Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167993.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_25, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 17943224
ACGTcount: A:0.35, C:0.15, G:0.15, T:0.35
Warning! 94000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 88 of 100
Found at i:15448369 original size:359 final size:357
Alignment explanation
Indices: 15446309--15450266 Score: 2011
Period size: 355 Copynumber: 11.0 Consensus size: 357
15446299 AACCTTTCTG
* *** * * * *
15446309 TTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATTTATAACTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
*** * * * * * * * *
15446374 GAGATTTAAAAAATAAATCCATCTGCCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTAT
66 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAATTAT
* * * * * * * * * * *
15446439 TTATTTGAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGGCTTAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTG
130 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTA
* * * * * *
15446504 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATACCTT-AGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAA
195 TTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATA-TTTCA-AAAATTAATAAG-AAGA-TTTTAAAAA
* * * * * * * *
15446568 GTAAATCTGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC
256 ATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * **
15446633 ATTATAACTTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGATCTTG
321 ATTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTGTTC-AA
* ** * * * * * * * * **
15446672 TTCATACTATTTTATTCAGAGTAAAAAAATACTAATTCAATAATATT-TCGAAACTTGATAACCA
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA
* * * ** * * * *** * * **
15446736 AGAAAATTAAAAAAGTAAATCTAATTGCCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATGATT
65 AGAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAATT
* * *
15446801 ATCTA-TTCTAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT-T-ATTCATACAAG
128 ATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAG
* * * *
15446863 CTTATTCTAATTAAAATAAT-GCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
191 CTTATTCGAAATAAAATAATAG-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGA-TTTTAA
* * * * * * * * * *
15446927 AAAATAAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAATAATTATTTATTTGAA
253 AAAATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * *
15446992 ATTGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAG
318 ATCATTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTG-TTCAA
* * * * *
15447034 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATA-AAATTTATTAACATT-TGGAAAAA-TAATAAGA
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAAATTAATAAGT
* * * ** * *
15447096 AAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAAT
64 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAAT
* * * * * * * *
15447161 TGTCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTCTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACACA-
127 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACA-AG
* * * * *
15447225 CTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTT-AGTAAAA-TAATAAGAA-A-CTTAA
191 CTTA-TTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGAAGATTTTAA
* * * * * * * * **
15447285 AAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTAAATGATTATCTATTTCA
253 AAAATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * *
15447349 AATTGTTATGACCCTTTT-TTTGTCATAAAACAATTATT--T
317 AATCATTATGA-CCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTCAA
* * * *
15447388 TTTATTGGACATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACGTC-AAAAATTAATAA
1 TTCA-T--ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
15447452 CTAAGAGATTTAAAAAATAAATAAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAG
62 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAACAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAA
* * * * * * *
15447517 TTAT-TAATCTCAAATCGTTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATTATAGAA
126 TTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAA
* * *
15447580 GCTTATTC--AATTAAA-AATAGGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAGA-CT
190 GCTTATTCGAAATAAAATAATA-G-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-AGATTT
* * ** ** * *
15447641 TAAAAAATAAATGTGTTTGCCAACCCAATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTT
250 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
15447706 CAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAATATATTTGTTTC-C
315 CAAATCATTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTG-TTCAA
* * * * * * * * *
15447750 TATCTTCCAAGTTTATTTAGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGG
1 T-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
* ** * * *
15447814 AA-ATGATTTGAAAAAAATAAAAATACTTACCGAACATGTTCAAATAGTGAT-GACA-TTCAAAC
64 AAGA-GATTT--AAAAAATAAATATGTTTACCAAACA-GTTCAAATAGTTATGGCCATTTC-AAC
* * * ** ** *
15447876 AATTATTTACTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG--ATATAAACTAATTGTTTAAGTTCATA
124 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAC-AATTGTTTCTGATCATA
* * * * * * *
15447939 AAACCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAGTT
187 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAG-AAGATTT
* * * *
15448003 T--AAAATAAATTTGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTACTT
250 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * *
15448066 AAAATCATTATGACCTTGTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTGAA
315 CAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTCAA
*
15448110 TTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
15448175 GTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTTCAGCAATTA
66 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGGCCA-TTTCAACAATTA
* * * * *
15448240 TCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTG-TTTGTCATATAACAATTGTCTT-TGATCATATATGTT
129 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGATCATACAAGCT
*
15448303 TATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTTAAAAAAA
193 TATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGATTTT-AAAAAA
* * * * * *
15448367 TAAATATGTTTACCAAATCAATTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCA
257 TAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
15448432 TTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTA
322 TTATGACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATT-GTTCAA
* * ** *
15448470 TTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCTAAAAATTAATAACTAA
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *** ** *
15448535 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGATTACATGAACAATTAT
66 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAATTAT
* * * *
15448600 CTATTTCAAA----T-TG--CTTTTGTTTTGTCAT-AAA-AATTTTTTTTCAATTCATACTAGCT
130 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GA-TCATACAAGCT
* * * *
15448656 TATTTGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGATATTTAAAA
193 TATTCGAAATAAAATAATAGT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAT-TTTAAAA
* * * * *
15448720 AATAATTTTGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT
255 AATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
*** * ***
15448785 TGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG
320 CATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTG-TTCAA
* * * * * * *
15448825 TTCATATAAGTTTTTTTAGAATAAAATAGTACTAATATATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-T-
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
15448887 --AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCGAAA-GGTTATGACTATTT-AAGCTAT
65 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AGTTC-AAATAGTTATGGCCATTTCAA-CAAT
* ** * * ** * *
15448948 TAT-TATTTTC-GATTGTTAT--TTTTTTGTTATG-CTACAAAACAATAATTCCT-ATTCATAAA
127 TATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACA
* * * * * * * *
15449007 AGCTTATTC-AGATTGAAATAATACTAATTTATTAATTAATT-GACAATTAATAATTAAAATGTT
189 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAATAA-GAAGAT-TT
* * * * * * * * * *
15449070 TAAAAGATAAATATGTTTGCCAAA-CTATATCAAATAGTCATCACTATTTGTATAAGTATTTATT
250 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAAT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * *
15449134 TCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAAAAATTATTTTAG
314 TCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATT-GTTCAA
* * *
15449180 TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTGAAAATTAATAA-TGA
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A
* * * * ** * * * *
15449244 AGAGA-ATAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA
65 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTT---C-A--A
* * * *
15449308 TATATTTTATTTACACAATTATTTATGTCAAATTGTTATGATCTTTTTTTTTTAATCATAAAACA
123 CA-A--TTA--T---C---TA--T-T-TCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTT-GTCATAAAACA
* * *
15449373 ATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCTAAAA
171 ATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * *** * * * * *
15449436 ATTAATAAGTTGGAGA-TTTAGATAATATAATCTGTTTATTGAATGAGTTCAAATAGTCATGTCC
234 ATTAATAA---GAAGATTTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * **
15449500 ATTTGAACTATTATATATTTCAAAATCGTTATGACATTTTGATTGTCATAAAACAATTTTTTTTA
295 ATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAA-TTGTTCAA
** * * * * *
15449565 TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATAATAGTTTTTTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TA
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** * * * * *
15449625 AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTGCTGAGCCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-ATTA
65 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAAACAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAATTA
* * * * * * *
15449689 TCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGCCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACATGCTT
129 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTT
* * ** * * * *
15449753 ATTCTG-AGTAAAAT-ATTGCTAAACTAGTAGTA-TTCTAAACAATTAATAAATAAGAGATTTAA
194 ATTC-GAAATAAAATAATAG-TAATTTATTAATATTTC-AAA-AATTAAT-AAGAAGA-TTTTAA
* *** * * * *
15449815 AAAATAAATGTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTAT-TA--TC--
253 AAAATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
15449875 GT--TT-TAACCTTTTGTTTACTCATAAAATAATTGTTTTAG
318 ATCATTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTG-TTCAA
** * ** * * *
15449914 TTTGTACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATTTCTTCAACATTC-AAAATATTAATAAGC
1 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTCTAAAA-ATTAATAAGT
* * * * * * * * *
15449977 AAAAAATTAAAAAAACTAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
64 AAGAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAAT
* * * *
15450042 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCA-AAAACAATTGTTTC-AATTCAT-CAAG
127 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAA-
* * * * ** *
15450104 GCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTGAAAATTGATAAGTTAGAGA-TTTA
190 GCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-AGATTTTA
* ** * *** ** * * * *
15450168 AAAAATGAATCAGCTTATTGAATCGGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCA
252 AAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * *
15450233 AATTGTTATGAACATTTGTTTTGTCATAAAACAA
317 AATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAA
15450267 ATATTTGTAA
Statistics
Matches: 2788, Mismatches: 614, Indels: 387
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
348 21 0.01
349 46 0.02
350 8 0.00
351 60 0.02
352 17 0.01
353 76 0.03
354 117 0.04
355 424 0.15
356 83 0.03
357 241 0.09
358 219 0.08
359 281 0.10
360 270 0.10
361 147 0.05
362 264 0.09
363 135 0.05
364 92 0.03
365 7 0.00
367 4 0.00
369 1 0.00
370 1 0.00
372 3 0.00
374 1 0.00
376 3 0.00
377 2 0.00
378 2 0.00
379 2 0.00
380 8 0.00
381 6 0.00
382 44 0.02
383 11 0.00
384 70 0.03
385 99 0.04
386 23 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAACAATTATC
TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTAT
TCGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGATTTTAAAAAATAAA
TTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
GACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTCAA
Found at i:15450221 original size:354 final size:348
Alignment explanation
Indices: 15449322--15452359 Score: 1038
Period size: 360 Copynumber: 8.5 Consensus size: 348
15449312 TTTTATTTAC
* * *
15449322 ACAATTATTTATGTCAAATTGTTATGATCTTTTTTTTTTAATCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* *
15449387 TACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGA
64 T-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGA
* * *
15449452 TTTAGATAATATAATCTGTTTATTGAAT-GAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATAT
128 TTTA-A-AAAATAATCTGTTTATTGAATCG-GTTCAAATAGTTATGACCATTTGAAC-A--AT-T
* * *
15449516 ATTTCAAAATCGTTATGACATTTTGATTGTCATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAAATTATT
186 A-TT---AATCGTTATAACATTTTGATTCTCATAAAACAATTTGTTTTATTCATACAAAATTATT
* * * *
15449581 TAGAATAAAATAATAATAGTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCT
247 TAGAATAAAATAATAATAGTTTTTCAACATTTCAAAAATTAATAAGAAATTAAAAAACTAAATCT
* **
15449646 ATTTGCTGAGCCAATTCAAATAATTATGACTATTTGA
312 ATTTACTGAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * ** * *
15449683 AC-ATTATCTATCTCAAATTATTATGA-TCTTTGTTTTGCCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATA
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-
* ** * * ** ** * * * *
15449746 CATGCTTATTCTGAGTAAAATATTGCTAAACTAGTAGTATTCTAAACAATTAATAAATAAGAGAT
65 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTTAGAGAT
* * * * * *
15449811 TTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATT-ATC
129 TTAAAAAAT-AATCTGTTTATTGAATCGGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATTAATC
* * * * ** ***
15449875 GTTTTAACCTTTTGTTTACTCATAAAATAA-TTGTTTTAGTTTGTACATGCTTATTT-GAAATAA
193 GTTATAACATTTTGATT-CTCATAAAACAATTTGTTTTA-TTCATACAAAATTATTTAG-AATAA
*
15449938 AATAATACTA-TTTCTTCAACA-TTCAAAATATTAATAAGCAAAAAATTAAAAAAACTAAATCTA
255 AATAATAATAGTTT-TTCAACATTTCAAAA-ATTAATAAG----AAATT-AAAAAACTAAATCTA
*
15450001 TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
313 TTTACTGAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * *
15450037 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCA-AAAACAATTGTTTCAATTCATC
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATC
* * * * * *
15450101 AAGGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTGAAAATTGATAAGTTAGAGATT
66 AA-GCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATT
* * * * *
15450166 TAAAAAATGAATCAGCTTATTGAATCGGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCT-AT-
130 TAAAAAAT-AATCTGTTTATTGAATCGGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTAT-TAATC
* * * * * *
15450229 -TT-CAA-A--TTG--T-T-AT-GAAC-ATTTGTTTT-GTCATAAAACAAATATTT-GTAAT-CA
193 GTTATAACATTTTGATTCTCATAAAACAATTTGTTTTATTCATACAA-AATTATTTAG-AATAAA
* * * * * * * * *
15450280 TTACTAAT--CTATT-AATATTTCAAAAATTAATT-AGATATTTAAAAAA-TAAATCTATTTA-T
256 ATAATAATAGTTTTTCAACATTTC-AAAAATTAATAAGA-AATTAAAAAACTAAATCTATTTACT
* * *
15450339 CAAACTAGCTT-AAATAGTTATGACTATTTGA
319 GAAAC-A-ATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * * *
15450370 GCATTTTTTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATA
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-
* ** * * * * * * *
15450435 TAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTGACTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAG-TAAAAAT
65 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTTAGAGA-
* * * * * *
15450498 TTTAAAAACTAAATATGTTTATTGAA-CTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAGTA-ATTATCT
128 TTTAAAAAAT-AATCTGTTTATTGAATC-GGTTCAAATAGTTATGACCATTTGA--ACA--AT-T
* * * * * * * * *
15450561 ATTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTATTTCAGTTCCTA-AAAGCTTA
186 A-TT--AATCGTTATAACATTTTG-ATTCTCATAAAACAATTTGTTTTA-TTCATACAAA-ATTA
* * * * * * * *
15450624 -TT-GAAAAAAATAAGACTAAGTTATT-AATATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA
245 TTTAGAATAAAATAATAAT-AGTTTTTCAACATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGA-AATTAAAAAA
* * * * * * *
15450686 -TGAATCTGTTTAC-AAAATAAGTTTAATTAATTATGACTATTTCA
304 CTAAATCTATTTACTGAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGA
* ** * * * * * * *
15450730 ACAATTATCTAAT-TGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCG
1 ACAATTATCT-ATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCA
* **** ** * *
15450794 TACAAGCCTATTTTGGATAAAATAATACA-AATTTATTAATA--AAAAGATAATTAATAAGTAAA
64 T-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTTAG
* * * ** *** * * * * * * *
15450856 AAATAT-AAAAATAAATCTATTTACAGAAAAAGTTTAAATATTTATTACTATATAAATAATTATT
125 AGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTATTGAATCGGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAA-CA--A-T
* * * * ***
15450920 TATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTTTGTTATAAAACAA-TTGTTTTCATTCATACAAGCCTA
185 TA-TT--AATCGTTATAACATTTTG-ATTCTCATAAAACAATTTGTTTT-ATTCATACAAAATTA
* * * *
15450984 --TACGAATTAAAATAATATTAGTTGATT-AATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
245 TTTA-GAA-TAAAATAATAATAGTT-TTTCAACATTTCAAAAATTAATAAG---AA-A-TTAAAA
* * ** * *
15451046 AA-TAAATATGTTTTTTG-AACAAATTCCAAT--TCATGACTATTTGA
302 AACTAAATCTATTTACTGAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * *
15451090 ATAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAT
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
** * * * * * * *
15451154 -ATATTTTAGTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTGAGTAAAAGA
65 CA-AGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGA
* ** *** *
15451217 ATTAAAAAATGAATCTGTTTATAAAAAATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATATATTTAT
128 TTTAAAAAAT-AATCTGTTTATTGAATCGGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAAC--A-A-TTA-
* * * * * *
15451282 TTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGAAATAAACCAA-TTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTAT
187 TT--AATCGTTATAACATTTTGATTCT--CATAAAACAATTTGTTT-TATTCATACAAA-ATTAT
* * * *
15451344 TT-GGATAAAATAATACTAATTTATT-AAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAA-
246 TTAGAATAAAATAATAATAGTTT-TTCAACATTTCAAAAATTAATAAG---AA-A-TTAAAAAAC
* * * **
15451406 TAAATCTATTTAC-CAAGCGAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGA
305 TAAATCTATTTACTGAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * ** *
15451450 ACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTT-TTTTATTATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* ** * * *
15451514 ACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAA-TATTAAGTTGGAGAT
65 -CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGAT
* * * * * * ** * *
15451576 ATAAAAAATAAATCTATTCATAGAA-CTAGTTCAAACAACTATGTCCATTTAAACTATTATCTAT
129 TTAAAAAAT-AATCTGTTTATTGAATC-GGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAAC-A--AT-TA-
* * * * *
15451640 TTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AGTATTGTTTCTATTCATACAAAATTATT
187 TT--AATCGTTATAACATTTTG-ATTCTCATAAAACAAT-TTGTTT-TATTCATACAAAATTATT
* * * * * *
15451704 TAGAATAAAATAATACTAATTTATT-AATAATTTC-AAAACTAATAAGAGATTTAAAAACTAAAT
247 TAGAATAAAATAATAATAGTTT-TTCAA-CATTTCAAAAATTAATAAGAAATTAAAAAACTAAAT
* * * * * *
15451767 TTGTATA-TCGAACCAATTCAAATAGTTATGACCATTTGA
310 CTATTTACT-GAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * *
15451806 AAAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TCTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTATGTTCATT
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-T
* * * * ** * *
15451870 AACACCTTATTCGACAGTAAATATTGCGCTAA-AA-TTAATAATATTTTTAAAAAATTAATAAGT
65 CA-AGCTTATTC-AAAATAAA-A-T--AATAATAATTTATTAATA-TTCT-AAAAATTAATAAGT
* * * *** * * * * *
15451933 AAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAAGCAA
122 TAGAGATTTAAAAAAT-AATCTGTTTATTGAATC-GGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAA-C-A
* * * * * * * *
15451996 TTATCTATTCCAAATCATTCTAAC-CTTTGTTTAGTCATAAAATAATTT-TTTCAATTCATACAT
183 --AT-TATT---AATCGTTATAACATTTTGATT-CTCATAAAACAATTTGTTT-TATTCATACAA
* * * * * * * *
15452059 AACTATTCAAAATAAAAAAATACTAATTTATT-AACA-CTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATAA
240 AATTATTTAGAATAAAATAATAATAGTTT-TTCAACATTTC-AAAAATTAAT----AAGAAAT-T
* * * * * *
15452122 AAAAAAATAAATCGATTTAC-CAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAA
298 AAAAAACTAAATCTATTTACTGAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * *** *
15452173 ATAATTATTTATTTAAAATAAATATGACCTTTT-TTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAT
1 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
** * * * * * *
15452236 -AAAATTTTATCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAATTTGATAAGTTAGAG
65 CAAGCTTAT-TC-AAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTTAGAG
** * * * *
15452299 ATTT-AAAAATAAGTCAATTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTAT
127 ATTTAAAAAATAA-TCTGTTTATTGAATCGGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTAT
15452360 CTATTTCAAA
Statistics
Matches: 2042, Mismatches: 469, Indels: 337
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
332 1 0.00
333 77 0.04
334 109 0.05
335 6 0.00
336 1 0.00
337 2 0.00
338 8 0.00
339 9 0.00
340 5 0.00
341 12 0.01
342 10 0.00
343 11 0.01
344 3 0.00
345 1 0.00
347 4 0.00
348 34 0.02
349 53 0.03
350 1 0.00
351 1 0.00
352 8 0.00
353 29 0.01
354 118 0.06
355 108 0.05
356 95 0.05
357 113 0.06
358 226 0.11
359 154 0.08
360 371 0.18
361 160 0.08
362 104 0.05
363 38 0.02
364 68 0.03
365 8 0.00
366 11 0.01
367 80 0.04
368 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (348 bp):
ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATC
AAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTT
AAAAAATAATCTGTTTATTGAATCGGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATTAATCGTT
ATAACATTTTGATTCTCATAAAACAATTTGTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAAT
AATAGTTTTTCAACATTTCAAAAATTAATAAGAAATTAAAAAACTAAATCTATTTACTGAAACAA
TTCAAATAATTATGACTATTTGA
Found at i:15450545 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 15450281--15463608 Score: 4002
Period size: 181 Copynumber: 73.6 Consensus size: 178
15450271 TTGTAATCAT
* * * *
15450281 TACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT---TAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * * * *
15450343 CTAGCTT-AAATAGTTATGACTATTTGAGCATTTTTTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTC
64 CTAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
15450407 TATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * **
15450458 TATTGACTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAACTAAATATGTTTATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * ** * * *
15450523 ACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
15450588 TGTCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCCTAAAAGCTTA-TT-GAAAAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15450637 GACTAAGTTATTAATATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACAAA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAA
* * * * * * * * ** *
15450702 ATAAGTTTAATTAATTATGACTATTTCAACAATTATCTAATTGAAATTACTATAACCTTTTGTTT
64 CT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
15450767 TGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCGTACAAGCCTATTTTGG-ATAAAATAA
128 TGTTATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGGAATAAAATAA
* *** * *
15450819 TACAAATTTATTAATA-AAAAGATAATTAATAAGTAAAAA-ATATAAAAATAAATCTATTTACAG
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-A-AATTAATAAGTAAAAATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACA-
** * * * * * * * *
15450882 AAAAAGTTTAAATATTTATTACTATATAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* **
15450947 TTGTTATAAAACAATTGTTT-TCATTCATACAAGCCTA-TACGAATTAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAA
* * * * ***
15450999 TATTAGTTGATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACAA
* * * * * * * *
15451064 ACAAATTCCAAT--TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACCTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * ** * *
15451127 TGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-TATTTTAGTTGAAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15451177 TACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTGAGTAAAAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTATAAA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAA
** *
15451242 AAATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-ATATATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
64 CTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
** * *
15451306 TTGAAATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGG-ATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* *
15451357 TACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * ** * *
15451422 GCGAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * *
15451487 TATTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * ** * * * * *
15451538 TACTAATTTATTAATA-TTCTAAA-TATTAAGTTGGAGATATAAAAAATAAATCTATTCATAGAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACA-AA
* ** * * * * * *
15451601 CTAGTTCAAACAACTATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTT
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* ** *
15451666 GTCATAAAA-AGTATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAA
129 GTTATAAAACA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15451717 TACTAATTTATTAATAATTTCAAAACTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATTTGTATATCGAA
1 TACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * * * * * * * *
15451779 CCAATTCAAATAGTTATGACCATTTGAAAAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTT
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
15451843 ATCATAAAACAATTATTTATGTTCATTA-ACACCTTA-TTCGACAGT-AAATAT
129 GTTATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TACA-AGCTTATTTGGA-A-TAAAATAA
* * * * *
15451894 TGCGCTAAAATTAATAATATTTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTT
1 T--ACT-AATTTATTAATA--TTT-CAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * ** * *
15451959 GCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAAGCAATTATCTATTCCAAATCATTCTAACC-T
59 -ACAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTT
* * * * * * *** *
15452022 TTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATAAC-TATTCAAAATAAAAAAA
122 TTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * ** **
15452079 TACTAATTTATTAACA-CTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATAAAAAAAAATAAATC-GATTTAC
1 TACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAA-AAAT-TTAAAAAATAAATCTG-TTTA-
* * * * ***
15452142 CAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATAAATATGACCTTTT-
60 CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * ** * *
15452206 TTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAATTTTATCTGAAATAAAATAA
125 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * ** **
15452260 TATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAATAAGTCAATTTATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * * **
15452324 A-TCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTT
63 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * *
15452388 TTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * *** * *
15452440 TATTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAGGCGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * *
15452504 AC-----C----AG-T-T-CCTGTTTGAACAATTATCTATTTCTAATTGTTATAACCTTTTGTTC
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
15452557 TGTTTCTAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAACAA
128 TG-TTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15452609 TACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCGT
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTT-AC-A
* * * * *** * ** * ** **
15452674 AGC-AGTTTAAACAGTTAAGACTATACAAATAATTATCAATTTCTAATCATTATGACCTTTCATT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * *
15452738 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGGTTATTTGCAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * *
15452790 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGT---GATTTAAAAAGTGAATCAGTTTATCAAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * * * * * * * * * * *
15452852 TTAATTCAAATAATTATGGCTATGTCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTG
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** *
15452917 GTCATATAAA-AATTATATT-TGA-ACATTCAATCTTATTTAAAATAAAAGAA
129 GTTATA-AAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * *
15452967 TACTAATTTATTAATCTTTGACAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATGAATTTGTTTACTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-AA
* * * * * * * *
15453031 ACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTGAAATTGTTATAACCTTTTTATT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTT
* * * * * * *
15453096 TTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAG-TCTATTTGTATTAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * *
15453148 TACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGAA-TT-AAAAATAAATTTGTTTGCCA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACA
* * * ** ** * *** *
15453211 AACTACTTCAAATATTTAAGACCGTAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGATCTTTTGTT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * ***
15453276 TTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATAACAA-CTTAATCAAAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAAC-AATTGTTTCTATTCAT-ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* ** * * * * * * *
15453328 AAGAAAGTTATTAATATTTAAAAAAATTAATCAGGAACAGATTTTAAAAAATAATTTTGTTTACT
1 TACTAATTTATTAATATTT--CAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-
* * * * * * * * * ** *
15453393 TAACCAATTCAGACAATTATAACTATTTAAACAATTATCTGCTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
61 AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* ** * * * * **
15453458 TTTGTAATATATAA-GTTTGTTTAGAATAAAGTAATACTAGTCTATTAATATT--TCTAAAACTA
126 TTTGT--TATAAAACAATTGTTT---CT--ATTCATACAAG-C--TT-AT-TTGGAATAAAA-TA
15453520 A
178 A
** * ** * *
15453521 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTAATCAAACCAATTCAA-ATAGTTATGACTATTTGACAAA
1 TACTA-ATTT-----ATTAA--TATT--TC-AA--AATT-AATA-AG-TA--AAAATTTAAAAAA
* * * * * * ** *
15453585 T-TATTTATTT-CAAA-TAATT-ATAAT-TTTCTGTTTAATTATAAAACAATTATTTTTATTCAT
48 TAAATCTGTTTACAAACTAGTTCA-AATAGTTATGACT-ATT-T-GAACAATTA--TTTATT--T
* * ** ** * * * ** * *
15453645 ACAAACTTATTCAAATTAAAATAATATTAAT-TTAT-TAAC-ATT-TTGATAATTTC-TAAATAA
105 -CAAA-TTGTT---A-TGACCTTTTGTT-TTGTTATAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATACA-AG
*** *
15453705 AAAATTT--AA-AAAACAA
160 CTTATTTGGAATAAAATAA
* * ** * * * * *
15453721 AAGGTTTTGTCATAATGTAATTGTTTC--TATTCATACA--AAATTAA-TCAAAATAAAATAATA
1 TA-CTAAT-T--T-AT-TAA-TATTTCAAAATTAATA-AGTAAA--AATTTAAAA-AATA-AAT-
* ** * * ** * * *
15453781 CTAATTTATTAA-TATTTCAAA-AATTA-GTAAAAGTCCT-AAAAACTAAATCTGT-TTATCAAA
53 CT-GTTTACAAACTAGTTCAAATAGTTATG-ACTA-T-TTGAACAA-T-TAT-T-TATT-TCAAA
** * ** * * * ** *
15453841 CCAGTTCA--A-CTAGTTATGCTTATT-TGA-ATAATTAACTGTCTCAAATTGTTA-AGATCTTT
109 -TTGTT-ATGACCT--TT-TG-TT-TTGTTATA-AAACAATTGTTTC-TATTCATACA-AGC-TT
**
15453900 ATTTTGTCATAAAATAA
163 A-TTTGGAATAAAATAA
* * * * *
15453917 TTGTTTCT-ATTTATATAAGCT-TATTCAAAGTAAAATATTGCT--AAATTAATAAAAGATAAAT
1 ----TACTAATTTAT-TAA--TAT-TTCAAAAT-TAATA-AG-TAAAAATT--TAAAAAATAAAT
* * * * * * **
15453978 GTGTTTGCCAAACCAAG-TCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
53 CTGTTT-ACAAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT
* ** * * * * * * *
15454042 GACCTTTTGTTTAGCCATAAAATAATTGATT-TAGTTCATATATGCTTTTTTGAAATAAAAAAAA
116 GACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAAT--AAAATA
15454106 A
178 A
* * ** * * *
15454107 TACTAATTTGTTAAGA-TTCAAAAACTTAATAAACAAGAAATTTTATAAAATAAATCTATTTATT
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAA-TTAATAAGTAA-AAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * *** *
15454171 GAACAAGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACTTTTTGT
61 AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * * * *
15454236 TTTATAACAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCTGAAATAAAATAA
126 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * ** * ** * *
15454289 TATTACTATATTAATATTTCAAAAATTGGTAAGTTAAAAATTTTAAAAATAGGTCAGTTTATCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * * ** * *
15454354 A-TCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTTAACAATTATCTT-TTTCAAATAGATGCGAACTTTTAT
63 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * * **
15454417 TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAGAAT-AAATAA
126 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * *
15454469 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAGTAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA
1 TACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CA
* * * **
15454534 AAC-----C----AGTT-T--CTATCTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAAACCTTTTGTT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * ** * *
15454587 CTATTATAAAATAATTATTTCAATTCATTTAAGCTTATTAGTAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * * *
15454639 TACTAATTTAATAATATTGCAAAAATTTATAACTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACAA
* * * ** *
15454704 AGC-AGTTCAAACAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGCCCTTTTGT
63 A-CTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* ** ***
15454767 TGTGTCCTAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
126 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * ** * *
15454820 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * * * *
15454885 A-TCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTT
63 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * ***
15454949 TGGTCATATAACAATTGTATT-TGA-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * ** * **
15455001 TACTAATTTACTAATCTTTCAAAAATTAATACGTAAGAGATTTTTTAAAA-AAATTTGTTTATTG
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CA
* * ** * * *
15455065 AACTAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTATT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * *
15455130 CTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAGTTAGAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * *
15455182 TACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAGGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTGCTT
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTA--AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-A
* * * * * ** *
15455246 AAC-ATGCTGAAATATTTAAAGACTATATGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
62 AACTA-GTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
15455310 TTTTGTCATAAAA-TATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA
125 TTTTGTTATAAAACAAT-TGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * * * *
15455366 AACAAATTTATAAATATTTAGAAAATTAATAAG--AGATTTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAA
1 TACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * ** * *** **
15455429 C-CGTTCAAATAATTATGACTATTTGATTAATTATCTATTTCAAATCACTATGATATTTTGTTTT
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * * * *
15455493 GTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGGAACAAAGTAA
129 GTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * *
15455543 TACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---ATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * * *
15455605 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAGTTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTCT
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15455670 ATTACAAAACAATTATTT-TATTCATACAAGC-TATTCGGATTAAAATAA
129 GTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * **
15455718 TACTAATTTATTAATATTTCGATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAATTATGTTTATTGA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* ** * * * * * * * * * *
15455783 ACTTGACCAAATAATCATGATTGTGTGAATAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTCTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * ***
15455848 TGTCATAAAAGATTTGTTT-AAGTTCATATAAGATTATTCAAAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * * * * *
15455899 TAGTAATTGAGTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGAATTAAAAAATGAATCCGTGTACTG
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-A
* * * * * * * * * *
15455963 AACAAGTTAAAATAATTATGACTGTGTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
15456028 TTGTCATCAAAGAATT-TTTCTGTAT-ATACAAGCATATTTTGAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * *
15456079 TA-TAAATTTATTAATA-TTAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAGT
1 TACT-AATTTATTAATATTTCA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * * * * **
15456142 GAACAAGTTTAAATCA-ATATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGATTTTTTG
61 AAACTAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * ** * *
15456206 TTTTATCT-TAAAACAACTACTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCGAATTAAAATAA
125 TTTTGT-TATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAA
* * * *
15456260 TATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGA
1 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACA-A
* * * * * * * * *
15456325 ACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAATACTTATCTATTTGAAATCGTTATGATCTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* *** *
15456390 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCCTACAAGCTTATTCAAAATATAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * ** * * * * *
15456441 TACTAATTTATTATTATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTAAAAAAATATATCTATTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * * * * * * ** *
15456506 ACAAGTTCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTAATTAAATTTTGATT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * ***
15456571 TGTCATAAAACAATTGTTT-TGATTCATAGAAAG-TTACTCAAAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* ** *
15456622 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGCTTAAAAAACTAAATCTATTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTA-CAA
* * * ** * *
15456683 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACACTTATCTATCTCAAATCATTCTGA-TTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * *** * *
15456747 TGTCATAAAACAATTATTTCTGGCCATACAAACTTATTT-GAAGTAAAATAT
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAA
* * * * * * * * * * *
15456798 TGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTGAAAAATTAATATATTTGTCGA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACAA
* * * * * * ** *
15456863 ACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * ** * ** ** **
15456928 AGTCAT-ATGC--TTATTTGAGATAAAATA-ATA-C-TATTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTT
128 TGTTATAAAACAATTGTTT-CTAT-TCATACA-AGCTTATTTG--G-A--A--T-AAA-A-TAA
* * ** ***** *
15456986 TGACT-ATTTGAACAATTATTTATTT-AAAATCATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAAAT-
1 T-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAAATTA-AT-AAGTAAAAATTTA--A-AAAATAAATC
* ** * *
15457048 TGTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATA-AAAT-AATA-TT--AC-TTTATTAATATTTCA
54 TGTTT--A--C---AAA-C-TAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT--TATTTC-
* ** **** * * *
15457106 AAAATTG--A-GAACTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCAGTT-TATCGAATCCATTCAAATA-ATT
106 -AAATTGTTATGACCTT-TTG-TTTTGTTA-TAAAACAATTGT-T----TCTATTC--ATACA--
* *
15457166 ATGCTTATTT-GAATAATTATCTA
158 A-GCTTATTTGGAATAA-AAT-AA
** * **** * * ** ** *
15457189 TTTTGAATCGTTATGAACT-TTT-GGTTTGTCATAA--AACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCT
1 TACT-AAT--TTATTAA-TATTTCAAAAT-TAATAAGTAA-AA---ATTTAAAAAATA-AA-TCT
* ** * * * * * * ** * * *
15457250 -ATT-CGAAA-TA--AAAAATAATTAATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATT-TAAA
55 GTTTAC-AAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA-A-ATTGTTAT
* ***** * * **** *
15457308 AAAGAAAT-ATTT-TTACTAAACCAATT-CAAATAGTT-AT--TA-C-TATTT-GAATAATTATA
116 GACCTTTTGTTTTGTTA-TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAA--A-A
*
15457364 TAT
176 TAA
* * ** * *** *** *
15457367 TTCAAATTGT-TATAACCTTTTATTTTGTAATAA--AACAATTATTTAAGTTCATATAAGCTTGT
1 TACTAATT-TAT-TAATATTTCAAAAT-TAATAAGTAA-AA--ATTTAA-AAAATA-AATC-TGT
* * * ** ** * **
15457429 TCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTATGAAAATTAAT-AACTAAGAGAATTAAAAAA
57 T-----T---ACAA-ACTAGT-TCA-AATAGTTATGACTATT--TGAAC--A-ATTATT--TATT
** ** * * *** ** *
15457492 T-AAATTTGTTTACTGAACAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATC
104 TCAAA-TTG-TTA-TG-AC-CTTTTGTTTTGTT-A---TAAAACAATTGTT-TCTA-TTCATA-C
* **
15457556 ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AA
157 A--A-G--CTTAT-TTGGA--ATAAAATAA
* ** * *** * *** * *
15457585 -AATGTTTTTGTTCATATATGTT--TGTTTGGAATAA--AATAATATTAATTTATTAATAT-TTT
1 TACT-AATTTATT-A-ATAT-TTCAAAATT--AATAAGTAAAAAT-TTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * * * * **
15457644 AAAAATTA-ATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAA
59 ACAAACTAGTTCAAATAGTT-----AT-GA-CTATTT---GAA-CAATT---AT--TTATTTCAA
* * * * * * * * *
15457708 TTTGAATAATTA--TTTATTTTAAATTGTTAT-GACCATTTGTTT-TGTTACAAAACAATTG-TT
108 ATTG--TTATGACCTTT-TGTT---TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATT-C-ATACAA--GCTT
* *** *
15457768 -TTT-G-TTTGTACAA
163 ATTTGGAATAAAATAA
* * * * ** * * * * * *
15457781 -GCTGATTTGAAATAACATAATTCTAATTTCTTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA--TAT
1 TACTAATTT---ATTA-ATATTTC-AA--AATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAA-ATCTGT
* * * ***
15457842 TTAAAAACTGAATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATT
57 TTACAAAC----TA-G--T-TCAAAT-A---------GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
* * * * *
15457907 TCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAATAAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT-
104 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
*
15457970 TAATTAAAATAA
168 GAA-TAAAATAA
**
15457982 TA-TAAATTTATTAATA-TTCAAACAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATCTGTTTAC
1 TACT-AATTTATTAATATTTC-AA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTAC
* * * * *
15458045 TGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGTTATGACTTTTT
61 -AAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
* * * * * *
15458109 GTTTTGTCATCAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAA
124 GTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15458164 TATTAATTTACTAATATTTCGATAGTTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATATGTTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * * ** *
15458228 ACAAGTTCAAACAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
** * * * * * * *
15458293 CATCATCAAACAATTGTATCAATTCATATAGGC----TT-G-TTAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * * * * *
15458338 CACTAATTGATTAATATTCTAAAAAGTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTGCTTACTGA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-AA
* * * * *
15458403 ACAAGTTCAAATAGTTAT-ACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* *
15458467 TG-TCTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTACTTT-GAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGGAATAAAATAA
* * *
15458517 TA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTG-TT-----
1 TACTAA-TTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAA
** * * * * * *
15458575 -T--TT----T-G--AACAC-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTAGGACATTTTGTTTT
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15458629 GTCATAAACCAATTGTTTCTACTCATACAAGCATATTTGAAATAAAA-AA
129 GTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* *
15458678 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * * * *
15458743 GCTAGTTCAAATAATTATCACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTGATTATCTTTTTTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
15458808 TATCATAAAGCAATTGTTT-TAATACATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* ** * * * * * *
15458859 TACTAAATTAAAAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * *
15458924 ACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACATTTATCTATTTCAAA-TGATTATGACCTTTTGTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTG-TTATGACCTTTTGTT
* * * ** *
15458988 TTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * *
15459040 TACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTT-AAAAACAAATCTATTTACTGAA
1 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC--AA
* * * * * *
15459101 AC-GGGTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * *
15459164 TGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * *
15459214 TACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTATTTGCCAA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACAA
* * ** * * * * *
15459279 ACCAGTTGAAATAGTTGA-GAGAATTAGAACAA-TATTTTATTTTAAA-TGTTCTAACTTTTTGT
63 ACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTA-TTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * * **
15459341 TTAGTAATAAAACAATTATTTC-AGTTAATACAAGCTTATTTACAATAAAATAA
126 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15459394 TATTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CA
* * * * * *
15459459 AACTAATTCAATTAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATAT-ATATTTGTTATGACCTTTTG
62 AACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA-AATTGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
15459522 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATGTGAAATAAAATAA
125 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * * * * ***
15459576 TACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAAGAACTAAAGCTATTTTTTGA
1 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACAA
* * * * ** * * *
15459641 ACCAGTTGAAATGGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATG--GTATTTGTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTT
* * * * * * *
15459704 TTCTCATAAAATAATTG-TTCTAATCATACAAGCATATTTAG-ATGAAAGTAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAA
* * * * * * *
15459755 TACTAATTT-TATAATATTATAAAAATTAATAAG---AGATTTACAAAATAAATGTATTTGCCGA
1 TACTAATTTAT-TAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACAA
* * * * * * * * *
15459816 ACCAATTTAAATAGTTAAGACTATTAT-AATAATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGA-CTTATTA
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-GACCTT-TTG
* * * * * *
15459878 TTTAGTCATATAATAATTGTTTC-AGATCATACAAGCTTCTTTGGAATAAAATAA
125 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * *
15459932 TACTAATTTATTAACATTTGAAATATTAAT-A-TAAAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTAC
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAA-ATTAATAAGT-AAA-A-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * ** * *
15459995 TGAAC-AATATCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT
61 -AAACTAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
* * * * * * *
15460059 GCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
124 GTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * *
15460114 TACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAACAAG---AGACTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-AAA
* * * * *
15460176 CCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTC
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
15460241 TATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * * **
15460292 TACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAACAATAAAATCCGTTTATTG
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTA-CA
* * * * *
15460357 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACATTTTGTT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * ** *
15460422 TTGTTATAAAACAACTATTTC-AGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGGAGAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15460474 AACTAATTTATTAACATTTCCAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCAA
1 TACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * ** *
15460539 ACCATTTCAAATA---AT---TA--T-AAC-------TATTTCAAATCATTATAACCTTTT-TTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
15460587 TGTAATAAAACAATCGTTTCAATTCATATAAGTTTATTT-GAAGTAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAA
* * * * *
15460638 TACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAGAA-GAATCTATTGACCA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAA-AATAAATCTGTTTA-CA
* * * *** * *
15460702 AA-TAATTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACATTTTGT
62 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * *
15460766 TTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAA
126 TTTGTTATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * *
15460819 TA-TAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTA
1 TACT-AATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAA-AAAATAAATCTGTTTAC-A
* * *
15460881 AAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGT
62 AACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * ***
15460945 TTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAA
126 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * *
15460998 TACTAATTTA-T-ATATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAG
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAC
* * ** * *
15461061 TGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATTCATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTA
65 T-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * **
15461126 ATAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAA
129 GTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * ** * * ** *
15461176 TACTAATTTATTAATACTAT-AAAA-TAATGAGTTGGAGATGTT-AAAAATAAAGCTACTTACTG
1 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAG-TAAAAAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTAC-A
* * * * * * * * **
15461238 AACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
** * ** *
15461303 TTGTCGTAAAACTAA-TGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * *
15461355 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AA--AGAGATTTAAAAACTAAATCTCTTTATCAAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C-AA
* * * * * ** * * * *
15461417 AC-AATTTAAATAATTATGACTACTTGAACAATAACCTATCTT-AGATTATTGTGATC-TTTGTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
15461479 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAT
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * *** * *
15461531 TGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGCTT-AAAAATAAATGTGTTTGTCGA
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-AC--
* * * ** *
15461595 ACAAC-AATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTG
61 A-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * *
15461659 TTTAGTCAT-AAACTAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAA
125 TTTTGTTATAAAAC-AATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * ** * *
15461713 TAATAATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTTATAAAATAAATGTGTTTACC
1 TACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAAT-AAGTAAAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-C
* * * ****
15461777 AAA-TAAGTTCAAATAGTT-TGAATATTTGAACAATTATCTATTTAAAACAAATATGACCTTTTT
61 AAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTT
* * * ****
15461840 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAA
124 GTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * * * * ** * *
15461895 TATTACTATATTAACATTTCAAAATTGAGAAGTTAGAGATATAAAAAATAGGTCAGTTTATCGAA
1 TACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * * * * * *
15461960 TTGGTTCAAATAATTATGA-TCATTTTAACAATTATCT-TTTCAAATAGTTATGAACTTTT-TTT
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * *
15462022 TGTCATAAAACAAATTTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAA
128 TGTTATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * *
15462072 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAACATAAATCTATTTACCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * ** **
15462137 AC-----C----AG-T-TCA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * ** * ** *
15462190 TGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATA-TTACAAAAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * *
15462240 TACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACAA
* ** * * **
15462305 AGTAGTTCAAATAGTTAAT-ACTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
63 ACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * ***
15462369 GTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * *
15462421 TACCAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGT---GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * * * * *
15462483 TTAGTTCAAATAATTATG-GTCATGTCAACAATTATTTA-TTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTT
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
15462546 GGTCATATAACAATTGTATT-TGA-ACATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * *
15462597 TACTAATTTATTAATCTTTCATAAATCAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTATCGA
1 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* ** * *
15462661 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA-T-TTTATGCTTCAAATCATTATTACCTTTTAT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT--TTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * * ** * ****
15462724 TCTATCATAAAACAATTATCTT-GGTTCATGC-AGCTTATACAAAATAAAATAA
126 TTTGTTATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
** * * * * * * * *
15462776 TGTTAATCTAATAATATTCCCAAAATTAATAATTAAGAGAATTAAAAAAATAGATTTGTTTGTCT
1 TACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTGTTT-AC-
* * * * * ** *
15462841 AACCT-GTTCAAATATTTAAAGACTA-TTGAATAACTATCAATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
61 AAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * **
15462904 TTTTGTCATAAAA-TATTTTTTTTGAATTCATACTTGCTTATTTGGAATAAAATAA
125 TTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * * * * *
15462959 -A-AAATTTATTTATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTA
1 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAA
* * * * * *** * *
15463022 ACCAGTTGAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATTACATTTTGTTT
63 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * * * * *
15463087 TGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGAAACAAAGTAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
* * * *
15463138 TACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AAATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAA
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA
* * * * * *
15463200 CTAGTTCAAACAGTTATGGCTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTAT-AACTTTTCGTTC
64 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTT
* * * *
15463264 TATTACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTA-TTCGAATTAAAATAA
128 TGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAA
* * * *
15463315 TACTAATTTATTAATATTTTGAGAATTAATAAGTAAAAAATTTTTAAAAATAAATATGTTTACCA
1 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGT-AAAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CA
** * * * * * * * * *
15463380 AACTAGACCAAATAATCATGTCTGTGTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
15463445 TTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGCTCATATAAGCTTACTCGAAATAAAATAA
127 TTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
** * * * ** * *
15463497 TACTAATTTAGGAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCCATGTACTG
1 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-A
* * * * * *
15463561 AACAAGTTAAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTGAAAT
62 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
15463609 CGCTATTATT
Statistics
Matches: 9818, Mismatches: 2466, Indels: 1730
0.70 0.18 0.12
Matches are distributed among these distances:
161 76 0.01
162 56 0.01
163 10 0.00
164 95 0.01
165 22 0.00
166 15 0.00
167 31 0.00
168 123 0.01
169 176 0.02
170 53 0.01
171 4 0.00
172 9 0.00
173 30 0.00
174 137 0.01
175 171 0.02
176 389 0.04
177 773 0.08
178 618 0.06
179 1028 0.10
180 1364 0.14
181 2289 0.23
182 967 0.10
183 189 0.02
184 179 0.02
185 26 0.00
186 107 0.01
187 8 0.00
188 26 0.00
189 20 0.00
190 35 0.00
191 42 0.00
192 53 0.01
193 37 0.00
194 43 0.00
195 30 0.00
196 31 0.00
197 39 0.00
198 38 0.00
199 61 0.01
200 50 0.01
201 60 0.01
202 34 0.00
203 33 0.00
204 29 0.00
205 23 0.00
206 23 0.00
207 17 0.00
208 17 0.00
209 17 0.00
210 8 0.00
211 10 0.00
212 26 0.00
213 9 0.00
214 12 0.00
215 3 0.00
216 6 0.00
217 8 0.00
218 11 0.00
219 14 0.00
220 4 0.00
222 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAACT
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
TATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
Found at i:15451357 original size:358 final size:358
Alignment explanation
Indices: 15450379--15453289 Score: 1298
Period size: 360 Copynumber: 8.1 Consensus size: 358
15450369 AGCATTTTTT
** * * * * * *
15450379 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAG
* * * * * * * *
15450443 TTCGGATTAAAATAATATTGACTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAA
66 TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAA-AATTATTAAGTAAAAGA-ATTAAAAA
* * * ** * * * * * * * *
15450506 CTAAATATGTTTAT-TGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGA-GTAATTATCTATTTGAAA
128 ATAAATCTATTTATAAAAAAT-GTTCAAATAATTATGACTATTTAACAT-ATTATTTATTTCAAA
* * * * * * *
15450569 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCCTAAAAGCTTA-TTGAAAAA
191 TTGTTATGACATTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAATAA
* * * * * * *
15450632 AATAAGACTAAGTTATTAATATTATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTG-TT
254 AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* * * * * * *
15450696 TAC-AAAATAAGTTTAATTAATTATGACTATTTCAACAATTATC
318 TTCGAACA-AA-TTCAAAT-ATCATGACTATTTGAAAAATTATC
* * * * * * * * * * * **
15450739 TAATTGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCGTACAAGCCTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA
* * * **** * *
15450804 TTTTG-GATAAAATAATACAAATTTATTAATAAAAAGATAATTAATAAGTAAAA-AA-TATAAAA
65 -GTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTAAGTAAAAGAATTA-AAAA
* * * * *
15450866 ATAAATCTATTTACAGAAAAA-GTTTAAATATTTATTACTATATAA-ATAATTATTTATTTCAAA
128 ATAAATCTATTTATA-AAAAATGTTCAAATAATTATGACTATTTAACAT-ATTATTTATTTCAAA
* * * * **
15450929 TTGTTATAACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TCATTCATACAAGCCTATACGAATTA
191 TTGTTATGACATTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTTGAA-TA
* * *
15450993 AAATAATATTAGTTGATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT
253 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * *
15451058 TTTTGAACAAATTCCAAT-TCATGACTATTTGAATAATTATC
317 TTTCGAACAAATTCAAATATCATGACTATTTGAAAAATTATC
* * * * *
15451099 TATTTCAAATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-TATTTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTA
*
15451162 GTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTGAGTAAAAGAATTAAAAAAT
65 GTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTAAGTAAAAGAATTAAAAAAT
* * * *
15451227 GAATCTGTTTATAAAAAATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATA-TATTTATTTCAAATCG
130 AAATCTATTTATAAAAAATGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACATATTATTTATTTCAAATTG
* * *
15451291 TTATGACCTTTTGTTTTGAAATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGATAAAATA
194 TTATGACATTTTGTTTTGTAATAAA-CAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGAATAAAATA
* * * * * *
15451356 ATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACC
258 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCG
* * * * *
15451420 AAGCGAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATT
322 AA-CAAATTCAAATATC-ATGACTATTTGAAAAATTATC
* * * *
15451459 TATTTCAAATCATTATGATCTTTTTTTTTATTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAG
***
15451524 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAA-TATTAAGTTGGAG-ATATAAAAAAT
66 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTAAGTAAAAGAAT-TAAAAAAT
* * * * * * * *
15451585 AAATCTATTCAT-AGAACTAGTTCAAACAACTATGTCCATTTAA-ACTATTATCTATTTCAAATT
130 AAATCTATTTATAAAAAAT-GTTCAAATAATTATGACTATTTAACA-TATTATTTATTTCAAATT
* * *
15451648 GTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAGTATTGTTTCTATTCATACAAA-ATTATTTAGAATAA
193 GTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAACA--ATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTT-GAATAA
* * * *
15451712 AATAATACTAATTTATTAATAATTTCAAAACTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGTAT
254 AATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* * * *
15451773 ATCGAACCAATTCAAATAGTTATGACCATTTGAAAAATTATC
318 TTCGAACAAATTCAAATA-TCATGACTATTTGAAAAATTATC
* * * * * * * * **
15451815 TATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTATCATAAAACAATTATTTATGTTCATTA-ACACCTT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TACA-AGTTT
* * * * * * * * *
15451878 A-TTCGACAGT-AAATATTGCGCTAAAATTAATAATATTTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAA-AT
64 AGTT-GA-AATAAAATAAT--ACT-AATTTATTAATA-TTCT-GAAAATTATTAAGTAA-AAGAA
* * *** * * * * *
15451940 TTAAAAAATAAATATGTTT-GCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAGCA-ATTATCTA
121 TTAAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAT-GTTCAAATAATTATGACTATTTAA-CATATTATTTA
* ** * * * * * * * *
15452003 TTCCAAATCATTCTAAC-CTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATAA-C-TAT
184 TTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCTATTCATA-A-AAGCTTAT
** * * * * **
15452065 TCAAAATAAAAAAATACTAATTTATTAACA-CTCAAAAAATTAATAA--ACAAGAAATAAAAAA-
246 T-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
** * * * * *
15452126 AAATAAATCGATTTACCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAATAATTATT
308 AAAT--AT-G-TTTTTCGAACAAATTCAAATA-TCATGACTATTTGAAA-AATTATC
* * * * * *
15452182 TATTTAAAATAAATATGACCTTTT-TTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAATTTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTA
* * * * * *
15452245 -TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAATT-TGATAAGTTAGAG-ATTTAAA
65 GT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAT--TAAGTAAAAGAATTAAAA
* * * ** * * * *
15452306 AATAAGTCAATTTATTGAATCA-GTTCAAATAATTATGGCCATTTGA-ATAATTATCTATTTCAA
127 AATAAATCTATTTA-TAAAAAATGTTCAAATAATTATGACTATTTAACAT-ATTATTTATTTCAA
* * * * * *
15452369 ATCGTTATGA-ATTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAA
190 ATTGTTATGACA-TTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTT-GAA
* * *** *
15452432 TAAAATAATATTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAGGCGATTTAAAAAATAAATTTG
251 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * *
15452496 TTTATCGAAC-----C-AGT-TC----CTGTTTGAACAATTATC
315 TTTTTCGAACAAATTCAAATATCATGACTATTTGAAAAATTATC
* ** * ** * * *
15452529 TATTTCTAATTGTTATAACCTTTTGTTCTGT-TTCTAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-T-TATAATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTT
* * * * * * *
15452592 TATTTGAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAA
63 TAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTAAGTAAAAGAATTAAAAA
* ** ** * * * * ** ** *
15452657 ATAAATCTATTTGTCGTAGCA-GTTTAAACAGTTAAGACTATACAA-ATAATTATCAATTTCTAA
128 ATAAATCTATTTAT-AAAAAATGTTCAAATAATTATGACTATTTAACAT-ATTATTTATTTCAAA
** * ** * * * *
15452720 TCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGGTTATTTGCAATAA
191 TTGTTATGACATTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTG-AATAA
* * *
15452785 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCA-GTT
254 AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTT
* * ** * * * * *
15452845 TATCAAATTAATTCAAATAATTATGGCTATGTCAATAATTATC
317 TTTCGAACAAATTCAAAT-ATCATGACTATTTGAAAAATTATC
* * * ** * * * *
15452888 TATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATAAA-AATTATATT-TGA-ACATTCAA-TC
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATA-AAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGT-
* * * * * *
15452949 TTATTTAAAATAAAAGAATACTAATTTATTAATCTT-TGACAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAA
62 TTAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGA-AAATTATTAAGTAAAAGAATTAAA
* * * * ** * * * * * *
15453012 AAATGAATTTGTTTACTGAACCA-GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTGTATACTTGA
126 AAATAAATCTATTTA-TAAAAAATGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACATATTATTTATTTCA
* * * * * * * *
15453075 AATTGTTATAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAG-TCTATTTGTA
189 AATTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCT-TATTTG-A
* * * * * * * * *
15453139 TTAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTT
250 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
** * * * * * ** ** *
15453203 GTTTGCCAAACTACTTCAAATATTTAAGACCGTAAGAACAATTATC
314 GTTTTTCGAACAAATTCAAATA-TCATGACTATTTGAAAAATTATC
* * * *
15453249 TATTTCAAAACATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAA
15453290 AATTTTCAAT
Statistics
Matches: 1965, Mismatches: 448, Indels: 275
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
347 52 0.03
348 4 0.00
349 65 0.03
350 143 0.07
351 4 0.00
352 1 0.00
353 4 0.00
354 1 0.00
355 32 0.02
356 77 0.04
357 80 0.04
358 340 0.17
359 197 0.10
360 352 0.18
361 256 0.13
362 131 0.07
363 41 0.02
364 81 0.04
365 5 0.00
366 21 0.01
367 75 0.04
368 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (358 bp):
TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAG
TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTATTAAGTAAAAGAATTAAAAAATA
AATCTATTTATAAAAAATGTTCAAATAATTATGACTATTTAACATATTATTTATTTCAAATTGTT
ATGACATTTTGTTTTGTAATAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGAATAAAATAATA
CTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTCGAACA
AATTCAAATATCATGACTATTTGAAAAATTATC
Found at i:15452605 original size:169 final size:168
Alignment explanation
Indices: 15452347--15452662 Score: 390
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168
15452337 ATTATGGCCA
* *
15452347 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTCA
* * * * * *
15452412 TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAAATTATTAATATT-TCAAAAATTAAT-AGTAG
65 TCATACAAGCCTATTTGAAATAAAACAATACTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAA
**
15452475 GCGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCCTG
129 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCCTG
* * *
15452515 TTTGAACAATTATCTATTTCTAATTGTTAT-AACCTTTTGTTCTGTTTC-TAAAATAATTG-TTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTT-T-TGTCATAAAATAATTGTTTT
* * *
15452577 CAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAC
63 CA--TCATACAAGCCTATTTGAAATAAAACAATACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAC
15452642 TAAAAGATTTAAAAAATAAAT
126 TAAAAGATTTAAAAAATAAAT
15452663 CTATTTGTCG
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 16, Indels: 12
0.82 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
167 7 0.06
168 34 0.27
169 61 0.49
170 23 0.18
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (168 bp):
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTCAT
CATACAAGCCTATTTGAAATAAAACAATACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAA
GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCCTG
Found at i:15455027 original size:531 final size:526
Alignment explanation
Indices: 15454015--15456927 Score: 1416
Period size: 542 Copynumber: 5.4 Consensus size: 526
15454005 AAGACTATTA
* * *
15454015 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TAGCCATAAAATAATTGATTTAGTTC
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTA-TCATAAAATAATT-ATTTAGTTC
* * * * ** * *
15454079 ATATATGCTTTTTTGAAATAAAAAAAAATACTAATTTGTTAAGATTCAAAAACTTAATAAAC-AA
64 ATATAAGCTTATTAG-AAT--AAAATAATACTAATTTAATAATATTCAAAAA-TTAAT-AACTAG
* * ** * * *
15454143 GAAATTTTATAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTGCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATT
124 GAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAAC-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATT
* * * * * * * *
15454207 ATCTATTTAAAATAAATATGACTTTTTGTTTTATAAC-AAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGC
186 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-CCTAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGC
* * * *
15454271 TTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAATTGGTAAGTTAA-AAATTTTA
250 TTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA-T--TAAG-TAAGAGATTTTA
* * * * * * *
15454334 AAAATAGGTCAGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTTAACAATTATCTTTTTCAA
309 AAAATA-ATCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
15454399 ATAGATGCGAACTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAGAATA
373 ATAGATACGAACTTTTATTTGGTCATAAAACAATTGTATTTCAACATACAAGCCTATTCAAAATA
* * *
15454464 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAGTAAGTAGGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGT
438 AATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAA-AAATTTGT
15454528 TTACCAAACCAGTT-T-CTAT-C-T
502 TTACCAAACCAGTTATACTATACTT
* * *
15454549 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTCAATTCA
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTT-AGTTCA
* *
15454614 TTTAAGCTTATTAGTAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTGCAAAAATTTATAACTAGGAGA
65 TATAAGCTTATTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-CAAAAATTAATAACTAGGAGA
* *
15454679 TTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAAACAGTTAATACTATATGAACAATTATCTAT
128 TTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAA-CAGTTCAAATAGTTAATACTATATGAACAATTATCTAT
* * *
15454744 TTCAAATCATTATGCCCTTTTGTTGTGTCCTAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
192 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
*
15454809 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGA-TTTAAAAAGTGAA
257 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTTAAAAA-T-AA
* * * *
15454873 TCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
316 TCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATAGATAC
* * * * * * *
15454938 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
381 GAACTTTTATTTGGTCATAAAACAATTGTATTTCAACATACAAGCCTATTCAAAAT-AAATAATA
* * ** ***
15455003 CTAATTTACTAATCTTTC-AAAAATTAATACGTAAGAGATTTTTTAAAAAAATTTGTTTATTGAA
445 CTAATTTACTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAAAAATTTGTTTACCAAA
*
15455067 CTAGTTCAAATAGCTATGACTATTT
510 CCAGTT---ATA-CTAT-AC---TT
* ** * * * * *
15455092 GAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCA
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTA-TTTAGTTCA
* * *
15455157 TACAAGCTTAGTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAGGAGA
65 TATAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAATAACTAGGAGA
* * * * * * * * *
15455222 ATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTTAACATGCTGAAATATTTAAAGACTATATGAACAATTATCAA
128 TTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACA-GTTCAAATAGTT-AATACTATATGAACAATTATCTA
* * * * * ** *
15455287 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTAT
191 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAAACA-ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
15455352 TTGGAATAAAATAAAACAAATTTATAAATATTTAGAAAATTAA-TAAGAGATTTTAAAAAATAAT
254 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAAGTAAGAGATTTT-AAAAATAA-
* * * * * * * *
15455416 TTTGTTTACCTAA-CCGTTCAAATAATTATGACTATTTGATTAATTATCTATTTCAAATCA-CTA
316 TCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAAT-AGATA
* * * * * * *** * ** * ** *
15455479 TGATA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGGAACAAAGTAA
380 CGA-ACTTTTATTTGGTCATAAAACAATTGTATTTCAACATACAAGCCTATTCAAAATAAA-TAA
* * * * * *
15455543 TACTAATCTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGATA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATC
443 TACTAATTTACTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAA-AAATTTGTTTACC
* *
15455602 AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
507 AAACCAGTT---ATA-CTAT-AC---TT
* * * * * * * * *
15455630 GAGCAGTTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATTACAAAACAATTATTTTA-TTCA
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTA-TTTAGTTCA
* * * * * * * ** *
15455694 TACAAGC-TATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCGATAATTAATAAGTAAAAAA
65 TATAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAATAACTAGGAGA
* * * * ** * * ** * * * * * * * *
15455758 TTTTAAAAATAATTATGTTTATTGAACTTGACCAAATA-ATCATGATTGTGTGAATAGTTATTTA
128 TTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAAC-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTA
* * * * * * * * *
15455822 TTTCAAATCGTTATGATCTTTTCTTTTGTCATAAAAGATTTGTTTAAGTTCATATAAGATTATTC
191 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * * *
15455887 AAAATAAAATAATAGTAATTGAGTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGAATTAAAAAATGAA
256 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATT-A-AGT-AAGAGATTTTAAAAAT-AA
* * ** * * ** * * * * * *
15455952 TCCGTGTACTGAA-CAAGTTAAAATAATTATGACTGTGTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTA
316 TCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATAGATA
* * * * * ** * * ***
15456016 -TAACTTTTTGTTTTGTCATCAAAGAATT-T-TTCTGTATATACAAGCATATTTTGAATAAAATA
380 CGAAC-TTTTATTTGGTCATAAAACAATTGTATT-TCAACATACAAGCCTATTCAAAAT-AAATA
* * * * *
15456078 ATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTT
442 ATACT-AATTTACTAATATTTCAA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAA-AAATTTGTTT
*** * *
15456139 AGTGAACAAGTTTAAATCAATATGACTATTT
504 ACCAAACCAG-TT--AT-ACTAT-AC---TT
* * * * * ** * * * *
15456170 GAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGATTTTTTGTTTTATCTTAAAACAACTACTTCTA-TTC
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTA-TT-TAGTTC
* * * * * ** * * ** *
15456234 ATACAAGTTTATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAT
64 ATATAAGCTTATTAGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAATAACTAGGAG
* * * * * * * *
15456299 ATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-AGAACAAGTTCAAATAG-TCATGACCATTTGAATACTTATC
127 ATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTA-AAC-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATC
* * * ** *
15456362 TATTTGAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCCTACAAGCTTA
189 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA
* * * **
15456426 TTCAAAATATAATAATACTAATTTATTATTATTCTAAAAATTAA-TAAGTTGGAGATTAAAAAAA
253 TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAGTAA----GAGATTTTAAAAA
* * * * * * *
15456490 TATATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAAT
313 TA-ATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAA-TAATTATCTATTTCAAAT
* ** * * * * * *
15456553 CG-TAATTAAATTTTGATTT-GTCATAAAACAATTGT-TTTGATTCATAGAAAG-TTACTCAAAA
375 AGAT-ACGAACTTTT-ATTTGGTCATAAAACAATTGTATTTCA-ACATA-CAAGCCTATTCAAAA
* * *
15456614 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-CAAGAG--CTTAAAAAACTAAAT
436 T-AAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAA--AAAT
* * * *
15456672 CTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
498 TTGTTTACCAAACCAGTT---ATA-CTAT-AC---TT
* * * * * * * * * * **
15456709 GAACACTTATCTATCTCAAATCATTCTGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGGCCA
1 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTT-AGTTCA
* * * * * * * * **
15456773 TACAAACTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAAAGA
65 TATAAGCTTATTAGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTC-AAAAATTAATAACTAGGAGA
* * * * * * *
15456838 TTTGAAAAATTAATATATTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTA-GAATAATTATCTA
128 TTTAAAAAATAAATCTATTTG-CTAAACAGTTCAAATAGTTAATACTA-TATGAACAATTATCTA
*
15456902 TTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTT
191 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
15456928 AGTCATATGC
Statistics
Matches: 1889, Mismatches: 393, Indels: 190
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
530 14 0.01
531 274 0.15
532 66 0.03
533 48 0.03
534 74 0.04
535 62 0.03
536 123 0.07
537 100 0.05
538 240 0.13
539 70 0.04
540 98 0.05
541 27 0.01
542 373 0.20
543 193 0.10
544 75 0.04
545 8 0.00
546 44 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (526 bp):
GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTAGTTCAT
ATAAGCTTATTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCAAAAATTAATAACTAGGAGATTT
AAAAAATAAATCTATTTGCTAAACAGTTCAAATAGTTAATACTATATGAACAATTATCTATTTCA
AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTTAAAAATAATCTGTTTACC
AAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATAGATACGAACTTTTAT
TTGGTCATAAAACAATTGTATTTCAACATACAAGCCTATTCAAAATAAATAATACTAATTTACTA
ATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAAAAATTTGTTTACCAAACCAGTTATACT
ATACTT
Found at i:15458181 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 15456967--15463610 Score: 4609
Period size: 181 Copynumber: 37.3 Consensus size: 180
15456957 ACTATTTGTC
* * * * *
15456967 GAACCAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATC-ATATGACCTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * ** * *** * *
15457031 TTTATCATAAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTAT
66 TTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * *
15457096 TAATATTTCAAAAATTGAGAACTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCAGTTTA-T
130 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * ** *
15457147 CGAATCCA-TTCAAATAATTATG-CTTATTTGAATAATTATCTATTTTGAATCGTTATGAACTTT
1 -GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * ** * * *
15457210 TGGTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCGAAAT-AAA-AA-A-TAATTA
63 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
15457271 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATATTTTTACT
128 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * *
15457325 AAACCAA-TTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTA
1 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * ** * * * * *
15457389 TTTTGTAATAAAACAATTATTTAAGTTCATATAAGCTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATCTAA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
15457454 TAATATT-ATGAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT
130 TAATATTCA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* ** * * * * * *
15457506 GAACAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * * *
15457571 TTTATCATAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATATGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
15457636 AATATTTTAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
131 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * * * *
15457683 AAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * ** * * * *
15457748 TTTGTTACAAAACAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTGATTTGAAATAACATAATTCTAATTTCTT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
15457813 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAACTGAATATGTTTA-T
131 AATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * ** * * * *
15457863 CAAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTA
1 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
15457928 TTTTGTTATAAAATAAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAATTAAAATAATA-TAAATTT
65 TTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTT
** *
15457991 ATTAATATTCAAACAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATCTGTTTACT
128 ATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACT
* * * * *
15458046 GAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGTTATGACTTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
15458111 TTTGTCATCAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTACT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
15458176 AATATTTCGATAGTTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATATGTTTACC
131 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * *
15458226 AAACAAGTTCAAACAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
** * * ** * * * * *
15458291 TTCATCATCAAACAATTGTATCAATTCATATAGGC----TTG--TTAAAATAACACTAATTGATT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
15458350 AATATTCTAAAAAGTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTGCTTACT
131 AATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* *
15458401 GAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* *
15458465 TTTGTC-TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTACTTTG-AATAAAATAATA-TAAGTTTA
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTA
* * * **
15458527 TTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTT
129 TTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
** *
15458579 GAACACA-TTTGAATAGTTAT--CTATTT---CAA--AT-T-TTT---A--G----GACATTTTG
1 GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* ** *
15458625 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTACTCATACAAGCATATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTAT
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
15458689 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-T
130 TAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * * * * *
15458740 CAAGCTAGTTCAAATAATTATCACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTGATTATCTTTTT
1 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * *
15458805 TTTTATCATAAAGCAATTGTTT-TAATACATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
** * * * * *
15458869 AAAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC
129 TTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * *
15458922 GAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACATTTATCTATTTCAAAT-GATTATGACCTTTTG
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTG
* * * **
15458986 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA
** * *
15459050 TTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAACAAATCTATTTACT
129 TTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * * *
15459098 GAA-ACGGGTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTA
1 GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * *
15459161 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
15459225 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTATTTGCC
130 TAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * ** * * * * * *
15459277 AAACCAGTTGAAATAGTTGA-GAGAATTAGAACAA-TATTTTATTTTAAAT-GTTCTAACTTTTT
1 GAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * *
15459339 GTTTAGTAATAAAACAATTATTTCAGTTAATACAAGCTTATTT-ACAATAAAATAATATTAATTT
64 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * *
15459403 ATTAACATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACC
128 ATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * *
15459458 AAACTAA-TTCAATTAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATAT-ATATTTGTTATGACCTTT
1 GAAC-AAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTT
** * * * *
15459520 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATGTGAAATAAAATAATACTACTTT
63 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * * **
15459585 ATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAAGAACTAAAGCTATTTTTT
128 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * *
15459639 GAACCAGTTGAAATGGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATG--GTATTTG
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTG
* * ** * * *
15459702 TTTTCTCATAAAATAATTG-TTCTAATCATACAAGCATATTT-AGATGAAAGTAATACTAATTT-
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
15459764 TATAATATT-ATAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTACAAAATAAATGTATTTGCC
129 T-TAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * *
15459814 GAACCAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTAT-AATAATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGA-CTTA
1 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTT-
* * * * * * * *
15459875 TTATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGATCATACAAGCTTCTTTGGAATAAAATAATACTAATT
62 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * *
15459940 TATTAACATTTGAAATATTAATATA-AAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACT
127 TATTAATA-TTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT
* ** * *
15459996 GAACAA-TATCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTG
1 GAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * *** * *
15460060 CTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15460125 TAATATTTCAAGAA-T--TAA-CAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTACT
130 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * *
15460173 GAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
15460238 TTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAG
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15460303 TAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAACAATAAAATCCGTTTATT
130 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACT
* * * * * * *
15460356 GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACATTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * ** * *
15460421 TTTGTTATAAAACAACTATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGGAGAAAACTAATTTATT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
15460486 AACATTTCCAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA-T
131 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * *
15460536 CAAACCATTTCAAATA---AT---TA--T-----A--A-CTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-
1 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * ** * * *
15460584 TTTTGTAATAAAACAATCGTTTCAATTCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTAT
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
15460649 TAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAGAA-GAATCTATTGACC
130 TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTACT
* * * * * * * *
15460701 AAATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAACATTATAACATTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * *
15460766 TTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTCATGCAAGTTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTT
66 TTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * *
15460828 -TTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCT
128 ATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACT
* * * * *
15460880 AAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * **
15460945 TTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
15461009 -ATATTCCAAAAATTAAGAAGTAA-AAATTAAAAAAATAAATCTATTTAC-
131 AATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* ** * * *
15461057 CAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTAT-TCATTTCAAATCATTATGATCTTTT
1 GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
** * * * * * *
15461121 GTTTAATAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTT
64 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * ** * **
15461185 ATTAATACT-ATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTT-AAAAATAAAGCTACTTACT
128 ATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * * **
15461237 GAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * **
15461302 TTTGTCGTAAAACTAA-TGTTTTTATTCATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTA
66 TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * *
15461365 TTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACTAAATCTCTTTATCA
129 TTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CT
* * * * * * * ** * *
15461415 AAACAA-TTTAAATAATTATGACTACTTGAACAATAACCTATCTT-AGATTATTGTGATC-TTTG
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * * *
15461477 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATATTGCTAAATTAA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * *
15461542 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGCTT-AAAAATAAATGTGTTT-GT
130 TAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * *
15461592 CGAACAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTT
1 -GAAC-A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * *
15461657 TGTTTAGTCAT-AAACTAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATT
63 TGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
* ** * * * * *
15461721 TATTAAGATTCAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTTATAAAATAAATGTGTTTACC
127 TATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * **
15461777 AAATAAGTTCAAATAGTT-TGAATATTTGAACAATTATCTATTT-AAAACAAATATGACCTTTTT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACC-TTTT
* * * *** * * *
15461840 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTATA
64 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * ** *
15461905 TTAACATTTC-AAAATTGAGAAGTTAGAGATATAAAAAATAGGTCAGTTTA-T
129 TTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
*** * * * *
15461956 CGAATTGGTTCAAATAATTATGA-TCATTTTAACAATTATCT-TTTCAAATAGTTATGAACTTTT
1 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
** * *
15462019 -TTTTGTCATAAAACAAATT-TTT-TCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT
64 GTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
15462081 ATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAACATAAATCTATTTAC-
128 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
** * * **
15462134 ---C-A----AACCAG-T-TCA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * ** ** * ** *
15462188 TTTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATATTACAAA-AAAATAATACTAATTTAAT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
15462252 AATATTCCAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC
131 AATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* ** ** * *
15462303 AAAGTAGTTCAAATAGTTAAT-ACTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
1 GAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* ** *
15462367 TTGTGTCATAAAACAATTGTTTC-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
15462431 TTAATATTCCAAAAAGTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACC
129 TTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* ** * * * * * * *
15462480 AAATTAGTTCAAATAATTATG-GTCATGTCAACAATTATTTA-TTCAAATTGTTATTACCTTTTG
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * ** * *
15462543 TTTGGTCATATAACAATTGTATT-TGAACATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTA
65 TTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
15462607 TTAATCTTTCATAAATCAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTA-T
129 TTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * *
15462658 CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-T-TATGCTTCAAATCATTATTACCTTT
1 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT--TTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * * * *** ** *
15462721 TATTCTATCATAAAACAATTATCTT-GGTTCATGC-AGCTTATACAAAATAAAATAATGTTAATC
63 TGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * *
15462784 TAATAATATTCCCAAAATTAATAATTAAGAGAATTAAAAAAATAGATTTGTTTGTCT
127 TATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACT
** * * * * *
15462841 -AACCTGTTCAAATATTTAAAGACTA-TTGAATAACTATCAATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
1 GAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * ** * *
15462904 TTTTGTCATAAAA-TATTTTTTTTGAATTCATACTTGCTTATTTGGAATAAAATAA-A-AAATTT
65 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG--TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * *
15462966 ATTTATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT
128 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CT
* * * * ** * *
15463021 -AACCAGTTGAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATTACATTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
15463085 TTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGAAACAAAGTAATACTAATCTATT
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* *
15463150 AATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATATATTTA-T
131 AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * * * *
15463196 CGAACTAGTTCAAACAGTTATGGCTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTAT-AACTTTTC
1 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-
* * * * * * * *
15463260 GTTCTATTACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTA
64 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
** * * * * * *
15463325 TTAATATTTTGAGAATTAATAAGTAAAAAATTTTTAAAAATAAATATGTTTACC
129 TTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * ** * * * * * * *
15463379 AAACTAGACCAAATAATCATGTCTGTGTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGT
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * **
15463444 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATATAAGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGG
66 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** *
15463509 AATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCCATGTACT
131 AAT-ATTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* * * * * *
15463560 GAACAAGTTAAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTGAAATCG
1 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
15463611 CTATTATTAG
Statistics
Matches: 5086, Mismatches: 1108, Indels: 538
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
161 55 0.01
162 69 0.01
164 106 0.02
165 22 0.00
166 16 0.00
167 32 0.01
168 75 0.01
169 19 0.00
170 6 0.00
171 4 0.00
172 3 0.00
173 29 0.01
174 128 0.03
175 126 0.02
176 253 0.05
177 653 0.13
178 418 0.08
179 541 0.11
180 571 0.11
181 1048 0.21
182 810 0.16
183 85 0.02
184 17 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
AATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
Found at i:15458690 original size:161 final size:162
Alignment explanation
Indices: 15458424--15458737 Score: 449
Period size: 161 Copynumber: 1.9 Consensus size: 162
15458414 TAGTTATACA
* * *
15458424 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTTTTGTCTAAAATAATTGTTTCTAT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACATTTTGTTTTGTCTAAAACAATTGTTTCTAC
* * *
15458489 TCATACAAGCTTACTTTGAATAAAATAATATAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAA
66 TCATACAAGCATACTTTGAATAAAATAATATAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAA
*
15458554 A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTGAACAC
131 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTTTGAACAC
* * ** *
15458585 ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTAG-GACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-GTGACATTTTGTTTTGTC-TAAAACAATTGTTTCT
15458649 ACTCATACAAGCATA-TTTGAAATAAAA-AATACTAA-TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAC
64 ACTCATACAAGCATACTTTG-AATAAAATAATA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAC
15458711 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
15458738 ATCAAGCTAG
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 12, Indels: 9
0.87 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
161 78 0.57
162 58 0.43
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (162 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACATTTTGTTTTGTCTAAAACAATTGTTTCTAC
TCATACAAGCATACTTTGAATAAAATAATATAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAA
AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTTTGAACAC
Found at i:15460239 original size:898 final size:873
Alignment explanation
Indices: 15457180--15463608 Score: 3335
Period size: 898 Copynumber: 7.2 Consensus size: 873
15457170 TTATTTGAAT
** * *
15457180 AATTATCTATTTTGAATCGTTATGAACTTTTGGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCAT
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTT-GTTTAGTCAT-AAATAATTG--TTTCAGTTCAT
* * * * *
15457242 ACAAGCCTATTCGAAAT-AAA-AA-A-TAATTAATTAATATTTC-AAAAATTAATA-AGTAAGAG
61 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCGAAAAATTAATATA-AAAGAG
* * * * * * *
15457301 ATTTAAAAAAGAAATATTTTTACTAAACCAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATA
124 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-CAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
15457366 TTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTAATAAAACAATT-ATTTAAGTTCATATAAGCTTGTT
188 TTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT
* * * * * *
15457430 CGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATA
252 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAGT---AGAATTAAAAAATA
* * * * ** * * * * * **
15457494 AATTTGTTTACTGAACAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATCATT
313 AATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * ** * * * * *
15457559 ATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATATGTTTGTTTGGAATAAAATA
377 ATAACCTTTTG-TTTAGTAATAAAACAATTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATA
* **
15457623 ATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA
440 ATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA
* * * * *
15457684 AACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCA-TTTGT
504 AA-CAATTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGT
* * *** ** * * * * * *
15457748 TTTGTTACAAAACAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTGATTTGAAATAACATAATTCTAATTTCTT
566 TTTGTCATAAAACAA-TGTTTCAATTCATAAAAACTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
15457813 AATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAACTGAATATGTTTATCAAA-TAAGTTCAA
629 AATATTTC-AAAAATTAATAAG--AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAA
* * * * * * * *
15457876 ATAGTTATGATTATTTGAATAAT-TGCCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTTATAAA
690 ATAATTATGACTATTTGAACAATAT--C-ATCT-AAA-T-CTTTGA--TTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * *
15457940 ATAAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAA
747 A-CAA-TTGTTTAATCATAAAAGCTTA-TTTGATGAAAATAATACT-AATTTA-TAATATT----
* * * * * * * * * *
15458004 CAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATCTGTTTACTGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGA
803 TAAAAATTAA-TAAGAGAATT-AAAAA-TAAATGTATTTGCCGAACCAA-TTTAAATAGTTAAGA
15458068 CTATT-TGAAC
864 CTATTAT-AAC
* * * * * * **
15458078 AATTATTTATTTGAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTATTTTTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTAGTCAT-AAATAATTGTTTCAGTTCATACA
* * * * *
15458143 AGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTACTAATATTTCG-ATAGTTAATA-AGTAAA-AGAT
64 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCGAAAAATTAATATA--AAAGAGAT
* * * * * * * * *
15458205 TT-TAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAACAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATT
126 TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * ** * * ** * * *
15458269 TCAAATCATTATGACTTTTTGTTTCATCATCAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTT-GT---
190 TAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * *
15458330 --TAAAATAACACTAATTGATTAATA-TTCTAAAAAGTAATG-AGTAAGAGATTTAAAATATGAA
255 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-GAAGT-AGA-A-TTAAAAAATAAA
** * * * *
15458391 TCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGT
315 TCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * *
15458455 GACCTTTTGTTTTGT-CTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTACTTT-GAATAAAATAAT
379 AACCTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTA-TTTAGAATAAAATAAT
* * * * * *
15458518 A-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTT-----
442 ACTAA-TTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA
* * * * * *
15458576 ----TT----T-G-AACAC-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTAGGACATTTTGTTTTG
505 ACAATTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTG
* * * * * *
15458630 TCATAAACCAATTGTTTCTACTCATACAAGCATATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATA
570 TCATAAAACAA-TGTTTCAATTCATAAAAACTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
15458694 TTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAGCTAGTTCAAATAATT
633 TTTCAAAAATTAATAA--GAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATT
* * * * * * *
15458759 ATCACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTGATT-ATCTTTTTTTTTATCATAAAGCAATT
696 ATGACTATTTGAACAA-TA-TCATCT-AAAT-CT--TTGA--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
15458823 GTTTTAATACATACAAGTTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAAATTAAAAATATTCTGAAAATTA
753 G-TTTAAT-CATAAAAGCTTATTTG--ATGAAAATAATACT-AATTTATAATATT-TAAAAATTA
* * * * * * * * *
15458887 ATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGTCCATT-T
812 ATA---A-GAGAATT-AAAAATAAATGTATTTGCCGAACCAA-TTTAAATAGTTAAGACTATTAT
15458950 GAAC
871 -AAC
* * * *
15458954 ATTTATCTATTTCAAATGATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATG
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG-TTTAGTCAT-AAATAATTGTTTC-AGTTCATA
** * *
15459017 CAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG-AAAATT-A-AT--AAGAGAT
62 CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCGAAAAATTAATATAAAAGAGAT
* *** * *
15459077 TT-AAAAACAAATCTATTTACTGAAACGGGTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATC
126 TTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * ***
15459141 TCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTCATACAAGTTTATTTGG
190 TAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * *
15459204 ATTAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT
255 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAGAAGT-AGA-A-TTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * * *
15459268 GTATTTGCCAAACCAGTTGAAATAGTTGA-GAGAATTAGAACAA-TATTTTATTTTAAA-TGTTC
316 CTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGA-TATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATTGTTA
* * * *
15459330 TAACTTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTATTTCAGTTAATACAAGCTTATTTACAATAAAATAAT
378 TAACCTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* *
15459395 ATTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
442 ACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAA
* * * * *
15459460 ACTAATTCAATTAGATTTTACTATTTGAACAATTATCTATAT-ATATTTGTTATGACCTTTTGTT
505 AC-AATTCAAATAG-TTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATTGTTATGACATTTTGTT
*
15459524 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATGTGAAATAAAATAATACTACTTTATTA
567 TTGTCATAAAACAA-TGTTTCAATTCATAAAAACTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * ** * * *
15459589 ATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAAGAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTGAAATG
630 ATATTTCAAAAATTAATAAG--AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATA
* * * *
15459654 GTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATGGTATTTGTTTTCTCATAAAATAAT
693 ATTATGACTATTTGAAC-AATATC-ATCT-AAATC-TT-TGAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
15459719 TGTTCTAATCATACAAGCATATTTAGATGAAAGTAATACTAATTTTATAATATTATAAAAATTAA
752 TGTT-TAATCATAAAAGCTTATTT-GATGAAAATAATACTAA-TTTATAATATT-TAAAAATTAA
* *
15459784 TAAGAGATTTACAAAATAAATGTATTTGCCGAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATTATAAT
813 TAAGAGAATTA-AAAATAAATGTATTTGCCGAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATTATAAC
* * * *
15459846 AATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGACTTATTATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGATCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACTT-TTGTTTAGTCATA-AATAATTGTTTCAGTTCATAC
* * * *
15459910 AAGCTTCTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAATATTAATATAAAAGAGATTT
63 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAATATAAAAGAGATTT
* * *
15459975 GAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAATATCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATCTATTT
128 -AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAT-TCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
15460040 AAAATTGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATATAAGCTTATTCGA
191 AAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAA
* * *
15460104 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAACAAG-AGACTTAAAAAATAAATCTAT
255 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAGAATTAAAAAATAAATCTAT
*
15460168 TTACTGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
320 TTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-TATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
* * ** *
15460233 TTTTGTTCTA-TCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
383 TTTTGTT-TAGTAATAAAACAATTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
* * * * * ** ** *
15460297 ATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAAT-AACTAAGAGATTTTAACAATAAAATCCGTTTATTGAACC
446 ATTTA-TTAAATTCCAAAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTA-CCAAAC
* * * * *
15460361 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACATTTTGTTTTGT
507 AATTCAAATAGTT-ATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGT
* * ** * * * ** * * *
15460426 TATAAAACAACTATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGGAGAAAACTAATTTATTAACAT
571 CATAAAACAA-TGTTTCAATTCATAAAAACTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
15460491 TTCCAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCAAACCATTTCAAATAATTA
634 TTCAAAAATTAATAAG--AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTA
* * * *
15460556 TAACTATTT---CAA-ATCAT-TATAA-C----CTTTT-TTTTGTAATAAAACAATCGTTTCAAT
697 TGACTATTTGAACAATATCATCTA-AATCTTTGATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AA-
* * * * *
15460610 TCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAA
759 TCATAAAAGCTTATTTGATG-AAAATAATACTAATTTA-TAATATTT-AAAAATT-A--A-TAAG
* ** *
15460675 AGAATTAAAAGA-AGAATCTA-TTGACC-AAATAATTTCAAATAGTTATGACTATT-TCAAC
817 AGAATTAAAA-ATA-AATGTATTTG-CCGAACCAATTT-AAATAGTTAAGACTATTAT-AAC
* * * * * *
15460733 AATTATCTATTTCAAAACATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TTCATGC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTAGTCAT-AAATAATT-GTTTCAGTTCATAC
* * *
15460797 AAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAA-A-A-
63 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCGAAAAATTAAT-ATAAAAGAGAT
* * * * *
15460857 TTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
126 TTAA-AAAATAAATCTATTTACTAAACA-ATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
15460922 TTCAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAACCTTATTCA
189 TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA
* *
15460987 AAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAATTAAAAAAATAAATC
254 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGT-AGAATT-AAAAAATAAATC
* ** * **
15461050 TATTTAC-CAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTAT-TCATTTCAAATCATTAT
317 TATTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGA-TATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * *
15461113 GATCTTTTGTTTAATAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATA
379 AACCTTTTGTTTAGTAATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* * *** * * **
15461178 CTAATTTATT-AATACTATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTT-AAAAATAAAGCTACTTACTGAA
443 CTAATTTATTAAATTCCA-AAAATTAATGAGCAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
* * * * * * *
15461240 CAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTTT
506 CAA-TTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTT
* ** *
15461305 GTCGTAAAACTAATGTTTTTATTCATACAAAA-TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
569 GTCATAAAAC-AATGTTTCAATTCATA-AAAACTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
15461369 TATTTCAAAAATTAA-AA-AGAGATTTAAAAACTAAATCTCTTTATCAAAACAATTTAAATAATT
631 TATTTCAAAAATTAATAAGAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATT
* * * *
15461432 ATGACTACTTGAACAATAACCTATCTTAGATTATTGTGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
696 ATGACTATTTGAACAAT-ATC-ATC-TA-AATCTT-TGAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-
** * * * *
15461497 TTTTGTTAATAAAAGCTTATTTGGAAT-AAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAAT
754 -TTTAATCATAAAAGCTTATTT-G-ATGAAAATAATACT-AATTTATAATATT-TAAAAATTAAT
* * * * *
15461561 AAGTAAGAGGCTTAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA
814 AAG--AGA--ATTAAAAATAAATGTATTTGCCGAAC--CAATTTAAATAGTTAAGACTATTATAA
15461626 C
873 C
*
15461627 AATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAGTCATAAACTAATTGTTTCAGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTAGTCATAAA-TAATTGTTTCAGTTCATACA
* * * * * * * *
15461692 TGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAGATTCAAAAAATTAATA-AACAAAAAATTT
64 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAATATAA-AAGAGA-TT
* * * * * *
15461756 TATAAAATAAATGTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGAATATTTGAACAATTATCTATTT
127 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTT
**** * * * *
15461820 AAAACAAATATGACCTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCA
191 AAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * **
15461884 AAATAAAATAATATTACTATATTAACATTTC-AAAATTGAGAAGTTAGAGATATAAAAAATAGGT
254 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAG-TAGA-AT-TAAAAAATAAAT
*** * * *
15461948 C-AGTTTA-TCGAATTGGTTCAAATAATTATGATCATTTTAACAATTATCT-TTTCAAATAGTTA
316 CTA-TTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGAT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * *
15462010 TGAA-CTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAA
378 T-AACCTTTTGTTTAGTAATAAAAC-AATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAA
* * * * *
15462072 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAACATAAATCTATTTACCAA
441 TACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA
* ** ** *
15462137 AC----C----AGTT-CA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTTTG
505 ACAATTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTG
* * ** * * * *
15462192 TTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATATT-ACAAAAAAATAATACTAATTTAATAATA
570 TCATAAAACAA-TGTTTCAATTCATAAAAACTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * ** ** * *
15462256 TTCCAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAAGTAGTTCAAATAGTT
633 TTTCAAAAATTAATAA--GAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATT
** * * *
15462321 AAT-ACTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATT
696 -ATGACTATTTGAACAA-TATC-ATCT-AAATC-TT-TGA--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** * * *
15462385 GTTTCGATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAGTA
753 GTTT--AATCATAAAAGCTTATT--TGATGAAAATAATACTAATTTA-TAATATT-TAAAAATTA
* * * * * * * ** * * * * * *
15462449 ATAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATG-GTCATGT-CAAC
812 ATAAGAGAATTAAAAA-TAAATGTATTTGCCGAACCAATTTAAATAGTTAAGACT-AT-TATAAC
* ** * * * * ** *
15462512 AATTATTTA-TTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATT-TGAACATTC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTAGTCATA-AATAATTGT-TTCAGTTCATAC
* * * *
15462575 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC-ATAAATCAATA-AGTAAGAGAT
63 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCGAAAAATTAATATA-AAAGAGAT
* * * * * *
15462638 TT-AAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-T-TAT
126 TTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAAC-AATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * * * * ** * *
15462699 GCTTCAAATCATTATTACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATCTTGGTTCATGC-AGCTTATA
189 --TTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATT
** * * * * * *
15462763 CAAAATAAAATAATGTTAATCTAATAATATTCCCAAAATTAATAATTAAGAGAATTAAAAAAATA
252 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGT---AGAATT-AAAAAATA
* * * * * * * * * * *
15462828 GATTTGTTTGTCT-AACCTGTTCAAATATTTAAAGACTA-TTGAATAACTATCAATTTCAAATCG
313 AATCTATTT-ACTGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
* * * * * * * ** *
15462891 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATTTTTTTTGAATTCATACTTGCTTATTTGGAATAAAA
375 TTATAACCTTTTGTTTAGTAATAAAACA-ATTGTTT-CATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAA
* * ** * * *
15462956 TAA-A-AAATTTATTTATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTAC
438 TAATACTAATTTA-TTAAATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * *** *
15463019 CTAACCAGTTGAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATTACATTTTG
502 C-AAACAATTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTG
* *** * ** * * *
15463084 TTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTCGAAACAAAGTAATACTAATCTAT
565 TTTTGTCATAAAA-CAATGTTTCAATTCATAAAAACTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15463149 TAATATTTCAAAAATTAATAAGA-A-ATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACTAGTTCAAACA
628 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATA
* * * * * * * * * * *
15463212 GTTATGGCTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTATAACTTTTCGTTCTATTACAAAACAA
693 ATTATGACTATTTGAACAA-TA-TCA-TCTAAA-TCTT-TGA-TTTT-GTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
15463277 TTGTTTCTATTCATACAAA-CTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAGAAT
751 TTG-TT-TAATCATA-AAAGCTTATTTG-ATGAAAATAATACTAATTTA-TAATA-TTTAAAAAT
* * * * * * ** * * * * *
15463341 TAATAAGTAAAAAATTTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGA-CCAAATAATCATGTCTGT
810 TAATAAG---AGAA---TTAAAAATAAATGTATTTGCCGAACCA-ATTTAAATAGTTAAGACTAT
* *
15463405 GT-GAAT
868 -TATAAC
* * * * * *
15463411 AATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTAGTCAT-AAATAATTGTTTCAGTTCATACA
* * * ** * *
15463476 AGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGGAATAATCCAAAAATTAATA-ATAAAGAGATTT
64 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAATATA-AAAGAGATTT
* * * * * * * * *
15463540 AAAAAATGAATCCATGTACTGAACAAGTTAAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTG
128 AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTA
15463605 AAAT
192 AAAT
15463609 CGCTATTATT
Statistics
Matches: 4334, Mismatches: 875, Indels: 641
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
870 10 0.00
871 25 0.01
872 60 0.01
873 6 0.00
874 8 0.00
875 3 0.00
876 231 0.05
877 277 0.06
878 95 0.02
879 18 0.00
880 11 0.00
881 149 0.03
882 134 0.03
883 133 0.03
884 325 0.07
885 190 0.04
886 112 0.03
887 145 0.03
888 17 0.00
889 69 0.02
890 72 0.02
891 23 0.01
892 139 0.03
893 153 0.04
894 266 0.06
895 109 0.03
896 198 0.05
897 303 0.07
898 573 0.13
899 139 0.03
900 158 0.04
901 143 0.03
902 35 0.01
903 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (873 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTAGTCATAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAG
CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAATATAAAAGAGATTTAAA
AAATAAATCTATTTACTAAACAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTG
AACCAGTTCAAATAGTTATGATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTT
AGTAATAAAACAATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
TTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAATTCAAATAGTTA
TACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATGTTT
CAATTCATAAAAACTTATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGA
GAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATATC
ATCTAAATCTTTGATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAATCATAAAAGCTTATTTGATGAA
AATAATACTAATTTATAATATTTAAAAATTAATAAGAGAATTAAAAATAAATGTATTTGCCGAAC
CAATTTAAATAGTTAAGACTATTATAAC
Found at i:15460566 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 15460542--15460578 Score: 65
Period size: 19 Copynumber: 1.9 Consensus size: 19
15460532 TTATCAAACC
15460542 ATTTCAAATAATTATAACT
1 ATTTCAAATAATTATAACT
*
15460561 ATTTCAAATCATTATAAC
1 ATTTCAAATAATTATAAC
15460579 CTTTTTTTTG
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 17 1.00
ACGTcount: A:0.46, C:0.14, G:0.00, T:0.41
Consensus pattern (19 bp):
ATTTCAAATAATTATAACT
Found at i:15462265 original size:168 final size:174
Alignment explanation
Indices: 15458595--15463546 Score: 1352
Period size: 182 Copynumber: 27.8 Consensus size: 174
15458585 ATTTGAATAG
** ** * * * * *
15458595 TTATCTATTTCAAATTTTTAGGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTACTCATACAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
** * *
15458660 CATATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAA
66 CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * *
15458724 AAATAAATCTGTTTATCAAGCTAGTTCAAATAATTATCACTATTTGAACAA
130 AAATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAA-TAT-A-TA---GAACAA
* * ** * * * * * * *
15458775 TTATTTATTTCAAAT-AGTGATTATCTTTTTTTTTATCATAAAGCAATTGTTTTAATACATACAA
1 TTATCTATTTCAAATCA-TTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA
** * * ** ** * *
15458839 GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTAAAAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAA
65 GCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
15458904 AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAT
129 AAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-AGTAATAT--A-TAGAACAA
* ** * * * *
15458956 TTATCTATTTCAAATGATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAA-
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* * * ***
15459020 AATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T-TAA-TAAGAGATTT-AA
66 CA-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * * *
15459081 AAACAAATCTATTTACTGAAA-CGGGTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAA
130 AAATAAATATATTTAC-CAAACCAGTTC--A-AGTAAT-A-TA-TAGAACAA
* * ** ** * *
15459132 TTATTTATCTCAAATTGTTATGATCTTTAT-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTC-TTTCATACAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTT-TGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA
** *** * * *
15459194 GTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
65 GCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * *
15459259 AAAGTAAATGTATTTGCCAAACCAGTTGAAATAGTTGAGAGA-ATTAGAACAA
129 AAAATAAATATATTTACCAAACCAGTT--CA-AG-T-A-ATATA-TAGAACAA
* * * ** * * * * *
15459311 -TATTTTATTTTAAAT-GTTCTAACTTTTTGTT-TAGTAATAAAACAATTATTTCAGTTAATACA
1 TTA-TCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGT-GTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
* * * * * * *
15459373 AGCTTATTTACAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTA
64 AGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * *
15459438 AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAATTCAATTAGATTTTACTATTTGAACAA
127 AAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTA-A---TA-TA-TAGAACAA
* * ** ** * *
15459492 TTATCTATAT-ATATTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAA
1 TTATCTATTTCA-AATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA
* * * * ** ** *
15459556 ACTTATGT-GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTA
65 GCATAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTA
* * ** **** * * *
15459620 AGAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTGAAATGGTTATGACTATTTGAACAA
128 AAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTT-CAA--GTAAT-A-TA-TAGAACAA
* * * * *** * * *
15459673 ATATCAATCTCAAATCGTT--ATGGTATTTGTTTTCTCATAAAATAATTG-TTCTAA-TCATACA
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCT-TTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTC-AATTCATACA
* * * **
15459734 AGCATATT-TAGATGAAAGTAATACTAATTT-TATAATATTATAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTT
64 AGCATATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * *
15459794 ACAAAATAAATGTATTTGCCGAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATTATAATAA
127 AAAAAATAAATATATTTACCAAACC-AGTT-CA-AG-TAATA-TA-TAGAACAA
* * *** * * *
15459848 TTATCTATTTGAAATCGTTTGGA-CTTATTATT-TAGTCATATAATAATTGTTTCAGA-TCATAC
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTT-TTGTTGT-GTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATAC
* * *** * ** * *
15459910 AAGCTTCTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAATATTAATATA-AAAGAGATT
63 AAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATA-AGTAAGAGATT
* ** * * *
15459974 TGAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAATATCAAATAATTATGGTTATTTGAACAA
126 T-AAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGT-TCAAGTAA-TA----TA-TAGAACAA
* ** ** *
15460030 TTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGCTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTTCAA--CATAT
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTG-TTGTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATAC
* * * * * *
15460092 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T-TAA-CAAGAGACTTA
63 AAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTA
* ** * * *
15460154 AAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGGAACAA
128 AAAAATAAATATATTTACCAAACCAG-TT-CA-AG-TA--A-TATATAGAACAA
** * * * * ***
15460208 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* *** * * * * *
15460273 CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAA
66 CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAA
* * *** *
15460338 CAATAAA-ATCCGTTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAA
130 AAATAAATAT--ATTTACCAAACCAGTTC--A-AG-TAATA-TATA-GAACAA
* ** ** * * * * * **
15460390 TTATTTATTTCAAATTGTTAGGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAACTATTTCAGCTCATACAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* ** ** * * * *
15460455 CTTATTCGGAATAGGAGAAAACTAATTTATTAACATTTCCAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAA
66 CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * *
15460520 AAATAATTCTATTTATCAAACCATTTCAAATAAT-TAT------A
130 AAATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAATATATAGAACAA
* * * * *
15460558 --A-CTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATCGTTTCAATTCATATAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
** ** * * * * * *
15460619 TTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAAA
66 CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * ** * * **
15460684 AGAA-GAATCTATTGACCAAATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAA
130 A-AATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-AGTAAT-A-TA-TAGAACAA
* * * * * *
15460735 TTATCTATTTCAAAACATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTCATGCAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATT-GTTTCAATTCATACAA
** *** * *
15460799 GTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTA
65 GCATATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * *
15460860 ACAAAATAAATTTATTTTCTAAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
128 A-AAAATAAATATATTTACCAAACCA-G-TT-CA-AGTAAT-A-TA-TAGAACAA
* * * *
15460914 TTATCTATTTCAAAT--TGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACA
1 TTATCTATTTCAAATCAT-TAA-AACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
* * * * *
15460977 ACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATATTCCAAAAATTAAGAAGTAA-AAATTAA
64 AGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTA
* *** * *
15461039 AAAAATAAATCTATTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAA
128 AAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-AGTAAT-A-TAT-AGAACAA
** * * * * * *
15461092 TTAT-TCATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTT-TAATAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATATA
1 TTATCT-ATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGT-GTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
** * * * * **
15461155 AGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--CTATAAAATAATGAGTTGGAGATGTT
64 AGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTATAAGTAAGAGAT-TT
** * ** * * * * * *
15461218 -AAAAATAAAGCTACTTACTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTA
127 AAAAAATAAATATATTTACCAAACCAG-TT-CA-AGTAATAT--A-TAGAACAA
* * * **
15461271 TTATCTATTTCAAATTGC-TATGAAA--TTTTGTTTTGTCGTAAAACTAA-TGTTTTTATTCATA
1 TTATCTATTTCAAA-T-CAT-TAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAATTCATA
* * * *
15461332 CAA-AATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-AA--AAGAGATT
62 CAAGCA-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
15461393 TAAAAACTAAATCTCTTTATCAAAACAATTTAAATAATTATGACTACTTGAACAA
126 TAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAA-TAT-A-TA---GAACAA
* * * * *** * * *** * *
15461448 TAACCTATCTT-AGATTATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATAAAA
1 TTATCTAT-TTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA
* *** * * * * * **
15461511 GCTTATTTGGAATAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGCTT-A
65 GCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
15461575 AAAATAAATGTGTTTGTCGAACAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
129 AAAATAAATATATTT-ACCAA-ACCAGTTC--A-AG-TAATA-TA-TAGAACAA
* ** * *
15461629 TTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTT-TAGTCAT-AAACTAATTGTTTCAGTTCATACA
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGT-GTCATAAAAC-AATTGTTTCAATTCATACA
* * * * * * ** * *
15461692 TGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAGATTCAAAAAATTAATAAACAAAAAATTTT
64 AGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGA-TTT
* * * ** *
15461757 ATAAAATAAATGTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTGAATAT-TTGAACAA
127 AAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-AG--T-AATATATAGAACAA
* * ** * * * *
15461810 TTATCTATTT-AAAACAAATATGACCTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAA
1 TTATCTATTTCAAATC-ATTAAAACC-TTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
* * * * * * * * * *
15461874 AGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAACATTTC-AAAATTGAGAAGTTAGAGATATA
64 AGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTA
** * * * *** * *
15461938 AAAAATAGGTCA-GTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTATGATCATTTTAACAA
128 AAAAATAAAT-ATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAA-TAT-AT-A---GAACAA
* * *
15461991 TTATCT-TTTCAAAT-AGTTATGAA-CTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATTTTTTC-A-TCATAC
1 TTATCTATTTCAAATCA-TTA-AAACCTTTTGTTGTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAATTCATAC
* *** *
15462050 AAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTT
63 AAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA-TAAGTAAGAGATTT
* *
15462115 AAAACATAAATCTATTTACCAAACCAGTTC-A-T-AT-T-T-GAACAA
127 AAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAATATATAGAACAA
* * * **
15462157 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* *
15462222 CATATT-ACAAA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAA
66 CATATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA-TTATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** *
15462285 AAAATAAATATGTTTGCCAAAGTAGTTCAAATAGTTAATACTATAAGAATAA
129 AAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-AG-TAATA-TAT-AGAACAA
** *
15462337 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCATACAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* * * *
15462402 CTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAA--GTAA-TAAGTGATTTAAAA
66 CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * ** * *
15462464 AGTGAATTTGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATGGTCATGTCAACAA
131 AATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAA-TAT-AT-A-G--AACAA
* ** ** * * *
15462514 TTATTTA-TTCAAATTGTTATTACCTTTTGTT-TGGTCATATAACAATTGTATTTGAA--CATTC
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGT-GTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATAC
* *** * * * *
15462575 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCATAAATCAATAAGTAAGAGATTT
63 AAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT-TATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
15462640 -AAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
127 AAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-AGTAAT-A-TA-TAGAACAA
** * * * * ** *
15462693 TT-T-TATGCTTCAAATCATTATTACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATCTT-GGTTCATGC
1 TTATCTAT--TTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGT-TTCAATTCATAC
* * ** * * * *
15462755 -AGCTTATACAAAATAAAATAATGTTAATCTAATAATATTCCCAAAATTAATAATTAAGAGAATT
63 AAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAG-ATT
* * * * ** * * * * * *
15462819 AAAAAAATAGATTTGTTTGTCTAACCTGTTCAAATATTTAAAGACTATTGAATAA
126 TAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-A-GT-AATA-TATAGAACAA
* * * ** * * * * * **
15462874 CTATCAATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATTTTTTTTGAATTCATACTT
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACA-ATTGTTTCAATTCATACAA
* *** * * **
15462939 GCTTATTTGGAATAAAATAA-A-AAATTTATTTATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
65 GCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * *
15463002 AAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTGAAATAATTATGATTATTTGAACAA
129 AAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAA-TAT-A-TA---GAACAA
* ** * * * * *** *
15463054 TTATCTATTTCAAATCACTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
** * * * * * *
15463119 TTTATTCGAAACAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAAATTTAAAA
66 CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * *
15463181 AATAAATATATTTATCGAACTAGTTCAAACAGTTATGGCTATTTGAGCAA
131 AATAAATATATTTACCAAACCAGTTC--A-AGTAAT--ATA-TAGAACAA
* * ** * * * * * *
15463231 TTATTTATTTTAAATTGTTATAA-CTTTTCGTTCTATTACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTT-GTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA
* * * * *** * * * *
15463295 ACTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAGAATTAATAAGTAAAAAATTTTT
65 GCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGTAAGAGA-TTTA
* * ** * * * *
15463360 AAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGACCAAATAATCATGTCTGTGTGAATAA
128 AAAAATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAAT-A----TAT-AGAACAA
* * ** * ** *
15463413 TTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATATAAG
1 TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
* * * ** *
15463478 CTTACTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGGAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAA
66 CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAAGT-AAGAGATTTAA
15463542 AAAAT
129 AAAAT
15463547 GAATCCATGT
Statistics
Matches: 3663, Mismatches: 823, Indels: 571
0.72 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
163 8 0.00
164 87 0.02
165 21 0.01
166 15 0.00
167 28 0.01
168 82 0.02
169 17 0.00
170 2 0.00
171 2 0.00
172 1 0.00
173 5 0.00
174 59 0.02
175 96 0.03
176 257 0.07
177 339 0.09
178 373 0.10
179 483 0.13
180 468 0.13
181 578 0.16
182 618 0.17
183 85 0.02
184 35 0.01
185 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (174 bp):
TTATCTATTTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG
CATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAA
AATAAATATATTTACCAAACCAGTTCAAGTAATATATAGAACAA
Found at i:15462640 original size:357 final size:356
Alignment explanation
Indices: 15460548--15463551 Score: 2059
Period size: 357 Copynumber: 8.4 Consensus size: 356
15460538 AACCATTTCA
* * *
15460548 AATAATTATAACTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATCGTTTCAATTC
1 AATAATTAT--CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTC
* * * * * * *
15460612 ATATAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAG
63 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-A--A-TAAGAG
* * * * * * *
15460677 AATTAAAAGAA-GAATCTATTGACCAAATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCT
124 ATTTAAAA-AATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCT
* * * * * *
15460741 ATTTCAAAACATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTT-ATTCATGCAAGTTTAT
188 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGA-ACATACAAGCTTAT
* * * *
15460805 TTTGAATAAAATAATA-TAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAA
251 TTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAA
* * * * *
15460866 TAAATTTATTTTCTAAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTG
314 TAAATATGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * *
15460909 AACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCAT
* * * *
15460974 ACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAATT
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG---AGATT
* * *
15461037 AAAAAAATAAATCTATTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTAT-TCATT
127 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCT-ATT
* ** * * * * * *
15461101 TCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAATAATAAAAGAATTGTTTCT-ATTCATATAAGTTTATTCA
191 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGA-ACATACAAGCTTATTTA
* * **
15461165 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-CT-ATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTT-AAAAATAA
254 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAA
** ** ** * * * * *
15461226 AGCTACTTACTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTG
317 ATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
*** ** * *
15461266 AACT-ATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACTAA-TGTTTTTATTC
1 AA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTG-TTTCATTC
** * * *
15461329 ATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGAGATT
63 ATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATT
* * * ** * * * * *
15461393 TAAAAACTAAATCTCTTTATCAAAACAATTTAAATAATTATGACTACT-TGAACAATAACCTATC
127 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTA-TGTGAACAATTATCTAT-
* * * * * *
15461457 TT-AGATTATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTA-ATAAAAGCTTATTT
190 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTG-AACATACAAGCTTATTT
* * * * * **
15461519 GGAATAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGCTT-AAAAATAA
253 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
15461582 ATGTGTTTGTCGAACAAC-AATTCAAATAGTTAAGACTATTAG
317 ATATGTTT-AC-CA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
15461624 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAGTCAT-AAACTAATTGTTTCAGTTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCA-TTCA
* * * * * *
15461688 TACATGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAGATTCAAAAAATTAATAAACAAAAAA
64 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT----AAGAGA
* * * * * *
15461753 TTTTATAAAATAAATGTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGAATATTTGAACAATTATCTA
125 -TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTA
* * * * ** *
15461817 TTT-AAAACAAATATGACCTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT
189 TTTCAAATC-ATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGAACATACAAGCTTAT
** * * * * * * * * *
15461881 CCAAAATAAAATAATATTACTATATTAACATTTC-AAAATTGAGAAGTTAGAGATATAAAAAATA
251 TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
** * * * * * *
15461945 GGTCA-GTTTATCGAATTGGTTCAAATAATTATGA-TCATTTT
316 AAT-ATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG
* * *
15461986 AACAATTATCT-TTTCAAAT-AGTTATGAACTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCA-TCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCATTCA
* * * *
15462047 TACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGA
64 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA
* **
15462112 TTTAAAACATAAATCTATTTACCAAACCAGTTC--------AT-A-T-T-TGAACAATTATCTAT
125 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTAT
** * * * ** *
15462165 TTCAAATCATTAAAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTG-TTTCAATTCATTTAAGCATA-TT
190 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGAA--CATACAAGCTTATTT
* * * * * *
15462228 ACAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
253 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * **
15462293 TATGTTTGCCAAAGTAGTTCAAATAGTTAAT-ACTATAAG
318 TATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTG
*
15462332 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCGATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCAT
* * * *
15462397 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGTGATTTAA
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
15462462 AAAGTGAATTTGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATG-GTCATGTCAACAATTATTTA-TTCA
130 AAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATGTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * *
15462525 AATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTGAACATTCAAGCTTATTTGGAAT
194 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGAACATACAAGCTTATTTAGAAT
* * * *
15462590 AAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCATAAATCAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGT
258 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* *
15462654 TTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
323 TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * **
15462688 AATAATT-T-TATGCTTCAAATCATTATTACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATCTTGGTTC
1 AATAATTATCTAT--TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCATTC
* * * ** * * *
15462751 ATGC-AGCTTATACAAAATAAAATAATGTTAATCTAATAATATTCCCAAAATTAATAATTAAGAG
63 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CCAAAA--ATTAA-TAAGAG
* * * * * * ** * * * *
15462815 AATTAAAAAAATAGATTTGTTTGTCTAACCT-GTTCAAATATTTAAAGACTAT-TGAATAACTAT
124 -ATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAAATTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATGTGAACAATTAT
* * * * * **
15462878 CAATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATTTTTTTTGAATTCATACTTGCTT
186 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGAA--CATACAAGCTT
* * * *
15462943 ATTTGGAATAAAATAA-A-AAATTTATTTATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
249 ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * * *
15463006 TAATTCTATTTACCTAACCAGTTGAAATAATTATGATTATTTG
314 TAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * **
15463049 AACAATTATCTATTTCAAATCACTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCATTCAT
* * * * * * *
15463114 ATAAGTTTATTCGAAACAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAA
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * * * * * * * * *
15463179 AAAATAAATATATTTATCGAACTAGTTCAAACAGTTATGGCTATTTGAGCAATTATTTATTTTAA
130 AAAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * * * *
15463244 ATTGTTAT-AACTTTTCGTTCTATTACAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAACTTA-TTCGAA
195 ATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGA-ACATACAAGCTTATTTAGAA
** * * * *
15463306 TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAGAATTAATAAGTAAAAAATTTTTAAAAATAAATA
257 -TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATA
** * * * * *
15463371 TGTTTACCAAACTAGACCAAATAATCATGTCTGTGTG
320 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
15463408 AATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCAT
* * ** *
15463473 ATAAGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGGAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGAT
65 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAAT-AAGAGAT
*
15463538 TTAAAAAATGAATC
126 TTAAAAAATAAATC
15463552 CATGTACTGA
Statistics
Matches: 2062, Mismatches: 460, Indels: 240
0.75 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
345 59 0.03
346 91 0.04
347 53 0.03
348 20 0.01
349 48 0.02
350 1 0.00
351 1 0.00
353 2 0.00
354 6 0.00
355 97 0.05
356 267 0.13
357 394 0.19
358 206 0.10
359 232 0.11
360 142 0.07
361 183 0.09
362 119 0.06
363 73 0.04
364 65 0.03
365 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (356 bp):
AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTCATA
CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
AAATAAATCTATTTACCAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTCAAA
TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGAACATACAAGCTTATTTAGAATAAA
ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
CCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
Found at i:15465519 original size:177 final size:175
Alignment explanation
Indices: 15465292--15465612 Score: 432
Period size: 177 Copynumber: 1.8 Consensus size: 175
15465282 ATATTAAGAA
* * *
15465292 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATCGAT-ATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAA-AG-TCATGACT
* * * * *
15465356 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTAATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTCT
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTAATGA-TATTTT-TTTGGTCATAAAACAAATGTTTCT
15465420 ATTCATACAAGTTTATTTTGATTAAAATAATATTACTTAATATTTTGAC
127 ATTCATACAAGTTTATTTTGATTAAAATAATATTACTTAATATTTTGAC
* * *
15465469 AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAATAAGTTCAAAAGTCATGATTA
1 AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATC-GAACAAGTTCAAAAGTCATGACTA
* * ** *
15465533 TTTTAATAATTATCTATTTCAAATCGTCTTGATATTTTTTTGGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTAATGATATTTTTTTGGTCATAAAACAAATGTTTCTATT
15465598 CATACAAGTTTATTT
130 CATACAAGTTTATTT
15465613 GAAAAAAAAA
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 16, Indels: 8
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 42 0.34
176 36 0.29
177 47 0.38
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (175 bp):
AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAAAGTCATGACTAT
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTAATGATATTTTTTTGGTCATAAAACAAATGTTTCTATTC
ATACAAGTTTATTTTGATTAAAATAATATTACTTAATATTTTGAC
Found at i:15466006 original size:136 final size:135
Alignment explanation
Indices: 15465831--15466077 Score: 361
Period size: 136 Copynumber: 1.8 Consensus size: 135
15465821 TAAAAATTAA
* * *
15465831 TAAGAGATTTAAAAACTAAAATGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAATGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT
*
15465896 ATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTTTTAGAATATTATTAATTA
66 ATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTTTTAGAATATTATTAATTA
15465961 ATAAG
131 ATAAG
* * *
15465966 TAAGAGATTTAAAAAAT-TAATGCGTTTGCCAAACCCATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAAT--GTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
* * * * *
15466030 TTTTCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTGTTTAGTCTTAAAATAATT
64 TTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATT
15466078 GTTTCAATTC
Statistics
Matches: 98, Mismatches: 12, Indels: 3
0.87 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
134 3 0.03
135 16 0.16
136 79 0.81
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (135 bp):
TAAGAGATTTAAAAAATAAAATGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT
ATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTTTTAGAATATTATTAATTA
ATAAG
Found at i:15467110 original size:360 final size:355
Alignment explanation
Indices: 15466743--15467680 Score: 881
Period size: 360 Copynumber: 2.6 Consensus size: 355
15466733 CTATATGTAT
* * ***
15466743 AATTATCTATTTCACATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAATAAACATTTTTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACA
* ** * *
15466808 AGTTTGCTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAATTTGAAAATTAACAAAATATTTAAAAA
66 AGATTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAATTTGAAAATTAATAAAAGATTT-AAAA
* * *
15466873 AATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAACAATTTAAAACAATTATTTATTTCAAA
130 AATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAA-TATTT-GAACAATTATCTATTTCAAA
* *
15466938 TCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTA-TTCGAAAT
193 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCTATTCATACAAG-CTTATTTC-AAAT
* ** * * *
15467001 AAAGTAATGATA-ATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATATA-TAACAA-ATTTTAAAAATGAAT
255 AAA-TAAT-ATAGAGTTATTAATATTC-AGAAAACAAATA-AGCAA-AAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * *
15467062 CTGTTGGCCTGATCAA-CACAAATAGTTATAATTGTTTAAAC
315 ATGTTGACCAAAT-AAGCACAAATAGTTATAACTATTCAAAA
*** * * * * * * * *
15467103 AATTATCTATTTCAAAGCATTATGACCTTTTCTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTGTTCGTATA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACA
* * *
15467168 AGATTATTTGAAATAACATAATTTTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTT
66 AGATTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAATT-TGAAAATTAATAA--AAGA--TTT
* * * * * **
15467232 AAAAACTGATTCTATTTA-TCAAA-TAAGTTCAAAGAGTTATAATTATTTGAACAATTGCCTATT
126 AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACT-AGTTCAAATAGTTATAA-TATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
15467295 TAAAATC-TCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTCA
188 TCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* *
15467359 ATTAAATAATATAGAGTTATTAATATTCAGACAACAAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
252 AATAAATAATATAGAGTTATTAATATTCAGAAAACAAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* **
15467424 GTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTCAAAA
317 GTTGACCAAATAAGCACAAATAGTTATAACTATTCAAAA
* * * * * *
15467463 AATTGTTTATTTGAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAAATGATTGTTTTTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACA
* * * * * * *
15467528 AGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTACTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTT
66 AGATTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAATTTGA-AA--ATTAA-TAAAAGATTTA
* * * * *
15467593 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAATATTTGAATAATTATCTATTTCAA
127 AAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAATATTTGAACAATTATCTATTTCAA
15467658 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
192 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
15467681 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 455, Mismatches: 100, Indels: 47
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
359 52 0.11
360 272 0.60
361 26 0.06
362 58 0.13
363 41 0.09
364 6 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (355 bp):
AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACA
AGATTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAATTTGAAAATTAATAAAAGATTTAAAAA
ATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAATAA
TATAGAGTTATTAATATTCAGAAAACAAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTGACCAA
ATAAGCACAAATAGTTATAACTATTCAAAA
Found at i:15467272 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15466743--15467680 Score: 754
Period size: 181 Copynumber: 5.2 Consensus size: 179
15466733 CTATATGTAT
* ** * * * *** * *
15466743 AATTATCTATTTCACATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAATAAACATTTTTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* ** * * *
15466808 AGTTTGCTTGAAATAAAATAA-TATTAATTTATTAATAATT-TGAAAATTAACAA--AATA-TTT
66 AGCTTATTTGAAAT-AAATAATTA-TAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGTTT
* * * *
15466868 AAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATAACAATTTAAAAC
128 -TAAAAATAAATATGTTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AAAC
* * *
15466922 AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * *
15466986 AGTCTTATTCGAAATAAAGTAATGATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATATA-TAACAAATT
66 AG-CTTATTTGAAATAAA-TAATTATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA-AGTAA-AAGTT
* * ** ** ** * *
15467050 TTAAAAATGAATCTGTTGGCCTGATCAA-CACAAATAGTTATAATTGTTTAAAC
127 TTAAAAATAAATATGTTTACCAAAT-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC
* * * * * * *
15467103 AATTATCTATTTCAAAGCATTATGACCTTTTCTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTGTTCGTATA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
15467168 AGATTATTTGAAATAACATAATTTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTA
66 AGCTTATTTGAAATAA-ATAATTATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGTTTTA
* * * * * * * *
15467233 AAAACTGATTCTATTTATCAAATAAGTTCAAAGAGTTATAATTATTTGAAC
130 AAAA-TAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC
** * * * *
15467284 AATTGCCTATTTAAAATC-TCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTATTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * ** *
15467347 AAGCTTATTTCAATTAAATAA-TATAGAGTTATTAATATTC-AGACAACAAATAAGCAAAAGATT
65 AAGCTTATTTGAAATAAATAATTATA-ATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAAAG-TT
* * *
15467410 TAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTCAAAA
127 TTAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC
* * * ** * * ** * *
15467463 AATTGTTTATTTGAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAAATGATTGTTTTTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * *
15467528 AGCTTATTTGGATTAAAATAA-TATTAATTTACTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTT
66 AGCTTATTTGAAAT-AAATAATTA-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTT
* * * *
15467592 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAAT
128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC
15467643 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
15467681 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 606, Mismatches: 129, Indels: 47
0.77 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 12 0.02
179 189 0.31
180 108 0.18
181 255 0.42
182 38 0.06
183 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
AGCTTATTTGAAATAAATAATTATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGTTTTAA
AAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAAC
Found at i:15467685 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15467665--15467710 Score: 83
Period size: 15 Copynumber: 3.1 Consensus size: 15
15467655 CAAATCATTA
15467665 TGACCTTTTGTTTTG
1 TGACCTTTTGTTTTG
*
15467680 TGACCTTTTGTTTTA
1 TGACCTTTTGTTTTG
15467695 TGACCTTTTGTTTTG
1 TGACCTTTTGTTTTG
15467710 T
1 T
15467711 CATAAAATAA
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 2, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 29 1.00
ACGTcount: A:0.09, C:0.13, G:0.17, T:0.61
Consensus pattern (15 bp):
TGACCTTTTGTTTTG
Found at i:15467968 original size:180 final size:176
Alignment explanation
Indices: 15467692--15468170 Score: 504
Period size: 176 Copynumber: 2.7 Consensus size: 176
15467682 ACCTTTTGTT
* * * *
15467692 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATAGAAGCTTATCCAAAATAAAAT
1 TTATTACCTTTTG-TTTGTCATAATAT-AAT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
** *
15467757 AATACTACGTTACTAATATATCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-
63 AATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAC
* * * * *
15467820 TAGAATCAATTTAAATAATTATGACCACTTGAACAACTATCTATTTGAAATCG
126 CA-AA-CAATTCAAATAATTATGAACACTTAAACAACTATCTATTTCAAATCG
**
15467873 TTATTACCTTTTGTCTTGTCATAATATAATTTTTT-TTAGCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATTACCTTTTGT-TTGTCATAATATAATTTTTTGTT--CATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* *
15467937 AATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA
63 AATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA
* * * * ** * *
15467999 AACAGTTCAAATAGTTATGAATATTTAAATGATTATCTATTTCAAATTG
128 AACAATTCAAATAATTATGAACACTTAAACAACTATCTATTTCAAATCG
**
15468048 TT-TTAACCTTTTGTTCAATCATAATATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
1 TTATT-ACCTTTTGTT-TGTCATAATATAATT-TTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * *
15468112 TGATACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTTAAAAATAAATCT
62 TAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
15468171 GTTTGTCGAA
Statistics
Matches: 251, Mismatches: 33, Indels: 29
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.01
175 59 0.24
176 76 0.30
177 8 0.03
178 4 0.02
179 9 0.04
180 69 0.27
181 23 0.09
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
TTATTACCTTTTGTTTGTCATAATATAATTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
ACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
AATTCAAATAATTATGAACACTTAAACAACTATCTATTTCAAATCG
Found at i:15468322 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 15468298--15468340 Score: 68
Period size: 19 Copynumber: 2.3 Consensus size: 19
15468288 TTGTTGAACC
15468298 ATTTCAAATAATTATAACT
1 ATTTCAAATAATTATAACT
*
15468317 ATTTCAAATCATTATAACT
1 ATTTCAAATAATTATAACT
*
15468336 TTTTC
1 ATTTC
15468341 TTTTGTAATA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 22 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.14, G:0.00, T:0.47
Consensus pattern (19 bp):
ATTTCAAATAATTATAACT
Found at i:15468480 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 15468461--15468490 Score: 60
Period size: 14 Copynumber: 2.1 Consensus size: 14
15468451 GTTAACCAAA
15468461 TAAGTTCAAATAGT
1 TAAGTTCAAATAGT
15468475 TAAGTTCAAATAGT
1 TAAGTTCAAATAGT
15468489 TA
1 TA
15468491 TGACTATTTC
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 16 1.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.13, T:0.37
Consensus pattern (14 bp):
TAAGTTCAAATAGT
Found at i:15468614 original size:14 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15468584--15468617 Score: 52
Period size: 14 Copynumber: 2.3 Consensus size: 15
15468574 ATATAAATTT
*
15468584 ATTAATATTTCAAAA
1 ATTAATAATTCAAAA
15468599 ATTAATAATT-AAAA
1 ATTAATAATTCAAAA
15468613 ATTAA
1 ATTAA
15468618 AAAAATAAAT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
14 9 0.50
15 9 0.50
ACGTcount: A:0.59, C:0.03, G:0.00, T:0.38
Consensus pattern (15 bp):
ATTAATAATTCAAAA
Found at i:15468750 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15468494--15470925 Score: 1541
Period size: 180 Copynumber: 13.6 Consensus size: 179
15468484 ATAGTTATGA
* * * * * * * *
15468494 CTATTTCAAAACATTATAACCTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGGTTCTATCCATGCAAGTTT
1 CTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
* *** * *
15468559 GTTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAAAATTAAAAAAA
65 ATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAAGATTTAAAAAA
* * *
15468623 TAAATTTATTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
129 TAAATCTATTTATTGAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
15468675 CTATTTCAAA-CATAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTGTTCGTGCAACCTTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* * * * *
15468739 TTCTAAATAAAATAATACTAATTTCTT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAGAAAA
66 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-TTAAAGATTTAAAAAA
* * ** *
15468801 TAAATATGTTTA-CCAAGCGAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
129 TAAATCTATTTATTGAA-C-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * * * * * *
15468853 TTATTTCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTCGTAAAAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
** * * ** *
15468918 TTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TT-ATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAA
66 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AATTAAAGATTTAAAAAA
** * * * *
15468980 TAAAGGTATTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCTATTTGAACTATTAT
129 TAAATCTATTTATTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* *** ** * * * * * **
15469032 CTATTTGAAATTGCTATGAAATTTTGCTTTGTCATAAAACTATTATTTTTATTCATACAAAATTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* * * * *
15469097 TTCAGAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAACTA
66 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
15469159 AATTTGTTTATCGAAACAATTCAACTAATTATGACTATTTGAACAA-TAA
131 AATCTATTTATTG-AACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
15469208 CTTATCTCAGATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTCATACAAGCTT
1 C-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
* * * * * ** *
15469272 ATTCAGAATAAAATATTACTAAATAAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAACAAGAGGTTT-AAAA
65 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAATTAA-AGATTTAAAAA
* * ** * * * *
15469335 A-AAATGTGTTTGCTGAACTAGTTTAAATAGTTAAGTCTATTAGAACAATTAT
128 ATAAATCTATTTATTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
15469387 CTAATTCAAATCATTTTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* * ** *
15469451 TTGAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAACAACTA-ATTTTATAA
66 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAATTAA--AGA-TTTAAAA
* * *
15469514 AATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAACAGTT-TGACTAATTGAACAATTAT
127 AATAAATCTATTTATTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * * *
15469567 CTA-TTAAAAAAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TGTTTCAGTTCATAAAATCTTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* * * * * *
15469630 TCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAAT
66 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TTAAAGATTTAAAAAAT
** * * * * * *
15469694 AGGTCAATTTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTAT
130 AAATCTATTTATTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * ** *
15469745 CTATTTCAAAT-AGTTATGAACTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCATCATACAAGCCT
1 CTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
** * *
15469808 A-TCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAA
65 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAA-AGATTTAAAAAA
* ** * *
15469872 TAAATATATTTA-CCAA-A---C-CA-A--T-T-CCTATTTGAACAATTAT
129 TAAATCTATTTATTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
** ** * ** ** * *
15469912 CTATTTCAAATTGTTAAAACCTTTT-TCTTTG-CTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAACA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT
** * * * * *
15469975 TATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTTATAACTAAGAGATTTACAA
64 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAATTAA-AGATTTAAAA
* * * *
15470039 AATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAA-AGATTAAGACTATTAT-AACAATTAT
127 AATAAATCTATTTATTGAA-CAGTTCAAATAG-TTATGACTATT-TGAACAATTAT
* ** * ** * * *
15470093 CTATTTCAAATCGTCCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGTTT
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTT
* * ** * ***
15470157 ATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATT-ACA-TTCAAAATATTAATAAGAAATAAATTTTTTTA
65 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAATTAA-AGA-TTTAAAA
* * * *
15470220 AA-AAATCTATTTATCGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
127 AATAAATCTATTTATTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
15470273 CTATTTAAAATCGTTATAAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* * * * * ** *
15470338 TCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGTAGATTTAAAAGAT
66 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TTAAAGATTTAAAAAAT
* * * * ** *
15470403 AAAT-TAGTTTATCGAATTAATTCAAATAATTATGGTTATTCGAACAATTAT
130 AAATCTA-TTTATTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * ** * *
15470454 CTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATATAAGCCTA
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* * *
15470519 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAAT
66 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTA-AAGATTTAAAAAAT
* * *** *
15470583 AAATCTGTATACCCAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
130 AAATCTATTTATTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** * * * * * *
15470634 ATAGTTCAAATTGTTAT-AGCCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGTTT
1 CTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
** * ** * * * *
15470698 ATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAACAATA-TT-ATGAAATTAATAACTAAGAGATTTGAATA
65 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAATTAA-AGATTTAAAAA
* * **** * * * * *
15470761 ATAAATTTGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTAT
128 ATAAATCTATTTATTGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** * * * * * * *
15470814 CTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTTGTAAAATAAATGTTTTTGCTCATATAAGTTTG
1 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* **
15470879 TT-AAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA
66 TTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
15470926 GAGATTTACA
Statistics
Matches: 1748, Mismatches: 419, Indels: 168
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
167 37 0.02
168 28 0.02
169 63 0.04
170 3 0.00
171 1 0.00
172 2 0.00
173 1 0.00
175 3 0.00
176 81 0.05
177 106 0.06
178 277 0.16
179 397 0.23
180 438 0.25
181 301 0.17
182 10 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAAGATTTAAAAAATA
AATCTATTTATTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
Found at i:15469444 original size:178 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15469218--15470354 Score: 470
Period size: 178 Copynumber: 6.4 Consensus size: 179
15469208 CTTATCTCAG
* * * *** *
15469218 ATCATTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
1 ATCATTATGACCTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * *
15469283 AATATTACTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAAACAA-GAGGTTTA-AAAA-AAATGTGTT
66 AATAATACTAAATAAATAAGATTCAAAAAATTAATAAACAACGAAGTTTATAAAATAAATCTGTT
* * * * * *
15469345 TGCTGAACTAGTTTAAATAGTTAAGTCT-ATTAGAACAATTATCTAATTCAA
131 TACTGAACAAGTTCAAACAGTT-AGACTAATT-GAACAATTATCT-ATTAAA
* * * *
15469396 ATCATTTTGACCTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTGAAAATAA
1 ATCATTATGACCTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * *
15469461 AATAATACTAATTTATTAAGATTCAAAAAATTAATAAACAACTAATTTTATAAAATAAATCTGTT
66 AATAATACTAAATAAATAAGATTCAAAAAATTAATAAACAACGAAGTTTATAAAATAAATCTGTT
* *
15469526 TATTGAACAAGTTCAAACAGTTTGACTAATTGAACAATTATCTATTAAA
131 TACTGAACAAGTTCAAACAGTTAGACTAATTGAACAATTATCTATTAAA
** * * * *
15469575 AAAAATATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAA-TGTTTCAGTTCATAAAATCTTATCCAAAAT
1 ATCATTATGACC-TTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *** **
15469638 AAAATAATA-TTACTATATTAATATTTC-AAAAATTGATAAGTTA-G-AGATTTA-AAAATAGGT
64 AAAATAATACTAAATA-AATAAGA-TTCAAAAAATTAATAAACAACGAAG-TTTATAAAATAAAT
** ** * * * * * *
15469698 CAATTTA-TCGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAA
126 CTGTTTACT-GAACAAGTTCAAACAGTTA-GACTAATTGAACAATTATCTA-TTAAA
* * * * * * **
15469754 AT-AGTTATGAACTTTTTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCA--TCATACAAGCCTA-TCGGAA
1 ATCA-TTATGACCTTTGTTTAGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * ** *
15469815 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAGTAAGTAA-G-AGATTTAAAAAATAAAT
63 TAAAATAATACTAAATAAATAAGA-TTCAAAAAATTAATAAACAACGAAG-TTTATAAAATAAAT
* * ** *
15469877 ATATTTACCAAACCAA-TTC---C---T--A-T--TTGAACAATTATCTATTTCAA
126 CTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAACAGTTAGACTAATTGAACAATTATCTA-TTAAA
** ** * * * * ** * * **
15469921 ATTGTTAAAACCTTTTTCTTTG-CTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAACATATTTGAAAT
1 ATCATTATGACCTTTGT-TTAGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
15469985 AAAATAACACTAATTTAATAATATT-ATAAAAATTTAT-AACTAA-G-AGATTTACAAAATAAAT
64 AAAATAATACTAAATAAATAAGATTCA-AAAAATTAATAAAC-AACGAAG-TTTATAAAATAAAT
* ** * * *
15470046 GTGTTTGTTGAACCAGTTCAAA-AGATTAAGACT-ATTATAACAATTATCTATTTCAA
126 CTGTTTACTGAACAAGTTCAAACAG-TT-AGACTAATT-GAACAATTATCTA-TTAAA
* ** * * * * * *
15470102 ATCGTCCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGTTTATTCAAAATA
1 ATCATTATGACC-TTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* ** * * * ** * * * *
15470167 AAATAATACT-ATTTTATTACATTCAAAATATTAATAAGA-AATAAATTTTTTTAAA-AAATCTA
65 AAATAATACTAAATAAATAAGATTCAAAAAATTAATAA-ACAACGAAGTTTATAAAATAAATCTG
* * * * *
15470229 TTTA-TCGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA
129 TTTACT-GAACAAGTTCAAACAGTTA-GACTAATTGAACAATTATCTA-TTAAA
* * * * *
15470282 ATCGTTATAAACTTTTGTTCTA-TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
1 ATCATTAT-GACCTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
15470346 AAAATAATA
64 AAAATAATA
15470355 TTACTTTATT
Statistics
Matches: 737, Mismatches: 165, Indels: 112
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
166 6 0.01
167 35 0.05
168 27 0.04
169 62 0.08
173 1 0.00
175 1 0.00
176 1 0.00
177 30 0.04
178 174 0.24
179 114 0.15
180 156 0.21
181 123 0.17
182 7 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
ATCATTATGACCTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
AATAATACTAAATAAATAAGATTCAAAAAATTAATAAACAACGAAGTTTATAAAATAAATCTGTT
TACTGAACAAGTTCAAACAGTTAGACTAATTGAACAATTATCTATTAAA
Found at i:15470009 original size:169 final size:167
Alignment explanation
Indices: 15469731--15470045 Score: 401
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 167
15469721 AATTATGGCC
*
15469731 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACTTTTTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCA
* * * * *
15469796 TCATACAAGCCTATCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-TTAGTAAGTAA
66 TCATACAAGCATATCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTTA-TAACTAA
15469859 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAATTCCT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAATTCCT
* *
15469898 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-AAACCTTTTTCTTTG-CTATAAAATAATTGTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAA-CTTTTT-TTTGTC-ATAAAATAATTATTT-
* *
15469961 AATTCAT-TTA-AA-CATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTATAAAAATTTATA
62 --TTCATCATACAAGCATA-TCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTATAAAAATTTATA
*
15470023 ACTAAGAGATTTACAAAATAAAT
124 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
15470046 GTGTTTGTTG
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 11, Indels: 16
0.83 0.07 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 2 0.02
167 36 0.28
168 21 0.16
169 58 0.45
170 6 0.05
171 5 0.04
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (167 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACTTTTTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCA
TCATACAAGCATATCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTATAAAAATTTATAACTAAGA
GATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAATTCCT
Found at i:15470319 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 15468565--15470927 Score: 1436
Period size: 361 Copynumber: 6.6 Consensus size: 360
15468555 GTTTGTTTTG
* * * *
15468565 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAA-AAATTAAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAACTAAGAGATT-TAAAAATAAAT
* * * * * * * *
15468628 TTATTTTTTGAAC-ATGTTTAAATAG-TTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAA-CATA
63 GTGTTTGTCGAACTA-GTTCAAATAGATTAAGGCTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * ** * ** * * *
15468689 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTCT-GTTCGTGCAA-CCTTATTCTAAATAAAAT
126 ATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TACATCATACAAGCC-TATTCAAAATAAAAT
* * * * * *
15468752 AATACTAATTTCTT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGTAAA-AGATTTAGAAAATAAATATGTTTA
189 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * *
15468813 -CCAAGCGAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATCTTT
252 TCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTT
* * * * ***
15468877 TGTTTCGTA--AAAAAAGAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGA
315 TG-TTC-TATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAA
* * * * ** * *
15468923 AATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGG
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAATAACTAAGAGAT-TTAAAAATAAATG
* * * * ** * * * ***
15468986 TATTTATTGAACAAGTTCAAATA-ATTGTGTCTATT-TGAACTATTATCTATTTGAAATTGCTAT
64 TGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGATTAAGGCTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *** * *
15469049 GAA-ATTTTGCTTT-GTCATAAAACT-ATTATTTTTA-TTCATACAAAATTATTCAGAATAGAAT
128 -AACCTTTTG-TTTAGTCATAAAA-TAATT-GTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAAT
* * * *
15469110 AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAACTAAATTTGTTTATC
189 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATC
* * * * * * ** * *
15469171 GAAACAA-TTCAACTAATTATGACTATTTGAACAA-TAACTTATCTCAGATCATTATGATCTTTA
254 G-AACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTATC-TATTTAAAATTGTTATAAACTTT-
* *** * * *
15469234 T-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTCATACAAGCTTATTCAG
315 TGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
* * * *
15469278 AATAAAATATTACTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAAAC-AAGAGGTTTAAAAA-AAATG
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAAATAAATG
* * * * *
15469341 TGTTTG-CTGAACTAGTTTAAATAG-TTAAGTCTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCATTTT
64 TGTTTGTC-GAACTAGTTCAAATAGATTAAGGCTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * ** * * *
15469404 GACC-TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTGAAAATAAAATAATA
128 AACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * *
15469468 CTAATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAA-ACAACTAATTTTATAAAATAAATCTGTTTATTG
193 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGA-AA-GAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCG
* * **** * * *
15469531 AACAAGTTCAAACAGTTTGACTAATTGAACAATTATCTA-TTAAAAAAAATATGACCTTTTGTTT
255 AACAAGTTCAAATAGTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTC
*
15469595 TATCATAAAACAA-TGTTTCAGTTCATAAAATCTTATCCAA
320 TATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
* * * * * * * ** **
15469635 AATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAATAGGTCA
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATGT
* * * * *
15469700 ATTTATCGAATTAGTTCAAATA-ATTATGGCCATT-TGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT
65 GTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGATTAAGGCTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTAT
* * * **
15469762 GAA-CTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTCATCATACAAGCCTA-TCGGAATAAAATAAT
128 -AACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAAT
* * * *
15469824 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-C---
192 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* * * * * *
15469885 CAA--AC-CA-A--TT-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-AAACCTTT-TTCTT
257 CAAGTTCAAATAGTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTCTA
* * * * ***
15469941 TGCTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAA-CATATTTGA
322 T-C-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCA-TAAAAGCTTATCCAA
* *
15469982 AATAAAATAACACTAATTTAATAATATTATAAAAATTTATAACTAAGAGATTTACAAAATAAATG
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAACTAAGAGATTTA-AAAATAAATG
* * * * **
15470047 TGTTTGTTGAACCAGTTCAAA-AGATTAAGACTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCGTCCTA
64 TGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGATTAAGGCTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* ** * **
15470111 ACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAATAC
129 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *** *
15470176 TATTTTATT-ACA-TTCAAAATATTAATAAGAAATAAATTTTTTTAAA-AAATCTATTTATCGAG
194 TAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGAAAGAAA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* * *
15470238 CAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATAAACTTTTGTTCT
257 CAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTCT
15470303 ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
321 ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
* * * * * * *
15470343 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGT-TGTAGATTTAAAAGATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAACTAAG-AGATTTAAAA-ATAAAT
* * * * * **
15470407 -TAGTTTATCGAATTAATTCAAATA-ATTATGGTTATTCGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
63 GT-GTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGATTAAGGCTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
15470470 TAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATATAAGCCTATTCAAAATAAAATAAT
127 TAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * * *
15470535 ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAATCTGTATACCCAA
192 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* * * * * ** * *
15470599 CTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATAGTTCAAATTGTTATAGCCTTTTATTTT
257 CAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTCT
* ** * * * * **
15470664 ATCATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGTTTATTCGG
321 ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
* * * * *
15470704 AATAAAATAATACTAATCTAACAATA-TTATGAAATTAATAACTAAGAGATTTGAATAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAATG
* * ** *
15470768 TGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAG-TTAAGGCTA-TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
64 TGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGATTAAGGCTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * ** * * * ** *
15470831 GACATTTTATTTTGTTGTAAAATAAATGTTTTTGC-TCATATAAGTTTGTT-AAGAATAAAATAA
128 AACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG-TTTTACATCATACAAGCCTATTCAA-AATAAAATAA
* **
15470894 TATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGA
191 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGA
15470928 GATTTACAAA
Statistics
Matches: 1548, Mismatches: 354, Indels: 204
0.74 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
344 4 0.00
345 24 0.02
346 17 0.01
347 63 0.04
348 71 0.05
349 56 0.04
350 31 0.02
352 3 0.00
353 14 0.01
354 67 0.04
355 102 0.07
356 104 0.07
357 199 0.13
358 196 0.13
359 49 0.03
360 171 0.11
361 342 0.22
362 23 0.01
363 12 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATGTG
TTTGTCGAACTAGTTCAAATAGATTAAGGCTATTATAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
TTCAAATAGTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAACTTTTGTTCTATCAT
AAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
Found at i:15472188 original size:144 final size:143
Alignment explanation
Indices: 15471841--15472215 Score: 448
Period size: 144 Copynumber: 2.6 Consensus size: 143
15471831 AAATGCCTTT
* * *
15471841 TAAGGG-GTATTTCGTAATTTGACCTTGCCGAGCTAGATTTTCATGAAACTTTTTATATCTTAAT
1 TAAGGGTGT-TTTCGTAATTTGACCTTCCCGAGCTCGATTTTCATGAAACTTTTTAGATCTTAAT
* * * * * * * ** *
15471905 TTCACAATATTTCATGATTTTAGGTGCTTTTGAAATCATAGTAGTACTTTGAGAAATATGAAATT
65 TTTATAATATTTCATAATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAGTAC-TCCAAAAATATGAAATT
15471970 ACAAAAATACCCCTA
129 ACAAAAATACCCCTA
* * * *
15471985 TAAGGGTATTTTCGTAATTTGTCCTTCCCGAGCTCGAATTTTTATGAAAATTTTTAGATCTTAAT
1 TAAGGGTGTTTTCGTAATTTGACCTTCCCGAGCTCG-ATTTTCATGAAACTTTTTAGATCTTAAT
* *
15472050 TTTATAATATTTCATTATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAGTAC-CCAAAAAGTGTGAAATT
65 TTTATAATATTTCATAATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAGTACTCCAAAAA-TATGAAATT
**
15472114 ATGAAAATACCCCTA
129 ACAAAAATACCCCTA
* * * * *
15472129 TAAGGGTGTTTTCATAATTTGACCTTTCCGAGCTCGCATTCTCATGAAACTTTTCAGATCTCAAT
1 TAAGGGTGTTTTCGTAATTTGACCTTCCCGAGCTCG-ATTTTCATGAAACTTTTTAGATCTTAAT
*
15472194 TTTATAACATTTCATAATTTTT
65 TTTATAATATTTCATAATTTTT
15472216 TATGTTTTAA
Statistics
Matches: 196, Mismatches: 32, Indels: 6
0.84 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
143 4 0.02
144 126 0.64
145 66 0.34
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (143 bp):
TAAGGGTGTTTTCGTAATTTGACCTTCCCGAGCTCGATTTTCATGAAACTTTTTAGATCTTAATT
TTATAATATTTCATAATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAGTACTCCAAAAATATGAAATTAC
AAAAATACCCCTA
Found at i:15474754 original size:182 final size:182
Alignment explanation
Indices: 15474416--15474783 Score: 399
Period size: 182 Copynumber: 2.0 Consensus size: 182
15474406 ATAATATTTT
** *
15474416 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTAAGA
1 AAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * *
15474481 CTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTT
66 CTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTAGTTTAGCCATAAAATAATTGTTTT
* * * ***
15474546 AGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-CTTTTATTAACA-TTCA
131 AATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAC-TTTATTAACATTTCA
*
15474597 AAAAATTAATAAACAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
1 AAAAATTAATAAACAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATGTGTTTACT-GAACCAA-TTCAAATAGTT
* * * ** * *
15474659 ATGACTATTTGGACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTAGATTTA-CCATGAAA-CATT
62 AAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTAG-TTTAGCCATAAAATAATT
* * *
15474722 TTTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCA
126 GTTTT-AATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAACATTTCA
15474780 AAAA
1 AAAA
15474784 TTGAGAAGTT
Statistics
Matches: 154, Mismatches: 25, Indels: 14
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
180 1 0.01
181 30 0.19
182 110 0.71
183 13 0.08
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (182 bp):
AAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTAAGA
CTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTAGTTTAGCCATAAAATAATTGTTTT
AATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAACATTTCA
Found at i:15474785 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 15474407--15474969 Score: 525
Period size: 181 Copynumber: 3.1 Consensus size: 180
15474397 GCTAAACTAA
* ** * *
15474407 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTGAACCAA-TTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-CAAGTTCA
* *
15474470 AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT--TTTATGACCTTTTGTTTA-TCATAA
* * * * *
15474534 AATAATTGTTTT-AGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-CTTTTAT
126 AATAATTTTTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAC-TTTAT
*
15474588 TAACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTC
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAACAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTC
* * * * * *
15474651 AAATAGTTATGACTATTTGGACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTAGATTTACCATGA
63 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-TTATGACCTTTTG-TTTATCATAA
* ** *
15474716 AA-CATTTTTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTAT
126 AATAATTTTTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTACTTTAT
* * **** * * * **
15474770 TAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTTAAAAATAAATTAGTTTATCGTATTAGTTCAAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAA
* * * * * *
15474835 TAATTATCACCATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAAT
66 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAAT
* * ** *
15474900 AATTGTTTTTC-A-TCATATAAGCCTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTAT
129 AATT-TTTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTACTTTAT
15474951 TAATATTTCAAAAATTAAT
1 TAATATTTCAAAAATTAAT
15474970 GTTAGCTTTA
Statistics
Matches: 308, Mismatches: 59, Indels: 30
0.78 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
180 4 0.01
181 160 0.52
182 128 0.42
183 16 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTTTATGACCTTTTGTTTATCATAAAATAA
TTTTTTTCAATTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTACTTTAT
Found at i:15476651 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 15476149--15481538 Score: 3685
Period size: 181 Copynumber: 29.9 Consensus size: 178
15476139 ATTTAAACCA
* * * * * **
15476149 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGTTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * * * * **
15476214 TTGTTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCT-ATTAGCCT-GACCA
64 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA--CTAAATAA
* * * * *
15476276 GTACAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATAACAT
125 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCT
* * * * * *
15476330 TTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAG-TTGACTCGAAATAACATAA-ATCTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTT-ATTC-AAATAAAATAATA-CTA
* * * * *
15476393 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGATTAAG
62 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAG
* * *
15476458 TTCAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* *
15476511 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATT
* * * *
15476576 TATTAATATTCAAACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAATAAGTTC
65 TATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTC
* * * * * * *
15476641 AAATAGTTATGACTGTTAGAATAATT-TTTAATTTCAAATCATTCTAACCT
129 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * ** * *
15476691 TTTGTTTAGTCA-AATAATAACTGTTTCAATTCATACAAGCATATTCAGAATAAAATGATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAA-AACAA-TTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAA
* ** * * *
15476755 TTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTGAAAAACTAAATTTGTTTA-TCGAATAA
63 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAATAA
* * * *
15476819 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATTGTTATGACCT
125 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
15476873 TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15476937 ATATT-AT-TTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTGACTAAATTAGTT
64 TTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAATAAGTT
* * * * * ** *
15476999 CAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTTTTATTACCT
128 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
15477050 TTGGTTTTCTCATAAAACAATTTCTTTTCAAT-ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTT-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
* * * * **
15477114 TTTACTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACCAG
63 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAATAAG
* ** * *
15477174 TTCATATAGAAATGACTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATAGTTAT-AGCCT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCT
* * * * * * *
15477227 TTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* * * * ** * * *
15477292 TTAGTAATATTCTGAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATCTGCCAAACT-AGT
64 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-TAAGT
* * * * * * *
15477356 TTAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGACCT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * *
15477408 TTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * * ** *
15477473 TTATTAATACTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAACCATT
64 TTATTAATA-TTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGT
* * * * * *
15477538 TCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATAACTT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * ** *
15477590 TTTATTTTGTCATCAAACAATTGATCTTGTTCATACTATTTTATTCATAATAAAACAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* ** * * ** * * ** * *
15477655 TTAATAATATTTTGAAACTTGATAACCAAGAAAATTACAAAAATAAATCTAATTGCCAAACTAA-
64 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTAAA-TAAG
* * * ** * * *
15477719 TTCAAATAGTTAAGATTATATGAATGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACTT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * *
15477772 TTTCTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTTATTCATAAAAGCTTATTCTAATTAAAATAATGCTAATT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
* * * *
15477837 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAATCAGTT
65 TATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAATAAGTT
** * * * * * * * *
15477901 CAAAGGGTTAAGATTATTAGGATAATTATCTATTTGAAATTGTTTTGACCT
128 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * *
15477952 TATGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATAATAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
15478017 TTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGAAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGT
64 TTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGT
* * * * *
15478082 TCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATAACCT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * **
15478134 TTTGATTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAACTTAGATGGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
15478199 TTATTAATACTTACTAAAA-T-A-AA--AAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTACT
64 TTATTAATA-TT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGT
* * * ** *
15478259 TAAAATAATTAT-AGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
127 TCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * *
15478311 TTT-TTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTGA-TCATACGAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
* * **
15478374 TTTATTAATACTCAAAAAATTAATAACTAA-AGGATTTAAAAAATAAATAAGTTTACTAAACT-A
63 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-TAA
* * * *
15478437 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAGGATC-
125 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * *** *
15478490 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATAGAAAACTTATTCGGTTAAAA-ATATGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATA-CAAGCTTATTCAAATAAAATA-ATACTAA
* * * * * * **
15478554 TTTAAT-ATATTCAAAAAATTAATAAGTAATAGACTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAGCCAA-
63 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAA-ATAAG
** * * * * *
15478617 TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGTCCT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * *
15478670 TTTGTTTAGTCATAATA-TATTTGTTTCATATT-TTCCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTT--TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT-
* * ** * *
15478732 AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAAATAAAAATATTTACTGAA
61 AATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* * * * * * * *
15478796 CAAGTTCAAATAGTGATAACTATTCGAACAATTATTTACTTAAAATCATTATGACCT
122 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * *
15478853 TTTGTTTTGAT-ATAAAAAAATTATTTAAGTTCATAAAACCTTATCCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTG-TCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
* * * * ** * *
15478917 TTTCTTAATAATTTAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAAT
63 TTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGT
*
15478979 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTCGTTATGACCT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCT
* * ** * * *
15479031 TGTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTGAATTCATTCAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACCAATT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATT
* * * * *
15479096 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAGTTC
65 TATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTC
* * ** * * *
15479161 AAATAATTATGGCCCTTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT
129 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * * *
15479211 TTTGTTTGGTCATATAACAATTGTCTTTGA-TCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T-TTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
* ** * *
15479275 TTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AGATTTTTAAAAAATAAATATGTTTACTTAATCAA-
63 TTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAT-AAG
* * * * * *
15479337 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * *
15479390 TTTGTTCTATCTTAAAACAATTATTTCTATTTATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* ** * * * *
15479455 ATAAAAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACT-AGT
64 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-TAAGT
* * *
15479519 TCAAATAGTTATGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAA----T-TG--TT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * ** *
15479564 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AA
* * * ** * **
15479628 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGATATTTCAAAAATAGTTTTGTTTACCTAACCAA-
63 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAATAAG
* * *
15479692 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCT
126 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * * *
15479745 TTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTTTTTAGAATAAAATAGTACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* *
15479810 ATATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACT-AG
64 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-TAAG
* * * * *
15479869 TTTAAA-AGGTTAAGACTATTT-AAGTAATTAT-TATTTCCAATTGTTAT----T
126 TTCAAATA-GTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * ** * * * * *
15479917 TTT-TTTATG-CTACAAAATAATAATTCCTGTTCATAAAAGCTTATTTAGATTGAAATAATACTA
1 TTTGTTT-TGTC-ATAAAACAAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
15479980 ATTTCTTAATTACTT-GACAATTAATAAGTAAAATG-TTTAAAAGATAAATATGTTTGCTTAACT
62 ATTTATTAA-TA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TAAAT
* * * * * * * * *
15480043 -A-TACCAAATAGTCATCACTATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT
123 AAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
15480098 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAG
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15480163 TTATTAATATTCCAAAATTAATAA-TGAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAACAAGTT
64 TTATTAATATTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTT
* * * * * *
15480226 TAAATAATTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCT
128 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
** ** * *
15480277 TTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTCAAATAAAATAATAC-AAG
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAAT
* * ** * * * * *
15480341 TTCTTAATATT-AAGACAGTTAATGGGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
64 TTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGT
* * * * *
15480405 TCAAAT-CTGTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT
127 TCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * * *
15480457 TTTCTTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTCTTCAGATTAAAATAACATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAAT
* * *
15480522 TTATAAACATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAAAAATTTAAAAATAAAT
64 TTATTAATA-TTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGA-TT------T-------A---AAAAATAAAT
* * * * * * * *
15480586 ATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTCT-TGACTGTTTGAATAATTATATATTGT-AAATCATTG
110 CTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTA
15480649 TGACCT
173 TGACCT
* * ** * * *
15480655 TTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * *
15480720 TTATTAATATTCTAAAAACTAATGAGCAAGAGAATTAAAAGATTAATCTGTTTACCAAACATGTT
64 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTT
* * * *
15480785 CAAATAGTT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAACATTATGACCT
128 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * *
15480835 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AA
* * * * * ** * * *
15480899 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAA-ATATTTTAAAAATAAATATTTTTTTTGAACACGT
63 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGT
*
15480963 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * *
15481015 TTTATTTTGAT-ATAAACCAATTGTTTCTATTCATA-AACTCTTATTCTGAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAA-GCTTATTC-AAATAAAATAATACTA
* * * * * **
15481078 ATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAAGTATATCTATTTA-TCAAGC
62 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAT
* * * *
15481142 AAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGACCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCT
123 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* ** *
15481198 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAATTTTATTCAAAATAAAATAATAATAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT
* ** ** *
15481263 CTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGT
64 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGT
* * * * * **
15481328 TCAAATAGTCATGTCCATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAATAGTTATGATAT
127 TCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * ** * *
15481380 TTTGTTTTATTGA-AAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTAGAATATAATAATACTAA
1 TTTGTTTT-GTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAA
* * *
15481444 TTTATTAATTTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCAAATTAA
63 TTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-TAA
*
15481504 -TTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTAT
125 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
15481539 CTTAAAAACT
Statistics
Matches: 4120, Mismatches: 860, Indels: 462
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
171 6 0.00
172 60 0.01
173 10 0.00
174 124 0.03
175 16 0.00
176 127 0.03
177 448 0.11
178 206 0.05
179 421 0.10
180 818 0.20
181 847 0.21
182 593 0.14
183 284 0.07
184 13 0.00
188 1 0.00
191 1 0.00
195 1 0.00
197 7 0.00
198 131 0.03
199 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTT
ATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
Found at i:15477065 original size:177 final size:177
Alignment explanation
Indices: 15476279--15481538 Score: 2265
Period size: 180 Copynumber: 29.2 Consensus size: 177
15476269 CTGACCAGTA
* * * * * * * * *
15476279 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAAGTGTTATAACATTTTGTTTTGTTACA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
15476344 AAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAG-TTGACTCGAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTT
66 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATA-CTAA--TA-TATTATTT
* **
15476407 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGATTAAGTT
126 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATAAATT-AGTT
* * * *
15476460 CAAATAGTTATGACTC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAATTATGAC-CATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
15476524 AAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTC
65 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-AT-TTC
* * * * * *
15476587 AAACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAATAAGTT
127 AAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * ** * *
15476640 CAAATAGTTATGA-C-TGTTAGAATAATT-TTTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTC
1 CAAATAATTATGACCAT-TTA-AACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
15476702 A-AATAATAACTGTTTCAATTCATACAAGCATATTCAGAATAAAATGATACTAATTTATTAACAT
63 ATAA-AACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-A-TT
** * * *
15476766 TCAAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTGAAAAACTAAATTTGTTTATCGAATAAGTT
125 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTAT-AAATTAGTT
* * * * *
15476822 CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* *
15476886 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTATATTATTTCAAAA
66 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATTATTTCAAAA
* * *
15476951 GTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTGACTAAATTAGTT
131 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * *
15476999 CAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTTTTATTACCTTTGGTTTTCTCATA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * *
15477064 AAACAATTTCTTTTCA-AT-ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTT
66 AAACAA-TTGTTTT-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--TA-TATTATTT
* * **
15477127 CAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTT
126 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-AAATTAGTT
* * * * * * * * * *
15477176 CATATAGA-AATGACTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATAGTTATAGCCTTTTATTCTATCAT
1 CAAATA-ATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
15477240 AAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCT
65 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATA-TTAT-TTC-
* * * *** *** *
15477305 GAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATCTGCCAAACTAGTT
127 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT-TTATAAATTAGTT
* * * * * * * * *
15477357 TAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
15477422 AAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTTA
66 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-AT--TTCA
* * * ** *
15477487 GAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAACCATTT
128 -AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * * ** * * *
15477539 CAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATC
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* ** ** * * * *
15477604 AAACAATTGATCTT-GTTCATACTATTTTATTCATAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTTT
66 AAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--T-ATATTATTTC
* * * ** * * ** *** * *
15477668 GAAACTTGATAACCAAGAAAATTACAAAAATAAATCTAATTGCCAAACTAATT
127 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAAT-TTGTTTATAAATTAGTT
* * ** * * ** * * * * *
15477721 CAAATAGTTAAGATTATATGAATGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCGTA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
15477786 AAATAATTGTTTTA-TTCATAAAAGCTTATTCTAATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCA
66 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--T-ATATTATTTCA
* *
15477850 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAGTT
128 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-AAATTAGTT
*** * ** * * * * * * *
15477901 CAAAGGGTTAAGATTA-TTAGGATAATTATCTATTTGAAATTGTTTTGACCTTATGTTTAGTCAT
1 CAAATAATTATGACCATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
15477965 AAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATAATAATTTATTAACATTT-
65 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT---ATTTC
* * * * * **
15478029 AGAAAATTAATAAGAAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTT
127 A-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * * * *
15478083 CAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTGTTATA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** *
15478148 AAACAATTGTTTTAGTTAATACAAA-CTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTT
66 AAACAATTGTTTTAGTTCATA-AAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-AT--TT
* * * * * * *
15478211 ACTAAAA-T-A-AA--AAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTACTT
126 -CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * ** * *
15478260 AAAATAATTAT-AGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTCGT
1 CAAATAATTATGA-CCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** ** * *
15478323 AAAACAATTATTTTTGATCATACGAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTCA
65 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-AT-TTC-
* ** *
15478388 AAAAATTAATAACTAA-AGGATTTAAAAAATAAATAAGTTTACTAAACTAGTT
127 AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * ** ** *
15478440 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *** * * *
15478503 AAAACAATTGTTTCTA-ATCATAGAAAACTTATTC-GGTTAAAA-ATATGCTAATTTAATATATT
65 AAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATA-ATACTAATATATTAT-TT
* * * ** *** *
15478565 CAAAAAATTAATAAGTAATAGACTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAGCCAATT
126 C-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATAAATTAGTT
* ** * * ** * ** *
15478619 CAAATAGTTAAAACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGTCCTTTTGTTTAGTCAT
1 CAAATAATTATGACCATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * ** * * *
15478683 AATATATTTGTTTCATA-TT-TTCCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAACAT
65 AAAACAATTGTTT--TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATATATT-A-TT
* ** * * **
15478745 TCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAAATAAAAATATTTACTGAACAAGTT
125 TC-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT--AAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * ** * * * ** *
15478802 CAAATAGTGATAACTATTCGAACAATTATTTACTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGAT-AT
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG-TCAT
* * * * * * * *
15478866 AAAAAAATTATTTAAGTTCATAAAACCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTT
65 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-AT--TTC
* ** ** *
15478931 AAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATT
127 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * *
15478980 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTCGTTATGACCTTGTGTTTTGTCAT
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * *
15479044 AAAACAATTG-TTGAATTCATTCAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCT
65 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-AT-TTC-
* * * * * *
15479108 AAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAGTT
127 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * ** * *
15479160 CAAATAATTATGGCCCTTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * ** * *
15479225 TAACAATTGTCTTT-GATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTC
66 AAACAATTGT-TTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-A--TTTC
** * * * *
15479289 AAAAATTAATAAG--AGATTTTTAAAAAATAAATATGTTTACTTAATCAATT
127 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * * * ** * * *
15479339 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCTTA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * **
15479404 AAACAATTATTTCTA-TTTATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAATACTAATATAAAAATATTCT
66 AAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATAT-ATTAT-TTC-
* ** *
15479468 AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTT
127 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATAAATTAGTT
* ** * *
15479520 CAAATAGTTATGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTG---T----TTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* ** *** * *
15479578 AAACAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTT
66 AAACAATTGTTTT-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AA--TA-TATTATTT
* * * ** ** *
15479641 CAAAAATTAATATGTAAGATATTTCAAAAATAGTTTTGTTTACCT-AACCAATT
126 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA--TAAATTAGTT
* * * * *
15479694 CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTTATA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
15479759 AAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTTTTTAGAATAAAATAGTACTAATATATTAATATTTCA
66 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATA-T--TATTTCA
*
15479824 AAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTT
128 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-AAATTAGTT
* * * * ** *
15479871 TAAA-AGGTTAAGACTATTTAAGTAATTAT-TATTTCCAATTGTTAT----TTTT-TTTATG-CT
1 CAAATA-ATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTT-TGTC-
* * ** * * * * * * *
15479928 ACAAAATAATAATTCCT-GTTCATAAAAGCTTATTTAGATTGAAATAATACTAATTTCTTAATTA
63 ATAAAACAATTGTT-TTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-ATT-
** * * * * * * * *
15479992 CTTGACAATTAATAAGTAAAATG-TTTAAAAGATAAATATGTTTGCTTAACTA-TAC
125 -TCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATAAATTAGT-T
* * * * ** * * * * *
15480047 CAAATAGTCATCACTATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
15480112 AAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGT-TATTAATATTCC
66 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TATATT-AT-TTCA
* * * **
15480176 AAAATTAATAA-TGAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAACAAGTT
128 AAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * *
15480226 TAAATAATTATGACTATTTGAAA-AATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAC
1 CAAATAATTATGACCATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * *
15480290 CAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AAGT-TCTTAATAT
65 AAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA-TATATT-AT-T
* ** * * * **
15480351 T-AAGACAGTTAATGGGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
125 TCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * * * *
15480406 CAAAT-CTGTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCAT
1 CAAATAAT-TATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * **
15480470 AGAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTCTTCAGATTAAAATAACATTAATTTATAAACATTT
65 AAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--TAT-ATTATTT
* **** *
15480534 CAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAAAAATTTAAAAATAAATATGTTT
126 CAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTATAAAT---TA-G-TT
** * * * ** * *
15480592 GCCAAATAAGTTCAAATAGTCTTGACTGTTTGAATAATTATATATTGT-AAATCATTGTGACCTT
1 --CAAATAA--T----TA----TGACCATTTAAACAATTATCTATT-TCAAATTGTTATAACCTT
* * * * * * ** *
15480656 TTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATACTAATT
53 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATA
* * * * * * * * *
15480721 TATTAATATTCTAAAAACTAATGAGCAAGAGAATTAAAAGATTAATCTGTTTACCAAA-CATGTT
118 TATT-AT-TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTA-GTT
* * * * * *** *
15480785 CAAATAGTT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* ** * *
15480849 AAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
66 AAACAATT-GTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AA--TA-TATTATT
* * * * * * *
15480911 TCAAAAATTAATAAATAA-ATATTTTAAAAATAAATATTTTTTTTGAA-CACGTT
125 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATAAATTA-GTT
* * * ** * *
15480964 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGAT-AT
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG-TCAT
* ** ** *
15481028 AAACCAATTGTTTCTA-TTCATAAACTCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTT
65 AAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT---ATTT
* * * * * ***
15481092 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAAGTATATCTATTTATCAAGCAAGTT
126 CAAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-AAATTAGTT
* * * * * * *
15481147 CAAATAGTTATGACTC-TTTGACCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCAT
1 CAAATAATTATGAC-CATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * *
15481211 AAAACAATTATTTCTA-TTCATACAATTTTATTCAAAATAAAATAATAATAATCTATTAATATTC
65 AAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-AT-TTC
** * ** **
15481275 TAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
127 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-TAAATTAGTT
* * * * * * * ** * *
15481329 CAAATAGTCATGTCCATTTAAGCTATTATCTATTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTATTGA-
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTT-GTCAT
* * * * * * *
15481393 AAAACAATTATTTCTA-TTTATACAAA-ATTATTTAGAATATAATAATACTAATTTATTAATTTT
65 AAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATT-A--TT
* * * *
15481456 TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATT
125 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-AAATTAGTT
* * *
15481506 CAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTAT
1 CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTAT
15481539 CTTAAAAACT
Statistics
Matches: 3948, Mismatches: 880, Indels: 506
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 3 0.00
171 4 0.00
172 59 0.01
173 8 0.00
174 128 0.03
175 15 0.00
176 134 0.03
177 449 0.11
178 194 0.05
179 418 0.11
180 764 0.19
181 751 0.19
182 564 0.14
183 293 0.07
184 13 0.00
185 5 0.00
186 2 0.00
188 5 0.00
189 1 0.00
191 7 0.00
193 2 0.00
194 5 0.00
195 1 0.00
196 4 0.00
197 13 0.00
198 104 0.03
199 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
CAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATTATTTCAAAA
ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATAAATTAGTT
Found at i:15479314 original size:720 final size:712
Alignment explanation
Indices: 15476149--15524280 Score: 15267
Period size: 720 Copynumber: 66.7 Consensus size: 712
15476139 ATTTAAACCA
* * * * * * **
15476149 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGTTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
15476214 TTGTTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCT-ATTAGCCTGACCAG
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CC-AAACAG
* * * * * * *
15476277 TACAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATAACATTTTGTTTTGTT
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
15476341 ACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAG-TTGACTCGAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATA
191 ATAAAACAATTG-TTTT-ATCATAAAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATA-GTAATTTAATAATA
* * *
15476404 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTG-ATTAAGTTCAAATAGT
252 TTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGT
* * ** * * *
15476468 TATGACTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
314 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * *
15476533 -TTTTTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAAACAACTA
379 GTTTCTATT-ATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* * * * * * *
15476596 ATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTAGA
442 ATAACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT-GA
* * * * * * *
15476661 ATAATT-TTTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCA-AATAATAACTGTTTCAA-TTC
505 ACAATTATTT-ATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGTTT-AAGTTC
* * * * * **
15476723 ATACAAGCATATTCAGAATAAAATGATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAAAAAGAG
567 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
15476788 ATTTGAAAAACTAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCG
631 -TTT-AAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
*
15476853 ATTTAAAATTGTTATGACCT
693 ATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15476873 TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
15476937 ATATT-AT-TTC-AAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTGACTAAATTAGT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAA-CAGT
* * * * * ** * * *
15476998 TCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTTTTATTACCTTTGGTTTTCTCAT
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
15477063 AAAACAATTTCTTTTCAAT-ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTT
193 AAAACAA-TTGTTTT--ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * *
15477127 CAAGAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCATATAG-AAATG
255 CAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTTAA-G
* * *
15477188 ACTATTTGAACATTTATCTATTTCAAAT-AGTTAT-AGCCTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTG
318 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGA-CCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTG
* * * * * * ** *
15477250 TTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTAGTAATATTCTGAAAATTTA
380 TTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAA
* * * * * *
15477314 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATCTGCCAAACTAGTTTAAATAGTTA-AGACTATATAA
443 TAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT-TGA
* ** * ** *
15477378 ACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTGTTAATA
505 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATA
* * * * *
15477443 TAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGAT
570 AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTA-AAAATTAATAAGTAAGAG-T
* * * * * * * *
15477508 TTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATT
632 TTAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * *
15477573 TCAAATCATTATAACTT
696 TCAAATTGTTATGACCT
* * * ** * *
15477590 TTTATTTTGTCATCAAACAATTGATCTTG-TTCATACTATTTTATTCATAATAAAACAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T-TTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** * * ** * *
15477654 TTTAATAATATTTTGAAACTTGATAACCAAGAAAATTACAAAAATAAATCTAATTGCCAAACTAA
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
* * * ** * ** * * *
15477719 TTCAAATAGTTAAGATTATATGAATGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTCG
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
15477784 TAAAATAATTGTTTTATTCATAAAAGCTTATTCTAATTAAAATAAT-GCTAATTTAATAATATTT
192 TAAAACAATTGTTTTA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAG-TAATTTAATAATATTT
* **
15477848 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAAGGGTTAAG
255 CAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTTAAG
* * * * * ** * *
15477913 ATTATTAGGATAATTATCTATTTGAAATTGTTTTGACCTTATGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT
318 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
15477978 C-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATA-ATAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATA
383 CTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATA-AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA
* *
15478041 A-GAAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAA
445 ACTAAAG--ATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAA
* * ** * * * * *
15478105 CAATTGTCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTAATAC
506 CAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATA-
* * * * *
15478170 AAA-CTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAAAAAG-AA-ACT
570 AAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA--AAAATTAATAAGTAAGAGT
* * * ** * * * **
15478230 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTACTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAATGATTATCTATT
632 TTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT
15478294 TCAAATTGTTATGACCT
696 TCAAATTGTTATGACCT
* * * **
15478311 TTT-TTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTGA-TCATACGAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ** *
15478374 TTTATTAATACTCAAAAAATTAATAACTAA-AGGATTTAAAAAATAAATAAGTTTACTAAACTAG
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
* * *
15478438 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTC
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
15478501 ATAAAACAATTGTTTCTAATCATAGAAAACTTATTCG--GTTAAA-AATATGCTAATTTAAT-AT
191 ATAAAACAATTGTTT-T-ATCATA-AAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-G-TAATTTAATAAT
* * * * * *
15478562 A-TTCAAAAAATTAATAAGTAATAGACTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAGCCAATTCAAATAG
251 ATTTC-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAA-TCAATTCAAATAG
* * * * * * *
15478626 TTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGTCCTTTTGTTTAGTCATAATATATT
313 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* * *
15478691 TGTTTCATATTTTCCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAACATTCAAAAAATTA
378 TGTTTC-TATTATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
** ** ** *
15478756 ATAAGGAAATGATTTGAAAAAAATAAAAATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTGATAACTATTC
442 ATAACTAAA-GATTT--AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT-
* * *
15478821 GAACAATTATTTACTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGAT-ATAAAAAAATTATTTAAGTTC
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTAAGTTC
* * * * *
15478885 ATAAAACCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTTAAAAATTAATAAGCAAGAG
567 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * *
15478950 TTT-AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATT
631 TTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
15479014 T-AAATTCGTTATGACCT
696 TCAAATT-GTTATGACCT
* * * *
15479031 TGTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTGAATTCATTCAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACCAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTG-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *
15479095 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGTT
* * ** * * *
15479160 CAAATAATTATGGCCCTTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATA
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
15479225 TAACAATTGTCTTTGATCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCA
194 AAACAATTGT-TTT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCA
** * * * *
15479290 AAAATTAATAAG-AGATTTTTAAAAAATAAATATGTTTACTTAATCAATTTAAATAGTTATGACT
257 AAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAATTCAAATAGTTAAGACT
* * * * * * *
15479354 ATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTA-TCTTAAAACAATTATTTCT
321 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** *
15479418 ATTTATACAAGCTTATTC-GAAATAGAATAATACT-AATATAAAAATATTCTAAAAATTAATAAC
385 A-TTATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAC
* * * * * *
15479481 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGATTATATGAACAAT
447 TAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAT-TGAACAAT
* * * * **
15479546 TATCTATTT-CAA--A-T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAA-TTCATACTAG
510 TATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATAAAAG
** * * *
15479603 CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGATATTTCA
574 CTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA-GTTT-A
** * *
15479667 AAAATAGTTTTGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
635 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
*
15479732 ATTGCTATGACCT
700 ATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15479745 TTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTG-TTCATATAAGTTTTTTTAGAATAAAATAGTACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * *
15479809 TATATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAG
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
* * * * **
15479869 TTTAAA-AGGTTAAGACTATTT-AAGTAATTAT-TATTTCCAATTGTTAT----TTTT-TTTATG
127 TTCAAATA-GTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TG
* * ** * * * * * **
15479926 CTACAAAATAATAATTCCTGT-TCATAAAAGCTTATT-TAGATTGAAATAATACTAATTTCTTAA
189 -T-CATAA-AACAATTGTTTTATCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAA
* * * * * * * * * *
15479989 TTACTT-GACAATTAATAAGTA-AAATGTTTAAAAGATAAATATGTTTGCTTAA-CTATACCAAA
250 -TATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGA--TTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAAT-TCAAA
* ** * * * * ** * * * *
15480051 TAGTCATCACTATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAA
310 TAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC
* * * * *
15480116 AATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AAGTTATTAATATTC-CAA
375 AATTGTTTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAA
* * ** * * *
15480178 AATTAATAA-TGAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACT
437 AATTAATAACT-AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACT
* * * ** * ** ** * *
15480241 ATTTGAAAAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTA
500 A-TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AA
* * * * * **
15480306 -TTCATACAAGTTTATTTCA-AATAAAATAATAC-AAGTTCTTAATA-TTAAGACAGTTAATGGG
563 GTTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAG
* * * * *
15480367 TAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-CTGTATGACTAATTGAACAA
625 TAAGA-GTTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAA
* *
15480431 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT
687 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * * *
15480457 TTTCTTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTCTTCAGATTAAAATAACATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *
15480522 TTATAAACATT-TCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAAAAATTTAAAAATAAA
65 TTATTAATATTCT-AA-AAATTAATAAGTAAGAGA-TT------T-------A---AAAAATAAA
* * * * * *
15480585 TATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTCT-TGACTGTTTGAATAATTATATATTGT-AAATCATT
111 TCTGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATT
* * * * * * *
15480648 GTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAA
173 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * * * * * *
15480713 TACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAACTAATGAGCAAGAGAATTAAAAGATTAATCTGTTTACCA
236 TAGTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGA
* * * * * * *
15480777 AACATGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTT
299 ATCA-ATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTT
* * *
15480841 TTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATT
363 TAGTCATAAAACAATTGTTTCTATT-ATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATAAATTTATT
* * * * * **** *
15480905 AATATTTC-AAAAATTAATAAATAAATATTTTAAAAATAAATATTTTTTTTGAACACGTTCAAAT
426 AATA-TTCAAAAAATTAATAACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * *
15480969 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGAT-ATAAACC
490 AGTTATAACTA-TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAAC
* ** * *
15481033 AATTGTTTCTA-TTCATAAACTCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAA
553 AATTGTTT-AAGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAA
* * * * * * * *
15481097 ATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAAGTATATCTATTTATCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACT
616 ATTAATAAGT--AAGA-GTTTAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACT
* * * * *
15481162 CTTTGACCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCT
677 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** *
15481198 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAATTTTATTCAAAATAAAATAATAATAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* ** *
15481263 CTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGT
* * * * ** *
15481328 TCAAATAGTCATGTCCATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTATT
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT-GT
* * * * * * * *
15481391 GA-AAAACAATTATTTCTATTTATACAAA-ATTATT-TAGAATATAATAATACTAATTTATTAAT
190 CATAAAACAATTGTTT-TA-TCATA-AAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAAT
* * * * * *
15481453 TTTTCAAAAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTT
251 ATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTT
* * * ** *
15481515 ATGACTATTTCAACAATTATCTATCTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTT
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTAT-TT-----C-AAATC-ATTT-TGACCTT--TT---GT--TT
* ** * * * * ** *
15481580 ATGACTATTTCAACAATTATCTATCTTAAATTATTATAATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
364 A-GTC-A-TAAAACAATTGT-T-TC-T--ATTA-TACAAGC-TTATTCAG-AATAAAATAA---T
* ** * * * * ** *
15481645 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT-ATTGCTAAATTAATATTATTTTAAAAATTAAT
415 ATAAATTTAT-TAA---TA-TTCAAA-AAATTAATAACTAAA--GAT-TTA----AAAAA-T-A-
** * * * **
15481709 AAGTGAGAGATTTA--AAA-AAG---AAATGTGTTTGCTGAACTAGTTTAA-ATAGTTAAGACTA
464 AA-T---CTATTTACCAAACAAGTTCAAAT-AG-TT-AT-AACTA-TTGAACA-A-TT-A-TTTA
* * * * * * *
15481767 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCAAAAAATAATTTTTTTCAA
516 TT-TAA-AATCAT-TA--T--GA-CCTTTTG---TTTTG-----TCATAAAACAA-TTGTTT-AA
* * * * * * **
15481832 -TTCATACATGCTTATT-TGAAATAAAGTAATACAAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAAC
563 GTTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGT
** * * ** * * ** *
15481895 AAGAAATTAAAAA-AAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGGTTGTTTGAACAATTAT
626 AAGAGTTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** *
15481959 CTATTTATAAAAAG-TATGTCCT
691 CTATTT-CAAATTGTTATGACCT
* ** * * * *
15481981 TTTGTTTTATCATAAAATGATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATATTAC
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAA
* *
15482045 TTTATTAATACTTC-AAAAATTGAA-AAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCAGTTT-------A
64 TTTATTAATA-TTCTAAAAATT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * *
15482100 --TCGAATAGCT-TCAC-A--T----AATTATCTATTTCAAATCATTACGAACTTTTGTTTTAG-
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GT
* * * * * * *
15482154 CATAAAGCAATTGTTTTTCATCATACAAA-CCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATC
190 CATAAAACAATTG-TTTT-ATCATA-AAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATA
* *
15482218 TTTCAATAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CTAGTTCAAATA--
252 TTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATC-AATTCAAATAGT
* * ** * * * * * *
15482280 TATA-ACTACTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTTGTCATAAAACAA
314 TA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAA
* * * * * ** *
15482344 TTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAAT-T-CTTTTATAATAATATTCCAAAAA
377 TTGTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTAT--TAATATTCAAAAAA
* * * * * * *
15482407 TTAATAACTATGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCCAACCAA-TTCAAATATTTA-AGACTA
439 TTAATAACTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTA
* * * * * * * *
15482470 TATGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAGAATAAGTTTTTTTGA
501 T-TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTT-A
** ** * *
15482535 A-TTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATCAG
562 AGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAG
* * * * *
15482598 TAAGAGATTTAAAAAAATAATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
625 TAAGAG-TTTAAAAATA-AATT-TGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
* *
15482663 TTATTTATTTCTAATTGTTATGACCT
687 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * *** *
15482689 TTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTTTATTCATATAAG-TATGTTTGGAATAAAGTAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGATTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * **
15482753 TCTATTAATATT-TTGAAA--ACTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATAAAACGAGT
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGT
* ** * * * *
15482814 TCAAATAGTTATGACTATTTCAGTAATT-TTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTAT
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
15482878 AAAACAATTGTTTCGATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC
193 AAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTC
* * * * * * * * * * *
15482942 AACAATTAATGAGTAAAAAATTTATAAAATAAATATGTTTACTAAACGATATCAAATAGTCATGA
256 AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATCAAT-TCAAATAGTTAAGA
* * * * * * *
15483007 TTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTT-GTCACAAAAAAATTATTTC
319 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
15483070 -AGTTCATATAAGCATATTC-GAAATAAAATAATACT-AAGTTATTAGTATT-ATCAAAATTAAT
384 TA-TT-ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCA-AAAAATTAAT
* * * * ** * * *
15483131 AATTAAGGGATTTAAAAATTGAATCTATTTGTCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTGTAAC
444 AACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTG-AAC
* * *** * ** * * *
15483196 TATTATCTT-TTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATTATTTTTTCTA-TTCGTA
507 AATTAT-TTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATA
* * * * * *
15483259 CAATCTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TAAAGACAATTAATAAATAAAAGA
570 AAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAG-
* * * * * * * * * *
15483322 TTTGAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTATCTG
631 TTT--AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** *
15483387 TTTCAAATAATAATGACCT
694 TTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * ** *
15483406 TTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * * *
15483471 TTACTAATTTTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAGAAAAA-GAATTTGTTGACCAAATAACT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGT
* * * * * *
15483535 TCAAATAGTTATGGCTATCTGAACAATTATCGATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTGAT
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** * *
15483600 AAAACAATTGATCCTGT-TCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATAT
193 AAAACAATTG-T--TTTATCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAGT-AATTTAATAATAT
* * * * * ** **
15483662 TCCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAGCAAATCTAT-TTTTTGAA-CAAGTTCAAATAGTT
253 TTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACGAATCAA-TTCAAATAGTT
* * ** * * *
15483725 ATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC---T-TTT-GTCATAAACCCATTG
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
* * * * * * * *
15483785 TTTTTGTTCTTAAAAACTTACTT-GGAATAAAAAAATACT-AATTTATTCAA-ATTC-CAAAATT
380 TTTCTATT-ATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATT-AATATTCAAAAAATT
* * * * * * * * * * *
15483846 AATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTAGCGAGCGAGTTCAAATAATTATGACTATTTA
441 AATAACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTG
* * * * * * *
15483911 AACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTTATACAACAATTGTTTCTA-TTCA
504 AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCA
* * * * * **
15483975 TACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTATTATTCTAAAAATTAATAATTTGGAG
568 TAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * ** *
15484039 ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTTTAAACAATCAT-ATCCGTTTGAACCATTATCT
631 -TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCT
** * **
15484103 ATTTCAAATCATTACGATAT
693 ATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * * **
15484123 TTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATT-TTCAAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *
15484187 TTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATCAGT
65 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGT
* *
15484247 TCAAGTAGTTATGACTATTTG------------------A--A-TATGACCTTTTGTTTTATCAT
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
15484291 AAAACAATTGTTGTTCTTCATACAAGCTTATTCGGATTAGAATAATA-TGAATTTATTAATATTT
193 AAAACAATTGTT-TT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGT-AATTTAATAATATTT
** * * ** ** *
15484355 CACCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAAAATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGACAT
255 CAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAA-TTCAAATAGTTAA
* * ** * * * * **
15484418 GACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCGTTATAAAAAAATTGCA
317 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
15484483 TC-AGTTCATATAGGTTTATTCTA-AATAAAATAACACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
382 TCTA-TT-ATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTA
* * * * * *
15484544 A-AGAGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAGTTTAATTAGTTATAACTATTT
442 ATA-ACTAA-AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TT
* * * * * * * * *
15484608 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-ATTTATCATAAAAAAATT-TTTCTA-CTC
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTC
* **
15484670 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAA-AAT--TGAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA
567 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGA
* *
15484732 ATTAAAAAATAAA--TG--------------T---AT--TT-T-A-TA----AAC------CTA-
630 GTTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
*
15484762 TTCAAATAGTTATGACCT
695 TTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** * *
15484780 TTTGTTTGGTCATAAACCAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTAGTCGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * ** *
15484845 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAATTAAATCTGTTTGCTGAGCAAGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTT
* *
15484910 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAAT-AGTTAT-ACTCTTTTGTTTTGTCA
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC-CTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
15484973 TAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAG-TTCATTCTG-AATAAAATCATACTAATTTATTAATA-
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTT-ATTC-GAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
** * * * * * *
15485035 TTCTGTAAATTAATAGGAAGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAAG-
253 TTC-AAAAATTAATAAGTAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATCAA-TTCAAAT-AGT
* * * * ** * * * ** *
15485099 CATGTCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTGGTAAAAAAATT
314 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * ** * * ** ***
15485164 GTTTTTGTTAATACAAAATTATTGAAAATAAAATAATATTGATTTTTATTAATATTTTGAAAATT
379 GTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-T-AAATTTATTAATATTCAAAAAATT
* * * * * *
15485229 AAT-A--AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTG
441 AATAACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTG
* * * * * * * * ***
15485290 AACAATTATCTATCTCAAATAATTATGATC-TTTATTCTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCAT
504 AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCAT
* * * * *
15485354 AGAAGCATATTCAGATTAAAAATAATACTAATTTAATCAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
569 AAAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG-
* * * * * * * * *
15485418 TTTAAAAAACAAATATGTTTCCCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GAACTATTAGAATAATTATCTA
631 TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATG-ACTATTTGAACAATTATCTA
* * *
15485482 TTTCAAATTATTCTAACCT
694 TTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** * *** *
15485501 TTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCGGCTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATTCTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * ** ***
15485566 TTATTTTTATAAACTTTCTAAAAATTAGTAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCCATTTATTGA
65 TTA---TTA-ATA--TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
* * ** *
15485631 ACAAGTTCAAATAGATATGA-TAATTT-AGACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGT
123 AC-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
15485694 TTTATAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATT
185 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAAT
* * * ** * *
15485759 AATATTTCAAAAATTATTAAGCATGAGATTTAAAAACTAAACATTT-TTTTTGAACCAGTTCAAA
248 AATATTTCAAAAATTAATAAGTA-GAGATTTAAAAAAT-AA-ATTTGTTTACGAATCAATTCAAA
* * * * * * * * *
15485823 TAGTTACA-ACTA-CTAAACCAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATCATTAT-TTT-GTCATAA
310 TAGTTA-AGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-CCTTTTGTTTAGTCATAA
** * ** * *
15485884 AGTAATTGTTTCTAATCATACAAGCTGGTT-TGAATAAAAATAATACTAATTCAATAATATTTCA
372 AACAATTGTTTCT-ATTATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATA-T-A---AAT-TTA-TT--
* * * *
15485948 AAAATATATAAGTAATAAATTTAAAAAATAAATGTGTGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT
426 --AATAT-TCA--AA-AAA-TT----AAT-AA-----CTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * * * *
15486013 ATCGAATC-AGTTCGAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTGTTTCAAATCATTCTAACCT
473 A-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATT-GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCT
* * * *
15486076 TTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAA---T-TT----AT----T-A-AC---
535 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** * **
15486124 -----T--T-TTGAAAAATAAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAAATATGTCTACTGAATAGG
599 TTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTT---AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAA
* ** * ** *
15486181 TTAAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATC-ACTCTCAAATAATTATGATC-
660 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** * ** *
15486233 TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCGGATTAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15486298 TTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCATACCAGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA-AACAGTT
* * * * *
15486362 CAAATAGTTAGGACTATTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTCT-ACACTTTTGTTTAGTCAT
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * *
15486426 AAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAAAAATACTAATTTATTAA-CTTT
193 AAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * *
15486490 CAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA-CAAGTTGAAATAGAT
255 C-AAAAATTAATAAGT-AGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAA-TTCAAATAGTT
* * * *
15486554 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATT
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
15486618 GTTTCTACTCATAAAAACCTATT-TGATATAAAATAATCT-ACTTTATTAATATTTC-AAAAATT
379 GTTTCTA-TTATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATT
* * * * * * * *
15486680 ATTAAGC-AAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TCAAACTAGTTCAAATAGCTACAACTGCTT
441 AATAA-CTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACT-ATT
* * ** * * * * * * * * ** *
15486743 AAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA-TTTTTATTTTATCATAAGATAATTATTTCTGATCA
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCA
* * * * *
15486807 TACAAGCTTATTGAGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATGTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
568 TAAAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
** * *
15486872 ATTTAAAAAATAAATGTGTGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAATCAGTTTAAATA
631 -TTT-AAAAATAAA--T-T-T----G-TTTACCAAACAAAT-T-C--A---AAT-A-ATT--AT-
* * * ** * *
15486937 GTTAATTCTATTGGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTCTAACCT
673 G---A--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * *
15486982 TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTC-GAAGAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTA
* * ** * ***
15487046 ATTTATTAA-ATTTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATATTTAC-ATTTATTGAAC
63 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-CTGTTTACCAAAC
* * * ** * *
15487109 AAGTTCAAACAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCCATTGAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTG
125 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * *
15487174 TCACAAAACAATTGTTTCAGTTTAAAAAAG-TTTTTCCAAAGTAAAATAATATTACTTTATTAAT
189 TCATAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATAGTAATTTAATAAT
* * * * ** * * * *
15487238 A-TTCTGAAGATCAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATAGAATCACTTCAAAAAA
251 ATTTC-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAG
* * * * **
15487302 TTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAATTAA
313 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* ** * * * ** ** *
15487366 TTGTTTTTCAACATACAAGCTTATT-TGAACTAAAATCAGTATTACCTT-TTGTTTTGTCATAAA
377 TTGTTTCT-ATTATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAAT-AATATAAATTTATTAATAT-TC--AAA
** * **
15487429 ACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTTTAAATAAA-AAATACTAATTTATTAATATTTCAAG
436 A-AA---TTAAT-AAC--TAAAG---A-TTTAAA-AAATAAAT-CT-ATTTACCAA-A---CAAG
* *
15487493 AACTAGTACAAGATTCAAAAGATA-AATTATTTGCTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG
483 ---T--T-CAA-A-T----AGTTATAACTA--T--TGAA-CAA-T----TA--T-T---TATTT-
* * * **
15487557 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCAT
519 -A-AA--ATC-A-TT---A-TG-----ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCAT
* * * ** * * * *
15487622 ATAAGTTTATTTAG-ATAAAATAATAAAAAATTAATAATATTCTAAAAATTCATAACTAAGAGAT
569 AAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG-T
* * ** * * * * * * * * *
15487686 TTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACTAGTTCAAACAGTTAAGACAATATGAAAAAATATCTATT
632 TT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* *
15487751 CCAAATTGTTATTACCT
696 TCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *** *
15487768 TTTGTTTTGTAAT-AAACAAATTATTTCAGCTCATCCAAGTTTATTTGTAATAAAATAAAACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** *
15487832 TTTTTTAATATT-TCAAAATTTTAA-AAGTAACAAATTTAAAAAA-AAATTCTATTTAATGAACC
64 TTTATTAATATTCT-AAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTT-ACCAAAC
* * * * * * * * * *
15487894 AATTCAAAAAATTCTAACTGTTTGAACAATTATATATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT
125 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * * *
15487959 CATAAAATAATTATTTCTATTTATGCAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAAGAT
190 CATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
** * * * * * *
15488024 TTTGACAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCACTTCAAATAGTTA
253 TTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACGAATCAATTCAAATAGTTA
* * * * * * * ** *
15488089 AGAATGTGTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGGCCTTTTACTTT-GTTGTAAATCAATT-
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAATTG
* *
15488152 TTT-TAGCTCT-TACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
380 TTTCTA--T-TATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAAAT
* * * * *** * * * *
15488213 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGTTGAACCAA-TTCAAATAATTGTGACTATT
440 TAATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * * * * * ** *
15488277 ACAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTTGCCATAAAACAAATGTTTTTGGTC
503 -GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTC
* * * ** * *
15488342 ATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-
567 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * *
15488404 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAATTAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTTA
631 TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA-TCTA
*
15488469 TTTCAAATTGTTATGACCA
694 TTTCAAATTGTTATGACCT
* *** * * *
15488488 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTG-TTCATAC-AGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCCA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTGATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* ** * * * * ** * *** * **
15488551 ATTTATTAATATTTTGGAACTTAACAAGCAATG-GATTTAGAAAATGTATTTGTAGGCCTGATTA
63 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACA
* * * * * * * * *
15488615 GTGCTAACAGTTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGGTTTATC
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
15488680 ACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTC-AGAATAACATAATTCTAATTTATTAATA-
191 ATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * *
15488743 TT-ATAAAATTAATAAGCA-AGAATTTTAAAAAA-GAATCTGTTTACAGAA-CAAGTTCAAATAG
253 TTCA-AAAATTAATAAGTAGAG-A-TTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAA-TTCAAATAG
* * * * * * * * * *
15488804 TTATGACTATTTGTATAATTATCTATTTTAAATTACTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
313 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* * * * *
15488869 TTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTCAAATCTATTTATAGAATAAGT-TCAAATAGTTATGACTA
378 TGTTTCTATT-ATACAAGCTTA-TTCAGA---A--TA-A-AATAA-TAT-AAAT--TTATTAATA
** * * *** * ** * *** * * *
15488933 TTTGAATAATTATTTGTTTCAA-ATCATT-ATGACTTTTTGT-TTTATCATAA-AA---C-AATT
430 TTCAAAAAATTA-ATAACTAAAGAT--TTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATA
* * * * * * ** * *
15488990 GTTGT---TGTTCATACAAGCTTAGTTGGA-TTAAAAT-AATATTAGTTTATTAATATTTTGACA
491 GTTATAACTATTGA-ACAA--TTA-TT-TATTTAAAATCATTATGA-CCT-TT--TGTTTTGTC-
* ** *** *
15489050 ACTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAAATAAATATGCTTATTGAACAAGTTCAAATAGTAATAACTA
546 A-TAA-AA-CAATTG-TTTAAGTTCATAAA-A-GCTTATT---C-AG----AATA-AAATAA-TA
*** * * * * ** *** *
15489114 TCTAAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTCGACATAAAACAATTATATTAG
595 -CTAATTTATTA-ATATTTAAAAAT-TAAT-AAGTAAGAGTTT----A-AAAATAA--AT-TT-G
* * * * * * * ** * *
15489178 TTCATATAGGCTTATACGAAGTAAAATAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATT
647 -T--T-TA--C-CAAACAAATTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATT-AT--CT-----ATT
* *
15489243 TAAAAAATGAAGTTGTTTATCGAACAAGT
696 T----CA--AA-TTG-TTAT-G-AC--CT
* * * ** * * **
15489272 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATACAAGCTTATTTTAAATA
1 T----TTGTTTTGTC-A--T-AA-AACAAT-TGTTT--GAT--TCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * *
15489337 AAATAATA-TAAATTGACTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAA-AAATTTTAAAAAATAAATCT-
52 AAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTG
* *** *
15489399 ATTATTTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
115 TTTA-CCAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* *
15489464 CTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTACTCATAAAAACTTATTC-AGAATAAAATAAT-GC
178 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAG-
* * * * *
15489527 TAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-C
239 TAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATC
* * * * ** * ** *
15489591 AAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGTTCTTTTGTTTT
302 AA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTA
* * *
15489655 GTCATAAAACAATTATTTCTATTAATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
365 GTCATAAAACAATTGTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
* * * * * *
15489719 AATTCTAAAAATTAGT---TGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
428 TATTCAAAAAATTAATAACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * ** * * ** *
15489781 CA-AGTCCATTTGAACTATTACCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAATAAT
493 TATA-ACTA-TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
15489845 TGTTTTTA-TTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATT
556 TG-TTTAAGTTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATT
* * * * ** * *
15489908 --TGA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCGAACCGATTCAAATAGTTATAACTATTTG
619 AATAAGTAAGAG-TTTAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * *
15489970 AACAAGTATCTATATCAAATCAG-TATGATC-
682 AACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCT
* * *** * * * *
15490000 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTGGAGT-AAATATTGCTAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *** * *
15490064 CTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAACAATAAATATATTTGTTGAACCTGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAACAGTT
* * * * * * *
15490129 CAAGTAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACTTTTTATTTAGTCATA
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * * *
15490194 AAATAATT-TTTTCAGTTCTTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAATT-
194 AAACAATTGTTTT-A--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTC
* *
15490257 AGAAAATTAATAAGCATG-GAATTTAAAAAA-AAAATTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
256 A-AAAATTAATAAGTA-GAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * ** *
15490319 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGGCCTTCTACTTA-TCATAAAAAAATTGT
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * * ** *
15490383 TTC-AGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATTAAGTAATAT-TCTTTATTAATATTTC-AAAAATTG
381 TTCTA-TT-ATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTA
* * ** * * * * ** *
15490444 AGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTCATCAAATAAGCTCAAATAGTTATGGCCATTTG
442 ATAA-CTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTG
* * * * * * * **
15490508 AACAATTATCTAATTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTGTCATCAAACAATTATTT-TTTATCG
504 AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGT-TC-
* * *
15490572 A-AAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AG-G
567 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * ** * * * * * *
15490634 -----AGAT-TATCTGTTTACTGAGCTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATATT
631 TTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** *
15490693 TGAAATCATTATAACCT
696 TCAAATTGTTATGACCT
* ***
15490710 TTTGTTTTGTCA-AAACACAATT-ATTGATGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTGA--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * **
15490773 GTGTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAAAAATTTATTTGA-TGAACTA
63 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAAC-A
* * * * *
15490837 GTTCAAATAGTTAAGGCTATTTGAATAATTAGCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTT
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * ** *
15490902 GTAAAACAAATAT-TTTTGTTCACATAAGTTTGTTAGAAATAAAATAATTTTAATTTACTAATAT
191 ATAAAAC-AAT-TGTTTT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
** * * * * *
15490966 TTTGAAAATTAATAA--A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTTAATTAGTTAT
253 TTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATC-AATTCAAATAGTTA-
* * * ** *
15491028 A-ACAATTTGAACAATTAGT-TATTTCAAATCGTTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
316 AGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
15491091 TTTCTATTAATACAATCTTATT-TGAAATAAAGTATTGCT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTA
380 TTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* * * * * ** * * * * *
15491154 ATAAGTGACAA-ATTTAAAATATGAATATGTTGGCCTGATCAAG-GCAAATAGTTATGACTGTTT
442 ATAACT-A-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATAACT-ATT
* * * * * *
15491217 GAAAAATTATTTATTTCAAATGATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTC
** * * *
15491281 ATAAAAGCTTATTTGGAATAACATAATTCGAATTTATTAATATTT-AAAA--AAT---T-A-A--
567 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGT
* * * * * *
15491336 -T--AAAT-AA-GTGATTTATCAACCAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTAT
632 TTAAAAATAAATTTG-TTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC-TAT
* * *
15491395 TTCAAATCGCTATAACCT
695 TTCAAATTGTTATGACCT
** * * * * *
15491413 TTTGTTTTGTCACTAAATTATTTTTTTCATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAA
1 TTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTGATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15491477 TTTATTAATATTC-ATACAATTAATAAGTAAAACA-TTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATAAG
64 TTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAG
* * ** *
15491540 TTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
15491605 TAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGC-TATTCGGATTAAAATATTATTAATTTATTTATATTT
192 TAAAACAATTG-TTTT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * *
15491669 -AGACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAG--A
255 CA-AAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGTTA
* * ** * * *
15491730 CATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTG
316 -AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
* *** * * * * *
15491795 TATC-AGTTCATATTGGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTACTAATATTCTAAAAGTTA
380 TTTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* * * * * **** *
15491858 ATTAGTAAGAGATTCAAAAAATAATTCTTTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
442 ATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGA
** * * * * *
15491923 GGAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCATTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
505 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCA
* ** * * * *
15491987 TACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAT
568 TAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
15492051 TTTAAAAAATAAAATCTATTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
631 TTT-AAAAAT-AAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTA
*
15492116 TTTCAAATAGTTATGACCT
694 TTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * * **
15492135 TTTGTTTAGTCATAATCCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
15492200 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTGAGTA-AGT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CA-AACAGT
* * * * * * **
15492264 TCAAATAGTTATCACTATTTCAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATTATCTTTCATTTTGTCA
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15492328 TAAAAAAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTAATTAG-AATAAAGTAATACTAATTTACA-AATA-
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTA-ATAATAT
* * * * *
15492390 TTCTAAAAATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAGTTCAAATACT
253 TTC-AAAAATTAATAAGTA-GAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGT
* * * * * ** * *
15492455 CATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTCCTATTTTGTCATAAAACAATT
314 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * ** * **
15492520 GTTTATGTTGA-AGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTTAAAAATT
379 GTTTCTATT-ATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATT
* * * * * *
15492583 AAT-A--AGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTG
441 AATAACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTG
* * * ** * * ** ** * ***
15492644 AACAATTATCTATCTCAAATTGTTGTGATC-TTCATTTTGTTGTAAAACCATTGTTTCTTTTCAT
504 AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCAT
* ** * * * * *
15492708 ACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATATTCTAAAAGTTAATAAATAAGAGAT
569 AAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG-T
* * ** * * * ** ** * ** * *
15492773 TTAAAAAATAAATGTGTCTGTCAAACCAGTTGAAATGGTTAAAATTATTAAAATAATTTTCTATT
632 TT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * *
15492838 TCAAATCATTCTGATCT
696 TCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *
15492855 CTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTCATTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAAAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *** *
15492920 TTATTAACATTCAAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATTGAACAAA
65 TTATTAATATTC-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
*
15492985 TTCAAATAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCT-TTAT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTA
127 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTT-
* * * * * * *
15493047 GT-ATAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATAT-GAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
188 GTCATAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAA
* * ** * * * *
15493110 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTGAACCAGTTCAAATAG
250 TATTTCAAAAATTAATAAG-TAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAATTCAAATAG
* * * * * * ** *
15493175 TTATGACTGTTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATT-ATC-TTTGTTTTCTCATAAAAATA
313 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAAACA
* * * * * **
15493238 ATTGTTTCTAATCATACAAGCATATT-TGGATGAAAATAATACTAATTTTA-TAATATT-TTAAA
376 ATTGTTTCT-ATTATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAA
* * * * *
15493300 ATTAAT-A--AAATATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTA
438 ATTAATAACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTA
* ** * ** * ** * * * *
15493360 TTAGAATAATTATCCATTTGAAATTGTTCA-AAATTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTTAG
501 TT-GAACAATTATTTATTTAAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAG
* *
15493424 TTCATACAAA-CTTATTC-GATATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATTAATAAG
564 TTCATA-AAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--TAAAAATTAATAAG
* * * * *
15493487 CAAGAGATTTGAAAAAAATAATTTTTTTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCA
625 TAAGAG-TTT---AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * **
15493552 ATTATCTATCTAAAATCATTATGACCT
686 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15493579 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCATAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
15493644 TTATTAATATT-TCAAGAA-T--TAA-TAACATATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAAT
65 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGT
* * * * * *
15493704 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTT-TATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGCTCTATCA
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** ** * * * * *
15493768 TAAAATTATTGTTTCTATTCATTCAAGCTTCTTTGAAATAAAATAATACTAATTCAGTAA-ATTT
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * *
15493832 CCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAA-AAA-TTGATTTGTCG-AGCTAGTTCAAACAGT
255 -CAAAAATTAATAAGT-AGAGA-TTTAAAAAATAAATTTG-TTT-ACGAATC-AATTCAAATAGT
* * * ** * * * *
15493894 TAAGACTATATGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTAGTTTTGTCATAAAACAATT
314 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * *
15493959 ATTT-TAGCTCATACAAGCTTAATC-GAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
379 GTTTCTA--TTATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAAAT
* * * * * *
15494021 CT-ATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGAACCATTTCAAATA---AT---TA-T
440 -TAATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * * **
15494078 -AAC-------TATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATCATTTCAA-TTC
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTC
** * * * * * *
15494134 ATATGAGCTTATTTA-ATGTAAAATAATGCTCATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAGA
567 ATAAAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * * * **
15494198 GAATTAAAAAAAGAATTTGTTT----ATTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAGTAATTATCT
630 G-TTTAAAAATA-AATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
* ** *
15494259 ATTTTAGAA-CATTATGACCC
693 ATTTCA-AATTGTTATGACCT
* * **
15494279 TTT-TTTTGTCAT-AAACAATTGGTTAT-ATTCATGCAAGTTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-
* * * ** * * ****
15494339 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAA-AAATAAAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAT
62 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-
* * * * ** * *
15494403 GTTTAAATAGGTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTCTGTTTTGTC
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * *
15494468 ATAAACCAATTGTTTTTGTTCATCCAACCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTT-AT-TTATT
191 ATAAAACAATTG-TTTT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATT
* * * * * **
15494530 CCAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-AGCGGGTTCAAATAGTTA
254 TCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATC-AATTCAAATAGTTA
* * * * * * ** * * *
15494594 TGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGT
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
**
15494659 TTCTATTCATACAAG--T-TT--G-------T--TCGAAA--TA--AA-A--C--------AAT-
381 TTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA
* * * * * *
15494694 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTA-AGGCTATATGAAT
445 ACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT-TGAAC
* * * ** * * * ** *
15494758 AATTA-TCATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAAATATTTTTGTTCATATA
507 AATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAA
* * * * *
15494822 AGTTTGTTC-GAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTA
572 AGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT-
* * * * * * * * * *
15494883 AAAAATAAAATCTGTTTACCAAACCAGTTTAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTG
634 AAAAAT-AAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
**
15494948 AAATTGTTATGACAA
698 AAATTGTTATGACCT
* * * * * * * * * *
15494963 TTTATTTTGTCAT-AGACAGTTGTTTCTACTAATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * ** * *
15495027 TTATTAATATTCTAAAAGTTAATAAGTAACAGATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCCTGACCAGT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAGT
* * * * ** *
15495092 GCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTTTTAACAC
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
** * * ** ** *
15495157 AAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAGCTTATTTTG-AATAGCATAATTCTAATTTATTAATATTT
193 AAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * *
15495221 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
255 CAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGTTAA
* ** * * * * * *
15495285 GACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAGAAAATAATTTTT
317 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
15495350 TCTCTTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATATAAATTTATTAATATTC-AGACATTTATA
382 TCTATT-ATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA
* * * * ***
15495413 AGTAAAAGATTT-AAAAAT--A---AGTTACCCAATAAGTTCAAATAGTTATGGTTATTTGAACA
445 ACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAACA
* * * * * ** *
15495472 TTTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAA
508 ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAAA
* * * * * *
15495537 GCTTATT-AAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAACTAATAAGTAAAAGGTTTC
573 GCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGA-GTTT-
* * * * *
15495601 AAAAATAAATATT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-AATCATTTGAATAATT-TCTATTT
634 AAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTT
* *
15495663 CCAATTGTTATCACCT
697 CAAATTGTTATGACCT
* * * * ** * *
15495679 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTATCAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAACAATATTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15495743 TTTATTAATATACTAAAAATTAATGAGTTAAGAGA-TTGAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAA
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
* ** * * * * *
15495807 TTTAAATAGTTATTCCTATTTAAATAGTTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15495872 AAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTCG-AATTAAATAATA-TAAATTTATTTATA-
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAGT-AATTTAATAATAT
* * * * * * * *
15495934 TTCCAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAACAATAAATATGTTTTCTG-AGCATGTTCAAATAGTTA
253 TTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCA-ATTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
15495998 TGACTATTTGAACGATTACCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAACCAATTG
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
* * * * *
15496062 TTTCTGTTCATAGAAGCTTATT-TGAAATTAAATAATA-ATAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
380 TTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATA-AATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* * * * *
15496125 ATAAATAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACGAGTTTAAATAGATT-TGAA-TATT
442 ATAACT-AAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTAT-AACTA-T
* * * * * * ** * *
15496188 TAAAGAATTATCTATTT-AAGTCATTATAACCTTTTGTTCTACCAAAAAATAATTGCTTT-AGTT
502 TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAAGTT
* * * * * *
15496251 CATAAAAAC-TAATCCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCATG
566 CATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG
** * * * * * *
15496315 AGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCCAAACCAGTTCAAATATTTATGACTATTTAAACAATTATC
629 AG-TTTAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * *
15496380 AATCTCAAATTGTTACGATC-
692 TATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ***
15496400 TTTGTTTTTTCATAGAACAATTGTTTCTGATT-ATACAAGCTTATT-TTGATAAATATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA-ATAATACTA
* * * * **
15496463 ATTTAATAATATT-TCAAAA--ACTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAG
63 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAG
** * * * * ** * *
15496524 TTCAAATAGTTAAAATTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
15496589 TATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAA-CTTA-TCAAGAAGAAAAAAATACTAATTTATTAACAT
192 TAAAACAATTGTTTTA--TCATA-AAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * * *
15496652 TTGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTAAAATAGT
253 TTCAAAAATTAATAAG-TAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGT
* ** ** * * *
15496716 TATGACTATTTGAACAATTATAGATTT-AAAGTTGTTATTG-CCCTTTGTTTTGCCATAAAACAA
314 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATT-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* * * *
15496779 TTATTT-TAGTTCATTA-AGGCTTA-TCAAAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTC-AA
377 TTGTTTCTA-TT-A-TACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * *
15496839 AAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATC-AGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGG
436 AAATTAATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-A
* * * *
15496902 A-TATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATTG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTT
497 ACTA-TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
***** * * * * *
15496965 TTTCAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAA
560 TAAGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAA
* * * *
15497030 G--AGA-TTTAAAAA-AAATTCTATTTACCAAACCAATTGAAATACTTATGACTATTTGAACAAT
624 GTAAGAGTTTAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
15497091 TATCTATTTCAAATTGTTAT-ACCTT
688 TATCTATTTCAAATTGTTATGACC-T
* * * ** * *
15497116 TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15497180 TTAGTAATA---T-----TT--T--G-AA-A-A-TAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTT
* * * * * * ***
15497229 TAAACAATTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * ** * *
15497294 AAATAGTTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTGAAATGGAATAA-AGCTAATTTATTACTATTTC
194 AAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAG-TAATTTAATAATATTTC
* * * * ** *
15497358 AAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTTACCGAACCAGCTCAAATAATTATA
256 AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTTA-A
* * * ** * *
15497422 -ACAATTTAAACAATTATCTTTTTCAAATTGTTATT-ACTTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTG
317 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAATTG
* * * * * * * * *
15497484 TTTTTGTTAATATAAGTTTGATTGA-AATAAAATAATACT-AATTTGTTAATATTTAGAAAACTA
380 TTTCTATT-ATACAAGCTT-ATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* * * * * * *
15497547 ATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGA
442 ATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGA
* * * * ** * *
15497612 ATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATTTTTTATTTTGTCATTAAACAATTGGTTCT-A-TTCA
505 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAAGTTCA
** ** * * * * * *
15497675 TACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAATTAAGAAA
568 TAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAG-AG
* ** ** ** * * * * * * **
15497740 ATTAAAAA-ATAATTCTAATTGTCGTACCATTTTAAGTAGTTAAT-ACTATATGAATGATTATCT
631 TTTAAAAATA-AATT-TGTTTACCAAACAAATTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCT
15497803 ATTTCAAATTGTTAT-ACCCT
693 ATTTCAAATTGTTATGA-CCT
* * * ** *
15497823 ATTGTTTTATCATTAAACAATTGTTTTG-TTCATACAAGCTTATTC-GGATCAAAATAACACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAA
* * * **
15497886 TTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAATTAG
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAG
* * * * ** * * *
15497950 TTCAAATGGTGAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * * *
15498015 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAATTAATACTAATTTATTGACA-TT
192 TAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * *
15498079 CAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTT
255 C-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGTT
** * ** * * *
15498143 ATCACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTT-GTCATAAAATAATT
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATT
* ** * ****
15498207 GTTTC-AGTAGTA-ATAATTTCATTAGACCAGAA-ATAAA-AATATTAATTTATTAATATTTTCT
379 GTTTCTATTA-TACA-AGCTT-ATT----CAGAATA-AAATAATATAAATTTATTAATATTCAAA
* * * * * ** * * *** *
15498268 AAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATTAGTTAAAATAATTACGGCC
436 AAATTAATAACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACT
* * * * * *
15498333 ATTTGAAC-GTTCATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAAATGGTTT-
500 A-TTGAACAATT-ATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTA
* * * * * *
15498396 -TTATCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATAT
562 AGT-TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--AAAAATTAATAA
* * * * * * *
15498460 GTAAGAGATTTAAGAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAA
624 GTAAGAG-TTTAA-AAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
** * *
15498525 TTATC-AGTCTT-AAATCATTAAGATC-
687 TTATCTA-T-TTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *
15498550 TTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTGA-TCATAAAAACTTATTC-GATTAAAAAAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
15498613 TTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAG
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAACAG
* ** * * * * * * *
15498677 TTCAAATATTTAAAACTATTAGAATAATTATCTA-TTCTAAATCGTTCTAACCTTTTGCTTAGTC
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * * *
15498741 A-AAAGTACTTATTTCATATCTTAAAAG-TTATTC-AGAATAAAATAATCA-AAATTT-ATAAAC
191 ATAAAACAATTGTTT--TATCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAT-AGTAATTTAAT-AAT
* * * *
15498801 ATTTGAAAAATTAAGAAGAAAAAGATTTGAAAAAAATAAATCTT-TTTATCGAA-CAAGTTCAAA
251 ATTTCAAAAATTAATAAG-TAGAGATTT--AAAAAATAAAT-TTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAA
* * * * * * * * * *
15498864 TAGTTATGACTAGTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAAG
310 TAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC
* * * * * * *
15498929 ATTTTGTTTC-AGTTTATATAAGCTTATCCATAATAAAATAATGCT-AATTTCTTAATATTTC-C
375 A-ATTGTTTCTA--TTATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATA-TTCAA
* * * *
15498991 AAAATTAATAAGC--AAGAGTTTAAACAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATT
435 AAAATTAATAA-CTAAAGA-TTTAAA-AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA
* * ** *
15499054 ACTATTTGAGCAATTTTTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTT
497 ACTA-TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
15499118 CAGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTCTAAAAATTACTAAG
561 AAGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
15499183 T--GA-TTTAAAAAATTAATTTGTTTGCTAAATC-AATCCAAATAGTCATGTCCATTTGAACGAT
625 TAAGAGTTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
**
15499244 TATCTATTTCAAACCGTTATGACCT
688 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * * * * *
15499269 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG-TTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATTATATTGA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ** * * *
15499333 TTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAACCAAATCTATTTACTAAATAAG
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAG
* ** * * * * * *
15499398 TTTAGTTAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACTTTTGCTTTATCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15499463 TAAAACAATTGTTTCAGCTCCTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTT
192 TAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
*** * * *
15499528 CAAAAATTAAT-A--AGAGATTT-AAAAA-AAATCACTTTACCAAATCAGA-TCAAATAATTATG
255 CAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCA-ATTCAAATAGTTAAG
* * * ** * ** * *
15499587 GCCATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGTTATT-ATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTAT
318 ACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * * ** ** *
15499650 TT-T-TCGACATCAAGCTTATT-A-AATAAAATTATTATTACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAA
381 TTCTAT-TATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAA-TAATATAAATTTATTAATAT-TC--AAAA-AA
** * * * *
15499710 TTGTTTTTCAGCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTTATTAATATTTCAAGAATTAGTA
439 ---TTAAT-AAC-TA-AAG---ATTT--AA-AAAATAA-ATCTATT--TA---C--CAA--A--C
* ** *** * * *
15499775 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTA
480 A-AG--TT--CAAATAGTTATAACTATTGAA-CAATT---AT--TTAT------TT--A-AA--A
* * ** * * ** * * *
15499840 TCCATTTTAAATTGTTATAACGTTTTGTTCCATCATAAAATAATTATTTTTGTGCATACAAGTTT
523 T-CATTATGACCT-TT-T---GTTTTG-T-CAT-A-AAA-CAATTGTTTAAGTTCATAAAAGCTT
* ** *
15499905 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATCCATAAGTAAGATATTTAAAAAA
577 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGA-GTTT-AAAAA
*** * * * * * * * *
15499970 TAAATCCCTTTGCCAAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCG
639 TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
15500035 TTATGACCT
704 TTATGACCT
* * * ** * ** ** *
15500044 TTTGTTTTGTCATAAAATAAGTATTCCAGCTCATACAAATTTATTCGGAATAAAATAAAACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15500109 TTGTTAATATT-TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATAATTCTATTTACCAAAC
65 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT----AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
** * * * * * * *
15500173 TAACTCAAATAATTATAACTATTTGCACAATTATCTATTTTAGATCATTATTACTTTTTGTTTTG
125 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * *
15500238 TCATAAAACAATTGCTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTGATA
189 TCATAAAACAATTG-TTTT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATA
* * * * * * *
15500303 TTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAATCATTTCTAATAGTT
252 TTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTT
** * * * * ** * *
15500368 TTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATATTTTCTTTTA-TCATTAAACAATT
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAATT
* ** ** * * * * *
15500432 GGTTCTATTCATATTATTTTGTTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAACTTA
379 GTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* * *** *
15500496 ATAAC-CAAGAAATT-AAAAATAAATCTATTTGTTGAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATAT
442 ATAACTAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT-T
* ** * ** * * ** **
15500557 TAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT-TTTTTGTTTG
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCA
* * *
15500621 TACAAGCTTATTC-GAATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTTAAAAATTAAT-AGT-AGTAT
568 TAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAG-A-
* * * * ** ** * * *
15500683 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCATATGGTTAAAACTACTAGAATAATTATCTA
630 GTTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * *
15500748 TTTCAAATCATTTTCAACT
694 TTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15500767 TTTGTTTAGTCATAAAA-ATATTGTTTCGGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *** *
