Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167960.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_22, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
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Warning! 68000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 64 of 105
Found at i:11353626 original size:137 final size:137
Alignment explanation
Indices: 11353299--11353626 Score: 313
Period size: 137 Copynumber: 2.4 Consensus size: 137
11353289 GTTTAGTTTC
* * * * * * ***
11353299 AATCAATTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAG-TCATTTTCATTTTTTGACTGGCAATTT
1 AATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA-TCTAGATCATTGTCATTTTCTGACTGGTGGTTT
* ** * * * *
11353363 AATCCCTGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTAGTTTAATCTCGATCATTTTTCATTTTCTGACTCA
65 AA-ACCAATCA-TTT--TTTTTTGACTGGTAGTTTAATCTAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAA
* *
11353428 TTGTTTAATTCT
126 TGGTTTAATCCT
* ** *
11353440 AATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTAGGTTGTTTTCATTTTCTGACTGGTGGTTTA
1 AATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTAGATCATTGTCATTTTCTGACTGGTGGTTTA
*
11353505 AACCAATCATTTTTTTTCTGACTGGTGGTTTAATCTTAG-TCA-TTTTCATTTTCTAACTAATGG
66 AACCAATCATTTTTTTT-TGACTGGTAGTTTAATC-TAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGG
11353568 TTTAATCCT
129 TTTAATCCT
** * *
11353577 GGTTATTTTCATTTTTTGACTCATGTTTTAATCTCA-ATCATTGTCATTTT
1 AATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCT-AGATCATTGTCATTTT
11353627 TTGAGTCTTG
Statistics
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140 9 0.06
141 51 0.33
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Consensus pattern (137 bp):
AATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTAGATCATTGTCATTTTCTGACTGGTGGTTTA
AACCAATCATTTTTTTTTGACTGGTAGTTTAATCTAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGGTT
TAATCCT
Found at i:11353639 original size:137 final size:137
Alignment explanation
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11353370 GTCATTTTCA
* * * * * *
11353380 TTTTTTGACTTGTAGTTTAATCTCGATCATTTTTCATTTTCTGACTCATTGTTTAATTCTAATCA
1 TTTTTTGACTGGTAGTTTAATCTAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAATCCTAATCA
* ** * *
11353445 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTAGGTTGTTTTCATTTTCTGACTGGTGGTTTAAACCA
66 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTAGATCATTGTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAACCA
11353510 ATCATTT
131 ATCATTT
* **
11353517 TTTTTCTGACTGGTGGTTTAATCTTAG-TCA-TTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAATCCTGGT
1 TTTTT-TGACTGGTAGTTTAATC-TAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAATCCTAAT
* * * * * *
11353580 TATTTTCATTTTTTGACTCATGTTTTAATCTCA-ATCATTGTCATTTTTTGAGTCTTGGTTTAAT
64 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCT-AGATCATTGTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAA
* *
11353644 CCTATCGTTT
128 CCAATCATTT
* * * * * * ** * * * *
11353654 TTCATTTT--CT-G-ACTCATGAT-T-GATCA-TCTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAAACCCAG
1 TT--TTTTGACTGGTAGT-TTAATCTAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAATCCTAA
* * ** * * * ** *
11353712 TCGTATTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCA-ATCATTTTCATTTTTTGACTTATAGTTTAA
63 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCT-AGATCATTGTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
*
11353776 TCCCAATCATTT
127 -ACCAATCATTT
* * * * * ** ***
11353788 TCATTTTTGGACTCGTGGTTTAACTCTTG-T--TGTTTTCATTCTCTGACTCGTAACTTAATTCC
1 T--TTTTT-GACTGGTAGTTTAA-TCTAGATCAT-TTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAA-TCC
* * * * * * *
11353850 -AACCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-TATCGTTTTCATTTTCTGACTTGTGATT
60 TAATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTAGATCATTGTCATTTTCTGACTCGTGGTT
* *
11353913 TAATTCCAAACATTTT
124 TAA-ACCAATCA-TTT
* * * * * * * * ** *
11353929 CATTTTTTGACTTGTGGTTTAGTCTTGGTCATTTTTTATTTTTTGACCCATGATTTAATCCCT-A
1 --TTTTTTGACTGGTAGTTTAATCTAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAAT-CCTAA
* ** * * * * *
11353993 T-AGTTTTAATTTTTTGACTTGTGATTTAAT-TATGGTCATTTTGACTTTT-TGACTCATTGTTT
63 TCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTA-GATCATTGTCA-TTTTCTGACTCGTGGTTT
* * *
11354055 AATCTCGATCGTTT
125 AAAC-CAATCATTT
* * * * * ** *
11354069 ACATTTTTTGACTGGTGGTTTAATATAGGTCATTTTTCATTTCCTGACTTGTGGTTTAAT-CTCG
1 ---TTTTTTGACTGGTAGTTTAATCTAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAATCCT-A
* * *
11354133 ATTATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTCA-ATCATTTTCCATTTT
62 ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCT-AGATCATTGT-CATTTT
11354183 TTGAATCATG
Statistics
Matches: 508, Mismatches: 115, Indels: 82
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
132 1 0.00
133 80 0.16
134 14 0.03
135 4 0.01
136 3 0.01
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142 8 0.02
143 2 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.16, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (137 bp):
TTTTTTGACTGGTAGTTTAATCTAGATCATTTTTCATTTTCTAACTAATGGTTTAATCCTAATCA
TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTAGATCATTGTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAACCA
ATCATTT
Found at i:11353705 original size:98 final size:98
Alignment explanation
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Period size: 98 Copynumber: 1.9 Consensus size: 98
11353574 CCTGGTTATT
* * * *
11353584 TTCATTTTTTGACTCATGTTTTAATCTCAATCAT-TGTCATTTTTTGAGTCT-TGGTTTAATC-C
1 TTCATTTTTTGACTCATGATTTAAACCCAATCATAT-TCATTTTTTGACT-TGTGGTTTAATCTC
* *
11353646 TATCGTTTTTCATTTTCTGACTCATGATTGATCATC
64 AATC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTGATCATC
** * *
11353682 TTCATTTTTTGACTTGTGATTTAAACCCAGTCGTATTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCAA
1 TTCATTTTTTGACTCATGATTTAAACCCAATCATATTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCAA
*
11353747 TCATTTTCATTTTTTGACT
66 TCATTTTCATTTTCTGACT
11353766 TATAGTTTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
97 1 0.01
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Consensus pattern (98 bp):
TTCATTTTTTGACTCATGATTTAAACCCAATCATATTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCAA
TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTGATCATC
Found at i:11355797 original size:17 final size:17
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Indices: 11355744--11355799 Score: 53
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11355734 TGGTTTAATC
*
11355744 TTGATCGTTTTCATTTT
1 TTGATTGTTTTCATTTT
*
11355761 TTGACTTGTGATTT-A-ATT
1 TTGA-TTGT--TTTCATTTT
11355779 TTGATTGTTTTCATTTT
1 TTGATTGTTTTCATTTT
11355796 TTGA
1 TTGA
11355800 CTAGTGGTTT
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 3, Indels: 10
0.70 0.07 0.23
Matches are distributed among these distances:
15 3 0.10
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20 3 0.10
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Consensus pattern (17 bp):
TTGATTGTTTTCATTTT
Found at i:11357450 original size:35 final size:36
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Indices: 11357411--11357791 Score: 202
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11357401 TTTAATCGAG
11357411 GTCATTTTCATTTTCTTACTCATTG-TTTAATCCTA
1 GTCATTTTCATTTTCTTACTCATTGATTTAATCCTA
*
11357446 GTCATTTTCATTTT-TTGACT-ACT-AGTTTAATCCT-
1 GTCATTTTCATTTTCTT-ACTCATTGA-TTTAATCCTA
*
11357480 GATCATTTTTCATTTT-TTGACT--TGTGATTTAAACCT-
1 G-TCA-TTTTCATTTTCTT-ACTCAT-TGATTTAATCCTA
* * * *
11357516 GATCATTTTTA-TTTCTTGACTCA-TGCTTTAAACCTG
1 G-TCATTTTCATTTTCTT-ACTCATTGATTTAATCCTA
* * * *
11357552 GTCATATTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAATCTTTA
1 GTCATTTTCATTTTCTTACTCATTGATTTAATC-CTA
* * **
11357588 -TCATTTTCATTTTCTGAC-C-TTGAATTAATTTTA
1 GTCATTTTCATTTTCTTACTCATTGATTTAATCCTA
* * * * *
11357621 ATCATTTTGATATTT-TGACCCA-TGGTTTAATCCTA
1 GTCATTTTCAT-TTTCTTACTCATTGATTTAATCCTA
* ** *
11357656 ATTGTTTTCATTTT-TTGAC-C-TATGGTTTAATTCCTA
1 GTCATTTTCATTTTCTT-ACTCAT-TGATTTAA-TCCTA
* *
11357692 -TCATTTTC-TTTTTTTGACTCA-TGATTTAATTCTA
1 GTCATTTTCATTTTCTT-ACTCATTGATTTAATCCTA
*
11357726 GTCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTCA
1 GTCATTTTCATTTTCTTACTCATTGATTTAATCCT-A
*
11357762 -TCCTTTTCATTTTCTTACTCA-TGATTTAAT
1 GTCATTTTCATTTTCTTACTCATTGATTTAAT
11357792 TTCAATCGTT
Statistics
Matches: 284, Mismatches: 34, Indels: 56
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Matches are distributed among these distances:
33 3 0.01
34 42 0.15
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GTCATTTTCATTTTCTTACTCATTGATTTAATCCTA
Found at i:11357454 original size:87 final size:87
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Indices: 11357308--11357483 Score: 289
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11357298 ATTTTTTGAT
* *
11357308 TCGTGGTTTAATCCAAGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTT
1 TCGTGGTTTAATCCAAGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTT
*
11357373 TTGACTATTAGTTTAATCATGA
66 TTGACTACTAGTTTAATCATGA
* * *
11357395 TCGTGGTTTAATCGAGGTCATTTTCATTTTCTTACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTT
1 TCGTGGTTTAATCCAAGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTT
*
11357460 TTGACTACTAGTTTAATCCTGA
66 TTGACTACTAGTTTAATCATGA
11357482 TC
1 TC
11357484 ATTTTTCATT
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 7, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
87 82 1.00
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TCGTGGTTTAATCCAAGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTT
TTGACTACTAGTTTAATCATGA
Found at i:11357486 original size:70 final size:69
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Indices: 11357412--11358419 Score: 474
Period size: 70 Copynumber: 14.4 Consensus size: 69
11357402 TTAATCGAGG
11357412 TCATTTTCATTTTCTT-ACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTACTAGTTTAA
1 TCATTTTCATTTT-TTGACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACT-CTAGTTTAA
11357476 TCCTGA
64 TCCTGA
* * *
11357482 TCATTTTTCATTTTTTGACT--TGTGATTTAAACCT-GATCATTTTTATTTCTTGACTC-ATGCT
1 TCA-TTTTCATTTTTTGACTCAT-TG-TTTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCTA-G-T
* *
11357543 TTAAACCTGG
60 TTAATCCTGA
* * * * * * *
11357553 TCATATTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTTTA-TCATTTTCATTTTCTGAC-CTTGAATTAA
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATC-CTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCTAG-TTTAA
** *
11357616 TTTTAA
64 TCCTGA
* * * * * **
11357622 TCATTTTGATATTTTGACCCATGGTTTAATCCTAATTGTTTTCATTTTTTGAC-CTATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCTA--GTTTAA
11357686 TTCCT-A
64 -TCCTGA
* * *
11357692 TCATTTTCTTTTTTTGACTCA-TGATTTAATTCTAGTCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTG-TTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCTA-G-TTTA
*
11357755 ATCCTCA
63 ATCCTGA
* * * * * *
11357762 TCCTTTTCATTTTCTT-ACTCA-TGATTTAAT-TTCAATCGTTTTCATTTTTTGACGCGTGGTTT
1 TCATTTTCATTTT-TTGACTCATTG-TTTAATCCT-AGTCATTTTCATTTTTTGACTC-TAGTTT
*
11357824 AAT-CTCGG
62 AATCCT-GA
* * * *
11357832 TCGTTTTCATTTTTTGAC-C-TGTGATTTAATCCTTGTCATTTTTATTTTTTGACT-TACAATTT
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCAT-TG-TTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCT--AGTTT
** *
11357894 AATTTTGG
62 AATCCTGA
* ** * * ** * * ** *
11357902 TCGTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTAATCCTGGTTGTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTGCCAT
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACT-CTAGT-TTAA
11357967 TCC-GA
64 TCCTGA
* * * * * *
11357972 TCTTTTTCACTTTTTGACTC-GTGTTTAGTCCT-GATCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTC-TAGTTTAA
11358035 TCCTGA
64 TCCTGA
* * * * * * * * * *
11358041 TCGTTTTTTATTTTTTAAATCATGGTTTAATCCCAGTTATTTTCATTTTCTGACTTGTAATTTAA
1 TC-ATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGAC-TCTAGTTTAA
**
11358106 TTTTGA
64 TCCTGA
* * * * *
11358112 TCATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATTCTAATCATTTTTCACTTTTTGACTC-ATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCTAGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCTA-G-TTTA
*
11358176 ATTCT-A
63 ATCCTGA
* * * * * * *
11358182 GTAATTTTTATTTTTTGACTCATTGTTTAAT-TTCAATCATTTTCATTTTTTCACTAATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCT-AGTCATTTTCATTTTTTGACT-CTAGTTTA
*
11358246 ATCCTGG
63 ATCCTGA
* * * * * * * *
11358253 TCGTTTTTCATTTTTTAACTTA-AGTTTAATCCCAGTCATTTTCATTGTCTG-CTTTTAGTTTAA
1 TC-ATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGAC-TCTAGTTTAA
11358316 T-CTCGA
64 TCCT-GA
* * * * * * *
11358322 TCGTTTTTATTTTTTGAGTCA-TGATTTAAT-CTTGATAATTTTCATTTTCTGACTC-ATGAATT
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTG-TTTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCTA-G-TTT
* ** *
11358384 ATTTTTGG
62 AATCCTGA
*
11358392 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTA
11358420 TGTTTGCTTA
Statistics
Matches: 710, Mismatches: 165, Indels: 126
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
68 28 0.04
69 134 0.19
70 374 0.53
71 169 0.24
72 5 0.01
ACGTcount: A:0.20, C:0.15, G:0.11, T:0.53
Consensus pattern (69 bp):
TCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCTAGTTTAATC
CTGA
Found at i:11357583 original size:193 final size:193
Alignment explanation
Indices: 11357222--11357571 Score: 442
Period size: 193 Copynumber: 1.8 Consensus size: 193
11357212 GTCCCAGTTG
* * **
11357222 TTTTCATTTTCTAACTTATGGTTTAATCTTAGTCATTTTTCTTTTTCTGACTGGTAGTTTAATAC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTTCTTTTTCTGACTACTAGTTTAATAC
* * *
11357287 TAGTAGTTGTCATTTTTTGATTCGTGGTTTAATCCAAGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTT
66 TAGTAGTTGTCATTTTTTGATTCGTGATTTAAACCAAGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGCTTT
* * * *
11357352 AATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTATTAGTTTAATCATGATCGTGGTTTAATCGAGGTCA
131 AAACCTGGTCATATTCATTTTCTGACTATTAGTTTAATCATGATCGTGGTTTAATCGAGGTCA
* * *
11357415 TTTTCATTTTCTTACTCATTGTTTAATCCTAGTCA-TTTTCATTTTT-TGACTACTAGTTTAATC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTTC-TTTTTCTGACTACTAGTTTAATA
* * * *
11357478 CT-GATCATTTTTCATTTTTTGACTT-GTGATTTAAACC-TGATCATTTTTA-TTTCTTGACTCA
65 CTAG-T-AGTTGTCATTTTTTGA-TTCGTGATTTAAACCAAG-TCATTTTCATTTTCTT-ACTCA
11357539 TGCTTTAAACCTGGTCATATTCATTTTCTGACT
125 TGCTTTAAACCTGGTCATATTCATTTTCTGACT
11357572 CATGGTTTAA
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 18, Indels: 12
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
191 1 0.01
192 29 0.22
193 101 0.76
194 2 0.02
ACGTcount: A:0.21, C:0.15, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (193 bp):
TTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTTCTTTTTCTGACTACTAGTTTAATAC
TAGTAGTTGTCATTTTTTGATTCGTGATTTAAACCAAGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGCTTT
AAACCTGGTCATATTCATTTTCTGACTATTAGTTTAATCATGATCGTGGTTTAATCGAGGTCA
Found at i:11357804 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 11357553--11358419 Score: 216
Period size: 35 Copynumber: 24.8 Consensus size: 35
11357543 TTAAACCTGG
* * *
11357553 TCATATTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTT-TA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-TTCAA
* * *
11357588 TCATTTTCATTTTCTGAC-CTTGAATTAATTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTCAA
* * * *
11357622 TCATTTTGATATTT-TGACCCATGGTTTAA-TCCTAA
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAATTTC-AA
** * * * *
11357657 TTGTTTTCATTTTTTGAC-CTATGGTTTAATTCCTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATTTCAA
* * *
11357692 TCATTTTCTTTTTTTGACTCATGATTTAA-TTCTAG
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTC-AA
*
11357727 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTC-A
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-TTCAA
* *
11357762 TCCTTTTCATTTTCTTACTCATGATTTAATTTCAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTCAA
* * * * * * **
11357797 TCGTTTTCATTTTTTGACGCGTGGTTTAATCTCGG
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTCAA
* * * *
11357832 TCGTTTTCATTTTTTGAC-CTGTGATTTAATCCTT--G
1 TCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAAT--TTCAA
* * * ** ***
11357867 TCATTTTTATTTTTTGACTTACAATTTAATTTTGG
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTCAA
* * ** * * **
11357902 TCGTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTAA-TCCTGG
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** * ** * *** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** *
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* ** * **
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* * *
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*
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* * *
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* * * * * **
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1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTC-AA
* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ***
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* *
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TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTCAA
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* * **
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* ** ** *
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* *** * * * **
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* * *** *** * * *
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** ** * *
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* * *
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* * *
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*
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* *
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* * * *
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GTCA
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* * * ** * **
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*** * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * **
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*
11366631 ATCTTGGTCATTTTCATTTTCCGACTCATGGTTTAATCCCAA
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TCTTGGTCATTTTCATTTTCCAACTCATGGTTTAATCCCAA
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* * *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* ** * ** *
11366435 TTATT-ATTTTTTGACTTATAATTTAATTTTGGTCT
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* * * * * * *
11366470 TTTTTATTTTCTAACTCGTGGTTTAATCCCAATCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* * * * *
11366505 TTTTTATTTTCTGGCT-AGTGATTTAATC-C--TGG
1 TTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCTCAGTCG
** * * * * *
11366537 TCTTT--TTTTTTGACTCGCGATTTAATTTTAATCA
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*
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* * ** ** *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
** * * *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* * *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAG-TCG
* ** * *
11366711 TTTTAATTTTTTGACTTGTGGTTTAAT-TCGGGTCAT
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* * * * *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCTCAG-TCG
* * * * * *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAG-TCG
* * ** * * * *
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* *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* *** ** * * *
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* ** * *
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* * * * *
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* *
11366991 TTTTCATATTTTGATTCATGGTTTAATCTCAGTCG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* ** *
11367026 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTTGGGTCAT
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* * * * * *
11367062 TTTTCTTTTTTTGACTAATTGTTTCATCCCAATCG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* * *
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* ** * *
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* * * * *
11367167 TTTTCA-TTTCTAACTCATGGTTTTGATC-CCGATCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGG-TTTAATCTCAG-TCG
* * * ** *
11367202 TTTTAATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTTTGTTG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCAGTCG
* *
11367237 TTTTTC-TTTTTCTGACTGATGGTTTAATCTC-GATCA
1 -TTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCTCAG-TCG
* * *
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* ** *
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* * * * ** * * *
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* ** *
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* * ** *
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* * * ** * *
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* * *** * * *
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* * *
11367540 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-CTAATCAT
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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** * ** *
11367681 TTTTTTTTTTTCTGATTGGTGGTTTAATC-CTGATCG
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* * ** * * *
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * * * ** *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* ** * *
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* **** * * *
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** * * * *
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* ** *
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* *
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* *
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** * * * *
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**** * * * * * * * * *
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* * * *
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TCATGATTTAATCTCAGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTTCTTTT
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* ** * * * * * **
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* * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* ** * ** * * ** * **
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* * *
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*** * * * * * *
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* * * * * * *
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1 TTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATTTTGATCATTTTCA-TTTTTGACTCATGATTTAATCC
* * * * ** ** * *
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* * * * * * * * *
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* ** * *
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* ** * * *
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* * * ** ** * * **
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*** ** * * **
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* * * * * * *
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** ** * ** ***
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* ** ** * ** * * *
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1 -TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTTGATCATTTTCA-TTTTTGACTCATGATTTAATCC
* * * * * * *
11369154 GAGTCGTTTTCATTTTCTAACT-AGTGGTTTAATCT-TGATCG
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* * ** * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * **
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** * * * ** * **
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* * * ** * * ** *
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* * * * * *
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* * ** * **
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * ** * * *
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* *
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*** * * * **
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* * * * ** * * *
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* * * **
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** * * * *
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** * * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* ** *** * *
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* * ** * *
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*** * * * *
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*** * * ** * * *
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* ** * *
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* *** * * * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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** ** * * * ** *
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* * * ** * * * *
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** * ** * *
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* * ** * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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** * * **
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* * * * * ***
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** * * *
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* * * * *
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**** * * * * *
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* * *
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* * * * ** *
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** * *
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* * * * ** **
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* * *** ** *
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* * * * *
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* * **
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* *
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*
11368101 ATTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAGTCATTTTCATTTTTTGACCCATG
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* * *
11368158 ATTTAATCCCTATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTTCGGTTGTTTTTAATTTTTTG-
1 ATTTAATCCCAATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTTCGGTCG-TTTTCATTTTTTGA
* * * ** ** ** * ** *
11368222 CTTATGGTTTAATCCCAATCATTTTCTTTTTCCGACTGGTGGTTTAATCTTGATTGTTTTTCAGT
65 CTTATGGTTTAATCTCAATCGTTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAATCTTGAGTCATTTTCATT
* * * * * * **
11368287 TTTTGACTCGCAATTTAATCCCTGTCATTTTTATTTTTTGAGTCTTGGTTTAATTCGGGTCATTT
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* * * ** * * * *
11368352 T-ATTTTTTGACTTGTGATTAAATTCCGATCATTTTCTTTTTCTTACTTGTGGTTTAA-TCTTGA
194 TCATTCTCTGAC-T-TGATTTAATTTAGGTCATTTTCATTTTCTAACTT-AGGTTTAATTC-TGA
* ** * * *
11368415 TCGTTATTC-TTATTTTGACTCATGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTG
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* *
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66 CTAGA
* * * * * * * * *
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* * ** *
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** * * *
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*
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* *
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* * **
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* * *
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* * * * * *
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* *
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* * * ** * * * ** *
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** ** *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * **
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** *** * *
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** * * * ** * * *
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* *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * ** *
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** * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * * *
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** * *
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* * * * * * * * ** *
