Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167965.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_224, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  46922

Tables:   1   2   

This is table  1  of  2  ( 185 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99--139
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0
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4
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8
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2
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4
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0
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19
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0
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0
0
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14
57
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4
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74
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.08
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1.8
578
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6902--6944
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2.3
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10
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5
0
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0
0
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10401--10440
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11266--11313
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2.0
24
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12483--12532
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4
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2.8
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2.2
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11
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7
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14381--14428
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2.0
24
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19
2.2
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17561--17601
13
3.2
13
89
6
57
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7
7
78
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17553--17601
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17553--17601
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25
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10
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75
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5
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52
5
17
0
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17726--17772
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58
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19818--19962
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19914--19965
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1.18
20664--20712
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2.0
25
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0
50
0
4
0
96
0.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22840--22882
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9
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3
78
1.08
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10
7
4
77
1.11
23269--23323
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13
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1.29
23747--23797
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2.0
24
85
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7
13
5
72
1.26
24137--24213
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3.7
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70
13
52
18
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5
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1.33
24161--24220
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2.6
22
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57
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17
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17
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4
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7
76
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27328--27424
8
11.1
8
69
17
52
12
6
5
76
1.14
27906--27965
21
2.8
21
76
20
61
10
6
5
78
1.08
28080--28129
19
2.7
18
74
14
57
22
4
0
74
0.99
28898--28951
28
2.0
27
81
3
63
18
11
1
68
1.28
29109--29148
16
2.4
17
83
4
55
12
10
0
77
0.99
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21
2.3
20
78
14
51
23
4
6
65
1.35
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20
2.9
19
77
17
60
12
14
0
72
1.12
29867--29926
17
3.5
18
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8
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23
5
0
71
1.05
29865--29929
30
2.2
30
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10
82
24
4
0
70
1.06
31013--32188
585
2.0
578
81
9
1361
17
10
5
66
1.40

Tables:   1   2