Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
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Warning! 69000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 9 of 129
Found at i:1090992 original size:530 final size:526
Alignment explanation
Indices: 1090040--1090993 Score: 1184
Period size: 530 Copynumber: 1.8 Consensus size: 526
1090030 TTGAATGATC
* * *
1090040 AAAAACATTTGTTATATGACTAAACAAAAGGTTAATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTGAAAT
1 AAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTTAATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTGAAAT
* * * * *
1090105 AGCCATAGTTATTTGAAATGATTTGATAAAAAGATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAT
66 AGCCATAATTATTTCAAATGATTAGATAAAAAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAG
* ** *
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131 AATATTAATAAA--TTTATTGTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTAT
* * * *** *
1090235 GACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTATGTAGTTTTAATTGTTTGAACT
194 GACAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGACAATTATTCAAACAGTTGTAATTGTTTGAACT
*** * * *
1090300 GCTTCAGTGACTAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTA
259 GCTTCAAAAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
* *
1090365 GTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGT
324 CTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGT
* ** * *
1090430 TATAGTGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGGAACTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTA
389 CATAACGATTTGAAATAAGTAATTAGTCAAATAGGAACTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTA
1090495 AATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATAATATTTTATTCTGAATAGGCTTG
454 AATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATAATATTTTATTCTGAATAGGCTTG
1090560 TGTGAGAA
519 TGTGAGAA
* * *
1090568 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAAT
1 AAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTTAATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTGAAA-
* * *
1090632 TA-TCATAATTATTTCAACTGATTCAG-TAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAAT
65 TAGCCATAATTATTTCAAATGATT-AGATAAAAAGATTCACTTTTTAAAT--C--ACTTATTAAT
** * **
1090695 TTTTGGAATATTAATAAA-TTATTTTTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATT
125 TTTCAGAATATTAATAAATTTATTGTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATT
* * * * *
1090759 TTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATACATTTATTCAAACAGTTGTAATTGTTT
190 TTATGACAAAAC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGACAATTATTCAAACAGTTGTAATTGTTT
* *
1090824 GAATTTG-TTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAACTATTA
254 GAA-CTGCTTCAAAAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA-TATTA
* * * ** * * * *
1090887 ATAAATTACTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGATTTGAAACAATTGTTTTAT-GTCAAA
316 ATAAATTACTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATAAT-AAA
* * *
1090951 ATAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAGTAATTGGTCAAATAG
380 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAGTAATTAGTCAAATAG
1090994 CCATAACTAT
Statistics
Matches: 353, Mismatches: 62, Indels: 20
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
527 72 0.20
528 75 0.21
529 67 0.19
530 114 0.32
531 25 0.07
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (526 bp):
AAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTTAATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTGAAAT
AGCCATAATTATTTCAAATGATTAGATAAAAAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAG
AATATTAATAAATTTATTGTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGA
CAAAACAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGACAATTATTCAAACAGTTGTAATTGTTTGAACTGC
TTCAAAAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTACT
ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTCA
TAACGATTTGAAATAAGTAATTAGTCAAATAGGAACTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
TCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATAATATTTTATTCTGAATAGGCTTGTG
TGAGAA
Found at i:1092440 original size:67 final size:67
Alignment explanation
Indices: 1092332--1092469 Score: 179
Period size: 67 Copynumber: 2.1 Consensus size: 67
1092322 AATTAGTATT
* * * * * *
1092332 ATTTTATTTCAAATAGGTTTGTATGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGCTAAAAAACAACTATTTTATGACAAAAAGAAAGGTAATAA
1092397 CG
66 CG
* **
1092399 ATTTTATTTC-AATGAAGATTGTATGCTAAAAAACAACTATTTTATGACAAAAATAAATTTAATA
1 ATTTTATTTCAAAT-AAGATTGTATGCTAAAAAACAACTATTTTATGACAAAAAGAAAGGTAATA
1092463 ACG
65 ACG
1092466 ATTT
1 ATTT
1092470 AAAATAGATA
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 9, Indels: 2
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
66 3 0.05
67 58 0.95
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Consensus pattern (67 bp):
ATTTTATTTCAAATAAGATTGTATGCTAAAAAACAACTATTTTATGACAAAAAGAAAGGTAATAA
CG
Found at i:1092962 original size:606 final size:605
Alignment explanation
Indices: 1091821--1092994 Score: 1317
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1091811 TTATATGAAC
* * * *
1091821 AAAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAAGTAATAACAAATTGAAATATATAATTGTTCAAATA
1 AAAAACAACTATTTTATGAAAAAATAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * *
1091886 GTTATAATTATTTAAACTAGTTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTTT
66 GCCATAATTATTTAAACTAATTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTT
* * * * *
1091951 TGTAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTT
131 TGCAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
* * * * * *
1092016 TATGATAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTTATATAGGCTTAATCATTTG
196 TATGAGAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAAGCATAATCATTCG
* * *
1092081 AATTAGTTTAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTCCTAATGTTATTAA
261 AATTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTCCTAATGTTAATAA
1092146 ATTAGTATTATTTTATTCCAACTAAACTTGTATGAACAAAAATCATTACTTTATGATAGAACAAA
326 ATTAGTATTATTTTATTCCAACTAAACTTGTATGAACAAAAATCATTACTTTATGATAGAACAAA
* * * * * **
1092211 AGGTTATAACAATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTAACTTGGTAA
391 AGGTCAGAACAATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTAACTTGACAA
*
1092276 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
456 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* *
1092341 CAAATAGGTTTGTATG-TTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAACGATTTTA
521 CAAATAAGCTTGTATGATT-AAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTAATAACGATTTTA
1092405 TTTCAATGAAGATTGTATGCTA
584 TTTCAATGAAGATTGTATGCTA
** * *
1092427 AAAAACAACTATTTTATGACAAAAAT-AAATTTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAT
1 AAAAACAACTATTTTATGA-AAAAATAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
1092491 GGCCATAATTATTTGAACTAATTGGGT-AATTG-ATT-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTT
65 AGCCATAATTATTTAAACTAATTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTT
* * * * * *
1092552 TTGCAATTTTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTT
130 TTGCAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTT
* * *
1092617 TTATGAGAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAATCATAA-CTAT
195 TTATGAGAAAACAAAAAGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAAGCATAATC-AT
* * * * *
1092680 TCGAACTT-GTTCAGGAAACAAATTTATTTTTTCAAA--TCTTATGCTTTTTAGTTTT-TTGAAT
258 TCGAA-TTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-G-TTATAAATTTTCCT-AAT
* ** * * *** *
1092741 GTTAATAACTTGGTAGTATTATTTTATTATGAA-TAAGCTTGTATGGATTGAAA-CAATTATTTT
318 GTTAATAA-AT--TAGTATTATTTTATT-CCAACTAAACTTGTATGAACAAAAATC-ATTACTTT
* * ** *
1092804 ATGACTA-AACCAAAGGTCAGAACGATTT-AAAATAGATAATTATTTTAATAGTCTTAAA-ATTT
378 ATGA-TAGAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAAA-AGATAATTATTCAAATAGTCATAAATA-TT
* ** * * *
1092866 TGAACTAA-TTAGACAAACTCATTTATTTTTTAAATTTCTTATTAATT-TTCAAAATATTATTAA
440 TAAACTAACTT-GACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTCTT-AAAATATTAATAA
* * *
1092929 ATTAGTATTATTTT-TATTCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
503 ATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
1092993 AG
567 AG
1092995 ATCATAATGA
Statistics
Matches: 470, Mismatches: 78, Indels: 41
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
601 13 0.03
602 144 0.31
603 29 0.06
604 4 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (605 bp):
AAAAACAACTATTTTATGAAAAAATAAAAAGTAATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTCAAATA
GCCATAATTATTTAAACTAATTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTT
TGCAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
TATGAGAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAAGCATAATCATTCG
AATTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTCCTAATGTTAATAA
ATTAGTATTATTTTATTCCAACTAAACTTGTATGAACAAAAATCATTACTTTATGATAGAACAAA
AGGTCAGAACAATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTAACTTGACAA
ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
CAAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGTAATAACGATTTTATT
TCAATGAAGATTGTATGCTA
Found at i:1093521 original size:181 final size:181
Alignment explanation
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* * ** * * * *
1092429 AAACAACTATTTTATGACAAAA-ATAAATTTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
1092493 CCATAATTATTTGAACTAATTGGGT-AATTGA-TT-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
1092554 -GCAATTTTAATAAAGTAGTATTATTTT-ATTTTAGATAAGCTTTTATGAACT-G
130 AG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * *
1092606 AAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGTTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
1092671 CATAACTATTCGAACTTG-TTCAGG-AAACAAATTTATTTTTTCAAATCT-TATGCTTTTTAGTT
66 CATAACTATTTGAAC-TGATTC-GGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCT-TACTTATTAATT
* * * * *
1092733 TTTTGAATGTTAATAACTTGGTAGTATTATTTT-ATTATGAATAAGCTTGTATGGATTG
127 TTTAGAATATTAATAA-AT--TAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * **
1092791 AAACAATTATTTTATGACTAAACCAAAGGTCAGAACGATTTAAAATAGATAATTATTTTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * ** *
1092856 CTTAA-AATTTTGAACTAATTAGACAAACT-CATTTATTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAATTTT
66 CATAACTA-TTTGAACTGATTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
1092915 CAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTCGAATAAGCTTGTATGATTAG
129 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *
1092968 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGCTTGATATTTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * * * *
1093031 TTGTAACTATTTGAACTAATTCAGAAAATA-ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * ** * *
1093095 TTA-AATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGGGTAAGTTTTTATGAACT-G
128 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * *
1093148 AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTAAAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATATT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * * * * *
1093213 CATATCTATTTGAACTTATTCAATCAACAGATTTATTTTTTCAAGTCGCTTCCTTACTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
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130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * ** * * * * * *
1093330 AAATAATTATTTTATGATTAAACGAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTATTAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
1093395 CTTAACTATTTGAACTGATTTGGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTACGTATTAATTTTTA
66 CATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* *
1093460 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAG
131 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * **
1093511 AAACAATTATTCTATGACAAAATAAATA--TCATAACAATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
1093573 GTCATAACTATTTGAACTGGCTT-GGTAAACAGATTTAGTTATTAAATCTC--A--T-TTAATTT
64 GTCATAACTATTTGAACT-GATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * **
1093632 TCAAAATATTAATAAATCAGTATTATTTTAATTCTAAATAATTTTGTATGAATAG
128 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAG
** * * * * *
1093687 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACGATTTGAAAGAGATAACTGTTCAAATGGA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
1093752 CATGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA-CGAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATCAATTTT
66 CATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
1093815 CA-AA-ATGTAATAAATTAGTACTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG
129 TAGAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * ** * *
1093867 AAATAATTATTTTACGATGAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
1093931 TCATAACTCTTTGAGCTTG-CTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* ** * **
1093995 TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTTTCAAATAAGCTTGTATGACCAG
128 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAG
* * *
1094050 AAACAATTGGTTTATAACAAAAC-AAAGAGTCCTAACT-ATTT--AA-AGATAATTGTTCAAATA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* *
1094110 GTCATAACTATTTGATCATG-TTCAGG-AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT
64 GTCATAACTATTTGAAC-TGATTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* ** *
1094172 TTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTTAGAATAAGCTTACATGAACA-
127 TTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAG
** *
1094226 AAAGCAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATACCGATTCAAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-----T-G--AA--A-T-AGATA-
* * * * * *
1094290 TATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGATCTTATTCGGTAAAGAAATTCATTTTTTAAATCT-TA
52 -ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-
* * * * *
1094354 AAATTATTAATTCTCTA-AAT-TTAAATAAATTTGTATTAATTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATG
115 TACTTATTAATT-TTTAGAATATT-AATAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTATG
1094416 AATAG
177 AATAG
* ** ** * ** ** *
1094421 AAAAAATCATTTTACAACAAAATAAAAGGTTTTGGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
1094486 CATAACTATTTGAACTTATTCGGTCAATAGATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * **
1094551 GAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTAAATGAACT-G
131 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * ** *
1094602 AAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * * * * * * * * *
1094667 CACGACTATTTAAACTTATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTGTTAAGTATCT
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* * * * *
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130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * *
1094783 AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * * * *
1094848 CATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAATAGATTCAGTTTTTAGATATCTTACTTATTAAGTTTT
66 CATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT
* * * *
1094912 TGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTT-ATTTCGAATAAGCTTTTATGAATAG
129 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *
1094965 AAACAATTGTTTTGTGACAAAGCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAACAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * * *
1095030 CATATCTATATGCACT-AGTCAAGTTAATAGCTTCATTTTTTAAATCTATTACTTATT-ACTTTC
66 CATAACTATTTGAACTGATTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
1095093 AAAATATTAATAAATTAGCATTACTTT-ATTCTTAATAAGATTGTATCAATAG
130 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *
1095145 AAACAATTGTCTTATG--AAAA-AAATGGTCATAATG-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * * *
1095206 TATAACTAATTAAATTGGTTTGGTAAACATATTTAATTTTTAAA--T-GT-CTTATTAATTTTCA
66 CATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * ** * *
1095267 AAATATTAATAAAATAATATTATTTT-ATTTCAAACAAATTTATATGAA-AA
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* * * *
1095317 AAACATTTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGT
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* ***
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* * * * * * *
1098284 CAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTG-AATAAGATTGTATCAATAGAAACAATTGTC
128 CTAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTT
* ** * * * * * * * * *
1098348 ATATGACAAAACAATTGGTCATAATTATTTAAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACAAATT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * **
1098413 AAACTGGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA--T-GT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* ** *
1098474 AATTA-ATATTATTTTATTTTGAACAAATTTATATGAATG
321 AATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * *
1098513 AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATCATTATTCATATAG
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * *
1098578 CCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTT-T
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * * ** * * * * *
1098642 CATAATATTATTAGATTAGTATTATTTGAATCCAAACAACCTTGTATGAACATAAATAATTGTTT
130 -A-AATATTAATAAATTAGTATAATTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* ** * * * * *
1098707 TATGGCAAAATGAAAGGCTATGAA-GATTTGAAATATATAATTATTCAAAAAGTCATAATTATTT
192 TATGACAAAACAAAAGGTTAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
1098771 -AAATTGGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAGGT-TTTCTACTTATTAATGTTTGAAATAGTA
256 GAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAA-ATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * *
1098833 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAGGCTTGTATG-ATG
318 ATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * *
1098874 AAAAGAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATG
1 -AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * ***
1098939 GCCATAATTATTTGAA-TTGTTTTGATAAACAAATTTATCTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATT
64 GTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATT
* * * * * * * *
1099002 T-TGAAAATATTAATAAAGTAATATTACTTTATTTTG-GATAAGCTTTTAT-ACGTTGAAACAAT
127 TCT--AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAAAAAT
* * * ** * ** * * *
1099064 TATCTTATGATAAATTACATTGTTATAATGATTTTAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
187 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * *
1099129 ATTGGAACTTGTTCCA-TAAACA-ATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTA-TAATTTTATGAAA-
252 ATTTGAACTTGTT-CAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAAT
* * * * * * * *
1099190 GTTAATAAAATAGTATTTTTTTATTTTAAAAAAGCTTGTATAAACG
314 ATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * * * * *
1099236 AAAACAATTATTTTGTGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAT
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** * * * *
1099301 TCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* ** * * * *
1099366 AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTTG-AATAAGCTTGTATGCATA-AAAACAGTTGTT
130 A-AATATTAATAAATTAG-TATAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTT
* * * * * * * *
1099429 TTGTGATAAAAC-AAAGATCATAATAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * **
1099493 GAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTGAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* *
1099554 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATCAA
321 AATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT--G
* * * * *
1099594 AAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
1099658 CTACAATTATATT-AACTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATATT
66 C-ATAACTAT-TTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-TT
** * * * * * * * *
1099722 AGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTG-CATATGGTTGTATTATCTA-AAACAATTGT
128 CTAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAAAAATTGT
* * * * ** ** *
1099785 TTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTAGAAATAAACGTAACTATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * ** * *
1099850 TAAACTTGTT-TGACAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTTTGTCATTAATTTTTTG-AATGT
255 TGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATAT
*** * * * * **
1099913 TAATAAATTTCTATTAATCTATTCT-AAGTAAGCTTGTAAGAACC
316 TAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAATG
* * **** * * * * *
1099957 AGAATAATTGTTATAATAGTTTTAAC--CA--T-TTGAACTGATTTGAAAAATAAATTTATTTTT
1 A-AACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTCAT-AAC-GATTTG--AAATAGA-TAATTATT
* * * * * *
1100017 TAAAT-CTCTTATTAA-TTTTTGAA-ATATT--ATTAAATTAG-TATTATTTTAATCAAAATAAG
58 CAAATAGTC--A-TAACTATTTGAACTTATTCGA-TAAA-CAGAT-TTATTTT--T-TAAAT---
** ** * * * * *
1100076 CTTTTATGAACAAAAGAATTATTTTACAACA-AAACAAA--AGGTTATAA-TGATTTGAAAT-A-
111 C-TTT-T--ACTTATTAA-T-TTCTA-AATATTAATAAATTA-G-TATAATTTATTTGAAATAAG
** * * * **** ** * * ** * *
1100135 ---G-AT-AATA-ACTCATATAGTTTTA--AC-TATTTGAACTTTTTCGACAATTTGGATTTATT
167 CTTGTATGAATAGA-AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-AATGATTT-GA--AATA
** * * * * * * *
1100191 TTTAATT-TTC--TTCGTTATTAAGT-TTTGGAA--TATT-ATTAAATTAG---TATTATTTT--
227 GATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTT-GAACTTGTTCAGTAAA-CAGATTTATT-TTTTAA
* * * * ** * * *** ** *** *
1100244 AT-TCTGAATAATATAGTTTGGGCAGA-ACTAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTAT-AATA
288 ATCTCTTACTTAT-TAATTTTTG-AAATATTAATAAATT-A-GA-ATTATTTTA--TTTTGAATA
*
1100306 A-TTTG-A--AAT-
346 AGCTTGTATGAATG
*** * *** * * ** * * * *
1100315 AGGTAATTACTCAAATAGTCAAAAC--TATTTGA-AATGGTTTTGTAAATAGAT--TTACCTTTT
1 AAACAATT-GTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTG-AAATAGATAATTA---TTC
* * * * * * *
1100375 AAAT-CTCTTACTAATTAATTT--TCTAAATACTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCGACCAA
59 AAATAGTC--A-TAACT-ATTTGAACT-TATTC-GATAAA-CAGAT-TTA-TTT-TTT--A--AA
* ** * * * * * **
1100436 ACTTATATTAACAAAAATAATGGTT-T-TATGA-CAAAAAAAT-GTAATAA-CAATTTGAAATAG
110 TC-T-T-TT-AC-TTATTAAT--TTCTAAAT-ATTAATAAATTAGT-ATAATTTATTTGAAATA-
** * ** * * * ***** * * *
1100496 ATAATTGT-TCAAATAGTTACAA-T-TATT-TG--AATATGTTTGG-TA-AATGGAATT--ATTT
165 A-GCTTGTAT-GAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT-GATTTGAAATA
** * * * ** * * * * *
1100551 TCTAAATCTCTT-ACATA-T-A-AA-T-TTTTAAAATATT-AATAAATTAGTTTTATTCCATTTC
227 GAT-AAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA-CAGATTTATT---TTTT
* * * * ** * * ** *
1100609 AAATAAGCTTCTATGAGCTGAAATAATTGTTTCATGACAGAACAA-AAAGTCATAACGA-TTTAA
286 AAAT---C-TCT-T-A-CT-TATTAA-T-TTT--TGAAATATTAATAAA-TTAGAATTATTTTAT
** * *
1100672 AATAAATAA--TTG-ATCATAT-
338 TTTGAATAAGCTTGTATGA-ATG
** * * * ** ** ** * *
1100691 AGTCTTAATTGTTTGAATTGGTTCGACAAACAGATTTATTTTTTAA--ATTTCTTAGTAGTTTTT
1 AAAC--AATTGTTT-TA-T-G-AC-A-AAACA-A--AAGGTCATAACGATTT-GAAATAG---AT
* * ** * * * *
1100754 AGACTATTACAAAATTAAT-ATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTT-GTATGAACAGAAACAATTGT
51 A-ATTATT-C-AAA-TAGTCA-TA-ACTATTT-GAACTTA--TTCG-ATAAACAG----ATTTAT
** ** * * * * *
1100816 TTTATGATAAATGATAAAGTTATAACAATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAA-CT
102 TTT-T--TAAATCTTTTACTTAT--TAATTTCTAAATA-TTAA----T-AAATTAGT-ATAATTT
* * * *** * * * *
1100878 ATTTGAACT-GGCTAGGTA--AATA-AATTTATT-TTTTA--A-ATATCTAATTAA-TTCTGAAA
155 ATTTGAAATAAGCT-TGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AA--AAGGT-T-ATA
* ** * * * * *
1100934 AT-ATTAAT-AAATTAGTATTATT-TT-ATTTTG-AATAA-T-TTTGTA--TGTTGA-AAAACA-
214 ATGATT--TGAAA-TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG
* * *** ** * * * *
1100988 ATTGT-TTTACGATGAAA-C-AAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAAT-TATTCA-AATGGC
275 ATT-TATTT---TTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGAAATA-TTAATAAATT-AGAAT---
* *
1101048 CATAATTA-TTTGAACTAA---T-T-T-AAT-
330 TAT-TTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAATG
* * * *** * * ** * *
1101072 AAACTAATT-TATTTTTTA-AAATCTTTTA-CTTATTAA-TTTTTGAAATA-TTAATAAATT-AG
1 AAAC-AATTGT-TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAAT-TATTCA-
* * * * *** ***
1101131 TATTGT-TTTA-T-TTTGGATAAGCTT-TT--ATAAACTAGAACAATTGTTTT--ATCATAAGAC
60 AATAGTCATAACTATTT-G--AA-CTTATTCGATAAAC-AGATTTATT-TTTTAAATC-TTTTAC
** ** ** * * *
1101188 --AAAAAGGTCATAACGATT-TTAAA-TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTT
118 TTATTAATTTC-TAAATATTAATAAATTAGTATAA-T-TT---AT-TTGA-AA-TA--AG--CTT
* * * * * * * **** * * *
1101248 GTTTG-GTAGACAAATTTATTTT-T-TCAAATCTCTTGCTTATTAA-GTTTTTGAATGTTA-ATA
170 GTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA-TAATG-ATTTGAA--ATAGAT-
* ** * *
1101308 AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAC----T--G-AAACA-A-TTATTATTTG
230 AATT-GT-TCA-AATAGT-C--ATAA-C-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATT-TTT-
*** * * ** * * ** *
1101364 ACTAAA-C-AAAAGGTCA--AAGTGACTTGAAATAGATAAT-TATTCTAA-TAGTCTTAACTATT
285 --TAAATCTCTTA-CTTATTAA-T-TTTTGAAATA-TTAATAAATTAGAATTA-T-TTTA-T-TT
* * *
1101423 TGAAT----TGGT-TCAA-C
340 TGAATAAGCTTGTATGAATG
* * ** *** ** *
1101437 AAACACATT-TATTTTTTA-AATCTCTTATTAATTTTCA-AAATATTATTAAATTAG-T-ATTAT
1 AAACA-ATTGT-TTTATGACAA-AAC--A--AAAGGTCATAACGATT-TGAAA-TAGATAATTAT
** * *
1101497 T--TTTA-TCCGATTAAGC---TTGTA-TTATT--AGAAACA-A-TTATTTTATGTCAAAATAAA
57 TCAAATAGT-C-A-TAA-CTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTT-T-T--AAAT---
**** * * * * * * * *
1101551 AGAATAGTTA-TAACTATT-TGAACTAGTTTGGAAAACAACTTTTGTTTTTAAATCT-CTTGCCT
111 CTTTTACTTATTAA-T-TTCT-AAATA--TT--AATA-AA--TTAG--TAT-AATTTATTTG--A
* * * * * ****** * * * **
1101613 ATTAA--TT-TTTGAAATATTAATAAAGCATTATTATT-TTATTTCGGATAA-GTTTTTATGACC
161 AATAAGCTTGTATG-AATA-GAA-AAA--ATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATT
* * * * * *
1101673 TGAAATA-ATTTTTTTATTATTAAACAAA-AGGTCATAA-TGACTTT-AAATAGATAATTATTTA
220 TGAAATAGA-----TAATTGTT---CAAATA-GTCATAACT-A-TTTGAACTTG-T--TCA-GT-
* * * * * *
1101734 AATAGTCAAATCTATTTGAACGTGTTCGATAAACAAAT-TTAGTTTTTAAAATCTCTTGCTCATT
269 AA-A--CAGATTTATTT-----T-TT--A-AATC---TCTTACTTATT--AAT-T-TT--TGA--
* * * * *
1101798 AATTTTTTTAGTGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-TTGTATGAACTG
311 AA---TATTA---ATAA-A--TTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * ** * ** *
1101856 AAAGAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATTGGTT-TGACAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAG
* * * * * *
1101920 TCTTAACAATTTAAACTGGT-TTAG-CAAAC--A--CATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACT--TATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* * * * * * * ** * * * *
1101975 TTGGAATATTATTAAATTAATATTATAGTAATCCAAATAAGATTGTATGAAAAGAAACAATTTTT
128 CT-AAATATTAATAAATTAGTATAAT-TTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTT
* * * ** * * * *
1102040 TTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTTAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
1102104 GAAC-TGTTTCAATAAATAGATTTAGTTTCTAAATATCTTA-TTA--AA-TTTTAAAATATTAA-
256 GAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * ** * **
1102163 AAGATCAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATGAACAA
320 AA-ATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * *
1102205 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAG
* * * * * ** * *
1102269 ACATGACTATTTGAACTTGTATAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTGCCTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTAT-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTT
* * * * * * * * * *
1102333 CAAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAACTCGTATGACTATAAACAATTATTT
128 CTAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* * * * * * * *
1102398 TATAATAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTGAAA-CGTCATATCTATTT
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
1102461 GAACTTGCTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAGT-TTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
256 GAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* *
1102524 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAG
320 AAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * *
1102565 AAACAACTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTC-TAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAA
1 AAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * ** * * * * *
1102628 TCATAACTATTTAAACATGTTTAAAAAACATATTTATGTTTTAAAT-TTGTACTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * *
1102692 AGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGTAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
130 A-AATATTAATAAA-TTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* * *** *
1102756 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAACCATTCAAATCGTCATAACTATTTG
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
1102821 AATTTGTTCTA-TAAACAAATTCATTTTTTAAAATCTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAT
257 AACTTGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** * *
1102885 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATATGAATTG
320 AAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* *
1102926 ATTA-AATTGTTTTAT-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAGTAG
1 A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * * * *
1102989 TTATGACTATTTGAACATGTTCGGTAAATATATTTATTTTTAAAATCATTTACTCATTAATTGTC
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TC
* * * * * *
1103054 AAAATATTAATAAATTATTATTATTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACA-AGAACAATTGTT
129 TAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGA-AAAAATTGTT
* * * *
1103117 TTATGACAAAATAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * * *
1103182 GAACTTTTTTTGTAAATAG----ATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAAGTGTCTG-AATATTAAT
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
1103242 AAATTTGTATAATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAG
320 AAATTAGAATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAA-TG
* ** * * * * * *
1103283 AAAAAATCATTTTATGACAAGACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *** * *
1103348 CATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACATATTTAGTTTTTAAATGGCTTACTTATCAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-
* * * * *
1103413 GAATATTAATAAATTA-AAAATATGTTATTCTG-AATAAGCTTGTACGAATAGAAACAATTGTTT
130 AAATATTAATAAATTAGTATA-AT-TTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* * * **
1103476 GTA--ACAAAACAAAAGGCTATAACGATTTGAAATAAACGATTGTTC-AATCAGTCATAACTATT
192 -TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATT
* ** * * * * * **
1103538 TGCAA-TAGTT-AGGTTGACAAATTCATCTATTAAATC-CATTACTTATGAATTTTCAAAATATT
255 TG-AACTTGTTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * *
1103600 AATAAATTAGCATCACTTTGTTTTGAATAAGATTGTATCAATAG
317 AATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * **
1103644 AAACAATTATCTTATGACAAAA-AAAATGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * ** * * * * *
1103708 TTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTGAA---TGT-CTTATTAATTATC
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TC
* * ** * ** * * *
1103769 -ACAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTACAAACAAATTTATATGAACA-AAAACATTTGTT
129 TA-AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTT
* * * * * * * * *
1103832 TTACGAGAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAATTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
1103897 -AAATTGGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAA-TTTTCATAATATTAT
256 GAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * *** *
1103960 TAGATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAT
319 TAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * *
1104002 AAATAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAAAGATTTGAAATATG-TAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA-GATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * ** *
1104065 TCATAATTATTTGAAC-TAGTTTGGTGAACACATTTAATTTCTAAATCTCCTATTTATTAAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTT
* **
1104129 -TGAAATATTAATAAATTAG--T-A-TTATTT----T-A--TT-T-TGAACAG----GCTTG---
128 CT-AAATATTAATAAATTAGTATAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* ** ** * * *
1104173 TATGACAAAACAAAAGTTTATAACCATTTGAAAT-GATAATTGTTTGAATGGCCATAATTATTTG
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
1104237 AA-TTGATTC-GATAAACTGATTTAGTTTTTAAA--T-TT-C-----CATTTTTGAAATATTAAT
257 AACTTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * *
1104291 -AATGTA-ATATTATTGTATTTTGGATAAGCTTTTATAAATTG
320 AAAT-TAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * *
1104332 AAACAATTGTTTTATGATAAAACACAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * *
1104397 CAAAATTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TTCTTCCTTATTAATTT-
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTC
* * * * * * * *
1104460 TATGAGTGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCATATATGAACT-GAAACAATTA
129 TA--AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTG
* * * * *
1104523 TTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTA
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** *
1104587 TTTGAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATT
253 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATT
* ** * ** *
1104651 ATTAGTTTAGCAA-T-TTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACAG
317 AATAAATTAG-AATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * *
1104694 AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAATGATTT-AAGATA-ACCAATTATTCAAATA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGA-TAATTATTCAAATA
* * * ** * ** * * *
1104756 GTCATAATTATATGAGCTGGTTCAATAATTAGATCTAGTTTTTAAATC---TA-TTATTAATTTT
64 GTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * ** ** * **
1104817 TGAAATATTAATATACTAGTATTTTTTTATTTTG-AATAATTTTTTTATGAATA-AAAACAATCA
129 T-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAA-GCTTGTATGAATAGAAAA-AATTG
** * * * * ** * * * **
1104880 TTTTACAATAAAATAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATGCCTAT
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * ** *
1104945 TTGAACTTGTTCTTTAAACA-ACTTTATTTTTTAAATCCCCAACTCATTAA-TTTT-ATAATATT
254 TTGAACTTGTTCAGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATT
* * * * *
1105007 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTATAAACTTCTATGAATAG
317 AATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * * * *
1105051 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATCTAAAATAAATAATTGTTCAGATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
** * * * *
1105116 CATAACTAATTT-AACTCGCTT-GGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
66 CATAACT-ATTTGAACT-TATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * * * ** * * * * *
1105179 TGGAATA--AATTAATTAATATTATTTTATTTCG-AATAAAATTGTGTGCACAGAAACAATTGAT
129 T-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTT
* * *
1105241 TTATGACAAAACAAAA-GTCATAATCATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * * * *
1105305 GAACATATTCAAAAAATAGA-TTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTGATTTTTGGAACATTAATA
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * *
1105368 AATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAACTTGCATGAATAG
321 AA-TTAGAATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * ** ** ** * *
1105408 AATCAATTATTTTATGATAGGAGGAAAGGTCATATTGTTTTGAAATAGATAATTGTT---A-AG-
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
1105468 ----A-TA--T----TTA---G-TAAATAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAA-TTCT
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC-
* ** * * * * * * ** *
1105516 TGAAATATTAATAAAATAACATTATTGTACTTCAAATATGTTTATATGAACT-GAAATGATTATT
129 T-AAATATTAATAAATTAGTATAATT-TATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTT
* * *
1105580 TTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTG--A-A-ATAA---TT---ATA---AT---TATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * * * *
1105629 -AAATTGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTTTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAAT
256 GAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * ** * *
1105693 AAATTAG-TTTATTCTATTCCGAATAAGCTTGTGTGAGCTG
320 AAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATG
* * * * * *
1105733 AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * **
1105798 CTTAATTGTTTGAAC-TAGTTCGACAAATCA-ACTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTT-
66 CATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * * * *
1105860 TCAAATTTTTACTAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTCGTATGAACA-AAAACAATTG
129 T-AAA-TATTAATAAATTAGTA-TAATTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTG
* * * ** * * * * *
1105923 TTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTTGCAATAGATAATTGTTCAGATACTTATGACTA
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** * **
1105988 TTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTCATGAAATATTA
253 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* ** *
1106049 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTGTATG-TTG
318 ATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * * * *
1106090 AAAAAGAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTAATATCAATTTAAAATCA-ATAGTTGA-TCAAA
1 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATT-ATTCAAA
* * * * * * **
1106153 TGGCCATAATTATATGAACTGATTCAATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAAT
62 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * * * * * *
1106217 TTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTG-GATAAGTTTTTATAAACTA-AAACAAT
126 TTCT-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAAT
* * * *
1106280 TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGGTTCT-AAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAAC
187 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * *
1106344 TATTTGAATTTATTC-GATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTTG-AAT
251 TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * *** * *
1106404 GTTAATGAATTAGTATTATTGTATTCCAAATAAGCTTATACGAACTG
314 ATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * * *
1106451 AAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAAATAATTATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* ** * * * *
1106516 CTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACATATTTATTTTTTAAATC--TTA--TATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-
* * * *
1106577 AAATATT-TTAAAATTAGTATTATTT-TTATCCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTT
130 AAATATTAAT-AAATTAGTATAATTTATT-T-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTT
* * * * * *
1106639 TTATGAGAAAACAAAA-ATCATAATAATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * *
1106703 -AAGATGGTTTGGAAAACA-ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAA
256 GAA-CTTGTTCAGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
1106766 TAAAGTGGTATTATTTTATTTCT-AATAAGTTTTTATGAATTG
319 TAAATTAGAATTATTTTATTT-TGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * *
1106808 AAACAATAGTTTTTTGACAAAACAAACGGTCATAACGACTTT-AAATAAATAATTGTTCATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * * * * *
1106872 T-AAAATCTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTT
65 TCATAA-CTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTT
* * * * * ** * *
1106936 TTCAAATGTTAATAAATAAGTATTATTT-TTTCTAAATAAGCTCATATGAACTA-AAATAATTTT
128 CT-AAATATTAATAAATTAGTATAATTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGT
* * * * * ** * * *
1106999 TTTATGGCTAAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTTATAATCTTAAATATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * * *
1107064 TGAACTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATT
255 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
1107129 AAATTAGTATTATTTTAATCT-AAGTAAGCTCG-A--AAAG
320 AAATTAGAATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAATG
* * * * * * * * * *
1107166 AAACAACTGCTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAGCAATTTGAGATAGATGATTGTTCAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * ** * ** ** * * *
1107230 CATAACTATTTGAAC-TGTTAG-T-ATTA-TTTTACCTTGAATAAGCTTGTATAAACTGAAATAA
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTA-AATCTT-T-T--ACT-TATTAA
* * * ** * ** * * *
1107291 TTGT-T--TTATGACAAAACAAAAGGTCACAA-CGATTTTAAATAGGCAATTGT-TCAAATAGTC
125 TT-TCTAAATATTA-ATAA-ATTA-GT-ATAATTTATTTGAAATAAGC--TTGTAT-GAATAG--
* * * ** ** * * ** * *
1107351 ATAACTATTTGAATTTGTTTG-GTAAACAAATTTATTTTTTAA-AACTTTTG-CTTA-TTAATTT
180 A-AA-AAATTG--TTT-TATGACAAAACAAA---AGGTTATAATGA--TTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * * ** * * * *** * **
1107412 TTGAAATATTAAGAAATTAGTAT-AATTTAATTTTGGATA-AGCTTTTATGAACTGAAA-CAATT
235 TTCAAATAGTCA-TAACTA-TTTGAACTT-GTTCAGTAAACAG-ATTTAT-TTTTTAAATCTCTT
* *** * * * ** * * * * * *
1107474 -GTT-TT-ATGTTAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTTAAATATATAATTGGTCACATAGAACTTG
295 ACTTATTAAT-TTTTGA-AATA-TTAAT-A-AATTAGAATTATTTTATT-TTGA-ATA-AGCTTG
*
1107536 T-TCG-CT-
352 TAT-GAATG
** * **** * * *** *
1107542 AAACATATT-TATTT-TTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTA-ATAAATTTGGAT
1 AAACA-ATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAA--ATAGAT-AA-TT--AT
** * * ** * * * * ***** *
1107604 T-ATTTTATTCCA-AA-TAAGTTGTAAGATA-T-G--AAACA-A-ATATTTTATGACTAAAGAAA
57 TCA-AATAGT-CATAACT-ATTTG-AACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* * ** ** * * * * * * *
1107660 ATATCAAAGCGATCTAAA-ATGGAT-AATTATTCTAATGGT-TTT--AATTA-TTTGAATTGGTT
118 TTAT-TAA--TTTCTAAATATTAATAAATTAGTATAAT-TTATTTGAAATAAGCTTGTA-T-G-A
* * * * ** * ** * *
1107719 CTACAAGCACATT-TATTT-T-TTAAATC----TCTTATTAAT--TTTGGGAATATTATTAACTT
176 ATAGAA-AAAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTTA-TAATGATTT-GAAATA-GA-TAA-TT
* * ** * * * * *
1107775 AG-T--ATTATTTTTAACTGA-TT-AAGCTTCTATGATTAGAAACA-ATTT-TTTTATGACAAAA
234 -GTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-CTTGT-TCAGT--AAACAGATTTATTTT-T--TAAAT
**** *** * * * * * *
1107833 CAAAAATCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTG
290 CTCTTA-CTTATTAATTT----TTGA-AA-TATT-AATA-AATTAGAATTATTT----TATTTTG
* * * *** *
1107897 -GTAAACATATTTATTTTTT
342 AATAAGC-T-TGTATGAATG
* * * * *** * *
1107916 AAATCTCTTATTAATTTT-TGA-AATATCAATAA-ATCAGCATTATTTTATTTCAATAAGCTCGT
1 AAA---C-AATT-GTTTTATGACAA-AACAA-AAGGT---CA-TA-ACGATTT-GA-AA--TAG-
* ** * * * * **** * * * * *
1107978 ATGATTAAAAAACAATTATTTTATAACAAAACCAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGA-TAATC
49 ATAATT---ATTCAAATA-GTCATAAC-TATTTGAA---CTTATTCGA--T-AAACAGATTTATT
* * * * * * * * **
1108041 ATTCAAATGGCCATAGTTA-TT-TTAACTGATTCGGTAAACA-GATTTATTTTTTA-AATTTCAT
103 TTTTAAAT---C-T-TTTACTTATTAA-T--TTC--TAAATATTAATAAATTAGTATAATTT-AT
* ** * ** * ** ** ** * *
1108102 ACTT--ATTAATTTTAGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCCATCCACTCATGTATTA
157 --TTGAAATAAGCTT-G---TATGAATAGAA--AAAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAG-GTT-
** * *** * * * * *
1108164 ATTGAAACAATTGTTTTATGATAA---AT-AAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTT
211 A-T-AATGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATA-GTCATAAC--TATT---T-GA-ACTTGTT
* * * * * * * *
1108225 CAAATAGCAATA-ACTATTCGAACTTGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATTTCTTTCTTAT
265 C-AGTA--AACAGA-T-TT---A-TT-TT--TTAAATCT-CTTACTTATT-AAT---TTT-TGA-
* * * *
1108289 TAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACT-
311 -AA----T---A--TTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * **
1108348 AGAA-AATT-ATTT-T-----AAC---A-GTCTTAACCATTT-AAACT-GATTCAA-TAAACAAA
1 A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGA-T-AATTATTCAAA
* ** * * * *
1108398 T--T--T-A-T-TTTGTAA---ATCTC--T-TACTTATTAATTTTTAAAATATTATTA--AATTA
62 TAGTCATAACTATTTG-AACTTAT-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTA
* * ** * * *
1108448 GTAT-T--ATTCTAAT-----------------TCG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTG
124 ATTTCTAAATATTAATAAATTAGTATAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTG
* * * * ** ** * *
1108491 TTTTACGACAAAATAAAACGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTAT
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * ** * * ** * *
1108556 TTCAA-TTGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTAAAATATT
254 TTGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* ** ** * *
1108620 ATTAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATG-ATCA
317 AATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * *
1108663 AAATCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAAAGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAA
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * ** * * * * *
1108728 TCA-AAATATATTGAAATGGTTTGATAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATCAATTCT
65 TCATAACTAT-TTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T
* * * * * *
1108792 TTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AACAA-CTTATATTAACA-AAAATAATTGT
128 CTAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGT
* * * ** * *
1108854 TTTATAACAAAATATAAA-GTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTAT
190 TTTATGACAAAACA-AAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
1108918 TTGAACTGGCTTGA-TAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTA
254 TTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * *
1108982 ATAAATTAG-TTTATTCTATTCCGAA-AAGCTT-TATAAGATA
318 ATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATG
* * * * * *
1109022 AAATAACTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAA-TAGTTTGAAATAAATAATTATTCATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * ** * ** *
1109085 TCTTAGCTATTTGAAC-TAGTTTGGCATAC-GAATTTATTTTTTAAATCTCGTAGTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* * * * * * * * *
1109148 TTAGAATATTACTAAATCAATATTATTTTATTACG-TATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTA
128 CTA-AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTG
* * * * * *
1109211 TCTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTAT
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
1109276 TTAAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA--GC-T-CTTATTAATTCTTAAAATATTAA
254 TTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* ** *
1109337 TAAATTAGTATTATTTT-TTTCAAATAAGCTTGTATG-TTGG
319 TAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * * *
1109377 AAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAAGATTTAAAATAGATTATTGTTCAAATGG
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
1109442 CCATAATTATTTGAA-TTGATT-TAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACAT
65 TCATAACTATTTGAACTT-ATTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-A-AT
* * * * * * **
1109505 TT-GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTG-GATAAGCTTTTATTAAATA-AAACTATT
126 TTCTAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTA-TGAATAGAAAAAATT
* * *
1109567 GTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
188 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
1109632 ---G----T-TT-GGTAAACTGATTTATTTTTTTCAAATCTCAT-GTTAATTAATTTTTTG-AAT
253 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTT-ATTAA-TTTTTGAAAT
* * *
1109686 GTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAAATG
314 ATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AATG
* * * * * * *
1109733 AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * ** * * * * ** * *
1109798 CTTAACTATTTAAACCAACTC-AGCAGACACATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTACTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * * * *
1109862 AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAT-AAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAGTTGTTT
130 A-AATATTAATAAATTAGTA-TAATTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* * * * ** * * * *
1109926 TATGACAAAA-TAAAGATCAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTG
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * *
1109990 AACTGGTTTGGTAGACACATTTA-TTTTTAAAT-T-TT--TT-TTAAGTTTTGAAATATTATTAA
257 AACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * *** * *
1110049 ATTGGTATTATTTT-TATCCAAATAAACTTGTATGATTAG
322 ATTAGAATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * * *
1110088 AAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * *
1110152 CATAACTATTT-AGAC-TAGTGT-GAAAAATAGCTTTAGGTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
66 CATAACTATTTGA-ACTTA-T-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* * * * * * *
1110214 TTGAAATATTAATAAAGTCA-TATTATTTTATTTTG-GATAAGTTTTTATGAATTA-AAATAATT
128 CT-AAATATTAATAAA-TTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATT
* * * *
1110276 GTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGACTTT-AAAAAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATT
188 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-C
** * * * *
1110339 TATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTCTCTTGCTCATTAATTTTTCG-AAT
251 TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAAT
* **
1110403 GTTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAATG
314 ATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AATG
* * * * * * *
1110450 AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * ** * * * ** * *
1110515 CTTAACTATTTAAACCGACTC-AGCAAACACATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTACTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * * * *
1110579 AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAGTTGTTT
130 A-AATATTAATAAATTAGTA-TAATTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* * * * * * *
1110643 TATAACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTCTTC--A-AGTTATAACTATTTG
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** **
1110704 AA-TTGTTTTAGTAAACAAATTTGGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAAT-
257 AACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* ** * *
1110763 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAG
321 AATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
** * * * * * *
1110803 AAACAATTGTTTTATGGTAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATGGA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * * *
1110868 CATGACTATTTGAA-TTGTTCGATAAACAGATATATTTTTTAAATCTCCTACATGTTAATTTTTA
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTA
* * * *
1110932 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-AGAAATAATTGTTTTA
131 -AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTA
* * ** * * * *
1110996 TGACAAAATAAAAGATCCTAACT-ATTTGAAATAAATCATTGTTAAAACAGTCATAA-TGATTTG
194 TGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTG
* * * * * * * *
1111059 AACTTGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATTTTTTAGTTACTAATTTTTGGAATATTAATAA
257 AACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* ** **
1111124 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATACA-CTTGTATGAACAA
322 ATTAGAATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTGTATGAA-TG
* * * *
1111163 AAATAATTGGTTTATGA-AAAA-AAAAGGTCATAAC----TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
1111222 CATAACTATTTGAACATGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-
* * * * * * * *
1111286 GAATATTATTAAATTTA-TATTATTTTAGTTGGAATAAGCTTGTATGTATAGAAATAATTATTTT
130 AAATATTAATAAA-TTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
* * * * * *
1111350 ATGACAAAATGAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCACAACCATTTG
193 ATGACAAAA-CAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
