Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 69000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 77 of 129
Found at i:14620221 original size:48 final size:48
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Indices: 14620161--14620266 Score: 128
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14620151 ATCAATAATT
*
14620161 ATCAAAATTATATCGAAAA-TTACTAAAATTTTATCA-AAAGT-TATCAAA
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* * *
14620209 ATCAAAATTATATCAAAAGTTATCAAATTATATATATATTATATCAAA
1 ATCAAAATTATATCAAAAGTTATAAAATTATATATAAAGTATATCAAA
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1 ATCAAAATTA
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ATCAAAATTATATCAAAAGTTATAAAATTATATATAAAGTATATCAAA
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*
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1 AAAATAA
*
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1 AAAA-TAA
*
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1 AAAATAA
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1 AAAATAA
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1 AAAA
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AAAATAA
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14624877 AAAATTTGTG
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AAAAATAAAAAAGTGAAAAATG
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14625964 ACATTTGGAT
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1 CTTTGAATCTTTTATGAAG
*
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1 CTTTG-AAT-CTTTTATGAAG
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1 CTTTGAATCTTTTA
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CTTTGAATCTTTTATGAAG
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14626054 CATTGCGGAC
* *
14626064 CTTTGAATTTATTTACAAACCTTT-AGAT
1 CTTTAAATTTATTTACAAACCTTTGAAAT
* *
14626092 CTTTAAATTTTTTTACAAATCTTTGAAAT
1 CTTTAAATTTATTTACAAACCTTTGAAAT
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1 CTTT
14626125 TTGCAAATAT
Statistics
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CTTTAAATTTATTTACAAACCTTTGAAAT
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14626080 AAACCTTTAG
*
14626090 ATCTTT-AAATTTTTTTACAA
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*
14626110 ATCTTTGAAATCTTTTTGCAA
1 ATCTTTGAAATCTTTTTACAA
14626131 AT
1 AT
14626133 ATCTAGATTT
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ATCTTTGAAATCTTTTTACAA
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14626270 AATATGAGTA
* * * *
14626280 TTTGAATTTTAATATGTGAATCTCTTCAAATGTGAATT
1 TTTGATTTTTAAGATGTGAATCTCTTAAAATGTGAATC
* *
14626318 TTTTATTTTTAAGATGCGAATCTCTTAAAATGTGAATC
1 TTTGATTTTTAAGATGTGAATCTCTTAAAATGTGAATC
*
14626356 TTTGATTTTTAAGATGTGAATATC-TAAAAT
1 TTTGATTTTTAAGATGTGAATCTCTTAAAAT
14626386 TTATATTTGA
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TTTGATTTTTAAGATGTGAATCTCTTAAAATGTGAATC
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14630477 AATATATCAC
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1 AAATAAATAAATAA
* *
14630501 TAATAATTAAATAA
1 AAATAAATAAATAA
* *
14630515 ACAA-AACT-CATAA
1 A-AATAAATAAATAA
14630528 AAATAAATAAATAA
1 AAATAAATAAATAA
14630542 AA
1 AA
14630544 TGGAGAAAAA
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AAATAAATAAATAA
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14630816 CCTATGTCTT
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1 TTCTCTCTCTACC
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1 TTCTCTCTCTACC
14630852 AGATGCTTTA
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14631919 AATCGATGTC
* * **
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*
14631963 AAAAAATAAAATGGCTTGGTCTTAGACAAAGTAA
1 AAAAAATAAAATGACTTGGTCTTAGACAAAGTAA
14631997 AAAAAAT
1 AAAAAAT
14632004 GATATAATTT
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AAAAAATAAAATGACTTGGTCTTAGACAAAGTAA
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14632183 CAAAGTTCAA
14632193 AAAATAAAGGTGATCGAACTCAACC-AGGATCG
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* *
14632225 AAAATAAAGGTGATGGAACTGAACCAAGGTCG
1 AAAATAAAGGTGATCGAACTCAACCAAGGTCG
*
14632257 AAAATAAAAGTGA
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14632270 CAAGATTGAA
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AAAATAAAGGTGATCGAACTCAACCAAGGTCG
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14632303 CTAGACTGAG
*
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* * * *
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* *
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*
14632409 CCAGGGTAAAAAATGA
1 CCAAGGTAAAAAATGA
14632425 CTACGTCTGA
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14632407 AACCAGGGTA
* * * ** * *
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* * * *
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* ** * *
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1 AAAAAT
14632598 AAAAAGTGAT
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* * * *
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* * ** *
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* * * ** *
14632659 AAAATGAAAGTGATCAGATTGAATCAAAATCG
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* *
14632691 AAAATAAAAGTGATTGGATTGAACCAAGGTTG
1 AAAATAAAAGTGATTAGATTGAACCAAGGTAG
* * *
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14632603 GTGATCAAAC
* *
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** * *
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* ** * * *
14632678 TGAATCAAAATCG-AAAATAAAAGTGATTGGAT
1 TGAACCAAGGTTGAAAAATAAAGGTGATTAGAT
* *
14632710 TGAACCAAGGTTGAAAAATAAAGGTGATTGGAC
1 TGAACCAAGGTTGAAAAATAAAGGTGATTAGAT
* *
14632743 TGAACTAGGGTTGAAAA
1 TGAACCAAGGTTGAAAA
14632760 TGACTAGGTC
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TGAACCAAGGTTGAAAAATAAAGGTGATTAGAT
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14634131 TTTCA-TTTTTCCTTTCA
1 TTTCACTTTTTCCTTTCA
14634148 TTTCACTTTTTCCTTTCA
1 TTTCACTTTTTCCTTTCA
14634166 ATTTTTCTTT
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14637218 AACGATCAAT
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66 AGTCCTC
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1 AATTTAAAACCAAGCAAACAAAAAAATTAGGATAATTCAAAATTAATTAATGGCCTAACTCTTAG
14637365 AGTCCTC
66 AGTCCTC
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1 AAT
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AGTCCTC
Found at i:14637986 original size:14 final size:14
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Indices: 14637969--14638000 Score: 55
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*
14637969 TTTTATTTTATAAG
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14637983 TTTTATTTTAAAAG
1 TTTTATTTTAAAAG
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1 TTTT
14638001 CACCATTTGA
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TTTTATTTTAAAAG
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* * *
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*
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14650107 TCGGCAATGAAGG-CTAAAAA
1 TCGGCAATGAAGGCCTAAAAA
14650127 TTTTGCTTCC
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 5, Indels: 3
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14650295 TTGTCTATCC
* *
14650305 TAATTTTAGGGATACAAATATT
1 TAATTCTAGAGATACAAATATT
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1 TAATTCTAGAGATACAAATAT
14650348 AAATAAGATA
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0.90 0.10 0.00
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22 19 1.00
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TAATTCTAGAGATACAAATATT
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14652909 TGATTTAAAT
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1 TTAAATTATA
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1 TTAAATTATA
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1 TTAAATT
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Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 0
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Indices: 14654208--14654233 Score: 52
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14654198 AGCTATTAAA
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1 CTCATAAGAATT
14654232 CT
1 CT
14654234 TAATAATAAT
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CTCATAAGAATT
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*
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1 AAAA-AAAAAGAATAGAAGGGG
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*
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*
14659396 AAAAGAAAAAGAATAGAAGGGG
1 AAAAAAAAAAGAATAGAAGGGG
14659418 AAAAA
1 AAAAA
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AAAAAAAAAAGAATAGAAGGGG
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14659453 AAGACAAATA
* *
14659463 AAT AAT AAC AAT AAC AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
1 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
14659511 AAT AAT AAT AAT
1 AAT AAT AAT AAT
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AAT
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* *
14663435 AT AT AT AT ACT AC AA AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
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AT
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*
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*
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*
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AATACCTAAAATATATAAAATCAATAGAA
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* *
14663787 AATATATAAAATCAATATAAAATACCTT-A
1 AATATATAAAATCAATAGAAAAGACCTTCA
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1 AATATATAAAATCAATAGAAAAGACCTTCA
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1 AATAT
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*
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*
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1 TAAAAT
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TAAAATAAATAATGATAAATA
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1 TTA
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TTAATTAATTAT
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*
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*
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1 AAGGAAAGTA
*
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14669010 AGGGAAGGGG
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*
14669040 AAGGAAAGTAATGGAAACATA
1 AAGGAAAGTAAAGGAAACATA
14669061 AA
1 AA
14669063 TTCCTTTGTT
Statistics
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* * * * * * * *
14670585 GACTATTGAAGGCATTTTTAGTCAGAAAATGCCTTGAATAACCCCATTCAATTTTTTGTAAGAGA
1 GACTATTCAAAGCATTTTTGGCCA-AAAATGTCTTGAATAACCCCATTCAATATTTTATAAGGGA
* *
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* ** * * *
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*
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* * * * * * * *
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1 GACTATTCAAAGCATTTTTGGCCAAAAATGTCTTGAATAACCCCATT-C-AATATTTTATAAG-G
* *
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* * * **** * *
14670588 TATTGAAGGCATTTT-TAGTCAGAAAATGCCTTGAATAACCCCATT-CAATTTTTTGTAAGAGAT
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* *
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1 TATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATCCCTTACA-AAAAATTGAAAGGGAT
* * * * * * * * * *
14670714 TATTCATGGTATTTT-TGGCCAGAAATGTCTTAAATAACCCCATT-C-AATATTTTATAAGGGAT
1 TATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATCCC-TTACAAAAAATTGA-AAGGGAT
* **
14670776 TATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATCCCTTACAAAAAATTGAATGGGGC
1 TATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATCCCTTACAAAAAATTGAAAGGGAT
* * * * * *
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1 TATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATCCCTTACAAAAAATTGAAAG-GGAT
* *
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1 TATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATC
14670939 TCCAAAATGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
60 3 0.01
61 54 0.24
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TATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATCCCTTACAAAAAATTGAAAGGGAT
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14670640 TTGTAAGAGA
* * * * *
14670650 TTATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAAT-TCTTTCATAAAAATTGAAAGGGA
1 TTATTCAAGGCA-TTTCTAGCCAAAAATGTC-TGAATAATCCCTTACA-AAAAATTGAATGGGG
* * * * * * * * * * * *
14670713 TTATTCATGGTATTTTTGGCCAGAAATGTCTTAAATAACCCCATT-C-AATATTTTATAAGGGA
1 TTATTCAAGGCATTTCTAGCCAAAAATGTC-TGAATAATCCC-TTACAAAAAATTGA-ATGGGG
*
14670775 TTATTCAAGGCATTTTCTAGCCAAAAATGCCTTGAATAATCCCTTACAAAAAATTGAATGGGG
1 TTATTCAAGGCA-TTTCTAGCCAAAAATGTC-TGAATAATCCCTTACAAAAAATTGAATGGGG
* * * * * * *
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1 TTATTCAAGGCATTTCTAGCCAAAAATGTCTGAATAATCCCTTACAAAAAATTGAATGGGG
* *
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14670939 TCCAAAATGT
Statistics
Matches: 178, Mismatches: 41, Indels: 15
0.76 0.18 0.06
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14672986 TGTTTTTGTA
* * *
14672996 TATATTTATGTTAGTCATGTCTATTCGTT
1 TATATTTATGTTAATCATGTCTATTCATG
* * *
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1 TATATT
14673060 CATATTATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Indices: 14676517--14676582 Score: 123
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*
14676550 AATTGATCCCTTTTAGGAGGGGATTGATCCATT
1 AATTGATCCCTTTTAGGAGGAGATTGATCCATT
14676583 TTACCAGTTT
Statistics
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Indices: 14676687--14676915 Score: 422
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14676677 TTTTGTACAA
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1 AAAAATCAATCAATCCATTTTTGAATGGATTGATTGCTTTTGAGTTTTAAATAAAATTTTCAATT
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14676763 AAAAATCAATCAATCCATTTTTGAATGGATTGATTGCTTTTGAGTTTTAAATAAAATTTTCAATT
1 AAAAATCAATCAATCCATTTTTGAATGGATTGATTGCTTTTGAGTTTTAAATAAAATTTTCAATT
*
14676828 TCTATATAGGG
66 TCTGTATAGGG
* * *
14676839 AAAAATCAATCAATCCATTTTTGAATGGATTAATTGCTTTTGAGTTTTAAACAAAAATTTCAATT
1 AAAAATCAATCAATCCATTTTTGAATGGATTGATTGCTTTTGAGTTTTAAATAAAATTTTCAATT
14676904 TCTGTATAGGG
66 TCTGTATAGGG
14676915 A
1 A
14676916 GGATTGATAT
Statistics
Matches: 148, Mismatches: 5, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
76 148 1.00
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AAAAATCAATCAATCCATTTTTGAATGGATTGATTGCTTTTGAGTTTTAAATAAAATTTTCAATT
TCTGTATAGGG
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Indices: 14677396--14677423 Score: 56
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14677386 ATATCAAAAG
14677396 CATA CATA CATA CATA CATA CATA CATA
1 CATA CATA CATA CATA CATA CATA CATA
14677424 TATATGGCTA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
4 24 1.00
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CATA
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Indices: 14679443--14679483 Score: 57
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14679433 TTTGTGCACT
**
14679443 GAAATCATTTTTTTAACGAATA
1 GAAATCATTTTTTTAAAAAATA
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1 GAAATCATTTTTTTAAAAAA
14679484 ATATAAAAAC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 1
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
21 13 0.76
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*
14681439 ACTTTTGTATGTTTTCCATGAGCACATTC
1 ACTTTTCTATGTTTTCCATGAGCACATTC
14681468 ACTTTTCTATGTTTTCCATGAGCACATTC
1 ACTTTTCTATGTTTTCCATGAGCACATTC
14681497 A
1 A
14681498 TCATAAACCT
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 29 1.00
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ACTTTTCTATGTTTTCCATGAGCACATTC
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Indices: 14703143--14703184 Score: 59
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*
14703143 AGAGATTATGCTCGAAGGTCTT
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Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 2
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Period size: 22 Copynumber: 2.9 Consensus size: 21
14703873 TAGAAGACTC
*
14703883 AGAGATTATACCCGAAGGTCTT
1 AGAGATTATGCCC-AAGGTCTT
14703905 AGAGATTATGCCCAGAGGTCTT
1 AGAGATTATGCCCA-AGGTCTT
14703927 AGAGATTATGCCCAAAGGTC
1 AGAGATTATGCCC-AAGGTC
14703947 ATACAAATCT
Statistics
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0.89 0.02 0.09
Matches are distributed among these distances:
21 1 0.03
22 37 0.95
23 1 0.03
ACGTcount: A:0.31, C:0.19, G:0.25, T:0.25
Consensus pattern (21 bp):
AGAGATTATGCCCAAGGTCTT
Found at i:14704266 original size:75 final size:75
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Indices: 14704113--14704272 Score: 223
Period size: 75 Copynumber: 2.1 Consensus size: 75
14704103 CTTAAAGGTC
* * * *
14704113 TTAAAGATTATGCCTGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTAATCATACATTAGAGG
1 TTAAAAATTTTGCCCGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTCTGAATGCTAATCATACATTAGAGG
*
14704178 TATTAAAAAT
66 CATTAAAAAT
*
14704188 TTAAAACATTTTGCCCGAAGGTCTTAAGGA-TTCAAAATCTCTGAATGCTCATCATACATTAGAG
1 TTAAAA-ATTTTGCCCGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTCTGAATGCTAATCATACATTAGAG
* * *
14704252 GCGTTGAAACT
65 GCATTAAAAAT
14704263 TTAAAAATTT
1 TTAAAAATTT
14704273 AAAATGTTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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75 50 0.67
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ACGTcount: A:0.37, C:0.14, G:0.16, T:0.34
Consensus pattern (75 bp):
TTAAAAATTTTGCCCGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTCTGAATGCTAATCATACATTAGAGG
CATTAAAAAT
Found at i:14704295 original size:181 final size:180
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Period size: 181 Copynumber: 2.0 Consensus size: 180
14703997 ACTTTGAAAT
* *
14704007 TTTAAAATAATTTTCCCGTAGGTTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCACATACATAAAGG
1 TTTAAAATAATTTTCCCGAAGGTTTAAGGATTTCAAAATCTCTGAATGCTCCACATACATAAAGG
* * * * * ** *
14704072 CGTTGAAACTTTGAAATTTTAAAATGTTTTGCTTAAAGGTCTTAAAGATTATGCCTGAAGGTCTT
66 CGTTGAAACTTTAAAAATTTAAAATGTTTTACCTAAAGGTCTTAAAGAATATGCCCAAAGGACTT
* *
14704137 AAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTAATCATACATTAGAGGTATTAAAAA
131 AAGGATTTCAAAATCTTTGAATACTAATCATAAATTAGAGGTATTAAAAA
*
14704187 TTTAAAA-CATTTTGCCCGAAGGTCTTAAGGA-TTCAAAATCTCTGAATGCT-CATCATACATTA
1 TTTAAAATAATTTT-CCCGAAGGT-TTAAGGATTTCAAAATCTCTGAATGCTCCA-CATACA-TA
* * *
14704249 GAGGCGTTGAAACTTTAAAAATTTAAAATGTTTTACCTAGAGGTCTTAAAGAATGTGCCCAAAGG
62 AAGGCGTTGAAACTTTAAAAATTTAAAATGTTTTACCTAAAGGTCTTAAAGAATATGCCCAAAGG
* **
14704314 ACTTAAGGGTTTCAAAATCTTTGAATACTCCTCATAAATTAGAGGT
127 ACTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATACTAATCATAAATTAGAGGT
14704360 GCTGAAACTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTAAAATAATTTTCCCGAAGGTTTAAGGATTTCAAAATCTCTGAATGCTCCACATACATAAAGG
CGTTGAAACTTTAAAAATTTAAAATGTTTTACCTAAAGGTCTTAAAGAATATGCCCAAAGGACTT
AAGGATTTCAAAATCTTTGAATACTAATCATAAATTAGAGGTATTAAAAA
Found at i:14704376 original size:106 final size:106
Alignment explanation
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Period size: 106 Copynumber: 5.0 Consensus size: 106
14704189 TAAAACATTT
* * *
14704199 TGCCCGAAGGTCTTAAGGA-TTCAAAATCTCTGAATGCTCATCATACATTAGAGGCGTTGAAACT
1 TGCCTGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCGTTGAAACT
* * * * *
14704263 TTAAAAATTTAAAATGTTTTACCTAGAGGTCTTAAAGAATG
66 TTGAAAATTTAAAATATTTTGCCCAGAGGTCTTAAAGATTG
** * * * * * *
14704304 TGCCCAAAGGACTTAAGGGTTTCAAAATCTTTGAATACTCCTCATAAATTAGAGGTGCTGAAACT
1 TGCCTGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCGTTGAAACT
**
14704369 TTGAAAATTTAAAATATTTTGCCTGGAGGTCTTAAAGATTG
66 TTGAAAATTTAAAATATTTTGCCCAGAGGTCTTAAAGATTG
** * * * *
14704410 TGTTTGGAGATCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATCAGAGGCATTGAAACT
1 TGCCTGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCGTTGAAACT
* * * *
14704475 TTGAAAATTTAAAATATTTTACCCAAAGGTTTTAAAGGTTG
66 TTGAAAATTTAAAATATTTTGCCCAGAGGTCTTAAAGATTG
* * * * * *
14704516 TG-CTAGGAA-GTCTTAAGGATTTCAAAATCCTTGAATGCTCCACATACATCAAAAGTGTTGAAA
1 TGCCT--GAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCGTTGAAA
* * * * * * *
14704579 CTTCGAAATTTTAAAATGTTTTGCCCAAAGGACCTAAAGGTTG
64 CTTTGAAAATTTAAAATATTTTGCCCAGAGGTCTTAAAGATTG
* * * *
14704622 TGCCTGAAGGTCTTAAAGATTTCAAAATCTTTGAATGCTTCTCATATATTAGAGGCATTGAAACT
1 TGCCTGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCGTTGAAACT
* * * *
14704687 TTAAAAATGTAAAATATTTTGCCCGGAGGTCTTAAGGATT
66 TTGAAAATTTAAAATATTTTGCCCAGAGGTCTTAAAGATT
14704727 TTAAAATCTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
105 20 0.06
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107 4 0.01
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Consensus pattern (106 bp):
TGCCTGAAGGTCTTAAGGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCGTTGAAACT
TTGAAAATTTAAAATATTTTGCCCAGAGGTCTTAAAGATTG
Found at i:14704770 original size:84 final size:84
Alignment explanation
Indices: 14704622--14704810 Score: 279
Period size: 84 Copynumber: 2.2 Consensus size: 84
14704612 CTAAAGGTTG
* * *
14704622 TGCCTGAAGGTCTTAAAGATTTCAAAATCTTTGAATGCTTCTCATATATTAGAGGCATTGAAACT
1 TGCCCGAAGGTCTTAAAGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCATTGAAACT
14704687 TTAAAAATGTAAAATATTT
66 TTAAAAATGTAAAATATTT
* * * *
14704706 TGCCCGGAGGTCTTAAGGATTTTAAAATCTTTGAATGCTCCTCTTACATTAGAGGCATTGAAACT
1 TGCCCGAAGGTCTTAAAGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCATTGAAACT
* *
14704771 TTGAAAATTTAAAATATTT
66 TTAAAAATGTAAAATATTT
**
14704790 TGCTTGAAGGTCTTAAAGATT
1 TGCCCGAAGGTCTTAAAGATT
14704811 GTGCTCGAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
84 92 1.00
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Consensus pattern (84 bp):
TGCCCGAAGGTCTTAAAGATTTCAAAATCTTTGAATGCTCCTCATACATTAGAGGCATTGAAACT
TTAAAAATGTAAAATATTT
Found at i:14705140 original size:18 final size:18
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Indices: 14705113--14705168 Score: 58
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14705103 TAAATGATGT
*
14705113 AAATGTAAATGTCAATGC
1 AAATGAAAATGTCAATGC
* *
14705131 GAATGAAAATGTTAATGC
1 AAATGAAAATGTCAATGC
*
14705149 AAATGCAAGAATGTGAATGC
1 AAATG-AA-AATGTCAATGC
14705169 TTGATGCAAA
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 5, Indels: 2
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
18 19 0.61
19 2 0.06
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Consensus pattern (18 bp):
AAATGAAAATGTCAATGC
Found at i:14705401 original size:33 final size:34
Alignment explanation
Indices: 14705331--14705403 Score: 87
Period size: 33 Copynumber: 2.2 Consensus size: 34
14705321 CATGTACAAG
* * **
14705331 TGCAAATGCAAATGTCTTTTTTATTTTTGCAACA
1 TGCAAATGCAAATGTCTTTTTAAGTGATGCAACA
14705365 TGCAAAT-CAAATGTCTTTTGTAAGTGATGCAA-A
1 TGCAAATGCAAATGTCTTTT-TAAGTGATGCAACA
14705398 TGCAAA
1 TGCAAA
14705404 GATTTTTTTT
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 4, Indels: 3
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
33 19 0.56
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Consensus pattern (34 bp):
TGCAAATGCAAATGTCTTTTTAAGTGATGCAACA
Found at i:14706531 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 14706494--14706530 Score: 51
Period size: 5 Copynumber: 7.8 Consensus size: 5
14706484 AGGAGCATGT
*
14706494 TTTTC -TTTC TTTGC TTTTC TTTTC TTTTC TTTT- TTTT
1 TTTTC TTTTC TTTTC TTTTC TTTTC TTTTC TTTTC TTTT
14706531 TGGGAAACAT
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 2, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
4 8 0.28
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Consensus pattern (5 bp):
TTTTC
Found at i:14706776 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 14706761--14706798 Score: 53
Period size: 12 Copynumber: 3.2 Consensus size: 12
14706751 TTCTTTGCTA
14706761 TTTTT-TCTTTT
1 TTTTTATCTTTT
14706772 TTTTTATCTTTT
1 TTTTTATCTTTT
14706784 TTTTTCAT-TTTT
1 TTTTT-ATCTTTT
14706796 TTT
1 TTT
14706799 GTGGAAACCT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 3
0.89 0.00 0.11
Matches are distributed among these distances:
11 5 0.20
12 18 0.72
13 2 0.08
ACGTcount: A:0.05, C:0.08, G:0.00, T:0.87
Consensus pattern (12 bp):
TTTTTATCTTTT
Found at i:14706783 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 14706761--14706798 Score: 51
Period size: 11 Copynumber: 3.5 Consensus size: 11
14706751 TTCTTTGCTA
*
14706761 TTTTTTCTTTT
1 TTTTTTCATTT
14706772 TTTTTATC-TTT
1 TTTTT-TCATTT
14706783 TTTTTTCATTT
1 TTTTTTCATTT
14706794 TTTTT
1 TTTTT
14706799 GTGGAAACCT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 4
0.86 0.00 0.14
Matches are distributed among these distances:
10 2 0.08
11 21 0.84
12 2 0.08
ACGTcount: A:0.05, C:0.08, G:0.00, T:0.87
Consensus pattern (11 bp):
TTTTTTCATTT
Found at i:14708125 original size:118 final size:121
Alignment explanation
Indices: 14707888--14708113 Score: 305
Period size: 118 Copynumber: 1.9 Consensus size: 121
14707878 CTTAATCTCA
* * * ** * * *
14707888 TAATCTTTCATGATTTTTTGGTGTATTTGAAATCATATCCGTACTTCGAGAAATGTAAAATTACA
1 TAATATTTCATGATTTTTTGGTGCATTTGAAATCATAGCAATACTCCCAAAAATGTAAAATTACA
** *
14707953 AAAATACCTTTATAAGGGTATTTTTGTAATTTAACCTTTTCGACCATAGATTTTCT
66 AAAATACCCCTATAAGGGTATTTTTATAATTTAACCTTTTCGACCATAGATTTTCT
*
14708009 TAATATTTCATGA-TTTTTGGTGCATTTGAAATCATAGCAATAC-CCCAAAAATGTGAAATTAC-
1 TAATATTTCATGATTTTTTGGTGCATTTGAAATCATAGCAATACTCCCAAAAATGTAAAATTACA
* *
14708071 AAAATACCCCTATAATGGTATTTTTATAATTTGACCTTTTCGA