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**** * * * * *
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* * ** * * * * * *
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** * * * * * * * **
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* * * * ** * ** *
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* * ** * * * *
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* * * ** *
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** * ** * * ** *
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* * * ** * * * * * *
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** * * * *
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* *
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* * * **
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*
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* * * * *
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* *
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* * ** * * * **
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** *
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* * * * * *
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*
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AATTTTTTGACTTACGGTTTAATCTCAATCATTTTTCATTTTTTTTATTCACTG
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* * * * * * * * ***
11370090 ATCGTTTTCATTTTTATTTTTTGACTTACGGTTTAATCTCAATCATTTTTCATTT--T-TTTTAT
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* * * * * * ** *
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* * ** **
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1 T
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* * * * *
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63 CTCT-TGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
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*** ** * * * *
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** * * **** * *
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* ** * * * * *** *
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11382328 TCGTGATTTAAT-TTCGGTTGTTTTCATTTTCTGACTTATAAT
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* * * *** *
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* *** ** * * *
11382535 ACTCGTGGTTTAATCCCGGTTGTTTTCATTTTCTAAC-CTGTGAT
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* * ** * * * *
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* * * * *
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** * * * ** * *
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* * * * * * *
11382748 ATGCTTTAATTCTTA-TCATTTTCATTCTTTAACCCATGAT
66 TTGGTTTAA-TCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** ** * * * *
11382788 TTAATTCC-AGTTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTAAATCCCT-GTC-GTTTCATTTTTTGAC
1 TTAA-TCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * * *
11382850 TCATGATTTAAT-TCTAGTGATTTTCATTTTTTGATTCATGGT
64 TCTTGGTTTAATCT-TAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * *
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1 TTAATCCT-TGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAA-T-C--TTGGTCATTTTCATTT-T
* * * * * ** *
11382951 TTGACTCGTGATTTAAT-TCCAATCATTTTTCATTTTTTGAGTTTTAGT
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* * * * ** * *
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1 TTAATCCTTGTC-ATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * *
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64 TCT-TGGTTTAATCTTAGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
** * *
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1 TTAAT-CCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * ***
11383162 -TGTGATTTAATC-TAGGTCATTTTCATTTTCTAACTTGCAAT
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* ** * ** * * * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC
* ** * * * *
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66 T-TGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
** * * * * *
11383308 TTAATCCTTGTTGTTTTTC-TTTTTCTAACTCAAGGTTTAATCCAT-GTGATTTTTATTTTTTGA
1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTTTGA
** * * * *
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63 CTCTTGGTTTAATCTT-AGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
** * * * * *
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1 TTAATC-C--TTGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTG
* * * * * * *
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62 ACTCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGT
** * ** * *
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1 TTAATCCTT-G-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * ** * * *
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64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * ** * * * *
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1 TT-AATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT-GGTCATTTTCATTTTTTGA
* * ** ** * * * * *
11383687 CGCATGGCGTAATCCCATTCATTTTCATTTTCTAACTCATAGT
63 CTCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** * * *** *
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1 TTAAT-CCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * * * * *
11383792 -C---ATTTAATCCCTA-TCGTTTTC-TATTTCTGAATTGTGAT
64 TCTTGGTTTAAT-CTTAGTCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGT
* * * *
11383830 TTAAT--TTCGATCATTTTTATTTTTTGACTTATGGTTTAAT-TTCGATCATTTTCATTTTTTAA
1 TTAATCCTT-G-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT-GGTCATTTTCATTTTTTGA
** * * * * *
11383892 C-CTATAATTTAATC-TCGATCATTTT--TTCTCTAACTCGTGAT
63 CTCT-TGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * * *
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64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * ** * ** * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT--GGTCATTTTCATTTTTTGA
* * * * * * *
11384098 CCCGTGATTTAATCCTCGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTGAT
63 CTCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** * * * * *
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1 TTAA-TCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCTTGGTC-ATTTTCATTTTTTGA
* * * * ** *
11384204 CTCGTGGTTTAAT-TCCAATCATTTTC-TTTTCTCTAACTTATGAT
63 CTCTTGGTTTAATCT-TAGTCATTTTCATTTT-T-TGACTCGTGGT
* * * ** *
11384248 TTAAT-TTTGGTCATTTTCATTTTCTGACTCGA-GGTTTAATCTCGGTTGTTTTTTATTTTTTGA
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* * *
11384311 -TTTGTGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTAAGTCGTGGT
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** * ** * *
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* * ** * * ** * *
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* * ** * * ** * *
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1 TTAATCCTTGTCAT--T-TTC------ATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTC-ATTTTCAT
* * * * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCAT-TTTTTGACT
* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * *
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* ** * * ** * *
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* ** * * * * **
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* * * * *
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1 TTAATCCTT-G-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTTTGA
* * * * *
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* * * * ** * * *
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1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * ** * * * * * * *
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* * **** ** **
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* * ** ** * * * *
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* * * * * ** *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC
* ** * * * * * *
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* * * * ** * * * *** *
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* * * * * * * **
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* ****
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* * * * *
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* * * * * *
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1 TTAATCCTT-GTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGA
* * * * * * *
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63 CTCTTGGTTTAATCTT-AGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** ** * * *
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* * * ** * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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1 TTAATCCTT-G-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCA-TTTTCATTTTTTGA
* * * * * * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * **
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* ** * * * * **
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** * * * * * * * *
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** * *
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* * * *
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** * * *
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* ** * * **
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* * **
11386720 T-TGTGGTTTTATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGAC
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* ** * * * **** * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * ** ** *
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* ** ** * * * ** * *
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* * * * *
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*** ** * * * ** * * **
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* * * * * *
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* * ** * * *** * * *
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1 TTAATCCTT-GT-CATTTTCATT-TTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGA
* * * ** * ** *
11387139 CTCGTGATTTAAT-TTCGGTTGTTTTCATTTTTTTACTTATGAT
63 CTCTTGGTTTAATCTT-AGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * *** *** *
11387182 TTAAT--TACGATCATTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAGTTGGTTTCATATTTTGAC
1 TTAATCCT-TG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * * * ****
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* * * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-G-TTTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTTTGA
* * ** * * *
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* * * * *** *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTC-ATTTTT-TGAC
* ** * * * * *
11387455 TCATAATTTAATTTTGGTCATTTTGATTTTCTGACTTGTGGT
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* * * **
11387497 TTAATCCTGGTCATTTTTTATTTTTTGATTCATGGTTTAATCTCAGTCATTTTCATTTTTTGACA
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* * ** * *
11387562 T-GTGATTTAATC-CCGATCATTTTCCATTTTTTGACTCATGAT
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* * * * * * * * * * *
11387604 TTAATCCCTT-TCATTTTCATTTTCTCACTCATGATTTAAACTCGATCATATTAATTTTCTAAAT
1 TTAAT-CCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * *
11387668 CTTGGTTTAAT-TTAGATTATTTTCATTTTCTAACTCGTGAT
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* * * * * * * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * *
11387773 CATGGTTTAATTCTT-GTCATTTTCATTCTCTGACTCGTGAT
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* * * * * * * * * *
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* * * *
11387877 TCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATAGT
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* * * ** *** * *
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1 TTAA-TCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * * ** *
11387983 -TATGATTTAATCCTT-CTCATTTTTATTTTATAATTTATGAT
65 CT-TGGTTTAAT-CTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
** * * * **
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* * * * * * ** *
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** ** ** * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT-AAT-C--TTGGTCATTTTCATTTTTTG
* * * * * *
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*** * * * * * * **
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT--CTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * **
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*** ** * * * * * **
11388438 TTAAT-C-TCAAACTTTT--TTTCCATAACTCGTGATTTAATTTTAGTTGTTTTCATTTTTTGAC
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* * * *
11388499 T-TATGATTTAA--TTACGGTCATTTTAATTTTTTTACTCATGGT
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* *** * * * * * * * *
11388541 ATAATCCCAATCGTTTTTATTTTTTGGCTCATGGTTAAATTTTCGTCA-TTTCATTCTCT-AGCT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGA-CT
* * * * * * * **
11388604 -TATGCTTTAAT-TCCAATCATTTTCATTATCTGACCCATAAT
65 CT-TGGTTTAATCT-TAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * **
11388645 TTAATCCTTATCATTTTCTTTTTTTAACTCGTGATTTAAT-TCTAGTGGTTTTCATTTTTTGACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * *
11388709 CGT-GTATTTATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
65 CTTGGT-TTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * *
11388750 TTAATTCTGGTCATTTTCATATTTTGACTCA---TTTAATCCTGATCTTTTTTCTTTTTTTGACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * * *
11388812 CATGATTTAATCCCTT--TCGTTTTAATTTTCTCACTCGTGAT
65 CTTGGTTTAAT--CTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * * * * * * *
11388853 TTAA-ACTTGATCGTATTAATTTTTTGAATCTTGATTTAAT-TTAGATTAGTTTCAATTTCTGAC
1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT-GGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * *
11388916 TCGTT-ATTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGT
64 TC-TTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * ** * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * *
11389022 CATGGATTAATCCCT-GTCATTTTCATTATCTGACTCATGGT
65 CTTGGTTTAAT-CTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * *
11389118 -TATGGATTAATCCTT-GTCGTTTTCATTATCTGACTCATGGT
65 CT-TGGTTTAAT-CTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * * * *
11389159 TTAATTCTTGTCGTTTT-ATTTCTCTGACTCGTGATTCAATCTTTGTCATTTTTATTTTTTGATT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * *
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65 CTTGGTTTAAT-CTTAGTCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGT
* * * * * *
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1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGG-TTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * *
11389327 TCATGGTTTAATCTTGATTC-TTTTCATTTTCTT-ACTCATGAT
64 TCTTGGTTTAATCTT-AGTCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGT
* ** * *
11389369 TTAATCCTGGTTGTTTTCATTTTTTAACTCATGGTTTAATCCTGGT-AGTTTTCATTTTTTGACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACT
* ** * * * **
11389433 CATATTTTAATTCCT-GTCATTTTCATTCTTTGGCTCGTGAA
65 CTTGGTTTAA-TCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * ** ** * *
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64 TCTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * **
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCTTG-GTCATTTTCATTTTTTGAC
** * * ** * ** * *
11389642 TAATGATTTAATCTTGGTTGTTTTCATATCCTGACTCATGAT
64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** * * ** * *** * *
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1 TT-AATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * ** * * **
11389748 CATGGTATAATCCTACTTGTTTTTATTTTTTAACT-GATAAT
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** * * **** * ***
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1 TTAAT-CCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * * * *
11389851 T-TGTGATTTAATCCCTA-TCATTTT-TTGTTTTTGAATTGTGAT
64 TCT-TGGTTTAAT-CTTAGTCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGT
* * ** *
11389893 TTAAT-TTTGATAATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTTTGAC-
1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
** * * * * *
11389956 CTGTAATTTAATCTCAATCATTTT--TTTCTCTAACTCGTGAT
65 CT-TGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGT
* ** * * * * * * * *
11389997 TTAAT-TTTGGTTGTTTTTAATTTTTCACTTATGATTTTAT-TACGGTCATTTTTA-TTTTTGAC
1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* ** ** *
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64 TCT-TGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * * * *
11390101 TTAAT--TT-TCATCGTTTCATTCTCTGGCTTATGCTTTAAT-TCTAGTCGTGTTCATTTTCTGA
1 TTAATCCTTGTCAT--TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGA
* * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCAT-TTTCATTTTTTGAC
* * * *
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* * * ** ** * *
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1 TTAATCCTTG-TCATTT-TCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
** * * * * * * * * *
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** * * * * *
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1 TTAATCCTT-G-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * ** * * *
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64 TCTTGGTTTAATCTTAGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * ** * *
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1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * **
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* * * * ** * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTTGGTCATTTTCAT-TTTTTGAC
* ** * *
11390701 T-TGTGATTTAATC-CCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGAT
64 TCT-TGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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1 TTAATCCT-TGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT--C--TTGGTCATTTTCATTTTTT
** * * *
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* * ** * *
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1 TTAATC-CTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCA-TTTTCATTTTTTGA
* * * * * *
11391122 CTCGTGATTTAAATC-TGGTCATTTTCATTTCTTGACTCATGAT
63 CTCTTGGTTT-AATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * ** ** *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC
* ** * * *
11391230 ATAATTTAAT-TTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATAGT
66 TTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * ** **
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1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT-GGTCATTTTCATTT-T-TTG
* ** * * * *
11391332 -CTCGTGACTTAAT-TTTGATCGTTTTCATTTTTTTGACTCATGAT
62 ACTCTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCA-TTTTTTGACTCGTGGT
** ** * * * * ** ** ** *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGAC-
* * * * * * **
11391439 T-GTGATTTAATTCTGA-TCGTTTTCATTTTTTGACCCATAAT
64 TCTTGGTTTAA-TCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * * ** *
11391543 CGGTGGTTTAATCCTAATCTTTTTTTATTTTCTGACTCACGAT
65 C-TTGGTTTAATCTTAGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * ** **
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* * *
11391649 -TCTAGTTTAATCCT-GATCGTTTTC-TTTTTCTGACTCGTGGT
65 CT-TGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGT
* * * * ** *
11391690 TTAAT-CTTGGTCGTTATTC-TTTTTCTAACTTATGGTTTAATCCTGGTTGTTTTAATTTTTTGA
1 TTAATCCTT-GTCATT-TTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGA
* * * * * * * *
11391753 ATCATGGTTTAATC-TCGATCATTTTTTATTTTCTAACTCATGAT
63 CTCTTGGTTTAATCTTAG-TCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * ** * * *
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1 TTAATCCT-TGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATT-TTCATTTTTTGAC
* * * ** * *
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* * * * *** **
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* * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * ** * * ** *
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64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
** * ** * * * **
11392112 TTAATCCCAGTCATTATC-TTTTCTCCAACTCATGATTTAATTTTGCTTGTTTTCATTTTCTT-A
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTT-T-TGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTT-TTGA
* * * * *
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63 CTCTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * *
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1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * ** * * * *
11392277 TCGTGGTTTAATCCTGGTTGTATTT-GTTTTCTGAGTCATGGT
64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCAT-TTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* **** * * * * *** *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * ** ** *
11392383 C--GTTTTCAT-TT--TC-TAACTCATGGTTT-AATC-TGGGCCATT
65 CTTGGTTTAATCTTAGTCAT-TTTCATTTTTTGACTCGT-GG----T
* * * * * * * ** * * * **
11392422 TTCATTCTTTGACTCGTGGTTT-A-ATCTT-AGTCAT--TTTCAT-TTCCTGA--CTCGTGGTTT
1 TT-AATCCTTG--TCAT--TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTT
* ** * * ** * * * **
11392479 -AATCTTGGTCCTTTTTATT-TTC-TGACTCGTGTTTT-AATC-CCG-
61 GACTCTTGGT--TTAATCTTAGTCAT-TTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * **
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC
* * ** * * * * *
11392583 ATAGTTTAATC-CCGATTATTTTTCACTGTTTGACTCATTGT
66 TTGGTTTAATCTTAG-TCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** * ** * ** * *
11392624 TTAAT-CTTGATCATTTTCAATTGCTAACTTGTGGTTTAACCTAT-GTGGTTTTTATTTTCTGAC
1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* *
11392687 T-TGTGGCTTAATCTCT-GTCATTTTCATTTTCTT-ACTCATGGT
64 TCT-TGGTTTAATCT-TAGTCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGT
* * * **
11392729 TTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTCTGACTCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTACTGACT
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* * * * * *
11392793 CGTGATTTAATCCTT-GTCATTTTTATTTTCTGACTCATGAT
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* * * * * * *
11392834 TTAAT-TTTAATCGTTTTCATTTTCTGAGTCATGGTTTAATTCTAT--TCGTTTTGATTTTCTT-
1 TTAATCCTT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCT-TGGTCATTTTCATTTT-TTG
* ** * * *
11392895 ACTCATGGTTTAATCCCAGTCATTTTTATTTTCTGACACGTGGT
62 ACTCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * *
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* * * * * * **
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* *** * * * ** *
11393045 TTAGTCCAAATCGTTTTTC-TTTTTTGGACT-AGTGGTTTAATCCTGATTGTTTTCATTTTCT-A
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* * *** * * * * *
11393107 AT-TGTGGTCTAAT-TTAGGTTGCTTTCAATTTCTGAGTCATCGT
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** ** * * *
11393150 TTAATCCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTCCCGATTTAATCTTGGTCATTTTTCATTTTCTAACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACT
* * * * *
11393215 -TGTGATTTAAT-TTTGATCATTTTTAATTTTTGACTCATGGT
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** ** * * *
11393256 TTAATCCCAGTTGTTTTCA-TTTATGTCTCA--G-------TT-G---TTTTCA-TTTTTGTCTC
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC
* ** * * *** ***
11393306 ATGGTTTAATTCTTA-TTGTTTTCTTTCTCCAACTCGTAAC
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****** * * * *
11393346 TTAATTTAAAACATTTTCATTTTTTGACTCACGATTTAATCCAT-GTCATTTTCATTTTTTGAGT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * *
11393410 TTTGGTTT-AT-TTCGGTCATTTT--TTTTTT-ACTCATGGT
65 CTTGGTTTAATCTT-AGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * *** *
11393447 TTAATCTCAATGT--TATTCTTTTTTTGACT--TGCAGTTTAATCTCAATCATTTTCATTTTTAG
1 TTAATC-C-TTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG--GTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTG
** * * *
11393508 ACTAATAGTTTAATC----TCATTTTCCTTTTTTGACTCGTGAT
62 ACTCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
** * * * * * *
11393548 TTAATCCTAATTATTTTCATTTCTTGACTCGTGATTTAAACTTGGTC-TTATTCATTTTTTTACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATT-TTCATTTTTTGACT
* * ** * * * *
11393612 CGT-GTTTGAATTTTAGTTGTTTTTATTTTCTGACTTGTTGT
65 CTTGGTTT-AATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * * *
11393653 TTAATCATGGTCTTTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATCTTGATTATTTTTCATTTTTTGACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACT
* * * *
11393718 CATGATTTAAT-TTTGCTCATTTTTAGTTTTTTGACTCGTGGT
65 CTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCA-TTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * * * * **
11393760 TTAATTCTCGTCGTTTTCATTCTCTAACTCTTGATTTAAT-TTCAGTTGTTTTCATTTTTTGACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT-GGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * *
11393824 CATGGTTTAATCTTGGTCTTTTTCATTTTTTGACTCATGAT
65 CTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * **** *
11393865 TTAAT-TTTGATCATTTTTTATTTTTTAATTCGTGGTTTAATCCCAATCA--TT--TTTTCTGAC
1 TTAATCCTTG-TCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
* * ** * * * * *
11393925 TCGTGCTTTAATCCCAATCATATTCATTTTTTAACTCATGAT
64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * ** * * *
11393967 TTAAT-CTCGATCTTTTTCATGTTCTAACTTGTGGTTTAGT-TTGAATCATTTTCATTTTCTGAC
1 TTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTG-GTCATTTTCATTTTTTGAC
* * * * * * * **
11394030 TCATGGTCTAATCTGAGCCGTTTTCATTCTGTGACTTATGGT
64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
** ** * * * *
11394072 TTAAT-CTCAATCATTTTCATTTCCTAACTCGTGGTTTAATCTTGGTCCTTTTCATTTTCTGACT
1 TTAATCCT-TGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
** * * * * *
11394136 -TGTACTTTAATCCT-GATCTTTTTCATTTTTTTACTCATGAT
65 CT-TGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * ** **
11394177 TTAATCCTAT-TCGTTTTTATTTTTTTACTCATGGTTTAATCTCAGTCATTTTCATTTCCTGACT
1 TTAATCCT-TGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * *
11394241 -TGTAGTTTAATCCTATTCATTTTTCATTGTTTGACTTGTTGT
65 CT-TGGTTTAATCTTAGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** * ** * * *
11394283 TTAGTCCTAATTATTTTCATTTTTTGACTTGTCGTTTAA-CTTGGGTCATTTTCATTTTCTAACT
1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT-GGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * *
11394347 CGTGGCTTAATCCTGGCCATTTTCAGTTTTTGACTCGTGAG-
65 CTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTG-GT
* * * * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * *
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* * ****
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* * * *
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** ** * * * * * *
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*** * * * * * ***
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* * * * * * *
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* * * * * *
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*** * * * * ** * * * *
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* * * *
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* * ** * * **
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* ** * * ** *
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* * * ** * * * ** * *
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*** * * ** * * *
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* * ** *
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* * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * ** * *
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* * *
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* * ** *
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* *
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* ** ** * *
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* * * * ** *
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* * * ** **** *
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* * * * ** *** *
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* * * * *
11400244 -TATGCTTTAATTCTTA-TCATTTTCATTCTCTGACTCATGAT
65 CT-TGGTTTAA-TCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * ** * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * * * *
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65 CTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * * * * * **
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1 TTAATCCTTGTC--ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTT-GGTCA-TTTTCATTTTTTG
* * ** * *
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** * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATT-T-TC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGA
* * * * * * * ***
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** * * * ** *
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* * * * * **
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* * * * * ** *
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* * * * *
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** * ** * * * * *
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* * * * * *
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62 ACTCTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* ** * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * **
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** * * ** ** *
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* ** * * ** * ** **
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* ** * ** *** ** *
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* * * * * *** * * **
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* * * * *
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* * ** * *
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* ** * * *
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* ** * * * * * * *
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* * *
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** * * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * ** ** * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * ***
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* * * ** * *
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* * * * * **
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* * * * * * *
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** * * ** * * *
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* * * * * *
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** * * * * * * *
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* * ** * ** ** * *
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* ** * * ** * ** * *
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1 TT-AATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGA-C
* ** * * * * *
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* * * ** * * ** *
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** * * ** * * * *
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** * *
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* * ** * ** * *
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* * ** * * * * * *
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** * * ** * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * * * *
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** * * ** * *
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1 TTAATCCT-TGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * * **
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* ** * *** *
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** * * * **
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* * * * ** *
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* * ** * * * *
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* * * * * * **** *
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** * * * ** * ** * *
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64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * ** * * ** * * * * *
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1 TT-AATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT
* * ** * ** * * **
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* ***** * * *** * *
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* * * * * *
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* ** * *
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** * * * *
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* ** * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * ** * *
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* * ** * * * *
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*** * * * * * * *
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* * **
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* * * * * * * *
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62 ACTCTTGGTTTAAT-CTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCG-TGGT
** * * ** * ** ** *
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* * ** *
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* * * * * * **
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* * * *
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* * ** * * * *
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* * * * ** * *
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** * ** * * * *
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* ** * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * *
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** * * * * ** *
11406225 TGGTAGTTTAATCCTAATCATTTTCAATTTCAGACTCATGGT
64 TCTTGGTTTAATCTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * *** *
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** * * *
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64 TCTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
*** ** * * * * *
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* * * * * * ** *
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* ** * * *
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* * * **
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* * * * * * *
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** ** **
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* * * *
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* * * * * * * *
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** * ** * * * * * *
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* * * *
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*** * ** * *
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* ** * * * ** * *
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** * ** *
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* * * ** * * **
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** ** * * * *** *
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* * ** ** * * *
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* * * ** ** *
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* * * * * * ** *
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*** * ** * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * ** *
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* ** * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ***
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* * *
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* ** * ** * * *
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** ** * ** * * **** * * *
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* * * * * **
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* * * * **** *
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* * * * * ** *
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* ** * * * ** * * * ** *
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* ** *
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** * * * * * * *
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1 TTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTT-T-TGAC
* * * * * * * *
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** * * * * * ** * *
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* * * * *
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* ** * * *** *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** **
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* * * * * ** * **
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* * * *
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** * * * * **
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * *
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* * * * * ** * **
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*** * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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*** * * ** *
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* * * * *
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Statistics
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* * * * * *
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***
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 TCATTTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11374728 ATCTTGG
64 ATCCAAG
* * * * * **
11374735 TCATTTTTCTTTTTCTGACTGATGGTTTAATTCTAG-TCATTTTTATTTTCTAACTTATGGTTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11374799 GTCCAAAT
64 ATCC-AAG
** * * * * *
11374807 TGGTTTTCTTTTTCTGACT-AGTGGTTTAATCCT-GATTATTTTCATTTTCTAACT-GTGGTCTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
** *
11374869 ATTTAGG
64 ATCCAAG
* * * ** * **
11374876 TTACTTTCAATTTT-TGAGTCATCATTTAATCCCAG-TCATTTTCATTTTTTGACTC-TCAATTT
1 TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGT-GGTTT
**
11374938 AATCCTGG
63 AATCCAAG
* * * *
11374946 TCATTTTTTATTTTCT-A-TCGTGATTTAATTCT-GATCATTTTCAATTTTTGAC-CTGTGGTTT
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63 AATCC-AAG
** * * * ** *** **
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1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGTTTA
**
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64 A--TCCAAG
* * * * * *
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1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
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65 TCCAAG
* ** ** * * *
11375153 TCCTTTTCAGTTTT-TGACTTGTACTTTAATCTCA-ATCTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA
1 TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11375216 ATCCTAT
64 ATCCAAG
* * * ** *
11375223 TCATTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAACCTCAG-TCATTTTCATTTCCTGACTCGTAGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11375287 TCC-CG
65 TCCAAG
* * * * * *
11375292 TTAGTTTTTCATTGTCTGACTTATTGTTTAGTCTTA-ATTATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
1 TCA--TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
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63 AATCC-AAG
* * * * *
11375364 TCA-CTTCATTTTTTGACTCATGGCTTAATCCTAG-CCATTTTCATTTTTTAACTCGTGAG-TTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTG-GTTTA
*
11375426 ATCCCTA-
64 AT-CCAAG
* * * ** * * * * * ** *
11375433 TCGTTTTCATTTTTTGATTCATAATTTAATTTTGATCGTTTGCAGTTTTTGAGACATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11375498 CC-TG
66 CCAAG
** * * * *
11375502 ATTGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATC-ATGATCATTTTCATTTTTGGACTCATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11375566 ATCCTAG
64 ATCCAAG
* * * * * ** * **
11375573 TCGTTTTGATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGGTTGTTTTCATTTTCTGACTTATGGTTTAA-
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11375637 CCTCAG
66 CC-AAG
* * ** *
11375643 TAATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAAT-T-GCCATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAG--ATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11375706 AT-TAGGG
64 ATCCA-AG
* * * *
11375713 TCATTTTTCTTTTTTTGACT-ATTGGTTTAATCCT-GATCGTTTTCATTTTTTAACTCGTGGTTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
11375776 AATCCAAG
63 AATCCAAG
* * *
11375784 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTATGACTTACAAT--TTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGAC-T-C-GTGGTTT
* **
11375847 AATTCTGG
63 AATCCAAG
** * * * ** * *
11375855 TTGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTAGGTTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGGTGTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
11375920 CTCAA-
66 C-CAAG
* * * ** ** * *
11375925 ACAATTTCATTTTCTAACT-AGTGCCTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTTGACTAGGGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11375989 TCCCTG
65 TCCAAG
* * ** * * * ** *
11375995 TCATTTTTCATTTTATGACCCA-GCATTAGTCTCA-TTCATTTTTATTTTTTGACTTATGATTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11376058 ATTCTAG
64 ATCCAAG
** * * ** * ***
11376065 TCATTTTCATTTT-TGACTGGTGGTTTAATCTCTG-TC-GTTTCATTTTCAGGCTCACAGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11376127 TACC-AG
65 T-CCAAG
** * * *
11376133 TTGTTTTTCATTTTCTGACTCATTGTTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTTTGACTCTTGATTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11376197 AT-CTGG
64 ATCCAAG
* * * * * *
11376203 ATCATTTTCCTTTTCTAACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTTC-TTTTTCTAATTGGTGGTTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTTT
*
11376267 AATCC-TG
63 AATCCAAG
* * * * * *
11376274 TTCATTTTTATTTTTTGATTCATGGTTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11376339 TTCC-AG
65 -TCCAAG
* * * * * ** * ** *
11376345 TCATTTTCATTTTTTGAATTC-TAGTTCAATCTAGTTGTTTTTCATTTTTTTACTTTTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTG-ACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11376409 ACTTAA-
65 TC-CAAG
* * * * ** * * *
11376415 TCGTTTTCA-TTTCTTGACTCATGATTTAAACTCGATTGTATTCATATTTTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11376479 TCTC-AG
65 TC-CAAG
* * * * * * * * **
11376485 TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATTTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATTATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
***
11376550 CTTGG
66 CCAAG
* * * * *
11376555 TCATTTTTATTTTTTGACT-ATGGTTTAATTCT---TC-TTGTCTTTTTTCTCTGAC-CTGTGCT
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* *
11376614 TTAAT-TACTG
61 TTAATCCA-AG
* * ** * *
11376624 TCATTTTCAGTTGT-TGACTTATAATTTAATCCCTA-A-CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTT
1 TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
***
11376686 AAT-TTTG
63 AATCCAAG
* * * ** * * ** * * *
11376693 ATCATTTTTTATTTTTTAACTTGTGGTTTAATCTCGGTTGTTTTCATTTTTTAAC-CTATGATTT
1 -TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTT
*
11376757 AATCCCTA-
63 AAT-CCAAG
* * * * * * * *
11376765 TCATTTTTATTTTTTGAC-CTATGATTTAATTTTGGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11376829 TCCTAG
65 TCCAAG
** * * ** * * ** * *
11376835 TTGTTTAT-ATTTTTTGATTGGTGGTTTAATCCTGGTTGTTTTTTATTTATTGACTCGTGGTTTA
1 TCATTT-TCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11376899 ATCC-CG
64 ATCCAAG
* * * * * * * *
11376905 ATCATTTTTATTTTTTGATTCGTGATTTAATTTTGAT-AGTTTTCATTTTTTGAATCGTGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11376969 ATCC-CG
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11376975 ATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATTTTGAT-AGTTTTCATTTTTTGAATCGTGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11377039 ATTCTAA-
64 A-TCCAAG
* * ** * * * * *
11377046 TCGTTTTTCACTTTCTGACTTGTGATTTAATTCTAG-TCATTATCATTTTCTGACTCATGGTTTT
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11377110 ATCCTAG
64 ATCCAAG
* * ** * * * * ** *
11377117 TCATTTTCATTTTCTAATTTTTGTTTTAATCCCA-ATCGTTTTTCATTTTTTAACTCACGGTTTG
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11377181 ATCCTAG
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11377188 TCATTTTCAATTTT-TGACTCGTGGATAAATCT-GAGTCATTTTCA-TTTGTGCCTC--AGTTTC
1 TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11377248 ATCCTAG
64 ATCCAAG
* * ** * * *
11377255 TCATTCTT-TTTTTCTTACTCATGGTTTAATCCCGATCGTTATTCTTTTTTTGACTCAT-GTTTC
1 TCATT-TTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATT-TTCATTTTTTGACTCGTGGTTT-
*
11377318 AATCC-TG
63 AATCCAAG
* * ** * *
11377325 CTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCGCGATTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11377390 ATCTC-AG
64 ATC-CAAG
** * * * * * * * * * * *
11377397 TTGTTTTCATTTCCTAACTTATGATTTAAACCCAG-TCGTATTCATTTTTTGAATTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11377461 T-TTTG
65 TCCAAG
* * * ** * * * * *
11377466 GCTATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATTCCCG-TCGTTTTCATTCTCTGACTCATGATTTA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11377530 ATTCTAG
64 ATCCAAG
** * * * ** * * * * *
11377537 TTGTTTTTATTTTTTGACTTATAATTTAATTTTGATCTTTTTCATTTTCTGACTCATGG-TTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11377601 CTCGA-
66 C-CAAG
* * * * * * *
11377606 TCATTTTTATTTT-TAGACCCATGATTTAATCCCA-ATCATTTTCTTTTCTCTTG-CTTGTGATT
1 TCATTTTCATTTTCT-GACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTT-T-TTGACTCGTGGTT
* *
11377668 AAAT--ATGG
62 TAATCCA-AG
* * * * * * *
11377676 ATCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCT-GACCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
****
11377740 ATTTTGG
64 ATCCAAG
* * * * *
11377747 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTTATTTTTTGACTGGTGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA-
*
11377812 TTCAA-
65 TCCAAG
* * ** *
11377817 TCATTCTT--TTGTCTCTGACTCATGATTTAATTCTA-ATCATTTTCATTTTCTGACTAATGATT
1 TCATT-TTCATT-T-TCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
*
11377879 TAATCCTAG
62 TAATCCAAG
* * ** *
11377888 TTATTTTGATATTT-TGACTCA---TTTAATCTTTATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11377949 TCTC-AG
65 TC-CAAG
** * * * * * * *
11377955 TTGTTTTTATTTTTTGACTTATGGTTTAGTTCT-GATCTTTTTCATTTTTTAACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA-ATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11378019 TCCAGG
65 TCCAAG
** * * * * * ** * * *
11378025 TTGTTTTTCTTTTTTTGACTGATGGTTTAATCTTGGTTGTTATCATTTTTTGGCTCATGGTTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11378090 T-CTGG
65 TCCAAG
** * * *
11378095 ATTGTTTTCATTTTCTAATTCATGGTTTAATCTA-AGTCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11378159 ATCTCGA-
64 ATC-CAAG
* * * * * * *
11378166 TCATTTTCATTTTTTTACTTATAGTTTGATCCT--ATCGTTTTTCATTTTTTGACTAGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11378229 ATCTGGG
64 ATCCAAG
* * ** * *
11378236 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTGGGCCATTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11378301 CTTAG
66 CCAAG
* * * * * *
11378306 TCATTGTCATTTCCT-A-TCAT--TTT--TCT---T-TTTTTGATTGGTGGTTTAATTCG-GG--
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATT--T--TTTGACTCGTGGTT
* **
11378358 TCAT---TT
62 TAATCCAAG
* * * * * * * *
11378364 TCATTTTCTGATTCGTGGTTTAATATCAGTCGTTT--TC---AT-TTTTTGACTTGTGTTTTAAT
1 TCATTTTC--ATT--T--TCTGA-CTCA-TGGTTTAATCTAGATCATTTTCA-TT-T-TTTGACT
* * *
11378423 CCTGATCGTT-GT-C-A-
55 CGTGGT--TTAATCCAAG
** ** * * * * * * *
11378437 TTTTTTGACTCGAGGTT-TAATCTCGATCGTTT--T-T-TAT-TTTTTGGCCTTGGGTTT-AATC
1 TCATTT---TC-ATTTTCTGA-CTC-ATGGTTTAATCTAGATCATTTT--CATT--TTTTGACTC
* * *** *
11378495 CTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
56 GTGG----TTT-A--ATCCAAG
* * * * ** * ** *
11378517 TCATGATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTTGCGGTTTA-ATCCCTATCATTTTTATTT
1 TCAT--TTTCATTTT-CTGA--CTCATGGTTT-A-AT-C----TAGATCATTTTCA----T-TTT
* ** * *
11378581 TCTAACTCACGATTTAATCC-CG
49 T-TGACTCGTGGTTTAATCCAAG
* * * * *
11378603 ATCATTTTTTATTTT-TGGACTCGTAGTTTAATGC-CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATT
1 -TCA-TTTTCATTTTCT-GACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
* *
11378666 TAATCTAGG
62 TAATCCAAG
* * * * * *
11378675 TTATTTTCATTTTTTAACTCGTGGTTTAATCTCGAT--TTTT--TTTCTCT-A-TC-TGG--TAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGTTTAA
*
11378731 TACCTA-
65 T-CCAAG
* * ** * * * *
11378737 TCATTGTCATTTTTTGACTTGTGGTTCAAT-TCAGGTTC-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-A-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11378800 ATCCTTG
64 ATCCAAG
** * * * * ** * * *
11378807 TTGTTTTCATTTTTTGAGTCTTGGTTTCATCCCGA-CTATTTTTCAATTTTTGACTCTTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATC-A-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* **
11378871 AACCTGG
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11378878 T-ATTTTCA-TTTCTTGACTCGTGATTTAAACTTGGTCGTATTT-ATTTTTTGACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAATCTAGATCAT-TTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11378940 GTCCCTA-
64 AT-CCAAG
* * * * *
11378947 TCGTTTTCATTTTCTGATTCATGATTTAATTTTA-ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11379011 TCCTAG
65 TCCAAG
* * * * * * * **
11379017 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-TCATATCCTTTTCATTCTCTCACTTGTGACTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11379081 T-TTTG
65 TCCAAG
** * * * * * *
11379086 ATCATTTTCAGTTTT-TGACTCATTATTTGATTCCA-AACATTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTT
1 -TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
11379148 AATCCCAA-
63 AAT-CCAAG
** * * * * * * *
11379156 TTGTTTTCATTTTTTGAC-CTATGATTTAATCCATG-TCGTTTTCCTTTTTTGACTCATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11379219 ACTCC-GG
64 A-TCCAAG
* * *
11379226 TCATTTTTATTTTTTGATTCATGGTTTAATCT-GAGTCATTTTCATTTTTT-AGCTCGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTTA
***
11379289 ATCTTGG
64 ATCCAAG
* * * * *
11379296 TCATTTTTC-TTTTCTGA-TTAGTGGTTTAATCTTA-ATCATTTTCATTTTCTAACTGGTGATTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11379358 AATCCCTA-
63 AAT-CCAAG
* * * *
11379366 TCATTTTTCATTTT-TTAGCTCACGGTTTAATCCCA-ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11379429 AATCCTAAT
63 AATCC-AAG
* * ** * *
11379438 TGC-TTTTCATTTTATGAATTGTGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
1 T-CATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11379501 ATCC-TG
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* * * * ** * * * *
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*
11379568 TAAAT--TAG
62 T-AATCCAAG
* * * ** * * **
11379576 ATCGTATTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCGATCA---T--TTTTAT--CTTGTAATTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11379634 TTTCGA-
65 -TCCAAG
* * * * * * * *
11379640 TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATTCCT-G-TCATTTTCATTCTCTGATTTGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-T-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11379703 AT-TTTG
64 ATCCAAG
* * * * *
11379709 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TATTG-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTCA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA--GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11379772 AT-CTTG
64 ATCCAAG
* * * ** ***
11379778 GCCTTTT--TTTT-TTACTTGTGGTTTAATCTCA-ATCATTTTTCATTTTTTGACTCACAGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11379839 ATCCTAG
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11379846 T-GTTTTCATTTTTTGACTCAAGGTTTAATTTGGATCATTTTCATTTTCTGA-TCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11379909 CC-CG
66 CCAAG
** * * * * * **
11379913 ATCATTTTTTTTTTC-GACTTATGGTTTAATCTCGATCGTTAATC-TTTTTCTGACCCAAGGTTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATT-TTCATTTTT-TGACTCGTGGTTT
*
11379976 AATCCTAG
63 AATCCAAG
* * * * * * * **
11379984 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTCTAAACTTGGTCGTTTTCATTTTTGGACTCATAATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
***
11380049 -TTTG
66 CCAAG
* * * ** * * *
11380053 ATCGTTTTTATTTCTCT-ATCTCCTAATTTAATCCTAG-TCATTTTTTATTTTTTGAATTGTGGT
1 -TCATTTTCATTT-TCTGA-CTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
11380116 TTAATCCAAG
61 TTAATCCAAG
* * * * * *
11380126 TCATTTTTCATTTTCTGACTCGT-GTTTAATCCCAAAT-GTTTTCATTTTTTGAGTTAG-GGTTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTT
* *
11380188 AATTTCGA-
63 AA-TCCAAG
* * * * * * * * ** *
11380196 TTATTCTT-ATTTTTTAACTTAAGGTTTAATCCCA-TTCATTTTAATTTTTTTGACTCACGATTT
1 TCATT-TTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCA-TTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11380259 AATCTC-TG
63 AATC-CAAG
* * * * * * * * *
11380267 TCTTTTTGATTTTTTGACTCCTGGTTTAGTC-AGGGTTGC-TTTT-ATTTTTTGACTAGTGCTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA--GAT-CATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
11380329 AATCCAAG
63 AATCCAAG
* * * * * * *
11380337 TCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATCCCA-ATCATTTTTCTTTTTTTCGAGTGGTGGTTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTT-GACTCGTGGTTT
* *
11380401 AATCTAGG
63 AATCCAAG
* * * **
11380409 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTCGGTCA-TTT--TTTTTT-ACTCAAGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11380470 CCTAG
66 CCAAG
* ** * * * *
11380475 TCATTTTCATTTTTTGACTTGTCGTTTAATTCT-GGTCGTTTTC-TTTTTCTGACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTTTA
11380538 ATCCTAA-
64 ATCC-AAG
* * ** **
11380545 TCATTTTTCTTTTTTTGACTTGTGGTTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTCT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGG---T
** ** *
11380609 TTTTTCTGAC
61 TTAATCCAAG
* * * ** ** * * * *
11380619 TCATGGTTT-A-ATCCT-AGTCATTTTTCTTTTTTTGA-C-TTGT-AGTTTAATCCTGA-TCGT-
1 TCAT--TTTCATTTTCTGACTCATGGTT-TAATCTAGATCATTTTCA-TTT--T-TTGACTCGTG
* *
11380676 -TTTCATTTCCTGACTTG
59 GTTT-A-ATCC--A--AG
* ** * * * **
11380693 TGATTTAAACTTGGTCAT-ATTCAT--TTATGA-CTAG-TGGTTTAATCCTGATCATTTTCATTT
1 TCATTTTCA-TT-TTC-TGACTCATGGTT-TAATCTAGATCATTT--T-C--AT--TTTT-----
* * * *
11380753 TCTTACTCATGGTTTGATGCCTA-
50 --TGACTCGTGGTTTAAT-CCAAG
* * * * * * *
11380776 TCATTTTAATTCTCTAACTCATGATTTAAT-TATGGTTATTTTCATTTTCTT-ACTCGTAGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTTA
*
11380839 ATGCC-TG
64 AT-CCAAG
* * * * * * * * *
11380846 TCATTTTCATTCTCTAACACATGATTTAATTTTAG-TTATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11380910 TCCCTA-
65 T-CCAAG
* ** * * * *
11380916 TCA-TTT--TTTT-TGAATCGCGATTTAATTTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11380977 CC-CG
66 CCAAG
* * * * * * *
11380981 AT-GTTTTCATTTTTTGAC-C-TGTCATTTAATCTCGATCATTTT--TTTCTCTGACTTGTGATT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATG--GTTTAATCTAGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTG-GT
* *
11381041 TTAATTTCGA-
61 TTAA-TCCAAG
** * * * ** * * *
11381051 TTGTTTTCATTTTTTAACAT-GTGGTTTAATCCTAG-TTGTTTTCAATTTATGACTCGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11381114 AT-TATGG
64 ATCCA-AG
* * ** * * *
11381121 AT-ATTTTCATTTTTTAACTTGTAGTTTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11381184 ATCTTA-
64 ATCCAAG
* * * ** * * *
11381190 TCATTTTCATTCTC-GACTCATGATTTAATTCCAG-TTGTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11381253 TCCCTG
65 TCCAAG
* * * * * * * * * * *
11381259 TC-GTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATTCCA-ATGATTTTCATTTTCTAATTCATGGTTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11381322 TCTCGA-
65 TC-CAAG
* * * * * * * * *
11381328 CCATTTTTATTCTT-TGACTCATGATTTAATTCTAGTTGTATTTT--TTCTCTGACTCATGATTT
1 TCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGAT-CATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11381390 AATTTCAA-
63 AA-TCCAAG
* * * ** * * * * * *
11381398 TCGTTTTTCATTTTTTGAGTTTTGGTATAATCCTA-ATAATTTTTCATTCTTTAATTTGTGGTTT
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11381462 AATCTCGA-
63 AATC-CAAG
* *
11381470 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCTA-ATCATTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT-
*
11381534 AACCCAA-
63 AATCCAAG
* * * * * * * *
11381541 T--TGTATCAATTTTTTGACTTATGGTTTAATCCTA-ATCTTTTTTATTTTGTGACTTGTGATTT
1 TCAT-TTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* **
11381603 AATTCGGG
63 AATCCAAG
* * *** * * * * * *
11381611 TTATTTTCATTTTCTAACTCACAATTTAATCTTGGTCGTTTTCATTTTTTAACTTGTAGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11381676 CCATG
66 CCAAG
* * * * * * * * * *
11381681 TCGTTTTTATTTTTTGACTTATGGTTAAATTTGGGTCATTTT-ATTTTCTAACTCGTGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
* *
11381745 CTCGAT
66 C-CAAG
** * * ** * ** * *
11381751 TGTTTTTCTTTTTC-CAGCTGGTGGTTTAATCCTAG-TCATTTTTATTTACTGAATCGTGGTTGA