1111415 GACTTGTTC-GATAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTG-------GA-G
257 AACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * *
1111471 CATT--AA-TATTTTATTTTGAATAAGCCTATAT-AAT-
321 AATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * *
1111505 --ACAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
1111568 TATGAGATTTGAAATATAT-AA-TTATTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT
66 CAT-A-A-CT---AT-T-TGAACTTATTC-GATA---A-ACA-GATTT--A-TT-TTT--TAAAT
* * * * * *
1111630 ATATTTATTTTTAAAATGTTTTACTTATTAATTAACAAAATATTAATAAATTACTATTATTTAAA
111 CT-TTTA--CTT---A----TTA---A-T--TT--CTAAATATTAATAAATTAGTATAATTT-AT
* *
1111695 TT-AGAATAAGCTTGTATGAA-A-AAAATAATTGTTTTTTGACAAAACAGAAA-GTCATAA-GAT
157 TTGA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTTATAATGAT
* * * ** *
1111755 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTT
219 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTT
* * * *
1111820 TTAAATCTTCTT-CTTATTAGTTATCTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-ATTGAAAT
284 TTAAATC-TCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGAATTATTTTATTTTG-AAT
*
1111881 AAGCCTGTATGAATAG
345 AAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * ** *
1111897 AAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGCAATTATTCCAATAG
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
1111962 TGATAACTATTTGAACTTATTCAATACAA-A-ATTTAGTTTTTAAATCTCTTA-TTACTT--TTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATA-AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA-TTAATTT
** * * * * * * *
1112022 GGAAA-ATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTCAAATTAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTT
128 CTAAATATTAATAAATTAGTATAAT-TTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
* * * * ** * * *
1112086 TGTGACAAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTC--ACAGTTATAACTATTTG
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * *
1112149 TAC-TGATT-AGGCCAACAGATTCATTTTTTAAATCTATTACTTATTACTTTTT-AGAATATTAA
257 AACTTG-TTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * ** * *
1112211 TAAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGATTGTATTAATAG
319 TAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
** * * * * * * * * *
1112253 AAACAATTAATTTATGATAGAACAAATGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATTGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * ** *
1112318 TATAACTAGTTGAATCGGT-TT-GGTAAAAAGATTTATTCATTAAATC---T-CTTATTAATTTT
66 CATAACTATTTGAA-C-TTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * ** * *
1112377 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACA-AA-CTTACATGAACA-AAAACATTTG
129 T-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTG
* * * * * * *
1112439 TTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTAT
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * * *
1112504 TT-AAATTGGTTCGGCAAATAAATTTATTTTTTCAATCTCTCAATTATTAA-ATTTCATAATATT
254 TTGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATT
* * ** * ** *
1112567 ACTAGATTATTATTATTTTATTCTGAATAAAATTATATGAA-G
317 AATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * *
1112609 ATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
1 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
1112674 GTCATAACTAATTGAAC-TAGTTAGGTAAGCATATTTATTTTTTAAAT-TTCCTACTTATTAATT
64 GTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATT
* * * * * *
1112737 TTTAAAAATATTGATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAGGTTTGTATG-AT-GAAGAGCAA
127 TCT--AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA-A-AAA
* ** * *
1112799 TTGTTTTATGAC-AAA-AAAA-TTTGA-AACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
186 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * ** * *
1112860 TTATTTGAAC-TGATTCAATAAACTA-AATTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAA
250 CTATTTGAACTTG-TTCAGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * *
1112923 TATTAATAAAGTA-ATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG
313 TATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * * *
1112971 AAACAATTGTTTTATGATAAAATAGAAGGT-ATAAAGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAGTATT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
1113035 CATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAAAT-TCTTGCTTATTAATTT-
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * * * * * * * * *
1113098 TATGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTAAAGAAGCATGTATGAATTGGAACAATTATT
129 TA--AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTT
* * * * * * * *
1113163 TTATGACTAAACAAAAAGTTAGATTGATTTGAAATAGATTATTATTCTAATAGTCTTAACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * *
1113228 GAACTAGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAA-TTTTCATAATATTAAT
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
** * ** **
1113290 AGTTTAGAGA-TATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATGAACAA
320 AAATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * * * *
1113331 AAATAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATTATAAGGAGTTT-AGATAGATAATTGTTTAAATAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
1113394 TTATAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAACAGATTTA-GTTTTAAATC-TATAATTGATT--TTT
65 TCATAACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTT
* * * *** * *
1113454 -GAAATATTAATAAATTATTATTATTTAATTCT-AAATATTTTTGTATAAATA-AAAATAATTGC
128 CTAAATATTAATAAATTAGTATAATTT-ATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGT
* * ** * ** * * *
1113516 TTTACGACAAAAGAAAATATCATAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAAATGGACATTACTATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * * ** * *
1113581 TGAACTTACTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCCAACTCATCAATTTTT-AGAATATTAA
255 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * ** * *
1113645 TAAATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAACTTGTATGAATA
319 TAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * * * *
1113686 AAAGCAATTGTTTTCTAACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTTAAATAAATAAGTGTTTAAATAG
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * *
1113751 TCATAACTATTTAAACTCACTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA--T
65 TCATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* *** * * * *
1113813 -T---T-TT--TGAATT--TAT--TTTATTCCTAATATGGTTTTATGAACA-AAAACAATTAG-T
128 CTAAATATTAATAAATTAGTATAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATT-GTT
* * * *
1113865 TTATG-GAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTGTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * * * *
1113928 TAAACGTGTTTAGAAAATAAATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTCTTAATTTTTGGAATATTAAT
255 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* **
1113992 AATTTTA-AATTATTTTA-TTTGAAATATA-CTTGTATGAACA
320 AA-ATTAGAATTATTTTATTTTG-AATA-AGCTTGTATGAATG
* * * * *
1114032 AAATCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGCCATAA-TATTTTAAAATAGATAATTATTCAGATA
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * *
1114096 GTCATAATTATTTAAACTTTTTC-AGTAAACAGATTCT-TTTTTTAATTCTTTTACTCATTAATG
64 GTCATAACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-
* * * *
1114159 TT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAGTTTGTATGAACT-GAAATAAAT
126 TTCT-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-AAAT
* * * * **
1114222 TGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGGCT
187 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * ** *
1114287 ATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATC
252 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * ** * *
1114352 AATAAATTA-ATACTATTTTA-ATCCAA-AA-CTTGCATGAACAG
317 AATAAATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * * * *
1114393 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAAAACAAGTT-AAAAAAATAATTGCTT-AAATAA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAG
* * * * *
1114456 TCATAACGATTTAAACTTATTCGGTAAACTGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTCATTGT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T
* * * * * *
1114521 CGT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGGTTGTATGAACAAAAAAAATTATT
128 C-TAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTT
** * * *
1114585 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** * * * * *
1114650 AAACTTATTCAATAAATGGATTCACTTTTTAAATCTTGTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAAT
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** *
1114714 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAG-ATGAACTA
320 AAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAA-TG
* * * *
1114755 AAACAACTCTTTT-TGACAAAACAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * *** * * * * * * *
1114819 CATGATTATTTCTTC-TAGTTTGGTAAACATATTTCTTTTTAAAATTTTTTAGTTATTAATTAT-
66 CATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TC
* ** *
1114882 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATACG-AATAAGCTTGTATAAATA-AAAACAATTGT
129 T-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGT
* * * * * * * *
1114945 TTTATAATAGAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGCCAAAACTAT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
1115009 TTGAACTGGTT-TGATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTCTTAC----TAATTTTTGAAATATTA
254 TTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * ** **
1115069 TTAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTACATGAACAA
318 ATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * *
1115112 AAACATTTGTTTTTTGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTCCGAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
1115177 CATAATTATTTG-A-TCAGTTAGGTAAACAAAATTATTTGTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * * * * ** *
1115240 GAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTCAAATAAACTAGTATGAATTCAAAAAAGCTTATT
130 -AAATATTAATAAATT-AGTATAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAA--TTGTT
* ** * * * ** * * *
1115305 TTATGACAAAAC-AAA-GTCATAACAATTTGAAACAGATAACTATTCTTATAATCTTAATTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * * * * * * *
1115368 GAA-TTGGTTTGGTAAATAAATTTAGTTTTTTAATTCCCTTAGTTATTTATTTTTGGAATATCAT
256 GAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * **
1115432 TAGATTA-ATATTATTTTACTCTGAATATGCTTGTATGAACAA
319 TAAATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * ** * *
1115474 AAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTATTCAAATTGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * *
1115539 CATAACTATTTGTAC-TAGTTATG-TAAATAGATTTACATTTTAAATCTTTTACTTATTATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTA-TT-CGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * * *
1115602 TGAAAGATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGAATG-CTCA-AAAAC
129 T-AAATATTAATAAATTAG---TA---TAATTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAAA-
* * * * * * * * *
1115664 AATTATTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTATTGACAT-GACCAT
184 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCAT
* * * * * * *
1115728 AATTATTTGAAC-TGATTTAGTAAACAAATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTACTAATTTTTGGA
248 AACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * *
1115788 AGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
312 ATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * *
1115837 AAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAGTAGATAATTGTTCATACAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* ** * * * * * * *
1115902 CTTAACTATTTGAA-TCGCTTCAACAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACT-TATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * * * * *
1115966 GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACT-CAAACAATTATTT
130 -AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTT
* * * **
1116030 TATAACATAACGAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAA---TTC---T--T--TAA--ATAGG
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * *
1116083 AACCAGTTCGGTATACTA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
257 AACTTGTTCAGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* *
1116147 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-ATG
321 AATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * *
1116185 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
1 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * ** * * * ** * *
1116250 GCCATAATTGTGTGAACCGATTTGATAAACTGAGTTATTTTTTAAATC-TCAACTTATCAATTTT
64 GTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* ** * * * * * * *
1116314 TGAAATATTAATGAAGGAATATTATTTTGTTTCG-AATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAAGTAT
129 T-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGT
* * * * * *
1116377 TTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATGGTTCAAATAGTCATAACTATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** *** * * ** * * *
1116442 TGAACTTGTTTGGTAAATTCATTTATTTTTAAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTG-ATTGTTG
255 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTA
* * * * *
1116506 ATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAACATGTATGAACTA
318 ATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * ** * * * *
1116549 AAAAAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTTGTTTTAA-TAGTCTT-AACTACATGAATTGGTTC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-G--GTCATAACGA-T-TTGAAATAGAT-AATT-ATTC
* * *
1116612 --A-A--CA-AACATATTT--A-TT-TT---TTAA-AGTTTTTACTTATTAATTTAGCAATATTT
59 AAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTATTCGATAAACAG-ATTTA--T-TT--TTTA--AATCTTT
* * * * ** * * **
1116663 TACTCTGAATAAGCTTGTATGAATA--AAAACAATT-G--T--TTTATGACGAAACAAAGATCAT
115 TACT-T-ATTAA--TT-TCTAAATATTAATA-AATTAGTATAATTTAT-TTGAAA-TAAGCTTGT
* * * ** * * * * *
1116721 AACGATTTTAGATAGATAATTGTTCAATTAATCATAAC--TA-TTTA-AACT-AGTTCGATAAAT
172 -ATGA--ATAGA-A-AAAATTGTTTTA-TGA-CAAAACAAAAGGTTATAA-TGA-TTTG--AAAT
** * * * * ** *
1116781 AGAT--TTAGGTT-TTATATCTCTTATTAA-T-TTTCCAA-ATATT-AAAAAATTAG-TATTATT
226 AGATAATT--GTTCAAATA-GTC--A-TAACTATTT-GAACTTGTTCAGTAAA-CAGAT-TTA-T
* * * * ** * * * * * *
1116838 TCATTTTGAATAATTTTATCAATAGAAGCAATTGTTTTATGACA-AAACAAAATGTCATG-ATGA
281 T--TTTTAAAT-CTCTTA-C--T--TATTAATT-TTTGA-AATATTAA-TAAAT-T-A-GAATTA
* ** * * *
1116901 TTTGA-AATAAATAA--TAGT-TCAAATGG
332 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GAAT-G
* * * ** * * ** * * ** *
1116927 ACATGACTATTTTTACTTCTTTG-GTAAACATATTTA-TTTTTAA-AATTTTTACTTA-TTAATT
1 A-A--AC-AATTGT--TT-TATGACAAAACA-A--AAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * * * * ****
1116988 ATTAAAATATTAATAA--A-TT-AATATTATT--TTAATTC-GAATAACCTTGTGTGAA-CAAAA
55 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTATTCGATAA-ACAGATTTA--TTTTTTAAATCTTTT
* * * * * * ** *
1117045 AC-AATT-GTTTCATGACAA-AATAATAAGTCA-TAAAAATTTGAAAT-AAATAA-TTTGTCA--
116 ACTTATTAATTTC-T-A-AATATTAATAAATTAGT-ATAATTT-ATTTGAAATAAGCTTGT-ATG
* * * * ** * ** * ** *
1117102 AACAGTCATAATAATTTGAATTTGTCTGA-TAAACAAAATTATTTTTAAACATTTTACTTA-TTA
175 AATAG--A-AA-AAATTG--TTT-TATGACAAAACAAAA--GGTTATAATGATTTGAAATAGATA
** * * * * * * * ** * *
1117165 ATTGTTTTAATATTAATAA--ATTTGTA-TTATTTTATTTGAAATA-A--GCTTGTTTGAAT-TG
231 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCA-GT-AAACAGATTTATTTTTTAAATCT-
*** *** ** * * * * * ** *
1117223 AAAAAAAATT-ATTTTATGACAA-AACAA-AAGGTTATAGTGATTTCA-AATAAAT-AG-TTGT-
292 CTTACTTATTAATTTT-TGA-AATATTAATAA-ATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA
*
1117281 TCAAATAG
354 T-GAAT-G
** * * ** * * ** ** ** * *
1117289 TCATAATTATATAAACTTGTTCGGTAAACAAATTATTTTTTTAAATATCTT-AATTA-TTAACTT
1 AAACAATTGT-TTTA--TG-AC--AAAACAAA--A-GGTCATAACGAT-TTGAAATAGATAA-TT
* * * * ** * * **** *
1117352 -TT-AGAATATTAATAA--ATTGGTA-TTATTTTATTTCAAATAAACTTCTATGAGCTAAAACAA
55 ATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGA--T-AAACAGA-TT-TATTTTTTAAATC--
** * * * * * * *
1117412 TTCTT--TTATGATAA-AAC-AAA-AGGTCAT-AATGA-TTTGATCTAGTTTAGTAAACATA--T
112 TT-TTACTTAT--TAATTTCTAAATA-TTAATAAATTAGTATAATTTA-TTT-G-AAATA-AGCT
*** **** * * * ** * *
1117468 T-TATTTTTTA-AATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTT-TAA
169 TGTA-TGAATAGAAAAAATT-GTT-TT-A-TGACAAAACA--AA-AGGTTA-TAATGATTTGAAA
* * * ** * * * * **
1117529 TCTGTATTAGCTTGTAT-GAATAGAAATAATTATTTTATGA-TAGGAT-AAAAAATCATAACGAT
225 T-AG-A-TA-ATTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGA--ACT-TGTTCAGTAAA-C---A-GAT
* *** * * * * * * * * * * *
1117591 TTGAGATAAATAATTGTCAAATAGTAATAAATATTTGAACTGGTTTGATAAA-TAGATTTATATT
277 TT-A-TTTTTTAAATCTC--TTACTTATTAATTTTTGAAAT--ATTAATAAATTAGA-AT-TATT
* ** * *
1117655 TTAGATCTCTT-ATTAATTTTCAAAATATTAATAG
334 TT--AT-T-TTGAATAAGCTT----GTATGAAT-G
* ** ** * * ** * *** *
1117689 ATTAGTATTACTTTAT-TCCAAACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTTGTTTTATGACAA--A-
1 A-AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AA---A-A-GGTC-ATAACGATTTGAAATA-GATAATTAT
* * * * * * * * * *
1117749 ACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT-GTTCAAATAG-TCATAATTATTTGAA-CTGG
57 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT---T-ATTCGAT-AAACAGAT--TTATTTTTTAAATCT-T
** * ** ** * * *
1117811 TTAGGTA--AA-ATAGAAATATT-AT-TTTTA--AT-CTCTTATTT--ATTAA--TT-TTTGAAA
114 TTACTTATTAATTTCTAAATATTAATAAATTAGTATAAT-TTATTTGAAATAAGCTTGTATG-AA
* * * *** **** * * * * *
1117863 TACTAATAAATTTGTTCTATTTTATTTTGAATAA-GCTAGT-ATGAATTGAAAATTTGTTTA-TG
177 TA-GAA-AAAATTGTTTTATGACA-AAACAA-AAGGTTA-TAATGATTTG-AAA-TAGATAATTG
* * * * *
1117925 -ACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAAATAAATAATTGTTCA-TATAGTCTTAAATATTTGA
235 TTC---A-AATA-GTCATAACTA-TTTG------A-ACTTGTTCAGTA-A-----ACAGATTT--
** ** ** * ** ** *
1117987 ACTGGTTTGGCAAA-CAAATTTGTTTTTAATTCTCTT-ATTTATTAAT-TTTTGGAA-TATTATT
279 A-T--TTT-TTAAATC-TCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGAATTATT-TT
* ** ***
1118048 TTATTTCGA-ATAAGCT-TAT--ATG
336 AT-TTTGAATA-AGCTTGTATGAATG
* ** * * * * * * * *
1118070 AACAGAAATAATTGTTATGATAGAACAAAAAGTGATAACAATTTGACATATACAATTATTCAAAT
1 AA-A-CAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * *
1118135 AGTCATAACTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATT
63 AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * * *
1118195 TTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGAATG-ATAAAAAAAATTT
127 TCT-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAA-TT
** * * ** * * * *
1118258 GTTAAATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA-ATAATTGTTGAAATGGCCATAATTA
188 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * * * *
1118322 -TTGAAAATTATTCATTAAAGAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATT-ATTTTTGGAATATT
253 TTTG-AACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * *
1118385 AATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTG
317 AATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
** ** * * * **
1118429 AAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAACAATTAGAAATAGATAAATATTCATGTAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
** * * * * * *
1118494 TTTAACTATTTGAAC-TATTTCGATAAACGGATTTATTTTTTTAATCTCTTAATTTTTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * * * * * *
1118558 GAATATTATTAAATTATTATTATTTCATTTCG-AATAAGCTTCTATGAGCT-GAAACAATTATTT
130 AAATATTAATAAATTAGTATAATTT-ATTT-GAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAAAAATTGTTT
* * * ** * * * * *
1118621 TATAACAGAATAAAAGGTTATAACAATTTCAAATAGGTAATTATTTAAACA-T-A-AACTA---G
192 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
*
1118680 ----T-TTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
257 AACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * ** *
1118739 ATTAGCATTGTTTTATTTCAAATAGGCTTGTATG-ATG
322 ATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* ** * * * * * *
1118776 AAAAACAATTGTTTCATGATGAAACAAAAAGTTCATAGCAATTCGAAATAGATAATTGTTAAAAT
1 --AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * *
1118841 GGTCATAATTATTTGAACTAATTCAATAAACAGATTCACTTTTTAAA----TTCCTTATTAATTT
63 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* * * * * * * *
1118902 TTGGAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAA-CAATAATTTATGAATTGAAACAAT
128 CT-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGC--T--TGTATGAATAGAAAAAAT
* * * * * * * *
1118966 TGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTCGTAACT
187 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * *
1119031 ATTTGAATTTGTTCAG-AAATA-ATTT-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATT
252 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * *
1119093 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATTAACTA
317 AATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * *
1119137 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-G
* * * * * * * *
1119202 T-ATGACTGTTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTGT-
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TC
* * * * * * * *
1119265 TGACATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCGAAATAAACTTGTATGAACA-AAAACAATTATT
129 T-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTT
* * * * * *
1119329 TTATGATAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
1119394 GAACTTATT-TGATGAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATTTG-AATATTAA
256 GAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAA
* * **
1119457 TAAATTTA-TATTATTTTAATTAAAATAAGCTTGTATGAATAG
319 TAAA-TTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * *
1119499 AGAA-AATTATTTTAT-ACGAAACAAAAGTTTATAACGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAG
1 A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * ** * * *
1119562 TGATAACTATTTAAACTTGTTTAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * * *** * * *
1119627 AGAATCTTAATAAATTAGAATTATGTTATACCAAATTAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT
130 A-AATATTAATAAATTAGTATAAT-TTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
* * * * * * * * * *
1119692 GTAACAAAACAAAAGGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTCTACAAACAATTACAACTATTT-A
193 ATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** *
1119756 TA-TTGGTCAAGCCAACAAATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAA
258 -ACTTGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
* * * * *
1119818 T-AATTAGTATTACTTAATTTCGAATAAGAC-TGTATCAATAG
319 TAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAAT-G
* * * * *
1119859 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAATA-ATCATAATGATTTGAAATAAATAACTT-TTCAAATT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATA
* * * * * *
1119922 GTTATAACTATTTGAA--TAGGTTTGGTGAACAAATTTA-TTTTTAAATC---T-CATATTAATT
64 GTCATAACTATTTGAACTTA--TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-T
* * ** * * * *
1119980 TTCAAAATATTAATAAATTAATATTTTTTTATTTCG-AACAAGCTTATATGAACA-AAAACATTT
126 TTCTAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATT
** * * * * * * *
1120043 GTTTTGCGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTA
188 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *
1120108 TTTGAA-TTGCTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATAT
253 TTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATAT
* * * *
1120171 TATTAGATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAA-G
316 TAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * *
1120214 ACAAATAATTATTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
1 --AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** * * * *
1120279 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAGCATATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTT
64 GTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * * * *
1120344 TAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAGGCTTGTGTG-AT-GAAAAATAATTA
129 TA-AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAAA-AATTG
** *** * * * *
1120406 TTTTATGATGAAACAAAA-GTTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTA
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** ** * ** * *
1120470 TTTTAAC-TGATTTTGTAAAGTGATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTCTTAAATTTTGAAATATT
253 TTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * *
1120534 AATAAAGTA-ATATTATTTTATATTGGATAAG-TGTTTATGAACTG
317 AATAAATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TGTATGAA-TG
* * * * * *
1120578 AAACAATTGTTTTAT----AAACATATGGTCATAATGATTTTAAAT-GTATAAATGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
1120638 TCATAATTATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTTAAAT-TTCTTGCTGACTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTT
* * * * * * * * * *
1120702 TTGGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCATGTATAAATTGAAATAATTAT
128 CT-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGT
* * * * * * *
1120766 TTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAATTATTTGAAATATATAATTGTTCTAGTAGTCTTAACTATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * *
1120831 TGAA-TTAGTTTAACAAACACATTTACTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-ATAACATT
255 TGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATT
* ** * * *** * *
1120894 ATTAGTTTGGCAA-TATTTTACTCCAAATATGCTTGTATGAACAG
317 AATAAATTAG-AATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * ** * * *
1120938 AAACAATTGCTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAATAATTTGAGATAGACAATTGTTCAAATAG-
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *
1121001 CAATAACTATTTGAACTGGT-TTGGA-AAATAGATTT-TGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATT
66 C-ATAACTATTTGAACT--TATTCGATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * * **
1121059 TTTAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTCT-AAAAAATTTTGTATGAATA-AAAATAATT
127 TCT-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATT
* * * * *
1121122 GTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGAAT-ATGACT
188 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACT
* * * *
1121186 ATTTGAACTTGTTCGGTACATAGA-TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AGAATAT
252 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATAT
* ** *
1121249 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAGTGG
316 TAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * *
1121294 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGAG-CATAATGATTTGGAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
** * * * * *
1121358 TCATAACTATTTGAACTCGTTTGGTAAACAAATTTATTATTTAAAGCTTTTACTTATTAATTT-T
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* * ** * *
1121422 AGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACT-GAAATAATTAG-T
130 A-AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATT-GTT
* * *
1121485 TTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAGCTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** ** * * *
1121550 GAA-TGTATTCAAAAAACTTATTTATATTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTGTGAAATATTAAT
256 GAACT-TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * *
1121613 AAATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGTTTGCT-TGAA-C
320 AAA-TTAGAATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTG-TATGAATG
* * * * * *
1121652 ATAACTAATTATTTTATGAC-AAACTACAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGAT
1 A-AAC-AATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * * *
1121716 AATCATAGCTATTTGAACATATTC-AGTAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTCCTCATTAATT
63 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * ** ** * ** * *
1121780 TTTGATAA-A-CAGATTTATTTTTAAAACCTCTTA-TT--AAT--TTTTGAAATATTAATAGATT
127 TCT-A-AATATTA-ATAAATTAGTATAA--T-TTATTTGAAATAAGCTTG---TATGAATAGA-A
** * ** * * * ** *
1121838 AGCA-T-TTTTAT-TCCGAAC-AAA-CTTAT-ATGA---GAAA-AAATAGTTGTT-TTAT-GACA
182 AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *** ** * * * * * * * * *
1121891 AAACAAAAGGTAATAATGATT-TGAACA-A-A-TAATTATTCAAATACTCATAATTATTTGAACT
247 TAACTATTTG-AA-CTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTA-TT-AATT
** ** * * * ** * ** *
1121952 GGTGAGGTA--AACATAATT---ATT-TTTTAAATCTCTCACATATTAATTTTTAAAATATT
306 TTTGAAATATTAATA-AATTAGAATTATTTT--AT-TTTGA-ATA--AGCTTGTATGA-ATG
* *** *** * * * * * * **
1122008 AATA-AATTCATTTTATTTTATTTCGAATAAGCT-AGT-ATGAATTCAAA-AAAAAATTATT-TT
1 AA-ACAATT-GTTTTATGACAAAAC-AA-AAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * *** ** * * * * * * * **
1122068 AT-GACAAAAC-AAAAGGTCATTA-T-GATTTGAAATAGA-TAATTGTTCATATAGTCTTAAATA
61 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TTATTCGA--T-AAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTTTTACTTA
* ** * * * * * * *
1122128 TTTGAACTAGTTCGACAA-ACAAACTTATTTA-T-TAATTCTCTTAGTTATTAA--TT-TTTGAA
121 -TT-AA-T--TTCTA-AATATTAA-TAAATTAGTATAATT-TATTTG-AAATAAGCTTGTATG-A
* ** * * * *** * * ****
1122187 ATATTATTAGATTAGTATTATTTA-ATTCCGAATAAGCTTGT-ATGAACAAAAATA-ATTATTTT
176 ATA-GAAAAAATT-GTTTTA-TGACAAAAC-AA-AAGGTTATAATGATTTGAAATAGA-TA----
** * * * * * *
1122249 ATGATAGAACAAA-AGGCTATAA-TGATTTGAAGTT-TACAATTGTTCAAATAG-TCATAATTGT
231 AT--T-GTTCAAATAGTC-ATAACT-ATTTGAACTTGTTC-A--G-T-AAACAGAT--TTATTTT
* * * * ** ** * *
1122310 TTGAA-CTACTT--TGATAAATAGATTT---AT-TTCTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTTTG-
284 TTAAATCT-CTTACTTATTAAT--TTTTGAAATATTAATAAAT-T-AGAATTATTTTA-TTTTGA
* * *
1122366 A-AAGATT-AATAAATG
343 ATAAGCTTGTATGAATG
* * * ** * * ***
1122381 AGTATTATCTCATTCCGAATAAGCTTGAATGTTCAAATAC-AATTGTTATATGACCA-AACAAAT
1 A--A--A-C-AATT--G--T----TT-TATG-ACAAA-ACAAAAGGTCATA--ACGATTTGAAAT
* ** * * * * *
1122444 AGTAATAATGATTTGTAATA--AATAATTGTTGACATGGCCATAATTATTTGAATTGATTGGGTA
47 AG--ATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATT----T-G--A-ACTTATTCG-A-T-A------A
* *** * * * * * * *
1122507 A-ACATATTCACTTTTTAAATCATTTACTTATTAAATTT-TAGAATATGAATAAATTTATTTTAT
92 ACAGAT-TTATTTTTTAAAT-CTTTTACTTATT-AATTTCTA-AATATTAATAAA-TTAGTATAA
* * *
1122570 TTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA
152 TTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
* * * * * * * ** * *
1122633 CGATTTGAGATAGAAAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTAAAC-TGCTTTGGGAAACATATTT
215 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTT
* * * *
1122697 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGTAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAA
279 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAA
* *
1122761 TAAGCTTGTTTGAACTA
344 TAAGCTTGTATGAA-TG
* * * ** * * * *
1122778 AAACAACTATTTTATAACAGTACAAAAGGTTATAATGAATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * *
1122842 ---AA--A-TTG---GT-TT-GATAAATAGATTTATTTTTAAAATCTACTACTTACTAATTTTTA
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-
* * ** * *
1122896 AAATATCAATAAATTAGTATTATTTTATACCG-AATAGGCTTGTATG-GT-GAAAAACAATTGTT
130 AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTAT-TTGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAAA-AATTGTT
* * * * * *
1122958 TTCTAAC-AAA-AAAAGTTTCTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * ** *
1123021 GAAC-TGATTTAATAAATTGACTTATTTTTAAAATCTCCAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT
256 GAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * *
1123085 AAATTA-ATATTATTTTA-TTTCAGATAAGCTTTTATGAACTA
320 AAATTAGA-ATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TG
* *** * * * * *
1123126 AAACAATTGTTTTATGATC-AAACAAAAAGTCATATTTATTTTAATTAGATAATTGTTTAATTAG
1 AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
1123190 TCA-AACTATTTGAGCTTGTTTCG-TAAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTG
65 TCATAACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-
* * * * * * * * ** **
1123252 CCAAAATAATAATAAATTAATATGATTTTAATTCG-AATAAACTTGTATGAACATAAGCAATAAT
128 -CTAAATATTAATAAATTAGTAT-AATTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGT
* * * * ** * **
1123316 TTTATGATAAACCAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
1123381 TGAACTTGTTCAATAAACAAATTTACTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTGTCTT--AATATTA
255 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTA
* * *** *
1123444 ATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAG
318 ATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* ** * * * * *
1123487 AAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
1123552 CATAATTATTTAAAATTATTC-AGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTT-CATTATTAATTT-
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC-TTATTAATTTC
* * * * *
1123614 TCAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAACTA-AAATAATTA
129 T-A-AATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTG
* ** * * * * *
1123677 TTTTATTACAGCACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTAT
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * ** * * * * **
1123742 TAGATCTAGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTATCAAAATATTA
254 TTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * *
1123806 ATAAATTAGTATTATTTTA-ATCCAACTAAGCTTCTGTGAATGG
318 ATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * ** * * * **
1123849 AAACTATTATTTTAT-AAAAGAAAAAAATGTCATAATAATTTGAAAGAAATAGTTGCTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * ** * * *
1123913 TTATAGCTATTTGAAC-TAGTTTAATAAATAGATTTA-TTTTTAAA--ATTT-CTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * * ** * ** * *
1123973 TGAAATATTATTAGATTAATATTTTTTATTCCGAACA-AA-CTTACATAAATA-AAAACATTTGT
129 T-AAATATTAATAAATTAGTATAATTTATT-TGAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGT
* * * * * * *
1124035 TTTATAACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATGATTATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
1124100 TGAACTAGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAAAATTAG
255 TGAACTTGTTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
*** *** * *
1124164 TAAATTCATTTTTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAATTT
319 TAAATT-AGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * *
1124207 AAA-ATATTGTTTTATGATAAAACAAAA----AT---GATTTGAAATATATAATTGTTCATATAG
1 AAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
1124264 TCTTAACTATTGGAA-TTAGTTAGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATT
65 TCATAACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATT
* * * * * * * * *
1124328 TTTTAACATTATTATATTACTATTATTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTATT
127 TCTAAATATTAATAAATTAGTATAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTT
* * * *
1124391 TTATGACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTACATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * *
1124456 AAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTCTTTAAA--AC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGACTAATA
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * **
1124517 AATTAGTATTATTTTATTCT-AATAAACTTGTATGATAAA
321 AATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATG
* * * * * * * *
1124556 AAATAATTGTTATATGATC-AAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * ** *
1124620 TCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAAC-GAATTTACTTTTTAAATCACTTCCTTATTAACTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTT
* * * ** *
1124684 -TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTAA-CTTGAACAAACTA-AAACAATTG
128 CT-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTG
* * * * *
1124746 TTTTATGCCAAAACCAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATACT-GTCTTAACTA
189 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTA
* * * *
1124810 TTTGAAC-TGCTTC-GACAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATA
253 TTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATA
* * * * *
1124872 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTG
315 TTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * * * * *
1124918 AAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAAGTTATAACAATTTGAAGTATATAATTATTTAAATAG-
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
1124982 --GAACTA---G------TTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAAT-TTTCTACTTATCAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT-TACTTATTAATTTCT
* * *
1125035 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAGGCTTGTATG-AT-GAAAAATAATTAT
130 -AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAAA-AATTGT
* * * * *
1125097 TTTATGAC-AAACAAAA-GTTCATAATGATTTGACATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTAT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
*** ** * * * *
1125160 TTGAACAAATTC-GATAAATTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTA
254 TTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * * *
1125224 ATAAAATA-ATATTATTTTATATTGGACAAGTTTTTACGAGCTG
318 ATAAATTAGA-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATG
* * *** * *
1125267 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTATTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * *
1125332 CACAACTATTTGACCTTGTTC-AGTAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTCTCATTTATTAATTT
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT-T-ACTTATTAA-TT
* * * * * * * * *
1125395 TTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACA-AAATGAATTAT
127 TCTAAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AAATTGT
** * * * * ** * *
1125459 TTTATGAGTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATACTTACTCTAATAGTCTTAACTATT
190 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * *
1125524 TGAACTAGCTCTA-CAAACACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-AGAATATTA
255 TGAACTTGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * * ** * * **
1125583 TTAATTTAGTAA-TATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAACAA
318 ATAAATTAG-AATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * ** * *
1125626 AAATAATTATTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAAAAATTTGACATAGATAATTATTCAAACAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
1125690 CATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT
* ** *
1125750 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
130 -AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTT
** * * * * * * * * *
1125814 TA-GTACAAAACAAAATATGATAACGATTTAAAATGGATAATAGTTCAAATGGCCATGACTGTTT
192 TATG-ACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * ** *
1125878 GAACTCGTTTGGCAAACAAATTTATCTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTACT
256 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * **
1125942 AAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAAATTGTATGAATAG
320 AAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * *
1125983 AAATAATTGTTTAATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * *
1126048 TATAACTATTTAAACTCACTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-
* * * ** * * * * * *
1126113 GAATTTTAATAAATTAGTATTATGTTATTCCAATTAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTCTA
130 AAATATTAATAAATTAGTATAAT-TTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTA
* * * * *
1126178 TGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAAAGGTAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
194 TGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * * *
1126243 CATGTTTAGAAAACATATATATTTTTAAAAT-TTTTTCTTATTAATTTTT-AGAGTATTAATAAA
259 CTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAA
* * * **
1126306 TTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGTACA
323 -TTAGAATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATG
* * *
1126343 AAACCAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-TTCTAAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * * * *
1126406 GTCATAACTATTTGAACATGTTCAACAAACATATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTT
64 GTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTC
* * * * * **
1126471 TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-TAAACCATTGTT
129 T-AAATATTAATAAATTAGTA-TAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTT
* * * * * * * * *
1126535 TTATTACAAAATAAAATGTCACAATCATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCA-AGACTATT
191 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATT
* * * ** *
1126599 TGAACTTG-TCTAGTAAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATAATA
255 TGAACTTGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTA
1126662 ATAAATT
318 ATAAATT
1126669 TTTGAAATAA
Statistics
Matches: 24834, Mismatches: 6418, Indels: 5254
0.68 0.18 0.14
Matches are distributed among these distances:
313 1 0.00
314 3 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (359 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTA
AATATTAATAAATTAGTATAATTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATG
ACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
GAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
Found at i:1096284 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1095402--1099830 Score: 3160
Period size: 181 Copynumber: 24.7 Consensus size: 180
1095392 TGAAATCTGG
* * *
1095402 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTCTATGA-C
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* * * * *
1095466 AAAAAAAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAGTTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATA
66 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * * *
1095529 G-CTATAATTGTTTGAATTGATTC-GATAAACTTATATATCTTTTAAATCTCC
131 GTC-ATAACTATTTGAACTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * * *
1095580 AACTTCTCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGTATTAGCGTT-TATAAG
1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-TTGTATGA-
** * * * * *** * * *
1095644 T-TGAAACAATTTTTTTATTATAAAACACAAGGTCATAGCAATTTTAAATAGATAATTATTTAAA
64 TCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
*
1095708 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACGAATTTATTTTTTAAA--T-T
129 TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* *
1095758 T-CTTATTAATTTTATG-AATATTAATCAAA-TAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCATGTATGA
1 TACTTATTAATTTT-TGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
* * * * ** * * * *
1095820 ACTAAAACAATTAG-TATATAATTAAACAAAAGGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
64 TCAAAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * *
1095884 ATAGTCTTAACTATTTCAACTAGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC-
128 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * * * ***
1095937 T--TT-TTAATTTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAA
1 TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-A
* * * * *
1095998 T-AGAAACAATTGTTTCATGATAAAAC--AAGGATCATAATGATTTGAAATTGATAATTGCTCAA
64 TCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* ** * * *
1096060 ATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGACTTATTTTTTAAATCTCT
128 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * *
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1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATC
* * * *
1096179 AAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTAGAAATAGATAATTGTTCAAATG
66 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
1096244 GCCATAATTATTTTAACTGATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCT
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* * * * *
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* * * * *
1096360 TAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATA
66 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
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131 GTCATAACTATTTGAA-CTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTT-AAATCT-CT
* * * * * *
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1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AT
** * * * * * * *
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65 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
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130 AGTCATAACTATTTGAA-CTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * **
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1 TACT-TATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * *
1096723 -AAAGAAACAATTGTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAATAATTTGAGATAGATAATTGTTTAA
64 TCAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *
1096786 ATAGTGATAATTATTTGAACTGGCTT-AATAAACATATTTAGTTTTTAAA--TC-
128 ATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * * * * * *
1096837 -GCTTATTAATTTTCAAAATATTAATGAATCAATATTATTTTAATTCTAAATAA-TTATGTATGA
1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTGAATAAGCT-TGTATGA
* * * ** *
1096900 ACAGAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
64 TCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * ***** *
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129 TAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * ** * * * *
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1 TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GA
* * * * * *
1097082 T-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGATCATAACT-ATTTGAAACAAATAATTGTTCAA
64 TCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * ** * *
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128 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
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** *
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65 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * ** * * * * *
1097325 CAGTCCTAACTATTACATCATGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTC-
129 TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * *** *
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1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT
* * * *
1097441 CATAAACAATTGTTTTATGACAAGAA-AAGAGGTCATAGA-GAGTTAAAATAGATAATTGTTCAA
65 CAAAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* ** * * * *
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128 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
1097557 TACTTGTTAATAGTTTG-AATATTAAAAAATTTGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGA
1 TACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATG-
* **
1097620 AT-AGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTC-TAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTC
63 ATCA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
1097682 AAATAGCCATAACCATTTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCT
126 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** **
1097738 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAAATGA--
1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATC
* * * * ** * ** * * *
1097801 AATGAAATAATTTTTTTATGATAAAATAAAACATCCTAACAATTTAAAATAGATAATTATTTAAA
66 AA--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
1097866 TAGCCATGACTATTTGAACTTATTCTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
129 TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * *
1097919 TACTTATTAAGTGTCT-AAATATTAATAAATTTGTATAATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGA
1 TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGA
** * ** ** * *
1097982 AGAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAGCGATTTGAAAGAGGTAATTGTTCAA
64 TCA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * *
1098046 ATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTCAGTTTTTAAA--T-G
128 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * ** * **
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1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-TGAT
* * * * ** * *
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* * ** ***
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* ** * * * * *
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1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GAT
* ** ** * * * *
1098335 -AGAAACAATTGTCATATGACAAAACAATTGGTCATAATTATTTAAAATAAATAATTATTCAAAT
65 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * ** * *
1098399 TGTTATAACAAATTAAACTGGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA--T-G
130 AGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
** * * ** *
1098448 T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAATTTATATGAAT
1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AT
* * * * * * *
1098512 -GAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATCATTATTCATAT
65 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
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130 AGTCATAACTATTTGAACTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * *** * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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1 -TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT
* * * * *
1098873 GAAAAGA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAA
65 CAAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * ** * *
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* * * * * *
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** * * * ** * ** * * * *
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64 TC--AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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65 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** * *
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130 AGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * * *
1099351 TACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGCA
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* * * * * * *
1099415 T-AAAAACAGTTGTTTTGTGATAAAAC-AAAGATCATAATAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAA
64 TCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* ** * * *
1099478 TAGCCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTGAA--TC-
129 TAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
**
1099528 T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATC
1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATC
* *
1099592 AAAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-
66 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
1099656 GGCTACAATTATATT-AACTGATT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
131 GTC-ATAACTAT-TTGAACTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * *
1099708 TACTTATTAATATTAGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGCATATGGTTGTATTATC
1 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATC
* * * *
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Statistics
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* * ** * * **
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** * * * *
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** * * ** * * * * **
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* * * * *
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* ** * *
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** * * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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128 ATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAAC
* * * * * *
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** *** * * * *
1100964 AATAATTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTACGATGAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAT-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * ** **
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* *
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1 AAATTTATTTTTT-AAA---TTT-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * *
1101140 ATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTAG-AACAATTGTTTTATCATAAGACAAAAAGGTCATAACGA
60 ATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGATAA-AC-AAAAGGTCATAACGA