66 AAAATACCCCTATAAGGGTATTTTTATAATTTAACCTTTTCGA
14708114 GTTCAGATTT
Statistics
Matches: 91, Mismatches: 14, Indels: 3
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
118 38 0.42
119 15 0.16
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ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.12, T:0.41
Consensus pattern (121 bp):
TAATATTTCATGATTTTTTGGTGCATTTGAAATCATAGCAATACTCCCAAAAATGTAAAATTACA
AAAATACCCCTATAAGGGTATTTTTATAATTTAACCTTTTCGACCATAGATTTTCT
Found at i:14714892 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 14714877--14714901 Score: 50
Period size: 12 Copynumber: 2.1 Consensus size: 12
14714867 TTTGAAAAGT
14714877 ATGATGAAACAA
1 ATGATGAAACAA
14714889 ATGATGAAACAA
1 ATGATGAAACAA
14714901 A
1 A
14714902 ATGCCCTTCA
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
12 13 1.00
ACGTcount: A:0.60, C:0.08, G:0.16, T:0.16
Consensus pattern (12 bp):
ATGATGAAACAA
Found at i:14719301 original size:84 final size:85
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Indices: 14719060--14719406 Score: 396
Period size: 84 Copynumber: 4.1 Consensus size: 85
14719050 GTATTTATAC
* *
14719060 TTGCATTCACATCTGCATAAAAAAAAGAGAAGGTATTCACATTTGCATCACTTGCATTCATACTT
1 TTGCATTCACATCTGCAT-AAAAAAA-AGAA--CATTCACATTTGCAGCACTTGCATTCATACTT
* * *
14719125 GCATATCCATATTAAGAAAGACAT
62 GCATATGCATAATGAGAAAGACAT
* * * * * * * *
14719149 TTGAATTCACATC-ACA-AAAAAAAGGAAAATTCGCATTTGCATCACTTGCATTCATACATGCGT
1 TTGCATTCACATCTGCATAAAAAAAAGAACATTCACATTTGCAGCACTTGCATTCATACTTGCAT
*
14719212 GTGCATAATGAGAAAGACAT
66 ATGCATAATGAGAAAGACAT
* *
14719232 TTGCATTCACATCTGCATAAAAAAAAG-ACATTCACATTTGTAGCACTCGCATTCATACTTGCAT
1 TTGCATTCACATCTGCATAAAAAAAAGAACATTCACATTTGCAGCACTTGCATTCATACTTGCAT
*
14719296 ATGCATCATGAGAAAGACAT
66 ATGCATAATGAGAAAGACAT
* * * * *
14719316 TTGCATTCACATCTGCATAAAAAAAAG-ACATTCGCATTTGCAGCACTTACATTCGTTCTTACAT
1 TTGCATTCACATCTGCATAAAAAAAAGAACATTCACATTTGCAGCACTTGCATTCATACTTGCAT
* * *
14719380 GTGCATCATGAGAAAGATAT
66 ATGCATAATGAGAAAGACAT
*
14719400 TCGCATT
1 TTGCATT
14719407 TGCATCGCTT
Statistics
Matches: 223, Mismatches: 33, Indels: 9
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
83 60 0.27
84 131 0.59
85 11 0.05
86 7 0.03
88 2 0.01
89 12 0.05
ACGTcount: A:0.37, C:0.20, G:0.14, T:0.29
Consensus pattern (85 bp):
TTGCATTCACATCTGCATAAAAAAAAGAACATTCACATTTGCAGCACTTGCATTCATACTTGCAT
ATGCATAATGAGAAAGACAT
Found at i:14719628 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 14719610--14719642 Score: 59
Period size: 7 Copynumber: 4.9 Consensus size: 7
14719600 TATAAGACCT
14719610 TTGCAT-
1 TTGCATA
14719616 TTGCATA
1 TTGCATA
14719623 TTGCATA
1 TTGCATA
14719630 TTGCATA
1 TTGCATA
14719637 TTGCAT
1 TTGCAT
14719643 GTATTTGCAT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 1
0.96 0.00 0.04
Matches are distributed among these distances:
6 6 0.23
7 20 0.77
ACGTcount: A:0.24, C:0.15, G:0.15, T:0.45
Consensus pattern (7 bp):
TTGCATA
Found at i:14719690 original size:18 final size:18
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Indices: 14719667--14719702 Score: 54
Period size: 18 Copynumber: 2.0 Consensus size: 18
14719657 CATTCGTATT
*
14719667 CTTGCATTTACATTGACA
1 CTTGCATTCACATTGACA
*
14719685 CTTGCATTCGCATTGACA
1 CTTGCATTCACATTGACA
14719703 TTTCCATTAG
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 16 1.00
ACGTcount: A:0.25, C:0.25, G:0.14, T:0.36
Consensus pattern (18 bp):
CTTGCATTCACATTGACA
Found at i:14719710 original size:18 final size:18
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Indices: 14719677--14719715 Score: 51
Period size: 18 Copynumber: 2.2 Consensus size: 18
14719667 CTTGCATTTA
* *
14719677 CATTGACACTTGCATTCG
1 CATTGACACTTCCATTAG
*
14719695 CATTGACATTTCCATTAG
1 CATTGACACTTCCATTAG
14719713 CAT
1 CAT
14719716 CTTTTGATGA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 18 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.26, G:0.13, T:0.36
Consensus pattern (18 bp):
CATTGACACTTCCATTAG
Found at i:14720217 original size:104 final size:104
Alignment explanation
Indices: 14720085--14720548 Score: 537
Period size: 104 Copynumber: 4.5 Consensus size: 104
14720075 GAAAAGCAAG
*
14720085 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTAATTGGAAGAGCATTCAAAGATTTTAAGATTTCTAAGACCTC
1 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTAATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTTAA-ATTTCTAAGACCTC
* * * * *
14720150 CAAGCATAATTTTCAAGACATTTAG-GCAAAGCATTTTGA
65 CAGGCACAATTTTCAAGACCTTTAGAGCAAAACATTTTAA
* * * *
14720189 ATTTTTAAAGTTTCATGTCCTCTGATTGGAAGAGCATTCAAAGATTTTGAAATCTT-TAAGACTT
1 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTAATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTT-AAAT-TTCTAAGACCT
*** * ** *
14720253 TTGGGCATAATTTTCAAGACCTTT-GAGTGAAATATTTTAA
64 CCAGGCACAATTTTCAAGACCTTTAGAGCAAAACATTTTAA
* * * * * *
14720293 ATTTTTAAAGTTTCATGGCTTCTGATTAGAGGAGCATTCAAATATTTTGAAATCTCTAAGACCTT
1 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTAATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTT-AAATTTCTAAGACCTC
* * * * *
14720358 CAGGTACAAATTTCAATACTTTTAG-GCAAAACATTTAAA
65 CAGGCACAATTTTCAAGACCTTTAGAGCAAAACATTTTAA
* *
14720397 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTAATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTT-GA-CTCTAAGACCTCC
1 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTAATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAATTTCTAAGACCTCC
* *
14720460 AGGCACAATTTTCAAGACCTCT-GAACAAAACATTTTAA
66 AGGCACAATTTTCAAGACCTTTAGAGCAAAACATTTTAA
* *
14720498 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTTTAATTGGAGGAGCATACAAAGATTTTAAA
1 ATTTTTAAAGTTTCATGGCCTCTAATTGGAGGAGCATTCAAAGATTTTAAA
14720549 ATTTGCAAAA
Statistics
Matches: 306, Mismatches: 47, Indels: 16
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
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* *
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* *
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TTTG
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* *
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ATTT
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* * *
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* * * **
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** * * * * *
14730949 ATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTCTACAACAAAATAGAATG-TCATAATGATTTGAAATATA
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* * * * ** *
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* * *
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1 TTTTTTAAATCTT-TACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA-
* * * *
14731128 TAA-TTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAA
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* * * * *
14731192 ATAGTTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTCGCTCTG-TAGACAGA-TATA
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* * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * *
14731425 TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TAATATTTTATTCGAATT
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
14730770 AATAAGGTTGTATGAACAGAAACAAATGTTTTAGGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGAT
127 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * *
14730834 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GATAAAGAGATTTA-TTTTTAAAT
192 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * ** * **
14730897 C--T-CTTAATAATTTTCAAAATAGCAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTAT
256 CTTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGCTTGTAT
* * ** * *
14730958 GAATAGAAACAATTGTTCTACAACAAAATAGAATGTCATAA
319 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGTCATAA
* * * * * * * ** *
14730999 TGATTTGAAATATATAATAGTTCAAATAGACATGACTAGTCGAACTT-ATGCGATAAACAGATTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAACAGATTT
** * * **
14731063 ATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTT-AGAATACTAATAAATTAGTATTTTTTTATTTAAA
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAA
* * *
14731127 TTAA-TTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATA
129 -TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * *
14731191 AATAGTTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTCGCTCTGTAGACAGATATATTTTTTAAATCA
193 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-
* * * * *
14731256 TTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAGTTTATTCCGAAAAAGCTTGTTTGAG
257 TTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCTTGTATGAA
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* * * *
14731360 TCATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACATGTTTAGAAAACATATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* *
14731425 TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TAATATTTTATTCGAAT
66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCGAA-
* * * * * * * *
14731488 TAATCTTGCATGAATAGAATCGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATG-TCTTGGAAT-
129 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGAT-TTGAAATA
* * * * * *
14731551 GTATAATTGTTTAGATAGTCATAACTTTTTGAACTTGTT-TAGTAAACAAATTCATTTTTTTAAT
193 G-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATTTA-TTTTTTAAA
* * * * **
14731615 TCTCTTACTCATTAATTTTGGAATATTAATAAATTATTCAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATA
255 TCT-TTACTTATTAATTTTGAAATATTAAT-AA--ATT-AGT--A-TTATTT-TATTTCGAAA-A
* * * * *** ** *
14731680 TTTTA-CTTATTAATTGTCAAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAG-CTTGAA
310 ----AGCTT-GT-A-TG--AACAGA--AAC-AATT-GTTTTATGACAAAAC-AA-AAGTCAT-AA
**** * * * * * * * ** *
14731743 TGAACAAAAACA-ATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAAAAATTATT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C---A-AATA-GTCATAACTATTTGAACT----TGTT-TA
* * *
14731807 CAAATAGTCATAATAAGTTGAACTTGTTTGGTAAA-CAGATTTATTATTTAAATGTTTCACTTAT
53 GAAA-A--CA-GAT---TT--A-TT-TTT--TAAATC----TT-TTACTT--A---TT-A---AT
** * * * *
14731871 TAGTTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTGTTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAATA-
91 T--TT-T-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAA-AC
** * * ** *
14731935 AA-TCATTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
150 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
14731999 ATTATTTAAACTTGTT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAA
215 ACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAA-TTTTGAAA
* * * ** * *
14732063 TATTAATAGCA-TAGTATTATTTTATTT-TAAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTTTTTTAT
277 TATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
14732126 GACAAAACAAAAGATCATAA
340 GACAAAACAAAAG-TCATAA
* * ** * * *
14732146 TTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGGCTATTT-AATCTAG-TTCGATAAACATATT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTTAGA-AAACAGATT
* * * * ** * *
14732209 TATTTTTAAAATTTTTTATTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTAATATTTTAATTCTA
64 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGA
* * * * * * *
14732274 ATAAGCTTGTGTGAACCA-AAACTATTATTTTATAATAGAACAAAA-AGTCATAA-GATTTGAAA
128 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAA
* * * * ** *
14732336 TACATAATTCCTT-AAATAGTCATAACTAGTTGAAATAATT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAA
191 TAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTTATTTTTTAA
* ** * *
14732399 ATC--T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGGTTAGTATTATTTCATTTCGAACAAA-CTTAT
254 ATCTTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-AAAGCTTGT
* * * * *
14732460 ATGAACAAAAACATTTGTTTTATGATAAATCAAAAGGTTATAA
317 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* * * *
14732503 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGATTAGGTAAACAGAATT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-GAAAACAGATTT
* *
14732567 ATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TTGATTTTATTTTG
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATT-ATTTTA-TTCG
* ** * * *
14732629 AATAAGGTAATATGAATTGAAA-ATATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAA
127 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * *
14732693 TAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTAGTTGAACTGGTT-TGTCAAAAAAAATTATTTTTTAAA
191 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGT-AAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * *
14732757 TCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA
255 TCT-TTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCTTGTA
* * * * *
14732822 TGAACAGAAATAATTATTTTATGACAGAACAAATGGTTATAA
318 TGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAA
* * * * * * * *
14732864 TGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATTACTATTTGAACTGGTTTTGTAAACATATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* * *
14732929 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAAT
66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAAT
* * * * * * *
14732994 AAGCTTATATG-GTCAAAAACAACTGTTATATGACCAAACAAAAGGA-AATAACGATTTGAAATA
130 AAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATA
* * * * * ** * *
14733057 GATAATTGTTAAAAT-GGCTATAATTATTTGAAGTGGTTCCATAAATAGATTCATTTTTTAAATC
193 GATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * *
14733121 ACTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAA-CTTGTAT
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* * *
14733185 AAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
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** * * * * * *
14733226 CAATTT-AAATAGACAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATCT-AACTTTGTTCAGTAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTGTTTAGAAAACAGATTT
* * * * * * *
14733289 ATTTTTTAAAT-TCTTGCTTATTAATTATTGAAATATTAAGAAAATAATATT-TTTT-TT-GGAT
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* * * * * *
14733350 AAGTTTTTATGAACT-GAAACAATTG-TTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAA
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* * * *
14733413 ATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATAT
194 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTTATTTTTT-AAAT-C
* * * * * *
14733478 TTTTCCTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTA--
257 TTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCTTGTATG
* * * ** * * *
14733540 AATTATGAAACAAATATTTTATGACTAAATGAAAGGTTAGAA
320 AA-CA-GAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGTCATAA
** * * ** * * *
14733582 CAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAAATATTTGAACTAGTTT-GATAAACACATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAACAGATTT
* * * * ** *
14733646 ATTTTTTAGATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAACCAAA
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAA
* * * * **
14733711 TAAGCTTATATG---ACAAACAATTGTTTTAAGCCAAAAC-AAAGATTTTAACGATTTG---T--
129 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
14733767 -TCAATTAGTT-ATA-ACT-ATTA--ATTTGAA-TTAGTT-TGGTAAACAAATTTATTATTTAAA
194 AT-AATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCT-GTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * *
14733824 TCTATTACGTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTCTA
255 TCT-TTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCTTGTA
* * * ** * *
14733889 TCATA-AAAAAGAATTGTTTTACAATAAAACCAAAGGTCATAA
318 TGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTCATAA
* ** * * * * * * *
14733931 TGATTTTAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAAC-TGATTCGATAAATAGATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAACAGATTT
*** * *
14733995 ATTTTTTAAA--TTTT--TTATTAATTTAAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATC
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-A
* * * * * * * * *
14734056 TGAGCTTTTATTAAGT-GAAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTAAAATGATTTTAAAT
129 TAAGCTTGTATGAA-TAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
** * *
14734120 AGATAGCTGTTC--A-A---ATAACTATTTAAACTTGTT-TGATAAACAAATTTACTTTTTTAAA
192 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAA
* * * * * **
14734178 TCTCTTTCTT-CTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCTAAATAAGCTCA
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** * *
14734240 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATTAAACAAAATATCAGAA
316 TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* ** * * * * * *
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1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAACAGATTT
* *
14734347 A-TTTTTAAA---TTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAA
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAA
* * * *
14734407 TAAGCTTGTATGAACA-AAA-AATTTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTAAAATA
129 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * ** * *** * *
14734470 GATAAATGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAGTTAGATTTGTTTTTTAATTT
193 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAA--A
** * * * *
14734534 TCTTGGC-TATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAA--TAGTA
255 TCTTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-AAAGCTTGTA
* * * * *
14734596 TGAATAGAACCAATTGTTTGATAACAAAATAAAAGGTTC-TAA
318 TGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-G-TCATAA
* * * * * * * * *
14734638 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAAAAATATTTGAAATGGTTTGGTAAGCA-ATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* * * * * * *
14734702 CTTTTTATATCTCTTACTAATTAATTCTTGAAATATTTATAAATTAGTATTACTTTCT-TTTGAA
66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-TATTCGAA
* * * * * * * * *
14734766 AAAGCATGCATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAG-TAATAATGAATTGAAATA
129 TAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
** * * * ** *
14734829 GATAGCTATTTAAA-AGTCATAATTATTTGAA-TTGATTCAATAAACTGATTTATTTTTTAAATC
193 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * *
14734892 TCTTACTTATTAATTTTCAAAATAGTAATAAAGTATTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATG
257 T-TTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCTTGTATG
* * *
14734957 AACTAG-AACAATTGTTTCATGACAAAACAAATGATTATAA
320 AAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA
* * * * * * *
14734997 TGATTTTAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* ** * * *
14735062 TTTTTCAAATCTAATGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAA
* * * * * * * *
14735126 TAAGCTTGTATAAACT-GAAACAATTATTATATAACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATA
129 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * * * * *
14735190 GATAATTATTCTAATAGT--TAACTATTTGAACTGGTT-TGACAAACAAATTTATTTTATAAATC
193 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * *
14735252 --T-CTTATTAATTTTCATAGTATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATTCGAATAAGCTTGTATG
257 TTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAAAAAGCTTGTATG
* *
14735313 ATCAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAA
320 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA
* * * * * * * * *
14735352 CGATTTGAGATTGATATTTATTCAAACAATTATAACTAATTGAA-TTGCTTTAGAAAACA-ACTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGAAAACAGA-TT
* * ** **
14735415 TAGTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG
64 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-
** * * * * *
14735480 ATAAATTTTTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAATG-TCATAACAATTTTAAA
128 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAA
* * * * *
14735543 TACATAGTTGTTAAAACAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTT-TGGTAAATAGATTTATTTTTTAA
191 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATTTATTTTTT-A
* ** * *
14735606 AATCTCTTACTCAACAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTC-AATAAG-T
253 AATCT-TTACTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAAAAAGCT
* * * * *
14735668 TCGT-TGAACTA-AAATAGTTGTTTTTTTGACTAAACAAAATGTCAGAA
314 T-GTATGAAC-AGAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* * * * *
14735715 TGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCTTAACGACTTGAA-TTGGTTTGGCAAACA-A--T
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAGAAAACAGATTT
* * * * *
14735775 -TTTTTAAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAA
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAA
* * * *
14735839 TAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAAAGATCATAATGATTTGAGATAG
129 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
14735902 ATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTT-AAATTGTTTTGGTAAATAGATTTAGCTTTTCAAAAC
194 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATC
* * * * ** *
14735966 --T-CCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAGTATTATTTTA-TTCTG-AATATTTTGCATG
257 TTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAAAAAGCTTGTATG
* * *
14736026 AATAGAAACTATTATTTTATGACAAAAACAAAAAGTCATAA
320 AACAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAC-AAAAGTCATAA
* * * * * * * *
14736067 TGATATGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGACATGAGTA-TTGAACTTGTTTAG-TAATAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
** * * *
14736130 TTTTTTAAATCTACTACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATATATTAGTATTATTTTATTCCAAA
66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAA
* * * * * * *
14736194 TAAACTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATAAGAAAACAAAACATCATAACTATATGAAATA-
129 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
14736258 A-AA----T--AAT--T-GT---TATTTAAACTTGCTCAGTAAACATATTTACTTTTTATATTTT
194 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTTATTTTTTA-AATCT
* * * * * *
14736310 TTACTCATTAGTTTTTTG-AATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATATGTTTGTATGA
258 TTACTTATTA--ATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCTTGTATGA
* * * *
14736374 ATAGAAACAATTGGTTTATGACAAATCAAAAGGTCACAA
321 ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* * * * *
14736413 CT-ATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAACTATTTG-A-TTGTGTTCAGAAACCATAT
1 -TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TT-AGAAAACAGAT
* *
14736475 TTA-TTTTTACAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTACTTTATTT
63 TTATTTTTTA-AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC
* * * * * *
14736537 GAAATAAGCTTGTATGAGTAGAAACAAATATTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
126 G-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAA
* * * * * * *
14736602 ATATATAATTATTCAAATAGCCATAGCTATTTGAACTTGTTC-GATAAACAGATTCATATTTTCA
190 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * ** * *
14736666 ATCTCTTACTCATTAAATTTTGTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCCTAT
254 ATCT-TTACTTATT-AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGCTTGT
** * * *
14736731 ATGAATTGATACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAA
317 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* ** * * * * * *
14736774 CGATTTGAAATAGATAATCATTCAAGTAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* * * *
14736839 -TTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAAT
66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAAT
* * * *
14736903 AAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAA
130 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
14736967 ATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGGTAAACAAATGTATTTTTAAAAAT-
194 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATTTATTTTT-TAAATC
* * ** * * *
14737030 TTTACTTATTAGTTGTCGAAATATTAATAAATTTCTATTACTTTAATT-GAAATAAGCTTGTGTG
257 TTTACTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGCTTGTATG
* * * * *
14737094 AATAGAAAAAAATATTTTATGACAAAACAAAA-TCTTATAG
320 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTC--ATAA
* * * * ** * * * *
14737134 CGATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATATTCATAACCGTTTTAACTTGTTCA-ATAAATAGACTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAACAGATTT
* * * * * * *
14737198 AGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCTAG
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAA
* * ** * * * * * * *
14737263 TCAGCTTATATTTACAGAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATAG
129 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * ** * *
14737328 ATAATTGTTCAAACAGTTATAACTATTTGTACTAGTTAGGCT-AACATATTCATTTTTTAAATCT
194 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * *
14737392 ATACTTATTAATTTTTAAA-ATCTCAAAAAATTAGCAATACTTTA-TTCTGAATAAGAC-TGTAT
258 TTACTTATTAATTTTGAAATAT-T-AATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAAAAAG-CTTGTAT
* * *
14737454 -TACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAATGGTCATAA
319 GAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAA
* * * * * * * * *
14737495 TAATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTACTT-AA-TTGGTTTGGTAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAGAAAACAGATTT
** * * *
14737558 ATTTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTATTCAAA
65 A-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GA
* * * * * * * * * *
14737619 ACAAACTTATATAAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
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* ** * * * * * * * * * *
14737684 GATAGTTAATCATACAGCCTTAAATATTTG-ATTTGGTTCAGCAAACAAATTTATTCTTTAAATC
193 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * *
14737748 TCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT
257 T-TTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGCTTGTAT
* * * * *
14737812 GAACATATATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAA
319 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* * * * * * * * * * ** *
14737853 CGATTTGAAATATATAATTATTTAAATAGTAATAACTATTTAAACTAGTCTGGTAAGTATATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* ** * * *
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66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * * * * *
14737983 AAGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTATAACAAAACTAAAGTTCATAACAATTTGAAATAG
130 AAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAG
* * *
14738047 ATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAA-TTGATT-TGATAAACTA-ATTAATTTTTTAAAT
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* * * * * * * * *
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* * *
14738173 TGAACTA-AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAA
318 TGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* * * * *
14738215 TGATTTTAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCATAACTGTTT-AACTTGTTTGGTAAACAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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188 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT-TGAACTTGTTCTGT-AAACAGATTTATTTTT
* * * ** * *
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* * ** *
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314 TGTATGAACAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAA
* * * * * * * *
14738574 T-ATTTGAGATAGATAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAATAGATTAA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
* * *
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66 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAT
** * * * * ** * * *
14738698 AATTTTGCATGACTAAAAACAATTTTTTTACAATAAAACAAAATG-TTATAATGATTTGAAA-AG
130 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * *
14738761 ATAATAGTTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAATATATTTATTTTTTAAATCTC
194 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-
** * * * * *
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258 TTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-AAAGCTTGTATGA
* *
14738890 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAA
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** * * * * * *
14738929 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAACTTGCTT-GTTAAATAGATTT
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*
14738993 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCG
65 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTA-TTCG
* * *
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* * ** *
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190 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * * *
14739173 T-TTT-CTGATTAATTTCTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTA-TTCAAAACAAGCTTGC
255 TCTTTACTTATTAATTT-TGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGCTTGT
* * * * *
14739234 AAGAACA-AAACTAATTGTTTTGTGGCAAAAGGAAATGTCATAA
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** * ** * * * *
14739277 TTTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGGTAGTCATAACTATTAGAACTT-ATTCGATAAACATATTC
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAACAGATT-
** * * * * * *
14739341 T-TTTTTTAGTTCTCTTACTCATTAATGTTTGGAATATCAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAA
64 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGA
* * * * * * *
14739405 ATAAACTTGTATGAA-ATGAAACAATTATTTTATTA-TAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGGAAT
128 ATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * *
14739467 AGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAACATATTTATTTTTTAAAA
192 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATTTATTTTTT-AAA
** * * * *
14739531 TCTTTTACTCT-TTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAAATAAACTTG
255 TC-TTTACT-TATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGCTTG
14739594 TATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA
316 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
14739624 TAAATAACAC
Statistics
Matches: 6693, Mismatches: 1441, Indels: 975
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
342 6 0.00
343 17 0.00
344 13 0.00
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390 16 0.00
391 3 0.00
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413 8 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (358 bp):
TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAACAGATTTA
TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATA
AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGAT
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * ** * *
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126 AAAT-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAAT
* * * ***
14734140 ATTT-AAACTTGTTTGATAAACAAATTTACTTTTTTAAATCTCTTTCT--TCTAATTTTTTGAAT
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* * * * * * *
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** * ** * * ** * **
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* * * * **
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1 ATTTGAAA-TGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCAAAATATT
* ** * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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* ** * * *** *
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*** * * * * *
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* ** * *
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1 ATTTGAAATGGTTTGGTAAACAAATTTATTTT-TAAATCTCTTACTAATTAATTTTCAAAATATT
* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * ** * **
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** * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * * **
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* * * * * * **
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1 ATTTGAAATGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCAAAATATTA
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * * * *
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125 AAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAAT
* * * * * * *
14736104 A-TTGAACTTGTTTAGT-AATAGATTTATTTTTTAAATCTAC-TACCT-ATTAATTTTTAGAATA
1 ATTTGAAATGGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT-CTTA-CTAATTAATTTTCAAAATA
* *** * * * * *
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** ** ** ** ** * ** * * * ***
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* * * * * * * * ** *
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** * ** * * ** * * *
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177 --AT
* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * *
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126 AAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAAT
* * **** * * *
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1 ATTTGAAATGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTAC-TAATTAATT-TTCAAAATAT
* * ** * * * *
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* * * * * * *
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* ** * ** * * * * *
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1 ATTTGAAATGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCAAAATATT-
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* *
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** ** * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * * *
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Statistics
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178 T
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177 GT
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* * * * *
14742421 TACTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACT-GAAATAAATT-TTTTATGACAAAACAAAA-G
63 TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * *
14742483 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACAATTTGATCTAGT
125 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAT-TTGT
* * * * *
14742538 T-TGATAAGCATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATAATAATAAATTAGT
1 TCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAA-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
14742602 ATTATTTTAATCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTAG
64 ATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * *
14742666 AATGATTTGAAATA-ATTAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGT
129 AACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ATTTGT
* * * * *
14742717 T-TGATAAGA-AGATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATCAATAGACTT-G
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*
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63 TATTATTTTATT
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TATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATTTGT
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* *
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AGTCATAACTATTTGAAAT
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*
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TATAACTATTTAAATAG
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* * * * * * * *
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* **
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***
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* ** * *
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66 G-CTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTACGA-AAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * *
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GCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTACGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACA
ATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAA
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Period size: 711 Copynumber: 2.1 Consensus size: 716
14741247 AGATGGTAAT
* * * * *
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* * * * *
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* *
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128 AATTATTTTATGACAAAACAAAATA-CAT-ACGATT--AAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * *
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189 ACAATTTGAACTCACTTGGTAAAAAAATTATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * **
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253 TTAATAAATTAGTATTATTTTATCCAAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATCGCTTTATGACA
* * * * * *
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** * * * *
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383 TTAGAAAACAAATTTATTTATGAAAGTTTTAATTATTAACTTTTAGAATATTAATCAACTTATAC
* * * *
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448 TATTTTATTTCAAATAAGCTTAGATAAACAAAACTAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATA
*** * * * * ** * *
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513 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTTGATAAACAGATTC
** * * * * *
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578 AATTTTAAAATTCTCTTACTCATTAATTGTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATATCAA
* * * * *
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* *
14741972 GATAATTAT
708 AATAATTAC
* * *
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1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATGGTTCGATAAACATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAA
** *
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* ** *
14742109 TTATTTTATGACAAAACAAAA-A-AT-C-A-T-AATAATTTGTTGTTCAAATAGTCATAACAATT
130 TTATTTTATGACAAAACAAAATACATACGATTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAATT
*** * * * *
14742168 TGAACTTGTTTGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAA
195 TGAACTCACTTGGT-AAAAAAATTATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAA
* * * ** *
14742232 TAAATTTGTATTATTTTATCCAAAATAAGCTTGTATGAATAGATGA-AATCTTTTTATGATAAAA
257 TAAATTAGTATTATTTTATCCAAAATAAGCTTGTATAAATAGA-AACAATCGCTTTATGACAAAA
* * * * *
14742296 CAGAA-GGTTATAGCGATTTCATATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTT
321 CA-AATGGTCATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACGTACTT
* * * * *
14742360 GGTAAAC-AATTTCATTTTTTAAA-TCTCTTAATTATTAA-TTTTCAGAATATTAA-CCACTTAG
385 AGAAAACAAATTT-ATTTATGAAAGT-T-TTAATTATTAACTTTT-AGAATATTAATCAACTTA-
* * *
14742421 TACTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACTGAAA-TAAATT-TTTTATGACAAAACAAAA-G
445 TACTATTTTATTTCAAATAAGCTTAGATAAAC-AAAACT-AATTATTTTATAACAAAACAAAAGG
* * *
14742483 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACAATTTGATC-TAGTTTGATAAGC
508 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTA-TTTGATAAAC
* * * * *
14742547 ATATTTATTTTTAAAATT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTA
572 AGATTCAATTTTAAAATTCTCTTACTCATTAATTGTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * *
14742611 -ATCGAATAAGCTTGTATGAA-T-AGAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTAGAATGATT
637 TATCAAATAAGCTTATATGAACTGA-AACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAGAATGATT
*
14742673 TGAAAT-AATTAATTGC
701 TGAAATGAA-TAATTAC
* * *
14742689 TCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTGATAAGAAGATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGGTTCGAT-A-AACATTTATTTTTTAAATCTCT
14742747 TATTAATTTT
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TATTTTATGACAAAACAAAATACATACGATTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTT
GAACTCACTTGGTAAAAAAATTATTTTTTAAATCTTGTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAA
TTAGTATTATTTTATCCAAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATCGCTTTATGACAAAACAAAT
GGTCATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACGTACTTAGAAAA
CAAATTTATTTATGAAAGTTTTAATTATTAACTTTTAGAATATTAATCAACTTATACTATTTTAT
TTCAAATAAGCTTAGATAAACAAAACTAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
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AATTCTCTTACTCATTAATTGTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATATCAAATAAGCTT
ATATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATGAATAATTA
C
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * ** *
14743060 ATAAGCTTGTAAGATATGAAATA-AA-TATTTTATGACTAAACAAAATATCAGAACAATTTGAAA
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* * * ** ** * * * * **
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* * * * *
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* * * * * ** **
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64 ATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACA-AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * *
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* *
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* * * *
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** * * * * *
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130 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACTGATTTA
* * * * * * * **
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1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
** * * * * *
14743597 AAGCTTGTACT-AATTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAATGATTATAACAATTTTAAGTAG
66 AAGCTTGTA-TGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * *
14743661 ACAATTGCTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACAT-ATTTA
129 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTTGGTAAAC-TGATTTA
** * *
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1 -TTTTTTAAATCTC--TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* ** * * **
14743777 GAATAAGCTTGTATGAGTTGAAACAATTGTTTTATAACCAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAA
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* * * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * ** * **
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* * * ** * ** * * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * **
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* * * * ** * * * *
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* *
14744437 TTTTTTAAATCTCTTA--TA--AATTTTTG-AATATTAA-AAATTAGTTTTATTCTATTTTGAAT
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* * * * *
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* * * * * * * *
14744559 AATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTGAATTGGTTCGGCAAA-TGGATTTA
128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACT-GATTTA
* * *
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* * * * * * *
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* * **
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* *
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* * ** * **
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179 TA
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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190 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTATG
** * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * *
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1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATCTGAA
* * * * * *
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64 -TAAACTTGTATC-AATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAAT
* * * * * **** * * * *
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* * * * ** * * *
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190 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTAATAAGCTTGTATG
* * ** ** *
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254 AATGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * ** * *
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** * * * * * *
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* * * * ** * *
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64 TAAACTTGTATCAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT-ATTTGAAATA
* *
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** * ** * * * * *
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* * ** * * * * *
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251 ATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-
* ** * * ***
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314 TCAAATAGTCA-AATTA-TTTA-AACT---TATTTGG-TAAATA-GATTT--A
* *** * ** * * *
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1 TTTTTTAA--ATCTCT--TA--CTTATTAAT-TTTAAAAT-ATT-AATAAATTAGTA-TTA-TTT
* * * * ** ** **** * * *
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55 T-AA--TCTGA-ATA--AACTTGTATCAATAAAAAAATTGTTTTATGACAA-AACAAAATGT-CA
* * * * * * * * *
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112 TAA-CTAT-T-TGAA-ATAGATAA-T--TGT-T----CAAATAG-TCATAACTATTTGA-ACTTG
* ** * * * * ** ** *
14746953 ATAATTGTTCTCATAG-TCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAAATTTACCTTTT-AAATC
163 -T--TTGGT-AAATAGAT--TTATTTTTTAAATT--TT---T--ACTTA-TTAATTTTTGGAA--
* * * * * * * ** * *** * ** *
14747016 TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTG-AATAATT-TTATATGA
212 TATTAATAA-ATTAGTATTATT-TTATTTTAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTT-T-T--
* ** * *
14747078 ATAGAAACAATTATTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGCTAA-TAGTTCGA
271 AT-G--AC--------------AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAA
** ** * * * * * * *
14747142 ATAAACTTGACTATTTGAACTTGTTTAGTGAACATATTTA
318 ATAGTC-AAATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * * *
14747182 TTTTTAAAAT-TTTTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-GTTTCAA
1 TTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-GA
* * * * * * *
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63 ATAAACTTGTATCAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACTATTTGAAAT
* * *** ** * *
14747309 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACTTAATAAACATATTTAGTTTTTTAAAT
126 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAAT
* * *
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190 -TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTAATAAGCTTGTAT
** * * ** * *
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253 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * ** * *
14747504 AATAAAT-ATAACTATTTGAACATGTTTAGAAAAACATATTTA
317 AAT-AGTCA-AATTATTTAAACTTATTT-GGTAAATAGATTTA
* * ** * *
14747546 TTTTTTAAAT-TTTTACTTATGAATTTTTTTAATATTAATCAATTTA-TATTATTTT-ATTTGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATCTG-A
* * * * * * * * *
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63 ATAAACTTGTATCAATAAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT-ATTTGAAAT
* * * * * * * *
14747672 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTGAGCTTATTCGATAAACAGATTTATTTTCT-AATT
126 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATT
* * * * * * *
14747736 CTCTTACTCATT--TTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAGCTTATTT
191 -T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTAT
* * * ** *
14747799 GAATTGAAACAGTTTTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCA
253 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
14747864 AATAATCATGACTA-TTACAACTTGTTCGGTAAACATATTTA
317 AATAGTCA-AATTATTTA-AACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * **
14747905 TTTTTTAAACCTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAAT-ATTTAATATTATTTTAATCCAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * *
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65 AAACTTGTATCAATAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAACTATTTGAAATAGA
* * * *
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129 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTT
* * * *
14748092 TACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAATTTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTTTATGA
193 TACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * * *
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255 AT-GAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGG-TCA--T-AA-CAATTT-G-AAATAGA-TAA
* * * ** ** * * * **
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310 TTATTCAAATAGTCAAATTATTTAAACTTATTTGGTAA-A-TAGATTTA
* * ** * ** * * * *
14748260 TTTGTATT--AT-T-TTATTTGAAATAAGCTTAGATGAACAGAAAAAAATT--TCTT-TTATGA-
1 TTT-T-TTAAATCTCTTACTT--ATTAATTTTA-A--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
** * * * * * *** * * * * *
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59 CTGAA-TAAA-CTTGTATCAATAAAAAAATTG-T-TTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATT
* * * * * * ** * *
14748375 T-AAATTTG-T--TTAG-TAAACAAAGTC-T-TCTTTTTAAATCTCT-TTATTATTAAT--TTTT
120 TGAAA-TAGATAATT-GTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAA-CT-TGTT-TGGTAAATAGATTT
* ** * * * ** *
14748430 GGATTATTAATAAATTAGTA-TTATT--TTATTTTGAATAAGCTTATATGAATT-GAAACA-ATT
179 --ATT-TT-TTAAATTTTTACTTATTAATT-TTTGGAAT-A--TTA-ATAAATTAGTATTATTTT
* ** ** * ** * *** * * ** *
14748490 CTTTT-ATGACA-AATCAAAGGGTCATAACAATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATTGTCATGA
235 ATTTTAAT-A-AGCTTGTATGAATGA-AACAATTGTTTTAT-GACAA--A-ACAAAAGGTCATAA
** * * ** * ** * ** ** *
14748552 TTATTTG--ATCGAGT--GTGGTAAACATA-T-TTATTTTTTTTACTTATTAATTATCAAA-ATA
293 CAATTTGAAATAGA-TAATTATTCAA-ATAGTCAAATTATTTAAACTTATT--TGGT-AAATAGA
*
14748610 TTAA
353 TTTA
*** * * * * * * * * * ***
14748614 TAAATTAGCATTATTTTAATCCATATAAGCTTGTATGAATA--AAAACAATT-GTTTTATAACAA
1 TTTTTTA--AATCTCTTACT-TAT-TAA--TTTTA-AAATATTAATA-AATTAGTATTAT-TTTA
* * * * ** * *
14748676 AAC--AA-AAAGTCATAATGATTTGAA-ATAAATAATTGCTTAAATAGTA-ATAAC--TAT-T--
57 ATCTGAATAAA--C-T--TG-TATCAATA-AAAAAATTG-TTTTAT-G-ACAAAACAAAATGTCA
* * * * * * * *
14748731 TGAACTAGTTTGATACATAGATTTATTTTTTAAATCACTTATTAA-TTTTTGAA-AT-ATT-G--
112 T-AACTA-TTTGA-A-ATAGA-TAATTGTTCAAAT-AGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTA
* * * * * * ** * * *
14748790 -ATAGA-TTA-GTATT-ACTTTATTTC-AAATAA-ACTT---ATATGAACAAA--A--A-CA-TT
170 AATAGATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * ** ** * * * * **
14748840 TGTTTT-ATGA-C--AAAACAA--AAACATTTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTAATAATGATTT
234 TATTTTAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * * * *
14748899 GAAATATATAATTGTTTAAATAGT-ATAATTTTTTAAAC-TAGTTAGGTAAACAAAATTA
299 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATTATTTAAACTTA-TTTGGTAAATAGATTTA
* * * **
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1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATCTGAA
* * * * * * * * * *
14749021 TAAGCTAGTATGAATTGAGAAAATTCTTTTATGACAAGACAAAAGGTCATAACAATTTGAAGTAG
64 TAAACTTGTATCAA-TAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAG
* * ** * * * *
14749086 ATAATTGTTCAAACAGTCCTAACTATTTGAA-TTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCC
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-T
** * * * *
14749150 CCTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
191 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-AATAAGCTTGTATGA
* ** * * * * * *
14749215 ATAGAAAGAATTGTTTTATGACTTAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATAGAATTGTTCAAA
255 AT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * ** * *
14749280 TAGTCATAACTATTTGAACCGATTCGATAAATAGATTCT-
319 TAGTCA-AATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATT-TA
* * * * * * *
14749319 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTCATAAATTATTATTATTGTATTCTAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * * * * *
14749384 CAGCTTGCAT-AATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAG
65 AAACTTGTATCAAT-AAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAG
* * * ** * * * * **
14749448 ATAATTGTTGAAAT-GACCATAATTATTTGAACTAATTCGGCAAGTAGATTCACCTTTTAAA---
128 ATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTT
* * * * *
14749509 TCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TAATTATTTTCTTTTGAATAGGCTTTTATGA
192 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTT-AATAAGCTTGTATGA
* * * * * * *
14749573 ACTTAGACAACTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAA
255 A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
** * * * * *
14749638 TAGTCATAACAATCTGAATTTGTTTGGTAAACA-A--T-
319 TAGTCA-AATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * ** ** * * *
14749673 TTTTTTAAA-CTCCTATTTGTT--TTTT----TTTTTTTGGATAAGCT-TT-TATGAAT-TGAA-
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTAATCTGAAT
* * * *
14749727 ACAA-TTGTTTTATGTCAA-AACAAAAGGTCATAACGATTTTAT-ATAAATAATTGTTTAAAAAG
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* * * * * * * * * * * * * * *
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109 TCATAACTATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA
** ** * * * *
14749847 TA-ATTTTCCAAATGTTCATAAATTTGGA-TTATT--TTTTTCGAATAAGTTTGTAAGACATGAA
172 TAGA-TTT----AT-TTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT-A---T-TAATAAAT--T
* * * * * *** * ** * *** * * * *
14749908 AGAAATATTTTA--TGACTAAAC-AAAAGGTTTG-AACGATTTGAAGTA-GATAATTATTCTAAT
224 AGTATTATTTTATTTTAATAAGCTTGTATGAATGAAAC-AATTGTTTTATGACAA--A-ACAAAA
* ** * * * * * **
14749968 TGTTTTAACTATTTGAACTAG-T--TTA-GCAAATA--CATTTATTTTTTAAA--TATCTTATTA
285 GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA--AATTATTTAAACTTAT-TTGGTA
* *
14750025 ATTTTTAGA-ATA
347 A---ATAGATTTA
* * * * * * ** * * * * * *
14750037 -TTATTAAATTAATATTA-TTTTTAA-CTGAATAAGCTT-CTATGATTAGAAACTATTGTT-TTA
1 TTTTTTAAA-T-CTCTTACTTATTAATTTTAA-AATATTAATA-AATTAG-TATTATT-TTAATC
** * * *** * * * * *
14750097 TGACA-AAACAAAGATTTTAATGATTTGAGATTG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-T-ATTT
60 TGA-ATAAAC-TTG-TATCAAT-A-AAAAAATTGTTTTA-TG-ACAAA-A--CAAAATGTCA--T
* * * * *
14750158 GAACTGGTTTGGTAAACAG---A-T-TT--AAT-GT-TTAA--ATC-----------GGTAAACA
113 -AACT-ATTT-G-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATA
* * * * *
14750201 AATTTTATTTTTTAAATCGCTTT-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA
174 GA-TTTATTTTTTAAAT--TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * *
14750265 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAATGTTTTATAACTAAACAAATGGTCAAAACGATTT
236 TTTT-AATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* ** * * ** * * * * * *
14750330 GAAATATATAATTATTGTAATAATCTTAACCATTTGAAA-TGA-TTGATTAAAAAAAAATTC
299 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-AAATTATTT-AAACTTATTTG-GT-AAATAGATTTA
* * *
14750390 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTTTAAATATT-ATGAAATTAGTATTATTTTAATATGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATCTGAA
* * * * *
14750454 TAACCTTGTA-C-ATACAAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
64 TAAACTTGTATCAATA-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATA
** * *** * ** * * * * *
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127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATT
** * * * * * ** *
14750581 TCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTTGCATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTAT-
191 T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTATG
* * * * ** **
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254 A-AT-GAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACA-AA-AGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
* * ** * ** *
14750707 TCAAATAGTTAAAACTATTTGAAA-TGGTTTGGCAAGCATATTTA
314 TCAAATAG-TCAAATTATTT-AAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * * *
14750751 CTTTTTAAAACTGTTACTAATTAATTTCCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCCA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT--TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-GA
* * * * * * *
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63 ATAAACTTGTATCAA-TAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAAT
* * * * * * *
14750868 A-AT-A--GTT-ATAAT--T--T---T-TTTTAA-TGGGTTTCGTAAGTAGAATAATTTTGTAAA
126 AGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * * * *
14750919 --TCT-CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATTCTGAATAAGCTTTCTA
189 TTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTAATAAGC-TTGTA
* * * * * * *
14750981 TGAGCTTAAATAATTGTTTCATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAAATT-TT
252 TGA-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT-AATTATT
* * * * * * * **
14751045 TATATAGTCTTAATTGTTT-GA---A-TTGGTTCAACA-AACTA
315 CAAATAGTC-AAATTATTTAAACTTATTTGG-TAAATAGATTTA
* * * * * * *
14751083 TTTTTTAAATATCGTAGTTATTAATTTTCAGAATATTACAAAAATTATTATTATTTT-ATTTCGA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTAATCT-GA
* * * * * * ** * *
14751147 ATAAGCTTGTTTGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAGA-GTAATGGTTATAACAATTTGAAAT
63 ATAAACTTGTATCAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAACTATTTGAAAT
* * * ****
14751210 AGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGATCAACAAATAGATTTCA-TTTTTAAA-
126 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT-ATTTTTTAAAT
* * * * * * * * *
14751273 -TCT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTGGCATTATTTTATTTAGAAAAATCTTGTTTG
190 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTATG
* * ** * ** * * * *
14751336 -TTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTAAAATAGATAGTTGTTTA
254 AATG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
14751400 AATGGCCATGATTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACTA-ATTTA
317 AATAGTCA-AATTATTTAAACTT-ATTTGGTAAA-TAGATTTA
** * * * *
14751441 TTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * *
14751506 AAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAA-TGATTTTAAATA
65 AAACTTGTATCAA-TAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAACT-ATTTGAAATA
* * ***
14751569 GATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATC
127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAAT-
** * * * **
14751634 TCATGCTTATTAATTTTTAGAATGA-CAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT
190 TTTTACTTATTAATTTTTGGAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
14751698 GAACTGAAAAAATTATTGTATGACTAAGCAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
253 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * ** * ***
14751763 AATAGTCTTAACTATTTTAA-TTGATTCAGCAAACCCATTTA
317 AATAGTC-AAATTATTTAAACTT-ATTTGGTAAATAGATTTA
* * *
14751804 TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTATCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCTGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * * * *
14751865 AAGCTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGAT-T-ATAACGATTTGAGATT
65 AAACTTGTATCA-ATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAACTATTTGAAATA
* * ** * * * *
14751928 GAT-A---TT----T-GT--T--C-ATTTGATCTAGTTTAATAAACATATAT-TTTTTTAAAATT
127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTT
* * ** * * *** *
14751978 TTGCTTATCAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTAATCCGAATAAGCATGTATGAA
192 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * ** * **
14752043 CAGAATCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAAT
256 -TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * *
14752108 -GTTATAACTATTTGAAC-CAGTTTGATAAATAGATTTA
320 AGTCA-AATTATTTAAACTTA-TTTGGTAAATAGATTTA
** * ** *
14752145 TTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATATTGGAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTCCAAAC
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * *
14752205 AAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAG
65 AAACTTGTATCAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT-ATTTGAAATAG
* * * *
14752269 ATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA-TTGATTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCT
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-T
* * * * * * ** *
14752333 CTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATTATTTCA-TTTTATTTTATTCCAAATGAGCTAT-TAT
191 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TTAATAAGCT-TGTAT
* * * *
14752396 GAATTCCAAA-AACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTT
253 GAA-T-GAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * * * *
14752460 TATATAGTCTTAAA-TATTTGAA-TTGGTTTTGCAAACAAATTTA
315 CAAATAGTC--AAATTATTTAAACTT-ATTTGGTAAATAGATTTA
* * * ** *
14752503 TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTTGAATATTATTAGATTAGTGTTATTCTATTATTTTA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA--TTTT-AA-AATATTA-A-TA-AATTA--GTATTATTTTA
* ** * ** * * * ** *
14752568 TTCAAAATAAGCTTACATGAATAGAAGCAAA-TGTTTTATGAGAAAACAAGTTG-CATAA-TGTT
57 ATCTGAATAAACTTGTATCAATA-AA-AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT-AT
* * * ** * *
14752630 TTAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACATG-TTCATAACA-AGAGTCATTT
119 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAA-ATAGATTTATTT
* ** * * * *
14752693 TTT--ATTCTCTTTCTCGTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCAAAGAA
183 TTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAA
* * * * ** **
14752756 GCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAAGGTCGCAATGATTTGAAATAGAT
245 GCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * *
14752821 AATTATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACTTGTTTGGAAAACATATTTA
308 AATTATTCAAATAGTCA-AATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * *
14752871 TTTTTTAAATGT-TCTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATT-TTGTTAATCAGA
1 TTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTAATCTGA
* * * * * * * * * *
14752934 ATAAGCATGTATGACA-GAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATACCAATTTGAAATA
63 ATAAACTTGTATCA-ATAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATA
* * ** * * *
14752998 AATAATTTTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAATTTTTTGGTTAATAGATTTATTTTTTAAAATC
127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAAT-
* **
14753063 TTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTA
190 TTTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTAATAAGCTTGTA
* ** * * *** * *
14753126 TGAATAGAAAAAAATCATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATT-GT
252 TGAAT-G-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * *
14753190 CAAAATAGTCAAAATTATTTAAACTT-GTTCGCAAACATATTCA
315 C-AAATAGTC-AAATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * *
14753233 TTTTTTAAATCTCTTAAC-TATTAATTTTCATAATATTAATAACTTAGTATTATTTT-ATTTCGA
1 TTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-GA
* * * * * *
14753296 ATAAGCTTATATGAATTGAAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATA
63 ATAAACTTGTATCAA-TAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATA
* * * * * ** * * * *
14753360 GATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCTAGTTCAGTAAACATATTTACTTTTAAAATTT
127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TT
* ** * * * * * * * *
14753425 TTTATTTATTAATGGTCGAAATAATAATAAATCAGTATTATCTTAACTTGAATAAGCTTGTATAA
191 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTTAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * **
14753490 ATAGAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAAATGCTT-AA
255 AT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT-AATTATTCAA
* * * *
14753554 ATAGTCAAAACTAGTTGAAC-TAGTTTGATAAATAGATTTTA
318 ATAGTC-AAATTATTTAAACTTA-TTTGGTAAATAGA-TTTA
* * * * *
14753595 TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA---T--AATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATA
* * * ** * * *
14753651 AACTTATATGAACAAAAACTTTTGTTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTGAAAGTAGA
66 AACTTGTATCAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAA-TAGA
* * * * * * **
14753715 TAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAATTGTTTTTTAAATCTCG
129 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTT
* * * * * * ** *
14753780 CATTTATTGATTTTTGAAACATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAA
193 TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TTAATAAGCTTGTATGAA
* * * ** *
14753844 TTCAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAT
256 -T-GAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* **** * *
14753909 ATAGTCTTTAAA-TATTTGAAC-TAGTTCAACAAACAAATTTA
318 ATAGTC---AAATTATTTAAACTTA-TTTGGTAAATAGATTTA
* * ** * * **
14753950 TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * * * * * **
14754015 AAACTTGTATAAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTTTA
65 AAACTTGTATCAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGA
* * * * * *
14754080 CAATTGTTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAACTAGTTTAGTAAACAAATTTA--TTTTAAA--TCT
129 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTT
* * * * ** * *
14754139 -CTTATTGATTTTTGAAAGATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCGAATACG-TTGGAATG-AT
194 ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTAATAAGCTT-GTATGAAT
* * * * * * *
14754201 GAAAAACAATTATTATCTAACCAAACAAAAGATCAT-A-ATTTTCGATAAATAGATAATTATTCA
257 G--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-G--AAATAGATAATTATTCA
* * * * * ** * *
14754264 TATACTCTTAATTGTTTGAAC-TATTCAGCAAATGGATTTA
317 AATAGTC-AAATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * * **
14754304 TTTTTTAAATCTCCTT-CTTATCAAATTTTGAAATAATATTAAATTAGTATT-TTTTATTCCAAA
1 TTTTTTAAATCT-CTTACTTAT-TAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAA
* * * * * * * * * * * *
14754367 TAAGCTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAACAT
64 TAAACTTGTATCAA-TAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAG
* ** * * *
14754432 ATAATTGTTCAAATAG------------GAACTAGTTCAGTAAATATAATTATTTTTTAAATCTC
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TT
* * *
14754485 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-A
192 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-AATAAGCTTGTATGAA
* * **
14754549 TGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTTGTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
256 TG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * **
14754614 AT-GACCATAATTATTTGAA-TCGATTTGATAAATTGACCTA
318 ATAG-TCA-AATTATTTAAACT-TATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * * * *
14754654 TTTTTTAAATCAT-TAACTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-ATTTCAT
1 TTTTTTAAATC-TCTTACTTATTA-ATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGA-
* * * * * * * * * **
14754717 ATAAGCTTTTATGAATTGAGACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-AAAT
63 ATAAACTTGTATCAA-TAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATT-TGAAAT
* * **
14754781 AGATAATTGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAT-GATTTATTTTTTAAATT
126 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATT
* * ** * *
14754845 TCTTGCTTATTAATTTTCT-TAATGCTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTAT
191 T-TTACTTATTAATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-AATAAGCTTGTAT
* * * * * * ** * *
14754909 GAACTAAAACTATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCT
253 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * ** *** * *
14754974 AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACACATTTA
317 AATAGTC-AAATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * * ** * * *
14755015 TTTTTTAAATCTCTTTCTTATT-TTTTTAGAATATTATTAATTTAACAATATTTTACTCTAAATA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATA
* * * * * * *
14755079 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAGA-G-CATAACAATTTGAGATAAA
66 AACTTGTATCAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAACTATTTGAAATAGA
* * ** * * * * * *
14755142 TAATTGTTTAAATAGTCATAAGTATTTGAACAAGTTCGATAAACAGATTTAATTCTTAAA--TCT
129 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTT
* **
14755205 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATA
194 ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-AATAAGCTTGTATGAAT-
*** * * * *** *
14755269 GAAACAAACATTTTACGACAAACCAAAATGTCATAATGGTTTGAAATAAAT-ATTAATTCAAATA
257 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATA
** * * * * *
14755333 AACATGACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAAATTTA
321 GTCA-AATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
** * * * *
14755370 TTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-GAA
* * * * *
14755434 TAAAATTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCA-AAATGGTTTGAAAT
64 TAAACTTGTATCAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACT-ATTTGAAAT
* * ** * * * ** * * *
14755497 AAAT-ATTGTTCGAAGGGTCATAACTATTTGAACTCGCTCGACAAACATATTTATTATTTAAATC
126 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-
* * * *
14755561 TTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATG
190 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTATG
* * * * *
14755626 AGTAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCGA
254 AAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * ** * * *
14755691 ATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAACATATTTA
318 ATAGTCA-AATTATTTAAACT-TATTTGGTAAATAGATTTA
* * ** * *
14755731 TTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTA-TTTCATTTGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATCTG-A
* * * * ** * *
14755793 ATAAGCTTGCATGAACAGAACCAA-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGTTTTGAAAT
63 ATAAACTTGTATCAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACT-ATTTGAAAT
* * * * * * *
14755856 AGATAACTATTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGATAAATAGATTAATTTTTT-AATT
126 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATT
* * * *
14755920 CTCTTA-TTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATA
191 -T-TTACTT-ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTA
* * * * ** * *
14755984 TGAACTAAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAAAAAATTATTC
252 TGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * *
14756049 AAATACTCATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAACATATTTA
316 AAATAGTCA-AATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * **
14756091 TTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAATTTAATATT-TGTTTAATCCAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-T-AAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTAATCTGA
* * * * *
14756154 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
63 ATAAACTTGTATCAATAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATA
* ** * ** * * *
14756219 AATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAATTTGTTCAGTAAATAAAATTATTTTTTAGATCT
127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-T
* *
14756284 TTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTAT
191 TTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
14756347 GAATAGAAAAAATTCATTTTATGATAAAAC-ATA-G---T---GATTTCAAATAAATAATTATTC
253 GAAT-GAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * *
14756404 AAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAACAAATTCA
316 AAATAGTCA-AATTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTTA
* * * * * * *
14756446 --TTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACTTACTATTATTTTATTTTGAGT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * ** * * *
14756509 AAGCTTATATGAACCAAAATGATT-TTCTAATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
65 AAACTTGTATCAA-TAAAAAAATTGTT-TTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAG
* * * * * ** *** ** * *
14756572 ATACTTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAATTCAATAAGCATATTTATTTTTAAAATTTT
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TTT
* * * * * *
14756637 TTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATCAATTGGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA
192 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
14756702 -CAAAAATTATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATTA-ATAATTGCTT-A
256 TGAAACA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATT-ATTCA
* * * * *
14756764 AATAGTCATAACTGTTTGAAC-TAGTTTGATAAACAGATTTA
317 AATAGTCA-AATTATTTAAACTTA-TTTGGTAAATAGATTTA
* * * *
14756805 TTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAATATTTGAAATATTAATAGATTAGTATTCTTTTATTC-GAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTG-AA
* * * * * *
14756865 CAAACTTATATGAACAAAAACATT-TGTTTATGACAAAACAAAAAGTC---A-TA---G---T-G
64 TAAACTTGTATCAATAAAAAAATTGT-TTTATGACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAG
* * * * *
14756918 ---A-TGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATTC
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATT-
* * ** * * *
14756978 CTTACATATTAATTTTT-TTATATGAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAT-TAT
191 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT-TAATAAGCT-TGTAT
* * **
14757040 GAATTGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-AAAA--T--T---GATTTGAAATAGATTGTTTTAT
253 GAA-TG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-T-AATTAT
* * * *
14757097 GACAAA-AG-AAAATTGATTTGAAA--TA---GAT-AACAG-TTCCTA
314 -TCAAATAGTCAAATT-ATTT-AAACTTATTTGGTAAATAGATT--TA
* * * * **** ** *
14757136 TATTCTT-AA-CTATTGACACTAGTTTAGGAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTATTAA
1 T-TTTTTAAATCTCTT-AC-TTA-TTAATTTTA-AAA--TA-TTAATAAA--T-T-AG-TATTAT
* * * ** ** * *
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53 TTTAATCTGAATA-AACTTGTATCAATAAAAAAATTGTT-TTATGACA-AAAC----A--AA-AT
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* * * *
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* * * *
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* *
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*
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* * *
14745998 ATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAACAAATTTATGTTTTAAATTTTTT
444 ATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGT-TT-GGAAAACAAATTTATGTTTTAAATCTTTT
* *
14746062 GCTTATTCATTGTT-AGAATATTAATAA
507 ACTTATTAATT-TTGA-AATATTAATAA
* * * * ** * * *
14746089 A-T-TTATATTATTTTATTCCAATTACACTTGTACGAA-TATAAACAATTATTTTATGACACAAC
1 AGTATTATTTTATTTTA-T---ATAAGA-TTTTATAAACTA-AAACAACTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * ***
14746151 AAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTATTTAAAAAGTCATAACCATTTGAACTTATCCA
60 AAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACTACTTAAACTTATTTG
* * * * * * * * ** *
14746215 ATAAATCGATTCA-TATTTTATATCTCTTACTCATTAACTTTTGGAATATTAATAAATTAGTTTT
124 GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
** ** * * * * ** **
14746279 ATTTTATTCCAAATAAGCCTATATAAATTA-ATACAATTTTTTTACAATGAAACAAAAGGTCATA
189 ATTTTATTATAAATAAGGTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATA
* * * * *
14746343 GCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CTATGACTATTTAAACTTA-TTCAGTAAACATAT
252 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAATA-AT
* * * * *** * *
14746406 TTATTTTGAAAATATTTTACTTTTTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAGTTCG
314 TTATTTT--TAA-A-TCT-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * * * ** ** *
14746471 AATAAACTTGTGTGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAATCGTTA-TGATTTGAAA
374 AATAAGCTTATATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACT-ATTTGAAA
*
14746535 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
438 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
14746560 CTAATTCGAC
Statistics
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AGTATTATTTTATTTTATATAAGATTTTATAAACTAAAACAACTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
TCATAACAACTTTAAATAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACTACTTAAACTTATTTGGTAAATA
GATTTATTTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
TATAAATAAGGTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGA
AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAATTTATTTTTAAAT
CTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGATC
AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
GTCATAATTATTTGAACTGTTTGGAAAACAAATTTATGTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTG
AAATATTAATAA
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14746651 TTTTGTGAAC
* * *
14746661 TGAAACAATTATTTTATG-TTAAAACAAAAAGTTATAACGATTTTAAATAGATAATTGTATAAAT
1 TGAAACAATTATTTTATGACT-AAACAAAAAGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTATAAAT
* * *
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1 TGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATT
14746781 ATTCTAATAG
Statistics
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TGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTATAAAT
Found at i:14747451 original size:363 final size:360
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14746717 GTATAAATTG
* * * * **
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* * * * *
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* * * * * **
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* * * * ** *
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* * ** *
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* *
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* * *
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* * *
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* ** * * *
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* * * *
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194 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * * *
14747341 ACTCACTT-AATAAACATATTTAGTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATA
259 ACTTA-TTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
*
