Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167982.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_24, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 18142777
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.15, T:0.34
Warning! 63000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 84
Found at i:488 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 106--490 Score: 415
Period size: 176 Copynumber: 2.2 Consensus size: 175
96 TTAATTGTCA
* * * * * *
106 AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACTATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTATTCTGAAAAAACTTATATGAACAAAAACTATTATTTT
* * * *
171 ATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTTATAACTATTTGA
66 ACAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTCATAACTATTTGA
* * *
236 ACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTTTG
131 ACTGGTTAGACAAATAG---TATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTTTG
* * *
284 AAATATTAATAGATT-AGTATTT-TTTTATTTTGAAAAAACTTATGTGAACAAAAAC-ATTTATT
1 AAATATTAATAAATTCA-TATTTATTTTATTCTGAAAAAACTTATATGAACAAAAACTA-TTATT
* * ** * *
346 TTACAACAAAAC-AAAAGCTCATAACAATTT-AACTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
64 TTACAACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTCATAACTATT
* *
409 TGAACTGGTTAGGCAAATAG-ATTTTTTAAATCTCATACATATTAATTTTTG
128 TGAACTGGTTAGACAAATAGTATTTTTTAAATCTC-T---TATTAAATTTTG
460 AAATATTAATAAATTCAT-TTTATTTTATTCT
1 AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTATTCT
491 AAATAAGCTA
Statistics
Matches: 172, Mismatches: 26, Indels: 20
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
172 14 0.08
173 1 0.01
175 3 0.02
176 82 0.48
177 53 0.31
178 19 0.11
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (175 bp):
AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTATTCTGAAAAAACTTATATGAACAAAAACTATTATTTT
ACAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTCATAACTATTTGA
ACTGGTTAGACAAATAGTATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTTTG
Found at i:534 original size:176 final size:172
Alignment explanation
Indices: 106--537 Score: 401
Period size: 176 Copynumber: 2.4 Consensus size: 172
96 TTAATTGTCA
* * * **
106 AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACTATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTATTCTAAATAAGCTAGTATG-A-ATAAAAAATTGTTTT
* * *
171 ATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTTATAACTATTTGA
64 ATAACAAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTCATAACTATTTGA
* * *
236 ACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTTTG
128 ACTGGTTAGACAAATAG---TATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTTTG
* * * * * *
284 AAATATTAATAGATT-AGTATTT-TTTTATTTTGAAA-AAACTTA-TGTGAACAAAAACATTTAT
1 AAATATTAATAAATTCA-TATTTATTTTATTCT-AAATAAGC-TAGTATGAATAAAAA-A-TTGT
* * * ** * *
345 TTTACAACAAAACAAAAGCTCATAACAATTT-AACTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
61 TTTATAACAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTCATAACTATT
* *
409 TGAACTGGTTAGGCAAATAG-ATTTTTTAAATCTCATACATATTAATTTTTG
125 TGAACTGGTTAGACAAATAGTATTTTTTAAATCTC-T---TATTAAATTTTG
460 AAATATTAATAAATTCAT-TTTATTTTATTCTAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTATTCTAAATAAGCTAGTATGAA-T-AAAAAATTGTTTT
**
524 ATGGCAAAACAAAA
64 ATAACAAAACAAAA
538 ACGATTTAAA
Statistics
Matches: 203, Mismatches: 35, Indels: 34
0.75 0.13 0.12
Matches are distributed among these distances:
172 14 0.07
173 1 0.00
175 12 0.06
176 108 0.53
177 41 0.20
178 27 0.13
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (172 bp):
AAATATTAATAAATTCATATTTATTTTATTCTAAATAAGCTAGTATGAATAAAAAATTGTTTTAT
AACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTCATAACTATTTGAACT
GGTTAGACAAATAGTATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTTTG
Found at i:1232 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 961--1287 Score: 482
Period size: 180 Copynumber: 1.8 Consensus size: 180
951 AATCACTTAA
* * *
961 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAACTTGAATGAACTGA
1 TTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGAATGAAATGA
** *
1026 AACAATTGCTTTGTGTCAAACCAAAAGGTCATAATGATTCTCAATAGA-CAATTGTTCAAATAGT
66 AACAATTGCTTTACGTCAAACCAAAAGGTCATAATGATTCTAAATA-ATCAATTGTTCAAATAGT
1090 CATAACTATTTGAATTTGATCAATAAAAAAATTTAATTTTTAAACTCTTGT
130 CATAACTATTTGAATTTGATCAATAAAAAAATTTAATTTTTAAACTCTTGT
* * *
1141 TTATTAACTTTTGA-AATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTCTTTAATGAAA
1 TTATTAA-TTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA--ACTTGAATGAAA
* * *
1204 TGAAACAATT-TTTTACGTCAAACCAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAATTAATTGTTCAAATA
63 TGAAACAATTGCTTTACGTCAAACCAAAAGGTCATAATGATTCTAAATAATCAATTGTTCAAATA
1268 GTCATAACTATTTGAATTTG
128 GTCATAACTATTTGAATTTG
1288 TTTGGCAAAT
Statistics
Matches: 131, Mismatches: 12, Indels: 8
0.87 0.08 0.05
Matches are distributed among these distances:
179 26 0.20
180 81 0.62
181 24 0.18
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TTATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGAATGAAATGA
AACAATTGCTTTACGTCAAACCAAAAGGTCATAATGATTCTAAATAATCAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAATTTGATCAATAAAAAAATTTAATTTTTAAACTCTTGT
Found at i:1598 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 1557--1598 Score: 50
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
1547 ATAAGTTTCT
* *
1557 ATGATAAAAAATAATTGTTTA
1 ATGATAAAAAATAAATCTTTA
1578 ATGATAAAACAA-AAATCTTTA
1 ATGATAAAA-AATAAATCTTTA
1599 TCATTTCAAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 2
0.82 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
21 16 0.89
22 2 0.11
ACGTcount: A:0.55, C:0.05, G:0.07, T:0.33
Consensus pattern (21 bp):
ATGATAAAAAATAAATCTTTA
Found at i:1739 original size:180 final size:182
Alignment explanation
Indices: 1500--1903 Score: 428
Period size: 181 Copynumber: 2.2 Consensus size: 182
1490 TTTTAAATCT
* * * *
1500 CTTATTAATTTTTGAAATATTATAAAATTAATATTACTTTTA--ACGAAATAAGTTTCTATGATA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTA-TTTTATTACGAAATAAGCTTCTATGACA
* * * * * *
1563 AAAAATAATTGTTTAATGATA-AAACAAAAATCTTTATC-ATTTCAAACTGATAATTGTTCAAAT
65 AAAAACAATTATTTAATGACACAAACAAAAATC-ATAACAATTTCAAACTGATAATCGTTCAAAT
* * * * * *
1626 GGTCATACCTATTTGAAC-TGGTTCAATCAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTA
129 GGGCATAACTATTT-AACTTGATTCAATAAACAAATATATTTTTTAAAT-TTCTTA
* * *
1680 CTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGCATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTCTATGACCA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTACGAAATAAGCTTCTATGACAA
* ** ** * *
1744 AAAACAATTATTTTATGACACAAGGAAAGGTCATAACAATTTGAAATTGATAATCGTTCAAATGG
66 AAAACAATTATTTAATGACACAAACAAAAATCATAACAATTTCAAACTGATAATCGTTCAAATGG
* *
1809 GCATAATTATTTTACTTGATTCAATAAACAAATATATTTTTTAAATTTCTTA
131 GCATAACTATTTAACTTGATTCAATAAACAAATATATTTTTTAAATTTCTTA
* * *
1861 CTTGTT-ATTTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 CTTATTAATTTT-TGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATT
1904 CCATCTAAGC
Statistics
Matches: 185, Mismatches: 32, Indels: 13
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
179 5 0.03
180 77 0.42
181 103 0.56
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.08, T:0.43
Consensus pattern (182 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTACGAAATAAGCTTCTATGACAA
AAAACAATTATTTAATGACACAAACAAAAATCATAACAATTTCAAACTGATAATCGTTCAAATGG
GCATAACTATTTAACTTGATTCAATAAACAAATATATTTTTTAAATTTCTTA
Found at i:1915 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 1601--1942 Score: 420
Period size: 181 Copynumber: 1.9 Consensus size: 181
1591 AATCTTTATC
* * * * * * *
1601 ATTTCAAACTGATAATTGTTCAAATGGTCATACCTATTTGAACTGGTTCAATCAACATATTTATT
1 ATTTCAAACTGATAATCGTTCAAATGGGCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAAATATATT
* *
1666 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAA
66 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAAATATTAAAAAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAA
*
1731 GCTTCTATGACCAAAAACAATTATTTTATGACACAAGGAAAGGTCATAACA
131 GCTTCTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACACAAGGAAAGGTCATAACA
* * * *
1782 ATTTGAAATTGATAATCGTTCAAATGGGCATAATTATTT-TACTTGATTCAATAAACAAATATAT
1 ATTTCAAACTGATAATCGTTCAAATGGGCATAACTATTTGAAC-TGATTCAATAAACAAATATAT
* * * **
1846 TTTTTAAAT-TTCTTACTTGTT-ATTTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATC
65 TTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTT-GGAAATATTAAAAAATTAGCATTATTTTATTCCAAA
* * ** *
1909 TAAGCTTGTATTAACTTAAACAATTTTTTTATGA
128 TAAGCTTCTATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
1943 TAAATCAAAA
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 24, Indels: 6
0.82 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
180 9 0.07
181 125 0.93
ACGTcount: A:0.37, C:0.11, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
ATTTCAAACTGATAATCGTTCAAATGGGCATAACTATTTGAACTGATTCAATAAACAAATATATT
TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGGAAATATTAAAAAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAA
GCTTCTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACACAAGGAAAGGTCATAACA
Found at i:3873 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 3838--3875 Score: 60
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
3828 TAATGTGAAT
3838 AATTTTTTATGAACAAAAAC
1 AATTTTTTATGAACAAAAAC
3858 AATTATTTTATG-ACAAAA
1 AATT-TTTTATGAACAAAA
3876 CAAATGGTCA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 2
0.89 0.00 0.11
Matches are distributed among these distances:
20 10 0.59
21 7 0.41
ACGTcount: A:0.50, C:0.08, G:0.05, T:0.37
Consensus pattern (20 bp):
AATTTTTTATGAACAAAAAC
Found at i:4230 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 2911--5334 Score: 1915
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2901 ATAAATAAAC
* * *
2911 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTATATG
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
2974 ACTAAACAAAAGGTCCA-AACGATTTGAAATAGATGATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTGAAC
64 ACAAAACAAAAGGT-CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* ** * * * *
3038 TGGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC---C-TATTAATGTTCAAAAT
128 TTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * *
3088 ATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATAAGCTTGGATG-ATCAGAAATAATTGTTTAATG
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
3151 AGAAAA-TAAAGATCATAATGATTCGAGATTGATATTTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAA-T
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* ** * * * * * *
3214 TGGTTTGAAAAACAGTTTTAGTTATTGAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAAT
129 T-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * *
3268 ATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTCAAATAAG-TTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
3331 CAAAA-AATAGCTCATAATGACTTT-AAATAGTTAGAATGATCATTCAAAAAGTCA-AATCTTTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAG--ATAAT--T-GTTCAAATAGTCATAA-CTATT
* * * * * *
3393 TGAACTTTTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAAT
123 TGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * * **
3454 GTTAATAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAAA-AATCTTCTATGAACTA-AAGTAATTGTTTTATG
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * ** * *
3517 ACTAAACGAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATT-TTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * *
3581 AGTTCGGTAAACACA--TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
129 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * *
3632 ATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-AGAATAAGCTTGTGTGAAAAGGAACAATTGTTTTATGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
3696 CAAAA-TAAAGATCATAATG-TTTGAGATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* * * *
3759 T-TTTGGAAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAAT
129 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* ** * * * ** * * * *
3807 ATTAACAGGTCAGTATTATTTTAATGT-GAATAATTTTTTATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
3871 CAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGCTT-AAATAGACATGATTATTTGAACT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* ** * ** *
3935 AGTTCGGTAAGTAGATTTATTTTTTAAATCACCAACTTATTAATTTTTAGAAT
129 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
** **
3988 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
4053 AAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTCG
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * * *
4118 CTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAGTCTTTTATTTATTAATTTTTATAAT
131 TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * *
4168 TTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGAC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * *
4233 AAAACACAAGGTCATAACGATCTAAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTT-AAGTGT
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-T
* * * **
4297 GTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGGAAT
130 GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * * *
4348 ATTAATTAATTTA-CATTATTTGATTTAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGA
1 ATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
4412 CAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACAT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* ** * * * *
4477 ATTCAATAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAAT
130 GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * * *
4529 AATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATGGAAACAATTGTTTTATTAT
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* *
4594 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTG
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
*** * * * *
4659 TTTAATAAAC--ATATATTTTTTAAATCTTTTAGTTATT-ATTTGTAGAAAT
131 TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AAAT
* * * * * * * * *
4708 ATTAATAAATTAATGTTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTCTTTGATGAC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* ** * * * ** *
4773 AAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAAAGATTTGACCTTG
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * *
4838 TTCAGTAAGCATATTTA-TTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTATCTT--AAT
131 TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAAAAT
* * * * * * * * **
4887 ATTAATAATTTA-TGTTATTTTATTTGAAATAAGATTGTATAAAGAAAAAAAATCATTTTATGAC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * *** * * * * *
4951 AAAACACAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCGTAATTATTTAAACTTG
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * * **
5016 TTTGTTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAAT
131 TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
** * * ** * * * * *
5067 ATTAATAGCTTAGAATTATTTTATTTCGAATAATTTTAG-ATTAATTGAAATAATTTTTTTATGG
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
5131 CAAAACGAAAA-GTCAAAACGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCT
65 CAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * ** *
5195 AGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTAAAT-TTTTTTTTATT--TTTGTTGAAAT
129 TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTAAAAT
* * * * * * * * * * *
5245 TTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAAGATAAACTATTTTTTTATAAC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* *
5310 AAAACAAAAAGTCATAA-CATTTGAA
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
5335 CTAATTCAAT
Statistics
Matches: 1781, Mismatches: 397, Indels: 138
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 71 0.04
176 95 0.05
177 170 0.10
178 257 0.14
179 232 0.13
180 392 0.22
181 386 0.22
182 34 0.02
183 5 0.00
184 32 0.02
185 2 0.00
186 53 0.03
187 37 0.02
188 15 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
Found at i:5157 original size:538 final size:540
Alignment explanation
Indices: 2911--5328 Score: 2077
Period size: 538 Copynumber: 4.5 Consensus size: 540
2901 ATAAATAAAC
** * * * *
2911 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTT-GTATGAACTAAAACAATTATTATATG
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAATTTTAG-ATGAATTGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
2974 ACTAAACAAAAGGTCCA-AACGATTTGAAATAGATGATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTGAAC
64 ACAAAACAAAA-GT-CATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * ** * *
3038 TGGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CCTATTAATGTT-CA-AAATATTATTAAA
127 TAGTTCAGTAAACATATATA-TTTTTAAATCTTTTATTTATTAAT-TTGTAGAAATATTAATAAA
* * * ** * * * * * *
3097 TTAGTATTATTTTTATCCAAATAAGCTTGGATGATCAGAAATAATTGTTTAATGAGAAAATAAAG
190 TTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAA
** ** * * * * *
3162 A-TCATAATGATTCGAGATTGATATTTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAA-T-TGGTT-TGAA
255 AGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-GTTCAG-A
* * * * ** *
3223 AAACAGT-TTTAGTTATTGAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCATTAT
318 AAACA-TATTTAGTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAATTTA-TATTAT
* * ** *
3287 TTTATTTCAAATAAG-TTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGAC-AAA-AAATAGCTCATAAT
379 TTTATTTGAAATAAGATTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAT-GGTCATAAT
* * * * * *
3349 GACTTT-AAATAGTTAGAATGATCATTCAAAAAGTCA-AATCTTTTTGAACTTTTTTGGTAAATA
443 GA-TTTGAAATAGATA-ATTG-T--TT-AAATAGTCATAAT-TATTTGAACTTGTTCGGTAAATA
* **
3412 GATTTATTTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCA-AAT
501 GATTCA--TTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTT-AGAAT
* * * * * ** * *
3454 GTTAATAAATTAGTATTAGTTTATTTTGAAAAATCTTCTATGAACT-AAAGTAATTGTTTTATGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTAGATGAATTGAAA-CAATTGTTTTATGA
* * * * *
3518 CTAAACGAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATT-TTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTA
65 CAAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * * * * *
3582 GTTCGGTAAACACATAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTATTAAATTAG
129 GTTCAGTAAACATATATATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTGTAGAAATATTAATAAATTAA
* * * * * *
3645 TATTATTTTAAT-TAGAATAAGCTTGTGTGAAAAGGAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGA-T
194 TATTATTTTAATCCA-AATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGT
** * * * ** *
3708 CATAA-TGTTTGAGATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TTTGGAAAATA
258 CATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATGTTCAGAAAACA
* * ** * *
3771 GATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAACAGGTCAGTATTATTTTAATG
323 TATTTAGTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAATTTA-TATTATTTT-ATT
** *
3833 TG-AATAATTTTTTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGA
385 TGAAATAAGATTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGA
* * * * * * *
3897 AATAGATAATAGCTTAAATAGACATGATTATTTGAACTAGTTCGGTAAGTAGATTTATTTTTTAA
450 AATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAA
* * *
3962 ATCAC-CAACTTATTAATTTTTAGAAT
515 ATCTCTTAA-TCATTAATTTTTAGAAT
* ** *
3988 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATT-GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTAG-ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
4052 CAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTC
65 CAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * * * * * * * * *
4117 GCTCGGTAAATAGATTTATTTTTAAGTCTTTTATTTATTAATTTTTA-TAATTTTAATAAATTAG
129 GTTCAGTAAACATATATATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTGTAGAAATATTAATAAATTAA
* * * * *
4181 TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACACAAGGTC
194 TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTC
* * * * * *
4246 ATAACGATCTAAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTT-AAGTGTGTTCAGAAAACAT
259 ATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATGTTCAGAAAACAT
* * * *
4310 ATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATTAATTTACATTATTTGATTT
324 ATTTAGTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAA-TAATTTATATTATTTTATTT
* * * * * * * *
4374 AAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAA
386 GAAATAAGATTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAA
* * * * ** * *
4439 ATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACATATTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAT
451 ATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAA
*
4504 TCTCTTACTCATTAATTTTTAGAAT
516 TCTCTTAATCATTAATTTTTAGAAT
* * * * * * *
4529 AATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATGGAAACAATTGTTTTATTAT
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTAGATGAATTGAAACAATTGTTTTATGAC
** * *
4594 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTG
66 AAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
* * *
4659 TTTAATAAACATATAT-TTTTTAAATCTTTTAGTTATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATTAAT
130 TTCAGTAAACATATATATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTGTAGAAATATTAATAAATTAAT
* * * * * *
4722 GTTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTCTTTGATGACAAAACAAAAAGTCA
195 ATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTCA
* * ** * * *
4787 TAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAAAGATTTGACCT-TGTTCAGTAAGCATA
260 TAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATGTTCAGAAAACATA
*
4851 TTTA-TTTTTAAATCTTTACTTATTAATTATCTT-AATATTAATAATTTATGTTATTTTATTTGA
325 TTTAGTTTTTAAATCTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTAATAATTTATATTATTTTATTTGA
* * * * * *** *
4914 AATAAGATTGTATAAAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACACAA-GGTTATAGCAATTTCAAA
388 AATAAGATTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AATGGTCATAATGATTTGAAA
* * * *
4978 TAGATAATTGTTTAAATAGTCGTAATTATTTAAACTTGTTTGTTAAATAGATTCATTTTTTAAAT
452 TAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAAT
* *
5043 CTCTTAATTATTAATTTTTGGAAT
517 CTCTTAATCATTAATTTTTAGAAT
** * * * * *
5067 ATTAATAGCTTAGAATTATTTTATTTCGAATAATTTTAGATTAATTGAAATAATTTTTTTATGGC
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTAGATGAATTGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
5132 AAAACGAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAG
66 AAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
* * * *
5197 TTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAT-TTTTTTTTATT--TTTGTTGAAATTTTAATAAATTAAT
130 TTCAGTAAACATATATATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTGTAGAAATATTAATAAATTAAT
* * * *
5259 ATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAT-AAAGATAAACTATTTTTTTATAACAAAACAAAAAGTC
195 ATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTC
5323 ATAACA
259 ATAACA
5329 TTTGAACTAA
Statistics
Matches: 1540, Mismatches: 283, Indels: 110
0.80 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
533 5 0.00
534 103 0.07
535 39 0.03
536 119 0.08
537 98 0.06
538 321 0.21
539 88 0.06
540 195 0.13
541 297 0.19
542 52 0.03
543 134 0.09
544 88 0.06
545 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (540 bp):
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAATTTTAGATGAATTGAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
TCAGTAAACATATATATTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATA
TTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT
AACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATGTTCAGAAAACATAT
TTAGTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAATTTATATTATTTTATTTGAAAT
AAGATTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGA
TAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCT
TAATCATTAATTTTTAGAAT
Found at i:6254 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 6223--6261 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
6213 TTATTAATAA
6223 GTTTATATGACTAGAAATAATT
1 GTTTATATGAC-A-AAATAATT
6245 GTTT-TATGACAAAATAA
1 GTTTATATGACAAAATAA
6262 AGATCATATC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 3
0.85 0.00 0.15
Matches are distributed among these distances:
19 6 0.35
20 1 0.06
21 6 0.35
22 4 0.24
ACGTcount: A:0.44, C:0.05, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (20 bp):
GTTTATATGACAAAATAATT
Found at i:6595 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 6228--7386 Score: 1088
Period size: 179 Copynumber: 6.5 Consensus size: 180
6218 AATAAGTTTA
* * * * * * *
6228 TATGACTAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATATCAATTTAAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATAGT
* * * *
6292 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAATCAAATTTA-GTTTTAGAATC---T-CTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTA-AATCTTTTACTTA
*** * * * * **
6352 TTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTGTTCTATTTTGAATAATTTTG
129 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACCTTG
** *
6404 TATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGT
* * * ***
6469 TCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * *
6534 TAATTTTTAGAATATCAATAAATTAGTATTATCTTATTTCAAATAAACTTG
130 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACCTTG
* * * * *
6585 TATGAATAGAAACTATTGTTTTATGGCAAAGCAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTA-
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAG
* ** * * *
6649 TTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGT-AACAAGATTTATCTTTTAAATCTTTTAGTT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-ATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
6713 ATTAATTTTTGGAA-ATGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTT-
128 ATTAATTTTTGGAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-CCTTG
* * * * * *
6766 TATGTATAGAAACAATTGGTTTATTATAAAAAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTT
** ** * * * *
6831 CAAATAGTTGTAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATGTTTTAAAT-TTTTACTTAT
66 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
6894 TAATCTTTGGAATATTAGTAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTG
130 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAACCTTG
* * * * * * *
6944 TATGAACACAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTCATAATGATTTAAAATGGATACCT-G
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGTCATAACGATTTGAAATAGATA-ATAG
* * * *
7008 TTGAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA--TA
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* ** * * * * *
7071 TTTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTCCTATAATTTTATTTCCAATAAGCATA
129 -TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACCTTG
* * *
7124 TATGAATTGATACAATT-TTTTATGGCAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAG
* * ** *
7187 TTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTGTTTTTT-AATCTTTTACTTA
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * *
7251 TTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAAGCCTT-
129 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAA-CCTTG
* * * *
7303 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-TTTGAAATAAATAATTA-
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAG
* *
7366 TTTAAATAGTGATAACTATTT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTT
7387 AAATTTATAA
Statistics
Matches: 807, Mismatches: 142, Indels: 65
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
176 27 0.03
177 74 0.09
178 60 0.07
179 281 0.35
180 138 0.17
181 222 0.28
182 5 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTT
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACCTTG
Found at i:8524 original size:355 final size:357
Alignment explanation
Indices: 7854--8725 Score: 875
Period size: 355 Copynumber: 2.4 Consensus size: 357
7844 AACAGATTTA
* * * * * * * *
7854 TTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTAAG-ATACTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCTGA
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAA-TTTCAAGAATATTATTAATTTAGA-ATTATGTTATTCTGA
* * * * * * * * * *
7917 ATAAATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACATG-ACAAAAGGTAATAACGATTTAAAAT
64 TTAAATATATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATA-GAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
* ** * *
7981 AAATAATCATTCAAATA-TCCATAATTATTTGAACT-AGTTC-ACCTAATAAAATTATTTTTTAA
128 AGATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTTAACTGA-TTCGA--TAA-AAAATTATTTTTTAA
* * * * *
8043 ATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCAATTTATTTTATTCTAAATAAGTTAGT
188 ATCTCTTACTCA-TAAATTTTGAAATATTAATAAACTCAATTTATTTTATTCGAAATAACTTAGG
* * *
8108 AAGAGCTGAAAAAATTGTTTTACAATAAAATAAAATGCCATAACTATTTGAAATAGATAATTATT
252 AAGAGCTGAAAAAATTATTTTACAACAAAACAAAATGCCATAACTATTTGAAATAGATAATTATT
* * **
8173 CATATAGCCTTAACTATTTAAAATAGTTTGGCAAACAATTTT
317 CATATAGCCTTAACTATTTAAAATAGTTCGACAAACAA-AAT
* * *
8215 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAA-AATATTATTAGA-TTAGTATTATTTTATTCTA
1 -TTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATT-TCAAGAATATTATTA-ATTTAGAATTATGTTATTCT-
* * *
8278 GA-TAAGCT-TGT-TGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
62 GATTAA-ATATATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
* * * *
8340 ATATG-TAATTGTTTATATAGTTATAATTATTTTAACTGATTCGATAAAAAATTATTTTTTAAAT
126 ATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTGATTCGATAAAAAATTATTTTTTAAAT
*
8404 CTCTTA-T-A-AAATTTTGAAATATTAATAAACT-AGTTTTATTTTATTACG-AATAAACTT-GG
190 CTCTTACTCATAAATTTTGAAATATTAATAAACTCA-ATTTATTTTATT-CGAAAT-AACTTAGG
* * * *
8463 ATGAGCTGAAATAATTATTTTATAACAAAACCAAAA-GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTA
252 AAGAGCTGAAAAAATTATTTTACAACAAAA-CAAAATGCCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * *
8526 TTCATATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTCGATAAACAAAAT
315 TTCATATAGCCTTAACTATTTAAAATAGTTCGACAAACAAAAT
* *
8569 TTTTTTAAATTTCTTAGTTATGAATTTTAAGAATATTATTAATTTAGAATTATGTTATTCTGATT
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTCAAGAATATTATTAATTTAGAATTATGTTATTCTGATT
* *
8634 AAATATATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATAATTTGAAATAGA
66 AAATATATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGA
8699 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
131 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
8726 GAGCTTATTC
Statistics
Matches: 427, Mismatches: 61, Indels: 52
0.79 0.11 0.10
Matches are distributed among these distances:
352 7 0.02
353 56 0.13
354 77 0.18
355 117 0.27
356 9 0.02
357 1 0.00
358 1 0.00
359 23 0.05
360 4 0.01
361 72 0.17
362 56 0.13
363 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (357 bp):
TTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTCAAGAATATTATTAATTTAGAATTATGTTATTCTGATT
AAATATATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGA
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTGATTCGATAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA
CTCATAAATTTTGAAATATTAATAAACTCAATTTATTTTATTCGAAATAACTTAGGAAGAGCTGA
AAAAATTATTTTACAACAAAACAAAATGCCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCC
TTAACTATTTAAAATAGTTCGACAAACAAAAT
Found at i:8693 original size:179 final size:175
Alignment explanation
Indices: 7851--8725 Score: 594
Period size: 181 Copynumber: 4.9 Consensus size: 175
7841 GCAAACAGAT
* * * * * * *
7851 TTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTAAGATACTAATAAATTAATATTATTTTATTCTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA-TAAATTTTAAAATA-TTATTAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * * * * * * ** *
7916 AATAAATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACATG-ACAAAAGGTAATAACGATTTAAAA
64 -ATAAA-TTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATA-GAACAAAA-GTTATAATAATTTGAAA
* * * * *
7980 TAAATAATCATTCAAATA-TCCATAATTATTTGAACTAGTTC-ACCTAATA-AAA
125 TAGATAATTATTCATATAGT-CTTAATTATTTAAACTAGTTCGA--TAA-ACAAA
* * * * * *
8032 TTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCAAT-TTATTTTATTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA-TAAATTTTAAAATATT-ATTAATT-AGTATTATTTTATTCT
* * * * * * * ** * * **
8096 AAATAAGTTAGTAAGAGCTGAAAAAATTGTTTTACAATAAAATAAAATGCCATAACT-ATTTGAA
63 -GATAAATT-GTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAA-GTTATAA-TAATTTGAA
* * * * ** *
8160 ATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTAAAATAGTTTGGCAAACAATT
124 ATAGATAATTATTCATATAGTCTTAATTATTTAAACTAGTTCGATAAACAA-A
* *
8213 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATT-TTAAAATATTATTA-ATTAGTATTATTTTATTCT-
* * *
8278 GATAAGCTTGT-TGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
63 GATAA-ATTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAA-GTTATAATAATTTGAAAT
* * *
8342 ATG-TAATTGTTTATATAGT-TATAATTATTTTAACT-GATTCGATAAA-AAA
126 A-GATAATTATTCATATAGTCT-TAATTATTTAAACTAG-TTCGATAAACAAA
* * * *
8391 TTATTTTTTAAATCTCTTA--TA-AAATTTTGAAATATTAATAAACTAGTTTTATTTTATTAC-G
1 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTAAAATATT-ATTAATTAGTATTATTTTATT-CTG
* * * * * * * *
8452 AATAAACTTGGATGAGCTGAAATAATTATTTTATAACAAAACCAAAAGTCATAATGATTTGAAAT
64 -ATAAA-TTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAA-CAAAAGTTATAATAATTTGAAAT
* *
8517 AGATAATTATTCATATAGTCTTAATTGTTTGAACTAGTTCGATAAACAAA
126 AGATAATTATTCATATAGTCTTAATTATTTAAACTAGTTCGATAAACAAA
* * * * *
8567 AT-TTTTTTAAATTTCTTAGTTATGAATTTTAAGAATATTATTAATTTAGAATTATGTTATTCTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTAA-AATATTATTAA-TTAGTATTATTTTATTCTG
*
8631 ATTAAATATATATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATAATTTGAAAT
64 A-TAAAT-TGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAA-GTTATAATAATTTGAAAT
* * * *
8696 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
126 AGATAATTATTCATATAGTCTTAATTATTT
8726 GAGCTTATTC
Statistics
Matches: 542, Mismatches: 115, Indels: 76
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Consensus pattern (175 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTAAAATATTATTAATTAGTATTATTTTATTCTGAT
AAATTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGTTATAATAATTTGAAATAGATA
ATTATTCATATAGTCTTAATTATTTAAACTAGTTCGATAAACAAA
Found at i:9404 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 8894--13764 Score: 2227
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8884 GTATGTTGAA
* * * * * * ***
8894 AAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGC
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* * * * *
8959 CATAATTATTTGAATTGATTCAGTAAATTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
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* * ** *
9023 AAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTTAACT-T--TTG--TGAACTA
128 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAA-TATGCTTGTATGAACTG
* ** * * * *
9071 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAATTAGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* * *
9136 CATAACTATTTGAACTTTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
65 CATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAA-TTTT
* * *
9201 TGAAA-GTTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTCGAATATGCTTGTATGAATTG
127 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * *
9253 AAACAATTATTTTACGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATATTTATTCTAATAAT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* * * * *
9318 CTTAACTATTTGAACTGAT-ACGCAAACACATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAATTTTCA
65 CATAACTATTTGAACTGTTCA-GTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTA
* * *
9382 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTCGAAT-TAGCTCGTATG-ATTAG
129 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-TTCGAATAT-GCTTGTATGAACT-G
* * * * ** * *
9433 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATGATAATGATTTGAGATTTATATTTGTTCAAATAATC
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATC
* * ** * * * * * *
9498 CTAACTATTAGAACTGCTTTGGAAAACA-ACTTTAGTTTTCAAATCTCTTACTTAATAATTTTTT
66 ATAACTATTTGAACTG-TTCAGTAAACACA-TTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTA
* * * * * *
9562 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTC-AGATAAGTTTTTATTAACAG
129 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGA-ATATGCTTGTATGAACTG
* * * *
9613 AAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCCA-AATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GT-TATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAA
* * * *
9677 TCATACCTATTTGAAATTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
64 TCATAACTATTTG-AACTGTTCAGTAAACACATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTT
** * * * *
9742 TTGAATGTTAATAAATAAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAT--A-TG
127 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTC-GAATATGCTTGTATGAACTG
* * ** *
9792 --AC---TA----A-G-C---A-AAAGGTTAGAACAATTTAAAATAGATAATTATCT-AATAGT-
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTAT-TCAA-A-TA
* * * ** * * * *
9840 CT-TTAACTATTTGAATTGGTTTGGCTAAA-ATATTTATTTTTTAAAACTCTTACCTATTAATTT
63 ATCATAACTATTTGAACT-GTTCAG-TAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
* * * * * **
9903 TTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAAAAG
126 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * * *
9957 AAATAATTGTTGTATGA-AAAA-ATAAAGTTCATTACGATTT-AAGATGGATAATTGTTC-AATA
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGTT-ATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATA
* * * * *
10018 GTCATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTT
63 ATCATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* * * *
10079 CAAAATATTAATAAATCAGTATTATTTTATTT-GAATA--ATTCTATTGAA-TAG
127 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTA-TGAACT-G
* * * * * ** * *
10130 AAACAATTTTTTTACGATAAAACAAGAGATCACGATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATGGA
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AA
* ** * * * * * **
10195 -CATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAATATTTATTTTTTAAATCTCCTAC-CATTAATTTAG
64 TCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
* * * * * ** *
10258 AGAATATTAAAAAATTAGTATTGTTTTATTCCAAATAAACTTGAATGAA-TAG
128 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACT-G
* * * * * * * * * *
10310 AAAGAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACT-ATGTGAAATAAAAAATTGTTGAAATAG
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAA
* ** * * **
10374 TCATAACTGTTT-AAGCT-TACTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTT
64 TCATAACTATTTGAA-CTGT--TCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
** * ** * *
10437 TTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTTAATAAGCTTGTATGGA-TAG
126 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACT-G
* ** * * ** * ** * *
10491 AAACCATTGGTTTATCACAAAATAAAAGGCCATAACT-ATTTCAAATAGATAATTGCTCAAACAG
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAA
* * * * * **
10555 TCA-AAGCTACTTGAACGTGTTCTG-AAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAAATT
64 TCATAA-CTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* * *
10617 TGAAATATTAATAAATT--TAATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
127 TAAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTTTTC-GAATATGCTTGTATGAACT-G
* * * * *
10669 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAGTAAT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* *** * * *
10734 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATGGATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTTTT
65 CATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
* * * * *
10799 AGAATATTAATAAATTAGTGA-TATTTTATTTCTAATAAGCCTATATGAACTG
128 AAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * * *
10851 ATACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGATCATAACGGTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 AAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAG-TTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAA
* * * * * * * *
10916 TTATGACTATTTGAACTTTTTCAATAAACATATTTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
64 TCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
* * * * * **
10980 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAA-AA
128 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * ** * * * *
11031 AAACAATTGTGTCATGAC-AAAC-AAAGTTCATAAAACAATTTGAAATAAAT-ATTGTTTAACTA
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTT-AT--AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * *
11093 GTCCCATAACTATTTGAACTCTATTC-GATAAATAAATTTATTTTTT-AATCT-TTACTTATTAG
63 AT--CATAACTATTTGAA--CTGTTCAG-TAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA
* * * * ** *
11155 TTGTCT-GAATATTAATAAATTTGTATAATTTTTTTTTAAATAAAGCTTGTATGAA-TAAG
123 TT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTTTTCGAAT-ATGCTTGTATGAACT--G
* * * *
11214 AAA-ATTTTGTTTTATGATCAAAACAAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
1 AAACA-ATTATTTTATGA-CAAAAC-AAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * * **
11278 AGTCATAATTATTTGTACTTGTTCGGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTT
62 AATCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
* * * * * ** * *
11343 TTAAAATATTAATAAAATAGAATTGTGTTATTTCAAATAAACGTGTATGAA-TAA
126 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTTTTCGAATATGCTTGTATGAACT-G
* * * * * * ***
11397 AAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAACGGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* * ** * * * *
11462 CATAACTATTTGTGA-TGGTCAAGCCAACATATTTGTTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT
65 CATAACTATTTG-AACTGTTC-AGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
* * * ** * *
11526 AGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCGAATAAAAC-TGTATCAA-TAA
128 AAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTTTTCGAAT-ATGCTTGTATGAACT-G
* * * * * * * *
11578 AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* * * * * * * *
11643 TATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTCTTAATTTTCA
65 CATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTA
* * ** * **
11708 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAA
129 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * *
11759 AAACATTTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAAATAG
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAA
* * * * * * * * *
11824 TCATAATTATATGAACTGGTT-ATGCAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAAGTTT
64 TCATAACTATTTGAACT-GTTCA-GTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* * * * * * * *
11888 TGAATTGTTAATAAATGT-GTTTTATTTTATTTCAAAT-TAG-TTACTAAGAATTG
127 TAAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTT-TTTCGAATAT-GCTT-GTATGAACTG
* * * * * * * * * *
11941 AAAAAATTGTTTTACGACAAAACCAAAGGTATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATAT-AGC
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATC
* * * * * *
12005 TTTAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAG-TTATTAATTTTA
66 -ATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTT
* * * * ** * **
12069 AAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTGTGAACAA
128 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * ** * * **
12121 AAATAATTGTTTTATGAGATAACAACAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATGGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* * * * *
12186 CATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTAACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTG
65 CATAACTATTTGAACT-GTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTA
* * * * *
12247 AAATATTAGTAAATTAGTATTGTTTTATTCCAAATAGGCTTGTAT-AA-TG
129 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * ** * *
12296 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGCTAATTATTCTAAT-
1 --AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * ** ** *
12360 AGCTATAATTATTTAAACTAATT-TGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATT
63 ATC-ATAACTATTTGAACT-GTTCAG-TAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT
* * * * ** * *
12424 TTTTAAA-ATTAATAAAGTAATATTACTTTATTTT-GGATAAACTTTTATGTACTG
125 TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-TTTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * * * * * *
12478 ACATAGTTGTTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAATGATTTTAAAGAGATAATTGTTCAAATAGA
1 AAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-A
* ** * * * * *
12543 -CATAACTATTTGAACTTATTTGGT-AA-ATATATATTTTTTAAATTTCTTACTTATTGATTTTC
64 TCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT-
* * * * * *
12605 T-CAATGTTAATAAATTAATATTATTATATTTT-TAATAAGCATGTATGAACTG
127 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATT-T-TTTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * ** * * *
12657 AAATAATTATTTTTTGACTAAACAAAAGATCAAAACAATTTGGAATAAATCATTATT-ATAATAA
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAA
* * * * * * *
12721 TCTTAATTATTTGAACTGATT-TG-AAAAACATATT-TATTTTAAA-ATC---CTTATTATTTTT
64 TCATAACTATTTGAACTG-TTCAGTAAACACAT-TTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* * * * *
12779 TGAAATAGTAATAAATTGGTACTATTTTATTAT-GAATAAT-TTTGTATGAA-TAG
127 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TT-TCGAAT-ATGCTTGTATGAACT-G
* ** *
12832 AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-TATCATAACAATTTGAAATAGATAA-CAGTTCAAATG
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGT-T-ATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-
* * * ** * **
12895 GA-CATGATTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTT
62 AATCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
* * * **
12959 TTAGAAT-TATAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-TAG
126 TTAAAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACT-G
* * * ** * * *
13013 AAAAAATTATTTTATGAGAAAACAAAAGATTGTAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATACT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* * * * * **
13078 CATAACT-TTTGGAACTTGCTT-AGTAAACAAATTTACTGTTTAAATATTTTATTTATTAA-TTT
65 CATAACTATTT-GAAC-TG-TTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* * * * * * *
13140 TAGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAGCAG
127 TA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * * * * * * *
13194 AAATAGTTAGTTTATG-GAAAACAAATTGTCATAACGATTTAAAATAGATAAGTACTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
* * * * * *
13258 CATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTTCTTATTAATTTTTG
65 CATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
13322 AAATTTTAATAAATTTATTGTTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAA-TAG
129 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTTTTC-GAATATGCTTGTATGAACT-G
* * * *
13374 AACCAATTATTTTATGACAAAACAAATAGTTATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAG
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAA
* * * * * * * *
13438 TCATAAGTATTTGAACTTGTT-TGATAAATAGATTGATTTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA
64 TCATAACTATTTGAAC-TGTTCAG-T-AA-ACA--CATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA
*** * * * * * *
13502 TTTTTGGTATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATTATCTG
123 TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
* * * * * * * *
13559 AAACAATTGTTTTATTACAAAATAGAAGGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAT
*** ** * * * * * * *
13624 CATGGTTATTCAAACTTGTTCAGT-AA-ATATATATATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTG
65 CATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTA
* * * * *
13687 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
129 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAATATGCTTGTATGAACT-G
*
13738 AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
13765 AGTCAAAACA
Statistics
Matches: 3663, Mismatches: 795, Indels: 471
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
162 60 0.02
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167 1 0.00
168 1 0.00
169 1 0.00
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173 20 0.01
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188 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATC
ATAACTATTTGAACTGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTAAA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTCGAATATGCTTGTATGAACTG
Found at i:9824 original size:163 final size:162
Alignment explanation
Indices: 9650--9950 Score: 394
Period size: 162 Copynumber: 1.9 Consensus size: 162
9640 GGTCCAAATG
* *
9650 ATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATACCTATTTGAAATT-GTTCAG-TAAATAGATTT
1 ATTTAAAATAGATAATTA-TCAAATAGTCTATAACTATTTG-AATTGGTTCAGCTAAA-AGATTT
* * * * * *
9712 ATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATAAGTATTATTTTATTCTG
63 ATTTTTTAAAA-CTCTTACCTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATAAGTATCATTTTAATATG
9776 AATAAGCTTGTATATGACTAAGCAAAAGGTTAGAACA
126 AATAAGCTTGTATATGACTAAGCAAAAGGTTAGAACA
* * ** *
9813 ATTTAAAATAGATAATTATCTAATAGTCTTTAACTATTTGAATTGGTTTGGCTAAAATATTTATT
1 ATTTAAAATAGATAATTATCAAATAGTCTATAACTATTTGAATTGGTTCAGCTAAAAGATTTATT
* *
9878 TTTTAAAACTCTTACCTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTAATATGAATAA
66 TTTTAAAACTCTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAAGTATCATTTTAATATGAATAA
9943 GCTTGTAT
131 GCTTGTAT
9951 GAAAAGAAAT
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 15, Indels: 9
0.83 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
161 6 0.05
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164 4 0.03
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.10, T:0.45
Consensus pattern (162 bp):
ATTTAAAATAGATAATTATCAAATAGTCTATAACTATTTGAATTGGTTCAGCTAAAAGATTTATT
TTTTAAAACTCTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAAGTATCATTTTAATATGAATAA
GCTTGTATATGACTAAGCAAAAGGTTAGAACA
Found at i:10978 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 9788--13778 Score: 2692
Period size: 181 Copynumber: 22.2 Consensus size: 179
9778 TAAGCTTGTA
* * * * * * * * *
9788 TATGACTAAGCAAAAGGTTAGAACAATTTAAAATAGATAATT-ATCTAATAGTCTTTAACTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTT
* * * *
9852 GAA-TTGGTTTGGCTAAA-ATATTTATTTTTTAAAACTCTTACCTATTAATTTTT-GAAATATTA
65 GAACTT--TTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTA
* * * * * * *
9914 TTAAATTAGTATCATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTG
126 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATG-AATGAAACAATTGTTT
* * * *
9969 TATGA-AAAA-ATAAAGTTCATTACGATTT-AAGATGGATAATTGTTC-AATAGTCATAATTATT
1 TATGACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
10030 TGAACTGGTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
64 TGAACT-TTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * *
10091 AAATCAGTATTATTTTATTT-GAATAA--TTCTATTGAATAGAAACAATTTTTT
128 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA-TGAAT-GAAACAATTGTTT
* * * * ** * * * * * *
10142 TACGATAAAACAAGAGATCACGATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATGGACATGACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * ** *
10207 AACTTGTTTGGTAAAAATATTTATTTTTTAAATCTCCTAC-CATTAATTTAGAGAATATTAAAAA
66 AACTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
* * * * *
10271 ATTAGTATTGTTTTATTCCAAATAAACTTGAATGAATAGAAAGAATTGTTT
130 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
10322 TATGACAAAATAAAAGATCATAACTATGTGAAATAAAAAATTGTTGAAATAGTCATAACTGTTT-
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
10386 AAGCTTACTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
66 AA-CTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* ** * * *
10451 AGTTAGTATTATTTTATTTTTAATAAGCTTGTATGGATAGAAACCATTGGTT
129 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
10503 TATCACAAAATAAAAGGCCATAACTATTTCAAATAGATAATTGCTCAAACAGTCA-AAGCTACTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTT
* * **
10567 GAACGTGTTCT-G-AAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAAATTT-GAAATATTAA
65 GAAC-T-TTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAA
*
10628 TAAATT--TAATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTT
127 TAAATTAGT-ATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * * * *
10681 TATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAGTAATCATAACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *** * * *
10746 AACTTGTTCAATAAATGGATTCATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATA
66 AACTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * *
10811 AATTAGTGA-TATTTTATTTCTAATAAGCCTATATGAACTGATACAATTGTTT
129 AATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTT
* * * * * *
10863 TATGACAAAAAAAAAAGATCATAACGGTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTT
1 TATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
10928 GAACTTTTTCAATAAACATATTTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
65 GAACTTTTT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * * ** *
10992 AATTAATATTATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAAAAAAACAATTGTGT
129 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTT
* * * * * *
11043 CATGAC-AAAC-AAAGTTCATAAAACAATTTGAAATAAAT-ATTGTTTAACTAGTCCCATAACTA
1 TATGACAAAACAAAAGGTCAT--AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT--CATAACTA
* * * * * *
11105 TTTGAACTCTATTCGATAAATAAATTTATTTTTT-AATC-TTTACTTATTAGTTGTCT-GAATAT
62 TTTGAACT-TTTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAGAATAT
* * * * *
11167 TAATAAATTTGTATAATTTTTTTTTAAATAAAGCTTGTATGAATAAGAAA-ATTTTGTTT
124 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAAT--GAAACA-ATTGTTT
* ** *
11226 TATGATCAAAACAAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
1 TATGA-CAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * * * * * *
11291 TGTACTTGTTCGGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
64 TGAACTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAAT
* * * * * * *
11356 AAAATAGAATTGTGTTATTTCAAATAAACGTGTATGAATAAAAACAATTGTTT
128 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * * * **
11409 TGTAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAAACGGTCATAACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** ** * *
11474 TGA-TGGTCAAGCCAACATATTTGTTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
66 -AACT-TTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * * * *
11538 AATTAGTATTACTTTATTCCGAATAAAAC-TGTATCAATAAAAACAATTGTTT
129 AATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * ** * * *
11590 TATTACAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
11655 AACTGGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATA
66 AACT-TTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* ** * * ** *
11719 AATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTT
129 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTT
* * * *
11771 TGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAAATAGTCATAATTATAT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTT
** * * * * * * * *
11836 GAACTGGTTATGCAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAAGTTTT-GAATTGTTAAT
65 GAACTTTTTA-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAAT
* * * * *
11900 AAATGT-GTTTTATTTTATTTCAAATTAG-TTACTAAGAATTGAAAAAATTGTTT
128 AAAT-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAA-TGAAACAATTGTTT
* * * * * * *
11953 TACGACAAAACCAAAGGT-ATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAG-CTTTAACTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTT
* * * * * * *
12016 GAACTAGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTAAAAATATTATTA
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* * * * ** *
12081 TATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTGTGAACAAAAATAATTGTTT
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* * * * * * *
12133 TATGAGATAACAACAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * *
12198 AACTGGTTCGGTAAACATATTAACTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT-GAAATATTAGTA
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* * * *
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* * * * * *
12310 TATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGCTAATTATTCTAATAG-CTATAATTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTT
* * * * *
12374 AAACTAATTT-GATAAAC-TGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTTA-AA-ATTA
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* * * *** * * * * * *
12435 ATAAAGTAATATTACTTTATTTTGGATAAACTTTTATGTACTGACATAGTTGTTT
126 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-AATGAAACAATTGTTT
* * * * * * *
12490 TATGATAAAATAAAAAGTCATAATGATTTTAAAGAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
12555 AACTTATTTGGT-AA-ATATATATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTGATTTTCT-CAATGTTAAT
66 AACTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TAGAATATTAAT
* * ** * * *
12616 AAATTAATATTATTATATTTTTAATAAGCATGTATGAACTGAAATAATTATTT
128 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTT
* * * * * * * * * * * *
12669 TTTGACTAAACAAAAGATCAAAACAATTTGGAATAAATCATTATT-ATAATAATCTTAATTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
12733 GAACTGATTT-GAAAAACATATTTA-TTTTAAAATC-CTTA-TTATT--TTTTGA-AATAGTAAT
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* * * ** *
12791 AAATTGGTACTATTTTATTAT-GAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTT
128 AAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* ** * ** * * * *
12844 TATGACAAAATAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAACAGTTCAAATGGACATGATTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
12909 AACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAAT-TATAATA
66 AACTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATAT-TAATA
* * * *
12973 AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAAAATTATTT
129 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * ** * * *
13025 TATGAGAAAACAAAAGATTGTAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATACTCATAACT-TTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-
* * * * * *
13089 GAACTTGCTTAGTAAACAAATTTACTGTTTAAATATTTTATTTATTAA-TTTTAGAAATATTAAT
65 GAACTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT
* * * * *
13153 AAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAGCA-GAAATAGTTAG-TT
128 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA--ATGAAACAATT-GTTT
* ** * * **
13206 TATG-GAAAACAAATTGTCATAACGATTTAAAATAGATAAGTACTCAAATAGTCATAACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
13270 AACGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTTCTTATTAATTTTT-GAAATTTTAATA
66 AAC-TTTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATA
* * * * *
13333 AATTTATTGTTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTATTT
129 AA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * * * * *
13386 TATGACAAAACAAATA-GTTATAA-TATTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAAGTATT
1 TATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
13449 TGAACTTGTTT-GATAAATAGATTGATTTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGTATA
64 TGAACTT-TTTAG-T-AA-ACA-T-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * *
13513 TTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATTATCTGAAACAATTGTTT
123 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATGAAACAATTGTTT
* * * * ** * *** **
13571 TATTACAAAATAGAAGGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGGTTATTCA
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
13636 AACTTGTTCAGT-AA-ATATATATATTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATA
66 AACTT-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATA
* * * *
13698 AATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTT
129 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTT
* * * *
13750 TATGACAAAATAAAAAGTCAAAACAATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
13779 TGTTTGTAGA
Statistics
Matches: 2978, Mismatches: 671, Indels: 324
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TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTT
Found at i:14129 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 13794--14450 Score: 665
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13784 GTAGAACTAT
* * * * *
13794 TTCAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCT
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* * * * *
13859 TAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AAT-AAATAATACTAATTTATTAATATT
13923 TCAAAAATTAATACA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAA
129 TCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTACCAAA-CAA
* * * ** * *
13975 TTCAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCA
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* *
14040 TAAAA-AAATTGTTTTTGTTCATACAATCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATT
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* * * ** ** *** *
14104 AT-GAAAATTAATAAGTAACAGATTTAGAAAATGTATCTATTGGCTTGACTAG
129 -TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTACCAAAC-AA
* * * * * *
14156 TACAAACAATTATGACTGTTTGAATAATTATCTGTTTCAAATTGTTATGGCCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
14221 CAAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTCATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATT
66 -TAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAA-ATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
14286 TCAAAAATTAATTAGTAAGA-ATTTTAAAAATAAATCTTTTAACAAA-AA
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTACCAAACAA
*
14334 GTTCAAATAGTTATGACTATTTTGAACAATTAT-TATTT-AAATTGTTAT-ACCTTTTTGTTTTG
1 -TTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTG
**
14396 TCATAAAACAAAT-TTTTCATTCATACAAGC-T-TTCA-AATAAATAATACTAATTTAT
63 TCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATAATACTAATTTAT
14451 AAATTTAAAT
Statistics
Matches: 386, Mismatches: 77, Indels: 35
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
172 14 0.04
173 5 0.01
174 4 0.01
176 15 0.04
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTACCAAACAA
Found at i:14822 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 14482--16984 Score: 1776
Period size: 179 Copynumber: 14.2 Consensus size: 179
14472 TTTAAAAGAT
* * * *
14482 AATTATTTAATTTCAAAT-GTTATGA-CTTTTG--TTGTCAT-AAACAATTATTTTTGTTCATAC
1 AATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** * * * * *
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** * * * * *
14607 AAAAAATAAATATGCTTACCGAACAAATTCAAATAGTAATAACTATTTGAAT
128 AAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** * * *
14659 AATTATCTATTTCAAGTCGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTATCAATTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * *
14724 GGCATATTCAAAACAAAATAATACTAACTTACTACTATTCTAAAAATTAATGAGTAAGATTTAAA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAA
* * * * *
14789 AAATGAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTGTTTGAAC
131 AAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
14838 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
*** * * * * *
14903 AGCTTATTTTGAATAAAATAAT-GTAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAAGTAAAAATTT-
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGATTTA
* **** * * *
14966 AAAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAT
129 AAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * *
15017 AATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGCTTCTATTCA-AAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * *
15081 AACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTCAA-ATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTT
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAGATTT
* *** * * *
15145 AAAAAATAAAT-CATTTACCAAGTGAGTTAAAATAGTTATGACTATTTAAAT
128 AAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
15196 AATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** *
15260 AAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGATTTAAA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAA
* * * ** *
15323 AACT-AA-ATGTTTATCGGACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
131 AAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
15370 AATTATCTATCTCAAATTGGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TCTATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATAC
* ** * * * ** * *
15433 AAACTTATTCGGAGTAAAATACTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTTATAAG--AGATTTAA
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAA
* ** * * *
15496 AAAATAAATGTATTTGGCAAATC-CGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC
130 AAAATAAATATATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * *
15546 AATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * *
15610 ATGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGGAATT
65 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-G-ATT
*
15674 TAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
127 T-AAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
15728 AATTATC-ATTTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTC-ATTTCATA
1 AATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * * * *
15791 AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGA-AATTGGAGA
64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT-A-ATAAGT-AAGA
* * *
15854 -TTAAAAACATAAAT-TAGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAAC
125 TTTAAAAA-ATAAATATA-TTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
15909 AATTATCTATTTCAGATTGTTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-TCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * **
15972 AAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAACATATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAG---TA
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGATTTA
* * * * ** * *
16029 CAAGAT-TATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
129 AAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * **
16079 AATTATATATTTCAAGTCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTGATATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * *
16144 AACTTTTTAAAAATAAAATAATAC--------T-A-A-TCTAATAA-TATTAAG--AGATTTGAA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAA
* * **** * * * * *
16195 AAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAAT
131 AAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * *
16244 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGTCCTTTTTGTTTTGTCGTAAAATAAATAT-TTTTTGTTTAT
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTCTATTCAT
* * * * * * * * *
16308 ATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGATTT
63 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTT
* * * * * * *
16371 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTT-AAGC
128 AAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-C
* * * * * * * * *
16423 AATTATTTATTTCATATCGTTATGACCATTTGCTTTATCTTAAAACAATTATTTCTATTGATA-T
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * * *
16487 AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATCCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTT
66 AG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-AGATTT
* * * ** *** * *
16552 AAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAGTGCAAATAGTTATGACTATCTT-AAC
128 AAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAAC
* ** * *
16604 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTACTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
16669 AGCTTATT-AGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTT
66 AGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-AGATTT
* * * *** * *
16733 AAAAACTAAATTTGTTTATTGAACAACTTCAAATAGTTATGATTATTTGAAC
128 AAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *** * *
16785 AATTACCTATTTAAAATCACCATAACTTTTTTGTTTTGTCAT--AA-AA----TTC----C-TAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * *
16838 AAGCTTATTTC-AATTAAAATAATGCAAATTTATT-ATCATTC-AGAAAATTAATAAGTAAAAGA
65 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTA-AAAATTAATAAGT--AAGA
* * *** * *
16900 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGTATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
125 TTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
16955 AAATATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
16985 AACGATTTGA
Statistics
Matches: 1852, Mismatches: 387, Indels: 183
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
160 6 0.00
161 4 0.00
162 4 0.00
163 1 0.00
164 5 0.00
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184 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAA
AAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
Found at i:15163 original size:358 final size:358
Alignment explanation
Indices: 14482--16985 Score: 1834
Period size: 351 Copynumber: 7.1 Consensus size: 358
14472 TTTAAAAGAT
* * * * *
14482 AATTATTTAATTTCAAAT-GTTATGA-C-TTT-TGTTGTCAT-AAACAATTATTTTTGTTCATAC
1 AATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** * * *** *
14542 TAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTT
65 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTT
* ** * * *
14607 AAAAAATAAATATGCTTACCGAACAAATTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
129 -AAAAATAAATATGTTTACCGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * ** * * * ** *
14672 AAGTCGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTATCAATTCATATAGGCATATTCAAAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCAAAA
* * * * * * *
14737 CAAAATAATACTAACTTACTACTATTCTAAAAATTAATGAGT-A-AGATTTAAAAAATGAATCTA
258 TAAAATAATACTAATTTATTA-AATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TA
* * *
14800 TTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTGTTTGAAC
321 TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* *
14838 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * *
14903 AGCTTATTTTGAATAAAATAAT-GTAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAAGTAAAAATTTA
66 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTA
*** * * *
14967 AAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAA
130 AAAATAAATATGTTTACCGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
15032 ATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGCTTCTATTCA-AAAAACTTATTTAGAATA
195 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCAAAATA
* * *
15096 AAATAATACTAATTTATTCAAATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCATTT
260 AAATAATACTAATTTATT-AAATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTATTT
* * * * *
15161 ACCAAGTGAGTTAAAATAGTTATGACTATTTAAAT
324 ACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
15196 AATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * * **
15260 AAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
66 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAA
* * *
15322 AAACT-AA-ATGTTTATCGGAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCA
131 AAA-TAAATATGTTTACCGAACAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * ** *
15384 AATTGGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TCTATACAAACTTATTCGGAG
194 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATAAAAACTTATTCAAAA
* * ** * *
15447 TAAAATACTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTA
258 TAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TA
** * * *
15508 TTTGGCAAATCCGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC
321 TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * *
15546 AATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * *
15610 ATGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGGAATT
65 AAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAG-ATT
* * * *
15674 TAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-ATT
128 T--AAAAATAAATATGTTTACCGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-T
* * * * *
15738 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTC-ATTTCATAAAAGCTTATCC
190 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAACTTATTC
* * * * * * **
15802 AAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAATTGGAGA-TTAAAAACATAA
254 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAA
* * *
15866 ATTAGTTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAAC
317 ATTA-TTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * *
15909 AATTATCTATTTCAGATTGTTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-TCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* ** *
15972 AAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAACATATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACAAGA-TT
65 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA-AAGATTT
* * * *
16036 ----AT--CTA--TTTACTGAAC-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTC
129 AAAAATAAATATGTTTACCGAACAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * ** * * *
16092 AAGTCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTGATATTCATACAAACTTTTTAAAAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCAAAA
* * *
16157 TAAAATAATACTAA--T-CT-AA-T-----AA-T-AT---TAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGT
258 TAAAATAATACTAATTTATTAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTAT
**** * * * * *
16207 TTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAAT
322 TTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * *
16244 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGTCCTTTTTGTTTTGTCGTAAAATAAATAT-TTTTTGTTTAT
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTATTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTCTATTCAT
* * * * * ***
16308 ATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATT
63 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGATT
* * * * * * *
16370 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTA-GTTCAATTATTTATAACAATTT-AAGCAATTATTTAT
128 T-AAAAATAAATATGTTTACCGAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTAT
* * * * * * * * ** *
16433 TTCATATCGTTATGACCATTTGCTTTATCTTAAAACAATTATTTCTATTGATATAGTCTTATTCG
190 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCA
* * * * * *
16498 GAATAAAGTAATCCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATGAAT
255 AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** *** * *
16563 CTGTTGGCTTGACCAGTGCAAATAGTTATGACTATCTT-AAC
319 -TATTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAAC
* * * *
16604 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTACTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
16669 AGCTTA-TTAGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTT
66 AGCTTATTTA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT
* ** * *
16733 AAAAACTAAATTTGTTTATTGAACAAC-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTACCTATTT
129 AAAAA-TAAATATGTTTACCGAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* *** * * * *
16797 AAAATCACCATAACTTTTTTGTTTTGTCAT--AA-AA----TTC----C-TACAAGCTTATTTC-
192 CAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTA-TTCA
* * * * *
16849 AATTAAAATAATGCAAATTTATTATCATT-CAGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
255 AAATAAAATAATACTAATTTATTA-AATTCCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* *** * *
16913 TTTGTTTACTGTATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
318 -TTATTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
16955 AAATATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTA
16986 ACGATTTGAA
Statistics
Matches: 1709, Mismatches: 342, Indels: 200
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
334 3 0.00
335 65 0.04
336 25 0.01
337 3 0.00
338 57 0.03
339 1 0.00
340 4 0.00
342 1 0.00
343 2 0.00
344 99 0.06
345 1 0.00
346 2 0.00
347 2 0.00
348 2 0.00
349 22 0.01
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353 93 0.05
354 13 0.01
355 18 0.01
356 19 0.01
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361 11 0.01
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363 101 0.06
364 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (358 bp):
AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAA
AAATAAATATGTTTACCGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTCAAAATAA
AATAATACTAATTTATTAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTATTTAC
CAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
Found at i:16591 original size:695 final size:699
Alignment explanation
Indices: 14780--16721 Score: 1678
Period size: 695 Copynumber: 2.8 Consensus size: 699
14770 TTAATGAGTA
* * ** ** * * * *
14780 AGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGGCAAATCCGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
* * * * * * *
14845 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGCTTA
66 TATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA
** * * * * * * *
14909 TTTTGAATAAAATAAT-GTAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAAGTAA-AAATTT--AAAA
130 TTTCAAATAAAATAATACT-AGTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AAGGAATTTAAAAAA
* * **** * * *
14970 ATAAATATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTT-AAAT
193 ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATC-ATTTTAAAAT
* * * * * ** ** * ** *
15034 CATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGCTTC-TATTCA-AAAAACTTATTTAGAATAA
257 CGTTATGACCATTTGCTTTATCATAAAAAAATTATTTCAT-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAA
* * * *
15097 AATAATACTAATTTATTCAA-ATTCCAAAAATT-AGTAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATCA-
321 AATAATACTAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAAG-AAATAAGAGA-TTAAAAACATAAATTAG
* * ** ** * * *
15158 TTTA-CCAAGTGAGTTAAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAT
383 TTGATCGAA-CCAGTGCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAA
* ** * *
15222 CTTTTGTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTA
446 CTTTTGTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
* * *
15286 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATGTTTATCGGACCAGTTCAAA
509 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-AG--TTAAAAACTAAATATTTATCGAACCAGTTCAAA
* * * * *
15351 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGGTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACA
570 TAATTATGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCGGTATAACCTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * *
15416 ATTGTTTCTATCTATACAAACTTATTCGGAGTAAAATACTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAAT
635 ATTATTGATATCTATACAAACTTATT----GTAAAATA---CTAAAATAATAATAATCTAAAAAT
*
15481 TTATAAG
693 ATATAAG
15488 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGGCAAATCCGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGGCAAATCCGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
* * *
15553 TATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTAT
66 TATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT
*
15618 TTCAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGGAATTTAAAAAAAT
131 TTCAAATAAAATAATACTAGTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AAGGAATTTAAAAAAAT
* *
15683 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCATTTTAAAATCGT
195 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCATTTTAAAATCGT
* * *
15748 TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATA
260 TATGACCATTTGCTTTATCATAAAAAAATTATTTCATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATA
* * * ** *
15813 ATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAATTGGAGATTAAAAACATAAATTAGTTTATCG
325 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAATAAGAGATTAAAAACATAAATTAGTTGATCG
* * * * * * *
15878 AATCAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAGATTGTTTTGAACTTTTGTT
390 AACCAGTGCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG-T
* **
15943 TTGTCATAAAACAATTTTTTTCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAACATATTAA
453 TTGTCATAAAACAATTTTTTTCATCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * **
16008 TATTTCAAAAATTAATAAG-TACAAGATTATCTATTTA-CTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
518 TATTTCAAAAATTAATAAGTTA-AAAACTAAATATTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACT
* * *
16071 ATTTGAACAATTATATATTTCAAGTCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTGATA
581 ATTTGAACAATTATATATCTCAAATCGGTATAACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTGATA
* *
16136 T-TCATACAAACTT-TT-TAAAA-A-TAAAATAATACTAATCTAATAATAT-TAAG
645 TCT-ATACAAACTTATTGTAAAATACTAAAATAATAATAATCTAAAAATATATAAG
* * * *** * *
16186 AGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGTTGAA-CCAGTTCAAATAGTTAAGGCTA-TATGAATAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGGCAAATCC-GTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTA
** * * * * *
16249 TCTATTTCAAATTGTTATGTCCTTTTTGTTTTGTCGTAAAATAAATAT-TTTTTGTTTATATAAG
64 TCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTGTTTAGTCATAAAAT-AAT-TGTTTTAGTTCATACAAG
* * * * ***
16313 TTTGTTT-AGAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-A-G-ATTT-AA
126 CTTATTTCA-AATAAAATAATACTAGTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAGGAATTTAAA
* * * * * * *
16373 AAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTT-AAGCAATTAT-TTATTTC
190 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAA-CAATTATCAT-TTTA
* * * * * * **
16436 ATATCGTTATGACCATTTGCTTTATCTTAAAACAATTATTTC-TATTGAT-ATAGTCTTATTCGG
253 AAATCGTTATGACCATTTGCTTTATCATAAAAAAATTATTTCAT-TTCATAAAAG-CTTATCCAA
* * * *
16499 AATAAAGTAATCCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAA-ATGAA
316 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAGAAATAAGAGA-TTAAAAACATAAA
* *
16562 TCT-GTTGGCTTG-ACCAGTGCAAATAGTTATGACTATCTTAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
379 T-TAGTT-GATCGAACCAGTGCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATCGTT
* * * * ** *
16625 ATGACCTTTTACTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGGAATAACATA
441 ATGAACTTTT-GTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATCATACAAGCTTATTTA-GAATAAAATA
*
16689 ATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAA
503 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
16722 ATAAGAGATT
Statistics
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (699 bp):
AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGGCAAATCCGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
TATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT
TTCAAATAAAATAATACTAGTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAGGAATTTAAAAAAATA
AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCATTTTAAAATCGTT
ATGACCATTTGCTTTATCATAAAAAAATTATTTCATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA
TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAATAAGAGATTAAAAACATAAATTAGTTGATCGA
ACCAGTGCAAATAGTTATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTG
TCATAAAACAATTTTTTTCATCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTCAAAAATTAATAAGTTAAAAACTAAATATTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
AACAATTATATATCTCAAATCGGTATAACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTGATATCTATA
CAAACTTATTGTAAAATACTAAAATAATAATAATCTAAAAATATATAAG
Found at i:16768 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 16173--16984 Score: 615
Period size: 181 Copynumber: 4.6 Consensus size: 178
16163 AATACTAATC
* * * * *
16173 TAATAATATTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTAT
1 TAATAA-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
16238 ATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGTCCTTTTTGTTTTGTCGTAAAATAAATATTTTTTG
64 -TTAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGCTTTGTC-CAAAA-CAAT-TTTTCTG
* * * * * * *
16303 TTTATATAAGTTTGTTTA-GAATAAAATAATAT-TAGTTTATTAATATTTTGAAAA-
124 TTCATACAAGCTT-ATTAGGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
*** * * * * *
16357 T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTT
1 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
16419 AAGCAATTATTTATTTCATATCGTTATGACCATTTGCTTTATCTTAAAACAATTATTTCTATTGA
66 AA-CAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTC-CAAAACAATT-TTTCTGTTCA
* * * *
16484 TA-TAGTCTTATTCGGAATAAAGTAATCCTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
128 TACAAG-CTTATTAGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * ** * *
16535 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACCAGTGCAAATAGTTATGACTATC
1 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-
*
16599 TTAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTACTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTC
64 TTAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTC-CAAAACAATT-TTTCTGTTC
*
16664 ATACAAGCTTATTAGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
127 ATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * *
16716 TAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAACAACTTCAAATAGTTATGATTATTT
1 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
** * *** * * * *
16781 GAACAATTACCTATTTAAAATCACCATAACTTTTTTGTTTTGT-CATAA-AA---TTC----C-T
66 -AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGCTTTGTCCAAAACAATTTTTCTGTTCAT
** * *
16836 ACAAGCTTATT-TCAATTAAAATAATGCAAATTTATT-ATCATTC-AGAAAAT
129 ACAAGCTTATTAGGAA-TAAAATAATTCTAATTTATTAAT-ATTCTA-AAAAT
* * * * * *
16886 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGTATAATTTCAAATAGTTATGACTATTT
1 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* *
16951 GAACAAATATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT
66 -AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
16985 AACGATTTGA
Statistics
Matches: 507, Mismatches: 103, Indels: 52
0.77 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
168 4 0.01
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184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTCCAAAACAATTTTTCTGTTCATAC
AAGCTTATTAGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
Found at i:16936 original size:876 final size:869
Alignment explanation
Indices: 14545--16977 Score: 2295
Period size: 876 Copynumber: 2.8 Consensus size: 869
14535 TTCATACTAG
* * *
14545 CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
1 CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAA
* * * * * *
14610 AAATAAATATGCTTACCGAACAAATTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAG
62 AAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AACAATTATCTATTTCAA-
* * * * * * * *
14675 TCGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTATCAATTCATATAGGCATATTCAAAACAA
125 TCGTTTTGACCTTTTG-TTTATCTTAAAATAATTGTTTCTATTCATATAGTCTTATTC-AAATAA
* * * *
14740 AATAATACTAACTTACTACTATTCTAAAAATTAATGAGT-A-AGATTTAAAAAATGAATCTATTT
188 AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTT
* * * *
14803 ACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
253 ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * *
14868 TATTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATGTAAATTT
318 TATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTCATACAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * * *
14933 ACTAATATTCCAAAGATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAA-TAAATATGTTTTTTGAACACGTTCA
381 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAACAC-TTCA
* * * *
14996 AATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
445 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTTT-AACTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
15061 CCAATTGCTTCTATTCAAAAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTCAAATTCCAAAA
509 -CAATT-C-TCTA--C---AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATT-ATATT-CAAAA
* * * * *
15126 ATTAGTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTAC-CAAGTGAGTTAAAATAGTTATGACTA
564 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * **
15189 TTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
628 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTGATATT
* *
15254 CATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATT
693 CATACAAAATTATTAAAAATAAAATAATACTAA-TTACTAATA--TT--AAATTAATAAGAGATT
* * *
15319 TAAAAACTAAATGTTTATCGGACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCA
753 TAAAAACTAAATGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATCTCA
*
15384 AATTGGTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCTATACAAA
818 AATTGGTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATCTATACAAA
* * * ** ** * * * *
15436 CTTATTCGGAGTAAAATACTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTTATAAGAGATTTAAAAAAT
1 CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * *
15501 AAATGTATTTGGCAAA-TCCGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATT
66 AAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATA-ACTATT-TAACAATTATCTATTTC-AATC
* *
15564 GTTTTAACCTTTTGTTTAGT-TATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACA-TGCTTATTTCAAATA
127 GTTTTGACCTTTTGTTTA-TCT-TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATATAGT-CTTA-TTCAAATA
* * * * *
15626 AAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAG-GAATTTAAAAAAATAAATCTA
187 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTT-AAAAAATGAATCTA
* *
15690 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCATTTTAAAATCGTTATGAC
250 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * *
15754 CTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTA
314 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TTTCATACAAGCTTAT-TAGAATAAAATAATATTA
* * * ** * *
15819 CTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGAAATTGGAGA-TTAAAAACATAAATTAGTTTATCGAATC
377 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAC-TAAATTTGTTTATTGAA-C
* * * * **
15882 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAGATTGTTTTGAACTTTTGTTTTGT
439 ACTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTTT-AACTTTTGTTTTGT
* *
15947 CATAAAACAATTTTTTTCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAACATATTAATAT-
503 CAT-AAACAA-----TTC-TC-TACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC-AA-AT-TTATTATA
* * ** *
16011 TTCAAAAATTAATAAGTACAAGA--T------T--ATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTA
557 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTA
* * *
16066 TGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGTCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
622 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTAT
* * *
16131 TGATATTCATACAAACTTTTTAAAAATAAAATAATACTAA-T-CT-A-A-T-AA-TATTAAGAGA
686 TGATATTCATACAAAATTATTAAAAATAAAATAATACTAATTACTAATATTAAATTAATAAGAGA
* * * *
16189 TTTGAAAAA-TAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTA
751 TTT-AAAAACTAAA--TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
16253 TTTCAAATTGTTATG-TCCTTTTTGTTTTGTCGTAAAATAAATAT-TTTTTGTTTATATAAG
813 TCTCAAATTGGTATGAT-C--TTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT-TGTTTCTATCTATACAAA
* * * *
16313 TTTGTTTAGAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
1 CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
16378 AAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTATTTATAACAATTTAAGCAATTATTTATTTCATATCGT
66 AAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAA-CAATTATCTATTTCA-ATCGT
* * * * * * *
16443 TATGACCATTTGCTTTATCTTAAAACAATTATTTCTATTGATATAGTCTTATTCGGAATAAAGTA
129 TTTGACCTTTTG-TTTATCTTAAAATAATTGTTTCTATTCATATAGTCTTATTC-AAATAAAATA
* * * ** **
16508 ATCCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTT
192 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCA
* * * *
16573 GACCAGTGCAAATAGTTATGACTATCTT-AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTAC
257 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTAT
* *
16637 TTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGGAATAACATAAT-TCTAATTTAT
321 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTCATACAAGCTTATTA-GAATAAAATAATAT-TAATTTAT
16701 TAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAACAACTTCAAA
383 TAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAAC-ACTTCAAA
* * ***
16766 TAGTTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATCACCATAACTTTTTTGTTTTGTCAT-AA-
447 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTTTAAC--TTTTGTTTTGTCATAAAC
* *
16829 AATTC-CTACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATGCAAATTTATTATCATTCAGAAAATTAATAA
510 AATTCTCTACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACAAATTTATTAT-ATTCA-AAAATTAATAA
* * *
16892 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGTATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
572 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
*
16957 ATATTTATTTCAAATCATTAT
637 TTATTTATTTCAAATCATTAT
16978 GACTTTTAAC
Statistics
Matches: 1242, Mismatches: 224, Indels: 167
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
863 6 0.00
864 2 0.00
865 6 0.00
866 41 0.03
867 2 0.00
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895 5 0.00
896 3 0.00
897 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (869 bp):
CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
AAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAACAATTATCTATTTCAATCGTTT
TGACCTTTTGTTTATCTTAAAATAATTGTTTCTATTCATATAGTCTTATTCAAATAAAATAATAC
TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAACA
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGT
CATAAAACAATTGTTTCTTTCATACAAGCTTATTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTC
TAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAACACTTCAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTTTAACTTTTGTTTTGTCATAAACAATTCTCTACA
AGCTTATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
AAATAAATTTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
TCATTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTGATATTCATACAAAATTATTAAAAATAAA
ATAATACTAATTACTAATATTAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATGTTTATCGAACCAGTT
CAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATCTCAAATTGGTATGATCTTTGTTTTGTCATAA
AAAAATTGTTTCTATCTATACAAA
Found at i:17297 original size:180 final size:176
Alignment explanation
Indices: 16984--18111 Score: 577
Period size: 177 Copynumber: 6.5 Consensus size: 176
16974 TTATGACTTT
* * * * * * *
16984 TAACGATTTGAAATATAT-A-TATTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGCTCA-GTAAATAG
1 TAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-GTCATAACTATTTAAATTAG-TTAGGTAAACAG
* * * * * *
17046 AATTATTTTTTAAATCTCTTATAAAATT-TTGAAATATTAACAAATTAGT-TTTTATTTATTCCA
63 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAT-TAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT-TTTATTTCA
*
17109 AATAAACTTGTATGAGCTAAAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
126 AATAAACTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAA
* * * * *
17159 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATAATGTCTTAACTGTTTGAGTTAGTTCAGG-AAACATA
1 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATGTCATAACTATTTAAATTAGTT-AGGTAAACAGA
* * * *
17223 TTTATTTTTTTAATCTCTTAGTTATGAATT-TTTAGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTT
64 TTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-T-AATTCTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
* * * * * * *
17287 CAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGATTTATGATAGAACAAAAGATTA
124 CAAATAAACTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAA
* * * * *
17340 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAATAGAT
1 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TGTCATAACTATTTAAATTAGTTAGGTAAACAGAT
* *
17405 TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
65 TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATA
* * **
17470 AGA-TTGTAT--GTTGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAA
130 A-ACTTGTATGAGCT-A-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAA
* * * * * * * * *
17517 TAATGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCA-GCAAACTA-
1 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GTCATAACTATTTAAATTAGTT-AGGTAAAC-AG
* * * ***
17580 ATTTATTTTTGAAA-----TATTAA----T-AAA-A-TAGT--ATT-ATTTTATTTTGGAT-AAG
63 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAA-
* * * * * *
17629 CT---TTTATGA--A-CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
127 ATAAACTTGT-ATGAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAA
* * * * *
17674 TAACAATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAAATT-GTTCA-GTAAACAG
1 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GTCATAACTATTT-AAATTAGTT-AGGTAAACAG
** * *
17737 ATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATT-TGTTTAATGTTAATAAATTTACT-TTATTTTA
63 ATTTATTTTTT-AAA--TC-T-CTTATTAATTCT-TGAAATATTAATAAA-TTAATATTATTTTA
* * * * * ** *
17800 TTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAATCTTA
121 TTTCAAATAAACTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAA
* * * * * * * * * *
17854 GAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTATCCATTTGAACT-GATTCA-GCAAACAC
1 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GTCATAACTATTTAAATTAG-TT-AGGTAAACAG
* * * * *
17917 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TCCAA
63 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAA
* * * * * *
17981 ATAAACTTATATGATCAAAAACAATT-TTTTATGACAAAAC-AAAGATCA
127 ATAAACTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAA
** * * * * * * * * **
18029 TAGTGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGGTCGTAACTATTTAAACTGGTTCGAAAAACA-AC
1 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GTCATAACTATTTAAATTAGTTAGGTAAACAGA-
*
18093 TTTAATTTTTAAATCTCTT
64 TTTATTTTTTAAATCTCTT
18112 GCTTAATAAT
Statistics
Matches: 733, Mismatches: 157, Indels: 127
0.72 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
156 1 0.00
157 81 0.11
158 7 0.01
159 4 0.01
160 1 0.00
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162 10 0.01
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167 9 0.01
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171 1 0.00
172 8 0.01
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179 13 0.02
180 110 0.15
181 98 0.13
182 19 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGTCATAACTATTTAAATTAGTTAGGTAAACAGATT
TATTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAA
ACTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAA
Found at i:17717 original size:157 final size:157
Alignment explanation
Indices: 17431--17746 Score: 368
Period size: 157 Copynumber: 2.0 Consensus size: 157
17421 TTATTAATTC
* *
17431 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGATTGTATGTTGAGAAACAATTGTT
1 TTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTAAATAAGATTGTATGCTGAGAAACAATTGTT
** ** * ** *
17496 TTATGACAAAATGAAAGGTAATAATGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATGGCCATAATTATTT
66 TTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAACCATAACTATTT
*
17561 GAACTAATTCAGCAAACTA-ATTTATTT
131 GAAATAATTCAGCAAAC-AGATTTATTT
** * *
17588 TTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-A-AAACAATTG
1 TTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTAAATAAGATTGTATG--CTGAGAAACAATTG
* * * * * *
17651 TTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAATCATAACTAT
64 TTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAACCATAACTAT
** *
17716 TTGAAATTGTTCAGTAAACAGATTTATTT
129 TTGAAATAATTCAGCAAACAGATTTATTT
17745 TT
1 TT
17747 TCAAATCTCT
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 24, Indels: 6
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
156 1 0.01
157 129 0.98
158 1 0.01
159 1 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (157 bp):
TTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTAAATAAGATTGTATGCTGAGAAACAATTGTT
TTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAACCATAACTATTT
GAAATAATTCAGCAAACAGATTTATTT
Found at i:18341 original size:689 final size:690
Alignment explanation
Indices: 17096--18409 Score: 1525
Period size: 689 Copynumber: 1.9 Consensus size: 690
17086 CAAATTAGTT
* * * *
17096 TTTATTTATTCCAAATAAACTTGTATGAGCTAAAATAATTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
1 TTTATTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTTTTTATGACAAAACAAAAGCTCAGA
** * * * *
17161 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCATAATGTCTTAACTGTTTGAGTTAGTTCAGGAAACATATTT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCATAATGTCTTAACCATTTGACTGAGTTCAGCAAACACATTT
* *
17226 ATTTTTTTAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTTCAAA
131 ATTTTTTTAATCTCTTAG-T-TGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCCAAA
* * * * *
17291 TAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGATTTATGATAGAACAAAAGATTATAACAATTTGAAATAG
194 TAAACTTATATGAACAAAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAG
* * * ** * *
17356 ATAATTGTTCAAATTGTCATAACTATTTAAATTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
259 ATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAACTGGTTCGAAAAACAGATTTAATTTTTAAATCTC
* * * * * **
17421 TTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGATTGTATGTTGAGA
324 TTAATAATTCTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTACTTTATTTGAAATAAGATTGTAAATT-AGA
* *
17486 AACAATTGTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAATGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATGGCC
388 AACAATTGTTTTATGACAAAATCAAAGGTAATAATGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATAGCC
17551 ATAATTATTTGAACTAATTCAGCAAACTAATTTATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTT
453 ATAATTATTTGAAC-AATTCAGCAAACTAA-TTATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTT
*** * * *
17616 TATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAA
516 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTT-AGAACAA
* *
17680 TTTTAAATAGATAA-TTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAAATTGTTCAGTAAACAGATTTATT
580 TTTGAAATAGATAATTTGTCT-AATAATCATAACTATTTGAAATTGTTCAGTAAACAGATTTATT
17744 TTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTGTTTAATGTTAATAAATTTAC
644 TTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTGTTTAATGTTAATAAATTTAC
* * * * *
17791 TTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGA-TAAA-AAAATCTTA
1 TTTA-TTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACTAAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGCTCA
* *
17854 GAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-TAATAGTCTTATCCATTTGAACTGA-TTCAGCAAACAC
64 GAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATAAT-GTCTTAACCATTTG-ACTGAGTTCAGCAAACAC
*
17917 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTAG-T-AATTTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TC
127 ATTTATTTTTTT-AATCTCTTAGTTGAATTTTTAG-AATATTATTAAATTAATATTATTTTATTC
* * *** *
17978 CAAATAAACTTATATGATCAAAAACAATT-TTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAGTGATTTGAG
190 CAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAA
* * *
18041 ATTGATATTTGTTCAAATGGTCGTAACTATTTAAACTGGTTCGAAAAACA-ACTTTAATTTTTAA
255 ATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAACTGGTTCGAAAAACAGA-TTTAATTTTTAA
* * ** * *
18105 ATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTGCTTTATTTGGGATAAGTTTTT
319 A--TC-T-CTTAATAATTCTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTACTTTATTTGAAATAAGATTGT
* * *
18170 AAATT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAACGGTCATAATGATTTTAAATAGT-TAATTGT
380 AAATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATCAAA-GGTAATAATGATTTGAAATA-TATAATTCT
* * * * * ** * *
18232 TTAAATAGTCATATTTATTTTTTAA-AATCTCTTGCTTATTAA-T-TTTTTG-AATGTTAATAAA
443 TCAAATAGCCATAATTA--TTTGAACAAT-TC-AGCAAACTAATTATTTTTGAAATATTAATAAA
* * *
18293 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAA
504 ATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
** * *
18358 AGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTTGTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA
569 AGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTTGTCTAATAATCATAACTATTTGAA
18410 TTGGTTTGGC
Statistics
Matches: 517, Mismatches: 83, Indels: 44
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
688 1 0.00
689 167 0.32
690 32 0.06
691 94 0.18
692 35 0.07
693 61 0.12
694 4 0.01
695 67 0.13
696 48 0.09
697 8 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (690 bp):
TTTATTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTTTTTATGACAAAACAAAAGCTCAGA
ACGATTTGAAATAGATAATTATTCATAATGTCTTAACCATTTGACTGAGTTCAGCAAACACATTT
ATTTTTTTAATCTCTTAGTTGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCCAAATA
AACTTATATGAACAAAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGAT
AATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAACTGGTTCGAAAAACAGATTTAATTTTTAAATCTCTT
AATAATTCTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTACTTTATTTGAAATAAGATTGTAAATTAGAAAC
AATTGTTTTATGACAAAATCAAAGGTAATAATGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATAGCCATA
ATTATTTGAACAATTCAGCAAACTAATTATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTT
CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTAGAACAATTTGAA
ATAGATAATTTGTCTAATAATCATAACTATTTGAAATTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTCAA
ATCTCTTGCTTATTAATTTGTTTAATGTTAATAAATTTAC
Found at i:18406 original size:155 final size:152
Alignment explanation
Indices: 18098--18406 Score: 325
Period size: 155 Copynumber: 2.0 Consensus size: 152
18088 ACAACTTTAA
* ***
18098 TTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTGCTTTATTTGGGATA
1 TTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTACTTTATTTCAAATA
* * * * ** * * *
18163 AGTTTTTAAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAACGGTCATAATGATTTTAAATAGTTAA
66 AGTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAA
* **
18228 TTGTTTAAATAGTCATATTTAT
131 TTGTCTAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
18250 TTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
1 TTTTT-AAATCTCTTGCTTAATAA-TTTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTACTTTATTTCAAA
* * * *
18314 TAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATAG
64 TAAG-TT-TATAAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAG
*
18379 ATAATTTGTCT-AATAGTCTTAACTAT
127 ATAA-TTGTCTAAATAGTCATAACTAT
18405 TT
1 TT
18407 GAATTGGTTT
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 26, Indels: 7
0.79 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
152 5 0.04
153 46 0.37
154 8 0.06
155 62 0.49
156 5 0.04
ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.11, T:0.45
Consensus pattern (152 bp):
TTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATCAATAAAGTAGTATTACTTTATTTCAAATA
AGTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAA
TTGTCTAAATAGTCATAACTAT
Found at i:18589 original size:153 final size:154
Alignment explanation
Indices: 18289--18590 Score: 335
Period size: 153 Copynumber: 2.0 Consensus size: 154
18279 TGAATGTTAA
* * * ** * * *
18289 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATAACTAAAC
1 TAAATTAGTATTATCTTAATCCAAATAAGCTAATATGAACAAAAACAATTGTTCTATAACTAAAC
* * * * * * * *
18354 AAAAAGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTTGTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGG
66 AAAAAGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTTGTCAAACAATCTTAACTAATTGAACTGGTTCGG
18419 CAAAATACATTTATTTTTACTTAT
131 CAAAATACATTTATTTTTACTTAT
*
18443 TAAATTAGTATTATCTTAATCCAAATAAGCTAATATGAA-AAGAAACAATTGTTCTATGAC-AAA
1 TAAATTAGTATTATCTTAATCCAAATAAGCTAATATGAACAA-AAACAATTGTTCTATAACTAAA
* * *
18506 -ATAAAGATCACAATTATTTGAGATAGATAA-TTGTTCAAACAATCTTAACTAATTGAACTGGTT
65 CAAAAAG-TCACAATGATTTGAAATAGATAATTTG-TCAAACAATCTTAACTAATTGAACTGGTT
* *
18569 CGG-TAAATAGATTTAGTTTTTA
128 CGGCAAAATACATTTA-TTTTTA
18591 AATCTCTTAT
Statistics
Matches: 122, Mismatches: 22, Indels: 9
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
152 18 0.15
153 55 0.45
154 49 0.40
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (154 bp):
TAAATTAGTATTATCTTAATCCAAATAAGCTAATATGAACAAAAACAATTGTTCTATAACTAAAC
AAAAAGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTTGTCAAACAATCTTAACTAATTGAACTGGTTCGG
CAAAATACATTTATTTTTACTTAT
Found at i:18976 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 18443--28848 Score: 5319
Period size: 181 Copynumber: 57.9 Consensus size: 181
18433 TTTTACTTAT
* * * ** * *
18443 TAAATTAGTATTATCTTAATCCAAATAAGCTAATATGAAAAGAAACAATTGTTCTATGACAAAA-
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * ** * * * * * * *
18507 TAAAGATCACAATTATTTGAGATAGATAATTGTTCAAACAATCTTAACTAATTGAACTGGTTCGG
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * *
18572 TAAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAA--TTTGAAAATATTAA
131 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-GAATATTAA
* * ** * * **
18618 TAAATCAGTATTATATTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACAACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
18682 C-AAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGAGTATTTGAACTTGTTTT
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTC
* * * *
18746 G-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAATATTAA
129 GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* *
18798 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATCAA-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTGATCACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
18862 CAAAAGATCATAACCATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTAGAGCTTGCTCG
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
*
18927 ATAAACATATTTATTTTGTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * *
18979 TAAATCAGTATTATTTTGTTGT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
** * * * * * *
19043 -AAAAGGTCATAACTTTTTAAAATAGAAAACTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATGGTTA
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTGTTC
* *
19107 GA-AAATA-ATTTTAATTTTTT-AAT-TTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
129 GATAAACATA-TTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
** * * * *
19158 TAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATTAGCTTGTATCAATAAAAACAATTGTTTTATGACATAA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * *
19222 CAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTGTTTGAACTTGTTTC
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTC
* * ***
19286 -ATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
129 GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * *
19338 TAAATTAGTA-T-TTTT-TTT-GAATAAGCCTATATGAACT-GATACAATTGTTTAATTATAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
19398 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGTTTG
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * ***
19463 GTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTAGT-ATTTGTCAAAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTGGAATATTAA
* * * * * *
19515 TAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATTAACAAAAACAATTGTTTTATGAC--AAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
19578 AAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC-A
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * *
19642 GTAACCAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTATCT-GAATATTAA
131 -TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGGAATATTAA
* * * * * * *
19694 TAAATTTGTGTTATTTCATTTGAAATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAAATTGTTTTATGATAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * * * *
19759 CAAAAGGTTATAGTGATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTTATAAGTATTTAAACTTGTTCA
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * *
19824 ATAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * ** * * * * *
19876 TAAGTTAGAATTATGTTATTTTGAATAAGGTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTGTGATAAAAT
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* *
19941 AAAATGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC---A--A----AAC-----C--
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * *
19990 --AACAGATTCATTTTCTAAATCTGTTATTTATTAATTTTTAGAATATTAA
131 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * * *
20039 TAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGATTGTGTGAACATAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** * * * * * *
20104 AAATGGTCATAACGATTCAAAACAAATAATTGTTCAAATAGT-TTAACTAATTGAACTAGTT-TA
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* ** * * **
20167 GTAAACATATTTATTTTTTAATTCTCGTACTCACTAATTTTTAAAATATTAA
131 -TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * * * *
20219 TAAATTAATATAATTTTATTCTGAACA-AA-CTTGTTTGAACAAAAATATTTGTTTCTA--ACAG
1 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT-TATGACAA
* * * * * * *
20280 AACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGCACTAGTT
63 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * *** *
20345 TGATAAATATATTTATTTTTTAATTCACCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
128 CGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * *
20399 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTATATG-TTGAAAAATAATTATTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
20463 CAAAAGTTAATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAA-ATGATT
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TT
* * * * * * * **
20526 TGACAGAC-TGATTTATGTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTATAATATTAA
128 CGATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * *
20580 TAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACTA-AAGCAATTATTTTATGATAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
20644 TAAAAGGTCACAACGATTTTAAAAAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTT-A
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * *
20708 AGT-AA-ATA--TATTTTTT---TC--CTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAA
130 A-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
*** * * * * * *
20752 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCAAATAT-AAGTTGTAGCAATTATTTTATAACTAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * *
20816 CAAAAGGTCATAACGATTCGAAATAGATAATTGTTGC-AATAGTCTTAACTATTTCAA-TTGGAT
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-G-T
* * * * **
20879 TGGA-AATAC--ATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATGTTTAGAATATTGT
127 TCGATAA-ACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * * ** *
20931 TAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATATGCTTGTATGAATAGAAATAAACGTTTTAGGACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
20996 -AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACATGGTTCG
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTGTTCG
* * * ** * * * *
21059 -TAAAAAGATTTAATAATTAAATC---T-C--CTTAATTTCTGAAATAGTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** **
21104 TACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * *
21168 AAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGG
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * ** *
21233 TAAAC-TAATTAATCTTTTAAATATTCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
131 TAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * *
21284 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
21349 -AAAGGATAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCA
66 AAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * * *
21413 ATAAGCAAATTTATTTTTAAAATCTTTTATTTTTTAA-TTTTGGAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** * *
21464 TAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGGCTT-TTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-GCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
21528 CAAATGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTC-
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * * *
21592 AAAAATAGATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAACATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * *
21643 TAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAA-CGAACCAATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
21706 CAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * *
21770 AGCAAACATATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTGGAATATTAA
130 A-TAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * ** * *
21824 TAAATTAATATTATTTTTTTTCAAATAAGTTTACATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * * * * * * *
21889 AAAAAATCACAAAGATTTGAAGTAGATAATTATTTAAATAGTCA-AGACTATTTAAATTTGTTTG
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * *
21953 GTAAACATA--TATTTTTTAAATCTTCTGCTTATTAATTGTCGAAATA-TATA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA-A
* * * ** *
22003 TAAATTAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCTCATAT-AGATAGAAACAATTATTTTATGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * *
22066 ACAAAAAAGTC--AA-GAATTTGAAATAAATAATAGTTCGAATAGTCATAACGATTTGAACTTGT
64 AC-AAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * *
22128 T-TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAA
127 TCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAA
* * * * **
22183 TAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAACAGAAAAAAATCATTTTATGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAA
* ** * * * * *
22247 CCAAAAGGTTGTAGC-ATTTTCG-AATCA-ATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTAAACATG
64 ACAAAAGGTCATAACGA-TTT-GAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * * * *
22309 TTC-AGTAAATAGATTCATTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAA
126 TTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * ** * **
22365 TAACA-TAATATGATATATTTATTT-AAACT-TGC-TCAATAAATAGATTC-A-T-TTTTA--A-
1 TAA-ATTAGTAT--TAT-TTTATTTCAAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* ** * * * * **
22420 AAATCTCTTAA--TTATTAAC--TTTCAGAATA-TTAA-T-ATC--ATAGT-ATTATTTTACTTC
61 AAA--ACAAAAGGTCA-TAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TA-ACTA-TT-
* * * * * ** * * *
22475 GAATAAACTTATAT-GAACTGAA-ATAATTT-TTTTATGACAAAAC-AATAGGTCA-TAATGATT
118 ---TGAACTTGT-TCG-A-TAAACAT-ATTTATTTT-T--TAAATCTTTTA-CTTATTAAT-TTT
* *
22535 TGAAATAGATAA
171 TGGAATA-TTAA
* * * * * * ***
22547 TTACTGTAA-TAGTCATGACTATTTGATCTAGTTC-AGTAAACATAT-TTTTATTTTTAA-AATT
1 -TA----AATTAGT-AT---TA-TT--T-TATTTCAAATAAGC-T-TGTATGAATAGAAACAATT
* * *** ** * * * * * ** * *
22608 TTTACTTATTA-ATTGTCAAAATATTAATAA--ATTAGTATTATATTAATCTGAACAAGCTTGTA
51 GTT--TTATGACA-AAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAAT-TGTTCAA-ATAG--
* * * ** * * * * ** *
22670 TGAATAGAAACTATTGTTTTATACCTGAACAATAAATAATAATGATTTGAAATAAATAATTACTT
107 T-CAT---AACTA---TTTGA-ACTTGTTCGATAAA-CATATTTATTT--TTTAAAT-CTT--TT
* * ** *
22735 AAATATCCATGACTATTTAAATTGGTTTGATAAA
158 -ACT-T--ATTA--ATTT---TTGGAAT-ATTAA
* * * * * * * ** * * * **
22769 CAAATT--TATT-TTTTAAATCTCTTATTAA--TTTTTTAAATATTAATATATTCATATTAT-TT
1 TAAATTAGTATTATTTT--ATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATT-GTTTTATGAC
* ** ** * * * * * *
22828 TATTC-TGA-G-CA-AACTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAAAAAAAAGGTCATAA
61 AAAACAAAAGGTCATAAC-GATTTGAA-ATAGATAATTG--TT----C----AAATA-GTCATAA
* * * * * * * * * *
22889 CGATTTGAAATAGATAAT-TATTTAA-ATAGTCATAATTATTTGAA-CTGGTTTGGCAAATAGAA
113 CTATTTGAACTTG-T--TCGA-TAAACATA-T--TTATTTTTTAAATCT--TTT----ACT--TA
** * *
22951 TT-ATTTTTTAAATCTCTTAC
163 TTAATTTTTGGAA--TATTAA
* * * * * * * * * *
22971 T-GATTA--ATT-TTTTGAAATATTAATAAATATGTTTATTTTATTTTGAATA-AGTTAGTAAGA
1 TAAATTAGTATTATTTT---AT-TT--CAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAA-ACAATT-GT----
* * ** * * * * * * * * *
23031 ACTAAAAAAATTATTTTATGACAAAAAAAAGTCGTAATGATTTAAAATAAAGAATTGTTGATATA
53 -TTTATGACA--A----A--AC---AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
23096 GCCTTAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTT
106 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* * *
23160 CTAGAATATTAT
170 TTGGAATATTAA
* * ** * * * * *
23172 TACATTAGTATTTTTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGTCAAAAT
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
23237 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTAAACTGGTTCAA
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* ** * * * *
23302 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCGTATTTATTAGTTTTTGAAATATTAG
131 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * *
23353 TAAATTAGTATTATTTT-GTTCTGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * *
23416 ACAAAAGTTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTTAAAC-TGATT
64 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TT
** * * * * **
23480 TAATAAAC-TGATTTATGTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTATAATATTAA
128 CGATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * *** * * * * *
23534 TAAAGTAATATTATTTTATTTTGGACAAGCTAT-TTTGAAACTA-AAATAATTATTTTATGATAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATG-AA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
23597 AATAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTC-AA-A---A-AATTATTTAAACTTGT
63 AA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * *
23656 TC-AGTAAATAGA-TT-TTTTTT-AAT-TTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAA
127 TCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * *
23708 TAAATTAGTATTATTTAATTTTAAATAAGCATGTATGAGCT-GAAGCAATTATTTTATGACTAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
23772 CAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATA-AGTAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTT-AAATTGGTT
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT
* * * * * ** * *
23835 CAACAAACACA--TATTTTTTAAATC-CTTACTTACTAACATTTAGAATATTAT
128 CGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * * * * * * *
23886 TAATTTAGCAATAATTTA-CTCTAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAAATGTTTTAAGATAGAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
23950 C-AAAGATCATAATGATTTG----AGAT-A--GAT--AAT--T-ATAACTATTTGAACTGGTTCG
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * * * * *
24002 GTAAAGAGATTTA-GTTCTAAA---TAT-CTTATTAATTTTTGAAATAGTCA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** * * ** *
24049 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAATTTTGTATAAATACAAACAATTGTTTTACAACAAAAT
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *** * * * *
24114 AAAATGTCGTAACTATTTGAAATAGAAAATAACTCAAACCA-ACATGACTATTTGAACTTGTTCA
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * ** * *
24178 ATAAATAGATTAATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAA-CTTTAGAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * *
24229 TAAATTAGTGTTATTTTATTCCGAATAAACTGGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACCAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** * * *
24294 -AAAGGATTATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTC-
66 AAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * *
24357 AGTGAACAAATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAA
130 A-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * *
24409 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGGTTTTTTGAACAAAAACAATTGTTGTATGACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
*** * * * *
24474 AAATCATCATAATGATTTGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTC-A
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * *
24538 -AAAAATAGTTTTCTTTTTTAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGGACATTGA
131 TAAACATA--TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** *
24589 TAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCGTGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
24653 CAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAACTATTTAAAT-GTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * ** *
24717 ATAAACAGATTTATTTTTTGAATTCCCTTGCTCT-TTAATTTTTGGAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACT-TATTAATTTTTGGAATATTAA
* * *
24770 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * ** * * *
24835 AAAAGGTCACAATGATTTGAAGTAAATAATTATTC-GATAAACAT-ATTTTTTTAA-TCT-TT--
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCG
* * * * * * * * * * *
24894 -T--ACTTA-TTAATTGTCAAA-ATATTAATAAATTGA-TATT---ATTTTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** ** ** * *
24938 TCCAAATAAGCTCGTA-TGGA-TAGAAACAA--TTGCT-T-TAT-G-AA-AA-------A--ACA
1 T--AAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * *
24985 AAA-AAAA--TCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTG
62 AAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * *
25046 TTC-AGTAAACAAATTTATATTTTAAATCATTTACTTATTAATTGTCTT--AATATAAA
126 TTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAA
* * * * *
25102 TAAATTTGTATTATTTTATTTGAAAT-AGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAACC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * ** * * * * * *
25166 AAAATGTTATAGCGATTCCAAATCGATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTTAAACTTGTT-TA
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * **
25230 GTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTCAGAATATTAA
131 -TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
** * * * * *
25282 TAACA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAACCTTATATAAACT-GAAATAATTTTTTTTATGACAA
1 TAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAA-TTGTTTTATGACAA
** * * * * *
25345 AACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTCTTTGATCTAGTT
63 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * * * * ***
25410 TGGTAAAAATATTTATTTTTAAAATTTTTTATTTATTAATTGTCAAAATATTAA
128 CGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * ** *
25464 TAAATTAGTATT-TTATTA-ATCTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACTATCATTTTATAACAAA
1 TAAATTAGTATTATT-TTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * *
25527 ACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCAAAATTATTTGAACTAGTT
64 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * ***
25591 TGATGAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAA
128 CGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** * * ** * * * *
25641 TAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTCATATGAAGAAAAATATTTGTTTTATGACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
25706 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGA
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
* * * * * * * *
25771 CAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTGAAATAGTAA
131 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** * * * * *
25822 TAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTAGTAAGAACT-GAAAAAATTATTTTACGATAA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * * *
25884 AATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AGGAATTGTTCATATTGCCTTAACTATTTGAACTGGT
63 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * * *
25948 T-TAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAT
127 TCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * *
26003 TACATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAACA-AAATTAATTGTTCTATGATAGA
1 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAA
* * * *
26066 ACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAGTT
64 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT
* ** *
26130 CGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
128 CGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** ** * * * * *
26184 TAAATTAATATTATTGCATTTTGAATAGGCTAGAATG-AT-GAAAAGCAACTATTTTATGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * * *
26247 ACAAAAGTTCATAACAATTTGACATAGATAGTTATTCAAATGGCCATAA-TTTTTGACCTAT-TT
64 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT
* * * * * * * **
26310 TGATAAAC-TGATTTATGTTTTAAATCTCTAATTTATCAAATTTTATAATATTAA
128 CGATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
** * *** * * * *
26364 TAAAGCAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-GAAATAATTGTTGTATGA-TAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
26427 TAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAGCTTGTTTG
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * * * *
26492 GTAAATAGATTT-TTTTCT-GAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * ** * * * * * *
26542 TAAATTATTACTATTTTATTTTGAAGAAGCATGTATGAGCT-GAAGCAATTATTTTATGACTAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
26606 CAAAAGGTTC-GAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTT
65 CAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
** * * * * *
26670 GGCAAATAAATTTATTTTTTAAATC-----CTTATTAATGTTTAGAATATTAT
129 GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * * * * * *
26718 TAATTTA-TCAATATATCACTTCGAATCAGCTTGT-TGAATAGAAATAAATGTTTTAGGATAAAA
1 TAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * *
26781 C-AAAGATCATAACGATTGGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTC
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTC
* * * *
26844 AAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
129 GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* *
26896 TAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGAATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* *
26960 CAAAAGATCATAGA-GTTTTGAAATAGATAATTGTT-AAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
65 CAAAAGGTCATA-ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * *
27023 CGGTAAACAAATTTATTATTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTGGAATATTGA
128 CGATAAACATATTTATT-TTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * *
27078 TAAATTGGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAA-
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
27142 AAAGAGGTCACAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTTG
66 AAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* ***
27207 ATAAACATA--TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * *
27257 TAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTCGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAA
* * * * * *
27322 AAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAA-TGATTTGAACTTATT
65 CAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTT
* * * * *
27385 -TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTCTT--CATATTAA
128 CGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAA
* * * * ** *
27439 TAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAGTAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATGACAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * ** * * * * *
27503 CAAAAGGTTATAGCGGTTCCAAATTGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTAAACTTGTTTG
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * * *
27568 ATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
** * * * *
27620 TAACA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAACCTTATATGAACT-GAAATAAATT-TTTTATGATAA
1 TAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-CAATTGTTTTATGACAA
* * * * *
27682 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATA-TAGT
63 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGT
* * * * * ***
27746 TC-A-ATAGATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAA
127 TCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * *
27799 TAAATTAGTATTATTTTAATATGAAAT-AGCTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATAACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
27863 CAGAAA-GTCAGAACTATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCATAACTATTTGAACTAGTT
65 CA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* *
27926 TGATAAAC-TGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA
128 CGATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * * * * *
27976 TAGATTAGTATTGTTTTATTCCAAACAAACTTATATGAGA-AAAAACATTTGTTTTATGATAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
28040 CAAAA-TTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTTATTTGAACTGGTTA
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTC
* * * * * *
28103 GGTAAAGAGAATT-TTTTTT-AATC---T-CATATTAATTTTTGAAATATTAA
129 GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* ** * * *
28150 TAAATTCATTTTATTTATTTT-TTT-GGATAAGCTAGTATGAATTGAGAA-ATTTGTTTTATGAC
1 TAAATT-A--GTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGA-AACAATTGTTTTATGAC
* * * * * *
28212 AAGACAAAGGGTCATAACGATTTGAATTAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAG
61 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * * *
28277 TTC-AGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTAT
126 TTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * * *
28333 TAGATTAGTATTGTTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACATAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
28398 AAAAGGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TTAGTTCG
66 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCG
* * * * * *
28462 GTAAACAGATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAGAGATTAA
130 ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGA-ATATTAA
* * * * *
28514 TAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATG-GTCAAAAACAATTGTTATGTGACCAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * **
28577 ACAAAAGGTGATAAAGATTTGAAATAGACAATTGTTAAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTC
64 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * * ** *
28642 TACAAATAGATTCACCTTTT-AA---GTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
129 GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * *
28691 TAAATTAGAATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGCAGGAACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
28755 TAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATATTCGTGACTATTTGAATTTGTTC-
65 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* *
28819 AGGAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTTT
130 A-TAAACATATTTA-TTTTTTAAA-TCTTT
28849 CCTATCAATT
Statistics
Matches: 7819, Mismatches: 1825, Indels: 1166
0.72 0.17 0.11
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227 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA
TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
Found at i:20118 original size:163 final size:163
Alignment explanation
Indices: 19827--20145 Score: 408
Period size: 163 Copynumber: 2.0 Consensus size: 163
19817 TTGTTCAATA
* * *
19827 AACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGAATTATGT
1 AACAAATTCATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGT
* * * * * * *
19892 TATTTTGAATAAGGTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTGTGATAAAATAAAATGTTATAACGAT
66 TATTTCGAATAAGATTGTATGAACAGAAAAAATTGATTTATGACAAAATAAAATGTCATAACGAT
** * *
19957 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACC
131 TCAAAACAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACC
* * * *
19990 AACAGATTCATTTTCTAAATCTGTTATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACT-
1 AACAAATTCATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTA-TG
* * * *
20054 TTATTTCGAATAAGATTGTGTGAACATAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-CAAATGGTCATAACG
65 TTATTTCGAATAAGATTGTATGAACAGAAAAAATTGATTTATGACAAAATAAAAT-GTCATAACG
20118 ATTCAAAACAAATAATTGTTCAAATAGT
129 ATTCAAAACAAATAATTGTTCAAATAGT
20146 TTAACTAATT
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 22, Indels: 4
0.84 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
162 4 0.03
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (163 bp):
AACAAATTCATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGT
TATTTCGAATAAGATTGTATGAACAGAAAAAATTGATTTATGACAAAATAAAATGTCATAACGAT
TCAAAACAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACC
Found at i:20859 original size:172 final size:172
Alignment explanation
Indices: 20556--20869 Score: 393
Period size: 172 Copynumber: 1.8 Consensus size: 172
20546 TAAATCTCTA
***
20556 ACTTATCAATTTTTATAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACT
1 ACTTATCAATTTTTATAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCAAATATGAACT
* * **
20621 AAAGCAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTCACAACGATTTTAAAAAGATAATTATTCAAATAG
66 AAAGCAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTCACAACGATTCGAAAAAGATAATTATTCAAATAG
20686 TCAAAACTATTTGAACTTGTTAAGTAAATATATTTTTTTCCT
131 TCAAAACTATTTGAACTTGTTAAGTAAATATATTTTTTTCCT
* * * *
20728 ACTTATTAATTTTT-TGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCAAATAT-AAG
1 ACTTATCAATTTTTAT-AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCAAATATGAA-
* ** * * *
20791 TTGTAGCAATTATTTTATAACT-AAACAAAAGGTCATAACGATTCGAAATAGATAATTGTTGC-A
64 CTAAAGCAATTATTTTATAA-TAAAACAAAAGGTCACAACGATTCGAAAAAGATAATTATT-CAA
**
20854 ATAGTCTTAACTATTT
127 ATAGTCAAAACTATTT
20870 CAATTGGATT
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 19, Indels: 8
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
171 3 0.03
172 114 0.96
173 2 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (172 bp):
ACTTATCAATTTTTATAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCAAATATGAACT
AAAGCAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTCACAACGATTCGAAAAAGATAATTATTCAAATAG
TCAAAACTATTTGAACTTGTTAAGTAAATATATTTTTTTCCT
Found at i:21267 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 21235--21281 Score: 69
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 24
21225 TTGTTTGGTA
21235 AACTAATTAATCTTTTA-AATATTC
1 AACTAATTAAT-TTTTAGAATATTC
*
21259 AACTTATTAATTTTTAGAATATT
1 AACTAATTAATTTTTAGAATATT
21282 AATAAATTAG
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 1, Indels: 2
0.88 0.04 0.08
Matches are distributed among these distances:
23 5 0.24
24 16 0.76
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.02, T:0.49
Consensus pattern (24 bp):
AACTAATTAATTTTTAGAATATTC
Found at i:21817 original size:360 final size:359
Alignment explanation
Indices: 19990--22367 Score: 1695
Period size: 360 Copynumber: 6.6 Consensus size: 359
19980 AGTCAAAACC
* * * * * *
19990 AACAGATTCATTTTCTAAATCTGTTATTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTACT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
20054 TTATTTCGAATAAGATTGTGTGAACATAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGA
65 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
** * * * * * * *
20119 TTCAAAACAAATAATTGTTCAAATAGT-TTAACTAATTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCA-TAAATAGATTTATTT
* ** * * * * *
20183 TTTAATTCTCGTACTCACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATAATTTTATTCTGAACA-A
193 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAA-ATA
* * * * * ** *
20247 A-CTTGTTTGAAC-AAAAATATTTGTTTCTA--ACAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAT
256 AGCTTGTATGAACGAAACA-A-TTGTTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * *
20308 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGCACTAGTT-TGATA
318 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TA
* * * * *
20350 AATATATTTATTTTTTAATTCACCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
*** * * * * * * * * * *
20415 TATTCCAAATAGGCTTATATG-TTGAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTAATAGCAA
66 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * *
20479 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAAATGATTTGACAGACT-GATTTAT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTG--TTCATA-AATAGATTTAT
* * * * * * * *
20542 GTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTATAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATA
191 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATA
* * * * * * * * *
20607 AGCTTTTATGAACTAAAGCAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTCACAACGATTTTAAAAAGAT
256 AGCTTGTATGAACGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * *
20672 AATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTAAGT-
320 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
* *
20711 -A-A-ATATATTTTTT---TC-C-TACTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** *** * * * * * *
20767 TTATTTCAAATAAGCAAATAT-AAGTTGTAGCAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAACG
65 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * ** *
20831 ATTCGAAATAGATAATTGTTGC-AATAGTCTTAACTATTTCAATTGGATT-GGAAATACATTTAT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTCATAAATAGATTTAT
* * ** * * * * **
20894 TTTTTAAATC-CTTACTTATTAATGTTTAGAATATTGTTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATA
191 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATA
* * * ** * * ** *
20958 TGCTTGTATGAATAGAAATAAACGTTTTAGGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGAT
256 AGCTTGTATGAA-CGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
*
21022 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACATGGTTC-GTA
320 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTGTTCAGTA
* * ** * * *
21061 AAAAGATTTAATAATTAAATCTC---C---TTAATTTCTGAAATAGTAATACATTAGTATTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * *
21120 TATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATAATGAT
66 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * ** * *
21184 TTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTA-ATTAATCT
131 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTCATAAA-TAGATTTATTT
* ** ** *
21248 TTTAAATATTCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA
193 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAG
* * * *
21313 CTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGGATAATAATGATTTGAAATAAATA
258 CTTGTATGAA-CGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATA
* * *
21377 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCAATA
321 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
* * * * * * * *
21416 AGCAAATTTATTTTTAAAATCTTTTATTTTTTAA-TTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * *
21480 TATTTTGAATAAGGCTT-TTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGA
66 TATTTTGAATAA-GCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* *
21544 TTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAATAGATTTATTTT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCATAAATAGATTTATTTT
* * *
21609 TTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAG
194 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAG
* * *
21672 CTTGCATGAACGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAAT
258 CTTGTATGAACGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * *
21737 TGTTTAGATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAGCA
323 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
* * * *
21774 AACATATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTAT
1 AACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * ** * *
21838 TTT-TTTTCAAATAAGTTTACATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAATCACAAA
64 TTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * ** * *
21902 GATTTGAAGTAGATAATTATTTAAATAGTCA-AGACTATTTAAATTTGTTTGGT-AA-ACATATA
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAA-CTG-TTCATAAATAGATTTA
* * * * * *
21964 TTTTTTAAATCTTCTGCTTATTAA-TTGTCGAA-ATATATATAAATTAATATTATTTTAATATG-
190 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATAT-TA-ATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGA
** * *
22026 AATAAGCTCATATAGATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTC--AA-GAATTTGA
252 AATAAGCTTGTAT-GA-ACGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGA
* * * * *
22087 AATAAATAATAGTTCGAATAGTCATAACGATTTGAACTTGTTTAGTA
313 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
* * * *
22134 AATAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTAT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * ** * ** *
22197 TTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACAGAAAAAAATCATTTTATGACAAACCAAAAGGTTGTAGC
64 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * *
22262 -ATTTTCG-AATCA-ATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTAAACATGTTCAGTAAATAGATT
128 GA-TTT-GAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCA-TAAATAGATT
* * * *
22324 CATTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
188 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
22368 CATAATATGA
Statistics
Matches: 1587, Mismatches: 347, Indels: 166
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
349 5 0.00
350 49 0.03
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352 92 0.06
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357 1 0.00
358 94 0.06
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361 178 0.11
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363 10 0.01
364 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (359 bp):
AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCATAAATAGATTTATTTTTT
AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTT
GTATGAACGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA
Found at i:22392 original size:87 final size:88
Alignment explanation
Indices: 22296--22459 Score: 267
Period size: 88 Copynumber: 1.9 Consensus size: 88
22286 ATGGTCATAA
* * * *
22296 TTATTTAAACATGTTCAGTAAATAGATTCATTTTT-AAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAAT
1 TTATTTAAACATGCTCAATAAATAGATTCATTTTTAAAAATCTCTTAATTATTAACTTTCAGAAT
22360 ATTAATAACATAATATGATATAT
66 ATTAATAACATAATATGATATAT
*
22383 TTATTTAAACTTGCTCAATAAATAGATTCATTTTTAAAAATCTCTTAATTATTAACTTTCAGAAT
1 TTATTTAAACATGCTCAATAAATAGATTCATTTTTAAAAATCTCTTAATTATTAACTTTCAGAAT
*
22448 ATTAATATCATA
66 ATTAATAACATA
22460 GTATTATTTT
Statistics
Matches: 70, Mismatches: 6, Indels: 1
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
87 32 0.46
88 38 0.54
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.05, T:0.45
Consensus pattern (88 bp):
TTATTTAAACATGCTCAATAAATAGATTCATTTTTAAAAATCTCTTAATTATTAACTTTCAGAAT
ATTAATAACATAATATGATATAT
Found at i:22917 original size:16 final size:18
Alignment explanation
Indices: 22891--22932 Score: 61
Period size: 18 Copynumber: 2.4 Consensus size: 18
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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** * * *
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191 AATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * * * * * ** *
28711 TCGAATAAGCTTGCAGGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTTA
255 TTAAATAAG-TTGTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTGA
* ** * * *
28776 AATAGACAATTGTTCAAATATTCGTGACTATTTGAATTTGT
318 AATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-CTGT
** * * * * *
28817 TCAGGAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTTCCTATCAA---T----T-TT--T---TT--T-
1 TCAATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * *
28865 TTA---T-TT-TGGATAATCTTTTATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCA
65 TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCA
* * * * * * * ** *
28924 TAACGATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTC-GATAAATAGA
128 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAGA
* * ** * * * * * *
28988 TTTATTTTTTCAAATCAT-TTGCTTATTAATTTTCCAAATGTTCATAAGTTTGAATTATTATATT
192 ATTATTTTTT-AAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * * * **
29052 TCGAATAAGCTTGTAAG-ACATGAAACAAA-TATTTTATGACTAAACAAAATGT-TTGAACAATT
255 TTAAATAAG-TTGTATGAAC-T-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGT-AATGATT
* * * * * *** * *
29114 TGAAATAGATATTATTCTAATTGTTTTAATTATTTGACCTGGT
315 TGAAATAAAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GT
* * * * * * *
29157 TCAACAAACACATTTATTTTTTTAATCTCTTA-TTA--ATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTAT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
* * ** * * * * *
29219 TATTTT-TAACTGAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAGATTATA
66 TATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATA
** * * * * * * * * * *
29283 ACAATATGAGATTGATAATTGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAATTGATTC-GATAAATAGATT
130 ATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAGAAT
* * * *
29347 TATTGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGA
194 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * *
29412 ATAAGCTTGTATG-A-TAAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAATAATAGGTCATAATGATTTG-AA
259 ATAAG-TTGTATGAACT-AAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGTCGTAATGATTTGAAA
* ** * * *
29474 TAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGAT
320 TA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTG-T
*** * * * *
29513 TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTTCTTATTAA-TTTAGGAAATATTAATAAATTAGT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA-G-AATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
29577 ATTATTTTATTC-CATCTAAGCTTGTGTTAA-ATGAAAAAATTATTTTATGACAAATTAAAAGGT
64 ATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAA-AAAAAGGT
* ** * ** * ** ** *
29640 TATAACAATTTTAAATAGATAATTGCTCAAATA---AT-A--A---GAACTTATTTGGTAAACAT
126 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAG
* * * * * * *
29696 ATTTATTTTTT-AGTCTCTTTCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTC
191 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * **
29760 TAAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAA
256 TAAATAAG-TTGTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTGAA
* * * * * * * *
29825 GTATATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAATGAT
319 ATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTG-T
* * * * *
29865 TCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAGTTTTTGAAATATT-ATGAAATTAGT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAAT-AAATTAGT
* * * * * * * *
29929 ATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTA-CAAAAAAAATAATTGTTTTATGATAAAAGAGAAGGTCA
64 ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCA
* * * * * * * *
29993 TAATGATTTAAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAATTATTTGAATTGGTTC-G-ACAATTAG
128 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTA-AA-CAG
* * * ** * * * * *
30056 ATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTTGCATTATTTTATTT
191 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * ** * * ** *
30121 TGAATAAAATAGTA-AAAATGGAACCAAA-TGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTA
256 TAAAT-AAGTTGTATGAACT--AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTG
* * ** * *
30184 AAATAGATAATTATTCAAATAGTAAGAACTATTTGAAATGGT
317 AAATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GT
** * ** ** *
30226 TTGACAAGCAGATTTACCTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT-TAGAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * * * * *
30290 ATTATTTTATT-TCAAACAAACTTATATTAATAAAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTA
64 ATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTC
** * ** * * * * * *
30354 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAGTTATAATTATTTAAACTAGTTCTGTAAATAGA
127 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGA
* * * * * *
30419 ATTATTTTCTAAATCTCTTA--TA--AAATTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATTTC
192 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * ** **
30480 GAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTCTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA
257 AAATAAG-TTGTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTGAAA
* * * *
30545 TAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGT
320 TAAA-AATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GT
** ** * * * * * * * * *
30584 TTGACCAACAAATATATTTTTTAATTCTCATAGTTATTACTTTTTGGAATATTACTAAA-T--TA
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTAGAATATTAATAAATTAGTA
** * * * * * * * * *
30646 TTATTTTATTCCAAATATGATT-TATGAGCA-AAA-ATTTTTTTTATGATAGAACAAAGGTTATA
65 TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATA
** * * ** * ** ** *
30708 ACAATTTGATATAGATAATTGTTCCAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAATTGATTT
130 ATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGAATT
* *
30773 GTTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAGA
195 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA-A
* * * ** * *
30833 AAAAGCTTGTATG--TTGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAAT
259 ATAAG-TTGTATGAACT-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTGAAAT
* * * * * * *
30896 AGATAGTTATTTAAATGGCCATGATTATTTGAACTGAT
321 A-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTG-T
* * * * *
30934 TCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATT-ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGT
1 TCAATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGT
* * * *
30997 ATTATTTTGTTTTGGATAAGCTAT-TATGAA-ATAAAACAATTTTTTTATGACAAAAAAAATGGT
64 ATTATTTTATTCTGAATAAGCT-TGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAA-GGT
* * * * **
31060 CATAATGATTTTAGATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTCTTC-GATAAACA
126 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACA
* * * * * * * *
31124 TATTTATTTTTTCAAATCTCATGCCTATTAATTTTTTG-AATGTCAATAAATTAGTATTATTTTG
190 GAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * **
31188 TTTTGAATAAGCTTG-ATGAA-TATAAATACTTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATT
253 TTTTAAATAAG-TTGTATGAACTA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATT
* * * * * *
31251 TG-AATAGATAACTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGT
315 TGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GT
*** * * *
31294 TTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTA-TTAATTTCAGAATATTGTTTAGAAAACAGCTT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-A-TT----A-A-T-TTTAG---A-A----
** * * * * * **
31358 TAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTACTTTTTGAAAATATTAATAAAG-TAGTATGATTTTATTTT
49 TA-TTAATAAA--T-TAG--TATTA--TTTT--A-TTCTGAAT-AAGCTTGTATGA----A-CAT
* * * ** ** * * *** * *
31422 AGATAAGT-TTTTATGAGCTGAAACAATTGT-TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTA
97 AAACAATTGTTTTATGA-CAAAAA-AAAGGTCATAATGATTTGA-AATA-G--ATAATTA-TTTA
* * * ** *
31485 AATAGATAATTATTCAAATAGTCAAATCTATTGCAACTTGTTTGGCAAACA-AATTTATTTTTTT
155 AATAG----TCA-T---A-A--C---TAT-TTG-AACTGGTTCAGTAAACAGAA-TTA-TTTTTT
* * * * * *
31549 AAATATCTTGCTCATTACTGTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
202 AAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAG-T
* * * * ** * *** *
31613 TGTATGAATTGAAATAATTGTTTAACAACTAAACAAAAAGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATT
265 TGTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCGTAATGATTTGAAATA-AAAATT
* * * * * *
31678 GTTCTAATAGTCTTAACTACTCGAAATTGT
328 GTTCAAATAGCCATAACTATTTG-AACTGT
* * * ** * ** *
31708 TCAACAAACACATTTATTTTTTAAAT-TGCTTACTTACAAATTTTTGGAATATT-ATTTACTAGT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
31771 ATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAA-AGGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCA
64 ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACA-TAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCA
* * * * * * ** *
31835 TAAAGATTTGAAATAGATAAGTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTGTTTTGGTAAATAG-A
128 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGAA
* * ** *** * *
31899 TTTTCTTTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTATCAAAATCCAAATAGATAAGTATT-TTTTATTTT
193 TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * * **
31959 GAATAATTTTGCAT-AAGC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATTACAATTTGA
257 AAATAA-GTTGTATGAA-CTA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTGA
* * * * *
32022 AATAGATAATAGTTCAAATGGACATAACTATTTGAAGTTGT
318 AATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-CTGT
** * ** * * *
32063 TCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCAAACTTATTAATCCTTACAATACTAATAAATTAGTA
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTA
* ** * *
32128 TTATTTTACTTC-AAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAAAAAA--TCAT
65 TTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCAT
* * * * * * * *
32189 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAACCATTTGAACTTGCTCGGTAAACA-AAT
129 AATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGAAT
* * * * *
32253 ATATTTTTCAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
194 -TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-T
* * * * * *
32318 AAA-AAGGTTTTACGATC-AGAAACAATTAG-TTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGA
257 AAATAA-GTTGTATGAACTA-AAAAAATT-GTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTGA
* * *
32380 AATAGATAATT-TTCAAATAGTCATAATTATTTGAACATGT
318 AATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAAC-TGT
* * * * *
32420 TCAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAAAT-T-TCACTTAGTAATTTTTGGATTATTAATAAATTTA
1 TCA-ATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAA-TTA
* * * * * * * *
32482 -AATTATTTTATT-TGAAATAAGTTTGCATTAATAGAATCAATTTTTTTATGACAAAAAAAAGAG
62 GTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAA-AG
* * * * * ** *
32545 GTTATAATGTTTTGAAATAGATAACTT-TTCAGATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCTGTAAA
124 GTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAA
* * * * * * *
32609 CA-AATTCTTTTTTCAATTCTTTTACTCATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATCTT
188 CAGAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * ** * * * * * * *
32673 ACTTCAAATTTGCTTATATGAACTGAAACAAGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATT
252 ATTTTAAATAAG-TTGTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATT
* * * * * * *
32738 TGAAATAGATACTTATTCAAATAGTCATGACCATTTGAAATTGT
315 TGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTG-AACTGT
*** * * * * * * * *
32782 TTGGTAGATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTGTCAAAATATTTATAAATTAATA
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGTA
* * * * **
32847 TTATTTT-TATCCGAATAAACTTGTATGAACATAAATAATTATTTTAT-AGCAAAACAAAAAATC
65 TTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGA-CAAAA-AAAAGGTC
** * * ** * * *
32910 ATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTTAGTAAACAG
127 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTCAGTAAACAG
* * *
32974 ATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA
191 AATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * *
33037 CTCAAAATAAGCTTGGATGAACAAAAGAAAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAG--GTTATGCTA
253 TTTTAAATAAG-TTGTATGAAC-TAA-AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCGTAATG--A
* * * * * * *
33099 TTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCATAATTATTTAAATATGT
313 TTTGAAATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-CTGT
* * * *
33145 TCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTATTA-TTATTAATTTTTGAATTATTAATAAATTAGT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTAGAA-TATTAATAAATTAGT
* * * * *
33209 ATTATTTTATTTTGAATAACCTTATTTGAAC-TGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
64 ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTC
* * * * * * *
33273 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCCGTAAACATA
127 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGA
* * * * ** * **
33338 TTTA-TTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCC
192 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * *
33401 AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTGAA
257 AAATAAG-TTGTATGAACTA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCGTAATGATTTGAA
* * * *
33465 ATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTTTTTAAACTAGT
319 ATAAA-AATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GT
** * * *
33505 TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTA
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * * ** * * *
33566 TTACTTTATTCTGAACAAACCTAAATGAATA-AAAGCATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
65 TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAA-CAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCA
* * * * * * * *
33630 TAATAATTTTAAATATATAATTCTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAGGTT-AGGTAAACAGA
128 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-GTAAACAGA
* *
33694 ATTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTC
192 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT
* * * ** * ** * *
33757 CAAATAAGCTAGTATGAATTCAAACAAACCTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTA
256 TAAATAAG-TTGTATGAACT-AAA-AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTG
* * * * *** *
33822 AAATAGATAATTATTCATACAGTTTTAAATATTTGAACTGGT
317 AAATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GT
* * * *
33864 TC-TTCAAA-AAATTTA--TTTTAAA--TCTTAGTTATTAACTTTTATAAACAAAAATATTAAAA
1 TCAAT-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA--TTT-T-----AGAATATT--AA
* * * * * * *
33923 TAGATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAACC
55 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAA-A
* ** * * * * **
33988 AAAAGGTTATAATGATTT-AAAGTTTATAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTTG
119 AAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA
* * * *
34052 GTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTACTTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTA
183 GTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** * * * **
34113 TTTTATTCTGAAA-AAGCTTGAATGTTC-AAATACAATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATA
248 TTTTATT-TTAAATAAG-TTGTATGAACTAAA-AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTA
** * * * * * * *
34176 ACAATTTGAACTAAATAATTGTTGACATAACCACAATTATTTGAACTAAT
309 ATGATTTGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GT
* * * * * * *
34226 T-AGGTAAACATATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTAGT
1 TCA-ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTAGAATATTAATAAATTAGT
* * *
34290 TTTATTTTATT-TCGAATAGGCTTGTATGAAC-TGAAACGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
64 ATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGT
* * * * *
34353 CATAACGATTTGAAATGGATAATT-GTT---T--T-A-AACTACTT---C-GG--C---AAACAT
126 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAG
* * * * ** * *
34401 ATTTATTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTGTTAAATTATTATTATTTTATTC
191 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * ** * * * * * **
34466 CAAATAAGCTTATACAAACTAAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA
256 TAAATAAG-TTGTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGATTTGAA
* **
34531 ATAGATAATTGTTC-AA-A--CAGGA--A-TTG----GT
319 ATA-AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGT
* * * * * *
34559 ACGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATAAATGTTT-GAATTATTAATAAATTAGT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTAGAA-TATTAATAAATTAGT
* * **
34623 ATTATTTTATTCTGAATAGGCATT-TATGATA-A-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATTT
64 ATTATTTTATTCTGAATAAGC-TTGTATGA-ACATAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGT
** * * * * *** *
34685 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAACCAATT-TGATAAAC
126 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAAC
* * * * * *
34748 TGACTTATTTTGTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT-AATGTAATATTATTTTA
189 AGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTA
* * * ** * * * * * *
34812 TTTCAAATAAGCTTTTATGAATTGGAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAGGTCATATTTATGT
253 TTTTAAATAAG-TTGTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCGTAATGAT-T
* * * **
34877 T-AAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTAGATGAACTTGT
315 TGAAATAAA-AATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAAC-TGT
* * *
34920 TCGATAAACATATTTATTTTTT
1 TCAATAAATAGATTTATTTTTT
34942 TTAATTTCTT
Statistics
Matches: 9392, Mismatches: 2089, Indels: 1403
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
330 17 0.00
331 55 0.01
332 140 0.01
333 109 0.01
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* * * * * * * * *
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** * * *
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** * * * * * ** **
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* * * * * * * * * *
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* * *** *
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* * * * *
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* * * * * * * *
25388 GTCATGAC-TCTTTGATCTAGTTTGGTAAAAATATTTATTTTTAAAATTTTTTATTTATTAATTG
501 GTCAT-ACTTATTTGAACTAATTTGATAAACAGATTT-TTTTT--AA--TCTCA--TATTAATT-
** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* **
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* * * * ** * * * *
25638 TAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTCATATGAAGAAAAATATTTGTTTTATGACAA
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* * * * *
25703 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTT
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*
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876 CGACAAATAGATT
* * * *
25781 TATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT-GAAATAGTAATAAATTTATTTTATTTTATTTTG
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTCG
* * * * *
25845 AATAAG-TTAGTAAGAA-CTGAAAAAATTATTTTACGATAAAATAAAAGGTCATAACA-ATTTGA
64 AATAAGCTT-GTATGAATC-AAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGA
* * * * * * *
25907 AATA-AGGAATTGTTCATATTGCCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTA
126 AATAGA-CAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAGTTCAATAAAT-AATTTATTTTTTA
* * * * * *
25971 AATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTATG-AATAAGCTT
188 AATTTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAAATAAGCTT
* * * * * * * *
26035 GTATGAACA-AAATTAATTGTTCTATGATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATATATAATT
253 GTATGAATAGAAACT-ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACTATTTGAAATAAATAATT
*
26099 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTT
316 GTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--T-CT-CTT
* ** *** * *
26164 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTGCATTTTGAATAGGC-TAGAATGATG-AAA
376 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTA-TATGA-GAAAA
* * * * * * *
26227 AGCAACTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGACATAGATAGTTATTCAAATGGCC
439 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * *
26292 ATAATT-TTTGACCTATTTTGATAAACTGATTTATGTTTTAAATCTCTAATTTATCAAATTTTAT
504 ATACTTATTTGAACTAATTTGATAAACAGATTT-T-TTTT-AATCTC--A--TATTAATTTTTA-
* ** * * *
26356 AATATTAATAAA-GCAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAATAATTGTTGTA
561 AATATTAATAAATTC-ATATTATTTTATTTTGGATAAGCTAGTATGAATTGAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
26420 TGATAAATAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAGC
625 TGACAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
26485 TTGTTTGGTAAATAGATTT-TTTTCT-GATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
690 TAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * ** **
26548 ATTACTATTTTATTTTGAAGAAGCATGTATGAGCTGAAGCAATTATTTTATGAC-TAAACAAAAG
755 AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAT-AACAAAAG
** * * * * *
26612 GTTCGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAAAT
819 GTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGACAAAT
*
26677 AAATT
884 AGATT
* * * * * * *
26682 TATTTTTTAAA--TC---CTTATTAATGTTTAGAATATTATTAATTTATCAATATATCACTTCGA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAT-ATTATTTTATTTCGA
* * * * * *
26742 ATCAGCTTGT-TGAAT-AGAAATAAA-TGTTTTAGGATAAAAC-AAAGATCATAACGATTGGAGA
65 ATAAGCTTGTATGAATCA-AAA-AAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAA
* * * *
26803 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAA-
128 TAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAAT-AGTTCAATAAATA-ATTTATTTTTTAAAT
* * * *
26867 TTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGA
191 TTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATATGAAATAAGCTTGT
* * * *
26930 ATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAGAGT-TTTGAAATAGATAATTGT
255 ATGAATAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATA-ACTATTTGAAATAAATAATTGT
* * *
26994 TAAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTATTTTAATTCTCTTACTCT
318 TAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATT-TTTTAAATCTCTTA----
* * * **
27059 TTAATTTTTGGAATATTGATAAATTGGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGA-ATTGAAA
377 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGA-AAAAA
* * * ** *
27123 CAATTGTTTTATTACAAAA-AAAGAGGTCACAATGATTTGAAGTAGATAATTATTCAAATAGTCA
441 CAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * **
27187 TGAC-TATTTGAACTTATTTGATAAACATATATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAA
505 T-ACTTATTTGAACTAATTTGATAAACAGAT-TTTTTTTAATC---T-CATATTAATT-TTTAAA
* * **** * * *
27251 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTCGTATGGATAGAAACAATTGTTTTATGA
563 TATTAATAAATTCATATTATTTTATTTTGGATAAGCTAGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
27316 CAAAAAAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAA-TGATTTGAA
628 C--AAAAAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA
* * *
27379 CTTA-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTCTT--CATATTAATA
689 C-TAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATA
* * * *
27441 AATTTGTATTATTTTA-TTCAAAGTAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATGACA-AACC
751 AATTAGTATTATTTTATTTTAAA-TAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACATAA-C
* * ** * * * * *
27504 AAAAGGTTATAGCGGTTCCAAATTGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGA
814 AAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGA
*
27569 TAAATAGATT
879 CAAATAGATT
* * * *
27579 CATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTTG
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-ATTA-TATTATTTTATTTCG
* * * * *
27643 AATAACCTTATATGAACTGAAATAAATT-TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
64 AATAAGCTTGTATGAA-TCAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAA
* * * * *
27707 TAGACAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATATAGTTCAATAGAT-ATTTATTTTTAAAATT
128 TAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGA-ATAGTTCAATAAATAATTTATTTTTTAAATT
* * *
27771 TTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAAAT-AGCTTGTAT
192 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAAATAAGCTTGTAT
* *
27835 GAATAGAAACTATTGTTTTATAACAAAACAGAAAGTCAGAACTATTTGAAATAAATAATTGCTTA
257 GAATAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTG-TTA
* * **
27900 AATATTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTT
320 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTT
* * * * *
27965 TGAAATATTAATAGATTAGTATTGTTTTATTCCAAACAAACTTATATGAGAAAAAACATTTGTTT
385 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGAAAAAACAATTGTTT
* *
28030 TATGATAAAACAAAA-TTCATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATACTTATTTG
450 TATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATACTTATTTG
** * * *
28094 AACTGGTTAGGTAAAGAGAATTTTTTTTAATCTCATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCAT
515 AACTAATTTGATAAACAG-ATTTTTTTTAATCTCATATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTCAT
* * * * *
28159 TTTATTTATTTTTTTGGATAAGCTAGTATGAATTGAGAA-ATTTGTTTTATGACAAGACAAAGGG
578 ATTA-TT-TTATTTTGGATAAGCTAGTATGAATTGA-AACAATTGTTTTATGACAA-AAAAAAGG
* * * * * *
28223 TCATAACGATTTGAATTAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACA
639 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATA
* * * * * *
28288 AATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTGTTTTATT
704 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * *
28353 TTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAGGTTATAATGATTTGA
769 TTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTTATAACGATTTGA
* * * * * * ** *
28418 AGTATACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTAGTTCGGTAAACAGATT
834 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAGATT
* *
28473 TATTTTGTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AGAGATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCG
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGA-ATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCG
* * * ** *
28536 AAATAAGCTTGTATG-GTCAAAAACAATTGTTATGTGACCAAACAAAAGGTGATAAAGATTTGAA
64 -AATAAGCTTGTATGAATCAAAAA-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAA
* * * * * * * **
28600 ATAGACAATTGTTAAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCTACAAATAGATTCACCTTTT-AA
127 ATAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAGTTCAATAAATA-ATTTATTTTTTAAA
* * * *
28664 ---GTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTT-ATTTCG-AATAAGCTTG
190 TTTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
28724 CAGGAACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGACAATTG
254 TATGAA-TAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACTATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * *
28788 TTCAAATATTCGTGACTATTTGAATTTGTTC-AGGAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTC-----
317 TT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTATT
** * **** * * **
28846 ----TTT--CCTATCAAT---TT--T-TT-TTTTATTTTGGATAATCTTTTATGA-ATTGAAACA
379 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGA-AAAAACA
* * * * * * *
28897 ATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
443 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-A
* * * * * *
28962 C-TATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCATTTGCTTATTAATTTTCCAAA
507 CTTATTTGAACTAATTTGATAAACAGA-TT-TTTTTT--AATC---T-CATATTAATTTT-TAAA
* * * * * * * * * * *
29026 TGTTCATAAGTTTGA-ATTATTATATTTCGAATAAGCTTGTAAGACA-TGAAACAAATATTTTAT
563 TATTAATAA-ATTCATATTATTTTATTTTGGATAAGCTAGTATGA-ATTGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * ** * *
29089 GACTAAACAAAATGT-TTGAACAATTTGAAATAGAT-ATTATTCTAATTGTTTTAATTATTTGAC
626 GAC-AAAAAAAAGGTCAT-AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * ** * * * * *
29152 CTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTTAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAAT
689 CTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
** * * ** * * * * *
29213 TAGTATTATTTT-TAACTGAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTTTCATGACAAAAC-AAA
754 TAGTATTATTTTAT-TTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACATAACAAAA
* * * * * * * * *
29276 GATTATAACAATATGAGATTGATAATTGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAA-TTGATTCGATAA
818 GGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-TTCGACAA
29340 ATAGATT
882 ATAGATT
* * * *
29347 TATTGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCG
* ** * * *
29411 AATAAGCTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAATAATAGGTCATAATGATTTG-AA
64 AATAAGCTTGTATGAATCAAAAA-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAA
* ** * * * *** *
29474 TAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACT-GATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
128 TAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAG-TTCAATAAA-TAATTTATTTTTTAAA
* **
29538 TTTCTTT-CTTATTAA--TTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT-TCCATCTAAGC
190 TTT-TTTACTTATTAATTTTTA-G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAAATAAGC
* * ** * ** * * * *
29598 TTGTGTTAA-ATGAAAAAATTATTTTATGACAAATTAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAA
251 TTGTATGAATA-GAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACTATTTGAAATAAATAA
* * * * **
29662 TTGCTCAAATA---AT-A--A---GAACTTA-TTTGGTAAACATATTTATTTTTTAGTCTCTTTC
314 TTG-TTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA-AATC--TC
* * * * * **
29717 TTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ATTG
374 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGA-AA
* * * * ** * * *
29781 AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAGTATATAATTATTCTAATAGT
438 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * *
29846 CTTAAC-CATTTGAAATGA-TTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAGTTTT
503 CAT-ACTTATTTGAACTAATTTGA-TAAACAGA-TT-TTTTTT-AATCTC--A--TATTAATTTT
* ** * * * *** *
29909 TGAAATATT-ATGAAATT-AGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTA-CAAAAAAAATAATTGT
559 T-AAATATTAAT-AAATTCA-TATTATTTTATTTTGGATAAGCTAGTATGAATTGAAACAATTGT
* * * * ** * * *
29971 TTTATGATAAAAGAGAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAATTATT
621 TTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * ** * *
30036 TGAA-TTGGTTCG-ACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTA
685 TGAACTAGTTTAGTA-AA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * ** * ** *** ** * * * *
30099 TTAAATTTGCATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTAAAAATGGAACCAAATGTTTGATGACAAAA
748 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACATAA
* * * * * * * *
30164 TAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAGAACTATTTGAAA-TGGTTT
813 CAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTAGTTC
**
30228 GACAAGCAGATT
877 GACAAATAGATT
** * *
30240 TACCTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCG
* * * * * * * * * *
30304 AACAAACTTATATTAATAAAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTAATAACA-ATTTGAAA
64 AATAAGCTTGTATGAATCAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTGAAA
* * ** * * ** * *
30368 TAGATAATTGTGCAAATAGTTATAATTATTTAAACTAGTTCTGTAAATAGAATTATTTTCTAAAT
128 TAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAGTTCAATAAATA-ATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * * *
30433 CTCTTA--TA-AAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATTTTATTCT-ATTTCG-AATAAGCTTGT
191 TTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAAATAAGCTTGT
* * * *
30492 ATGAGCT-GAAA-TAATTGTCTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTG
255 ATGA-ATAGAAACT-ATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACTATTTGAAATAAATAATTG
* * * * ** * *
30555 TTCATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTTTGACCAACAAATATATTTTTTAATTCTCATAGTTA
317 TT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC----TTA
* * * * * *
30620 TTACTTTTTGGAATATTACTAAA-T--TATTATTTTATTCCAAATATGATT-TATGAG-CAAAA-
377 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGAAAAAAC
* * * * * * * *
30679 ATTTTTTTTATGATAGAACAAAGGTT-ATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCCAATAGTCATA
442 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-
* ** ** * ** * * *
30743 AC-TATTTAAACTGGTTCAACAAATTGATTTGTTTTTTAAATTTCTTATTAATTCTTGAAATATT
506 ACTTATTTGAACTAATTTGATAAACAGA-TT-TTTTTT-AATCTCATATTAATT-TTTAAATATT
* * * *
30807 AATAAATT-AGTATTATTTTATTTAGAAAAAGCTTGTATG--TTGAAAACAATTGTTTTATGACA
567 AATAAATTCA-TATTATTTTATTTTGGATAAGCTAGTATGAATTG-AAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * * * *
30869 AAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAGTTATTTAAATGGCCATGATTATTTGAACT-GA
630 AAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
* * * *
30933 TTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATT-ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAG
694 TTAG-TAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* ** * * *
30996 TATTATTTTGTTTTGGATAAGCTAT-TATGAA-ATAAAACAATTTTTTTATGACA-AAAAAAATG
757 TATTATTTTATTTTAAATAAGCT-TGTATGAACA-AAAATAATTATTTTATGACATAACAAAA-G
* * * * * * ** * *
31058 GTCATAATGATTTTAGATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTCTTCGATAAAC
819 GTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGACAAAT
*
31123 ATATT
884 AGATT
* * * * * * * *
31128 TATTTTTTCAAATCTCATGCCTATTAATTTTTTGAATGTCAATAAATTAGTATTATTTTGTTTTG
1 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCG
* * * *
31193 AATAAGCTTG-ATGAAT-ATAAATACTTATTATATGACT-AAACAAAAGGTCA-AAATGATTTG-
64 AATAAGCTTGTATGAATCA-AAAAAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAAA-GATTTGA
* * * * * * * *** *
31253 AATAGATAACTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAA
126 AATAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAGTTCAATAAATA-ATTTATTTTTTAA
* ** *
31318 ATCTTTTA-TTAATTTCAGAATATTGTTTAGAAAACAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATT
189 ATTTTTTACTT-A-TT----A-ATT-TTTAG---A-A----TA-TTAATAAA--T-TAG--TATT
* * * *
31382 ACTTTTTGAAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAGCTGAAACA
232 A--TTTT---AATA-T--GAAA-TA--A-GCTTGTA---T-G---A------AT-A---GAAACT
* * *
31447 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TGACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-
268 ATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACT-A-TTTGAAATAAATAATTGTT-AAATAGTCAT
* * ** * *
31509 AATCTA-TTGCAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATATCTTGCTCATTACTGTTTT
329 AA-CTATTTG-AACTAGTTCGATAAACAAATTTA-TTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAAT-TTTT
* *** * ** *
31573 G-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATTGAAATAATTGTTT
386 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGA-AAAAACAATTGTTT
* ** * * ** * * * *
31636 AACAACTAAACAAAAAGTT-AAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAAC-TACT
450 TATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTTATT
* * ** ** * * * *
31699 CGAAATTGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAAT-TGCTTACTTACAAATTTTTGGAATATT-A
513 TGAACTAATTTGATAAACAGA-TT-TTTTTT-AATCT-CATA-TT---AATTTTT-AAATATTAA
** * * ** * * **
31762 TTTACT-AGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAAAGGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
569 TAAATTCA-TATTATTTTATTTTGGATAAGCTAGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
31826 TAAAGATCATAAAGATTTGAAATAGATAAGTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT-GTTTTG
633 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTA
* ** *** * *
31890 GTAAATAGATTT-TCTTTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTATCAAAATCCAAATAGATAAGTATT
697 GTAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * * *
31950 -TTTTATTTTGAATAATTTTGCAT-AAGCAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATT
761 ATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTTATA
* * * * * * * **
32013 ACAATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATAACTATTTGAAGTTGTTCGGTAAATAGATT
825 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAGATT
* ** ** * * * *
32077 TATTTTTTAAATATCAAACTTATTAATCCTTACAATACTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAA
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCGA
** * *
32142 ATAAAATTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGA-AAAA-AAAA--TCATAATGATTTGAAAT
65 ATAAGCTTGTATGAATCA-AAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAAT
* * * * * * * ** * * * *
32202 AAATAATTGTTCAAAAAGTCATAACCATTTGAACTTGCTCGGTAAACAAATATATTTTTCAAATC
129 AGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAGTTCAATAAA-TAATTTATTTTTTAAATT
* * * * *
32267 TTTTATTTATTAATTTTT-GAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAAA-AAGGTTTT
192 TTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAAATAAGCTTGT
* * * *
32329 ACG-ATCAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATT
255 ATGAAT-AGAAACTATT-GTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATT
* * *
32391 -TTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-ATGTTCAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCACT
316 GTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTC-GATAAACAAATTTATTTTTT-AAA--TCTCT
* * * * ** * ** * *
32453 TAGTAATTTTTGGATTATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTTGAAATAAGTTTGCATTA-ATAG
375 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGA-AA
* * * *** *
32516 AATCAATTTTTTTATGACAAAAAAAAGAGGTT-ATAATGTTTTGAAATAGATAACTT-TTCAGAT
438 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-A-GTTCATAACAATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAAT
* * * *
32579 AGTCATAAC-TATTTAAACTTATTCTG-TAAACAAATTCTTTTTTCAATTCTTTTACTCATTAAT
500 AGTCAT-ACTTATTTGAACTAATT-TGATAAACAGATT-TTTTTT-AA-TC--TCA-T-ATTAAT
* * * * *** ** * *
32642 TTTTGGAATGTTAATAAATT-AGTATTATCTTACTTCAAATTTGCTTA-TATGAACTGAAACAAG
556 TTTT-AAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTTTGGATAAGC-TAGTATGAATTGAAACAAT
* * * * * *
32705 TGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATACTTATTCAAATAGTCATGACC
618 TGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * * **
32770 ATTTGAAATTGTTTGGTAGATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTGTCAAAATATT
682 ATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * *** * *
32835 TATAAATTAATATTATTTT-TATCCGAATAAACTTGTATGAACATAAATAATTATTTTAT-AGCA
747 AATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGA-CA
* ** * * * * * * *
32898 AAACAAAAAATCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTG
810 TAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTAAACTAG
* * *
32962 TT-TAGTAAACAGATT
874 TTCGA-CAAATAGATT
* * *
32977 TATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-CT
1 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTT
* * * * ***
33039 CAAAATAAGCTTGGATGAA-CAAAAGAAAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-GCTATT
62 C-GAATAAGCTTGTATGAATC--AA-AAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATT
* * * * * * * *
33101 TGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCATAATTATTTAAATATGTTCAGTAAATAGATTCATTTTT
123 TGAAATAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATA-GTTCAATAAATA-ATTTATTTTT
* * *
33166 TAAATCTTATTA-TTATTAATTTTT-GAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAA
186 TAAAT-TTTTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAAATAA
* * * * * *
33228 CCTTATTTGAACT-GAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGA
249 GCTTGTATGAA-TAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACT-ATTTGAAATAAA
* * * * * * *
33291 TAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCCG-TAAACATATTTA-TTTTAAAATTTT
311 TAATTGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-CGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC
* ** * *
33354 TACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGA-A
372 T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGA
* * * * * **
33418 TAGAAAA-AATTGTTTTATAATAGAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAA
436 -A-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * *
33481 ATAGTCATAACTT-TTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCACTTTTTAATTTT
498 ATAGTCAT-ACTTATTTGAACTAATTTGATAAACAGA-TT-TTTTTT-AATCTCATATTAATTTT
* * * * * * * * *
33545 TGAAATATTAATAGATT-AGTATTACTTTATTCTGAACAAACCTA-AATGAA-TAAAAGCATTTG
559 T-AAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTTTGGA-TAAGCTAGTATGAATTGAAA-CAATTG
* ** * * * * *
33607 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAATATATAATTCTTCAAATAGTTATAATTAT
620 TTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
33672 TTGAAC-AGGTTAGGTAAACAGAATTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
684 TTGAACTAGTTTA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* ** * **
33735 ATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAACAA-ACCTATTTTATGAT
748 ATAAATT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA--CAAA-AATAATTATTTTATGA-
* * * * * * * ** * * *
33798 GA-AACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATACAGTTTTAAATATTTGAACTG
808 CATAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTA
** *
33862 GTTCTTCAAA-AAATT
873 GTTCGACAAATAGATT
* * * *
33877 TA--TTTTAAA--TCTTAGTTATTAACTTTTATAAACAAAAATATTAAAATAGATTAGTGTTATT
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-T-----AGAATATT--AATAAATTA-TATTATT
* * * * * *
33938 TTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-CAAAAATAATTGTTTTATGACAAACCAAAAGGTTATAATG
56 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATCAAAAA-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAG
** * * * ***
34002 ATTT-AAAGTTTATAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAATAGATTTAT
120 ATTTGAAA-TAGACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAGTTCAATAAATA-ATTTAT
* * * * *
34066 TTTTTAAA---TCT-CTTATTACTTTTT-GAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAA
182 TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAAA
* * * * * * * *
34126 -AAGCTTGAATG-TTCA-AATACAATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAACT
246 TAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACTATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACTATTTGAAAT
* ** * * * * * * * *
34188 AAATAATTGTTGACATAACCACAATTATTTGAACTAATTAGGTAAACATATTCACTTTTTAAATC
308 AAATAATTGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-
* * * * * * *
34253 ACTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATG
371 -C-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATG
** * * * *
34318 A-ACTGAAACGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATGGAT-A--A-T--
433 AGA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * ** *
34376 --T-GT--T--TTA----AACTACTTCGGCAAACATATTTATTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAA
497 AATAGTCATACTTATTTGAACTAATTTGATAAACAGATTT-TTT-TT-AATCTC--A--TATTAA
** **** ** * *
34430 TTTTTAAAATATTGTTAAATT-ATTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTA-TACAAACTAAAACAA
555 TTTTT-AAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTTTGGATAAGC-TAGTATGAATTGAAACAA
* * * * * * **
34493 TTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AA-A--CAGGA-
617 TTGTTTTATGACA-AAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * * * *
34553 -ATTGGTAC--G---A-TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATAAATGTTTGAATTAT
681 TATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * *
34611 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAGGCATT-TATG-ATAAAAACAATTATTTTATGACA
746 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGC-TTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACA
* * * * * * *
34674 AAACAAAA-TTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAACCA
810 TAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTAAACTA
* * * *
34737 ATTTGATAAACT-GACT
873 GTTCGACAAA-TAGATT
* * *
34753 TATTTTGTAAATCTCTAACTTATCAATTTTT-GAAATATTAAT-AATGTAATATTATTTTATTTC
1 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAAT-T-ATATTATTTTATTTC
* * *** * *
34816 AAATAAGCTTTTATGAATTGGAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAGGTCATA
63 GAATAAGCTTGTATGAATCAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA
34870 TTTATGTTAA
Statistics
Matches: 7053, Mismatches: 1534, Indels: 1036
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
867 7 0.00
868 15 0.00
869 2 0.00
870 2 0.00
871 59 0.01
872 3 0.00
873 56 0.01
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876 17 0.00
877 112 0.02
878 77 0.01
879 56 0.01
880 66 0.01
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882 30 0.00
883 13 0.00
884 6 0.00
885 26 0.00
886 7 0.00
887 113 0.02
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891 29 0.00
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895 298 0.04
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898 96 0.01
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907 9 0.00
908 1 0.00
909 1 0.00
910 1 0.00
912 10 0.00
913 1 0.00
914 3 0.00
915 1 0.00
917 3 0.00
918 3 0.00
919 3 0.00
921 2 0.00
922 2 0.00
923 4 0.00
924 1 0.00
925 10 0.00
927 2 0.00
928 2 0.00
929 1 0.00
930 6 0.00
931 1 0.00
932 1 0.00
935 1 0.00
936 2 0.00
937 1 0.00
938 1 0.00
939 3 0.00
940 3 0.00
941 6 0.00
942 74 0.01
943 26 0.00
944 8 0.00
945 13 0.00
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948 58 0.01
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952 4 0.00
953 98 0.01
954 35 0.00
955 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (888 bp):
TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTCGAA
TAAGCTTGTATGAATCAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAG
ACAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATAGTTCAATAAATAATTTATTTTTTAAATTTTTT
ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATATGAAATAAGCTTGTATGAAT
AGAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTAAATAGT
CATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAGAAAAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATACTTATTTGAACTAA
TTTGATAAACAGATTTTTTTTAATCTCATATTAATTTTTAAATATTAATAAATTCATATTATTTT
ATTTTGGATAAGCTAGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAACGATTT
GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTT
AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT
GTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTG
TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAGATT
Found at i:29415 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 28863--31321 Score: 1545
Period size: 180 Copynumber: 13.8 Consensus size: 179
28853 TCAATTTTTT
* * * * *
28863 TTTTATTTTGGATAATCTTTTATGAATT-GAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAA
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAA
* * * * *
28927 CGATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGATAAATAGATTTA
64 CGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTA
* ** * * * * *
28992 TTTTTTCAAATCAT-TTGCTTATTAATTTTCCAAATGTTCATAAGTTTGAATTA
128 TTTTTT-AAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
29045 TTATATTTCGAATAAGCTTGTAAGA-CATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAATGTT-TGA
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTAT-A
* * * ** * * * * * * *
29108 ACAATTTGAAATAGAT-ATTATTCTAATTGTTTTAATTATTTGACCTGGTTCAACAAACACATTT
63 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTT
* * *
29172 ATTTTTTTAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTA
127 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * *
29221 TTTT-TAACTGAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAGATTATAAC
1 TTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTTATAAC
* * * * *
29285 AATATGAGATTGATAATTGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAATAGATTTAT
65 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTAT
* * *
29350 TGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTA
129 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
29401 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAAATAATTGTTTTATGGCAAAATAATAGGTCATAAT
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGGTTATAAC
** * * * * * * * *
29466 GATTTG-AATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTTGGTAAACAAATTTAT
65 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTAT
* * **
29530 TTTTTAAATTTCTTTCTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTA
129 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * * *
29581 TTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTGTTA-AATGAAAAAATTATTTTATGACAAATTA-AAAGGTTAT
1 TTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGATTA-GAAACAATTGTTTTATGACAAA--ACAAAGGTTAT
* * * * * * * * *
29643 AACAATTTTAAATAGATAATTGCTC-A-A---ATAA-TA--AGAACTTATTTGGTAAACATATTT
62 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTT
* * * *
29700 ATTTTTT-AGTCTCTTTCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTA
127 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
29752 ATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATT-GAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAA
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAA
* * * * * * * *
29816 TGATTTGAAGTATATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAATGATTC-AGTAAATAAATTT
64 CGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGA-TAAATAGATTT
* *
29880 ATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAGTTTTTGAAATATT-ATGAAATTAGTATTA
127 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTA
* ** * ** * * * * * *
29933 TTTTAATCCGAATAAGCTTGTA-CAAAAAAAATAATTGTTTTATGATAAAAGAGAAGGTCATAAT
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAGGTTATAAC
* ** * * * * * *
29997 GATTTAAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAATTATTTGAATTGGTTCGACAATTAGATTTAT
65 GATTTGAAATAGATAATTGTTCA-ATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTAT
* * ** * * * * *
30062 TTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTTGCATTA
129 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * ** * * * * * * *
30113 TTTTATTTTGAATAAAATAGTAAAAATGGAACCAAATGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAAT
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTTATAAC
* * * * * * * * ** *
30178 GATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAGAACTATTTGAAATGGTTTGACAAGCAGATTTAC
65 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTAT
* *
30243 CTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTA
129 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * * * * * * * *
30294 TTTTATTTCAAACAAACTTATATTAATAAAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTAATAAC
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTTATAAC
* * * * * *
30359 AATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAGTTATAATTATTTAAACT-AGTTCTG-TAAATAGAATT
65 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTC-GATAAATAGATTT
* * * *
30422 ATTTTCTAAATCTCTTA--TA--AAATTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTA
127 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
30471 TTCTATTTCGAATAAGCTTGTATGAGCT-GAAATAATTGTCTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-TTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAA
* * * * * ** * * *
30535 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTGAACT-AGTTTGACCAACAAATAT
64 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-ATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGATAAATAGATTT
* * * * * *
30599 ATTTTTTAATTCTCATAGTTATTACTTTTTGGAATATTACTAAA-T--TATTA
127 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
*** * * ** * * * * *
30649 TTTTATTCCAAATATGATT-TATGAGCA-AAA-ATTTTTTTTATGATAGAACAAAGGTTATAACA
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTTATAACG
* * * * * * *
30711 ATTTGATATAGATAATTGTTCCAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAATTGATTTGTT
66 ATTTGAAATAGATAATTGTT-CAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTATT
*
30776 TTTTAAA--T-TT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
130 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
30822 TTTTATTTAGAAAAAGCTTGTATG-TT-GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAA
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAA
* * * * * * * *
30885 CGATTTAAAATAGATAGTTATTTAAATGGCCATGATTATTTGAACTGATTCGATAAACTA-ATTT
64 CGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAA-TAGATTT
* * *
30949 ATTTTTTAAATTTCTTGCTTATT-ATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTA
127 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
31001 TTTTGTTTTGGATAAGCTAT-TATGAAATA-AAACAATTTTTTTATGACAAAAAAAATGGTCATA
1 TTTTATTTTGAATAAGCT-TGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTTATA
* * * * ** * *
31064 ATGATTTTAGATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTCTTCGATAAACATATTT
63 ACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTT
* * * * *
31129 ATTTTTTCAAATCTCATGCCTATTAATTTTTTG-AATGTCAATAAATTAGTATTA
127 ATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * * * *
31183 TTTTGTTTTGAATAAGCTTG-ATGAATATAAATACTTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAAT
1 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAAC
* * * * * * * *
31247 GATTTG-AATAGATAACTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACACATTTAT
65 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTAT
31311 TTTTTAAATCT
129 TTTTTAAATCT
31322 TTTATTAATT
Statistics
Matches: 1761, Mismatches: 427, Indels: 181
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 22 0.01
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183 6 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTTATAACG
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTATTT
TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
Found at i:30009 original size:351 final size:351
Alignment explanation
Indices: 29365--31321 Score: 853
Period size: 361 Copynumber: 5.5 Consensus size: 351
29355 AAATCTGTTA
* * * *
29365 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATAAA
* * * * *
29430 AAATAATTGTTTTATGGCAAAATAATAGGTCATAATGATTTGAATAGATAATCATTCAAATGGCC
66 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAATAGATAATCATTCAAATAGCC
** * * ** *
29495 ATAATTATTTTAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTTCTTATTAATTTAGGA
131 ATAACCATTTGAAATGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTAGGA
* * ** *
29560 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTGTTAAATGAAAAAATTATTTTAT
196 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCATATAAGCTTGTGACAAATAAAAAAATTATTTTAT
** * *
29625 GACAAATTAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGCTCAAATAATAAGAACTTATTTGGT
261 GACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGCTCAAATAATAAGAACTTATTTGGT
29690 AAACATATTTATTTTTTAGTCTCTTT
326 AAACATATTTATTTTTTAGTCTCTTT
* * *
29716 CTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ATT
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATA-A
* * * * *
29780 GAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAGTATATAATTATTCTAATAG
65 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAA-TAGATAATCATTCAAATAG
* * * * *
29845 TCTTAACCATTTGAAATGATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAT-TTATTAGTTTT
129 CCATAACCATTTGAAATGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-TCTTATTAATTTA
* *
29909 TGAAATATT-ATGAAATTAGTATTATTTTAATCCGA-ATAAGCTTGT-ACAAA-AAAAATAATTG
193 GGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATCC-ATATAAGCTTGTGACAAATAAAAA-AATTA
* * ** *** ** ** *
29970 TTTTATGATAAAAGAGAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAATTAT
255 TTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGCTCA-A-A-TAATAAGAAC
* * * * * *
30035 TTGAATTGGTTCGACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTG
317 TT-ATTTGG-T--A-AA-CATATTTATTTTTT-AGTCTCTTT
* * * * * * * * * ** *
30077 GTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTTGCATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTA--A-AAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATAAA
** * * * * * * *
30139 TGGAACCAAATGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAAT
66 ---AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTT-GAATAGATAATCATTCAAAT
** * * * * * ** * *
30204 AGTAAGAACTATTTGAAATGGTT-TG-ACAAGCAGATTTACCTTTTAAATCTCTTACTGATTAAT
127 AGCCATAACCATTTGAAATGATTCAGTA-AA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAAT
*** * * * * * * **
30267 TTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTAT-ATTAATAAAAAAAATT
190 TTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCATATAAGCTTGTGACAAAT-AAAAAAATT
* * * * **
30331 ATTTTATGACAAAATAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TGCAAATAGTTATAATT
254 ATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGCT-CAAATA---ATAAGA
* * * * * * **
30395 ATTTAAACTAGTTCTGTAAATAGAATTATTTTCTA-AATC--T
315 ACTT--A-T--TT-GGTAAACATATTTATTTTTTAGTCTCTTT
* * * * * **
30435 CTTATAAAATTTTGAAATATTAATAAATTAAT-TTTATTCTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAGC
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATT-TATTCT-AAATAAGCTTGTATGATA
** * * * ** * ** *
30498 TGAAATAATTGTCTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATA
64 AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTG-AATAGATAATCATTCAAATA
* * ** * * * ** * * * ** *
30563 GTCTTAACTGTTTGAACTAGTTTGA-CCAACAAATATATTTTTTAATTCTCATAGTTATTACTTT
128 GCCATAACCATTTGAAAT-GATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTA-ATT
* * * * * * ** ** * *
30627 TTGG-AATATTACTAAA-T--TATTATTTTATTCCAAATATGATT-T-A-TGAGCAAAAATTTTT
191 TAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCATATAAGCTTGTGACAAATAAAAAAATTAT
* * * * * * * * * * *
30685 TTTATGATAGAA-CAAAGGTTATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCCAATAGTCATAAC-TAT
256 TTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGCTCAAATAATAAGAACTTA-
* * * ** ***
30748 TTAAACTGGTTCAACAAATTGATTTGTTTTTTAAATTT
320 TT----TGG-TAAACATATTTATTT-TTTAGTCTCTTT
* * * **
30786 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAGAAAAAGCTTGTATG-TTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGATAA
* * * * * * *
30849 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-AATAACGATTTAAAATAGATAGTTATTTAAATG
65 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAA-AATGATTT-GAATAGATAATCATTCAAATA
* ** * * * *
30913 GCCATGATTATTTGAACTGATTC-GATAAACTAATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATT-ATTT
128 GCCATAACCATTTGAAATGATTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTT
** * ** **** * * *
30976 TTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTGTTTTGGATAAGCTAT-T-ATGAAATAAAACAATTT
192 AGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCATATAAGCT-TGTGA-CAAATAAAAAAATTA
** * * * *
31039 TTTTATGACAAAA-AAAATGGTCATAATGATTTTAGATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAACTA
255 TTTTATGACAAAAGAAAA-GGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGCTCAAATA---AT-A--A
* * * * * *
31103 TTTGAACTTCTTCGATAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCATG
313 ---GAACTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTT--AGTCTCTTT
* * * * * * *
31147 CCTATTAATTTTTTG-AATGTCAATAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTG-ATGA-AT
1 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATA-
* * * * * *
31209 ATAAATACTTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAATAGATAA-CTATTCTAATA
64 AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAATAGATAATC-ATTCAAATA
* * * * * ** *
31273 GTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCT
128 GCCATAACCATTTGAAATGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
31322 TTTATTAATT
Statistics
Matches: 1196, Mismatches: 321, Indels: 169
0.71 0.19 0.10
Matches are distributed among these distances:
343 1 0.00
345 2 0.00
346 1 0.00
347 12 0.01
348 11 0.01
349 16 0.01
350 93 0.08
351 222 0.19
352 142 0.12
353 8 0.01
354 9 0.01
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359 19 0.02
360 87 0.07
361 260 0.22
362 76 0.06
363 8 0.01
364 1 0.00
365 5 0.00
366 4 0.00
367 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (351 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATAAA
AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAATAGATAATCATTCAAATAGCC
ATAACCATTTGAAATGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTAGGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCATATAAGCTTGTGACAAATAAAAAAATTATTTTAT
GACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGCTCAAATAATAAGAACTTATTTGGT
AAACATATTTATTTTTTAGTCTCTTT
Found at i:30190 original size:532 final size:529
Alignment explanation
Indices: 29184--31157 Score: 1234
Period size: 532 Copynumber: 3.7 Consensus size: 529
29174 TTTTTTAATC
* * *
29184 TCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAACTGAATAAGCTTCTATGATTA
1 TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTT-ACTAAATAAGCTTCTATGATTA
* * *
29249 GAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAGATTATAACAATATGAGATTGATAATTGTTCAACTAGT
65 GAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAGATCAAAACAATATGAGATTGATAATTATTCAACTAGT
* * * *
29314 CATAACTATTTGAATTGATTCGATAAATAGATTTATTGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTG
130 CATAACCATTTGAAATGATTCGATAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * ** * *
29379 AAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATAAAAAATAATTGTTTTA
195 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATCAAAAAAAATAATTGTTTTA
* * * * *
29444 TGGCAAAATAATAGGTCATAATGATTTGAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAAC
260 TGACAAAAGAATAGGTCATAATGATTTAAATAGATAATCATTCAAATAGCCATAATTATTTGAAC
* ** *
29509 TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTTCTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATT
325 TGATTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATT
* * ** * ** * *
29574 AGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTGTTAAATGAAAAAATTATTTTATGACAAATTAAAAGG
390 AGCATTATTTTATTCCATATAAAATAGTGAAAAATGAAAAAATTATTTGATGACAAAATAAAAGG
* *
29639 TTATAACAATTTTAAATAGATAATTGCTCAAATAATAAGAACTTATTTGGTAAACATATTTATTT
455 TTATAACAATTTAAAATAGATAATTACTCAAATAATAAGAAC-TATTTGGTAAACATATTTATTT
29704 TTTAGTCTCTT
519 TTTAGTCTCTT
* * *
29715 TCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATT-CTAAATAAGCTTGTATGAAT
1 TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTT-TTACTAAATAAGCTTCTATG-AT
* * * * ** *
29779 T-GAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGA-AGTAT-ATAATTATTCTA
63 TAGAAACAATTGTTTCATGACAAAAC-AAAGATCAAAACAATATGAGA-T-TGATAATTATTC-A
* * *
29841 A-TAGTCTTAACCATTTGAAATGATTC-AGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTA
124 ACTAGTCATAACCATTTGAAATGATTCGA-TAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTACTTATTA
*
29904 GTTTTTGAAATATT-ATGAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTA-CAAAAAAAATAA
188 ATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATCAAAAAAAATAA
* * * *
29967 TTGTTTTATGATAAAAGAGA-AGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAA
252 TTGTTTTATGACAAAAGA-ATAGGTCATAATGATTT-AAATAGATAATCATTCAAATAGCCATAA
* * ** * * * *
30031 TTATTTGAATTGGTTCGACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGG-AAT
315 TTATTTGAACTGATTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAA-TTTAGGAAAT
* * ** * *
30095 ATTATTAAATTTGCATTATTTTATTTTGA-ATAAAATAGT-AAAAATGGAACCAAA-TGTTTGAT
379 ATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTCCATATAAAATAGTGAAAAAT-GAA-AAAATTATTTGAT
** * *
30157 GACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAGAACTATTTGAAA
441 GACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTACTCAAATAATAAGAACTA-TT----
* * * *
30222 TGGTTTGACAAGCAGATTTACCTTTTAAATCTCTT
501 TGG--T-A-AA-CATATTTA-TTTTTTAGTCTCTT
* * * * * * * *
30257 ACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAACAAACTTATATTAA
1 TCTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-CT-AAATAAGCTTCTATGAT
* * * * * * * * * * * *
30320 TAAAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGT-AATAACAATTTGAAATAGATAATTGTGCAAA
63 TAGAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAGA-TCAA-AACAATATGAGATTGATAATTATTCAAC
* **
30384 TAGTTATAATTATTT-AAACT-AGTTCTG-TAAATAGAA-TTATT-TTCTAAATCTCTTA--TA-
126 TAGTCATAACCATTTGAAA-TGA-TTC-GATAAATA-AATTTATTGTT-TAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * ****
30441 -AAATTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATA
186 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATCAAAAAAAATA
* * * * ** * ** * * *
30505 ATTGTCTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAA
251 ATTGTTTTATGACAAAAGAATAGGTCATAATGATTT-AAATAGATAATCATTCAAATAGCCATAA
* * * * * * * *
30570 CTGTTTGAACT-AGTTTGACCAACAAATATATTTTTT-AATTCTCATAG-TTATTACTTTTTGG-
315 TTATTTGAACTGA-TTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATT-TC-TTGCTTATTA-ATTTAGGA
* *** *
30631 AATATTACTAAATT---ATTATTTTATTCC-----AAATA-TGATTTATGAGCAAAAATTTTTTT
376 AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCATATAAAATAGTGAAAAATGA--AAAAA-TTATTT
* * * * * * ** * * * *
30687 TATGATAGAA-CAAAGGTTATAACAATTTGATATAGATAATTGTTCCAATAGTCATAACTATTTA
438 GATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTACTCAAATAATAAGAACTA-TT-
* * * ** ***
30751 AACTGGTTCAACAAATTGATTTGTTTTTTAAATT
501 ---TGG-TAAACATATTTATTT-TTTAGTCTCTT
* * * *
30785 TCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAGAAAAAGCTTGTATG-TT
1 TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-CTA-AATAAGCTTCTATGATT
* * * * * * * * * *
30848 -GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-AATAACGATTTAAAATAGATAGTTATTTAAA
64 AG-AAACAATTGTTTCATGACAAAAC-AAAGATCAA-AACAATATGAGATTGATAATTATTCAAC
* * * ** * * * *
30911 TGGCCATGATTATTTGAACTGATTCGATAAACT-AATTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATT-AT
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* ** ** * * * *
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190 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCT-TGTATCAAAAAAAATAATT
* * * ** * * *
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254 GTTTTATGACAAAAGAATA-GGTCATAATGA-TTTAAATAGATAATCATTCAAATAGCCATAATT
** * * * * *
31102 ATTTGAACTTCTTCGATAAACATATTTATTTTTTCAAATCTCATGCCTATTAATTT
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31158 TTTGAATGTC
Statistics
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GCATTATTTTATTCCATATAAAATAGTGAAAAATGAAAAAATTATTTGATGACAAAATAAAAGGT
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TAGTCTCTT
Found at i:30342 original size:181 final size:178
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28886 GAATTGAAAC
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* * * * ** * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 -AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * **
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* * * *
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* * * ** * ** * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
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* * * ** *
29735 TTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAT
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* * * * * * * *
29785 AATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAGTATATAATTATTCTAATAGTCTTA
1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * *
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* * *
29915 ATT-ATGAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTA-CAA-AAAAAA
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* * * * * *
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* * * * * * * ** **
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* * * * ** * ** * **
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* * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** *
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* * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
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* * * * * *
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* * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAA-GGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * *
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* * ** ** *
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31400 TAAA
176 -AAA
* *** * ** * ** * * * **
31404 GTAGTATGATTTTAT-TTTAGAT--AA-GTTTTTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC
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* ** * * **
31465 AAA-AGGTCATAA-TGACTTT-AAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCAAATCTATTGCAA-CTTG
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* ** * ** * * * **
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* * *****
31585 ATTAGTATTATTTTATTTTG
162 CTT-GTATTA--ATAAAAAA
* * ** * ** ** * * * **
31605 AATAAGCTTGTATGA-ATTGAAAT-AATTGT-TTAACAACTAAACAAAAAGTTAAAATGATTTGA
1 AAT-TG-TTTTATGACA---AAATAAAAGGTCATAATGA-TTTA-AAATAG--ATAATTATTCAA
* ** * * * ** * * * **** *
31667 A-A-TAGATAA-T-TGTTCTAATAGTCTT--AACTACTCGAAATTGTTCAA-CAAACACAT-TTA
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* *
31724 TTTTTTAAATTGCTTACTTACAAATTTTTGGAATATTATTTACTAGTATTATT-TTAATCCGAAT
118 ATTTTTAAA-----TA-TT---AA----T--AA-ATTA-GTA-T--TATT-TTATT--T-CGAAT
* * *
31788 AAGCTTGTATGAA-AGGAAAC
159 AAGCTTGTATTAATA-AAAAA
* * * * *
31808 AATTGTTTTATGACAAAAT-AAAGATCATAAAGATTTGAAATAGATAAGTGTTCAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
31872 AATATTTGAACTGTTTTGGTAAATAGATTT-TCTTTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTATCAAA-
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* * * * ** * * * *
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* * * * ** * * *
31983 AATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATTACAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACAT
1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCAT
* * * * * * ** **
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* * * ** * * *
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* * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * ** * * * *
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* * * * ** * *
32290 TTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAAAAGGTTTTA-CGATCAGAAAC
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* *
32341 AATTAG-TTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGTCAT
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* * * * * *
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* * * * * **
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** * * * *
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** * ** * * * **
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* * * *
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* * * * * * *
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** * * ** * *
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* * * * *
34276 ATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGAACT-GAAAC
128 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAA-TAAAAAA
* * * * *
34327 GATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATGGATAATT
1 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATT
34377 GTTTTAAACT
Statistics
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215 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
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AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAAATGGTTTGAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATT
AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAATAAAAAA
Found at i:31672 original size:182 final size:182
Alignment explanation
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31351 ACAGCTTTAG
* *
31361 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTACTTTTTGAAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTTTAGAT
1 TTTTTAAATATCTTGCTCATTACTTTTTG-AAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTTTAGAT
* * * * ** * *
31426 AAGTTTTTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGA
65 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTAACAATAAAACAAAAAGTCAAAATGACTTTAAATAGA
31491 TAATTATTCAAATAGTCAAATCTATTGCAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATT
130 TAATTATTCAAATAGTCAAATCTATTGCAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATT
* * *
31544 TTTTTAAATATCTTGCTCATTACTGTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAA
1 TTTTTAAATATCTTGCTCATTACT-TTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTTTAG-A
* * *
31607 TAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTAACAACT-AAACAAAAAGTTAAAATGA-TTTGAAAT
64 TAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTAACAA-TAAAACAAAAAGTCAAAATGACTTT-AAAT
* *
31670 AGATAATTGTTCTAATAGTC
127 AGATAATTATTCAAATAGTC
31690 TTAACTACTC
Statistics
Matches: 124, Mismatches: 18, Indels: 9
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.12, T:0.43
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TTTTTAAATATCTTGCTCATTACTTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTTTAGATA
AGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTAACAATAAAACAAAAAGTCAAAATGACTTTAAATAGAT
AATTATTCAAATAGTCAAATCTATTGCAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATT
Found at i:31725 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 31356--31733 Score: 408
Period size: 182 Copynumber: 2.1 Consensus size: 181
31346 AGAAAACAGC
* * *
31356 TTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTACTTTTTGAAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATATCTTGCTCATTACTTTTTG-AAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTT
* * * * ** * *
31421 TAGATAAGTTTTTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTAA
65 TAGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTAACAATAAAACAAAAAGTCAAAATGACTTTAA
* * ***
31486 ATAGATAATTATTCAAATAGTCAAATCTATTGCAACTTGTTTGGCAAACAAA
130 ATAGATAATTATTCAAATAGTCAAATCTATCGCAAATTGTTCAACAAACAAA
* * *
31538 TTTATTTTTTTAAATATCTTGCTCATTACTGTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 TTTA-TTTTTTAAATATCTTGCTCATTACT-TTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATT
* * *
31602 TT-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTAACAACT-AAACAAAAAGTTAAAATGA-TT
64 TTAG-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTAACAA-TAAAACAAAAAGTCAAAATGACTT
* * * *
31664 TGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAA-CTACTCG-AAATTGTTCAACAAACACA
127 T-AAATAGATAATTATTCAAATAGTC-AAATCTA-TCGCAAATTGTTCAACAAACAAA
31720 TTTATTTTTTAAAT
1 TTTATTTTTTAAAT
31734 TGCTTACTTA
Statistics
Matches: 163, Mismatches: 26, Indels: 15
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
181 14 0.09
182 117 0.72
183 27 0.17
184 5 0.03
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
TTTATTTTTTAAATATCTTGCTCATTACTTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTTT
AGATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTAACAATAAAACAAAAAGTCAAAATGACTTTAAA
TAGATAATTATTCAAATAGTCAAATCTATCGCAAATTGTTCAACAAACAAA
Found at i:33885 original size:356 final size:352
Alignment explanation
Indices: 31376--34833 Score: 1182
Period size: 363 Copynumber: 9.7 Consensus size: 352
31366 AAATCTCTTG
* * * * * *** * *
31376 CTTATTACTTTTTGAAAATATTAATAAAGTAGTATGATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAGCT
1 CTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTT-GAAAAACCTATATGA-AT
* * * *
31441 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
63 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
31506 TCA-AATCTA-TTGCAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATATCTTGCTCATTACTG
128 TCATAAT-TATTTG-AAC-AGTTAGGTAAACAGATTTA--TTTTTAAAT-TCTTACTTATTAAT-
* *** * ** * * *
31569 TTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTG
186 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATACAAAAAACTA
* * * * * * * ** * * * *
31633 TTTAACAACTA-AACAAAAAGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTA
251 TTTTATAA-TAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATA
** * * * * *
31697 CTCGAAA-TTGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATTGCTTA
315 -TTTAAACTAGTT-TATAAATAAATTTA-TTTTTAAA-T-C-TA
** * ** * * ** * * *
31740 CTTACAAATTTTTGGAATATT-ATTTACTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAA-AG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAACCTATATGAATA-
* * * * * * *
31803 GAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAAAGATTTGAAATAGATAAGTGTTCAAATAG
64 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * **
31867 TCATAAATATTTGAACTGTTTTGGTAAATAGATTTTCTTTTTAAA-TC-T-CTTTTTAATTATCA
128 TCATAATTATTTGAACAG-TTAGGTAAACAGA-TTTATTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTTTG
*** * * *** ** * * * *
31929 AAATCCAAATAGATAAGTATT-TTTTATTTTGAATAATTTTGCAT-AA-GCAGAAACAATTATTT
191 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATACA-AAA-AACTATTT
* * * * * * * * * ** * *
31991 TATGACAAAACAAAATGTCATTACAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATAACTATTT
254 TATAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTA-CTCAAACAGTCATAAATATTT
* * * ** * *
32055 GAAGTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCAAA
318 AAACTAGTT-TATAAATAAATTTA-TTTTT-AA-ATC-TA
** * * * ** ** *
32095 CTTATTAATCCTT-ACAATACTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAAATTGTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAACCTATATGAATA
* * * *
32159 GAAACAATTGTTTTATGA-AAAA-AAAA--TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAG
64 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAG
** * * * * * * *
32220 TCATAACCATTTGAACTTGCTCGGTAAACAAATATATTTTTCAAATCTTTTATTTATTAATTTTT
128 TCATAATTATTTGAAC-AGTTAGGTAAACAGATTTATTTTT-AAAT-TCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * * *
32285 GAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGGTTTTACG-AT-CAGAAACAATTAG
190 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTAGTATGAATACA-AAA-AACTAT
* * * * * * * * *
32347 TTTATGACA-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGTCATAATTAT
252 TTTATAATAGAACAAAAA-GTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATAT
* * * *
32410 TTGAAC-ATGTTCAGAAA-ACAGATTTATTTTTTAAAATTTCA
316 TTAAACTA-GTTTATAAATA-A-ATTTA-TTTTT-AAATCT-A
* * * * * * * *
32451 CTTAGTAATTTTTGGATTATTAATAAATTTA-AATTATTTTA-TTTGAAATAA-GTTTGCATTAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGA-TTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AACCTAT--ATGAA
* * * * *
32513 TAGAATCAATTTTTTTATGACAAAAAAAAGAGGTTATAATG-TTTTGAAATAGATAACTT-TTCA
62 TA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTT-AAATATATAA-TTATTCA
* * * ** * * *
32576 GATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTCTGTAAACAAATTCT-TTTTTCAATTCTTTTACTCATT
123 AATAGTCATAATTATTTGAAC--AGTTAGGTAAACAGATT-TATTTTTAAATTC--TTACTTATT
* * * ** *
32639 AATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATCTTACTT-CAAATTTGCTTA-TATGAACT-GAAA
183 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGC-TAGTATGAA-TACAAA
* * * * * * * * * * * * * *
32701 CAAGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATACTTATTCAAATAGTCAT
245 AAACTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCAT
* ** * * * *
32766 GACCATTTGAAA-TTGTTTGGTAGATATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
310 AAATATTT-AAACTAGTTT-ATAAATAAATTTA-TTTTTAAATC---TA
* * ** * * * ** * * *
32814 CTGATTAATTGTCAAAATATTTATAAATTAATATTATTTT-TATCCGAATAAACTTGTATGAACA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTAT-TTTGAA-AAACCTATATGAATA
* * ** ** * * * **
32878 TAAATAATTATTTTAT-AGCAAAACAAAAAATCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATA
64 -AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATA
* * *
32942 GTCATAATGATTTGAACTTGTTTA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATT
127 GTCATAATTATTTGAAC-AG-TTAGGTAAACAGATTTA-TTTTT-AAAT-TCTTACTTATTAATT
* * * * * * * *
33006 GTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTACTCAAAATAAGCTTGGATGAACAAAAGAAAAA
187 -T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATACAA-AAAAC
* * * * * * * * * * * * * *
33069 TTTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT-GCTATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCATAATT
249 TATTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAAT
* * *
33133 ATTTAAA-TATGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTA
314 ATTTAAACTA-GTTTA-TAAATAAATTTA-TTTTTAAATC-TA
* * * * *
33175 TTATTATTAATTTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAACCTTATTTGAAC
1 --CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAACC-TATATGAA-
* * * *
33240 TGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
62 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATA
* * ** * * * * **
33305 GTCATGATTATTTGATCTAGTTCCGTAAACATATTTATTTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCA
127 GTCATAATTATTTGAAC-AGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
33370 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTA
191 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATACAAAAAACTATTTTA
* * * * *
33435 TAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTTTTTAAA
256 TAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATATTTAAA
*
33500 CTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-A
321 CTAGTTT-ATAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTA
* * * *
33533 CTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTCTGAACAAACCTAAATGAATAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAACCTATATGAATAA
* * * *
33598 AAGCATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAATATATAATTCTTCAAATAGT
65 AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAGT
* *
33663 TATAATTATTTGAACAGGTTAGGTAAACAGAATTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
129 CATAATTATTTGAACA-GTTAGGTAAACAGATTTATTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGA
* *
33728 AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAACAAACCTATTT
192 AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATACAAA-AAA-CTATTT
* * * * * * **
33792 TATGAT-GAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATACAGTTTTAAATATTT
254 TATAATAG-AACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATATTT
* *
33856 GAACTGGTTCT-TCAAA-AAATTTA-TTTTAAATCTTA
318 AAACTAGTT-TAT-AAATAAATTTATTTTTAAATC-TA
* * * * *
33891 GTTATTAACTTTTATAAACAAAAATATTAAAATAGATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAAACTTG
1 CTTATTAA-TTTT-T-----GAAATATT--AATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAACCTA
* * * * * *
33956 TATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAACCAAAAGGTTATAATGA-TTTAAAGTTTATAATTG
56 TATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAA-TATATAATTA
* * * * *
34020 TTGAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTTAT
119 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-CAGTTAGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTCTTACTTAT
* * * * * *
34082 TACTTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGCTTGAATG--TTC-AAA
182 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-CAAATAAGCTAGTATGAATACAAAA
* * * * * * * * * ** * * * **
34143 TACAATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAACTAAATAATTGTTGACATAACC
246 AACTATT-TTATA--ATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTC
* * * * * * *
34208 ACAATTATTTGAACTA-ATTAGGTAAACATATTCACTTTTTAAATCACTTA
308 ATAAATATTTAAACTAGTTTA--TAAATAAATTTA-TTTTTAAAT--C-TA
* * * * * ** * * *
34258 CTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAACCTATATGAA-TA
* * * ** *
34323 AAACGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATGGATAATT-GT----T--T
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
34381 --TAA--A-CT--AC--TTCGGCAAACATATTTATTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAA
129 CATAATTATTTGAACAGTTAGGTAAACAGATTTATTT-TTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGA
** * * *
34437 AATATTGTTAAATTATTATTATTTTATTCCAAATAAGCT--TAT-ACAAACTAAAACAATTATTT
192 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGA-ATAC-AAAA-AACTATTT
* * * * * ** * *
34499 TATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAG----GAAT-TGGT
254 TATAATAGAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATAT-TT
34559 --AC--G---ATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTA
318 AAACTAGTTTATAAATAAATTTA-TTTTTAAA--T-CTA
* * * * * * ** * *
34591 GTTATAAATGTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAGGCATTTATG-ATAA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAACCTATATGAAT-A
* ** ** * * *
34655 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GA
64 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAG-
* * * * * * * *
34719 CCATAATTATTTGAACCAATTTGATAAACTGACTTATTTTGTAAATCTCTAACTTATCAATTTTT
128 TCATAATTATTTGAA-CAGTTAGGTAAACAGATTTATTTT-TAAAT-TCTTACTTATTAATTTTT
* * **
34784 GAAATATTAAT-AATGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAAT
190 GAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAAT
34834 TGGAACAATT
Statistics
Matches: 2392, Mismatches: 526, Indels: 365
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
331 1 0.00
332 49 0.02
333 69 0.03
334 1 0.00
335 2 0.00
337 1 0.00
339 2 0.00
340 4 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (352 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAACCTATATGAATAAA
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAGTCA
TAATTATTTGAACAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATACAAAAAACTATTTTATAATA
GAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATATTTAAACTAGT
TTATAAATAAATTTATTTTTAAATCTA
Found at i:34063 original size:544 final size:536
Alignment explanation
Indices: 31444--34939 Score: 1946
Period size: 544 Copynumber: 6.5 Consensus size: 536
31434 ATGAGCTGAA
* * * * *
31444 ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTC
1 ACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAAT-AATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * * * *
31508 A-AATCTA-TTGCAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATATCTTGCTCATTACTGTT
65 ATAAT-TATTTG-AAC-AGTTAGGTAAACAGATTCA-CTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TT
* * * * * * *
31571 TTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTT
125 TTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACTGAAACAATTATT
* ** * * * * * * * * * * *
31635 TAACAACTAAACAAAAAGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTACTC
190 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAATATTT
* * *** * * ** * *** *
31700 GAAATTGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATTGCTTACTTACAAATTTTTGGAATATT-ATT
255 GAACTAGTTCCGTAAACAAATTTA-TTTTAAAATT-CTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATA
* * * * * *
31764 TACTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAA-AGGAAACAATTGTTTTATGACA-AA-A
318 AATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACA-GAAAAAATTGTTTTATAACAGAACA
* * * * * * *
31826 TAAAGATCATAAAGATTTGAAATAGATAAGTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT-GTTTTG
382 AAAAG-TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-TTTG
* * * * * * * * *
31890 GTAAATAGATTT-TCTTTTTAAATCTCTTTTTAA-TTATCAAA-ATCCAAATAGATAAGTATT-T
445 ATAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAAGAT--TAATAAATTAGTATTAC
* * *** ** * *
31951 TTTATTTTGAATAATTTTGCATAAGCAGAA-
507 TTTATTCTGAAAAAGCCTAAATGATCA-AAT
* * * * * * * *
31981 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATTACAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGAC
1 ACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAAATAATTA-TTCAAATAGTC
* ** * * * * * ** **
32045 ATAACTATTTGAAGTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCAAACTTATTAATCCTT-A
65 ATAATTATTTGAA-CAGTTAGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * ** * *
32109 CAATACTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAAATTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTT
129 -AATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACT-GAAACAATTATTTT
* * * **
32173 ATGA-AAAA-AAAA--TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAACCATTTGA
192 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAATATTTGA
* * * * * * * * ** *
32234 ACTTGCTCGGTAAACAAATATATTTTTCAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAA
257 ACTAGTTCCGTAAACAAATTTA-TTTTAAAAT-TCTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAA
* * ** * * * * * *
32299 TTAGTATTATTTTATTTCGAAA-AAGGTTTTACGATCAGAAACAATTAG-TTTATGACA-AAAAA
320 TTAGTATTATTTTA-ATCCAAATAAACTTGTATGAACAGAAAAAATT-GTTTTATAACAGAACAA
* * * * * *
32361 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-ATGTTCAG
383 AAA-GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTA-GTT-TG
* * * ** *
32424 A-AAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCACTTAGTAATTTTTGGATTATTAATAAATTTA-AATTA
445 ATAAATAGATTTATTTTTT-AAA--TCACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAA-TTAGTATTA
* ** * * *
32487 TTTTATT-TGAAATAAGTTTGCATTAAT-AGAAT
506 CTTTATTCTGAAA-AAGCCT-AAATGATCA-AAT
* * * ** * *
32519 -CAATTTTTTTATGACAAAAAAAAGAGGTTATAATGTTTTGAAATAGATAACTT-TTCAGATAGT
1 ACAATTCTTTTATGACAAAACAAA-AGGTAATAATAATTTGAAATAAATAA-TTATTCAAATAGT
* * ** * * * * *
32582 CATAACTATTTAAACTTA-TTCTGTAAACAAATTC-TTTTTTCAATTCTTTTACTCATTAATTTT
64 CATAATTATTTGAAC--AGTTAGGTAAACAGATTCACTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * ** * *
32645 TGGAATGTTAATAAATTAGTATTATCTTACTTCAAATTTGCTTA-TATGAACTGAAACAAGTGTT
126 TGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGC-TAGTATGAACTGAAACAATTATT
* * * * * **
32709 TTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATACTTATTCAAATAGTCATGACCATTT
190 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAATATTT
* * ** * * * * * * * *
32774 GAAATTGTTTGGTAGATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTGTCAAAATATTTATA
255 GAACTAGTTCCGTAAACAAATTTA-TTTTAAAAT-TCTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATA
* * * * * * * *
32839 AATTAATATTATTTTTATCCGAATAAACTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATAGCAAAACAA
318 AATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATAACAGAACAA
* * * * *
32904 AAAATCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTT-AG
383 AAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACT-ATTTAAACTAGTTTGA-
* * *
32967 TAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTAT
446 TAAATAGATTTATTTTTT-AAATC----ACTTATTAATT-T-TTGAAAGATTAATAAATTAGTAT
* * * * ** * *
33030 TATTTTACTC-AAAATAAGCTTGGATGAACAAAAGA
504 TACTTTATTCTGAAA-AAGCCTAAATGATC-AAA-T
* * ** * *
33065 AAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATGCT-ATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCA
1 ACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * *
33128 TAATTATTTAAATATGTTCA-GTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTTATTA-TTATTAATTTTTG
66 TAATTATTTGAACA-GTT-AGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * *
33191 AATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAACCTTA-TTTGAACTGAAACAATTCTTTT
128 AAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGC-TAGTATGAACTGAAACAATTATTTT
* * *
33255 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTGA
192 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAATATTTGA
* * * *
33320 TCTAGTTCCGTAAACATATTTATTTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT
257 ACTAGTTCCGTAAACAAATTTATTTTAAAATTCTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATT
* * *
33385 AGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATAATAGAACAAAAAG
322 AGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACAGAAAAAATTGTTTTATAACAGAACAAAAAG
*
33450 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTTTTTAAACTAGTTTGATAAATA
387 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATA
* * *
33515 GATTTATTTTTTAAATCACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTCTGA
452 GATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCTGA
33580 ACAAA-CCTAAATGAAT-AAA-
517 A-AAAGCCTAAATG-ATCAAAT
* * * * * * * *
33599 AGCATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAAATATATAATTCTTCAAATAGTT
1 A-CAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
33664 ATAATTATTTGAACAGGTTAGGTAAACAGAATT-A-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
65 ATAATTATTTGAACA-GTTAGGTAAACAG-ATTCACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
33727 AAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAACAAACCTATT
128 AAATATTAATAAATT-AGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACTGAAAC-AA-TTATT
** * * **
33791 TTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATACAGTTTTAAATATTT
190 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAATATTT
* * *
33856 GAACTGGTT-CTTCAAA-AAATTTATTTT-AAA-TCTTAGTTATTAACTTTTATAAACAAAAATA
255 GAACTAGTTCCGT-AAACAAATTTATTTTAAAATTCTTACTTATTAA---TTAT---C-AAAATA
* * * *** *
33917 TTAAAATAGATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACA-AAAATAATTGTTTTATG
312 TT--AATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACAGAAAA-AATTGTTTTATA
* * * ** * * *
33981 ACA-AACCAAAAGGTTATAATGATTT-AAAGTTTATAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTGAA
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* * * *
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* * * *
34109 ATTATTTTATTCTGAAAAAGCTTGAATGTTCAAAT
502 ATTACTTTATTCTGAAAAAGCCTAAATGATCAAAT
* * * * * * **
34144 ACAATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAACTAAATAATTGTTGACATAACCA
1 ACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * *
34209 CAATTATTTGAACTAATTAGGTAAACATATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAAATTTTGGA
66 TAATTATTTGAAC-AGTTAGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * *
34274 ATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGAACTGAAACGATTGTTTTATG
130 ATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACTGAAACAATTATTTTATG
* * *
34339 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATGGAT-A--ATT------G-------T-TTTAAACT
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* * * * * * * * **
34387 ACTTCGGCAAACATATTTATTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTGTTAAATTA
260 AGTTCCGTAAACAAATTTATTT-TAAAAT-TCTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTA
* * * * ** * * * *
34452 TTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATACAAACTA-AAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGG
323 GTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAAC-AGAAAAAATTGTTTTATAACAGAACAAAAAG
* * * * * * *
34516 TTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAG---GAA-T-TGGT--AC------GATAAAT
387 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTAT-TTAAACTAGTTTGATAAAT
* * * * ** *
34568 AAATTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATAAATGTTTGAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
451 AGATTTATTTTTTAAA--T-C-ACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTACTTTAT
* * * ** *
34633 TCTGAATAGGCATTTATGAT-AAAA
512 TCTGAAAAAGCCTAAATGATCAAAT
* ** * * * * *
34657 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAATTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACC
1 ACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG-TC
* * * * * *
34721 ATAATTATTTGAACCAATTTGATAAACTGACTT-A-TTTTGTAAATCTCTAACTTATCAATTTTT
65 ATAATTATTTGAA-CAGTTAGGTAAACAGA-TTCACTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * * *
34784 GAAATATTAAT-AATGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATTGGAACAATTGTTT
127 GAAATATTAATAAAT-TAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACTGAAACAATTATTT
* * * * * * * **
34848 TGTGATAAAACAAAAGGTCATATTTATGTT-AAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTAGAT
191 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAATATTT
* *
34912 GAACTTGTT-CGATAAACATATTTATTTT
255 GAACTAGTTCCG-TAAACAAATTTATTTT
34940 TTTTAATTTC
Statistics
Matches: 2363, Mismatches: 453, Indels: 294
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
510 21 0.01
512 8 0.00
513 180 0.08
514 56 0.02
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518 2 0.00
519 2 0.00
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530 21 0.01
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TATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAATATTTGAACTA
GTTCCGTAAACAAATTTATTTTAAAATTCTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTA
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AACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATT
TATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCTGAAAAA
GCCTAAATGATCAAAT
Found at i:34377 original size:181 final size:181
Alignment explanation
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31339 ATTGTTTAGA
* * * * * *
31349 AAACAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTACTTTTTGAAAATATTAATAAAGTAGTATGAT
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* * * * *
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65 TTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * *
31478 GACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTA-TTGCAACTTGTTTGGC
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* * * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * * * **
31660 GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTACTCGAAATTGTTCA-AC
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* ** * ** *
31713 AAACACATTTATTTTTTAAAT-TGCTTACTTACAAATTTTTGGAATATT-ATTTACTAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * *
31776 TTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAAAGGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAAAG
65 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * *
31840 ATTTGAAATAGATAAGTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT-GTTTTGGT
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAG-TTAGGT
* * ** *** * *
31892 AAATAGATTT-TCTTTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTATCAAAATCCAAATAGATAAGTATT-T
1 AAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * * * *
31951 TTTATTTTGAATAATTTTGCAT-AAGCAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATTAC
65 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * *
32015 AATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATAACTATTTGAAGTTGTTCGGT
129 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGT
* * ** ** *
32068 AAATAGATTTATTTTTTAAATATCAAACTTATTAATCCTT-ACAATACTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * **
32132 TTTACTTCAAATAAAATTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAA-AAAA--TCATAAT
65 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * ** * * *
32192 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAAAGTCATAACCATTTGAACTTGCTCGGT
129 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGT
* * * * * *
32245 AAACAAATATATTTTTCAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
32310 TTATTTCGAAAAAGGTTTTACGATCAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAATG
66 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
*
32374 ATTTGAAATAGATAATT-TTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-ATGTTCA-GA
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTA-GTT-AGGT
* * * * *
32425 AAACAGATTTATTTTTTAAAAT-T-TCACTTAGTAATTTTTGGATTATTAATAAATTTA-AATTA
1 AAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * * * * *
32487 TTTTATTT-GAAATAAGTTTGCATTAA-TAGAATCAATTTTTTTATGACAAAAAAAAGAGGTTAT
64 TTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCAT
* * * * **
32550 AATGTTTTGAAATAGATAACTT-TTCAGATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTCTGT
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* * * * * * *
32606 AAACAAATTCT-TTTTTCAATTCTTTTACTCATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * * *
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* * * ** * * *
32735 ATTTGAAATAGATACTTATTCAAATAGTCATGACCATTTGAAATTGTTTGGT
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGT
* * * * * * ** * *
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* * * * **
32852 TT-TATCCGAATAAACTTGTATGAACAT-AAATAATTATTTTAT-AGCAAAACAAAAAATCATAA
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** * * * * *
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* *
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* * * * *
33031 ATTTTA-CTCAAAATAAGCTTGGATGAACAAAAGAAA-AATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTT
63 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAC---TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * *
33093 ATGCT-ATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCATAATTATTT-AAATATGTTCA-GT
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* * * *
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* * * * *
33214 TTTATTTTGAATAACCTTATTTGAACTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
65 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * **
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * *
33458 ATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTT-TTTAAACTAGTTTGAT
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* * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * ** * * *
33571 TTA-TTCTGAACAAACCTAAATGAA-TAAAAGCATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT
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* * * * *
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* *
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* * * * * * * **
33750 TTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAACAAACCTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAA
65 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC-AA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
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* * * *
33868 CAAA-AAATTTA--TTTTAAA--TCTTAGTTATTAACTTTTATAAACAAAAATATTAAAATAGAT
1 -AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-T-----GAAATATT--AATAAAT
* * * ** * *
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* ** * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * * * * *
34115 TTA-TTCTGAAAAAGCTTGAATGTTC-AAATACAATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAAC
66 TTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACTGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * ** * *
34178 AATTTGAACTAAATAATTGTTGACATAACCACAATTATTTGAACTAATTAGGT
129 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGT
* * * * * * *
34231 AAACATATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTTTTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * *
34296 TTATTTCGAATAGGCTTGTATGAACTGAAACGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
66 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
*
34361 TTTGAAATGGATAATTGTT
131 TTTGAAATAGATAATTGTT
34380 TTAAACTACT
Statistics
Matches: 2233, Mismatches: 495, Indels: 243
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
175 47 0.02
176 104 0.05
177 369 0.17
178 35 0.02
179 293 0.13
180 258 0.12
181 542 0.24
182 383 0.17
183 48 0.02
184 16 0.01
185 75 0.03
186 16 0.01
187 36 0.02
188 9 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGT
Found at i:34628 original size:169 final size:159
Alignment explanation
Indices: 34231--34715 Score: 447
Period size: 164 Copynumber: 2.9 Consensus size: 159
34221 CTAATTAGGT
* * * * *
34231 AAACATATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTTTTATT
1 AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA-TAAATTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
34296 TTATTTCGAATAGGCTTGTATGAACTGAAACGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
64 TTATTCCGAATAGGCTT-TA-AAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA
* * * *
34361 TTTGAAATGGATAATTGTTTTAAACTACTTCGGC
127 TTTGAAATAGATAATTG-TTCAAACGAATTCGGC
* * * ** *
34395 AAACATATTTATTTCTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTGTTAAATTATTATTATT
1 AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA-TAAATTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
34460 TTATTCCAAATAAGCTTATACAAACTAAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAATGA
64 TTATTCCGAATAGGCTT-TA-AAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGA
34525 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGGAATT-GGTAC
127 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAC--GAATTCGG--C
*
34561 GATAA-ATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATAAATGTTTGAATTATTAATAAATTAGTAT
1 -A-AACAT--ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAAT-TTTGAA-TATTAATAAATTAGTAT
* ** *
34625 TATTTTATTCTGAATAGGCATTTATGA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-TTTCAT
60 TATTTTATTCCGAATAGGC-TTTAAAACT-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-AT
*
34688 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
122 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
34716 TGACCATAAT
Statistics
Matches: 260, Mismatches: 48, Indels: 22
0.79 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
163 6 0.02
164 122 0.47
165 3 0.01
166 1 0.00
167 6 0.02
168 62 0.24
169 58 0.22
170 2 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (159 bp):
AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
ATTCCGAATAGGCTTTAAAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTG
AAATAGATAATTGTTCAAACGAATTCGGC
Found at i:35393 original size:182 final size:178
Alignment explanation
Indices: 35070--36323 Score: 669
Period size: 180 Copynumber: 7.0 Consensus size: 178
35060 TAGTCTTAAT
* * * *
35070 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAA-TTGT
1 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT
* * * *
35134 TGC-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTATTAATCCAA-A-AATTA
66 TTCTA--TCATCTAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAAT-AT-TAAGACAATTA
* * * *
35196 AT-AGTAAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAATTTAAATAATTAG
125 ATAAGTAAA-AGATTTAAAAAAT-AATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAG
* * * *
35251 GACAATTT-AATAATTATCTATTTGAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATGTTT
1 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTT
35315 TTTCTACTCATCTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAAT
65 TTTCTA-TCATCTAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTAAGACAATTAAT
* * ** **
35380 AAGTAAAAGATTTAAAAAATATATCTGTTTGCCAAACAAGTTCAAACCGTTATG
127 AAGTAAAAGATTTAAAAAATA-ATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA-G
* * * * * * *
35434 G-TTATTT-CATCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
1 GACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T
* * * * **
35497 TTTTGT-TCATAC-AAGTTTATTCAGATTAAAATAATATCAATTTATAAATATTTTGACAATTAA
64 TTTTCTATCAT-CTAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-CAATTTATTAATATTAAGACAATTAA
* * * *
35560 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-TCGAACAAGGTCAAATAGTCAT
126 TAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTAG
* * * *
35614 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTTCTTTTGTAATAAAACACTTG
1 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-
*** * * * * * ** *
35678 TTTAAGT-TCATATAAGGTTTTTTGAAGTATGATAATACTAATTTATTAATGTTTCAA-A-AATT
63 TTTTTCTATCATCTAA-GCTTATTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAAT-ATT-AAGACAATT
* * * ** * * * *
35740 AATGAGTAAGAAAATTTAAAAAAAAGAATACATTTACCGAATAAGTGCAAATAGTTAT
124 AATAAGTAA-AAGATTT--AAAAAATAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAG
* * * * ** *
35798 GACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAA-ACATTATGATCTTTTGTTTCATCATAAAACAA-TTG
1 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTT
*
35861 GTTCTATTCATGC-AAGCTTATT-ATGAATAAAATAATTTA-AATTTATTAATATTGCAA-A-AA
65 TTTCTA-TCAT-CTAAGCTTATTCA--AATAAAATAA--TACAATTTATTAATATT--AAGACAA
* * * *
35921 TTAATAAATAAAA-TTTTAAAAAATAAATATGTTTTA-TGAACACA-TTCGAATAGTTAT
122 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATATG-TTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTAG
* * ** * *