15500831 TTTATTAACATT-TGAAAAATTAATGAGAAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTACGTACCGAACAA
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-A
* * * ** *
15500895 GTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTC
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
15500960 ATAAAACAATTGTTTTAGTTAATATAAGCTTATAC-ATAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
191 ATAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGT-AATTTAATAATA
* * * * * *
15501023 TTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATCAGTTAAAATAATT
252 TTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAATTCAAATAGTT
* * * ** * * * *
15501088 ATGGCCATTTGAACAACAATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTG
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
* * *
15501153 CTTT-TGATCATACAAGCTTATTCTA-AACAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
380 -TTTCT-ATTATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATT
* ** ** * * * *
15501215 AATAAC---GGATTTAAAAAATAAATCTGGTTACTGATCCAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGA
441 AATAACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGA
** * * *
15501277 ACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCAA--TCA
505 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--AAGTTCA
* * ** * * * *
15501339 TAGAAGCTTATTCAG-TTAAAAATAATAAAAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG--GGAT
568 TAAAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * * ** * * * *
15501401 TTTAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATTTTTT
631 TTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* *
15501466 TAAAATTGTTTTGACCTTTTTTTTAAAATCAT
696 TCAAATTGTTATGA-C-------------C-T
* * * * **
15501498 TTTGACCTTTTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTAATATCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
1 TTTG------TTTT-GTCATAAAACAATTGTTTGAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * * * *
15501563 TCCTAATATATTAACATTC-AAAAAGTTAATAAGCAAGAGGTTTGAAAAAATACATCTATTTAAC
58 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACC
** * * * * * * *
15501627 GGACAGGCTCAAATAGTCATGACTATTTG---AATAAT-TATTTAAAATCGTTATGACTTTTTAT
121 AAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
15501688 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAGGTTTATCCAAAATAAAAATAAAACTAATTTAT
185 TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATAGTAATTTAA
* * * * * * *
15501753 TAATATTTCAAAAATTACA-AAGCAAGAGATTCAAAAAAATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCA
247 TAATATTTCAAAAATTA-ATAAG-TAGAGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTACGAATC-AATTCA
* ** * * * * * * *
15501817 AATAGTCACTACTATTTAAATAATTGTATATTTAAAATCATTATGCCCTTTTGTTTCA-TCATAA
308 AATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTT-AGTCATAA
* * *
15501881 AACAATTGTTT-TAGTTCAAATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATGTC
372 AACAATTGTTTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATA-AATTTATTAATAT-TC
* ** *** * * * *
15501944 -AAAAA-TAAAAAAGAAAGTGATTTAAAAAGGGAATATGTTTACCAAATCAA-TTAAAATAATTA
433 AAAAAATTAATAACTAAA--GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTA
** * ** * ** *
15502006 TGGCCATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGT-AT-AAA-AATT-T
495 TAACTA-TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
15502067 TTCA--TCATACACGCCTGTTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
559 TTAAGTTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * * * *
15502129 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATGTA-C---CAAA--C---T-AGT-T-CCTATTTGAAT
622 AAGTAAGAG-TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
* ** * *
15502182 AATTACCTATTTCAAATCATTATAACAT
685 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * * * *
15502210 TTTGTTCTGTTGTAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAAAACAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * * *
15502275 TTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTGTCAAAACAATT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAACAGTT
* * * ** * * * *
15502340 TAAACAGTTAAGACTACATGAATAAGTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATA
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* ** * * * *
15502405 AAATAATCATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--
194 AAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCA
** * * * * * * *
15502468 TGAA--AATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGC
257 AAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTTA-AGA
* * * * * ** * **
15502531 CT-TGTCAACAACTATCTATTTCGAATCGTTATT-AAATTTTGTTTGGTCATTTAACAATTGTTT
319 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * * *
15502594 TTGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAACACT-AATTTATTAATCTTTC-AAAAATTAATA
383 CT-ATTATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-ATTCAAAAAATTAATA
* * * * * * * *
15502657 AGT-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCTAACTAGCTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAA
445 ACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAACAA
* ** * * * * *
15502721 TTGTAAACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAA
509 TTATTTA-TTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAAA
* * * * * *
15502785 GCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTCAAAAATTCATAACTAAGAGAATTA
573 GCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG--TTT
* ** * * * *
15502849 AAAAATAAATTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATATTTAAT-ACTATATGAATAATTATCTATTTC
634 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* *
15502913 AAATCGTTACGACCT
698 AAATTGTTATGACCT
* * ** *** *
15502928 TTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATAC-TCCTTATTTGGAATAAAATAA-AATA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTG-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-
* * * *
15502991 AATTTATTAATATT-TCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACG
62 AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-
* * **
15503055 GGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACAATTATCTATTTCAAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTT
125 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACC-TTTTGTTTT
* * * ** * * * * * *
15503119 GTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATCTAAGTTTGTTC-AGAATAAAGTAATACTAATCTATTAA
188 GTCATAAAACAATTG-TTTT-ATCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAA
* * * *
15503183 TATTTC-AAAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAGTTCAAATAG
250 TATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATC-AATTCAAATAG
** ** * ** * * * *
15503243 TTATTACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTTATAAAATAA
313 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAA
* * *
15503307 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGACTAAAATAATACT-AATTAATTAATATTTC-AACAA
377 TTGTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAA
* * * * * * * * * * *
15503370 TTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATTTTTACCAAACTAGGTCAAATAATCATGACAATT
439 TTAATAACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-T
* * * * * * * *
15503435 TGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTTTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTT
502 TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTC
* * * ** *
15503500 ATATAAGCTGATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTATTAATCAAAAAATTAATAA-TAAGG
567 ATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * * * *
15503563 GATTTAAAAAATGAATATT-TTTACTGAACTAGTTTAAATAATTATGATCGT-TTT-AACACTTA
630 G-TTT-AAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGA-C-TATTTGAACAATTA
* * *
15503625 TCTATTTGAAATTGCTATAACCT
690 TCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *** *
15503648 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCT-ATTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A
* * * * * ** *
15503711 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTGTTTTCTGAGCATG
63 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-G
* * * * * *
15503775 TTCAAATAATTAAGACAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAGTATGACCTTTTGTTTTCTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
15503840 T-AAACAAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
192 TAAAAC-AATTG-TTTT-ATCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
** * * * * * * * * * * *
15503903 TAAAAAAATTAACAAGTAAAATATTTAAAAAACAAATCTATTTACTAAGCGAGTTCAAATAATTT
253 TTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATC-AATTCAAATAGTTA
* * * * * * *
15503968 TGACTATTT-ACACAATTATTTATGTCAAATCATTGTGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATT
316 AGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-CCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * **
15504032 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTTATATTCTGAAAAT
379 GTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-AT-A-AATTTATTAATATTCAAAAAAT
* ** * * * * * * ** *
15504097 TAATAAGTTGGAGATTTAGATAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTT
440 TAATAA-CTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TT
* * * * * * * *
15504162 AAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGACATTTTG-TTTGTGATAAAACAATTGTTTTTA-TTC
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAAGTTC
* * * *
15504225 ATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATAATAGTTT-TTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA
567 ATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * * *
15504286 -TTTAAAAACTAAATCT-ATTA-CTGACGTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-ATTATTT
630 GTTTAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAAC-AAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
* *
15504347 ATCTCAAATTGTTATGATC-
693 ATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** * * *
15504366 TTTGTTTTGCCATAAAATAACTGTTTTTG-TTCATACAAGCTTATTCTGAGTAAAATATTGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
** * * * * ****
15504430 GCTAGTAGTATTCTAAACAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAG
64 TTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
* * *
15504495 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTAT-TA--TC--GT--TT-TGACCTTTTGTTTAT-TC
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTC
* ** * * * * ** *
15504551 ATAAAATAATTGTTTTAGTTTGTACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATTTCTTCAACAT
191 ATAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAAT-AATAT
* * * * *
15504615 TTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAACTAAATTTGTTTAC---T-AA---ACA-AGTTA
253 TTCAAAAATTAATAAG-TAGAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACGAATCAATTCAAATAGTTA
* * * * * *
15504672 TGGCTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTT--T--T----CAA----
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * * *** *
15504724 TTC----AT-CAAGGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTGAAAATTGATA
381 TTCTATTATACAA-GCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA
* ** * ** *** ** * ** *
15504784 AGTTGGAGATTTAAAAAATGAAT-TAGCATATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAAC
445 A-CTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAAC
* * ** * *
15504848 AATTATCTATTTTAAATTGTTATGAACATTTGTTTTGTCAT--AA-AA--G---AA----AT---
507 AATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAA
* * * * * *
15504898 -G-TT-TT-----T-AATTATTACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATTAG--ATA-TTTTA
572 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAA
* * * * * * * * *
15504951 AAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AAGCAATTTTTTATTTCAA
636 AAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAA
* *
15505015 ATTGTTGTGACTT
700 ATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15505028 TTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCTG-TTCATATAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTGA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * ***
15505092 CTTACTAATATTTTAATAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAACTAAATATGTTTATTGAACTAG
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
* * ** * ** *
15505156 ATCAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATGGTTATGACCTTTTGTTTTGTGA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
15505221 TAAAAAAATTATTTTAGTTCCTATAAGCTTATT-GAAA-AAAATAAGACTAAGTTATTAATATTA
192 TAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATT-
* * * * * * * *
15505284 T-GAAAATTAGTAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAAT-AAGTTTAATTAATTA
254 TCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAATCAA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * *
15505347 TGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTT
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-CA---A
* * * * ** * * *
15505412 TTTTTTCTGTTCGTACAAGCCTATTTTGGATAAAATAATACAAATTTATTAATA--AAAAGATAA
377 TTGTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAA-A-AA
* ** * * * * *
15505475 TTAATAAGTAAA-AAATATAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATATTTATGACTATA
439 TTAATAACTAAAGATTTA-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAT-
* * * ** * * * * *
15505539 TAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTCA-TT
502 TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAAGTT
* * * * * *
15505603 CATACAAGCTTATACGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAA
566 CATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT--AA
* * * **** * * * * *
15505668 AATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAATTC-CA-AGTCATGACTATTTAAATAATTATCT
628 GAGTTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
* *
15505731 ATTTCAAATTATTGTGACCT
693 ATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** *
15505751 TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-TATTTTAGTT-GAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** *
15505814 TTTATTAATATTCTAAAAATTATTGAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAATG
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACA-G
* * * * * **
15505879 TTCAAATAGTTCTGATTATTTGAAC-ATATATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGAA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
15505943 ATAAATCAATGGTTTCTATTCATAAAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAAT
191 ATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * * *
15506007 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAATCGAGTTCAAATAGCTA
253 TTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATC-AATTCAAATAGTTA
* * * *
15506072 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTG
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
15506136 TTTCTATTCATACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACT-AACTTATTGATATTCTAAATATTA
380 TTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* ** * * * *** * * * * ** ** * *
15506199 ATAAGTTGGAGATATAAGAAATAAGTCTAGACATCGAACTAGTTCAAAAAACTATGTCCATTTAA
442 ATAA-CTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGA
* * * * * *
15506264 ACTATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAA-AGTATTGCATTT-A-TT
505 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTG--TTTAAGTT
* *
15506326 CATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG
566 CATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
15506388 A-TTTAAGAACTAAATTTGTTTATCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCT
629 AGTTTAA-AAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
*
15506452 ATCTCAAA-TGTTATGA---
693 ATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** *
15506468 -----TCT-T--T------A-T-TTT-A-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATATTGTTAAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * **
15506515 TAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAATTAGTTC
66 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAGTTC
* * * * *
15506580 AAATAGTTAAGACTA-TTAAAGCAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATA
130 AAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** *
15506644 AAATAATT-TTTTCAATTCATACATAA-C-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA-C
194 AAACAATTGTTTT--A-TCATA-A-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATT
** * * * *
15506705 TCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTTAAAAATAAA-TCGATTTACTAAAT-AAGTTCAAATAG
254 TC-AAAAATTAAT-AAGTAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTG-TTTAC-GAATCAA-TTCAAATAG
* * * * * * *
15506768 TTATGAC-ATTTAAACAATTATTTATTTAAAATAACTATGACC-TTTGTTTTA-TCATAAAA-AA
313 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAA
* ** * * *
15506829 TTGTTT-TAGTTCATAAAATTTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTC-AAAA
377 TTGTTTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * * *** *** * ** *
15506891 ATTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAATAAGTC-AGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTATGGCCA
438 ATTAATAA-CTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * ** * * ****
15506954 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA
501 -TTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGT
* * ** * * *
15507019 TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAGG
565 TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
15507083 CGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAAC-----C-----AGT-T-CCTGTTTGAACAATTATT
629 AG-TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
15507136 TAATTCTAATTGTTATAACCT
692 TATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * **
15507157 TTTGTTCTATTTC-TAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTGTT-T-TGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * **
15507221 ATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAGTAG
63 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAG
* * * * * * * ** *
15507286 TTTAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCTAATCGTTATGACCTTTCATTTTGGCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
15507351 TAAAACAATTGTTTCAATTCTTACAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * * * * *
15507416 CAAAAAGTAATAAGT---GATTTAAAAAGTAAATTAGTTTATCAAATTAATTCAAATAATTATGG
255 CAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * *
15507478 CTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TGATA
319 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-T-
** * * * * **
15507541 TT-TGAACATTCAATCTTATTC-GAAATAAAAGAATACT-AATTTATTAATCTTTGAAAAATTAA
381 TTCT-ATTATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAA
* * * *
15507603 TAAGTAAAAGCTTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTTAAATAG-----ACTATTTGAA
443 TAACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAA
* * * * ** * * * **
15507662 CAATTGTATAATTCAAATTGTTATAACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTCGTTCATA
506 CAATTATTTATTTAAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATA
* * * *
15507727 TAAG-TCTATTC-GTAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTACAACAATTAATAACTAAGAG
570 AAAGCT-TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AA-AATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * * * * ** **
15507789 AATTAAAAATAATTTTGTTTGTCGAACTATTTCAAATATTTAAGACCGTAAGAACAATTATCTAT
631 -TTTAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
***
15507854 TTCAAAACATTATGACCT
695 TTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ** * *
15507872 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATATTAA-CTTAATCGGAATAAAATAAAACAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15507936 GTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAA-TAATAGATTTTAAAAAATAATTTTGTTTACTTAACC
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAAC
* * * * * * ** *
15507999 AATTCAAACAATTATAACTATTTAAACAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
125 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * * * *
15508064 TAGAAAACAAATT-TTTT-TTATATAAGTTTGTT-TAGAATAAAGTAATACTAGTCTATTAATAT
190 CATAAAAC-AATTGTTTTATCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * * * * * *
15508126 TTCTAAAACTAAT-A--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTAATCAAACCAATTCAAATAGTTAT
253 TTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTTAA
* * * ** * * *
15508188 GACTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCATTATAATTTTTTGTTTAATTATAAAACAATTAT
317 GACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * *** * **
15508252 TTTTATTCATACAAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTGATAATTGCTA
381 TTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA
* * * ** ** * * * *
15508317 A-AAAAAATTTAAAATA-AAAGGT-TTTGTCATA-ATG-T--AATTGTT-T--CTATTCATACAA
445 ACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTGA-ACAA
* * * * * * * * * * *
15508372 --AATTAATCAAAATAAAATAAT-A-CTAATTTATTAATAT-TTTAAA-AATTAG--TAAGAATC
509 TTATTTATTTAAAAT--CATTATGACCT--TTTGTT-TTGTCATAAAACAATT-GTTTAAG-TTC
* * * * ** ** * * * **
15508429 TTAAAAACTAAATCTATTTATCGGACCAGTTCAATTAGTTATGCTTATGTGAATAATTAACTATC
567 ATAAAAGC----T-TATTCA--GAATAAAAT-AA-TACTAAT--TTAT-T-AATATTTAAAAAT-
* * * **
15508494 TCAA-ATTGTTAAGATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATA-TAAGCTTATTCA
618 T-AATA-AG-TAAGA-----G--TT-T-A-AAAATAA--A-TT-TGTT--TACCAAACAAATTCA
* * * * * *
15508557 AAGTAAAATATTG-CTAAATTAAT-AAAAGATAAACATGTTTGCCAAACCAAGTCAAATAGTTAA
664 AA-T-AATTA-TGACT--ATT--TGAACA-ATTATC-TATTT--C--A--AA-T----T-GTTAT
15508620 GA-CT
708 GACCT
* *** * * * * ** * ** *
15508624 ATTAGAACAATGATCCATTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTAGCCATAAAATAATTGTTTTAG
1 -TTTG--TTTTG-T-CA--T-AAAACAAT-TG----TTTGATT---CATACAA-GCTTATTCAAA
* * * * * **** ** * *
15508689 TTCATAT-ATGCTTATTTGA--AATAAAAAAAAAATACTAATTTGTTA-AGATTCAGAAACTTAA
49 ATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTCTAAAAAT--TAATAAGTAAGAGATTTA-AAA---AA
* * * **
15508750 TAAA-CAAGAAATTTTA-TAAA-A--T-AAATCTATTTATTGAAC-AAGTGCAA-ATAGTTATGA
107 TAAATC-TG----TTTACCAAACAGTTCAAA--TAGTTA-TG-ACTATTTG-AACA-A-TTAT--
* * * *
15508807 CTATTTGAACAAATATCTATTTAAAAAATATGACTTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTGAG
158 CTATTT---C-AA-ATC-A--T------TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-
* * * * * *
15508872 CTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTA
208 -TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-TA
* * ** ** * * * * * * * *
15508937 AAAATTTAAAAAAT-AGGTCATTTATC-AAGTTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTTAATAATTA
271 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAA-TCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTA
** * * * * * *
15509000 TCTATTTCAAAT-A-GATGCAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGC
334 TCTATTTCAAATCATTTTG--ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTATACAAGC
* * * *
15509063 CTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAATTAGTAAGTACGAGATTTAA
396 TTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAACTA-AAGATTTAA
* * * * * *
15509127 AAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTC--------CT-A-T-TTGAACAATTATCTATTTCAAA
458 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTGAACAATTATTTATTTAAAA
** * * * * * **
15509181 TCATTAAAATCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAA-TTCATTTAAGCTTATT-AGTAAT
523 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATAAAAGCTTATTCAG-AAT
* * * ** * *
15509244 AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
586 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTT-AAAAATAAATTTGT
* * * * ** *
15509309 TTGCCAAAGC-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGAC
648 TTACCAAA-CAAATTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
15509372 CT
711 CT
* * * *
15509374 TTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
15509439 TTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGTT
* * * * * * ** * * *
15509504 CAAATAATTATGGCCATGTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTGGTCATA
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * * * *
15509569 TAACAATTGTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTCA
194 AAACAATTGT-TTT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCA
* *** * * * * * * *
15509634 AAAATTAATATGTAAGAGATTTTTTTAAA-AAATCTATTTATTGAA-CTAGTTCAAATTGCTATG
257 AAAATTAATAAGT-AGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATC-AATTCAAATAGTTAAG
* * ** ** * * * *
15509697 ACTATTTGAACGATTGTAAATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTA-TCATAAAACAATTATT
318 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * **
15509761 TTTGTTCATACAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACT-AATCTAAAAATATTTC-AAAAATTAAT
382 TCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAAT
* * * * * * * * * * *
15509824 AATTAGTAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCTAACATGCTCAAATATTTAAAGACTATATGAA
444 AACTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT-TGAA
* * * * * * * * *
15509889 CAACTA-TCAATTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGAA-CTCA
506 CAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGTTT-AAGTTCA
** ** * * * *
15509952 TACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATAAATATTTAAAAAATTAATAAG--AGATT
568 TAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGT
* * ** * **
15510015 TTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAAC-CGTTCAAATAATTATGAATATTTGATTAATTATCTATT
632 TT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
*** *
15510079 TCAAATCACTATGACAT
696 TCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15510096 TTTGTTTTGTCATAAAATAAATATTTTTG-TTCATATAAGTTTGTTCGAAACAAAGTAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * *
15510160 TCTT-TTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAG
64 T-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AG
** * * * * * * * *
15510220 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAGTTATTTATTTTAAATTATTATTACCTTTTGTTCTATTA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
15510285 CAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
192 TAAAACAATT-GTTTTA-TCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAATATT
* * * * * ** * * *
15510349 TCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACTTGA-CCAAATAATCA
254 TCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAA-TCAATTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * * *
15510413 TGACTGTGTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGATTTGT
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * *
15510478 TTC-AGTTCATATAAGATTACTCAAAATAAAATAATAGT-AATCTAGTAATAATCAAAAAATTAA
381 TTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAA
* * * * *** * * *
15510541 TAA-TAAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTGTATTGAACAAGTTAAAATAATTATGACTATGTGA
443 TAACT-AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAT-TGA
* * *** * * * **
15510605 ACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATT-TTT-TCTAT-AT
505 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGT-TCAT
*
15510667 AGACAAGCATATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAA
569 A-A-AAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
15510729 AAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTAGCGAACAAGTTTAAATCGA-TATGACTATTTGAGCAATTA
628 GAG-TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAAT-AATTATGACTATTTGAACAATTA
* * **
15510792 TTTATTTCAATTTGTTATGATTT
690 TCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** ** *
15510815 TTTGTTTTTTCGTAAAACAACTACTTCT-ATTCATACAATTTTATTCAAATTAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
15510879 TTTATTAATACTT-TGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAACAA
64 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA-AAC-A
* * * * * * *
15510942 GTTCCAATAGTCATGACTATTTGAATACTTATCTATTTGAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTG-C
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
15511006 TATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATATAATAATACTAATTTATTATTA-
191 -ATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * *
15511070 TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGT
253 TTC-AAAAATTAATAAG-TAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGT
* * * * ** * * * * *
15511134 CAAGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTAATT-ACATTTTGATTCGTCACAAAACAAT
314 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* ** * *
15511198 TGTTT-TGATTCATAAAAAATTACTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAA
378 TGTTTCT-ATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAA
* * * * * *
15511260 -T--TAAC-AAGAGCTTTAAAAACTAAATCTATTAACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATT
439 TTAATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-T
* * * * * * * * * *
15511321 TGAACACTTATCTATCTCAAATCGTTCTGATC-TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTGTAG-C
502 TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTT
* * * * * *
15511384 CATACAAA-CTTATT-TGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAA
566 CATA-AAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * * * * * *
15511447 GAGATTTGAAAAATTAATATGTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTAT
628 GAG-TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
**
15511512 CTATTTCAAATCATTATGACCT
691 CTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15511534 TTTGTTTAGTCAT------A-TGCTT-A-T--T-C-A----A---AAAA-AAAATAATACTATTT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * *
15511578 TATTAACT-TTC-AGAAAATTAGTAAGCATGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAG
66 TATTAA-TATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAG
* * * *
15511641 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TATGACCTTTTGTTTTATCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15511705 TAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * ** * * * *
15511770 CAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCAGTTTAACGAATCCATACAAATAATTATG
255 CAAAAATTAATAAG-TAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACGAATCAATTCAAATAGTTAAG
* * * *
15511835 -CTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
318 ACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
* * * ** *
15511899 TTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAA-AA-ACT-AATTAATTAATATTTC-AAAAATTAAT
382 TCT-ATTATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAAT
* * * * * * * * *
15511960 AAGTAAAGATTTAAAAAAGAAATATTTTTACTAAACCAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
444 AACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAACA
* * ** * * * *
15512025 ATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTAAGTTCATATAA
508 ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAAA
* * * * * *
15512090 GCTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAAT-AGCTAAGAGAATTA
573 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAGAG--TTT
*** ** * * * * * *
15512154 AAAAATAAATTTGTTTAGTGAACAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCA
634 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
*
15512219 AATCGTTATGACCT
699 AATTGTTATGACCT
* * * * * *** *
15512233 TTTGTTGTATCATAAAACAAACGTT-TTTG-TTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AA--TTGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* *
15512296 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAG
63 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAG
* * * * * ** * * *
15512357 TTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTGTTTTATTA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
15512421 CAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTAATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATA-TT
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * * * *
15512485 CTAAAA--AATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAATATGTTTATCAAAT-AAGTTTAAATAGTTAT
255 CAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGTTAA
* * ** ** * * * * * * *
15512547 GATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAATAAATTCT
317 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-CAATTGT
* * **
15512612 TT-TATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAACAACAAAT
381 TTCTATT-ATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT
* * * ** * * * *
15512675 AAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAA
444 AACT-AAAGATTTAAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAA
** * * * * *
15512740 CAATTATTTATTGGAAATCATTATAACTTTTTGATTTGTCATCAAACAATTGTTTTTA-TTCATA
506 CAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAAGTTCATA
* * * * * *
15512804 CAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTACTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATT
570 AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG-TT
* * * * *
15512869 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
633 TAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* *
15512934 AAATCGTTATGACTT
698 AAATTGTTATGACCT
* * ** * * * * **
15512949 TTTGTTTCGTCATCAAACAATTGTATCAATTAATATAGGCTT-GT-----TAAAATAGCACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * **
15513008 TGATTAATATTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAATATGAATCTGCTTACTGAACAAGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTT
* *
15513073 CAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTC-TA
129 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-
* * * *
15513136 AAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTACTTTG-AATAAAATAATA-TAAGTTTATTAATATT
193 AAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAGTAA-TTTAATAATATT
* * * * * *
15513199 CCAAAAATTAGTAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATTTG--T-----T---TT----T--TTAACA
254 TCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * *
15513248 C-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAAT-TTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTT
319 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
15513311 TTGCTCATACAAGCGTATT-TGAAATAAAA-AATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
383 CT-ATTATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA
* * * * * * * * * *
15513373 ACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTATCATTGTTTGAATA
445 ACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTGAACA
* * ** * * * * * *
15513438 ATTATTTATTTCAAAT-AGTTATTATATTTTGTTTTATCATAAAGCAACTATTTCTA-TTCATAC
508 ATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATAA
* * ** * * *
15513501 AAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAAATTAAAAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTT
571 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTT
* * * * * * * * * *
15513566 AAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTC
634 -AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* *
15513631 AAA-TGATTATAATCT
698 AAATTG-TTATGACCT
* ** * * *
15513646 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *
15513711 CTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAAACAAG-
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAAC-AGT
* * * *
15513770 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCAT
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
15513834 AAAACAATTGTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCT
193 AAAACAATTG-TTTTATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTC-
* * * * * * * *
15513898 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTATTTGCCAAACTAGTTGAAATAGTTAAGA
256 AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATC-AATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * *
15513963 GTA-TTGAACAA-TATTTTATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-ATT
319 CTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
15514025 CCAGTTCATACAAGCTTATTTACAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATG
383 CTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT-
* * * * * * *
15514089 AGC-AAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAATTAATT-TTACTATTTGAA
444 AACTAA-AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAA
* * * * * *
15514152 CAATTATCTATATAAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTAATAA
506 CAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAA
* * * ** *
15514217 AAACTTATATGA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATT
571 AAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGA-GTT
** * **** * * * * * * *
15514281 TAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCT
633 TAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** *
15514346 CAAATCATTATG--GT
697 CAAATTGTTATGACCT
* * * *
15514360 ATTT-TTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCATATTC-AAATGAAAGTAATACT
1 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACT
* * * * *
15514422 AATTTA-TAATATTATAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTACAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCA
62 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACA
* * * * * * * * * *
15514482 ATTTAAATAATTAAGACTATTTTAATAATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGA-CTTATTATTTAG
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTT-TTGTTTTG
* * * * * * * * *
15514545 TCATATAATAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A
189 TCATAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATA
* * * *
15514609 ATTCAAAATATTAATAAGAAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATA
252 TTTCAAAA-ATTAATAAG-TAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATA
* * ** * * ** * *
15514673 ATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
312 GTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* * * *
15514738 TTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACA-TTATTAATATTTC-AAAA
377 TTGTTTCTA--TTATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * *
15514800 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-CAGAATCAA-TTCAAATAATTATGAC
438 ATTAATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTAT-AA
* * ** * * * *
15514862 CTCTTGAACAACTATCCATTTCAAAAT-GTTATTACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTT
498 CTATTGAACAATTATTTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT
* * *
15514926 CAA---CATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAACA
561 -AAGTTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATA
** * * ** * * *
15514987 AG--AGA-CATAAACAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGAACA
623 AGTAAGAGTTTAAA-AATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTT-GAACA
* *
15515049 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAAACT
686 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ***
15515076 TTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTG-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ** *
15515140 TTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAATTAAGA-ATTTTAAAAATAAAT-TCGTTTATTGAACCA
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-CCAAACA
* * * * ** *
15515202 GTTCAAACAGTTGA-GACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACCTTTTGTTTT-T
126 GTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * * *
15515265 CATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGGATAAAACTAATTTATTAACAT
190 CATAAAACAATTGTTTTA--TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * * * * *
15515330 TTCTAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTATCGAACCATTTCAAATAATTA
253 TTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAGTTA
* *
15515395 TA-ACTATTT---CAA--ATC-A-TT-ATAA-CCTTTT---CTTTTG--TA---ATAAAACAATC
316 -AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * *
15515442 GCTTC-AGTTCATATAAGTTTATT-TGAAGTAAAATACA-CT-AATTTATTAATATTTC-AAGAA
379 GTTTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATA-ATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAAA
* * * * * * *
15515502 TTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTGACCAAATAATTTCAAATAGTTATGACTAC
439 TTAATAACT-AAAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-
* *
15515566 TTGAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-
501 TTGAACAATTATTTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTAAG
* ** * ** * *
15515629 TTTATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TA
564 TTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGT-
* * * * * * ** * *
15515692 AAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
626 AAGAGTTTA-AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA
***
15515757 TCTATTTCAAAACATTATGACCT
690 TCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *
15515780 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATCCATGCAAGTTTATTTTGAAAAAAATAATATAAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTGATTCATACAAGCTTA--TT-----CAA-AATA-AAA-
* * * * * *
15515845 TTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAATAA
55 ----TAATA---C-TAATTTATTAA-TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAA
* * * * * *
15515908 ATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTA
110 ATCTGTTTACCAAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
** * * *
15515973 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATCCATGCAGGTTTATTTTG-AATAAAATAA
174 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAT-CATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAA
** * * * * * * *
15516037 TA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTA
236 TAGT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTACGA
* * * * ** **
15516100 AACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGTT
299 ATCA-ATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTT
* * * * * *
15516165 TTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTACAATCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATT
363 TAGTCATAAAACAATTGTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATT
* * * * * ***
15516229 --TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTGAGTTCAAAT
426 AATATTCAAAAAATTAATAACT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * **** * **
15516292 AGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAAAAAGAAAAGT
490 AGTTATAACTAT-TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
15516357 ATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-CTAGAAAA
554 ATTGTTT-AAGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAA
* ** * ***** ** * * * *
15516420 -TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAGTAAAGCCACTTACTGAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATT
617 TTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATT
* * * **
15516484 TAAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAAT
680 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** * *
15516517 TTTGTTTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * ** * *
15516582 TTATTAATATT-TCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAAT
65 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAGT
* * * * * * * * *
15516642 TCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAACCTATCTCATATCATTGTGATC-TTTGTTTTGTCAT
128 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
15516706 AAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGATATAAAATATTACTAAATTAATAATA-TTC
193 AAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTC
* * ** * * * * *
15516770 TAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTT-AAAAAT-AATACTAATTACAAAT-ATTTC-TATTGATACA
256 -AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACGAATCAATTCAAATAG-T-TA
* * * ** * * ** * * * *
15516831 AGTTTCTGTTCATGCAA-AATTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTT--TGA-AA
316 AG--ACTATT--TG-AACAATTATCTA-TTTCAAATCATTTTGACCT-TT--TGTTTAGTCATAA
** * * * * * * ** * *
15516892 ATTACAAAGAGATT-TA-AAAACTAAATCTAATTACCGAA-ACAGGT--TA-AATAGTTATGAAT
372 A--AC-AATTGTTTCTATTATAC--AAGCTTATT-CAGAATA-AAATAATATAA-ATTTATTAAT
** * * * * ** ** ** ** *
15516951 ATTTGAATAATTATCTATCTCAA-ATCGTTATGATCTTTAT-T-TTGTCATAAAACAGTTGTTTC
429 ATTCAAAAAATTA-ATAACTAAAGAT--TTAAAAAATAAATCTATT-T-ACCAAACA--AG-TTC
*** * * * * **
15517013 TTTTCA--TACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAGTTTAATAAT-ATTCCA-AATATTAAT
486 AAAT-AGTTATAA-C-TA-TT-GA--ACAATTAT-TTA-TTTAA-AATCATT--ATGACCTT--T
* *** * * * * * *
15517074 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTATCTACTGAACCGGTTGA-AAATAG-TTA---AGAGT--
537 -TGT-TTTG--TCATAAAA-CAAT-TGT-T--T-AA---GTTCATAAA-AGCTTATTCAGAATAA
* * * ** ** *
15517132 ATTAGA-AC-AATTT-TT--TATTTCAAATCATT-CTGACCTTTTG-TTTTAAATTAATGAGCAA
588 AATA-ATACTAATTTATTAATATTT-AAA-AATTAAT-A-AGTAAGAGTTTAAA--AAT-A--AA
** ** * * * *** * * ** *
15517190 -GAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTCCAAATAGATTTTACTATT-TGAACAAT
643 TTTG-TTT-ACCAAACAAA-----TT--CAAATAATTATGACTA-TTTGAACAATTAT---C---
* **
15517253 TATCTATATAAAATCATTATGACCTT
692 TA--T-T-TCAAATTGTTATGACC-T
* * * * * * * *
15517279 TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATAT-GAAACAAAATAATACTAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ****
15517343 TTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGTAAAGC-GATTTTTTGAACTA
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAAAC-A
* * * ** * *
15517406 GTTGAAATAGCTATGACTATTTG----A--ATC---TT-AACTTGTTATGATC-TTTGTTTTCTC
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * ** *
15517460 ATAAAAAAATTGTTTCTGATCATACAAGCACATTTG-GATGAAAATAATACCAATTTTATAATAT
191 ATAAAACAATTGTTT-T-ATCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * * *
15517524 TTTAAAAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAAATAAATGTT-TTTGCAAAACCAGTTCAAATAGTTA
253 TTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTAC-GAATCAATTCAAATAGTTA
* * * * ** * * * * * *
15517585 AAACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCAGACTTTTTATTTGGTCAGATAATAATTGT
316 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
** *
15517650 TT-TAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAAATTA
381 TTCTA--TTATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAAAAATTA
* * * *
15517713 ATAAAC-AAGTGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
442 AT-AACTAA-AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TT
* ** * * **
15517777 GAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCA
503 GAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCA
* * *
15517841 TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAG
568 TAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
15517905 ATTTAAAAAATAAATTAGTTTA-TAGAATC-AATTCAAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTAT
631 -TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCA-AA-CAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTAT
* * *
15517967 CTATTTGAAATCGTTATTACCT
691 CTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15517989 TTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTT--TTCAGCATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGATT---CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * *
15518052 ATTTATTAATATT-TCAAGAATTAATAAG---G-GATTT-AAAAATAAATCTATTCACCAAACTA
63 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-A
* ** * *
15518111 GTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTCGAT
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-T
* * * * * * *
15518174 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTTAGTAAAAT
190 CATAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * * *
15518239 TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTGTCGAA-CTAGCTT-AAATAGT
253 TTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACGAATC-A-ATTCAAATAGT
* * * * ** * *
15518302 TAAGAATGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATT
314 TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * ** * * * * ***
15518367 ATCTCAACTTATACAAGCTTATTGGGAATAGAATAAAACT-AATGTATTAACATTTTCAAAATT-
379 GTTTCTA-TTATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
* * ** * * *
15518430 -T-A-TAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGTCAAACCATTTCAAATA---AT--TTA-T-AA
442 ATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTGAA
* * *
15518485 C---TA-TT-TTT-AAATCATTATGA-CTTTTGCTTTTTGTAATAAAACAATAGTTTCAGTTCAT
506 CAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG--TTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCAT
* * * * * * * **
15518543 ATAAGCCTATT-TGAAGTAAATTAATACTAATTTGACTAAATATTTTGAGAATTAATGTGTAAGA
569 AAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTT-A-TTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * *
15518607 GAATTAAAAAAGAAATCTGTTATA-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT---CAA--A--
630 G--TTTAAAAATAAATTTGTT-TACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
*
15518663 -A---C--A---TTATAACCT
692 TATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * ***
15518675 TTTG-TTTGTCATAAAACAATTGGTCCT-ATTCGTGCAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATA-TAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GT-TTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A
* * * * * * ****
15518737 ATTTATTAATATT-TCAAAATTAAGAATTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACATG
63 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-G
*
15518800 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-CA-TATGACC-TTTGTTTTGTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * * * *
15518862 TAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTT-AT-TTA-TT
192 TAAAACAATTGTTT-T-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * * * * *
15518924 CTAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTAT
255 C-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATC-AATTCAAATAGTTAA
* * ** * * * * *
15518989 GACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTT
317 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
* ** *
15519054 TCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-ATAAAA-TAATG
382 TCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT-
** ** * * *** * * ** * * *
15519116 AGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACT
444 AACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAACA
* * *** ** * * * **
15519181 ATTATCTATTTGAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACTATTATTTTTGTTCATACAA
508 ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATA-AA
* *
15519246 A-ATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAA
572 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAA
* * * * * * * *
15519307 AAACTAAATTTGTTTATCGAAA-TAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTAACCTATCTCA
636 AAA-TAAATTTGTTTA-CCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** *
15519371 AATCATTATGATC-
699 AATTGTTATGACCT
* *
15519384 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATACTACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *** *
15519448 ATAAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAAGGCA-
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAA-ACAG
* * * * * ** **
15519512 TTTAAATAGATATGACTTTTTGAACAGTTATCTATTTCAATTTTTTATGATATTTTGTTTTGTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15519577 TAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTC
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * *
15519641 CAAAAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCG-AGCAAGTTCAAATAGTTAT
255 CAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAGTTAA
* * * * * * * * *
15519704 CACTGTTTAAACAATTATTTATTTTAAAT-AGCTATT-ATCTTTTGATTT-GTTACAAAACAATT
317 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA--TTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATT
* * * ** *
15519766 ATTTCTATTGATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTACAAATATTCTAAAAATTA
379 GTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTA
*** * * * * ** *
15519830 ATTGGTAGGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGA
442 ATAACTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGA
* * * **
15519895 ACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATG
505 ACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCAT-
* * *
15519960 CAAAA--TTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAATTACTAAG--AGA-T
569 -AAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGT
* ** ** * * * *
15520020 TTAAAAACTAAATCTAATTACCGAAACAGGTTC-AATAGTTATCAATATTTGAATAATTATCTAT
632 TTAAAAA-TAAATTTGTTTACC-AAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** *
15520084 CTCAAATCATTATGATC-
695 TTCAAATTGTTATGACCT
* ** *** * * *
15520101 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAGT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * ** * *
15520166 TTAATAATATTCCAAATAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTATCTAATGAATCGGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACCAAACAGTT
* * * * * * * * **
15520231 GAAAATAGTTAAGAGTATTAGAACATTTTTTTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTT-AAAT
129 -CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-
* ** * ** * ** * * * **
15520295 TAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTTACTATT
192 TAA--AACAATTGTTTTATCATAA-AAGCTT-ATT--C-GA-AA--TAAAATA-ATAGTA--ATT
* * ** ** ** *
15520360 TGAACAATTATCTAT-ATAAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAAT-AA-TTGTTTTA
244 T-AATAA-TAT-T-TCA-AAAAT--TAAT-A--AGTAGAGATT-T-AAAAAATAAATTTG-TTTA
* * * * **** * * * *
15520422 -G-TTC-A-T-AAAAACTTATATGAAACAAAAAAATACTACTTTATTAATATTTCAAA-AATTAA
296 CGAATCAATTCAAATAGTTA-A-G--ACTATTTGA-AC-A-ATTA-T-CTATTTCAAATCATT-T
* * **** *** * * * **
15520481 TAAGCAAGAGATTTAAAAAGTAAAGCTATTTTTTGAACTAGTTGA-A-ATAGCTATGACTATTTG
351 TGACCTTTTG-TTTAGTCA-TAAAACAATTGTTT---CTA-TT-ATACA-AGCT-T-A-T-TCAG
** ** * * * * * ** *
15520544 AATCTTAACTTGTTATGATATTTGTT-TTCTCATAAAAAAATTGTTTTTGATCATACAAGCACAT
404 AA---TAAAATAATAT-AAATTTATTAATAT--TCAAAAAA---TTAAT-AAC-TA-AAG---AT
* * * * * * ** * *
15520608 TTGGATGAAAAT-AATACTAATTTTA--TAA-TATTTTAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
454 TT--A-AAAAATAAAT-CT-ATTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATAA-CTA-TTGAACAAT
* * * *** * **** * * *
15520668 AAATGTT-TTTGCAAAACCAGT-T--CAAATAGTTAAAACTATTAAAATAATTATCT-A-TT--T
510 -TAT-TTATTT--AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTAAGTTCAT
* * **** * * * ** *
15520725 GAAA--TCATTCAGACTTTTTATTTGGTTAGATAATAATTGTTTTAGT-TTATACAAGCTT-ATT
569 AAAAGCTTATTCAGA------A-TAAAATA-ATACTAATT-TATTAATATT-TA-AAAATTAATA
* * * *** * * * * *
15520786 TGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAAAGTAAT-AAATAAGAGATT-TGAAAA
623 AGTAAGAGTTTAAAAATAAATTTGTTTAC---CAAACAAA-T--TCAAAT---A-ATTATG----
*
15520848 TATAAATATTTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
674 ----ACTA--TTT---G---AA---C--A-A-TTAT--C----T-----ATT-TC------AAAT
*
15520913 TGTTATAACCT
702 TGTTATGACCT
* * *
15520924 TTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG-TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-A
1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* *
15520987 TGTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAAT
64 T-TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCA-AA-
* * * * * * * *
15521049 CAATTCAAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGCTTT
124 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
15521113 GTCATAAAATAATTGTTTTTCAGCATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
188 GTCATAAAACAATTG-TTTT-ATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAAT
* * * * * * *
15521178 ATTTCAAGAATTAATAAG--G-GATTT-AAAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTCAAATAGTT
251 ATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATC-AATTCAAATAGTT
* * ** * * * *
15521239 -TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTCGATCATAAAATAATT
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAG-TCATAAAACAATT
* * * *
15521302 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACT-AATTTAGTAAAATTTC-AAAAATT
379 GTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATT
* * ** * * * *
15521365 AATAACTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACTAGCTT-AAATAGTTA-AGAATGTA
441 AATAACTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG-TTCAAATAGTTATA-ACTAT-
* ** * * * * *
15521428 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATCTCAACTT
502 TGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTAAGTT
* * * * * * * *
15521493 -ATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAACATTTTCAAAATTTATAAG--AGA
566 CATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * *
15521555 -TTTAGAAAAT-AATTCTATTTGTCAAACCATTTCAAAT-A--AT---TA--T-AAC---TA--T
630 GTTTA-AAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
**
15521604 -TTT-AAATCATTATGA-CT
693 ATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * ** * *
15521621 TTTGCTTTTGTAATAAAACAATAGTTTCAGTTCATATAAGCCTATTTGAAGTAAATTAATACTAA
1 TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTGA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * ** * * *
15521686 TTGACTATTATTTTGAGAATTAATGTGTAAGAGAATTAAAAAA-AGAATTTGTTTACCAAATAAG
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCAAA-CAG
*
15521750 TTCAAATAGTTATGAC----T-----ATT-TC-A----AAA-CATTATAACCTTTTGTTTTGTCA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * ** * * * *
15521799 TAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTTTGTTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
192 TAAAACAATT-GTTTTA-TCATAAAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATAGT-AATTTAATAATAT
* * * * * *** * * * *
15521862 TTCAAAAATTAAGAATTAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTAAACATGTTTAAATAGTTAT
253 TTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATCA-ATTCAAATAGTTAA
* * * * *
15521927 GACTATTTGATCAACTATCTATTTCAAA-CA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTT
317 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
15521990 TCTGTTCGTGCAACCTTATTCTA-AATAAAATAATACT-AATTTATT--TATTCTAAAAATTAAG
382 TCTATT-ATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT
* * * * * *
15522051 AAGTAAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
444 AACTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAACA
* ** * * * * *
15522116 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTA-TTCATACA
508 ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATAAA
* ** * ** *
15522180 AGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTA
572 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAG-T-TT
* * *** * * * * * * *
15522243 AAAAATAAAGTTATTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGA
634 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* **
15522308 AATTGCTATGAAAT
699 AATTGTTATGACCT
* ** * *
15522322 TTTGTTTTGTCGTAAAACTATTATT-TTTG-TTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-A--ATTGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * *
15522385 ATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAATA
63 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACA
* * * * * *
15522445 GTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATAACCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
126 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
15522509 ATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATACT-GCTAAATAAATAATA
191 ATAAAACAATTGTTT-T-ATCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAG-TAATTTAATAATA
* * * * *
15522572 -TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAAAT-AGTTTAAATAG
252 TTTC-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-G-AATCAATTCAAATAG
* * *
15522635 TTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCATTTTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAATAAT
313 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
*
15522699 TGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAGATTCAAAAAA
378 TGTTTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAA
* * * * *** *
15522761 TTAATAAAAACAAAAAATTTTATAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACT
439 TTAAT---AACTAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACT
* * * * * * *
15522825 AATTAAACAAATATATA-TTAAAAACAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TGTTTCA
500 -ATTGAACAATTATTTATTTAAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAA
* * * * * * * *
15522888 GTTCATAAAATCGTATCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAAATTGATAAGT
563 GTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--AAAAATTAATAAGT
* *** * * * * * *
15522953 TAGAGATTTAAAAA-ACAAGTCAATTTATCGAATC-AGTTCAAACAATTATGGCCATTTGAACAA
626 AAGAG-TTTAAAAATA-AA-TTTGTTTA-CCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
* * *
15523016 TTATCTATTTCAAATAGTTATAAACT
687 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15523042 TTT-TTTTGTCATAAAATAATT-TTT-TTTCGCCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGATT---CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* *
15523104 ATTTATTAATATT-TCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC--
63 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAG
* ** ** * *
15523166 --C--A-A--T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTA
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * *
15523222 TAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATA-TT
192 TAAAACAATTGTTT-TA-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTT
* * * * ** * *
15523286 CTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTACAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAAT-GATTA
255 C-AAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACGAATCAATTCAAATAG-TTA
* ** ** * * *
15523350 AAACTATTAT-AACAATTATCTATCCCAAATCATCCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTG
316 AGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
15523414 TTTC-AGTTCATACATGCTTATT-AAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATTCAAAATATTAA
380 TTTCTA-TT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAA
* * * * *
15523477 TAA-GAAAGAAATTTTTAAAAA-AAATCTATTTAACAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTG
443 TAACTAAAG--A-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTG
* * * *
15523540 AACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAA-CTCA
504 AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCA
* * * * * * * *
15523604 TAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGT-TGTAG
568 TAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG-AG
* * * ** ** **
15523668 ATTTAAAAGATAAATTAGTTTATCGAATTAATTCAAATAATTATGGTTATTCAAACAATTATCTA
631 -TTTAAAA-ATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * *
15523733 TTTCAAATCATTATAAACT
694 TTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15523752 TTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGAT--TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * **
15523816 TTTATTAATATT-TCAAAAATTCATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATATACCTAATTAG
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAG
* * ** *
15523880 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTAT-AGCCTTTTATTTTGTC
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
15523944 ATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATCTAACAATA-
191 ATAAAACAATTGTTT-T-ATCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
* * * * * * **
15524007 TT-ATGAAATTAATAAATAAGAGATTTAAATAATAAATTTGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAGTT
253 TTCA-AAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACGAATCAATTCAAATAGTT
* * * * * * ** * *
15524071 AAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAATAAAT
315 AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * * * ***
15524136 GTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTAAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA
379 GTTTCTATT-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAA
* * * * * *
15524201 T-A--AGAGATTTAAAAAATAAATTTGA-TTACCAAACTAGTTCAACTAGTTATAACAATTTAAA
443 TAACTAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTGAA
15524262 CAATTATTTATTTCAAAAT
506 CAATTATTTATTT-AAAAT
15524281 AATACTACTT
Statistics
Matches: 35877, Mismatches: 8292, Indels: 6481
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
656 3 0.00
657 41 0.00
658 39 0.00
659 21 0.00
660 61 0.00
661 95 0.00
662 108 0.00
664 4 0.00
665 2 0.00
666 14 0.00
667 37 0.00
668 53 0.00
669 44 0.00
670 5 0.00
671 4 0.00
673 1 0.00
674 4 0.00
675 39 0.00
676 6 0.00
677 2 0.00
678 2 0.00
679 3 0.00
680 29 0.00
681 93 0.00
682 344 0.01
683 215 0.01
684 371 0.01
685 247 0.01
686 175 0.00
687 131 0.00
688 57 0.00
689 35 0.00
690 136 0.00
691 138 0.00
692 35 0.00
693 37 0.00
694 103 0.00
695 127 0.00
696 408 0.01
697 582 0.02
698 783 0.02
699 442 0.01
700 269 0.01
701 336 0.01
702 592 0.02
703 513 0.01
704 458 0.01
705 336 0.01
706 298 0.01
707 357 0.01
708 387 0.01
709 355 0.01
710 563 0.02
711 661 0.02
712 963 0.03
713 684 0.02
714 986 0.03
715 1018 0.03
716 1097 0.03
717 1579 0.04
718 1981 0.06
719 1683 0.05
720 2205 0.06
721 1227 0.03
722 1300 0.04
723 1530 0.04
724 707 0.02
725 681 0.02
726 624 0.02
727 486 0.01
728 321 0.01
729 87 0.00
730 64 0.00
731 89 0.00
732 106 0.00
733 146 0.00
734 141 0.00
735 154 0.00
736 172 0.00
737 240 0.01
738 498 0.01
739 110 0.00
740 123 0.00
741 210 0.01
742 36 0.00
743 57 0.00
744 15 0.00
745 38 0.00
746 46 0.00
747 29 0.00
748 80 0.00
749 101 0.00
750 194 0.01
751 82 0.00
752 119 0.00
753 48 0.00
754 25 0.00
755 98 0.00
756 127 0.00
757 29 0.00
758 19 0.00
759 19 0.00
760 30 0.00
761 31 0.00
762 89 0.00
763 28 0.00
764 140 0.00
765 56 0.00
766 108 0.00
767 52 0.00
768 140 0.00
769 51 0.00
770 63 0.00
771 99 0.00
772 41 0.00
773 38 0.00
774 26 0.00
775 162 0.00
776 17 0.00
777 3 0.00
778 136 0.00
779 24 0.00
780 23 0.00
781 15 0.00
782 61 0.00
783 179 0.00
784 307 0.01
785 105 0.00
786 77 0.00
787 30 0.00
788 99 0.00
789 45 0.00
790 13 0.00
791 28 0.00
792 56 0.00
793 30 0.00
794 13 0.00
795 126 0.00
796 53 0.00
797 193 0.01
798 50 0.00
799 108 0.00
800 11 0.00
801 2 0.00
802 7 0.00
803 15 0.00
804 8 0.00
805 3 0.00
806 1 0.00
807 6 0.00
808 5 0.00
809 3 0.00
810 5 0.00
811 4 0.00
812 52 0.00
813 8 0.00
814 47 0.00
815 2 0.00
816 4 0.00
817 1 0.00
818 1 0.00
820 6 0.00
821 9 0.00
822 62 0.00
823 88 0.00
824 3 0.00
825 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (712 bp):
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAGTTCA
AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
ACAATTGTTTTATCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCAAAAA
TTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACGAATCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTG
AACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCTATTATA
CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAACTAAAGATTT
AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTGAACAATTATTTATTTAA
AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATAAAAGCTTATTCAGAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAATAAATTTGTTTA
CCAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
Found at i:15480450 original size:359 final size:360
Alignment explanation
Indices: 15476149--15520212 Score: 9877
Period size: 358 Copynumber: 121.8 Consensus size: 360
15476139 ATTTAAACCA
* * * * * **
15476149 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTGATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGTTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15476213 TTTGTTAATATCCTAAAAATTAATAA-GTAATG-GATTTAAAAAATGAATCT-ATTAGCCT-GAC
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA--CTAAAC
* * * * * * *
15476274 CAGTACAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAAGT-GTTATAACATTTTGTTTT
125 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
15476338 GTTACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAG-TTGACTCGAAATAACATAA-ATCTAATTTATTA
189 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTC-AAATAAAATAATA-CTAATTTATTA
* *** **
15476401 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGATTAAGTTCAAATA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* * * *
15476466 GTTATGACTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCT
316 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15476511 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15476574 TTTATTAATATTCAAACAACTAATTA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAATAAG
65 TTTATTAATATTCAAA-AATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
15476638 TTCAAATAGTTATGACTGTTAGAATAATT-TTTAATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTC
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
15476702 A-AATAATAACTGTTTCAATTCATACAAGCATATTCAGAATAAAATGATACTAATTTATTAACA-
192 ATAA-AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
15476765 TTCAAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTGAAAAACTAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAAT
255 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* *
15476830 TATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATTGTTATGACCT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15476873 TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * **
15476937 ATATT-AT-TTCAAAAGTTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTGACTAAATTAGT
66 TTATTAATATTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAACAAGT
* * * * * ** * * *
15476998 TCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATTTTTATTACCTTTGGTTTTCTCAT
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
15477063 AAAACAATT-TCTTTTCAAT-ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATT
194 AAAACAATTGT-TTCT-ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * **
15477126 TCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCATATAGAAAT
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* *
15477187 GACTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATAGTTAT-AGCCT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCT
* * * * * * * *
15477227 TTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * ** * * * *
15477292 TTAGTAATATTCTGAAAATTTATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCCATCTGCCAAACTAGT
66 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
* * * * * * ** *
15477356 TTAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCTT
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
15477421 AAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTT
194 AAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT
* * * * * * *
15477486 -AGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTT
257 CA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * *
15477550 GACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATAACTT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ** * *
15477590 TTTATTTTGTCATCAAACAATTGATCTT-GTTCATACTATTTTATTCATAATAAAACAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * ** * * ** * *
15477654 TTTAATAATATTTTGAAACTTGATAACCAAGAAAATTACAAAAATAAATCTAATTGCCAAACTAA
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AA
* * * ** * ** * *
15477719 -TTCAAATAGTTAAGATTATATGAATGATTATCTATTCCAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
15477783 GTAAAATAATTGTTT-TATTCATAAAAGCTTATTCTAATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * **
15477847 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-AGTTCAAAGGGTTA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
15477911 AGATTATTAGGATAATTATCTATTTGAAATTGTTTTGACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *
15477952 TATGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATAATAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
15478017 TTATTAACATTTAGAAAATTAATAA-GAAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
66 TTATTAATATTCA-AAAATTAATAATG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * ** * * *
15478081 TTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTGTTA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * **
15478146 TAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAA-CTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAC
193 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * * ** * * *
15478209 TTACTAAAA-T-A-AA--AAGAAACTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTACTTAAAATAATT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* **
15478269 AT-AGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
319 ATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * **
15478311 TTT-TTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTGATCATACGAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * ** *
15478375 TTATTAATACTCAAAAAATTAATAACTAAAG-GATTTAAAAAATAAATAAGTTTACTAAACTAGT
66 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
* * *
15478439 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCA
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *** * *
15478502 TAAAACAATTGTTTCTAATCATAGAAAACTTATTCGGTTAAAA-ATATGCTAATTTAAT-ATA-T
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
15478564 TCAAAAAATTAATAAGTAATAGACTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAGCCAA-TTCAAATAGTT
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAA-ACAAGTTCAAATAGTT
** * * ** * *
15478628 AAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGTCCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *
15478670 TTTGTTTAGTCATAATATATTTGTTTCATA-TT-TTCCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-
* * ** * *
15478732 AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAAATAAAAATATTTACTGAA
63 AATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATGAAGA-GATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* * * * * *
15478796 CAAGTTCAAATAGTGATAACTATTCGAACAATTATTTACTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
124 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
15478861 GAT-ATAAAAAAATTATTT-AAGTTCATAAAACCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTA
189 G-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
15478924 ATAATTT-AAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAAT
251 AT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
*
15478985 AGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTCGTTATGACCT
315 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTATGACCT
* * * * * *
15479031 TGTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTGAATTCATTCAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACCAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15479095 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATC-AG
66 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAG
* * ** * * *
15479158 TTCAAATAATTATGGCCCTTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15479223 TATAACAATTGTCTT-TGA-TCATATATGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCT
193 TAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * *
15479286 TTCAAAAATTAATAAG--AGATTTTTAAAAAATAAATATGTTTACTTAATCAA-TTTAAATAGTT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * ** *
15479348 ATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *
15479390 TTTGTTCTATCTTAAAACAATTATTTCTA-TTTATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * *
15479454 TATAAAAATATTCTAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAG
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * *
15479518 TTCAAATAGTTATGATTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--A-T-TG--TTTTTGTTTTGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** ** *
15479576 TAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * ** * *
15479640 TCAAAAATTAATATGTAAGATATTTCAAAAATAGTTTTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTA
*
15479704 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * * *
15479745 TTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTTTTTAGAATAAAATAGTACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *
15479810 ATATTAATATTTCAAAAATTAATAAT----AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACTAGT
66 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGT
* * * * **
15479870 TTAAA-AGGTTAAGACTATTT-AAGTAATTAT-TATTTCCAATTGTTAT----TTTT-TTTATG-
129 TCAAATA-GTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGT
* * ** * * * * * *
15479926 CTACAAAATAATAATTCCTGTTCATAAAAGCTTATTTAGATTGAAATAATACTAATTTCTTAATT
191 C-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA-T
* * * * * * * ** * *
15479991 ACTT-GACAATTAATAAGTAAAATG-TTTAAAAGATAAATATGTTTGCTTAACTA-TACCAAATA
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT-TCAAATA
* * * * * * *
15480053 GTCATCACTATTTGTATAAGTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT
316 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15480098 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAG
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15480163 TTATTAATATTCCAAAATTAATAATGAAGAGA-TTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTT
66 TTATTAATATTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTC
* * * ** * **
15480227 AAATAATTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCA
131 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * * *
15480292 AATGATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTCAAATAAAATAATAC-AAGTTCTTAATA-TT-AA
196 AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* ** * * *
15480354 GACAGTTAATGGGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-CTGTATG
260 -A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT-TATG
* * *
15480418 ACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT
322 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15480457 TTTCTTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTCTTCAGATTAAAATAACATTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15480521 TTTATAAACATTTCAACAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAAAAATTTAAAAATAAAT
65 TTTATTAATA-TTCAA-AAAT--TAA-T---A-A-TGAAGAGAT--------TTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
15480586 ATGTTTGCCAAATAAGTTCAAATAGTCT-TGACTGTTTGAATAATTATATATTGT-AAATCATTG
112 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTA
* * * * * *
15480649 TGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAAT
175 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT
* * * * * * *
15480714 ACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAACTAATGAGCAAGAGAATTAAAAGATTAATCTGTTTACCAA
239 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAA
* * * ***
15480778 ACATGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAACATTATGACCT
303 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15480835 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-
* * * * ** *
15480897 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AA-ATATTTTAAAAATAAATATTTTTTTTGAACA
63 AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-AATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
* *
15480960 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGA
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-
* ** * *
15481025 T-ATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAACTCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA
190 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
15481089 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAAGTATATCTATTTATCAAGCAAGTTCAAATAG
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
15481154 TTATGACTCTTTGACCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCT
317 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** *
15481198 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAATTTTATTCAAAATAAAATAATAATAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* **
15481262 TCTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTG--GAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA--TGAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
* * * * **
15481325 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
15481388 ATTGA-AAAACAATTATTTCTATTTATACAAA-ATTATTTAGAATATAATAATACTAATTTATTA
189 -GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
15481451 ATTTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAA-TTCAAAT
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAAT
* * * **
15481511 AGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATCTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATT
315 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TT-----C-AAAT-T-GTTAT-GACCT
* * ** * * * * * ***
15481567 AATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATCTTAAATT-ATTATAATCTTTGTTTTGT
1 --TT----T-GTTTTGTC-A-TAAAACAA-T-TGT-T-TT-AGTTCA-TACAAGC-TT-ATTCAA
* * ** * ** * * * *** *
15481631 CATAAAAT-A-ATTGTTTCTATTCATA--C-AAGCTTATTTGAAAT-AAAATATTGCTAAATTAA
49 AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCAAAAATTA-AT--AATGAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * ** * * **
15481690 TAT-TATTT--TAAA-AA-TT--AATAAGTGA-GA-GATTTAAAAAAGAAATGTGTTTGCTGA--
110 -ATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTT-CAAATC
* ** * * * * * *** * *
15481744 ACTA-G---TTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT
171 ATTATGACCTTT---T-GTTTTGTC-A-TAAAACAAT----TGTTTCTATTCA-TAAAAGCTTAT
** * * * * * * * ** * * **
15481805 GTTTAGTCAAA-AA-A-TAATTT-TT-TTCAATTCATACATGCTTATTTGAAATA-AAGTAATAC
225 -TCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAAT--TAATAAGTAAGAGATTTAA-A-
* ** ***
15481864 AAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAACAAGAAATT-AAA-AAAAAT--CTATTTACTGAAC
284 AAA-----TAA-ATTT-G---TTTACCAAACAAG---TTCAAATAGTTATGACTA-TT--TGAAC
** * ** *
15481925 AAGTTCAAATAGTT-ATGGTTGTT-TGAACAAT
333 AA-TT-ATCTATTTCA-AATTGTTATG-AC-CT
* * * * * * *
15481956 TATCTATT-T-ATAAAA-AGTATGTCCTTTTGTTTTATCATAAAATGATTGTTTTAGTTCATAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGT--TTTAG---T-TCAT-ACA--A--G-CTTA-TTC---AA
* *
15482018 AGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAAAATTGAA-AAGTTAA-AGATT
49 A----A--TAAAAT--AATACTA--A-TTTATTAATA-TTCAAAAATT-AATAA-TGAAGAGATT
* * * *
15482081 TAAAAAATAAGTCAGTTTA-T---C--G----AATAGCT-TCAC-A--T----AATTATCTATTT
100 TAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
15482128 CAAATCATTACGAACTTTTGTTTTAG-CATAAAGCAATTGTTTTTCA-TCATACAAA-CCTATTT
165 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA-AAAGCTTA-TT
** * *
15482190 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAATAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
226 CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** * *
15482255 TTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATA--TATAACTACTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTAT
291 TTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
*
15482318 AACCT
356 GACCT
* * * * *
15482323 TTTATTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATTCT--
1 TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15482386 TTTATAATAATATTCCAAAAATTAATAACT-ATGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCCAACC
65 TTTAT--TAATATT-CAAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAAC
* * * * * * *
15482450 AA-TTCAAATATTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATAACTTTTTGTTTTG
125 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** ** *
15482514 TCATAGAATAAGTT-TTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATT
190 TCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * *
15482577 AATATTTTAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAA-ATAATTCTATTTACCTAACTAGTTCAA
250 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATT-TGTTTACCAAACAAGTTCAA
* * *
15482641 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACCT
313 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *** *
15482689 TTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTTTA-TTCATATAAG-TATGTTTGGAATAAAGTAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTA
* *** * * * *
15482752 ATCTATTAATATTTTGAAA--ACTAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TAAAACGAG
64 ATTTATTAATATTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* ** * * * *
15482813 TTCAAATAGTTATGACTATTTCAGTAATT-TTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** *
15482877 TAAAACAATTGTTTCGATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-TAATTTATTAATATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * *
15482941 CAACAATTAATGAGTAAAAAATTTATAAAATAAATATGTTTACTAAACGA-TATCAAATAGTCAT
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT-TCAAATAGTTAT
* * *
15483005 GATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15483044 TTT-TTTTGTCACAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCATATTCGAAATAAAATAATACTAAG
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
15483108 TTATTAGTATT-ATCAAAATTAATAATTAAGGGATTTAAAAATTGAATCTATTT-GTCAAACAAG
66 TTATTAATATTCA--AAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * * * *** *
15483171 TTTAAATAATTATGACTA-TTGTAACTATTATCTTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTC
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * * *
15483235 ATAAAATTATTTTTTCTATTCGTACAATCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA--
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
15483298 TAAAGACAATTAATAAATAAAAGATTTGAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGT
256 TCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * ** *
15483363 CATGACAATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATAATAATGACCT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * ** *
15483406 TTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * * *
15483471 TTACTAATTTTCCAAAAATTAATGA-GTAAGAGAATTAGAAAAA-GAATTTGTTGACCAAATAAC
66 TTATTAATATT-CAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
15483534 TTCAAATAGTTATGGCTATCTGAACAATTATCGATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTGA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * *
15483599 TAAAACAATTGATCCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * ** * * ****
15483663 CCTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAGCAAATCTATTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
*
15483727 GATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * ** *
15483766 ----TTTTGTCATAAACCCATTGTTTTTGTTCTTAAAAACTTACTT-GGAATAAAAAAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
15483826 TTTATTCAA-ATTCCAAAATTAATAA-GTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTAGC-GAGCGA
65 TTTATT-AATATTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAA
* * * * * * *
15483888 GTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTT
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
15483953 ATACAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTATTA-T
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * * * * * * * *
15484017 TCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTTTAAACAATCA
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
** * ** * **
15484082 T-ATCCGTTTGAACCATTATCTATTTCAAATCATTACGATAT
320 TGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * **
15484123 TTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTA-TTCATGCAAAATT-TTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * *
15484186 TTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATC-AG
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAG
* *
15484246 TTCAAGTAGTTATGACTATTTG------------------A--A-TATGACCTTTTGTTTTATCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
15484290 TAAAACAATTGTTGT-TCTTCATACAAGCTTATTCGGATTAGAATAATA-TGAATTTATTAATAT
193 TAAAACAATTGTT-TCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
** * * ** ** **
15484353 TTCACCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAAAATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGACA
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* *
15484417 TGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** * * * * * *
15484458 TTTGTTTCGTTATAAAAAAATTGCATCAGTTCATATAGGTTTATTCTAAATAAAATAACACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *
15484523 TTATTAATATTTCAAAAATTAA-AGA-GTAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTA-TCGAACA
66 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATA-ATG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACA
* * * * * * *
15484585 AGTTTAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-ATTTAT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * **
15484649 CATAAAAAAATT-TTTCTACTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAA-AAT--TGAATTTATTAATA
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* *
15484710 -TTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-A-TTAAAAAATAAATGTAT-TTTA-TAAACCTA-TTCAAAT
254 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACCAAA-CAAGTTCAAAT
* ** ** ** ** *
15484769 AGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATA-AACCAAT-TATTTC-TTTTCATACAAGC-
315 AGTTATGA-C---TATTT-G--A-ACAA-TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** * ** * **
15484820 TTAG--TCGAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATATTCTAA--AAATT-AATAAGTAAAATAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TGTTTTAGTTCATA--C-AAGCTTATTCAA-AA-TAAAATA-
* ** * * * * * * * * * * * *
15484879 TTAAAAATTAAATCT-GT-TTGCTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATTT
58 ATACTAATT-TAT-TAATATT-C--A-AAAATT--AATAATGAAGA-GATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * ** * * * *
15484941 ATTT--TAAA-TAGTT-ATACT-CTTTTG--T-TTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTC-GTA
114 GTTTACTAAACAAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* ** ** * * * ** * ** *
15484996 -CA-AGTTCATTCTG-AATAAAATCATACTAATT-TATT-A-ATATTCTGTAAATT--AATAGGA
175 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTGTTTCTATTCATAAAAGCT-T--ATTCAAATA-AA
* * * *** * * * * *
15485053 AGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAAGCATGTCA-ATTTGAACAAT
234 ATAATA-CTAATTTATTAA--TATTT-C-AAA-AA-TT--AATAAGTAAG--AGATTTAAAAAAT
* * * ** ** * ** *
15485117 -TATCTATTT--CAAA-TTGTT-ATGACCA-TT-TG--TTTTGTGGTAA-AAAAAT-TGTTT---
288 AAATTTGTTTACCAAACAAGTTCA--AATAGTTATGACTATT-T-G-AACAATTATCTATTTCAA
**
15485168 -TTGTTAAT-ACAA
348 ATTGTT-ATGACCT
** * ** * * * ** * **
15485180 AAT-TATTGAAAATAAAATAATATTGATTTTTA-TTAATATTTTGAAAATTAAT-AAGAGATTTA
1 TTTGTTTTG-TCATAAAA-CA-ATTG--TTTTAGTTCATA----CAAGCTTATTCAA-A-ATAAA
* * * * * * * * *
15485242 A-AA-ACTAAATCTATT--TA-TCGAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCT
55 ATAATACT-AATTTATTAATATTC-AA--AAATT-AATAATGAAGA-GATTTAAAAAATAAATCT
* * * * ** * * * * * ** **
15485301 ATCT-C-AAATAA-TT-ATGATCTTTAT-TCTGTCATAGAACAATTGTTTCT-TTTCATAGAAGC
114 GTTTACTAAACAAGTTCA-AATAGTTATGACTAT--TTGAACAA-T-TATCTATTTCAAATCATT
** * **** * * * * *
15485360 AT-A--TTCAGATTAAAAATAATACTAATT-TAATCATTTTCA-AAAA--TTAAT-AAGTAAGAG
174 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGT-TTC-TATTCATAAAAGCTTATTCAAATAA-A-
* ** *** * * * * * * *
15485417 AT-TTAAAAAACAAAT-ATGTTTCCCGAACCAGTTCAA-ATAGTTAGA-ACTATTAGAATAAT-T
234 ATAATACTAATTTATTAATATTT--C-AA-AAATT-AATA-AGTAAGAGA-T-TTA-AAAAATAA
* * ** * ** * ** * ** *
15485477 ATCTATTT--CAAATTA-TTCTAA-CCTTTTGTTTAGTCAT-AA-AACAAT-TATTTC----GGC
290 ATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-T-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTG-
* **
15485531 TCAT-ACAAG
352 TTATGAC-CT
* ** * * * * * **
15485540 TTT-ATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTTTTATA-AA-CTT-TCTAAAAATTAGTAAGCAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT--TTTA-GTTCATACAAGCTTAT-TCAAAA-TA--AAATAA
* * * * * * * * * * * * * *
15485601 GA--AATTT-TAAAAAAT-AAATCCATT--TATTGAACA-AGTT--CAAATAGATATGATAATTT
59 TACTAATTTATTAATATTCAAA--AATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CT
* ** * ** * * * * * * **
15485657 AGACAA-TT-ATCTATTTAAAATTGTTAT-AAC-CTT-T-TGTTTTATAAT-A--A--AACAATT
121 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTT
* * * ** *
15485711 GTTTTAGTTCAT-AAA-AACT-TATCCA-AAAT-AAA----A-T----------AATACTACTTT
184 GTTTT-G-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *** *
15485756 ATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCATGAGATTTAAAAACTAAACATTT-TTT-TTGAACCAGTT
247 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA-ATTTGTTTACCAAACAAGTT
** * * * * * * *
15485819 CAAATAGTTACAACTA-CTAAACCAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATC-
310 CAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** * * *
15485869 ATTATTTTGTCATAAAGTAATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTGGT-TTGAATA-AAAATAATACT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCT--TATTCAAAATAAAATAATACT
*
15485931 AATTCAATAATATTTCAAAAATATATAAGTAATAAATTTAAAAAATAAATGTGTGTAAGAGATTT
63 AA-T---T--TA-TT----AATAT-T---CAA-AAA-TT----AAT-AA----TG-AAGAGATTT
* * ** * * * * *
15485996 AAAAAATAAATGTGTTTA-TCGAATCAGTTCGAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTGTTT
101 AAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
15486060 CAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAA-TTTATT-A
165 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGCTTATTCA
* ** * * * * * *
15486122 ACTTTTGAAAAATAA-A-TAA-GCA--AGAGATTTGAAAAA--AATAAAT-A-TG-TCT----AC
228 A---AT--AAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** * * * * * **
15486173 TGAA-TAGGTTA--AAA-TTGTT-ATGACTA-TT-TGAAC-AATT-ATC-ACTCTC-AAAT--AA
287 TAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCA--AATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* *
15486225 TT-AT--GATC-
349 TTGTTATGACCT
* * * * ** *
15486233 TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCATATTCGGATTAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15486297 TTTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCATACCAG
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * *
15486360 TTCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTCT-ACACTTTTGTTTAGTC
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTC
* * * ** * *
15486424 ATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAAAAATACTAATTTATTAA-CT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * *
15486488 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAGTTGAAATAGA
255 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* *
15486553 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * ** * *
15486596 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-CTCATAAAAACCTATTTGATATAAAATAAT-CTAC
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15486659 TTTATTAATATTTCAAAAATTATTAA-GCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTC-AAACTAG
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* ** ** * * * * * * *
15486722 TTCAAATAGCTACAACTGCTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGA-TTTTTATTTTATCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
15486786 TAAGATAATTATTTCTGA-TCATACAAGCTTATTGAGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATGT
193 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCA-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
** *
15486850 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA--T-T-T----G-TTT-ACCAA-ACA-A-
* * * * ** * *
15486915 GCTTACCGAATCAGTTTAAATAGTTAATTCTATTGGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTCTAAC
307 G-TT--CAAAT-AG-TT--AT-G---A--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
15486980 CT
359 CT
* * * * *
15486982 TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTC-GAAGAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTA
* * ** * * *
15487046 ATTTATTAAATTTTGAAAAATTAATAA-GCAAGAGATTTGAAAAAATATTTAC-ATTTATTGAAC
64 ATTTATT-AATATTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTT-AAAAAATAAAT-CTGTTTACTAAAC
* * * ** * *
15487109 AAGTTCAAACAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCCATTGAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTG
125 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
15487174 TCACAAAACAATTGTTTC-AGTTTAAAAAAG-TTTTTCCAAAGTAAAATAATATTACTTTATTAA
190 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATT-CAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * ** * *
15487237 TA-TTCTGAAGATCAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TAGAATC-ACTTCAAA
252 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AA-CAAGTTCAAA
* * * * ** *
15487299 AAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT
314 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
** **** ** * * *
15487346 TTTGTTTTGTCATAAATTAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAACTAAAATCAGTATTAC
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-AATACTA-
* ** * * * * * **
15487411 CTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTTTAAATAAA-AAATACT
64 ATTTAT-TAATAT--TCAAA-AA------TT-AATAATGAAG-AGA-TTTAAA-AAATAAAT-CT
* * * * * * * * * * * *
15487474 AATTTA-TTAA-TATTTCAAGA-A-CTA-GTACAAGATTCAAAAGATAAAT-TATTTGCTGAACC
114 -GTTTACTAAACAAGTTCAA-ATAGTTATG-ACTA-TTTGAACA-AT-TATCTATTT-C-AAATC
* * * ** * * ** * * *
15487533 AATTCAAAT-A-GTTATGACTATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATCTT-TTG
171 -ATT---ATGACCTTTTG--T-TTTGTCATAAAACAAT-TGTTTC-TATTCATAAAAGCTTATTC
*** *** * * * * * *
15487592 TTTTGTCATAA-AATAA-TTATT--TTTGTTCATATAAGTTTATTTAGATAA-A-ATAATAAAAA
227 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCA-A-AA-ATTAATAAG-TAAGAGAT-TTAAAAA
* * * * ** * * * * * *
15487651 ATTAATAAT-ATT-CTAAA-AA-TTC--ATAACTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTG
286 ATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-C--
* * *
15487709 AACTAGTTCA--AAC-
346 AAATTGTT-ATGACCT
* ** * * * * ** * *
15487722 --AGTTAAGACAATATGAAAAAATATCTATTCCAAATTGTT-ATTACCTTTTG-TTTTGTAATAA
1 TTTGTTTTGTC-ATA--AAACAAT-TGT-TT-----TAGTTCA-TA-C--AAGCTTAT-TCA-AA
* * * * ** * * * *** * **
15487783 ACAAATTATTTCAGCTCATCCAAGTTTAT-TTGTAATAAAATAA-AACT-AA-TTTTTTAATATT
50 ATAAAATA-AT-A-CTAAT-TTA-TTAATATT-CAA-AAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAA
* ** * * * *** * *** *
15487844 TCAAA-AT-TTTAAAAGTAACAAATTTAAAAAAAAAT-TCTATTTAATGAACCAATTCAAAAAAT
107 T-AAATCTGTTTACTA--AACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT--TGAA-CAATT-ATCTATT
* * * * *
15487906 TCTAA-C-TGTTTGAACAATTATATATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
164 TCAAATCAT-TATG-AC--CT-T-T-TGTT---------------------TTGTCATAAAACAA
* * ** * * * * ** *
15487969 TTATTTCTATTTATGCAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAAGATTTTGACAATT
201 TTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * *
15488034 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCACTTCAAATAGTTAAGAATGTGTG
265 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* *
15488099 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATGGCCT
330 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
** ** * * * *
15488130 TTTACTTTGTTGTAAATCAATT-TTTTAGCTCTTACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A
* * ** *
15488192 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGTTGAACCA
64 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACA
* * ** * * * *
15488256 A-TTCAAATAATTGTGACTATTACAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTTGC
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * ** *
15488320 CATAAAACAAATGTTTTTGGTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
15488385 TTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAATTAGTTA
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * *
15488446 TAACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTATGACCA
320 TGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *** * * *
15488488 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATAC-AGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCCAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
*** * * * ** * *** * **
15488552 TTTATTAATATTTTGGAACTTAACAA-GCAATG-GATTTAGAAAATGTATTTGTAGGCCT-GATT
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACTAAACA
* * * * * * * * *
15488614 AGTGCTAACAGTTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATAACCTTTTGGTTTAT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
15488679 CACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTCAGAATAACATAATTCTAATTTATTAATA-
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
15488743 TT-ATAAAATTAATAAGCAAGA-ATTTTAAAAAA-GAATCTGTTTA-CAGAACAAGTTCAAATAG
255 TTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAG
* * * ** * *
15488804 TTATGACTATTTGTATAATTATCTATTTTAAATTACTATAACAT
317 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * **
15488848 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTCAAATCTATTTATAGA-A
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAA-ATA-AAATA-ATA
* * * * *** * ** *
15488911 -TAAGTTCA--AATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATTTG-TTTCAAATCATTATGACTTTTT
61 CTAA-TTTATTAATA-TTCA--A-AAATT-AATAATGAAGAGATTT-AAA--A-AAT-A-AATCT
**** * * * *
15488971 GTTTTATCATAAAACAA-TTGTTGTTGTTCATACAAGCTTAGTTGGATTAAAATAATAT-TAGTT
114 G-TTTA-C-T-AAACAAGTTCAAATAGTT-AT--GA-C-TA-TTTGA--ACAAT--TATCTA-TT
* ** *** * ** * * *
15489034 T-ATTAAT-ATTTTGACAACTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAA-AATAAATATGCTTATTGA-ACA
164 TCA--AATCATTATGAC--CT--TTTGT-TTTG-TCATAAAACAAT-TGT-TTC-TATTCATAAA
* *** * ** **
15489094 AG----TTCAAATAGTAATAACTATCTAAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
218 AGCTTATTCAAATA-AAATAA-TA-CTAATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTA--A---TAAG-T
** * * * * * * * * *
15489155 TCGACA--TAAAACAATTATATTAGTTCATATAGGCTTATACGAAG-TAAAATAACTTATTAATA
272 AAGAGATTTAAAA-AA-TAAATTTG-T--T-TA--C-CAAAC-AAGTTCAAAT-AGTTATGACTA
** * * * *
15489217 TTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAGTTGTTTATCGAACAAGT
326 TTTGAACAATT-AT--CT-----ATTT----CA--AA-TTG-TTAT-G-AC--CT
* * * *** * * * * **
15489272 TCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAAT-TATCTATTTCAAATCATCATACAAGCTTATTTTAAA
1 T----TTGTTTTGTC-ATAAAACA-ATTGT-TTTAGTTCAT--------ACAAGCTTATTCAAAA
* * *
15489335 TAAAATAATA-TAAATTGACTAATATTCCAAAAATTAATAA-GCAA-AAATTTTAAAAAATAAAT
51 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATG-AAGAGA-TTTAAAAAATAAAT
* * * * *
15489397 CT-ATTATTTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
112 CTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
15489461 GACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTACTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATG
176 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA
* * * * * *
15489526 CTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAC
240 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC
* * * * * **
15489591 AAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGTTCT
305 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15489647 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTAATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
15489711 TTTATTAAAATTCTAAAAATTAGT--TG-A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
* * * * * * * **
15489772 TCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACTATTACCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGT
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
15489837 AAAATAATTGTTTTTATTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
194 AAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * *
15489901 C-AAAATT--TGA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCGAAC-CGATTCAAATAGTTAT
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG-TTCAAATAGTTAT
* * * * *
15489961 AACTATTTGAACAAGTATCTATATCAAATCAG-TATGATC-
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCT
* *** * * *
15490000 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAACTTATTTGGAGT-AAATATTGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
** * * * * ** * **
15490063 ACTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAACAATAAATATATTTGTTGAACCTG
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
15490127 TTCAAGTAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACTTTTTATTTAGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
15490192 TAAAATAATTTTTTC-AGTTCTTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAAT
193 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
15490256 T-AGAAAATTAATAAGCATG-GAATTTAAAAAA-AAAATTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
256 TCA-AAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
15490318 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGGCCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * * * * * * **
15490360 TCT-ACTTATCATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATTAAGTAATA-TTC
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15490422 TTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTG--GAGATTTAAAAAATAAATCAGTTCA-TCAAATA
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA--TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACA
* * * * * *
15490484 AGCTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTGT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
15490549 CATCAAACAATTATTT-TTTATCGA-AAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTATTAAT
191 CATAAAACAATTGTTTCTAT-TC-ATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * *
15490612 ATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA--T------T--ATCTGTTTACTGAGCTAGTTCAAATAGT
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * ** *
15490667 TATAACTATTTGAACAATTATATATTTGAAATCATTATAACCT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ***
15490710 TTTGTTTTGTCA-AAACACAATT-ATTGATGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * *
15490773 GTGTAATAATATTATAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAAAAAATTTATTTGA-TGAACT
64 ATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACA
* * * *
15490836 AGTTCAAATAGTTAAGGCTATTTGAATAATTAGCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * * * * * ** *
15490901 TGTAAAACAAATATTTTTGTTCACATAAGTTTGTTAGAAATAAAATAATTTTAATTTACTAATAT
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * *
15490966 TTTGAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTTAATTAGTTA
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * **
15491027 TAACAATTTGAACAATTAGT-TATTTCAAATCGTTATGACAA
320 TGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** * * *
15491068 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTAATACAATCTTATTTGAAATAAAGTATTGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ** * *
15491132 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGACA-A-ATTTAAAATATGAATATGTTGGCCTGATCA
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA-TGA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACTAAACA
* * * * * * *
15491195 AG-GCAAATAGTTATGACTGTTTGAAAAATTATTTATTTCAAATGATTATGACCATTTGTTTTAT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * *
15491259 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAACATAATTCGAATTTATTAATAT
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
15491324 TTAAAAAATTAATAAATAAGTGA-TT------T--A------T--CAACCAAGTTGAAATAGTTA
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * *
15491372 TGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAATCGCTATAACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCT
** * * *
15491413 TTTGTTTTGTCACT-AAATTATTTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACA
1 TTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
15491475 AATTTATTAATATTCATACAATTAATAA-GTAAAACA-TTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATA
63 AATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA
* * ** *
15491538 AGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
15491603 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGC-TATTCGGATTAAAATATTATTAATTTATTTATAT
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * **
15491667 TT-AGACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGAC
255 TTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* *
15491731 AT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTGACCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *** *
15491772 TTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTATCAGTTCATATTGGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * ** *
15491837 TTACTAATATTCTAAAAGTTAATTA-GTAAGAGATTCAAAAAATAATTCTTTTTTTTGAACAAGT
66 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
** * *
15491901 TCAAATAGTTATGACTATTTGAGGAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCATTTGTTTTTGTCA
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCA
* **
15491966 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * *
15492030 CCAAAAATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAAATCTATTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTT
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
*
15492093 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * **
15492135 TTTGTTTAGTCATAATCCAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * **
15492199 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-GTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTGAGTAAG
65 TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * **
15492263 TTCAAATAGTTATCACTATTTCAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATTATCTTTCATTTTGTC
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * **
15492327 ATAAAAAAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTAATT-AGAATAAAGTAATACTAATTTACAAATA-
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
15492390 TTCTAAAAATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAC
255 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAG
* * * **
15492454 TCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
317 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
** * * ** *
15492498 CCTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTATGTTGA-AGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * *
15492561 ATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAACAA
64 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAA
* ** * * ** *
15492622 G-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTGTGATC-TTCATTTTGTT
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * * *
15492685 GTAAAACCATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATA-T
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** * * *
15492749 TCTAAAAGTTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTGTCAAACCAGTTGAAATGGTTA
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
** * ** * * ** * *
15492814 AAATTATTAAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTCTGATCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15492855 CTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTCATTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAAAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
15492920 TTATTAACATTCAAAAAAATTAATGA-GCAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATTGAACAA
66 TTATTAATATTC--AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* *
15492984 ATTCAAATAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCT-TTAT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTT
127 GTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15493046 AGT-ATAAAATAATTATTTC-AGTTCATAAAAACTTATATGAAATAAAATAATACTACTTTATTA
189 -GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTAT-TCAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * ** * * ** *
15493109 ATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTGAACCAGTTCAAATA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* * * * ** * *
15493174 GTTATGACTGTTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATTATC-
316 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ***
15493218 TTTGTTTTCTCATAAAAATAATTGTTTCTA-ATCATACAAGCATATT-TGGATGAAAATAATACT
1 TTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACT
** * * *
15493281 AATTT-TATAATATTTTAAAATTAAT-A--AA-ATATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACCA
63 AATTTAT-TAATATTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACA
* * * * * ** * ** *
15493341 A-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCCATTTGAAATTGTTCA-AAATTTTTGTTTAG
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTG
* * *
15493404 TCATATAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAA-CTTATTCGATATAAAATAATACTAATTTATTAA
190 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
15493467 CA-TTCAAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAATTTTTTTTACCAAACAAGTTCAA
252 TATTTC--AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAA
* * * * **
15493531 ATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATCTAAAATCATTATGACCT
313 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15493579 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCATAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
15493644 TTATTAATATTTCAAGAA-T--TAAT-AACATATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAA-T
66 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAGT
* * * * * *
15493704 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTT-TATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGCTCTATCA
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** ** * * * *
15493768 TAAAATTATTGTTTCTATTCATTCAAGCTTCTTTGAAATAAAATAATACTAATTCAGTAA-ATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** * * * *
15493832 CCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAA-AAA-TTGATTTGTCGAGCTAGTTCAAACAGTT
257 -CAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTG-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
15493895 AAGACTATATGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACAT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15493937 TTAGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTAATCGAAATAGAATAAAATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * ** * *
15494002 TTATTAATATTTCAAAAATCT-ATAA-GTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGAACCAT
66 TTATTAATA-TTCAAAAAT-TAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* *
15494065 TTCAAATA---AT---TA--T-----A--A-CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * ** * * * *
15494114 TAAAACAATCATTTCAATTCATATGAGCTTATTTAATGTAAAATAATGCTCATTTATTAATATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * **
15494179 CAAGAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA-AGAATTTGTTT----ATTAAGTTCAAATAGTTAT
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** * ** *
15494239 GACTATTAGAGTAATTATCTATTTTAGAA-CATTATGACCC
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATTGTTATGACCT
* * * **
15494279 TTT-TTTTGTCAT-AAACAATTGGTTATA-TTCATGCAAGTTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-
* * ** * * ** * *
15494339 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAA-AAATAAAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAT
63 AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * ** * *
15494403 GTTTAAATAGGTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTCTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * *
15494468 ATAAACCAATTGTTTTTGTTCATCCAACCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT--TATTC
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * **
15494531 CAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCGGGTTCAAATAGTTATG
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * **
15494596 ATTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATAT
322 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * *
15494635 TTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTGTTCGAAATAAAACAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
*** * ** * ** * * * ** * * *
15494699 GAGATTTAA-A--AAATAAATTTGTTTACCAA-ACCAGTTCAAATAATTAAGGCTATATGAATAA
65 TTTA-TTAATATTCAA-AAA-TTAATAATGAAGA-GA-TTTAAA-AAATAAATCTGT-TTACTAA
* * * * * *
15494760 TTATC-ATTTTAAATCA-TTATAACCT-TTTG-----TT-T-TGTTGTAAAAT-A-AAT-A---T
123 --A-CAAGTTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGACCTT
* * ** * * * * * *
15494809 TT-TTGT-TCATATAA-GTTTG-TTCGA--AATAGAA---TA---AAAT-TAAT-TTATTAATAT
182 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAAT-T
* * * * *
15494860 T-TTAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AA--AA------T-----A-AAATCTGTTTACCAAACCA
246 TATTAATATTTCA-AA-A-A-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAA
* * * * * * **
15494909 GTTTAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGACAA
307 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * * *
15494963 TTTATTTTGTCAT-AGACAGTTGTTTCTA-CTAATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ** * *
15495026 TTTATTAATATTCTAAAAGTTAATAA-GTAACAGATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCCT-GACC
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTT-TACTAAACA
* * * * **
15495089 AGTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTTTTAA
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * ** ** *
15495154 CACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAGCTTATTTTGAATAGCATAATTCTAATTTATTAATAT
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
15495219 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
15495284 TGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** *
15495325 TTTGTTTTGTCAGAAAATAATT-TTTTCTCTTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-
* * * * ** *
15495387 AATTTATTAATATTCAGACATTTATAA-GTAAAAGATTT-AAAAAT-AA---G-TTACCCAATAA
63 AATTTATTAATATTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
** * * * * *
15495445 GTTCAAATAGTTATGGTTATTTGAACATTTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
15495510 ATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTAAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * *
15495575 TTGACAACTAATAAGTAAAAGGTTTCAAAAATAAATATT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
15495639 T-AATCATTTGAATAATT-TCTATTTCCAATTGTTATCACCT
320 TGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ** * *
15495679 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTATCAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAACAATATTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
15495743 TTTATTAATATACTAAAAATTAATGAGTTAAGAGA-TTGAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAA
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAAT-AATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* ** * * * * *
15495807 TTTAAATAGTTATTCCTATTTAAATAGTTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15495872 AAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTCGAATTAAATAATA-TAAATTTATTTATA-T
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * ** * *
15495935 TCCAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAACAATAAATATGTTTTCTGAGCATGTTCAAATAGTTAT
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * *
15495999 GACTATTTGAACGATTACCTATTTCAAATAGTTATGACCT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ** * *
15496039 TTTGTTTTGTTACAAACCAATTGTTTCT-GTTCATAGAAGCTTATTTGAAATTAAATAATAATAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* *
15496103 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT-AAAAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACGA
65 TTTATTAATATT-CAAAAATTAAT-AATGAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * * * * **
15496167 GTTTAAATAGATT-TGAATATTTAAAGAATTATCTATTT-AAGTCATTATAACCTTTTGTTCTAC
127 GTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
15496230 CAAAAAATAATTGCTT-TAGTTCATAAAAACTAATCCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
191 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * * * *
15496294 TTTCAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCCAAACCAGTTCAAATATTT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
15496359 ATGACTATTTAAACAATTATCAATCTCAAATTGTTACGATC-
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ***
15496400 TTTGTTTTTTCATAGAACAATTGTTTCT-GATT-ATACAAGCTTATT-TTGATAAATATAATACT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA-ATAATACT
* * * * *
15496462 AATTTAATAATATTTC-AAAA--ACTAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCAAACC
63 AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACA
** * * * * ** * *
15496522 AGTTCAAATAGTTAAAATTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
15496587 CATATAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAA-CTTA-TCAAGAAGAAAAAAATACTAATTTATTAA
191 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGCTTATTC-A-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * *
15496649 CATTTGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTAAAATA
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
** *
15496714 GTTATGACTATTTGAACAATTATAGATTT-AAAGTTGTTATTG-CCC
316 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTGTTA-TGACCT
* * *
15496759 TTTGTTTTGCCATAAAACAATTATTTTAGTTCATTA-AGGCTTA-TCAAAAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA-TACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTA
* * * * *
15496822 CTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTGAAAAATAAATCAGTTTATCGAATC-
64 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACA
* *
15496885 AGTTCAAATAATTATGGA-TATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATTG-CCTTTTGTTTT
126 AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
15496948 GTCATAAAGCAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAA
189 GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
15497012 TATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAA-AAATTCTATTTACCAAACCAA-TTGAAAT
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAA-CAAGTTCAAAT
*
15497070 ACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-ACCTT
315 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-T
* * * * *
15497116 TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCT-TTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
15497179 ---A-T--TAGT--AATATT--T--TGAA-A-A-TAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTT
65 TTTATTAATATTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTT
* * * * * * ***
15497229 TAAACAATTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
130 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * ** *
15497294 AAATAGTTATTT-TAGCTCATACAAGCTTATTTGAAATGGAATAA-AGCTAATTTATTACTATTT
195 AAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
15497357 CAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTTACCGAACCAGCTCAAATAATTAT
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
15497421 AACAATTTAAACAATTATCTTTTTCAAATTGTTATTACTT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *
15497461 TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGATT-GAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * *
15497525 TTTGTTAATATTTAGAAAACTAATTA-GTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCAT
65 TTTATTAATATTCA-AAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * ** *
15497589 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATTTTTTATTTTGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** ** * *
15497654 TTAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * ** ** ** * * * *
15497719 TGAAACTTAATAATTAAGAAAATTAAAAAAT-AATTCTAATTGTCGTACCATTTTAAGTAGTTAA
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-A
* **
15497783 T-ACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTAT-ACCCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCT
* * * ** *
15497823 ATTGTTTTATCATTAAACAATTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTC-GGATCAAAATAACACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAA
* * * ** **
15497886 TTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAATTAG
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * ** * * *
15497950 TTCAAATGGTGAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
15498015 TAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAATTAATACTAATTTATTGACA-T
193 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ***
15498078 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
15498143 ATCACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ** **
15498185 TTTGATTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTAGTAATA-ATTTCATTAGACCAGAAAT-AAA-AAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT--TCATACA-AGC-TTA-TTCA-AAATAAAATAAT
* * * *
15498247 ATTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTAATAA-GTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TC
60 ACTAATTTATTAATA--TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-
* ** * * * * * * *
15498309 GAATTAGTTAAAATAATTACGGCCATTTGAAC-GTTCATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTG
121 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
15498373 TTTTATCATAAAACAAATGGTTTTTA-TCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
185 TTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
15498437 TTAATATTTCAAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAGAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGTTTA
248 TTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCA
* ** * *
15498502 AATAGTTATGATTATTTGAACAATTATC-AGTCTT-AAATCATTAAGATC-
312 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-T-TTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15498550 TTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCT-GATCATAAAAACTTATTC-GATTAAAAAAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15498613 TTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AAGATATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAACCA
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-AATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAA
* ** * * * * * * *
15498676 GTTCAAATATTTAAAACTATTAGAATAATTATCTA-TTCTAAATCGTTCTAACCTTTTGCTTAGT
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * *
15498740 CA-AAAGTACTTATTTC-ATATCTTAAAAG-TTATTCAGAATAAAATAAT-CAAAATTTATAAAC
191 CATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAC-TAATTTATTAAT
* * * * * *
15498801 ATTTGAAAAATTAAGAAGAAAAAGATTTGAAAAAAATAAATCTT-TTTATCGAACAAGTTCAAAT
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * * * **
15498865 AGTTATGACTAGTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCT
315 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * * *
15498911 TTTGTTTTGACATAAAAGATTTTGTTTCAGTTTATATAAGCTTATCCATAATAAAATAATGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
15498976 TTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAA-GCAAGAG-TTTAAACAAATAAATTTGTTTACCAAACAA
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * * * **
15499039 ATTCAAATAGTTATTACTATTTGAGCAATTTTTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
15499103 ATAAAACAATTATTTC-AGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATA-
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
15499166 TTCTAAAAATTACTAAGT----GATTTAAAAAATTAATTTGTTTGCTAAATCAA-TCCAAATAGT
255 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * * **
15499226 CATGTCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * * * * *
15499269 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATTATATTGA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** ** * *
15499333 TTTATTAACATTTTGAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTGAAAAACCAAATCTATTTACTAAATAA
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* ** * * * * * *
15499397 GTTTAGTTAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACTTTTGCTTTATC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
15499462 ATAAAACAATTGTTTC-AGCTCCTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAT
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*** * *
15499526 TTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAA-AAATCACTTTACCAAATC-AGATCAAATAATT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
15499584 ATGGCCATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTATCT
319 ATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
** * * * * *
15499626 TTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCG-ACAT-CAAGCTTATT--AAATAAAATTATTATTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA-TAATACTA
* ** * * ** * ** * * * *
15499687 CCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAGCATACAAGCTTATTTGAAATA-AAATAATA
64 -ATTTAT-TAATAT--TCAAA-AA---TTAAT-A--AT-GAAG-AGATTTAAAAAATAAAT-CTG
* * * * * * * * * *
15499750 TTTA-TTAA-TATTTCAAGAATTAG-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATATGT-TTATCGAACCAG
115 TTTACTAAACAAGTTC-A-AA-TAGTTATGACTATTTGAACAAT---TATCTATT-TCAAATCA-
* * * * ** ** * * *
15499810 TTCAAAT-A-GTTTTGACTATTTG-AATAATTATCCA-T-TTTAAATTGTTATAACGTTTTGTTC
172 TT---ATGACCTTTTG--T-TTTGTCATAA--AACAATTGTTTCTATTCATA-AAAG-CTTATT-
* ** * * **
15499870 CATCATAAAATAATTA-TTTTTGTGCATACAAGTTTATTCAGAATAA--AATAA-TACTA-ATTT
226 CA-AATAAAATAA-TACTAATT-T--AT-TAA-TAT-TTCA-AA-AATTAATAAGTAAGAGATTT
* **** * * ** * ** *
15499930 -AATAAT--ATTCTAAAAATCCATAAGTAAGATATTTAAA-AAATA-AATCCCTTTG-CCAA--A
281 AAAAAATAAATT-TGTTTA-CCA-AA-CAAG---TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTA
* * *
15499987 -CCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAAT
338 TCTATTTC-AA-A-TT--G--T-TATG-AC-CT
* ** * * * ** * *
15500019 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-G-TCATAAAATAAGTATTCCAGCTCATACAA
1 T-T-TGTTT--TGTC-ATA-AAACAATTGTTTTAGTTCAT---ACAAG-CTT--A--T--T-C--
* * *
15500082 ATTTATTCGGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTTATAA-GTAAGAGATTTA
47 A---A-----AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTT-
* * * * * * *
15500146 AAAAAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAA-CTCAAATAATTATAACTATTTGCACAATTATCTA
101 ---AAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
15500210 TTTTAGATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-TGTTCATATAAGTTTGTT
162 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATAAAAGCTT-AT
* * * * * *
15500274 TGAAATAAAATAAAACTAATTTATTGATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAA
225 TCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
15500339 ATCTGTTTACCAAATC-ATTTCTAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
290 ATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* **
15500403 ATAATAT
354 ATGACCT
* * * * ** ** *
15500410 TTTCTTTTATCATTAAACAATTGGTTCTA-TTCATATTATTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * ** *
15500474 TTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGA-AATT-AAAAATAAATCTATTTGTTGAACCAA-
65 TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * ** *
15500536 TTCAAATAGTTAAGACTATATT-AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTT
128 TTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * * * *
15500600 ATAAAATAATT-TTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACAAATTTAATAATATT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
15500664 T-AAAAATTAAT-AGT-AGTATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCATATGGTTA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
** * * * ** * * *
15500726 AAACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTCAACT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** *
15500767 TTTGTTTAGTCATAAAA-ATATTGTTTCGGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *** **
15500831 TTTATTAACATTTGAAAAATTAATGA-GAAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTACGTACCGAACAA
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * ** *
15500895 GTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
15500960 ATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATATAAGCTTATACATAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
15501023 TTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATC-AGTTAAAATAAT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGT
* * ** * **
15501087 TATGGCCATTTGAACAACAATATATTTCAAATCATTATGACCT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *
15501130 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGCTTTT-GATCATACAAGCTTATTCTAAACAAAATAATATTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15501194 TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--ACG-GATTTAAAAAATAAATCTGGTTACTGATCCAGT
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
* * * *
15501255 TCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCAT
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** ** * *
15501319 AAAACAATTGTTTCCAATCATAGAAGCTTATTCAGTTAAAAATAATAAAAATTTAATAATATTCC
194 AAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * ** * **
15501384 AAAAATTAATAAG---G-GATTTTAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAA
258 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
15501445 CTATTAGAATAATTATTTTTTTAAAATTGTTTTGACCTTTTTTTTAAAATCAT
323 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-C-------------C-T
* * * * **
15501498 TTTGACCTTTTTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTAATATCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATA
1 TTTG------TTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * *
15501562 ATCCTAATATATTAACATTCAAAAAGTTAATAA-GCAAGAGGTTTGAAAAAATACATCTATTTAA
58 ATACTAATTTATTAATATTCAAAAA-TTAATAATG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTT-A
** * * * * * * *
15501626 C-GGACAGGCTCAAATAGTCATGACTATTTG---AATAAT-TATTTAAAATCGTTATGACTTTTT
119 CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * * *
15501686 ATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAGGTTTATCCAAAATAAAAATAAAACTAATTT
184 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAAT-AAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
15501751 ATTAATATTTCAAAAATTACA-AAGCAAGAGATTCAAAAAAATAAATCTATTTTCTAAACAAATT
247 ATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * * ** *
15501815 CAAATAGTCACT-ACTATTTAAATAATTGTATATTTAAAATCATTATGCCCT
310 CAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
** * * * * *
15501866 TTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAAATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAATAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *** * *
15501931 TTATTAATATGTCAAAAA-TAAAAAAGAAAGTGATTTAAAAAGGGAATATGTTTACCAAATCAA-
66 TTATTAATAT-TCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAG
* * * * * ** *
15501994 TTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGT-A
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
15502058 T-AAA-AATT-TTTC-A-TCATACACGCCTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
15502118 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATGTACC--A-AA---C---TAG-T-T-
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** * *
15502171 CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATAACAT
322 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * * * * *
15502210 TTTGTTCTGTTGTAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAACTTATTCAAAACAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * *
15502275 TTAATAATATTTTAAAAATTAATAACT-AAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTGTCAAAACAA-
66 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACAAG
* * * ** * * * *
15502338 TTTAAACAGTTAAGACTACATGAATAAGTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * *
15502403 TAAAATAATCATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
193 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * *
15502467 T--TGAA--AATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * **
15502527 TGGCCT-TGTCAACAACTATCTATTTCGAATCGTTATTAAAT
320 T-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * ** * * *
15502568 TTTGTTTGGTCATTTAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAACACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15502633 TTATTAATCTTTCAAAAATTAATAA-GTA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCT-AACTAGC
66 TTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGT
* * * * ** * *
15502695 TCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTGTAAACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCA
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
15502759 TAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATT
193 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** *
15502823 TCAAAAATTCATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATATTTAA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-A
* * * *
15502888 T-ACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** *** *
15502928 TTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATAC-TCCTTATTTGGAATAAAATAA-AATA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-
* * *
15502991 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AAC
63 AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAAC
** * **
15503054 GGGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACAATTATCTATTTCAAAATTGTTATGACCTTTTTGTTT
125 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACC-TTTTGTTT
* * * * ** * * * *
15503118 TGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATCTAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATACTAATCTATTAA
188 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
15503183 TATTTC-AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAG
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* ** *
15503243 TTATTACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CT
317 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15503286 TTTAGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGACTAAAATAATACTA
1 TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * *
15503350 ATTAATTAATATTTCAACAATTAATAA-GTAAAAAATTTTAAAAATAAATATTTTTACCAAACTA
64 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * * * * *
15503414 GGTCAAATAATCATGACAATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTTTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
15503479 ATAAAAGAATTGTTT-TAGTTTATATAAGCTGATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTATTA-
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * *
15503542 ATCAAAAAATTAATAA-TAAGGGATTTAAAAAATGAATATT-TTTACTGAACTAGTTTAAATAAT
255 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
15503605 TATGATCGT-TTT-AACACTTATCTATTTGAAATTGCTATAACCT
318 TATGA-C-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *** *
15503648 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A
* * * * * * *
15503711 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTA-GTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTGTTTTCTGAGCAT
64 ATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * * *
15503774 GTTCAAATAATTAAGACAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAGTATGACCTTTTGTTTTCTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
15503839 AT-AAACAAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
192 ATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * * * * * * *
15503903 TAAAAAAATTAACAAGTAAAATATTTAAAAAACAAATCTATTTACTAAGCGAGTTCAAATAATTT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * ** * *
15503968 TGACTATTT-ACACAATTATTTATGTCAAATCATTGTGATCTT
320 TGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCT
* * *
15504010 TTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAATAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT--AA-AATAATAC
* * * *
15504074 TAATTTATTTATATTCTGAAAATTAATAAGTTG--GAGATTTAGATAATAAATCTGTTTA-TCAA
62 TAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA--TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AA
* * * * * * * * *
15504136 ATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGACATTTTG-TT
123 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * *
15504200 TGTGATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATAATAGTTT-TTA
188 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * **
15504263 ATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCT-ATTA-CTGACGTAA-TTCAAA
251 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC--AAGTTCAAA
* * *
15504321 TAGTTATGACTATTTGAAC-ATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-
314 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ** * * * *
15504366 TTTGTTTTGCCATAAAATAACTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCTGAGTAAAATATTGCTAAG
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * ** * *
15504431 CTAGTAGTATTCTAAACAATTAATAAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAG
66 TTATTAATATTC-AAA-AATTAAT-AATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * *
15504495 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTAT-TA--TC--GT--TT-TGACCTTTTGTTTAT-TC
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TGTC
* ** * * * * *
15504551 ATAAAATAATTGTTT-TAGTTTGTACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATTTCTTCAACA
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATA
* * * * *
15504614 TTTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAACTAAATTTGTTTACTAAACAAGTT---AT-G-
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * *
15504674 ---G-CTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACC-
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15504712 TTT-TTTT-T--T----C-A-------A-TTCAT-CAAGGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAC
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
** * * ** * * **
15504759 TTTATTAATATTTTGAAAATTGATAAGTTG--GAGATTTAAAAAATGAAT-TAGCATATTGAATT
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA--TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAACA
* * * * ** * *
15504821 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGAACATTTGTTTTGT
126 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
15504886 CATAAAAGAAATGTTTTTAATT-ATTACTAATC-TATT--AAT-ATTTCAA-A--AATTAATTAG
191 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA-TA-AAAGCTTATTCAAATAAAAT-AATACTAATTTATTA-
* * * * * * * * * *
15504943 ATATTTTAAAATAAATCTATTTA-TCAA-ACTAGTTTAAATAGTTATGACTAT-TTAAGCAATTT
251 ATA-TTT-CAA-AAAT-TAATAAGT-AAGA-GA-TTTAAA-A--AATAAATTTGTTTACCAA---
*** * * * * ** * * ** * * *
15505005 TTTATTTCAAATTGTTGTGACTTTTTGTTCTATTAT-AAAAT--AATTGTTTCTGTTCAT
303 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG-TTATG-ACCT
** * * * ** ** * * ** *
15505062 ATAAGCTTAT-TCAGATTAA-AATAATACT-G-ACTTACTAATATT-TT-AATAAT-TAATAAGT
1 -TTTG-TTTTGTCATA-AAACAATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAA-AATAAAATAA-T
** * * * * * * * * * * * * *
15505120 AAAAATTT-TAAAAACT-AAATATGT-TTATTGAACTAGA-TCAAATAGT-CATGACTATTTGAG
60 ACTAATTTATTAATATTCAAAAAT-TAATAATGAA-GAGATTTAAAAAATAAAT--CTGTTT-AC
* * * * * * * **
15505180 TAATTATCTATTTAAAATGGTTATGACCT-TTTG-----TT-T-TGTGATAAAAAAATTAT----
120 TAA--A-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACC
* ** * * ***** * * * * *
15505233 TTTAG-TTCCT-AT-AAGCTTATTGAAAAAAATAAGACTAAG-TTATT-AATATTATGAAA-ATT
180 TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCAA-A-TA--AAATAAT
* * * * ** * ** * ** *
15505292 AGTAA-TTA--AGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGA-ATAAGTTTAATTAATTATGACTA
239 ACTAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAA--AAAATAAATT-TG--T-
* ** * ** * * * * * * *
15505353 TT-TC-AACAA-TT-ATCTATTTAAAATTACTAT-AAC-CTTTTGTTTTGTCATAA----AATGA
296 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATT-TCA-AATTGTTATGA
**
15505408 TTT
358 CCT
* * * * * ** * **
15505411 TTTTTTTCTGTTCGTACAAGCCTATT-TTGGATAAAATAATACAAATTTATT-AATAA-AAAGAT
1 TTTGTTT-TG-TCATA-AA-ACAATTGTT---TTAGTTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAA-AT
* * * ** ** * * * * **
15505473 AATTAATAAGTAAAAAATATAAAAATAAATCTATTTATCGAACA-AGTTT-AAATATTTATGACT
57 AA-TACTAATTTATTAATAT-TCAA-AAAT-TAATAAT-GAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT--CT
* * * ** * * * * * *
15505536 ATATAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTTC
114 GT-TTACTAA--A-CAAGTTCAAATAGTTATGAC----TA-TTTG--A-ACAATTATCT-ATTTC
* ** * * ** *** ** * * *
15505600 -ATTCA-TACAAGCTTATACGGATTAAAATAATATTAATT-TATTAATATTTCA-ACAA--TTAA
166 AAATCATTATGACCTT-T-TGTTTTGTCATAA-AACAATTGT-TT-CTA-TTCATAAAAGCTTAT
* ** ** * * ** * *
15505659 T-AAGTAAAA-AATTTTAA-AAATAAATATGTTTTTTGAACAAATT-CCAAGTCATGACTATTTA
225 TCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-----TTTCAA-AAATTAATAAGT-AAGA-GATTTA
* * * * ** * * ** * ** *
15505720 AATAAT-TATCTATTT--CAAATTATTGTGACCT--TT-TG--T-TTTGTAATAAAACAAT-TGT
282 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTG--A-ACAATTATCTAT
* **
15505775 TTC-AGTTCATAT-A--T
343 TTCAAATTGTTATGACCT
** * ** * ** * * *
15505789 TTTAG--TTGAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATATTCTAAAAATTATT--GAGTAAAAGAA
1 TTT-GTTTTGTCATAAAACAAT--TGTTTTAGTTCATA--C--AAGCTTATTCAAAATAAAATAA
** * * * * * **
15505849 T--TAA-AAAATAA-A-TC---TATTTATAA--AA-AAATGTT--CAAATAGTTCTGATTATTTG
59 TACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAATGAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTG----TTT-
*** * * * * * *
15505901 AACATATATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTG-A-AATAAATCAATGGTTTCTATTC
118 -AC-TA-AACAAGTTCAAATAGTTATGA-C---TA-TTTGAACAAT-TATC--T-ATTTCAAATC
*** * * * * **
15505964 A-TA--AAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATAATAATT-TA-T--TAAAA---T-TTC--A-AAA
171 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAA
* * * * * * ** * * *
15506014 AT--TAATAA-GTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA-ATCGAGTTCAAATAGCTATG
234 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--TA--AGA--GA-TTTAAA-A--AATA
* * * * ** * ** ***
15506074 ACTAT-TTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGATCT-TTTG---TTTTATC-ATAAAACA
289 AATTTGTTTACCAA--A-CAAGTTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCA-A
15506132 ATTGTT-T---C-
348 ATTGTTATGACCT
* ** * **** * ** * ** * * * * * * *
15506140 TAT-TCAT-ACA-AGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-CTTATTGATATTCTAAATATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACT
* ** ** * * * ** **
15506201 AAGTT-GGAGATATAAGAAATAAGTCTAGA-CATCGAACTAG-TTCAAAAAACTATGTCCATTTA
63 AATTTATTA-ATAT-TCAAA-AA-T-TA-ATAAT-GAA-GAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTT-
* * * * * * *
15506263 AACTATTATCTATTTCAAATTA-TTATGAC-ATTTTG-----TT-T-TGTCGT-AAA-AAGTATT
118 -ACTA--AACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTA-T
* * * * ** * * * * * * * *
15506317 G--C--AT-TTAT-TCATACAA-AATTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATT-TATTAATAT-TT
176 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAA-AA-GCTTATTCAAATAAAATAAT
** * * * * * ** * * * * * * *
15506372 CAAAAATTAATAAGAGATTT-AAGAACTAAATTTGTTTATCGAACCAATTCAAATAGT-TATGAC
239 -ACTAATTTATTA-ATATTTCAA-AAATTAATAAG--TA-AG-A--GATTTAAAAAATAAAT--T
* * * ** * * *
15506435 TGTTTGAACAATTATCTA-TCTCAAAT-GTTATGA-TCTTT--A-TTTTATC-A-TACAAGCTTA
293 TGTTT-ACCAA--A-CAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATTG
* **
15506492 TT-CGAAAT
352 TTATGACCT
**** * * * * * * * *
15506500 AAAATATTGTTA-AATTAATAATAT-TTTAAAAATT-A-ATAAG--TA-ACAAATTTAAAA-AAT
1 TTTGTTTTGTCATAA--AACAAT-TGTTT--TAGTTCATACAAGCTTATTCAAA-ATAAAATAAT
* * * * * * * * ** **
15506557 AAATATGTTTGCTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAA-AGCAATTATCTATTTCAAATC-
60 -ACTA-ATTT-ATTAA-TA-TTCAAA-AATTAATA--ATGAAGAG-ATTTA-AAAAAT-AAATCT
* ** **** * * * ***
15506620 -ATT-CT-AAC-CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATAACTATTCGAAAT
114 GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACT-ATTTGAACAATT-AT-C-T-A-T-TTC-AAAT
* * * * ** ** *
15506681 AAAATAAT-A-CTAATTT-ATTAG-CACTCAAAA-AA---TTAATAAACA-AGAAA--TT-TTTA
170 --CATTATGACCT--TTTGTTTTGTCA-T-AAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCA
* * * * * * * * * ***
15506734 AAAATAAATCGATTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTAT-GACATTTAA-ACAATTATTTATTTAA
228 AATA-AAAT--A-ATACTAATTTA-TT--AATA-TT-TCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
15506797 AATAACTATGACCTTTGTTTTATCATA-AA----AAATTGTT-T---TAGTTCATAAAATTTTAT
283 AA-AA-TA--A-ATTTG-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAA--TTAT
** * ** * *
15506853 CTGAAAT-AAAATAATATTACTT
339 CT-ATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** * ** * * * * **
15506875 TATTAATATT-TCA-AAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAATAAGTCAGTTTATTGAATTGGTT
1 T-TT-GTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTTAG--TT-CATACAAG-C---TTATTCAA---AAT
* * * * * *** *** *
15506938 CAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGAATTTTTGTTTTGTTAT
52 AAAATAA-TA---CTAATT---T-ATTA-ATA-TTCAAA-AATTAAT-AA-TGAAGAGAT-TTAA
* * * * * * ** * * * ** *
15507002 AAAAT-AAT-TGTTTTTCATCATACAAG-CCTATTTGGAATAAAATAATATTAAATTATTA-ATA
103 AAAATAAATCTG-TTTAC-T-AAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACT-AT-TTGAACAATTATCTA
* * ** * * * * *
15507063 TTTCAAA-AATTAATAGTAGGCGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCA--GTTCCTGTT-
162 TTTCAAATCATT-AT-G-A--C-CTTT------T-GTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * * ** ** **
15507124 -TGAACAA--TTATTTAATTCTAATTGTTA-TAACCTTT-TGTTCTATTTCTAAAATAATTGTTT
213 AT-AA-AAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAA--TTTAT-TAATATTTC--AAA-AATT-AAT
* * * * ** * *
15507184 CAGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA--ATAA-TA-TTCTAAA-AATTA
268 AAG----TA-AGA--GATTT--AA-AAAATAA-ATTTGTTTACCA-AACAAGTTC-AAATAGTT-
* * * * * * * *
15507244 ATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAGTAGTT-TAAACAGT
319 ATGACT-----ATTTGAACAAT-TATCTA-TT-TC-AAATTGTTAT-GAC-CT
** * * * * * * ***
15507296 TAAGACTATATG-AATAATTATCTATT-TCTAATCGTT-ATGACCTTTCATT-TTGGCATAAA-A
1 TTTG--T-TTTGTCATAA--AACAATTGT-T-TTAGTTCAT-A-CAAGC-TTATT--CA-AAATA
* * * **
15507356 CAATTGTTTCAATTCTTACAAGCTTATTTGCAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
53 -AA----AT-AATAC-T--AA-TTTA-TT--AATATTCA-AA-A-------ATT-A-A-T-----
* * * * * *
15507420 AAGTAATAAGTGATTTAAAAAGTAAAT-TAGTTTA-TCAAATTAA-TTCAAATAATTATGGCTAT
88 AA-T--GAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
15507482 ATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TGATATT-TG
147 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T-TTCT-
* ** * * * *
15507545 A-ACATTCAATCTTATTCGAAATAAAAGAATACTAATTTATTAATCTTTGAAAAATTAATAAGTA
209 ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
15507609 AAAGCTTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTT-TAA-A--TA-GACTATTTGAACAATTG
273 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
15507668 TATAATTCAAATTGTTATAACTTT
338 TCTATTTCAAATTGTTATGAC-CT
* * * **
15507692 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTCGTTCATATAAG-TCTATTCGTAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * *
15507756 TCTAATAATATTACAACAATTAATAACT-AAGAGAATT-AAAAATAATTTTGTTT-GTCGAACTA
65 TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAA
* * * ** ** *
15507818 TTTCAAATATTTAAGACCGTAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
15507883 ATAAAACAATTTTTTCAATTCATATTAA-CTTAATCGGAATAAAATAAAACAAAGTTATTAATAT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
15507947 TTCAAAAATTAATGAA-TAATAGATTTTAAAAAATAATTTTGTTTACTTAACCAA-TTCAAACAA
255 TTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAG
* * *
15508010 TTATAACTATTTAAACAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCT
317 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * * * *
15508054 TTTATTTTGTTAGAAAACAAATT-TTTT--TT-ATATAAGTTTGTTTAGAATAAAGTAATACTAG
1 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15508115 TCTATTAATATTTC-TAAA--ACTAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTAATCAAACCAA
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA-CAA
* * ** **
15508175 -TTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCATTATAATTTTTTGTTTAAT
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
15508238 TATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAACA
191 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * ** * * * ** ** * * *
15508302 TTTTGATAATTGCTAA--AAAAAATTTAAAATA-AAAGGT-TTTGTCATA-ATG-T--AATTGTT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *** * *
15508359 -T--CTA-TTCATACAA-AAT-TA-ATCAAAATAAAATAATACT
319 ATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCT
* * * * * * * * * * * * **
15508396 AATTTATTAATAT-TTTAAA-AATTAG--TAAGAATCTTAAAAACTAAATCTATTTATCGGACCA
1 --TTTGTT-TTGTCATAAAACAATT-GTTTTAG-TTCATACAAGCTTATTC-A-AAAT---A--A
** * * ** * *
15508457 GTTCAATTAGTTATGCTTATGTGAATAATT-AACTATCTCAA-ATTGTTAAGATCTTTGTTTTGT
54 AAT-AA-TACTAAT--TTAT-T-AAT-ATTCAAAAAT-T-AATAATG--AAGA-----G-ATT-T
* * * * **
15508520 CATAAAATAATTATTTATGTTCATA-TAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTG-CTAAATTAAT-A
101 -AAAAAATAA--A--TCTGTT--TACTAAAC-AAGTTCAAA-T-AGTTA-TGACT--ATT--TGA
* * * * * * *** * ** * * *
15508581 AAAGATAAACATGTTTGCCAAACCA--A-GTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATGATCCATT
151 ACA-ATTATC-TATTT--CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAAT--T--GTT
* * ** * * * ** * ** *
15508643 TCAAATCATTC-TGACATTTTGTTTAGCCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATATGCTTATTTG
206 TC---T-ATTCATAAAAGCTTATTCA--AATAAAATAA---TACTAATT--TAT-T-AATATTTC
** * * ** ** * * ** * * * *
15508707 AAATAAAAAAAAAATACTA-ATTTGTTAAGATTCAGAAACTTAATAAACAAGA-AATTTTATAA-
258 AAA-AATTAATAAGTA--AGAGAT-TTAA-A-AAATAAATTTGTTTACCAA-ACAAGTTCA-AAT
* * * * * *
15508769 A-ATA-AATCTATTTATTGAACAAGTGCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAAATATCTATTTAA
315 AGTTATGA-CTA--T-TTGAACAA-T-----TA-TCTAT-T-----T---CAAAT-TGT-TAT-G
***
15508831 AAAA
357 ACCT
* * * * * * * * *
15508835 TATGACTTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTGAGCTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATA
1 TTTG-TTTTG-------TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * ** *
15508900 ATATTACTATATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAA-AAATTTAAAAAATAGGTC-ATTTA-T
58 ATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
*** * * * * * * *
15508962 CAAGTTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTTAATAATTATCTATTTCAAAT-A-GATGCAAACTTT
121 -AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG--ACCTTT
* * * * *
15509025 TATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATT
183 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATT
* *
15509089 TATTAATATTTCAAAAAATTAGTAAGTACGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-----
246 TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
* ** ** *
15509149 C----AG-T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAATCT
310 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * ** *
15509193 TTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCTTATT-AGTAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAA
* * ** * * *
15509257 TTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AG
65 TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAG
* * *
15509321 TTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTGTGTC
128 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
15509385 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATAT
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
15509449 TCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
15509513 ATGGCCATGTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * ** *
15509555 TTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTT-GAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * *** * * * *
15509619 TTTACTAATCTTTCAAAAATTAAT-ATGTAAGAGATTTTTTTAAA-AAATCTATTTATTGAACTA
65 TTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAATG-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * ** ** * * * *
15509682 GTTCAAATTGCTATGACTATTTGAACGATTGTAAATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * **
15509747 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
15509812 TCAAAAATTAATAA-TTAGTAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCTAACATGCTCAAATATTTA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-
* * * * *
15509876 AAGACTATATGAACAACTATC-AATTCAAATCGTTATGACCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** * *** * *
15509917 TTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
15509982 ATTTATAAATATTTAAAAAATTAATAA-G-AGA-TTTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT-AAC-C
64 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAA
* * ** * *
15510042 GTTCAAATAATTATGAATATTTGATTAATTATCTATTTCAAATCACTATGACATTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
15510107 ATAAAATAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAACAAAGTAATACTAATCTT-TTAATAT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATAT
* * * * *
15510171 TTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTA
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
** * * * * *
15510232 TGACTATTTGAGTAGTTATTTATTTTAAATTATTATTACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * *
15510273 TTTGTTCTATTACAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * **
15510337 TTTATTAATATTTCAATAATTAATAA-GTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACTT
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAA
** * * * * * * * *
15510400 GACCAAATAATCATGACTGTGTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
15510465 ATAAAAGATTTGTTTC-AGTTCATATAAGATTACTCAAAATAAAATAATAGTAATCTAGTAATA-
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *** * *
15510528 ATCAAAAAATTAATAA-TAAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTGTATTGAACAAGTTAAAATAAT
255 TTC-AAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
15510592 TATGACTATGTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACTT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *
15510635 TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTCTA-TAT-AGACAAGCATATTTC-GAATAAAATAATA-T
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGT-TCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT
* *
15510696 AAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTAGC-GA
63 -AATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAA
* * * * * * ** **
15510757 ACAAGTTTAAATCGATATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAATTTGTTATGATTTTTTGTTT
123 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * ** * **
15510822 TTTCGTAAAACAACTACTTCTATTCATACAATTTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAA
188 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
15510887 TACTTT-GACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAACAAGTTCCAAT
252 TA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AACAAGTTCAAAT
* * * * * *
15510950 AGTCATGACTATTTGAATACTTATCTATTTGAAATCGTTATGATCT
315 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15510996 TTTGTTTTG-CTATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATATAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * *
15511059 ATTTATTATTATTCTAAAAATTAATAAGTTG--GAGATTTAAAAAATATATCTATTTA-TCGAAC
64 ATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA--TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC
* * * * * ** * * * * *
15511121 AAGTTCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTAATTACATTTTGATTCG
125 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** *
15511186 TCACAAAACAATTGTTT-TGATTCATAAAAAATTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
190 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * *
15511250 ATTTCAAAAA-T--TAA-CAAGAGCTTTAAAAACTAAATCTATTAACCAAACCAGTTTAAATAGT
253 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
15511311 TATGACTATTTGAACACTTATCTATCTCAAATCGTTCTGATC-
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** * * *
15511353 TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTGTAG-CCATACAAACTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
15511417 ATTAATAATATTCTAAAAATTATTAA-GTAAGAGATTTGAAAAATTAATATGTTT-GTCAAACCA
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAA
* * * * *
15511480 GTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
15511545 AT------A-TG-CT-TATTC----AA----A---AAA-AAAATAATACTATTTTATTAA-CTTT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
15511588 CAGAAAATTAGTAAGCATGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTTT
257 CA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * **
15511653 TGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAATCATATGACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * * * *
15511693 TTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
15511758 TTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTG--GAGATTTAAAAAGTAAATCAGTTTAACGAATCCA
66 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA--TGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACAA
* * * *
15511821 -TACAAATAATTATG-CTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGT
127 GTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** *
15511884 CATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAA-AA-ACTAATTAATTAATA
191 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
15511946 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAAGAAATATT-TTTACTAAACCAGCTCAAATAGT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * *
15512009 TATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *
15512052 TTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTAAGTTCATATAAGCTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * *
15512117 CTAATAATATT-ATGAAAATTAATAGCT-AAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTAGTGAACAAA
66 TTATTAATATTCA--AAAATTAATA-ATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
** * * * * * * * *
15512180 TTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTGTATCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * ** *
15512245 TAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * *
15512310 TAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATA
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
15512371 ACAATTTGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACCA
322 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * ** * *
15512409 TTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAGCTAATTTGAAATAACATAATTCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15512473 TTTATTAATATTCTAAAA--AATAA-GTAAGATATTTAAAAACTAAATATGTTTA-TCAAATAAG
65 TTTATTAATATTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * * ** ** * * *
15512534 TTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTTA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
15512599 TAAAATAAATTCTTT-TATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-
193 TAAAA-CAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
** * ** * *
15512661 TTCAAACAACAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAAATAGT
255 TTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * ** ** * *
15512726 TATGATTATTTGAACAATTATTTATTGGAAATCATTATAACTT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *
15512769 TTTGATTTGTCATCAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15512833 TTTACTAATATTTCAACAATTAATAA-GTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAG
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * *
15512896 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * ** *
15512961 TCAAACAATTGTATCAATTAATATAGGCTT-GT----TAAAATAGCACTAATTGATTAATA-TTC
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * **
15513020 TAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAATATGAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-
258 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
** * *
15513084 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTAACCT
322 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* **
15513123 TTTGTTTTGTC-TAAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTACTT-TGAATAAAATAATA-T
1 TTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT
* * * *
15513184 AAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAA-GTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTT--T----
63 AA-TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* * * ** *
15513241 ---TT----TA---A-CAC-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTATGACATTTTGTTTTG
125 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * *
15513294 TCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCGTATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATA
190 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
15513358 TTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTT
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * **
15513423 ATCATTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATTATAT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * *
15513465 TTTGTTTTATCATAAAGCAACTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * * *
15513529 ATTAAAAATATTCTGAAAATTAAT-AGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAACAA
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAA
* * * * * * *
15513592 GTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGATTATAATCTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
15513657 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATATTAATCTATTAATAT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
15513721 TTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAAACAAG-TCAAATAGTT
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
15513780 ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *** *
15513821 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
15513885 TTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTATTTGCCAAACTAGT
66 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
* * * * * * * *
15513949 TGAAATAGTTAAGAGTA-TTGAACAA-TATTTTATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCA
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
15514012 TAAAATAATT-ATTCCAGTTCATACAAGCTTATTTACAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-T
193 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
15514075 TCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAATTAATT
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * **
15514140 -TTACTATTTGAACAATTATCTATAT-AAAGTCATTATGACCT
319 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGACCT
* * * * * *
15514181 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTAATAAAAACTTATAT-GAAATAAAATAATACTAC
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * ** * *
15514245 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-GCCAGACATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAG
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
15514309 TTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATG--GTATTT-TTTTCTC
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTC
* * * *
15514371 ATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCATATTCAAATGAAAGTAATACTAATTTA-TAATAT
192 ATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
15514434 TAT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTACAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAA-TTTAAATAAT
255 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
15514493 TAAGACTATTTTAATAATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGA-CT
318 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-GACCT
* * * * * * ***
15514535 TATTATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
1 T-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * **
15514600 TTTATTAAAATTCAAAATATTAATAA-GAAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
65 TTTATTAATATTCAAAA-ATTAATAATG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* ** * * **
15514664 GTTCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
15514729 ATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACA-TTATTAATA
192 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA
* *
15514792 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTA-CAGAATCAA-TTCAAATAA
254 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
15514855 TTATGACCT-CTTGAACAACTATCCATTTCAAAATGTTATTACCG
317 TTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15514899 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCA--ACATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
15514962 TTTATTAATATTTCAAGAATTAACAA-G-AGACA--TAAACAATAAATCTATTTACTGAACTAGT
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGT
** * * * *
15515023 TCAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTCTATCA
129 TCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** *
15515088 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *** * *
15515153 CAAAAATTAATAATTAAGA-ATTTTAAAAATAAATTCGTTTATTGAACCAGTTCAAACAGTTGA-
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-AT
* * * *
15515216 GACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACCT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** ** *
15515256 TTTGTTTT-TCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGGATAAAACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * *
15515320 TTATTAACATTTCTAAAATTTATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTA-TCGAACCAT
66 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAG
* * *
15515383 TTCAAATA---AT---TA--T-----A--A-CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTAA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15515432 TAAAACAATCGCTTC-AGTTCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAAT-ACACTAATTTATTAATATT
193 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * * *
15515495 TCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTGACCAAATAATTTCAAATAGTTA
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* ***
15515559 TGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ***
15515600 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TTTATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A
* * * * * * *
15515663 ATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAT-AA-AAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACAT
64 ATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* *
15515726 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * *
15515791 ATAAAACAATTGGTTT-TATCCATGCAAGTTTATTTTGAAA-AAAATAATATAAATTTGTTAATA
192 ATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAAAAGCTTA--TTCAAATAAAAT-A-AT--A----CTAAT-
* * * *
15515854 TTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAATAAATTTATTTT
245 TT------ATTAAT-A-T-TT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTA
* * * ***
15515917 CTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCT
299 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ***
15515979 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TCCATGCAGGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A
* * * * * * *
15516042 ATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAT-AA-AAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACAT
64 ATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* ** *
15516105 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
15516170 ATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTACAATCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT--TATT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ***
15516233 CCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTAT
256 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** *
15516298 GACTATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
**** * ** * ** *
15516338 TTTGTTTAAAAAGAAAAGTATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *** *
15516402 TTTATTAATACT-AGAAAA-TAATGAGTTG--GAGATGTAAAAAGTAAAGCCACTTACTGAACAA
65 TTTATTAATATTCA-AAAATTAAT-A-ATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * * * *** **
15516463 GTTCAAATAATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTC
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
15516528 ATAAAACTATTGTTTTTATTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * *
15516592 TTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAATTA
255 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * ** * *
15516653 TGCCTATTTGAATAATAACCTATCTCATATCATTGTGATC-
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* ** * *
15516693 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGATATAAAATATTACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ** *
15516757 ATTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGAGGTTT-AAAAAT-AATACTAATTAC-AAA-TA
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACTAAACAA
* * * * ** * * * *
15516817 TTTCTATTGATACAAGTT-T--CTGTTCATGCAA-AATTATTTAGAATAAAAT-AATACTAATCT
127 GTTC-A---A-A-TAGTTATGACTATT--TG-AACAATTATCTA-TTTCAAATCATTA-TGACCT
* ** * *** * * * ***
15516877 ATTAATATTTTG--A-AAATTACAAAGAGATT-TAAAAACT-AAATCTAATTACCGAAACAGGTT
181 -TT--TGTTTTGTCATAAA--AC-AATTGTTTCTATTCA-TAAAAGCTTATT--C-AAATAAAAT
* * * * * ** * * *** * *
15516937 AA-A-T-AGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATCTCA-A-ATCGTTATGATCTTTATTTTGTC
236 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAGAGAT--TTA-AAAAATAAATTTGT-
* * ** ** *** *
15516997 ATA--AAAC-AG-T----T-GTT-T--CT-TTTCATACAA-GCT-TATTT-GGATTAAAAT-A-A
296 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
15517044 T
360 T
* ** * *** * * * * ** * *
15517045 ATTAGTTTAATAATATTCCAAATATTAATAAG-T-A-A-AAGATT-TAAAAAATAAATGTATCTA
1 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT--TTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA-ATA-ATA
* * * * * * ** * *
15517105 CTGAACCGGTTGA-AAATAGTT--AAGAGT-ATTA-GAACA-ATTTTTTATTTCAAATCATTCTG
61 CT-AA----TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGA---TTTA--AAAAATAAATCTG
** ** * * * * * * * *
15517164 ACCTTTTGTTTTA-AA-TT--AATGAG-CAAGA-GATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-C
115 ----TTTACTAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTT-GAACAAT-TATCTATTT--CAAATC
* ** * * ** * * * ** * *
15517222 A--A-GTCCAAATAGATTTT-ACTATTTGAACAATTATCTATATAAAATCATTATGACCTT-TTT
171 ATTATGACC-TTTTG-TTTTGTC-A-TAAAACAATTGT-T-TCT--ATTCA-TAAAAGCTTATTC
** *** * * ** * * *
15517282 ATTTTGTCATAA-AATAATTGT-TT--TAGTTCATAAAAACTTATATGAAACAAAATAATACTAT
227 A-AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC--AAAAA-TTA-AT-AAGTAAGA-GAT-TTA-
*** * ** ** * * * * * * *
15517343 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGTAAAGCGATTTTTTGAACTAGT
282 AAAAATAA-ATTT----GTTTACCAAAC-A-AG-TTCAAATAGT-TA-TGACTATTTGAAC----
* *
15517408 TGAAATAGCTATGACTATTTGAATCTTAACTTGTTATGATC-
333 ---AAT---TAT--CTA-TT---TC--AAATTGTTATGACCT
* * * ** *** *
15517449 TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTCT-GATCATACAAGCACATT-TGGATGAAAATAATACCA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTA
* * * * * *
15517512 ATTT-TATAATATTTTAAAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTTTTTGCAAAACCA
64 ATTTAT-TAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
** * * * * * *
15517572 GTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCA-GACTTTTTATTTGGT
127 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
15517636 CAGATAATAATTGTTT-TAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
191 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * *
15517700 -TTCAAAAAAATTAATAAACAAGTGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
254 TTTC--AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* *
15517764 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCT
316 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * *
15517809 TTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-AT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
15517872 GTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATC
66 -TTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-AATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTA-AA-C
* * * * * * * *
15517934 AA-TTCAAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGCTTT
125 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15517997 GTCATAAAATAATTGTTTTTCA-GCATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
189 GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
15518061 TATTTCAAGAATTAATAAG---G-GATTT-AAAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTCAAATAG
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* *
15518121 TT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT
317 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
15518164 TTTG-TTCGATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACTA
1 TTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
15518227 ATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAAT-AAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-GTCGAACT
64 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-AATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACA
* * * * * ** *
15518290 AGCTT-AAATAGTTAAGAATGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTG
126 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * ** * * * *
15518354 TCATAAGACAATTATCTCAACTT-ATACAAGCTTATTGGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAAC
190 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * *
15518418 ATTTTC-AAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTTGTCAAACCATTTCAAATA
253 A-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* **
15518477 ---AT---T-TAT-AAC---TAT-T-TTT-AAATCATTATGA-CT
316 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * * ** * *
15518507 TTTGCTTTTTGTAATAAAACAATAGTTTCAGTTCATATAAGCCTATTTGAAGTAAATTAATACTA
1 TTTG--TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* ** * * * *
15518572 ATTTGACTAAATATTTTGAGAATTAAT-GTGTAAGAGAATTAAAAAAGAAATCTGTTATAC-AAA
64 ATTT-A-TTAATA-TTCAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACTAAA
* *
15518635 TAAGTTCAAATAGTTATGAC----T-----A-T-TC-A----AAA-CATTATAACCTTTTG-TTT
124 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * ** * * **
15518682 GTCATAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
189 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * **** * *
15518746 TATTTC-AAAATTAAGAATTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACATGTTTAAATAG
252 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
**
15518809 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA--CATATGACC-
317 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * *
15518850 TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-GTTCGTGCAACCTTATTCTAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15518914 TTTATT--TATTCTAAAAATTAAGAA-GTAAAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAG
65 TTTATTAATATTC-AAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * ** * *
15518976 TTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * **
15519041 TAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** * ** * *** * *
15519105 -ATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGT
257 CA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * **
15519168 GTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAATTGCTATGAAAT
321 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * * ** * *
15519208 TTTGTTTTGTCGTAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15519273 TTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAA-TAGT
66 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGT
* * * * * * *
15519333 TTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTAACCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCAT
129 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
15519397 AAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATACTACTAAATAAATAATA-TTC
194 AAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *** * * *
15519461 TAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAAGGC-A-TTTAAATAGATA
258 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACCAA-ACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * **
15519524 TGACTTTTTGAACAGTTATCTATTTCAATTTTTTATGATAT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * **
15519565 TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGAAATAAAA-AATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * ** *
15519628 TTTATTAATATTCCAAAAACTAATAA-GTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCGAGCAAG
65 TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAATG-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * * * *
15519691 TTCAAATAGTTATCACTGTTTAAACAATTATTTATTTTAAAT-AGCTATTATCTTTTGATTTGTT
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * **
15519755 ACAAAACAATTATTTCTATTGATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACAAATA-T
192 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * *
15519819 TCTAAAAATTAATTGGTAGGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCA
256 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * **
15519884 TGTCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCT
320 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * * ** *
15519925 CTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * ** * *
15519989 TCTATTAATATTTTGAAAA-T--TACT-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTAATTACCGAAACAGG
65 TTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAG
* * * * * *
15520050 TTC-AATAGTTATCAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
128 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * * *
15520113 TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAGTTTAATAATATTC
193 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * *
15520178 CAAATAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
257 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
15520213 GTATCTAATG
Statistics
Matches: 32040, Mismatches: 8254, Indels: 6821
0.68 0.18 0.14
Matches are distributed among these distances:
321 4 0.00
322 3 0.00
323 14 0.00
324 29 0.00
325 7 0.00
326 19 0.00
327 68 0.00
328 166 0.01
329 93 0.00
330 45 0.00
331 40 0.00
332 16 0.00
333 8 0.00
334 19 0.00
335 126 0.00
336 236 0.01
337 188 0.01
338 48 0.00
339 91 0.00
340 395 0.01
341 215 0.01
342 188 0.01
343 192 0.01
344 486 0.02
345 411 0.01
346 220 0.01
347 159 0.00
348 71 0.00
349 63 0.00
350 305 0.01
351 284 0.01
352 321 0.01
353 527 0.02
354 924 0.03
355 1327 0.04
356 1702 0.05
357 2055 0.06
358 2640 0.08
359 2480 0.08
360 2474 0.08
361 2573 0.08
362 2451 0.08
363 2064 0.06
364 830 0.03
365 395 0.01
366 430 0.01
367 113 0.00
368 95 0.00
369 60 0.00
370 79 0.00
371 52 0.00
372 54 0.00
373 67 0.00
374 100 0.00
375 162 0.01
376 118 0.00
377 136 0.00
378 349 0.01
379 441 0.01
380 152 0.00
381 81 0.00
382 87 0.00
383 136 0.00
384 77 0.00
385 53 0.00
386 122 0.00
387 87 0.00
388 96 0.00
389 73 0.00
390 157 0.00
391 95 0.00
392 57 0.00
393 53 0.00
394 81 0.00
395 54 0.00
396 71 0.00
397 65 0.00
398 38 0.00
399 37 0.00
400 45 0.00
401 68 0.00
402 40 0.00
403 67 0.00
404 83 0.00
405 44 0.00
406 34 0.00
407 33 0.00
408 25 0.00
409 67 0.00
410 44 0.00
411 42 0.00
412 15 0.00
413 34 0.00
414 28 0.00
415 25 0.00
416 19 0.00
417 19 0.00
418 17 0.00
419 26 0.00
420 31 0.00
421 27 0.00
422 19 0.00
423 18 0.00
424 22 0.00
425 21 0.00
426 11 0.00
427 6 0.00
428 13 0.00
429 15 0.00
430 4 0.00
431 3 0.00
432 5 0.00
433 24 0.00
434 34 0.00
435 20 0.00
436 22 0.00
437 31 0.00
438 5 0.00
439 4 0.00
440 2 0.00
441 1 0.00
444 3 0.00
445 4 0.00
446 17 0.00
447 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTC
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
Found at i:15480579 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 15480549--15480584 Score: 56
Period size: 17 Copynumber: 2.1 Consensus size: 18
15480539 AATAATAAGT
*
15480549 AAAAGATTTAAAAAATAA
1 AAAAAATTTAAAAAATAA
15480567 AAAAAATTT-AAAAATAA
1 AAAAAATTTAAAAAATAA
15480584 A
1 A
15480585 TATGTTTGCC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
17 9 0.53
18 8 0.47
ACGTcount: A:0.75, C:0.00, G:0.03, T:0.22
Consensus pattern (18 bp):
AAAAAATTTAAAAAATAA
Found at i:15480951 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 15480918--15480950 Score: 59
Period size: 15 Copynumber: 2.1 Consensus size: 16
15480908 ATTTCAAAAA
15480918 TTAATAAATAAATATT
1 TTAATAAATAAATATT
15480934 TTAA-AAATAAATATT
1 TTAATAAATAAATATT
15480949 TT
1 TT
15480951 TTTTGAACAC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 1
0.94 0.00 0.06
Matches are distributed among these distances:
15 13 0.76
16 4 0.24
ACGTcount: A:0.55, C:0.00, G:0.00, T:0.45
Consensus pattern (16 bp):
TTAATAAATAAATATT
Found at i:15481556 original size:65 final size:65
Alignment explanation
Indices: 15481475--15481609 Score: 270
Period size: 65 Copynumber: 2.1 Consensus size: 65
15481465 AATAAGAGAT
15481475 TTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATC
1 TTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATC
15481540 TTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATC
1 TTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATC
15481605 TTAAA
1 TTAAA
15481610 TTATTATAAT
Statistics
Matches: 70, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
65 70 1.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.13, G:0.03, T:0.40
Consensus pattern (65 bp):
TTAAAAACTAAATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATC
Found at i:15482169 original size:163 final size:163
Alignment explanation
Indices: 15481979--15482275 Score: 361
Period size: 163 Copynumber: 1.8 Consensus size: 163
15481969 AAAGTATGTC
* ** ** * *
15481979 CTTTTGTTTTATCATAAAATGATTGTTTTAGTTCATA-AAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATT
1 CTTTTGTTTTAGCATAAAACAATTGTTTTACATCATACAAA-CCTATCTAAAATAAAATAATACT
* *
15482043 ACTTTATTAATAC-TTCAAAAATTGAA-AAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAA
65 AATTTATTAAT-CTTTCAAAAATT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAA
15482105 -TAGCTTCACATAATTATCTATTTCAAATCATTACGAA
127 CTAG-TTCACATAATTATCTATTTCAAATCATTACGAA
* * * **
15482142 CTTTTGTTTTAGCATAAAGCAATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTA
1 CTTTTGTTTTAGCATAAAACAATTGTTTTACATCATACAAACCTATCTAAAATAAAATAATACTA
* **
15482207 ATTTATTAATCTTTCAATAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAG
66 ATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAACTAG
15482272 TTCA
131 TTCA
15482276 AATATATAAC
Statistics
Matches: 112, Mismatches: 17, Indels: 10
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
162 6 0.05
163 100 0.89
164 6 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (163 bp):
CTTTTGTTTTAGCATAAAACAATTGTTTTACATCATACAAACCTATCTAAAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAACTAG
TTCACATAATTATCTATTTCAAATCATTACGAA
Found at i:15483672 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15482858--15483680 Score: 403
Period size: 181 Copynumber: 4.6 Consensus size: 181
15482848 TCAAATCGTT
* * * * * * *
15482858 ATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTC-GATTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATA
1 ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGATCCAG-TTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATA
* * * * * * * *
15482922 ATA-TAATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAGTAA-AAAATTTATAAAATA-AATATGTTTAC
65 ATACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAGAAAA-AGAATTTGTTGAC
* ** ** * * * ** *
15482984 TAAACGA-TATCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
128 CAAATAACT-TCAAATAGTCATGACAATCTGAACAATTATCTGTTTCAAATAATA
* * * * * * * *
15483038 ATGACC-TTT-TTTTGTCACAAAAAAATT-ATTTCAGTTCATATAAGCATATTCGAAATAAAATA
1 ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGA-TCCAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATA
* * * * * * * *
15483100 ATACTAAGTTATTAGTATTATC-AAAATTAATAATTAAGGGATTTA-AAAATTGAATCTAT-TTG
65 ATACTAATTTACTAATATT-CCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAGAAAA-AGAAT-T-TGTTG
* * * * * * * * * * **
15483162 -TCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTAT-TGTAACTATTATCTTTTTGAAATTGCT-
126 ACCAAATAACTTCAAATAGTCATGACAATCTG-AACAATTATCTGTTTCAAA-TAATA
* * * * * ** * * * * *
15483217 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATTATTTTTTCTA-TTCGTACAATCTTATTTCAAATAAAATA
1 ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAA-CAATTGATCCAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATA
* * * * * * * * * *
15483281 ATACAAATTTATTAATA-T-AAAGACAATTAATAAATAAAAG-ATTTGAAAAAATAAATATATTT
65 ATACTAATTTACTAATATTCCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGAATTAG-AAAAA-GAATTTGTTG
* * * * * *
15483343 ATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACAATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATAATA
126 ACCAAATAACTTCAAATAGTCATGACAATCTGAACAATTATCTGTTTCAAATAATA
* * * * *
15483399 ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGTTTGTTTGAACTAAAATAA
1 ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGATCCAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATAA
* *
15483464 TACTAATTTACTAATTTTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAGAAAAAGAATTTGTTGACCAA
66 TACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAGAAAAAGAATTTGTTGACCAA
* * * *
15483529 ATAACTTCAAATAGTTATGGCTATCTGAACAATTATC-GATTTCAAA-ACATT
131 ATAACTTCAAATAGTCATGACAATCTGAACAATTATCTG-TTTCAAATA-ATA
* * * * *
15483580 ATGACTTTTTGTTTTGTGATAAAACAATTGATCCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAA-TAAAATA
1 ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGATCCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAACTAAAATA
* * *
15483644 AT-TTAAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGTAA
65 ATACT-AATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
15483681 AAATTTTAAA
Statistics
Matches: 487, Mismatches: 123, Indels: 65
0.72 0.18 0.10
Matches are distributed among these distances:
178 51 0.10
179 75 0.15
180 24 0.05
181 200 0.41
182 127 0.26
183 8 0.02
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
ATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGATCCAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATAA
TACTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAGAAAAAGAATTTGTTGACCAA
ATAACTTCAAATAGTCATGACAATCTGAACAATTATCTGTTTCAAATAATA
Found at i:15484774 original size:516 final size:512
Alignment explanation
Indices: 15483810--15485799 Score: 1515
Period size: 516 Copynumber: 3.8 Consensus size: 512
15483800 ACTTACTTGG
* *
15483810 AATAAAAAAATACTAATTTATTCAA-ATTC-CAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTT-AAAATAAAT
* * *
15483873 CTGTTTAGC-GAGCGAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTATTA
64 CTGTTTA-CTGAGCAAGTTCAAATAGA-TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTA
* *
15483936 TAATCTTTTGTTTTGTTATACAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAA
127 T-ACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCT-AAATAAAATAA
* * **
15484000 TACTAATTTATTATTATTCTAAAAATTAATA-ATTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCG
190 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCG
* * ** * * * **
15484064 AATAAGTTTAA-ACAATCATATCCGTTTGAACCATTATCTATTTCAAATCATTACGATATTTTAT
255 AACAAGTTTAATA-AGTCATATCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTA-
* * *
15484128 TTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATT-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAT
318 TTTGTCGTAAAAAAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAA-AAT--TGAATTTAT
* * *
15484191 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATT-TGTTTACAAA-ATCAGTTCAAGTA
380 TAATATTT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTAT-TTTATAAACCT-A-TTCAAATA
* *
15484254 GTTATGACTATTTGAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTGT-TCTTCATACAAGC
441 GTTATGACTATTTGAATATGACCTTTTGTTTGATCATAAAACAATTATT-TCTCTTCATACAAGC
* *
15484318 TTATTCGG
505 TTAGTCGA
* * ** * *
15484326 ATTAGAATAATA-TGAATTTATTAATATT-TCACCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAATAAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAATAAAT
* * * * *
15484389 ATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGACATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATG
64 CTGTTTACTGAGCAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-
* * ** * * *
15484454 ACCTTTTGTTTCGTTATAAAAAAATTGCATC-AGTTCATATAGGTTTATTCTAAATAAAATAACA
128 ACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCTAAATAAAATAATA
*
15484518 CTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAA-AGAGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTATCG
192 CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAGAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCG
* * * * *
15484581 AACAAGTTTAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATT
255 AACAAGTTTAATAAGTCATATCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATT
* * * * ** ***
15484646 TATCATAAAAAAATT-TTTCTACTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAAAATTGAATTTATTAATA
320 TGTCGTAAAAAAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAAAATTGAATTTATTAATA
* *
15484710 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAATTAAAAAATAAATGTATTTTATAAACCTATTC-AA-A--TA-
385 TT-TAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAACTAAAT-TATTTTATAAACCTATTCAAATAGTTAT
* * *
15484770 G------T---TATGACCTTTTGTTTGGTCATAAACCAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTAGTC
446 GACTATTTGAATATGACCTTTTGTTTGATCATAAAACAATTATTTCTCTTCATACAAGCTTAGTC
15484826 GA
511 GA
* *
15484828 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAATTAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAA-TAAATC
* * * *
15484893 TGTTTGCTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATAGTTATAC
65 TGTTTACTGAGCAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAC
* * * * *
15484958 TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGTTCATTCTGAATAAAATCATACT
130 -CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCTAAATAAAATAATACT
** *
15485023 AATTTATTAATATTCTGTAAATTAATAG-G-AAGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAA
194 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAA
* * *
15485085 CAAGTTCAAATAAG-CATGTCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGT-T
257 CAAGTT-TAATAAGTCATATCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTT-TAT
* * * * *
15485148 TTGTGGTAAAAAAATTGTTTTTGTTAATACAAAATTATTGAAAATAAAATAATATTGATTTTTAT
319 TTGTCGTAAAAAAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAAT-AAA-AA-ATTGA-ATTTAT
* * * *
15485213 TAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTA-TTTATCGAACCAATTTAAATAG
380 TAATA-TTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TATTTTAT-AAACCTATTCAAATAG
* * *
15485277 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATAATTATGATCTTTATTCTGTCATAGAACAATT
442 TTATGACTATTTG---AA-TAT-GA-C-C---T--TT-TG-T-TTGA-----TCATAAAACAATT
* * * * *
15485342 GTTTCTTTTCATAGAAGCATATTC-A
487 ATTTCTCTTCATACAAGCTTAGTCGA
* * * * * * * *
15485367 GATTAAAAATAATACTAATTTAATCATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAA
1 -AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-TAAAATAAA
* * * * * * * * * * *
15485431 TATGTTTCCCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTC
63 TCTGTTTACTGAGCAAGTTCAAATAGATATG-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTA
* * * *** *
15485495 TAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCGGCTCATACAAGTTTATT-TGGAATAAAATAA
127 T-ACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCT-AAATAAAATAA
* * * * * *
15485559 TTCTAATTTATTTTTATAAACTTTCTAAAAATTAGTA-AGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCCA
190 TACTAATTTA---TTA-ATA--TTCTAAAAATTAATAGAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTA
* * * *
15485623 TTTATTGAACAAGTTCAA-ATAGAT-ATGAT-AATTT-AGACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT
248 TTTATCGAACAAGTTTAATA-AG-TCAT-ATCAATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * *
15485684 AACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATA-AAAACTTATCCAAAATAAAATAA
309 GACCTTTT-ATTTGTCGTAAAAAAATTGTTTTTA-TTCATACAAAA-TTATTCAAAATAAAA-AA
* *
15485747 TACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCATGAGATTTAAAAACTAAA
370 T--TGAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAACTAAA
15485800 CATTTTTTTT
Statistics
Matches: 1179, Mismatches: 188, Indels: 181
0.76 0.12 0.12
Matches are distributed among these distances:
501 2 0.00
502 161 0.14
503 161 0.14
504 24 0.02
505 9 0.01
506 26 0.02
507 7 0.01
508 24 0.02
509 2 0.00
510 2 0.00
511 2 0.00
512 2 0.00
513 1 0.00
514 28 0.02
515 26 0.02
516 204 0.17
517 101 0.09
518 2 0.00
524 3 0.00
525 1 0.00
526 1 0.00
527 1 0.00
530 1 0.00
532 2 0.00
533 2 0.00
534 1 0.00
535 2 0.00
539 3 0.00
540 167 0.14
541 30 0.03
543 3 0.00
544 5 0.00
545 23 0.02
546 37 0.03
547 94 0.08
548 2 0.00
549 17 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (512 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAATAAATCT
GTTTACTGAGCAAGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATACC
TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCTAAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAG
TTTAATAAGTCATATCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTGTCGT
AAAAAAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAAAATTGAATTTATTAATATTTAAA
AATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTATTTTATAAACCTATTCAAATAGTTATGACTATTTGA
ATATGACCTTTTGTTTGATCATAAAACAATTATTTCTCTTCATACAAGCTTAGTCGA
Found at i:15484779 original size:140 final size:145
Alignment explanation
Indices: 15484622--15484891 Score: 365
Period size: 144 Copynumber: 1.9 Consensus size: 145
15484612 AATTATCTAT
* * *
15484622 TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTT-ATCATAAAAAAATT-TTTCTACTCATACAAGCTTATTTT
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTGATCATAAAAAAATTATTTCTACTCATACAAGCTTA-GTC
*
15484685 G-AATAAAA-AAT-TGAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-A-TTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAA
15484745 TGTATTTTATAAACCTA
129 TGTATTTTATAAACCTA
* * ** **
15484762 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAACCAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTAGTCG
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTGATCATAAAAAAATTATTTCTACTCATACAAGCTTAGTCG
*
15484827 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAATTAAAT
66 AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAAT
15484892 CTGTTTGCTG
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 11, Indels: 10
0.84 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
140 23 0.21
141 13 0.12
142 25 0.23
143 3 0.03
144 33 0.30
145 2 0.02
146 12 0.11
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (145 bp):
TTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTGATCATAAAAAAATTATTTCTACTCATACAAGCTTAGTCG
AAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATG
TATTTTATAAACCTA
Found at i:15485074 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15484762--15485980 Score: 905
Period size: 181 Copynumber: 6.7 Consensus size: 181
15484752 TATAAACCTA
* * * * *
15484762 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAACCAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTAGTC-
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-TTATTCA
* *
15484826 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AATATTTAAAAATTAA
65 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAGATTTAAAAAATAA
* * * *
15484890 ATCTGTTTGCTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
129 ATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
15484943 TTTAAATAGTTAT-ACTCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGTTCATTC
1 TTCAAATAGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTT-ATTC
* * ** *
15485007 TGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTCTGTAAATTAAT-AGGAAGAAGATTTAAAAAATAA
64 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAGATTTAAAAAATAA
* * * *
15485071 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAAG-CATGTCAATTTGAACAATTATCTAT
129 ATCTATTTACTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * * * * *
15485124 TTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTGGTAAAAAAATTGTTTTTGTTAATACAAAATTATTGA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AAGTTATTCA
* * * * * *
15485189 AAATAAAATAATATTGATTTTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAG-AGATTTAAAAACTA
65 GAATAAAATAATACT-A-ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAGATTTAAAAAATA
*
15485249 AATCTATTTA-TCGAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
128 AATCTATTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
15485303 CTCAAATAATTATGATC-TTTATTCTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATAGAAGCATATTCA
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-TTATTCA
* * * * *
15485367 GATTAAAAATAATACTAATTTAATCATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAACAA
65 GAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
15485430 ATATGTTTCCCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GAACTATTAGAATAATTATCTAT
129 ATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
15485483 TTCAAATTA-TTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCGGCTCATACAAGTTTATTT
1 TTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-TTATTC
* * * * *
15485547 GGAATAAAATAATTCTAATTTATTTTTATAAACTTTCTAAAAATTAGTAAGCAAGAA-ATTTTAA
64 AGAATAAAATAATACTAATTTA---TTA-ATA--TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAGA-TTTAA
* * *
15485611 AAAATAAATCCATTTATTGAACAAGTTCAAATAGATATGA-TAATTT-AGACAATTATCTAT
122 AAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGA-ACAATTATCTAT
* * * * * * * *
15485671 TTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCC
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCAT-ACAAGTTATTC
* * * * * *
15485735 AAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTATTAAGCATG-AGATTTAAAAACTA
64 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAAGATTTAAAAAATA
* ** * ** * * * *
15485798 AA-CATTTTTTTTGAACCAGTTCAAATAGTTACAACTA-CTAAACCAAATATCAAT
128 AATC-TATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTAT
* * * * * ** ** ** *
15485852 CTCAAATCGTTATGATC-ATTATTTTGTCATAAAGTAATTGTTTCTAATCATACAAGCTGGTT-T
1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-TTATTCA
* * *
15485915 GAATAAAAATAATACTAATTCAATAATATT-TCAAAAA-TATATAAGTAATAA-ATTTAAAAAAT
65 GAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTA-ATAAGTAAGAAGATTTAAAAAAT
15485977 AAAT
127 AAAT
15485981 GTGTGTAAGA
Statistics
Matches: 809, Mismatches: 178, Indels: 102
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
176 4 0.00
177 12 0.01
178 37 0.05
179 90 0.11
180 173 0.21
181 302 0.37
182 30 0.04
183 18 0.02
184 3 0.00
185 3 0.00
186 3 0.00
187 19 0.02
188 111 0.14
189 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTATTCAG
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAGATTTAAAAAATAAAT
CTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:15486697 original size:362 final size:359
Alignment explanation
Indices: 15486108--15486886 Score: 853
Period size: 362 Copynumber: 2.2 Consensus size: 359
15486098 GTTTCAGTTC
* * * * * *
15486108 ATACAAATTTATTAACTTTTGAAAAATAAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAAATATGTCTAC
1 ATACTAATTTATTAAC-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAAAATAAATATATCTAC
* * * * * *
15486173 TGAATAGGTTAAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATCACTCTCAAATAATTATGATCTTTAT
64 TGAACAAGTTAAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCACTCTAAAATAATTATGACCTTTAT
* * ** * *
15486238 TTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
129 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTACTCATAAAAACATATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* *
15486303 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAA-TATGTTTGCCATACCAGTTCAAA
194 AATATTCTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAACTAT-TTT--CAAACCAGTTCAAA
* ** * * *
15486366 TAGTTAGGACT-ATTAGAACAATTAT-ATATTTCAAATCATTCTACACTTTT-GTTTAGTCATAA
256 TAGCTACAACTGATTA-AACAAATATCA-ATCTCAAATCATTAT-CACTTTTAGTTTA-TCATAA
15486428 AACAATTATTTC-AATTCATACAAGCTTATTTG-GAATAAAAAAA
317 AACAATTATTTCTAA-TCATACAAGCTTA-TTGAGAATAAAAAAA
* * *
15486471 ATACTAATTTATTAACTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTACT
1 ATACTAATTTATTAACTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATCTACT
* * ** *
15486536 GAACAAGTTGAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTAAAATCGTTATGACCTTTTG
65 GAACAAGTTAAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATC-ACTCTAAAATAATTATGACC-TTTA
* * *
15486600 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTACTCATAAAAACCTATT-TGATATAAAATAAT-CTACTTTA
128 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTACTCATAAAAACATATTCGGAT-TAAAATAATACTAATTTA
* * *
15486663 TTAATATT-TCAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCAAACTAGTTCAA
192 ATAATATTCT-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAA-CTATTTTCAAACCAGTTCAA
* * * * * *
15486727 ATAGCTACAACTGCTTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATTTTTATTTTATCATAAGAT
255 ATAGCTACAACTGATTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATCACTTTTAGTTTATCATAAAAC
* * *
15486792 AATTATTTCTGATCATACAAGCTTATTGAGGATAAAAATA
320 AATTATTTCTAATCATACAAGCTTATTGAGAATAAAAAAA
* *
15486832 ATACTAATTTAATAATGTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT
1 ATACTAATTTATTAA-CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT
15486887 GTGTGTAAGA
Statistics
Matches: 350, Mismatches: 52, Indels: 31
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
360 17 0.05
361 77 0.22
362 160 0.46
363 90 0.26
364 3 0.01
365 3 0.01
ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.08, T:0.37
Consensus pattern (359 bp):
ATACTAATTTATTAACTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATCTACTG
AACAAGTTAAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCACTCTAAAATAATTATGACCTTTATTT
TATCATAAAACAATTGTTTCTACTCATAAAAACATATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
TATTCTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAACTATTTTCAAACCAGTTCAAATAGCT
ACAACTGATTAAACAAATATCAATCTCAAATCATTATCACTTTTAGTTTATCATAAAACAATTAT
TTCTAATCATACAAGCTTATTGAGAATAAAAAAA
Found at i:15486855 original size:180 final size:175
Alignment explanation
Indices: 15484763--15486886 Score: 654
Period size: 181 Copynumber: 11.7 Consensus size: 175
15484753 ATAAACCTAT
* ** * ** * *
15484763 TCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAACCAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTAGTCG
1 TCAAATCA-TTATGA-CTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTATTGG
* * * * * * *
15484827 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAATTAAAT
64 ATA-AAAATAATACTAATTTAATAATTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * ** *
15484892 CTGTTTGCTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
128 AT-TTT-C-AAACAAGTTCAAATAGATACGACTA-TTAAACAATTATCAATC
* * * * * *
15484944 TTAAAT-AGTTAT-ACTCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAG-TTCATT
1 TCAAATCA-TTATGA--CTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTT-ATT
* * * * *** *
15485006 CTGA-ATAAAATCATACTAATTTATTAATATTCTGTAAATTAAT-AGGAAGAAGATTTAAAAAAT
62 -GGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATTTTCAAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAAT
* * * * * *
15485069 AAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAAGCAT--GTCAATTTGAACAATTATCTATT
124 AAA--TATTTTC-AAACAAGTTCAAAT-AG-ATACGACTA-TTAAACAATTATCAATC
** * * * ** * * * ** * ** *
15485125 TCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTGGTAAAAAAATTGTTTTTGTTAATACAAAATTATTGAA
1 TCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTATTGGA
* * * * ** *
15485190 AATAAAATAATATTGATTTTTATTAATATTT-TGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAA
65 TA-AAAATAATACT-A-ATTTAATAAT-TTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
15485250 ATCTATTTATCGAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC
126 A--TATTT-TC-AAACAAGTTCAAATAGATACGACTA-TTAAACAATTATCAATC
* * * * * ** * * *
15485304 TCAAATAATTATGA-TCTTTATTCTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATAGAAGCATATTCAG
1 TCAAATCATTATGACT-TTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTATT-GG
* *
15485368 ATTAAAAATAATACTAATTTAATCATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAAT
64 A-TAAAAATAATACTAATTTAATAATTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
15485432 ATGTTTCCCGAACCAGTTCAAATAGTTA-GAACTATTAGAATAATTATCTATT
128 AT-TTT--CAAACAAGTTCAAATAGATACG-ACTATTA-AACAATTATCAATC
* * * * ** *
15485484 TCAAATTATTCTAACCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAATTATTTCGGCTCATACAAGTTTATTTG
1 TCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTA-TTG
* * * * * *
15485548 GA-ATAAAATAATTCTAATTTATTTTTATAAACTTTCTAAAAATTAGTAAGCAAGAAATTTTAAA
63 GATA-AAAATAATACTAATTTA-----AT-AATTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA
** * * * *
15485612 AAATAAATCCATTTATTGAACAAGTTCAAATAGATATGA-TAATTTAGACAATTATCTATT
120 AAATAAAT--ATTT-TCAAACAAGTTCAAATAGATACGACT-A-TTAAACAATTATCAATC
* ** * * * * * * * ***
15485672 TAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCCA
1 TCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-CTCATACAAGCTTATTGG
* * * * * * *
15485736 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTATTAAGCATGAGATTTAAAAACTAAA
64 ATA-AAAATAATACTAATTTAATAAT-TTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
* ** * * * * *
15485800 CATTTTTTTTGAACCAGTTCAAATAGTTACAACTACTAAACCAAATATCAATC
126 -A-TATTTTCAAACAAGTTCAAATAGATACGACTATTAAA-CAATTATCAATC
* * * ** * *
15485853 TCAAATCGTTATGA-TCATTATTTTGTCATAAAGTAATTGTTTCTAATCATACAAGCTGGT-TTG
1 TCAAATCATTATGACT-TTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCT--TATTG
* * * *
15485916 AATAAAAATAATACTAATTCAATAATATTTC-AAAAA-TATATAAGTAATAAATTTAAAAAATAA
63 GATAAAAATAATACTAATTTAATAAT-TTTCAAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * * * *
15485979 ATGTGTGT--AA-GAGATTTAAA-AAATA-AATGTGTTTATCGAATCAGTTCGAATAG
126 ATAT-TTTCAAACAAG-TTCAAATAGATACGA-CTATTAAAC-AATTA--TC-AAT-C
* * * * * *
15486032 TTAAGA-CTATTA-GAATAATTATCTGTT-TCA-AATCATTCTAACCTT-TTATTTAGTCATA-A
1 TCAA-ATC-ATTATGACT-TTTAT-T-TTATCATAA--A-AC-AA--TTATT-TCTACTCATACA
* * * ** ** * * * * * *
15486091 A-ATAATT-GTTTCAGTTCATACAAATTTATTAACTTTT-GAAAAATAAATAAGCAAGAGATTTG
54 AGCTTATTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAA-TTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * * * * * *
15486153 AAAAAAATAAATATGTCTACTGAATAGGTTAAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATCACTC
117 -AAAAAATAAATAT-T-TTC-AAACAAGTTCAAATAGATACGACTA-TTAAACAATTATCAATC
* * * * ** *
15486217 TCAAATAATTATGA-TCTTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCGG
1 TCAAATCATTATGACT-TTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTATT-GG
* * *
15486281 ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATA
64 ATAAAAATAATACTAATTTAATAATTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
* * * * *
15486345 TGTTTGCCATACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAACAATTAT-ATATT
129 T-TTT--CAAACAAGTTCAAATAGATACGACTATTA-AACAATTATCA-ATC
* * * * *
15486396 TCAAATCATTCTACACTTTT-GTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
1 TCAAATCATTAT-GACTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTA-TTG
* * * *
15486460 GAATAAAAAAAATACTAATTTATTAACTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAA
63 G-ATAAAAATAATACTAATTTAATAATTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAA
* * * * * * *
15486525 ATTTATTTACTGAACAAGTTGAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATT
126 A--TATTTTC-AAACAAGTTCAAATAGATACGACTA-TTAAACAATTATCAATC
* * * * * * * *
15486579 TAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTACTCATAAAAACCTATTTGA
1 TCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTATTGGA
* * * * *
15486644 TATAAAATAAT-CTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAG
65 TA-AAAATAATACTAATTTAATAAT-TTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-
* * * * *
15486707 CTATTTTCAAACTAGTTCAAATAGCTACAACTGCTTAAACAAATATCAATC
127 -TATTTTCAAACAAGTTCAAATAGATACGACT-ATTAAACAATTATCAATC
* * *
15486758 TCAAATCATTATGATTTTTATTTTATCATAAGATAATTATTTCTGA-TCATACAAGCTTATTGAG
1 TCAAATCATTATGACTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCT-ACTCATACAAGCTTATT--G
15486822 GATAAAAATAATACTAATTTAATAATGTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
63 GATAAAAATAATACTAATTTAATAAT-TTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
15486886 T
127 T
15486887 GTGTGTAAGA
Statistics
Matches: 1473, Mismatches: 335, Indels: 273
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.00
175 11 0.01
176 14 0.01
177 13 0.01
178 96 0.07
179 204 0.14
180 291 0.20
181 361 0.25
182 139 0.09
183 113 0.08
184 39 0.03
185 14 0.01
186 17 0.01
187 22 0.01
188 110 0.07
189 18 0.01
190 8 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (175 bp):
TCAAATCATTATGACTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTACTCATACAAGCTTATTGGAT
AAAAATAATACTAATTTAATAATTTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATT
TTCAAACAAGTTCAAATAGATACGACTATTAAACAATTATCAATC
Found at i:15486969 original size:906 final size:909
Alignment explanation
Indices: 15485271--15487017 Score: 2630
Period size: 906 Copynumber: 1.9 Consensus size: 909
15485261 GAACCAATTT
15485271 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATAATTATGATCTTTATTCTGTCATAGA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATAATTATGATCTTTATTCTGTCATAGA
* * *
15485336 ACAATTGTTTCTTTTCATAGAAGCATATTCAGATTAAAAATAATACTAATTTAATCATTTTCAAA
66 ACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCAAA
15485401 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTCCCGAACCAGTTCAAATAGTTAGAACTA
131 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTCCCGAACCAGTTCAAATAGTTAGAACTA
* * * **
15485466 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCGGC
196 TTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAAC
* * * * *
15485531 TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTTTTATAAACTTTCTAAAAATTAGTA
261 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAAAATACTAATTTA---TTATAAACTTTCAAAAAATTAATA
*
15485596 AGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCCATTTATTGAACAAGTTCAAATAGATATGATAATTTAGAC
323 AGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCCATTTACTGAACAAGTTCAAATAGATATGATAATTTAGAC
* *
15485661 AATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
388 AATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTTAGCTCATAAA
* *
15485726 AACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCATGAGATTTA
453 AACCTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTA
* ** *
15485791 AAAACTAAACATTTTTTTTGAACCAGTTCAAATAGTTACAACTACTAAACCAAATATCAATCTCA
518 AAAACTAAACA-TATTTTCAAACCAGTTCAAATAGCTACAACTACTAAACCAAATATCAATCTCA
* * *
15485856 AATCGTTATGATCATTATTTTGTCATAAAGTAATTGTTTCTAATCATACAAGCTGGTTTGAATAA
582 AATCATTATGATCATTATTTTATCATAAAGTAATTATTTCTAATCATACAAGCT-GTTTGAATAA
*
15485921 AAATAATACTAATTCAATAATATTTCAAAAATATATAAGTAATAAATTTAAAAAATAAATGTGTG
646 AAATAATACTAATTCAATAATATTTCAAAAATATATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTG
* * * *
15485986 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAATCAGTTCGAATAGTTAAGACTATTAGAATAAT
711 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAAT
*
15486051 TATCTGTTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTG-TTTCAGTTCATACAAA
776 TATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTTCAGTTCATACAAA
15486115 TTTATTAACTTTTGAAAAATAAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAAATATGTCTACTGAATAG
841 TTTATTAACTTTTGAAAAATAAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAAATATGTCTACTGAATAG
15486180 GTTA
906 GTTA
* *
15486184 AAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATC-ACTCTCAAATAATTATGATCTTTATTTTGTCATAG
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TCTCAAATAATTATGATCTTTATTCTGTCATAG
*
15486248 AACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCGGATT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCTA
65 AACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTC-A
* * *
15486312 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCC-ATACCAGTTCAAATAGTTAGGA
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTCCCGA-ACCAGTTCAAATAGTTAGAA
15486375 CTATTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTCT-ACACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
193 CTATTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTCTAAC-CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
*
15486439 CAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAAAAATACTAATTTA-T-T-AACTTTCAAAAAATTAA
257 CAACTCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAAAAATACTAATTTATTATAAACTTTCAAAAAATTAA
* ** *
15486501 TAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACAAGTTGAAATAGATATGACT-ATTT-
321 TAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCCATTTACTGAACAAGTTCAAATAGATATGA-TAATTTA
* *
15486564 GAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-CTC
385 G-ACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTT-TAGCTC
*** *
15486628 ATAAAAACCTATTTGATATAAAATAAT-CTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAG
448 ATAAAAACCTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAG
* *
15486692 ATTTAAAAACTAAAGC-TATTTTCAAACTAGTTCAAATAGCTACAACTGCTTAAA-CAAATATCA
513 ATTTAAAAACTAAA-CATATTTTCAAACCAGTTCAAATAGCTACAACTAC-TAAACCAAATATCA
** *
15486755 ATCTCAAATCATTATGATTTTTATTTTATCAT-AAGATAATTATTTCTGATCATACAAGCT-TAT
576 ATCTCAAATCATTATGATCATTATTTTATCATAAAG-TAATTATTTCTAATCATACAAGCTGT-T
* * *
15486818 TGAGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATGTTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
639 TGA--ATAAAAATAATACTAATTCAATAATATTTCAAAAATAT-ATAAGTAAGAAATTTAAAAAA
* **
15486882 TAAATGTGTGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAATCAGTTTAAATAGTTAATTCTA
701 TAAATGTGTGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTA
* * *
15486947 TTGGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTCAG
766 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTTCAG
15487012 TTCATA
831 TTCATA
15487018 TAAGCTTATT
Statistics
Matches: 756, Mismatches: 62, Indels: 38
0.88 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
903 1 0.00
904 7 0.01
905 87 0.12
906 220 0.29
907 161 0.21
908 4 0.01
909 1 0.00
911 3 0.00
912 140 0.19
913 132 0.17
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (909 bp):
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATAATTATGATCTTTATTCTGTCATAGA
ACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCAAA
AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTCCCGAACCAGTTCAAATAGTTAGAACTA
TTAGAACAATTATATATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAAC
TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAAAATACTAATTTATTATAAACTTTCAAAAAATTAATAAGC
AAGAAATTTTAAAAAATAAATCCATTTACTGAACAAGTTCAAATAGATATGATAATTTAGACAAT
TATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTTAGCTCATAAAAAC
CTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAA
ACTAAACATATTTTCAAACCAGTTCAAATAGCTACAACTACTAAACCAAATATCAATCTCAAATC
ATTATGATCATTATTTTATCATAAAGTAATTATTTCTAATCATACAAGCTGTTTGAATAAAAATA
ATACTAATTCAATAATATTTCAAAAATATATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTGTAAGA
GATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCT
ATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTTCAGTTCATACAAATTTAT
TAACTTTTGAAAAATAAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAAATATGTCTACTGAATAGGTTA
Found at i:15487339 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 15486954--15487371 Score: 461
Period size: 181 Copynumber: 2.3 Consensus size: 182
15486944 CTATTGGAAT
* * * * *
15486954 AATTTTCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTCAGTTCATAT
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCAGTTCAAAA
* * * *
15487019 AAGCTTATTTCGAAGAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT
65 AAGCTTATTTCAAAGAAAATAATACTAATTTATTAAATTCTGAAAAATCAATAAGCAAAAGATTT
** * * * * * *
15487084 GAAAAAATATTTACATTTATTGAACAAGTTCAAACAGTTATGACTATTTGAGC
130 GAAAAAATAAATACATTTATAGAACAACTTCAAAAAATTATGACCATTTGAAC
* ** * * * *
15487137 AATTATCCATTGAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCAGTTTAAAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCAAAAA
* * * *
15487202 AG-TT-TTTCCAAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTCTG-AAGATCAATAAGTAAAAGAT
66 AGCTTATTT-CAAAG-AAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCTGAAAAATCAATAAGCAAAAGAT
*
15487264 TT-AAAAAATAAAT-CAGTTTATAGAATC-ACTTCAAAAAATTATGGCCATTTGAAC
128 TTGAAAAAATAAATACA-TTTATAGAA-CAACTTCAAAAAATTATGACCATTTGAAC
* *
15487318 AATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAATTAATTGTTT
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
15487372 TTCAACATAC
Statistics
Matches: 193, Mismatches: 37, Indels: 12
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
180 5 0.03
181 90 0.47
182 51 0.26
183 47 0.24
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (182 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCAAAAA
AGCTTATTTCAAAGAAAATAATACTAATTTATTAAATTCTGAAAAATCAATAAGCAAAAGATTTG
AAAAAATAAATACATTTATAGAACAACTTCAAAAAATTATGACCATTTGAAC
Found at i:15487428 original size:67 final size:67
Alignment explanation
Indices: 15487331--15487467 Score: 211
Period size: 67 Copynumber: 2.0 Consensus size: 67
15487321 TATCTATTTC
* ** *
15487331 AAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAATTAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAC
1 AAATCAGTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAA
15487396 TA
66 TA
* * *
15487398 AAATCAGTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTTTAAA
1 AAATCAGTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAA
15487463 TA
66 TA
15487465 AAA
1 AAA
15487468 AATACTAATT
Statistics
Matches: 63, Mismatches: 7, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
67 63 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.08, T:0.45
Consensus pattern (67 bp):
AAATCAGTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAA
TA
Found at i:15487759 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15487409--15488893 Score: 772
Period size: 181 Copynumber: 8.3 Consensus size: 179
15487399 AATCAGTATT
* * ** * *
15487409 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGAACAT-TCAAGCTTATTTTAAATAAAA-AATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATAT-AAGTTTA-TTTAGATAAAATAATA
** * * * * * *
15487472 CTAATTTATTAATATTTCAAGAACTAGT-AC--A-AGATTCAAAAGATAAAT-TATTTGCTGAAC
64 AAAAATTATTAATATTT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAC
*
15487532 CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
128 CAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
*
15487584 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGATAAAATAATAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGATAAAATAATAAA
* * * *
15487649 AAATTAATAATATTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACTA
66 AAATTATTAATATT-TAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACCA
* * * * * * * *
15487714 GTTCAAACAGTTAAGACAATATGAAAAAATATCTATTCCAAATTGTTATT
130 ATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* ** * **
15487764 ACCTTTTGTTTTGTAATAAACA-AATTATTTCAGCTCATCCAAGTTTATTT-G-TAATAA-AATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGATAA-AATAATA
* * * * * **
15487825 AAACTAATTTTTTAATATTTCAAAATTTTAA-AAGTAACAAATTTAAAAAA-AAATTCTATTTAA
64 AAA--AA-TTATTAATATTT-AAAA-ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTGC
* * * * * * *
15487888 TGAACCAATTCAAAAAATTCTA-ACTGTTTGAACAATTATATATTTTAAATCGTTATA
123 TGAACCAATTCAAATAGTT-AAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * ** * **
15487945 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTTATGCAAGCTTATTCGGAATAAAATAAT-A
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAG-ATAAAATAATAA
** * * * * * * **
15488009 CTAATCTAATAAGATTTTGACAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAC
65 AAAAT-TATTAATA-TTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAC
* * * * * *
15488074 CACTTCAAATAGTTAAGAATGTGTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
128 CAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* ** ** * * * * * *
15488126 GCCTTTTACTTTGTTGT-AAATCAATT-TTTTAGCTCTTACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTATTTTTGTTCATA-TAAGTTTATT-TAGATAAAATAAT
* * * * * *
15488187 AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGTTGA
63 AA-AAAATTATTAATATTT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGA
* ** ** * ** *
15488252 ACCAATTCAAATAATTGTGACTATTACAATAATTATCTATTTCAAATCATTATT
126 ACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * * * *
15488306 ATCTTTTGTTTTGCCATAAAACAAATGTTTTTGGTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAG-ATAAAATAATAA
* * * * *
15488371 TAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ATCAAAC
65 AAAATTATTAATA-TTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCT-GAAC
* * * * *
15488431 CAGTTTAATTAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTTATTTCAAATTGTTATG
128 CAATTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * *
15488484 ACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATA-CAGTCTTATTTGGAATAAAGTAATG
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGT-TTATTTAG-ATAAAATAATA
** * ** * * * ** * * **
15488548 CCAATTTATTAATATTTTGGAACTTAACAAGC-AATG-GATTTAGAAAATGTATTTGTAGGCCTG
64 AAAAATTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA-CTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTG-CTG
** * * * * * * * ***
15488611 -ATTAGTGCTAACAGTTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAAGCATTATA
125 AACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * * * * * * * **
15488665 ACCTTTTGGTTTATCACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTCAGAATAACATAATTC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAG-ATAAAATAATAA
* * * * * *
15488730 TAATTTATTAATA-TTATAAAATTAATAAGC-AAGA-ATTTTAAAAAA-GAATCTGTTTACAGAA
65 AAAATTATTAATATTTA-AAAATTAATAA-CTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAA
* * * * **
15488791 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGTATAATTATCTATTTTAAATTACTATA
127 CCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * *
15488844 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGTTTATTT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTT-TGTTCATATAAGTTTATTT
15488894 CAAATCTATT
Statistics
Matches: 991, Mismatches: 260, Indels: 114
0.73 0.19 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 10 0.01
175 61 0.06
176 5 0.01
177 53 0.05
178 104 0.10
179 111 0.11
180 254 0.26
181 324 0.33
182 58 0.06
183 4 0.00
184 7 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAGATAAAATAATAAA
AAATTATTAATATTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACCAA
TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
Found at i:15488183 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 15487527--15488419 Score: 978
Period size: 361 Copynumber: 2.5 Consensus size: 360
15487517 AATTATTTGC
* *
15487527 TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTG
1 TGAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTG
* *
15487592 TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTAG-ATAAAATAATAAAAAATTAA
66 TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAAT-AATAATTAA
** * ** * *
15487656 TAATATTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACTAGTTCAAA
130 TAATATT-TTGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCACTTCAAA
* * **
15487721 CAGTTAAGACAATATGAAAAAATATCTATTCCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTAATAAACA
194 CAGTTAAGACAATATGAAAAAATATCTATTCCAAATTATTATGACCTTTTACTTTGTAATAAACA
* *** *
15487786 AATTATTTCAGCTCATCCAAGTTTATTTGTAATAAAATAAAACT-AATTTTTTAATATTTCAAAA
259 AATTATTTCAGCTCATCCAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAA-TAAATTTATTAATATTTCAAAA
* *
15487850 TTTTAA-AAGTAACAAATTTAAAAAAAAATTCTATTTAA
323 -ATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAAAAATTATATTTAA
* * * * * * *
15487888 TGAACCAATTCAAAAAATTCTAACTGTTTGAACAATTATATATTTTAAATCGTTATAACCTTTTG
1 TGAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTG
* * * ** * * *
15487953 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTTATGCAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAA
66 TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATAATAAT-TAA
* *
15488018 TAAGATTTTGACAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCACTTCAAA
130 TAATATTTTGA-AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCACTTCAAA
* * * * * * * **
15488083 TAGTTAAGA-ATGTGTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGGCCTTTTACTTTGTTGTAAAT
194 CAGTTAAGACA-ATATGAAAAAATATCTATTCCAAATTATTATGACCTTTTACTTTGTAATAAA-
* * *
15488147 C-AATT-TTTTAGCTCTTACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAA
257 CAAATTATTTCAGCTCAT-CCAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAA
* * * * **
15488209 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGT
321 AAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAAAAATTATATTTAA
* ** * * *
15488249 TGAACCAATTCAAATAATTGTGACTATTACAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATCTTTTG
1 TGAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTG
* * * * * * * *
15488314 TTTTGCCATAAAACAAATGTTTTTGGTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTAT
66 TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATAATAA-TTAA
*
15488379 TAATATTTTGAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
130 TAATATTTTGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
15488420 ATTTATCAAA
Statistics
Matches: 436, Mismatches: 87, Indels: 22
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
357 22 0.05
358 4 0.01
360 7 0.02
361 280 0.64
362 122 0.28
363 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
TGAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTG
TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTAAT
AATATTTTGAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCACTTCAAACA
GTTAAGACAATATGAAAAAATATCTATTCCAAATTATTATGACCTTTTACTTTGTAATAAACAAA
TTATTTCAGCTCATCCAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
AATAAGTAACAAATTTAAAAAAAAATTATATTTAA
Found at i:15488989 original size:120 final size:120
Alignment explanation
Indices: 15488776--15489006 Score: 320
Period size: 120 Copynumber: 1.9 Consensus size: 120
15488766 TTTAAAAAAG
* * * *
15488776 AATCTGTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGTATAATTATCTATTTTAAATTACT
1 AATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACT
* *
15488841 ATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGTTTATTTCA
66 ATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTGT-TATTCATACAAGTTTATTTCA
* * * * *
15488896 AATCTATTTATAGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTGTTTCAAATCATT
1 AATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACT
* * *
15488961 ATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTGTTGTTCATACAAG
66 ATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTGTTATTCATACAAG
15489007 CTTAGTTGGA
Statistics
Matches: 96, Mismatches: 14, Indels: 2
0.86 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
120 93 0.97
121 3 0.03
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.09, T:0.45
Consensus pattern (120 bp):
AATCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACT
ATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTGTTATTCATACAAGTTTATTTCA
Found at i:15489304 original size:175 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15488902--15489315 Score: 430
Period size: 175 Copynumber: 2.3 Consensus size: 179
15488892 TTCAAATCTA
* * * * *
15488902 TTTATAGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTGTTTCAAATCATTATGACT
1 TTTATAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * **
15488967 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTGTTGTTCATACAAGCTTAGTTGGATTAAAATAATATTAG
66 TTTTGTTTGATCATAAAACAATTATTGTAGTTCATACAAGCTTAGTACGA-TAAAATAATA-TAG
* *** *
15489032 TTTATTAATATTTTGACAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
129 CTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * **
15489083 CTTATTGAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATCTAAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
1 TTTATAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * *
15489148 TTTTGTTTCGA-CATAAAACAATTATAT-TAGTTCATATAGGCTTA-TACGA-AGTAA-AATA-A
66 TTTTGTTT-GATCATAAAACAATTAT-TGTAGTTCATACAAGCTTAGTACGATA-AAATAATATA
* * * *
15489207 -CTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAGT-TG
128 GCTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATG
* *
15489258 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
1 TTTATAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCAT
15489316 CATACAAGCT
Statistics
Matches: 190, Mismatches: 39, Indels: 14
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 87 0.46
176 4 0.02
178 5 0.03
179 2 0.01
180 3 0.02
181 87 0.46
182 2 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
TTTATAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
TTTTGTTTGATCATAAAACAATTATTGTAGTTCATACAAGCTTAGTACGATAAAATAATATAGCT
TATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
Found at i:15489878 original size:177 final size:178
Alignment explanation
Indices: 15489315--15494672 Score: 3175
Period size: 181 Copynumber: 30.0 Consensus size: 178
15489305 TTTCAAATCA
* * * *
15489315 TCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATA-TAAATTGACTAATATTCCAAAAATTAA-TAAGC
1 TCATACAAACTTA-TTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAAG-
* * * *** *
15489377 AAAAATTTTAAAAAATAAATCT-ATTATTTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
63 --AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
15489441 TATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTAC
124 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * *
15489496 TCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT---TAA
* * * * * * * * *
15489560 AATATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAATAATTAT
62 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** ** * *
15489625 TTATTTCAAATTGTTATGTTCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* ** * * * * *
15489677 TAATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAGTTGA-AGA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAAGAGA
* * * * * *
15489741 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACTATTACCTAT
66 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** *
15489806 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTTTAT
131 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * *
15489854 TCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTTGA-TAAGAG
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATTAAGAG
* * * * * * *
15489917 ATTTAAAAACTAAATCTATTTACCGAAC-CGATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAGTATCT
65 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * *
15489981 ATATCAAATCAGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
129 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * ** *
15490030 TCATACAAACTTATTTGGAGT-AAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT---TAAG
* * * **** ** * * *
15490094 AGATTTAAACAATAAATATATTTGTTGAACCTGTTCAAGTAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
63 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
15490159 TATTTCAAATCATTCTGACTTTTTATTTAGTCATAAAATAATT-TTTTCAGT
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* ** * * * * *
15490210 TCTTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAAT-TAGAAAATTAA-TAAGCA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATTAAG-A
* *
15490273 TGGAATTTAAAAAA-AAAATTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
64 --G-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * ** * * *
15490337 TCTATTTAAAATCGTTATGGCCTTCT-ACTTATCATAAAAAAATTG-TTTCAGT
126 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * **
15490389 TCATA-AAAGCTTATCTAAAATTAAGTAATA-TTCTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGAAGTT
1 TCATACAAA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT---AA-TT
* ** * * * * * *
15490451 -GGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTCATCAAATAAGCTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAATT
60 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
15490515 ATCTAATTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTGTCATCAAACAATTATTTTT-T
125 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * *
15490568 ATCGA-A-AAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTATTAATATT-TCAAAAATTAA-T-A
1 -TC-ATACAAA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATTAA
** * * * ** * * *
15490628 -AG---TAGGAGAT-TATCTGTTTACTGAGCTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
62 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * ** *
15490688 ATATTTGAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA-AAACACAATTATTGATGT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTTTAT
* * * * * *
15490740 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAGTGTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAG
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT---TAAG
* * ** * * * * *
15490805 AGATTTAAAAAAAAAATTTATTTGA-TGAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATTTGAATAATTAG
63 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
** * * *
15490869 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAAATATTTTTGT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* ** * * * *
15490921 TC--ACATAAGTT-TGTTAGAAATAAAATAATTTTAATTTACTAATATTTTGAAAATTAA-TAAA
1 TCATACA-AACTTAT-TTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAAG
* * * * *
15490982 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTTAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTAGT
63 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-T
* ** *
15491047 -TATTTCAAATCGTTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * *
15491098 TAATACAATCTTATTT-GAAATAAAGTATTGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-TAAGTG
1 TCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAA--G
* * * * ** * * * * *
15491161 ACAAATTTAAAATATGAATATGTTGGCCTGATCAAG-GCAAATAGTTATGACTGTTTGAAAAATT
63 --AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
15491225 ATTTATTTCAAATGATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAT
125 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * *
15491279 TCATA-AAAGCTTATTTGGAATAACATAATTCGAATTTATTAATATT-T-AAAA--AATT---A-
1 TCATACAAA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAAGAG
* * * *
15491335 A--T---AAAT-AA-GTGATTTATCAACCAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CT
65 ATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-
** * **
15491392 TATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACT-AAATTATT-TTTTTCAT
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTT-AT
* * * *
15491443 TCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTC-ATACAATTAA-TAAGT
1 TCATACAAACTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATTAAG-
* * * * *
15491505 AAAACATTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTA
63 -AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * *
15491570 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
126 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * ** * * * * *
15491623 TCGTACAAGC-TATTCGGATTAAAATATTATTAATTTATTTATATT-TAGACAATTAATGAGTAA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAAT---TAA
* * * * * ** *
15491686 AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGACAT-ACTATTTGAATAATTAT
62 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
** * * * *
15491750 CTATTTCAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTG-TATCAGT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
**** * * *
15491802 TCATATTGGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTAAAAGTTAATTAGTAAG
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-T--TAAG
* * **** **
15491867 AGATTCAAAAAAT-AATTCTTTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGGAATTAT
63 AGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
15491931 CTATTTCAAATCATTATCACCATTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * *
15491984 TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-TAAGCA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAAG--
* * * * *
15492047 AAATTTTAAAAAATAAAATCTATTTTCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
63 AGA-TTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** *
15492112 TCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAATCCAATTGTTTCTAT
126 TCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * *
15492165 TCATACAAGCATATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT---TAA
* * * ** ** * * *
15492229 AACATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTGAGTAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTCAATAATTAT
62 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * ** * *
15492294 TTATTTCAAAT-AGTTATTATCTTTCATTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTAT
127 CTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* ** * * ** * *
15492346 TAATACAAGTTTAATTAGAATAAAGTAATACTAATTTACAAATATTCTAAAAATTAGTAGGTAGG
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA--A-TTAAG
* * * *
15492411 AGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATACTCATGTCCATTTGAACAATTA
63 AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** * * *
15492475 TCTATTTCAAATCATTATGACCTCCTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTATGT
126 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * *
15492528 TGA-AGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAA-TAAGAG
1 TCATA-CAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAAGAG
* *
15492591 ATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
65 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* ** * * ** ** *
15492655 ATCTCAAATTGTTGTGATC-TTCATTTTGTTGTAAAACCATTGTTTCTT-T
129 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTAT
* * * * * *
15492704 TCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATATTCTAAAAGTTAATAAATAAG
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT---TAAG
* * ** * * * ** * ** * *
15492769 AGATTTAAAAAATAAATGTGTCTGTCAAACCAGTTGAAATGGTTAAAATTATTAAAATAATTTTC
63 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * *
15492834 TATTTCAAATCATTCTGATCTCTTGTTTAGTTATAAAACAATT-ATTTCATT
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * * *
15492885 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATTAATGAGCAA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAAATTAAT---TAA
* * *** * *
15492950 GAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATTGAACAAATTCAAATAGATT-TTACTATTTGAACAATT
62 GAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATT
* * *
15493014 ATCT-TTAT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTAGT-ATAAAATAATT-ATTTCAGT
125 ATCTATT-TCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * *
15493068 TCATAAAAACTTATAT-GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCA
1 TCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT---TA
* ** * * ** * * *
15493131 AGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAAATA
61 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * *
15493196 TCAATCTCAAATCATTATTATC-TTTGTTTTCTCATAAAAATAATTGTTTCTAA
126 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTAT
* * * * *
15493249 TCATACAAGCATATTT-GGATGAAAATAATACTAATTT-TATAATATT-TTAAAATTAA-TAAAA
1 TCATACAAACTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCTAAAAATTAATTAAGA
* * * * * * *
15493310 TATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATC
64 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** * ** * * *
15493374 CATTTGAAATTGTTCA-AAATTTTTGTTTAGTCATATAATAATTG-TTTTAGT
128 TATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * *
15493425 TCATACAAACTTA-TTCGATATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATTAATAAGCA
1 TCATACAAACTTATTTAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAAATTAAT---TA
* * * *
15493489 AGAGATTTGAAAAAAATAATTTTTTTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAAT
61 AGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* *
15493554 TATCTATCTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGT
124 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
** * * *
15493609 TCATA-AAAGCTTATCCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAGAATTAA-TAACA
1 TCATACAAA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATTAAGA
* * *
15493671 TATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTT-T
64 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTAT
* * * * * * ** *
15493734 ATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGCTCTATCATAAAATTATTGTTTCTAT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * * *
15493786 TCATTCAAGCTTCTTT-GAAATAAAATAATACTAATTCAGTAA-ATTTCCAAAAATTAATAACTA
1 TCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAT---TA
** * * * * * * *
15493849 AGAGATTTTAAAAAA-AAA-TTGATTTGTCGAGCTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAGCAAT
61 AGAGA-TTTAAAAAATAAATTTG-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * *
15493912 TATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTAGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTAGC
124 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * * * *
15493967 TCATACAAGCTTA-ATCGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATCTATAAGTA
1 TCATACAAACTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAA--T-TAATTA
* * * * *
15494030 AGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTTACCGAACCATTTCAAATA---AT---TA--T-----A--
61 AGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *** *
15494079 A-CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAAT-AAAACAATCATTTCAATTCA-
125 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTT-T-GTCATAA-AA-CAATTGTTTTTAT
** * * * * * *
15494135 T-ATGAGCTTATTTAATGTA-AA-ATAAT---GCTCATTTATTAATATT-TCAAGAATTAATGAG
1 TCAT-A-CAAACTT-ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT---
* ** * **
15494193 TAAGAGAATTAAAAAA-AGAATTTGTTT----ATTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAGTAA
59 TAAGAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
15494253 TTATCTATTTTAGAA-CATTATGACCCTTT-TTTTGTCAT-AAACAATTGGTTATAT
123 TTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* ** * * *
15494307 TCATGCAAGTTTATTTTGAAAAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAA-T--TAATTAA
* ** * **** * * * * *
15494371 -AAATAAAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACATGTTTAAATAGGTATGATTATTTGAATAATTAT
62 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
** * * * *
15494435 CTATTTCAAATTGTTAAGACCTTCTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * * * * *
15494487 TCATCCAACCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATT--TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAA
1 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT---AATTAAG
* * * ** * * *
15494549 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCGGGTTCAAATAGTTATGATTCTTTGAACAATTATT
63 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** * * *
15494614 TATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTAT
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
15494665 TCATACAA
1 TCATACAA
15494673 GTTTGTTCGA
Statistics
Matches: 4013, Mismatches: 895, Indels: 541
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
161 10 0.00
162 3 0.00
163 12 0.00
164 103 0.03
165 64 0.02
166 11 0.00
167 9 0.00
168 13 0.00
169 9 0.00
170 12 0.00
171 132 0.03
172 17 0.00
173 6 0.00
174 21 0.01
175 61 0.02
176 223 0.06
177 584 0.15
178 229 0.06
179 340 0.08
180 477 0.12
181 1043 0.26
182 364 0.09
183 140 0.03
184 123 0.03
185 7 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAAGAGA
TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
Found at i:15490493 original size:179 final size:180
Alignment explanation
Indices: 15489414--15490535 Score: 501
Period size: 177 Copynumber: 6.3 Consensus size: 180
15489404 TTGAACATGT
* * ** *
15489414 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTACTTAGTCAT
** * * * * *
15489479 AAACCAATTGTTTCTA-CTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTATTAA-AATT
66 AAAAAAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAA-T
* * ** * * * * *
15489542 TCA-AAAATTAATAAGTA-AAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGT
129 T-AGAAAATTAAGAAGCATGGA-ATTTAAAAAAAAAATA-GTTCACCAAACAAGC
* * * * * ** ** * ** *
15489595 TCAAATAATTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGTTCTTTTGTTTTGTCAT
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTACTTAGTCAT
* * * * * *
15489660 AAAACAATTATTTCTA-TTAATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATT
66 AAAAAAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAA-T
** * * * * *
15489723 CTA-AAAATT-AGTTG-A-AG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
129 -TAGAAAATTAAGAAGCATGGAATTTAAAAAA-AAAATAGTTCACCAAACAAGC
* * * * * * * * ** * **
15489772 TCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACTATTACCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGT
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTACTTAGTCAT
* * * * * * * *
15489837 AAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 AAAAAAATTG-TTTCAGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAAT
* * * ** * * * *
15489900 TCA-AAATTTGATAAG-A--G-ATTTAAAAACTAAATCTA-TTTACCGAAC-CGAT
129 T-AGAAAATTAAGAAGCATGGAATTTAAAAA--AAAAATAGTTCACCAAACAAG-C
* * * * * ** *
15489949 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAGTATCTATATCAAATCAGTATGATCTT-TGTTTTGTCAT
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTACTTAGTCAT
* *** * * * *** * * *
15490013 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-CTTATTTGGAGT-AAATATTGCTAAACTAATAATATT
66 AAAAAAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAAT
* * * * ***** ** *
15490075 CTA-AAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAACAATAAATATA-TTTGTTGAACCTGT
129 -TAGAAAATTAAGAAGCATGGA-ATTTAAA-AA-AAAAATAGTTCACCAAACAAGC
* * * * * * *
15490128 TCAAGTAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACTTTTTATTTAGTCAT
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTACTTAGTCAT
* * * * *
15490193 AAAATAATTTTTTCAGTTCTTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAATTA
66 AAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAATTA
* * * * *
15490258 GAAAATTAATAAGCATGGAATTTAAAAAAAAAATTGTTTACCGAACAAGT
131 GAAAATTAAGAAGCATGGAATTTAAAAAAAAAATAGTTCACCAAACAAGC
* * *
15490308 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGGCCTTCTACTTA-TCAT
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTACTTAGTCAT
* * * *
15490372 AAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATTAAGTAATA-T-TCTTTATTAATATT
66 AAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAT-TTTATTAACAAT
* * * * *
15490434 TCA-AAAATTGAGAAG-TTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTCATCAAATAAGC
129 T-AGAAAATTAAGAAGCATGGA-ATTTAAAAAAAAAAT-AGTTCACCAAACAAGC
* * *
15490487 TCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATGA
1 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
15490536 ACATTTGTTT
Statistics
Matches: 745, Mismatches: 166, Indels: 62
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 33 0.04
176 42 0.06
177 188 0.25
178 53 0.07
179 170 0.23
180 102 0.14
181 154 0.21
182 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (180 bp):
TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTACTTAGTCAT
AAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACAATTA
GAAAATTAAGAAGCATGGAATTTAAAAAAAAAATAGTTCACCAAACAAGC
Found at i:15491481 original size:164 final size:164
Alignment explanation
Indices: 15491199--15491502 Score: 389
Period size: 164 Copynumber: 1.9 Consensus size: 164
15491189 TGATCAAGGC
* * * *
15491199 AAATAGTTATGACTGTTTGAAAAATTATTTATTTCAAATGATTATGACCATTTGTTTTATCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTACTTATTTCAAATGACTATAACCATTTGTTTTATCATAA
* * * * *
15491264 AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAACATAATTCGAATTTATTAATATTTAAA
66 AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAAA
15491329 AAATTAATAAATAAGTGATTTATCAACCAAGTTG
131 AAATTAATAAATAAGTGATTTATCAACCAAGTTG
* * *
15491363 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACTTATTTCAAATCG-CTATAACCTTTTGTTTTGTCACT
1 AAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTACTTATTTCAAAT-GACTATAACCATTTGTTTTATCA-T
** * * *
15491427 AAATTATTTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTT-CAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTC
64 AAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGCAA-TAAAATAATACAAATTTATTAATATTC
* *
15491490 ATACAATTAATAA
128 AAAAAATTAATAA
15491503 GTAAAACATT
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 19, Indels: 6
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
163 2 0.02
164 104 0.88
165 12 0.10
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (164 bp):
AAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTACTTATTTCAAATGACTATAACCATTTGTTTTATCATAA
AACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGCAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAAA
AAATTAATAAATAAGTGATTTATCAACCAAGTTG
Found at i:15492189 original size:363 final size:359
Alignment explanation
Indices: 15491356--15494698 Score: 2381
Period size: 363 Copynumber: 9.3 Consensus size: 359
15491346 ATTTATCAAC
* ** *
15491356 CAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTT
** * * * * *
15491420 TGTCACTAAATTATTTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTA
64 TGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * ** *
15491484 ATATTC-ATACAATTAATAAGTAAAACA-TTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATAAGTTCAAAT
128 ATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACTGAACAAGTTCAAAT
* * * *
15491547 AGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
191 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTGT-TTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * * *
15491611 AATTGTTTTTGTTCGTACAAGC-TATTCGGATTAAAATATTATTAATTTATTTATATT-TAGACA
255 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAA
* * * * *
15491674 ATTAATGAGTAAAAGATTTT-AAAAATAAATATGTTTACCGAA
318 ATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTTCCAAA
* ** * * *
15491716 TAAGTTCAAATAGACAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT
* * *** * *
15491780 GTCATAAAGCAATTGTATC-AGTTCATATTGGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTACTAA
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * **
15491844 TATTCTAAAAGTTAATTAGTAAGAGATTCAAAAAATAATTCTTTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
129 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATT-TATTTACTGAACAAGTTCAAATAG
** * *
15491909 TTATGACTATTTGAGGAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCATTTGTTTTTGTCATAAAACAA
193 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC-TTTGTTTTTGTCATAAAACAA
15491974 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAT
257 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAAT
* *
15492038 TAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAATAAAATCTATTTTCTAAA
320 TAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAAT-AAAT-TGTTTTCCAAA
*
15492078 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTA
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTT
** *
15492143 GTCATAATCCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * **
15492208 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTGAGTAAGTTCAAATAGT
130 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * ** *
15492273 TATCACTATTTCAATAATTATTTATTTCAAA-TAGTTATTATCTTTCATTTTGTCATAAAAAAAT
194 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACCTTTGTTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** *
15492337 TGTTTCTATTAATACAAGTTTAATTAGAATAAAGTAATACTAATTTACAAATATTCTAAAAATTA
258 TGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * * *
15492402 GTAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA
322 ATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTTCCAAA
* * * * ** *
15492441 TC-AGTTCAAATACTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTCCTATTT
1 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTT
* * * ** * *
15492505 TGTCATAAAACAATTGTTTATGTTGA-AGCAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATCTATT
64 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
15492568 AATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-TCGAAACAAG-TCAA
127 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACT-G-AACAAGTTCAA
* * * * ** **
15492627 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTGTGATC-TTCATTTTGTTGTAAAA
189 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTGTTTTTGTCATAAAA
* * * * * *
15492691 CCATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATATTCTAAAA
254 CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* ** *
15492756 GTTAATAAATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATGTGTCTGT-CAAA
318 ATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TGT-TTTCCAAA
* * * ** * ** * * * * * *
15492798 CCAGTTGAAATGGTTAAAATTATTAAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTCTGATCTCTTGTTTA
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
15492863 GTTATAAAACAATTATTTC-ATTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTA
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
15492926 ACATTCAAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATTGAACAAATTCAAA
128 ATATTC-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAAT-AATTTATTTACTGAACAAGTTCAAA
* * *
15492991 TAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCT-TTAT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTAGT-ATA
190 TAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAA-TTATTATGACC-TTTGTTTTTGTCATA
* * * * * * *
15493052 AAATAATTATTTC-AGTTCATAAAAACTTATATGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC
251 AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
* * * **
15493116 AAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTGAA
314 AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAA-TTGTTTTCCAAA
* * * * * * *
15493162 CCAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATTATC-TTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15493226 CTCATAAAAATAATTGTTTCTAATCATACAAGCATATTTG-GATGAAAATAATACTAATTT-TAT
65 GTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-T
* * * *
15493289 AATATT-TTAAAATTAAT-A--AA-ATATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACCAA-TTCAAA
127 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACTGAA-CAAGTTCAAA
* * * * * * ** ** * *
15493348 TAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCCATTTGAAATTGTTCAAAATTTTTG-TTTAGTCATATAA
190 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATT-ATGACCTTTGTTTTTGTCATAAAA
* * * * *
15493412 TAATTGTTT-TAGTTCATACAAACTTATTCGATATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAA
254 CAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-CAA
* * *
15493476 AAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAATTTTTTTTACCAAA
316 AAATTAATAAGCAAGAGATTT-TAAAAAATAAATTGTTTT-CCAAA
* * * *
15493522 CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATCTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* **
15493587 GTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TCCATAATAAAATAATACTAATTTATTA
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * **
15493650 ATATT-TCAAGAA-T--TAA-TAACATATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAA-TTCAAA
128 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACTGAA-CAAGTTCAAA
* * * * *
15493709 TAGTTATGACTATTTGAACAACTT-TATATTTCAAATTATTATAACCTTT-TGCTCTATCATAAA
190 TAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTGT-TTTTGTCATAAA
** * * * *
15493772 ATTATTGTTTCTATTCATTCAAGCTTCTTTGAAATAAAATAATACTAATTCAGTAA-ATTTCCAA
253 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAA
* *
15493836 AAATTAATAA-CTAAGAGATTTTAAAAAA-AAATTGATTTGT-CGAG
316 AAATTAATAAGC-AAGAGATTTTAAAAAATAAATTG-TTT-TCCAAA
* * * * * * * * *
15493880 CTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTAGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
15493945 GTCATAAAACAATTATTT-TAGCTCATACAAGCTTAATCGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAA
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
15494009 TATT-TCAAAAATCT-ATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGAACCATTTCAAAT
129 TATTCT-AAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATT-TATTTACTGAACAAGTTCAAAT
* *
15494072 A---AT---TA--T-----A--A-CTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TCTTTTGTAATAAAAC
191 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTGT-TTTTGTCATAAAAC
** * ** * * * *
15494120 AATCATTTCAATTCATATGAGCTTATTT-AATGTAAAATAATGCTCATTTATTAATATTTCAAGA
255 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAA--TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * * * * * *
15494184 ATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAAGAATTTG-TTT---AT
318 ATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATTGTTTTCCAAA
* * ** * * *
15494222 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAGTAATTATCTATTTTAGAACATTATGACCCTTT-TTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
15494286 GTCAT-AAACAATTGGTTATATTCATGCAAGTTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TAAATTTATTA
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * ** ** * *
15494348 ATATTCCAAAAATTAATAATTAA-AAATAAAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACATGTTTAAATA
128 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTATTTACTGAACAAGTTCAAATA
* * * * * *
15494412 GGTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTCTG-TTTTGTCATAAACCA
192 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTT-TGTTTTTGTCATAAAACA
* * * * **
15494476 ATTGTTTTTGTTCATCCAACCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT--TATTCCAAAAATT
256 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * *
15494539 AAGAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAG
321 AATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-TGTTTTCCAAA
** * * * * **
15494578 CGGGTTCAAATAGTTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
15494643 GTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTGTTCGAAATAAAACAATACTAA
65 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
15494699 GAGATTTAAA
Statistics
Matches: 2360, Mismatches: 484, Indels: 280
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
339 27 0.01
340 59 0.03
341 16 0.01
342 46 0.02
343 2 0.00
344 3 0.00
345 4 0.00
346 96 0.04
347 7 0.00
349 1 0.00
351 11 0.00
352 24 0.01
353 2 0.00
354 20 0.01
355 52 0.02
356 59 0.03
357 242 0.10
358 288 0.12
359 199 0.08
360 227 0.10
361 190 0.08
362 217 0.09
363 367 0.16
364 191 0.08
365 10 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTG
TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGT
TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
GCAAGAGATTTTAAAAAATAAATTGTTTTCCAAA
Found at i:15492310 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 15492263--15492311 Score: 55
Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 17
15492253 ACTGAGTAAG
*
15492263 TTCAAATAGTTATCACTAT
1 TTCAAATAGTTAT--TTAT
*
15492282 TTC-AATAATTATTTAT
1 TTCAAATAGTTATTTAT
15492298 TTCAAATAGTTATT
1 TTCAAATAGTTATT
15492312 ATCTTTCATT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 3, Indels: 4
0.79 0.09 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.23
17 9 0.35
18 8 0.31
19 3 0.12
ACGTcount: A:0.37, C:0.10, G:0.04, T:0.49
Consensus pattern (17 bp):
TTCAAATAGTTATTTAT
Found at i:15492313 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 15492263--15492313 Score: 50
Period size: 16 Copynumber: 3.0 Consensus size: 16
15492253 ACTGAGTAAG
15492263 TTCAAATAGTTATCACTAT
1 TTCAAATAGTTAT---TAT
*
15492282 TTC-AATAATTATTTAT
1 TTCAAATAGTTA-TTAT
15492298 TTCAAATAGTTATTAT
1 TTCAAATAGTTATTAT
15492314 CTTTCATTTT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 2, Indels: 7
0.76 0.05 0.19
Matches are distributed among these distances:
16 10 0.36
17 7 0.25
18 7 0.25
19 4 0.14
ACGTcount: A:0.37, C:0.10, G:0.04, T:0.49
Consensus pattern (16 bp):
TTCAAATAGTTATTAT
Found at i:15493100 original size:540 final size:537
Alignment explanation
Indices: 15491347--15520214 Score: 5814
Period size: 540 Copynumber: 53.7 Consensus size: 537
15491337 AAATAAGTGA
* * * * ** *
15491347 TTTATCAACCAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAATCGCTATAAC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC-T-TTTCAAATCATTATGAC
** * * * * * *
15491411 CTTTTGTTTTGTCACTAAATTATTTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACA
64 CTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* * * *
15491475 AATTTATTAATA-TTCATACAATTAATAAGTAAAACATTAAAAAATAAATTTATTTA-CCAAATA
128 AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG--AAA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * * *
15491538 AGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTCGTTTTGT
* * * * * * * *
15491603 CAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGC-TATTCGGATTAAAATATTATTAATTTATTTATA
253 CATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * **
15491666 TT-TAGACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGT-TTACCGAATAAGTTCAAATAG
318 TTCTA-A-AATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAATAG
* * * * * * *
15491729 --ACATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAA
379 TTA-AAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* *** * * * * *
15491792 TTGTATCAGTTCATATTGGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTAAAAGTT
443 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATT
* * *
15491857 AATTAGTAAGAGA-TTCAAAAAATAATTCTT
508 AA-TAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
**** * ** *
15491887 TTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGGAATTATCTATTTCAAATCATTATCACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * **
15491952 ATTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-T
65 TTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* *
15492015 AAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAATAAAATCTATTT-TCTAAAC
128 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAA-TTTAAAAAAT-AAATCTATTTATCCAAAC
* * * * *
15492079 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTAG
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTG
** * * *
15492144 TCAT-AATCCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
252 TCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * * * * ***
15492208 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTCTACTGAGTAAGTTCAAATAGT
317 ATT-CTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTTC-AAACCAGTTCAAATAGT
** ** * * * ** * *
15492273 TATCACTATTTCAATAATTATTTATTTCAAA-TAGTTATTATCTTTCATTTTGTCATAAAAAAAT
380 TAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* * * * * *
15492337 TGTTTCTA-TTAATACAAGTTTAATT-AGAATAAAGTAATACTAATTTACAAATATTCTAAAAAT
444 TGTTTC-AGTTCATACAAGCTT-ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAAT
* * *
15492400 TAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAAT-TT
507 TAATA-GCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * *
15492431 GTTTACCAAATC-AGTTCAAATACTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
1 -TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGA
** * * *
15492495 CCTCCTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-ATGTTGA-AGCAAA-ATTAT-TCAGAATAAAATAA
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATA--AAAGCTTATATCA-AATAAAATAA
* * * * * * *
15492556 TACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAACA
124 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * *
15492621 AG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTGTGATCTTCATTTTGTT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGTC
* * * * *
15492685 GT-AAAACCATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATAT
254 ATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * *
15492749 TCTAAAAGTTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTGTCAAACCAGTTGAAATGGTTA
319 TCTAAAA-TTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
15492814 AAATTATTAAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTCTGATCTCTTGTTTAGTTATAAAACAATTAT
382 AAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * *
15492879 TTCATTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATTAAT
447 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTC-AAAAAATTAAT
* *
15492944 GAGCAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTA
511 -AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
*** * *
15492972 TTTATTGAACAAATTCAAATAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCTTTAT-AAAGTCATTATGA
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTTT-TCAAA-TCATTATGA
* * * *
15493035 CCTTTTGTTTTAGT-ATAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATATGAAATAAAATAATAC
63 CCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATAC
* * * **
15493099 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TCTGAAC
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAC
* * * * ** * * *
15493163 CAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATTATCTTTGTTTTCT
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGT
* * * *
15493228 CATAAAAATAATTGTTTCTAATCATACAAGCATATTTGGATGAAAATAATACTAATTTTATAATA
253 CATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * *
15493293 TTTTAAAA-T--T-AATAAAATATTTAAAAAATAAATGTGT-TTACTGAACCAATTCAAATAGTT
318 TTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT-C-AAACCAGTTCAAATAGTT
* * * * ** * *
15493353 AAGACTATTAGAATAATTATCCATTTGAAATTGTTCAAAAT-TTTTGTTTAGTCATATAATAATT
381 AAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTC-TGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * *
15493417 GTTTTAGTTCATACAAACTTATTC-GATATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATT
445 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTACTAACATTC-AAAAAATT
* *
15493481 AATAAGCAAGAGATTTGAAAAAAATAATTTTT
508 AAT-AGCAAGAGATTT-AAAAAAATAAATCTT
* * *
15493513 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATCTAAAATCATTATGACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* *
15493578 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTAT-CCATAATAAAATAATACTA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATACTA
* * * *
15493642 ATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAACATATTTAAAAAATAAATATATTTA-CCAAACCAA-TT
129 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA-CAAGTT
* * * * * * * * *
15493705 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTT-TATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGCTCTATCAT
193 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGTCAT
** * * * * * * *
15493769 -AAAATTATTGTTTCTATTCATTCAAGCTTCTTTGAAATAAAATAATACTAATTCAGTAA-ATTT
256 AAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA-TT
* * * * * * * *
15493832 CCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAA-AAAT-TGATTTGTCGAGCTAGTTCAAACAGTT
320 -CTAAAATTAATAAATAAAAGA-TTTAAAAAATAAATGTG-TCT-TCAAACCAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * *
15493895 AAGACTA-TATGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTAGTTTTGTCATAAAACAAT
381 AAAACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* * * * * * * * *
15493958 TATTTTAGCTCATACAAGCTTAATC-GAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
444 TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAAAAAT
* * * *
15494021 CT-ATAAGTAAGAGATTT-AGAAAATAATTCTA
507 -TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * *
15494052 TTTACCGAACCATTTCAAAT-A--AT---TA--T-AAC---TA---TTTCAAATCATTATGACCT
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTCAAATCATTATGACCT
* * ** * ** * * * *
15494102 TTTCTTTTGTAATAAAACAATCATTTCAATTCATATGAGCTTAT-TTAATGTAAAATAATGCTCA
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAA-ATAAAATAATACTAA
* * * *
15494166 TTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAA-AGAATTTGTTTAT-----TA
130 TTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGA-AATTTAAAAAATA-AATCTATTTATCCAAACA
* ** * * ** * *
15494224 AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAGTAATTATCTATTTTAGAA-CATTATGACCCTT-TTTTTG
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCA-AATTGTTATGA-TCTTCGTTTTG
* * * ** * ** *
15494287 TCAT--AAACAATTGGTTATATTCATGCAAGTTTATTTTGAAAAAAATAATA-TAAATTTATTAA
252 TCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACT-AATTTAATAA
* * ** * * * ** *
15494349 TATTCCAAAAATTAATAATTAAAA-ATAAAAAAAATAAATTTATTTTTTGAA-CATGTTTAAATA
316 TATT-CTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGT-GTCTTCAAACCA-GTTCAAATA
* ** * * * ** * * * *
15494412 GGTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTCTGTTTTGTCATAAACCAA
378 GTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
** * * ** *
15494477 TTGTTTTTGTTCATCCAACCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTA-T-TTATTCCAAAAATT
443 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATT
* * * * *
15494539 AAGAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATG
508 AA-TAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * ** * * * * * **
15494569 TTTACCGAGCGGGTTCAAATAGTTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATA
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
15494634 TTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTGT-TCGAAAT---A-AA-AC-
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATACT
* * * *
15494691 --------AATA---C---------TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACCAGTT
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAAGTT
* * * * * * * * * ** *
15494735 CAAATAATTAAGGCTATATGAATAATTATCAT-TTTAAATCATTATAACCTTTTGTT--TTGTTG
193 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATCTCAA--ATTGTTA--TGATCTTCGTT-TTG
* * * * ** * ** * * *** ** * * *
15494797 T-AAAATAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATT
252 TCATAA-AAACA--ATTGTT--TCT-A-TTCATAC-AAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAAT
* * * * *
15494861 TTAA-AA-ATTAATAAGAGATTTAAAAAAT-AAA-ATCT-----GT---T-T-AC--CAAACCAG
309 TTAATAATATT-CTAA-A-A-TTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTTCAAACCAG
* * * * * * * * * * * * *
15494910 TTTAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGA-CAATTTATTTTGTC
370 TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTC
* * * * * * * * *
15494974 AT-AGACAGTTGTTTCTA-CTAATACAATCTTATTC-GAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA
434 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACA
* * * * * *
15495036 TTCTAAAAGTTAATAAGTAACAGATTTAAAAAAATGAATCTG
497 TTCAAAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
** ** * * * * * *
15495078 TTGGCCTGACCAGTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
** * ** * * ** ** *
15495143 TTTTGTTTTAACACAAAACAATTGTTTCTA-TTTGTACAAGCTTATTTTGAATAGCATAATTCTA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACTA
* *
15495207 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTAT-CGAACAA
129 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAA
* * * * * * *
15495271 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTC
190 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGTC
* * * * * ** *
15495336 A-GAAAATAATTTTTTCTCTTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
254 ATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACT-AATTTAATAATA
* * * *
15495399 TTC-AGACATTTATAAGTAAAAGATTT-AAAAAT-AA-GT-TAC-CCAATA--AGTTCAAATAGT
318 TTCTA-AAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGT-CTTCAA-ACCAGTTCAAATAGT
**** * * * * * ** * *
15495456 TATGGTTATTTGAACATTTATTTATTTTAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
380 TAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* ** * * * * *** * *
15495520 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAACT
444 TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATT
* * * * *
15495584 AATAAGTAAAAGGTTT-CAAAAATAAATATT
508 AAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * ** *
15495614 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-AATCATTTGAATAATT-TCTATTTCCAATTGTTATCAC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
15495677 CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTATCAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAACAATATT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* * * * *
15495741 AATTTATTAATA-TACTAAAAATTAATGAGTTAAGAGATTGAAAAATGAATCTATTTA-CCAAAC
128 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--AA-A-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAC
* * ** * * * * * *
