Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167971.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_23, whole genome shotgun sequence
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Warning! 68000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 62 of 120
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* *
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* * *
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** * *
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131 TTATTTCCAAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATGAAAAGTAATAATGA
* * * * * ** *
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196 TTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAGTCATAACTATTTGAACGAG-ATCAACAAATAGAATTATT
* *
6879714 TTCTAAATCTCTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTTTATTTCGAATAAGCTT
260 TTCTAAATCTCTTATAAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
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325 CTATCAGCTTAAATAATTGTTTTATGAGAAAAGA
* * * * *
6879813 AAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTTTTCATA-TAGTCT-TAATTGTTTGAATTGGTTTG
1 AAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCA-AGTAGT-TAAAACTATTTGAAATGGTTTG
** * * * *
6879876 GCAAATGGATTTATTTTTTTAAATCTCATAGTT-ATTAATTTTCAAAATGTTACTAAATTATTAT
64 GCAAACAGATTTA-CTTTTTAAATCTCATA-TTGATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * * * * *
6879940 TTTTTTA-TTCCAAATAAGTTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGA-TAGA-GCAAATGTTA
127 TATTTTATTTCCAAA-AAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATG-AAAAGTAA
* *
6880002 TAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATCAACAAATAGA
190 TAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAGTCATAACTATTTGAACGAGATCAACAAATAGA
* * * * * * ** *
6880066 TTTCTTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTATAAA
254 ATTATTTTCTAAATCTCTTATAAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAT
* ** * * * *
6880131 AATC-T-TATTTG-TTGAAAAACAATTGTTTTGTGATAAAACA
319 AAGCTTCTATCAGCTT---AAATAATTGTTTTATGAGAAAAGA
* * * * ** * * ** ** * * * * **
6880171 AAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATTGTTATTTAAATAGCCATGATTATTGGAATTGATTTGTT
1 AAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAGTAGTTAAAACTATTTGAAATGGTTTGGC
* * * * ** *
6880236 AAA-ATGATTTATTTTTTAAATATCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTAT
66 AAACA-GATTTACTTTTTAAATCTCATATTGATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * * * * * *
6880300 TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAATGGTCATAAT
130 TTTATTTCCAAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATGAAA-AGTAATAAT
* ** * * * *
6880364 GATTT--AATAGATAATTGTTG-AAATAGTCACAACTATTTGAACCTGTTCGATAAATAGATTTA
194 GATTTGAAATAGATAATTG-TGCAAATAGTCATAACTATTTGAACGAGATCAACAAATAGAATTA
* * * * * * * *
6880426 TTTTTTCAAATTTCATGCTAATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
258 TTTTCT-AAA--TC-T-CTTA-TAAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGA
* * * * * ** *
6880490 ATAAGCTTGTA-CGAACTGAAATAATTATTATATGACTAAACA
317 ATAAGCTTCTATC-AGCTTAAATAATTGTTTTATGAGAAAAGA
* * * ** * * * * *
6880532 AATGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAA-TAGTCT-TAACTATTTGAATTGATTTA
1 AAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTC-AAGTAGT-TAAAACTATTTGAAATGGTTTG
** * * * *
6880595 GCAAACCCATTTATTTTTTAAATCTC---TT-ATTAATTATCAAAATAATATTAAATTAGTATTA
64 GCAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCATATTGATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
6880656 TTTT
129 TTTT
6880660 TATGTGAATA
Statistics
Matches: 663, Mismatches: 151, Indels: 67
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
355 2 0.00
356 59 0.09
357 117 0.18
358 273 0.41
359 79 0.12
360 3 0.00
361 117 0.18
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364 1 0.00
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Consensus pattern (358 bp):
AAAGGTTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAGTAGTTAAAACTATTTGAAATGGTTTGGC
AAACAGATTTACTTTTTAAATCTCATATTGATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTCCAAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATGAAAAGTAATAATGA
TTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAGTCATAACTATTTGAACGAGATCAACAAATAGAATTATTT
TCTAAATCTCTTATAAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTC
TATCAGCTTAAATAATTGTTTTATGAGAAAAGA
Found at i:6881442 original size:181 final size:180
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* * * * * * *
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1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* *
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* * * *
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* ** *
6880964 TATATAAGCA-AAAACTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
1 TGTATAA--ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * ** * * * * *
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64 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * ***
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* * * *
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1 -TGTA-TAAAT-AAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * ** *
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1 TGTATAAATAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
** *
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*
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* ** * * *
6881509 TGAAT-GTTCAAATACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAAT
1 TGTATAAAT-AAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * ** ** ** *
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*
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* * * * * *
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1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
6881754 GTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGCTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAGT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * ***
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* * * * ** ** * * * * *
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1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
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65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * ** *
6881987 ATTAAATTTTGTAAT-TTCAATAAATT-GATATAATTTTA--TTCCATAGGCT
130 ATTAATTTTTGAAATATT-AATAAATTAG-TATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * **
6882036 TGTAT-GATGAAAAACAATTGTTATATGA-AAGAACAAAAGTTTGTAACGATTTGAAATAGATAA
1 TGTATAAAT--AAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * ** * * *
6882099 TTGTTCAAATGGCCAAAATTATTT----TA--TCCA-ATTCA-ATGTATTTTTTAAAT-TCCTAA
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* * * * * *
6882155 TATATCAATTTTTGAAGTATCAATAAAGTAATATTATTTTA-TTTCATATAAGCT
128 T-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCT
* * * * * * * *** * *
6882209 TTTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTTATATTTATTTTAAATAGATAATA
1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
** * * * * * *
6882274 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTCGATAAACAAATTGATTTTGTAAAATTTTTTATT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTT-TTAAATCTCTTACT
* * *
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129 TATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * *
6882391 TGTATGAACTGAAA-ATTCTATTTTATGAC-AAGCAAAAGGTCGTAACGA-TTGAAATAGATAAT
1 TGTAT-AAATAAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
** * * * ** *
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64 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * *
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128 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* *
6882565 TGTATGAACA-AAAACAATT-TCTTTATGACAAAACAAATA--TAATAACGATTTGAGATAGATA
1 TGTAT-AA-ATAAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
6882626 ATTGTTCAAAAAATCAT-ACTTATTTGAACTGGTTCAATACATAGATTTAGTTTTTAAA--TCTT
62 ATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * **
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126 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * ** * *
6882741 TGTATGAAT-AGA-AATTATTTTACGACAAAACAAAATATCATAACGATTTGATATAGATAATAG
1 TGTATAAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * ** * * * *
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66 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *
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131 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * *
6882919 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATT
1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * *
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65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* **
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* * * *
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1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
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65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTAGTTC-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
**
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** * * * * * * * * * *
6883280 TACATGAATAAAGCCAAATGTTCTATGAGAAAACAAAATGTCATAATGTTTTAAAATAAATAATT
1 TGTATAAATAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
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* * **
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* * * * * * **
6883461 TGTATGAACTGAAACGATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATAATTTGAAATAGATAATT
1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
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65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTCGATAAAC-AGATT-TATTTTTTAAATCTCTTA
* * * **
6883588 CTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTTCAAATAAGCT
127 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * * *
6883642 TATATGAATTGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATT
1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * ** * * *
6883707 ATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACTTGTTTAAAAAACATATTTATTTTTTAAATGT-TCTACT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACT
* ** * * * * *
6883771 TATTAATTGTCAAAATAATAATAAATTAATA-T-TTTTA-ATCGAAATAAGCA
129 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCT
* * * * * * * *
6883821 TGTAT-GATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATACCAATTTGTAATAAATAATT
1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* ** * * * * * * *
6883885 TTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAATTGATCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* ***
6883950 ATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCT
130 ATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * ** *
6884001 TGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGAC---ACAAAATGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATT
1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * ** * *
6884063 G-TCGAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTTGGCAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAAC
65 GTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-AC
* * * *
6884127 -TATGAATTTTCATG--ATATTAATAACTTAGTATTTTTTTTATTTCGAATAAGCT
128 TTATTAATTTT--TGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * * * *
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1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
6884244 ATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGATAAACATATTTACTTTATGAATTTTTTACTT
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** * ** * ***
6884309 ACCAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTCTAACCCT-AATAAGCT
130 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTTGAATAAGCT
* * ** * * * *
6884360 TGTATGAACAAAACAAAAAGTTATAAAGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATA-GTCAAAACTA
1 TGTATAAATAAAAC-AATTGTT-T-----TATG--A-CAA-AA-----CAAA-AGGTCATAACGA
* * * * * * * * * **
6884424 TTTGAACTTG-T--TTGAT-AAATAG--ATTTATTTTTTAAATCT-CTT--AT-TA-ATTTTTGA
49 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAA-CTAGTTCGATAAACAGATTT-A
** ** * * * * * ** **
6884478 AATAGT-AATATATTA-GTATTACTTTATTCTGAACAAACTT-ATACGAA-TAAAAACATTTGT-
111 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATT-TT-TGAA-ATA-TTAATA--AATTAGTATTATTT-TA
* ***
6884538 TTTATGGCAAAACAAAA
168 TTT-T-G-AATA-AGCT
* * * ** * * * * * *
6884555 GGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGT-TCA-AATAATCATAA--TTATTTGAACTGGTTAGG
1 TGT-ATAA--A--TAAAACA-ATTGTTTTATGACAA-AA-CAAAAGGTCA--T-AAC-GATT-TG
* * * * * * * * * * *
6884616 TAAACCAAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAAATA-TT-AATAAATTCA-TT
53 -AAA-TAGATAATTGTTCAAA----TAG-TCA-TAACTATTTGAACTAGTTCGATAAA--CAGAT
* * * * ** **
6884677 TTATGTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAATTTATTTTATGACAA-AACAA-AAGG
108 TTAT-TT-TT-TAAAT---CT-CT-T-ACTT-------ATTAATTTT-TGA-AATATTAATAAAT
* ** *
6884740 TAATAACATTTTGAAATAGATAATTGCTCATATAGTCT
155 TAGTATTATTTT---AT---T--TTG--AATA-AG-CT
* * * ** ** *** ** *
6884778 T-TA-AATATTTAAAC--TAG-TTCA-G-C-AAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTT-ACCTA-T
1 TGTATAA-A-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA---AGGTCATAACGAT-TTGAAATAGA
* * * * * * **
6884833 TAATTTTTGAAGTA-TTACTATATTATTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTAGTATGAACAAAAA
60 TAATTGTTCAAATAGTCA-TA-ACTATT-TGA-ACTAGTTC-G-ATAAAC-AG-AT---------
* ** *** * * * * *
6884896 TAATTGTTTTATGATAGAATAAAAGGTTA-TAATGATTTGAAGT-TT-A-CAATT-GTTCAAATA
108 TTATT-TTTTA--A-A-TCTCTTA-CTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAG-T--ATTA
** *
6884956 GTCATATATTTGAACT-AGTT
163 -TTTTAT-TTTGAA-TAAGCT
* * * *
6884976 TAGTAAACAAATTTATTTTAAATCTCTTATTACTTTT-TGAAAGATTAACAAATTA-GT-ATTAT
1 T-GT--ATAAA--TA----AAA---C-AATT-GTTTTATGACA-A--AACAAA--AGGTCA-TA-
*** * * * * * * *** * * **
6885038 TTTATTCT-AAATAAGCTGGAATGATGAAA-A-ACAATTGTTATATG-ACCA-AAC-A-AAAGGC
45 ACGATT-TGAAAT-AGAT-AATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAA---
* * * * * **
6885096 CATAATTT-TTTTTAAACATATAATTATTCATATAATCTTAATTGTTTGAACTATTTCAGCAAA-
103 CA-GATTTATTTTTTAA-ATCT-CTTA--C-T-T-A--TTAATT-TTTGAAATA-TT-AATAAAT
*
6885159 TAGGT-TTATTTTTTAAATCTTTTTACTATCAA--T
155 TA-GTATTA--TTTT--A--TTTTGA--AT-AAGCT
* * *** *** * * * **
6885192 T-TTTGAAATAATATTA-AATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTATATGAACTGAAACAA
1 TGTAT-AAATAA-A--ACAATT-GTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATA-ACGATTTG--A-AA
* * ** * * * * * *
6885254 TTATTTTATAATAGAACAAA-AGGTTATAA-TGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGGAACT
56 -TA---GATAATTGTTCAAATA-GTCATAACT-ATTTGAACTA-GT--TCGAT-AAACA-G-A-T
* * *
6885317 GATTTAGTAAACAAAATTATTTTTTCAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
108 --TTA--------------TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * *
6885382 ATATTATTTTATTTTCAATAGGCT
157 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * *
6885406 TGTAT-GATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCGTAACAATTTGAAATAGATAAT
1 TGTATAAAT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * **
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64 TGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-
* * *
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* * * * * ****
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1 TGTATAAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATT-TGAAATAGATAA
* * * * ** * *
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** * * *
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* * * * * *
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1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * **
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1 TGTATAAATAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* ** * * * *
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**
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129 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * ** * * * * * **
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1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
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** **
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130 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * ** * * *
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1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
** ** ** * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
6886486 TTTATGAGTAGAAACAATTAG-TTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAAT
1 TGTATAAATA-AAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
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*
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* * * * * *
6886665 TGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA-TATTTTGGAAATATATAA
1 TGTATAAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTT-GAAATAGATAA
* * * * * * * *
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* **
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127 CTT-ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * * * *
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1 TGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
6886912 ATTCAAATATTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAAATTTATTTTTTAAATCT-TTAAC
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** * * *
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* * ** * * * *
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1 TGTATAAATAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* ** * * * *
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*
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1 TGTAT-AA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * *
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* * ** *
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* ** ** * *
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* * * * * * * * * *
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* *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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*
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* * *
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* * * ** ** * ** * *
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* ****
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* * *
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* **
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* * *
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* * * * * * ** * * * * **
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6889492 ATTAATTTTCT-AAATATTAATAAA
130 ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAA
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Statistics
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* * * * *
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382 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * * *
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* * * ** * ** *
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** *
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* ** *
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* * * * *
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* * * ** ** ** *
6881585 ATAATTATTTGAACCAATTTGATAAACAAATACACATTTTAAATAACTTATTTATTAATTTTTGA
256 ATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* *
6881650 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATGAACTGAAACAATTGTTTTAT
321 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTAT
* * * *
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386 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * *
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451 TTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
***
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* * * * * * *
6881934 GTTCAAATAG---GAAC----CG-A-T--TT-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAACCTCCTACTT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTT
* * * * *
6881987 ATTAAATTTTGT-AAT-TTCAATAAATT-GATATAATTTTA-TTC-CATAGGCTTGTATG-ATGA
130 ATT-AATTTT-TAAATATT-AATAAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-AATGAAT-C
* * ** *
6882046 AAAACAATTGTTATATGA-AAGAACAAAAGTTTGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
189 AAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** ** * * * *
6882110 GCCAAAATTATTT----TA--TCCA-ATTC-AATGTATTTTTTAAAT-TCCTAATATATCAATTT
253 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTT
* * * * * * * *
6882166 TTGAAGTATCAATAAAGTAATATTATTTTA-TTTCATATAAGCTTTTATGAATTGAAATAATTGT
317 TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGT
* * * *** * *
6882230 TTTATGATAAAACAAAATGTTATATTTATTTTAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATT
381 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
6882295 TGAACTTTTTCGATAAACAAATTGATTTTGTAAAATTTTTTATTTATTAATTTTCT-AAATACTA
446 TGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTT-TTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTA
* *
6882359 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATGAGCA
509 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * *
6882391 TGTATGAACTGAAA-ATTCTATTTTATGAC-AAGCAAAAGGTCGTAACGA-TTGAAATAGATAAT
1 TGTATGAA-TAAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
** * * * * *
6882453 TGTTTTAATACTCTTAACTATTTGAACT-GATTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TC--TC
64 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTC
* * * * * *
6882513 TTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTA-TCAATATTTTA-CTCTAATAAGCTTGTATGAA-CA
128 TTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-AATGAATC-
* * *
6882575 AAAACAATT-TCTTTATGACAAAACAAATA--TAATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAAA
189 AAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** * * * *
6882637 AATCAT-ACTTATTTGAACTGGTTCAATACATAGATTTAGTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATT
252 AGTCATAAC-TATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * ** * *
6882697 TTTGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATTTGTATGAA-T-AGA-AATTAT
316 TTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGT
* ** * * * * * * *
6882759 TTTACGACAAAACAAAATATCATAACGATTTGATATAGATAATAGTTTAAATGGACATGACTATT
381 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
6882824 TGAGCTTCTTCGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAA
446 TGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * *
6882888 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGCATAATCT
510 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* *
6882919 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATT
1 TGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
6882984 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCGGTAAATAGATTTATGTTTTAAATCT-TTTCCT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CT
* *
6883048 TATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAAT-AGA
129 TATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC-TTAATGAATCA-A
* *
6883112 AACAATTGGTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
191 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
6883177 ATAACTATTTGAA--AGTATTCAGA-AAATATATTTATTTTTCAAGT-TTTTACTTATTAATTTT
256 ATAACTATTTGAACTAGT-TT--GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** ** * *
6883238 TGAAATATTAATAAATTTCTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTACATGAA-TAAAGCCAAATGT
318 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACTAAA-ACAATTGT
* * * *** * * *
6883301 TCTATGAGAAAACAAAATGTCATAATGTTTTAAAATAAATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATT
381 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
6883366 TGAACATGTTCGGT-AACAAGATTCATTTTTTAATTCTCTTT-CTCATTAATTTATGAAATATTA
446 TGAACTTGTTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
**
6883429 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
509 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * *
6883461 TGTATGAACTGAAACGATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATAATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
6883526 ATTCAGATAGTCATAACTATTTAAAC-ATGTTTGGT-AACAAGATTCT-TTTTTTAATTTTCTTT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTCGGTAAAC-AGATT-TATTTTTTAAATCTCTTT
* * * **
6883588 CTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTG
127 CTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-ATGAATCA
* * * * *
6883653 AAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
190 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
6883718 TATGACTAGTTGAACTTGTTTAAAAAACATATTTATTTTTTAAATGT-TCTACTTATTAATTGTC
255 CATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTT
* * * * * *
6883782 AAAATAATAATAAATTAATA-T-TTTTA-ATCGAAATAAGCATGTATG-A-TAGAAACAATTATT
319 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * * * **
6883842 TTATGATAAAACAAAAAGTCATACCAATTTGTAATAAATAATTTTTCAAATAGTCATAAAGATTT
382 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
6883907 GAAATTGATCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCTT--AATATTAA
447 GAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAA
* ***
6883970 TAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCT
510 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * *
6884001 TGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGAC---ACAAAATGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATT
1 TGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
6884063 G-TCGAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTTGGCAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAAC
65 GTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-TC
* * * * * * **
6884127 -TATGAATTTTCATGATATTAATAACTTAGTATTTTTTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATTG
128 TTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-ATGAATCA
* * * * * *
6884191 AAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAGCAATTTGAAATAGATGATTATTCAAATAGT
190 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * ** * **
6884255 CATGACTATTTGATCTAGTTCGATAAACATATTTACTTTATGAATTTTTTACTTACCAATTGTCA
255 CATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * ***
6884320 AAATATTAATAAATTAGTATTATTCTAACCCT-AATAAGCTTGTATG------AACAA-------
320 AAATATTAATAAATTAATATTATT-TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * *
6884371 A--AC---A-AAAA-GTTATAA-AGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCAAAACTATTTG
384 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
6884428 AACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATAGTAATAT
448 AACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * *
6884489 ATTAGTATTACTTTATTCTGAACAAACT
513 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * *
6884517 TATACGAATAAAAACATTTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATT
1 TGTATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
6884582 GTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACCA-AATTATTTTTTAAATCTCTTGCT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCT
* * *
6884646 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATGTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATTC
129 TATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA--ATGAA-TC
* * * * *
6884709 AAAAAAATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTGCTCATAT
189 AAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
6884773 AGTCTTTAAATATTTAAACTAG-TTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTACCTATTAAT
252 AGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * * * *
6884837 TTTTGAAGTATTACTATATTATTATTATTTTATTCTGAATAAACTAGTATGAACAAAAATAATTG
315 TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * * * ** * ** *
6884902 TTTTATGATAGAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCAT-A-TAT
380 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
6884965 TTGAACTAGTT-TAGTAAACAAATTTA--TTTTAAATC---T-CTTATTACTTTTTGAAAGATTA
445 TTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * *
6885023 ACAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
509 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * ** * * *
6885055 GGAATG-ATGAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGCCATAATTTTTTTTAAACATATAA
1 TGTATGAAT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * * * * * *
6885119 TTATTCATATAATCTTAATTGTTTGAACTATTTCAGCAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTTTTTA
63 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-
* * * *
6885184 C-TATCAATTTTTGAAATAATATTAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-CT
127 CTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-ATGAATC-
* * * * * * * *
6885247 GAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAG
189 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
6885312 ---GAAC----TG-A-T--TTAG-TAAACAAAATTATTTTTTCAATCTCCTACTTATTAATTTTT
254 TCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *** *
6885365 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTCAATAGGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTTTT
319 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * *
6885430 ATGACAAAACAAAAGTTCGTAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATTA-CCATAATTATTTG
384 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTG
* * * ** *
6885494 AAC-CGATTTGATAAACTGACCTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
448 AACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * *
6885558 AAGTAATATTATTTTA-TTTCAGATAAGCT
512 AATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCT
* * * * ** *
6885587 TTTATGAATCGAGACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAGGGTCATCTTTATTCT-AAATAGATAA
1 TGTATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAATGATT-TGAAATAGATAA
* * * ** ** * *
6885650 TTATTCAAATAG-CTATGACTATTTGAGCTTTTTTAGTAAACAGATTTTTTTTTTAAAATTTCTT
63 TTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT
* * **
6885714 GT-TTATTAATTTTCTCAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGT-ATGAA
126 -TCTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC-T-TAATGAA
* * * * * * *
6885777 -CTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAACGATTTGAAATAAATAATTATTCTAA
187 TC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
6885841 TAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATT-GTT
251 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** * * * *
6885905 TTAG-AATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAGAAATTG
316 TTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAATTG
* * * ** * ** *
6885968 TTTTATTACAAAACAAACA--TCGTAACGATTTGAGGTAGATAATTGTTTAAATAGTTGTAAGTA
380 TTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
6886031 TTTGAACTAGTTCAATAAACAGATTTAATTCTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTA
444 TTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
**
6886092 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTT
509 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* ** * * * * **
6886124 TGTATGAATAGAAGCAATCATTTTAAGACAAAACAACATGTCATAATGGTTTGAAATAGATAAAA
1 TGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
6886189 ATTTAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCT
65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTT
** *
6886254 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAAT-AGAA
130 ATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-AATGAATCA-AA
* * * ** * * * ** **
6886318 ACAATTCTTTTATGATAAAACCAAATATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTGAAGGGTCA
192 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
** * ** * * * * *
6886383 TAGGTATTTGAACTAGCTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAGATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA
257 TAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * * * *
6886448 ATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTTTATG-AGTAGAAACAATTAG-TTTA
322 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-GTTTTA
* * *
6886511 TGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT-AA
385 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
6886575 ATATGTTCAGA-AAACATAATTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
450 CT-TGTTC-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
6886638 ATTTA-TATTA-TTT-TTTTGAAATAAGCT
513 A-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCT
* * * *
6886665 TGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAAT-ATTTTGGAAATATATAA
1 TGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTT-GAAATAGATAA
* * * * * * *
6886729 TTGTTTAGATAGCCATAACTATTTGAAC-ATGTTCGGTGAATAGATTAATTTTTTAATTCTCTTA
63 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-
* *
6886793 T-TCATTAATATTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-C
126 TCTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-ATGAATC
* * * * * * *
6886856 TGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
189 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
6886921 TTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAAATTTATTTTTTAAATCT-TTAACTTATT-ATT
253 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAAC-AAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT
** * * * *
6886984 TGTCAAAATATTAATAAATTAATATT-TTTTAATCTGAATAAGCTTCTATGAGC-AAAAGCAATT
316 T-TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAATT
* * * * **
6887047 GTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAAAG
379 GTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* *
6887112 ATTTGAACTTGGTCGATAAACAGATTTA-TTTTTAGATCTTTTACTTATTAATTCTCTTG--ATA
443 ATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATA
*
6887174 TTAATAAAATT-GTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCT
506 TTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCT
* ** * * * *** *
6887209 TGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTTTGACAAAAAAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAAT
1 TGTATGAAT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * *
6887274 TATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAATAGATTCATTTTTTAAATCT-TTTAA
64 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-C
* * * *
6887338 TTATTAATTTTTAGAATAATAATAACTTAGTATTATTTTATTTCAAATCAGCTTATATGAACCAA
128 TTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-ATGAATCAA
** * * *
6887403 AATGATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
191 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * ** * * * *
6887468 ATGATTACTTGATCTAGTTCGGTAAGCGTATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGA
256 ATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * **
6887533 AATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTTTAATAAGCTTTTATGAACAAAAATTATTGTTTTAT
321 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * *
6887598 AACAGAACAAAAAGTCCTAATAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC
386 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * *
6887663 TGGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAGATT
451 TTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * *
6887723 AGTATTTTTTTATTTCGAACAAACT
516 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
** * * * *** *
6887748 TACATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAACGTCATTGCGATTTGGAAA-AGATAAC
1 TGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-GAAATAGATAAT
* * * * ** * * * * *
6887812 CGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTAAGTAAATAGAATTATGTTTTAAATCTCTTACA
64 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCT
* * * * * * *
6887877 TATTAATTTTTTAATATGAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCGAATGAGC-TAGTATGAATTGA
129 TATTAATTTTTAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA--ATGAA-TCA
* **
6887940 AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAA----AT---GATTTGAAATAGATAACGGTTC--ATAGT
190 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
6887995 CTTAACTATTTTAACTGGTTT-AGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT
255 CATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT
** * * ** * * *
6888059 TG-AATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACAAAAATAATTGTTT
318 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
* * * * * * * * * *
6888123 TATGATAGAACAAAAGGTTATAACTATTTGAGATATACAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTA
383 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
6888188 AACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTG-AGTGATTAATA
448 AACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT-ATTAATA
* *** *
6888251 AATTACTATTATTTTATTCCAAATCAA-AT
512 AATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGCT
* * * *
6888280 TGTAT-AATAAGAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAAT
1 TGTATGAAT-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * * * *
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** * **
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127 CTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-ATGAATCA
* * * *
6888472 AAGCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGAGTTT-AAATAGACAATTGTTCAAATAG
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* * * * *
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254 TCATAACTATTTGAA-CTAGTTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
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** * * * *
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* * *
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* * *** *
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* * * * * * * * *
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1 TGTATGA-ATAAAAC-AAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * ** ** * * *
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63 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-
* ** *
6888950 CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTCT-ATG-ATT
127 CTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCT-TAATGAATC
* * * *
6889012 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAATGATTT-AAGATTA-ATAATTGCTCAAA
189 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-A-TAGATAATTGTTCAAA
* * *
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** *
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315 TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * * * *
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379 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * ** * * * ** * * * *
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444 TTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* **
6889329 ATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAAT
508 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * ** * * * *
6889362 AGTATGAATAGAACTACTTGTTTGATGATGAAATAAAAGGTTATAACGAATTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAATAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
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65 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTT
6889492 ATTAATTTTCTAAATATTAATAAA
130 ATTAATTTT-TAAATATTAATAAA
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Statistics
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Alignment explanation
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6880779 ATTTGATTTA
* * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * ** * *
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* * * * ** *
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** *
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* * *
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* * * ** *
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* * * * *** * * ** **
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* * ** *
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* * * * *
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189 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
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* * *
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* * * * ** * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * **
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* * * ** *
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191 GAAACAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * * * **
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* * * ** *
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* * * *
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* * ** * * * *
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1 TGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * * * ** * * * *
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* ** *
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* * ** * * * * *
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192 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * * *
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257 CATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** *
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*
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * * *
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**
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** * * * * * *
6883280 TACATGAATA-AAGCCAAAT-GTTCTATGAGAAAACAAAATGTCATAATGTTTTAAAATAAATAA
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* * * * * *
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64 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCT-TTA
* * *
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127 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * ** * *
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191 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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1 TGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
* * * **** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* *
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1 TGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
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* * * * * * **
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* * * * * *
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256 TCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * **
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* *
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66 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTTA
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131 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAACAGA
* * * * *
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258 ATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
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* * * * * * * * **
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* * * * *
6885182 TAC-TATCAATTTTT-GAAATAATATTAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA
125 TACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * * *
6885245 CTGAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAAT
189 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
6885310 AG---GAAC----TG-A-T--TTAG-TAAACAAAATTATTTTTTCAATCTCCTACTTATTAATTT
254 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
6885363 TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTCAATAGGCT
319 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * * ** *
6885406 TGTATG-ATGAAAAATAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCGTAACAATTTGAAATAGATAA
1 TGTATGAAT-AGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * * ** **
6885469 TTATTCAAATTA-CCATAATTATTTGAAC-CGATTTGATAAACTGACCTATTTTTTAAATCTTTA
64 TTATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT-
* * * *
6885532 ACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAAT
126 ACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-
* * **** *
6885596 C-GAGACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAAGGGTCATCTTTATTCT-AAATAGATAATTATTCAA
189 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * ** * * **
6885658 ATAG-CTATGACTATTTGAGCT-TTTTTAGTAAACAGATTTTTTTTTTAAAATTTCTTGTTTATT
252 ATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATT
* * * * *
6885721 AATTTTCT-CAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCA
314 AATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * * *
6885769 TGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAGAACGATTTGAAATAAATAAT
1 TGTATGAA-TAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * ** * *
6885833 TATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATATCTTT-C
65 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AA-ATCTTTAC
* * * * * * *
6885897 TTATT--GTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-CTCTGAATAAGCTTGTATGAACA-
128 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAG
* * * ** *
6885958 AAAGAAATTGTTTTATTACAAAACAAACA--TCGTAACGATTTGAGGTAGATAATTGTTTAAATA
192 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * * *
6886021 GTTGTAAGTATTTGAACTAGTTCAATAAACAGATTTAATTCTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTT
255 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * **
6886082 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTT
320 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * * * * * * **
6886124 TGTATGAATAGAAGCAATCATTTTAAGACAAAACAACATGTCATAATGGTTTGAAATAGATAAAA
1 TGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
* * * * *
6886189 ATTTAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCT
66 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTT
** *
6886254 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAA
130 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * ** * * * ** **
6886319 CAATTCTTTTATGATAAAACCAAATATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTGAAGGGTCAT
195 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
** * * * * * *
6886384 AGGTATTTGAACTAGCTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAGATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
260 AACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
*
6886449 TTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
325 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * ** * *
6886486 TTTATGAGTAGAAACAATTAGTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATT
1 TGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
* * * * * * *
6886551 GTTCAAATAGTCATAATTATTT-AAATATGTTCAGAAAACATAA-TTATTTTTAAAATTTTTACT
66 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTTTACT
* * * *
6886614 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-TTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGA
129 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * * * * *
6886677 ACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA-TATTTTGGAAATATATAATTGTTTAGATAG
193 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
6886741 CCATAACTATTTGAAC-ATGTTCGGTGAATAGATTAATTTTTTAATTCTCTTA-TTCATTAATAT
256 TCATAACTATTTGAACTA-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTT
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* * * *
6886847 TATATGAACT-GAAACAATT-GTTTTATTACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTGAAATAAATAA
1 TGTATGAA-TAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * *
6886910 TTATTCAAATATTCATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAAATTTATTTTTTAAATCTTTAA
64 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-AAATTTATTTTTTAAATCTTT-A
* * * * * * *
6886975 CTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAAATTAATATT-TTTTA-ATCTGAATAAGCTTCTATGAGC
127 CTTATTAATTT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAC
* * * *
6887037 A-AAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTAAAATAAATAATTGTTCAAA
190 AGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* ** * * * *
6887101 TAGTCAAAAAGATTTGAACTTGGTCGATAAACAGATTTA-TTTTTAGATCTTTTACTTATTAATT
253 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
*
6887165 CTCTTG--ATATTAATAAAATT-GTATTATTTTATTCGAAATAAGCT
318 -T-TTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * * * * *** * *
6887209 TGTATGAATAGAAAAAAATCATTTTTTGACAAAAAAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAAT
1 TGTATGAATAG-AAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
* * * * * * *
6887274 TATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGTTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTTTAAT
65 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TTTACT
* * * *
6887339 TATTAATTTTTAGAATAATAATAACTTAGTATTATTTTATTTCAAATCAGCTTATATGAACCA-A
129 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAGA
** * * *
6887403 AATGATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
193 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * * *
6887468 ATGATTACTTGATCTAGTTCGGTAAGC-GTATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTG
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* *
6887532 AAATATTAATAAATT-GATATTATTTTATTTTTAATAAGCT
322 AAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * ** * * * * *
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1 TGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
** * * * * * *
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65 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTT
* * * * * * ** *
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* * ** **
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195 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * **
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1 TGTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT
* * * * ** * *
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66 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTT
* ** * * *
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* * * * * * * * *
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195 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
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* * *
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* *
6888280 TGTAT-AATAAGAAACAATT-GTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAA
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** * * * * * * * ** *
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** ** **
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* * * *
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* * *
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256 TCATAACTATTTGAA-CTAGTTCGATAAAC-AGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
6888770 CTTATTAATTTTTA-AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTA-TTCACAATAAGATTGTAAGATA-
127 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGA-AC
* * * * * * * * *
6888832 TGAAACAAATATTTTTTA-G-CTAAACAAAAAGTCAAAACGATTTAAAATATATAATTATTCTAA
190 AGAAAC-AAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* ** ** * ** * *
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* * *
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* * * * *
6889003 TCTATGATTAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAATGATTT-AAGATTAATAA
1 TGTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAAATAA
** * * * *
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64 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTAC
* * *
6889129 TTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATCAT
128 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAG
* * * *
6889193 AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATATT
192 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * ** * * * * ** * * * *
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* * * **
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* * ** * * * * *
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1 TGTATGAATAGAAAC-AATTAGTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
* * * * ** *
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64 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTAC
*
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TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAC
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* *
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** * * * * *
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* * * * *
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**
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* * *
