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
189 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * *
792419 TCTCTAACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATCAATTAGTATTATTTAATTTCGAATAA-CTTGTA
254 TCTCT-A-TTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATA
* * * * *
792483 TGACAAAAAACAATTGTTATATGACTAAACAAAAGGTAATAA
315 TGA-ATAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG
* * * * * * * * *
792525 CAATTTGAAATAGATAATTG-TTAAGATGGCCATATCTATTTGAGCTTGTTCA-ATAAACATATT
1 CAATTTGAAATAAATAATTGTTTAA-ATAGTCATAACTATTTAAACTAGTT-AGGTAAACAAATT
* * * * *
792588 TATTTTTTTAAATCTATTGCTTATTAATTTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATAATTTT-ATTT
64 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * ** *
792651 TGAATAAGCATGTATGAACCGAAATAATTGTTTT
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TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCCGAT
AAGCTTGTATGAATAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAAAAATAACAATTTGAAATAGATA
ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAT
TATTAATTTTTGGAATATTAATAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAAA
TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG
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790302 AATTTTGAAA
* * *
790312 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGATTGTATCATAAAAAAATAATTGTTTTATG
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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1 TTCAAATAGATAATT
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TTCAAATAGATAATTG
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792365 TTCAAATAGT
* *
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* * *
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* *
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* * * **
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** * * ** *
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* * * * **
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CATAACTATTTGAATTAGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTATAACTTATTAATTTTTG
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792768 ATTTAATTTT
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * ** *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTGTTTTATG
* ** * * * * *
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* * * * * * *
793083 T-ATTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAA
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* * * *
793134 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
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* * * * **
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66 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT
* * * * * * **
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* * * * *
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** ** * * * * *
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65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T
* * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * *
793560 CAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA-A-AAAATTTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTAAATT
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** * * * * * *
793623 TATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAGTTGTCTAAA
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* * * * *
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* *** * * *
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* *
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* * * ** *
793856 TATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTTTGAGTCAA-CTTGTGCGAAATAGAAACAATTGTTTTA
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** * * * * **
793919 CAACAAAACAAATGGTTATAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTTTTAATTCT-TTTG
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA--CTATTTG
** * * * * * * *
793983 TGTTGG-TCAATTCAACGGATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATAAATTTTTAGGA
126 AATTGGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTCA-AA
* * * * * * * *
794039 TATTAATAGATTAGCATTACTCTATCTCGAATAAGAC-TGTATCAATAGAAACAATTGTTTTATA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAATATAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
794103 ACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT
* * * * * *
794168 GGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTAAAA
130 GGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAA
* * * * * * ** * * *
794216 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAGCAAAAACATTTGTTTTAAGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
794281 CAAAACAAAAGGTCATAA-CAGTTTGAAATAGATAATTTTTCATATAGCCTTAACTATTTCAATT
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* *
794345 GGTTCGATAAA-AAATTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
130 GGTTCGATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AA
* * * * * * * *
794397 TATTATTAGATTAGTATTATTGTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTGTTTTATGA
* * *
794462 AAAAACAAAAGG-CTATAATGATTTGAAATATACAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
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* ** * *
794525 TGGTTCGGTAAACATTTTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAA
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* *
794578 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTAT
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* * * * * *
794641 GACAAAACAAAAGATCTTAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTGATAATTATTTGAAT
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* * ** * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T
* * * * ** *
794888 T-ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTTAAA-CTTCCTGCTTATTAATTTTTTGAG
129 TGGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAA-TTTTCAAA
* * * * * * *
794941 TGTTAATAGAA-GAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTAT
1 TATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TATAAACAATTGTTTTAT
* ** * * * * * *
795004 TATTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAATCTTAACTATTTGAAT
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
* * *
795069 TGATTC-AGTAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAA
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* ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * * *
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* **
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* * * * * * * *
797898 GGTAAACAGATTTATTTTTCCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTT-TTGAATGTAAATAAATTTAG
562 GATAAACAAATTTATTTTT-TAAATC-TCTTACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAGA-TTAG
* * * * **
797961 -ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGT
623 TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGT
*
798024 CAGAATGATTTGAAATTA-ATA
686 CATAATGATTTGAAA-TAGATA
* * ** * *
798045 ATTATTTT--AATAG-CTTTAGCTATTTGAA-TTGGCTCGATAAAAATATTTATTTTTTAAATCT
1 A--ATTTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCT
* * ** * *
798106 CTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACCATTATTTTATTTTGAATAAACATATAT-A
61 CCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AACTTGTATGA
* * * * ** * * *
798170 ATAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAAATTGATAACTT-TTGA
125 AT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCTTAAAGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCA
** * * *** * * *
798234 AATGGCCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAAC-AGACTCACTTTTTAAATCACTTA--T-T-A
188 AACAGTCATAATTATTTGAATTG-TTCAATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAA
* * * * * * * * *
798294 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGATTATTTTATTTTCATTAAGCTTGTATGAATTCAGACAACT
251 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAAATTATTTTATTTTGAATAAGC-TATATAAATTGAAACAATT
* * * * * ** ** * * * *
798359 GCTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTTAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAACAA
315 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * * *
798424 TTTGAA-TTTTTTCGGAAAATAAATTTA-TTTTAAACTCTTCCTTATTAATTTTTGAATTATTAA
380 TTTGAACTTGTTT-GGTAAACAGATTTATTTTTAAATTC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * ** *
798487 GAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAA
442 TAAA-TA--A-TA--TTATTTT-AACAAACTTATT-TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
798551 CAAAAGGTCATAATGATTTTG-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTG-TT
499 CAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAAT-AATAATTTTTCATATAGTCTTAACTATTT-AAATTGATT
* * * * * * * * *
798614 CGGTAAGCAGATTTATTTTTCCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTT-TTGAATGTAAATAAATCTA
561 CGATAAACAAATTTATTTTT-TAAATC-TCTTACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAGAT-TA
* * * * * **
798677 G-ATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTAAG-ATATAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGT
622 GTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGT
* *
798740 CATAATGATTTGAAATTGAAA
686 CATAATGATTTGAAATAGATA
** * * ** *
798761 AATTATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTGAA-TTGGCTCGGTAAAAATATTTATTTTTTAAATCTC
1 AATT-TTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCTC
* * * ** * *
798824 TTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATG-A
62 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AACTTGTATGAA
* * * ** * *
798888 TCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGA-TT----T-GATAATTGTTGAAA
126 T-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCTTAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * ** * * * * *
798947 TAGCCATAATTATTTGAACTGATTCGGT-AA-TAGATTCACTTTTTAAATCACTTACCTATTAA-
190 CAGTCATAATTATTTGAATTG-TTCAATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAAT
* * * * * *
799009 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTG
253 TTTTGAAATATTAATAAATTA-AATTATTTTATTTTGAATAAGC-TATATAAATTGAAACAATTG
* * * ** * * * *
799074 TTTTATGATAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAACAAT
316 TTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAT
* ** * * * * *
799139 TTGAATTTGTTCCGTAAACAAATTTA-TTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGA
381 TTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * ** *
799203 AATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCATT-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACA
444 AA-TA--A-TA--TTATTTT-AACAAAC-TTATTTGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
799267 AAAGGTCATAATGATTTTG-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTG-TTCG
501 AAAGGTCATAATGA-TTTGAAAT-AATAATTTTTCATATAGTCTTAACTATTT-AAATTGATTCG
* ** * * * * * * *
799330 GTAAGTAGATTTATTTTTCCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTT-TTGAATGTAAACA-ACTTTA-
563 ATAAACAAATTTATTTTT-TAAATC-TCTTACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAGA--TTAG
* * * * ** * **
799391 AATTATTTTATTTCGAAGAAGCTTGTAAG-ATATGAAGCAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGT
623 TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGT
* *
799455 CAGAATGATTTGAAATTGATA
686 CATAATGATTTGAAATAGATA
* * * *
799476 ATTATTTT--AATAG-CTTTAGCTATTTTAA-TTAGCTT-GGTAAACACATTTATTTTTTAAA--
1 A--ATTTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTA--TTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATC
* * ** * *
799534 T-CT-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATG
60 TCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AACTTGTATG
* * **** * * *
799597 -ATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGGAATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTGA
124 AAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCTTAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
** * * ** * * *
799661 AATGGCCATAATTATTAGAATTGATTTGATAAACTGATTCACTTTTTAAATCACTTAC-T-TAAT
188 AACAGTCATAATTATTTGAATTG-TTCAATAAACTAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAA-
* * * * * * *
799724 AATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAAT
251 ATTTTTGAAATATTAATAAATTA-AATTATTTTATTTTGAATAAGC-TATATAAATTGAAACAAT
* * ** * * ** * ** * * *
799789 TGTTTTATGACAAAATAAAATATCACAATGATTTTAAATAGACCATTGTTTAAATAGTCATAACA
314 TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACT
* * * * * * * * *
799854 ATTTGAATTTGTTCGATAAACAAATTTA-TTTTAAACTCTTGCCTATTACTTTTTGAATTATTAA
379 ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * ** *
799918 GAAATTAGTATTATTTTATCTTGGATAAGCTT-TTATGAACTGAAACAATTG-TTTATGTCAAAA
442 TAAA-TAATATTATTTTAAC----A-AA-CTTATT-TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* *
799981 CAAAAGGTCATAATGATTTTG-AATAAATAATTGTTCA-ATTAGTCATT-ACTATTTGAACTTG-
499 CAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAAT-AATAATTTTTCATA-TAGTC-TTAACTATTT-AAATTGA
* * * * * *
800042 TTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCAT-TTCCTTATTAAATTTT--TGAATGTAAACAAAT
559 TTCGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC-TCTTACTTATT-AATTTTCAT-AATATTAATAGA-
* * * ** * **
800104 TTA-CATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAGCAAATATTTTATGACTAAACAAA
619 TTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAA
* *
800167 AGGTCAGAATGATTTAAAATTA-ATA
682 AGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATA
* * * ** *
800192 ATTATTTT--AATA-ACTTTAGCTATTTGAA-TTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCT
1 A--ATTTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCT
* * * * * *
800253 CTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAACATATATG-
61 CCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AACTTGTATGA
* * * * * * * * * *
800317 ATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAATAGGTAATGACA-ATTTGAAATTGATAATTTTTGA
125 AT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT-CTTAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
** * * ** * * * *
800381 AATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGGTAAAC-AGATTCACTTTTTAAAT-TACTTATTTATT
188 AACAGTCATAATTATTTGAATTG-TTCAATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCT-CTTACTTCTA
* * * * * * * *
800444 AATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTCGTATGAATTCAAAAAA
250 AATTTTTGAAATATTAATAAATTA-AATTATTTTATTTTGAATAAGCT-ATATAAATTGAAACAA
* * * * ** * * *
800509 TTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAAC
313 TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAAC
* * * * * * *
800574 AATTTGAATTTG-TTCGTAAACAAATTTA-TTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTA
378 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * *** * *
800637 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TTATGAATTGAAAGAATTG-TTTATGTCAAA
441 ATAAA-TA--A-TA--TTATTTT-AACAAACTTATT-TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * *
800700 ACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATACTCATCACTATTTGAACTT-ATT
498 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AATAATTTTTCATATAGTCTTAACTATTT-AAATTGATT
* * * * * *
800764 CGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAA-C-CATTTCTTATTAATTTT--TGAATGTAAATAAATTTA
561 CGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTC-TTACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAGA-TTA
* * * * ** * *
800825 -TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATCACTAAATAAAAGT
622 GTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGG
* *
800888 TTAGAATGATTTGAAATTA-ATA
685 TCATAATGATTTGAAA-TAGATA
* * * * * *
800910 ATTATTTT--AATAG-CTTTAGCTATTTGAA--TAGGCTCGATAAACACATTTATTTTTTAATCT
1 A--ATTTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTA--TTCGGTAAACATATTTATTTTTAAATCT
* * * * * ** * *
800970 CTTACTTATTAGTTTTTGAAAGATTAATAAATTAATTTTATTTTATTTCAAATAAACATATATG-
61 CCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AACTTGTATGA
* * * ** * * *
801034 ATAAAAA-AATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTGAA
125 ATAAAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCTTAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
** * * ** ** * * * * *
801098 ATGGCCATAATTATTTGTACTAATTCGGTAAAC-AGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAG
189 ACAGTCATAATTATTTG-AATTGTTCAATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAA
* * * * * * *
801162 TTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTCGTATGAATTCAAACAATT
252 TTTTTGAAATATTAATAAATTA-AATTATTTTATTTTGAATAAGCT-ATATAAATTGAAACAATT
* * * * ** * * * *
801227 GTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAACA
315 GTTTTATGATAAAA-CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACT
* ** * * * *
801292 ATTTGAATTTGTTCCGTAAACAAATTTA-TTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAA
379 ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * ** *
801356 -AAGATTAGTTTTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAA
442 TAA-A-TA-----ATATTATTTT-AACAAACTTATT-TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * *
801419 ACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGCTT
498 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AATAATTTTTCATATAGTCTTAACTATTT-AAATTGATT
* * * * * *
801484 AG-TAAATAGATTTATTTTTTCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTT--TGAATGTTAATAAATTTA
561 CGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATC-TCTTACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAGA-TTA
* * * * * * *
801545 -TATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATAAG-ATATGAAACAAATATTTTAT-AATTAAACGAAAG
622 GTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAATAATTATTTTATGAA-AAAACAAAAG
*
801607 GTCAGAATGATTTGAAATTA-ATA
684 GTCATAATGATTTGAAA-TAGATA
* * * ** * * *
801630 ATTATTTT--AATAG-CTTTAGCTATTTGTA-TTGGCTCAGTAAACACATTTATTATTTAAATAT
1 A--ATTTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-ATTCGGTAAACATATTTATT-TTTAAATCT
* * * * **** * *
801691 CTTACTTATTAATTTTTGAAGTATTATTAAATGAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTTTACG
61 CCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAA-CTTGTATG
* * * * * * * *
801755 ATTAGAAAA-AATTGGTTTCTGACAAAAC-AAATATCTTAATGACTTCAGATTAG-TAATTGTTC
124 AATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCTTAAAGATTTGA-AATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
801817 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAC-ATATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATT
187 AAACAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTCAATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTCTA
* ** * * **
801881 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATGATCAAAAACA
250 AATTTTTGAAATATTAATAAATTA-AATTATTTTATTTTGAATAAGCTATATA-AAT-TGAAACA
* * * * ** ** * ** *
801945 TTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATCATTCGAACGGCTATAA
312 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAA
* * ** ** * * * *
802010 TTATTTTAACTAATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAGCTCTCACTTATTAATTTAGT-AAGTA
377 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAA-AT-TCTCTTATTAATTT-TTAAAATA
* * * * * *
802074 CTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATT-AACTAAAACAATTGTTTTATGTC
438 TTAATAAA-TAATATTATTTTA----A-C-AAACTTAT-TTGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * ** *
802138 TAACCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGA-CATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTT
495 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-ATAATTT-TTCATATAGTCTTAACTATTT-AAATT
* * * * * * *
802202 G-TTCGTTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTACTAA-TTT-ATGAATGTTAATAAAT
557 GATTCGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAT-AATATTAATAGAT
* * * * * * * *
802264 TAATATTAATTTATTCTAAATAGGCTTGTATGCACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAA
620 TAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATG-AATAGAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAA
* ** * *
802328 GGTCAAAACAACTTCAAATAGAT-
683 GGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *** * * *
802351 AATTGTTCTAATAATCTTAACCAGTTGAACTAATTCAACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
1 AATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCTCCT
* ** * * * * * **
802416 ATTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTAAATTAGAAAAAGCTTGTACAAAT-
64 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-CTTGTATGAATA
** * * * * * *
802480 AAAACAATTGTTTTACAACAATAGA-AAAAGGTCATAACA-ATTTGGAACAGATAATCGTTCATA
128 AAAACAATTGTTTTATGACAA-A-ACAAAAGATCTTAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * * * ** * *
802543 TAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTC-A-ACACTTAGATTTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTAA
190 CAGTCATAATTATTTGAA-TTGTTCAATAAAC-TA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAA
* ** * * ** *
802606 GTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAACA-TG-ACCAA
252 TTTTTGAAATATTAATAAATTA-AATTATTTTATTTTGAATAAGCTA-TAT-AA-ATTGAAACAA
* * * * * * *
802669 TTGTTTGATGACAAAATAAGAA-GTTATAACGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATA-TTCAAA
313 TTGTTTTATGATAAAACAA-AAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTT-ATA
* * * * *
802732 ACTATTTGAAATGGTTTAGTAAACATATTTACTTTTTAAA-TCTCTTAATGATTATTTTTCTAAA
376 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTCTC-T--T-ATTAATTTT-TAAA
* *
802796 ATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATT-AACAAAGACAATTGTTTTAT
435 ATATTAATAAA-TA--A-TA--TTATTTT-AACAAACTTAT-TTGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* ** * * * **
802860 GAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATGTAGTCTT-ATTATTTGAGC
492 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AATAATTTTTCATATAGTCTTAACTATTT-AAA
* * * * *** ** * * * * *
802924 TAGTTTAG-CAAATGGATTT-TTTTAAAAATTTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTACTAAAT
555 TTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAGAT
* * * * * * * * * *
802987 TAGTATTATTTTATTCTGAATAAGATTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAGG
620 TAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAG
** ** *
803052 GTTGTAACAATTTGAAATAAAT-
684 GTCATAATGATTTGAAATAGATA
** ** * *
803074 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAA---ACT
1 AATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCTCCT
* * * ** * * *
803136 -CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAGGCTTCTAT-ATTG
64 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-ACTTGTATGAAT-
** * * ** * *
803199 AAAGGCAATTGTTTTATGA-GAAACAAAAAAGTAATAACA-ATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAA
127 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCTTAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
** * * *
803262 TGGACATAATTATTTGAA-----C--T-GA-T--TT-ATTTTTTAAATCTCTTA--T-T-AACTT
190 CAGTCATAATTATTTGAATTGTTCAATAAACTAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTCTAAATTT
* * * * * * * *
803311 TTGAAATATTAATATAA-TAGTATTACTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAACTCAAACAATTG-
255 TTGAAATATTAATA-AATTA-AATTATTTTATTTTGAATAAGC-TATATAAATTGAAACAATTGT
* * ** * * * * *
803374 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTTAAATAGTCATTACTATT
317 TTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
* ** * * * * *
803439 T-AAATTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCTAATCTCTTGGTTATTAATTTTTCAAATGTTA
382 TGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTT-AAAT-TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * ** * * *
803503 ATACATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACCGAAACAATTATTCTATGACTAAA
441 ATA-AATAATATTATTTTA----ACA-AA-CTTATTTGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * * *
803568 CAAAATGTTAAAATGATCTAAAATTAAAAATTATTC-TA-ATGTCTTAACTATTTAAACTGGTTC
499 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAATAATTTTTCATATA-GTCTTAACTATTTAAATTGATTC
** * * * *
803631 ----AACAAATACATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATT
562 GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAGATTAGTATT
* * * * * *
803688 ATTTTTATCCAAATATGCTTGTATG-ATCAAAAATAATTATTTTATGAGAAAA-GAAAGATCATA
627 A-TTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATA
* *
803751 ATGATTTGAGATTGAT-
690 ATGATTTGAAATAGATA
*
803767 ATTTGTTCAAATAGTCATAACT
1 AATT-TTCAAATAGTCATAACT
803789 TGCTTTTTAA
Statistics
Matches: 8711, Mismatches: 1492, Indels: 1066
0.77 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
665 23 0.00
666 13 0.00
667 14 0.00
668 42 0.00
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* ** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * ** ** *
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* **
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* * * * * *
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* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG
* * ** * * * * * **
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* * ** * * * *
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* *
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* * *
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* * ** * *
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* * * *
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1 ATTTATTTTT-TAAATC-TTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTAT
* * * * * *
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* * * ** * ** * **
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* *
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* * * * * * * * *
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63 TGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * ** * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * ** * **
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1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* *
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* * ** ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * ** * * * *
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* * *
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* * * * * **
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** * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * ** * * ** * ** *
800181 TAAAATTA-ATAATTATTTTAATA-ACTTTAGCTATTTGAA-TTGGCTCGGTAAACAC
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* *
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* * * * * * * * * **
800301 CG-AATAAACATATATG-ATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAATAGGTAATGACAATTTG
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* * * * * ** *
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* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCT--TTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
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62 TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * ** * *
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*
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1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * *
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1 ATTTATTTTTT-AAATC-TTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * *
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63 TGAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* ** * ** * ** * *
800901 AAATTA-ATAATTATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTGAA-TAGGCTCGATAAACAC
127 AAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAATTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAA
* * * *
800954 ATTTATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAAGATTAATAAATTAATTTTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * *
801018 CAAATAAACATATATG-ATA-AAAAAATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGA
64 GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * ** ** *
801081 AATTGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGTACTAATTCGGTAAACAG
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA
* * * * *
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* * ** * * *
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* * * ** * **
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127 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA
* *
801315 ATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAA-AAGATTAGTTTTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAA-ATTAGTATTATTTTA-T
* * * *
801376 TTG-GATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTT
62 TTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * *
801439 TAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGCTTAGTAAATAG
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* *
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* * * * * * * ** * *
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* ** * ** * * * *
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* * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
** * * * * * * * * *
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* * * * *
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*
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* * * *
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** * * * * ** * *
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128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA
* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTG-AA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** ** * * * * * *
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63 TGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * * *
802162 AAATAGACATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTG-TTCGTTAAATAG
127 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAA
* * * * * *
802215 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTACTAATTTATGAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTC
1 ATTTA-TTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
* * * * * ** * *
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* * * ** * ** * ** *
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127 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA
* ** * *
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* ** ** **
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* * * * * * * * * *
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126 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAAC--AA
* * ** *** *
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1 ATTTATTTTTTAA-ATCTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
** * * * * * * *
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63 TGAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * *
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126 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA
* * * * * *
802758 ATTTACTTTTTAAATCTCTTAATGATTATTTTTCTAAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT-T-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * * **
802823 TTGAACA-AA-CTTATATTAACA-AAGACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATT
62 TTGAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* ** * * * * ***
802885 TGAAATAAATAATTGTTCATGTAGTC-TTATTATTTGAGCTAGTTTAGCAAATGG
125 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA
** * * * *
802939 ATTT-TTTTAAAAATTTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
* * * * * * * ** **
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63 TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * *
803067 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACAA
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAA
* * * * *
803119 ATTTATTTTTTAAAAC--T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGAATTATTTTATTTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG
* * * * * * **
803181 AAATAGGCTTCTAT--ATTGAAAGGCAATTGTTTTATGA-GAAACAAAAAAGTAATAACAATTTG
65 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAA--CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTG
* * * *
803243 AAATAGATAGTTGTTTAAATGGACATAATTATTTGAACT
127 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
803282 GATTTATTTT
Statistics
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Consensus pattern (179 bp):
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Found at i:796970 original size:537 final size:535
Alignment explanation
Indices: 795571--803786 Score: 3540
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795561 GTAAATAGAT
* * * * * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* *
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* * ** * * * * *
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* * ** * * * *
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** * *
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* * * * * **** *
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* *
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* *
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* * * * *
796558 AAAACAATTTTTTTATGGCAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAAATACTTATTCAAATAG
441 AAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAG-TCATAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * *
796623 TCATGACTATTTGATCTAGTTTGATAAACATAA
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* *
796656 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCCA
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* * * * * * * * *
796720 AATAAGTTTTTATGAACTGAAATTATTGTTTTGTAATAGAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAAAT
66 AATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAAT
* *
796785 AAATAATTACTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC
131 AAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * *
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196 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAA
* * *
796912 CAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
261 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* *
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325 AGTCATAATTATTTAAATTGTTTAG-TAAAC-AAATTCATTTTTTAAATCTCTTA-ATTATTAAT
*
797040 TTTTGAAATATTAATAAATT--CATTTTATTTTATTCTAAATAAGCT-AGTATGAATTGAAAA-A
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** * * * **
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*
797161 ATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAA
512 ATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAA
* * * * ** * * * *
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1 -TTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCC
* * * ** * * * *
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65 AAATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAA
*** * * * **
797315 TATGCAATTATTCAAATTGTCATAATTATTTAAACTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTTAAA
130 TAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAA
* * * * * *
797380 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGACTAATAAATTACTATTATTTTCTTTTGAATAAACATAAA
194 --TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATA
* * * * *
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257 TGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
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* * * * * *
797573 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTAACTAAGCTTG-TATGAATTCAGAC
383 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAATTAAAAC
* * * * * *
797637 AATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATA
446 AATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
797702 ACAATTTGAATTTGCTTGGTAAACAAA
509 ACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAA
* * * * **
797729 TTCA-TTTT-AAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTT
1 TT-ATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCC
* * * * * *
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65 AAATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAAT-AAAACAAAA-AGTCATAATAATTTGA
** * * * *
797855 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTCC
128 AATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAACAAATTTATTTTT-T
* * * * * * *
797919 AAATCATTTCCTTATTAATTTTTTG-AATGTAAATAAATTTAGATTATTTTATTTCGAATAAGCT
191 AAATC--TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACT
* * * * * * *
797983 TGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTA-ATAA
253 TATATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAA
* ** * ** * ** * *
798046 TTATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGATAAA-AATATTTATTTTTTAAATCTCTT
315 TTGTTCAAATAGTC-ATAATTATTTAAATTGTTTAG-TAAACAA-ATTCATTTTTTAAATCTCTT
* * * * ** *
798109 ACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACCATTATTTTATTTTGAATAAACAT-ATAT-AAT
377 AATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAAT
* * * * * * * *
798172 AAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAAATTGATAACTT-TTGAAA
440 -TAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAA-AATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAA
* * * *
798236 TGGCCATAATTATTTGAACT-GATTTGGTAAACAGAC
501 TAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGGTAAACA-AA
* * * *
798272 TCACTTTTT-AAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTT
1 TTA-TTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATC
* * * * * * * * * * * * * * **
798331 C-ATTAAGCTTGTATGAATTCAGACAACTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTTA
64 CAAATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
* * ** * ** ** *
798395 ATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTGAA-TTTTTTCGGA-AAATAAATTTA--TTTTA
129 ATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTT--GATAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * * * *
798456 AACTCTTCCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTT
192 AA-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTAT
* * *
798521 ATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTG-AATAAATAATTG
256 ATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTG
* * ** * * * * **
798584 TTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTGTTCGGTAAGCAGATTTATTTTTCCAAATCAT-TTCCT
318 TTCAAATAGTCATAATTATTT-AAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTT-TAAATC-TCTTAAT
* * * * *
798648 TATTAATTTTTTGAATGTAAATAAATCTAG-ATTATTTTATTTTAAATAAGCTTG-TAAG-A-TA
380 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT-TAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAATTA
* * * * * * **
798709 TAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTGAAAAATTATTTTAATA
442 -AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAA-AATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATA
* * * * * *
798774 G-CTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAA-AATA
503 GTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAA-A
* * * * *
798807 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTC
1 -TTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCC
* * * * * * * * ** * * **
798872 AAATAAACATATATGATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTG--A
65 AAATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAA
* * * * * * * *
798935 T-AAT--TGT--TGAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTCGGT-AATAGATTCACTTTTTAAA
130 TAAATAAT-TACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
798994 TCACTTACCTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTA
194 T--CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATA
** * * * * * *
799058 TGAATTCAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTT
257 TGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * ** * **
799123 AAATAGTTATAACAATTTGAATTTGTTCCGTAAACAAATT--TATTTTAAA-CTCTTGCTTATTA
321 AAATAGTCATAATTATTT-AAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
* * *** * * *
799185 ATTTTT-GAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCAT-TTATGAACTGAAACA
385 ATTTTTGGAA-TATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAATTAAAACA
* * * * * * *
799248 ATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTG-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATC
447 ATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAA--AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * ** *
799312 ATTATTTGAACTTGTTCGGTAAGTAGAT
509 ACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACA-AA
* * * * * * * *
799340 TTATTTTTCCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTTTTG-AATGTAAACAACTTTA-AATTATTTTAT
1 TTATTTTT-AAAATC-TCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTAA
* * * * * * ** * * * * * *
799402 TTCGAAGAAGCTTGTAAGATA-TGAAGCAAATATTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAGAATGATT
62 TCCAAATAAGCTTTTATGA-ACTAAAATAATTGTTTTAT-AATAAAACAAAAAGTCATAATAATT
** * ** * ** * * * * *
799465 TGAAATTGATAATTATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTTAA-TTAGCTTGGTAAACACATTTATTT
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* * ** *
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* * ** *
799591 TATATG-ATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGGAATAATGATTTGAAATTGATAAT
253 TATATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * ** * *
799655 TGTTGAAATGGCCATAATTA-TTAGAATTGATTT-GATAAACTGATTCACTTTTTAAATCACTTA
316 TGTTCAAATAGTCATAATTATTTA-AATTG-TTTAG-TAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTA
* * * ** *
799718 CTTAATAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTG-TATGAATT
378 ATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAATT
* * * * * * ** * *
799781 CAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATATCACAATGATTTTAAATAGACCATTGTTTAAATAG
441 AAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * *
799846 TCATAACAATTTGAATTTGTTCGATAAACAAA
504 TCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAA
* * * * *
799878 TT-TATTTT-AAA-CTCTTGCCTATTACTTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTT-ATCT
1 TTAT-TTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC-
*** * * * * *
799939 TGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTG-TTTAT-GTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTG
64 CAAATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAAT-AAAACAAAAAGTCATAAT-AATTTG
** * * * * *
800002 -AATAAATAATTGTTCAATTAGTCATTACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTT
127 AAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAACAAATTTA-TTTTT
* * * * * * * *
800065 TAAATCATTTCCTTATTAAATTTTTG-AATGTAAACAAATTTACATTATTTTATTTCGAATAAGC
190 TAAATC--TTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAAC
* * * * * * * * *
800129 TTGTAAG-ATATGAAGCAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATTA-ATA
252 TTATATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATA
* ** * * ** * * ** * *
800192 ATTATTTTAATA-ACTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTT
314 ATTGTTCAAATAGTC-ATAATTATTTAAATT-GTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
800256 ACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTA-CTATTATTTTATTTCGAATAAACAT-ATATG-A
377 AATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGC-ATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAA
* * * * * * * * * * *
800318 TCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAATAGGTAATGACAATTTGAAATTGATAATTTTTGAAA
439 T-TAAAACAATTATTTTATGACAAAATAA-AAGTCAT-AAAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * *
800383 TGGCCATAATTATTTGAACT-GATTCGGTAAACAGA
501 TAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGGTAAACAAA
* * * *
800418 TTCACTTTTT-AAAT-TACTTATTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 TT-A-TTTTTAAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
*** * ** * * * * * * * *
800481 TTGACTAAGCTCGTATGAATTCAAAA-AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTT
63 CCAAATAAGCTTTTATGAACT-AAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTG
* * ** * * ** * *
800545 AAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAACAATTTGAATTTG-TTCG-TAAACAAATTTA--TTTT
127 AAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-CTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTT
* * * * * *
800606 AAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT
191 AAA-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTA
** * * * *
800671 TATGAATTGAAAGAATTG-TTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGT
255 TATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * ** * * **
800735 TCAAATACTCATCACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAA-C-CATTTCTT
319 TCAAATAGTCATAATTATTT-AAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTT-AAATCTC-TTAATT
* * * * *
800798 ATTAATTTTT-GAATGTAAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG-TAAG-ATATG
381 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAAT-TA
* * * * **
800859 AAACAAATATTTTATCACTAAATAAAAGT-TTAGAATGATTTGAAATTA-ATAATTATTTTAATA
442 AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGTCATA-AA--ATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
800922 G-CTTTAGCTATTTGAA-TAGGCTCGATAAACACAT
503 GTC-ATAACTATTTGAACTA-GTTTGGTAAACA-AA
* * * * * * *
800956 TTATTTTT-TAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAAGATTAATAAATTAATTTTATTTTATTTCA
1 TTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCA
* * * * * * ** * * **
801020 AATAAACATATATG-A-TAAAAAAATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAA
66 AATAAGCTTTTATGAACTAAAATAA-TTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAA
** ** * * * * * * * * * *
801083 TTGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGTACTAATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAAT
130 TAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * **
801148 CACTTACTTATTAGTTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTCGTAT
195 --CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATAT
** * * * * *
801213 GAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTT
258 GAATAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * ** * **
801278 AAATAGTTATAACAATTTGAATTTGTTCCGTAAACAAATT--TATTTTAAA-CTCTTGCTTATTA
321 AAATAGTCATAATTATTT-AAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
** *** ** * *
801340 ATTTTT-GAATTATTAA-AAGATTAGTTTTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACA
385 ATTTTTGGAA-TATTAATAA-ATTAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGCTGATATGAATTAAAACA
* * * * * * * *
801403 ATTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCA
447 ATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * *
801468 CTATTTGAACTTGCTTAGTAAATAGAT
510 CTATTTGAACTAGTTTGGTAAACA-AA
* * * *
801495 TTATTTTTTCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
1 TTA-TTTTTAAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAAT
* * * * * * * * * * * * *
801557 TCAAATAAGCCTATAAGATA-TGAAACAAATATTTTATAATTAAACGAAAGGTCAGAATGATTTG
63 CCAAATAAGCTTTTATGA-ACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTG
* * ** * ** * * ** * *
801621 AAATTAATAATTATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTGTATTG-GCTCAGTAAACACATTTATTATT
127 AAATAAATAATTACTCAAATAGTC-ATAATTATTTGAACTGATTTGA-TAAACAAATTTATT-TT
* * * * * **** *
801684 TAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAGTATTATTAAATGAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGC
189 TTAA-ATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TTTGAATAAAC
* * * * * ** * * * *
801748 TTTTACGATTAGAAAA-AATTGGTTTCTGACAAAACAAATATCTTAATGACTTCAGATTAG-TAA
252 TTATATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAGATAA
* * * * * * * *
801811 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAG
315 TTGTTCAAATAGTCATAATTATTT-AAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAA
* * *
801876 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG-TATG-ATCA
379 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTCAAATAAGC-TGATATGAAT-T
* * * * * * * *
801939 AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATCATTCGAA-CG
441 AAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * ** *
802003 GCTATAATTATTTTAACTAATTCAGTAAACAGAT
504 TC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACA-AA
* * * * * * *
802037 TTATTTTT-TAAGCTCTCACTTATTAA-TTTAGTAAGTACTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
1 TTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCC
** * * * * * * * * * *
802100 ATCTAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTAT-GTCTAACCAAAAGGTTATAATGATTTTAA
65 AAATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAAT-AAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
* * * ** * * * * * * *
802164 ATAGACATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTG-TTCGTTAAATAGATTTATTTTTTTA