1 TCATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11381814 ATCTCGAA-
64 ATC-C-AAG
* * * * * * * **
11381822 -CGTTTTCATATTT-TGACTCGTGATTTAATTTCGATCATTTTTC-CTTTTTAACTCGTCATTTA
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*** *
11381884 ATTTTAC
64 ATCCAAG
* * * * ** * * * *
11381891 T-ATTTTCATTTTCTGACCCTTGGTTTAATCTCGATCCTTTTCATTTCCTAACACATGGTTTATT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11381955 CCCAAT
66 -CCAAG
** * * * ** * * *
11381961 TGTTTTTCATTATT-TGACTCACGATTTAATCCT-GGTTGTTTTC-TTTTCCTGACTCATGATTT
1 TCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTT
***
11382023 AAAT-TTGG
63 -AATCCAAG
** * * ** * * * * *
11382031 TTGTATTCA-TTTCATGGCTTGTGTTTTAATCCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGGCTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11382094 ATCCCAC
64 ATCCAAG
* ** * * * *** *
11382101 TCATTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAATGCCT-G-TTATTTTAATTCTCAAACTCGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11382164 ATTCCAA-
64 A-TCCAAG
* * ** * *** * * * * *
11382171 TCGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATCCCTATCGTTTTCTATTTCTAGA-TTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTC-ATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11382235 TTTCGA-
65 -TCCAAG
* * * ** * * **
11382241 TCGTTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTTAACTTGTAATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
11382306 ----G
66 CCAAG
** * * * * * * ** * ** **
11382307 TCGATTGTTTTTTTCTCTAACTCGTGATTTAATTTCGGTTGTTTTCATTTTCTGACTTATAATTT
1 TC-ATT-TTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11382372 AATTCTAG
63 AATCCAAG
* * * *
11382380 TCA-TTTCAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTCA-ATCATTTTCATTTTTTTACTCATGGTTTA
1 TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11382443 AT--TTT
64 ATCCAAG
** ** * * * *
11382448 TTTTGTTTCATCCTCTGGCTCATGCTTTAATTCCAG-T-AGTTTTCATTTTTTGA-TCCGTGATT
1 TCAT-TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACT-CGTGGTT
*
11382510 TAATCCCTA-
62 TAAT-CCAAG
* * ** * ** * * *
11382519 TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCGGTTGTTTTCATTTTCTAAC-CTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTTAA
*
11382583 TCTCGA-
65 TC-CAAG
** * * * *
11382589 TCATTTT--TTTCTCTGACTTGTGATTTAATTTTGATCCTTTTCATTTTTTGACAT-GTGGTTTA
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGAC-TCGTGGTTTA
*
11382651 ATCCTAG
64 ATCCAAG
* * * * * *
11382658 TCATTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAAT-TATGGA-CATTTTCATTTTTTAACTTGTAGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA--GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11382721 ATCCTGG
64 ATCCAAG
* * * * * * * *
11382728 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAATTCT-TATCATTTTCATTCTTTAACCCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11382792 TTCC-AG
65 -TCCAAG
** * ** * * * * *
11382798 TTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTAAATCCCT-G-TC-GTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11382860 ATTCTAG
64 ATCCAAG
* * * * * ** * *
11382867 TGATTTTCATTTTTTGATTCATGGTTTTATCTCGGCCATTTTTATTTTTTTG-CT-GATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCA-TTTTTTGACTCG-TGGTTTA
11382930 ATTCC-AG
64 A-TCCAAG
* * * * * * ** *
11382937 TTGTATTTT--TTTCTTTGACTCGTGATTTAATTCCA-ATCATTTTTCATTTTTTGAGTTTTAGT
1 -T-CATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
*
11382999 TTAATCCTAG
61 TTAATCCAAG
* * * * ** * * *
11383009 TCGTTTTTCATTTTTTTTATTTGTGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTA
1 TC-ATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11383074 ATCCTAA-
64 ATCC-AAG
* * * * *
11383081 TCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATACCT--TTCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
11383144 AATCC---
63 AATCCAAG
* * ** * * * * * ***
11383149 TGA---TC---TTGTGACTTGTGATTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTCTAACTTGCAATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11383208 CCTGG
66 CCAAG
** ** * * * * * * *
11383213 TTGTTTTCATTTTCTGACTTTTAGTTTAATCTCGATCGTTTTCATTTTCTAACTTGTAGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11383278 CCCAG
66 CCAAG
* * * * ** * **
11383283 TAATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCTTGTTGTTTTTC-TTTTTCTAACTCAAGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTTTA
*
11383347 ATCCATG
64 ATCCAAG
* * * * * * * * *
11383354 TGATTTTTATTTTTTGACT-AGTGGTTAAATTTGGGTCATTTTTATTTTTTGACTTGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11383418 TCTC-AG
65 TC-CAAG
** * ** * * * * *
11383424 TTGTTTTTCTTTTTCCAACTGATGGTGTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTCTGAATCATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11383488 ATCTCAA-
64 ATC-CAAG
* * * * * * **
11383495 TCACTTTCATTTTCT-AGCTCGTGATTTAATTTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*** *
11383559 TTTTAC
65 TCCAAG
* * * * ** * * *
11383565 TCTTTTTCATTTTCTGACCCTTGGTTTAATCTCAG-TCCTTTTCATTTCCTAACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT-A
*
11383629 AT--ATGG
64 ATCCA-AG
* * * ** * * * * * * * **
11383635 TTGA-ATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATTTCGATCATTTTCATTTTCTGGCGCATGGCGTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11383699 TCCCAT
65 TCCAAG
* * * ** *
11383705 TCATTTTCATTTTCTAACTCATAGTTTAATGCCT-G-TCATTTTAATTTTCAGACTCGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11383768 ATTCCAA-
64 A-TCCAAG
* * *** * * * * *
11383775 TCGTTTTCATTTTTTGA--CA---TTTAATCCCTATCGTTTTC-TATTTCTGAATTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11383834 TTTCGA-
65 -TCCAAG
* * * * * * * **
11383840 TCATTTTTATTTTTTGACTTATGGTTTAATTTCGATCATTTTCATTTTTTAAC-CTATAATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTTAA
*
11383904 TCTCGA-
65 TC-CAAG
* * * * * * * * * ** *
11383910 TCATTTT--TTCTCTAACTCGTGATTTAATTTTGGTTATTTTCATTTTCTGACTTATGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11383973 -TATAG
66 CCA-AG
* * * *
11383978 TCATTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCA-AT-AGTTTTCATTTTTTGATTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* ****
11384041 GTTTTCG
64 ATCCAAG
* ** * * * * * * * *
11384048 TC-GTTTCATTCTT-TGGTTCAT-CTTTATTTCCA-ATCGTTTTCATTTTCTAACCCGTGATTTA
1 TCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTA-ATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11384109 ATCCTCG
64 ATCCAAG
* ** * * ** * * * *
11384116 TCATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATTCCAG-TGGTTTTCATTTTTTGAGTCATTGTTTTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTTA
*
11384180 AT--ATTG
64 ATCCA-AG
* * * * ** *
11384186 GCTATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTCCA-ATCATTTTC-TTTTCTCTAACTTATGATT
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTT-T-TGACTCGTGGTT
****
11384249 TAATTTTGG
62 TAATCCAAG
* * ** * * *
11384258 TCATTTTCATTTTCTGACTCGA-GGTTTAATCTCGGTTGTTTTTTATTTTTTGATTTGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11384322 AT-CTAG
64 ATCCAAG
* * * * * *
11384328 ATCATTTTCATTTTTTAAGTCGTGGTTTAATCTCA-ATCATTTTTCATTTTTTGACTCATGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
***
11384392 AATCCCTT
63 AATCCAAG
** * * ** * * * * *
11384400 TTGTTTTCATTTTCTCACTCGTTATTTAAACTCGATCGTATTATTTAGATTATTTTCA-T--T-T
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATC--A-T-TTT-CATT-TTTTGACTCGTGG
*
11384461 TTTGA-CTC-A-
60 TTTAATC-CAAG
* * * * * * * * ***
11384470 TGA-TTT-A-ATCCTG-TTCGT-TTTTATTTTCT-GACTCATGGTTT-A-ATCCCGACT-GT--T
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA--ATCTAGA-TCAT--TTTCATTTTTTGACTCGTGGT
* * *
11384524 TTCATTTTCTAAC
61 TT-A--ATCCAAG
* * * * ** ** ** *
11384537 TCGTGATTTAATTTT-GGTCGTTTTTCTTTCTTGACTTATGGATTAATTTGGGTCATTTTCATT-
1 TCAT--TTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTTAAT--C-TA--GA-TCATTT---TCATTTT--TTG
* * ** ** *
11384600 A-TC-TGACTCCTGGTTTAAT
52 ACTCGTG-GT-TTAATCCAAG
* * * * * * *
11384619 TC-TTGTCATTTCCCT-TCT-TTGACTTATGAT-TCA-ATCCTTGTT-ATTTTCATTCTCTGACT
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTCATG-GTT-TAATCT-AGATCATT-TTCA--TT--TT-T-TGACT
* * * **
11384678 CATGATTCAATCCTTG
55 CGTGGTTTAATCCAAG
* * * * * * * *
11384694 TCATTTTTATTTTCAGATTCATGATTTAATTTTGATCATTTTCATCTTTTT-ACTTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGTTTAA
11384758 TCTCAA-
65 TC-CAAG
* * * * * * * * *
11384764 TCGTTTGCATTTTTTTACTCATGATTTAATC-ATGATCGTTTTCATTTTATGGCTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11384828 ACC-TG
65 TCCAAG
* * * * * * * * *
11384833 ATCTTTTTCATTTTATGGCTCATGGTTTAATCTTGATCTTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11384898 TCTTGG
65 TCCAAG
* ** * * * * * **
11384904 ACGCTCTCA-TTTCTTGACTCATGGTTTAATCCAGTTCGTTTTCATTTTTTGACTCATAATTTAA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11384968 TTCCTA-
65 -TCCAAG
* * * ** * * * * *
11384974 TCATTTTCATTCTCTAACTCGTGAATTAATTTCGATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11385039 CCCTG
66 CCAAG
* * * * * * *
11385044 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATTTTGATTATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTTAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11385109 CTCGA-
66 C-CAAG
* * ** * * * *
11385114 TCATTTTCATTTTATGACTCGTCATTTAATTTTAG-TCATTTTCATTTTGTGAC-CTTTAGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTTA
* *
11385177 TTCCCAG
64 ATCCAAG
* * * * * ** ** *
11385184 TCCTTTTCAATCTCTAACTCATAGTTTAATCCT-GATTGTTTTTCATTTTTTGACTAATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11385248 ATCCCAA-
64 AT-CCAAG
** * * * * * ** * * * *
11385255 TTTTTTTCATTTCCTGACTCGTGATTTAAAT-TCGGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11385319 TCCTGG
65 TCCAAG
* * * ** *
11385325 TCATTTTCATTTTCTGGCTCATGGTTTAATCCCA-CTCGCTTTCATTTTCTAATCCCACTCGT--
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTT-T--T--GACTCGTGG
* * *
11385387 TTTCATTTTCTAAC
60 TTT-A--ATCCAAG
* ** ** * * ** *
11385401 TCATAGTTTAATGCTC-G--TCAT--TTTAATTCTCAGA-C-TCGTGATGTAATTCCAATCGT--
1 TCAT--TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCT-AGATCATTTTCAT-T-TTTTGACTCGTGG
* ****
11385457 TTTCAT-TTTT
60 TTTAATCCAAG
* * * ** ** * ** * * *
11385467 TGACTTGTGATTTAATCCCT-ATCGTTT--TCTATTTCTAAATTGTAATTTAATTTCGA-TCAT-
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATC---ATTTTCATTT--TTT-GACTCGTG
* *** *
11385527 -TTTCATTTTTTGAC
59 GTTT-A--ATCCAAG
* * * ** ** * * * *
11385541 TTATGGTTTAATCCCATTCAT-TTTCATTTTTTGACCT-GCAATTTAATCTCCATCATTTTTTTC
1 TCAT--TTTCAT---TTTC-TGACTCATGGTTTAATCTAG--A--TCAT-T--TTCA---TTTT-
* * *
11385604 TCTAACTCGTGATTTAATTTC--G
49 T-TGACTCGTGGTTTAA-TCCAAG
* * * * * * *
11385626 GCTGTTTTCATTTTCTGACTTATGATTTAAT-TATGGTCATTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11385690 ATTTTC-A-
64 A--TCCAAG
* * * * *
11385697 TCA-TTTCATTCTCTGGCTCATGTTTTAATTCTA-ATCATTTTCATTTTCTT-ACTTGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTTA
*
11385759 ATTCCTA-
64 A-TCCAAG
* * * ** * *
11385766 TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATTCTA-ATGGTTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11385830 TTCCAA-
65 -TCCAAG
* * * * * * * * * *
11385836 TAATTTTCTTTTCTCTCACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCTTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* **
11385901 TACTGG
65 TCCAAG
* * * * * * * * *
11385907 TTATTTTTTATTTGT-TGATTCATGGTTTAATTTCGATCATTTTTATTTTTAGACTCATGCTTTA
1 TCA-TTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11385971 ATCCTAA-
64 ATCC-AAG
* **** * * * *
11385978 TCATTTTTCA-TTTC--A--CATGATTTAATCCCTTTCGTTTTCATTTTCTCACTCGTGATTTAA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11386038 ACTCGA-
65 TC-CAAG
* * * * * * * * * * * * *
11386044 TCGTTTTAATTTTTTAAATCTTGGTTTAATTTAGATTATTTTTACTTTATGACTCGTGATTTACT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11386109 CCTAG
66 CCAAG
* * * * * * *
11386114 TCATTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAATCCT-GACCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
****
11386178 TTTTGG
65 TCCAAG
* * * ** * * *
11386184 TCGTTTTC-CTTTCTTGACTCATGGATTAATCCCGATCATTTTTATTATCTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* **
11386248 TTCTTG
65 TCCAAG
** * * * * * * * * *
11386254 TTGTTTTCATTCTCTGACTCGTGGTTTAATTCTTG-TTATTTTCATTCTCTGACTCGTGATTCAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11386318 TCCTTG
65 TCCAAG
* * * * * * * *
11386324 TCATTTTTATTTTCTGATTCATGATTTAATGTTGATCATTTTCATCCTTTT-ACTTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGTTTAA
11386388 TCTC-AG
65 TC-CAAG
* * ** * * **
11386394 TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGACTTAATCCTA-ATCGTTTTCATTTTCTGA--CGTGACTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11386456 TCCTAA-
65 TCC-AAG
* * * * * **
11386462 TCGTTTTCATTTTCTGACACATGGTTTAATCCT-GATCTTTTTCATTTTCTGACAC--AATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11386524 TCCTAG
65 TCCAAG
* * *
11386530 TCATTTTCATTTT-TGTACTCATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTG-ACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11386593 A-CTCATG
64 ATC-CAAG
** ** * * * *
11386600 TCATTTTCATTCTT-TGACTTGTGAATTAATTTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11386664 TCCCTG
65 TCCAAG
* ** ** * ** * *
11386670 TCATTTTCA---TCTGGCTTGTCATTTAATCTCGATTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTTAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
***
11386732 CTTGG
66 CCAAG
* * ** * ** * * *
11386737 TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGACTTAATTTTAG-TTGTTTTCAGTTTTTGACCCTTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11386801 TCCCAA-
65 T-CCAAG
* * ** ** *
11386807 TCCTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCT-GATTGTTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11386871 ATCCTAG
64 ATCCAAG
** * * * * * ** * * * *
11386878 TTGTTTTCATTTCCTAACTCGTGATTTAAATCT-GGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11386942 TCTC-AG
65 TC-CAAG
* * * ** * * * *
11386948 TTATTTTCATTTTCT-AGCTCATGGTTTAATCCCA-CTTGTTTTCATTTTCTAACTCATAGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11387011 ATGCC-CG
64 AT-CCAAG
* * * * * * *
11387018 TCATTTTAATTCTCAGACTCATGATTTAATTCTA-ATCTTTTTCATTATTTT-ACTTGTGATTTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATT-TTTTGACTCGTG-GTTT
* *
11387081 AATCCTTAT
63 AATCC-AAG
* * * ** * * * * * *
11387090 TGCTTTTTTA-TTT-TGAATTGTGATTTAACCTCA-ATCATTTT--TTCTCTAACTCGTGATTTA
1 T-CATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11387150 ATTTC-GG
64 A-TCCAAG
** * * * * * *
11387157 TTGTTTTCATTTTTTTACTTATGATTTAAT-TACGATCATTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11387221 TCCCAG
65 TCCAAG
*** * * * * ****
11387227 TTGGTTTCATATTT-TGACTCATGGTTTAATTTTCG-TCA-TTTCATTATCT-AGCTCACACTTT
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTT
* *
11387288 AATTCTAG
63 AATCCAAG
* * * * *
11387296 TCGTTTTCATTTTTTGAC-C-TGTGATTTAATCCCT-G-TCATTATCATTTTTTGGCTCGTGATT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATG-G-TTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
* *
11387357 TAATTCTAG
62 TAATCCAAG
** * * * *
11387366 TGGTTTTCAATTTCTGACTCATGGTTTTATCCT-GGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11387430 TTCAA-
65 TCCAAG
* ** * * * * * *
11387435 TCATTTTCTTTTTTTCTGACTCATAATTTAATTTTGGTCATTTTGATTTTCTGACTTGTGGTTTA
1 TCATTTTC--ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11387500 ATCCTGG
64 ATCCAAG
* * * *
11387507 TCATTTTTTATTTTTTGATTCATGGTTTAATCTCAG-TCATTTTCATTTTTTGACAT-GTGATTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGAC-TCGTGGTTT
*
11387570 AATCC-CG
63 AATCCAAG
* * **** * * * *
11387577 ATCATTTTCCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCTTTCATTTTCATTTTCTCACTCATGATTTA
1 -TCATTTT-CATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11387642 AACTCGA-
64 ATC-CAAG
* * * * * * * * * *
11387649 TCATATTAATTTTCTAAATCTTGGTTTAATTTAGATTATTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
***
11387714 TTTAG
66 CCAAG
* * * * * * * *
11387719 TCGTTTTCCTTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-GATCGTTTTCATTATCTAACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* **
11387783 TTCTTG
65 TCCAAG
* * * * * * * * * ** *
11387789 TCATTTTCATTCTCTGACTCGTGATTCAATCCT-TATCATTTTTAATTTCT-ATTTCAAGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTTA
*
11387852 ATACCGA-
64 AT-CCAAG
* * *
11387859 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11387923 TTCC-CG
65 -TCCAAG
* ** *** * * ** *
11387929 TCATTTTCATTCTCTGACTTGTCAATTAATTTTGATCATTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
***
11387994 CCTTC
66 CCAAG
* * * * * * ** * *
11387999 TCATTTTTATTTTATAATTTATGATTTAATCCT-GATTGTTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11388063 TCCCGG
65 TCCAAG
* * * * * * ** *
11388069 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTTCA-ATTATTTTTAAATTTTTTTACT-AAGATTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCA-TTTT-CATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11388132 AATCCCAG
63 AATCCAAG
** * * * * ** * * * *
11388140 TTGTTTTCATTTCCTAACTCATGATTTAAATCCA-ATTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11388204 TCCTGG
65 TCCAAG
* * * * * ** *
11388210 TCGTTTTCATTTTCT-AGCTCATGGTTTAATCCCA-CTCATTTTCATTTTCTAACTTATAGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11388273 ATGCC-TT
64 AT-CCAAG
* * * * * * * *
11388280 TCATTTTAATTCTCAGACTCGTGATTTAATTCTA-ATCATTTTCATTTTTTGGCTTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11388344 TCCCTA-
65 T-CCAAG
* ** * * * * *
11388350 TCATTTT--TGTTTCTGAATTGTGATTTAATTTCGGTCA--TTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAA
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11388411 T-CTGG
65 TCCAAG
* ** * ** * *
11388416 ATCA-TTT--TTTT-TGACCCATAATTTAATCTCA-AAC-TTTT--TTTCCATAACTCGTGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGTTT
***
11388473 AATTTTAG
63 AATCCAAG
** * * * * * * * *
11388481 TTGTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAAT-TACGGTCATTTTAATTTTTTTACTCATGGTATAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11388545 TCCCAA-
65 T-CCAAG
* * * * * * * * * ** *
11388551 TCGTTTTTATTTTTTGGCTCATGGTTAAATTTTCG-TCA-TTTCATTCTCT-AGCTTATGCTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTTA
11388613 ATTCCAA-
64 A-TCCAAG
* * ** * * * *
11388620 TCATTTTCATTATCTGACCCATAATTTAATCCT-TATCATTTTCTTTTTTTAACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11388684 TTCTAG
65 TCCAAG
** * * * *
11388690 TGGTTTTCATTTTTTGACTCGT-GTATTTATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGT-TTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* **
11388753 ATTCTGG
64 ATCCAAG
* * * *
11388760 TCATTTTCATATTT-TGACTCA---TTTAATCCT-GATCTTTTTTCTTTTTTTGACTCATGATTT
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
***
11388820 AATCCCTT
63 AATCCAAG
* * * * * * * * * * * * *
11388828 TCGTTTTAATTTTCTCACTCGTGATTTAAACTTGATCGTATTAATTTTTTGAATCTTGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11388893 -TTAG
66 CCAAG
* * * * ** * *
11388897 ATTAGTTTCAATTTCTGACTCGTTATTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11388961 ATCTTGG
64 ATCCAAG
* * * ** * * * * * * *
11388968 CCGTTTTCATTTTCTAACTCATTATTTAATTTTGGTCATTTTCCTTTCTTGACTCATGGATTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11389033 CCCTG
66 CCAAG
* * *
11389038 TCATTTTCATTATCTGACTCATGGTTTAATTCTTG-TCATTTT-ATTTCTCTGACTCGT-G----
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGTTTA
*
11389096 ATTC-A-
64 ATCCAAG
* * * * * * * *
11389101 --ATTTTC-GTTTCTTGACTTATGGATTAATCCTTG-TCGTTTTCATTATCTGACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* **
11389162 ATTCTTG
64 ATCCAAG
* * * * * * * * *
11389169 TCGTTTT-ATTTCTCTGACTCGTGATTCAATCTTTG-TCATTTTTATTTTTTGATTCATGATTTA
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11389232 ATGCTAA-
64 AT-CCAAG
** * * * * *
11389239 TCATTTTCATCGTTT-T-ACTTGTGATTTAATCTTGATTATTTTAATTTTTTGACTCAG-GATTT
1 TCATTTTCAT--TTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTT
*
11389301 AATCC-TG
63 AATCCAAG
* * * *
11389308 ATCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTTGATTC-TTTTCATTTTCTT-ACTCATGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTT
**
11389371 AATCCTGG
63 AATCCAAG
** * * * * **
11389379 TTGTTTTCATTTTTTAACTCATGGTTTAATCCT-GGT-AGTTTTCATTTTTTGACTCATATTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11389442 ATTCC-TG
64 A-TCCAAG
* * ** * * * *
11389449 TCATTTTCATTCTT-TGGCTCGTGAATTAATTTTA-ATCATTTTCATTTTTTCACTCATGATTTA
1 TCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11389512 ATCCCTA-
64 AT-CCAAG
* * * ** ** * *
11389519 TCATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCCGATTGTTTTCA-TTTTTGACCCTTGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
* **
11389583 TCTGG
66 CCAAG
* * ** ** *
11389588 TCTTTTTCATTTTCT-AGCTCATGGTTTAATCTCGATTGTTTTTCATTTTTTGACTAATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11389652 ATCTTGG
64 ATCCAAG
** * * * * ** * * * *
11389659 TTGTTTTCATATCCTGACTCATGATTTAAATCT-GGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11389723 TCCCAG
65 TCCAAG
* * * ** * * **
11389729 TCATTTTCATTTTCTGGCTCATGGTATAATCCTA-CTTGTTTTTATTTTTTAACT-GATAATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCG-TGGTTTA
*
11389792 ATGCCCA-
64 AT-CCAAG
* * ** * * * * *
11389799 TCATTCTAATTCCCAGACTCAT-GATTAATTCCA-ATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11389862 TCCCTA-
65 T-CCAAG
* * * ** * * * * *
11389868 TCATTTT-TTGTTTTTGAATTGTGATTTAATTTTGATAATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAA
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11389932 T-CTTG
65 TCCAAG
* * * * *
11389937 ATCATTTTCATTTTTTGAC-C-TGTAATTTAATCTCA-ATCATTTT--TTTCTCTAACTCGTGAT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATG--GTTTAATCT-AGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGT
****
11389997 TTAATTTTGG
61 TTAATCCAAG
** * * * * * * * **
11390007 TTGTTTTTAATTTT-TCACTTATGATTTTAT-TACGGTCATTTTTA-TTTTTGACTTATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11390069 ATCTC-AG
64 ATC-CAAG
** * * ** * * * * ** *
11390076 TTGTTTTCATTTT-TCAACTCATGGTTTAATTTTCATC-GTTTCATTCTCTGGCTTATGCTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCT-GACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11390139 TTCTAG
65 TCCAAG
* * * * * * ** *
11390145 TCGTGTTCATTTTCTGACCCCTGATTTAATCCCT-G-TTATTTTCATTTTTTGACTTATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11390208 ATTCTAG
64 ATCCAAG
** *** ** * * * * * * *
11390215 TGGTTTTATCATGGCCAT-TTTCAT-TTTCTGACTCGTGGTTTAATCTCTGTCATCTTTT-ATTT
1 T-CATTT-TCATTTTC-TGACTCATGGTT-T-AATC-TAG-ATCAT-T-T-TCATTTTTTGA-CT
** * ** **
11390277 TTTGATTCGTGGTTTAA-
55 CGTGGTT--TAATCCAAG
* * * ** * * * *
11390294 TCCGTCATTTTCATTTTTTTAACTCATGGTTTAATCCCGCTCATTTATCATTTTTTGGCTCATGA
1 T-CAT--TTT-CA-TTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTT-TCATTTTTTGACTCGTGG
****
11390359 TTTAATCTTTT
60 TTTAATCCAAG
** * ** ** * * * * * * * * *
11390370 TTGTTTTCATTTTCTCACTTGTAATTTAAACTCGATCGTATTAATTTTCTAAATCTTGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11390435 -TTAG
66 CCAAG
** * * * * * *
11390439 ATTGTTTTCATTGTT-TGACTTATGATTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTCT-A-ACATGGTTT
1 -TCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11390500 AATCCCA-
63 AATCCAAG
* * * * * * * * * * * * *
11390507 TCTGTTTTCATTTTTTAACTCGTGATTTAATTTTGTTCGTTTTCCTTTCTTGACTCATGGATTAA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11390572 TCCCGG
65 TCCAAG
* * * * * * ** *
11390578 TCATTTTCATTATCTGACTCATGGTTTAATTCTTG-TTATTTTCATTCTCTAACTCGTGACTCAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11390642 TCCTTT
65 TCCAAG
* * * ** * * *
11390648 TCATTTTTATTTTTTGATTCATGACTTAATGCT-GATCATTTTCATCATTTT-ACTTGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11390711 ATCC-CG
64 ATCCAAG
* * * ** * * *
11390717 ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATC-ATGATCGTTTTTGTTTTCTAACTCATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11390781 ATCC-TG
64 ATCCAAG
* * * * * * * * *
11390787 AT-TTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCGTTTTCATTTTTTTACTTGCGATTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11390850 ATCCTTT
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11390857 TCATTTTCATTTTTTGACTTACGATTTAATCTCA-ATCATTTTTCATTTTTTTATTCACT-GTTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCA-TTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTT
*
11390920 AATCTCGA-
63 AATC-CAAG
* * * * * * * * * *
11390928 TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCTGGGTCGTTCTCATTTTCTAACTCATAGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11390993 CCCAAT
66 -CCAAG
** * * ** * *
11390999 TGTTTTTCTTTTTTTGACTGGTGGTTTAATCCT-GATCGTTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11391063 T-CACG
65 TCCAAG
* ** * *
11391068 ATCATTTTCATTTTCTGACTCTTGAATTAATCTCGATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT-
**
11391133 AAT-CTGG
63 AATCCAAG
* * * * * *
11391140 TCATTTTCA-TTTCTTGACTCATGATTTAAACCT-GGTCATATTCATTTTCTGACTTGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11391203 ATCTTTA-
64 ATC-CAAG
** * * * *
11391210 TCATTTTCATTTTCTGACTCATAATTTAATTTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11391275 CC-CG
66 CCAAG
* * * * ** ** **
11391279 TTCGTTTTCAATTTT-TAACTTATGGTTTAATTTCTATTGTTTTC-TTTCTCTTG-CTCGTGACT
1 -TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTT-T-TTGACTCGTGGTT
***
11391341 TAAT-TTTG
62 TAATCCAAG
* * * ** ** * * * ** **
11391349 ATCGTTTTCATTTTTTTGACTCATGATTTAATC-CCATCGCTCTCATTTTCTAACTTATAATTTA
1 -TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11391413 ATTCTAA-
64 A-TCCAAG
** * * * * * **
11391420 TTGTTTTCATTTTTTTA--CATGTGATTTAATTCT-GATCGTTTTCATTTTTTGACCCATAATTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATG-G-TTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
****
11391482 AATTTTGG
63 AATCCAAG
* * * * * * *
11391490 TCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTTATTTTCT-AATCGGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGTTTAA
11391554 TCCTAA-
65 TCC-AAG
* * * * * *
11391560 TCTTTTTTTATTTTCTGACTCACGATTTAGTACTAG-TCATTTTCA-TTTTTGACTCGTGATTTA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
** *
11391623 ATCTGAT
64 ATCCAAG
** * * *
11391630 TTGTTTTCATTTT-TCAACTTC-TAGTTTAATCCT-GATCGTTTTC-TTTTTCTGACTCGTGGTT
1 TCATTTTCATTTTCT-GAC-TCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTT
***
11391691 TAATCTTGG
62 TAATCCAAG
* * * * * ** * * *
11391700 TCGTTATTCTTTTTCTAACTTATGGTTTAATCCT-GGTTGTTTTAATTTTTTGAATCATGGTTTA
1 TCATT-TTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11391764 ATCTCGA-
64 ATC-CAAG
* * * * * * *
11391771 TCATTTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATCTA-AGTTATTTTCATTTATTGACTCATGATTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11391835 AACC-CG
64 ATCCAAG
* * * * ** * *
11391841 TTC-TTATTCATTTTCTAACTCAT-GTTTGAATTTTGGTCATTTTTGTTTTTTGACTCATAGTTT
1 -TCATT-TTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
**
11391904 AAT-CTTG
63 AATCCAAG
* * * ** * *
11391911 GCTATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCA-ATTGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
****
11391975 ATTTTGG
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11391982 TCGTTTTCATTATT-TGACTCATGGTTTAATCCT-CATCGTTTTCATTCTCTGACTCATGATTTA
1 TCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11392045 ATTCC-TG
64 A-TCCAAG
* * * * * ** * * ** *
11392052 TCATTTTTATTTTCT-AGCTCATGATTTAATTTTGGTTGTTTTCATTTTCTGACCCAAGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11392116 TCCCAG
65 TCCAAG
* * * * * * ** *
11392122 TCATTATC-TTTTCTCCAACTCATGATTTAATTTTGCTTGTTTTCATTTTCTT-ACTCATGGTTT
1 TCATTTTCATTTTCT--GACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTT
**
11392185 AAT-CTTG
63 AATCCAAG
* * * * *
11392192 TTCATTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAATTTTAG-TCATTTTCATTTTCTT-ACTCGTGGTTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTT
*
11392255 AATCCTAG
63 AATCCAAG
* * * ** * * * *
11392263 TCA-ATT--TTTT-TGACTCGTGGTTTAATCCT-GGTTGTATTT-GTTTTCTGAGTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCAT-TTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11392322 ATTCGAA-
64 A-TCCAAG
* * * * * ** *** *