6889832 TAACTATTTGAACTAGTTTAACAAATACATTTATTTTTTAAATATCTTATTGATTAATTTTT-AG
1 TAACTATTTGAACTAGTTCAACAAATACATTTATTTTTT-AA-ATC-T-TTCACTAATTTTTGA-
* *
6889896 AATATTATTAAATTAGTATTA-TTTTAGTCCAAAAAAGCTTATATG-GAAAGAAATAATTATTTT
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* * * * * * * *
6889959 TTGACAAAATAAAGATCTTAATAATTTGCGATAGATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGGA
125 ATAACAAAACAAAGATCATAATAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATCAGAACTATTTGAA
* * * * *
6890024 CTATTTCAGTAAATAGA-TTTAATTTTTAAA-TCTC-TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT
190 CTACTTCAGAAAACA-ACTTT-AGTTTTAAACTCTCGTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGT
6890086 AGTATTATTTTATT
253 AGTATTATTTTATT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAAAAAAGCTTATATGAGAAAAAAACAATTATTTTATAACA
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CAGAAAACAACTTTAGTTTTAAACTCTCGTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTAT
TTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAAACT
Found at i:6890273 original size:181 final size:181
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Indices: 6889884--6890527 Score: 576
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6889874 TATCTTATTG
* * * * ** * *
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1 ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAA-CTTGTAT-GAATAGA
* * * * * * ** *
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64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAAT
* * * *
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* * ** * *
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* * * *
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66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTTAAAT-AATCA
* * * * * *
6890189 TGATTATTTGAACTTGTTTGGTAAAGAGATTAATTTTTTATATCTCCT-ACCT
130 TAACTAATTGAACTTGCTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCT-CTGACCT
* *
6890241 ATTAGTTTTCAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAA
1 ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAA
* * * ** * * *
6890306 AAACTATTTTATGATGAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTTGAGTAATCAT
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAATCAT
** * *
6890371 AACTAATTGAACTTGCTTGGTAAACAGATTTCTTTTTTAAATCTTTGACTT
131 AACTAATTGAACTTGCTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTGACCT
*** * ** * * *
6890422 ATTAATTTTTGTAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATACGCTTATATGATTATAAA
1 ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAA
*
6890487 CAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAA
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAA
6890528 CATGTTAAGA
Statistics
Matches: 377, Mismatches: 77, Indels: 23
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.01
176 65 0.17
177 66 0.18
178 5 0.01
180 2 0.01
181 236 0.63
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAATCAT
AACTAATTGAACTTGCTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTGACCT
Found at i:6890636 original size:144 final size:145
Alignment explanation
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Period size: 144 Copynumber: 1.9 Consensus size: 145
6890394 ACAGATTTCT
*
6890404 TTTTTAAATCTTTGACTTATTAATTTTTGTAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATA
1 TTTTTAAATCTTTGACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * *
6890469 CGCTTATATGATTATAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAACATGTT
66 AGCTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAACATGTT
6890534 AAGAAAATAGATTTA
131 AAGAAAATAGATTTA
* *
6890549 TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAA
1 TTTTTAAATCTTTGACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-CTAGTATTATTTTATTTTG-AA
* * * * *
6890611 TAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAA
64 TAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAA
6890672 ATAGAAAATT
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 13, Indels: 5
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
143 4 0.04
144 93 0.86
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ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (145 bp):
TTTTTAAATCTTTGACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATA
AGCTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAACATGTT
AAGAAAATAGATTTA
Found at i:6890868 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 6890512--6892039 Score: 1159
Period size: 180 Copynumber: 8.5 Consensus size: 181
6890502 AAAACAAAAG
* * *
6890512 GTCATAACTATTTGAACATGTTAAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-CGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * *
6890574 TTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTG
65 TAAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTG
** *
6890637 TTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGAAAATT-TTCAAATA
128 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
6890690 GTCATAACTATGTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAATAATCTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
6890755 AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAATTGATATAATTATTT
66 AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTT
* *
6890820 TAT-ATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
131 TATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * *
6890870 GTTATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * **
6890935 -CGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATAATT
66 AAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTT
** * * ** * *
6890999 TTATGGCAAAACAAAA-GTTATAATAGCTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
130 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
6891050 GTCATAACAATTTAAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTAT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
*** * * * * *
6891115 CTTAATATTAATAGATTTA-TATTAATTTATTT-GAA-ATAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTAT
66 AAGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-AGCTTATATGAATAGAAACAATTGT
* * ** * *
6891177 TTTATGATAAAATAAAAGGTTATAGTAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATTA
129 TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TA
* * * * *
6891231 -TCATAATTATTTAAAATTG-TCTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * *
6891294 TTAGAATACTCATAAATTGGCATTATTTTATTTC-AATAAACTTATATGAATTGAAACAATTCTT
65 TAAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTT
* * * ** * *
6891358 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGAAACAATTCT
130 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAAT-A
* * * * * * * * * * *
6891412 TTTATGACTAATTGATCTAGCTC-AGTAAA-CGTATTTA-TTTTTAAATTTTTTTACTCATTAAT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAATAG-ATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAAT
* * *
6891474 TGTCAA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
63 T-TTAAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAATAGAAACAAT
* * * ** * * *
6891537 TGTCTTATAATAGAACAAAA-GTCATAAGGACTTGAAATAAATAATT-TGTCACATA
126 TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATA
* * * *
6891592 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAGT--TTTC
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
6891654 AA-AATATTAATAGATTTGTATTACTTTATTCTGGACA-AA-CTTATATGAACA-AAATATTTGT
66 AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGA-ATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGT
* * *
6891715 TTTATGATAGAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATA
129 TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
6891768 GTCATAATTATTTGAA-TTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-T
* * * * * * * *
6891832 TTTTA-AA-ATTAATAAATTCA-TTTTATTTTGTTTCAAATAAGC-TAGTCTAAATTGAAAAAAT
63 TTTAAGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA-TATGAATAGAAACAAT
* * * * * * *
6891893 TGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAACATTTTGAAAATAGATAATTGTTGATATA
126 TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAATAGATAATTATTCAAATA
** * * * * * **
6891950 GTTTTAAATATTTGAACTAGTTCGACAAATAAATTTA--TTTTAATTCTCTTGGTTATT-ATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * *
6892012 TGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTT
66 AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
6892040 TTTAAATCTC
Statistics
Matches: 1061, Mismatches: 237, Indels: 103
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 24 0.02
176 91 0.09
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178 42 0.04
179 131 0.12
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTT
TATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
Found at i:6891628 original size:542 final size:536
Alignment explanation
Indices: 6890512--6891941 Score: 1581
Period size: 542 Copynumber: 2.6 Consensus size: 536
6890502 AAAACAAAAG
6890512 GTCATAACTATTTGAAC-ATGTTAAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTA-GTT-AGATAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATT
* *
6890573 T-TTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTG
64 TCTT--AATATTAATAGATTTATATTAATTTATTTGAAAT-AGCTTGTATGAATAGAAATAATTG
* * *
6890637 TTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGAAAATTTTCAAATAGTCATAACTATG
126 TTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTCAAATAGTCATAATTAT-
* * * * * * * * *
6890702 TGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAATAATCTTAAGAATATTAAT
190 TTAAATTGTTAGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * * **
6890767 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAATTGATATAATTATTTTATATGAAACAA
255 AAATT-GCATTATTTTATTTCAAATAAG-CTATATGAATTGAAAAAATTATTTTATACAAAACAA
** * * *
6890832 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAAT
318 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGAAACAAATAGTTATGACTAATTGAACTAGCTCAAT
* *
6890896 AAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATT
383 AAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
* ** * *
6890961 TTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATAATTTTATGGCAAAACAAAAGTTATAATAGC
448 TTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATAATCTTATAACAAAACAAAAGTCATAAGAGC
6891026 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
513 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * *
6891050 GTCATAACAATTTAAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTAT
1 GTCATAACTATTTGAACTAGTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATT-T
* *
6891115 CTTAATATTAATAGATTTATATTAATTTATTTGAAATAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTT
65 CTTAATATTAATAGATTTATATTAATTTATTTGAAATAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTT
* * * ** *
6891180 ATGATAAAATAAAAGGTTATAGTAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATTA-TCATAATTATTTA
130 ATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATT-TTCAAA-TAGTCATAATTATTT-
* * * *
6891244 AAATTGTCT-GATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATACTCATA
192 AAATTGT-TAGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * *
6891308 AATTGGCATTATTTTATTTC-AATAAACTTATATGAATTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAA
256 AATT-GCATTATTTTATTTCAAATAAGC-TATATGAATTGAAAAAATTATTTTAT-ACAAAACAA
* * ** * *
6891372 AAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGAAACAATTCTTTTATGACTAATTGATCTAGCTCAG
318 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGAAACAAAT-AGTTATGACTAATTGAACTAGCTCAA
* * * * *
6891437 TAAACGTATTTATTTTTAAATTTTTTTACTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
382 TAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAT
* * ** * *
6891502 TTTAA-TCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTCTTATAATAGAACAAAAGTCATAAG-
447 TTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATAATCTTATAACAAAACAAAAGTCATAAGA
*
6891565 GACTTGAAATAAATAATT-TGTCACATA
511 G-CTTGAAATAAATAATTGT-TCAAATA
* * * *
6891592 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAGT--TTTC
1 GTCATAACTATTTGAACTAGTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTC
** * * * * *
6891654 AAAATATTAATAGATTTGTATTACTTTATTCTGGACAA-A-CTTATATGAACA-AAATATTTGTT
66 TTAATATTAATAGATTTATATTAATTTATT-T-GA-AATAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTT
* *
6891716 TTATGATAGAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAGTCATAATTATTT
128 TTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAA-TTTTCAAATAGTCATAATTATTT
* * * *
6891781 GAATTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTTA-AA-ATTAA
192 AAATT-GTTAGGTAAATAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAA
* * * *
6891844 TAAATT-CATTTTATTTTGTTTCAAATAAGCTAGTCTAAATTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAA
254 TAAATTGCA--TTATTTTATTTCAAATAAGCTA-TATGAATTGAAAAAATTATTTTAT-ACAAAA
*
6891908 TAAAAGGTCATAAC-ATTTTGAAAATAGATAATTG
315 CAAAAGGTCATAACGA-TTTG-AAATAGATAATTG
6891942 TTGATATAGT
Statistics
Matches: 750, Mismatches: 110, Indels: 62
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
536 2 0.00
537 9 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (536 bp):
GTCATAACTATTTGAACTAGTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTC
TTAATATTAATAGATTTATATTAATTTATTTGAAATAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTA
TGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAT
TGTTAGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTG
CATTATTTTATTTCAAATAAGCTATATGAATTGAAAAAATTATTTTATACAAAACAAAAGGTCAT
AACGATTTGAAATAGATAATTGAAACAAATAGTTATGACTAATTGAACTAGCTCAATAAACATAT
TTATTTTTAAAATCTGTTACTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCA
AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATAATCTTATAACAAAACAAAAGTCATAAGAGCTTGAAATA
AATAATTGTTCAAATA
Found at i:6892050 original size:52 final size:53
Alignment explanation
Indices: 6891982--6892092 Score: 143
Period size: 53 Copynumber: 2.1 Consensus size: 53
6891972 CGACAAATAA
* * * * * * *
6891982 ATTTATTTTAATTCTCTTGGTT-ATTATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATT
1 ATTT-TTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
6892035 ATTTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
1 ATTTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
6892088 ATTTT
1 ATTTT
6892093 ATTTTGGATA
Statistics
Matches: 50, Mismatches: 7, Indels: 2
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (53 bp):
ATTTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT
Found at i:6892219 original size:230 final size:234
Alignment explanation
Indices: 6891801--6892273 Score: 528
Period size: 232 Copynumber: 2.0 Consensus size: 234
6891791 GGTAAACAAA
* * * * *
6891801 ATTATTTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTTAAAATTAATAAATTCATTTTATTTTGTTTC
1 ATTATTTTTTTAAATCCCTTACTTAATAATTTTTGAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC
* ** *
6891866 AAATAAGCTAGTCTAAATTGAAAAAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAACATTTTGAAA
66 AAATAACCTAGTCTAAACCGAAAAAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAGAACATTTTGAAA
* * ** * *
6891931 ATAGATAATTGTTGATATAGTTTTAAATATTTGAACTAGTTCGACAAATAAATTTA-TTTT-AAT
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGTTCGACAAACAAATTTATTTTTCAAA
* * *
6891994 TCTCTTGGTTATT-ATTTTTGGAATATTATTAGATTAGT
196 TCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTAGG
* *
6892032 ATTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTATTTTTTTAAATCCCTTACTTAATAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
*** ** * * ** *
6892097 TGGATAACCTTTTGTGAACCGAAACGATTGTTTTATAACAAAA-CAAAGGTCAGAACAATTTT--
65 CAAATAACCTAGTCTAAACCGAAAAAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAGAAC-ATTTTGA
* * **
6892159 AAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT
129 AAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGTTCGACAAACAAATTTA-TTTTT
* * *
6892223 CAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGG
192 CAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTAGG
6892266 ATTATTTT
1 ATTATTTT
6892274 ATTTTGAATA
Statistics
Matches: 198, Mismatches: 37, Indels: 11
0.80 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
229 1 0.01
230 47 0.24
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232 63 0.32
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ACGTcount: A:0.37, C:0.08, G:0.10, T:0.46
Consensus pattern (234 bp):
ATTATTTTTTTAAATCCCTTACTTAATAATTTTTGAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC
AAATAACCTAGTCTAAACCGAAAAAATTGTTTTATAACAAAATAAAAGGTCAGAACATTTTGAAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTAGTTCGACAAACAAATTTATTTTTCAAA
TCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTAGG
Found at i:6892371 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 6892037--6892714 Score: 668
Period size: 181 Copynumber: 3.8 Consensus size: 180
6892027 TTAGTATTAT
* ***
6892037 TTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGGAT
1 TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT
* * * * ** * * *
6892102 AACCTTTTGTGA-ACCGAAACGATTGTTTTATAACAAAACAAAGGTCAGAACAATTTTAAATA-A
66 AAGCTTGTATGATA-TGAAAAAAATGTTTTATAACAAAACAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGA
* * *
6892165 GTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA
130 -TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTA
* * ** **
6892217 TTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTTTGA
1 TTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAA
* * *
6892281 ATAAGCTTGTTTGATATGAAAAAAATATTTTATGACTAAAA-AAAGGTCAGAACGATTTGAAATA
64 ATAAGCTTGTATGATATGAAAAAAATGTTTTATAAC-AAAACAAAGGTCAGAACGATTTGAAATA
* ** ** * * *
6892345 GATAATTATTCTTATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGACAAGCATATTTA
128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTA
* * * **
6892398 TATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTTG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAA
1 TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TTCAA
* * * * * *
6892457 ATAAGCTTCTATGAT-TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAGGATCATAACGATTTGAGAT
64 ATAAGCTTGTATGATAT-GAAAAAAATGTTTTATAACAAAACAAAGG-TCAGAACGATTTGAAAT
* * * * *
6892519 TGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCGAACTGGTTTGATGAACAGATTTA
127 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTA
*
6892573 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT
* *
6892638 GAA-CTTGTATGATCA--AAAATAAATGTTTTATAACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
66 -AAGCTTGTATGAT-ATGAAAA-AAATGTTTTATAACAAAACAAAGGTCAGAACGATTTGAAATA
6892700 GATAATTGTTCAAAT
128 GATAATTGTTCAAAT
6892715 GGCCATAATT
Statistics
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174 8 0.02
175 67 0.16
176 66 0.16
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181 140 0.34
182 12 0.03
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAT
AAGCTTGTATGATATGAAAAAAATGTTTTATAACAAAACAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGAT
AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTA
Found at i:6892749 original size:154 final size:154
Alignment explanation
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Period size: 154 Copynumber: 2.0 Consensus size: 154
6892558 TGATGAACAG
*
6892568 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
* * * *
6892632 TCAAATGAA-CTTGTA-TGATCAAAAATAAATGTTTTATAACAAAA-CAAAGGTCATAATGATTT
66 T-AAAT-AAGCTTGTACT-AACAAAAACAAATGTTTTATAACAAAATAAAAGGTAATAATGATTT
6892694 GAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATA
128 GAAATAGA-AATTGTTCAAATGGCCATA
*
6892722 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
** ** * * *
6892787 TGTATAAGCTTGTACTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATGATTTTAA
66 TAAATAAGCTTGTACTAACAAAAACAAATGTTTTATAACAAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAA
6892852 ATAGAAATTGTTCAAAT
131 ATAGAAATTGTTCAAAT
6892869 AGTAATAACT
Statistics
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154 103 0.79
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ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (154 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
TAAATAAGCTTGTACTAACAAAAACAAATGTTTTATAACAAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAA
ATAGAAATTGTTCAAATGGCCATA
Found at i:6893180 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 6892721--6894457 Score: 1151
Period size: 181 Copynumber: 9.6 Consensus size: 182
6892711 AAATGGCCAT
*
6892721 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * * *
6892786 CTGTATAAGCTTGTACTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGT-AATAATGATTTT
66 CCATATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAA-AACGATTTG
** * *
6892850 AAATAGA-AATTGTTCA-AATAGTAATAACTATTTGAACTT-G-TTCGATAAATA
129 AAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTAGATAAACA
* * *
6892901 GATTTATTTTTTAAACTCTCATT-CTTATTAATTTTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTAATT
1 AATTTATTTTTTAAA-TCTC-TTACTTATTAA--TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** *
6892964 TATTCCGA-ATAAGCTTGTTGAAACTTAAACAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAACGA
62 TATTCC-ATATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTGTTTTATGAA-AAACAAAAGGTCAAAACGA
* * * **
6893028 TTTAAAATGGATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTTAG-TAAACA
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
*
6893084 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGGATTATTTTATT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * *
6893149 CCATATTAGCTTGTACTCACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGT-AATAATGATTTT
66 CCATATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAA-AACGATTTG
** *
6893213 AAATAGA-AATTGTTCA-AATAGTAATAACTATTTGAACTT-GTTT-GATAAATA
129 AAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTAGATAAACA
* ** * *
6893264 GATTTATTTTTTAAACTCTCATT-CTTATTAATTTTTTTTAATTTTAATAAATTAGTATTAATTT
1 AATTTATTTTTTAAA-TCTC-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* ** * ** *
6893328 GTTCCGA-ATAAGCTTGTTGAAACTTAAACAATTGTTTTATGGCTAAACAAAAGGTCAAAACAAT
63 ATTCC-ATATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTGTTTTAT-GAAAAACAAAAGGTCAAAACGAT
* ** *
6893392 TTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTCAG-TAAACA
126 TTGAAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
* ** * *
6893447 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTTTAATATTTTAAT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
6893512 --ATGAATTAGCCTGTACAAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
66 CCAT--ATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAAAACGATTT
* ** * ** **
6893574 GAAATTGATAATCATTCAT-ATAGTCTTAACTATTTGAATTGG-TTCGGCAATTA
128 GAAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
* * * * * * * *
6893627 GATTTCTTTTTT-ATTTTCTTAGTTATTAA-GTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * ** *** * * * * * * * * *
6893690 TCAAAATAAAATAT-TATGGAC-AGAACCAACTATTTGATGACAAAACAAAATGTTATAGCTATT
65 TCCATATAAGCT-TGTACAAACTA-AAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAAAACGATT
* * * * ** ** * * *
6893753 TGAAGTAGTTAATTATTCA-AAAAACCAAAACTATTTGAAATAGTTTAG-TAAATA
127 TGAAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
* * *
6893807 GATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * ** * * * *
6893871 TTCAAACAAACTTATATGAA-TGAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGT-ACTAACAATT
65 TCCATATAAGCTTGTACAAACT-AAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCA-AAACGATT
* * * * * *
6893934 TAAAATAGTTAATTATTCA-AGTAG--TTATACTTACTTGAATTGGTTTAG-TAAATA
127 TGAAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTA-AC-TATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
* * ** *
6893988 AAATTATTTTTTAAATCTCTTAC--A--AAATTTTGAAATATTAGCAAATTAGTTTTATTTTATT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * ** * * * ** * *
6894049 CTGA-ATAAACTTGTATGAGCGAAAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAAATCATAATGATTTG
66 C-CATATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAAAACGATTTG
* * * **
6894113 AAATAAATAATTGTTCAT-ATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCA-ACAAATG
129 AAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
** * * * * * *
6894165 GTTTTATTTTTTTAATATCATAGC-TATGAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * ** * * * *
6894228 TTCTGA-ATAAACTTGTATGAAC-AGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAAC-AT
64 TTC-CATATAAGCTTGTACAAACTA-AAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCAAAACGA-
* * ** ** *
6894290 TTTGAAATAGATAATTATACA-AATAGTAATAACTATTTGAA-CAGTTT-GGTAAACA
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
*
6894345 AATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * **
6894406 TGAAATAAGCTTG--CAAGTTGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
66 CCATATAAGCTTGTACAAACT-AAAA-CAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGGT
6894458 AATAACAATT
Statistics
Matches: 1238, Mismatches: 244, Indels: 154
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 1 0.00
175 5 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (182 bp):
AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
CCATATAAGCTTGTACAAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAA
ATAGATAATTGTTCATAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGATAAACA
Found at i:6893189 original size:517 final size:508
Alignment explanation
Indices: 6892211--6893231 Score: 1231
Period size: 517 Copynumber: 2.0 Consensus size: 508
6892201 TCGGTAAACA
* * * *
6892211 AATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTAT
1 AATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGGATTATTTTAT
* * * *
6892276 TTTGAATAAGCTTGTTTGATATGAAAAAAATATTTTATGACTAAAAAAAGGTCAGAACGATTTGA
66 TCTGAATAAGCTTGTCTGATATGAAAAAAATATTTTATGACAAAAAAAAGGTAAGAACGATTTGA
** ** * * *
6892341 AATAGATAATTATTCTTATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGACAAGCATATTTATATTTTAA
131 AATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACAGATTTATATTTTAA
*
6892406 ATCTCTTATTAATTTTTTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAACCAAATAAGCTTCTATGA
196 ATCTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-ACCAAATAAGCTTCTATGA
* * * * *
6892471 TTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAGGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATA
260 TTA-AAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAGGATCAAAACGATTTAAAATGGATAATTGTTCAAATA
* ** * *
6892536 GTCATAACTATTCGAACTGGTTTGATGAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
324 GTCATAACCATAAGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
6892601 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATGAACTTGTATGATCAAAAATAAATGTTT
389 TGAAATATTAATAAATTAAGATTATTTTATTCCAAATGAACTTGTATCATCAAAAACAAATGTTT
*
6892666 TATAACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCAT
454 TATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGA-AATTGTTCAAATGGCCAT
*
6892721 AATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 AATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGGATTATTTTA
* * * * * *
6892784 TTCTGTATAAGCTTGTACT-A-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATGAT
65 TTCTGAATAAGCTTGT-CTGATA-TGAAAAAAATATTTTATGACAAAA-AAAAGGTAAGAACGAT
* * * * * *
6892847 TTTAAATAGA-AATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTT
127 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACAGATTTATATT
* *
6892911 TTAAACTCTCATTCTTATTAATTTTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATT-CCGAATA
192 TTAAA---TC--TCTTATTAA-TTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT-ATTT-TTACCAAATA
*
6892975 AGCTTGT-TGAAACTT-AAACAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGG-TCAAAACGATTTAAAATG
249 AGCTTCTATG--A-TTAAAACAATTGTTTTATG-A-AAA-AAAAGGATCAAAACGATTTAAAATG
* *
6893037 GATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
308 GATAATTGTTCA-AATAGTCATAACCATAAGAACTGGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * *
6893100 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGGATTATTTTATTCCATATTAGCTTGTAC
371 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAAGATTATTTTATTCCAAATGAACTTGTA-
* * *
6893165 TCA-CTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTTAAATAGAAATTGTTCA
435 TCATCAAAAACAAATGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGAAATTGTTCA
6893229 AAT
500 AAT
6893232 AGTAATAACT
Statistics
Matches: 433, Mismatches: 56, Indels: 37
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
508 6 0.01
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (508 bp):
AATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGGATTATTTTAT
TCTGAATAAGCTTGTCTGATATGAAAAAAATATTTTATGACAAAAAAAAGGTAAGAACGATTTGA
AATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACAGATTTATATTTTAA
ATCTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTACCAAATAAGCTTCTATGAT
TAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAGGATCAAAACGATTTAAAATGGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACCATAAGAACTGGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
AAATATTAATAAATTAAGATTATTTTATTCCAAATGAACTTGTATCATCAAAAACAAATGTTTTA
TAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGAAATTGTTCAAATGGCCAT
Found at i:6893386 original size:363 final size:362
Alignment explanation
Indices: 6892721--6893639 Score: 1412
Period size: 363 Copynumber: 2.5 Consensus size: 362
6892711 AAATGGCCAT
*
6892721 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * *
6892786 CTGTATAAGCTTGTACTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTAATAATGATTTTA
66 C-ATATTAGCTTGTACTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTTA
6892851 AATAGAAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
130 AATAGAAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
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195 CTCTCATTCTTATTAATTTTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCCGAATAAGCTTG
* *
6892981 TTGAAACTTAAACAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAACGATTTAAAATGGATAATTGT
260 TTGAAACTTAAACAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAGATAATTGT
*
6893046 TATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTTAGTAAACA
325 TATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTCAGTAAACA
*
6893084 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGGATTATTTTATT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* *
6893149 CCATATTAGCTTGTACTCACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTTA
66 -CATATTAGCTTGTACTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTTA
*
6893214 AATAGAAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
130 AATAGAAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA
* *
6893279 CTCTCATTCTTATTAATTTTTTTTAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTGTTCCGAATAAGCTTG
195 CTCTCATTCTTATTAATTTTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCCGAATAAGCTTG
** *
6893344 TTGAAACTTAAACAATTGTTTTATGGCTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGT
260 TTGAAACTTAAACAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAGATAATTGT
6893409 TATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTCAGTAAACA
325 TATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTCAGTAAACA
* ** * *
6893447 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTTTAATATTTTAAT
1 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * ** *
6893512 -ATGAATTAGCCTGTACAAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
66 CAT--ATTAGCTTGTACTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTT
* ** * ** ** * *
6893575 AAATTGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCGGCAATTAGATTTCTTTTTT
129 AAATAGA-AATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAATAGATTTATTTTTT
6893639 A
192 A
6893640 TTTTCTTAGT
Statistics
Matches: 508, Mismatches: 43, Indels: 10
0.91 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
361 2 0.00
362 45 0.09
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364 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (362 bp):
AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
CATATTAGCTTGTACTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTTAA
ATAGAAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAAC
TCTCATTCTTATTAATTTTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCCGAATAAGCTTGT
TGAAACTTAAACAATTGTTTTATGAATAAACAAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAGATAATTGTT
ATAATAGTCTTAACCATAAGAATTGGTTCAGTAAACA
Found at i:6893493 original size:18 final size:16
Alignment explanation
Indices: 6893470--6893511 Score: 50
Period size: 19 Copynumber: 2.5 Consensus size: 16
6893460 AATCTCTTAC
6893470 TTATTAATTTTTGAAATA
1 TTATTAATTTTT--AATA
6893488 TTATTAAATTTTTAATA
1 TTATT-AATTTTTAATA
6893505 TT-TTAAT
1 TTATTAAT
6893512 ATGAATTAGC
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 5
0.82 0.00 0.18
Matches are distributed among these distances:
15 3 0.13
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ACGTcount: A:0.38, C:0.00, G:0.02, T:0.60
Consensus pattern (16 bp):
TTATTAATTTTTAATA
Found at i:6894146 original size:358 final size:357
Alignment explanation
Indices: 6893781--6894454 Score: 808
Period size: 358 Copynumber: 1.9 Consensus size: 357
6893771 AAAAAACCAA
* ** * * *
6893781 AACTATTTGAAATAGTTTAGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-CTGATTAATTTTCTA-
1 AACTATTTGAAATAGTTCAACAAATAGATTTACTTTTTAAATATCATAGCT-ATGAATTTT-TAG
*
6893844 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAACAAACTTATATGAA-TGAAAATAATTGTTTT
64 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCTAAACAAACTTATATGAACAG-AAATAATTGTTTT
* * * *
6893907 ATGACAAAACAAAAAG-TACTAACAATTTAAAATAGTTAATTATTCAAGTAGTTAT-ACTTACTT
127 ATGACAAAACAAAAAGTTA-TAACAATTTAAAATAGATAATTATACAAATAGTAATAAC-TACTT
** * *
6893970 GAATTGGTTTAGTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACAAAATTTTGAAATATTAGCAAATT
190 GAA-CAGTTTAGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACAAAATTTTGAAATATTAACAAATT
* * * *
6894035 AGTTTTATTTTATTCTG-AATAAACTTGTATGAG-CGAAAA-TAATTGTTTTATGAGAAAACAAA
254 AGTATTATTTTATT-TGAAATAAACTTGCA--AGTCGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAA
6894097 AAATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTT
316 AAATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTT
* * * * * *
6894139 AACTATTTGAATTGGTTCAACAAATGGTTTTATTTTTTTAATATCATAGCTATGAATTTTTAGAA
1 AACTATTTGAAATAGTTCAACAAATAGATTTACTTTTTAAATATCATAGCTATGAATTTTTAGAA
* * * *
6894204 TATTATTAAATTAGTATTATTTTTTTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGA
66 TATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTCTAAACAAACTTATATGAACAGAAATAATTGTTTTATGA
* * * * * *
6894269 TAGAACAAAAGGTTATAACATTTTGAAATAGATAATTATACAAATAGTAATAACTATTTGAACAG
131 CAAAACAAAAAGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTATACAAATAGTAATAACTACTTGAACAG
* * * * * *
6894334 TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
196 TTTAGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTATTA
* *
6894399 TTTTATTTGAAATAAGCTTGCAAGTTGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
261 TTTTATTTGAAATAAACTTGCAAGTCGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
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CAAAACAAAAAGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTATACAAATAGTAATAACTACTTGAACAG
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TTTTATTTGAAATAAACTTGCAAGTCGAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAAT
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* *
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65 ACA
* * **
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66 CA
6894532 ATTT
1 ATTT
6894536 AAAATAGATA
Statistics
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CA
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6894455 GGTAATAACA
* * * *
6894465 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAACAATTGTTTTATGACACAATGAAAAGTAAT
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTG--AAACAATTATTTTATGACACAATCAAAAGTAAT
** *
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* *
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*** * *
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* * * * **
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* * * * ** *
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* **
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1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATGAC
6894876 TAAACAAGAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
180 9 0.05
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.41
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CAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTTGAATTGATTCAATAAACTGATATA
TTTTTTAAATCTCTTACTTATGAATTTTTTAAATATTAATAAAAAAGTACT
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6895018 ATAGTTATGA
* * * * * * * * * * *
6895028 CTATTTAAAATCAATATGGCTTTTTATTTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTTATAAAAACTT
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT
** * * * *
6895273 ATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAA
65 ATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
6895338 T-AAATTTGTTAACCGAACCAGTTTAAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
130 TAAAATCTATTTACCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
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1 CTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * * * *
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65 ATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * * * * * * *
6895520 T-AAATTTGTTTGCTGAACCAGCTCAAATATTTAAGGCTATATGAAAAAATTCTT
130 TAAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATT-AT
* * ** * * * * *
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1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA-AGCT
* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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1 CTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * *
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65 ATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* ** ** * *
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130 TAAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
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1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTT
* * ** * *
6896000 ATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAACATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAA
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* * * ** * * * *
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** * * * * * *
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1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * * **
6896182 TTCAAAATAACATAAT-TCTCATTTATTAACAATCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
66 TTCGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * *
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** * * * *
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1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATACAAGCT
** * * ** * * * **
6896363 TATTTTAAATAAAATAATGA-AAATTTGTTAATATTAAAAAAATTAATAAATAAAAAATTTTGAA
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* * * *
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* * * ** * * * *
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1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * *
6896546 TTC-ATATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAGACAATTAATAAGTAA-AAACTTTTAAA
66 TTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAA
* * * * * *
6896608 AAT-AAATATGTTTACCGAACAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTAT
128 AATAAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** * ** * * * *
6896662 TTATTTCAAAT-AGTTATGAACTTTTGTTTCCTTATAAAACAATTGTACCAATTTATATAGGCTT
1 CTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * ** ** *
6896726 ATAT-GGAATAAAATATTACAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAA
65 AT-TCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * *
6896790 AT-GAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTAT
129 ATAAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** *
6896843 CTATTTTAAATTATTATGACCAGTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTCATACAAGCTTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * * * *
6896907 TTCCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAGTAAGCAA-AAATTTAAGAAAT
66 TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * *** * * * * *
6896971 -AAATTTGTTTTTTGAATACGTTGAAATAGTTATGAATA-TTGAATAATTAT
131 AAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
6897021 CTATTTCAAAT-AGCTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAGAAGCTT
1 CTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * *
6897085 ATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAA
65 ATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * **
6897150 T-AAATTTATTTACC-AAGCAAGCTCAAATAGTTATGATTGCTTGAACAATTAT
130 TAAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
6897202 TTATTTCAAAT-AGTTACGATCTTTTATTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTT
1 CTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * * * *
6897266 ATTTGGAATAAAATAAT-CTCATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAA
65 ATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
6897330 T-AAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCAATTAT
130 TAAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
6897382 CTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTG-CTGTAAAACAATTATTTCCATTCATACAGAAG-
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC--AAGC
* * *
6897445 -TATTCAAAATAAAATAGTACCT-ATTTATTAATATTTT-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAA
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* * * * *
6897504 AACT--AATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAATTATGATTATTTGAAAAATTAT
127 AAATAAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * *
6897558 CTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTTTTTTTCATATAAGCTT
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTT
* * *
6897622 AATT--ATATTAAGATAATATTAATTTAATAATA
65 -ATTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATA
6897654 AAAAATAAAA
Statistics
Matches: 1960, Mismatches: 423, Indels: 129
0.78 0.17 0.05
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.00
175 19 0.01
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178 55 0.03
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Consensus pattern (182 bp):
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TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
AAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
Found at i:6898337 original size:181 final size:181
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Indices: 6897675--6903235 Score: 4145
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6897665 TGTTTTGCTG
* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * *
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1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * *
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* * * *
6898162 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCG
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** * * * * * * * *
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1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
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* * *
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* * * * * * * ** * *
6898578 AATCAGTTTAAATACTTATGGCCATTTGAACAAATATCTATTTTAAATTATTATTA-CTTTTCAT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GT
**** * * * * *
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* * *
6898707 AATATTT-AAAGAA-T--T-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA
130 AATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * *
6898755 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
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* * * ** * *
6898884 AATA-TTCTAAAAATTCATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATCAATTTGT-T
130 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * * * * *
6898935 GATCAGTTTAAATAATTAAGTCTATATGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * ** * *
6899000 TTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCAT-CTAA-CTTTATTCGGAATAAAATAAAACTAATTTGT
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* * * *
6899063 TAATATTTC-AAAATT--TTA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCA
129 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* ** * * * * *
6899112 AACTAGTTCAAATAAATATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTTGTT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * **
6899177 TTGTCATCAAACAATTATTTTTGTTCATATAAG--TATGGTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
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* * * *
6899240 TAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTCTTTA-CTA
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* * * * * * * *
6899293 AACTATTTTAAATAGTTTTGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * ** ** * *
6899358 TTATCATCAAATAGTTGGTTCTA-TCCGTACTATTTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTGAAT
66 TTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** ** * ** * *
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130 AATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * * * * *
6899473 AACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACCTATTATT
1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* ** * *
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66 TTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTAT
* *
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* * * * * *
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* *
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131 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCA
* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * *
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181 A
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* *** *
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** * * *
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* *
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** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
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1 AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
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* * * *
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* *
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* *
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128 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
6903236 AATTTCTTGA
Statistics
Matches: 4253, Mismatches: 944, Indels: 369
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* * * * *
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** * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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*
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* * * ** * * * *
6899077 T--TTA-TAAGAGAT-TTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAG
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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190 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTG-TTTAGTAATAAAATAATT-
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* ** * *
6899437 AATAACCAAGA-A-AATAAAAAATAAATTTAATTGCT-GAACCAG
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* * *
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* * * *
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*
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* * *
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65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
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127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-CAATTTTAATAGTTA
* * * * * * * * *
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190 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGT
** * * * * * * * *
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255 TTAAG-TCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTGAATAACA-TTAAAAAACTTAA
* * * * * *
6900159 T----AAGAGAT--TTAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAG
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* * * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * * ** * *
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* * * * **
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* ** * * * * ** * *
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* * * *
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256 T-A-AGTCCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAAT-TGAATAACATT-AAAAAACTT
* * * * ** * *
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316 AAT-AACAAAGAGATAAT-AAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
*** * * *
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65 ATAAAACAAAT--TTTTTGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *** ** * **
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127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATTTGTTTACTAAAC-AATTTTAATAGTT
* * * * * * * * * * *
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189 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTG
* * * * * * * * *
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254 TTTAAGTCCATACAAG---CTT-A--T-T-T----CAAA-TAA-AATAATACTAATTGAATAACA
* * ** * * ** * * * * *
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305 TT-AAAAAACTTAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAA-CAAG
* * * * * * * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* ** * * *
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66 TAAAACAAAT-TTTTTGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
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129 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAATTTTAATAGTTAAGA
* * * * * *
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193 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTT
* ** * * * * *
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* * *
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315 TAATAAC-AAAGAGATAATAAAAAATAAACCT-ATTGATCGAA-CAAG
* * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
*** * *
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66 TAAAACAAAT--TTTTTGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * *
6901402 TCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATC-ATTTCAAATAATT
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATTTGTTTACTAAA-CAATTT-TAATAGTT
* * * * * * * * * * *
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189 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTG
** ** * * * * *
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254 TTTAAG-TCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTGAATAA-CATTAAAAAACTTA
* ** * * * *
6901591 AT-A-AGAGATTTAA-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAA-
317 ATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAA-CAAG
* * * * * * * * * * *
6901631 TTTAAGTAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACATT-AGATTGTTATGACC-ATTTGTTCTAT
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTA-TTGTTTTGT
* * * * *
6901694 CATAAAA-TAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
64 CATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * * *
6901758 TTCCAAAAATTAAGAACTACGAGAATTAAAAATAAATTTGTTT-GTCGATCAATTTCAAATATTT
126 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACT-AAACAATTT-TAATAGTT
* ** * * * * * * * * *
6901822 ATGACTA-TAAAATAATTATCTATTTTAAAAT-GTTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAAT
189 AAGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTAGTAATAAAATAAT
* * ** * * * * *
6901885 T-TTTGGAA-TTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAA
252 TGTTT--AAGTCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTGAATAACA-TTAAAAAA
** * *** * * * *
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313 CTTAATAACAAAGAGATAAT-AAAAAATAAACCTATTGATCGAA-CAAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATAT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * ** * *
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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190 AGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTT-TAGTAATAAAATAATT
* * * * * * ** *
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* * * ** * ** * *
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315 TAATAA-CAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