129 ATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTA
* * * * * * * ** *
802228 AATCTCTTTCTTACTAATTTATG-AATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCTAAATAGGCTTG
192 AA--TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTA
* * * * * ** * *
802292 TATGCACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCAAAACAACTTCAAATAGATAATTG
255 TATG-AATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * ** * * ** * ** * * *
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318 TTCAAATAGTCATAATTA-TTTAAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA
*** * * * * * *
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382 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTATTT-TATTCA-AATAAGC-TGATATGAATTAAA
* ** * * ** *
802483 ACAATTGTTTTACAACAATAGA-AAAAGGTCATAACAATTTGGAACAGATAATCGTTCATATAGT
444 ACAATTATTTTATGACAA-A-ATAAAA-GTCATAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
802547 CTTAACTATTTGAACT-GGTT--CAACACTTAGAT
505 CATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAA-AC--A-AA
* * * * ** * ** * * ***
802579 TTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCA
** ** * ** * * * * * * **
802644 AATAAAATAGTATGAAC-ATGACCAATTGTTTGATGACAAAATAAGAAGTTATAACGATTTGAAA
66 AATAAGCTTTTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAA
* * * * * * * * * *
802708 TAGATAGTTATTCAAATATTCAAAACTATTTGAAATGGTTT-AGTAAACATATTTACTTTTTAAA
130 TAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * * * *
802772 TCTCTTAATGATTATTTTTCTAAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTAT
194 --TCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTAT
* * * * ** *
802837 ATTAACAAAGACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT
256 ATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
** * ** * * *** * * *
802902 CATGTAGTC-TTATTATTTGAGCTAGTTTAGCAAATGGATT--TTTTTAAAAATTTCTTAGTTAT
320 CAAATAGTCATAATTATTT-AAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTT-TAAATCTCTTAATTAT
** * * * * * **
802964 TAATTTTCAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGATTATATGAACAAAAACA
383 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTC-AAATAAGCTGATATGAATTAAAACA
* * * * * ** * *
803029 ATTGTTTTATGATAGAACAAAGGGTTGTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
447 ATTATTTTATGACAAAATAAA-AGTCATAA-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ***
803094 CTATTTGAACTGGTTCAATAAACAAA
510 CTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAA
* * * * *
803120 TTTATTTTTTAAAA---C-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGAATTATTTTATTT
1 -TTA-TTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC
* * * ** * * * *
803180 CAAATAGGCTTCTAT--ATTGAAAGGCAATTGTTTTATGA-GAAACAAAAAAGTAATAACAATTT
64 CAAATAAGCTTTTATGAACT-AAA-ATAATTGTTTTATAATAAAAC-AAAAAGTCATAATAATTT
* * ** * * *
803242 GAAATAGATAGTTGTTTAAATGGACATAATTATTTGAAC-----TG--------ATTTATTTTTT
126 GAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTT
* * * * *
803294 AAATC-T-CTTATTAACTTTTGAAATATTAATATAA-TAGTATTACTTTATTTTGGATAAACTTT
191 AAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTA
* * *
803356 TATGAACT-CAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTG
255 TATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * **
803419 TTTAAATAGTCATTACTATTTAAATTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCTAATCTCTTGGTT
318 TTCAAATAGTCATAATTATTTAAATT-GTTTAGTAAACAAATTCATTTTTT-AAATCTCTTAATT
** * * * ***
803484 ATTAATTTTTCAAATGTTAATACATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTG-TATGAACCGAA
381 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTC-AAATAAGC-TGATATGAATTAAA
* * * * * *
803548 ACAATTATTCTATGACTAAACAAAATGT--TAAAATGATCTAAAATTA-AAAATTATTCTAAT-G
444 ACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAAAAT--T-TGAAA-TAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
803609 TCTTAACTATTTAAACT-G---GTTCAACAAA
504 TCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAA
* * * *
803637 TACATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATC
1 T-TATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC
* * * * * * * * * * *
803697 CAAATATGCTTGTATGATCAAAAATAATTATTTTATGAGAAAAGAAAGA-TCATAATGATTTGAG
64 CAAATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
** * **
803761 ATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAA
129 ATAAATAATTACTCAAATAGTCATAA
803787 CTTGCTTTTT
Statistics
Matches: 5933, Mismatches: 1388, Indels: 732
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
516 42 0.01
517 68 0.01
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519 53 0.01
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (535 bp):
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AATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAAT
AAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAA
TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
GTCATAATTATTTAAATTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTT
GGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCAAATAAGCTGATATGAATTAAAACAATTATTTTA
TGACAAAATAAAAGTCATAAAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
AGTTTGGTAAACAAA
Found at i:796976 original size:356 final size:357
Alignment explanation
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* * * * * * *
795571 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTGATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCTA
* * * * ** * *
795636 AATAAGCTAT-TATGAAC--AAAACCAATAGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
65 AATAAGCT-TGTATGAACTGAAAA--AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGA
* * * * * * *
795698 AATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAATAAATTTA-TTTTT
127 AATAGATAATTATTCAAATAGTTATAA-TTTTTGAACT-TGTT-TGATAAACAGATTTATTTTTT
* * * *
795760 AAGATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTTGGAATAAGCT
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** * * * * * * * *
795824 TGCATGAATAGAACCAATTATTTTATGATAAAACAAAAGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTG
251 TATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
795889 TTTAGATAGTCAAAACTATTTGAAATA-TTTTAGTAAA-TAGA
316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAAAA
* * *
795930 TTCTTTTT--AATTGTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTT-AT-T
1 TTATTTTTAAAATT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTAATCT
* * * * * * * * * *
795991 AAAGCAAACTTATATAAACTGAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAAAAGTCATTAATGAATTTG
64 AAA-TAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATC-GTAA-CAATTTG
* * * *
796056 AAATAGATAACTATTCAAATAGTTATGACTATTTTGAACTTGTTTGGTAAAACATATTTATTTTT
126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT-AAT-TTTTGAACTTGTTTGAT-AAACAGATTTATTTTT
* *
796121 TAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAAATAA
188 T-AAATC--TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-G-AATAA
* * * * ** * * *
796185 ACTTGA-ATGGATAGAAAGTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA--AGTTGAAATAAAT
248 GCTT-ATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
** ** * *
796247 AATTGCACTTATAATCATAA-TGATTTGAACTTATTTTGATAAA-AAAA
311 AATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TAGTTTGATAAACAAAA
* * *
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1 TTA-TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAAT
* * * * * ** ** **
796355 TTGAAATAAGGTTGTATGAA-TAGAAAAAATTCTTTTATAACAAAACAGAAGGTTATGGCAATTT
62 CT-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTT
* * * * *
796419 CAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTT-AGTAAACAGATTCATTTTT
125 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTT
* * * *
796483 TAAATCCCTTAATTATTAATTTTT-AGAATATTAATAACTTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGC
188 TAAAT--CTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
* * * * * ** * *
796547 TGATATGATCTAAAACAATTT-TTTTATGGCAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAAATAC
250 TTATATGAACAAAAAC-ATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * *
796611 TTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGATAAACATAA
313 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
*
796656 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATAAATTAGTATTATTTTAATCCAA
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATAAATTAGTATTATTTTAATCTAA
* * ** * * *
796721 ATAAGTTTTTATGAACTGAAATTATTGTTTTGTAATAGAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAAATA
66 ATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAAATA
* *
796786 AATAATTACTCAAATAGTTATAATTTTTGAAC-TGATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-
131 GATAATTATTCAAATAGTTATAATTTTTGAACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
796849 TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAATTTTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAAC
195 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAAC
*
796913 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
260 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * **
796978 GTCATAATTATTTAAATTGGTTAGCCAAACAAAA
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* * * * * *
797012 TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCT
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATT-AGTATTATTTTAATCT
* * * * *
797076 AAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGCTTTATGACAAAA-TAAAAAT-G-----ATTTGAAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAAA
* * * * * ** * *
797134 TAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTGTTTTTTAAAT
129 TAGATAATTATTCAAATAGTTATAA-TTTTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA-
* * ** * * *
797199 CTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTATAT
192 -TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATAT
* * * * * * *
797264 GAACAAAAATAATTGTTTTATGATCGAACCAAAGGTTATAATGATTTGAAATATG-CAATTATTC
256 GAACAAAAACATTTGTTTTATGA-CAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-GATAATTGTTC
* * * ** *
797328 AAATTGTCATAATTATTTAAACT-GATTCAATAAACAAAT
319 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGATAAACAAAA
* * * * * * ** *
797367 TTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGACTAATAAATTACTATTATTTTCTTTT
1 TTA-TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA-TTATAAATTAGTATTATTTTAATCT
* * * ** * * * * * ** ** **
797432 GAATAAACATAAATG-A-TAAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGA
64 AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGA
* * * * * ** * * *
797495 AATTGGTAATTGTTGAAATTGCAATAATTATTTGAAC-TGATTTCG-TAAACAAATTCACTTTTT
127 AATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTG-TTT-GATAAACAGATTTATTTTTT
* * *
797558 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTT-TAACTAAGCT
189 AAA--TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TAAGCT
* *** * * * * * * *
797622 TGTATGAATTCAGACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATT
251 TATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
797687 GTTTAAATAGTCATAACAATTTGAATTTGCTTGGTAAAC-AAA
315 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
* * * * * * *
797729 TTCA-TTTT-AAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTT
1 TT-ATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCT
* * * ** * ** * **
797791 AGATAAGCTTTTATGAACT-AAAACAATTTTTTTATGTCAAAACAAAAGGGTCATAATGATTTGA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAA-AATCGTAACAATTTGA
* * * * * *
797855 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTCCA
127 AATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTT-TA
* * *
797920 AATCATTTCCTTATTAATTTTTTG-AATGTAAATAAATTTAG-ATTATTTTATTTCGAATAAGCT
190 AATC--TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
* * ** ** * * *
797983 TGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTA-ATAA
251 TATATGA-ACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAA
* ** * * * * * * *
798046 TTATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGATAAA-AATAT
313 TTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAA-AA
* * * * ** * * *
798091 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACCATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCTA
* * * * * * * * ** ** **
798156 AATAAACATATAT-AA-TAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAA
65 AATAAGCTTGTATGAACT-GAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAA
* * * ** * * * *
798219 ATTGATAACTT-TTGAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTTGGTAAACAGACTCACTTTTTA
128 ATAGATAA-TTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTA
* * *
798282 AATC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTTC-ATTAAGCTTGT
190 AATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTAT
*** * ** * * * ** *
798343 ATGAATTCAGACAACTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTTAATAGACAATTGTT
254 ATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * ** * *
798408 TAAATAGTCATAACAATTTGAA-TTTTTTCGGA-AAATAAAT
318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT--GATAAACAAAA
* * * * * * * *
798448 TTA-TTTT-AAA-CTCTTCCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCTA
* * * ** * ** * * *
798510 GATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTG-AA
65 AATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAA-CAATTTGAAA
* * * * * * * *
798574 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTGTTCGGTAAGCAGATTTATTTTTCCAAA
129 TAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTT-TAAA
* * * ** *
798639 TCATTTCCTTATTAATTTTTTG-AATGTAAATAAATCTAG-ATTATTTTATTTTAAATAAGCTTG
192 TC--TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA
* * * ** * * * * *
798702 TAAG-ATATAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTGAAAAATTA
253 TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTG
** * * * * * * * *
798766 TTTTAATAG-CTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAA-AATAT
316 TTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAA-AA
* * * * * *
798808 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTT-ATTTC
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCT-
* * * * * * * * * * * *
798872 AAATAAACATATATGATC-AAAAACAATTGTTATATGAC-CAA-ACAAAA-GGTAATAA--CG-A
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAA
* * * * ** * * * * *
798930 TTTGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGGT-AATAGATTCACTTTTTAA
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * * *
798993 ATCACTTACCTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGT
191 AT--CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTAT
*** * * * * * *
799057 ATGAATTCAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTT
254 ATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
799122 TAAATAGTTATAACAATTTGAATTTGTTCCG-TAAACAAAT
318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAAACAAAA
* * * * * * * *
799162 TTA-TTTT-AAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCTA
* * ** * ** * * *
799224 GATAAGCATT-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTG-A
65 AATAAGC-TTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAA-CAATTTGAA
* * * * * * ** *
799287 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATCATTATTTGAACTTGTTCGGTAAGTAGATTTATTTTTCCAA
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTT-TAA
* * * * * * *
799352 ATCATTTCCTTATTAATTTTTTG-AATGTAAACAACTTTA-AATTATTTTATTTCGAAGAAGCTT
191 ATC--TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
* * ** * ** * * * *
799415 GTAAGATA-TGAAGCAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTGATAATT
252 ATATGA-ACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* ** * * * * * * * *
799479 ATTTTAATAG-CTTTAGCTATTTTAATTAGCTTGGTAAACACAT
315 GTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
* * * * *
799522 TTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTT-ATTTC
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCT-
* * * * * * * * * ***** **
799582 AAATAAACATATATGATC-AAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGGAATAATGATTTGAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAA
* * * * ** * * * *
799646 ATTGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTAGAA-TTGATTTGATAAACTGATTCACTTTTTAA
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * * *
799710 ATCACTTACTTAATAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGT
191 AT--CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTAT
*** * * ** * * **
799774 ATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATATCACAATGATTTTAAATAGACCATTGTT
254 ATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * *
799839 TAAATAGTCATAACAATTTGAATTTGTTCGATAAACAAAT
318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
* * * * * * *
799879 TTA-TTTT-AAA-CTCTTGCCTATTACTTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTT-ATCTT
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATC-T
** * * ** * ** * * *
799940 GGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTG-TTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTG-A
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAA-CAATTTGAA
* * * * * * *
800003 ATAAATAATTGTTCAATTAGTCATTACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAA
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTTA-TAATTTTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAA
* * * * *
800068 ATCATTTCCTTATTAAATTTTTG-AATGTAAACAAATTTA-CATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
191 ATC--TTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
* * ** * ** * * * *
800131 GTAAGATA-TGAAGCAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATTA-ATAAT
252 ATATGA-ACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAAT
* ** * * * * * * * * * *
800194 TATTTTAATA-ACTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAACACAT
314 TGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
* * * * * *
800238 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTT-ATTTC
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCT-
* * * * * * * * * * * ** ** *
800302 GAATAAACATATATGATC-AAAAACAATTGTTATATGACCAAACAATAGGTAATGACAATTTGAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAA
* * * * ** * * * *
800366 ATTGATAATTTTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAA
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * * * **
800430 ATTACTTATTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTCGT
191 A-T-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTAT
* * * *
800495 ATGAATTCAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTG
254 ATGAA--CAAAAACATTTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
800558 TTTAAATAGTTATAACAATTTGAATTTGTTCG-TAAACAAAT
316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
* * * * * * *
800599 TTA-TTTT-AAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCTA
* * * * ** * ** * ** *
800661 GATAAGCTTTTATGAATTGAAAGAATTG-TTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
800725 AAATAATTGTTCAAATACTCATCACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAAC
130 AGATAATTATTCAAATAGTTAT-AATTTTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AAAT
* * * * * *
800790 CATTTCTTATTAATTTTTG-AATGTAAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAA
193 C-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATAT
** ** * * * * * *
800853 GATA-TGAAACAAATATTTTATCACTAAATA-AAAGTTTAGAATGATTTGAAATTA-ATAATTAT
256 GA-ACAAAAACATTTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGT
** * * * * * *
800915 TTTAATAG-CTTTAGCTATTTGAA-TAGGCTCGATAAACACAT
317 TCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTA-GTTTGATAAACAAAA
* * * * * * * *
800956 TTATTTTT-TAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAAGATTAATAAATTAATTTTATTTT-ATTTC
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATCT-
* * * * * * * * ** ** *
801019 AAATAAACATATATG-A-TAAAAAAATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAA-TTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAA
* * * * ** * ** * * * *
801082 ATTGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGTACTAATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATT-TTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * **
801147 TCACTTACTTATTAGTTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTCGTA
192 T--CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATA
*** * * * * *
801212 TGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTT
255 TGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * *
801277 TAAATAGTTATAACAATTTGAATTTGTTCCG-TAAACAAAT
318 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAAACAAAA
* * * * * * * * *
801317 TTA-TTTT-AAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAAAGATTAGTTTTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATAA-ATTAGTATTATTTTAATCTA
* * * ** * ** * ** *
801379 GATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAAAT
* * * * * * *
801444 AAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGCTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTCAAA
130 AGATAATTATTCAAATAGTTAT-AATTTTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTT-AAA
* * * *
801508 TCATTTCCTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCCTAT
192 TC--TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTAT
* ** ** * * ** * *
801571 AAGATA-TGAAACAAATATTTTATAATTAAACGAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTA-ATAATTA
254 ATGA-ACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTG
** * * * * ** * * *
801634 TTTTAATAG-CTTTAGCTATTTGTA-TTGGCTCAGTAAACACAT
316 TTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAAAA
* * * *
801676 TTATTATTT-AAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAGTATTATTAAATGAGTATTATTTTTAA-C
1 TTATT-TTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-TAAATTAGTATTA-TTTTAATC
* * * * * * * * * * ** * *
801739 CAAATAAGCTTTTACG-ATTAGAAAAAATTGGTTTCTGACAAAA-CAAATATCTTAATGACTTCA
63 TAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAAAATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGA
* * * * * * *
801802 GATTAG-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTT
127 -AATAGATAATTATTCAAATAGTTATAA-TTTTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTT
* *
801865 AAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
189 AAATC--TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
* * * **
801930 GTATGATCAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATCA
252 ATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * * *
801995 TTCGAA-CGGCTATAATTATTTTAACTA-ATTCAGTAAACAGAT
316 TTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAAAA
* ** * * * * * * *
802037 TTATTTTT-TAAGCTCTCACTTATTAA-TTTAGTAAGTACTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
1 TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTG-AAATA-TTATAAATTAGTATTATTTTAATCT
** * ** * ** ** ** ** *
802100 ATCTAAGCTTGTATTAACT-AAAACAATTGTTTTATGTCTAACCAAAAGGTTATAATGATTTTAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTGAA
* * * * * * * * *
802164 ATAGACATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTGTTCGTTAAATAGATTTATTTTTTTAA
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTTATAA-TTTTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAA
* * * * * * * * *
802229 ATCTCTTTCTTACTAATTTATG-AATGTTAATAAATTAATATTAATTTA-TTCTAAATAGGCTTG
191 A--TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTA
* ** * * * * ** * *
802292 TATGCACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCAAAACAACTTCAAATAGATAATTGT
253 TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * ** *
802357 TCTAATAATCTTAACCAGTTGAACTAATTCAACAAA-AAAA
317 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
* * * * ** *
802397 TTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTAAAT-T
1 -TTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTAATCT
* * * * * * *
802461 AGAAAAAGCTTGTA-CAAAT-AAAACAATTGTTTTACAACAATAGAAAAAGGTCATAACAATTTG
64 A-AATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAA-ATCGTAACAATTTG
* * ** * * * * *
802524 GAACAGATAATCGTTCATATAGTCT-TAACTATTTGAAC-TGGTTCA-ACACTTAGATTTATTTT
126 AAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAA-TTTTTGAACTTGTTTGATAAAC--AGATTTATTTT
* * ** * ** * * *
802586 TTAATTTTTTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-A
187 TTAA--ATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
* ** * * * * * * * *
802650 ATAGTATGAACATGACCAATTGTTTGATGACAAAATAAGAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAG
250 TTA-TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * *
802715 TTATTCAAATATTCAAAACTATTTGAAATGGTTT-AGTAAACATAT
313 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAAAA
* * * * * * * *
802760 TTACTTTTT-AAATCTCTTAATGATTATTTTTCTAAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTT
1 TTA-TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTAATC
* * * * * * * * ** *
802824 TGAACAAACTTATATTAAC--AAAGACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
63 TAAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-A-AATTGTTTTATAACAAAAGAAAAAATCGTAACAATTTG
* * ** * * * ** *
802887 AAATAAATAATTGTTCATGTAGTCT-T-ATTATTTGAGCTAGTTT-AGCAAATGGATTT-TTTTA
126 AAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATAATT-TTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTT
* * * *
802948 AAAATTTCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAG
188 TAAA--TCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAG
* * * * ** ** *
803011 ATTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAGGGTTGTAACAATTTGAAATAAATAA
249 CTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* ** *
803076 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACAAAT
313 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAAA
* * * *
803121 TTATTTTTTAAAA----CT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGAATTATTTT-ATTT
1 TTA-TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTAATCT
* * * * * * * **
803180 CAAATAGGCTTCTAT--ATTGAAAGGCAATTGTTTTATGAGAAACA-AAAAAGTAATAACAATTT
64 -AAATAAGCTTGTATGAACTGAAA--AAATTGTTTTATAACAAA-AGAAAAAATCGTAACAATTT
* * * * * * *
803242 GAAATAGATAGTTGTTTAAAT-G-GA-CA----T-AA-TTATTTG---AACTGATTTATTTTTTA
125 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATTTTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTA
* * * * * *
803295 AATC-T-CTTATTAACTTTTGAAATATTAATATAA-TAGTATTACTTTATTTTGGATAAACTTTT
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** * * *
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*
801182 TAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTCGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAA
582 TAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAAT-AAAA
*
801247 GGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTTATAACAATTTGAATTTGTTCCGTAAA
646 GGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTGAATTTGTT-CGTAAA
801312 CAAATTTA
710 CAAATTTA
*
801320 TTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAA-AAGATTAGTTTTATTTTATTTTGGATAA
1 TTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGGATAA
* *
801384 GCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAAATA
65 GCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTGAATAAATA
* * *
801449 ATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGCTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCATT
130 ATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTCCAAATCATT
* * * *
801513 TCCTTATTAA-TTTTTGAATGTTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATAAGATA
194 TCCTTATTAATTTTTTGAATGTAAATAAATTTAGATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAAGATA
* * *
801577 TGAAACAAATATTTTATAATTAAACGAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTAATAATTATTTTAATA
259 TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTAATAATTATTTTAATA
* * * *
801642 GCTTTAGCTATTTGTATTGGCTCAGTAAACACATTTATTATTTAAATATCTTACTTATTAATTTT
324 GCTTTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * ** * * * * *
801707 TG-AAGTATTATTAAATGAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTTTACGATTAGAAAA-AATTG
389 TGAAAG-ATTAATAAATTACTATTATTTTAT-TTCAAATAAACATATATGA-TAAAAAACAATT-
* * ** * * * * * * * *
801769 GTT-TCTGACAAAACAAATA--TCTTAATGACTTCAGATT-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAAC
450 GTTATATGACCAAACAAA-AGGTAATAACGATTTGAAATTGA-TAATTGTTGAAATGGCCATAAT
* * * * * * *
801830 TATTTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
513 TATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTTGGAATAT
** * *
801895 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-A-TCAAAAACATTTGTTTTATGAC
574 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTC--AAACAATTGTTTTATGAC
* * * ** ** * * ** * * *
801958 AAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATCATTCGAA-CGGCTATAATTATTTTAACTA
637 AAAATAAAAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTC-ATAACAATTTGAATTT
* *
802022 ATTCAGTAAACAGATTTA
701 GTTC-GTAAACAAATTTA
* ** * * * * *****
802040 TTTTTTAAGCTCTCACTTATTAA-TTTAGTAAGTACTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCT
1 --TTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTG-AATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGAT
* * * * * * * *
802104 AAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGTCTAACCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGA
63 AAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTGAATAAA
* * * * * * * **
802169 CATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTGTTCGTTAAATAGATTTATTTTTTTAAATC-T
128 TAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTCCAAATCAT
* * * * * * * * *
802233 CTTTCTTACTAA-TTTATGAATGTTAATAAATTAATATTAATTTA-TTCTAAATAGGCTTGTATG
193 -TTCCTTATTAATTTTTTGAATGTAAATAAATTTAGATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAAG
* * * * * ** * * *
802296 CA-CTGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAATAAAAGGTCAAAACAACTTCAAA-TAGATAATTGTT
256 -ATATGAAACAAATATTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTA-ATAATTATT
* * * * * * *** *** * * *
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318 TTAATAGCT-TTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
** * * * * * * * *
802422 TAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTAAATT-AGAA-AAAGCTTGTA-CA-AATAAA
382 TAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCA-AATAAA-CATATATGATAA-AAA
* * * * * * * ** * * * * *
802483 ACAATTGTTTTA-CAACAATAGAAAAAGGTCATAACAATTTGGAACAGATAATCGTTCATATAGT
444 ACAATTGTTATATGACCAA-A-CAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTGAAATGGC
* * * * * * *** *
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507 CATAATTATTTGAACTGATTCGGTAA-AC--AGATTCACTTTTTAA----ATCACTTATTAATTT
*** * * ** * *
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565 TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCA--AACAATTG
* * * * * * * * * * * *
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628 TTTTATGACAAAATAA-AAGGTCACAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAACAA
* * * *
802736 TTTGAAATGGTTTAGTAAACATATTTA
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** * * * * *
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1 --TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTT-TGAATTATTAAG-AAATTAGTATTATTTTATTTTGG
* * * * * ** * *
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** * * * * ** * ** **
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124 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTCCAAA
* ** ** * * * * *
802952 T-TTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTACTAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGATT
189 TCAT-TTCCTTATTAATTTTTTGAATGTAAATAAATTTAG-ATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT
* * ** * * * * ** *
803014 ATATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAGAACAAAGGGT-TGTAACAATTTGAAATAAATAA
251 GTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTA-AACAAAAGGTCAG-AATGATTTGAAATTAATAA
* ** * * * * ** * *
803076 TTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAA--AC-T-
313 TTATTTTAATAGCT-TTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * ** ** * * *
803136 CTTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAGGCTTCTAT-ATTGA
377 CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATGA-TAA
** * * * * * * *
803200 AAGGCAATTGTTTTATGA-GAAACAAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATG
441 AAAACAATTGTTATATGACCAAAC-AAAAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTGAAATG
* * * *
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* * * *
803316 ATATTAATATAA-TAGTATTACTTTATTTTGGA-TAAACTTTTATGAACTCAAACAATTG-TTTA
570 ATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTT-GACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
803378 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTTAAATAGTCATTACTATTTAAA
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*
803443 TTGGTTCAGTAAACAAATTTA
698 TTTGTTC-GTAAACAAATTTA
* * * * * * * * **
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1 ---TTT-TAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGA
* * * * * *
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CTTATTAATTTTTTGAATGTAAATAAATTTAGATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAAGATATG
AAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATTAATAATTATTTTAATAGC
TTTAGCTATTTGAATTGGCTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
AAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATGATAAAAAACAATTGTTATA
TGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAA
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ATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCA
CAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTGAATTTGTTCGTAAACAAATT
TA
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Alignment explanation
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1 TATTATTTAAATTAG
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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128 TCATT-ACTATTTAAACTGGTTCA
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* ** * * ** * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * ** * **
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* * *
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* * * * * *
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** * * * ** *
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* * * **
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129 ACTATTTGAACT-TGTT-CGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * ** * *
804330 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATGAACAAAAAC
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAC
* * * * * *
804395 AATTGTTTTATTAAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATG
65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
804460 ACTATTTTAACTTGTTTGGTAAATATATTTA-CTTTTAAATCTCCTACCTA
129 ACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* *
804510 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAAACTTGTATGAATAGAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAAT-AAGCTTGTATGAATA-AA
* * *
804574 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGGC
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* * * *
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* * * *
804690 TTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATT-TCAAATATGCTTGTATGAACAGAAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
** *
804754 CAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTCAT
64 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
*** * * * *
804818 AACTATTTGAA-TGTGTTCAAAAAATATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTA
128 AACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *
804869 TTAATTTTTTTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-T-TAGAATAAGCTTATATGAATATAA
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* * * * *
804932 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGCCATAA-CAGTTTGAAATAGAAAATTATTCAAATAGTC
63 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
** * * * * * *
804996 ATAACTATTCAAACTTGTTTGGTACATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTGCTCA
126 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * *
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** * * *
805114 CAATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
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** * * * * *
805179 GTCAATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
128 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * * * * * *
805231 TTAATTATCAAAACATTAATAAATTAATATTATTTAAATCCAAATAAGCTTCTATAAACAAAACA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAACA
* * *
805296 ATTGTTTTTTGACAAAACAAATAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAACTAGTCATAA
66 ATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * * * *
805361 CTATTTGAATTTATTCGATAAATAGAGTTGTTCTTTAAATCTTTTACCTTA
130 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTA
* * * * *
805412 TTGATTGTCT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAAT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
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* * * * * * *
805475 -ATTTTATTTTATGACAAAACAAAAGT-TTAGA-GAAATTTGAAACAGGTAATCACTCAAATAGT
64 CA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATA-ATG--ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * *
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125 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGT-AAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * *
805590 TTAACTTTCA-AATATTAATAAATTAGAATTATGTTATT-TCGAATAAGCTTGTAGGAATAGAAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* * * * * * *
805653 CAATTATTTTGTGA-TAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAAGAGATAATTATTCAAACAGTTAAA
64 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** * * * *
805717 ACTATTTGCACTAG-TCAGGCCAACAGACTCATTTTTTAAATTTGTTACTTA
129 ACTATTTGAACTTGTTC-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * * *
805768 TTAATTTTTAGAAT-TTAATTAATTAGCCATTACTTTATTTTGAATAAGATTGGTATCAACAGAA
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* * * * * * *
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62 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAA--AGT-CATAATGATT-TGAAATAGATAATTA-TTCAAA-
* * * * *
805897 TA-TTATAACTAATTTCG-ACTGGTT-GATAAATAGATTTAATTTTTTTAAATCT-GT-C--A
121 TAGTCATAACT-ATTT-GAACTTGTTCGGTAAACAGATTT-A-TTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * ** * *
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* * * * ** *
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* * * *
806079 CTTAACTATTTGAA-TTGATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGA-TTA
125 CATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTA
* * * * * * * *
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1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAC
* * * * * *
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65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCA-
** * * * * * * *
806261 TAAACTATTTGAACTACTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCCCCTACTCA
127 T-AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* ** * *
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1 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAA
* * **
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*
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* * * * *
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* * * *
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* ** * * * * **
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1 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAC-TAGTCA
* * * * ** **
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* *
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1 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTATTCAACTAGTCA
* * * * *
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* * * **
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* *
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** * * *
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* * * *
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* * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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** ** * * * ** *
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * * *
805424 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATTTTATTTTATGA
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* * * * * * *
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189 CAAAACAAAAGGTCATA-AAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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185 ATGACAAAACAAAAG-GT-CATAA-AATT-TGAAATAGATAATTA-TTCAAA-TAGTCATAACT-
* * * * *
805908 ATTTCG-ACTGGTTGA-TAAATAGATTTAATTTTTTTAAATCT-GT-C--ATTAATTTTT-GAAA
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* * * * * *
805966 TATTAATAAGTTAATATTAAGTT-ATCTAACA-AA-CTTATATGAGTAAAAA
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* * * * ** *
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1 CAATTAT-TTT-ATGACAAAAC-AAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAACTAGT
* * ** * * *
806079 CTTAACTATTTGAA-TTGATTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGATTATTAATTTTC
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* * * * * * * *
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122 -TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAATTGTTTT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** ** * *
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* * * ** *
806379 CAATTGTTTTATGACAAAATAAATGTTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
1 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAAT
806429 AGTTCAAATT
Statistics
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AAAGGTCATAAAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
AACATATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTA
ATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
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* * * * ** * **
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* * * * *
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* *** * ** * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * *** **
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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*
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * *
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* * * * *
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* * ** * **
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* * * * * **
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** * * * * * * * * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * * * * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA-T-TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGAT-TTGA
* * * *
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62 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTTC-GAAAACAGATTTA-TTTTT
* * * *
809579 TAAATCCCTTACTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
124 TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * ** * * ** **** * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTT-TTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATT-TGAAA
* * * * ** ** ** ** *
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* * * * ** * * * * ****
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* * * * **** * *
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* * * * * ** * *
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* *
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123 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
** * * * * *
809985 AATAA--TT-T-TGAATGAACA-AATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATAATTTCAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * *
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65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTC-GAAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* ** * * * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * * * * *
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65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTCGAAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * *
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* *** * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** ** * *
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65 AGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTGGTTTCGAAAACAGATTTA-TTTTTTAAA
* * * * * *
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* * * * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * *
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65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTCGA-AAACAGATTTATTTTTT-AAA
* * ** * * * * * *
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128 TCTCTT-ACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* *** * * * * *
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1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** * * * *
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65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTCGA-AAACAGATTTATTTTTTAAAT
** * * **
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* * * * * ** *
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1 AATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* **
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* ** *
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** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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*
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* ** * **
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* * * * * * **
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** * * * ** * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * ** * *
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* ** * * * **
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129 CTCTTACTTATTAATTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * * *
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193 AATATAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTAAAATAGATAATAGTTCAA
** * * * *
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258 ATAGTCATAACTATTTGAATTAGT-TGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-T-C--ATTAA
* * * * * *
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* * * ** * * * * * *
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1 AATAAGCTTATATGAACAAAAACAA-T-TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGAT-TTGA
* * * * ** * *
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62 AATAGATAATTGTTCAAATAGCCTTAA-CTATTTGAACTGGTTTGGAAAACAGATTTA-TTTTTT
* * * *
809580 AAATCCCTTACTCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCT
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187 TG
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ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
Found at i:809878 original size:18 final size:18
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*
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1 ATAATT
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809918 ATAGATTTAG
** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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*
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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* * ** * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * **
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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** *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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** * * * * * * * ** * * *
811257 TGAAATAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATGGATAATTATTCTAATA
255 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATA
* * * ** *
811322 GTTTTAACTATTTAAACTT-GTTCGACAAACACATTTAT
320 GTTATAACTATTT-GA-TTAGTTAGGTAAACA-AATTAT
* * ***
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* * * *** * * * ** * **
811422 ATAATCTTCTATG-A-TAAAAAACAATTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAGCGATTTGAGATTG
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** * * **
811484 ATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAA-AAATTTTATTTTTTAAATCT
127 ATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TTGTTTAGTAAACAAA--TTATTTTTTAAATCT
* * * * *
811548 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGA
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* * * * ** *
811612 TA-AAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATCGATAATTGTTCAA
253 -ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAA
* ** * * * * * * *
811676 ATGGCCA-AATTTATTTTAACT-GATTCGATAAACATA-TGT
317 ATAGTTATAA-CTA-TTTGATTAG-TTAGGTAAACAAATTAT
* ** *
811715 TTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCTATG--
1 TTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-T-TGAA
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Statistics
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (355 bp):
TTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
GCTTGTATGAATTGAAAAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
TTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGTTTAGTAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTAATT
ATTAATTTTCAGAATATTAATAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAAC
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTTATA
ACTATTTGATTAGTTAGGTAAACAAATTAT
Found at i:811234 original size:541 final size:531
Alignment explanation
Indices: 809873--811677 Score: 1565
Period size: 541 Copynumber: 3.4 Consensus size: 531
809863 GTTCAAATAG
* * * ** * * *
809873 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAATTGTTTTCGTGAATAGATTTA-GTTTTTAAAT
1 AGATAATTGTTCAAATAGT--TAACTATTTGAATTGGTTAAGT-AAAAAATTTATTTTTTTAAAT
** * * * *
809937 CTC-T--TT-TTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCTAAATAA--TT-T-T
63 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
** * * *
809994 GAATGAACA-AATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATAATTTCAAATAGATAATTGTTCA
128 GAACAAAAATAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
810058 AATGGACATGACTATTTGAACTT-TTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAACTATTA
193 AATAGTCATAACTATTTG-ACTTGTTT-AGTAAACAAA-TTATTTTTTAAATCT-CTTATTA-TA
** * * * ** * *
810122 ATTTTCAGAA--TATAAATAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAACAAAAACAT
253 ATTTTTTGAAGTTATAAAT--TT-GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-GATTAGAAACAA
* ** *
810185 TTGTTTTATGACAAAA-AAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAA
314 TTGTTTTATGACAAAACAAAAA-GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAA
* *
810249 TTATTTGATCTAGTTAGGTAAACAGAATTACTTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
378 TTATTTGAACTATTTA-GTAAACAG-ATTAC-TTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTG-AAT
* * * *
810314 ACTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAA-AAGTTGTTTTGTG
439 ATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAA-TTGTTTTATG
* * *
810377 TCAAAAGAAATGGTCATAACGATTTGAAAT
502 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * *
810407 AGATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGCAAAAAA-TTA-TTTTTTAAATC
1 AGATAATTGTTCAAATAG--TTAACTATTTGAATTGGTTAAGTAAAAAATTTATTTTTTTAAATC
* * * * * * * **
810470 TCTTAGTTATTGATTTTGGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTACA
64 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * *
810535 AACAAAAATAATTGTTTTATGAT-AGAACAAAAGGTTATAACGATTTCAAGTATACAATTGTTTA
129 AACAAAAATAATTATTTTATG-TCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * *
810599 AATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAACATACTTATTTTTTAAATCTCTTCTTATTACT
193 AATAGTCATAACTATTTGACTT-GTTTAGTAAACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTATTATAATT
* *
810664 TTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTACGATTAGAAACAATTG
256 TTTTG-AAG-TT-ATAAATTTGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-GATTAGAAACAATTG
* * * * * **
810729 TTATATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTGAAATGGCCATAATTAT
317 TTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTAT
*
810794 TTGAGCTGATTTAGTAAACAGATTCACTTTTTAAATTAT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
382 TTGAACT-ATTTAGTAAACAGATT-ACTTTTTAAATT-TCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTA
*
810858 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
443 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
*
810923 CAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
508 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * **
810947 AAAGAATTGTTCAAATAGTTGAACTATTTGAATTTATTAAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-C
1 AGATAATTGTTCAAATAGTT-AACTATTTGAATTGGTTAAGTAAA-AAATTTATTTTTTTAAATC
* * * * *
811011 TCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGACATTAGTATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATG
64 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
811076 AACTAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAA
129 AACAAAAATAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *
811141 ATAGTCATAACTATTTGACTTGCTTAATAAATAGATGTATTTTTTCAAATCTTTTGATTACTAAT
194 ATAGTCATAACTATTTGACTTGTTTAGTAAACAAAT-TATTTTTT-AAATCTCTT-ATTA-TAAT
* * * * * * *
811206 TTTTTGAAGTTAGTAAATTTGGATTATTTTATTTTGAATAAGCCTGTAAATT-GAAATAAATATT
255 TTTTTGAAGTTA-TAAATTTGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAGATTAGAAACAATTGTT
* * * * * * *
811270 TTATGACTAAACAAAAGGTCAA-AATGATTTGAAATGGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATT
319 TTATGACAAAACAAAAAGT-AATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATT
* * * * *
811334 TAAACT-TGTTCGACAAACACATTTA-TGTTTT-AATCCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATT
383 TGAACTAT-TTAG-TAAACAGA-TTACT-TTTTAAAT-TTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATT
* *** * * **
811396 ATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCGAATAATCTTCTATG-ATAAAAAACAA---TTTTATGACA
442 AATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
811456 AAAC-AAAGATCTTAGCGATTTGAGAT
505 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* ** * **
811482 TGATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAAAAATTT-TATTTTTTAAAT
1 AGATAATTGTTCAAATAGT--TAACTATTTGAATTGGTTAAGTAAAAAATTTAT-TTTTTTAAAT
* *
811546 CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-ATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTAT
63 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * *
811610 GATA-AAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATCGATAATTGTTC
128 GA-ACAAAAATAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTC
811674 AAAT
192 AAAT
811678 GGCCAAATTT
Statistics
Matches: 1028, Mismatches: 191, Indels: 103
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
532 15 0.01
533 5 0.00
534 35 0.03
535 129 0.13
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537 2 0.00
538 14 0.01
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543 9 0.01
544 6 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (531 bp):
AGATAATTGTTCAAATAGTTAACTATTTGAATTGGTTAAGTAAAAAATTTATTTTTTTAAATCTC
TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
CAAAAATAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAAT
AGTCATAACTATTTGACTTGTTTAGTAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTATTATAATTTTTTG
AAGTTATAAATTTGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAGATTAGAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAT
TTAGTAAACAGATTACTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAAT
Found at i:812686 original size:361 final size:356
Alignment explanation
Indices: 812239--817304 Score: 2763
Period size: 355 Copynumber: 14.1 Consensus size: 356
812229 TATTCGGTTA
* * * *
812239 AAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAACATAAATGTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGGAAGAG-TTTAAAAAATAAATTTG
* * * ** * * * * *
812303 TTT-GTCGAACCAATTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAAC
64 TTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * *
812367 CTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTATTTCATAACTTACAGGCTTATTCAAAATAAAATAATCCAA
128 CTTTTGTTT-GTCATAAAATATTTGTTTCATAACATACA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
812432 ATTTACTAACTTCAAAAAATTAATAATCAAAAGATTTGAAAAAATAGATCTATTTATTAAGCAAG
191 ATTTATTAAATTCTAAAAATTAATAAT-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * *
812497 TT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACA
254 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACA
* *
812561 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATGCAAAAT
319 TAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* *
812600 AAAATAATACTAATGTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAGTTT-AAAAAATAAATTTGT
* * * *
812665 TTACTCAATAAATTCAAATAGTT-CGACTATTTGAACAATTCTCTATTTAAAATCGTTATGACCT
65 TTACTCAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
812729 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTAATCAAAAATAAAATAATACTA
130 TTTG-TTTGTCATAAAATATTTGTTTCATA-ACATAC-AGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTA
* *
812793 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-ATAATTTAAAAAAGTGAATCTGTTTACTAAATC
191 ATTTATTAA-ATTCTAAAAATTAATAA-TAAGA-GATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACTAAA-C
* * * * * * * * *
812857 -AGCTCAAATAATTATGGCCATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTT-
251 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * **
812920 -CATATAACAATTGTTTCTAATCGTACAAGCTTATTTGAAAT
316 ACATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
812961 AAAATAATACTAA-TTATTAATCTTTCAAAAAGTAATCA-G-AGA-TTT-AAAAATAAGTATGTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAGTTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * * * *
813021 TAC-CAGACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTGTATACTTGAAATCGTTATAACCT
66 TACTCA-ACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * ** ***
813085 TTTGTTCTATCATAAAACAATTAT-TTTTGT-TTGTACTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
130 TTTGTT-TGTCATAAAA-TATT-TGTTTCATAACATAC-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * ** * * * * *
813148 ATCTAATAATATTCCCAAAATCAGTAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TTTTTCGCTGAACCA
191 ATTTATTAA-ATTCTAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACT-AAACA
* * * * * * *
813211 A-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTATCTATTTCGAATCGTTATGACCATTTGCTTTGA
252 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA
* * *
813275 CATAAAACAACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAAT
317 CATAAAACAA-TTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
813316 AAAATAA-AATGAATTTACTAGTATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAT-AATTCT
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-GAAGAGTTTAAAAAATAAATT-T
* * * * * *
813379 ATTTAC-CTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGA
63 GTTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * ** * * *
813443 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTT-TTTGTTCATATA-AGTCGT-TTCAAAATAAAATAAT
127 CCTTTTG-TTTGTCAT-AAA-ATAT-TTGTTTCATAACATACAG-CTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * *
813505 GCTAA-TTATTTATATTCTGAAAATTAATAGTTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
187 ACTAATTTA-TTAAATTCTAAAAATTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* * * *
813569 CAAGTTCAAATAGTCAT-ATTCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTATTATGACCTTTTGTTT
250 CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * *
813633 TGCCATAAAACAATCTG-TTCATTCA-A-AA--TTATTTAGAAT
314 TGACATAAAACAAT-TGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * ** * * * * *
813672 AAAATAATACTGATCTATTAATATTTTGAAAATTAA-AAAG-AGA-TTTAAAAACTGAATCT-AT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAGTTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * * *
813733 T-CACAAAAACAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC
66 TACTCAACAA-A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * ** ** * ** * *
813797 TTTAT-TTTGTCACAAAACAATTGTTTTTTTTTTCATGCAAGCTTATTCGTATTATAATAATACT
129 TTT-TGTTTGTCATAAAA-TATT-TGTTTCATAACATAC-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * * **
813861 AACTTAATAATATT-TCAAAAA-T--TAATAAGAGATTAAAAAAAT-AA-GTATTTGCCAAATTA
190 AATTTATTAA-ATTCT-AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * *
813920 GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTTTAG
253 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTT-G
* * * * *
813985 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCGTGCAAGCTTATTTAAAAT
316 ACATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
814027 AAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGTAAGGGATTTAAAAAAATAAATATG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAG-TTT-AAAAAATAAATTTG
* * * * * *
814092 TTTACTGAACAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTTTCTATTTAAAGAT-GTTACGA
64 TTTACTCAACAAATTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCGTTATGA
* * * * * **
814155 ACTTTTGTTTGTCAAAAAAAATATTGTTTCAGTTTATAAATA-A-CTTAGTCAAAATAAAATTTG
127 CCTTTTGTTTGTCATAAAATAT-TTGTTTCA---TA-ACATACAGCTTATTCAAAATAAAA-TAA
* * * * * * * * *
814218 TATTACTTTACTAATATTTTGAAAACTAATAAGCAAGAGA-TTAAAAACTAAATTTGTTTACTAG
186 TACTAATTTATTAA-ATTCTAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA-
* * ** * * *
814282 ACCAA-TACAAATACCTATGACTATTTAAACAATTA-CTATCTCAAATCAATTAT-ATC-TTTGT
248 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGT
* * *** *
814343 TTTGTCATAAAAC-ATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTTGGAGT
312 TTTGACATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * ** * * * *
814388 AGAATATTGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGGAGATTTAAAAAAATAAATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAA-GAG-TTT-AAAAAATAAATTT
* ** * * * * **
814452 GTTTACTGAACCAGTTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAACCATTCCG
63 GTTTACTCAA-CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATG
* * * ** * *
814517 ACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-AGT-TCATACATGCTTATTTGAACTGAAATAATA
126 ACCTTTTGTTT-GTCATAAAATATTTGTTTCA-TAACATACA-GCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * *
814580 CTATTTTATTAACA-TCTAGAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAA
188 CTAATTTATTAA-ATTCTA-AAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAA
* * *
814644 ACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
249 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * ** * *
814709 T-ATAATAAAACAATTGTTTCAATTTTTAAAAGTTTATTC-AAAT
314 TGA-CATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * **
814752 TAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAACTTGG-AGA-TTTAAAAAATAAATCA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA---GGAAGAGTTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * *
814815 ATTTA-TCGAATC--AGTCAAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
63 GTTTACTC-AA-CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * *
814877 AACATTTT-TTTGTCATAAACA-ATTGTTTTTCATCATATA-AGCCTATTCAGAAT-AAATAATA
126 -ACCTTTTGTTTGTCATAAA-ATATT-TGTTTCATAACATACAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * *
814938 CTAA-TTATTAATATT-TCAAAACTTAATGAGTAGGTGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTA-TCGA
188 CTAATTTATTAA-ATTCT-AAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AA
* * * ** *
814999 ACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATATATTTTGAATCATTATAACCTTTTGTTT
249 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
815064 TGTCATAAAAAAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT
314 TGACATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * ** ** *
815108 AAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAGATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGGAAGAG-TTTAAAAAATAAATTTG
* * * * *
815172 TTTTC-CAAGTC-AATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
64 TTTACTCAA--CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* ** * * * * *
815235 TCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTT-TTTGTTCATATA-AGTTTGTTCAGAATAAAATAATA
127 CCTTTTG-TTTGTCATAAAAT--AT-TTGTTTCATAACATACAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * *
815298 TTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAATGAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC
188 CTAATTTATTAA-ATTCT-AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* * * * ** * ** *
815359 CAGTTTAATTAGTTATAAAAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTG
251 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
815424 TCATAAAATACTTTTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTCAAAAT
316 ACATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAG-CTTATTCAAAAT
* * * ** * * * * *
815466 AAAGTAAT-GTAATTAATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAATAAAAATTTAAAAAATGAATCTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGGAAGAGTTTAAAAAATAAATTTGT
** * * * * * *
815529 TGGC-CTGACTAGTGT-AAATAGTT-TGACTGTTTGAACAATTATCTCTTTCAAATCATTATGAC
65 TTACTC-AACAAAT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * * * * *
815591 CTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTC-TATTCCTACAAGCTTAATCAGAATAACATAATTCT
128 CTTTTG-TTTGTCATAAAATATTTGTTTCATA-ACATAC-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * *
815655 AATTTATTAATATTCTAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAACTAAATATGTTTATCGAATC-A
190 AATTTATTAA-ATTCTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAA
* *** * *** *
815716 CTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTT-AT
253 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA-
* * * *
815780 CATAAAATAATTTTTTATATTCATACAATCTTATTTC-AATT
317 CATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAAAT
* * * * * *
815821 AAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAAAACTCT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGGAAGAG-TTTAAAAAATAAA-TTT
* * * * * * *
815885 ATTTTC-CAAATAAATTCAAATAGTTATGACTAGTT-ATATAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
63 GTTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * ** * * *
815948 ACTTTTTATTTTATCAAAAAACAATTGGTTTTGT-TCATAAAAGCTTATTTGGATTAGAATAATA
126 ACCTTTT-GTTTGTCATAAAA-TATTTGTTTCATAACAT-ACAGCTTA-TT-CA--A-AATAA-A
* * * *
816012 TTAATTTATTAATGTTTTGATAATTAATTTATTCATATTTCGATAATTAATAAGTAAAAGATTTA
182 ATAA--TACTAA----TT--T-ATTAA---ATTC-TA-----AAAATTAATAA-TAAGAGATTTA
* ** * * *
816077 AAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
228 AAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
816142 AATCATTATGACATTTTG-TTTCATCATAAAACAATTGTATCTGTTAATATAGGCTTATTCAAAA
293 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAACAATTGT-TTTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
816206 T
356 T
* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGG-AAGAG-TTTAAAAAATAAATTT
* * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * ** * * *
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187 ACTAATTTATTAA-ATTCTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* * * * * *
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251 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * *
816867 TCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGAATT
314 TGA-CATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
816912 AAAGTAATACTAATTTAAT-A-ATTCCAACAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGAG-TTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * ** * *
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65 TTACTCAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * *
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* ** * * *
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* *
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* * * * *
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* *
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Statistics
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TTAAATTCTAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * *
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* * *
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** ** * * **
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127 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * * * ** *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAATT
** * * * * *
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815053 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAG
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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*
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* * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * ** * * * ** *
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*** * * * * ** * *
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* *
814632 TCTATTTACCA-AACAAATTCAAATAGTTATGACT
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* * *
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* ** * * * * * * * *
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* * * * * *
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130 AGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AA-CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
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* * * * ***
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255 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAA
* * * *
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* * * *
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445 TAAAATAATACTAAT-TATTAATATT-T-CAAA--AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * *
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504 GTTTACCAGA-ACAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
815202 ATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAG
* * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * ** ** * *
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* * * * * * *
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1 ATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTT-
* * * * * * * *
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63 TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
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128 TAAGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * * * *
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192 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAG
* * * * * *
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255 CTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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443 AATAAAATAATACTA-ATTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * *
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* * * ** * ** * ** ** * *
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1 A--TT-TGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCT-TTTGTTTTGACATAAAAC-AATT
* * * * * ** *
817422 -TAATAATA-TTC-TAAAA-ATTAGT-AAGAGATTTTAAAAAAATA--AATGTATT--T-GCTGA
59 GT--T-TTAGTTCATAAAAGCTTATTCAA-A-A---TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * ** * **
817477 ACCAGTTCAA-ATAGTTAAGACTATT--AGAATAATATTTAATT--TCAA-ATCGTTCTAA-CCT
116 A-AAATT-AATA-AG-TAAGAGT-TTAAAAAATAA-ATCTATTTACTCAACA-AATTCAAATAGT
* ** * * ** * ** * * * ** *
817535 TTTGTTTAGTCAT-AA-AATAAT-TATTTCAGTTC-ATACAAGC-TT-ATTCGAAATAAAATAAT
174 TATGACTA-T-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * ** * *
817594 ACTAATTTGCTA-ACATTTGA-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAA-AATA--AATTTGTT-
237 --T-GTTT-CTATTCA--T-ACAAGCTT-AT--TCAA-A-A--T-AAAATAATACTAATTTATTA
* * ** * * *** *
817653 -TA-CCGAACAAATTCAA-ATAGTTATGACTATTTAAACAAT-TATGAATTTA--AAATC-GTT-
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* * * * * * * * * ****
817710 ATGACCTTTTGTTTTG-CCA--TAAACAATTGTTTTAGTTCGTAAA-AACTTAT--CC---AAAA
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* * * * * * *
817766 TA-AATAATACTACTGTATTAATATTTCA-A-AAG-TTA-ATAAGAGATTTAAA-AA-A-TAA--
402 TATCATAAAACAATTGT-TT-CTA-TTCATACAAGCTTATTTAA-A-A-TAAAATAATACTAATT
* * * ** * * * *** *
817821 A-TCA-GTTT-AAATAATT-AT-GGCCATTTAAACAACT--ATCTATTT--CA-AATTGTT--AT
461 ATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGAGATTTAAA-AAATAAATATGTTTACCAGAACAATTCAAA
* * **
817874 TACTTTTTTCT
524 TAGTTATGACT
* * * * ***** * * *
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1 ATT-T-G---AACAATTATCTATTTCAA-ATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGACATAAAAC-AAT
* * * * * * *
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58 TGT--T-TTAGTTCATAAAAGCTTATTCAA---A-AT-A-AAATAATA-CTAATTTA-TTAA-TA
* * ** * * * * * *
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111 TTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAAT-TCA-AA--T
* * * * * **** * * *** *** *
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171 AGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCT-TT-GTTTTGTCATAAA
** ** * * * *** *
818116 ACTAATT-TAGTAATATTC-TA-AAAATTAAT--AACTAAAA-AAT-TTAAAAAATAAATCCATT
232 AC-AATTGT--TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT--A-T
* * * * * * * *** * * * * * *
818174 TGCT--AAACTAGT---TCAAATAGTT-AAGACTACA--TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
291 T-CTAAAAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTT
* * * * ** **
818231 ATGACCT-TTTG-----TTTTCTCA--T-AAAACAAT-TG-TC-TTTG-TTA--ATGTAA-GTTT
354 ATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTATCATAAAACAATT
* * ** * * * *
818280 G-TTCTA--AATA-AA----A--TAATACTAATTTATTAAT-ATT-TTAGAAAATT----AATTA
417 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAA-AATAAAATAATACTAATTATTA-ATATTTCAAAAATTA
* * * * * *
818329 GTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATATTTACTA-AACCATTTCAAATAGTTTTGACT
480 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAGAA-CAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * **
818384 ATTT-AATAACTATTTATTTTAAATGGTTAT-AACTTCTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTCCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGACATAAAACAATT-GTTTT
** ** * * * **
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64 AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * * * * *
818511 AAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGC-CGAACTAATTCAAATAGTTAAGACTATGTGAACAAT
129 AAG-AGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
818575 TATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTAAAAAAATTGTTT-TATTCATACAAG
192 TATCTATTTCAAATCGTTATGACC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * * * *
818639 CTT-TTACTAATTAAAATAATGCTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATGAA-TGAGAGATTTA
255 CTTATT-CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AAGT-AAAAATTTA
* * * * * * * *
818702 AAAAATAAATTTTTTTGCCGAATCAGTTCAAATGGTTAAG-CTTATTAGAACAATTATCTATTTG
317 AAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
818766 AAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCCTATTCAGA
381 AAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAA
* * * * *
818830 ATGAATTAATACTAATCTATTAACATTTGGAAATTAA-TAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATA
444 ATAAAATAATACTAAT-TATTAATATTT-CAAA--AATTAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATA
* * *
818894 TGTTTAACA-AACAAGTTCAAATAATTATTACT
503 TGTTTACCAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
818926 ATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGGTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAG
* * * ** * * *
818991 TTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACATACTAAAA-TAATAAGT
66 TTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
** ** * * * ** **
819054 AAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCGTTTGAATGA
129 AAG-AGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
* * ** * *
819117 TTGTCTATTTCAAATCATTGCGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATACAA
191 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * *
819181 GCTTATTCAAAATAAAACAATAGTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-A
254 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* * * * * * * * *
819244 AAAATAAATATATTTACTAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAAGAATTAT-TAATCCAA
318 AAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * ***
819308 GTCATTAAGA--TATTTGTTTTATCAGAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAGCTTATTT-GGT
383 ATCATTATGACCT-TTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* *
819369 TAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT
445 T-AAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * *
819434 GTTTATC-GAGCCAATTCAAATAGTTA-AAGCT
504 GTTTACCAGA-ACAATTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * * * * * * *
819465 ATTAGAATAATTAT-TAATTTTAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTGGTCATAATATATTTGTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTA
* * * *
819529 -TATCTTACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAA
65 GT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * * *
819591 GGAA-ATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAC-CGAATAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAA
127 GTAAGA-G-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
819654 CAATTATTTATTTAAAATCATCATGACCCTTTGTTTTGACATAAAACAATTCTTTC-AGTTCATA
188 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * * * * * * *
819718 AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTCTTAATAATTCAAAAAAAATTACTAAGCAAGAG
251 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC--TAAAAATTAATAAGTAAAAA
* * * *
819783 TTT--AAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTA
313 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * ** * * * ** * * *
819845 TTTAAAATCGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAAAAATTGTTTGAATTCATACAAGCTCAGTC
377 TTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* * *
819910 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAA
441 AAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A--GATTTAAAAAATAAA
* * * * *
819975 TCTATTTACCA-AATCAGTTCAAATAGTTATGGCC
501 TATGTTTACCAGAA-CAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
820009 A-TTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTCACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
820072 GATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAACTT-GTAAGT
65 GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGT
* * * * *
820136 AAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TGTTTA-TCGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
129 AAGAG-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * *
820199 TT-GCATACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATA
191 TTATC-TA-TTTCAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * ** * * *
820262 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-
253 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTA
* * * * * *
820326 AAAAACAAAT-TTTTTGC-CAAACTAGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTT
317 AAAAATAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * **
820388 CAAATCATT-T----TTGT-TTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCATACTAGTTTGTTTGGAA
380 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * *
820447 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT
445 TAAAATAATACT-AA-TTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * *
820511 GCTTGCCTA-ACCAGTTCAAATAATTATGACT
504 GTTTACC-AGAACAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * **
820542 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTCTGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAG
* * * * *
820607 TTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAA
66 TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
820671 -A-TTTAAAAGATAAATTTGTTTA-TCAA-ATTAGTTCAAAAAGTTATGACTATTT-AAGTAATT
131 GAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACA--AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATT
* * ** * * * ** * *
820731 ATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCTTTTGTTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAACT
193 ATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
** * * * * * *
820796 TATT-TGATTAAAATAACACTACTTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA
257 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA
* * * * * * *
820860 TAAATATGTTTACT-AAACTAGATCAAATAATTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATC
322 TAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
820924 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTT-TAGTTCATATCAA-CTTATTTGAAAA-A
386 ATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTT-AAAATA
** * * * * *
820985 AAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATTAGGAGATTTAGAAAATGAATCTATG
447 AAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* *
821050 TACC-GAACAAGTTTAAATAATTATG-CT
507 TACCAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
821077 A--T-AAC-CTTTTGTTTTGTCACCAAATTGTT-T----TTTCTG--TT--CAT---ACAA--G-
1 ATTTGAACAATTATCTATT-T---CAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGACATAAAACAATTGT
* * * * ** * * *** **
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61 TTTAGTTC--ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAA-A-T
* * ****** * * *
821183 TAAAAAATAA-A-TTTGTTTCCTAAA-C-A---AGT--TCAAA-TC---T--TTATGACTAATTG
121 TAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
821233 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
186 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * * * * * **
821298 ACAAACTTATTCAGATTAAAATAATATTAATATATAAATATTTTGATGAA-TAATAAGTAAAAGA
250 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAA-A
*
821362 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAACAATTATCT
313 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
821425 ATTTCAAAACATTGTGACCTTTTGTTT-TGTAAAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTAT
376 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAT-CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT
* *
821488 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAT
439 TTAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
821552 TAATCTATTTA-CTGAACATGTTCAAATAGTTATGACT
498 AAATATGTTTACCAGAACA-ATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
821589 ATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCT-
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATT-GTTTTA
** * * * *
821652 GTTCATGCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTCATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
65 GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * *
821716 AAAAATTTAAAAAATAAATAT-TTTTCT-AACACGTTCAAATATTTGTGACTATTTGAACAATTA
129 AAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * * * *
821779 TCTATTTCAAGTCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCACAAAAGCTT
194 TCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * *
821844 ATTCGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAAAATT-TCAAATATTAATAAGTAAAATATTTAAAAA
258 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAA
* * * * * * *
821907 AGTAAATCTATTTACTGAGTGAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAAT
321 A-TAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * * * **
821972 TGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATATTCATAGAA-TTTATTCGAAATAAA
385 CATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAA
* * *
822036 ATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTC
449 ATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
** * *
822100 A-TTGAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATT
508 ACCAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * * *
822126 GTTTGAGCTATAATCTATTTCAAATGGTTATAACACTTTTATTTTGTCGTAAAATAATTATTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-T
* * * *
822191 A-TTTATAAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-
64 AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
822253 -AGA-TTTAAAAATTAAATCTATTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATT
129 AAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *
822315 ATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
193 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * * *
822380 ATTCAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
258 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAA
* * * * * * *
822445 TAAATATGTTT-GTCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC
322 TAAATCTGTTTACT-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * *** *
822509 GTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTCTTTCAATTTATACATTTTTATTTGAAATAAAA
386 ATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAA
* * *
822574 TAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAAATAAATCTGTT
450 TAATACTAA-TTATTAATATTTCA-AAAATTAAT----AAGAGA-TTT-AAAAAATAAATATGTT
* *
822638 TATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATTACT
507 TACCAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACT
* ** * **
822666 ATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TATGA-CTTTT-TTTTTATCATAAAATGATTGTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTT
* * * * *
822727 CAGTGCATAAAAGCTTATT-GAAATAAATATAAT--TATTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAA
63 TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * ** * * * * *
822789 ATAA-ATATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTA-TCAA-ATGCTTCAAATAATTATGGCCATTTAAAT
127 GTAAGA-GTTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTCAACA-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
822850 AATTATCTATTTCAAAT-GTTACGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATA-
189 AATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * *
822912 AAGCCTATT--GAATAAAATAATACTAATTTATT-ATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
252 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAA-AAATT
* * *
822973 TAACAAATAAATCTATTTA-TAGAA-C----C----A-TT-T--CTATTTGAATAATTATCTATT
315 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * *
823024 TCAAATCATTAT-AAATTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTG
379 TCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTA
* *
823087 GAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAA
442 AAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
823150 TATGTTTGCCA-AAGTAATTCAAATAATTAAGACT
501 TATGTTTACCAGAA-CAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * *** * * * * * *
823184 ATATGAATAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCACATAACAATTTTTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTA
** * * * * *
823249 --TCATTCAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTCATAAGTA
65 GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
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130 AGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * * * * * * * *
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193 ATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
* * * *
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257 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAA
* * * * * * * *
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320 AATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *** **
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385 CATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTTAAAAT
* * * *
823631 AAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTCA-CAGTAGATTTAAAAAATAATTCA-GTT
446 AAAATAATACT-AA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTAAAAAATAAAT-ATGTT
* * **
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507 TACCAGAAC-AATTCAAATAGTTATGACT
* * * ** *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAG
* * * * * * * *
823786 TTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAAAAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--A
66 TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * **
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131 GAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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322 TAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
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* * **
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* * *
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511 AGAACAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * ** *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-T
* * * ** *
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64 AGTTCATAAAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAA-A-A-TTAA
* * * * * * * * *
824360 TAAGTAAAACATTTATAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAA
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* * *
824424 CAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGACTTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATA
188 CAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * *
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251 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA-AAAAT
** * * ** * * *
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314 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCA-GTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
824615 TTTTAAGTCATTGTGACCTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTT
377 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTT
* * * * * * * * *
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441 AAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTC-AAAAAT--T-AATAAGAG-ATTTAAAAAATAA
* * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * * * * * * ** * * *
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* *
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** * *
825016 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA
258 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-A-TTTAAAAA
* * * * * *
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321 ATAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
*** ** * * * ** * *
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385 CATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAA
* * *
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** *
825274 ACCA-AACAAGTTCAAATAGCCAT-ATCC
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* * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TA
* * * * * ** *
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65 GTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
825428 AA-A-TTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCGAATC-AGTTCTAATAGTAATGATTATTTAAACAAT
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* * * * * *
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*** * * * * * * *
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* *
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TCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
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* *
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*
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1 ATTAAT
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* * *
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* *
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* * *
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* * *
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Statistics
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TTTGATAATT
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815822 AAATAATACA
* * *
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* * * ** * *
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* * *** * * * *
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131 CAAAAAACAATTGGTTCTGTTAATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** *
816027 TTTGATAATT
196 TTCAAAAATT
* * * * * *
816037 AATTTATTCATATTTCGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCGAACA
1 AATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAAAACTATATTTACCAAACA
* * *
816101 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTCA
66 AATTCAAATAGTCATAACTAGTT-ATATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTCA
* * * *
816165 TCATAAAACAATT-GTATCTGTTAATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAAT
130 TCAAAAAACAATTGGT-TCTGTTAATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
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194 ATTTCAAAAATT
816241 AAT
1 AAT
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Statistics
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AATTCAAATAGTCATAACTAGTTATATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTCAT
CAAAAAACAATTGGTTCTGTTAATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTCAAAAATT
Found at i:817167 original size:179 final size:176
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Indices: 816515--817304 Score: 656
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816505 ATAGTTGTGA
* * *
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* * * * *
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* * * * **
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* ** * ** * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 TCATAAAA-AATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** * *
816932 ATTCCAACAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATGTGTTTGCTGAACAAGTTCAAATAC
64 ATTCGAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAA-AATATAT-TTACCAG-ACAAGTTCAAATAG
* * * * *
816996 TTAAGATTATTAGAACAATTATCTGCTTCAGATCGTTTTGACCTATTGTTTAG
125 TTATGACTATTAGAACAATTATCT-ATTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTAG
* *
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* *
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* * * *
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128 TGACTATTAGAACAATTATCTATTCAAA-TCGTTATGACCTATTGTTTAG
* * * * * *
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*
817292 TTTC-AAAAATTAA
64 ATTCGAAAAATTAA
817305 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 481, Mismatches: 98, Indels: 64
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Matches are distributed among these distances:
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TCATAAAAAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TCGAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAAAATATATTTACCAGACAAGTTCAAATAGTTATGA
CTATTAGAACAATTATCTATTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTAG
Found at i:817629 original size:317 final size:315
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Period size: 317 Copynumber: 1.8 Consensus size: 315
817039 TATTGTTTAG
*
817049 TCATAAAAAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAAAAAAAATAATACTAATTTATTAACA
1 TCATAAAAAATTATTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAAAAAAAATAATACTAATTTAATAACA
* *
817114 TTCGAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAAATATGTTTACCAGACAAGTTCAAATAGATTT
66 TTCGAAAAATT-ATGAGCAAGAGATTTAAAAAAAAAATGTTTACCAGACAAGTTCAAATAGATTA
* *
817179 GACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT
130 GACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTAGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAAAATTATTT
* * **
817244 CAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTAAAAAG
195 CAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTTCAAAAATTAAAAAG
817309 CAAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAATTCATTATGATCTTTATTTTC
260 CAAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAATTCATTATGATCTTTATTTTC
* *** *
817365 TCATAAAATAATTATTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGGATAAAAATAATACTAATTTAATAA
1 TCATAAAA-AATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATTCAAAAAAAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * ** * *
817428 TATTCTAAAAA-T-T-AGTAAGAGATTTTAAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAATA
64 CATTCGAAAAATTATGAGCAAGAGA-TTTAAAAAAA-AAATGT-TTACCAG-ACAAGTTCAAATA
* * *
817490 G-TTAAGACTATTAGAATAA-TATTTAATTTCAAA-TCGTTCTA-ACCTTTTGTTTAGTCATAAA
125 GATT-AGACTATTAGAACAATTATCT-ATTT-AAAGTC-AT-TAGACCTTTTGTTTAGTCATAAA
* * * * * * * *
817551 ATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTGCTAACATTTGAAA
185 AAAATTATTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTTCAAA
*
817616 AATTAATAAGCAAG
250 AATTAAAAAGCAAG
817630 AGATTTGAAA
Statistics
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Consensus pattern (315 bp):
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TTCGAAAAATTATGAGCAAGAGATTTAAAAAAAAAATGTTTACCAGACAAGTTCAAATAGATTAG
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AATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTTCAAAAATTAAAAAGC
AAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAATTCATTATGATCTTTATTTTC
Found at i:818228 original size:181 final size:180
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817814 AAAATAAATC
* * * * * * * * * * *
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* ** * * * *