* * * * * *
1101204 TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTAGAACTT-GTTTGGTAGAC
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*
1101259 AAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAAGTTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTT
1 AAATTTATTTTTT-AAA--T-TT-CTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * *
1101323 ATTCCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTATT-TGACTAAACAAAAGGTCA-AAGTGA
60 ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT-TTATGA-TAAACAAAAGGTCATAA-CGA
* * * * *
1101386 CTTGAAATAGATAATT-ATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCAACAAAC
122 TTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAAC
* * * * * *
1101441 ACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCC
1 AAATTTATTTTTTAAATTTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTC
* * ** *
1101505 GATTAAGCTTGTATTATTAGAAACAATTATTTTATG
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Statistics
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Consensus pattern (176 bp):
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AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
GATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAAC
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* * ** * * * * *
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** ** * ** * * * *
1101618 TTTTTGAAATATTAATAAAGCATTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGACCT-GAAATAAT
64 TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAAT
* * ** * * *
1101682 TTTTTTATTATTAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTATTTA
128 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
1101734 AATAGTCA-AATCTATTTGAACGTGTTC-GATAAACAAATTTAGTTTTTAAAATCTCTTGCTCAT
1 AATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTT-AAATCT-TTACTTAT
*** * *
1101797 TAATTTTTTTAGTGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAG-TTGTATGAACT-GAAA
61 TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA
* * * * ** *
1101859 GAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATTGGTT-T
124 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCA
* * * * * * * * *
1101915 GACAGTCTTAACAATTTAAACTGGTTTAGCAAACACA--T-TTTTTAAATC--T-CTTATTAATT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTTTACTTATTAATT
*** * * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* * *
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126 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
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1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * * * *
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63 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * * *
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* * * * *
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** ** *
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* * *
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128 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * ** *
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1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTAT-TTTTAAATCTT-TACTTATTAA
* * ** *
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***
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128 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * *
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1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACAAATTTA-TTTTT-AAATC-TTTACTTATT
*** * * * *
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*
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATC-TTTACTTATTAAT
* ** * * * * * * **
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* * * * *
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* * * *
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*** ** * * * *
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* **
1103470 TTGTTTGTA--ACAAAACAAAAGG-CTATAACGATTTGAAATAAACGATTGTTC-
127 TTGTTT-TATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* ** * * *
1103521 AATCAGTCATAACTATTTGCAA-TAGTT-AGGTTGACAAATTCATCTATTAAATCCATTACTTAT
1 AAT-AGTCATAACTATTTG-AACTTGTTCA-GTAAACAAATTTAT-TTTTAAAT-CTTTACTTAT
* * * * * ** * *
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61 TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* * * *
1103649 ATTATCTTATGACAAAA-AAAATGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
126 ATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
** * * * ** * * *
1103703 AATTTTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTGAA--TGT-CTTATTAAT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTACTTATTAAT
* * * * * ** * * * *
1103765 TATCACAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTACAAACAAATTTATATGAACAAAAACATTTG
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* * * * *
1103830 TTTTACGAGAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCA
130 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * *
1103880 TATAGCCTTAATTATTT-AAATTGGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * * * * *
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63 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * *
1104009 T-TTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAAAGATTTGAAATATG-TAATTGTTCA
128 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA-GATAATTGTTCA
* * ** * * * * *
1104060 AATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGTGAACACATTTAATTTCTAAATCTCCTATTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTT-ATTTTTAAATCT-TTACTTATT-A
*
1104125 ATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
63 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1104161 TGAACAGGCT
Statistics
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Consensus pattern (179 bp):
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Alignment explanation
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1101684 TTTTATTATT
* * * *
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* * * *
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* ** * ** * * * * *
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* *** * * **
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* * * * * * * * * *
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* * * * **
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*
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* * * * * *
1102224 AAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATGGACATGACTATTTGAACTTG
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** * **
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256 AATTTA-TTTTTAAATCATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
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* * ** *
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* * *
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*
1102738 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACA
508 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
** * * *
1102763 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAACCATTCAAATCGTCATAACTATTTGAATTTGT
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT
* * * * **
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66 TCAATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGT
* * * *
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* * * * * * *
1102955 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAGT-AGTTATGACTATTTGAACATGTTCGGTAAATA
193 CATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAA-TCAGTCATAACTATTTGAATA-GTTAGGTAAACA
* * * * *
1103019 TATTTATTTTTAAAATCATTTACTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATTATTATTTTAAT
256 AATTTATTTTT-AAATCA-TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
1103084 TCGAATAAGCTTGTATGAACA-AGAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAATGATTTG
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* * * * *
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* * * * *
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* **
1103273 GTATGAAGAGAAAA-AATCATTTTATGACA
504 GTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
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* * ** * ** **
1103367 TCAATAAACATATTTAGTTTTTAAATGGCTTACTTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAAAA
66 TCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * *
1103432 ATATGTTA-TTCTGAATAAGCTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTGTAACAAAACAAAAGGCT-A
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** **
1103495 TAACGATTTGAAATAAACGATTGTTCAATCAGTCATAACTATTTGCAATAGTTAGGTTGACAAAT
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* * * * * * *
1103560 TCATCTATTAAATCCATTACTTATGAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGCATCACTTTGTTTTG
259 TTAT-TTTTAAAT-CATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
* *
1103625 AATAAGATTGTATCAATAGAAACAATTATCTTATGACAAAA-AAAATGGTCACAATGATTTGAAA
322 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT-TTATGACAAAACAAAA-GGTCA-AATGATTTGAAA
** * * * *
1103689 TAGATAATTGTTCAAATTTTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTGAAT
384 TAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * * ** *
1103754 GTCTTATTAATTATCACAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTACAAACAAATTTATATGAAC
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* * *
1103819 AAAAACATTTGTTTTACGAGA
512 AAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
1103840 AAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAATTATTTAAA-TTGG
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-G
** * * * * *
1103904 TTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGT
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* * * * * *
1103969 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTTTTTATGACAAAATAAAAGGC-CA
130 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTATAACAAAACAAAAGGCTCA
* ** * * * *
1104033 TAAAGATTTGAAATATGTAATTGTTCAAAT-AGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGTGAACACA
195 TAACGATTTGAAATAAATAATTGTTC-AATCAGTCATAACTATTTGAA-TAGTTAGGTAAACAAA
* * *
1104097 TTTAATTTCTAAATC-TCCTATTTATTAAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
258 TTT-ATTTTTAAATCAT--TACTTATT-AATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * *
1104160 TTGAACAGGCTTGTATG-ACA-AAACAA-AAGTTTAT-----AAC-------C-----ATTTGAA
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** *** * * * * *
1104205 AT-GATAATTGTTTGAATGGCCATAATTATTTGAATTGATTCGATAAAC-TGATTTAGTTTTTAA
383 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAACAT-ATTTATTTTTTAA
* * * * * * *
1104268 ATTTC-CATT--TT-TGA-AATATTAAT-AATGTAATATTATTGTATTTTG-GATAAGCTTTTAT
446 ATGTCTTATTAATTATCAGAATATTAATAAAT-TTATATTATT-T-TATTGAAATAAGCTTGTAT
* *** *
1104326 AAATTGAAACAATTGTTTTATGATA
508 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
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1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT
*** * * * * * * *
1104416 TTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTCCTTATTAATTTT-ATGAGTGTTAATAAAATAG
66 TCAATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-GAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
1104480 TATTATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGG-
129 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATT-GTTTATAACAAAACAAAAGGC
* * * * * **
1104543 TCAAAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAT-AGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCA-ACAAA
192 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTC-AATCAGTCATAACTATTTGAA-TAGTT-AGGTAAA
* * * * * ** * *
1104606 CACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAAT-TTTTA
254 CAAATTTA-TTTTTAAATC-ATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * *
1104670 CTCCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAATGATTT
317 TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AATGATTT
* * * * * * * * ** * * *
1104734 -AAGATA-ACCAATTATTCAAATAGTCATAATTATATGAGCTGGTTCAATAATTAGATCTAGTTT
380 GAA-ATAGA-TAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACATATTTATTTT
* * ** * * * **
1104797 TTAAATCTATTATTAATT-TTTGAAATATTAATATA-CTAGTATTTTTTTATTTTG-AATAATTT
442 TTAAATGTCTTATTAATTATCAG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA--TTGAAATAA-GC
* * ** ** *
1104859 TTTTATGAATAAAAACAATCATTTTACAATA
502 TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * ** *
1104890 AAATAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAA-TAGCTCAAATAGACATGCCTATTTGAACTTG
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** * * ** * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* * *** * *
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* ** * * * *
1105207 TTCGAATAAAATTGTGTGCACAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATCATTTG
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* * * * * *
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381 AAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACATA-TTTATTTTTT
* * * ** * *
1105334 AAATTTTTACTTATTGATTTTTGGAACATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAACTTG
444 AAA--TGT-CTTATTAATTATCAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-TTGAAATAAGCTTG
* * * * * *
1105399 CATGAATAGAATCAATTATTTTATGATA
505 TATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
** ** ** * *
1105427 GGAGGAAAGGTCATATTGTTTTGAAATAGATAATTGTT---A-AG-----A-TATTT--A---G-
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT
* * * * * * *
1105476 ----TAAATAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTCTTGA-AATATTAATAAAATAA
66 TCAATAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTCAGAATATTAATAAATTAG
* * * * * * ** * * *
1105535 CATTATTGTACTTCAAATATGTTTATATGAACT-GAAATGATTATTTTATTACAAAAGAAAAGG-
129 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATT-GTTTATAACAAAACAAAAGGC
* * * * * *
1105598 TCATAATGATTTG----AAATAATT-AT-AATTA-T-TTAA--A-TTG----GTTTGGTAAATAG
192 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAATCAGTCATAACTATTTGAATAGTTAGGTAAACA-
* * * *
1105648 AA-TTATTTTCTAAATCTTTTACTTATAAAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGT-TTATTCTAT
256 AATTTATTTT-TAAATC-ATTACTTAT-TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * * **
1105710 TCCGAATAAGCTTGTGTGAGCT-GAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
318 TTTGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AATGATTT
* * * * * * * * *
1105774 GAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAACTAG-TTCGACAAATCA-ACTTATTTT
380 GAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAA-CATATTTATTTT
* * * *
1105837 TTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTCA-AATTTTTACTAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATA
442 TTAAATGTC----TTATTAATTATCAGAA-TATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-T-TGAAATA
* *
1105899 AGCTCGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATA
499 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * * * * * *
1105933 GAACAAAATGTTATAACAATTTTGCAATAGATAATTGTTCAGATACTTATGACTATTTGAACTAG
1 AAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG
*** * *
1105998 TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAA--TTCATGAAATATTAATAAATTA
65 TTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-G-AATATTAATAAATTA
* * * * *
1106057 GTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAAGAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGG
128 GTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTG-TTTATAACAAAACAAAAGG
* * * * * * * * * * * *
1106121 -TAATATCAATTTAAAATCAATAGTTGATCAAAT-GGCCATAATTATATGAACT-GATTCA-ATA
191 CTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTC-AATCAGTCATAACTATTTGAA-TAG-TT-AGGTA
* ** * *
1106182 AACTAATTTATTTTTTAAATC-TTCAACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTATT
252 AACAAATTTA-TTTTTAAATCATT--ACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
1106246 TTATTTTGGATAAGTTTTTATAAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATG
314 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AATG
* * * * * *
1106310 GTTCT-AAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTATTCGATAAACAAATTTA
376 ATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACATATTTA
* * ** * * * *
1106373 TTTTTTCAAATCTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATGAA-TTAGTATTATTGTATTCCAAATAA
438 TTTTTT-AAATGTCTTATTAATTATCAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-GAAATAA
* * ** * * *
1106437 GCTTATACGAACTGAAACAATTATTATATGACT
500 GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
1106470 AAACAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGT
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT
* * * *
1106535 TCAACAAACATATTTATTTTTTAAA--TCTTA--TATTAATTTT-TGAAATATT-TTAAAATTAG
66 TCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAG-AATATTAAT-AAATTAG
* * * * *
1106594 TATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAA--
129 TATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTG-TTTATAACAAAACAAAAGG
* ** ** * * * * *
1106655 ATCATAATAATTTGAAATTGATATTTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTAAGATGGTTTGGAAAA
191 CTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTC-AATCAGTCATAACTATTTGA-ATAGTTAGGTAAA
* * * ** * *
1106719 CAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTGGTATTATTTTA
254 CAAATTTA-TTTTTAAATC-ATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * *
1106784 TTTCT-AATAAGTTTTTATGAATTGAAACAA-TAGTTTTTTGACAAAACAAACGGTCATAACGAC
317 TTT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTA--TTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AATGA-
* * * * * * * *
1106847 TTT-AAATAAATAATTGTTCATATAGT-AAAATCTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATT
377 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAA-CTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACATATTTATT
* * * * *
1106910 TTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAA-TAAGTATTATTTT-TTCTAAA
440 TTTT-AAATGTC-T--T-ATTAA-TTATCAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-GAAA
** * * * * *
1106972 TAAGCTCATATGAACTAAAATAATTTTTTTATGGCT
497 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * ** * * * * *
1107008 AAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTTATAATCTTAAATATTTGAACTGGT
1 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT
**** * ** *
1107073 TTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTA
66 TCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTA
1107138 TTATTTTA
131 TTATTTTA
1107146 ATCTAAGTAA
Statistics
Matches: 3845, Mismatches: 803, Indels: 535
0.74 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
501 7 0.00
502 33 0.01
503 59 0.02
504 53 0.01
505 17 0.00
506 76 0.02
507 22 0.01
510 7 0.00
511 121 0.03
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513 114 0.03
514 14 0.00
515 15 0.00
516 46 0.01
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519 4 0.00
520 5 0.00
521 1 0.00
522 2 0.00
523 76 0.02
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527 29 0.01
528 2 0.00
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531 9 0.00
532 7 0.00
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542 91 0.02
543 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (532 bp):
AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT
TCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTA
TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTATAACAAAACAAAAGGCTCAT
AACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAATCAGTCATAACTATTTGAATAGTTAGGTAAACAAATTT
ATTTTTAAATCATTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
AGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTATGACAAAACAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAGATAA
TTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATGTCTTATT
AATTATCAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
TGTTTTATGACA
Found at i:1105420 original size:357 final size:355
Alignment explanation
Indices: 1104274--1107145 Score: 1165
Period size: 357 Copynumber: 8.1 Consensus size: 355
1104264 TTAAATTTCC
* * * * * ** * *
1104274 ATTTTTGAAATATTAAT-AATGTAATATTATTGTATTTTGGATAAGCTTTTATAAATTGAAACAA
1 ATTTTTG-AATATTAATAAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGCATGAATAGAAACAA
* * * * * * *
1104338 TTGTTTTATGATAAAACACAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAAT
64 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAT
* * * * *
1104403 TATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TTCTTCCTTATTAATTTTATGAGT
129 TATTT-AA-CTGCTTGGTAAATAGATTTAATTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TG-GA
* * * * * * *
1104467 GTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCA-TATATGAACTGAAACAATTATTTTATGA
188 ATAAATTAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGAATTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGA
* * * *
1104531 CTAAACAAAAGGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCT-TAACTATTTGAACT
253 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACT
*
1104595 GGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
317 -GTTCAA-AAAAACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * ** * * *
1104637 ATTTTTAGAATATT-ATTAGTTTAGCAAT-TTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
1 ATTTTT-GAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGCATGAATAGAAACAA
* ** * **
1104700 TTATTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAATGATTTAAGATAACCAATTATTCAAATAGTCATAAT
64 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAT
* * * ** * * * *
1104764 TATATGAGCTGGTTCAATAATTAGATCTAGTTTTTAAATC---TA-TTATTAATTTTT-GAA-AT
129 TAT-TTAACTGCTT-GGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAA
* * *** * * * * **
1104823 ATTAATATACTAGTATTTTTTTATTTTGAATAATTTTTTTATGAATAAAAACAATCATTTTACAA
192 ATTAAT-TA--A-TATTATTTTATTTCGAATAAGAATTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * * ** **
1104888 TAAAATAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATGCCTATTTGAACTT
253 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-T
* * * * ** *
1104953 GTTCTTTAAACAACTTTATTTTTTAAATCCCCAACTCATTA
317 GTTC--AAAAAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
*
1104994 ATTTTAT-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGTATAAACTT-CTATGAATAGAAACA
1 ATTTT-TGAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGC-ATGAATAGAAACA
* * *
1105056 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATCTAAAATAAATAATTGTTCAGATAGTCATAA
63 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
*
1105121 CTAATTTAACTCGCTTGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA
128 -TTATTTAACT-GCTTGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA
* * *
1105186 AATTAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-AATTGTGTGCACAGAAACAATTGA-TTTATGACA
191 AATTAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGAATTATATGAACAGAAACAATT-ATTTTATGACA
*
1105249 AAACAAAA-GTCATAATC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACATA
255 AAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TG
* * *
1105312 TTCAAAAAATAGATTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTG
318 TTCAAAAAA-ACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* *
1105350 ATTTTTGGAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAACTTGCATGAATAGAATCAA
1 ATTTTT-GAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTTG-AATAAACTTGCATGAATAGAAACAA
* ** ** * **** * * *
1105414 TTATTTTATGATAGGAGGAAAGGTCATATTGTTTTGAAATAGATAATTGTT---A-AG-----A-
64 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAT
* * * * * *
1105469 TATTT-A-------GTAAATAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTCTTGAAATATT
129 TATTTAACTGCTTGGTAAATAGATT-TAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA--
* * * * * * * * * ** *
1105525 AATAAAATAACATTATTGTACTTCAAATATG-TTTATATGAACTGAAATGATTATTTTATTACAA
191 AATTAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGAATTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAA
* ** * * *** *
1105589 AAGAAAAGGTCATAATGATTTG--A-A-ATAATT-AT-AATTA-TT-TAA--A-TTGGTTTGGT-
256 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGTTC
* * * * *
1105642 AAATAGA-ATTATTTTCTAAATCTTTTACTTATAA
321 AAAAAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * ** * *
1105676 AATTTTGAAATATTAATAAA-TTAGT-TTATTCTATTCCGAATAAGCTTGTGTGAGCT-GAAATA
1 ATTTTTG-AATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGCATGA-ATAGAAACA
* * * * * * *
1105738 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAA
63 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ** * * * ** **
1105803 TTGTTTGAACTAG-TTCGACAAATCA-ACTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAA-TTTTCAAA
128 TTATTT-AACT-GCTT-GGTAAAT-AGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
* * * * * ** * *
1105865 TTTTTACTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAG-CTCGTATGAACAAAAACAATTGTTTTA
189 ---TAAATTAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGAATTATATGAACAGAAACAATTATTTTA
* * * * * * * *
1105928 TGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTTGCAATAGATAATTGTTCAGATACTTATGACTATTTGA
250 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA
*** * *
1105993 ACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTA
314 ACT-G-TTCAAAAAAACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * * * * * *
1106034 ATTCATGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAAGA
1 ATTTTTG-AATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGCATGAAT-AGAAACA
* * * * * * * * * *
1106097 ATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTAATATCAATTTAAAATCAATAGTTGA-TCAAATGGCCATA
63 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATT-ATTCAAATAGTCATA
* * ** * ** *
1106161 ATTATATGAACTGATTCAATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTGAAA
127 ATTAT-TTAACTGCTT-GGTAAA-TAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
* * * * * * * * *
1106225 TATCAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAG-TTTTTATAAACTA-AAACAATTGTTTTAT
189 TA--AATTAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGAATTATATGAAC-AGAAACAATTATTTTAT
* *** * *
1106288 GATAAAACAAAAGGTCATAATGGTTCT-AAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
251 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * *
1106352 TTTATTCGATAAACAAA-TTTATTTTTTCAAATCTCTTA-TTA--A
315 -CTGTTC-A-AAA-AAACATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA
* * * * ** * ** *
1106394 TTTTTTGAATGTTAATGAA-TTAGTATTATTGTATTCCAAATAAGCTTATACGAACT-GAAACAA
1 ATTTTTGAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTGCATGAA-TAGAAACAA
* * * * ** * * * *
1106457 TTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAAC
64 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAT
* *** * * * * *
1106522 TATTTGAACTGGTTCAACAAACATATTTATTTTTTAAATC--TTA--TATTAATTTTTGAAATAT
129 TATTT-AACTGCTT-GGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAA
* * * * * * * * *
1106583 TTTAAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAG-CTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATGA
192 ATT--AATTAATATTATTTTAT-TTCGAATAAGAATTATATGA-ACAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * *
1106645 GAAAACAAAA-ATCATAATAATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGAT
253 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-CT
* * ** * *
1106708 GGTTTGGAAAACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTA
317 -G-TT-CAAAAAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * ** ** *
1106750 ATTTTTGAAATATTAATAAA-GTGGTATTATTTTATTTCTAATAAGTTTTTATGAATTGAAACAA
1 ATTTTTG-AATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGCATGAATAGAAACAA
* * * * * * *
1106814 -TAGTTTTTTGACAAAACAAACGGTCATAACGACTTT-AAATAAATAATTGTTCATATAGT-AAA
64 TTA-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC-AATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * * **
1106876 ATCTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCAA
127 AT-TATTT-AAC-TGCTTGGTAAATAGATTTAATTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGA
* * * * * * *
1106941 ATGTTAA-TAAATAAGTATTA-TTT-TTTCTAAATAAG-CTCATATGAACTA-AAATAATTTTTT
188 A--TAAATTAATTAA-TATTATTTTATTTC-GAATAAGAATTATATGAAC-AGAAACAATTATTT
* * * * * ** * ** * *
1107001 TATGGCTAAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTTATAATCT-TAAATATTT
248 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTT
*** *
1107065 GAACTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
312 GAACT-G-TTCAAAAAAACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
*
1107112 ATTTTTGGAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTA
1 ATTTTT-GAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTA
1107146 ATCTAAGTAA
Statistics
Matches: 1899, Mismatches: 454, Indels: 313
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
325 84 0.04
326 30 0.02
327 4 0.00
328 3 0.00
329 5 0.00
330 1 0.00
332 3 0.00
333 2 0.00
334 5 0.00
335 5 0.00
336 6 0.00
337 42 0.02
338 3 0.00
339 52 0.03
340 12 0.01
344 10 0.01
345 84 0.04
346 9 0.00
347 1 0.00
348 2 0.00
349 1 0.00
350 6 0.00
351 1 0.00
352 7 0.00
353 23 0.01
354 61 0.03
355 73 0.04
356 72 0.04
357 364 0.19
358 203 0.11
359 340 0.18
360 55 0.03
361 108 0.06
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363 28 0.01
364 9 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (355 bp):
ATTTTTGAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTTGAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATT
ATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTA
TTTAACTGCTTGGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAAATTA
ATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGAATTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
AAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGTTCAAAAA
AACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
Found at i:1105424 original size:178 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1104274--1105424 Score: 948
Period size: 178 Copynumber: 6.4 Consensus size: 180
1104264 TTAAATTTCC
* * * * * * * * *
1104274 ATTTTTGAAATATTAAT-AATGTAATATTATTGTATTTTGGATAAGCTTTTATAAATTGAAACAA
1 ATTTTTGGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAA
* * * * * * *
1104338 TTGTTTTATGATAAAACACAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAAT
65 TTATTTTATGACAAAACA-AAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * *** *
1104403 TATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TTCTTCCTTATTA
129 TATTTGAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTA
* * * * * *
1104456 ATTTTAT-GAGTGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACT-GAAACA
1 ATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACA
* * * * *
1104519 ATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAA
64 ATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * *
1104584 CTATTTGAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
128 CTATTTGAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * ** * * * * * *
1104637 ATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAAT-TTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAAT
1 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAAT
* * ** * * *
1104701 TATTTTATGACAAAATAAAAATCATAATGATTT-AAGATA-ACCAATTATTCAAATAGTCATAAT
66 TATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAA-ATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * *
1104764 TATATGAGCTGGTTCAATAATTAGATCTAGTTTTTAAATC---TA-TTATTA
129 TATTTGAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * ** * *
1104812 ATTTTTGAAATATTAATATACTAGTATTTTTTTATTTTGAATAATTTTTTTATGAATAAAAACAA
1 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-ACTTGTATGAATAGAAACAA
* ** * * * * * **
1104877 TCATTTTACAATAAAATAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACATGCC
65 TTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* ** * **** *
1104942 TATTTGAACTTGTTCTTTAAACA-ACTTTATTTTTTAAATCCCCAACTCATTA
129 TATTTGAACTGGTTCAATAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* *
1104994 ATTTTAT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTATAAACTTCTATGAATAGAAACAA
1 ATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAA
* * * *
1105057 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATCTAAAATAAATAATTGTTCAGATAGTCATAAC
65 TTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* ** *
1105122 TAATTT-AACTCGCTT-GGTAAATAGATTTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTA
129 T-ATTTGAACT-GGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * *
1105174 ATTTTTGGAATA--AATTAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAAATTGTGTGCACAGAAACAAT
1 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAAT
*
1105237 TGA-TTTATGACAAAACAAAAGTCATAATC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAAC
66 T-ATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * *
1105300 TATTTGAACAT-ATTCAAAAAATAGA-TTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTG
129 TATTTGAAC-TGGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * *
1105350 ATTTTTGGAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAACTTGCATGAATAGAATCA
1 ATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAACTTGTATGAATAGAAACA
1105413 ATTATTTTATGA
64 ATTATTTTATGA
1105425 TAGGAGGAAA
Statistics
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183 5 0.01
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Consensus pattern (180 bp):
ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAAT
TATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
TTTGAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
Found at i:1105953 original size:181 final size:179
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 8.9 Consensus size: 179
1105640 GTAAATAGAA
* * * * * **
1105650 TTATTTTCTAAATCTTTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TTATTCTATTCCG
1 TTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * *
1105714 AATAAGCTTGTGTGAGCTGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * *
1105779 AAATAATTGTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTCGACAAATCAAC
130 AAATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAA-CAAT
* * * *
1105830 TTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAA-TTTTCAAATTTTTACTAAATTAGTATTATTTTATTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * * *
1105894 GAATAAGCTCGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTTGCA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAA
* * * * * * * *
1105959 ATAGATAATTGTTCAGATACTTATGACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGAT
128 ATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-AT
* ** *
1106012 TTATTTTTTAAA--TC-ACTTATTAATTCATGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-A
**** * * * * * * *
1106073 AATAAGCTTGTATGTTGAAAAAGAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTAATATCAATTTAAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * * *
1106138 CAATAGTTGATCAAATGGCCATAATTATATGAACT-GATTCAATAAACTAAT
130 AAATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAAC-AAT
** * * * *
1106189 TTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATC-TCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * ***
1106254 GATAAGTTTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGGTTCT-AAA
65 AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATT-TGAAA
* * * *
1106318 TAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-TTCGATAAACAAAT
129 TAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCGATAAAC-AAT
* * * *
1106370 TTATTTTTTCAAA--TC-TCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATGAATTAGTATTATTGTATTCC
1 TTATTTTTT-AAATCTCTTCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * * ** *
1106431 AAATAAGCTTATACGAACTGAAACAATTATTATATGACT-AAACAAAAGGTCAGAATGATTTCAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * *
1106495 ATAAATAATTATTC-TAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACATAT
128 ATAAATAATTGTTCAT-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-AT
* * *
1106548 TTATTTTTTAAA--TCTT-ATATTAATTTTTGAAATATT-TTAAAATTAGTATTATTTT-TATCC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAT-TCT
* * * * *
1106608 AAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAA-ATCATAATAATTTGAA
64 AAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
** * * * * *
1106671 ATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGATGGTTTGGA-AAACAATT
128 ATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAA-CTAG-TTCGATAAACAA-T
* * *
1106724 TTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTGGTATTATTTTATTTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCT
* * * * * * * * *
1106789 -AATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATAGTTTTTTGACAAAACAAACGGTCATAACGACTTT-AA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAA
* * * * * *
1106852 ATAAATAATTGTTCATATAGT-AAAATCTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAAAT
128 ATAAATAATTGTTCATATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTCGATAAA-CAAT
* * * * *
1106905 TTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATAAGTATTATTTT-TTCT
1 TTATTTTTT-AAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
** * * * * * * **
1106969 AAATAAGCTCATATGAACTAAAATAATTTTTTTATGGCT-AAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTAT-GATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * * * **
1107033 ATAGATAATTATTCTTATAATCTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAACACAT
128 ATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-AT
* * *
1107086 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTA
1 TTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * * * * * *
1107151 AGTAAGCTCG-A--AA--AGAAACAACTGCTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAGCAATTTGAGA
65 AATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * *
1107210 TAGATGATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACT
129 TAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACT
1107246 GTTAGTATTA
Statistics
Matches: 1108, Mismatches: 252, Indels: 116
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.00
176 108 0.10
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA
ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
AATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAT
Found at i:1106392 original size:359 final size:359
Alignment explanation
Indices: 1105681--1107142 Score: 897
Period size: 359 Copynumber: 4.1 Consensus size: 359
1105671 TATAAAATTT
* * *
1105681 TGAAATATTAATAAATTAGT-TTATTCTATTCCGAATAAGCTTGTGTGAGCTGAAATAATTGTTT
1 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTATTCCAAATAAGCTTGTAT-AGCTGAAAGAATTGTTT
* * * * * * * * * *
1105745 TATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAATTGTTTG
65 TATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGATCAAATAGCCATAATTATATG
* *** * * *
1105810 AACTAGTTCGACAAATCAACTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTCAAATTTTTACTAA
130 AACTAGTTCAACAAATCAACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTCAAATTATCAATAA
* * *
1105875 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTCGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAA
195 AGTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTCGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA
* * * * * * * * *
1105940 ATGTTATAACAATTTTGCAATAGATAATTGTTCAGATACTTATGACTATTTGAACTAGTTTGGTA
260 AGGTCATAACAATTCTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATA
* *
1106005 AATAGATTTATTTTTTAAATCACTTATTAA-TTCA
325 AACAAATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTCA
* *
1106039 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCC-AATAAGCTTGTAT-GTTGAAAAAGAATTGT
1 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTA-TTCCAAATAAGCTTGTATAGCTG--AAAGAATTGT
* * * * *
1106102 TTTATAACAAAATAAAAGGTAATATCAATTTAAAATCAATAGTTGATCAAATGGCCATAATTATA
63 TTTATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGATCAAATAGCCATAATTATA
* * *
1106167 TGAACT-GATTCAATAAA-CTAATTTATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTTTGAAA-TAT
128 TGAACTAG-TTCAACAAATC-AACTTATTTTTTAAATCTCT-AACTTATTAA-TTTTCAAATTAT
* * * ** *
1106228 CAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGATAA
189 CAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTCGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGATAA
*** * * *
1106293 AACAAAAGGTCATAATGGTTCT-AAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-
254 AACAAAAGGTCATAACAATTCTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAA-CTAG
* **
1106356 TTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTATTAATTTTT
318 TTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCACTTATTAATTTCA
* * * * * * * * *
1106399 TG-AATGTTAATGAATTAGTATTATTGTATTCCAAATAAGCTTATACGAACTGAAACAATTATTA
1 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTATTCCAAATAAGCTTGTA-TAGCTGAAAGAATTGTTT
* * * * ** * * * * * *
1106463 TATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAAATAATT-ATTCTAATAGTCTTAACTATTT
65 TATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGA-TCAAATAGCCATAATTATAT
* * * **
1106527 GAACTGGTTCAACAAA-CATATTTATTTTTTAAATCT-T-A--TATTAATTTTTGAAA-TAT-TT
129 GAACTAGTTCAACAAATCA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAA-TTTTCAAATTATCAA
* ** * * * *
1106585 TAAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATGAGAA
192 T-AAAGTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTCGTAT-AAACAAAAACAATTGTTTTATGATAA
* * * * * * *
1106648 AACAAAA-ATCATAATAATT-TGAAATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGATGG
254 AACAAAAGGTCATAACAATTCTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAA-CTAG
* * * * *
1106710 TTTGGA-AAACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT-T
318 -TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTCA
* * * * * * * ** * *
1106755 TGAAATATTAATAAAGTGGTATTATTTTATTTCTAATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATAGTTT
1 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTATTCCAAATAAGCTTGTAT-AGCTGAAAGAATTGTTT
* * * * * * * * * *
1106820 TTTGACAAAACAAACGGTCATAACGACTTT-AAATAAATAATTGTTCATATAG-TAAAATCTATT
65 TATAACAAAACAAAAGGTAATAAC-AATTTAAAATAAATAATTGATCAAATAGCCATAAT-TATA
* * **** * * * ** *
1106883 TAAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGT-T-
128 TGAACTAGTTCAACAAATCAACTTATTTTTT-AAATCTCTAACTTATTAA-TTTTCAAAT-TATC
* * * * * * *
1106946 AATAAA-TAAGTATTATTTT-TTCTAAATAAGCTCATATGAACTAAAATAATTTTTTTATGGCT-
190 AATAAAGT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTCGTATAAACAAAAACAATTGTTTTAT-GATA
* * * ** * ** * * * *
1107008 AAATAAAAGGTTAGAATGATT-TGAAATAGATAATTATTCTTATAATCTTAAATATTTGAACTGG
253 AAACAAAAGGTCATAACAATTCTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTAG
* ** * *
1107072 TTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-T
318 TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTCA
* *
1107117 TGGAATATTATTAAATTAGTATTATT
1 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1107143 TTAATCTAAG
Statistics
Matches: 873, Mismatches: 185, Indels: 88
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
353 7 0.01
354 58 0.07
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360 17 0.02
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362 125 0.14
363 4 0.00
364 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (359 bp):
TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTATTCCAAATAAGCTTGTATAGCTGAAAGAATTGTTTT
ATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGATCAAATAGCCATAATTATATGA
ACTAGTTCAACAAATCAACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTCAAATTATCAATAAA
GTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTCGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA
GGTCATAACAATTCTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAA
ACAAATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTCA
Found at i:1107832 original size:645 final size:644
Alignment explanation
Indices: 1106628--1107890 Score: 1407
Period size: 645 Copynumber: 1.9 Consensus size: 644
1106618 GTATGATAAA
* * * * * *
1106628 AAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAATCATAATAATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAGTC
1 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCACAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTC
* *
1106693 ATAACTATTTAAGATGGTTTGGAAAACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA
66 ATAACTATTTAAGATGGTTTGGAAAACAAATTTAGTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGA
* * * * * * *
1106758 AATATTAATAAAGTGGTATTATTTTATTTCTAATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATAGTTTTTT
131 AATATTAAGAAAGTAGTATAATTTAATTTCTAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATAGTTTTAT
* * *
1106823 GACAAAACAAACGGTCATAACGACTTTAAATAAATAATTGTTCATATAGTAAAATCTATTTAAAC
196 GACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTTAAATAAATAATTGGTCACATAG------------AAAC
* * *
1106888 TTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAAT
249 TTGTTCGCTAAACAAATTTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAAT
* * * * * * * * *
1106953 AAGTATTATTTTTTCTAAATAAGCTCATATGAACTAAAATAATTTTTTTATGGCTAAATAAAAGG
314 AAGGATTATTTTTTCCAAATAAGCTCATAAGAACTAAAACAAATATTTTATGACTAAAGAAAAGA
* * * * * *
1107018 TTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTTATAATCTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAACA
379 TCAGAACGATCTAAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAAATATTTGAACTGGTTTGACAAACA
*
1107083 CATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
444 CATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTGGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
* *
1107148 CTAAGTAAGCTCGAAAAGAAACAACTGCTTTATGACAAAATAAAAATCATAGCAATTTGAGATAG
508 CTAAGTAAGCTCGAAAAGAAACAACTGCTTTATGACAAAACAAAAATCATAACAATTTGAGATAG
* *
1107213 ATGATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGTTAGTATTATTTTACCTTGAATAAGCTTGTA
573 ATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTGTTAGTATTATTTTACCTTGAATAAGCTTGTA
1107278 TAAACTG
638 TAAACTG
* * * *
1107285 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTTAAATAGGCAATTGTTCAAATAGT
1 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCACAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
1107350 CATAACTATTTGAA-TTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTTTTGCTTATTAATTTTT
65 CATAACTATTT-AAGATGGTTTGGAAAACAAATTTAGTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTT
* * *
1107414 GAAATATTAAGAAATTAGTATAATTTAATTT-TGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTT
129 GAAATATTAAGAAAGTAGTATAATTTAATTTCT-AATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATAGTTT
** * *
1107478 TATGTTAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTTAAATATATAATTGGTCACATAG-AACTTGTTCGC
193 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-ACTTTAAATAAATAATTGGTCACATAGAAACTTGTTCGC
* * * * * ** **
1107541 TAAACATATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTA
257 TAAACAAATTTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATAAGGATTA
** * *
1107606 TTTTATTCCAAATAAG-TTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAAGAAAATATCA-AA
322 TTTT-TTCCAAATAAGCTCATAAGA-ACTAAAACAAATATTTTATGACTAAAGAAAAGATCAGAA
* ** * * * *
1107668 GCGATCTAAAATGGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTGAATTGGTTCT-ACAAGCACATT
385 -CGATCTAAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAAATATTTGAACTGGTT-TGACAAACACATT
* *
1107732 TATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTGGGAATATTATTAACTTAGTATTATTTTTAA-CTGA
448 TATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTGGGAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTTAATCTAA
* ** * ** * * *
1107793 TTAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAATCTTAACGATTTGAGATTG
512 GTAAGC-TC---GAAAAGAAACAACTGCTTTATGACAAAACAAAAATCATAACAATTTGAGATAG
*
1107858 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
573 ATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACT
1107891 AGTTTGGTAA
Statistics
Matches: 504, Mismatches: 89, Indels: 38
0.80 0.14 0.06
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AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCACAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTAAGATGGTTTGGAAAACAAATTTAGTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTTGA
AATATTAAGAAAGTAGTATAATTTAATTTCTAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATAGTTTTAT
GACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTTAAATAAATAATTGGTCACATAGAAACTTGTTCGCTAAA
CAAATTTATTTTTTAAAATATCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATAAGGATTATTTT
TTCCAAATAAGCTCATAAGAACTAAAACAAATATTTTATGACTAAAGAAAAGATCAGAACGATCT
AAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAAATATTTGAACTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTT
AAACTCTTACTTATTAATTTTGGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAGTAAGCTCG
AAAAGAAACAACTGCTTTATGACAAAACAAAAATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAA
TAATCATAACTATTTAAACTGTTAGTATTATTTTACCTTGAATAAGCTTGTATAAACTG
Found at i:1107863 original size:176 final size:176
Alignment explanation
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1107666 AAGCGATCTA
* * ** * *
1107676 AAATGGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTGAATTGGTTCTACAAGCACATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAATTGATTCTA-AA-CACATTTATTTTTTA
* * * * * *
1107741 AATCTCTTATTAATTTTGGGAATATTATTAACTTAGTATTATTTTTAACTGATTAAGCTTC-TAT
64 AATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAACTCAATAAGC-TCGTAT
* * * *
1107805 GATT-AGAAACAATTTTTTTATGACAAAA-CAAAAATCTTAACGATTTG
128 GATTAAAAAACAATTATTTTATAACAAAACCAAAAATCATAACGATTTG
* * * * * * * * *
1107852 AGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAA-TTGATT-CTAAACACATTTATTTTTTA
* * * * **
1107917 AATCTCTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATCAGCATTA-TTTTATTTCAATAAGCTCGTATG
64 AATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAACTCAATAAGCTCGTATG
** *
1107981 ATTAAAAAACAATTATTTTATAACAAAACCAAAGGTCATAATGATTTG
129 ATTAAAAAACAATTATTTTATAACAAAACCAAAAATCATAACGATTTG
* * * * * *
1108029 AAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAGTTATTTTAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTA
1 AAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAATTGATTC--TAAACACATTTATTTTTTA
1108094 AATTTCATACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
64 AA--TC-T-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
1108143 ATTCCATCCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (176 bp):
AAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAATTGATTCTAAACACATTTATTTTTTAAA
TCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTAACTCAATAAGCTCGTATGAT
TAAAAAACAATTATTTTATAACAAAACCAAAAATCATAACGATTTG
Found at i:1108145 original size:181 final size:175
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Indices: 1107536--1108337 Score: 575
Period size: 181 Copynumber: 4.5 Consensus size: 175
1107526 ATAGAACTTG
* * *
1107536 TTCGCTAAACATATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTT
1 TTCGGTAAACATATTTATTTTTT-AAATC---T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * * * * **
1107600 GGATTATTTTATTCCAAATAAGTTGTAAGA-TATGAAACAAATATTTTATGACTAAAGA-AAATA
60 GTATTATTTTATTTC-AATAAGCTCTATGATTAAGAAACAATTATTTTATGAC-AAA-ACAAAGG
* * * * * * *** * * * *
1107663 TCA-AAGCGATCTAAAATGGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTGAATTGG
122 TCATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTAAACTGA
* * * * *
1107717 TTC--TACAAGCACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTGGGAATATTATTAACTTAGTAT
1 TTCGGTA-AA-CATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
** * * * ** *
1107780 TATTTTTAACTGATTAAGCTTCTATGATT-AGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAATCTTA
64 TA-TTTTATTTCAATAAGC-TCTATGATTAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGTCATA
* * *
1107844 ACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-A