6902476 TCCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACCAGATAAGTTTAATTAATT
127 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAATTTTAA-TAGTT
* * * * *
6902541 ATGA-TAATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
189 AAGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAA-T
* * * * * * *
6902605 TGTTT-TGTTCATACAAGCCTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAGACAA-T
252 TGTTTAAGTCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTGAATAACATTAA-AAAACT
* * * * * *
6902667 TAATAAGTAAA-AGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTG-TCAAATAAG
315 TAATAA-CAAAGAGATAATAAAAAATAAACCT-ATTGATCGAACAAG
* * * * * * * * *
6902711 TTCAAATTGTTATGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAA-CTATTATGA-CTTTTATTTTGCC
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTATTGTTTTGTC
* *
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* * * * * ** ** *
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127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAA-TTTTAATAGTTA
* ** * * * *
6902903 TA-ACTATTTAAATGATTATCTATTTCAAATCCTTATGACCTTTTGTTTCA-T-ATAAAATAAAT
190 -AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTT-AGTAATAAAATAATT
* * * * * * * * * * *
6902965 ATATCAGTTCATATAGGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAA-TT
253 GTTTAAGTCCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTGAATAACATT-AAAAAACTT
* * ** * * * * *
6903028 ATTGAGTAAGAGAT-TTAAAAAATGAATCTATTTA-CTAAACAAG
316 AATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATC-GAACAAG
* * * * * * * ** *
6903071 TTTAAATCA-TTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTTAAATCATTATGAAATTTTGTTTTGTC
1 TTCAAAT-AGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* *
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65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * *** * * *
6903198 TTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCAATTT-CTTGAA-TATGTTGAAATAG
126 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTAC-TAAACAAT-TT-TAATAG
* ** * *** * *
6903260 TTATGACCT-TTTGTTTTGTCTTAAATTAAT-TGTTTCTGTTCA-TACAAGCATATTCG---A--
187 TTAAGA-CTATTTG----AAC---AATT-ATCTATTTCAAATCATTATAA-CAT-TTTGTTTAGT
** ** * * * ** *
6903317 AATAAAATAA-T-ACT-AGTTTAT-TAA---TA-TTCCAA-AAATTAATAACTAAAAGACTTAA-
241 AATAAAATAATTGTTTAAGTCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ACTAATTGA-ATAAC
* * * * * * **** *
6903372 A--AAATAAACCTATTTACCAAGCAAGTTTAATTAGTTGT-GA-CTATT--T-GAACAA-
304 ATTAAA-AAACTTAATAACAAAG--AG-ATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
** * * * ** **
6903424 TT-ATTTATTTCAA-A-TAGTTATGATC--TT-T-TGTTT--TGTCG-TA--AAATAGTTGTTTA
1 TTCAAATAGTT-AAGACTA--TATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTA-TTGTTT-
* * ** * ** * * ** *
6903477 TGTTCAGATAA-GTATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT-G-AA-AATTTGAAAACTAA-
61 TG-TCATAAAACAAATTTTTTG--T----TCATAC-AAGTTATTCGAAATAAAAT-AATACTAAT
** * * * ** * * * * ***
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117 TTA-TTA--ATATTTCAAAAATTAATAAG--TA--AGA-GA-TTTAAA-AATAAAT-TTGTTTAC
* * * * * * * * *
6903598 TGAACAATTATCTAAT--TCAA-ATTGTTAT-AAC-CTTTTGTTTTGTC--A-CA--A-AACA-A
171 TAAACAATT-T-TAATAGTTAAGACTATT-TGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATAACATT
* * ** * * * * * * *
6903651 TTGTTTCTGTTCATGCAA-AATTATTT-AG--AATA-AA-ATAATATT--GATATATTAATA-T-
232 TTGTTT-AG-TAATAAAATAATTGTTTAAGTCCATACAAGCTTAT-TTCAAATAAAATAATACTA
* * ** * * * * * ** * **
6903706 TTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTG-T-TTACTAAAT-----------T-----
294 ATTGAATAACATTAAAAAACTTAATAAC-AAA-GAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAAC
6903753 -AG
357 AAG
* * * * * ** * * * *
6903755 TTCAAATAGTTATGATTATTTTAATAATTATCTATCACAAATCATTAAGATCT-TTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * * *
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66 TAAAACAAATT-TTT-TGTT-CATACAAG-TTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * **
6903881 -TTCTAAAAATTAATCAGTAAGATATTTAAAAAAATAAATGTATTT-GTCAAACCAGTTCAAATA
126 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATTTGTTTACT-AAA-CAATTTTAATA
* * * * * *
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186 GTTAAGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATA
* * ** * * * *
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250 ATTGTT-TAAGTCCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTGAATAACA-TTAAAAA
* * ** * * * *
6904071 A-TTAGTGAGCAAA-AGATTTTAAAAAATATATCTATT--T--ACCAAA
312 ACTTAAT-AACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAG-TTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTATTGTTTTGT
* * * *
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64 CATAAAACAAATT-TTT-TGTTCAT-ACAA-GTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * **
6904232 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGCTTTAAAAACTAAAGTTGCTTTTC-GAACTAGTTCAAATAG
125 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATTTG-TTTACTAAAC-AATTTTAATAG
* * * * * * * * * ** * *
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187 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAAT
** * * * * * *
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252 TGTTTAAG-TCCATACAAGCTTATTTCA-AAT-AAAATAATACTAATTGAATAACATT-AAAAAA
* * * ** * ***
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313 CTTAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAA-CAAG
* * * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATAT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * * ** * *
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* * * * * **
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126 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AA-AAATAAATTTGTTTACTAAACAA-TTTTAATAGT
* * * * * * *
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188 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAAT
* ** * * * * * * *** *
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** * * ** * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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126 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC-AATTTTAATAGTTA
* * * * *
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190 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA-CATTTTG-TTTAGTAATAAAATAATT
* * * * ** * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * * * ** *
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* * * ** ** * * * *
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189 -AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATT
* * * * * * *
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** * * * * * * *
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316 AA-TAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATA-GTTAAGACTATATGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGT
* * * ** * * * *
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64 CATAAAACAAATT--TTTTGTTCATAC-AAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * ** * * **
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126 TTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATTTGTTTACTAAAC-AATTTTAATAGT
* * * * * * * *
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* * ** * * * *
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** * ** * *
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317 ATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAA-CAAG
* * * * * * * * *
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* * * * *
6905947 ATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAATTACTACAAATTTATTAACA
65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
6906010 TTTGAAAAATT-ATATAGAAAGAGATTTAAAATAAAAATCTATTTACTGAAC-A----AAT--TT
126 TTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAA-ATAAATTTGTTTACTAAACAATTTTAATAGTT
* * * * * * * * * **
6906067 CA-ACTCATTCT-AAC-CTT-T-TGTTT--AGTCATAAAAAAATTAT-TTTAGTTCATACATGCT
189 AAGACT-ATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAG-TAATA-A-AAT
* * * * * * * *
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249 AATT-G--TTTAAGTCCATAC-AAGCTTATTTCAA-A-T-AAAATAATACTAAT-TG-AATAACA
*
6906181 TTAAAAAA--TAA-ATC-----G---AT-----AT--A-C-------CGAACAAG
305 TTAAAAAACTTAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * ** * * ** *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA---CCTATTGTT-TT
* * ** *** * * * *
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62 GTCATAA-AACAAATTTTTTGTTCATACAAG-TTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * **
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124 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACT-AAA-CAATTTTAATA
* * * * * * ** * * *
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186 GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTAGTAATAAAATA
* * * * *
6906462 ATTGTTT--TTCATCATACAAGCCTATTT-AGAAT-AAATAATACTAATCT-ATTAATATTTCAA
250 ATTGTTTAAGTC--CATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAAT-TGAATAACA-TTAAA
* * * ** * *
6906522 AAA-TTAATAA-ATAG-TAT-ATCTAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACCAA-
310 AAACTTAATAACAAAGAGATAAT-AAAAAATAAACCTATTGATC-GAA-CAAG
* ** * * * * * *
6906569 TTCAAATGGTTATTACTAGT-TGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGAC
1 TTCAAATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * * * * * *
6906633 ATAAAAC-AATTATTTCTATCCATATAAGCCTATTC-AGAATAAAATAATACTAGTGTAATAATA
65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * *
6906696 -TTCTTAAAATTAATAACTAAGAGACTTAAAAAAAAAAACTTGTTT-GTCGAACTAGTTTAAATA
126 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT-TAAAAATAAATTTGTTTACT-AAAC-AATTTTAATA
* * * * * * * * * ** *
6906759 GTTAAGGCAATATGAACAAATCTTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAA-AT
186 GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAA
* * *** * * * * *
6906823 TTTTTTTAGTTTTTACTAAG-TTATTT-AGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAA
251 TTGTTTAAGTCCATAC-AAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACT-AATTGAATAACA-TTAAAAA
** * * *** * **
6906885 A-TTAATAAGTAGGAGAT--TTAAAAATAATTTTATT--TGCCAATTTAG
312 ACTTAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGAT-CGAA-CAAG
* * * * * * * * * *
6906930 GTCAAACAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCG
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * * *
6906995 TAAAAC-AATTGTTTTGTTCATATAAGATTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAAATT-TTTTGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * * *
6907059 TGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTACTTAT
129 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAATTTTAA-TAGTTA-
* * ** * *
6907124 A-ACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCATTTAT-TTT-GTCATAAAATAATT
190 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTT-TGTTTAGTAATAAAATAATT
** * * ** * * * * * *
6907186 GTTTCTGTTCATAC-TGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAA-TT
253 GTTTAAGTCCATACAAG-CTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTGAATAACATT-AAAAAACTT
** * * * * * * *
6907249 AATAAGTAACAGAT-TTAAAAAATGAAA-ATGTTGGCTTG-ACCAG
316 AATAACAAAGAGATAATAAAAAAT-AAACCTATT-GATCGAACAAG
* * * * * * * * *
6907292 TGCAAATATTTATA-ACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGATCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * * * * * *
6907356 ATAAAAC-AATTATTTCTATTCGTACAAACTTATTCAAAATAACATAATTCCAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATAC-AAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *
6907420 TTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAA-AAATGAATATGTTTACTGAACAAGTTTAAATAG
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAAT---T-TGTTTACTAAACAA-TTTTAATAG
* * * * *
6907480 TTATGACTATTTGAACAATTATGC-ATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTT-TTCCATAAAATA
187 TTAAGACTATTTGAACAATTAT-CTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGT-AATAAAATA
* * * * * * * * * * *
6907543 ATTTTTTCTA-TTCATAGAAGCTTATTTCAAATAAAACAATGCAAATTTATTAATATTCAAACAA
250 ATTGTTT-AAGTCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTGAATAACATT-AAAAAA
* * ** * * * * *
6907607 -TTAATAAGTAAA-AGAT-TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAA
313 CTTAATAA-CAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * *
6907652 TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * * * * *
6907717 TAAAA-TAATTTTTT-TTCATACAAGCTTATGCGAATTAAAATAATATTAATTTCTTCATATTTT
66 TAAAACAAATTTTTTGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
*** * * * * ** *
6907780 GGCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTCATA
130 AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATTTGTTTACT-AAACAA-TTTTAATAGTTA-A
* * * * * *
6907844 -ATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTCA-TCATAAAATAATTGT
191 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTT-AGTAATAAAATAATTGT
* * * * * * * * * * *
6907907 TTTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAAGAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA-TTATT
255 TTAAGTCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTGAATAACATT-AAAAAACTTAAT
* ** * * *
6907971 GAGTAAGA-AGT-TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
319 AACAAAGAGA-TAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * * * * *
6908011 TTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTTTTTATTTCAAATTGTTATGACC-ATTTTTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * *
6908075 TAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAA-AATAAAATAATTAATA
66 TAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * * * ** * **
6908137 TTCCAAAAATTAATATGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGGACTCATTCAAATAGTT
126 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATTTGTTTACTAAAC-AATTTTAATAGTT
** * * *** * * ** * **
6908201 TTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAAGGTTATGACATTTTATTTTCTCATAAACCAATTG
189 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTG
* * * * * * * *
6908266 TTTCTA-TTCATACAAACTTA-TTCAAAACAAAATAATACCAACTT-ATTAATATTTCAAAAA-T
254 TTT-AAGTCCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAA-TTGAATAACA-TTAAAAAACT
* * * * *
6908327 TAATAAGTAAA-AGAT-TTTAAAAATAAA-ATATGTTTATC-AAGCAAG
315 TAATAA-CAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTA--TTGATCGAA-CAAG
* * * * *
6908372 CGT-AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTC--A-----A--A--TA--GTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * *
6908423 ATAAAAC-AATTGTTTCTATTAACACAAGTTTATTCGAAATAAAA-ATATACTAATTTATTAATA
65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATA
* * * * * **
6908486 -TTCTAGAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAACTTTGTTTATCGTACA-AATTCAAATAG
126 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTA-C-TAAACAATTTTAATAG
* * * * *** * * ** * *
6908549 TCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGGGACCTTTTGTTTTGTCGTTAAACAAT
187 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAAT
** * * * * * * **
6908614 TGTTTTTGTTCATA-TAGAATTATTT-AGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA
252 TGTTTAAGTCCATACAAG-CTTATTTCA-AA-TAAAATAATACTAATTGAATAACA-TTAAAAAA
* * * * * *
6908677 -TTAAT----AAGAGAT-TTAACAAATAAACCTATTTACCGAACCAT
313 CTTAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * *
6908718 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATCTCAAATTGTTATGATCT-TTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * * * *
6908782 TAGAAC-AATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT
66 TAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *** * * *
6908846 CCAAAAATTAATACGTAAGAAATTTAAAAATGTGTTTG-TT--GAACCAATTTAAATAGTTAAGA
128 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAATTTTAATAGTTAAGA
* ** ** * * * * * * *
6908908 CTATTAGATTAATTATCTATTTCAAATGGTTCTTACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTC
193 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTA
* * * *
6908973 AGTTCATACAAACTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAA-TTAATAA
258 AGTCCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTGAATAACATT-AAAAAACTTAATAA
* * ** * * *
6909036 GC-AAGAGAT-TTGCAAAAATAAATTTGTTTG-CCAAACAAG
321 -CAAAGAGATAAT-AAAAAATAAACCT-ATTGATCGAACAAG
* * * * * * * * * * *
6909075 TTCAAACA-TATATGAATATTTGAATAATTATCTACTTAAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGT-TAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * * * *
6909139 ATAAAAC-AATTGTTTAAGTTCATAAAAACTTA-TCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCAT-ACAAGTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** ** * * **
6909202 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTTTTGAATAAGTTCAAATAGTT
126 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAA-TTTTAATAGTT
* * * * * * * *
6909267 ATGGCCT-TTTGTACAATTATATATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGATTT-GTTATAAAATAAT
189 A-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTG-TTTAGTAATAAAATAAT
* * * ** ** **
6909330 CGTTT--TTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCA-TAAA
252 TGTTTAAGTC--CATACAAGCTTATTTCAAATAAAAT-A--A-TACTAATTG-AATAACATTAAA
** * ** * * ****
6909392 ACAACTGGTTTTCAACATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATA-CTATTAATATTTCAAG
310 A-AACT--TAAT-AACA-A-AGAGATA-AT--AA-AAAATAA-ACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * *** * * ** *
6909452 AATT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAACTAGTTCAAATATTTATCA-CTA--
1 --TTCA--AATAG--TT-AAGACTATA-TGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATT
*** * * * *** * * * **
6909513 -TTTAAACA-ATTATC-AATTTCAAATTGTT-ATAACCTTTTATTCTATCATGAAGCAATTATTT
57 GTTTTGTCATA-AAACAAATTT---TTTGTTCAT-ACAAGTTATTCGA-AAT-AA--AATAATAC
** * * * * *
6909574 TTGTTTATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTAATA-ATATTCAAAAATTCATAAC
113 TAATTTAT-TAA---TATTT--CA-AAAAT--TAATAA-GTAAGAGAT-TT-AAAAA-T-A-AA-
* * * * * * * * *
6909638 TAAGTGATTTA--AAA-AA--TAAATACATTTACCAAACCAGTTTAAAGAGTTAAGACTATATGA
162 T--TTG-TTTACTAAACAATTTTAAT--AGTTA--AGACTA-TTTGAACAATT-A-TCTAT-T--
* * * ** *** ***** * * *
6909698 ACAATTATCTATTCCA-AATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGCTCAC
214 TCAA--ATC-ATT--ATAA-CATTTTG---TTTAGTAATAAAATAATTGTTTAAGTCCA--T---
* * * * * ** * *
6909762 ACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA-TT--T-ATAAA-TGAT
265 ACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTGAATAACATTAAAAAACTTAATAACAAAGAGAT
* *** * *
6909821 -TTAAAAAATAATTATATTTA-CTGAACTAG
330 AATAAAAAATAAACCTATTGATC-GAACAAG
* * * * * * *
6909850 TTCAAATAATTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * * *
6909914 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAATTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAAAT-TTTTTGTTCATA-CAAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
6909979 T-AGAAAATTAATCAGTAAGGGATTTAAAAAGTAAATCTAT-TTATCAAACCATTTTAAAATCTA
128 TCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAAT-T-TGTT-T---A-C----T---A---A
* ** * * *
6910042 TTTATCAAACCATTTTAAAATGTTTTGACTATCTGAATAATTATCTATCTT-AAATTATTATAAC
174 ---A-C--A--ATTTTAATA-GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATAAC
* ** * * * * * * * * * *
6910106 CTTTCATTTTGTCATCAAACAATTAGTTCT-A-TTCATACTA-TTATATTTGAAATTAAAGAATA
229 ATTTTGTTTAGTAATAAAATAATT-GTT-TAAGTCCATACAAGCT-TATTTCAAATAAAATAATA
* * * * **** * * * ** * * * *
6910168 CTAAGTTG-TTAATATTATAAAA-TTAATGAGTTGGAGA-ATTAAAGAATTAATTTGTTTACCAA
291 CTAA-TTGAATAACATTAAAAAACTTAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGA
6910230 ACAAG
355 ACAAG
* * * * * * * ** * *
6910235 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAA-ATATTATCTATTTTTAAATCATTATGATATTTTGTTTTAT
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACA-ATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGT
** * * * * *
6910299 TGTAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATAT
64 CATAAAACAA-ATTTTTTGTTCATAC-AAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * **
6910364 TTCAAAAA-T--TAAG-AAAAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTACATGACCAATTCAAATAGTTA
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATTTGTTTAC-TAAACAATTTTAATAGTTA
* * * * * *
6910425 TGACTATTTGAACAATTATTTATCTCAAATCATTATGATC-TTTAT-TTT-GTTATAAAACAATT
190 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTT-TGTTTAGTAATAAAATAATT
** ** * * * * * * **
6910487 GTTTCTGTTTATACAAGCTTA-CTCAGAGTAAAATATTGCTAAACT-AATAATATTCTAAAA-TT
253 GTTTAAGTCCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACT-AATTGAATAACATTAAAAAACTT
* * ** * * *
6910549 AAT----AAGAGAT-TTCAAAAATAAATGTGTTTGCT-GAACCAG
316 AATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCT-ATTGATCGAACAAG
* * * * * *
6910588 TTCAAATAGTTAAGGCTAT-TAGAATAATTATCT-TTCTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGT
1 TTCAAATAGTTAAGACTATAT-GAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGT
* * * * * * *
6910651 CATAAAA-TAATTATTTCAGTTAATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAACA
64 CATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * **
6910715 -TTCAAAAAATTAGTAAGCAAGA-ACTTAAAAAAATAAATCTGGTCA-TAGAACAAATTCAAATA
126 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT-TAAAAATAAATTTGTTTACTA-AAC-AATTTTAATA
* * * * *
6910777 GTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTA-TAATAAAAT
186 GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTG-TTTAGTAATAAAAT
* * * * * * * * * * *
6910841 AATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAA-ATAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAA
249 AATTGTTTAAGTCCATACAAGCTTATTTCAAATA-AAATAATACTAATTGAATAACA-TTAAAAA
* * **** * * * * * * **
6910904 A-TTGAGAAGTTGGAGAT-TTAAAAACTAAATCAATTTATCAAATTAG
312 ACTTAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * * * * * *
6911014 ATCAAA-AACTTGTTTGTCATCATATAAACCTT-TTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 ATAAAACAAATTTTTTGT--TCATA-CAA-GTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * **
6911077 TTTTAAAAACTAATGAGTATGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCGAACTAGTTAAAATAGTT
126 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATTTGTTTACTAAAC-AATTTTAATAGTT
* * * * * * * * * *
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189 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTG
* * * * *
6911207 TTTATG-CTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATACTAGTCT-AATAATATTATGAAAA-TT
254 TTTAAGTC-CATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAAT-TGAATAACATTA-AAAAACTT
* * * ** * *
6911269 AATAACTAAGAGAT-TTAAGAACATAAATTTGTTTG-TCAAACCAA-
316 AATAACAAAGAGATAATAA-AAAATAAACCT-ATTGATCGAA-CAAG
* * * * * * * * *
6911313 TTCAAATAGCTAAGGCTATATAAATAACTACCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * *
6911378 TAAAACAAATGTTTTTGTTCCTATC-AGTTTGTTC-AAAGTAAAATAATAGTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAAAT-TTTTTGTTCATA-CAAG-TTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * *
6911441 TTTTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTAAATTAGTTA
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAATTTTAA-TAGTTA
* * * * * * * *
6911502 TA-ACAATTTGAAAAATTATTTATTTTAAAT--TTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAAGAATT
190 -AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATT
* ** * * * ** ** * * * *
6911563 GTTTCTA-TTGATA-TAGTGTTATTTGAAATAATGTAATGTTAATTTATTAATATTCTAAAAA-T
253 GTTT-AAGTCCATACAAG-CTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTGAATAACATT-AAAAAACT
* * ** * * * * * ** * * *
6911625 TCATTAGTAACAG-T-TTAAAAAATGAATCTGTTGGCCTATCTAG
315 TAATAACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATCGAACAAG
* * * * * * ** * *
6911668 TGCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCGATTGCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
6911733 CAAAAC-AATTGTTTCTATTTGA-ACAAACTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTATTAT
66 TAAAACAAATT-TTT-T-GTTCATAC-AAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * ** *
6911796 TCCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTATA-TCAAATAAGTTCAAATATTT
127 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATTTGTTTACT-AAACAA-TTTTAATAGTT
* * * * * * *
6911860 ATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-
189 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTG
* * * * * * * *
6911924 TTTGCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAAT-GTAAATTTATTAACATTCAGACAA-T
254 TTT--AAGTCCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTGAATAACATT-AAAAAACT
* * * * * * *
6911986 TAGTAAGTAAA-AGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAATAAG
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* * * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
* * * * * *
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* * * ** ** * ** *
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* * ** * * * * *
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* * ** * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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319 AACAAAGAGATAATAAAAAATAAACCTATTGATC-GAACAAG
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * *
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65 ATAAAACAAATT-TTT-TGTTCATACAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * **
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* * ** * * **
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** * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * * * ** * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTC
* * * * * *
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* * * * * * **
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126 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAA-TTTTAATAGT
* * * * ** * ** * *
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188 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTAATAAAATAATT
* ** * ** * * ** **
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** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * *** * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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** * * * **
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* * * * * ** *
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** ** * * * **
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* * * ** * * * * *
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* **
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125 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAA-TTTTAATA
* * * * * * * *
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* * * * * * * ** *** *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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* * * * * * ** *
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* ** * * *
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191 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTT-TAGTAATAAAATAATTGT
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* * * * * *
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* * * *
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1 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTTGTCA
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* * * * * * *
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* * * *
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253 G
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* * *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* *** ** ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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** * *
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* *
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* * * *
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*
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TAAAACAATTTTTTCATATCATACAAACTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTC
CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTATCAAACT
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Period size: 180 Copynumber: 46.7 Consensus size: 175
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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1 TTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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126 TTCAAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACTAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * * * *
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126 -TTCAAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACTAG
** * * * * * *
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* * * *
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* * *
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126 TTCAAAAAA-TTAAT----AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACT-AG
* * * * ** *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
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*
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* * * *
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1 TTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
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126 TTCAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAG
* * * * *
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* ** * * ** * *
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* * *
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** ** * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * ** * ** * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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174 AG
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* * * *
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* *
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1 TTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 TTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * * *
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* * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * *
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* * * * * * * * *
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127 TCAAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAG
** * * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGT
* * ** *
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* * * * * * *
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* ** * * ** *
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1 TTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * *
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*** * * * *
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* * * * * * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
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*** * * * * ** *
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* * * * * ** * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
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* * * * * *
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* * * * *
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1 TTCAAAT-ATTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** *
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* *
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* * * * *
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1 TTCAAA-TATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
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* * * * * * * *
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* * * * * **
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * **
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1 TTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
*
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* * ** * **
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* * *
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1 TTCAAATA-TTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TG-
* ** * * * * * * * * * * *
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** * *** ** ** * * ** ***
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** * ** * *
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1 TTCAAATATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
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** * * * *
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* * * * ** *
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* * * ** * * * *
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*** * * *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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65 TAAAACAATTGTTTCATAT-CATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTT-ATTATAT
* * * * * *
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** * * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** ** * * *
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** * * * * * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
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** * * * * * *
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*
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* * * * * *
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* ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
6904950 ATTTCAAAAAA-TAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACCATACTAG
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* * * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * *
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* * ** *
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* * * * ** *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
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65 TAAAACAATTGTTTCATA-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT-TATA-T
* * * * * ** *
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127 TCAAAAAATTA-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAG
* * * ** ** *
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1 TTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
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65 TAAAACAATTGTTTCATATCA-TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT-ATATT
* * * * * * *
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128 CAAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAG
* *
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1 TTCAAATA--TTATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** ** * *
6905586 CATCAAATAATTGGTT-ATGTTCATACTATTTTATTTGGAATAAAATACTACTAATTTAATAATA
63 CATAAAACAATTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTATA
* * * * * ** *
6905650 TTTCAAAACATAATAACCAAGAAAATTAAAAAGTAAATCTAATT-GCTAAACTAG
126 -TTCAAAA-A-ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACTAG
* * * * *
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1 TTCAAATA-TTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** ** * *
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64 ATAAAACAATTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTATA-T
* * *
6905831 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-TCAG
127 TCAAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACT-AG
* * * * * * * *
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1 TTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
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AAAACAATTGTTTCATATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTATATTCAA
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*
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* ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * ** * * *
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1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * * * **
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* ** * * *
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* * * * ** * * *
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1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTAA--CATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * * *
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* * * * **
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* * *
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1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT---TTAACAT-ACAA-GCTTATTCAAAATA
* * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * ** * **
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1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TTAACATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAA
* ** * ** *
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* * * ** * * **
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* * * * * * * * * *
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1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTAA--CATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * *
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* *
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* * * ** * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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1 -TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTT-AACATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * *
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*
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* * * * * * **
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1 TTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * *
6905099 TAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGC
64 TAATACTAATTTATTAATATT-T-GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * *
6905163 CGAA-TCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGACAATTATTTATTTCAAATTG
127 CAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACAATTATCTATTT-AAATTA
* *
6905214 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTTAACTCATACAAGGTTATTCAAAATAGAA
1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTAA--CATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * * * *
6905278 TAA-ACTAATTTATAAATATTTCAAAAATTTATAGGTAAGAGATTTAGAGAATAATTCTATTTAT
64 TAATACTAATTTATTAATATTT--GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
** * * * * * * **
6905342 CGTACCAGTTCAAATAATTGTAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATGG
127 CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GACAATTATCTATTT-AAATTA
** * * * * * *
6905394 TTATTTCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-ATATGA-GT--ATG--T-TT-GAAATAAAATA
1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * *
6905451 ATAGTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAACTATTTACCA
66 ATACTAATTTATTAATATTT--GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * *
6905516 AACCATTTCAAATAGGTT-TGACTATTTGAATAATTTATCTATTTCAAATCA
129 AACTAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTG-ACAA-TTATCTATTT-AAATTA
* * * * * * * ** ***
6905567 TTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTATGTT--CATACTATTTTATTTGGAATAAA
1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATT-T-TTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * ** * * * ** *
6905630 ATACTACTAATTTAATAATATTTCAAAACATAATAACCAAGAAAATTAAAAAGTAAATCTAATTG
63 ATAATACTAATTTATTAATATTT-GAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * *
6905695 CTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAGCTATTATCTATTTCAAATCA
126 CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-CAATTATCTATTT-AAATTA
* * * * *** *
6905748 TTATGACATTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATACAAGCTT-TTTTGATTAAAAT
1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
6905811 AATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC
65 AATACTAATTTATTAATATTT--GAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * * * *
6905876 GAA-TCAGTTTAATTGGTTAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
128 AAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAATTATCTATTT-AAATTA
* * * * *
6905927 TTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT--CATACAAGCTTATTCAGAATAAA
1 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT---TTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * *
6905990 TTACTACAAATTTATTAACATTTGAAAAATT-ATATAGAAAGAGATTTAAAATAA-AAATCTATT
63 ATAATACTAATTTATTAATATTTG--AAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGTT
6906053 TAC
124 TAC
6906056 TGAACAAATT
Statistics
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0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 3 0.00
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Consensus pattern (176 bp):
TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTTGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA
CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACAATTATCTATTTAAATTA
Found at i:6906435 original size:181 final size:181
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6906053 TACTGAACAA
* * * * * * * *
6906063 ATTTCAACTCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATACATGCTTAT
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** * * *
6906127 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-AATTAAAAAAT
65 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
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129 AAATTAG-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * *
6906243 ATTTAAAATCATTATGACTTTTTATTTTATCATAGAACAATTATTTCAATTCATAAAAGCTTATC
1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT
* * * * * *
6906308 AAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAACTTAGAGATTTAAAAAATAA
66 TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * * *
6906373 ATTAGTTTATCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAAATAGCT
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* ** * * *
6906424 ATTTCAAATCATTATGAACTTTCATTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTAT
1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTAT
* * * * *
6906487 TTAGAAT-AAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AGTATATCT-AAAAAT
65 TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAAT
* * * * *
6906549 AAATTTGTTTA-CTGAACCAA-TTCAAATGGTTATTACTAGTTGAACAATTATAT
129 AAATTAGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
** * * * * * * *
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1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT
* * * * * * * * *
6906667 CAGAATAAAATAATACTAGTGTAATAATA-TTCTTAAAATTAATAACTAAGAGACTTAAAAAAAA
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* * * * * * * * * *
6906731 AAACTT-GTTTGTCGAACTAGTTTAAATAGTTAAGGCAATATGAACAAATCTTT
129 AAA-TTAGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * ** *
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1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGCTTA
* * *
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* * * ** * * * *
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128 TAA-ATTAGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
6906963 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT-TGTTCATATAAGATTGTT
1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT
** * ** *
6907027 TGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATA
66 TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATA
* * * * * * * * *
6907092 AATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTACTTATAACTGTTTGAACAATTATTT
130 AATTAGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
** * * * * * **
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* *
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166 ATTTGAACAAT-TATCT
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1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-AT-AAAACAATTGT-T-TC-T--ATTCA-TAAA
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1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT
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1 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT
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129 AAAT-TAGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
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* * * *
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* *
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* *
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* * * * * *
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** * ** *
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* * * *
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* * * * *
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** * *
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* * *
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** * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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*** ** *
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* ** * ** *
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* * * ***
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*
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* * * * *
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* * * *
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* *
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66 TA
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TA
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*
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * ** * **
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* * * * *
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* * * * * *
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129 TTTACCAAACCA-GTTCAAA--TAGTTAT--GA-C----T---A---TTTGA--A-C--AATTAT
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173 CTAT-T-TC
* * ** * * * *
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* * * * * * ** * *
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62 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAA
* * * * * * *
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125 ATCGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTA-TTTC
** * ** * * * ** *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * * *
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* ** * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * ** * * *
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* * * ** * * **
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * *
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** * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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TAATATTTCAAAAATTAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATCAATTCAAA
TAGTTAAGACATTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
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6914837 TGATCGAAAC
* * * * * * * *
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* * * * * ** * ** * *
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* * * * * * ** **
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* * ** * *
6915029 AAAATAATATTAATTTAATAATATTTTGAAATTTAATA-ACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTA
1 AAAATAATACTAATTTAATAAGATTTCAAAAATTAATAGA--AAGAAATTTAAAAAATAAATCTA
* * * *** *
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** * * * * * *
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* * * * * *
6915209 AAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAGTAATAAATTTAAAAAATAAATTTATT
1 AAAATAATACTAATTTAATAAGATTTCAAAAATTAATAGAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATA
* * *
6915274 TACCGAATCAATTCAAATGGTTAAGACAATTGACCAATTATCTATTTGAAATCATTCTGACCATT
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*
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* * ** *
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1 AAAATAATACTAATTTAATAAGATTTC-AAAAATTAA-TAGAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTA
*
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64 TATACCGAATCAA-TTCAAATAGTT
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TACCGAATCAATTCAAATAGTTAAGACAATTGACCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATT
TCTTTAGTCATAAAACAATAGTTTAGTTCATACAAGCTTATTCTGAAT
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* ** ** * * *
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* * **
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* * *
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*
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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* * **
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* * * * * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
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** * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** *
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* * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* ** ** * * * **
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* *
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* * * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
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*
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* * * * *
6917176 -GAAACAACTGTTTTATTACAGAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
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* * * * **
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129 TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * ** * ** * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
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* * * *
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* ** ** * *** * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
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66 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTT
* * * * * * * *
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* * * * ** * * ** * *
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1 AAAAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *** * *
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAAT
* * * * *
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65 AGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTT
* * * * * * *
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* * * * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
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* * * * * * *
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** * * ** * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * ** * ** * * *
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** * ** *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * * *
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*
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** * * ** * * *
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* ** *
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * * *** * *
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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*
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* * * * * *
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* *
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** * * * * *
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** * **** * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * ** * *
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*
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129 TTAGAATATTAATA
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* * *
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* * *
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* * * *
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* *
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* *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * ** *
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** * * * * * *
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* * * * * **
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* * * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * *
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** * * * ** *
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** ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * **
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315 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTTAAATAAGCTTGTT-TGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * *
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378 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TT