11392329 CCATTTTCATTTTTTAACTCGTGGTTTAAT-TCGGGCCATTTTCATTCCCTGAATCGT--TTTCA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT-A
* * *
11392391 TTTTCTAAC
64 --ATCCAAG
* * * * * * * * *
11392400 TCATGGTTT-A--ATCTGGGC-CAT--TTTCATTCTTTGACTCGTGGTTT-A-ATCTT-AGTCAT
1 TCAT--TTTCATTTTCT-GACTCATGGTTT-AATC-TAGA-TCAT--TTTCATTTTTTGACTCGT
* * *
11392456 --TTTCATTTCCTGAC
58 GGTTT-A-ATCC-AAG
* * * * * * * * * * **
11392470 TCGTGGTTT-AATCT-TG-GTCCT-TTTTATTTTCT-GA-C----TCGTGTTTT-AATC-CCG--
1 TCAT--TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA--ATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
***
11392521 --ATCCTTT
62 TAATCCAAG
* * * *
11392528 TCATTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCTCAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11392592 TCC-CG
65 TCCAAG
* * * * * ** * *
11392597 ATTATTTTTCACTGTT-TGACTCATTGTTTAATCTTGATCATTTTCAATTGCTAACTTGTGGTTT
1 -TCA-TTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11392661 AA-CCTATG
63 AATCC-AAG
** * ** * * *
11392669 TGGTTTTTATTTTCTGACTTGTGGCTTAATCTCTG-TCATTTTCATTTTCTT-ACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTTA
***
11392732 ATCTTGG
64 ATCCAAG
* ** *
11392739 TCATTTTCATTTTCTGACTCTTGGTTTAATCTTAG-TCATTTTCATTTACTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11392803 TCCTTG
65 TCCAAG
* * * * * * *
11392809 TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATTTTA-ATCGTTTTCATTTTCTGAGTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* * *
11392873 TTCTAT
65 TCCAAG
* * * * * * *
11392879 TCGTTTTGATTTTCTTACTCATGGTTTAATCCCAG-TCATTTTTATTTTCTGACACGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11392943 T-CATGG
65 TCCA-AG
* * * * * *
11392949 TCATTTTAATTTTCTAACACATGGTTTAATCTTGGTCATTTTTC-TTTTTCTAACT-GTTGGTTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTT-TGACTCG-TGGTTT
*
11393012 AATCCTAG
63 AATCCAAG
* * * * * * * * *
11393020 TCTTTTTTATTTTCTAACTTATGGTTTAGTCCAAATCGTTTTTC-TTTTTTGGACTAGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATC-ATTTTCATTTTTT-GACTCGTGGTTTA
*
11393084 ATCC-TG
64 ATCCAAG
** * ** * * * *** * * * * *
11393090 ATTGTTTTCATTTTCT-AATTGTGGTCTAATTTAGGTTGCTTTCAATTTCTGAGTCATCGTTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11393154 TCCCAG
65 TCCAAG
* ** * * * * * * *
11393160 TCATTTTCATTTTTTGACTCCCGATTTAATCTTGGTCATTTTTCATTTTCTAACTTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11393225 T-TTTG
65 TCCAAG
* * ** * * *
11393230 ATCATTTTTAATTTT-TGACTCATGGTTTAATCCCAG-TTGTTTTCA-TTTATGTCTCAGTTGTT
1 -TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-G-TGGT
* ****
11393292 TTCATTTTTG
61 TTAATCCAAG
* * ** * ** ** *
11393302 TCTCATGGTTTAATTCTTATTGTTTTCTTTCTCCAACTCGTA-ACTTAATTTAAAACATTTTCAT
1 --TCAT--TTTCATT-TT-CTG-ACTCATGGTTTAA-TC-TAGA--TCA-TT--------TTCAT
** * *
11393366 TTTTTGACTCACGATTTAATCCATG
46 TTTTTGACTCGTGGTTTAATCCAAG
* * ** * * * *
11393391 TCATTTTCATTTTTTGAGTTTTGGTTT-ATTTCGGTCATTTT--TTTTTT-ACTCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
11393452 CTCAATG
66 C-CAA-G
* * ** *
11393459 TTATTCTT--TTTT-TGACT--TGCAGTTTAATCTCA-ATCATTTTCATTTTTAGACTAATAGTT
1 TCATT-TTCATTTTCTGACTCATG--GTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
11393518 TAAT-C---
62 TAATCCAAG
* * * * * * *
11393523 TCATTTTCCTTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTA-ATTATTTTCATTTCTTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* ***
11393587 ACTTGG
65 TCCAAG
* * * * ** * * * *
11393593 TC-TTATTCATTTTTTTACTCGT-GTTTGAATTTTAG-TTGTTTTTATTTTCTGACTTGTTGTTT
1 TCATT-TTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11393655 AAT-CATGG
63 AATCCA-AG
* * * * * * *
11393663 TCTTTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATCTTGATTATTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11393728 T-TTTG
65 TCCAAG
* * * * * * * * * *
11393733 CTCATTTTTAGTTTTTTGACTCGTGGTTTAATTCTCG-TCGTTTTCATTCTCTAACTCTTGATTT
1 -TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11393797 AATTTC-AG
63 AA-TCCAAG
** * * * * * *
11393805 TTGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
***
11393870 -TTTG
66 CCAAG
* * * * * * * *
11393874 ATCATTTTTTATTTTTTAATTCGTGGTTTAATCCCA-ATCA--TT--TTTTCTGACTCGTGCTTT
1 -TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
11393934 AATCCCAA-
63 AAT-CCAAG
* * * * * * * * * * *
11393942 TCATATTCATTTTTTAACTCATGATTTAATCTCGATCTTTTTCATGTTCTAACTTGTGGTTTAGT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA-A
**
11394007 TTGAA-
65 TCCAAG
* * * * * **
11394012 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTCTAATCT-GAGCCGTTTTCATTCTGTGACTTATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11394076 TCTCAA-
65 TC-CAAG
* * * * * * * * **
11394082 TCATTTTCATTTCCTAACTCGTGGTTTAATCTTGGTCCTTTTCATTTTCTGACTTGTACTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11394147 CC-TG
66 CCAAG
* * * * * * * * *
11394151 ATCTTTTTCATTTTTTTACTCATGATTTAATCCTA-TTCGTTTTTATTTTTTTACTCATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11394215 ATCTC-AG
64 ATC-CAAG
* ** * * * * *
11394222 TCATTTTCATTTCCTGACTTGTAGTTTAATCCTA-TTCATTTTTCATTGTTTGACTTGTTGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11394286 GTCCTAA-
64 ATCC-AAG
* * ** * * * * * *
11394293 TTATTTTCATTTTTTGACTTGTCGTTTAA-CTTGGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTGGCTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11394357 TCCTGG
65 TCCAAG
* * * * *
11394363 CCATTTTCAGTTTT-TGACTCGTGAG-TTAATCCT-TATCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTT
1 TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATG-GTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
****
11394425 AATTTTGG
63 AATCCAAG
* * ** * * * ** *
11394433 TCGTTTACAGTTTT-TGA-GAATGGTTTAATCATA-ATCGTTTTCATTTTCTAACTTATGATTTA
1 TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11394495 AT-CATG
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11394501 ATCATTTTGATTTTTTGACTCATGTTTTAATCCTAG-T-AGTTTTGATTTTCTGACTCATGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11394564 AATCTCGA-
63 AATC-CAAG
* ** **
11394572 TCGTTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCTCAG-TCATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11394636 TCGC-GG
65 TC-CAAG
* * * * **
11394642 TCTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTGGGTCATTTTTCTTTTTTTGACTATTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11394707 TCTCGA-
65 TC-CAAG
* * *
11394713 TCATTTTCATTTT-TGACTCATGGTTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
** *
11394777 TTAGG
66 CCAAG
* *** ** * * * *
11394782 TCATTTTCATTTTATGACTCACAATTTTAATTCTAG-TTGTTTTTATTTTCTGACTCATGCTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11394846 ATCTAGG
64 ATCCAAG
** * ** * * * **
11394853 TTGTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTAATCTCA-ACCGA-TTTCATTTTCTGACTTGTGCCTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11394916 ATACCGA-
64 AT-CCAAG
* * * * ** **
11394923 TCATTTTCATTTTTTGACTAAGGGTTTAATCCCT-G-TCATTTTTCATTTTCTGAC-CCAGCATT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11394985 AGTCTC-AT
63 AATC-CAAG
* * * * *
11394993 TCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATTTTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTAGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11395057 TCTC-TG
65 TC-CAAG
* * ** * * * * *** *
11395063 TTA-GTTCATTTTCTGACTCACAGTCTAATATCAG-TTATTTTTCATTTTCTGACTCACAGTCTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11395126 ATATC-AG
64 AT-CCAAG
* * *
11395133 TTATTTTTCATTTTCTGACT--TGCTGTTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTTTGACTCTTGATT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATG--GTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
*
11395195 TAAT-CTAG
62 TAATCCAAG
* * * * *
11395203 ATCATTTTCATTTTCTAACTCATAGTTTAATCTTGATCATTTTTC-TTTTTCTGATTGGTGGTTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTTT
*
11395267 AATCC-TG
63 AATCCAAG
* * * *
11395274 TTCATTTTTATTTTTTGACTCATAGTTTAATCTA-AGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11395338 ATTCC-AG
64 A-TCCAAG
* * * **
11395345 TCATTTTCATTTTCTGACTTC-TGGTTTAATTTGGTTGTTTTTCATTTTTTGACT--TGGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGG-TTTA
*
11395407 AACCTAA-
64 ATCC-AAG
* * * ** * * * *
11395414 TCATTTTCA-TTTCTTGACTCATGATTTAAACTTGATTGTATTCATTTTTTGATTTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11395478 TCTC-AG
65 TC-CAAG
* * * * * * *
11395484 TCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTT-ATTTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11395548 CTC-GG
66 C-CAAG
* * ** * * * ** *
11395553 TCATTTTCATTTTTTGACT-ATGGTTTAATTCTTG-TTGTCTTC-TTTCTCTGACCCAAGCTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGTTTA
* *
11395615 AT-TACTG
64 ATCCA-AG
* ** * * *
11395622 TCGTTTTCATTTGT-TGAC-CTATAATTTAATCCCT-GA-CATTTTCATGTTTTGACTCATGATT
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTC-ATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
***
11395683 TAAT-TTTG
62 TAATCCAAG
* * * * * * * * * * *
11395691 ATCGTTTTCATTTTTTAACTCGTGGTTTAATCTTGGTCGTTTTCATTTTTTCACCCATGATTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11395756 TCCCTG
65 TCCAAG
* * * * * * * *
11395762 TCATTTTTATTTTTTGACTTC-TGATTTAATTTTGGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11395826 TCTTGG
65 TCCAAG
** * ** * * * ** *
11395832 TTGTTTACATTTTCTGACTGGTGGTTTAATTTTGGTTGTTTTTCATTTATTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11395897 TACCAA-
65 T-CCAAG
* * * * * * *
11395903 TC-GTTTCATTTTCTAACT--T-GTTTAATACCA-ATC-GTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11395962 TCCCAA-
65 T-CCAAG
* * * ** * * * *
11395968 TCGTTTTTCATTTTCTAAATTGTGGTTTAATCCTAG-TCGTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11396032 AT-TTTG
64 ATCCAAG
* * * * * * * * * *
11396038 ATCGTTTTCATTTTTTGAATCGTGGTTTAATTCCA-ATCGTTTTTCACTTTCTGACTTGTGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11396102 AATTCTAG
63 AATCCAAG
* * ** * * * * * *
11396110 TCATTTTTATTTTCTTACTTGTGGTTTTATC-CGAGTCATTTTCATTTTCTAACTTGTGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11396174 TCTCGA-
65 TC-CAAG
* * * * * * * * *
11396180 TCATTTTTCATTTTTTGACTCACGATTTGATCCT-GGTCATTTTCATTTTCTGACTCTTGGATAA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11396244 ATCTGAG
64 ATCCAAG
* * * * * * *
11396251 TCATTTTCATTTT-TGCCTCA--ATTTCATCCCATTCGTTC-TTTT-TTTTTTTGACTCATGGTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--C--TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
*
11396311 TAATCC-CG
62 TAATCCAAG
* * * * *
11396319 ATCGTTATTCTTTTTTTTACTCAT-GTTTCAATCCTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTT
1 -TCATT-TTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
*
11396382 TAATCCCAG
62 TAATCCAAG
** * * * * ** * * *
11396391 TTGTTTTTCATTTTTTGACCCGTGATTTAATCTCAG-TCATTTTCATTTCCTAACTCATGATTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11396455 AACCCAG
64 ATCCAAG
** * * * * * * **
11396462 TTGTATTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATTTCGCTTATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAA
1 TCAT-TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11396526 TTCC-CG
65 -TCCAAG
** * * ** * * **
11396532 TTGTTTTCATTCTCTGACTCATGATTTAATTCTAG-TTGTTTTTATTTTTTGACTCATAATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
****
11396596 TTTTGG
65 TCCAAG
* * * * * **
11396602 TCTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTAGACCCATCATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
11396667 CCCAA-
66 -CCAAG
* * ** * * * * *
11396672 TCATTTTCTTTTCTCTTACTTGTGATTAAATATGGATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11396737 ACCTAA-
65 TCC-AAG
** * * * * * * *
11396743 TTGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
***
11396808 CTTGG
66 CCAAG
* * * * ** * * * * *
11396813 TTATTTTTATTTTTTTACTGGTGATTTAATTTCA-ATCATTCTCTTTTTTTTGACTCGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTC-ATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11396877 ATTC-TG
64 ATCCAAG
* * * * *
11396883 ATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-TTATTTTGA--TATT---T--T-GTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11396939 ATCTCTA-
64 ATC-CAAG
* * * ** * ** * *
11396946 TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCCGGTTGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11397011 CC-TG
66 CCAAG
* * * **
11397015 ATCATTTTCATTTT-TAACTCATGGTTTAATCCAAGTTGTTTTTC-TTTTTCTGACT-GATGGTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTT-TGACTCG-TGGTT
11397077 TAATCTC--G
62 TAATC-CAAG
* * * * ** *
11397085 -CTTGTTTCATTTTTTGGCTCATGGTTTAATCTAGGTTGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
1 TCAT-TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11397149 TCTAAG
65 TCCAAG
* * * * * *
11397155 TCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTTCGATCATTTTCATTTTGTT-ACTCATAGTTTGA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTTAA
* *
11397219 TCCCTAT
65 T-CCAAG
* * * * * *
11397226 TGATTTT-ATTTTTTTGACT-AGTGGTTTAATCTAGGTCATTTTTATTTTCTGACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCA-TTTTCTGACTCA-TGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11397289 ATCTAGG
64 ATCCAAG
* ** * * ** * **
11397296 CCATTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCTTAG-TCGTTGTCATTTCCT-A-TCATTTTTCTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTC-GTGGT-TT
** *
11397358 TTTCTAA-
63 AATCCAAG
* * * * * * * * * * *
11397365 TTAGTGGTTT-A-ATTC-GAGTCAT--TTTCATTTCTTGACTCAGGGTTT-A-ATCTCG-GTCAT
1 TCA-T--TTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-A-ATCTAGA-TCA--TTTTCATTTTTTGACTCGT
** * * **
11397422 TTTTTATTTTCTGG
58 GGTTTA-ATCCAAG
* * * * * * * * * *
11397436 CCCTGGGTTT-A-ATCCTG-GTCAT--TTTCATTTTTTGACTCATGATTT-A-ATTTTG-GTCGT
1 TCAT---TTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-A-ATCTAGA-TCAT--TTTCATTTTTTGACTCGT
* ****
11397493 --TTTCAT-TTTT
58 GGTTTAATCCAAG
* * * * *
11397503 TGATTTGCGATTTAATCCCT-ATCATTTTCAT-TTTCTGA-CTCACGATTTATCCTAATCGTTTT
1 TCATTTTC-ATTT--T--CTGA-C----TCATGGTT-TAATCT-A-GA----T-C--AT--TTTC
* * *
11397565 TCATTTTTTGACTCGTAGTTTAATGTC--G
44 A--TTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-CCAAG
* * * * * * * *
11397593 TTTATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTAGGTTATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11397658 TCC-CG
65 TCCAAG
* * ** *** * * * * * *
11397663 AC-TGTTTCTTTTTTCT-ATCTGGTGGTTTAATCCCTATCGTTGTCAATTTTTGACTTGTAGTTC
1 TCAT-TTTC-ATTTTCTGA-CTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11397726 AAT-TATGG
63 AATCCA-AG
** ** * * *
11397734 TTGTTTTCACTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAG-TTGTTTTCATTTTTTGAGTCTTGGTTTC
1 TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11397797 ATCC-CG
64 ATCCAAG
* ** * * * * * *
11397803 ATTATTTTTCAATTTT-TGACTTGTGATTTAAACCT-GGT-GTTTTCATTTCTTGACTCGTGATT
1 -TCA-TTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
* **
11397865 TAAACCTGG
62 TAATCCAAG
** * * * * * *
11397874 TTGTATTT-ATTTTCTGACTTATGGTTTAGTCCCTATCATTTTCATTTTCATTTTCTGATTTGTG
1 TCAT-TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTA-GA---TCATTTTCATTTTTTGACTCGTG
* *
11397938 ATTTAATTTCAA-
59 GTTTAA-TCCAAG
*
11397950 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11398014 TTTCGA-
65 -TCCAAG
** * * * * * ** *
11398020 TTGTTTTCATTTTCTAACTTATGATTTAATTTCGATTGTTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11398085 TCCCTA-
65 T-CCAAG
* * * * * * * *
11398091 TCATTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATTCCA-AACGTTTT-ATTTTCTAACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11398154 TCCCAA-
65 T-CCAAG
** * * * * * *
11398160 TTGTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11398224 -CTCTGG
65 TC-CAAG
* * * * *
11398230 TCATTTTTATTTTTTGACTTATGGTTTAATCTA-AGTCATTTTCATTTTTTAACTCGTTGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* **
11398294 GCCTGG
65 TCCAAG
* * ** * * * * *
11398300 TCATTTTTCCTTTTTTGACTGGTGGTTTAATCTTA-ATCGTTTTCATTTTCTAACTAGTGATTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11398364 ATCCCTA-
64 AT-CCAAG
* * *
11398371 TCATTTTTCATTTTTTAACTCATGGTTTAAT-T-GCAATCATTTTCA-TTTTTGACTCATGGTTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAG--ATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11398433 AATCCTGAT
63 AATCC-AAG
** * * * * ** * *
11398442 TGTTTTTCTTTTTATGAAT-AGTGGTTTAATCTAGGTTGTTTTCATTTGTTGACTAGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11398506 TCTCGA-
65 TC-CAAG
* * * * * * *
11398512 TCATTTTTCA-TTT-TGA-T-GTGTGATTTAAACCTAG-TCGTTTTCATTTCTTAACTGGTGATT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATG-G-TTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
* **
11398572 TAA-ACTGG
62 TAATCCAAG
** * * * * * * * *
11398580 ATTGTATTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATGTCGATCATTTTTATCTCGTAATTTGACGCGTGG
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCAT-T--T--TTTGACTCGTGG
* **
11398645 TTTAATTCTCG
60 TTTAATCCAAG
* ** * * * * ** * *
11398656 TCATTTTCATTCTCTGACTTGTGATTTAAGT-TTGGTCGTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11398720 TCCCTA-
65 T-CCAAG
* * * * * * * * *
11398726 TCATTTTCACTTTCTGACTCATGATTTTATCCT-TATCGTTTTCATTTTCTGACACATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11398790 TCCCAAA
65 T-CCAAG
* ** * *** * * *
11398797 T-GTTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCCTATCGTTTTCATTTTTTTGACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCA-TTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11398861 T-TATTG
65 TCCA-AG
* * * ** * * *
11398867 TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTCAATC-ATGGCCGTTTTC-TTTTTCTAACTGGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTTTA
11398930 ATCTC-AG
64 ATC-CAAG
* * * ** * * *
11398937 TTATTTTTTATTTTTTGACTCACAGTTTAATCCCA-ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11399001 AT-TTGG
64 ATCCAAG
* ** * **
11399007 ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCGATCGTTTTC-TTTTTCTGACTTATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTTTA
*
11399071 ATCTCGA-
64 ATC-CAAG
* * * * * * * * * **
11399078 TCGTTAATC-TTGTTTTGACTTAAGGCTTAATCCT-GGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATAATTT
1 TCATT-TTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
***
11399141 AAT-TTTG
63 AATCCAAG
** * * * ** * * *
11399148 ATTGTTTTTA-TTTCTCCATCTCCTTATTTAATCCTAG-TCATTTTTTATTTTTTGAATCATGGT
1 -TCATTTTCATTTTCT-GA-CTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
*
11399211 TTAATCCAAA
61 TTAATCCAAG
* * * * **
11399221 TCATTTTTCATTTTCTGACTCGT-GTTTAATCCTAAAT-GTTTTCATTTTTTGAGTCAAGGTTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11399284 ATTTCAA-
64 A-TCCAAG
** * * * * * * ** * * *
11399291 TTGTTTTTATTTTTTAACTTAAGGTTTAACCCCGTTCATTTTAATTTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCA-TTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11399356 TCTC-GG
65 TC-CAAG
* * * * * * * * * *
11399362 TCGTTTTGATTTTTTGACTCGTGGTTT-AGCCACAGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTAAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11399426 TCCAAG
65 TCCAAG
* * * * * *
11399432 TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCA-CTCA--TT--TTTTTTGATTGGTGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
* *
11399492 GTCGA-
66 -CCAAG
* * * * * *
11399497 TCGTTTTCATTTTTTGACTTACT-GTTTAATCCTAG-TTATTTTCATTTTTTGACCCGTTGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* *
11399560 ATTCTAG
64 ATCCAAG
** * * * *
11399567 TTGTTTT-TTTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAG-TTATTTTTCTTTTTTTGACTTGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11399630 TCC-TG
65 TCCAAG
* * * *
11399635 ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAACCCTA-ATCATTTTTCATTTTCTGACTTGTGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11399699 AAACCTAG
63 AATCCAAG
* * * * *
11399707 TCATATTCATTTT-TGAC-CAATGGTTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTG
1 TCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11399769 ATGCCTA-
64 AT-CCAAG
* * * ** * * * * *
11399776 TCATTTTAATTCTCTAACTCATTATTTAAT-TATGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTGA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11399840 TGCCTA-
65 T-CCAAG
* ** * ** * * * * *
11399846 TCATTTTAATTCACTAACTCATTATTTAAT-TATGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAGTTTAG
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11399910 TGCC-TG
65 T-CCAAG
* * * * * * *
11399916 TCATTTTCATTCTCTGACACATGATTTAACTTTAG-TTATTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11399980 TCCCTAA-
65 T-CC-AAG
* * * * * * *
11399987 -CA-TTT--TTTT-TGAATCATGATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11400047 CCTGG
66 CCAAG
* * * * * * *
11400052 TCATTTTCATTTTTTGAC-CTATGATTTAATCTCGATCATTTT--TTCTCTGACTTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTC-ATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11400114 T-TTTG
65 TCCAAG
** * * * * * * * *
11400119 ATTGTTTTCATTTTTTCACAT-GTGGTTTAATCCTAG-TCGTTTTCATTTTCTGGCTTGTGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11400182 AAT-TACGG
63 AATCCA-AG
* * * ** * ** * ** *
11400190 ACATTTTCATTTTTTAACTTGTAGTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTTAACTTATGCTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA-
**
11400255 TCTTA-
65 TCCAAG
* * ** *
11400260 TCATTTTCATTCTCTGACTCATGATTTAATTCTAG-TTGTTTTCA-TTTTTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11400323 TCCCTG
65 TCCAAG
* * * * * * * * * * *
11400329 TC-GTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTTATCTTGATCATTTTTATTATTTGACGCATGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
* *
11400393 TCTAG
66 CCAAG
* * * * * **
11400398 TCGTATTTT--TTCTCTAACTCATGATTTAATTTCA-ATCATTTTTCATTTTTTGAGTTTTGGTT
1 TC--ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
*
11400460 TAATCCCAG
62 TAATCCAAG
* * ** * *
11400469 TCATTTTTCATTTTTTGATTTGTGGTTTAATCTCA-ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11400533 ATCTTAA-
64 ATC-CAAG
* * ** * * * * * *
11400540 TCATTTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAATACCT--TTCGTTTTCATTTTTTGACTAGCGATTT
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11400603 AAACC-CG
63 AATCCAAG
* * * * * * * * * *
11400610 --ATTGTATCAATTTTTTGACTTATGGTTTAATATTGATCTTTTTTATTTTGTCACTTGTGATTT
1 TCATT-T-TC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11400673 AATTC-AG
63 AATCCAAG
* * * * * * ** * *
11400680 ATCGTTCTCATTTTCTAACT-A-GCAATTTAATCTTGGTTGTTTTCATTTTCTGACTC--AGTTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATG--GTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11400741 AATCTCGA-
63 AATC-CAAG
** * * * * **
11400749 TTGTTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATCTCGATTGTTTTCATTTTCATTTTCTAACTTATGG
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT--A--G--ATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGG
**
11400814 TTTAAAT-TGA-
60 TTT-AATCCAAG
* * * * * ** * ** *
11400824 TCGTTTTTCTTTTTCTAACTCGTGGTTTAATCCATG-TTGTTTTTATTTTTTGACTTATGGTTAA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
****
11400888 ATTTGGG
64 ATCCAAG
* * * * * ** ** * *
11400895 TAATTTT-ATTTTTTAACTCATGGTTTAATCTCGGTTGTTTTTC-TTTTTCCAATTGGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTTTA
* *
11400958 AGCCTAG
64 ATCCAAG
* * * * * *
11400965 TCATTTTCATTTTCTAAATCATGGTTTAATCTCGAACATTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA-
*
11401030 TCC-TG
65 TCCAAG
** * * * * *
11401035 TCATTTTCATTTTCTGACT-ATTGAATTAATTTTGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTCA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11401099 TCCCTA-
65 T-CCAAG
* ** * ** ** * * * * *
11401105 TCATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATCCCGATTGTTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTTAC
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
**
11401170 CCTGG
66 CCAAG
* * ** * *
11401175 TCATTTTCATTTT-TGACTCATGATTTAATTTA-AGTTGTTTTCATTTTTTGACCCTTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11401238 TCTC-GG
65 TC-CAAG
* * * ** ** *
11401244 TCCTTTTCATTTTCTAACTCATTGTTTAATCCT-GATTGTTGTTCATTTTTTGACTAAT-ATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATT-TTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11401307 ATCCTAG
64 ATCCAAG
** * * * * ** * * * *
11401314 TTGTTTTCATTTCCTGACTCGTGATTTAAATCT-GGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11401378 TCCCGG
65 TCCAAG
* ** * * ** *** ** *
11401384 TCATTTTCATTTTTTGGTTCATGGTTTAATCCCA-CTTGTTTTCATTTTCAAACTTATAGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11401448 GGCC-CG
65 -TCCAAG
* * * ** * * * * *
11401454 TGATTTTAATTCTCAAACTGATGATTTAATTGTA-ATCATTTTCATTATTTT-ACTTGTGATTTT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATT-TTTTGACTCGTG-GTTT
*
11401517 AATCCCTA-
63 AAT-CCAAG
* * ** * * * **
11401525 TCATTTT-TTGTTTCTGAATTGTGATTTAATTTTGATCATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAA
1 TCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11401589 TCC-CG
65 TCCAAG
* * * ** * * * *
11401594 ATCATTTTCATTTTTTGACCCGTAATTTAATCTTGATCATTTT--TTATTCT-AGTTCGTGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATT-TTTTGA-CTCGTGGTTT
****
11401656 AATTTTGG
63 AATCCAAG
** * * * * *
11401664 TTGTTTTCATTTT-TGGCTTATGATTTAGT-TACGATCATTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11401727 TCCTAG
65 TCCAAG
* * * * * * *
11401733 T--TGTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTTTTG-TCA-TTTCATTCTCT-AGCTCCTGCTTT
1 TCAT-TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTT
***
11401793 AATTTTTAG
63 AA-TCCAAG
* * * * * ** *
11401802 TCGTTTTCATTTTCTAACCCGTGATTTAATCCCT-G-TCATTTTCATTTTTTGACTTATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT--CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
11401865 ATTCC-AG
64 A-TCCAAG
** * * *
11401872 TGGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTTATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11401936 TTCAA-
65 TCCAAG
* * * * * *
11401941 TCATATTCTTTTCTCTGACTCATGATTTAATTTCGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11402006 TCCTAG
65 TCCAAG
* * * * * *
11402012 TCATTTTTTATTTTTTGATTCGTAGTTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTA
1 TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11402076 ATCC-TG
64 ATCCAAG
* * * * * * ** * *
11402082 ATCGTTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCA-TTCATTTTCATTTTCTCTCTCATGATTT
1 -TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11402146 AAACTCGA-
63 AATC-CAAG
* * * * * * * * * * *
11402154 TCGTATTAATTTTCTAAATCTTGGTTTAATTTAGATTATTTTTATTTTCTGACTCAT-GTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11402218 CC-CG
66 CCAAG
* * * * * * * * * * * *
11402222 ACCGTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATTTTGGTCATTTTCCTTTCTTGACTCATGGATTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11402287 TCCCAG
65 TCCAAG
* * * * * * * * *
11402293 TCATTTTCATTATCTAACTCATGGTTTAATTCTTG-TCATTTTCATTCTCTAACTTGTGATTCAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11402357 TCCTTG
65 TCCAAG
* * * * * * * *
11402363 TCATTTTTATTTTCT-ATTTCATGATTTAATGTTGATCCTTTTCATCTTTTT-ACTTGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11402426 ATCTC-AT
64 ATC-CAAG
* * ** * *
11402433 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTCCTGACTCATTGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11402497 T-CTTG
65 TCCAAG
* * * * ** *
11402502 ATCTTTTTCATTTTTTGACTAATGATTTAATCCTAG-TTGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11402566 ATCCCAG
64 ATCCAAG
** * * * * * * * **
11402573 -CCGTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAATTTTTG-TCATTTTCATTCTCTAACTCGTGAATTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
***
11402636 T-TTTG
65 TCCAAG
* * ** * * * *
11402641 ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCT-TCTCATTTTTATTTTATGACTCATGATTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11402705 ATCC-TG
64 ATCCAAG
** * ** * * * * *
11402711 ATTGTTTTCACTTTT-TAACTTGTGATTTTATCTTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTT
1 -TCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
*
11402774 AATTTC-AG
63 AA-TCCAAG
* * * * * * * * * *
11402782 TTATTTTCATTTTCTAACCCTTGGTTTAATCCCAG-TCCTTTTCATTTTCTAAGTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11402846 TCC-TG
65 TCCAAG
* * * ** ** * *