127 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTAAACTGA
* * * *
1107892 GTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATCAGCATT
1 -TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* *
1107957 ATTTTATTTCAATAAGCTCGTATGATTAAAAAACAATTATTTTATAACAAAACCAAAGGTCATAA
65 ATTTTATTTCAATAAGCTC-TATGATTAAGAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAA
* ** * ** *
1108022 TGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAGTTATTTTAACTGA
128 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTAAACTGA
* *
1108070 TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCATACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGT
1 TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
1108135 ATTATTTTA-TTCCATCCA-CTC-ATGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAATAAAAAGG
62 ATTATTTTATTTCAAT-AAGCTCTATG-ATTAA--GAAACAATTATTTTATGACAAA-ACAAAGG
* * * * **
1108197 TTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCAATAACTATTCGAACTTG-
122 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTAAAC-TGA
* * * *
1108251 TTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATTTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGT
1 TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* *
1108316 ATTAATTTATTCTGAATAAGCT
62 ATTATTTTATT-TCAATAAGCT
1108338 TGTATAAACT
Statistics
Matches: 494, Mismatches: 98, Indels: 56
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Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
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ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (175 bp):
TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTCAATAAGCTCTATGATTAAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGTCATAACGA
TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTAAACTGA
Found at i:1108649 original size:315 final size:314
Alignment explanation
Indices: 1108059--1108649 Score: 694
Period size: 315 Copynumber: 1.9 Consensus size: 314
1108049 GGCCATAGTT
* ** * * *
1108059 ATTTTAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCATACTTATTAATTTTAGAAATATT
1 ATTTAAACTGATTCAATAAACAAATTTATTTTGTAAATCTCATACTTATTAATTTTAGAAATATT
* * * * ** * *
1108124 AATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCCACTCATGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAA
66 AATAAATTAGTATTATTTAATTCAATCAACT-ATGTATGAATCAAAACAATTGTTTTACGAAAAA
* * * **
1108189 TAAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCAATAACTATTCGAACTTGTTC
130 TAAAAACGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGCAATAACTATTCGAACTTGTTC
* * * * * *
1108254 AGTAAATATATTTATTTTTTAAATTTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATT
195 AGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAAGTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
1108319 AATTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACTAGAAAATTATTTTAACAGTCTTAACC
260 AATTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACTAGAAAATTATTTTAACAGTCTTAACC
*
1108374 ATTTAAACTGATTCAATAAACAAATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AAATAT
1 ATTTAAACTGATTCAATAAACAAATTTATTTTGTAAATCTCATACTTATTAA-TTTTAGAAATAT
*
1108438 TATTAAATTAGTATTATTCTAATTCGAAT-AAGCT-TGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTACGAC
65 TAATAAATTAGTATTATT-TAATTC-AATCAA-CTATGTATGAATCAAAACAATTGTTTTACGA-
* *
1108500 AAAAT-AAAACGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTC-TTAACTATTTC-AA-
126 AAAATAAAAACGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAG-CAATAACTA-TTCGAAC
** * * * *
1108561 TTGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTAAAATATTATTAAA
189 TT-GTTCAGCAAATAGATTTA-TTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAAGTTTTAAAATATTAATAAA
* * *
1108626 TTATTATTATTTTATTTTGAATAA
252 TTAGTATTAATTTATTCTGAATAA
1108650 AATAGTATGA
Statistics
Matches: 229, Mismatches: 38, Indels: 18
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Matches are distributed among these distances:
313 2 0.01
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ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.08, T:0.45
Consensus pattern (314 bp):
ATTTAAACTGATTCAATAAACAAATTTATTTTGTAAATCTCATACTTATTAATTTTAGAAATATT
AATAAATTAGTATTATTTAATTCAATCAACTATGTATGAATCAAAACAATTGTTTTACGAAAAAT
AAAAACGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGCAATAACTATTCGAACTTGTTCA
GCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAAGTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
ATTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACTAGAAAATTATTTTAACAGTCTTAACC
Found at i:1109285 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1108390--1116578 Score: 4443
Period size: 181 Copynumber: 45.7 Consensus size: 180
1108380 ACTGATTCAA
* * * *
1108390 TAAACAAATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 TAAACGAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
1108455 TCTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTACGACAAAATAAAACGTCATAACAA
66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAA
** * * * * *
1108520 TTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTCAATTGGTTTGG
131 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * * ** * * * *
1108570 CAATTA-G-ATTTATTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTAAAATATTATTAAATTATTAT
1 TAA--ACGAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * * * * *
1108633 TATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGATCAAAATCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATA
63 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
1108698 A-AGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAATCA-AAATATATTGAAATGGTTTGA
127 ATA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTAGTTTGG
* * *
1108752 TAAAC-AGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATCAATTCTTTA-AATATTAATAAATTAGTATT
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
1108815 ATTTTATTTCGAACAA-CTTATATTAACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAATATAAA-GTAATA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATA
* * * * * *
1108878 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGCTTGA
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * *
1108932 TAAATAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGT-TT
1 TAAA-CGAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
1108994 ATTCTATTCCGAA-AAGCTT-TAT-AAGATAAAATAACTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-A-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
1109055 ATAGTTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAGCTATTTGAACTAGTTTGG
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * * * * * *
1109109 CATACGAATTTATTTTTTAAATCTCGTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATCAATATTAT
1 TAAACGAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
1109174 TTTATTACGTATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATCTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATA
66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA
* * * **
1109239 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAG
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * *
1109290 TAAAC-AGATTTATTTTTTAAA--GC-T-CTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* *** * *
1109350 TTTT-TTTCAAATAAGCTTGTATGTTGGAAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAA-
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * *
1109413 AGATTTAAAATAGATTATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTTAG
129 A-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGG
* ** *
1109466 TAAACTG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACATTT-GAAATATTAATAAAGTAGTATT
1 TAAAC-GAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
1109529 ATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATTAAATAAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* *
1109594 TGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG---T--C-A--T-AACTAGTTTGG
128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * * *
1109638 TAAACTG-ATTTATTTTTTTCAAATCTCAT-GTTAATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTA
1 TAAAC-GAATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
1109701 TTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAAATGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAG
62 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * ** **
1109766 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACCAACTCAG
126 AATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * * * *
1109821 CAGAC-ACATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTACTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTA
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
1109885 TTTTAATAT-AAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAGTTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCAGAA
65 TTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
1109948 CAATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGG
128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * * *
1110001 TAGAC-ACATTTA-TTTTTAAAT-T-TT--TT-TTAAGTTTT-GAAATATTATTAAATTGGTATT
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
1110058 ATTTT-TATCCAAATAAACTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATA
64 ATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
1110121 ATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AGACTAGTGT-G
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTAGTTTGG
* ** * ** * *
1110174 AAAAATAGCTTTAGGTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTCA-TAT
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTAT
* * * * * * *
1110237 TATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATA
63 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
1110302 ATGACTTT-AAAAAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATTTATTTGAACTTGTTTGG
127 AT-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTTGG
* * * * * * *
1110356 TAAA-TAGATTTATTTTTTTAATTCTCTTGCTCATTAATTTTTCGAATGTTAATAAATTAGTGTT
1 TAAACGA-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
1110420 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAATGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * **
1110485 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC-CGACTCAG
128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGG
* * * *
1110538 CAAAC-ACATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTACTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTA
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
1110602 TTTTA-ATCTAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAGTTGTTTTATAACAAAA-TAAAGATCATAA
65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
1110665 TGATTTGAGATAGATAATTCTTC--A-AGTTATAACTATTTGAA-TTGTTTTAG
128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGG
* ** * *
1110715 TAAACAAATTTGGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTAT
1 TAAACGAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * ** * *
1110775 TTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGGTAAAACAAAAAGTCATAACA
66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA
* * * * * * * * *
1110840 ATTTAAAATAAATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAA-TTGTTCGA
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * * *
1110890 TAAAC-AGATATATTTTTTAAATCTCCTACATGTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
1110954 TTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAAAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCCTAACT
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-T
* * * * * *
1111019 -ATTTGAAATAAATCATTGTTAAAACAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTCGG
129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAGTTTGG
* * * * * *
1111070 TAAGC-ATATTTATTTTTTAAATTTTTTAGTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
1111134 TTTTATTTCAAATACA-CTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGA-AAAA-AAAAGGTC---A
65 TTTTATTTCGAATA-AGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ***
1111193 TAA-CTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-ATGTTCAA
128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTTGG
* * * *
1111245 AAAAC-ATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTTA-TATT
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * * * * * * *
1111307 ATTTTAGTTGGAATAAGCTTGTATGTATAGAAATAATTATTTTATGACAAAATGAAAAGGTCAAA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATA
* * * * * *
1111372 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCACAACCATTTGGACTTGTTCGA
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGG
* * * * **
1111426 TAAAC-AGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAGCATTAAT--A-T--T-TTA
1 TAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * **
1111484 ---T-TTT-GAATAAGC--CTAT--ATAATACAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAACG
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* * * * *
1115442 TTATTTTACTCTGAATATGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTTAT
1 TTATTTTACTCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTATATGACAGAACAAAAGGTAAT
* ** * * * *
1115507 AATGATTTGAAGTTTACAATTATTCAAATTGTCATAACTATTTGTACTAGTTATGTAAATAGATT
66 AATGATTTGAAATAAACAATTATTCAAATTGCCATAACTATTTGAACTAGTTATGTAAACAAATT
* * *
1115572 TACATTTTAAATCTTTTACTTATTATTTTTTGAAAGATTAATAAATTAGCATTATT
131 CACATTTTAAATC----ACTTACTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGCATTATT
* **
1115628 TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGAATGCTCAAAAACAATTATTATATGACCA-AACAAAAGGTAA
1 TTATTTTACTCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTATATGA-CAGAACAAAAGGTAA
* * * * *
1115692 TAATGATTTGAAATAAATAATTATTGACA-TGACCATAATTATTTGAACTGATTTA-GTAAACAA
65 TAATGATTTGAAATAAACAATTATTCAAATTG-CCATAACTATTTGAACT-AGTTATGTAAACAA
* * *
1115755 ATTCACTTTTTAAATCACTTACTAATTTTTGGAAGATTAATAAATTAGTATTATT
128 ATTCACATTTTAAATCACTTACTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGCATTATT
* ** * * * *
1115810 TTA--TT--TC-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGGT
1 TTATTTTACTCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTATATGACAGAACAAAAGGT
1115867 CATGACAATT
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Consensus pattern (182 bp):
TTATTTTACTCTGAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAATTATTATATGACAGAACAAAAGGTAAT
AATGATTTGAAATAAACAATTATTCAAATTGCCATAACTATTTGAACTAGTTATGTAAACAAATT
CACATTTTAAATCACTTACTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGCATTATT
Found at i:1115785 original size:363 final size:356
Alignment explanation
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Period size: 363 Copynumber: 7.3 Consensus size: 356
1113841 GTTTTATGAA
* * * *
1113851 CAAAAACAATTAGTTTATGGA-A-AACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
1 CAAAAACAATTATTTTAT-AACAGAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTATT-AA
* * * * * *
1113913 ATAATCATAACTGTTTAAAC-GTGTTTAGAAAATAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTT-CTTAA
63 AT-ACCATAATTATTTGAACTG-GTTT-GTAAATAAATTTATTTTT-AAA---TCACTTAC-TAA
* * *
1113976 TTTTTGGAATATTAATA-ATTTTA-AATTATTTTATTTGAAATATA-CTTGTATGAACAAAATCA
120 TTTTTGGAATATTATTAGA--TTAGTATTATTTTATTTG-AATA-AGCTTGTATGAACAAAAACA
* * * * *
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181 ATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** * * * * * *
1114102 ATTATTTAAACTTTTTCA-GTAAACAGATTCT-TTTTTTAATTCTTTTACTCATTAATGTTTGAA
245 ACTATTT-GACTAGTT-ATGTAAACAGATT-TACTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAA
* * * * *
1114165 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCA---AATAAGTTTGTATGAACT
307 ATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTATTGAATAAGCTTGAATG-ACT
* * * * * * *
1114213 GAAATA-AATTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
1 CAAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATT-AAAT
* *** * * * * * *
1114277 AGTCATGGCTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTG
65 A-CCATAATTATTTGAACTGGTT-TGTAAATAAATTTAT-TTTTAAATC----ACTTACTAATTT
*** * * * * * * ** * * *
1114342 TCAAAATATCAATAAATTAATACTATTTTAATCCAA-AA-CTTGCATGAACAGAAATAATTGTTT
123 TTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTT
* * * ** * * * * * *
1114405 TATGACAAAACAAAAAGTCAAAACAAGTT-AAAAAAATAATTGCTT-AAATAATCATAACGATTT
188 TTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * * * * * *
1114468 AAACTTA-TTCGGTAAACTGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTCATTGTCGTAATATTAA
252 -GAC-TAGTTATGTAAACAGATTTA-CTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * *
1114532 TAAATTTGTATTATTTTATTTGA---AATAAGGTTGTATGA-A
314 TAAATTAGCATTATTTTATTTTATTGAATAAGCTTGAATGACT
* * * * ** * * * *
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1 CAAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATT-AAAT
* * ** ** ** * *
1114636 AGTCATAATTATTTAAACTTATTCAATAAATGGATTCACTTTTTAAATCTTGTTA-TTATTAATT
65 A-CCATAATTATTTGAACTGGTT-TGTAAATAAATTTA-TTTTTAAATC-----ACTTACTAATT
* * * * * *
1114700 TTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAG-ATGAACTAAAACAACT-
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* * * *
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185 TTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * *
1114828 TTCTTCTAGTT-TGGTAAACATATTT-CTTTTTAAAATTTTTTAGTTATTAATTATTGAAATATT
250 TT-GACTAGTTAT-GTAAACAGATTTACTTTTT-AAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * *
1114891 AATAAATTAGTATTATTTTA--ATA-CGAATAAGCTTGTATAAAT
312 AATAAATTAGCATTATTTTATTTTATTGAATAAGCTTGAATGACT
* * * *
1114933 -AAAAACAATTGTTTTATAATAGAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTTAAAT
1 CAAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT-ATTAAAT
* * * * *
1114997 AGCCAAAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTCTTACTAATTTTTGA
65 A-CCATAATTATTTGAACTGGTTTG-TAAATAAATTTATTT-TTAAATCACTTACTAATTTTTGG
* * * ** *
1115062 AATATTATTAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTACATGAACAAAAACATTTGTTTTTT
127 AATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTTT
* * * * *
1115127 GGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTCCGAATAGTCATAATTATTTGA-T
191 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGACT
* * * *
1115191 CAGTTAGGTAAACAAAATTA-TTTGTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
256 -AGTTATGTAAACAGATTTACTTT-TTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * *
1115255 T--C---ATTTTATTTTATTTCAAATAAACTAGTATGAATT
319 TAGCATTATTTTATTTTA-TT-GAATAAGCTTGAATG-ACT
* * * ** * * * **
1115291 CAAAAA-AGCTTATTTTATGACAAAAC-AAA-GTCATAACAATTTGAAACAGATAACTATTCTTA
1 CAAAAACA-ATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATT-AAA
* * * * * *
1115353 TAATCTTAATTATTTGAATTGGTTTGGTAAATAAATTTAGTTTTTTAATTCCCTTAGTTATTTAT
64 T-ACCATAATTATTTGAACTGGTTT-GTAAATAAATTTA--TTTTTAAATCACTTA-CTA---AT
* * * * * *
1115418 TTTTGGAATATCATTAGATTAATATTATTTTACTCTGAATATGCTTGTATGAACAAAAATAATTA
121 TTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG
* * * * ** * *
1115483 TTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTATTCAAATTGTCATAACTAT
185 TTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
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250 TTG-ACTAGTTATGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAA
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* * * *
1115657 CAAAAACAATTATTATATGACCA-AACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTATTGACA
1 CAAAAACAATTATTTTAT-AACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATT-AAA
* * *
1115721 TGACCATAATTATTTGAACTGATTTAGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTAATTTTTG
64 T-ACCATAATTATTTGAACTGGTTT-GTAAATAAATTTA-TTTTTAAATCACTTACTAATTTTTG
* * * **
1115786 GAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTT
126 GAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTT
* ** * * * * * *
1115851 TGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAGTAGATAATTGTTCATACAGTCTTAACTATTTGAA
190 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAC
* ** * * * *
1115916 TCGCTTCA-ACAAATAGATATATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAA
255 TAG-TT-ATGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
*
1115980 TTAGTATTATTTTATTTTA---AATAAGCTT-ATATGAACT
318 TTAGCATTATTTTATTTTATTGAATAAGCTTGA-ATG-ACT
* * * * *
1116017 C--AAACAATTATTTTATAACATAACGAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTCTT---T-
1 CAAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTAAATA
* ** * * *
1116076 --A-AA-TA--GGAACCAGTTCGGTATACT-AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
66 CCATAATTATTTGAACTGGTT-TGTA-AATAAATTTA-TTTTTAAATC----ACTTACTAATTTT
* * * * **
1116134 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTT
124 TGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
1116199 TATGACAAAACAAAAGTTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTGTGT
188 TTTGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
1116263 GAAC-CGATT-TGATAAACTGAGTTATTTTTTAAATCTC-AACTTATCAATTTTTGAAATATTAA
252 G-ACTAG-TTATG-TAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* ** ** * * **
1116325 TGAAGGAATATTA-TTT-TGTT-TCGAATAAGCTTTTATGAACT
314 TAAATTAGCATTATTTTATTTTATTGAATAAGCTTGAATG-ACT
* * * * * * * * * **
1116366 --GAAACAAGTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATGGTTCAAAT
1 CAAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATT-AAAT
* * * **
1116429 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATTCATTTATTTTTAAA
65 A-CCATAATTATTTGAACTGGTTT-GTAAATAAATTTATTTTTAAA
1116475 AATTTCTTGT
Statistics
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0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
CAAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTAAATA
CCATAATTATTTGAACTGGTTTGTAAATAAATTTATTTTTAAATCACTTACTAATTTTTGGAATA
TTATTAGATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTTTGACAA
AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGACTAGTTA
TGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCATT
ATTTTATTTTATTGAATAAGCTTGAATGACT
Found at i:1116230 original size:169 final size:169
Alignment explanation
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Period size: 169 Copynumber: 1.8 Consensus size: 169
1115925 CAAATAGATA
* *
1115935 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
** * *
1116000 ATAAGCTTATATGAACTCAAACAATTATTTTATAACATAACGAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
66 ATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAACGAAAAGTTATAATGATTTGAAATA
1116065 GATAATTCTTTAAATAGGAACCAGTTCGGTATACTAATT
131 GATAATTCTTTAAATAGGAACCAGTTCGGTATACTAATT
* *
1116104 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * ** * *
1116169 ATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACT-ATTTGAAA
66 ATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAACGAAAAGTT-ATAA-TGATTTGAAA
1116232 TAGATAATT
129 TAGATAATT
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Statistics
Matches: 121, Mismatches: 14, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
168 6 0.05
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Consensus pattern (169 bp):
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ATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATAACAAAACGAAAAGTTATAATGATTTGAAATA
GATAATTCTTTAAATAGGAACCAGTTCGGTATACTAATT
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Period size: 180 Copynumber: 4.3 Consensus size: 179
1116659 ATTTTACTCT
* * * * * ** * *
1116669 GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACGAAAC-AAAGATCATAACGATTTTAGA
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* * ** * * * * * * *
1116733 TAGATAATTGTTCAATTAATCATAACT-ATTTAAACTAGTTCGATAAATAGATTTAGGTTTT---
66 TAAATAGTTGTTCAAACAGTCATAA-TAATATAAACTTGTTCGATAAACAAAATTA-TTTTTAAA
* * * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * ** * * * ** * * * * *
1116908 TAAATAATAGTTCAAATGGACATGACT-ATTTTTACTTCTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAA
66 TAAATAGTTGTTCAAACAGTCAT-AATAATATAAACTTGTTCGATAAACAAAATTATTTTTAAAA
*
1116972 TTTTTACTTATTAATTATTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC
130 TTTTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * * * *
1117023 GAATAACCTTGTGTGAACAAAAACAATTGTTTCATGACAAAATAATAA-GTCATAAAAATTTGAA
1 GAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAAAAATTTCAA
* * * *
1117087 ATAAATAATT-TGTCAAACAGTCATAATAATTTGAATTTG-TCTGATAAACAAAATTATTTTTAA
65 ATAAATAGTTGT-TCAAACAGTCATAATAATATAAACTTGTTC-GATAAACAAAATTATTTTTAA
** * *
1117150 ACA-TTTTACTTATTAATTGTTTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTT-ATTT
128 A-ATTTTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * * * ***
1117202 GAAATAAGCTTGTTTGAATTGAAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTC
1 G-AATAAACTTGTATGAA--CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTC
* * * *
1117267 AAATAAATAGTTGTTCAAATAGTCATAATTATATAAACTTGTTCGGTAAAC-AAATTATTTTTTT
63 AAATAAATAGTTGTTCAAACAGTCATAATAATATAAACTTGTTCGATAAACAAAATTA-TTTTTA
* * * * *
1117331 AAATATCTTAATTATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTC
127 AAAT-TTTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
* * * * * *
1117386 AAATAAACTTCTATGAGCTAAAACAATTCTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA
1 GAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
1117441 TGATTTGATC
Statistics
Matches: 465, Mismatches: 106, Indels: 45
0.75 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 34 0.07
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ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
GAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTCAAA
TAAATAGTTGTTCAAACAGTCATAATAATATAAACTTGTTCGATAAACAAAATTATTTTTAAAAT
TTTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC
Found at i:1117942 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1117466--1126668 Score: 2457
Period size: 181 Copynumber: 51.3 Consensus size: 180
1117456 TAGTAAACAT
* * * ** *
1117466 ATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-AT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * ** * **
1117530 CTGTATTAGCTTGTATGAATAGAAATAATTAT-TTTATGATAGGATAAAAAATCATAACGATTTG
65 C-GAATAAGCTTGTATGAACAG-AA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * *
1117594 AGATAAATAATTG-TCAAATAGTAATAAATATTTGAACTGGTTTGATAAATAG--
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* ** * * *
1117646 ATTTATATTTTAGA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTC
1 ATTTAT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
1117707 CAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAA
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* * *
1117772 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAAATAGAA
128 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGT-AAATAGAA
* * *
1117826 ATATTATTTTT-AATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTGT-TCTATTTTATT
1 AT-TTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT-TATTTTATT
* * **
1117889 TTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAA
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAA
* * * * * *
1117953 ATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTTGG-CAA-ACAA
128 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * *
1118004 ATTTGTTTTTAATTCTCTTATTTATTAATTTTTG-----------GA--A-TATTATTTTATTTC
1 ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * *
1118055 GAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTG-TTATGATAGAACAAAAAGTGATAACAATTTGACAT
66 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
1118119 ATACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTTGGT-AA-ACAA
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* *
1118168 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
1118229 TGAATAAGCTTGAATGATAAAAAAAATTTGTTAAATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAA
65 CGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAAATTTGTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * ** *
1118294 ATA-ATAATTGTTGAAATGGCCATAATTA-TTGAAAAT--TATTCATTAA-AGAA
128 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTGGT-TTGGTAAATAGAA
* * * *
1118344 ATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATT-ATTTTTGGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * ** * *
1118408 TGAATAAGTTTGTATGAACTG-AAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAACAATTAGA
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* * ** ** * * * *
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127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-GGTAAATAGAA
* * * * * *
1118524 ATTTATTTTTTTAATCTCTTAATTTTTAATTTTTG-AATATTATTAAATTATTATTATTTCATTT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * *
1118588 CGAATAAGCTTCTATGAGCTGAAACAATTAT-TTTATAACAGAATAAAAGGTTATAACAATTTCA
65 CGAATAAGCTTGTATGAACAG-AA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * *
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127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* *
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1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * ** * * ** * * * *
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65 CGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTGTTT-ATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * ** *** *
1118822 AATAGATAATTGTTAAAATGGTCATAATTATTTGAACTAATTCAATAAACAG--
127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
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1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * ** * * *
1118935 CAAATAA-CAATAATTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATT
65 CGAATAAGC--T--TGTATGAACAGAAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * * **
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124 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
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1 ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * *
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66 GAATAAGCTTGTATGAAC-AGAA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
1119181 ATAGATAATTATTCAAATAGGT-ATGACTGTTTGAACTTGTTTGGT-AA-ACAT
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* * * * * *
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1 ATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
1119296 CGAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTAT-TTTATGATAAAACAAAAAGTTATAACGATTTG
65 CG-AATAAGCTTGTATGAAC-AGAA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * ** * *
1119360 AAATAAATAATTATTCAAATATTCATAACTATTTGAACTTATTTGATGAATAG--
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
1119413 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATTTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAA
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAT
** * * * *
1119476 TTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAGAAAATTAT-TTTAT-ACGAAACAAAAGTTTATAACGATTT
63 TTCGAATAAGCTTGTATG-A-ACAGAAAATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * **
1119539 GAAATAGGTAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTAAACTTGTTTAATAAATAG--
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * *
1119593 ATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AGAATCTTAATAAATTAGAATTATGTTATA
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * *
1119657 CCAAATTAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT-TGTAACAAAACAAAAGGTCATAATGCTTTG
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTGTTTATG--ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * * * *** ** *
1119721 AAATAGATAATTCTACAAACAATTACAACTATTT-ATATTGGTCAAG-CCA-ACAA
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTGGTTTGGTAAATAGAA
* *
1119774 ATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAAT-AATTAGTATTACTTAAT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * *
1119836 TTCGAATAAGAC-TGTATCAATAGAAACAATTAT-TTTATGACAAAACAAATA-ATCATAATGAT
63 TTCGAATAAG-CTTGTATGAACAG-AA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGAT
* * * * *
1119898 TTGAAATAAATAACTT-TTCAAATTGTTATAACTATTTGAA-TAGGTTTGGT-GA-ACAA
123 TTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTTGGTAAATAGAA
** * *
1119954 ATTTATTTTTAAATCTC--A--TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTTTTTTATTTC
1 ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * *
1120015 GAACAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTT-TGCGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAA
66 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTGTTTAT--GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * ** *
1120079 ATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGCTTCAGT-AA-ACAA
128 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * *
1120130 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
1120194 AT-GAATAAGCTTGTATGAAGACAAATAATTATTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTG
64 -TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTGTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * *
1120258 AAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTCG-ATA-AGCAT
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAG-AA
*
1120311 ATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTA-
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * ** * * *
1120373 TTCTAAATAGGCTTGTGTGATGAA-A-AATAATTAT-TTTATGATGAAACAAAAGTTCATAGCAA
63 TTC-GAATAAGC-T-TGT-ATGAACAGAA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * *
1120435 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTTTGTAAAGT-G--
122 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAA-TAGAA
** * * * *
1120492 ATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTCTTAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATAT
1 ATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
* * * * * * * * *
1120557 T-GGATAAG-TGTTTATGAACTGAAACAATTGTTT-T-A-TAAACATATGGTCATAATGATTTTA
64 TCGAATAAGCT-TGTATGAACAGAAA-ATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * ** * *
1120617 AAT-GTATAAATGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTCGATAAATAG--
127 AATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * * * *
1120669 ATTTATTTTTTTAAATTTCTTGCTGACTAATTTTTGGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATT
1 ATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * * **
1120734 TTGAATAAGCATGTATAAATTGAAATAATTAT-TTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAATTATTTG
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAG-AA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * * * * *
1120798 AAATATATAATTGTTCTAGTAGTCTTAACTATTTGAATTAG-TT--TAACAAACAC
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAA-ATAGAA
* * ** * * * *
1120851 ATTTACTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-ATAACATTATTAGTTTGGCAATATTTTAC
1 ATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * **
1120915 TCCAAATATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGCTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAATAATTTG
63 TTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * *
1120979 AGATAGACAATTGTTCAAATAG-CAATAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAATAG-A
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * *
1121033 TTTTGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTA-TTC
1 ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * ** * * *
1121093 TAAAAAATTTTGTATGAATA-AAAATAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
66 -GAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAT--TTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * *
1121157 AATAGATAATAGTTCAAATGAAT-ATGACTATTTGAACTTGTTCGGTACATAG--
127 AATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
*
1121209 A-TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** *** * *
1121272 TTGAATAAAATTGTATGAGTGGAAACAATTAT-TTTATGACAAAACAAATGAG-CATAATGATTT
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAG-AA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTT
* * * *
1121335 GGAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTTGGT-AA-ACAA
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * *
1121389 ATTTATTATTTAAAGCTTTTACTTATTAATTTTAG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
1121453 CAAATAAGCTTTTATGAACTGAAATAATTAGTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAA
65 CGAATAAGCTTGTATGAACAG-AA-AATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * ** * ***
1121518 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAGCTATTTGAA-T-GTATT-CAAAAAACTT
128 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-TTGGTAAATAGAA
* *
1121569 ATTTATATTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTGTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
1 ATTTAT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * *
1121632 T-GAAATAAGTTTGCT-TGAACATAACTAATTAT-TTTATGAC-AAACTACAAGGTCATAATGTT
64 TCG-AATAAGCTTG-TATGAACAGAA--AATT-TGTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGAT
* * * * **
1121693 TTGAAATAGATAATTGTTCAGATAATCATAGCTATTTGAACAT-ATTCAGTAAATAG--
123 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * * * * *
1121749 ATTCATTTTTTAATTCTCTTCCTCATTAATTTTTG--ATA--AACAGATT--TATT-TTTAAAAC
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT--TAT
* * * ** * * * * ** * * *
1121807 CTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGCA-TT-TTTAT-TCCGAAC-AAA-CTTAT-AT
63 TTC-GAATAA-GCTTG---TATGAACAGA--A-AATTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * ** * * * ** * * *
1121866 GA---GAAA-AAATAGTTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTAATAATGATTT-G-AACA-A-AT
120 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC--TATTTGA-ACTGGTTTGGTAA-ATAGA-
1121921 A
180 A
* * * * ** ** * *
1121922 A-TTA--TTCAAATACTCATAATTATTTGAACTGGTGAGGTA--AACATAATTA-T-TT-TTTAA
1 ATTTATTTTTAAAT-CTCTTACTTA-TT-AATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTT-T
** * * * * *** *** *
1121979 ATCTCTC-ACATATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTCAT-TTTATTTTATTTCGAATAAGCT
61 AT-T-TCGA-ATA--AGCTTGTATGAACA--GA-AAATT--TGTTTATGACAAAAC-AA-AAGGT
* * * * * * ** * * * ** * *
1122041 -AGT-ATGAATTCAAA-AAAAAATTATT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTCATTA-TGATTT-G-A
114 CA-TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC--TATTTGA--ACTGGTTTGGTA
1122098 AATAGATA
174 AATAGA-A
* ** * * ** * * ** * * * * *
1122106 A-TTGTTCATATA-GTCTTAAATATTTGAACTAGTTCGACAA-ACAAACTTATTTATTAATTCTC
1 ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTA-TT-AA-T-TTTTGA-AATATTAA-TAAATTAGT-ATTATT
* * * * * * ***
1122168 TTAGTT--ATTAA--TT-TTTGAA-ATATTATTAGATTAGTATTATTTA-ATTCCGAATAAGCTT
59 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGA--A--A-ATTTGT-TTA-TGACAAAAC-AA-AAG---
* ** ** * * ** * * *
1122226 GT-ATGAACAAAAAT-AATTATTTTATGATAGAACAAA-AGGCTATAA-TGATTTGAAGT-TTAC
112 GTCAT-AAC-GATTTGAA--A-TAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACT-ATTTGAACTGGT--
* **
1122286 AATTGTTCAAATAGTC
168 --TTGGT-AAATAGAA
* * * * * ** **
1122302 A-TAATTGTTTGAA-CTACTT--TGATAAATAGATTT---AT-TTCTTAAATCTCTTACTTATTA
1 ATTTATT-TTTAAATCT-CTTACTTATTAAT--TTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTA-TTATT-
* * ** * ** * * * *
1122359 ATT-TTT-G-A-AAGATT-AAT-AA-ATGAGTATTATCTCATTCCGA-ATAAGCTTGAATGTTCA
59 -TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-GAAAATT-TGT--TTATGACA-AAAC--AAAAGGTCA
* * ** * * * ** *
1122416 AATAC-AATTGTTATATGACCAA----ACAAATAGTAATAA-TGATTTGTAA-TAAATAATTGTT
116 TA-ACGATTTGAAATA-GA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTG-AACT-GGT--TTGGT
* *
1122474 GACATGGCCATA
173 -AAATAG--A-A
* * *** * * * * * *
1122486 A-TTATTTGAATTGATTGGGTAAACATATTCACTTTTT-AAATCATT--T-ACTTATTA-AATTT
1 ATTTATTT---TTAAATCTCT-TACTTATT-AATTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTT
* * *** * * * *** * *
1122545 TAGAATAT-GAATAA-ATT-TAT-----TTTATTTTATTT-TGA-ATAAGCTTGTATG-AACTAA
60 T---ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAATTTGTTTATGACA-AAAC-AAAAGGTCA-TAA
* *** ** * ** ** *
1122599 -AATAATTGTTTTATGATAA---AACAAA-AGGTCATAACGATTTGAGA-TAGAAAATTATTCAT
119 CGAT--TTGAAATA-GATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGA-ACT-G--GTTTGGT-AA
*
1122658 ATAG-T
175 ATAGAA
* * * * * * * * *
1122663 CTTAACTATTTAAA-CTGCTTTGGGAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT
1 ATTTA-TTTTTAAATCT-C-TT-----ACTTATTAATTTTTGAAA-----TA-TTAATAA-ATTA
* * * * * * ** *
1122727 GTAATATTATTAAATTAGTATTATTTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAACTA-AAACAACTATTT-
51 GTATTATT-TT-ATTTCG-A--A--TA---AG-C-----TTGTATGAAC-AGAAA-ATTTGTTTA
* * * *
1122790 T-ATAACAGTACAAAAGGTTATAATGAATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG----AA--A--T
98 TGACAA-A--ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
*
1122846 ----TGGTTTGATAAATAG--
160 GAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * *
1122861 ATTTATTTTTAAAATCTAC-TACTTACTAATTTTTAAAATATCAATAAATTAGTATTATTTTATA
1 ATTTATTTTT-AAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * *** * * * * * *
1122925 CCGAATAGGCTTGTATGGTGAAAAACAATTGTTTTCTAAC-AAA-AAAAGTTTC-TAATGATTTG
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTG
* * * ** *
1122987 AAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTTAATAAATTG--
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* ** * *
1123040 ACTTATTTTTAAAATCTCCAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * ***
1123105 C-AGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATC-AAACAAAAAGTCATATTTATTT
65 CGA-ATAAGCTTGTATGAAC-AGAAA-ATTTG-TTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * * * *
1123167 TAATTAGATAATTGTTTAATTAGTCA-AACTATTTGAGCTTGTTTCGT-AA-ACAT
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* *** * * * *
1123220 ATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGCCAAAATAATAATAAATTAATATGATTTTAAT
1 ATTTATTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
1123284 TCGAATAAACTTGTATGAACATAAGCAATAAT-TTTATGATAAACCAAAAAGTCATAACAATTTG
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAA--AAT-TTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* ** * *** *
1123348 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTCAAT-AA-ACAA
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
1123401 ATTTACTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * *
1123463 TTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATCAT-TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATT
63 TTC-GAATAAGCTTGTATGAACAG--AAAAT-TTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * * ** **
1123527 TCAAATAGATAATTATTGAAATAGTCATAATTATTTAAAATTATTCAGTAAATAG--
124 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
1123582 ATTCATTTTTTAAATCTCTT-CATTATTAA-TTTTCAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTAT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * **
1123645 TTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATTAT-TTTATTACAGCACAAAAGGTCATAACGATTT
63 TTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * *
1123709 GAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTAGATCTAGTTTGGTAAAT--AT
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * ** *
1123763 ATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-A
1 ATTTA-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * * **
1123826 TCCAACTAAGCTTCTGTGAATGGAAACTATTAT-TTTAT-AAAAGAAAAAAATGTCATAATAATT
64 TCGAA-TAAGCTTGTATGAACAGAAA--ATT-TGTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * * * **
1123889 TGAAAGAAATAGTTGCTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACTAGTTTAATAAATAG--
124 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * *
1123944 ATTTATTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAATATT-TTTTATTCC
1 ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * ** * * * * *
1124005 GAACAAACTTACATAAATAAAAACATTTGTTTTATAACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
66 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
1124070 TAGATAATTGCTCAAATAGTCATGATTATTTGAACTAGTTAGGTAAACA-AA
129 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * *
1124121 A-TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAAAATTAGTAAATTCATTTTTATTTTATT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * *** *
1124185 CCAAATAAGCTGGTATGAATTTAAAATATTGTTTTATGATAAAACAAAA----AT---GATTTGA
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAT-TTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * *
1124243 AATATATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTGGAATTAGTTAGGT-AA-ACAA
127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * * *
1124295 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTTTT-TAACATTATTATATTACTATTA-TTTAT
1 ATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * *
1124358 TTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTAT-TTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTG
63 TTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * ***
1124422 AAGTACATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATAG--
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
1124475 ATTTATTCTTTAAA--AC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGACTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
1 ATTTATT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * *
1124535 CTAATAAACTTGTATGATA-A-AAAATAATTGTTATATGATC-AAACAAAAGGTAATAATGATTT
65 CGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAAAT--TTGTT-TATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * * *
1124597 GAAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAA-CG-A
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
1124651 ATTTACTTTTTAAATCACTTCCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * ** * * * *
1124716 TGAATTAA-CTTGAACAAACTA-AAACAATTGTTTTATGCCAAAACCAAAGGTCATAATGATTTG
65 CGAA-TAAGCTTGTATGAAC-AGAAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * **
1124779 AAATAGATAATTGTTCATACT-GTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAAT--AA
126 AAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* *
1124832 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-T
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * *
1124895 TCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTAT-TTTATAACAAAATAAAAAGTTATAACAATTT
64 TC-GAATAAGCTTGTATGAACAG-AA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * ** * * * *
1124959 GAAGTATATAA---TT---AT--T--TAA--ATAGGAACTAGTTCGATAAACAG--
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * *
1125001 ATTTATTTTTTTAAT-TTTCTACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
1125065 TTGAATAGGCTTGTATGATGA-AAAATAATTAT-TTTATGAC-AAACAAAAGTTCATAATGATTT
64 TCGAATAAGCTTGTATGA--ACAGAA-AATT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * *** * * *
1125127 GACATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACAAATTCGATAAATTG--
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * * *
1125181 ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATAT
1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
* * * * * * * * * * *** *
1125246 T-GGACAAGTTTTTACGAGCTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTATTTATTTTA
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * ** * *
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* * * *
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1 ATTTA-TTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * ** * **
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* ** * * * * * * *
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125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTA-AATAGAA
* * * *
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1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * **
1125604 TCAAATAAACTTATATGAACA-AAAATAATTATTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAAAAATTTG
64 TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAT--TT-GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * *
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126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
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** * * ** * *
1125780 CTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT-TAGTACAAAACAAAATATGATAACGATTTA
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* * * * * * * * *
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** *
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1 ATTTAT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * *
1125961 TAGAATAAAATTGTATGAATAGAAATAATTGTTTAATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGA
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* * * *** *
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127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* * * * *
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1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
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* * * * * *
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127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTTGGTAAATAGAA
* * * *
1126259 ATATATTTTTAAAAT-TTTTTCTTATTAATTTTT-AGAGTATTAATAAATTTA-TATTATTTTAT
1 ATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAT
* * * *
1126321 TT-GAAATAAGCTTGCATGTACA-AAACCAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-TTC
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* * * * *
1126383 TAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-G-TT--CAACAAACAT
124 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTTGGTAA-ATAGAA
* * * *
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1 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * ** * * * *
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65 CGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA--ATTTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTG
* * * * * * * *
1126566 AAATAAAAAATTATTCAAATAGTCA-AGACTATTTGAACTTGTCTAGT-AA-ACAT
126 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
* ** *
1126619 ATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATAATAATAAATT
1 ATTTATTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATT
1126669 TTTGAAATAA
Statistics
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GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAA
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1117870 AAATTTGTTC
* ** * *
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* * * * * *
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*
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* * *
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* * * * *
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*
1118172 ATTTTTTAAATCTCTTATT
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1118191 AATTTTTAAA
Statistics
Matches: 123, Mismatches: 21, Indels: 5
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
164 101 0.82
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Consensus pattern (165 bp):
TATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACAGAAAAATTGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
AATTTGAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTGATTTGGCAAACAAATTTAG
TTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGGAATAT
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*
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* * * * * * * **
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* *** * * * *
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** ** * *
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1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAA
* * * * * *
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65 ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGC--T--TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
* * * * * *
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* * * * *
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* *** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
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1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAA
* *
1119460 ATTTA-TATTATTTTAATTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAGAA-AATTATTTTAT-ACGAAACA
65 A-TTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGA-AACAATTATTTTATGACAAAACA
* * * * * * *
1119522 AAAGTTTATAACGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTA
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
1119575 AACTTGTTTAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATCTTAATAA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAA
* * * * * * * *
1119640 ATTAGAATTATGTT-ATACCAAATTAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAA
65 ATTAGTATTATTTTAAT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
1119704 AAGGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTCTACAAACAATTACAACTATTT-
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** ** *
1119755 ATA-TTGGTCAAGCCAACAAATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTTGAATATTAA
1 A-ACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAA
* * *
1119818 T-AATTAGTATTA-CTTAATTTCGAATAAGAC-TGTATCAATAGAAACAATTATTTTATGACAAA
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* * * *
1119880 ACAAATA-ATCATAATGATTTGAAATAAATAACTT-TTCAAATTGTTATAACTATTTG
125 ACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * **
1119936 AA-TAGGTTTGGTGAACAAATTTA-TTTTTAAATCTC--A--TATTAATTTTCAAAATATTAATA
1 AACT-TGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATA
* * * * * * * * * * **
1119995 AATTAATATTTTTTTATTTCGAACAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTGCGACAAAACAA
64 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * * * *
1120060 AAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTG
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
1120112 AA-TTGCTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAT-AATATTATT
1 AACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT--TGAATATTAAT
* * * * *
1120175 AGATTAGTATTATTTT-ATT-ATGAATAAGCTTGTATGAAGACAAATAATTATTCTATGACAAAA
63 AAATTAGTATTATTTTAATTCA--AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
* *
1120238 CAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
126 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
1120293 AACTGGTTCGATAAGCATATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTAGAATATTACTA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTT-GAATATTAATA
* * * * **
1120357 AATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAGGCTTGTGTG-ATGAAAAATAATTATTTTATGATGAAAC
64 AATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* *** * * * * *
1120420 AAAAGTTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTT
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * ** * *
1120474 AAC-TGATTTTG-TAAAGTGATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTCTTAAATTTTGAAATATTAAT
1 AACTTG--TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAAT
* * ** * *
1120537 AAAGTAATATTATTTTATATT-GGATAAG-TGTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTAT----AA
63 AAATTAGTATTATTTTA-ATTCAAATAAGCT-TGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAA
* * * * * *
1120595 ACATATGGTCATAATGATTTTAAAT-GTATAAATGTTCAAATAGTCATAATTATTTA
125 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
1120651 AACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTCTTGCTGACTAATTTTTGGAATGTTAATA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATA
* * ** * * * * *
1120716 AAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATAAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAA
64 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
1120781 AAGGTTAAAATTATTTGAAATATATAATTGTTCTAGTAGTCTTAACTATTTG
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
1120833 AA-TTAGTTTAACAAACACATTTACTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTATAACATTATT
1 AACTT-GTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAAT
** * * * * * * * ** *
1120897 AGTTTGGCAATATTTTACTCCAAATATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGCTTTATGATAAAAC-
63 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* * * *
1120961 AAAGATCATAATAATTTGAGATAGACAATTGTTCAAATAG-CAATAACTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTG
* * *
1121014 AACTGGTTTGGA-AAATAGATTT-TGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
1 AACTTGTTT-GATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAAT
* * ** * * * *
1121073 AAATTAGAATTATTTT-ATTCTAAAAAATTTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAAC
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* * *
1121137 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGAAT-ATGACTATTTG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTG
* * * * *
1121191 AACTTGTTCGGTACATAGA-TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAA
* ** ** * *
1121255 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAGTGGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
65 ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * *
1121320 TGAG-CATAATGATTTGGAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
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1121371 AACTCGTTTGGTAAACAAATTTATTATTTAAAGCTTTTACTTATTAATTTTAGAATTTTAATAAA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAA
* * *
1121436 TTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTTTATGAACT-GAAATAATTAGTTTATGACAAAACAA
66 TTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * *
1121499 ATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAGCTATTTG
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * * *
1121551 AA--TGTATTCAAAAAACTTATTTATATTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTGTGAAATATTAAT
1 AACTTGT-TT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAAT
* * * * *
1121613 AAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGTTTGCT-TGAACA-TAACTAATTATTTTATGAC-AA
63 AAA-TTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTG-TATGAATAGAAAC-AATTATTTTATGACAAA
* * * * *
1121674 ACTACAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAATCATAGCTATTTG
125 AC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * * * *
1121731 AACAT-ATTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTCCTCATTAATTTTTG-ATA--AACAG
1 AACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAA
* * * * * ** * *
1121792 ATT--TATT-TTTAAAACCTCTTATTAA--TT-TTTGAAATATTAATAGATTAGCATTTTTAT-T
65 ATTAGTATTATTT-TAA-TTC-AAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACA-ATT---A-TTTTATGA
** * * * * ** * * * ***
1121850 CCGAAC-AAA-CTTAT-ATGA---GAAA-AAATAGTTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGG
121 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * ** *
1121901 TAA-TAATGATTTG---AACA-AATAATTATTCAAATACTCATAATTATTTGAACTGGTGAGGTA
1 -AACT--TG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTA-TT-AATTTTTGA-ATA
* * * * * *
1121961 --AACATAATTA-T-TT-TTTAAATCTCTCACATATTAA-TTTTTA-AAATATTAATA-AATTCA
58 TTAATA-AATTAGTATTATTTTAA--T-TCA-A-A-TAAGCTTGTATGAATA-GAA-ACAATT-A
*** *** * ** * * * * *
1122018 TTTTATTTTATTTCGAATAAGCT-AGT-ATGAATTCAAAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAA
113 TTTTATGACAAAAC-AA-AAGGTCA-TAATG-ATT-TGAAATAGATAATTGT-T--C---A-AAT
*
1122081 AGGTCATTA-TGATTTG
166 A-GTCATAACT-ATTTG
* * * * * * * * * ** ** *
1122097 AAATAGATAATTGTTCATATAG-TCTTAAATATTTGAA-CTAGTTCGACAAACAAACTTATT---
1 AACTTG-T--TTGAT-AAACAGAT-TT-ATTTTTTAAATCT-CTT--ACTTATTAA-TTTTTGAA
*** * * * * * * **
1122157 TATTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAAT-ATTATTAGATTAGTATTATTTA-ATTCCGAAT
56 TATTAA-TAAATTAG-TATT-A-TTTT-AATTCA-AATAAGCTT-GTATGA-ATAGA-AAC-AAT
* * * * ** *
1122220 AAGCTTGTATG----AACAAAA----ATAATTATTT--TAT-GAT-A--GAACAAA-AGGCTATA
111 TA--TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATA
1122270 A-TGATTTG
173 ACT-ATTTG
* * * * * * * * *
1122278 AAGTT-TACAATTGTTCAAATAG-TCATAATTGTTTGAA-CTACTT--TGATAAATAGATTT--A
1 AACTTGT----TTGAT-AAACAGAT--TTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAAT--TTTTGAA
** * * *** * * * ** * *
1122336 T-TTCTTAAA-T-CTCTTACTTATTAATTTTTGA-AAGATT-AATAAAT-G--AGTATTATCTCA
56 TATTAATAAATTAGTATTA-TT-TTAA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTA
* ** * * * * * * * * *
1122393 T-TC-CGA-ATAA-G-CTTGAATG--TTCAAAT--ACAATTGTT-ATAT-GACCA-AACAAATAG
118 TGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTG
* * * * * * * **
1122446 TAA-TAATGATTTG-TAATA-A-A-TAATTGTTGACATGGC-CATAATTATTTGAATTGATTGGG
1 -AACT--TG-TTTGATAA-ACAGATTTATTTTTTAAAT--CTCTTACTTA-TT-AATT-TTTGAA
* * * * * * * *
1122505 TA--AACATATTCACTTTTTAAATCATTTACTT--ATTAA-ATTTTA-GAATATGAATA-AATTT
56 TATTAATAAATT-A-GTATT--AT--TTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAA-ACAA-TT
*** **** * ** ** * ** *
1122563 ATTTTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAACTAAAATA-ATTGTTTTATGATAAAACAAA-A
112 ATTTTATGACA-AAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGA---TAAT-TG-T---TCAAATA
*
1122625 GGTCATAACGATTTG
167 -GTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
1122640 AGA-TAGAAAATT-ATTCATATAG-TCTTAACTATTTAAA-CTGCTTTGGGAAACATATTTATTT
1 A-ACTTG---TTTGA-T-AAACAGAT-TT-ATTTTTTAAATCT-C-TT-----ACTTA-TTAATT
* * * * * * **
1122701 TTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGTAATATTATTAAATT-AGTATTATTTATTTTGAATAAG
50 TTTGAA-----TA-TTAATAA-ATTAGTATTATT-TT-AATTCA--A--A-TAAGCTTG--T-A-
* * * ** * * *
1122765 CTTG-TTTGAACTAAAACAACTATTT-T-ATAACAGTACAAAAGGTTATAATGAATTGAAATAGA
97 --TGAATAGAA--ACAATTA-T-TTTATGACAA-A--ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
1122827 TAATTGTTCAAATAG----AA--A-TTG
153 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
1122848 -----GTTTGATAAATAGATTTATTTTTAAAATCTAC-TACTTACTAATTTTTAAAATATCAATA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATA
* * * * * * * *
1122907 AATTAGTATTATTTT-ATACCGAATAGGCTTGTATG-GTGAAAAACAATTGTTTTCTAAC-AAA-
64 AATTAGTATTATTTTAAT-TCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * *
1122968 AAAAGTTTC-TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTG
127 AAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * ** *
1123022 AAC-TGATTTAATAAATTGACTTATTTTTAAAATCTCCAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATA
1 AACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATA
* * * * *
1123086 AATTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATC-AAAC
64 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAAC
* * * * * * *
1123149 AAAAAGTCATATTTATTTTAATTAGATAATTGTTTAATTAGTCA-AACTATTTG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *** *
1123202 AGCTTGTTTCG-TAAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGCCAAAATAATAAT
1 AACTTGTTT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT--TTGAATATTAAT
* * * * * * * * * *
1123265 AAATTAATATGATTTTAATTCGAATAAACTTGTATGAACATAAGCAATAATTTTATGATAAACCA
63 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* ** * **
1123330 AAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * *
1123383 AACTTGTTCAATAAACAAATTTACTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTGTCTT-AATATTAATA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATA
* * * *
1123447 AATTTGTATTATTTT-ATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACA
64 AATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* *** * * * * *
1123511 AAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGTCATAATTATTTA
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
1123564 AAATT-ATTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTT-CATTATTAATTTTCAGAATATTAAT
1 AACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATTTT-TGAATATTAAT
* * ** * * * **
1123627 AACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTA-AAATAATTATTTTATTACAGCAC
63 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * *
1123691 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTAG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * ***
1123745 ATCTAGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATA
* * * * * * * *
1123809 AATTAGTATTATTTTAATCCAACTAAGCTTCTGTGAATGGAAACTATTATTTTAT-AAAAGAAAA
64 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAA-AACA
* * * * * * * *
1123873 AAATGTCATAATAATTTGAAAGAAATAGTTGCTCAAATAGTTATAGCTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
1123926 AACTAGTTTAATAAATAGATTTA-TTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAG
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAA
* * * * ** * * * * * *
1123987 ATTAATATT-TTTT-ATTCCGAACAAACTTACATAAATAAAAACATTTGTTTTATAACAAAAGAA
65 ATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * *
1124050 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATGATTATTTG
129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
1124102 AACTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAAAATTAGTAA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAA
* * * ** * *
1124167 ATTCATTTTTATTTT-ATTCCAAATAAGCTGGTATGAATTTAAA-ATATTGTTTTATGATAAAAC
65 ATT-AGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATTATTTTATGACAAAAC
* * * *
1124230 --AA----A-AATGATTTGAAATATATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTGG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
1124277 AA-TTAGTTAGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTTTTTAACATTATT
1 AACTT-GTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAATATTAAT
* * * ** * * *
1124341 ATATTACTATTA-TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAGAACA
63 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* * * * *
1124404 AAAGGTTATAATGATTTGAAGTACATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTA
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * * *
1124457 AACTGGTTCAATAAATAGATTTATTCTTTAAA--AC-T-CTTATTAATTTTTGAAAGACTAATAA
1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAA
* * * * * *
1124518 ATTAGTATTATTTT-ATTCTAATAAACTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTATATGATC-AAACA
65 ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACA
* * * * *
1124580 AAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAATTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
1124633 AAC-TGATTCGATAAAC-GAATTTACTTTTTAAATCACTTCCTTATTAACTTTTGAAATATTAAT
1 AACTTG-TTTGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAAT
* * * * ** * *
1124696 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTAA-CTTGAACAAACTA-AAACAATTGTTTTATGCCAAAA
63 AAATTAGTATTATTTTA-ATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
* * *
1124759 CCAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATACT-GTCTTAACTATTTG
126 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
1124814 AAC-TGCTTCGACAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTA
1 AACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATA
* * *
1124878 AATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTATTTTATAACAAAAT
64 AATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * ** * * **
1124941 AAAAAGTTATAACAATTTGAAGTATATAA---TT---AT--T--TAA--ATAGG
127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
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1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTG-AATATTAATA
* ** * * *
1125047 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTATTTTATGAC-AAACA
64 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* * * * * *
1125110 AAAGTTCATAATGATTTGACATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
*** * ** * * * *
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1 AACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAA
* * ** * * * * * * *
1125228 AATAATATTATTTTATATT-GGACAAGTTTTTACGAGCT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAACA
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* * * * * * *
1125291 AAAGGTCGTATTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAATCACAACTATTTG
128 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
1125344 ACCTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTCTCATTTATTAATTTTTTGAATGTTAAT
1 AACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAAT
* * * * **
1125408 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACA-AAATGAATTATTTTATGAGTAAAC
63 AAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTATTTTATGACAAAAC
* * * ** * *
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* * * * *
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1 AACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATA
* * * * * * * * *
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* ** * * *
1125650 AAGATCATAAAAATTTGACATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTG
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* * *
1125702 AA-TTGGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
1 AACTT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATA
* ** *
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64 AATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATG-ACAAAAC
** * * * * * * * * *
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127 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * ** *
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* ** * * *
1125944 ATTAGTATTATTTT-ATTTAGAATAAAATTGTATGAATAGAAATAATTGTTTAATGACAAAACAA
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* * * * *
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129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
*** * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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129 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
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* * * * * *
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*
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
1126601 AACTTGTCT-AGTAAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTA
1 AACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
1126647 TTTGTCAAAA
Statistics
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TTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
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* * * * * * ** * *
1117522 ATTTTA-ATCTGTATTAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGGATAAAAAATCATA
64 ATTTTATATC-GAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * * * * ** * *
1117586 ACGATTTGAGATAAATAATT-GTCAAATAGTAATAAATATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTT
128 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TTATAACTATTTGAACTTATTCGAT-AACAGATTT
* * * * * * *
1117650 ATATTTTAGA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTACTTT-ATTCCAA
191 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TAA
* * * ** * * * * *
1117710 ACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATA
255 ATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * * * *
1117775 AATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAAATAGAAATATTATTTTT-AA
319 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGAT-AAACAG--AT-TTATTTTTAAA
* * * * **** *
1117839 TCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTG-TTCTATTTTATTTTGAATAAGCTAGT
380 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAAT-TATTTTATACCAAATAAGCTTGT
* * * * *
1117903 ATGAATTGAAA-ATTTGTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAAATAATTGT
444 ATGAAATGAAACAATTGTTT-TGTACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTCT
* * * * **** * * * * *
1117965 TCATATAGTCTTAAATATTTGA-ACTGGTTTGGCAAACAAATTT-GTTTTTAATTCTCTTATTTA
507 ACAAATAGTCATAATTATTT-ATA-T--TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-ATTACTTA
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567 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGACTGTATAAATTGAA-A
* * * * * ** * * *
1118074 GAAATAATTGTTATGATAGAACAAAA-AGTGATAACAATTTGACATATACAATTATTCAAATAGT
631 -CAATTATT-TTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
1118138 CATAACTATTTGAATTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAAG
693 CATAACTATTTGAATAGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATATTAATTTTTAAAAT
* **
1118203 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGA-ATGATA-AAAAA-AATTTGTTAAAT
758 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-ATATGA-ACAAAAACAA-TTGTTTTAT
* * * * * * *
1118265 GACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATA-ATAATTGTTGAAATGGCCATAATTA-TTGAAA
820 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTG--A
*
1118328 ATTATTC
883 ATTGTTC
* * * * * * *
1118335 ATTAAAGAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATT-ATTTTTGGAATATTAATAAATTTGTATT
1 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** ** * * *
1118399 ATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAA
64 ATTTTATATCGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * ** * *
1118464 CAATTAGAAATAGATAAATATTCATGTAGTTTTAACTATTTGAAC-TATTTCGATAAACGGATTT
129 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TTATAACTATTTGAACTTA-TTCGAT-AACAGATTT
* * * * * * *
1118528 ATTTTTTTAATCTCTTAATTTTTAATTTTT-GAATATTATTAAATTATTATTA-TTTCATTTCGA
191 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-AA
* * * * *
1118591 ATAAGCTTCTATGAGCTGAAACAATTATTTTATAACAGAATA-AAAGGTT-ATAACAATTTCAAA
255 ATAAGCTTGTATGA-ATGAAACAATTATTTTATGAC-GAA-ACAAAAGTTCATAACAATTTGAAA
* *
1118654 TAGGTAATTA-T----T--T-A-AAC-A--TAAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT
317 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAAT
* * ** *
1118707 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTGTTTTATTTCAAATAGGCTTGTAT
381 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATACCAAATAAGCTTGTAT
** * *** *
1118772 G--ATGAAAAACAATTGTTTCATG-ATGAAACAAAAAGTTCATAGCAATTCGAAATAGATAATTG
446 GAAATG--AAACAATTGTTT--TGTACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-
* * * * * *
1118834 TTA-AAATGGTCATAATTATTTGAACTAATTCAATAAACAGATTCACTTTTT-AA--ATTCCTTA
505 CTACAAATAGTCATAATTATTT--A-TATTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCATTACTTA
* * * * * *
1118895 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAACAATAATTTATGAATTGA
567 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT---AAGACTGTATAAATTGA
* * * * *
1118960 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTC
629 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTC
* ** ** * * *
1119025 GTAACTATTTGAATTTGTTCAG-AAA-TAATTT-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA
694 ATAACTATTTGAATAGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CATATTAATTTTTAA
* * * * * * *
1119087 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATTAACTAAAACAATTATTTTAT
755 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
** ** * *
1119152 GACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGTATGACTGTTTGAAC
820 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-
*
1119217 TTGTTT
884 TTGTTC
* * * * * * *
1119223 GGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTGTTGACATATTAATAAATTAATATT
1 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATT
* * *
1119288 ATTTTA-ATCGAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTTATA
64 ATTTTATATCG-AATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * *
1119352 ACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAACTATTTGAACTTATTTGATGAATAGATTT
128 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATATT-ATAACTATTTGAACTTATTCGAT-AACAGATTT
* * *
1119417 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATTT-GAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATTAA
191 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATTTA
* *
1119480 AATAAGCTTGTATGAATAGAGAA-AATTATTTTAT-ACGAAACAAAAGTTTATAACGATTTGAAA
254 AATAAGCTTGTATGAAT-GA-AACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAA
* * * *
1119543 TAGGTAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTAAACTTGTTTAATAAATAGATTTAGTTTTTAAAT
317 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAAT
* * * *
1119608 CTTTTACTTATTAATTTTT-AGAATCTTAATAAATTAGAATTATGTTATACCAAATTAGCTTGTA
381 CTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGAATTATTTTATACCAAATAAGCTTGTA
*
1119672 T-AAATAGAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTCTA
445 TGAAAT-GAAACAATTGTTTTGT-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTCTA
* * * * * ** *
1119736 CAAACAATTACAACTATTTATATTGGTCAAGCCAACAAATTTATTTTTTAAATCCATTACTTATT
508 CAAATAGTCATAATTATTTATATT--TCAA-TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CATTACTTATT
* * * * *
1119801 AATTTTTTGAATATTAAT-AATTAGTATTACTTAATTTCGAATAAGACTGTATCAATAGAAACAA
569 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGACTGTATAAATTGAAACAA
* * *
1119865 TTATTTTATGACAAAACAAATA-ATCATAATGATTTGAAATAAATAACTT-TTCAAATTGTTATA
634 TTATTTTATGACAAAACAAA-AGATCATAATGATTTGAAATATATAA-TTGTTCAAATAGTCATA
* *
1119928 ACTATTTGAATAGGTTTGGTGAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCATATTAATTTTCAAAATATTA
697 ACTATTTGAATAGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * **
1119992 ATAAATTAATATTTTTTTATTTCGAACAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTGCGACAAAA
762 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
1120057 CAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGCTTC
827 CAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTG-TTC
* * *
1120121 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATT
1 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
1120186 ATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAAGACAAATAATTATTCTATGACAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTA-TATCGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * * * ** *
1120250 AAGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAGCATATTT
128 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TTATAACTATTTGAACTTATTCGATAA-CAGATTT
*
1120315 ATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTT-ATTCTA
191 ATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TA
* * * * *
1120378 AATAGGCTTGTGTG-ATGAAAAATAATTATTTTATGATGAAACAAAAGTTCATAGCAATTTGAAA
254 AATAAGCTTGTATGAATG--AAACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAA
* * * * **
1120442 TAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTTAAC-TGATTTTG-TAAAGTGATTTATTTTTAAA
317 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG--TTTGATAAACAGATTTATTTTT-AA
** * * * ****
1120505 ATCTCCAACTTCTTAAATTTTGAAATATTAATAAAGTA-ATATTATTTTATATTGGATAAG-TGT
379 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATACCAAATAAGCT-T
* * * * * * * *
1120568 TTATGAACTGAAACAATTG-TTT-TA-TAAACATATGGTCATAATGATTTTAAAT-GTATAAATG
442 GTATGAAATGAAACAATTGTTTTGTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTC
* * * * *
1120629 TTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTC-TTGCT
506 TACAAATAGTCATAATTATTTATA--T-TTCAATAAACAGATTTA-TTTTTTAAA--TCATTACT
* * * * *
1120693 GACTAATTTTTGGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CATGTATAAATTGA
565 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGAC-TGTATAAATTGA
* * * * * * * *
1120757 AATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAATTATTTGAAATATATAATTGTTCTAGTAGTC
629 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTC
* *** *
1120822 TTAACTATTTGAATTA-GTTTAACAAACACATTTACTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
694 ATAACTATTTGAA-TAGGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTC--A--TATTAATTTTT
* * * ** * * * * * * * * * *
1120886 ATAACATTATTAGTTTGGCAATATTTTACTCCAAATATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGCTTT
753 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
1120951 ATGATAAAAC-AAAGATCATAATAATTTGAGATAGACAATTGTTCAAATAGCAATAACTATTTGA
818 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGA
* *
1121015 ACTGGTTT
883 A-TTGTTC
* * * * *
1121023 GGAAAATAGATTT-TGTTTTTAAATCTC---TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATT
1 AGTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
1121084 ATTTTAT-TCTAAAAAATTTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATATCGAATAAA-CTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * * * * *
1121148 ATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGAATATGACTATTTGAACTTGTTCGGTACATAGA-T
128 ACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-ATTATAACTATTTGAACTTATTCGATA-ACAGATT
* * *
1121211 TATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
190 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAA
** * * * ** ** *
1121276 ATAAAATTGTATGAGTGGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGAGCATAATGATTTGGAATA
255 ATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * * *
1121341 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTTGGTAAACAAATTTATTATTTAAAGCT
319 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATT-TTTAAATCT
* * * * * *
1121406 TTTACTTATTAATTTTAG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGA
383 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATACCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * *
1121470 ACTGAAATAATTAGTTTATG-ACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
448 AATGAAACAATT-GTTT-TGTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTCTACAA
** * * ** * **
1121534 ATAGTCATAGCTATTTGAATGTATTCAAAAAACTTATTTATATTTTAAATTTTTACTTATTAATT
511 ATAGTCATAATTATTT--ATAT-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCATTACTTATTAATT
* * **
1121599 TGTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGTTTGCT-TGAACA-T--AACT
573 TTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGACTG-TAT-AA-ATTGAAAC-
* * * * * *
1121658 AATTATTTTATGAC-AAACTACAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAATCAT
632 AATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * ** ** * *
1121722 AGCTATTTGAACATATTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTCCTCATTAATTTTTGATA
696 AACTATTTGAATAGGTTTGGTAAACA-A---A---TTT-ATT-T-TT--T-A--AA----T-CT-
* * * *
1121787 AACAGATTTATTTTTAAAACCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGCATTTTTATTCC
740 --CATATTAATTTTTAAAA-----TATTAA----T--AA-ATTAGT--ATT---A-TTTTATTTC
* * * * * * **
1121852 GAACAAACTTATATGAGA-AAAAATAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAA
785 GAATAAGCTTATATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAA
* * * *
1121916 CA-A-ATAATTATTCAAATA-CTCATAATTATTTGAACTGGTG
849 -ATAGATAATTATTCAAATAGC-CATAACTATTTGAATTGTTC
* *
1121956 AGGTAAACATAA-TTATTTTTTAAATCTCTCACATATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTCA-T
1 A-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-AGT
* * * * * *
1122019 TTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
61 ATTATTTTATATCGAATAAACTTGTATGAA--C-AAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG
* * * * * *
1122084 TCATTATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT-TAAATATTTGAAC-TAGTTCGACAAA
123 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-T-TATAACTATTTGAACTTA-TTCGA-TAA
* * * * * * *
1122147 CAAACTTATTTATTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTT-GAAATATTATTAGATTAGTATTA-TTT
184 CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** ** * * * **
1122210 AATTCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGA-TAGAACAAAAG-GCTATAATG
248 AATT-TAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACGA-AACAAAAGTTC-ATAACA
* ** * * * * * ** *
1122273 ATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAATTGTTTGAACTACTTTGATAAATAGATTTATT
309 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATT
* * * * * * *
1122338 TCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATGAGTATTATCTCATTCCGAATAA
374 T-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATACCAAATAA
* * * *
1122403 GCTTGAATGTTCAAAT---ACAATTGTTATATG-ACCAAACAAATA-GTAATAATGATTTGTAAT
438 GCTTGTATG---AAATGAAACAATTGTT-T-TGTACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAAT
* * ** * * * *** * * *
1122463 AAATAATTGTTGACATGGCCATAATTATTTGA-ATTGATTGGGTAAACATATTCACTTTTTAAAT
497 AGATAATTCTACAAATAGTCATAATTATTT-ATA-T--TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
1122527 CATTTACTTATTAAATTTTAGAATATGAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGT
558 CA-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGAC-TGT
* * * * * * * * * * * *
1122590 ATGAACTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAGATAGAAAATTATT
620 ATAAATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATATATAATTGTT
* * * * * *
1122655 CATATAGTCTTAACTATTTAAACT-GCTTTGGGAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
685 CAAATAGTCATAACTATTTGAA-TAGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC--A--TAT
** * * * * *
1122719 TAATTTTTGTAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAACTAAAACA
745 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACA
* * * ** * * * *
1122783 ACTATTTTATAACAGTACAAAAGGTTATAATGAA-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG----A
810 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATA
* *
1122843 A--A-TTG--GT-TTG
874 ACTATTTGAATTGTTC
* * * * *
1122853 A-TAAATAGATTTATTTTTAAAATCTAC-TACTTACTAATTTTTAAAATATCAATAAATTAGTAT
1 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTA-TTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTAT
* ** *** * * * * ***
1122916 TATTTTATACCGAATAGGCTTGTATGGTGAAAAACAATTGTTTTCTAACAAAA-AAAGTTTC-TA
63 TATTTTATATCGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * * * * * ** *
1122979 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTTAATAA-ATTGACT
128 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-ATTATAACTATTTGAACTTATTCGATAACA--GATT
* ** * *
1123043 TATTTTTAAAATCTCCAACTTATCAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTC
190 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-
* * * * *** *
1123106 AGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATC-AAACAAAAAG-TCATATTTATTTTA
253 AAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGA-CGAAAC-AAAAGTTCATAACAATTTGA
* * * * * * *
1123169 ATTAGATAATTGTTTAATTAGTCA-AACTATTTGAGCTTGTTTCG-TAAACATATTTATTTCTTA
315 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTT-GATAAACAGATTTATTT-TTA
* *** * * * * *
1123232 AATCTTTTACTTATT-ATTTGCCAAAATAATAATAAATTA-ATATGATTTTA-ATTCGAATAAAC
378 AATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATA-CCAAATAAGC
* ** * * * * ** *
1123294 TTGTATGAACAT-AAGCAATAATTTTATGATAAACCAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
440 TTGTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTGT-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * ** * * *
1123358 TTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGA-ACTTGTTCAATAAACAAATTTACTTTTTAAATCTTTTA
503 TTCTACAAATAGTCATAATTATTT-ATA--T-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-ATTA
* * * *
1123422 CATATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAG-CTTGTATGA
563 CTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGAC-TGTATAA
** * * * * *** * * * *
1123483 ACAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTATTGAAA
624 ATTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAA
* * ** * * *
1123548 TAGTCATAATTATTTAAAATTA--TTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTCATTATTAA
689 TAGTCATAACTATTT-GAA-TAGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-TCA-TATTAA
* * * * * *
1123611 TTTTCAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATT
748 TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATT
* * ** * * * * *
1123676 ATTTTATTACAGCACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTA
813 GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTA
* *
1123741 TTAG-ATCTAGTTT
878 TTTGAAT-T-GTTC
* * * * **
1123754 GGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTAT
1 AGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-TTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * ** * *
1123818 TATTTTA-ATCCAACTAAGCTTCTGTGAATGGAAACT-ATTATTTTAT-A-AAAGAAAAAAATGT
63 TATTTTATATCGAA-TAAACTTGTATGAA-CAAAAATAATTATTTTATGACAAA-ACAAAAA-GT
** * * * ** * ** *
1123879 CATAATAATTTGAAAGAAATAGTTGCTCAAATAGTTATAGCTATTTGAAC-TAGTTTAATAAATA
124 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TTATAACTATTTGAACTTA-TTCGAT-AACA
* * * *
1123943 GATTTA-TTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAATTTTT-GAAATATTATTAGATTAATATT-TTTT-A
186 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA
** * * ** * * * * * * * * *
1124001 TTCCGAACAAACTTACATAAATAAAAACATTTGTTTTATAACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTT
250 TT-TAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGTTCATAACAATTT
** * * * * * * * *
1124066 GAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATGATTATTTGAACTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTT
313 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTT
* * * *** *
1124131 AAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAAAATTAGTAAATTCATTTTTATTTTATTCCAAATAAGCT
377 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGAATTATTTTATACCAAATAAGCT
* * * * * *
1124196 GGTATGAATTTAAA-ATATTGTTTTATGATAAAAC--AA----A-AATGATTTGAAATATATAAT
441 TGTATGAAATGAAACA-ATTGTTTTGT-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * * *
1124253 TGTTCATATAGTCTTAACTATTGGA-ATTAGTTAGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTA
504 TCTACAAATAGTCATAATTATT-TATATT--TCA-ATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATC-ATTA
* * * * * * * *
1124317 GTTATTAAATTTTT-TAACATTATTATATTACTATTA-TTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAA-
563 CTTATT-AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGAC-TGTATAAAT
** * * * * * * *
1124378 CAAAAAAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTACATAATTATTCAAATA
626 TGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
* *** * * * * * *
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691 GTCATAACTATTTGAA-TAGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCATATTAATTTTTAA
* * * * * * *
1124507 AAGACTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAATAAACTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTATA
755 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGA-ACAAAAACAATTGTTTTA
* * ** * * * * * *
1124570 TGATC-AAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAATTATTTGA
819 TGA-CAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGA
*
1124634 ACTGATTC
883 ATTG-TTC
* * * * *
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1 AG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ATTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * ** * * * * * *
1124706 TATTTTATTTTGAATTAACTTGAACAAACTAAAACAATTGTTTTATGCCAAAACCAAAGGTCATA
63 TATTTTATATCGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * * * ** * * *
1124771 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATACTGTCT-TAACTATTTGAACTGCTTCGACAAATAAATT
128 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAT-TATAACTATTTGAACTTATTCGA-TAACAGATT
* *
1124835 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTCTA
190 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TA
* * * * *
1124899 AATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAAGTT-ATAACAATTTGAAG
254 AATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACGAAA-CAAAAGTTCATAACAATTTGAAA
* * * * *
1124963 TATATAATTATTTAAATAG---GAAC----T--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAAT
317 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAAT
* * * **** *
1125016 -TTTCTACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTA
381 CTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATACCAAATAAGCTTGTA
* * * * * *
1125080 TG--ATGAAAAATAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGTTCATAATGATTTGACATAGATAATTAT
445 TGAAATG--AAACAATTGTTTTGT-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTCT
* * * * * * ** *
1125142 TCAAATGGCCATAATTATTTGAACAAATTCGATAAATTGACTTATTTTTTAAATC-TCTAACTTA
507 ACAAATAGTCATAATTATTT--A-TATTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCAT-T-ACTTA
* * * * * * * ** * ** **
1125206 TCAAATTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATATT-GGACAAGTTTTTACGAGCTGAAA
567 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGACTGTATAAATTGAAA
* * * * * * * * * * *
1125270 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTATTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAATCAC
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* * ** * **
1125335 AACTATTTGACCT-TGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTCTCATTTATTAATTTTTTG
696 AACTATTTGA-ATAGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA---TCTCA--TATTAATTTTTAA
* * * * ** *
1125399 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACAAAATGAATTATTTTAT
755 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
** * * * * * * * *
1125464 GAGTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATACTTACTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC
820 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-
* *
1125529 TAGCTC
884 TTGTTC
* * * * *
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1 -AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
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** * * * * *
1125659 AAAATTTGACATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGATT
128 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-TTATAACTATTTGAACTT-ATTCGAT-AACAGATT
*
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190 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-T
* ** * * * * *
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* * * * * * * ** *
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315 AATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTTAT-TTTTA
** * * ** **
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378 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGAATTATTTTATACCA-AATAAGCT
* * * *
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* * * * * * ** * * *
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* * * * * **
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** * * * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * ** * *
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* ** * * *
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*
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** * * * * *
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* * * * ** ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** ** * ** * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * **
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** ** * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * *
1108876 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGCTT-GATAAATAGA
496 TAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCG-TAAACATA
* * * * * *
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** * * * * *
1109002 CCGAA--AAGCTT-TAT-AAGATAAAATAACTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAA-TAGTT
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
1109275 TTTAAACTAGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAA---GCT-CTTATTAATTCTTAAAATATT
182 --GAAATTAGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATT-TTTAAATATT
** *** * * *
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243 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AACAAAAATAATTATTTTATGACAG
* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
1109463 TAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACA-TTTGAAATATTAATAAAGTAGTA
372 CAATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAA-ATTTTGAAATATTAATAAATTAATA
* * * * * *
1109527 TTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATTAAATAAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCAT
435 TTATTTTA-TTT-AACAAGCTTTTA-TGAATAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
* * * *
1109592 AATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA---G----T--TTGGTAAAC-TGAT
497 AATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAACAT-AT
* * *
1109647 TTATTTTTTTCAAATC---TCATGTTAATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTT
561 TTA-CTTTTT-AAATCATTTCA--TT-ATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * * * * * *
1109708 ATTTGGAA-TAAGCTTGTATGAAATGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAACGAT
620 ATTTTGAATTAA-CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
1109772 TTGAAATAGATAATTGTTC-TAAT
684 TTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* ** * * * *
1109795 AGTCTTAACTATTTAAACCAAC-TC-AGCAGACACATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTACTAAT
1 AGTCTTAACTATTTGAA-CTGCTTCGA-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * *
1109858 TTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATATAAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAGTT
64 TTTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * * * * *
1109922 GTTTTATGACAAAATAAAGA-TCAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACT
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* * * * *
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185 A-TT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAA-TTTTTAAATATT
* * *** * ** * * * * *
1110044 ATTAAATTGGTATTATTTT-TATCCAAATAAACTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAGAA
243 AATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAG
* * * * * *
1110108 AAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AGACTAGT
307 AACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTAAT
* * ** ** * * * *
1110171 GTGAA-AAATAG-CTTTAGGTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTCA
371 -TCAATAAATTGAC-TTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAA
* * * * * *
1110234 TATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTC
433 TATTATTTTA-TTT-AACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTC
* * * * *
1110299 ATAATGACTTT-AAA-AAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATTTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT
495 ATAATTA-TTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGATTCGTAAAC
* * * * * * *
1110361 AGATTTATTTTTTTAATTC-TCTTGC-TCATTAATTTTTCG-AATGTTAATAAATTAGTGTTATT
557 ATATTTA-CTTTTTAAATCAT-TT-CATTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATT
* * * * * * *
1110423 TTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAAATGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAACG
618 TTATTTTGAATTAA-CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
1110487 ATTTGAAATAGATAATTGTTC-TAAT
682 ATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * *
1110512 AGTCTTAACTATTTAAACCGAC-TC-AGCAAACACATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTACTAAT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTG-CTTCGA-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * *
1110575 TTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAGTT
64 TTTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * * ** * * * * *
1110639 GTTTTATAACAAAATAAAGA-TCATAATGATTTGAGATAGATAATTCTTCAAGTTATAACTATTT
127 ATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAA-ATAGAA--A-TT
** * ** * *
1110703 GAATTGTTTTAGTAAACAAATTTGGTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAAT-
188 --A--GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATTTT-TAAATATTAATA
** * * * * ** *
1110763 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGGTAAAACAA
247 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAAC-A
** * * * * * ** *
1110828 AAAG-TCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAA-TTGTTCGAT
311 AAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAAT
** * * * * *
1110891 AAACAGA-TATATTTTTTAAATCTCCT-ACATGT-TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
376 AAATTGACT-TATTTTTTAAAT-T-CTAACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATATT
* * * * * * * *
1110953 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCCTAA
437 ATTTTATTT--AACAAGCTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
1111017 CTATTTGAAATAAATCATTGTTAAAACAGTCATAA-TGATTTGAACTTG-TTCGGTAAGCATATT
499 TTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGATTC-GTAAACATATT
* * * * * * *
1111080 TATTTTTTAAAT-TTTTTAGTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTC
562 TACTTTTTAAATCATTTCA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG
* * * *
1111143 AAATACACTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGA-AAAA-AAAAGGTCATAAC----TGAAA
626 AATTA-ACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
*
1111202 TAAATAATTGTTCA-AAT
690 TAGATAATTGTTCATAAT
* * * * *
1111219 AGTCATAACTATTTGAACATG-TTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAAC-TGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
** * *
1111282 TTTGGAATATTATTAAATTTA-TATTATTTTAGTT-GGAATAAGCTTGTATGTA-TAGAAATAAT
65 TTT-GAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAAT
* * * * * * * *
1111344 TATTTTATGACAAAATGAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCACAAC
126 TATTTTATAACAAAA-CAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA-
* * * * * * **
1111409 CATTTGGACTTGTTCGATAAACAGATTCATATTTTAAA-TCTCTTACTCATTAATTTTTGGAGCA
185 -A-TT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTC-TACTTATCAATTTTT-AAATA
** * * * ** * ** * *
1111473 TTAATATTTTA-TTTTGAATAAGCCTATATAATACAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATA
241 TTAATAAATTAGTATT--AT-----TTTAT-TTTGAATAAGCTTGT-AT-GAACAAAA----ATA
** * * * *
1111537 ACGATTTAAAATAGATA-ATTATTCAAATAGTT-ATGA-GATTTGAAATATATAATTATTCAAAT
292 ATTATTT--TAT-GACAGA--A--CAAA-AGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* ** *** * * * * *
1111599 AGTTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAT-ATTTATTTTTAAAATGTTTTACTTAT-TAAT
349 AGTCATAACTATTTGAACTAATTCAATAAAT-TGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAAT
*** * * * * * * *
1111662 TAACAAAATATTAATAAATTACTATTATTTAAATTAGAATAAGCTTGTATGAAAAAAATAATTGT
412 T-TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTT-TATT-TAACAAGCTTTTATGAATAAAACAATTGT
* * * *
1111727 TTTTTGACAAAACAGAAA-GTCATAA-GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGTCATAACTAT
474 TTTATGATAAAACA-AAAGGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
1111790 TTGAACTT-ATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCTTC-TTATTAGTTATCTG-AATAT
538 TTGAACTTGA-TTCGTAAACATATTTACTTTTTAAATCAT-TTCATTATTAATT-TTTGAAATAT
* * * * * *
1111852 TAATAAATTTATATTATTTTA-ATTGAAATAAGCCTGTATGAA-TAGAAAAAAATTATTTTATGA
600 TAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATTAA-CTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGA
* * * ** * *
1111915 CAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGCAATTATTC-CAAT
662 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
** ** * * *
1111960 AGTGATAACTATTTGAACTTATTC-A-ATACAAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTA-TTACT--TT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAAC-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
1112020 TTGGAAAATTAATAAATTAGAATTATGTTATT-TCAAATTAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTA
65 TTTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTA
* * * * * * *
1112083 TTTTGTGACAAAAC-AAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCACAGTTATAACTATT
128 TTTTATAACAAAACAAAAAG-TTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTA-A-ATAGAA--ATT
* * * * * *
1112147 TGTACTGATTAGGCCAACAGATTCATTTTTTAAATCTAT-TACTTATTACTTTTTAGAATATTAA
188 AGTTC-GA-TA----AACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATCAATTTTTA-AATATTAA
* * ** * * * * * * *
1112211 TAAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGATTGTATTAATAGAAACAATTAATTTATGATAGAAC
245 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAAC
* * * * * * * * ** **
1112276 AAATGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATTGTTATAACTAGTTGAA-TCGGTTTG
310 AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AATTCA
* ** * ** * *
1112340 GTAAAAAGATTTATTCATTAAA-TCT--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
374 ATAAATTGACTTATTTTTTAAATTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
* ** * * * * * *
1112402 TTTATTTTGAACAAACTTACATGAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATG
439 TTTA-TTT-AACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATT
* * * * * * * * * * *