* * * * * **
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* ** * * *
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501 AGTATTATT-TTATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * *
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563 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTTGTTTGA-TAA
* * * * * * *
6920674 ACACATTTA--TTTGAAA--TC--ATTTATGAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTACTATTTT
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* * **
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* * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * **
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375 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAA
* * * * * * **
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439 T-TGTTCAGA-AAATAGATTTATTTTTAAAAT-T-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * *
6921260 TTAGTATTATTTTATTTAAGATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAA
499 TTAGTATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * ** * ** *
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563 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTTGTTTGATAAA
* * *
6921390 TATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTT
627 CATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** *
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* * * * * ** * **
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1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* ** * * ** *
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66 GTCATAACTATTTGAACTTATT-TGATAA-ATAGATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATT
** * * * *
6921604 GTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATGTTATTAGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA-AAT
128 -T-TTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTG-AATAAGCTTATATGAATA-AAAACAAT
** * * *** * * * *
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* * * * *
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251 TATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTATTATTAATTTT
6921787 TAGAATTTTA
Statistics
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TTATTTTTAAAATTTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATA
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Alignment explanation
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* * * *
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*** * * * * * ** *
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* * * * * * ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * ** * ** *
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* * * * * * *
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* ** * * * * ** * **
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** * * * * * *
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** * * * * * * ** * *
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1 AAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAAGTATTT-AAATTGATTTGATAAATAGATTTATTTTT
* * * * * ** *
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* * ** **
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* * * * * * * *
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** * * * * * * *
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*** * * * * ** *
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* * ** * *
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** * * * *** *
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** * * * *** *
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* * * * * * * * * *
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183 TTATTCAAATAGTCAT-ATTGTTTGAA-TTAGTTAG-TAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTT
* ** * * *
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** * * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* **
6917411 TTGTTCAAATAGTCATAACGATTTGAACTT-GTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
183 TTATTCAAATAGTCATATTG-TTTGAA-TTAG-TTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
** * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * **
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* * *
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123 CTTATATGAACT-AAAAAATTTTT-TATAATAAA-CAAAAAGTCATAACAATTT-AAAAA-ATAA
* * * *
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**
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* ** ** *
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1 AAATAAATAATTGCTTAAATAGTCATAAGTATTTAAATTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTA
* *
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** *
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* * * * * * * * * ***** *
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** * * * * *
6918266 TGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTG
316 CATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTC
* * * * ** * * * * * * *
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* * ** * * * **
6918365 AAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* ** * *
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247 TATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTT-ATCCGAAATAAACTTGTATGA-ACAA
* * * * *** *
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309 AAAAAATCATTTTATAATAGA-ACAAAAA-GTCATAACAATTTC
* * * * * * * * * *
6918660 AAATAGATAATT-ATTAAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAACAGATTCACTTTTA
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* ** ** **
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65 AAAT--C-T-CTTATTAGTTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * * * * * *
6918789 GTATAAACTGAAACATTTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATT
126 ATATGAACT-AAAAAATT-TTTTAT-A-ATAAACAAAAAGTCATAA-CAATTTAAA-AAATAATT
* ** * * ** * * * * *
6918853 GTTCAAATAGTTGTGACTATTCAAATTTGTTCAGTATACA-AATTATTTTTTTAAA-CTCTTGCT
185 ATTCAAATAGTCAT-ATTGTTTGAATTAGTT-AGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT
* ** ** ** * * * **
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247 TATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TCCGAAATAAACTTGTATGAACAAA
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6918980 AACAATTTTTTTATGACA-AATCAAAAGGTTATAATGATTTT
310 AAAAATCATTTTATAATAGAA-CAAAAAGTCATAACAATTTC
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
6919083 TTTTAATCTCTTTCTTATTGATTTTCCAAATGTTAATAAATTATTATTAATTTGTTTTGAATAAG
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** * * * * * * *
6919148 CTTGCATAAACTGAAACAATTTTTT-TAAGACTAAAC-AGAAGATTAGAACGATTTGAAATAGAT
123 CTTATATGAACT-AAAAAATTTTTTAT-A-A-TAAACAAAAAG-TCATAACAATTT-AAA-AAAT
* * * *** * * * *
6919211 AATTATTCTAATAATCTTAACCATTTGAACT-GATTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCT
181 AATTATTCAAATAGTCAT-ATTGTTTGAATTAG-TT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTT
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6919275 TACTTATTAATTGTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAA
243 TACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTT-ATCCGAAATAAACTTGTATGAA
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6919339 C-AAAATAATTGTTTTACGATAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTG
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6919383 AAATAGATAATTG-TTCACATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTT
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* * * * * ** **
6919447 AATTTTCTTAGCTATTAAGTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-AA
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* * * * * * *
6919638 -TGGATTAATTTTCTAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCG--ATCAAACTTATATTAA
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* ** * * * * * ** *
6919700 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTAATAATGATTTG
306 CAAAAAAAATCATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTC
* * * * * * *
6919745 AAATAAATAATTG-TTCAAATAGTTATAA-TAATTTGAGTT-AGTTCGGTAAATAGAATTATTCT
1 AAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAAGT-ATTTAAATTGA-TTTGATAAATAGATTTATTTT
* * * ** * * * * * *
6919807 CTAAATCTCTTATAAATTTTTGAAATATTAATGAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGT
63 TTAAATCTCTTATTAGTTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTAT
** * * * *
6919872 ATGAGTTAAAATAATTGTTCTAT--T--CCAAATAAG-CTTAA-AA--T---AAATAATTGTTCA
128 ATGAACTAAAA-AATT-TTTTATAATAAACAAA-AAGTCATAACAATTTAAAAAATAATTATTCA
* *** * * ** * * *
6919926 TATAGTC---TTAACT-ATTTAGTTCGGCAA-ATGGATTTATATTTTAAATCTCTTAGTTATTAA
190 AATAGTCATATTGTTTGAATTAGTTAGTAAACAT--ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * ** *** * * *
6919986 TTTTCAGAATATTACTAAACTAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATATGTTTATATGACCAGAA
253 TTGTCA-AA-A-TA-TTAA-TAAATTA-TATTATTTTA-TCCGAAATAAACTTGTATGAACAAAA
* ** * * *
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311 AAAATCATTTTATAATAGAACAAAAAGTC-ATAACAATTTC
* * * * * * * * *
6920090 AAATAGATAAATG-TTCAAATAGTCATAACTATTTTAACT-AGTTCACTAAACAAATTTATTTTT
1 AAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAAGTATTTAAATTGATTTGA-TAAATAGATTTATTTTT
* *
6920153 TAAAATCTCTTATTAATTCTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA
64 T-AAATCTCTTATTAGTT-TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA
**** * * *
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127 TATGAACTAAAA-AATT-TTTTAT-A-ATAAACAAAAAG-TCATAACAATTTAAAAAATA-ATTA
* * * * * *
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186 -TTCAAATAG-TCAT-ATTGTTTGAATTAG-TT-AGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * ** * * * *
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245 CTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTA-TCCGAAATAAACTTGTATGAACA
* ** * * * * ** *
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308 AAAAAAATCATTTTATAATAGAACAAAAAG-TCATAACAATTTC
* * * * * *
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1 AAATAAATAATTGCTTAAATAGTCATAAGTATTT-AAATTGATTT-GATAAATAGATTTATTTTT
* ** ** * * ***
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64 T-AAA--TC-T-CTTATT-AGTTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT-TTATTTTGAATAA
* * * * * * *
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122 GCTTATATGAACT-AAAAAATT-TTTTAT-AATAAACAAAAAGTCATAACAATTT-AAA-AAATA
* * * * * * * * *
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182 ATTATTCAAATAGTCAT-ATTGTTTGAATTA-GTT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTT
* ** * * * *
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244 ACT-TATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTA-TTTTATCCGAAATAAACTTGTATGAA
* * * * * * **
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306 CAAAAAAAATCATTTTATAAT-AGAACAA-AAAG-TCATAACAATTTC
** * * * * * * * *
6920798 AAGATTCATATTTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGAAAAACA-ACTTTAGTTT
1 AA-ATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAAGTATTTAAATTGATTTGATAAATAGA-TTTATTTT
* * * *
6920861 TTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTATGAAATATTAATAAAGTAATATTAATTTATTCT-AATAAG
63 TTAAATCTCTTA-TTAGTT--TTCA--AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAG
* * * * * * * *
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123 -CTTATATGAACT-AAAAAATT-TTTTAT-A-ATAAACAAAAAGTCATAA-CAATTTAAAAAATA
* * * * * * ** *
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182 ATTATTCAAATAGTCATA-TTGTTTGAA-TTAG-TTAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTT
* * * * * * * * *
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243 TACTTATTAATTGTCA-AAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATCCGAAATAAACTTGTATGAA
** * * ** * *
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306 CAAAAAAAATCATTTTAT-AATAGAACAAAAAGTCATAA-CAATTTC
* * * * * * * * * *
6921160 AATTAAATAAATGTTTTAATAGT-ATTAACTATTTGAATATG-TTCGATAAACAAATTCATTTTT
1 AAATAAATAATTGCTTAAATAGTCA-TAAGTATTTAAAT-TGATTTGATAAATAGATTTATTTTT
* * * * * *
6921223 TAAGTCTCTTACTCATTAATTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAGATAAGCT
64 TAAATCTCTTA-TTAGT--TTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGA-ATAAGCT
* * * * * *
6921287 TATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACA-AAACAAAAGGTCACAATAATTTGAAATAGATAAT
125 TATATGAACT-AAAAAATT-TTTTA-TA-ATAAACAAAAAGTCATAACAATTT-AAA-AAATAAT
* ** * ** *
6921351 TATTCAAATTGTCATGGCTATTTGAACTTA-TTCAAAAAATATATTTATTTTTTAAATC-TTTAC
184 TATTCAAATAGTCAT-ATTGTTTGAA-TTAGTT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
* ** * *
6921414 TTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTATAAACAA
246 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT-ATATTATTTT-ATCCGAAATAAACTTGTATGAACAA
* *** * * * * * *
6921478 AAAGAATTGCTTTATGACAAAACAAAAAGACATTACAATTTG
309 AAAAAATCATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTC
* * * * **
6921520 AAATAAATAATTGCTCAAATAGCCATAAAG-ATTTGAACTTG-TTCAGCGAACA-A-ATTTATTT
1 AAATAAATAATTGCTTAAATAGTCAT-AAGTATTT-AAATTGATT-TGATAA-ATAGATTTATTT
* * * ** ** * *
6921581 TTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATGTTA-TTAGAAATAA
62 TTTAAATC---T-CTTATTAGTTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTG-AATAA
* * * * * *
6921645 GCTTGTAT-AAATAGAAAAAATCATTTTATGACA-AAACAAAAAGTTATAGCAATTTCAAATAGA
122 GCTTATATGAACT--AAAAAAT-TTTTTAT-A-ATAAACAAAAAGTCATAACAATTT-AAA-AAA
* * * * * * *
6921708 TAATTGTTAAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-GTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTC
180 TAATTATTCAAATAGTCAT-ATTGTTTGAA-TTAGTT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT
*
6921772 TTAATTATTAATT
242 TTACTTATTAATT
6921785 TTTAGAATTT
Statistics
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0.72 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
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339 4 0.00
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AACTAAAAAATTTTTTATAATAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAAAATAATTATTCAAATAGT
CATATTGTTTGAATTAGTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAA
ATATTAATAAATTATATTATTTTATCCGAAATAAACTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATAA
TAGAACAAAAAGTCATAACAATTTC
Found at i:6922163 original size:28 final size:28
Alignment explanation
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*
6922151 GAGGCTGGCCACCTTGCCTACCTCCCTC
1 GAGGCTGGCCACCCTGCCTACCTCCCTC
*
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1 GAGGC
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (28 bp):
GAGGCTGGCCACCCTGCCTACCTCCCTC
Found at i:6922537 original size:398 final size:368
Alignment explanation
Indices: 6922151--6922859 Score: 956
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6922141 TACCTCCCTC
* * * * * * *
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* * * *
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* * ** *** * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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*
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* * ** * *
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* *
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131 TTAACTCATCCGACATCCCAGATCAGCCTTCCTGTCACGGTTCACACCCTTGTGAGGTATTGTCC
*
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196 GCTCTGGCCCCCTGGCCTCACGGTTTTATCCTACAAAAGGTGCCTCACAAGG-AGAGGTGGTGTG
* * *
6922781 ACCCTTATATACCCTAGTGACCCTCCTATTATGTTTGATGTGGGATTCAGGACTCTTCCTTAGGT
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325 CCGTGACATTCTCC
6922860 TGCCAGCGGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (368 bp):
GAGGCTGGCCACCCTGCCTACCTCCCTCGAGGTGCTCGACATGGATCGAACGGTTTAGGGCTAGC
TCTGATACCACTTGTCACGGCTCAAGACTTAAGCTTCAAACCTGCATGACTCTGAGACCCAGGCA
TTAACTCATCCGACATCCCAGATCAGCCTTCCTGTCACGGTTCACACCCTTGTGAGGTATTGTCC
GCTCTGGCCCCCTGGCCTCACGGTTTTATCCTACAAAAGGTGCCTCACAAGGAGAGGTGGTGTGA
ACCTTATATACCCCAGTGACCCTCCTATTATGTTCGATGTGGGATTCAGGACTCTTCCTTAGGTC
CGTGACATTCTCCCACACCCAACCTCGTGACACCCTCATCACG
Found at i:6927700 original size:180 final size:180
Alignment explanation
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6927351 GGTCAAAATA
* * * * *
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* * *
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* ** * * *
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131 CCTTCTATAAGCACAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCTTAACG
* * * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATA
* *
6927606 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTAATATTAT-TTTATTTCAAAT
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTCTCATAATATTAATAAATTAATATTATATTTAATT-AAAT
** * * * * *
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129 AACCTTCTATAAGCACAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCT-TAACG
* *
6927722 ATTTAAAATAGATAATCATTCAAAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
6927747 GGCCGTAATT
Statistics
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0.80 0.16 0.03
Matches are distributed among these distances:
179 6 0.04
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Consensus pattern (180 bp):
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTATA
TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTCTCATAATATTAATAAATTAATATTATATTTAATTAAATAA
CCTTCTATAAGCACAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCTTAACG
Found at i:6928431 original size:181 final size:178
Alignment explanation
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6927899 TGATAAAAAT
* * * * * * *
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1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTT-GTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * * * * * *
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63 TTCA-AATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * ** * ** *
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127 -AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTATTTGAACTGTTTAGTAAATAG
** * * ** * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTT-GTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * *
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* * * * ** *
6928216 AGATAGATAATTATTCATATAGTCATAA-CTATTTGAGCTGATCCAATAAATAG
127 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTG-TTTAGTAAATAG
* * * * *
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** * * **
6928334 CAGTTAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAACTTTAA
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*
6928399 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAATTTGTTTAGTAAACT-G
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** * *
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1 ATTTATTTT-TTAAATCTCTTG-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * **
6928515 TTAAATAAGTTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGCCTAAACAAAAGGCCAGGATGATTTGA
64 TCAAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-A
* ** * * * ** * *
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* ** * *
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1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTT-GTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* * * *
6928697 TT-AAATAAG-TTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCGTAATGATTT
63 TTCAAATAAGTTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * *
6928758 --A-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TGTTTGAAATGTTTTTGTGAATAG
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* * *
6928808 ATTTAGTTTTTAAATCTC---TTATTAATTTTTAAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTA-TTC
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* * *
6928869 TAAATAA--TT-T-TGAA-T-GAACAGTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTGATTTCA
66 -AAATAAGTTTGTATGAACTAAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-A
* *
6928928 AATAGATAATTGTTCAAAT-G--AACATGACTATTTGAACT-TATTTGATAAATAT
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCAA-AT--CTATTTGAACTGT-TTAG-TAAATAG
* * * * * * *
6928980 ATTTATTTTTTAAATCTCCTAGCTACTAATTTTCAGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCT-CTTGTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * **
6929045 CAAACAAACTTATATGAAC-AAAATC-ATTAGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTT
65 CAAATAAGTTTGTATGAACTAAAA-CAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTT
* * * * *
6929108 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAAT-TATTTGAACTGGTTAGGTAAACAA
127 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTATTTGAACTGTTTA-GTAAATAG
* * * *
6929161 AATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TT-TTTT-TT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTT-GTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * *
6929222 CCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGA
64 TCAAATAAGTTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGA
6929261 ATTGAAATAG
Statistics
Matches: 916, Mismatches: 190, Indels: 133
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
166 4 0.00
167 16 0.02
168 19 0.02
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170 4 0.00
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175 14 0.02
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185 1 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (178 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTGTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
AAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAACTGTTTAGTAAATAG
Found at i:6928514 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 6927909--6929260 Score: 764
Period size: 182 Copynumber: 7.6 Consensus size: 179
6927899 TGATAAAAAT
* ** * * * * *
6927909 ATTTATTTTTTAAAATTTCTTACTTATTAGTTTTCT-GAATATTAATAAAATAATGTTATTTTAT
1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACACATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * * * * * *
6927973 TT-AGAATAAGCATGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAAGTTAGAACGATTT
64 TTCA-AATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * ** ** * * **
6928037 GAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAA-CTATTTGAA-CAGCTCGGCAAGCAC
128 -AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTATTTGAATTTG-TTTGTAAACTG
** ** * ** * * *
6928090 ATTTAGCTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATT-ATCAGTTTAGCAATATTTTACT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACACATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * *
6928153 CCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATAATTTTATGATAATAC-AAAGATCATAATGATTTG
65 TCAAATAAGTTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-
* * * ** ***
6928216 AGATAGATAATTATTCATATAGTCATAA-CTATTTG-AGCTGATCCAATAAA-TAG
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAATTTG-T-TTGTAAACT-G
* * * **** * *
6928269 ATTTAGTTTTTAACTCTCATGTTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACACATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * **
6928334 CAGTTAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAACTTTAA
66 CAAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTAA
6928399 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAATTTGTTTAGTAAACTG
130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAATTTGTTT-GTAAACTG
* * *
6928450 ATTTATTTTCTTAAATCTCTTGCACATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTT-TTAAATCTCTTACACATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * **
6928515 TTAAATAAGTTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGCCTAAACAAAAGGCCAGGATGATTTGA
65 TCAAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-A
* ** * * * **
6928580 AATAGATAATTATTTTAATAGCCTTAA-CTATTTGAATTTGTTGGGTAAACAC
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTATTTGAATTTGTT-TGTAAACTG
** ** * *
6928632 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACACATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* * * *
6928697 TT-AAATAAG-TTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCGTAATGATTT
64 TTCAAATAAGTTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* *
6928758 --A-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TGTTTGAAATGTT-TTTGTGAA-TAG
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTG-AAT-TTGTTTGTAAACT-G
* * *
6928808 ATTTAGTTTTTAAATCTCTT----ATTAATTTTTAAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTA-TT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACACATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
6928868 CTAAATAA--TT-T-TGAA-T-GAACAGTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTGATTTC
66 C-AAATAAGTTTGTATGAACTAAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-
* * *
6928927 AAATAGATAATTGTTCAAAT-G--AACATGACTATTTGAACTTATTTGATAAA-TAT
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAA-AT--CTATTTGAATTTGTTTG-TAAACT-G
* * * *
6928980 ATTTATTTTTTAAATCTCCTAGCTAC--TAATTTTCAGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-C-ACATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * ** * **
6929043 TCCAAACAAACTTATATGAAC-AAAATC-ATTAGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
64 TTCAAATAAGTTTGTATGAACTAAAA-CAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-T
* * * * * **
6929106 TTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAAT-TATTTGAACTGGTTAGGTAAACAA
126 TTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTATTTGAATTTGTT-TGTAAACTG
* * ** *
6929161 AATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TT-TTTT-TT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACACATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * *
6929222 CCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGA
65 TCAAATAAGTTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGA
6929261 ATTGAAATAG
Statistics
Matches: 915, Mismatches: 185, Indels: 145
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
166 4 0.00
167 16 0.02
168 19 0.02
169 6 0.01
170 5 0.01
171 46 0.05
172 44 0.05
175 14 0.02
176 68 0.07
177 9 0.01
178 79 0.09
179 88 0.10
180 101 0.11
181 199 0.22
182 204 0.22
183 10 0.01
184 2 0.00
185 1 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (179 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTACACATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
CAAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAA
TAGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAATTTGTTTGTAAACTG
Found at i:6929080 original size:348 final size:352
Alignment explanation
Indices: 6928401--6929210 Score: 756
Period size: 348 Copynumber: 2.3 Consensus size: 352
6928391 AACTTTAAAT
*
6928401 AGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAATTTGTTTAGTAAACTGATTTATTTTCTTAAAT
1 AGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAATTTGTTTAGTAAACTGATTTAGTTTCTTAAAT
* * * *
6928466 CTCTTGCACATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTGTAT
66 CTCTT---CATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGAAT
* * * * **
6928531 GAACTAAAATAATTGTTTTATGCCTAAACAAAAGGCCAGGATGATTTGAAATAGATAATTATTTT
128 GAAC--AAAT-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCAAGATGATTTCAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
6928596 AATAGCCTTAACTATTTGAATTTGTTGGGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
190 AATAGACATAACTATTTGAACTTATTGGATAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCCTACTTACTA
** * * * * *
6928661 ATTTTTGGAATACTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGTTGTATGAAAAGAAACAATT
255 ATTTTCAGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAAAAACTTATATGAAAAGAAACAATT
6928726 GTTTTATGACAAAATAAAGATCGTAATGATTTA
320 GTTTTATGACAAAATAAAGATCGTAATGATTTA
* *
6928759 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-TGTTTGAAATGTT-TTT-GTGAA-TAGATTTAGTTT-TT
1 AGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTG-AAT-TTGTTTAGTAAACT-GATTTAGTTTCTT
* * *
6928819 AAATCTCTT-ATTAATTTTTAAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAA
62 AAATCTCTTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGAA
* * *
6928883 TGAAC-AGT-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG-TGATTTCAAATAGATAATTGTTCAA
127 TGAACAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCA-AGATGATTTCAAATAGATAATTATTCAA
* * * *
6928945 AT-GAACATGACTATTTGAACTTATTTGATAAATATATTTA-TTTTTTAAATCTCCTAGC-TACT
191 ATAG-ACATAACTATTTGAACTTATTGGATAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCCTA-CTTACT
* * *
6929007 AATTTTCAGATTATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAACAAACTTATATGAACAA-AATC
254 AATTTTCAGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAA-AAACTTATATGAA-AAGAAAC
* * * **
6929070 -ATTAGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAA
316 AATT-GTTTTATGACAAAA-TAAAGATCGTAATGA-TTT--A
* * * * ** * *
6929111 TAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAAT-TATTTGAA-CTGGTTAGGTAAACAAAATTA-TTTTTTA
1 -AGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTATTTGAATTTGTTTA-GTAAACTGATTTAGTTTCTTA
* *
6929173 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
63 AATCTCTT-C--ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
6929211 CATTTTTTTT
Statistics
Matches: 368, Mismatches: 58, Indels: 53
0.77 0.12 0.11
Matches are distributed among these distances:
346 3 0.01
347 54 0.15
348 101 0.27
349 13 0.04
350 6 0.02
351 2 0.01
352 6 0.02
353 98 0.27
357 35 0.10
358 39 0.11
359 9 0.02
360 2 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (352 bp):
AGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAATTTGTTTAGTAAACTGATTTAGTTTCTTAAAT
CTCTTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGAATGAA
CAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCAAGATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGA
CATAACTATTTGAACTTATTGGATAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCCTACTTACTAATTTTC
AGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAAAAACTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTA
TGACAAAATAAAGATCGTAATGATTTA
Found at i:6930630 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 6929257--6931087 Score: 1456
Period size: 181 Copynumber: 10.1 Consensus size: 181
6929247 AAATTGTTTT
* * * *
6929257 ATGAATTGAAATAGATAATTGGTT-ATATAGTCTTAACTATTTGAACTGATTC-AGTAAA-ATAA
1 ATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGA-TAAACAT-A
* * * * ** * * *
6929319 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAGTTATTGGAATATTGTTAGATTAGTATCATTTTATTTT
63 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* ** * * * * *
6929384 AAATAAGAGAT-TATGA-ACAAAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATA
128 GAATAAG-CTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * *
6929438 ACGATTTCAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCA-AGACTATTT-ACATTGGTTTGGTAAACAGAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGA-ATTGATTCGATAAACATAT
* * *
6929501 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATT-TTTTTTTTC-
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * ** ** *
6929564 AATTAAGCTTATATGATCAAAAACAATTGTTATATGACCGAACAAAAACTAATA
129 AA-TAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * **
6929618 ACGATTTAAAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATATGAGCCTGATTC-AGTAAACATAT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTGATTCGA-TAAACATAT
* *
6929682 TTACTTTTTAAAT-TACTTATTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
64 TTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * **
6929745 TGAATAAGCTTGCATGA-ATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
127 CGAATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
6929800 ATGATTTTAAACAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAATTTATTTGATAAACAAATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAACATATTT
* * * *
6929864 ATTTTTTTAAA-CTCTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGG
66 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * ** *
6929928 ATAAGGTTTTATGA-ATTAAAACAATTTTTTTATGTCAAAACAAAATATTATA
130 ATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * **
6929980 ACGATTTTAACTAAATAATTATTAAAATAGTCATAACTATTT-AACTTG-CTCGATAAACAGGTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTCGATAAACATATT
* * * ** * * *
6930043 TATTTTTTCAAA-CTTTTGCTTATTAATTTTTTAAA-GCTAATAAATTTGGATTATTTTATTTTG
65 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* ** * * * * *
6930106 AATAAGCTTGTAAGATATGAAACAAATATTTTATAACTAAACAAAAGGTCAGA
129 AATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * * *
6930159 ATGATTAGAAATAGATAATTATTTC-AATAGTTTTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAACATATT
* * * *
6930223 TATGTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTGTTA--ACG
65 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTCG
* * * *
6930286 AAAAAGCTTCTATGATAAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTA
129 AATAAGCTTGTATGAT---AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * **
6930341 ACGATTT-AAGATTGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATGTAT
1 ATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTCGATAAACATAT
*
6930404 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* *
6930469 AATAAACTTGTATGATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
129 AATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
6930522 ATGATTTGAAATCGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCGATAAACATATTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAACATATTT
* * * * ** * * *
6930587 ATTTTTTAATTTTTTTACTTATTTATTTAGGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCCAT
66 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-
* * * * *
6930651 CTAAGCTTGTAT--TAACTGAAACAATTATTTTATGACAAATCAAAAGGTTATA
130 ATAAGCTTGTATGATAA--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
6930703 ATGATTCT-AAATAGACAATTGGTCACATAGTAATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACA-A-
1 ATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTCGATAAACATAT
* * *
6930764 TT-TTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAGTTTA-TTC
64 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* ** * * *
6930826 TGAATAAGCATGTATGA-ACTGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGT-TTGA
128 -GAATAAGCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-A
* * * * *
6930881 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAATTGATTC-AGTAGACAAATT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGA-TAAACATATT
* * * *
6930945 TATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTATTATTATTAATTTAAT
65 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-T--TTTATT
* * * * * * *
6931010 CCGAATAAGCTTGTAAGA-ACAAAATAATTGTTTTACGATAAAACAAAGGGTCATA
126 TCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
6931065 ATGATTTGAAATAGATAATTGTT
1 ATGATTTGAAATAGATAATTGTT
6931088 ATAATAATAA
Statistics
Matches: 1310, Mismatches: 275, Indels: 127
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 5 0.00
178 127 0.10
179 117 0.09
180 341 0.26
181 387 0.30
182 223 0.17
183 40 0.03
184 48 0.04
185 20 0.02
186 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAACATATTT
ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
TAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
Found at i:6930808 original size:722 final size:719
Alignment explanation
Indices: 6929493--6931001 Score: 1734
Period size: 722 Copynumber: 2.1 Consensus size: 719
6929483 TTGGTTTGGT
* * * *
6929493 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTTTT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATT
* ** * * **
6929558 TTTTTCAATTAAGCTTATATGATCAAAAACAATTGTTATATGACCGAACAAAAACTAATAACGAT
66 GTTAACAATAAAGCTTATATGATAAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAACT-ATAACGAT
* * *
6929623 TTAAAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATATGAGCCTGATTCAGTAAACATATTTACTT
130 TTAAAATAAATAATTGTTGAAATAGCCATAACTATATGAACCTGATTCAGTAAACATATTTACTT
* * *
6929688 TTTAAATTACTTATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
195 TTTAAATTACTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAA
** *
6929753 CTTGCATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAACAGATAA
260 CTTGCATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAACAGATAA
* * * *
6929818 TTGTTCAAATAGTCAAACTATTTGAATTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTTCCT
325 TTGTTCAAATAGCCAAACTATTTGAATTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTTACT
** * * *** * * *
6929883 TATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGGTTTTATGAATTAAA
390 TATTAATTTAGGAAATAGTAAGAAATTAATATTATTTTATTCCAGATAAGCTTGTATGAACTAAA
* * * * * * * *
6929948 ACAATTTTTTTATGTCAAAACAAAATATTATAACGATTTTAACTAAATAATTATTAAAATAGTCA
455 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACGATTCTAAATAAACAATTAGTAAAATAGTAA
*
6930013 TAACTATTTAACTTGCTCGATAAACAGGTTTATTTTTTCAAACTTTTGCTTATTAATTTTTTAAA
520 TAACTATTTAACTTGCTCGATAAACA-GATTATTTTTTCAAACTTTTGCTTATTAATTTTTTAAA
* * * *
6930078 GCTAATAAATTTGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATAA
584 GCTAATAAATTAGGATTAGTTTATTCTGAATAAGCATGTAAGA-ACTGAAACAAATATTTTATAA
* * * *
6930142 CTAAACAAAAGGTCAGAATGATTAGAAATAGATAATTATT-TCAATAGTTTTAACTATTTGAATT
648 CAAAACAAAAGGTCAGAATGATTAGAAATAGATAATTGTTCT-AATAGTCTTAACCATTTGAATT
*
6930206 GGTTC-GAC
712 GATTCAG-C
* * * *
6930214 AAACACATTTATGTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATT
* * *
6930279 GTTAACGAA-AAAGCTTCTATGATAAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCT-TAA
66 GTTAAC-AATAAAGCTTATATGAT---AAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAA-AACTATAA
* ** * * * * * ** **
6930342 CGATTTAAGATTGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATGTATTT
126 CGATTTAAAATAAATAATTGTTGAAATAGCCATAACTATATGAACCTGATTCAGTAAACATATTT
*
6930406 ATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTT-GAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
191 ACTTTTTAAAT-TACTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* *
6930469 AATAAACTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
254 AATAAACTTGCATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * * *
6930533 TC-GATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCGATAAACATATTTA-TTTTTTAA
318 -CAGATAATTGTTCAAATAGCCA-AACTATTTGAATTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAA
** * * * **
6930596 TTTTTTTACTTATTTATTTAGGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGT
381 -ACTCTTACTTATTAATTTAGGAAATAGTAAGAAATTAATATTATTTTATTCCAGATAAGCTTGT
* * * * * * *
6930661 ATTAACTGAAACAATTATTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAATGATTCTAAATAGACAATTGGT
445 ATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACGATTCTAAATAAACAATTAGT
* * * * *
6930726 CACATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-ATT-TTTTTT-AAATCTCTTT-CTTAT
510 AAAATAGTAATAACTATTT-AACTTGCTCGATAAACAGATTATTTTTTCAAA-CT-TTTGCTTAT
* * * *
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* * * ** *
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*
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* *
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65 T
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TAAAATAAATAATTGTTGAAATAGCCATAACTATATGAACCTGATTCAGTAAACATATTTACTTT
TTAAATTACTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAC
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TGTTCAAATAGCCAAACTATTTGAATTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTTACTT
ATTAATTTAGGAAATAGTAAGAAATTAATATTATTTTATTCCAGATAAGCTTGTATGAACTAAAA
CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACGATTCTAAATAAACAATTAGTAAAATAGTAAT
AACTATTTAACTTGCTCGATAAACAGATTATTTTTTCAAACTTTTGCTTATTAATTTTTTAAAGC
TAATAAATTAGGATTAGTTTATTCTGAATAAGCATGTAAGAACTGAAACAAATATTTTATAACAA
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CAGC
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1 A
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* * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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** * *** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* ** *
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* * * * *
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1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAA-AATTATTCAAATAGTCAT
* * *
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ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC
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* * * * * *
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* * * *
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** * * *
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* *
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* * * ** *
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260 ACTCACTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACT
* *
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325 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAAATAACTATTCTAATAG
* *** * * *
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6932117 TTGGA
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** **
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1 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACT-GGTTCAAAAATAGATTTAGT
* *
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* *
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* * * * * *
6932306 TAATTGTTCAAATGGACATGA-CTATTT-GAACTTGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATC
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6932368 TTC-TAC-CTACTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGT
255 TTCTTACTC-ACTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGT
* * *
6932430 ATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-GATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATT
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* *
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380 ATTCTAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTACATGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
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6932570 AT
1 AT
6932572 ATTAATAAAT
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TCTAAATATCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCATATAAC
AATTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATAACAAAATAAAAAGTCACAACGACTTTAAATAGAAAA
TTCTTCAAATAGACAAATCTATTTGGAATTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATTTCTTA
CTCACTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACTG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAAATAACTATTCTAATAGT
CATAACTATTTGAACTTACATGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATCAATTTTTG
GA
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* * * * * *
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*
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* * * * *
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* * * * *
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATT
* * * *
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*
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* * * **
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1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTAT
* * * * * * * **
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** * ** * *
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130 AACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAAGGTCATAACT
* * * ** *
6932656 ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAATCATAACTATTAACTATTTGAACATGTTC-AAAAAGGA
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-A--GT--C-A-TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-CA
* * *
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* * * * * *
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* *** * *
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* * * * * **
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* * * * * * ** * *
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* * * * * **
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* * * ** **** * * * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * ** * *
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* ** * ** * *** * *
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*
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180 CT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * ** * * *
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1 -ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT
* *
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* * ** * * * * * * * *
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* * * **
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* * * * * * *
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* * *
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* * ** * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * *
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* * *
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* * ** * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* ** *
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**
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* * * * ** * *
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* * * *
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* * * **
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* **** ** * ** * * * *
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* ** * ** * * * *
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** * * * * * * * * **
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* * * * * * ** * * * ** * ** *
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* * * * * ** * * * *
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* * ** *** * * * *
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* ** ** * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * *
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*** * * * * * * * *
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* *
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* * ** * * * *
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* * * *** *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** ** * * *
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** * * * * **
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* * * ** * * *
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* * ** * * * * * * * **
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * ** *** * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * **
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** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * * * **
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* * * * ** **
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** * * * ** ** *
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* * * * * **
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* * * * * * * *
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254 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGTTACTATGAATAGAAAAAATTGTTTT
* * * * * * * *
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*
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* * * * * ** *
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* * * * *
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128 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCAT
*
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192 AACTATTTGAA
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ATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAACAAAAACAAT
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* * *
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* * * * ** *
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*
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
6933624 ATGAA-TTTAAAAATATTAATACATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TGTATGAACAGAA
64 ATTAATTTTTAAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAA-ACTTGTATGAACAGAA
* ** *
6933687 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTTA
128 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
6933752 TAACTAATTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTATTATTTCTTAATTTTCAAA
193 TAACTATTTGAACT-GATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT-TAA
* * * * * *
6933817 ATATGAATAAATTAATATTATTTT-ATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTAT
255 ATATGAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTAT
* * *
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* * * * * *
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381 ACTGATTTGA-AAA-TAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * *
6934009 TTTATTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTACTAAGAATTGAAAAAATTACTTTACGATGAAATAAA
443 -TTAATTTATTTTATTTCAAATAAGCTT-TTAAGAACTGAAACAATTACTTTATGATAAAATAAA
*
6934073 AGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGT
506 AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGT
** *** * * * * *
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1 TCAAATAGTAATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* ** * * *
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65 TTAATTTTTAAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAGAAAT
* * *
6934231 AATTGTTTTATGACATAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATA
130 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATA
* * * *
6934296 ACTATTTGAACTGGTTCGCTAAACAGATTTATTTTTCAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAT
195 ACTATTTGAACTGATTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTT-AAAT
* * * * *
6934361 ATTAGTAAATTAGTTTTATTTTAATTCAAGTAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGAC
257 ATGAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAT-AAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * **
6934426 AAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGTTGTAATTATTTCAACTGA
321 AAAAAAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTCAACTGA
* *
6934491 TTTGATAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAAT-AAGTAATA
386 TTTGA-AAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-AAATTTTGAAATATTAATAAATTAAT-
* * **
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448 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTAAGAACTGAAACAATTACTTTATGATAAAATAAAAGGTCAT
** * *
6934620 AACAATTTTAAATATATAATTGT
513 AATGATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * *
6934643 TCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACTGATTTATGTTTTTTAATTTCTTTCTTA
1 TCAAATAGTAATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACTGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *** * * * *
6934708 TTAATTTTTTAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTGGCATGTATGAGCTGAAAC
65 TTAATTTTTAAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAGAAAT
* * *
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TAATTTTTAAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAGAAATA
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CTATTTGAACTGATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAATATGA
ATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAA
AAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTCAACTGATTTGA
AAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTGAAATATTAATAAATTAATTTATTTTA
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GAAATAAATAATTGT
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* * * * ** * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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** * * * * * * *
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* * *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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** * * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * *
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1 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGCTCAGCTAAAC
* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * ** *
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1 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGCTCAGCTAAAC
* * * *
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66 AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * *
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* * * * * ** *
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1 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGCTCAGCTAAAC
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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131 TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAA-G