35978 GACTATTTG------------TTTCAAATCA-TTATGACCATTTGTTTAATAATAAATCAATTGT
1 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T
* ** * * *
36030 TTTTGT-TCATAAAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAA-A-AATTA
64 TTTTCTATCATCTAAGC-TTATTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT--AAGACAATTA
* * * * *
36092 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAGCAAGTTCAAATATTTAT
125 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTAG
* * * * *
36147 GACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAACCA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAA-TTG
1 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTT
* ** * * *
36209 TTTCTAT-ATATACAATTTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAGTATTCCAA-A-AATT
65 TTTCTATCATCT--AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT--AAGACAATT
*** * *
36271 AATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
124 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
36324 CATGTCCATT
Statistics
Matches: 848, Mismatches: 153, Indels: 145
0.74 0.13 0.13
Matches are distributed among these distances:
166 2 0.00
168 87 0.10
169 42 0.05
170 6 0.01
178 8 0.01
179 10 0.01
180 167 0.20
181 162 0.19
182 167 0.20
183 130 0.15
184 59 0.07
185 8 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT
TTCTATCATCTAAGCTTATTCAAATAAAATAATACAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGT
AAAAGATTTAAAAAATAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAG
Found at i:35639 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 35068--35986 Score: 743
Period size: 182 Copynumber: 5.1 Consensus size: 180
35058 GATAGTCTTA
* * *
35068 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTG
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
35133 TTGCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTATTAATCCAAAAATTAAT
66 TTTCTGTTCATACAAGTTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
* * * * * *
35198 -AGTAAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA-CTGAACAAATTTAAATAATT
130 AAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
35249 AGGACAATTT-AATAATTATCTATTTGAAAT-AGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATG
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--
* ** * *
35312 TTTTTTCTACTCAT-CTAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT--AAGACA
63 TTGTTTCTGTTCATAC-AAGTTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA-A-A
* * * ** * **
35374 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATATATCTGTTTGCCAAACAAGTTCAAACCGTT
124 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
** * * * **
35431 ATGGTTATTT-CATCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 ATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *** *
35494 TATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATA-TCAATTTATAAATATTTTGACAATT
64 TGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT
* *
35558 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGGTCAAATAGTC
127 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
35612 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTCTTTTGTAATAAAACACTT
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * * * * ** * *
35677 GTTTAAGTTCATATAAGGTTTTTTGAAGTATGATAATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAA
65 GTTTCTGTTCATACAA-GTTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * * * * *
35742 TGAGTAAGAAAATTTAAAAAAAAGAATACATTTACCGAATAAGTGCAAATAGTT
129 TAAGTAA-AAGATTTAAAAAATA-AATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * **
35796 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAAACATTATGATCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTG
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
35861 GTTCTATTCATGCAAGCTTATT-ATGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTGCAAAAATTA
66 TTTCTGTTCATACAAGTTTATTCA--AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * *
35924 ATAAATAAAA-TTTTAAAAAATAAATATGTTTTAT-GAACACA-TTCGAATAGTT
128 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-ATTTATCGAACA-AGTTCAAATAGTT
35976 ATGACTATTTG
1 ATGACTATTTG
35987 TTTCAAATCA
Statistics
Matches: 586, Mismatches: 124, Indels: 57
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
180 79 0.13
181 142 0.24
182 169 0.29
183 134 0.23
184 62 0.11
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
TTTCTGTTCATACAAGTTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT
Found at i:36362 original size:147 final size:141
Alignment explanation
Indices: 36186--36463 Score: 337
Period size: 147 Copynumber: 1.9 Consensus size: 141
36176 CATTATGATC
* ** * *
36186 TTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCTATAT-AT-ACAATTTTATTTGAAATAAAATAAAACTA
1 TTTTGTTTAGTCATAAACAATTGTTTCTAT-TCATGA-AAAATTATTTAAAATAAAATAAAACAA
* * *
36249 ATTTATTAGTATTCCAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTG-AACAA
64 ATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAA-AAATTCATTTACTGAAAC-A
36313 GTTCAAATAGTCATGTCCA
123 GTTCAAATAGTCATGTCCA
*
36332 TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGAAAAATTATTTAAAATAAAATAATACAAA
1 TTTTGTTTAGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATGAAAAATTATTTAAAATAAAATAAAACAAA
*** *
36397 TCTATTAATATTTTGATAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAATTCATTTACTGAAACAGTTCAAA
65 TCTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAATTCATTTACTGAAACAGTTCAAA
36462 TA
130 TA
36464 TTTATGACTA
Statistics
Matches: 115, Mismatches: 13, Indels: 12
0.82 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
142 23 0.20
143 16 0.14
146 14 0.12
147 61 0.53
148 1 0.01
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (141 bp):
TTTTGTTTAGTCATAAACAATTGTTTCTATTCATGAAAAATTATTTAAAATAAAATAAAACAAAT
CTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAATTCATTTACTGAAACAGTTCAAAT
AGTCATGTCCA
Found at i:36749 original size:157 final size:157
Alignment explanation
Indices: 36454--36738 Score: 344
Period size: 157 Copynumber: 1.8 Consensus size: 157
36444 TTACTGAAAC
* * * * * * *
36454 AGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTTGTC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCAATCTCAAAATATTATGACCTTTATTTTGTC
** ** * *
36519 ATAAAACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTTGGATAAAAAATAATACTAATTTAATAGTAT
66 ATAAAACAATTATGCTCCATCATACAAGCTTATTTGCATAAAAAATAATACTAATTTAATAATAT
36584 TAAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACA
131 TAAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACA
* *
36611 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCAATCTCAAAATATTATGACC-TTTATTTTGT
* * *
36676 CATAAAACAATT-TGCTCCATTTATGCAAGCTTATTT-CA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTA
65 CATAAAACAATTATGCTCCA-TCATACAAGCTTATTTGCATAA-AAAATAATACT-AATTTAATA
36737 AT
127 AT
36739 GTTCCAAAAA
Statistics
Matches: 106, Mismatches: 18, Indels: 8
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
156 3 0.03
157 68 0.64
158 35 0.33
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (157 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCAATCTCAAAATATTATGACCTTTATTTTGTC
ATAAAACAATTATGCTCCATCATACAAGCTTATTTGCATAAAAAATAATACTAATTTAATAATAT
TAAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACA
Found at i:37932 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 36611--38069 Score: 1084
Period size: 177 Copynumber: 8.2 Consensus size: 180
36601 TTGCTGAACA
* * *
36611 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTA-TGACCTTTTATTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATTGA-CTTTTGTTTT
* * * *
36674 GTCATAAAACAATT-TGCTCCATTTATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATT
64 GTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * * * * * *
36736 AATGTTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAA-C
126 AATATTCTAAAAATTAATAAATTAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC
* * * *
36790 ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCCATTTTAAATCATTA-TGACCATTTGTTTT
1 A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTGA-CTTTTGTTTT
* * * * *
36854 TTCATAAACCAATTGTTTCTATTCA-AAAAACATTATTCAAAATAAAATAATACTCATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
36918 TATTCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTATTTATTGAGTG
128 TATTCTAAAAATTAATAAATTAGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC
* * * ** **
36971 AGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTA-TGA---TCATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTGACTTTTGTTTTGT
* *
37032 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
37097 TCTAAAAATTAATAAGTTCA-AGATTTAAAACATTAATCTATTT-TCCAAAC
131 TCTAAAAATTAATAAATT-AGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC
* * * * * *
37147 AAGTTC-AA-A--T-TGTCCATTTGAACTATTAT-TCATTTCAAATCGTT-GTGACAATTTGTTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATTGAC-TTTTGTTT
* * ** * * *
37205 TGTCGTAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAC
63 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * * * *
37270 TATT-TCAAAAATTAAT-AA-GAGA-TTTAAAATCTAAATCTTTTTTACCAAACC
128 TATTCT-AAAAATTAATAAATTAGAGTTTAAAAAATAAATC-TATTTATCGAATC
* * * *
37321 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGGTC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTGACTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * *
37385 CCTAAAACATTTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
37450 TTTAAACATTAAT--ATTA-AGGATTTAAAAAATAAATGTA-TTAGTC--ATAC
131 TCTAAAAATTAATAAATTAGA-G-TTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAAT-C
* * * * * * * * * *
37498 CGAATCAAATAGCTAAGACTACTAGAACAATTATCTATTTCTAATCGTT-CTGACTTTTGTTTAG
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTGACTTTTGTTTTG
* * * * *
37562 TCATAAAATAATTGCTTC-AGCTCATACATGC-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *** * *
37625 ATTCAAAAAATTAGTAAGTAAGAAAAT-AAAAA-AAATCTGTTTGTCG-ATC
129 ATTCTAAAAATTAATAAATTAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC
* * * * * * * *
37674 AAGTTGAAATAGTTTTGATTATTTGACCAATTATCTATTTAAAAT-ATTTATGGCCTTTTATTTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTGACTTTTGTTTT
* * ** * *
37738 ATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
37802 TATTATAAAAATTGATAAATTAGACGTTTAAAACATAAATCAATTTATCGAATC
128 TATTCTAAAAATTAATAAATTAGA-GTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATC
* * *
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* *
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** * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *** * * *
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** ** * *
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* *
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* * * * ** * * *
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* * ** * * * ** *
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* *
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** * * *** * * *
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** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * **
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* * * * * * * * *
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1 AAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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1 AAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * *
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* * * * ** ** * *
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*
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178 GATTT
*** * * * * * * *
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1 AAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGAC-TATTTGAACAAT---TAT-C
** * * ** * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 AAAAAATAAATATGTTTAT-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
*** * * * * * *
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* * * *
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* *** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* *
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* *
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* * * *
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64 TCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATTCATACAAGCTTATTC
*
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* ** ** * * * * *
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1 AAAAAATAAATATGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT
* * * * * * * * *
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64 TCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATTCATACAAGCTTATTC
** ** * *
39428 GGAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTT
128 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * *** * * * * *
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1 AAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT
* * ** * *
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* * * * *
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* ** * * *
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1 AAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * *
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39764 TTTTATATTA
Statistics
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ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
Found at i:39450 original size:539 final size:537
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * * ***
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * *
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1 TGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC-----CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
38696 TTGTTCATACAGGCTTATTCG--AT----TAA-A--AATTTACTAATATTTTGACAAA-TAATAA
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* * ** * * *
38751 GTAAAAGATTTTAAAAATAACTATGTTTATTGAA-CAAGTCCAAATAGTCATAACTATTTGAATA
124 GT-AAAG--TTTAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * *
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185 ATTA-TTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATGATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACA
* * * * *
38879 GGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAACTAATGAGTAAGAGATTTA
248 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * *
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313 AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* ** *
39009 AATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATCATTTCTATTCATACAAACTCATTCCAAAT
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*
39074 AAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATTTATT
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* *
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66 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-G
* * * * *
39299 TTTAAGAAATAAATCCGTTTACCAAGCAAGCTCTAATAGTTATGGCTGTTTGAATAATTATTGAT
130 TTTAA-AAATAAATCTGTTTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT-AT
* * * * * *
39364 TTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTATGATCAAAGACTTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTG
193 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATGATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
39429 GAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT
258 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
39493 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAATAATTATCTATTTTC-AATCATTAT
323 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTAT
* * ** * *
39557 GACCTTTGGCTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTGTTCATACATAA-TTATT-CAGAATAAAATAA
387 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AACTTATTCCA-AATAAAATAA
** * * * * *
39620 TATTGATTTATTAAAATTTTAAAAATTAATAAG-AG--ATTTAAAAACTAAA--TATTTACAGAA
450 TATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATTTATTTTCTGAA
*
39680 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
515 C-AATTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
39704 TGAACAATGATCTATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTTTTTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* ** * * * * *
39767 TATATTAGCTTATTTGGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
65 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
39810 AAAATAAATG
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TGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGT
TTAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTATTTC
AAATAGTTATGACCTTTTGTTTTATGATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAA
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCCAAATAAAATAATATAAA
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATTTATTTTCTGAACAATTC
AAATAGTTATGACTATT
Found at i:40161 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 39834--41133 Score: 933
Period size: 181 Copynumber: 7.2 Consensus size: 179
39824 CTGCCAAAGC
* * ** * *
39834 AGTTCAAAAAGTTAAGACTA-TTGAACAATTA-CATATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTGTAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTT-AAATCATTTTGACCTTTTGTTTTG
* * * *
39897 TCATAAAACAATTATTTTAGTTCAT-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
64 TCAAAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
*
39961 -TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTAAAATAATAAATATGTTTTCCAAACA
129 TTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTT-CAAACA
* * * *
40013 AGATCAAATAGATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAACTCATTTTGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA-TCATTTTGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
40078 CAAAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATTAAAAATAAAATAATTCTACTTTATTAACAT
65 CAAAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * * ** *
40143 TTCAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAATTAAAGCTGGTTTTTGAACC
130 TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTTCAAACA
* * * * * * * * * * * * **
40194 GGTTCAAATAGTTATAACCATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTACTATAATC-TTCATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGT
* ** * ** * * *
40258 TATAAAAA-AATTATTTTTGATCATACAAGCTTATCGAATA-AAAATAATACTAATTTAATAATA
65 CA-AAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
* * * * **
40321 TTACAAAAA-T--T-AGAAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAATT
129 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCAAACA
* * * * * * **
40369 AGTTCAAATGGTTAAGACTATTGGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAAGATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
40434 CATAAAATAATTGTTACAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-
65 CAAAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * *
40498 TTCAAAAATTAATACGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
130 TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTT-TCAAACA
* * * * *
40550 AGTTCAAAGAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
40615 CATAAAACT-ATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCAAAAATAAAAATAGTACTACTTTATTAAT
65 CA-AAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAC
* * *
40679 ATTTCATAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACC
128 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTT-TCAAACA
* * * * * ** *
40732 AGTTCAAATAATTATGCCCATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATT-ACCTTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATT-TTGACCTTTTGTTTTG
* * * **** * ** *
40796 TCATAAAACAATTGTTTCTCAACATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 TCAAAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
* * *
40861 TTTCAAGAATTACT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCA
129 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCAAA-CA
* * ** * * * * *
40910 A-TTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
40974 C-ATAAATCAATTATTT-ATGTTCATACAAGTTTATTCGAAAT-AAATAATACTAATTTAATAAT
65 CAAAAAAT-AATTATTTCA-GTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
* ** * * *
41036 ATTTTAAAAATCCATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTCCTGAACT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTTC-AAACA
* * * * *
41089 AGTTCAAATAGTTAAGACAATATAAACAATTATCGATTTCAAATC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATC
41134 GTATTATTTT
Statistics
Matches: 876, Mismatches: 208, Indels: 73
0.76 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 5 0.01
175 67 0.08
176 74 0.08
177 123 0.14
178 4 0.00
179 52 0.06
180 157 0.18
181 235 0.27
182 134 0.15
183 25 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (179 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTC
AAAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
TCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCAAACA
Found at i:40557 original size:356 final size:352
Alignment explanation
Indices: 39834--41133 Score: 1094
Period size: 356 Copynumber: 3.6 Consensus size: 352
39824 CTGCCAAAGC
* * *
39834 AGTTCAAAAAGTTA-AGACTA-TTGAACAATTA-CATATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTGTA
1 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTAT-AACTTTT-T-T-
* * *
39896 GTCATAAAACAATTATTTTAGTTCAT-CAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
60 GTTATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAATA-AAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * *
39959 CATT-CAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTAAAATAATAAA-TATGTTTTCCAAACAAGATCAAAT
124 TATTAC-AAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAA-AATAAATTA-GTTTT-CGAACTAGTTCAAAT
* * * * * *
40022 AGATATGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAACTCATTTTGACTTTTTGTTTTGTCAAAAAAT
182 AGTTAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * *
40086 AATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATTAAAAATAAAATAATTCTACTTTATTAACATTTCAAAAA
246 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAA
* * * *** *
40151 TTATTAAGCAAGAGATTTAAAAATTAAAGCTGGTTT-TTGAACC
311 TTA-TACGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACA
* * * * * * **
40194 GGTTCAAATAGTTATAACCATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTACTATAATCTTCATTTTGTT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA-CTT--TTTTGTT
* * *
40259 ATAAAAAAATTATTTTTGATCATACAAGCTTA-TCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
63 ATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* *
40323 ACAAAAATTAGA-AAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTGTCGAATTAGTTCAAATGGTTAAGA
128 ACAAAAATTA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTT-TCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
** * * * *
40386 CTATTGGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAAGATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTAC
190 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* *
40451 AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATACGC
255 AGTTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATT-ATACGC
*
40515 AAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
319 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * *
40550 AGTTCAAAGAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AAC--TT-TTTTGT
* * * * * * * * *
40615 CATAAAACTATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTA-TCAAAAATAAAAATAGTACTACTTTATTAAT
62 TATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTC--GAATAAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * *
40679 ATTTCATAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAAT
125 ATTACAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTT-TCGAACTAGTTCAAATAGT
* * * * * * ** * * * *
40744 TATGCCCATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
185 TAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
**** ** * *
40809 GTTTCTCAACATACAAGCTT-TTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T-
250 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTA
*
40871 TAC-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCA
314 TACGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CA
* *
40910 A-TTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA-CTTTT-TTGT-T
* * *
40974 CATAAATCAATTA-TTTATGTTCATACAAGTTTATTCGAA-ATAAATAATACTAATTTAATAATA
63 -ATAAAACAATTATTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATA
** * *
41037 TTTTAAAAATCCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCGTTTCCTGAACTAGTTCAAATAGTT
126 TTACAAAAAT---TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTTC-GAACTAGTTCAAATAGTT
* * *
41102 AAGACAATATAAACAATTATCGATTTCAAATC
186 AAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC
41134 GTATTATTTT
Statistics
Matches: 755, Mismatches: 143, Indels: 87
0.77 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
355 26 0.03
356 173 0.23
357 142 0.19
358 15 0.02
359 120 0.16
360 91 0.12
361 42 0.06
362 6 0.01
363 133 0.18
364 7 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (352 bp):
AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTTGTTATA
AAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTACA
AAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTT
AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCA
TACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTATACGCAAGAGAT
TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
Found at i:41061 original size:540 final size:535
Alignment explanation
Indices: 39809--41074 Score: 1412
Period size: 540 Copynumber: 2.4 Consensus size: 535
39799 ATTTAATAAT
* * * * * *
39809 AAAAATAAATGTATTCTGCCAAAGCAGTTCAAAAAGTTAAGACTA-TTGAACAATTA-CATATTT
1 AAAAATAAATCTGTT-TACCAAATCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC-TATTT
* * * * *
39872 CAAATTGTTTTGACCTTTTG-TGTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCAT-CAAGCTTATTCA
64 CAAATTGTTATAAGCTTTTGTTCTA-TCATAAATCAATTATTTAT-GTTCATACAAGCTTATTC-
*
39934 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTAAAATAATAAA
126 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAA-CAAGAGATTTAAAA-AATAAA
* * * * *
39998 TATGTTTTCCAAACAAGATCAAATAGATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAACTCATTTT
189 TATATTTACCAAACAAGATCAAAGAGATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* *
40063 GACTTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATTAAAAATAAAATAATT
254 GACTTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATCAAAAATAAAATAATA
* * * *
40128 CTACTTTATTAACATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAATTAAAGCTGGTTTTTGAAC
319 CTACTTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAGTTTTCGAAC
* * *
40193 CGGTTCAAATAGTTATAACCATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTACTATAATCTTCATTTTGT
384 CAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTACTATAACCTTCATTTTGT
* * * *
40258 TATAAAAAAATTATTTTTGATCATACAAGCTTATCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
449 CATAAAAAAATTATTTCTCAACATACAAGCTTATCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
*
40323 ACAAAAATTAGAAAGAGATTTA
514 ACAAAAATTACAAAGAGATTTA
* ** * * * * * *
40345 AAAAATAAATGTGTTTGTCGAATTAGTTCAAATGGTTAAGACTATTGGAATAATTATCTATTTCA
1 AAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * * *
40410 AATCATTCTAAGATTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATT-GTTACAGTTCATACAAGCTTATTCAGA
66 AATTGTTATAAGCTTTTGTTCTATCAT-AAATCAATTATTTA-TGTTCATACAAGCTTATTCA-A
* * * *
40473 ATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATACGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATC
128 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATA-ACAAGAGATTT-AAAAAATAAATA
* * * * *
40537 TATTTACCAAACAAGTTCAAAGAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGA
191 TATTTACCAAACAAGATCAAAGAGATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-
* * * * * *
40602 AC-TTTTGTTTTGTCATAAAACT-ATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCAAAAATAAAAATAGT
255 ACTTTTTGTTTTGTCA-AAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATCAAAAAT-AAAATAAT
* * *
40665 ACTACTTTATTAATATTTCATAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTATCGA
318 ACTACTTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAGTTT-TCGA
** * * ** * *
40729 ACCAGTTCAAATAATTATGCCCATTTGAATAATTAT-ATATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATT
382 ACCAGTTCAAATAATTATAACCATTTGAATAAATATCA-ATCTCAAATTACTATAACC-TTCATT
* * * * *
40793 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTCAACATACAAGCTTTTTTGAA-ATAAAATAATACTAATTTATT
445 TTGTCATAAAAAAATTATTTCTCAACATACAAGC-TTATCGAATA-AAAATAATACTAATTTAAT
* * *
40857 AATATTTCAAGAATTACTAAGAGATTTA
508 AATATTACAAAAATTACAAAGAGATTTA
*
40885 AAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAATTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTC
1 AAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
*
40949 AAATTGTTATAAGCTTTTGTTCTATCATAAATCAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTCGAAA
65 AAATTGTTATAAGCTTTTGTTCTATCATAAATCAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTC-AAA
* * * **
41014 T-AAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATCCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
129 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAC-AAGAGATTTAAAAAATAAAT
41075 TCGTTTCCTG
Statistics
Matches: 605, Mismatches: 100, Indels: 47
0.80 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
535 25 0.04
536 76 0.13
537 151 0.25
538 113 0.19
539 69 0.11
540 166 0.27
541 5 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (535 bp):
AAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
AATTGTTATAAGCTTTTGTTCTATCATAAATCAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAATA
AAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAACAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTT
ACCAAACAAGATCAAAGAGATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACTTTT
TGTTTTGTCAAAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATCAAAAATAAAATAATACTACTTT
ATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAGTTTTCGAACCAGTTCA
AATAATTATAACCATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTACTATAACCTTCATTTTGTCATAAAA
AAATTATTTCTCAACATACAAGCTTATCGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAAAAA
TTACAAAGAGATTTA
Found at i:42318 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 41206--43186 Score: 916
Period size: 181 Copynumber: 11.0 Consensus size: 181
41196 AAATTTCAAT
* * * * * *
41206 TCTATTTA-CTGAACCAATTCAAATAATTATA-ACTGTTTGAA-AAATATATATTTTAAATCATT
1 TCTATTTATC-GAACCAATTCAAATAAGTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATT
* ** * * * * * * * *
41268 ATTAGTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTTATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAA
64 ATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * * *
41333 AACTAATTTATTTATATTT-AGAAAATCAATCAGTGAGAGAATTAAAAAACAAA
129 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *** * * * *
41386 TCTATTGA-CCAAACAATTTCAGAT-AGTTTTCACCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATT
1 TCTATTTATCGAACCAA-TTCAAATAAG-TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATT
* * * ** * ** **
41449 ATAACCTTTTGTTTTGTCATC-AAACTATTGGTTTTGTTCATACT-ATTTTATTTGAAATAAAAT
64 ATGACCTTTTGTTTTGTCA-CAAAACAAATATTTTTGATCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * ** ** * *
41512 AATACTAATTTAATAATATTCTGCAAACTATTTTTTTAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAA
127 AATACTAATTTATTAATATT-T-CAAA--A-ATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * * ** * * **
41573 TCTAATT-GCTAAATGAGTTCAAAT-AGTTAAGACTATATGCATGATTGTTTATTTCAAACT-GC
1 TCTATTTATC-GAACCAATTCAAATAAG-TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAAT
** * * * *
41635 TATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAATAAAT-TTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAAT
63 TATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
41698 AATACAAATTTGA-TAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGACATTT-AAAAA-AAT
127 AATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** * * * **
41751 TTTGTTT-TCAAAATCAATTCAGAT-GGTTAAGACTATTAAAATAATTATCCATTTGAAATCGTT
1 TCTATTTATC-GAACCAATTCAAATAAG-TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATT
* * * * * * * ** * * * * *
41814 CTTACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCGTACAAGTTTATTTC-AAATAAATTA
64 ATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATA
* * *
41878 ATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGATATTTAAAAAAATAAA
128 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* ** * * *
41933 TCTATTTATCGAA-CAAGTTTAAAT-AGTTATTATTATTTGAACAATTTTCTATTT-AGAATCAT
1 TCTATTTATCGAACCAA-TTCAAATAAG-TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATAAT
* * * * ** * *
41995 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAGATAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
63 TATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * *
42060 ATACAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGGGATTTAAAAAGTGAA
128 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * * *
42114 TCTATTTGCCGAATCATTTCAAATAAGTAAGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT
1 TCTATTTATCGAACCAATTCAAATAAGTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT
* * * * * *
42179 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATATTTTTGATCATTTAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
66 GACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* *
42244 CTAATTTATTAATCTTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
131 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * **
42295 TCTCTTTATCGAACCAATTCAAAT-AGTTACGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTA
1 TCTATTTATCGAACCAATTCAAATAAG-TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTA
** ** * * * **
42359 T-A-AATTTGTATTCTACCACAAAACAATTATTTCT-ATTCTTATAAGCTTA-AAAAAATAAAAT
65 TGACCTTTTGT-TT-TGTCACAAAACAAATATTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* ** * * * *
42420 AATACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAATAACTTAGAGAATT-AAAAATAAA
127 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** * * *
42474 TTTGTTTATCAAACTAGTACAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAA-ATGTTA
1 TCTATTTATCGAACCAATTCAAATAAGTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-ATTA
* * ***
42538 TGACCTTTTGTTTTGTCACAAAAC-AAT-TTTTTAGTTTATACT-AGCTTATTTGGAATAAAATA
65 TGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTT-GATCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * *
42600 A-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAA-ATA
128 ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** * *
42653 TTTATGTTTACCTAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGCTATCTATTACAAATCATT
1 TCTA--TTTATCGAACCAATTCAAATAAGTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATT
* ** * * * *
42718 ATAACCTTTTGTTTCATCACAAAA-AAA-ATGTTTTCATTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAGT
64 ATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATAT-TTTTGA-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * *
42781 AATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AATA-TTTTAAAAAATAAA
127 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * **
42833 TCTATTTA-AGAAACCAGTTTAAAT-AGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAACCAT
1 TCTATTTATCG-AACCAATTCAAATAAG-TAAGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATAAT
* * ** * * * * * * ** *** *
42895 TATGACTTTTTGTCCTAAT-ATAAAACAATTGTTTCTGTTTATACGAGCTT-TTTGGATTAAAAT
63 TATGACCTTTTGT-TTTGTCACAAAACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
** * * *
42958 AATACTAATTTATTAATATTTTGACAA-TAATAAGTACA-AAATTTTAAAAATAAA
127 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
43012 TATGTTT-GCTGAACTAGA-TCAAAT-AGTCAA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
1 TCTATTTATC-GAACCA-ATTCAAATAAGT-AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAAT
* ** * * ** * * *
43073 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGGAATTGTTTAAGTTCTTATAAGTTTATTCAAAATAAAATA
63 TATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* ** *
43138 ATACCAATTTACCAATATTTC-AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA
128 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
43187 ATTTATTTAC
Statistics
Matches: 1360, Mismatches: 361, Indels: 161
0.72 0.19 0.09
Matches are distributed among these distances:
176 6 0.00
177 41 0.03
178 219 0.16
179 278 0.20
180 98 0.07
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182 183 0.13
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184 5 0.00
185 2 0.00
186 44 0.03
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188 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TCTATTTATCGAACCAATTCAAATAAGTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTAT
GACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAAATATTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
Found at i:42830 original size:359 final size:358
Alignment explanation
Indices: 42221--43075 Score: 781
Period size: 359 Copynumber: 2.4 Consensus size: 358
42211 TGATCATTTA
** *
42221 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTA
1 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
42286 AAAAATAAATCTCTTTATCGAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTGTATACTTCA
66 AAAAATAAATATCTTTACCGAACCAATTCAAATAATTACGACTATTTGAACAACTATATACTTCA
** * *
42351 AATTGTTATAAATTTGTATTCTACCACAAAACAATTATTTCTATTCTTATAAGCTTAAAAAAATA
131 AATCATTATAAATTTGTATTCTACCACAAAAAAATTATTTCTATTCATATAAGCTTAAAAAAATA
** * * *
42416 AAATAATACTAATCTATTAATATTTTGATAATTAATAACTTAGAGAATTAAAAATAAATTTGTTT
196 AAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--TAGAGAATTAAAAATAAATCTATTT
* * * **
42481 ATCAAACTAGTACAAATATTTAAGACTATATGA-ACAATTATCCATTTCAAAATGTTATGACCTT
259 AACAAACCAGTACAAATAGTTAAGACTATATGACA-AATTATCCATTTCAAAACATTATGACCTT
* ** *
42545 TTGT-TTTGTCACAAAACAATT-TTT-TAGTTTATACT
323 TTGTCCTAAT-ACAAAACAATTGTTTCT-GTTTATACG
* * *
42580 AGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTT
1 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTT
** * * * * * *
42644 AAAAAAATATTTATGTTTACCTAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGCTATCTA-TT
65 -AAAAAATAAATATCTTTACCGAACCAATTCAAATAATTACGACTATTTGAACAACTATATACTT
* * * *
42708 ACAAATCATTATAACCTTTTGT-TTC-ATCACAAAAAAAATGT-TTTC-ATTCATATAAGTTTGT
129 -CAAATCATTATAA--ATTTGTATTCTACCAC-AAAAAAAT-TATTTCTATTCATATAAGCTT-A
** * * *
42769 TCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-A-ATATTTTAAAAAATAA
188 AAAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGAGA-ATT-AAAAATAA
* ** * * ** *
42832 ATCTATTTAAGAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGACAAATTATTTATTTCAAACCATTA
251 ATCTATTTAACAAACCAGTACAAATAGTTAAGACTATATGACAAATTATCCATTTCAAAACATTA
* *
42897 TGACTTTTTGTCCTAATATAAAACAATTGTTTCTGTTTATACG
316 TGACCTTTTGTCCTAATACAAAACAATTGTTTCTGTTTATACG
* ** * *
42940 AGCTT-TTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAA-TAATAAGTACA-AAATTT
1 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTA-AGAGATTT
* * * * * * * * * * * *
43002 TAAAAATAAATATGTTTGCTGAACTAGA-TCAAATAGTCA-AACTATTTGAATAATTATCTATTT
65 AAAAAATAAATATCTTTACCGAACCA-ATTCAAATAATTACGACTATTTGAACAACTATATACTT
43065 CAAATCATTAT
129 CAAATCATTAT
43076 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 401, Mismatches: 77, Indels: 39
0.78 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
356 28 0.07
357 31 0.08
358 19 0.05
359 166 0.41
360 96 0.24
361 55 0.14
362 6 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (358 bp):
AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTA
AAAAATAAATATCTTTACCGAACCAATTCAAATAATTACGACTATTTGAACAACTATATACTTCA
AATCATTATAAATTTGTATTCTACCACAAAAAAATTATTTCTATTCATATAAGCTTAAAAAAATA
AAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGAGAATTAAAAATAAATCTATTTAA
CAAACCAGTACAAATAGTTAAGACTATATGACAAATTATCCATTTCAAAACATTATGACCTTTTG
TCCTAATACAAAACAATTGTTTCTGTTTATACG
Found at i:43631 original size:446 final size:443
Alignment explanation
Indices: 42820--43631 Score: 1019
Period size: 446 Copynumber: 1.8 Consensus size: 443
42810 AATAAAATAT
*
42820 TTTAAAAAATAAATCTATTTAAGAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGACAAATTATTTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTATTTAAGAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACAAATTATTTAT
* * * *
42885 TTCAAACCATTATGACTTTTTGTCCTAATATAAAACAATTGTTTCTGTTTATACGAGCTTTTTGG
65 TTCAAACCATTATGAATTTTTGTCCTAATATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTTTTGG
*
42950 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATAATAAGTACAAAATTTTAAAAATAAATAT
130 ATTAAAATAATACTAATTTATCAATATTTTGACAATAATAAGTACAAAATTTTAAAAATAAATAT
* * *
43015 GTTTGCTGAACTAGATCAAATAGTCAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
195 ATTTGCTGAACAAGATCAAATAGTCAAACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * **
43080 TTTTGTTTTGTCATAAAGGAATTGTTTAAGTTCTTATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAA
260 TTTGGTTTTGTAATAAAAGAATTGCTTAAGTTCAAATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAA
* *
43145 TTTACCAATATTTCAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAATTTATTTACTGAACAAGCTTAT
325 TTTACCAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATTTATTTACTGAACAAGCTTAT
43210 TTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAGGATAATTAATATGTAAAAGA
390 TTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAGGATAATTAATATGTAAAAGA
* * * *
43264 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATA-AGTTCAAATCGTTATGGCTATTTGA-ATAATTATTT
1 TTTAAAAAATAAATCTATTTA-AGAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACA-AATTATTT
*** * ** * * * *
43327 ATTTCAAATTGTTATGAATTTTTGT-TTTGTAATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGGTTAT
63 ATTTCAAACCATTATGAATTTTTGTCCTAAT-ATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTT-T
*
43391 TTGGATTAAAATAATATTAATTTATCAATATTTTGACAATTAATAAGTA-AAAAGTTTTAAAAAT
126 TTGGATTAAAATAATACTAATTTATCAATATTTTGACAA-TAATAAGTACAAAA-TTTTAAAAAT
* * * * * *
43455 AAATATATTT-ATCGAACAAGTTGAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAACTCA
189 AAATATATTTGCT-GAACAAGATCAAATAGTCA-AACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCA
* * **
43519 TT-TGACCTTTGGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTCAGTTCAAATAAGCTTT-TTTGAAATAAAA
252 TTATGACCTTTGGTTTTGTAATAAAAGAATTGCTTAAGTTCAAATAAG-TTTATTCAAAATAAAA
** ** * * *
43582 TAATATTAATTTATTAATA-TTCACAAGTTAATGAGTAATAGAATTAAAAA
316 TAATACCAATTTACCAATATTTCA-AAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAA
43632 TTAATCTATT
Statistics
Matches: 308, Mismatches: 49, Indels: 20
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
443 3 0.01
444 95 0.31
445 50 0.16
446 128 0.42
447 32 0.10
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (443 bp):
TTTAAAAAATAAATCTATTTAAGAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGACAAATTATTTATT
TCAAACCATTATGAATTTTTGTCCTAATATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTTTTGGA
TTAAAATAATACTAATTTATCAATATTTTGACAATAATAAGTACAAAATTTTAAAAATAAATATA
TTTGCTGAACAAGATCAAATAGTCAAACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATGACCT
TTGGTTTTGTAATAAAAGAATTGCTTAAGTTCAAATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAAT
TTACCAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAAATTTATTTACTGAACAAGCTTATT
TTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTAGGATAATTAATATGTAAAAGA
Found at i:43779 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 43200--44203 Score: 734
Period size: 181 Copynumber: 5.6 Consensus size: 179
43190 TATTTACTGA
* *
43200 ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-AGGATAATTAATATGTAAAAGA
1 ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCA-CA-AATTAATAAGTAAAAGA
* * ** * * * *
43264 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAGTTCAAATCGTTATGGCTATTTGAATAATTATTTAT
64 ATT-AAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * ** ** * *
43329 TTCAAATTGTTATGAATTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTATTTTTGTTCAT
128 TTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTCTATTCAT
* * * * * * *
43381 ATAAGGTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATCAATATTTTGAC-AATTAATAAGTAAAAAG
1 ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA--TTCACAAATTAATAAGT-AAAAG
** * * * * * *
43445 TTTTAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTGAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTAT
63 AATTAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * *
43510 TTC-AACTCATT-TGACCTTTGGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTC-AGTTCAA
128 TTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTCTA-TTCAT
* * * * *
43561 ATAAGCTT-TTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCACAAGTTAATGAGTAATAGAA
1 ACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCACAAATTAATAAGTAAAAGAA
* * * * *
43625 TTAAAAATTAATCTATTTATCAAACATGTTCGAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTT
65 TTAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * **
43690 CAAAATATTACGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTGTT
130 CAAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTCTATTCAT
* * * *
43740 GCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAA-AT
1 ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-CACAAATTAATAAGTAAAAGAA
* * *
43804 TTAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACACA-TTCAAATAGTTATCACTATTT-AAGTAATTAACCA
65 TTAAAAATAAATCTATTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTA
* * * * * * *
43866 TTTAAAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAATTAATTGTTTCTATTCAG
127 TTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTCTATTCAT
* * * * * * *
43920 AAAAGCTTA-TTCGAAATAAAACAATACT-AATTTTTTAAAATTTCA-AATATTAATAAATAGAA
1 ACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCACAA-ATTAATAAGTAAAA
* * * * *
43982 G-ATTAAAATAGTAAATCTGTTTA-CTGAGCGAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
62 GAATTAAAA-A-TAAATCTATTTATC-AAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * * **
44044 TTTATCTC-AAATCATTAAGATCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
123 TCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTCTATTCAT
* ** * * ****
44101 ACAAGTTTA-TGCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAACTAATAAGTTGGTG
1 ACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-ACAAATTAATAAGTAAAAG
* *
44164 ATTTAAAAAATAAATCTATTCA-CAAACAAGTTCAAATAGT
63 AATT-AAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGT
44204 CATGTCCATT
Statistics
Matches: 657, Mismatches: 134, Indels: 65
0.77 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
178 70 0.11
179 140 0.21
180 181 0.28
181 201 0.31
182 55 0.08
183 9 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCACAAATTAATAAGTAAAAGAAT
TAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
AAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGCTTCTATTCAT
Found at i:44894 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 44529--44948 Score: 508
Period size: 180 Copynumber: 2.3 Consensus size: 181
44519 TTATTTTGTC
* * *** *
44529 ATAAAACTAGTTTATTAATATTTTTGAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTT
* ** ** *
44594 ACTGAATCAGTTAATATAATGATGGCCATTTGAATTATTATCTATATCAAATTGTTATGACCTTT
65 ACTGAATCAGTTAATATAATGATGACCATTTGAACAATTATCTATATCAAATCATTAAGACCTTT
*
44659 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGATCATACAAGTTTATTTGAAATAAA
130 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* *
44711 ATAATCCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
1 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * *
44776 TTGAATCAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAAGATC-T
66 CTGAATCAGTT-AATATAATGATGACCATTTGAACAATTATCT-ATATCAAATCATTAAGACCTT
* **
44838 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAG-TCATAGAAGCTTATTTTGTTA-AAA
129 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGATCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAA
* * * *
44891 ATAATACTAATTTAATGATATTTCAAACATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAAT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
44949 GTGCTTGCGA
Statistics
Matches: 205, Mismatches: 29, Indels: 10
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
180 94 0.46
181 72 0.35
182 39 0.19
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
CTGAATCAGTTAATATAATGATGACCATTTGAACAATTATCTATATCAAATCATTAAGACCTTTT
GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
Found at i:46018 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 45678--48970 Score: 1687
Period size: 181 Copynumber: 18.3 Consensus size: 181
45668 TAAAAAATAA
* * * * * *
45678 ACCTTTTGTTCTGTCATAAAAC-AATTATTTATGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTATTCATA-TAGCTTATTCAG-AATAAAATAAA
* ** * * * * *
45741 AGTAATCCGA-TAATATTTTAAAACTTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATT-TATTT-TTT
63 AATAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCT
* * * * *
45803 AAATCAGCTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCGAATCATTATG
127 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * *
45859 ACCTTTTCTTTTGTTATAAAACAAAATTTTCAATTTATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTCTATTCATA-TAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAA
*
45924 TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCTAA
65 T-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCTAA
* *
45988 CTAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
129 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* ** * ** *
46041 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TGTTCATATAAATTTGTTTGGAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTTCTATTCATAT-AGCTTATTCAGAATAAAATAAAA
* * * * * * * *
46105 CTAATCTATTAATATTTTAGAAATTAAT-A--AA-ACATTTAAAAAATAAATCCT-TTTACCAAA
64 ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCTAA
* * * * * * * * ** *
46165 CCAGTCCAATTAGTTATGATTGTTTGATCAATTATTTATTAC-AATTGTTATT
129 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * * * * * *
46217 ACTTTTTGTTCTATTATAAAAC-AATAGTTTCTATTTATACAAGCATATTCGGATTAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTTCTATTCATA-TAGCTTATTCAGAATAAAATAAAA
* * * * * * * * *
46281 CTATTTTATTAATATTTCAACAA-T-GTAA--AA-A-A-TTAAGAAAGTAAA-TATGTTTACCAA
64 ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTCTATTTATCTA
* * * **
46338 ACTA-TATCAAATAGTCATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
128 ACTAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* *
46392 A-CTTTTGTTCTGTCAT-AAA-AAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTA-TTCATAT-AGCTTATTCAG-AATAAAATAA
* * * * * * * * *
46452 TACTAAGTTATTAGTATTCCAAAAATGAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAA-TATATTTA-CT
62 AAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCT
* * * * * * * *
46515 GAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTGAAATCACTATA
127 -AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * ** *
46571 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATTTTTTCTGTTCATACAAG-TTATTTTGGATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-AATTTTTCTATTCATA-TAGCTTATTCAGAATAAAATAA-A
* * *
46634 CA-AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-C
63 AATAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATC
* * * * * * **
46694 CAAATAAATTTAAATTGTTATGATTATTTGAAC----A---A---CAAATTGTTATG
126 TAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
46741 ACTTTTTGTTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTATTCA-ACAAGCTTATT-TGAATTAAAAT-A
1 ACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTATTCATA-TAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA
* ** * * *
46802 ATATCAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-T-TTTAC
62 AAAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCTATTTAT
* ** * * * *
46865 CGAAAAAGTTCAAGTAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAAG
125 CTAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * *
46922 AACTTTTGTTCTATAATAAAAC-AATTGTTT-TAGTTAATATAAGTTTATT-TGAAATAAAATAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTA-TTCATAT-AGCTTATTCAG-AATAAAATAA
* * * * *
46984 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAA-TCTATTTAT-
62 AAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTCTATTTATC
** * * **
47047 TGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAACCATCTATTTCAACA-CATTATG
126 T-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATG
* * * ** *
47104 ACTTTTTGTTTTGTCAGAAAGC-AATTAGATCTATTCATGAAAGCTTATTTC-GAATAAAAT-AA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTATTCAT-ATAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAA
* * * * * * *
47166 CATATATTTATAAATATTTCAAAAATTAATAAATAATA-ATTTAAACAATAAA-TGTATTTTTCT
63 AATA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCT
* * * * * **
47229 GAAC-ATGTTTAATTAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
127 -AACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * *
47285 ACCATTTATTTTGTGATAAAATC-AGTTGCTTT-TGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAATT--TTTCTATTCATA-TAGCTTATTCAG-AATAAAATA
* * * * * *
47347 ATATTAATTTCTTAA-ATTTCCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTA-
61 AAAATAATTTATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTAT
* ** * * ** * *
47409 CAAAGAGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAATAAACATTTATTTCAAATTATTATG
125 CTAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * * * **
47467 ATCTTTTCTTTGGTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATT-TGAAAAAAATAATG
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTATTCAT-ATAGCTTATTCAGAATAAAATAAAA
* * * * *
47530 CTACTTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCAA
64 ATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCTA
* * * * * ** * *
47593 ACAAGTTCAAATAGTCATGCCCATTTGAGCTGTTATCAATTTGAAATCATTATG
128 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * **
47647 ACATTTTATTTTGTCGTAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCATACAAAATTATT
1 ACCTTTTGTTTTGTC-----ATAA-AACAA--ATT-----T--TT-CTATTCATA-TAGCTTATT
* * ** * *
47712 TAGAATAAAATAATACCAATTTATTATTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAG-GATTCAAAAAATAA
49 CAGAATAAAATAAAAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
47772 ATT-TGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTTTTTTCAAATCAT
114 ATTCTATTTATCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCAT
*
47836 TTTG
178 TATG
* * * * * * * *
47840 ACTTTTTGTTTAGTTATAAAA-TAATTGTTT-TAGCTCATACATGCCTATTCCA-AGTAAAAT--
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTA-TTCATATA-GCTTATT-CAGAATAAAATAA
** * * * *
47900 -AATAA--TATT--TA----GGAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAAT-AACTC-AGTTTATC
62 AAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTA-TTTATC
* * * * * * * *
47954 GAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTGTATATTTAAAATCATTATG
126 TAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * *
48010 GCTTTTTATTTTATCATAAAAC-AATTGTTT-TAGTGCATAGAAGCTTATTC-GAAATAAAAT-A
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTA-TTCATA-TAGCTTATTCAG-AATAAAATAA
* * * * * * *
48071 ATATTACTTATTAATATTTCAAAAAGTGATAAGTAAGAGATCTAAAAAATAAATT-AATTTATC-
62 AAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCT
* * * * * * * * * * *
48134 AAATCGGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATATATTTAAAATTATTGTG
127 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
48190 AACTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTCAGAATAAAATAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCT-ATTCATAT-AGCTTATTCAGAATAAAATAAA
* * * * * * *
48253 ATTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAA-TCTGTTTACCGA
63 AATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCTA
* * * * *
48317 ACCAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTATTATA
128 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * *
48371 ACCTTTTGTTATGTCATAAAAC-AATTATTTCTATTCATACAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCTATTCATA-TAGCTTATTCAGAATAAAATAAAA
* * * *
48435 CT-ATTGTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTT-GCT
64 ATAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCT
* * * * * * * **
48496 AAATCAGTTCAAATAGTTAAGGCTGTATGAACAATTCTTTTATTTCAAATTTTTATG
127 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * *
48553 ACCTTTTGTTTTGTCGTATAACAATTTTTTC-AGTTCTTATAACTTATTCAGAATAAAATAAAAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTCTA-TTCATATAGCTTATTCAGAATAAAATAAAA-
* * * * *
48617 A-AATTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-TAAAA-AAATTATATTTATCGAA
64 ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCTAA
* * * *
48679 CCAATTCAAATAATTAT-ATCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
129 CTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * * * * *
48732 ACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTTGTTCTTATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-ATTTTTCTATTCATAT-AGCTTATTCAGAATAAAATAAAA
* * ** * *
48797 TTAATTTATTCATATTTTGAAAACTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTA-CTAA
64 ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCT-A
* * * * * * *
48860 ACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACAATTTTTTTTTTCAAATCGTTATG
128 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
** *
48914 ACAATTTG-TTTGTCATAAAAC-AATCGTTTCTATTCATATAGTCTTATTCAGAATAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTTCTATTCATATAG-CTTATTCAGAATAAA
48971 GTTATGAAAA
Statistics
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AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATCTAACT
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
Found at i:46895 original size:171 final size:170
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Indices: 46574--46896 Score: 449
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46564 CACTATAACC
* * * *
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* * * *
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**
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* *
46870 -AAGTTCAAGTAGTCATGACTATTTGAA
125 TAAATTCAAATAGTCATGACTATTTGAA
46897 TAATTATCTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (170 bp):
TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGTTATTTTGAATAAAATAATACAAAT
TTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAATT
CAAATAGTCATGACTATTTGAACAACAAATTGTTATGACT
Found at i:48645 original size:362 final size:361
Alignment explanation
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45156 CAGTTCGTAA
* * * *
45166 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT
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* ** * ** * *
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** * * * * *
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* * *
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* ** * * * * * * * * ** *
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257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
** * * * *
45484 ACCTTTCATTTAGTCATATAACAATTGTTTTTTTTTATCATAC
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* * * * * *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
45591 TAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTTTAACTATTTAAACAATTGTATACTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
45656 CAAATAATTATTTAAAAAATAAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAA
129 C--A-AATCA-TT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCA-GTTCATATAA
* * ** * * *
45720 GCTTATT-TGAAATAAAATAATAGTAATCCGA-TAATATTTTAAAACTTAATAACTAAGAGATTT
183 GCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * **** * * * *
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* * * * * *
45848 GAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTTATAAAACAAAAT-TTTCAATTTATAC
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* * * *
45899 TAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAATGAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
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64 TTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** *
46027 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT--GTTCATATAAATTTGTT
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
** * * * *
46090 TGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAGAAATTAAT-A--AA-ACATTTAAAAAATAA
190 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * **
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255 AT-CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * *
46214 ATTACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTCTATTTATAC
319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** * * * *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
46314 TAAGAAAGTAAATATGTTTACCAAACTA-TATCAAATAGTCATGACTACTTGAATAATTATCTAT
65 TAA-AAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** *
46378 TTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTCTGTCATAAAA-AATTATTTT-AGTTCATATAAGCTTATT-
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC
* * * * * * *
46439 TGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAGTATTCCAAAAATGAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGA
191 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * *
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255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * *
46569 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATTTTTTCTGTTCATAC
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTATTCATAC
**** * *
46611 AAG-TTATTTTGGATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * *
46673 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAATTTAAATTGTTATGATTATTTGAAC----A---A--
64 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * *
46729 -CAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCA-ACAAGCTTATT-
128 TCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTC
* ** * *
46790 TGAATTAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
191 AGAA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * ** * * *
46854 AATATTTTTACCGAAAAAGTTCAAGTAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * *
46919 AAGAACTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATAT
319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* ** *
46962 AAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAAGAGAAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG-AT
* * * * * * * **
47026 TAAAAAAATGAATCTATTTATTGAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAACCATCTATT
64 TTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ***
47091 TCAACA-CATTATGACTTTTTGTTTTGTCAGAAAGCAATTAGATCTA-TTCATGA-AAGCTTATT
128 TCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCAT-ATAAGCTTA-T
* * * * *
47153 TC-GAATAAAATAACA-TATATTTATAAATATTTCAAAAATTAATAAATAATA-ATTTAAACAAT
189 TCAGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * *
47215 AAATGTATTTTTCTGAA-CATGTTTAATTAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATT
253 AAATCT-GTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
47279 GTTATGACCATTTATTTTGTGATAAAATCAGTTGCTTT-TGTTCATAC
316 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTG-TTTCTATTCATAC
** * * ** *
47326 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTCTTAA-ATTTCCCAAAATTAATAAGTAAAAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ** *
47390 TAAAAAATAAATCTGTTTACAAAGAGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAATAAACATTTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
47455 CAAATTATTATGATCTTTTCTTTGGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATT-TG
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAG
* * * *
47518 AAAAAAATAATGCTACTTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * ** * *
47582 TTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGCCCATTTGAGCTGTTATCAATTTGAAATCATTATG
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * *
47647 ACATTTTATTTTGTCGTAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCATAC
322 ACCTTTTGTTTTGTC-----ATAA-AAC-A--ATT----GT--TT-CTATTCATAC
** * * * *
47703 AAAATTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTATTATTATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAG-GATT
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* * * * *
47762 CAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTTTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TAT
* * * * * * * * *
47826 TTCAAATCATTTTGACTTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTTT-AGCTCATACATGCCTATTC
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATT-
* ** * * *
47890 CA-AGTAAAAT-A-A-TAA--TATT--TA----GGAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAA
190 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * *
47943 CTCAGTTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTGTATATTTAAAATCATTA
255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
48008 TGGCTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTGCATAG
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * *
48050 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATT-TCAAAAAGTGATAAGTAAGAGATC
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
48113 TAAAAAATAAAT-TAATTTA-TCAAATCGGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATATAT
65 TAAAAAATAAATCT-GTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
48176 TTAAAATTATTGTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATATAAGCCTATT
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
* * * * *
48239 CAGAATAAAATAAAATTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAA
190 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * *
48304 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTATTA
255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * *
48369 TAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAC
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
48411 AAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACT-ATTGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATT
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48475 TAAAAAATAAATTTATTTGCTAAATCAGTTCAAATAGTTAAGGCTGTATGAACAATTCTTTTATT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATT
** * * *
48540 TCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTATAACAATTTTTTCAGTTCTTATAA-CTTATTCAG
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* * * * * * *
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193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
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258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * *
48732 ACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTTGTTCTTAT
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATAC
* * * * * * * *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
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66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** **
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* * * * * *
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193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT
* * *
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257 CTGTTTA-CC-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
49071 TGACCTTTTATTTTATCACAAAGCAATTGTTTCTGTTCATAA
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * *
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65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
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129 CAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCA-GTTCATATAAGCTTA-TTC
* * ** * *
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191 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** ** * * **
49368 ATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAATTGTT
255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATT
* * * * * *
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319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
*** * * * * * * * *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * ** *
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66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTT
* * ** * * * * *
49604 AAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATCAATTCATAT-AGCCTTATTCAA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAG-CTTATTCAG
* * * *
49668 AATAAAATAATACTATTTTATTAATA-TTCAAAAAAATAATGAGTAAGAGTTTTAAAAAATGAAA
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAA
* * * *
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256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
49796 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTACTATTTACAC
321 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** ** ** * * *
49837 AAGCTTGGTT-GGAATAAAATAATAAAAATTTATTAGCATTCCAAAAATTAATAAGCAA-AAATT
1 AAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** *
49900 TTAAAAATAAATCTATTTTTTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
49965 CAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTT-TGTTCATATAAGCATATT-T
129 CAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* ** * * * * *
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192 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * ** *
50092 TTTGTTTACCAAGAA--AGTTTAATTAGTTATGATTGCTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGT
256 TCTGTTTACC--GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T
* * * *
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318 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * *
50198 AAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTATGAAAATTAAT-AGATAGGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAGAGATT
* * * * * *
50261 TAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTTAATTAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
50326 GAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATCTGTTCA-TGCA-A-AA--TTATTTAGA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* * * * * ** * * *
50386 ATAAAATAACATTGATCTATTAATGTTTTGAAAATTAAT--G--ATAGATATAAAAACTAAATCT
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** ** * * * * * * * *
50447 ATTTACAAAAATAGTCCAAATAGTTTTAACTATTTGGATAATTATCTATCTCAAATCGTTATG-G
259 GTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * *
50511 TTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTTTCATAC
324 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** * * *
50549 AAGCTTCTTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
** * * * ** *
50614 AAAAAAAATAAATGC-AATTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAACTATCTAT
66 --AAAAAATAAAT-CTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * * *
50678 TTTAAATCATTCTAACTTTTTATTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTGATACAAGCTTATTTA
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * ** *
50743 AAATAAAATAATACTAATTTAGTAACATTTTTAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTAAAACAAAAG
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTT--AA-AAAAT
** * * * * * *
50807 AAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGATT-TTACTATTTGAATAATTTTTTATTT-AAAGTC
253 AAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TC
* * * * * *
50870 CTTATGACTTTTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAA
316 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * *
50916 AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * *
50980 TAAAAACTTAAGCTATTTTC-AAACTAGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATAT-TAATC
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT
** * ** * * *
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128 TCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGT-TCATATAAGCTTATT
* * *
51103 TAG-ATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
190 CAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
51163 AATGTGTTTGCCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGATAC--TTATTTATTTCAAATCAT
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCAT
** * * * * * *
51226 TCCGACATTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTT-TAGATCATAT
318 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * *
51270 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * *
51335 GAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCCATTT
66 -AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* ** * * * *
51400 AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATAAAAGTTTATCCAA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* ** *
51464 AATAAAATAATGCTACCTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * * **
51528 TAGTTTACCAAATTAGTTCAAA-CGATTATGGCCATTTGAACAACTACCTATTTTAAATTGTTAT
258 T-GTTTACCGAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
51592 TA-CTTTCTGTTTTGTCATACAACAATTGTTTTTCA-ACTTAC
321 GACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
** * *
51633 AAGCTTATTTGAAATAAAATAACT-CTAATTTTTTAATATT-TCAAGAA-T--TAA-TAAGA-AT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
51691 TTAAAAAGTAAATCTATTTATCGAAACTATTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTAT
64 TTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * ** *
51756 TTTAAATTGTTTTAACCTTTTGTACTATCATAAAACAATTGTGTTT--GTTCAT-TCAAGCTTAT
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T-TTTCAGTTCATAT-AAGCTTAT
*
51818 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT
189 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * *
51882 AAATCCGTTTGCCAAACC-GATTCAAACAATTAAGACTATATGAACAATTATATATTTGC-AATT
253 AAATCTGTTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATC
* * * * * * *
51945 GTTACGACATTTTATTTTGTCAT--AATAA-TGATTTCAACTCATAC
316 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATAC
* * * * *
51989 AAGCTTATTCGAATTAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATT--T-A-TAAGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
52050 TAGAAAATAATTCTATTTA-TCAAATCAGTTCAAACAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * * *
52114 TCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTTTCAT-AAACAATTGTTTT-TGTTAATATAAGTTTGTTCA
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * ** * *
52177 AAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTGGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAGAAAGA-AAA
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAA
* * * * * *
52241 TTTGTTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTAT-TGATTTCAAATCGTTA
256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTA
* * * *
52305 TAACCTTTTATTTTGTCATGAAACAATTGGTTCTATTCATAC
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* ** * * * ** * *
52347 TATTTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAACTTAATAACCAAGAAAAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * * * *
52411 TAAAAAATAAATCTAATTGCTGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTA--TAAACGATTATCTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * *
52474 CAAATCATTATGA-CTCTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTT--GTTCATACAAGCTTATTCG
129 CAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * *
52536 GATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AAAAA-AAAT
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * * *
52599 TTATTTTTCGAATCAGTACAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTG
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
52664 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTTATAC
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * *
52704 ATGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTAATAAAATT-TAAAAAATTAATAAG-AA-AAATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
52766 TTAAAAATAAATCTGTTTATCGAATA-AGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTA--
65 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * **
52828 -C----C-TTTTGA---TTTG---T-T-ATAAAATAATTATTTCAGTTAATACAAGCATAGACAG
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
** * * *
52879 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAA-AAATT
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * * * *
52942 TGTTTATTGAATCAGTTAAAATAATTTTGGCCATTTGAACGATTAT-TGATTTCAAATCTTTATG
258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATG
* *
53006 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTT-TTTATCATAC
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
* * * * * *
53045 AAGTTTAATCGAAATAAAATAAT-TTGATTTATTATTATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
53108 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCAATCT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
53173 CAAATCACTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGATCATAGAAGCTTATT--G
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
** * *
53234 GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAACATAAA
193 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * ** * * * *
53298 TGTGTTTGTCAAACCAATTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTT
256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * * *
53363 AACCTTTTATTTAGTCATAAAATATTTATTTC-ATATCTTAT
321 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
* * * * * * * * * *
53404 AGGCTTATTCAGAACAAAATAATCCAAACTTACTAA-CTTCAAAAAATTAATAA-TCAAAAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATT
* * * * *
53467 TGAAAAATAAATCTGTTTATTGAGCAAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
53531 AAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-AGTTCATAAAAGCTTATGCAAA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* * *
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* ** * * *
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259 GTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
*
53720 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC
324 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
*
53758 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAA-ATGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATT
* * * * * * * * *
53822 TAAAAAGTGAATTTGTTTACTGAATCAGCTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
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129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* * * * * *
53950 AAATAAAATAATACTAATTTATTATTGTTTCATAAATTAATAAGTAAAACATTCAAAAAATAAAT
193 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * **
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* * * * * *
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320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * *
54120 TAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATTAA-ATT-TGCAAAATTAATAACTAAGAGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * * *
54183 TTAAAAAATAAATTTTTTTTCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTT
64 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * **
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129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATA-TAAGCTTATTCAG
* *
54312 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATT
193 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * **
54372 TTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATG
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * *
54437 ACCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAAATGTTTTTGTTCATAT
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
54477 AAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTTATATTCTAAAAATTAAT-AGCTAGGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAGAGATT
* * * * * *
54540 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
54605 GAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATCTATTCA-TTCA-A-AA--TTATTTAGA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* * * *
54665 ATAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCT
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
54726 ATTCACAGAAAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA
259 GTTTACCG-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * *
54791 TC-TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTTTTCATAC
323 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * *
54829 AAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
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* * * * * * **
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65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** * *
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129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* *
55020 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTT-AAAAATTAATGAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
55084 TTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAAACAATTGTTTATTT-AAAACAATT
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATC-ATT
* * * *
55147 CA--AACTTTTGTTTTGTCCAAAAAAAATAATTGTTTC-AGTTCATAA
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* * * ** **
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
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65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-A-AACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * **
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128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* * * ** * *
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* * * * ** *
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255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* ** * *
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* * * * * * *
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1 AAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
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64 TTA-AAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * ** * * *
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127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * * * * ** *
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192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * * * * *
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257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * *
55876 AACATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATAT
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * *
55916 AAGCCTATT-AAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAGGAGAT
1 AAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
55979 TTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATCTATTATATAT
64 TTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
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127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTC
* * * * * *
56105 TGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAATTGAGAGATTTAAAAAATA
191 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * * *
56169 AATTTGTTTGCCAAATCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * *
56234 ATGATCTTTTGCTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAT
319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
56277 AAGTTTGTTCAAAATAAAAAAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT--G--A-AGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
56336 TAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * *
56400 TCAAATCATTATGACCATTTT-TTTTATCATAAAATAGTTTTTTCTA-TTGATA-CAGTCTTATT
128 TCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAG-CTTATT
* * * * *
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190 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * *** * * * * *
56523 AGTCTATGGGCCTG-ACCAGTGT-AAATAGTTTTAACTGTTTGAATAATTATCTCTTTCAAATCA
254 AATCTGTTTACC-GAACCAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * *
56586 TTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTCCTAC
317 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
** * * ** *
56631 AAGCTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATT-TTGAAAGT--TAA-TAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * *** *
56692 AAAAACTGAATCTGTTTATCGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTT
66 AAAAAATAAATCTGTTTA-CTAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
*** * * * ** *
56756 CAAATTGCTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAATTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTA-TTCA
* * * ** * * * *
56820 -ATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGACAACAAATAAGTAAAAGATTTAAAGAACAAC
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * * *
56883 TCTATTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTAT
256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
56948 GACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTTTGTTCATAG
321 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
*** * * * * * * * *
56989 AAGCTTATTTGGATTTAAATAATATTAATTTATTAATGTTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** ** * *
57054 TAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGACATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * * *
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130 AAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG-
* * * * *
57181 AATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATC
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
57246 TATTTACCAAACAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCGA-TATG
258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATG
* * * * * * *
57310 GCATTTTGTTTTGTCATTAAATAATTATTTCCATTCATAT
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
57350 AAGCTTATTCCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAA-A-AAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
57413 TAAAAAATAAATATATTTTA-TGAACACA-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT
65 TAAAAAATAAATCT-GTTTACT-AA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
57476 TTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTTATACAAGCATATT-
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTC
* * * *
57538 TGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGA-TTTTAAAATAATA
191 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATA
* * *** * * * *
57598 AATTTGTTTATCGAGTAAGTTTAAATAGTTATTATGCCTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* *
57662 AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
316 A-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
57709 AAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * *
57774 -AAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTC
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** ** * *
57838 AAATCATTATGACCTTTTATTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAAAA
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAA
* ** ** *
57903 TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAATCTAAATTTG
195 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
** * * * * * ** * *
57964 TTTACCGAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAGCAATTATCTCTCTCAAATTGTTGTGATC
260 TTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* ** *
58029 -TTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATAC
325 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
** * * * *
58065 AAGCTTATTCGGATTAAAATAAAACTAATTTAATAATATTC-AAAAA--ATTAA-TAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * ** *
58126 AAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTAAAACAATTATCTACTT
66 -AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * * *
58191 CAAATTGTTTTGACATGTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTT-AATTCATACAAGCTTA-TCAG
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* * * *
58254 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-ATAT
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * *
58317 ATGTTTATTGAACAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCATTA
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA
* *
58380 -GACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAA
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * * *
58421 AAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT-TTTTCAAAAATTAAAAAGCAAGTTATG
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG--A-G
* ** * * * ** * **
58485 ACTATTTGAACAAATATCAATCTCCTCA-TAAAATAATT-ATTTTTGATCATACAAGCATATTTG
62 ---ATTT-AA-AAA-ATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCA-AATAG-T--TATGA-C-TATTT-
* * * * * *** * *** *
58548 GATAAAAATAATACTAATTTAATAAT-ATTCTAAAAATTAGTAAGAGAT-TTAAAA-AATGTATT
113 G--AACAATTAT-CT-ATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGT-TTTG-TCATAAAACAAT-T-TT
* ** ** * * **
58610 TGCTGAACCAATTCAAATAGTTAAGAC-TATT-AGAATAATTTTTAATTTTAAGTCATTCTAACC
169 T--T----CAGTTC--ATA--TAAG-CTTATTCAGAATAA--AATAATACTAATTTA-T-TAATA
***** * * * ** **** * * ** **
58673 TTTTGTTGAGTCATAGAATAATTG-TTTCAGTTCATAGAAGCTTATTTA--GAAAAAAAT-AATA
219 TTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTT-AAAAAATA-AATC-TGTTTACCGAACCAGTTCAA-A
* * * * ** * **** *** *
58734 CTAATTAATTAAC-ATTTGAAAAATTA-ATA-AACAAGA-GATTA-GAAAAAATAAATTTGTTTA
279 -TAGTT-A-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATG-ACCTTTTGTTTTG-TCA
* * * *
58794 CTGAACCAATTTGAATAGTAATGACTATTTAAAC
338 -TAAAACAA-TTG--T--T--T--CTATTCATAC
** * * ** * ** *
58828 AA--TTA-TCAATTTAAAATCATTA-TAACCTT-TTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTGAGTTCA
1 AAGCTTATTCAAAATAAAAT-AATACTAA-TTTATTAATAT-TC-TAAA-AATT-AATAAG----
* * * * * * * *
58888 TAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTATTGTA-TTAATATTTCAAA-AGTTAATAAGA-GAT
56 TAAGAG---ATTTAAAA-AATA-AAT-CTGTT-TACTAAACAGTTCAAATAGTT-AT--GACTAT
* * * * * * **** * *** * *
58950 TTAAAAAATAATC-AGTTCAAATAATTATG-TCTATTTAAACAACTATC-TATTTCAAATTGTT-
111 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTT---GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC
* * ** ** * *
59011 A-TTACTTTTTTG-TT-TTC-TCATAAAACAATTGCT--TTTCAATATAGAAGCCTATTTCAAAT
172 AGTT-CATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTT--AT-T--AA---TATTTCAAA-
** ** ** * * * * * *
59070 AA--AATAA-TACTA-ATTT-ACTAATATTTCAAGAATTA-CTAA-GAGTTTTAAA-A--AAT-A
226 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TG-TTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTATGA
* *** * * * * * ** * *
59124 -AATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAAT-AGTTATGA-C---T-ATTTG--A-ACAATTATTTATT
288 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTT
* **
59179 TCAAATTGTTAC
351 TC-TATTCATAC
* **** ** * * ** * * *
59191 AACCTT-TT-GTTCTATCATAAAAC-AATTGT-TT-CTATTCATATAAGCTTATTCAG-AATA-A
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTC-TA-AAAATTAATAAGTAAGAGA
** * * * * ** * * * *
59249 AAT-AATACT-AATTTAGTAATATTCTGAAA-A-TT--AATAACTAAGA-AATGTT-AAAAATAA
63 TTTAAAAAATAAATCT-GT--T-TACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAAT-T
* *** ** ** * *
59306 ATCCATTTGCTAAA-C--TA-G-CTCAAATAATAAGACTACAT-GAACAATTATTATTTCAAATT
121 ATCTATTT-C-AAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTG--T-CATAAAACAA-T-TT-TTTC-AGTT
** * * ** * * *
59365 GTTATGACCTTTTATTTTC-TCATAAAACAATTATCT-TTGTTAATATAAGTTTGTTCGAAATAA
176 CATATAAGC--TTA--TTCAGAATAAAATAA-TA-CTAAT-TT-AT-TAA-TAT-TTC-AAA-AA
** * * * * * *
59428 --AATAA-TACTA-ATTT----ACT-AATAT-TTTA--GAA--AATT-AATTAG-TAAGA-GATT
228 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
59476 T-AAAAAGTAAATATGTTTACTAAACCATTTCAAAT-A-GTTTTGAATATTTG--A-ATAACTAT
293 TGAACAA-T-TATCTATTT-C-AAATCA-TT---ATGACCTTTTG--T-TTTGTCATAAAACAAT
* * * *
59535 CTATTTCAAATCATTAT
347 -TGTTTCTATTCA-TAC
* * ** * ** * ** *
59552 AACTTCTTATTTTGTCATCAAGCAATTGGTCCT-ATTCATACTATTTTATTCTGAATAA--AATA
1 AA--GCTTA---T-TCA-AAATAAAATAATACTAATT--TA-T-TAATATTCT-AAAAATTAATA
** ** * * * * ** *
59614 A-TACTA-ATTTAATAGTATTTTGAAA-CT-TAATAACCAAAAAAATT-AAA-AAATA-AATCTA
54 AGTAAGAGATTTAA-A--A-AAT-AAATCTGT--TTA-CTAAACAGTTCAAATAGTTATGA-CT-
* * ** * * * *
59672 ATTGCCGAACCAGTTCAAATAGTT-AAGA-C-TATATGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTAT-
109 ATT--TGAA-CAATT-ATCTATTTCAA-ATCAT-TATG-AC-CTT-T-TGTT-----TTGTCATA
* * * ** * * * *
59733 GACCATTTTTTTGTTGTTGTAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTTTTCTAATTAAAATAAT
159 AAACAATTTTTT-CAG-T-TCATATAA--G-CTTA-T--T-C-AG--------AA-TAAAATAAT
* * * * * * * ***
59798 GCTAATTTAATAATATTTAAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATTAATTTTTTTGTTGAA
204 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA
* * * * * * * ** *
59863 TCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTT
269 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * *
59928 GTCATAAAATAATTGTTTCAATGCATAC
334 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * * * * *
59956 AAGCCTATTTAGAATAAATTAATATTAATTTATTAACATT-TAGAAATTAATAAGAAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** * * * * * * *
60020 AAAAAAATAAATCTATCAAATGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTAAATAAATGTCTATTT
66 -AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
60085 AAAATCATTATAACCTTTTGGTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGAT-GG
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TTCAG
* * * *
60149 AATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTGAGAGCTTT-AAAAATAAAT
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * ** *
60212 CTGTTTACTGAATTAGTTAAAATAATTAT-AGTTGTTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTGT
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * *
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** *
60317 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
60381 TAAAAAATAAATATGTTTACTGAACCGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTT
* * * * * * * *
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129 CAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
** * * *
60507 GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATACTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAATAATAAAT
193 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * ** *
60572 GTGTTTACCGAGCCAATACAAATAGCTA-AAGTTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTA
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTA
* ** * * * *
60635 TGACCTTTTGGTTACTCATAAAATACTTGTTTC-ATATCTTAT
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
* * * *
60677 AAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTATATTTATTAACATGCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GAT
* *
60740 TTGAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTAT
64 TT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * **
60805 TTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTCTCAATTCATAAAAGCTTACCCA
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * * *
60870 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAAT-TATTCAAAAATTAATAAGCAATAG-TTT--CAAATAAA
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
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256 TCTGTTTACCG-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * ** *
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* * * *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
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66 AAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTT
* * * * * * *
61165 CAAATCATTATTACCTTTTG-TTCGATCATATAACAATTGTTTT-TGATCATATATGTTTATTC-
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * *
61227 GAAATAAAATAAAAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
192 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * ** *
61292 TGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATT
256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATT
* * * * * * *
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319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
* * * * *
61398 AAGCTTATTCAAAACAAAATAAT-CTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GAT
* ** * * * * * *
61461 TTGGAAAAATAAATCTG-TTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAAAAATTATCAAT
64 TT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
61525 TTCAAATCGTCATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT--TTATCATATATGTTTATT
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGT-TCATATAAGCTTATT
* * * *
61588 C-GAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATA
190 CAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * ** *
61652 AATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCA
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCA
* * * * * * * *
61715 TTCTGACCTTTAGTTTAGTCATACAATATTTGCTTC-ATATCTTAC
317 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
** * * * *
61760 AAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAG-AAAATGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GAT
* * ** * *
61823 TTGGAAAAATATATCTG-TTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAA-AATTTATTTA
64 TT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTA
* * * * * * *
61886 TTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAGTTATTTCAGTTCATAAAAACTTATGC
126 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC
* * * * *
61951 AAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAATAG-TTT--AAAATAAA
191 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
62013 TTTGTTTATCGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTAAAATCATTGT
256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * **
62078 GACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTATCTGAATTCATAC
321 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * *
62119 AAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * *
62180 AAAAAGTGAATCAGTTTA-TCAAATCAGTTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTT
66 AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
62244 CAAATCGTTATTACC-TTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTT-ATGATCATATATGTTTATT-TG
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTCAG
* *
62306 AAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
193 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
62371 GTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGATA-AAGCTA-TTAAGATAATTAT-TAATTTCAAATCATT
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGA-ACAATTATCT-ATTTCAAATCATT
* * * * *
62433 CTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTAC
319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
** * * * * *
62476 AAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-CTAAATTTCTTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GAT
* * * ** * * * *
62539 TTGGAGAAATAAATTTGTTTACCGAACGAGTTCACATAGTGATGACTATTTGAAAAATTATTTA-
64 TT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
62603 TTCAAAATCATTATGACCTTTT-TTTTGACATAAAACAATTGATTT-AGTTCATAAAAGCTTATC
127 TTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
* * * * *
62666 CAAAATAAAATGATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAA
190 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * * *
62728 ATTTGTTTACTGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTG
255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * **
62793 TGATCTCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATTA-
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TAC
* * * * *
62835 AAGCATAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAGGTGAGTGATT
1 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
62898 TAAAAAATGAATCT-ATTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTCAACAATTATCAATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
62962 CAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTT--TTATCATATATGTTTATT-TG
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGT-TCATATAAGCTTATTCAG
* * * *
63024 AAATAAAATAAAAGTAATTTATTAGTCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
193 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** ** * *
63089 ATTTTTACC-AAGCCAATACAAATAGCTAAAACTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTC
257 CTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTA
* * * * *
63152 TGACTTTTTGTTTAGTTATAAAATATTTGTTTC-ATGTC-T-C
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
* * * * *
63192 ATGAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATA
1 A--AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-G
* * * ** ** * *
63255 ATTTGGAAAAACAAATCTGCTTACCGAACAAGTTTGAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTT
62 ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * *
63320 A-TTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT
125 ATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTAT
* * * * * *
63384 CCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--CAAATA
189 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* ** ** * * * * * * * *
63446 AATTTGTTTTTCGAAAAAATTGAAATTGTTAT-TCTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCGTT
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** *
63510 GTGACCTTTT-TTTTGTCATAAAGCAATTGTCTAAATTCATAT
319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* *
63552 AAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGTGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ** * ** * * * * * *
63616 TAAAAAGTGAATTTGCTTA-TGGAATTAATTCAAATAACTACGGCCATTTCAAAAATTATCAATT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT--AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * * * *
63680 T-AAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATCACAATTGTTTT-TGATCATATATGTTTATTC-
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* **
63742 GAAATAAAATAATAGTAATTTTATTAATCCTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
192 G-AATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * ** *
63807 ATGTGTTTACCGAGTCAATTCAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCAT
255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCAT
* * * * * *
63870 TCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTATTT-T-TTATATTAC
318 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT-CA-TAC
* * * * ** * *
63914 AAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-GTAAATTTATTTACATTAAAAAAACTAATAAGGAA-ATGAT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GAT
* * * * *
63977 TTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAATA-AGTTCAAATAATGATGACTATTTGAACAATTATTTA
64 TT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CTAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
64041 TTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCC
126 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC
* * *
64106 AAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAG-AATGAG-TTT--AAAATAA
191 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
64167 ATTTGTTTACCAAGAA--AATTCAAATTGTTATGGCTATTTAAACAACTGTCTA-TTAAAATCAT
255 ATCTGTTTACC--GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* ** * **
64229 TGTGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATAC
318 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
64273 AAGCTTAGTCAAAATAAAATAATATTAATTTACTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
64334 AAAAAGTGAATCTGCTTACTGAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTC
66 AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
64399 AAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAACTTTTTT-A--TCATATATGTTTATTCAGA
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* * * *
64461 AGAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATT
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
** * * * * *
64526 TGTTTATTGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-GCATACTTCAAATCATTATA
258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATG
* * * * * * *
64590 ACCTTTTGTTCTATCGTAAAACAATTATTTTTGTTCATAT
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * ** * * *
64630 AAGCTTATTCGAAATAAAATATTACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * ** *
64695 AAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTC
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * *
64760 AAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCGTACT-AGCTTTATTCAG
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATA-TAAGC-TTATTCAG
* * * *
64817 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATT
193 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
64881 ATGTTTGCCTAACCAATTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATG
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* ** * * *
64946 ACCATTTGTTTTGTCATAAAACAAACGTTTTTATTTATAT
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
64986 AAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-T---AGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ** *
65046 TAAAAAATAAATCTGTTTATTAAATCAATTCAAAAAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** ** * * * * * ** * *
65111 CAAATTGTTATGATTTTTTCTTCTATTACAAAACAATAATTTCAGTTCATAAAAACTTATTCAGA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* * * * * * *
65176 TTAAAATAATAATAATTTATTAATATCTCAAAAATTAATATGTAA-AAATTTTTAAAAATAAATA
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATC
** * * * * * * * *
65240 TGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACCATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATGA
258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
** * * * *
65305 AGTTTTGTTTTGCCATAAAAAAATTGTTT-TAGATCACATC
323 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-C
** * * * *
65345 -AGCTTATTTGAAAGAAAATAATGCTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * *
65409 -AAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTG
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
*** * * ** ** * **
65473 AAATTGCTATAATCTTTTGTTTTGTCACCAAATTATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTTGA
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* *
65537 ATAAAATAATAC-AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * * *
65599 TTGTTTA-CTATA-CATGTTCAAATTTTTATGACTAATTGATCTATTATTTATTTCAATTTATTA
257 CTGTTTACCGA-ACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * *
65662 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTTTCATAC
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
*** * * * * * * * *
65704 AAGCTTATTTGGATTCAAAA-AATATTAAATATATAAATATT-TCAAAAAATAGTAATTAAAAGA
1 AAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
65767 TTTTAAAAAATAAATATATTTATTAAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATAT
63 -TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *
65831 ATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTAT-ATATAAGCTTAT
125 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGT-TCATATAAGCTTAT
* * * * **
65895 T-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTACTA-TTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGAAATAAAAAA
189 TCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * * *
65958 TTAGTCTATTTACTGAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTTTCTATTTCAAAAC
252 TAAATCTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * **
66022 ATT-TGAGCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGT
316 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* **
66067 AAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTGGTTAATATTAC-AAAAATTAATAAGTAA-A-A
1 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
66127 TTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATGTTCAAATATTTGTGGCTATTTGAACAATTATCTA
63 -TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * *
66192 TTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTTATCATAAATCAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATT
126 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATT
* * *
66256 C-GAAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAA
190 CAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT---AAAAA
* ** * * * * * *
66320 ATAAATCTATTTATTGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATTTCTTTCAAATC
251 ATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
66385 CTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATAC
316 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
** * **
66431 AATTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
66496 AAAAAATAAATATGTTCACCGAATA-AGTTCAAATAGTCATGTCTGTTTGAGCTATTATCTATTT
66 AAAAAATAAATCTGTTTA-CTAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * * * ** *
66560 CAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTTATACAAAATTATTCAA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAG
*
66624 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATC
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
66685 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA
258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * *
66750 TC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTGTATTCATAC
323 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
** * * * * * * *
66788 AAGCTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTACTAATATT-TTAAAACTAATAAGTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * ** *
66852 AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTA-TT--A-GA--A--TA-TTC
66 AAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * *
66908 AAATCGTTTTGAGCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTTATACATGCTTATT-TGAA
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG-A
* * ** *
66972 AAAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAATTAATAAACAAGAAATTTTTAAAAAATAAAT
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAAT
* * * * ** * ** *
67036 CTGGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTCAAACAATTATATATTT-ATAAGAAGTAT
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTAT
* * *
67100 GACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTT-TAGTTCATAA
321 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
** * *
67141 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAA-AAGATAA-AGA
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT-AATAAG-TAAGAGA
* * ** *
67203 TTTAAAAAATAAGT-TAGTTTA-TCAAATC-GCTTCAAATAATTATGGTTATTTAAACAATTATC
63 TTTAAAAAATAAATCT-GTTTACT-AAA-CAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** * * * *
67265 TATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAG-TC
124 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTCAGTTCATATAAGCT-
* *
67327 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAA
186 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * *
67392 ATAAATCTATTCACCG----AG--C---CAGTT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
251 ATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
67445 ATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAT
316 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
** * * * * *
67491 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTAATAATATTCCAAAAATTGATAATTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
67556 AAAAAATAAATCTGTTTGTCGAAGCAATTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTA
66 AAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TT-
* * * *
67621 TCAAA--AGTTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATATTTTT-A--TCAT-TCAAGCCTAT
128 TCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTCAGTTCATAT-AAGCTTAT
* * *
67680 TCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
189 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * **
67745 AATTTGTTTATCGAACTAG-TCAAATA--TATAACTATTTAAACAATTGTAAACTTT-AAATCAT
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCAT
* * * * * * * * *
67806 TATAACTTTTTGTTCTATCTTAAAAGAATTATTTTTGTTCATAC
318 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * *
67850 AATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * *
67915 AAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * *
67980 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAG-CATAAAATAATTTTTTTTTGAATTTATACT-AGCTTATT
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA---TTTTTTCAGTTCATA-TAAGCTTATT
* * * * *
68043 -TGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAGAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAAAT
190 CAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
68102 AATTTTGTTTGA-CTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-A
253 AAATCTGTTT-ACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
68165 GTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAAATGTTTTTCTTCATAT
317 -TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * *** * * * * *
68211 AAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATATTAATCTGTTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TACGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
68271 TAAAAAATAAATTTATTTA-TCAAACGAGTTCAAATAATTATGGCT-TGTTG-----TT-T-TGT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * ** * *
68327 TATGAAA-CAAT-TG----TTT-TTGT-TCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAA-TT
127 T-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAC-AATTT--TTTCAGTTCATA-TAAGCT
* * * * * * * * *
68383 TATTAATAGTTCAACA-AATAATAAGTAAATAAT-TTT-AAAAA-T-A-AA-T-A-TG--TT---
186 TATTCAGA-AT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * *
68434 ---T--A-----TT---GAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
249 AAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** *
68486 TTGTTATGACC------TTT-T-AT-------TT-TGTC-A-T-AT--
314 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* *
68513 AAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACT-ATGTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAG--AGA
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATA-TTCTAAAA--ATTAA-TAAGTAAGA
* * * * ** * * * * * * * * *
68574 -TTTAAAAA-ATGAATATGTTTGTTGAGCAACTTTAAATAATTATGAGTATTTCAATAATTTTCT
61 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *** ** ** * *
68637 TTTTGAAATTGCTAT-AGCC-TTTGTTTTGTCATAAAATTATTTTTTTTGTTCATACAAGTTTAT
125 ATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTAT
** ** * *
68700 TTTGAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA--T-AAAGACACTTAATAAGTAAAACATTT--AAA
189 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * *
68760 ATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTGTTTGAGCAATTATTTATTTCAAATT
251 ATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T
* *
68824 C-TTATGA-CTTTCTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAC
315 CATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * * *
68870 AAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATT-TCGACAATTAATAAGTAAAAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * * ** * *
68934 TAAGCAATAAATATGTTT-TTCGAACAAGTTCAAATAGTCCTGACAATTTGAATAATTATCTATT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
68998 TTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATATAAGCTTATT-T
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * * * *
69061 GAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAA-AAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAA
192 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
69125 TTTGTTTACC-AAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTA
256 TCTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
69189 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTT-TGTTCATGC
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAC
* * *
69231 AAGCTTATTTC-AAAT-AAA-AATA--AATTTATTAATATT-TGAGAAATCAATAAGTAA-AAAT
1 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * *
69289 TTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
64 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * * * **
69354 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAACCAATTGTTTCTGTTTATAAAAACTTATTTGG
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* * * *
69419 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * **
69484 TATTTATC-AAGCGAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATG
258 TGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * *
69548 ATCTTTTATTTTGTCATAAAA-AATTGTTTCTATTCGTAT
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * * **
69587 AAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAACATTCTTAAAATTAATAAGTTGGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** * * *
69652 AAAAAATAAATTTGTTTA-TCGGACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCTATTTGAGCTATTATCTATT
66 AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * * **
69715 TCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATTGTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCA
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * ** * *
69779 AAATAAAATAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTATAT
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
69840 CTATTTATCGAACCAGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATG
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
69905 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTATATTCATAC
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
*** * ** * * * * * * *
69944 AAGCTTATTTGGAGTAACTTATTGCTAAATTAATAGTATCCTAAAAATTAATAA--CA-A-ATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * *
70005 AACAAATAAATGTGTTTGCCAAAGTAATTCAAAT-GATTATGACCATTAGAGCAATTATCTATTT
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
70069 CAAATCGTTATGACATTTTATTTAGTCATAAAATAAGTTTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* ** * * *
70134 ATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAATAAATTAAAAAAATAAATCT
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * * *
70198 ATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGA
259 GTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGA
* *
70262 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATA-
323 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * * * *
70300 AATGCTTATTCGAAGTAAAATAATATTACTTTATCAATATT-TCAAAAATTGATAAATTAGAGAT
1 AA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * * * * *
70364 TTAAAAAATAAGTCAGTTTA-TCAAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTAAACAATTATCTAT
64 TTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * *
70428 TTCAAATCATTACAAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTC
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC
* * * *
70491 GGAATAAAGTAATACTAATTTGTTAATATTT-TAAAA--AATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
191 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * **
70552 TATATTTACCAAACCAGTTC------------CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * *
70605 AACCTTTTGTTCTAGTTATAAAATAATTG-TTGTAGTTTATAT
321 GACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* *** * * * *
70647 AAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAACTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
70712 AAAAAATTAATCTGTTTGTCGAAGCAGTTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTACCTATTTC
66 AAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
70777 AAATCATTAAGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAA
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG-A
* ** * * *
70841 ATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTGAAAGTTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAA
194 AT--AA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * *** * *
70906 CCTATCTATCGAATCAAG-TCAAAAAATGATGGCCATGCCAATAATTATCTATTTGAAATCATTA
256 TCTGTTTACCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
70970 TTACCTTTTG-TTTGCTCATATAACAATTATATT-TGA-ACATTC
320 TGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATAC
* * * *
71012 AAGCTTACTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAATAACTAAGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * ** *
71076 TAAAAAATAAACCTATTTTACCAAACTA-TCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAAC
65 TAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAAC-AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
71140 TTCAAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATTATTTT--GTTCATACAAGCTTATTC
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATATAAGCTTATTC
* * * * *
71203 -GAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAATA
191 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATA
* * * * * * *
71267 AAT-TGTTTGCTGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** *
71331 ATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTGAATTCCTAC
319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATAC
* *** *
71375 TAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-ATGA
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA-GA
* * * * * *
71437 TTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAGGTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
63 TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
71502 TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATATTTTT--GTTCATATAAGTTTGTT
127 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
* * ** * *
71565 CAGAATAAAGTACTACT-ATTGTATTAATATTTTGAATATTAAT-A--AA-ATATTTAAAAAATA
190 CAGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
71625 AATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTATGAC-ATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATC-GT
254 AATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * *
71688 -TGA----TT-TTTTGTTATAAAACAATT-TTTTTGTTTATGC
319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* *** * * * * *
71724 AAGGTTATTTGGATTAAAACAATACTAATTTCTTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAA-AAATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * ** * * *
71787 TTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAATCCTGATTATTTGAATAATTATTTATTT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
*** * * * * **
71852 CAAATTGCTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTGGGA
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGA
* * * *
71917 ATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAACTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATC
194 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * *** *
71981 TGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTATAA
258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* *
72046 CCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATT-TTTCCTATTCATAC
323 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATAC
* *
72085 AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGATAATTAATAAGTAAAAGA
1 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
72147 GTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAATAAGTTCAAATTGTTATGA-TA--AGTACAATTATTTA
63 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
72208 TTTC-AA-CTTGTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TCCATACAAGTTTAT
126 TTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTAT
* * * * *
72270 TCGGATTACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAT
189 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT
* *** * * * * *
72335 AAACCTGTTTATAAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
253 AAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * *
72400 AATGACTTTTTCTTTTGTAATAATATAATTGTTTC-AGTTTATAT
318 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * * * * *
72444 AAGTTTGCTT-GAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAACAAT
1 AAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * * *
72508 TAAAAAAAAGAATATGTTTACTAAAATAGTTCAAATAGTTTTAAGTATCTAAATAGTTATCTATT
65 TAAAAAATA-AATCTGTTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
72573 TCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTTGTTCA-TTCATACAAGCTTATTCTG
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAG
* * *
72637 AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATCTT-AAAAATAAA
193 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAA
* * ** *
72699 TCTATTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTA
256 TCTGTTTACCGAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * *
72763 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTAGTTT-TGTTCATA-
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAC
*** * * * *
72804 ATAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAACAATTAATAAGTAAAAGA--
1 A-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *** * * *
72867 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAGTGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTA-TT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** ** * * * * * *
72931 CAAATTGTTACAATCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATT-TG
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAG
* **
72994 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAA
193 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** ** * * * * * * * * *
73058 TCTGTTTACTAAATAAGTTTAAACAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCTGTTTGAAATCATTAT
256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * **
73123 GACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATGT
321 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
** * *
73164 AAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAACAGCTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
73224 TAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
73289 CAAATCGTTAGGATC-TTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTAT-A-TTCATACAAGCTTATTCG
129 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TCAGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * ** * * *
73351 GAGT-AAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATCAAT
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * ** * * *
73411 GTGTTTATTGAATCAATTCAAATAGTTAAGATTGTTAAAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTA
257 CTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
** * * *
73476 ACCTTTTGTTTAATAATAAAATAATTGTTT-TAGTTTATAC
322 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * * *
73516 ATGCTTATTCGAAATAAAATAACACT-CTTCTATTAACACTCAAAAAATTAATAAG-AAG-GAAG
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG-A-
*
73578 TTTAAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
63 TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * *
73642 ATCTCAAATCGTTAGGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTAT-A-TTCGTACAAGCTTA
125 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TCAGTTCATATAAGCTTA
* ** * * ** * *
73704 TTCGGCGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT
188 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * ** *
73765 CAATGTGTTTGCTGAATCAATTCAAATAGTTAAGATTATTAAAACAATTATTTATTTCAAATCAT
253 AAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * ** * * *
73830 TCTAACCTTTTGTTTAATAATAAAATAATTGTTT-TAGTTTATAC
318 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * * *
73874 ATGCTTATTCGAAATAAAATAACACT-CTTCTATTAACACTCAAAAAATTAATAAG-AAG-GAAG
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG-A-
*
73936 TTTAAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
63 TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* ** * * * * * *
74000 ATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATC
125 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
* * * * * **
74065 CAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAA
190 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * * * *
74130 ATCAGTTTATTGAATCA-ATCAAATAATTATCACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTA
255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
74194 AGATCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATAC
320 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * *
74236 AAGCCTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** ** * *
74300 TAAAAAATAAAAATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTTGTATATT
65 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATT
* * * ** * * **
74364 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTTTCATAAAATTATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTG
128 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTCA
* * * *
74428 GAATACAATAATACTAATATAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
192 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * *
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256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** *
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319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
** * * * * * *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * *
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66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
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* * * * * *
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193 A-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAA
* * ** * * ** ** * *
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255 ATCTGTT-TACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* *** * *
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* * * *
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1 AAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
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*** * ** * *
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* * * * ** * *
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189 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * *
75205 AAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTTCAAATCA
253 AAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCA
* * * *
75270 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAC
317 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
*** * * * * * * * *
75315 AAGCTTATTTGTATTGAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
75380 TACAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTC
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** ** * * * * *
75445 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAA
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAA
* * * *
75510 TAAAATAATTA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCT
195 TAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * *
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259 GTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA
* * *
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323 CCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * *
75677 AAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
75742 -AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTT
66 AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * *
75806 AAATCATTATGACCTTTTGCATTATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACATAA--TTATTTAG
130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCAT--ATAAGCTTATTCAG
* * * * ** * * **
75869 AATAAAATAATGCTGATTCATTAAGATTTTGACAATTAATAAG--AG-CA-TTAAAAACCAAATC
193 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
75930 TGTTTACTGAACTAGTTGAAATAGTTATGACTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCATTATGA
258 TGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * * *
75995 TC-TTTATTTTGTCACAGAACAATTGTTTCTTTTGATAT
323 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
** * * * *
76033 AAGCTTATTCGGATTAAGATAATACTAA--T-TTAATA--ATAAAAATT-A-AA-T--GAGTTTT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * *
76088 ACCAAACCAGTTCAAAT-AG-TTA--AAAC-TTTTAGAACAATTAT--CTATTT--A-AA--ATC
66 A--AAA--A-AT-AAATCTGTTTACTAAACAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * **** * * ** * * * * *
76141 -A-TTCTAA-CCTTTTG---TTTAG--TCAAAAAACAATTATTTCAGTTCA-TACATGCTTA-TT
124 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT--TTTCAGTTCAT-ATAAGCT
* * * * * * * * * ***
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186 T--ATTCAGAA-TAAAATAATACTAATT--TATT-AATATTTCAA-AAATTAATAAGTA-AGAGA
** * * * ** * *
76253 -AAAAA--ATAAATATGTTTATCAAAAAAGTTCAAATAGATAT-AGCCATCTT-AACAATTATCT
243 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT-TTGAACAATTATCT
* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * **
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255 ATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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126 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTTCAGTTCATATAAGCTTAT
* * * *
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189 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * **
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* * * * *
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319 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
*** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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** * * * *
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* ** * * * * *
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**** * * * * * ** *
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1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT
* ** * * * ** ** *
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* * * * * *
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* * * *
78012 A-ATTAAAATAATGCTAATTTAATAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
191 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * * ** *
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256 TCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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130 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTCAGTTCATATAAGCTT--ATTCA
*
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Statistics
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TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
Found at i:49978 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 49027--85931 Score: 10012
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49017 CTGACCAATG
* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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** * * ** *
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* * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * * **
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* * ** * * * * ** *
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* * * *
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* * * * *
49696 CAAAAAAATAATGAGT-AAGAGTTTTAAAAAATGAAA-CTATTTTCCAAACAAGTT
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* * * * ** ** ** *
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65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *** *
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129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
*
49930 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
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* * * * * * * ** *
49995 AACCAATTGTTTTTGTTCATATAAGCATATTTGAAATAAAATAGTACTGGTTTATTAATATTCCA
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* * * *
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* * * ** *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
50175 AAAGCAATTATCTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTAT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T
* * * * **
50239 -GAAAATTAAT-AGATAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTT
128 CAAAAATTAATAAG-TA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
50291 TAATTAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCA-TTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
50355 AAAAAAATCTG-TTC-ATGCA-A-AA--TTATTTAGAATAAAATAACATTGATCTATTAATGTTT
65 AAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * * *
50414 TGAAAATTAAT--G-ATAGA-TATAAAAACTAAATCTATTTA-CAAAAATAGTC
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACA-AGTT
* * * * * * * *
50463 CAAATAGTTTTAACTATTTGGATAATTATCTATCTCAAATCGTTATG-GTTTTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
50527 AAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTCTTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* ** * * *
50592 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGC-AATTGCCAAACCAGTT
130 AAAATTAATAAGTAA-AGATTT--TAAAAATAAAT-CTGTTTACCGAACAAGTT
* ** * * * * * *
50645 CAAATAGTTAAGACTATTAAAACAACTATCTATTTTAAATCA-TTCTAACTTTTTATTTAGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
50709 AAAATAATTATTTC-AGTTGATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAACATTT
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * **
50773 TTAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTAAAACAAAAGAAATCTGTTTACTAAACAAGTT
128 CAAAAATTAAT-AAGTAA-AGATTT--TA-AAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * ** * *
50829 TAAATAGATT-TTACTATTTGAATAATTTTTTATTT-AAAGTCCTTATGACTTTTTATTTTGCCA
1 CAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
50892 TAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
50957 CAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAACTTAAGCTATTT-TCAAACTAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * **
51009 TAAATAGTTATTACTATTTGAACAAATAT-TAATCTCAAATAGTT-TGA-TATTTAG-TTTCCCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
51070 TAAAGCAATTCTTT-TTTATCATACAAGCTTATTTAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
64 TAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
51134 TTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAA-TT
127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * ** * *
51184 CAAATAGTTAAGACTATTAGATAC--TTATTTATTTCAAATCA-TTCCGACATTTTGTTTAGTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
51246 TATAATAATTGTTT-TAGATCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-T
64 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
51309 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTT
127 TC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
51365 CAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCCATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * **
51430 AAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATGCTACCTTATTAATATTTC
66 AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * **
51494 AAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAATTAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * *
51546 CAAA-CGATTATGGCCATTTGAACAACTACCTATTTTAAATTGTTATTACTTTCTGTTTTGTCAT
1 CAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
51610 ACAACAATTGTTTTTCA-ACTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAACT-CTAATTTTTTAATATT
65 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATT
* * * * *
51673 TCAAGAATTAATAAG---A-A-TTTAAAAAGTAAATCTATTTATCGAAACTATTT
127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCG-AACAAGTT
* * * * * * ** *
51723 CAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTTAACCTTTTGTACTATCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * *
51788 AAACAATTGTGTT-TGTTCATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
66 AAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * *
51851 TAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTGCCAAAC-CGATT
129 -AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG-TT
* * * * * * * * *
51904 CAAACAATTAAGACTATATGAACAATTATATATTTGC-AATTGTTACGACATTTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
51968 --AATAA-TGATTTCAACTCATACAAGCTTATTCGAATTAGAATAAAACTAATTTATTAATATTT
65 AAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
52030 CAAAAAATTTATAAG---AGA-TTTAGAAAATAATTCTATTTATCAAATC-AGTT
128 C-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTA-AAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
52080 CAAACAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTTTCAT-
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * **
52144 AAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTGG
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
52209 AAAATTAATCAGTAAGAGA-TTTAGAAAGA-AAATTTGTTTACCAAACCATTT
130 AAAATTAATAAGTAA-AGATTTTA-AAA-ATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
52260 CAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTAT-TGATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** * *
52324 GAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** * * * ** * *
52389 AAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCTGAACAAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
52441 CAAATAGTTAAGACTA--TAAACGATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACTCTTTGTTTTGTCGT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * *
52503 AAAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * ** *
52567 AAAAATTAATAAATAAGAGA-TTTAAAAA-AAATTTATTTTTCGAATC-AGTA
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * *
52617 CAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
52681 AAAACAATTATTT-TAGTTTATACATGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTAATAAAATTT
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
52745 AAAAAATTAATAAG-AAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * *
52796 CAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTA---C--CT--TT-TGA---TTTG---T-T-ATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * * ** * *
52845 AAATAATTATTTCAGTTAATACAAGCATAGACAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCC
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * **
52909 TAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAA-AAATTTGTTTATTGAATC-AGTT
130 AAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * ** *
52959 AAAATAATTTTGGCCATTTGAACGATTAT-TGATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** * * *
53023 AAAA-AATTATTT-TTTATCATACAAGTTTAATCGAAATAAAATAAT-TTGATTTATTATTATTT
65 AAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* *
53085 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
53138 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCAATCTCAAATCA-CTAAGA-TCTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * *** *
53201 AAAACAATTGTTTTTGA-TCATAGAAGCTTATT-GGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TT
65 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** *
53263 CTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAACATAAATGTGTTTGTCAAACCAA-TT
128 C-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* ** * * * * * * * *
53317 TAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTATTTAGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * * * * * *
53382 AAATATTTATTTC-ATATCTTATAGGCTTATTCAGAACAAAATAATCCAAACTTACT-A-ACTTC
66 AAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** *
53444 AAAAAATTAATAA-TCAAAAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTATTGAGCAAGTT
129 -AAAAATTAATAAGT--AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * *
53497 -AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTA-TTATGACCTTTTGTTTTGACAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * *
53560 AAAACAATTG-TT-TAGTTCATAAAAGCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTT
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
53623 CAAAATTTAATAAG--AAGAGTTTAAAAAAAAATTTGTTTACAGAATAAATT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * *
53673 CAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTCTCTATTTAAAAT-CTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
*
53736 AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCT
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * * *
53800 GAAAATTAATAAGTAAATGA-TTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTGAATC-AGCT
129 AAAAATTAATAAGTAAA-GATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * *
53852 CAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTACTTTTTGTTTGGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
53916 ATAACAATTGTTTTTGA-TCGTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTATTGTTT
65 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** * *
53980 CATAAATTAATAAGTAAAACATTCAAAAAATAAATCT-CTTAACGAAGCCAA-TT
128 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA--CAAGTT
* * * * * * * *
54033 TAAATAGTTATGACTATTT-AAGAAATTGTATACTTGAAATTGTTAT-AATCTTTTGTTTTGTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
54096 TAAAAAAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATTAA-ATT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT
* * * **
54160 TGC-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTTTCGAACCAA-TT
127 T-CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * *
54213 CAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGACATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** *
54278 AAACAACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTT
66 AAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT
* * * * *
54341 CAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACTAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
54390 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
54455 AAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTTATA-TTCT
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * *
54518 AAAAATTAAT-AGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
129 AAAAATTAATAAG-TA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
54570 TAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCA-TTATGACTTTTTGTTTTGCCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
54634 AAAACAATCT-ATTC-ATTCA-A-AA--TTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATTAATATTT
65 AAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
54693 TAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAACTAAATCTATTCACAGAAAACAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACA-AGTT
* * * *
54743 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGA-TCTTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
54806 AAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
** * * * **
54871 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAT-AA-GTGTTTGCCAAATTAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* ** * * * *
54921 CAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTAACCTTTT-TTTAGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
54984 AAAACAATT-TATTTTAGTTTATGCAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
65 AAAACAATTGT-TTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
55048 T-AAAAATTAATGAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAGTT
127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
55102 CAAATAGATT-TGACTATTTGAAACAATTGTTTATTTAAAACAATTCA-AAC-TTTTGTTTTGTC
1 CAAATAG-TTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATAGTT-ATGACTTTTTGTTTTGT-
* * * * * * **
55164 CAAAAAAAATAATTGTTTC-AGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAGTACTACTTTAGAAA
62 C--ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * *
55228 TATTTCAAAAATTAATAACCAAGAGA-TTTAAAACTAAATCTATTTATCAGATC-AGTT
123 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTA-CCGAACAAGTT
* * * * * *
55285 TAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGA-TCTTTGTTTTGTCAC
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * * ** *
55348 AAAACAATTGTTTCTGTCCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTT-
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
55412 TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAGTAAATGTGTTTGCCGAACTAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTT--TAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * **
55467 CAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACATTTTGTTTAATCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
55532 AAATAATT-TTTTTCAGTTCATACATGCTTATGTGAATTAAAATAATACTATTTTATTAACATTT
66 AAACAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
55596 -AGAAAATTAATAAGGAAGAAATTTAGAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATT
128 CA-AAAATTAATAAGTAA-AGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
55650 CAAATAGTTATGACTATTTGAACATTTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTGGTTTTATAATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* ** * * * * * *
55715 AAA-AATTGTTTCAATTTTTAAAAGTTTATAAAAATAAAACAATATTACTTTATTAATATTTCAA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * ** * * *
55779 AAATTGAGAAGTTGGAA-ATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATC-ATTT
131 AAATTAATAAG-T-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * * *
55829 TAAATAATTATGGCAATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-ATTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCAT
* * *
55893 AAAACAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
65 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
55957 CAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
56010 CAAATAGTTATGACTATTTGATCTATTATATATTTCGAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
56074 AAAA-AATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T
* * * * * * *
56138 -GAAAATTAATAATTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAATCAA-TT
128 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
56190 CAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TCTTTTGCTTTATCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
56254 AAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAAAAATATTAATTTATTAATATTTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
56319 AAAAATTAAT--G--AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
56366 CAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCATTTT-TTTTATCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
56429 TAAAATAGTTTTTTCTATTGATAC-AGTCTTATT-CAA-AAAGTAATGCTAATTAATTAATA-TT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *** *
56490 CTAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATGAGTCTATGGGCCTG-ACCAGTGT
128 C-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACC-GAACAAGT-T
* * * * * * *
56545 -AAATAGTTTTAACTGTTTGAATAATTATCTCTTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCAC
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
56608 AAAATAATTGTTTCTATTCCTACAAGCTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTTT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
56673 GAAAGTTAATAAG---AGA-TTTAAAAACTGAATCTGTTTATCGAATAAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
*** * * * *
56721 CAAATAGTTATGACTATTTGAGTGATTACCTATTTCAAATTGCTATAAAC-TTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT-GACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
56785 AAAATAAAAT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT
65 AAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** * * * * *
56848 CAGACAACAAATAAGTAAAAGA-TTTAAAGAACAACTCTATTTACCGAATAAATT
128 CA-AAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAA-AATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
56902 CAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAAA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** * * * * **
56967 AAACAATTGTTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTGGATTTAAATAATATTAATTTATTAATGTTTTG
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
57032 ATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTT
130 AAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
** * * **
57083 CAAATAGACATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATG--TATTTTGTTTCATCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * * *
57145 TAAAAAAATTGTATCCGTTAATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
57210 TAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
57263 CGAATAGTTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCGATATGGCATTTTGTTTTGTCATT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
57328 AAATAATTATTTCCATTCATATAAGCTTATTCCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * * *
57393 AAAAATTAATAAGTAAA-AATTAAAAAATAAATATATTTTA-TGAACACA-TT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACA-AGTT
* *
57443 CAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
57507 AACCAATTGTTTCTATTTATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * **
57572 AAAA-T--TAA-T-AAGATTTTAAAATAATAAATTTGTTTATCGAGTAAGTT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTT-AAA-AATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * *
57619 TAAATAGTTATTATGCCTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TCTTTTGTTTTGT
1 CAAATAG---TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGT
* * *
57683 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
62 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
57747 TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGA-TTTAAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTT
126 TTC-AAAAATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * *
57802 CAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTTTAAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * *
57866 AAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
57931 GAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAATCTAAATTTGTTTACCGAA-ATAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTT
* * * * * * * * * **
57979 TAAATAGTTATGACTATGTGAGCAATTATCTCTCTCAAATTGTTGTGA-TCTTTATTTCATCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* ** * * *
58043 AAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAAAACTAATTTAATAATA-TTCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * * *
58107 AAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACTAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * ** * * * * * *
58156 TAAATAGTTAGGACTATTAAAACAATTATCTACTTCAAATTGTTTTGACATGTTGTTTAGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
58221 AAACAATTATTT-TAATTCATACAAGCTTATCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCA
66 AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * **
58284 AAAAATTAATGAGCAAGAGA-TTTAAAAA-AATATATGTTTATTGAACAAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAA-ATCTGTTTACCGAACAAGTT
* *
58335 CAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCA-TTA-GACATTTTGTTTTGTC
1 CAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
58396 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATTT
63 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * *** *
58460 TTCAAAAATTAAAAAGCAAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCCTCATAAAATAA-TT
126 TTCAAAAATTAATAAGTAA---A-GA-T-TTT-AA-AAATA--AATCTGTTTACCGAACAAGTT
** * ** * * * * * ***
58523 -ATTTTTGATCATACAAGCATATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATT
1 CA-AATAG-T--TATGA-C-TATTT-G--AACAATTAT-CT-ATTTCA-AATAGTTATGACTTTT
* *** * * ** * * *
58586 AGTAAGAGAT-TTAAAA-AATGTATTTGCTGAACCAATTCAA--ATAGTTAAGACTATTAGAATA
54 TGT-TTTG-TCATAAAACAAT-TGTTT-CT-ATTC-ATACAAGCTTA-TTAA-A--A-TAAAATA
** *** ** * * ***
58647 ATTTTTAA-TT-TTAAGTCA-TTCTAACCTTTTGTTGAGTCATAGAATAATTGTTTCAGTTCATA
108 A-TACTAATTTATTAA-T-ATTTC-AA-AAATTAATAAG---TA-AA-GA-T-TTT-A-AAAATA
* * * **
58709 GAAGCTTATTTA--GAAAAAAAT
159 -AATC-TGTTTACCGAACAAGTT
* * * * ** * **** ***
58730 -AATACTAATTAATTAAC-ATTTGAAAAATTA-ATA-AAC-AAGAGATTA-GAAAAAATAAATTT
1 CAA-A-TAGTT-A-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TTATG-ACTTTTTGTTTT
* * * * * * ** *
58789 GTTTACTGAACCAATTTGAATAGTAATGACTATTTAAACAA--TTATCAATTTAAAATCATTA-T
60 G-TCA-TAAAACAA-TTG--T--T--T--CTATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAAT-AATACT
* * * ** * * *
58851 AACCTT-TT-GTTTTGTCATAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAAT
113 AA-TTTATTAATATT-TC--AAA-AATT-AATAAG----T-AAAGATT-T-T-AAA-AATA-AAT
* ** * *
58914 ACTATTGTA-TTAA-TATTT
162 -CTGTT-TACCGAACAAGTT
* * * * * * * *****
58932 CAAA-AGTTAATAAGA-GATTTAAAAAATAATC-AGTTCAAATAATTATGTCTATTTAAACAACT
1 CAAATAGTT-AT--GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTT--TGTTTT
* *** *** *** * *
58994 ATC-TATTTCAAATTGTTAT-TACTT--T-TTTG-TT-TTCTCATAAAACAATTGCT--TTTCAA
60 GTCATAAAAC-AATTGTT-TCTA-TTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAA-TACTAATTT--A
* ** ** * * *
59050 TATAGAAGCCTATTTCAAATAA--AATAA-TACTA-A-TTTACTAATATTTCAAGAATTA-CTAA
119 T-T--AA---TATTTCAAA-AATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATC-TG-TTTACCGAA
*
59109 -GAGTTT
174 CAAG-TT
* * * *** * * * * *
59115 TAAA-A--AAT-A-AATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTG-----TT-TT
* * * *** ** * *
59175 -T-ATTTCAAATTGTTACAACCTTTTGTTCTA-TCATA-AAAC-AATT-GTTTCTATTCATA-TA
60 GTCA--T-AAA-----ACAA--TTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * * * *** *
59233 AGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTAGT-AATATTCTGAAAATTAA--TAACTA-AGAA
114 A-TTTATTAATATTTCAAA-AAT--TAA-TAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA
*
59293 -ATGTT
174 CAAGTT
* * * * * * ** * * * *
59298 -AAA-A-ATA-AATCCATTTGCTA-AACTAGCTCAAATAATAAGACTACATGAACAATTATTAT-
1 CAAATAGTTATGA-CTATTTG-AACAATTATCT-ATTTCA-AATAGT-TATG-AC--TT-TT-TG
* * * ** * * * * ** ****
59357 TTCAAATTGTTAT-GACCTTTTATTT-T-CTCATA-AAAC-AATT-ATCTTTGTTAATA-TAAGT
56 TT----TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAA-T
* * * * * * *
59415 TTGTTCGAA-A--T-AAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAGAAAATTAAT-TAG--TA-AG-
116 TTATT--AATATTTCAAAA-ATTAATAA-GTA--AAGATTTTA-AAAATAAATCT-GTTTACCGA
*
59471 A-GA-TT
173 ACAAGTT
* * * * * * * * ** *
59476 TAAAAAG-TA--AATATGTT-TACTAA--A-CCATTTCAAATAGTTTTGAATATTTGAATAACTA
1 CAAATAGTTATGACTAT-TTGAAC-AATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTG--T-TTTG
* * * ** ** * *
59534 TCTATTTCAAATC-ATTATAACTTCTTATTTTGTCAT-CAAGC-AATT--GGTCCTATTCATACT
61 TC-A--T-AAAACAATTGT---TTC-TA---T-TCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACT
* * * * * * * * * * *
59594 ATTTTATT-CTGA-AT-AAAATAATACTAATTTAATAGTATTTTGAAACTTAA-----TAACCAA
113 AATTTATTAAT-ATTTCAAAA-ATTAATAA-GTAA-AG-ATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGA
* *
59651 AAAAATT
173 ACAAGTT
** * * * * * * * * * ** *
59658 -AAA-AAATA-AATCTAATTG-CCGA--A-CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTAT
1 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTG---TTTTGT
*** * **** * * * ** * * * *
59716 C-TATTCCAAATTGTTATGACCATT--TTTTTG-TTGTTGTAAA-ACAATTGT-TTTATTCATAC
62 CATAAAAC-AATTGTT-T--CTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTAT-T
* * * **
59775 AAGCTTTTTCTAATTAAAATAATGCTAATTTAATA-ATATTTAAAAAATTAATAAATAAGAGATT
121 AA--TATTTC-AA--AAATTAA---TAA-GTAA-AGAT-TTT---AAA--AATAAAT--CTG-TT
*
59839 TA---AA-AAATT
167 TACCGAACAAGTT
* ** * * * * * ** * * * **
59848 -AATTTTTTTGTTGAATCAGTTCAA-ATGGTTA-AGATTATTAGAATAATTAT--CTATTTGAAA
1 CAA-ATAGTT-ATGACT-ATTTGAACA--ATTATCTATT-TCA-AATAGTTATGACTTTTTG-TT
* ** * ** * * ** * ** * * * ** *
59908 TTGT-TTTGACCTTTTGTTT-T-GTCATAAAATAATTGTTTCAATGCATACAAGCCT-ATTTA-G
58 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *** *** *
59968 AATAAATT--AATATTAATTTA-TTAACATTTAGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAA
121 AAT-ATTTCAAAAATTAA-TAAGTAAAGATTT-TAAA--AAT-A-AATCTG-TTT-ACCGAA-CA
*
60030 ATCTAT
176 A-GT-T
* * * * * * *
60036 CAAATGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTAAATAAATGTCTATTTAAAATCA-TTATAACC
1 CAAAT-----AGTT---AT-G-----ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACT
* * * * **
60100 TTTTGGTTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTA
51 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTA
* * * * * **
60164 ATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGT-GAGAGCTTTAAAAATAAATCTGTTTACTGAATTA
114 ATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAA
60227 GTT
177 GTT
* * * * ** * *
60230 AAAATAATTAT-AGTTGTTTGAATGATTATCTATTTCAAATCA-TTGTGACCTTTTGTTTTGTCA
1 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * *
60293 TAAAACAAATGTTTTTGA-TCAAACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
60357 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC-CGTT
127 TCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * *
60410 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAGTCA-TTAAGA-TATTTGTTTTGTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * **** * *
60472 GAAAATAATTTTTTCTGA-TCATAAAAGCTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATACT
64 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
60536 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAATAATAAATGTGTTTACCGAGCCAA-TA
127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAA-AATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTT
* * * ** * * * **
60590 CAAATAGCTA-AAGTTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGGTTACTC
1 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * *
60652 ATAAAATACTTGTTTC-ATATCTTATAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTATATTTATTAACA
63 ATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA
* * * **
60715 -TGCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTT
125 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-GATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
60772 CAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGACAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** *
60836 AAAACAATTGTCTCAATTCATAAAAGCTTACCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAAT-TATT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TT
* * * *
60900 CAAAAATTAATAAGCAATAG--TTT-CAAATAAATTTGTTTA-CGAAACAAATT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCG-AACAAGTT
* * * * * * * * *
60950 CAAATTGTTATAACTATTTAAACAGTTGTCTATTTAAAATCA-TTGTGACCTTTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* ** ** *
61014 AAAACAATTTTTTGAATT-ATATGAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
61077 AAAAAATTAATAAGTAAGTGA-TTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCGAATC-TGTA
129 -AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
61130 CAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTAT-TAATTTCAAATCA-TTATTACCTTTTG-TTCGATC
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTG-TC
* * * * * * * * *
61192 ATATAACAATTGTTTTTGA-TCATATATGTTTATTCGAAATAAAATAAAAGTAATTTATTAATCT
63 ATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
61256 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAA-TT
126 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTT
* * ** * * * * *
61311 CAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCA-TTCTGACATTTTATTTAGTC
1 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
61373 ATAAAATATTTGTTTC-ATATCCTACAAGCTTATTCAAAACAAAATAAT-CTAAATTTATTTACA
63 ATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* *
61436 -TTCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTG-TTACCGAACAAGTT
125 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-GATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * * * *
61492 CAAATAATTATGGCCATTTCAAAAATTATCAATTTCAAATCGTCATTACCTTTTGTTTGGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
61557 TAACAATTGTTT-TTTATCATATATGTTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTCTC
66 AAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
61621 AAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAA-TT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTT
* * ** * * * * *
61673 CAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCA-TTCTGACCTTTAGTTTAGTC
1 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
61735 ATACAATATTTGCTTC-ATATCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACA
63 ATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * *
61798 -TTCAAAAAATTAATAAGAAAATGATTTGGAAAAATATATCTG-TTACCGAACAAGTT
125 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-GATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
61854 CAAATAGTGATGACTATTTGAA-AATTTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGACA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
61917 TAAAACAGTTATTTC-AGTTCATAAAAACTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAAT
64 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
61981 TCAAAAATTAATAAGCAATAG--TTT-AAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATT
127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
62032 CAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTAAAATCA-TTGTGACCTTTTATTTTGTTAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * *
62096 AAAACAATTATCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
62161 AAAAATTAATAAGT---GA-TTTAAAAAGTGAATCAGTTTATCAAATC-AGTT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * * * * *
62209 TAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTAC-CTTTGTTTGGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
62273 TAACAATTGTTTATGA-TCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTC
66 AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
62337 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAA-TT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTT
* * * * * * *
62389 CAAATAGATA-AAGCTA-TTAAGATAATTAT-TAATTTCAAATCA-TTCTGACCTTTTGTTTAGT
1 CAAATAGTTATGA-CTATTTGA-ACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
62450 CATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-CTAAATTTCTTTAC
62 CATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * *
62513 A-TTCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAGAAATAAATTTGTTTACCGAACGAGTT
124 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-GATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
62571 CACATAGTGATGACTATTTGAAAAATTATTTA-TTCAAAATCA-TTATGACCTTTT-TTTTGACA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
62633 TAAAACAATTGATT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATGATACTAATTTCTTAATAAT
64 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
62697 TCAAAAATTAATAAG-CAAGAGTTT-AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATT
127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * *
62748 CAAATTGTTATGACTATTTAAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTGTGA-TCTCTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
** *
62812 AAAACAATTGTTTGAATTCATTA-AAGCATAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCA-TACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** * * * *
62876 C-AAAATTAATAGGTGAGTGATTTAAAAAATGAATCT-ATTACCAAATC-AGTT
128 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * * * *
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* * * *
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129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA--CAAGTT
* ** ** * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * *
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* * * * *
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** * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
63352 TAAAATAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAAT
64 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** * *
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127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * *
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* * * * ** *
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130 AAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
** * * * * * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
** * * * * * * **
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* * *
63773 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGTCAA-TT
127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTT
* * ** * * * *
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1 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
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** * * * *
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124 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-GATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
64073 AAAAAAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATT
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * *
64137 CAAAAATTAATAAG-AATGAGTTT-AAAATAAATTTGTTTACCAAGAA-AA-TT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACC--GAACAAGTT
* * * * * * * * **
64187 CAAATTGTTATGGCTATTTAAACAACTGTCTA-TTAAAATCA-TTGTGACCTTTCATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * *
64250 AAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATATTAATTTACTAATATTCC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
64315 AAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAGTGAATCTGCTTACTGAATCAA-TT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * * * *
64363 CAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
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66 AAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * ** *
64490 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * *
64543 TAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-GCATACTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTCTATCG
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * ** *
64606 TAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATATTACTAATATAAAAATATTC
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
64671 CAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTT
128 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
** * *
64724 CAAATAGTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTC--A-A---ATCA-TTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
64782 AAGCAATTTTTTCAATTCGTACTAGCTTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATTTTT
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC-TTATT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT
* * * * * *
64846 CAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGCCTAACCAA-TT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * **
64899 CAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-CTATGACCATTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
** * * * * * * *
64963 AAAACAAACGTTTTTATTTATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAATATTTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ***
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129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * ** * * * * * * * *