1112467 ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTT-AAATTGGTTCGGCAAATAAATTTAT
501 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC-GTAAACATATTTAC
* * * * * * * *
1112531 TTTTTCAATC-TCTCAATTATTAA-ATTTCATAATATTACTAGATTATTATTATTTTATTCTGAA
565 TTTTTAAATCATTTC-ATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAA
* * * * * * * *
1112594 TAAAATTATATGAA-GATAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATA
628 TTAACTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
*
1112658 TATAATTGTTCA-AAT
692 GATAATTGTTCATAAT
* * * ** * * * *
1112673 AGTCATAACTAATTGAACTAG-TTAGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATTTCCTACTTATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAACT-GCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
1112737 TTTAAAAATATTGA-TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGTTTGTATG-A-TGAAGAGCAA
65 TTT--GAATATT-ATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AA-AACAA
* * * * * *
1112799 TTGTTTTATGAC--AA-AAAAATTTGA-AACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA
125 TTATTTTATAACAAAACAAAAAGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA
* * * * * *
1112860 TTATTTGAACTGATTCAATAAACTA-AATTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAAT
185 --A-TT--A--G-TTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATTTTT-AAAT
* * * * ** * * *
1112924 ATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAT
240 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC
* * * * * * * * * * **
1112989 AAAATAGAAGGT-ATAAAGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAGTATTCATAACTATTTAAACTTG
305 AGAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAA
** * * ** * * * *
1113053 TTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAAATTCTTGCTTATTAATTTTATG-AATGTTAATAAAATA
370 TTCAATAAATTGACTTA-TTTTTT-AAATTCTAACTTATCAAATTT-TGAAATATTAATAAATTA
* * * * ** * *
1113117 GTATTATTTTATTTTAAAGAAGCATGTATGAATTGGAACAATTATTTTATGACT-AAACAAAAAG
432 ATATTATTTTA-TTT-AACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGG
* * * * * * * *
1113181 T--TAGATTGATTTGAAATAGATTATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAA
493 TCATA-ATT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAA
* * * * ** *
1113244 CACATTTATTTTTTAAATC-TTAC-TTATTAA-TTTTCATAATATTAATAGTTTAGAGA-TATTT
556 CATATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-ATATTATTT
* * * * * * * * *
1113305 TA-CTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATTATAAGGA
619 TATTTTGAATTAA-CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* *
1113368 GTTT-AGATAGATAATTGTTTA-AAT
683 -TTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * ** * * * *
1113392 A-TTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAGATTTA-GTTTTAAA--TC-TA-TAATTGATT
1 AGTCT-TAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *** * * *
1113451 TTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTAATTCTAAATATTTTTGTAT-AAATAAAAATAATTG
65 TTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTA
* ** * * ** * * *
1113515 CTTTACGACAAAAGAAAATA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAAATGGACATTACTA
128 TTTTATAACAAAACAAAA-AGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAAT--AGA--A--A
* * * * * *
1113579 TTTGAACTTACTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCCAACTCATCAATTTTTAGAATATTA
186 -TT--A-GT--TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATTTTTA-AATATTA
* ** * * ** * * * *
1113644 ATAAATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAACTTGTATGAATAAAAGCAATTGTTTTCTAACAAAA
244 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAA
* * * * * * * *
1113709 CAAAAGTTCATAACGATTTTAAATAAATAAGTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACTT-
309 CAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AATTC
** ** * *
1113773 GGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA-TCT---TT-T--ACTTATT--AAT-TT--T---TTGAAT-
373 AATAAATTGACTTA-TTTTTTAAATTCTAACTTATCAAATT-TTGAAATATTAATAAATT-AATA
* * * * *
1113822 TTATTTTATTCCTAATATGGTTTTATGAACAAAAACAATTAG-TTTATG-GAAAACAAAAGGTCA
435 TTATTTTATT--TAACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATT-GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * * * *
1113885 TAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTGTTTAAACGTGTTTAGAAAATAAAT
496 TAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAACATAT
* * * *
1113950 TTA-TTTTTAAA--ATTTTTACTTCTTAATTTTTGGAATATTAATAATTTTAA-ATTATTTTA-T
561 TTACTTTTTAAATCA-TTTCA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAATATTATTTTATT
* * * *
1114010 TTGAAATATACTTGTATGAAC-AAAATCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGCCATAA-TATTT
623 TTGAATTA-ACTTGTATGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TT
* * *
1114073 TAAAATAGATAATTATTCA-GAT
685 TGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * ** * * * * *
1114095 AGTCATAATTATTTAAACTTTTTC-AGTAAACAGATTCT-TTTTTTAATTCTTTTACTCATTAAT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGA-CAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * *
1114158 GTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTC-AAATAAGTTTGTATGAACTGAAATA-AA
64 TTTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAA-ACAA
* * * * * ** *
1114221 TTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGGC
125 TTATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG--A----
* * * * * **
1114286 TATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATATTTTAAATCTTT-TACTTATTAATTGTCAAAATA
184 -AATT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATCAATT-TTTAAATA
* * * * ** * * *
1114350 TCAATAAATTAATACTATTTTA-ATCCAA-AA-CTTGCATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACA
241 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACA
* * ** * * * * * * * *
1114412 AAACAAAAAG-TCAAAACAAGTT-AAAAAAATAATTGCTT-AAATAATCATAACGATTTAAACTT
306 GAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
** * * * * * *
1114474 ATTCGGTAAACTGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTC--ATTGTCGTAATATTAATAAAT
369 ATTCAATAAATTGACTTA-TTTTTTAAAT-TCTAACTTA-TCAAATT-TTGAAATATTAATAAAT
** * * * * * * *
1114537 TTGTATTATTTTATTTGAAATAAGGTTGTATGAACAAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
430 TAATATTATTTTATTT--AACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAG
* *** * * * * * *
1114602 GTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTT-ATTCAATAAA
492 GTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC-GTAAA
*** * * * * *
1114666 TGGATTCACTTTTTAAATC-TTGTTATTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTT
556 CATATTTACTTTTTAAATCATT-TCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * * * *
1114730 A-TTTCAAATAAGCTTAG-ATGAACTAAAACAACTCTTTT-TGACAAAACAAAAGGTCTTAATGA
620 ATTTTGAATTAA-CTT-GTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
*
1114792 TTTGAAATAGATAATTATTCA-AAT
683 TTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * *** * ** * * * * * *
1114816 AGTCATGATTATTTCTTCTAG-TTTGGTAAACATATTTCTTTTTAAAATTTTTTAGTTATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAACT-GCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * *
1114880 ATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATAC-GAATAAGCTTGTAT-AAATAAAAACAATT
65 TTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATT
* * * * * ** * **
1114943 GTTTTATAATAGAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATAGCCAAAACTA
127 ATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA--A
* * *
1115008 TTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTTGTTAAA---TCT-CTTA-CTAATTTTTGAAATATT
186 -TT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATC-AATTTTT-AAATATT
* * * * * ** * * * * * *
1115068 ATTAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTACATGAACAAAAACATTTGTTTTTTGGCAAA
243 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGA
* * * * * * *
1115133 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTCCGAATAGTCATAATTATTTGATC-AGTT-
308 ACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTC
* *** * * * * * * * *
1115196 AGGTAAACAAAATTATTTGTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTT
373 A-ATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATAT
* * ** * *
1115261 TATTTTATTTCAAATAAACTAGTATGAATTCAAAA-AAGCTTATTTTATGACAAAAC-AAA-GTC
436 TATTTTATTT--AACAAGCTTTTATGAA-T-AAAACAA--TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTC
** * * * * ** * * * * * * *
1115323 ATAACAATTTGAAACAGATAACTATTCTTATAATCTTAATTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAATAA
495 ATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GATTCGTAAACAT
* * ** * * * * * *
1115387 ATTTAGTTTTTTAATTCCCTT-AGTTATTTATTTTTGGAATATCATTAGATTAATATTATTTTAC
559 ATTTA-CTTTTTAAATCATTTCA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
* * * * * * * *
1115451 TCTGAA-TATGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAATGATTT
622 TTTGAATTA-ACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* ** * *
1115515 GAAGTTTACAATTATTCA-AAT
686 GAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * * * ** * *
1115536 TGTCATAACTATTTGTACTAG-TTATG-TAAATAGATTTACATTTTAAATCTTTTACTTATTATT
1 AGTCTTAACTATTTGAACT-GCTT-CGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * ** *
1115599 TTTTGAAAGATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTATTCTGAATAAGCTTGAATGCTCAAAAAC
64 TTTTG-AATATTATTAAATTAG---TA--TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
* * * * * ** * * * *
1115664 AATTATTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTATTGACATGACCATA
123 AATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAAT-A-GA-A
* * * * *
1115729 ATTATTTGAACTGATTTAGTAAACAAATTCACTTTTTAAA---TC-ACTTA-CTAATTTTTGGAA
185 ATTAGTT---C-G----A-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATC-AATTTTT-AAA
* * ** * * *
1115789 GATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTTTGA
239 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGA
* * * ** * * * * *
1115854 CAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAGTAGATAATTGTTCATACAGTCTTAACTATTTGAA-TC
304 CAGAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
** * * * * * * *
1115918 GCTTCAACAAATAGA-TATATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATT
368 AATTCAATAAATTGACT-TATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * * * *
1115982 AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACTCAAACAATTATTTTATAACATAACGAAAGG
431 AATATTATTTTA-TTT-AACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGG
* * * * * * * * *
1116047 TTATAATGATTTGAAATAGATAATTCTTTAAATAG---GAACCAGTT---C--G----GTATAC-
493 TCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAACA
* * *
1116099 TAATTTATTTTTTAAATC-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
558 T-ATTTACTTTTTAAATCATTTCA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* *** * *
1116163 TTTTGAA-TAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACTATT
621 TTTTGAATTA-ACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
1116227 TGAAATAGATAATTGTTCA-AAT
685 TGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * * * * * * ** * * *
1116249 GGCCATAATTGTGTGAACCGATTTGATAAACTGAGTTATTTTTTAAATCTC-AACTTATCAATTT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * ** * * * * * *
1116313 TTGAAATATTAATGAAGGAATATTATTTTGTT-TCGAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAAGTAT
66 TTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTAT
* * * * *** * ** *
1116377 TTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATGGTTCAAATAGTCATAACTATT
129 TTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA--A-T
* * *** * * ** * * * * *
1116442 TGAACTTGTTTGGTAAATTCATTTATTTTTAAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTGATTGTTGA
187 T--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTC-TACTTATCAA-TTTTTAAATATTAA
* * * * *
1116507 TAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAACATGTATGAACTAAAAA-AATTATTTTATAACTA-A
245 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAATAATTATTTTATGAC-AGA
* * * * * * **
1116570 ACAAAAG---GT--TG-TTT----TA-AT-AGTCTT-AACTA--CATGA--ATTGGTTC-AA--C
308 ACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTC
* * * * * * * * *
1116615 AA-ACA-T-ATTTATTTTTTAAAGTTTTTACTTAT-TAATTTAGCAATATT--TTACTCTGAATA
373 AATAAATTGACTTATTTTTTAAA-TTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAT-T-AAT-
* ** ** ** * * * ****
1116674 AGCTTGTATGAATAAAAACAATTG-TTTTATG-ACGAAACAA-AG----ATCATAACGATTTTAG
434 A--TTAT-TTTAT-TTAACAA--GCTTTTATGAATAAAACAATTGTTTTATGATAA-AACAAAAG
* * * * * * * * * * *
1116732 ATAGATAATT-GTTCAATTAATCATAACTATTTAAACTAGTTCGATAA--A-TAG-ATTTAGGTT
492 GT-CATAATTATTTGAAATAA--ATAATTGTTCAAA-TAG-TC-ATAACTATTTGAACTT-GATT
* * * * *** *
1116792 --T---TATATCT-CTTATT-AAT--TTTCCAAATATTAAAAAATT---A-G------------T
550 CGTAAACATATTTACTTTTTAAATCATTT-C-ATTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAAT
* * * * *
1116832 ATTATTTCATTTTGAA-TAA-TTTTATCAA-TAGAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTC
612 ATTATTTTATTTTGAATTAACTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
1116894 ATGATGATTTGAAATAAATAATAGTTCA-AAT
676 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * ** * * ** * * *
1116925 GGACATGACTATTTTTACTTCTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTA
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-
** * * * * * * *
1116989 TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-GAATAACCTTGTGTGAACAAAAACAATTGT
65 TTTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTAT
* * * * * * * * *
1117053 TTCATGACAAAATAATAAGTCATAAAAATTTGAAATAAATAATT-TGTCAAACAGTCATAATAAT
129 TTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-T-TAA-A-T-A-GA-AA-
* * * * * *
1117117 TTGAATTTGTCTGATAAACAAAATTA-TTTTTAAACATTT-TACTTATTAATTGTTTTAATATTA
186 TT--A-GT-TC-GATAAACAGATTTATTTTTTAAA-TTTTCTACTTATCAATT-TTTAAATATTA
* * * *
1117180 ATAAATTTGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTTTGAATTGAAAAAAAATTATTTTATGACA
244 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAA--CAAAAATAATTATTTTATGACA
* * * * * * * * * **
1117244 AAACAAAAGGTT-ATAGTGATTTCAAATAAATAGTTGTTCAAATAGTCATAATTATATAAACTTG
306 GAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAA
** ** * * *
1117308 TTCGGTAAA-CAAATTATTTTTTTAAATATCTTAA-TTATTAACTTTT-AGAATATTAATAAATT
370 TTCAATAAATTGACTTA-TTTTTTAAAT-TC-TAACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAAATT
** * * * * *
1117370 GGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTCTATGAGCTAAAACAATTCTTTTATGATAAAACAAAAGG
431 AATATTATTTTATTT--AACAAGCTTTTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGG
* * *
1117435 TCATAATGATTTG--AT--CT-A--GTT----TAGT-A-AACATATTT--A-TT--TT-TTAAA-
493 TCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGATTCGTAAAC
* * * * * * ** * * ** *
1117480 TTTTTTACTTATT-AAT--TGTCA-AAAT-ATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATCTGTA--TT
557 ATATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAATAT-TATTTT
** * * * * * **** *** * * **
1117537 AGCTTGTATGAA-TAGAAAT-AA-TTATTTTA-TGATAGGAT-AAAAAATCATAACGATTTGAGA
620 ATTTTGAATTAACTTG-TATGAACTAAAACAATTG-TTTTATGACAAAA-CA-AA--A--GGTCA
** *
1117597 TAAATAATTGTCAAATAG-TAA----T-A-AAT
677 T-AACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* *** * * * * * *
1117623 ATTTGAA-C----TG----G-TTTGATAAATAGATTTATATTTTAGA--TC-T-CTTATTAATTT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * * * * * * * *
1117674 TCAAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTT
66 T-TGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATT
* ** * * * * *
1117739 TTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
130 TTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG--A-AATTAGTT
* ** * * * * *
1117804 GAACTGGTTAGGTAAAATAGAAATATTATTTTTAA-TCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATACTA
192 ---C--G--A--T-AAACAGATTTATT-TTTTAAATTTTC-TACTTATCAATTTTT-AAATATTA
* * ** * *
1117868 ATAAATTTGT-TCTATTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAT--TT-GTTTATGACAA
244 ATAAATTAGTAT-TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAATAATTATTTTATGACAG
* * * * * * * **
1117929 AACAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTGGT
307 AACAAAAGTTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAAT
**** ** * *
1117993 TTGGCAAA-CAAATT-TGTTTTT-AATTCT--CTTAT----TTATT--AAT-TT--T---TGGAA
371 TCAATAAATTGACTTAT-TTTTTAAATTCTAACTTATCAAATT-TTGAAATATTAATAAAT-TAA
* * * * * * *
1118041 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTG--TTATGATAGAACAAAAAGTG
433 TATTATTTTATTT--AACAAGCTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTC
** * * * * * *
1118104 ATAACAATTTGACATATACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTTGGTAAACAA
495 ATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGA-TTCGTAAACAT
* * * *
1118168 ATTTATTTTTTAAATC---TC-TTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
559 ATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* * ** * * *
1118229 TGAA-TAAGCTTGAATG-A-TAAAAAAAATTTGTTAAATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTT
624 TGAATTAA-CTTGTATGAACT-AAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
*
1118291 GAAATA-ATAATTGTTGA-AAT
686 GAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * ** * * * * *
1118311 GGCCATAATTA-TTGAAAATTATTC-ATTAAAGAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATT-AT
1 AGTCTTAACTATTTG-AACTGCTTCGA-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * ** *
1118373 TTTTGGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATGATTG
64 TTTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTA
* *
1118438 TTTTATGACAAAACAAAAA-TTCATAACAATTAGAAATAGATAAATATTCATGTAGTTTTAACTA
128 TTTTATAACAAAACAAAAAGTT-ATAACAATTTGAAATAG----ATA---AT-TA--TTTAA--A
* * * * * * * * * *
1118502 TTTG-AACTATTTCGATAAACGGATTTATTTTTTTAA-TCTCTTAATTTTTAATTTTTGAATATT
180 -TAGAAATTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTC-TACTTATCAATTTTTAAATATT
* * * * * * ** * *
1118565 ATTAAATTATTATTATTTCATTTCGAATAAGCTTCTATGAGCTGAAACAATTATTTTATAACAGA
243 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGA
* ** * * * *
1118630 ATAAAAGGTT-ATAACAATTTCAAATAGGTAATTATTTAAACA-T-A-AACTAGTTTG-----A-
308 ACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTAAT
* * * * * **
1118685 T-AA-ACA--GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCA
371 TCAATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATA
* * * * *
1118746 TTGTTTTATTTCAA-ATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTCATGATGAAACAAAAAGTT
435 TTATTTTATTT-AACA-A-GCTTTTATGAAT--AAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAAGGT
*** * * * * * * *
1118809 CATAGCAATTCGAAATAGATAATTGTTAAAATGGTCATAATTATTTGAAC-TAATTCAATAAACA
494 CATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC-GTAAACA
* * * * *
1118873 GATTCACTTTTT-AA--A-TTCCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-T
558 TATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
* * * * * * *
1118933 TTCAAATAACAATAATTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACGAT
623 TTGAATTAAC--T--TGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * *
1118998 TTTAAATATACAATTGTTCA-AAT
684 TTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * *
1119021 AGTCGTAACTATTTGAATTTG-TTC-AGAAA-TAATTT-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAA-CTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * ** * * *
1119082 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATTAACTAAAACAATTAT
65 TTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTAT
* * ** * *
1119147 TTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGTATGACTGT
129 TTTATAACAAAACAAAAAG-TTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATA-G-A--A---A
* * * * * * * *
1119211 TTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTT-TATTTATTAATTGTTGACATATTA
186 TT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATCAATT-TTTAAATATTA
* * * * * * *
1119275 ATAAATTAATATTATTTTA-ATCGAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGATAAA
244 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGA
* * * *
1119339 ACAAAAAGTT-ATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAACTATTTGAACTTATT
308 AC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
** * * * * * * ** *
1119403 TGATGAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATTTG-AATATTAATAAATTTATA
372 CAATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAAT-TTTGAAATATTAATAAATTAATA
* * * * ** * *
1119467 TTATTTTAATTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAGAA-AATTATTTTAT-ACGAAACAAAAGTTTA
435 TTATTTT-ATT-TAACAAGCTTTTATGAATA-A-AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
** ** * * * * ** * *
1119530 TAACGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTAAACTTGTTTAATAAATAGAT
496 TAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAACATAT
* * * * *
1119595 TTAGTTTTTAAATC-TTTTACTTATTAATTTTT-AGAATCTTAATAAATTAGA-ATTATGTTATA
561 TTACTTTTTAAATCATTTCA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATT
*** * * * * * *
1119657 CCAAATTAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAATGCTTTG
623 TTGAATTAACTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * *
1119721 AAATAGATAATTCTACA-AAC
687 AAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * *
1119741 AAT-TACAACTATTT-ATATTG-GTCAAGCCAACAAATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTA
1 AGTCT-TAACTATTTGA-ACTGCTTCGA-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTA
* * * * *
1119802 ATTTTTTGAATATTAAT-AATTAGTATTACTTAATT-TCGAATAAGAC-TGTATCAA-TAGAAAC
62 A-TTTTTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAG-CTTGTATGAACTA-AAAC
* * ** *
1119863 AATTATTTTATGACAAAACAAATAA-TCATAATGATTTGAAATAAATAACTTTTCAAATTGTTAT
123 AATTATTTTATAACAAAACAAA-AAGTTATAACAATTTGAAATAGATAA---TT---A-T-TTA-
* * * * * * *
1119927 AACTATTTG-AA-TAGGTTTGGTGAACAAATTTA-TTTTTAAA---TCT-CATATTAATTTTCAA
178 AA-TA---GAAATTA-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATTTT-TA
* * * * * * * * **
1119985 AATATTAATAAATTAATATTTTTTTATTTCGAACAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTGC
237 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTAT
* * * * * * * *
1120050 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAT
302 GACAGAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** * *** * * * * * * *
1120115 TGCTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT-TAATTTTCATAATATTATTAGAT
367 TAATTCAATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAAAT
* * * * * * * *
1120179 TAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAAGACAAATAATTATTCTATGACAAAACAAAAG
430 TAATATTATTTTATT-T-AACAAGCTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAG
** * * *
1120244 GTCATAAAGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGATAAG
492 GTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCG-TAAA
* * *
1120308 CATATTTATTTTTTAAATC--TTCTACTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATTATT
556 CATATTTACTTTTTAAATCATTTC-A-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATT
* * * * *** * * ** * * *
1120370 TTATTCT-AAATAGGCTTGTGTGATGAAAAATAATTATTTTATGATGAAACAAAAGTTCATAGCA
618 TTATTTTGAATTA-ACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
*
1120434 ATTTGAAATAGATAATTATTCA-AAT
682 ATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * * * * *** * ** * *
1120459 GGCCATAATTATTTTAACTGATTTTG-TAAAGTGATTTATTTTTAAAATCTCCAACTTCTTAAAT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTG-CTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** * *
1120523 TTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATAT-TGGATAAG-TGTTTATGAACTGAAACAATT
65 TTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCT-TGTATGAACTAAAACAATT
* ** ** *
1120586 GTTTTATAAACATATGGTCATAATGATTTTAAATGTATA-AATGTTCAAATAGTCATAATTA-TT
127 ATTTTAT-AACA-A--AACA-AA--AAGTT--A--TA-ACAAT-TTGAAATAG--ATAATTATTT
* * * * *
1120649 ---TA-AACTTA-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTTAAA-TTTCTTGCTGA-CTAATTTTTGGA
177 AAATAGAAATTAGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATTTTC-TACTTATC-AATTTTT-AA
* * * * ***
1120707 ATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATAAATTGAAATAATTATTTTATG
238 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATG
* * * * * * *
1120772 ACTA-AACAAAAGGTT-AAAATTATTTGAAATATATAATTGTTCTAGTAGTCTTAACTATTTGAA
303 AC-AGAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *** * * * * * * *
1120835 TTAGTTTAACAAACACATTTACTTTTTTAAATCTCTTACTTAT-TAATTTTTATAACATTATTAG
366 CTAATTCAATAAATTGACTTA-TTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAA
* *** * ** * * *
1120899 TTTGGCAATATTTTACTCCAA-ATATGCTTGTATGAACAGAAACAATTGCTTTATGATAAAAC-A
428 ATTAATATTATTTTA-TTTAACA-A-GCTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAA
* * * * * * * * *
1120962 AAGATCATAATAATTTGAGATAGACAATTGTTCAAATAG-CAATAACTATTTGAACTGGTTTGGA
489 AAGGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGATTCGT
* * ** *
1121026 AAATAGATTTTGTTTTTAAATC---TC-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGA-ATTAT
553 AAACATATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-ATATTAT
* ** * * *
1121086 TTTATTCT-AAAAAATTTTGTATGAA-TAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAA
617 TTTATTTTGAATTAA-CTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* *
1121149 TGATTTGAAATAGATAATAGTTCA-AAT
680 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * ** * * * *
1121176 GAAT-ATGACTATTTGAACTTG-TTCGGTACATAGA-TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAAT
1 -AGTCTTAACTATTTGAAC-TGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * ** * *
1121238 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATG-AGTGGAAACAATT
64 TTTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATT
* * * ** * * * *
1121302 ATTTTATGACAAAACAAATGAG-CATAATGATTTGGAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
127 ATTTTATAACAAAACAAA-AAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA--
* * * * * * *
1121366 ATTTGAACTCGTTTGGTAAACAAATTTATTATTTAAAGCTTT-TACTTATTAA-TTTTAGAATTT
185 A-TT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA-TTTTCTACTTATCAATTTTTA-AATAT
*** * ** * *
1121429 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACTGAAATAATTAGTTTATGACAA
242 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAG
* * *
1121494 AACAAATGGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAGCTATTTGAA-TGTA
307 AACAAA-AGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AA
* * * * * * *
1121557 TTCAAAAAACTT-ATTTATATTTTAAATTTTTACTTAT-TAATTTGTGAAATATTAATAAATTTA
370 TTCAATAAA-TTGACTTATTTTTTAAATTCTAACTTATCAAATTT-TGAAATATTAATAAATTAA
* * * * * *
1121620 TATTATTTTATTTGAAATAAG-TTTGCT-TGAACATAACTAATTATTTTATGA-CAAACTACAAG
433 TATTATTTTATTT--AACAAGCTTT--TATGAATAAAAC-AATTGTTTTATGATAAAAC-AAAAG
* * * * *
1121682 GTCATAATGT-TTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAATCATAGCTATTTGAACAT-ATTCAGTAA
492 GTCATAAT-TATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC-GTAA
* * * * * * * * *
1121745 ATAGATTCATTTTTTAATTC-TCTTCCTCATTAATTTTTG--ATA--AACAGATT--TATT-TTT
555 ACATATTTACTTTTTAAATCAT-TTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTT
* * * * * * * ** *
1121802 AAAACCTCTT--ATTAA-TT-TTTGAAATATTAATAGATTAGCATTTTTAT-TCCGAAC-AAA-C
619 --TA--TTTTGAATTAACTTGTATGAACTA-AAACA-ATT-G---TTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * *
1121860 TTAT-ATGA---GAAA-AAATAGTTGTTTTATGACA-
674 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAT-A-AT
** ** * * * * * * * * *
1121891 AAACAAAAGGTA-AT-AA-TGATTTG---AACAAA-TAATTATTCAAATACTCATAATTATTTGA
1 AGTCTTAA-CTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTA-TT-A
* ** * * * *
1121949 ACTGGTGAGGTAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTCACATATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
62 A-T--T---TTTGA-AT-ATTA----TTAAA--T-T-A-GTATT-A-TTTT--ATTCTAAAT-AA
* * * * * * * ** * * * * *
1122014 TTCATTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTA-TGAAT-TCAAAAAAAAATTATTTTATGACAA-A
105 -GC-TTGTA--TGA--ACTAA-AA-CAATTATTTTATAACAAAACAAAA--A-GTTATAACAATT
** * * * * * *
1122076 ACAAA-AGGTCATTATGATTTGAAATAGATAATT-GTTC-AT--ATAG-TCTTAAATATTTGAAC
159 TGAAATA-G--ATAATTATTT-AAATAGA-AATTAGTTCGATAAACAGAT-TT--ATTTTTTAAA
* * * * ** ** *** * *
1122135 TAGTTCGAC-AAACAA-ACTTATTTATTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATT--ATTA
216 T-TTTCTACTTATCAATTTTTAAATATTAA-TAAATTAG-TATT-A-TTTT---ATTTTGAATAA
* * *** * * * *** * * * * * *
1122196 GATTAGTAT-TATTTAATTCCGAATAAGCT-TGTA-TGAACAAAA-ATAATTATTTTATGATAGA
273 GCTT-GTATGAACAAAAAT--AATTATTTTATG-ACAGAACAAAAGTTCA-TA-ATGAT--TTG-
* * * *
1122257 ACAAAAGGCTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAATTGTTTGAACTACTTT
329 ----AA----AT-A-GA--T-AA--TT---AT---TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTC
* * * * * * * * * *
1122322 GATAAATAGATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATGAGTATT
373 AATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * ** * * ** *
1122387 ATCTCATTCCGAATAAGCTTGAATG-TTCAAATACAATTGTTATATGACCAAACAAATA-GTAAT
437 ATTTTATT--TAACAAGCTTTTATGAAT-AAA-ACAATTGTTTTATGATAAAACAAA-AGGTCAT
* * * * * * * *
1122450 AATGATTTGTAATAAATAATTGTTGACATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTGGGTAAACATAT
497 AATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATT-CGTAAACATAT
* * * * *
1122514 TCACTTTTTAAATCATTT-ACTTATTAAATTTT-AGAATATGAATAAATTTATTTTATTTTATTT
561 TTACTTTTTAAATCATTTCA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* *
1122577 TGAA-TAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
624 TGAATTAA-CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * *
1122641 GATAGAAAATTATTCAT-AT
688 AATAGATAATTGTTCATAAT
* * ** * *
1122660 AGTCTTAACTATTTAAACTGCTTTGGGAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
1122725 TTGTAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAGCTTGTTTGAACTAAAACAACTATT
66 TTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATT
** * * * * * *
1122789 TTATAACAGTACAAAAGGTTATAATGAA-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGAAATTGGTTTG
130 TTATAACAAAACAAAAAGTTATAA-CAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGAAATTAGTTCG
* * * * *
1122853 ATAAATAGATTTATTTTTAAAATCTACTACTTA-CTAATTTTTAAAATATCAATAAATTAGTATT
194 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATC-AATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATT
*** * *** * * * *
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* * * * *
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321 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAATAAATTGACTT
* * *
1123044 ATTTTTAAAATCTCCAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAGA
386 ATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-A-A
* * * * * * *
1123109 TAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATCAAACAAAAAGTCATATTTATTTTAATTAG
448 CAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATTATTTGAAATAA
* * * *
1123174 ATAATTGTTTAATTAGTCA-AACTATTTGAGCTTGTTTCGTAAACATATTTA-TTTCTTAAATC-
512 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAACATATTTACTTT-TTAAATCA
* *** * * * * *
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576 TTTCA-TTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATTAACTTGTAT
* ** * * * * *
1123300 GAAC-ATAAGCAATAATTTTATGATAAACCAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
639 GAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
1123364 A-AAT
703 ATAAT
* ** * * * * *
1123368 AGTCATAAAGATTTGAACTTG-TTCAATAAACAAATTTACTTTTTAAATCTTTTACATATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAAC-TGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * *
1123432 GTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAAAAATC
65 -T-TTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * * *
1123495 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGTCATAATTA
127 ATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA--A
* * * * *
1123560 TTTAAAATTATTC-AGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTC-A-TTATTAATTTTCAGAATA
186 -TT---A--GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTCTACTTATCAATTTTTA-AATA
* * * *
1123622 TTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATTATTTTATTACA
241 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACA
* * * * * * * *
1123687 GCACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTAGATCTAGT
306 GAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAAT
*** * * * * ** *
1123752 TTGGTAAATAT-ATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTAT-TAATTATCAAAATATTAATAAATTAG
371 TCAATAAAT-TGACTTATTTTTT-AAATTCTAACTTATCAAATT-TTGAAATATTAATAAATTAA
** * * * * * * * *
1123815 TATTATTTTAATCCAACTAAGCTTCTGTGAATGGAAACTATTATTTTAT-AAAAGAAAAAAATGT
433 TATTATTTT-ATTTAAC-AAGCTTTTATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGATAA-AACAAAAGGT
* * * * * * * * ** * *
1123879 CATAATAATTTGAAAGAAATAGTTGCTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACTAGTTTAATAAATAG
494 CATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAACAT
* * *
1123944 ATTTA-TTTTTAAA--ATTTC-TTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAATATT-TTTTATTC
559 ATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* ** ** * * * *
1124004 CGAACAAACTTACAT-AAATAAAAACATTTGTTTTATAACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGA
624 TGAATTAACTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
*
1124068 AATAGATAATTGCTCA-AAT
688 AATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * ** * *
1124087 AGTCATGATTATTTGAACTAG-TTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAACT-GCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * * *
1124151 TTTGAAAAATTAGTAAATTCATTTTTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAATTTAAAA-TATT
65 TTTG-AATATTATTAAATT-AGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-CTAAAACAATT
* * * * * * * * * *
1124215 GTTTTATGATAAAACAAAAATGATT-TGA-AATAT-ATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTGG
127 ATTTTATAACAAAACAAAAA-G-TTATAACAATTTGA-AATAGATAAT-TA-T-TTAA--ATAGA
* * * * * * * * *
1124277 AATTAGTTAGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-TCTCTTAGTTATTAAATTTTTTAACATTATT
184 AATTAGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATTTTC-TACTTA-TCAATTTTTAAATATTAAT
* *
1124341 ATATTACTATTA-TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-AATTATTTTATGACAGAACA
246 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAACA
* * * **
1124404 AAAGGTT-ATAATGATTTGAAGTACATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAA
311 AAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAA
* * * * * * * * *
1124468 TAAATAGATTTATTCTTTAAA-ACT--CTTATTAATTTTTGAAAGACTAATAAATTAGTATTATT
375 TAAATTGACTTATTTTTTAAATTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
* * * * * * * * *
1124530 TTATTCTAATAAACTTGTATGATAAAAAATAATTGTTATATGATCAAACAAAAGGTAATAATGAT
440 TTATT-TAACAAGCTTTTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATTAT
* * *
1124595 TTGAAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACGA-ATTTACT
503 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCG-TAAAC-ATATTTACT
* * * *
1124658 TTTTAAATCACTTCCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTA
566 TTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATTA
* ** * * *
1124723 ACTTGAACAAACTAAAACAATTGTTTTATGCCAAAACCAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
631 ACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
*
1124788 ATTGTTCATACT
696 ATTGTTCATAAT
* *
1124800 -GTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* *
1124864 TTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATT
66 TT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATT
* * * * *
1124929 TTATAACAAAATAAAAAGTTATAACAATTTGAAGTATATAATTATTTAAATAGGAACTAGTTCGA
130 TTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGAAATTAGTTCGA
*
1124994 TAAACAGATTTATTTTTTTAATTTTCTACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
195 TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* **
1125059 TTTATTTTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAATAATTATTTTATGACA-AACAAAAGTTCATAATG
259 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGTTCATAATG
* * * * * *
1125123 ATTTGACATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACAAATTCGATAAATTGACTTATT
324 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAATAAATTGACTTATT
* *
1125188 TTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATATTGGACAA
389 TTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TT-AACAA
* * * * * * * *
1125253 GTTTTTACGAGCTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTATTTATTTTAAATAGATA
451 GCTTTTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATTATTTGAAATAAATA
* * * * * *
1125318 ATTATTCAAATAATCACAACTATTTGACCTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTC
515 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC-GTAAACATATTTACTTTTTAAATCATT-
* * * * *
1125381 TCATTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCATGTATG
578 TCA-TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATTAA-CTTGTATG
* * ** * ** * **
1125444 AAC-AAAATGAATTATTTTATGAGTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATACTTACTC-
640 AACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
1125507 TAAT
704 TAAT
* *
1125511 AGTCTTAACTATTTGAACTAGC-TCTACAAACACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAACT-GCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
1125571 TTTAGAATATTATTAATTTAGTAATATTTTACTTC-AAATAAACTTATATGAACAAAAATAATTA
65 TTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTA
* * * * * * * *
1125635 TTTTATGATAAAACAAAGA-TCATAAAAATTTGACATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTAT
128 TTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAA-A-T-AGAA--A-
* * *
1125699 TTGAATTGGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA
186 TT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATTTTT-AAATATTAA
* ** * * * * *
1125760 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA-GTACAAAA
245 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATG-ACAGAA
* * * * * * * * **
1125824 CAAAA-TATGATAACGATTTAAAATGGATAA-TAGTTCAAATGGCCATGACTGTTTGAACTCGTT
309 CAAAAGT-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
**** *** * * * * * * *
1125887 TGGCAAACAAATTTATCTTTTAAATCTCCAACTTAT-TAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTA
372 CAATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATA
* ** * * * * *
1125951 TTATTTTATTTAGAATAAAATTGTATGAATAGAAATAATTGTTTAATGACAAAACAAAAGATCAT
435 TTATTTTATTT--AACAAGCTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * *
1126016 AACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC-TCACTCGGTAAATAGAT
497 AATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC-GTAAACATAT
* * * * * * *
1126080 TTATTTTTTAAATCTTTTGC-TTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATGTTA-TTC
561 TTACTTTTTAAATCATTT-CATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
* * * * * *
1126143 CAATTAAGCTTTTATGAAC-AGAAACAATTGGTCTATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGA
625 GAATTAA-CTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * *
1126207 AAAAGGTAATTGCTCA-AAT
688 AATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * * * *
1126226 AGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGA-AAACATATATATTTTTAAAAT-TTTTTCTTATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAAC-TGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *
1126289 TTTAGAGTATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATGTAC-AAAACCAAT
65 TTT-GAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAAT
* * * * ** * * *
1126351 T-GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGTTCTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
126 TATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATT-TGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA-
* * * * * * * *
1126414 TATTTGAACATGTTCAACAAACATATTCATTTTTT-AATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATA
185 -A-TT----A-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTC-TACTTATCAATTTTT-AAATA
** * ** ** * *
1126478 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTTAAACCATTGTTTTATTACA
241 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACA
* * * * * *
1126543 AAATAAAA-TGTCACAATCATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCA-AGACTATTTGAACT-
306 GAACAAAAGT-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTA
* * * * * * * *
1126605 -TGTCTAGTAAACAT-ATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTAT--TATTTGTCAAA-A-TAAT-AA
369 AT-TC-AATAAA-TTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTT-TGAAATATTAATAAA
* * * * ***
1126663 -TAA-ATT-TTTGA---AATAA------AT-AATAACAA-AA--G-GTTATGGTAATTTGAAATA
429 TTAATATTATTTTATTTAACAAGCTTTTATGAATAA-AACAATTGTTTTATGATAA-AACAAA-A
* * * * * * * * * *
1126711 -G--ACAATT-GTTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGATAA--A-TAG-A-TTCATTT
491 GGTCATAATTATTTGAAATA--AATAATTGTTCAAA-TAG--TCATAACTATTTGAACTTGATTC
* * * * * * * * * * * * **
1126767 TTTAA-ATCTCCTAATTTTT-AAT--TTCCAAATATTAATAACTTAGCATTATT-TTATTTTGAA
551 GTAAACATAT-TTACTTTTTAAATCATTTC-ATTATTAAT--TTTTGAAATATTAATAAATT-AA
* * * ** * * ** * * * ***
1126827 TAATCTTATATGAACTGAATTAATTTTTTTTATG-AC-AAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGGA
611 TATTATTTTAT--TTTGAATTAA---CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAA--AACA
* *** * * * * *
1126889 ATA-G--ATATTTA-TTCAATTAG-TCA-TG-AC-TATT
669 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * *** * * *
1126920 AGATC-T-AGT-TTGGTGAACAT-ATT----TAA-TTTTTTAATTTTTT-ACT-TTTTAATTATC
1 AG-TCTTAACTATT--TGAAC-TGCTTCGACAAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-
* * * * * * ** * *
1126974 AAAATATT-AATA-AATTAGTATTACT-TT-TAAT--TC-GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACT
60 TAATTTTTGAATATTATTA-AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * *** * ** *
1127032 ATTGTTGTACAATAGAAA-AAAAACCCATAACAATTTGAAA-GGAATAATTGCTCAAATAGTCAT
124 ATTATTTTATAACA-AAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAG-ATAATTATTTAAATAG----
* ** * *
1127095 AACTATTTAAACTGGTTTGATCGACTGATTTA-TTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTTTAA
183 AA--A-TT--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAA--TTTTTAA
* * * * * * * * * * *
1127155 ATATTAATAGATTAATATTTCTTTTATTCTGAACAAACTTATATAAACAAAAACATTTTGTTTTA
238 ATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATA-ATTATTTTA
* * * * ** * *
1127220 TTACAAGAA-AAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTATAATTATTTGA
301 TGAC-AGAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
** ** * *** * * * * * * *
1127284 GTTGCTT-AGGTAAACAAAATTA-TCTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTAATAA
365 ACTAATTCA-ATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAA
* * * ** * * *
1127347 ATTCATTTTATTTTATTCTAAATAAGCTAGTATCATTTGAAAA-AATTGTTTTATGA-CAAA-AA
428 ATTAATATTATTTTATT-T-AACAAGCTTTTATGA-AT-AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAA
* * * * * * * * *
1127409 AA----A-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTAG-ATTTAGTTTGGC
489 AAGGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GATTCGT
* * * * *
1127468 AAACAAATTTATTTTTTAAATC-TCTT-AGTTATTAATTTTTTG-AATATTATTATATTAGTATT
553 AAACATATTTACTTTTTAAATCAT-TTCA-TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
* * * * * *
1127530 ATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGCATGAAC-AAAAGTAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTAT
615 ATTTTATTTTGAATTAA-CTTGTATGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* ** * * *
1127593 AACAATTTGATGTATAAAATTATTCA-AAT
678 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * * * * * *
1127622 AGTCATAATTATTTAAAATGGTTCGATAAACAGATTTATTCTTCAAA--AC-T-CTTATTAATTT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
1127683 TTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATG-A-TAAAA-AATAATT
66 TTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATT
* * * * * * *
1127745 GTTATAAGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTATTGAAATTGCCATAATTA
130 -TTAT-A-ACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG--A-AATTA
* ** * * * * ** *
1127810 TTTGAACTGAATCGGTAAATGGATTCACTTTTTAAATCATT-TACTTATTAACTTTTCGAACATT
189 ---G---T---TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATCAA-TTTTTAAATATT
* * *** * * * *
1127874 AAT-AATTAAGTATTATTTT-TTTT-AATATGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGAAAA
243 AATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAG
* * * ** * * **
1127936 AACGAAAGGTT-ATAACGATTTGACATAGATAATTATTCTTATAGTCTTAACTGTTTGAACTGCT
307 AAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAAT
** ** * * * * * * *
1128000 TCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTTGCAGTTAT-TAATTTTTAGAATATTATTAAATTAG
371 TCAATAAATTGACTTATTTTTTAAATTC-T-AACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAAATTAA
* * * * * * * *
1128063 TATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATCGAAACAATTATTTTATAACATAACAAAAGGT
433 TATTA-TTTTA-TTT-AACAAGCTTTTATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGT
* * * * * * * *
1128128 TATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG----GA--A-TT--A---GTTTAGTAAATAG
494 CATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAAACAT
* * *
1128181 ATTTATTTTTTTAAATC-TCTTACA-TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
559 ATTTA-CTTTTTAAATCAT-TT-CATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * *** * * * *
1128244 TTGT-AATTGGA-TTGTATGATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGTTCCTAACGATT
621 TTTTGAATT-AACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* *
1128307 TG-CATTGATAATTGTTCA-AAT
685 TGAAATAGATAATTGTTCATAAT
** * * * * *
1128328 AACCATAATTATTTGAA---C--CGA-TAAC----TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTGATTT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * *
1128383 TTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATT-TAGGATAAGCTTTTATGAACTAAAATAATTGT
66 TTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTAT
* * * ** *** * * * *
1128447 TTTATGATAAAACAAAAGGCCATATTTATTTTAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAATTATT
129 TTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA--A-T
* * * * * * *
1128512 TGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT-TTTTTTAAATTTAT-TATTTATTAATTTTTTGAATGTTAA
187 T--A---GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTT-TCTACTTATCAA-TTTTTAAATATTAA
** * * *
1128575 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTGTGTGAATTAAAAA-AATTA-TTTATGACTA-A
245 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAATAATTATTTTATGAC-AGA
* * * ** **
1128637 ACAAAAGGTT-AGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTT
308 ACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
* ** * * * **
1128701 TAGCAAATAT-ATTTATTTTTTAAA-TCT--CTTATC-AATTTTTAGAATATT-ATTAATTCAGC
372 CAATAAAT-TGACTTATTTTTTAAATTCTAACTTATCAAATTTTGA-AATATTAATAAATT-AAT
* * * * * * * * *
1128760 AATATTTTACTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATAACAAAAC-AAAGATCA
434 ATTATTTTA-TT-TAACAAGCTTTTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
** * * * * * *
1128824 TAACGA-TTAAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AACTATTTAAACTAG-TTCGATAAACAG
496 TAATTATTTGAA-ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCG-TAAACAT
* * * *
1128886 ATTTAGTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
559 ATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* * * * *
1128947 T-AAATAATTTTGTATGAA-TAGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAACGATTTA
624 TGAATTAA-CTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* *
1129009 AAATAGATAATAGTCCA-AAT
687 AAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * * * ** * * ** *
1129029 GGACATGATTGTTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTGATT
1 AGTCTTAACTATTTGAAC-TGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** * *
1129093 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATG-ATTAGAAACAATTG
65 TTT-GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTA
* * * * *
1129157 TTTTAGAACAAAA-AAAAAGTCATAACAA-TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
128 TTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG----AA--A-
* * * * ** * * *
1129220 TTGAACTCACTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATTT-GGCTTATTATTTTTTGAAATTTTA
186 TT--AGT---TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTCTACTTATCAATTTTT-AAATATTA
** ** * ** * *
1129284 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-TAAAAAACAGTAACAATTGGTTTAGGACAAA
244 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGA
* * * * *
1129348 ACAAAA-TGTCATAATG-TTCTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTTAAC-ATG
308 ACAAAAGT-TCATAATGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-A
*** * ** *
1129410 TTTGGTAGACAGA-TTCATTTTTT-AATTCT--CTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAAT
370 TTCAATAAATTGACTT-ATTTTTTAAATTCTAACTTA-TCA--AATTTT-GAAATATTAATAAAT
* * * * *
1129471 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACTGAAACAATTGTTTTATTG-TAAAA-AAAA
430 TAATATTATTTTATTT--AACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTA-TGATAAAACAAAA
* * * * * * *
1129534 --TCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATGA-TGATTTGAACTTG-TTCAATA
491 GGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGATTC-GTA
*
1129595 AACATATTTA-TTTCTTAAATCCTTT-ACTTATT-ATTTGTTG----A-T-AT--ATTAATATTA
554 AACATATTTACTTT-TTAAATCATTTCA-TTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAATATTA
* *** * * *
1129649 TTTTAATACAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
616 TTTTATTTTGAATTAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * *
1129714 AATTTAAAATAAATAGTTATTCA-AAT
681 GATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
* ** * * * *
1129740 AGTCATAAAGATTTGAATTTG-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
1 AGTCTTAACTATTTGAA-CTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *
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65 -T-TTGAATATT-ATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAAT
* * * * *
1129865 TCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAA-TTCAAATAGAAAAATTGCTGTGATAGTCATAA
126 T-ATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAG-ATAA----T-T-AT--T--TAA
** * * * ** * * *
1129929 TTATTTAAACTT-GTTCGGTGAACAGATTCATTTTTTAAA-CCTCTTAATTATTAATTTTTGGAA
179 --ATAGAAA-TTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTC-TACTTATCAATTTTT-AAA
* * ** ** * ** *
1129992 TATTAA-AATCTTAATATTATTTTATTTCAAATAATTTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTAAT
239 TATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTT-AT
* * *
1130056 GACA-AAGCAAAAAG-TCATAA-CATTTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTG
302 GACAGAA-C-AAAAGTTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * * * *
1130118 AGCTAATTCAGTAAACAT-ATTTATTTTTAAAAATTTTTACTTAT-TAATTATCAAA-ATTTAAA
364 AACTAATTCAATAAA-TTGACTTATTTTT-TAAATTCTAACTTATCAAATTTTGAAATA-TT-AA
* ** * * * * *
1130180 TAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTT-TGAACAAAAACTATTGTTTTATAACAAAA
425 TAAATTAATATTATTTT-AT-TTAACAAGCTT-TTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAA
* ** * * * * *
1130244 CAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAGTTTA
486 CAAAAGGTCATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC
* * * * ** * *
1130309 ATAAACAGATTTAATTTTTAAATC---T--TTATTAGTTTTTGAAATATTAATATGTTAGTATTT
551 GTAAACATATTTACTTTTTAAATCATTTCATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTA
** * * * * * *
1130369 TTTTATTTTGAACAAATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGCCATAAC
616 TTTTATTTTGAATTAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
*
1130434 AATTT-AAAGTAGATAATTGTTCA-AAT
681 GATTTGAAA-TAGATAATTGTTCATAAT
* * * * **
1130460 AGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTA-TATATTAAT