* * ** * * ** * *
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1 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGCTCAGCTAAAC
* *
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66 AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * * *
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** * * * *
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1 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTA-AACTT-GCTCAGCTA
* ** * * *
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* * * * * *
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127 TTATTTC-GAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATTACAAAACAAAA-G
** ** * * *
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1 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GCTCAGCT-AA
* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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128 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAA-G
* * * * * * *
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* * * * *
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55 -CTCAGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
* * * ** * * * * *
6937042 GTATTATTTTATTTTGAACAAACTCATATG-ATAAAAAATAATTGTTATATGACTAAACAAAAGG
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*
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* * * * *
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* * * *
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* * ** * * * * * *
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189 ACAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATCT
* ** ** * *
6935186 CGCTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATGAATTA
253 AGCTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA
***
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* * *
6935291 ATTGA-TTTATTACAAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATCA-TCA
1 ATT-ATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCA
* ** ** * * * * *
6935353 TAACTATTTAAACGTGCTCAGCAAAATAAATTTATTGTTTAAAT-TATTATTTATTAATTTTT-G
63 TAACTATTTAAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAG
* * **
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* * * ** * *
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184 TTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACAAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
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247 TGATCTAGCTTGGTAAACAGATT--TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * *
6935599 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCC-AATAAACTTATATTAACT-GAAACA
310 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACA
* * * * * * *
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** * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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255 CTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAATTA
* * * * *
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* * * *
6935998 ATCT-TTTTATGACAAAAGAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * **
6936355 ATTATTTTATAATAGAACAAAACGTGATAACAATTTGAAATAAATAATTGCCCAAATAGTCATAA
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* * * * * *
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* * * *
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* ** *
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254 GCTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-
* ** * *
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* * * * * ** *
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* * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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*** * * ** * *
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* * * * *
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Statistics
Matches: 1453, Mismatches: 289, Indels: 194
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* * *
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* ** * * * * **
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* ** * * * * * * **
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* * * * * * *
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* *
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* ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
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** ** * *
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* * * * * *
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* * * **
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* * * *
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** * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * **
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* * * *
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* * *
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* *
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Statistics
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * **
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* *
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* ** * *
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* *** * * * * *
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* * * * *
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130 ATAAATTTATATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAATAGAATAA-TTGTTTTATGACAAAA
* * * * * **
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* * * * * *
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** * * *
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* ** * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** ** *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * ** * *
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*
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* * * * *
6938971 TTTTATGACAAAATAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * ***
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* * * * * * * * * *
6939098 TATTAAA-TTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTATTTTATAATA
128 TAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAATAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
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* * *
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254 TAGTAAACAGA-TTAATTTTTAAATCTCTTAC-T-TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * *
6939278 ATTATTTTATTTCGAATAGGCTTCTATGATGAA-AAACAATTG-
316 ATTATTTTATTTCAAATAAGC-T-TAT-ATGAACTAACAATTGA
* * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * **
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66 TTAAACTAG-TTCT-ATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATAT
* * * * * * *
6939447 TAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAAATTTTATGAACTAAAACT-ATTGTTTTATGATA
128 TAATAAATTTATATTATTTTATTTGA-ATAAACTTGTATGAA-TAGAA-TAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
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190 AAACAAAAAGTCATA-ATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGT-
* * * * *
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253 TTAGTAAACAGA-TTA-ATTTTTAAATCT-CTTACT-TATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATT
* * *
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* * * * *
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129 AATAAATTTA--TATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAATAG-AATAATTGTTTTATGACA
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1 TTTTATG-ACAAA-ACAAAAGGTC-A--T-AA--TGATTT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAATA
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55 GTCATAACTAT-TTAAACTAGTTCTATAAACATATTTATTTTTTA--AATCTTTTACTTATTAAT
* * ** ** * *
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* ** * * * * * ** * ** * * *
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* *
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345 ACTA-ACAATTGA
* * * * * * * * * * *
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1 T-TTTATGACAAA-A--CAAAAGGTCATAATG-A-TT-T--GAAATAGATA---ATTGTTCAAAT
* * * * * ** * * * *
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54 AGTCATAACTAT-TTAAACTAGTTCTATAAACATATTTAT-TTTTTA-AATCTTTTACTT--ATT
* * * * ** ** **** * *
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169 TAGAATAATTGTT-TTAT-GACAAAAC-A--AAAAGTCATAATATTTG-AAATAGA-T-A--ATT
* *** * * * * * * * * * * *
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* ** ** * ** * *
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* * * *
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335 GCTTATATG-A-A--C-TAAC-AATTG-A
** ** * * * ** * * * *
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1 -TT-TTATGACAAAACA-A-A-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCAT
* * * *** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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245 TGAAT-T-GTTTAGTAAACAGA-TTAAT-TTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATT
* * * * *
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305 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT---AACAATTGA
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1 TTTTATGACAA-AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** * * *
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65 TTTAAACTAG-TTCTATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATT
* * * * * * *
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129 AATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAA-TAAACTTGTATGAATAGAATA-A-TTGTTTTATGAC
* * * * *
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189 AAAACAAAAAGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-G
* * * * *
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252 TT-TAGTAAACA-GATTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG
* * * *
6941462 T-TTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAGTTCAAAAAAACTT-A
315 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGA--AC-TAACAA-TTGA
* * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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66 TTAAACTAGTTCT-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTCAAAATATT
* * * * * * * * * * *
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129 AATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAA-TAGAATAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * * *
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191 AACAAAAAGTCATAAT-ATTTGAA-ATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
* * * * *
6941758 TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTGTGAAAGATTAATAAATTAGT
252 TTTAGTAAACAGA-TTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * * *
6941823 ATTCTTTTATTCCGAATAAGCTTGA-ATGTTCAA-AAACAATTG-
316 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-ATATG---AACTAACAATTGA
* * * * * * *
6941865 TTATATGACCAAACTAAAGGTAATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTGACAA-GGT-ATAATT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACT
* * * * ** * * **
6941927 ATTTAAA-TTGATTC-AGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTGCTTTTTAATTTTTGAAATA
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* * * * * * *
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127 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAA-TAGAATAATTGTTTTATGAC
* * * * * * *
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189 AAAACAAAAAGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-
* * * * * * *
6942117 TTTGGCAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGT
252 TTTAGTAAACAGATTAATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* *
6942182 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATT-A
316 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT--AACAATTGA
* * * * * * *
6942224 TTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG---GAAC---
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
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66 TTAAACTAGTTCTATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
** * ** *
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131 TAAATTTA-TATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAATAG-AA-TAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * *
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192 ACAAAAAG-TCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTT
* ** ** * * * *
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255 AG-TAAACAGA-TTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
*** * *
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* * * * * * *
6942569 TTTTATGATAAAACAAAAGATCATATTTATTTTAAATAG-TAATTATTCAAATAGTCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * ** ** **
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66 TTAAACTAGTTCT-ATAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTCAAAATAT
* * * * * * * *
6942696 TAATAAA-TTAGAGTTATTTTATTTCGAATAAGCATATATGAACT-GCAACAATTATTTAATGAT
128 TAATAAATTTATA-TTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAA-TAG-AATAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * * **
6942759 GAAATAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTCA
189 AAAACAAAAAGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
* * * * * ** * * *
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252 TTTAGTAAACAGA-TTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
6942889 AATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-A
316 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC--TAACAATTGA
*
6942931 TTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * **
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65 TTTAAACTAGTTCT-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATT
* ** *
6943054 AATAAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGA-GACA
129 AAT-AAATTTATATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAATAG-AATAATTGTTTT-ATGACA
* * * * * *
6943118 AAATAAAATGTCAT-ATCAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTG
190 AAACAAAAAGTCATAAT--ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
* ** * ** * *
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252 TTTAGTAAACAGA-TTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGT
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316 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAACT---AACAATTGA
* ** * * *
6943289 TTTTATGAAAAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* *** *
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* * * * * * * * *
6943416 TAATAAA-TAAGAATTATTTTATTCTGAAT-AAGTTTTATTAGTAGAAACAATTGGTTTACGACA
128 TAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAATAG-AATAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
6943479 AAA-TAAAAGATCATAATGATTTAAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATATCAATTTGAACGTG
190 AAACAAAAAG-TCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
* * * * * * *
6943543 TTTAG-AAACTATATTTATTTTTTGAAT-TTTTATTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATTTG
252 TTTAGTAAAC-AGA-TTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG
* ** *
6943606 TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTCCATGAACAAAATCAATT-A
315 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC-TAA-CAATTGA
* * * * * *
6943649 TTTTATGACAAAAC-AAAGGT-TTAGT-TTTTGAAATAAATAATTGTTTAGATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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129 AATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAATAG-AATAATTGTTTTATGACAA
* * *
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191 AACAAAAAGTCAT-AAT-ATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
* * * * * * *
6943901 TTTGGTAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATA
252 TTTAGTAAACAGATTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * * *
6943966 TTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAAT-AGA--AACAATTG-
317 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTAT-ATGA-ACTAACAATTGA
* * *
6944004 TTTTATGACAAAACAAATA-GTCATAACAATTAGTCATAATAATTAGCAATAAATAATTATTCAA
1 TTTTATGACAAAACAAA-AGGTCAT---AA-T-G-----AT--TT-GAAATAGATAATTGTTCAA
* ** * * * * * * * * *
6944068 ATAGTTATAAAGATTTGAATTTGTT-AAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAG
52 ATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCTA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* ** * * * * * * * * *
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116 TTTTCAAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAA-TAAACTTGTATGAATAGAATAA-TT
* * * * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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306 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-AAC-AATTGA
* * * * * *
6944379 TTTTATGACAAAACTAACGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * *
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66 TTAAACTAGTTCT-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
* * ** * * *
6944505 ATAAA-TTAGTATTATTTTAATCTAAATATGCTTGTATGAACAAAACT-ATTGTTTTATAACAAA
130 ATAAATTTA-TATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAATAGAA-TAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
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192 ACAAAAAGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTT
* * *
6944633 -GATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTAT
255 AG-TAAACAGA-TTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
** * * * *
6944693 TATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTG-
318 TATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC--TAACAATTGA
* * * ** * *
6944733 TTTTATTACAAAAAAAAAAGGACATAACAATCTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTA
1 TTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *** * * ** * **
6944797 TTTGAAC-GGTTAGGTAAACACAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTTTTGAAATATTA
65 TTTAAACTAGTTCTATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
* * * * * * * * * *
6944861 ATAAATTCATTTTATTTTATTTTCATTAAGCTAGTGTGAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAAA
130 ATAAATTTATATTATTTTA-TTTGAATAAACTTGTATGAATAG-AATAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
6944926 C-AAAA---AT--GACTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTCAG
193 CAAAAAGTCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTTAG
* * * * * * * ** * * *
6944985 CAAAAAAATATATTTTTTAATTCTCTTAGTTAATAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGCATTAT
257 TAAACAGAT-TAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** *
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321 TTTATTTC-AAATAAGCTTATATG--AACTAACAATTGA
* * * **
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* *** * * * ** *
6945151 TTGAACTAGTTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAACATTAA
66 TTAAACTAGTTCTATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
* * * * *
6945216 TAAA-TTAGTATT-TATTCA-TT--ATAAACTTGTACGATTAAAAACAATTGTTTTATGATC-AA
131 TAAATTTA-TATTAT-TTTATTTGAATAAACTTGTATGAAT-AGAATAATTGTTTTATGA-CAAA
* * * * * * * * * * * *
6945275 ACAAAAGGTAATAGTGATTTAAAATAGGTAATTGTTGAAATGGCCAGAATTATTTGAACTGATTC
192 ACAAAAAGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTT
* * *
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255 AGTAAACAGATT-AATTTTTAAATCT-CTTACTTATTAA-TTTTT--A--A---A---A-T-A--
*
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303 TT----A-A-T--AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAACT--AACAATTGA
* * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * ** * **
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65 TTTAAACTAGTTCTA-TAAACATATTTATTT-TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATAT
* ** * * * * * * *
6945594 TAAGAAATCAATATTAATTTATTTAGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGTCAA
128 TAATAAATTTATATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAATAG-AATAATTGTTTTATGACAA
* * * *
6945659 AACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
191 AACAAAAAGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTT
* * * * * ** * * *
6945724 CAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAGTCTTTTACTTATTAATTTTTCGAATGTTAATAAATTTGGA
254 TAGTAAACAGA-TTAATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * *
6945789 TTATTTTATTCCGAATGAA-CTTGTAAGATA-TGAAACAAAT-A
317 TTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTATATGA-ACT--AACAATTGA
* * ** * * * **
6945830 TTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAGCGATTGGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * **
6945895 TTGAATTGGTTCGACAAAC--AGTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTGATTTTTGAAATATT-A
66 TTAAACTAGTTCTATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
* ** * * * * * *
6945957 TAAAATTAGTATTATTTTTAACTAAACAAGCTTATATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
131 TAAATTTA-TATTA-TTTTATTTGAATAAACTTGTATGAATAG-AATAATTGTTTTATGACAAAA
6946022 CAAA
193 CAAA
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Consensus pattern (356 bp):
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TTAAACTAGTTCTATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
TAAATTTATATTATTTTATTTGAATAAACTTGTATGAATAGAATAATTGTTTTATGACAAAACAA
AAAGTCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTAGTAAA
CAGATTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
TTCAAATAAGCTTATATGAACTAACAATTGA
Found at i:6939565 original size:530 final size:529
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* * *
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*
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* * *
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128 ATAAGCTTGTATGAACTAAAA-AATTATTTTAT-A-ATAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA--
* * * * *
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188 ATA-GATAATT---GT--TCATAATTA-TGAAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * ** *
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440 TTTTTGAAACATCAATAAGTAATATTATTTTTATTTCAAATAAAATTCTATGAACTAAAACAATT
*
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505 ATTTTATGACAAAATAAAAAGTCAT
* * *
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1 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTATTCGGCTAACAAATT
* *
6939060 TATTTTTTAAATCTTGTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTGTTTTGA
65 TATTTTTTAAATCTT-TAGTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * *
6939125 ATAAGCTTATATAAACTAAAACAATTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATA
128 ATAAGCTTGTATGAACTAAAA-AATTATTTTATAATA-AACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATA
* * * *
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191 GATAATTGTTCATAATTATGAAACTAGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT--CATACT
* * * ** *
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* * * *
6939312 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATGGC
318 AACAATTGTTATATGAC-AAACAAAATG-TAATAATGAATTGAAATAAAAAATTATTCAAATGAC
* *
6939376 CATAATTATTTGAATTGATTTGACAAACT-AACTTC-TTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTT
381 CATAATTATTTGAATTGATTTGACAAA-TGAA-TTCACTTTTTAAATCACTAACTTATCAATTTT
* * * * * *
6939439 TGAAATATTAATAAAGTAATATTA-TTTTATTTCAGATAAAATTTTATGAACTAAAACTATTGTT
444 TGAAACATCAAT-AAGTAATATTATTTTTATTTCAAATAAAATTCTATGAACTAAAACAATTATT
* *
6939503 TTATGATAAAATAAAAGGTCAT
508 TTATGACAAAATAAAAAGTCAT
* * * * * * *
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1 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTATTCGGCTAA-CAAAT
* * *
6939588 TTATATTTTTAAATTCCTTTTG-TATTAATTTTCTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
64 TTAT-TTTTTAAA-T-CTTTAGTTATTAATTTT-TAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT
** * *
6939652 CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATATTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
125 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAATTATTTTATAA-TAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAA
6939717 TAGATAATTGTTC-TAAT
189 TAGATAATTGTTCATAAT
6939734 AGTGTTAACT
Statistics
Matches: 628, Mismatches: 91, Indels: 54
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (529 bp):
AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTATTCGGCTAACAAATTT
ATTTTTTAAATCTTTAGTTATTAATTTTTAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
AGCTTGTATGAACTAAAAAATTATTTTATAATAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAA
TTGTTCATAATTATGAAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCATACTATTAATTT
TTGAAAGATTAATAAATATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTCTATGATAAAAAACAATTG
TTATATGACAAACAAAATGTAATAATGAATTGAAATAAAAAATTATTCAAATGACCATAATTATT
TGAATTGATTTGACAAATGAATTCACTTTTTAAATCACTAACTTATCAATTTTTGAAACATCAAT
AAGTAATATTATTTTTATTTCAAATAAAATTCTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAATA
AAAAGTCAT
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Alignment explanation
Indices: 6939752--6940017 Score: 382
Period size: 140 Copynumber: 1.9 Consensus size: 144
6939742 CTATTTGTAT
* *
6939752 TGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAATATCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTA
1 TGGTTTGGCAAACACATTTAGTTTTTAATATCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTA
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66 GCCATATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATC
6939882 ATAACAATTTGAAC
131 ATAACAATTTGAAC
* *
6939896 TGGTTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAATTTTT-GAAATATTA-TAAATT
1 TGGTTTGGCAAACACATTTAGTTTTTAATATCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTATTAAATT
* * * ** *
6939956 AG-TATTATTTTATTCTTAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA
65 AGCCA-TATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
6940018 ATGTCATAAT
Statistics
Matches: 110, Mismatches: 10, Indels: 8
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Matches are distributed among these distances:
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142 1 0.01
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Consensus pattern (144 bp):
TGGTTTGGCAAACACATTTAGTTTTTAATATCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTA
GCCATATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATC
ATAACAATTTGAAC
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Alignment explanation
Indices: 6939880--6940882 Score: 965
Period size: 181 Copynumber: 5.6 Consensus size: 181
6939870 AAAACAAAGA
* * * * *
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1 TCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* ** *
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66 AGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTT
* * *
6940003 TTATGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATGATAGTTCAAATA-
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* * * *
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* ** * *
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65 TAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTT
* * *
6940184 TTATGACAAAACAAAAGATCACAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
130 TTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
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1 TCATAACTATTTAAACT-TGTTTGGTAAACAT-ATTTATTTTT-TAAATCTTTTACTTATTA-AT
* * * *
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* * * *
6940363 GATTTATGACAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTAGAAATAGATAATTCTTCAAATAG
127 GTTTTATGACAAAA-CAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *****
6940420 TCACAACTATTTGAACTTCTACAAAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT
1 TCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * *
6940484 TGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTAAAATAAGCTTACATGAATAGAACCAATTGTT
66 AGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTT
* * * *
6940548 TTATTACAAAACAAAAGATTATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAG
130 TTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
6940601 TCATAACTATTTAAACATGTTTGGTAAACAGATTCA-GTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTT
1 TCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
** * *
6940665 -GAAATATTAATAAATT--TAATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATTGAAACAATTGTT
66 AGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * * * * * **
6940727 TTATTG-CTAAATAGAAGGTTACAATGATTTAAAATAGATACTTATTTGAATAG
130 TTA-TGACAAAACA-AAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
6940780 TCATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATA--TATATTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGT
1 TCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-T
* * *
6940842 CA-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGC
65 TAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
6940883 ATCGGTTTTA
Statistics
Matches: 680, Mismatches: 116, Indels: 60
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 39 0.06
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179 120 0.18
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181 213 0.31
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184 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
TCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
AGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTT
TATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
Found at i:6941995 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 6940888--6945227 Score: 1169
Period size: 180 Copynumber: 24.3 Consensus size: 178
6940878 TAAGCATCGG
*** * *
6940888 TTTTAAATCTCTTTAGTATTAATTTTT-AGATTATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATA
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* * * * * * *
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65 AGCTTGA-ATGAACTAAAAAAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAAA
* * * ** * * * * *
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128 TAATTGTTCACA-AGGTATAACTATTTAAAT-TGA-TTCAGTAAACAGATTTAT
* * * * *
6941068 GTTTTAAAT-TTTCTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA---CATCT-GAAT
1 -TTTTAAATCTCT-TGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * ** * * *
6941128 AAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTT-TAAAAAGAACAAAAAATCATAACGATTTAAAATAA
64 AAGCTTGAATGAACTA-AAAAAATTATTTATGACAA-AACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAA
* * * * * *
6941191 ATAATTGCTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGATT-GGTAAATAGATTTAT
127 ATAATTGTTCACAA-GGT-ATAACTATTT-AAATTGATTCAGTAAACAGATTTAT
* ** * * *
6941244 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAACTTTCAAAATATTAAT-GATTAGTTTTATCTTATTTCGAACTA
1 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-TA
* * * ** * ** *
6941304 A-CTT-ATAT-AAATAAAAACATTTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
65 AGCTTGA-ATGAACTAAAAA-AATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAA
* * * * * *
6941366 ATAATTGTT-A-AA-ATCATAATTATTTAAATTGGTT-ATATAAACATAATTATT
127 ATAATTGTTCACAAGGT-ATAACTATTTAAATTGATTCA-GTAAACAGATTTA-T
* * * * * * *
6941417 TTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTAAAATATTAAGAAATTTGT-TTATTTTATTCCAAATAA
1 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
* * ** * ** *
6941481 GCTAGTATGAGTTCAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
66 GCTTGAATGAACT-AAAAAAA-TTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAAA
* * * * * * * ** * *
6941546 TAATTGATCATATA-GTCTTAAATATTTGAACTGGTTTGGCAAACAAATTTAT
128 TAATTGTTCACA-AGGT-ATAACTATTTAAATTGATTCAGTAAACAGATTTAT
* * * * * *
6941598 TTTTTAAT-T-TTAGC-TATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTTTTTCAAATA
1 TTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * * * * ** * *
6941660 ATCTTGTATCAAC-AAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTACAATGATTTGAAGTTTG
65 AGCTTGAATGAACTAAAAA-AATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAA--ATA
* * ** * * *
6941724 CA-AATT-TTCAAATAGCCATAACAATTTGAACT-AGTTCAGTAAACAGATTTATT
126 AATAATTGTTCACA-AGGTATAACTATTTAAATTGA-TTCAGTAAACAGATTTA-T
* * * * *
6941777 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTGTGAAAGATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTCCGAATAA
1 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
** * * * * *
6941842 GCTTGAATGTTC-AAAAACAATTGTTATATGACCAAACTAAAGGTAATAACTATTTGAAATAGAT
66 GCTTGAATGAACTAAAAA-AATTATT-TATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAAAT
* * *
6941906 AATTGTTGACAAGGTATAATTATTTAAATTGATTCAGTAAACAGATTCACT
129 AATTGTTCACAAGGTATAACTATTTAAATTGATTCAGTAAACAGATTTA-T
* * *
6941957 TTTTAAATCACTTGCTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
1 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
** * *
6942022 GCTTGTGTGAACTAAAAAAATTATTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
66 GCTTGAATGAACTAAAAAAATTATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAAATAA
* * * * * * * ** * *
6942087 TTGTTCATATGGTCTAACTGTTTGACTTGCTTTGGCAAACAAATTTAT
131 TTGTTCACAAGGTATAACTATTTAAATTGATTCAGTAAACAGATTTAT
*
6942135 TTTTCAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
1 TTTT-AAATCTCTT-GCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * * * ** *
6942199 AAGCTT-ATATGAACTGAAATAATTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
64 AAGCTTGA-ATGAACTAAAAAAATTA-TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAA
** * * * *
6942263 ATAATTGTT-------TA-AA-TA-GGAACTGGATT-AATAAACAAATTTACT
127 ATAATTGTTCACAAGGTATAACTATTTAAATTGATTCAGTAAACAGATTTA-T
* * *
6942305 TTTTAAA--TC-T-CTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAAT-A
1 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
* ***** ** * * * * *
6942365 GACTTGTATTTTGGAAAGTAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGTTCATAATGAA-TTGAAATACA
66 G-CTTGAATGAACTAAAAAAATT-ATTTATGACAAAACAAAAGGTAATAA-CAATTTGAAATAAA
* * * * * ** *
6942428 TAATTATTCA-AATGGCCATAATTATTTGAACTGATTC-GATAAATTGACTTTTT
128 TAATTGTTCACAA-GG-TATAACTATTTAAATTGATTCAG-TAAACAGA-TTTAT
** * * * * * *
6942481 TTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAA
1 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
** * * * * * *** * *
6942546 GCTTTTATGAACTGAAACAACTGT-TTTATGATAAAACAAAAGATCATATTTATTTTAAAT-AGT
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* * * * ** * *
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** * *
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* *
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Statistics
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * **
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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6944123 A
180 A
* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * *
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* ** * * ** * * *
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * * * *
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360 T
* * * * * * * *
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* * * *
6945641 ACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATAGTC
66 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
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* * * * * ** * *
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* * * ** * * * **
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257 TTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * **
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* ** * * * *
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386 2 0.00
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TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAA
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
TAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTACT
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6943546 AGAAACTATA
*
6943556 TTTATTTTTTGAATT
1 TTTATTTATTGAATT
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1 TTTATTTATTGAATT
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1 TTTA
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TTTATTTATTGAATT
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6944005 TTTATGACAA
*
6944015 AACAAATAGTCAT
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1 AACAATTAGTCAT
*
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AACAATTAGTCAT
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*
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1 TAGTCATAATAAT
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1 TA
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TAGTCATAATAAT
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6944757 TAACAATCTG
* * *
6944767 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-GGTT-AGGTAAACACAAT-TATTTTTT
1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAAATATTTGAACTGGTTCA-GCAAA-AAAATATATTTTTT
* * *
6944829 AAATCCCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-CATTTTATTTTATTTTCATTAAGCT
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* **
6944893 AGTGTGAATTGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAATGACTTGA
127 AGTATG-ATAAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAATGACTTGA
*
6944940 AATAGATAATTGTTCATATAGTCT-TAAATATTTGAACTGGTTCAGCAAAAAAATATATTTTTTA
1 AATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAAATATTTGAACTGGTTCAGCAAAAAAATATATTTTTTA
* * ** * * * * *
6945004 ATTCTCTTAGTTAATAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGCATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG
65 AATCCCTTACATAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-CATTATTTTATTCTCAATAAGCTAG
* *
6945069 TATGATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGA
129 TATGATAAAAAATAATTATTTTATGACAAAAC--AA----A-AATGACTTGA
* ** * * * * * * *
6945121 AGTTTA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAA
1 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAAATATTTGAACTGGTTCAGCAAAAAAATATATTTTTTAA
** * * * *
6945185 ATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATTA
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6945223 GTATTTATTC
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AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAAATATTTGAACTGGTTCAGCAAAAAAATATATTTTTTAA
ATCCCTTACATAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTACATTATTTTATTCTCAATAAGCTAGTA
TGATAAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAATGACTTGA
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6945343 AAACAGATTC
*
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1 ACTTTTTAAATTATTTACTTATTA
* *
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1 ACTTTTTAAATTATT
6945415 AAAAATTAGT
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ACTTTTTAAATTATTTACTTATTA
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6945381 TTTAAATTAT
* * * *
6945391 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATAAAC
1 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAAAATCAATATTAATTTATTTCAAATAAGCTAGTATAAAC
* *
6945456 TAAAACAATTATTTTATGTCAAAATAAAAGGTCATAACTATTTTAAATATACAATTGTTCAAATA
66 TAAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATA
* * *
6945521 GTCGTAACTCTTTGAATTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTCTTTTC-A-CTC
131 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TT-TTTTCAAGCTC
* * ** *
6945571 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATCAATATTAATTTATTT-AGGATAAGCTTTTATGA
1 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA-AAATCAATATTAATTTATTTCA-AATAAGCTAGTATAA
* * * * *
6945635 ATTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTTAAATAAATAATTGTTTAA
64 ACTAAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTTAAATAAACAATTGTTCAA
*
6945699 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAGTCTT
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1 TTACTTATTAATTTTT
6945769 CGAATGTTAA
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TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAAAATCAATATTAATTTATTTCAAATAAGCTAGTATAAAC
TAAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATA
GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAGCTC
Found at i:6946016 original size:179 final size:182
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Period size: 181 Copynumber: 3.5 Consensus size: 182
6945381 TTTAAATTAT
** ** *
6945391 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA-AAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAGC-TAGTATA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTTAACT-AAACAAGCTTA-TAT-
* * * * * * * ** * * * *
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* * * *
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128 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAAGTTA-TT-TTTTCAAATCTC
* * * ** * * *
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* * * ** *
6945635 ATT-GAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTTAA
64 ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTGGAAATAAATAATTATTTAA
* * *
6945699 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAGTCTT
129 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAAGTTATTTTTTCAAATCTC
* * * * ** * ** * *
6945753 TTACTTATTAATTTTTCG-AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCCGAATGAA-CTTGTAAG
1 TTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTT-TAACTAAACAAGCTTATATG
* * * * *
6945816 A-TATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAGCGATTGGAAATAGATAATTATTCT
64 ATTA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTGGAAATAAATAATTATT-T
** *
6945880 -AATAGTTTTAACTATTTGAA-TTGGTTC-G-ACAA-ACAGTTATTTTTT-AAATCTC
127 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTA-AACAAAGTTATTTTTTCAAATCTC
*
6945932 TTACTTATTGATTTTTGAAATATTATA-AAATTAGTATTATTTTTAACTAAACAAGCTTATATGA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-AGAAATTAGTATTATTTTTAACTAAACAAGCTTATATGA
6945996 TTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
65 TTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
6946026 GATCTTAACG
Statistics
Matches: 367, Mismatches: 68, Indels: 41
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Matches are distributed among these distances:
178 7 0.02
179 76 0.21
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181 124 0.34
182 109 0.30
183 6 0.02
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TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTTAACTAAACAAGCTTATATGAT
TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACGATTGGAAATAAATAATTATTTAAAT
AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAAGTTATTTTTTCAAATCTC
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Indices: 6946659--6947125 Score: 494
Period size: 181 Copynumber: 2.6 Consensus size: 181
6946649 TGTTTAAGTT
* * * * * *
6946659 CATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTACGA
1 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
6946724 TATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAAGC-AGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAGTTATC
66 TATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CTAGTTCAAATAATTAAGACCATATCAACAATTATC
** * **
6946788 CATTTGTAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTT
130 CATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGAA
* * * * *
6946840 CATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAATATTAATAAGTAAGT
1 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * *
6946905 TATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAA-TCAGTTCAAATAATTATTG-CCATGTCAACAATTAT
66 TATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAATTA-AGACCATATCAACAATTAT
* ** * * *
6946968 CTATTTCAAATTGTTATTACC-TTTAGTTTTGTCATATAACAATTGTATT-TGAA
129 CCATTTCAAATCATTATGACCATTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAGAA
* * *
6947021 CATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTTATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
1 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* *
6947086 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATA
66 TATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATA
6947126 GCAATGACTA
Statistics
Matches: 232, Mismatches: 48, Indels: 12
0.79 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
180 3 0.01
181 225 0.97
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
TATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACCATATCAACAATTATCC
ATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGAA
Found at i:6947159 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 6946598--6947165 Score: 488
Period size: 181 Copynumber: 3.1 Consensus size: 181
6946588 TTCCTATTTG
** * * * * ** * **
6946598 AACAATTATTTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATTGT-AAACTAA-TGTTTAAGTTCA
1 AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGAACA
* * * * * *
6946661 TATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTACGATA
65 TACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATA
* * *
6946726 TTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGAAGC-AGTTCAAACAGTTAA-GACTATATG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CTAGTTCAAATAG-TAATGACTATATA
* * * ** ** * **
6946778 AATAGTTATCCATTTGTAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCAT
1 AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGAACAT
* * * * *
6946843 AGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAATATTAATAAGTAAGTTAT
66 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATAT
* * * * * * * * *
6946908 TTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAA-TCAGTTCAAATAATTATTG-CCATGTC
131 TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAAT-AGTAATGACTATATA
* * * *
6946959 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACC-TTTAGTTTTGTCATATAACAATTGTATT-TGAAC
1 AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACCATTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAGAAC
* * * *
6947022 ATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTTATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
64 ATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAT
* * *
6947087 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGCAATGACTATTTA
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTAATGACTATATA
* *
6947140 AACAAATT-TAAACTTCAAATTGTTAT
1 AAC-AATTATCAATTTCAAATTGTTAT
6947166 AAAATAAATC
Statistics
Matches: 305, Mismatches: 72, Indels: 21
0.77 0.18 0.05
Matches are distributed among these distances:
180 40 0.13
181 256 0.84
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGAACAT
ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATAT
TTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTAATGACTATATA
Found at i:6947170 original size:73 final size:73
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Indices: 6947093--6947240 Score: 253
Period size: 73 Copynumber: 2.0 Consensus size: 73
6947083 AGAGATTTAA
6947093 AAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGCAATGACTATTTAAACAAATT-TAAACTTCA
1 AAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGCAATGACTATTTAAAC-AATTGTAAACTTCA
*
6947157 AATTGTTAT
65 AATTATTAT
* *
6947166 AAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGCAATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAA
1 AAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGCAATGACTATTTAAACAATTGTAAACTTCAA
6947231 ATTATTAT
66 ATTATTAT
6947239 AA
1 AA
6947241 CCTTTTGTTT
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 3, Indels: 2
0.93 0.04 0.03
Matches are distributed among these distances:
72 4 0.06
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Consensus pattern (73 bp):
AAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGCAATGACTATTTAAACAATTGTAAACTTCAA
ATTATTAT
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Indices: 6947166--6949656 Score: 1414
Period size: 181 Copynumber: 14.0 Consensus size: 176
6947156 AAATTGTTAT
* * * ** * ** *
6947166 AAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGCAATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* *
6947231 ATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTGAAAT
66 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-TT-TCTTGAAAT
* * * *
6947295 AAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATCAA
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
6947347 AAAATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTTAAATATTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
6947412 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTCGAATTCATA-ATAGCTTACTTGG
66 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTTG--TTCATACA-AG-TTTCTTGA
* *
6947475 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGGAGATTTAA
126 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* *
6947526 AAAAT-AATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATT-TATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *
6947590 AATCATTATAGCCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGCTTGAAAT
65 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTT-CTTGAAAT
* * *
6947655 AAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAATATTAATAAGAGATTTAA
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * * * *
6947703 AAAATAAATTTATTCATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTTTTTATTTCAA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * * * *
6947768 ATCATTATGACTTTTTATTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACACGCTTATTCGAATTA
66 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTCTT-GAAATA
*** ** *
6947833 AAATAATACTAATTTATTAATATTT-TGTAATCGATAAGTAAAATTTAA
130 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGATTTAA
* * * * * *
6947881 AAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAAAT-G--A--AC-A----AA-TATTA---ATCTCAA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* ** * * * *
6947932 ATCATTATAATC-TTTGTTTCCTCATAAAATAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTCG-GAT
66 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGTTTCTT-GAAAT
* * *
6947994 AAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTTATAATTAATAAGAGATTTAA
129 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGAGATTTAA
*** *** * * * *
6948043 AAAATAAATAGGTTTATTGAA-TCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTACCTA-TTCA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * * * *** *
6948106 AATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTCAATTCATACAAGGTTAT-TTGGAA
65 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA-GTT-TCTTGAAA
* *
6948170 TAAAATAATACTAATTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGATATTTGAA
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-A-G--ATTT-AA
* * * * * * *
6948224 AAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAATAATTATCTATTTGAA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * **
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*** **
6948352 ATAAAATAATACCGCTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAACAAGAGATTTAA
127 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAA
* * * * * * * *
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1 AAAATAAATTTA-TTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * *** *
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* *
6948532 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAA
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* **** * *
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1 AAAATAAAT-TTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * ** * *
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* * *
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128 TAAAATAATACTAAT--TTA-TTAAT-AT-TTC-AAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAA
** * * * * * * *
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1 AAAATAAATTTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * ** * * **
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65 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-TT-TCTTGAAA
* * * *
6948895 TAGAATAAAATTAATTTATTGATATTTCAAAAA-TATATAAGAGATTTAA
128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGAGATTTAA
* * * * * ** * *
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1 AAAATAAATT-TATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
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65 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTCTT-GAAAT
*
6949073 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAA
129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAA
* * * * * * * * *
6949125 AAAGTAAATCTACTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCTA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * * * *
6949190 ATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTATTTACACTATTTTATTTGAAATA
66 ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTT-CTTGAAATA
* * * * * * * *
6949255 AAATAGTGCAAATTTAATAATATTTTGCAACTTAA-TAACCAAGAAAATTAAA
130 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-CAA--AAATTAA-TAAG-AGATTTAA
* * * * * * ** * **
6949307 AAAATAAATCTAATTGCCAAACCAATTCAAATAGTGAAAACTATAT-AAGTGATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * *
6949371 AATCATTATGATCTTTTCTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAT-TT-GTACAAGCTTATTCATAT
65 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGTTTCTTGA-AA
*
6949434 TAAAATAATACTAATTTCA-TAATATTTAAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAA
128 TAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * * * * * * *
6949487 AAAACAAATTTGTTTACCAAA-TCATTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCA
1 AAAATAAATTTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * * *** * * *
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65 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTCTTGA-AAT
* * *
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129 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGA
6949657 AAGAGATTTA
Statistics
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AAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTCTTGAAATAA
AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
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6949527 CTATTAGAAT
* * *
6949537 AATTATATACTTCAAATTGTTTTGACCATTTGTTTAGTCATAAATCAATTGTTTCAATTCATACA
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* * *
6949602 AGCTTATTCAGAATAAATTAATAATAATTTATTAACA-TTCAAGAAATTAATAAG-AAAGAGATT
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6949665 TAAAATCCTTATGATTAATTGAAC
129 TAAAATCCTTATGATTAATTGAAC
* * ** * *
6949689 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTCTATTCATACA
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* * * *
6949754 AGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAAATAATAAGTAAAAGATTTA
66 AGCTTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATAAACATTTCAACAAATAATAAGTAAAAGATTTA
6949819 AAA
131 AAA
6949822 AATAAATATG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATTATATACTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTAGTCATAAAACAATAGTTTCAATTCATACA
AGCTTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATAAACATTTCAACAAATAATAAGTAAAAGATTTA
AAATCCTTATGATTAATTGAAC
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Alignment explanation
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6949348 TATATAAGTG
* **
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* *
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* * *
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** * * *
6949553 TTGTTTTGACCATTTGTTTAGTCATAAATCAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATA
196 TCATTTTGACCATTTGTTTAGTAACAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATT-AGAAATA
* * *
6949617 AATTAATAATAATTTATTAACATTCAAGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAATCCTTATGATTA
260 AAATAATAATAATTTATGAACATTCAA-AAATTAATAAGAAAGAGAATTAAAATCCTTATGATTA
6949682 ATTGAACA
324 ATTGAACA
* ** * *
6949690 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTCTATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTCTTTTGTCATAAAAAAATAGTTT-TATTCATACA
* * *
6949754 AGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTT-ATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATT
64 AGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTCAT-AATATTT-AAAAAACTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * *
6949817 TAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATCTAC
127 TAAAAAACAAATATGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGT-TAAGACTATTAGAATAATTATATAC
* * * *
6949880 TTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTCGTAACAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTG
190 TTCAAATCATTTTGACCATTTGTTTAGTAACAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTAG
* * * * *
6949945 AAATAAAATAATTATAATTTATGAATATTCTAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAA
255 AAATAAAATAATAATAATTTATGAACATTCAAAAATTAATAAGAAAGAGAATTAAA
6950001 TAGTTAATAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTCTTTTGTCATAAAAAAATAGTTTTATTCATACAAG
CTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTCATAATATTTAAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTAAA
AAACAAATATGTTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAA
TCATTTTGACCATTTGTTTAGTAACAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTAGAAATAA
AATAATAATAATTTATGAACATTCAAAAATTAATAAGAAAGAGAATTAAAATCCTTATGATTAAT
TGAACA
Found at i:6950062 original size:16 final size:17
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Indices: 6950041--6950076 Score: 56
Period size: 16 Copynumber: 2.2 Consensus size: 17
6950031 TAGTTATGAC
*
6950041 TATCTATTTGAAAA-AT
1 TATCTATTTCAAAACAT
6950057 TATCTATTTCAAAACAT
1 TATCTATTTCAAAACAT
6950074 TAT
1 TAT
6950077 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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TATCTATTTCAAAACAT
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Indices: 6949673--6950329 Score: 666
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6949663 TTTAAAATCC
* * * * ** *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
6949918 TTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATTA-TAATTTATGAATATTCTAAAAT
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* * * * * **
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*
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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1 TTATGACTATTTGAAA-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *
6950281 TTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
65 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
6950330 TAAAATTTCA
Statistics
Matches: 393, Mismatches: 64, Indels: 40
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Matches are distributed among these distances:
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TTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
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TAAGTAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTCAAATAG
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Indices: 6950397--6950736 Score: 449
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6950387 TATTCGAAAT
* *
6950397 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA---GGAGATTTAAAAAATAAATATAT
* * *
6950462 TCATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAGCTATTATCTATC-CAAAT-AGTTATGATA
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*
6950525 TTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTATATTTATACAAAATTAATCTAA
127 -TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTATATTCATACAAAATTAATCTAA
* * * *
6950575 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAA-GAGATTTAAAAACTAAATTTATTTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGGAGATTTAAAAAATAAATATATTCA
* * *
6950638 TCAAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTCAA-CAATTATCTATCTCAAATCATTATGATATT
66 TCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACCATTT-AAGCAATTATCTATCTCAAATCATTATGATATT
*
6950701 TGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA
129 TGTTTTATCATAAAATAATTGTTTATATTCATACAA
6950737 GCTTATTCGA
Statistics
Matches: 144, Mismatches: 14, Indels: 13
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (175 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGGAGATTTAAAAAATAAATATATTCA
TCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTAAGCAATTATCTATCTCAAATCATTATGATATTTG
TTTTATCATAAAATAATTGTTTATATTCATACAAAATTAATCTAA
Found at i:6950855 original size:176 final size:170
Alignment explanation
Indices: 6950500--6950932 Score: 424
Period size: 176 Copynumber: 2.5 Consensus size: 170
6950490 CATTTAAGCT
6950500 ATTATCTATC-CAAATAGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTATATTTATACAA
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** * * * * ** *
6950564 AATTAATCTAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAA
63 GCTTATTCGAAATAA-AATACTAAATTAACAATATTTCAAAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAA
* * * *
6950629 ATTTATTTATCAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTCAACA
127 ATGTATTTATCAAACCAATTTAAATAGTTAAGAATATTACAACA
*
6950673 ATTATCTATCTCAAATCATTATGATATTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG
1 ATTATCTATCTCAAAT-ATTATGATATTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-TATTTATACAAG
*
6950738 CTTATTCGAAATAAAATACTGTAAAATTAACAATATTTTAGAAATAAATAAGAGATTTAAAAGA-
64 CTTATTCGAAATAAAATAC--T-AAATTAACAATATTTCA-AAATAAATAAGAGATTTAAAA-AC
* * ** * * *
6950802 TAAATGTGTTTGTGGAACCAGTTTAACTAGTTAAGAATATTAGAACA
124 TAAATGTATTTATCAAACCAATTTAAATAGTTAAGAATATTACAACA
* * * * * *
6950849 ATTATCTATATTAAATTGTTCTAACCT-TTTGTTTAATCATAAAATAAATT-TTTTAGTTTATAC
1 ATTATCTATCTCAAA-TATTATGA--TATTTGTTTTATCATAAAAT-AATTGTTTTA-TTTATAC
* *
6950912 ATGCCTATTCGAAATAAAATA
61 AAGCTTATTCGAAATAAAATA
6950933 TACTAATTTA
Statistics
Matches: 216, Mismatches: 32, Indels: 20
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Matches are distributed among these distances:
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173 56 0.26
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175 14 0.06
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Consensus pattern (170 bp):
ATTATCTATCTCAAATATTATGATATTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTATTTATACAAGCT
TATTCGAAATAAAATACTAAATTAACAATATTTCAAAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATGT
ATTTATCAAACCAATTTAAATAGTTAAGAATATTACAACA
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Indices: 6951006--6951692 Score: 800
Period size: 349 Copynumber: 2.0 Consensus size: 351
6950996 TAGTTATGAC
* * * *
6951006 TATTTCAACAATTATCTATTTATAAGAAGTATGATCTTTTGTTTTATTATAAAACGGTTGTTTCA
1 TATTTCAACAATTATCTATTTATAAGAAGTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACGATTGTTTCA
* * * * * * *
6951071 GTTTATAAAAGCTTATATGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATT-AAAAGTT
66 ATTCATAAAAGCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGAAAA-CT
* * * * *
6951135 AA-AGAT-TGAAAAAAT-AAGT-CAGTTTA-TCGAATCACTTCAAATAATTATGGCCATTT-ACA
130 AAGAGATGT-AAAAAATAAAATCCA-TTTACT-GAAGCAATTCAAACAATTAAGGCCATTTGA-A
** * *
6951194 CAATTATCTATTT-CAAATCATTACGAACTTTTCTTTTATGATAAAACAA-TTGTTTTGCATCAT
191 CAATTATCTATTTACAAAAAATTACGAACTTTTCTTTGATCATAAAACAATTTGTTTTG-ATCAT
* *
6951257 ACAAGCCTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
255 ACAAGCCTATTCGAAATAAAACAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAAT
*
6951322 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAGCTAGTTTT
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* ** * **
6951355 TATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATTATTGTTTC
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* * * *
6951419 AATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACT
65 AATTCATAAAAGCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGAAAACT
*
6951484 AAGAGATGTAAAAAATAAAATCCATTTACTGAAGCAATTCAAACAATTAAGGCTATTTGAACAAT
130 AAGAGATGTAAAAAATAAAATCCATTTACTGAAGCAATTCAAACAATTAAGGCCATTTGAACAAT
* * ** * * * * **
6951549 TATCTATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTTGATCATTGAAG
195 TATCTATTTACAAAAAATTACGAACTTTTCTTTGATCATAAAACAATTTGTTTTGATCATACAAG
* * * *
6951614 CCTATTTGGAATAAAACAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAA
260 CCTATTCGAAATAAAACAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAA
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ATTCATAAAAGCTTATATGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGAAAACTA
AGAGATGTAAAAAATAAAATCCATTTACTGAAGCAATTCAAACAATTAAGGCCATTTGAACAATT
ATCTATTTACAAAAAATTACGAACTTTTCTTTGATCATAAAACAATTTGTTTTGATCATACAAGC
CTATTCGAAATAAAACAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAA
AAAAACCTATTTACCAAGCTAGTTTT
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*
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* * * *
6951258 CAAGCCTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
66 CAAGCCTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATG
*
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131 TAAAAAATAAAATCCATTTACCAAGCTAGTTTTTATTTGA
* * * **
6951362 ACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTTTGTTCTATTATAAAATTATTG-TTT-CAATTC
1 ACAATTATCTATTTCAAATCATTACGAA-CTTTTCTTCTATGATAAAACAATTGTTTTGC-A-TC
* * * * * *
6951424 ATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAG
63 ATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAG
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128 ATGTAAAAAATAAAATCCATTTAC
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Statistics
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ACAATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTCTTCTATGATAAAACAATTGTTTTGCATCATA
CAAGCCTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATG
TAAAAAATAAAATCCATTTACCAAGCTAGTTTTTATTTGA
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6951345 AGCTAGTTTT
* * * * * * ** * *
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1 TATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTCT-TGTTATAAAACAAATGTTTT
** * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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128 TAAGAGAT-TTAAAAAT-AAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGAC
* * ** * * * * * *
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1 TATTTAAACAATTATTTATTT-TAAATCATTATGACTTTTTGTCTT-GTTATAAAACAAATGTTT
* ** * * * * *
6951601 TTGATCAT-TGAAGCCTATTTGGAATAAAACAATACT-AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATA
64 TTGTTCATAT-AAGTTTGTTTGGAATAAAATAA-AATGAATCTATTAATATTTCAAAAATT-ATA
* * * * * * * *
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* * * * ** * * * ** * * *
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1 TATTTAAACAATTATTTA-TTTTAAATCATTATGACTTTTTGTCT-TGTTATAAAACAAATGTTT
* * * *** * *
6951779 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATA
64 TTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAA-AATGAATCTATTAATATTTC-AAAAATT-ATA
* * * * * * ** * * *
6951842 ACTAAGAGAATTAAACAATAATTTTGTTTACCGAACTGGTTTAAATATTTAAGAC
126 AATAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGAC
* * * * * * * *
6951897 TATATGAACAATTATCTATTTTGAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-ATATGTTTTT
1 TATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTCTTGTTATAAAACAAATGTTTTT
* * * * *
6951960 -TTGAATGTACACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
66 GTT-CA--TATA--AGTTTGTTTGGAATAAAATAAAATGAATCTATTAATATTTCAAAAATT-AT
* * *
6952024 AAATAAGAGATTTAAAAATAATTCTATTTGCCTAACCAGTTCAAATAATTATGAC
125 AAATAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGAC
* *
6952079 TATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGTCTTTTTGTCTTGTTATAAAACAAATGTTTTT
1 TATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTCTTGTTATAAAACAAATGTTTTT
* *
6952144 GTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAA-T-T-AATA
66 GTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAA-AATGAATCTATTAATATTTCAAAAATTATAAATA
* * * *
6952205 AGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCCAATAGTTATGAC
130 AGAGATTT--AAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGAC
* ** *
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1 TATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTCTTGTTATAAAA
6952311 TAATTATTTC
Statistics
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0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
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TATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTCTTGTTATAAAACAAATGTTTTT
GTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAAAATGAATCTATTAATATTTCAAAAATTATAAATAA
GAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGAC
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6951349 AGTTTTTATT
*
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1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATTATTGTTTCAATTC
* * *
6951424 ATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAG
66 ATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAG
* * *
6951489 ATGTAAAAAATAAAATCCATTTACTGAAGCAATTCAAACAATTAAGGCTATTTGAACAATTATCT
131 ATGTAAAAAATAAAATCCATTTACTGAACCAATTCAAACAATTAAGACTATTTAAACAATTATCT
* * *
6951554 ATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTTGATCATTGAAGCCTAT
196 ATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATTGAAGCCTAT
* *
6951619 TTGGAATAAAACAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAAA
261 TTGGAATAAAACAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAG-AATTTAAAAAAAA
* * ** *
6951684 ACCTATTTATCGAACTAGTTCAAATATATAACTATTTGAACAATTGTAAGCTTTAAATTGTTTTA
324 ACCTATTTATCAAACGAGTTCAAATATATAACTATTTGAACAATTGTAAGCTTTAAATCATTATA
** * * *
6951749 ACCTTTTGTTCCATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
389 ACCTTTTGTTCCATCATAAAACAATTATTTCCGTCCACACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAC
6951814 TAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAACAATAATTTTGTTTACCGAAC
454 TAATCTAATAATATTTCT-AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAACAATAATTTTGTTTACCGAAC
6951878 TGGTTTAAATATTTAAGACTATA
518 TGGTTTAAATATTTAAGACTATA
** * * * * * *
6951901 TGAACAATTATCTATTTTGAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGAAT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAT-T-ATTGTTTCAAT
* * *
6951966 GTACA-CT-AGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
64 -T-CATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAAT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAT
* * * * * * *
6952028 AAGAGAT-TTAAAAAT-AATTCTATTTGCCT-AACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAA
126 AAGAGATGTAAAAAATAAAATCCATTT-ACTGAACCAATTCAAACAATTAAGACTATTTAAACAA
* *** * * * *
6952090 TTATTTATTT-TAAATCGTTATGTCTTTTTGTCTT-GTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAT-
190 TTATCTATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGT-TTGGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCAT-TG
** * **
6952152 AAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AG-ATTTAA
253 AAGCCTATTTGGAATAAAACAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAATTT-A
* * * ** * * *
6952215 AAAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCCAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTA-TTTT
317 AAAAA-AAACCTATTTATCAAACGAGTTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATT-GTAAGCTTT
* * *** * * *** *
6952279 AAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCCGTCCACACAAGCCTATTTGGAT
378 AAATCATTATAACCTTTTGTTCCATCATAAAACAATTATTTCCGTCCACACAAGCCTATTCAAAA
* * * ** * *
6952344 TAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTCTACAATTAATAGGTAA-A-AATTTTTAAAAAATAAAT
443 TAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCTAAAATTAATAACTAAGAGAA---TTAAACAATAATT
* * ** * * * *
6952407 ATATTTATTGAACTAGG-TCAAATAGTCAAGACTATT
505 TTGTTTACCGAACT-GGTTTAAATATTTAAGACTATA
** ** * * * **
6952443 TGAATTATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTAGTT-TGTCATATAAA-AATTATTTCAGC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-GTTCTATCATA-AAATTATTGTTTCAAT
* * * * *
6952506 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATT
64 TCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATT
6952552 ATGAAAATTA
Statistics
Matches: 523, Mismatches: 105, Indels: 48
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
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546 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (540 bp):
TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATTATTGTTTCAATTC
ATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAG
ATGTAAAAAATAAAATCCATTTACTGAACCAATTCAAACAATTAAGACTATTTAAACAATTATCT
ATTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATAAAACAAATGTTTTTGATCATTGAAGCCTAT
TTGGAATAAAACAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAATTTAAAAAAAAAC
CTATTTATCAAACGAGTTCAAATATATAACTATTTGAACAATTGTAAGCTTTAAATCATTATAAC
CTTTTGTTCCATCATAAAACAATTATTTCCGTCCACACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTA
ATCTAATAATATTTCTAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAACAATAATTTTGTTTACCGAACTGG
TTTAAATATTTAAGACTATA
Found at i:6952355 original size:178 final size:176
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6950384 TTTTATTCGA
*
6950394 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATATAT
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* * * * * * * * * * **
6950458 ATGTTCATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTT-AAGCTATTATCTA-TCCAAAT-AGTTA
61 CTATTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAA-CAATTATTTATTTTAAATCA-TTA
** * * * * * * * ** *
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123 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTT-ATTTGG
* *
6950573 AA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * *
6950636 TATCAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA--TA
66 TACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCT-
* * * * * * * *
6950699 TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * ** * * * * * *
6950747 AATAAAATACT-GTAAAATTAACAATATTTTAGAAATAAATAAGAGATTTAAAAGATAAATGTGT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
*** * * * * * * * * ** * *
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65 TTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCT
** * * * * * * * *
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129 TTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* *
6950924 AATAAAAT-ATACTAATTTATT-ATCATTT-AGAAAA-T--T---A-A--TAAAAAATAAATTTG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * *
6950977 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTATAAGA--AGTATGA
64 TTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-TAA-ATCATTATGA
* * * ** * ** * * * * *
6951040 TCTTTTGTTTTATTATAAAACGGTTGTTTCAGTTTATAAAAGCTTATATGA
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * *
6951091 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGTTAAAGATTGAAAAAATAAGTC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
6951155 -AGTTTATCGAATC-ACTTCAAATAATTATGGCCATTT-ACACAATTATCTATTTCAAATCATTA
62 TA-TTTACCGAA-CGAGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGA-ACAATTATTTATTTTAAATCATTA
* * * * * * * * * * *
6951217 CGAACTTTTCTTTTATGATAAAACAATT-GTTTTGCATCATACAAGCCTATTCGA
123 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTG-TTCACACAAGCTTATTTGG
*
6951271 AATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
6951336 TATTTACC--A--AG--CTAGT-TT-T---TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
62 TATTTACCGAACGAGTTCAAATATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGAC
* * * ** * *** * *
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* * *
6951440 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AAAT
* * * * * * * **
6951505 CCATTTACTGAA-GCAATTCAAACAATTAAGGCTATTTGAACAATTATCTATTTATAAAAAATTA
61 CTATTTACCGAACG-AGTTCAAA-TATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-TAAATCATTA
* * * * * *** *
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123 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * *
6951623 AATAAAACAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAA-AAACC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * ** * *
6951687 TATTTATCGAACTAGTTCAAATA-TATAACTATTTGAACAATT-GTAAGCTTTAAATTGTTTTAA
62 TATTTACCGAACGAGTTCAAATATTATGACTATTTGAACAATTATTTA-TTTTAAATCATTATGA
*** * ***
6951750 CCTTTTGTTCCATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAA
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * *
6951801 AATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAACAATAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
6951865 TTGTTTACCGAACTG-GTTTAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTTGAATCATTAT
61 CTATTTACCGAAC-GAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
* * *
6951929 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TATGTTTTTTTGAATGT-ACACTAGCTTATTTGG
124 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TATTTTTG--T-TCACACAAGCTTATTTGG
* *
6951984 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AAAAATAATT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
6952047 CTATTTGCCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATG
61 CTATTTACCGAACGAGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATG
* * * * * * * * * *
6952112 TCTTTTTGTCTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGG
125 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* *
6952164 AATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAT
* * * ** *
6952229 TTATCAAACGAGTTCCAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTTAAATCATTATGACTT
65 TTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCT
* * ** * *
6952294 TTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCCGTCCACACAAGCCTATTTGG
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * * *
6952342 ATTAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTCTACAATTAATAGGTAAAAATTTTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA---AGAGA--TTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * ** * * ** *
6952407 ATATTTATTGAACTAGGTCAAATAGTCAAGACTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATTGTTATA
61 CTATTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATG
** * * * * *
6952472 ACCTTTTAG-TTTGTCATATAAA-AATTATTTCAGCTCATATAAGCTTATTCGA
125 ACCTTTT-GTTTTGTCATA-AAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* *
6952524 AATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTAT-GAAAATTAACATTAAGA-A-TT--AAAAT-AA--
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT-A-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** ** * * *
6952581 TATTTAGTGAA-TTGTT-TAATAATTA--ACTATTTCAACAATTA--TATTTTGTAA--A-T-TG
62 TATTTACCGAACGAGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTT-AAATCATTATG
* *** * * *
6952636 --C-TATAAATTGATCATAAAATAA-T-TTTAT-TT---AC-AG-TTATTTTG
125 ACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * * * ** *** *
6952678 ATATAATAA-AATTATTAATATATAAACATTT-AAATAGTAAATATTTTA-ATTTGTTAAATAAT
1 A-ATAA-AATAA-TACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATA--AGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * ***
6952740 TCAAATTTA--TAACTATTTGAACA-ATTATTTA-TTTTTAAATCTTATGATTT-TTTTTTGTCA
60 TC-TATTTACCGAACGAGTTCAA-ATATTA-TGACTATTTGAA-C-AATTATTTATTTTAAATCA
* * ** * **** * * **
6952800 -TA-AATCAATTGTTTCTATTCAT--AACAAGCTTATTCAAATACA-ATAATATTAATTT--
120 TTATGACCTTTTGTTT-T-GTCATAAAACAA--TTATTTTTGTTCACACAAGCTT-ATTTGG
* * * * * * * ** * *
6952855 ATTAAATTTTGACAAAAATAAGTTA-TAAAATTT-ATAAAAATAAT-ATTGTTTTATAACAATTC
1 AATAAA-----ATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGAGATTTA-AA-AAAT-
* ** ** * ** * * ** * * * *
6952917 AATGTTAACTATTT-TTGAATAATTATTTATTTTTAAAAATCATTGTG-AC-CTTTTTTGTTTTC
57 AA----ATCTATTTACCGAACGAGT-TCAAATATTATGACT-ATT-TGAACAATTATTTATTTT-
* **** ** * * **
6952979 TAAT-A-TA--A-AAAATGTTTACTCATATAAAC--TTA--TTTG---AAATAA-AATA-TT--
114 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * * * * * * *
6953027 ACT--AAT-TTATTAA--TATTCCAAAAATT----AATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTG
1 AATAAAATAATACTAATTTATT--AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
** * ** * *
6953083 TTTACTAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGAATAACTGAACAATTATCTT-TTTCAAAACATTATGA
64 TTTACCGAACGA-GTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTTAAATCATTATGA
* * * * ** *
6953146 CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTAGTTATGTTCATGCAAGCTTATTTTG
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * * * *
6953197 AATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATTTGAAAACTTAGTAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
6953261 TGCTTT--TGAAC-ATGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTAT
62 T-ATTTACCGAACGA-GTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
* * * * * * *
6953323 -AACTGTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTCATTTGG
124 GACCT-TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* ** * *
6953376 GATAAGGTAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATC
* * * **
6953440 TGTTTA-CTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTCCAAAATGCTATT
62 TATTTACCGAA-CGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATT-TTAAAT-C-ATT
* * * * * * * *
6953504 AT---CTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGA
122 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
*
6953556 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTTATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * **
6953620 TTGTTCACCGAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAGCCATTATTTATTTCAAATTGTTAT
61 CTATTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
* * * * * * * * * ** ***
6953684 AACATTATATTTTG--GTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAAATT-TTCAA
124 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACAC-AAGCTTATTTGG
* * * *
6953735 AATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAACAAATTAAAAAGAGATTTAAAAACA-AAATTTG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTA
* *** * * * * * * * * * * *
6953799 CTTATTAAACCAATTCTAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAATC
64 TTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACC
* * *** ** * *
6953864 -TTTGTTTTATCAAAAAACAATTATTTACATTCATGCAAGCTTAGTCGG
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * * * * * *
6953912 AGTAAAATATTGAC-AAATTAATAGTA-TTCTAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAAATACATGTG
1 AATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
6953975 TTTGCCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGC-TT-TGA
64 TTTACCGAACGAGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAA-T-CATTATGA
* * * * * * * * *
6954038 CCTTTTGTTTAGTCATAAGATAATT-TTTTCAGCTCATACATGCTTATTCGA
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * *
6954089 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT----AAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * **
6954153 TATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAAGAT
60 TCTATTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
* ** * * * *
6954218 GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCGA
124 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * * * *
6954271 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAGTAATTGATAAGTTAGAGATCTAAAAAATAAGT-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * *
6954335 TAGTTTATAGAATTG-GTTCAAATAATTTTGCCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
62 TA-TTTACCGAA-CGAGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
* * * * ** * * ***
6954399 GAACATTTGTTTTGTTAT-AAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAA
124 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * *
6954451 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * ** *
6954516 TATTCATC-AA--A---C-CA-A-T-T-CCTATTTGAATACTTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
62 TATTTACCGAACGAGTTCAAATATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGAC
* * * * * * * * *
6954570 CTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAACTTATTTAG
127 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * *
6954620 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAATAGATTTAAAAAATTAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * ** * * * * *
6954685 TGTTTGCTGAA-GCAGTTCAAATGGTTAAAACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATAATG
62 TATTTACCGAACG-AGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATG
** * * * ** * * * *
6954749 ACCTTTTCATTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATATGTTTGTTT-G
125 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* **
6954800 AACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAAAAAA-AGAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATA-AA
* ** * * * * *
6954864 TCTATTTACCTAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTAT
60 TCTATTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
* * * ** *
6954929 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGA-TTCTATTCATGCAAGCTTATTTTG
124 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * * * *
6954982 AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAATTTTAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
6955046 TGTTTTCTGAAC-ACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
62 TATTTACCGAACGA-GTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATG
* * ** * * *
6955110 ACCTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTATTTTCATTCATAAAAGTTTCA-TTGG
125 ACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTT-ATTTGG
* *
6955163 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATCAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---A-GATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * ** *
6955228 TATTTATCGAGCGAGTTCAAATAGTTATAAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAA
62 TATTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGA
* * * * * * * * *
6955293 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTAGA
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* *
6955344 AATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTTGAAGATTTAAAAAACAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA---G-AGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * * * **
6955408 CTATTTACTGAATAAGTTTAAACAATCAT-ATCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGTTAT
61 CTATTTACCGAACGAGTTCAAA-TATTATGA-CTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTAT
* ** * * * * ** ***
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* ** * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * * * * ** *
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66 TACCGAA-CGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCT
* * *
6955654 TCAT-TTTT-TCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTTGG
129 T-TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * ** * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * * * * * *
6955766 TGTTTATTGAACCAATTCAAATAATTAAGCCTATTAGAATAATTATTGATTTCAAATCGTTTTGA
62 TATTTACCGAACGAGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGA
* * * * ** * *
6955831 CTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTT--CACATGCTTATTTGA
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
** *
6955880 AATAAAATAATACTCTTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTAAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--AG-A-TTT-AAAAAATAAA
* * * * * * * * **
6955944 TTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATA--GT-A--ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATG
60 TCTATTTACCGAACGAGTTCAAATATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATG
* * * * * * * * ****
6956004 ACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTGATAAAAACTTATCCAA
125 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
* * * **
6956056 AATAAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** ** ** * * *
6956120 AAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATCTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTTAT
62 TA-TTTACCGAACGAGTTCAAAT-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCA-TTAT
* * * * ** * * * ***
6956184 GATCTATT-TTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTCATAATACAAGCTTGTTCCA
124 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
*
6956236 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * *
6956301 TGCTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT
62 TATTTACCGAACGAGTTCAAATA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAAT
6956358 TGTTTTAAGC
Statistics
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TACCGAACGAGTTCAAATATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCTTT
TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGCTTATTTGG
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* * * * * *
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** * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * ** ** * * * *
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** * *** * *
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** * * *
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* * * ** * *** *
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** * * * *** * *
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* * * * * * * * * * *
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127 A--AA-A-ATTTAAAAAAATAAATATATTTATCAAAC-GAGGTCAAATAGTCAAGAC
* * ** * * *
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* * * *
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* * ** * * * * * *
6952023 TAAATAAGAGATTT--AAAAATAATTCTATTTGCCTAACCAGTTCAAATAATTATGAC
125 T-AA-AA-A-ATTTAAAAAAATAAATATATTTATCAAACGAGGTCAAATAGTCAAGAC
* * * * * ** * * * * * * **
6952079 TATTTAAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGTCTTTTTGTCTTGTTATAAAACAAATGTTTTT
1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTAGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCA
* * * ** * * * * *
6952144 GTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAG
66 GCTCACACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAA
* * * * *
6952209 ATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCCAATAGTTATGAC
131 ATTTAAAAAAATAAATATATTTATCAAACGAGGTCAAATAGTCAAGAC
* * * * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTAGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCA
* * * *
6952322 G-TCCACACAAGCCTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTCTACAATTAATAGGT
66 GCT-CACACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA---
* ** *
6952386 AAAAATTTTTAAAAAATAAATATATTTATTGAACTAGGTCAAATAGTCAAGAC
127 AAAAA-TTTAAAAAAATAAATATATTTATCAAACGAGGTCAAATAGTCAAGAC
* **
6952439 TATTTGAATTATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTAG-TTTGTCATATAAA-AATTATTT
1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAA-CTTTTAGTTTTGTCATA-AAATAATTATTT
* * * * * *
6952502 CAGCTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATT
64 CAGCTCACACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
6952552 ATGAAAATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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185 2 0.00
186 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTAGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCA
GCTCACACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAA
ATTTAAAAAAATAAATATATTTATCAAACGAGGTCAAATAGTCAAGAC
Found at i:6953217 original size:181 final size:179
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Period size: 181 Copynumber: 50.4 Consensus size: 179
6952729 TGTTAAATAA
* * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *
6952799 ATAAATCAATTGTTTCTATTCATAACAAGCTTA-TTCAAATACAATAATATTAATTTATTAA-AT
65 ATAAAACAATTG-TTCTATTCAT-ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * *
6952862 TTTGACAAA--AATAAGTTATAAAATTTATAAAAATAATAT-TGTTT--TATAACAA
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTA-AAAAATAA-ATCTGTTTACTA-AACAG
* * * *
6952914 TTC-AAT-GTTA--ACTATTTTTGAATAATTATTTATTTTTAAAAATCATTGTGACCTTTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTA--TTTGAACAATTATCTA--TTT-CAAATCATTATGACC--TTTTGT
* * * * * * *
6952975 TTTCTAATATAAA-AAATGTT-TACTCATATAAACTTA-TTTGAAATAAAATATTACTAATTTAT
59 TTTGTCATA-AAACAATTGTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
6953037 TAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACTAAACATG
122 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA-G
* ** * * *
6953096 TTCAAATAGTTATGAATAACTGAACAATTATCTTTTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
6953161 TAAAATAATTAGTTATGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATT
66 TAAAACAATT-GTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * *
6953225 TGAAAACTTAGTAAGTAA-A-AATTTTAAAAATAAATATGCTTT--TGAACATG
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* * * * ** *
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* * *
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* * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAAT-C-ATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
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* ** * * * **
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* * * * * ** * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * * * * *
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* * * * * **
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128 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AG
* * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T-CATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
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** * *
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126 ATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAA--TTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AG
* * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
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66 TAAAACAATTGTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * **
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128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAAT-TAAAAAATAAATCT-GTTTACTA-AA-CAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *** *
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66 TAAAACAATTGTTCTAT--TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
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129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAG
* * * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
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* * * * * * *
6954649 TAAAAATTAATAACTAATAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTGCTGAAGCAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAG
* ** * * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
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66 TAAAACAATTGTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
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128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATA-AATCTGTTTA-CTAA-ACAG
* * * *
6954881 TTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
6954946 TAAAACAATTGATTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTG-TTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * *
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*
6955061 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
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65 ATAAAACAATTGTTCT-ATTCATACAAGCTT-ATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
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128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GAATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AG
* * * * ** *
6955243 TTCAAATAGTTATAAATATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
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** * * *
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129 TC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AA-ACAG
* * * * * * * ** * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** ** *** *
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65 ATAAAACAATTG-TTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * *
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129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAG
* * * * ** * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTC
* * * * * * ** *
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65 ATAAAACAATT-GTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
6955729 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATATGTTTATTGAACCAA
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAG
* * * * * * * * *
6955781 TTCAAATAATTAAGCCTATTAGAATAATTAT-TGATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** *
6955845 ATAAAATAATTGTT-TCAGTTC--ACATGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTCTTTTATTAACA
65 ATAAAACAATTGTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
6955906 -TTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAAG
127 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-ATT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AG
* ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * **** * * *
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66 TAAAACAATTGTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** * ** * **
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130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAG
* ** * * *
6956136 TTCAAATAATTATCTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATGATCTATT-TTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ***
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65 ATAAAACAATTGTTCTATTC---ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * **
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127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AG
* * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG---
* *** * * * * * ** * ** * *
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63 TC-ATAAAACAATTGT-TCTA-TTCATACAA-GCTTATTTTGAATAAAATA-AT-ACTAATTT--
* * * ** * * * * * **** *
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120 -AT-TAATATTTC-AA-AAATTAATAAGT-AAGAGAATT-A-AAA-AATAAATCTGTTTACTAAA
*
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177 -C-AG
* * * * *
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1 TT-C--AA-ATAGTT-ATGACTA-T-TTGAAC-A-AT-------TATCTATTTCA-AATCATTAT
* * * * **
6956569 GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-CCTCAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAAT
49 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT
* * * * *
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112 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGAATTAAAAAATAAATCT-GTTTACT-
**
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* * * ** ** * * *
6956702 TTCAAATAATTAT-AGTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTATTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *** * *
6956766 ATAAAACAATTATT-TTTCATCATACAAACCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATAT
65 ATAAAACAATTGTTCTAT--TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
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128 TTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAG
*** * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
6956936 TAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTT
66 TAAAACAATTG-TTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * * * * *
6957001 TGAAAATTGATAA-CAAGGAGATTTAAAAAGTAAACCTATTTGCTGAAATAG
130 CAAAAATTAATAAGTAA-GAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAG
* * * * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT--CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * ***
6957116 CATATTACAATTGTT-T-TTCATCATTCTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 CATAAAACAATTGTTCTATTCAT-A--CAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
6957179 CTTTAAAAAATTAAT-A--AA-AG-ATT-TAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAG
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AG
* * * * ** * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * *
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66 TAAAACAAT--TGTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ** *
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129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATT-AAAAAAT-AAATCTGTTTACTAAAC-AG
* * * * *
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1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
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65 ATAAAACAA-TTGTTCT--ATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * *
6957537 ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAATTCTGTTTACCTAACCAG
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAG
* ** * * * *** * * * ****
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1 TTCA-AA-TA-GTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTT-CAAATCA-T-TA-TGACCTTTTG
* ** * * ** ** * * *
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58 TTTTGTCATAAAACAATTGTTCTA-TTCATACAA-GCT-TATTTTGAATAAAATAAT-A-CTAAT
* * *** ** * **
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118 TTAT-TAATATTTCAAA------AATT-A-ATAAG--TA-AGAGAATTAAAA-AATA--AATCT-
* * * *
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* * ** ** * * * * * * * ** * ***
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTT--CAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
6957848 GACTATATGAACAATT-ATCTATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGT--
62 GTC-ATA-AAACAATTGTTCTA-TTCATA-C-A-A-G--C--TTATTTTG-AATAAAATAA-TAC
** * * *** * * * ** *
6957910 TTTTTTGAATTCATA-CTCGCTTATTTGGAATAA--AATA-AAATAAATTTATTAAT-T-TTT-C
114 TAATTT--ATTAATATTTC-AAAAATT--AATAAGTAAGAGAATTAAA-AAATAAATCTGTTTAC
*
6957968 -AAA-AA
173 TAAACAG
* * * ** * * * *
6957973 TT--AATAAG-TAAGA-GATTTAAACAACAATTCTGTTTACCTAA-CTAGTTAAT-A-GTTATGA
1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTT--CAAATC-A-TT-ATGACCTTTTG-
* * * * * * *
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58 TTTTGTCATAAAACAATTGTTCTA-TTCATA-CA--A-G--C--TTATTTTG-AATAAAA-TAAT
** ** * * * * * *
6958091 GTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTA-ATATTTTAAAAATTA
112 ACTAAT-TT-AT-TAA-TAT-TTC---A-AAAAT--TAATAA-GTA--AGAGA-ATTAAAAAATA
*** * *
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162 A-ATCTG-TTT---ACTAAA-C-A-G
* * ** *
6958181 TATCAAATAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTT
1 T-TCAAAT-AG-T----TA----TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * * *
6958246 TTGTTCTATTATAAAATAATTCTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAGTTAAAATAATACTAAT
55 TTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGA-ATAAAATAATACTAAT
* * * * * ** *
6958310 TTATTAATATTTTAACAACTGATAAGTAA-AAAATTTAAAAGGTAAATATGTTTACTAAACTAG
118 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AG
* * * * ** *
6958373 ATCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
6958438 TAAAAAAATTATTTTAATTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA--
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* * * * * *
6958500 TCATGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAACAAATGAATCTGTTTGCCAAACAAG
129 TCA--AAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AG
* * * * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
6958618 ATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATA-
65 ATAAAA-CAATTGTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * *
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128 TTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AG
** * * *** *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * *
6958800 TAAAATAATTGTTTCTA-TCATACATGCTTATTCCGATTAACAA-AATATTAATTTATTAATATT
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** * * * *
6958863 TTGATAATTAATAAGT-AGA-ACATTTGAAAAATAAATATGTTT-TTCAAACAAG
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-A-TTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AG
* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
6958979 -ATAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 TA-AAACAATTG-TTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
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129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGT-TTACTAAACA-G
* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
*
6959159 TAAAACAATTGTT-TCAGTTCATATAA-CTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
66 TAAAACAATTGTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * **
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128 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGT-TTACTAAACA-G
* * * *
6959273 TTCAAATAGTTATGACTATCTT-AAAAATTATCTATTTTAAAACATTATGA-CTTTTGTTTTCTC
1 TTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** *
6959336 ATAAAACATTTGGTTGTATTCATGTAAACTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATT-GTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * * *
6959400 TTCAAAAATTAGTAAGT-A-A-AA-TATAAAAATAATTATATTTTCTGAACACT
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*