11402851 ATTATTTTTCA-TTT-TGACT-ATGATTTAATCCCA-ATTGTTTTCATTTCCTGACTCATGATTT
1 -TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
**
11402912 AAAT-CTGG
63 -AATCCAAG
** * * ** * ** * *
11402920 TTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATCCCGATCGTTTTCATTTTTT-AGCTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTTAA
* *
11402984 TCCCAC
65 TCCAAG
* * * * * ** *
11402990 TCATTTTCATTTTCTAACTCATAGTTTAATGCTTG-TCATTTTAATTCTCAGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11403054 TTCTAA-
65 -TCCAAG
* * ** * *** ** * * * *
11403060 TCATTTTTATTTTTTGACTGGTGATTTAATCCCTATTGTTTTC-TGTTTCTGAATTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11403124 TTTC-AG
65 -TCCAAG
* ** * * **
11403130 TCA--TTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTAGATCA-TTT--TTTTTT-ACCCATAATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11403189 CTCGA-
66 C-CAAG
* ** * * * ** * * *** *
11403194 TCTTTTTTTTTTCTCTAACTC--GAG-ATAATTTTAG-TTGTTTTCGTTTTCTGACTTACGATTT
1 TCATTTTCATTT-TCTGACTCATG-GTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11403255 AAT-TATGG
63 AATCCA-AG
* * * ** * * *
11403263 TCATTTTAATTTTTTGAC-AATGGTTTAATCCTA-ATTGTTTTTATTTTTGTCATTTCATTCTCT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTT-TGA---C--TC-GT
* * * *
11403326 GG-CTCATGCTTTAAT
58 GGTTTAAT-C--CAAG
* ** *** * * * * *
11403341 TCCA--GTCATTTTCAT-TTTC-TGACCCATAATTTA-ATCCTTGTCATTTTTTTTAACTCGTGA
1 T-CATTTTCATTTTC-TGACTCATG--GTTTAATCTAGATCATTTTCA--TTTTTTGACTCGTGG
11403401 TTTAATTCC-AG
60 TTTAA-TCCAAG
** * * * *
11403412 TGGTTTTCATTTTCTAACTCGTGGTTTTATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTC---GTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11403473 TCC-TG
65 TCCAAG
* * * * * ** * * * *
11403478 ATCATTTTTAATTTTTTGACTAATGATTTTATCCT-TTTCATTTTAATTTTCTCACTCGTGATTT
1 -TCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* *
11403542 AAACTCGA-
63 AATC-CAAG
* * * * * * * * * * * * * *
11403550 TCGTATTAATTTTTTGAATCTTGGTTTAATTTAGATTAGTTTGAATTTTCGACTCTTGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11403615 -CATGG
66 CCA-AG
* ** * * * *
11403620 TCATTTTTATTTTCTGACTCATTATTTAATCCTAG--CAGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
****
11403683 ATTTTGG
64 ATCCAAG
** * * * * * *
11403690 TCGGTTT-ACTTTCTTGACTCATGGATTAATCCTTG-TCATTTTCATTATCTGACTCATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11403753 ATTCTTA-
64 A-TCCAAG
* * * * * * * *
11403760 TCATTTTTATTCTCTGACTCATGATTCAAT-TCATG-TCATTTTTATTTTTTGATTCATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-A-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11403823 AT-GTTG
64 ATCCAAG
** * * *
11403829 ATCATTTTCATCATTT-T-ACTTGTGATTTAATCTCA-ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATT
1 -TCATTTTCAT--TTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
11403891 TAATCCTAA-
62 TAATCC-AAG
* * * * **
11403900 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTTGAT-TTTTTCA-TTTTTGACTCATAATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11403963 CCTAG
66 CCAAG
** * * * ** **
11403968 TCGCTTTCATTTT-TAACTCATGGTTTAATCCCAG-TCATTTTTATTTTTTGACTTATATTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11404031 TTCC-TG
65 -TCCAAG
* * ** * * * *
11404037 TCATTTTCATTCTCTGACTCGTGAATTAATTTTA-ATCATTTTCATTTTTTTCACTCATGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCA-TTTTTTGACTCGTGGTTTA
**
11404101 ATCTTTA-
64 ATC-CAAG
** * ** * * * *
11404108 TCATTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATTGTTTTTATTTTTTTACCCTTGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11404172 T-CTTG
65 TCCAAG
* * * * * * * ** *
11404177 ATCCTTTTCATTTTCTAACTTATGGTTGAGTCCCA-ATTATTTTTCATTTTTTGACTAATGATTT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
**
11404241 AATCCTGG
63 AATCCAAG
** * * * * * * * ** * * * *
11404249 TTGTTTTCATATCCTAACTCGTGATTTAA-ATATGGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11404313 TCCTGG
65 TCCAAG
* * * * * ** * * **
11404319 TTATTTTCATTTTCTGGCTCATGGTATAATCCCA-TTTGTTTTCATTTTCTAACT-GATAATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCG-TGGTTTA
*
11404382 ATGCC-TG
64 AT-CCAAG
* ** ** * * * * * * *
11404389 TCATTTTAATTCACAAACTCATGATTGAATTCCA-ATCGTTTTCATTTTTTGAATTGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11404453 TCCCTA-
65 T-CCAAG
* * ** * * * * *
11404459 TCGTTTTCTATTTT-TGAGTTGTGATCTAATTTCGATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAA
1 TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
**
11404523 T-CTTG
65 TCCAAG
* * * * * * *
11404528 ATAATTTTCATTTT-TTAC-C-TGTAATTTAATCTCGATCATTTT--TTTCTCTAACTCGTGATT
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCATG--GTTTAATCTAGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGGTT
****
11404588 TAATTTTGG
62 TAATCCAAG
** * * * * * *
11404597 TTGTTTTCAATTTCTGACTTATGATTTAAT-TACGATCATTTTAAATTTTTGACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTA-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11404661 TCCCAA-
65 T-CCAAG
* * * ** * * * ** *
11404667 TCATTTTCATTTTTTAACTCATGGTTTAATTTTCATCA-TTTAATTCTCT-AGCTTATGCTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGA-CTCGTGGTTTAA
11404730 TTCC-AG
65 -TCCAAG
* * * ** *** * * *
11404736 TCGTTTTCATTTTCTGACCCCTAATTTAATCCCTATTATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
11404801 -CAAGG
66 CCAA-G
* * * * * * * *
11404806 TCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATC-AGAGCCATTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGA-TCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11404870 TCCTAG
65 TCCAAG
* * * ** * * * * *
11404876 TCGTTTTCA-TTTCTTAACTTATGGTTTAATCCCGGTCCTTTTCATTTTTTCACTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11404940 TCTCGA-
65 TC-CAAG
* * ** ** * * *
11404946 TCCTTTTTCATTTTTTGACTCATAATTTAATCCCGGTCGTTTTCAATTTTTT-ACTCATGGTTTA
1 T-CATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTC-ATTTTTTGACTCGTGGTTTA
***
11405010 ATCTTGG
64 ATCCAAG
* * * * *
11405017 TCATTTTTCATTGTT-TGACTCATTGTTTAATTTCA-ATCATTTTC-TTTTTCTGGCTCTTGTTT
1 TCA-TTTTCATT-TTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTT-TGACTCGTGGTT
*
11405079 TAATACAAG
62 TAATCCAAG
* * * * * * ** * * *
11405088 TCGTTCTAATTTTCTAACTGATGGTTTAA-CTTAGGTTGTTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTGA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-TAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT-A
* **
11405152 TTGTAA-
64 ATCCAAG
** * * * * ** * * *
11405158 TTGTTTTGATTTTTTGACTCGTGGTTTCATCCCGATCATTTT--TTTTTTGACTGGTGGTGTAGT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
*
11405221 -CATGG
66 CCA-AG
* ** ** * * * * * ** *
11405226 TCATTTT-TTATTTCAAAACTTGTGATTTAATCCCA-ATCGTTTTCGTTTCTTGACTTATGATTT
1 TCATTTTCAT-TTTC-TGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTT
* **
11405289 AAACCTGG
63 AATCCAAG
* * * * * ** * **
11405297 TCGTATTCATTTTTTGACTCACGGTTTAATTTCA-ATTGTTTTCATTTTCTGAC-AATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-AGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11405360 TCTC-GG
65 TC-CAAG
* * * * * *
11405366 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAGTCCCA-ATCATTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
* * *
11405430 TTTTCGA-
64 -ATCCAAG
* * * * ** * * * ** *
11405437 TCGTTTTCTTTTTCTAACTCGTAATTTCAACCT-GGTCATATTCATTTTTTGGGTCATGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
*
11405501 TCC-CG
65 TCCAAG
* * * * * * ** *
11405506 ATCATTTTCATTTTATGAGT-AGTGCTTTAATTTTGGTTGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
1 -TCATTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11405570 ATCTC-GG
64 ATC-CAAG
** * * * *
11405577 TCATTTTCAATTTT-TGACTTGTGATTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTTTGAATCATGGTTTAA
1 TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11405641 TATCTA-
65 T-CCAAG
* * * * * * *
11405647 TCGTTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATCCT-GATCATTTTTAGTTTTTGACTCATAGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
11405711 TACCAA-
65 T-CCAAG
* * * * ** * * * * *
11405717 TCGTTTTTTATTTTTTGACTCGTAATTTAATCTTGATCATTTTTATTTATTGACCCGTGATTTAA
1 TC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
* *
11405782 ACC-TG
65 TCCAAG
* * * * * * *
11405787 ATCGTATTT-ATTTTCTAACTCGTAGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTCTAACTCGTGGTTTA
1 -TCAT-TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTAGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
*
11405851 ATCCTAG
64 ATCCAAG
* * * *
11405858 TCGTTTTTATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCTAG-TCATTTTCATTTTCTCG-CTTGTGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTAGATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGGTTTA
11405921 ATCCTAA-
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***
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*
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* *
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*
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* * * * * * * *
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****
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****
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**
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*
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*
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***
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**
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*
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* ** * * * ** * *
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***
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** * * * * * *
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*
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** * * ** ** * * * * * * *
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*
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*
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*
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*
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** **
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* * * * *
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* * *
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* * ** *
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* * * *
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** ** * *
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*
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* * *
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* * * * *
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* * **
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* *
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*
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* *
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ACTCAA
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* ** * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * ***
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* * * ** * * ** * * *
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* * **
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* * ****
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* * * *
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* * * * * *****
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* * * *** *
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* * * * * * * * ** **
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* * **
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * *
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* *** * * * * * *
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**
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* * *
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***
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*
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*
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*
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**
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*
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** * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * *
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*
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* ** * * *
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* * * *
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*
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* * * * **** *
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* * * * * * * * * *
11381139 TTGTAGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAATCT-TATCATTTTCATTCT
64 TTATGGTTTAATCCTAATAATTTTCATTTTCTAATTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTT
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** *
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** * * * * *
11381277 CGTGATTTAATTCC-AATGATTTTCATTTTCTAATTCATGGTTTTATCTCGACCATTTTTATTCT
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* * * ** *
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1 TTTAATCCTAGTTGT-TTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCAAT--TGTTTCATTTTTTGA
* * * **
11381416 GTTTTGGTATAATCCTAATAATTTTTCATTCTT-TAATTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCAT
63 CTTATGGTTTAATCCTAATAA-TTTTCATT-TTCTAATTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCAT
*
11381480 TTTCTGACTCATGG
126 TTTCTGACTCATGA
* ** * *
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1 TTTAATCCTAGTTGTTTTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCAATTGTTTC-ATTTTTTGAC
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ATGGTTTAATCCTAATAATTTTCATTTTCTAATTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCT
GACTCATGA
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* * * * **** *
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* * * * * * ** * * *
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64 TTATGGTTTAATCCTAAT-ATTTTTCATTTTCTAATTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTT
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128 TCTGACTCATGA
** *
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** * ** * * *
11381277 CGTGATTTAATTCC-AATGA-TTTTCATTTTCTAATTCATGGTTTTATCTCGACCATTTTTATTC
65 TATGGTTTAA-TCCTAAT-ATTTTTCATTTTCTAATTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATT-
11381340 TT-TGACTCATGA
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* * * ** *
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1 TTTAATCCTAGTTGT-TTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCAAT--TGTTTCATTTTTTGA
* * *
11381416 GTTTTGGTATAATCCTAATAATTTTTCATTCTT-TAATTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCAT
63 CTTATGGTTTAATCCTAAT-ATTTTTCATT-TTCTAATTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCAT
*
11381480 TTTCTGACTCATGG
126 TTTCTGACTCATGA
* ** * *
11381494 TTTAATCCTAATCATTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAACCCAATTGTATCAATTTTTTGAC
1 TTTAATCCTAGTTGTTTTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCAATTGTTTC-ATTTTTTGAC
* * * * * * * *
11381559 TTATGGTTTAATCCTAATCTTTTTTATTTTGTGACTTGTGATTTAAT-TCGGGTTATTTTCATTT
64 TTATGGTTTAATCCTAATATTTTTCATTTTCTAATTTGTGGTTTAATCTC-GATCATTTTCATTT
* **
11381623 TCTAACTCACAA
128 TCTGACTCATGA
* * * * * *
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1 TTTAATCCTAGTTGTTTTTATTTTTTGACTCATG-A-TTTAATCCCAAT-T-G-TTTCATTTTTT
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61 GACTTATGGTT
11381707 AAATTTGGGT
Statistics
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ATGGTTTAATCCTAATATTTTTCATTTTCTAATTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCT
GACTCATGA
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* * * * *
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* * *
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* * ** *
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* *
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Statistics
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ATTTAATCCCAATCATTTTCATTTTTTAACTTGTAATTTAATCCCGATCGTTTTCTATTTCTAGA
TCGTGATTTAATTTCGATCGTTTTCATTTTCTGACTTATA
Found at i:11382392 original size:139 final size:139
Alignment explanation
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Period size: 139 Copynumber: 3.5 Consensus size: 139
11382234 ATTTCGATCG
** *
11382244 TTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTTAACTTGTAATTTAATGTC
1 TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTTAACTTGTAATTTAATCTC
* * * * *
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66 GATTGTTTTTTTCTCTGACTCGTGATTTAATTTCGGTAGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAA
*
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* * * ** ** *
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*** ** * * * * * * *
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11382511 AATCCCTA-TCA
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* ** * * *
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** * * * ** * *
11382587 GATCATTTTTTTCTCTGACTTGTGATTTAATTTTGATCCTTTTCATTTTTTGACATGTGGTTTAA
66 GATTGTTTTTTTCTCTGACTCGTGATTTAATTTCGGTAGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAA
11382652 TCCTAGTCA
131 TCCTAGTCA
* * * *** *
11382661 TTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATTATGGA-CATTTTCATTTTTTAACTTGTAGTTTAATC
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Statistics
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GATTGTTTTTTTCTCTGACTCGTGATTTAATTTCGGTAGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAA
TCCTAGTCA
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11382347 GTTTTCATTT
* * * *
11382357 TCTGACTTATAATTTAATTCTAGTCA-TTTCAATTTTTTGA-CTCGTGGTTTAATCTCAATCATT
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*
11382420 TTCATTTTTTTACTCATGGTTTAATTTTTTTTGTTTCATCC
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* ** *
11382461 TCTGGCTCATGCTTTAATTCCAGTAGTTTTCATTTTTTGATCCGTGATTTAATCCCTATCATTTT
1 TCTGACTCATAATTTAATTCCAGTAG-TTTCATTTTTTGATCCGTGATTTAATCCCAATCATTTT
*
11382526 CATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
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11382549 CCCGGTTGTT
Statistics
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* *
11385366 TCATTTTCTAATCCCACTCGTTT
1 TCATGTTCTAATCCCACTCGCTT
*
11385389 TCATTTTCTAA
1 TCATGTTCTAA
11385400 CTCATAGTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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11385446 ATTCCAATCG
* ** * * * *
11385456 TTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATC-CCTATCGTTTTCTATT-TCTAAATTGTAATTTAATT
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*
11385519 TCGATCATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCAT-TCA
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* * * *
11385626 -GCTGTTTTCATTTTCTGACTTATGATTTAAT-TATGGTCA
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* * * * ** ** * *
11385665 TTTTAATTTTTTGA-CT-CATGGTTTAATTTTCATCATTTCATTCTCTGGCTCATGTTTTAA-TT
1 TTTTCATTTTTTGACCTGCA--ATTTAATCTCCATCATTTTTTTCTCTAACTCGTGATTTAATTT
* * *
11385727 CTAATCATTTTCATTTTCTT-ACTTGTGATTTAATTCC-TATCA
64 C-GATCATTTTCATTTT-TTGACTTATGATTTAA-TCCATGTCA
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1 TTTTCATTTTTTGAC
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ATCATTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAATCCATGTCA
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Alignment explanation
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Period size: 104 Copynumber: 2.4 Consensus size: 104
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* * * *
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1 TTTTCATTTTCTTACTTATGATTTAATTATGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT
* * * * *
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* * * *
11385734 TTTTCATTTTCTTACTTGTGATTTAATTCCT-ATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATTC
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** * **
11385798 TAATGGTTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATTCCAATAA
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* *
11385839 TTTTC-TTTTCTCTCACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTT
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11385885 CTAACTCTTG
Statistics
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TTTTCATTTTCTTACTTATGATTTAATTATGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT
AATCATTTCATTCTCTGACTCATGGTTTAATTCCAATAA
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11386387 ATCTCAGTCA
* *
11386397 TTTTCATTTTTTGACTCGTGACTTAATCCTAATCG
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*
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** * *
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1 TTTTCATTTTCTG--ACATGACTTAATCCTAATCG
** * * *
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* * *** *
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65 TGGT
* * * *
11386487 TTAATCCTGATCTTTTTCATTTTCTGACACAATTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTGTACTCAT
1 TTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACACAACTTAATCCTAATCATTTTCATTTTTGTACACAT
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66 GGT
* *
11386555 TTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
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11386583 TCATAGTTTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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GGT
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* *
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* * **
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131 TCGATTG
** * * * * *
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** * * *
11386769 TAG-TTGTTTTCAGTTTTTGACCCTTGGTTTAATCCCAATCCTTTTCAT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TCGATTG
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Period size: 141 Copynumber: 2.2 Consensus size: 140
11386681 TGGCTTGTCA
* * * * * ** *
11386691 TTTAAT-CTCGATTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTTATCTTGGTCATTTTCATTTTTTGAC
1 TTTAATCCT-GATTGTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAATCCTAGTCATTTTCATTTCCTAAC
* * * *
11386755 TCGTGACTTAATTTTAGTTGTTTTCAGTTTT-TGACCCTTG-G-TTTAATCCCAATCCTTTTCAT
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**
11386831 TTTAATCCTGATTGTTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAATCCTAGTTGTTTTCATTTCCTAAC
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* * * * *
11386896 TCGTGATTTAAATCTGGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATCTCAGTTATTTTCATTTT
65 TCGTGACTTAAATCTAGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATCCCAATCATTTTCATTTT
*
11386961 CTAGCTCATGG
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*
11386972 TTTAATCC-CACTTGTTTTCATTTT
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11386996 CTAACTCATA
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 21, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
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TTTAATCCTGATTGTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAATCCTAGTCATTTTCATTTCCTAACT
CGTGACTTAAATCTAGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATCCCAATCATTTTCATTTTC
TAACTCATGG
Found at i:11388421 original size:33 final size:32
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Indices: 11388323--11388430 Score: 94
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11388313 AATCATTTTC
* ***
11388323 ATTTTTTGGCTTGTGATTTAATCCCTATCATT
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* * *
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*
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1 ATTTTTTGAC
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Statistics
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ATTTTTTGACTTGTGATTTAATCTGGATCATT
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* * * *
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1 ATTTTCCTTTCTTGACTCATGGATTAATCCCTGTCATTTTCATTATCTGACTCATGGTTTAATTC
*
11389166 TTGTCGTTTTATTTCTCTGACTCGTGATTCA
66 TTGTCATTTTATTTCTCTGACTCGTGATTCA
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1 AT
11389199 CTTTGTCATT
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ATTTTCCTTTCTTGACTCATGGATTAATCCCTGTCATTTTCATTATCTGACTCATGGTTTAATTC
TTGTCATTTTATTTCTCTGACTCGTGATTCA
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11390638 TCAATCCTTT
* * * * * * *
11390648 TCATTTTTATTTTTTGATTCATGACTTAATGCTGATCATTTTCATCATTT-T-ACTTGTGATTTA
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* * *
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* * * * *
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1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CTGGTCGTTCTCATTTTCTAACTTGAGATTTAA
** * * * * *
11390851 T-CCTTTTCATTTTCATTTTTTGACTTACGATTTAATCTCAATCATTTTTCATTTTTTTATTCAC
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11390915 TGTTTAATCTCGA
127 TGTTTAATC-CGA
11390928 TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCTGGGTCGTTCTCATTTTCTAACTCAT-AG-TTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCT-GGTCGTTCTCATTTTCTAACT--TGAGATTTA
** * ** * * *
11390991 ATCCCAATTGTTTTTCTTTTTTTGACTGGTGGTTTAATC-CTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCG
63 ATCCCAATTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTC-GATCTTTTTCATTTTTTAACTC-
*
11391055 TTGTTTAATCACGA
126 ATGTTTAATC-CGA
* * * * * * * * * *
11391069 TCATTTTCATTTTCTGACTCTTGAATTAATCTCGATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCT-GGTC-GTTCTCATTTTCTAACTTGAGATTT-A
*** * * * * * * * **
11391134 AT--CTGGTCATTTTCATTTCTTGACTCATGATTTAAAC-CTGGTCATATTCATTTTCTGACTTG
63 ATCCCAATTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTC-GATCTTTTTCATTTTTTAACTCA
**
11391196 TGGTTTAATCTTTA
127 T-GTTTAATC-CGA
* * * * * * * *
11391210 TCATTTTCATTTTCTGACTCATAATTTAATTTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCAT-AG-TTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCT-GGTCGTTCTCATTTTCTAACT--TGAGATTTA
* * * * * * * * *
11391273 ATCCC-GTTCGTTTTCAATTTTTAACTTATGGTTTAATTTCTAT-TGTTTTC-TTTCTCTT-GCT
63 ATCCCAATTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCT-TTTTCATTT-T-TTAACT
* * **
11391334 CGTGACTTAATTTTGA
125 CATG-TTTAA-TCCGA
* * * *** * *
11391350 TCGTTTTCATTTTTTTGACTCATGATTTAATCCCATCGCTCTCATTTTCTAACTT-ATAATTTAA
1 TCATTTTTA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCTGGTCGTTCTCATTTTCTAACTTGA-GATTTAA
* * * * * * * *
11391414 TTCTAATT-GTTTTCATTTTTTTACAT-GTGATTTAAT-TCTGATCGTTTTCATTTTTTGACCCA
64 TCCCAATTCATTTTCATTTTTTGAC-TCATGATTTAATCTC-GATCTTTTTCATTTTTTAACTCA
* ** *
11391476 TAATTTAATTTTGG
127 T-GTTTAA-TCCGA
*
11391490 TCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCT
1 TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCT
11391522 CGATCATTTT
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TCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCTGGTCGTTCTCATTTTCTAACTTGAGATTTAATC
CCAATTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCTTTTTCATTTTTTAACTCATGTT
TAATCCGA
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11392293 GTTGTATTTG
* * * *
11392303 TTTTCTGAGTCATGGTTTAATTCGAACCATTTTCATTTTTTAACTCGTGGTTTAATTCGGGCCAT
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** * * *
11392391 TTTTCTAACTCATGGTTTAA-TCTGGGCCATTTTCATTCTTTGACTCGTGGTTTAA-TCTTAGTC
1 TTTTCTAACTCATGGTTTAATTC-GAACCATTTTCATTCTTTAACTCGTGGTTTAATTC-GAGCC
* *
11392454 ATTTTCATTTCCTGACTCGT
64 ATTTTCATTCCCTGAATCGT
11392474 GGTTTAATCT
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TTTTCTAACTCATGGTTTAATTCGAACCATTTTCATTCTTTAACTCGTGGTTTAATTCGAGCCAT
TTTCATTCCCTGAATCGTTTTCA
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11392442 TTAATCTTAG
* * ** * * *
11392452 TCATTTTCATTTCCTGACTCGTGGTTTAATCTTGGTCCTTTTTATTTTCTGACTCGT-GTTTTAA
1 TCATTTTCATTTCCTGACCCATGGTTTAATCTCAGTCATTTTCATTTTCTGACTCATAG-TTTAA
11392516 TCCCGATCCTTT
65 TCCCGATCCTTT
** *
11392528 TCATTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCTCAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTCCTGACCCATGGTTTAATCTCAGTCATTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAAT
11392593 CCCGAT
66 CCCGAT