1 AGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAAT
* * * *
1130523 ATTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAAT
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* * *** * * * * * * * *
1130586 TGTTATGCCACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGACCATAATT
126 TATTTTATAACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAAT-A-GA-AATT
* * * * * *
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188 AGTT---C-GA-----TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTCTACTTATCAATTTTTAAATATTA
* * ** * * ** *
1130712 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTTTGAACTGAAACAATTGTTTTGGGACAAAA
244 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC-AGA
* ** * * * **
1130777 TAAAAAAG-TCATAATGATTTTCAATAGATAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAAGTTGTT
308 -ACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
* ** ** * * *
1130841 CAAAAAATT---TTATTTTTTAACCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAATATT
372 CAATAAATTGACTTATTTTTTAAATTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
* * *
1130903 ATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTAAAATAATTGTTTTAT-ATCAAAAC-AAAGGTCATA
437 ATTTTA-TTT-AACAAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
1130966 ATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTTG-TT--TAATAAATGAT
498 ATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTCGTAA-ACAT-AT
* * * *** *
1131028 TTAATTTTTTAAATCTTTTGC-TTATTAATTTTTCG-AATGTTAATAAATTTGGATTGTTTTA-T
561 TT-ACTTTTTAAATCATTT-CATTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
** * * * * * * * * *
1131090 TCCAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAGGGTCAAAACAATTT
623 TTGAATTAA-CTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* *
1131154 AAAATAGATAATTATTC-TAAT
686 GAAATAGATAATTGTTCATAAT
* * * * * *
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1 A-GTCTTAACTATTTGAACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * *
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* * * * * * * *
1131300 TGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCT-TAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAGC
126 TATTTTATAACAAAACAAAAAGT-TATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG--A-A--
* * * * * *
1131363 TATTTGAATTGGTTTAATA-AGTAGTTTTATTTTTTAAA-TCTCTTACATATTAATTTTTAAAAT
185 -A-TT-AGTTCG-ATAA-ACAG-A--TTTATTTTTTAAATTTTC-TACTTATCAATTTTT-AAAT
* * * * *
1131426 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTATGATCTAAAAGAATTGTTTTATGAC
240 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGAC
* * * * * * * * * *
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305 AGAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAA
* * * * * * *
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370 TTCAATAAATTGACTTATTTTTTAAA-TTCTAACTTATCAAATTTT--GAAATATTAATAAATTA
* * * * * * * *
1131619 GTATTATTTTATTCTATCTAAGCTTATATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAATAGGT
432 ATATTATTTTATT-TAAC-AAGCTTTTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGT
* * * * * * *
1131684 TATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACA
494 CATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGATTC-GTAAACA
** * * *
1131748 -ATTTTTTTTTTTAAATCTCTTTC-TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTAATTT
558 TA-TTTACTTTTTAAATC-ATTTCATTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * * * * * * * * * *
1131810 ATTATGGATGAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAATAAAAGGTCAGAATGATT
620 ATTTTGAATTAACTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * *
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* * ** ** *
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TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGTTCATAATGAT
TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAATAAATTGACTTATTTT
TTAAATTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTAACAAGCTTT
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AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATTAACTTGTATGAACTAAAACAA
TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAT
Found at i:1126962 original size:321 final size:321
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* * *
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* * * *** *
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* * * * *
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* *
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* *
1126645 TATTTGTCAAAATAATAATAAATTTTTGAAATAAATAATAACAAAAGGTTATGGTAATTTG
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* * * ** * *
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** * ** *
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66 AATCTCCTAATCATTAATTTTCCAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
** * * * * * *
1126835 TATGAACTGAATTAATTTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGGAATAGATATTT
131 TATGAACTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATC-ATTTGAAATAAAAAATT
* * * * * * * *
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194 ATTCAAATAGTCAAGACTATTAGAACTAGTCTAGTAAACATATTT-ATTTCTTAAATCTTTTACT
* *
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258 TATTAATTATCAAAATAATAATAAATT
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AATCTCCTAATCATTAATTTTCCAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
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TAATTATCAAAATAATAATAAATTTTTGAAATAAATAATAACAAAAGGTTATGGTAATTTG
Found at i:1127969 original size:179 final size:182
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1127662 CTTCAAAACT
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * *
1127853 CTTATTAACTTTTCGAACATTAAT-AATTAAGTATTA-TTTT-TTTT-AATATGCTTATATGAAT
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATT-AGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
* * * * **
1127914 TGAAACAATTGTTTTATGAA-AAAACGAAAGGTTATAACGATTTGACATAGATAATTATTCTTAT
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* * * ** * *
1127978 AGTCTTAACTGTTTGAACTGCTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTGCA
129 AGCCATAACTATTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * * *
1128032 GTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
* * *
1128097 GAAACAATTATTTTATAACATAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
66 GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
1128162 ---GAATTAGTTT--A--G--T----AAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCT-TA
131 CCATAACTA-TTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCA-CTTTTTAAATCT-TGCA
* * * * * ** * * *
1128203 CATATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTGT-AATTGGATTGTAT-GAT-
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* * * * * *
1128264 GAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-GTTCCTAACGATTTG-CATTGATAATTGTTCAAA
66 G--AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * *
1128327 TAACCATAATTATTTGAACCG-AT-----AAC---TT-ATTTTTTAAATCTCT-AA
128 TAGCCATAACTATTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCT-TGCA
* * * * * * * * *
1128372 CTTATTGA-TTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTA-TTTTATTTAGGATAAGCTTTTATGAA-
1 CTTATTAACTTTTAG-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
* * * * * ** *** * * *
1128434 CTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGCCATATTTATTTTAAATAGATAGTTGTTCAAAT
65 C-GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * ** * * ** **
1128499 AGTCATAATTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATT-TTTTTTTAAAT-TTATTA
129 AGCCATAACTATTTGAAC-TGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTT-GCA
* * * ** ** * * * * *
1128552 TTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAGCCTGTGTGAATT
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
* * * * * *
1128616 AAAAAAATTA-TTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
66 GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
*** ** * * * * *
1128680 TTTTAACTATTTGAACTGGTTTAGCAAATATATTTATTTTTTAAATC-T---
131 CCATAACTATTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * * * * * * * *
1128728 CTTATCAATTTTTAGAATATT-ATTAATTCAGCAATA-TTTTACTTCGAATAAGCTTATATGAAT
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATT-AGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
* * * * *
1128791 AGAAATAATTATTTTATAACAAAAC-AAAGATCATAACGA-TTAAAGATAGATAATTATTCAAAT
65 CGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * *
1128854 AGTCA-AACTATTTAAACT-AGTTC-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTT---
129 AGCCATAACTATTTGAACTGA-ATCAG-CAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * * ** * *
1128904 -TTATTAA-TTTTTGAA-ATACTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAA
1 CTTATTAACTTTTAGAACAT--TAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAA
* * * * * * *
1128965 TAGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAACGATTTAAAATAGATAA-TAGTCCAAA
64 TCGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAA
* * * * * * ** * * * * ***
1129028 TGGACATGATTGTTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCAAA
128 TAGCCATAACTATTTGAAC-TGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * * ** * * * *
1129083 CTTATTGATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAAATTGTATGATTA
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
* * * * * * *
1129147 GAAACAATTGTTTTAGAACAAAA-AAAAAGTCATAAC-AATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
66 GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * * *
1129210 TCATAACTATTTGAACTCACT-AGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTG-G
131 CCATAACTATTTGAACTGAATCA-GCAAACAGATTCACTTTTTAAAT-CTTGCA
* * *
1129262 CTTATT-ATTTTTTGAA-ATTTTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGCTT-TAAAAA
1 CTTATTAACTTTTAGAACA--TTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAA
* * ** ** * * * * *
1129323 ACAGTAACAATTGGTTTAGGACAAAACAAAATGTCATAATG-TTCTTAAATAGATAATTGTTCAA
64 TC-GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATT-TGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * ** * * * * *
1129387 ATAGTCATAATTATTTTAACATG-TTTGGTAGACAGATTCATTTTTTAATTCTCT-TA
127 ATAGCCATAACTATTTGAAC-TGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCT-TGCA
* * * **
1129443 CTCATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAA-
1 CTTATTAACTTTT-AGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
* *** * * * *
1129505 CTGAAACAATTGTTTTATTGTAAAA-AAAA--TCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAAT
65 C-GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * ** * * *
1129567 AGTCATGA-TGATTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTA-TTTCTTAAATCCTT-TA
129 AGCCATAACT-ATTTGAAC-TGAATCAGCAAACAGATTCACTTT-TTAAAT-CTTGCA
* * * * *** * * *
1129621 CTTATT-A--TTT-G----TTGATATATTAATATTA-TTTTAATACAAATAAACTTGTATGAA-C
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
* * * * * * * * *
1129676 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAGTTATTCAAATA
66 -GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* ** * ** * * * * * **
1129741 GTCATAAAGATTTGAATTTGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
130 GCCATAACTATTTGAA-CTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * * * *
1129794 CTTATTAA-TTGTCT-TAATATTAATAAAATT-GTATTA-TTTTA-TTCGAAATAAGCTTTTATG
1 CTTATTAACTT-T-TAGAACATTAAT-AAATTAGTATTATTTTTATTTTG-AATAAGCTTATATA
* * * * * * **
1129854 AA-CAGAAA-ATTTCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGC-AATTCAAATAGAAAAATTGCT
62 AATC-GAAACAATT-ATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAG-ATAATTATT
*** * * * * * ** *
1129916 GTGATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTCGGTGAACAGATTCATTTTTTAAACCTCTT--A
124 CAAATAGCCATAACTATTTGAAC-TGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAA--TCTTGCA
* * * * * * ** ** *
1129975 ATTATTAATTTTTGGAATATTAA-AATCTTAATATTA-TTTTATTTCAAATAATTTTATATGAA-
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAA-ATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
* * * * * * *
1130037 CTGAAATAATTTTTTTAATGACAAAGCAAAAAGTCATAAC-ATTTTGAAATAGATATTTATTCAA
65 C-GAAACAATTATTTT-ATAACAAAACAAAAGGTTATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * **
1130101 ATAGTCATGACTATTTGAGCT-AATTCAGTAAACATATTTA-TTTTTAAAAAT-TTTTA
127 ATAGCCATAACTATTTGAACTGAA-TCAGCAAACAGATTCACTTTTT--AAATCTTGCA
* * *** * * *
1130157 CTTATTAA-TTATCA-AA-ATTTAAATAAATTAGTATTA-TTTTAATCCAAATAAGCTTGTTTGA
1 CTTATTAACTT-TTAGAACA-TT-AATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAA
* * * * * * * *
1130218 A-CAAAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
63 ATC-GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * ** * *
1130282 ATGGCCATAACTATTTGAACT-AGTTTAATAAACAGATTTAATTTTTAAATC-T---
127 ATAGCCATAACTATTTGAACTGA-ATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * * ** * ** *
1130334 -TTATT-AGTTTTTGAAATATTAATATGTTAGTATT-TTTTTATTTTGAACAAATTTATATGAA-
1 CTTATTAACTTTTAG-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
* * * * * ** * *
1130395 CAAAAACATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGCCATAACAATTT-AAAGTAGATAATTGTTCAAA
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* * * * * * *
1130459 TAGTCATAATTATTTGAACTG-GTTAGGTAAACAGAATT-ATTTTTTAAATCTCT-TA
128 TAGCCATAACTATTTGAACTGAATCA-GCAAACAG-ATTCACTTTTTAAATCT-TGCA
* * * *
1130514 -TATATTAA-TATTT-GAAATATTAATAAATTCA-TTTTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATG
1 CT-TATTAACT-TTTAG-AACATTAATAAATT-AGTATTATTTTTATTTTGAATAAGC-T-TAT-
* * *** * * * *
1130574 ATAAA---AAACAATTGTTATGCCACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
59 ATAAATCGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * ** * *
1130636 GAAAT-GACCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAAGAGATTCACTTTTTAAA---T-CA
124 CAAATAG-CCATAACTATTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * * * *
1130691 CTTATTAA-TTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGTTTGTTTGAA-
1 CTTATTAACTTTTAG-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
* *** * * * * ** *
1130752 CTGAAACAATTGTTTTGGGACAAAATAAAAAAGTCATAATGATTTTCAATAGATAATTGTTCAAA
65 C-GAAACAATTATTTTATAACAAAA-CAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * * * *
1130817 TAGTCGTAACTATTTGAAGTTG-TTCA--AAA-A-ATTTTATTTTTTAACCTCTTG--
128 TAGCCATAACTATTTGAA-CTGAATCAGCAAACAGA-TTCACTTTTTAA-ATCTTGCA
* * * * * * *
1130868 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAGAAATTAATATTA-TTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAAT
1 CTTATTAACTTTTAG-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAAT
** * * * * * * * *
1130931 TAAAATAATTGTTTTATATCAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATA
65 CGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * ** * * * ***
1130995 GTCTTAACTATTTAAACTTG-TTTAATAAA-TGATTTAATTTTTTAAATCTTTTG
130 GCCATAACTATTTGAAC-TGAATCAGCAAACAGA-TTCACTTTTTAAATCTTGCA
* * ** * * * *** *
1131048 CTTATTAATTTTTCGAATGTTAATAAATTTGGATT-GTTTTATTCCAAATAAGCTTGTA-AGATA
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATA-A-A
* * * * * * * * *
1131111 T-GAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAGGGTCAAAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTAAT
64 TCGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
*** * ** * * * *
1131175 AGGTTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATATCTT--A
129 AGCCATAACTATTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTT-AA-ATCTTGCA
* * * * **** * *
1131229 CTTTTTAA-TTTT-GAAATATTATTAAAGTAGTATTATTTTTA-ACCAAATAAGCTTCTACGATA
1 CTTATTAACTTTTAG-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATA-TA-A
* * * * * *
1131291 A--GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCT-TAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAA
63 ATCGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGT-TATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * ** * ** ** * * * *
1131352 ATAGTCATAGCTATTTGAATTGGTTTAATAAGTAGTTTTATTTTTTAAATCTCT-TA
127 ATAGCCATAACTATTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCT-TGCA
* * * * * * *
1131408 CATATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATATGCTTGTAT-GATC
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
* * * * * ** * * * *
1131471 TAAAAGAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTAATTGAAATAGTTAATCATTCAAATG
66 -GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * **
1131536 GCCATAATTATTTTAACT-AATTC-GATAAATAGATTTA-TTTTTAAAATTTTTTA
130 GCCATAACTATTTGAACTGAA-TCAG-CAAACAGATTCACTTTTT-AAATCTTGCA
* * * *
1131589 CTTATT-A-TTTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCT-ATCTAAGCTTATATTA
1 CTTATTAACTTTTA-G-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGA-ATAAGCTTATATAA
* * * * * * * * *
1131650 A-CTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAATAGGTTATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAA
63 ATC-GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
** * ** *** **
1131714 ATAGTAATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACA-ATTTTTTTTTTTAAATCTCT-TT
127 ATAGCCATAACTATTTGAAC-TGAATCAGCAAACAGA-TTCACTTTTTAAATCT-TGCA
* * ** * * * * * *
1131770 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTA-ATTTATTATGGATGAGCTTATATGAA-C
1 CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
* * * * * * * * **
1131833 TGAAACAATTATTTTATAACTAAATAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAAATAATTGTTTTAATA
66 -GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
*** * * * * * * * *
1131898 GTTTTAACCATTTGAACT-AATTCGGTAAAAATATTTATTTTTTAAATCTAT-TA
130 GCCATAACTATTTGAACTGAA-TCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCT-TGCA
* * * * *** * *
1131951 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTTAATAAAAATAAG-TGTGTACAAA
1 CTTATTAACTTTTAG-AACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCT-TATATAAA
* * * * * * * *
1132013 -CCAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATT
64 TCGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATT
1132069 GTTTATATAT
Statistics
Matches: 3281, Mismatches: 703, Indels: 465
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
167 1 0.00
168 27 0.01
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170 114 0.03
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172 7 0.00
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174 51 0.02
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184 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (182 bp):
CTTATTAACTTTTAGAACATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATC
GAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
CCATAACTATTTGAACTGAATCAGCAAACAGATTCACTTTTTAAATCTTGCA
Found at i:1129376 original size:711 final size:710
Alignment explanation
Indices: 1126701--1131991 Score: 3147
Period size: 711 Copynumber: 7.4 Consensus size: 710
1126691 GGTTATGGTA
* * * * ** * *
1126701 ATTTGAAATAGACAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTCATT
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* ** * * * *
1126766 TTTTAAATCTCCTAATTTTTAA-TTTCCAAATATTAATAACTTAGCATTATTTTATTTTGAAT-A
65 TTTTAAATCT--T--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
* * * * **
1126829 ATCTTATATGAACTGAATTAATTTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGGAATAGA
126 AT-TTGTATGAAC--AA-AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGA
* * * * * * * * * * *
1126894 TATTTA-TTCAATTAGTCATGACTATTAGATCTAGTTTGGTGAACATATTTAATTTTTT-AATTT
187 TA-ATAGTTCAAATAGACATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCT
* * * * ** * *
1126957 TTTACTTTTTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTTAATTCGAATAAGCTTGTATG
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* * * * * **** * * *
1127022 A-ACTAAAACTATTGTTGTACAATAGAAAAAAAACCCATAACAATTTGAAA-GGAATAATTGCTC
314 ATA-AAAAACAATTGTTTTAGAACA-AAAAAAAGGTAATAAC-ATTTGAAATAG-ATAATTGTTG
* * * * * * * * *
1127085 AAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTGATCGACT-GATTTA-TTTTT-AA-ATCT-CTTATTA
375 AAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTCGGT-AAATAGATTCATTTTTTAAATATTTACTTATT-
* * * * * * * * * **
1127145 ATTTTTTTAAATATTAATAGATTAATATTTCTTTTATTCTGAACAAAC-TTATATAAACAAAAAC
438 ATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTAAATAAGCTTTA-ATGAACTGAAAC
* * * * * * * ** *
1127209 ATTTTGTTTTATTACAAGAA-AAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTTA
501 A-ATTGTTTTATGACAA-AACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* ** * * * * *
1127273 TAATTATTTGAGTTGCTT-AGGTAAACAAAATTA-TCTTTAAATCT-CTTACATATTAATTTTTA
564 TAACTATTTGAACTGGTTCA-GCAAACATATTTATTTTTTAAATCTGC-T---TATTAATTTTTA
* * * * * * *
1127335 AAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCTAAATAAGC-TAGTATCATTTGAAAAAATTGTT
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*
1127397 TTATGAC-AAA-AAA-A--A-AATG
686 TTATAACAAAACAAAGATCATAATG
* * ** **** *
1127416 ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTA-TTAGATTTAGTTTGGCAAACAAATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAACTATTTA-AACTAGTTCAATAAACAGATTTAT
* * * *
1127480 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTTG-AATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
64 TTTTTAAA--TCTT--TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
** * * * * * * ** *
1127544 AAGCTTGCATGAACAAAAGTAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGATGTATA
124 AAATTTGTATGAACAAAA--AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGA
* * * * * * * * * *
1127609 AAATTA-TTCAAATAGTCATAATTATTTAAAATGGTTCGATAAACAGATTTATTCTTCAAA--AC
187 TAA-TAGTTCAAATAGACATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* *
1127671 T--CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAT
251 TAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT
* * * * * *
1127734 AAAAAATAATTGTTATAAGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTATTGAAAT
316 AAAAAACAATTGTT-TTAGAACAAAAAAAAGGTAATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT
* * * * * *
1127799 TGCCATAATTATTTGAACTGAATCGGTAAATGGATTCACTTTTTAAATCATTTACTTATTAACTT
379 AGTCATAATTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAAT-ATTTACTTATT-ATTT
* * * *
1127864 TTCG-AACATTAAT-AATTAAGTATTATTTT-TTTT-AATATGC-TTATATGAATTGAAACAATT
442 TTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTA-ATGAACTGAAACAATT
* * * * * * ** * *
1127924 GTTTTATGAAAAAACGAAAGGTTATAACGATTTGACATAGATAATTATTCTTATAGTCTTAACTG
505 GTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* *
1127989 TTTGAACTGCTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTGCAGTTATTAATTTTTAGAATATTA
570 TTTGAACTGGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATC-TGC--TTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * * * * *
1128054 TTAAATTAGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATCGAAACAATTATTTTATAACATA
632 ATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTATAACAAA
* *
1128119 ACAAAAGGTTATAATG
696 AC-AAAGATCATAATG
* * * *
1128135 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG---GA--A--T----TAGTTTAGTAAATAGATTTATTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAACTATTTAAACTAGTTCAATAAACAGATTTA-TT
* * * **
1128189 TTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGTAATTGG
65 TTTTAAATCT-TT---TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
* * * * * ** *
1128254 A-TTGTATGATGA-AAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGTTCCTAACGATTT-GCATTGAT
126 ATTTGTATGA--ACAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGAT
* * *
1128316 AATTGTTCAAATA-ACCATAATTATTTGAAC-----CGAT-AAC----TTATTTTTTAAATCTCT
188 AATAGTTCAAATAGA-CATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * *
1128370 AACTTATTGATTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTAGGATAAGCTTTTATGA-A
252 AACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA
* * * ** ** * * *
1128434 CTAAAATAATTGTTTTATGATA-AAACAAAAGGCCATATTTATTTTAAATAGATAGTTGTTCAAA
317 -AAAAACAATTGTTTTA-GA-ACAAAAAAAAGGTAATA-ACATTTGAAATAGATAATTGTTGAAA
* * * *
1128498 TAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATT-TTTTTTTAAATTTATTATTTATTAAT
378 TAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATAT-TTACTTATT-AT
* * * * * * *
1128561 TTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTGT-GTGAATTAAAAAAAT
440 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAG-CTTTAATGAACTGAAACAAT
* * * * * * * **
1128624 T-ATTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACT
504 TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * *
1128688 ATTTGAACTGGTTTAGCAAATATATTTATTTTTTAAATCT-CTTATCAATTTTTAGAATATT-AT
569 ATTTGAACTGGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * * *
1128751 TAATTCAGCAATATTTTACTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATAACAAAAC
634 AAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTATAACAAAAC
*
1128816 AAAGATCATAACG
698 AAAGATCATAATG
* * * *
1128829 A-TTAAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCAAACTATTTAAACTAGTTCGATAAACAGATTTAGT
1 ATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAACTATTTAAACTAGTTCAATAAACAGATTTATT
* *
1128893 TTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTT
65 TTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATTT
* * * *
1128958 GTATGAATAGAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAACGATTTAAAATAGATAATAGT
130 GTATGAACA-AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATAGT
* * * * * *
1129023 CCAAATGGACATGATTGTTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTAT
194 TCAAATAGACATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTAT
* ** * *
1129088 TGATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGATTAGAAAC
259 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAC
* * * * * *
1129152 AATTGTTTTAGAACAAAAAAAAAGTCATAACAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
323 AATTGTTTTAGAACAAAAAAAAGGTAATAACATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCATAAT
* * * * * *
1129217 TATTTGAACTCACTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTGGCTTATTATTTTTTGAAATTT
388 TATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATATTT-ACTTATTATTTTTTGAAATAT
* ** * * * *
1129282 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTAAAAAACAGTAACAATTGGTTTAGGACAA
452 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTAATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * *
1129347 AACAAAATGTCATAATG-TTCTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTTAACAT-G
517 AACAAAAAGTCATAACGATT-TTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGG
** * * * * * * *
1129410 TTTGGTAGACAGATTCATTTTTTAATTCT-CTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAG
580 TTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTGC-T--T-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG
* * * ***
1129474 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACT-GAAACAATTGTTTTATTGTAAAA-AAA-ATC
641 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAGATC
*
1129536 ACAATG
705 ATAATG
* * * * * *
1129542 ATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATGA-TGATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACT-ATTTAAACTAGTTCAATAAACAGATTTAT
* * * * * *
1129606 TTCTTAAATCCTTTACTT-ATTATTTG-----TTGATATATTAATATTATTTTAATAC-AAATAA
64 TTTTTAAATCTTTTA-TTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAA
* * *
1129664 ACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATA
126 ATTTGTATGAAC-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATA
* * ** * * * * *
1129729 GTTA-TTCAAATAGTCATAAAGATTTGAATTTGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
189 -ATAGTTCAAATAGACATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTA
* *
1129793 ACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAAATT-GTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTTTATG
253 ACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATG
* * * * * * * * *
1129854 A-ACAGAAA-ATTTCATTTTATG-ACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTCAAATAGAAAAATTGCT
314 ATA-AAAAACAATT-GTTTTA-GAACAAAA-AAAAGGTAATAACATTTGAAATAG-ATAATTGTT
** * * * ** *
1129916 GTGATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTCGGTGAACAGATTCATTTTTTAAACCTCTTAATTAT
374 GAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATAT-TTACTTAT
* * * * * *
1129980 TAATTTTTGGAATATTAA-AATCTTAATATTATTTTATTTCAAATAA-TTTTATATGAACTGAAA
437 TATTTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTA-ATGAACTGAAA
* * * *
1130043 TAATTTTTTTAATGACAAAGCAAAAAGTCATAAC-ATTTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTC
500 CAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * ** * * * * * * *
1130107 ATGACTATTTGAGCTAATTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAAATTTTTACTTATTAATTATCAA
563 ATAACTATTTGAACTGGTTCAGCAAACATATTTATTTTT-TAAA--TCTGCTTATTAATTTTTAG
* * * * * * *
1130172 AAT-TTAAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTTTGAACAAAAACT-ATTGTTTT
625 AATATT-AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAA-TAATTGTTTT
* **
1130235 ATAACAAAACAAAAAGTCATAACA
688 ATAACAAAACAAAGA-TCATAATG
* * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTAAACTAGTTCAATAAACAGATTTATT
* ** * * * *
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* * * * *
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130 GTATGAACAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATAG
* * * * *
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193 TTCAAATAGACATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACT-T
* * * *
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257 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAA
* * * *
1130581 ACAATTGTTAT-GCCACCAAATAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GAC
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* * * * *
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* ** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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*
1130959 GGTCATAATG
701 GATCATAATG
* * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAACTATTTAAACTAGTTCAATAAACAGATTT-AT
* * * * *
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64 TTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
** * * * * * *
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* *** * * * **** * *
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186 ATAA-TAGTTCAAATAGACATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * **** * *
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250 CTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATG
* * * ** * * *
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314 ATAAAAAACAATTGTTTTA-GAACAAAAAAAAGGTAATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTGAA
** * * *** * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * * *
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* ** * * * * ** *
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* * * * *
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630 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTATATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATAAC
* * *
1131672 AAATCAATAGGTTATAATG
693 AAAACAA-AGATCATAATG
* * * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTAAACTAGTTCAATAAACAGA-TTTAT
* * * * **
1131755 TTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTATGGAT
64 TTTTTAAA--TC-TT-TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* ** * * * * * * * ** * *
1131819 GAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAATAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAAA
124 AAATTTGTATGAAC--AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGA
* ** *** ** ** * * * *
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* *
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* ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * *
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* * * *
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* ** *
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* ** **
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* * *
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** * * * * * *
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* ** * * * *
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64 AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTAATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG
** * *
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* * * * **
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* * * *
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66 TATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTA-ATGAACAGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAAG
* * * * * *
1129534 TCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATGA-TGATTTGAACTT
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*** * *
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1 GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATT
* * ** * *
1129642 AATATTATTTTAATACAAATAAACTTGT-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA
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* * * * ** *
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* * *
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** * * *
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* * * * * * * *** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * **
1130122 AATTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAAAT-TTTTACTTATTAATTATCAAAAT-TTAAATAAAT
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* ** * * * *
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127 AGTCATAAC-ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * **
1130303 AGTTTAATAAACAGATTTAATTTTTAAA--TC-T--TTATTAGTTTTTGAAATATTAATATGTTA
1 -GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * * * * *
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* * *
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* * *
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1 -GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * *
1130543 CA-TTTTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT-ATGATA-AAAAACAATTG--TTATGCCACCAAATA
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* * * * * *
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* * *
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* ** * ** *
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* * *
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* * * * *
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* ** * * *
1130897 AATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTA-AAATAATTGTTTTAT-ATCAAAAC-AAA
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* * * * *
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** * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * *
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**** * * * * *
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*** * *
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* * * * * *
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** ** * * *
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1 -GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * *
1131438 GTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGT-ATGATCTA-AAAGAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
65 GTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT-TAATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA
* * * * ** * * * *
1131501 GTCATAATTAATTGAAATAGTTAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT
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* * * * * * * *
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1 -GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATT
* ** * * * * *
1131618 AGTATTATTTTATTCTATCTAAGC-TTATATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAATAG
64 AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTA-ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA
* * * * *
1131682 GTTATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTT
128 GTCATAA-CATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T
*** * * *
1131736 GTTCAATAAACA-ATTTTTTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATT
1 GTTTGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * ** * * * * * * *
1131799 AATATTAATTTATTATGGATGAGC-TTATATGAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAATAAAAG
64 AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTA-ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA
* * * * ** ** *
1131863 GTCAGAATGATTTCAAATAAATAATTGTTTTAATAGTTTTAACCATTTGAACT
128 GTCATAA-CATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
1131916 AATTCGGTAAAAATATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTA
1 -GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* ** * * *
1131981 GTATTATTTTAATAAAAATAAG-TGTGTACA--AAC-CAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAAA
65 GTATTATTTTATTTTAAATAAGCT-T-TA-ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * *
1132042 GGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTT
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Statistics
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1126691 GGTTATGGTA
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *** * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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** * * *
1127965 TAATTATTCTTATAGTCTTAACTGTTTGAACT-GCTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-
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* * * * ** *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
1128188 TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGT-AATT
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* * * * * * * ** *
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128 AGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAG
* ** * *
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* * * * *
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* * * ***
1128433 ACTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGCCATATTT
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* * * **
1128474 ATTTTAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT-TT
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* * *
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* * * * * * * * * * *
1128602 AGCCTGTGTGAATTAAAAAAATT-ATTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGAT
128 AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGAT
* ** * * * * *
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193 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * *
1128728 -CTTATCAATTTTTAGAATATT-ATTAATTCAGCAATATTTTACTTCGAATAAGCTTATATGAA-
258 ACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAAC
* * *
1128790 TAGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAGATCATAACG
321 TA-AAACAATTGTTTTAT-ACAAAACAAAGGTCATAACG
* * * * ** * *
1128829 A-TTAAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AACTATTTAAACTAGTTCGATAAACAGATTTAG
1 ATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAA-TGATTTAT
* *
1128892 TTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
** * * *
1128953 ATTTTGTATGAA-TAGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAACGATTTAAAATAGA
128 AGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGA
* * * * * * * ** *
1129016 TAA-TAGTCCAAATGGACATGATTGTTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
192 TAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
** * * ** ** *
1129080 AAACTTATTGATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATG-A
256 TTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAA
* * * *
1129144 TTAGAAACAATTGTTTTAGAACAAAAAAAAAGTCATAAC-
320 CTA-AAACAATTGTTTTA-TACAAAACAAAGGTCATAACG
* * *** *
1129183 AATTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TCACTAGGTAAATAGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-ATAAAT-GATTTAT
* ** * * *
1129247 TTTTTAAATATTTGGCTTATTATTTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
** * * * * * ** *
1129312 AGCTT-TAAAAAACAGTAACAATTGGTTTAGGACAAAACAAAATGTCATAA-TGTTCTTAAATAG
128 AGCTTGT-ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT-TAAAATAG
* * * ** * * *
1129375 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTTAAC-ATGTTTGGTAGACAGATTCATTTTTTAATTCT
191 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
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* ** * * *
1129504 ACTGAAACAATTGTTTTATTGTAAAA-AAA-ATCACAATG
319 ACTAAAACAATTGTTTTA-TACAAAACAAAGGTCATAACG
* * * *
1129542 ATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATGA-TGATTTGAACTTGTTCAATAAACAT-ATTTA
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTAAT-AA-ATGATTTA
* * * * **
1129605 TTTCTTAAATCCTTTACTTATT-ATTTGTTG---A-T-AT--ATTAATATTATTTTAATACAAAT
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* ** * *
1129662 AAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAA
127 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGA
* ** * * * * *
1129727 TAGTTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGAATTTGTT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT
192 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
*
1129791 TTACTTATTAATTGTCT-TAATATTAATAAAATT-GTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTTTAT
256 TTACTTATTAATT-T-TGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTTTAT
* * * *
1129853 GAAC-AGAAA-ATTTCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGC-
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* * * * *** * * *** *
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1 ATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAAT-AA-ATGATTTA
* * * * * *
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** * * * * * * *
1130023 TAATTTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTAATGACAAAGCAAAAAGTCATAACATTTTGAAATA
126 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATA
* * * * * *
1130088 GATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAGCTAATTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAAAT-
190 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTT-TAAATC
* * * * *
1130152 TTTTACTTATTAATTATCAAA-ATTTAAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTT-
254 TCTTACTTATTAATTTTGAAATA-TT-AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-TTA
* * * *
1130215 TGAACAAAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACA
316 TGAACTAAAACAATTGTTTTAT-ACAAAAC-AAAGGTCATAACG
* * * * * *
1130259 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAACAGATTTAAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAA-TGATTTATT
* ** * * *
1130324 TTTTAAATC---T--TTATTAGTTTTTGAAATATTAATATGTTAGTATTTTTTTATTTTGAACAA
65 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAA
** * ** * * * *
1130384 ATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGCCATAACAATTTAAAGTAGATA
129 GCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATA
* * * *
1130449 ATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTT
194 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* *
1130513 A-TATATTAATATTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGA
258 ACT-TATTAAT-TTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTTTATGA
* *** *
1130575 TA-AAAAACAATTGTTATGCCACCAAATA-AAAGGTAATAACG
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* *
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* * ** * * ** **
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* * * ***
1130864 CTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGA
255 CTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGA
* * *
1130929 ATTAAAATAATTGTTTTATATCAAAACAAAGGTCATAATG
319 ACTAAAACAATTGTTTTATA-CAAAACAAAGGTCATAACG
* * * *
1130969 ATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTTGTTTAATAAATGATTTAATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATGATTT-ATT
* * * * * **
1131034 TTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTCGAATGTTAATAAATTTGGATTGTTTTATTCCAAATAA
65 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAA
* * * * * *
1131099 GCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAGGGTCAAAACAATTTAAAATAGAT
129 GCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGAT
* * * * ** * *
1131163 AATTATTCTAATAGGT-TTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATATCT
193 AATTATTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * ** * *
1131227 TACTTTTTAATTTTGAAATATTATTAAAGTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTACG-A-
257 TACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTTTATGAAC
* *
1131289 TAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCTTAACG
321 T-A-AAACAATTGTTTTAT-ACAAAACAAAGGTCATAACG
* * * * *
1131329 ATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAA-TTGGTTTAATAAGTAGTTTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAATAAAT-GATTTAT
* * * *
1131393 TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
* * * * * * *
1131458 TGCTTGTATGATCTAAAAGAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTAA-TTGAAATAGT
128 AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTAAAATAGA
* * * * * * * * * *
1131522 TAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTC-GATAAATAGATTTATTTTTAAAATTTT
192 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
** * *
1131586 TTACTTATT-ATTTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTATCTAAGCTTATATT
256 TTACTTATTAATTTT--GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTTTATG
* * * *
1131649 AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAATAGGTTATAATG
318 AACTAAAACAATTGTTTTAT-ACAAAACAA-AGGTCATAACG
* * * * * ** *
1131691 ATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAATTTTTTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATGA-TTTATT
* * * * ** *
1131756 TTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTATGGATG
65 TTTTAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
* * * * * * ** * *
1131820 AGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAATAAAAGGTCAGAATGATTTCAAATAAAT
128 AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGAT
* ** ** * * * * * *
1131885 AATTGTTTTAATAGTTTTAACCATTTGAACTAATTCGGTAAAAATATTTATTTTTTAAATCTATT
193 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** * **
1131950 ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAAAAATAAG-TGTGTACAAAC
258 ACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TTTATGAAC
* * *
1132014 -CAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATAACG
321 TAAAACAATTGTTTTAT-ACAAAA-CAAAGGTCATAACG
* *
1132052 ATTTAAAATAAATAATTGTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTT
1132072 TATATATGTT
Statistics
Matches: 3899, Mismatches: 861, Indels: 498
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
339 72 0.02
340 42 0.01
341 7 0.00
343 1 0.00
344 3 0.00
345 1 0.00
346 3 0.00
348 2 0.00
349 89 0.02
350 145 0.04
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363 250 0.06
364 26 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATGATTTATTT
TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGC
TTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAAT
TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
TATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACTAAAA
CAATTGTTTTATACAAAACAAAGGTCATAACG
Found at i:1132711 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 1132681--1132715 Score: 52
Period size: 10 Copynumber: 3.5 Consensus size: 10
1132671 AGCTCTTGCT
1132681 CTCTTGATTC
1 CTCTTGATTC
*
1132691 ATCTTGATTC
1 CTCTTGATTC
*
1132701 CTCTTGTTTC
1 CTCTTGATTC
1132711 CTCTT
1 CTCTT
1132716 TCTTCTTAGT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 3, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
10 22 1.00
ACGTcount: A:0.09, C:0.29, G:0.09, T:0.54
Consensus pattern (10 bp):
CTCTTGATTC
Found at i:1134134 original size:177 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1133783--1134180 Score: 464
Period size: 177 Copynumber: 2.2 Consensus size: 180
1133773 TTTTTAGGTT
* * * * *
1133783 ATTAAGTTTTGAAATATTATTCAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAATATGAACAGAAC
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAATATGAACAAAAA
* * * *
1133848 CAATTGTTTTATGAAAAAATAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGACAGTTATTAAAATAGTCAA
66 CAATTGTTTAATG-AAAAATAAATGGTAATAATAATTTGAAATAGACAATTATTAAAATAGTCAA
* * *
1133913 AACTATTTAAAATGGTTTGGTAAACACATTTACTTTTTAAATCTCTTACTG
130 AACTATTTAAAATGGTTTGGTAAACAAAATTACTTTTTAAATCTCTTACTC
* * * *
1133964 ATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-ATCAAACTTATATTAACAAAA
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AAAATAATATGAACAAAA
* * * * * *
1134028 ACAATTGTTTAATG-ACAA-AAAT-GTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
65 ACAATTGTTTAATGAAAAATAAATGGTAATAATAATTTGAAATAGACAATTATTAAAATAGTCAA
* * * *
1134090 AATTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAAAATTA-TTTTCTAAATCTCTTACTC
130 AACTATTTAAAATGGTTTGGTAAACAAAATTACTTTT-TAAATCTCTTACTC
* * * *
1134141 ATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTGTTTTATT
1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1134181 CCAAATATGC
Statistics
Matches: 184, Mismatches: 31, Indels: 8
0.83 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
176 4 0.02
177 106 0.58
178 4 0.02
179 3 0.02
180 2 0.01
181 65 0.35
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATAATATGAACAAAAA
CAATTGTTTAATGAAAAATAAATGGTAATAATAATTTGAAATAGACAATTATTAAAATAGTCAAA
ACTATTTAAAATGGTTTGGTAAACAAAATTACTTTTTAAATCTCTTACTC
Found at i:1134794 original size:355 final size:356
Alignment explanation
Indices: 1134254--1135982 Score: 923
Period size: 355 Copynumber: 4.8 Consensus size: 356
1134244 GAAATAAATA
*
1134254 AATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAACTGAAACAATTATTATAT
1 AATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAACTGAAACAATCATTATAT
1134319 AACTAAACAAAAAGGTCTGAATGATTTAAAATAGATAATTATTATAATAGTCTTAACTATTTAAA
66 AACTAAAC-AAAAGGTCTGAATGATTTAAAATAGATAATTATTATAATAGTCTTAACTATTTAAA
* * *
1134384 CTGGTTTAACAAACATATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAACTATTATTAAATTAGTA
130 CTGGTTCAACAAACACATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAACTATTATTAAATTAATA
* * * *
1134449 TTATTTTTATCCAAATAAGCATGGATGATAA-AAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAGATCAT
195 TTATTTTAATCCAAATAAGCATGAATGA-AAGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATAAT
** * * * *
1134513 AATGATTTGAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAAATGCTTCAAAAAACA-ACT
259 AACAATTTGAGATAGATAATTGTCTAAATAGTCATAACTATTTGAAATGCTTCAAAAAACAGA-T
1134577 TTAGTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAAATTTTTG
323 TTAGTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAAATTTTTG
* * * * * * * *
1134611 AATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAAGGTTGTATGATCTGAAATAATCATTTTAT
1 AATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAACTGAAACAATCATTATAT
* * * * * * *
1134676 GACTAAAC-AAA-GTTTAGAATGATTTGAAATATATAATTATTCT-GTAGTCTTAACTATTTGAA
66 AACTAAACAAAAGGTCT-GAATGATTTAAAATAGATAATTATTATAATAGTCTTAACTATTTAAA
* *
1134738 CTGGTTCGATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAA-TATTATTAAATTAA
130 CTGGTTCAACAAACACA-TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-GAACTATTATTAAATTAA
* * * * * *
1134802 TATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGAATGAAAGGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATAA
193 TATTATTTTAATCCAAATAAGCATGAATGAAAGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATAA
* * * * *
1134867 TAACAATTTGGGATAGATAATTGTCTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTTAGAAAACAGAT
258 TAACAATTTGAGATAGATAATTGTCTAAATAGTCATAACTATTTGAAATGCTTCAAAAAACAGAT
**
1134932 TTAGTTTTTAAATCTC----TTATT-AATTTTCAA
323 TTAGTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAAATTTT-TG
* * * * * ** ** * * ** ** *