15495804 AAATTTAAATAGTTATTCCTATTTAAATAGTTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTG
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTG
* * * * * *
15495869 TCA-AAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTCGAATT-AAATAATA-TAAATTTATTT
252 TCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTT-GGATTAAAATAATACT-AATTTAATA
* * * * * ** *
15495931 ATATTCCAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAACAATAAATATGTTTTCTGAGCATGTTCAAATAG
315 ATATTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTTCAAACCA-GTTCAAATAG
** * ** * * * * * * *
15495995 TTATGACTATTTGAACGATTACCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAACCAA
379 TTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
15496059 TTGTTTCTGTTCATAGAAGCTTATT-TGAAATTAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAAT
443 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAAT
** * * *
15496123 TAATAAATAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTG
507 TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * *
15496155 TTTACTAAACGAGTTTAAATAGATT-TGAATATTTAAAGAATTATCTATTT-AAGTCATTATAAC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* ** * * *
15496218 CTTTTGTTCTACCAAAAAATAATTGCTTT-AGTTCATAAAAAC-TA-ATCCGAAATAAAATAATA
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATAT-C-AAATAAAATAATA
* * *
15496280 CTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TCCAAA
126 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-A--A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA
* * * * * * *
15496344 CCAGTTCAAATATTTATGACTATTTAAACAATTATCAATCTCAAATTGTTACGATCTTTGTTTTT
187 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTG
* * *
15496409 TCAT-AGAACAATTGTTTCTGATT-ATACAAGCTTATTTTGA-TAAATATAATACTAATTTAATA
252 TCATAAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCATATTTGGATTAAA-ATAATACTAATTTAATA
* * *
15496471 ATATT-TCAAAA--ACT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAGTTCAAATA
315 ATATTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATA
* * * * * *
15496532 GTTAAAATTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAA
378 GTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* * * * **
15496597 TTGTTTCAGTTCATACAAACTTA-TCAAGAAGAAAAAAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAAT
443 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAAT
* * *
15496661 TAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTG
507 TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * ** **
15496693 TTTATCGAACAAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATAGATTT-AAAGTTGTTATTG-
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-CTTTTCAAA-TCATTA-TGA
* * * * * * *
15496756 CCCTTTGTTTTGCCATAAAACAATTATTTTAGTTCATTAAGGCTTATCA-AAAATAAAATAATAC
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT-ATCAAATAAAATAATAC
* * * *
15496820 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATC-AGTTTATCGAAT
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCCAAA
* * * ** * *
15496884 C-AGTTCAAATAATTATGGA-TATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATTG-CCTTTTGTT
187 CAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTA-TGATC-TTCGTT
* * * * *** * * * *
15496946 TTGTCAT-AAAGCAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTAT
249 TTGTCATAAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAA
* * * * * * * * *
15497009 TAATATT-T-CAA-GAATTAATAAGAGATTTAAAAAA-AATTCTAT-TTACCAAACCAATTGAAA
313 TAATATTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAA
* ** * * * * *
15497069 TACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-ACCTTTTTGTTCTA-TCATAAA
376 TAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTT-TAGTCATAAA
* ** * * * *
15497132 ACAATTATTTCTTTTCATACAAACTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAAATTAGT-A-A-T-----
439 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAA
*
15497188 -ATT--TTG-AA-A-A--TAAAAAAATAAAT-TT
504 AATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * ***
15497213 GTTTGCCAAACTAGTTTAAACAATTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGAC
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * * **
15497278 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAGTTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTGAAATGGAATAA-AGCT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATA-CT
* * * * * *
15497342 AATTTATTACTATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTA-CCGAACC
128 AATTTATTAATATTTCAAAAA--T-TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * * * * * * * ** *
15497406 AGCTCAAATAATTATAACAATTTAAACAATTATCTTTTTCAAATTGTTATTACTTTTTATTTTAT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTCGTTTTGT
* * * * ** * * **
15497471 CAT-AAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAAT
253 CATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCAT-ATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * * * * * *
15497534 ATT-TAGAAAACTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTAT-TTACCAAACCATTTCAAATA
317 ATTCT--AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAATA
*** * * * * * * * *
15497597 GTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATTTTTTATTTTGTCATTAAACAA
378 GTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* * ** * * * *** *
15497662 TTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACT
443 TTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAAT
** * * * *
15497726 TAATAATTAAGAAAATT-AAAAAATAATTCTA
507 TAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* ** ** * * * * * * ** **
15497757 ATTGTCGTACCATTTTAAGTAGTTAAT-ACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGA-
* * * * * ** *
15497820 CCTATTGTTTTATCATTAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTAT-TCGGATCAAAATAACAC
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAAT-AAAATAATAC
* * * * *
15497883 TAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCCAAT
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAC
* * * * * * * * * * *
15497947 TAGTTCAAATGGTGAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAG
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTG
* *** * * * *
15498012 TCAT-AAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAATTAATACTAATTTATTGA
252 TCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * * * * ** *
15498075 CATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATA
316 TATTC-TAAAATTAATAAATAAAAGATTT-AAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATA
** * * * * * * * *
15498140 GTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTT-GTCATAAAATA
378 GTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTG-TTTAGTCATAAAACA
* ** ** * * * **
15498204 ATTGTTTCAGTAGTAATA-ATTTCATTAGACCAGAA-ATAAA-AATATTAATTTATTAATATTTT
442 ATTGTTTCAGT--TCATACA-AGC-TTA-TTCAGAATA-AAATAATACTAATTTACTAACATTCA
** * * * *
15498266 CTAAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAAATAAATCTG
501 AAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * ** * * * * *
15498303 TTTATCGAATTAGTTAAAATAATTACGGCCATTTGAAC-GTTCATCTATTTCAAATCATTATGAC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT-ATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * *
15498367 CATTTGTTTTATCATAAAACAAATGGTTT--TTATCATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATAC
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATAC
* * * *
15498430 TAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAGAAATAAATCTGTTTA-CTAAA
127 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A-A--TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA
* * * * ** * *
15498494 CTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATC-AGTCTTAAATCATTAAGATCTTTGTTTT
187 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTT
* * * * * * *
15498558 GTCGT-AAAACAATTATTTCTGA-TCATAAAAACTTA-TTCGATTAAAAAAATACTAATTTAATA
251 GTCATAAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * * *
15498620 ATATTTCAAAAATTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATA
315 ATA-TTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATA
* ** * * * **
15498685 TTTAAAACTATTAGAATAATTATCTA-TTCTAAATCGTTCTAACCTTTTGCTTAGTCA-AAAGTA
378 GTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTC-AAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACA
* * * * * **
15498748 CTTATTTCA-TATCTTAAAAG-TTATTCAGAATAAAATAAT-CAAAATTTA-TAAACATTTGAAA
442 ATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC-TAATTTACT-AACATTCAAAA
* * *
15498809 AATTAAGAAGAAAAAGATTTGAAAAAAATAAATCTT
504 AATTAA-TAGCAAGAGATTT-AAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * *
15498845 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * *
15498910 TTTTGTTTTGACATAAAAGATTTTGTTTCAGTTTATATAAGCTTAT-CCATAATAAAATAATGCT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATACT
* * * *
15498974 AATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAACAAATAAATTTGTTTA-CCAAACA
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AA-A-TTTAAA-AAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * * * * * * **
15499038 AATTCAAATAGTTATTACTATTTGAGCAATTTTTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTTTTTGTC
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGTC
* * * * *** * * * *
15499103 AT-AAAACAATTATTTC-AGTTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATA
254 ATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * * *
15499166 TTCTAAAAATTACTAAGT----GATTTAAAAAATTAATTTGT-TTGCTAAATCAATCCAAATAGT
318 TTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT-C-AAACCAGTTCAAATAGT
* *** * * ** *** * * *
15499226 CATGTCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
380 TAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * ** * * * * * ***
15499291 GTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATTATATTGATTTATTAACATTTTGAAAATTAA
445 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAA
* * ** *
15499356 TAAGTAAGAGATTTGAAAAACCAAATCTA
510 T-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * ** * * * * *
15499385 TTTACTAAATAAGTTTAGTTAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAAC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
15499450 TTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGCTCCTAAAAGCTTAT-CCAAAATAAAATAATACTA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATACTA
* * *
15499514 CTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAA-AAATC-ACTTTA-CCAAATC-AGA
129 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCCAAA-CAAGT
* * * * * * *
15499574 TCAAATAATTATGGCCATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTATCTTTCATTTTGTCA
192 TCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGTCA
* * *** * * * * * * ** *
15499638 T-AAAACAATTATTTTTCGACAT-CAAGCTTA-TT-AAATAAAATTATTATTACCTTT--TGTTT
255 TAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAA-TAATACTA-ATTTAATAATA
** * * *
15499697 TGTCATAAAACAATTGTTTTTCAGCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAT-T-TATT--AA
318 T-TC-T--AA-AA---TTAAT-A-AATAAAAG---ATTT--AA-AAAATAA-ATGTGTCTTCAAA
* * * * * * ** **
15499758 -TATTTCAAGAATTAG-TAAGAGA-T-TTAAAAAATAAATATGT-TTATCGAACCAGTTCAAATA
366 CCAGTTC-A-AA-TAGTTAA-A-ACTATT--AGAATAATTATCTATT-TCAAATTA-TTCTGAT-
* * * * * ** * * * **
15499818 GTTTTGACTATTTG-AATAATTATCCATT-TTAAATTGTT-ATA-ACGTTTTGTTCCATCATAAA
421 CTTTTG--T-TTAGTCATAA--AACAATTGTTTCA--GTTCATACAAG-CTTATT-CAGAATAAA
* ** * * ** * * ** * * * **
15499879 ATAAT--TATTTTTGT-GCA-T-ACAAGTTTATTCAG-AATA-AAATAATACTAATTTAATAAT
477 ATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAA-A-AAAATAAATCTT
* * * * * * * * * *
15499936 ATT-CTAAA-AA--TC-CATAAGTAAGA-TATTTAAAAAATAAATCCCTTTGCCAAACCAGTTCA
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT-TAT--CTTT-TCAAATCA-TT-A
* * ** ** * ** * ** * ** * * * ***
15499995 -AACAGTTAAG-ACTAT-ATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
60 TGAC-CTTTTGTTTTGTCAT-AA-AACAAT-TGTTTCAGTTC-ATAAAAGC--TT-ATATCAAAT
* * * ** * *
15500057 AAAATAAGTATTCCAGCTCATACAAATTTATTCGGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTC
117 AAAATAA-TA--CTA-AT-TTATTAATAT-TTC---A-AAAAT-TAA-TAA---G--AA-ATTT-
*** * * ** * * ** * ** *
15500122 AAAAATTTATAAGTAAGAGATTTA--AAAAAAAAAT-AATTCTATTTACCAAACTAACTCAAATA
163 AAAAA---AT-A--AATCTATTTATCCAAACAAGTTCAA--ATAGTTA--TGACT-ATTTGAACA
* * * ** ** *
15500184 ATTATAACTATTTGCACAATTATCTATTTTAGATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
217 ATTAT--CTATCT-CA-AATTGT-TA---T-GATC----TT-CGTTTTGTCAT-AAAAA---CAA
* * ** * * * * * *
15500249 TTGCTTT-TGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTGATATT-TAAAAAA
264 TTG-TTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT--AAAA
* * * * * * * * ***
15500312 TTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGT-TTACCAAATCATTTCTAATAGTTTTGACTAT
326 TTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTAT
* ** * * * * * *
15500376 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAATATTTTCTTTTA-TCATTAAACAATTGGTTCTA-
389 TAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTT-GTTTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AG
** ** * * * * * * *
15500439 TTCATATTATTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAA
452 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAAT-AGCAA
*
15500504 GA-AATT--AAAAATAAATCTAT
516 GAGATTTAAAAAAATAAATCT-T
** * * * * **
15500524 TTGT-TGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATATT-AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATGA
1 TT-TACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTAT-TTGAACAATTATC-TTTTCAAATCATTATGA
* * ** ** * *
15500586 CCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT-TTTTTGTTTGTACAAGCTTAT-TCGAATTAAAATAATAC
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATAC
* * * * * *
15500649 AAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAGTAGTATATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACC
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA--AG-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * ** * * * * ** * * * * *
15500712 AGTTCATATGGTTAAAACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTCAACTTTTGTTTAGT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGT
* ** * *** * * * *
15500777 CATAAAAA-TATTGTTTCGGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA
253 CATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * *
15500841 TT-TGAAAAATTAATGAGA-AAGAGATTTAGAAAAATAAATCTACGTAC--CGAACAAGTTCAAA
318 TTCT--AAAATTAAT-AAATAAAAGATTTA-AAAAATAAATGT--GT-CTTCAAACCAGTTCAAA
** * * * * * * * * *
15500902 TAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC
376 TAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAAC
* * * * * * * *
15500967 AATTGTTTTAGTTAATATAAGCTTATACATAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-TAA
441 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTACTAACA-TTCAAAA
* *
15501030 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAACTAAAT-TT
504 AATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * ** *
15501063 GTTTACAAAATC-AGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAACAATATATTTCAAATCATTATGA
1 -TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGA
* * * * *
15501127 CCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGCTTT-TGATCATACAAGCTTAT-TCTAAACAAAATAATA
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATA
* * ** ** * *
15501190 TTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACG-GATTTAAAAAATAAATCTGGTTA-CTGATCCA
126 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAA
* * ** *
15501253 GTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
190 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGTCA
* * * * ** **
15501318 T-AAAACAATTGTTTCCAATCATAGAAGCTTATTCAG-TTAAAAATAATAAAAATTTAATAATAT
255 TAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATT-AAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * ** * * *
15501381 TC-CAAA--AATTAATAAGGGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAA
319 TCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATAGTTAA
* * * * *
15501443 AACTATTAGAATAATTATTTTTTTAAAATTGTTTTGACCTTTTTTTTAAAATCATTTTGACCTTT
383 AACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA-----TT-A------TTCT--GATC-TTTTG------
* * * * * * *
15501508 TTTTAGTCATAAAATATTTGTTT-AATATCATAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATCCTAATA
427 -TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
15501571 TATTAACATTCAAAAAGTTAATAAGCAAGAGGTTTGAAAAAATACATCTA
489 TACTAACATTCAAAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* ** * * * * * * * *
15501621 TTTAACGGACAGGCTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA---TTTAAAATCGTTATGACTT
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTCAAATCATTATGACCT
* * * * *
15501683 TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCAT-AAAGGTT-TATCCAAAATAAAAATAAAACT
66 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATAT-C-AAAT-AAAATAATACT
* *
15501746 AATTTATTAATATTTCAAAAATTACA-AAGCAAGAGATTCAAAAAAATAAATCTATTT-TCTAAA
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAG--A-A-ATT-TAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA
* * * * * * * * ** ** *
15501809 CAAATTCAAATAGTCACT-ACTATTTAAATAATTGTATATTTAAAATCATTATGCCCTTTTGTTT
187 CAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTT
** * * ** ** * * *
15501873 CATCAT-AAAACAATTGTTT-TAGTTCAAATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATT
250 TGTCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * *** * * * *
15501936 AATATGTC-AAAAATAAAAAAGAAAGTGATTTAAAAAGGGAATATGT-TTACCAAATCAATTAAA
314 AATAT-TCTAAAATTAATAAATAAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAA
* *** * * * * * * * *
15501999 ATAATTATGGCCATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGT-AT-AAA
375 ATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* * * * *
15502062 -AATT-TTTCA--TCATACACGCCTGTTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
440 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAA
* * *
15502121 AAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTA
503 AAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * *
15502156 TGTACCAAACTAGTTC------------CTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATAACA
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* ** * * *
15502209 TTTTGTTCTGTTGTAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAA-CTTAT-TCAAAACAAAATAATACT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-AAAGCTTATATC-AAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
15502272 AATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTGTCAAAACA
128 AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * ** * * * * * *
15502337 A-TTTAAACAGTTAAGACTACATGAATAAGTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGT
* * ** * * * *
15502401 TAT-AAAATAATCATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
253 CATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
** * ** * * * * * * *
15502464 ATT-TTGAA--AATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATT
317 ATTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATAGTT
*** * * * * ** * * ** * **
15502526 ATGGCCT-TGT-CAACAACTATCTATTTCGAATCGTTATTAAATTTTGTTTGGTCATTTAACAAT
381 A-AAACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
** ** * * * *
15502589 TGTTTTTGAACATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATCTTTC-AAAAATT
444 TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAA-CATTCAAAAAATT
* *
15502653 AATAAG-TA-AGATTT-AAAAAATAAATCTG
508 AAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * * * *
15502681 TTTATCTAACTAGCTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTGTAAAC-TTT-AAATCATTATAA
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-T-T-ATCTTTTCAAATCATTATGA
* * * * * *
15502744 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* * * * *
15502809 AATATAATAATATTTCAAAAATTCATAACTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTAT-CAAAT
128 AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGA-AATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAC
* * * * * * * * *
15502872 TAGTTCAAATATTTAAT-ACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACCTTTTGTTTT
188 AAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTT
* * ** * * *
15502936 GTCATAAAATA-AGTT-TTTTTGAATTCATAC-TCCTTATTTGGAATAAAATAA-AATAAATTTA
251 GTCATAAAA-ACAATTGTTTCT--ATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACT-AATTTA
* * * * * * * * * **
15502997 TTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTAT-TTACCTAACGGGTTCA
312 ATAATA-TTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCA
* ** * * * * * * *
15503061 AATAATTATGACTATT-TAACAATTATCTATTTCAAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCGTA
374 AATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTC-AAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATA
* ** * * * * * *
15503125 AAACAAATGTTTTTGTTCAT-CTAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTC
437 AAACAATTGTTTCAGTTCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTC
*
15503189 --AAAATTAAT---AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTA
500 AAAAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * ** * **
15503221 TTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-C
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * *
15503285 TTTTAGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TCAGACTAAAATAATAC
65 TTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATAC
* * * * *
15503348 TAATTAATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATTTTTA-CCAAAC
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAC
* * * * * * * * ** * ** *
15503412 TAGGTCAAATAATCATGACAATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTT
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTG
* * * * * * *
15503477 TCAT-AAAAGAATTGTTT-TAGTTTATATAAGC-TGATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
252 TCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCAT-ATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * ** * * * * * *
15503539 TTAATCAAAAAATTAAT-AATAAGGGATTTAAAAAATGAATAT-TTTTACTGAACTAGTTTAAAT
315 ATATTC-TAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT-C-AAACCAGTTCAAAT
* * * * * * * ** * * * * *
15503602 AATTATGATCGT-TT-TAACACTTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA
377 AGTTA-AAAC-TATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* * * ** * * * *
15503665 CAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAA
440 CAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTACTAACATTCAAA
* * *
15503728 AAATTAATTAGTAA-AAATTT-TAAAAATAAATCTGT
503 AAATTAA-TAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT-T
** * * * * * *
15503763 TTT-CTGAGCATGTTCAAATAATTAAGACAATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAGTATGACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* ** *
15503827 TTTTGTTTTCTCAT-AAACAAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTAT-TTAGAATAAAATAATACT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATACT
* ** * * * * *
15503890 AATTTATTAAAATTAAAAAAATTAACAAGTAAAATATTTAAAAAACAAATCTATTTA-CTAAGCG
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * * ** * **
15503954 AGTTCAAATAATTTTGACTATTT-ACACAATTATTTATGTCAAATCATTGTGATCTTTTTTTTTT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC--TTCGTTTT
** *** * * *
15504018 GTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTAT
251 GTCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATT-TGGAT-TAA-AATAATACTAATTTAA
* * *** * * * * **
15504082 TTATATTCTGAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAGATAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAA
313 TAATATTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAA
* *** * * ** * *
15504147 TAGTCATGTCCATTTA-AACT-ATTATATATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTGTTT-GTGATAA
376 TAGTTAAAACTA-TTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAA
* ** * * * * *
15504208 AACAATTGTTTTTA-TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATAATAGTTT-TTAATATTTC-
438 AACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCA
*
15504270 AAAAATTAAT---AAGAGATTT-AAAAACTAAATC-T
501 AAAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* ** * **
15504302 ATTA-CTGACGTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-ATTAT-TTATCTCAAATTGTTATG
1 TTTACCAAAC--AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTT-T-TCAAATCATTATG
* * * * ** * * * * *
15504363 ATC-TTTGTTTTGCCATAAAATAACTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TCTGAGTAAAATATTG
62 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATA
** * * * * * * **
15504426 CTAAGCTAGTAGTA-TTCTAAACAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGT-TG
126 CTAATTTATTAATATTTC-AAA-AA-T--T-AATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCA
* * * * * *
15504489 AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTAT-TA--TC-----GTTTTGACCTTTTGTT
185 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTT
* ** * * * * *
15504546 TAT-TCAT-AAAATAATTGTTT-TAGTTTGTACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATTTC
249 T-TGTCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTA
* * ** * * *
15504607 TTCAACATT-TAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAACTAAATTTGT-TTACTAAACAAGT
312 AT-AATATTCT--AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAA-TAAATGTGTCTT-C-AAACCAGT
* * * ** * *
15504670 T---AT-G-----GCTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTT--T--T
371 TCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCAT
* * * * * * * **
15504721 ----CAA----TTCA--TC--A-AGGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTT
436 AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCA
* * *** * *
15504773 GAAAATTGATAAGTTGGAGATTT-AAAAAATGAAT-TAG
501 AAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT-T
** *** ** * * * ** *
15504810 CATATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGAAC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * *
15504875 ATTTGTTTTGTCATAAAAGAA----AT--GTT--T------TTA-AT----T---AT--TACTAA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15504916 TCTATTAATATTTCAAAAATTAATTAGATATTT-TAAAATAAATCTATTTAT-CAAACTAGTTTA
130 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAAGTTCA
* * * * * * * * *
15504979 AATAGTTATGACTATTT-AAGCAATTTTTTATTTCAAATTGTTGTGACTTTTTGTTCTATTAT-A
195 AATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTCGTTTTGTCATAA
* * * * ** * * * *
15505042 AAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTGACTTACTAATATTTTA
258 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTA
* * * * ** * * * **
15505107 ATAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAACTAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGA
323 A-AATTAATAAATAAAAGA-TTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAA
* * * ** * * * * * * *
15505171 CTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATGGTTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAAAAATTATTTT
385 CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * * * * *
15505236 AGTTCCTATAAGCTTATT--GAAAAAAATAAGACTAAGTTATTAATATT-ATGAAAATTAGTAAT
450 AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCA-AAAAATTAAT-AG
* * *
15505298 TAAGAGATTT-AAAAAATGAATCTG
513 CAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
** * * * * * * * *
15505322 TTTACTGAATAAGTTTAATTAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATTACTATAACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * * ***
15505387 TTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTTCTGTTCGTACAAGCCTATTTTGGATAAAATAATA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CA---ATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATA
* ** ** *
15505452 CAAATTTATTAATA--AAAAGATAATTAATAAGTAAAAAATATAAAAATAAATCTATTTAT-CGA
126 CTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG--AAATTTA-AAAAATAAATCTATTTATCCAA
* * * * * * * * * **
15505514 ACAAGTTTAAATATTTATGACTATATAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTATTT
186 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTCGTTT
* * ** * *
15505579 TGTCAT-AAAATAATTGTTT-TCATTCATACAAGCTTATACGGATTAAAATAATATTAATTTATT
250 TGTCATAAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * * ** * * *
15505642 AATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAATTC-CA
314 AATATTCT-AA-AATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTG-TCTTCAAACCAGTTCAAA
* ** * * * *
15505705 -AGTCATGACTATTTA-AATAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA
376 TAGTTAAAACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* ** * * * *
15505768 CAATTGTTTCAGTTCATA-TATTTTAGTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
440 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAA
* * * * *
15505831 AATTATTGAGTAAAAGAATT-AAAAAATAAATCTA
504 AATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
** * * * * * *
15505865 TTTATAAAAAAATGTTCAAATAGTTCTGATTATTTGAAC-ATATATTTATTTCAAATCGTTATGA
1 TTTACCAAACAA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT-TATCT-TTTCAAATCATTATGA
* ** * * * *
15505929 CCTTTTATTTTGAAATAAATCAATGGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTAT-TTAGAATAAAATAATA
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATA
* * * *
15505992 ATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAT
126 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA
* * * * ** *
15506056 CGAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTT
187 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTT
* ** * * * * *
15506121 ATCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTGA
251 GTCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
* *** * * * * * * * * * *
15506185 TATTCTAAATATTAATAAGTTGGAGATATAAGAAATAAGTCTAGACATCGAACTAGTTCAAAAAA
316 TATTCTAAA-ATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGT-GTCTTCAAACCAGTTCAAATAG
* *** * * * *
15506250 CTATGTCCATTTA-AACT-ATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CATTTTGTTTTGTCGTAAAA-
379 TTAAAACTA-TTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAAC
** * * *
15506311 AGTATTGCATTT-A-TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
441 A--ATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCA
* *
15506373 AAAAATTAAT---AAGAGATTT-AAGAACTAAAT-TT
501 AAAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * *
15506405 GTTTATCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATCTCAAAT-GTTATGA
1 -TTTA-CCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGA
* * * * * ** ** * *
15506468 TC-TTTATTTTATCATACAAGC--TT-ATTC-G-AAATAAAATATTGT-T-AAAT-TAATAATA-
63 CCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATAC
* * * * * ** **
15506523 T--TTTA--AA-AATT----AA-TAAGTAACAAATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAATTAG
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAAG
* * * ** * * * * *
15506577 TTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAAGCAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTC
191 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGTC
* * * * * * * * **
15506641 AT-AAAATAATTTTTTCAATTCATACATAAC-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA
254 ATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * **
15506704 CTCAAAAAATTAATAAACAAGAA-ATTTTTAAAAATAAATCGAT-T-TACTAAATAAGTTCAAAT
318 TTC-TAAAATTAATAAATAA-AAGA-TTTAAAAAATAAAT-G-TGTCTTC-AAACCAGTTCAAAT
** * * * * * * *
15506766 AGTTATGAC-ATTTA-AACAATTATTTATTTAAAATAACTATGA-CCTTTGTTTTA-TCATAAAA
377 AGTTAAAACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTG-TTTAGTCATAAAA
* * ** * * * * *
15506827 -AATTGTTTTAGTTCATAAAATTTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTC-AA
440 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAA
* ** * **
15506889 AAATTGATAAGTTAGAGATTT--AAAAATAAGTCAG
503 AAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
*** *** * * * **
15506923 TTTATTGAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAT
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * * ** *
15506988 TTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* ** * *
15507051 AAATTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTAGGCGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-CAAAC--
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA--A-GAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAA
* * * * * * *
15507113 ---C----AG-T-T-CCTGTTTGAACAATTATTTAAT-TCTAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
190 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTT-T-T
* * * * * * *
15507167 TTC-T-AAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATA
251 GTCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * * * ** * *
15507229 ATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAGTAGTTTAAACA
315 ATATTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATA
* * ** * * ** * *
15507294 GTTAAGACTA-TATGAATAATTATCTATTTCTAATCGTTATGACCTTTCATTTTGGCATAAAACA
378 GTTAAAACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACA
* * * * * *
15507358 ATTGTTTCAATTCTTACAAGCTTATT-TGCAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
442 ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAA
* * * *
15507422 GTAAT---AAGTGATTT-AAAAAGTAAAT-TAG
506 TTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT-T
* * * * * * *
15507450 TTTATCAAATTAA-TTCAAATAATTATGGCTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTAC
1 TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * ** ** * *
15507514 CTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TGATATT-TGAACATTCAATCTTAT-TCGAAATAAAAGAATA
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T-TTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATA
* *
15507576 CTAATTTATTAATCTTTGAAAAATTAATAAGTAAAAGCTTT-AAAAATAAATCTATTTA-CCAAA
126 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAA--TTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA
* * * * * * *
15507639 CCAGTT-TAA-A--TA-GACTATTTGAACAATTGTATAAT-TCAAATTGTTATAACTTTTTTGTT
187 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATCTCAAATTGTTATGA--TCTTCGTT
* * * * * * *
15507698 TTGTCAT-AAAACAATTATTT-TCGTTCATATAAGTC-TATTCGTAATAAAATAATACTAATCTA
249 TTGTCATAAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAG-CATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * *
15507760 ATAATATTAC-AACAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAATTTTGTTTGTCGAACTATTTCA
312 ATAATATT-CTAA-AATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCA
* * ** * * ** * * *
15507823 AATATTTAAGACCGTAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
374 AATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAA
* * * * * * * * * *
15507888 ACAATTTTTTCAATTCATATTAA-CTTAATCGGAATAAAATAAAACAAAGTTATTAATATTTC-A
439 ACAATTGTTTCAGTTCATA-CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAA
** * * *
15507951 AAAATTAATGAATAATAGATTTTAAAAAAT-AATTTT
502 AAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * **
15507987 GTTTACTTAACCAA-TTCAAACAATTATAACTATTTAAACAATTATCTACTTCAAATTGTTATGA
1 -TTTAC-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGA
* * * * * * * * *
15508051 CCTTTTATTTTGTTAGAAAACAAATT-TTT---TTTATATAAGTTTGT-TTAGAATAAAGTAATA
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATA
* * * * * *
15508111 CTAGTCTATTAATATTTCTAAAACTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTAAT-CAAACCAA
126 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA-CAA
* * ** * * * **
15508175 -TTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCATTATAATTTTTTGTTTAAT
190 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTCGTTTTGT
* * * * * * * * *
15508238 TAT-AAAACAATTATTTTTATTCATACAAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAACA
253 CATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * ** * * * ** *
15508302 TTTTGATAATTGCTAAA-AAAA-ATTTAAAATA-AAAGGT-TTTGTCATAATGTAATTGTTTCTA
318 TTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCA-AA--CCA--G-TTCAA
* * * * * * * * *** * *
15508363 TTCA-TACAAAATTAATCAAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAA-TATTTTAAAAATTAG-TAA
375 AT-AGT-TAAAACT-ATTAGAAT--AATTAT-CT-ATTTCA--AATTATTCTGATCTTTTGTTTA
* * ** * * *** * *
15508424 GAATCTTAAAAACTAAATCTATTT-A--TCGGACCAG-TTCAATT-AG-TTATGCTTAT-GTGAA
431 G--TCAT-AAAAC--AAT-TGTTTCAGTTCATACAAGCTT--ATTCAGAATAAAATAATACT-AA
* * *** * * ** ** * * * *
15508482 -TAATTAACTATCTCAAATTGTTAAGATCTTTG-TTTTGTCATAAAATAATTATT
487 TTTACTAAC-AT-TCAAAAAATTAATAGC-AAGAGATT-TAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * *
15508535 TATGT-TCATATAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTG-CTAAATTAAT-AAAAGATAAACATGTTT
1 T-T-TACCAAACAAG----TTCAAA-T-AATTA-TGACT--ATT--TGAACA-ATTATC-T-TTT
* * *** * ** * * * * * **
15508597 GCCAAACCA--A-GTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA-TGATCCATTTCA-AATCATTCTGA
50 --CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCAGTTCATAA--AAGCT--
* * **** ** * * * * * **
15508657 CATTTTGTTTAGCCATAA-AATAATTGT-TT--TAGTTCATATATGCTTATTTGAAA--TAAAAA
107 TATATCAAATA-AAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAAT--TAATAAGAAATTTAAAAA
* * * * *** * * * * *
15508716 AAAAATACTAATTTGT-TAAGATTCAGAAACTT--AATAAACAAGAAATTTTATAAAATAAATCT
168 ATAAAT-CT-ATTTATCCAA-A--C---AAGTTCAAATAGTTATG-ACTATT-T-GAA-CAAT-T
* * * * *** * *
15508778 ATTTATTGAACAAGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTTAAAA-AATATGACT
220 ATCTA-T---C---T-CAAATTGTTATGA-TCTTCG---TTTTGTC-A-TAAAAACAAT-TG--T
* * * * * * *
15508842 TTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTGAGCTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATATTAC
268 TTCT-ATTCAT-AC-AAGC-A-TATTTG-G---AT-TAAA---A-T---AAT--ACT-A-ATT--
* * * * * * ***
15508907 TATATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAAAA-ATTTAAAAAAT--AGGTCATTTATCAAGTTA
310 TA-A-TAATA-TTCTAAAATTAATAA-ATAAAAGATTTAAAAAATAAATGT-GTCT-TCAAACCA
* *** * ** * * * * * *
15508969 GTTCAAATAATTATGGCCATTTTAATAATTATCTATTTCAAATAGATGC-AAACTTTTATTTTGT
369 GTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT-TATTCTGATCTTTTGTTTAGT
* * * *
15509033 CATAAAACAATTATTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
433 CATAAAACAA-T-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAAC
* * *
15509096 ATTTCAAAAAATTAGTAAGTACGAGATTT-AAAAAATAAAT-TT
496 A-TTCAAAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* ** *
15509138 GTTTACCAAACCAGTTC------------CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAAT
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * **
15509191 CTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCTTAT-T-AGTAATAAAATAATAC
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA--AATAAAATAATAC
* * * * *
15509254 TAATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-GCCAAAG
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAA--T-TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAA-
* * ** * * * *
15509318 C-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTG
187 CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTT
* * * * * *
15509381 TGTCAT-AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATT
250 TGTCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* * * ** * * * *
15509444 AATATTCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTGT-TTACCAAATCAGTTCAAA
314 AATATT-CTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAA
* *** * * * * * * *
15509508 TAATTATGGCCATGT-CAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTGGTCATATAA
376 TAGTTAAAACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* ** * * *
15509572 CAATTGTATT-TGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTC-AA
440 CAATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAA-CATTCAAA
* **** *
15509635 AAATTAATATGTAAGAGATTTTTTTAAA-AAATCTA
503 AAATTAATA-GCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
*** * *** * * ** ** *
15509670 TTTATTGAACTAGTTCAAATTGCTATGACTATTTGAACGATTGTAAATTTCAAATTGTTATAACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-CTTTTCAAATCATTATGACC
* * * * ** *
15509735 TTTTATTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTA-ATCAAAATAAAATAATACTA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATACTA
* ** * * * *
15509799 ATCTAAAAATATTTCAAAAATTAATAATTAGTAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTT-GCCTAACA
129 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AG-A-AATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * * * * * * * *
15509862 TGCTCAAATATTTAAAGACTATATGAACAACTATCAAT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
189 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTG
*** * ** * * * * * *
15509926 TCATAAAATATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTT-ATAA
252 TCATAAAA-ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAAT-A
* * * * *
15509990 ATATT-TAAAA--AATTAATAAGAGATTTTAAAAAATAATTTTGT-TTACCTAACC-GTTCAAAT
315 ATATTCTAAAATTAATAAATAAAAGA-TTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAAT
* * * * * * * *
15510050 AATTATGAA-TATTTGATTAATTATCTATTTCAAATCACTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAA
377 AGTTA-AAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAA
* * * ** * * * * * **
15510113 TAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTC-GAA-ACAAAGTAATACTAATCTT-TTAATATTTTA
440 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA-AAA-TAATACTAAT-TTACTAACATTCAA
*
15510175 AAAATTAAT---AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTA
502 AAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * ** * * * * *
15510207 TTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAGTTATTTATTTTAAATTATTATTACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * *
15510272 TTTTGTTCTATTACAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TCAGATTAAAATAATACT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATACT
* * * * * *
15510335 AATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTAT-CGAACT
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* ** * * * * * * * * * * *
15510399 TGACCAAATAATCATGACTGTGTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGT
* * * * *** * * * *
15510464 CAT-AAAAGATTTGTTTC-AGTTCATATAAG-ATTACTCAAAATAAAATAATAGTAATCTAGTAA
253 CATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCA-TATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * * * * *
15510526 TAATCAAAAAATTAAT-AATAAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTGTATT-GAACAAGTTAAAAT
316 TATTC-TAAAATTAATAAATAAA-AGATTTAAAAAAT-AA-ATGTGTCTTCAAACCAGTTCAAAT
* ** * * ** * * *
15510589 AATTATGACTATGT-GAACAATTATCTATTTGAAATTGCTAT-AACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
377 AGTTAAAACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAA
* * * * * *
15510652 GAATTTTTTCTA-TAT-AGACAAGCATATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-A
440 CAATTGTTTC-AGT-TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTACTAACATTCA
* * *
15510712 AGACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATC-T
501 A-AAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * ** *
15510749 TTTAGCGAACAAGTTTAAATCGA-TATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAATTTGTTATGAT
1 TTTACCAAACAAGTTCAAAT-AATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * ** * **
15510813 TTTTTGTTTTTTCGTAAAACAACTACTTCTA-TTCATACAATTTTAT-TCAAATTAAAATAATAC
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCAAA-TAAAATAATAC
* * * *
15510876 TAATTTATTAATACTTT-GACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA--CAGA
127 TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCA-A
* * * * * * * *
15510938 ACAAGTTCCAATAGTCATGACTATTTGAATACTTATCTATTTGAAATCGTTATGATCTTTTGTTT
186 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTT
* * * * * * *
15511003 TG-C-TATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATATAATAATACTAATTTATT
250 TGTCATA-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* * *** * * * * * *
15511066 ATTATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATCTATTTATCGAACAAGTTCAAAT
314 AATATTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAAT
* ** * * * ** * * * *
15511131 AGTCAAGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATTGTAATTA-CATTTTGATTCGTCACAAAA
377 AGTTAAAACTATTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAA
* * ** * * * *
15511194 CAATTGTTT-TGATTCATAAAAAATTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
440 CAATTGTTTCAG-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAA
* * *
15511257 AAATT-A-A-CAAGAGCTTT-AAAAACTAAATCTA
503 AAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * * *
15511288 TTAACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACACTTATCTATCTCAAATCGTTCTGATC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * *
15511353 -TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTGTAG-CCATACAAA-CTTATTTGAAGTAAAATATTGCT
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CAGTTCATA-AAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * * *
15511415 AAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTGAAAAATTAATATGTTTGT-CAAACC
128 AATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * * * **
15511479 AGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-C--C-TTTTGT-
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGTC
* ** * * *
15511539 -T-TAGTC-ATATG-CT-TATTC--A-AA--A-A-----A--AAAATAATACTATTTTATTAACT
254 ATAAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAA-T
* * * * **
15511586 -TTCAGAAAATTAGTAAGCAT-GAA-ATTTAAAAAAATAAATCTGT-TTACCAAAAAAGTTCAAA
317 ATTC-TAAAATTAATAA--ATAAAAGATTT-AAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAA
*** * * * * * * *
15511647 TAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAA
376 TAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTG-TTTAGTCATAAAA
* * * * * * * * *
15511710 CAATTATTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTC-AAA
440 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAAA
*** * *
15511774 AATTGAGA-AGTTGGAGATTT-AAAAAGTAAATCAGT
504 AATT-A-ATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATC-TT
* * * * * * *
15511809 TTAACGAATCCA-TACAAATAATTATG-CTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * **
15511872 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAA-AA-AC
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATAC
* * * * * *
15511933 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAAGAAATATTTTTA-CTAAACC
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * * * * *
15511997 AGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGT
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGT
* * * * * * *** * *
15512062 AAT-AAAACAATTATTT-AAGTTCATATAAGCTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAAT
253 CATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
* ** * * * * * **
15512125 ATTATGAAAATTAATAGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGT-TT-AGTGAACAAATTTGAATA
317 ATTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTTCA---AACCAGTTCAAATA
** * ** * *
15512188 GTTAAGGCTA-TATGTATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTGTA-TCATAAAAC
378 GTTAAAACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTT-TAGTCATAAAAC
** ** * * * ** * * * **
15512251 AAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA
441 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAA
15512316 TTAATA--AA-AGATTT-AAAAAATAAAT-TT
506 TTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * **
15512343 GTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGAC
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * * * * *
15512407 CATTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAGCTAATTTGAAATAACATAATTCT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* * * * * *
15512471 AATTTATTAATA-TTCTAAAAAATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAATATGTTTAT-CAAATAAG
128 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAAG
* * * ** * * * * * ** *
15512534 TTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTTA
191 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGTCA
* * ** *
15512599 TAAAATA-AATTCTTT-TATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
255 TAAAA-ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACT-AATTTAATAATA
* ** * * * ** *
15512661 TTCAAACAACAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATTTGT-TTACTGAATAAGTTTAAATAG
318 TTCTAA-AATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAA-TAAATGTGTCTT-C-AAACCAGTTCAAATAG
** * * * * ** * * * *
15512725 TTATGATTATTTGAACAATTATTTATTGGAAATCATTAT-AACTTTTTGATTT-GTCATCAAACA
379 TTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTG-TTTAGTCATAAAACA
* * * * *
15512788 ATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTACTAATATTTC-AACA
442 ATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAAAA
* * * *
15512851 ATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATATG
505 ATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * *
15512883 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * * **
15512948 TTTTGTTTCGTCATCAAACAATTGTATCAATTAATATAGGC-T-TGT----TAAAATAGCACTAA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACTAA
* * * * ** **
15513007 TTGATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAATATGAATCTGCTTA-CTGAACAA
130 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAA
* ** * * * *
15513070 GTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTC
190 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGTC
* * * *
15513134 -TAAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTACTTT-GAATAAAATAATA-TAAGTTTATTAAT
254 ATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATA-TTTGGATTAAAATAATACTAA-TTTAATAAT
* * * * *
15513196 ATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAAT-T-TGTT--------TT----T--TT
317 ATT-CTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTTCAAACCAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
15513244 AACAC-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAACCAATT
381 AAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
** * * * * * *
15513307 GTTTTTGCTCATACAAGCGTATT-TGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
445 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTA
* *
15513370 ATAACTAAAAGATTT-AAAAAATAAAT-TT
509 ATAGC-AAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * * * * *
15513398 GTTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTATCATTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATTA
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCA-TTATGA
** * * * * * *
15513462 TATTTTGTTTTATCATAAAGCAACTATTTCTA-TTCATACAAGTTTAT-TCAGAATAAAATAATA
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATA
* ** * * *
15513525 CTAAATTAAAAATA-TTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-CGA
126 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA---A-GAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAA
* * * * * * *
15513588 ACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGATTATAATCTTTTGTT
186 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTG-TTATGATC-TTCGTT
* * * * * *
15513652 TTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-AATTATTTAGAATAAAATAATATTAATCTAT
249 TTGTCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCA-TATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAA
* * * * *
15513715 TAATATT-TTAAA--AATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGT-TTACTGAAACAAG-TCAA
313 TAATATTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT-C--AAACCAGTTCAA
** * * * ** *
15513774 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTAT-TTT-GTCATAAA
375 ATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTT-TGTTTAGTCATAAA
** * ** * * * *
15513837 ACAATTGTTT-TTTTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAA
439 ACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAA
* * * *
15513901 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAGTAAATGTA
504 AATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * * * *
15513935 TTTGCCAAACTAGTTGAAATAGTTAAGAGTA-TTGAACAA-TATTTTATTTTAAATCATTCTAAC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA-TCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
15513998 CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTCCAGTTCATACAAGCTTAT-TTACAATAAAATAATACT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATACT
* * * *
15514062 AATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAA
128 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAAATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCCAAA
* * * * * ** * *
15514125 CAAATTCAATTAATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATAT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTT
187 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAA-TTGTTATGATC-TTCGTTT
* * * * * * * * * *
15514188 TGTTAT-AAAACAATTGTTT-TAGTTAATAAAAACTTATATGAAATAAAATAATACTACTTTATT
250 TGTCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAAT
* *** * * * * * ** *
15514251 AATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAAAAACTAAA-GCTATTTTTTGAACCAGTTGAAA
314 AATATTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATG-T-GTCTTCAAACCAGTTCAAA
** * * * * * * * * * * *
15514315 TAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGGTATTTT-TTT-CTCATAAAAT
376 TAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAAC
* * * * *
15514378 AATTGTTTCTGATCATACAAGCATATTCA-AATGAAAGTAATACTAATTTA-TAATATT-ATAAA
441 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTACTAACATTCA-AAA
* * *
15514440 AATTAAT---AAGAGATTT-ACAAAATAAATGTG
504 AATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * * *
15514470 TTTGCCGAACCAA-TTTAAATAATTAAGACTATTTTAATAATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGA
1 TTTACC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTAT-GA
* * * * * * * **
15514533 -CTTATTATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
63 CCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATAC
* *
15514597 TAATTTATTAA-AATTCAAAATATTAATAAGAAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTA-CCGA
127 TAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAG--A-A-ATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCCAA
* ** * * * * *
15514660 ACAAGTTCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
186 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTT
* * * **** * *
15514725 TGTCAT-AAAACAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACA-TTAT
250 TGTCATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTA-ATTTAA
* * * * *
15514787 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGT-TTACAGAATCAATTCA
313 TAATA-TTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGT-GTCTT-CA-AACCAGTTCA
* * * * * * * * * * * * * *
15514850 AATAATTATGACCTCTT-GAACAACTATCCATTTCAAAATGTTATTACCGTTTGTTTTGTCATAA
374 AATAGTTA-AAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAA
* * * * *
15514914 AACAATTTTTTTCA--ACATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
438 AACAA-TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTC
* ** * *
15514976 -AAGAATT-A-A-CAAGAGACAT-AAACAATAAATCTA
500 AAAAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
** * * ** * *
15515009 TTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAA
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT-GAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * **
15515074 CTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACTA
* * * * ** *
15515139 ATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAATTAAGAATTTTAAAAATAAAT-TCGTTTAT-TGAACCA
129 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--GA-AATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATCCAAACAA
* * * * * * * *
15515202 GTTCAAACAGTTGA-GACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACCTTTTGTTTT-T
190 GTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGT
* * * * * ** * * *
15515265 CAT-AAAACAATTATTTC-AGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGGATAAAACTAATTTATTAAC
253 CATAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * * * * * * *
15515328 ATTTCTAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTATCGAACCATTTC-AA-A--
317 A-TTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-TCAAACCAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
15515389 T---A--ATT---AT-A--A-CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATC
380 TAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
15515442 GCTTCAGTTCATATAAGTTTATT-TGAAGTAAAAT-ACACTAATTTATTAATATTTC-AAGAATT
445 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAAAAATT
* * * * *
15515504 AATGAGTAAAAGAATTAAAAAAA-GAATCTA
508 AAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * *
15515534 TTGACCAAATAATTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * ** * * **
15515599 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TTTATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TA
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT-
* * * * * * *
15515662 AATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTT-TCTAAACAT
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-AGAAATTTAA-AAAATAAATCTATTTATCCAAACAA
* * *** * *
15515726 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTC
190 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTGTC
* * ** *
15515791 AT-AAAACAATTGGTTT-TATCCATGCAAGTTTATTTTGAAAAAAATAATATAAATTTGTTAATA
254 ATAAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCATA-TTTG-----GAT--TA-AAA-----TAATA
* * * * * * *
15515854 TTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAAT-AATAAAA-AATTAACAAAATAAATTTATTTT
304 ---C-TAATTTAATAA-TATT-CTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAA-AAAATAAATGTGTCTT
* ** * * ** * *
15515917 CTAAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTT
362 C-AAACCA-GTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTT
* * * * * * **
15515981 TGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TCCATGCAGGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAAT
425 TGTTTAGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AAT
** * * ** * * *
15516044 TTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATAA-AAAATTAACAAAATAAAT-TT
488 TTACTAACATTCAAAAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * ** *
15516092 ATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGAC
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
15516157 CTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTACAATCTTAT-TTAGAATAAAATAATACT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATACT
* * * ***
15516221 AATTTATT--TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTG
128 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAA--TTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACA
* * * **
15516283 AGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTT--TTGTT-T
189 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTT-TTGT
* * ** * * * *
15516345 -AAAAAGAAAAGTATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACAAATTTATTA
253 CATAAA-AACA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * *** * * *** * *
15516409 ATA--CTAGAAAATAATGAGTTGGAGATGTAAAAAGTAAA-GCCACTTACTGAACAAGTTCAAAT
315 ATATTCTA-AAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT-C-AAACCAGTTCAAAT
* * *** * ** * ** *
15516471 AATCATGTCCATTTA-AACT-ATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAA
377 AGTTAAAACTA-TTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* * ** * * *
15516534 CTATTGTTTTTA-TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
440 CAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAA
*
15516597 AAATTAA-A--AAGAGATTT-AAAAACTAAAT-TT
503 AAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
** * * * * * * * * * *
15516627 GTTTATAAAAAAAATTCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAACCTATCTCATATCATTGTGAT
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * *
15516692 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGATATAAAATATTACT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACT
* * *
15516755 AAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTT-AAAAAT-AATACTAATTA--CAAA
128 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AA-A--TTTAAAAAATAAAT-CTATTTATCCAAA
* * * * * ** * ** *
15516815 -TATTTCTATTGATACAAGTT-T--CTGTTCATGCAA-AATTATTTAGAAT-AAAATAATACTAA
187 CAAGTTC-A---A-A-TAGTTATGACTATT--TG-AACAATTATCTA-TCTCAAATTGTTA-TGA
** * * ** * * ***
15516874 TCTATTAATATTT-TGA-AAATTACAAAGAGATTTAAAAACTAAATC-TA-ATTACCGA-AACAG
241 TC--TTCGT-TTTGTCATAAA-AAC-AATTG-TTT-----CT-ATTCATACA--AGC-ATATTTG
* * * * * *** **
15516934 G-TTAAATAGTTATGAAT-ATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTAT-GATCTTTATTTTGT
291 GATTAAA-A-TAAT-ACTAATTT-AATAA-TA--T-TCTAAAAT--TAATAAAT-AAAAGATT-T
* * ** * * * ** * * ** *
15516996 CATAAAACAGTTGTTTCTTTTCATACAAGCTT-ATTTGGATTAAAATAATATTAGTTTAA-TA-A
344 -AAAAAATAAATGTGTC--TTCAAACCAG-TTCAAATAG-TT-AAA-ACTATTAGAATAATTATC
* * * **** *** * * *** * *
15517058 TATTCCAAA-TATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATGTATCTACTGAACCGGTTGAAAA
402 TATTTCAAATTATT-CTGA-TCTTTTG-TTT-AGTCATAAA---A-CAATTGTTTCAGTT---CA
* ** * ** * * * * * ****
15517121 TAGTTAAGAGTATT-AGAACAATTTTTTATTTCAAATCATT-CTGACCTTTTGTTTTAAATTAAT
456 TA--CAAGCTTATTCAGAATAA---AATAATACTAAT--TTACT-AAC-ATT-CAAAAAATTAAT
15517184 GAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TT
511 -AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * *
15517211 GTTTACCAAACAAGTCCAAATAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATATAAAATCATTATGA
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGA
* * * * * *
15517275 CCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATATGAAACAAAATAATAC
63 CC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATAC
* * * * ***
15517340 TATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGTAAAGCGATTT-TTTGAAC
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAC
* * * * * *
15517404 TAGTTGAAATAGCTATGACTATTTG----A--ATC--T-T-AACTTGTTATGATCTTTGTTTTCT
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGT
* * * *
15517459 CATAAAAA-AATTGTTTCTGA-TCATACAAGCACATTTGGATGAAAATAATACCAATTTTATAAT
253 CATAAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * *
15517522 ATT-TTAAA--AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-TTTTGCAAAACCAGTTCAAATAGT
317 ATTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT-C-AAACCAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
15517583 TAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCAGA-CTTTTTATTTGGTCAGATAATAAT
380 TAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* * ** *
15517647 TGTTTTAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATT
444 TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTC-AAAAAATT
* * * *
15517712 AATAAACAAGTGATTTGAAAAAATAAATCTG
508 AAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * ** *
15517743 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* ** *
15517808 TTTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGCTTAT-CCAAAATAAAATAATACT-
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATACTA
* ** *
15517870 ATGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATAGAATC
129 AT-TTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCCAAAC
* * * * * * * * * * *
15517934 AA-TTCAAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGCTTT
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTT
* * * * * * * *
15517997 GTCAT-AAAATAATTGTTTTTCA-GCATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
251 GTCATAAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * ** * * ** *
15518060 ATATT-T-CAA-GAATTAATAAGGGATTT-AAAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTCAAATAG
315 ATATTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGT-GTCTTCAAACCAGTTCAAATAG
** * * * * * * *
15518121 TT-TGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTCGATCATAAAATA
379 TTAAAACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAG-TCATAAAACA
* * * *
15518183 ATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTTAGTAAAATTTC-AAAA
442 ATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAAAA
** * *
15518246 ATTAATAAATAAGAGATTT-TAAAAATAAATCTG
505 ATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
** * * * * * * * * ** *
15518279 TTTGTCGAACTAGCTT-AAATAGTTAAGAATGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGAC
1 TTTACCAAACAAG-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * * * ** * *
15518343 CTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATCTCAACTT-ATACAAGCTTAT-TGGGAATAGAATAAAAC
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATAT-CAAATAAAATAATAC
* * * * * * * * *
15518406 TAATGTATTAACATTTTC-AAAATTTATAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGT-CAAACCAT
127 TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAAG
* * ** * * * *
15518469 TTCAAATAATTTATAACTATTTTTA-AATCAT-TA--T--GACT-TT-TG--C-T--TTTTGTAA
191 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGTCA
* * * * * * *
15518521 T-AAAACAATAGTTTC-AGTTCATATAAGCCTATTTGAAGTAAATTAATACTAATTTGACTAAAT
255 TAAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTT-AAT-AAT
* * *** * * * * **
15518584 ATTTTGAGAATTAATGTGTAAGAGAATTAAAAAAGAAATCTGT-TATACAAATAAGTTCAAATAG
317 ATTCT-AAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCT-T-CAAACCAGTTCAAATAG
** * *
15518648 TTATGACTATT--CA-AA--A-C-A-TT---A-TA-----ACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAAT
379 TTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAAT
* * * * * * ** * *
15518695 TGGTCCTA-TTCGTGCAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC--AAAA
444 TGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTACTAACA-TTCAAAAAA
* ** *
15518756 TTAAGAATTAA-AAATTT-AAAAAATAAAT-TT
506 TTAA-TAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
**** * * *
15518786 ATTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-CA-TATGAC
1 -TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGAC
* * * ** *
15518849 C-TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTAT-TCTAAATAAAATAATACT
64 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATACT
* * * *
15518912 AATTTATT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGC
128 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAC
* * * * *
15518973 GAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTG
188 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTCGTTTTG
* * ** * *
15519038 TAAT-AAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
252 TCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * *** * * * ** * *
15519102 ATTATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAA-GCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAAT
317 ATTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATG-TGTCT-TCAAACCAGTTCAAATAGT
**** * * ** * ** * * *
15519165 TGTGTCCATTTA-AACT-ATTATCTATTTGAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACTA
380 TAAAACTA-TTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
* ** ** * * *
15519228 TTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
443 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACA-TTCAAAAAAT
*
15519292 TAAT---AAGAGATTT-AAAAACTAAAT-TT
507 TAATAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * * *
15519318 GTTTATCGAAA-TAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTAACCTATCTCAAATCATTATGA
1 -TTTA-CCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGA
* * * * *
15519382 TC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATACTAC
63 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATC-AAATAAAATAATAC
* * * * * * **
15519445 TAAATAAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAAG
127 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AA-A--TTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAA-
* * * * * * * * * *
15519509 GC-A-TTTAAATAGATATGACTTTTTGAACAGTTATCTATTTCAATTTTTTATGATATTTTGTTT
186 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGAT-CTTCGTTT
* * * *
15519572 TGTCAT-AAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTA
250 TGTCATAAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATA
* * * * * * *
15519635 ATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGT-TTACCGAGCAAGTTCAAAT
315 ATATT-CTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTT--CAAACCAGTTCAAAT
** * * * * * * * * *
15519698 AGTTATCACTGTTTA-AACAATTATTTATTTTAAA-TAGCTATTATCTTTTGATTT-GTTACAAA
377 AGTTAAAACT-ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTCTGATCTTTTG-TTTAGTCATAAA
* * * * * * *
15519760 ACAATTATTTCTA-TTGATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACAAATATTCTAA
439 ACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAA
* * * * *
15519824 AAATTAATTGGTAGGAGA-TTCAAAAAATAAATCTA
503 AAATTAA-TAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTT
* * * * * *
15519859 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC
1 TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTTCAAATCATTATGACC
* * *
15519924 TCTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAA--TTAT-TCAGAATAAAATAATAC
65 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT--AAAAGCTTATATCA-AATAAAATAATAC
* ** * * * * *
15519986 TAATCTATTAATATTTTGAAAATTACTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTAATTA-CCGAAACAGG
127 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCC-AAACAAG
* * * ** **
15520050 TTC-AATAGTTATCAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCAT
191 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGTCAT
* * * *
15520114 -AAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAGTTTAATAATATTC
256 AAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
* * *
15520178 CAAATAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGT
321 TAAA-ATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGT
15520215 ATCTAATGAA
Statistics
Matches: 21410, Mismatches: 4983, Indels: 3872
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
479 2 0.00
480 44 0.00
481 12 0.00
482 1 0.00
483 2 0.00
484 1 0.00
485 2 0.00
486 15 0.00
487 21 0.00
488 83 0.00
489 7 0.00
490 2 0.00
491 2 0.00
496 41 0.00
497 3 0.00
499 1 0.00
501 4 0.00
502 27 0.00
503 49 0.00
504 6 0.00
505 79 0.00
506 97 0.00
507 91 0.00
508 109 0.01
509 144 0.01
510 83 0.00
511 17 0.00
512 133 0.01
513 11 0.00
514 71 0.00
515 49 0.00
516 336 0.02
517 344 0.02
518 148 0.01
519 134 0.01
520 289 0.01
521 508 0.02
522 137 0.01
523 278 0.01
524 196 0.01
525 265 0.01
526 217 0.01
527 427 0.02
528 149 0.01
529 165 0.01
530 133 0.01
531 195 0.01
532 225 0.01
533 347 0.02
534 499 0.02
535 989 0.05
536 1238 0.06
537 1294 0.06
538 1144 0.05
539 1562 0.07
540 1828 0.09
541 1238 0.06
542 1273 0.06
543 803 0.04
544 575 0.03
545 433 0.02
546 270 0.01
547 151 0.01
548 117 0.01
549 65 0.00
550 48 0.00
551 46 0.00
552 40 0.00
553 57 0.00
554 64 0.00
555 43 0.00
556 116 0.01
557 76 0.00
558 130 0.01
559 265 0.01
560 119 0.01
561 38 0.00
562 30 0.00
563 48 0.00
564 74 0.00
565 32 0.00
566 13 0.00
567 7 0.00
568 11 0.00
569 11 0.00
570 12 0.00
571 19 0.00
572 16 0.00
573 22 0.00
574 14 0.00
575 16 0.00
576 12 0.00
577 26 0.00
578 11 0.00
579 26 0.00
580 22 0.00
581 30 0.00
582 40 0.00
583 29 0.00
584 64 0.00
585 37 0.00
586 100 0.00
587 36 0.00
588 34 0.00
589 22 0.00
590 29 0.00
591 28 0.00
592 30 0.00
593 19 0.00
594 14 0.00
595 6 0.00
596 6 0.00
597 6 0.00
598 8 0.00
599 8 0.00
600 5 0.00
602 5 0.00
603 31 0.00
604 36 0.00
605 32 0.00
606 32 0.00
607 10 0.00
608 5 0.00
609 2 0.00
610 6 0.00
611 5 0.00
612 6 0.00
613 3 0.00
615 15 0.00
616 6 0.00
617 14 0.00
618 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (537 bp):
TTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTCAAATCATTATGACCT
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATATCAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCCAAACAAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTCGTTTTGTCATAAAAA
CAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAA
TTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTA
GAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA
TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACATTCAAAAAATTAATAGCAAGAGAT
TTAAAAAAATAAATCTT
Found at i:15494598 original size:178 final size:176
Alignment explanation
Indices: 15494225--15494698 Score: 454
Period size: 178 Copynumber: 2.7 Consensus size: 176
15494215 TGTTTATTAA
* * * * *
15494225 GTTCAAATAGTTATGACTATTAGAGTAATTATCTATTTTAGAA-CATTATGACCCTTT-TTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGA-CCTTTGTTTTGT
* * *
15494288 CATAAACAATTGGTTATATTCATGCAAGTTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATA
64 CATAAACAATTGTTTATATTCATACAAGTTTA--TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATT-ATA
* * * *** *
15494351 TTCCAAAAATTAATAATTAAAAATAAAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAT
125 TTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAATAAAAAAAATAAATATATTTACCGAACAG
* * * *
15494403 GTTTAAATAGGTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGACCTTCTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TGTTTTGTC
* * * **
15494468 ATAAACCAATTGTTTTTGTTCATCCAACCTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT-TATTCC
65 ATAAA-CAATTGTTTATATTCATACAAGTTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTATATTCC
** * * *
15494532 AAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAGCGG
129 AAAAATTAAGAAGTAAAA-ATAAAAAAAATAAATATATTTACCGAACAG
* * * ** *
15494581 GTTCAAATAGTTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTA
1 GTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTGTTTTGTC
* * * *
15494646 ATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTGTTCGAAATAAAACAATACTAA
65 AT-AAACAATTGTTTATATTCATACAAGTTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
15494699 GAGATTTAAA
Statistics
Matches: 240, Mismatches: 46, Indels: 19
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
177 28 0.12
178 141 0.59
179 50 0.21
180 21 0.09
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (176 bp):
GTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTGTTTTGTCA
TAAACAATTGTTTATATTCATACAAGTTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTATATTCCAA
AAATTAAGAAGTAAAAATAAAAAAAATAAATATATTTACCGAACAG
Found at i:15495327 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15494696--15504720 Score: 4174
Period size: 181 Copynumber: 55.5 Consensus size: 181
15494686 AAAACAATAC
* * * * * * * *
15494696 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTATATGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * * * * * *
15494761 TATC-ATTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAAATATTTTTGTTCATATAAG-
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * *
15494824 TT-TGTTCGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-
131 TTAT-TTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15494872 TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTACCAAACCAGTTTAATTAGTTATAACAATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * ** * * * * * *
15494937 TTATTTATTTGAAATTGTTATGACAATTTATTTTGTCAT-AGACAGTTGTTTCTACTAATACAAT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
15495001 CTTA-TTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAGTTAATAAG
130 CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * *** ** * * *
15495053 TAACAGATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCCTGACCAGTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * **
15495118 TTATCTATTTCAAATCGTTGTGACCTTTTGTTTTAACACAAAACAATTGTTTCTATTTGTACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** *
15495183 CTTATTTTGAATAGCATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
130 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *
15495235 TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
15495300 TACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAGAAAATAATTTTTTCTCTTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
15495365 TTATTTCA-ATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAGACATTTATAAG
131 TTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** *
15495415 TAAAAGATTT-AAAAAT-AA---G-TTACCCAATAAGTTCAAATAGTTATGGTTATTTGAACATT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
15495474 TATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTGTTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * ** * *
15495539 TTA-TTAAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAACTAATAAG
131 TTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
15495590 TAAAAGGTTTCAAAAATAAATATTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-AATCATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAA
* * * * *
15495654 TT-TCTATTTCCAATTGTTATCACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTATC-AGTTCATATA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTA-TTCATACA
* * * * *
15495716 GGCTTATTT-GAAATAAAACAATATTAATTTATTAATA-TACTAAAAATTAATGAG
128 AGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * ** * * *
15495770 TTAAGAGA-TTGAAAAATGAATCTATTTACCAAACAAATTTAAATAGTTATTCCTATTTAAATAG
1 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
** * * * *
15495834 TTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAATTGTTTCTATTTATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
15495899 CTTATTTCGAATTAAATAATA-TAAATTTATTTATA-TTCCAAAATTAATAAG
130 CTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
15495950 TAA-AAATTTAAACAATAAATATGTTT-TCTGAGCATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACGA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
15496013 TTACCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAACCAATTGTTTCTGTTCATAGAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
15496078 CTTATTT-GAAATTAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAA
130 CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15496130 TAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACGAGTTTAAATAGATT-TGAATATTTAAAG
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAAC
* * * * ** * * * *
15496193 AATTATCTATTT-AAGTCATTATAACCTTTTGTTCTACCAAAAAATAATTGCTT-TAGTTCATAA
63 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * ** *
15496256 AAAC-TAATCCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
127 AAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
15496311 CATGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TCCAAACCAGTTCAAATATTTATGACTATTTAAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
15496375 TTATCAATCTCAAATTGTTACGATC-TTTGTTTTTTCATAGAACAATTGTTTCTGATT-ATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * *
15496438 GCTTATTTTG-ATAAATATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--ACTAA-
129 GCTTATTTAGAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * ** * * * *
15496487 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAATTGTTAGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
15496552 TATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
** * * * *
15496616 CTTATCAAGAAGAAAAAAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAG
130 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
15496668 CAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
** * * * *
15496733 TTATAGATTT-AAAGTTGTTATTG-CCCTTTGTTTTGCCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATTA
65 TTATCTATTTCAAA-TCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA-TA
* ** * *
15496795 -AGGCTTATCAAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
126 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
15496850 TAAGAGATTTGAAAAATAAATCAGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGA-TATTTGAGCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACA
* * * *
15496913 ATTATCTATTTCAAATCATTATTG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTCA-ACATAC
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * * *
15496976 AAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-
127 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
15497027 TAAGAGATTTAAAAAA-AATTCTATTTACCAAACCAA-TTGAAATACTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
15497090 TTATCTATTTCAAATTGTTAT-ACCTTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
15497154 ACTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAAATTAGTAATA--T------TT--T--G
129 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** * * * * * *
15497194 -AA-A-A-TAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTTAAACAATTAAGACTATATGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
15497255 TATTTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAGTTATTT-TAGCTCATACAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
** * *
15497319 CTTATTT-GAAATGGAATAA-AGCTAATTTATTACTATTTCAAAAATTTATAAG
130 CTTATTTAG-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * *
15497371 TAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGAACCAGCTCAAATAATTATAACAATTTAAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * * * *
15497436 TATCTTTTTCAAATTGTTATTACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
15497501 TTGATTGA-AATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTT-AGAAAACTAATTAG
131 TT-ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
* * * * * * *
15497552 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** * * * * **
15497617 TATCTATTTCAAATCATTATTATTTTTTATTTTGTCATTAAACAATTGGTTCTATTCATACTATT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* ** * *
15497682 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAAT
131 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * ** * ** * * * * * **
15497733 TAAGAAAATTAAAAAATAATTCTAATTGTCGTACCATTTTAAGTAGTTAAT-ACTATATGAATGA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA
* * * * *
15497797 TTATCTATTTCAAATTGTTAT-ACCCTATTGTTTTATCATTAAACAATTGTTT-TGTTCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
15497860 GCTTA-TTCGGATCAAAATAACACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** * * * *
15497913 TAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAATTAGTTCAAATGGTGAAGACTATTAGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
15497978 TATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * * *
15498042 CTTATTAAAAATAAATTAATACTAATTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAAG
130 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* ** *
15498094 TAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
15498159 TTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGT-AGTA-AT
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TACA-
** * * * *
15498221 AATTTCA-TTAGACCAGAAATAAAAATATTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAG
128 AGCTT-ATTTAGA--A-TAA-AATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAG
* * * ** * * * * * *
15498279 TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATTAGTTAAAATAATTACGGCCATTTGAAC-GT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
15498343 TCATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAAATGGTTTTTA-TCATACAA
66 T-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAA
* * *
15498407 GTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATATG
129 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * *
15498461 TAAGAGATTTAAGAAATAAATCTGTTTA-CTAAACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
15498525 TTATC-AGTCTT-AAATCATTAAGATC-TTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTGA-TCATAA
65 TTATCTA-T-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * * * *
15498586 AAACTTA-TTCGATTAAAAAAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAA
127 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * ** * *
15498640 TAAGATATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATTAGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * ** * * * *
15498705 TATCTA-TTCTAAATCGTTCTAACCTTTTGCTTAGTCA-AAAGTACTTATTTC-ATATCTTAAAA
66 TATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAA
* * * * * *
15498767 G-TTATTCAGAATAAAATAAT-CAAAATTTATAAACATTTGAAAAATTAAGAAG
129 GCTTATTTAGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15498819 AAAAAGATTTGAAAAAAATAAATCTTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAATA
1 TAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
15498884 ATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAAGATTTTGTTTC-AGTTTATAT
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTA-TTCATAC
** * * * *
15498948 AAGCTTATCCATAATAAAATAATGCTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAG
127 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15499003 CAAGAG-TTTAAACAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAGCAA
1 TAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
15499067 TTTTTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTTATAAAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * *
15499130 GCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATA-TTCTAAAAATTACTAAG
129 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
15499183 T----GATTTAAAAAATTAATTTGTTT-GCTAAATCAA-TCCAAATAGTCATGTCCATTTGAACG
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *
15499242 ATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * * **
15499307 AATTATTTAGAATAAAATTATATTGATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAG
129 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** * * * ** *
15499360 TAAGAGATTTGAAAAACCAAATCTATTTA-CTAAATAAGTTTAGTTAGTTATGATTATTTGAACA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
15499424 ATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGCTCCTAAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
** * *
15499488 AGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-
128 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** * * * * *
15499538 TAAGAGATTT-AAAAA-AAATCACTTTACCAAATC-AGATCAAATAATTATGGCCATTCT-AACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACA
* * * * ** * * ***
15499599 ATTATCCATTTCAAATTGTTATTATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCGACAT-CAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * ** * * *
15499663 GCTTA-TTA-AATAAAATTATTATTACCTT-TT-GTTTTGTCATAAAA-CAAT---
129 GCTTATTTAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATT-TCA-AAAATTAATAAG
* ** ** * * * ** * * * * *
15499711 T----GTTTTTCAGCATACAAGCT-TATT-TGAAATAAAAT--AATATTTATTAATATTTCAAGA
1 TAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGT-TTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
** ** ** * * * * * *
15499768 ATTAGTAAGAGATTT-AAA---AAAT-A-AATATGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTT-TTGAC
64 ATTA-T---CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-T-G--TCA--TAAAACAATTGTT-TC
* * ** *** * ** * * *
15499826 TATTTGA-ATAA--TTATCCATTTTAAATTGTTA-TAACGTTTTGTTCCATCA--TAAAATAATT
118 TA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAA---TTTATT-AAT-ATTTCAAA-AATT
* **
15499885 ATTTTTG
176 A-ATAAG
* * * ** *
15499892 TGCATACA-AGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTCTAAAAATC-CATAAG
1 T--A-AGAGA-TTTA---A-AA-AATA-AAT-CT-GTTT-ATCAA-A--C--AAGTTCAAAT-AG
* * * * ** * * * ** ** *
15499954 -TAAGA-TATTTAAAAAATAAATCCCTTTGCCAAACCAGTTCA-AACAGTTAAG-ACTAT-ATGA
47 TTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT--CAAATC-GTT-ATGAC-CTTTTGTTTTGTCAT-A
** * * * * ** * * * * * * *
15500014 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTATTCCAGCTCATA
105 A-AACAAT-TGTTTCTATTC-ATACAAGC--TTATTTAG-AATAAAATAA-TA--CTA-AT-TTA
** * * *
15500079 CAAATTTATTCGGAATAAAATAA-AAC
159 TTAATAT-TTC--AA-AAATTAATAAG
** * ** ** * * * * * *** *
15500105 T-A-ATTTGTTAATATTTCAAA--AATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATAATTCTATTT
1 TAAGAGAT-TTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCA--AACA-AGTTCAAATAGTTATGA--CTATTT
* ** ** * * * * *
15500166 -ACCAA--A-CTAACTCAAATAATTAT-AAC---T-ATTTG-CACAATTATCTATT-TTAGATC-
59 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA--AACAATTGTT---TCT
*** * * * * * ** * *
15500219 ATT-ATTAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAA
119 ATTCA-TACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT-TAA---TATTT--CA-AA
* *
15500282 AATAAAACTAATT
172 AAT-TAA-TAA-G
* * * * * * * * * * *
15500295 TATTGATATTTAAAAAATTAATCAG--TA--AGA-GA-TTTAAAAAG-TA-AATCTGTTT-ACCA
1 TA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACA
* * * * * *** * *
15500351 A--ATC-ATTTCTAATAGTTTTGA-CTATTTGAATAATTATC-TATTTCAAATCGTTATAATATT
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTG--T-TTTGTCATAAAAC-AATTGTT-T-CTATT
* ** * * ** * * * *
15500411 --TTC--TTTTATCATTA-AA-CAATTGGTTCT-ATTCATATTATTTTGTTC-AAAATAAAATAA
122 CATACAAGCTTAT--TTAGAATAAAATAATACTAATT--TATTAATAT-TTCAAAAAT-TAATAA
15500468 -
181 G
** * * * * * * * * ** * *
15500468 TACTA-ATTTAATAATATTCCAAAACT-TAATAACCAAGAAATTAAAAATAAATCT-A-TTTGTT
1 TAAGAGATTTAA-AA-AAT--AAATCTGT-TTATCAAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTAT-TT
** * * * * * * *
15500529 GAACCAATTCAAATAGTT-AAGA-C-TATATTAACAATTATCAAT-TTCAAATTGTTAT-GACCT
59 GAA-CAATT-ATCTATTTCAA-ATCGT-TA-TGAC-CTT-T---TGTT----TTGTCATAAAACA
* * * ** * * ** *
15500589 TTTGTTT-TGTT-ATAAAATAATTTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACAAA
110 ATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTTAG--AATA-AA----A-T--AA-T--------ACTAA
*
15500652 TTTAATAATATTT-AAAAATTAAT-AG
155 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * ** * * *
15500677 T-AGTATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCATATGGTTAAAACTACTAGAATAA
1 TAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * **
15500741 TTATCTATTTCAAATCATTTTCAACTTTTGTTTAGTCATAAAA-ATATTGTTTCGGTTCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * *
15500805 GCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAG
129 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* *** * * *
15500858 AAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTACGTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
15500923 TTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATATAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
** * *
15500987 GCTTATACATAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAG
129 GCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15501040 TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAAA-ATCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
** * * *
15501103 ACAATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGCTTT-TGA-TCATAC
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATAC
* *
15501166 AAGCTTATTCTA-AACAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-
127 AAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15501219 -ACG-GATTTAAAAAATAAATCTGGTTA-CTGATCCAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
15501281 TTATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCAATCATAGAAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * ** * *
15501345 CTTATTCAG-TTAAAAATAATAAAAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
130 CTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** * *
15501397 ---G-GATTTTAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *** * * *
15501458 TATTTTTTTAAAATTGTTTTGACCTTTT-TTTTAAAATCATTTTGAC-CTT-TTTTTAGTCATAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT---GTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCAT-A
* * * * * * *
15501520 AATATTTGTTTAATATCATAAAAGCTTATTTGAAATAA-AATAATCCTAATATATTAACATTCAA
126 CA-A---GCTT-AT-T--TAGAA---TA----AAATAATACTAAT--TTAT-TAATAT--TTCAA
15501584 AAAGTTAATAAG
171 AAA-TTAATAAG
* * * * * ** * * *
15501596 CAAGAGGTTTGAAAAAATACATCTATTTAACGGACAGGCTCAAATAGTCATGACTATTTG---AA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
15501658 TAAT-TATTTAAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATA-AAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-
* ** * *
15501721 GTTTATCCAAAATAAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACA-AAG
129 GCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAG
* * * * * * *
15501775 CAAGAGATTCAAAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAGTCACT-ACTATTTAAAT
1 TAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAAC
* * * * * ** * *
15501838 AATTGTATATTTAAAATCATTATGCCCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAAAT
63 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * * *
15501902 AAGTTTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATGTCAAAAATAAAAAAG
127 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *** * * * * * *
15501957 AAAGTGATTTAAAAAGGGAATATGTTTACCAAATCAA-TTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
15502021 TTACCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGT-AT-AAA-AATT-TTTC-A-TCATACACG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * *
15502080 CCT-GTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
130 CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15502132 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATGTA-C---C-A----AACTAG-T-T-CCTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * ** * * *
15502185 TACCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTCTGTTGTAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAAC
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * * * *
15502250 TTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAC
131 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * ** *
15502301 TAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTGTCAAAACAA-TTTAAACAGTTAAGACTACATGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * **
15502365 GTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATCATTT-TAGTTCATACAA
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
**
15502429 GCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--TGAA--AATAAG
129 GCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
15502478 TAAGCGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCT-TGTCAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACA
* * * ** * ** * * *
15502541 ACTATCTATTTCGAATCGTTATTAAATTTTGTTTGGTCATTTAACAATTGTTTTTGA-ACATTCA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * *
15502605 AGCTTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
15502659 T-A-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCTAACTAGCTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * *
15502722 TGTAAACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAA
66 TATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * *
15502785 GCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTCAAAAATTCATAAC
129 GCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** * * *
15502838 TAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATATTTAAT-ACTATATGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA
* * *
15502902 TTATCTATTTCAAATCGTTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATAC
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATAC
** * * *
15502966 -TCCTTATTTGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG
127 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** *
15503020 TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACGGGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
15503084 TATCTATTTCAAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCAT-CTA
66 TATCTATTTC-AAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-A
* * * * *
15503148 AGTTTGTTCAGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAA-T--TAA-
128 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * **
15503197 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAGTAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
15503262 TATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTAGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
15503326 CTTATTCAGACTAAAATAATACTAATTAATTAATATTTCAACAATTAATAAG
130 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * * *
15503378 TAAAAAATTTTAAAAATAAATATTTTTACCAAACTAGGTCAAATAATCATGACAATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
15503443 TATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTTTCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTTATATAAG
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * *
15503507 CTGA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTATTA-ATCAAAAAATTAATAA-
130 CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
15503558 TAAGGGATTTAAAAAATGAATATTTTTA-CTGAACTAGTTTAAATAATTATGATCGT-TTT-AAC
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C-TATTTGAAC
* * * * * * * *
15503620 ACTTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCA
63 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * *
15503685 AGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTAG
128 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
15503739 TAA-AAATTTTAAAAATAAATCTGTTT-TCTGAGCATGTTCAAATAATTAAGACAATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
15503802 TTATCTATTTCAAATCAG-TATGACCTTTTGTTTTCTCAT-AAACAAATTGTTTTTGTTCATAAA
65 TTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACA
* ** *
15503865 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAAAAAAATTAACAAG
128 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
15503919 TAAAATATTTAAAAAACAAATCTATTTA-CTAAGCGAGTTCAAATAATTTTGACTATTT-ACACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACA
* * * * * *
15503982 ATTATTTATGTCAAATCATTGTGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * *
15504047 AGTTTATTCAAAATAAAATAATAATAATAATTTATTTATA-TTCTGAAAATTAATAAG
128 AGCTTATTTAGAAT--AA-AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
** * * * * * * * *
15504104 TTGGAGATTTAGATAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAACTAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * **
15504169 TATATATTTCAAATCGTTATGACATTTTG-TTTGTGATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAA
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* *
15504233 TTATTTAGAATAAAATAATAATAGTTT-TTAATATTTCAAAAA-T--TAA-
131 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * **
15504279 TAAGAGATTTAAAAACTAAATCT-ATTA-CTGACGTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
15504340 ATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGCCATAAAATAACTGTTTTTGTTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * ** * * *
15504404 GCTTATTCT-GAGTAAAATATTGCTAAGCTAGTAGTA-TTCTAAACAATTAATAAA
129 GCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA-AATTAATAAG
* * ** * * *
15504458 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC-A-
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** *
15504521 -AT-TA-TT---ATCGTTTTGACCTTTTGTTTAT-TCATAAAATAATTGTTT-TAGTTTGTACAT
66 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * *
15504578 GCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-ATTTCTTCAACATTTAAAAAATTAATAAG
129 GCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
15504631 CAAAAAATTTAAAAAACTAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTT---AT-G----G-CTATTTGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* *
15504686 ATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTTTTTT
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
15504721 CAATTCATCA
Statistics
Matches: 7392, Mismatches: 1843, Indels: 1232
0.71 0.18 0.12
Matches are distributed among these distances:
163 50 0.01
164 100 0.01
165 28 0.00
166 12 0.00
167 9 0.00
168 8 0.00
169 98 0.01
170 9 0.00
171 21 0.00
172 36 0.00
173 169 0.02
174 232 0.03
175 229 0.03
176 477 0.06
177 515 0.07
178 117 0.02
179 542 0.07
180 905 0.12
181 1769 0.24
182 1045 0.14
183 188 0.03
184 159 0.02
185 174 0.02
186 18 0.00
187 23 0.00
188 21 0.00
189 23 0.00
190 14 0.00
191 8 0.00
192 11 0.00
193 25 0.00
194 15 0.00
195 10 0.00
196 17 0.00
197 15 0.00
198 27 0.00
199 27 0.00
200 28 0.00
201 34 0.00
202 20 0.00
203 10 0.00
204 50 0.01
205 14 0.00
206 22 0.00
207 2 0.00
208 11 0.00
209 16 0.00
210 15 0.00
211 9 0.00
212 2 0.00
213 6 0.00
215 6 0.00
216 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
Found at i:15495854 original size:17 final size:16
Alignment explanation
Indices: 15495806--15495848 Score: 59
Period size: 18 Copynumber: 2.5 Consensus size: 16
15495796 TACCAAACAA
15495806 ATTTAAATAGTTATTCCT
1 ATTTAAATAGTTA-T-CT
15495824 ATTTAAATAGTTATCT
1 ATTTAAATAGTTATCT
15495840 ATTTCAAAT
1 ATTT-AAAT
15495849 TATTATGATC
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 3
0.89 0.00 0.11
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.25
17 5 0.21
18 13 0.54
ACGTcount: A:0.37, C:0.09, G:0.05, T:0.49
Consensus pattern (16 bp):
ATTTAAATAGTTATCT
Found at i:15498023 original size:361 final size:359
Alignment explanation
Indices: 15497200--15504652 Score: 1822
Period size: 361 Copynumber: 20.5 Consensus size: 359
15497190 TTTGAAAATA
* * * * * * * *
15497200 AAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTTAAACAATTAAGACTA-TATGAACAATTATTTATTT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTT
*** * * * * ** * * *
15497264 CAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAGTTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTGAA
65 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTA-TTCATACAAGTTTATTTAAA
** * * * * * *
15497329 ATGGAATAA-AGCTAATTTATTACTATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTC
129 ATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * *
15497393 T-ATTTACCGAACCAGCTCAAATAATTATAACAATTTAAACAATTATCTTTTTCAAATTGTTATT
193 TAATTT--CGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * ** * *
15497457 ACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGATTGAAAT-AAAATAATA
256 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAACTTCATTG-GATCAAAATAATA
** * * *
15497521 CTAATTTGTTAATATTT-AGAAAACTAATTAGTAAGAGATTT
319 CTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * * ** * *
15497562 AAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * * *
15497627 AAATCATTATTATTTTTTATTTTGTCATTAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTAGAA
66 AAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTT-TATTCATACAAGTTTATTTAAAA
* ** * * * *
15497692 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAATTAAGAAAATTAAAAAATAATTCTA
130 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * ** *
15497757 ATTGTCGTACCATTTTAAGTAGTTAAT-ACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATACC
195 ATT-TCGTACAAGTTTAAATAGTT-ATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
* * * *
15497821 CTATTGTTTTATCATTAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTT-ATTCGGATCAAAATAACACT
258 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAACTTCATT-GGATCAAAATAATACT
15497884 AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
321 AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * ** * *
15497923 AAAAAATAAATTTGTTTACCCAATTAGTTCAAATGGTGAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
** * * * *
15497988 AAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAAAAA
66 AAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTA-TTCATACAAGTTTATTTAAAA
* * * * *
15498053 TAAATTAATACTAATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT
130 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCT
* * * * *
15498118 ATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAAC
194 AATT-TCGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
* * * * * * *
15498183 CTTTTGATTTGTCATAAAATAATTGTTTCAG-T-AGTAATAATTTCATTAGACCAGAAATAAAAA
258 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA-TAA-AACTTCATTGGATCA-AAAT---AA
* * * * *
15498246 TATTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAGTAAAAAATTT
317 TACTAATTTAATAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* ** * * * * * * *
15498289 AAAAAATAAATCTGTTTATCGAATTAGTTAAAATAATTACGGCCATTTGAAC-GTTCATCTATTT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT-ATCTATTT
* * * *
15498353 CAAATCATTATGACCATTTGTTTTA-TCATAAAACAAATGGTTTTTATCATACAAGTTTATTTAA
65 CAAATCATTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGGTTTAT-TCATACAAGTTTATTTAA
*
15498417 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAAT-ATGTAAGAGATTTAAGAAATAAA
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAAATTAATAAT-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * **
15498481 TCT-GTTTAC-TAAACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATC-AGTCTT-AAATCA
191 TCTAATTT-CGT--ACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTA-T-TTCAAATTG
* * * * * * *
15498542 TTA-AGATC-TTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTGATCATAAAAACTT-ATTCGATTAAAA
251 TTATA-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-AAAACTTCATTGGATCAAAA
* *
15498604 AAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGATATTT
314 TAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* ** * * *
15498650 AAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATTAGAATAATTATCTA-TTC
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * ** * * * * * *
15498714 TAAATCGTTCTAACCTTTTGCTTAGTCA-AAAGTACTT-ATTTCATATCTTAAAAG-TTATTCAG
66 -AAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTT-AT-TCATACAAGTTTATTTAA
* * * * * ** *
15498776 AATAAAATAAT-CAAAATTTATAAACATTTGAAAAATTAAGAAGAAAAAGATTTGAAAAAAATAA
128 AATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTT--AAAAAATAA
** * * * * * * * * **
15498840 ATCTTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCATTA
190 ATCTAATT-TCGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * * *
15498905 TGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAAGATTTTGTTTCAGTTTATATAAGCTT-ATCCAT-AAT-AAA
254 TAACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACA-ATTGTTTCTGTTCATA-AAACTTCAT---TGGATCAAA
* ** * * *
15498966 ATAATGCTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGA-GTTT
313 ATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * * ** * * * *
15499012 AAACAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAGCAATTTTTTATTT
1 AAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* ** * * * * * * *
15499077 AAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCAGTTTATAAAAGCTTATTCAA
65 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTT-A-TTCATACAAGTTTATTTAA
* * * * *
15499140 AATAAAATAATATTAATTTATTGATATTCT-AAAAA-T--T-ACTAAGTGATTTAAAAAATTAAT
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** ** * ** * * **
15499200 -TTGTTT-GCTAAATCAA-TCCAAATAGTCATGTCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAACCGTT
192 CTAATTTCG-T--A-CAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * *
15499262 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAA-TT-ATTTAGAAT-AAAA
253 ATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT--AAAACTTCA-TT-GGATCAAAA
* * * * * ** *
15499324 TTATATTGATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
314 TAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
** * ** ** * ** * * *
15499370 GAAAAACCAAATCTATTTACTAAATAAGTTTAGTTAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTT
1 -AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * **
15499435 AAAATCGTTATGAA-CTTTTGCTTTA-TCATAAAACAATT-GTTTCAGCTCCTAAAAGCTTATCC
65 CAAATCATTAT-AACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGGTTT-A-TTCATACAAGTTTATTT
* *
15499497 AAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAA-AAA
126 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** * *
15499556 TC-ACTTTAC-CAAATCAGATCAAATAATTATGGCCATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGT
191 TCTAATTT-CGTACA--AGTTTAAATAGTTATCACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * ** * * * * * * **
15499618 TATTATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCG-ACATCAAGCTT-ATTAAAT-AAAATT
252 TATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATAAAACTTCATTGGATCAAAA-T
* * * ** ** * * * ** * *
15499680 ATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAGCATACAAGCTTATTT
315 AATACTA-ATTTAATAATAT-TTCAAA-AA---TTAATAAG--T--AAG-ATATTT
* * * * ** * * * *
15499736 GAAATA-AAATAATATTTA-TTAA-TATTTCAAGAATTAG-TAAGA-GATTTA-AAAAATAAATA
1 AAAAAATAAAT-CTGTTTACCGAACCAGTTC-A-AA-TAGTTAAGACTA-TTAGAACAAT---TA
* * * ** * * * * * **
15499795 TGT-TTATCGAACCAGTTCA-AATAGTTTTGACTATTTG-AATAATTATCCATT--TTAAATTGT
58 TCTATT-TCAAATCA-TT-ATAA-CCTTTTG--T-TTAGTCATAA--AACAATTGGTT-TATTCA
* ** * * * * *
15499855 TATAACGTTT-TGTTCCATCATAAAATAAT--T-ATTTTTGTGCATACAAGTTTATTCAGAATAA
113 TACAA-GTTTAT-TT--AAAATAAAATAATACTAATTTAT-T--A-A-TA-TTTA--AAAAAT-T
** * * * * * * * * *
15499916 AATAA-TACTA-ATTT-AATAAT-ATTCTAAAAATCCATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATC-
165 AATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT--AATTTCGT-A-CAAG---TTTAAATAGT-TATCA
* * * * * * * *
15499976 C-CTTTG-CCAA--A-CCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
222 CTATTTGAACAATTATCTATTTC-AA-A-TT--G--T-TAT-AAC-CTT-T-TGTTT--TATC-A
* * ** * *
15500036 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTATTCCAGCTCATACAAATTTATTCGGAAT-AAAAT
272 TA-AAACAATTG--TT-TC------T--G--TT-CA--T-A-A-AACTTCATT-GG-ATCAAAAT
* ** * *
15500100 AAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTT
315 AATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * * ** * * *
15500145 AAAAAAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAACTCAAATAATTATA-ACTATTTGCACAATTATCT
1 ----AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCT
* * * * * * * * *
15500209 ATTTTAGATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTGTTCATATAAGTTTGTT
61 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-GTTTATTCATACAAGTTTATT
* * * * * *
15500274 TGAAATAAAATAAAACTAATTTATTGATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAA
125 TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
15500339 ATCT-GTTTAC-CA-AATCATTTCTAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
190 ATCTAATTT-CGTACAA--GTTT-AAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
** * * * * ** * ** **
15500401 TTATAATATTTTCTTTTATCATTAAACAATTGGTTCTATTCATATTATTTTGTTCAAAAT-AAAA
251 TTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAACTTCATT--GGATCAAAA
* * ** *
15500465 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGA-AATT
314 TAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* *** * * *
15500510 -AAAAATAAATCTATTTGTTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTA-TATTAACAATTATCAATTT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTT
** * * * * ** * ** * ** *
15500573 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCGAAT
65 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTATTCATACAAGTTTATTTAAAA
* * * *
15500638 TAAAATAATACAAATTTAATAATATTT-AAAAATTAAT-AGT-AGTATATTTAAAAAATAAAT-T
130 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCT
** ** * * * * ** * * * ** *
15500699 TGTTTACCAAACCAGTTCATATGGTTAAAACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTCA
194 AATTT--CGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-A
* * ** *
15500764 A-CTTTTG-TTTAGTCATAAAA-ATATTGTTTCGGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAAT-AAATTA
256 ACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACA-ATTGTTTCTGTTCATA-AAACTTCATT--GGATCAAAATA
* * * * * *
15500824 ATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGAAAGAGATTT
316 ATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
*** * ** * *
15500868 AGAAAAATAAATCTACGTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTT
1 A-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* ** * * * * * * * ** *
15500933 AAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATATAAGCTTATACATA
65 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTA-TTCATACAAGTTTATTTAAA
** * *
15500998 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-
129 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * ** * ** * **
15501061 TTGTTTAC-AAAATCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAACAATATATTTCAAATCATTAT
193 TAATTT-CGTACA--AGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * ** *
15501125 GACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGCTTT-TGATCATACAAGCTT-ATTCTAAACAAAATAA
255 AACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATA-AAACTTCATT-GGATCAAAATAA
* *
15501188 TATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACG---G--ATTT
317 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGATATTT
* * * * * * * *
15501227 AAAAAATAAATCTGGTTACTGATCCAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTC
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
15501292 AAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCCAATCATAGAAGCTTA-TTCAG
66 AAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTT--ATTCATACAAGTTTATTTAAA
* ** * ** * * *
15501354 TTAAAAATAATAAAAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGGGATTTTAAAAATAAATG
129 AT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** ** * * ** * * * * *
15501415 TGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATTTTTTTAAAATTGTTTTGA
193 TAATT-TCGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG--TT-A
* * * * *
15501480 CCTTTTTTTTAAAATCATTTTGACCTTTTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTAAT-ATCATAAAAG
254 ---------T--AA-CCTTTTG------TTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-CTGTTCATAAAA-
* * * * * * **
15501544 CTT-ATTTGAAAT-AAAATAATCCTAATATATTAACA-TTCAAAAAGTTAATAAGCAAGAGGTTT
298 CTTCA-TTG-GATCAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAGATATTT
* * * * * * * * *
15501606 GAAAAAATACATCTATTTAACGGA-CAGGCTCAAATAGTCATGACTATTTG---AATAAT-TATT
1 -AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATT
* * * * * * * **
15501666 TAAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCAATTCATA-AAGGTTTATCC
64 TCAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTT--ATTCATACAA-GTTTATTT
* * ** *
15501729 AAAATAAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTACA-AAGCAAGAGATTCAAAAAAAT
126 AAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA-ATAATTAAGAGATT-TAAAAAAT
* * * * * * * * * *
15501793 AAATCTATTTTC-TAAACAAATTCAAATAGTCA-CTACTATTTAAATAATTGTATATTTAAAATC
188 AAATCTAATTTCGT--ACAAGTTTAAATAGTTATC-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* ** * * * *
15501856 ATTATGCCCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCA-AATAAGTTTATTCAGAAT-A
250 GTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATAA-AACTTCATT--GGATCA
* * * * * *
15501918 AAATAATAATAATTTATTAATATGTCAAAAATAAAAAAGAAAG-TGATTT
311 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAT-ATTT
*** * * * * * * * * * * *
15501967 AAAAAGGGAATATGTTTACCAAATCAATTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTACCTATTTC
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
** * * ** * **
15502032 AAATTGTTATGAA-CTTTTGTTTTGT-AT-AAA-AATT--TTTCA-TCATACACGCCTGTTCGAA
66 AAATCATTAT-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTT-ATTCATACAAGTTTATTTAAA
* * *
15502090 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * ** *
15502155 -A--T-GTACCA----AACTAG-T-TC-CTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATAACA
194 AATTTCGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
* * ** * ** ** *
15502209 TTTTGTTCTGTTGTAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAACTT-ATTCAAAACAAAATAATACTA
259 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAACTTCATT-GGATCAAAATAATACTA
* * * *
15502273 ATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAAAAATTT
322 ATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * ** * * * * * * * *
15502311 TAAAAATAAATTTGTTTGTCAAAACAATTTAAACAGTTAAGACTA-CATGAATAAGTATCTATTT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTT
* * * * * *** * *
15502375 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATCATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA
65 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTA-TTCATACAAGTTTATTTAAA
** * * * * *
15502440 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--TGAA--AATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATTT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * * * * *
15502501 GTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGC-CT-TGTCAACAACTATCTATTTCGAATCGTTAT
194 AATT-TCGTA-CAAGTTTAAATAGTTAT--CACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-
* ** ** * ** * * *
15502563 TAA-ATTTTGTTTGGTCATTTAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTT-ATTCAGAAT-AAAATA
254 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA-TAAAACTTCATT--GGATCAAAATA
* * *
15502625 ACACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAG--ATTT
316 ATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * * * * **
15502667 AAAAAATAAATCTGTTTATCTAACTAGCTCAAATAGTTATA-ACTATTTA-AATAATTGTAAACT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAACAATTATCTA-T
** *
15502730 TT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTT
63 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGGTTTA-TTCATACAAGTTTATTT
* * * * * * *
15502793 GAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTCAAAAATTCATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAA
126 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** ** ** * * * * *
15502858 TTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATATTTAAT-ACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
191 TCTAATT-TCGTACAAGTTTAAATAGTT-ATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
** * * * ***
15502922 CGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATACTCCTT-ATTTGGAAT-AAAA
254 TAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTCTG--TTCATAAAACTTCA-TTGG-ATCAAAA
* * * *
15502984 TAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTT
314 TAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * ** * * *
15503030 AAAAAATAATTCTATTTACCTAACGGGTTCAAATAATTATGACTATT-TAACAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * * * *
15503094 AAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCAT-CTAAGTTTGTTCA
66 -AAATCATTATAACC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-GTTTATTCATAC-AAGTTTATTTA
* * * *
15503158 GAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTT-CAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * ** * *
15503218 CTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
192 CTAATT-TCGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * * *
15503283 A-CTTTTAGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAGA-CTAAAATAA
256 ACCTTTT-GTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAACTTCATT-GGATC-AAAATAA
* * *
15503345 TACTAA-TTAATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTT
317 TACTAATTTAA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * * * * * * * * * * *
15503388 TAAAAATAAATATTTTTACCAAACTAGGTCAAATAATCATGACAATTTGAATAATTATCTATTTT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * ** * * * * * * **
15503453 AAATCATTATGACCTTTTATTTTTTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTTATATAAGCTGATTCGAAA
66 AAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTA-TTCATACAAGTTTATTTAAAA
* * * * * *
15503518 TAAAATAATACTAATTTATTATTAATCAAAAAATTAATAA-TAAGGGATTTAAAAAATGAATAT-
130 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * *
15503581 TTTTACTGAACTAGTTTAAATAATTATGATCGT-TTT-AACACTTATCTATTTGAAATTGCTATA
195 ATTT-C-GTACAAGTTTAAATAGTTATCA-C-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * ** * * *
15503644 ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGTTTATTTTGAAT-AAAATAAT-
256 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAACTTCA--TTGGATCAAAATAATA
* * * * *
15503707 TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTAGTAA-AAATTT
319 CT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * * * * * *
15503748 TAAAAATAAATCTGTTTTCTG-AGCATGTTCAAATAATTAAGACAATTTGAATAATTATCTATTT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * ** * * * * *
15503812 CAAATCAGTATGACCTTTTGTTTTCTCAT-AAACAAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTAG
65 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC-AATTG-GTTTATTCATACAAGTTTATTTAA
* * * * * * *
15503876 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAAAAAAATTAACAAGTAAAATATTTAAAAAACAAATC
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * ** *
15503941 T-ATTTAC-TAAGCGAGTTCAAATAATTTTGACTATTT-ACACAATTATTTATGTCAAATCATTG
193 TAATTT-CGT-A-CAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * * * * * * ** *
15504003 TGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAA
254 T-AACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAACTTCATT--GGAT-CAA-AA
* * * * ** *
15504068 TAATAATAATTTATTTATA-TTCTGAAAATTAATAAGTTGGAGATTT
314 TAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGATATTT
* * * * ** * * * * * *
15504114 AGATAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTA-AACTATTATATATTT
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** *
15504178 CAAATCGTTATGACATTTTGTTT-GTGATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGA
65 CAAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-GTTTATTCATACAAGTTTATTTAAA
* * * *
15504242 ATAAAATAATAATAGTTT-TTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCT
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
15504302 -ATTAC-TGACGTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-ATTATTTATCTCAAATTGTTATG
194 AATTTCGT-AC--AAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* ** * * * * * *
15504363 ATC-TTTGTTTTGCCATAAAATAACTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCTGAGT-AAAATATT
256 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAACTTCATT-GGA-TCAAAATAAT
* ** * * * *
15504425 GCTAAGCTAGTAGTA-TTCTAAACAATTAATAAATAAGAGATTT
318 ACTAATTTAATAATATTTC-AAA-AATTAATAAGTAAGATATTT
* *** *
15504468 AAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTAT-TA--TC
1 AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** * * *
15504530 --GT--TT-TGACCTTTTGTTTATTCATAAAATAATTGTTTTAGTTTGTACATGCTTATTTGAAA
66 AAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTA-TTCATACAAGTTTATTTAAAA
* * ** * *
15504590 TAAAATAATACT-ATTTCTTCAACATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAACTAAAT
130 TAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-TAAAT
15504653 TTGTTTACTA
Statistics
Matches: 5329, Mismatches: 1315, Indels: 903
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
343 3 0.00
344 162 0.03
345 7 0.00
346 49 0.01
347 49 0.01
348 14 0.00
349 5 0.00
350 44 0.01
351 11 0.00
352 13 0.00
353 80 0.02
354 75 0.01
355 22 0.00
356 204 0.04
357 437 0.08
358 477 0.09
359 326 0.06
360 574 0.11
361 658 0.12
362 438 0.08
363 331 0.06
364 165 0.03
365 141 0.03
366 341 0.06
367 49 0.01
368 15 0.00
369 7 0.00
370 2 0.00
371 19 0.00
372 10 0.00
373 5 0.00
374 30 0.01
375 48 0.01
376 23 0.00
377 44 0.01
378 30 0.01
379 9 0.00
380 37 0.01
381 4 0.00
382 22 0.00
383 64 0.01
384 4 0.00
385 10 0.00
386 8 0.00
387 6 0.00
388 9 0.00
389 6 0.00
390 2 0.00
391 6 0.00
392 3 0.00
393 5 0.00
394 2 0.00
395 8 0.00
396 8 0.00
397 6 0.00
398 10 0.00
399 13 0.00
400 8 0.00
401 15 0.00
402 6 0.00
403 1 0.00
404 9 0.00
405 5 0.00
406 12 0.00
407 18 0.00
408 3 0.00
409 11 0.00
410 6 0.00
411 8 0.00
412 5 0.00
413 19 0.00
414 18 0.00
415 5 0.00
417 3 0.00
418 7 0.00
419 9 0.00
420 5 0.00
421 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (359 bp):
AAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
AAATCATTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGGTTTATTCATACAAGTTTATTTAAAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAA
TTTCGTACAAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTT
TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAACTTCATTGGATCAAAATAATACTAATTT
AATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
Found at i:15498352 original size:366 final size:360
Alignment explanation
Indices: 15497200--15516798 Score: 3389
Period size: 362 Copynumber: 54.5 Consensus size: 360
15497190 TTTGAAAATA
* * * * * *
15497200 AAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTTAAACAATTAAGACTA-TATGAACAATTATTTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTT
* * * * * * * ** * **
15497264 CAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAGTTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTGAA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAA
** * * *
15497329 ATGGAATAA-AGCTAATTTATT-ACTATTTC-AAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAAT
130 ATAAAATAATA-CTAATTTATTAAC-A-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * * * * * * **
15497391 TCTATTTACCGAACCAGCTCAAATAATTATAACAATTTAAACAATTATCTTTTTCAAATTGTTAT
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * * ** * * *
15497456 TACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT-TAATATAAGTTTGATTGA-AATAA-AATA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT-A-ATAA--TTCATT-ACCATAATAAAA
* ** * * * *
15497518 ATACTAATTTGTTAATATTT-AGAAAACTAATTAGTAAGAGATTT
317 ATATTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * ** * *
15497562 AAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * ** * * * ** ** ** * *
15497627 AAATCATTATTATTTTTTATTTTGTCATTAAACAATTGGTTC-TATTCATACTATTTTATTTAGA
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAAA
* * *** * * * * *
15497691 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAATTAAGAAAATTAAAAAATAATTCT
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * ** * **
15497756 AATTGT-CGT--ACCATTTTAAGTAGTTAAT-ACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTA
195 -GTT-TAC-TAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * * * * *
15497817 TACCCTATTGTTTTATCATTAAACAATTGTTT-TGTTCATACA-AGCTT-ATT-CGGATCAA-AA
256 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATA-ATA-ATTCATTAC-CAT-AATAA
* * * * *
15497877 TAACACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
315 AAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * *
15497923 AAAAAATAAATTTGTTTACCCAATTAGTTCAAATGGTGAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
15497988 AAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTAAAA
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAAA
* *
15498052 ATAAATTAATACTAATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATC
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * * **
15498117 TATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAA
194 TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAA
* * *
15498182 CCTTTTGATTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTAGTAATAATTTCATTAGACCAGAAATAAAAAT
259 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTA-TAATAA-TTCATT--ACCA-TAATAAAAAT
* *
15498247 ATTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAGTAAAAAATTT
319 ATTAATTTAATAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * * *
15498289 AAAAAATAAATCTGTTTATCGAATTAGTTAAAATAATTACGGCCATTTGAAC-GTTCATCTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT-ATCTATTT
* * * ** * * * *
15498353 CAAATCATTATGACCATTTGTTTTA-TCATAAAACAAATGGTTT-TTATCATACAAGTTTATTTA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAAC-AATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCA
* * *
15498416 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAGAAATAAA
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
15498481 TCTGTTTACTAAACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATC-AGTCTT-AAATCATT
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-T-TTAAAATCATT
* * * * * *
15498544 A-AGATC-TTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTGATCATAAAAACTT-ATT-CGATTAA-AA
255 ATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATAATAA-TTCATTACCA-TAATAA
* * * *
15498604 AAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGATATTT
315 AAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* ** * * * *
15498650 AAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAAACTATTAGAATAATTATCTA-TTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * ** * * *
15498714 TAAATCGTTCTAACCTTTTGCTTAGTCA-AAAGTACTTATTTCATATCTTAAAAG-TTATTCAGA
66 -AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAA
* * ** * * *
15498777 ATAAAATAAT-CAAAATTTATAAACATTTGAAAAATTAAGAAGAAAAAGATTTGAAAAAAATAAA
130 ATAAAATAATAC-TAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAA
* * * * * *
15498841 TCTTTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCATTA
192 TCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * * * *
15498905 TGACCTTTTGTTTTGACATAAAAGATTTTGTTTCAGTTTATATAA-GC-TTATCCATAAT-AAAA
256 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCAGTATA-ATAATTCATTA-CCATAATAAAAA
** * * * *
15498967 TAATGCTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAG-CAAGAGTTT
318 T-AT--TAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * ** * * * *
15499012 AAACAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAGCAATTTTTTATTT
1 AAA-AAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * *
15499077 AAAATTGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGT-TTATAAAAGCTTATTCAA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAA
* * * * * * *
15499140 AATAAAATAATATTAATTTATTGATATTCTAAAAATTACTAAGT----GATTTAAAAAATTAATT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * *
15499201 TGTTTGCTAAATCAA-TCCAAATAGTCATGTCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAACCGTTATG
194 TGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * *
15499265 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAA-AATT-ATT--TAGAATAAAATT
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-AT--AATAATTCATTACCATAATAAAA--
* * * ** * *
15499326 ATATTGATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
317 ATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
** * * * * * ** * * *
15499370 GAAAAACCAAATCTATTTA-CTAAATAAGTTTAGTTAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATT
1 -AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATT
* * ** * *
15499434 TAAAATCGTTATGAA-CTTTTGCTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAGCTCCTAAAAGCTTATCC
64 TCAAATCGTTAT-AACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTC
* *
15499497 AAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAA-AA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * * * * **
15499555 ATCACTTTACCAAATC-AGATCAAATAATTATGGCCATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGT
191 ATCTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
* * ** * * *
15499618 TATTATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTC-G-A-CATCAAGCTT-ATTA-AATAA-A
254 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAGTATAAT-AA--TTCATTACCATAATA
* * * ** ** * * * ** * **
15499677 ATTATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAGCATACAAGCTTATTT
314 A-AAATATTA-ATTTAATAATAT-TTCAAA-AA---TTAATAAG--TA-AA--AAATTT
* * * * ** * * *
15499736 GAAATA-AAATAATATTTA-TTAA-TATTTCAAGAATTAG-TAAGA-GATTTA-AAAAATAAATA
1 AAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAACTAGTTC-A-AA-TAGTTAAGACTA-TTAGAACAAT---TA
* * * ** * * * * ** **
15499795 TGT-TTATCGAACCAGTTCA-AATAGTTTTGACTATTTG-AATAATTATCCATT-TTAAAT-TGT
58 TCTATT-TCAAATC-GTT-ATAA-CCTTTTG--T-TTAGTCATAA--AACAATTATTTCATATCA
* * * ** *
15499855 TATAACGTTTTGTTCCATCATAAAATAATTATTTTTGTGCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATA
114 TA-AAAG-CTTATT-CAAAATAAAATAA-TA--------C-T--AA-TTTA-T-----TAACAT-
* ** * *
15499920 ATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATCCATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCCCTTTGCCA
156 -T-C--A---AA-AA-A-T-T----A---ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA
* * * * * * *
15499985 AACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
203 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTT
* * * * * * *
15500050 TTGTCATAAAATAAGTATTCCAGCTCATACA-AATTTATT-CGGAATAA-AATAAA-ACTAATTT
268 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATA-ATAATTCATTAC--CATAATAA-AAATATTAATTT
** * * *
15500111 GTTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTT
327 AATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * ** * * *
15500145 AAAAAAAAAATAATTCTATTTACCAAACTAACTCAAATAATTATA-ACTATTTGCACAATTATCT
1 --AAAAAATA-AATT-TGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCT
* * * * * * * ** * * *
15500209 ATTTTAGATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTGT-TCATATAAGTTTGT
61 ATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-ATTTCATATCATAAAAGCTTAT
** * * * * * *
15500273 TTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTGATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTA
125 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
15500338 AATCTGTTTACCAAATC-ATTTCTAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
190 AATCTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
** * * * * * * * ** *
15500402 TATAATATTTTCTTTTATCATTAAACAATTGGTTCTATTCATATTATTTTGTT--CAAAATAAAA
254 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT-ATAATAATTCATTACCATAAT-AAA
* * * ** *
15500465 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAACCAAGAAA-TT
316 -AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * *** * * * *
15500510 -AAAAATAAATCTATTTGTTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTA-TATTAACAATTATCAATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTT
* * * * * * ** ** * *
15500573 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTTTTTTGT-TTGTACAAGCTTATTCGAA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAA
* * * * * * *
15500637 TTAAAATAATACAAATTTAATAATATT-TAAAAATTAAT-AGT-AGTATATTTAAAAAATAAATT
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATC
* * * * ** * * * * *
15500699 TGTTTACCAAACCAGTTCATATGGTTAAAACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTCA
194 TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-A
* * * ** * *
15500764 A-CTTTTGTTTAGTCATAAAA-ATATTGTTTCGGT-TCATACAAGC-TTATTCAAAATAAATTAA
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCAGTATAATA-ATTCATTA-CCATAATAAA--AA
* * * * * *
15500825 TACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAG-AAAGAGATTT
318 TATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AAATTT
* *** * ** * *
15500868 AGAAAAATAAATCTACGTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTT
1 A-AAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * * *
15500933 AAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TAATATAAGCTTATACAT
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAA
* * *
15500997 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAA
129 AATAAAATAATACT-AATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** * *
15501060 TTTGTTTACAAAATC-AGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAACAATATATTTCAAATCATTA
192 TCTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * * * *
15501124 TGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGCTTT-TGATCATACA-AGCTT-ATT-CTA-AACAAA
256 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAG-T-ATA-ATA-ATTCATTACCATAA-TAA
* *
15501184 ATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACG-----GATTT
315 A-AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAAAAATTT
* * * * * * * * * *
15501227 AAAAAATAAATCTGGTTACTGATCCAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
15501292 AAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCA-ATCATAGAAGCTTATTC-AG
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-CATATCATAAAAGCTTATTCAAA
* ** * * * * *
15501354 TTAAAAATAATAAAAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG---G-GATTTTAAAAATAAATG
130 AT-AAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * ** * * * * ** * *
15501415 TGTTT-GTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATTTTTTTAAAATTGTTTTG
194 TGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* *** * * * * * * *
15501479 ACCTTTT-TTTTAAAATCATTTTGAC-CTTTTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTAATATCATAAA
258 ACCTTTTGTTTT---GTCA-TAAAACAATTGTTTCAGT-AT--AATA---ATTCATTACCAT--A
* * * * * * **
15501542 AGCTTATTTGAAATAAAATAATCCTAATATATTAACATTCAAAAAGTTAATAAGCAAGAGGTTT
311 A---TA----AAA-ATATTAAT-TTAATA-A-T-A-TTTCAAAAA-TTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * * *
15501606 GAAAAAATACATCTATTTAACGGAC-AGGCTCAAATAGTCATGACTATTTG---AATAAT-TATT
1 -AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * * *
15501666 TAAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA-ATTCATAAAGGTTTATCCA
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCA
* * * *
15501730 AAATAAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTACA-AAGCAAGAGATTCAAAAAAAT
128 AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATT-TAAAAAAT
* * * * * * * *
15501793 AAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAGTCACT-ACTATTTAAATAATTGTATATTTAAAATCA
189 AAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA
** ** * * *
15501857 TTATGCCCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCAAATAAGTTTATT--CAGAATAA
253 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT--AATAA-TTCATTACCATAAT-A
* * * * * **
15501919 AATAATAATAATTTATTAATATGTCAAAAATAAAAAAG-AAAGTGATTT
314 AA-AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AAATTT
*** * * * * * * * * * *
15501967 AAAAAGGGAATATGTTTACC-AAATCAATTAAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTACCTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
15502031 CAAATTGTTATGAA-CTTTTGTTTTGT-AT-AAA-AATT-TTTC--ATCATACACGCCTGTTCGA
65 CAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAA
* *
15502089 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
15502153 CTATGTAC----C-A----AACTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATA
193 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * ** * * * *
15502206 ACATTTTGTTCTGTTGTAAAATAATTGTTTCAATTCATACA-AACTT-ATT--CAAAACAAAATA
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT-ATA-ATAA-TTCATTACCATAA-TAAA-A
* * *
15502267 ATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAAAAATTT
317 ATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** * * * * * *
15502311 TAAAAATAAATTTGTTTGTCAAAAC-AATTTAAACAGTTAAGACTA-CATGAATAAGTATCTATT
1 AAAAAATAAATTTGTTT-ACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATT
* * * * * * * **
15502374 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATCATTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTG
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCA
* *** * * *
15502438 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--TTGAA--AATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAAT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * ** *
15502499 TTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCT-TGTCAACAACTATCTATTTCGAATCGTTA