817889 TCGTAAAACAATTGTTTTTCAAT-ATAGAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
817953 ATTTCAAGAATTAATAAG---G-GATTTAAGAAATAAATCTATTTACTGAACC
129 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * * *
818002 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
818067 CATAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAGCCTCTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** *
818132 TCTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATCCATTTGCTAAACT
131 T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* ** * * *
818183 AGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
818248 CATAAAACAATTGTCTTTGTTAATGTAAGTTTGTTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * *
818313 TTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATATTTACTAAACC
130 TTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * * * * * *
818365 ATTTCAAATAGTTTTGACTATTT-AATAACTATTTATTTTAAATGGTTAT-AACTTCTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTG
* * ** ** *
818428 TCATCAAACAATTGGTCCTGTTCATACT-ATTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAA
65 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-TAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * * ** * **
818491 TATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCCGAACT
128 TATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTG
* * * * * * * *
818610 TCGTAAAAAAATTG-TTTTATTCATACAAGCTT-TTACTAATTAAAATAATGCTAATTTAGTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * **
818673 ATTTTGAAAATTAATGAA-TGAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGCCGAA-T
129 A-TTTAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * * *
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1 -AGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
** * * * * *
818789 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCCTATTC-AGAATGAATTAATACTAATCTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * * *
818853 CATTTGGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAAC-AAACA
128 TATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACT
* * * * * * * * *
818907 AGTTCAAATAATTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGGTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
818972 CATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * *
819036 CATACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAATT
130 TTTA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACT
* * ** ** * * **
819088 AGTTAAAATAATTAT-AGCCGTTTGAATGATTGTCTATTTCAAATCATTGCGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
819152 TCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATAGTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
819217 TTTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATATTTACTAAACC
130 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * * * * * *
819267 AATTCAAATAATTATGACTATTTGAAGAATTAT-TAATCCAAGTCATTAAGA--TATTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTG
* * * * * ** *
819329 TCAGAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATTTG-GTTAAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
819393 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-TCGAGCC
129 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACT
* * * * * * *
819446 AATTCAAATAGTTA-AAGCTATTAGAATAATTAT-TAATTTTAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
819509 GTCATAATATATTTGTTTCAT-ATCTTACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAAT-CTAAATTTATT
64 GTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * **
819571 AACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-T
126 AATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * * *
819627 AAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATCATGACCCTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * * *
819692 ACATAAAACAATTCTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTCTTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-
* * * * * *
819757 ATTCAAAAAAAATTACTAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACTGAACA
129 ATT---TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * ** *
819809 AATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTATGATATTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** * * * *
819874 CATAAAAAAATTGTTTGAATTCATACAAGCTCAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
819939 TCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCAAA-T
131 T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * *
819989 CAGTTCAAATAGTTATGGCCA-TTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTCACT-ACCTTTTGTTTG
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
820052 GTCATATAATAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
820117 CTTTCAAAAACTT-GTAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TGTTTA-TCGAACC
129 ATTT-AAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACT
* * * * * *
820170 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-GCATACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * **
820233 ATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
820298 ATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAACAAAT-TTTTTGCCAAACT
129 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
*
820349 AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * * *
820406 TCATAAAGCAATT-TTTTCAATTCATACT-AGTTTGTTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTA
65 TCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATA-TAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * ** *
820468 ATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGCTTGCCT-AACC
127 ATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACTAAACT
* * * *
820523 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTCTGACCTTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
820588 CATAAAACAAATGTTTTTTTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
820653 TTCAAAAATTAATAA-T-A-A-ATTTAAAAGATAAATTTGTTTA-TCAAATT
131 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACT
* * * * ** *
820700 AGTTCAAAAAGTTATGACTATTT-AAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * * * * * *
820764 TTACAAAACAATAATTTCTATTCATAAAAACTTATTTG-ATTAAAATAACACTACTTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
820828 TTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACT
130 -TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
* * * * *
820879 AGATCAAATAATTATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
820944 CATAAAA-AATTATTTTAGTTCATATCAA-CTTATTTGAAAAAAAATAATACTAAGTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAT-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
821007 TTTTGAAAATTAATAATTAGGAGATTTAGAAAATGAATCT
130 -TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
821047 ATGTACCGAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (180 bp):
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CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT
Found at i:819441 original size:358 final size:358
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Indices: 817829--836714 Score: 8672
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817819 AAATCAGTTT
* * * * * ** * * * *
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* * * * *** *
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* * *
817958 AAGAATTAATAAG---G-GATTTAAGAAATAAATCTATTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATG
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
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* * * * * * *
818083 TTGTTCATATAAGCCTCTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAAC
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* ** * *
818148 TAAAAAATTTAAAAAATAAATCCATTTGCTAAACTAGTTC
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* ** * ** *
818188 AAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * * * *
818253 AACAATTGTCTT-TGTTAATGTAAGTTTGTTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
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* * * * * * *
818316 AGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATATTTA-CTAAACCATTTCAAATAGTTTT
128 A-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
818380 GACTATTT-AATAACTATTTATTTTAAATGGTTAT-AACTTCTTATTTTGTCATCAAACAATTGG
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** * ** * *
818443 TCCTGTTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATA
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** * * * * **
818508 ACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGCCGAACTAATTC
318 AGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAAC-AATTC
* * * * *
818550 AAATAGTTAAGACTATGTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTTTCTTTTGTCGTA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-C-TTTTGTTTTGTCATA
* *** * *
818615 AAAAAATTGTTT-T-ATTCATACAAGCTT-TTACTAATTAAAATAATGCTAATTTAGTAATATTT
64 AAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * ** * * *
818677 TGAAAATTAATGAA-TGAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGCCGAATCAGTTCAAATGGTTAA
127 CAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
818741 GCTTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
191 GC-TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * * * * **
818806 TCAGTTCATACAAGCCTATTCAGAATGAATTAATACTAATCTATTAACATTTGGAAATTAATAAG
255 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAG
*
818871 -AAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAAC-AAACAAGTTC
320 TAAA-AGATTT-AAAAAATAAATATATTT-ACTAAACAA-TTC
* * * * * * * *
818912 AAATAATTATTACTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGGTTAGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * *
818977 AACAATTGTTT-TAGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACATAC
65 AACAATTGTTTCT-GATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC
* * * * ** * *
819041 TAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATTAGTTAAAATAATTATAG
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAT-G
** * * * ** *
819105 CCGTTTGAATGATTGTCTATTTCAAATCATTGCGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * *
819170 TGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTA
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTA
819235 AAAGATTT-AAAAATAAATATATTTACTAAACCAATTC
322 AAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAA-CAATTC
* * * * * * * *
819272 AAATAATTATGACTATTTGAAGAATTAT-TAATCCAAGTCATTAAGA-TATTTGTTTTATCAGAA
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* * *
819335 AACAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATTTGG-TTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * *
819399 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAGCCAATTCAAATAGTTAAAGC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGC
* * * * * * *
819464 TATTAGAATAATTAT-TAATTTTAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTGGTCATAATATATTTGTTTC
193 TATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-
* * * * *
819528 AT-ATCTTACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATA
256 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC--AAAATTAATA
* * * * ** *
819590 AGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTC
318 AGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * * * * *
819633 AAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATCATGACCCTTTGTTTTGACATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * **** * * *
819698 AACAATTCTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTCTTAATAATTCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--
* * * * * *
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128 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * ** * *
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191 G-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
*** * * *
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255 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAA
** * * * * *
819954 GTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCAAATCAGTTC
319 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAA-CAATTC
* * * * * *
819995 AAATAGTTATGGCCA-TTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTCACT-ACCTTTTGTTTGGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGA-CTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *** * *
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64 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
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129 AAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
820186 ACTATTTGAATAATT-GCATACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTAT
192 -CTATTTGAATAATTATC-TA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** * ** *
820249 TTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATA
254 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATA
* * * * * * *
820314 ACTAAGAGATTT-AAAAACAAAT-TTTTTGCCAAACTAGTTC
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAAC-AATTC
*
820354 AAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT---TTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
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65 AACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* * * ** * *
820475 AAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGCTTGCCTAACCAGTTCAAATAATTATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-
* * * * *
820540 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTCTGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
820605 TTTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGT
* * * * *
820669 --AA-ATTTAAAAGATAAATTTGTTTA-TCAAATTAGTTC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-AAA-CAATTC
* * * ** * * * *
820705 AAAAAGTTATGACTATTT-AAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCTTTTGTTACA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATA
** * * * * * *
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64 AAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * *
820832 GACAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACTAGATCAAATAATTATG
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * *
820895 ACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTT
192 -CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
820959 TAGTTCATATCAA-CTTATTTGAAAA-AAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
256 TTGTTCATA-CAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATA
* ** * * * * ** *
821022 ATTAGGAGATTTAGAAAATGAATCTATGTACCGAACAAGTTT
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * * * * *
821064 AAATAATTATG-CTA--T-AAC-CTTTTGTTTTGTCACCAA--A-T-TG--TTTT-TTCTGTTCA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCA--AATCATTATGACTTTTGTTTTG-TCA
* * * * * *
821117 TACAAGC--TTATTTC-GA--ATA-AA----A--T--AACACAAT-TTACTAA--TATTAAGA--
62 TA-AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * **
821163 -CAATTAA-TAGAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CCTAAACAAGTTCAAATCTT
126 TCAA-AAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGT
* * * *
821221 TATGACTAATTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
188 TATG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * * * *
821286 GTTTCTATTCATACAAACTTATTCAGATTAAAATAATATTAATATATAAATATTTTGATGAA-TA
252 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCA-AAATTA
* *
821350 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTC
315 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * *
821395 AAATAGTCT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTGTGACCTTTTGTTTTGT-AAA
1 AAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
821458 AAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCT
64 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * *
821522 AAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTA-CTGAA-CATGTTCAAATAGTTAT
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCA-GTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
821585 GACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGT
191 G-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
821649 TCTGTTCATGCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTCATTAATATTCCAAAAATTAATA
255 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAATTAATA
* *
821713 AGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATAT-TTTTCT-AACACGTTC
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACA-ATTC
* * * * *
821752 AAATATTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAGTCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * * *
821817 ACCAATTGTTTTTGTTCACAAAAGCTTATTCGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * *** *
821881 ATATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAGTAAATCTATTTA-CTGAGTGAGTTTAAATAGTTATGA
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTATG-
* * * * * * * *
821945 CTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTA
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * *
822010 TATTCATAGAA-TTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGT
*** * * * *
822074 TGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCATTGAACAAGTTC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * * * * * ** * * *
822113 AAATAGTCAT-ATTGTTTGAGCTATAATCTATTTCAAATGGTTATAACACTTTTATTTTGTCGTA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT--GACTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** *
822177 AAATAATTATTTCT-ATTTATA-AAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
64 AAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
822240 AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-
* * * * * *
822301 CTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
822365 TATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGT
* * * * *
822430 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAACCAATTC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTT-ACTAAACAATTC
* * * * * * *
822469 AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *** * *
822534 AATAATTCTTTC-AATTTATACATTTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-A
65 AACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
** * *
822597 GAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
129 -AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA-
* * * ** * * **
822662 TACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TATGA-CTTTTTTTTTATCATAAAATGATTG
190 TGCTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * *
822724 TTTCAGTGCATAAAAGCTTATT-GAAATAAATATAAT--TATTTTATTAATATTTCAAAAATTAA
253 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAA
* * * * ***
822786 AAAAT-AAATATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTA-TCAAATGCTTC
316 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TTTACT-AAACAATTC
* * * * * * * *
822828 AAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTACGAACTTTTATTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
822892 AACAATTGTTTTTCATCATA-AAGCCTA-TT-GAATAAAATAATACTAATTTATT-ATATTTCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * *
822953 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTATAGAA-C----C----A-TT-T-CTA
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGCTA
* ** * * * **
823006 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AAATTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCAGT
195 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
* *** * * * * *
823070 TCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTGATAACTAAG
260 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAA
* * * *
823135 AGATTTAAAAAA-AAATATGTTTGCCAAAGTAATTC
324 AGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAA-CAATTC
* * * * * * ** * * *
823170 AAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCACA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTAT-GACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
823235 TAACAATT-TTT-TTATCATTCAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCA
64 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
823298 AAAATTCATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATA--TATAAC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAT-GC
* ** * * * * * * *
823361 TATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGATCTGTCATAAAGCAATTATTTTT
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * *
823426 GTTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTA
258 GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
823491 AGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTC
322 AAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAA-CAATTC
* * * * *
823528 AAATATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTAG-CATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTT-GTCATA
* * * *** *
823592 AAATAAGTT-TTTTTGAATTTATTTTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATAT
64 AAACAA-TTGTTTCTG-A-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * * * **
823655 TTCAAAAATTCA-CAGT---AGATTTAAAAAATAATTCAGTTTACCTAACTAGTTCAAATAACTA
125 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA
* **
823716 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAGT
190 TG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * *
823781 TTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAAAAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATA
254 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATA
* *
823846 AG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACGAGTTC
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-AAAC-AATTC
* ** * *
823884 AAATAGTTATGACTAATTGAGTAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTT-TTTTGTTATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACTTTTGTTTTGTCATAA
* * **
823947 AACAAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
65 AAC-AATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * * * *
824010 AACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCTAATAGTCATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-
* *
824075 CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTG---T----C-A-------
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* *
824125 ---T-AT--AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATT-ATATTACAAAAATTAATAAGT
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGT
* * * * * * *
824183 AAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTT-GTCGAGCAACTTT
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-AAACAA-TTC
* * * * * * *** *
824222 AAATAATTATGACTATTTTAATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTATAGCCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * ** *
824287 AATGATTCTTTCT-ATTCATACAAGTTTGTTTTTAAATAAAATAATA-AAATTTTATTAATA--T
65 AACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTT-ATTTGGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTT
* * * * * * *
824348 -AAAGACACTTAATAAGTAAAACATTTATAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAAT-CTT
127 CAAA-A-A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTT
* *
824411 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTGTTTTGTCATAAAACAAT
189 ATG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
824474 TGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTA
251 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTA
* ** ** * * *
824539 ATAAGTACAAGATTTAAGCAATAAATATATTTTTTGAATATGTTC
315 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACA-ATTC
* * * * * * *
824584 AAATGGTCT-TGACAATTTGAATAATTATCTATTTTAAGTCATTGTGACCTTTT-TTTTGTAATA
1 AAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
824647 AAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTT-GATATAAAACAATACCAATTTACTAATATTC
64 AAACAATTGTTTCT-GATCATACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * *
824710 CAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTA-CCAAACATGTTTAAATAGTTA
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCA-GTTCAAATAGTTA
* * * * * *
824774 TGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGG
190 TG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
824839 TTCTGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAAAAATA--AATTTATTAATATTTGAAAAATCAAT
254 TTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAAT
* * * * * *
824901 AAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATGTTT
317 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACA-ATTC
* * ** *
824943 AAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTG---T-T--T--
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
825000 -----TTG-TTC--AT-A-A-AAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * *
825054 AAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAGCGAGTTTAAATAGTTATGA
130 AAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATG-
* * * ** *
825118 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATGGCTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * * * *
825183 TATTCATATAAGTTTATTCGAAATTAGATAATACTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGT
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGT
*** * * * *
825248 TGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGTTC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
** * * * *
825287 AAATAGCCAT-ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCTTA
1 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATA
** *** * * * *
825351 AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAAATTATTAAAAATAAAATAATACCAATTTATCAATTTTTT
64 AAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * *
825415 GAAAA-T--TAAG-AAGAAATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAATCAGTTCTAATAGTAATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-
* * * * * * *
825476 TTATTTAAACAATTATCTATCTCAAAAT-GTTATTATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *** * * * * * * *
825539 ATATTCATACAAGTTTATTCAGGGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTATTCTAAAAATTAATAA-
256 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG
* * * * * *
825603 T---AGATTTAAAAAGTAAATGTGTTTGCCGAACCATTATCTATTTC
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTT-----A-C-TAAAC-AATTC
* * * * ** * *
825647 AAATCGTTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAAT-TTTTTCAGTTCATACATG-C--TT-ATT
1 AAATAGTTATGA-C---TATTT-G--A-ACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACTTTTGTTT
** * * * * * * ** * * ** ** *
825707 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAGAAATTA-AT-GAACAACAAGTTTTAAAAAAT
57 TGTCATAAAACAAT--T-GTTTCTGATCATACA-AGCTTATTTGGAATAA-AA-TAATACTAATT
* * * * * * * * * * *
825770 AAAT-CTGTTTACCGAATAAGTTCAACT-AGTTATG-GCTATTTGAACAAT-TA-CTATTTATTA
116 TATTAATATTT--C-AA-AAATT-AA-TAAG-TAAGAG--ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TC
* ** * * * * *** ** * * ** * *
825830 TAAATA-TGACCATTTGTT-T--TATCACAA-AACAAT-TGTTTTAGTTCATAAATG--C--TT-
171 GAACCAGT-TCAAATAGTTATGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT-TATGACCTTTTG
* ** ** * * * * ** * *
825884 ATCCGAAATAAAATAATAT-TACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAA-
234 TTTTGTCATAAAACAAT-TGT-TTTTGTTCATA---C-AAGCTT-AT---TCA-A-A-ATAAAAT
* * * ***** * * * *
825947 AATAAGTCAGTTTATTGAAT-TGGTTC-AAA-TAAT--TTTGGCCATTT-GAACAT-TATCTATT
286 AAT-ACT-AATTTATT-AATAT--TTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
826005 T-C-AAATC-ATTAC
346 TACTAAA-CAATT-C
* * * * * * * ** * * ****
826017 GAACTTTTGTT-TG--TTTTTAAATAATTGT-T-TTTC--ATCA-CACCAAC--CT-ATTCAAAA
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* * ** * * * * * ***
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62 TAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-ACTAATTTA-TTAATAT
** * * * * * *** * * * ***
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125 TTCAAAAAT-TA-ATAAGTAA-GAGATT--TA-AAAAATAAATCTGT-TTATCGAACCAGTTCA-
* * * * * * * * * **
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182 AATAGTTATG--CTATT-T-GAATAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** ** * * *
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242 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-C-AAAA-TAA-AA-TAATACTAATTTATTAA
* * ** ** ** * * ** *
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302 TATTTCAAAATTAATAAGTAAAAG-A-TTTAAA-AAATAA-A-TATATTTACTAA--A-C-AATT
826355 C
358 C
** ** * * ***
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1 AAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *** * *** ** * ** **
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* * * * * *** * * ** * * ** * * *
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126 TCAA--AAATTAATAAGTAAGA--GATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCG-AACCAGTTCAAAT
* * * *
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185 AGTTATGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * *
826575 TTATATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATT
250 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
* * * ** * *
826640 AATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCCTATTTACCGAACTATTTT
314 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTACTAAAC-AATTC
* * ** * * * * *
826686 AAATAGTTATGACTATATGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTATATTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * * * *
826751 AACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATGCTAATCTAATAATATTCCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * ** * * * *
826816 AAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAGATATTTAAGACT
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-CT
* * * * *
826881 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTT
194 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT
* *** * *
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257 TG--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATA
** * * * * *
827009 AGTAAGTGCTTTAAAAAATAATTATGTTTATCTAACCAGTTC
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTAAACAATTC
* * * * *
827051 AAATAATTATGACTTTTTGAACAATTATCTATTTCAAGTCATTATGAACTTTTATTTTTTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * ** ** *
827116 AGCAAATGTTTTTGTTCATATAATTTTATTCAGAATAAAGTAATACT-ATTCTATTAATATTTCA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCA
* * * * * * *
827180 AATATTAAT-A--AA-ATATTTTAAAAATAAATCTATTTAT-TAAGCTAGTTTAAATAGTTATGA
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATG-
** * * * *
827240 CTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATC-AT-TGA-CTTTT-TTTT-T-ATAAAACAATTATTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* **** * * *
827299 TGTTTATACAAGCTTATTCGGTTTAAAACACTACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGC
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGT
* * * *
827364 AAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGA-TC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAAC-A-ATTC
* * * * * * *
827403 AAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * * *
827468 AAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAAGAATACTAATTTATTAATAATCCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
** * * * *
827533 AAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGTATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAATTATGAC
130 AAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-C
* ** * * *
827597 TATTTGAACAATTATCTATTTGGAAT-GTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-TTTTC
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-
* * ** *
827660 TATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAGGACAATTAATAAG
257 TGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG
* * * * * *
827724 TAAAAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTT
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * * *
827764 AAATCGTTATGACTATATATG--CAATTATTTATTTC-AA-CTTGTATGACTTTTTGTTATGTCA
1 AAATAGTTATGACTAT-T-TGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGAC-TTTTGTTTTGTCA
* *** *
827825 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
62 TAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * **
827889 TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAGCCA
126 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
827954 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACC--TTATTTTGTAATAAAATAATTGT
190 TG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * * * *
828017 TTTAGTTTATAAAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATAATAATTTACTAATATTCTGAAAATTAAT
254 TTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAAT
* * * * *
828081 GAGTAAAAGAATTGAAAAAA-CAATCTATTTATTGAAA-AAGTTC
317 AAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATATATTTACT-AAACAA-TTC
* * * * *
828124 AAATAGCTT-TGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACACTATGACTTTTTGTTTTATCATA
1 AAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATA
* *
828188 AAACAATTAG-TTCT-ATTCATGCAAGCTTATTCT-GAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATAT
64 AAACAATT-GTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * * * *
828249 TCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACATGATCAAATAGCT
125 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCA-GTTCAAATAGTT
* * *
828312 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTG
189 ATG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * *** * *
828377 GATTTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAATCATTAA
253 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA-AATTAA
* * * *** * *
828441 TAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGTGAGTTT
316 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTAAACAATTC
* * * * ** ** *
828485 AAATAGTTGTGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAATCTTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* *
828550 AACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCT
65 AACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * * ** * * *
828613 AAAAATTAAGAATGT-GGAGATTTAAAAAATAAATCTGTCTACCGAATAAGTTTAAACAGTCATG
128 AAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
828677 TCCATTTAAACT-ATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTATTTTTTCGTAAAACAATTGTT
192 -CTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
*** ** *
828741 TCCATTCATGA-AAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATA
255 TTTGTTCAT-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATA
* * * * *
828805 AG----AGATTT-AAAACTAAATTTGTTTACAAAATCAGTTC
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAA-CAATTC
** *
828842 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTAGGA-TCTTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACT-TTTGTTTTGTCATA
* * * * * ** *
828905 AAACAATTGTTTAT-ATTCATAAAAGCTTA-TTCGAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTT
64 AAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
828968 TAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTAA
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTAT
** * * * * * **
829032 GACTATCAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACATTTTGTTTAATCATAAAATTATCTAT
191 G-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT--AA--A---A-
* * ** * ** ** * *
829097 TTCAAATCGTTTTGACCTTTTTTTTAATCATAAAATTATTGTTTTAGTTCAAATAATACT-CTTC
247 --C-AA-----TTG----TTTTTGT--TCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-
* * * * * *
829161 TATTAACA-TTCAAAAAATTAACAAGTAGGAAG-TTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAACAAGT
296 TATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-T
829224 TC
357 TC
* * ** * * *
829226 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCCTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * **** * * *
829291 AAAAATTGTTTC-AATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT-ATATTACTATATTAATATTTCA
65 AACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * *
829354 AAAATTGAGAATTTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTAGT-AAATCAGTTAAAATAATTAT
129 AAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * * ** *
829416 AGCCATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCTTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
191 -GCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* *
829481 TTTGATCATACAAGCCTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
255 TTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATA
** ** ** *
829545 AGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGTTC
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAAC-AATTC
* * * * *
829587 AAATAGTCATAAGTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *** * * * *
829652 CACAGTTATTTATGTTCAAACAAGCTTATTCAAAATACAATAATACTAATCTAATAATATTAT-G
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCA
* * * * * *
829716 AAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTAAGG
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTT-ATG
* * * * * *
829780 CTATATAAATAATTATTTACTTCAAA-CAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAACAAATG-TT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
829843 TTGCTCATATAAGATTGTTCATAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
256 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAG
* * * *
829908 ----AGATTTAAAAAGTAAATTTATTTACCAAACTAGTTC
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAAC-AATTC
* ** * *
829944 AAATAGTTATAAAAATTTGAACAGTTATTTATTTC-AA--A-T-T-A----------GT-AT-AA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * * * * *
829991 CCATTTGTTTCTGTTGATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATA-TCCTAA
66 ACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
* * * *** * *
830055 AAATTAATAAGTAACAGATTT-AAAAATGAATATGTTGGCCTG-ACCAGTACAAATAGTTATAAC
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTAT-GC
* * * * * * * * *
830118 TGTTGGAATAATTATATGTTTCAAAGCATTATAACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTTT
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * *
830183 GTTCGTACAAG-TTGACTT-AGAATAATATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
258 GTTCATACAAGCTT-A-TTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAA
* * * * * * * *
830245 GTAAGAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTATCGATTA-AGTTC
319 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTA-AACAATTC
* * ** * *
830286 AAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGCTATAATCTTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
830351 AATAATAT-TTTCT-AGTCATACAAGCTTATTT-CAATTAAAATAATACAAATTTATT-A-A-TT
65 AACAAT-TGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * **
830410 CAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAATAAGTTCAAATAGTTAT
127 CA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
830475 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTATTATCATAAAACTATTGTT
191 G-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * *
830540 TTTGTTTATACAAGCGTATTCGAATTGAAATAATATTAATTTATTAACACTTT-ATCAATTAATA
255 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCA-AAATTAATA
* * * * * *
830604 AGTAAAATATTTTAAAAATAAGTATGTTTACCAAACAGGTTC
318 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACA-ATTC
* * * * * * * * **
830646 TAACAGTTATAACTACTTAAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *** * *
830711 AACAATTGTATC-AATCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
830775 AAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTA-CTGAACAAGCTCAAATAGTT-TGAC
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTATG-C
* * * * * **
830838 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-CAGTTATGATCTTTTTATTTTGTTATAAAATGATTGTTT
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * *
830902 CTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGG
256 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG
** * * *
830967 TAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTC
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * * * * * ** *
831007 AAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT-TCTTTACCGTA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGT-TTTGTCATA
* ** ** ** ** * * **
831071 AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAGAATACGATAATACCGATTCATTAAGATTTTG
64 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
831136 AAAATTAATAAG--AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-C
* * * * * * * *
831197 TTTTTGAATAATTATGTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAATAATTGTTTCT
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * * * * *
831261 T-TTCATATAAGCTTATTCGAATTAAGATAATACTAATTTAATAATA----AAAATAAATGAGT-
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTA
*** * ** * * *
831320 TTTG--TCAAACCAGTTCAA-ATAGTTA--AAACTATT-
322 AAAGATTTAAA--AAATAAATATATTTACTAAACAATTC
* * * *
831353 ATAATAATTAT--CTATTT---CAA--AT-TA-TTC---T-A--A--CCTTTTGTTTAGTCAAAA
1 A-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
831401 AACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
831465 AAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGCTCAAATAGATATGGC
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAT-GC
* * * * * * * *
831527 TATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTT
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
831592 -TATCATACAAGGTTGTTCAAAATAAAATAATGCTAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT
258 GT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGT
* * * * *
831656 AAGAGATTTACAAAATAAATCTATTTATCGAACCAATTC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTAAACAATTC
* * * *
831695 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATCATTTAAAAAAATAAACCTTTT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC--A--AATCA-TT------AT-GA-CTTTT
* * * * * * * *
831760 GTTCTATCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTA
53 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * *
831825 ATAATATTCCAAAAATTAGTAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTATCGAATCAGTTTAA
118 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAA
* * * * * * *
831890 ATAGTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTCTTTTGTCAT-AAA
183 ATAGTTATG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
831954 -ATTTTTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTTG
247 CAATTGTTTTT--GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTTC
* * * ****
832017 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAAGTGGTTC
308 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTAAACAATTC
* * * * * *
832069 TAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGA-TGTGACCTTTGGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
832133 AAACAAATATTT-TTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCC
64 AAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
832197 AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATCAAACCAGTTTAAGTAGTTATGA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-
** * * * * * *
832258 CTATTTGAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACATTTTCTTTTGTCAT-AAACATTTATTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * *
832322 AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT-A-ACGT--TGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAG
* * *
832383 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CAGTT--T--A-AA-T-
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAATTC
* * * * ** * * *
832414 --A-A-TTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGCTTTCTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *** *
832475 AACAATTTTTTTTCAGT-ATAGAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCA
65 AACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
** *
832539 TGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-C
* * ** * * *
832600 TATTTGAATAATTCTCTATTTCAAATTGTTAAAACCTCTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * * * *
832665 ATTTATATAAGCTTACTT-GGAATAAAGTAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATTAATAACT
258 GTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGT
* * * ** * *
832729 AAGAGATTAAAAAAATAAATACATTTTTTGAACTAGTTC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAAC-AATTC
* * * **
832768 AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * * * * * *
832833 AACAATTGCTTTTTGTTAATATGAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTTTA
65 AACAATTG-TTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC
* * * * * *
832898 AAAAATTAATTAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTA-CTAAACCATTTCAAAATAGTTTT
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTC-AAATAGTTAT
* * * ** * * *
832961 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTAAATTTTTATTTTGACATCAAAC-ATTG-T
191 G-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * * *
833024 CTTGTTCATACTA-TTTTTTTAGAA-CAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAA
255 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAA
** * * * * * ** *
833087 CCAAGAAAATTACAAAAAATAAATCTAATTGCCGAACCATTC
319 GTAA-AAGATT-TAAAAAATAAATATATTTACTAAACAATTC
** * * * * * * *
833129 AAATAGTT-TAGACTATATAAAACGATTATCTATTCCAAATCGTTATAACCTTTTCTTTTATCGT
1 AAATAGTTAT-GACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
833193 AAAACAATTATTTC--ATTTATACAAGCTTATTCT--AATTAAAATAATGCTAATTTAATAATAT
63 AAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
833254 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAGTTCAAATGGTTA
125 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
833319 AGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
190 TG-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * *
833384 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAA
254 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC---AAAATTAA
* * *
833448 CAAG-AAATAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTC
316 TAAGTAAA-AGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * * * * * * * * *
833493 GAATAATTATTATTATTTGAACAGTTGTCAATTTAAAATCATTATAACTTTTTGGTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * *
833558 AACATTTGTTT-TAGTTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTAC
65 AACAATTGTTTCT-GATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC
* * * * * * ** *
833622 TAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTGTTGAATTAGTT-AATATAATTATA
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAA-ATAGTTAT-
* ** * * * *
833685 GCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTGTTACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGGTT
191 GCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT
* * ** *
833750 TTT-ATCATACAGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
255 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAA
** * * * * *
833814 GTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATCAGTTT
319 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTAAACAATTC
* * * * *
833855 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGA-TATATGTTTTGTTATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTTTTGTCATA
* * *
833918 AAACAATTGTTTCTAATCATA-GAGACTTATTTGGTAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT
64 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAG-CTTATTTGG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
833981 CAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATGTATTTGTC-AAGTCAATTCAAATAGTTAA
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CCAGTTCAAATAGTT-A
** * * * * * * * * * * *
834041 AACTATTAGAATTATTACCTATTTCAAATCATTCTAACTTTTTGCTTAGTCATAAAATATTTGTT
190 TGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
834106 TCAT-ATCTTACTAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCACAGAATTAA
255 T-TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-A-AATTAA
* * * *
834168 AAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAATTC
316 TAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACTAAAC-AATTC
* * * * * * *
834213 AAATAGTGATGGCTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTAGACATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * **** * * * *
834278 AACATTTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATAATTCAT
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
** * * * * *
834343 AAATTAATAAACAAGA-ATTT--AAAATAAATTTATTTA-CTGAGCAAATTCAAATAGTTATGAC
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTATG-C
* * * * * *
834404 TATTTAAATAATTGA-CTATTTAAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTG
193 TATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
** * *
834468 AATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAA
257 TGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAG
** * * * * * * *
834532 TAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCGAATCAGTTC
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTAAACAATTC
* * * * * ** * * *
834572 AAATAATTATGGCCATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTTCCTTTGATTTGGTCATAT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTG-TTTTGTCATAA