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322 AATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTTTATGAATAA
** * * * *
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1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGCTAATTATTCAAATAAA
* * * * *
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** * * * *
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129 AGAATATTAAT-AATTTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATACAAA-CAATTGTT
* * * *** * * *
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192 TTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
14747702 GAGCTTATTCGATAAACAGATTTATTTTCTAATTCTCTTACTCATT--TTTTTAGAATATTAATA
257 AAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
* * * **
14747765 AATTAATATTATTTTATTTCAAACAAGCTTATT-TGAATTG
322 AATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTT-TTATGAATAA
* * * * *
14747805 AAACAGTTTTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAAT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGCTAATTATTCAAATAAA
* * ** * ** *
14747870 CATGACTATTACAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAACCTTTTACTTATTAATTGTTA
66 CTTAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * *
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* * *
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259 ACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATA
* *
14748119 ATTTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTTTATGAATAGA
322 AATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTTTATGAATA-A
*
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1 AAACAATTATTTTA
14748173 CTTCAAAACA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGCTAATTATTCAAATAAA
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AGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTTTATGAATAA
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* * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * *** * * *
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* * **
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** * * ** *
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* * * * * * *
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124 TTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACGAGTGTGATAAACAGATTTATTT
* * ** * * * * *
14748585 TTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTAATCCATATAAGCTTGTAT
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* ** *
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* * * *
14748714 AAATAGTAATAACTATTTGAACTAGTTTGATACATAGATTTATTT
130 AAATAGTAATAACTATTTGAACGAGTGTGATAAACAGATTTATTT
* * * *
14748759 TTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTGATAGATTAGTATTACTTTATTTCAAATAAACTTA
1 TTT---TCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
* *
14748824 TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAA
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14748861 CATTTGTTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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185 1 0.00
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14748818 AACTTATATG
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14748853 AACAAAAACATTTGTTTTATGACAA
1 AACAAAAACATTTGTTTTATGACAA
*
14748878 AATAAAAA
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14748886 GTAATAATGA
Statistics
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AACAAAAACATTTGTTTTATGACAA
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14748890 TAATGATTTG
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*
14748916 AAATAGTATAATTTTTT
1 AAATAGTATAATTGTTT
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1 AAA-TAGT
14748941 TAGGTAAACA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAGTATAATTGTTT
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14748849 ACAAAACAAA
* * * * ** * *
14748859 AACATTTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTAATAATGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGT-
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
14749169 AATATTATTATATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGA-
129 AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAG
* * * * * * *
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** * * * *
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* * * * * ** *
14749348 GAAAGATTCATAAATTATTATTATTGTATTCTAAATCAGCTTGCAT-AATCAAA
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* * * * *
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* * * ** * * **
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* * * * *
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* * * *
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* *
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65 ATAACTATTTGAATT
14749658 TGTTTGGTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TATTAATAAATTATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAG
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14750158 GAACTGGTTT
*
14750168 GGTAAACAGA-TTTAATGTTTAAATC
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* *
14750193 GGTAAACAAATTTTATTTTTTAAATC
1 GGTAAACAAATTTTAATGTTTAAATC
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1 G
14750220 CTTTCTTATT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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14750912 TTGTAAATCT
* * * * * * *
14750922 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTA-TTCTGAATAAGCTTTCTATGAGC
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* * * * * * * * *
14750986 TTAAATAATTGTTTCATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAAATT-TTTATAT
63 TGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAAT
* * * * * * *
14751050 AGTCTTAATTGTTTGAA-TTGGTTCAACAAAC-----TATTTTTTAAATATCGTA
127 AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
14751099 GTTATTAATTTTCAGAATATTACAAAAATTATTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTTTGAAC-
1 CTTATTAATTTT-TGAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * ** * * *
14751163 AAAAACAATTGTTTTATGA-TAGAGTAATGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
64 GAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
14751227 ATCATAACTATTTGAACTGGA-TCAACAAATAGATTTCA-TTTTTAAA--TC-T-
128 GTCATAACTATTTGAACT-TATTCAATAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
14751276 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTGGCATTATTTTATTT-AGAAAAATCTTGTTTG--TT
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAACT
* ** * * * * *
14751338 GAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTAAAATAGATAGTTGTTTAAAT
64 G-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *** *
14751403 GGCCATGATTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTG
127 AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * *** *
14751457 TTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-
1 CTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * *
14751521 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTAAAATAG
65 AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
14751586 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCATG
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTA
* *
14751639 CTTATTAATTTTTAGAATGA-CAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACT
1 CTTATTAATTTTT-GAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
14751703 GAAAAAATTATTGTATGACTAAGCAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
64 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** **
14751768 TCTTAACTATTTTAA-TTGATTCAGCAAACCCATTTATTTTTTAAA--TC-T-
129 TCATAACTATTTGAACTT-ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
*** * * *
14751816 CTTATTAATTATCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATAAGCTTGTATGATA-
1 CTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA-AC
** * * * * * *
14751879 AAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATTATAACGATTTGAGATTGATATTTGTTC--AT
63 TGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
14751941 -TTGAT--CTA---G----T-TT-AATAAACATATATT-TTTTTAAAAT-T-TTG
127 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * * * * *
14751981 CTTATCAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTAATCCGAATAAGCATGTATGAACAG
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
** * * * * * *
14752046 AATCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAAT-GT
65 AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** *
14752110 TATAACTATTTGAAC-CAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT-
130 CATAACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
14752158 -TTATTAATATTGGAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAAC--
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
*
14752219 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 AAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
14752284 ATCATAATTATTTGAA-TTGATT-AGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA
128 GTCATAACTATTTGAACTT-ATTCA-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
14752337 TTTATTAATTTTTGAAATATTAATTATTTCA-TTTTATTTTATTCCAAATGAGCTAT-TATGAAT
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATGAAC
* * * * * * *
14752400 TCCAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTTATAT
63 T-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * **** * *
14752465 AGTCTTAAATATTTGAA-TTGGTTTTGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTA
127 AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * **
14752519 GTTATTAATTTTTTGAATATTATTAGATTAGTGTTATTCTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTAC
1 CTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTA--G-TA-T-TATT-TTAT-TTC-AAATAAGCTTGT
* * * * * *
14752584 ATGAA-TAGAAGCAAA-TGTTTTATGAGAAAAC--AAGTTGCATAATGTTTTAAAATAGATAATT
57 ATGAACT-GAA-AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * *
14752645 GTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTC-AT-AACAAGAGTCATTTTTT-ATTCTCTTT
119 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * * *
14752705 CTCGTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCAAAGAAGCTTATATGAACT-
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * ** * *
14752769 AAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAAGGTCGCAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
65 AAAA-AATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * *
14752834 GTTATGACTAGTTGAACTTGTTTGGA-AAACATATTTATTTTTTAAATGT-TCTA
128 GTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TA
* * * *
14752887 CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATT-TTGTTA-ATCAGAATAAGCATGTATG-AC
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * * * * *
14752949 AGAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATACCAATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATA
63 TGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * *** * * *
14753014 GTCATAAAGATTTGAAATTTTTTGGTTAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTA
128 GTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTA
*
14753068 CTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAA-
1 CTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAC
** * * ** *
14753130 TAGAAAAAAATCATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTG-TCAAA
63 T-G-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AA
* * * * ** * *
14753194 ATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTC-GCAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTAA
125 ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-A
* * * *
14753250 C-TATTAATTTTCAT-AATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATT
1 CTTATTAATTTT--TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * *
14753313 GAAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
64 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
14753377 TTATGACTATTTGATC-TAGTTCAGTAAACATATTTACTTTTAAAATTTTTTA
129 TCATAACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * * * * * *
14753429 TTTATTAATGGTCGAAATAATAATAAATCAGTATTATCTTAACTT-GAATAAGCTTGTAT-AAAT
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * * *
14753492 AGAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAAATGCTT-AAAT
64 -GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAAT
* * ** *
14753556 AGTCAAAACTAGTTGAAC-TAGTTTGATAAATAGATTTTATTTTTTAAA--TC-T-
127 AGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * * *
14753607 CTTATTAA----T-AATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTATATGAAC--A
1 CTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGA
* *
14753665 AAAACTTTTGTTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTGAAAGTAGATAATTGTTCAAATA
66 AAAA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * * * * **
14753729 ATCATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAATAGAATTGTTTTTTAAATCTCGCA
128 GTCATAACTATTTGAACTTATTCA-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
14753782 TTTATTGATTTTTGAAACATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATT
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
14753846 CAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATAT
64 -GAAAAAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
14753911 AGTCTTTAAATATTTGAAC-TAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTA
127 AGTC-ATAACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
14753966 GTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATAAAC-A
1 CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * ** *
14754030 AAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAG
65 AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
14754095 TCAT-A-TATTTGAAC-TAGTTTAGTAAACAAATTTA--TTTTAAA--TC-T-
129 TCATAACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
14754139 CTTATTGATTTTTGAAAGATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCGAATACG-TTGGAATG-A-T
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAACT
* * * * * * * *
14754201 GAAAAACAATTATTATCTAACCAAACAAAAGATCATAA--TTTTCGATAAATAGATAATTATTCA
64 G-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-G--AAATAGATAATTGTTCA
* * * * * ** **
14754264 TATACTCTTAATTGTTTGAAC-TATTCAGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCCTT-
124 AATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTA
* * * * * *
14754320 CTTATCAAATTTTGAAATAATATTAAATTAGTATT-TTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACT-
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * * *
14754383 AAAACAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAACATATAATTGTTCAAATAG
65 AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
14754448 ---GAACTA---G------TTCAGTAAATATAATTATTTTTTAAATCTCCTA
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** *
14754488 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-A-TG
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* ** * *
14754551 AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTTGTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
65 -AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * ** ** ** *
14754616 -GACCATAATTATTTGAA-TCGATTTGATAAATTGACCTATTTTTTAAATCAT-TAA
127 AG-TCATAACTATTTGAACT-TATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTA
* * * * * *
14754670 CTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCATATAAGCTTTTATGAATTG
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * ***
14754735 AGACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTCT-AAATAGATAATTGTTCAAATAG
65 AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
14754799 TTATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA-TGATTTATTTTTTAAATTTCTTG
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * ** *
14754850 CTTATTAATTTTCTTAATGCTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACT-
1 CTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * * *
14754914 AAAACTATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
65 AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * *
14754979 TCTTAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTT
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * *
14755031 CTTATT--TTTTTAGAATATTATTAATTTAACAATATTTTA-CTCTAAATAAGCTTGTATGAAC-
1 CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
14755092 AAAAACAATTGTTTTATTACAAAAC-AAAGAG-CATAACAATTTGAGATAAATAATTGTTTAAAT
64 GAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
14755155 AGTCATAAGTATTTGAAC-AAGTTCGATAAACAGATTTAATTCTTAAA--TC-T-
127 AGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** **
14755205 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TA
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-
** * * * * * * *
14755269 GAAACAAA-CATTTTACGACAAACCAAAATGTCATAATGGTTTGAAATAAAT-ATTAATTCAAAT
64 GAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAAT
** * ** * * **
14755332 AAACATGACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCAA
127 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** *
14755386 CCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTAT-AAATA
1 CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-
* * * * * * * **
14755450 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAAAATGGTTTGAAATAAAT-ATTGTTCGAAGGG
64 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
*** * * * * *
14755514 TCATAACTATTTGAACTCGCTCGACAAACATATTTATTATTTAAATCTTTTA
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *
14755566 CTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATG-AGTA
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-
* * * * *
14755630 GAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCGAATAG
64 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
14755695 TCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-AAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTA
129 TCATAACTATTTGAACT-TATTCA-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
14755746 CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTCATTTGAAATAAGCTTGCATGAACA
1 CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
** * * * * *
14755810 GAACCAA-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAACTATTCAGATAG
64 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
14755874 TCATAACTATTTGAACATGTTCGATAAATAGATTAATTTTTTAATTCTCTTA
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* *
14755926 -TTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACT
1 CTT-ATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
14755990 -AAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATA
64 GAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * *
14756054 CTCATGACTATTTGAACTTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
128 GTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * * * *
14756107 CTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAATTTAATATT-TGTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC
1 CTTATTAATTT-T-TGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
* * *
14756170 -AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
63 TGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * * * * * * * *
14756234 AGTCATAAAGATTTGAATTTGTTCAGTAAATAAAATTATTTTTTAGATCTTTTA
127 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* *
14756288 CTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-T
1 CTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
14756351 AGAAAAAATTCATTTTATGATAAAAC-ATA-G---T---GATTTCAAATAAATAATTATTCAAAT
64 -GAAAAAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * ** * *
14756408 AGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAACAAATTCA--TTTTAAATCTCTTA
127 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * ** * * *
14756460 ATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACTTACTATTATTTTATTTTGAGTAAGCTTATATGAAC-C
1 CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * *
14756524 AAAATGATT-TTCTAATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATACTTATTCAAATA
65 AAAA-AATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
14756587 GTCATGATTATTTGATCTAATTCAATAAGCATATTTATTTTTAAAATTTTTTA
128 GTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
14756640 CTTATTAATTGTTGAAATATTAATCAATTGGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTATGAAC-
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
14756703 -AAAAATTATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATTA-ATAATTGCTT-AA
64 GAAAAA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTG-TTCAA
* **
14756765 ATAGTCATAACTGTTTGAAC-TAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA--T-TT-
125 ATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
14756817 CTTATTAATATTTGAAATATTAATAGATTAGTATTCTTTTA-TTCGAAACAAACTTATATGAAC-
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACT
* ** * * *
14756880 -AAAAACATT-TGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGTGATGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
64 GAAAAA-ATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT-TTGAAATAG--ATAATT-GTTC
* * * * * * * ** * * * *** *
14756943 AATTAGTTAGGTAAACAAAATT--ATTTTTTAAATTCCTTACATATTAATTTTTTTATATGAATA
123 AAATAGTCA--T-AAC-TATTTGAACTTATTCAA-T--AAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTT
14757006 A
180 A
* * * * ** * ** * *
14757007 ATTCATTTTATTTTATTTCGAATAAGCTATTATGAATTGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAAAA
1 CTT-A--TTA-ATT-TTT-GAAT-A--T-TAATAAATT----AGTATTATTTTATTTCAAATAAG
* * * *
14757072 ATTG-AT---TTGAAATAGATTGTTTTATGACAAAAGAAAA--T--T---GATTTGAAATAGATA
52 CTTGTATGAACTGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
** ** * * * ** *
14757126 ACAGTTCCTATATTCTTAACTA-TTGACAC-TAGTTTAGGAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
116 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
*
14757189 CA
179 TA
* * * ** *
14757191 GTTATTAATTTTTGAA-ATTATTTTATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
1 CTTATTAATTTTTGAATATTA--ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * *
14757255 GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACTATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAG
64 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** ***
14757320 TAATAGCTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** *
14757372 CTTATTAATTTTTGAGAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTAT-AA-TA
1 CTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-
* * * * * * * * *
14757435 AGAAACAATTGATCTATGACCAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTGAAAT-
64 -GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *** *
14757499 GACCACAATTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACA-AGTTTACTTTTTAAA--TC--A
128 G-TCATAACTATTTGAACTT-ATTCAATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTA
** *
14757549 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTG
1 CTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * *
14757614 AAACAATTGTTTTATGACAAAACACAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTTAAATAGT
65 AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * * ** * *
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* *** *
14757730 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * * *
14757795 AAACAATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTTAAATAG
65 AAAAAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
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129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTA
* * * * *
14757912 CTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTA-TTCTAAATAAGATTATAAGATA
1 CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA-A
* * * * * * * * *
14757975 -TGAAACAAA-TATTTTCTAACTAAATAAAAGGTCATAACGATTTAAAATATATAATTATTCTAA
62 CTGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
** * ** **** *
14758038 TAGTTTTAACTATTAGAACTGGTTTGGCAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTA
126 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * * *
14758094 CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATCATTTT-TAACCAAATGAGC-TCTATG-ATT
1 CTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
14758156 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAACAA--TCTTAATGATTTGAGATTGATAATTGCTCAAAT
64 -GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** * * * *
14758219 AGTCATAATTATTTGGACTGCTTTAGTAAACATATTTGTTTTTTAAATCTCTTA
127 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
14758273 CTTATTAATTTTTGAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATGAGCTTGTATGATCAT
1 CTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-T
* * * * * ** *
14758338 -AAACAATTGTTTTACGACAAAATAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCATATAG
64 GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** **** ** * * * *
14758402 TC-TTACTATTTGAAATGGTTTGGCAATTAGACTTATTTTTTAATTTTCTTG
129 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * ** ** * *
14758453 GTTATTAAGTATGGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAACAG
1 CTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG
** * * * * * *
14758518 AACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGAATTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
65 AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** *** * * *
14758583 CAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGTTTTACTTTTTAAATCTCTTA
130 CATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* *
14758634 CTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAA
1 CTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAA
14758661 AGGTTAGAAT
Statistics
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14750887 AATGGGTTTC
* * * * *
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* ** * * * * * * *
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65 TTTTATTCCAAATAAGC-TTGTATGA-ATTCGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