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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*
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* * ** * * * * * *
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* *** * *
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* * * * * *
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* ** * * * *
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* * *** *
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*
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356 AATAG
* * * ** * * *
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* * *
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* * **** *
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* * * * *
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* * * * * * ** * *
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253 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
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318 -GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * ** * * **
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT--CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *** * * * *
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* * * * * *
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127 TTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* * * * ** * * * * * **
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192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCATT
* * * * * *
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255 CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** * * *
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319 A-GATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * *
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1 TT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * * * * *
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* * * * *
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127 TTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATT-AGTTTA-TTGA--A---C---A--A-G-TTC--AA
* ** * * * * * * *
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176 A-TAATTA-TAA-CCATTTGAACAATTA-TCTATTT-CAAATC-ATT-ATGAACTTTTG-TTTTG
* * * ** * * * *
6957673 T--TGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTT
233 TCATAAACAATTGT-T-TTTC-ATTCA-TACAAGC-TTATTCG--A-AATA-AAA---------T
* *
6957736 CATAC-AAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAATTAAG
280 AATACTAA-TTTA--T----T--AAT-AT--T--TC-AA-AA-ATT---------AATAAGTAAG
* * * ** * * * *
6957800 AGAATTAAAAAAATAATTTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAT
319 AG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * ** *
6957843 TTAAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
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* * *** * * * * *
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65 --TTATTT-CATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * * * **
6957973 TTAATAAGTAAGAGATTTAAACAACAATTCTGTTTACCT-AACTAGTT--AATAGTTATGATTAT
127 TTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATT-AGTTTA-TTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCAT
* * * *
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190 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCAT
* * * *
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254 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
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318 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * * *
6958201 TTTTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** * * * * *
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* * * ** * * * * * * * *
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130 ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTA-GTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTTGA
* ** * * *
6958396 ATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-ATTTTAATTCA
194 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCATTCA
* * *
6958459 TATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA--TCATGAAAATTAATAAATAAGA
257 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGTAAGA
* * ** *
6958522 GATTTAACAAATGAATCTGTTTGCCAAACAAGTTTAAATAA
320 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * *** * **
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1 TTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
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* * * ** * *
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126 ATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCA
* * *** * *
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189 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTC
* * * ** *
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252 ATTCATACAAGCTTATT-CGAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
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315 TAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * ** *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAA
* * ** * * *
6958987 TTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAGAAA-T
65 TTATTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * * * * * * * *
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129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* * * * * *
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192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCA-TT
* * * * *
6959178 CATATAA-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAGAAA-TAATGAGAAAG
255 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
6959240 AGAATTAAAAAATGAATCT-TGTTACCGAACATGTTCAAATAG
319 AGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * *
6959282 TTATGACTATCTT-AAAAATTATCTATTTTAAAACATTATGA-CTTTTGTTTTCTCATAAAACAT
1 TTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
6959345 TTGGTTGT-ATTCATGTAAA-CTTATTTTG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAA
65 TT-ATT-TCATTCAT-AAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * ** * *
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126 ATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTAGT-TTAT-TGAACAAGTTCAAATAATTATAACCA
*
6959467 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAA-T-TTTTTCT
189 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTGTTTTTC-
* * * ** * *
6959530 GTTCATAAAAGCGTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTA
252 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
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317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * *
6959639 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * * *
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66 TATTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATA-ATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * * ***
6959769 TAATAAGTTGGAGATTCAAAAAATAAATTTA-TTCACCGAACAAGCTCAAATAGTCATGTGCATT
128 TAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AA-TTAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATT
* * * ** * * * * *
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** * *
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254 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
6959958 -A-ATTTAAAAACTAAATCTGTATATCGAACTAGTTCAAATAA
318 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * *
6959999 TTATGA-TTTTTGAGCAATTATCTATTTCAAATTGTCATGA--TATTTGTTTTATCATAAAGCAA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * * *
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65 TT-ATTTCATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAT-ATTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * *
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126 ATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTAGTTTATTG---AA-CAAGTTCAAATAATTATA-A
* * * * * ** * * *
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186 CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGT-TTTGTCATAAACA-ATTGTTT
* **
6960242 TT-AGTTCATACATGCTTATTC-ATAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAATTAA
249 TTCA-TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
** * * * ** * *
6960304 TAAACAACAAATTTTACAAAAA-AAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAAAAG
311 TAAGTAAGAGA-TTTA-AAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * *** *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
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66 TATTTC-ATTCATAAAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * **
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* * ** * *
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192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCATTC
* * *
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256 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * *
6960669 GTTTAAAAAATAAAT-T-TATT-T------A--TTGAATCG
321 ATTTAAAAAATAAATCTGT-TTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * * * * *
6960699 --AT-TCTTACTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTGTAACCTTTTGTTCT-ACTGTAAAATA
1 TTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACA
* * * * * * *
6960760 A-TAGTTTCAGTTTATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TCCAAAAA
64 ATTA-TTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *** * * *
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* * * *
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* * * *
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252 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
** * * * *
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317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAAGTTTAAATAG
* * * * ** * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
* * * ** * * *
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* * * * * * * *
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** * ** * * **
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* * * * * *
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318 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAG
* * *
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* * * * * * * * *
6961481 TTTTTTTGAATTCATAATAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTAATTAATATTTTAAAAAT
65 -TTATTT-CATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * **
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128 TAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAA-T-TAGTTTA-TTGAA-CAAGTTCAAATAATTATAACCA
* * *
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189 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCA
* * * * *
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253 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
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318 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * * *
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* * * **
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* * * * * * *
6961886 TGATAAG-TA-AAATTTAGAAAACAA--A-TATGTT--AC-----CAAACTAGA-T-CAA--A--
128 TAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTAGTTTATTGAACAAGTTCAAA-TA-ATTATAACCATT
* * * * * * * *
6961933 TGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTTT-TTA
191 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCAT-
* * * **
6961996 TCATACAAGCTTATTCG-GATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTT---TGA-TAATCAA-TA
254 TCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTA
* ** ** * *
6962055 AGAGATTTAAAATATAAATGAGTTTATTGATC-AGTTCAAATAG
317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
** * *
6962098 TTAT--CTATTT---CAA--ATC-ATTT----T-G--AT---CTTTTGTTTAATCATATAATAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * * * * *
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66 TATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
** * * * **
6962209 AATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTA-TTT-TTCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTGT
129 AATAAGTTAGAGATTT-AAAAAAT-AAT-TAGTTTATT-GAACAAGTTCAAATAATTATAACCAT
* * * *
6962272 TTTAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT-AG
190 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCA-
** * * * * **
6962335 CCCATAGAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAA
253 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
6962400 GAGATTTAAAAAATAAAAT-AGTTTACTGAATCAA-TTCAAATAA
318 GAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * *
6962443 TCATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTTAAATCGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * *
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66 TATTTCATTC-A-TAA-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * * **
6962571 TAAT-A---AGAGATTTAAAAAAGAAATATGTTTGTTGATCCAGTTCAAAGAGTTATGATTATTT
128 TAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTA-GTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* * ** * * * * * * * * *
6962632 GAACAATTATTTATTTCAGATTGTTAT-AACCTTTGCTCTATTATAAAATAATTATTTAT-GTTC
192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCATTC
* * * * *
6962695 ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTA
256 ATACAAGCTTATTCGAAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
** * * * *
6962759 AGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGTCGAACTAG-TTCAATAG
317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * *
6962802 TT-TAGACTATATGAAAAATTATTTATTTCAATTTGTTATAATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAA
1 TTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
6962866 TTACTTAAGGTCATAGAAGCTTAATC-AGAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
65 TTATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
6962930 T--T-A-TAAGAGATTTAGAAAATAATTCTA-CTT-GTGAAACTAGTTTAAATAATTATAACTAT
128 TAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAA-T-TAGTTTATTG-AACAAGTTCAAATAATTATAACCAT
* * * *
6962989 TTGAACAATTATTTATTTCAAGTCATTAT-AACTTTTCGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-G
190 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTT-GTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCA
* ** * * * * * *
6963052 TTAATTTAAGTTTGTTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAA
253 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* **
6963117 GAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTGCCAAA-ATCA-TTTCAAATAG
318 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACA--AGTTT-AAATAG
* * * * * * * * * *
6963161 TTTTGATTGTTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAATAAG
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
** * * *** ** * * *** * *
6963226 TGGTTGT-GTTTATTCTATTTTATTCAAAATTAAATAATGCAAATTTAATAATATTTCAAAACTT
65 TTATT-TCATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
*** * * * * * * * * *
6963290 AATAACCAAGAAAATTTAAAAAA-AA--AATTAAATGAACCAA-TTTAAATAGTTAAAACTATAT
129 AATAAGTTAG-AGATTTAAAAAATAATTAGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* ** * * *
6963351 AAATGATTCTCTATTTCAAATC-TCTATGAA-TTGATCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT--
192 GAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGAACTT-TTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTT-TCA
* * * * *
6963412 TT-GTACAAGCTTATTC-ATACTAAAAAAATACTAATTTCA-TAATATTTAAAAAAACTAATAAG
253 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTT-CAAAAATTAATAAG
* * * *
6963474 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC-A-TTTCAAATGG
315 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTT-AAATAG
* * * * * * *
6963520 TTAAGACTATTAGAATAATTA-C-A--TCAAATCATTTTGACCATTTGTTTAGTCATAAAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
6963581 TGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATT
66 TATTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
** * * * * * **
6963644 AATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATTGAATAAATTTAAATAGTTATTATTATTT
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* * ** ** * *
6963708 GAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTAT-AACCTTTTAATTTGTCGTAAAACAA-T-TATTTCAAT
192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTC-AT
* * * *
6963770 TAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-GAAATTAATAAGTA
254 TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
6963833 AAAAAGTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAATC-AGTTAAAATAA
317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAA-CAAGTTTAAATAG
* * * * * *
6963877 TTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCATATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT-AAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
* ** * * * *
6963941 TGTTTTTTTTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAAT
65 T-TATTTCAT-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
** * * * *** * * *
6964006 TAATTGGTAACAGATTTAAATAATAAATCTA-TTTACCAAACCAGTTCAAATAATAATAACTATT
128 TAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATT
* * ** * * * *
6964070 TGAACAATTATCAATCTCAAATTGTTA--AAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-AA
191 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACT-TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCAT
* * ** * * * * *
6964132 TCATAGAAACTTATTC-AGTTAAAAACAATGCTAATTTAATAATA-ATCTGAAAA-T--TAA-TA
254 TCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* ** **
6964191 AGAGATTTAAAAAATAAATGTG-TTCGCTAAATTAGTTTAAATAG
317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAG
** * ** * * * * *
6964235 TTAAAACAATTACAATAATTATCTATTTCAAATCATTCA-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * *** * * **
6964299 TTGTTTCATGTTTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATGAACATTTTGAAAATT
65 TTATTTCAT-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
** * * *** * * * ** * *
6964364 AATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAATTTTAAATGGTTATGACTATTT
129 AATAAGTTAGAGATTT-AAAAAAT-AATTAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* * * * * *
6964429 AAACAATTAT-T-TTTATAAATTCCTTATGACCATTTGTTTTGACATAAAACAATTG--TTTCAA
192 GAACAATTATCTATTT-CAAA-TCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTC-A
* * * *
6964490 TTCATA-AATGGTTA-TC----CAAAAT-A-A--AA---A-T--GA-TT----AA-TAATCAG--
253 TTCATACAA-GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * **
6964531 -GAGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTCATGTAG
317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * ** * * *
6964574 TTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTACAAGCTTTTATTTTGTCATAAAATAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
6964639 TGTTTAAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
66 TATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * ** ***
6964703 AATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTA-TTTGTCGAATTAGTTCAAATAATTATGGTCATTT
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* ** * ** * * * *
6964767 CAGTAATTATGTATTTCAAATTGTTATCACCTTTTGTTTGGTCATATAA-AATTTGTTTTTTA-T
192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA-AACAA-TTGTTTTTCATT
* * *
6964830 CATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAGTAAGTAAG
255 CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * *
6964894 AAATTAAAAAAATAAATATGTTGACCGAACCAGTTCAAATAG
319 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * *
6964936 TTATAACTATTTAAACAA-T-TCTATGCTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTGTGTCATAAAATA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT--TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
6964999 ATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAACAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAA
64 ATTATTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * * ** * *
6965062 TTAATAA-CTAGGGGATTTAAAAGATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-TTCAAATAATGA-AGACT
127 TTAATAAGTTA-GAGATTTAAAAAAT-AATTAGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAATTATA-ACC
* * * * ** * * * *
6965124 ATATGAATAGTTATCTAATTCAAATCATTATGTCCTTTTGTCTTATCATAAA-AGAAT-TTTGTC
188 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAACA-ATTGTTTTTC
* * * *
6965187 AATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
252 -ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
6965251 TAAGACATTTAAAAAACAATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAA
315 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * *
6965297 TTAT-ACTATTTGAACAGTTATATATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA
* * * * * * * * * *
6965361 TGT-TTTTATTCGTATAAGTTTATTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAACT
65 T-TATTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * ** * * *
6965425 AATAAG-T---GATTTTAAAAATAAATCT-GTGCATTAAACTGGTTCAAATAGTTATGACTATTT
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
** * * * * * * *
6965485 GGGCAATTATTTACTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCT-ATT
192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCATT
* * * ** * * *
6965548 CATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAA
255 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * *
6965613 AATTTAAAAAATAGATATGTTTACCACACTAGATCAAATAA
320 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * *
6965654 TCATGACAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTATCACAAAATAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
6965719 TGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTA-ATCTAAAAAT
66 TATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * * * * * ** **
6965782 T-ATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGACT-GTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTTT
128 TAATAAGT-TAGAGATTTAAAAAATAATTAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* * * *
6965844 -AACTAATTATCTATTTGAAAT-AGCTAT-AACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-TTTTTCT
192 GAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTC-
* * *
6965905 AATCAT-CTAAGCTTACTAC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--TA
252 ATTCATAC-AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATA
* * * *
6965963 AG--A-AGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATTG
313 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * *
6966007 TTATGGCTATTTGAGCATTTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * * * * * * ** *
6966072 TATTTTTGTTCACACAAGTTTATTC-AGATCAAAACATTATTAATTTATAAATATTTTGACAATT
66 TA-TTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *** ** * *
6966136 AATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATA-TTTACCAAACAAGTTCAAATGGTCATGAA-TATT
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTAT-AACCATT
* * * *
6966199 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTG--TTTCA-
191 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTC-AT-AAACAATTGTTTTTCAT
* * * * *
6966260 T-AT--AAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAA
254 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
6966321 GAGAATTAAAAAA-AGAATATGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATAG
318 GAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * *
6966364 TTATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * ** * ***** * * **
6966428 TTGGTTCTGTTCATGCAAGATTATT-----T-TGGGCA-ATT-ATCTATTAACATTTCAAAACCT
65 TTATTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * * * * *
6966485 AATAAG-T---GATTTTAAAAATAAATCT-GTGCA-TCACACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGA-ACAAGTTCAAATAATTATAACCATT
** * * * * * * *
6966544 TGGGCAATTATTTACTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCT-AT
191 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCAT
* * * ** * * *
6966607 TCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAA
254 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * *
6966672 AAATTTAAAAAATAGATATGTTTACCACACTAGATCAAATAA
319 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * * *
6966714 TCATGACAATTTGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTATCACAAAAGAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
6966779 TGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTA-ATCTAAAAAT
66 TATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * * * * * ** **
6966842 T-ATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGACT-GTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTTT
128 TAATAAGT-TAGAGATTTAAAAAATAATTAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTT
* * * *
6966904 -AACTAATTATCTATTTGAAAT-AGCTAT-AACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTG-TTTTCT
192 GAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTC-
* * *
6966965 AATCAT-CTAAGCTTACTAC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--TA
252 ATTCATAC-AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATA
* * * *
6967023 AG--A-AGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATTG
313 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * *
6967067 TTATGGCTATTTGAGCATTTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * * * * * * ** *
6967132 TATTTTTGTTCACACAAGTTTATTC-AGATCAAAACATTATTAATTTATAAATATTTTGACAATT
66 TA-TTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *** ** * *
6967196 AATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATA-TTTACCAAACAAGTTCAAATGGTCATGAA-TATT
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTAT-AACCATT
* * * *
6967259 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTG--TTTCA-
191 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTC-AT-AAACAATTGTTTTTCAT
* * * * *
6967320 T-AT--AAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAA
254 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
6967381 GAGAATTAAAAAA-AGAATATGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATAG
318 GAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * *
6967424 TTATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * ** * ***** * *
6967489 TGGTTCTGTTCATGCAAGATTATT-----T-TGGGCA-ATT-ATCTATTAATATTTCAAAAACTA
66 TATTTC-ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** ** ** * * *
6967546 ATAAG-T---GATTTTAAAAATAAATCT-GTGCATCAAACTGGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
130 ATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTTG
** * * * * * * * *
6967606 GGCAATTATTTACTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTCTATTATAAAATAACTGTTTCT-ATTC
193 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCATTC
* * * ** * * * *
6967669 ATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAA
256 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * *
6967734 ATTTAAAAAATAGATATGTTTACCACACTAGATCAAATAA
321 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * * *
6967774 TCATGACAATTTGAATAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTATCACAAAAGAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
6967839 TGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTA-ATCTAAAAAT
66 TATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
** * * * * * * ** **
6967902 T-ATAAGAAAGAGATTTAAAAAATGACT-GTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTTT-
128 TAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTTG
* * * *
6967964 AACTAATTATCTATTTGAAAT-AGCTAT-AACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTG-TTTTCTA
193 AAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTC-A
* * *
6968026 ATCAT-CTAAGCTTACTAC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--TAA
253 TTCATAC-AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* * * *
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* * * * * * * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * * * * ** *
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* * * *** ** * *
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129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTAT-AACCATT
* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * ** * ** ** * *
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* ** ** ** * * *
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** * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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321 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * * *
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1 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
6968898 TTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTA-ATCTAAAAA
65 TTATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * * * * * ** **
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* * * *
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* * *
6969084 TAATCAT-CTAAGCTTACTAC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--T
252 -ATTCATAC-AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAAT
* * * *
6969142 AAG--A-AGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATTG
312 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * *
6969187 TTATGGCTATTTGAGCATTTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * * * * ** *
6969252 TATTTTTGTTCACACAAGTTTATTC-ATATCAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGACAATT
66 TA-TTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *** ** * *
6969316 AATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATA-TTTACCAAACAAGTTCAAATGGTCATGAA-AATT
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTAT-AACCATT
* * * *
6969379 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTG--TTTCA-
191 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTC-AT-AAACAATTGTTTTTCAT
* * * * *
6969440 T-AT--AAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAA
254 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
6969501 GAGAATTAAAAAA-AGAATATGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATAG
318 GAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * *
6969544 TTATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * ** * *
6969608 TTGGTTCGGTTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAAT-TCAAATTTATTAATATTTCAAAAA
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* * ** * * * * * **
6969671 TTAACAAG-TA-AAATTTTAAAAAGGAAATATGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTT
127 TTAATAAGTTAGAGA-TTTAAAAAATAATTA-GTTTAT-TGAACAAGTTCAAATAATTATAACCA
* * *
6969733 TTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-
189 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTGTTTTTC
* * * * * *
6969796 ATTTATAAAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGT-
252 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
6969860 AGAAGATTTAAAAAATATATATGTTTACCAAGCAAGTTCAAATAG
317 AG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * * *
6969905 TTATGACTATTGGAACAATTATTTATTTCAATTCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACCAA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAA
* * ** * * *
6969970 TTGTTTCTATTCATACAATTTTATTCGAAATAGAATAATACTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAAT
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* ** *
6970034 TAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTACCGAACAAGTTTGAATGGACATACAAGTT
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* ** * *
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** ** * *
6970162 AAAACAATTGTTTTGT--TT-ATGTAAAATTATTCCG-AATAAAATAATACTGATATATTAATAT
237 -AAACAATTGTTTT-TCATTCATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * * *
6970223 TTTGATAA-T--TAA-TAAGAGATTTACAAACA-AAATCTATTTACTGAAA-TAGTTCAAATAT
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*
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** * * * *
6970335 --GCTT-ATT--T----G---ATTC------CAATAATACTAA-TTAATAATATTCCAAAAA-T-
65 TTATTTCATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** * * * * * * *
6970379 -T-AGTAAGAGATTTAAAAAAATAAAAATGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAG
130 ATAAGTTAGAGATTT-AAAAAATAATTA-GTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCATTTG
* * * * * * *
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* * * * *
6970504 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAG
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* * * *
6970568 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACACGTTGAAA-AG
319 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAG
* * * *
6970609 ATT-TGACAATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
1 -TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
6970672 ATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATA-GAACTTTAGTAATATTTCAAAAA
64 ATTATTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAA-TTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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254 -TCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
** ** * *
6970922 AGAGATTTAAAAAATAAATGGGTTTGCCGAATCAA-TTCAAATAG
317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAG
* * * * * * * * *
6970966 TTAAGACTATTGGAATAATTATCTATTTCAATTCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAAT
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * *
6971031 TATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-GTTCAAAAAATT
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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250 TCA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
** * * * *
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** * * * * * * ** * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * *
6971519 TTTGAACAATTATCTATTTCAATTTATTAT-AACATTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCT-G
189 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTCA
* * * *
6971582 TTCATACAAGCTTATAT-GAAATAAAATAATAATAATTTA-GAATA-TTCTGAAAATTAATAACT
253 TTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * * *
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* * ** * ** *** * * * *
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*** * * * * *** * * * ** *
6972177 AATAACCAAGAAAATTAAAACATAAATCTA-ATTGCCGAACTAA-TTTAAATAGTTAAAATTATA
129 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TAGTTTATTGAAC-AAGTTCAAATAATTATAACCATT
* ** * * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * *
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317 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTT-AAATAG
* * * * * * * * *
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* * * * * *
6972474 TTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAAT
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** ** * * * **
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* * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * *
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* ** * * *
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* * ** *
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252 ATTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * *
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** * * * * * * * * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACA
* * * * *** * * **
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* ** * * *** * ** * *
6973254 TCAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAATGGTTATGACTAT
127 TTAATAAGTTAGAGATTT-AAAAAAT-AATTAGTTTATTGAACAAGTTCAAATAATTATAACCAT
* * * ** * * *
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*
6973381 ATTCATAAAAGCTTAT
252 ATTCATACAAGCTTAT
6973397 CTAAAATAAA
Statistics
Matches: 15449, Mismatches: 3578, Indels: 2530
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Matches are distributed among these distances:
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309 2 0.00
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** * *
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** ** * *
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*
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* * * * * * *
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* * ** * * * * *
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** * * * *
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** * * ** ** *
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** * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* ** * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * ** * * *
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443 TGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATA
* *
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* * * ** * * * *
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* ** ** *
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** * * ***
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* * * * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * *** * ** * ** *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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*
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* * * ** * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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188 T-AAAAATAAATATGTTTCTC-AAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** *
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* * * * * **
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440 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAA-GCTTATTTTGAATAAAA
*
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504 TAATACTAATTTATTAATATTAAGAAATTAA
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1 TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAAT
* * * ** * * **
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65 TATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* * ***
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129 CTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAA
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255 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGA-AA
* * * * * * * * *
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318 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTG
* * * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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510 TAATTTATTAATA-T-TAAGAAATTAA
* * * * * * * *
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1 T-A--A-GAGATTTAAAA-ATAAATCTATTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * *
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185 ATTTAAAAATA-AA-TATGTTT-CTCAAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATC
* * * *
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* * * * * * *
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310 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAA
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* * * * * * * *
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440 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAAT
**
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505 AATACTAATTTATTAATATTAAGA-AA-T--TAA
* * * * * * * * * * * *
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1 -TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAA
* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * ** *
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* * * **
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* * * * * *
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1 TAAG----AGATTTAA-AAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
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* * * * *
6966262 TAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAA-
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* * * * *
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187 TTAAAAATA-AATATGTTT-CTCAAACT-AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * ** ** ** *
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249 TTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTTTCAATTCATATAAGCTTATT
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** * * * ** * *
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378 ATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * *
6966571 TGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAAT
443 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT
**
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508 ACTAATTTATTAATATTAAGA-AA-T--TAA
* * * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * *
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128 GCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAATTAATAAGTAAA-AAATTTA
* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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** * * * *
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377 AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * ** *
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442 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAAT-AAAAT
* * * **
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505 AATACTAATTTATTAATATTAAGA-AATTAA
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6967198 TAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATGGTCATGAATATTTGAA
1 TAAG----AGATTTAA-AAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
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* * * * *
6967322 TAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAA-
125 CAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-AAAAT
* * * * *
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187 TTAAAAATA-AATATGTTT-CTCAAACT-AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * ** ** ** *
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249 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTTTCAATTCATATAAGCTTATTT
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* * * * * * * * *
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444 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA
**
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509 CTAATTTATTAATATTAAGA-AA-T--TAA
* * * * * * * * * * * *
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1 -TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAA
* * * * * * * *
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** * * * * * *
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128 GCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAATTAATAAGTAAA-AAATTTA
* * * * * ** *
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190 AAAATAAAT-A-TGTTT-CTCAAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-AATTATCTATT
* * * * * * * *
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** * * * *
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377 AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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**
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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247 TATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTTTC-AATTCATATAAGCT
* ** * * *
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309 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAG-AGATTTAAAA
* * * * * * * *
6969155 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATTGTTATGGCTATTTGAGCATTTATTTATTTCAACT
373 AATGAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * *
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* * **
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500 AAAATAATACTAATTTATTAATATTAAGA-AATTAA
* * * * * **
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1 TAAG----AGATTTAA-AAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
6969383 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTG----T-TTCATA
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* * * * *
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125 CAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-AAAAT
* * * * *
6969506 TTAAAAAAAGAATATGTTTACT-GAA-TAAGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTATCTA
187 TTAAAAATA-AATATGTTT-CTCAAACT-AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * ** ** **
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249 TTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTTTCAATTCATATAAGCTTA-T
* * * * * * *
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312 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATG
* * * * * * *
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377 -AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * **
6969760 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTT-TTTCAAAATAAAAT
441 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-TGAATAAAAT
*
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505 AATACTAATTTATTAATATT--AAGAAATTAA
* * * * *
6969855 TAAGTAGAAGATTTAAAAAATATATATGTTTA-CCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTGGA
1 T-A--AG-AGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * *
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** * * * * *** *
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123 TACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAAAA
* * * ** *
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186 TTT-AAAAATAAA--TA--T---------GTTT--CT---CAAACTAGTTCAAATAGTCATAACT
* ** * * * *
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232 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTTTCA
* * * ** * * * *** *
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296 ATTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT
* * * *
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360 AAGAGATTTA-AAA-AATGAATCTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* *
6970298 ATTATCTA--TC---TCA--A--A--------TCTGT-AT-----GA---TTT-T-TTCATACAA
422 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAA
* ** * *
6970335 GCTTA-TTTGATTCCAATAATACTAA-TTAATAATATTCCAA-AAATTAG
487 GCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAGAAATTAA
** * * * ** * *
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1 TAAGAGATTT--AAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAA
* * * * * * * * **
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** * * * * * *
6970512 CTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAA
129 CTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAAAAATTT-A
* * * * * *
6970576 AAAATAAATCTATTTAC-CAAAC-ACGTTGAAA-AGAT-TTGACAATTTGAACAATTATCTATTT
190 AAAATAAATATGTTT-CTCAAACTA-GTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
6970637 -AAAGTCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-AGTTCATAAAAACTTATTTG
252 CAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTTTCAATTCATATAAGCTTATTTG
* * * *** * *
6970700 AAATAAAATAATA-GAACTTTAGTAATATTTCAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAACTAAA
315 AAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATGAA
**** * * ** * * * * * *
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379 -TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
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* * * *
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505 AATACTAATTTATTAA-TATTAAGAAATTAA
*** ** * * *
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1 TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAA
* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * *** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
6971784 TAGAACAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAACTT--T--ATAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCT
318 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATGAA-TCT
*** ** * * * * * *
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* * * *
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** ** * * * * * * *
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* * * * * * *
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** ** * * * * * **
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* * * * * * * * * * * ** * *
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189 AAAA-ATAAATAT-GTTTCTCAAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * ** ** * *
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* * ** * * **
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* * * * * * * * *
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379 TCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * *** *
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*
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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251 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTTTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGA
* * * *** * * * *
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* * * **
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** * * * * * * *
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*
6973051 ATACTAATTTAATAATATTCTAA-AAATTAA
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* * * * * * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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126 AAGCTTATTTGAATA-AAAT-AATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAAAAATT
* * * * * * * *
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188 T--AAAAATAAATATGTTT-CTCAAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * *
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*
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314 GAAATAAAA
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*
6959304 CTATTTTAAAACATTAT
1 CTATCTTAAAACATTAT
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CTATCTTAAAACATTAT
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Indices: 6960707--6976257 Score: 5213
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * **
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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** * ** * * * * *
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*** * * * *
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* * * * * ** * * *
6961375 AAATTAAAAAAAAAATTTGTTTGCCTAACCAATTCAAATATTTAAGACTAT
127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
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127 GATTTAAAAAATAAATCTAT-TTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
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129 TTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * ** * * ** ** ** *
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1 TT-GAA-CA-ATT-ATCTATT-TCAAATCAT-T-ATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTG
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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1 TTGA-ACAAT-TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
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124 AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-AT
* * * * * * * * *
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65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAT
* * * * ** * * * * *
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130 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * ** * * * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * *
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* * * * * *
6962758 AAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGTCGAACTAGTTC-AATAGTT-TAGACTAT
123 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTAT-GACTAT
* * * * ** * * * ** * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * * * * *
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65 TCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * * * * * * * *
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129 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * * * * *
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65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAG
** ** * * * * * *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA----TTGTTTT
* * * * * * * *
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123 AAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * ** * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
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6963412 -TT-GTACAAGCTTATTC-ATACTAAAAAAATACTAATTTCA-TAATATTTAAAAAAACTAATAA
63 ATTCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCT-ATTAATATTT-CAAAAA-T--TAA
* * * * * * ** *
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* * * * * **
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * *
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66 CATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAG
** ** * * * *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * ** * ** * * **
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * *
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* * * * * * * * *