* * * * *** ** * *
834637 AACAATTGTTT-TTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATTGTAATTTATCAATCTTTCAA
65 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
** * * *
834701 AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATATAAATCAATTTA-CTGAACTAGTTTAAATAGTTATTA
130 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTA-TG
* * * * * * * * *
834761 CTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAATAATT-TTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * ** * *
834825 TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACT
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGT
* * * * * *
834890 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GTCAAACTAGTTT
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-AAAC-AATTC
* * * *
834929 AAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT---TTTTGTTTTGACATAAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAA
* *** * ** *
834988 ACAAAAT-TTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA
66 AC-AATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA
* * * * * * *
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129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-C
* * * * *
835116 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-TTATTGTCATAAAACAAATGGTTT
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
835180 TATTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGT
* * * *
835244 ---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACTAGTTT
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-AAAC-AATTC
* ** * ** * * * * *
835280 AAAAAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTCTATTACAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * ** * **
835345 AACAATAATTTCT-ATTAATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG
65 AACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * * * *
835409 ACAATTAATAAGCAA-A-ATTTTTAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGATCAAATTGTCATGA
129 AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-
* * * * * * *
835471 CTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * ** * *
835536 AGTTAATATC-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-
257 TGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG
* * * ** *
835599 T--TAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTT
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
* * * *** * **
835637 AAATAATTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACTTTT-TTTTGTCACCAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAA
** * ** * *
835701 ATGATTTTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTACAATAAAATAATAC-AA--CATTAGTA-TT-AA
66 ACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * **
835759 GACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATCCTTATG
130 -A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
835823 AGTAATTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT
192 -CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
835886 CTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAAAAATAATAAGT
256 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGT
* *
835951 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTC
321 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-AAACAA-TTC
* * * *
835990 AAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTT-TTTTGTAATA
1 AAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
836053 AAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTT--
64 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * *
836116 AAAATTAATGAGTAAGAGAATT-AAAAATTAATTTGTTTATCGAA-TATTTCCAAATAGTTATGA
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTT-CAAATAGTTATG-
* * * * *
836179 CTA-TTGAACAATTATCTATTTCAAAACATGATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT
192 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* *** * *
836243 TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATTCCAAAAATTAATAAG
257 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAG
* *
836307 TAAAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAATAC-GTTC
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAA-ACAATTC
* * *
836345 AAATAGTTATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTGTTTTGTCAT-AA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
836409 ACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTT-GAAAAAAATAATACT-ATTTATTAA-ATTTTAA
66 ACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * ***
836470 AAATTAATAAATAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAGTGAGTTCAAATAGTTATGAC
130 AAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATG-C
* * * * * * * * *
836534 TCTTTGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCAT--AA-TATAGTTTTC
193 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-
* ** * * *
836596 TATTCATA-AATTTTATT-ATATAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
257 TGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG
*** * * **
836659 TTGGAGATTT-AAAAATAAATCTATTCACCGAACAAGTTC
320 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAA-TTC
*
836698 AAACAGTTATGA-TATTT
1 AAATAGTTATGACTATTT
836715 TGTTTTTTGT
Statistics
Matches: 14205, Mismatches: 3284, Indels: 2083
0.73 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
324 3 0.00
325 2 0.00
326 9 0.00
327 16 0.00
328 16 0.00
329 68 0.00
330 187 0.01
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334 30 0.00
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336 42 0.00
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350 63 0.00
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359 924 0.07
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364 274 0.02
365 204 0.01
366 46 0.00
367 40 0.00
368 21 0.00
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377 10 0.00
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383 8 0.00
384 161 0.01
385 50 0.00
386 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (358 bp):
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAA
ACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGCTAT
TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAAAG
ATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAATTC
Found at i:821565 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 821080--824126 Score: 2347
Period size: 180 Copynumber: 17.1 Consensus size: 180
821070 TTATGCTATA
** *** * * *
821080 ACCTTTTGTTTTGTCACCAAATTGTTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAACA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATA
* * * * * *
821144 C-AATTTACTAATA-TTAAGACAATTAAT-AGATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTCCTAA
65 CTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA
** * * *
821206 ACAAGTTCAAATCTTTATGACTAATTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * *
821260 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAACTTA-TTCAGATTAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAAT
* * * ** * * *
821323 ATTAATATATAAATATTTTGATGAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGA
64 ACTAATTTATTAATA-TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA
* * * *
821387 ACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTGTG
127 ACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* *
821441 ACCTTTTGTTTTGT-AAAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * *
821505 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACTGAACA
66 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
* * * * *
821570 TGTTCAAATAGTTATGACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
130 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * *
821621 ACC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA
* * * * *
821684 -TAAATTCATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATAT-TTTTCT-AA
65 CT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA
* * * * *
821745 CACGTTCAAATATTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAGTCGTTATG
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
** * ** * * *
821798 ATTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCACAAAAGCTTATTCGAAAT-AAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * **
821862 TAATTTATTAAAATTTCAAATATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAGTAAATCTATTTACTGAGT
66 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTATTTACTGAAC
* * * * * * *
821927 GAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * *
821979 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-ATATTCATAGAA-TTTATTCGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
** * *
822042 CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCATTGAAC
65 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* * * * * * *
822107 AAGTTCAAATAGTCAT-ATTGTTTGAGCT-ATAATCTATTTCAAATGGTTATA
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * **
822158 ACACTTTTATTTTGTCGTAAAATAATTATTTCTA-TTTATA-AAAATTATTT-AGAATAAAATAA
1 AC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAA
* *
822220 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTA-TCA
63 TACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-G
* * * *
822280 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATG
126 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * *
822335 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAAT
* * * * * *
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* * * *
822461 ACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTA
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* * * * * ***
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* ** * *
822580 TAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGA
66 TAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACT-GA
* * * **
822644 ACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAG-TATG
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AA-TCGTTATG
* * ** * *
822698 A-CTTTTTTTTTATCATAAAATGATTGTTTCAGTGCATAAAAGCTTA-TTGAAATAAATATAAT-
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA-ATAATA
* * * * * *
822760 -TATTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAATAA-ATATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTA-TCAA
65 CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAA
* * * * * *
822821 -ATGCTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTACG
128 CAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * *
822873 AACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATA-AAGCCTA-TTG-AATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
*
822933 ACTAATTTATT-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTA-TAGA
64 ACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GA
*
822996 AC-----C----A-TT-T--CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-
127 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
** * * * * *
823036 AAATTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
* * * * * * ** *
823101 TAATTTAATAATATTCTAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTGCCAAAGT
66 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-C
* * * * * ***
823165 AA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTGTTTATAAAAAATTATG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCGTTATG
* * * * * * * *
823217 GCCTTTTGTTTGGTCACATAACAATTTTTTTA--TCATTCAAGCCTATTT-AGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA
* * * **
823279 CTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTCATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
65 CTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* * * ** * * *
823344 TAGTTCAAATA--TATAACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATCATTATA
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * ** * *
823394 ACCTTTTGATCTGTCATAAAGCAATTATTTTTGTTCATACAATCTTA-TTCAGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA
* * * * * * * *
823458 CTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGCTAAAC
65 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC
* * * * * * *
823522 CAGTTCAAATATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
129 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * *** *
823574 ACCTTTCGTTTTAG-CATAAAATAAGTTTTTTTGAATTTATTTTAGCTTATTTGGAATAAAATAA
1 ACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * *
823638 -AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTCA-CAGT---AGATTTAAAAAATAATTC-AGTTTACC
63 TACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTA-C
* ** *
823697 T-AACTAGTTCAAATAACTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
124 TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
** ** * * * *
823753 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT-AGAATAAAAAAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA
* *
823817 CTAATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAA
65 CTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA
* * * * *
823877 CGAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAGTAATTATTTATTTCAAATAGTTATG
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* ** *
823930 A-CTTTT-TTTTGTTATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAAT
* * * * * * *
823991 ACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAA
64 ACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA
* * * * * *
824056 CTAGATCTAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
128 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
824109 ACCTTTTGTTTTGTCATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATA
824127 TAAGCTTATT
Statistics
Matches: 2298, Mismatches: 431, Indels: 275
0.76 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
161 5 0.00
163 52 0.02
164 9 0.00
165 4 0.00
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171 2 0.00
173 5 0.00
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181 346 0.15
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184 2 0.00
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Consensus pattern (180 bp):
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TAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAA
GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
Found at i:822117 original size:538 final size:535
Alignment explanation
Indices: 821080--836659 Score: 7274
Period size: 542 Copynumber: 29.2 Consensus size: 535
821070 TTATGCTATA
** ** * * * *
821080 ACCTTTTGTTTTGTCACCAAATTGTTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAACAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT
*
821145 AATTTACTAATA-TT-AAGACAATTAAT-AGATAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTCCTAA
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** * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* * * * *
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*
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* * * * * * *
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*
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* *
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT
* * *
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* * * *
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* * *
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* * * ** *
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258 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATATATTTACTGA-ACAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** *
821944 ACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
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* * *
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** * * ** * * * *
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* *** *
822136 TAATCTATTTCAAATGGTTATA
514 TTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * * **
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* * * *
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* * * * *
822284 AGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
822349 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-T
192 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
822413 TCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GTCGAACCAATTCAAATAGTT
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
822477 AAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTC
318 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * *** *
822542 TTTCAATTTATACATTTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAA
383 TTT-AATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAA
** * * *
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446 TAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
822671 AACAATTATATATTT-ATAAGA-AGTATG
509 AATAATTATCTATTTCA-AA-ACATTATG
* * * * * * *
822698 A-CTTTTTTTTTATCATAAAATGATTGTTTCAGTGCATAAAAGCTTATTGA-AATAAATATAAT-
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAA-ATAATA
* * * * * * *
822760 TATTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAATAAATATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATC-AA-AT
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAA-ATA-TTTTTCTAACAA
* * * * * * *
822823 GCTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTACGAACTTTTATTTTGT
128 G-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ATTTTTGTTTTGT
** * *
822887 CATAAAACAATTGTTTTTCATCAT-AAAGCCTATT-GAATAAAATAATACTAATTTATT-ATATT
191 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
822949 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTA-TAGAAC----C----A-TT-T
256 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-GAACAGTTCAAATAGTTAT
** * *
823003 --CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AAATTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTT
320 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * *
823065 TCAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTGATAA
385 T-AATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
823130 CTAAGAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTGCCAAAGTAA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAATA
449 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * *
823193 ATTATCTGTTTATAAAAAATTATG
513 ATTATCTATTT-CAAAACATTATG
* * * * * * *
823217 GCCTTTTGTTTGGTCACATAACAATT-TTT-T-TATCATTCAAGCCTATTTAGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* * * * * *
823279 CTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTCATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
65 -TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATAT-TTT-TCTAAC
* * * ** * * * * * *
823344 TAGTTCAAATA--TATAACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGATCTG
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTG
* * * * * *
823407 TCATAAAGCAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
190 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
823472 -TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATATT
254 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGT
* * * * *
823535 TAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTAG-CATAAAATAAG
317 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAATAA-
* * * * * *
823599 TTTTTTTGAATTTATTTTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAA
380 -TTGTTT-AATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * * **
823662 ATTCA-CAGT---AGATTTAAAAAATAATTCAGTTTACCTAACTAGTTCAAATAACTATGACTAT
441 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
*
823723 TTGAATAATTATCTATTTCAAATA-GTTATG
506 TTGAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATG
* ** * * * * *
823753 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAAAAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-
* * * * * *
823818 TAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGA
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAA--TATTTTTCTAACAA
* * * * * *
823880 GTTCAAATAGTTATGACTAATTGAGTAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACTTTT-TTTTGTTA
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATTTTTGTTTTGTCA
*
823944 TAAAACAAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
193 TAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
824008 TCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCTAATAGTCAT
256 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTAT
* * *
824073 GACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCAT---ATAA--G--
320 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* *
824131 --CTT-AT-T---C--A----AAATAAAATAATACTAAGTTATT-ATATTAC-AAAAATTAATAA
385 TAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAA
* * ** * * * * *
824181 GTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTGTCGAGCAACTTTAAATAATTATGACTATTTTAATAA
449 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * ****
824246 TTTTCTTTTTGAAATTGCTAT-
514 TTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * *
824267 AGCCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTCTTTCTATTCATACAAGTTTGTTTTTA-AATAAAATAA
1 A-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CT-TATTTAGAATAAAATAA
* *
824331 TAAAATTTTATTAATA--T-AAAGACACTTAATAAGTAAAACATTTATAAAATAAAT-TTGTTTA
63 TATAA-TTTATTAATATTTCAAA-A-A-TTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATT-TTT-
* * * * *
824392 TTGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGACTTTC
121 CT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGA-TTTT
* * * *
824455 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTT
183 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTT
* * ** ** *
824520 ATTAATATTTCAACAATTAATAAGTACAAGATTTAAGCAATAAATATATTTTTTGAATATGTTCA
247 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACA-GTTCA
* * * * * *
824585 AATGGTCT-TGACAATTTGAATAATTATCTATTTTAAGTCATTGTGACCTTTT-TTTTGTAATAA
311 AATAGT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
824648 AACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGATATAAAACAATACCAATTTACTAATATTCCAA
375 AATAATTG-TTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
* * * * * * * *
824713 AAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACATGTTTAAATAGTTATGAC
439 AAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
*
824778 TATCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
503 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * *
824811 ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAAAAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATA
* * * *
824875 -AATTTATTAATATTTGAAAAATCAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAT
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATAT-TTTTCT-AACAA
* * *
824939 GTTTAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA------------C-
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
824991 -----CATTTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTC
193 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * *
825051 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAGCGAGTTTAAATAGTTA
257 CAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA-C-AGTTCAAATAGTTA
* *** ** *
825115 TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATGGCTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
319 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * * *
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384 TT-AATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
** * * * ** * *
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*
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511 TAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * ** * *
825333 ACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTAAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-
* * * ** * * * *
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65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAA--TATTTTTCTAA-CA
* * * * * * * * *
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127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGATTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * * * * *
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191 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
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255 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTT-----A-C-TGAAC-AGTTCA
* * * * ** * *
825648 AATCGTTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAAT-TTTTTCAGTTCATACATG--C--TT-ATT
311 AATAGTTATGA-C---TATTT-G--A-ATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTT
** ** * * * * *
825707 TGAAATAAAATAA-T-ACTAATTTAT-TAA-C--ATTCAGAAAT-TAATGAACAAC-AAGTT-TT
367 TGTCATAAAATAATTGTTTAATTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAAT-AA-TACTAATTTATT
*** ** * * * * ** * * * * * *
825763 AA-AAAATAAATCTGT-TTACCG-AATA-AGTTCAACTAGT-TATGGCTATTTGAACAATTACTA
429 AATATTCTAAAAAT-TAATA-AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT--CTGTTT-ACCGA--ACAA
* * ** * * * *
825823 -TTTATTATAAATATGACCATTTG--T-TTTATC-A---CAAAACAATTGTTTT
486 GTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAAC-A-T-TATG
* * ** * * * *
825869 A-GTTCATAAATGCTTATCCGAAATAAAATAA-TATTACT-TT-AT-TAA---TATTT--CA-AA
1 ACCTT--T---TG-TT-T-TGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAA
* * * * * ** ** *
825923 AAT--TGATAAGTTA--GAGATTT-AAAAAATAAGTCAGTTTATTGAATTGGT-TCAAAT-AATT
58 AATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAG--TA-AAAATT--TAAAAAATAAATA
* * * * *
825981 TTGGCCATTTGAACATTATCTATTTCAAATCA-TTACGAACT-TTTG--T--TTGT-T-TTT-AA
116 TT-----TTT---C--TAACAAGTTCAAAT-AGTTATG-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * ** * **** *** **
826037 A----TA--A--T-TGTTTT-TCATCACACCAA--CCTATTCAAAATAAAATAATATT--AATTT
169 ATCGTTATGATTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAATAA
* * ** ** * * * ** * * **
826088 ATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACGAAACTAGTT
233 AATAATA-CT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAA-AGATTTA-AAAAATAAAT
* *** * * * *
826151 CCTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAAC-ATTT---T--GT-TCTATTAT-AAA--
292 -ATATTT--AC--TGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT-TCAAATC
** * * * * * * *
826206 A-TA--A--TTGTTGTAGT-TCATGTAAACTTATTCG--GAA-TAAAATAATACTAATTT--AAT
350 ATTATGACCTT-TTGTTTTGTCA--TAAAATAATT-GTTTAATTCATATAA-GCTTATTTGAAAT
* * ** * * *
826260 --AAT-ATTCCAA-AAATTAACA-ACTAAGAGATT--TAA--AA-A-A-TT----AAT---T-TG
410 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
** * * * * * * * **
826305 TTTGTCGAAGC-AGTTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAA
474 TTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * **
826367 ACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AAT--AA-AATA
** * * **
826431 ATAATAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAACCTATCTACC
62 AT-ATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAA--TATTTTTC
* * * ** * * *** * * * * * *
826495 GAATCAA-TTTAAATAATGGTGGCCATGCCAACAATTATTTATTTGAAATCATTATTACCTTTTG
122 TAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTG
* * * * ** **
826559 TTTGGTCATATAACAATTATATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
185 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
826624 TAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCCTATTTACCGAACTATTTTAA
249 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTACTGAAC-AGTTCAA
* * * ** * * * * *
826688 ATAGTTATGACTATATGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTATATTGTCATAAAA
312 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** * * * * * *
826753 CAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATGCTAATCTAATAATATTCCAAAA
377 TAATT-GTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* * * * * * * *
826818 ATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAGATATTTAAGACTAT
441 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * *
826883 ATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
506 TTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * *
826913 ACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATA
1 ACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTCTG--TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATA
* * *** *
826977 AAATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGTGCTTTAAAAAATAATTATGTTTATCT
62 ATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATAT-TTT-TCT
* * * * * * * *
827042 AACCAGTTCAAATAATTATGACTTTTTGAACAATTATCTATTTCAAGTCATTATGAACTTTTATT
123 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ATTTTTGTT
* * * * ** *
827107 TTTTCATAAAGCAAATGTTTTTGTTCATATAATTTTATTCAGAATAAAGTAATACT-ATTCTATT
187 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATT-TATT
* * * * * *
827171 AATATTTC--AAA-TATTAA-TAAAATATTTTAAAAATAAATCTATTTA-TTAAGCTAGTTTAAA
250 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA-C-AGTTCAAA
** * * *
827231 TAGTTATGACTATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCA-T-TGA-CTTTT-TTTT-T-ATAAAAC
313 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* ** * * * *** * * *
827290 AATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATTCGGTTTAAAACACTACTAATTTATTAATATT-TCAACA
378 AATT-GTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * * * * * * *
827354 ATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAATCATGATTAT
441 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
827419 TTGAATAATTATTTATTTTAAATCGTTATG
506 TTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * ** *
827449 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAAGAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-
* * ** *
827514 TAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGTATCTGTTTAT-TGAA
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAAATAAATAT-TTT-TCT-AA
* * * ** * *
827577 CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGGAAT-GTTATAACCTTTTGTTTT
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTT
* * * * *
827641 GTTATAAAAGAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAA
189 GTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
*** * * * * ** * * *
827705 TATTAGGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAATCG
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA-CAGTTCAAATAG
* * * * * *
827770 TTATGACTATATATG--CAATTATTTATTTC-AA-CTTGTATGACTTTTTGTTATGTCATAAAAC
316 TTATGACTAT-T-TGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * *
827831 AATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAC
378 AATTGTTT-AATTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAA
* * ** **
827894 AATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAGCCATGACT
440 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* *
827959 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATG
504 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * * **
827991 ACC--TTATTTTGTAATAAAATAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAAT
* * * * * * *
828052 AATAATTTACTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAAAAGAATTGAAAAAACAATCTATTTATT-G
64 -ATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAA-AATTTAAAAAATAA-ATATTT-TTCT
* * * * * **
828115 AAAAAGTTCAAATAGCTT-TGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACACTATGACTTTTTGT
123 AACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGT
* * * ** * *
828179 TTTATCATAAAACAATTAG-TTCTATTCATGCAAGCTTATTCTGAATAAAATAAT-TTAAATTTA
186 TTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTA
* * * * * *
828242 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAACATGATCAA
248 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACA-GTTCAA
*
828306 ATAGCTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
312 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
*** * * * *
828370 CCCATTGGATTT-GTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAA
376 ATAATT-G-TTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
** * * * * *** * * *
828434 TCATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGTGAGTTTAAATAGTTGTGATT
439 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *** **
828499 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTACA
504 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * *
828531 ATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-GAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA
* ** * * ** *
828595 CTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAGAATGTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTCTACCGAA
65 -TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-GTAAAAATTTAAAAAATAAATAT-T-TTTCTAA
* * * * * * * * * * *
828659 TAAGTTTAAACAGTCATGTCCATTTAAACT-ATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTATTT
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTT
* * *** *
828723 TTTCGTAAAACAATTGTTTCCATTCATGAAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
188 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT-AAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * **
828787 GTATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAACTAAATTTGTTTACAAAATCAGTTCAAATA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA-CAGTTCAAATA
* ** * * *
828847 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACA
315 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * ** * *
828910 ATTGTTTATATTCATAAAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAAT
379 ATTGTTTA-ATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * * * *
828975 TAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATC
443 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *** * *
829039 AGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTA
507 TGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* ** * *
829068 ACATTTTGTTTAATCATAAAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTTTTTAATCATAAAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TA---A--T----T-G-TTT---C-----TGT--TCATACAA-
** * * * * * * * *
829133 TATTGTTTTAG-TTCAAATAATACT-CTTCTATTAACA-TTCAAAAAATTAACAAGTAGGAAGTT
43 GCTT-ATTTAGAATAAAATAATA-TAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAAATT
* * *
829195 TAAAAAATAAATTTATTTATT-GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
103 TAAAAAATAAA--TATTT-TTCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * ** * * *** *
829259 TAAAATTGTTATAACCCTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAA
165 TCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTC-A
* * * * * * *
829324 AATAAAAT-ATATTACTATATTAATATTTCAAAAATTGAGAATTTAAAGATTTAAAAAATAAAT-
228 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * * *
829387 TAGTTTAGTAAATCAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCTTTAT
293 TA-TTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
** * * * *
829451 GATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTGATCATACAAGCCTATTTCAAATAAAATAAT
355 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAAT--TCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
* * *
829515 ACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGA
418 ACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA
* * * * * * * *
829579 ACTAGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATA
482 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * * * * * *
829633 ACCTTTTGTTTTGTCATAACACAGTTATTTATGTTCAAACAAGCTTATTCAAAATACAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-
* * * * * * *
829698 TAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACTGAAC
65 TAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATATTTTT-CT-AA-
* * * * * * *
829762 CAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATAAATAATTATTTACTTCAAA-CAGTTATGACCTTTTGTTT
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGA-TTTTTGTTT
* * * * * * *
829825 TGTCTTAAAACAAATG-TTTTGCTCATATAAGATTGTTCATAATAAAATAATATTAATTTATTAA
188 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * **
829889 TATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAG
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTTCAAATAG
* ** * * * * * * *
829950 TTATAAAAATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATTAGTATAACCATTTG--TT-TC----------
316 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * * *
830002 TG-TTGATACA-AT---CTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAA
381 TGTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * ** * * * * *
830062 TAAGTAACAGATTT-AAAAATGAATATGTTGGCCTG-ACCAGTACAAATAGTTATAACTGTTGGA
446 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * *
830125 ATAATTATATGTTTCAAAGCATTATA
510 ATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * * * *
830151 ACCTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAG-TTGACTTAGAATAATATAAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTTAGAATAAAAT-AAT
* * * * * * * **
830215 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTATCGATT
64 ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATAT-TTT-TCTAAC
* * * * * *
830280 AAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGCTATAATCTTTTGTTTTA
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT-TTTTGTTTTG
* * * * *
830345 TCATAAAATAATAT-TTTCTAG-TCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATT-A
190 TCATAAAACAAT-TGTTT-TTGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
830407 -A-TTCAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AATAAGTTCAAAT
252 TATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTGAA-CAGTTCAAAT
* * * * *
830469 AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTATTATCATAAAACT
314 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-T
** * * * * * * * * **
830534 -ATTGTTTTTGTTTATACAAGCGTATTCGAATTGAAATAATATTAATTTATTAACACTT-TATCA
378 AATTG-TTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
* * * * * * * * * * *
830597 ATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAATAAGTATGTTTACCAAACAGGTTCTAACAGTTATAACTAC
441 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
830662 TTAAATAATTATATATTTCAAATCGTTATG
506 TTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
** * * ** * * * * *
830692 ACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATC-AATCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAA-TA
* * * * * * *
830756 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTACTGAACA
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATAT-TTTTCT-AACA
* * * *
830821 AGCTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-CAGTTATGATCTTTTTATTTT
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGA--TTTTTGTTTT
* ** * * * * *
830884 GTTATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
189 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * ** *
830949 A-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAG
253 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA-CAGTTCAAATAG
* * * * * * ** * *
831013 TCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT-TCTTTACCGTAAAACAA
316 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAATAA
** * ** * ** ** * * * *
831077 TTGTTTCTGTTCATACAAAATTA-TTCAGAATACGATAATACCGATTCATTAAGATTTTGAAAAT
380 TTGTTT-AATTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * * *
831141 TAATAAG--AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTTTTT
443 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * *
831202 GAATAATTATGTATCTCAAATCATTATG
508 GAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * * * *
831230 ATC-TTTATTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTA-TTCGAAT----TAAGAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT
* * * * * *
831289 AA--TACT-A-A--T------TTAATAA-TAAAAA--T---AAATGAGT-TTTGTCAAACCAGTT
66 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATTTTTCTAACAAGTT
** ** * * * * *
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131 CAAATAGTTATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCAT
* ** * * *
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194 AAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
831463 AAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGCTCAAATAGATA
258 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTA
* * * * ** * * * * *
831523 TGGCTATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGT
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** * * * ** * * *
831588 TTTTTATCATACAAGGTTGTTCAAAATAAAATAATGCTAATTGATTAATCTT-TCAAAAATTAAT
384 TTAAT-TCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT
* * *
831652 AAGTAAGAGATTTACAAAATAAATCTATTTATCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
447 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
831716 CAATTGTATACTTCAAATCAATCATTTAAAAAAATAA
511 TAATTATCTATTTC-AA--AA-CA-TT------AT-G
* * * * * *
831753 ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA
* * * * * * * * *
831817 CTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAGTAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTATCGAAT
65 -TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATAT-TTT-TCTAA-
* * * * * * * *
831882 C-AGTTTAAATAGTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTCTTTT
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTT
* * * ** *
831946 GTCAT-AAA-ATTTTTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATT
189 GTCATAAAACAATTGTTTTT--GTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATT
** * * * ** *
832008 AATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AAGTGGTTCTAA
250 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTGAA-CAGTTCAAA
* * * * * *
832072 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGA-TGTGACCTTTGGTTTTGTCATAAAA
313 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * *
832136 CAAATAT-TTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCCAAA
377 -TAAT-TGTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
* * * * * * *
832200 AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATCAAACCAGTTTAAGTAGTTATGACTA
440 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
** * ***
832261 TTTGAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTATG
505 TTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * ** * *
832292 ACATTTTCTTTTGTCATAAACAT--TTATTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * * *
832354 GT--TGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA-A------T--C-A
64 ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATTTTTCTAACAA
* * * * * * * * * * * *
832406 GTTTAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGCTTTCTC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTC
* *
832471 ATAAAACAA-T-TTTTT-TTCAGTATAGAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAAT
192 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCA-TA-A-AAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * *
832533 ATTTCATGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACTAGTTCAAATAG
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-GAAC-AGTTCAAATAG
* ** ** * * *
832593 TTATGACTATTTGAATAATTCTCTATTTCAAATTGTTAAAACCTCTTGTTTTATCATAAAACAAT
316 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * * *
832658 TGTTTCTATTTATATAAGCTTACTTGGAATAAAGTAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATTA
381 TGTTT-AATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * ** * * *
832723 ATAACTAAGAGATTAAAAAAATAAATACAT-TTT-TTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATAT
445 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-C-TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * ***
832786 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
508 GAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * ** *
832814 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATGAG-TT-TGTTCGAAATAAAATAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TTAG-AATAAAATAA
* * * *
832877 TATTAAGTTATTAATATTTTAAAAAATTAATTAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACTA
63 TA-TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATAT-TTTTCT-
* * * * * * *
832941 AACCATTTCAAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTAAATTTTTAT
123 AACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GATTTTTGT
* * * ** * * * * *
833006 TTTGACATCAAAC-ATTG-TCTTGTTCATACTA-TTTTTTTAGAA-CAAATAATACTAATTTAAT
186 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** * * * * * *
833067 AATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTACAAAAAATAAATCTAATTGCCGAACCA-TTCAA
250 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATT-TAAAAAATAAATATATTTACTGAA-CAGTTCAA
* * * * * * * *
833131 ATAGTT-TAGACTATAT-AAAACGATTATCTATTCCAAATCGTTATAACCTTTTCTTTTATCGTA
312 ATAGTTAT-GACTATTTGAATA--ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
833194 AAACAATTATTTCATTTATACAAGCTTATTCT-AATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATT-TC
374 AAATAATTGTTTAATTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-
* * * *
833257 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTTCAAATGGTTAAG
437 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
833321 ATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTA
501 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * *
833356 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-
* * ** *
833421 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAACAAG-AAATAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCA
65 TAATTTATTAATATTTC--AAAAATTAATAAGTAAA-A-A-TTTAAAAAATAAA--TATTTTTCT
* * * * * * * * * * * *
833484 AACAAGTTCGAATAATTATTATTATTTGAACAGTTGTCAATTTAAAATCATTATAACTTTTTGGT
123 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTT
* * * * * ** *
833549 TTGTCATAAAACATTTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTA
187 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * ** *
833614 ATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAA-ACTTAAAAAATAAATCA-GTTTGTTGAATTAGTT-AA
251 ATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTACTGAA-CAGTTCAA
* * ** * * * * *
833675 TATAATTAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTGTTACCTTTTGTTCTATCATAA
312 -ATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
833739 AACAATTGGTTT-TTATCATACAGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TC
375 AATAATT-GTTTAAT-TCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-
* * * *
833802 AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATC-AGTTTAAATAGTTATG
437 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
833866 ACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAG
501 ACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAAACATTATG
* * * ** * *
833901 A--TATATGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTAATCATA-GAGACTTATTTGGTAA-AAAATAA
1 ACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CTTATTTAG-AATAAAATAA
* *
833962 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG---AAATTTAAAAAATAAATGTATTTGTC-AA
63 TA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAA--TATTTTTCTAA
** * * * * * * *
834023 GTCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATTATTACCTATTTCAAATCATTCTAACTTTTTGCT
125 --CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTT
* * * * * * ** *
834087 TAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCTTACTAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-CTAAATTTAT
187 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * * * * * *
834150 TAACA-TTCACAGAATTAAAAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAATTCA
249 TAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTTCA
* * * * * * * *
834214 AATAGTGATGGCTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTAGACATAAA
311 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *** * * *
834279 ACATTTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATAATTC-AT
376 ATAATTGTTT-AATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAA
** * * * * *
834343 AAATTAATAAACAAGA-ATTT--AAAATAAATTTATTTACTGAGCAAATTCAAATAGTTATGACT
439 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
*
834405 ATTTAAATAATTGA-CTATTT-AAAATCATTATG
504 ATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAAA-CATTATG
* * * *** * *
834437 GCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTGAATTCATACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-
* * ** * * *
834502 TAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAATAAGTGATTTAAAAAGTGAAT-TTGTTTACCGAAT
65 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATT-TTT--CTAA-
* * * * *
834566 C-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT--TTCCTTTGATT
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATT--TTTG-TT
* * * * * * ** *
834628 TGGTCATATAACAATTGTTTTT-ATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATTGTAATTTATCA
187 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *
834692 ATCTTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAATATAAATCA-ATTTACTGAACTAGTTTAAA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAAT-ATATTTACTGAAC-AGTTCAAA
* * * * * * * * * *
834752 TAGTTATTACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAAT
313 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * ** * ** *