11392599 TATTTTTCAC
Statistics
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TCATTTTCATTTCCTGACCCATGGTTTAATCTCAGTCATTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAAT
CCCGATCCTTT
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11392375 CCCTGAATCG
* * ** *** * *
11392385 TTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTGGGCCA-TTTTCATTCTTTGACTCGTGGTTTAATCT
1 TTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATCCCGATTATTTTTCACTCTTTGACTCATGGTTTAATCT
* * * **
11392449 T-AGTCATTTTCATTTCCTGACTCGTGGTTTAATCT-TGGTCCTTTTTATTTTCTGACTCGTGTT
66 TGA-TCATTTTCAATTCCTAACTCGTGGTTTAACCTAT-GTCCTTTTTATTTTCTGACTCGTGGC
*
11392512 TTAATCCCGATCCTTTTCATTTTCATTTT-TTGACCCATGGTTTAATCTCAGTCA
129 TTAAT--C--T-C-TGTCATTTTCATTTTCTT-ACCCATGGTTTAATCTCAGTCA
* * *
11392566 TTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAATCCCGATTATTTTTCACTGTTTGACTCATTGTTTAATCT
1 TTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATCCCGATTATTTTTCACTCTTTGACTCATGGTTTAATCT
* * ** *
11392631 TGATCATTTTCAATTGCTAACTTGTGGTTTAACCTATGTGGTTTTTATTTTCTGACTTGTGGCTT
66 TGATCATTTTCAATTCCTAACTCGTGGTTTAACCTATGTCCTTTTTATTTTCTGACTCGTGGCTT
* **
11392696 AATCTCTGTCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAATCTTGGTCA
131 AATCTCTGTCATTTTCATTTTCTTACCCATGGTTTAATCTCAGTCA
* *
11392742 TTTTCATTTTCTGACTCTTGGTTTAATC
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11392770 TTAGTCATTT
Statistics
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TTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATCCCGATTATTTTTCACTCTTTGACTCATGGTTTAATCT
TGATCATTTTCAATTCCTAACTCGTGGTTTAACCTATGTCCTTTTTATTTTCTGACTCGTGGCTT
AATCTCTGTCATTTTCATTTTCTTACCCATGGTTTAATCTCAGTCA
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11393210 TAACTTGTGA
11393220 TTTAATTTTGA-TCATT
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11393253 GGTTTAATCC
Statistics
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TTTAATTTTGACTCATT
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Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
11393253 GGTTTAATCC
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*
11393284 CAGTTGTTTTCATTTTTGTCT
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11393305 CA
1 CA
11393307 TGGTTTAATT
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CAGTTGTTTTCATTTATGTCT
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Period size: 36 Copynumber: 2.0 Consensus size: 32
11395060 CTGTTAGTTC
11395070 ATTTTCTGACTCACAGTCTAATATCAGTTATTTTT
1 ATTTTCTGACTCACAGTCTAATATCAGTTA---TT
11395105 CATTTTCTGACTCACAGTCTAATATCAGTTATT
1 -ATTTTCTGACTCACAGTCTAATATCAGTTATT
11395138 TTTCATTTTC
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ATTTTCTGACTCACAGTCTAATATCAGTTATT
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11395881 TTGACTCGTG
11395891 GTTTAATACCAATCGTTTCATTTTCTAACTT
1 GTTTAATACCAATCGTTTCATTTTCTAACTT
11395922 GTTTAATACCAATCGTTTCATTTTCTAACTTGT
1 GTTTAATACCAATCGTTTCATTTTCTAAC-T-T
* *
11395955 GGTTTAATCCCAATCGTTTTTCATTTTCTAAATT
1 -GTTTAATACCAATCG--TTTCATTTTCTAACTT
11395989 GT
1 GT
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Statistics
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GTTTAATACCAATCGTTTCATTTTCTAACTT
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Period size: 176 Copynumber: 27.8 Consensus size: 176
11394145 ATCCTGATCT
* * ** * * *
11394155 TTTTCATTTTTTTACTCATGATTTAAT-CCTATTCGTTTTTATTTTTTTACTCATGGTTTAA-TC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCGGTT-GTATTTATTTTTTGACTCATGATTTAATTC
* ** * * * * **
11394218 TCAGTCATTTTCATTTCCTGACT--TGTAGTTTAATCCTA-TTCATTTTTCATTGTTTGACTTGT
65 -CAATCATTTTCATTTTTTGACTCATG-A-TTTAATTC-AGATC-GTTTTCATTTTTTGACTCAT
* * * * ** **
11394280 TGTTTAGTCCTAATT-ATTTTCATTTTTTGACTTGTCG-TTTAA-CTTGGGTCA
125 GGTTTAATCCTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCAT-GATTTAATC-TCAGTCA
* ** * *** * * *
11394331 TTTTCATTTTCTAACTCGTGGCTTAATCCTGGCCAT-TTTCAGTTTTTGACTCGTGAGTTAA-TC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCGGTTGTATTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATTC
* * * ** * * * **
11394394 CTTATCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATTTTGGTCGTTTACAGTTTTTGA-GAATGGTT
65 C-AATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCAGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTT
* * * * * * *
11394458 TAATCATAATCG-TTTTCATTTTCTAACTTATGATTTAATCATGA-TCA
129 TAATCCTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATC-TCAGTCA
* * * * ** * *
11394505 TTTTGATTTTTTGACTCATGTTTTAATCCTAGTAGT-TTTGATTTTCTGACTCATGATTTAA-TC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCGGTTGTATTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATTC
* * * ** * * *
11394568 TCGATCGTTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCTCAG-TCATTTTCATTTTTTGACTTATGGT
65 -CAATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TCAGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGT
* * * * **
11394632 TTAATCGC--GGTCTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTGGGTCA
128 TTAATC-CTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCAGTCA
* * * * * * ** *
11394680 TTTTTCTTTTTTTGACT-ATTGGTTTAATCTCGATCAT-TTTCA-TTTTTGACTCATGGTTTAA-
1 -TTTTCATTTTCTAACTCA-TGATTTAATCCCGGTTGTATTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAAT
* * * * * * * * **
11394741 TCTAGGTCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATTTAGGTCATTTTCATTTTATGACTCACAA
63 TCCA-ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCAGATCGTTTTCATTTTTTGACTCA-TG
* * * * **
11394806 TTTTAATTCTAGTTGTTTTT-ATTTTCTGACTCATGCTTTAATCT-AGGTTG
126 GTTTAATCCTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCA-GTCA
* * ** * * **** * ** ** *
11394856 TTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTAATCTCAACCG-ATTTCATTTTCTGACTTGTGCCTTAATAC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCGGTTGTATTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATTC
* * * * * * * * * **
11394920 CGATCATTTTCATTTTTTGACTAAGGGTTTAATCCCTG-TCATTTTTCATTTTCTGACCCA-GCA
65 CAATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TCAGATC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGGT
* * * *
11394983 TTAGT-CTCA-TTCATTTTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATTTTAGTCA
128 TTAATCCT-AGTT-GTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCAGTCA
* * * * * * * * *
11395031 TTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAATCTCTG-T-TAGTTCATTTTCTGACTCA-CAGTCTAAT
1 TTTTCATTTTCTAACTCA-TGATTTAATCCCGGTTGTA-TTTATTTTTTGACTCATGA-TTTAAT
* * * * * * ** *
11395092 AT-CAGTTATTTTTCATTTTCTGACTCA-CAGTCTAATATCAGTTATTTTTCATTTTCTGACT--
63 -TCCAATCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGA-TTTAAT-TCAGATCGTTTTCATTTTTTGACTCA
* ** *
11395153 TGCTGTTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTTTGACTCTTGATTTAATCT-AGATCA
124 TG--GTTTAATCCTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCAG-TCA
** * ** * * * ** *
11395207 TTTTCATTTTCTAACTCAT-AGTTTAATCTTGATCATTTTTCTTTTTCTGATTGGTGGTTTAA-T
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGA-TTTAATCCCGGTTGTATTTATTTTT-TGACTCATGATTTAATT
** * * * **
11395270 CCTGTTCATTTTTATTTTTTGACTCAT-AGTTTAATCTAAG-TCATTTTCATTTTTTGACTTGTG
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** * * ** **
11395333 GTTTAATTCC-AG-TCATTTTCATTTTCTGACTTC-TGGTTTAAT-TTGGTTGT
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* * * *** ** *
11395383 TTTTCATTTTTTGACT--TGGATTTAAACCTAATCAT-TTTCATTTCTTGACTCATGATTTAAAC
1 TTTTCATTTTCTAACTCAT-GATTTAATCCCGGTTGTATTT-ATTTTTTGACTCATGATTT-AA-
* ** * * ** * *
11395445 TT--GATTGTATTCATTTTTTGATTTGTGATTTAATCTCAG-TCATTTTTATTTTTTGACTCATG
62 TTCCAATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TCAGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATG
* * * * * * *
11395507 ATTTATTTCGA-TCG-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGGTCA
126 GTTTAATCCTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCAGTCA
* * * * ** * * * * * * *
11395556 TTTTCATTTTTTGACT-ATGGTTTAATTCTTGTTGTCTTCT-TTCTCTGACCCAAGCTTTAATTA
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCGGTTGTATT-TATTTTTTGACTCATGATTTAATTC
** * * * * * * * *
11395619 CTGTCGTTTTCATTTGTTGAC-CTATAATTTAATCCCTGA-CATTTTCATGTTTTGACTCATGAT
65 CAATCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGATTTAAT-TCAGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGT
* * * * * * ** *
11395682 TTAAT-TTTGATCG-TTTTCATTTTTTAACTCGTGGTTTAATCTTGGTCG
128 TTAATCCTAG-TTGTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCAGTCA
* * * * ** * *
11395730 TTTTCATTTTTTCACCCATGATTTAATCCCTGTCATTTTTATTTTTTGACTTC-TGATTTAATTT
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCGGTTGTATTTATTTTTTGAC-TCATGATTTAATTC
*** * * * * * * * **
11395794 TGGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCTTGGTTGTTTACATTTTCTGACTGGTGGTT
65 CAATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTC-AGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTT
** * * * * *
11395858 TAATTTTGGTTGTTTTTCATTTATTGACTCGTGGTTTAATAC-CAATC-
129 TAATCCTAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCAGTCA
* * ** * * * * ** * *
11395905 GTTTCATTTTCTAACT--TG-TTTAATACCAATCGT-TTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCCC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCGGTTGTATTTATTTTTTGACTCATGATTTAATTCC
* * * * ** * * * *
11395966 AATCGTTTTTCATTTTCTAAATTGTGGTTTAATCCTAG-TCGTTTTTATTTTTTGACTCATGATT
66 AATC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTC-AGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTT
* * * * * * * *
11396030 TAAT-TTTGATCG-TTTTCATTTTTTGAATCGTGGTTTAAT-TCCAATCGT
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* * ** * ** ** * ** * *
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* * * * * * ** ** ** * *
11395828 TTGGT--TGTTTACATTTTCTGACTGGTGGTTTAATTTTGGTTGTTTTTCATTTAT-TGACTCGT
126 CTGATCAT-TTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCT-AATCATTTTCATTT-TCTAACTAGT
* * * * *
11395890 GGTTTAATACCAATC-G-TTTCATTTTCTAACT--T-GTTTAATACCAATC-GTTTCA
188 GATTTAATCCCAAACAGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTCA
* ** * *** * * * * ** * *
11395942 TTTTCTAACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTTCATTTTCTAAATTGTGGTTTAATCCTAGTCG
1 TTTT-TGACTCATGATTTAATCCTTGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAGTCA
* * ** * * * *
11396007 TTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATTTTGATCGTTTTCATTTTTTGAA-TCGTGGTTTAATTC
64 TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTAAGATCATTTTCATTTTCT-AACTC-TTGTTTAA-GC
* * * * * * * * * * *
11396071 C-AATCGTTTTTCACTTTCTGACTTGTGATTTAATTCTAGTCATTTTTATTTTCTTACTTGTGGT
126 CTGATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTAATCATTTTCATTTTCTAACTAGTGAT
* * ** ** * * *
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191 TTAATCCCAAACAGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAATCA-TTTTCA
* * * * * *
11396190 TTTTTTGACTCACGATTTGATCCTGGTCATTTTCATTTTCTGACTCTTGGA-TAAAT-CTGAGTC
1 -TTTTTGACTCATGATTTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCAT-GATTTAATCCT-AGTC
* * * * * * * *
11396253 ATTTTCA-TTTTTGCCTCAAT--TTCATCCCATT-CGTTC-TTTT-TTTTTTTGACTCATGGTTT
63 ATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTT--T--AATTAAGATCATTTTCATTTTCTAACTC-TTGTTT
* * * * * * * * * *
11396312 AATCCCGATCGTTATTCTTTTTTTTACTCATG-TTTCAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTC
122 AAGCCTGATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTT-AATCCTAATCATTTTCATTTTCTAACT-
* *** * * * * * * *
11396376 A-TGGTTTAATCCC-AGTTGTTTTTCATTTTTTGACCCGTGATTTAATCTCAGTCATTTTCA
185 AGTGATTTAATCCCAAACAG-TTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTCA
* * * * *
11396436 TTTCCTAACTCATGATTTAAACCCAGTTGT-A-TTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TTCGC
1 TTT-TTGACTCATGATTT-AATCC--TTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAG-
* * ** ** * * *
11396497 TTATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATTCCCG-TTGTTTTCATTCTCTGACTCATGATTTAA
61 TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATT-AAGATCATTTTCATTTTCTAACTCTTG-TTTAA
** ** * * ** ** * *
11396561 TTCT-AGTTGTTTTT-ATTTTTTGACTCATAATTTAATTTTGGTCTTTTTCATTTTCTGACTCA-
124 GCCTGA-TCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTAATCATTTTCATTTTCTAACT-AG
* * * * * ** *
11396623 TGGTTTAATCTCGATCA-TTTTCATTTT-TAGACCCATCATTTAATCCCAATCATTTTCT
187 TGATTTAATCCCAAACAGTTTTCATTTTCTA-ACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTCA
* ** * * * * * * * * *
11396681 TTTCTCTTACTTGTGATTAAAT-ATGGATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAACCTAATT
1 TTT-T-TGACTCATGATTTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAGTC
* * * ** * * * *
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63 ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTAAGATCATTTTCATTTTCTAACTC-TTGTTTAAGCC
* * * * * * * * * *
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127 TGATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCT-AATCATTTTC-ATTTTCTAACTAGTGA
* ** * * * * * * *
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190 TTTAATCCCAAACAGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTCA
* * * ** **
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1 TTTTTGACTCATGATTTAATCCT-TGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAGTCAT
* *** * * *
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** * ** * * **
11397048 AGTTGTTTTTC-TTTTTCTGACT-GATGGTTTAAT-CT-CGCTTGTTTCATTTTTTGGCTCA-TG
129 A-TCATTTTTCATTTTT-TGACTCG-TGATTTAATCCTAATCAT-TTTCATTTTCTAACT-AGTG
* * **** * * *
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189 ATTTAATCCCAAACAGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAA-TCATTTTCA
* * *
11397164 TTTTCTGACTCGTGGTTTAAT--TTCGATCATTTTCATTTTGTT-ACTCAT-AGTTTGATCCCTA
1 TTTT-TGACTCATGATTTAATCCTT-G-TCATTTTCATTTT-TTGACTCATGA-TTTAAT-CCTA
* * * * * *
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60 GTCATTTTCA-TTTTTTGACTCA-TGGTTTAAT-TAAGATCATTTTCATTTTCTAACTC-TTGTT
* ** * * *
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121 TAAGCCT-GATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATC-----C----T-A------ATCA
* * * * * ** * *
11397350 TTTTTCTTTTTCTAATTAGTGGTTTAATTCGAGTCA-TTTTCA-TTTCTTGACTCAGGGTTTAAT
169 -TTTTCATTTTCTAACTAGTGATTTAATCCCAAACAGTTTTCATTTTC-TAACTCATGGTTTAAT
* ** *
11397413 CTCGGTCATTTTTTA
232 CCCAATCA-TTTTCA
* * * * ** * *
11397428 TTTTCTGGC-CCTGGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTTTGGTCG
1 TTTT-TGACTCAT-GATTTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAGTCA
* **** * ** *
11397492 TTTTCATTTTTTGA-T-TTGCGATTTAATCCCTATCATTTTCATTTTCTGACTCACGATTT-ATC
64 TTTTCATTTTTTGACTCATG-G-TTTAATTAAGATCATTTTCATTTTCTAACTCTTG-TTTAAGC
* * * * * *
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* *** ** * *
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187 TGATTTAATCCCA-AACAGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAATCAT-TTTCA
* ** * * * * * * * ** *
11397672 TTTTTCTATCTGGTGGTTTAATCCCTATCGTTGTCAATTTTTGACT--TGTAGTTCAATTATGGT
1 TTTTT-GA-CTCATGATTTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-A-TTTAATCCTAGT
** * ** * * * *
11397735 TGTTTTCACTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AG-TTGTTTTCATTTTTTGAGTCTTGGTTTCA
62 CATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT--TAAGATCATTTTCATTTTCTAACTCTT-GTTTAA
* * * * * * ** * * *
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124 GCCTGATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTAATCATTTTCATTTTC-TAACTAGT
* ***** * * *
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188 GATTTAATCCCAAACAGT-TTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCC-A--A---TCATTTTCA
* ** * *
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1 TTTT-TGACTCATGATTTAATCCTT--GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAGTC
* ** ** *
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* ** *
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* * **
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* *
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1 -TTTTTGACTCATGATTTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATC-CTAGTCA
* * *
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* * * * * *
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127 TGATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTAATCATTTTCATTTTCTAACTAGTGATT
* * * * **
11398362 TAATCCCTATCATTTTTCATTTTTTAACTCATGGTTTAATTGCAATCATTTTCA
192 TAATCCCAAACAGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTCA
*
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TTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTAAGATCATTTTCATTTTCTAACTCTTGTTTAAGCCTGAT
CATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTAATCATTTTCATTTTCTAACTAGTGATTTAAT
CCCAAACAGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTCA
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* * *
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* ** * *
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* * * * * *
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**
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* * * ** *
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* * * ** *
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*
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189 TCGTTTTCATTTTTTGACTC
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TCATGGTTTAATCTAAATCATTTTCATTTTTTGACTCAAGGTTTAATCCCAATCGTTTTCTTTTT
CTAACTTAAGGTTTAACCCCGATCGTTAATCTTGTTTTGACTCAAGACTTAATCCTGGTCGTTTT
CATTTTTTGACTCATAATTTAATTTTGATTGTTTTTATTTCTCCATCTCCTTA
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* * *
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* * *
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* * * * * * * **
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** *
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* *
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TAGTCATTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCCGAACATTTTTTTTGAATCATGATTTAATT
TTGATCATTTTCATTTTCTCACATGTGGTTTAATCC
Found at i:11400231 original size:173 final size:172
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Period size: 173 Copynumber: 2.5 Consensus size: 172
11399906 TTAGTGCCTG
* * *
11399916 TCATTTTCATTCTCTGACACATGATTTAACTT-TAGTTATTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAA
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** * * * ** * * *
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* * *
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** * *
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* * *
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* * *
11400213 GTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTTAACTTATGCTTTAATTCTTA
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*
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*
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Statistics
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TCATTTTATTCTCTGACTCATGATTTAATTCTAGTTGTTTTCATTTTTCACTCGTGATTTAATCC
CTGTCGTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATTACGGACATTTTCATTTTCTAACTTGTAGTTTA
ATCCCGATCATTTTCATTTTTTAACCTATGATTTAATTCTGA
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Indices: 11399953--11400548 Score: 415
Period size: 138 Copynumber: 4.3 Consensus size: 136
11399943 AACTTTAGTT
* * * * * *
11399953 ATTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCCTAACATTTTTT-T-TGAA-TCATGATTTAATTTT
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* ** * ** * *
11400015 GGTCATTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACCTATGATTTA
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11400080 ATCTCGATC
128 ATCTCGATC
* * ** ** * * * * *
11400089 ATTTT--TTCTCTGACTTGTGATTTAATT-TTGATTGTTTTCATTTTTTCACAT-GTGGTTTAAT
1 ATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTT-ATCATTTT--TTCTCTAAC-TCATGATTTAAT
* * * ** * * *
11400150 CCTAGTCGTTTTCATTTTCTGGCTTGTGATTTAATTACGGACATTTTCATTTTTTAACTTGTAGT
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*
11400215 TTAATCCCGATC
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* * * *
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* * * * *
11400292 TAGTTGTTTTCATTTTTGACTCGTGATTTAATCCCTGTC-GTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTT
64 TAGTTGTTTTCATTTTTGACTTGTGATTTAATCCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTG-TTTA
*
11400356 ATCTTGATC
128 ATCTCGATC
* * *
11400365 ATTTTTATTATTTGACGCATGATTTAATTC-TAGTCGTATTTTTTCTCTAACTCATGATTTAATT
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* * * * *
11400429 -TCAATCAT-TTTTCATTTTTTGAGTTTTGGTTTAATCCCAGTCATTTTTCATTTTTTGATTTGT
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*
11400492 GGTTTAATCTCAATC
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* *
11400507 ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTTAATCATTTTTT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (136 bp):
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GTTGTTTTCATTTTTGACTTGTGATTTAATCCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTGTTTAATC
TCGATC
Found at i:11400498 original size:107 final size:105
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Period size: 107 Copynumber: 1.8 Consensus size: 105
11400392 TTCTAGTCGT
* * * *
11400402 ATTTT-TTCTCTAACTCATGATTTAAT-TTCAATCATTTTTCATTTTTTGAGTTTTGGTTTAATC
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*
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* * * *
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**
11400572 CCTTTCGTTTTCATTTTTTGA
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Statistics
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Consensus pattern (105 bp):
ATTTTATTCTCTAACTCATGATTTAATCTTAATCATTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATAC
CAGTCGTTTTCATTTTTTGATTTGTGGTTTAATCTCAATC
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11400993 ATCTCGAACA
* * * **
11401003 TTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAATTCCTGTCATTTTCATTTTCTGACT-ATTGAATTAATTT
1 TTTTCATTTTTTGACCCATAGTTTAATTCCGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATTG-ATTAATCC
* * ** *
11401067 TGATCATT-TTCATTTTTTGACTCATGATTTCATCCCTA-TCATTTTCATTTTTTGACTTGTGAT
65 TGATCATTGTTCATTTTTTGACTAAT-ATTTAAT-CCTAGTCATTTTCATTTCCTGACTCGTGAT
* * *
11401130 TT-AATCCCGATTGTTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTT-A-CCCTGGTCATTTTCATTTTTGAC
128 TTAAAT-CCGATTGTATTCATTTTATGACTTGTG-TTTTAATCCC-GGTCATTTTCATTTTTGAC
11401192 TCATGATTTAATTTAAGTTG
190 TCATGATTTAATTTAAGTTG
* * * *
11401212 TTTTCATTTTTTGACCCTTGGTTTAA-TCTCGGTCCTTTTCATTTTCTAACTCATTGTTTAATCC
1 TTTTCATTTTTTGACCCATAGTTTAATTC-CGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATTGATTAATCC
** **
11401276 TGATTGTTGTTCATTTTTTGACTAATATTTAATCCTAGTTGTTTTCATTTCCTGACTCGTGATTT
65 TGATCATTGTTCATTTTTTGACTAATATTTAATCCTAGTCATTTTCATTTCCTGACTCGTGATTT
* *
11401341 AAATCTGGTTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATCCCGGTCATTTTCATTTTT
130 AAATCCGATTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATCCCGGTCATTTTCATTTTT
11401398 TGGTTCATGG
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TTTTCATTTTTTGACCCATAGTTTAATTCCGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATTGATTAATCCT
GATCATTGTTCATTTTTTGACTAATATTTAATCCTAGTCATTTTCATTTCCTGACTCGTGATTTA
AATCCGATTGTATTCATTTTATGACTTGTGTTTTAATCCCGGTCATTTTCATTTTTGACTCATGA
TTTAATTTAAGTTG
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11403425 CTAACTCGTG
* * *
11403435 GTTTTATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTC
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GTTTAATCCTGATCATTTTTAATTTTTTGACTC
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11405577 TCATTTTCAA
* * * * * * *
11405587 TTTTTGACTTGTGATTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTTTGAATCATGGTTTAATATCTATCGT-
1 TTTTTGACTCGTAATTTAATCTAGATCATTTTCATTTATTGAACCATGATTTAATACCTATCGTA
* * * * * *
11405651 TTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATCCTGATCATTTTTAGTTTT-TGACTCATAGTTTAATACC
66 TTT-ATTTTCTAACTCATAGTTTAATCCTGATCATTTTCA-TTTTCTAACTCATAGTTTAAT-CC
11405715 -AATCGTTTTTTAT
128 TAATCG-TTTTTAT
* * * *
11405728 TTTTTGACTCGTAATTTAATCTTGATCATTTTTATTTATTGACCCGTGATTTAA-ACCTGATCGT
1 TTTTTGACTCGTAATTTAATCTAGATCATTTTCATTTATTGAACCATGATTTAATACCT-ATCGT
* * * *
11405792 ATTTATTTTCTAACTCGTAGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTCTAACTCGTGGTTTAATCCTA
65 ATTTATTTTCTAACTCATAGTTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTAACTCATAGTTTAATCCTA
*
11405857 GTCGTTTTTAT
130 ATCGTTTTTAT
* * **
11405868 TTTCTGACTCATGGTTTAATCCTAG-TCATTTTCATTT
1 TTTTTGACTCGTAATTTAAT-CTAGATCATTTTCATTT
11405905 TCTCGCTTGT
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TTTTTGACTCGTAATTTAATCTAGATCATTTTCATTTATTGAACCATGATTTAATACCTATCGTA
TTTATTTTCTAACTCATAGTTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTAACTCATAGTTTAATCCTAA
TCGTTTTTAT
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11406797 TCCCTGTCAT
* ** *
11406807 TTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATCCTGGTTGTTTTATTGTCTCTGACTCATGATTTAA
1 TTTCATTTTTTGACCTGTGATTTAATCCTGGACGTTTTATTGTCTCTAACTCATGATTTAA
*
11406868 TTTCATTTTTTGACCTGTGATTTAATCC-GGACGTTTTATTTTCTCTAACTCATGATTTAA
1 TTTCATTTTTTGACCTGTGATTTAATCCTGGACGTTTTATTGTCTCTAACTCATGATTTAA
11406928 TTTC
1 TTTC
11406932 GATCATTTTG
Statistics
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TTTCATTTTTTGACCTGTGATTTAATCCTGGACGTTTTATTGTCTCTAACTCATGATTTAA
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11407770 TTAATGGTTT
*
11407780 TCATTTTT-TAACTCGTGATTTAATCCCGG
1 TCATTTTTCTAACTCGTGATTTAATCCCGA
* * *
11407809 TCCTTTTTCTAACTGGTGGTTTAATCCCGA
1 TCATTTTTCTAACTCGTGATTTAATCCCGA
11407839 TCATTTTT
1 TCATTTTT
11407847 ATTTTGTAAC
Statistics
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TCATTTTTCTAACTCGTGATTTAATCCCGA
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11409306 TCCCAGTCAG
* * * * *
11409316 TTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAATGATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTCG
1 TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTAG
** * *
11409381 ATCGTTTTTCTTTTATTGA-TTGGTGGTTGAATCCCGATCATTTTT-ATTTTTTTA-TCATGGTT
65 ATCGTTTTGATTTTA-TGACTT-GTGGTTGAATCCCGATCATTTTTCATTTTCTTACACATGGTT
*
11409443 TAATCTTGTTC-AT
128 TAATCTTGATCAAT
* * *
11409456 TTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCGAGTCATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAATGTAG
1 TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-AGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTAG
* * * * *
11409521 GTCGTTTTGATTTTATGACTTGTGGTTTAGTCCCGGTCATTTTTCATTTTCTTACACATTGTTTA
65 ATCGTTTTGATTTTATGACTTGTGGTTGAATCCCGATCATTTTTCATTTTCTTACACATGGTTTA
11409586 ATCTTGATCAAT
130 ATCTTGATCAAT
* * * ** * *
11409598 TTT-ATTTTTGGACTCATTGTTTAATCCCAGTCCTTCTTTTTTTGACTTATGATTTAATCCCGGT
1 TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCAGTCATT-TTCATTT---TT-TGA-CTCAT---GGT
* * * *
11409662 TGACTCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTTC
56 TTAATC-TAG----ATC---G---TTTTGATTTTATGACTTGTGGTTGAATCCCGATCATTTTTC
* * *
11409727 ATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTTGATC-GT
110 ATTTTCTTACACATGGTTTAATCTTGATCAAT
* * ** ** * *
11409758 TTTCATTTTTGGACTCATGGTTTAATCTCGGTC-TTTTTTTTTTTCTGACTGGTGATTTAATCTT
1 TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CAGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCTA
* * * * ***
11409822 GATCATTTTCATTTTCTAACTCAAGGCTT-AATCCCGATCA-TTTTCATTTTCTT
64 GATCGTTTTGATTTTATGACTTGTGG-TTGAATCCCGATCATTTTTCATTTTCTT
11409875 TCTTGTGATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (141 bp):
TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTAGA
TCGTTTTGATTTTATGACTTGTGGTTGAATCCCGATCATTTTTCATTTTCTTACACATGGTTTAA
TCTTGATCAAT
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11409652 TAATCCCGGT
* * * * *
11409662 TGACTCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTA
1 TGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTC
* *
11409697 TGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTTCATTTTC
1 TGACTCATGGTTTAATCTCGATCA-TTTTCATTTTC
* * *
11409733 TAACTCATGGTTTAATCTTGATCGTTTTCATTTT-
1 TGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTC
* * **
11409767 TGGACTCATGGTTTAATCTCGGTCTTTTTTTTTTTC