14751021 AACAATTTGAAATAAATAAATT-TTTATATAGTCTTAATTGTTTGAATTGGTT---C-AACAAA-
128 AACGATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTCTTAAATATTTGAATTGATTCAGCAAACAAAT
* * ** *
14751080 CTATTTTTTAAATATCGTAGTTATTAATTTTCAGAATATTACAAAAATTATTATTATTTTATT-T
192 TTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTCAGAATATTA-TTAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * * ** * * *
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* * * * * * * *
14751208 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTA-TTTGAACTGGATCAACAAATAGATTTCATTTTTAA
317 ATTGATATTTGTTTACAT-TTGAT--CTAGTTT-AA-T--A--AAC--ATATATTT--TTTTAAA
* * * * ** * * *
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*** * * * * * * * * * * *
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* ** * * * * *
14751400 AATGGCCATGATTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTGTTTATT
498 AATAGTTATAACTAGTTGAACTAG-TTTGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-TTTATT
* ** * *** * * * *
14751463 AATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAA
557 AATATTGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAACAA
* * * * * *
14751528 TTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAAC
622 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAT
14751593 TATTTGAACTTATTCA-
687 TATTTGAACTTATT-AG
* * * * *
14751609 ATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTAGAATGA-CAATAAATT-AGTA
1 GTAAATAGAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAT-ATTAATAAATTCA-TA
* * * *
14751672 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAAAATTATTGTATGACTAAGCAAAAGGTCA
62 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * **
14751736 AAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTTAATTGATTCAGCAAACCCAT
127 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAAATATTTGAATTGATTCAGCAAACAAAT
* * *
14751801 TTATTTTTTAAATCTC-TTATTAATTATCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAA
192 TTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAA
* *
14751864 TAAGCTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATT-ATAACGATTTGAGATT
256 TAAGCTTATATGA-AAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATTCATAACGATTTGAAATT
*
14751928 GATATTTG-TT-CATTTGATCTAGTTTAATAAACATATATTTTTTTAAAATTTTGCTTATCAATT
320 GATATTTGTTTACATTTGATCTAGTTTAATAAACATATATTTTTTTAAAATTTT-CTTATTAATT
* * *
14751991 GCTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTAATCCGAATAAGCATGTATGAACAGAATCAATTGT
384 GCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* * *
14752056 TTTATAACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAAT-GTTATAACTATT
449 TTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATAACTAGT
*
14752120 TGAACCAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATATTGGAAATATTAAT-AAT
514 TGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATATTGGAAATATTAATAAAT
* *
14752184 TAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAG
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*
14752249 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA-TTGATTAG
644 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTT-ATTAG
* * * *
14752308 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATTATTTCATTTTA
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* * *
14752373 TTTTATTCCAAATGAGCTAT-TATGAATTCCAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
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* * * * * * **
14752437 ACAATTTTAAATAGATAATTGTTTATATAGTCTTAAATATTTGAATTGGTTTTGCAAACAAATTT
129 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAAATATTTGAATTGATTCAGCAAACAAATTT
* ** *
14752502 ATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTTGAATATTATTAGATTAGTGTTATTCTATTATTTT
194 ATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTCAGAATATTATTA-A--A---TTA--GTATTATTTT
* * * * * * * *
14752567 ATTCAAAATAAGCTTACATGAATAGAAGCAAATGTTTTATGAGAAAAC-AAG-TTGCATAATGTT
248 ATTCTAAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATT-CATAACGAT
* * * * * * *
14752630 TTAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTA-TTTGAACATGTTCATAACA-AGAGTCATTT
312 TTGAAATTGATATTTGTTTACAT-TTGAT--CTAGTTT--A-A---T-A-AACATATA-T--TTT
*** ** ** * * * * *
14752693 TTTATTCTCTTTCTCGTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCAAAGAAGC
363 TTTAAAAT-TTTCTTATTAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGC
* * ** *
14752758 TTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAAGGTCGCAATGATTTGAAATAGATA
427 TTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATA
** * * * * * *
14752822 ATTATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACTTGTTTGGA-AAACATATTTATTTTTTAAATGTTCT
490 ATTGCTCAAATAGTTATAACTAGTTGAACTAGTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * * * * *
14752886 ACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATT-TTGTTA-ATCAGAATAAGCATGTATG-A
554 A-TTAAT-ATTG--GAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTCA-AACAAACTTATATGAA
* * * * * * * *
14752948 CAGAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATACCAATTTGAAATAAATAATTTTTCAAAT
613 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* ** * * *
14753013 AGTCATAAAGATTTGAAATTTTTTG
678 AATCATAATTATTTGAACTTATTAG
* * * **
14753038 GTTAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTAT
1 GTAAATAGAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTCATAT
* * * * *
14753102 TATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAAATCATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTA
63 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCG-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
** * * * *
14753166 TAGTGATTTCAAATAGATAATT-GTCAAAATAGTC-AAAATTATTTAAACTTG-TTC-GCAAACA
127 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCTTAAA-TATTTGAA-TTGATTCAGCAAACA
* * * * *
14753227 TATTCATTTTTTAAATCTCTTAACTATTAATTTTCATAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATT
189 AATTTATTTTTTAAATCTCTT---TATTAATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT
* *** * *
14753292 -TCGAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATT-TTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAACGATTT
251 CT-AAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGAT-TCATAACGATTT
* * * *
14753354 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGATCTAGTTCAGTAAACATAT-TTACTTTT
314 GAAAT---TGA-TATT----T-GTT-T-AC-ATTTGATCTAGTTTAATAAACATATATT-TTTTT
* * * * * *
14753418 AAAATTTT-TTATTTATTAATGGTCGAAATAATAATAAATCAGTATTATCTTAA-CTTGAATAAG
366 AAAATTTTCTTA-TTA--ATTGCT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC-CGAATAAG
* * * * **
14753481 CTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
426 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * *
14753546 ATGCTTAAATAGTCAAAACTAGTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTTATTTTTTAAATCTCTTA
491 TTGCTCAAATAGTTATAACTAGTTGAACTAGTTTGATAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * **
14753611 TT-A-A-T---AATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAAC
555 TTAATATTGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAAC
** *
14753670 TTTTGTTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTGAAAGTAGATAATTGTTCAAATAATCAT
620 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAATCAT
**
14753734 AATTATTTGAACTGGTTAG
684 AATTATTTGAACTTATTAG
* ** * * * *
14753753 GTAAATAGAATTGTTTTTTAAATCTCGCATTTATTGATTTTTGAAACATTAATAAATTCATTTTA
1 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTCATATTA
* *
14753818 TTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
65 TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAAAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
14753883 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTTAAATATTTGAACT-AGTTCAACAAACAAAT
129 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-TTAAATATTTGAATTGA-TTCAGCAAACAAAT
* ** *
14753947 TTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCA
192 TTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * * * *
14754012 AATAAACTTGTAT-AAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTT-ATAACAATTTGAA
254 AATAAGCTTATATGAAA-AAAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
14754075 GTTTACAATTGTTCAAATAGTCATATATTTGAACTAGTTTAGTAAACA-A-ATTTATTTT-AAA-
317 ATTGATATTTGTT----TA--C----ATTTGATCTAGTTTAATAAACATATATTT-TTTTAAAAT
* * ** * * * * *
14754136 TCTCTTATTGATTTTTGAAAGATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCGAATACG-TTGGAATGA
371 TTTCTTATTAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTT-GTATGA
** * * * * ** * **
14754200 TGAAAAACAATTATTATCTAACCAAAC-AAAAGATCATAAT--TTTCGATAAATAGATAATTATT
435 ACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAG-TCATAATGATTT-G--AAATAAATAATTGCT
* * * * * *
14754262 CATATACTCT-TAA-TTGTTTGAACTA--TTCAGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCCTTCTT
496 CAAATAGT-TATAACTAG-TTGAACTAGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAA--T-CTT-TT
* * * * * * * *
14754323 ATCAA-ATTTTGAAATAATATTAAATTAGTATT-TTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACTAAA
554 ATTAATA-TTGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAA
* * * * * * * *
14754386 ACAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAACATATAATTGTTCAAAT-A--G
618 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA
* * *
14754448 GAACTA---G----T-TCA-
683 TAATTATTTGAACTTATTAG
* *
14754459 GTAAATATAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATT
1 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTCA-TATT
*** * * * *
14754523 ATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-A-T-GAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTT
64 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCG-AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAA-GGTC
* * * * * * * * **
14754585 GTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GACCATAATTATTTGAATCGATT-TGATAAATT
126 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCTTAAATATTTGAATTGATTCAG-CAAACA
* ** * * * * *
14754648 GACCTATTTTTTAAATCAT-TAACTTATTAGTTTT-TGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTA
189 AATTTATTTTTTAAATC-TCT---TTATTAATTTTCAG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
* * *** * * * * ***
14754711 TT-TCATATAAGCTTTTATGAATTGAGACAATTGGTTTATGATAAAACAAA-AGGTCATATTTAT
249 TTCT-AAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGA-TTCATAACGAT
* * * * * * *
14754774 TCT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATGATTTA-TTT
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* * * ** * * **
14754837 TTTAAATTTCTTGCTTATTAATTTTCT-TAATGCTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAA
363 TTTAAAATT-TT-CTTATTAA-TTGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAA
* * * * * * * *
14754901 GCATGTATGAACTA-AAACTATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTAAGAATGATTTGAAATAGA
425 GCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTAT-AATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAA
* * * * ** * *
14754964 TAATTGTTCTAATAGTCT-TAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
488 TAATTGCTCAAATAGT-TATAACTAGTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-
* * * ** * * ** * * * * *
14755028 TTTCTTATTTTTTTAGAATATTATTAATTTAACAATATTTTA-CTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
551 TTTATTAATATTGGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAACAAACTTATATGAAC
* * * * *
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614 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
14755155 AGTCATAAGTATTTGAAC-AAGTTCG
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* * * * *
14755180 ATAAACAGATTTAATTCTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATT
1 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTCA-TATT
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64 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAA-AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * ** * * * * * *
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315 AAATTGATA-T-TT------GT--TTAC-ATTTGATCTAGTTTAATAAACATATATT-TT-TTTA
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367 AA-ATTTT-CTTATTAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTG
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* * * * * * *
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495 TCAAATAGTTATAACTAGTTGAACTAGT-TT--GATAAATAGATTTATTTTTTAAA-TCTT--TT
* * * * * ** *
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554 ATTAA-TATTGGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAA
* * * * * * *
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617 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATC
* * * *
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682 ATAATTATTTGAACTTATTAG
* *
14755897 ATAAATAG-ATTAATTTTTTAATTCTCTTA-TTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTA
1 GTAAATAGAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTCA-TA
* * * * * * *
14755959 TTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAA--CTAAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTC
62 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * * * * *
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126 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAAATATTTGAA-TTGATTCAGCAAACAA
* * * * *
14756086 ATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTATTTGTCAAAATATTAATAATTTAATATT-TGTTTAA
190 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTA-TTA--ATTT-TCAGAATATTATTAAATTAGTATTAT-TTTAT
* * * * * *
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250 TCTAAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGA-TTCATAACGATTT
** * *
14756213 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAT-TTGTTCAGTAAATAAA-AT-TA-TT
314 GAAATTGATATTTGTT----TA--C------ATTTG-ATCTAGTT---T-AATAAACATATATTT
** * * **
14756274 TTTTAGATCTTTTACTTATTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTT-ATTTGAAAT
362 TTTTA-AAATTTT-CTTATTAATTG-CTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCG-AAT
* * * * * *
14756337 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTCATTTTATGAT------AAAA--CATAGTGATTTCAAATAA
423 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATT-GTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAA
** * * * * * * * * * *
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487 ATAATTGCTCAAATAGTTATAACTAGTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC
** * * ** ** *
14756457 TTAATTATTAAT-TTTTAGAATATTAATAACTTACTATTATTTTATTTTGAGTAAGCTTATATGA
550 TT--TTATTAATATTGGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGA
* ** * * *
14756521 ACCAAAATGATT-TTCTAATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATACTTATTCAA
612 ACAAAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * *
14756584 ATAGTCATGATTATTTGATCTAATTCA-
676 ATAATCATAATTATTTGAACTTATT-AG
* ** * * * * * * * **
14756611 ATAAGCATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATCAATTGGTATTA
1 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTCATATTA
* ** * * * *
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65 TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAAA--ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * * *
14756738 AACAATTTGAAATTA-ATAATTGCTT-AAATAGTCATAACTGTTTGAACTAGTTTGA-TAAACAG
128 AACGATTTGAAA-TAGATAATT-ATTCAAATAGTCTTAAATATTTGAA-TTGATTCAGCAAACAA
* * * * * *
14756800 ATTTATTTTTTAAATTTC-TTATTAATATTTGA-AATATTAATAGATTAGTATTCTTTTATTCGA
190 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAAT-TTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * * * * ** *
14756863 AACAAACTTATATGAACAAAAACATTTG-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGTGATGTTCAAA
254 AATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATTCATAACGAT-TTGAAA
* * * * * * * *
14756927 TAGTCATAATTATTTGA-ATTAG-T-TAGGTAAACAAA-AT-TA-TTTTTT-AAATTCCTTACAT
318 T--TGATATTTGTTT-ACATTTGATCTAGTTTAATAAACATATATTTTTTTAAAATT--TT-CTT
* *** * * * * **
14756985 ATTAATT-TTTTTATATGAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAT-TATGAATTGA
377 ATTAATTGCTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATCCGAATAAGCT-TGTATGAACAG-
* * * ** * *
14757047 AAAAAATTGTTTTATGACAAAA-AAAATTGATTTGAAATAGATTGTTTTATGACAA-AAGAAAAT
439 AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAA---A---GTCATA-A-TG-ATT-TGA-AATAA-ATAAT
* * * * *
14757110 TGATTTGAAATAGATAACAGTTCCTATATTCTTAACTA-TTGACACTAGTTT-AGGAAACAAATT
492 TG--CT--CA-A-AT---AG----T-TA----TAACTAGTTGA-ACTAGTTTGA-TAAATAGATT
* * * * **
14757173 TATTTTTTAAATCTCTCAGTTATTAATTTTTGAAATTATT-TTATATTAGTATTATTTTATTTTG
537 TATTTTTTAAATCT-T---TTATTAATATTGGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * * *
14757237 AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACTATTTGAAGT
597 AACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * ** * ** *
14757302 ATACAATTATTCAAATAGTAATAGCTATTTAAACTGGTTTG
662 AGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTTATTAG
* * *
14757343 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAGAGATTAATAAATT-ACTATT
1 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTCA-TATT
*** * ** * * * * *
14757407 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTAT-AATAAGAAACAATTGA-TCTATGACCAAACAAAAAGTAAT
64 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAAAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * ** * *
14757470 AACAATTTGAAATGGATAATTGTTGAAAT-GAC-CACAATTATTTGAATTGATTTGGTAAACAAG
128 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTA-AA-TATTTGAATTGATTCAGCAAACAAA
* * ** * * *
14757533 TTTACTTTTTAAATCAC-TTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
191 TTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA
* *** * * * * *
14757597 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACACAAG-GTCATAATGATTTTAAATA
256 TAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACA-AAGATTCATAACGATTTGAAATT
* * * * * * * *
14757661 GACAATTGTTTAAATAGTTGTAACTA-TTTGAATTTGTTCGGTAAACTAATTTATTTTTGTGAAC
320 GATATTTGTTTACAT--TTG-ATCTAGTTT-AA---------TAAAC--ATATATTTTTTTAAAA
* ** * * ** * *
14757725 TCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATG
370 T-TTTCTTATTAATTGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATG
* * * * ** *
14757790 AACTGAAACAATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTTA
434 AACAGAAACAATTGTTTTATAAT-AAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCA
* * * * ** ** *
14757854 AATAGTCATCAC-AATCTGACCTTCTTCAATAAATAGGTTTATTTTTTCAAATCTTTTCCTTATT
498 AATAGTTATAACTAGT-TGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTT-AAATC--TT--TTATT
* ** * * * **
14757918 AATTTTTCAAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTA-TTCTAAATAAGA-TTATAAGATA-TGAA
557 AATATTGGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAACAA-ACTTATATGA-ACAAAA
* * * * * * * * * * * **
14757979 ACAAATATTTTCTAACTAAATAAAAGGTCATAACGATTTAAAATATATAATTATTCTAATAGTTT
618 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA
* * ** *
14758044 TAACTATTAGAACTGGTTTG
683 TAATTATTTGAACTTATTAG
* * * * *
14758064 GCAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATT-AGTAT
1 GTAAATAGAATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTCA-TAT
* * * * * * *
14758128 CATTTT-TAACCAAATGAGC-TCTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAACAA--TC
63 TATTTTAT-TCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTC
* * * * ** * * * * * * * *
14758188 TTAATGATTTGAGATTGATAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTGGACTGCTTTAGTAAACATA
126 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAAATATTTGAATTGATTCAGCAAACAAA
* * * *
14758253 TTTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
191 TTTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTCAG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * ** * * * * *
14758316 TCGAATGAGCTTGTATGATCATAAACAATTGTTTTACGACAAAATAAAAGA-TCATAACAATTTG
252 T-AAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAA-CAAAGATTCATAACGATTTG
* ** * *
14758380 AAATAGATAATCATTCATATAGTCTTACTATTTGAAATGGTTTGGCAATTAGAC-T-TA-TTTTT
315 AAAT---TGAT-A-T--T-T-GT-TTAC-ATTTGATCTAGTTT---AA-TAAACATATATTTTTT
** * * * * ** *
14758442 TAATTTTCTTGGTTATTAAGTATG--GGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAA
365 TAAAATT-TT-CTTATTAA-T-TGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAG
* * * * * * * * * * *
14758505 ATAGTATGAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGAATTGAAATAGATAA
426 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
** * * * * * * * *
14758570 TTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGTTTTACTTTTTAAATCTCTTAC
491 TTGCTCAAATAGTTATAACTAGTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TT--
* ** * ** * * * * * * *
14758635 TGATTAATTTTCTAAATATTAATAAA--AG-GTTAGAATAATTTGAAATAGATAATTATTTTAAT
553 T-ATTAATATTGGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAACA-A-ACTTATATGAAC
** * *** * ** ** ** *** * *
14758697 AGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTTTCACTAATTTTTGA
614 A---AAAAC-AATTGTTTTA--T-GACAAA-ACA-AAAGGTCATAACGATTTGA--AA---TAGA
* * * * * *
14758762 AATATTATT-AAATTAGT-ATTATTTTTATCCGAATAAGCTT-GTATG
665 TA-ATTGTTCAAA-TAATCATAATTATT-T--G---AA-CTTATTA-G
* * * * **** * * * **
14758807 ATCAGAA-ACAATTATTTTATGAGAAAGCAAAGATCATAATGATTTGAGATTG-ATATTTGTTCA
1 GT-A-AATAGAATTATTTT-T--TAAATCTCTTA-CTTATTAATTT----TTGAATA-TTAAT-A
* * * * * ******
14758870 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-CAGAAAACAACTTTAGTCTTAAATCTCTTGCTTATTAA
54 AAT--TCAT-ATTATTT----TA-TTCCA-AATA-AGC-TT-GT-ATGAAT-TCGAAAAAATT-A
** * ** * ** * * **
14758934 TTTT-TGA-AATATTAATAAAGT-AGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGTT-TT-TAATAAACTTA
104 TTTTATGACAA-AACAA-AAGGTCA-TAACGATTTGAAATAG-ATAA-TTATTCAAATAGTCTTA
* * * * * * * *
14758993 ACTATTTGAACTGGTT-TGACAAATACATTTATTTTTTAAATATCTTATTGATTAATTTTTAGAA
164 AATATTTGAATTGATTCAG-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-T-TT-ATTAATTTTCAGAA
* * *
14759057 TATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT-TAGAATAAGCTTCTAT-AGAAAGAAACAATTGTTTTAT
225 TATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTATATGA-AAAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * * *
14759120 G-CAAAATAAAGA-TCTTAATGATTTACGACAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTAAAC
288 GAGAAAACAAAGATTCATAACGATTT------GA-AATTGAT--ATTTGT-TTA-C-ATTTGATC
* * * * * ** * *
14759183 TATTTTAGT-AA-ATAGATTTAGTTTTTAAA-TCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTA
341 TAGTTTAATAAACATATATTT--TTTTAAAATTTTCTTATTAATTGCTGAAATATTAATAAATTA
* * ** ** * * * * *
14759245 GTATTATTTTATTTTC-AATAATTTTGCCTGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
404 GTATTATTTTA-ATCCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAG
* ** * * ** * * * * *
14759309 TTATAACAATTTGAAA-AGATAATTGTTCAAAT-GAACATTATTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT
468 TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAG-TTATAACTAGTTGAACTAGTTTGATAAAT
* * * ** *
14759372 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTAACAATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-
532 AGATTTATTTTTTAAATCT-TT---TATTAATATTGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * ** * *
14759436 TTCTGAATAAAGTTTTATGAACAGAAACAACTATTTTATGATGAAACAAAAGATCATAACTATTT
593 TTC-AAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * *
14759501 GAAATAAATAATTATTCGAATAATCATAACTAATTGAACTTGCTCA-
657 GAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTT-ATTAG
* * * * *
14759547 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACT-AGCATT
1 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTCA-TATT
* * * * ** **
14759611 ATTTTATTTCGAATATGCTTATATGAA--CAGAAACGATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
64 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTC-GAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
14759674 AACTATTTGAACAT-GTTCAA--A---AAATAGAT-TT--ATTTTTAAAATT--TT-----TACT
128 AACGATTTGAA-ATAGAT-AATTATTCAAATAG-TCTTAAATATTT-GAATTGATTCAGCAAACA
* * ** * * * * * * * * * * * *
14759723 TATTAATTTTTGGAA--T-ATTAATAAATTT-ATATTATTGTATTTGGAATAAG-CTTGTGTGAA
189 AATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTCAGAATA-T-TA-TT-AAATTAGTATTATTTTAT
** * ** * * * *
14759783 TAGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAATGTCATAATGATTTTA-AATAAAA-AATTG-TTCA
250 TCTAAATAA--G-CTTATATGAAAA-AAAA---CA-ATTG-TTTTATGAGAAAACAA-AGATTCA
* * * * * * * *
14759845 -AA-TA-GTCATAA---CTATTTG---A-ATTTG-T-TCG-GTAA-ATAGAT-TCA-TTTTTT-A
305 TAACGATTTGA-AATTGATATTTGTTTACATTTGATCTAGTTTAATAAACATAT-ATTTTTTTAA
* * * * * * * *
14759893 AATCTCTTACTCAATAATT-TTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCCT
368 AAT-T-TT-CTTATTAATTGCTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTT
* * * * * * * * *
14759957 ATATGAACTGATACAATTGTTTTAT-ATGAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAACTA
429 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * * * * * *
14760021 TTGAAATACTTATGACTATTTGAACTTA-TTCGGTAAACATATTTA-TTTTAAACAT-TTGTTAC
494 CTCAAATAGTTATAACTAGTTGAAC-TAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAA-ATCTT-TTA-
* * * * * * * *
14760083 TTATTAATTGTTGAAATATTACTAAATTAATATTTTTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAA
555 TTAAT-ATTG--GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAACAAACTTATATGAACAA
* * * *
14760147 AAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAA-GTTATAAC-AGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
616 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAA
** *
14760210 TCATAACAATTTGAACTTGTTCA-
680 TCATAATTATTTGAACTTATT-AG
** * * * * *
14760233 ACAAACAGATTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTATATT
1 GTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTCATATT
** * * *
14760297 ATTTTATTTGAAAT-GGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