834817 AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAAT
378 AATTGTTTAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * ** * * * * * *
834882 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGGCTATAT
443 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* *
834947 GAACAATTATCTATTTC--AA-ATCAT-
508 GAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * ** * * *
834971 ---TTTTGTTTTGACATAAAACAAAAT-TTTCACTTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* * * **
835032 TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAAC
65 T-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAA--ATATTTTTCTAAC
* * * * * * *
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126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA--TTTTTGTTTT
* * * * * * *
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* * * * *
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253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACT-GAAC-AGTTCAAATAG
* * ** ** *
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* * * * * * * * *
835350 TAATT-TCT-ATTAATAAAAACTTA-TTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACA
377 TAATTGTTTAATTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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** ** * * * *
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189 GTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
835753 TA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT
252 TATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTTCAAAT
** * * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * *
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441 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTA
* * *
836005 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTA
505 TTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * *
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA
* * * * * *
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* * * * * * *
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125 CAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTT
* ** ** *
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188 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * *
836287 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTTCT-AATACGTTCAAATA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACA-GTTCAAATA
* * * * *
836350 GTTATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAA
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* * *
836413 TTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGAAA-AAAATAATACT-ATTTATTAA-ATTTTAAAAATT
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* * * *** *
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* * * ***
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508 GAATAATTATCTATTTCAAAACATTATG
* * * * * ** * *
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATA
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65 -TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
836660 TGGAGATTTA
Statistics
Matches: 11546, Mismatches: 2571, Indels: 1854
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561 4 0.00
562 3 0.00
563 11 0.00
564 63 0.01
565 157 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT
AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATTTTTCTAACAAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTAT
TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAATTC
ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
TTTCAAAACATTATG
Found at i:823106 original size:166 final size:163
Alignment explanation
Indices: 822842--823150 Score: 394
Period size: 163 Copynumber: 1.9 Consensus size: 163
822832 AATTATGGCC
* *
822842 ATTTAAATAATTATCTATTTCAAATGTTACGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA
1 ATTTAAATAATTATCTATTTCAAATATTACGAAATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA
* *
822907 TCATAAAGCCTATTGAATAAAATAATACTAATTT-ATTATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAG
66 TCATAAAGCCTATTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAG
*
822970 ATTTAACAAATAAATCTATTTATAGAACCATTTCT
130 ATTTAA-AAAAAAATCTATTTATAGAACCATTTCT
* * * * * *
823005 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAAATTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTG--TTTC
1 ATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTACGAAATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC
* *
823067 AGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTGATAACT
65 A--TCATA-AAGCCTA-TT-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACT
823132 AAGAGATTTAAAAAAAAAT
125 AAGAGATTTAAAAAAAAAT
823151 ATGTTTGCCA
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 13, Indels: 13
0.83 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
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168 1 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (163 bp):
ATTTAAATAATTATCTATTTCAAATATTACGAAATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA
TCATAAAGCCTATTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGA
TTTAAAAAAAAATCTATTTATAGAACCATTTCT
Found at i:823316 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 823003--824126 Score: 910
Period size: 179 Copynumber: 6.3 Consensus size: 179
822993 AGAACCATTT
* * ** * * * *
823003 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AAATTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTC
1 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT
* * * * *
823067 AGTTCATAT-AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTGATAA
65 TGATCAT-TCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * *
823130 CTAAGAGATTTAAAAAAAAATATGTTTGCCAAAGTAATTCAAATAATTAAGA
128 GTAAGAGATTTAAAAAAAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGA
* * * * * * *
823182 CTATATGAATAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCACATAACAATTTTTT
1 CTATATGAATAATTATCTATTT-CAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT
* * *
823247 T-ATCATTCAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTCATAAGT
65 TGATCATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
*
823311 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAAT-A-TATA-A
130 AAGAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTA-AGA
* * ** * * * * * *
823360 CTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGATCTGTCATAAAGCAATTATTTT
1 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT
* * * * * * *
823425 TGTTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAC
65 TGATCATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
823489 TAAGAGAATTAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATATTTAAGA
129 TAAGAGATTTAAAAAAAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGA
* * * * *
823540 TTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTAG-CATAAAATAAGTTTTT
1 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA-TTTTT
* ** * * *
823604 TTGAATTTATTTTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTCA-
64 TTG-A-TCATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * *
823667 CAGT---AGATTTAAAAAATAAT-TCAGTTTACCTAACTAGTTCAAATAACTATGA
126 AAGTAAGAGATTTAAAAAAAAATAT--GTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGA
* * **
823719 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAGTTTT
1 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTT
* * * * * *
823784 TGTTCATAT-AAGTTTGTTTAGAATAAAAAAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-
65 TGATCAT-TCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
823844 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTTATGA
129 TAAGAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGA
* * * *
823896 CTA-ATTGAGTAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-CTTTT-TTTTGTTATAAAACAAATTTTT
1 CTATA-TGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTT
* * * *
823958 TTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAA
64 TTGATCATTCAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *** * * * * *
824022 GTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCTAATAGTCATGA
128 GTAAGAGA-TTTAAAAAAAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGA
* * ** *
824075 CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATA
1 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
824127 TAAGCTTATT
Statistics
Matches: 747, Mismatches: 157, Indels: 80
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.00
175 65 0.09
176 7 0.01
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178 74 0.10
179 286 0.38
180 104 0.14
181 33 0.04
182 39 0.05
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTT
GATCATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
AGAGATTTAAAAAAAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTAAGA
Found at i:824273 original size:159 final size:160
Alignment explanation
Indices: 823956--824285 Score: 407
Period size: 159 Copynumber: 2.1 Consensus size: 160
823946 AAACAAATTT
* * * *
823956 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATA
1 TTTTG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATA
* * *
824021 AGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCTAATAGTCATGACTATTTAAATA
65 AGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCTAATAATCATGACTATTTAAATA
*
824086 ATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTG
130 ATTATCTATTTCAAATCGCTATTACCTTTTG
*
824117 TTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATT-ATATTACAAAAATTAATAA
1 TTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
824181 GTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTGTCGAGC-A-ACTTTAAATAATTATGACTATTTTAAT
66 GTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGA-TCT-AATAATCATGACTATTTAAAT
* * * *
824244 AATTTTCTTTTTGAAATTGCTA-TAGCCTTTTG
129 AATTATCTATTTCAAATCGCTATTA-CCTTTTG
824276 TTTTGTCATA
1 TTTTGTCATA
824286 AAATGATTCT
Statistics
Matches: 145, Mismatches: 21, Indels: 8
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
157 1 0.01
158 5 0.03
159 97 0.67
160 37 0.26
161 5 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (160 bp):
TTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAA
GTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCTAATAATCATGACTATTTAAATAA
TTATCTATTTCAAATCGCTATTACCTTTTG
Found at i:824586 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 824122--825559 Score: 803
Period size: 181 Copynumber: 8.1 Consensus size: 177
824112 TTTTGTTTTG
* * *
824122 TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATT-ATATTACAAAAATTAATAAGTAAG
1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAA-
* * * * ** * * *
824186 AGATTTAAAAAATGAATATGTTTGTCGAGCAACTTTAAATAATTATGACTATTTTAATAATTTTC
64 AGATTT-AAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* * * ** *
824251 TTTTTGAAATTGC-TATAGCCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTCTTTCTAT
128 TATTTCAAATT-CTTAT-GACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * *
824302 TCATACAAGTTTGTTTTTAAATAAAATAATA-AAATTTTATTAATA-TA-AAGACACTTAATAAG
1 TCATACAAG-CT-TATTCAAATAAAATAATACAAA-TTTATTAATATTACAA-A-AATTAATAAG
* * * * * * *
824364 TAAAACATTTATAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAAT
61 T-AAAGATTTA-AAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* *
824428 TATTTATTTCAAATTCTTATGACTTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
124 TATCTATTTCAAATTCTTATGACTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** * *
824483 TCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTACA
1 TCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACAAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTA-A
* * * * * *
824548 AGATTTAAGCAATAAATATATTTTTTGAATATGTTCAAATGGTCT-TGACAATTTGAATAATTAT
64 AGATTTAA-AAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTTAAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTAT
* * * *
824612 CTATTT-TAAGTCATTGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGT
127 CTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * * * * * *
824663 TCATATAAGCTTATTTGATATAAAACAATACCAATTTACTAATATTCCAAAAAATAATGAGTAAG
1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAA-
* * * **** *
824728 AGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTAT
64 AG-ATT-TAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * *
824793 CTATTTCAAA-ACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGT
127 CTATTTCAAATTC-TTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * ** *
824845 TCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAA-AA-ATAAATTTATTAATATTTGAAAAATCAATAAGTAAA
1 TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAA
* * *
824908 AATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATCT
65 GA-TTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
* *
824973 ATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTTGTTCAT--AA-AA--G-TT-TAT
129 ATTTCAAATTCTTATGA-CTTTTG-TTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** * *** *
825018 T--TGA-AA---TA---AAAT--AATACTA-ATTTATTA-AAATTCCAAAA--ATTAATAAGTAA
1 TCAT-ACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACAAAT-TTATTAATATTACAAAAATTAATAAGT-A
* * ***
825068 AAGATTTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAGCGA-GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
63 AAGA-TTT-AAAAATAAATATGTTTTTTGAA-C-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * *
825131 TATTTATTTCAAATGGC-TATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
124 TATCTATTTCAAAT-TCTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * * *
825186 TCATATAAGTTTATTCGAAATTAGATAATACTAACTTATTAATATT-CTTAAAATTAATAAGTTG
1 TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAC-AAAAATTAATAAG-TA
* * ***** * * ** * *
825250 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGTTCAAATAGCCAT-ATCCATTTGAGCT-ATT
63 AAGATTT-AAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTGA-ATAATT
*
825313 ATCTATTTCAAA-TCATTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTAT
125 ATCTATTTCAAATTC-TTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * * * * *** *
825367 TCATACAAAATTATTAAAAATAAAATAATACCAATTTATCAATTTTTTGAAAATTAAGAAG--AA
1 TCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * *
825430 -ATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAATCA-GTTCT-AATAGTAATGATTATTTAAACAATTAT
65 GATTTAAAAA-TAAATATGTTTTTTGAA-CATGTT-TAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * *
825492 CTATCTCAAAATGTTATTA-TCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATAT
127 CTATTTCAAATTCTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
*
825543 TCATACAAGTTTATTCA
1 TCATACAAGCTTATTCA
825560 GGGTAAATTA
Statistics
Matches: 976, Mismatches: 197, Indels: 175
0.72 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
161 13 0.01
162 20 0.02
163 72 0.07
164 11 0.01
166 1 0.00
167 2 0.00
168 6 0.01
169 1 0.00
170 3 0.00
171 3 0.00
173 5 0.01
174 2 0.00
175 3 0.00
176 45 0.05
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180 193 0.20
181 314 0.32
182 115 0.12
183 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAG
ATTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
TTCAAATTCTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
Found at i:825162 original size:163 final size:157
Alignment explanation
Indices: 824855--825172 Score: 399
Period size: 163 Copynumber: 2.0 Consensus size: 157
824845 TCATGCAAGC
* **
824855 TTATTTCAAATAAAAAAATAAATTTATTAATATTTGAAAAATCAATAAGTAAAAATTTTAAAAAT
1 TTATTTCAAATAAAAAAATAAATTTATTAAAATTCCAAAAATCAATAAGTAAAAATTTTAAAAAT
* * * * *
824920 AAATATGTTTTCTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGT
66 AAATATATTTACTCAACATGTTTAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATTTCAAATGGC
824985 TATGACCATTTGTTTTTGTTCATAAAAGT
131 TATGACCATTTG-TTTTG-TCATAAAAGT
* * *
825014 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAA
1 TTATTTCAAATAAAAAAATA--AATTTATTAAAATTCCAAAAATCAATAAGTAAAA-ATTTT-AA
* * *
825079 AAATAAATCTATTTAC-CAAGCGA-GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCA
62 AAATAAATATATTTACTCAA-C-ATGTTTAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATTTCA
*
825142 AATGGCTATGA-TATTTTGTTTTGTCATAAAA
125 AATGGCTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAA
825173 CAATTGTTTC
Statistics
Matches: 137, Mismatches: 15, Indels: 12
0.84 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
159 18 0.13
161 38 0.28
162 13 0.09
163 67 0.49
164 1 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (157 bp):
TTATTTCAAATAAAAAAATAAATTTATTAAAATTCCAAAAATCAATAAGTAAAAATTTTAAAAAT
AAATATATTTACTCAACATGTTTAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATTTCAAATGGC
TATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAGT
Found at i:825993 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 825654--826005 Score: 392
Period size: 180 Copynumber: 2.0 Consensus size: 180
825644 TTCAAATCGT
* * * **
825654 TATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATA
1 TATGACCTTTTATTTAGTCACAAAACAATTTTTTCAGTTCATAAATGCTTATCCGAAATAAAATA
* * *
825719 ATACTAATTTATTAACATTCAGAAATTAATGAACAACAAGTTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG
66 ATACTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATGAACAACAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCG
* * *
825784 AATAAGTTCAACTAGTTATGGCTATTTGAACAATTA-CTATTTATTATAAA
131 AATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAAC-ATTATCTATTTATTATAAA
825834 TATGACCATTTGT-TTTA-TCACAAAACAATTGTTTT-AGTTCATAAATGCTTATCCGAAATAAA
1 TATGACC-TTT-TATTTAGTCACAAAACAATT-TTTTCAGTTCATAAATGCTTATCCGAAATAAA
* * * * ** * *
825896 ATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAT-AAGTTA-GAGATTTAAAAAATAAGTCAGTT
63 ATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATGAA-CAACAAGATTTAAAAAATAAATCAGTT
** ** *
825959 TATTGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACATTATCTATTT
126 TACCGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACATTATCTATTT
826006 CAAATCATTA
Statistics
Matches: 142, Mismatches: 24, Indels: 12
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
179 4 0.03
180 114 0.80
181 23 0.16
182 1 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TATGACCTTTTATTTAGTCACAAAACAATTTTTTCAGTTCATAAATGCTTATCCGAAATAAAATA
ATACTAATTTATTAACATTCAAAAATTAATGAACAACAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCG
AATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACATTATCTATTTATTATAAA
Found at i:826028 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 825634--830000 Score: 1891
Period size: 181 Copynumber: 24.2 Consensus size: 180
825624 TTTGCCGAAC
* *
825634 CATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-ATTTAGTCATAAAATAATT-TTTTCAGTTCATA
1 CATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTT-AGTTCATA
* * * * * * * *
825697 CATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAGAAATTAATGAA-CAACAAGT
64 AATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAA-GAGA
* * * *
825760 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAACTAGTTATGGCTATTTGAA
127 TTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAA
* * * * * *
825814 CAATTA-CTATTT-ATTATAAATATGACCATTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTTAGTTCATA
1 C-ATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA
* * * *
825877 AATGCTTATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATT
64 AATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** ** *
825942 TAAAAAATAAGTCAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAA
129 TAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAA
* * * * *** *
825994 CATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTGTTTGT-T-TTTAAATAATTGTTTTTCATCACAC
1 CATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA-
* *
826057 CAA--CCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
64 -AATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* *
826120 TTAAAAACTAAATCTA-TTTA-CG-A-AA---C---T-AGT-T--CCTATTTGAA
128 TTAAAAAATAAATC-AGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGGCC-ATTTGAA
* ** * * * * *
826161 CAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTGTAGTTCATGT
1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCA--T
* * * * * *
826226 AAA--CTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAGAT
63 AAATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** ** ** * * * * *
826289 TTAAAAAATTAATTTGTTTGTCGAAGCAGTTCAAACAATTAAGACTATATGAA
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* ** * * * * *
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA-
* *
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64 AATGCTTATTCGAAATAAAATAAT-AT--TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * ** ***
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* * * ** * * * **
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGT-TTTAGTTCA-T
* * * * *
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63 AAATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
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* ** * * * * * * * * *
826707 CAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTATATTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAC
1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA-
** * * * * *
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64 AATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * * * * * *
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* * * *
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAATAA-TTGTTTT-AGTTCA
* * * * * * *
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* * * * ** * **
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* * * * ** * *
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA-
* * * * *
827137 AAT-TTTATTC-AGAATAAAGTAATACT-ATTCTATTAATATTTCAAATATTAAT-A--AA-ATA
64 AATGCTTATTCGA-AATAAAATAATATTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * * * *
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127 TTTAAAAAATAAATC-AGTTTACCGAA--TAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAA
* * * * * *
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA-
*** * * * * * * *
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64 AATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ***
827372 TTAAAAATAAAT-ATGTTTACTGAACT-AGATCAAATAATCATGATTATTTGAA
129 TAAAAAATAAATCA-GTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAA
* * * * * * * *
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1 -CATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA-
* * * * * *
827489 AA-GCTTATTGGGAATAAAAGAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGAT
64 AATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGAT
** * ** * * * *
827552 TTAAAAAATGTATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAA
128 TTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAA
** * * * * * *
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA
** *** * *
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64 -AATGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * ** * * *
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127 TTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCAT-T-TGAA
* * * * * *
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1 CATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA
* * * * *
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** * *** * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * *
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* * ** * * * ** * *
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* * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCAT-
** * * *
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* ** ** * * * *
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** * * * *
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* * * ** ** * * *
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* ** * * * * * * **
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** * * * * * * * ** *
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** * ** * *
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** *
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* ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* *** * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 C-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTA-GTTCATA
* * * * * * * * *
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*** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 -CATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA
* * **
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* * * * ****
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* * * * *
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* * * * *
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** * **
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* * * *
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* * * *
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* ** * * *** * * *
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* * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *** *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * **
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* * * * * * * * * * *
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* * * ** * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
** * ** *
827568 TTTATTGAAC-AAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGGAAT-GTTATAAC
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* * * ** *
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129 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* *** * * * * ** *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTAT
* ** * * * *
827749 TTACC-AAATAAGTTTAAATCGTTATGACTATAT-ATGCAATTATTTATTTC-AA-CTTGTATGA
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* * * * ** * * * *
827810 CTTTTTGTTATGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCATAT-T
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* * * **
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAACCT
* ** * *** * * * *
827928 GTTTATAGAAC-AAGTTCAAATAGCCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGA
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* * * * * * ** *
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128 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TATTTGAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * * * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAG-ATTTAAAAAATAAACCTA
** * * * * * * * *
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* * * * ** *
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128 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGAATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAA
* * * * * *
828225 AAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTA
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
* ** * * ** * * *
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* * * * * *
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128 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TATTTGAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* ** * * * **
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTAT
* * * * * * * * ** * *
828470 TTACCG-AGTGAGTTTAAATAGTTGTGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTACAATC
66 TTACCGAACT-AATTTAAATAATTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
* * * ** *
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130 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* ** * *
828586 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAGAA-TGTGGAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
* * * * * * * * * * *
828650 TCTACCGAA-TAAGTTTAAACAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAATCATTATGAC
65 TTTACCGAACTAA-TTTAAATAATTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * * ** ** * *
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129 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGAATTCAT-ACAAGCTTATTTGAAATAA
* * ** *
828767 AAAATAATACTAATTTATTAGTATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAACTAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
* * * * * * ** **
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* * * * * *
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128 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGA-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * ** * * * * ** *
828942 AAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTAT
* * * * * ** * *
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* ** ** * * * * *** * * *
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130 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGAATTC-ATACAAGC-TTATTTGAA--ATAA
* * * * * * *
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** ** * * * *
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* ** * * * * * * * **
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*
829322 AAAATAA
178 GAAATAA
* * * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAACCT
* * * * * * *
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* ** * * * * *
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* *
829507 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAA--TA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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128 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGA-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * * * ** *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTAT
* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * **
829867 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTA
1 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
* * * * * ** * * * * *
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* * * * * ** * *
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130 TTTTATTT-TGTCATAAAACAAT-TTATTTG-AATTCA-TACAAGCTTATTTGAAATAA
* * ** ** * * * * **** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * ** * * *
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130 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * * * ** *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** * * * * *** *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTA
* * * * * * * * * *
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* ** * * * * *
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127 ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TATTTGAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTAT
* * * * * * *
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* * ** * ** *
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128 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTATTTGAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
** * ** *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTAT
* * * * * * * * * * *
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130 TTTT
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1 AATTAT
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * * **
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*
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* * * * *
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* ** * ** ** * * * *
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1 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* *
831141 T-A-A-TAAGAG-TATTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTTTT
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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AATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTTTTTATCATAAAACAA
Found at i:831894 original size:193 final size:193
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* * * * *
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* * * *
831625 TAATTGATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTACAAAATAAATCTATTTATCGAACC
66 TAATTGAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTACAAAATAAATCTATTTATCGAACC
* * *
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**
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * **
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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** *
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* * *
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*** *
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* *
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* ** *
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1 -ATAACTAT-TTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
851912 -AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTT
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* * * * * * * ** *
851975 TTGACTAAATAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTTATAGTT
129 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
*
852028 TTAACTATTTGAA-TTAGTTCG
1 ATAACTATTTGAACTT-GTTCG
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Statistics
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*
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1 GTCATAATTGATTTGAACT
848248 GTTTAGGTAA
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 1, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
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GTCATAATTGATTTGAACTA
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** *
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* ** * ** * * **
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* * * ** * * * * * * *
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* *
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** * * * * *
846890 GTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAACGATTT
63 -TCTGAATAAGC-TATATGAAT--AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTT
* * * * ** * * *
846955 TAAATAGATAATTG-TTCAAATAGACATAACTATTTGAACGTA-TTCAAAAAATAT
120 GAAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAAC-TAGTTTGATAAACAA
* * *
847009 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATAAATAAATTTA-TATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
** * *
847072 CAAAATAAGCT-TGCATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTG
64 CTGAATAAGCTAT--ATGAAT-AAA-CATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTTG
* * *
847136 AAATAGATAATTG-TTCAGATAGTCATAACTATTTGGAAATA-TTTGATAAACAA
121 AAATAGATAATTGTTTCA-ATAGCCATAAATA-TTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * * * * * *
847189 ATTAATGTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTAAAATATTCATGAATTAGTATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * *
847252 TCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTG-CAAAAAAAAAGGTTACAATGATTTG
65 T-GAATAAGC-TATATGAA-T-AAACATTTGTTTTA-TGAC-AAAAAAAA-G--ATAATGATTTG
* * * * * * *
847316 AAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCA-AGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAT
121 AAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATA-AATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * * * * *
847369 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTTTTGAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * **
847434 TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCATAACAATTTGAA
65 TGAATAAGC-TATATGAAT--AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTTGAA
* * ** * *
847499 ATAAATAATTGTTT-AATTA-CTTATAAGGATTTGAACTTGTTT-AGTAAACAA
123 ATAGATAATTGTTTCAA-TAGC-CATAAATATTGGAACTAGTTTGA-TAAACAA
* * * * *
847550 AGTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCTT--AATACTAATAAGTT-GTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * ** ** *
847612 T-TGTAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTGGTGACAAAACAAAA-AGTTATAGCAATT
63 TCTG-AATAAGC-TATATGAAT--AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAAGA-TAAT-G--ATT
* * * ** * * * * *
847675 TCAAATAGATAATT-TTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAG
119 TGAAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * *
847730 ATTAATTTTTTAAA--TCTAATTATTAATTTTT-AGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * *
847791 TCGAATAAGCTGATATTAACTAAA-ATAATTTTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAAAGATTTG
65 T-GAATAAGCT-ATATGAA-TAAACAT--TTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTTG
* * * * * * *
847855 AAATAAATACTT-ATTCAAATAGTCATAACA-ATTTGATCTAGTTTGGTAAAC-A
121 AAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAA-ATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * * * *
847907 ATTTATTTTTAAAAAT-T-TTGCTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTT-TAAATCTCTT-ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * **
847970 CTGAATAAGTTTTTATTAATAGAA-ATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAAATCATAACAATTTGA
64 CTGAATAAG-CTATATGAATA-AACA-T-TTGTTTTATGACA-AA-AAAAA-GATAATGATTTGA
* ** * * * * **
848034 AATAAATAATTACTTAAATAGTCATAACTTTTTAAACTAGTTTGATAAACAA
122 AATAGATAATTGTTTCAATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
*
848086 ATTTATTTTTTAAA--TC-TATTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * *
848148 GAACAAACTTATATGAATAAAGCCATTTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAACT
66 GAATAAGC-TATATGAATAAA--CATTTGTTTTATGACAAAAAAAA-G--ATAATGATTTGAAAT
* * * *
848213 AGATAATTGTTTGAATAGTCATAATTATTGGAACT-GTTTAGGTAAACAGA
125 AGATAATTGTTTCAATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTT-GATAAACA-A
* *
848263 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * *
848326 CCGAATAAGCTAGTATGAAGTGAAA-ATTTTGTTTTATGTC-AAAACAA-A-AATGATTTGAAAT
64 CTGAATAAGCTA-TATGAA-T-AAACA-TTTGTTTTATGACAAAAAAAAGATAATGATTTGAAAT
* * *
848387 AGATAATTG-TTCATATAGCCTTAAATATTTGAACTAGTTTGACAAACAA
125 AGATAATTGTTTCA-ATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* ** * *
848436 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * * **
848501 TGAATAAGCTTGTTTGAATAAAAATAATTATTTTGTGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
65 TGAATAAGC-TATATGAATAAACAT--TTGTTTTATGACA-AA-AAAAAG--ATAATGATTTGAA
* * * * * ** * * ***
848566 GTATACAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGTAAATTG
123 ATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* **
848617 ATTTATATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACAATTATTTTATT
1 ATTTAT-TTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * **
848682 TTGAATAAACATATATGATAAAAAACAATTGTTATATGACCAAATCAAAGGAA-ATAACAATTTG
64 CTGAATAAGC-TATATG--AATAAACATTTGTTTTATGA-CAAA--AAA--AAGATAATGATTTG
* ** * * * * *
848746 AAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAACT-GATTCGATAAACAG
121 AAATAGATAATTGTTTCAATAGCCATAAATATTGGAACTAG-TTTGATAAACAA
* * *
848799 ATTCACTTTTTAAATCACTTATTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * *
848862 TTAACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTA
65 TGAA-TAAGC-TATATGAA-T-AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTTGA
* * * * * * *
848927 AATAG-TCAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTG-CTCAGTAAACAA
122 AATAGAT-AATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGA-TAAACAA
* * * * * *
848979 ATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTAGAATTATTAAAAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTT-ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * ** * ** * *
849041 TGGATAAGCTTTTATGAACTGAAATAAATGTTTTATGTCTAAACAAATGGTCATGATGATTTTAA
65 TGAATAAGC-TATATGAA-T-AAACATTTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAG--ATAATGATTTGAA
* * * * * * * * *
849106 ATAAATAATTG-TTCAAATAGCCATCACTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAG
123 ATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * *
849157 ATTTATTTTTTCAAATCAT-TTCCTTTTTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTT
1 ATTTATTTTTT-AAATC-TCTT-ATTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT
** * * * ** * * * *
849219 ATTCCAAATGAGCTTGTAAGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAGCAAAAGGTTAGAATGATT
61 ATTCTGAATAAGC-TATATGA-AT-AAACATTTGTTTTATGAC-AA-AAAAAAG--ATAATGATT
* *** * * * * * ** *
849284 TGAAATAGATAATT-ATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAA-TTGACTCGGCAAACAC
119 TGAAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAG-TTTGATAAACAA
* * *
849339 ATTTATTTTTTAAA--T-TTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TTAC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-C
** * * * * * *** **
849400 CAAATAAGTCTCTATGATTAGAAACAATTATTTTATAACAAAACATATATCTTAACAATTTGAGA
65 TGAATAAG-CTATATGA--ATAAACATTTGTTTTATGACAAAA-A-A-AAGATAATGATTTGA-A
* * * ** * *
849465 TTA-ATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-GATTCGATAAACAT
123 ATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAG-TTTGATAAACAA
*
849515 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATAAATTCATATTA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-T--T--A---GTATTA
* * * *
849580 TTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGATAAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAACAA
57 TTTTATTCT-GAATAAGC-TATATG--AATAAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAA
* * * * ** * **
849644 CGATTTCAAATAGATAATTG-TTCAAATAGCTATAATTATATT--AACTAATTCAACAAACTG
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* * * * *
849704 ATTTATTTTTTAAGTTTCTTACTTATT-ATTTTAGTAAGTGTTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* * * ** *
849768 TC--ATCTAAGCTTGTATTAACTAAAACAAATGTTTTATGACAAATCAAAAAGTTATAACGATTT
63 TCTGA-ATAAGC-TATATGAA-T-AAACATTTGTTTTATGACAAA--AAAAAG--ATAATGATTT
* * * ** * ** * * * *
849831 TAAATTGACAATTG-TTCAAATAGTAATAACTATTCAAACTTGCTTGGTAAACAG
120 GAAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * * *
849885 ATTTATTTTTTTAAATCTATTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTAT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCT-CTTATTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * *
849949 TCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAACAGGTCAGAATGATTTC
63 TCTGAATAAGC-TATATGAA-T-AAACATTTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAG--ATAATGATTTG
** * ** * * * *
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121 AAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAG-TTTGATAAACAA
* *
850067 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATTTTAATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT
* * * * ** *
850132 -AGAATAAGTTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTGGA
64 CTGAATAAG-CTATATGAAT-AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTTGAA
** ** * * * * * ** ** *
850196 ATAGATAATCATTT-ATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCGGCAATTAG
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* * * * * * * *
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1 ATTTA-TTTTT-TAAATCTCTT-ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* ** * * * * * *
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63 TCTGAATAAGCTA-TATGAATA--AACATTTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAG--ATAATGATTTG
* ** * * * *
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121 AAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAA-TATTGGAACTAGTTTGA-TAAACAA
* * * * * *
850430 ATTTACTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTTTAAAATATTAATAACTTAATATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * **
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* * * * * ** * ***
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120 GAAATAGATAATTGTTTCA-ATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * * **
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* * * * * *
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** * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * *
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* * * * ** **
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* * * *
850971 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATACA--A-CATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * ** *
851033 TGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACAATTTGAG
65 TGAATAAGC-TATATGAA-T-AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTTGAA
* * * * *
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123 ATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATA-TTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * * *
851147 GATTTATTTTTTAAATCTC---TTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTAGCATTATTTTTTTT
1 -ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT
** * * * * *
851209 CCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACCAAAG-TCACATCAATTT-C
64 CTGAATAAGC-TATATGAAT--AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAAGAT-A-AT-GATTTGA
* * * * * *
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122 AATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTT-GATAAACA-A
** *
851325 A-TTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * *
851388 CTGAATAAGCTAGTATGAATTAAAAAAATTATTTTATGAGAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGA
64 CTGAATAAGCTA-TATGAA-T-AAACATTTGTTTTATGACAAAA-AAAA-G--ATAATGATTTGA
* * * * ** * *
851453 AATAGATAATT-ATTCATATAGTCTTAACTATTTAAACT-GATTCGACAAACAA
122 AATAGATAATTGTTTCA-ATAGCCATAAATATTGGAACTAG-TTTGATAAACAA
* * * * * *
851505 ATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTACTAATTTTTGGAATATTATTAGATTACTATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * *
851569 TCAAATAAGCTTGTATAAACATAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTTTTTTTTTTAAAT
65 T-GAATAAGC-TATAT-GA-ATAAACATTTGTTTTATGACA-AA-AAAA------------AGAT
* * * * * * ** * * * * *
851634 GATTGATTTGAAGTATACAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAATAG
112 -AATGATTTGAAATAGATAATTGTTTC-AATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* * * *
851697 ATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGCATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * * *
851761 TCGAACAACCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATATGACTAAACAAAAGGTAATAAGCAATTTG
65 T-GAATAAGC-TATATG--AATAAACATTTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGATAAT--G--ATTTG
* * * ** * * * *
851826 AAATAGATAGTTG-TTGAGATACCCATATCTATTTGAGCTTGTTTGATAAACAT
121 AAATAGATAATTGTTTCA-ATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
* *
851879 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTATTA--ATTTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
851941 TGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTTTGACTAAATAAAAGGTTAGAACGATTTGAA
65 TGAATAAGC-TATATGAA-T-AAACATTTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAG--ATAATGATTTGAA
852006 ATAGATAATT
123 ATAGATAATT
852016 ATTCTTATAG
Statistics
Matches: 4079, Mismatches: 768, Indels: 687
0.74 0.14 0.12
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172 4 0.00
173 31 0.01
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175 31 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (173 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
GAATAAGCTATATGAATAAACATTTGTTTTATGACAAAAAAAAGATAATGATTTGAAATAGATAA
TTGTTTCAATAGCCATAAATATTGGAACTAGTTTGATAAACAA
Found at i:849919 original size:728 final size:719
Alignment explanation
Indices: 846617--852008 Score: 1992
Period size: 728 Copynumber: 7.5 Consensus size: 719
846607 ACAAAATATT
* * * * * * * ** *
846617 ATAACTGTTTGAACTTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTA
1 ATAACTATTTAAAC-TGATTCGATAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTGA
* * * ** * * * *
846681 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTAT-ATAATAAAATTGTATGAATAGAAACAACTATATT
65 -AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTT
* * * * * ** * *
846745 ATGACAAAATAAAAGATC-ATAACAATTTGAAATAAACAATTGTTCAAAGAGTTATAACTATTTG
128 ATGACAAAACAAAAG-GCAACAACGATTTCAAATAGTCAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *** * * * ** *
846809 AACTCACTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTA-TTCATTAATTTTTTAA-AACTTAA
192 AACTAACTCAACAAACAAATTTA--TTTT-AAA-CTCTTACTT-ATTAATTTTAGAAGTA-TTAA
* * ** * * * * *
846872 TAAATTAGTATTATTTTTGTCCAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGA-TAAA
251 AAAATTAATATTATTTTAATTCAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAAATGTTTTATGACTAAA
* * * ** * *
846935 -ATAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG-ACATAACTATTTGAACGT-A
315 CA-AAAA-GTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGCA-ATAACTATTCAAACTTGC
*** * * * * * * *
846997 TTCAAAAAATATATTTATTTTTT-AAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATAAATAAATTTA
377 TT-GGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCATTTCCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA-TTA
* * * * * * * *
847060 -TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAA-TAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