1 T-GACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTC
** * *
11409803 TGACTGGTGATTTAATCTTGATCATTTTCATTTTC
1 TGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTC
* * * *
11409838 TAACTCAAGGCTTAATCCCGATCATTTTCATTTTC
1 TGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTC
11409873 T
1 T
11409874 TTCTTGTGAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTC
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Indices: 11409664--11409873 Score: 228
Period size: 70 Copynumber: 3.0 Consensus size: 71
11409654 ATCCCGGTTG
* * * * *
11409664 ACTCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTTCAT
1 ACTCATGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTTCAT
11409729 TTTCTA
66 TTTCTA
* * * **
11409735 ACTCATGGTTTAATCTTGATCGTTTTCATTTT-TGGACTCATGGTTTAATCTCGGTC-TTTTTTT
1 ACTCATGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTAT-GACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTTCA
*
11409798 TTTTCTG
65 TTTTCTA
** * * * * *
11409805 ACTGGTGATTTAATCTTGATCATTTTCATTTTCTAACTCAAGGCTTAATCCCGATCA-TTTTCAT
1 ACTCATGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTTCAT
11409869 TTTCT
66 TTTCT
11409874 TTCTTGTGAT
Statistics
Matches: 114, Mismatches: 22, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
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ACTCATGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTTCAT
TTTCTA
Found at i:11409801 original size:161 final size:163
Alignment explanation
Indices: 11409500--11409819 Score: 448
Period size: 161 Copynumber: 2.0 Consensus size: 163
11409490 TTTTCATTTT
* * * * * * *
11409500 TTGACTTATGGTTTAATGTAGGTCGTTTTGATTTTATGACTTGTGGTTTAGTCCCGGTCATTTTT
1 TTGACTCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTT
* * *
11409565 CATTTTCTTACACATTGTTTAATCTTGATCAATTTTATTTTTGGACTCATTGTTTAATCCCAGTC
66 CATTTTCTAACACATGGTTTAATCTTGATCAATTTTATTTTTGGACTCATGGTTTAATCCCAGTC
*
11409630 -CTTCTTTTTT-TGACTTATGATTTAATCCCGG
131 TCTTCTTTTTTCTGACTGATGATTTAATCCCGG
11409661 TTGACTCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTT
1 TTGACTCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTT
* * * *
11409726 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTTGATC-GTTTTCATTTTTGGACTCATGGTTTAATCTCGGT
66 CATTTTCTAACACATGGTTTAATCTTGATCAATTTT-ATTTTTGGACTCATGGTTTAATCCCAGT
* * *
11409790 CTTTTTTTTTTTCTGACTGGTGATTTAATC
130 CTCTTCTTTTTTCTGACTGATGATTTAATC
11409820 TTGATCATTT
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 18, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
160 4 0.03
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Consensus pattern (163 bp):
TTGACTCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTT
CATTTTCTAACACATGGTTTAATCTTGATCAATTTTATTTTTGGACTCATGGTTTAATCCCAGTC
TCTTCTTTTTTCTGACTGATGATTTAATCCCGG
Found at i:11409855 original size:231 final size:231
Alignment explanation
Indices: 11409435--11409856 Score: 514
Period size: 231 Copynumber: 1.8 Consensus size: 231
11409425 TATTTTTTTA
* * * *
11409435 TCATGGTTTAATCTTGTTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCGAGTCATTTTCATTTT
1 TCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCGAGTCATTTTCATTTT
* * * * * * ** *
11409500 TTGACTTATGGTTTAATGTAGGTCGTTTTGATTTTATGACTTGTGGTTTAGTCCCGGTCATTTTT
66 CTAACTCATGGTTTAATCTAGATCGTTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGGTCATTTTT
* * * ** *
11409565 CATTTTCTTACACATTGTTTAATCTTGATCAATTTTATTTTTGGACTCATTGTTTAATCCCAGTC
131 CATTTTCTGACACAGTGTTTAATCTTGATCAATTTTATTTTTGAACTCAAGGCTTAATCCCAGTC
11409630 CTTCTTTTTTTGACTTATGATTTAATCCCGGTTGAC
196 CTTCTTTTTTTGACTTATGATTTAATCCCGGTTGAC
*
11409666 TCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGA-TCATTTTTCATT
1 TCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTATGACTCGTGGTTTAAT-CCGAGTCA-TTTTCATT
* *
11409730 TTCTAACTCATGGTTTAATCTTGATCGTTTTCATTTT-TGGACTCATGGTTTAATCTCGGTC-TT
64 TTCTAACTCATGGTTTAATCTAGATCGTTTTCATTTTAT-GACTCATGGTTTAATCCCGGTCATT
** **
11409793 TTTTTTTTTCTGAC-TGGTGATTTAATCTTGATC-ATTTTCATTTTCT-AACTCAAGGCTTAATC
128 TTTCATTTTCTGACACAGTG-TTTAATCTTGATCAATTTT-ATTTT-TGAACTCAAGGCTTAATC
11409855 CC
190 CC
11409857 GATCATTTTC
Statistics
Matches: 159, Mismatches: 26, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
230 7 0.04
231 91 0.57
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Consensus pattern (231 bp):
TCATAGTTTAATCTAGGTCATTTTCATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCGAGTCATTTTCATTTT
CTAACTCATGGTTTAATCTAGATCGTTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGGTCATTTTT
CATTTTCTGACACAGTGTTTAATCTTGATCAATTTTATTTTTGAACTCAAGGCTTAATCCCAGTC
CTTCTTTTTTTGACTTATGATTTAATCCCGGTTGAC
Found at i:11409883 original size:70 final size:69
Alignment explanation
Indices: 11409672--11409947 Score: 223
Period size: 70 Copynumber: 3.9 Consensus size: 69
11409662 TGACTCATAG
* * * *
11409672 TTTAATCTAGGTCATTTTGATTTTATGACTCGTGGTTTAATCCCGATCATTTTTCATTTTCTAAC
1 TTTAATCTTGATCATTTTCATTTT-TGACTCATGGTTTAATCCCGATCA-TTTTCATTTTCTAAC
* *
11409737 TCATGG
64 TCGTGA
* * * * ** *
11409743 TTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTGGACTCATGGTTTAATCTCGGTCTTTTTTTTTTTCTGACT
1 TTTAATCTTGATCATTTTCATTTTT-GACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTCTAACT
*
11409808 GGTGA
65 CGTGA
* * * **
11409813 TTTAATCTTGATCATTTTCATTTTCTAACTCAAGGCTTAATCCCGATCATTTTCATTTTCTTTCT
1 TTTAATCTTGATCATTTTCATTTT-TGACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTCTAACT
*
11409878 TGTGA
65 CGTGA
** * * * * * *
11409883 TTTAATC-CCAGTCGTATTCATTTTTTAACTCATAGTTTAATTCC-AGTCGTTTTCATTTTCTAA
1 TTTAATCTTGA-TCATTTTCA-TTTTTGACTCATGGTTTAATCCCGA-TCATTTTCATTTTCTAA
11409946 CT
63 CT
11409948 TATGAATTAA
Statistics
Matches: 163, Mismatches: 37, Indels: 11
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Matches are distributed among these distances:
69 2 0.01
70 117 0.72
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ACGTcount: A:0.20, C:0.18, G:0.12, T:0.50
Consensus pattern (69 bp):
TTTAATCTTGATCATTTTCATTTTTGACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTCATTTTCTAACTC
GTGA
Found at i:11409958 original size:35 final size:35
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Indices: 11409722--11409958 Score: 117
Period size: 35 Copynumber: 6.8 Consensus size: 35
11409712 TCCCGATCAT
* **
11409722 TTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAA-TCTTGATCG
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAG-TCG
* * * *
11409757 TTTTCATTTT-TGGACTCATGGTTTAA-TCTCGGTCT
1 TTTTCATTTTCT-AACTCATGATTTAATTC-CAGTCG
** * ** ** *
11409792 TTTTTTTTTTCTGACTGGTGATTTAA-TCTTGATCA
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAG-TCG
* ** * *
11409827 TTTTCATTTTCTAACTCAAGGCTTAA-TCCCGATCA
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** ** *
11409862 TTTTCATTTTCTTTCTTGTGATTTAATCCCAGTCG
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* *
11409897 TATTCATTTTTTAACTCAT-AGTTTAATTCCAGTCG
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* *
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1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT
11409959 CCTGGTTGTT
Statistics
Matches: 152, Mismatches: 43, Indels: 14
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:11410177 original size:36 final size:36
Alignment explanation
Indices: 11410042--11410946 Score: 203
Period size: 35 Copynumber: 25.9 Consensus size: 36
11410032 TTTTTTACTC
*
11410042 ATGGTTTAAT-TTGAGTC-GTTTTCATTTT-TGGACTT
1 ATGGTTTAATCCTGA-TCAGTTTTCATTTTCT-GACTT
* *
11410077 ATGGTTTAATCCTGA-CCGTTTTCATTTTCTGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
** * *
11410112 GCGGTTTCATCCTAATC-GTTTTCATTTTCTGACTT
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * *
11410147 ATGGTTTCATCCTGATCATTTTTCATTTTCTGAGTT
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * * * *
11410183 GTGATTTAATCTTGATCA-TTTTTATTTCCTAATTT
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * * * *
11410218 GTGATTTAA-ACTCAATCA-TATACATTTTCTGACTC
1 ATGGTTTAATCCT-GATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * *
11410253 ATGTTTTAATCC-CAGTCA-TTTTCATTTTATGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGA-TCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * *
11410288 ATGGTTTAATCCCGAT-TGTTTTTATTTTATGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * *
11410323 ATGGTTTAATCCCTG-TC-GTTTTAATTTTTTGATCCT
1 ATGGTTTAAT-CCTGATCAGTTTTCATTTTCTGA-CTT
* * *
11410359 -TGATTTAAT-CTCGATCA-TTTTC-TGTTCTCTAACTC
1 ATGGTTTAATCCT-GATCAGTTTTCAT-TT-TCTGACTT
* * * * *
11410394 ATGATTAAATTCT-AGTCA-TTTTGATTTTCTGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGA-TCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * **
11410429 ATGTTTTAATCCCGGTC-GTTTTCTTTTTCTGACCC
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * * * *
11410464 ATAGTTTGAT-TTCAGTCA-TTTTTATTTTTTGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGA-TCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * * *
11410499 GTGATTTAAT-CTCGGT-TGTTTTCATTCT-TAACTT
1 ATGGTTTAATCCT-GATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * * * * *
11410533 GTGATTTAAACCAG-TC-GTATTAATTTTTTGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * *
11410567 ATGATTTAATTCCAG-TCA-TTTTCATTTTCTGACTC
1 ATGGTTTAA-TCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * *
11410602 GTGGTTTAATCTTGATC-GTTTTTATTTTTTAAC-T
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * * * *
11410636 GTGCTTTAATCCTGGT-TGTTTTTATTTTTTGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * *
11410671 ATGGTTTAATCATTG-TCA-TTTTTATTTTTTGACTC
1 ATGGTTTAATC-CTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * *
11410706 ATTGTTTAAT-CTCAGTCA-TTTTTATTTTTTGACTCA
1 ATGGTTTAATCCTGA-TCAGTTTTCATTTTCTGACT-T
* * * * * *
11410742 ATTGTTTAATCATGGTC-CTTTTCATTTTCTAACTC
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* * * * * *
11410777 ATGATTTAATTCTGGTCA-TTTTCTTTTTTTGACTC
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
** * * * *
11410812 ATATTTTAAT-TTCGAT-TGTTTTCATTTTCTAACTC
1 ATGGTTTAATCCT-GATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
* *
11410847 ATGGTTTAATTCCAG-TCA-TTTTCATTTTCTAACTCT
1 ATGGTTTAA-TCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACT-T
* * *
11410883 A-GGTTT-AT-CTTAGTC-GTTTTTCTTTTTTTGACTT
1 ATGGTTTAATCCTGA-TCAG-TTTTCATTTTCTGACTT
* * *
11410917 GTGGTTTAATCCCGATC-GTTTTAATTTTCT
1 ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCT
11410947 ATTTTAATTT
Statistics
Matches: 654, Mismatches: 158, Indels: 116
0.70 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
32 1 0.00
33 13 0.02
34 67 0.10
35 471 0.72
36 96 0.15
37 6 0.01
ACGTcount: A:0.19, C:0.16, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (36 bp):
ATGGTTTAATCCTGATCAGTTTTCATTTTCTGACTT
Found at i:11410329 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 11410095--11410470 Score: 393
Period size: 176 Copynumber: 2.1 Consensus size: 175
11410085 ATCCTGACCG
** * * * * *
11410095 TTTTCATTTTCTGACTCGCGGTTTCATCCTAATCGTTTTCATTTTCTGACTTATGGTTTCAT-CC
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCC
* * * * * **
11410159 TGATCATTTTTCATTTTCTGAGT-TGTGATTTAATCTTGATCATTTT-TATT-TCCTAATTTGTG
66 TG-TC-GTTTTAATTTTCTGA-TCT-TGATTTAATCTCGATCATTTTCTGTTCT-CTAACTCATG
11410221 ATTTAAACTC-AATCATATACATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCAGTCA
126 A-TTAAACTCTAATCATATACATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCAGTCA
* * * *
11410271 TTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGATTGTTTTTATTTTATGACTCATGGTTTAATCCC
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCC
*
11410336 TGTCGTTTTAATTTTTTGATCCTTGATTTAATCTCGATCATTTTCTGTTCTCTAACTCATGATTA
66 TGTCGTTTTAATTTTCTGAT-CTTGATTTAATCTCGATCATTTTCTGTTCTCTAACTCATGATTA
* * * ** * *
11410401 AATTCTAGTCATTTTGATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCGGTCG
130 AACTCTAATCATATACATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCAGTCA
* * *
11410447 TTTTCTTTTTCTGACCCATAGTTT
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
11410471 GATTTCAGTC
Statistics
Matches: 164, Mismatches: 30, Indels: 12
0.80 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 1 0.01
175 39 0.24
176 119 0.73
177 5 0.03
ACGTcount: A:0.20, C:0.18, G:0.11, T:0.50
Consensus pattern (175 bp):
TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCC
TGTCGTTTTAATTTTCTGATCTTGATTTAATCTCGATCATTTTCTGTTCTCTAACTCATGATTAA
ACTCTAATCATATACATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCAGTCA
Found at i:11410521 original size:141 final size:138
Alignment explanation
Indices: 11410249--11410751 Score: 367
Period size: 141 Copynumber: 3.6 Consensus size: 138
11410239 ACATTTTCTG
* * * * * *
11410249 ACTCATGTTTTAATCCCAGTCATTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGATTGTTTT-TAT
1 ACTCATGATTTAA-ACCAGTCATTTTAATTTTATGACTCATGATTTAATCCCGGTCGTTTTCT-T
* ** * * * * **
11410313 TTTATGACTCATGGTTTAATCCCTGTCGTTTTAATTTTTTGA-TCCTTGATTTAATCTCGATCAT
64 TTTCTGACTCATGGTTTAATTTCAGTCGTTTTTATTTTTTGACT-CGTGATTTAATCTCGGTTGT
*
11410377 TTTCTGTTCTCTA
128 TTTC-ATTCT-TA
* * * *
11410390 ACTCATGA-TTAAATTCTAGTCATTTTGATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCGGTCGTTTTCTT
1 ACTCATGATTTAAA--CCAGTCATTTTAATTTTATGACTCATGATTTAATCCCGGTCGTTTTCTT
* * * *
11410454 TTTCTGACCCATAGTTTGATTTCAGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTCGGTTGTT
64 TTTCTGACTCATGGTTTAATTTCAGTCGTTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTCGGTTGTT
11410519 TTCATTCTTA
129 TTCATTCTTA
** * * * * * * *
11410529 ACTTGTGATTTAAACCAGTCGTATTAATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAGTCATTTTCATTT
1 ACTCATGATTTAAACCAGTCATTTTAATTTTATGACTCATGATTTAATCCCGGTCGTTTTCTTTT
* * * *
11410594 TCTGACTCGTGGTTTAATCTTGA-TCGTTTTTATTTTTTAACT-GTGCTTTAATC-CTGGTTGTT
66 TCTGACTCATGGTTTAAT-TTCAGTCGTTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTC-GGTTGTT
* * *
11410656 TTTATTTTTTG
129 TTCA-TTCTTA
* * * * * * *
11410667 ACTCATGGTTT-AATCATTGTCATTTTTATTTTTTGACTCATTG-TTTAATCTCAGTCATTTT-T
1 ACTCATGATTTAAACCA--GTCATTTTAATTTTATGACTCA-TGATTTAATCCCGGTCGTTTTCT
* *
11410729 ATTTTTTGACTCAATTGTTTAAT
63 -TTTTCTGACTC-ATGGTTTAAT
11410752 CATGGTCCTT
Statistics
Matches: 291, Mismatches: 58, Indels: 27
0.77 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
136 1 0.00
137 24 0.08
138 84 0.29
139 56 0.19
140 23 0.08
141 101 0.35
142 2 0.01
ACGTcount: A:0.20, C:0.16, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (138 bp):
ACTCATGATTTAAACCAGTCATTTTAATTTTATGACTCATGATTTAATCCCGGTCGTTTTCTTTT
TCTGACTCATGGTTTAATTTCAGTCGTTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTCGGTTGTTTT
CATTCTTA
Found at i:11410698 original size:104 final size:104
Alignment explanation
Indices: 11410162--11410735 Score: 306
Period size: 104 Copynumber: 5.5 Consensus size: 104
11410152 TTCATCCTGA
* * * * * ** *
11410162 TCATTTTTCATTTTCTGAGTTGTGATTTAATCTTGATCATTTTTATTTCCTAATTTGTGATTTAA
1 TCATTTTT-ATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCGTTTTTATTTTTTAACTTGTGATTTAA
* * * * *
11410227 ACTCAATCATA-TACATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCAG
65 AC-CAGTCGTATTA-ATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAG
* * * ** * * * ** *
11410268 TCATTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGATTGTTTTTATTTTATGACTCATGGTTTAAT
1 TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCGTTTTTATTTTTTAACTTGTGATTTAA-
* * * * *
11410333 CCCTGTCGTTTTAATTTTTTGA-TCCTTGATTTAATCTCGA-
65 ACCAGTCGTATTAATTTTTTGACT-CATGATTTAAT-TCCAG
* * * * * * * * * * * * ** *
11410373 TCATTTTCTGTTCTCTAACTCATGATTAAATTCTAG-TCATTTTGATTTTCTGACTCATGTTTTA
1 TCATTTT-TATTTTTTGACTCGTGGTTTAA-TCTTGATCGTTTTTATTTTTTAACTTGTGATTTA
* * ** * * *
11410437 ATCCCGGTCGT-TTTCTTTTTCTGACCCAT-AGTTTGATTTCAG
64 A-ACCAGTCGTATTAATTTTT-TGACTCATGA-TTTAATTCCAG
* * * * * *
11410479 TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTCGGTTGTTTTCA-TTCTTAACTTGTGATTTAAA
1 TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCGTTTTTATTTTTTAACTTGTGATTTAAA
11410543 CCAGTCGTATTAATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAG
66 CCAGTCGTATTAATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAG
* * * *
11410582 TCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCGTTTTTATTTTTTAAC-TGTGCTTTAAT
1 TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCGTTTTTATTTTTTAACTTGTGATTTAAA
* * * * *
11410646 CCTGGTTGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAA-T-CATTG
66 CC-AGTCGTATTAATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCA--G
* * * *
11410686 TCATTTTTATTTTTTGACTCATTGTTTAATC-TCAGTCATTTTTATTTTTT
1 TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGA-TCGTTTTTATTTTTT
11410736 GACTCAATTG
Statistics
Matches: 357, Mismatches: 93, Indels: 38
0.73 0.19 0.08
Matches are distributed among these distances:
102 2 0.01
103 74 0.21
104 101 0.28
105 100 0.28
106 77 0.22
107 3 0.01
ACGTcount: A:0.20, C:0.16, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (104 bp):
TCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCGTTTTTATTTTTTAACTTGTGATTTAAA
CCAGTCGTATTAATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAG
Found at i:11410875 original size:35 final size:34
Alignment explanation
Indices: 11410130--11410889 Score: 305
Period size: 35 Copynumber: 21.7 Consensus size: 34
11410120 ATCCTAATCG
* * *
11410130 TTTTCATTTTCTGACTTATGGTTTCATCCTGATCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCAG-TCA
* ** * **
11410165 TTTTTCATTTTCTGAGTTGTGATTTAATCTTGATCA
1 -TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCAG-TCA
* * * * ** * * *
11410201 TTTTTATTTCCTAATTTGTGATTTAAACTCAATCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-CAGTCA
* * *
11410236 TATACATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCAGTCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CCAGTCA
* * **
11410271 TTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCGATTG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCAG-TCA
* * * *
11410306 TTTTTATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCTGTCG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CCAGTCA
* * * *
11410341 TTTTAATTTTTTGA-TCCTTGATTTAATCTC-GATCA
1 TTTTCATTTTCTGACT-CATGGTTTAATC-CAG-TCA
* * * *
11410376 TTTTC-TGTTCTCTAACTCATGATTAAATTCTAGTCA
1 TTTTCAT-TT-TCTGACTCATGGTTTAA-TCCAGTCA
* * * *
11410412 TTTTGATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCGGTCG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CCAGTCA
* * * * *
11410447 TTTTCTTTTTCTGACCCATAGTTTGATTTCAGTCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-AATCCAGTCA
* * * * * **
11410482 TTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTCGGTTG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-CAGTCA
* * ** * * *
11410517 TTTTCATTCT-TAACTTGTGATTTAAACCAGTCG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCAGTCA
* * * *
11410550 TATTAATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAGTCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCCAGTCA
* ** *
11410585 TTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCAG-TCA
* * * * * * **
11410620 TTTTTATTTTTTAACT-GTGCTTTAATCCTGGTTG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCC-AGTCA
* *
11410654 TTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CATTGTCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCA--GTCA
* * *
11410689 TTTTTATTTTTTGACTCATTGTTTAATCTCAGTCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-CAGTCA
* * * *
11410724 TTTTTATTTTTTGACTCAATTGTTTAAT-CATGGTCC
1 TTTTCATTTTCTGACTC-ATGGTTTAATCCA--GTCA
* * **
11410760 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATTCTGGTCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCCAGTCA
* * ** * **
11410795 TTTTCTTTTTTTGACTCATATTTTAATTTC-GATTG
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCCAG-TCA
*
11410830 TTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCA
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCCAGTCA
*
11410865 TTTTCATTTTCTAACTC-TAGGTTTA
1 TTTTCATTTTCTGACTCAT-GGTTTA
11410890 TCTTAGTCGT
Statistics
Matches: 555, Mismatches: 136, Indels: 67
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
33 11 0.02
34 71 0.13
35 381 0.69
36 85 0.15
37 7 0.01
ACGTcount: A:0.20, C:0.16, G:0.11, T:0.52
Consensus pattern (34 bp):
TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCAGTCA
Found at i:11410904 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 11410240--11411567 Score: 265
Period size: 35 Copynumber: 37.7 Consensus size: 35
11410230 CAATCATATA
* * *
11410240 CATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCAGTCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * **
11410275 CATTTTATGACTCATGGTTTAA-TCCCGATTGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
* * * * * *
11410310 TATTTTATGACTCATGGTTTAATCCCTGTCGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * * * *
11410345 AATTTTTTGA-TCCTTGATTTAATCTCGA-TCATTTT
1 CATTTTCTAACT-CATGGTTTAAT-TCCAGTCATTTT
* * *
11410380 C-TGTTCTCTAACTCATGATTAAATTCTAGTCATTTT
1 CAT-TT-TCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * * * *
11410416 GATTTTCTGACTCATGTTTTAATCCCGGTCGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * * * *
11410451 CTTTTTCTGACCCATAGTTTGATTTCAGTCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * * * * **
11410486 TATTTTTTGACTCGTGATTTAA-TCTCGGTTGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTC-CAGTCATTTT
* ** * * * *
11410521 CATTCT-TAACTTGTGATTTAA-ACCAGTCGTATT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * *
11410554 AATTTTTTGACTCATGATTTAATTCCAGTCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * ** *
11410589 CATTTTCTGACTCGTGGTTTAA-TCTTGATCGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
* * * * * **
11410624 TATTTTTTAACT-GTGCTTTAA-TCCTGGTTGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCC-AGTCATTTT
* * *
11410658 TATTTTTTGACTCATGGTTTAA-T-CATTGTCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCA--GTCATTTT
* * * *
11410693 TATTTTTTGACTCATTGTTTAA-TCTCAGTCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTC-CAGTCATTTT
* * * * *
11410728 TATTTTTTGACTCAATTGTTTAA-T-CATGGTCCTTTT
1 CATTTTCTAACTC-ATGGTTTAATTCCA--GTCATTTT
* **
11410764 CATTTTCTAACTCATGATTTAATTCTGGTCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * ** * **
11410799 CTTTTTTTGACTCATATTTTAATTTC-GATTGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
11410834 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* *
11410869 CATTTTCTAACTC-TAGGTTT-A-TCTTAGTCGTTTTT
1 CATTTTCTAACTCAT-GGTTTAATTC-CAGTC-ATTTT
* * * ** * *
11410904 CTTTTTTTGACTTGTGGTTTAA-TCCCGATCGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
* ** * * * * *
11410939 AATTTTCTATTTTAAT-TTTCTGACT-CAGGGTTTAATCTTGAT
1 CATTTTCTA-ACTCATGGTT-TAATTCCA--G--TCAT-TT--T
* ** * *
11410981 CATTTTTCTTTTTTTGACTTGTGGTTTAA-TCCCGATCGTTTT
1 CA-TTTTC------TAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
* *
11411023 AATTTT-TAAACTCATGCTTTAA-TCTCAGTCATTTT
1 CATTTTCT-AACTCATGGTTTAATTC-CAGTCATTTT
* ** *
11411058 CATTTTCTGACTCATGGTTTAA-TCTTGGCCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTC-CAGTCATTTT
* * *
11411093 CATTTTCTGACTCATGGTTT-AGTCCCGATCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
* * * *
11411128 TATTTTCTGACTCATGGTCTAA-TCTCAG-CATATT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTC-CAGTCATTTT
* ** *** **
11411162 CATTTTCTGACTTGTGGTTTAA-TCTTTTTTTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * ** * *
11411196 CAATTTCTGACTTGTGATTTAA-TCTCAATCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTC-CAGTCATTTT
* * * *
11411231 CA-TTTCTGGACTCATGATTTAA-ACTCAGTCATATT
1 CATTTTCT-AACTCATGGTTTAATTC-CAGTCATTTT
* * * * *
11411266 CATTTTGTCACTCGTGGTTTAATCCCAGTCGTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* * * * ** *
11411301 CATTTTTTGATTTATGG-TTAATTTGAGTCTTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
* *
11411335 CA-TTTCTTAACCCATGGTTTAA-TCCCGATCATTTT
1 CATTTTC-TAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
** *
11411370 CATTTTCTAACTTGTGGTTTAA-TCCTGGTCATTTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCC-AGTCA-TTTT
* * ** * **
11411406 CTTTTTC-AAATTGTAGTTTAA-TCTTGATCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAG-TCATTTT
** * * * *
11411440 TGTTTTCTGACTCATAGTTTAATTTCAATCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCCAGTCATTTT
** * * *
11411475 CATTTTCTGTCTCGTGATTTAATCCCCA-TCATTTT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAAT-TCCAGTCATTTT
* *
11411510 CATTTTCTGACT--TGTGATTAATTCCAGTCATTTTT
1 CATTTTCTAACTCATG-GTTTAATTCCAGTCA-TTTT
* *
11411545 CATTTTTTCACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
11411568 CTTTGTCATT
Statistics
Matches: 963, Mismatches: 253, Indels: 153
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Matches are distributed among these distances:
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* *
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*
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* * * * **
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* * *
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* ** * * ** *
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* * ** *
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*
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* *
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TCTTAGGCCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTAATTTTCTA
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* *
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*
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*
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* * *
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* * * * * ***
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* * * *
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* * * * * * *
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* *
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** *
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* *
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*
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*
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*
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* ** * *
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* *
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*
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66 ATAAAATAAAACT--CAAAAAT-ATCAAAAAA-AATAATGA
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**
11468077 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AGC AAT AAT AAT AAT
1 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
11468116 TAATTAATTA
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AAT
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*
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*
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*
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1 AAAAAATGATAAAAT
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1 A
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* * *
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* * ** *
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1 ATA ATA AT-A ATA AT-A ATA AT-A ATA ATA ATA ATA ATA ATA ATA ATA
*
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1 ATA ATA ATA ATA ATA AT-A ATA ATA ATA A
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ATA
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*
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1 TAATAA
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*
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*
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*
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1 AAATAATAAT
*
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*
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*
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*
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* *
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* *
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* * * * * *
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TTATTTTAG
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0.82 0.05 0.13
Matches are distributed among these distances:
14 3 0.07
15 31 0.69
16 11 0.24
ACGTcount: A:0.68, C:0.00, G:0.06, T:0.26
Consensus pattern (16 bp):
TAATAAAAAATGATAA
Done.