65076 CAAAAAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCTTCTATTACA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
** * * * * * *
65141 AAACAATAATTTC-AGTTCATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATCTC
66 AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * ** * *
65205 AAAAATTAATATGTAAAAATTTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGAT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * ** *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
65322 AAAAAATTGTTT-TAGATCACATC-AGCTTATTTGAAAGAAAATAATGCTAAGTTATTAATA-TT
66 AAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * **
65384 CTAAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTT
128 C-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
65437 TAAATAATTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTAT-AATCTTTTGTTTTGTCAC
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* ** * **
65501 CAAATTATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAC-AATTTATTAATA-TT-
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
65563 AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTATACATGTT
129 AA-A-AATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTT
** * * * * *
65617 CAAATTTTTATGACTAATTGATCTATTATTTATTTCAATTTA-TTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * * *
65681 AAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTCAAAA-AATATTAAATATATAAATATT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAAT-AAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * ***
65745 TCAAAAAATAGTAATTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATTAAACAAGTT
127 TCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
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1 CAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * *
65863 TAAAACAATTGTTTC-AGTAT-ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTACTA-
64 TAAAACAATTGTTTCTA-T-TCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * * * * * *
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126 TTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCA
* * ** ** **
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64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * *
66107 ACAAAAATTAATAAGTAAA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATGTT
127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
66224 AAATCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTC
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* * ** *
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129 AAAAATTAATAAGT-AAAGATTT---TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * **
66344 TAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATTTCTTTCAAATCCTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* **
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65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
** * * * *
66472 TAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTCACCGAATAAGTT
129 -AAAAATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * **
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66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * *
66655 AAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACCAGTT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
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66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * *
66830 AAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTT
130 AAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
** * * * *
66881 CAAATAGTTAAAACTA-TT--A-GA--A--TA-TTCAAATCGTTTTGAGC-TTTTGTTTAGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
66936 AAAATAATTTTTTC-AGTTTATACATGCTTATTTGAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAACATT
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * *
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127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGA-TTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* ** * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
67117 TAAAACGATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATT
64 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
67181 TCAAAAATTGAA-AAGATAAAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATC-AA-ATCGCTT
127 TCAAAAATT-AATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACA-AG-TT
* ** * * * *
67235 CAAATAATTATGGTTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTATTTTATCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCAT
* *
67299 AAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAG-TCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCT-TATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
67362 TCAACAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAACAAATAAATCTATTCACCG----AG--
127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * *
67410 C---CAGTT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATAACCTTTTGTTTTGTTAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
67468 AAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTAATAATATTC
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * **
67532 CAAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAAGCAA-TT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
67585 CAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTATCAAA-AGTTATGGCCTTTTGTTTGGTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TT-TCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
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64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
67713 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAG-T
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * ** * * * *
67765 CAAATA--TATAACTATTTAAACAATTGTAAACTTT-AAATCA-TTATAACTTTTTGTTCTATCT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
67826 TAAAAGAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
67890 CTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTT
128 C-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTT-GTCAT
* * * * * * *
68008 AAAATAATTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATA
65 AAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * * * * *
68072 TTTTAGAAATTAACAAG---AGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGA-CTAACTAGTT
125 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-ACCGAACAAGTT
* * * *
68124 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTTTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * ** * * * *
68189 AAACAAATGTTTTTCTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATATTAATCTGTTAATATTTCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * * *
68254 AAAATTAATACG---AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACGAGTT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * *
68301 CAAATAATTATGGCTTGTTGTTTTGTTATGAAACAATTGTTTTTGTTCATACA-AGCT-T-A--T
1 CAAATAGTTATGAC---------TATT-TG-AACAATTATCTAT-TTCA-A-ATAGTTATGACTT
* * *** * * * * * *
68361 TTAG-ATTAAAATAATACTAATT-TATTAATAGTTCA-ACAA-ATAATAAGTAAATAATTTTAAA
52 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGT-TT-CTA-TTCATACAAGCTTATTA--AAATAA----AAT
* * ** * * ** * ** **
68422 AATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATA-ATTATCTATTTCAAA
107 AAT-ACTA-ATTTATT-AA-TATTTCAAA-A---ATTAATAAGT-AA-AGATTTTAAAAAT-AAA
**** **
68486 T-TGTTATGACCTTTTATTTTGT
161 TCTGTT-T-ACCGAACA-AGT-T
* * * ** * * * * * * ****
68508 CATATAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTATGTTATTAATATTTCAAA-AATTAGTAAGTAAGA
1 CAAAT-AG-TTA-T--GACTATTTGA-AC-A-ATTA-T-CTATTTCAAATAGTTA-TGACTTTTT
* * * * * * * *
68572 G-ATT-T-AAAAAATGAATATG-TT-TGTTGA-GCAA-C-T-TT-AAAT--AATTATGAGT-ATT
55 GTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAAT-ACTAATT
* ** ** ** * * * * * **
68624 TCAATAAT-TTTCTTTTTGAAATTGCTATAGCCT-TTGTTTTGTCATAAAATTATTTTTTTTGTT
117 T-ATTAATATTTC----AAAAATTAATA-AG--TAAAGATTT-T-A-AAAATAAATCTGTTT-AC
68687 C-ATACAAGTT
170 CGA-ACAAGTT
* * ** * ** * * * ** ***
68697 ----TA-TTTTGAATAAAAT-AATAAAAATTTA-TT--AATA-TAAAGACACTTAATAAG-TAAA
1 CAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG--ACTT--TTTGTTTTG
* * ** * * **
68751 ACATTTAAAATAAATT-TGTT-TA-TCGA-ACAAG-TTCA--AATCTTATGACTGTTTGAGC-AA
61 TCA--TAAAA-CAATTGT-TTCTATTC-ATACAAGCTT-ATTAA-AATA-AAAT-AAT-A-CTAA
* * * * **** * *
68808 -TTATT--TATTTC-AAATTCTTATGACTTTCTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATA
115 TTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAAGA-TTT-T-A-AAAATAA----ATCTGTT--TA
* * *
68869 CAAGCTTATTCAAATT
169 C---C-GA-ACAAGTT
* * * * ** * * * * * * *
68885 ACAATAATATTAATTTATTAATATTTCG-ACAATTA-ATAAGTAAAAGATTTAAGCAATAAATAT
1 -C---AA-A-T-AGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG-ACT--TTTT
* * * * * ** **
68948 GTTTT-TC---GAACAA--G-TTCAAATAGTCCTGACAA--TT-TGAATAATTATCT-ATTTTAA
55 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC---TATTCAT-ACAAGCTTATTAA-AATAAAATAATACTAA
* * * ***** * *** * *
69002 ATCATT-GTGACCTTT-TGTTTTGTAATAA-AACAATTG-TTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGA
115 TTTATTAAT-A--TTTCAAAAAT-TAATAAGTA-AA--GATTTTA-AAAATA-AATC-TGTTT-A
*** * * *
69063 AATAAAATAATA
169 CCGAACA-AGTT
* * * ** * ** * * * * ** * * **
69075 CCAAT--TTATTAATATTCCAAAAAAAAT-GA-GT-AAGAGAATTAAAAAATGAATTTG-TTTAC
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATAGTT-ATGACT--TTTTGTTTTGT
* * * ** * *
69134 CA-AACATGTTTA-AATAGTTATGACTATCTGAATA-ATTATC-TATTTCAA-AACATTATGAC-
62 CATAA-A-----ACAATTGTT-T--CTAT-T-CATACA--AGCTTATTAAAATAAAATAAT-ACT
* * * * * * ** ** *
69193 ATTTTGTT-TTGTCATAAAATAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAAATAAATT
113 AATTTATTAATAT-TTCAAA-AATT-AATAAG-T-A---AAG---ATTT----TAAAAATAAATC
* **
69257 TATTAATATTTGAGA-AA--T
163 TGTT--TA-CCGA-ACAAGTT
** * * * * ** * * * *
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1 CAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAAT---TATCTATTTCAAATA-GTTATGACT--TTTTG--T
* ** * * ** ** * **** **** *
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* * * * ** ** ** **
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118 ATTAATATTT-CAAAAA-TTA-AT--AAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCT--GTTTACCGAACA
*
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* ** * * * * ** * * **
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1 CAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTA-TT-TCAA-ATAGTTATGACT--TTTTG--T
* ** * * * * * ** * * ** *
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57 -TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAGC--TTA---T-T-A-AAATAAAATAATAC
* * * * * *
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* * * **
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163 TGTT-TACCGA---ACAAGTT
* * *
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1 CAAA-TAG-TTAT--GACTA-TT----T-G--A-A-C------A---ATTATCTATTTCAAATAG
* * ** **
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* * ** * * * *
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107 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACC
*
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* * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * ** * * * * * *
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66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * * *
69986 AAAAATTAATAA--CAA-A-TTTAACAAATAAATGTGTTTGCCAAAGTAA-TT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAA-AAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
70034 CAAAT-GATTATGACCATTAGAGCAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTAGTCAT
1 CAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * *
70098 AAAATAAGTT-TTTC-AGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-T
65 AAAACAA-TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * ** * **
70160 TCAAAAATTAATAAACAATAAATTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTT
127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * ** * *
70214 CAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTTATCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
70278 AAAACAATTATTT-TAGTTCATA-AATGCTTATTCGAAGTAAAATAATATTACTTTATCAATATT
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-GCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * * ***
70341 TCAAAAATTGATAAATTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCAAATTGGTT
127 TCAAAAATTAAT-AAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * ** *
70395 CAAATAATTTTGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTACAAAC-TTTTGTTTTATCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA-TGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * *
70458 TAAAATAATT-TTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTGTTAATATT
64 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
70521 TTAAAAAATAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATATTTACC--A-AA---
127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * *
70565 C---CAG-T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAGTTAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTT-TTGTCAT
* * * * * ** * *
70624 AAAATAATTG-TTGTAGTTTATATAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * **
70688 CAAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTGTCGAAGC-AGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * *
70741 CAAACAATTAAGACTATATGAACAACTACCTATTTCAAATCA-TTAAGA-TCTTTTGTTTTGTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCA
* *
70804 TAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAAT
64 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TT-AAA-ATAA-AATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * *
70868 ATTTTGAAAGTTAATAAGTAAGTGA-TTTAAAAAGTAAACCTATCTATCGAATCAAG-T
124 ATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * *** * * * *
70925 CAAAAAATGATGGCCATGCCAATAATTATCTATTTGAAATCA-TTATTACCTTTTG-TTTGCTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTG-TCA
* * * * * * *
70988 TATAACAATTATATT-TGA-ACATTCAAGCTTACTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCT
64 TAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
71051 TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACCTATTTTACCAAACTA-TCT
126 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGT-T
* ** * ** * * *
71107 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACCTTTTGTATTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
71172 AAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* ** * * *
71236 AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAATAAAT-TGTTTGCTGAACTAGTT
130 AAAATTAATAAGTAA-AG-ATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
71287 CAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * * ** *
71352 AAATAAGTTTTTTGAATTCCTACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTT
66 AAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT
* * * * * *
71416 CAAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAGGT
128 CAAAAATTAATAAGTAAA-GATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * *
71469 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * * * *
71533 AAAGCAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAGTACTACT-ATTGTATTAATATTT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTT
** * * * * * * *
71597 TGAATATTAAT-A--AAATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
71646 TAAATAGTTATGAC-ATTTGAGCAATCATTTATTTCAAATCG-T-TGA----TT-TTTTGTTATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * ** * * *
71703 AAACAATT-TTTTTGTTTATGCAAGGTTATTTGGATTAAAACAATACTAATTTCTTAATATTTCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * *
71767 ACAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGAT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* ** * * * * *
71817 CAAATAATCCTGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** * *
71882 AAAAAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * **
71947 AAAACTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTAAACAAGTT
130 AAAATTAATAAGT-AA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * *
71998 TAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * *
72063 AAAGAATT-TTTCCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-
66 AAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * *
72125 AAGATAATTAATAAGTAAAAGAGTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTT
129 AA-A-AATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
72179 CAAATTGTTATGA-TA--AGTACAATTATTTATTTCAACTTG-TATGACTTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * *
72240 AAACAATTGTTTCTATCCATACAAGTTTATTCGGATTACAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * ***
72305 ACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAACCTGTTTATAAAACAAGTT
130 AAAATTAATAAGT-AAAGATTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * *
72357 CAAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TAATGACTTTTTCTTTTGTAAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * *
72421 AATATAATTGTTTC-AGTTTATATAAGTTTGCTTGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTC
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * *
72485 CAAAAATTAATGAGTAAAACAATTAAAAAAAAGAATATGTTTA-CTAAAATAGTT
128 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATA-AATCTGTTTACCGAACA-AGTT
* * * * * * * * *
72539 CAAATAGTTTTAAGTATCTAAATAGTTATCTATTTCAAA-ACATTATGACTTTTTGTTTTATCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
** *
72603 AAAACAATT-TGTTC-ATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATT
65 AAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * **
72665 CCAAAAATTAATAAGTAAAAATCTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAACACA-TT
127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTT
* *
72718 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** *
72782 AAACCCATTAGTTT-TGTTCATA-ATAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
65 AAAACAATT-GTTTCTATTCATACA-AGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ***
72845 CCAACAATTAATAAGTAAAAGA--TAAAAAATAAATCTATTTACCGAGTGAGTT
127 TCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * *
72897 CAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTA-TTCAAATTGTTA-CAATCTTTTGATTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* *
72960 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** * ** *
73024 TAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTT
129 -AAAAATTAATAA-GTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * * * *
73077 TAAACAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCTGTTTGAAATCA-TTATGACATTTTATTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * ** **
73141 AAAACAATTATTTTTATTCATGTAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * **
73206 AAAAATTAAT-A--ACAG-CTTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATC-AGTT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * *
73254 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTAGGA-TCTTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** * * * ** * *
73318 AAATAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTCGGAGT-AAATATTGCTAAACTAATAATATTTTA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * **
73382 AAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAATCAA-TT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * ** * * * * ** *
73429 CAAATAGTTAAGATTGTTAAAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTAATAAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
73493 AAAATAATTGTTT-TAGTTTATACATGCTTATTCGAAATAAAATAACACT-CTTCTATTAACA-C
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT
* * * * *
73555 TCAAAAAATTAATAAG-AAGGAAGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTT
127 TC-AAAAATTAATAAGTAAAG-A-TTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
73611 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTAGGA-TCTTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * **** * * ** * *
73675 AAACAATTATTTATATTCGTACAAGCTTATTCGGCGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
73740 AAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATCAATGTGTTTGCTGAATCAA-TT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * ** * * * * ** *
73787 CAAATAGTTAAGATTATTAAAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTAATAAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
73851 AAAATAATTGTTT-TAGTTTATACATGCTTATTCGAAATAAAATAACACT-CTTCTATTAACA-C
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT
* * * * *
73913 TCAAAAAATTAATAAG-AAGGAAGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTT
127 TC-AAAAATTAATAAGTAAAG-A-TTT-TAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
73969 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
74034 AAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * ** * * **
74099 AAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAA--T
130 AAAATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * ** * *
74149 CAAATAATTATCACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTAAGA-TCTTTTCTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* * * *
74213 AAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
65 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** *
74277 CAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAAATGTTTACCGAACTAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
74330 CAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTTGTATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTTTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
** * * * ** * * *
74394 AAAATTATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAATACAATAATACTAATATAATAATATTAT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T
* * * * *
74459 -AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATCGAACCAA-TT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * ** * *
74511 GAAATAGTTAAGGA-TGTATGAA-ATATTATCTATTTAAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCT
1 CAAATAGTT-ATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * ** * ** * * *
74574 TAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAATTTGTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * *
74639 TGAAAATTAATAAG---AGA-TTCAAAAAGTAAATTTATTTACCAAACCAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * ** *
74688 CAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATAACCATTTGTTTTGTTAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * * *
74752 AAAATAATTATTTCTATTGATA-TAGTCTTATTAGAGATAGAGTAATGCTAATCTATTAATA-TC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * ** * *
74815 CTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTAAAAAATGAATTTGTTAAATTGACCAA-TA
128 C-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTT-TACCGAACAAGTT
** ** ** * * ***
74869 CAAATAGTTAAAACCGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTGGA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * *
74934 AAACAATTGTTTCTGTTCGTACAAG-TTGACTCGAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTC
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-A-TTAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTT
* * *
74997 CAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAACTAAACCTATTTATC-AATCAAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * *
75046 CAAATAGTTACT-ACTCTTTGAACATTTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
** * * *
75110 AAATTAATT-TTTGCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT
65 AAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** * *
75174 -AGACAACTAATTGGTAAA-ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTT
128 CA-AAAATTAATAAGTAAAGAT-TTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * *
75227 CAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTTCAAATCA-TTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
75291 TAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGTATTGAAATAATATTAATTTATTAATATTT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * * *
75356 TGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTACAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
128 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * **
75409 CTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
75474 AAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTA-TAATTTATTAATATTCC
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC
* * ** * *
75538 AAAAATTAATGAGTAAGAGA-TTTAAAATATGAATCTGTTTACTAAACGAGCT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
75590 CAAATAGTTATGACTGTTTGAGCAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TCTTTATTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-
* *
75654 AAAACAATTGCTTCTATTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
75718 TAAAAATTAATAGGTAGGAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
129 -AAAAATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * ** *
75770 CAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATCA-TTATGACCTTTTGCATTATCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * *
75834 AAAATAATTATTTCTGTTCATACATA-ATTATTTAGAATAAAATAATGCTGATTCATTAAGATTT
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * *
75898 TGACAATTAATAAG---AGCA--TTAAAAACCAAATCTGTTTACTGAACTAGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAAAG-ATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
75947 GAAATAGTTATGACTTTTTGAATAATTATATATCTCAAATCA-TTATGA-TCTTTATTTTGTCAC
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * ** * * *
76010 AGAACAATTGTTTCTTTTGATATAAGCTTATTCGGATTAAGATAATACTAA--T-TTAATA-AT-
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * *
76070 AAAAATTAAATGAGTTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACT-TTTA--GAACAA-TT
129 AAAAATT-AATAAG---T---AAA-GATTTTAAA-A-ATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
** * * * * * * * *** * **
76127 -ATCTATTTA-AAATCATTCT-AAC-CTTTTGT-TTAGTCAAAAAACAATTA-TTTCAG---T-T
1 CAAATAGTTATGACT-ATT-TGAACAATTATCTATT--TCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGT
** * * *** * * **
76182 CATACATGCTTATTTAGAATAAAATT-ATACTAA-TTTATTGAAATTCAAAA-AATA--AATAAA
62 CATA-AAAC--AATT-G-TTTCTATTCATAC-AAGCTTATT-AAAAT-AAAATAATACTAATTTA
** * * * * * *
76242 CAAGAGATTT-AAAAA--AATAAAT-ATG-TTTATCAAAAAAGTTCAAAT-AGATATAGCC-ATC
119 TTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTT-T--AAAAA--T-AAATCTG-TTTA-CCGAAC
76300 ---TT
175 AAGTT
* **** * **
76302 -AACA-A-TTAT--CTATTTTAA-ATCATTAT-TACCTTTTGTTTAGTCATATAAC-AATTGTTT
1 CAA-ATAGTTATGACTATTTGAACA--ATTATCTA--TTTCAAATAGT--TATGACTTTTTGTTT
* * * * * * * * *
76359 T-TTATCATACAAGTTG-TTCGA--AATA-AA----A-TAATACT-AATTGAT--TAATCTT-TC
59 TGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAA-AATAAAATAATACTAAT-TTATT
* * * * * *
76410 AAAAATT----AA-TAAGTAAG---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCCAA-TT
121 AATATTTCAAAAATTAA-TAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTT
* * * * *
76462 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATACTTCAAATCAATTATTTTAAAAAATAAACCTTT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TT----TCAAATA-GTT-----AT-GACTTTT
* * * * * * * * * * * *
76527 TATTCTGTCATAAAAAAATTATTTATGTTCATACCAGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTGATCT
54 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * **
76592 AATAGTA-TTCTGAAAATTAATAACTAAGAGA-TTTAAAAATAAAATTTGTTTGTCGAACCAA-T
118 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAAT-AAATCTGTTTACCGAA-CAAGT
76654 T
179 T
* * * * * ** *
76655 TAAATAGCTAAGACTATAT-AAGCAATTGTCTATTTCAAATCA-TTATGACCATTTCTTTTGTCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
76718 TAAAACAATTTTTTCAATTTATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATATATTTATTAATATT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATT
* * * * * *
76782 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACCAGTT
127 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
76836 CTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCA-TTATGACCTTTGGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * * * * *
76900 AAAACAAATGTTTTTATTCATATGAGTTTGTTTGAAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * *
76965 AAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACCAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
77013 CTAGTAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
77077 AAACAATTATTT-TAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATGAT-GT--TGTATTAATAATTC
66 AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * **
77138 AAAAGTTAATAAGTAATATACTTAAACAAATAAAT-TAGTTTACTAAATCAA-TT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAA-AAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * * *
77191 CAAATAATTATG-GTCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTCTCAT
1 CAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
77255 AAAACAATTGCTTT-TCAAT-ATAGAGGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTACTAATATT
65 AAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
77318 TCAAGAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTT
127 TCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * *
77368 CAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * * * *
77433 AAACAATTGTTTCTATTTATATAAGCTTATTTGGAATAAAGTATTACTAATTTAGTATTA-TTCT
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * * ** *
77497 AAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAAAAATAAATAC-ATTTGCTAAACTAGTT
129 AAAAATTAATAAG-TAA-AGATTTTAAAAATAAAT-CTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
77549 AAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * *
77613 AAAATAATTGGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTT
65 AAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** * *
77678 TAGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCATTT
128 CA-AAAATTAAT-AAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
77732 CAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCA-TTATAATTTTTTGTTTTGACAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * **** * * *
77796 CAAACAATTGGTCCTGTTCATACTCTTTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** * ** ** * * *
77861 AAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTGCTGAACCAGTT
129 AAAAATTAATAA-GTA-AAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* ** ** * * *
77914 CAAATAGTTAAGACTACATGAATGATTATCTATTCCAAACT-GTTATGACCTTTTTCTTTTATCA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
77978 TAAAATAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCTAATTAAAATAATGCTAATTTAATAATTTTT
64 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
78042 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAATC-AGTT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * * * * *
78095 TAAATGGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTTTGACATTTTGTTTAGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
78160 AAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAA--T-TTAACA-TTCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
* * *
78221 AAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTT
129 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
78273 CAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCCATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
78338 AAACATTTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATT-GATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTT
66 AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT--ATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * * ** * * ** * ***
78401 ACTAAAAAATAAATTAGTTTATTGAATTAGTTAATATAATTATAGCCATTTGAACGATTATCTTT
127 --TCAAAAATTAATAAG--TAAAG-ATT--TTAA-A-AA-TAAATCTGTTT-ACCGA--A-CAAG
78466 TT
178 TT
* * * * * ** * * * *
78468 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TGTTT--TTTA-TCAT-ACAATCTT-A
1 CAAATAGTTATGA-C---T-ATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC-TTTTTGT
** * * ** *
78527 TTTGAAATAAAATAATAT-TAATT-TATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAAATATTTAAAAA
57 TTTGTCATAAAACAAT-TGT--TTCTATTCATA---C-AAGCTT-AT---TAAAATA---AAATA
* * ** * * ** * **
78590 ATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTACT-AATCTCAAA
108 AT-ACTA-ATTTA-TTAA-TATTTCAAA-AATTA--A-TAAGT-AA-AGATT-TTAAAAAT-AAA
* * *
78653 T-TG-TTA-AGACCTATGTTTTGT
161 TCTGTTTACCGAAC-AAG---T-T
* * * ** * * * ** * * ** *
78674 CGTAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAA-ACTTATTTGGTT-AAA-AATAAT-ACTAATTTAATA
1 C---AAATAGTTATGACT-AT--TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT--TTTTGTT
* * * * ** * * * * * * **
78735 ATAT-TTCAAA-AATT-AAT-AAGT-A-A-GAGATT-TAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGTCAA
58 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAA-AT-AATA-C---T-AA
* * * *** * ** * *
78792 TTTA--AATAGTTAAAACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGT
115 TTTATTAATATTTCAAA-AATT--AATAAGTAAAGATTTTAAA----AATAA--ATCTGTTTA--
** *
78855 CATAAAATATTTGTTT
169 CCGAACA-A---G-TT
* * ** * * *** * * ** ***
78871 CATAT-TTTACAAGCTTATTCAGAATAA--AAGAATCT-AAAT--TTATGAACATTCAGAGAAT-
1 CAAATAGTTATGA-C-TATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG-ACTTTTTG-TTTTG
* * ** *** * *** * * * *
78929 T-A-AAAAGGAAATGATTTGAAAAAATA-AATCTGT-TT-ACCGAACA-AATTCAAATTGTGATG
61 TCATAAAA-CAATTG-TTTCTATTCATACAAGCT-TATTAAAATAAAATAATACTAATT-T-ATT
* * * * ** * ** ** * *
78988 ACTATTTGAACAATTATTTATTTAAA-ATCATT-ATGA-CCATTTGTTT--TG-AC-A--T
121 AATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAAGAT-TTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * ** * * * * ** * * * * ***
79040 AAAACA-TT-TGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATA-ATATTAATTTCTTACAAA
1 CAAATAGTTATG-ACTATTTGA-ACAA--TTAT-CTATTTCAAATAGTTATGACTTT-TT--GTT
* * ** ** * * *** * ** *
79102 AT-TAAT-AAACAAGAGTTTAAAAT-AAATTTGTTTACCCAAGAAATTCAAATAGTTATGACT-A
58 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA--TTA-AAA-T-AAA-A-TAAT-ACTAA
** ** *** * *
79163 TTTGAACAGTTGTCTATTT-AAAATCATT-ATGACCTTTTGCTTTGTTATAAAA-CAAT-TGTTT
115 TTT----A-TT-AATATTTCAAAA--ATTAAT-AAGTAAAG-ATT-TTA-AAAATAAATCTGTTT
* * *
79224 GAATTCATGCAAGCTTAGGT
168 --A--C-CG-AA-C-AAGTT
* * * * * * * *** *
79244 AAAATAAAATAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGTG-ATT-T
1 CAAAT--AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTT-ATGACTTTTTGTTTTGT
* * ** ** * **
79299 -A-AAAAGTGAATATGTTTACTGAATCA-A-AATAATTATGTCTATTTCAATAATTATCT-ATTT
62 CATAAAA--CAAT-TGTTT-CT-ATTCATACAA-GCTTAT-TAAAATAAAATAA-TA-CTAATTT
* * **** * ** * **** * *
79359 -TAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTAT-CATACATGTTTATTCA
118 ATTAAT-ATT-TCAAAAATTAATAAG---TA-AA-GATT-TTAAAAATAAAT-C-TGTTTA--CC
* * **
79422 AAATAAAAT
171 GAACAAGTT
* * * * * * * ** * * ** * *** *
79431 -AAGAGTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTA-ATAAGT-AAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATT
1 CAA-A-T-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATAGTT--ATGACTTTTTGT-TT
* * * * * * *
79493 T-ACA-AAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTG-TATATTTCAAAT--CATTAT
59 TGTCATAAA--A----CAATTGTT-T--CTA-TTCATACAA--GCT-TA-TTAAAATAAAATAAT
* * * * * ** * * *
79552 AACT--TTTGTT-CTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
110 -ACTAATTTATTAATAT-TTCAAA-AATTA-ATAAG----TA-AAGATT-TTAAAAAT-AAAT-C
** * *** * *
79614 TACTAATATAAAAATATT
163 TGTTTACCGAACAA-GTT
* * * * * * * *
79632 CCAAA-AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCA--A---AT
1 -CAAATAGTT-ATGACT-----ATTTGAACAAT-TATCT-ATT-TCAAA-TAGTT-ATGACTTTT
* ** * * * * * * * *
79691 AGTTAAGGCTATATGAACAA-T-TATCTATTTCAAATCATTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAT-
54 TGTTTTGTC-ATA-AAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CA----AG-CTTAT--TAAAATAAAATA
* * * * * * * * * *
79753 TTTC-ACTTCATGCTAACT-TATTCGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTA
108 ATACTAATTTAT--TAA-TAT-TTC---A-AAAAT-TAAT-AA-GTA--AAGATTTTAAAAATAA
* * *
79816 ATATG--TA-AG-A-GA-TT
160 ATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * * * ** *
79830 TAAAAAATAAT-TCTGTTT--AC-CTAATC-AGTTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATAGTTATGACTTTTTG---TTTTGT
*** * ** *** * * ** * *
79889 C-TATTTCAAATTGCTATGACCT-TTTGT-TTTG-TTA-TAAAA-CAAAT-GTTTTTATTCATAT
62 CATAAAAC-AATTG-T-T--TCTATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTAT-T
* * * *
79947 AAGTTTGTTCAGAGTAAAATAATGCCAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAA
121 AA-TAT-TTCA-A--AAATTAAT---AA-GTA--AAGATTT-------------T--A---A--A
* * * **
80012 AATAAATTTGTTTATCAAACTCGTT
155 AATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * * * * *
80037 TAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATTGTTA--ATTTTTTGTTCTATTACA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
** * *
80100 AAACAATAATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
80165 ACAATTAATAAGCAAA-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGAT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *** * *
80214 CAAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAACCTTTATGACCTTTT-TTTTGTTATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
80278 AAA-AATTATTT-TAGTTCACATC-AGCATATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TT
66 AAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
80339 CTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCAAACAAGTT
128 C-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* ** * * * * * * **
80393 TAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAATCGCTATAACTTTTTCTTTTGTCACC
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
** * * * *
80458 AAATGATTTTTTCTATTCATACAAGTTTGTTACAAATAAAATAATAC-AACTTATTAATA-TT-A
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * **
80520 AGACAATTAATAGGTAAAAGATCTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTT
130 A-A-AATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
** * * * * *
80573 CAAATCCTTATGACTAATTAAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC-TTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
80638 AAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTGTTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* *
80703 AACAAA-TAATAAGTAAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTT
129 AA-AAATTAATAAGTAAAGAT-TTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * * *
80755 CAAATAGTTTTGACAATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCA-TTGTAACCTTTTGTTTTGTAAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
80819 AAAATAATTGTTT-GAGCTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATA-TT
65 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** * * * * *
80882 CTAAAATTAATGAGTAACAGAACTAAAAAATTAATTTGTTTATC-AA-ATATTT
128 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTT
* * *
80934 CCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACCTTTAGTTTTGTCA
1 -CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* *
80998 TAAAACAATTAG-TTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAGATTTATTAATAT
64 TAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATAT
* * * * *** *
81061 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTT
126 TTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * **
81115 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTACGACCTTTCAG-TTTGTCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCAT
* * *
81179 -AAACTAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAA-ATTT
65 AAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * * * * *
81242 TTAAAAATTAATAAATAAAATATTTTAAAATAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTT
127 TCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTT-AAA-AATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
81298 TAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGA-TCTTTTGTTTTATCAT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* * ** ** *
81362 AAAATAATTGTTTCTATTCGTACAATTTTATTTGAATGAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTC
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
** * * * *
81426 TAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTCAAAAATAAATCTATTCACCGAATAAGTT
129 -AAAAATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * * **
81479 CAAATAGTCATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-TATTTTATTTTGTTGT
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * *
81543 AAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTCATA-AAAATAATACTAATTTATTAATGTTTCA
65 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * *
81607 AAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAACTAAATCTGTTTATCAAACCAGTT
130 AAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * *
81654 CAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATCTCAAATCGCTATGA-TCTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
81718 AAATAATTGCTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATATTA-TGAAATTAATAATA-TTC
66 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* * ** *
81781 TAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAAAAATGTGTTTGTCAAATC-AGTT
129 -AAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTT
* * * * * * * **
81829 CAAATAGTTAAGATTATTAGAACAACTATCTATTTCAAATCA-TTCTGACCTTTTATTTAT-TTG
1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTT-TGTCA
* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
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* * * *
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** * * ** * *
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* * ** * * * * * *
59512 GTTTTGAA--TATTTGAATAACTATCT-ATTTCAAATCATTAT-AACTTCTTATTTTGTCATCAA
444 G--CTAAAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTCTGACCTT-TTGTTTAGTCATAAA
** * * * * * ** * * *
59573 GCAATTG-GTCCTATTCATACTATTTTATTCTG-AATAAAATAATACT-AATTTA-ATAGTATTT
505 ATATTTGTTTCATA-TCTTACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTA-CATTC
** * ** ** * * ** * * * *
59634 TGAAACTTAATAACCAAAAAAATT-AAAAAATAAATCTAATTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAA
566 AAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGAT
* * * * ** * *** *
59698 GACTATATGAACGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACCATTTTTTTGTTGTTGTAAAACAATTG
631 GACTATTTGAACAATTATTTATTCAAAATCATTATGACC-TTTTGTT-TTGACATAAAACAATTA
* * * * *
59763 TTTTA-TTCATACAAGCTTTTTCT
694 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCA
* * ** * * ** *
59786 AATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTAAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATTAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAAT
* ** * * * * * * * ** *
59851 TTTTTTGTTGAATC-AGTTCAAATGGTTAAGATTA-TTAGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTT
63 TTGTTT-ACGAA-CAAATTCAAATTGTTATGACTATTTA-AACAATTGTCTATTTAAAATCATTG
* * * * * * * * * *
59914 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATGCATACAAGCCTATTTAGAATAAATTAAT
125 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * * * * **
59979 ATTAATTTATTAACATT-TAGAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT-ATCAAATG
190 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT----AAGTGATTT-AAAAAGTGAATCTGCT-TACCG
* ** * * * * * * * * * *
60042 AA-CAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTAAATAAATGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGG
249 AATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGT
* * ** * * * * * ** * *
60106 TTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATT
313 TTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATT
* * * * * * *** * *
60171 AATACTTACTAAAA-TAATAAGTGAGAGCTTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAATTAGTTAAAA
378 AAT-CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAA
** * * * ** * * *
60234 TAATTATAGTTGTTTGAATGATTATCT-ATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
442 TAGCTAAAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* ** * ** * * *
60298 CAAATGTTT-TTGATCAAACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-A
506 TATTTGTTTCAT-ATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACA-TTCAA
* * * * * * *
60360 AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAAC-CGTTCAAATAGTTATGA
568 AAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGA
* * * * * * *
60423 CTATTTGAACAATTATTAATCTC-AAGTCATTAAGA--TATTTGTTTTGTCAGAAAATAATTTTT
633 CTATTTGAACAATTATTTAT-TCAAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGACATAAAACAATTATT
* * **
60485 TCTGATCATAAAAGCTTAT-TT
696 TCAGTTCATAAAAGCTTATCCA
*** ** * *
60506 GGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATACTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAATAATAAA
1 AAAT-AAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT-AA-AATAAA
* * * * * * * * * * * *
60571 TGTGTTTACCGAGCCAATACAAATAGCTA-AAGTTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATT
62 TTTGTTTA-CGAACAAATTCAAATTGTTATGA-CTATTTAAACAATTGTCT-ATTTAAAATCATT
* ** ** * * ** * * *
60634 ATGACCTTTTGGTTACTCATAAAATACTTGT-TTCATATCTTATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
124 GTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAAT-TCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATA
* * * * * *
60698 AT-CTATATTTATTAACATGCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTA-
188 ATACTA-ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-G---TGATTT-AAAAAGTGAATCTGCTTAC
* * * * * * * ** * * *
60761 CTAAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTT
247 CGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTT
* * * * ** * * * **** *
60826 GTTTTGACATAAAACAATTG-TCTCAATTCATAAAAGCTTACCCAAAATAAAATAATACTAATTT
311 GTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTT
* * * * * * *
60890 CTTAAT-TATTCAAAAATTAATAAGCAATAG-TTT--CAAATAAATTTGTTTA-CGAAACAAATT
375 ATTAATCT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCG-AGCCAATT
* * * * * * * * * *
60950 CAAATTGTTATAA-CTATTTAAACAGTTGTCT-ATTTAAAATCATTGTGACCTTTTATTTTGTCA
438 CAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCA
* * ** * * * *
61013 TAAAACAATTT-TTTGA-AT-TATATGAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
501 TAAAA-TATTTGTTTCATATCT-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACA
* * * * * *
61074 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGTGATTT--AAAAAGTGAATCTGTTTATCGAATC-TGTACAAATA
563 TTCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATA
* * * * * * * * *
61136 ATTATGGCCATTTCAACAATTATTAATTTC-AAATCATTATTACCTTTTG-TTCGATCATATAAC
626 GTGATGACTATTTGAACAATTATTTA-TTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAAC
* ** * * * * * *
61199 AATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTCG
689 AATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCA
* * * ** *
61228 AAATAAAATAAAAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAAT
* * * * * * * * * * *
61293 GTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTA-AAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTC
63 TTGTTTA-CGAACAAATTCAAATTGTTATGA-CTATTTAAACAATTGTCT-ATTTAAAATCATTG
* * * * ** * * *
61356 TGACATTTTATTTAGTCATAAAATATTTGT-TTCATATCCTACAAGCTTATTCAAAACAAAATAA
125 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAAT-TCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAA
* * * *
61420 T-CTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAA-TAAATCTG-TTAC
189 TACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-G---TGATTT--AAAAAGTGAATCTGCTTAC
* *
61482 CGAA-CAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAAAAATTATCAATTTCAAATCGTCATTACCTTTT
247 CGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTT
* *
61546 GTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATCATATATGTTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTA
311 GTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTA
* *
61611 TTAATCTCTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAA
376 TTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAA
* *
61676 ATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTAGTTTAGTCATACAA
441 ATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* *
61741 TATTTGCTTCATATCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATCTAAATTTATTTACATTCAAAAA
506 TATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTTACATTCAAAAA
* *
61806 ATTAATAAGAAAATGATTTGGAAAAATATATCTG-TTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTA
571 ATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTA
* *
61870 TTTGAA-AATTTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAGTTATTTCAG
636 TTTGAACAA-TTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTCAG
* *
61934 TTCATAAAAACTTATGCA
700 TTCATAAAAGCTTATCCA
*
61952 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAATAGTTTAAAATAAATTTG
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTG
*
62017 TTTATCGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTAAAATCATTGTGACC
66 TTTA-CGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTGTGACC
* *
62082 TTTTATTTTGTTATAAAACAATTATCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAA
130 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
62147 TTCATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCAGTTTATCAAATCAGTTTAA
195 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGCTTACCGAATCAGTTCAA
62212 ATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACC-TTTGTTTGGTCATATAA
260 ATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAA
*
62276 CAATTGTTTATGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAA
325 CAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAA
*
62341 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGATAAAGCTAT
390 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTAAAGCTAT
*
62406 TAAGATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATAT
455 TAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATAT
* *
62471 CTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATCTAAATTTCTTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAAAT
520 CTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAAAT
* * * * *
62536 GATTTGGAGAAATAAATTTGTTTACCGAACGAGTTCACATAGTGATGACTATTTGAAAAATTATT
585 GATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATT
62601 TATTCAAAATCATTATGACCTTTT-TTTTGACATAAAACAATTGATTT-AGTTCATAAAAGCTTA
650 TATTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATT-ATTTCAGTTCATAAAAGCTTA
62664 TCCA
714 TCCA
*
62668 AAATAAAATGATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTG
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTG
* * *
62733 TTTACTGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTGTGATC
66 TTTAC-GAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTGTGACC
* * * *
62798 TCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAATTCATTA-AAGCATAGTTAAAATAAAATAATACTA
130 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCA-TACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTA
* * * *
62862 ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAGGTGAGTGATTTAAAAAATGAATCT-ATTACCAAATCAG
194 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA----AGTGATTTAAAAAGTGAATCTGCTTACCGAATCAG
* *
62925 TTCAAATAATTATGGCTATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCA
255 TTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCA
* * *
62990 TATAACAATT-TTTTTTATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAAAAGTAATTTATTAGTCTTT
320 TATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTT
* * * *
63054 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATTTTTACCAAGCCAATACAAATAGCTAAA
385 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTAAA
* * *
63119 ACTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACTTTTTGTTTAGTTATAAAATATTTGTTT
450 GCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTT
* * ** *
63184 CATGTCTCATGAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAG
515 CATATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAG
* * * **
63249 GAAATAATTTGGAAAAACAAATCTGCTTACCGAACAAGTTTGAATAGTGATGACTATTTGAACAA
580 GAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAA
* *
63314 TTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAG
645 TTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAG
63379 CTTATCCA
710 CTTATCCA
*
63387 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTCAAATAAATTTG
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTG
* * * * *
63452 TTTTTCGAAAAAATTGAAATTGTTAT-TCTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCGTTGTGACC
66 -TTTACGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTGTGACC
* * * *
63516 TTTT-TTTTGTCATAAAGCAATTGTCTAAATTCATATAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAA
130 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * *
63580 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGCTTATGGAATTAAT
195 TTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGCTTACCGAATCAGT
* * * *
63645 TCAAATAACTACGGCCATTTCAAAAATTATCAATTT-AAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCAT
256 TCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCAT
* * *
63709 ATCACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTTATTAATCCTT
321 ATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAA-TTTATTAATCTTT
*
63774 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGTCAATTCAAATAGCTAAA
385 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTAAA
*
63839 GCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTATTT
450 GCTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTT
** * * * *
63904 TTTATATTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATGTAAATTTATTTACATTAAAAAAACTAATAAG
515 CATATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAG
* *
63969 GAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATGATGACTATTTGAACAA
580 GAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAA
* * *
64034 TTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAG
645 TTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAG
64099 CTTATCCA
710 CTTATCCA
64107 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAG-AATGAGTTTAAAATAAATTT
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAA-GAGTTTAAAATAAATTT
* * * *
64171 GTTTACCAAGAAAATTCAAATTGTTATGGCTATTTAAACAACTGTCTA-TTAAAATCATTGTGAC
65 GTTTACGAA-CAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTGTGAC
* *
64235 CTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATATTA
129 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTA
* * * *
64300 ATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTGAATCTGCTTACTGAATCAATTCA
194 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGCTTACCGAATCAGTTCA
64365 AATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATA
259 AATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATA
* * *
64430 ACAACT-TTTTT-ATCATATATGTTTA-TTCAGAAGAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAA
324 ACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGA-AATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAA
* ** * * * * *
64492 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAGTTTAAATAG-TTATGA
388 AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTAAAG-
** * * * * *
64556 CTATTTGAATAATTGCA-T-ACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTA-TCGTAAAACAATTAT
451 CTATTAAAATAATT--ATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAA-TATT-T
** * * * * *** * *
64618 -TTTTGT-TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATATTACT-AATATAAAAATATTCCAAAAATTA
511 GTTTCATATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTA
** * * * * * * * * ** *
64680 ATAACTAAAAGATTT-AAAAAACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATATG
575 ATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTG
* * * * * *
64744 AACAATTATCTATTTC-AAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTCAATTCG
640 AACAATTATTTA-TTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTCAGTTCA
** *
64801 TACTAGCTTTATTCA
704 TAAAAGC-TTATCCA
* * * ** * * *
64816 GAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAT
1 AAATAAAATAATACT-AATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAATA-AAT
* * * ** * * * * * *
64880 TATGTTTGCCTAACCAATTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTAT
63 T-TGTTT-ACGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTGT
* * ** * ** * * * *
64945 GACCATTTGTTTTGTCATAAAACAAACGTTTTTATTTATATAAG-TTTGTTCAAAATAAAATAAA
126 GACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAG-TCAAAATAAAATAAT
* * * * * ***
65009 ACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTAAATCA
190 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-GATTTAAAAAGTGAATCTGCTTACCGAATCA
* ** * * ** ** * * ** * **
65073 ATTCAAA-AAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCTTCTAT
254 GTTCAAATAA-TTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTT-TGG
** ** * * *** * * *
65137 TACA-A-AACAATAATTTCAGTTCATAAAAACTTA-TTCAGATTAAAATAATAATAATTTATTAA
317 T-CATATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGA-AATAAAATAATAGTAATTTATTAA
* * * * * * ** * *
65199 TATCTCAAAAATTAATATGTAA-AAATTTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGA-TCAAAT
380 TCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCA-ATTCAAAT
* * * ** * * * * ** * * *
65262 AG-TCATGACCATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCGTTATGAAGTTTTGTTTTGCCATAAAAA
443 AGCTAAAG-CTATTAAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAT
* * * * * * * * *
65326 AATTGTTTTAGATC--ACATCAGCTTATTTGAAAGAAAATAATGCT-AAGTTATTAATATTCTAA
507 ATTTGTTTCATATCTTACA--AGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACATTCAAA
** * * ** * * **
65388 AAATTAATAATTAAGA-GATTT--AAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTTAAATAATTTTGA
569 AAATTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGA
* ** *** * * * ** ** *
65450 CTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAATCTTTTGTTTTGTCACCAAATTATTTTTTC
633 CTATTTGAACAATTATTTATTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTC
* ***
65515 TA-TTCATACAAGCTTATTTT
698 -AGTTCATAAAAGCTTATCCA
* * * * *
65535 GAATAAAATAATAC-AATTTATTAAT-ATT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAA
* ** * * * * * * * * * * *
65597 ATTTGTTTACTATACATGTTCAAATTTTTATGACTAATTGATCTATTATTTATTTCAATTTATTA
61 ATTTGTTTACGA-ACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTG
* * * * *** * *** *
65662 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTCAAAA-AA
125 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAAT-AAAATAA
* * * * ** * * * ** *
65726 TATTAAATATATAAATATTTCAAAAAATAGTAATTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATATTTA-T
189 TACT-AATTTATTAATA-TTCCAAAAAT--TAA-TAAGTGA-TTTAAAAAGTGAATCTGCTTACC
* * * * * * * * * *
65790 TAAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTAT-ATATTTCAAATCATTGTGACCTTT
248 GAATC-AGTTCAAATAAT-TATGGCCATTTCAACAATTATCA-ATTTCAAATCGTTATTACCTTT
* * * ** * * *
65853 TGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTAT-ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
310 TGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTG-ATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATT
* * ** * * * * * * *
65917 TATT-A-CTATTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGAAATAAAAAATTAGTCTATTTACTGA-ACATG
374 TATTAATCT-TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCA-A
* * * * * *
65979 TTCAAATAG-TTATGACTATCT-GAATAATT-TTCTATTTCAAAACATT-TGAGCTTTTGTTTTA
436 TTCAAATAGCTAAAG-CTAT-TAAAATAATTATT-AATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTA
* * * ** * ** *
66040 -TCATAAAATAATTGGTTC-TATTCATGTAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATATAAATTGGTTA
497 GTCATAAAATATTTGTTTCATA-TCTTACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTT
* * ** * * * *
66102 ATATT-ACAAAAATTAATAAGTAAA--ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATGTTCAAA
560 ACATTCA-AAAAATTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAA
* * * **
66164 TATTTG-TGGCTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGATTTTTTGTTTT-ATCATAA
624 TA-GTGATGACTATTTGAACAATTATTTA-TTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAA
* * * *
66226 ATCAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCG
686 AACAATTATTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCA
* * * *
66258 AAATAAAATAATAATAATTTATTAA-AATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT-----AAAAT
* * * * * * * * * * * * * *
66322 AAATCTATTTATTGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATTTCTTTCAAATCCT
59 AAATTTGTTTA-CGAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCAT
* * * * * ** ** * *
66387 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAATTTTATTTAAAATAAAATA
123 TGTGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATA
* * * *
66452 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATG-TTCACC
188 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-T---GATTTAAAAAGTGAATCTGCTT-ACC
* * * * ** * * * * * * *
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248 GAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGT
* * * * * * * *** ** *
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313 TTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTAT
* * * * * * * *
66645 TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAA
377 TAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAA
* * * * * * * *
66706 TAG-TTATGACTACTT-CAACAATTATCT-ATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTA-TCATA
442 TAGCTAAAG-CTA-TTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTAGTCATA
* * * * * * * * * *
66766 AAACAATTGTTT-GTATTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAA-TTACTAATATT-
503 AAATATTTGTTTCATA-TCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACATTC
** * * * * * *
66828 TTAAAACTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA
566 AAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGA
** * * * * * * * *
66891 AAACTA-TT--A-GA--A--TATTC-AAATCGTTTTGAGCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTT
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* * * **
66947 TTCAGTTTATACATGCTTATTTGA
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* * * * *
66971 AAA-AAAATAATACTAATTTATTAA-CATTTAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTTAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAG--A-GTTT--AAAATAA
* * * * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * *
67164 ATTATTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAAAGATTTAAAAAAT-AAGT-TAGTTTATC
190 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-AATAAG-T---GATTTAAAAAGTGAA-TCT-GCTTACC
* ** * * * * * *
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248 GAATCAG-TTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTG
** * * * * * * *
67290 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGTCTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
312 TTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGA-AATAAAATAATAGTAATTTA
* * * * * * *
67354 TTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTCACCGAGCCAGTT---
376 TTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAA
* * * * * * *
67416 -T--CT--A--T-TT-GAACAATTATCT-ATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAA
441 ATAGCTAAAGCTATTAAAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAA
* * * * * * * * * *
67471 ATAATTGTTTTAGT-TCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATTTTAATAATATTCCA
505 ATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTTACATTCAA
* ** * ** * * *
67534 AAAATTGATAATTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTGTCGAAGCAA-TTCAAATAATTAA
568 AAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTGAT
* * * * * * * * *
67596 GACTATATGAATAATTATCTATTTATCAAAA--GTTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAACAAAT
631 GACTATTTGAACAATTAT-T-TAT-TCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATT
* ** * *
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693 ATTTCAGT-TCATAAAAGCTTATCCA
** *
67683 AAATAAAATAATACTAATTTAC-TAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTT-CTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAA
* * * * ** *
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* * * * * * * * * *** * *
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125 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAAT
* * *
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Statistics
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AAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTG
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TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTCTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGCTTACCGAATCAGTTCAAA
TAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAAC
AATTGTTTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAA
TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCGAGCCAATTCAAATAGCTAAAGCTATT
AAAATAATTATTAATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATC
TTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAGGAAATG
ATTTGGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTT
ATTCAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATC
CA
Found at i:67552 original size:169 final size:169
Alignment explanation
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67239 TAATTATGGT
* *
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1 TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTA
* * *
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*
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* * * * *
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** * * * *
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* * *** *
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* * * ** * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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128 GTAAGAGATTTAAAAAATAAA--TCTAT-TC-ACCGAG-CCAGT-T-T--C
* ** * * * *
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1 TATTTAAACAATTATCTA-TTTCAAATTATTATGAACTTTTAT-TT-TATCATAAAACAATTGTT
*** * * *
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* *
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Statistics
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CATCATACAAGTCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCACCGAGCCAGTTTC
Found at i:68169 original size:17 final size:18
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*
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*
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*
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1 ACTATTTCAAATAATTAT
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Statistics
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ACTATTTCAAATAATTAT
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Alignment explanation
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68331 AAACAATTGT
* * *
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* * * * *
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*
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130 ATTATCTATTTCAAATTGCTATGACC-TTTA
* * *
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1 TTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATAGTTCAACAAA-TAAT
* * * * * * * *
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64 AAGTAA-ATAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAACATCAAATAATCATGACTATTTCAA
* * * *
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128 TAATTATCTATTTCAAATTGCTATGA-CCTTTA
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1 TTTTGTCATA
68670 AAATTATTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTA
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71461 AACCAGGTCA
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AATAATTATACTATTTG
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72034 AA
1 AA
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* * *
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*
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*
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* ** * **
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* * * * * * * *
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*
78533 ATAAAATAATATTAATTTATTAATA
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA
78558 TTTCAAAATT
Statistics
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TAAAATAATACTAATTTATTAATACTTAC
Found at i:79240 original size:171 final size:171
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* * *
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* * * * *
79014 ATCATTATGACCATTTGTTTTGACATAAAACATTTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATA
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*
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* * * * *
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* ** ** **
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AAATAATACTAATTTCTTACAAAATTAATAAACAAGAGTTT
Found at i:79357 original size:16 final size:17
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Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:79396 original size:177 final size:176
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* * * * ** * * * *
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* ** * *
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* * * **
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* * * ** ** * *
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* * **** *
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* * * * ** *
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126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-A--AAACTATAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * *
78809 ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATTGTTT--T
* * * * * * *
78874 ATT-TTACAAGCTTATTCAGAATAAAAGAAT-CTAAATTTATGAACA-TTCAGAGAATTAAAAAG
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
* * * * * *
78936 GAA-ATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAAT-TCAAATTGTGATGACT
126 TAAGA-GATTT-AAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * *
78991 ATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGT-TTTGACATAAAACATTTGTTTTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACC-TTT-TATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA
* * * * **
79055 GTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTT-CT--TA---C-AAAATTAATAAACA
64 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * *
79113 AGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCCAAGAAAT-TCAAATAGTTATGACT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA--CAA-AACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * *
79162 ATTTGAACAGTTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGTTATAAAACAATTGTTTGAA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* *
79227 TTCATGCAAGCTTAGGT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
64 TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * ** * *
79291 AGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACTGAA-TCA-AAATAATTATGTCT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACT-ATAAATAGTTATGACT
* * * * * *
79339 ATTTCAATAATTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
79404 ATCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAAGAGTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAAGTAA
65 -TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
*
79469 GAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACAAAACTAGTTTAAATAGTTATGACT
129 GAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACAAAACTA---TAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
79521 ATTTGAACAATTGTATATTTCAAATCATTA-TAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATT-TGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* ** * *
79585 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
79650 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTC-AAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTT-ACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * *
79701 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T-TT---TTGT-TTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAC
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTA-
* ** * * *
79759 TTCATGCTAA-CTTATTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATATGT
64 TTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
79822 AAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAATCAGTTTAAATAATTATGACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTATAAATAGTTATGACT
* * *** * * * *
79875 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTG-TTTTA
* * * * * * * *
79940 TTCATATAAGTTTGTTCAGAGTAAAATAATGCCAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
80002 -AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTCGTTTAAAAAGTTATGACT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CAAA-AC-TATAAATAGTTATGACT
* * * * * ** * * * * **
80052 ATTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATTGTTAATT---TTTTGTTCTATTACAAAACAATAATTTCT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATT-ATTACCTTTTATT-TGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * *
80114 ATTCATAAAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGCA
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * *
80179 A-A-ATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACT
128 AGAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACT--AT-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * * *
80229 ATTTGAATAAGTATTTATTTCAAACCTTTATGACCTTTTTTTTGTTATAAAA-AATTATTTTAGT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-T
* * * * *
80293 TCACATC-AGCATATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTA
65 TCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * **
80356 AGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAACTATGACT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTATAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * ** ** *
80408 ATTTGAACAATTATATATTTGAAATCGCTATAACTTTTTCTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* * * *
80473 TTCATACAAGTTTGTT-ACAAATAAAATAATAC-AACTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGG
64 TTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG
* * * * * * **
80534 TAAAAGATCTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCCTTATGACT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * ** * * * *
80588 AATTAAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTAC-CTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * * *
80653 ATTCATACAAGCTTGTTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGT
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGT
* * * * * *
80717 AAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGT-TCAAATAGTTTTGACA
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
80770 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTGAG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-
* * ** * * * *
80835 CTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATA-TTCTAAAATTAATGAGTAA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * *
80899 CAGAACTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAATA-TTTCCAAATAGTTATGACT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CAAA-ACTAT--AAATAGTTATGACT
* * *
80950 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACC-TTTAGTTTTGTCATAAAACAATTAGTTC
1 ATTTGAACAATTGTCTATTT-AAAATCATTATTACCTTTTA--TTTGTCATAAAACAATT-GTTT
* *
81013 TATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAGATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
62 TATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * **** *
81076 GTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTCAAATAGTTATGACT
125 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAAC-T-AT-AAATAGTTATGACT
* * * * * ** *
81130 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTACGACCTTTCAGTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTA-TTTGTCATAAAAC-AATTGTTT-T
* * * * *
81194 ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAA-ATTTTTAAAAATTAATAAAT
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * *
81258 AAAATATTTTAAAATAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACT
127 AAGAGA-TTTAAAA-AATAAATATATTTA-C-A-AAACTATAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * *
81313 CTTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* ** ** *
81378 TTCGTACAATTTTATT-TGAATGAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
** * * * * * * *
81441 TGGAGATTTCAAAAATAAATCTATTCACCGAATAAGT-TCAAATAGTCATGTCC
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * * ** ** *
81494 ATTTGAGCTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTATTTCT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCA-TTATTACCTTTTA-TTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* ** * *
81558 ATTTATACAAAATTATTC-ATA-AAAATAATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAA-T--TAA-TA
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
81617 AGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * ** * * * *
81669 ATTTTAACAATTATCTATCTCAAATCGCTATGATCTTTGT-TTTGTCATAAAATAATTGCTTCTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTT-TATTTGTCATAAAACAATTG-TTTTA
* * *
81733 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATATTA-TGAAATTAATAATA-TTCTAAAAA-T--TAA-T
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * *
81792 AAGAGATTTAAAAAA-AAATGTGTTTGTCAAATC-AGTTCAAATAGTTAAGATT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTT-ACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * ** *
81844 ATTAGAACAACTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTATTTATTTGTAAAATAATT-TTTTCA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATTGTTTT-A
* ** * *
81908 GTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT-ATCATGT-AGAAAATTAATAAA
64 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAG
* * * * * * *
81971 CAAGAAATTT-AAAAATTATTTTATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTATAAATAGTTATGACT
* * ** * * * *
82024 ATTTGAACAATTATCTATTTATAAGAAGTATGACCTTTTGTTT-T-ATCATAA-AA-----TT-T
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
82080 TCATAAAAGCATT-TTCGAAATAAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAAA-TAAAAAGTTA
65 TCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TA
* * * * *
82143 A-AGATTTAAAAAATAAGTCA-GTTTATCAAATTACT-TCAAATAATTATGGCC
128 AGAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTA-CAAA--ACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
82194 ATTTAAACAATTATTTTTTTCAAAT-AGTTATGAACTTTT-GTTGTCATAAAACAATTGTTTT-T
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCA-TTATTACCTTTTATTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT
* * *** *
82256 CATCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
65 --TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * *
82321 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT-----A-T-TGAACTAGTT-T--TT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * * *
82361 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTATGTTATAAAATAGTTGTTTTAG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATT-TGTCATAAAACAATTGTTTTA-
* *** * * * * * *
82426 TTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCCAAAAATTGATAATTAT
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
** * * * * * * * * *
82491 CTG-TTGCAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAGCGGTTTAAACAATTAAGACT
129 GAGATT-TAAAAAATAAATATATTTAC-AAAAC--TATAAATAGTTATGACT
* * * ** * * *
82542 ATATGAATAATTATCTATTTATAAAAAATTATGACCTTTTCTTTGGTCATATAACAATTGTTTT-
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTA-AAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
82606 TGATCATTCAAGCCTACTT-GAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATCTGTCAAAAATTAATAAG
64 T--TCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* *** *
82670 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACTAATTCAAAT-G-TATAACT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACT-A-T-AAATAGTTATGACT
** * * * * * ** * * *
82722 ATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGCTCTACCATGAAACAATTACTTTTG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATT-GTTTTA
* * * * * *
82787 TTTATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * ** * * *
82852 GAAAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATATTTAAGACT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
82903 ATATGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTC
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT-
* * ** *
82968 AATTCATTCTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-
63 -ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** * *
83028 TAAGAGATTT-AAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
83081 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTCTTGTCATAAAACAAATTTTTTTG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTAT-TTGTCATAAAAC-AATTGTTTTA
* * * *** * * **
83146 TTCATATAAGTTTGTTTTGAATAAAGTAATACTAATATGCTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
83208 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-TAACGAGTTCAAATAGTTATGATT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
** * * * ** * * * * * *
83258 ATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATCATTATGGCTTTTTGTTT-TATATAAAATAATTATTTCCA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTTGT-CATAAAACAATTGTTT-TA
* * ** * **
83322 TTTATACAAGCCTATTC-GGAT-TAA-AATACTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGTAA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
83384 -AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACTAGATCAAATAGTCATGACT
129 GAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACT--AT-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
83435 ATTTGAATAATTATCTATGTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTATTTTAG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-
** * * * * *
83500 TTTGTATAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAAGTAATTAATA-TT-AGAAAATTAATAATTA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTA
* * * * * *
83563 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAACAAGTTTAAATAATTATGACT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTT-AC-AA-AACTATAAATAGTTATGACT
* * * * *** * * * * * *
83615 ATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTCCTCATAAAATGATTTTTTTTC
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAA-CA-ATTGTTT-
*** * *
83680 TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA--TAAAGACAATTAATAA
62 TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* * * * *
83743 GTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATA-TTATGACT
125 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
83797 ATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTC-TTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTATTTCT
1 ATTTGAACAATTGTCTA-TTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * *
83861 ATTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAA-ATTTTC-ACAATTAATAAGT
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
* ** * * ** * * *
83924 AAAACTTTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGT-TCGAATAGTTCTGACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATA--TATTTACAA-AACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * * * *
83977 ATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* * ** *
84042 TTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * ** * *
84106 AGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACATGTTCAAATAGTTATGGCT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAAC-T-AT-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
84158 ATCTGAATAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACATTTTGGTTTGTCATAAAATAATCAGTTCT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTT-AAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAAT-TGTTTT
* *** * *
84222 ATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGC
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * *
84286 AA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATGACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATA--TATTTACAAAAC-TATAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
84338 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTTTTTCTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* * *** * * *
84403 TTTATAAAAGCTT-TTTGGAATAAAATAATACTATTTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
84467 AAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * ** * * * * * *
84517 ACTTGAATAATTATTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* ** * * * * ** **
84582 TTCATATAAATTTATTCGAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTTACCAGTTG
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
84647 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCATGAACAAGT-TCAAATAGTCAT-ATCC
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CAA-AACTAT-AAATAGTTATGA-CT
* * * * * * ** *
84697 ATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTATATTTTGTTGTAAAATAATTGTTTCT
1 ATTTGAA-CAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTA-TTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
** * * **
84761 ATTCATACAAAATCATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TA
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
84822 AGAGATTTAAAGACTAAATCTATTTATTGAACCAATTGT-AATAGTTATGATT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA--CAA--AACTATAAATAGTTATGACT
* ** * * * *
84874 ATTTGAATAATCATCTGTCTT-AAATCGTTATAATCTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTAT
1 ATTTGAACAATTGTCTAT-TTAAAATCATTATTACCTTT-TATTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * *** * * * * * * *
84937 ATTCATGCAAACTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAGTA-TTCTAAAAATTAACAAGT
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* **** * *
85001 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTTGAATTAGTTCAAATAATTAAT-ACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTT-ATGACT
* * * * * * * *
85054 A-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTGACTTTTTGTTTAGTCATAAAA-TATTTTTTTC
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATT-ACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATTGTTTT-
* * * * * * * * *
85116 AGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATTAGACCAATTTATTGACAATT-AACAAATTAATAAA
63 A-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAG
* * * * * * * *
85180 CAACAAATTAAAAAAATAAATCTTTTTACCGAACAAAT-TCAAATAGTTATGGCT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTAT-AAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
85234 GTTTGAACTATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-
* * * *
85299 TTCATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAAATCT-ATAAGT
64 TTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGT
* * * * * * *
85362 TAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATC-AAATTGGTTCAAATAATTTTGGCC
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATA-TTTA-CAAAACT--AT-AAATAGTTATGACT
* * ** * * *
85415 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTT-T
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
85479 CATCATACAAGCCTATT-AGAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAATAATTAATAACT
65 --TCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
85543 AAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTGCTAAAGTAGTTGAAATAGTTAAGACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * ** * * *
85596 ATATGAACAATTGTTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCATTGTTTTAG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-
* * *
85661 TTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
64 TTCATACAAGCTTATTC-----AAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * ** * * * * *
85726 AAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTATGGCC
123 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CAAAACTA-T-AAATAGTTATGACT
*** ** * * *
85779 ATGCCAACAATTAACTATTTGAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATTGT-TTT-
* * * *
85844 A-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A---ATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTA
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
85904 AAATATTCAAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTACTTATTGAGAATAAAATAAT-ACT
128 AGAGATT-TAAAAAATAAATATATTTAC-AAA--AC-TA-T-A-AAT--AGTTATGACT
** ** * * * * ***** * *
85962 AATTT-ATTAATAATCCA---AAAATTAATAATA-AAGAGA-TT-T-A-AAAGATGAATCT-ATT
1 -ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTTGTCATAAA-A-CAAT-TGTTT
* * * * * **
86017 TATTGA-ACAAG--T-TT--AAAT--AATTATGACT-GTTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGT
62 TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAA-AAT
* **** * * * * * * * ** * **
86073 T-ATAACCTTTTTGCTTTGCTATAAA-AGAT-TTTTTTCTATTC-ATACA-AGCTTATTTC-
119 TAATAA-GTAAGAGATTT--AAAAAATAAATATATTTACAAAACTATAAATAG-TTATGACT
** ** * * ** *** *
86129 AAGT-AA-AATAATACAAATTTATTAA-CATTAAGA-GAATTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT
1 ATTTGAACAATTGT-C-TATTTA-AAATCATTATTACCTTTTA-TTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** *
86190 CTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG
62 -TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
86255 TAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-ACAAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACG
126 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACA-AAACTA--T-AAATAGT-TATGACT
* * * ** * * * * *
86310 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGTAACAAAACAATTATTTTAG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-
* * * * ** * *
86375 TTCTTATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * *
86439 AGAGAATT-AAAAA-AAATCTATTTATCGAATAAGT-TAAAATAGTTATGATT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTAT-AAATAGTTATGACT
** * * * * *
86489 AGCTGAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTCGACATAAAACAATTGGTTCT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTT-AAAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATT-GTTTT
* * *** * *
86553 GTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
63 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
86617 AA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACAC-ATTAAAATAGTTATGACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC-AAA-ACTA-T-AAATAGTTATGACT
* * * * * * *
86669 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTCTG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* * * * *
86734 TTCATAAAAGCTTAATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTA
64 TTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
86798 AAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACT
128 AGAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * ** ** * * *
86851 ATTTAAACAGTTATTTATTTCAAATTGTTACAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* * * *
86916 TTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTT
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
86980 GGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAACAGTCATGTCT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C-AA-AACTATAAATAGTTATGACT
* * * * * * ** *
87032 ATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTATTATGATATTTTATTTTGGCATAAAACAATTGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTA-TTTGTCATAAAACAATTG-TTTTA
* ** * *
87097 TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--A
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
87160 -A-ATTTAAAAACTAAAT-T-TGTTACAAAATCATTTCAATTAGTTATGACT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATAT-TTACAAAA-C-TAT-AAATAGTTATGACT
* * * * *** * * *
87208 ATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGCAATGATC-TTCATTCTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATT-TGTCATAAAACAATTG-TTTTA
* * * ** * * *
87272 TTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTTCTAAACTAATACTATTTTAAAAATTAATAAGTAA
64 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *** * *
87337 GAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
** * * * * * * * *
87388 ATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATTAAATAATTGTTTCAG
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTT-GTCATAAAACAATTGTTTTA-
** * *
87453 TTCATACATA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTCTTTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAGC
64 TTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
* * * * *
87516 AAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAATAGTTATGACT
127 AAGAGA-TTT-AAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--TAAATAGTTATGACT
* * * * *
87569 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACC-ATTAGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTA
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTA--TTTGTCATAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * ** *
87633 GTTCATAAAATCTTCTCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGTTAAGTT
64 -TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
87698 GGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCGAATC-AGTTGAAATAATTATCACC
128 AGAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTA-CAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * * * * * *
87750 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCA-TTATTACCTTTT-ATTTGTCATAAAAC-AATTGTTTT
* **
87814 CATT-ATACAA-CTTGTTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
63 -ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* ** ** *
87877 AGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTA--T-AAATAGTTATGACT
* * *
87930 ATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTAT
1 ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTAT
87961 GTTCATAACT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (176 bp):
ATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATTACCTTTTATTTGTCATAAAACAATTGTTTTATT
CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
GATTTAAAAAATAAATATATTTACAAAACTATAAATAGTTATGACT
Found at i:81271 original size:23 final size:22
Alignment explanation
Indices: 81236--81279 Score: 63
Period size: 22 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
81226 CTATTTTATT
81236 AAATTTTTAAAAATTAATAAATA
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1 AAAT-TTTTAAAAATAATAAAT
81280 CTATTTACCG
Statistics
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Consensus pattern (22 bp):
AAATTTTTAAAAATAATAAATA
Found at i:87050 original size:16 final size:17
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87019 AACAGTCATG
87029 TCTATTT-AAACTATTA
1 TCTATTTCAAACTATTA
*
87045 TCTATTTCAAATTATTA
1 TCTATTTCAAACTATTA
87062 T
1 T
87063 GATATTTTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TCTATTTCAAACTATTA
Found at i:87084 original size:181 final size:181
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Period size: 181 Copynumber: 10.0 Consensus size: 181
86158 AAGAGAATTA
* * *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
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* * ** *
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129 AATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * * ** *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * *
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* ** *
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* * * * * * *** *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTA
* * * * *
86593 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACACA-TTAA
65 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACA-AGTTCA
86656 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
129 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
86773 TTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAGCGAGTTCA
65 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCA
* * * ** ** *
86838 AATAGTTATGACTATTTAAACAGTTATTTATTTCAAATTGTTACAATCTTTTG
129 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* *
86891 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * *
86956 TAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAA
66 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAA
* * * * * * ** *
87021 CAGTCATGTCTATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTATTATGATATTTTA
131 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * ** *
87072 TTTTGGCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
87137 TAATATTTTAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAACTAAATTTG-TTACAAAATC-ATTTCAA
66 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-CAAGTTCAA
* * * *** * **
87196 TTAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGCAATGATC-TTCA
130 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * * ** *
87247 TTCTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTTCTAAACTAA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
87312 TACTATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACCAGTTCAAA
66 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAA
* ** * *
87377 TAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTG
131 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * **
87428 TTTAGTCATTAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTCTTTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA-AGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
87491 ATTAACATTC-AGAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
64 ATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGT
* * * *
87554 TC-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCATTAG
126 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
87609 TTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-AAATCTTCTCCAAAATAAAATAATATTACTTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGT-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
** ** ** * *
87672 ATTAATATT-TCAAAAATTGTTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAATC-AGTT
64 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTT
* * * * * *
87735 GAAATAATTATCACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATGATCTTTTG
127 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTG
* * * **
87790 TTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTCATT-ATACAA-CTTGTTCTGAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
87852 ATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTGAACCAGTTC
64 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTC
*
87916 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATG
128 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
87962 TTCATAACTA
Statistics
Matches: 1304, Mismatches: 264, Indels: 90
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 77 0.06
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178 9 0.01
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183 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
Found at i:87710 original size:718 final size:721
Alignment explanation
Indices: 86164--87955 Score: 1751
Period size: 718 Copynumber: 2.5 Consensus size: 721
86154 CATTAAGAGA
* * * * * * *
86164 ATTA-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAA
1 ATTAGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *** * *
86228 TTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAT-ATGTTTAACAAACAA
66 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGA-TTTAAAAAATAAATCA-GTTTACCAAATAA
* * * * * * * ** ** * *
86292 GTTCAAATAGTCTTGACGATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-CAATGACCTTTTCTTTTGT
129 GTTGAAACAATCATCACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTTATGATATTTTATTTTGG
* * * ** * ** *
86356 AACAAAACAATTATTTTAGTTC-TTATA-AGTTTGTTTGAACTAAAATAATACTAATTTATTAAT
193 CATAAAACAA--ATTTT-TTTCATTATACAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
86419 A-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA-AATCTAT--TTATCGAATA--AGTTAAAA
255 ATTTC-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAA-ATATGCTTA-C-AAAACCAGTTCAAA
* ** * * * *** * * * *
86478 TAGTTATGATTAGCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTT-TTGTTTCGACATAAAA
315 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCGCAATGATCTTCAT-TCT-GTCATAAAA
* * * * ** * * * * **
86542 CAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAA-TAAAATAATT-TAAATTTATTAATATTCCAA
378 CAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTTCTAAA-CTAATACTATTTTAA
* * *
86605 AAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACACATTAAAATAGTTATGACTA
441 AAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTTCTAAACACATTAAAATAGTTAAGACTA
** * * * *
86670 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTCTGT
506 TTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAACCAATTGTTTCAGT
* * *
86735 TCATAAAAGCTTAATTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTGATAAGTAAA
571 TCATAAAAGCTTAATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGCAAA
* * * *
86800 AGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAGTTAT
636 AGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
* * * *
86865 TTATTTCAAATTGTTACAATC
701 CTATTTAAAATCGTTACAACC
* * * * **
86886 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAA
1 ATTAGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTAA
* **
86951 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGT
66 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCAAATAAGT
* * ** *
87016 TTAAACAGTCATGTCTATTTAAACT-ATTATCTATTTCAAAT-TATTATGATATTTTATTTTGGC
131 TGAAACAATCATCACCATTTAAA-TAATTATCTATTTCAAATAT-TTATGATATTTTATTTTGGC
* *
87079 ATAAAAC-AATTGTTTTT-ATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTATTAATA
194 ATAAAACAAATT-TTTTTCATT-ATAC-AAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
87142 TTTTAAAAATTAATAAG-A-A-ATTTAAAAACTAAATTTG-TTACAAAATCATTTCAATTAGTTA
256 TTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACAAAACCAGTTCAAATAGTTA
* *
87203 TGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGCAATGATCTTCATTCTGTCATAAAACAATTGTT
321 TGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCGCAATGATCTTCATTCTGTCATAAAACAATTGTT
87268 TTTATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTTCTAAACTAATACTATTTTAAAAATTAATAA
386 TTTATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTTCTAAACTAATACTATTTTAAAAATTAATAA
* * * *
87333 GTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTAT-TGAAC-CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAAC
451 GTAA-AAATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TCTAAACACA-TTAAAATAGTTAAGACTATTAAAAC
* *
87396 AATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATTAAA-TAATTGTTTCAGTTCATAC
513 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCA-TAAACCAATTGTTTCAGTTCATA-
* ** *
87460 ATA-CTT-ATTCAAAATAAAATAATACTCTTTTATTAACATT-CAGAAAATTAATAAGCAAGAAG
576 AAAGCTTAATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCA-AAAATTAATAAGCAA-AAG
*
87522 -TTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTC-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
638 ATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
**
87585 ATTTAAAATCGTTATGACC
703 ATTTAAAATCGTTACAACC
* * *
87604 ATTAGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-AAATCTTCTCCAAAATAAAATAATATT
1 ATTAGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAT-TTATCCAAAATAAAATAATACT
* ** * * *
87667 ACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGTTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAATC
64 AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCAAATA
* * * * * *
87731 AGTTGAAATAATTATCACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATATTTATGATCTTTTGTTTTGT
128 AGTTGAAACAATCATCACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATATTTATGATATTTTATTTTGG
* * **
87796 CATAAAACAAATTTTTTTCATTATACAACTTGTTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
193 CATAAAACAAATTTTTTTCATTATACAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
**
87861 TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAT
258 TCAAAAATTAATAAGTA-GAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACAAAACCAGTTCAAATAGTTAT
*
87926 GACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATC
322 GACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATC
87956 ATTATGTTCA
Statistics
Matches: 878, Mismatches: 154, Indels: 76
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
717 62 0.07
718 288 0.33
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720 17 0.02
721 17 0.02
722 170 0.19
723 85 0.10
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (721 bp):
ATTAGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCAAATAAGT
TGAAACAATCATCACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATATTTATGATATTTTATTTTGGCAT
AAAACAAATTTTTTTCATTATACAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
AAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACAAAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
ATTTGAACAATTATATATCTCAAATCGCAATGATCTTCATTCTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
TCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTTCTAAACTAATACTATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
AATTTAAAAAATAAATGTGTTTTCTAAACACATTAAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCT
ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAACCAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAAT
TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAATA
AATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTT
ACAACC
Found at i:87981 original size:13 final size:13
Alignment explanation
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Period size: 13 Copynumber: 2.0 Consensus size: 13
87953 ATCATTATGT
87963 TCATAACTACTTG
1 TCATAACTACTTG
87976 TCATAACTACTTG
1 TCATAACTACTTG
87989 AGTAATTATC
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 13 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.23, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (13 bp):
TCATAACTACTTG
Found at i:89331 original size:178 final size:175
Alignment explanation
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88881 AAACTATTTT
* * * * * * *
88891 CTAAACCAGTTCAATTAGTTACAACCATTTGAACAAA-TATCGATCTTAAATTGTTATGATC-TT
1 CTAAATCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAA-AAATTATC--TATTAAATTGTTATGAACTTT
* * * * * *
88954 TGTTTTGTCA-AAAAAAATTGTTTCTGATCATATAAGTTTATTTAGATAAAAAATACTAATTTAA
63 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TTAGAGAAAAAATACTAATTTAA
* * *
89018 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAAATTTAAAAATAAATGTGTTTG
127 TAACATTTCAAAAATTAAAAAGCAATAAATTTAAAAATAAATGTGTTTG
* *
89067 CTAAATCAGTTCAAATGGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATT--A-T-TT-T-AACTTTT-T
1 CTAAATCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAAAAATTATCTATTAAATTGTTATGAACTTTTGT
* * * * *
89125 GTTTAGTCATAAAACTATTGCTTCAGTTCATATAAGCTTATTCG-GAATAAATACTAATTTATTA
66 -TTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTAGAGAAAAAATACTAATTTAATA
*
89189 ACA-TTCAAAAAATTAAAAAGCAA-AAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTT-
129 ACATTTC-AAAAATTAAAAAGCAATAA-A-TTT-AAAAATAAATGTGTTTG
** * * *
89237 CTTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAAAAATTATTTATTTAAAATTGTTATGAACTT
1 C-TAAATC-AGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAAAAATTATCTA-TT-AAATTGTTATGAACTT
*
89301 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT
62 TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTAT
89344 CCAAAATAAA
Statistics
Matches: 223, Mismatches: 34, Indels: 38
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Matches are distributed among these distances:
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180 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
CTAAATCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAAAAATTATCTATTAAATTGTTATGAACTTTTGT
TTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTAGAGAAAAAATACTAATTTAATAAC
ATTTCAAAAATTAAAAAGCAATAAATTTAAAAATAAATGTGTTTG
Found at i:90029 original size:180 final size:178
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 17.9 Consensus size: 178
89687 TATTCGAAAT
* * * ** * *
89697 AACAAATTAATTTTTCAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAGAATAATAACAAATTAGTATTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * ** *
89762 TATTCCAAACAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAAC
65 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAATCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGAT
*
89827 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTAGTA
130 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTAGTA
*
89878 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * *
89943 ATTTTGAATAAACTTGTTTGAATCG-AACAAATTGGTTTATGACAAAACAAATGATCATAACGAT
66 ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATCGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGAT
* * *
90007 TTGAAATAGAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGAATTTAGAA
130 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG---TTAGTA
* *
90058 AACAGATTTATTTTTTAAA-ATTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTATT
** * * *
90121 TTA-TGGGAAATAAGCTTGCATGAA-CAAAACCAATTGTTTTATGAGAAAACAAAA-AGTCATAA
64 TTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATCGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
* * * * ** * *
90183 -CATTTTGAAATAGAT--TTTTTTACATACACATAACTATTTGAACTTATTCGGTA
126 TGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AGTA
* * * * * *
90236 AACAAATTTATTTTTTTAATTCTCTTGCTCT-TTAATTTTTGAAGTATTAATAAATTTGTATTAT
1 AACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * **
90300 TTTATTTCAAATAAAG-TTATATGAA-CTAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGGTCACC
63 TTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATA
* ** * * *
90363 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAACCATGACTATTTGAATTTATTTAGTA
125 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CT-GTTAGTA
* ** * *
90419 AACATATTTATTTTTTAAAAAT-TTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATAAATATTAT
1 AACAGATTTATTTTTT--AAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
90483 TTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGA-GATAAAACAAAA-AGTTAGA
63 TTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATCGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGA-TCATA
** * * * * *
90545 ACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCGGTA
125 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AGTA
* *
90601 AACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * * * *
90665 TT-GTTCGAAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAAAAATCATTTAATGACAAAGCAAAAGATTATAGT
64 TTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * * * *
90728 GATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTGGAACTTGTTCGATA
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG-TA
* * * * * **
90782 AATAGAATCATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAACAGCTTAGTATTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * *
90847 TATTACGAATAAGCTTGTATGAA-CTGAAATAATTTTTTTATTACAAAACAAAATG-TCATAATG
65 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATG
* * *
90910 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAGTA
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-AGTA
* * * * *
90963 AACATG-TTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTGAATATTAATAAATTTGTATTATT
1 AACA-GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
91027 TTAATTT-GAATAAGCTTATATGAA-CAAAAACTATTGTTTTATAACAGAACAAAAAAAATCATA
64 TT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACA-AA-ACAAAAGATCATA
* * * * * * *
91090 ATAATTTGAAAGAAATAATTGCTCAAAAAGTCATAACTATTTGAAATGGTTTGTTA
125 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTAG-TA
* * *
91146 AGCA-ATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
91209 TTATTTCGAACAAACTTATAT-TATCAAAAACAATTGTTTTATTAAAAAACAAAA-ACTAATAAT
64 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAAT
* * * * * * *
91272 AATTCGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATTCTTTGAACTAGTTCGGTA
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-AGTA
* * * * * * *
91326 AATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTTTTATTC
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * **** *
91391 TA-TTCGAAATAAGCTTCTAT-AAGTTGGAAA-AAAAAATTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAAT
65 TATTTCG-AATAAGCTTGTATGAA--TCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* ** **
91452 GATTTGAAATAGGA-AATTGTTC--ATAGTCTTAACTATTTGAACAAATTCAACA
127 GATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AGTA
* * * * * * * *
91504 AACAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTATTAATTTTTTTAATTTTATTATATTAGAACTATT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * * * *
91568 TTATTTTGAATAAACTTATATGAA-CAAAAATAATTGTTTCATGACATAATAAAGGGTTATAACT
64 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-T
* * *
91632 -ATTTGAAGTATACT-ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTA
127 GATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG--TTAGTA
* * * * ** *
91685 AATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAAGATTAATAAATTAAAACTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * * * *
91750 TA-TTCTGAATAAAATTGTAT-AA---AAA-AATTATTATATGACCAAATAAAAGGTAATAACGA
65 TATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA
* * * * * * * *
91809 TTTAAAATAGATAATTGTTGAAATGGAT-AAAATTATTTGAATTAATTCAGCA
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT-GTT-AGTA
* *
91861 AACATATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATTAGTATTATTC
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * ** * * * * *
91921 GATTTCAAATAAGTTTGTGTGAATTAAAACAAATATTTTAT-AGCAGAACAAAAGGTCATAACGA
65 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAATCGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGATCATAATGA
* * * * * *
91985 TTTTAAATTGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTTGTTCGATA
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTAG-TA
* * * * *
92037 AACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTGGAAATATTAAAAAATTAGTATTATT
1 AACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * *
92101 TTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA-CTGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAATG-TCATAAT
64 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAAT
* * * * * *
92164 GATTTTAAATAAATAATTATTC-AATAGTAATAACTATTTTAACTTGTTCGATA
127 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG-TA
* * * * * *
92217 GACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTATT
1 AACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * ** * * * * *
92282 TTATTTCAAATAAGCTTGTAAGATAT-GAAACAAATATTTTATGATTAAACAAGAGGTTAGAACG
64 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * ** **
92346 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGGTCGGTA
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--GTTAGTA
* * * * *
92399 AACACATTTA--TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATACTATTAAATTAGTATTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * **
92462 T-TAATCAAATAAGCTTCTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATTTTAATG
65 TAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * * * *
92524 ATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGATTCGATA
128 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAG-TA
* * * *
92577 AACAGATTTATTTTTAAAATATTTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * *
92642 TATTTCAAATAAGCTTGTAT-AATCAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAACATCATAATGA
65 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA
* ** * * *
92706 TTTGAAGTAGATAATCATTCAAATCA-CCATAATTATTTTAACTGATTTAGTA
129 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTG--TTAGTA
* * **
92758 AATAGATTTGTTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTT-TTAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * * *
92822 TTATTTCGTCTAAGCTTGTATTAA-CTAAAACAATTATTTTATTACAAATCAAAAGGTTATAACG
64 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATC-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * *
92886 A-TTGTAAATAAACAATTATTCAAATA
128 ATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATA
92912 ATAATAATAA
Statistics
Matches: 2389, Mismatches: 499, Indels: 293
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
171 27 0.01
172 21 0.01
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Consensus pattern (178 bp):
AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATCGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATT
TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGTA
Found at i:90920 original size:544 final size:536
Alignment explanation
Indices: 89697--102433 Score: 3264
Period size: 543 Copynumber: 23.6 Consensus size: 536
89687 TATTCGAAAT
* * * *
89697 AACAAATTAATTTTTCAAATCT-TCAACTTATTAATTTTTAGAATAATAACAAATTAGTATTATT
1 AACAAATT-ATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * **
89761 TTATTCCAAACAAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACA
63 TTATTACAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * *** *
89825 ACTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTAGTAAACAGATTTATT
127 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAGTAAACAAATTTATT
* *
89890 TTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
192 TTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATA
* * ** * * * *
89953 AACTTGTTTGAAT-CGAACAAATTGGTTTATGACAAAAC-AAATGATCATAACGATTTGAAATAG
256 AGCTTGTATGAATAAAAAC-AATTGTTTTA-GATAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATA-
* * * *
90016 AA-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGAATTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAA-A
317 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-ATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* ** *
90078 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATGGGAAATAAGCTTGCATG
381 TTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * *
90143 AACAAAACCAATTGTTTTATGAGAAAACAAAA-AGTCATAAC-ATTTTGAAATAGAT--TTTTTT
444 AACAAAA-AAATTATTTTATGA-CAAACAAAAGA-TAATAACGA-TTTCAAATAGATAATTATTC
* * *
90204 ACATACA-CATAACTATTTGAACTTATTCGGTA
505 AAATA-ATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * *
90236 AACAAATTTATTTTTTTAATTCTCTTGCTCT-TTAATTTTTGAAGTATTAATAAATTTGTATTAT
1 AACAAA-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * **
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* * *
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* * * * *
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*
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* *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ****
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* *** * **
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* * * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * * * *
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** ** * * * * * * * * *
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123 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAA--T-TTATTTAGTAA-AC
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93116 TTAAA-ATA-TTATT-AAATTAGTATTA-TT-TTAATTCGAATAAGGTTATATGAACAAAAAAAT
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* * * * * * * * *
93288 TATTA-AGTTTTGGAATATTATTAAATAAGTATTA-TT-TT-ATTTTGAATA-AAAT-AGTATGA
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526 CTTGTTCGGTA
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* * * * * * * *
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93688 ATAAGCTTTTATGAGCT-GAAATATTTATTTTATA-ACAAAGCAAAAGGTTATAAAAATTTAAAA
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93751 TAAATAATTGTTCATATAGCCTTAATTCTTTGAATTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
315 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
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505 AAATAATCATAATTATTTGAACTTG-TTCGGTA
* *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
94951 CTTGTATAAACTGAAATAATTGTTTTATGATTAAACAAAATG-TTAGAATGATTTGAAATAGATA
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* ** * * * * * ** *
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* * * * *
95054 AACGCATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTT
1 AAC-AAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* ** * * *
95119 TAAT-CTAAATAAGCTT-TATGAAAAGAAGCAATTGTTTTATGACAAAATAAATA--TCATAACG
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* * * ** * *
95180 ATTTGAGATAGATATTTGTAT-AAATAATCATAACTATTT-AAAATATTTCAGTAAATAGATTTA
127 ATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTT-AGTAAACAAATTTA
* * * *
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** * * * * * * *
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446 CAAAAA-AATTATTTTATGACAAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * *
95563 GTCCTAAGTATTTGTACTTGTTCGATA
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* * ** * * *
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95654 TTATTTCAAATATGTTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGAT-ATAATT
63 TTATTACAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATG
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127 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAGTAAACAAATTTATT
* * * **
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95844 AAAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTTTACAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
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* ** *
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* * *
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* * * * * *
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1 AACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTT
*** **
96197 TAATT-CAAATAAGCTTGTATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAACTCATAATGA
64 T-ATTACAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
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96261 TTTGAAATA-AAAATTTATTCAAATAGTCATTACTATTTGAATATA-TTCGATAAACAAATTTA-
128 TTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAG-TAAACAAATTTAT
* * * * *
96323 TTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATAAATATATT-TTAATTATTTTAA-TTGAA
191 TTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTAATTTG-A
* * * * * * *
96385 AGAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAAT
253 ATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAT
** * * * *
96449 AGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTTAGTTTTTAAA
316 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAAC-TGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
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* * * ** * * *
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442 TGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCA
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* ** * * *
96673 AATAGGTTCA-TTTTTAAATC-CATTATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACT
1 AACAAATT-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * *
96736 TTATTTCGAATAAGAC-TGTATCAA-TAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGCCATAAC
63 TTATTACAAATAAG-CTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * ** * *
96799 GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTGGTTT-GATAAATAGATTTT
126 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAG-TAAACA-AATTT
* * * *
96863 ATTTTTT-AAA--TCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAA
189 ATTTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAA
* * * * * * * * ** *
96924 CAAACTTATATGAAAAAAAATATTTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAATGATTCGAAATAA
254 TAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAA
* * * * * * * ** * * *
96989 ATAATTATTCATATAGGCTTAATTATTTGAATTGGTTCAGTAAACAAATTTATCTTTTAAATCTC
318 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT
* * * * *
97054 TTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA
383 TTACTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAA
* * * *
97119 CATAAATAATTGTTTTATGGCAAA-ACAAA-ATAAT--TG--TTCAAATAG--------TC--AT
446 CA-AAAAAATTATTTTATGACAAACA-AAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAAT
* *
97168 AA-C-----TATTTGAACTAGTTTGGTA
509 AATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * * * * *
97190 AGCATATTTATTTTTTAAATATCCTACTTATTAATTTTTAAAAAATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTT
*** * * * * * *
97255 TATTTTGAATAGGCTTATATG-A-TGAAAAATAATTGTTTTATGA-AAAAAAAAAGTTTATAACT
64 TATTACAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-T
* * * * * * * * * * *
97317 -ATTTGAAATACATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGCATTAATTCAATAAACTAATTTAC
126 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAGTAAACAAATTTAT
*** * * * * * * *
97381 TTTTT-AAATCTCCAACTTCTCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATGTTTG-A
191 TTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTTGAA
* * ** * * * ** * *
97444 TAAGCTTTTATGATTTGAAACAATTGTTGTATGATAAAA-AAAAGGTTATAATGATTTTAAATAG
254 TAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAA
* * * * *
97508 ATAATTGTTCAAATAATCATAACTGTTCGAACTTG-TTCGGTAAACA-AGTTTATTTTTTTTAAT
318 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTTGGTAAACAGA-TTTA-TTTTTTAAAT
* * * * *
97571 -TTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTACTATTTTATTTC-AAATAAACTTGT
380 CTT-TTACTTATTAA-TTTTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGT
* * * ** * * * * * * *
97634 ATAAACTGAAATAATTATTTTATGACTAAA-TGAAGGT-CTAAACAATTTGACATAAATAATTGT
441 ATGAAC-AAAAAAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGATAAT-AACGATTTCAAATAGATAATTAT
* * * * * * *
97697 TCTAACAGTCTTAATTATTTGAACTAGTTCAGCA
503 TCAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * * * *
97731 AACATATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAGAATATT-ATTACTTCAGCAATATT
1 AACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATT-AGTATTATT
* * * * * * * * *
97791 TTACT-CTAAATAACCTTATATGAAC--AAA-GATAGATAATTAT-TCAAATAGTCATAA-CT-A
63 TTATTAC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG-T-TTTATGACAAA-A--CAAAAGGTCA
* * * * *
97849 TTTGAACTGGTTTGCTAAATAGAT--TTAGTTTCTAAAT-CTCTTATTAA-TTTTTCAA-ATA-T
122 --T-AA-TGATTTG--AAATAGATAATT-G-TTC-AAATAGTC--A-TAACTATTTGAATTTATT
* ** * ** * * *
97908 TAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAATTTTGTA-TGAATCAAAACAATCGTTTTACGACA
175 TAGTAAACAAAT-TTA-TTT-TT-T-AA-AATTTT-TACT---T---ATTAAT-TTTTTA-AATA
* * ** * * * * * * * * ** * *
97972 -AAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGAAAATAGTTTGAATGGAT-ATGACTATTTAAACTT
225 TTAA-TAAAT-T-AGTATTATTTTAATTTGAATA-AGCTTGTATGAATAAAAAC-AATT---GTT
* * * *** * ** * ** * ** * * * *
98035 GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTGA-AATCTCCAACT-TTTAATT-TTTAGAATATTAATAAATT
282 -TTAGATAAA-ACAAAAAGTCATAACAAT-TTGAAATAAATAATTGTTCA-AATAGTCAT-AACT
** * * * * *** * ****
98097 AGTATT-ATTTTATTT--TAAATAAACTTGTATGAATAGAAAAT-TTTGT-TTTATGATAAAACA
342 A-T-TTGAACTGATTTGGTAAACAGA-TT-TAT--TTTTTAAATCTTT-TACTTAT--TAATTTT
* * * * ** * * ** * * *
98157 AAAGAATCATGACAATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACATCA
398 TAATATTAAT-A-AATTT-GTAT-TAT-TTTATTCGAA-A-T-A-AGCT-TGT--A-TGA-A-CA
* * *** ** * ** * ** * *
98222 TAAACAAATTTATTTT-TTA-AATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAAT-TTTAATAAATT--AG
448 -AAA-AAA-TTATTTTATGACAAAC-AAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAAT-TATTCAAA
* * ***
98281 T-ATTAT-TTTATTTTGAA-TATGCTTTTATGA
508 TAATCATAATTA-TTTGAACT-TG-TTCGGT-A
* ** * * *** * * *
98311 ATAGAAACAATTGGTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA-TAATATTTTGAAATAGATAATTATTCAA
1 A-ACAAATTATT--TT-T--TAAATCTCTTA-CTTATTAAT-TTTTG-AATA-TTAA-TA---AA
* * * * * * *** * *
98374 ATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAAT-AGATTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATT
52 TTAGT-AT---TATTT-TA-TTA--C---AAATAAG-CTTGTATGAA--CTGAAAC-AATT-GTT
** ** * * * ** * * * *
98438 TT-TGA-AATATTAATAAATTAAT-ATTATTTTACTTCAAATAA--GCTT-ATATGAACTGA-AA
101 TTATGACAA-AACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTG-TTCAAAT--AGTCATAA
* * * ** ** ** * * ** * * *
98496 C-AATT-ATTTTAATTACAAAACAAA---AGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAA
160 CTATTTGAATTTATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAA-AATTTTTACTTA-TTAATTTTTTAAA
* * * ** * * * * ** * * ** *
98555 TAGTCAT-AACTA-T-TTGAACTT-GTTCG-GTAAACATATGTAT-TTTTAAATCGTTTACTTAT
223 TATTAATAAATTAGTATT-ATTTTAATTTGAATAAGC-T-TGTATGAATAAAAACAATT-GTT-T
* * *
98614 TA-ATTATTGAAACATTAATAAAT--TAATATTATTT-TAATCCAAATAACCTT-TT-ATGAATA
283 TAGA-TA---AAACA--AA-AAGTCATAACA--ATTTGAAAT--AAATAA--TTGTTCA--AATA
* ** * * ** * * * *
98673 G--A-AAC-AATTG-TTTTATGT-CAAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTG
333 GTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-
* * * * * * *
98732 TGAAACATTATTAGATTAGTATTACTTTATTCTGAAGA-AA-CTTGTATCAACAAAAATAATTAT
397 T-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTC-GAA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAA-AATTAT
* * * * * * ** * * *
98795 TTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
458 TTTATGAC-AAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAATTATT
* *
98860 TGAACTAGTTCAGTA
522 TGAACTTGTTCGGTA
* *
98875 AAC-ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAA-AGATAATAAATTAGTATTATTTT
1 AACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTT
* * ** ** * * * *
98934 ATTGCAAATAAGCTTGAATGGTCAAAAACAATTGTTATATGACCAAAC-AAAGGTAATAACGATT
65 ATTACAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * * * * * *
98998 TGAAATTGATAACTATTGATAA-GGTCATAATTATTTGAATTGATTCAATAAACAAATTCA-TTT
130 TGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAGTAAACAAATTTATTTT
* * * * * * *
99061 TT-AAATTACTTACTTTTTTATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAA
194 TTAAAATT-TTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAG
* * * * *
99125 CTTGTATGAACT-AAAAC-ATTGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTCGAAATAGAT
258 CTTGTATGAA-TAAAAACAATT-GTTTTA-GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAT
* * * * * * * *
99188 AACTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACT-ATTTCAGCAAACAGATTTATTTTTCAAATCTCT
320 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * * *
99252 TAGTTAGTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATG-A
384 TACTTATTAA-TTTTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAA
* * * ** * * * * * * *
99316 CTTGAAACAATTATTTTATAATGGAATAAAAGGTTATAATGATTTGATATAGATAACTATTCAAA
446 C--AAAAAAATTATTTTATGA-CAAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAA
* **
99381 T-A--A-GA--A-TTG-----GTTCAATA
508 TAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
*
99398 AACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AACAAA-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * *
99463 TTACTT-CGAATAGGCTTGTATG-A-TGAAAAGCAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
63 TTA-TTACAAATAAGCTTGTATGAACTG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * ** * **
99525 CAATTTGAAATACATAATTGCTCAAAT-GGCATAATTATTTGAATCGA-TTCGATAAACTGATTT
125 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAG-TAAACAAATTT
* * * * * * ** * *
99588 ATTTTTT-AAATCTCTAACATATCAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAAAATTATTTTATTTTGG
189 ATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA
* * * * * *** *
99652 ATATGCTTTTATGAACT-GAAATAATTATTTTATGATAAAAC-AAAAGTGCATATTTATTTTAAA
253 ATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAAGT-CATAACAATTTGAAA
* * * * ** * * *
99715 TAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTTGATAAACATAATTATTTTTTAAAA
315 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAA
** * * *
99780 T-TTCTTGTTTATTAATTTTATGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCATG
379 TCTT-TTACTTATTAATTTT-T-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTG
* * * * * * * * * *
99843 TATGAACTAAAACAATTATTTCATGACTAATCAAAAGGT-TTGAGCAATTTGACATAGATAATTT
440 TATGAAC-AAAAAAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGATAAT-AACGATTTCAAATAGATAATTA
* * ** * * *** ***
99907 TTCTAGTGGTCTTAACTATTTGAACCAATTCAACA
502 TTCAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * ** * * *
99942 AATAGATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAATTTAGTATTATTC
1 AACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTT
*** * * * * * *
100007 TATTTTGAATAAACTCGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA
64 TATTACAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * ** *
100071 TTTGAAATA-AAAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTTGCTCTA-TAAA-AAGATTTA
128 TTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTATTTAGTAAACAA-ATTTA
* * ** * *
100133 CTTTTT-AAATCTTTTACCTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAG-ACTTATTTT-ATTTCA
190 TTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTAATTT-G
* * * * *** *
100195 AATGAGCTTTTATGAATAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAA-TGTATGTCATAACAATTTGAAA
252 AATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATT-GTTTTA-GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * *
100258 TAGATAATTATTAAAATAGTCATAACTATTTGAA-TG-TGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAA
315 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGAT-TT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAA
* ** * * *
100321 AT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATTTAAATTATTTTATTTGAAATAAACTTGC
378 ATCTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGT
* * * * * * * * * *
100385 ATCAATAAAACCAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATATATAATTATT
441 ATGAACAAAA-AAATTATTTTATGA-CAAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATT
** * * * * * *
100450 CAGGTAGTCATAACTATTTAAACTTATTCAGTG
504 CAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * * * * *
100483 AATAGATTCTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AACA-AAT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
100548 TTACTT-CAAATAAGCTTATATGAACCGAAATACTTATTTTAATTACAAAAGAAAAGGTCATAAT
63 TTA-TTACAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * * *
100612 GATTTGAAATAAATAGTTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACATATATA
126 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAG-TAAACAAATTTA
* * * * * **
100676 TTTTTTTAAAATTTTTCACTTTTTAGTTATTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATACGA
190 -TTTTTTAAAATTTTT-ACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA
* * * *
100741 ATAACCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG-T----C---AA-TC---ACAAGTTAAAATA
253 ATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATA
* *** * *
100794 AATAATTGCTT-AAATAGTCATAA-TAATTTGAATTTG-TTCAATAAATATATTTATTTTTTAAA
317 AATAATTG-TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-CTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * *
100856 TCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATCTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTTTT
379 TCTTTTACTTATTAATT-T-TTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATAAGC--TTG
* * * * * * * *
100921 TATGAATAGAAAATATTATTTTGTGAGAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTAT
440 TATGAACA-AAAAAATTATTTTATGA-CAAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTAT
* * * * **
100986 TCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTATTCAATA
503 TCAAATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * * *
101020 ATA-GAATCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTAGATTATTAATAAATTAGTATTAGT
1 A-ACAAATTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * **
101083 TTATTTCGACTAAGCTTATATGAATTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAA
63 TTATTACAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * * * * *
101148 TTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATCATGATTATTTG-ATCTAGTTCAGTAAACATATTTATG
128 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-TTTAGTAAACAAATTTATT
* * * * * * *
101212 TTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTCATTCGGATAA
192 TTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAA
* * * * * **
101277 GCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATA
257 GCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTT-AGATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATA
* *
101342 ATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGA-TTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T
321 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
** * * * ** * *
101403 -CTTATTAACTTTCAAAATATTAAT-GATTAGTTTTACCTTATTTCGAACA-AA-CTTATATCAA
385 ACTTATTAA-TTT-TTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAA-ATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * * * *
101464 CAAAAACATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATATTTGTTAAAATA
446 CAAAAAAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATA
* * **
101529 GTCATAATTATTT-AAATTGGTTATAG-A
510 ATCATAATTATTTGAACTT-GTT-CGGTA
* * * *
101556 AACAGAGTTATTTTTTAAATCTCTCACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTTGT-TTATTT
1 AACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * * *
101620 TATCCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATG
64 TATTACAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * ** * **** *
101685 ATTTAAAATAGA-AATTGTTCATACAGTTTTAAATATTTGAACCGGTTCAGTAAACAAATTTATT
127 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTAGTAAACAAATTTATT
* ** * * ** *
101749 TTTT--AATTTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTTTTTTTAATA
192 TTTTAAAATTT-TTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATA
* * * * * *** * ****
101812 AGCTTGTATCAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGGTTTGAAGTTTGC
256 AGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA-GATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAT
* * ** * *
101877 AATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT
320 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * **
101941 TATTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTAAATGTT
384 TACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATG--
* * * * * ** * * *
102005 AA-AAAACAATTGTTATATAACCAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTGACA
444 AACAAAAAAATTATTTTATGA-CAAACAAAAGATAATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCA-A
** * ** *
102069 A-GGTCATAATTATTTAAACTAATTCGGCA
507 ATAATCATAATTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * * * * *
102098 AATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTT
1 AACAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
*** * * * * * * **
102163 TATTTTGAATAAGCTTTTATGAATTGAAAAAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAAT
64 TATTACAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
* * ** * * * * * *
102228 TTGAAATAGATAATTGCTCATACGGTCTTAATTGTTTGAA-CTACTTTGGCAAACAAATTTA-TT
129 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTA-TTTAGTAAACAAATTTATTT
* * * * *
102291 TTTCAAATCTCTTA-TCATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAAT
193 TTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAAT
* * * * * **
102354 AAGCTTATATGAACT-GAAACAATTATTTTCTA-ATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
255 AAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATT-GTTT-TAGATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATA
*
102417 GATAATTGTTCAAATAG
317 AATAATTGTTCAAATAG
102434 GAACTAGATC
Statistics
Matches: 9060, Mismatches: 2270, Indels: 1732
0.69 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
494 5 0.00
495 11 0.00
496 15 0.00
497 19 0.00
498 12 0.00
499 2 0.00
500 11 0.00
501 33 0.00
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503 20 0.00
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532 410 0.05
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* * * * *
93120 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGGTTATATGAACA-AAAAAATTTGTTTTA
191 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA-TTGTTTTA
* * * * *
93184 TGACAAAAGAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAA
255 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAA
* * * ** * * * **
93249 CTGGTTCGGCAATTAGATTTATTTCTTAATTTTCTTGGTT
319 CTTGTTCAGTAAACAAATTTATTT-TTAAATCTCTTACTT
* * * *** ** * * *
93289 ATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAACAATCA
1 ATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAA-AA
* * * * *
93354 A-AA-----CTAT-TCAAATAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
64 ACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * * * *
93411 -AAGCTATTTGAAATAT-TTTGGCAAGTAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT
128 TAA-CTATTTGAAAT-TGTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * ** * * *
93474 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAAATTATATTAACAAAAACAATTGTTTTA
190 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * *
93539 TGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAA
255 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAA
** * * * *
93604 -TTGGTTTGGCAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACTC
319 CTT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTT-TAAATCTCTTACTT
* * * * * * *
93644 ATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCGAATAAGCTTTTATGAGCT-GAA
1 ATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAA
* * * * * ** * * * * *
93708 ATATTTATTTTATAACAAAGCAAAAGGTTATAAAAATTTAAAATAAATAATTGTTCATATAGCCT
64 ACAATTGTTTTATGACAAA-CAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * * *
93773 TAATTCTTTG-AATTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATT-AGTTTTCA
128 TAACTATTTGAAATTG-TTCGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTA
* * ** *
93836 GAATATTACTAAATTAGTAGTATTTTATTTTTAATAAGCTTGTATG-ACTAGACACAATTGTTTT
191 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTT
* * * ** * ** * *
93900 ATGATAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAAGTATTTGAATAGTCAAAACTATTTAA
254 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATACTATTTGA
**
93965 AC-TGCTTCAAAAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTT
318 ACTTG-TTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * *
94002 ATTAATTCTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATG-TTGAAAA
1 ATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAA
* * * * * *
94066 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGGTCAAATGGCCA
64 ACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
94131 TAATTA-TTAAAATTGATTCAATAAACT-GATTAATTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
128 TAACTATTTGAAATTG-TTCGATAAA-TAGATTTATT-TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * * *
94194 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTT
190 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTT
* * * * * *
94258 ATGACAAAACAAATGGTCATAA-TATTTTTAAAAAGATAATT-GT--GATAGTCATAACTATTTG
254 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTG
* * * * *
94319 AACTTATT-TGATAGACAGATTTATTTTTCCAAATCTCATACTT
317 AACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTT--AAATCTCTTACTT
* * * * * *
94362 ATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATTAGCTTGTATAAACT-GAA
1 ATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * * * * * *
94426 ACAATTATTATATTACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT
64 ACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
94491 TAAATATTTGAACTAGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTTGAA
128 TAACTATTTGAAATTGTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTAA
* * * *
94552 ATATTATTAAATCAATATTATTTTTATTT-GAATAAGCTCT-TATGCTAA-A-AAACAGTTGTTT
192 ATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCT-TGTATG--AACAGAAACAATTGTTT
* * * * * * *
94613 TATGAGAAAACGAATA--TCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTG
253 TATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTT
* ** * * *
94676 GAA-TTGGTTCAGAAAACAGCTTTAGGTTTTAAATCTTTTGCTT
316 GAACTT-GTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * * *
94719 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAACT-AAA
1 ATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
*
94783 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGACTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATAGT
64 ACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACT-A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
94846 CA-AATCTATTT-AAATTTGTTCGATAAATAGATATATATTTTTTAAATCTCTTGCTTGTTAAAT
126 CATAA-CTATTTGAAA-TTGTTCGATAAATAGAT-T-TA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* ** * * * *
94909 TTTCAAATGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTGT-GAATAAACTTGTATAAACTGAAATAATTG
186 TTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG
** * * * * * ** * *
94973 TTTTATGATTAAACAAAATGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAATTAT
250 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTAT
* * * * * ** *
95038 CTAAACTAGTTTAGCAAACGCATTTATTTTTTAAATCTCTTATTT
314 TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTT
* * * *
95083 ACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTT-TATGAA-AAGAA
1 ATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAA-AA
* ** * * * *
95146 GCAATTGTTTTATGACAAA-ATAAATATCATAACGATTTGAGATAGATATTTGTAT-AAATAATC
64 ACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTC
* *
95209 ATAACTATTTAAAATAT-TTC-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAA---TTT-CTTACTAATTTTT
127 ATAACTATTTGAAAT-TGTTCGA-TAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * * *
95268 AAAATATTAATATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATTAACAAAAACAATTGTTTT
189 TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * *
95333 ATGAGAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGCTTATTTGA
254 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAC-TATTTGA
* * * *
95398 ACTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTATAAATCTCTTACCT
318 ACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTT-TAAATCTCTTACTT
* * * *
95439 ATTAATTTTTAGAATATTAATATATAAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAATAAAAA
1 ATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA
* * * * * * * * *
95504 CAATTGCTTTCTAACAAACGAAAGGTCATAACTATTTAAAATAAATAATTATTCAAACAGTCCTA
65 CAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
95569 AGTATTTGTACTTGTTCGATAAATAGATTTATAGCTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTTAAA
130 ACTATTTGAAATTGTTCGATAAATAGATTTAT--TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTAAA
* * * * *
95633 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATATGTTTATATGAACAGAAACAATTGGTTTATGA
193 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * * *
95698 CAAAACAAAAGGAT-ATAATTATTTGACATTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACG
258 CAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAACT
* * * *
95762 TGTTTAGAAAATAAATTTATTTTTCAAAT-TTTTACTT
321 TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTT-AAATCTCTTACTT
* * * *
95799 ATTAATTTTTAGAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTGTTCAAAAAAAAGCTTGTATGAATAGA
1 ATTAATTTTT-GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-CAAATAAGCTTGTATGAATA-A
* ** * * *
95863 AAA-AATTATTTTACAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATC
62 AAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
95927 ATAACTATTT-AAACTTGTTCAATAAACAAATTCATATTTTAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTT
127 ATAACTATTTGAAA-TTGTTCGATAAATAGATTTAT-TTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTT
** * * * * * *
95990 GGAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGATACAATTATTTT
189 TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
** * * *
96055 ATGATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGATTATTTGA
254 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTGA
* * *
96120 ACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTT
318 ACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTT-AAATCTCTTACTT
* * * *
96161 ATTAATTGTAGATATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAAAAAAA
1 ATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA
** * *
96225 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAACTCATAA-TGATTTGAAATA-AAAATTTATTCAAATAGT
64 ACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGT
* * * * * *
96288 CATTACTATTTG-AATATATTCGATAAACAAATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT
126 CATAACTATTTGAAAT-TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * * * * * * *
96352 AAATATAAATATATT-TTAATTATTTTAATT-GAAAGAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTCTTT
190 AAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* * * *
96415 TATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTT
253 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTA-TTT
96480 GAACTTGTTC-GATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTT
316 GAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * *
96523 ATTAATGTTTGGAATATTAATAAATTAGGATTATGTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAACATAAA
1 ATTAAT-TTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* ** * * *
96588 A-AATTGTTTTGTGACAAA-AAAATATCTTAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTTAT
64 ACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * ** *
96651 AACTATTTG-TATTGGTCAAGTTAATAGGTTCATTTTTAAATCCATTATTTATTAA-TTTTTAGA
129 AACTATTTGAAATTGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTA-A
* * * * * * *
96714 ATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGAC-TGTATCAATAAAAATAATTATTTTAT
192 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
96778 GACAAAACAAATGGCCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTAATTGAAC
256 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAAC
* * * *
96843 TGGTT-TGATAAATAGATTTTATTTTTTAAA--TC-T-CTT
320 TTGTTCAG-TAAACA-AATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTT
* * *** * * * *
96879 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAAAAAAAA
1 ATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA
* * * * * * * * * *
96944 TATTTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAA-TGATTCGAAATAAATAATTATTCATATAGGCT
65 CAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
97008 TAATTATTTG-AATTGGTTC-AGTAAACAAATTTATCTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTC
128 TAACTATTTGAAATT-GTTCGA-TAAATAGATTTAT-TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * * * *
97070 ATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTT
190 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
*
97134 TATGGCAAAAC-AAA----AT-A--A--T----T-G-------TTCAAATAGTCATAACTATTTG
253 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTG
* ** * * * *
97177 AACTAGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATATCCTACTT
317 AACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTT
* * *** * *
97219 ATTAATTTTTAAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATG-ATGAAAA
1 ATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAA
* * * * * * * * *
97283 ATAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAGTTTATAACTATTTGAAATACATAATTATTCAAATGGCCAT
64 ACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *** * * * *
97348 AATTATTTG-CATTAATTCAATAAACTA-ATTTACTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAAATTTTGA
129 AACTATTTGAAATT-GTTCGATAAA-TAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTA
* * * * *** *
97411 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATGTTTG-ATAAGCTTTTATGATTTGAAACAATTGTTGTA
191 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * *
97475 TGATAAAA-AAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTGTTCGAA
255 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT-ACTATTTGAA
* * * *
97539 CTTGTTCGGTAAACAAGTTTATTTTTTTTAATTTCTTACTT
319 CTTGTTCAGTAAACAAATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * * * *
97580 ATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTACTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATAAACT-GAA
1 ATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * ** * * * * *
97644 ATAATTATTTTATGACTAAA-TGAAGGTC-TAAACAATTTGACATAAATAATTGTTCTAACAGTC
64 ACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCAT-AACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
97707 TTAATTATTTGAACTAGTTC-AGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
127 ATAACTATTTGAAATTGTTCGA-TAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
97757 TTAATTTTTA
Statistics
Matches: 3519, Mismatches: 752, Indels: 395
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
336 13 0.00
337 30 0.01
338 3 0.00
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343 2 0.00
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Consensus pattern (357 bp):
ATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAC
AATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
CTATTTGAAATTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTAAATAT
TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAA
AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATACTATTTGAACTTGTTC
AGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTT
Found at i:97617 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 97148--97774 Score: 475
Period size: 180 Copynumber: 3.5 Consensus size: 179
97138 GCAAAACAAA
* * *
97148 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATATC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACA-ATTTATTTTTTAAATATC
** * * *
97213 CTACTTATTAATTTTTAAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATGAT
65 CTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAT
* * *
97278 GAAAAATAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAGTTTATAACTATTTGAAATAC
130 GAAAAACAATTGTTGTATGAAAAAAAAAAGGTTATAACTATTTGAAATAC
* * * * * * ** * *
97328 ATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGCA-TTAATTCAATAAACTAATTTACTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAAC-AATTTATTTTTTAAATAT
* * * * * * *
97392 CCAACTTCTCAA-ATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATGTTTG-ATAAGCTTTTAT
64 CCTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAAATAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTATAT
*** * * *
97455 GATTTGAAACAATTGTTGTATGATAAAAAAAAGGTTATAA-TGATTTTAAATAG
127 GATGAAAAACAATTGTTGTATGAAAAAAAAAAGGTTATAACT-ATTTGAAATAC
* * * * *
97508 ATAATTGTTCAAATAATCATAACTGTTCGAACTTGTTCGGTAAACAAGTTTATTTTTTTTAATTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAA-TTTA-TTTTTTAAATAT
* * * ** * * *
97573 CTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTACTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATAA
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* * * ** ** * * *
97638 ACTG--AAATAATTATTTTATGACTAAATGAAGGTCTA-AACAATTTGACATAA
128 A-TGAAAAACAATTGTTGTATGAAAAAAAAAAGGT-TATAACTATTTGAAATAC
* * * * * * *
97689 ATAATTGTTCTAACAGTCTTAATTATTTGAACTAGTTCAGCAAACATATTTATTTTTT-AA-AT-
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACA-ATTTATTTTTTAAATATC
* *
97751 CT-TTTATTAATTTTTAGAATATTA
65 CTACTTATTAATTTTTTGAATATTA
97775 TTACTTCAGC
Statistics
Matches: 344, Mismatches: 88, Indels: 34
0.74 0.19 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 19 0.06
177 1 0.00
178 1 0.00
179 9 0.03
180 175 0.51
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182 9 0.03
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (179 bp):
ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAATTTATTTTTTAAATATCC
TACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATG
AAAAACAATTGTTGTATGAAAAAAAAAAGGTTATAACTATTTGAAATAC
Found at i:98635 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 97820--98699 Score: 926
Period size: 180 Copynumber: 4.9 Consensus size: 179
97810 ATGAACAAAG
* * * * *
97820 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGCTAAATAGATTTAGTTTCTAAA
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAA
* * **
97885 TC--T-CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAATTTTGTA
65 TCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTA
* * * *
97946 TGAATCA-AAACAATCGTTTTACGACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAA
129 TGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* ** * *
97997 ATAGA-AAATAGTTTGAATGGAT-ATGACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTGA
1 ATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTT-A
** * *
98060 AATCTCCAACTT-TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTT
63 AATCT-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * ** *
98123 GTATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGATAAAACAAAAGAATCATGACAATTTAAA
126 GTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAA
* * *** * * *
98178 ATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACATC-ATAAACAAATTTATTTTTTAA
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-TGTTCGGTAAATAGATTTA-TTTTTAA
* ** * *
98242 ATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTT
64 ATC-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
*
98307 ATGAATAGAAACAATTG-GTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTTGAA
128 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAA
* *
98358 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAGATTT-TTTTTAATT
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTAAAT
* * * *
98422 CTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATAT
66 CT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* *
98487 GAACT-GAAACAATTATTTTAATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
130 GAA-TAGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * *
98538 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATGTATTTTTAAAT
1 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTAAAT
* * * * * * *
98603 CGTTTACTTATTAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTTTAT
66 C-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
*
98668 GAATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAA
130 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
98700 TTTATTTTTT
Statistics
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ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTAAAT
CTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
Found at i:98878 original size:291 final size:286
Alignment explanation
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Period size: 292 Copynumber: 1.8 Consensus size: 286
98402 TAAATAGATT
* * * *
98412 TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAAT
1 TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTGTGAAACATTAATAAATTAATATTACTTTACTTCAAAG
* * ** * **
98477 AAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTAATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
66 AAACTTATATCAACAAAAACAATTATTTTAATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * *
98542 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATGTA-TTTTTAAATCGT
131 ACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAT-T-TATTTTTTAAATC--
98606 TTACTTATTAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTTTATGAA
192 -T-CTTATTAATTATTGAAACA-TAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTTTATGAA
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254 TAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAATTTA
* * * * * *
98704 TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTGTGAAACATTATTAGATTAGTATTACTTTA-TTCTGAA
1 TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTGTGAAACATTAATAAATTAATATTACTTTACTTC-AAA
* * * * *
98768 GAAACTTGTATCAACAAAAATAATTATTTT-ATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTT
65 GAAACTTATATCAACAAAAACAATTATTTTAATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * *
98832 TACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCAGTAAACATTTATTTTTTAAATCTCT
130 GACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * *
98897 TATTAATTTTTGAAAGATAATAAATTAGTATTATTTTATTGCAAATAA
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98945 GCTTGAATGG
Statistics
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.08, T:0.43
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TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTGTGAAACATTAATAAATTAATATTACTTTACTTCAAAG
AAACTTATATCAACAAAAACAATTATTTTAATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
ACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACATTTATTTTTTAAATCTCTT
ATTAATTATTGAAACATAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTTTATGAATAGAAAC
AATTGTTTTATGTCAAAACAAATTTA
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Period size: 464 Copynumber: 2.0 Consensus size: 469
98213 CTCACATCAT
* * ** *
98223 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTGTGAAACATTAATAAATTAGTATTACT
* * ** * * * * * * *
98288 TTATTTTGAATATGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATATT
66 TTATTCTGAAGAAACTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * *
98353 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCGGTAAATAGATTTTTTTT
131 TTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCAGTAAACAGATTTTTTTT
* *
98418 AATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTT
196 AAATCTCTTA-TCATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTT
** * * * * *
98483 ATATGAACTGAAACAATTATTTTAATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
260 ATATGAACAAAAACAATTATTATAATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAACT
** * **
98548 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATGTATTTTTAAATCGTTTACTTA
325 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATGTATTTTTAAATCACTTACTTA
* *
98613 TTAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAACCTTTTATGAA-TAGAAA
390 TTAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACTA-AAA
*
98677 CAATT-GTTTTATGTCA
454 C-ATTGGTTTTATGACA
* * * *
98693 AAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTGTGAAACATTATTAGATTAGTATTACT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTGTGAAACATTAATAAATTAGTATTACT
* ** *
98758 TTATTCTGAAGAAACTTGTATCAACAAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAA
66 TTATTCTGAAGAAACTTGTATCAACAAAAACAATT-GGTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* ** * * * *
98823 TTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TAGTTCAGTAAACA-TTTATTT
130 TTTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTCAGTAAACAGATT-TTT
*
98886 TTTAAATCTC-T-T-ATTAATTTTTGAAAGA-TAATAAATTAGTATTATTTTA-TTGCAAATAAG
193 TTTAAATCTCTTATCATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTACTT-CAAATAAG
** * * *
98946 CTTGA-ATGGTCAAAAACAATTGTTAT-ATGACCAAAC-AAAGGTAATAACGATTTGAAATTGAT
257 CTT-ATATGAACAAAAACAATTATTATAATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGAT
* * * *
99008 AACTATTGATAA-GGTCATAATTATTTGAA-TTGATTCAATAAACAAAT-TCATTTTTAAATTAC
321 AACTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAAATGT-ATTTTTAAATCAC
* * * * * ***
99070 TTACTTTTTTATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA
383 TTACTTATTAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAA
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448 CTAAAACATTGGTTTTATGACA
99157 AAACAAA
1 AAACAAA
99164 AGGTCATAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (469 bp):
AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTGTGAAACATTAATAAATTAGTATTACT
TTATTCTGAAGAAACTTGTATCAACAAAAACAATTGGTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
TTGAAATAGACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTCAGTAAACAGATTTTTTTT
AAATCTCTTATCATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATAAGCTTA
TATGAACAAAAACAATTATTATAATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAACTA
TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATGTATTTTTAAATCACTTACTTAT
TAATTATTGAAACATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACTAAAACA
TTGGTTTTATGACA
Found at i:99115 original size:179 final size:181
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Period size: 181 Copynumber: 20.5 Consensus size: 181
98683 TTTTATGTCA
* * * * * * * * *
98693 AAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTGTGAAACATTATTAGATTAGTATTACT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * * * *
98758 TTATTCTGAAGAAACTTGTATCAACAAAAATAATT-ATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACA
66 TTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAA-CATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
* * ** * * * * * **
98822 ATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCAGT
130 ATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * *
98874 AAAC--ATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T--TAATTTTTGAAAGA-TAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * *
98932 TTATTGCAAATAAGCTTGAATGGTCAAAAACAATT-GTTATATGACCAAAC-AAAGGTAATAACG
66 TTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
* * * * *
98995 ATTTGAAATTGATAACTATTGATA-AGGTCATAATTATTTGAATTGA-TTCAAT
130 ATTCGAAATAGATAACTATTCATATA-GTCATAATTATTTGAACT-ATTTCAAC
** *
99047 AAACAAATTCATTTTT-AAAT-TACTTACTTTTTTATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCT-CTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * * * *
99110 TTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACTAAAACATTGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA
65 TTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
* * *
99175 ATTCGAAATAGATAACTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTATTTCAGC
130 ATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * * * * *
99227 AAACAGATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTAGTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAA-TTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * *** * *
99292 TTTATTCCAAATAAGCTT-ATATG-ACTTGAAACAATT-ATTTTATAATGGAATAAAAGGTTATA
65 TTTATTCCAAATAAGCTTGA-ATGAAC-AAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATA
** * * * *
99354 ATGATTTGATATAGATAACTATTCA-A-A-T-A-AGA--A-TTG-----GTTCAAT
127 ACAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATA-ATTATTTGAACTATTTCAAC
* * * * *
99397 AAACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAAATTCA-TTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * * *
99462 TTTACTT-CGAATAGGCTTGTATGATGAAAAGCAGTT-GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA
65 TTTA-TTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACA-TTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAA
* * * ** * * * * *
99525 CAATTTGAAATACATAATTGCTCAAAT-GGCATAATTATTTGAATCGA-TTCGAT
128 CAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAA-CTATTTCAAC
** * * * * * * **
99578 AAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTAACATA-TCAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAAAATTAT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGT-AATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
**** * ** * * * * *
99642 TTTATTTTGGATATGCTTTTATGAACTGAAATA-ATT-ATTTTATGATAAAACAAAA-GTGCATA
65 TTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAAC--AAAAACATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGT-AATA
*** ** * * * * * ** *
99704 TTTATTTTAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTTGAT
127 ACAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * ** * **
99759 AAACATAATT-ATTTTTTAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTATG-AATGTTAATAAATTAGTATT
1 AAACA-AATTCA-TTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTT-TGAAACATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
99822 ATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATT-ATT-TCATGACTAATCAAAAGGT-TT
63 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAAC-ATTGGTTAT-ATGACAAAACAAAAGGTAAT
* * * * * * * * * *
99884 GAGCAATTTGACATAGATAATTTTTC-TAGTGGTCTTAACTATTTGAACCAATTCAAC
126 -AACAATTCGAAATAGATAACTATTCATA-TAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * * * ** * * * *
99941 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAATTTAGTATTATT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
* *** * * * * * * * * * * *
100006 CTATTTTGAATAAACTCGTATAAATAGAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
66 TTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
* * * * * * * * * * *
100070 ATTTGAAATA-AAAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACT-TGCTCTAT
130 ATTCGAAATAGATAA-CTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTAT-TTCAAC
* * * * * **
100122 AAA-AAGATTTACTTTTT-AAATCTTTTACCTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAG-ACTT
1 AAACAA-ATTCA-TTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTA-TT
* * ** * * * *** * *
100184 ATTTTATTTCAAATGAGCTTTTATGAATAGAAACAATTAGTT-TATGACAAAA-TGTATGTCATA
63 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATA
* * * * * *
100247 ACAATTTGAAATAGATAATTATTAAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-
127 ACAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTAT-TTCA-AC
* * * * * * * * * *
100302 AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATTTA-AATTAT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAA-TTAGTATTAT
** * * * * * * * * * *
100365 TTTATTTGAAATAAACTTGCATCAATAAAACCAATT-ATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT
65 TTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAAC
** * * * ** * * **
100429 GTTTTGAAATATATAATTATTCAGGTAGTCATAACTATTTAAACT-TATTCAGT
129 AATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTAT-TTCAAC
* * * * * * * * * *
100482 GAATAGATTCTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAATATTA
1 AAACAAATTC-ATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGA-AACATTAATAAATTAGTATTA
* * *
100546 TTTTACTT-CAAATAAGCTT-ATATGAACCGAAATACTTATT--TTA-ATTACAAAAGAAAAGGT
64 TTTTA-TTCCAAATAAGCTTGA-ATGAA-C-AAAAAC--ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGT
* ** * * ** * * * * *
100606 CATAATGATTTGAAATAAATAGTTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-TGTTCGAT
123 AATAACAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTAT-TTCAAC
* * * ** * * * *
100665 AAACATATATAT-TTTTTTAAAAT-TTTTCACTTTTTAGTTATTGAAATATTAATAAATTAATAT
1 AAACA-A-AT-TCATTTTTCAAATCTCTT-ACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * * * * *
100728 TATTTTAATACGAATAACCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGTC-AATCACAA-GT--T
62 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAAT
** * * * *
100788 AA-AA-T--AAATA-ATTGC--TT-AAATAGTCATAATAATTTGAA-TTTGTTCAAT
126 AACAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTAT-TTCAAC
* * * * * * * *
100836 AAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATC-TTAATAAATTTGTATTA
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATT-T-TTGAAACATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * * * *
100899 TTTTATTCAAAATAAGCTTTTTTATGAATAGAAAATATT-ATTTTGTGAGAAAACAAAAGGTTAT
64 TTTTATTCCAAATAAGC--TTGAATGAACA-AAAACATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAAT
* * * * * *
100963 AGCAATTTC-AAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTTAAACT-TATTCAAT
126 AACAA-TTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTAT-TTCAAC
* * * **
101019 AATA-GAA-TCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTT-AGATTATTAATAAATTAGTATT
1 AA-ACAAATTCATTTTTCAAATCTC-TTACTTAGTAATTTTTGA-AACATTAATAAATTAGTATT
* * * * *** * * * *
101080 AGTTTATTTCGACTAAGCTT-ATATGAATTGAAACAATT-CTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
63 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGA-ATGAACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAAT
* * * * * * **
101143 AACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATCATGATTATTTGATCTAGTTCAGT
126 AACAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * * * * * * *
101199 AAACATATTTATGTTTT-AAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAGTATTAT
1 AAACAAATTCAT-TTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * ** * * * *
101263 TTTCATT-CGGATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATT-GTTTTAAAATAGAACAAAAAGTCATAA
65 TTT-ATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAA
** * * * ** * * * ***
101326 TGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATT-GGT
128 CAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTA-TTTCAAC
* * * * * ** * * * **
101380 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T--TAACTTTCAAAATATTAAT-GATTAGTTTTACC
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * **
101440 TTATTTCGAACAAACTT-ATATCAACAAAAACATT-TTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATG
66 TTATTCCAAATAAGCTTGA-ATGAACAAAAACATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
* ** * * * * * ** *
101503 ATTTGAAATAGATATTTGTTAAAATAGTCATAATTATTTAAATTGGTT-ATAG
130 ATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCA-AC
* * * * * * *
101555 AAACAGAGTT-ATTTTTTAAATCTCTCACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTTGT-TTAT
1 AAACA-AATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
101618 TTTATCCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTT-ATTTTATGACAAAACAAAATGTCATA
65 TTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAA--CAAAAACA-TTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATA
** ** * * * ** * *** **
101682 ATGATTTAAAATAGA-AATTGTTCATACAGTTTTAAATATTTGAACCGGTTCAGT
127 ACAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * * * * * * * *
101736 AAACAAATTTATTTTT-TAATTTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
* *** * * * * * * * * **
101800 TTTTTTTTAATAAGCTTGTATCAACAAAAATAATT-GTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATG
66 TTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAA-CATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
* * * * * * * * * * * * **
101864 GTTTGAAGTTTG-CAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTAGTTCAGT
130 ATTCGAA-ATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * * * * *
101916 AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
*** * * * * *
101981 TTATTTTGAATAAGCTTAAATGTTA-AAAAACAATT-GTTATATAACCAAACAAAAGGTAATAAT
66 TTATTCCAAATAAGCTTGAATG-AACAAAAAC-ATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAAC
* * * * * * * **
102044 AATTTGAAATAGATAATTGTTGACA-AGGTCATAATTATTTAAACTAATTCGGC
129 AATTCGAAATAGATAACTATTCATATA-GTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
* * * ** * *
102097 AAATAGATTCACTTTTT-AAATCACTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
1 AAACAAATTCA-TTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
*** ** * * * * * *
102161 TTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATTGAAAAA-ATT-ATTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAA
65 TTTATTCCAAATAAGCTTGAATGAA--CAAAAACATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAA
* * ** ** * * **
102224 CAATTTGAAATAGATAATTGCTCATACGGTCTTAATTGTTTGAACTACTTT-GGC
128 CAATTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTA-TTTCAAC
* * * * * *
102278 AAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTA-TCATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAA-TTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
* *
102342 TTTATTTCGAATAAGCTT-ATATGAAC
65 TTTATTCCAAATAAGCTTGA-ATGAAC
102368 TGAAACAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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186 1 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
AAACAAATTCATTTTTCAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACATTGGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACAA
TTCGAAATAGATAACTATTCATATAGTCATAATTATTTGAACTATTTCAAC
Found at i:100132 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 99403--102589 Score: 2110
Period size: 181 Copynumber: 17.8 Consensus size: 180
99393 CAATAAACAA
* *
99403 ATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACT
1 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
99468 TCGAATAGGCTTGTAT-GAT-GAAAAGCAGTTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAATT
65 TCGAATAAGCTTGTATAAATAG-AAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATT
* * * * *
99530 TGAAATACATAATTGCTCAAAT-GGCATAATTATTTGAA-TCGATTCGATAAACT-G
127 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTC-ATAAA-TAG
* * * * **
99584 ATTTATTTTTTAAATCTCTAACATATCAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAAAATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * * *
99649 TGGATATGCTTTTATGAACT-GAAATAATTATTTTATGATAAAAC-AAAAGTGCATATTTATTTT
66 CGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGT-CATAATAATTTG
* * * * * * *
99712 AAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTTGATAAACAT
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTGTTCATAAATAG
* * ** *
99765 AATTATTTTTTAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTATG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * **
99829 TTCAAATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTATTTCATGACTAATCAAAAGGT-TTGAGCAATT
64 TTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT-AATAATT
* * * * * * *** *
99892 TGACATAGATAATTTTTCTAGTGGTCTTAACTATTTGAACCAATTCAACAAATAG
127 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-ATAAATAG
** * * *
99947 ATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAATTTAGTATTATTCTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * **
100012 TGAATAAACTCGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAA
66 CGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
* * * * *
100077 ATA-AAAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTTGCTCTATAAAAAG
131 ATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-ATAAATAG
* * * * *
100128 ATTTACTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAG-ACTTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATT
* * * * * *** * *
100192 TCAAATGAGCTTTTATGAATAGAAACAATTAGTTTATGACAAAA-TGTATGTCATAACAATTTGA
65 TCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGA
* * *
100256 AATAGATAATTATTAAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATAG
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCA-TAAATAG
* * * *
100308 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAATTTA-AATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * * **
100371 T-GAAATAAACTTGCATCAATA-AAACCAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTT
65 TCG-AATAAGCTTGTATAAATAGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTT
* * ** * * *
100434 GAAATATATAATTATTCAGGTAGTCATAACTATTTAAACTTATTCAGTGAATAG
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-TAAATAG
* * * * *
100488 ATTCTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAC
1 ATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * ** * * * * * *
100552 TTCAAATAAGCTTATATGAACCGAAATACTTATTTTAATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTT
64 TTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTT-ATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTT
* * * * * *
100617 GAAATAAATAGTTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAT
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-ATAAATAG
* * * * * *
100671 ATATATTTTTTTAAAAT-TTTTCACTTTTTAGTTATTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
1 ATTTA-TTTTTT-AAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * *
100735 ATACGAATAACCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGTC-AATC-ACAAGT--TAA-AA--T
63 TTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTT
* *
100793 ---A-A-ATAATTGCTT-AAATAGTCATAA-TAATTTGAATTTGTTCAATAAATAT
128 GAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTC-ATAAATAG
* * *
100842 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATCTTAATAAATTTGTATTATTTTA-
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * **
100904 TTCAAAATAAGCTTTTTTATGAATAGAAA-ATATTATTTTGTGAGAAAACAAAAGGTTATAGCAA
64 TTC-GAATAAGC--TTGTATAAATAGAAACA-ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAA
* * * * * *
100968 TTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTATTCA-ATAATAG
125 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCATA-AATAG
* * * *
101024 AATCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTT-AGATTATTAATAAATTAGTATTAGTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * *
101087 TTCGACTAAGCTTATATGAATTGAAACAATTCTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACAATTT
64 TTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATTT
* * * * * * * * *
101151 GAAATAGATAACTATTCAAATAATCATGATTATTTGATCTAGTTCAGTAAACAT
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-TAAATAG
* * * * *
101205 ATTTATGTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTCA-T
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT
* * * ** * * *
101269 TCGGATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGA
65 TCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGA
* * * **
101334 AATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATTGGTAAATAG
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCATAAATAG
* ** * * **
101386 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAACTTTCAAAATATTAAT-GATTAGTTTTACCTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * * *
101446 CGAACAAACTTATATCAACAAAAAC-ATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA
66 CGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
* * * * *
101510 ATAGATATTTGTTAAAATAGTCATAATTATTT-AAATTGGTT-ATAGAAACAG
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAT--AAATAG
* * * * **
101561 AGTTATTTTTTAAATCTCTCACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTTGT-TTATTTTATCC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
101625 CAAATAAGCTAGTATGAATTCA-AAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTT
66 CGAATAAGCTTGTAT-AAAT-AGAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTT
* * * ** * ** * *
101689 AAAATAGA-AATTGTTCATACAGTTTTAAATATTTGAACCGGTTCAGTAAACAA
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-TAAATAG
* * * * * *
101742 ATTTATTTTTT-AATTTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTTTTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * * * * * * **
101806 TTAATAAGCTTGTATCAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGGTTTGAA
66 CGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
* * * * * *
101871 GTTTG-CAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TTAGTTCAGTAAACAT
131 -ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCA-TAAATAG
* *
101922 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * * *
101987 TGAATAAGCTTAAATGTTAA-A-AAACAATTGTTATATAACCAAACAAAAGGTAATAATAATTTG
66 CGAATAAGCTT--GTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTG
* * * * ** **
102050 AAATAGATAATTGTTGACAA-GGTCATAATTATTTAAACTAATTCGGCAAATAG
129 AAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-ATAAATAG
* * * * *
102103 ATTCACTTTTTAAATCACTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * * *
102168 TGAATAAGCTTTTATGAATTGAAAAAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
66 CGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
* * ** * * * *** * *
102233 ATAGATAATTGCTCATACGGTCTTAATTGTTTGAACTACT-TTGGCAAACAA
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TGTTCATAAATAG
* * * *
102284 ATTTATTTTTCAAATCTCTTA-TCATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * *
102348 TCGAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTATTTTCTAATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTG
65 TCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTG
* * *
102412 AAATAGATAATTGTTCAAATAG---GAACTA---GATC-AG-T--T-AATAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCATAAATAG
*
102453 ATTTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATT
1 A-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
102514 CCGAAT-AGACCTGTAT-GATGGAAAGCAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATT
65 TCGAATAAG-CTTGTATAAATAGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATAATT
*
102576 TGAAATACATAATT
127 TGAAATAGATAATT
102590 TATTTTATTC
Statistics
Matches: 2350, Mismatches: 539, Indels: 249
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
164 1 0.00
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168 6 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
CGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCATAAATAG
Found at i:104001 original size:181 final size:180
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Indices: 102588--104375 Score: 1535
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102578 AAATACATAA
* * * ** * * *
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* * * *
102652 ATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAAGC-AGTTCGATAAATAG
65 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-CTAGTTCGGTAAACA-
* * * *
102716 AA-CTATGTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAAT
128 AATTTAT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
*** * * * * * * *
102769 TTT-TTTCTATTTTGAATAAGCTGGTATGAGCTAAAATAACTATTTTATGACAAAAC-AAATGTC
1 TTTATTT-TATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * ** * * * * ** ***
102832 ATAATTATTTGAAATATATAATTGTTCATATAGTTTTAACTGTTTGAACTGGTTTGACAAATGGA
65 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAA
* * * * *
102897 TTCATTTTTTAAA--TCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTACTAAATTGGT
130 TTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * * *
102947 ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTTTTTTATGATAGAACAAAAAGTCA
1 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
** * * * * * *
103012 TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGAT
66 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAAT
*
103077 TTATTTTTAAA--T-GT-CTTATTAATTCTTT-AAATATTAATAAATTA-T
131 TTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * *** * * * * *
103122 TATTATTTGATTTCAAA-AATGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATAATAGAATAAAAAGT
1 T-TTATTTTATTCCAAATAA-GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* ** * * * * * *
103186 CATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATTAATAG
64 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAA
**
103251 ATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGT
129 ATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * *
103300 ATTACTTTATTCCAAACAAACCTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCT
1 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * *
103365 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAAAA
66 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAAT
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* * *
103480 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTATTTTATGACAAAACAAA
1 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA--C--AAAAAC--AATTGTTTTATGACAAAACAAA
* *
103545 AGGTCCTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGAACT-GGTCAGGTA
60 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTC-GGTA
* *
103608 AACAAAATTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTCA-T
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* * * *
103666 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAATCTTATTTATTTTATGATAAAACAAA
1 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA--C-AAAAA-C--AATTGTTTTATGACAAAACAAA
** * * * * **
103731 AAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAAATAGTTCGACAA
60 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAA
* * * * * * *
103796 AGAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATAAGT
125 ACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
** * * * * *
103853 GGTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGATTA
1 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * ** * * * * * *
103918 TAATGATTTCAAGTTTACAGTTGTTCAAATAGTCAAAATTATTTGAACTACTTCGGTAAATAGAT
66 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAAT
*
103983 TTATTTATTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGT
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* * ** * * ** * *
104034 ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGTTCAAATACAATTGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAA
1 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
104099 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGACAT-GACCATAATTATTTGAA-TTGATTCGGTAAATAG
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* *
104162 ATTCAATTTTTAAAT-TACTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGT
129 ATT-TATTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * *
104215 TTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCA
1 TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* ** * * * * *
104280 TGACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTACTTGAACT-GCTTCGATAAACAAA
66 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAA
*
104344 TTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTT
130 TTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
104376 CAGAATTGGA
Statistics
Matches: 1315, Mismatches: 249, Indels: 86
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.00
176 166 0.13
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178 80 0.06
179 64 0.05
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188 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAAT
TTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
Found at i:104574 original size:237 final size:238
Alignment explanation
Indices: 104143--104611 Score: 561
Period size: 237 Copynumber: 2.0 Consensus size: 238
104133 ATAATTATTT
*
104143 GAATTGATTCGGTAAATAGATTCAATTTTTAAATTACTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATA
1 GAATTGATTCGGTAAATAGATTCAATTTTTAAATTACCTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATA
* *
104208 AATTAGTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTCTATGACAAAACAA
66 AATTA--TTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTCTATGACAAAAAAA
* * * * *
104273 AAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTACTTGAACTGCTTCGATA
129 AAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTACTTGAACTGATTCGATA
* * * *
104338 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATTG
194 AACAAACTT-TTTTTTAAATCTATAAATTATTAATTTTCAGAATTG
* * * * *
104384 GAATTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CCTACTTATTAATTTTTGAAA-ATTAAT
1 GAATTGATTCGGTAAATAGATTCAATTTTTAAAT-TACCTACTTATTAAATTTTGAAATATTAAT
* * ** ** *
104447 AAATTA-TTATTTTA-TTCTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAATTATTGTTTTATGACAAAAAAA
65 AAATTATTTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTCTATGACAAAAAAA
* ** * * *
104510 AAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TCGATTCGAT
129 AAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTACTTGAACT-GATTCGAT
**
104574 AAACTGACTTTTTTTTAAATCTATAAATTATTAATTTT
193 AAACAAACTTTTTTTTAAATCTATAAATTATTAATTTT
104612 TGAAATATTA
Statistics
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0.82 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
236 29 0.15
237 102 0.53
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242 1 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (238 bp):
GAATTGATTCGGTAAATAGATTCAATTTTTAAATTACCTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATA
AATTATTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTCTATGACAAAAAAAAA
GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTACTTGAACTGATTCGATAAA
CAAACTTTTTTTTAAATCTATAAATTATTAATTTTCAGAATTG
Found at i:104771 original size:417 final size:419
Alignment explanation
Indices: 103972--104788 Score: 1024
Period size: 417 Copynumber: 1.9 Consensus size: 419
103962 GAACTACTTC
*
103972 GGTAAATAGATTTATTTATTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATT
1 GGTAAATAGATTTATTTATTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTA-TATT
* * ** **
104037 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGTTCAAATACAATTGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAATAA
65 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAAAAAAAGGTAATAA
* * * *
104102 TGATTTGAAATAGATAATTGTTGACATGACCATAATTATTTGAATTGATTCGGTAAATAGATTCA
130 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACCATAATTATTTGAATCGATTCGATAAATAGATT-A
* * * * *
104167 ATTTTTAAATTACTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAAT
194 ATTTTTAAATTACTAAATTATTAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAAT
*
104232 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGA
259 AAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGA
* * *
104297 TAATTGTTCATATAGTCTTAACTACTTGAACTGCTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
324 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACTGCTTAGATAAACAAATTTATTTTTT-AATCTCT
104362 TAGT-TATTAATTTTCAGAATTGGAATTGGTTT
388 T-GTGTATTAATTTTCAGAATTGGAATTGGTTT
*
104394 GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAA-ATTAATAAA-T-TATTA
1 GGTAAATAGATTTATTTATTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTATATTA
** * * * ** * * *
104456 TTTTATTCTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAATTATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGTTCATAAT
66 TTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAAAAAAAGGTAATAAT
*
104521 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAATCGATTCGATAAACT-GACTT-
131 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACCATAATTATTTGAATCGATTCGATAAA-TAGA-TTA
* * *
104584 TTTTTTAAATCTA-TAAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGAA
194 ATTTTTAAAT-TACTAAATTATTAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAA
* * * * ** *
104648 TAAGCTTTTATAAACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-ATTTATTTTAAATA
258 TAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATGA-CAATTTGAAATA
* * * * * * * *
104712 GATAATTGTTTAAATTGTCATAACT-TTTGAATTTGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTTAATT
322 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAA-CTGCTTAGATAAACAAATTTA-TTTTTTAATC
104775 TCTTGTGTATTAAT
385 TCTTGTGTATTAAT
104789 GTTTGCATGT
Statistics
Matches: 338, Mismatches: 50, Indels: 20
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
415 2 0.01
416 30 0.09
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ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (419 bp):
GGTAAATAGATTTATTTATTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTATATTA
TTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAAAAAAAGGTAATAAT
GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACCATAATTATTTGAATCGATTCGATAAATAGATTAAT
TTTTAAATTACTAAATTATTAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAA
GCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATA
ATTGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACTGCTTAGATAAACAAATTTATTTTTTAATCTCTTGT
GTATTAATTTTCAGAATTGGAATTGGTTT
Found at i:105372 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 104391--105816 Score: 1177
Period size: 181 Copynumber: 8.0 Consensus size: 180
104381 TTGGAATTGG
104391 TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCT-ACTTATTAATTTTTGAAA-ATTAATAAA-T--
1 TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * *
104451 TATTATTTTATTCTGAATAGGCTTGTATG-AT-GAAAAATTATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGT
65 TATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * *
104514 TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAATCGA-
128 TCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C-AT
* * * * * * *
104568 TTCGATAAACT-GACTT-TTTTTTAAATCTATAAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAA
1 TTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * *
104631 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATAAACT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGT
65 TATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
** * * * **
104695 CATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATTGTCATAACT-TTTGAATTT
129 CATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
* * * ** * * * *
104746 GTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCT-TGTGTATTAATGTTTG-CATGTGAATAAATTA
1 -TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * * * * * *
104809 ATATTATTTTATTTCAAAAAAGCATGTATGAACTA-AAAAAATTATTTTATGACTAAATAAAAGG
64 GTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * *
104873 TCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT-AAGC-T
128 TCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CAT
** * * * * * *
104925 GGTTCAGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TCT--CTTGTTAATTTTT-AGAATATTATTAATTT
1 --TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATT
* * ** *
104985 AGCAATATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATA-
63 AGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AG
* * * * * *
105049 -TCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTTTTTGAA-TT
127 GTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
*
105101 GATTTGATAAATAGATTT-TGTTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
1 --TTTGGTAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
** * * * *
105161 AGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAC
63 AGTATTATTTTATTCCGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * *
105225 GTCATAACTATTTGAAATAGGTAATAGTGCAAATGGACATGACTATTTAAACAT
127 GTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
* * * *
105279 AATTGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACATATTAATTTTT-ATAATATTAATAAATTA
1 -TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA
* * * *
105343 GTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGAT
64 GTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * *
105408 CATAA-TGATTTGGAATAAATAATTGTTGAACTAGTCATAACTATTTGAACTT
129 CATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
* * ** *
105460 TTTGGTAAATGGATATTCTTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGGTATTTTAATAAATTAG
1 TTTGGTAAATAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
105525 TATTATTTTATTCCTAATAAGCTTTTATGAATAAAAACATTTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTC
65 TATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
**
105590 ATAACTATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
130 ATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
** * * * * * *
105641 GTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTTA
1 -TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTA
** * * * * *
105705 -TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACAGAACCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGG
64 GTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGG
* * * *
105769 ACATAA-TGTTTTGAAATATATAATTGTAT-AGATAGTC--AACTATTTGAA
128 TCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAA
105817 TATGTTCAAT
Statistics
Matches: 1006, Mismatches: 197, Indels: 90
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 5 0.00
176 179 0.18
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179 131 0.13
180 215 0.21
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
ATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
TAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
Found at i:105872 original size:94 final size:97
Alignment explanation
Indices: 105740--105927 Score: 292
Period size: 94 Copynumber: 2.0 Consensus size: 97
105730 CATGAACAGA
*
105740 ACCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGACATAATGTTTTGAAATATATAATTGTATAGATAG-
1 ACCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGACATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTATAGATAGT
*
105804 T-CAACTATTTGAATATGTTCAATAAACAAAT
66 TACAACTATTTGAACATGTTCAATAAACAAAT
* * *
105835 ACCAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTATAGATAGT
1 ACCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGACATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTATAGATAGT
* *
105899 TATAACTATTTGAACATGTTCAGTAAACA
66 TACAACTATTTGAACATGTTCAATAAACA
105928 GATTCATTTT
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 7, Indels: 3
0.89 0.07 0.03
Matches are distributed among these distances:
94 39 0.46
95 21 0.25
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ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.12, T:0.34
Consensus pattern (97 bp):
ACCAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGACATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTATAGATAGT
TACAACTATTTGAACATGTTCAATAAACAAAT
Found at i:106237 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 105837--109419 Score: 2330
Period size: 181 Copynumber: 19.9 Consensus size: 181
105827 AAACAAATAC
* * * *
105837 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTAT-AGATAGTTA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCA
* ** * * * * * * *
105901 TAACTATTTGAACATGTTCAGTAAACAGATTCATTTTATAATTCTCTTACTCATTAATTTTAG-A
65 TAACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA
* * **
105965 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAGATAAGCTTATATGAATTGAAA
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * * * * * **
106017 CAATTATTTTATTACAAAATAACAGGTTACAATAATTTGAAATAGATAATTAATCAAATAGTCAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * *
106082 GACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-AA
66 AACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAA
* * * * *
106146 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATACGAATAAGCTTTTATAAACAGAAA
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * ** * * * * *
106198 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAAAACTGTTCTAATAGCCAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
** *
106263 AAAGATTTGAACTTGTTCAAT-G-AAA-TGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTC
66 AACTATTTGAACTTGTT---TGGAAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-
* * *
106325 TT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTAGACATAAGCTTGTATGAATAGAAA
125 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* ** * * *** *
106380 -AACTCATTTATGACAAAATAAAAGGTTATGGCGATTTCAAATAGATAATTG-TC--ATA---AT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
106438 ---TATTTAAACTTTTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAA
66 AACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
106499 TGTTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAA
131 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * * * *
106550 TAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATATTTGTTTAAATAATCAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * *
106615 CACTATTTGATCTAGTTT-GATAAACATATTTACTTTTGAAATTTTTTACTTATTAA-TTGTCAA
66 AACTATTTGAACTTGTTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * *
106678 ACTATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGTTTGTATGAATAGAAA
130 A-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * * * ** * * *
106731 CCATGGTTTTATAACATAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAATCAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
*
106796 AACTATTTGAACTAGTTT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAA
66 AACTATTTGAACTTGTTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * * * * * * *
106856 ATATTAATAGATTAGTATTTTTTTCTTTTGAACAAACTTATATGAATAAAAA
130 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * * * *
106908 CATTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGCTCAAATAGTTAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
106973 AATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTTTTACGTATTACTTTTTGAAA
66 AACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * **
107038 TATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTAT-GAACAAGCTAGTATGAATTGAAA
131 TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * * *
107089 -ATTTGTTTTATGAAAAAACAAAA----A-CA--ATTTGAAATAGAGAATTGTT-AATATAGTCT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCA
* * * * * * * *
107145 TAATTATTAGAACTAGTTT-GACAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTAATTATTAATTTTTGG
65 TAACTATTTGAACTTGTTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * *
107209 AATATTATTATATTATTATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAAA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * * * * * * * *
107262 TAATTGTTTTAAGATAGAATAAAAGGTGATAATGATCT-AAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * ** * * *
107326 TCACTATTTAAAC-TGATT-CAACATCTCTTATTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGTAAACATC
65 TAACTATTTGAACTTGTTTGGAA-A--ACAGATT--T-ATTTTTTAAA-T-CTTT--T--AC-T-
* * * * * * * * *
107389 TCTTACTTATT-AATTTTTGAACTATTAA-TA-AATTAGTGTTATTTTATTCCGAATAAACTAGT
116 TATTAATTTTTGAAATATT-AA-TA--AATTAGTATTA-TTTTA-TT---T-CGAATAAGCTTGT
*
107451 ATGATA-AAAAA
171 ATGA-ACAGAAA
* * * ** * * * *
107462 CAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTATTGAAATGGCCAT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* ** * * * * * * *
107527 AATTATTTGAACTAATTTAGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTT-CTTATTAATATTATG-
66 AACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TTTTACTTATTAAT-TTTTGA
* * * *
107590 AATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAACAAGCTTGTATGAACTGAAA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* * * ** *
107643 TAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATAGTCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
107707 TAACTATTTGAATTTG-TT-CAATAA-AGA-TT-TTTTTT-AA-CTCTTGCCTATTAATTTTTGA
65 TAACTATTTGAACTTGTTTGGAA-AACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
** * * * * **
107765 AATATTAGGAATTTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAA
129 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
* *
107818 CAATTGTTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
1 CAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
107882 TAACTATTTGAACTTATTT-GATAAATAGTTTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTACTTTTTC
65 TAACTATTTGAACTTGTTTGGA-AAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
107946 AAATGTTAATAAATTTGAATTGTTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAA
128 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAA
* * * * * * * * **
108000 AAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATTGATAATTATTCTAATAGTTTT
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
108065 AAATATTTGAACTAGTTTGGTAAACACATTTATATTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
66 AACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ** * * * *
108130 TATTATTAAATTACTATTATATTTAACT-AAATAAACTTCTATGTTA-AGAAA
131 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AACAGAAA
** * * * * ** * *
108181 CAATTACTTTCTAACGAAAC-AAAGATTTTAATGATTT-AAGATTGATAATTATTCAAATAGTCA
1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * **
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* * ** * ** * *
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* * * * ** *
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* * * * ** * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * ** * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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** *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* *
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* * *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* *
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*
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* ** * * * *
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** * * * *
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* * * * * *
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** * ** * *
110498 AAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATGGA-CATGACTATTTGAATTTG-TTT
380 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAAT-GATCATAACTATTTGAA-CTGATTT
* * * * * * * * * *
110561 GGTAAATAGATTTATATTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTT-TAGAATATTAATAGATTAATAT
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* *
110625 TATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAA
506 TATTTTATTTC-AATAAGCTTGTAT-AATTGAAA
** * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAATCAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA-G--
* * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * **
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*
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* ** * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * *
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* ** * * * ** * *
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**
111224 AAAAA
533 TGAAA
* * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAATCAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTA-
* * * * * * ** * **
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* * * *
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* * * * * * *
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*** * ** * *
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* ** * * ** *
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* *
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** * * * * *
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**
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* * * * * * *
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1 CAATTGTTTTATGACAAAATCAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTAA
* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * **
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * ** * *
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** * * * * * * * *
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* * *** ** * * *
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** * * * * * *
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* ** * *
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** * * * ** * * * *
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** * ** * * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * ***
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* * * * **** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* * ** ** ** * **
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113302 TCTCCAACTT
Statistics
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* *
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* *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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** ** * * **
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* * * ** *
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* * * * * * *
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** * * * *
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* ** * * * * *
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* * ** * ** *
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* ** *
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129 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTAACTAAATAAACTTGTATG-TAAGAAACAATTATTTTATAA
* ** * *
108195 CGAAACAAAGATTTTAATGATTT-AAGATTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG
192 C-AAACAAAGATTATAACAATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
* * *
108259 GTTCGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAGTCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAGATTAG
255 GTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAG
* * * * * * *
108324 TATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGATCACAAACAATTTTTTTATGACAAAACAGAAGGTC
320 TATTATTTTATTTCGAACAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
108389 ATAATGATTTGAAATAGATAATCACTCAAAT-GACCATAATTATTTTAACTGATTCGATAAGTAG
385 ATAATGATTTGAAATAGATAATCGCTCAAATAG-CCATAATTATTTGAACTG-TTCAATAAATAG
* *
108453 ATTTACTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTGTTTTAGGAAATATTAATAAATCATTATTATTTTATT
448 ATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTATTTT--GAAATATTAATAAATCATTATTATTTTATT
* * * *
108517 TCATCTAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGCTTATAGCGA-TTCT
510 TGA-CTAAGCTTGTATGAATTGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTC-
* * *
108581 AAATACACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTT
572 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTT
** * *
108646 AAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTT
636 AAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTT
108711 GTATGAACTAAAA
701 GTATGAACTAAAA
* * * *
108724 CAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTT
1 CAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTCAT
* * * * **
108789 AACTATTTGAA-TTGATTTAGTAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTCAAA
65 AACTATTTGAACTAG-TTTAGTAAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * * * * **
108853 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTAAAATAAGCTTGTATG-AACAAAGAAATTCTTTTACG
128 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAACT-AAATAAACTTGTATGTAAGAAA-CAATTATTTTATA
* * * * *
108917 ACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCATAA-AGTCTTAACTATTTGAAC
191 AC-AAA-CAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAAC
* * ** * * * * ** * ** *
108981 TGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATT
253 TAGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATT
* * * * ** * * * *
109046 ACTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAACAG-AACAATTGTTTGATGTCAAAATAAAAGG
318 AGTATTATTTTATTTCGAACAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* ** * *** * * * * * *** * *
109110 TTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCAAAAATATTTGAAATGGTTTGGTTAACA
383 TCATAATGATTTGAAATAGATAATCGCTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GTTCAATAAATA
* * * * * * * * *
109175 AATTCACTTTTTAAACCTCTTACTGATTAATTTTGTAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
447 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTTG-AAATATTAATAAATCATTATTATTTTATT
* * * * *** * * * ** *
109240 TCAAAC-AAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAAAGTCATAATGATTTG
510 T--GACTAAGCTTGTATGAATTGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTC
* * * * * * * * *
109303 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAATATAATTATTTTCTA
572 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTA
* * * * ** * **
109368 AATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAACATTAATAAATTAGT-TTTATTCTA--TT--CCAA----
637 AATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATT-TATTTTGAATAAGCTT
109424 --ATG--C----A
701 GTATGAACTAAAA
* * * * * *
109429 C--TTG---TATGAGCTGAAATAAAAAGTCATAA-CACTTTGAAATAAATAATTGTTCATATGGT
1 CAATTGTTTTATGA-CT-AAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTTA-ATAGT
* * * *
109488 CTTAACTATTTGAACAAG---AGGTTATA-ACA---A--TTTGAA------A--TA--AA----T
62 CATAACTATTTGAACTAGTTTA-G-TAAACACATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* ** *
109530 -AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAACTTGTATG-AACTAAAACAATTATT
125 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ACT-AAATAAACTTGTATGTAA--GAAACAATTATT
* * * * * ** * *
109592 ATATTACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTT
186 TTATAAC-AAAC-AAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * *
109657 GAACTGGTTTAGTAAATACATTTATTTTTTAAA--TC-T-C-TATTAGTTTTT-GAATATTATTA
249 GAACTAGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATA
* * ** ** *
109716 AATTAGTATTATTTT-TTTCCGAATAAGCTTGGATGATTAGAAACAATAATTTTATGAGAAAAC-
314 AATTAGTATTATTTTATTT-CGAACAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * *** * * *
109779 -AAGGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCTA
378 AAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATCGCTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-GTTCAA
* * * * * *
109843 -AAACA-ATTTTAGTTCTTAAATCTCTTA-TTAAT-TTTTGAAATATTAATAAAGT-AGTATTAT
441 TAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTTGAAATATTAATAAA-TCATTATTAT
* * * * * *
109903 TTTATTTCGAATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACCAAAGGTCATAACA
504 TTTATTT-GACTAAGCTTGTATGAATTGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGC-
* * *
109968 AATTT-AAATAG-TCAAATTGAATGTTCAAATAGTCAA-ATCTATTTGAACTTGTTT-AGTAAAT
566 GATTTCAAATAGAT--AA-T---TGTTCAAATAGT-AATAACTATTTAAACTTGTTTGA-TAAAT
* *
110029 AGATTTATTTTTTTAAATCTCTT-GTTGATTAATTTTAT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTT
623 AGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAATT-ATTAATTTT-TGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATT
* *
110092 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA
685 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA
* * * * ** * *
110121 TAATTGTTTTGTGACTAAA-AAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAAAGTCTT
1 CAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTCAT
* * * * *
110185 AACTATTTGAATTGGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAACCTTTTACTTATTAATTTTT-AGA
65 AACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-A
* * * * ** * *
110249 ATATTATTAAATTCGTATTATTTTAATTTGAATAAGGTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATA
128 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-CTAAATAAACTTGTATG-TAAGAAACAATTATTTTATA
* * * ** * *
110314 ATAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAGGA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
191 A-CAAACAAAGATTATAACAATTTGAAATA-GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
110378 A-TTTTG-AAATATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAAAATATGAATAGA
254 AGTTTGGTAAA-A-AAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTC-AAATATTAATAAA
* * * * ** * * * * *
110436 TAAATATTATTTTATTTAGAATAATTTTGCATGAGCAAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAAA
316 TTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAA
** * * * * * * * * ***
110501 AGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAATTTGTTTGGTAA
380 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGCTCAAATAGCCATAATTATTTGAA-CTGTTCAATAA
* ** * * * * *
110566 ATAGATTTATATTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAATATTATTTT
444 ATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTTGA-AATATTAATAAATCATTATTATTTT
* * * * ** * * *
110631 ATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAACTATT
507 ATTT-GACTAAGCTTGTATGAATTGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATT
* * ** * *
110696 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGGCATAATAACTATTTAAACTTACTCGGTAAATAGATTTATT
570 TCAAATAGATAATTGTTCAAATA-G--TAATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTTATT
* * * * * * ** *
110761 TTTTAAA-ATC----TTCTTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAATATTATTTTATTTCAAATAC
632 TTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAA
*
110821 GCTTGTAT-AAATAGAAA
697 GCTTGTATGAACTA-AAA
* * * * * *
110838 CAATTAG-TTTCTGACAAAAC-AAAGGTCATAA-GTATTTGAAATAGGTAATGGTTCAAATAGTT
1 CAATT-GTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTC
* *
110900 GTAACTATTTGAATGTGTTTTATGACAAAATAGTCTTAACTATTTAAGCTGGTTTGACAAATATA
63 ATAACTA--T---T-TG----A--AC----TAGT-TT-AGTA---AA-C-------AC------A
* * *
110965 TTTATTTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT
93 TTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-CT
* * * * ** * * * ** *
111030 GAATTAGCTTGTATGAAAAGAAACAATGGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGAT
156 AAATAAACTTGTATG-TAAGAAACAATTATTTTATAAC-AAACAAAGATTATAACAATTTGAAAT
* * * * *
111095 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGTACTA-TTTCAGTAAATAAATTTAGTTTTTAAA-
219 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GGTAAAAAAAATTATTTTTTAAAT
* ** * * * ** *
111158 -TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATT-ATAATACCAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCA
283 CTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCTTGTA
* * * * *
111219 TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAGAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
347 TGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGCTC
* * * * *** ** * **** *
111284 AAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCCCCCACCTATTA
412 AAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-
* * * * * * * *
111349 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTT-TTTGAATAGAAGCAAT
475 ATTTT-GAAATATTAATAAATCATTATTATTTTA-TTTGACTAAGCTTGTATGAATTGAA-AAAT
* * * * * * * * * * *
111413 TGCTTTGTGACAAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTTATAAA
537 TGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAAC
* ** * ** * * *
111478 TATTTGAACTTACTCGATAAGCAAATTTATTTTTTAAAT-T-TT--TTATTAATTTTTGAAATAT
601 TATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATGT
* * ** * *
111539 T--TAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAAAAA
666 TAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA
* * * *
111585 CAATTGGTTTATGA-TAAAATAAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 CAATTGTTTTATGACT-AAA-CAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGT
* ** * * * *
111648 CATAACTATTTGAACGT-GTTCAAAAAATAGATTTATTTTTAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTG
62 CATAACTATTTGAAC-TAGTTTAGTAAACACATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* ** * * *
111711 GAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTAGTATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTT
126 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAACTA-AATAAACTTGTATGTA-AGAAACAATTATTTT
* * * ** * *
111775 ATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGTCATAACTATTTAA
188 ATAAC-AAAC-AAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * * *
111840 ACTTGTTCGAT-AAATAGATTTTTTTTTAAAT-TGCTTACTAATTAATTTTT-ATACTATTAATA
251 ACTAGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTCA-AATATTAATA
* * * * **
111902 AATTAGTATTATTTTAGTTT-GAATAAACTTGTATGAACTGATACAATT-TTATTATGATGAAAC
314 AATTAGTATTATTTTA-TTTCGAACAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT-TTATGACAAAAC
** *** ** * *
111965 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATCA-TTATGACTATTTGAACTTGTTCA
377 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGCTCAAAT-AGCCATAATTATTTGAAC-TGTTCA
* * * * * * * *
112029 GTAAACATATTTA-TTTTAAAATCTTCTACTTATTAACTGTTAAAATATTAATAAA-CTAATATT
440 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-A-TTTTGAAATATTAATAAATC-ATTATT
* * * *** * *
112092 ATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
502 ATTTT-ATTTGACTAAGCTTGTATGAATTGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAG
* * * * * * *** *
112157 TGATTTGAAATAAATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATGCAACAAATAGATTTA
565 CGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTTA
* * * * * * * *
112222 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-GAATGATAATAAATTTGTGTTATTTTA-ATTGAA
630 TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT-TTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTG-A
*
112285 ATAAGCTTGTAGGAA-TAGAAA
693 ATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
* * * * * * *
112306 -ATTTTATTTTATGAC-AAGACAAAAGGTTATGACGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTC
1 CA-ATTGTTTTATGACTAA-ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTC
* * * * * *
112369 ATAACCATTTGAACTTG-TTCGATAAACAAATTCAGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTG
63 ATAACTATTTGAACTAGTTTAG-TAAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *** ** * *
112433 AAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCCGATAAGTTTGTATG-ACCAGAAACAACTGTTTT
126 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ACTAAATAAACTTGTATGTA--AGAAACAATTATTTT
** * * * ** * * *
112497 GCAACAAAATAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTG
188 ATAAC--AA-ACAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * *
112562 CACT-GTTCAGG-CCAACAAATTCAATTTTTAAATC-CATTACTT-TTCAA-TTTT-AGAATATT
250 AACTAGTT-TGGTAAAAAAAATT-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATT-AATTTTTCA-AATATT
** * * * * * *
112621 AATAAATTAAAATTACTTTA-TTCTAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGACA
310 AATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAACAAG-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACA
** * ** * * ** * ** * * *
112684 AAACAAATTGTCATAACGACATGAAATAAATATTTCTTTTC-AATTGTTATAACTAATGGAACTG
373 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA-ATC-GCTCAAATAGCCATAATTATTTGAACT-
* * * * * * * *
112748 GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTCAAAATATTAATAAATTAAT
435 GTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTT-GAAATATTAATAAATCATT
* * * ** * *
112810 ATTATTTTATTATGAAC-AAACTTATATCAA-CAAAAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGA
499 ATTATTTTATT-TG-ACTAAGCTTGTATGAATTGAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
** * * * * *** * * ** * * *
112873 TATAATGATTTGAAAAAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAA
560 TATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAATAG
* * * ** * * * *
112938 ATATACTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTT
625 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTT
* * *
113003 CGAAGAAGCTTCTATGAA-TATAAA
690 TGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAA
** * * * * * * * * *
113027 TGATTGTTTTCTGACAAAACAAAAGATTATAATGACTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTAT
1 CAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAATAGTCAT
* * * * ** * *
113092 AATTATTTAAACTGGTTCAGT----A-A--TA--GAT-AATCTCCTACTTATTAGTTTTTGAAAT
65 AACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACACATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * ** * ** * * * *
113147 ATTAATAAGTTAGTGTTATTTTATTTTGAATAGGCTTTTATGATGAA-AAACAATTGTCTTATGA
130 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ACTAAATAAACTTGTATG-T-AAGAAACAATTATTTTATAA
* * * * *
113211 CAAA-AAAAAGTTCAAAACAATTT-AAAGTAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAA-T
192 CAAACAAAGA-TT-ATAACAATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* *** * *
113273 TGATTCAATAAACTAATTTATGTTTTTAATCTCCAACTTCTCAATGTTTTAAATATTAATAAAGT
254 AG-TTTGGTAAA--AA---A-------AAT-T---A----T---T-TTTTAAAT-CT-CT----T
* * * * * * * * **
113338 AATATTATTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAACCTATTA
288 -A-CTTA--T-T-AATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCTTGTA
* * * *
113403 TGAA-ATGAAACACTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAA-ATGATAATTGC
347 TGAACA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-GATAATCGC
** * * * *** *
113466 TCAAATAGTTATGACTATTTGTACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATTCCTTGCT-
410 TCAAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGTTCAATAAATAGATTTA-TTTTTT-AAA-T-CTT-TTA
* * * * *
113530 CATTAATT-TTTTG-AATGTTGATAAAAT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATT
469 C-TT-ATTATTTTGAAATATTAAT-AAATCATTATTATTTTA-TTTGACTAAGCTTGTATGAATT
* * * * ** * * *
113592 GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAT
530 GAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * ** *
113657 TTTTAACTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTT-A-TA--AATTTT
594 TAATAACTATTTAAACTT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT
* * * ** * * * ** *
113717 TAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTATTTCAAATAAGTTTGTAT-AGA-TAGAAA
658 TGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACTA-AAA
* * ** *** * *
113773 CAATT-ATTTATGACAAAAC-AAAGACCATACCAATTT-AAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
1 CAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTT-TAATAGTCA
* * **
113835 TAACTATTTGAACTAGTCT-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAA
64 TAACTATTTGAACTAGTTTAG-TAAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* ** * * *
113895 AATA-TATATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGAATGAGTAA-AAACATTTGTTTT
127 AATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTA-ACTAAATAAACTTGTAT--GTAAGAAACAATTATTTT
* ** ** *
113958 ATAATAAAACAAATGATCGTAAGGATTTGAAATAAATAATTA-T----T--T-ATAACTATTTGA
188 ATAA-CAAACAAA-GATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * * * * *
114015 ACTCA-CTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTGAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAA
251 ACT-AGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAA
* * * * * ** *
114078 ATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAGTAATTGGTTTATGACAAAACAAA
315 ATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * *** * * *
114143 AGGTCATAACGATTTAAAATAGATTATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAAAAA
380 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGCTCAAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGTTCAATAA
* * * * * *
114208 ATATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATCTTTGGAATAGTAGTAAAT-TTATATTATTT
444 ATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AT-TTTGAAATATTAATAAATCAT-TATTATTT
** * * ** * * **
114271 TATTCAAAATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTCATGGCAAAACAAAAGGTTATAATGAT
506 TATT-TGACTAAGCTTGTATGAATTGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGAT
* * ** * * *
114336 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCGAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATTTT
569 TTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTT
* * * * ** * * *
114401 TTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATAG-TAATACGTTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAG
634 TTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAAT-GTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAG
* * * * * *
114465 CCTATATCAATTGATA
698 CTTGTATGAACTAAAA
** * * * *
114481 CAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
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* * * * * * *
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*** * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * ** ** * * * *
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* * * * *
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** * * *** * * * * ***
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* * * * * * *
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** * * ** * * * * * *
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* * * *** * * *
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* * * * * * * **
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1 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCAT
* *
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* * * * * * * **
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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*** *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * ** * *
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* * * * * ***
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* * * * * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * **
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* * * *
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* * *
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* * * ** *
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* * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* ** * * * * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * **
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* ** * * * * * *
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* * * * * *
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*** * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* **** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** *
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* * * * * * * * *
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** * *** * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * **
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* * * *
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** * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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** * * **
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*** ** * * * * * *
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* ** * * * * *
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** * * * * *
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* * ** * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *** * *
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* ** * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * ** * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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*
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* * **
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* * * * *
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* * *** * * *
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* * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * * **
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* * * * * *
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** * * ***
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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** * * *
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* ** *
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* * ** * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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* * *
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* * * * * ** *
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* * *
111682 ATTTTTAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGAATA
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* ** * ** *
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* ** * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
112140 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTA
65 AAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-
* * * * *
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* * * * * ** * * *
112268 GTGTTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTAGGAATAGAAAA-TTTTATTTTATGACAAGACAAAAG
185 ATATTATTTTATTTAG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAG
* * * * * * *
112331 GTTATGACGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTG-TTCGATAAA
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* * *
112395 CAAATTCAGTTTTTAAATC-TCTTATTTATTAATTTTT-GAAATA
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* * * ** * ***
112438 TTAATAAATTAGA-ATTATGTT-ATTCCCG-ATAAGTTTGTATGACCAGAAACAACTGTTTTGCA
1 TTAATAAATTA-ATATTATTTTAATT--TGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * **
112500 ACAAAATAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCAC
63 ACAAAA-CAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* ** * * * * *
112565 TGTTCAGGCCAACAAATTCAATTTTTAAATC-CATTACTTTTCAA-TTTTAGAATATTAATAAAT
127 TTTTC--GAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTA---TT-AATTTTTAAAATATTAAT-AA-
* * * * * * *
112628 TAAAATTACTTTATTCTA-AATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA
183 TAATATTATTTTATT-TAGAATAAG-CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAA
** * ** * * * * ** * * *
112691 TTGTCATAACGACATGAAATAAATATTTCTTTTC-AATTGTTATAACTAATGGAACTGGTTTAGT
246 AGGTCATAACAATTTGAAATAGATA-AT-TGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGT
* * *
112755 AAACAAATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTCAAAATA
309 AAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * *
112797 TTAATAAATTAATATTATTTT-ATTATGAACAAACTTATATCAACAA-AAACATTTGTTTTACGA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
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64 CAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * * * * * * * *
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128 -TTTCGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTAAAATATTAATA-A-TA
* * * * * * ** * * *
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* ** * * * ** * * * * *
113054 TATAATGACTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTTAAACTGGTTCAGT-AATAG
250 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAG
* *
113118 ----A----T-AATCTCCTACTTATTAGTTTTT-GAAATA
315 ATTTATTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAG-AATA
* * * * * * * *
113148 TTAATAAGTTAGTGTTATTTTATTTTGAATAGGCTTTTATGATGAA-AAACAATTGTCTTATGAC
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* * *
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* * * ** * ** * *
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*** ** * ** * *** ** *
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* * * * * * *
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* *
113518 AAATTCCTTGCTCATTAATTTT
341 -AATT--TT--T-A-GAA--TA
** * * * ** *
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* * * * * **
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* * ** * * * *
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** * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * ** * *
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* * **
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** * ** * * * *
114509 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATATA
251 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGA
* * *
114574 TTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTT-GAAATA
316 TTTA-TTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTAG-AATA
*** * *
114613 TTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTAGTATGAACAA-AAATAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGAC
* ** * * * *
114677 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTACAAATAGTCATATCTATTT
65 AAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
114735 GAAATTATTC
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AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTTT
CGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAATAATATTATTTTA
TTTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAACAATTT
GAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTA
AATCTTCTACTTATTAATTTTTAGAATA
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* * * *
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* * *
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* * *
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** * *
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* * * *
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** * * * *
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*** * **
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* * **
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* *
110053 TTGATTAATTTTATGAATG
517 CTGATTAATTTTATGAATA
** * * * *
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1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACT
* * *
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66 AAACAAAAGGTCA-AACTATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCTTAACTATTTGAACTGG
* *
110200 TTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAACCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTCGT
129 TTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAA---TCT-C-TATTAATTTTT-GAATATTATTAAATTAGT
* * ** * *
110265 ATTATTTTAATTT-GAATAAGGTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATAATAAAATAAAGATCA
188 ATTATTTT--TTTCGAATAAGCTTGGATGAAAAGAAACAATAATTTTATAAGAAAACAAAGATCA
* *
110329 TAATGATTTGAGATAGGA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTTGAAATATAG
251 TAATGATTTGAGAT-GGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCT-AAA-ACA-
* *
110392 A-TTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATGAATAGA-TAAATATTATTTTATTTAG
312 ATTTTAGTTCTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAAGT-AATATTATTTTATTTAG
*
110455 AATAA-TTTTGCATGAGCAAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAAAAGGTCATAAC-AATTTAA
376 AATAAGTTTT-CATGAACAAAAACAATTGTTTTATAAC-AAAAAAAAAGGTCATAACAAATTTAA
* * * * *
110518 A-A-T-AGA-T-AATTGTTCAAATGGACATGA-CTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATTTA-T
439 ATAGTCAAATTGAA-TGTTCAAATAGACA-AATCTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATT
110576 ATTTTAAATCTCCTACCT-ATTAATTTT-TAGAATA
502 ATTTTAAATCT-CTACCTGATTAATTTTAT-GAATA
* * *
110610 TTAATAGATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACT
** * * *
110675 AAACAAAAAATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGGCATAATAACTATTTAAACT
66 AAACAAAAGGTCA-AACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-T--TAACTATTTGAACT
*** ** * * * * * * *
110740 TACTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCT-TCTTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAATAT
127 GGTTTAGCAAACACATTTATTTTTT-AAATCTCTATTAATTTTT-GAATATTATTAAATTAGTAT
* * * * * * * * *
110804 TATTTTATTTCAAATACGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTAGTTTCTGACAAAACAAAGGTCATA
190 TATTTT-TTTCGAATAAGCTTGGATGAAA-AGAAACAATAATTTTATAAGAAAACAAAGATCATA
* * **
110868 A-GTATTTGAAATAGG-TAATGGTTCAAATAGTTGTAACTATTTGAA
253 ATG-ATTTGAGAT-GGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
110913 TGTGTTTTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (535 bp):
TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACT
AAACAAAAGGTCAAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT
TAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTATTAATTTTTGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT
TTTCGAATAAGCTTGGATGAAAAGAAACAATAATTTTATAAGAAAACAAAGATCATAATGATTTG
AGATGGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCTAAAACAATTTTAGTTCTTAA
ATCTCTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAAGTAATATTATTTTATTTAGAATAAGTTTTCATGA
ACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAAAGGTCATAACAAATTTAAATAGTCAAATTGAATGT
TCAAATAGACAAATCTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTATTTTAAATCTCTACCTGA
TTAATTTTATGAATA
Found at i:111639 original size:17 final size:18
Alignment explanation
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Period size: 16 Copynumber: 2.8 Consensus size: 18
111603 ATAAAAAGGT
111613 CATAACTATTTGAAATAG
1 CATAACTATTTGAAATAG
* *
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1 CATAACTATTTGAAATAG
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1 -CATAACTATTTGAA
111662 CGTGTTCAAA
Statistics
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CATAACTATTTGAAATAG
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110960 ATATATTTAT
* * * * * * * * *
110970 TTTTTAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTAATCTGAAT
1 TTTTTAAAT-TCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-AATTATGTTATTCAGTAT
* * * ** * * *
111034 TAGCTTGTATGAAAAGAAACAA-TGGTTTTATGAC-AAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAG
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* * ** * * *
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128 ATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTAAACT-TGTTCGA-CAAACAAA-TTAATTTTTAAATT
* * ** * * * * ** *
111159 -C-T-CTTATTAATTTTTAAAATATT-ATAATACCAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCAT
190 CCTTACTAATTAATTTTTAGAATATTAATAA-ATTAAAATTACTTTAGTTTAAATAAACTTGTAT
* ** * * ** ** * *
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254 CAACTGAAACAATT-TTATTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACATGAAATAAATAATTATTC
* * * * * * ** * * * * * *
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318 AAAT-CATTATAACTAATGGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTAAAAT--TCTACTTATT
* * * * * *
111348 AATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTT-TTTGAATAGAAGCAA
379 AATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAACTTATATGAACAAAAACAA
* * * *
111412 TTGCTTTGTGACAAAAACAAAA-GATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTTAT
444 TTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGATCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCT-T
* * * * *
111475 AAATATTTGAACTTACTCGATAAGCAAATTTATTTTTTAAAT-TTT-TTATTAATTTTTGAAATA
506 AACTATTTGAACTTATTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTATTATTAATTTTT-AAATA
* * * * * * *
111538 T-TTAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAA
570 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-TATTGTTTTATGACAA
* * * *
111602 AATAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGT
634 AA-CAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACGTGT
* * *
111667 TCAAAAAATAGATTTA
698 TCAAAAAACAAATTCA
* * * * *
111683 TTTTTAAATTTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTAGTATAA
1 TTTTTAAATTCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTAAATTATGTTATTCAGTATAA
* ** *
111748 GCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
66 GCTTGTATGAACAGAAACAACTATTTTACAACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
*** * * * ** *
111813 ATTATTCAAATGGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTTTTTTTTAAATTGCTTAC
131 ATTATTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGTTCGACAAACAAATTAATTTTTAAATTCCTTAC
* * ** * * *
111878 TAATTAATTTTTATACTATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTTTGAATAAACTTGTATGAACTGA
196 TAATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAAAATTACTTTAGTTTAAATAAACTTGTATCAACTGA
* ** ** *
111943 TACAATTTTATTATGATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATCATT
261 AACAATTTTATTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACATGAAATAAATAATTATTCAAATCATT
* * * * * *
112008 ATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTAAAATCTTCTACTTATTAACTGTT-AA
326 ATAACTAATGGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTAAAA--TTCTACTTATTAA-TTTTCAA
* * * *
112072 AATATTAATAAACTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
388 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * *
112137 GACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAAATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
453 GACAAAACAAAAGGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAA
* * * * * *
112201 CTTATGCAACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTGAATGATAATAAAT
517 CTTATTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TTTA-TTATTAATT-TTTAAAT-ATATTAAAT
* * * * * * *
112266 TTGTGTTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTAGGAATAGAAAATTTTATTTTATGACAAGACAAAAG
578 TAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * *
112331 GTTATGACGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTTCGATAAAC
642 GTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACGTGTTCAAAAAAC
112396 AAATTCA
707 AAATTCA
* * *
112403 GTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGAATTATGTTATTCCCG-
1 -TTTTTAAAT-TCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-AATTATGTTATT-CAGT
* * * *
112466 ATAAGTTTGTATGACCAGAAACAACTGTTTTGCAACAAAATAAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
62 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAACTATTTTACAACAAAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* ** * *
112531 AGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCAC-TGTTCAGGCCAACAAATTCAATTTTTAAA-
126 AGATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGTTC-GACAAACAAATT-AATTTTTAAAT
*
112594 TCCATTACT-TTTCAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAAAATTACTTTA-TTCTAAATAAGAC-T
189 TCC-TTACTAATT-AATTTTTAGAATATTAATAAATTAAAATTACTTTAGTT-TAAATAA-ACTT
* ** * *
112655 GTATCAA-TAGAAATAATTGTT-TTATGACAAAACAAATTGTCATAACGACATGAAATAAATATT
250 GTATCAACT-GAAACAATT-TTATTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACATGAAATAAATA-A
* ** * *
112718 TCTTTTC-AATTGTTATAACTAATGGAACTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCT-CT
312 T-TATTCAAATCATTATAACTAATGGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTAAAATTCTACT
* *
112780 TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAACAAACTTATATCAACAAAA
375 TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAACTTATATGAACAAAA
* * * *
112845 ACATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGAT-ATAATGATTTGAAA-AAGATAATTATTCATATAGC
440 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGATCATAATGATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAG-
** * * *
112908 CTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATATACTTTTCAAATCTCTTAATTATTAATTTTTA
503 CTTAACTATTTGAACTTATTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TT-ATTATTAATTTTTA
* * * *
112973 TAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCG-AAGAAGCTTCTATGAATATAAATGATTGTTTT
566 -AATA-TATTAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAT-ATTGTTTT
* * * * * *
113037 CTGACAAAACAAAAGATTATAATGACTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAA
627 ATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
113094 TTATTTAAAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (713 bp):
TTTTTAAATTCTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTAAATTATGTTATTCAGTATAA
GCTTGTATGAACAGAAACAACTATTTTACAACAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
ATTATTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGTTCGACAAACAAATTAATTTTTAAATTCCTTAC
TAATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAAAATTACTTTAGTTTAAATAAACTTGTATCAACTGA
AACAATTTTATTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACATGAAATAAATAATTATTCAAATCATT
ATAACTAATGGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTCAAAAT
ATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTTAACTATTTGAACTTA
TTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTATTATTAATTTTTAAATATATTAAATTAGTATTA
TTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAAAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACG
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACGTGTTCAAAAAACAAATTCA
Found at i:113350 original size:36 final size:36
Alignment explanation
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Period size: 36 Copynumber: 2.1 Consensus size: 36
113300 AATCTCCAAC
113310 TTCTCAATGTTTT-AAATATTAATAAAGTAATATTAT
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113346 TTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTAT
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113382 TT
1 TT
113384 TATTTTGGAT
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 0, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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TTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTAT
Found at i:113402 original size:36 final size:35
Alignment explanation
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113313 TCAATGTTTT
*
113323 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTCTCAATTTTTG
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1 A
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Statistics
Matches: 33, Mismatches: 1, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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AAATATTAATAAAGTAATATTATTTCTAATTTTGG
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Period size: 183 Copynumber: 1.9 Consensus size: 184
113343 TATTTCTCAA
* * *
113353 TTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAACCTATTATGAAATGAAACACTT
1 TTTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAACCTATTATGAAATGAAACAATT
* * * * *
113418 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAAATGATAATTGCTCAAATAGTTATGACTA
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* * * * *
113537 TTTTTG-AATGTTGATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-ATGTATGAATTGAAACAAT
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* * * * *
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ATTTTATGATAAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAAATGATAATTGCTCAAATAGTTATAACTA
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Found at i:114504 original size:181 final size:181
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* * ** * ** ** ** * *
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* *
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* * * * ** * **** *
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* * * ** * * *
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* * * *
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* * * ** * ** *
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* * * * * *
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* *** *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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** ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* *
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* * * ***
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* ** * ** * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * **
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* * * * *
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** * * * ** * ** ** * *** *
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*
113431 AC
180 TC
* ** * * * ** *
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* * * * * *** * *
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* * ** * * * ** * * *
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*
113608 GACTAA----AC
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* * * * * * * * ** * * *
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* * ** * *
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* * * * * ** *
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** *
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* * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * *
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* ** * * **
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* *** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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** *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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*
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** * **
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* * * *
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (176 bp):
AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGCTCAGGTAAATAGATTCATTTTTTAAAT
CTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTATTCC
Done.