440 GTATTAATTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGAACTGAAA-CAAATATTTTATGACTAAACAAAAGG
* * * * * * * * * * **
847123 TCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTC-AGATAGTCATAACTATTTGGAAAT-ATTTGATAAA
504 TCAGAATGATTTCAAATAGATAATTATTCTA-ATAATCTTAACCATTT-GAACTGACTCGGCAAA
* * * * * * **
847186 CAAATTAATGTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTAAAATATTCA-TGAATTAGTATTATTTT
567 CAAATTTATTTTTTAA-ACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATTAAATTAACATTATTTT
* * * * ** * * **
847249 ATT-TCAAATAAG-CTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTGCAAAA-AAAAAGGTT-ACAA
630 -TTACCAAATAAGTC-TCTATG-ATTAGAAACAATTATTTTATAACAAAACATATATCTTAAC-A
* * *
847309 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
691 --ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCC
* * * * ** *
847340 A-AGACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTTTT
1 ATA-ACTATTTAAAC-TGATTCGATAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTA-ATTTT
* * * *
847403 GAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
63 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTT
* * * * * * * * * * **
847467 TATGACAAAATAAAATGTC-ATAACAATTTGAAATAAAT-AATTGTTTAATTACTTATAAGGATT
127 TATGACAAAACAAAA-GGCAACAACGATTTCAAAT-AGTCAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
*** * ** * * * * *
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190 TGAACTAACTCAACAAACAAA-TT-TATTTTAAA-CTCTTACTTATTAATT-T-TAGAAGTATTA
* * * * * * ** *
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250 AAAAATTAATATTATTTTAATT-CAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAAAT-GTTTTATGACT
* * * * * * * * *
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312 AAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAG-CAATAACTATTCAAACTTG
* * ** * * *
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376 CTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCATTTCCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTA
* * * ** * * * * * *
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* * * * * * * * * * * * * *
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504 TCAGAATGATTTCAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACCATTTGAACTGA-CTCGGCAAAC
* * * * * * * ** *
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** * * * * ** * * * * * * *
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633 -CCAAATAAGTCTCTATGATTAGAAACAATTATTTTATAACAAAACATATATCTTAACAATTTGA
* *
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* * * * *
848057 ATAACTTTTTAAACT-AGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT--C-TA-TTATTAATTTTTG
1 ATAACTATTTAAACTGA-TTCGATAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAA-TTTTG
* * * * ** *
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64 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTT
* * * * ** *
848180 TATGACAAAA-AAAAGGTC-ATAATGATTTGAACTAGAT-AATTGTTTGAATAGTCATAATTATT
127 TATGACAAAACAAAAGG-CAACAACGATTTCAAATAG-TCAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * ** * * * *
848242 GGAACT-GTTTAGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAA
190 TGAACTAACTCA-ACAAACA-AATT-TATTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTAGAAGTATTAA
* * * * * * *** * *
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* * * * ** * ** * *
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** * ** * * ** *
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* *** ** * *
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* * ** * * * * * * * * * * * * **
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* * *
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*** * * * * * * * * * * **
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* *
848742 TTTGAAATAAATAATTGTTGAAATGGCC
692 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCC
* * *
848770 ATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTTATTAATTTTGAA
1 ATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTGAA
* * * **
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* * * * *
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** ** * *
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* ** * * * * **
849030 TTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAATAAATGTTTTATGTCTAAACAAATGGTCAT
261 TTATTTTAATTCAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAATGTTTTATGACTAAACAAAAAGTCAT
* * * * * ** * * *
849095 GATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATCACTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATT
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* *
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* * * *
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* * * * *
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*
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* *
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*
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714 ATAGCC
* * * *
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*
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*
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* * ** **
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* * * ** *
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* ** *
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*
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** * * * *
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* * *
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* *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * **
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* * * ** ** * * * ** **
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* * * * * * ** * * ** *
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* * * ** * * * * *
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* *** * ** * * * *
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* * ** * * * * * * *
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* * * * * ** *
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** * ** * * *
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* * * * *
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*** ** * * * * * * * * *
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* ** * **
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*** * * * * * * * * ***
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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*** ** * *
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* * ** ** * * * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * ** *** *
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* * ** * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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567 CAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAAC-ATTATTTT
* * * ** * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* *** ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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AGCC
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * **
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* * * *
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128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACA-A
* * * * *
854595 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTTTATTTTAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * ** *
854659 ATAAACCAATTATTTCTTTTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATA
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
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131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
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* * *
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129 TTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * ** * * * ** ** *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * **
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* * * *
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128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA-CAA
* * * * *
855127 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAA-C-TGGAATGATC-TCTATTTTG
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT--TATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * * *
855188 TCCTAAAACATTTATTTGTA-TTCATAGAATG-TTA-TTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATA
64 TCATAAAACAATTGTTT-CAGTTCATACAA-GCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
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126 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
** * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * *
855364 ATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACA-T
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
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131 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATCGAACAA
* * * *
855480 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * *
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65 CATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
855608 GTTT-AAAAATTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAATAAAT-TAGTTTATTGAATCAA
129 -TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAA-CAA
* * ** * * *
855661 -TTCAAATAATTATGGCCGTTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
855725 ATAAAACAATTGTTTTCA--TCATACAATCCTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *
855788 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAAT-TCATTTACCTAA-ACA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATCGAACA-A
* * * ** * * *
855839 GTTCAAATGGTTATGACTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
855904 ATAAAATAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTTGGAATAAAATATTACTAATGTAATACTA
66 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA--A
* * * * * *
855968 TTTTTGAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAATAATAAATTTA-TT-T-G--C--
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * *
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1 GTTCAAA-TAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
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64 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * ** *
856136 ATTTTAAAAATTAAAAAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTCAATTGCCGACCAA
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATCGAACAA
* * * ** *
856190 -TT-TAATAAATTATGACTAACTTGAAACAA-TATCTATTTCCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTT
1 GTTCAAAT-AGTTATGACT-ATTTG-AACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * *
856252 TGTCAGTAAAAACAAATGTTT--TTTCAAAATAAGTTTGTTTG-GATAAAAATAATTATTAATTT
62 TGTCA-T-AAAACAATTGTTTCAGTTC-ATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAA-TACTAATTT
** * * * * * * * *
856314 ATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAGTTAAGAAGTTAATTTGTTTA-CTAATCTA
122 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * * * * * *
856374 GTTTAATTAGTT-TAACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAAT-TTTATGAACATTTGTTTTGGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GT
* * * *
856437 TAT-AAACAATTGTTT-ATATTCATAC-AGTCTTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAAT
65 CATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * * *
856499 -TTAT-GAAAATTAATAAGTAACAAATTTAACAAAATGAAT-TGGTTAGCCTACCCAA
128 ATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTATTTA-TCGA-ACAA
* * * * * * * * * *
856554 -TGCAAATATTTTAGGATTGTTTGAAAAATTATCTATTTC-AATCATTATAAAC-TTTGTGTTAT
1 GTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** ** * * *
856616 CACAAATCAA-TGTTTCTA-TTCCAGACAAATTTATTCCCAAATAACATAATCCT-ATCTTTTTA
65 CATAAAACAATTGTTTC-AGTT-CATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTA
* * * *
856678 ATA-TTCCAAAATTAATAA-TAAGAGATTGAAAAAATGAATCTATCTA-CTGAACAA
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAA
* *** * *
856732 GTTCAAATAGTTAATGA-TATTTGAACAATTATCTATTCCAAATTGCTAT-AACTTTTCTTTTTG
1 GTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTG
* * * * * *
856795 TCATATAAC-ATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCCAAAT-AAGTAACACAAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
856857 TA-TTC-AACATTAAAGAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAA
127 TATTTCAAAAATT--A-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * *
856913 GTTCAAATAGTTATGACATATTTGAACAATTATTTAATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTTTTT
1 GTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
856978 TATATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAGCAAACTTATTCG-GATTAAA-AATATTAATTTATTAA
64 T-CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
857040 TATTTTTACAAA-TAATAAGCAAAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTTA-CGAACAA
127 TA-TTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * *
857094 GTCCAAATAGTCAT-AGCTATTTTAATAATTATCTATTTCAAAATGCGTTATGACCTTTTGTTTC
1 GTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAAT-CATTATGACCTTTTGTTTT
* * * ** * ** * * *
857158 AT-TTTAAATGATTGTATCAGTTCATTTAGGC-TATTCCGAAATAAAATATTACTAATTTATTAA
63 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
857221 TA-TTCCAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTA-CTGAATAA
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAA
* * *
857276 GTTCAAATAGCTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATTCATTTTGAACCTTTTG-TTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAA-TCATTATG-ACCTTTTGTTTT
* * *
857340 GTTATAAAACAGTTGTTTCTA-TTCATAC-AGCTTATTTCAAATAAAGATAA-A--AATTTATTA
63 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA-ATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
857400 ATATTCCAAAAATTAATAAAT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACAT
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * *
857455 GTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTAGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
857519 CATAAACCAATTGTTTCTA-TTCACACAAGCTCATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
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129 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * *
857630 GCTTC-AATAGTTATGATTGTTTAAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTT
1 G-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * ** * * * *** *** * *
857693 TCATCAATTATTTATTTCAAAT-AGT-TATGATCT-TTTGTTTTTTCATAA-AATAATTGT-CT-
64 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA-TACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTA
* * * * * *
857752 CTA-TTCACACAAGTT--T-ATTCAGA-A--TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AA
126 ATATTTCA-A-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATA--AATCTATT--TA-TCGAACAA
* * * * * * * * * *
857808 ATT--AATAGGTT-GGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCCAACAAGTTCA-AATAGTCATG
1 GTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT---C-A-AA--TCATTAT-GACCTT
*** * ** * ** * * * *** *
857868 TCCATTTG--A-ATAATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTCTTCTGTTTTAAAACAAT--
56 TTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCAGTTCA-TACAAGC--TTATT-TGAAATAAAATAATAC
** * ** * * * * * * *** * * * *
857928 TGTTTCTATTCATA-TAGAAATATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTTTAAAAT
116 TAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GAT-TTAAAAAATAAATCTATTT---AT
* *
857991 -TAATAAGA
175 CGAA-CA-A
* ** * * * * ** * *
857999 GATTTAAA-AACTA-AATCTATTT-ACCGA--ATC-AATTCAAATAGTTATGAC-TGCTTGAACA
1 G-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTG---T
* * ** ** * ** * ** **
858057 ATTATCTATCTCAA-AATTG-TT-A-TGAAT-C---TTTATTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTT
60 TTTGTC-AT-AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAA-T-ACTAAT
* * * * * * *
858114 TTCATATAAGCT-TATTCAGGTTAAGA-TAAT-ACTAATTTA-AATAATAAAAATAAATGTGTTT
120 TT-AT-TAA--TAT-TTCA----AAAATTAATAAGTAA--GAGATTTA-AAAAATAAATCT-ATT
* *
858175 TAACCGATCTAA
172 T-ATCGAAC-AA
* * * * * * * *
858187 -TTCAAATAGCTAAGACTATTAGAACAGTTATCTATTT-AAGGTCATTTTGACC-TTTATTTAGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
858249 CATAAAA-TATTATTTCAATTCATACTAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGT
65 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
858313 TTGAAAAATTAATAAGCAGGAGATTTAAAAAAATTAATATGTTTACCTAACAA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
** * * * * * *
858366 GTTCAAATAAATATGACTATTTGAATAATTGTCTTTTTAAAATCACTGTGACC-TTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * * *
858430 ATAAAACAATTGTTTCACTTCATAAAAACTTA-TCCAAATAAAATAACACTACTTCATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
858494 TCAAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTGATTT-TTGAACCA
131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATCGAACAA
** * * * * ** * *
858545 GTTCAAATAGTTACAACTCTTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGCTATGATC-TTTATTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** *
858609 ATAAAA-AATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTA-TTCCAATAAGAATAATACTAATTTAATAATA
66 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATA
* * ** *
858671 TTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTACCGAATC-A
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * ** * ** * * *
858720 GTTCTTAATGGTTAAGACTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCCTAACCTTTTGTTTAG
1 GTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** *
858785 TCATAAAATAATT-TTT-AGTTAATACATGCTTATTCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
64 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
858848 A-TTCAAAAAATTAATATGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
128 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * *
858903 GGTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * * *
858968 ATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCCTTA-TCCAAATAAAACAATACTACTTTATTAACAT
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
859032 TCTAAAAAATCAATACGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCAATTTATTGAATCAA
130 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * * ** * *
859085 -TTCAAA-AATTATGGCCATCCTTGAACAATTAT-TAATTCAAATTGTCTATTACCTTCATTCTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTAT--TTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTT--TTGTT
* *
859147 AAT-CCATAAAACAATTGTTT---TTAACACTACAAGGC-T-TTTGAAATAAAATAATACTAATT
61 -TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT--CA-TACAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * *
859206 T-TTAATATTTCCAAGAATTAGTAAG---GAGATCT-AAAACTAAATCTATTTAACCAAAACA
121 TATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA-A
* * * * * * * * *
859264 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAATCTATTTTAAGAAT-GTTA-AAGCTTCTATTCT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTA-TTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * * *
859327 ATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAA-TTAATAA
63 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * *
859390 TCTCT-ATAAAATTCCATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAAATCTGTTT-GCTAAACTA
127 TATTTCA-AAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTATC-GAACAA
* * * * * * *
859446 GTTCCAACAATTAAGACTATATGAACAATT-CCTAATTT-AAAACATTATGA-CTTTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
859508 CATAAAAC-ATTATCCTTAAG--CATACAAAG-TTTTTTCAGAAT-AAATAAAACTAATTTGTTA
65 CATAAAACAATTGT--TTCAGTTCATAC-AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
859568 ATATTTCAAAATTTTATAAGTAAAAGGTTTAAAAAAT-AATTTATTCACCTGAACCAA
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA-CAA
* ** * * * * * *
859625 -TTCAAATAATTAAAAGTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATCCATTATTA-CTTTTTTTTTGC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ***
859688 CAT-AAA-AATTGTTT-TGTTCATATAAGTTTGTCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-TAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * ** *
859749 TT-AGAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTACTAAAACCA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAACAA
* * * * * * * **
859801 TTTCAAATAGTTTTGATTATATGAATAATTATCTATTTCCAAATCGTTATAATTTTTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * ** *
859866 CATCTATTC-ATTGGTTT-TGTTCATACTATTTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 CAT-AAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * * * * *
859928 ATTTCAAAACTT-ATAACCAAGAGAATGAAAAGATAAATCTA-TTACCTAACCA
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* ** * * * *
859980 GTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACTATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCATTTG--TTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * ** *
860043 ATAAAACAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTG-GATAAAATAATAAAAATTTAATAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
860106 TCAAAAA-T--CAA-TAAGAGATTTAAAAAAATATATTTGTTTACCAAAC-A
131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * ** * *
860153 GTTTATAT-GATTAAT-ACTATTAGAACAGTTATCCTATTTTAAATTGTTCTAACACTTTTGTTT
1 GTTCAAATAG-TT-ATGACTATTTGAACAATTAT-CTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTT
* * * * * *
860216 AGTCATAAAGCAATTATTTCAGTTCAT---A-TTTATTTGAAATAAATTAATATTAATTTATTAA
62 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * *
860277 CA-TTCAAAAGATTAATAACAAAAGAGATTTAAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAA
127 TATTTCAAAA-ATTAATAA-GTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * *
860335 GTTCAAATAGTTATTATTATTT-AAGCACATTGTCTATTT-AAATCACTTATGACCTTTTGTTTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CA-ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * ** * *
860398 TTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTTATACGGAATAAAATATTACTAATTTATT-AT
63 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
860462 ATTTCTAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-A
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * * *
860515 GTT-AAATAATTATGGCAATTTGAACAATT-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** *
860578 ATAAAAAAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTA-TTCAAAT-AAATAATACTAATATTATTAA-A
66 ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATA
** * * *
860639 TCTTCAAAAATCCATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTTGTTTGTCGAATCAA
129 T-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTATCGAA-CAA
* ** * * * * * * *
860694 -TTCAAATA-TTGA-AACTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAAACCATTT-TCTAG
1 GTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTG
* * ** *
860755 TCAT-AAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTTAATATATTAA
64 TCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAA
* * *
860817 CA-TTCAAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTGAAAAAATAAATCTGTGTTAGGT-GAATAA
127 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAT-TTA--TCGAACAA
* * * * * ** * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** *
860936 CATAAAACAATTGTTTCAGGTCATA-AAGGTTA-TCCAAAT-AAAGAATACTAATTTATTAATAT
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* *
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* * ** * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * *
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66 ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
861351 TTCAAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAGC-A
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * * * * *
861403 GTTC--CTA-TT-TTA--AATT----AATTCACCTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTGTTCTAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
861457 TATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATGAGCTTA-TT-AAA-AAAATAAAACTAATTTAATAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
861519 TCCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT--AAAATAAATCTGTTT-GCTGAA-ATA
130 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACA-A
* * ** * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGT
* * *
861634 CATAAAATAAATTG-TTCAGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-C-AAATTATTAATA
65 CATAAAA-CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
861696 TTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCGAATTC-A
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA--CAA
* * * * * * * * * * *
861746 TTTCAAACA-TTATGGCCATTTCAATAATTATTTATTTCAAACCGTTATGA-CTTTTCCTTTGGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGT
* * * * * * * *
861809 CATATAACAAATGTTTTA-ATCATTCAAGCTTATTCGCAAT-AAATAATACTAATTTATTAATCT
65 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
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130 TTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * * ** * * * *
861924 GTTCAAATAATTATGACTATTAGAATAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
861989 ACAAAACAATTATTTCTA-TTCTTATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
862053 TTCAAAAAGTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGAT-GAACTA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ATCGAACAA
* ** * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * ** * *
862166 CATAAATGAA-T-TTTCAATTTATACTAGCTTA-TTCATTTGAAAATGTCAAAACAAATTTATTA
65 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAA--T-AATACTAATTTATTA
* ** * *
862228 ATATTTC-AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAATATATTTCTATTTACCTAACTAA
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTATCGAAC-AA
*
862285 -TTCAAATA-ATATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * * * *
862347 AT--AACAAATGTTTTTGTTTATATAAGTTTATTCGAAATAAAGT-ATACT-ATCTATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
862408 TAAAAAATTAATAAG--AG-CATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AACTA
131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
862517 CATAAAAGATTTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** *
862581 TTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-AGAATTTGTTTGCCAAACAA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTATCGAACAA
* * * * * * * * *
862634 GTTTAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTATGTTTTGAC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
*
862699 ATAAAATAATT-TTCTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
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* * *
862760 TA-TT-AAGACAATTAATAACTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTAGT-GAACAA
127 TATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAACAA
* * * * **
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGT
* * * * *
862878 CATAATACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGGTTATTTGGATTAAAATAATATTAA-TTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * * **
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129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ATCGAACAA
* * * * * * * *
862994 GTTTAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATA
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * ** *
863059 ATAAAACAACTGTTTCAATTCAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTAATGTTTTATTCATA-
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATAT
* * * * *
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130 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * * *
863177 GCTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAACTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTATTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
863242 ATAAAATAGTTAGTTT-TGTTTATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA--AATTGAATGATA
66 ATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** ** * * * *
863303 TTAAAAAAATTAATAAGTAA-A-A-TTAAACCA-AACT-TGTTT-TTGAAC-T
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * *
863349 GTTCAATATAGTTATACACTATTTGCAC-ATGTATC-ATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTT
1 GTTCAA-ATAGTTAT-GACTATTTGAACAAT-TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * * *
863412 GTCACAAACCAATTGTTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTAGGAATGAACT-ATAACTAA-TTATTA
63 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTA
* * * * *
863474 AAATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAGAAA-GAATCTATTTAACGAAGGCGA
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA-AAATAAATCTATTTATCGAA--CAA
* * * *
863532 GTTCAAATAGTTATTG-CTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGATCTTGTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * **
863596 CATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** **
863660 -TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTCGCTGAACAA
129 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTATC-GAACAA
* * * ** * * ** * * *
863713 GTTCAAATAGTAAAGTCTATTCAAACTATTAGCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** ** *
863778 GTAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAATATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGT
66 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
863842 TTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAATCAA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * * * * *
863891 -TTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAGTTATCTATCTAAAATCATTAT-A-ATTTT-TTTTCTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
863952 ATAACATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTACTAAATTAATAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
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130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * ** * * ** * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
864129 ATAAAATAATTATTTCAATTTATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACCATTTTATTAACA-T
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * *
864193 TCAGAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAGAAAATAAGCCTATTTACCAAACAA
131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTATCGAACAA
* * * * * *
864246 GTGCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *** * *
864311 ATAAAATAATTGTTTCAGTCCATAAAATCTTATCCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * * *
864376 TCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAAATAAACCAATTTATCAAATC-A
131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * * * **
864428 GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTGCTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
*
864493 ATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
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* * * *
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* * * * *
864603 ---C----AG-T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * *
864657 ATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATGCTAATTTAATAATA-
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* * * ** **
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* * * * * * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
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* * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTG
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *** ** *
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65 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* **
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * **
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* * * * * * *** * *
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* * * * * * * * * ***
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** ** * * * *
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66 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
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131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAA
866392 GT
1 GT
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Statistics
Matches: 9285, Mismatches: 2152, Indels: 1451
0.72 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
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161 3 0.00
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* *
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1 AATAGTTATGA----TTG--TTTTAAACAATTATTTATTTCA
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1 AATAGTTATGAT
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Consensus pattern (36 bp):
AATAGTTATGATTGTTTTAAACAATTATTTATTTCA
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1 CAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTTCAT
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1 CAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTTCAT
857739 AAAATAATTG
Statistics
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CAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTTCAT
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860755 TCATAAATAT
** * * * *
860765 TTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTTAATATATTAACA-TTCAAAAAAT
1 TTGTTTCAGGTCATAAAAGCTTAATC-AAAT-AAATAA---TAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * *
860829 TAATAAGTAA-AGATTTGAAAAAATAAATCTGTGTTAGGTGAATAAGCTCAAATACTTATGAATA
60 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAA-CTGAGTTAGGTGAACAAACTCAAATACTTATGAATA
**
860893 TTTGAACAAT-TA-ATTATATAACTTGTTATGA-ACTTTATTTTATCATAAAACAA
124 TTTGAACAATGTATATT-TA-AA-TCATTATGACACTTTA-TTTATCATAAAACAA
* *
860946 TTGTTTCAGGTCAT-AAAGGTT-ATCCAAATAAAGAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
1 TTGTTTCAGGTCATAAAAGCTTAAT-CAAAT--A-AATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** * * * *
861009 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAA-TGAGTT-TTTGAACAAATTCAAATAGTTGTGACTATTT
62 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAACTGAGTTAGGTGAACAAACTCAAATACTTATGAATATTT
* *
861072 GAACAATGGTATATTTAAATCATTATGACATTTTATTTGTCATAAAACAA
127 GAACAAT-GTATATTTAAATCATTATGACACTTTATTTATCATAAAACAA
* * *
861122 TTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTAATCGAATAAATAATAATTTATTAATATTCTCCCAAAAATTAG
1 TTGTTTCAGGTCATAAAAGCTTAATCAAATAAATAATAATTTATTAATATT-T--CAAAAATTA-
*
861187 A-AAGTAAGTGA-TTAAAAA
62 ATAAGTAAGAGATTTAAAAA
861205 GTGAATCTAT
Statistics
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TTGTTTCAGGTCATAAAAGCTTAATCAAATAAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
GTAAGAGATTTAAAAAAATAAACTGAGTTAGGTGAACAAACTCAAATACTTATGAATATTTGAAC
AATGTATATTTAAATCATTATGACACTTTATTTATCATAAAACAA
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862629 AACAAGTTTA
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1 AATAATTAT-ACTATTTG
862657 AATAATTAT-CTATTTG
1 AATAATTATACTATTTG
862673 AA
1 AA
862675 ATCACTATAA
Statistics
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AATAATTATACTATTTG
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Period size: 710 Copynumber: 1.8 Consensus size: 712
861581 TAAGACTACA
* *
861591 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGGAACTTTGTTTTGGCATAAAATAAATTGTTCAGTTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGAACTTTGTTTTGGCAT-AAACAAATTGTTCAGTTT
* * *
861656 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATCAAATTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGATTTAA
65 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCAAATTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * * * * * *
861721 AAAGTGAATCTATTTACCGAATTCATTTCAAACATTATGGCCATTTCAATAATTATTTATTTCAA
130 AAAATAAATCTATTTACCGAACTCAGTTCAAACATTATGACCATTTCAATAATTATTCATTCCAA
* *
861786 ACCGTTATGACTTTTCCTTTGGTCATATAACAAATGTTTTAATCATTCAAGCTTATTCGCAATAA
195 ACCGTTATGACTTTTCCTTTGGTCATAAAACAAATGTTTTAATCATTCAAGCTTATTCGAAATAA
* * * * *
861851 ATAATACTAATTTATTAATCTTTCTAAAATTAATAACTGAGCAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
260 ATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGCAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * *** *
861916 TCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAATAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTT
325 CCAAACAAGTTCAAATAATTATAACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATCACTATAACCTTAT
* * *
861981 GTTCTATTAC-AAAACAATTATT-TCTATTCTTATAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACT-AA
390 GTT-T-TGACAAAAACAATT-TTCTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAA
* * * *
862042 TCTAATAATATTTCAA-A-AAGTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTT-GATGAACT
450 TCTAATAATA-TT-AAGACAAGTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTAG-TGAACA
* *
862103 AGTTCAAATATT-TAAAACAGTATGAATAATTGTCTATATCAAA-TGTTATGACTTTT-GTTTTG
512 AGTTCAAATGTTAT-AAACA-TATGAATAATTATCTATATCAAATTGTTATGACTTTTAGTTTTG
862165 TCATAAATGAATTTTCAATTTATACTAGCTTATTCATTTGAAAATGTCAAAACAAATTTATTAAT
575 TCATAAATGAATTTTCAATTTATACTAGCTTATTCATTTGAAAATGTCAAAACAAATTTATTAAT
862230 ATTTCAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAATATATTTCTATTTACCTAACTAATTCAAATAAT
640 ATTTCAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAATATATTTCTATTTACCTAACTAATTCAAATAAT
862295 ATGATATT
705 ATGATATT
* * **
862303 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTCAT-AACAAA-TGTTTTTGTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGAAC-TTTGTTTTGGCATAAACAAATTG-TTCAGTT
* * * * *
862365 TATATAAGTTTATTCGAAATAAAGT-AT-ACTATCTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGAGCAT
64 TATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCA-AAT-TATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAG-AT
* * * *
862428 TTAAAAAATAAATCTATTTATC-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT-ATTA-TCAT
126 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTCAGTTCAAACA-TTATGACCATTTCAATAATTATTCAT
* * * ** * *
862489 TCCCAAATCGTTA-GACATTTT-CTTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCTATTCATAT-AAGTTTAT
190 T-CCAAACCGTTATGAC-TTTTCCTTTGGTCATAAAACAAATGTTT-TAATCAT-TCAAGCTTAT
*
862551 TCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAG-AGATTTAAAAAA-
251 TCGAAAT-AAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGCA-ATTTAAAAAAT
* * * * * * *
862614 AGAATTTGTTTGCCAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCA
314 A-AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATAACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATCA
*
862679 CTATAACCTTATGTTTTGACATAAAATAATTTTCTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAAT
378 CTATAACCTTATGTTTTGACA-AAAACAATTTTCTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAAT
* * * * *
862744 AATATAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAACTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTAGT
442 AATATAAATCTAATAATATTAAGACAAGTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTAGT
* * * * * *
862809 GAACAAGTTCAAATGTTATGAATATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTAGTT
507 GAACAAGTTCAAATGTTATAAACATATGAATAATTATCTATATCAAATTGTTATGACTTTTAGTT
862874 TTGTCATAA
572 TTGTCATAA
862883 TACAATTGTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (712 bp):
TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGAACTTTGTTTTGGCATAAACAAATTGTTCAGTTTA
TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCAAATTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
AAATAAATCTATTTACCGAACTCAGTTCAAACATTATGACCATTTCAATAATTATTCATTCCAAA
CCGTTATGACTTTTCCTTTGGTCATAAAACAAATGTTTTAATCATTCAAGCTTATTCGAAATAAA
TAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGCAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
CAAACAAGTTCAAATAATTATAACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATCACTATAACCTTATG
TTTTGACAAAAACAATTTTCTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAATCTAAT
AATATTAAGACAAGTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTAGTGAACAAGTTCAAAT
GTTATAAACATATGAATAATTATCTATATCAAATTGTTATGACTTTTAGTTTTGTCATAAATGAA
TTTTCAATTTATACTAGCTTATTCATTTGAAAATGTCAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAATT
AATAAGCAAGAGATTTAAAAATATATTTCTATTTACCTAACTAATTCAAATAATATGATATT
Found at i:863090 original size:360 final size:361
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Period size: 358 Copynumber: 16.6 Consensus size: 361
860235 CAGTTCATAT
* * * *
860245 TTATTTGAAATAAATTAATATTA-ATTTATTAACATTC-AAAAGATTAATAACAAAAGAGAT-TT
1 TTATTTGAAATAAAATAAT-TAAGATTTATTAATATTCTAAAA-ATTAATAAC-TAAGA-ATATT
* ** * * * * *
860307 AAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTATTATTT-AAGCACATTGTCTA
62 -TAAAAAATAAATCTATTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TA-ATTATTTA
* * * * * * *
860371 TTT-AAATCACTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTTATA
123 TTTCAAATC-GTTATGA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGGTTATT
* * * * * * *
860435 CGGAATAAAATATTACTAATTTATT-ATATTTCTAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAATA-
186 CGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAACTAAAAGATTTAAAAAAAG
* * * * ** * * * **
860497 AATTTGTTTATCGAATC-AG-TTAAATAATTATGGCAATTTGAACAATT-TCTATTTCAAATCGT
250 AATATGTTTAAC-AAACAAGTTTAAATAATCATAACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCAC
* * ** * * ** *
860559 TATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTGTTTTTTA-TCATACAAGC
314 TATAACCTTATGTTTTGAAATAAAACAA-TGTTCTCAATTCAAACAAGC
* * * ** * *
860607 TTA-TTCAAAT-AAATAATACTAATA-TTATTAAATCTTC-AAAAATCCATAA-GAAG-AGATTT
1 TTATTTGAAATAAAATAAT--TAAGATTTATT-AATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAATATTT
* * * * ** *
860666 AAAAAATAAATGTTGTTTGTCGAATCAA-TTCAAATA-TTGA-AACTATAAGAATAATTATCTAT
63 AAAAAATAAAT-CTATTTAT-GAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATTTAT
* * * * * * * *
860728 TTCAAATCGTTTTAAACCATTT-TCTAGTCAT-AAATATTTGTTTC-ATATCATACAAGCTTATT
124 TTCAAATCGTTAT-GA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGGTTATT
* * * * * * *
860790 CAAAATAAAATAAT-CTTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTGAAAAAAT
186 CGAAATAAAATAATAC-CAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAAAGATTT-AAAAAA-
* *** * * * * * * * * *
860853 A-AATCTGTGTTAGGTGAATAAGCTCAAATACTTATGAA-TATTTGAACAATTAATTATAT-AAC
248 AGAATATGT-TTA-ACAAACAAGTTTAAATAATCAT-AACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAA
*** * * ** * *
860915 TTGTTATGAA-CTT-TATTTT-ATCATAAAACAATTGTT-TCAGGTCATA-AAGG
310 TCACTAT-AACCTTATGTTTTGA-AATAAAACAA-TGTTCTCAATTCAAACAAGC
** * *
860965 TTA-TCCAAAT-AAAGAA-TACTA-ATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TT
1 TTATTTGAAATAAAATAATTA--AGATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGA-ATATT
* * * * * * ** *
861024 AAAAAAATAAAT-GAGTTTTTGAACAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATGGTATATTT
62 TAAAAAATAAATCTA-TTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
* * * *
861088 -AAATCATTATGACATTTTA-TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTAATCG-
126 CAAATCGTTATGAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGGTTATTCGA
* * ** **
861149 AAT-AAATAAT---AATTTATTAATATTCTCCCAAAAATTAGAAAGTAAGTGA-TTAAAAAGTGA
189 AATAAAATAATACCAATTTATTAATA-T-T-CCAAAAATTAAAAACTAAAAGATTTAAAAAAAGA
* * * * * * ** * * * **
861209 ATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCTGTTT-AATAATTATCTATTTCCAATCGTT
251 ATATGTTTAAC-AAACAAGTTTAAATAATCATAACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCACT
* * ** * * ** *
861272 AAGAACATT-TGTTTTGTCATAAAA-AATTTTTTTTA-TCATACAAGC
315 -ATAACCTTATGTTTTGAAATAAAACAATGTTCTCAATTCAAACAAGC
* * * *
861317 CTATATGGAATAAAATAA-TACTA-ATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAATAAG-ATATTTA
1 TTATTTGAAATAAAATAATTA--AGATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAATATTTA
* ** * * **
861378 AAAAATAAATCTGTTTA-CCA-AAG--C----AG-T-T-CCTATTTTAAATTAATTCACCTATTT
64 AAAAATAAATCTATTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAA-TAATT-ATTTATTT
* * * * * * * ** *
861432 CAAATCATTATAACTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATGAGCTTATT--AA
126 CAAATCGTTATGACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGGTTATTCGAA
* * * * * * *
861494 A-AAAATAAAACTAATTTAATAATATTCCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAATA-AATC
190 ATAAAATAATACCAATTTATTAATATT-CCAAAAATTAAAAACTAAAAGATTTAAAAAAAGAATA
* * * * * * ** * * **
861556 TGTTT-GCTGAAA-TAGTTCAAACAGTTA-AGACTACATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
254 TGTTTAAC--AAACAAGTTTAAATAATCATA-ACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCACTA
** * * * *
861618 TGGAA-CTT-TGTTTTGGCATAAAATAAAT-TGT-TCAGTTTATACAAGC
316 T--AACCTTATGTTTTGAAATAAAA-CAATGT-TCTCAATTCAAACAAGC
* * *
861664 TTATTTGAAATAAAATAATCAA-A-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT--G---ATTTAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATTAAGATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAATATTTAAA
* * * * * * * *
861722 AAGTGAATCTATTTACCGAATTC-ATTTCAAACA-TTATGGCCATTTCAATAATTATTTATTTCA
66 AAATAAATCTATTTA-TGAA--CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCA
* * * * * * * * *
861785 AACCGTTATGACTTTTCCTTTGGTCATATAACAAATGTTT-TAATCATTCAAGCTTATTCGCAAT
128 AATCGTTATGACTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGGTTATTCGAAAT
* * * * * ** *
861849 -AAATAATACTAATTTATTAATCTTTCTAAAATTAATAACTGAGCA-ATTTAAAAAATA-AATCT
192 AAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAACT-AAAAGATTTAAAAAA-AGAATAT
* * * * * * * * * ***
861911 GTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAATAATTGTA-TACTTCAAATTGTTATAA
255 GTTTAACAAACAAGTTTAAATAATCATAACTATTTGAATAATT-AACTATTTCAAATCACTATAA
* * * * * * ** *
861975 CCTTTTGTTCT-ATTACAAAACAAT-TATTTCTATTCTTATAAGC
319 CCTTATGTTTTGA-AATAAAACAATGT-TCTCAATTCAAACAAGC
* * * * *
862018 TTATTCGGAATAAAATAA-TACTA-ATCTAATAATATT-TCAAAAAGTAATAACTAAGAGA-A-T
1 TTATTTGAAATAAAATAATTA--AGATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGA-ATATT
* * * * ** * * * *
862078 T-AAAAATAAATTTGTTTGATGAACTAGTTCAAATATTTAAAAC-AGTATGAATAATTGTCTATA
62 TAAAAAATAAATCTATTT-ATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATAATTATTTATT
* ** * * * * *
862141 TCAAAT-GTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAATGAA-T-TTTCAATTTATACTAGCTTATTC-AT
125 TCAAATCGTTATGACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGGTTATTCGAA
* * * * * * * *
862202 TTGAAAATGTCAAAACAAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAATAT
190 AT-AAAA--T-AATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-AAACTAAAAGATTTAAAAAAAG
* * * * * * * * *
862265 ATTTCTATTTACCTAACTAA-TTCAAATAAT-ATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
250 A-ATATGTTTAACAAAC-AAGTTTAAATAATCATAACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCA
* * * ** * *** * * * *
862327 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAACA-AATGTT-TTTGTTTATATAAGT
313 CTATAACCTTATGTTTTGAAATAAAACAATGTTCTCAATTCAAACAAGC
* * ** * * **
862374 TTATTCGAAATAAAGT-A-TACTATCTATTAATATT-TAAAAA--ATTAA-TAAGAGCATTTAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATTAAGATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAATATTTAAA
* * * *
862433 AAATAAATCTATTTATCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT-ATTA-TCATTCCCAAA
66 AAATAAATCTATTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATT-TCAAA
* * * * *
862496 TCGTTA-GACATTTTCTTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCGAAATAA
130 TCGTTATGAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGGTTATTCGAAATAA
* * * *
862560 AATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAAGAATTTGTTT
194 AATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAAAGATTTAAAAAAAGAATATGTTT
** * * *
862625 GCCAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTA
259 AACAAACAAGTTTAAATAATCATAACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCACTATAACCTTA
* * * * *
862690 TGTTTTGACATAAAATAATTTTCTCTATTCATACAAGC
324 TGTTTTGAAATAAAACAATGTTCTCAATTCAAACAAGC
862728 TTATTTCG-AATAAAATAATATAA-ATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAACTAA-AATATT
1 TTATTT-GAAATAAAATAAT-TAAGATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAACTAAGAATATT
*
862788 TAAAAAATAAATCTATTTAGTGAACAAGTTCAAAT-GTTATGAATATTTGAATAATTATTTATTT
62 TAAAAAATAAATCTATTTA-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
* * * * *
862852 TAAATTGTTATGACTTTTAGTTTTGTCATAATACAATTGTTTCTATTCATACAAGGTTATTTGGA
126 CAAATCGTTATGACTTTTA-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGGTTATTCGAA
* ** *** *
862917 TTAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTTGACAATTAAAAACTAAAAGATTTAAAAAATA-AATA
190 ATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAAAGATTTAAAAAA-AGAATA
** ** * * * *
862980 TGTTTAATGAATGAGTTTAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATAA
254 TGTTTAACAAACAAGTTTAAATAATCATAACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCACTATAA
* *
863045 CCTTTTGTTTT-ATAATAAAACAACTGTT-TCAATTCAAATAAGC