193 CTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * ** ** * * * *
15502562 TTAA-ATTTTGTTTGGTCATTTAACAATTGTTTTTGAACATTCAAGCTT-ATT--CAGAATAAAA
256 -TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAAT-AA--TTCATTACCATAAT-AAA
* * * * *
15502623 TAACACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATTT
316 -AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * **
15502667 AAAAAATAAATCTGTTTATCTAACTAGCTCAAATAGTTATA-ACTATTTA-AATAATTGTAAACT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAACAATTATCTA-T
* * *
15502730 TT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTATTTTAGT-TCATACAAGCTTATT
63 TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATT
** * * * * * *
15502792 TGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTC-AAAAATTCATAACTAAGAGAATTAAAAAATA
126 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* ** * * * * *
15502856 AATTTGTTTA-TCAAATTAGTTCAAATATTTAAT-ACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCG
190 AATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA
** * ** * * * * **
15502919 TTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCAT-ACTCCTTA-TTTGGAATA
253 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAGTA-TAATAATTCATTACCAT--AAT-
* * * * * *
15502981 AAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTT
313 AAA-AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** * * *
15503030 AAAAAAT-AATTCTATTTACCTAACGGGTTCAAATAATTATGACTATT-TAACAATTATCTATTT
1 AAAAAATAAATT-TGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * ** ** * *
15503093 CAAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGT-TTTTGT-TCATCTAAGTTTGTT
65 C-AAATCGTTATAACC-TTTTGTTTAGTCATAAAAC-AAT-TATTTCATATCATAAAAGCTTATT
* * * *
15503156 CAGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTC--AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
126 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * ** * * **
15503215 AATCTATTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGT
190 AATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
* * * * * *
15503279 TATGA-CTTTTAGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA-AGCTT-ATT-CAGACTAA
254 TATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT-ATA-ATA-ATTCATTAC-CA-TAA
* * *
15503340 -AATAATACTAA-TTAATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTT
312 TAAAAATATTAATTTAA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * *
15503388 TAAAAATAAATATT-TTTACCAAACTAGGTCAAATAATCATGACAATTTGAATAATTATCTATTT
1 AAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * ** * * * * * * *
15503452 TAAATCATTATGACCTTTTATTTTTTCATAAAAGAATTGTTTTAGT-TTATATAAGCTGATTCGA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAA
** * * * *
15503516 AATAAAATAATACTAATTTATTATTAATCAAAAAATTAATAA-TAAGGGATTTAAAAAATGAATA
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * ***
15503580 TTTTTACTGAACTAGTTTAAATAATTATGATCGT-TTT-AACACTTATCTATTTGAAATTGCTAT
194 TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C-TATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * * *** *
15503643 AACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTC--TATTCATGCAAGTTTATTTTGAATAA-AATA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTA-TAAT--AA-TTCA-TTACCATAATAAAA
* * *
15503705 AT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTAGT-AAAAATTT
317 ATATT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * *
15503748 TAAAAATAAATCTGTTTTCTGAGC-ATGTTCAAATAATTAAGACAATTTGAATAATTATCTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* ** * * * *
15503812 CAAATCAG-TATGACCTTTTGTTTTCTCAT-AAACAAATTGTTT-TTGTTCATAAAAGCTTATTT
65 CAAATC-GTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC-AATTATTTCAT-ATCATAAAAGCTTATTC
* * * * * * *
15503874 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAAAAAAATTAACAAGTAAAATATTTAAAAAACAAA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
15503939 TCTATTTACTAAGCGAGTTCAAATAATTTTGACTATTT-ACACAATTATTTATGTCAAATCATTG
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * * * * **
15504003 TGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGTTTATTCAAAATAAAATA
256 T-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT-ATA-ATAATTCATT-ACCAT--AATA
* * * * * *** *
15504067 ATAATAATAATTTATTTATA-TTCTGAAAATTAATAAGTTGGAGATTT
314 AAAATATTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * * * *
15504114 AGATAATAAATCTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTA-AACTATTATATATT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
15504177 TCAAATCGTTATGACATTTTGTTT-GTGATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAA-ATTATTT
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATA-AAAGCTTATTC
* * * * *
15504239 AGAATAAAATAATAATAGTTT-TTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * **
15504298 ATCT-ATTACT-GACGTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-ATTATTTATCTCAAATTGT
191 ATCTGTTTACTAAAC--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
* * * * * ** * ** * *
15504359 TATGATC-TTTGTTTTGCCATAAAATAACTGTTTTTGT-TCATACAAGC-TTATTC-TGAGT-AA
254 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATA-ATTCATTA-CCAT-AATAAA
** * * * * *
15504419 AATATTGCTAAGCTAGTAGTA-TTCTAAACAATTAATAAATAAGAGATTT
316 AATA-T--TAATTTAATAATATTTC-AAA-AATTAATAAGTAAAAAATTT
* ***
15504468 AAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC-A--AT-TA-TT-
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * ** * * **
15504527 --ATCGTTTTGACCTTTTGTTTATTCATAAAATAATTGTTTTAGT-TTGTACATGCTTATTTGAA
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAAA
* * * * *
15504589 ATAAAATAATACT-ATTTCTTCAACATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAACTAAAT
130 ATAAAATAATACTAATTTATT-AACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAAT
* * * * * *
15504653 TTGTTTACTAAACAAGTT---AT-G----G-CTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATG
193 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* *** *
15504709 ACC-TTT-TTTT-T--T----CAA----TTCA-T-CAAGGCTT-A-T-CCAAAATAAAATAATAT
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATAATTCATTACCATAAT-AAA-AATAT
* * ** * *** *
15504756 TACTTTATTAATATTTTGAAAATTGATAAGTTGGAGATTT
321 TAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** ** * * * * * * *
15504796 AAAAAATGAATTAGCATATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
15504861 AAATTGTTATGAA-CATTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGT-TTTTA-ATTATTACTAATC-TATT
66 AAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-CAAT-TATTTCATATCA-TA-AAAGCTTATT
* * ** * **
15504922 -AATATTTCAAAAATTAAT--TAGATATT-TTAA-AAT-AAATCTATTTATCAA--ACTAG-TTT
126 CAA-A-AT--AAAA-TAATACTA-AT-TTATTAACATTCAAA-AAATTAAT-AAGTAAGAGATTT
* * * * *** * * * *
15504978 AAATAGT-TATGACTATTTAAGC-AATTTTTTATTTCAAATTGTTGTGACTTTTTG------T-T
182 AAAAAATAAAT--CTGTTT-A-CTAA---ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
15505034 CTA-TTATAA--A--ATAA----TTGTTTCTGTTCATATAAGC--TT-ATTCAG-ATTAA-AA-T
240 CTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTT-TG-TCATA-AAACAATTGTTTCAGTA-TAATAATT
* * * * * *
15505084 -AATA-C-TGACT--TACTAAT-ATTT--TAATA--------ATTAATAAGTAAAAATTTT
301 CATTACCAT-AATAAAAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** * * * * ** *
15505129 AAAAACTAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTA
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * *
15505194 AAATGGTTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAAAAATTATTTTAGT-TCCTATAAGCTTATT-GAA
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAAA
* * * * * * *
15505257 A-AAAATAAGACTAAGTTATTAATATT-ATGAAAATTAGTAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
15505320 TGTTTACTGAATAAGTTTAATTAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATTACTATAA
194 TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAA
* * * * * * ** *** *
15505385 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTTCTGT-TCGTACAAGCCTATTTTGGATAA-AAT
259 CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA---ATTGTTTCAGTAT--AATAATTC-A-TTACCATAATAAA
** * ** *
15505448 AATACAAATTTATTAATA--AAAAGATAATTAATAAGTAAAAAATAT
316 AATATTAATTTAATAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * *
15505493 -AAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATATTTATGACTATATA-AATAATTATTTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * **
15505556 CAAATTGTTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTCAT-TCATACAAGCTTATACGG
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-ATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAA
* * * * * * *
15505620 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * * * * *
15505684 ATGTTTTTTGAACAAATTC-CA-AGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTGTG
193 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * * * *
15505747 ACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATATATTTTAGTTGA-AATAA-AATAAT
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT-A-ATAATTCA-TT-ACCATAATAAAAAT
* * * *
15505809 ACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTATTGAGTAAAAGAA-TT
319 ATTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-AATTT
* * *** ** ** * * *
15505851 AAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAATGTTCAAATAGTTCTGATTATTTGAAC-ATATATTTATT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT-TATCTATT
* * * ** * ** * *
15505915 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGAAATAAATCAATGGTTTC-TATTCATAAAAGTTTATTTA
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCA
* * * *
15505979 GAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
15506043 TCTGTTTACCAATCGAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * * * * * *
15506108 GATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA-AGTTTATTTGA-AATAA-AATA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT-ATA-ATAATTCA-TT-ACCATAATAAAA
* * * * * *** * *
15506170 ATACTAACTTATTGATA-TTCTAAATATTAATAAGTTGGAGATAT
317 ATATTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * ** * * ** * * * *
15506214 AAGAAATAAGTCTAG-ACATCGAACTAGTTCAAAAAACTATGTCCATTTA-AACTATTATCTATT
1 AAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATT
** * * * * *
15506277 TCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAA-AGTATTGCATTT-AT-TCATACAAA-ATTA
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA--ATT--ATTTCATATCATA-AAAGCTTA
* * * * *
15506338 TTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAGAAC
124 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
15506398 TAAATTTGTTTATCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATCTCAAAT-
188 TAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC
* * * * * *
15506461 GTTATGATC-TTTATTTTATCAT---ACAA--G---C----T--T-ATTCGA--A--ATAA-AAT
252 ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATAATTC-ATTACCATAATAAA
* * * * *
15506505 ATTGTTAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAACAAATTT
316 AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * *
15506550 AAAAAATAAATATGTTTGCTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-AAGCAATTATCTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA-CAATTATCTATTT
* * * *
15506614 CAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCA-ATTCATACATAA-C-TATTC
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATA-A-AAGCTTATTC
* * * ** * *
15506676 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCACTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTTAAAAATAA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAA
* * * * *
15506741 ATC-GATTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTAAACAATTATTTATTTAAAATAACT
191 ATCTG-TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT
* * * *
15506804 ATGACC-TTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTTAGTTCATAA-AATT--TTATC-TGAAATAAA
255 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATAATAATTCATTACCAT--AAT-AA
* * * * * *
15506863 ATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTT
315 A-AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* ** ** * * * * * * * *
15506910 -AAAAATAAGTCAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * ***
15506974 AAATCATTATGAA-TTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTT-TTCATCATACAAGCCTATTTGG
66 AAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAT-ATCATAAAAGCTTATTCAA
* * * * *
15507037 AATAAAATAATATTAAATTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AGTAGGCGATTTAAAAAATAAAT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** **
15507100 TTGTTTA-TCAAAC-----C----AG-T-T-CCTGTTTGAACAATTATTTAATTCTAATTGTTAT
193 CTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * *
15507152 AACCTTTTGTTCTATTTC-TAAAATAATTGTTTCAGT-TCATATAAACTT-ATTTGA-AATAA-A
257 AACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT-A-AT-AA-TTCA-TT-ACCATAATA
* * * *
15507212 ATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTT
314 AAAATATTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * *
15507259 AAAAAATAAATCTATTTATCGAAGTAGTTTAAACAGTTAAGACTA-TATGAATAATTATCTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTT
* * ** * * * * * ***
15507323 CTAATCGTTATGACCTTTCATTTTGGCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCTTACAAGCTTATTTGC
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAA
* * * *
15507387 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAAT-
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
15507447 TAGTTTA-TCAAATTAA-TTCAAATAATTATGGCTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
194 T-GTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * * * * * * *
15507510 TTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TGATATT-TGAACATTCAATCTTATT-CGA-AATAAAA
256 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T-TTCAGTATAAT-AAT-TCATTACCATAAT-AAA
* * * * **
15507571 GAATACTAATTTATTAATCTTTGAAAAATTAATAAGTAAAAGCTTT
316 -AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * *
15507617 -AAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTT-TAA-A--T-AGACTATTTGAACAATTGTATAATTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
15507676 AAATTGTTATAACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTCGT-TCATATAAG-TCTATTCG
66 AAATCGTTATAAC-CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTA-TTTCATATCATAAAAGCT-TATTCA
* * * * * * * *
15507739 TAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-ACAACAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * ** **
15507802 TTTGTTT-GTCGAACTATTTCAAATATTTAAGACCGTAAGAACAATTATCTATTTCAAAA-CATT
192 TCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCATT
* * * * * * **
15507865 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAAT-TCAT-ATTAACTTAATCGGAATAAAAT
255 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATAATTCA-TT-ACCATAAT-AAA-
* ** * * * *
15507928 AAAACAAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAA-TAATAGATTTT
316 AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAA-AAAATTT
* ** * * * * *
15507974 AAAAAATAATTTTGTTTACTTAACCAATTCAAACAATTATA-ACTATTTA-AACAATTATCTACT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * * * *
15508037 TCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTTAGAAAACAAATT-TTT--T-TTATATAAGTTTGTTTA
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC-AATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCA
* * * * * * *
15508098 GAATAAAGTAATACTAGTCTATTAATATTTC--TAAA--ACTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
15508158 TCT-ATTAATCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCAT
192 TCTGTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTAAAATCAT
** ** * * * * *
15508220 TATAATTTTTTGTTTAATTATAAAACAATTATTTTTATTCATACA-AACTT-ATT-CGGATTAA-
254 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGT-ATA-ATAA-TTCATTAC-CA-TAAT
* * * ** * **
15508281 AATAATATTAATTTATTAACATTTTGATAATTGCTAA--AAAAAATTT
313 AAAAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** * * * * * * * * *
15508327 AAAATAA-AAGGTTTTGTCATAATGTAA-TTGTTTCTATTCA-TACAAAATTAATCAAAATAAAA
1 AAAA-AATAA--ATTTGT-TTACCG-AACTAG-TTCAAAT-AGT-TAAGACT-AT-TAGA-ACAA
* * * *** * * *
15508389 TAATACTAATTT-ATTAAT-ATTTTAAAAATTAG-TAAGAATCTTAAAAACTAAATCTA-TT--T
55 TTAT-CT-ATTTCA--AATCGTTATAACCTTTTGTTTAG--TCAT-AAAAC--AAT-TATTTCAT
** ** ** *** * * * *** *
15508448 ATCGGACCAG-TTCAATT--AGTTATGCTTAT-GTGAA-TAATTAACTATCTCAAATTGTTAAGA
110 ATCATAAAAGCTT--ATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAC-AT-TCAAAAAATTAATA
** ** ** * * * * **
15508508 TCTTTG-TTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATA-TAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTG
170 AGTAAGAGATT-T-AAAAAATAA--A--TCTGTT--TACTAAAC-AAGTTCAAA-T-AGTTA-TG
* * * * * * * * ** *
15508570 -CTAAATTAAT-AAAAGATAAACATGTTTGCCAAACCA--AGTCAA---ATAGTTAAGACTATTA
223 ACT--ATT--TGAACA-ATTATC-TATTT--AAAATCATTA-T-AACCTTTTGTTTTGTC-A-TA
* * * ** ** *
15508628 GAACAATGATCCATTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTAGCCATAA-AATAAT-TGT--TTTAG
276 AAACAAT--T--GTTTC-AGT-ATAAT-A-A--TTCATTA-CCATAATAAAAATAT-TAATTTA-
* * * ** * *
15508689 TTCATATATGC-TTATTTGA-AA-TAAAAAA---
328 ATAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * * * *
15508717 AAAATACT-AATTTGTTAAGATTCAGAAACTTAATAAACAAGAAATTTTATA-AAATA-AATCTA
1 AAAA-AATAAATTTGTT----TACCG-AAC-TAGT--TCAA-ATAGTTAAGACTATTAGAA-C-A
* * * * * * * * * *
15508779 TTTATTGAACAAGTGCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAATATCTATTTAAAAAATATGACTT
54 ---ATT-ATCTATTTCAAATCGTTATAACCT-TTTG------T-T-TAGTCATAAAACA--A---
* * * * *
15508843 TTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTGAGCTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATATTACT
101 --T-TATT-T-------C-A-----T-A--TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * ** * ***
15508908 ATATTAATATTTC-AAAAATTGATAAGTTAA-AAATTTAAAAAATAGGTC-ATTTA-TCAAGTTA
146 TTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAA
* * * * * * * * *
15508969 GTTCAAATAATTATGGCCATTTTAATAATTATCTATTTCAAAT-A-GATGCAAACTTTTATTTTG
208 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT--AACCTTTTGTTTTG
* * ** * * *
15509032 TCATAAAACAATTATTTTTCA-TCAT-ACAAGCCTATT--CAGAATAAAATAATACTAATTTATT
271 TCATAAAACAA-T-TGTTTCAGT-ATAATAATTC-ATTACCATAAT-AAA-AATATTAATTTAAT
* ** *
15509093 AATATTTCAAAAAATTAGTAAGTACGAGATTT
330 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * *
15509125 AAAAAATAAATTTGTTTACC-AA--A---C---CAGTT---CCTATTTGAACAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * **
15509178 AAATCATTAAAATCTTTTGTTCTA-TTATAAAATAATTGTTTCA-ATTCATTTAAGCTTATT-AG
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCA-
* * * * * **
15509240 TAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAAT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
15509305 CTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCA
193 CTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * *
15509368 TGACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA-AGCTT-ATT-CGA-AATAAAA
256 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATA-ATA-ATTCATTACCATAAT-AAA
* * * * * ***
15509429 TAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGATTT
316 -AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * * *
15509475 AAAAAGTGAATCTGTTTACC-AAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATGT-CAATAATTATCTATT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATT
* * * * * * **
15509538 TCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTGA-A-CATTCAAGCTTATTC
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA-T-TATTTCATATCATAAAAGCTTATTC
* * * ***
15509601 AAAATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTC-AAAAATTAATATGTAAGAGATTTTTTTAAA-A
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATA
* * * * * * * * ** * **
15509664 AATCTATTTATTGAACTAGTTCAAATTGCTATGACTATTTGAACGATTGTAAATTTCAAATTGTT
190 AATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT
* * * * ** * ** * *
15509729 ATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATTTTTGT-TCATACAAGC-TTAATCAAAATAAAAT
255 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATA-ATTCATT-ACCATAAT-AAA-
* * * * * *
15509792 AATACTAATCTAAAAATATTTCAAAAATTAATAATTAGTAGAA-TT
316 AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAAATTT
* * * * * *
15509837 AAAAAATAAATTTGTTTGCCTAAC-ATGCTCAAATATTTAAAGACTA-TATGAACAACTATC-AA
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTT-AAGACTATTA-GAACAATTATCTAT
* * * * * * **
15509899 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGA-ACTCATACTAGCTTAT
63 TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA--ATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTAT
*** * * * * * *
15509963 TTGGAATAAAATAAAACAAATTTATAAATATTTAAAAAATTAATAAG--AGA-TTTTAAAAAATA
125 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * ** * *
15510025 ATTTTGTTTACCT-AAC-CGTTCAAATAATTATGAATATTTGATTAATTATCTATTTCAAATCAC
190 AATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
* * * * * ** ** * *
15510088 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAATATTTTTGT-TCATATAAGTTTGTT-CGA-AACAAA
254 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT-A-ATAA-TTCATTACCATAATAAA
* * * *
15510150 GTAATACTAATCTT-TTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTT
316 --AATATTAAT-TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * ** * * *
15510193 AAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAGTTATTTATTTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * *
15510258 AAATTATTATTACCTTTTGTTCTA-TTACAAAACAATTATTT-TTATTCATACAAGCTTATTCAG
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAA
* * * * * *
15510321 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** ** * * * * * * * * *
15510385 ATGTTTA-TCGAACTTGACCAAATAATCATGACTGTGTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTAT
193 CTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * * *
15510449 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCAGT-TCATATAA--GATTACTCAAAATAAAATA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT-A-ATAATTCATTAC-CATAAT-AAA-A
* * * *
15510511 ATAGTAATCTAGTAATA-ATCAAAAAATTAATAA-TAAAGAGAA-TT
317 ATATTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-A-AATTT
* * * ** * * * *
15510555 AAAAAATGAATCTGTGTATTGAACAAGTTAAAATAATTATGACTATGT-GAACAATTATCTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
15510619 GAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTC-TAT-ATAGACAAGCATATTTC
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATA-A-AAGCTTA-TTC
* * * *
15510682 -GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
127 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * **
15510744 AATCT-TTTAGC-GAACAAGTTTAAATCGATATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAATTTGT
190 AATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCAT
* ** * * * ** * * *
15510807 TATGATTTTTTGTTTTTTCGTAAAACAACTACTTCTATTCAT-ACAATT--TTATTCA-AATTAA
254 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT-ATAATAATTCATTA-CCATAA-T-A
* * * * *
15510868 AATAATACTAATTTATTAATACTTT-GACAATTAATAAGTAAAAGATTT
314 AA-AATATTAATTTAATAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * * *
15510916 AAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTTCCAATAGTCATGACTATTTGAATACTTATCTATTTG
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
15510981 AAATCGTTATGATCTTTTGTTTTG-CTATAAAATAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTATTCGA
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTC-ATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAA
* ** * ** *
15511044 AATATAATAATACTAATTTATTATTATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATC
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * ** * *
15511109 TATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTAATT
194 TGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * * * * * * *
15511173 ACATTTTGATTCGTCACAAAACAATTGTTTTGATTCATAA-AA--AATTACTCAAAATAAAATAA
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGT-ATAATAATTCATTAC-CATAAT-AAA-AA
* * * **
15511235 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGCTTT
318 TATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * * * * *
15511274 AAAAACTAAATCTATTAACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACACTTATCTATCTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * **
15511339 AAATCGTTCTGATC-TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTT-GTAGCCATACAAA-CTTATTTGA
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATA-AAAGCTTATTCAA
* * * * * * * * * * *
15511401 AGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTGAAAAATTAATA
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
15511466 TGTTT-GTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
194 TGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * * * *
15511530 ACCTTTTGTTTAGTCAT------A-TGCTT-A-T-TCA-AA---A--A--A-AA-AATAATACTA
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATAATTCATTACCATAATAAAAATATTA
* * * * * **
15511575 TTTTATTAA-CTTTCAGAAAATTAGTAAGCATGAAATTT
323 ATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** ** * *
15511613 AAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTT
1 -AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * *
15511678 AAAATC-ATATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTATTTCA-ATTCATAAAAGCTTATCCA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCA
* * * * * ** *
15511740 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAA
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
15511804 TCAGTTTAACGAATCCA-TACAAATAATTATG-CTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
192 TCTGTTT-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT
* ** ***
15511867 ATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCAT-ACAAGCCTATT--TGGAATAA
255 AT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGT-ATAATAATTC-ATTACCATAATAA
* * *
15511927 AAAAACTAA-TTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTT
315 AAATATTAATTTAA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* ** * * * * * *
15511972 AAAAAAGAAATATT-TTTACTAAACCAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTT
1 AAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
15512036 CAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTAAGT-TCATATAAGCTTGTTCAA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCAA
* * * * *
15512100 AATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-ATGAAAATTAAT-AGCTAAGAGAATTAAAAAATAAA
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCA-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * ** * * * * * * *
15512163 TTTGTTTAGTGAACAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * ** ** ** *** *
15512228 GACCTTTTGTTGTATCATAAAACAAACGTTTTTGT-TCATATAAGTTTGTTTGGAATAA-AATAA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT-A-ATAA--TTCATTACCATAATAAAAA
* * *
15512291 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAAAGATTT
318 TATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * *
15512330 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATA-ACAATTTGAATAA-TATTTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * * **
15512393 TAAATTGTTATGACCATTTGTTTTA-TTACAAAACAATTGTTTC-TATTCGTACAAGCTAATTTG
65 CAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCA
* * * * * *
15512456 AAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTC-TAAAA--AATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAAT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** * **
15512518 ATGTTTA-TCAAATAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCGCTAT
193 CTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * * * * * * * *
15512582 AACCTTTTATTTTGTTATAAAATAAATTCTTTTATTCATACA-AGCTT-ATTTCAATTAA-AATA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCAGT-ATA-ATA-ATTCATTACCA-TAATAAAA
* * ** *
15512644 ATATAAATTTATTAATA-TTCAAACAACAAATAAGTAAAAGATTT
317 ATATTAATTTAATAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * *
15512688 AAAAAATTAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATT
1 AAAAAA-TAAATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATT
** * * * * * *
15512752 GGAAATCATTATAACTTTTTGATTT-GTCATCAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTC
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTC
* * * * * * *
15512815 AGATTAAAATAATATTAATTTACTAATATTTC-AACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * *
15512878 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
191 ATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA
* * * * * * ** ** * **
15512943 TGACTTTTTGTTTCGTCATCAAACAATTGTATCAAT-TAATATAGGC-TT--GTTAA-AATAGCA
256 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATA-ATTCATTACCATAATAAAAATA
* * * * * * *
15513003 CTAATTGATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTT
320 TTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * *
15513044 AAAATATGAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-ATACTATTTGAACAATTATCTATTTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
15513108 AAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTC-TAAAAATAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTACTT-T
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCAT-AAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTA-TTCA
* * * * * *
15513170 GAATAAAATAATA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAA
128 AAATAAAATAATACTAA-TTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * **
15513233 TTTGTTT--T-------TT----TA---A-CAC-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTAT
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * ** * * **
15513280 GACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCAT-ACAA-GCGTATT-TGA-AATAAAAA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATAATAATTC--ATTACCATAAT-AAAA
* * * * *
15513341 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTT
317 ATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** * * * * *
15513385 AAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTATCATTGTTTGAATAATTATTTATTTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * ** * * * * *
15513450 AAATAGTTATTATATTTTGTTTTA-TCATAAAGCAACTATTTC-TATTCATACAAGTTTATTCAG
66 AAATCGTTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAA
* ** * ** * *
15513513 AATAAAATAATACTAAATTAAAAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATC
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
15513578 TATTTA-TCGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGATTATA
194 TGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * * ** *
15513642 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATT-ATTTAGAATAA-AATAAT
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT-ATA-ATAATTCA-TTACCATAATAAAAAT
* * * *
15513705 ATTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTT
319 ATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * *
15513743 -AAAAATAAATCTGTTTACTGAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCG-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * ***
15513806 CAAATCGTTATGATCTTTAT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGTTTATTTGG
65 CAAATCGTTATAACCTTT-TGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAA
* * * * * *
15513868 ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATG
129 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * *
15513933 TATTTGCCAAACTAGTTGAAATAGTTAAGAGTA-TTGAACAA-TATTTTATTTTAAATCATTCTA
194 TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTAAAATCATTATA
* * * * * * *
15513996 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTCCAGTTCATACA-AGCTT-ATTTACAATAA-AATAA
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATA-ATA-ATTCA-TTACCATAATAAAAA
* * * * * * *
15514058 TACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTT
318 TATTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* ** * * * * ** * *
15514101 AAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAATTAATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATAT
1 -AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
15514165 -AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGT-TAATAAAAACTTATAT-
65 CAAA-TCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTAT-TC
* * * ** ** * *
15514227 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAAAAACTAAA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * * *
15514292 GCTATTTTTTGAACCAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTAT
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
** * * * * ** *
15514357 --GGTATTT-TTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTG-ATCATACAAGCA-TATTCA-AATGAAAGT
257 AACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATA-ATTCATTA-CCATAAT-AAA--
* *
15514416 AATACTAATTT-ATAATATTAT-AAAAATTAATAAG----AGATTT
316 AATATTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * ** * *
15514456 ACAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAATTTAAATAATTAAGACTATTTTAATAATTATCTATTTG
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * **
15514521 AAATCGTT-TGGA-CTTATTATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGT-TTATACAAGCTTATTTG
66 AAATCGTTAT-AACCTT-TTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCA-TATCATAAAAGCTTATTCA
* * * *
15514583 GAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAATATTAATAAGAAAGAGATTTGAAAAAATAAA
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAA
* ** * ** * **
15514648 TCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTAT
192 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * *
15514713 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAA-AA-GC-TTATCCAAAATAAAATA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG--TATAATAATTCATTA-CCATAAT-AAA-A
* * * *
15514775 ATACTACA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
317 ATATTA-ATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * * * * * *
15514819 AAAAAATAAATTAGTTTACAGAA-TCAATTCAAATAATTATGACCTCTT-GAACAACTATCCATT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGA-CTATTAGAACAATTATCTATT
* * * * *
15514882 TCAAAAT-GTTATTACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCA-A-CATATAAGCTTATTC
64 TC-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA-TTATTTCATATCATAAAAGCTTATTC
* * * * * *
15514944 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAGAATTAACAAG--AGACA--TAAACAATAA
127 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * **
15515004 ATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
191 ATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTAAAATCATT
* * * * * * ***
15515069 ATAAACTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACA-AGCTT-ATTTGGAATAA-AA
255 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-T-ATA-ATA-ATTCA-TTACCATAATAA
* * * * * *
15515131 TAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAA-TTAAGAATTT
315 AAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** * * * * *
15515176 TAAAAATAAATTCGTTTATTGAACCAGTTCAAACAGTTGAGACTA-TATGAATAATTATTTATTT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTT
* ** * ** * **
15515240 CAAATTGTTAGGACCTTTTGTTT-TTCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGA
65 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAA
** * * * * *
15515304 ATAGGATAAAACTAATTTATTAACATTTC-TAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTT
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
15515368 TATTTA-TCGAACCATTTCAAATA---AT---TA--T-----A--A-CTATTTCAAATCATTATA
194 TGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * * * * ** * *
15515416 ACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATCGCTTCAGT-TCATATAAGTTTATT-TGA-AGTAAAATAC
258 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT-A-ATAA-TTCATTACCATAATAAAA-AT
* * * *
15515478 ACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAA-TT
319 ATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-AATTT
* * * * * *
15515520 AAAAAA-AGAATCTATTGACC-AAATAATTTCAAATAGTTATGACTACTT-GAACAATTATCTAT
1 AAAAAATA-AATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTAT
* * * * * * * ** * *
15515582 TTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTAT-TTATGCAAGTTTATTT
63 TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-ATTTCATATCATAAAAGCTTATTC
** * * * * *
15515646 TGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAATA
127 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATA
* * * * *
15515708 AATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-CAT
190 AATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCAT
* * * * ** **
15515772 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TCCATGCAAGTTTATTTTGAAAAAAAT
254 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGT--AT--AA---TA-ATTCATTACCAT
* *
15515836 AATATAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAA-TT
310 -A-ATAAA------AATATT----AATTTAATAA-TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * ** * * *
15515898 AACAAAATAAATTTATTTTCTAAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
1 AA-AAAATAAATTTGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATT
* * * * * ** * * *
15515962 TCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT--TATCCATGCAGGTTTATTT
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-ATTTCATAT-CATAAAAGCTTATTC
** * * * * *
15516025 TGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAATA
127 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATA
* * * * * * ** *
15516087 AATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTA
190 AATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT
* * * * * * ** *
15516152 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGT-TCGTACAATCTTATTTAGAATAA-AAT
255 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTAT--AATAAT-TCA-TTACCATAATAAA
* * * * **
15516215 AATACTAATTT-AT-TTATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTT
316 AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* * * *
15516258 AAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGT-GAACAATTATTTATT
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATT
* * * *** * ** * * * *
15516321 TCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAAAAAGAAAAGTATTGTTTC-TATTCATACAAGTTTATTCG
64 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCA
* * * * * * ** * * *
15516385 GAATAAAATAATACAAATTTATTAATACT-AGAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAGTAAAG
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
*** * * * * * * * * ***
15516448 CCACTTACTGAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATG
193 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-
* * * * * ** *
15516513 AA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATACAAAATT-ATTTAGAATAA-AATAA
257 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGT-ATA-ATAATTCA-TTACCATAATAAAAA
* * * *
15516575 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTT
318 TATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
* *** ** * * * * * * * * *
15516614 AAAAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAACCTATCTC
1 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * ** *
15516679 ATATCATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATAAAAGCTTATTTGAT
66 AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATA-TCATAAAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
15516742 ATAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAA
130 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
15516799 TAATACTAAT
Statistics
Matches: 14375, Mismatches: 3467, Indels: 2795
0.70 0.17 0.14
Matches are distributed among these distances:
325 17 0.00
326 5 0.00
327 12 0.00
328 67 0.00
329 23 0.00
330 10 0.00
331 15 0.00
332 27 0.00
333 102 0.01
334 10 0.00
335 79 0.01
336 192 0.01
337 40 0.00
338 27 0.00
339 66 0.00
340 254 0.02
341 108 0.01
342 113 0.01
343 79 0.01
344 305 0.02
345 97 0.01
346 118 0.01
347 98 0.01
348 31 0.00
349 78 0.01
350 291 0.02
351 118 0.01
352 71 0.00
353 224 0.02
354 511 0.04
355 395 0.03
356 715 0.05
357 1046 0.07
358 1214 0.08
359 1100 0.08
360 1128 0.08
361 1150 0.08
362 1288 0.09
363 762 0.05
364 275 0.02
365 221 0.02
366 468 0.03
367 88 0.01
368 10 0.00
369 18 0.00
370 11 0.00
371 17 0.00
372 12 0.00
373 25 0.00
374 25 0.00
375 25 0.00
376 26 0.00
377 53 0.00
378 60 0.00
379 279 0.02
380 66 0.00
381 16 0.00
382 7 0.00
383 83 0.01
384 20 0.00
385 10 0.00
386 10 0.00
387 13 0.00
388 10 0.00
389 6 0.00
390 17 0.00
391 11 0.00
392 15 0.00
393 33 0.00
394 25 0.00
395 5 0.00
396 1 0.00
397 1 0.00
398 4 0.00
399 6 0.00
400 3 0.00
401 11 0.00
402 12 0.00
403 10 0.00
404 15 0.00
405 20 0.00
406 9 0.00
407 19 0.00
408 20 0.00
409 19 0.00
410 9 0.00
411 22 0.00
412 10 0.00
413 19 0.00
414 17 0.00
415 12 0.00
416 19 0.00
417 19 0.00
418 81 0.01
419 10 0.00
420 6 0.00
421 10 0.00
422 2 0.00
423 10 0.00
424 11 0.00
425 15 0.00
426 7 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
AAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCATATCATAAAAGCTTATTCAAAA
TAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTATAATAATTCATTACCATAATAAAAATATTAATT
TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
Found at i:15499685 original size:64 final size:67
Alignment explanation
Indices: 15499611--15499745 Score: 188
Period size: 64 Copynumber: 2.1 Consensus size: 67
15499601 TATCCATTTC
* *
15499611 AAATTGTTATTATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTC-GACAT-CAAGCTTA-TT-AA
1 AAATTATTATTACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCAG-CATACAAGCTTATTTGAA
15499672 ATA
65 ATA
** *
15499675 AAATTATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAGCATACAAGCTTATTTGAAA
1 AAATTATTATTACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCAGCATACAAGCTTATTTGAAA
15499740 TA
66 TA
15499742 AAAT
1 AAAT
15499746 AATATTTATT
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 5, Indels: 5
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
64 42 0.68
65 9 0.15
66 2 0.03
67 9 0.15
ACGTcount: A:0.36, C:0.12, G:0.07, T:0.44
Consensus pattern (67 bp):
AAATTATTATTACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCAGCATACAAGCTTATTTGAAA
TA
Found at i:15499887 original size:237 final size:238
Alignment explanation
Indices: 15499449--15499890 Score: 513
Period size: 237 Copynumber: 1.9 Consensus size: 238
15499439 TCGTTATGAA
*
15499449 CTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGCTCCTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA
1 CTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGC-CATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA
*
15499514 CTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAATCACTTTACCAAATCAGATCAAA
65 CTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAATCACTTTACCAAACCAGATCAAA
* * ***
15499579 TAATTATGGCCATTCTAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTATCTTTCATTTTGTCATAAAAC
130 TAATTATGACCATTCTAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTAACTTTCATTCCATCATAAAAC
15499644 AATTATTTTTCGACATCAAGCTTATTAAATAAAATTATTATTAC
195 AATTATTTTTCGACATCAAGCTTATTAAATAAAATTATTATTAC
* * * ***
15499688 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAG-CATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT-A-A-T
1 CTTTTGCTTTATCATAAAACAATTG--TTTCAGCCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT
* * * * * *
15499749 A-TTTATTAATATTTCAAGAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAACCAGTT
64 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAA-AAATCA-CTTTACCAAACCAGAT
* * * * * **
15499812 CAAATAGTTTTGACTATT-TGAATAATTATCCATTTTAAATTGTTA-TAACGTTTTGTTCCATCA
126 CAAATAATTATGACCATTCT-AACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTAAC-TTTCATTCCATCA
*
15499875 TAAAATAATTATTTTT
189 TAAAACAATTATTTTT
15499891 GTGCATACAA
Statistics
Matches: 169, Mismatches: 27, Indels: 16
0.80 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
235 31 0.18
236 12 0.07
237 76 0.45
238 1 0.01
239 43 0.25
241 6 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (238 bp):
CTTTTGCTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGCCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAC
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAATCACTTTACCAAACCAGATCAAAT
AATTATGACCATTCTAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTAACTTTCATTCCATCATAAAACA
ATTATTTTTCGACATCAAGCTTATTAAATAAAATTATTATTAC
Found at i:15501512 original size:22 final size:23
Alignment explanation
Indices: 15501460--15501511 Score: 86
Period size: 23 Copynumber: 2.3 Consensus size: 23
15501450 AGAATAATTA
**
15501460 TTTTTTTAAAATTGTTTTGACCT
1 TTTTTTTAAAATCATTTTGACCT
15501483 TTTTTTTAAAATCATTTTGACCT
1 TTTTTTTAAAATCATTTTGACCT
15501506 TTTTTT
1 TTTTTT
15501512 AGTCATAAAA
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 2, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 27 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.10, G:0.06, T:0.63
Consensus pattern (23 bp):
TTTTTTTAAAATCATTTTGACCT
Found at i:15502294 original size:169 final size:163
Alignment explanation
Indices: 15502011--15502321 Score: 410
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 163
15502001 AATTATGGCC
**
15502011 ATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTATAAAAATTTTTCATCATA
1 ATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTATAAAAATTTTTCATCATA
** * * * * * *
15502076 CACGCCTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
66 CAAACCTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATT
15502141 TAAAAAATAAATCTATGTACCAAACTAGTTCCT
131 TAAAAAATAAATCTATGTACCAAACTAGTTCCT
*
15502174 ATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTCTGTTGTA-AAATAATTGTTTC
1 ATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTG-T-T-TTGTATAAA-AATT-TTTC
* *
15502237 AATTCATACAAACTTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACT
60 -A-TCATACAAACCTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACT
*
15502302 AAAAAATTTTAAAAATAAAT
123 AAAAAATTTAAAAAATAAAT
15502322 TTGTTTGTCA
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 14, Indels: 10
0.84 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
162 3 0.02
163 33 0.26
164 1 0.01
165 4 0.03
166 9 0.07
167 4 0.03
168 1 0.01
169 71 0.56
ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.05, T:0.39
Consensus pattern (163 bp):
ATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTATAAAAATTTTTCATCATA
CAAACCTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATT
TAAAAAATAAATCTATGTACCAAACTAGTTCCT
Found at i:15505174 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 15504950--15516786 Score: 3343
Period size: 181 Copynumber: 66.0 Consensus size: 177
15504940 TAGATATTTT
* ** * * *
15504950 AAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAGCAATTTTTTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAA-CAATTATTTATTTCAA
* * * * * * *
15505015 ATTGTTGTGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAGATTA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAATA
* * *
15505080 AAATAATACTGACTTACTAATATTTTAATAATTAATAAGTAAAAATTTTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGTAAAAA-TTTAA
* * * ** * *
15505131 AAACTAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * *
15505196 ATGGTTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAAAAATTATTT-TAGTTCCTATAAGCTTATT-GAAAA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTAGAATA
* * * * * *
15505259 AAATAAGACTAAGTTATTAATATTATGAAAATTAGTAATTAAGAGATTTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * * * * * * *
15505310 AAAATGAATCTGTTTACTGAA-TAAGTTTAATTAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCA
** * * * * * *
15505374 AATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTTCTGTTCGTACAAGCCTATTTT
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-A---ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTA
* * *** *
15505439 GGATAAAATAATACAAATTTATTAATA-AAAAGATAATTAATAAGTAAAAA-ATATA
124 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-A-AATTAATAAGTAAAAATTTA-A
* * * * * * * *
15505494 AAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATATTTATGACTATATAAATAATTATTTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAA
* * * * *
15505559 ATTGTTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TCATTCATACAAGCTTA-TACGGAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTA--GAA
* * *
15505622 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGT-AAAAATTTAA
* * * * * * *
15505675 AAAATAAATATGTTTTTTGAACAAATTC-CA-AGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * **
15505738 ATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA-TATTTTAGTT-GAAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAG-AAT
* * * *
15505801 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATTGAGTAAAAGAATTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* ** ** *
15505853 AAAATAAATCTATTTATAAAAAAATGTTCAAATAGTTC-TGATTATTTGAAC-ATATATTTATTT
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTA-GTTCAAATAG-TCATGACTATTT-AACAAT-TATTTATTT
* * ** * * * *
15505916 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGAAAT-AAATCAATGGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTAG
62 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAG
* * *
15505980 AATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
125 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
** *
15506035 AAAATAAATCTGTTTA-CCAATCGAGTTCAAATAG-CTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAA-CTAGTTCAAATAGTC-ATGACTATTT-AACAATTATTTATTTC
** * * * * * *
15506098 AAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AA
* * * ** * *
15506163 TAAAATAATACTAACTTATTGATATTCTAAATATTAATAAGTTGGAGATATAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA-ATTAATAAG-TAAAAATTTAA
* * ** * ** * * * *
15506216 GAAATAAGTCTAG-ACATCGAACTAGTTCAAA-AAACTATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTC
1 AAAATAAATCT-GTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTC-ATGACTATTT-AACAATTATTTATTTC
* * * * * **
15506279 AAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAA-AGTATTGCATT-TATTCATACAAAATTATTTA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA--ATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTA
* *
15506342 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
124 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * * * * * * *
15506394 GAACTAAATTTGTTTATCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATCTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * ** * ** *
15506459 A-TGTTATGATC-TTTATTTTATCATACAA-GCTT-ATTC-G-AAATA-AA--ATATT-G--T--
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGAATAA
* * *
15506510 --TAA-ATTAA--TAAT-AT-TTTAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAA
130 AATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* ** * * * * *
15506552 AAAATAAATATGTTTGCTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAGCAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAA-CAATTATTTATTTCAA
** * * * * ** * *
15506617 ATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACATAAC-TATTCGAAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACA-AGCTTATTAG-AAT
** *** ** *
15506681 AAAATAATACTAATTTATTAGCACTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTTA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTTAAAATTAATAAGTAA-AAA-TTTAA
* * * *
15506734 AAAATAAATC-GATTTACT-AAATAAGTTCAAATAGTTATGAC-ATTTAAACAATTATTTATTTA
1 AAAATAAATCTG-TTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTC
*** * * **
15506796 AAATAACTATGACC-TTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTT-TAGTTCATAAAATTTTATCT-GA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTAT-TAG-
* * * * * *
15506857 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTT-A
125 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAA
* * * * * * * * * *
15506911 AAAATAAGTCAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
** ** * * ** * *
15506976 ATCATTATGAATTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAATA
* * * ***
15507041 AAATAATATTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAGGCGATTTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAA
* ** * * * *
15507091 AAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTC-------C-TG--T-TTGAACAATTATTTAATTCTAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAA
* * * * * *
15507145 TTGTTATAACCTTTTGTTCTATTTC-TAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTTGAAAT
66 TTGTTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AAT
* * *
15507209 AAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* * * * * * * * * * *
15507261 AAAATAAATCTATTTATCGAAGTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCTA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAA
* ** * * ** * *
15507326 ATCGTTATGACCTTTCATTTTGGCATAAAACAATTGTTTCAATTCTTACAAGCTTATTTGCAATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AATA
** * *
15507391 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGT---GATTTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* ** * * * * * * *
15507438 AAAGTAAAT-TAGTTTATCAAATTAATTCAAATAATTATGGCTATATCAACAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATCT-GTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCA
* * * * * ** * * *
15507502 AATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TGATATT-TGAACATTCAATCTTATTCGAA
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-T-TTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-A
* * * *
15507565 ATAAAAGAATACTAATTTATTAATCTTTGAAAAATTAATAAGTAAAAGCTTT-A
126 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* *** * * * * *
15507618 AAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTT-TAA-A-T-A-GACTATTTGAACAATTGTATAATTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * *
15507678 ATTGTTATAACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TCGTTCATATAAG-TCTATTCGTA
65 ATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCT-TATTAG-A
* * ** *
15507741 ATAAAATAATACTAATCTAATAATATTACAACAATTAATAACTAAGAGAA-TT-A
126 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGTAA-A-AATTTAA
* * * * * * * * ** *
15507794 AAAATAATTTTGTTTGTCGAACTATTTCAAATATTTAAGACCGTA-AGAACAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGA-C-TATTTAACAATTATTTATTTCA
*** * * ** * **
15507858 AAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATATTAA-CTTAATCGGAA
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATA-CAAGCTT-ATTAGAA
* * * * *
15507922 TAAAATAAAACAAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAA-TAATAGATTTTAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAAT-AAGTAA-A-AATTTAA
* * * * * * * * * *
15507976 AAAATAATTTTGTTTACTT-AACCAATTCAAACAATTATAACTATTTAAACAATTATCTACTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTA-TTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCA
* * * * * * *
15508040 AATTGTTATGACCTTTTATTTTGTTAGAAAACAAATT-TTT-T-TT-ATATAAGTTTGTTTAGAA
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTAGAA
* * * * *
15508101 TAAAGTAATACTAGTCTATTAATATTTCTAAAACTAATAAG---AGATTTAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * ** * * * *
15508150 AAAATAAATCTATTAATCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGACAAATTATTTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAC-AATTATTTATTTCAA
** * ** ** * * * * * * * *
15508215 ATCATTATAATTTTTTGTTTAATTATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAACTTATTCGGATTA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAATA
* * * ** *
15508280 AAATAATATTAATTTATTAACATTTTGATAATTGCTAA-AAAAAATTTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * * * * * * *
15508329 AATAA-AAGGTTTTGTCATAATGTAA-TTGTTTC---TATTCAT-ACAAAATTAATCAAAATAAA
1 AA-AATAA--ATCTGT-TTATTG-AACTAG-TTCAAATAGTCATGAC-TATTTAA-C--AATTAT
* * * * * * * * * *
15508388 ATAATACTAATTTATTAAT-A--TTTTAAAAATTAGTAAGAATCTTAAAAACTAAATCTATT-T-
56 TTATTTC-AAATTGTT-ATGACCTTTT----GTT--T-TG--TCAT-AAAA-TAATTGT-TTCTG
* ** * * *** * * * * * **
15508448 ATCGGACCAG-TTCAATTAG-TTATGCTTAT-GTGAA-TAATTAACTA-TCTCAAATTGTTAAGA
107 TTCATACAAGCTT--ATTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA-TATTTTAAAATTAATAAG-
***** *
15508508 TCTTTGTTTTGTCAT
167 --TAAAAATT-T-AA
* * * *
15508523 AAAATAATTATTTATGTTCATAT-AAGCTTA-TTCAAAGTAAAAT-ATTG-CTAAATTAATAAAA
1 AAAATAA--A--TCTGTTTAT-TGAA-C-TAGTTCAAA-T--AGTCA-TGACT--ATT--TAACA
* ** * ** * * ** * * * * **
15508584 GATAAACATGTTTGCCAAACCAAGTCAAAT-A-GTTAAGACTAT-T-AGAACAATGATCCATTTC
51 -AT-TATTTATTT--CAAA--TTGT--TATGACCTTTTG-TTTTGTCATAA-AATAAT-TGTTTC
*** * ** * * ** * *
15508645 AAATCATTCTGACATTTTGTTTAGCCATAAAATAAT--TGTTTTAGTTCATATATGCTT--ATTT
105 TGTTCATAC--A-AGCTT-ATTAG-AATAAAATAATACTAATTTA-TT-A-ATAT-TTTAAAATT
*
15508706 GA-AA-T-AAAA---AA
161 AATAAGTAAAAATTTAA
* * * ** * * * *
15508717 AAAATACTAATTTGTTAAGATTCAGAA--ACTT--AATAAACAAGAAATTTTATAAAATAAATCT
1 AAAATA--AATCTGTT--TATT--GAACTAGTTCAAATAGTCATG-ACTATT-T--AA-CAAT-T
* *** *
15508778 ATTTATTGAACAAGTGCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAATATCTATTTAAAA-AATATGAC
54 ATTTATT-------T-CAAATTGTTATGACCT-TTTG---TTTTGTC-A--TAAAATAAT-TG--
* * * *
15508841 TTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTGAGCTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATATTA
101 TTTCTG---T-T--C-ATAC-A-------AGCT--T-AT----TA---G-AATAAAATAATACTA
* * * *
15508906 CTATATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAAAAATTTAA
140 ATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAA
** * * * * * * * * *
15508946 AAAATAGGTC-ATTTA-TCAAGTTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTTAATAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAA-CTAGTTCAAATAGTCATGACTA-TTTAACAATTATTTATTTCA
* * * * * * ** *
15509009 AATAG--ATGCAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCAGA
64 AATTGTTATG--ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGA
* * * *
15509072 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAGTAAGTACGAGATTTAA
126 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--TAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAA
* *** * * *
15509127 AAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTC-------C-T-A-T-TTGAACAATTATCTATTTCAAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAA
** ** * * * * ** **
15509181 TCATTAAAATCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCTTATTAGTAATAA
66 TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AATAA
* ** * ** *
15509246 AATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAACCAAGAGATTTAA
130 AATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* **** * * *
15509296 AAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTC
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAA-CTAGTTCAAATAG-TCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTC
** * * * * *
15509359 AAATCATCATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AA
* ** * **
15509424 TAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGATTTAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * ** * * * * * * * *
15509477 AAAGTGAATCTGTTTA-CCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCAATAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCA
* * * * * ** * *
15509541 AATTGTTATTATCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATT-TGAACATTCAAGCTTATTCAAAA
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAA
* * * * * **
15509605 TAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTTTT
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAA
* * * * * **
15509659 TAAA-AAATCTATTTATTGAACTAGTTCAAATTG-CTATGACTATTTGAACGATTGTAAATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTC-ATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCA
* * * * * * * * *
15509722 AATTGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATCAAAAT
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTAGAAT
* ** * * *
15509787 AAAATAATACTAATCTAAAAATATTTCAAAAATTAATAATTAGTAGAA-TTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTA--AAAATTTAA
* ** * * * * * * * *
15509839 AAAATAAATTTGTTTGCCT-AAC-ATGCTCAAATATTTAAAGACTATATGAACAACTA-TCAATT
1 AAAATAAATCTGTTT-ATTGAACTA-GTTCAAATA-GTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTT
* * * * *
15509901 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-ATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTT
62 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTCTG--TTCATACAAGCTTA-TT
* * * * * * *
15509965 GGAATAAAATAAAACAAATTTATAAATATTTAAAAAATTAATAAG--AGATTTTAA
123 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * * * * ** *
15510019 AAAATAATTTTGTTTACCT-AAC-CGTTCAAATAATTATGAATATTTGATTAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTA-TTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCA
*** * * * * * * * *
15510082 AATCACTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAA-A
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGAATA
*
15510146 CAAAGTAATACTAATCTT-TTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
129 -AAA-TAATACTAAT-TTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* ** * ** * *
15510195 AAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAGTTATTTATTTTAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * * * * *
15510260 ATTATTATTACCTTTTGTTCTATTACAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGATTA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAATA
* *
15510325 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGT-AAAAATTTAA
* * * ** * * * *
15510376 AAAATAAATATGTTTATCGAACTTGACCAAATAATCATGACTGTGTAAATAATTATTTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * *
15510441 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCAGTTCATATAAGATTACTCAAAATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAATA
* * * *** *
15510506 AAATAATAGTAATCTAGTAATAATCAAAAAATTAATAA-TAAAGAGAATTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTTAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAA
* * * * * * * * *
15510557 AAAATGAATCTGTGTATTGAACAAGTTAAAATAATTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTGAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * * *
15510622 ATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTCTATAT-AGACAAGCATATTTCGAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTA-TTAGAAT
*
15510686 AAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
128 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
** * * * *
15510738 AAAATAAATCT-TTTAGCGAACAAGTTTAAATCGAT-ATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAG-TCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCA
* ** * * * * ** * **
15510801 ATTTGTTATGATTTTTTGTTTTTTCGTAAAACAACTACTTCTATTCATACAATTTTATTCA-AAT
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAA-
* *
15510865 TAAAATAATACTAATTTATTAATACTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* ** * * * * * *
15510918 AAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTTCCAATAGTCATGACTATTTGAATACTTATCTATTTGAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * *
15510983 ATCGTTATGATCTTTTGTTTTG-CTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AAT
* * * ** *
15511047 ATAATAATACTAATTTATTATTATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAA
* * * * * * * * *
15511099 AAAATATATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * * ** * *
15511164 ATTGTAATTACATTTTGATTCGTCACAAAACAATTGTTT-TGATTCATAAAAAATTACTCAAAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTG-TTCATACAAGCTTA-TTAGAAT
* * **
15511228 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG---AGCTTTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * *** * * * * * *
15511276 AAACTAAATCTATTAACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACACTTATCTATCTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * * *
15511341 ATCGTTCTGATC-TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTGTAG-CCATACAAACTTATTTGAAGT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTAGAA-T
* * * * * * * *
15511404 AAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTGA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * * ** * * * ** * *
15511456 AAAATTAATATGTTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTA-TTTAACAATTATTTATTTCAA
** * *** * ******** * * **
15511521 ATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATATGCTTATTCAAAAAAAAAATAATACTATTTTATTA-AC
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT---GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGA-
* * * ** * * ****
15511585 TTTCAGAAA-ATTAGTAA-GCATGAA-A-TTTAAAA-AAATAA--ATCTGTTTACCAA
126 -AT-A-AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAAAATTT---AA
* * * * * * *
15511636 AAAAGTTCAAAT-AG-TT-TTG-ACTATTTGAACA-A-TTAT--TTATTTAA-AATCATATGACC
1 AAAA--T-AAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAA-ATAGTCATGACTATTTAACAATTAT-TTA--
**** * * * * ** * *
15511692 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAAT-TCAT--AA-AA--G---C--TT-ATCCAA----
59 TTTCAAATTGTTAT-GACCTTTTGTTT---TGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
* * * * * * *** * * ** ** *
15511741 AATA-AA-ATAATATTACT-TTATTAAT-ATTTCAAAAATTGAGA-AGTTGGAGATTTAA
120 ATTAGAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTTAAAATTA-ATAAGTAAAAATTTAA
* * ** * * * * * *
15511796 AAAGTAAATCAGTTTAACGAATCCA-TACAAATAATTATG-CTCATTTGAATAATTATCTATTTC
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAA-CTAGTTCAAATAGTCATGACT-ATTT-AACAATTATTTATTTC
** * * * ** * *
15511859 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAA
* * *
15511924 TAAAA-AA-ACTAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * * * * * * *
15511974 AAAAGAAATATTTTTACTAAACCAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * ** * * *
15512039 ATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTAAGTTCATATAAGCTTGTTCAAAATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAATA
* * *
15512104 AAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAAT-AGCTAAGAGAA-TTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAG-TAA-A-AATTTAA
* * * * ** * * * * *
15512155 AAAATAAATTTGTTTAGTGAACAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGT-ATAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTAT-T-TAACAATTATTTATTTCA
* * * * ** * * * * *
15512219 AATCGTTATGACCTTTTGTTGTATCATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAAT
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTAGAAT
* *
15512284 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A--AAAGATTTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* *** * * * * * *
15512332 AAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAA-TATTTATTTTAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * * * *
15512396 ATTGTTATGACCATTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTAATTTGAAATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AATA
* * * *
15512461 ACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAA--AATAAGTAAGATATTTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * * * * * * * ***
15512509 AAACTAAATATGTTTA-TCAAATAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCA
* * * * * * * **
15512573 AATCGCTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAATAAATTCTTT-TATTCATACAAGCTTATTTCAAT
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGAA-
** **
15512637 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAACAACAAATAAGTAAAAGATTTAA
127 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* * * * * **
15512690 AAAATTAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTGG
1 AAAA-TAAATCTGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTC
** * * * * * * * *
15512754 AAATCATTATAACTTTTTGATTTGTCATCAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAT
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAA
* * *
15512819 TAAAATAATATTAATTTACTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTT-A
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* *** * * * * *
15512871 AAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * ** * * * *
15512936 ATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTCATCAAACAATTGTATCAATTAATATAGGC---TT-G-TTAA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGAATAA
** * * * * *
15512996 AATAGCACTAATTGATTAATATTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAA
130 AATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * * * * * *
15513046 AATATGAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
** * * * *
15513110 ATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTC-TAAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTACTTTGAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAT
** * *
15513174 AAAATAATA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAAAATTTTA
128 AAAATAATACTAA-TTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * *
15513225 AAAATAAATTTGTTTTTTTAAC-A---C--AT--T--TGA--A--T---AGTTATCTATTTCAAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAA
* * ** * * * *
15513273 TTTTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCGTATTTGAAATAA
66 TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AATAA
** *
15513338 AA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAA
130 AATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* * * * * * * *
15513387 AAAATAAATTTGTTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTATCATTGTTTGAATAATTATTTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * ** * ** * * * *
15513452 ATAGTTATTATATTTTGTTTTATCATAAAGCAACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAATA
* ** * * * *
15513517 AAATAATACTAAATTAAAAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAA
* * * * * * *
15513568 AAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * **
15513633 A-TGATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAAT
65 ATTG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAT
* * *
15513697 AAAATAATATTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AGATTT-A
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * *
15513744 AAAATAAATCTGTTTACTGAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTG-AACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCA
* * * * * * * *
15513808 AATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGTTTATTTGGATT
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAT
* * *
15513871 AAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * * **** * * * * * *
15513923 AAAGTAAATGTATTTGCCAAACTAGTTGAAATAGTTAAGAGTATTGAACAA-TATTTTATTTTAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAACAATTA-TTTATTTCAA
** * * * * * * *
15513987 ATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTCCAGTTCATACAAGCTTATTTACAATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAATA
* ** * * *
15514052 AAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AA
* * * * * * * * * *
15514104 AAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAATTAAT-TTTACTATTTGAACAATTATCTATAT-AA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
** * * * * *
15514167 AGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATAAAAACTTA-TATGAA
65 A-TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTA-G-A
* * * *
15514230 ATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAA
126 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAG-TAAAAATTTAA
* * * * * * * * ** *
15514284 AAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
** * * * *
15514349 ATCATTATG--GTATTT-TTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAGCATATTCA-AAT
65 ATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAAT
* * * *
15514410 GAAAGTAATACTAATTTA-TAATATTATAAAAATTAATAAG---AGATTTAC
128 -AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* *** * * * * * * * * *
15514458 AAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAATTTAAATAATTAAGACTATTTTAATAATTATCTATTTGAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTA-TTTAACAATTATTTATTTCAA
* * * * * * *
15514523 ATCGTT-TGGA-CTTATTATTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTATTTGGAA
65 ATTGTTAT-GACCTT-TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAA
* **
15514586 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAATATTAATAAG-AAAGAGATTTGAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA-ATTAATAAGTAAA-A-ATTT-AA
* ** * * * ** *
15514640 AAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* * * * *
15514705 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTAT-TAGAAT
* *
15514769 AAAATAATACTACA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
128 AAAATAATACTA-ATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
** * * * * * * **
15514821 AAAATAAAT-TAGTTTACAGAA-TCAATTCAAATAATTATGACCTCTTGAACAACTATCCATTTC
1 AAAATAAATCT-GTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGA-CTATTTAACAATTATTTATTTC
* * * * * *** * *
15514884 AAAATGTTATTACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCAACATATAAGCTTATTCGAAA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAG-AA
* * * *
15514948 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAACAAG-AGACA--TAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * *
15514997 ACAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT--AACAATTATTTATTTCA
* * * * *
15515062 AATTGTTATAAACTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAAT
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAT
* * * * *
15515127 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAATTAAGAATTTTA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * *
15515178 AAAATAAAT-TCGTTTATTGAACCAGTTCAAACAGTTGA-GACTATATGAATAATTATTTATTTC
1 AAAATAAATCT-GTTTATTGAACTAGTTCAAATAG-TCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTC
* * * * * *
15515241 AAATTGTTAGGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAA
** * * * *
15515305 TAGGATAAAACTAATTTATTAACATTTCTAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
* * * * * *
15515358 AAAATAATTTTATTTATCGAACCATTTCAAATA---AT---TA--TAAC-------TATTTCAAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAA
** * * * * * * * * * *
15515408 TCATTATAACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATCGCTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGAAGTAA
66 TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGAA-TAA
* * * *
15515473 AAT-ACACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAA
130 AATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
* * ** * * * * *
15515522 AAAA-AGAATCTATTGA-CCAAATAATTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTC
1 AAAATA-AATCTGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGACTA-TTTAACAATTATTTATTTC
*** * * * * * *
15515585 AAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTTATGCAAGTTTATTTTGA
63 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGA
* ** *
15515649 ATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAATTAA
126 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * * *
15515701 CAAAATAAATTTATTT-TCTAAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
1 -AAAATAAATCTGTTTAT-TGAACTA-GTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTT
*** * * * * * *
15515764 CAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATCCATGCAAGTTTATTTTG
62 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAG
* *
15515828 AAAAAAATAATATAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAATAA-TAA
125 AATAAAAT-A-AT--A----CTAAT-TT------ATTAAT-ATT-TT--AAAA-TTAATAAGTAA
*
15515892 AAAATTAA
170 AAATTTAA
* * * * * *
15515900 CAAAATAAATTTATTT-TCTAAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
1 -AAAATAAATCTGTTTAT-TGAACTA-GTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTT
*** * * * * * * *
15515963 CAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATCCATGCAGGTTTATTTTG
62 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAG
* ** *
15516027 AATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAATTAA
125 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * * *
15516080 CAAAATAAATTTATTT-TCTAAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
1 -AAAATAAATCTGTTTAT-TGAACTA-GTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTT
* ** * *
15516143 CAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTACAATCTTATTTAGA
62 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGA
** * *
15516208 ATAAAATAATACTAATTTATT--TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAA
126 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAA
** * * *
15516260 AAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTCA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTCATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCA
** * **** * * * *
15516324 AATCATTATGATCTTTTGTTTAAAAAGAAAAGT-ATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAA
64 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT-AGAA
* * ** * ** * *
15516388 TAAAATAATACAAATTTATTAATACTAGAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAA
127 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAA
* * *** * * * * * * *
15516439 AAAGTAAAGCCACTTACTGAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAA
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
* ** * * **
15516504 ATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACT-ATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAAT
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTAGAAT
* * *
15516568 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AA--AGAGATTTAA
128 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * ** ** * * * * * * ** * *
15516616 AAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAACCTATCTCAT
1 AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAA
** * * * * * *
15516681 ATCATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGATATA
65 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGA-ATA
* * * *
15516745 AAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
129 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAA
15516787 GAGGTTTAAA
Statistics
Matches: 8821, Mismatches: 2107, Indels: 1458
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
154 13 0.00
155 3 0.00
156 2 0.00
157 11 0.00
158 67 0.01
159 13 0.00
160 30 0.00
161 47 0.01
162 114 0.01
163 23 0.00
164 90 0.01
165 38 0.00
166 13 0.00
167 9 0.00
168 37 0.00
169 107 0.01
170 125 0.01
171 12 0.00
172 8 0.00
173 17 0.00
174 302 0.03
175 136 0.02
176 524 0.06
177 693 0.08
178 525 0.06
179 868 0.10
180 1347 0.15
181 2197 0.25
182 640 0.07
183 128 0.01
184 109 0.01
185 43 0.00
186 3 0.00
187 4 0.00
188 18 0.00
189 21 0.00
190 23 0.00
191 17 0.00
192 18 0.00
193 13 0.00
194 17 0.00
195 16 0.00
196 13 0.00
197 10 0.00
198 14 0.00
199 160 0.02
200 7 0.00
201 6 0.00
202 9 0.00
203 10 0.00
204 15 0.00
205 14 0.00
206 4 0.00
207 12 0.00
208 5 0.00
209 1 0.00
210 3 0.00
211 3 0.00
212 2 0.00
213 11 0.00
214 4 0.00
218 2 0.00
219 1 0.00
220 4 0.00
221 21 0.00
222 10 0.00
223 9 0.00
224 4 0.00
225 2 0.00
226 15 0.00
227 1 0.00
229 8 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
AAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAA
TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTAGAATAAA
ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
Found at i:15505988 original size:360 final size:360
Alignment explanation
Indices: 15504985--15508299 Score: 1103
Period size: 359 Copynumber: 9.3 Consensus size: 360
15504975 TTTAAATAGT
* * * ** * * * * *
15504985 TATGACTATTTAAGCAATTTTTTATTTCAAATTGTTGTGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATT
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT
* * * * * * * * * *
15505050 GTTTCTGTTCATATAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATACTGACTTACTAATATTTTAATAATTA
66 GTTTCTATTCATACAAGTTTAGTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * ** ** * * * *
15505114 ATAAGTAAAAATTTTAAAAACTAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGA
130 ATAAGTAAAAAATATAAAAA-TAAATCTATTTATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATATAA
* * * * * * ** * ** *
15505179 GTAATTATCTATTTAAAATGGTTATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAAAAATTATTTT-AGTTCCT
194 ATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAATAAAATAATGGTTTTCA-TTCAT
* * * * * * * * * * * *
15505243 ATAAGCTTAT--TGAAAAAAATAAGACTAAGTTATTAATATTAT-GAAAATTAGTAATTAAGAGA
258 AAAAGCTTATACAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAAA
* * * * * * *
15505305 TTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAAT-AAGTTTAATTAAT
322 TTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAATCAAATTCAAAT-AC
* * * * * * * *
15505345 TATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAA-CA--
* * * * ** * * * **
15505410 TTTTTTTTCTGTTCGTACAAGCCTATTTTG-GATAAAATAATACAAATTTATTAATA--AAAAGA
63 -ATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-GTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A
** * * *
15505472 TAATTAATAAGTAAAAAATATAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATATTTATGACTA
125 -AATTAATAAGTAAAAAATATAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** *
15505537 TATAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTCAT
189 TATAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAATAAAATAATGGTTTTCAT
* * * * * *
15505602 TCATACAAGCTTATACGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAA
254 TCATAAAAGCTTATACAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* *** *
15505667 AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CAAATTCCAAGT-C
319 AAATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCAATCAAATT-CAAATAC
* * * *
15505709 -ATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT
* *
15505773 GTTTC-AGTTCATA-TATTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
66 GTTTCTA-TTCATACAAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * *
15505836 TTGAGTAAAAGAAT-TAAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAATGTTCAAATAGTTCTGATTATTT
130 ATAAGTAAAA-AATAT-AAAAATAAATCTATTTATAAAAAAA-GTTCAAATAGTTATGACTATAT
*
15505900 GAACAT-A-TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGAAAT-AAATCAATGG-TTTCTA
192 -AA-ATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAATAAAAT-AATGGTTTTC-A
* **
15505961 TTCATAAAAGTTTATTTAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAA
253 TTCATAAAAGCTTATACAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
15506026 AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAATCGAGTTCAAATAGC
318 AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAATCAAATTCAAATA-C
* * * *
15506070 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT
* * * *
15506135 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTGATATTCTAAATATTAA
66 GTTTCTATTCATACAAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
*** * * *** ** ** * ** * * *
15506200 TAAGTTGGAGATATAAGAAATAAGTCTAGACATCGAACTAGTTCAAAAAACTATGTCCATTTAAA
131 TAAGTAAAAAATATAA-AAATAAATCTATTTATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATATAAA
* ** * * * *** * **
15506265 CT-ATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAAAGTATTGCATTT-ATTCA
195 -TAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAAT-AAAA-TAATGGTTTTCATTCA
* ** * * *
15506328 TACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AG
257 TA-AAAGCTTATACAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAA
* * * * * *
15506388 ATTTAAGAACTAAATTTGTTTATCGAA-CCAATTCAAATAGT
321 ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAATCAAATTCAAATA-C
* * * *
15506429 TATGACTGTTTGAACAATTATCTA--TC---TCA--A--A-----TG--TTATGAT----C-TTT
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT
* * * ** * * *
15506473 ATTT-TA-TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATATTGTTAAATTAATAATATTTTAAAAATTA
66 GTTTCTATTCATACAAGTTTAGTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * * * ** *
15506535 ATAAGTAACAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGCT-GAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TA
130 ATAAGTAAAAAATAT-AAAAATAAATCTATTT-ATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATATA
* * * * * * ** *
15506598 AAGCAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAT-TTTTTCAATTC
193 AA-TAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAATAAAATAATGGTTTTC-ATTC
* * ** * **
15506662 ATACATAA-C-TATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA-CTCAAAAAATTAATAAACA
256 ATA-A-AAGCTTATACAG-AATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
15506723 AGAAATTTTTAAAAATAAAT-CGATTTACTAAAT-AAGTTCAAATAGT
317 A-AAAATTTAAAAAATAAATATG-TTTAC-CAATCAAATTCAAATA-C
* * * * *
15506769 TATGAC-ATTTAAACAATTATTTATTTAAAATAACTATGACC-TTTGTTTTATCATAAAA-AATT
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT
* * * *
15506831 GTTT-TAGTTCATAAAATTTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAAT
66 GTTTCTA-TTCATACAAGTTTAGT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * * * * * ** *** * * * *
15506893 TGATAAGTTAGAGATTTAAAAATAAGTC-AGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTT
128 TAATAAGTAAAAAATATAAAAATAAATCTA-TTTATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATAT
* * * * * ** *
15506957 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-TTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-T
192 AAATAATTATTTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTATTTTGAAATAAAATAA-TGGTTTTCATT
* * *** * * * ***
15507020 CATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGTAGGC
255 CATAAAAGCTTATACAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * *
15507084 GATTTAAAAAATAAATTTGTTT----ATCAAA--C---CAG
320 AATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAATCAAATTCAAATAC
* * * * * * ** * * ** *
15507116 T-T-CCTGTTTGAACAATTATTTAATTCTAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTTCTAAAATAAT
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TAATAAAACAAT
* ** * *
15507179 TGTTTC-AGTTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATT
65 TGTTTCTA-TTCATACAAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * ** ** * * * *
15507243 AATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAGTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATG
129 AATAAGTAAAAAATAT-AAAAATAAATCTATTTATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATATA
* * * * ** * * *
15507308 AATAATTATCTATTTCTAATCGTTATGACCTTTCATTTTGGCATAAAACAATTG-TTTCAATTCT
193 AATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAATAAAATAATGGTTTTC-ATTCA
* ** * * * * *
15507372 TACAAGCTTAT-TTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGT----G
257 TAAAAGCTTATACAG-AATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAA
* * * *
15507432 ATTTAAAAAGTAAAT-TAGTTTATCAAAT-TAATTCAAATAAT
321 ATTTAAAAAATAAATAT-GTTTA-CCAATCAAATTCAAAT-AC
* * * * * ** * *
15507473 TATGGCTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-T
1 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT
* * * *
15507537 GATATT-TGA-ACATTCAA-TCTTA-TTCGAAATAAAAGAATACTAATTTATTAATCTT-TGAAA
66 G-T-TTCT-ATTCATACAAGT-TTAGTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAA
** * ** ** *
15507597 AATTAATAAGTAAAAGCTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTT-TAA-A--TA-GACTAT
125 AATTAATAAGTAAAAAATATAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * ** * ** *
15507657 TTGAACAATTGTATAATTCAAATTGTTATAACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTCGT
190 ATAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAAC-CTTTTATTTTGAAATAAAATAATGGTTTTCAT
* * * * * * * * *
15507722 TCATATAAG-TCTATTC-GTAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTACAACAATTAATAACTA
254 TCATAAAAGCT-TATACAG-AATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
15507785 AGAGAA-TT-AAAAATAATTTTGTTTGTCGAA-CTATTTCAAATATT
317 A-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACCAATCAAATTCAAATA-C
* ** * * * *
15507829 TAAGAC-CGTAAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 TATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAAT
* * * * * * * * * *
15507893 TTTTTCAATTCATATTAA-CTTAATCGGAATAAAATAAAACAAAGTTATTAATATT-TCAAAAAT
65 TGTTTCTATTCATA-CAAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * * * * * * ** * * *
15507956 TAATGAA-TAATAGATTTTAAAAAATAATTTTGTTTACTTAACCAA-TTCAAACAATTATAACTA
128 TAAT-AAGTAA-AAAATAT-AAAAATAAATCTATTTA-TAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * ** * *
15508019 TTTAAACAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTTAGAAAACAAAT--TTTT--
189 TATAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAATAAAA-TAATGGTTTTCA
* * * * ** * * * * * * *
15508080 TTTATATAAGTTTGTTTAGAATAAAGTAATACTAGTCTATTAATATTTCTAAAACTAATAAG---
253 TTCATAAAAGCTTATACAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
15508142 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTAATCAAACCAATTCAAATAGT
318 AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAATCAAATTCAAATA-C
* * * ** * *
15508185 TATGACTATTT-GACAAATTATTTATTTCAAATCATTATAATTTTTTGTTTAATTATAAAACAAT
1 TATGACTATTTAAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAAT
* * ** * * *
15508249 TATTTTTATTCATACAAACTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
65 TGTTTCTATTCATACAAGTTTAGTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
15508300 CATTTTGATA
Statistics
Matches: 2280, Mismatches: 507, Indels: 340
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
333 3 0.00
334 6 0.00
335 59 0.03
336 117 0.05
337 5 0.00
338 5 0.00
339 17 0.01
340 35 0.02
341 1 0.00
343 6 0.00
344 2 0.00
345 3 0.00
346 29 0.01
347 28 0.01
348 12 0.01
349 73 0.03
350 126 0.06
351 7 0.00
352 38 0.02
353 75 0.03
354 14 0.01
355 14 0.01
356 227 0.10
357 68 0.03
358 135 0.06
359 315 0.14
360 255 0.11
361 20 0.01
362 138 0.06
363 303 0.13
364 73 0.03
365 63 0.03
366 8 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT
GTTTCTATTCATACAAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
TAAGTAAAAAATATAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATATAAAT
AATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGAAATAAAATAATGGTTTTCATTCATAAA
AGCTTATACAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTA
AAAAATAAATATGTTTACCAATCAAATTCAAATAC
Found at i:15506374 original size:363 final size:359
Alignment explanation
Indices: 15505622--15506483 Score: 874
Period size: 363 Copynumber: 2.4 Consensus size: 359
15505612 TTATACGGAT
* * * *
15505622 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATG
1 TAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
** * * * * *
15505687 TTTTTTGAACAAATTC-CA-AGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTGTGACC
66 -TTTACGAACAAATTCAAATAGT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGATC
* * * * *
15505750 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATATTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAAT
128 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAAC
* * ***
15505815 TTATTAATATTCTAAAAATTATTGAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATAAAAAAATGT
193 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTAGACATAAAAAAATGT
* ** * * * * * *
15505880 TCAAATAGTTCTGATTATTTGAACATATATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGAAAT
258 TCAAAAAACTATGATCATTTAAACATATATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGAAAT
** *
15505945 AAATCAATGGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTAGAA
323 AAATCAATGCATTCTATTCATAAAAGATTATTTAGAA
* *
15505982 TAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 TAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * *
15506047 TTTACCAATCGAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATC
66 TTTACGAA-CAAATTCAAATAG-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGATC
*
15506112 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
128 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTA
* * *** * * ** **
15506176 ACTTATTGATATTCTAAATATTAATAAGTTGGAG-ATATAAGAAATAAGTCTAGACATCGAACTA
191 ACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGAAT-TAAAAAATAAATCTAGACATAAAAAAA
* *
15506240 -GTTCAAAAAACTATG-TCCATTTAAAC-TATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTT
255 TGTTCAAAAAACTATGAT-CATTTAAACATA-TATCTATTTCAAATCATTATGACATTTT-ATTT
* *
15506302 GTCGTAAA-AAGT-ATTGCATT-TATTCATACAAA-ATTATTTAGAA
317 -T-G-AAATAAATCAATGCATTCTATTCATA-AAAGATTATTTAGAA
* * * *
15506345 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAGAACTAAATTTG
1 TAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * *
15506406 TTTATCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATCTCAAATGTTATGATC-
66 TTTA-CGAACAAATTCAAATAG-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGATCT
*
15506470 TTTATTTTATCATA
129 TTTGTTTTATCATA
15506484 CAAGCTTATT
Statistics
Matches: 417, Mismatches: 69, Indels: 35
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
357 13 0.03
358 8 0.02
359 66 0.16
360 67 0.16
361 5 0.01
362 112 0.27
363 130 0.31
364 9 0.02
365 4 0.01
366 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (359 bp):
TAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
TTTACGAACAAATTCAAATAGTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGATCTTT
TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAGTTTAGTTGAAATAAAATAATACTAACTTA
TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTAGACATAAAAAAATGTTCA
AAAAACTATGATCATTTAAACATATATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGAAATAAA
TCAATGCATTCTATTCATAAAAGATTATTTAGAA
Found at i:15506967 original size:517 final size:515
Alignment explanation
Indices: 15506005--15506977 Score: 1067
Period size: 517 Copynumber: 1.9 Consensus size: 515
15505995 ATTTATTAAA
*
15506005 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAATCGAGTTCAAATAGC
1 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAATCGAGTTCAAATAGC
* * * * *
15506070 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
66 TAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* ** * * * * *
15506135 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTGATATTCTAAATATTAA
131 GTTTCAATTCATACAAGACTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTGACACTCAAAAAATTAA
**** * * * *
15506200 TAAGTTGGAGATATAAGAAATAAGTCTAGACATCGAACTAGTTCAAAAAACTATGTCCATTTAAA
196 TAAACAAGAAATATAAGAAATAAATC-AGACATCGAAATAGTTCAAAAAACTATGTACATTTAAA
* * * * * * *
15506265 CTATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAAAGTATTGCATTTATTCATA
260 CAATTATCTATTTAAAATAACTATGACACTTTGTTTTATCATAAAAAG-ATTGCATTTATTCATA
*
15506330 CAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAG
324 CAAAATTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAG
* ** * **
15506395 AACTAAATTTGTTTATCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATCTCAAA
389 AAATAAATCAGTTTATCGAACCAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATCTCAAA
15506460 TGTTATGATCTTTATTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATATTGTTAAATTAATAAT
454 TGTTATGATCTTTATTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATATTGTTAAATTAATAAT
* * * *
15506522 ATTTTAAAAATTAATAAGTAACAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAAT-TAGTTCAAATA
1 ATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAATCGAGTTCAAATA
* * *
15506585 GTTAAGACTA-TTAAAGCAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAAT
64 GCTAAGACTATTTAAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAC
* *
15506648 AATTTTTTCAATTCATACATA-ACTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT-AGCACTCAAAA
127 AATTGTTTCAATTCATACA-AGACTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTGA-CACTCAAAA
* ** * * **
15506711 AATTAATAAACAAGAAATTTTTAA-AAATAAATC-GATTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATG-
190 AATTAATAAACAAGAAA--TATAAGAAATAAATCAGACAT-CGAAAT-AGTTCAAAAAACTATGT
* *
15506773 ACATTTAAACAATTATTTATTTAAAATAACTATGAC-CTTTGTTTTATCATAAAAA-ATTG-TTT
251 ACATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAACTATGACACTTTGTTTTATCATAAAAAGATTGCATT
* * *
15506835 TAGTTCATA-AAATTTTATCTGA-AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATA
316 TA-TTCATACAAA-ATTAT-TGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TA
* * * **** * *
15506898 AGTTAGAGATTTAA-AAATAAGTCAGTTTATTGAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATA
375 A-TAAGAGATTTAAGAAATAAATCAGTTTATCGAACCAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACA
*
15506962 ATTATCTATTTCAAAT
439 ATTATCTATCTCAAAT
15506978 CATTATGAAT
Statistics
Matches: 372, Mismatches: 67, Indels: 34
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
513 7 0.02
514 47 0.13
515 3 0.01
516 28 0.08
517 245 0.66
518 38 0.10
519 4 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (515 bp):
ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAATCGAGTTCAAATAGC
TAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
GTTTCAATTCATACAAGACTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTGACACTCAAAAAATTAA
TAAACAAGAAATATAAGAAATAAATCAGACATCGAAATAGTTCAAAAAACTATGTACATTTAAAC
AATTATCTATTTAAAATAACTATGACACTTTGTTTTATCATAAAAAGATTGCATTTATTCATACA
AAATTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAGAA
ATAAATCAGTTTATCGAACCAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATCTCAAATG
TTATGATCTTTATTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATATTGTTAAATTAATAAT
Found at i:15507581 original size:177 final size:176
Alignment explanation
Indices: 15507197--15508222 Score: 532
Period size: 177 Copynumber: 5.8 Consensus size: 176
15507187 TTCATATAAA
* * *
15507197 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAA
1 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAAA
* * * * * * *
15507262 AAATAAATCTATTTATCGAAGTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCTAA
63 AAATAAATCTATTTATCAAAGTAATTCAAACAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAAA
*
15507327 TCGTTATGACCTTTCATTTTGGCATAAAACAATTGTTTCAATTCTTACAAG
128 TCGTTATGACCTTT-ATTTTGGCATAAAACAATTATTTCAA-TCTTACAAG
* * *
15507378 CTTATTTGCAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTAATAAGT-GATTTAAAAAG
1 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAA
* * * *
15507442 TAAAT-TAGTTTATCAAATTAATTCAAATAATTATGGCTATATCAACAATTATCTATTTCAAATC
66 TAAATCTA-TTTATCAAAGTAATTCAAACAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
15507506 GTTATTACCTTT-TGTTTGGTCATATAACAATGATATTTGAA-CATT-CAAT
130 GTTATGACCTTTAT-TTTGG-CATAAAACAAT--TATTTCAATC-TTACAAG
* * * ** *
15507555 CTTATTCGAAATAAAAGAATACTAATTTATTAATCTTTGAAAAATTAATAAGTAAAAGCTTT-AA
1 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAAA
* ** * * * * * * *
15507619 AAATAAATCTATTTACCAAACCAGTT--TA-AA-T-AGACTATTTGAACAATTGTATAATTCAAA
63 AAATAAATCTATTTATCAAAGTAATTCAAACAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * ** * *
15507679 TTGTTATAACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTCGTTCATATAAG
128 TCGTTATGAC--CTTTATTTTGGCATAAAACAATTA-TTTCAATCTTACAAG
* * * * * * * *
15507731 -TCTATTCGTAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTACAACAATTAATAACTAAGAGAATT-A
1 CT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAA
* * * * * * * * * ** **
15507794 AAAATAATTTTGTTTGTCGAACTATTTCAAATATTTAAGACCGTAAGAACAATTATCTATTTCAA
62 AAAATAAATCTATTTATCAAAGTAATTCAAACAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * *
15507859 AACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATATTAA-
127 ATCGTTATGACC-TTTATTTTGGCATAAAACAATTATTTCAA-TCTTA-CAAG
* * * * * * * *
15507911 CTTAATCGGAATAAAATAAAACAAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAATAATAGATTTTAA
1 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT--A-AGTAGA-TTTAA
* * * * ** * * *
15507976 AAAATAATTTTGTTTA-CTTAACCAATTCAAACAATTATA-ACTATTTAAACAATTATCTACTTC
62 AAAATAAATCTATTTATC-AAAGTAATTCAAACAATTA-AGACTATATCAACAATTATCTATTTC
* ** * * *
15508039 AAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTTAGAAAACAAATT-TTT---TTTATATAAG
125 AAATCGTTATGACC-TTTATTTTGGCATAAAAC-AATTATTTCAATCT-TACAAG
* * * * * * * *
15508090 TTTGTTT-AGAATAAAGTAATACTAGTCTATTAATATTTCTAAAACTAATAAG-AGATTTAAAAA
1 CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAA
* ** * * * ** *
15508153 ATAAATCTATTAATCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTAT-TTGACAAATTATTTATTTCAAAT
65 ATAAATCTATTTATCAAAGTAATTCAAACAATTAAGACTATATCAAC-AATTATCTATTTCAAAT
*
15508217 CATTAT
129 CGTTAT
15508223 AATTTTTTGT
Statistics
Matches: 654, Mismatches: 150, Indels: 89
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
173 3 0.00
174 59 0.09
175 40 0.06
176 90 0.14
177 141 0.22
178 9 0.01
179 48 0.07
180 89 0.14
181 89 0.14
182 79 0.12
183 7 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (176 bp):
CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAAA
TAAATCTATTTATCAAAGTAATTCAAACAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCG
TTATGACCTTTATTTTGGCATAAAACAATTATTTCAATCTTACAAG
Found at i:15510109 original size:179 final size:182
Alignment explanation
Indices: 15509784--15510114 Score: 411
Period size: 179 Copynumber: 1.8 Consensus size: 182
15509774 GCTTAATCAA
* * *
15509784 AATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTTCAAAAATTAATAATTAGTAGAATTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAAAACAAATCTAAAAATATTTAAAAAATTAATAA-TAGTAGAATTAAAAAATAAATT
* * * * **
15509849 TGTTTGCCTAACATGCTCAAATATTTAAAGACTATATGAACAACTATCAATTCAAATCGTTATGA
65 TGTTTACCTAACACGCTCAAATAATTAAAGAATATATGAACAACTATCAATTCAAATCACTATGA
*
15509914 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTTGG
130 CATTTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTTGG
* * * *
15509967 AATAAAATAAAACAAATTTATAAATATTTAAAAAATTAAT-A-AG-AGATTTTAAAAAATAATTT
1 AATAAAATAAAACAAATCTAAAAATATTTAAAAAATTAATAATAGTAGA-ATTAAAAAATAAATT
* * * ** * *
15510029 TGTTTACCTAAC-CGTTCAAATAATT-ATGAATATTTGATTAATTATCTATTTCAAATCACTATG
65 TGTTTACCTAACACGCTCAAATAATTAAAGAATATATGAACAACTATC-AATTCAAATCACTATG
15510092 ACATTTTGTTTTGTCATAAAATA
129 ACATTTTGTTTTGTCATAAAATA
15510115 AATATTTTTG
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 21, Indels: 8
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
178 15 0.12
179 48 0.38
180 26 0.21
182 1 0.01
183 35 0.28
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (182 bp):
AATAAAATAAAACAAATCTAAAAATATTTAAAAAATTAATAATAGTAGAATTAAAAAATAAATTT
GTTTACCTAACACGCTCAAATAATTAAAGAATATATGAACAACTATCAATTCAAATCACTATGAC
ATTTTGTTTTGTCATAAAATATGTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTTGG
Found at i:15510469 original size:358 final size:357
Alignment explanation
Indices: 15508604--15520212 Score: 6152
Period size: 362 Copynumber: 32.5 Consensus size: 357
15508594 TTTGCCAAAC
* * * * * * * * *
15508604 CAAG-TCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATGATCCATTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTA
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
15508668 GCCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATATGCTTATTTGAAATAAAAAAAAAATACTAATTTGTT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT---AAAATAATACTAATTTATT
* * * * * ** *
15508733 AAGA-TTCAGAAACTTAATAAACAAGAAATTTTATAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTGCAA
128 AATATTTCA-AAAATTAAT----AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAA
* *** * * *
15508797 ATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTATTT-AAA-AAATATGACTTTTTGTTTTATCACAAAA
186 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
15508860 CAATTG-TTTGAGCTCATAAAAACTTATTC-GAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAA
251 CAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * **
15508923 AAATTGATAAGTTAA-AAATTTAAAAAATAGGTCA--TTTATC-AA
314 AAATTAATAAG-TAAGAGATTTTAAAAATAAAT-ATGTTTATCGAA
** * * * * * * *
15508965 GTTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTTAATAATTATCTATTTCAAATAG--ATGCAAACTTTTAT
1 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG--ACCTTTTGT
* ** *
15509028 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTAT
63 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAT
* *
15509092 TAATATTTCAAAAAATTAGTAAGTACGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-----C--
127 TAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAA
* * ** * * * *
15509150 --AG-T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAAAATCTTTTGTTCTATTATAAAA
186 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** ** * *
15509210 TAATTGTTTCAATTCATTTAAGCTTATT-AGTAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAA
251 CAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* ** * * * ** *
15509274 AATTTATAACCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAA
315 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * *
15509317 GC-AGTTCAAATAGTTAAT-ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTT
1 -CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* ** *
15509380 GTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTA
64 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
15509445 ATATTCCAAAAAGTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAAT
129 ATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * *
15509509 AATTATGGCCATGTCAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTGGTCATATAACA
188 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
15509574 ATTGTATTTGA-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTCAAAAA
253 ATTGT-TTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * * *
15509638 TTAATATGTAAGAGATTTTTTTAAA-AAATCTATTTATTGAA
317 TTAATAAGTAAGAGA-TTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * ** * ** * * * *
15509679 CTAGTTCAAATTGCTATGACTATTTGAACGATTGTAAATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * **
15509744 ATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATCTAAAAAT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
15509809 ATTTCAAAAATTAATAATTAGTAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCTAACATGCTCAAATATT
131 ATTTCAAAAATTAAT-A--AG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
15509874 TAAAGACTATATGAACAACTATC-AATTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAT
191 T-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * ** * * *
15509937 GTTTTTTTGAACTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATAAATATTT-AAAAA
255 -TGTTTTT--ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
15510001 --ATTAA-TAAGAGATTTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAA
317 TTAATAAGTAAGAGATTTT-AAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * ** *
15510040 C-CGTTCAAATAATTATGAATATTTGATTAATTATCTATTTCAAATCACTATGACATTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
15510104 GTCATAAAATAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAACAAAGTAATACTAATCTT-TTAA
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAA
* * *
15510168 TATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTAT
130 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTAT
** * * * ** * * * * * *
15510233 GACTATTTGAGTAGTTATTTATTTTAAATTATTATTACCTTTTGTTCTATTACAAAACAATTATT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* *
15510298 TTTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAA
259 TTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* *
15510363 GTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
324 GTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
** ** * * * * * *
15510397 CTTGACCAAATAATCATGACTGTGTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * * * * * * *
15510462 GTCATAAAAGATTTGTTTCAGTTCATATAAGATTACTCAAAATAAAATAATAGTAATCTAGTAAT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * *
15510527 A-ATCAAAAAATTAATAATAAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTGTATTGAACAAGTTAAAATAA
131 ATTTC-AAAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
15510591 TTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* *
15510656 T-TTTTCTATAT-AGACAAGCATATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGA
255 TGTTTT-TAT-TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A
* * * *
15510715 CAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTAGCGAA
315 -AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * ** * * * **
15510758 CAAGTTTAAATCGATATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAATTTGTTATGATTTTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * ** * * **
15510823 TTCGTAAAACAACTACTTCTATTCATACAATTTTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAA
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
15510887 TACTTTGACAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTTCCAATA
130 TA-TTT--CAA-AAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACA-AACAAGTTCAAATA
* * * * * *
15510951 GTCATGACTATTTGAATACTTATCTATTTGAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTG-CTATAAAATA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACA
* * *
15511015 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAAATATAATAATACTAATTTATTATTA-TTCTAAAA
253 ATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * * *
15511078 ATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATCTATTTATCGAA
316 ATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * * * * * *
15511120 CAAGTTCAAATAGTCAAGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATTGTAATTACATTTTGATT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * ** * *
15511184 CGTCACAAAACAATTG-TTTTGATTCATAAAAAATTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
15511248 ATATTTCAAAAATTAACAAGAGCTTTAAAAACTAAATCTATTAACCAAACCAGTTTAAATAGTTA
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
15511313 TGACTATTTGAACACTTATCTATCTCAAATCGTTCTGATC-TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** * * * * * * *
15511377 TTGTAGCCATACAAACTTATT-TGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAT
258 TTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
* * * *
15511440 TAAGTAAGAGATTTGAAAAATTAATATGTTTGTCAAA
321 TAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * * *
15511477 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * *
15511542 GTCAT------A-TG-----CTT-ATTCAA----A----AAA-AAAATAATACTATTTTATTAA-
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
15511584 CTTTCAGAAAATTAGTAAGCATGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTCAAATA
131 ATTTCA-AAAATTAATAAG-A-G--ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATA
* * * * *
15511649 GTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATC-ATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * * *
15511713 TTATTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATT
254 TTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * ** *
15511778 GAGAAGTTGGAGA-TTTAAAAAGTAAATCA-GTTTAACGAA
319 AATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAAT-ATGTTTATCGAA
* * * * *
15511817 TCCA-TACAAATAATTATG-CTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTT
1 -CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
** * * * *
15511880 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAA-AA-ACTAATTAATTA
64 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
15511943 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAAGAAATATTTTTACTAAACCAGCTCAAATAG
129 ATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-AAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
15512008 TTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * *
15512073 T-ATTTAAGTTCATATAAGCTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAAT
255 TGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAAT
* * *
15512136 TAAT-AGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTAGT-GAA
318 TAATAAG-TAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAA
* ** * * * * *
15512176 CAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTGT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* ** * * * * * *
15512241 ATCATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
15512306 ATTTTAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATA
131 ATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
15512371 ACAATTTGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
15512435 CTATTCGTACAAGCTAATT-TGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATA-TTCTAAAA--AATAA
260 TTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* *
15512496 GTAAGATA-TTTAAAAACTAAATATGTTTATCAAA
324 GTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTATCGAA
* * * ** * * *
15512530 TAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15512595 GTTATAAAATAAATT-CTTTTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAAATTTATT
66 GTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * * *
15512657 AATA-TTCAAACAACAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAA
128 AATATTTC--A-AA-AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTAC-AAACAAGTTCAA
* * ** * * * * *
15512721 ATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTGGAAATCATTATAACTTTTTGATTTGTCATCAAA
186 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
15512786 CAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTACTAATATTTCAACA
251 CAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * *
15512851 ATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAA
316 ATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * *
15512892 CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTC
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * *** * * * * ** *
15512957 GTCATCAAACAATTGTATCAATTAATATAGGC---TT-G--TTAAAATAGCACTAATTGATTAAT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
15513016 A-TTCTAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAATATGAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAG
131 ATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-AAACAAGTTCAAATAG
* * * *
15513080 TTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTC-TAAAAATAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAA
* * *
15513143 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTACTT-TGAATAAAATAATA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAA
254 TTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
15513206 TTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTT-T----
317 TTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * ** *
15513241 ----TT----TA---A-CAC-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTATGACATTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
15513293 GTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCGTATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAAT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
15513357 ATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCTAGTTCAAATAGT
131 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * ** * * *
15513422 TATCATTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATTATATTTTGTTTTATCATAAAGCAACT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * ** *
15513487 ATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAAATTAAAAATA-TTCTGAAAATTA
256 GTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * * *
15513551 ATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
320 ATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * * * *
15513589 CAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GATTATAATCTTTTGTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTT
* * ** * * *
15513653 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAATATTAATCTATTA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
*
15513717 ATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAAACAAG-TCAAATAGTT
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC--AAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
15513780 ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* ** * *
15513844 TTTTT-TTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAA
257 TTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
* * ** *
15513907 TAAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATGTATTTGCCAAA
321 TAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTATCGAA
* * * * * * * * * *
15513944 CTAGTTGAAATAGTTAAGAGTA-TTGAACAA-TATTTTATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * *** *
15514007 AGTCATAAAATAATTATTCCAGTTCATACAAGCTTATT-TACAATAAAATAATACTAATTTATTA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
15514071 ACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAAT
129 ATATTTC-AAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAC-AAACAAGTTCAAA
* * * * *
15514135 TAATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATAT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAA
187 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * *
15514198 CAATTG-TTTTAGTTAATAAAAACTTATATGA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAA
251 CAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
** * *
15514261 AAATTAATAAGCCAGACA-TTTAAAAACTAAAGCTAT-TTT-TTGAA
314 AAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAA--TATGTTTATCGAA
* * * * * * * *
15514305 CCAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATG--GTATTT-TTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTT
* * * * * *
15514367 TCTCATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAGCATATTC-AAATGAAAGTAATACTAATTTA-TA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
15514430 ATATTAT-AAAAATTAATAAGAGATTTACAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAA-TTTAAATAAT
129 ATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-AC-AAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
15514493 TAAGACTATTTTAATAATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGA-CTTATTATTTAGTCATATAATAA
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** *
15514556 TTG-TTTCAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAATA
254 TTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-A
* * * * *
15514619 TTAATAAGAAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
317 TTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* ** * * * *
15514661 CAAGTTCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15514726 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTACA-TTATTAA
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA
15514790 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACAGAATCAA-TTCAAAT
130 TATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACA-AA-CAAGTTCAAAT
* * * * * *
15514853 AATTATGACCT-CTTGAACAACTATCCATTTCAAAAT-GTTATTACCGTTTGTTTTGTCATAAAA
188 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* *
15514916 CAATT-TTTTTCA-ACATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
251 CAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * *
15514978 GAATTAACAAG--AGACA---TAAACAATAAATCTATTTA-CTGAA
314 AAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAA-AATAAATATGTTTATC-GAA
* * * * * *
15515018 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTC
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
15515083 TATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ** * *
15515148 AATTTCAAAAATTAATAATTAAGAATTTTAAAAATAAAT-TCGTTTATTGAACCAGTTCAAACAG
130 TATTTCAAAAATTAATAA--GAG-ATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-CAAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
15515212 TTGA-GACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAA
190 TT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** * * *
15515275 TT-ATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGGATAAAACTAATTTATTAACATTTCTAAAAT
254 TTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *
15515339 TTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTATCGAA
318 TAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * *
15515379 CCATTTC--A-A---AT-A--A-TT--AT-A--A-CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * ** * * * * *
15515428 GTAATAAAACAATCGCTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAAT-ACACTAATTTATTAAT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
15515492 ATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTGACCAAATAATTTCAAATAG
131 ATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAG
* * *
15515556 TTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** * *
15515621 TGGTTTTATTTATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATT
255 TGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * *
15515685 AATAA-TAA-AAAATTAACAAAATAAATTTATTT-TCTAAA
319 AATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAATATGTTTATC-GAA
* * * * *
15515723 CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
15515788 GTCATAAAACAATTGGTTTTATCCATGCAAGTTTATTTTGAAA-AAAATAATATAAATTTGTTAA
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAAT-A-AT--A----CTAA
* * * * * *
15515852 TATTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTT
122 T-TT------ATTAAT-A-T-TT-CAAAAATTAAT-A-AGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTA
* * * *
15515917 CTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTT
173 C-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * **
15515982 GTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATCCATGCAGGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTT
237 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * * * *
15516046 GTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAATAAATTTATTT-TCTAAA
301 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAATATGTTTATC-GAA
* * * * *
15516102 CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGTTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
15516167 GTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTACAATCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATT--
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ***
15516229 TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAG
130 TATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAG
* * * * **** * **
15516294 TTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAAAAAGAAAAGTAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
15516359 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-CT-AGAAAA-T
255 TGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT
* ** * *****
15516421 AATGAGTTGGAGA-TGTAAAAAGTAAAGCCACTTA-CTGAA
319 AATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTATC-GAA
* * * * * * * **
15516460 CAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTAAACT-ATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * ** *
15516524 TGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
15516588 ATATTTCAAAAATTAAAAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAATTA
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
15516653 TGCCTATTTGAATAATAACCTATCTCATATCATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
15516717 TTCTATTCATAAAAGCTTATT-TGATATAAAATATTACTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAA
258 TTTTATTCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
* **
15516780 TAAGTAAGAG-GTTTAAAAAT-AATACTAATTA-C-AA
321 TAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATA-TGTTTATCGAA
* * * * ** * ** *
15516814 -ATATTTCTATTGATACAAGTT-T--CTGTTCATGCAA-AATTATTTAGAATAAAAT-AATACTA
1 CA-AGTTC-A---A-A-TAGTTATGACTATT--TG-AATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTA-TG
* * * *** ** * * * *
15516873 ATCTATTAATATTTTG--A-AAATTACAA-AGAGATT-TAAAAACTAAATCTAATTACCGAAACA
54 ACCT-TT--TGTTTTGTCATAAA--ACAATTGTTTTTGTTCATAC--AAGCTTATT--CGAAATA
*** * * * * *** * * *** * * *
15516933 GGTTAA-A-T-AGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTG
110 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA---ATAAGAGAT--TTA-AAAAATAAATCTG
* * *** ** * *
15516995 TCATA-AAACAGTTGTTTCTTTTCA--TACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAT-TAGTTTAAT
169 T-TTACAAACA--AG-TTCAAAT-AGTTATGA-C-TATTT-GA--ACAAT--TATCTA-TTTCA-
* * ** * *** * * * * * * * * * *
15517056 AAT-ATTCCA-AATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTATCTACTGA-AC-CGGTTG
220 AATCGTT--ATGACCTT--T-TGT-TTTG--TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTT-
* * * * * *
15517117 AAAAT-AG-TTAAGAGTATTAGA-AC-AATTTTTTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTAA
276 --ATTCAGAATAA-A--A-TA-ATACTAATTTATTA-AT-AT----TTC--A----------AAA
* * * * * *
15517178 ATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA
316 ATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * * * *
15517221 CAAGTCCAAATAGATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATATAAAATCATTATGACCTTTTTATT
1 CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTT
* * * * * *
15517285 TTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATAT-GAAACAAAATAATACTATTTTATT
64 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *** * *
15517349 AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGTAAAGC-GATTTTTTGAACTAGTTGAAA
128 AATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTG--TTTACAAACAAGTTCAAA
* * * * * *
15517413 TAGCTATGACTATTTG----A--ATC---TT-AACTTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAA
187 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * *
15517467 AATTGTTTCTGA-TCATACAAGCACATT-TGGATGAAAATAATACCAATTT-TATAATATTTTAA
252 AATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAA
* * *
15517529 AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AA-ATGTTTTTGCAAAA
314 AAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTAT-C-GAA
* ** * * * * *
15517569 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCA-GACTTTTTATTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * *
15517633 GGTCAGATAATAATTGTTTTAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
15517698 CA-TTCAAAAAAATTAATAAACAAGTGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAA
130 TATTTC--AAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAA
* * *
15517762 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAAC
187 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
15517826 AAATGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTCAAAA
252 AATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAA
* * *
15517890 ATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATAGAA
316 ATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATAT-GTTTATCGAA
* * * * * * * *
15517932 TCAA-TTCAAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGCT
1 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* *** *
15517995 TTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAGCATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
64 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
15518060 ATATTTCAAGAATTAATAAGGGATTT-AAAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTCAAATAGTT-
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
15518123 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTCGATCATAAAATAATTG
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTG
* * * * *
15518187 TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAAT
257 TTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * *
15518252 AAATAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTGTCGAA
322 AAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * * * * * *
15518288 CTAGCTT-AAATAGTTAAGAATGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTT
1 CAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * **** * * * * *
15518352 TGTCATAAGACAATTATCTCAACTT-ATACAAGCTTATTGGGAATAGAATAAAACTAATGTATTA
65 TGTCATAAAACAATTGT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * *
15518416 ACATTTTC-AAAATTTATAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGTCAAACCATTTCAAATA---
129 ATA-TTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACAAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
15518477 AT---T-TAT-AAC---TAT-T-TTT-AAATCATTATGA-CTTTTGCTTTTTGTAATAAAACAAT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG--TTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * ** *
15518530 AG-TTTCAGTTCATATAAGCCTATT-TGAAGTAAATTAATACTAATTTGACTAAATATTTTGAGA
255 TGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTT-A-TTAATATTTCAAAA
** * * * * *
15518593 ATTAATGTGTAAGAGAATTAAAAAAGAAATCTG-TTATACAAA
316 ATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTAT-CGAA
* *
15518635 TAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT-CA-AA--A-C-A-TT---A----TA--ACCTTTTG-TTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* ** * * * * * *
15518682 GTCATAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTTTGTTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTA
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * *** * *
15518745 ATATTTC-AAAATTAAGAATTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACATGTTTAAATA
129 ATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACAAACAAGTTCAAATA
* *
15518808 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-C-ATATGACC-TTTGTTTTGTCATAAACCAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
15518870 TTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATT--TA-TTCTAAAAA
254 TTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * *
15518931 TTAAGAAGTAAAAGA-TTTAGAAAATAAATCTGTTTA-CCAA
317 TTAATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * * *
15518971 GCGAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTT
1 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
15519036 TGTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ** * * * ** *
15519101 TATTATAAAATAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAATT
130 TATT-TCAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * ** * * *
15519166 GTGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACTATTA
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* ** *
15519231 TTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T
257 TTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
*
15519293 AA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAA
322 AAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTATCGAA
* * * * * * * * *
15519328 -ATAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTAACCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTT
1 CA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
15519391 TGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATACTACTAAATAAATAA
65 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * *
15519456 TA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAAGGC-A-TTTAAA
130 TATTTC-AAAAATTAATAAG--AGA--TTTAAAAAATAAATCTG--TTTACAA-ACAAGTTCAAA
* * * * ** ** *
15519518 TAGATATGACTTTTTGAACAGTTATCTATTTCAATTTTTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACC
187 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
15519583 AATTGTTTCTATTCATACAAGCATATT-TGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
252 AATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
15519646 ACTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCGAG
316 ATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
* * * * * * * * * * *
15519687 CAAGTTCAAATAGTTATCACTGTTTAAACAATTATTTATTTTAAATAGCTATTATCTTTTGATTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * **
15519752 GTTACAAAACAATTATTTCTATTGATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACAAAT
66 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
15519817 A-TTCTAAAAATTAATTGGTAGGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG
131 ATTTC-AAAAATTAA----TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
15519881 TCATGTCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAATAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * ** * **
15519946 TGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAA-T-
255 TGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * ** *
15520009 -T-ACTAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTAATTACCGAAA
320 ATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTATCG-AA
* * * * * * *
15520046 CAGGTTC-AATAGTTATCAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTT
1 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
15520109 GTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAGTTTAATAA
66 GTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
15520173 TATTCCAAATAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
130 TATTTCAAA-A--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
15520213 GTATCTAATG
Statistics
Matches: 8680, Mismatches: 1918, Indels: 1303
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
328 15 0.00
329 43 0.00
330 11 0.00
331 27 0.00
332 7 0.00
334 7 0.00
335 30 0.00
336 74 0.01
337 50 0.01
338 8 0.00
339 26 0.00
340 200 0.02
341 118 0.01
342 114 0.01
343 74 0.01
344 184 0.02
345 117 0.01
346 27 0.00
347 130 0.01
348 99 0.01
349 52 0.01
350 137 0.02
351 120 0.01
352 16 0.00
353 47 0.01
354 462 0.05
355 565 0.07
356 629 0.07
357 754 0.09
358 769 0.09
359 597 0.07
360 694 0.08
361 610 0.07
362 783 0.09
363 344 0.04
364 75 0.01
365 13 0.00
366 7 0.00
367 8 0.00
368 4 0.00
369 11 0.00
370 16 0.00
371 14 0.00
372 3 0.00
373 20 0.00
374 7 0.00
375 9 0.00
376 13 0.00
377 8 0.00
378 16 0.00
379 284 0.03
380 14 0.00
381 7 0.00
382 6 0.00
383 18 0.00
384 3 0.00
385 9 0.00
386 5 0.00
387 1 0.00
389 1 0.00
392 3 0.00
393 1 0.00
395 1 0.00
396 6 0.00
397 4 0.00
398 16 0.00
399 12 0.00
400 17 0.00
401 38 0.00
402 27 0.00
403 16 0.00
404 6 0.00
405 10 0.00
406 5 0.00
407 5 0.00
408 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (357 bp):
CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
ATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
AAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA
Found at i:15511387 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 15511354--15511392 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
15511344 GTTCTGATCT
15511354 TTGTTTTGCCATA-AAACAA
1 TTGTTTTGCCATACAAACAA
15511373 TTGTTTGTAGCCATACAAAC
1 TTGTTT-T-GCCATACAAAC
15511393 TTATTTGAAG
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 3
0.85 0.00 0.15
Matches are distributed among these distances:
19 6 0.35
20 1 0.06
21 6 0.35
22 4 0.24
ACGTcount: A:0.33, C:0.18, G:0.13, T:0.36
Consensus pattern (20 bp):
TTGTTTTGCCATACAAACAA
Found at i:15512876 original size:716 final size:714
Alignment explanation
Indices: 15511609--15524278 Score: 4702
Period size: 717 Copynumber: 17.6 Consensus size: 714
15511599 TAAGCATGAA
* * *
15511609 ATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTT
1 ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
15511674 ATTTAAAATC-ATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAGCTTATC
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
*** * * * * * ** *
15511738 CAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAA
130 TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * ** * *
15511803 ATCA-GTTTAACGAATCCA-TACAAATAATTATGCTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
193 AT-ATATTTATCAAAT-AAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
*** * *
15511866 TATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAA-
256 TAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-CAATAAAAT
* *
15511929 AA-ACTAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAAGAAATATT-TTTAC
319 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTAC
** * * * **
15511991 TAAACCAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG
383 TAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * * * * *
15512056 TTTTGTAATAAAACAATT-ATTTAAGTTCATATAAGCTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTA
448 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * *
15512120 ATAATATTATGAAAATTAAT-AGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTAGTGAACAAATTTG
512 TTAATATT-TCAAAATTAATAAG-TAAGAG-ATTTAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTA
* * * * * *
15512184 AATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTGTATCATAAA
574 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TGTCATAAA
** * * * * * *
15512249 ACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAA
638 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
15512314 AATTAATAAAAG
703 AATTAATAAAAG
* * * * * *
15512326 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAA-TATTTA
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
15512390 TTTTAAATTGTTATGACCATTTGTTTTATTACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTAATTT
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* * * * *
15512455 GAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAA-AATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAATA
131 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
* * ** **
15512519 TGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCGCTATAA
196 TATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * *
15512584 CCTTTTATTTTGTTATAAAATAAATTCTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATA-
261 CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAA-TAAAATAATAC
** *
15512647 TAAATTTATTAATA-TTCAAACAACAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATTTGTTTACTGA
324 T-AATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACTAA
* * * ** * *
15512711 ATAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTGGAAATCATTATAACTTTTTGATT
386 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * * *
15512776 TGTCATCAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTACTAA
451 TGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ** *
15512841 TATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
516 TATTTCAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGT
* * * *
15512906 TATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTCATCAAACAATT
580 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATT
* * * * * * ** * *
15512971 GTATCAATTAATATAGGC----TT-G-TTAAAATAGCACTAATTGATTAATATTCTAAAAATTAA
644 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
15513030 TGAGCAAGAG
709 T-A--AA-AG
* * * **
15513040 ATTTAAAATATGAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * *
15513104 TTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTC-TAAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTACT
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-T
* * * *
15513168 TT-GAATAAAATAATA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAAT
129 TTGGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATT-CTAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * **
15513230 AAAT-T-TGT-T----T---TTT---T-A--A-CA-CATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTT
191 AAATATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * *
15513277 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCGTATTTGAAATAAAA-A
256 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-CAATAAAATA
* * *
15513341 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCG
320 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CT
** * * * * * * **
15513406 AGCT-AGTTCAAATAGTTATCATTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATTATATTTTG
384 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTG
* * * * * * * *
15513469 TTTTATCATAAAGCAACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAAATTAA
448 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15513534 AAATATTCTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAACAAGTTTAA
513 TAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTTAA
* * * * *
15513598 ATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAA
575 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAA
** * * *
15513662 ACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATATTAATCTATTAATATTTTAAA
638 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
*
15513727 AATTAATAAGAG
703 AATTAATAAAAG
*
15513739 ATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTGAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
15513802 ATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTTCATACAAGTTTATT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * *
15513865 TGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAA
130 TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * * * * *
15513930 ATGTATTTGCCAAACT-AGTTGAAATAGTTAAGAGTA-TTGAACAA-TATTTTATTTTAAATCAT
193 ATATATTTATCAAA-TAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCAT
* * * * **
15513992 TCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTCCAGTTCATACAAGCTTATTTACAATAAAATA
256 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-CAATAAAATA
* * * * *
15514057 ATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTAC
320 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * * *
15514121 TAAACAAATTCAATTAATT-TTACTATTTGAACAATTATCTATAT-AAAGTCATTATGACCTTTT
383 TAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTT
* * * * * *
15514184 GTTTTGTTATAAAACAATTG-TTTTAGTTAATAAAAACTTATATGA-AATAAAATAATACTACTT
447 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATT
* ** * * ** * *
15514247 TATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTG
510 TATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACTGAACAAGTTT
* * * * *** *
15514312 AAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGGTATTTT-TTTCTCATAAA
573 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAA
* * ** * *
15514376 ATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCATA-TTCAAATGAAAGTAATACTAATTTA-TAATATTATA
638 ACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
*
15514438 AAAATTAATAAGAG
701 AAAATTAATAAAAG
* * * * * * * * *
15514452 ATTTACAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCAA-TTTAAATAATTAAGACTATTTTAATAATTATCT
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
15514516 ATTTGAAATCGTT-TGGA-CTTATT-ATTTAGTCATATAATAATTGTTTC-AGTTTATACAAGCT
65 ATTTCAAATCGTTAT-GACCTT-TTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT
* * *
15514577 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAATATTAATAAGAAAGAGATTTGAAAA
126 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA-A-TAATAAGTAAGAGATTT-AAAA
* * * * * * * * *
15514642 AATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAT
188 AATAAATATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
** * * * *
15514707 TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTA-TCCAAAATAA
253 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTC--AATAA
* *
15514771 AATAATACTACA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTT
316 AATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * *
15514835 TAC-AGAATCAA-TTCAAATAATTATGACCT-CTTGAACAACTATCCATTTCAAAAT-GTTATTA
380 TACTA-AAT-AAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATAA
* * *
15514896 CCGTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-ACATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATA
441 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* *
15514958 CTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAACAAG--AGACA--TAAACAATAAATCTATTTACTGAAC
504 CTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACTGAAC
* * * * *
15515019 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTCT
567 AAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-T
* * * *
15515084 ATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
630 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*
15515149 ATTTCAAAAATTAATAATTAAG
695 ATTTTAAAAATTAATAA--AAG
* *** * * * *
15515171 AATTTTAAAAATAAAT-TCGTTTATTGAACCAGTTCAAACAGTTGA-GACTATATGAATAATTAT
1 -ATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * *
15515234 TTATTTCAAATTGTTAGGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAATTATTTC-AGCTCATACAAGCTT
63 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT
* ** * * *
15515297 ATTCGGAATAGGATAAAACTAATTTATTAACATTTCTAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
127 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** *
15515362 TAATTTTATTTATCGAACCA-TTT---CAA--AT-A--A-TT--AT-A--A-CTATTTCAAATCA
190 TAAATATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * *
15515411 TTATAACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATCGCTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGAAGTAAAAT
255 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAA-TAAAAT
* * * * * * *
15515476 -ACACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTGAC
319 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTAC
* * * * *
15515539 CAAATAATTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTG
383 TAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * * ** *
15515604 TTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTTATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTG
448 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTA
* * * * * * * *
15515668 TTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAA
512 TTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAA
* *
15515732 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
575 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA
* * * * * *
15515797 CAATTGGTTT-TATCCATGCAAGTTTATTTTGAAAAAAATAATATAAATTTGTTAATATTCCAAA
639 CAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT-A-AT--A----CTAAT-TT-----
*
15515861 AATTAATAATTATTCCAAAAATTAATAATAAAA
689 -ATTAAT-ATT-TT--AAAAATTAAT-A-AAAG
* * * * * * *
15515894 AATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
1 ATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * *
15515959 ATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATCCATGCAGGTTTAT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * *
15516023 TTTGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAA
129 TTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAA
* * * * * * *
15516085 TAAATTTATTT-TCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
190 TAAATATATTTATC-AAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
15516149 GTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-GTTCGTACAATCTTATTTAGAATAAA
254 ATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTT-CAATAAA
* * * *
15516213 ATAATACTAATTTATT--TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAAAAAATAAATCTGTTTA
317 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
* * * * * * *
15516276 CCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTT
382 CTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
**** * ** * * * *
15516341 GTTTAAAAAGAAAAGTATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACAAATTTA
447 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
* ** * ** * * * * *
15516406 TTAATACTAGAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAGTAAAGCCACTTACTGAACAAGTTCAAA
512 TTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAA
* * * * * * * * **
15516470 TAATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAAC
576 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAC
* * ** * *
15516535 TATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
640 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA
15516600 TTAA-AAAGAG
705 TTAATAAA-AG
* * ** * * * * * * *
15516610 ATTTAAAAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAACCTA
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
15516675 TCTCATATCATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTT
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* * * *
15516739 -GATATAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTT-AAAAAT-A
131 GGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * **
15516801 ATACTAATTA-CAAAT-ATTTCTATTGATACAAGTTTCTG-TTCA--TGCAA-AATTATTTAGAA
193 ATA-TATTTATCAAATAAGTT-TA---A-ATAA--TTATGATT-ATTTG-AATAATTATCTA-TT
* * * * ** * *** *
15516860 TAAAAT-AATACTAATCTATTAATATTTTG--A-AAATTACAAAGAGATTTA-AAAACTA-AATC
247 TCAAATCATTA-TAACCT-TT--TGTTTTGTCATAAA--AC-AATTGTTTTAGTTCA-TACAAGC
* * ** * * * * * ** * ***
15516919 TAATTACCGAA-ACAGGTTAA-A-T-AGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTT
304 TTATT-TC-AATA-A-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAAAGATTT
** ** ** * *** ** * *
15516980 ATGATCTTTATTT-TGT-CATAAA-ACAGTT-GTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAA
364 AAAAAATAAATTTGTTTAC-TAAATA-AGTTCAAAT-AGTT-AT--GA-C-TATTT-GA--ACAA
* ** * *** * * * * * *
15517041 TAATAT-TAGTTTAATAAT-ATTCCA-AATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTATC
418 T--TATCTA-TTTCA-AATCATT--ATAACCTT--T-TGT-TTTG--TCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
15517103 TACTGA-AC-CGGTTGAAAAT-AG-TTAAGAGTATTAGA-AC-AATTT-TT--TATTTCAAATCA
471 TATTCATACAAGCTT---ATTCAGAATAA-A--A-TA-ATACTAATTTATTAATATTTCAAA--A
* ** *** * *** ** *
15517159 TT-CTGACCT-TTTGTTTTAAATTAATGAGCAAGAGATTTA---AA-AA-AATAAATTTGTTTAC
526 TTAAT-AAGTAAGAGATTTAAA--AAT-A--AATCTATTTACTGAACAAGTTTAAA-TAG-TTA-
** * *** * * * ** ** * * * *
15517217 CAAACAAGTCCAAATAGATTTTACTATTTGAACAATTATC-TATATAAAATCAT-TATGACCTTT
582 -TGACTA-TTTGAACA-ATTAT-CTATTT---CAA--ATCGT-TATGACCTTTTGTTTG-TCATA
** ** * * * * * * *
15517280 TTA-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATATGAAACAAAATAATACTATT
636 AAACAATTGT--T-----------TCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
*
15517344 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG
687 TTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A--AA-AG
* * **** * * *
15517376 ATTTAAAAAGTAAAGC-GATTTTTTGAACTAGTTGAAATAGCTATGACTATTTG----A--ATC-
1 ATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * **
15517433 --TT-AACTTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCACAT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTAT
* * *
15517493 TTGG-ATGAAAATAATACCAATTT-TATAATATTTTAAAA-ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
129 TTGGAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCTAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * ** * * *
15517554 AATGT-TTT-TGCAAA-ACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATC
192 AATATATTTAT-CAAATA--AGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
15517616 ATTCA-GACTTTTTATTTGGTCAGATAATAATTGTTTTAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAA
254 ATT-ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-CAATAAA
* ** ** *
15517680 ATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATAAACAAGTGATTTGAAAAAATAAATCTGT
317 ATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGT
** * * **
15517744 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCT
379 TTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
* * * * *
15517809 TTTG-TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-AT
444 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
*
15517872 GTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATCA
509 -TTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTTACT-GAA-CA
* * * * * * *
15517935 A-TTCAAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGCTTTG
568 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTG
* * * * * *
15517998 TCATAAAATAATTGTTTTTCA-GCATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
631 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * **
15518062 ATTTCAAGAATTAATAAGGG
695 ATTTTAAAAATTAATAAAAG
* * * *
15518082 ATTT-AAAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * ** * *
15518145 TTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCGATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
** * * * * * *
15518210 AAAATAAAATGATACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTTAAAAATAAA
131 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * * * ** *
15518275 TCTGTTTGTCGAACT-AGCTTAAATAGTTAAGAATGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTT
194 TATATTTATC-AAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** * ** *
15518339 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATCTCAACTT-ATACAAGCTTATTGGGAATAGAATAA
258 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATT-TCAATAAAATAA
* * * * * * *
15518403 AACTAATGTATTAACATTTTC-AAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTT-GT
321 TACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACT
** * * *
15518461 CAAACCATTTCAAATA---AT---T-TAT-AAC---TAT-T-TTT-AAATCATTATGA-CTTTTG
384 -AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * * * * *
15518511 CTTTTTGTAATAAAACAATAG-TTTCAGTTCATATAAGCCTATT-TGAAGTAAATTAATACTAAT
448 --TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAAT
* * * ** * * * * *
15518574 TTGACTAAATATTTTGAGAATTAATGTGTAAGAGAATTAAAAAAGAAATCTGTTATAC-AAATAA
509 TT-A-TTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAATAAATCTATT-TACTGAACAA
* *
15518638 GTTCAAATAGTTATGACTA-TT---CAA--A---A---C--A---TTATAACCTTTTGTTTGTCA
569 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCA
* * * * * * *
15518686 TAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-T
634 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
*
15518749 TTCAAAATTAAGAATTAAAA-
698 TTAAAAATT---AA-TAAAAG
* * **** * *
15518769 ATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
15518834 TTTCAAA-C-ATATGACC-TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTC
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-
* * * *
15518896 T-AAATAAAATAATACTAATTTATT--TATTCTAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAGAAAATAA
130 TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *** * * ** * * **
15518958 ATCTGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTA
193 ATATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
15519023 TGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAA
258 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTT-CAATAAAATAA
* *** * ** * * *
15519087 TACTAATTTATTAATA-TT-ATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGCTATTTATTG
321 TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTA
* * * * * * * * *** *
15519149 AACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAATTGCTATGAA-ATTTTGT
385 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGT
* * * * ** *
15519213 TTTGTCGTAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATT
449 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
15519278 AATATTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-TCGAA-ATAGTTTAAA
514 AATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACT-GAACA-AGTTTAAA
* * * * * * * *
15519338 TAATTATGACTATTTGAACAGTAACCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAT
576 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAC
* *** * * * * *
15519402 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATACTACTAAATAAATAATATTCTAAAAA
640 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA
15519467 TTAATAAGTAAG
705 TTAATAA--AAG
* *** * * * * *
15519479 AGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAAGGC-A-TTTAAATAGATATGACTTTTTGAACAGTTA
1 A--TTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** ** * * *
15519542 TCTATTTCAATTTTTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCAT
62 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * *
15519607 ATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA
127 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** * * * * * * * * *
15519670 TAAATATGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATCACTGTTTAAACAATTATTTATTTTAAAT-A
190 TAAATATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * *
15519734 GCTATTATCTTTTGATTTGTTACAAAACAATTATTTCTA-TTGATACAAGTTTA-TTCAAAATAA
255 -TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTC--AATAA
** ** ** * * *
15519797 AATAATACTAATTTACAAATA-TTCTAAAAATTAATTGGTAGGAGATTCAAAAAATAAATCTATT
316 AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
** * * * * * * *
15519861 TACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTC
380 TACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
* * * * ** *
15519926 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATC
445 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT
* * * * *
15519991 TATTAATATTTTGAAAA-T--T-ACTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTAATTACCGAA-ACAGGT
510 TATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACTGAACA-AGTT
* * * * * * *
15520051 TCAATAGTTATCAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTGTCATA
572 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTGTCATA
* * * * * **
15520115 AAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAGTTTAATAATATTCCA
636 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
*
15520180 AATAGTAATAAGTAAAAG
701 AA-A--ATTAA-TAAAAG
* * * ** * * * * * * * * *
15520198 ATTTAAAAAATAAATGTATCTAATGAATC-GGTTGAAAATAGTTAAGAGTATTAGAACATTTTTT
1 ATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACCAAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * ** ** *** *
15520262 TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTA-AATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATA-AA-T
64 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA-TAA--AACAATTG-TTTCTATTCATACAAGC
* ** * ** * *
15520324 TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTTACT-ATTTGAACAAT-TATCTATATAA-AATCATT
125 TTATTT-----GGAA--TAAAATA-A---TACTAATTT-ATTAATAT-TCTA-A-AATAATAAGT
* * * * * ** * ** **
15520386 ATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGT-TTTAGTTCATAA-AAACTTATATGAAACAAAA
175 AAGA------GA--TT-T-AAAAAATAAATATATTTA--TCA-AATAAGTTTAAAT-AATTATGA
** * * * * * * **** **** * *
15520449 AAATACT-ACTTTATTA-ATATTTCAAA-AATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGTAAAGCTATT
226 TTAT-TTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATAACCTTTTG-TTTTGTCA-TAAAACAATT
* * * * ** ** * * *
15520511 TTTTGAACTAGTTGAAATAGCTATGAC-TATTTGAATCTTAACTTGTTA-TGATATTTGTT-TTC
286 GTTT----TAGTT--CATA-C-AAG-CTTATTTCAA---TAAAATAATACT-A-ATTTATTAATA
** ** ** * *
15520573 TCATAAAAAAATTGTTTTTGATCATACAAGCACATTTGGATGAAAATAATACTAAT-TTTA-T-A
337 T--TTCAAAAATT-AATAAG-T-A-A-AAG---ATTT--A-AAAAATAA-A-T-TTGTTTACTAA
* * * * * * * * * *
15520635 AT-ATTTTAAA-AATTAATAAGA-GATTTAAAAAATAAATGTTTTTGCAAAACCAGTTCA-AA--
386 ATAAGTTCAAATAGTT-AT--GACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-C-AAATCA-TT-ATAACC
* **** * * * * **
15520694 --TAGTTAAAACTATTAAAATAATTATCTATTTGAAATCATTC-AGACTTTTTATTTGGTTAGAT
443 TTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGT-T-TTT--ATTCATACAAG-C---TTATTCAG--A-AT
** ** * * ** * **
15520756 AATAATTGTTTTAGTTTATACAAGCTTATTT-GGAATAAAATAA-TACTA-ATTTATTAACATTC
495 AA-AATAATACTAATTTAT-TAA---TATTTCAAAAT-TAATAAGTA--AGAGAT-TTAA-A---
* ** * * * * * * * * *
15520818 AAAAAAAGTAATAAATAAGAGATTTGAAAATATAAATATTTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTA
547 AATAAATCTATTTACT--GA-A----CAAGTTTAAATA--GTTA-TG-ACTA-TT----T-G--A
* * * *
15520883 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGT
593 -----------ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGT
* * * **** *
15520948 TTTTGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
646 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTTAAAAATTAAT
15521012 AAATAAGAG
710 --A-AA-AG
* * * * *
15521021 ATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATCAA-TTCAAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTA
1 ATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTA
* * * * * * *
15521082 TCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-GCATACAAGCG
62 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCT
* * *
15521146 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAGAAT--TAA-TAAGGGATTT-AAAA
126 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA-AATAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * *
15521206 ATAAATCTATTCACCAAACT-AGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
189 ATAAATATATTTATCAAA-TAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
** * *
15521269 TGTTATAACCTTTTG-TTCGATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAAT
253 CATTATAACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTC--AAT
* * * * * * *
15521331 AAAATGATACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGT
314 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * * ** * *
15521396 TTGTCGAACT-AGCTT-AAATAGTTAAGAATGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGAC
379 TT-ACTAAATAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * ** * * *
15521459 CTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATCTCAACTT-ATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACT
442 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * *
15521523 AATGTATTAACATTTTCAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTT-GTCAAACC
506 AATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAATAAATCTATTTACT-GAACA
*
15521583 A-TTTCAAATA---AT---TA--T-AAC---TA--T-TTT-AAATCATTATGA-CTTTTGCTTTT
568 AGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG--TTT
* * * * * * *
15521630 GTAATAAAACAATAGTTTC-AGTTCATATAAGCCTATTT-GAAGTAAATTAATACTAATTGACTA
630 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
15521693 TTATTTTGAGAATTAATGTGTAAGAG
693 ATATTTTAAAAATTAA----TAAAAG
* * *
15521719 AATTAAAAAA-AGAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT---CAA--A---
1 ATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * *
15521775 A---C--A---TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTTTGTT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * * *
15521832 TTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAATTAA-AAATTTAAAAAATA
130 TGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
15521895 AATTTATTTTTTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAACTATCTATTTCAAA-CA-
192 AATATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * *
15521957 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-GTTCGTGCAACCTTATTCTAAATAAAAT
256 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-TCAATAAAAT
* * *
15522021 AATACTAATTTATT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGT-AAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTAC
319 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* *** * ** * *
15522082 CAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTG
383 TAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * * **
15522147 TTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
448 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * *
15522212 TAATATTAT-AAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGT-TATTTATTGAACAAGTTCAA
513 TAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAATAAA-TCTATTTACTGAACAAGTTTAA
* * * * * * * * * ** *
15522274 ATAATTGTGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCGTAAAA
575 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA
* * * * ** ** * *
15522339 CTATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAA
639 CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA
*
15522404 ATTAATAAGAG
704 ATTAATAAAAG
* * * * * * * *
15522415 ATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAA-TAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATAACCT
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
15522479 ATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
** * * * * * *
15522543 CAGAATAAAATACTGCTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAA
130 TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * *
15522608 ATGTGTTTGCTGAAAT-AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCATT
193 ATATATTT-ATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * *
15522672 TTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATA
257 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTC--AATAAAATA
* ** * * *
15522735 ATACTAATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAAAACAAAAAATTTTATAAAATAAATCTGTTT
320 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT--AAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTT
* * * * * * * * * * *
15522799 ATTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTAATTAAACAAATATATA-TTAAAAACAAATATGACCTT
381 ACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATAACCTT
* * * * * * * * *
15522862 TTGTTTTATCATAAAACAA-TG-TTTCAGTTCATAAAATCGTATCCAAAATAAAATAATATTACT
445 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * * *
15522925 ATATTAATATTTCAAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAA-ACAAGTCAATTTA-TCGAATC-
509 TTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATA-AA-TCTATTTACT-GAA-CA
* * * * * * * * *
15522987 AGTTCAAACAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACTTTTTTTTGTC
568 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTC
* * * *** * * *
15523052 ATAAAATAATTTTTTTTCGCCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
633 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
15523117 TCAAAAATTAGTAAGTAAGAG
698 TTAAAAA-T--TAA-TAAAAG
* *
15523138 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC-----C--A-A--T-T-CCTATTTGAACAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* ** * * * * * ** *
15523191 TTTCAAATTGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATATTT
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
* * * * * *
15523256 GAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTACAAAATAAA
131 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * ** ** * * ** * * ** **
15523321 TGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATGATTAAAACTATTAT-AACAATTATCTATCCCAAATCATCC
194 TATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
** * * * **
15523385 TAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTAAAATAAAATAATA
258 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAATAAAATAATA
* * * * * * *
15523450 TTATTTTATTAACA-TTCAAAATATTAATAAG-AAAGAAATTTTTAAAAA-AAATCTATTTAAC-
323 CTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAA-AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACT
* * * *
15523511 AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
384 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * ** * * * * * * *
15523576 TTTATCATAAAAAAATTGTTTCAACTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
449 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
15523641 AATATTTCAAAAATTGAGAAGT-TGTAGATTTAAAAGATAAAT-TAGTTTA-TCGAATTAA-TTC
514 AATATTTC-AAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAA-ATAAATCTA-TTTACT-GAA-CAAGTTT
* ** ** * * * *
15523702 AAATAATTATGGTTATTCAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAA
573 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTTGTCATAA
* * *** * *
15523767 AACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA
637 AACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
*
15523831 AAAATTCATAAGTAGGAG
701 AAAATTAATAA--A--AG
* * * ** * *
15523849 ATTTAAAAAATAAATCTATATACCTAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATA
1 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
15523914 TTTCAAATTGTTAT-AGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGTTTATT
66 TTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
** * ** * * * *
15523978 CAGAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTATGAAATTAATAAATAAGAGATTTAAATAATAAA
130 TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** *** * * * ** *
15524043 TTTGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
194 TATATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * ** * * * * * * **
15524108 GACCTTTTTATTTTGTTGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTAAGAATAAAATAAT
259 AACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TCAATAAAATAAT
* ** * *
15524173 ATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGATTACCAAA
322 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
* * * * *
15524234 CT-AGTTCAACTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCAAA
387 -TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
15524279 ATAATACTAC
Statistics
Matches: 8976, Mismatches: 2114, Indels: 1723
0.70 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
680 1 0.00
681 15 0.00
682 201 0.02
683 31 0.00
684 175 0.02
685 125 0.01
686 135 0.02
687 42 0.00
688 31 0.00
689 30 0.00
690 2 0.00
692 12 0.00
693 40 0.00
694 8 0.00
695 4 0.00
696 194 0.02
697 221 0.02
698 253 0.03
699 121 0.01
700 103 0.01
701 177 0.02
702 123 0.01
703 89 0.01
704 86 0.01
705 79 0.01
706 16 0.00
707 10 0.00
708 10 0.00
709 40 0.00
710 285 0.03
711 284 0.03
712 312 0.03
713 351 0.04
714 404 0.05
715 472 0.05
716 613 0.07
717 669 0.07
718 324 0.04
719 356 0.04
720 221 0.02
721 68 0.01
722 131 0.01
723 260 0.03
724 106 0.01
725 11 0.00
726 8 0.00
727 11 0.00
728 10 0.00
729 23 0.00
730 23 0.00
731 24 0.00
732 42 0.00
733 20 0.00
734 16 0.00
735 5 0.00
736 23 0.00
737 125 0.01
738 174 0.02
739 83 0.01
740 42 0.00
741 19 0.00
742 16 0.00
743 32 0.00
744 21 0.00
745 24 0.00
746 20 0.00
747 19 0.00
748 36 0.00
749 35 0.00
750 35 0.00
751 9 0.00
752 17 0.00
753 22 0.00
754 9 0.00
755 26 0.00
756 76 0.01
757 11 0.00
758 4 0.00
759 8 0.00
760 3 0.00
761 4 0.00
762 59 0.01
763 3 0.00
764 5 0.00
765 8 0.00
766 60 0.01
767 19 0.00
768 42 0.00
769 16 0.00
770 22 0.00
771 11 0.00
772 5 0.00
773 2 0.00
774 7 0.00
775 1 0.00
776 1 0.00
777 7 0.00
778 1 0.00
779 9 0.00
780 9 0.00
781 19 0.00
782 6 0.00
783 6 0.00
784 6 0.00
785 5 0.00
787 5 0.00
788 6 0.00
789 5 0.00
790 1 0.00
791 12 0.00
792 14 0.00
793 21 0.00
794 7 0.00
795 8 0.00
796 9 0.00
797 3 0.00
798 1 0.00
799 8 0.00
800 1 0.00
801 4 0.00
803 2 0.00
804 2 0.00
807 3 0.00
808 3 0.00
809 5 0.00
810 10 0.00
811 6 0.00
813 1 0.00
814 6 0.00
816 2 0.00
819 7 0.00
820 11 0.00
821 8 0.00
822 77 0.01
823 83 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (714 bp):
ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
TATTTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAG
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGAC
TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAAAG
Found at i:15513092 original size:536 final size:535
Alignment explanation
Indices: 15511563--15520290 Score: 3932
Period size: 536 Copynumber: 16.3 Consensus size: 535
15511553 ATTCAAAAAA
* * * * * *
15511563 AAAATAATACT-ATTTTATTAACT-TTCAGAAAATTAGTAAGCATGAAATTTAAAAAAATAAATC
1 AAAATAATACTAAATTTATTAA-TATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATT
** * * * *
15511626 TGTTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TATGA
63 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGA
* * ** * * * *
15511690 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATT
127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * *** * *
15511755 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCA-GTTTAACGAATC
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAAT-ATGTTT-ACCAAAC
* * * * *
15511819 CA-TACAAATAATTAT-GCTCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTT
254 TAGTTCAAATAGTTATAACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTT
* * *
15511881 TGTCATAAAACAATTGTTTTTC-A-TCATACAAGCCTAT-TTGGAATAAAAAAACTAATTAATTA
317 TGTCAT-AAACAATTG--TTTCAATTCATACAAG-CTATGTT--AA-AATAATACTAATTTATTA
* * * * *
15511943 ATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAAGAAATATTTTTACTAAACCAGCTCAAAT
375 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT
* * * *
15512006 AGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACA
439 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACA
* * * *
15512071 ATTATTTAAGTTCATATAAGCTT-GTTCAAAAT
504 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
* * *
15512103 AAAATAATACT-AATCTAATAATATT-ATGAAAATTAAT-AGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATT
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATTCA--AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * ** * * * * * *
15512165 TGTTTAGTGAACAAATTTGAATAGTTAAGGCTATATGTATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
63 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGA
* * ** * * * * ** *
15512230 CCTTTTGTTGTATCATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATT
127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * *
15512295 AATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACTA
* * * * ** *
15512356 GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTGTTTTATT
256 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTT-GT
* * *
15512420 ACA-AAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTAAT-TTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATA
320 -CATAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT-ATGTT---A-AA-ATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
15512483 TTCT-AAAA--AATAAGTAAGATATTTAAAAACTAAATATGTTTA-TCAAATAAGTTTAAATAGT
378 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGT
* * ** * * *
15512544 TATGATTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAATAAAT
442 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAA-CAAT
* *
15512609 TCTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATT
506 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAAT
** *
15512638 AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAACAACAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAAATTT
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATTT
* * * * * *
15512702 GTTTACTGAATAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTGGAAATCATTATAAC
64 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-CAAATCATTATGAC
* * * * *
15512767 TTTTTGATTTGTCATCAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTA
128 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * *
15512832 ATTTACTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
193 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGT
*
15512897 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTCAT
258 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * ** *
15512962 CAAACAATTGTATCAATTAATATAGGCT-TGTTAAAATAGCACTAATTGATTAATATTCTAAAAA
323 -AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTATGTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * * *
15513026 TTAATGAGCAAGAGATTTAAAATATGAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATT
387 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *
15513090 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTCTA-AAAATAATTGTTTCTA-T
452 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT-TATAAAACAATTGTTT-TAGT
*
15513153 TCATACAAGCTTACTTT-GAAT
515 TCATACAAGCTTA-TTTCAAAT
* * * *
15513174 AAAATAATA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * ** *
15513237 TTT--T-------TT----TA---A-CAC-ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTATGACA
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGACC
* ** * *
15513284 TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCGTATT-TGAAATAAAA-AATACTA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTA
* * * * * *
15513347 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCTAG
193 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACTAG
* * * * * * *
15513412 TTCAAATAGTTATCATTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATTA-TATTTTGTTTTATC
257 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTC
* * * * * * **
15513476 ATAAAGCAACTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAAATTAAAAATATT
321 ATAAA-CAATTGTTTCAATTCATACAAG-CTA-T--G-TTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
15513541 CTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAACAAGTTTAAATAGTCA
380 CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
15513605 TGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
444 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTG
**
15513669 TTTCTA-TTCATACAAAATTATTT-AGAAT
508 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCA-AAT
* * * *
15513697 AAAATAATA-TTAATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTG
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* *
15513756 TTTACTGAAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
65 TTTACTG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TCAAATCATTATGAC
* * ** *
15513820 C-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATACTA
128 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * *
15513883 ATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTATTTGCCAAACTA
193 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTACCAAACTA
* * * * * * * * * *
15513947 GTTGAAATAGTTA-AGAGTA-TTGAACAA-TATTTTATTTTAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAG
256 GTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTG
* * * * * *
15514009 TCATAAAATAATTATTCCAGTTCATACAAGCTTATTTACAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
319 TCAT-AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TATGT----TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
15514074 TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAATTCAATTAAT
378 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
15514139 T-TTACTATTTGAACAATTATCTATAT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAT
442 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAT
* * * * *
15514202 TGTTTTAGTTAATAAAAACTTATATGAAAT
506 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAAT
* * ** * * ** *
15514232 AAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGCCAGACATTTAAAAACTAAAGCTA
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
** * * * * *
15514296 TTTTTTGAACCAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATG--G
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TCAAATCATTATGACC
* * * * *
15514359 TATTT-TTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCATATTCA-AATGAAAGTAATAC
129 T-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATAC
* * *
15514421 TAATTTA-TAATATTAT-AAAAATTAATAAG----AGATTTACAAAATAAATGTGTTTGCCGAAC
191 TAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAATAAATATGTTTACCAAAC
* * * * * * * *
15514480 CAATTTAAATAATTA-AGACTATTTTAATAATTATCTATTTGAAATCGTT-TGGACTTATTATTT
254 TAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACTTTTTGTTT
* * * * *
15514543 AGTCATATAATAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
317 TGTCATA-AACAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TA--T-G-TTAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * **
15514608 AATTC-AAAATATTAATAAGAAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT
376 TATTCTAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAT
* ** * * * * *
15514672 AATTATGGTTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
439 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACA
* * *
15514737 ATTGTTTTAGTTTATAAAAGCTTA-TCCAAAAT
504 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
* *
15514769 AAAATAATACTACA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAG
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * *
15514833 TTTACAGAATCAA-TTCAAATAATTATGACCT-CTTGAACAACTATCCATTTCAAAAT-GTTATT
65 TTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTA-TTC-AAATCATTATG
* * *
15514895 ACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-ACATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAAT
126 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT
* * ** * * **
15514957 ACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAACAAG----AGACATAAACAATAAATCTATTTACTGAA
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA-AATAAATATGTTTACCAAA
* * * *
15515018 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAAC-TTTTGTT
253 CTAGTTCAAATAGTTATAACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACTTTTTGTT
* * * ** *
15515082 CTATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTA
316 TTGTCAT-AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TA--T-G-TTAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
15515147 AAATT-TCAAAAATTAATAATTAAGA-ATTTTAAAAATAAAT-TCGTTTATTGAACCAGTTCAAA
375 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTAAACAAGTTCAAA
* * * * * ** *
15515209 CAGTTGA-GACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAGGACCTTTTGTTTT-TCATAAAA
438 TAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAA
* * * *
15515272 CAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTA-TTCGGAAT
502 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
** * * * * * *
15515306 AGGATAAAACT-AATTTATTAACATTTCTAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTA
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * *
15515370 TTTA-TCGAACCATTTCAAATA---AT---TA--T-AAC---TA--T-TTCAAATCATTATAACC
65 TTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * * *
15515419 TTTTCTTTTGTAATAAAACAATCG-CTTCAGTTCATATAAGTTTATT-TGAAGTAAAAT-ACACT
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACT
* * * * * * *
15515481 AATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAAAGAATCTATTGACCAAA-TA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATA-AATATGTTTACCAAACT-
* * * * * * *
15515545 ATTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGT
255 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * * * *
15515610 CATAAAACAATTGGTTT-TATTTATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAAT
320 CAT-AAACAATT-GTTTCAATTCATACAAG-CTA---TG-TTAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * * * *
15515673 ATTCCAAAAATTAATAA-TAA-AAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAG
377 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG
* * * *
15515736 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
441 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAT
* * * *
15515801 TGGTTTTA-TCCATGCAAGTTTATTTTGAAA-
506 T-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTCAAAT
* * * *
15515831 AAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAATAATAAAAA
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT-A--AGT-----AA--GA-GAT-----
* * * * *
15515895 ATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
49 -TTAA-AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
15515960 TTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATCCATGCAGGTTTATTT
112 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC
* * * * *
15516025 TGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAATTAACAAAATAA
176 AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAATAA
* * * * * * * * *
15516088 ATTTATTTTCTAAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTA
239 ATATGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* ** * * *
15516152 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTACAATCTTATTTAGAATAAAATAA
303 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TA--T-G-TTAAAATAA
* * * * *
15516217 TACTAATTTATT--TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
362 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAA
*** * * * * *
15516280 GTGAGTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTT
427 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTT
**** * ** * *
15516345 AAAAAGAAAAGTATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTA-TTCGGAAT
492 TGTTATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
* * ** * * ****
15516389 AAAATAATAC-AAATTTATTAATACT-AGAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAGTAAAGCCA
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * * *** **
15516451 CTTACTGAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAA
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGACC
* ** *
15516516 TTTTGTTTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * ** ** *
15516581 TTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAAT
194 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTACCAAACTAGT
* ** * * * * * * *
15516642 TCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAACCTATCTCATATCATTGTGA-TCTTTGTTTTGTCAT
258 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
15516706 AAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGATATAAAATATTACTAAATTAATAATATTCT
323 -AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TA--TG-T-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT
* ** * * *
15516771 AAAAATTAATAAGTAAGAGGTTT-AAAAAT-AATACTAATTAC-AAA-TATTTCTATTGATACAA
382 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACTAAACAAGTTC-A---A-A-TA
* * ** * ** * *
15516832 GTT-T--CTGTTCATGCAA-AATTATTTAGAATAAAAT-AATACTAATCTATTAATATTTTG--A
440 GTTATGACTATT--TG-AACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTA-TAACCT-TT--TGTTTTGTTA
** * *** * * *
15516890 -AAATTACAAAGAGATTTA-AAAACTA-AATCTAATTACCGAAACAGGT
497 TAAA--AC-AATTGTTTTAGTTCA-TACAAGCTTATT-TC--AA-A--T
* * * ** * * *** ** * *
15516936 TAAATAGTTA-TGAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TCTTTATTTTGTCAT
1 AAAATA-ATACT-AA-ATTT-ATTAA-TA--T-TCAAAAAT--TAATAAGT-AAGAGATT-TAAA
* * * ** * * * *** *
15516999 AAA-ACAGTTGTTT-CTTTTCATACAAGCTT-ATTTGGATTAAAAT-AATATTAGTTTAA-TA-A
54 AAATAAATTTGTTTAC---TGA-ACAAG-TTCAAATAG-TT---ATGACTATTTGAACAATTATC
** *** * * * * *
15517058 TATTCCAAAT-ATTAAT-AAGTAAAAG-ATT-T-AAAAAATAAATGTATCTACTGAACCGGTTGA
110 TATT-CAAATCATT-ATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-T-T--T-TA----TT--
* * ** * ** * * * * * * * ***
15517118 AAATAGTTAAGAGTATT-AGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTAAATTA
161 -CATA--CAAGCTTATTCAGAATAA---AATAATACTAAT--TTATTA-ATATT-TCAAAAATTA
* * * * * * *
15517182 ATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTCCAAATAGATT-TTACTATTT
216 ATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAG-TTATAACTATTT
* * * * * * * *
15517246 GAACAATTATCTATATAAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTC
278 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCAATTC
* * ** * *
15517311 ATAAAAACTTATATGAAACAAAATAATACTATTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGA
341 ATACAAGC---TATG--TTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * * * *
15517375 GATTTAAAAAGTAAAGC-GATTTTTTGAACTAGTTGAAATAGCTATGACTATTTG----A--ATC
400 GATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * * **
15517433 ---TT-AACTTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTCT-GATCATACAAGCACA
464 TATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA
**
15517492 TTT-GGAT
528 TTTCAAAT
* * *
15517499 GAAAATAATACCAATTTTA-TAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT
1 -AAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T
* ** * ** * * *
15517559 T-TTTGCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTCA-G
63 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATT-ATG
* * * * * * * **
15517622 ACTTTTTATTTGGTCAGATAATAATTG-TTTTAGTTTATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
126 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
* ** ** * *
15517686 CTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATAAACAAGTGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCG
190 CTAATTTATTAATATTTC--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATATGTTTACCA
* * * * * * *
15517750 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-T
251 AACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTT
* *** * **
15517814 TTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATT
316 TTGTCAT-AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TAT----GTTAAAATAATACTAAT-TTATT
*
15517878 AATATT-TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATCAA-TTC
374 AATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTA-AA-CAAGTTC
* * * * * * * *
15517939 AAATAATTATGACCACTT-AAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGCTTTGTCATA
435 AAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATA
* *
15518003 AAATAATTGTTTTTCAG--CATACAAGCGTA-TTCGAAAT
499 AAACAATTG-TTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
* * *
15518040 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG---G-GATTT-AAAAATAAATCTA
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* ** * * ** *
15518099 TTCACCAAACTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGACC
* * * * *
15518163 TTTTG-TTCGATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACTA
129 TTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * ** *
15518227 ATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACTAG
193 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAG
* * * * * * * *
15518292 CTT-AAATAGTTA-AGAATGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGT
257 -TTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
15518355 CATAAGACAATTATCTCAACTT-ATACAAGCTTATTGGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAACA
320 CATAA-ACAATTGTTTCAA-TTCATACAAGC-TA-T--G-TTAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
15518419 TTTTCAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTT-GTCAAACCATTTCAAATA--
378 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
15518477 -AT---T-TAT-AAC---TAT-T-TTT-AAATCATTATGA-CTTTTGCTTTTTGTAATAAAACAA
442 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG--TTTTGTTATAAAACAA
* * * * * *
15518529 TAGTTTCAGTTCATATAAGCCTATTTGAAGT
505 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCAAAT
* * ** * ** * * *
15518560 AAATTAATACT-AATTTGACTAAATATTTTGAGAATTAATGTGTAAGAGAATTAAAAAAGAAATC
1 AAAATAATACTAAATTT-A-TTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* * *
15518624 TGTTATAC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGAC----T-----A-T-TC-A---AAA-CATTATAA
63 TGTT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTCAAATCATTATGA
* ** * * * * **
15518672 CCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTTTGTTTTGAATAAAATAATA-T
127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * ****
15518735 AAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAGAATTAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAAC-
192 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACT
* * * * *
15518797 ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-C-ATATGAC-CTTTGTTTTG
255 A-GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTG
** * * * *
15518859 TCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATT--TA
319 TCATAAA-CAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TA-TGT---TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
15518922 TTCTAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTT
378 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
15518987 ATGACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTG
443 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTG
* **
15519052 TTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGGAAT
508 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCAAAT
* ** * ** *
15519080 AAAATAATACT-AATTTATTAATATT-ATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGCTA
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * * * *** **
15519142 TTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAATTGCTATGAAA
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGACC
* * * * ** *
15519207 TTTTGTTTTGTCGTAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTAA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* *
15519272 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAA-TAG
194 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTA-CCAAACTAG
* * * * * * * * * *
15519332 TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTAACCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
257 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * *
15519396 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATACTACTAAATAAATAATATT
322 T-AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC-TATGT-----TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * * *
15519460 CTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTTTTGAAGGC-A-TTTAAATAGAT
380 CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AA-ACAAGTTCAAATAGTT
* * * ** * ** * *
15519523 ATGACTTTTTGAACAGTTATCTATTTCAATTTTTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTG
443 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTG
* *
15519588 TTTCTA-TTCATACAAGCATATTTGAAAT
508 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCAAAT
* * *
15519616 AAAA-AATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATG
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * * * * *
15519678 TTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATCACTGTTTAAACAATTATTTATTTTAAAT-AGCTATTAT
65 TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCA-TTATGAC
* * * * * * * *
15519742 CTTTTGATTTGTTACAAAACAATTATTTCTATTGATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTA
128 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
** ** ** * * * * *
15519807 ATTTACAAATA-TTCTAAAAATTAATTGGTAGGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
193 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT-TAAAAATAAATATGTTTACCAAACTA
* ** * * * * * *
15519871 GTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTCTTGTTTTGTC
256 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
* ** * ** * *
15519936 ATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT
321 AT-AAACAATTGTTTCAATTCATAC-AAGCTA-T--G-TTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** * *
15520001 TTGAAAA-T--T-ACTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTAATTACCGAAACAGGTTC-AATAGTTA
380 CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
15520061 TCAATATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
444 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGT
* ** *
15520125 TTCT-TTTCATACAAGCTTATTTGGATT
509 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCAAAT
* * * * * * * *
15520152 AAAATAATA-TTAGTTTAATAATATTCCAAATAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTA
1 AAAATAATACTAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * * * * * *
15520216 TCTAATGAATC-GGTTGAAAATAGTTAAGAGTATTAGAACATTTTTTTATTTCAAATCATTCTGA
65 TTTACTGAA-CAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATGA
15520280 CCTTTTGTTTT
127 CCTTTTGTTTT
15520291 AAATTAATGA
Statistics
Matches: 6332, Mismatches: 1334, Indels: 1045
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
503 10 0.00
504 3 0.00
505 50 0.01
506 6 0.00
507 42 0.01
508 53 0.01
509 15 0.00
510 56 0.01
511 16 0.00
512 3 0.00
514 2 0.00
515 50 0.01
516 206 0.03
517 11 0.00
518 18 0.00
519 35 0.01
520 115 0.02
521 84 0.01
522 125 0.02
523 109 0.02
524 169 0.03
525 103 0.02
526 15 0.00
527 36 0.01
528 15 0.00
529 109 0.02
530 14 0.00
531 90 0.01
532 64 0.01
533 60 0.01
534 250 0.04
535 597 0.09
536 980 0.15
537 578 0.09
538 398 0.06
539 371 0.06
540 482 0.08
541 94 0.01
542 19 0.00
543 28 0.00
544 4 0.00
545 14 0.00
546 5 0.00
547 17 0.00
548 19 0.00
549 6 0.00
550 18 0.00
551 13 0.00
552 11 0.00
553 2 0.00
554 1 0.00
555 6 0.00
556 7 0.00
557 34 0.01
558 144 0.02
559 188 0.03
560 46 0.01
561 17 0.00
562 16 0.00
563 8 0.00
564 10 0.00
565 3 0.00
568 2 0.00
569 12 0.00
570 10 0.00
571 6 0.00
572 9 0.00
573 14 0.00
574 3 0.00
575 7 0.00
577 4 0.00
578 5 0.00
579 6 0.00
580 2 0.00
581 1 0.00
583 12 0.00
584 57 0.01
585 9 0.00
586 83 0.01
587 9 0.00
588 7 0.00
589 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
AAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTCAAATCATTATGACCTT
TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT
TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCA
AATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA
CAATTGTTTCAATTCATACAAGCTATGTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
CAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAC
AAGCTTATTTCAAAT
Found at i:15513392 original size:162 final size:162
Alignment explanation
Indices: 15513087--15513401 Score: 422
Period size: 162 Copynumber: 1.9 Consensus size: 162
15513077 TAGTTATACT
* * *
15513087 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTCTAAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCTAAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
15513152 TTCATACAAGCTTACTTTGAATAAAATAATATAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAA
66 CTCATACAAGCGTACTTTGAATAAAATAATATAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
*
15513217 AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTTTTAACAC
131 AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTTAACAC
* * ** * * *
15513249 ATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATTTTTATGACATTTTGTTTTGTC-ATAAACCAATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCTA-AAAACAATTGTTTCT
*
15513313 GCTCATACAAGCGTA-TTTGAAATAAAA-AATACTAA-TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAC
65 ACTCATACAAGCGTACTTTG-AATAAAATAATA-TAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAC
15513375 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
128 TAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTT
15513402 ATCGAGCTAG
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 16, Indels: 8
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
161 39 0.29
162 94 0.71
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.07, T:0.43
Consensus pattern (162 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCTAAAAACAATTGTTTCTA
CTCATACAAGCGTACTTTGAATAAAATAATATAAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAA
AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTTAACAC
Found at i:15515405 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 15515381--15515417 Score: 65
Period size: 19 Copynumber: 1.9 Consensus size: 19
15515371 TTATCGAACC
15515381 ATTTCAAATAATTATAACT
1 ATTTCAAATAATTATAACT
*
15515400 ATTTCAAATCATTATAAC
1 ATTTCAAATAATTATAAC
15515418 CTTTTCTTTT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 17 1.00
ACGTcount: A:0.46, C:0.14, G:0.00, T:0.41
Consensus pattern (19 bp):
ATTTCAAATAATTATAACT
Found at i:15515423 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 15515377--15515423 Score: 60
Period size: 19 Copynumber: 2.5 Consensus size: 19
15515367 TTATTTATCG
*
15515377 AACCATTTCAAATAATTAT
1 AACCTTTTCAAATAATTAT
*
15515396 AA-CTATTTCAAATCATTAT
1 AACCT-TTTCAAATAATTAT
15515415 AACCTTTTC
1 AACCTTTTC
15515424 TTTTGTAATA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 4
0.80 0.07 0.13
Matches are distributed among these distances:
18 1 0.04
19 21 0.88
20 2 0.08
ACGTcount: A:0.40, C:0.19, G:0.00, T:0.40
Consensus pattern (19 bp):
AACCTTTTCAAATAATTAT
Found at i:15515736 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 15515398--15516782 Score: 1125
Period size: 180 Copynumber: 7.6 Consensus size: 180
15515388 ATAATTATAA
* * * * * * * *
15515398 CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAA-TCGCTTCAGTTCATATAAGTTT
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TTCATACAAGTTT
* * * *
15515462 A-TTTGAAGTAAAATACA-CT-AATTTATTAATATTTCAAGAATTAATGAGTAAAAGAATTAA-A
65 ATTTTGAA-TAAAATA-ATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AATAAAA-AATTAACA
* ** * * * *
15515523 AAA-AGAATCTATTGACCAAATAAT-TTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTAT
126 AAATA-AATTTATTTTCTAAA-CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* *
15515578 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTTATGCAAGTTTA
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGTTTA
*
15515643 TTTTGAATAAAATAATATAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATA
66 TTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATA
15515708 AATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
131 AATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* *
15515758 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATCCATGCAAGTTTA
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGTTTA
* *
15515823 TTTTGAAAAAAATAATATAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTATTCCAAAAATTAATA
66 TTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCC--------------A----AAAA-TTAATA
15515888 ATAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
112 ATAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
15515953 TTAT
177 TTAT
* * *
15515957 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATCCATGCAGGTTTA
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGTTTA
*
15516022 TTTTGAATAAAATAATATAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATA
66 TTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATA
15516087 AATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
131 AATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
*** * * * *
15516137 CTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT-GTTTCTGTTCGTACAA-TCT
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTCATACAAGT-T
* * **
15516200 TATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATT--TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAA-A
64 TATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAA-AATTAACA
* * * * ** * *
15516261 AAATAAATCTGTTTACCAAGTGA-GTTCAAATAGTTATGACTATGTGAACAATTAT
126 AAATAAATTTATTTTCTAA-ACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * **** * **
15516316 TTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAAAAAGAAAAGTATT-GTTTCTATTCATACAAGTTT
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTCATACAAGTTT
** * * * *** *
15516380 ATTCGGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA--CTAGAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAA-AA
65 ATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAAT-AATAAAAAAT-TAACAA
* *** * * * * * * * * * * *
15516441 AGTAAAGCCACTTACTGAACAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTAAACTATTAT
127 AATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
**** ** * * **
15516495 CTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATACAAAATTA
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGTTTA
* * * * * *
15516560 TTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AA-AGAGATTTAA-AAACT
66 TTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAAT
* * * ** * * * * * *
15516621 AAATTTGTTTAT-AAAAAAAATTCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAAC
130 AAATTTATTT-TCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * *
15516672 CTATCTCATATCATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAAAAGCTT
1 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTCATACAAGTTT
* * *
15516735 A-TTTGATATAAAATATTACTAAA-TTAATAATATTCTAAAAATTAATAA
65 ATTTTGA-ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
15516783 GTAAGAGGTT
Statistics
Matches: 1000, Mismatches: 155, Indels: 103
0.79 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 7 0.01
176 65 0.06
177 56 0.06
178 21 0.02
179 258 0.26
180 368 0.37
181 46 0.05
185 1 0.00
194 1 0.00
198 4 0.00
199 173 0.17
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
CTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGTTTA
TTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATA
AATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
Found at i:15515874 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 15515852--15515889 Score: 76
Period size: 19 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
15515842 AATTTGTTAA
15515852 TATTCCAAAAATTAATAAT
1 TATTCCAAAAATTAATAAT
15515871 TATTCCAAAAATTAATAAT
1 TATTCCAAAAATTAATAAT
15515890 AAAAAATTAA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.11, G:0.00, T:0.37
Consensus pattern (19 bp):
TATTCCAAAAATTAATAAT
Found at i:15516326 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15515871--15516779 Score: 632
Period size: 179 Copynumber: 5.1 Consensus size: 179
15515861 AATTAATAAT
* * * * *
15515871 TATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGT
1 TATTCCAAAAATTAAGAATAAAAAATTAACAAAATAAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGT
*
15515936 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
66 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
15516001 GGTTTTATCCATGCAGGTTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTGTTAA
131 GGTTTTATCCATACAGATTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATT-A
* * * * *
15516051 TATTCCAAAAATTAATAATAAAAAATTAACAAAATAAATTTATTTTCTAAACATGTTTAAATAGT
1 TATTCCAAAAATTAAGAATAAAAAATTAACAAAATAAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGT
** * *
15516116 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTAATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT
66 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *
15516181 -GTTTCTGTTCGTACA-ATCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATT-
131 GGTTT-TATCCATACAGAT-TTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTA
** * **
15516229 TATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGCTTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCAAGTGA-GTTCAAAT
1 TATTCCAAAAATTAAGAA-TAAAA-AATTAACAAAATAAATCTATTTACCAA-ACATGTTCAAAT
* * * **** * **
15516292 AGTTATGACTATGTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTAAAAAGAAAAGT
63 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** *
15516357 ATT-GTTTCTATTCATACA-AGTTTATTCGGAATAAAATAATACAAATTTATTA
128 ATTGGTTT-TATCCATACAGA-TTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTA
* * * *** * * * * * ** *
15516409 -ATACTAGAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAA-AAAGTAAAGCCACTTACTGAACAAGTTCAAAT
1 TATTCCA-AAAATTAA-GAATAAAAAAT-TAACAAAATAAATCTATTTACCAAACATGTTCAAAT
* * * * * * *** ** *
15516471 AATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACT
63 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
15516536 ATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
128 ATTGGTTTTATCCATACAGATTTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATT-A
* * * * * * * ** * ** *
15516589 TATTTCAAAAATTAA-AA-AGAGATTTAA-AAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAAT
1 TATTCCAAAAATTAAGAATAAAAAATTAACAAAATAAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
15516651 TATGCCTATTTGAATAATAACCTATCTCATATCATTGTGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT
66 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
15516715 -GTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTT-GATATAAAATATTACTAAATTAATAA
131 GGTTT-TATCCATACAGA-TTTATTTAGA-ATAAAATAATA-TAAATTTATTA
*
15516765 TATTCTAAAAATTAA
1 TATTCCAAAAATTAA
15516780 TAAGTAAGAG
Statistics
Matches: 580, Mismatches: 126, Indels: 50
0.77 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 8 0.01
176 61 0.11
177 59 0.10
178 21 0.04
179 246 0.42
180 178 0.31
181 7 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TATTCCAAAAATTAAGAATAAAAAATTAACAAAATAAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGT
TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
GGTTTTATCCATACAGATTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTA
Found at i:15517079 original size:293 final size:293
Alignment explanation
Indices: 15516546--15517091 Score: 763
Period size: 293 Copynumber: 1.9 Consensus size: 293
15516536 ATTGTTTTTA
*
15516546 TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGAGA
1 TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGAGA
* ** * **
15516611 TTTAAAAACTAAATTTGTTTATAAAAAAAATTCAAATAATTATGCCTATTTGAATAATAACCTAT
66 TTTAAAAACTAAATCTAATTACAAAAAAAATTCAAATAATTATGAATATTTGAATAATAACCTAT
* * *
15516676 CTCATATCATTGTGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGA
131 CTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGA
* * * *
15516741 TATAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAATAATACT
196 TATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAATACT
15516806 AATTACAAATATTTCTATTGATACAAGTTTCTG
261 AATTACAAATATTTCTATTGATACAAGTTTCTG
* ** *
15516839 TTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAATTACAAAGAGA
1 TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGAGA
* * ** * * *
15516904 TTTAAAAACTAAATCTAATTACCGAAACAGGTT-AAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATCTA
66 TTTAAAAACTAAATCTAATTA-CAAAAAAAATTCAAATAATTATGAATATTTGAATAATAACCTA
* * * *
15516968 TCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTG
130 TCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTT-
* ** *
15517033 GAT-TAAAATAATATTAGTTTAATAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
194 GATATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
15517092 ATAAATGTAT
Statistics
Matches: 218, Mismatches: 33, Indels: 4
0.85 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
293 209 0.96
294 9 0.04
ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (293 bp):
TTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGAGA
TTTAAAAACTAAATCTAATTACAAAAAAAATTCAAATAATTATGAATATTTGAATAATAACCTAT
CTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGA
TATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAATACT
AATTACAAATATTTCTATTGATACAAGTTTCTG
Found at i:15518046 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 15517188--15520212 Score: 1312
Period size: 181 Copynumber: 17.1 Consensus size: 178
15517178 ATTAATGAGC
* * *
15517188 AAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TTGTTTACCA-AACAAGTCCAAATAGATT-TTACTATTTGAAC
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTA-CAGAACAA-TTCAAATAG-TTATGACTATTT-AAC
* ** * *
15517250 AATTATCTATATAAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATA
61 AATTATCTATTTAAAATTGTTATAACC-TTTT-GTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA--TCATA
* * * * * **
15517314 AAAACTTATAT-GAAACAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
122 CAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * *** * * * *
15517371 AAGAGATTTAAAAAGTAAAGCGA-TTTTTTGAACTAGTTGAAATAGCTATGACTATTT---GA--
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTAACAATT
* * * * * * *
15517430 ATC---TT-AACTTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTCTGATCATACAAGCA
65 ATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTATCATACAAGCT
* *** * *
15517490 CATT-TGGATGAAAATAATACCAATTT-TATAATATTTTAAAAA-T--T-AAT
128 TATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * ** * *
15517537 AAGAGATTTAAAAAATAAATGT-TTTTGCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATT-TAACAAT
* ** * * * * * *
15517601 TATCTATTTGAAATCATTCA-GACTTTTTATTTGGTCAGATAATAATTG-TTTTAGTTTATACAA
64 TATCTATTTAAAATTGTT-ATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAATAATTGTTTTTA--TCATACAA
*** * *
15517664 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATAAAC
125 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAAATTAATAAAT
* *
15517719 AAGTGATTTGAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTACAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAA
* * * *
15517783 TTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGC
63 TTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATCATACAAGC
*
15517848 TTATCCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
127 TTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * *
15517900 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACCACTTAAGCAAC
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTAA-CAAT
* * * *
15517964 TATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAGCATACAAGC
64 TATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATCATACAAGC
* * *
15518029 GTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AAT
127 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * *
15518077 AAGGGATTT-AAAAATAAATCTA-TTCACCA-AACTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-CAGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAA
* * *
15518138 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCGATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG
63 TTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTG-TCATAAAATAATTGTTTTTA-TCATACAAG
* * *
15518203 CTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAAT
126 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * * *
15518256 AAGAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTGTC-GAACTAGCTT-AAATAGTTAAGAATGTATGAACA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTT-ACAGAAC-A-ATTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACA
* * * * * * * * ** *
15518318 ATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATCTCAACTTATACAA
62 ATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TCATACAA
*** * * * *
15518383 GCTTATTGGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAACATTTTC-AAAATT--T--AT
125 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * *
15518433 AAGAGATTTAGAAAATAATTCTA-TTTGTCA-AACCATTTCAAATA---AT---T-TATAAC---
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTT-ACAGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTAACAAT
** * * * * * *
15518486 TAT-T-TTT-AAATCATTATGA-CTTTTGCTTTTTGTAATAAAACAATAG-TTTCAGTTCATATA
64 TATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG---TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA--TCATACA
* ** * * * ** * ***
15518546 AGCCTATTTGAAGTAAATTAATACTAATTTGACTAAATATTTTGAGAATTAATGTGT
124 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-A-TTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * *
15518603 AAGAGAATTAAAAAAGAAATCT-GTTATACA-AATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT--C---
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTT-TACAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAACAAT
* * * ** * * *
15518660 -A---A---AACA---TTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTT
64 TATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TCATACAAGCT
* *** * *
15518715 TGTTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAGAATT
128 TATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * *** * *
15518765 AA-AAATTTAAAAAATAAATTTA-TTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAAT
* ** * ** * * *
15518828 TATCTATTTCAAA--CATATGACC-TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGT-TCGTGCAAC
64 TATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTT-T-TATCATACAAG
* * *
15518889 CTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGT
126 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* * * * *
15518940 AAAAGATTTAGAAAATAAATCT-GTTTACCA-AGCGAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-CAGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAA
* * * * * * *
15519003 TTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAG
63 TTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TCATACAAG
* *** * *
15519068 TTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-ATAAAA-TAATGAGT
126 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAAT
** * * ** * * * * *
15519119 TGGAGATGTAAAAAATAAAGCTA-TTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACTAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAAT
* * * * * *
15519183 TATCTATTTGAAATTGCTATGAA-ATTTTGTTTTGTCGTAAAACT-ATTATTTTTGTTCATACAA
64 TATCTATTTAAAATTGTTAT-AACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-TAATTGTTTTT-ATCATACAA
** * *
15519246 AATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AAT
125 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * *
15519296 AAGAGATTTAAAAACTAAAT-TTGTTTATC-GAA-ATAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-CAGAACA-A-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACA
* * * * * ** * *
15519358 GTAACCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGT-TCATACA
62 ATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTT-T-TATCATACA
* * * * *
15519421 AGCTTATTCAAAATAAAATACTACTAAATAAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT
124 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* * *** * * * *
15519476 AAGAGGTTTAAAAAATAAATGT-GTTTTTTGAAGGC-ATTTAAATAGATATGACTTTTTGAACAG
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAA--CAATTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAA
* * * * ** ** *
15519539 TTATCTATTTCAATTTTTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAG
63 TTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TCATACAAG
* ** * * *
15519604 CATATTTGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGT
126 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * *
15519656 AAAAGATTT-AAAAATAAATAT-GTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATCACTGTTTAAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAAT
* * * * * * * * * * * * *
15519719 TATTTATTTTAAATAGCTATTATCTTTTGATTTGTTACAAAACAATTATTTCTATTGATACAAGT
64 TATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TCATACAAGC
** ***
15519784 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACAAATA-TTCTAAAAATTAATTGGT
127 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* * * * * *
15519836 AGGAGATTCAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAAT
* * ** * * * *
15519900 TATTTATTTCAAATCATTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGT-TCATGCAAA
64 TATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTT-T-TATCATACAAG
* * * ** *
15519964 ATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAA-T--T-ACT
126 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * * *
15520013 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTA-ATTACCGAAACAGGTTC-AATAGTTATCAATATTTGAATAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAG-AACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAA
* * ** * * * *
15520076 TTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAG
63 TTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTT-TGTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTATCATACAAG
*** * * * * * * * *
15520140 CTTATTTGGATTAAAATAATATTAGTTTAATAATATTCCAAATAGTAATAAGT
126 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
*
15520193 AAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT
15520213 GTATCTAATG
Statistics
Matches: 2184, Mismatches: 481, Indels: 357
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
160 1 0.00
161 37 0.02
162 18 0.01
163 19 0.01
164 47 0.02
165 48 0.02
166 56 0.03
167 7 0.00
168 7 0.00
169 9 0.00
170 93 0.04
171 4 0.00
172 16 0.01
173 7 0.00
174 8 0.00
175 130 0.06
176 294 0.13
177 230 0.11
178 33 0.02
179 308 0.14
180 264 0.12
181 365 0.17
182 100 0.05
183 83 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (178 bp):
AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACAGAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTAACAATTA
TCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATCATACAAGCTTAT
TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
Found at i:15518347 original size:356 final size:353
Alignment explanation
Indices: 15517657--15518457 Score: 902
Period size: 356 Copynumber: 2.2 Consensus size: 353
15517647 TGTTTTAGTT
*
15517657 TATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATAAACAA
1 TATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTC---AAAATTAAT----AA
* * * * *
15517721 GTGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
59 GAGATTT--AAAAATAAATCTATTCACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTA
* * *
15517786 TCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA
122 TCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTCGTCATAAAACAAATGTTTCTATTCATAAAAGCTTA
* *
15517851 TCCAAAATAAAATAATACTATGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT
187 TCCAAAATAAAATAATACTATGTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * *
15517916 AAATTAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACCACTTAAGCAACTATCTATTTGAAATCGT
252 AAATTAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTAAGA-CACTTAAACAACTATCTATTTCAAATCGT
* * * *
15517981 TATTACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAGC
316 TATTACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAA-T-TATCTCAAC
* * * *
15518021 -ATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGGGATT
1 TATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAA-AATTAATAAGAGATT
* *
15518085 TAAAAATAAATCTATTCACCAAACTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
65 TAAAAATAAATCTATTCACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTA
* * * *
15518149 AAATTGTTATAACCTTTTGTTCGATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
130 AAATTGTTATAACCTTTTGTTCG-TCATAAAACAAATGTTTCTATTCATAAAAGCTTATCCAAAA
* *
15518214 TAAAATGATACTAAT-TTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTTAAAAATAAATCT
194 TAAAATAATACT-ATGTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T
* * * * * * *
15518278 -GTTTGTCGAA-CTAGCTT-AAATAGTTAAGA-A-TGTATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
257 AGTTTATAGAATC-A-ATTCAAATAATTAAGACACT-TA--AACAACTATCTATTTCAAATCGTT
* *
15518338 -TTGACCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATCTCAAC
317 ATT-ACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTATCTCAAC
* * * * *
15518375 TTATACAAGCTTATTGGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAACATTTTCAAAATTTATAAGAGAT
1 -TATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTTCAAAATTAATAAGAGAT
*
15518440 TTAGAAAATAATTCTATT
64 TTA-AAAATAAATCTATT
15518458 TGTCAAACCA
Statistics
Matches: 374, Mismatches: 48, Indels: 37
0.81 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
353 1 0.00
354 9 0.02
355 50 0.13
356 232 0.62
357 24 0.06
358 8 0.02
361 2 0.01
362 7 0.02
363 38 0.10
364 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (353 bp):
TATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAATTAATAAGAGATTT
AAAAATAAATCTATTCACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAA
AATTGTTATAACCTTTTGTTCGTCATAAAACAAATGTTTCTATTCATAAAAGCTTATCCAAAATA
AAATAATACTATGTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTT
TATAGAATCAATTCAAATAATTAAGACACTTAAACAACTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTT
TGCTTTGTCATAAAACAATTATCTCAAC
Found at i:15518985 original size:176 final size:177
Alignment explanation
Indices: 15518657--15520212 Score: 1084
Period size: 179 Copynumber: 8.7 Consensus size: 177
15518647 GTTATGACTA
* * * * * * * * *
15518657 TTCAAAACATTATAACCTTT-TGTTTGTCATAAAACAATTGGTCCTATTCGTGCAAGTTTGTTTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * * *
15518721 GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TCAAAATTAAGAATTAA-AAATTTAAAAAATAAA
65 AAATAAAATAATACT-AATTTATT--TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *** * *
15518783 TTTATTTTTTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
127 TCT-GTTTACCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
15518835 TTCAAA-CA-TATGACCTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTCTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTA
* * *
15518898 AATAAAATAATACTAATTTATTTATTCTAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTAGAAAATAAATCTG
66 AATAAAATAATACTAATTTATTTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * *
15518963 TTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTATTTAT
131 TTTACCAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * *
15519011 TTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT-T
1 TTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * ** *
15519075 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TATAAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAATAAA
65 -AAATAAAATAATACTAATTTATTTAT-TCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * *
15519138 GCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACTATTATCTAT
127 TCTGTTTA-CCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* *** ** * * * * * **
15519190 TTGAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTC-
1 TTCAAATCATTATG-ACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* *
15519254 AGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAA
65 A-AATAAAATAATACTAATTTATT--TATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
15519314 ATTTGTTTATCGAA-ATAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAGTAACCTAT
126 ATCTGTTTA-CCAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
15519367 CTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTA
* ** * * *
15519432 AATAAAATACTACTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATG
66 AATAAAATAATACT-AATTTAT-TTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
*** * * * *
15519497 TGTTTTTTGAAGGC-A-TTTAAATAGATATGACTTTTTGAACAGTTATCTAT
129 TG-TTTACCAA--CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** ** * *
15519547 TTCAATTTTTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATT-T
1 TTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * *
15519611 GAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAA
65 -AAATAAAATAATACTAATTTATT--TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
15519674 TATGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATCACTGTTTAAACAATTATTTAT
127 TCTGTTTACC-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
15519726 TTTAAATAGCTATTAT--CTTTTGATTTGTTACAAAACAATTATTTCTATTGATACAAGTTTATT
1 TTCAAAT--C-ATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* ** ** * *
15519789 CAAAATAAAATAATACTAATTTACAAATATTCTAAAAATTAATTGGTAGGAGATTCAAAAAATAA
63 CTAAATAAAATAATACTAATTT--ATTTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * *
15519854 ATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATTTAT
126 ATCTGTTTACC-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * **
15519907 TTCAAATCATTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTC-
1 TTCAAATCATTATGACCT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * * *
15519971 AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAA-T--T-ACTAAGAGATTTAAAAACTAAA
65 A-AATAAAATAATACTAATTTATT--TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * * *
15520032 TCTAATTACCGAAACAGGTTC-AATAGTTATCAATATTTGAATAATTATCTAT
127 TCTGTTTACC--AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
15520084 CTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATT-TG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT-
* * * * * * * * *
15520148 GATTAAAATAATATTAGTTTAATAATATTCCAAATAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
65 AAATAAAATAATACTAATTT-AT-TTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
15520213 GTATCTAATG
Statistics
Matches: 1083, Mismatches: 234, Indels: 120
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 4 0.00
175 20 0.02
176 241 0.22
177 144 0.13
178 32 0.03
179 294 0.27
180 167 0.15
181 176 0.16
182 5 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
TTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTA
AATAAAATAATACTAATTTATTTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
TTTACCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:15520798 original size:177 final size:182
Alignment explanation
Indices: 15520582--15520912 Score: 415
Period size: 183 Copynumber: 1.8 Consensus size: 182
15520572 CTCATAAAAA
* * **
15520582 AATTGTTTTTGATCATACAAGCACATTTGGATGAAAATAATACTAATTT-TATAATATT-TTAAA
1 AATTGTTTTAGATCATACAAGCACATTTGGATGAAAATAATACTAATTTAT-TAACATTCAAAAA
* * *
15520645 AA-T-T-AATAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTTTTTGCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTA
65 AAGTATAAATAAGAGATTTGAAAAAATAAATATTTTTACAAAACAAGTTCAAATAGTTAAAACTA
* *
15520706 TTAAAATAATTATCTATTTGAAATCATTCAGACTTTTTATTTGGTTAGATAAT
130 TTAAAACAATTATCTATTTAAAATCATTCAGACTTTTTATTTGGTTAGATAAT
* * **
15520759 AATTGTTTTAGTTTATACAAGCTTATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAA
1 AATTGTTTTAGATCATACAAGCACATTTGG-ATGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAA
* * **
15520823 AAGTAATAAATAAGAGATTTGAAAATATAAATATTTTTACAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
65 AAGT-ATAAATAAGAGATTTGAAAAAATAAATATTTTTACAAAACAAGTTCAAATAGTTAAAACT
**
15520888 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
129 ATTAAAACAATTATCTATTTAAAAT
15520913 TGTTATAACC
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 19, Indels: 10
0.81 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
177 47 0.37
178 8 0.06
179 1 0.01
181 1 0.01
182 12 0.09
183 58 0.46
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (182 bp):
AATTGTTTTAGATCATACAAGCACATTTGGATGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAA
AGTATAAATAAGAGATTTGAAAAAATAAATATTTTTACAAAACAAGTTCAAATAGTTAAAACTAT
TAAAACAATTATCTATTTAAAATCATTCAGACTTTTTATTTGGTTAGATAAT
Found at i:15521107 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15520303--15524221 Score: 1908
Period size: 181 Copynumber: 22.1 Consensus size: 181
15520293 ATTAATGAGC
* * *
15520303 AAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TTGTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGATT-TTACTATTTGAA
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTA-TAGAATC-AGTTCAAATA-ATTATGACTATTT-AA
* * * *
15520364 CAATTATCTATATAAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCAT
61 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCAT
* * * * **
15520428 AAAAACTTATATGAAACA-AAAA-AATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC
124 ACAAGCTTAT-TCAAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * ** *
15520486 AAGAGATTTAAAAAGTAAAGCTA-TTTTTTGAA-CTAGTTGAAATAGCTATGACTATTT---GA-
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTAACAAT
* ** * * * *
15520545 -ATC---TT-AACTTGTTATGA--TATTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTTTGATCATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
** *** *
15520603 CACATT-TGGATGAAAATAATACTAATTT-TATAATATTTTAAAAA-T--T-AAT
129 CTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * ** * * * ** * *
15520652 AAGAGATTTAAAAAATAAATGT-TTTTGCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAAAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATT-TAACAAT
* * * * * * * * *
15520716 TATCTATTTGAAATCATTCA-GACTTTTTATTTGGTTAGATAATAATTGTTT-TAGTTTATACAA
65 TATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAA
*** * *
15520779 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAAGTAATAAAT
128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAAATTAATAAAT
* * * * *
15520834 AAGAGATTTGAAAATATAAATAT-TTTTACAGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACA
* ** * * * *
15520897 ATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAA
63 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
*
15520962 GCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * *
15521016 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACCACTTAAGCAAC
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAA-CAAT
* * * * * ***
15521080 TATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAGCATACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC
* * *
15521145 GTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AAT
130 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * *
15521193 AAGGGATTT-AAAAATAAATCTA-TTCACCA-AA-CTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-TAGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACA
** * * * *
15521253 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTCGATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACA
63 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACA
* * * *
15521317 AGCTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAACT
127 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * * * *
15521372 AAGAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTGTCGAA-CTAGCTT-AAATAGTTAAGAATGTATGAACA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-AG-TTCAAATAATTATGACTAT-TTAACA
* ** * * * * **
15521434 ATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATCTCAACTT-ATACA
63 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACA
** * * * *
15521498 AGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAACATTTTC-AAAATT--T--AT
127 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * *
15521549 AAGAGATTTAGAAAATAATTCTA-TTTGTCA-AACCATTTCAAAT-A--AT---TA--TAAC---
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTAT-AGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAACAAT
* * * *
15521601 TA--T-TTT-AAATCATTATGA-CTTTTGCTTTTGTAATAAAACAATAGTTTCAGTTCATATAAG
65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* ** * * * * * ** * ***
15521661 CCTATTTGAAGTAAATTAATACTAATTGACTATTATTTTGAGAATTAATGTGT
129 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * *
15521714 AAGAGAATTAAAAAA-AGAAT-TTGTTTACCA-AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAAAA
1 AAGAGATTTAAAAAATA-AATCTAGTTTA-TAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACA
* **** ** ** * * * ** **
15521776 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGGTCCTAT-TCGTGCAA-GTTTGTTT-TG--
63 -ATTAT---CTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGT--TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* * * ** * * ** * * *
15521835 AATA-AA--ATAAT-ATAAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAAGAATT-AAAAATTTAAAAAAT
121 CATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATA-CT-AATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAAT
***** * * *
15521894 -A-A-ATTTATTTTTTAAA-C-A-TGTT-TA-AAT-AGTT-ATGACT-ATT-TG---A-TCAACT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGT-TTATAGAATCAGTTCA--AATAATTATGACTATTTAACA
* * * *
15521943 A-TC--TATTTCAAA-CA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAA
63 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
* * * *
15522003 CCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGT
128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* ** * *
15522055 AA-AGATTTAGAAAATAAATCT-GTTTA-CCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACAA
* ** * * * *
15522117 TTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAG
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* *** * *
15522182 TTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-ATAAAA-TAATGAGT
129 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAAT
** * * * * * *
15522233 TGGAGATGTAAAAAATAAAGT-TA-TTTATTGAA-CAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTAGTTTATAGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACA
* *** ** * * * *
15522295 ATTATCTATTTGAAATTGCTATGAAATTTTGTTTTGTCGTAAAACTATTATTTTTGTTCATACAA
63 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
** * *
15522360 AATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AAT
128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * *
15522410 AAGAGATTTAAAAACTAAAT-TTGTTTATCGAAAT-AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAG-AATCAGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACAA
* * * * *
15522473 TAACCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAG
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* * * * * * *
15522537 CTTATTCAGAATAAAATACTGCTAAATAAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT
129 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* * * * * * *
15522590 AAGAGGTTTAAAAAATAAATGT-GTTTGCT-GAAAT-AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTT-ATAG-AATCAGTTCAAATAATTATGACTATT-TAACA
* * * * *
15522652 ATTATCTAATTCAAATCATTTTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAA
63 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
* * *
15522716 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAAAAC
128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT--AAAT
* * * * * *
15522772 AAAAAATTTTATAAAATAAATCT-GTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTT-TGACTAATTAAACA
1 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-AGTTCAAATAATTATGACT-ATTTAACA
* * * * * * * *
15522834 AATATATA-TTAAAAACAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TGTTTCAGTTCATAAA
63 ATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACA
* * * * * * * *
15522897 ATCGTATCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAAATTGATAAGT
127 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* * * * * * * *
15522953 TAGAGATTTAAAAAACAAGTC-AATTTATCGAATCAGTTCAAACAATTATGGCCATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACAAT
* * * * * *
15523017 TATCTATTTCAAAT-AGTTATAAACTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCG-CCATACAA
65 TATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAA
* * * *
15523079 GCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGT
128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* *
15523133 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTA--TT-T---A-C----CAAACCAA-T-T-CCTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAA-TAATTATGACTATTT-AACAA
** ** * * * ** **
15523184 TTATCTATTTCAAATTGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAG
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* ** * * * *
15523249 CATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTTATAACT
129 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* * * * * * **
15523302 AAGAGATTTACAAAATAAATGT-GTTTGTTGAACCAGTTCAAATGATTAAAACTATTATAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATT-TAACAAT
** ** * ** * * *
15523366 TATCTATCCCAAATCATCCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGC
65 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC
* * *
15523431 TTATT-AAAATAAAATAATATTATTTTATTAACA-TTCAAAATATTAATAAGA-
130 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAA-AT
* * * * * *
15523482 AAGAAATTTTTAAAAA-AAATCTA-TTTA-ACAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACA
* * * *** *
15523544 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAACTCATAAAA
63 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
* * * * * * *
15523609 GTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGT
128 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * ** *
15523663 -TGTAGATTTAAAAGATAAAT-TAGTTTATCGAATTAATTCAAATAATTATGGTTATTCAAACAA
1 AAG-AGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATT-TAACAA
* * * * **
15523726 TTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAG
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* * * *
15523791 CCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGT
129 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * *** *
15523844 AGGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TATACCTAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTT-AACAAT
* ** * * * *
15523908 TATATATTTCAAATTGTTAT-AGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* * * ** *
15523972 TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAACAATA-TT-ATGAAATTAATAAAT
129 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAAT
* * ** * * * * * * *
15524024 AAGAGATTTAAATAATAAAT-TTGTTTGCCA-AACCGGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTT-ATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTAT-TTAACAA
* ** * * * *
15524087 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAA
64 TTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
* * * **
15524152 GTTTGTT-AAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--T-AAT
128 GCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
15524202 AAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT
15524222 TTGATTACCA
Statistics
Matches: 2852, Mismatches: 655, Indels: 463
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
156 2 0.00
157 4 0.00
158 16 0.01
159 3 0.00
160 17 0.01
161 70 0.02
162 14 0.00
163 15 0.01
164 18 0.01
165 36 0.01
166 46 0.02
167 11 0.00
168 48 0.02
169 97 0.03
170 65 0.02
171 9 0.00
172 16 0.01
173 12 0.00
174 15 0.01
175 110 0.04
176 123 0.04
177 168 0.06
178 118 0.04
179 178 0.06
180 498 0.17
181 739 0.26
182 183 0.06
183 192 0.07
184 7 0.00
185 10 0.00
186 10 0.00
187 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAACAATT
ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT
TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
Found at i:15521364 original size:356 final size:356
Alignment explanation
Indices: 15520303--15524221 Score: 2013
Period size: 356 Copynumber: 11.1 Consensus size: 356
15520293 ATTAATGAGC
* * *
15520303 AAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TTGTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGATT-TTACTATTTGAA
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTA-TAGAATCAA-TTCAAATA-ATTATGACTATTT-AA
* * * * * ***
15520364 CAATTATCTATATAAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA
61 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATA
* * * * *
15520429 AAAACTTATAT-GAAACAAAAAAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGAT
125 CAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGAT
* * ** * * * *
15520493 TTAAAAAGTAAAGCTATTTTTTGAACTAGTTGAAATAGCTATGACTATTTGAATC--TTAACT-T
185 TTAAAAA-TAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAACAATTATCTAT
* * * * * **
15520555 GT----T-ATGAT-A---TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCACATT-
248 TTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC
*** *
15520609 TGGATGAAAATAATACTAATTT-TATAATATTTTAAAAA-T--T-AAT
311 AAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * ** * * * * ** * *
15520652 AAGAGATTTAAAAAATAAATGT-TTTTGCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAAAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACTATT-TAACAAT
* * * * * * * * * *** *
15520716 TATCTATTTGAAATCATTCA-GACTTTTTATTTGGTTAGATAATAATTGTTTTAGTTTATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAG
* * *
15520780 CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAAGTAATAAATAAGAGATTTG
129 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAAA-T--T-AATAAGAGATTT-
* * * *
15520844 AAAATATAAATATTTTTA-CAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
187 AAAA-ATAAATCTATTTATCA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT
* ** * * * * * *
15520908 AAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCCAAA
250 CAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
15520973 ATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
314 ATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * *
15521016 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACCACTTAAGCAAC
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACTATTTAA-CAAT
* * * *
15521080 TATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAGCATACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGC
* * *
15521145 GTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGGGATTTAAAAATAA
130 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAA
* * **
15521210 ATCTATTCACCAAACTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
195 ATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* *
15521274 TAACCTTTTGTTCGATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGAT
260 TAACCTTTTGTTTG-TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * *
15521339 ACTAATTTAGTAAAATTTCAAAAATTAATAACT
324 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * * * * * *
15521372 AAGAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTGTCGAA-CTAGCTT-AAATAGTTAAGAATGTATGAACA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-A-ATTCAAATAATTATGACTAT-TTAACA
* * * * * * *
15521434 ATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAGACAA-T-TATCTCAACTTATAC
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC-A-TCATAC
* * * * * *
15521497 AAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATGTATTAACATTTTC-AAAATTTATAAGAGATTTAGA
126 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA-A
* * * *
15521561 AAATAATTCTATTTGTCAAACCATTTCAAATA---AT---TA--T-AAC---TA--T-TTT-AAA
189 AAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * ** *
15521610 TCATTATGA-CTTTTGCTTTTGTAATAAAACAATAGTTTC-AGTTCATATAAGCCTATTTGAAGT
254 TCATTATAACCTTTTG--TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * ** * ***
15521673 AAATTAATACTAATTGACTATTATTTTGAGAATTAATGTGT
316 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * *
15521714 AAGAGAATTAAAAAA-AGAAT-TTGTTTACCA-AAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--CA
1 AAGAGATTTAAAAAATA-AATCTAGTTTA-TAGAATCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTAACA
* * ** * *
15521773 A--A---A---C--A---TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTCCT-ATTCGTGCA
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACA
* * * *
15521824 AGTTTGTTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAATTAA-AAATT
127 AGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGAGATT
* * * * * * *
15521886 TAAAAAATAAATTTATTTTTTAAAC-ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGATCAACTATCTATT
186 T-AAAAATAAATCTATTTATCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
* ** * * * * *
15521950 TCAAA-CA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTCTA
249 TCAAATCATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* *
15522013 AATAAAATAATACTAATTTATT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGT
313 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* ** * * *
15522055 AA-AGATTTAGAAAATAAATCT-GTTTA-CCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATC-AATTCAAATAATTATGACTATTT-AACAA
* * * * * *
15522117 TTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCT-ATTCATACAA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAA
* * * * * * ** *
15522181 GTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAATAATGAGTTGGAGATGTAAAA
128 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA-AATTAATAAGAGAT-TTAAA
** * * * * * * *
15522246 AATAAAGT-TATTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAA
190 AATAAA-TCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
*** * * * * * ** *
15522310 TTGCTATGAA-ATTTTGTTTTGTCGTAAAACT-ATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAAT
254 TCATTAT-AACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
*
15522373 AAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AAT
316 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * * * *
15522410 AAGAGATTTAAAAACTAAAT-TTGTTTATCGAAAT-AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAG-AATCAATTCAAATAATTATGACTATTT-AACAA
* * * * * * * **
15522473 TAACCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAG
* * * * *
15522537 CTTATTC-AGAATAAAATACTGCTAAATAAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTA
129 CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--AGA--TTT-
* * * * * * *
15522600 AAAAATAAATGTGTTTGCTGAAA-TAGTTTAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTAATT
187 AAAAATAAATCTATTT-ATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTT
* * *
15522663 CAAATCATTTTGACC-TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCGA
250 CAAATCATTATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAA
* *
15522726 AATAAAATAATACTAATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAAAAC
313 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT--AAAT
* * * * * *
15522772 AAAAAATTTTATAAAATAAATCT-GTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTT-TGACTAATTAAACA
1 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAA-TTCAAATAATTATGACT-ATTTAACA
* * * * ** *
15522834 AATATATA-TTAAAAACAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TG--TTTCAGTTCATA
63 ATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATA
* * * * * * * * *
15522895 AAATCGTATCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAAATTGATAAGTTAGAGAT
125 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
* * * * * * *
15522960 TTAAAAA-ACAAGTCAATTTATCGAA-TCAGTTCAAACAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTA
185 TTAAAAATA-AA-TCTATTTATCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA
* * * * *** *
15523023 TTTCAAAT-AGTTATAAACTTTTTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCGCCATACAAGCCTATTC
247 TTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
* * *
15523087 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGT
311 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * *
15523133 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCA-AACCAATTC--CT-ATT-TG-------AACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-TAGAATCAATTCAAATAATTATGACTATTTAACAAT
* ** * * * **
15523185 TATCTATTTCAAATTGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTG--TTTCAATTCATTTAA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC-A-TCATACAA
* * * *
15523248 GCATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTA
128 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA--T-TAA-TAAGAGATTTA
* * * ** * ** **
15523312 CAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAAT-GATTAAAACTA-TTATAACAATTATCTATCC
188 -AAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTT
** * *
15523375 CAAATCATCCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATT-AA
250 CAAATCATTATAACCTTTTGTTT-GTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAA
* * *
15523438 AATAAAATAATATTATTTTATTAACA-TTCAAAATATTAATAAGA-
313 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAA-AT
* * * * * *
15523482 AAGAAATTTTTAAAAA-AAATCTA-TTTA-ACAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAA-TTCAAATAATTATGACTATTT-AACA
* * * * *
15523544 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTG--TTTCAACTCATAA
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC-A-TCATAC
* * * * * * *
15523607 AAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGTAGATTT
126 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA---G-AGATTT
* * * * ** *
15523672 AAAAGATAAAT-TAGTTTATCGAATTAATTCAAATAATTATGGTTATTCAAACAATTATCTATTT
187 AAAA-ATAAATCTA-TTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT
* * * * *
15523736 CAAATCATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAA
250 CAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAA
* * *
15523800 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGT
313 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
* * *** * *
15523844 AGGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TATACCTAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACTATTT-AACAAT
* * * * * ** *
15523908 TATATATTTCAAATTGTTAT-AGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAG
* * ** * *
15523972 TTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTATGAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA
129 CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA--AATTAATAAGAGATTTAAA
* * ** ** * * * * *
15524036 TAATAAATTTGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAA
190 -AATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
* * ** * * * * * *
15524101 TCATTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-AAGAAT
254 TCATTATAACC-TTTT-GTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA-AAT
* **
15524165 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--T-AAT
316 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
15524202 AAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT
15524222 TTGATTACCA
Statistics
Matches: 2747, Mismatches: 585, Indels: 467
0.72 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
325 5 0.00
326 61 0.02
327 4 0.00
328 3 0.00
329 32 0.01
330 4 0.00
331 1 0.00
332 2 0.00
334 1 0.00
335 2 0.00
337 2 0.00
338 2 0.00
339 5 0.00
340 41 0.01
341 31 0.01
342 105 0.04
343 65 0.02
344 12 0.00
345 4 0.00
346 6 0.00
347 66 0.02
348 85 0.03
349 207 0.08
350 96 0.03
351 7 0.00
352 7 0.00
353 10 0.00
354 9 0.00
355 143 0.05
356 453 0.16
357 187 0.07
358 40 0.01
359 23 0.01
360 99 0.04
361 271 0.10
362 303 0.11
363 194 0.07
364 141 0.05
365 12 0.00
366 3 0.00
367 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (356 bp):
AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATAGAATCAATTCAAATAATTATGACTATTTAACAATT
ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCT
TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAA
TCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
AACCTTTTGTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
Found at i:15523285 original size:169 final size:168
Alignment explanation
Indices: 15523006--15523321 Score: 422
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168
15522996 AATTATGGCC
* * ***
15523006 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACTTTTTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACTTTTTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCAAG
* * * *
15523071 CCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-TTAGTAAGTA
66 CCATACAAGCATATTCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTTA-TAACTA
15523134 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAATTCCT
129 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAATTCCT
* *
15523174 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-AAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAA-CTTTT-TTCTGTCATAAAATAATTGTTTCA
** ** *
15523238 ATTCATTTAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTTATAACTA
64 AGCCATACAAGCATATTCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTTATAACTA
*
15523303 AGAGATTTACAAAATAAAT
129 AGAGATTTAAAAAATAAAT
15523322 GTGTTTGTTG
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 17, Indels: 7
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
167 3 0.02
168 34 0.27
169 86 0.68
170 4 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (168 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACTTTTTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCAAG
CCATACAAGCATATTCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTTATAACTAAG
AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAATTCCT
Found at i:15523537 original size:892 final size:885
Alignment explanation
Indices: 15522370--15524057 Score: 1910
Period size: 892 Copynumber: 1.9 Consensus size: 885
15522360 AATTATTCAG
* *
15522370 AATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTT
1 AATAAAATAACACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATGTGTT
* * ** * * * *
15522435 TATCGAAATAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATAACCTATCTCAAATCATTATGATCTT
66 TATCGAAACAGTTCAAATAATTAAAACTATTTGAACAATAACCTATCCCAAATCATCATAACCTT
** * * * *
15522500 TGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATACTGCTAAATA
131 TGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATA
* * * * * * *
15522565 AATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAAATAGTTTA
196 AATAACATTCTAAAAATTAATAAGAAAGAAGTTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAAAAAGTTTA
* *
15522630 AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCATTTTGACC-TTTG-TTTAGTCATAA
260 AATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAA
* ** * * *
15522693 AATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAGA-TTCAA
324 AAAAATTGTTTCAACTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAGATTTC-A
* * *
15522757 AAAATTAATAAAAACAAAAAATTTTATAAA-ATAAATCT-GTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGT
388 AAAATT--GAAAAACAAAAAA-TTTA-AAAGATAAAT-TAGTTTATCGAATCAA-TTCAAATAAT
* *
15522819 T-TGACTAATT-AAACAAATATATA-TTAAAAACAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
447 TATG-CTAATTCAAACAAATATATATTTAAAAAC-AATATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * *
15522881 -TG-TTTCAGTTCATAAAATCGTATCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAAA
510 TTGTTTTCA--TCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTAATATATTAATATTTC-AAAAA
* * * * *
15522944 TTGATAAGTTA-GAGATTTAAAAAACAAGTCAATTTATCGAATCAGTTCAAACAATTATGGCCAT
572 TTCATAAG-TAGGAGATTTAAAAAACAAATCAATATACCGAATCAGTTCAAACAATTATGACCAT
* * * *
15523008 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCG-
636 TTGAACAATTATATATTTCAAATAGTTATAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTAT-GT
* ** * *
15523071 CCATACAAGCCTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAGTAAGTA
700 CCATACAAGCCTATTCAG-AATAAAATAATACTAATCTAACAATATTAT--AAAATTAATAAATA
15523134 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAATTCCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
762 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAATTCCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
15523199 TGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATATTTGA
827 TGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATATTTGA
15523258 AATAAAATAACACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTACAAAA-TAAA
1 AATAAAATAACACTAATTTAATAATATTTC-AAAAA--T-TAA-TAAGAGATTTA-AAAACTAAA
* * * * * * *
15523321 TGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATGATTAAAACTATTAT-AACAATTATCTATCCCAAATCATCC
60 TGTGTTTATCGAAACAGTTCAAATAATTAAAACTATT-TGAACAATAACCTATCCCAAATCATCA
*
15523385 TAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATT-AAAATAAAATAAT
124 TAACC-TTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* ** * * * *
15523449 ATTATTTTATTAACATTC-AAAATATTAATAAGAAAGAAATTTTTAAAAA-AAATCTATTTAAC-
188 ACTAAATAAATAACATTCTAAAA-ATTAATAAGAAAG-AAGTTTAAAAAATAAATCTATTT-ACG
* * *
15523511 AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
250 AAA-AAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTAAAATCATTATGACCTTTTGT
* * *
15523576 TTTATCATAAAAAAATTGTTTCAACTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
314 TTTATCATAAAAAAATTGTTTCAACTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ***** * *
15523641 AATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGTAGATTTAAAAGATAAATTAGTTTATCGAATTAATTCAAAT
379 AAGATTTCAAAAATTGAAAAACAAAAAATTTAAAAGATAAATTAGTTTATCGAATCAATTCAAAT
* * * * * * * * *
15523706 AATTATGGTTATTCAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAACA
444 AATTATGCTAATTCAAACAAATATATATTTAAAAACAATATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACA
* * *
15523771 ATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
509 ATTG-TTTTCATCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTAATATATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
15523836 TCATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATATACCTAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTT
573 TCATAAGTAGGAGATTTAAAAAACAAATCAATATACCGAATCAGTTCAAACAATTATGACCATTT
* ** **
15523901 GAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTTA
638 GAACAATTATATATTTCAAATAGTTATAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTCCA
** *
15523966 TACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTATGAAATTAATAAATAAGAGAT
703 TACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTATAAAATTAATAAATAAGAGAT
* * * *
15524031 TTAAATAATAAATTTGTTTGCCAAACC
768 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACC
15524058 GGTTCAAATA
Statistics
Matches: 658, Mismatches: 113, Indels: 55
0.80 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
887 3 0.00
888 30 0.05
889 4 0.01
890 36 0.05
891 184 0.28
892 265 0.40
893 124 0.19
894 12 0.02
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.07, T:0.38
Consensus pattern (885 bp):
AATAAAATAACACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATGTGTT
TATCGAAACAGTTCAAATAATTAAAACTATTTGAACAATAACCTATCCCAAATCATCATAACCTT
TGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATA
AATAACATTCTAAAAATTAATAAGAAAGAAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACGAAAAAGTTTAA
ATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
AAATTGTTTCAACTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAGATTTCAAAA
ATTGAAAAACAAAAAATTTAAAAGATAAATTAGTTTATCGAATCAATTCAAATAATTATGCTAAT
TCAAACAAATATATATTTAAAAACAATATAAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTCATC
ATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATATTAATATATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTAGGAG
ATTTAAAAAACAAATCAATATACCGAATCAGTTCAAACAATTATGACCATTTGAACAATTATATA
TTTCAAATAGTTATAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTCCATACAAGCCTATTC
AGAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTATAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
CTATTTACCAAACCAATTCCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAAAACCTTTTGTTCT
GTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATATTTGA
Found at i:15523828 original size:711 final size:710
Alignment explanation
Indices: 15521834--15524280 Score: 2115
Period size: 711 Copynumber: 3.4 Consensus size: 710
15521824 AGTTTGTTTT
* * * * * *
15521834 GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAATTAA-AAATTTAAAAAATAA
1 GAATAAAATACTACTAAA-TAAATAATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * ** * * * * *
15521896 ATTTATTT-TTTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGATCAACTATCTATTTCAAA-CAT-
64 ATGTGTTTGCTGAAACA-GTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTAATCCAAATCATC
* * * ** * * * * *
15521958 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTCTAAATAAAATAA
128 CTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * ** *
15522023 TACTAATTTATT--TATTCTAAAAATTAAGAAGTAAAG--ATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCA
193 TACTAATTTATTAACATTC-AAAAATTAATAAG-AAAGAAATTTTTAAAATAAATCTGTTTAACA
* * * * ** *
15522084 AGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTT
256 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * **** * *
15522149 TTGTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTA
321 TTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTA
* * *
15522214 ATA-TT-ATAAAA-TAATG-AGTTGGAGATGTAAAAAATAAAGTTATTTATTGAA-CAAGTTCAA
386 ATATTTCA-AAAATTGA-GAAGTT-GAGATTTAAAAAATAAA-TTATTTATCGAATCAA-TTCAA
* * * * *
15522274 ATAATTGT-GTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAAT-TGCTATGAAA-TTTTGTTTTGTCGTA
446 ATAATTATGGT-CATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAT--TAT-AAACTTTTTTTTTGTCATA
* ** *** * *
15522336 AAACTATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCA
507 AAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * *
15522401 AAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAAATAGTTTAAATAATTATGACT
572 AAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C----CA---TAAACAATTATGACT
** * * **
15522463 ATTTGAACAATAACCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGT
629 ATTTGAACAATAACCTATCTCAAATCATTAAAACCTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCAAT
*
15522528 TCATACAAGCTTATTCA
694 TCATACAAGCATATTCA
* * *
15522545 GAATAAAATACTGCTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAAT
1 GAATAAAATACTACTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** *
15522610 GTGTTTGCTGAAATAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCATTTTG
66 GTGTTTGCTGAAACAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTAATCCAAATCATCCTA
*
15522675 ACC-TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
131 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * ***
15522739 TAATTTATTAAGATTCAAAAAATTAATAAAAACAAAAAATTTTATAAAATAAATCTGTTTATTGA
196 TAATTTATTAACATTC-AAAAATTAAT-AAGA-AAGAAATTTT-TAAAATAAATCTGTTTAACAA
* * * * *
15522804 ACAAGTTCAAATAGTT-TGACTAATTAAACAAATATATA-TTAAAAACAAATATGACCTTTTGTT
257 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATC-ATTATGACCTTTTGTT
* * * *
15522867 TTATCATAAAACAA-TGTTTCAGTTCATAAAA-TCGTATCCAAAATAAAATAATATTACTATATT
321 TTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGT-TTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
* * * * *
15522930 AATATTTCAAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAACAAGTCAATTTATCGAATCAGTTCAAA
385 AATATTTC-AAAAATTGAGAAGTT-GAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTATCGAATCAATTCAAA
* * * *
15522995 CAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAAC-TTTTTTTTGTCATAAAAT
447 TAATTATGGTCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAAC
* ** *
15523059 AATTTTTTTTCGCCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
511 AATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* *
15523124 TTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACCAA-T-T-CCTATTTGAACAAT
576 TTA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCATAAACAATTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * **
15523185 TATCTATTTCAAATTGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGC
640 AACCTATCTCAAATCATTAAAACC-TTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGC
*
15523250 ATATT-T
704 ATATTCA
* * * *
15523256 GAAATAAAATAAC-ACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTACAAAATAA
1 G-AATAAAAT-ACTACTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * *
15523320 ATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAAT-GATTAAAACTATTATAACAATTATCT-ATCCCAAATCAT
64 ATGTGTTTGCTGAAACAGTTCAAATAG-TTAAAACTATTAGAACAATTATCTAAT-CCAAATCAT
* *
15523383 CCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATT-AAAATAAAATA
127 CCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * *
15523447 ATATTATTTTATTAACATTCAAAATATTAATAAGAAAGAAATTTTTAAAAAAAATCTATTTAACA
192 ATACTAATTTATTAACATTCAAAA-ATTAATAAGAAAGAAATTTTTAAAATAAATCTGTTTAACA
* *
15523512 AACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
256 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
*
15523577 TTATCATAAAAAAATTGTTTCAACTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTA
321 TTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTA
* *
15523642 ATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGTAGATTTAAAAGATAAATTAGTTTATCGAATTAATTCAAATA
386 ATATTTCAAAAATTGAGAAGTTG-AGATTTAAAAAATAAATTA-TTTATCGAATCAATTCAAATA
* *
15523707 ATTATGGTTATTCAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAACAA
449 ATTATGGTCATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAACAA
* *
15523772 TTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
513 TTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * *
15523837 CATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATATACCTAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
578 -ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-----A--T-AAACAATTATGACTATTTG
* ** * ** * * * * * * * *
15523902 AACAATTATATATTTCAAATTGTTATAGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTTA
634 AACAATAACCTATCTCAAATCATTAAAACC-TTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCA-ATTCA
**
15523966 TACAAGTTTATTCA
697 TACAAGCATATTCA
* * * * * * *
15523980 GAATAAAATAATACT-AATCTAACAATATTAT-GAAATTAATAAATAAGAGATTTAAATAATAAA
1 GAATAAAATACTACTAAAT-AAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * * *
15524043 TTTGTTTGC-CAAACCGGTTCAAATAGTTAAGGCTA-TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
65 TGTGTTTGCTGAAA-CAGTTCAAATAGTTAAAACTATTA-GAACAATTATCTAATCCAAATCATC
* * * * ** * ** * * *
15524106 ATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-AAGAATAAAAT
128 CTAACC-TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAAT
* * ** ** * * *
15524170 AATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATTTGATTACC
191 AATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGAAATTTTTAAAATAAATCTGTTTAAC
* * * * * *
15524231 AAACTAGTTCAACTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCAAAAT
255 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-AAAAT
15524281 AATACTACTT
Statistics
Matches: 1418, Mismatches: 248, Indels: 130
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
709 33 0.02
710 139 0.10
711 244 0.17
712 242 0.17
713 116 0.08
714 9 0.01
715 14 0.01
716 6 0.00
717 45 0.03
718 49 0.03
719 108 0.08
720 126 0.09
721 13 0.01
722 84 0.06
723 151 0.11
724 34 0.02
725 5 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (710 bp):
GAATAAAATACTACTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
GTGTTTGCTGAAACAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTAATCCAAATCATCCTA
ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
TAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAGAAAGAAATTTTTAAAATAAATCTGTTTAACAAACAA
GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATC
ATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT
TCAAAAATTGAGAAGTTGAGATTTAAAAAATAAATTATTTATCGAATCAATTCAAATAATTATGG
TCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTTT
CATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAA
GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCATAAACAATTATGACTATTTGAACAATAACCTATCTCA
AATCATTAAAACCTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCATATTCA
Found at i:15523989 original size:362 final size:358
Alignment explanation
Indices: 15521765--15524278 Score: 1789
Period size: 361 Copynumber: 7.0 Consensus size: 358
15521755 ATAGTTATGA
** * * * *
15521765 CTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTCCT-ATTCGTGCAAGTTT
1 CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GT-TTAATTCATACAAGTTT
* ** * * * *
15521829 GTTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAATTAA-AAATTTAAAA
64 ATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
** * * * * * * * *
15521891 AATAAATTTA-TTT-TTTAAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGATCAACTATCTATTTCAA
127 AATAAA-TTAGTTTATCGAACCA-GTTCAAATAATTAAGGCTA-TTAAACAATTATCTATTTCAA
* * ** * ** * * * *
15521954 A-CA-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCGTGCAACCTTATTCTAAATA
189 ATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * *
15522017 AAATAATACTAATTTATT--TA-TTCTAAAAATTAAGAAGTAA-AGATTTAGAAAATAAATCTGT
254 AAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
*
15522078 TTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
317 TTACCAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
15522121 TTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA
1 CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGTTTA
** * * * ** *
15522186 TTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAA-TAATGAGTTGGAGATGTAAAAAAT
65 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * * * **
15522249 AAAGTTA-TTTATTGAACAAGTTCAAATAATTGTGTCCATTTAAACTATTATCTATTTGAAATTG
130 AAA-TTAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTA-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * ** ** *
15522313 CTATGAAA-TTTTGTTTTGTCGTAAAACT-ATTATTTTTGTTCATACAAAATTATTCAGAATAAA
193 TTAT-AAACTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * *
15522376 ATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTAT
256 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-
* * * * * *
15522438 CGAAATAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATAAC
320 CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * ** *
15522477 CTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
1 CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGTTTA
* * * * *
15522541 TTCAGAATAAAATACTGCTAAATAAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAAT
65 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * * *
15522606 AAATGT-GTTT-GCTGAAATAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATC
130 AAAT-TAGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTATTA-AACAATTATCTATTTCAAATC
** * * *
15522669 ATT-TTGACCTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAA
192 ATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* ** * * *
15522731 AATAATACTAATTTATTAAGA-TTCAAAAAATTAATAAAAACAAAAAATTTTATAAAATAAATCT
255 AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-AT--AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * *
15522795 GTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTAATTAAACAAATAT
315 ATTTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** ** * * * * *
15522839 ATATTAAAAACAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TGTTTCAGTTCATA-AAATCGT
1 CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGT-TT
* * * * * * * * *
15522902 ATCCAAAATAAAATAATATTACTATATTAATATTTCAAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAA
64 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * *
15522967 ACAAGTCAATTTATCGAATCAGTTCAAACAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-
128 ATAAATTAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTA-TTAAACAATTATCTATTTCAAATC
* ** * *
15523031 AGTTATAAACTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCGCCATACAAGCCTATTCGAAATAAA
192 A-TTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
15523095 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
256 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* *
15523160 CCAA--A---C-CA-A--T-T-CCTATTTGAACAATTAT
320 CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * ** **
15523188 CTATTTCAAATTGTTAAAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATTTAAGCATA
1 CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGTTTA
* * * * *
15523253 TT-TGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTACAAAA
65 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** **
15523317 TAAATGT-GTTTGTTGAACCAGTTCAAATGATTAAAACTATTATAACAATTATCTATCCCAAATC
129 TAAAT-TAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTATTA-AACAATTATCTATTTCAAATC
** * ** *
15523381 ATCCTAACCTTTTGTTTAATCATAAAATAATTG--TTTCAGTTCATACATGCTTATT-AAAATAA
192 ATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * * *
15523443 AATAATATTATTTTATTAACA-TTCAAAATATTAATAAGAAAGAAATTTTTAAAAA-AAATCTAT
255 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATT-ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAT
* * *
15523506 TTAACAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
317 TT-ACCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
15523549 CTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTCAACTCATAAAAGTTTA
1 CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGTTTA
* * * * * * * * *
15523614 TCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGAAGT-TGTAGATTTAAAAG
65 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAA
** * * *
15523677 ATAAATTAGTTTATCGAATTAATTCAAATAATTATGGTTATTCAAACAATTATCTATTTCAAATC
128 ATAAATTAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTATT-AAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
15523742 ATTATAAACTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAA
192 ATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * *
15523807 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATATAC
257 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* *
15523872 CTAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
321 C-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
15523911 ATATTTCAAATTGTTAT-AGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGTTT
1 CTATTTCAAATTATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTA-ATTCATACAAGTTT
* * * * * *
15523975 ATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTAT-GAAATTAATAAATAAGAGATTTAAATAA
64 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* ** * * * * *
15524039 TAAATTTGTTTGCCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCA
129 TAAATTAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTAT-TAAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * ** * ** * * *
15524104 TTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-AAGAATAAA
193 TTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTCAA-AATAAA
* ** *
15524168 ATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGA-TTA
256 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTA
* * * *
15524229 CCAAACTAGTTCAACTAGTTATAACAATTTAAACAATTAT
320 CC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
*
15524269 TTATTTCAAA
1 CTATTTCAAA
15524279 ATAATACTAC
Statistics
Matches: 1683, Mismatches: 387, Indels: 174
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
348 13 0.01
349 168 0.10
350 80 0.05
351 2 0.00
352 2 0.00
353 1 0.00
354 10 0.01
355 132 0.08
356 223 0.13
357 130 0.08
358 67 0.04
359 15 0.01
360 26 0.02
361 300 0.18
362 295 0.18
363 203 0.12
364 12 0.01
365 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (358 bp):
CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAATTCATACAAGTTTAT
TCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
AATTAGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTATTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
TAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAACT
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
Found at i:15525493 original size:143 final size:145
Alignment explanation
Indices: 15525119--15525492 Score: 456
Period size: 145 Copynumber: 2.6 Consensus size: 145
15525109 AAATGCTTTT
* * * *
15525119 TAAGGGCTA-TTTCGTAATTTGACCTTGCCGAGCT-AGATTTTCATGAAACTTTTCATATCTTAA
1 TAAGGG-TATTTTCATAATTTGACCTTTCCGAGCTCGGATTTTCATGAAACTTTTCAAATCTTAA
* * * * **
15525182 TTTCATAATATTTTATGATTTTAGGTGCATTTGAAATCACAGCAATACCTTGAGAAATGTGAAAT
65 TTTTATAATATTTCATAATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAATACCTCAAGAAATGTGAAAT
*
15525247 TACCAAAATACTCCTA
130 TACCAAAAGACTCCTA
* * * * *
15525263 TAAGGGTATTTTCGTAATTTG-CCTTTCCCAAGCTCGAATTTTCATGAAAATTTTTAAATCTTAA
1 TAAGGGTATTTTCATAATTTGACCTTT-CCGAGCTCGGATTTTCATGAAACTTTTCAAATCTTAA
* * *
15525327 TTTTCATAATATTTCATTATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAGTACC-CAAGAAGTGTGAAA
65 TTTT-ATAATATTTCATAATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAATACCTCAAGAAATGTGAAA
15525391 TTACCAAAAGAC-CCTA
129 TTACCAAAAGACTCCTA
* * *
15525407 TAAGGTGT-TTTT-ATAATTTGACCTTTTCGAGCTCGGATTTTCATGAAACTTTTCAGATCTCAA
1 TAAGG-GTATTTTCATAATTTGACCTTTCCGAGCTCGGATTTTCATGAAACTTTTCAAATCTTAA
*
15525470 TTTTATAACATTTCATAATTTTT
65 TTTTATAATATTTCATAATTTTT
15525493 TTTGTTTTAA
Statistics
Matches: 198, Mismatches: 26, Indels: 14
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
142 17 0.09
143 47 0.24
144 42 0.21
145 51 0.26
146 41 0.21
ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (145 bp):
TAAGGGTATTTTCATAATTTGACCTTTCCGAGCTCGGATTTTCATGAAACTTTTCAAATCTTAAT
TTTATAATATTTCATAATTTTTGGTGCATTTGAAATCACAGCAATACCTCAAGAAATGTGAAATT
ACCAAAAGACTCCTA
Found at i:15525885 original size:24 final size:25
Alignment explanation
Indices: 15525824--15525895 Score: 80
Period size: 24 Copynumber: 3.0 Consensus size: 25
15525814 GGAGGGGAGA
*
15525824 GGGGGCTCTT-AAAAAAAAGAGAGG
1 GGGGGCTCTTAAAAAAAAAAAGAGG
* *
15525848 AGGAG-TC-TACAAAAAAAAAAG-GG
1 GGGGGCTCTTA-AAAAAAAAAAGAGG
15525871 GGGGGCTCTTAAAAAAAAAAAGAGG
1 GGGGGCTCTTAAAAAAAAAAAGAGG
15525896 AGGAGTTTCT
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 5, Indels: 9
0.73 0.10 0.17
Matches are distributed among these distances:
22 1 0.03
23 7 0.18
24 26 0.68
25 4 0.11
ACGTcount: A:0.49, C:0.08, G:0.32, T:0.11
Consensus pattern (25 bp):
GGGGGCTCTTAAAAAAAAAAAGAGG
Found at i:15528203 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 15527708--15541604 Score: 7560
Period size: 181 Copynumber: 77.7 Consensus size: 182
15527698 GCTAAACTAA
* * *
15527708 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGT-GTTTACTGAACCAA-TTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * ** * *
15527771 AATAGTTAAGACTATGAGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TT-TGACCTTTTGTTTAGTTATA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * **
15527834 AAATAATTATTTTAGTTCATACATGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTCTTTTAT
129 AAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
15527889 TAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-TCG-AACAAGT
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTAGTTTACT-GAAACAAGT
* * * * *
15527950 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT-TGTTATAACCTTTAGTTTTATCA
62 TCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
15528014 TGAAACAATTTTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
127 TAAAACAATTTTTT-AATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * * * *
15528071 TAGTATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATTGTATC-AGTTTAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
* * * * **
15528135 ATAATTATCACCATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCT-TTATGATATTTTGTTTTGTCATAAA
66 ATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * **
15528199 ACAATTGTTTTCCA-TCATAAAAGCCTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTAT
131 ACAATT-TTTT-AATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
15528252 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAA-TATGCTTACT-AAACTAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTCA
* *
15528315 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATATATTTCAAAT-TGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * *
15528379 AACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGGAATACAATAATACTAATCTAA
130 AACAATTTTTTA-ATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** *
15528433 TAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACTGAACCAA-TTCA
1 TAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * * * * *
15528496 AATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAA-CTATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * *
15528560 AACAAATTTTTT--TCTCATATGAGTTTGTTCAGAATAAAATAATATTAATTTAT
130 AAC-AATTTTTTAAT-TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** *
15528613 TAATATTTTAAGAA-T--CAA-TAAGAGATTTAAAATGTAAATCTA-TTTAC-CAAACCAA-TTC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAA-CAAGTTC
** * * * * *
15528671 AAATAGTTACAACCAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC-ATTATAACCATTTGCTTTGTCAT
64 AAATAGTTATGACC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * ** *
15528735 AAAATAATTTTTCT-ATTGATACAATCTTATTCAAAATAAAGTAATGTTAATTTGT
128 AAAACAATTTTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15528790 CAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTA--TTAGCCTG--ACCAG
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA--CTGAAACAAG
* * * * * * * * *
15528849 TACAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTGTTTCAAA-GTGTTATAACCTTGTGTTTTGTT
61 TTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** ** * * * * *
15528913 ACAAAATAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTGACTCAAAATAACATAA-ATCTAATTTAT
126 ATAAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-CTAATTTAT
* ** * **
15528971 TAATATTTCGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAACCTAAATTTGTTTA-TCG-ATTAAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACT-GAAACAAGTTCA
* ** * *
15529034 AATAGTTACGACTC-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-CCTATAACCTTTTGTTTTGTCGTA
65 AATAGTTATGAC-CATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
15529097 AAACATTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTAT
129 AAACAATTTTTT-AATTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15529152 TAATA-TTCAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTAC-AAAATAAGTTC
1 TAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTC
* * * * *
15529214 AAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATTTATTTTAAATC-GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
** * * * * *
15529278 AAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTAT
129 AAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * **** * * * *
15529333 CAACATTTTTTCAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCG-AACACGTTCT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * * * * ***
15529396 ATTAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTCACCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
15529460 AACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTAT
130 AACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15529514 TAATA-TTC-CAAA--AATGAGTAAGAGAATTAAAATATGAATCT-GTTTACTG-AACAAGCTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* ** * * * *
15529573 TATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTTATTTTGTCATA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
15529637 AAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAGTAATACTAACTTAT
129 AAACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15529692 TAATA-TTCTAAAAGTTAATAGGTACGAGATTTAAAAAATAAAATATGTTTAC-CAAATAAGTTC
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTC
* * * * * **
15529755 AAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTTAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
15529819 AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAGGATTATAT-AGAATAAAATAATA-GAGATTCAT
129 AAACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTA-ATTTAT
* ** * * * * *
15529874 TAACATTTTGAAAATTAATAAG--AG-TA-TTAAAAACTTAATCT-GTTTAC-CAAACTAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
** * * * * * * * *
15529933 AATAGTTATGACTTTTTGATCAAGTATATATCTCAAATCAG-TATGATC-TTTATTTTGTCATAG
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
15529996 AACAATTGTTTCT-TTTCATATAAGTTTATTC-GAATTAAGATAATACTAATTTAA
130 AACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * *** ** * ** *
15530050 TAATA----AAAAATAAATGAGT--TTTATCGAACCAGTTCAAA-TAG-TTA---AAACTA-TT-
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAAT-AAATTAGTTTACTGAAACAAGTTC
* ** * *
15530102 AGAATAATTAT--CTTTTTG---AA--A-----------T-TGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCAT
64 A-AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
15530148 AAAAAAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
128 AAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** *
15530204 TAGA-A-TTAAAAAATTTAATAACCAAGAGATTTAAAAAAAATAAA-TATGTTTA-TCAAACAAG
1 TA-ATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAG
* * * * * * *
15530265 CTCAAATAGATATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATTACCTTTTGTTTAGTC
61 TTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
15530329 ATATAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGGTTGTTCAGAATAAAATAACACTAATTGAT
126 ATAAAACAATT-TTTTAAT-TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
15530387 TAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTA-TCG-AACCAGTTC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTACT-GAAACAAGTTC
* * * * * * *
15530449 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATATTTCAAATCAATTATCTAAAAAATAAATCTTTTG
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC---TGT-T-----AT-GACCTTTTG
* * * * * * * *
15530514 TTCTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCGTACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATAGTAATCTA
119 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTA-ATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTA
*
15530578 A
182 T
* * * * * * * *
15530579 TAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGC-CAAACCAGTTTAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
* * * * * * *
15530643 ATAGTTAAGACTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATC-ATTATCACCTTTTCTTTTGTCATAAA
66 ATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* ** * * * *
15530707 ACAATTTTTTTCAATTTATACTAGCTTATTTAAAATAAAATAA-AATAAAATTAT
131 ACAA-TTTTTT-AATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * ** *
15530761 TAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCT--AACCGGTTT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-CTGAAACAAGTTC
* * * * * * * *
15530823 TAATAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTGAAATC-ATTATGACCTTTGGTTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * ** * * *
15530887 AAACAAATGTTTTT-GTTTATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATGATGCTAATCTAT
129 AAAC-AAT-TTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
** * *
15530942 TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-TCAAACTAGTTCAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
* * *
15531002 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA
66 ATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
15531065 ACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT-GT--TGTAT
131 ACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
15531115 TAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCAGTTTACT-AAATC-AGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAA-CAAGTTCA
* * * * ** * * *
15531178 AATAATTATGGCCTTTTAAACAACCATGTATTTCAAAT-TGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* ** * * *
15531242 ATCAA--TTGCATTTCGATAAAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAC
130 AACAATTTTTTAATTC-AT-AA-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15531296 TAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTCAAAAAATAAATCTA-TTTAC-CAAACTAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * ***
15531355 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTCAAAT-TGTTATAACCTTTTGTTCCATCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
15531419 AACAATTGTTTCT-GTTTATATAAGCTTATTCAGTATAAAATAATATTAATTTAG
130 AACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * ** *
15531473 TAATA-TTCTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATGAATCCA-TTTGTTG-AACTAGTTC
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTC
* * * * *
15531535 AAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
** * * * * *
15531599 AAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTC-GAAATAAAATAATACTAAGTTAT
129 AAACAATT--TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * * *
15531655 TAATATTTTAGAAAACTAACCAGTAAGGGATTTAAAAAGTAAATCT-GTTTACT-AAACCA-TTG
1 TAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTT-
* * * * * *
15531717 CAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATC-ATTATAACTTTTTGTTTTGTCAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** ** ** * *
15531781 CAAACAATTGGTCCT-ATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAA
128 AAAACAATT--TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * *
15531837 TAATATTAT-AAAATTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAAATAAATCTAATTGT-C-G-AACAAG
1 TAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT-TAAAAAATAAAT-TAGTT-TACTGAAACAAG
* * * * * * *
15531898 TTCAAATAGTTAAGACAATATGAACGATTATCTATTCCAAATC-ATTATGACCCTTT-TTTTGTC
61 TTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
15531961 GTAAAACAATTATTTT-ATTCATACAAGCTTAGTCTGATTAAAATAATGA-TAATTTAA
126 ATAAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-ACTAATTTAT
* * *
15532018 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATTTA-TTTACCGAATC-AGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* ** * * * * * *
15532081 AATGGTTGA-GATTATTAGAATAATTACCTATTTGAAAT-TGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATA
65 AATAGTT-ATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
15532144 AAAAAATTGATTTAGTTCACACAAGCTAATTTAGAATAAATTAATATTAATTTAT
129 AAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
15532199 TAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAATAGATTTAAAAAAATAAA-TATGTTTA-TCG-AACAAGT
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTA-GTTTACT-GAAACAAGT
** * * * * * * * *
15532260 TTGAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATCAATTTAAAATC-ATTATAACCTTTTGATTTG-CT
62 TCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-
* * * * * * * *
15532323 ATAAAACATTTGTTTTAGTTAACACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACT-ATTTAT
126 ATAAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * * * ** *
15532380 TAATACTTACTAAAA-GAATAAGTGTGAAACTTAAAAAATAAAATAGTTTA-TCG-AATTAGTTA
1 TAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACT-GAAACAAGTTC
* *
15532442 AAATAATTAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
64 AAATAGTTATGA-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
15532505 AAAACAATTGTTTT-TTATCATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATATTAATTTAT
128 AAAACAATT-TTTTAAT-TCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
*
15532561 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TACGTTTACTG-AACTAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * * * * * *
15532624 AATAGTTATGACTATTTGAATAGTTAT-TAATCTCAAATC-ATTAAGATC-TATGTTTTGTCATA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
15532686 AAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAA-CTTATT-TGATTAAAAATAATACTTATTTAA
129 AAACAATT-TTT-TAATTCATA-AAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* * * * **
15532741 TAACATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-T-GTGTTGCCGAGTCAA-TTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGT-TTACTGAAACAAGTTCA
** * * * * * * * *
15532803 AATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * **
15532867 AA-TATTTGTTTCATATCTTACAAGGTCATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTAT
130 AACAATTT-TTTAAT-TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAT
** * **
15532921 TAA-CCTTCAAAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAATAAATCTA-TTTAC-CCAACAAGTT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTT
* * * * * * **
15532982 CAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATC-ATTATGACCATTTGTTTTAACAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
15533046 AAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAGATAATACTAATTTCT
128 AAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
15533102 TAATAATTT-TAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCG-AACAAATTCA
1 TAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * * *
15533162 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
15533226 AACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTAT
130 AACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
15533280 TAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCT-GTTTA-TCGAATC-TGTTT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACT-GAAACAAGTTC
* * * * * *
15533338 AAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATTACCTTTTATTTAGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
15533402 TAATAATTGTTTTTGA-TCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTAT
129 AAACAA-T-TTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* ***
15533457 TAA-ATTTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTA-TTTACCG-AATTGGTT
1 TAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTT
* * * * * * * * *
15533518 TAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATC-GTTATAACCTTTTATTCTGTCAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
** * * * * *
15533582 AAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAA
128 AAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
15533638 AAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAGAAAATAAATTTGTTTGC-CAAACTAGTTCAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
* * * * * *
15533702 ATCGTTAAGACTATATGAA-AATTTTTTTATTTCAAATC----AT----TTTTGTTTTGTCATAA
66 ATAGTTATGACCATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** **
15533758 AACAATTTTTTCACTTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAGA-A-TGAATTTAT
130 AACAATTTTTT-AATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATACT-AATTTAT
* * ** * * *
15533812 TAATATTTCAAAATTTAATATGTAAGAGATTCGAAAAATAATTTTGTTTATCT--AACCAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTA-CTGAAACAAGTTCA
* * * ** *
15533875 AATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC-ACTAAGACC-TTTGTTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
15533938 AACATATGTTTTT-ATTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTAT
130 AACA-AT-TTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15533992 TAATATTTTAAAAATCAATAA-T---CGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTA-TCAAACTAGTTTA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTCA
*** * * * * * * * *
15534051 AA-AGTTATG-GTTTTTTAGCAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGA-TTTTTTTATTCTATTAC
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGT-TT-TGTCAT
* * * *
15534112 AAAACAATAATTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCATATTAAAATAATACCAATTTAT
128 AAAACAAT--TTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * *** * * *
15534168 TAATATTTTGACAATTAATAAGCAA-A-ATTTTTTAAA-AAATTTGTTTAC-CAAACTAA-ATCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAAC-AAGTTCA
* ** * * * * *
15534228 AATAGTCATGATGATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-A
* * ** * * *
15534292 AAAAAATTATTTTAGTTCATATCAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTTAGTTAT
129 AAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15534347 TAATATTAT-GAAAATTAAAAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTG-AACAAGTTTA
1 TAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* ** * * * *
15534410 AATAATTATGAATATTTAAACAATTATCTATTTGAAAT-TG-TATAACCTTTTGTTTTGTCACCA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TA
** * * * **
15534473 AATGATTTTTTTTTATTCATAGAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAATTTAT
129 AAACA-ATTTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
15534527 TAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAACAAGTT
1 TAATATTTCAA-A-AATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTT
** * * * * *
15534588 CAAATCCTTATGACTAATTGAGCAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
15534652 AAAATAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTAT
128 AAAACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * **
15534708 AAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAGTATGTTT-CTTCAACAAGTTC
1 TAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTC
* * * * * * * *
15534770 AAATAATCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-TATTGTGACTTTTTGTTTTGTAAT
64 AAATAGT-TATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
15534833 AAAAAAAATTGTTTCAGTTTATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTCAT
128 -AAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
15534890 GAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAGGAGAATTTAAAAATTTAATTTGTTTATTG-AAC-ATTTCT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTC-
* * * * *
15534952 AAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAA-ATATTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* **
15535016 AAACAATTGATTCT-ATTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAAATAA-A--AATTTAT
129 AAACAATT--TTTTAATTCATAAAAGCTTA-TTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15535069 TAATATTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAACTAAA-TACGTTTTCTG-AACACGTT-A
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTCA
* * ***
15535130 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTCACTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* *
15535194 ACCAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTTT
130 AACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * **
15535248 TAA-ATTTCCAAAACTTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATTCG--ATGAGTT
1 TAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACT-GAAACAAGTT
* * * * *
15535309 CACATAGTTATTATTC-TTTGAACAATTA-CTTATTTCAAAT-TGTTATGATCTTTTGTTTGGTC
63 CAAATAGTTATGA-CCATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
15535371 ATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATATAATG-TTATTCAAAAGAAAATAATGCTAATTTA-
126 ATAAAACAATT-TTT-TAATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * *
15535428 T-ATA-TTCAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTCA-ATCAC-CAAACAAGTTC
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-AGTTTACTGAAACAAGTTC
* * **** * **
15535489 AAATAGTCATGTCCATTTGAGTTGTTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
15535553 AAACAATTATTTCT-ATTTATACAAA-ATTATTTAGAATAAAGTAATACTAATTTAT
129 AAACAATT-TTT-TAATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * * * *
15535608 TAATATTTC-AAAA--ACTAA-TAAGAGATTTAAAAGCTAAATCAATTTA-TCAAACCAGTTTAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
** * * * *
15535668 ATAGTTATGATTATTTCAACAATTATCTATCTCAAAT-TATTATGATCTTTT-TTTTGTCATAAA
66 ATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * * *
15535731 ATAATTATTTCT-GTTCATACAGGCTTATT-TGAAGTAAAAT-ATCGCAAAATTAA
131 ACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAAT-ACTAATTTAT
* * *
15535784 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTT-GTCAAACTAGTTC
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTC
* ** * * * *
15535846 AAATAGCTAAAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
15535910 AAATAATTTTTTCAATTCACACATGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTAT
129 AAACAATTTTTT-AATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * *
15535965 T-ATCA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTAAAAGAAATAAATTTGTTTA-TCG-TACAAGT
1 TAAT-ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATTAGTTTACT-GAAACAAGT
* * * *** *
15536026 TCAAATAGTTATGACTATATGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAG-TATGACCTTTTGTTTTATC
62 TCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * * * *
15536089 ATAAAATGATTGTTTCAGTTCATAAAAGCATATT-TGAAATAAAATAATATTACTTTAT
126 ATAAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * **
15536147 TAATATTTCAAAAATTAAAAATTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCA-ATTAATCAAA-TTGCTTC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAG-TTC
* * * * * * * *
15536209 AAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATTTATTTCAAGTC-ATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
** * * * *
15536273 AAACAATTTTTTTTTATCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATACTATTAATTTAT
129 AAACAATTTTTTAAT-TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
*
15536328 TAATATTTCAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTACT-AAAC-----C
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTACTGAAACAAGTTC
* * * * * *
15536385 ----AGTT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATC-ATTATAACCTTTTGTTCTATTATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * ** *
15536441 AGATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAA
129 AAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
15536496 TAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGAGATGTAAAAAATAAATTTGGTT-GTCAAAGCAA-TTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAA-CAAGTTCA
* * * * * * * **** * *
15536559 AACAATTAAGACTATATGAACAATTATTTGTTT-ATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * *
15536623 TAACAATTTTTT-TTGATCATTCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
129 AAACAATTTTTTAAT--TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
15536678 AAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-AAACTAA-TTC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAAC-AAGTTC
* * * ** * * * * * *
15536736 AAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATC-ATTATAACCTTTTATTCTATCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
15536798 AAACAATTATTTT-GTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATCTAA
129 AAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * * * *
15536852 CAAT-TTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTA-TTT-GTTAAACCAA-TTC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTACTGAAA-CAAGTTC
* * * * *
15536913 AAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** *
15536977 AAATAATTTTTTTTCAATTGATAATAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTAT
129 AAACAA--TTTTTT-AATTCATAA-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * ** *
15537034 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA-AATTCAAAAATATTTCTA-TTTATCT-AACCAA-TTC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-CTGAAACAAGTTC
* * * *
15537095 AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATGTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * ** * *
15537159 AAACAAATGTTTTT-GTTTATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTAT
129 AAAC-AAT-TTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15537214 TAATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAATAATAAATCTA-TTTA-TCAAACGAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * ** * * * *
15537273 AATAGTTATGACTATCTGAGTAATTATTTATTTCAAATC-GTTATGACTTTTTGTTTAGTTATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* ** ** *
15537337 AATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCCTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTAT
130 AACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15537391 TAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAA-TATGTTTAGTG-AACTAGATCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * *
15537454 AATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
15537518 AAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAAGTTAT
130 AACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * ** *
15537572 TAATATTACTAAAGTTAATGATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT-GTTTGTTG-AACAAGTTTA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * ** * * * * *
15537635 AATATTTATGACTATTTCTACAATTATCTTTTTGAAAT-TGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** ** * ** *
15537699 AATGATTTTTTTTTGTTCATACGAGCTTTTTTTGAATAAAATAATACAAATTTAT
130 AA-CA-ATTTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15537754 TAATA--TAAAGATAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCG-AACAAGTT
1 TAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTT
* * * ** * * * * **
15537815 CAAAT-CTTATGACTATTAGATTATTTATTTATTTAAAAT-TCTTATGAATTTTTGTTTTGTCAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
15537878 AAAACAATTGTTTCT-ATTCGTAAAAGCTTATTCA-AATTACAATAATATTAATTTAT
128 AAAACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
15537934 TAATATTTTAACAATTAATGAGTAAAAGATTTAAGAAATAAA-TATGTTT-TTCG-AACAAGTTC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACT-GAAACAAGTTC
** * * ** * * * * *
15537996 AAATAGTCCTAACTATTTGATTAATTATTTATTTTAAATC-ATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
15538060 AAACAATCGTTTCAGTTCATATAGGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTTT
129 AAACAAT-TTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
** ** * * * * * * *
15538115 TAATATGCCAAAAATTAATGGGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTGCT-ATACATGTTTAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
* * * *
15538179 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAC-ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA
66 ATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * ** ** *
15538243 ATAATTGGTTTT-GTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAAATTAT
131 ACAATT--TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * * *
15538296 TAATATTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAA-TATGTTTTCTG-AACATGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTCA
* * *
15538358 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** *
15538422 ACCAATTGTTTCT-ATTCCTAAAAGATTATTTGGAATAAAATAATACTAGTTTAT
130 AACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ***
15538476 TAA-AATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACT-AAGTGAGTTC
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTC
* * *** *
15538538 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA-TTCTAAA-CCACTATGATCTTTTGTTTTGTCAT
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
15538601 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
128 AAAACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * * *
15538657 TAATA-TTCTATAAATTTATAATTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCG-AACAAGTTCA
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * * * * * **
15538720 ATTAGTCA--ATCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACATTATATTTTGTTGTA
65 AATAGTTATGA-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* *
15538782 AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATAGC-AATTTAT
129 AAACAATT-TTT-TAATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-CTAATTTAT
** * * * *
15538837 TAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCT-GTTTA-TCAAACTAGTTCT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
** * * *
15538896 AATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCAT-TT-TGATC-TTTGTTTTGTTATA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** * * * * ** *
15538958 AAAGAATTGTCTATATTCATGCAAGCTTATTAAGAGTAAAATATTGCTAAACTAA
129 AAACAATTTTTTA-ATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
15539013 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATAAATGAGTTT-GTCAAACTAGTTCA
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * * * * * * *
15539076 AATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCCATTTCAAATC-ATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
15539140 AATAAATTTTTTAGTTCATACATGCTTA-TCTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
130 AA-CAATTTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15539194 TAACA-TTC-AAAA--AAT---T---A-A--TAAACAACAAA-T-GTTTACCG-AACAAGTTCAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
* * *** * * *
15539243 ATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAAAT-AAATAT-AACATTTGTTTTATCATAA
66 ATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
15539305 AACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATA-TCACTTTAT
130 AACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * * * ***
15539359 TAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAACTCAATTTA-TCAAATTGGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * * * ** * *
15539422 AATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTACAAACTTTTGTTTT-TCATCA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* *** * *
15539485 TACAA--GCCT-ATT--TGAAA---TA---A-AATAAAATAATATTAATTTAT
130 AACAATTTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
15539526 TAATATTTCAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT---A-AA---C--
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
* * * * *
15539582 -TAG-T-T--CCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-TGTTATAACGTTTTGTTCTGTTATAA
66 ATAGTTATGACC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
15539641 AATAATTGTTTTAATTCATATAAA-CTTATTCAAAAT-ATATAATACAAATTTAA
130 AACAATT-TTTTAATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15539694 TAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCT-GTTT-GTCGAAGC-AGTT
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACT-GAAACAAGTT
* * * * *
15539755 GAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
15539819 AAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAA-CTTATTAAAAATAAAATAATAATAATTTAT
128 AAAACAATT-TTTTAATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * **
15539875 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATTTGTTTAC-CAAATTAGTTCA
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * *** * * * * * *
15539938 AATAATTATGGCCATGCCAATAATTAACTATTTCCAATC-GTTATTACCTTTTG-TTTGGCTGTA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATA
* **
15540001 TAACAATTGTATTTGAA--CATTCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-A---AT
129 AAACAATT-T-TTT-AATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
15540052 TAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATCTA-TTTAC-CAAACTAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * ** * * ** ** *
15540115 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATC-GTTATAACCTTTCATACTATCATAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * *
15540179 AACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATCTAA
130 AACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15540233 TAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAATAAA-T-GTTTGCTG-AACTAGTTC
1 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTC
* * * * * *
15540294 AAA-ATTTA-AACTATAT-AAAAATTATCTATTTTAAATC-GTTAT-ACCTTTT-TTTTGTCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** ** *
15540353 AAATAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTAT
129 AAACA-ATTTTTT-AATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * *
15540409 TAATATTTCAAAAATTAAT-A-T------TTCAAAAATTATTAATCT-GTTTACCT-AACCAA-T
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA--ATAAAT-TAGTTTA-CTGAAACAAGT
* * * * * * *
15540463 TCGAATAATTATAACTATTTGAACACTTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCATTTGTTTTGTCA
62 TCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15540527 TAAAATGAATGTTTTT-GTTCATATAAGTTTGTT-AAAAAAAAATAATACTAATTTAT
127 TAAAA-CAAT-TTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
15540583 TAATATTTC--AAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAATATAAATCTA-TTTAC-CAAACTAGTTTA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTCA
* * ** * * * * * * *
15540642 AATAGTTTTGACTATTTGAGTAATTATTTGTTTCGAATC-ATTATGACTTTTTGTTTTGTTACAA
65 AATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
15540706 AACAATTGTTTGT-GTTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAACAATACTAATTTAT
130 AACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
15540760 TAATATTTCAACAATTAAAAAGTAAAAAATTTTTAAAAATAAA-TACGTTTACCG-AACTAGATC
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTTC
* * ** * * * *
15540823 AAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTATTTTATCATA
64 AAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
** * * * * *
15540887 AATGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATT-GGAATAAAAATAATACTAGTTTAT
129 AAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* * * *
15540942 TAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-AAACAAGTTA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTTC
* ** * * * * * *
15541004 AAATAATTATGATTGA-TTCAACGATTATCTA-TTGAAAT-TGCTATAACCTTTTG-TTTGTTAT
64 AAATAGTTATGA-CCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** * *
15541065 -AAAGAATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTC--AATAAAAT-ATACAAATTT-T
128 AAAACAATTTTTTAATTCATAAAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
15541116 TAATA-TT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCG--ATAAGTT
1 TAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTT
* * ** * *
15541176 CAAATCGTTATGA-TATTTGTGCAATTATTTA-TTCAAA-CTGTTATGACTTTTTG-TTT-TCAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* *
15541236 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCA-AATTAAAATAATAC--ATTTAT
128 AAAACAATT-TTT-TAATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * *
15541290 TAATATTTCGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAGAT-AA-TATGTTTACT-AAACAAGTT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAA-ATAAATTA-GTTTACTGAAACAAGTT
* * * *** * *
15541352 CAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTCAAATC-ACAATGACCTTTT-CTTTGTAA
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
15541415 TAAAACAATTGTTTTAGTTC-TTAAAGTTTGTT-TGAACTAAAATAATACTAATGTAT
127 TAAAACAATT-TTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
15541471 TAAT-TTATCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA-GAATCTA-TTTACCG-AATAAGTT
1 TAATATT-TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAAACAAGTT
* ** * * **
15541532 CAAATAGTTATGACTAGATGAACAATTATCTATTTCAAAAC-ATTATGACCTTTTGTTTTAACAT
63 CAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
15541596 AAAACAATT
128 AAAACAATT
15541605 GGTTCTGTTT
Statistics
Matches: 10709, Mismatches: 2235, Indels: 1545
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
152 1 0.00
153 7 0.00
154 58 0.01
155 41 0.00
156 8 0.00
157 6 0.00
158 7 0.00
159 1 0.00
160 10 0.00
161 4 0.00
162 6 0.00
163 3 0.00
164 11 0.00
165 73 0.01
166 54 0.01
167 79 0.01
168 167 0.02
169 42 0.00
170 4 0.00
171 32 0.00
172 76 0.01
173 81 0.01
174 330 0.03
175 164 0.02
176 627 0.06
177 1204 0.11
178 412 0.04
179 575 0.05
180 1499 0.14
181 3125 0.29
182 1460 0.14
183 380 0.04
184 13 0.00
185 3 0.00
186 1 0.00
187 1 0.00
188 2 0.00
191 8 0.00
192 133 0.01
193 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (182 bp):
TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAAACAAGTTCAA
ATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
ACAATTTTTTAATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
Found at i:15540427 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 15540407--15540440 Score: 68
Period size: 15 Copynumber: 2.3 Consensus size: 15
15540397 AAATGAATTT
15540407 ATTAATATTTCAAAA
1 ATTAATATTTCAAAA
15540422 ATTAATATTTCAAAA
1 ATTAATATTTCAAAA
15540437 ATTA
1 ATTA
15540441 TTAATCTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
15 19 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.06, G:0.00, T:0.41
Consensus pattern (15 bp):
ATTAATATTTCAAAA
Found at i:15540445 original size:18 final size:17
Alignment explanation
Indices: 15540405--15540445 Score: 59
Period size: 15 Copynumber: 2.5 Consensus size: 17
15540395 TAAAATGAAT
15540405 TTATTAATATTTCAAAA
1 TTATTAATATTTCAAAA
15540422 --ATTAATATTTCAAAAA
1 TTATTAATATTTC-AAAA
15540438 TTATTAAT
1 TTATTAAT
15540446 CTGTTTACCT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 0, Indels: 5
0.81 0.00 0.19
Matches are distributed among these distances:
15 11 0.52
16 4 0.19
18 6 0.29
ACGTcount: A:0.49, C:0.05, G:0.00, T:0.46
Consensus pattern (17 bp):
TTATTAATATTTCAAAA
Found at i:15542596 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 15541613--15544080 Score: 1554
Period size: 181 Copynumber: 13.8 Consensus size: 180
15541603 TTGGTTCTGT
* * * * * *
15541613 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-TAAAATAAATCCATTTTCTGAACACA-
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA-AG
* *
15541675 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATTATCTATTTCAAA-CAGTTATGACCTTTTCTTTTGT
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * * ** *
15541739 CATAAACCCATTATTTCTATTCATAAAAGCTTAATT-GGAATAAAATGATACTAA
128 CATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
15541793 TTTATTAA-AATTCAAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGACCGAG
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * ** * * *
15541857 TTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAACTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTCGTCA
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCA
* **
15541922 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
130 TAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * * *
15541974 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAATTTTGAGATTTAAAAAATAAACCTGTTTACTGAATAAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGT
* * * * * * * * * * **
15542039 TTAAACAATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTTAAATCATTATGACATTTTAG-TTA-TTG
66 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTAGTCA
* * * **
15542102 TAAAATAATTGATTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAA
130 TAAAACAATTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
15542154 TTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATC-AT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-CAAG
** * *
15542214 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCACAAATCATTATGATCTTCAT-TTT-GTC
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTAGTC
* * * * *
15542277 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAGCA-AAAATATTGCTAA
129 ATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTCA-A-AATAAAATAATACTAA
*** * * * * * * *
15542331 ACCAATAATAGTTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACCAG
1 TTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
* ** * *
15542395 TTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTGTTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCA
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCA
* * * **
15542460 TAAAATAATTGTTTCAGTTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTCT
130 TAAAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* *
15542512 TTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGA-AGTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
* **
15542575 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-A--A--TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-
63 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAG
** * * * *
15542634 TCATAAAACAATTGTTGTTGTTAATGA-AAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAC
127 TCATAAAACAATTGTT-TCATTCAT-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * *
15542689 TTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAAT-TAGTTTATTGAATCAA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-AAACAA
* * * * * *
15542753 -TTCAAATAATTATTG-CCATTTGAATAATTATCTATTTTCAAAT-ATTTATGATCTTTTATTTT
64 GTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTA
* *** * *
15542815 GTCATAAAACAAATGTTTTTCA-TCATATGGGCTTGTTTC-AAATAAAATAATATTAA
126 GTCATAAAAC-AAT-TGTTTCATTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * ** * *
15542871 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATTAATATGCTTACCAAACCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGT
* * * *
15542936 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATACTTCAAATCGTTAT-A----------A-TCGT
66 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCAT
* * * * ** *
15542989 AAAACAATTATTTATATTCATACATGCTTGTTTGAAATACAATAATACTAA
131 AAAACAATTGTTT-CATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
15543040 TCTAATAATATTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGTCGAACCAA
1 TTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTAAACAA
* * * * * *
15543104 -TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAA-CTATTATGACATTTTGTTTTGT
64 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * ** * * * * * *
15543167 CGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAAAAAAATTAA
128 CATAAAACAATTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
** * *
15543221 TTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCAA-
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-CAAG
* * * * **
15543281 TTCAAATAGTTAT-AATAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTCCTC
65 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * *
15543345 ATAAAACAGTTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAA
129 ATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * *
15543398 TTTGTTAATATCCCAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCGATTGGACT-AACCA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TACTAAACAA
* * * *
15543461 GTACAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGT-ATTATAACCTTTTGTCTT-G
64 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGT-TTAG
* * * ** * * ** * *
15543524 TTACAAAACAATTATTTTTGTTCATACAACCTAACTT-TGAATAACATAA-ATCTGA
127 TCATAAAACAATT-GTTTCATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAA
* * * * * * * *
15543579 TGTATCAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTA-TCGATCAAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAAG
* * * * ** *
15543639 TTCAAATAGTTACT-ATTCTTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTCTA-T
65 TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TAGT
* * * *
15543702 CTTAAAATAATATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAAA
128 CATAAAA-CA-ATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AA
* * * * * *
15543758 TTTATTAATATTT-AGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAATA
1 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACT-AAACA
* * * * * * *
15543821 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATTTTTTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGT
63 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* ** * * *
15543886 CATAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTC-ATATGAAAATAATATTAA
128 CATAAAACAATTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAA
** * * * * * * * * * *
15543940 TTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAATATAGATTTGTTTATTGAACAAAT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGT
* * * * * ** *
15544005 TCTAATTGTCATAACTACTTGAGTAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTCA-TCA
66 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-AGTCA
15544069 TAAAACAATTGT
130 TAAAACAATTGT
15544081 ATCAAATTCA
Statistics
Matches: 1772, Mismatches: 396, Indels: 240
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.00
168 7 0.00
169 114 0.06
170 7 0.00
175 6 0.00
176 144 0.08
177 321 0.18
178 31 0.02
179 47 0.03
180 104 0.06
181 562 0.32
182 324 0.18
183 23 0.01
184 78 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGT
TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCAT
AAAACAATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
Found at i:15542709 original size:358 final size:353
Alignment explanation
Indices: 15541613--15543951 Score: 1685
Period size: 358 Copynumber: 6.5 Consensus size: 353
15541603 TTGGTTCTGT
* * * **
15541613 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-TAAAATAAATCCATTT-TCTGAACACA
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAAC-CA
*
15541675 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATTATCTATTTCAAA-CAGTTATGACCTTTTCTTTTG
63 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** *
15541738 TCATAAACCCATTATTTCTA-TTCATAAAAGCTTAATT-GGAATAAAATGATACTAATTTATTAA
126 TCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ** * *
15541801 AATTCAAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGACCGAGTTCAAATAG
189 TATTC-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * **
15541866 TTATAACTATTTAAACAACTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTCGTCATAAAACAAT
249 TTATGACTATTTGAACAATTATTTA--T-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* **
15541931 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
311 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * **
15541974 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAATTTTGAGATTTAAAAAATAAACCTGTTTACTGAATAAGT
1 TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACCAGT
* * * * * * * * * *
15542039 TTAAACAATCATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTTAAATCATTATGACATTTTAGTTATTG--
65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTT-TTGTC
* ** **
15542102 -TAAAATAATTGATTTTA-TTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
128 ATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * *
15542165 TTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATC-ATTTCAAATAGTTATGA
191 TTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * ** * *
15542229 CTATTTGAACAATTATCTATCACAAATCATTATGATC-TTCATTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
255 CTATTTGAACAATTAT-T-T-ATAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
15542293 TATTCATACAAGCTTATTTAGAGCA-AAAATATTGCTAA
317 TATTCATACAAGCTTATTCA-A-AATAAAATAATACTAA
*** * * *
15542331 ACCAATAATAGTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTATTGAACCAGT
1 TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACCAGT
* ** * * *
15542396 TCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTGTTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT
65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** *
15542461 AAAATAATTGTTTCAGTTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTCTTTTATTAACATTCA
130 AAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-
15542526 AAAAATTAATAAGTAAGAAGTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
194 AAAAATTAATAAG--AG-A-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* *
15542591 ACTATTTGAACAA-TATTTA-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTGT-T
254 ACTATTTGAACAATTATTTATAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT-TCT
* * * * *
15542653 GTTAATGA-AAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAC
318 ATTCAT-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * ** * * *
15542689 TTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAAT-TAGTTTATTGAATCAA
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATTGAACCAG
* * * * *
15542753 TTCAAATAATTATTG-CCATTTGAATAATTATCTATTTTCAAAT-ATTTATGATCTTTTATTTTG
64 TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* *** ** * *
15542816 TCATAAAACAAATGTTTTTCATCATATGGGCTTGTTTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
126 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** *
15542880 ATTTCAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATTAATATGCTTACCAAACCAGTTCAAATAGT
190 A-TTCAAAAATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
15542945 TATGACTATTTGAACAATTA--TAT--A-C-TTCA-AA----TCGTTATAATCGTAAAACAATTA
250 TATGACTATTTGAACAATTATTTATAAATCGTT-ATAACCTTTTGTT-TTATCATAAAACAATTG
* * * ** *
15542999 TTTATATTCATACATGCTTGTTTGAAATACAATAATACTAA
313 TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
15543040 TCTAATAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTGTCGAACCAAT
1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACCAGT
* * * * * *
15543105 TCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAA-CTATTATGACATTTTGTTTTGTCG
65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
15543169 TAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAAAAAAATTAATTTATTAATATTT
129 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
** * *
15543234 TGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAT-AAT
193 CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** *
15543297 AATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTCCTCATAAAACAGTTGTTTCT
257 -ATTTGAACAATTATTTA--T-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
15543362 ATTGATAC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAA
318 ATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* ** * * *
15543398 TTTGTTAATATCCCAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATC-GATTGGACT-AACC
1 TTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-TATTGAACC
* * * * *
15543460 AGTACAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGT-ATTATAACCTTTTGTCTTG
62 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * ** * * * *
15543524 TTACAAAACAATTATTTTTGTTCATACAACCTAACTT-TGAATAACATAA-ATCTGATGTATCAA
126 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAA
* * * * * *
15543587 TATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTATCGATCAAGTTCAAATAGTTAC
189 TATT-CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA-
* * * * * * * *
15543652 T-ATTCTTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTCTATCTTAAAATAATATT
252 TGACTATTTGAACAATTAT-T-TAT-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-CA-ATT
* *
15543716 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAAA
312 GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AA
* * * * * * **
15543758 TTTATTAATATTTAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAG
1 TTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATTGAACCAG
* * * * * *
15543823 TTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATTTTTTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
15543888 TAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTC-ATATGAAAATAATATTAATTTATTAATATT
129 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT
15543952 TTGACAATTA
Statistics
Matches: 1543, Mismatches: 336, Indels: 198
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
345 2 0.00
346 51 0.03
347 3 0.00
348 2 0.00
349 3 0.00
350 95 0.06
351 118 0.08
352 2 0.00
353 1 0.00
354 5 0.00
355 7 0.00
356 45 0.03
357 188 0.12
358 469 0.30
359 138 0.09
360 80 0.05
361 197 0.13
362 48 0.03
363 86 0.06
364 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (353 bp):
TTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACCAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA
AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
GAACAATTATTTATAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
Found at i:15544940 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15544635--15544966 Score: 443
Period size: 182 Copynumber: 1.8 Consensus size: 181
15544625 AATAGTTAAA
* * * *
15544635 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACATTTTGTTTAGTTATAAAATAATTATTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTT
* * * * * *
15544700 CAGTTTATACAAGCTTATTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAG
66 CAGTTCATAAAAACTTATCCAGAATAAAATAAAACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAG
15544765 TAAGAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGCTCAAATATATATG
131 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGCTCAAATATATATG
* * * * *
15544817 ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTT
* * * *
15544882 CAGTTCATAAAAACTTGTCCA-AACTAAAATAAAACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTATTA
66 CAGTTCATAAAAACTTATCCAGAA-TAAAATAAAACTAATTTATTAA-AATTCAAAAAATTAATA
*
15544945 AGTAAGAGATTTAAAAACTAAA
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
15544967 ACTATTTTTC
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 20, Indels: 5
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
181 14 0.11
182 110 0.86
183 4 0.03
ACGTcount: A:0.45, C:0.09, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
ACTATTAGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTT
CAGTTCATAAAAACTTATCCAGAATAAAATAAAACTAATTTATTAAAATTCAAAAAATTAATAAG
TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGCTCAAATATATATG
Found at i:15546468 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15545692--15547434 Score: 1318
Period size: 181 Copynumber: 9.7 Consensus size: 181
15545682 ATAAACTAAC
* * * * *
15545692 TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATAAATTTTTAAAATATTAATAAAAGTAATATTATTTTATTTT
1 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTT
** * * * * *** *
15545757 GGATAAGCTTTTATGAACT-TAAACAATTGTTTTATCATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAA
65 AAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * * *
15545821 ATAGATAATTGTTCAAATAATAAAAACTATTTGAACTTTTTTGGTAAACAAAT
129 ATAGAAAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAAT
* ** *
15545874 TATTTTTTTTAAAAT-TTGTT-CTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 T-TATTTTTT-AAATCTT-TTAC-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* ** * * * * * *
15545937 TTTAAATTAGCACATATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTG
62 TTTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * * * * **
15546002 AAATAGATAATTGTTCTAATATTCTTAATTATCT-AAATTGGTTCGACAAA-AACAT
127 AAATAGAAAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAA-AT
* ** * * ** * * *
15546057 TTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAGAATACCATTAATTTAACAATATTTTATTCTG
1 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
* * * * * *
15546118 AATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGAT
66 AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * *
15546182 AGATAATTGTTCAAATAATCATAACCATTAGAA-TTGGTTCGATAAACATAT
131 AGAAAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAAAT
* * * * * *
15546233 TTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTGGTTTTATTTTGTTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
* * * * *
15546294 AATAA-TTCTATATGAATAGAAACACTAGTTTAATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAA
66 AATAAGCT-TATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* *
15546358 TAGAAAATAGCTCAAAT-G-CATATGACTATTTGAACTTGTTCGGTGAATAAAT
130 TAGAAAATAGTTCAAATAGTCATA--ACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAAT
** * *
15546410 TTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
** * * ***
15546475 AATAAATTTATATGAATAGAAACAATTTTTTTATG-----AC-AAAGATCATAGTGATTTGAAAT
66 AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
** *
15546534 A-AATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTT-GGTAAATAGA-
131 AGAA-AA-TAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAATAAAT
* * * *
15546584 TT-TTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCTA
1 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
* * * * *
15546648 AATAAGCTTTTATGAACAGAAACAGTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
66 AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * ** *
15546713 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAG-AAA-ACAT
131 AGAAAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAATAAAT
* ** * * *
15546762 ATAGAATTTTAAAT-TTTTACTTATTAATATTTCAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC
1 TTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* * * * * **
15546825 AAAATAAGCTTACATGAATAGAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TTTTTGAA
64 TAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * *
15546889 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCTGTAAATATAT
129 ATAGAAAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAAT
* * * ** *
15546942 TCATTTTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
1 TTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * ** *
15547007 AAATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTAAA
65 AAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * *** * *
15547071 ATAGATAATTA-TTCAAATAGTCA-ACACTATTTGAACTTCTTCAAAAAACATAT
129 ATAGA-AAATAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAAT
* * * * * * *
15547124 TTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTCTAATTTG
1 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
* * * * * * *
15547189 AATAAGCTTGTATGAACAGAAAGAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTCTTAAAAATTTGAAAT
66 AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * *
15547254 A-AATAATTGTTCAAATAGTCATAA-GATTTGAACTTGTTCGATAAACAGAT
131 AGAA-AATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAAT
* * * ** * * ***
15547304 TTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGTCATTATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCG
1 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
* * * * * * * *
15547369 AATAAACTTGTA-CAATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAA
66 AATAAGCTTATATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
15547433 TA
130 TA
15547435 TATTATTTAA
Statistics
Matches: 1247, Mismatches: 262, Indels: 106
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 82 0.07
174 4 0.00
175 51 0.04
176 143 0.11
177 140 0.11
178 59 0.05
179 139 0.11
180 154 0.12
181 276 0.22
182 66 0.05
183 109 0.09
184 24 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA
AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
AGAAAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAAT
Found at i:15547573 original size:160 final size:160
Alignment explanation
Indices: 15547295--15547588 Score: 383
Period size: 160 Copynumber: 1.8 Consensus size: 160
15547285 ACTTGTTCGA
* *** * * * *
15547295 TAAACAGATTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGTCATTATGTTAATAAATTTGTATTAT
1 TAAACAGATTCATTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTGTCATAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *
15547360 TTTATTCCGAATAAACTTGTACAATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACG
66 TTTATTCCGAATAAACTTGTACAATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
15547425 ATTTGAAATATATTATTTAAATTGATTTGG
131 ATTTGAAATATATTATTTAAATTGATTTGG
*
15547455 TAAACAGATTCATTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTCATTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTGTCATAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * ** * * * *
15547520 TTTATTTTGAATAAACTTTTATGAA-CTTAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAGGGTCATAAC
66 TTTATTCCGAATAAACTTGTA-CAATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAAC
15547584 AATTT
130 AATTT
15547589 TCAATAGACA
Statistics
Matches: 112, Mismatches: 21, Indels: 2
0.83 0.16 0.01
Matches are distributed among these distances:
160 110 0.98
161 2 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (160 bp):
TAAACAGATTCATTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTGTCATAATATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTCCGAATAAACTTGTACAATCAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
ATTTGAAATATATTATTTAAATTGATTTGG
Found at i:15547877 original size:877 final size:868
Alignment explanation
Indices: 15546572--15548302 Score: 1945
Period size: 877 Copynumber: 2.0 Consensus size: 868
15546562 TTGAACTCAC
* * ** * * *
15546572 TTGGTAAATAGATTTTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATT
1 TTGGTAAACAGATTTTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
15546637 TTTTTATTCTAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAGTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA
66 ATTTTATTCTAAATAAACTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* *
15546702 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTTAGAAAACATATAGA
131 CAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAGAAAACATAT--A
* * *
15546767 ATTTTAAATTTTTACTTATTAATATTTCAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAA
194 ATTTTAAACTCTTACTTATTAATATTTCAAATATTAAGAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAA
* * *
15546832 GCTTACATGAATAGAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATTTTTGAAATAGATAA
259 GCTTACATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATTTTTGAAATAGATAA
* * *
15546897 TTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCTGTAAATATATTCATTTTTTTAATTCTCTTA
324 TTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCTGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTCTCTTA
* * *
15546962 CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA-ACT
389 CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATATAAGATA-T
* * *
15547026 AAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG
453 AAAACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * *
15547091 -TCAACACTATTTGAACTTCTTCAAAAAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTAC-TTATTAATTG
518 TTCAA-ACTATTTAAACTACTTCAAAAAACAAATTTATTT-TTAAATCTCTT-CGTAATT--TT-
* * *
15547154 TCAAAATATTAATAAATTAATATTA-TTCTAATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAAGAATTTT
577 T-AAAATATTAATAAATTAATATTATTTCTAA-CTGAATAAGCTTCTATGAACAGAAAGAATTGT
** *
15547218 TTTATGACAAAACAAAAAGTCTTAAAAATTTGA-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-GAT
640 TTTACAACAAAACAAAAA-TCTTAAAAATTTGAGAAT-AATAATTGTTCAAATAGTAATAACGAT
* * * *
15547281 TTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAA-TTGTCATTATGTTA
703 TTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTGTCA-AATATTA
* * * *
15547345 ATAAATTTGTATTATTTTATTCCGAATAAACTTGTACAATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAA
763 AAAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAACTTGTACAATCAAAAACAATTATTATATGACAAAA
15547410 CAAAAGGTAATAACGATTTGAAATATATTATTTAAATTGAT
828 CAAAAGGTAATAACGATTTGAAATATATTATTTAAATTGAT
*
15547451 TTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTA
1 TTGGTAAACAGATT--TTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTA
* * ** * * *
15547516 TTATTTTATTTTGAATAAACTTTTATGAACTTAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAGGGTCAT
64 TTATTTTATTCTAAATAAACTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * *
15547581 AACAATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AGATTTGTTCGGTAAAA-AT-
129 AACAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATGTGTTCAG-AAAACATA
* * * * * ****
15547643 T-TTTTTTAACTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGGA
192 TAATTTTAAACTCTTACTTATTAATATTTCAAATATTAAGAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAA
** * * *
15547706 TAAGCTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGTCAAAA-AAAAGGTCAGAGTGATTTT-AAAT
256 TAAGCTTACATGAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAAT--TTTTGAAAT
* * ** * *
15547768 A-ACTGATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTT-TGGTAAATGGATTTATTTTTTAAA
318 AGA-TAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCT-GTAAATAGATTCATTTTTT-AA
* * *
15547831 ATT-T-TTCGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCCAAATAAGCA
380 ATTCTCTT-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCA
* * * * * * *
15547893 TGTAAGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATT
443 TATAAGATATAAAACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTAAAATAGATAATT
* ** * **** * *
15547958 ATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAATAAATTTCTTTTTAAATCTCTTCGTAA
508 ATTCAAATAGTTCAAACTATTTAAACTACTTCAAAAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTCGTAA
* * * * * *
15548023 TTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAACTGAATAAGCTTCTATGATCAGAAATAATT
573 TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTCTAACTGAATAAGCTTCTATGAACAGAAAGAATT
** * * *
15548088 GTTTTACAACAAAACAAAAATCTTAACGATTTGAGACTGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTAT
638 GTTTTACAACAAAACAAAAATCTTAAAAATTTGAGAATAATAATTGTTCAAATAGTAATAACGAT
* * *
15548153 TTGAACTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAA
703 TTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTGTCAAATATTAAAAAA
* * ** ** *
15548218 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAATGATTATTTTATGACAAAACAAAA
768 TTAGTATTATTTTATTCCGAATAAACTTGTACAATCAAAAACAATTATTATATGACAAAACAAAA
* *
15548283 GGTCATAATGATTTGAAATA
833 GGTAATAACGATTTGAAATA
15548303 GATAATCGTT
Statistics
Matches: 710, Mismatches: 122, Indels: 51
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
868 90 0.13
869 6 0.01
871 33 0.05
872 100 0.14
873 6 0.01
874 2 0.00
875 1 0.00
876 32 0.05
877 261 0.37
878 15 0.02
879 13 0.02
880 2 0.00
881 145 0.20
882 4 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (868 bp):
TTGGTAAACAGATTTTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTCTAAATAAACTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCAGAAAACATATAAT
TTTAAACTCTTACTTATTAATATTTCAAATATTAAGAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGC
TTACATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATTTTTGAAATAGATAATT
ATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTCTGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTCTCTTACT
TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATATAAGATATAAA
ACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTCACAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTC
AAACTATTTAAACTACTTCAAAAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTCGTAATTTTTAAAATATT
AATAAATTAATATTATTTCTAACTGAATAAGCTTCTATGAACAGAAAGAATTGTTTTACAACAAA
ACAAAAATCTTAAAAATTTGAGAATAATAATTGTTCAAATAGTAATAACGATTTGAACTGGTTCG
ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTGTCAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTT
ATTCCGAATAAACTTGTACAATCAAAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATT
TGAAATATATTATTTAAATTGAT
Found at i:15548010 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15547484--15548417 Score: 428
Period size: 175 Copynumber: 5.2 Consensus size: 181
15547474 AATCACTTAA
* * *** * * * * * *
15547484 TTATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTTTATGAACTT
1 TTATTAATTTTTGA-AATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTAAGAAATG
* * * * * * ** *
15547548 AAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAGGGTCATAACAATTTTCAATAGAC-AATTGTTCAAATAG
65 AAACAAATATTTTATGACAAAA-AAAAGGTCAGAACGATTTGAAATA-ACTAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
15547612 TCATAACTATTTAGATTTGTTCGG-TAA-AAATTT--TTTTT-AACTCTTAT---
128 TCATAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAATAAATTTACTTTTTAAAAT-TTTTCGC
**** * * *
15547659 TTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAAATGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTAAGAAATGA
* * * ** * *
15547724 AACAATTGTTTTATGTCAAAAAAAAGGTCAGAGTGATTTTAAATAACTGATTATTCAAATAGTCA
66 AACAAATATTTTATGACAAAAAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAACTAATTATTCAAATAGTCA
* * * * ** *
15547789 TAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAATGGATTTATTTTTTAAAATTTTTCGC
131 TAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAATAAATTTACTTTTTAAAATTTTTCGC
* * *
15547840 TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTAAGATAT
1 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAAGAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTAAGAAAT
* * *
15547903 GAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGA-TAATTATTCTAATA
64 GAAACAAATATTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATA-ACTAATTATTCAAATA
** *
15547967 GTTTTAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAATAAATTT-CTTTTT-AAATCTCTTCG-
127 GTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAATAAATTTACTTTTTAAAAT-TTTTCGC
** * ** * * * *
15548020 ----TAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAATAAGCTTCTATGATCA-
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTAT-TCCAAATAAGCATGTAAGA-AAT
* * * ** * ** * * *
15548079 GAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAA-ATCTTAACGATTTGAGACTGA-TAATTGTTCAAATA
64 GAAACAAATATTTTATGACAAAA-AAAAGGTCAGAACGATTTGA-AATAACTAATTATTCAAATA
* * * * ** * * * *
15548142 GTAATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACATATTTA-TTTTTTAAA----TCTC
127 GTCATAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAATAAATTTACTTTTTAAAATTTTTCGC
* * * * * *
15548192 TTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG--ATCA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTAAGAAATGA
* * ** *
15548255 AA-AATGATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATCGTTTAAAT
66 AACAA--A-TATTTTATGACAAAA-AAAAGGTCAGAACGATTTGAAATA-ACTAATTATTCAAAT
* * * * * * * * * *
15548318 GGCCATAATTATTTTAA-TTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTT-AAATTTCTT-AC
126 AGTCATAACTATTTAAACTAG-TTTGGCAAATAAATTTACTTTTTAAAATTT-TTCGC
** * *
15548373 TTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATCAGTATTATTTTATTCCA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCCA
15548418 TCTAAGCTTG
Statistics
Matches: 596, Mismatches: 121, Indels: 78
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
171 2 0.00
173 5 0.01
174 54 0.09
175 144 0.24
176 134 0.22
177 55 0.09
178 13 0.02
179 3 0.01
180 4 0.01
181 107 0.18
182 74 0.12
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
TTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCATGTAAGAAATGA
AACAAATATTTTATGACAAAAAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAACTAATTATTCAAATAGTCA
TAACTATTTAAACTAGTTTGGCAAATAAATTTACTTTTTAAAATTTTTCGC
Found at i:15548105 original size:176 final size:177
Alignment explanation
Indices: 15547923--15548308 Score: 449
Period size: 176 Copynumber: 2.2 Consensus size: 177
15547913 TTTTATGACT
* * **
15547923 AAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAACTAGT
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTAGT
* * * * **
15547988 TTGGCAAATAAATTT-CTTTTTAAATCTCTTCGTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAT
66 TCGACAAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTA-
* *
15548052 TTTTAACT-GAATAAGCTTCTATGATCAGAAATAATTGTTTTACAACA
130 TTTTAACTCGAATAAGCTTCTATGATCAAAAATAATTATTTTACAACA
* * * * *
15548099 AAACAAAA-ATCT-TAACGATTTGAGACT-GATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTG
1 AAACAAAAGGT-TATAACGATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTA
* * * *
15548161 GTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATT
64 GTTCGACAAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATT
** * * **
15548226 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAATGATTATTTTATGACA
129 ATTTTAACTCGAATAAGCTTCTATGATCAAAAATAATTATTTTACAACA
* *
15548275 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAAT
15548309 CGTTTAAATG
Statistics
Matches: 172, Mismatches: 31, Indels: 13
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 58 0.34
176 97 0.56
177 17 0.10
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTAGT
TCGACAAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTAT
TTTAACTCGAATAAGCTTCTATGATCAAAAATAATTATTTTACAACA
Found at i:15548426 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 15547436--15548500 Score: 480
Period size: 181 Copynumber: 6.0 Consensus size: 177
15547426 TTTGAAATAT
* * * * **
15547436 ATTATTTAAATTGATTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTT-TCATAA
1 ATTATTTTAATTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAAT--C-T-CTTATTAATTTAGGA-AA
* * ** * * ** * *
15547500 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTTTATGAACTTAAACAATTGTTTTGTGA
61 TATTAAAAAATCAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
* * ** ** * * *
15547565 CAAAACAAAGGGTCATAACAATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATA
126 CAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGACAATCGTTCAAATGGCCATA
* * * * **
15547617 ACTA-TTTAGATTTG-TTCGGTAAA-A-ATTT--TTTTTAACTCTTATTTATTAATTTTTGAAAT
1 ATTATTTTA-A-TTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTAGGAAAT
* * *** * * * *
15547676 ATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGT
62 ATTAAAAAATCAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTATTTTATGA
* * * * * ** * *
15547740 CAAAA-AAAAGGTCAGAGTGATTTTAAATA-ACTGATTATTCAAATAGTCATA
126 CAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGAC-AATCGTTCAAATGGCCATA
* * ** * * **
15547791 ACTATTTGAATTTG-TTTGGTAAATGGATTTATTTTTTAAAATTTTTCGCTTATTAATTTTTTG-
1 ATTATTTTAA-TTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTT-AAA----TCTCTTATTAA-TTTAGGA
* * * * * ** *
15547854 AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTA-TTCCAAATAAGCATGTAAGATA-TGAAACAAATATTT
59 AATATTAA-AAAATCAGTATTATTTTATTTCC-AATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTATTT
* * * * * * ** * * ***
15547916 TATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTA
121 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGACAATCGTTCAAATGGCCATA
* * * * * * * ** **
15547973 ACTATTTAAACT-AGTTTGGCAAATAAATTT-CTTTTTAAATCTCTTCGTAATTTTTGAAATATT
1 ATTATTTTAATTGA-TTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTAGGAAATATT
** * ** * * * * * * **
15548036 ATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAATAAGCTTCTATGATCAGAAATAATTGTTTTACAACAA
65 AAAAAATCAGTATTATTTTATTTC-CAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAA
* * * * * * **
15548100 AACAAAA-ATCTTAACGATTTGAGACT-GATAATTGTTCAAATAGTAATA
129 AACAAAAGATCATAATGATTTGA-AATAGACAATCGTTCAAATGGCCATA
* * * * * * * * **
15548148 ACTATTTGAACTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTA
1 ATTATTTTAATTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTAGGAAATATTA
* * * **
15548213 AAAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAATGATTATTTTATGACAAAA
66 AAAAATCAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA
* * *
15548278 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTTAAATGGCCATA
131 CAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGACAATCGTTCAAATGGCCATA
15548325 ATTATTTTAATTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTAGGAAAT
1 ATTATTTTAATTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTAGGAAAT
* * * ** *
15548390 ATTAATAAATCAGTATTATTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAACTTAAACAATTGTTTTATGA
62 ATTAAAAAATCAGTATTATTTTATTTCCA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGA
* * * *
15548454 CAAATCAAAAGATTATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATGG
126 CAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGACAATCGTTCAAATGG
15548501 TAAATAGATT
Statistics
Matches: 701, Mismatches: 144, Indels: 78
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 2 0.00
174 52 0.07
175 144 0.21
176 155 0.22
177 71 0.10
178 5 0.01
179 7 0.01
180 14 0.02
181 175 0.25
182 73 0.10
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (177 bp):
ATTATTTTAATTGATTTGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTAGGAAATATTA
AAAAATCAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA
CAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGACAATCGTTCAAATGGCCATA
Found at i:15548735 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 15548712--15548754 Score: 77
Period size: 18 Copynumber: 2.4 Consensus size: 18
15548702 AATCTCTTAT
15548712 TTATTAATTTTCAAAATA
1 TTATTAATTTTCAAAATA
*
15548730 TTATTAATTTTTAAAATA
1 TTATTAATTTTCAAAATA
15548748 TTATTAA
1 TTATTAA
15548755 ATTAGTATTA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 24 1.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.02, G:0.00, T:0.53
Consensus pattern (18 bp):
TTATTAATTTTCAAAATA
Found at i:15549072 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 15548730--15549365 Score: 549
Period size: 181 Copynumber: 3.5 Consensus size: 178
15548720 TTTCAAAATA
* * * * *
15548730 TTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCAGAATAAGCTTATATGAACAAA
1 TTATTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA-AATAA-ATTATATGAACAAA
** * * * * * *
15548795 ACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGGTCATAATGATCTAAAATAGATAATCATTCACATAGTCT
64 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * *
15548860 TAACTGTTTGAATTGGTTCA-GCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTAG
129 TAACTATTTGAAATGGTT-AGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCTTAC
* * *
15548910 TTATTAAGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAATAGA
1 TTATTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAATTA-TATGAACA-A
* * * * * * *
15548975 ACCAATTGTTTGATGACAATATAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
63 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
15549040 AAAAGTACTTGAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTCTTAAATCTCTTAC
128 ATAACTATTTGAAATGGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCTTAC
* * ** * * *
15549091 TAATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATCTTAACAA
1 TTATTAAGTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAA-TTATATGAAC-A
* *
15549155 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATATATAATTGTTCAAATAGT
62 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * *
15549220 TATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAATAAAATTATTTTCTAAATATCTTAC
127 CATAACTATTTGAAATGGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCTTAC
* * ** * * * * *
15549272 TTATAAAGTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTTTTATCCTACTTCGAATACACTTGTATGAGCTG
1 TTATTAAGTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATA-AATTATATGAAC-A
* *
15549336 AAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGT
62 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
15549366 TACAGCAATT
Statistics
Matches: 363, Mismatches: 82, Indels: 21
0.78 0.18 0.05
Matches are distributed among these distances:
179 2 0.01
180 52 0.14
181 301 0.83
182 8 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TTATTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAATTATATGAACAAAAC
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAAATGGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCTTAC
Found at i:15550718 original size:360 final size:361
Alignment explanation
Indices: 15549911--15551713 Score: 1661
Period size: 360 Copynumber: 5.0 Consensus size: 361
15549901 CAGCAAACAC
** * *
15549911 ATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGGAATATTTTTAAA-TTAGTAATATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
* * * *
15549971 CCAAA-AAGCTTGTATCAAAAGGAACAATTGTTTTATGACAAAAT-AAAGATCATAACATTTTGA
65 CAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACATTTTGA
* * ** *
15550034 GATAGATAA-TGTTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGTCTCGAAAAATAG-TTTCAGTTTTT
130 AATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-CTCGGTAAATAGATTT-ATTTTTT
* * * * **
15550097 AAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATCAGCATTATTTTAATCTAAATAATTTT
192 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTT
* * * * ** * *
15550158 GCATGAAAAAAAACAATTATTTGT-GGACAAAACAAAAGGTCATAACGATATGAAATAGATAA-T
257 GTATGAACAGAAACAATTGTTT-TATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * ** *
15550221 AGTTCAAATGGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAA
321 A-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATAT
*** * *
15550263 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC
** ** *
15550328 TGAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGA-TTTGA
66 AAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAA-CATTTTGA
*
15550392 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAA
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAA
* * * * * *
15550457 ATATTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTT
194 ATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGT
* * * *
15550522 ATGAATAGAAACAATTGGTTTATAAC-AAACAAAAGGTCATAATGATCTAAAATAGATAATTATT
259 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
* * * *
15550586 CAAACAGTTATAACTATTTGAA-TGTGTTCAAAAAATAT
324 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTAATAAATAT
*
15550624 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTATTTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC
* * * *
15550688 AAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTTGAA
66 AAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACATTTTGAA
* * ** * *
15550753 ATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTAAACATATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAT
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
15550818 TCTCTTGCTCATTAATTTTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTT-GT-TGCAAATAAGCTTA
195 TCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTG--AATAAGCTTG
* * * * *
15550880 TATGAACAGATACAACTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTAT
258 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
* * *
15550945 TCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAT
323 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATAT
* * * *
15550984 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT
* * * * * *
15551048 CAAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGATAAAATAAAA-AGTCATAACATTTTA
65 CAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGA-TCATAACATTTTG
* **
15551112 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACT--T--G----T--ATTTATTTTTTAA
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAA
*
15551167 ATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTTGAAATAAGC
194 ATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATCTG-AATAAGC
* ** ** * *** *
15551228 TTGTATGAACA-AAAGAAATCATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAA
255 TTGTATGAACAGAAA-CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * * * *
15551292 TTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTATGATAAATAG
319 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATAT
* **
15551335 ATTCATTTTTTAAAATCTTTTAAC-TATTAATTTTTGGAATATTAAT-AGCTTAGTATTATTTTA
1 ATTTATTTTTT-AAATCTTTT-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
** * * * * * *
15551398 TTTC-AAATAATTTTAG-ATTAACT-GAAATAATTTTTTTAT-AGCAAAACAAAAGGTCATAATG
63 -TTCAAAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAATAAAAGATCATAA-C
* * * * * * * * * *
15551459 A-TTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCAGTGAACATATTTAT
123 ATTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GCTCGGTAAATAGATTTAT
* * * *
15551523 TTTTAAAACCTTTTACTTATTAATTATTGAAAT-TTGAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
187 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT-AATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAAT
* * * * * *
15551587 AAGCATGTATGAACATAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAA
251 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
** * *
15551652 TAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAATATA-AG
316 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAATAAATAT
*
15551697 ATTTAATTTTTAAATCT
1 ATTTATTTTTTAAATCT
15551714 CATATTAATT
Statistics
Matches: 1189, Mismatches: 201, Indels: 113
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
350 38 0.03
351 115 0.10
352 131 0.11
353 10 0.01
355 1 0.00
356 38 0.03
357 39 0.03
358 70 0.06
359 54 0.05
360 260 0.22
361 211 0.18
362 83 0.07
363 132 0.11
364 7 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (361 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC
AAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACATTTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
CTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTAT
GAACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAATAT
Found at i:15550739 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15549911--15551681 Score: 1566
Period size: 181 Copynumber: 9.9 Consensus size: 181
15549901 CAGCAAACAC
** * *
15549911 ATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGGAATATTTTTAAATTAGTAATATTTTAATC
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
15549972 CAAA-AAGCTTGTATCAAAAGGAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAA-CATTTTGA
66 TAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGA
* * *
15550034 GATAGATAA-TGTTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TGTCTC-G-AAAAAT
130 AATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCGGTAAATAT
* ** * * * *
15550084 AGTTTCAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATCAGCATTATTTTAA
1 A-TTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * * * *
15550145 TCTAAATAATTTTGCATGAAAAAAAACAATTATTTGT-GGACAAAACAAAAGGTCATAACGATAT
64 TCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * *
15550209 GAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAA
128 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAT
*** * *
15550263 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* ** * * *
15550328 TGAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAATGATTTGAA
66 TAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * *
15550393 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTCGGTAAATAG
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAT
* * * *
15550444 ATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
15550509 TGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATAAC-AAACAAAAGGTCATAATGATCTAAA
66 TAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * ***
15550573 ATAGATAATTATTCAAACAGTTATAACTATTTGAA-TGTGTTCAAAAAATAT
131 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAATAT
*
15550624 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * *
15550687 CAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTTG
65 CTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTG
* * * * * *
15550751 AAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTAAACATATTCGGTAAACAG
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAT
* * * * *** *
15550804 ATTTATTTTTTAATTCTCTTGCTCATTAATTTTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTGTTG
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
* * * * * *
15550868 C-AAATAAGCTTATATGAACAGATACAACTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGA
65 CTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * ** *
15550932 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAT
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAT
* * * *
15550984 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * *
15551048 CAAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAA-CATTTTA
65 CTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTG
* **
15551112 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAC---TT--G------T
129 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAT
15551154 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
* ** * * ***
15551216 TT-TGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAGAAATCATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTATAGCAAT
63 TTCT-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
* * * * *
15551279 TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTAT-GATAAATAG
126 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCGGTAAATAT
* **
15551335 ATTCATTTTTTAAAATCTTTTAAC-TATTAATTTTTGGAATATTAATAGCTTAGTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTT-AAATCTTTT-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * *
15551399 T-TCAAATAATTTTAG-ATTAACTGAAATAATTTTTTTAT-AGCAAAACAAAAGGTCATAATGAT
64 TCT-AAATAAGCTT-GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGAT
* * * * * * * * *
15551461 TTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCAGTGAACAT
126 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAT
* * * * *
15551517 ATTTATTTTTAAAACCTTTTACTTATTAATTATTGAAAT-TTGAATAAATTAGTATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATT-AATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
15551581 CTGAATAAGCATGTATGAACATAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGA
65 CTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* *
15551646 AATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
130 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
15551682 TTGGTTTAAT
Statistics
Matches: 1297, Mismatches: 242, Indels: 110
0.79 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.00
170 131 0.10
171 7 0.01
172 2 0.00
173 2 0.00
174 4 0.00
175 51 0.04
176 29 0.02
177 57 0.04
178 11 0.01
179 87 0.07
180 301 0.23
181 473 0.36
182 133 0.10
183 6 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
TAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAT
Found at i:15551294 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 15550983--15551672 Score: 480
Period size: 170 Copynumber: 3.9 Consensus size: 170
15550973 TTAGTAAACA
*
15550983 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
1 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * * *
15551048 CAAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGATAAAATAAAAAGTCATAACATTTTAA
66 CAAAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACATTTTAA
*
15551113 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTG
131 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTAAACTTG
*** * *
15551153 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT
1 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
** * * * *
15551218 TGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAGAAATCATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTT
66 CAAAATAAGCTTGTATGAACATAAA-AAATCATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC-ATTTT
* **
15551282 -AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTATG
129 AAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTAAAC---T-TG
* * * ** *
15551327 ATAAATAGATTCATTTTTTAAAATCTTTTAAC-TATTAATTTTTGGAATATTAATAGCTTAGTAT
1 -T--AT---TT-ATTTTTT-AAATCTTTT-ACTTATTAATTGTAGAAATATTAATAAATTAATAT
* ** * * ** *
15551391 TATTTTATTTC-AAATAATTTTAG-ATTAAC-TGAAATAATTTTTTTAT-AGCAAAACAAAAGGT
57 TATTTTA-ATCAAAATAAGCTT-GTATGAACAT-AAAAAATCATTTTATGA-CAAAACAAAAAGT
* * * * * * * ** *
15551452 CATAATGA-TTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCAGTG
118 CATAA-CATTTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT-A--A--AGATTTA-AAC-TTG
* * * * *
15551512 AACATATTTATTTTTAAAACCTTTTACTTATTAATTATTGAAAT-TTGAATAAATTAGTATTATT
1 ----TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTAGAAATATT-AATAAATTAATATTATT
** * ** ** * * *
15551576 TTAATCTGAATAAGCATGTATGAACATAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATAA
61 TTAATCAAAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAT
* *
15551641 TTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA
126 TTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
15551673 CTATTTGAAT
Statistics
Matches: 414, Mismatches: 68, Indels: 68
0.75 0.12 0.12
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.01
170 137 0.33
171 5 0.01
173 1 0.00
174 2 0.00
175 1 0.00
177 2 0.00
178 1 0.00
180 11 0.03
181 116 0.28
182 111 0.27
183 11 0.03
185 3 0.01
186 2 0.00
187 5 0.01
188 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (170 bp):
TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
CAAAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACATTTTAA
AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTAAACTTG
Found at i:15551472 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15551158--15551678 Score: 445
Period size: 182 Copynumber: 2.9 Consensus size: 181
15551148 ACTTGTATTT
* * * * *
15551158 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-TAATATT-AATAAATTTA-TATTATTTT-ATTT
1 ATTTTTAAAACCTTTTACTTATTAATTAT-TGAAAT-TTGAATAAA-TTAGTATTATTTTAATCT
* ** ** * * ** *
15551219 GAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAGAAATCATTTTATGGCAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTTA
63 -AAATAAGCATGTATGAACATAAA-CTATTGTTTTATAGCAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGA
* * *
15551283 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTATGA-TAAATAGATTC
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGT-TCAGTAAACAGATTC
* * * ** *
15551339 ATTTTTTAAAATCTTTTAAC-TATTAATTTTTGGAATATT-AATAGCTTAGTATTATTTT-ATTT
1 A-TTTTTAAAACCTTTT-ACTTATTAATTATTGAAAT-TTGAATAAATTAGTATTATTTTAATCT
*** * * *
15551401 CAAATAATTTTAG-ATTAAC-TGAAA-TAATTTTTTTATAGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
63 -AAATAAGCAT-GTATGAACAT-AAACT-ATTGTTTTATAGCAAAACAAAAGGTCATAATAATTT
* * * * * * * *
15551463 GAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCAGTGAACATATTT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCAGTAAACAGATTC
*
15551521 ATTTTTAAAACCTTTTACTTATTAATTATTGAAATTTGAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAA
1 ATTTTTAAAACCTTTTACTTATTAATTATTGAAATTTGAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAA
* * *
15551586 TAAGCATGTATGAACATAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAA
66 TAAGCATGTATGAACATAAACTATTGTTTTATAGCAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAG
* *
15551651 ATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTT
131 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
15551679 GAATTGGTTT
Statistics
Matches: 275, Mismatches: 50, Indels: 30
0.77 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
180 5 0.02
181 127 0.46
182 137 0.50
183 6 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
ATTTTTAAAACCTTTTACTTATTAATTATTGAAATTTGAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAA
TAAGCATGTATGAACATAAACTATTGTTTTATAGCAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAG
ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCAGTAAACAGATTC
Found at i:15552904 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 15552544--15553438 Score: 799
Period size: 180 Copynumber: 5.0 Consensus size: 178
15552534 ATTTTACTCC
* * *
15552544 GAATAAGTTTATATGAATAGAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATACCGATTTGAAA
1 GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
15552608 TAGATAATTGCTCAAATA-ATCATAACTATTTGAA-TTGATTCGATAAACAAATTTAGTTTTTGA
65 TAGATAATTGTTCAAATAGA-CATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAA
* * *
15552671 ATCT--CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTT
128 ATCTCACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * *
15552720 GAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATT-TTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA
1 GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAA
** * * *
15552784 TAGATAATAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
65 TAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * *
15552849 CTCCAATTTATTAATTTTTAGAAGATTAATAAATTAGTATTATCTTATTTT
130 CT-C-ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
** * *
15552900 GAATAAACTTGTATGAGTAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATC-TAACGATTTGAAA
1 GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAA
* * * ** * **** * *
15552964 TAAATAATTATTTAAATAGTTATAATTATTTGAACTCACATGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
65 TAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT-AA-
* * * * * * *
15553029 ATTTCAGTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAATATTACTTTATTCT
128 ATCTCACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * * * *
15553080 AAATTAGCATT-TATGAACAAAAATAATTGGTTTGTGA-AAAA-AAAAGGGTTATAACGATTTGA
1 GAATAAG-TTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA--GTCATAACGATTTGA
** * * *
15553142 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACATGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAA
63 AATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT-A
* * * * **
15553207 AATTTTACTTATTAATCTTT-GTAATATTAGTAAATTTCTATTATTTTA-TTT
127 AATCTCACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * **
15553258 GAAATAAGTTTGTATGAACATAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAA
1 G-AATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAA
* * * * * *
15553323 ATAAATAATTGTTCAAATAGTA-ATAAATAGTTAAATTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAA
64 ATAGATAATTGTTCAAATAG-ACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAA
* * * *
15553387 ATCTCTTACTCAATAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTT
128 ATCTC--ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
15553439 CAAATAAGCT
Statistics
Matches: 579, Mismatches: 114, Indels: 46
0.78 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 13 0.02
176 90 0.16
177 8 0.01
178 9 0.02
179 73 0.13
180 319 0.55
181 61 0.11
182 6 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
TCACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
Found at i:15553455 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 15553436--15553463 Score: 56
Period size: 14 Copynumber: 2.0 Consensus size: 14
15553426 TATTATTTTA
15553436 TTTCAAATAAGCTT
1 TTTCAAATAAGCTT
15553450 TTTCAAATAAGCTT
1 TTTCAAATAAGCTT
15553464 ATATGAATTA
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 14 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.07, T:0.43
Consensus pattern (14 bp):
TTTCAAATAAGCTT
Found at i:15554450 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 15554084--15555198 Score: 900
Period size: 181 Copynumber: 6.2 Consensus size: 180
15554074 AACAAAAAAC
* * * *
15554084 AATTGTTTTAT-AGTAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
1 AATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * *
15554148 AACTA-ATCAAACTAGTTTGGTAAATAAATTTAATTTTTAAA--TC--ACTTATTAA-TTTTCAA
65 AACTATTTGAAA-TGGTTT-GCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAA
* * * * *
15554207 GATATTAATAAATT-GATATTATTTTA-TTCTAAACAAATTTA-TATGAACAAAAAC
128 -ATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTC-AAA-TAAGTTAGTATGAATAGAAAT
* * * * * *
15554261 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATGACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATA
1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * *
15554326 ATTATTTGAAATGGTTCAGCTAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
66 ACTATTTGAAATGGTT-TGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAAT
* ** * * *
15554391 ATTAATAAATTCAAT-TTATTTTATTTTGAATAAGTTAGTAAGAGCTA-AAAA
130 ATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTAGTATGA-ATAGAAAT
** * * * * * ** *
15554442 AATTGTTTTACAATAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCATACAACCTTA
1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * **
15554507 ACTATTTGAAGTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAAT
66 ACTATTTGAAATGGTTT-GCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAAT
* *
15554572 ATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTT-GTATGAATAGAAAT
130 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAG-TTAGTATGAATAGAAAT
* * * * *
15554623 AATTGTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAATTAT
1 AATTG-TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *
15554688 AATTATTT-AAACTGGTTTGCTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTATTA-TGTATAAATTTTTGA
65 AACTATTTGAAA-TGGTTTGC-AAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGT-TATTAATTTTTGA
* * * ** * * *
15554751 AATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTACGAATAA-ACATGGATGAGTTGAAAT
127 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTA-GTATGAATAGAAAT
* * * * * * * *
15554805 AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATGATTATTCATATAGTCTTA
1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
15554870 ACTATTTGAATTGGTTTGACAAACAAATTTTTTTTTTAAATCTCTTAGTAATGAATTTTT-AGAA
66 ACTATTTGAAATGGTTTG-CAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGA-AA
* * *
15554934 TATTATTAATTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATTTA-TATGAATAGAAAT
129 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGTTAGTATGAATAGAAAT
* * *
15554986 AATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* ** * * * * * * * *
15555051 ACTA-TTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--T-TTCG-TACTAATTCTTAAAAT
66 ACTATTTGAAATGGTTT-GCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAAT
*
15555111 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTT-GTATGTTAA-A-AAAT
130 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGTTAGTATG--AATAGAAAT
*
15555162 AATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGT-ACTAACAATTT
1 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTT
15555199 TATTTCAAAT
Statistics
Matches: 747, Mismatches: 154, Indels: 75
0.77 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 84 0.11
177 82 0.11
178 8 0.01
179 2 0.00
180 38 0.05
181 375 0.50
182 154 0.21
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAAATGGTTTGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATA
TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTAGTATGAATAGAAAT
Found at i:15554728 original size:363 final size:359
Alignment explanation
Indices: 15554193--15555145 Score: 1102
Period size: 363 Copynumber: 2.6 Consensus size: 359
15554183 TTTAAATCAC
* * * * *
15554193 TTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATT-GATATTATTTTATTCTAAACAAATTTATATGAACAA
1 TTATTAATTTTCAAAATATT-ATTAATTAG-TATTATTTTATTCTAAATAAATTTATATGAATAG
* * * * * * *
15554257 AAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATGACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAAT-AT
64 AAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
* *
15554321 TCATAATTATTTGAAA-TGGTTCAGCT-AACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
129 T-ATAATTATTT-AAACTGGTT-TGCTAAATAAAATTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTT
* ** *
15554384 TTGAAATATTAATAAATTCAATTTATTTTATTTTGAAT-AAGTTAGTAAGAGCTAAAAAAATTGT
190 TTGAAATATTAATAAATT-AATTTATTTTATTTCGAATAAACAT-GGAAGAGCTAAAAAAATTGT
* * * * *
15554448 TTTACAATAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCATACAACCTTAACTATT
253 TTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACAACCTTAACTATT
*
15554513 TGAAGTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
318 TGAAGTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* ** *
15554555 TTATTAATTGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGA
1 TTATTAATTTTCAAAATATTATTA-ATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATTTATATGAATAGA
*
15554620 AATAATTGTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAAT
65 AATAATTG-TTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
*
15554685 TATAATTATTTAAACTGGTTTGCTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTATTA-TGTATAAATTTTT
129 TATAATTATTTAAACTGGTTTGCTAAATAAAATTATTTTTTAAATCT-TTACT-TATTAATTTTT
* * * * * *
15554749 GAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTACGAATAAACATGGATGAGTTGAAATAATTGTTTT
192 GAAATATTAATAAATTA-ATTTATTTTATTTCGAATAAACATGGAAGAGCTAAAAAAATTGTTTT
* * * * **
15554814 ATAACAAAACAAAAGGTCGTAACGATTTGAAATAGATGATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGA
256 ACAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACAACCTTAACTATTTGA
* *
15554879 ATTGGTTTGACAAACAAATTTTTTTTTTAAATCTCTTAG
321 AGTGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * *
15554918 TAATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAATTTATATGAATAG
1 TTATTAATTTTCAAAATATTATTAA-TTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAATTTATATGAATAG
* *
15554982 AAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
64 AAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
* * * ** * * * * * *
15555047 CATAACTA-TTGAACTTATTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAA--TTT-CGTACTAATTCTTA
129 TATAATTATTTAAACTGGTTT-GCTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTG
* *
15555107 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC
193 AAATATTAATAAATTAAT-TTATTTTATTTCGAATAAAC
15555146 TTGTATGTTA
Statistics
Matches: 506, Mismatches: 71, Indels: 33
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
356 1 0.00
357 42 0.08
358 2 0.00
359 1 0.00
361 31 0.06
362 126 0.25
363 297 0.59
364 6 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (359 bp):
TTATTAATTTTCAAAATATTATTAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATTTATATGAATAGAA
ATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATTA
TAATTATTTAAACTGGTTTGCTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAA
TATTAATAAATTAATTTATTTTATTTCGAATAAACATGGAAGAGCTAAAAAAATTGTTTTACAAC
AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACAACCTTAACTATTTGAAGTGG
TTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
Found at i:15554878 original size:544 final size:531
Alignment explanation
Indices: 15554037--15559605 Score: 1216
Period size: 540 Copynumber: 10.2 Consensus size: 531
15554027 TTATTAATTT
* * * * *
15554037 TAAATAAGCATTACTTTATTCTGAATAAGAC-TGTATGAACAAAAAACAATTGTTTTATAGTAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CTTGTATG---AAAAAATAATTGTTTTATA-TAAA
* * *
15554101 ACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTAATCAAACTAGTTT
61 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAACTAGTTT
* *
15554166 GGTAAATAAATTTAATTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTGATATTATTT
126 GCTAAATAAAATTAATTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTGATATTATTT
** * * * *
15554231 TATTCTAAACAAATTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATGACAAT
191 TATTCTAAACAAACATAGATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAACAAT
* * * *
15554296 TTAAAATAGATAATTGTTCAAATATTCATAATTATTTGAAATGGTTCAG-CTAACAAAATTATTT
256 TTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTT-AGACAAACAAAATTATTT
* * **
15554360 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTCAAT-TTATTTTATTTTGAAT-
320 TTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAG-AATATT-ATAAATTCAATATTATTTTATTTCAAATA
* * * *
15554422 AAGTTAGTAAGAGCTA-AAAAAATTGTTTTACAATAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAG
383 AAGTTA-TAAGA-ATAGAAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * * *
15554486 ATAATTGTTCATACAACCTTAACTATTTGAAGTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
446 ATAATTGTTCAAACAACCATAACTA-TTGAACTGATTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAA--T-
* * *
15554551 TTAGTTATTAATTGTCAAAATATTAT
507 TTAG-TACTAATTCTCAAAATATTAA
* *
15554577 TAGATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTTATGATAGAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-A-AAATAATTG-TTTTAT-ATAAAA
* * * * * *
15554642 CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAATTATAATTATTTAAACTGGTTTG
62 CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAACTAGTTTG
* * *
15554707 CTAAATAAAATTATTTTTTAAATCTA-TTATGTATAAATTTTTGAA-ATATTAATAAATT-AGTT
127 CTAAATAAAATTAATTTTTAAATC-ACTTA--T-T-AA-TTTTCAAGATATTAATAAATTGA-TA
* * * **** * **
15554769 TTATTTTATTAC-GAATAAACATGGATGAGTTGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCG
185 TTATTTTATT-CTAAACAAACATAGATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAA
* * * * * * * *
15554833 TAACGATTTGAAATAGATGATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGACAAACAAAT
249 TAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTTAGACAAACAAAA
* * * * *
15554898 TTTTTTTTTAAATCTCTTAGTAATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTATTATTTTATTTCA
314 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAGAATATTATAAATTCAATATTATTTTATTTCA
* * * ** * *
15554963 AATAAATTTATATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAAT
379 AATAAAGTTATAAGAATAGAAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAT
* ** * * * *
15555028 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTT
444 AGATAATTGTTCAAACAACCATAACTATTGAACTGATTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTT
* *
15555093 CGTACTAATTCTTAAAATATTAA
509 AGTACTAATTCTCAAAATATTAA
*
15555116 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATGTTAAAAAATAATTGTTTTATAATAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATG--AAAAAATAATTGTTTTAT-ATAAAA
* ** * * * * *
15555180 CAAAAGG-TACTAACAATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTTTGACA
62 CAAAAGGTTA-TAACAATTTGAAAT-AAATA---AT-TA--TT--CAAATAA-----TTATAAC-
* * * * * * *
15555244 AAATAAAAGGTAATAATGACTTGAAAT-AGA-TAATTGTTTAAATTGCCATAATTATTTGAACTA
111 TAATCAAA-CTAGT-TTG-C-T-AAATAAAATTAATT-TTTAAA-T--C--ACTTA-TT-AA-T-
* ** * * * * * *
15555307 ATTCAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTA
161 -TT---TCAA--GA--TA-TTAATAAAT-TGA--TATT-ATTTT---ATTCTAAACAAA-CA-TA
* * * * * * ** * * * ** *
15555372 TTATGTTATCTTAGATA-AACTT-TTGTA-AACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATTT
208 -GATG--AAC--AAAAACAA-TTGTTTTATAAC-AAAACAAAAG-GTAATAACAATTTAAAA-TA
* * * **
15555434 GATAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCGGTAAACAA
264 GAT---AA--TT--AT---TCA--A-----ATAGTCATAACTATTTGAAATGGTTAGACAAACAA
* * * * * ** *
15555499 ATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAA-AGTTAATAAATT-AGCATTATTTTC
312 AATTATTTTTT-AAATCTCTTACTAATGAATTTTTAGAATA-TT-ATAAATTCAATATTATTTTA
* * * * * * * * * *
15555562 TTTCGAAT-AAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACT-AAATAAAACGTCATAACGA
374 TTTCAAATAAAG-TTATAAGAA-TAGAAAAAATTGTTTTA-CAATAAAACAAAAAGTCATAACAA
* ** * * * * *
15555624 TTTGAAATAGATAATTATTCTGATAATCTTAACTATTTGAACTGATTCA-CAAACACATTTATTT
436 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAACCATAACTA-TTGAACTGATTTAGCAAACAAATTTATTT
* * * * *
15555688 TTGAAATCTCTTACTTATTAAGTT-TCAAAATATGAT
500 TTTAAA--T-TTA-GTACTAA-TTCTCAAAATATTAA
** * * *
15555724 TAAATTAGTATTATTTT-TATCCGAA-CAGCTTGTATGATAAAAA-AATTTATTTTATGGTAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGA-AAAAATAA-TTGTTTTAT-ATAAAA
* ** * ** * * * ** * *
15555786 CAAATA--TCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCCTAACT-ATTAGAACTACTT
62 CAAA-AGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCA-AACTAGTT
* ** * ** * * * *
15555848 CGAAAAACAACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAAGT-AGT
125 TGCTAAATAAAATTAATTTTTAAA--TC--ACTTATTAA-TTTTCAAGATATTAATAAATTGA-T
* * * *** ** * *** ** *
15555911 ATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATTAATTGAAACTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTA
184 ATTATTTTATTCTAAACAAACATAGATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGG-TA
* * * ** * *
15555976 A-AACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAAATTATTCAG-TAAACAG
248 ATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTT-AGACAAACAA
* * * * * * *
15556039 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATT-AGTATTATTTTAT
312 AATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAGAATATT-ATAAATTCAATATTATTTTAT
* * * * * * * * * ***
15556103 TTCAAAT-AAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTTAGAATGCTT
375 TTCAAATAAAG-TTATAAGAATAGAAAAAATTGTTTTA-CAATAAAACAAAAAGTCATAACAATT
* * * ** * **
15556166 TGAAATGGATAATTGTTCTAATAA-TTTGAACTATTTGAACTG-TTTCGACAAACATCTTTATTT
438 TGAAATAGATAATTGTTCAAACAACCAT-AACTA-TTGAACTGATTTAG-CAAACAAATTTATTT
* * ** *
15556229 TTTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTTGAAATATTAT
500 TTTAAA--T-TTA-GTACT-AATTCTCAAAATATTAA
* * * * * * *
15556265 TAAATTAGAATCATTTCAATTC-GAATAAACTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTGTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTT-TATTCTAAATAAGCTTGTATG-AAA-AAATAATTGTTTTAT-ATAAAA
* ** * * * * * * * * ** * * *
15556329 -TAAAGACTATTATAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTCA
62 CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAACTAGTT-T
* * * * * * * **
15556393 G-TAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTTTTAATTTTCAAAATATTAGTAAATCAATATTATTT
126 GCTAAATAAAATTAATTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTGATATTATTT
* * * * * * * * * * * *
15556457 TATTTTGAATAATTC-TATATGAATAGAAAA-AAGTGTTTGATGACAAAACAAAATGTCATAACG
191 TATTCTAAACAA-ACATAGATGAACA-AAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAACA
* * ** * * ** * * * * * *
15556520 ATTT-ATATGGATAATGGTTCAAATGGACATGGCTATTT-AAACTTGTTCTG-TAAATAGATTTA
254 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAA-TGGTT-AGACAAACAAAATTA
* * * * * *
15556582 TTTTTTAAATCTCCTACCT-ATTAATTTGTAGAATATTTATAAAAT-AGTATTATTTTATTTCGA
317 TTTTTTAAATCTCTTA-CTAATGAATTTTTAGAATA-TTATAAATTCAATATTATTTTATTTCAA
* * * * ** * *
15556645 ATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACTATTTGAAAT
380 ATAAAGTTATAAGAATAGAAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAAT
* * * * ** * **** * * *
15556709 AAAAAATTCTTCAAATAGTCATAACTA-TGAAAGCTTACCCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAA
444 AGATAATTGTTCAAACAACCATAACTATTG-AA-CTGATTTAGCAAACAAATTTATTTTTT-AAA
* * * ***
15556773 TCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
506 ---TTTA-GTACTAATTCTCAAAATATTAA
* * * * * * * *
15556803 TAAATTAATATTATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGGACAGAAACAATTGGTTTATCACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-GA-AAAAATAATTGTTTTAT-ATAAAAC
* * * * * * * * ** *
15556868 AAAAGGTCATAAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCAGAACTATTTGAACAAGTTTA
63 AAAAGGTTAT-AACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAACTAGTTT-
* * * * * * * ** *
15556933 G-AAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTACTTATTAAAATTTGGA-ATATTAATAAATTTA-ATT
126 GCTAAATAAAATTA-ATTTTTAA--ATCACTTATT-AATTTTCAAGATATTAATAAATTGATATT
* * * * * * * * * *
15556995 ATTTTATTCAAAATAAGC-TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAGAAGGTCATA
187 ATTTTATTCTAAACAAACATAG-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATA
* * * * *
15557059 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAAC-GAAT
251 ACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTT-AGACAAACAAAAT
* * * * *
15557122 TCATTTTTTTAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTGA-TATTTTATTT
315 T-ATTTTTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAGAATATT-ATAAATTCAAT-ATTATTTTATTT
* * * * * * ** ** * **
15557185 CGAAT-AAGCCTATATGAACT-GATACAATTGATTT-CTAGCAAAAC-CTAGGTCATAATGATTT
377 CAAATAAAG-TTATAAGAA-TAGAAAAAATTGTTTTAC-AATAAAACAAAAAGTCATAACAATTT
* * *** * * * * * *
15557246 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACT-TTTTCGGTAAACATATTTATTTTA
439 GAAATAGATAATTGTTCAAACAACCATAACTA-TTGAACTGATTT-AGCAAACAAATTTATTTTT
* * * * * *
15557310 AAATATTTTACTTATTGATTTTTAAAATATTAA
502 TAA-A-TTTA-GTACTAATTCTCAAAATATTAA
* * * * * * * * *
15557343 TAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAAGAAAAACAATTGTGTCATGACAAAAT
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATG-A-AAAAATAATTGTTTTAT-ATAAAAC
* * * * * * * **
15557408 AAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAGTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTG
63 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAAC-TAGTTTG
* * * * * * **
15557472 ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATTAGTTGTTTGA-ATATTAATAAATTTTGATA
127 CTAAATAAAATTAATTTTTAAATC----ACTTATTAATT-TTCAAGATATTAATAAA--TTGATA
* * * ** * * *
15557536 --ATTTTATT-TGAAATAAAC-TTGTATGAATAGAAAA-TTTTGTTTTATGACACAAGAAAAGGT
185 TTATTTTATTCT-AAACAAACATAG-ATGAACA-AAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGT
* * * * * * * * * * *
15557596 TATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGTACTTGTTCGATAAAC-A
247 AATAACAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTTAGACAAACAA
* * * * * *
15557660 AATTCATGTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAAT-AGA-ATTATGTTA
312 AATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAGAATATT-ATAAATTCA-ATATTATTTTA
* * * * *** * * *
15557723 TTTCTAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTGTGATAAAAC-AAAGGTCATAATAGTT
374 TTTCAAATAAAG-TTATAAGAATAGAAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACAATT
** * * * * * ** *
15557786 TGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAGCTATTTGCACT-AGTCAGGCCAACTGATTCATTTT
438 TGAAATAGATAATTGTTCAAACAACCATAACTA-TTGAACTGATTTA-GCAAACAAATTTATTTT
* * * * *
15557850 TTAAAATCGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
501 TT-AAAT--TTA-GTACTAATTCTCAAAATATTAA
* * ** * *
15557885 TAAATTAATATTACTTTATTCCGAATAA-CATTGTATGAACAGAAACAATTG------GT----C
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGC-TTGTATGAA-A-AAATAATTGTTTTATATAAAAC
** * ** * * ** ** *
15557939 AATTGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTATAACTAATTGAACTGGTTTAG
63 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAACTAGTTT-G
* * * * * * * * *
15558004 -TAAATAGATTTATTTTTTAAAGTTCTTTCTTCTTAACTTTCAAAAAATTAATAAATTAATATTA
127 CTAAATAAAATTAATTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTGATATTA
* * * * * * * * *
15558068 TTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
188 TTTTATTCTAAACAAACATAGATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAAC
* * * * * * * *
15558133 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAATTGGTTAGGCAAACAAAATTGT
253 AATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTTAGACAAACAAAATTAT
* * * * *** * *
15558198 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTT-GAAATATTAATAGATTTTTTTTTATTTTATTCCAAA
318 TTTTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAG-AATATT-ATAAATTCAATATTATTTTATTTCAAA
** *** * * **
15558262 T-AAGACACTAAGAA-ATGAAAAAAAAAATTTT-CGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
381 TAAAGTTA-TAAGAATA-G-AAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * * * *
15558324 TAAAGAATTGTTCATATAACCTTAACTATTTAAACT-AGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAA
443 TAGATAATTGTTCAAACAACCATAACTA-TTGAACTGA-TTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * *
15558388 TTTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTAT
506 --T-TTAG-TACTAATTCTCAAAATATTAA
** * * * * *
15558418 TGCATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTGTAAACAAAAATAATTGTTTTATGAGATAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTAT-GA-AAAAATAATTGTTTTAT-ATAAAA
* * * * * * * *
15558482 CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTG
62 CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAACTAGTTTG
* * ** * * *
15558547 GTAAA-CAAATTAACTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGAA-ATATTAGTAGATT-AGTATTAT
127 CTAAATAAAATTAA-TTTTTAAATCACTTATTAA-TTTTCAAGATATTAATAAATTGA-TATTAT
* * * * ** * * ** * *
15558609 TTTATTCTGAA-TAGC-TTGTATGATGAAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAATTTCATAAT
189 TTTATTCTAAACAAACATAG-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAAC
* * * * * * * ** * * ** *
15558672 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AACAGGCAATAATTATTTGAACTAATTTGATAAACTGACTTA
253 AATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAAATGGTTAGACAAACAAAATTA
* * * * ** ***
15558736 TTTTTTAAATATCTAACTTATCAATTTTT-GAAATATTAATAAA-GAAATATTATTTTATTTTGG
317 TTTTTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAG-AATATT-ATAAATTCAATATTATTTTATTTCAA
* * * * * * ** * * ** *
15558799 ATAAACTTTTATGTACTA-AAACAGTTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT
380 ATAAAGTTATAAG-AATAGAAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * * * * *
15558863 AGATAATTATTTAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGA-TTATTTTTTAAAAT
444 AGATAATTGTTCAAACAACCATAACTA-TTGAACTGATTTAGCAAACAAATTTATTTTTT-AAA-
* * * ** *
15558927 TTCTTACTTATTAATTTTCTGAATGTTAA
506 -T-TTA-GTACTAATTCTCAAAATATTAA
* * * * * * *
15558956 TAAATTAGTATTATTATATTTTGAATAAGCATGTATGAACTGAAATAATTATTTTTTGACT-AAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA--AAAATAATTGTTTTAT-A-TAAAA
* * * * * * * ** *
15559020 CAAAAGATCTA-AACAATTTGGAATAGATAATTGTTCTAATAGTCT-TAACTATTTGAACT-GGT
62 CAAAAGGT-TATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAAT-TATAACTAATCAAACTAGTT
* * * * * *
15559082 T-C-AAAAAACACATTTATTTTTAAATC-C-TATTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTGGTATTA
125 TGCTAAATAA-A-ATTAATTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTGATATTA
* * ** * * * * * * *
15559143 TTTTATTCTGAA-TAATTTTGTATGAATAGAAACGATTATTTTATAATAAAACAAAATGTAATAA
188 TTTTATTCTAAACAAACATAG-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAA
* * * * * * ** * * * *
15559207 CAATTTTAAATAGATAA-CAGCTCAAATGGAT-ATGACTATCT-AAACTTATTCGATAAACAGAT
252 CAATTTAAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAA-TGGTTAGACAAACAAAA
* * * * * *
15559269 TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATAATAATAAATT-AGTATTATTTTATTCC
314 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATGAATTTTTAGAAT-ATTATAAATTCAATATTATTTTATTTC
* * * * * * ** * *
15559333 AATTAAACTTGTATGAATGGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACAACTTGAA
378 AAATAAAGTTATAAGAATAGAAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAA
* * * ** * * * * * * *
15559397 ATTGATAGTTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTG-CTCAGTAAATAAAATTATTATTTAA
442 ATAGATAATTGTTCAAACAACCATAACTA-TTGAAC-TGATTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAA
* * *
15559461 ATCTT-CTACTTATTAACTTTAGAAATATTAA
505 AT-TTAGTACTAATT--C-TCA-AAATATTAA
*
15559492 TAAATTAGTATTATTTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTAG-TTTATGACAA
1 TAAATTAGTATTA-TTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAA-A-AAATAATT-GTTTTAT-ATAA
** * * * * *
15559555 AACAAATTGTCATAACAATTTGAAGTAGATAATTGTTCAAATAATCATAAC
60 AACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAAC
15559606 CATTTGAATG
Statistics
Matches: 3855, Mismatches: 881, Indels: 589
0.72 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
529 5 0.00
530 9 0.00
531 225 0.06
532 47 0.01
533 127 0.03
534 17 0.00
535 50 0.01
536 240 0.06
537 257 0.07
538 380 0.10
539 344 0.09
540 496 0.13
541 344 0.09
542 211 0.05
543 257 0.07
544 306 0.08
545 16 0.00
547 7 0.00
550 1 0.00
552 6 0.00
553 5 0.00
554 4 0.00
555 2 0.00
556 5 0.00
557 13 0.00
558 18 0.00
559 13 0.00
560 8 0.00
561 3 0.00
562 8 0.00
563 1 0.00
564 1 0.00
565 10 0.00
568 6 0.00
569 4 0.00
570 3 0.00
571 8 0.00
572 7 0.00
573 3 0.00
574 3 0.00
575 6 0.00
578 11 0.00
579 1 0.00
580 1 0.00
581 5 0.00
583 7 0.00
584 15 0.00
585 22 0.01
586 11 0.00
587 5 0.00
588 1 0.00
589 7 0.00
590 2 0.00
591 6 0.00
593 2 0.00
596 6 0.00
598 2 0.00
600 1 0.00
601 2 0.00
603 42 0.01
604 126 0.03
605 31 0.01
606 24 0.01
607 13 0.00
608 34 0.01
609 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (531 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAAAAATAATTGTTTTATATAAAACAAA
AGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATTATAACTAATCAAACTAGTTTGCTAA
ATAAAATTAATTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTGATATTATTTTATTC
TAAACAAACATAGATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAA
ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTTAGACAAACAAAATTATTTTTTAAA
TCTCTTACTAATGAATTTTTAGAATATTATAAATTCAATATTATTTTATTTCAAATAAAGTTATA
AGAATAGAAAAAATTGTTTTACAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
AAACAACCATAACTATTGAACTGATTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTAGTACTAATTCT
CAAAATATTAA
Found at i:15555205 original size:67 final size:67
Alignment explanation
Indices: 15555128--15555255 Score: 184
Period size: 67 Copynumber: 1.9 Consensus size: 67
15555118 AATTAGTATT
* *
15555128 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTAAAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTACTAA
1 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTACTAA
15555193 CA
66 CA
** * * * *
15555195 ATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTTTGACAAAATAAAAGGTA
1 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTA
15555256 ATAATGACTT
Statistics
Matches: 53, Mismatches: 8, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
67 53 1.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.07, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (67 bp):
ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGTTAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTACTAA
CA
Found at i:15556682 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 15555195--15560113 Score: 3616
Period size: 181 Copynumber: 27.4 Consensus size: 180
15555185 GGTACTAACA
* * * * * * *
15555195 ATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTTTGACAAAATAAAAGGTAATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * ** * *
15555259 ATGACTTGAAATAGATAATTGTTTAAATTGCCATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACTGATTT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTT
* *
15555324 ATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * ** *
15555374 ATGTTATCTTAG-ATAAACTTTTGTAAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATTTGAT
1 ATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
15555437 AACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTCGGTAAACAAATT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATT
* * *
15555502 TATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAA-AGTTAATAAATTAGCATT
129 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATA-TTAATAAATTAGTATT
* * * * *
15555556 ATTTTCTTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAACGTCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* ** * * ** *
15555620 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCTGATAATCTTAACTATTTGAAC-TGATTC-ACAAACACATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCTGTAAACAGATT
* * * * *
15555683 TATTTTTGAAATCTCTTACTTATTAAGTTTCAAAATATGATTAAATTAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * **
15555736 ATTTT-TATCCGAA-CAGCTTGTATG-ATA-AAAAAATTTATTTTATGGTAAAACAAATA--TCA
1 ATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCA
* * * * * * ** *
15555795 TAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCCTAACTATTAGAACTACTTC-GAAAAACA-A
63 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGA
* * * *
15555858 CTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT
127 -TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * ** * *
15555914 ATTTTATTT-TAGATAAGTTTTTATTAATTGAAACTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAA
1 ATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
15555978 ACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAAATTATTCAGTAAACAGATTT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTT
* * *
15556043 ATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
130 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
15556096 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * **
15556161 TGCTTTGAAATGGATAATTGTTCTAATAAT-TTGAACTATTTGAAC-TGTT-TCGACAAACATCT
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTCT-G-TAAACAGAT
* * * * *
15556223 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGAATC
128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * *
15556277 ATTTCAATTCGAATAAACTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTGTATGACAAAA-TAAA-GACTATT
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATA
** * * * * *
15556340 ATAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTTCAGTAAATAGATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCTGTAAACAGATT
* * * * *
15556404 TAGTTTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTTTCAAAATATTAGTAAATCAATATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
15556453 ATTTTATTTTGAATAA-TTCTATATGAATAGAAAAAAGTGTTTGATGACAAAACAAAATGTCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * ** * *
15556517 ACGATTT-ATATGGATAATGGTTCAAATGGACATGGCTATTTAAACTTGTTCTGTAAATAGATTT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTT
* * * *
15556581 ATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTGTAGAATATTTATAAAATAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATT
* *
15556633 ATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *** * *
15556698 CTATTTGAAATAAAAAATTCTTCAAATAGTCATAACTA--TGAAAGCTTACCCGGTAAATAGATT
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AA-CTTGTTCTGTAAACAGATT
* * *
15556761 TATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATT
129 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
15556815 ATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGGACAGAAACAATTGGTTTATCACAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-A
* * * ** * *
15556880 ACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCAGAACTATTTGAACAAGTT-TAGAAAACAAATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATT
* * * *
15556944 TATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAAAATTTGGAATATTAATAAATT--TAATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTAGAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * *
15556995 ATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAGAAGGTCATA
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * **
15557059 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC-GAATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAG-ATT
* * * *
15557123 CATTTTTTTAATCTTTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTGA-T
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * **
15557176 ATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACT-GATACAATTGATTTCTA-G-CAAAAC-CTAGGTCA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG-TTT-TATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * *
15557237 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTTTTCGGTAAACATAT
63 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGAT
* * * * * *
15557302 TTA-TTTTAAAATATTTTACTTATTGATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATT
128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * * *
15557355 ATTTTAATCCAAATAGGCTTGTATGAAGAAAAACAATTGTGTCATGACAAAATAAAAAGTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
15557420 CGATTTGAAATAAATAGTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGATAAACAGATTT
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATTT
* * * *
15557484 ATTTTTTAAATCAT-TTACTTATTAGTTGTTTGAATATTAATAAATT-TTGATA
130 ATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATT-TTAGAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * * *
15557536 ATTTTATTT-GAAATAAACTTGTATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGACACAAGAAAAGGTTAT
1 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * *
15557599 AGCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGTACTTGTTC-GATAAACAAAT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGAT
* * * * *
15557663 TCATGTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGAATT
128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
15557717 ATGTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTGTGATAAAAC-AAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * ** *
15557781 -TAGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAGCTATTTGCACTAG-TCAGGCCAACTGATT
66 CGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-TGTAAACAGATT
* * *
15557844 CATTTTTTAAAATC-GTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATT
129 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * **
15557897 ACTTTATTCCGAATAA-CATTGTATGAACAGAAACAATTG------G-----TCAATTGGTCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
15557950 ATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTATAACTAATTGAACTGGTT-TAGTAAATAGAT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGAT
* * * * * *
15558013 TTATTTTTTAAAGT-TCTTTCTTCTTAACTTTCAAAAAATTAATAAATTAATATT
128 TTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
15558067 ATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** * * *
15558132 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGCAAACAAAATT
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCTGTAAACAGATTT
* * ** *
15558196 GTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTT-GAAATATTAATAGATTTTTTTTT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAG-AATATTAATA-AATTAGTATT
* * ** * * *** * *
15558249 ATTTTATTCCAAATAAGAC-ACTAAGAA-ATGAAAAAAAAAATTTT-CGATAAAACAAAAGGTCA
1 ATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAATA-G-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * ** * * * * * * *
15558311 TAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAACCTTAACTATTTAAACTAGTTCAGCAAATAAAT
63 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGAT
* * * **
15558376 TTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTATTGCATTAGTATT
128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * * *
15558430 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTGTAAACAAAAATAATTGTTTTATGAGATAACAAAAGGTTATAA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * *
15558495 CAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTT-TGGTAAACAAATTA
66 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATTT
* * * *
15558559 ACTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * **
15558607 ATTTTA-TTCTGAAT-AGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAATTTCAT
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ** *
15558669 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AACAGGCAATAATTATTTGAACTAATT-TGATAAACTGA
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGA
* * * * * ** *
15558732 CTTATTTTTTAAATATCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGAAATATT
127 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
15558787 ATTTTATTTTGGATAAACTTTTATGTACTA-AAACAGTTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
15558851 ATGATTTTAAATAGATAATTATTTAAATAATCATAACTATTTGAACTTATT-TAGTAAATAGA-T
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCT-GTAAACAGATT
* * *
15558914 TATTTTTTAAAATTTCTTACTTATTAATTTTCTGAATGTTAATAAATTAGTATT
129 TATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
15558968 ATTATATTTTGAATAAGCATGTATGAACT-GAAATAATTATTTTTTGACTAAACAAAAGATC-TA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-
* * * * * *** *
15559031 AACAATTTGGAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAACACATT
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATT
* * * *
15559096 TA-TTTTTAAATC-C-TA-TTA--ATTTTTAAAATAGTAATAAATTGGTATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * * *
15559142 ATTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACGATTATTTTATAATAAAACAAAATGTAATA
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * * * * * *
15559206 ACAATTTTAAATAGATAACAGCTCAAATGGAT-ATGACTATCTAAACTTATTC-GATAAACAGAT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGAT
* *
15559269 TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATAATAATAAATTAGTATT
128 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
15559323 ATTTTA-TTCCAATTAAACTTGTATGAATGGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
1 ATTTTATTTCGAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * *
15559387 ACAACTTGAAATTGATAGTTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGCTCAGTAAATAAAATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTT
* *
15559452 ATTATTTAAATCT-TCTACTTATTAACTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * **
15559504 ATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTAG-TTTATGACAAAACAAATTGTCAT
1 A-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
15559568 AACAATTTGAAGTAGATAATTGTTCAAATAATCATAACCATTTGAA-TGTGTT-TAGAAAACATA
64 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCT-GTAAACAGA
* * * *
15559631 TTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTTA-TATG
127 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * * * * *
15559685 ATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTATTTTATGACCAAACAAATGGTTATA
1 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** * * *
15559749 ATGTTTTGAAATAGATAATTATTTAGGTAGCCATAACTATTTAAACTTGATT-GGTAAACAGATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCTGTAAACAGATT
* * * * *
15559813 CATTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTCAGTATATTAATAAATTAGAATT
129 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * *
15559867 ATTTTATTTCAAATAAGCTAATATTAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAACCAAAGGTCACA
1 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
15559931 ATGATTTGAAATAGATAACTATTTAAATAGTTATGACTAGTTGAACTTGTT-TGATAAACATATT
65 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTG-TAAACAGATT
* * *
15559995 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTCTT-GAAATATTAATAAATCAATATT
129 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
15560048 ATTTTA-ATCTGAATAAGCTTCTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
1 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
15560112 AC
65 AC
15560114 AATTATGTTT
Statistics
Matches: 3729, Mismatches: 816, Indels: 388
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 5 0.00
170 123 0.03
171 3 0.00
173 3 0.00
174 108 0.03
175 25 0.01
176 212 0.06
177 112 0.03
178 85 0.02
179 281 0.08
180 733 0.20
181 1210 0.32
182 735 0.20
183 90 0.02
184 2 0.00
185 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACAGATTTA
TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
Found at i:15560153 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 15560129--15560175 Score: 62
Period size: 18 Copynumber: 2.7 Consensus size: 18
15560119 TGTTTGTAGA
15560129 ACTATTTCAAATAATTAT
1 ACTATTTCAAATAATTAT
*
15560147 GACTATTT-GAATAATTAT
1 -ACTATTTCAAATAATTAT
15560165 A-TATTTCAAAT
1 ACTATTTCAAAT
15560176 CATAATTACC
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 2, Indels: 4
0.81 0.06 0.13
Matches are distributed among these distances:
16 5 0.20
17 4 0.16
18 9 0.36
19 7 0.28
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.04, T:0.45
Consensus pattern (18 bp):
ACTATTTCAAATAATTAT
Done.