64 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * * **
14760360 GTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATTA-TCATAATTATTTAAACTTG-TCCAATAAACAAAT
129 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCTTAAATATTTGAA-TTGATTCAGCAAACAAAT
* * * *
14760423 TCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTAATAAATT-GATATTATTTTATT-T
192 TTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTCAGAATATTATTAAATTAG-TATTATTTTATTCT
* * *** * * * *
14760486 TAATAAACTTATATGAATTGAAATAATTCTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAA
253 AAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGA-TTCATAACGATTTGAA
* * **
14760550 ATAGATAATTGTTCATATAGTCATGACTAATTGATCTAGTTTGGTAAACATAT-TTATTTTTAAA
317 ATTGATATTTG-T--T-TA--C---A-T--TTGATCTAGTTTAATAAACATATATT-TTTTTAAA
* * *
14760614 CTTTTTTACTTATTAACTAT-C-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTT
369 --ATTTT-CTTATTAA-T-TGCTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTT
* * * *
14760677 GCATGAATAGAAACAATT-TTTTCATAATAGAACAAAAAGTCATAAGGATTTGAAATAAATAATT
429 GTATGAACAGAAACAATTGTTTT-ATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAA-T
* * ** * * *
14760741 TG-TCACATAATCGTAACTATTTGAGCTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATT
492 TGCTCAAATAGTTATAACTAGTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATT
* * ** * * * *
14760805 AGTTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTACTTAATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACAT
557 AATATTGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAACAA
* * * * * * * * * *
14760870 TTGTTTTTTTACAGAATC-AAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAACAGTTATAA
622 TTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAA
14760934 TTATTTGAA-TTAGTTAG
686 TTATTTGAACTTA-TTAG
* * * *
14760951 GTAAATAGAATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAAATTAATAAATT-TTTTTG
1 GTAAATAGAATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTCATATT-
*** * * *
14761015 ATTTTGATTTTGAATAAGCTAGTATAAATT-GAAAAAATTA-TTTATGACAAAATAAAAGGTCAT
64 ATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTCGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * *
14761078 AAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTCTTATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTT-TGACAAA-AAA
128 AACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAAATATTTGAATTGATTCAG-CAAACAAA
* ** *
14761140 ATTA-TTTTTAATTATCT-TAGTTATT-ATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTC
191 TTTATTTTTTAA--ATCTCT--TTATTAATTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTC
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14761202 CAAATAAGCTTGTATGAACAAAATTAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTT-ATAATAATTTGA
252 TAAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATTCATAACGATTTGA
* * * * ** * * *
14761266 AGTAT-ACAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGAT-TTATTTTTT
316 AAT-TGA-TA-T-TT---GT--T--T-AC-ATTTGATCTAGTTTAATAAACATATATT-TTTTTA
* ** * * * ** *
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** * * * ** * * * ** * *
14761393 TG-ATTGAAAACATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
432 TGAACAG-AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCT
* ** * * * * * * **
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496 CAAATAG-TTATAACTAGTTG-AACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAA
* * * * * * ** * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * ** * *
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* * * *
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* * * * ** * * *
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** * * * * * * * *
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317 ATTGATATTTGTTTACATTTG--AT--CTAGTTT-AA-T-A---A--ACATATATT---TTTTTA
* * * * * * * *
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367 AA--ATTTTCTTATTAATTGCTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTT
* * * * * ** * * *
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* * * * ** *
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* * * * *** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * *
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253 AAATAAGCTTATATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATTCATAACGATTTGAAA
* * * * ** * * *
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* ** * * * * * *
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** * * ** * *
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* ** * * * * ** *
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* * ** * * ** **
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * ** *
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** *
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* * *
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* *
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* *
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* * *
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* * *
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*
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * * *** * *
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* *
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** * * *
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* * * * **
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* * * * * **
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*
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* * *
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*
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* *
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
145 88 0.68
146 42 0.32
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Consensus pattern (146 bp):
TCATAACTAATTGAACATGCTCAAAAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
GGAATATTAATAAACTAGCATTATTGTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGGTTT
ATAACAAAACAAAAGG
Found at i:14759925 original size:181 final size:181
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Indices: 14759669--14763088 Score: 2483
Period size: 181 Copynumber: 19.2 Consensus size: 181
14759659 AAAACAAAAG
* * * * *
14759669 GTCATAACTATTTGAACATGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * ** * *
14759733 TGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTGTATTTGGAATAAGCTTGTGTGAATAGAAATAATTGTT
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* * * * * *
14759797 TTATAACAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAAAAAATTGTTCAAATA
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* * * * *
14759849 GTCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAATAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
14759914 CAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCCTATATGAACT-GATACAATTGTT
66 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTT
** * * * * *
14759978 TTAT-ATGAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAACTATTGAAATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * * * *
14760029 CTTATGACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA-TTTTAAACATTTGTTACTTATTAATTG
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
14760093 TT-GAAATATTACTAAATTAATATTTTTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG
65 TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * *
14760156 TTTTATGGCAAAACAAAA-GTTATAAC-AGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
14760209 GTCATAACAATTTGAACTTGTTCAACAAACAGATTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* * * *
14760274 CTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAAT-GGCTTGTATGAATAGAAAAAATTA
65 -TTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* ** *
14760335 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATTA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TA
* * * * * * * *
14760390 -TCATAATTATTTAAACTTGTCCAATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
14760454 TAGAATACTAATAAATT-GATATTATTTTATTT-TAATAAACTTATATGAATTGAAATAATTCTT
66 TAGAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
*
14760517 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * * * * *
14760569 GTCATGACTAATTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAAACTTTTTTACTTATTAACTA
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
14760633 TCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGCATGAATAGAAACAATT-TT
65 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * * * *
14760697 TTCATAATAGAACAAAAAGTCATAAGGATTTGAAATAAATAATT-TGTCACATA
130 TT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATA
* * * * * *
14760750 ATCGTAACTATTTGAGCTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAGTTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * * * * *
14760811 CAAAATATTAATAAATTAGTATTACTTAATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTT
66 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
14760876 TTTTACAGAATC-AAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAACA
131 TATGACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
14760927 GTTATAATTATTTGAA-TTAGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTTAAATCTCTTACTTAGTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** * * * *
14760991 TTT-GAAAATTAATAAATT-TTTTTGATTTTGATTTTGAATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAATT
64 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* * * **
14761054 -ATTTATGACAAAATAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTCTTATA
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * * *
14761108 GTCTTAAATATTTGAACTGGTTTGACAAA-AAAATTA-TTTTTAATTATCTTAGTTATT-ATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
14761170 TGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAATTAATTGTT
66 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTT
* * ** * * *
14761234 TTATAACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
14761286 ATCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
14761347 T-GAAAGATTAATAAATTAGTATCATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGAATG-ATTGAAAACATTTG
66 TAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTG
* * * * * *
14761409 TTATATGACCAAACAAAAGGTAAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
14761462 GACCATAATTATTTGAAATTATTTGGTAAATAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTT
1 G-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * ** *
14761523 TTGGAATAGTAAGAAATTTGTATCATTGTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-ATGAAACGATTGT
65 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGT
* * * * * * **
14761587 TTTATGGCAAAACAAAAGGTCGTAACAAATTGAAATGGATAATTATTCATGTA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * * * *
14761640 GTCTTAATTGTTTGAA-TTGTTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
14761704 TT-GAAATATTATTAAATTAGTATTTTTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACTA-AAACAATTA
65 TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
* * * * * *
14761767 TTTTATAACAGAACAAAAGGTTATTATGATTTAAAATAGATAA----T----TA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * * *
14761813 CTCA-AA-TA--AGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
14761874 T-GACATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAGTAAACTTGTATG-ATGAAAAACTAA-TG
66 TAGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAAC-AATTG
** * * * * *
14761936 TTTTATGACAAAACAAAAATTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTGAAATG
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
14761990 GCCATAATTATTT-AAATTGATTC-AGCAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * *
14762053 TTTAGAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAGCAATTA
64 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
** * * *
14762117 TTTTATGACAAAACAGTAGGTCATTAA-TATTTTAAATA-TTCAATTGTTCAAATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATA
* * * * * *
14762171 TTCATAACTATTTGAATTTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* *** * ** *
14762236 TT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATCCAAACGATTGT
65 TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * *
14762300 TTTATCACAAAAC-AAAGGTCATAACAATTTAAAATA-AGTAATTGTTCAAATA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATA
* * * * * *
14762352 GTCATAACTATTTGAGCTTGTTCAATAAACAAATTTAGTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * *
14762417 TTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATG-ATATGAAACAAATAT
65 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGT
* * * * ** **
14762481 TTTATGGCTAAA-AAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTACTCTTATA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * * ** *
14762533 GTTTTAATTATTTGAACTAGTTTGATAAGCACATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TA-T--TTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** ** * * *
14762594 CAGAATATTTTTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTTTATGATTAGAAACAATTATT
66 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
14762658 TTATGAC-AAA-AAAA-G--AT--C-A--T--AA-AGATAATTGTTCAAATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * * * * *
14762697 GTCATAACTATTCAAATTTATTTGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTGTTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATTT
* * * *
14762762 TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATG-ATCA-AAACCAATTG
65 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAA-CAATTG
* * *
14762825 TTTTAT-ACCAATAC-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
128 TTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
14762878 GCCATAATTATTTTAA-TTGATTCAATAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TA
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* ** *
14762940 TTAGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTA-TTCTGTATAAGCTCGTACT-AACT-GAAACAAT
65 TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTA-TGAA-TAGAAACAAT
* *
14763002 TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGA-AATTGTTCAAATA
126 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
*
14763057 GTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAG
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAG
14763089 TCAGAACGAT
Statistics
Matches: 2539, Mismatches: 560, Indels: 282
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
164 57 0.02
165 2 0.00
166 1 0.00
167 3 0.00
168 8 0.00
169 167 0.07
170 15 0.01
171 2 0.00
172 3 0.00
173 7 0.00
174 1 0.00
175 9 0.00
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182 143 0.06
183 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
Found at i:14760170 original size:506 final size:503
Alignment explanation
Indices: 14759192--14760174 Score: 1162
Period size: 506 Copynumber: 1.9 Consensus size: 503
14759182 CTATTTTAGT
* *
14759192 AAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTAT
1 AAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTAT
* ** * *
14759257 TTTCAATAATTTTGCCTGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTG
66 TTGCAATAAGCTTGCCTGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * *
14759322 AAAAGATAATTGTTCAAATGAACATTATTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAA
131 AAAAAAAAATTGTTCAAATGAACATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAA
* * * *
14759387 ATCTCTTAACAATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGTTTT
196 ATCTCTTAACAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGCTAT
* *
14759452 ATGAACAGAAACAACTATTTTATGATGAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTATT
261 ATGAACAGAAACAACTATTTTATGATGAAACAAAAGATCACAACTATTTGAAATAAATAACTATT
* * * *
14759517 CGAATAATCATAACTAATTGAACTTGCTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATT
326 CGAATAATCATAACTAATTGAACTTACTCAGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT
* * * * * *
14759582 AATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTATTTTATTTCGAATATGCTTATATGAACAGAAACGA
391 AATTGTTGAAATATTAATAAACTAACATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAA
14759647 TTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAACATGTTCAAA
456 TTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAACATGTTCAAA
* **
14759695 AAATAGATTTA-TTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTAT
1 AAATAGATTTAGTTTTT-AAA--TCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* ** * * * **
14759758 TGTATTTGGAATAAGCTTGTGTGAATAGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAATGTCATAATG
61 TGTATTTGCAATAAGCTTGCCTGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * *
14759823 ATTTTAAATAAAAAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAATAGATTCAT
126 ATTTGAAA-AAAAAATTGTTCAAATGA-ACATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCAT
* *
14759887 TTTTTAAATCTCTTACTCAA-TAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AA
189 TTTTTAAATCTCTTA-ACAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAA
* * * * *
14759950 T-AAGCCTATATGAACTGATACAATTGTTTTAT-ATGAAACAAAAGGTCACAA-TGATTTGAAAT
252 TAAAG-CTATATGAACAGAAACAACTATTTTATGATGAAACAAAAGATCACAACT-ATTTGAAAT
* * * * * * * *
14760012 AGATAACTATT-GAAATACTTATGACTATTTGAACTTATTCGGTAAACATATTTA-TTTTAAACA
315 AAATAACTATTCG-AATAATCATAACTAATTGAACTTACTCAGTAAACAGATTTATTTTTAAA-A
* * * * *
14760075 T-TTGTTACTTATTAATTGTTGAAATATTACTAAATTAATATTTTTTTAATTT-GAATAAGCTTG
378 TCTT-TTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAACATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTA
* *
14760138 TATGAACAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAG
441 TATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAG
14760175 TTATAACAGT
Statistics
Matches: 400, Mismatches: 65, Indels: 27
0.81 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
502 5 0.01
503 14 0.04
505 12 0.03
506 238 0.60
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508 7 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (503 bp):
AAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTGTAT
TTGCAATAAGCTTGCCTGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
AAAAAAAAATTGTTCAAATGAACATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAA
ATCTCTTAACAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAGCTAT
ATGAACAGAAACAACTATTTTATGATGAAACAAAAGATCACAACTATTTGAAATAAATAACTATT
CGAATAATCATAACTAATTGAACTTACTCAGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT
AATTGTTGAAATATTAATAAACTAACATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAA
TTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAACATGTTCAAA
Found at i:14761981 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 14761670--14761981 Score: 367
Period size: 169 Copynumber: 1.8 Consensus size: 169
14761660 TTTAGCAAAC
* ** ** * *
14761670 AGATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTTTTAT
1 AGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * **
14761735 TCCAAATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTATTATGATTTA
66 TCCAAATAAACTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATTATAACAATTTA
*
14761800 AAATAGATAATTACTCAAATAAGAACTGGTTTAATAAAT
131 AAATAAATAATTACTCAAATAAGAACTGGTTTAATAAAT
*
14761839 AGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTTTGACATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 AGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * ** * *
14761904 TTCGAGTAAACTTGTATGATGAAAAACTAA-TGTTTTATGACAAAACAAAA-ATTCATAACAATT
66 TCCAAATAAACTTGTATAAACAAAAAC-AATTATTTTATAACAAAACAAAAGATT-ATAACAATT
*
14761967 TGAAATAAATAATTA
129 TAAAATAAATAATTA
14761982 TTGAAATGGC
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 25, Indels: 4
0.80 0.17 0.03
Matches are distributed among these distances:
168 2 0.02
169 112 0.97
170 2 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (169 bp):
AGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
TCCAAATAAACTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATTATAACAATTTA
AAATAAATAATTACTCAAATAAGAACTGGTTTAATAAAT
Found at i:14763676 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 14763146--14763708 Score: 482
Period size: 178 Copynumber: 3.1 Consensus size: 178
14763136 AAATTAGTTC
* * *
14763146 AGTAAACAAATTTATTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTATTAAATTTGTAT
1 AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCT-AAATATTATTAAATTAGTAT
* * * * * *
14763210 TATTTTAATCTGAATAAG-CTTGTGCA-AACTAAAA-AATTATTTTATAACAAAACAAAATGTCA
65 TATTTT-ATTTCAA-AAGACTTAT--ATAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTAA
* * ** *
14763272 TAATGATTTGAAATTGATAATCGTTCATATAGTCT-TAACTATTTGAACTGGTTT
126 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TAT-ACTATTTGAACTGGTTT
* ** * * ** *
14763326 AGCAATTAGATTTATTTTTT-ATTTTCTTGGTTATTAAGTTTC-ATAATATTATTAAATTAGT-T
1 AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCTA-AATATTATTAAATTAGTAT
* ** * * * * *
14763388 TATTTTA-TTCAAAATA-AAATAATATTCAAAATTAGGTTATTTGATGACAAAACAAAATGTTAT
65 TATTTTATTTCAAAAGACTTAT-ATA-ACAAAAATA-ATTATTTTATGACAAAACAAAATGTAAT
* * * * * * * *
14763451 AACAATTTCAAATAAAAAATTATTAAAATAGCTAAAACTATTTGAAATGGTTT
127 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TTATACTATTTGAACTGGTTT
* * * *
14763504 AGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATT
1 AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCTAAATATTATTAAATTAGTATT
*
14763569 ATTTTATTTCAAACAGACTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAGAA-GTAATA
66 ATTTTATTTCAAA-AGACTTATAT-AACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAA-AATGTAATA
* *
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* *
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* ** * * * * *
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* * * **
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * *** *
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** ** * * *
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*** * ** * * *
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* ** * * ** * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 -AAATATTAATAAATTAGTA-TTAATTTATTTCAATAAACTTGTACGAACAAAAATAATTGTTTT
* * * * * * ** *
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64 ATGATAAAACAAAAAGTAATAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTACTTGA
* * * ** * *
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128 ACTAG-TTC-AACAAACAAATTTATTTTTTAAATA-TCTTAC----TAATTCTTC
* * * * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCA-ATAAA-CTTGTACGAACAAAAATAATTGTTTT
* * * * * * * * * *
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* * ** * * * *
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128 ACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTT-AAATATCTTAC-TA--ATTC-TTC
* * * * * *** *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTC-A-ATAAACTTGTACGAACAAAAATAATTGTTTT
* * * * * * * * * * * *
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*
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128 ACTAGTTC
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* * *
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** * * * * * *
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*
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*
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* * *** *
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** * * * * *
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*
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14764231 TATTAATTTT
Statistics
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GATAATTATTCAAACAGCCATAACTACTTGAACTGATTCGATAAACA
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* * * * * *
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* ** * *
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* * * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * *
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* * ** * * * * *
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*
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14765084 TTAGTTCCGC
Statistics
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TTAATAATTCTTCAAATATTAATAAATAAGTATTAATTTATTCTACAAAAG
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* *
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1 AACAGAAACAATAGT-TTAAC
14765364 AA
1 AA
14765366 TTTGAAATAG
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AACAGAAACAATAGTTTAAC
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* *
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* * * * *
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**
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*
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1 AAATAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTT
* *
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131 AAAAATAGATAATT
14765881 GTTTAAATAT
Statistics
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AAAAATAGATAATTTATGTTCAAA
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * *
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128 CTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT
* * *
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* * *
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*
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* *
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* ** * *
14765833 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTAAAAATAGATAATTGTTTAAATATTCATAAC
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* * * *
14765898 TATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTCAGTAATTTTTGGAATAT
129 TATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT
* * * * ** * **
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194 TAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATAACA
* * * *