319 CCTTATGTTTTGA-AATAAAACAA-TGTTCTCAATTCAAACAAGC
* * * * * *
863088 TTATTTGAAATAAAATAATTAATGTTTTATTCATATTCTAAAACTTAATAAGTAAGAGTAATTAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATTAA-GATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAATATTTAA
* * * * * * *
863153 AAAATGAATCTGTTGATCGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAACTATCTATTTCAA
65 AAAATAAATCTATTTAT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * * * *
863218 AACATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAGTTAGTTT-TGTTTATGCAAGCTTATTTTG-AA
129 ATCGTTATGA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGGTTA-TTCGAAA
* * * ** * * ** *
863281 TAAAATAATA--AATTGAATGATATTAAAAAAATTAATAAGT-AAA-A-TTAAACCAA-ACT-TG
191 TAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAAAGATTTAAAAAAAGAATATG
*** * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ***
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* ** * * * ** *
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*** * * * ** * * * **
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * * *
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** * * * * * * * * *** *
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** * *
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** ** * * * *
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** * * * * * *** *
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** * * * ** * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* ** * ** ** * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * *
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* ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * * * * * * * ***
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* * *
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* * ** * * * * * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * *
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* *
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*
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* *
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* * * * *
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** * * * *
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*
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* * *
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*** * * *
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* * * *
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*
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TACTAACTTAATAATATCCTAAAAATTTATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATCA
GTACAAACAATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTC
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AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
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* * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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* * *
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* * ** *
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* *
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* * * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTAGTATGAACATAAAA-AATTATTCT
* * * * * ** *
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65 ATGACAAAACAAAA-G--ATAA--ATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCATAATTATTTG
** *
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124 AATT-GTTTGA-TAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGC-TAGTATGA-ACATAAAA-AATTATT
* * * *
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** *
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* * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGC-TAGTATGAACAT-AAAAAATTATTC
* * ** * * * * ** *
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64 TATGACAAAACAAAA-G--A-TA-AATTTGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCATAATTATTTG
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* * * * ** *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTAGT-ATGAACATAAAA-AATTATTC
* * * * * * *
867807 TAATGTCAAAATAATAGGTCATAATGATTT-TAATAAATAATTATTCAA-ATAGTCATAACTATT
64 T-ATGACAAAACAA-AAG--ATAA--ATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCATAATTATT
* ** * ** * *
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122 TGAA-TTGTTTGATAAACAAAATT-ATTTTTTAAATC-TCT--TTATTAA-TTTTTG
* * * ** * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCTGAATAAGCTAGTATGAACAT-AAA-AAATTATT
* * * * * ** *
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63 CTATGACAAAACAAAA-G---ATA-AATTTGAAATAGATAATTGTTAAT-ATAGTCATAATTATT
* ** * * ** **
868051 TGAACTGGTTTGGCAAACACATTTATAGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCA
122 TGAA-TTGTTTGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTTG
* * * * * ** *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTAGTATGAACATA-AAA-AATTA-T
* * *
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* *
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* * * * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTAGTATGAACATAAAAAATTATTCT
* ** * * *
868350 ATGAC-AAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCAA-ATGGACATAATTATTTTA
65 ATGACAAAACAAAAG--ATAA--ATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCATAATTA-TTTG
** * * * * * * *
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124 AA-TTGTTTGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTTA-TTA--ATTTT-TG
* * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTAGTATGAACAT-AAAAAATTATTC
* * * * *
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64 TATGACAAAACAAAAG---ATAA--ATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCATAATTATTT
** * * *
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123 GAA-TTGTTTGATAAACAAAATTA-TTTTTT-AAATCTC-TT--TATTAATTTTT-G
* * * * *
868649 -AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAAATAAGCTTGTATGAAC-TAAAACAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTAGTATGAACATAAAA-AATTATTC
** * * * * *
868712 TATGAGTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAGATAATTGTT-GTAATAGTCTTAACTATTT
64 TATGACAAAACAAAA-G--ATAA--ATTTGAAATAGATAATTGTTAAT-ATAGTCATAATTATTT
* ** ** ** * **
868776 GAACTAATTGGCATGCAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATGTTTAA
123 GAATTGTTTGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTC---TTTATTAAT-TTTTG
* * * ** * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTAGTATGAACATAAAAAATTATTCT
** * ** * * * *
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65 ATGACAAAACAAAA-G--ATAA--ATTTGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCATAATTATTTGA
* * * * * * * * * *
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125 ATTG-TTTGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCT-CT--TTATTAATTTTTG
* * * ** ** * *
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1 AAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCTGAATAAGCTAGTATGAACATAAA-AAATTATTC
* * *
869071 TGATGACAAATA-AAAGATTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA-ATAGTCAAAATTATT
64 T-ATGACAAA-ACAAA-A-GATAA--ATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCATAATTATT
* * * * *
869134 TGAAATGGCTTGGTAAAC-AAATTCACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTT
122 TG-AATTGTTTGATAAACAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTT--T-ATTAATTTTTG
* * * * * * *
869189 AAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTTAACAAACTTA-TATTAACA-AAAATAATTATTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGC-TAGTATGAACATAAAA-AATTATTC
* *
869252 TATGA-AAAA-AAAATA-ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTTATAATTATTTGAAT
64 TATGACAAAACAAAAGATA-AATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCATAATTATTTGAAT
* * * * * * *
869313 TGGTTCGATAAATAGAATTATTTTCTAAATCTTATTTATAAAATTTTG
127 T-GTTTGATAAACAAAATTATTTTTTAAATC-TCTTTATTAATTTTTG
* *
869361 AAATATTAATAAATTGGTTTTATT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATT
869385 CAATTCCAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TGACAAAACAAAAGATAAATTTGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCATAATTATTTGAATTGTT
TGATAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTTG
Found at i:867528 original size:166 final size:166
Alignment explanation
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867195 AATCTCTTGG
* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* **
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* *
867371 TTATTCATTTTTGAAAGATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTAAATAAACTTATATGATAAAA
1 TTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTATATGA-AAAA
867436 AAACAATTGTTATATGAT-CAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TCGAAAT-G
65 AAACAATTGTTATATGATACAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAG
** * * *
867498 ACCATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTCACTTTTTTAAATTAC
129 -CCATAACCATTTAAACTAATTTAGTAAAC--A---GC-----T--ATTAC
* * * * *
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1 TTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTATATGAA
867610 CTGAAACAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (166 bp):
TTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTATATGAAAAAA
AACAATTGTTATATGATACAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCC
ATAACCATTTAAACTAATTTAGTAAACAGCTATTAC
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Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 10.7 Consensus size: 177
867378 TTTTTGAAAG
* * * * *
867388 ATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTA-AATAAACTTATATGATAAAAAAACAATTGTTATATG
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTAGAATAAGCTTGTATG--AACAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
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62 A-CAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAG-TCATAACTATTTGAA
* * * * ***
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* * * * * * *
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1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGAC
* * ** * * * ** * *
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* * * * * ** **
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* * * * * * * *
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1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGT-ATG-AACAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
867813 CAAAATAATAGGTCATAATGATTT-TAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
63 CAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * ** * * * ***
867877 GTTCG-ATA-AACAGTTTAAATAGTCAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAAT
127 ATTGGCATACAA-A-TTT-ATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTAAAAAT
* * * * * * * *
867929 GTTAATAAATTTG-AGTTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTA-AAATATGAAACAAATATTTTATG
1 ATTAATAAATTAGTA-TTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGTATGAACA--AAACAATTGTTTTATG
* * * * * **
867992 ACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACT
62 AC-AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * ** * *
868057 GGTTTGGCAAACACATTTATAGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAAT
126 -AATTGGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTAAAAAT
* * * * * * *** **
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1 ATTAATAAATTAGTATT--ATTTTATTAGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGA
* * * *
868174 CAAAACAAAGCTC-TAAACAATTT-AAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCCATAACTATTTGAAA
63 CAAAAAAAAGGTCAT-AACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTG-AA
** * * * * **
868237 CTGGTTTAGTA-ACAAATCTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAAT
124 CT-AATTGGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTAAAAAT
* * * *
868291 ATTAATAAATTAGTATTGTTTTCTTTAGAATAAGTTTGTATGATCACAAA-AATTGTTTTATGAC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTAGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGAC
* ** * * * *
868355 -AAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGACATAATTATTTTAAACTAA
64 AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTAA
* * * * *
868419 TTCG-ATAAATAGATTTA-CTTTTAAATTTCTTATTTATT-ATTTTAGGAAAT
128 TTGGCATACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTA-AAAAT
** * * *
868469 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAACTAAAAAAATTGTTTTATGAC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAGA-ATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * * * **
868534 AAATCAAAAGATTATAATGATTTTAAATAGACAAATGTTCAAATAGTAATAATTATTTGAACTTG
64 AAA-AAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAA
* * * ***
868599 TT-CCATAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTT-TCCTATTAATTTTTCGAAT
128 TTGGCATACA-A-ATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTAT-TTATTAATTTTAAAAAT
* * *
868652 GTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-AG-AATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * ** *
868717 GTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAGATAATTGTTGTAATAGTCTTAACTATTTGAACTA
63 -CAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
*
868782 ATTGGCATGCAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATGTTTAAAAAT
127 ATTGGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAAT-TTTAAAAAT
* ** * **
868834 ATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTTGTACAAACAAAACAATTCTTTTACAACA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACA
** * * * * * *
868899 AAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCACATAGCCTTAATTATTTGAATTGAT
65 AAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAAT
* * * * * * * ** * ***
868964 TCGACAAATAGATTTATTTTTTAATTTTGTTGGTTATTAAGTTTCGGAAT
129 T-GGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTAAAAAT
* * ** * * * * *
869014 GTTATTAAATTAGTAATTA-TTTATTCCA-AATAAAATAGTATAAATAAACCAATTGTTTGATGA
1 ATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATT--AGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
869077 CAAATAAAAGATTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAATTATTTGAAATGG
63 CAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-A
* * * * * * * **
869142 CTTGGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAAT
127 ATTGGCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTAAAAAT
* ** * * * * * *
869193 ATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTTAACAAACTTATATTAACAAAAATAATTATTTTATGA-
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGAC
* * *
869257 AAAAAAAA--TAAT-A--ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAA
64 AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
869312 TTGGTTCGAT
Statistics
Matches: 1355, Mismatches: 320, Indels: 146
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 39 0.03
176 5 0.00
177 39 0.03
178 169 0.12
179 186 0.14
180 243 0.18
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182 146 0.11
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ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAA
AAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTG
GCATACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTAAAAAT
Found at i:870148 original size:179 final size:180
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869833 CTAATTTATT
* * ** * * * * *
869843 AACATTTATTTATTTCAATTTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCATCTCAT
1 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCATCTAAG
** * *
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* **
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* *
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* * * ** ** *
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65 GATAAGTGTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
870151 TTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTGACTATTTG
130 TTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTTAACCATTTA
* * * * *
870202 AATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAATCTTTTATTTTGTCATCAAACA
1 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACA
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AACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCATCTAAG
ATAAGTGTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTAATAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
TTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTTAACCATTTA
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869855 TTTCAATTTG
* * * ** * * ** **
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* * * ** * * *
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* * * * *
869991 CTGAACCAGTTCAAATAATTATAACCATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCA
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* * * * * * * **
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1 TTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTCTGAATAAAA
* * * * *
870108 TAATACTAATTTAATAGTATTTGGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTAC
65 TAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
* * * *
870173 CAAACCATTTCAAATAGTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
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* * * * * *
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1 TTATGAA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTCT-GAATAAA
* ** * ** * **
870287 ATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAACTTAATAACCAAGAAAAGT--GAAATAAATCTAAAT
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* * *
870349 GTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TATGAATGATTATCTATTTTAAATCA
128 ATCGAACCAGTTCAAATAGTT-AGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
870403 TTATGAACTTTTATTTTGTCGTAAAACAATT-GTTTTGTTCATAGAAGTTTATTCTGATTAAAAG
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTCTGAATAAAAT
* * * *
870467 AATAGTAATTTAATAATATTTTGAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATT
66 AATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC
* * * *
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131 GAACCAGTTCAAATAGTT-AGACTATTAGAATAA-TTATCTATTTCAAATCA
* * * * ** * *
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1 -TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTC-TGAATAA
* * * ** *** * *
870645 ATTAATAATAATTTATTAGCATTAAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAACAAAT-T-TGT
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** * * * * * * * **
870708 T-T---ACCA-TTTGAACAGTT-GTCTATTTAAAAATCATTATAAC-CTTTCGATTTG
127 TATCGAACCAGTTCAAATAGTTAGACTA-TT-AGAATAATTAT--CTATTTCAAATCA
* * ** * * * * * * * * *
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1 TTAT-GAACTTTTATTT-TGTCATAAAACAA--TTAGTTTTG-TTCATACAAGT--TTATTCTGA
* * * * ** * * * * **
870818 TTAATAT-ATCCTAA---AATAATAAGTAAGATATTTAA-AAATAA-ATCTATTTACTGATCAAT
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* * ** *
870877 TAA-C-ATATTAT-G-GCCA-TTTGAAT-GATTA-TCTATT----T-----------T-AAATCA
118 AAATCTAT-TTATCGAACCAGTTCAAATAG-TTAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
870919 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTTTTATCATACAAGCTTATT-TGAAATAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAG-TTTTGT-TCATACAAGTTTATTCTG-AATAA
* ** * * *
870982 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--TAAATAAATATGTTT
63 AATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * ** *
871045 ATCAAACCAATTCAAATAGTTATGAGTATTTTAATAATTA--TAGTCTT-AAATCG
128 ATCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTAGAATAATTATCTA-T-TTCAAATCA
* * * * * * *
871098 TTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTGATCATAGC-AGCTTATTCAG-TTAAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATA-CAAGTTTATTCTGAAT-AA
** * *
871159 AATAATACTAATTTAATAATA-TTCCAAGAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAAGAAATTTATT
63 AATAATACTAATTTAATAATATTTTGAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * * *
871219 TGTC-ATACTAGTTTAAGTAATTAAATTTATTAAAATAATTTTCCATTTCAAATCA
127 TATCGA-ACCAGTTCAAATAGTTAGA-CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * * *
871274 TTCT-AGCCTTTTGTTTAGTCATAAAA-TATTTGATTTATATC-TAACATGCTTATT-TGGAATA
1 TTATGA-ACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGT-TCAT-ACAAGTTTATTCT-GAATA
* * * * *** * * * *
871335 AAATAATCCAAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTGAAAAAAATAAATCCAT
62 AAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTAT
* * * * * *
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126 TTATCGAACCAGTT-CAAATAGTTA-GACTATTAGAATAATT-ATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * **
871456 TTATGACCTTTT-GTTTGACATAAAACTATT-GTTTTGGTTCATA-ATGGCTTATCCAAAATAAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTT-GTTCATACA-AGTTTATTCTGAATAAA
* * ** * *
871518 ATAATACTAATTT-TTAATA-TTTCAAAAGTTAATAAACAATAG-TTTAAAAAAATAAAAAT-TT
64 ATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT--AAATCTA
** * * * * * * * **
871579 TTTGCCGATCAAATTCAAATAGTTATAACTATAATGAACAATTACCTATTGAAAATCA
125 TTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * **
871637 TTATG-ACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGCTCATGCAAATTTATTCAAAATAAAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTCTGAATAAAA
* * * * * * *
871700 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT-ATAATTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTA-
65 TAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
* ** * * * ** ** *
871763 CTAAATAG-TCAAATAATTATGGCCATTTTACCAAATATCTATTTCAAATCA
130 CGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
871814 TTATTACCTTTT-GTTTGTTCATAAGACAATT-GTTTTTTATCATACAAATTTATT-TGAATAAA
1 TTATGAACTTTTATTTTG-TCATAAAACAATTAGTTTTGT-TCATACAAGTTTATTCTGAATAAA
* * * * * *
871876 ATAATACTAATTT-ATTA-ATCTT-CAAA-TATTAA-TAAGAGATTT-ACAAA-AAATCTGTTTA
64 ATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
** * * * *
871934 TC-AATTAGTT-AAATAGTTATGACTAGTT-GAACAATTGTATACTTCAAATCA
129 TCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
871985 TTAT-AACTTTT-TGTTCTATCATAAAAAAATTA-TTTCTATTTATACAAGTTTATT-TGAAATA
1 TTATGAACTTTTAT-TT-TGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTCTG-AATA
* * * * * * * * *
872046 AAATAATATTAATCTATTAATATTCT-AAAA--ATTAA-T--GAG--TAAAAAAATAAATTTGTC
62 AAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * *
872103 TA-CTGAATTACTTCAAATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTATTTGTTTTAAATC-
127 TATC-GAACCAGTTCAAATAGTT-AGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
872157 --AT----TTTTGTTTTGCCATAAAACAATT--TTTTCAATTCATACTAGCTTATT-TAGAATAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTT--GTTCATACAAGTTTATTCT-GAATAA
* * ** ** *
872213 AATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATCT-AGAGATTTAAAAAATAATTCTA-T
63 AATAATACT-AATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
872275 TACCTAACCAATTC-AATAATTATGACTATTTGAATAATTA-CTATTTCAAATCG
127 TATCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * ** * * * * * **
872328 TTATGACCTTTTGGTTTTATTGTAAAATAAAT-GTTTTATTCATATATGTTTGCT-TGAAATAAA
1 TTATGAACTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTCTG-AAT-AA
* * * * * ** * *
872391 AAAAAAACTAATCTATTAATAATTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTT
63 AATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * ** * * *
872452 ATC-AAACAGTTCAAATAGCTTATAATTATTTGAGGAATTATTTATTTTAAAACTA
128 ATCGAACCAGTTCAAATAG-TTA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC-A
* * *
872507 TTAT--A-TTTT-TGTTATACTATAAAACAA-TAGTTTTG-TCATACAAGCTTATTC--------
1 TTATGAACTTTTATTTTGT-C-ATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTCTGAATAAA
* * * * *
872558 A-GAT--TAATTTATTAATA-TTTCAATGATGAATAA-TAA-A-ATTTTAAAAAATAAA--TATT
64 ATAATACTAATTTAATAATATTTTGAA-AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
872614 TAATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCA
127 T-ATCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * ** * **
872670 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-ATTTA-TTTCAATTCATATAAAATTATT-TGAAATAAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTCTG-AATAAA
* * *** * * * *
872732 ATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAATGAATATGTTTA
64 ATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * ** * *
872796 TTGAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTCAACAATTATCTATTTGAAATC-
129 TCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** ** * * *
872848 TCTAT-AACATTTTCTTTTGCCATAAAATGATTTTTTTCTATTTATACAAGCTTATT-TCGAATA
1 T-TATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTCT-GAATA
* * * * *
872911 AAATAATAC-AATTTATTAATATTAAT-ACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAT-TT
62 AAATAATACTAATTTAATAATATT-TTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTA
* ** * * * * * **
872973 TTTA-CTGAACAAGTTCAAATCTTTATGACTTTTTGAAAAACTT-TTTATTT-TAATTG
125 TTTATC-GAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTAGAATAA-TTATCTATTTCAAATCA
* * * ** *
873029 TTATG-AC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTTATTATACAAACTTATT-TAGATTAAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGT-TCATACAAGTTTATTCT-GAATAAA
* * * * *
873090 ATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAA-ATGTTT
64 ATAATACTAATTTAATAATATTTTGA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * *
873152 ATTGAA-CAGTTCAAATAATCATACTATTCA-AATAA-TATCCATTTAAAATCA
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* * * * ** * *
873203 TTTTGACCTTTTGTTTTG-CAATAAAATAATTA-TTTTAGTTTGTATAAATTTATT-TGAAATAA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTC-ATAAAACAATTAGTTTT-GTTCATACAAGTTTATTCTG-AATAA
* * *** * * * * *
873265 AATAATGCTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAGTAA-AAAATT-AAAAATGAATCTGTTT
63 AATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* *
873328 A-CTGAA-CATGTTCAAATAGTTATGA-TATCT-GAACAATTATCTATTTCAAAACA
128 ATC-GAACCA-GTTCAAATAGTTA-GACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
873381 TTATG-ACTTTTTGTTTTGTGATAAAAC----A--TTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAAT-AAA
1 TTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTCTGAATAAAA
* * *
873438 TAATA-TAAATTTATTAATA--TTCAAAATTAATAAGTAATA-ATTT-AAAAATAAA--TATGTT
65 TAATACT-AATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TT
* * *
873496 -TCTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
128 ATCGAACCA-GTTCAAATAGTTA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
873550 TCATG-ACTTTTTTGTTTTGTTATAAATCAATTA-TTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-GAAATA
1 TTATGAAC--TTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTCTG-AATA
* * * *** * *
873612 ATATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATT
62 AAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * *** * * * * * * *
873677 TACCTAGTTAGTTTATATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCG
127 TATCGAACCAGTTCAAATAGTTAGA-CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * ** * * *
873732 TTATGATCTTTTATTTTATCATAAAACAATT-GTTTCTAATCATATAATTTTATT-TGAAATAGA
1 TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTCTG-AATAAA
* * * * * * **
873795 ATAATATTAATTTATTGATATTCT-AAATGTTAATAACTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
64 ATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * ** * * * * *
873859 ACCTAATAAGTT-AAAAAGTCATG-TTCATTTTGAACT-ATCATCTATTTCAAATCA
128 ATCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GACT-A-TTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * ***
873913 TTATGACCATTTTGTTTTGTCAT--AACAATT-GTTTCTATTCATACAA-ATTATTAAAAATAAA
1 TTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTCTGAATAAA
* **
873974 ATAATACTAATTT-TTAAATATTTCAAAAATTAATAAG
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874011 AGATTTAAAA
Statistics
Matches: 2966, Mismatches: 701, Indels: 600
0.70 0.16 0.14
Matches are distributed among these distances:
157 1 0.00
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Consensus pattern (180 bp):
TTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTCTGAATAAAAT
AATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC
GAACCAGTTCAAATAGTTAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
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870016 CATTTAAACA
* * * * *
870026 ATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTAAGATAA
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* * * * *
870091 GTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAGTATTTGGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAA
66 GTTTATTCAAAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTGGAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * *
870156 AAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
131 AAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * ** * ** **
870221 TCATTATAATCTTTTATTTTGTCATCAAACAGTTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTTGGAATAA
196 TCATTATAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGGTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* * ** *
870286 AATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAAGTGAAATAAATCTAAATGT
261 AATAATAATAATTTAATAACATTAAAAAAATTAATAACCAAGAAAAGTGAAATAAATCTAAATGT
870351 CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATG
326 CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATG
* * * *
870385 ATTATCTATTTTAAATCATTATGAAC-TTTTATTTTGTCGTAAAACAATT-GTTTTGTTCATAGA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTAAGAGA
** * * *
870448 AGTTTATTCTGATTAAAAGAATAGTAATTTAATAATATTTTGAAAAATAATAAGTAAGAGATTTA
65 AGTTTATTCAAAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTGGAAAAATAATAAGTAAGAGATTTA
* *** * * * *
870513 AAAAATAAATTTATTTATTGAATCAGTTCAAATGGTTCAGACTATTAGAATAATTTATGT-TTTG
130 AAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT-AGACTATTAGAATAA-TTATCTATTTC
* * * * * *
870577 AAATCAGTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATGCAAGCTTATTCATA
193 AAATCA-TTATAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGGTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGA
* * *
870641 ATAAATTAATAATAATTTATTAGCATTAAAAAAATTAATAA
257 ATAAAATAATAATAATTTAATAACATTAAAAAAATTAATAA
870682 GAAAGAGATT
Statistics
Matches: 237, Mismatches: 56, Indels: 8
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Matches are distributed among these distances:
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359 134 0.57
360 9 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (359 bp):
ATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAGTTTTGTTAAGAGAA
GTTTATTCAAAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTGGAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAA
AAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
TCATTATAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGGTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
AATAATAATAATTTAATAACATTAAAAAAATTAATAACCAAGAAAAGTGAAATAAATCTAAATGT
CGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATG
Found at i:871893 original size:177 final size:172
Alignment explanation
Indices: 871631--872079 Score: 435
Period size: 171 Copynumber: 2.6 Consensus size: 172
871621 TACCTATTGA
* *** * **
871631 AAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATGCAAATTTATTCAAAA
1 AAATCATTATAACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAATTTATT-TGAA
*
871695 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATAATTAAGTGATTTA-AAAAGTGAATCTA
63 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATAA-TAAGAGATTTACAAAA---AATCTA
* * * * * *
871759 TTTA-CTAAATAGTCAAATAATTATGGCCATTTTACCAAATATCTATTTC
124 TTTATC-AAATAGTCAAATAATTATGACCAGTTGAACAAATATATACTTC
* *
871808 AAATCATTATTACCTTTTGTTTGTTCATAAGACAATTGTTTTTTATCATACAAATTTATTTGAAT
1 AAATCATTATAACCTTTTGTTT-TTCATAAAACAATTGTTTTTT-TCATACAAATTTATTTGAAT
* * *
871873 AAAATAATACTAATTTATTAATCTTC-AAATA-T-TAATAAGAGATTTACAAAAAATCTGTTTAT
64 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATAATAAGAGATTTACAAAAAATCTATTTAT
* * * * * *
871935 CAATTAGTTAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTGTATACTTC
129 CAAATAGTCAAATAATTATGACCAGTTGAACAAATATATACTTC
* * * * *
871979 AAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTCTATTT-ATACAAGTTTATTTGAA
1 AAATCATTATAACCTTTTGTT-TTTCATAAAACAATTGTTT-T-TTTCATACAAATTTATTTG-A
* *
872043 ATAAAATAATATTAATCTATTAATATTCTAAAAATTA
62 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
872080 ATGAGTAAAA
Statistics
Matches: 225, Mismatches: 35, Indels: 26
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
171 87 0.39
172 30 0.13
173 16 0.07
174 8 0.04
175 1 0.00
176 4 0.02
177 41 0.18
178 37 0.16
179 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (172 bp):
AAATCATTATAACCTTTTGTTTTTCATAAAACAATTGTTTTTTTCATACAAATTTATTTGAATAA
AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATAATAAGAGATTTACAAAAAATCTATTTATCA
AATAGTCAAATAATTATGACCAGTTGAACAAATATATACTTC
Found at i:874588 original size:684 final size:682
Alignment explanation
Indices: 873443--875237 Score: 1499
Period size: 684 Copynumber: 2.6 Consensus size: 682
873433 ATAAATAATA
* *
873443 TAAATTTATTAATATTCAAAATTAATAAGTAATAATTTAAAAATAAATATGTTTCTAAACATGTT
1 TAAATTTAATAATATTCAAAATTAATAAGTAATAATTTAAAAATAAATATGTTTCAAAACATGTT
* * * * *
873508 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACTTTTTTGTTTTGTTAT
66 CAAATAATTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACTCTTTTGTTTAGTCAT
* * *
873573 AAATCAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAATATAATACTAATTTATTAAAATTCC
131 AAATCAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAC
* * * * * *
873638 AAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAGTTAGTTTATATAGTTATAG
196 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATAA
* * *** *
873703 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC
261 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGATCGTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * *** * * **
873768 TAATCATATAATTTTATTTGAAATAGAATAATATTAATTTATTGATATTCTAAATGTTAATAACT
326 TAATCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACT
* * **
873833 TGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAATAAGTTAAAAAGTCATGTTCATTTTGAACTATC
391 TAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAATAAGTTAAAAAGTCAAGGCCATTTTGAACTATC
** *
873898 ATCTATTT-CAAATCATTATGACCATTTT-GTTTTGTCAT-AAC-AATTGTTTCTATTCATACAA
456 ATCTATTTCCAAATCATTACAAAC-TTTTGGTTTTGTCATAAACAAATT-TTTC-A-TCATACAA
873959 AT-TA-TTAAAAATAAAATAATACTAATTT-TTAAATATTTCAAAAATTAATA-A-GAGATTTAA
517 ATCTATTTAAAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATA-TTCAAAAATTAATAGAGGAGATTTAA
*
874019 AA-ACTATATATGTTTA-CAAACCAGTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAAAAAATAATT
580 AATA-TAAATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAAAAAATAATT
874082 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAGAAAAATATTGC
644 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAGAAAAATATTGC
*
874121 TAAA-TTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTACA-AGATTTAAAAAATAAAATGTGTTTGCAAA
1 TAAATTTAATAATATTC--AAAATTAATAAGTA-ATA-ATTT-AAAAAT-AAATATGTTT-CAAA
** *
874184 AC-TAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGT
59 ACAT-GTTCAAATAATTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACTCTTTTGT
* * * *
874247 TTAGTCATAAAT-AATTTTTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAAGAAAATAATACTAGTTTAT
123 TTAGTCATAAATCAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTAT
* *
874310 TAACA-TACAGAAAATTAATACA-TAAGAA-ATTTTTAAAAAAATAAATCTATTTGCCGAATAAG
187 TAAAATTACA-AAAATTAATA-AGTAA-AAGA--TTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAG
*
874372 TTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGATCGTTTGTTTTATCA
246 TTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGATCGTTTATTTTATCA
*
874437 TAAAACAATTG-TT-TAAGTTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
311 TAAAACAATTGTTTCTAA--TCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * * * *
874500 T-TCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAATATAAGT-TAGTTTATC-AA-AACGGTTCAAGTA
374 TCT-AAAAATTAATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCTAATAA--GTT-AA-AA
* * *
874561 A-TTAAGGCCA-TTTGAA-TGATTATCTATTTCCAAATCGTTACAAACTTTTGGTTTTGTCATAA
433 AGTCAAGGCCATTTTGAACT-ATCATCTATTTCCAAATCATTACAAACTTTTGGTTTTGTCAT-A
* ***
874623 AACAAAATTTTTCATCATACAAGTCTATTTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA
496 AAC-AAATTTTTCATCATACAAATCTATTTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA
* *
874688 AATTAATATGAGGAGATTTAAAATATAAATCTGTTTACCAGACCAGTTCCTATTTCAACATTTCA
560 AATTAATA-GAGGAGATTTAAAATATAAATATGTTTACC--A--A------A---C--CAGTTCA
* * * * * *
874753 AATCATTATAACCTTT-TATTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TATTTCATATAAACTTATTC-AA
609 AATCATTATGATCTTTGT-TT-TGTCAAAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAA
* * *
874815 AAAAAATAATAC
671 GAAAAATATTGC
* * **
874827 T-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTGCCGAA
1 TAAATTTAATAATATT-C-AAAATTAATAAGTAATA-ATTT-AAAAATAAAT-ATGTTT-CAAAA
* * * * * * * * *
874890 -GTAGTTTAAATAGTTAAGACTA-TATGAATAATTATATATGTCAAATAATTATAACT-TTTTGT
60 CAT-GTTCAAATAATTATGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACTCTTTTG-
* * * * *
874952 TTTA-TCATAAAAACAATTGTCTC-AGTTCATACAAGC----TCGAAATAAAATAATACTAATTT
122 TTTAGTCAT-AAATCAATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAAGAAAATAATACTAA-TT
** * ** * * * ***
875011 TATT-ATCTTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTACCGAACCTGTTT
184 TATTAAAATTACAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTT
* * * * * * * * *
875075 AAATAATTATAACTATTTAAACATTTGTATACTTT-AAATCATTAT-ACCCTTT-TGTTCTATCA
249 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA-TTTAAAATAAATATGATCGTTTAT-TT-TATCA
* * ** * * * * * * * *
875137 TAAAACAATTATTTTTGTTCATACAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAATAGTATTC
311 TAAAACAATTGTTTCTAATCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTC
*
875202 CAAAAATTAATAAC-TATGAGATTTAAAAAAATAAAT
376 TAAAAATTAATAACTTA-GAGATTT-AAAAAATAAAT
875238 TTGTTTGTCG
Statistics
Matches: 907, Mismatches: 131, Indels: 135
0.77 0.11 0.12
Matches are distributed among these distances:
677 11 0.01
678 4 0.00
679 15 0.02
680 8 0.01
681 52 0.06
682 49 0.05
683 63 0.07
684 183 0.20
685 28 0.03
686 11 0.01
687 20 0.02
688 29 0.03
689 7 0.01
690 21 0.02
691 2 0.00
693 1 0.00
695 1 0.00
698 1 0.00
699 9 0.01
700 127 0.14
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703 30 0.03
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706 94 0.10
707 39 0.04
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (682 bp):
TAAATTTAATAATATTCAAAATTAATAAGTAATAATTTAAAAATAAATATGTTTCAAAACATGTT
CAAATAATTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATCATGACTCTTTTGTTTAGTCAT
AAATCAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAC
AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATAA
CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGATCGTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC
TAATCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACT
TAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAATAAGTTAAAAAGTCAAGGCCATTTTGAACTATC
ATCTATTTCCAAATCATTACAAACTTTTGGTTTTGTCATAAACAAATTTTTCATCATACAAATCT
ATTTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAGAGGAGATTTAAAATATA
AATATGTTTACCAAACCAGTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTCTA
TTCATACAAGCTTATTCGAAGAAAAATATTGC
Found at i:875228 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 874750--875516 Score: 546
Period size: 178 Copynumber: 4.3 Consensus size: 180
874740 TTTCAACATT
* * * * * *
874750 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAT-TTCATATAAACTTATTCA
1 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCA
*
874814 AAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
65 AAATAAAATAATACTAATTTAAT-ATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * *
874878 CAGTTTGCCGAAGTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATATATG
129 TTGTGTACCGAACTAGTTTAAATAATTAAGACTATATAAACAATTATATATG
* * * * ** *
874930 TCAAATAATTATAACTTTTTGTTTTATCATAAAAACAATTGTCTCAGTTCATACAAGC----TCG
1 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
874991 AAATAAAATAATACTAATTTTATTATCTTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAAT
65 AAATAAAATAATACTAA-TTTAATATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAAT
* * *
875056 TTGTGTACCGAACCT-GTTTAAATAATTATA-ACTATTTAAACATTTGTATACT-
129 TTGTGTACCGAA-CTAGTTTAAATAATTA-AGACTATATAAACAATTATATA-TG
* * * *
875108 TTAAATCATTATACCCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAGGCTTATTCAA
1 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAA
*
875173 AATAAAATAATACTAATATAATAGTATTCCAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAAATAAAT
66 AATAAAATAATACTAATTTAATA-TATTCCAAAAATTAATAACTATGAGATTT-AAAAAATAAAT
* ** * * ** ** * * *
875238 TTGTTTGTCGAATTAATTCCAATGGTTAAGACTAATATGAACAATTATTTATT
129 TTGTGTACCGAACTAGTTTAAATAATTAAGACT-ATATAAACAATTATATATG
* * *** * * **
875291 TCAAATCA-T-T----TTTTGTT-TGTCATAAAAATAATT-TTTCAATTTATACTAGCTTATTTG
1 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * * ** * *
875348 GAATAAAAATAA-AATGAATTTATTAGTATTTCAGAAAGTAATATGTAAGGGATTT-AAAAATAA
65 AAAT-AAAATAATACT-AATTTAATA-TATTCCAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * ** * *
875411 TTTTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATGATTATCTATT
127 ATTTGTGTACCGAACTAGTTTAAATAATTAAGACTATATAAACAATTATATATG
* * * * *
875465 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATA
1 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
875517 TTGTTTGATG
Statistics
Matches: 458, Mismatches: 101, Indels: 55
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 23 0.05
175 34 0.07
176 27 0.06
177 79 0.17
178 110 0.24
179 8 0.02
180 44 0.10
181 81 0.18
182 33 0.07
183 19 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAA
AATAAAATAATACTAATTTAATATATTCCAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATTT
GTGTACCGAACTAGTTTAAATAATTAAGACTATATAAACAATTATATATG
Found at i:875475 original size:357 final size:352
Alignment explanation
Indices: 874747--875516 Score: 822
Period size: 357 Copynumber: 2.2 Consensus size: 352
874737 CTATTTCAAC
* * * *
874747 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAT-TTCATATAAACTTAT
1 ATTTCAAATCATTAT-ACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTT-TGTTCATACAAACTTAT
*
874811 TCAAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
64 TCAAAAAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *
874876 ATCAGTTTGCCGAAGTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATATATGTCAAATAATTA
129 ATCAGTTTGCCGAAGTAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATATGTC-AATAATCA
* *
874941 TAACTTTTTGTTTTATCATAAAAACAATTGTCTCAGTTCATACAAGCTCGAAATAAAATAATACT
193 T-A-TTTTTGTTTTATCATAAAAACAATTGTCTCAATTCATACAAGCTCGAAATAAAATAATAAT
* * *
875006 AATTTTATTATCTTTCAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTACCGAACCT
256 AATTTTATTATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTACCGAACCT
* *
875071 GTTTAAATAATTATAACTATTTAAACATTTGT
321 GTTCAAATAATTATAACTATTTAAACATTTCT
* * * **
875103 ATACTTTAAATCATTATACCCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAGGCTTA
1 AT--TTCAAATCATTATA-CCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAACTTA
* *
875168 TTCAAAATAAAATAATACTAATATAATAGTATTCCAAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAAA
63 TTCAAAA-AAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAA
** * * * * * *
875233 TAAATTTGTTTGTCGAATTAATTCCAATGGTTAAGACTAATATGAACAATTATTTATTTC-A-AA
126 TAAATCAGTTTGCCGAAGTAATTCAAATAGTTAAGACT-ATATGAACAATTATATATGTCAATAA
* * * * * * *
875296 TCAT-TTTTTG-TTTGTCATAAAAATAATT-TTTCAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAAAT
190 TCATATTTTTGTTTTATCATAAAAACAATTGTCTCAATTCATACAAGC----TCGAAAT-AAAAT
* * * * *
875358 AA-AATGAA-TTTATTAGTATTTCAGAAAGTAATATGTAAGGGATTT-AAAAATAATTTTGTTTA
250 AATAAT-AATTTTATTA-TATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTA
* * **
875420 CCTAA-CTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATGATTATCT
313 CCGAACCT-GTTCAAATAATTATAACTATTT-AAACATT-TCT
* * *
875462 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATA
1 ATTTCAAATCATTAT-ACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATA
875517 TTGTTTGATG
Statistics
Matches: 343, Mismatches: 53, Indels: 35
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
353 13 0.04
354 16 0.05
355 6 0.02
356 4 0.01
357 100 0.29
358 98 0.29
359 52 0.15
360 36 0.10
361 18 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (352 bp):
ATTTCAAATCATTATACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAACTTATTC
AAAAAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
CAGTTTGCCGAAGTAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATATGTCAATAATCATAT
TTTTGTTTTATCATAAAAACAATTGTCTCAATTCATACAAGCTCGAAATAAAATAATAATAATTT
TATTATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTGTACCGAACCTGTTCA
AATAATTATAACTATTTAAACATTTCT
Found at i:875859 original size:177 final size:178
Alignment explanation
Indices: 875516--875932 Score: 479
Period size: 178 Copynumber: 2.3 Consensus size: 178
875506 TTTTGTTCAT
* * *
875516 ATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTACAAATAGTTAAA
1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-CATTTGAAATAGATAATTATT-CAAATAGTTAAA
* * * * *
875581 ACTATTTGAAATTGTTTGTAAACAGATTTACTTTTTAAGTCTTTTATTGATTAATTTTCTAAATA
64 ACTATTTGAAATGGTTTGTAAACAGAATTACTTTTTAAATCTTTTATTGATAAATTTTCGAAATA
* *
875646 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGACAAAAACA
129 TTAACAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGACAAAAACA
* * *
875696 ATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAACAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAAT-GTTACAA
1 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAAAA
* ** *
875759 TTATTT-AAACTGGTTTGGTAAATTGAATTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATAAAATTTT-GAA
65 CTATTTGAAA-TGGTTT-GTAAACAGAATTACTTTTTAAATCTTTTA-TTGAT-AAATTTTCGAA
* ** ** *
875821 ATA-TAACAAATTAGTTTTATTTTATTCCAAGTAAACTTATATGACTGAAATA
126 ATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGACAAAAACA
* *
875873 ATTGTCTTATAGACAAAACAAAAAGGTTAT-ACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
1 ATTGTTTTAT-GACAAAAC-AAAAGGTTATAACATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
875933 CATAACTTAT
Statistics
Matches: 201, Mismatches: 27, Indels: 19
0.81 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 3 0.01
177 66 0.33
178 67 0.33
179 40 0.20
180 25 0.12
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAAAAC
TATTTGAAATGGTTTGTAAACAGAATTACTTTTTAAATCTTTTATTGATAAATTTTCGAAATATT
AACAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGACAAAAACA
Found at i:877497 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 877248--877588 Score: 393
Period size: 181 Copynumber: 1.9 Consensus size: 178
877238 ACCAAACAAG
* * * * *
877248 TTCAAATAGTTATGACAATTTAAATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTTTTTTATCA
1 TTCAAATAATTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATAAACTTTTCTTTTATCA
* * * *
877313 TAAAACAA-TTG-TTTTAATTTATA-AGAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTACTTTGCTAATA
66 TAAAA-AATTTGTTTTTAA-TCATACA-AGCCTATTCAAAATAAAATAATA--A-TTTACTAATA
* * *
877375 TTTCAAAAGTTAATAATTTA-TAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCGA
125 TTTCAAAAATTAATAA-GTAGGAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCGA
* * * * *** *
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* *
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**
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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AATAATTATACTATTTG
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878758 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTGAATAATTATCT
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** * ** * *
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**** *
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* * * * *
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* *
879185 TTCAAATCGTTATCACTTTTTGTCTTGTCATAAAATA
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Statistics
Matches: 705, Mismatches: 141, Indels: 73
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Matches are distributed among these distances:
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183 97 0.14
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TACAAGCTTATTTGGAATAAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAATT
TAAAAAATAATTCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT
CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAGTTGTTTCATTCA
Done.