1134962 AATATTGATATATTAATATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
1 AATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAACTGAAACAATCATTATAT
* * * * * * **
1135027 GACAAAACAAAAGGTCAT-AACGATTT-GAATAGATAATTATTCA-AATGGAT-ATGCCTATTTG
66 AACTAAACAAAAGGTC-TGAATGATTTAAAATAGATAATTATT-ATAATAG-TCTTAACTATTT-
* **** * ** *
1135088 AACCT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTACCTATC-TATTAATTTTTAGAA-TATT-TATAAA
127 AAACTGGTTCAACAAACACA-TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-GAACTATTAT-TAAA
* ** * * *
1135149 TTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAG-AAACAATTG-TTTATGACAAAATAAA
189 TTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCATGAATGAA-AGAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAA
* * * * * * *
1135212 AGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGT-TCAAATAGTCATAACTATGTGAACTTGC-T-AAT
252 AGATAATAACAATTTGAGATAGATAATTGTCT-AAATAGTCATAACTATTTGAA-ATGCTTCAAA
* * * * ** *
1135274 AAACAAATTTAATTTTTTAAATATTTTACTCATT-AATTTTTGG
315 AAACAGATTT-AGTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAAATTTTT-G
* * * * *** * * * * ** **
1135317 AATATGT-ATAAATTAGT-TTTTTTTTTTTTTACTATGGTTGTATGAACAAAAACAATTGGTT-T
1 AATGT-TAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAACTGAAACAA-TCATTAT
* * * * * * * *
1135379 ATAACAAAATAAAATGT-TATAACT-ATTTGAAATAGA-AATTGTTCA-AATAGTCATAGCTATT
64 ATAACTAAACAAAAGGTCT-GAA-TGATTTAAAATAGATAATTATT-ATAATAGTCTTAACTATT
* * * * *
1135440 TGAA-TGTGTTTAA-AAAGCAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTCATTAATTTTTTGAA-TATTA
126 TAAACTG-GTTCAACAAA-CACA-TTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAA-TTTTTGAACTATTA
* * * ** * *
1135502 ATAAATTTATATGATTTT-ATTTAGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAA
184 TTAAATTAATATTATTTTAATCCA-AATAAGCATGAATGAA-AGAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * *
1135565 AACAAA-ATGTTATAACTATTTGA-ACTAGAAAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AAACTT
247 AACAAAGA--TAATAACAATTTGAGA-TAGATAATTGTCTAAATAGTCATAACTATTTGAAA--T
**** * * * * ** * *
1135627 G-TTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTCAAT-AATTTTTGG
307 GCTTCAAAAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAAATTTTT-G
* * * * * ** *
1135676 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCCT-ATATGAACT-AATACAATTGTTTT
1 AATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-CTGGTATGAACTGAA-ACAATCATTAT
*** * * * * *
1135739 ACGGCAAAATAAAAGCTC-GTAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATA--CTTATTACTAT
64 ATAACTAAACAAAAGGTCTG-AATGATTTAAAATAGATAATTATT-ATAATAGTCTTA--ACTAT
* * ** * * * ** * *
1135800 TTGAACTTGTTC-AGTAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA
125 TTAAACTGGTTCAACAAACACA-TTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAACTATTAT
*** * * * * *
1135864 TAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAATGAAAGCAATTGTTTTATAACAAAA-
185 TAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCATGAATGAAAGAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
1135928 AAAGAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGT-TCAAATAGTCATAACGATTT
250 AAAG--A-TAATAACAATTTGAGATAGATAATTGTCT-AAATAGTCATAACTATTT
1135983 AAACTTATTC
Statistics
Matches: 1105, Mismatches: 192, Indels: 145
0.77 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
350 30 0.03
351 196 0.18
352 51 0.05
353 11 0.01
354 124 0.11
355 221 0.20
356 7 0.01
357 67 0.06
358 62 0.06
359 113 0.10
360 83 0.08
361 95 0.09
362 43 0.04
363 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
AATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAACTGAAACAATCATTATAT
AACTAAACAAAAGGTCTGAATGATTTAAAATAGATAATTATTATAATAGTCTTAACTATTTAAAC
TGGTTCAACAAACACATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAACTATTATTAAATTAATAT
TATTTTAATCCAAATAAGCATGAATGAAAGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATAATAA
CAATTTGAGATAGATAATTGTCTAAATAGTCATAACTATTTGAAATGCTTCAAAAAACAGATTTA
GTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAAATTTTTG
Found at i:1135388 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 1134258--1136346 Score: 1492
Period size: 180 Copynumber: 11.7 Consensus size: 181
1134248 TAAATAAATG
* *** * ** * * *
1134258 TTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTGGTATGAACTGAAACAATTATTATATAACT
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-
* * * * * *
1134323 AAACA-AAAAGGTC-TGAA-TGATTTAAAATAGATAATTATT-ATAATAGTCTTAACTATTTAAA
65 AAA-ATAAAAGATCAT-AACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
1134384 CTGGTTTAACAAACATA-TTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT-GAACTA
126 CTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAA-TA
* *** * *
1134435 TTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCATGGATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * ** * * * *
1134498 GAAAA-CAAAGATCATAA-TGATTTGAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAA-A
64 CAAAATAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * ** * *
1134560 TGCTTCAAAAAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAAATTTTT-GAATG
128 TG-TTCAATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATT-AATTTTTAGAATA
* * * * * ** * ** *
1134615 TTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAAGGTTGTATGATCTGAAATAATCATTTTATGACT
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * ** * *
1134680 AAA-CAAAGTTTAGAA-TGATTTGAAATATATAATTATTC-TGTAGTCTTAACTATTTGAACTGG
66 AAATAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * *
1134742 TTCGATAAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAGAATA
130 TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * *
1134790 TTATTAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGAATGAA-AGGAAATAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGAC
* * ** *
1134854 AAAAT-AAAGATAATAACAATTTGGGATAGATAATTG-TCTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TT
65 AAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
1134916 GTTTTAGA-AAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATA
129 G-TTCA-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * * ** *
1134966 TTGATATATTAATATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * ** *
1135031 AAACAAAAGGTCATAACGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATGGAT-ATGCCTATTTGAACCTG
66 AAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG
*** * *
1135094 TTTGGTAAACAGATTTATTTTTT--A-CCTAT-CT-ATTAATTTTTAGAATA
130 TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * *
1135141 TTTATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG-TTTATGACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* *
1135205 AAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATGTGAACTTGC
66 AAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * *
1135270 T-AATAAACAAATTTAATTTTTTAAATATTTTACTCATTAATTTTTGGAATA
131 TCAATAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * * *
1135321 TGT-ATAAATTAGT-TTTTTTTTTTTTTACTATGGTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATAAC
1 T-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * *
1135384 AAAATAAAATG-TTATAACTATTTGAAATAGA-AATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAA-TG
65 AAAATAAAA-GATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* * *
1135446 TGTTTAA-AAAGCAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTCATTAATTTTTTGAATA
128 TGTTCAATAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* *
1135499 TTAATAAATTTA-TATGATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
1135563 AAAACAAAATG-TTATAACTATTTGAACTAGAA-AATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACT
65 AAAATAAAA-GATCATAACTATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
*** * * * *
1135626 TGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTCAATAATTTTTGGAATA
128 TGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
** * * * * * * *
1135680 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCCTATATGAACTAATACAATTGTTTTACGGCA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
1135745 AAATAAAAGCTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTTATTACTATTTGAACTTGT
66 AAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * * *
1135810 TCAGT-AACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
131 TCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * ** * *
1135860 TTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAATGAAAGCAATTGTTTTATAACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
1135925 AAA-AAAGAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTTAAACTT
66 AAATAAA-AGA-TCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * * * *
1135989 ATTCAGT-GACTAGAGTTATTTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTGTCT-GAGTA
129 GTTCAATAAAC-AGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATT-TTTAGAATA
* * * * * * *
1136043 TTCATAAAATT-TTTTTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAA-AATTATTTTATG
1 TTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATG
* * ** * *
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* * * *
1136169 TTGTTCAATAAACAGATTTAGTTGTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
127 TTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * *
1136224 TTAATAAATTAGAATTATGTTATTACT-AATAAGCTTGTAAGAATAGAAACAATTGTTCTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * *
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** * * * * *
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* ** * *
1134385 TGGTTTAACAAACATA-TTATTTTTTAAATC-TCT--TATTAATTTTT-GAACTA
126 TTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTATTAATTTTTAGAA-TA
* * * * * *
1134435 TTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCATGGATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * ** * * * * * * *
1134498 GAAAA-CAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAA-AT
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* ** * * *
1134561 GCTTCAAAAAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGT-TTATTAAATTTTT-GAATG
128 G-TTTAGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCT-TT-TACTATT-AATTTTTAGAATA
** * * * ** * **
1134615 TTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGGTTGTATGATCTGAAATAATCATTTTATGAC
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * ** * * * ** *
1134679 TAAA-CAAAGTTTAGAATGATTTGAAATATATAATTATTC-TGTAGTCTTAACTATTTGAAC-TG
65 AAAATAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * *
1134741 GTTCGATAAACACATTTATTTTTTAAATC-TCT--TATTAATTTTTAGAATA
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* * * * *
1134790 TTATTAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGAATGAA-AGGAAATAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGAC
* ** *
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* * * * *
1134916 GTTTTAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATC-TCT--TATTAATTTTCAAAATA
128 G-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTATTAATTTTTAGAATA
* * ** *
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1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * ** *
1135030 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATGGAT-ATGCCTATTTGAACCT
65 AAAATAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTT
* * *
1135093 GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT--A-CCTAT-CTATTAATTTTTAGAATA
128 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTATTAATTTTTAGAATA
* *
1135141 TTTATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG-TTTATGAC
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* *
1135204 AAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATGTGAACTT
65 AAAATAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
1135268 G-CTAATAAACAAATTTAATTTTTTAAATATTTTACTCATTAATTTTTGGAATA
128 GTTTAGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACT-ATTAATTTTTAGAATA
* * * ** * * * * *
1135321 TGT-ATAAATTAGT-TTTTTTTTTTTTTACTATGGTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATAAC
1 T-TAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * *
1135384 AAAATAAAATGTTATAACTATTTGAAATAG-AAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAA-TGT
65 AAAATAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-T
* * *
1135447 GTTTA-AAAAGCAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTCATTAATTTTTTGAATA
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* * *
1135499 TTAATAAATTTATATGATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
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66 AAATAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * *
1135629 TTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTCAATAATTTTTGGAATA
130 TTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-ATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * * * *
1135680 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCCTATATGAACTAATACAATTGTTTTACGGCA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
1135745 AAATAAAAGCTCGTAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTTATTACTATTTGAACTTGT
66 AAATAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * *
1135810 TCAGT-AACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
130 TTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC-TATTAATTTTTAGAATA
* ** * *
1135860 TTAATAAATTAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAATGAAAGCAATTGTTTTATAAC
1 TTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * *
1135924 AAAAAAAGAAAGTCATAACAATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTTAAACT
65 -AAAATA-AAAGTCATAACAATTTGAAATAGAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * *
1135988 TATTCAGT-GACTAGAGTTATTTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTGTCT-GAGTA
127 TGTTTAGTAAAC-AGATTTA-TTTTTTAAATCTTTT-ACTATTAATT-TTTAGAATA
* * * * * * *
1136043 TTCATAAAATT-TTTTTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAA-AATTATTTTATG
1 TTAAT-AAATTAATATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATG
* ** * *
1136105 ACAAAATAAAAGGAT-ATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCGAATAGTCATAGCTATTTGAAC
63 ACAAAATAAAA-G-TCATAACAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
1136169 TTGTTCAATAAACAGATTTAGTTGTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
126 TTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAC-TATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * *
1136224 TTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTACTAATAAGCTTGTAAGAATAGAAACAATTGTTCTATGAC
1 TTAATAAATTA-ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * *
1136288 AAAATAAATGGTCATAACGATTTGAAATA-AATAATTATTCAAACAGTCATAACGATTTGCA-TT
65 AAAATAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* ** * * * *
1136351 GTTAAAGCCAACGGATTCATTTTTTAAATC---CATTATTAATTTTTAGAATA
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1 TTA
1136404 TTAATAAGAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
173 2 0.00
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TAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTATTAATTTTTAGAATA
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* * * * * * *
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* * * * * * *
1136551 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATCAAC-A
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* * * ** * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * * *
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66 CATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* ** **
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* * * * * *
1136780 AAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTTAAATGGA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-
* * * ** *
1136845 T-ATGACTATTTGAACTTA----GTAAATAGCTTTATTTTTAAATCTCCAACTCATTAA-TTTTA
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* * ** *
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* * * * *
1136953 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
1137133 GAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAGTAA
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * ** * * * * *
1137198 TCATAAGTATATGAACGTGTTAAGAAAATAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTTTTAATTTCT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* *
1137262 GGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAA-TA
129 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTA
** * *
1137312 GAATTAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG-TCTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * **
1137376 GTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATATATTCTTTTTTTAATTCTCTTTCTCATTTATTCA
64 GTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATT-TTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* *
1137441 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACTA
128 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
** * * *
1137494 AAATGATTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTG--A-A-AT-A--GTT---ATA--
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
1137547 -AT---TATTTGAACTGATTTAGTAAATAGAATTATTTTCTATATCTCTTACTTA-TATATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAG-ATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTT
* * ** *
1137607 -GAAATATTAATAAATGAGTTTTATTCTT-TTTTGAATAAGCTTGTAT-AAGCTG
129 AG-AATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CTA
* * ** * *
1137659 AAATACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * **** *
1137724 CTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAACAAAT-GAGTTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT
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* * * * *
1137787 TAGAATTTTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTG
128 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * * * * ** * * *
1137840 AAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTAAAACAATTTAAAATAGACAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** ** * *
1137905 CATAACCATTTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--T-GT-CTTATTAATTCTT-
66 CATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
** * * * ****
1137965 GAAATATTAATAAATTAGCGTTATTCTATTTCGAATAAACTTGTATGTTGAA
130 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * * * * *
1138017 AAACAAATATTTTATGACAAAATACAAGG-CAATAACGATTTGAAATAAATAGTTGTTCAAAT-G
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * ** * * * *
1138080 ACTATAATTATTTAAACTAATTCAGCAATTTA-ATTTATTTTTTTAAGTCTCTTAATTATTAATT
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* *** *
1138144 TTT-GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA
126 TTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
* * ** *
1138199 AAATAATTGCTTTATGA-AAAA-AAAAGGTCATAACAAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
1138261 TCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGA-TT-TTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
1138326 TTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTAACTAAGCTTGTATAAACTA
128 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * * * * *
1138379 AAACAATTATTATT-TGACCAAACAAAATGTCAAAATGATTTTAAATAGATAATTATTCTAATAG
1 AAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
1138443 TCTTAAATATTTGAAC-TAGTTTGGAAAACACATTTAATTTTT--ATTTC-T-CTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
1138503 T-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGTTTGTATGATCAA
128 TAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * * *
1138556 AAATAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATTA-ATATTTTTTCAAATA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-A-TAGATAATTGTTCAAATA
** ** * * *
1138618 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGAAAATA-ACTTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
64 GTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATAGA-TTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
1138682 TTAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAACTG
127 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * * *
1138736 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGACTTGAAATTGATAAATTATTCAAATAG
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* * * * * *
1138801 T-AAAATCTATTTGAACTTGTTTGGTGAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTT
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* * * * ** * * *
1138865 TTTGAATGTTAATAAGTTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATTG
127 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * ** * * * * *
1138919 AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTCGAAATATATAATTATTCTAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
1138984 CTTAACTATTTGAA-TTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCATACTTAATAATTTTT
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* * * * *
1139048 GGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-AA
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* * * *
1139099 GAAACAATTATTTTATGACAAAATAAATA--TCATAATGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATA
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * *
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64 GTCATAACTATTTGAACT-TATTTGGTAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * ** * *
1139222 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTTAATAATTTTGCATCAAC-A
127 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTA
*
1139275 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTCAT-ATCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-
1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
1139338 GAACATGACTATTTGAACTTCTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTT
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* * * *
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* * * * * * *
1139456 GAAACAAATGTTTTATAACAAAA-AAAAGATCATAACT-ATTTGGAATAAATAATTATTCAAACA
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** * *
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* *
1139584 -GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAGAATAAGGTTGTATGAA-GA
129 AG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAACTA
** * * **
1139635 GAAATGATTG-TTTAAGAACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 -AAACAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
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64 GTCATAACTATTTGAACTTATTT-GGTAAATAGATT-TTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
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127 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* *
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* * ** * * *
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** ** ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * * *
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** * * **
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* * * *
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* * * * * * * * **
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* ** *
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* * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAA
** * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * *** * * *
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* *
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*
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* * *
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* *
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* * *
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* * *
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*** * *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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128 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * *
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* * * *
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255 TAGTTTAGAAAACAGATTTAATTTTT-AAT-TTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-T
** * *
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* * * * *
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1 AATTGTTTTATG-ACAAAA-AAAAGGTCATAACAATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAATCAT
* * * *
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* * * * * * * * *
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128 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTAT
* * * * *
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191 GACCAAAA-A-AATGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAA
1139896 C
254 C
1139897 ATGTTCAATT
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AAAAAATGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGTTT
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TTTATTTTGAATAAGTTTTATGAACTAAAAT
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*
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* * * *
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* *
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* * ***
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* *
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* * * *
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CGAACTGA
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1141114 AAGGGTAACT
* *
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*** *
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* *
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Statistics
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* * * *
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64 T
* ** * * *
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64 T
** *
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1 AAACTAGGCTTAAATTTTCATTGATGCTAACTAAATTGGGCTTAAAT
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AAACTAGGCTTAAATTTTCATTGATGCTAACTAAATTGGGCTTAAATTTCCATAAGGGCTAGCT
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1141241 AATGCCAACC
* * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * *
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** * * * *
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* * **
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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*
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*
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* *
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* *
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* ** *
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** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * **
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* * *
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* * * *
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* * **
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* * * ** **
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*
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* * *
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* *** * * *
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* * *
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* ** ***
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* * *
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*
1142288 -AACTTGGGCTTAAATC-TTCATTAGGTGCCAGTT
1 AAAC-TGGGCTTAAATCTTTCATTA-GTGCCAGCT
** * * *
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1 AAACT
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AAACTGGGCTTAAATCTTTCATTAGTGCCAGCT
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1141839 TCATGAGGGG
* * *
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* *
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* * ** *
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*
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* * * ** *
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* * * *
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* ** * ** * * * * * * *
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1142208 TTGGTGCTAG
Statistics
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CAAATAATACTAGGCTTAAATCCTATCATAAGTGCCAACTAAACTAGGCTTAAATCTTTTCATGG
AGCCAGATAAACTAGGCTTAAATTTTCATTGGTGC
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* * * *
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* * * * *
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* **
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* * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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*
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* * * *
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* * *
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* *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* **
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* * *
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* * * *
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* * **
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* * * **
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* *
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* * *
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*** * * *
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*
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* * ** * *
1142220 AAACTAGATTTAAAT-TCTTTCAAGGGGTGCCAGCT
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* *
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* * *
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1 AAATTGGGCTTAAATCTTTTCATGA-GTGCCAGCT
* * * *
1142321 AAGTTGGGCTTGAATCTTTTCATGTGGTGCTAGCT
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1142356 AAA
1 AAA
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Statistics
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*
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AAAAAAAATTTATGATTTGAA
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*
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1150038 GAAAATGAAA
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AAAT
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* * * *
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*
1153367 AATAA AATAAA AATAA AAGTAA AAGTAA AATAA AGAT-A AAT-G AATAA
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* * * *
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*
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1153426 GATCAATACA
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* *
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*
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1153426 GATCAATACA
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*
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*
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1153426 GATCAATACA
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*
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* *
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* * **
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* * * * *
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*
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TAT
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*
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*
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* *
1177870 TTTTAGATCTTAATTTTATAATATTTCATGATTTTT-GTGCCATTTAAAATCATAGCAGT-ACCT
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* * * * * * * * *
1177933 CGAGAAGTGTGAAATTACTAGAATATCCTCATAAAGGTATTTTTGTAATT-TGATCTTTTTGAGC
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1177997 TCAAATTTTCATGAAAC-
128 TCAAATTTTCATGAAACA
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* *
1178079 AAAAAGTGTGAAATTACCAAAATACCCTTATAAGGGTATTTTGGTAATTAAGCCTTCTTGAGCTC
65 AAAAAGTGTGAAATTACCAAAATACCCTCATAAAGGTATTTTGGTAATTAAGCCTTCTTGAGCTC
*
1178144 GAATTTTCATGAAACA
130 AAATTTTCATGAAACA
* * **
1178160 TTTTAGATCACAATTTTATAATATTTTATGATTTTTTATGC-TTTAAAATC
1 TTTTAGATCTCAATTTTATAATATTTCATGATTTTTGGTGCATTTAAAATC
1178210 CTAAAAATGA
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TTTTAGATCTCAATTTTATAATATTTCATGATTTTTGGTGCATTTAAAATCATAGCAGTCCCCTA
AAAAGTGTGAAATTACCAAAATACCCTCATAAAGGTATTTTGGTAATTAAGCCTTCTTGAGCTCA
AATTTTCATGAAACA
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1188101 ACTGACCCCT
*
1188111 AATGAAATATTAAGCTTAGATTAGCTAGCCTCC
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* * *
1188144 AATG-AAT-GTAAGCCCAGTTTAGCTAGCCTTC
1 AATGAAATATTAAGCCTAGATTAGCTAGCC-TC
** *
1188175 AAAAAAATATTTAAGCCTAGATTAACTAGCCTCC
1 AATGAAATA-TTAAGCCTAGATTAGCTAGCCT-C
*
1188209 AATGAAATATTAAGCCTAGATTAGCTAAACCTC
1 AATGAAATATTAAGCCTAGATTAGCT-AGCCTC
* * *
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1 AATGAAATATTAAGCCTAGATTAGCTAG-CCTC
*
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* *
1188308 AAAGAAAGATTTAAGCC
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1188041 ATTCTCAAGC
*
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1 ATGTAAGCCCAGTTTAGCTAGCCTTCAAAGAAAAATTTAAGCCCAAATTAACTGACCCCTAATGA
*
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66 AATATTAAGCCTAGATTAGCTAGCCTCCAATGA
* *
1188149 ATGTAAGCCCAGTTTAGCTAGCCTTCAAA-AAAATATTTAAGCCTAGATTAACT-AGCCTCC-AA
1 ATGTAAGCCCAGTTTAGCTAGCCTTCAAAGAAAA-ATTTAAGCCCAAATTAACTGA-CC-CCTAA
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AATATTAAGCCTAGATTAGCTAGCCTCCAATGA
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* * *
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1188176 AA
66 AA
* * * *
1188178 AAAATATTTAAGCCTAGATTAACTAGCCTCCAATGAAATATTAAGCCTAGA-TTAGCTAAACC-T
1 GAAATATTTAAGCCTAGATTAGCTAGCCTCCAATGAAATATTAAGCCCA-ATTTAGCT-AGCCTT
*
1188241 CAAT
64 CAAA
* * *
1188245 GAAATA-TTAAGCCTAGATTAGTTGGTCCT-TAATGAAATATTAAGCCCAATTTAGCTAGCCTTC
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1188308 AAA
65 AAA
* * * * * * *
1188311 GAAAGATTTAAGCCCAAATTAGTTGGCTCCCCCGATGAAATATTAAGCCCA
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Statistics
Matches: 151, Mismatches: 22, Indels: 17
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GAAATATTTAAGCCTAGATTAGCTAGCCTCCAATGAAATATTAAGCCCAATTTAGCTAGCCTTCA
AA
Found at i:1188327 original size:34 final size:32
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Indices: 1188054--1188332 Score: 172
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1188044 CTCAAGCATG
* * * *
1188054 TAAGCCCAGTTTAGCTATCCTTCAAAGAAAAATT
1 TAAGCCCA-ATTAGCTAGCCTTCAATGAAATA-T
* * *
1188088 TAAGCCCAAATTAACTGACCCCT-AATGAAATAT
1 TAAGCCC-AATTAGCT-AGCCTTCAATGAAATAT
** * *
1188121 TAAGCTTAGATTAGCTAGCCTCCAATG-AAT-G
1 TAAGCCCA-ATTAGCTAGCCTTCAATGAAATAT
* **
1188152 TAAGCCCAGTTTAGCTAGCCTTCAAAAAAATATT
1 TAAGCCCA-ATTAGCTAGCCTTCAATGAAATA-T
* * *
1188186 TAAGCCTAGATTAACTAGCCTCCAATGAAATAT
1 TAAGCCCA-ATTAGCTAGCCTTCAATGAAATAT
* *
1188219 TAAGCCTAGATTAGCTAAACC-TCAATGAAATAT
1 TAAGCCCA-ATTAGCT-AGCCTTCAATGAAATAT
* * *
1188252 TAAGCCTAGATTAGTTGGTCCTT-AATGAAATAT
1 TAAGCCCA-ATTAGCTAG-CCTTCAATGAAATAT
* *
1188285 TAAGCCCAATTTAGCTAGCCTTCAAAGAAAGATT
1 TAAGCCCAA-TTAGCTAGCCTTCAATGAAATA-T
1188319 TAAGCCCAAATTAG
1 TAAGCCC-AATTAG
1188333 TTGGCTCCCC
Statistics
Matches: 194, Mismatches: 37, Indels: 28
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Matches are distributed among these distances:
31 21 0.11
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TAAGCCCAATTAGCTAGCCTTCAATGAAATAT
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* * *
1188389 CATTTGCCTTACTTGCATTTACATCATAATAAAAGGACATTTG
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* * *
1188432 CATTTGCATTGCTTGCATCTGCATCATAA-GAAA-GACATTCG
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* *
1188473 TATTTGCATCACTT
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*
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*
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Matches: 24, Mismatches: 3, Indels: 0
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CATTCGCATTGACATTTG
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1188889 ATAAGATTAA
* * *
1188899 ACATGAGTCC-AGATTAGTTGGG
1 ACATGAG-CCTAGATTAGCTAGC
*
1188921 ACATGAGCCTAGATTAACTAGC
1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
* *
1188943 ACATGAGGCC-AGATCAGTTAGC
1 ACATGA-GCCTAGATTAGCTAGC
* ** * * * * *
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1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
* *
1188987 ACATGAGTCTAGATTAGCTGGC
1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
*
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1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
* * *
1189031 ACATGAGTCTAGATTAGTTAAC
1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
* * * *
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1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
*
1189075 ACATGAGTCC-AGATTAGCTGGC
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** * * *
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1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
*
1189119 ACATGAGCCTAGATTAGCTGGC
1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
*
1189141 ACATGAGCCTAGAGTAGCT-GAC
1 ACATGAGCCTAGATTAGCTAG-C
* * *
1189163 AGATGAACATAAGATTAGCTAGC
1 ACATGAGCCT-AGATTAGCTAGC
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1 ACAT
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ACATGAGCCTAGATTAGCTAGC
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1188889 ATAAGATTAA
* * *
1188899 ACATGAGTCCAGATTAGTTGGGACATGAGCCTAGATTAACTAGC
1 ACATGAGTCCAGATTAGCTGGCACATGAGCCTAAATTAACTAGC
* * * * * ** * * *
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* * * *
1188987 ACATGAGTCTAGATTAGCTGGCACATGAGCCTAGAGTAGCTAGC
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* * ** * *
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1 ACATGAGTCCAGATTAGCTGGCACATGAGCCTAAATTAACTAGC
** * * *
1189075 ACATGAGTCCAGATTAGCTGGCACAAAAGCCCAAATTAGCTAGT
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1189152 GAGTAGCTGA
Statistics
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ACATGAGTCCAGATTAGCTGGCACATGAGCCTAAATTAACTAGC
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1188889 ATAAGATTAA
* * * *
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** * *
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65 GCATATGAGCCTAAATTAACTGGC
* * * *
1188987 ACATGAGTCTAGATTAGCTGGCACATGAGCCTAGAGTAGCTAGCACATGAGTCTAGATTAGTTAA
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66 CATATGAGCCTAAATTAACTGGC
** * * * * *
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*
1189140 CACATGAGCCTA
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1189152 GAGTAGCTGA
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CATATGAGCCTAAATTAACTGGC
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1189199 TTAGTAGTTA
*
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* * ** * *
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1 TATTTA-TTTCTCAACTTTTG-ATGTCATTTCGATCAT
* * ** * * *
1189281 TTTGTTATTTCTTAACTTGCGGTGTTA-TTCAAGTCAT
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* *
1189318 TATTCATTTCTCAACTTTTGGTGTCATTTCGATCAT
1 TATTTATTTCTCAACTTTTGATGTCATTTCGATCAT
* * ** * * * *
1189354 TTTGTTATTTTTCAACTTACGATGTCGTTTTGGTCGT
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* * *
1189391 TATTTATTTCTCAACTTTAGGA-GTCATTTTGATCCT
1 TATTTATTTCTCAACTTT-TGATGTCATTTCGATCAT
* ** **
1189427 TATTTATTTTTTGACTTTTGATACCATTTCGATCAT
1 TATTTATTTCTCAACTTTTGATGTCATTTCGATCAT
*
1189463 TTTGTTATTTCTCAACTT
1 TAT-TTATTTCTCAACTT
1189481 GCAGAGTTTT
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Matches are distributed among these distances:
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TATTTATTTCTCAACTTTTGATGTCATTTCGATCAT
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1190112 TTATGGAGTG
*
1190122 CTCAATCT-TTTATTTTTTAACTTGCAATTCAATTCCTGTCTCATTATTCTTTGACTT-CTAGTT
1 CTCAATCTCTTTA-TTTTTAACTTGCAATTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACTTAC-AGTT
*
1190185 TAAT
64 CAAT
* * ** * * *
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1 CTCAATCTCTTTATTTTTAACTTGCAATTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACTTACAGTTCA
1190254 AT
66 AT
** * * *
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1 CTCAATCTCTTTATTTTTAACTTGCA--ATTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACT
1190312 CAATGTTCAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CTCAATCTCTTTATTTTTAACTTGCAATTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACTTACAGTTCA
AT
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1190139 TAACTTGCAA
*
1190149 TTCAATTCCTGTCTCATTATTCTTTGACTTCTAGTTTAATCTCAATCTCTTTATTTTTGACTCG-
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGAC-TCTAGTTTAATCTC-ATCTC-TT-TTTTTGACTCGC
* * *
1190213 TGATTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTTACAGTTCAATCTTGATCTCTTTATTTTTTACT
62 AG-TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCA-AGTTCAATCTTGGTCTCTTTATTTTTTACT
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125 CATGG
* * * * * * *
1190283 TTCAATCCCTGTCTTATTATTCTTTGACTCAATGTTCAATC-C-TGGTCTTTTTCTAACTCACAG
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACTCTA-GTTTAATCTCAT-CTCTTTTTTTGACTCGCAG
* * * * * * *
1190346 TTTAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATTGTTTAATATTGGTTTCTTTATTTTTTTACTCA
64 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCA-AGTTCAATCTTGGTCTCTTTA-TTTTTTACTCA
*
1190411 CGG
127 TGG
* * * * * * * *
1190414 TTCAATCCTTGTCTCGTTATTCTCTAACTCATGGTTTAAACTTGATCTCCTTTGTTTGACTCGCA
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACTC-TAGTTTAATC-TCATCT-CTTTTTTTGACTCGCA
*
1190479 GTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCTTGGTCCCTTTTATTTTTTGACT
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*
1190544 CGTGG
125 CATGG
* * * * * * ** * ** *
1190549 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTTTAACTCACAATTCAATCCCAGTCTC--TTCCTAACTCATAA
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACTC-TAGTTTAATCTCA-TCTCTTTTTTTGACTCGCAG
* * * * * *
1190612 TTCAATCCCTATTTCATTATTCTCTGACAT-ATAGTTCAAACTTGGTTTTTTTATTTTCTAACTC
64 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAAC-TCA-AGTTCAATCTTGGTCTCTTTATTTT-TTACTC
*
1190676 GTGG
126 ATGG
* * *
1190680 TTCAATCCTTATCTCGTTATTCT
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCT
1190703 CTAACTCGCG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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133 7 0.02
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TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTTTGACTCTAGTTTAATCTCATCTCTTTTTTTGACTCGCAGTT
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1190139 TAACTTGCAA
* *
1190149 TTCAATTCCTGTCTCATTATTCTTTGACTTC-TAG
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* * ** *
1190183 TTTAATCTCAATCTCT-TTATT-TTTGACTCGTG
1 TTCAATCCCTGTCT-TATTATTCTTTGACTCATG
* * * *
1190215 ATTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTTACA-G
1 -TTCAATCCCTGTCTTATTATTCTTTGAC-T-CATG
* *
1190250 TTCAAT-CTTGATCTCT-TTATT-TTTTACTCATGG
1 TTCAATCCCTG-TCT-TATTATTCTTTGACTCAT-G
1190283 TTCAATCCCTGTCTTATTATTCTTTGACTCAATG
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1190317 TTCAATCC
1 TTCAATCC
1190325 TGGTCTTTTT
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 20, Indels: 30
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Matches are distributed among these distances:
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32 5 0.05
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Consensus pattern (33 bp):
TTCAATCCCTGTCTTATTATTCTTTGACTCATG
Found at i:1190320 original size:67 final size:67
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Indices: 1190149--1190579 Score: 347
Period size: 67 Copynumber: 6.5 Consensus size: 67
1190139 TAACTTGCAA
* * * * * ** * *
1190149 TTCAATTCCTGTCTCATTATTCTTTGACTTCTA-GTTTAATCTCAATCTCTTTATTTTTGACTCG
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAAC-TCAATGTTCAATCTTGATCTCTTTATTTTTTACTCA
* *
1190213 TGA
65 CGG
* *
1190216 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTTACA-GTTCAATCTTGATCTCTTTATTTTTTACTCA
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAACTCA-ATGTTCAATCTTGATCTCTTTATTTTTTACTCA
*
1190280 TGG
65 CGG
* * * * * * *
1190283 TTCAATCCCTGTCTTATTATTCTTTGACTCAATGTTCAATCCTG--GTC-TT-TTTCTAACTCAC
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCTTGATCTCTTTATTTTTTACTCAC
*
1190344 AG
66 GG
* * * * * * *
1190346 TTTAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATTGTTTAATATTGGTTTCTTTATTTTTTTACTCA
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCTTGATCTCTTTA-TTTTTTACTCA
1190411 CGG
65 CGG
* * * * * * * *
1190414 TTCAATCCTTGTCTCGTTATTCTCTAACTC-ATGGTTTAAACTTGATCTCCTT-TGTTTGACTCG
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAACTCAAT-GTTCAATCTTGATCTCTTTATTTTTTACTCA
*
1190477 CAG
65 CGG
* * *
1190480 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCTTGGTCCCTTTTATTTTTTGACTC
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCTTGATCTC-TTTATTTTTT-ACTC
**
1190545 GTGG
64 ACGG
* *
1190549 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTTTAACTCA
1 TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAACTCA
1190580 CAATTCAATC
Statistics
Matches: 289, Mismatches: 63, Indels: 22
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
63 45 0.16
64 2 0.01
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TTCAATCCCTGTCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCTTGATCTCTTTATTTTTTACTCAC
GG
Found at i:1190383 original size:34 final size:34
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Indices: 1190216--1190449 Score: 110
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1190206 TGACTCGTGA
* * * **
1190216 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTTACAG
1 TTCAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATGG
* * * * *
1190250 TTCAAT-CTTGATCTCTTTATT-TTTTACTCATGG
1 TTCAATCCCTG-TTTCATTATTCTCTAACTCATGG
* *
1190283 TTCAATCCCTGTCTT-ATTATTCTTTGACTCAAT-G
1 TTCAATCCCTGT-TTCATTATTCTCTAACTC-ATGG
* **
1190317 TTCAAT-CCTG-GTC-TT-TT-TCTAACTCACAG
1 TTCAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATGG
* *
1190346 TTTAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATTG
1 TTCAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATGG
* ** * * * * *
1190380 TTTAAT-ATTGGTTTCTTTATTTTTTTACTCACGG
1 TTCAATCCCT-GTTTCATTATTCTCTAACTCATGG
* * *
1190414 TTCAATCCTTGTCTCGTTATTCTCTAACTCATGG
1 TTCAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATGG
1190448 TT
1 TT
1190450 TAAACTTGAT
Statistics
Matches: 150, Mismatches: 36, Indels: 28
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
28 1 0.01
29 12 0.08
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35 4 0.03
ACGTcount: A:0.20, C:0.23, G:0.09, T:0.49
Consensus pattern (34 bp):
TTCAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATGG
Found at i:1190444 original size:131 final size:131
Alignment explanation
Indices: 1190216--1190709 Score: 451
Period size: 131 Copynumber: 3.7 Consensus size: 131
1190206 TGACTCGTGA
* * * *
1190216 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTTACAGTTCAATCTTGATCTCTTTA-TTTTTTACTCA
1 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCATAGTTCAATATTGGTCTCTTTATTTTTTTACTCA
* * * *
1190280 TGGTTCAATCCCTGTCTTATTATTCTTTGACTCAATGTTCAATCCTGGTCTTTTTCTAACTCACA
66 TGGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCCTGGTCTTTTTCTAACTCACA
1190345 G
131 G
* * * * * *
1190346 TTTAATCCCTGTTTCATTATTCTCTAACTCATTGTTTAATATTGGTTTCTTTATTTTTTTACTCA
1 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCATAGTTCAATATTGGTCTCTTTATTTTTTTACTCA
* * * * * * * * * *
1190411 CGGTTCAATCCTTGTCTCGTTATTCTCTAACTC-ATGGTTTAAACTTGATCTCCTTTGTTTGACT
66 TGGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAAT-GTTCAATCCTGGTCT--TTT-TCTAACT
*
1190475 CGCAG
127 CACAG
* * *
1190480 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCA-ATGTTCAATCTTGGTCCCTTTTATTTTTTGACT
1 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCATA-GTTCAATATTGGTCTC-TTTATTTTTTTACT
* * * ** * *
1190544 CGTGGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTTTAACTCACA-ATTCAATCCCAGTCTCTTCCTAACTC
64 CATGGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCA-ATGTTCAATCCTGGTCTTTTTCTAACTC
* *
1190608 ATAA
128 ACAG
* * * * * *
1190612 TTCAATCCCTATTTCATTATTCTCTGACAT-ATAGTTCAA-ACTTGGTTTTTTTATTTTCTAACT
1 TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAAC-TCATAGTTCAATA-TTGGTCTCTTTATTTTTTTACT
* * *
1190675 CGTGGTTCAATCCTTATCTCGTTATTCTCTAACTC
64 CATGGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTC
1190710 GCGATTCAAT
Statistics
Matches: 289, Mismatches: 63, Indels: 23
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
130 45 0.16
131 93 0.32
132 44 0.15
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135 50 0.17
137 1 0.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.24, G:0.08, T:0.46
Consensus pattern (131 bp):
TTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCATAGTTCAATATTGGTCTCTTTATTTTTTTACTCA
TGGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAATGTTCAATCCTGGTCTTTTTCTAACTCACA
G
Found at i:1190517 original size:34 final size:34
Alignment explanation
Indices: 1190478--1190709 Score: 106
Period size: 34 Copynumber: 6.9 Consensus size: 34
1190468 TTTGACTCGC
1190478 AGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCA-
1 AGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAT
* * * * * * * *
1190511 ATGTTCAAT-CTTGGTCCCTTTTATTTTTTGACTCGT
1 A-GTTCAATCCCT-ATCTC-ATTATTCTCTAACTCAT
* * *
1190547 GGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTTTAACTCAC
1 AGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAT
*
1190581 AATTCAATCCC-AGTCTC----TTC-CTAACTCAT
1 AGTTCAATCCCTA-TCTCATTATTCTCTAACTCAT
* * *
1190610 AATTCAATCCCTATTTCATTATTCTCTGACAT-AT
1 AGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAAC-TCAT
* * * * ** * *
1190644 AGTTCAA-ACTTGGTTTTTTTATTTTCTAACTCGT
1 AGTTCAATCCCT-ATCTCATTATTCTCTAACTCAT
* * *
1190678 GGTTCAATCCTTATCTCGTTATTCTCTAACTC
1 AGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTC
1190710 GCGATTCAAT
Statistics
Matches: 144, Mismatches: 39, Indels: 31
0.67 0.18 0.14
Matches are distributed among these distances:
29 21 0.15
30 4 0.03
33 10 0.07
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ACGTcount: A:0.23, C:0.25, G:0.07, T:0.44
Consensus pattern (34 bp):
AGTTCAATCCCTATCTCATTATTCTCTAACTCAT
Found at i:1190621 original size:266 final size:264
Alignment explanation
Indices: 1190216--1190709 Score: 681
Period size: 266 Copynumber: 1.9 Consensus size: 264
1190206 TGACTCGTGA
* *
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* * * * * *
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*
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*
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*
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* * *
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**
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** * * *
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* * *
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*
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*
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*
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*
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* *** *
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* * * * * *
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63 GT
* *
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* * **
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1 ATCTTTAAAACCTCCGGGCATA
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* *
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* ** * *
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* *
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Done.