14766027 AAATAAAAGTTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGT
258 AAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-A--AAT-A--ATTT--ACTT-T
14766092 TGAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
314 T---T--A-A-A---ATTTTT---A-C--TTA---A
* * * *
14766128 TTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAGGCTTGTATGAATAGAAT
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* ** * * * *
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* * ** * ** *
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* *** * ** *
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* * ***
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Matches are distributed among these distances:
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TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAAACAATT
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TTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA
ATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA
CAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAATAATTTACTTTTTAAAATTTTTA
CTTAA
Found at i:14766363 original size:176 final size:178
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14765731 TTCAAAAAAT
* *
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* * ** *
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* ** *
14765869 AAATAGATAATTGTT-TAAATATTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAT
128 AAATAGATAATTGTTCT-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAAC
* * ** *
14765920 AGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTCAGTAATT-TTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTA
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* * * ** * * ** *
14765984 TTTCGAATAAGCCTATATGAGCT-GGTATAATTGTTTTATAATGAAA-TAAAAGTTCATAACT-A
62 TTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAA-TGA
* * * * * * *
14766046 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGTTGAGTAAAC
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* * * * *
14766101 ATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
1 AAATTTA-TTTTAAAA-ATTTT--TTATTAATTGTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTA
* * * *
14766165 ATTCGAATAGGCTTGTATGAATAGAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAATGATTT
62 TTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTT
* * * *
14766230 AAAACAAATAATTGTTCTAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTTAGTAAAC
127 AAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAAC
* * ** * *
14766282 AAATTTATTTTAAAAATTTTTTATTACTTGTTT-G-ATATTAACAAATTTGCATTATTTTTTTTA
1 AAATTTATTTTAAAAATTTTTTATTAATTGTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTC
* * * * *
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66 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAA
*
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* ** * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * **
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* * **
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* ** * ** * *
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* * *
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*
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1 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTACTAATT-TCTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * ** *
14766167 TCGAATAGGCTTGTATGAATAGAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTAA
65 TCGAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTAAA
* * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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*
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CAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTCATTTTAAAAAT
CTTTTATCAGTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTACATTATTTTATTTAAAATAAGCCTATATG
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ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAT
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* *
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TATTAATTTTTAAAATCATTACT
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* * **
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* ** * ** *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * *
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*** * * * * * *
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* *
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* * *
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** * * * **
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* * * * * ** * *
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** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * ** * ** * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
** * * * * ** * * *
14768107 TAATTTTGTATGAATAGACACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAG
66 TAAACTTATTTGAATAAAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA
* * * * * ** * * **
14768172 ATAATAGTTCAAAT-G-GACAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAGATGA
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAAATTT
* * * * *
14768221 ATTTTTTAAATCT-TTAATTTACTAATTTTTTAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
1 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * *
14768284 GATAAACTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAA
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* * * *
14768349 TAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTT
127 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAAATTT
* * * * * *
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*** * * * * * *
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14768533 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
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14768558 ATTTATTAAT
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* *
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* * **
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
14767026 TGAGTTA-T-TAAGAACTGAAAAC-ATTGTTTTA-CGATAACACAAATTGTCATAACAATTTAAA
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* **
14767087 ATAAAGGATTGTTCAAATAGCCT-TAACCATTTGAACT-AGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTAA
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* *
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*
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* * ** * * ** *
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* * * * * ** ** ** * * * *
14767450 TATATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAGTTAATT-TG-ATAA-ATTATTT-TTGTTTTA
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*** * ** * * * * * * *
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190 AATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTAATTTTGAACAAACTTA
* * * * * * * * *
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255 CATGAA-TAAAAACAATTAATTTATGAAAAAACAAAAGGT-TATAACAACTTGAAATAGATAATT
* * * ** * *
14767638 ATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTT
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* * * * *
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* *** * * ** * * ** *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * * * * *
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** * * * ** * * * * *
14767935 TTGTATGAACAAAAAAAAAGTGTTTTAGGACAAAAC-AAAGATCATAACAA-TTTAAGATAGATA
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* * * ** * * * *
14767998 ATTATTTAAATAGTCATATCTATTTGAATTG-GTTCGATAAAGAGATTT
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* * * * * * *
14768046 ACTTTTTAAATCT-GT--T-ATTGACTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA
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*** * * * * * * *
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* * * * * * ** * * * * ** *
14768171 GATAATAGTTCAAAT-G-GACAACTATTTAAACTTG-TTCGGTAAACAGATGAATTTTTTAAATC
130 AAGAATTGTTCAAATAGCTATAACCAGCTGAAC-TGATTCAGCAAACAAATTTATTTTTAAAATC
** * ** * * * * * **
14768233 T-TTAATTTACTAATTTTTTAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AGATAAACTTGTA
194 TCTT-GCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTAATTTTGA-ACAAACTTACA
* ** * * * * *
14768296 TGAATAGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT
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* * **
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* * * * * *
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* * * * * * * ** * * * *
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* *
14768531 ATATAATTGTTCAAATAG
129 AAAGAATTGTTCAAATAG
14768549 TCATAACTAA
Statistics
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Consensus pattern (362 bp):
ATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
TAAGACTGTAAGAACAAAAACAATTGTTTTATCACAAAACAAATTGTCATAACAATTTAAAATAA
AGAATTGTTCAAATAGCTATAACCAGCTGAACTGATTCAGCAAACAAATTTATTTTTAAAATCTC
TTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTAATTTTGAACAAACTTACATGAA
TAAAAACAATTAATTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAACAACTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
AGTCATAACTATTTAAACGAGTTTGACAAACAAATTT
Found at i:14767691 original size:542 final size:534
Alignment explanation
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14766590 CATCATATTC
* * * **
14766600 ATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCA
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* * * **
14766663 AATAAGAC-TGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATCACAAAACAAATTGTCATAACAATTTGAAA
64 AATAA-ACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* ** * * ** * *
14766727 TAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAGCTGAACTGATTT-AGTAAGTAGATTTATTTTTTAAT
128 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTTGA-CAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * *
14766791 TTTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTA-T
192 TCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAAC-TAGT
* * ** * *
14766855 TTGAATAAAAACATTTAATTTATGAA-AAAACAAAAGGTTATAACATCTTGAAATAGATAATTTT
256 ATGAATAAAAACAATTGTTTTAT-AACAAAACAAAAGGTTATAAGAT-TTGAAATAGATAATTAT
** ** * * *
14766919 TCAAATAGTCATAATTATTTGAACGAGTTTGGCAAATCGAATTATTTTTAAATGTCTTACTGATT
319 TCAAATAGTCATAATTATTTGAATTAGTTTGATAAAT-GATTTATTTTTAAA--TCTCACTTATT
* * * * * *
14766984 AATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTTTGAATGAGTTATTAAGAACTGAAAACA
381 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AATTTTTATGAACTGAACA-A
* * * ** * *
14767049 TTGTTTTACGATAACACAAATTGTCATAACAATTTAAAATAAAGGATTGTTCAAATAGCCTTAAC
444 TTGTTTTACGATAA-AAAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG-CATAAC
* * * *
14767114 CATTTGAACTAGTTCAGCAAACAAATTT
507 TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTT
* * * *
14767142 ATTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAT-AATATTATTACATTACTATTATTTAATTTTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTT-ATAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGA
* * * * * *
14767206 ATAAACTTGCATGAATAGAAATAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAGAACTTGAAATA
65 ATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* *
14767271 TATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-AGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
130 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGA-TTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * **
14767335 TCCTACTTGTTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTAGTAT
194 TCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTAGTAT
*
14767399 G-ATGAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATATATAATTATT
258 GAAT-AAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTT-ATAA-GATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * * *
14767462 CAAATGGCCATAATTATTTGAGTTAATTTGATAAATTATTTTTGTTTTAAATCTCAAACTTATCA
320 CAAATAGTCATAATTATTTGAATTAGTTTGATAAATGATTTAT-TTTTAAATCTC--ACTTATTA
* * * *
14767527 ATTTTTTAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATACATTTTTATGAACTGAATCAAT
382 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-ATTTTTATGAACTGAA-CAAT
* * * * * *
14767592 TATTTTATGATAAAATAAATGGTC-TATCAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAAT
445 TGTTTTACGATAAAAAAAAT-GTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG-CATAACT
*
14767656 ATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTT
508 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTT
* * * *
14767683 ATTTTTTAAAAATTTCTT-GCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGC-ATTATTTTATTT
1 ATTTTTT--AAATCTCTTAG-TTATTAATTTTATAAATATTAATAAATTA-CTATTATTTTATTT
* * * * * ** * **
14767746 TGAATAAGCATGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAATGAAAGGTCAAAATGATTTGAA
62 TGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * * * * *
14767811 ATAGATAATTATTCTAACAGTCTTAGCTATTTAAGCTGAATTGGCAAACATATTTATTTTTTAAA
127 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * * * * * * * *
14767876 TC-CTTACTTCTTAAATTTTAGAATATTATTAATTTAACAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTA
192 TCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTAGTA
* * * ** * * *
14767940 TGAACAAAAAAAAAGTGTTTTAGGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTT-AAGATAGATAATTAT
257 TGAA-TAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAA-GATTTGAA-ATAGATAATTAT
* * * * *
14768003 TTAAATAGTCAT-ATCTATTTGAATTGGTTCGATAAAGAGATTTACTTTTTAAATCT--GTTATT
319 TCAAATAGTCATAAT-TATTTGAATTAGTTTGATAAA-TGATTTA-TTTTTAAATCTCACTTATT
* * * * *
14768065 GACTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAA-TAGACACA
381 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTT-TATGAACT-GA-ACA
* * * * * *
14768129 ATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAAT-GGACAA
443 ATTGTTTTACGATAAAA-AAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTA-TTCAAATAGCATAA
* * **
14768192 CTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAGATGA
506 CTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTT
* * * * * *
14768221 ATTTTTTAAATCT-TTAATTTACTAATTTTTTAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
1 ATTTTTTAAATCTCTT-AGTTATTAATTTTATAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGA
* *
14768284 GATAAACTTGTATGAATAGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAA
65 -ATAAACTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * **
14768349 TAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAAT
128 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * * * *
14768414 CTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTACATTAGTATTATTTAATTTTGAATAAACTTGCAT
193 CTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTAGTAT
* * * * * * *
14768479 GAATAGAAATAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAGAACTTGAAATATATAATTGTTCA
258 GAATAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAAG-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
14768544 AATAGTCATAA
322 AATAGTCATAA
14768555 CTAATTTATT
Statistics
Matches: 1122, Mismatches: 243, Indels: 99
0.77 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
535 3 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (534 bp):
ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTATAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAA
TAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA
ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTAGTATGAA
TAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
GTCATAATTATTTGAATTAGTTTGATAAATGATTTATTTTTAAATCTCACTTATTAATTTTTGAA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTTATGAACTGAACAATTGTTTTACGAT
AAAAAAAATGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCATAACTATTTGAACTTGTT
CAGTAAACAGATTT
Found at i:14768573 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 14768554--14768582 Score: 58
Period size: 14 Copynumber: 2.1 Consensus size: 14
14768544 AATAGTCATA
14768554 ACTAATTTATTAAT
1 ACTAATTTATTAAT
14768568 ACTAATTTATTAAT
1 ACTAATTTATTAAT
14768582 A
1 A
14768583 TTTCAAAAAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 15 1.00
ACGTcount: A:0.45, C:0.07, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (14 bp):
ACTAATTTATTAAT
Found at i:14768876 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 14768564--14769393 Score: 851
Period size: 178 Copynumber: 4.6 Consensus size: 180
14768554 ACTAATTTAT
* * *
14768564 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACGAGATTTAAAAAAGAAATATGTTTAC
1 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC
* * * * * * *
14768629 CAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG
66 CGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
* * *
14768694 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAA
131 TTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAA
* * ** * *
14768745 AAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AGGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
1 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATATATTTA
** * * * *
14768809 TTGAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTT
65 CCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTT
** * * * * * *
14768874 GTTCCATCATAAAATAATTGCATCA-ATTTATATAGGCTTATTTGAAATAAAA
130 GTTTTATCATAAAACAATTG-TTTATATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAA
* * * * * * ** *
14768926 TGATACTAATTGATTAATATTCCAAAAATTATTGAGTAAGAGATTT-AAAATTTGATCTATTTAC
1 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC
* *
14768990 CGAATAAGTTCAAATAGT--TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
66 CGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
* * * *
14769053 TTTTGTGATAAAATAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAA
131 TTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAA
* * * *
14769104 TAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAAATAATTA-ATTTA
1 TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA
* * * * * *
14769167 TC-AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTGTTT-ACA-TAGTTATGATCTT
65 CCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACCTT
* * *
14769229 TTGTTTAATC-TAAAACAATTGTTTATATTCATAAAAGTTTATTTAGAAT-AAA
128 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAA
* * * *
14769281 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAGAAATAAATCTATTTA
1 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA
* * *
14769345 CCGAACAAGTTCAAATCA-TCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAA
65 CCGAACAAGTTCAAAT-AGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
14769394 GTTGTTTTGT
Statistics
Matches: 525, Mismatches: 105, Indels: 40
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC
CGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
TTTTATCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAA
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Alignment explanation
Indices: 14768564--14769393 Score: 947
Period size: 359 Copynumber: 2.3 Consensus size: 354
14768554 ACTAATTTAT
* * * * *
14768564 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACGAGATTTAAAAAAGAAATATGTTTAC
1 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAATAG--ATCTATTTAC
* * * ** *
14768629 CAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG
63 CGAATAAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* *
14768694 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-TGAATTAAAAAAATATTAATTTA
127 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGCTTATTCTGAA-TAAAAAAATATAAATTTA
** * * ** * * *
14768758 TTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAA-CAAGTTTA
191 TTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATA-ATTTA-TCAAGCAAGTTCA
* *
14768822 AATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAT-TTTAAATTA-TTATGACCTTTTGTTCCATCATA
254 AATAGTCATAACTATTTGAACAATTAT-T-TGTTTAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTCAATC-TA
* * * *
14768885 AAATAATTGCATCA-ATTTATATAGGCTTATTT-GAAATAAAA
315 AAACAATTG-ATCATATTCATAAAAGCTTATTTAG-AAT-AAA
* * * *
14768926 TGATACTAATTGATTAATATTCCAAAAATTATTGAGTAAGAGATTTAAAATTTGATCTATTTACC
1 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAA-TAGATCTATTTACC
14768991 GAATAAGTTCAAATAGT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
64 GAATAAGTTCAAATAGTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
14769055 TTGTGATAAAATAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATATAAATTTATTA
129 TTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAAAAATATAAATTTATTA
*
14769120 ATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAAATAATTAATTTATCAAGCAAGTTCAAATAG
194 ATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATAATTTATCAAGCAAGTTCAAATAG
* * * * *
14769185 TTATGACTATTTGAACAATTATTTGTTTACATAGTTATGATCTTTTGTTTAATCTAAAACAATTG
259 TCATAACTATTTGAACAATTATTTGTTTAAATAGTTATGACCTTTTGTTCAATCTAAAACAATTG
* * *
14769250 TTTATATTCATAAAAGTTTATTTAGAATAAA
324 ATCATATTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAA
* * *
14769281 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAGAAATAAATCTATTTAC
1 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA-GTAAGAGATTT-A-AAATAGATCTATTTAC
* * * *
14769346 CGAACAAGTTCAAATCA-TCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAA
63 CGAATAAGTTCAAAT-AGT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
14769394 GTTGTTTTGT
Statistics
Matches: 398, Mismatches: 57, Indels: 30
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
354 1 0.00
355 44 0.11
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363 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (354 bp):
TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAATAGATCTATTTACCGA
ATAAGTTCAAATAGTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
GTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAAAAATATAAATTTATTAAT
ATTTCAAAAATTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATAATTTATCAAGCAAGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACAATTATTTGTTTAAATAGTTATGACCTTTTGTTCAATCTAAAACAATTGAT
CATATTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAA
Found at i:14770572 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 14770548--14770594 Score: 53
Period size: 18 Copynumber: 2.7 Consensus size: 18
14770538 TGTTTACCTA
*
14770548 ACTATTTCAAATACTTAT
1 ACTATTTCAAATAATTAT
*
14770566 GACTATTT-GAATAATTAT
1 -ACTATTTCAAATAATTAT
14770584 -CTATTTCAAAT
1 ACTATTTCAAAT
14770595 TGTTATAACC
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 3, Indels: 4
0.77 0.10 0.13
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.25
17 3 0.12
18 8 0.33
19 7 0.29
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.04, T:0.45
Consensus pattern (18 bp):
ACTATTTCAAATAATTAT
Found at i:14770591 original size:345 final size:352
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Indices: 14769825--14770630 Score: 812
Period size: 345 Copynumber: 2.3 Consensus size: 352
14769815 AGATTTTTCA
* * * ** *
14769825 AAAAAAAAAATATGTTCACCGAACAAGTTTGAATGGA-TT-TGACTA-TTGAACAATTATCTATT
1 AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAAT--ACTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * *
14769887 TAAAGTCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCTAA
64 TCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCCAA
*
14769952 AATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAATTAATATGCAAGAGATTGAAAAACTAAAGC
129 AATAAAATAATACTAC-C-ATT-ATATTTAAAAAATTAATATG--AGAGATTGAAAAACTAAAGC
* * * * * *
14770017 TATTTTTTAAACCAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAATCTCAATTTATTATGA
189 AATTTATTAAACCAATTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA
** * * * * *
14770082 TATTTATTTTCTTTTTAAACAATTATTTTTTATCATACAAGCCTATTCAGATAAATATAGTACTA
254 TATTTATTTTCTCATAAAACAATTATTTTTCAACATACAAGCCTATTCAAATAAATATAATACTA
* * ** *
14770147 ATTTAATAATATTCCAAAAATTAATGCGATATTT
319 AATTAATAACATTCCAAAAATTAATAAGAGATTT
** * * * * *
14770181 AAAAAATAAATATGTTTGTCGAACCAGTTCTAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTC
1 AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * *
14770246 AAGTTGTTCTGACCTTTTATTTAGTCATATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA
66 AAGTTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCCAAAA
* *
14770311 TAAAATAATACTA-C-TT-TATTTAAAAAATTAATA-G-GAGATTTAAAAA-TAAATCAATTTAT
131 TAAAATAATACTACCATTATATTTAAAAAATTAATATGAGAGATTGAAAAACTAAAGCAATTTAT
* * ** * * * *
14770370 TGAATCAATTCAAA-A-TTATGGCTATTTGAACAACTATCTATGTCAAATCATTATTACCT-TTT
196 TAAACCAATTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA--TATTT
* * * * * *
14770432 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATATAAGCTTATTCGAAATAAA-ATAATCCTAAATT
259 ATTTTCTCATAAAACAATTATTTTTCAACATACAAGCCTATTC-AAATAAATATAATACTAAATT
* * *
14770496 ATTAACATTTCAAGAATTAATAAGAGATTT
323 AATAACATTCCAAAAATTAATAAGAGATTT
* * * *
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* ** * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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* * * * *
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* *
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1 A-AAATA -A-AAATA AAAATA -AAAATA AAAATA AA-AATA A
14772208 TCTAATCTAA
Statistics
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* * *
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* *
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1 ATAA ATAA
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Statistics
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Statistics
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* * *
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14772224 CAAT AAAT AAT AAT AAT AAT AA
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Statistics
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AAT
Done.