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125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTAT
* *
6963951 ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TGATTAATATTTCAAAAATTAATTGGTA
65 -TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCT-ATTAATATTTCAAAAATTAA----TA
* * * * * *
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* * ** ** * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * ** * * * * * *
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* * ** ** * * * ** *
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** * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
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65 -TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---
* * * * * **
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126 -AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * **
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1 TTGAACAATTATCTATTT-CAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * ** * * * **
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** * * ** * * * * ** * *
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126 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * *
6964648 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-
* * * * ** * *
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127 -GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACT-AT
* ** * ** * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTTTAT
* * * *
6964828 ATCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAGTAAGTA
65 -TCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TA
* * * * * * * * * *
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124 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTAT--TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TT
* * *
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* * * * * * * *
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124 A-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * * **
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTTAT
* * * *
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65 TCATA-TAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--
* * * * * *
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126 AG--ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * *
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* * ** * *** *
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** * * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * ** * *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTT--CAAAAATTAA-TAAGA
* * * * * * * * *
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127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-ATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * *
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* * * * * *
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125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * *
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1 TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
* * * * * *
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* ** *
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125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * ** * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * * * * ** *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
* * * ** * *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * *
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65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAA
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1 TTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
** * ***** * ** *
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65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAT
* * ** * * * *
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130 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * ** * *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTT--CAAAAATTAA-TAAGA
* * * * * * * * *
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127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-ATTCAAATAATTATGACTAT
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * *
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* * * * * *
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125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * *
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1 TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
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6966965 AATCATCTAAGCTTACTAC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAA-GA
63 ATTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* ** *
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125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * ** * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * * * * ** *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
* * * ** * *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * *
6967317 TCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAA
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAA
* * * * * * *
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125 GAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTA-TCAA-ACCAATTCAAATAATTATGACTAT
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
** * ***** * *
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* * ** *** *
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131 TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * ** * *
6967668 CATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAA
66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTT--CAAAAATTAA-TAAGA
* * * * * * * * *
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127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-ATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * * *
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* * * * * *
6967911 GAGATTTAAAAAAT-GA-CTGTTTA-CTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGT
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * *
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1 TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
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* ** *
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125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
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* * * ** * **
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * *
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65 TCATATAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TA
* * * * * * *
6968440 AGAGAATTAAAAAA-AGAATATGTTTACTGAATA--AGTTCAAATAGTTATAACTAT
124 AGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTA-TCAA-ACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
** * ** ** * *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATT
* * ** *** *
6968616 TTAAAAATAAATCTGTGCATCAAACTGGTTCAAATAGTTATGACTAT
131 TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
** * * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * ** *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----A
* * * * * * * * * *
6968793 AATTTTAAAAATAGATATGTTTACCACACTAGA-TCAAATAATCATG-GTAAT
127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-ATTCAAATAATTATGACT-AT
* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * *
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65 TCATATAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAA-T-TAAT-AA
* * * * * *
6968971 GAGATTTAAAAAAT-GA-CTGTTTA-CTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGT
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * *
6969022 TT-AACTAATTATCTATTTGAAAT-AGCTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTGTTTTCT
1 TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
* * * * * *
6969085 AATCATCTAAGCTTACTAC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAA-GA
63 ATTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* ** *
6969146 -AGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATTGTTATGGCTAT
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * ** * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * * ** *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
* * * ** * **
6969326 AGATTTAAGAAATAAATATATTTACCAAA-CAAGTTCAAATGGTCATGAAAAT
126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * *
6969378 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTG----T-T
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * *
6969437 TCATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATGAGTAA
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAA
* * * * * * *
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125 GAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTA-TCAA-ACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * ***
6969554 CTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGGTTCGGT
1 TTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
** * * * * *
6969618 TCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATTCAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAA
65 TCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
* ** * * * * *
6969682 AATTTTAAAAAGGAAATATGTTT-TCTAAA-CACGTTCAAATAGTTATGACTTT
127 GA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCA-ATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
6969734 TTGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * *
6969799 TATAAAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAGAA
66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AG-A
* * * * * *
6969864 GATTTAAAAAATATATATGTTTA-CCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTAT
* ** * * *
6969980 TCATACAATTTTATTCGAAATAGAATAATACTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGTTT
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA----
* * * *
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125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTT--------A---TCAA---AC---CAA-TTCAAATAATTAT
* *
6970109 GTCCAT
172 GACTAT
* ** * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TAT
* ** * * ** *
6970179 T-ATGTAAAATTATTCCG-AATAAAATAATACTGATATATTAATATTTTGATAATTAATAAGAGA
65 TCATATAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * * * *
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129 TTTA-AAAAATAAATCTATTTA-TCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTTTA
* * * *** ** * *
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* ** * * * * * *
6970402 -AAATGTT----TGTCGAA-CTA-GT-TCAAA-TAGTTAAAACT-ATTA-GAAC-AA
125 GAGAT-TTAAAAAAT-AAATCTATTTATCAAACCAATTCAAA-TAATTATG-ACTAT
* * * * * * * * **
6970447 TTG--------TCTTTTTCAAATCGTTTTAACTTTTTGTTTAGCCATAAAACAATTATTTCAATT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * *
6970504 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAG
66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAG
* * * *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-ATTCAAATA-ATTATGACTAT
* *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* * * * * *
6970682 TTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATA-GAACTTTAGTAATATTTCAAAAATTAATATGCA
64 TTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TCTATTAATATTTCAAAAATT-A-AT--A
* * * ** * ** * *
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124 AGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * *
6970800 TTAAACAAATATCAATATCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTTTA
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-
** * * * ** *
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65 TCATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
*** ** * * * *
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129 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * *
6971040 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-GTTCAAAAAATTTAATAAGCA
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAA-TTAATAAG-A
* * * *
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127 -G--ATTT---A-AAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * *
6971162 TTCAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * *
6971226 TCATAAAAGCTTATTCAAAACAAAATAATATTACAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAA
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AA
* * ** * *
6971290 GAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTAACAAATCAATTCAAATAACCATGGCCAT
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * *
6971343 TTAAACAACTATCTATTTTAACTTATTATTACCTTTTATATTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-AT
* * * * * *
6971407 ACATACAAACTGT-TTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGA
65 TCATATAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * * * **** *
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129 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * *
6971520 TTGAACAATTATCTATTTCAATTTATTAT-AACATTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTGTT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * *
6971584 CATACAAGCTTATAT-GAAATAAAATAATAATAATTTA-GAATA-TTCTGAAAATTAATAACTAT
66 CATATAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A--A-
* * * * * * **
6971646 GATATTTAAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAGTAGTTAAAACTAT
125 GAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * ** * * * * *
6971700 ATT-AAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATT-ATTTAAG
1 -TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* * * * * * * * * *
6971763 CTCATAGAAGCTTATT-TAGAATAGAACAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAACTTTATAAGAG
64 TTCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAG
* * ** * * * *
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128 ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * *
6971942 AATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-ATAAAATTATTCAGTAAG
66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCA-AAAATTA---A-TAAG
* ** ** * * * *
6972006 AGATTTAAAACATAAATCTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGATTAT
126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTAT
* ** * ** * * * * * * *
6972122 TTATA-ATATTTTATTTGAAATAGCATAATGCAAATTTAATAATGTTCCAAAACTTAATAACCAA
65 TCATATA-AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AA
* * * * ** * * * * ** *
6972186 GAAAATTAAAACATAAATCTAATTGCCGAACTAATTTAAATAGTTAAAATTAT
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * ** * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
** * * * * *
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66 CATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCT-ATTAATA-TTTCAAAAA-T--TAA-TA
* * * * * * * ** *
6972366 AGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTACCGAATCATTTCAAATGGTTAAGACTAT
124 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * **
6972420 TAGAATAATTATATACTTCAAATCATT-TTAACTGTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAAT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * *
6972484 TCATATAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGAAA
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AA
* * * * * * *
6972548 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTTAAATAGTTATTATTAT
125 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * * * **
6972665 TAATATAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATATTAATTTATTAGTATTTCCTAAATTAATAAGTAA
65 TCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
* * * * * *
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127 G--ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * *
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66 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTA--A--TAAGA
* * *
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127 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* ** ** * * *
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1 TTGAAC--AATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * ** * *
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63 ATTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * * ** *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * * *
6973137 TAGAATACTTATCTATTTTAAATCATTCA-AACC-TTTGATTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCA
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * * * ** *
6973199 TGTCGTACAAGCTTATTCGAAAT-AAATCAATCCAAATTTATGAACATTTGGAAAATCAATAAGC
64 T-TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAAT-AATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-
* * * * **
6973263 AAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTTAAATGGTTATGACTAT
126 ---AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * ** * * **
6973319 TTGAACACTTAT-TTTTATGAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAAT
1 TTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * ** * * ***
6973383 TCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAA-AA-AAAAAGC-A--AGA-GTTT-AAAAA--AA-ATTCG
65 TCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATCTATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGAG
** * * * * ** * *
6973437 -TTTACCAAACAAATTCAGATAGTTAT--GA-CTATTTGAACAGTTAT-A-TAT
128 ATTTAAAAAATAAA-TC---TATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* ** *** ** * * * *
6973485 TT-AA-AATTGT-TATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTAAGTTCAT---ACAA--G
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG--AC---CT-TTTGTTT-TG-TCATAAAACAATTG
* * * * ** * * ** * * *** ** * *
6973542 CTTAT-TTGAAATAAAATAATTC-TAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGT---GATTTAA
58 TTTTTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * ****** * * * *
6973602 -AATGTGAATCTATTTGCCAAAT-TA-GT-TCAAA-TAATT-ATAGTCATT-T--C-A-
122 TAA-GAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCA-AATAATTATGACTAT
* ** * ** * * * * *
6973650 AT-AATTA-T-T-TGTTTCAAATTGTTATCACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTATTTTT-TA
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-
* * *
6973710 TCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAAT-A-A-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA
65 TCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
* * * * * * * *
6973771 GAGATTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATAACTAT
127 GA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * ** * * *
6973823 TTGAACCATTCTATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTT-T
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTAT
* * * * *
6973887 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAGA
65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AGA
* * * * * * *
6973952 GGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGAT-GAACCAATTTAGATAGTTAAGACTAT
127 -GATTTAAAAAATAAATCTATTT-ATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * **
6974004 ATGAATAATTATCTAATTCAAATCGTTA-GACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATT-TTTACAAT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTAT
* * * * *
6974067 TCATACT-AGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
65 TCATA-TAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TA
* * * * *
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* * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * *
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* * * * *
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130 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTAT
** * * * * * * * * *
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1 TTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * * ** *
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65 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTT--CAAAAATTAA-TAAG
* * * * * * * **
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126 AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCA-ATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * ***
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65 TCATATAAGCTTATTCG-AAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAT-AA
* * * * * * *
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* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TA
* * *
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* * * * *
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126 ----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * ** ** * * **
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * * ** *
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66 CATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
* * * * * *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * ** **
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * *
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* * * * *
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126 AGATTTAAAAAATA-AATCTATTTATC-AAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
** * * * *
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* * * *** *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* ** * * * *
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* * ** * *** * *
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126 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTAT
** * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTAT
** * ** *
6975845 TCA-AGTAAAATTATTC-AGAATAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTGATAATTAATAAGAG
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* * * * **
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* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TTA
* * * * * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * *
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65 TCATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAA-ATTAAT
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** ** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* ** * * ** * * **
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* * * **
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* * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* * * * * *
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1 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAG
* * * *
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* * * *
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* * ** ** * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * **
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** * ** * *
6963959 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATTGGTAACAGATTTA
64 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTA
* ** * ** * * *
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129 AAAAATAAATCTATTTTTCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * ** * * * * *
6964077 TTATCAATCTCAAATTGTTAAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-ATCATAGAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAA
* ** * * * * *
6964140 ACTTATTC-AGTTAAAAACAATGCTAATTTAATAATA-ATCTGAAAATTAAT----AAGAGATTT
65 GCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT
* * ** * * * ** * ** *
6964199 AAAAAATAAATGT-GTTCGCTAAATTAGTTTAAATAGTTAAAACAATTACAATAA
128 AAAAAATAAATCTATTTTTC-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
6964253 TTATCTATTTCAAATCATTCA-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAACATTTGTTTCATGTT-TTACA
1 TTATCTATTTCAAATCATT-ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACA
*** * * * * ** *
6964316 AGCTTATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATGAACATTTTGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTG
64 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-
* * ** * * * * *
6964381 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAATTTTAAATGGTTATGACTATTTAAACAA
128 AAAAAATAAATCTATTTTTCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
6964435 TTAT-T-TTTATAAATTCCTTATGACCATTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-A
1 TTATCTATTT-CAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACA
* *
6964497 ATGGTTATCCAAAATAAAA
64 A-GCTTATTCAAAATAAAA
6964516 ATGATTAATA
Statistics
Matches: 1708, Mismatches: 437, Indels: 182
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Matches are distributed among these distances:
175 9 0.01
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185 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAG
CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAA
AAATAAATCTATTTTTCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
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Alignment explanation
Indices: 6964535--6976237 Score: 4536
Period size: 534 Copynumber: 22.0 Consensus size: 534
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* *** * ** * *
6964535 TTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTCATGTAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
6964600 TTAAAATCGTTACAAGCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTAAGTTCATACAAGCTTATTTG
65 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG
* * ** * *
6964665 AAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAAT
130 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAAT
** * ** * * * ** * * **
6964730 CTATTTGTCGAATTAGTTCAAATAATTATG-GTCATTTCAGTAATTATGTATTTCAAATTGTTAT
194 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * * * *
6964794 CACCTTTTGTTTGGTCATATAAA-ATTTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
258 GACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTTAGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * * * * * *
6964857 TAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAAATTAAAAAAATAAATATGTTGACCGA
321 TATTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACAA
* * * * * *
6964922 ACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAA-T-TCTATGCTTTAAATCGTTATAACCTTTTGT
385 ACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTAT--TTCAAATCATTATTACCTTTT-T
* * ** * * *
6964985 TGTGTCATAAAATAATTATTTCTT-TTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAACAATACTAATCTAA
447 T-TGTCATAAAACAATTGTTT-TTCAACATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTAA
* *
6965048 TAATATTCTAAAAATTAATAACTAGGGGA
510 TAATATTCCAAAAATTAAT-A--A-GAGA
* * * * * * * * * *
6965077 TTTAAAAGATAAATTTGTTTGCTGAACCAATTCAAATAATGAAGACTATATGAATAGTTATCTAA
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA-CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * *
6965142 TTCAAATCATTATGTCCTTTTGTCTTA-TCATAAAAGAATT-TTGTCAATTCATACTAGCTTATT
65 TTCAAATCATTATAACCTTTTGT-TTAGTCATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATACAAGCTTATT
* * * * *
6965205 TGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGACATTTAAAAAACA
128 TGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * * *
6965269 ATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTAT-ACTATTTGAACAGTTATATATTTCAAATCATT
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT
* * * * * * *** *
6965333 ATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA-TTCGTATAAGTTTATTTGGAATAAAGTA
256 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * ** **
6965397 ATACTAATCTATTAATATTTCAAAAACTAAT----AAGTGATTTTAAAAATAAATCTGTGCATTA
320 ATATTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACA
*** * *** * * * *
6965458 AACTGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGGCAATTATTTACTTCAAATCATTATGACTTTTTGTT
384 AACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTT-TT
* * * * * * * *
6965523 CTATTATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATACTAATTTAT
448 -TGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTAA
* ** * * *
6965586 TAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAAA
510 TAATA--TT-CCAAAAATTAA-TAAGAGA
* * * * * * * * *
6965615 TTTAAAAAATAGATATGTTTACC-ACACTAGATCAAATAATCATGACAATTTGAATAATTATCTA
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGA-AC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * *
6965679 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTA-TCACAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-T
64 TTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
* * * * * ** *
6965742 TCAAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTAATCTAAAAATT-ATAATAAAGAGATTTAAAAAAT-
128 TGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
6965805 GA-CTGTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTTT-AACTAATTATCTATTTGAAAT-AG
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTAAAATCA-
* * * * * * * ** *
6965867 CTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTCTA-ATCATCTAAGCTTACT-ACAAATAA
254 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCA-AAATAA
** *
6965930 AATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--TAAG--A-AGATTT-AAAAATAAATCTAT
316 AATAATATTAA-TTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* ** * * * * * * ** *
6965986 TTACCAAA-CAAGTTCAAATTGTTATGGCTATTTGAGCATTTATTTATTTCAACTTGTTATGACT
378 TTAACAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-
* * *** * * * * * *
6966050 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGTTTATTC-AGATCAAAACATTATTA
441 CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATACTA
*** *
6966114 ATTT-ATAAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGA
504 ATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAG----AGA
* * * * * * * * * *
6966149 TTTAAGAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATGGTCATGAATATTTGAATAATTATCTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
6966214 TTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTGTTTCA--T-AT--AAGCTTATTT
65 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * *
6966273 GAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAA-AG
129 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGA-AATTTAAAAAATA-
* * ** * * * *
6966336 AATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-AT
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCAT
* * * * ** * ****
6966400 TATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGGTTCT-GTTCATGCAAGATTATT-----T-TGGG
255 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * ** * * ** *
6966458 CA-ATT-ATCTATTAACATTTCAAAACCTAAT----AAGTGATTTTAAAAATAAATCTGTGCATC
319 AATATTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC
* * * * *** * * * *
6966517 ACACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGGCAATTATTTACTTCAAATCATTATGACTTTTTGT
383 AAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTT-T
* * * * * * *
6966582 TCTATTATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATACTAATTTA
447 T-TGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** * * *
6966645 TTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAAA
509 ATAATA--TT-CCAAAAATTAA-TAAGAGA
* * * * * * * * * *
6966675 TTTAAAAAATAGATATGTTTACC-ACACTAGATCAAATAATCATGACAATTTGAATAATTGTCTA
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGA-AC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * *
6966739 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTA-TCACAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-T
64 TTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
* * * * * ** *
6966802 TCAAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTAATCTAAAAATT-ATAATAAAGAGATTTAAAAAAT-
128 TGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
6966865 GA-CTGTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTTT-AACTAATTATCTATTTGAAAT-AG
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTAAAATCA-
* * * * * * ** *
6966927 CTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTGTTTTCTA-ATCATCTAAGCTTACT-ACAAATAA
254 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCA-AAATAA
** *
6966990 AATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--TAAG--A-AGATTT-AAAAATAAATCTAT
316 AATAATATTAA-TTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* ** * * * * * * ** *
6967046 TTACCAAA-CAAGTTCAAATTGTTATGGCTATTTGAGCATTTATTTATTTCAACTTGTTATGACT
378 TTAACAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-
* * *** * * * * * *
6967110 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGTTTATTC-AGATCAAAACATTATTA
441 CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATACTA
*** *
6967174 ATTT-ATAAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGA
504 ATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAG----AGA
* * * * * * * * * *
6967209 TTTAAGAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATGGTCATGAATATTTGAATAATTATCTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
6967274 TTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTGTTTCA--T-AT--AAGCTTATTT
65 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * *
6967333 GAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAA-AG
129 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGA-AATTTAAAAAATA-
* * ** * * * *
6967396 AATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CAT
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCAT
* * * * ** * ****
6967460 TATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGGTTCT-GTTCATGCAAGATTATT-----T-TGGG
255 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * ** *
6967518 CA-ATT-ATCTATTAATATTTCAAAAACTAAT----AAGTGATTTTAAAAATAAATCTGTGCATC
319 AATATTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC
*** * *** * * * *
6967577 AAACTGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGGCAATTATTTACTTCAAATCATTATGACTTTTTGT
383 AAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTT-T
* * * * * * * *
6967642 TCTATTATAAAATAACTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATACTAATTTA
447 T-TGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** * * *
6967705 TTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAAA
509 ATAATA--TT-CCAAAAATTAA-TAAGAGA
* * * * * * * * * *
6967735 TTTAAAAAATAGATATGTTTACC-ACACTAGATCAAATAATCATGACAATTTGAATAATTGTCTA
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGA-AC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * *
6967799 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTA-TCACAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-T
64 TTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
* * * * * * *
6967862 TCAAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTAATCTAAAAATT-ATAAGAAAGAGATTTAAAAAAT-
128 TGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
6967925 GA-CTGTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTTT-AACTAATTATCTATTTGAAAT-AG
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTAAAATCA-
* * * * * * ** *
6967987 CTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTGTTTTCTA-ATCATCTAAGCTTACT-ACAAATAA
254 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCA-AAATAA
** *
6968050 AATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--TAAG--A-AGATTT-AAAAATAAATCTAT
316 AATAATATTAA-TTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* ** * * * * * * * ** *
6968106 TTACCAAA-CAAGTTCAAATTGTTATGGCTATTTGAGCATTTATTTGTTTCAACTTGTTATGACT
378 TTAACAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC-
* * *** * * * *
6968170 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGTTTATTC-ATATCAAAATAATATTA
441 CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATACTA
*** *
6968234 ATTT-ATAAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGA
504 ATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAG----AGA
* * * ** * * * * ** *
6968269 TTTAATAAATAAATATATTTAACAAACAAGTTCAAATGGTCATGAAAATTTGAATAATTATCTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
6968334 TTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTGTTTCA--T-AT--AAGCTTATAT
65 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * *
6968393 GAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAA-AG
129 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGA-AATTTAAAAAATA-
* * ** * * * *
6968456 AATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CAT
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCAT
* * * * * ** * ** *
6968520 TATGATCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGGTTCT-GTTCATGCAAGATTATT-----T-TGAG
255 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * ** *
6968578 CA-ATT-ATCTATTAATATTTCAAAAACTAAT----AAGTGATTTTAAAAATAAATCTGTGCATC
319 AATATTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC
*** * *** * * * *
6968637 AAACTGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGGCAATTATTTACTTCAAATCATTATGACTTTTTGT
383 AAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTT-T
* * * * * * * *
6968702 TCTATTATAAAATAATTGTTTCT-ATTCCTACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATACTAATTTA
447 T-TGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTA
* *** * *
6968765 TTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAA
509 ATAATATTCCAAAAATTAATAAG----AGA
* * * * * * * * * *
6968795 TTTTAAAAATAGATATGTTTACC-ACACTAGATCAAATAATCATG-GTAATTTGAATAATTATCT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGA-AC-AGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTTGAACAATTATCT
* * * * *
6968858 ATTTAAAATCATTATGACCTTTTGATTTA-TCACAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-
63 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * ** *
6968921 TTCAAAGTAAAATAATATTAATTTTTTATTAATCTAAAAATT-ATAATAAAGAGATTTAAAAAAT
127 TTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAAT
* * * * * * * * *
6968985 -GA-CTGTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTTT-AACTAATTATCTATTTGAAAT-A
190 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTAAAATCA
* * * * * * ** *
6969046 GCTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTGTTTTCTA-ATCATCTAAGCTTACT-ACAAATA
254 -TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCA-AAATA
** *
6969109 AAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAA-T--TAAG--A-AGATTT-AAAAATAAATCTA
315 AAATAATATTAA-TTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* ** * * * * * * ** *
6969165 TTTACCAAA-CAAGTTCAAATTGTTATGGCTATTTGAGCATTTATTTATTTCAACTTGTTATGAC
377 TTTAACAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC
* * *** * * * *
6969229 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCACACAAGTTTATTC-ATATCAAAATAATATT
441 -CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATACT
*** *
6969293 AATTT-ATAAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGA
503 AATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAG----AGA
* * * * * * * * ** *
6969329 TTTAAGAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATGGTCATGAAAATTTGAATAATTATCTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
6969394 TTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG-CAATAAAACACTTGTTTCA--T-AT--AAGCTTATTT
65 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * *
6969453 GAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAA-AG
129 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGA-AATTTAAAAAATA-
* * ** * * * *
6969516 AATATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-AT
191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCAT
* * * * ** ** ***
6969580 TATGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGGTTCGGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATA
255 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * ** * *
6969645 AT-TCAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAA-A-ATTTTAAAAAGGAAATATGTTT-T
320 ATAT-TAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAA
* * * * * * *
6969706 CTAAA-CACGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTT
382 C-AAACCA-ATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACC-TT
* * ** * * *
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444 T-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATT
* *
6969834 TATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAGAAGA
507 TAATAATATTCCAAAAATTAAT-A--AG-AGA
* * * * * *
6969866 TTTAAAAAATATATATGTTTACC-AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTGGAACAATTATTTA
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA-C-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * **
6969930 TTTCAATTCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACCAATTGTTTCTA-TTCATACAATTTTAT
64 TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-CAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTAT
* * * *** *
6969994 TCGAAATAGAATAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATA
127 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * *
6970059 AATTTATTTACCGAACAAGTTTGAATGGACATACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTAT
191 AATCTATTTA-C---C------------A-A-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * *
6970124 TATCTATTTCAAATCACAATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGTTTT-GTTTATGTAAAA
238 TATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA--TAAAA
** * * ** *
6970188 --TTATTCCGAATAAAATAATACTGATATATTAATATTTTGATAATTAAT----AAGAGATTTAC
301 GCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTA-
* * * * * *
6970247 AAACA-AAATCTATTT-ACTGAAA-TAGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTA--T
364 AAAAATAAATCTGTTTAAC--AAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT
* * * *
6970307 C---TCA--A--A------TCTGT-AT-----GA-T-TTTTT---CATACAAGCTTATT-TGATT
427 CAAATCATTATTACCTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCTAAAT
** *
6970347 CCAATAATACTAA-TTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGAGA
492 AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGA
** * * * * *
6970389 TTTAAAAAAATAAAAATGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTGTCTT
1 TTT-AAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
6970454 TTTCAAATCGTTTTAACTTTTTGTTTAGCCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTC
64 TTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * *
6970519 AAAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA
129 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * *
6970584 TCTATTTACCAAACACGTTGAAA-AGATT-TGACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTA
193 TCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * **
6970647 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAAT
257 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * ****
6970712 A-GAACTTTAGTAATATTTCAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTG
322 ATTAA--TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTAACA
* ** * * * * * * * *
6970775 AACCACTTTGAATAGTTATGACCATTTAAACAAATATCAATATCAAATCGTTATGATCTTTGTTT
384 AACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTT-TTT
* * * * **
6970840 TCTCATAAAACAATTGTTTTTTTATCATACGAGCTTATTC-GGATAAAAATAATACTAATTTAAT
448 TGTCATAAAACAATTG-TTTTTCAACATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATACTAATTTAAT
*** *
6970904 AAT-TTTTTATAATTAATAAGAGA
511 AATATTCCAAAAATTAATAAGAGA
** * * *
6970927 TTTAAAAAATAAATGGGTTTGCCGAATCAATTCAAATAGTTAAGACTATTGGAATAATTATCTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA-CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
6970992 TTCAATTCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG
65 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
6971057 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCAAAAAATTTAATAAGCATGACATTTGAAACAAAAA
130 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA-TTAATAAGCAAGAAATTT---A-AAAAA
* * * * *
6971122 AAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATCA
189 TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA
* *
6971187 TTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAACAAAAT
254 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* *
6971252 AATATTACATTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTAAC
319 AATATTA-ATTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC
* ** * * * * * *
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* *
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447 -TTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCT-TATTCTAAATAAAATAATACTAATTTAA
* *
6971446 TAATATTTCAAGAATTAATAAGAGA
510 TAATATTCCAAAAATTAATAAGAGA
* * * * ** ** * *
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1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTG-CCGAACAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * * * **
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* * * * * * * * * * *
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255 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * *** **
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320 ATATTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACA
* * * ** *
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* ** * * * *
6971917 TTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTA-ATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTAT
447 TTGTCATAAAACAATTGTTTTT-CAACATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTAA
*
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510 TAATATTCCA-AAAATTA---A-TAAGAGA
* * * * ** * * *
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1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAA-CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * **
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** * * * * * * * *
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* * * * ** * * * ** * * * *
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191 AATCTATTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
* * * ** * * *
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255 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * *
6972329 ATAATAATT-TCATAATATTTTAAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTAC
320 ATATTAATTAT--TAATA-TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAA
* * * ** * * * * *
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382 CAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT-TT
* * *
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445 T-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAAT
* * *
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506 TTAATAATATTCCAAAAATTAAT----AAGAGA
* * ** *
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1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * **
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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322 ATTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAAC-AA
*** * ** ** *
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* * * **
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*
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* ** * * * * * *
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1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCGAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
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* * * * * ** *
6973215 TCGAAAT-AAATCAATCCAAATTTATGAACATTTGGAAAATCAATAAGCAA-AAGATTTGAAAAA
127 TTGAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTT-AAAAA
* * * * *
6973278 ATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAATGGTTATGACTATTTGAACACTTAT-T-TTTATGAAA
188 ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA--AAA
** * * * *
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*
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* * * * * * * * ** *
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* * ***** *
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* * *
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** * * * * * * * * * *
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** * * * * * **
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* * * * *
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128 TGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATA
* * * * * * * * **
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191 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT
* * * * * ** *
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256 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * * *** *
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* ** * * * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * ** * *
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* *
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* * * ** * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * ** * * * * * **
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** * * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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* *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* *** * ** * * * **
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *** ** * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * ****
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AAATTAATAAGAGA
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* *
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AAAAAAAAAAAGCAAGAGTTT
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * * **
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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*
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* * * * *** * *
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* *
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* * ** *
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* * *
6975335 GCTTATTTCG-AATAACATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTT
127 GCTTA-TT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * ** * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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Statistics
Matches: 1998, Mismatches: 403, Indels: 233
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
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ATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
AAATATATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGT
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ATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGT
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* * *
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* *
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1 AAAAATTAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCA
* * * * **
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66 AATCATTATAACCTTTTATTTTGTCAT-AAACGAATTGTTTCTATTCATAAAATCTTTTTCAAAA
** *
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130 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCC
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AATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAACGAATTGTTTCTATTCATAAAATCTTTTTCAAAAT
AAAATAATACTAATTTATTAAAATTCC
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* *
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CACATG
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* *
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ACACATGCACATG
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*
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1 ACATGCACATGACACATGCACATG
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* * * * *
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1 CTTGGAGTGGGTTGTTACCTCAGACACCTTTCTGGTAGATGCTGGCA
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1 CT
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CTTGGAGTGGGTTGTTACCTCAGACACCTTTCTGGTAGATGCTGGCA
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*
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*
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*
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*
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* *
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1 TTTTAATTTTGATTT
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*
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* * *
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TTTATTTTTTATTTTACTTAAT
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*
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1 TTTT
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TTTTATTTTATTTTTA
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* * *
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* *
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GTTTTATTTTATTTTTATTTTCTATTTG
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*
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* *
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* *
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* * *
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*
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*
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Done.